EA045813B1 - ANTI-CD24 COMPOSITIONS AND THEIR APPLICATIONS - Google Patents

ANTI-CD24 COMPOSITIONS AND THEIR APPLICATIONS Download PDF

Info

Publication number
EA045813B1
EA045813B1 EA202092306 EA045813B1 EA 045813 B1 EA045813 B1 EA 045813B1 EA 202092306 EA202092306 EA 202092306 EA 045813 B1 EA045813 B1 EA 045813B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antibody
cells
cancer
seq
antibodies
Prior art date
Application number
EA202092306
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Ян Лю
Пань Чжэн
Ронда Флорес
Хун-Янь Чоу
Чжихун Сюэ
Пэйин Е
Мартин Девенпорт
Original Assignee
ОнкоСи4, ИНК.
Чилдрен'С Рисерч Инститьют
Чилдрен'С Нешнл Медикал Сентер
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ОнкоСи4, ИНК., Чилдрен'С Рисерч Инститьют, Чилдрен'С Нешнл Медикал Сентер filed Critical ОнкоСи4, ИНК.
Publication of EA045813B1 publication Critical patent/EA045813B1/en

Links

Description

Область техники, к которой относится изобретениеField of technology to which the invention relates

Настоящее раскрытие относится к aHTu-CD24 антителам, которые избирательно связывают человеческий CD24, экспрессируемый в раковых клетках, но не человеческий CD24, экспрессируемый в нераковых клетках. Раскрытие также относится к применению таких антител в лечении рака.The present disclosure relates to aHTu-CD24 antibodies that selectively bind human CD24 expressed in cancer cells, but not human CD24 expressed in non-cancerous cells. The disclosure also relates to the use of such antibodies in the treatment of cancer.

Уровень техникиState of the art

CD24 представляет собой небольшой сильногликозилированный муцин-подобный белок клеточной поверхности, связанный с гликозилфосфатидилинозитолом (GPI). CD24 экспрессируется на более высоких уровнях на гемопоэтических клетках, включая В-клетки, Т-клетки, нейтрофилы, эозинофилы, дендритные клетки и макрофаги, а также негемопоэтических клетках, включая нервные клетки, ганглиозные клетки, клетки эпителия, кератиноциты, мышечные клетки, клетки поджелудочной железы и эпителиальные стволовые клетки. В целом, CD24 имеет тенденцию экспрессироваться на более высоких уровнях в клетках-предшественниках и метаболически активных клетках и в меньшей степени в терминально дифференцированных клетках. Функция CD24 в большинстве типов клеток неясна, но сообщалось о различных иммунологических функциях CD24. Хотя CD24 обнаружен во многих нормальных тканях и типах клеток, CD24 сверхэкспрессируется почти в 70% случаев рака человека. Высокие уровни экспрессии CD24, детектируемые иммуногистохимическим методом, были обнаружены при эпителиальном раке яичников (83%), раке молочной железы (85%), немелкоклеточном раке легкого (45%), раке простаты (48%) и раке поджелудочной железы (72%). CD24 - один из белков, наиболее сильно экспрессируемых в раковых клетках. Экспрессия CD24 повышается во время онкогенеза, что предполагает его роль в прогрессировании опухоли и метастазировании. Сверхэкспрессия CD24 при раке также была идентифицирована как маркер, указывающий на плохой прогноз и более агрессивное течение болезни для больных раком. При раке молочной железы экспрессия CD24 значительно выше при инвазивной карциноме, чем при доброкачественных или предраковых поражениях. При немелкоклеточном раке легкого экспрессия CD24 была идентифицирована как независимый маркер общей выживаемости пациента. Кроме того, при плоскоклеточном раке пищевода сверхэкспрессия CD24 свидетельствует о метастазировании опухоли в лимфатические узлы, высокой степени злокачественности опухоли, а также о сокращении времени выживания. Подобные наблюдения были обнаружены при многих других формах рака, включая рак толстой кишки, гепатоцеллюлярную карциному, глиому, рак яичников и рак простаты. Хотя CD24 широко использовался в качестве маркера прогноза рака, он не использовался в качестве неоантигена, который может быть потенциальной мишенью для лечения рака, из-за его экспрессии на нормальных типах клеток и потенциальной токсичности. Зрелый CD24 представляет собой небольшой высокогликозилированный сиалогликопротеин из 31 аминокислоты с 16 потенциальными сайтами О-гликозилирования и 2 предполагаемыми сайтами N-гликозилирования. Гликозилирование - одна из самых сложных посттрансляционных модификаций белков. Известно, что во многих раковых клетках происходит переключение с нормального пути гликозилирования, что приводит к изменению экспрессии гликанов и приводит к гипергликозилированию или гипогликозилированию многих клеточных белков. Измененные паттерны гликозилирования, обнаруженные в раковых клетках, являются результатом многих способствующих факторов, включая нарушение регуляции на уровне транскрипции, нарушение регуляции белков-шаперонов во время гликозилирования и изменение активности гликозидазы и гликотрансферазы. Связанные с опухолью изменения гликанов включают более длинное или более короткое разветвление N-гликанов, более высокую или более низкую плотность О-гликанов, образование усеченных версий нормальных аналогов (Tn, sTn и Т-антигены) и образование необычных форм концевых структур с сиаловой кислотой и фукозой (эпитопы sLea и sLex).CD24 is a small, highly glycosylated cell surface mucin-like protein associated with glycosylphosphatidylinositol (GPI). CD24 is expressed at higher levels on hematopoietic cells, including B cells, T cells, neutrophils, eosinophils, dendritic cells and macrophages, as well as non-hematopoietic cells, including nerve cells, ganglion cells, epithelial cells, keratinocytes, muscle cells, pancreatic cells glands and epithelial stem cells. In general, CD24 tends to be expressed at higher levels in progenitor cells and metabolically active cells and to a lesser extent in terminally differentiated cells. The function of CD24 in most cell types is unclear, but various immunological functions of CD24 have been reported. Although CD24 is found in many normal tissues and cell types, CD24 is overexpressed in nearly 70% of human cancers. High levels of CD24 expression detected by immunohistochemistry were found in epithelial ovarian cancer (83%), breast cancer (85%), non-small cell lung cancer (45%), prostate cancer (48%) and pancreatic cancer (72%). . CD24 is one of the proteins most highly expressed in cancer cells. CD24 expression is increased during tumorigenesis, suggesting its role in tumor progression and metastasis. Overexpression of CD24 in cancer has also been identified as a marker indicating a poor prognosis and more aggressive disease course for cancer patients. In breast cancer, CD24 expression is significantly higher in invasive carcinoma than in benign or precancerous lesions. In non-small cell lung cancer, CD24 expression has been identified as an independent marker of overall patient survival. In addition, in esophageal squamous cell carcinoma, overexpression of CD24 indicates tumor metastasis to the lymph nodes, high tumor grade, and reduced survival time. Similar observations have been found in many other forms of cancer, including colon cancer, hepatocellular carcinoma, glioma, ovarian cancer, and prostate cancer. Although CD24 has been widely used as a cancer prognosis marker, it has not been used as a neoantigen that could be a potential target for cancer treatment due to its expression on normal cell types and potential toxicity. Mature CD24 is a small, highly glycosylated sialoglycoprotein of 31 amino acids with 16 potential O-glycosylation sites and 2 putative N-glycosylation sites. Glycosylation is one of the most complex post-translational modifications of proteins. It is known that in many cancer cells there is a switch from the normal glycosylation pathway, which leads to changes in glycan expression and leads to hyperglycosylation or hypoglycosylation of many cellular proteins. Altered glycosylation patterns found in cancer cells are the result of many contributing factors, including dysregulation at the transcriptional level, dysregulation of chaperone proteins during glycosylation, and altered glycosidase and glycotransferase activities. Tumor-associated glycan changes include longer or shorter branching of N-glycans, higher or lower density of O-glycans, formation of truncated versions of normal analogues (Tn, sTn and T antigens), and formation of unusual shapes of terminal structures with sialic acid and fucose (sLea and sLex epitopes).

Соответственно, в данной области техники существует потребность в улучшенных способах выявления и лечения рака, в частности в способах и композициях, способных отличать раковые клетки от незлокачественных.Accordingly, there is a need in the art for improved methods of detecting and treating cancer, particularly methods and compositions capable of distinguishing cancer cells from non-cancerous cells.

Краткое описание изобретенияBrief description of the invention

В настоящем документе предложено моноклональное анти-CD24 антитело, связывание которого с CD24 блокируется гликозилированием, присутствующим в нормальных клетках, но не в раковых клетках. Антитело, ввиду этого, может связывать экранируемый гликаном эпитоп, который не экранирован на раковых клетках, но экранирован на незлокачественных клетках. Антитело может связывать пептид, содержащий последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48.Provided herein is an anti-CD24 monoclonal antibody whose binding to CD24 is blocked by glycosylation present in normal cells but not in cancer cells. The antibody can therefore bind a glycan-screened epitope that is not screened on cancer cells but is screened on non-cancerous cells. The antibody can bind a peptide containing the sequence set forth in SEQ ID NO: 48.

В другом аспекте моноклональное антитело может связывать раковые клетки с минимальной реактивностью или без реактивности с клетками доброкачественной опухоли. В другом аспекте моноклональное антитело может связывать опухолевые клетки с минимальной реактивностью или без реактивности с неопухолевыми клетками.In another aspect, the monoclonal antibody can bind cancer cells with minimal or no reactivity to benign tumor cells. In another aspect, the monoclonal antibody can bind tumor cells with minimal or no reactivity to non-tumor cells.

В другом аспекте моноклональное антитело может связывать циркулирующие раковые клетки с минимальной реактивностью или без реактивности с гемопоэтическими клетками.In another aspect, the monoclonal antibody can bind circulating cancer cells with minimal or no reactivity to hematopoietic cells.

В другом аспекте моноклональное антитело не может связывать CD24 на клетках, лишенных специфических для рака паттернов гликозилирования, но может связывать CD24 на клетках с раковыми паттернами гликозилирования.In another aspect, a monoclonal antibody cannot bind CD24 on cells lacking cancer-specific glycosylation patterns, but can bind CD24 on cells with cancer-specific glycosylation patterns.

В другом аспекте композиция, которая может быть фармацевтической композицией, содержит моноклональное антитело или один или несколько его антигенсвязывающих фрагментов.In another aspect, the composition, which may be a pharmaceutical composition, contains a monoclonal antibody or one or more antigen binding fragments thereof.

В другом аспекте композиция используется для уничтожения раковых клеток посредством антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC).In another aspect, the composition is used to kill cancer cells through antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC).

- 1 045813- 1 045813

В другом аспекте композиция используется для уничтожения раковых клеток посредством антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP).In another aspect, the composition is used to kill cancer cells through antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP).

В другом аспекте композиция используется для уничтожения раковых клеток посредством комбинации ADCC и ADCP.In another aspect, the composition is used to kill cancer cells through a combination of ADCC and ADCP.

В другом аспекте композиция содержит Т-клетку с химерным рецептором антигена, которая может быть использована для придания Т-клеткам специфичности к раковым клеткам.In another aspect, the composition comprises a T cell with a chimeric antigen receptor that can be used to impart cancer cell specificity to the T cells.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело 3В6.In another aspect, the composition contains a 3B6 monoclonal antibody.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее последовательности, указанные в SEQ ID NO: 1 и 2.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising the sequences set forth in SEQ ID NOs: 1 and 2.

В другом аспекте композиция содержит моноклональные антитела, полученные в результате созревания аффинности моноклонального антитела 3В6.In another aspect, the composition contains monoclonal antibodies obtained by affinity maturation of the 3B6 monoclonal antibody.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 3-10.In another aspect, the composition contains a monoclonal antibody containing a heavy chain selected from any of the sequences set forth in SEQ ID NO: 3-10.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее легкую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 11-16.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising a light chain selected from any of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 11-16.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело РР6373, полученное в результате созревания аффинности моноклонального антитела 3В6.In another aspect, the composition contains a monoclonal antibody PP6373 obtained by affinity maturation of the monoclonal antibody 3B6.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее последовательности, указанные в SEQ ID NO: 6 и 16.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising the sequences set forth in SEQ ID NOs: 6 and 16.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, полученное путем гуманизации моноклонального антитела РР6373.In another aspect, the composition contains a monoclonal antibody obtained by humanizing the monoclonal antibody PP6373.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 29-32.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising a heavy chain selected from any of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 29-32.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее легкую цепь, выбранную из любой из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 33-36.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising a light chain selected from any of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 33-36.

В другом аспекте фармацевтическая композиция содержит моноклональное антитело H2L3, полученное путем гуманизации моноклонального антитела РР6373.In another aspect, the pharmaceutical composition contains a monoclonal antibody H2L3 obtained by humanizing the monoclonal antibody PP6373.

В другом аспекте фармацевтическая композиция содержит моноклональное антитело H3L3, полученное путем гуманизации моноклонального антитела РР6373.In another aspect, the pharmaceutical composition contains a monoclonal antibody H3L3 obtained by humanizing the monoclonal antibody PP6373.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее вариабельную последовательность тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising a heavy chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 30 and a light chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 35.

В другом аспекте композиция содержит моноклональное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 33.In another aspect, the composition comprises a monoclonal antibody comprising a heavy chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 31 and a light chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 33.

В другом аспекте композиция содержит одноцепочечное моноклональное антитело, содержащее последовательность, указанную в SEQ ID NO: 17.In another aspect, the composition comprises a single chain monoclonal antibody comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 17.

В другом аспекте композиция содержит биспецифическое антитело, содержащее первый домен антитела, включающий анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, и второй домен антитела, включающий второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. Биспецифическое антитело можно использовать для образования мостика между раковыми и иммунными эффекторными Тклетками у пациента, нуждающегося в лечении или профилактике рака.In another aspect, the composition comprises a bispecific antibody comprising a first antibody domain comprising an anti-CD24 antibody or an antigen binding fragment thereof, and a second antibody domain comprising a second antibody or an antigen binding fragment thereof. The bispecific antibody can be used to bridge the gap between cancer cells and immune effector cells in a patient in need of treatment or prevention of cancer.

В другом аспекте второй домен антитела обладает специфичностью связывания, отличной от специфичности первого домена антитела.In another aspect, the second domain of the antibody has a binding specificity that is different from that of the first domain of the antibody.

В другом аспекте второй домен антитела привлекает иммунные эффекторные Т-клетки к раковым клеткам.In another aspect, the second domain of the antibody recruits immune effector T cells to cancer cells.

В другом аспекте второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывает CD3.In another aspect, the second antibody or antigen binding fragment thereof binds CD3.

В другом аспекте второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывает α-цепь TCR, β-цепь TCR, γ-цепь TCR или δ-цепь TCR.In another aspect, the second antibody or antigen binding fragment thereof binds a TCR α chain, a TCR β chain, a TCR γ chain, or a TCR δ chain.

В другом аспекте первый домен антитела включает антитело, содержащее последовательность, указанную в SEQ ID NO: 17, а второй домен антитела содержит последовательность, указанную в SEQ ID NO: 18.In another aspect, the first domain of the antibody includes an antibody comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 17, and the second domain of the antibody contains the sequence set forth in SEQ ID NO: 18.

В другом аспекте первый домен антитела включает антитело, содержащее любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 23-27 и 37-41.In another aspect, the first domain of an antibody includes an antibody comprising any of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 23-27 and 37-41.

В другом аспекте композиция, содержащая биспецифическое антитело, может использоваться для лечения раковых клеток за счет антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC).In another aspect, a composition containing a bispecific antibody can be used to treat cancer cells through antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC).

В другом аспекте композиция содержит биспецифическое антитело с повышенной активностью ADCC.In another aspect, the composition contains a bispecific antibody with enhanced ADCC activity.

В другом аспекте композиция, содержащая биспецифическое антитело, используется для лечения раковых клеток за счет антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP).In another aspect, a composition containing a bispecific antibody is used to treat cancer cells through antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP).

В другом аспекте композиция, содержащая биспецифическое антитело, обладает повышенной активностью ADCP.In another aspect, a composition comprising a bispecific antibody has enhanced ADCP activity.

- 2 045813- 2 045813

В другом аспекте композиция содержит химерный рецептор антигена для использования в иммунотерапии, причем указанный рецептор включает одноцепочечное антитело, содержащее любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 1-36.In another aspect, the composition contains a chimeric antigen receptor for use in immunotherapy, wherein said receptor comprises a single chain antibody comprising any of the sequences set forth in SEQ ID NO: 1-36.

В другом аспекте химерный рецептор антигена используется в иммунотерапии, причем указанный рецептор включает одноцепочечное антитело, содержащее последовательность, указанную в SEQ ID NO: 28.In another aspect, a chimeric antigen receptor is used in immunotherapy, wherein said receptor comprises a single chain antibody comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 28.

В другом аспекте фармацевтическая композиция используется вместе со вторым противораковым лекарственным средством.In another aspect, the pharmaceutical composition is used in conjunction with a second anticancer drug.

В настоящем документе предложен способ лечения рака у пациента, который в этом нуждается, включающий введение пациенту одного или нескольких из антител, биспецифических антител, химерных рецепторов антигена или композиций, описанных в настоящем документе, причем рак представляет собой рак легкого, рак печени, рак головного мозга, рак шейки матки, рак яичника, рак почки, рак яичка, рак простаты или нейробластому.Provided herein is a method of treating cancer in a patient in need thereof, comprising administering to the patient one or more of the antibodies, bispecific antibodies, chimeric antigen receptors or compositions described herein, wherein the cancer is lung cancer, liver cancer, brain cancer brain, cervical cancer, ovarian cancer, kidney cancer, testicular cancer, prostate cancer or neuroblastoma.

Рак может связываться с композицией анти-CD24 антитела, описанной в данном документе.Cancer may bind to the anti-CD24 antibody composition described herein.

Кроме того, в настоящем документе предлагается способ диагностики злокачественной ткани или метастатического поражения с использованием композиции анти-CD24 антитела. Композиция антиCD24 антитела может связывать злокачественную ткань или метастатическое поражение на уровне выше пороговой величины, что может указывать на злокачественную ткань или метастатическое поражение.Further provided herein is a method for diagnosing malignant tissue or metastatic lesions using an anti-CD24 antibody composition. The anti-CD24 antibody composition may bind cancerous tissue or metastatic lesions at levels above a threshold, which may indicate malignant tissue or metastatic lesions.

В настоящем документе также раскрыт способ идентификации циркулирующих раковых клеток с использованием композиции анти-CD24 антитела. Композиция анти-CD24 антитела может связывать циркулирующие раковые клетки на уровне выше пороговой величины, что может указывать на циркулирующие раковые клетки. Кроме того, в настоящем документе предусмотрено применение описанной здесь композиции в изготовлении лекарственного средства для лечения заболевания или состояния, описанного в данном документе.Also disclosed herein is a method for identifying circulating cancer cells using an anti-CD24 antibody composition. The anti-CD24 antibody composition can bind circulating cancer cells at levels above a threshold, which may indicate circulating cancer cells. Further provided herein is the use of a composition described herein in the manufacture of a medicament for treating a disease or condition described herein.

Описание графических материаловDescription of graphic materials

Фиг. 1 - столбчатая диаграмма результатов ELISA (иммуноферментный анализ), показывающая, что связывание моноклонального анти-CD24 антитела 3В6 затруднено присутствием гликана, тогда как связывание коммерчески доступного моноклонального анти-CD24 антитела ML5 - нет. 3В6 прочно связывает CD24, лишенный модификаций N-гликаном и сиаловой кислотой (N-SA-CD24), и CD24, лишенный модификаций N-гликаном, сиаловой кислотой и О-гликаном (N-SA-O-CD24), но связывает очень слабо как CD24, лишенный модификаций N-гликаном (N-CD24), так и полностью модифицированный (модификации N-гликаном + сиаловой кислотой + О-гликаном) CD24. CD24GST представляет собой отрицательный контроль, слитый белок CD24-GST.Fig. 1 is a bar graph of ELISA results showing that binding of the anti-CD24 monoclonal antibody 3B6 is hindered by the presence of a glycan, whereas binding of the commercially available anti-CD24 monoclonal antibody ML5 is not. 3B6 strongly binds CD24, lacking modifications by N-glycan and sialic acid (N-SA-CD24), and CD24, lacking modifications by N-glycan, sialic acid and O-glycan (N-SA-O-CD24), but binds very weakly both CD24 lacking N-glycan modifications (N-CD24) and fully modified (N-glycan + sialic acid + O-glycan modifications) CD24. CD24GST is a negative control CD24-GST fusion protein.

Фиг. 2А, В - анализы связывания показывают, что 3В6 связывает клеточные линии нейробластомы и медуллобластому. Фиг. 2А - нормализованные графики аффинности моноклональных анти-CD24 антител ML5, 3В6 и SN3 и контрольного антитела, тестированных против 6 линий клеток нейробластомы, IMR32, SK-N-SH, SH-SY5Y, SK-N-BE(2), SK-N-AS и SK-N-BE(2)C. Хотя 3В6 имеет некоторую аффинность ко всем линиям клеток нейробластомы, кроме SK-N-AS, аффинность 3В6 была значительно ниже по сравнению с коммерчески доступными анти-CD24 антителами ML5 (BD Bioscience Cat#555426) и SN3 (Thermo Fisher Cat#MA5-11833). Фиг. 2В - флуоресцентное изображение результатов обработки 4 медуллобластом с помощью 3В6. 3В6 связало 3 из 4 опухолей.Fig. 2A,B - binding assays show that 3B6 binds neuroblastoma and medulloblastoma cell lines. Fig. 2A - normalized affinity graphs of monoclonal anti-CD24 antibodies ML5, 3B6 and SN3 and control antibodies tested against 6 neuroblastoma cell lines, IMR32, SK-N-SH, SH-SY5Y, SK-N-BE(2), SK-N -AS and SK-N-BE(2)C. Although 3B6 has some affinity for all neuroblastoma cell lines except SK-N-AS, the affinity of 3B6 was significantly lower compared to the commercially available anti-CD24 antibodies ML5 (BD Bioscience Cat#555426) and SN3 (Thermo Fisher Cat#MA5-11833 ). Fig. 2B is a fluorescent image of the results of treatment of 4 medulloblastomas with 3B6. 3B6 associated 3 out of 4 tumors.

Фиг. 3 - график конкурентного ELISA, сравнивающего способность вариантов 3В6 блокировать связывание 3В6 со слитым белком CD24-GST. РР6226 имеет ту же вариабельную область, что и 3В6.Fig. 3 is a graph of a competitive ELISA comparing the ability of 3B6 variants to block the binding of 3B6 to the CD24-GST fusion protein. PP6226 has the same variable region as 3B6.

Фиг. 4 - график конкурентного ELISA, сравнивающего варианты 3В6 по их способности блокировать связывание 3В6 со слитым белком CD24-GST. РР6226 имеет ту же вариабельную область, что и 3В6.Fig. 4 is a graph of a competitive ELISA comparing 3B6 variants for their ability to block the binding of 3B6 to the CD24-GST fusion protein. PP6226 has the same variable region as 3B6.

Фиг. 5 - график конкурентного ELISA, сравнивающего варианты 3В6 по их способности блокировать связывание 3В6 со слитым белком CD24-GST. РР6226 имеет ту же вариабельную область, что и 3В6.Fig. 5 is a graph of a competitive ELISA comparing 3B6 variants for their ability to block the binding of 3B6 to the CD24-GST fusion protein. PP6226 has the same variable region as 3B6.

Фиг. 6 - столбчатая диаграмма результатов ELISA, показывающая относительную аффинность химерных анти-CD24 антител с созревшей аффинностью к CD24, экспрессируемому клетками СНО (яичника китайского хомячка). Двенадцать клонов показали повышенную аффинность и различную специфичность в отношении полностью гликозилированного CD24, N-CD24, SA-CD24 и N-SA-CD24 по сравнению с 3В6 (РР6226).Fig. 6 is a bar graph of ELISA results showing the relative affinity of affinity matured chimeric anti-CD24 antibodies to CD24 expressed by CHO (Chinese hamster ovary) cells. Twelve clones showed increased affinity and different specificity for fully glycosylated CD24, N-CD24, SA-CD24 and N-SA-CD24 compared to 3B6 (PP6226).

Фиг. 7 - анализ титрования различных химерных анти-CD24 антител с созревшей аффинностью, тестированных против линии клеток рака легкого NCI-H727 (левая панель) и линии клеток нейробластомы IMR32 (правая панель). Максимальная протестированная концентрация антител составляла 5 мкг/мл с коэффициентом титрования 2х до минимальной концентрации 0,01 мкг/мл. Также показан неокрашенный (0 мкг/мл) отрицательный контроль.Fig. 7 is a titration analysis of various affinity matured chimeric anti-CD24 antibodies tested against the lung cancer cell line NCI-H727 (left panel) and the neuroblastoma cell line IMR32 (right panel). The maximum antibody concentration tested was 5 μg/mL with a titration factor of 2x to a minimum concentration of 0.01 μg/mL. An unstained (0 μg/mL) negative control is also shown.

Фиг. 8 - количественное сравнение связывания между различными гликоформами CD24 и антиCD24 антителами: исходный РР6229 против РР6373 с созревшей аффинностью.Fig. 8 - Quantitative comparison of binding between different CD24 glycoforms and anti-CD24 antibodies: parent PP6229 versus affinity matured PP6373.

CD24 с удаленным Fc (кристаллизующийся фрагмент) наносили на планшет для ELISA и затем обCD24 with the Fc removed (crystallizing fragment) was applied to an ELISA plate and then

- 3 045813 рабатывали либо буфером (CD24), либо NanA (SA-), либо NanA+N-гликаназой (SA-N-) перед добавлением заданных доз РР6626 (левая панель) или РР6373 (правая панель).- 3 045813 were treated with either buffer (CD24), NanA (SA-), or NanA+N-glycanase (SA-N-) before adding given doses of PP6626 (left panel) or PP6373 (right panel).

Максимальная испытанная концентрация составляла 7812,50 нг/мл с коэффициентом титрования 5х до минимальной концентрации 0,02 нг/мл.The maximum concentration tested was 7812.50 ng/mL with a titration factor of 5x to a minimum concentration of 0.02 ng/mL.

Фиг. 9 - картирование сайта связывания 3В6 с помощью анализа ингибирования пептидов. Из пяти протестированных перекрывающихся пептидов CD24 только один (пептид 4) содержит антигенный эпитоп.Fig. 9 - Mapping of 3B6 binding site using peptide inhibition assay. Of the five overlapping CD24 peptides tested, only one (peptide 4) contains an antigenic epitope.

Фиг. 10 - картирование сайта связывания РР6373 с помощью анализа ингибирования пептидов. Из пяти протестированных перекрывающихся пептидов CD24 только один (SNSGLAPNT (SEQ ID NO: 46)) содержит антигенный эпитоп.Fig. 10 - Mapping of PP6373 binding site using peptide inhibition assay. Of the five CD24 overlapping peptides tested, only one (SNSGLAPNT (SEQ ID NO: 46)) contains an antigenic epitope.

Фиг. 11 - картирование эпитопа РР6373 с усеченными пептидами из последовательности антигенного эпитопа пептида 4. Данные показывают, что оптимальный эпитоп содержится в последовательности SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48).Fig. 11 - Mapping of the PP6373 epitope with truncated peptides from the antigenic epitope sequence of peptide 4. The data indicate that the optimal epitope is contained in the sequence SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48).

Фиг. 12 - график, показывающий, что РР6373 снижает рост опухоли in vivo на мышиной модели. Голые мыши с пальпируемым ксенотрансплантатом рака легкого получали либо контрольный человеческий IgG, либо РР6373 в двух временных точках, указанных стрелками, после чего рост опухолей еженедельно измеряли.Fig. 12 is a graph showing that PP6373 reduces tumor growth in vivo in a mouse model. Nude mice bearing a palpable lung cancer xenograft received either control human IgG or PP6373 at two time points indicated by arrows, after which tumor growth was measured weekly.

Фиг. 13 - график, показывающий индуцированную РР6373 клеточную цитотоксичность (ADCC) против линии раковых клеток человека Н727. Клетки Н727 совместно инкубировали с эффекторными клетками PBL с РР6373 и человеческим IgG FC при 5 мкг/мл, индуцировавшими ADCC.Fig. 13 is a graph showing PP6373-induced cellular cytotoxicity (ADCC) against the human cancer cell line H727. H727 cells were co-incubated with PBL effector cells with PP6373 and human IgG FC at 5 μg/ml, which induced ADCC.

Фиг. 14 - график, показывающий, что РР6373 без фукозилирования ядра (d6873) индуцирует более высокую ADCC против линии раковых клеток человека Н727, чем РР6373. Клетки Н727 совместно инкубировали с эффекторными клетками PBL с d6373, PP6373 и человеческим FC IgG при 5 мкг/мл, индуцировавшими ADCC.Fig. 14 is a graph showing that PP6373 without core fucosylation (d6873) induces higher ADCC against the human cancer cell line H727 than PP6373. H727 cells were co-incubated with PBL effector cells with d6373, PP6373 and human FC IgG at 5 μg/ml to induce ADCC.

Фиг. 15 - графики проточной цитометрии, показывающие, что комбинация РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ показывает более высокую биспецифичность, чем РР6373-выступ и OKT3-впадина. Клетки Jurkat окрашивали супернатантами тканевых культур клеток 293Т, трансфицированных РР6373, OKT3, РР6373-выступ и OKT3-впадина или РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ, с последующей инкубацией с биотинилированным белком SA-N-CD24. Сигнал РЕ-стрептавидин (фикоэритрин-стрептавидин) измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.Fig. 15 are flow cytometry plots showing that the combination of PP6373-groove and OKT3-overhang shows higher bispecificity than PP6373-overhang and OKT3-hole. Jurkat cells were stained with tissue culture supernatants of 293T cells transfected with PP6373, OKT3, PP6373-overhang and OKT3-indentation, or PP6373-indentation and OKT3-overhang, followed by incubation with biotinylated SA-N-CD24 protein. The PE-streptavidin (phycoerythrin-streptavidin) signal was measured by flow cytometry. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 16 - графики проточной цитометрии, показывающие, что РР6373-ОКТЗ индуцирует более высокую биспецифическую активность, чем ОКТЗ-РР6373. Клетки Jurkat окрашивали супернатантами тканевых культур клеток 293Т, трансфицированных пустой плазмидой (отрицательный контроль), РР6373OKT3 или ОКТЗ-РР6373, с последующей инкубацией с биотинилированным белком SA-N-CD24. Сигнал РЕ-стрептавидин измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.Fig. 16 - Flow cytometry plots showing that PP6373-OCTZ induces higher bispecific activity than OKTZ-PP6373. Jurkat cells were stained with tissue culture supernatants of 293T cells transfected with empty plasmid (negative control), PP6373OKT3, or OKTZ-PP6373, followed by incubation with biotinylated SA-N-CD24 protein. The PE-streptavidin signal was measured by flow cytometry. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 17 - график проточной цитометрии, показывающий, что биспецифическое антитело РР6373OKT3 обладает противоопухолевой активностью. Клетки рака легких Н727 и активированные человеческие Т-клетки инкубировали в соотношении 1:5с супернатантами тканевых культур необработанных клеток 293Т или трансфицировали пустой плазмидой (нетрансфицированные), РР6373, OKT3, РР6373OKT3 в течение 12 ч. Цитокины (IFNr, TNF, IL10, IL6, IL4 и IL2) в средах тканевых культур измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.Fig. 17 is a flow cytometry graph showing that the bispecific antibody PP6373OKT3 has antitumor activity. H727 lung cancer cells and activated human T cells were incubated at a ratio of 1:5 with tissue culture supernatants of untreated 293T cells or transfected with empty plasmid (untransfected), PP6373, OKT3, PP6373OKT3 for 12 hours. Cytokines (IFNr, TNF, IL10, IL6, IL4 and IL2) in tissue culture media were measured using flow cytometry. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 18 - график проточной цитометрии, показывающий, что биспецифическое антитело РР6373OKT3 индуцировало цитотоксичность опухолевых клеток Т-клетками. Клетки рака легких Н727 и активированные человеческие Т-клетки инкубировали в соотношении 1:5 с супернатантами тканевых культур необработанных клеток 293Т или трансфицированных пустой плазмидой (нетрансфицированные), РР6373, OKT3, РР6373-ОКТЗ в течение 12 ч. Клетки рака легких и человеческие Т-клетки собирали и окрашивали античеловеческим CD45 и реагентом Aqua Live/Dead. Количество опухолевых клеток было нанесено на график как дважды негативное по анти-CD45 и Aqua. Было проведено три независимых эксперимента.Fig. 18 is a flow cytometry graph showing that the bispecific antibody PP6373OKT3 induced cytotoxicity of tumor cells by T cells. H727 lung cancer cells and activated human T cells were incubated in a 1:5 ratio with tissue culture supernatants of untreated 293T cells or transfected with an empty plasmid (untransfected), PP6373, OKT3, PP6373-OCT3 for 12 hours. Lung cancer cells and human T cells cells were collected and stained with anti-human CD45 and Aqua Live/Dead reagent. Tumor cell counts were plotted as double negative for anti-CD45 and Aqua. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 19 - анализ высокой биспецифической активности, индуцированной FIT-Ig с помощью проточной цитометрии. Клетки Jurkat окрашивали отрицательным контролем (нетрансфицированный супернатант 293Т) или FIT-Ig с последующей инкубацией с биотинилированным белком SA-N-CD24. Сигнал РЕ-стептавидин измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.Fig. 19 - analysis of high bispecific activity induced by FIT-Ig using flow cytometry. Jurkat cells were stained with negative control (untransfected 293T supernatant) or FIT-Ig, followed by incubation with biotinylated SA-N-CD24 protein. The PE-steptavidin signal was measured by flow cytometry. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 20 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что FIT-Ig имеет более высокую противоопухолевую активность, чем РР6373-ОКТЗ и ОКТЗ-РР6373. Клетки рака легкого Н727 и активированные Т-клетки человека инкубировали в соотношении 1:5с отрицательным контролем (нетрансфицированный супернатант 293Т), РР6373-ОКТЗ, ОКТЗ-РР6373 или FIT-Ig в течение 12 ч. Цитокины (IFNr, TNF, IL10, IL6, IL4 и IL2) в средах тканевых культур измеряли с помощью проточной цитометрии. Было проведено три независимых эксперимента.Fig. 20 - Flow cytometry analysis shows that FIT-Ig has higher antitumor activity than PP6373-OCTZ and OKTZ-PP6373. H727 lung cancer cells and activated human T cells were incubated at a ratio of 1:5 with negative control (untransfected 293T supernatant), PP6373-OCT3, OKT3-PP6373, or FIT-Ig for 12 hours. Cytokines (IFNr, TNF, IL10, IL6, IL4 and IL2) in tissue culture media were measured using flow cytometry. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 21 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что FIT-Ig индуцирует цитотоксичность опухолевых клеток Т-клетками. Клетки рака легкого Н727 и активированные Т-клетки человекаFig. 21 - Flow cytometry analysis shows that FIT-Ig induces tumor cell cytotoxicity by T cells. H727 lung cancer cells and activated human T cells

- 4 045813 инкубировали в соотношении 1:5с отрицательным контролем (нетрансфицированный супернатант 293Т), РР6373-ОКТ3, ОКТЗ-РР6373 или FIT-Ig в течение 12 ч. Клетки рака легких и человеческие Т-клетки собирали и окрашивали античеловеческим CD45 и реагентом Aqua Live/Dead. Количество опухолевых клеток было нанесено на график как дважды негативное по анти-CD45 и Aqua. Было проведено три независимых эксперимента.- 4 045813 was incubated 1:5 with negative control (untransfected supernatant 293T), PP6373-OKT3, OKTZ-PP6373 or FIT-Ig for 12 hours. Lung cancer cells and human T cells were collected and stained with anti-human CD45 and Aqua Live reagent /Dead. Tumor cell counts were plotted as double negative for anti-CD45 and Aqua. Three independent experiments were carried out.

Фиг. 22 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что FIT-Ig имеет более высокую термическую стабильность, чем РР6373-ОКТЗ и ОКТЗ-РР6373. Все биспецифические антитела РР6373OKT3, ОКТЗ-РР6373 и FIT-Ig инкубировали при указанной температуре в течение 20 мин, а супернатанты после центрифугирования при 14000g в течение 5 мин использовали для окрашивания клеток Jurkat. Затем биотинилированный белок SA-N-CD24 инкубировали с клетками Jurkat, и сигнал РЕ-стептавидин измеряли с помощью проточной цитометрии.Fig. 22 - Flow cytometry analysis shows that FIT-Ig has higher thermal stability than PP6373-OCTZ and OKTZ-PP6373. All bispecific antibodies PP6373OKT3, OKTZ-PP6373 and FIT-Ig were incubated at the indicated temperature for 20 min, and the supernatants after centrifugation at 14000 g for 5 min were used to stain Jurkat cells. Biotinylated SA-N-CD24 protein was then incubated with Jurkat cells, and the PE-steptavidin signal was measured by flow cytometry.

Фиг. 23 - схема конструкции CarT, содержащей анти-CD24-scFv.Fig. 23 is a diagram of a CarT construct containing anti-CD24-scFv.

Фиг. 24 - график цитотоксичности, индуцированной CD24 CART, для линии клеток рака легкого А549.Fig. 24 is a graph of CD24 CART-induced cytotoxicity for the A549 lung cancer cell line.

Фиг. 25 - график активации CART линией опухолевых клеток, о чем свидетельствует продуцирование IFNy.Fig. 25 is a graph of CART activation by a tumor cell line as evidenced by IFNy production.

Фиг. 26 - столбчатая диаграмма противоопухолевой активности CD24 CART против различных типов опухолей. Соотношение Е/Т для представленных данных равно 5.Fig. 26 is a bar graph of the antitumor activity of CD24 CART against various tumor types. The E/T ratio for the data presented is 5.

Фиг. 27 - ленточная диаграмма трехмерного структурного выравнивания химерного РР6373 (FR: белый, CDR: светло-серый) и huVHv1VLv1 (FR: серый, CDR: темно-серый).Fig. 27 is a strip diagram of the three-dimensional structural alignment of chimeric PP6373 (FR: white, CDR: light gray) and huVHv1VLv1 (FR: gray, CDR: dark gray).

Фиг. 28 - график относительной эффективности различных пар антител по экспрессии и связыванию CD24-GST.Fig. 28 is a graph of the relative potency of various antibody pairs for CD24-GST expression and binding.

Фиг. 29 - график связывания H2L3 и H3L3 с линиями раковых клеток человека NCI-H727 (вверху) и IMR32 (внизу). Показанные данные представляют собой среднюю интенсивность флуоресценции при использовании широкого диапазона антител.Fig. 29 is a graph of H2L3 and H3L3 binding to human cancer cell lines NCI-H727 (top) and IMR32 (bottom). Data shown are average fluorescence intensities using a wide range of antibodies.

Фиг. 30 - графики гибели клеток показывают, что при низкой концентрации HL33 более эффективен, чем РР6373, в ADCC. В качестве мишени использовали линию клеток рака легкого А549, а в качестве эффекторов использовали PBL человека. Используемая доза антител составляла 3 мкг/мл (верхняя панель) или 9 мкг/мл (нижняя панель).Fig. 30 - Cell death plots show that at low concentration, HL33 is more effective than PP6373 in ADCC. The lung cancer cell line A549 was used as a target, and human PBL was used as effectors. The dose of antibody used was 3 μg/ml (top panel) or 9 μg/ml (lower panel).

Фиг. 31 - графики гибели клеток показывают, что H3L3 придает сильную активность ADCC по отношению к множеству линий опухолевых клеток, включая линии клеток рака легкого А549 и NCI-H727 и линию клеток нейробластомы IMR-32. Человеческие РВМС (мононуклеарные клетки периферической крови) использовали в качестве эффекторных клеток.Fig. 31 Cell death plots show that H3L3 confers strong ADCC activity against multiple tumor cell lines, including the lung cancer cell lines A549 and NCI-H727 and the neuroblastoma cell line IMR-32. Human PBMCs (peripheral blood mononuclear cells) were used as effector cells.

Фиг. 32 - графики гибели клеток показывают, что H3L3 придает сильную активность ADCC множеству линий опухолевых клеток, включая линии клеток рака легкого А549 и NCI-H727 и линию клеток нейробластомы IMR-32. NK-клетки (естественные киллеры), очищенные из РВМС человека, используются в качестве эффекторных клеток.Fig. 32 Cell death plots show that H3L3 confers strong ADCC activity in multiple tumor cell lines, including the lung cancer cell lines A549 and NCI-H727 and the neuroblastoma cell line IMR-32. NK (natural killer) cells purified from human PBMCs are used as effector cells.

Фиг. 33 - анализ с помощью проточной цитометрии показывает, что антитела, распознающие экранируемый гликаном эпитоп, не распознают В-клетки, эритроциты и плохо взаимодействуют с нейтрофилами.Fig. 33 - Flow cytometry analysis shows that antibodies recognizing the glycan-screened epitope do not recognize B cells, red blood cells and interact poorly with neutrophils.

Подробное описание изобретенияDetailed Description of the Invention

Нацеливание на эпитопы, экспрессируемые раком, является широко применяемым подходом к лечению рака. Однако многие такие эпитопы не являются хорошими мишенями для лекарств, потому что они также экспрессируются в нормальных тканях, что может привести к проблемам токсичности. Идеальный опухолевый специфический антиген (TSA) должен иметь высокую экспрессию в опухоли, но минимальную экспрессию или отсутствие экспрессии в важных органах хозяина. Атрибуты менее идеальных, но в равной степени работоспособных TSA - это те, которые экспрессируются, но по-разному модифицируются в нормальных и раковых тканях, так называемые опухолевые антигены (ТАА). Примерами хорошо охарактеризованных опухолевых антигенов являются MAGE-A3, MUC-1 и NY-ESO 1.Targeting epitopes expressed by cancer is a widely used approach for cancer treatment. However, many such epitopes are not good drug targets because they are also expressed in normal tissues, which can lead to toxicity problems. An ideal tumor specific antigen (TSA) should have high expression in the tumor but minimal or no expression in important host organs. Attributes of less ideal but equally functional TSAs are those that are expressed but differentially modified in normal and cancer tissues, the so-called tumor antigens (TAAs). Examples of well-characterized tumor antigens are MAGE-A3, MUC-1, and NY-ESO 1.

Выявление новых TSA и ТАА является ограничивающим фактором в разработке новых или более эффективных средств лечения рака, особенно тех видов рака, для которых в настоящее время не существует опухолевых антигенов. CD24 является хорошей мишенью для рака по следующим причинам: он чрезмерно экспрессируется более чем в 70% всех раковых заболеваний человека и дифференциально гликозилирован при раке, он, по-видимому, является онкогеном и связан с плохим прогнозом при различных раковых заболеваниях и значительно более короткой продолжительностью выживаемости пациентов, и он является маркером раковых стволовых клеток, которые могут вызвать рецидив и метастазирование, давая начало новым опухолям. Авторы изобретения обнаружили анти-CD24 антитела, связывание которых с CD24 блокируется гликозилированием, которое происходит в нормальных клетках, но не в раковых. В результате антитела связываются с клетками раковых линий и раковыми тканями, но с минимальной реактивностью по отношению к множеству нормальных тканей и гемопоэтических клеток. В настоящем документе предусмотрены антитела и их антигенсвязывающие фрагменты. Антитело может представлять собой моноклональное антитело, человеческое антитело, химерное антитело или гуманизиThe identification of new TSAs and TAAs is a limiting factor in the development of new or more effective cancer treatments, especially those cancers for which no tumor antigens currently exist. CD24 is a good target for cancer for the following reasons: it is overexpressed in more than 70% of all human cancers and is differentially glycosylated in cancers, it appears to be an oncogene and is associated with poor prognosis in various cancers and significantly shorter lifespan patient survival and is a marker of cancer stem cells that can cause relapse and metastasis, giving rise to new tumors. The inventors discovered anti-CD24 antibodies whose binding to CD24 is blocked by glycosylation, which occurs in normal cells but not in cancer cells. As a result, the antibodies bind to cancer cells and cancer tissues, but with minimal reactivity to many normal tissues and hematopoietic cells. Antibodies and antigen-binding fragments thereof are provided herein. The antibody may be a monoclonal antibody, a human antibody, a chimeric antibody, or a human antibody.

- 5 045813 рованное антитело. Антитело может быть моноспецифическим, биспецифическим, триспецифическим или мультиспецифическим. Антигенсвязывающий фрагмент антитела может иммуноспецифично связывать CD24, и, в частности, человеческий CD24, предпочтительно экспрессируемый на поверхности живой клетки в эндогенной или трансфицированной концентрации. Антигенсвязывающий фрагмент может связывать CD24. Антитело может быть помечено детектируемой меткой или может включать конъюгированный токсин, лекарственное средство, рецептор, фермент или лиганд рецептора.- 5 045813 modified antibody. The antibody may be monospecific, bispecific, trispecific or multispecific. The antigen-binding antibody fragment can immunospecifically bind CD24, and in particular human CD24, preferably expressed on the surface of a living cell at endogenous or transfected concentrations. The antigen binding fragment can bind CD24. The antibody may be labeled with a detectable label or may include a conjugated toxin, drug, receptor, enzyme, or receptor ligand.

В дополнение к прямому нацеливанию на опухоль иммунная система обладает способностью распознавать и устранять рак в экспериментальных модельных системах и у пациентов. В результате иммунотерапия рака становится одной из самых многообещающих областей терапии рака. Активная иммунотерапия рака включает агенты, которые усиливают естественные иммунные ответы (включая антитела против PD-1, PD-L1 или CTLA-4); биспецифические молекулы, такие как антитела, которые образуют мостик между раковыми и иммунными эффекторными Т-клетками; или адоптивный перенос клеток (ACT) с использованием ex vivo стимулированных лимфоцитов, инфильтрирующих опухоль (TIL), активированных естественных киллеров (NK) или генно-инженерных Т-клеток (Т-клетки, модифицированные химерными рецепторами антигена (CAR) и Т-клеточными рецепторами (TCR)). Многие из этих технологий требуют наличия компонента нацеливания на опухоль для специфичности и эффективности.In addition to directly targeting tumors, the immune system has the ability to recognize and eliminate cancer in experimental model systems and in patients. As a result, cancer immunotherapy is becoming one of the most promising areas of cancer therapy. Active cancer immunotherapy includes agents that enhance natural immune responses (including antibodies against PD-1, PD-L1, or CTLA-4); bispecific molecules, such as antibodies, that form a bridge between cancer and immune effector T cells; or adoptive cell transfer (ACT) using ex vivo stimulated tumor infiltrating lymphocytes (TILs), activated natural killer (NK) cells, or genetically engineered T cells (chimeric antigen receptor (CAR) and T cell receptor modified T cells (TCR)). Many of these technologies require a tumor targeting component for specificity and effectiveness.

1. Определения.1. Definitions.

Используемая здесь терминология предназначена только для описания конкретных вариантов осуществления и не должна интерпретироваться ограничительно. Используемые в описании и прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа также обозначают множественное число, если контекст явно не диктует иное. Слово около (примерно, приблизительно) в сочетании с числовым значением обозначает разумное приближение к этому значению. В некоторых случаях около может быть истолковано как находящееся в пределах 10 % от конкретного значения, с которым оно употреблено. Например, фраза около 100 может охватывать любое значение от 90 до 110. При перечислении числовых диапазонов в данном документе явно полагается рассмотрение каждого промежуточного числа внутри диапазона с одинаковой степенью точности. Например, для диапазона 6-9 числа 7 и 8 полагаются в дополнение к 6 и 9, а для диапазона 6,0-7,0 - явным образом полагаются числа 6,0, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9 и 7,0.The terminology used herein is intended to describe specific embodiments only and should not be interpreted in a limiting manner. As used in the specification and the accompanying claims, the singular number also denotes the plural unless the context clearly dictates otherwise. The word about (approximately, approximately) in combination with a numerical value denotes a reasonable approximation to that value. In some cases, about can be interpreted as being within 10% of the specific meaning with which it is used. For example, the phrase about 100 could cover any value from 90 to 110. When listing numeric ranges, this document explicitly relies on treating each intermediate number within the range with the same degree of precision. For example, for the range 6-9, the numbers 7 and 8 are counted in addition to 6 and 9, and for the range 6.0-7.0, the numbers 6.0, 6.1, 6.2, 6.3 are explicitly counted. 6.4, 6.5, 6.6, 6.7, 6.8, 6.9 and 7.0.

Лечение или лечить применительно к защите животного от болезни означает предотвращение, супрессию, репрессию или полное устранение болезни. Предотвращение заболевания включает введение композиции согласно раскрытию животному до начала заболевания. Супрессия заболевания включает введение композиции согласно раскрытию животному после индукции заболевания, но до его клинического проявления. Репрессия заболевания включает введение композиции по раскрытию животному после клинического проявления заболевания.Treat or cure, in relation to protecting an animal from a disease, means preventing, suppressing, repressing or completely eliminating a disease. Prevention of disease includes administering the composition as disclosed to the animal prior to the onset of disease. Suppression of the disease involves administering the composition as disclosed to the animal after the induction of the disease, but before its clinical manifestation. Disease suppression involves administering the composition to the animal upon clinical manifestation of the disease.

Используемый здесь термин антитело предназначен для обозначения молекулы иммуноглобулина, которая обладает сайтом распознавания антигена вариабельной области. Термин вариабельная область предназначен для отличия такого домена иммуноглобулина от доменов, которые широко распространены среди антител (таких как домен Fc антитела). Вариабельная область включает гипервариабельную область, остатки которой отвечают за связывание антигена. Гипервариабельная область содержит аминокислотные остатки области, определяющей комплементарность или CDR (то есть, как правило, остатки приблизительно в позициях 24-34 (L1), 50-56 (L2) и 89-97 (L3) в вариабельной области легкой цепи и остатки приблизительно в позициях 27-35 (H1), 50-65 (Н2) и 95-102 (Н3) в вариабельной области тяжелой цепи) и/или остатках гипервариабельной петли (т.е. остатки 26-32 (L1), 50-52 (L2) и 9196 (L3) в вариабельной области легкой цепи и 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (Н3) в вариабельной области тяжелой цепи). Остатки каркасной области или FR представляют собой те остатки вариабельной области, которые отличаются от остатков гипервариабельной области, как определено здесь. Термин антитело включает моноклональные антитела, мультиспецифические антитела, человеческие антитела, гуманизированные антитела, синтетические антитела, химерные антитела, антитела семейства верблюдовых, одноцепочечные антитела, дисульфидно-связанные Fv (sdFv), интратела и антиидиотипические (анти-Id) антитела (включая, например, анти-Id и анти-анти-Id антитела к антителам по изобретению). В частности, такие антитела включают молекулы иммуноглобулинов любого типа (например IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY), любого класса (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2) или любого подкласса.As used herein, the term antibody is intended to refer to an immunoglobulin molecule that has a variable region antigen recognition site. The term variable region is intended to distinguish such an immunoglobulin domain from domains that are common among antibodies (such as the Fc domain of an antibody). The variable region includes a hypervariable region, the residues of which are responsible for antigen binding. The hypervariable region contains amino acid residues of the complementarity determining region or CDR (that is, generally, residues at approximately positions 24-34 (L1), 50-56 (L2) and 89-97 (L3) in the light chain variable region and residues approximately at positions 27-35 (H1), 50-65 (H2) and 95-102 (H3) in the heavy chain variable region) and/or hypervariable loop residues (i.e. residues 26-32 (L1), 50-52 (L2) and 9196 (L3) in the light chain variable region and 26-32 (H1), 53-55 (H2) and 96-101 (H3) in the heavy chain variable region). Framework region residues or FRs are those variable region residues that differ from the hypervariable region residues as defined herein. The term antibody includes monoclonal antibodies, multispecific antibodies, human antibodies, humanized antibodies, synthetic antibodies, chimeric antibodies, camelid antibodies, single chain antibodies, disulfide-linked Fv (sdFv), intrabodies, and anti-idiotypic (anti-Id) antibodies (including, for example, anti-Id and anti-anti-Id antibodies to the antibodies of the invention). In particular, such antibodies include immunoglobulin molecules of any type (eg, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA and IgY), any class (eg, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2) or any subclass.

Используемый здесь термин антигенсвязывающий фрагмент антитела относится к одной или нескольким частям антитела, которые содержат CDR антитела и, необязательно, каркасные остатки, которые составляют сайт распознавания антигена вариабельной области антитела и проявляют способность к иммуноспецифическому связыванию антигена. Такие фрагменты включают Fab', F(ab')2, Fv, одноцепочечный фрагмент (ScFv) и их мутанты, встречающиеся в природе варианты и слитые белки, содержащие сайт распознавания антигена вариабельной области антитела и гетерологичный белок (например, токсин, сайт распознавания антигена для другого антигена, фермент, рецептор или лиганд рецептора и т.д.). Используемый здесь термин фрагмент относится к пептиду или полипептиду, содержащему аминокислотную последовательность, состоящую по меньшей мере из 5 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 10 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 15 смежных аминокислотныхAs used herein, the term antigen-binding antibody fragment refers to one or more portions of an antibody that contain the antibody CDR and, optionally, framework residues that constitute the antigen recognition site of the antibody variable region and exhibit immunospecific antigen-binding ability. Such fragments include Fab', F(ab') 2 , Fv, single chain fragment (ScFv) and mutants thereof, naturally occurring variants and fusion proteins comprising an antibody variable region antigen recognition site and a heterologous protein (eg, toxin, antigen recognition site for another antigen, enzyme, receptor or receptor ligand, etc.). As used herein, the term fragment refers to a peptide or polypeptide containing an amino acid sequence consisting of at least 5 contiguous amino acid residues, at least 10 contiguous amino acid residues, at least 15 contiguous amino acid residues

- 6 045813 остатков, по меньшей мере 20 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 25 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 40 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 50 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 60 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 70 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 80 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 90 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 100 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 125 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 150 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 175 смежных аминокислотных остатков, по меньше мере 200 смежных аминокислотных остатков или по меньшей мере 250 смежных аминокислотных остатков.- 6 045813 residues, at least 20 contiguous amino acid residues, at least 25 contiguous amino acid residues, at least 40 contiguous amino acid residues, at least 50 contiguous amino acid residues, at least 60 contiguous amino acid residues, at least 70 contiguous amino acid residues, at least 80 contiguous amino acid residues, at least 90 contiguous amino acid residues, at least 100 contiguous amino acid residues, at least 125 contiguous amino acid residues, at least 150 contiguous amino acid residues, at least 175 contiguous amino acid residues , at least 200 contiguous amino acid residues or at least 250 contiguous amino acid residues.

Человеческие, химерные или гуманизированные антитела особенно предпочтительны для использования in vivo у людей, однако мышиные антитела или антитела других видов могут быть успешно использованы для многих применений (например, анализы обнаружения in vitro или in situ, применение в острый период in vivo и т.д.).Human, chimeric or humanized antibodies are particularly preferred for in vivo use in humans, however murine antibodies or antibodies of other species can be used successfully for many applications (eg, in vitro or in situ detection assays, in vivo acute use, etc. .).

Химерное антитело представляет собой молекулу, в которой разные части антитела происходят из разных молекул иммуноглобулина, такую как антитела, имеющие вариабельную область, полученную из нечеловеческого антитела, и константную область иммуноглобулина человека. Химерные антитела, содержащие одну или несколько CDR из нечеловеческих видов и каркасные области из молекулы иммуноглобулина человека, могут быть получены с использованием множества методик, известных в данной области, включая, например, трансплантацию CDR (ЕР 239,400; Международная публикация № WO 91/09967; и патенты США №№ 5,225,539, 5,530,101 и 5,585,089; содержание каждого из этих документов полностью включено в настоящий документ), венирование (veneering) или перекладку вариабельного домена (resurfacing) (ЕР 592,106; ЕР 519,596, содержание каждого из этих документов включено в настоящий документ путем ссылки) и перестановки цепей (chain shuffling) (патент США № 5,565,332, содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки).A chimeric antibody is a molecule in which different parts of the antibody are derived from different immunoglobulin molecules, such as antibodies having a variable region derived from a non-human antibody and a human immunoglobulin constant region. Chimeric antibodies containing one or more CDRs from a non-human species and framework regions from a human immunoglobulin molecule can be produced using a variety of techniques known in the art, including, for example, CDR grafting (EP 239,400; International Publication No. WO 91/09967; and US Pat. Nos. 5,225,539, 5,530,101 and 5,585,089, each of which is incorporated herein in its entirety), veneering or variable domain resurfacing (EP 592,106; EP 519,596, each of which is incorporated herein) by reference) and chain shuffling (US Patent No. 5,565,332, the contents of which are incorporated herein by reference).

Используемый здесь термин гуманизированное антитело относится к иммуноглобулину, содержащему каркасную область человека и одну или несколько CDR из нечеловеческого (обычно мышиного или крысиного) иммуноглобулина. Иммуноглобулин нечеловеческого происхождения, из которого берутся CDR, называется донором, а иммуноглобулин человека, из которого берется каркас, называется акцептором. Постоянные области не обязательно должны присутствовать, но если они есть, они должны быть по существу идентичны константным областям человеческого иммуноглобулина, то есть идентичны по меньшей мере примерно на 85-90%, предпочтительно примерно на 95% или более. Следовательно, все части гуманизированного иммуноглобулина, за исключением, возможно, CDR, по существу идентичны соответствующим частям последовательностей природного иммуноглобулина человека. Гуманизированное антитело - это антитело, включающее иммуноглобулин с гуманизированной легкой цепью и гуманизированной тяжелой цепью. Например, гуманизированное антитело не будет включать типичное химерное антитело, потому что, например, вся вариабельная область химерного антитела является нечеловеческой. Донорское антитело может называться гуманизированным в процессе гуманизации, поскольку ожидается, что полученное гуманизированное антитело будет связываться с тем же антигеном, что и донорское антитело, из которого взяты CDR. По большей части гуманизированные антитела представляют собой человеческие иммуноглобулины (реципиентные антитела), в которых остатки гипервариабельной области реципиента заменены остатками гипервариабельной области из нечеловеческого вида (донорское антитело), такого как мышь, крыса, кролик или примат, не являющийся человеком, имеющими желаемую специфичность, аффинность и связывающую способность. В некоторых случаях остатки каркасной области (FR) иммуноглобулина человека заменяются соответствующими остатками нечеловеческого происхождения. Кроме того, гуманизированные антитела могут содержать остатки, которых нет в реципиентном антителе или в донорском антителе. Эти модификации осуществляются для дальнейшего улучшения характеристик антител. В общем, гуманизированное антитело будет включать по существу всю последовательность по меньшей мере одного, а обычно двух вариабельных доменов, в которых все или практически все гипервариабельные области соответствуют таковым иммуноглобулина нечеловеческого происхождения, и все или практически все FR являются последовательностями человеческого иммуноглобулина. Гуманизированное антитело необязательно также может включать по меньшей мере часть константной области иммуноглобулина (Fc), как правило иммуноглобулина человека, который иммуноспецифически связывается с полипептидом FcyRIIB, который был изменен путем введения замен, делеций или добавлений аминокислотных остатков (т.е. мутаций).As used herein, the term humanized antibody refers to an immunoglobulin containing a human framework region and one or more CDRs from a non-human (usually murine or rat) immunoglobulin. The non-human immunoglobulin from which the CDRs are taken is called the donor, and the human immunoglobulin from which the framework is taken is called the acceptor. Constant regions need not be present, but if present, they should be substantially identical to human immunoglobulin constant regions, that is, at least about 85-90% identical, preferably about 95% or more. Therefore, all portions of the humanized immunoglobulin, with the possible exception of the CDRs, are substantially identical to the corresponding portions of the natural human immunoglobulin sequences. A humanized antibody is an antibody comprising an immunoglobulin with a humanized light chain and a humanized heavy chain. For example, a humanized antibody will not include a typical chimeric antibody because, for example, the entire variable region of the chimeric antibody is non-human. A donor antibody may be referred to as humanized during the humanization process because the resulting humanized antibody is expected to bind to the same antigen as the donor antibody from which the CDRs are taken. In general, humanized antibodies are human immunoglobulins (recipient antibodies) in which hypervariable region residues from the recipient are replaced by hypervariable region residues from a non-human species (donor antibody), such as a mouse, rat, rabbit, or non-human primate, having the desired specificity, affinity and binding capacity. In some cases, framework region (FR) residues of human immunoglobulin are replaced by corresponding residues of non-human origin. In addition, humanized antibodies may contain residues that are not present in the recipient antibody or the donor antibody. These modifications are made to further improve the characteristics of the antibodies. In general, a humanized antibody will comprise substantially the entire sequence of at least one, and typically two, variable domains, in which all or substantially all of the hypervariable regions are non-human immunoglobulin sequences, and all or substantially all of the FRs are human immunoglobulin sequences. The humanized antibody may also optionally include at least a portion of an immunoglobulin constant region (Fc), typically human immunoglobulin, that immunospecifically binds to an FcyRIIB polypeptide that has been altered by introducing substitutions, deletions, or additions of amino acid residues (i.e., mutations).

2. Композиции анти-CD24 антител.2. Compositions of anti-CD24 antibodies.

В данном документе описывается анти-CD24 антитело, которое может специфически нацеливаться на специфичную для рака гликоформу CD24. Ahtu-CD24 антитело можно использовать для разработки средств лечения рака, включая, но не ограничиваясь ими: конъюгаты антитело-лекарственное средство, терапевтические антитела с усилением ADCC, биспецифические антитела, CAR-T-терапии и TCRтерапии. В частности, анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут связываться с экранируемым гликаном эпитопом, который не экранирован на раковых клетках, но экранирован на незлокачественных клетках. В частности, анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент моThis document describes an anti-CD24 antibody that can specifically target a cancer-specific glycoform of CD24. The Ahtu-CD24 antibody can be used to develop cancer treatments, including, but not limited to: antibody-drug conjugates, ADCC-enhanced therapeutic antibodies, bispecific antibodies, CAR-T therapies and TCR therapies. In particular, an anti-CD24 antibody or antigen-binding fragment thereof may bind to a glycan-screened epitope that is not screened on cancer cells but is screened on non-cancerous cells. In particular, an anti-CD24 antibody or an antigen-binding fragment thereof may

- 7 045813 гут связываться с пептидом CD24, содержащим аминокислотную последовательность SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48).- 7 045813 can bind to the CD24 peptide containing the amino acid sequence SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48).

Ahtu-CD24 антитело может представлять собой ЗВ6, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 1, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 2. Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может быть версией 3В6 с созревшей аффинностью и может включать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 3-10, и вариабельную область легкой цепи, содержащую любую из последовательности, указанные в SEQ ID NO: 11-16. Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может представлять собой РР6373, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 6, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 16. Для терапевтического применения у людей анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может быть гуманизированной версией РР6373 и может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 29-32, и вариабельную область легкой цепи, содержащую любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 33-36. В частности, гуманизированное анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может представлять собой H2L3, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35; или может представлять собой H3L3, которое может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.The Ahtu-CD24 antibody may be 3B6, which may comprise a heavy chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 1 and a light chain variable region containing the sequence set forth in SEQ ID NO: 2. Ahtu-CD24 antibody or its antigen binding fragment may be an affinity matured version of 3B6 and may include a heavy chain variable region comprising any of the sequences set forth in SEQ ID NO: 3-10 and a light chain variable region containing any of the sequences set forth in SEQ ID NO: 11-16. The Ahtu-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof may be PP6373, which may comprise a heavy chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and a light chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 16. For for therapeutic use in humans, the anti-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof may be a humanized version of PP6373 and may comprise a heavy chain variable region comprising any of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 29-32 and a light chain variable region comprising any of the sequences specified in SEQ ID NO: 33-36. In particular, the humanized anti-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof may be H2L3, which may comprise a heavy chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 30 and a light chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 30 : 35; or may be H3L3, which may comprise a heavy chain variable region comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 31 and a light chain variable region containing the sequence set forth in SEQ ID NO: 35.

3. Композиции конъюгата антитело-лекарственное средство.3. Antibody-drug conjugate compositions.

Нацеленное на опухоль антитело можно использовать для предотвращения или ограничения роста опухолей, непосредственно влияя на биологию опухоли. Например, гуманизированное моноклональное анти-VEGF антитело (бевацизумаб; Авастин) блокирует рост опухолей, предотвращая VEGF-индуцированную васкуляризацию опухоли. Другие нацеленные на опухоль антитела используются для подавления роста опухолевых клеток или уничтожения раковых клеток посредством модификации самого антитела. Например, нацеленные на опухоль иммуноконъюгаты состоят из антитела и эффекторного фрагмента, связанных вместе ковалентными перекрестными связями или генетическим слиянием. Эффекторный фрагмент может быть цитотоксическим лекарственным средством (конъюгат антитело-лекарственное средство), белковым токсином (иммунотоксин) или радионуклидом (радиоиммуноконъюгат). Примером конъюгата антитело-лекарственное средство является брентуксимаб ведотин (ADCETRIS®, Seattle Genetics), который состоит из химерного моноклонального антитела брентуксимаб (сАС10, которое нацелено на белок клеточной мембраны CD30), связанного с тремя-пятью единицами антимитотического агента монометил ауристатин Е (ММАЕ, что отражено выражением ведотин в названии препарата).A tumor-targeted antibody can be used to prevent or limit the growth of tumors by directly influencing tumor biology. For example, a humanized monoclonal anti-VEGF antibody (bevacizumab; Avastin) blocks tumor growth by preventing VEGF-induced tumor vascularization. Other tumor-targeting antibodies are used to inhibit the growth of tumor cells or kill cancer cells by modifying the antibody itself. For example, tumor-targeting immunoconjugates consist of an antibody and an effector moiety linked together by covalent cross-links or genetic fusion. The effector moiety may be a cytotoxic drug (antibody-drug conjugate), a protein toxin (immunotoxin), or a radionuclide (radioimmunoconjugate). An example of an antibody-drug conjugate is brentuximab vedotin (ADCETRIS®, Seattle Genetics), which consists of the chimeric monoclonal antibody brentuximab (cAC10, which targets the cell membrane protein CD30) linked to three to five units of the antimitotic agent monomethyl auristatin E (MMAE, which is reflected by the expression vedotin in the name of the drug).

Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может быть включено в конъюгаты антитело-лекарственное средство, иммунотоксины или радиоиммуноконъюгаты. Нацеливающий антиCD24 компонент таких композиций может обеспечивать специфическую доставку конъюгата к раковым клеткам и тканям, ограничивая при этом воздействие на нормальные клетки и ткани и, таким образом, предотвращая нецелевую токсичность.The Ahtu-CD24 antibody or antigen-binding fragment thereof may be included in antibody-drug conjugates, immunotoxins or radioimmunoconjugates. The anti-CD24 targeting component of such compositions may allow specific delivery of the conjugate to cancer cells and tissues while limiting exposure to normal cells and tissues and thereby preventing off-target toxicity.

4. Композиции ADCC-антител.4. Compositions of ADCC antibodies.

Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, или композиция антитела, содержащая одно из вышеперечисленных, могут быть использованы для стимуляции гибели раковых клеток посредством по меньшей мере одного из следующих механизмов: антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC) и антителозависимого клеточного фагоцитоза (ADCP). ADCC - это механизм иммунной защиты, посредством которого определенный набор иммунных клеток (эффекторных клеток) организма активно взаимодействует с клеткой-мишенью (например, патогеном) и лизирует ее. ADCC был идентифицирован как важный клеточно-опосредованный врожденный иммунный ответ, функционирует как первая линия защиты организма от патогенов и действует для ограничения и сдерживания инфекций. Процесс ADCC рассчитан на уничтожение покрытой антителом клетки-мишени посредством нефагоцитарного процесса и характеризуется либо направленным высвобождением цитотоксических вакуолей, либо экспрессией молекул, индуцирующих гибель клеток. ADCC обычно инициируется, когда специфические антитела (в основном классы IgG) хозяина распознают и связывают антигены мембранной поверхности клеток-мишеней и одновременно взаимодействуют с рецепторами Fc (FcR) на поверхности эффекторных клеток. Наиболее распространенными эффекторными клетками, которые опосредуют ADCC, являются естественные клетки-киллеры (NK), хотя моноциты, макрофаги, нейтрофилы, эозинофилы и дендритные клетки также способны опосредовать ответ ADCC. Хотя ADCC является довольно быстрым ответом, эффективность варьируется в зависимости от нескольких параметров, таких как плотность антигена на поверхности клеток-мишеней и аффинность взаимодействия антиген-антитело, а также характеристики фрагментов Fc, которые определяют взаимодействия антител с различными членами семейства рецепторов Fc.An Ahtu-CD24 antibody or an antigen-binding fragment thereof, or an antibody composition containing one of the above, can be used to promote the death of cancer cells through at least one of the following mechanisms: antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) and antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP). ADCC is an immune defense mechanism by which a specific set of immune cells (effector cells) in the body actively interact with and lyse a target cell (such as a pathogen). ADCC has been identified as an important cell-mediated innate immune response, functions as the body's first line of defense against pathogens, and acts to limit and control infections. The ADCC process is designed to kill the antibody-coated target cell through a non-phagocytic process and is characterized by either the targeted release of cytotoxic vacuoles or the expression of molecules that induce cell death. ADCC is usually initiated when specific antibodies (mainly IgG classes) of the host recognize and bind membrane surface antigens of target cells and simultaneously interact with Fc receptors (FcRs) on the surface of effector cells. The most common effector cells that mediate ADCC are natural killer (NK) cells, although monocytes, macrophages, neutrophils, eosinophils, and dendritic cells are also capable of mediating the ADCC response. Although ADCC is a fairly rapid response, the effectiveness varies depending on several parameters, such as the density of antigen on the surface of target cells and the affinity of the antigen-antibody interaction, as well as the characteristics of Fc fragments, which determine the interactions of antibodies with various members of the Fc receptor family.

- 8 045813- 8 045813

Связывание антитела со специфическими рецепторами клеточной поверхности на клетках-мишенях - процесс, называемый опсонизацией, - является ключевым событием процесса ADCC. Процесс опсонизации привлекает фагоциты к клетке-мишени и может инициировать фагоцитоз. Связывание Fc-области антитела с FcR на фагоцитах также способствует образованию С3Ь, продукта расщепления компонента 3 комплемента, который является важным белком, который инициирует поглощение опсонизированной антителом клетки-мишени. Фагоцитоз, опосредованный антителами, также часто называют антителозависимым клеточноопосредованным фагоцитозом (ADCP). Однако в случае ADCC для уничтожения патогена не требуется, чтобы он был фагоцитирован. Как отмечалось выше, FcR на поверхности цитотоксических эффекторных клеток является ключом к индукции ADCC. У людей наиболее важными классами FcR, способными вызывать ADCC, являются FcyRI (CD64), FcyRIIa и FcyRIIc (CD32), а также FcyRIIIa (CD16). Впрочем, рецептор FcyRIIb подавляет ответ ADCC. Таким образом, баланс между активирующим и ингибирующим сигналами от FcyRs является важным фактором, определяющим величину ответа ADCC. После распознавания мишени специализированные внутриклеточные вакуоли (также называемые секреторными лизосомами) высвобождаются цитотоксическими эффекторными клетками в кальций-зависимом поляризованном экзоцитотическом процессе. Перфорин, цитолизин и гранзим В являются ключевыми компонентами, которые высвобождаются из вакуолей. Перфорин проникает и формирует поры в мембране клеткимишени. Для этого процесса требуется кальций. Гранзим В вызывает фрагментацию ДНК целевой клетки. Примером терапевтического антитела, которое работает с помощью ADCC, является трастузумаб (Герцептин, Genentech). Трастузумаб нацелен на HER2, который экспрессируется на аномально высоких уровнях при большом количестве видов рака молочной железы, часто называемых HER2положительным раком молочной железы, и подавляет рост HER2-положительного рака молочной железы, индуцируя ADCC у хозяина. Антитела, используемые для индукции ADCC, обычно требуют некоторой модификации, чтобы усилить их активность ADCC. Для этого существует ряд технологий, которые обычно включают конструирование антитела так, чтобы олигосахариды в Fc-области антитела не содержали фукозных сахарных единиц, что улучшает связывание с рецептором FcyIIIa. Афукозилированные антитела проявляют повышенную антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC). Например, технология Potelligent® компании Biowa использует линию клеток СНО, нокаутированную по гену FUT8, для производства 100 % афукозилированных антител. FUT8 - единственный ген, кодирующий α1,6-фукозилтрансферазу, который катализирует перенос фукозы от ГДФ-фукозы к GlcNAc через связь α1,6 олигосахарида сложного типа. Probiogen разработал линию СНО, которая предназначена для получения более низких уровней фукозилированных гликанов на MAb, хотя и не за счет нокаута FUT. Система Probiogen вводит бактериальный фермент, который перенаправляет путь синтеза фукозы de-novo к сахару-нуклеотиду, который не может быть метаболизирован клеткой. В качестве альтернативного подхода у Seattle Genetics есть проприетарная система подпитки, которая производит более низкие уровни фукозилированных гликанов на MAb, продуцируемых в клеточных линиях СНО (и, возможно, других). Компания Xencor разработала технологию XmAb Fc домена, предназначенную для улучшения устранения иммунной системой опухолевых и других патологических клеток. Этот домен Fc имеет две замены аминокислот, что приводит к увеличению аффинности к FcyRIIIa в 40 раз. Он также увеличивает аффинность к FcyRIIa с возможностью привлечения других эффекторных клеток, таких как макрофаги, которые играют роль в иммунитете, поглощая и переваривая чужеродный материал. Анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент могут быть включены в состав антител, уничтожающих рак посредством ADCC. Анти-CD24 нацеливающий компонент таких композиций может обеспечивать специфическую нацеленную доставку к раковым клеткам для ADCC-опосредованного разрушения при сохранении нормальных клеток и тканей. Активность ADCC анти-CD24 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента может быть усилена одной или несколькими модификациями, описанными в данном документе.The binding of an antibody to specific cell surface receptors on target cells, a process called opsonization, is a key event in the ADCC process. The process of opsonization attracts phagocytes to the target cell and can initiate phagocytosis. Binding of the antibody Fc region to the FcR on phagocytes also promotes the formation of C3b, a cleavage product of complement component 3, which is an essential protein that initiates the engulfment of antibody-opsonized target cells. Antibody-mediated phagocytosis is also often called antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP). However, in the case of ADCC, killing the pathogen does not require it to be phagocytosed. As noted above, FcR on the surface of cytotoxic effector cells is key to the induction of ADCC. In humans, the most important classes of FcRs capable of causing ADCC are FcyRI (CD64), FcyRIIa and FcyRIIc (CD32), and FcyRIIIa (CD16). However, the FcyRIIb receptor suppresses the ADCC response. Thus, the balance between activating and inhibitory signals from FcyRs is an important factor determining the magnitude of the ADCC response. Upon target recognition, specialized intracellular vacuoles (also called secretory lysosomes) are released by cytotoxic effector cells in a calcium-dependent polarized exocytotic process. Perforin, cytolysin and granzyme B are the key components that are released from the vacuoles. Perforin penetrates and forms pores in the target cell membrane. This process requires calcium. Granzyme B causes DNA fragmentation in the target cell. An example of a therapeutic antibody that works via ADCC is trastuzumab (Herceptin, Genentech). Trastuzumab targets HER2, which is expressed at abnormally high levels in a wide range of breast cancers, often referred to as HER2-positive breast cancer, and suppresses the growth of HER2-positive breast cancer by inducing ADCC in the host. Antibodies used to induce ADCC usually require some modification to enhance their ADCC activity. There are a number of technologies available to do this, which typically involve designing the antibody so that the oligosaccharides in the Fc region of the antibody do not contain fucose sugar units, which improves binding to the FcyIIIa receptor. Afucosylated antibodies exhibit increased antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC). For example, Biowa's Potelligent® technology uses a FUT8 knockout CHO cell line to produce 100% afucosylated antibodies. FUT8 is the only gene encoding an α1,6-fucosyltransferase that catalyzes the transfer of fucose from GDP-fucose to GlcNAc via a complex-type α1,6 oligosaccharide linkage. Probiogen has developed a CHO line that is designed to produce lower levels of fucosylated glycans on MAbs, although not by knocking out FUT. The Probiogen system introduces a bacterial enzyme that redirects the de-novo fucose synthesis pathway to a nucleotide sugar that cannot be metabolized by the cell. As an alternative approach, Seattle Genetics has a proprietary feeding system that produces lower levels of fucosylated glycans on MAbs produced in CHO (and possibly other) cell lines. Xencor has developed XmAb Fc domain technology designed to improve the immune system's elimination of tumor and other pathological cells. This Fc domain has two amino acid substitutions, resulting in a 40-fold increase in affinity for FcyRIIIa. It also increases affinity for FcyRIIa with the potential to recruit other effector cells such as macrophages, which play a role in immunity by engulfing and digesting foreign material. An anti-CD24 antibody or an antigen-binding fragment thereof may be included in antibodies that kill cancer through ADCC. The anti-CD24 targeting component of such compositions can provide specific targeting to cancer cells for ADCC-mediated destruction while sparing normal cells and tissues. The ADCC activity of an anti-CD24 antibody or an antigen-binding fragment thereof may be enhanced by one or more of the modifications described herein.

5. Композиции биспецифических антител.5. Compositions of bispecific antibodies.

В настоящем документе дополнительно предложено биспецифическое антитело, которое содержит первый домен антитела, содержащий первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, связанный со вторым антителом или его антигенсвязывающим фрагментом. Первый домен антитела может содержать описанное здесь анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, а второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связываться с другими иммуностимулирующими молекулами. В конкретном варианте осуществления второй домен антитела включает анти-CD3 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. В этом случае биспецифическое антитело может специфически нацеливаться на опухолевые клетки, экспрессирующие ракоспецифичную гликоформу CD24, одновременно связывая CD3 на цитотоксических Т-клетках, тем самым привлекая Т-клетки к месту опухоли, посредством чего Т-клетки будут проникать в опухоль и вызывать цитотоксичность в опухоли. Другие примеры антител-партнеров для использования в биспецифическом антителе с целью привлечения цитотоксических Т-клеток или других эффекторных клеток к месту опухоли известны в данной области.Further provided herein is a bispecific antibody that comprises a first antibody domain comprising a first antibody or an antigen binding fragment thereof linked to a second antibody or an antigen binding fragment thereof. The first domain of the antibody may comprise an anti-CD24 antibody or an antigen binding fragment thereof described herein, and the second antibody or an antigen binding fragment thereof may bind to other immunostimulatory molecules. In a specific embodiment, the second domain of the antibody includes an anti-CD3 antibody or an antigen binding fragment thereof. In this case, the bispecific antibody can specifically target tumor cells expressing the cancer-specific glycoform of CD24 while simultaneously binding CD3 on cytotoxic T cells, thereby attracting the T cells to the tumor site, whereby the T cells will infiltrate the tumor and cause cytotoxicity in the tumor . Other examples of antibody partners for use in a bispecific antibody to attract cytotoxic T cells or other effector cells to a tumor site are known in the art.

Второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может нацеливаться на комплементарный противоопухолевый путь или механизм. Второй домен антитела может включать антитело для иммунотерапии рака или его антигенсвязывающий фрагмент, который усиливает естественные иммунные отвеThe second antibody or antigen-binding fragment thereof may target a complementary antitumor pathway or mechanism. The second domain of the antibody may include a cancer immunotherapy antibody or an antigen binding fragment thereof that enhances natural immune responses.

- 9 045813 ты. Примеры таких антител для иммунотерапии рака включают анти-PD-l, анти-В7-Н1, анти-В7-Н3, анти-В7-Н4, анти-LIGHT, анти-LAG3, анти-TIM3, анти-TIM4, анти-CD40, анти-ОХ40, анти-GITR, антиBTLA, анти-CD27, анти-ICOS или анти-4-1ВВ антитела. Такие антитела можно использовать для лечения рака. Второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связывать α-цепь TCR, β-цепь TCR, γ-цепь TCR или 5-цепь TCR.- 9 045813 you. Examples of such antibodies for cancer immunotherapy include anti-PD-1, anti-B7-H1, anti-B7-H3, anti-B7-H4, anti-LIGHT, anti-LAG3, anti-TIM3, anti-TIM4, anti-CD40 , anti-OX40, anti-GITR, anti-BTLA, anti-CD27, anti-ICOS or anti-4-1BB antibodies. Such antibodies can be used to treat cancer. The second antibody or antigen-binding fragment thereof may bind the TCR α chain, the TCR β chain, the TCR γ chain, or the TCR 5 chain.

Биспецифическое антитело может содержать последовательности, указанные в SEQ ID NO: 17 и 18, или любую из последовательностей, указанных в SEQ ID NO: 23-27 и 37-41. В данной области известно много различных технологий биспецифических антител. Для большинства из них требуется, чтобы антитела двух компонентов были в одноцепочечном формате, чтобы две части могли экспрессироваться в единой конструкции. Предпочтительный метод заключается в экспрессии антител в виде одноцепочечного вариабельного фрагмента (scFv). Неограничивающие примеры технологий биспецифических антител включают BiTE (что означает Bi-specific T-cell Engager, биспецифическое средство привлечения Т-клеток), DART (что означает Dual-Affinity Re-Targeting, перенацеливание с двойной аффинностью), иммуноглобулин с тандемом Fab (FIT-Ig) и типа выступы-во-впадины. Такие биспецифические антитела, содержащие анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, в особенности рассматриваются в данном документе.The bispecific antibody may contain the sequences set forth in SEQ ID NOs: 17 and 18, or any of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 23-27 and 37-41. There are many different bispecific antibody technologies known in the art. Most require that the antibodies of the two components be in a single-chain format so that the two parts can be expressed in a single construct. The preferred method is to express the antibody as a single chain variable fragment (scFv). Non-limiting examples of bispecific antibody technologies include BiTE (which stands for Bi-specific T-cell Engager), DART (which stands for Dual-Affinity Re-Targeting), Fab tandem immunoglobulin (FIT- Ig) and protrusions-to-recessions type. Such bispecific antibodies containing an anti-CD24 antibody or an antigen-binding fragment thereof are particularly contemplated herein.

6. CAR-T терапевтические композиции.6. CAR-T therapeutic compositions.

Терапия на основе Т-клеток с химерным рецептором антигена (CAR), или CAR-T-терапия, представляет собой тип клеточного лечения, при котором Т-клетки больного раком генетически модифицированы ex vivo с возможностью экспрессии белка CAR, чтобы они могли атаковать раковые клетки. В частности, Т-клетки получают из крови пациента, которая, в частности, может быть собственной кровью пациента (аутологичной), и трансфицируют генной конструкцией, которая экспрессирует рекомбинантный CAR-рецептор. Затем в лаборатории выращивают большое количество CAR-T-клеток и вводят обратно пациенту, где они могут нацеливаться и уничтожать раковые клетки пациента. Т-клетки также могут быть аллогенными от подходящего донора или от универсальной или готовой линии Т-клеток, в которой один или несколько из локусов гена TCR и локусов HLA класса I аллогенных Т-клеток нарушены и полученные Т-клетки не способны распознавать аллогенные антигены.Chimeric antigen receptor (CAR) T-cell therapy, or CAR-T therapy, is a type of cell treatment in which a cancer patient's T cells are genetically modified ex vivo to express the CAR protein so they can attack cancer cells . In particular, T cells are obtained from the patient's blood, which in particular may be the patient's own blood (autologous), and are transfected with a gene construct that expresses the recombinant CAR receptor. Large numbers of CAR-T cells are then grown in the laboratory and injected back into the patient, where they can target and destroy the patient's cancer cells. The T cells may also be allogeneic from a suitable donor or from a universal or off-the-shelf T cell line in which one or more of the TCR gene loci and the HLA class I loci of the allogeneic T cells are disrupted and the resulting T cells are unable to recognize allogeneic antigens.

Белковые конструкции CAR имеют модульные структуры, обычно содержащие следующие основные компоненты: полученный из антитела внеклеточный одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), присоединенный к шарнирному/спейсерному пептиду и трансмембранному домену, который дополнительно связан с внутриклеточными доменами передачи Т-клеточных сигналов Т-клеточного рецептора. ScFv является нацеливающим элементом и экспрессируется на поверхности CAR-T-клетки для придания антигенной специфичности. Спейсер соединяет внеклеточный нацеливающий элемент с трансмембранным доменом и влияет на функцию CAR и гибкость scFv. Трансмембранный домен пересекает клеточную мембрану, заякоривает CAR на поверхности клетки и соединяет внеклеточный домен с внутриклеточным сигнальным доменом, тем самым воздействуя на экспрессию CAR на клеточной поверхности. Костимулирующий домен происходит из внутриклеточных сигнальных доменов костимулирующих белков, таких как CD28 и 4-1ВВ, которые усиливают продукцию цитокинов. Дзета-домен CD3 происходит из внутриклеточной сигнальной части Т-клеточного рецептора, которая опосредует нисходящую передачу сигналов во время активации Т-клеток. Примеры CAR-T-терапевтических средств включают такие, которые нацелены на поверхностные антигены В-клеток CD19 (такие как JCAR017 и JCAR014 [Juno Therapeutics]), CTL019 (тисагенлеклеуцел-Т (Kymriah™) [Novartis]) и КТЕ-С19 (аксикабтаген цилолейцел (Yescarta®) [Kite Pharma]) и CD22 (JCAR014 [Juno Therapeutics]). Другие примеры CAR-T-терапевтических средств включают такие, которые нацелены на Ll-CAM (JCAR023 [Juno Therapeutics]), ROR-1 (JCAR024 [Juno Therapeutics]) и MUC16 (JCAR020 [Juno Therapeutics]). ScFv-часть CAR является критическим компонентом, который обеспечивает специфичность для раковых клеток, предотвращая при этом активность против нормальных клеток, которая связана с нецелевой токсичностью. Следовательно, scFv-часть обычно происходит из части антитела, которая распознает целевой белок, специфически экспрессируемый на раковых клетках, но гораздо реже или, в идеале, совсем не экспрессируется на других клетках и тканях. Соответственно, scFv-фрагмент, полученный из любого из описанных здесь анти-CD24 антител, может быть использован в качестве нацеливающего на рак компонента рекомбинантного белка CAR. В частности, белок scFv может содержать последовательность, указанную в SEQ ID NO: 28.CAR protein constructs have modular structures typically containing the following core components: an antibody-derived extracellular single chain variable fragment (scFv) attached to a hinge/spacer peptide and a transmembrane domain, which is further linked to the intracellular T cell signaling domains of the T cell receptor. ScFv is a targeting element and is expressed on the surface of CAR-T cells to impart antigen specificity. The spacer connects the extracellular targeting element to the transmembrane domain and influences CAR function and scFv flexibility. The transmembrane domain crosses the cell membrane, anchors CAR to the cell surface, and connects the extracellular domain to the intracellular signaling domain, thereby affecting cell surface expression of CAR. The costimulatory domain is derived from the intracellular signaling domains of costimulatory proteins such as CD28 and 4-1BB, which enhance cytokine production. The CD3 zeta domain is derived from the intracellular signaling portion of the T cell receptor, which mediates downstream signaling during T cell activation. Examples of CAR-T therapeutics include those that target B cell surface antigens CD19 (such as JCAR017 and JCAR014 [Juno Therapeutics]), CTL019 (tisagenlecleucel-T (Kymriah™) [Novartis]), and CTE-C19 (axicabtagene ciloleucel (Yescarta®) [Kite Pharma]) and CD22 (JCAR014 [Juno Therapeutics]). Other examples of CAR-T therapeutics include those that target Ll-CAM (JCAR023 [Juno Therapeutics]), ROR-1 (JCAR024 [Juno Therapeutics]), and MUC16 (JCAR020 [Juno Therapeutics]). The ScFv portion of CAR is a critical component that provides specificity for cancer cells while preventing activity against normal cells that is associated with off-target toxicity. Therefore, the scFv portion is typically derived from a portion of the antibody that recognizes a target protein that is specifically expressed on cancer cells but is much less commonly, or ideally not, expressed at all on other cells and tissues. Accordingly, a scFv fragment derived from any of the anti-CD24 antibodies described herein can be used as a cancer-targeting component of a recombinant CAR protein. In particular, the scFv protein may contain the sequence set forth in SEQ ID NO: 28.

CAR Т-клетки продемонстрировали впечатляющие эффекты против гематологических опухолей, таких как острый лимфобластный лейкоз (ALL), В-клеточный острый лимфобластный лейкоз, миелоидный лейкоз взрослых (AML), диффузная большая В-клеточная лимфома (DLBCL), неходжкинская лимфома (NHL), хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL), первичная средостенная В-клеточная лимфома (PMBCL), лимфома клеток мантийной зоны (MCL) и множественная миелома (ММ). Однако на сегодняшний день CAR-Т-терапия продемонстрировала лишь ограниченный эффект против солидных опухолей. Из-за характерного паттерна экспрессии CD24 в опухолях и нормальных тканях данные, полученные с использованием CD24 CAR-T, продемонстрировали, что типы рака, на которые можно воздействоCAR T cells have demonstrated impressive effects against hematological tumors such as acute lymphoblastic leukemia (ALL), B-cell acute lymphoblastic leukemia, adult myeloid leukemia (AML), diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), non-Hodgkin lymphoma (NHL), chronic lymphocytic leukemia (CLL), primary mediastinal B-cell lymphoma (PMBCL), mantle cell lymphoma (MCL) and multiple myeloma (MM). However, to date, CAR T therapy has shown only limited effect against solid tumors. Due to the characteristic expression pattern of CD24 in tumors and normal tissues, data obtained using CD24 CAR-T have demonstrated that the types of cancer that can be targeted

- 10 045813 вать, включают, не ограничиваясь указанным, опухоли головного мозга, рак головы и шеи, саркому, рак легких, рак желудочно-кишечного тракта, рак молочной железы, рак яичка, рак простаты, рак поджелудочной железы, рак шейки матки, рак яичника, рак печени или гематологические злокачественные новообразования.- 10 045813 include, but are not limited to, brain tumors, head and neck cancer, sarcoma, lung cancer, gastrointestinal cancer, breast cancer, testicular cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, cervical cancer, cancer ovarian, liver cancer or hematological malignancies.

7. TCR-терапевтические композиции.7. TCR therapeutic compositions.

Подобно CAR-T-терапии, терапия с использованием генетически модифицированных Т-клеточных рецепторов (TCR) представляет собой тип клеточного лечения, при котором Т-клетки больного раком генетически модифицированы ex vivo для экспрессии модифицированного TCR с целью улучшения способности Т-клеточных рецепторов распознавать и атаковать специфические антигенные клеточные антигены, когда клетки снова вводят пациенту. Однако, в отличие от CAR Т-клеток, которые распознают белки, экспрессируемые на поверхности, Т-клеточная иммунотерапия с использованием генномодифицированных TCR была нацелена в большей степени на солидные опухоли. TCR могут распознавать опухолеспецифические белки внутри клеток. Когда опухолеспецифические белки разбиваются на фрагменты, они презентируются на поверхности клетки с другим белком, называемым главным комплексом гистосовместимости, или МНС. TCR рассчитаны на распознавание комбинации опухолеспецифического белкового фрагмента/МНС. Примеры мишеней для Т-клеток, модифицированных TCR, включают мишени, нацеленные на Mage-Аз, такие как KITE-718 (Kite Pharma), опухолевый антиген Вильмса 1 (WT-1), такой как JTCR016 (Juno Therapeutics) и NY-ESO 1.Similar to CAR-T therapy, genetically engineered T-cell receptor (TCR) therapy is a type of cell-based treatment in which a cancer patient's T cells are genetically modified ex vivo to express a modified TCR in order to improve the T-cell receptor's ability to recognize and attack specific cell antigens when the cells are reintroduced to the patient. However, unlike CAR T cells, which recognize proteins expressed on the surface, T cell immunotherapy using gene-edited TCRs has been targeted primarily at solid tumors. TCRs can recognize tumor-specific proteins within cells. When tumor-specific proteins are broken down into fragments, they are presented on the cell surface with another protein called the major histocompatibility complex, or MHC. TCRs are designed to recognize a tumor-specific protein fragment/MHC combination. Examples of TCR-modified T cell targets include Mage-Az targets such as KITE-718 (Kite Pharma), Wilms tumor antigen 1 (WT-1) such as JTCR016 (Juno Therapeutics) and NY-ESO 1.

TCR представляет собой гетеродимер, состоящий из двух субъединиц, TCRa и TCRe. Каждая субъединица содержит константную область, которая находится рядом с Т-клеточной мембраной и заякоривает рецептор в клеточной мембране, а также гипервариабельную область, которая участвует в распознавании антигена. Соответственно, scFv-фрагмент, полученный из любого из анти-CD24 антител, описанных в данном документе, может быть использован в качестве нацеливающего на рак компонента рекомбинантного белка TCR. В частности, белок scFv может содержать последовательность, указанную в SEQ ID NO: 28.The TCR is a heterodimer consisting of two subunits, TCRa and TCRe. Each subunit contains a constant region, which is adjacent to the T cell membrane and anchors the receptor to the cell membrane, as well as a hypervariable region, which is involved in antigen recognition. Accordingly, a scFv fragment derived from any of the anti-CD24 antibodies described herein can be used as a cancer-targeting component of a recombinant TCR protein. In particular, the scFv protein may contain the sequence set forth in SEQ ID NO: 28.

8. Пептидные композиции.8. Peptide compositions.

Описанное в данном документе анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связывать экранируемый гликаном эпитоп, который не экранирован на раковых клетках, но экранирован на незлокачественных клетках. В частности, анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связывать пептид CD24, содержащий аминокислотную последовательность SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48). Соответственно, пептиды, содержащие последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, могут быть использованы для нейтрализации анти-CD24 антител, которые связываются с эпитопами, содержащими ядро последовательности, указанной в SEQ ID NO: 48. Это может быть использовано в анализах на основе антител к лекарствам для обнаружения нейтрализующих антител. Пептиды, содержащие последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, можно использовать для ингибирования потенциальных неблагоприятных эффектов, связанных с антителами, которые связываются с эпитопами, составляющими ядро последовательности, указанной в SEQ ID NO: 48. Пептид может быть модифицирован для повышения стабильности для использования in vivo с помощью методов, известных в данной области, включая, но не ограничиваясь указанным, использование D-аминокислот, замену О на S в одной или нескольких пептидных связях, добавление последовательности слияния для улучшения растворимости или периода полужизни (например, слияние с альбумином). В еще одном варианте осуществления молекула, содержащая последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, может быть использована в качестве вакцины для лечения и профилактики рака.An anti-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof described herein can bind a glycan-screened epitope that is not screened on cancer cells but is screened on non-cancerous cells. In particular, an anti-CD24 antibody or an antigen-binding fragment thereof can bind a CD24 peptide containing the amino acid sequence SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48). Accordingly, peptides containing the sequence set forth in SEQ ID NO: 48 can be used to neutralize anti-CD24 antibodies that bind to epitopes containing the core sequence set forth in SEQ ID NO: 48. This can be used in assays based on anti-drug antibodies to detect neutralizing antibodies. Peptides containing the sequence set forth in SEQ ID NO: 48 can be used to inhibit the potential adverse effects associated with antibodies that bind to epitopes constituting the core sequence set forth in SEQ ID NO: 48. The peptide can be modified to improve stability for use in vivo using methods known in the art, including, but not limited to, the use of D-amino acids, the replacement of O with S in one or more peptide bonds, the addition of a fusion sequence to improve solubility or half-life (for example, fusion with albumin ). In yet another embodiment, a molecule comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 48 can be used as a vaccine for the treatment and prevention of cancer.

9. Способы лечения.9. Methods of treatment.

Композиции анти-CD24 антител или клеточные терапевтические средства, включающие такие композиции антител, описанные в данном документе, могут использоваться для лечения или предотвращения рака или другого аномального пролиферативного заболевания. В настоящем документе предлагается способ такого применения у пациента, нуждающегося в этом, который может включать введение пациенту анти-CD24 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента или фармацевтической композиции, содержащей вышеуказанное. Такие молекулы и фармацевтические композиции также можно использовать в изготовлении лекарственного средства для лечения или профилактики рака или другого аномального пролиферативного заболевания. Используемый здесь термин рак относится к новообразованию или опухоли, возникающим в результате аномального неконтролируемого роста клеток. Используемый здесь термин рак явно включает лейкоз и лимфомы. Термин относится к заболеванию с участием клеток, которые могут метастазировать в отдаленные участки. Пациент может быть человеком. Раком или другим аномальным пролиферативным заболеванием может быть (но не ограничиваясь указанным) одно или несколько из следующих: карцинома, включая карциному мочевого пузыря, молочной железы, толстой кишки, почки, печени, легких, яичников, поджелудочной железы, желудка, шейки матки, щитовидной железы и кожи; включая плоскоклеточный рак; гемопоэтические опухоли лимфоидной линии, включая лейкоз, острый лимфолейкоз, острый лимфобластный лейкоз, В-клеточную лимфому, Т-клеточную лимфому, лимфому Беркетта; гемопоэтические опухоли миелоидного происхождения, включая острые и хронические миелогенные лейкозы и промиелоцитарный лейкоз; опухоли мезенхимального происхождеAnti-CD24 antibody compositions or cell therapeutics including such antibody compositions described herein can be used to treat or prevent cancer or other abnormal proliferative disease. Provided herein is a method of such administration to a patient in need thereof, which may include administering to the patient an anti-CD24 antibody or an antigen binding fragment thereof or a pharmaceutical composition containing the foregoing. Such molecules and pharmaceutical compositions may also be used in the manufacture of a medicament for the treatment or prevention of cancer or other abnormal proliferative disease. As used herein, the term cancer refers to a growth or tumor resulting from abnormal, uncontrolled cell growth. As used herein, the term cancer clearly includes leukemia and lymphomas. The term refers to a disease involving cells that can metastasize to distant sites. The patient may be human. Cancer or other abnormal proliferative disease may be (but is not limited to) one or more of the following: carcinoma, including carcinoma of the bladder, breast, colon, kidney, liver, lung, ovary, pancreas, stomach, cervix, thyroid glands and skin; including squamous cell carcinoma; hematopoietic tumors of the lymphoid lineage, including leukemia, acute lymphocytic leukemia, acute lymphoblastic leukemia, B-cell lymphoma, T-cell lymphoma, Burkett's lymphoma; hematopoietic tumors of myeloid origin, including acute and chronic myelogenous leukemia and promyelocytic leukemia; tumors of mesenchymal origin

- 11 045813 ния, включая фибросаркому и рабдомиосаркому; другие опухоли, включая меланому, семиному, тетратокарциному, нейробластому и глиому; опухоли центральной и периферической нервной системы, включая астроцитому, нейробластому, глиому и шванномы; опухоли мезенхимального происхождения, включая фибросаркому, рабдомиосаркому и остеосаркому; и другие опухоли, включая меланому, пигментную ксенодерму, кератоактантому, семиному, фолликулярный рак щитовидной железы и тератокарциному. Также предполагается, что раковые заболевания, вызванные аберрациями апоптоза, также можно лечить способами и композициями по настоящему изобретению. Такие виды рака могут включать, но не ограничиваясь указанным, фолликулярные лимфомы, карциномы с мутациями р53, гормонозависимые опухоли молочной железы, простаты и яичников, а также предраковые поражения, такие как семейный аденоматозный полипоз и миелодиспластические синдромы. В конкретных вариантах реализации злокачественные или диспролиферативные изменения (такие как метаплазии и дисплазии) или гиперпролиферативные расстройства лечат или предотвращают способами и композициями по настоящему изобретению в яичниках, мочевом пузыре, молочной железе, толстой кишке, легких, коже, поджелудочной железе или матке. Раком также может быть саркома, меланома или лейкемия.- 11 045813 nia, including fibrosarcoma and rhabdomyosarcoma; other tumors including melanoma, seminoma, tetratocarcinoma, neuroblastoma and glioma; tumors of the central and peripheral nervous system, including astrocytoma, neuroblastoma, glioma and schwannomas; tumors of mesenchymal origin, including fibrosarcoma, rhabdomyosarcoma and osteosarcoma; and other tumors, including melanoma, xenoderma pigmentosum, keratoactantoma, seminoma, follicular thyroid cancer and teratocarcinoma. It is also contemplated that cancers caused by aberrations of apoptosis can also be treated with the methods and compositions of the present invention. Such cancers may include, but are not limited to, follicular lymphomas, p53 mutation carcinomas, hormone-dependent breast, prostate and ovarian tumors, as well as precancerous lesions such as familial adenomatous polyposis and myelodysplastic syndromes. In specific embodiments, malignant or dysproliferative changes (such as metaplasias and dysplasias) or hyperproliferative disorders are treated or prevented by the methods and compositions of the present invention in the ovary, bladder, breast, colon, lung, skin, pancreas, or uterus. Cancer can also be sarcoma, melanoma or leukemia.

Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно использовать в комбинации с одним или несколькими другими видами противоопухолевой терапии, включая, но не ограничиваясь, современные стандартные и экспериментальные химиотерапии, гормональные терапии, биологические методы лечения, иммунотерапии, лучевые терапии или хирургическое вмешательство. В некоторых вариантах реализации анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно вводить в сочетании с терапевтически или профилактически эффективным количеством одного или нескольких агентов, терапевтических антител или других агентов, известных специалистам в данной области для лечения и/или профилактика рака, аутоиммунного заболевания, инфекционного заболевания или интоксикации. Такие агенты включают, например, любые из обсуждаемых выше модификаторов биологического ответа, цитотоксины, антиметаболиты, алкилирующие агенты, антибиотики или антимитотические агенты, а также иммунотерапевтические средства.The Ahtu-CD24 antibody or antigen-binding fragment thereof may be used in combination with one or more other anticancer therapies, including, but not limited to, current standard and experimental chemotherapy, hormonal therapies, biological therapies, immunotherapies, radiation therapies, or surgery. In some embodiments, an anti-CD24 antibody or antigen-binding fragment thereof can be administered in combination with a therapeutically or prophylactically effective amount of one or more agents, therapeutic antibodies, or other agents known to those skilled in the art for the treatment and/or prevention of cancer, autoimmune disease, infectious illness or intoxication. Such agents include, for example, any of the biological response modifiers discussed above, cytotoxins, antimetabolites, alkylating agents, antibiotics or antimitotic agents, and immunotherapies.

Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно использовать в комбинации с одним или несколькими противоопухолевыми иммунотерапевтическими средствами. Противоопухолевые иммунотерапевтические средства могут включать молекулы, которые нарушают или усиливают альтернативные иммуномодулирующие пути (такие как TIM3, TIM4, ОХ40, CD40, GITR, 4-1-ВВ, В7-Н1, PD-1, B7-H3, В7-Н4, LIGHT, BTLA, ICOS, CD27 или LAG3) или модулируют активность эффекторных молекул, таких как цитокины (например, IL-4, IL-7, IL-10, IL-12, IL-15, IL-17, GF-beta, IFNg, Flt3, BLys) и хемокины (например, CCL21), с целью усиления иммуномодулирующих эффектов. Конкретные варианты реализации включают биспецифическое антитело, содержащее анти-CD24 антитело или его связывающий фрагмент и анти-PD-1 (пембролизумаб (Keytruda®) или ниволумаб (Opdivo®)), анти-В7-Н1 (атезолизумаб (Tecentriq®) или дурвалумаб), анти-В7-Н3, анти-В7-Н4, анти-LIGHT, анти-LAG3, антиTIM3, анти-TIM4, анти-CD40, анти-ОХ40, анти-GITR, анти-BTLA, анти-CD27, анти-ICOS или анти-41ВВ. В еще одном варианте осуществления анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно вводить в комбинации с молекулами, которые активируют различные стадии или аспекты иммунного ответа, чтобы достичь более широкого иммунного ответа. В более предпочтительном варианте осуществления анти-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно комбинировать с анти-PD-1 или анти-4-1ВВ антителами без усиления аутоиммунных побочных эффектов.The Ahtu-CD24 antibody or antigen-binding fragment thereof can be used in combination with one or more antitumor immunotherapies. Antitumor immunotherapies may include molecules that disrupt or enhance alternative immunomodulatory pathways (such as TIM3, TIM4, OX40, CD40, GITR, 4-1-BB, B7-H1, PD-1, B7-H3, B7-H4, LIGHT , BTLA, ICOS, CD27, or LAG3) or modulate the activity of effector molecules such as cytokines (eg, IL-4, IL-7, IL-10, IL-12, IL-15, IL-17, GF-beta, IFNg , Flt3, BLys) and chemokines (for example, CCL21), in order to enhance immunomodulatory effects. Specific embodiments include a bispecific antibody comprising an anti-CD24 antibody or binding fragment thereof and anti-PD-1 (pembrolizumab (Keytruda®) or nivolumab (Opdivo®)), anti-B7-H1 (atezolizumab (Tecentriq®) or durvalumab) , anti-B7-H3, anti-B7-H4, anti-LIGHT, anti-LAG3, antiTIM3, anti-TIM4, anti-CD40, anti-OX40, anti-GITR, anti-BTLA, anti-CD27, anti-ICOS or anti-41BB. In yet another embodiment, an anti-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof can be administered in combination with molecules that activate various stages or aspects of the immune response to achieve a broader immune response. In a more preferred embodiment, an anti-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof can be combined with anti-PD-1 or anti-4-1BB antibodies without increasing autoimmune side effects.

10. Получение.10. Receipt.

Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно получить с использованием эукариотической системы экспрессии. Система экспрессии может включать экспрессию с вектора в клетках млекопитающих, таких как клетки яичника китайского хомячка (СНО). Система также может представлять собой вирусный вектор, такой как дефектный по репликации ретровирусный вектор, который можно использовать для инфицирования эукариотических клеток. Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент также можно продуцировать в стабильной клеточной линии, которая экспрессирует антитело с вектора или части вектора, интегрированной в клеточный геном. Стабильная клеточная линия может экспрессировать антитело с интегрированного ретровирусного вектора, дефектного по репликации. Система экспрессии может представлять собой GPExTM.Ahtu-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof can be produced using a eukaryotic expression system. The expression system may include expression from a vector in mammalian cells, such as Chinese hamster ovary (CHO) cells. The system may also be a viral vector, such as a replication-defective retroviral vector, which can be used to infect eukaryotic cells. The Ahtu-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof can also be produced in a stable cell line that expresses the antibody from a vector or portion of a vector integrated into the cellular genome. A stable cell line can express an antibody from an integrated replication-defective retroviral vector. The expression system may be GPExTM.

Ahtu-CD24 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно очистить, используя, например, хроматографические методы, такие как аффинная хроматография, ионообменная хроматография, хроматография гидрофобного взаимодействия, DEAE-ионообмен, гель-фильтрация и хроматография на гидроксиапатите. В некоторых вариантах реализации слитые белки могут быть сконструированы так, чтобы они содержали дополнительный домен, содержащий аминокислотную последовательность, которая позволяет полипептидам захватываться аффинной матрицей. Например, описанные в данном документе антитела, содержащие Fc-область иммуноглобулинового домена, могут быть выделены из супернатанта клеточной культуры или цитоплазматического экстракта с использованием колонки с протеином А. Кроме того, для облегчения очистки полипептида можно использовать метку, такую как c-myc, гемагглютинин, полигистидин или Flag™ (Kodak). Такие метки могут быть вставлены в любом месте поThe Ahtu-CD24 antibody or antigen binding fragment thereof can be purified using, for example, chromatographic techniques such as affinity chromatography, ion exchange chromatography, hydrophobic interaction chromatography, DEAE ion exchange, size exclusion chromatography and hydroxyapatite chromatography. In some embodiments, the fusion proteins can be designed to contain an additional domain containing an amino acid sequence that allows the polypeptides to be captured by an affinity matrix. For example, antibodies described herein containing the Fc region of an immunoglobulin domain can be isolated from cell culture supernatant or cytoplasmic extract using a protein A column. Additionally, a tag such as c-myc, hemagglutinin, can be used to facilitate purification of the polypeptide , polyhistidine or Flag™ (Kodak). Such marks can be inserted anywhere along the

- 12 045813 липептида, включая карбоксильный или аминный конец. Другие слияния, которые могут быть полезны, включают ферменты, которые помогают в обнаружении полипептида, такие как щелочная фосфатаза. Иммуноаффинная хроматография также может использоваться для очистки полипептидов. Вакцины- 12 045813 lipeptide, including the carboxyl or amine terminus. Other fusions that may be useful include enzymes that aid in polypeptide detection, such as alkaline phosphatase. Immunoaffinity chromatography can also be used to purify polypeptides. Vaccines

В настоящем документе предложен способ лечения рака или обеспечения профилактики рака, описанного в настоящем документе, у пациента. С помощью этого метода можно вакцинировать пациента от рака. Способ может включать введение композиции, содержащей последовательность, указанную в SEQ ID NO: 48, пациенту, нуждающемуся в этом. Композицию также можно вводить пациенту, нуждающемуся в лечении побочных эффектов, связанных с терапией, включающем использование анти-CD24 антитела или клеток, экспрессирующих рецепторы, связывающие CD24. Композиция также может быть использована при производстве лекарственного средства для лечения рака или обеспечения профилактики рака.Provided herein is a method of treating cancer or providing prevention of the cancer described herein in a patient. Using this method, a patient can be vaccinated against cancer. The method may include administering a composition comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 48 to a patient in need thereof. The composition can also be administered to a patient in need of treatment of side effects associated with therapy, including the use of anti-CD24 antibodies or cells expressing CD24 binding receptors. The composition can also be used in the manufacture of a medicament for treating cancer or providing cancer prevention.

11. Фармацевтические композиции.11. Pharmaceutical compositions.

В настоящем документе предложена фармацевтическая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество любого из описанных выше анти-CD24 антител, клеточных терапевтических средств или пептидных композиций и физиологически приемлемый носитель или вспомогательное вещество. Фармацевтическая композиция может содержать профилактически или терапевтически эффективное количество анти-CD24 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и фармацевтически приемлемый носитель. В конкретном варианте осуществления термин фармацевтически приемлемый означает одобренный регулирующим органом федерального правительства или правительства штата или перечисленный в Фармакопее США или другой общепризнанной фармакопее для применения у животных и, более конкретно, у людей. Термин носитель относится к разбавителю, адъюванту (например, адъюванту Фрейнда (полный и неполный), вспомогательному веществу или несущей среде, с которыми вводится терапевтическое средство. Такие фармацевтические носители могут быть стерильными жидкостями, такими как вода и масла, в том числе нефтяного, животного, растительного или синтетического происхождения, такие как арахисовое масло, соевое масло, минеральное масло, кунжутное масло и т.д. Вода является предпочтительным носителем, когда фармацевтическая композиция вводится внутривенно. Солевые растворы и водные растворы декстрозы и глицерина также могут быть использованы в качестве жидких носителей, особенно для инъекционных растворов. Подходящие фармацевтические вспомогательные вещества включают крахмал, глюкозу, лактозу, сахарозу, желатин, солод, рис, муку, мел, силикагель, стеарат натрия, моностеарат глицерина, тальк, хлорид натрия, сухое обезжиренное молоко, глицерин, пропилен, гликоль, вода, этанол и т.д. Фармацевтическая композиция, если желательно, может также содержать незначительные количества смачивающих или эмульгирующих агентов или рНбуферов. Эти композиции могут принимать форму растворов, суспензий, эмульсии, таблеток, пилюль, капсул, порошков, составов с замедленным высвобождением и т.п.Provided herein is a pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of any of the anti-CD24 antibodies, cell therapeutics or peptide compositions described above and a physiologically acceptable carrier or excipient. The pharmaceutical composition may contain a prophylactically or therapeutically effective amount of an anti-CD24 antibody or antigen-binding fragment thereof and a pharmaceutically acceptable carrier. In a specific embodiment, the term pharmaceutically acceptable means approved by a regulatory agency of the federal or state government or listed in the United States Pharmacopoeia or other generally accepted pharmacopoeia for use in animals and, more particularly, in humans. The term carrier refers to the diluent, adjuvant (for example, Freund's adjuvant (complete and incomplete), excipient or carrier medium with which the therapeutic agent is administered. Such pharmaceutical carriers can be sterile liquids such as water and oils, including petroleum, animal , vegetable or synthetic origin, such as peanut oil, soybean oil, mineral oil, sesame oil, etc. Water is the preferred carrier when the pharmaceutical composition is administered intravenously. Saline solutions and aqueous solutions of dextrose and glycerol can also be used as liquid carriers, especially for injection solutions. Suitable pharmaceutical excipients include starch, glucose, lactose, sucrose, gelatin, malt, rice, flour, chalk, silica gel, sodium stearate, glycerol monostearate, talc, sodium chloride, skimmed milk powder, glycerin, propylene , glycol, water, ethanol, etc. The pharmaceutical composition, if desired, may also contain minor amounts of wetting or emulsifying agents or pH buffers. These compositions may take the form of solutions, suspensions, emulsions, tablets, pills, capsules, powders, sustained release formulations, and the like.

Как правило, ингредиенты фармацевтической композиции могут поставляться либо отдельно, либо в смеси в единичной дозированной лекарственной форме, например в виде сухого лиофилизированного порошка или безводного концентрата в герметично закрытом контейнере, таком как ампула или саше, с указанием количества активного агента. Если фармацевтическую композицию следует вводить путем инфузии, ее можно отпускать с бутылкой для инфузии, содержащей стерильную воду или физиологический раствор фармацевтического качества. Когда фармацевтическая композиция вводится путем инъекции, может быть предоставлена ампула стерильной воды для инъекций или физиологического раствора, чтобы ингредиенты можно было смешать перед введением. Фармацевтическая композиция может быть получена в нейтральной или солевой формах. Фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваясь указанным, соли, образованные с такими анионами, как происходящие из соляной, фосфорной, уксусной, щавелевой, винной кислот и т.д., и соли, образованные с такими катионами, как происходящие из гидроксидов натрия, калия, аммония, кальция, железа, изопропиламина, триэтиламина, 2этиламиноэтанола, гистидина, прокаина и т.д.Typically, the ingredients of a pharmaceutical composition may be supplied either separately or admixed in unit dosage form, for example as a dry lyophilized powder or an anhydrous concentrate in a sealed container such as an ampoule or sachet, indicating the amount of active agent. If the pharmaceutical composition is to be administered by infusion, it may be dispensed with an infusion bottle containing sterile water or pharmaceutical grade saline. When the pharmaceutical composition is administered by injection, an ampoule of sterile water for injection or saline may be provided so that the ingredients can be mixed before administration. The pharmaceutical composition can be obtained in neutral or salt forms. Pharmaceutically acceptable salts include, but are not limited to, salts formed with anions such as those derived from hydrochloric, phosphoric, acetic, oxalic, tartaric acids, etc., and salts formed with cations such as those derived from sodium hydroxides, potassium, ammonium, calcium, iron, isopropylamine, triethylamine, 2ethylaminoethanol, histidine, procaine, etc.

12. Способы введения.12. Methods of administration.

Способы введения составов и их фармацевтических композиций включают, но не ограничиваясь указанным, парентеральное введение (например, внутрикожное, внутримышечное, внутрибрюшинное, внутривенное и подкожное), эпидуральное и мукозальное (например, интраназальный и пероральный пути). В конкретном варианте осуществления композиция вводится внутримышечно, внутривенно или подкожно. Композицию можно вводить любым удобным путем, например инфузией или болюсной инъекцией, путем абсорбции через эпителиальные или кожно-слизистые оболочки (например, слизистую оболочку полости рта, слизистую оболочку прямой и кишки и т.д.) и можно вводить совместно с одним или несколькими другими биологически активными веществами. Введение может быть системным или местным.Methods of administration of the formulations and their pharmaceutical compositions include, but are not limited to, parenteral administration (eg, intradermal, intramuscular, intraperitoneal, intravenous and subcutaneous), epidural and mucosal (eg, intranasal and oral routes). In a specific embodiment, the composition is administered intramuscularly, intravenously or subcutaneously. The composition can be administered by any convenient route, for example by infusion or bolus injection, by absorption through epithelial or mucocutaneous membranes (for example, oral mucosa, rectal mucosa, etc.) and can be administered in conjunction with one or more other biologically active substances. Administration may be systemic or local.

ПримерыExamples

Раскрытие изобретения имеет множество аспектов, проиллюстрированных следующими неограничивающими примерами.The disclosure of the invention has many aspects, illustrated by the following non-limiting examples.

Пример 1. Синтез моноклональных антител к гипогликозилированному CD24.Example 1. Synthesis of monoclonal antibodies to hypoglycosylated CD24.

Сверхэкспрессия NEU1 и CD24 в опухолях предполагает нарушение регуляции гликозидазы. НаOverexpression of NEU1 and CD24 in tumors suggests glycosidase dysregulation. On

- 13 045813 рушение регуляции гликозидазы предполагает, что CD24, подобно MUC1, может быть гипогликозилирован в опухолях. Связывание антитела, 3В6, с CD24 затрудняется гликанами сиаловой кислоты (фиг. 1). По сравнению с коммерчески доступным анти-CD24 антителом, ML5 (BD bioscience), 3B6 прочно связывает N-SA-CD24 и N-SA-O-CD24, но всего лишь слабо N-CD24 или полностью гликозилированный CD24, как обнаружено с помощью ELISA. Это свидетельствовало о том, что эпитопы, которые связывает 3В6, действительно являются белковым остовом, и что связыванию 3В6 препятствует гликозилирование эпитопа. Результаты сортировки клеток с активированной флуоресценцией (FACS) и иммунофлуоресцентного (IFA) окрашивания показывают, что 3В6 связывает множество линий раковых клеток, включая нейробластому и медуллобластому (фиг. 2А-В). 3В6 связывает клеточные линии нейробластомы IMR32, SK-N-SH, SH-SY5Y, SK-N-BE(2) и SK-N-BE(2)C, но не SK-N-AS (фиг. 2А). 3В6 также связывает 3 из 4 опухолей медуллобластомы, полученных от пациентов, по оценке IFA окрашивания (фиг. 2В). Эти данные указывают на то, что 3В6 способен связывать линии раковых клеток и опухолей.- 13 045813 glycosidase dysregulation suggests that CD24, like MUC1, may be hypoglycosylated in tumors. Binding of the antibody, 3B6, to CD24 is hampered by sialic acid glycans (Fig. 1). Compared to the commercially available anti-CD24 antibody, ML5 (BD bioscience), 3B6 binds strongly to N-SA-CD24 and N-SA-O-CD24, but only weakly N-CD24 or fully glycosylated CD24, as detected by ELISA . This indicated that the epitopes that 3B6 binds are indeed a protein backbone, and that 3B6 binding is prevented by glycosylation of the epitope. Fluorescence-activated cell sorting (FACS) and immunofluorescence (IFA) staining results show that 3B6 binds multiple cancer cell lines, including neuroblastoma and medulloblastoma (Fig. 2A-B). 3B6 binds the neuroblastoma cell lines IMR32, SK-N-SH, SH-SY5Y, SK-N-BE(2), and SK-N-BE(2)C, but not SK-N-AS (Fig. 2A). 3B6 also bound 3 of 4 patient-derived medulloblastoma tumors as assessed by IFA staining (Fig. 2B). These data indicate that 3B6 is capable of binding cancer cell lines and tumors.

Пример 2. Созревание аффинности.Example 2: Affinity maturation.

Аффинность связывания 3В6 с CD24 была значительно ниже по сравнению с коммерческими антителами ML5 (BD Bioscience) и SN3 (Thermo Fisher). Для увеличения аффинности и специфичности связывания 3В6 с его антигеном проводили созревание аффинности 3В6. Сначала клонировали тяжелую (IgH) и легкую (IgL) цепи антитела 3В6 и идентифицировали последовательность вариабельной области Ig следующим образом: 3В6 IgH (SEQ ID NO: 1, CDR выделены подчеркнутым и полужирным шрифтом) EVKFEESGGGLVQPGGSIKLS CAASGVTFSEAWMDWVRO SPEKGLEWVAEIThe binding affinity of 3B6 to CD24 was significantly lower compared to the commercial antibodies ML5 (BD Bioscience) and SN3 (Thermo Fisher). To increase the affinity and specificity of binding of 3B6 to its antigen, affinity maturation of 3B6 was performed. First, the heavy (IgH) and light (IgL) chains of the 3B6 antibody were cloned and the Ig variable region sequence was identified as follows: 3B6 IgH (SEQ ID NO: 1, CDRs in underlined and bold) EVKFEESGGGLVQPGGSIKLS CAASGVTFSEAWMDWVRO SPEKGLEWVAEI

RDKTKNYVTYYAESVKGRFTISRDDSKSRVYLOMNNLRTEDTGIYYCTGARDKTKNYVTYYAESVKGRFTISRDDSKSRVYLOMNNLRTEDTGIYYCTGA

MDYWGOGTSVTVSSMDYWGOGTSVTVSS

3В6 IgL (SEQ ID NO: 2, CDR выделены подчеркнутым и полужирным шрифтом) DIVMTOTPLSLSVTIGOPASISCKSSOSLLYSNGKTYLNWLOORPGOSPKRLI3B6 IgL (SEQ ID NO: 2, CDRs in underlined and bold) DIVMTOTPLSLSVTIGOPASISCKSSOSLLYSNGKTYLNWLOORPGOSPKRLI

YQVSKLDPGIPDRFSGSGSETDFTLKISRVEAEDLGIYYCLQGTSYPWTFGGYQVSKLDPGIPDRFSGSGSETDFTLKISRVEAEDLGIYYCLQGTSYPWTFGG

GTKLEIKGTKLEIK

Фрагменты VH и VL исходного антитела 3В6 были преобразованы в формат scFv и клонированы в вектор фагового дисплея. ScFv моновалентно отображался на фаге, что позволяло отобрать клоны фага с более высокой аффинностью. Чтобы проверить уровень отображения scFv, scFv был слит с тегом обнаружения Flag-6xHis. ELISA на фаге выполняли для проверки связывания родительского антитела с антигеном в формате фагового дисплея. Сигнал связывания от фагового супернатанта был значительным, и проект перешел к созданию библиотеки.The VH and VL fragments of the original 3B6 antibody were converted to scFv format and cloned into a phage display vector. ScFv was displayed monovalently on the phage, allowing the selection of phage clones with higher affinity. To test the display level of scFv, scFv was fused to the Flag-6xHis detection tag. Phage ELISA was performed to test the binding of the parent antibody to the antigen in a phage display format. The binding signal from the phage supernatant was significant and the project moved on to library construction.

Было проведено три раунда отбора и скрининга. Снижение концентраций антигена CD24-GST и биотинилированного CD24-GST использовали при скрининге для отбора клонов с более высоким связыванием. Отобрали 48 клонов из каждой библиотеки мутагенеза CDR, культивировали, проанализировали на связывание и секвенировали. После подтверждения последовательностей клонов scFv с созревшей аффинностью, scFv клонов с созревшей аффинностью переформатировали в полноразмерные гены антител и временно экспрессировали в клетках млекопитающих. Все антитела с созревшей аффинностью получали в мелких сериях 0,01 л. Исходное антитело также было наработано для прямого сравнения. Плазмиды для указанных тяжелых и легких цепей (табл. 1) трансфицировали в суспензионные клетки HEK293 с использованием сред с химически определенным составом в отсутствие сыворотки для получения антител. Через пять дней после трансфекции кондиционированные среды собирали и осветляли. Целые антитела в кондиционированной среде очищали с использованием среды MabSelect SuRe Protein A (GE Healthcare).Three rounds of selection and screening were conducted. Reducing the concentrations of CD24-GST antigen and biotinylated CD24-GST was used in screening to select clones with higher binding. Forty-eight clones from each CDR mutagenesis library were selected, cultured, analyzed for binding, and sequenced. After confirmation of the sequences of the affinity matured scFv clones, the affinity matured scFv clones were reformatted into full length antibody genes and transiently expressed in mammalian cells. All affinity matured antibodies were prepared in small batches of 0.01 L. The parent antibody was also generated for direct comparison. Plasmids for the indicated heavy and light chains (Table 1) were transfected into suspension HEK293 cells using chemically defined media in the absence of serum to obtain antibodies. Five days after transfection, conditioned media were collected and clarified. Whole antibodies in conditioned media were purified using MabSelect SuRe Protein A media (GE Healthcare).

- 14 045813- 14 045813

Таблица 1Table 1

Антитела, продуцируемые в клетках HEK293 посредством временной трансфекции и очищенные с помощью IgG1Antibodies produced in HEK293 cells by transient transfection and purified with IgG1

Родительское Parental С созревшей аффинностью, панель 1 With Affinity Ripe, Panel 1 С созревшей аффинностью, панель 2 With Affinity Ripe, Panel 2 РР6226 - H4040+L4040 PP6226 - H4040+L4040 анти- CD24 anti- CD24 РР6228 - H4041+L4040 PP6228 - H4041+L4040 Р3050.Н1.А4 P3050.N1.A4 РР6368 - H4069+L4069 PP6368 - H4069+L4069 P3050.ComFl.All P3050.ComFl.All РР6230- H4042+L4040 PP6230- H4042+L4040 Р3050.Н2.А7 P3050.N2.A7 РР6369 - H4070+L4069 PP6369 - H4070+L4069 P3050.ComFl.H4 P3050.ComFl.H4 РР6231 - H4043+L4040 PP6231 - H4043+L4040 Р3050.Н2.В11 P3050.N2.B11 РР6370 - H4071+L4069 PP6370 - H4071+L4069 P3050.ComFl.2F4 P3050.ComFl.2F4 РР6232- H4040+L4041 PP6232- H4040+L4041 P3050.L3.B9 P3050.L3.B9 Р6371 - H4072+L4070 P6371 - H4072+L4070 P3050.ComFl.2F5 P3050.ComFl.2F5 РР6233- H4040+L4042 PP6233- H4040+L4042 P3050.L3.C7 P3050.L3.C7 РР6372 - H4073+L4071 PP6372 - H4073+L4071 P3050.ComFl.C9 P3050.ComFl.C9 РР6234- H4040+L4043 PP6234- H4040+L4043 P3050.L3.D8 P3050.L3.D8 РР6373 - H4069+L4071 PP6373 - H4069+L4071 P3050.ComFl.2Hl P3050.ComFl.2Hl РР6235- H4041+L4042 PP6235- H4041+L4042 P3050.H1.A4.L3.C7 P3050.H1.A4.L3.C7 РР6387 - H4071+L4071 PP6387 - H4071+L4071 P3050.ComF2.Bl P3050.ComF2.Bl РР6236- H4043+L4042 PP6236- H4043+L4042 P3050.H2.B11.L3.C7 P3050.H2.B11.L3.C7 РР6388- H4072+L4069 PP6388- H4072+L4069 P3050.ComF2.A5 P3050.ComF2.A5 Таблица: Список временной трансфекции и очистки, проведенной для получения IgG. Н40хх означает конструкцию тяжелой цепи, a L40xx - конструкцию легкой цепи. Р3050.хх обозначает исходный клон, полученный в результате пэннинга фага. Все IgG хорошо экспрессировались. Номера РР представляют собой серийные коды, используемые для различения продуцируемых белков. Table: List of transient transfections and purifications performed to obtain IgG. H40xx means heavy chain design and L40xx means light chain design. P3050.xx denotes the original clone obtained by phage panning. All IgGs were well expressed. PP numbers are serial codes used to distinguish the proteins produced.

Очищенные антитела с созревшей аффинностью и исходное антитело оценивали на их аффинность к антигену с помощью конкурентного ELISA. Антитело РР6226 (родительские вариабельные области 3В6) наносили на планшеты в концентрации 2 мкг/мл. Антитела с созревшей аффинностью сначала инкубировали с CD24-GST, затем инкубировали на планшете с последующей инкубацией антител для вторичной детекции. Как показано на фиг. 3-5, получено 16 антител с различной способностью конкурировать со своими родительскими клонами. Аминокислотные последовательности тяжелой и легкой цепей этих антител представляют собой SEQ ID NO: 3-10 (тяжелые цепи) и SEQ ID NO: 11-16 (легкие цепи). Чтобы определить, имеют ли клоны с созревшей аффинностью более сильное связывание с CD24, и регулируются ли взаимодействия гликаном, была произведена обработка CD24 либо N-гликаназой (NCD24), либо сиалидазой NanA (SA-CD24), либо обоими ферментами (N-SA-CD24). 16 клонов, описанных на фиг. 3-5, были протестированы с помощью ELISA. Как показано на фиг. 6, несмотря на значительную аффинность к CD24-GST, PP6231 и РР6230 не могут связываться с CD24, экспрессируемым клетками млекопитающих, независимо от гликозилирования. С другой стороны, большинство других клонов сохраняли преимущественное связывание с CD24, которые обрабатывались сиалидазой и/N-гликаназой. Тем не менее, поскольку относительное влияние сиалидазы и N-гликаназы на связывание антител значительно различается для разных клонов, каждый клон необходимо тестировать индивидуально, чтобы определить их чувствительность к гликановому экранированию.The purified affinity matured antibodies and the parent antibody were assessed for their affinity for the antigen using a competitive ELISA. Antibody PP6226 (parental variable regions 3B6) was applied to the plates at a concentration of 2 μg/ml. Affinity-matured antibodies were first incubated with CD24-GST, then plate incubated, followed by antibody incubation for secondary detection. As shown in FIG. 3-5, 16 antibodies were obtained with varying abilities to compete with their parental clones. The amino acid sequences of the heavy and light chains of these antibodies are SEQ ID NO: 3-10 (heavy chain) and SEQ ID NO: 11-16 (light chain). To determine whether affinity matured clones had stronger binding to CD24 and whether the interactions were glycan regulated, CD24 was treated with either N-glycanase (NCD24), NanA sialidase (SA-CD24), or both enzymes (N-SA- CD24). The 16 clones described in FIG. 3-5 were tested using ELISA. As shown in FIG. 6, despite significant affinity for CD24-GST, PP6231 and PP6230 cannot bind CD24 expressed by mammalian cells, regardless of glycosylation. On the other hand, most other clones retained preferential binding to CD24 that were treated with sialidase and/N-glycanase. However, because the relative influence of sialidase and N-glycanase on antibody binding varies significantly among clones, each clone must be tested individually to determine their sensitivity to glycan screening.

Было выбрано 6 клонов с сильным связыванием SA-N-CD24, но которые проявляют минимальное связывание с CD24, и они были протестированы на связывание с двумя линиями раковых клеток, линией клеток рака легкого Н727 и линией клеток нейробластомы IMR32. Как показано на фиг. 7, несмотря на сходство их связывания с SA-N-CD24, 6 клонов показали значительно различающееся связывание с раковыми клетками. Важно отметить, что РР6373 демонстрирует значительно более сильное связывание с обеими протестированными линиями раковых клеток. Поэтому этот клон выбран для дальнейшего изучения. Последовательность тяжелой цепи РР6373 указана в SEQ ID NO: 6, а последовательность легкой цепи указана в SEQ ID NO: 16. По сравнению с исходной последовательностью тяжелая цепь имеет три мутации в CDR2, тогда как легкая цепь имеет одну мутацию в CDR3 легкой цепи. Как показано на фиг. 8, эти мутации не только увеличивают связывание с SA-N-CD24 почти в 100 раз, но также делают взаимодействие более строго регулируемым посредством десиалилирования. Также следует отметить, что РР6373 приобрел способность связываться с CD24 даже без дегликозилирования на уровне 1/1000 от уровня SA-N-CD24. Однако, поскольку известно, что клетки СНО имеют неполное гликозилирование, вполне вероятно, что связывание отражает более высокую чувствительность антитела к обнаружению минорной гликоформы в рекомбинантном CD24, полученном из клеток СНО.Six clones with strong SA-N-CD24 binding but that exhibit minimal binding to CD24 were selected and tested for binding to two cancer cell lines, the lung cancer cell line H727 and the neuroblastoma cell line IMR32. As shown in FIG. 7, despite similarity in their binding to SA-N-CD24, 6 clones showed significantly different binding to cancer cells. Importantly, PP6373 exhibited significantly stronger binding to both cancer cell lines tested. Therefore, this clone was selected for further study. The heavy chain sequence of PP6373 is listed in SEQ ID NO: 6 and the light chain sequence is listed in SEQ ID NO: 16. Compared to the parent sequence, the heavy chain has three mutations in CDR2, while the light chain has one mutation in CDR3 of the light chain. As shown in FIG. 8, these mutations not only increase binding to SA-N-CD24 by nearly 100-fold, but also make the interaction more tightly regulated through desialylation. It is also noteworthy that PP6373 acquired the ability to bind to CD24 even without deglycosylation at a level of 1/1000 that of SA-N-CD24. However, since CHO cells are known to be incompletely glycosylated, it is likely that binding reflects greater sensitivity of the antibody to detect the minor glycoform in recombinant CD24 derived from CHO cells.

Пример 3. Антигенный эпитоп, распознаваемый 3В6 и РР6373.Example 3. Antigenic epitope recognized by 3B6 and PP6373.

Чтобы определить антигенный эпитоп, распознаваемый 3В6, и клон РР6373 с созревшей аффинноTo determine the antigenic epitope recognized by 3B6 and the affinity matured clone PP6373

- 15 045813 стью, были синтезированы перекрывающиеся пептиды, покрывающие зрелую аминокислотную последовательность CD24 (SEQ ID NO: 42), и предварительно инкубировали их с антителом 3В6 перед добавлением 3В6 на планшеты, предварительно покрытые белком NO' CD24 (CD24Fc, предварительно обработанный последовательно N-гликозидазой, NanA и О-гликозидазой). Как показано на фиг. 9, из 5 протестированных пептидов (SEQ ID NO: 43-47) только пептид 4 (SEQ ID NO: 46) демонстрирует значительное блокирование взаимодействия 3B6-CD24, что позволяет предположить, что эпитоп, связывающий CD24, заключен в этой последовательности. Чтобы подтвердить, что РР6373 распознает один и тот же эпитоп, титровали пять пептидов в большом диапазоне доз. Как показано на фиг. 10, только пептид 4 показал дозозависимое ингибирование связывания РР6373 с SA-N-CD24.- 15 045813, overlapping peptides covering the mature amino acid sequence of CD24 (SEQ ID NO: 42) were synthesized and pre-incubated with the 3B6 antibody before adding 3B6 to plates pre-coated with NO' CD24 protein (CD24Fc, pre-treated sequentially with N- glycosidase, NanA and O-glycosidase). As shown in FIG. 9, of the 5 peptides tested (SEQ ID NO: 43-47), only peptide 4 (SEQ ID NO: 46) showed significant blocking of the 3B6-CD24 interaction, suggesting that the CD24 binding epitope is contained within this sequence. To confirm that PP6373 recognizes the same epitope, five peptides were titrated over a wide range of doses. As shown in FIG. 10, only peptide 4 showed dose-dependent inhibition of PP6373 binding to SA-N-CD24.

Чтобы определить минимальный сайт связывания РР6373, проводили усекание пептида 4 по одной аминокислоте за раз и сравнивали его ингибирование связывания РР6373 с SA-N-CD24. Как показано на фиг. 11, в то время как делеция 3 аминокислот с С-конца устраняет ингибирование, делеция одной или двух аминокислот значительно улучшает ингибирование (левая панель). Кроме того, удаление любой аминокислоты с N-конца пептида 4 также устраняет ингибирование (правая панель). Эти данные идентифицируют SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48) как оптимальный эпитоп, распознаваемый РР6373. Произведенная идентификация антигенного эпитопа позволяет генерировать дополнительные антитела с аналогичными свойствами. В одном варианте осуществления можно генерировать новые антитела, используя синтетический пептид, содержащий последовательность SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48). Пептид может быть связан с другим иммуногенным белком-носителем или использоваться вместе с адъювантами. В другом варианте осуществления пептид можно использовать для идентификации других анти-CD24 mAb, которые распознают тот же эпитоп, для генерации ракоспецифичных антител для диагностики и лечения рака. В еще одном варианте осуществления антигенный пептид можно использовать для нейтрализации или ингибирования потенциальных неблагоприятных эффектов, связанных с антителами, которые связываются с эпитопами, содержащими коровую последовательность SEQ ID NO: 48. Пептид может быть модифицирован для лучшей стабильности при применении in vivo с использованием способов известных в данной области, включая, но не ограничиваясь этим, использование D-аминокислот, замену О на S в одной или нескольких пептидных связях, добавление последовательности слияния для улучшения растворимости или периода полужизни (например, слияния альбумина). В еще одном варианте осуществления молекула, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48, может быть использована в качестве вакцины для лечения и профилактики рака.To determine the minimal binding site of PP6373, peptide 4 was trimmed one amino acid at a time and its inhibition of PP6373 binding to SA-N-CD24 was compared. As shown in FIG. 11, while deletion of 3 amino acids from the C-terminus eliminates inhibition, deletion of one or two amino acids significantly improves inhibition (left panel). In addition, deletion of any amino acid from the N-terminus of peptide 4 also abolished inhibition (right panel). These data identify SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48) as the optimal epitope recognized by PP6373. The identification of the antigenic epitope allows the generation of additional antibodies with similar properties. In one embodiment, new antibodies can be generated using a synthetic peptide containing the sequence SNSGLAPN (SEQ ID NO: 48). The peptide may be linked to another immunogenic carrier protein or used in conjunction with adjuvants. In another embodiment, the peptide can be used to identify other anti-CD24 mAbs that recognize the same epitope to generate cancer-specific antibodies for the diagnosis and treatment of cancer. In yet another embodiment, the antigenic peptide can be used to neutralize or inhibit potential adverse effects associated with antibodies that bind to epitopes containing the core sequence of SEQ ID NO: 48. The peptide can be modified for better stability when used in vivo using methods known in the art. in the art, including, but not limited to, the use of D-amino acids, replacement of O with S in one or more peptide bonds, addition of a fusion sequence to improve solubility or half-life (eg, albumin fusion). In yet another embodiment, a molecule comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48 can be used as a vaccine for the treatment and prevention of cancer.

Пример 4. Экспрессия антигенного эпитопа в нормальных тканях по сравнению со злокачественными.Example 4 Antigenic Epitope Expression in Normal versus Malignant Tissues.

Чтобы определить, представлен ли эпитоп, распознаваемый РР6373, преимущественно в раковых тканях по сравнению с нормальными тканями, было проанализировано связывание тканей с помощью иммунофлуоресценции с использованием биотинилированного РР6373. Данные о нормальных тканях обобщены в табл. 2, а данные о раковых тканях - в табл. 3. Кроме того, было оценено связывание антитела с нормальным доброкачественным и злокачественным раком головного мозга. Данные представлены в табл. 4.To determine whether the epitope recognized by PP6373 is presented preferentially in cancer tissues compared to normal tissues, tissue binding was analyzed by immunofluorescence using biotinylated PP6373. Data on normal tissues are summarized in Table. 2, and data on cancer tissues are in table. 3. In addition, the binding of the antibody to normal benign and malignant brain cancer was assessed. The data is presented in table. 4.

Таблица 2 Иммунофлуоресцентное окрашивание РР6373 показало минимальное связывание с нормальными тканямиTable 2 Immunofluorescent staining of PP6373 showed minimal binding to normal tissues

Орган Organ +/- +/- Паттерн окрашивания Staining pattern Нормальный желудок Normal stomach - - Нормальная двенадцатиперстная кишка Normal duodenum - - Нормальный тонкий кишечник Normal small intestine - - Нормальная толстая кишка Normal colon - - Нормальная околоушная слюнная железа Normal parotid salivary gland - - Нормальная щитовидная железа Normal thyroid gland - - Нормальная поджелудочная железа Normal pancreas + + Слабо - клеточная поверхность, внутриклеточное? Weakly - cell surface, intracellular? Нормальная простата Normal prostate - - Нормальная аорта Normal aorta - - Нормальное яичко Normal testicle - - Нормальный большой сальник Normal greater omentum - -

- 16 045813- 16 045813

Нормальная молочная железа Normal mammary gland - - Нормальный лимфатический узел Normal lymph node - - Нормальная кожа Normal skin - - Нормальный продолговатый мозг Normal medulla oblongata Нормальная селезенка Normal spleen - - Мало положительных, клеточная поверхность? Few positive, cell surface? Нормальная матка Normal uterus - - Нормальное влагалище Normal vagina - - Нормальный мочевой пузырь Normal bladder - - Нормальный нерв Normal nerve - -

Таблица 3Table 3

Реактивность РР6373 к злокачественным тканямReactivity of PP6373 to malignant tissues

Орган Organ Процент положительных Percent positive Паттерн окрашивания Staining pattern Злокачественная толстая кишка Malignant colon 0/1 0/1 Злокачественный пищевод Malignant esophagus 0/1 0/1 Злокачественный желудок Malignant stomach 0/2 0/2 Злокачественный яичник Malignant ovary 16/25 16/25 поверхность клетки cell surface Злокачественные мягкие ткани Malignant soft tissue 0/1 0/1 Злокачественная почка Malignant kidney 1/1 1/1 поверхность слабо surface weak Злокачественная печень Malignant liver 14/19 14/19 поверхность клетки cell surface Злокачественная молочная железа Malignant mammary gland 12/20 12/20 поверхность клетки cell surface Злокачественная кожа Malignant skin 1/1 1/1 поверхность клетки cell surface Злокачественное яичко Malignant testicle 1/1 1/1 внутриклеточное/клеточная поверхность intracellular/cell surface Злокачественное легкое Malignant lung 11/39 11/39 поверхность клетки cell surface

Таблица 4Table 4

Связывание РР6373 с нормальными доброкачественными и злокачественными опухолями головного мозгаBinding of PP6373 to normal benign and malignant brain tumors

Патология Pathology поверхность клетки cell surface внутри клетки inside the cell отрицательно negative Астроцитома Astrocytoma 2/24 (8%) 2/24 (8%) 17/24 (71%) 17/24 (71%) 5/24 (21%) 5/24 (21%) Глиобластома Glioblastoma 3/8 (38%) 3/8 (38%) 2/8 (25%) 2/8 (25%) 5/8 (37%) 5/8 (37%) Олигодендроглиома Oligodendroglioma 4/8 (50%) 4/8 (50%) 3/8 (38%) 3/8 (38%) 1/8 (12%) 1/8 (12%) Эпендимома Ependymoma 5/8 (63%) 5/8 (63%) 0/8 (0%) 0/8 (0%) 3/8 (37%) 3/8 (37%) Медуллобластома Medulloblastoma 7/10 (70%) 7/10 (70%) 0/10(0%) 0/10(0%) 3/10(30%) 3/10(30%) Доброкачественная менингиома Benign meningioma 0/22 (0%) 0/22 (0%) 15/22 (68%) 15/22 (68%) 7/22 (32%) 7/22 (32%) Нормальная ткань ЦНС Normal CNS tissue 0/16(0%) 0/16(0%) 0/16(0%) 0/16(0%) 16/16(100%) 16/16(100%)

Как показано в табл. 2, за исключением поджелудочной железы и, возможно, селезенки, РР6373 не окрашивал нормальные ткани. Следует отметить, что большая часть окрашивания поджелудочной железы является внутриклеточной. В селезенке окрашивание клеток было редким. Напротив, как показано в табл. 3, большинство протестированных видов рака демонстрируют сильное связывание с РР6373. Как показано в табл. 4, в то время как нормальные ткани ЦНС лишены CD24, доброкачественная менингиома проявляет внутриклеточное окрашивание, но не проявляет окрашивание поверхности клетки. Важно отметить, что злокачественные опухоли головного мозга, включая астроцитому, глиобластому и олигодендроглиому, демонстрируют окрашивание клеточной поверхности в количестве 8-70%, кроме того, некоторые раковые ткани обнаруживают внутриклеточное окрашивание.As shown in table. 2, with the exception of the pancreas and possibly the spleen, PP6373 did not stain normal tissue. It should be noted that most staining in the pancreas is intracellular. In the spleen, cell staining was rare. On the contrary, as shown in table. 3, most cancers tested showed strong binding to PP6373. As shown in table. 4, while normal CNS tissues lack CD24, benign meningioma exhibits intracellular staining but does not exhibit cell surface staining. It is important to note that malignant brain tumors, including astrocytoma, glioblastoma, and oligodendroglioma, exhibit 8–70% cell surface staining, and some cancer tissues exhibit intracellular staining.

В одном из вариантов реализации РР6373 можно использовать для различения злокачественной опухоли мозга от нормальной или доброкачественной ткани мозга. В другом варианте реализации РР6367 можно использовать для идентификации раковых тканей в плотных органах, таких как печень, легкие, молочные железы и яичники.In one embodiment, PP6373 can be used to distinguish a malignant brain tumor from normal or benign brain tissue. In another embodiment, PP6367 can be used to identify cancerous tissue in solid organs such as liver, lung, breast and ovary.

Пример 5. РР6373 замедляет рост рака легких in vivo.Example 5 PP6373 slows the growth of lung cancer in vivo.

Чтобы проверить, может ли РР6373 замедлять рост опухоли in vivo, голых мышей заражали клеточной линией рака легких человека Н727 подкожно. После того, как опухоль стала пальпироваться, мышам, несущим опухоль, сделали две инъекции РР6373 в дозе 5 мг/кг (14 и 21 день после инокуляции Н727). Как показано на фиг. 12, по сравнению с контролем IgG, опухоль, обработанная РР6373, росла значительно медленнее. Эти данные демонстрируют, что немодифицированный РР6373 способен проявлять противоопухолевую активность in vivo.To test whether PP6373 could slow tumor growth in vivo, nude mice were infected with the human lung cancer cell line H727 subcutaneously. Once the tumor became palpable, tumor-bearing mice received two injections of PP6373 at a dose of 5 mg/kg (14 and 21 days after H727 inoculation). As shown in FIG. 12, compared with the IgG control, the tumor treated with PP6373 grew significantly more slowly. These data demonstrate that unmodified PP6373 is capable of exerting antitumor activity in vivo.

В соответствии с задержкой развития опухоли in vivo, исследования in vitro демонстрируют, чтоConsistent with the delay in tumor development in vivo, in vitro studies demonstrate that

- 17 045813- 17 045813

РР6367 опосредует сильную антителозависимую клеточную цитотоксичность, как показано на фиг. 13.PP6367 mediates potent antibody-dependent cellular cytotoxicity as shown in FIG. 13.

Поскольку на ADCC влияет гликозилирование, особенно фукозилирование, был использован инжиниринг антител для получения РР6373 без фукозилирования ядра FC (d6373). Как показано на фиг. 14, фукозилирование увеличивает ADCC-активность РР6373. Представленные данные показывают, что РР6373 можно использовать для лечения рака. В одном варианте осуществления РР6373 WT IgG1 можно использовать в качестве терапевтических антител против рака для введения больным раком. В другом варианте осуществления антитело может быть получено гликоинженерией либо химически, либо продуцировано в клеточной линии, лишенной фукозилтрансферазы.Because ADCC is affected by glycosylation, especially fucosylation, antibody engineering was used to generate PP6373 without fucosylation of the FC core (d6373). As shown in FIG. 14, fucosylation increases the ADCC activity of PP6373. The data presented show that PP6373 can be used to treat cancer. In one embodiment, PP6373 WT IgG1 can be used as therapeutic antibodies against cancer for administration to cancer patients. In another embodiment, the antibody can be glycoengineered either chemically or produced in a cell line lacking fucosyltransferase.

Пример 6. Биспецифические антитела на основе последовательности РР6373 и OKT3.Example 6. Bispecific antibodies based on the sequence of PP6373 and OKT3.

Для применения анти-CD24 антитела были получены биспецифические антитела, которые связывают как CD24, так и CD3. В одном варианте осуществления анти-CD24 и анти-CD3 (OKT3) антитела превращают в одноцепочечные антитела с реактивностью к CD24 и CD3, соответственно, и связывают гибкой линкерной последовательностью GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 49). Последовательность одноцепочечного антитела РР6373 указана в SEQ ID NO: 17, а одноцепочечная последовательность OKT3 указана как SEQ ID NO: 18.For the use of anti-CD24 antibodies, bispecific antibodies have been produced that bind both CD24 and CD3. In one embodiment, anti-CD24 and anti-CD3 (OKT3) antibodies are converted to single-chain antibodies with reactivity to CD24 and CD3, respectively, and linked by the flexible linker sequence GGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 49). The sequence of the single chain antibody PP6373 is shown in SEQ ID NO: 17, and the single chain sequence of OKT3 is shown in SEQ ID NO: 18.

В одном варианте осуществления биспецифическое антитело создают с помощью технологии выступа и впадины, в которых два партнера биспецифической молекулы имеют комплементарные мутации в области Fc для создания выступа и впадин для облегчения образования биспецифических гетеродимеров. Последовательности вариантов выступов и впадин РР6373 и OKT3 перечислены в SEQ ID NO: 1922. Чтобы оценить биспецифичность различных конфигураций выступов и впадин, был разработан анализ, состоящий из окрашивания клеток Jurkat продуктом котрансфекции различных продуктов, полученных с технологией выступа-впадины. Вкратце, клетки CD3+ Jurkat сначала окрашивали супернатантами тканевых культур из трансфицированных клеток 293Т. После смывания несвязавшихся антител клетки инкубировали с биотинилированным SA-N-CD24. Количество SA-N-CD24 на клетках Jurkat определяли с помощью РЕ-стрептавидина. Как показано на фиг. 15, комбинация РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ дает наивысшее связывание CD24 с клетками Jurkat, что указывает на то, что пара РР6373-впадина и ОКТЗ-выступ является наиболее подходящей для стратегии выступ-впадина.In one embodiment, a bispecific antibody is created using knob and trench technology, in which two partners of the bispecific molecule have complementary mutations in the Fc region to create a knob and trench to facilitate the formation of bispecific heterodimers. The sequences of the PP6373 and OKT3 knob and valley variants are listed in SEQ ID NO: 1922. To evaluate the bispecificity of the various knob and valley configurations, an assay was developed consisting of staining Jurkat cells with the cotransfection product of various products produced by the knob-valley technology. Briefly, CD3+ Jurkat cells were first stained with tissue culture supernatants from transfected 293T cells. After washing away unbound antibodies, cells were incubated with biotinylated SA-N-CD24. The amount of SA-N-CD24 on Jurkat cells was determined using PE-streptavidin. As shown in FIG. 15, the combination of PP6373-groove and OKTZ-overhang results in the highest CD24 binding to Jurkat cells, indicating that the pair of PP6373-groove and OKTZ-overhang is the most suitable for the protrusion-tooth strategy.

В другом варианте осуществления биспецифическое антитело создают посредством тандемного повтора двух одноцепочечных связывающих мотивов. И в этот раз тоже сравнили активность двух конфигураций с разными связывающими мотивами в противоположных порядках, РР6373-ОКТ3 и OKT3РР6373, как указано в SEQ ID NO: 23 и 24, соответственно. Как показано на фиг. 16, конструкция с одной цепью РР6373 на N-конце (РР6З7З-ОКТЗ; SEQ ID NO: 23) показывает более высокую биспецифическую активность. Чтобы определить, обладает ли биспецифическое антитело противоопухолевой активностью, совместно инкубировали линию клеток рака легкого Н727 с Т-клетками, которые были активированы с помощью анти-CD3 и анти-CD28 в течение 2 дней. Сначала проверили, может ли раковая клетка специфично запускать выработку цитокинов. Как показано на фиг. 17, значимые цитокины индуцируются биспецифическим антителом, но не OKT3-Fc PP6373-Fc. Что важнее, биспецифическое антитело не индуцирует продукцию цитокинов, если и Т-клетки, и опухолевые клетки не присутствуют вместе. Эти данные демонстрируют, что биспецифические антитела запускают активацию Т-клеток, задействуя как Т-клетки, так и опухолевые клетки.In another embodiment, a bispecific antibody is generated through a tandem repeat of two single chain binding motifs. And this time we also compared the activity of two configurations with different binding motifs in opposite orders, PP6373-OKT3 and OKT3PP6373, as indicated in SEQ ID NO: 23 and 24, respectively. As shown in FIG. 16, a design with a single chain of PP6373 at the N-terminus (PP6373-OCT3; SEQ ID NO: 23) shows higher bispecific activity. To determine whether the bispecific antibody had antitumor activity, the lung cancer cell line H727 was co-incubated with T cells that had been activated with anti-CD3 and anti-CD28 for 2 days. First, they tested whether a cancer cell could specifically trigger the production of cytokines. As shown in FIG. 17, significant cytokines were induced by the bispecific antibody, but not by OKT3-Fc PP6373-Fc. More importantly, the bispecific antibody does not induce cytokine production unless both T cells and tumor cells are present together. These data demonstrate that bispecific antibodies trigger T cell activation, involving both T cells and tumor cells.

Одновременно с анализом высвобождения цитокинов также оценили цитотоксичность опухолевых клеток с помощью основанного на микрочастицах подсчета количества живых опухолевых клеток, меченных красителем, методом проточной цитометрии. Как показано на фиг. 18, биспецифические антитела вызывают потерю опухолевых клеток, если и только если присутствуют Т-клетки.Simultaneously with the cytokine release assay, tumor cell cytotoxicity was also assessed using microparticle-based dye-labeled live tumor cell counting by flow cytometry. As shown in FIG. 18, bispecific antibodies cause tumor cell loss if and only if T cells are present.

В еще одном варианте биспецифическое антитело может быть получено с помощью технологии FIT-Ig. Вкратце, биспецифическое антитело образуется совместной экспрессией трех конструкций, кодирующих VL6373-CL-VHokt3-CH1-FC (SEQ ID NO: 25), VH6373-CH1 (SEQ ID NO: 26) и VLokt3-CL (SEQ ID NO: 27), соответственно. Как показано на фиг. 19, FIT-Ig-антитело показало хорошие активности биспецифического связывания как для OKT3, так и для SA-N-CD24. В дополнение к связыванию также было обнаружено, что это биспецифическое антитело вызывает значительный цитокиновый ответ (фиг. 20) и цитотоксичность по отношению к опухолевым клеткам (фиг. 21). Кроме того, это биспецифическое антитело (FIT-Ig) показало более высокую термостабильность по сравнению с предыдущими биспецифическими антителами РР6373-ОКТ3 и ОКТ3-РР6373 (фиг. 22).In yet another embodiment, the bispecific antibody can be produced using FIT-Ig technology. Briefly, a bispecific antibody is generated by coexpression of three constructs encoding VL6373-CL-VHokt3-CH1-FC (SEQ ID NO: 25), VH6373-CH1 (SEQ ID NO: 26) and VLokt3-CL (SEQ ID NO: 27), respectively. As shown in FIG. 19, FIT-Ig antibody showed good bispecific binding activities for both OKT3 and SA-N-CD24. In addition to binding, this bispecific antibody was also found to induce significant cytokine response (FIG. 20) and cytotoxicity toward tumor cells (FIG. 21). In addition, this bispecific antibody (FIT-Ig) showed higher thermostability compared to the previous bispecific antibodies PP6373-OCT3 and OKT3-PP6373 (Fig. 22).

Пример 7. Применение РР6373 в Т-клетках, модифицированных химерным рецептором антигена (CAR) (CAR-Т), для лечения рака.Example 7 Use of PP6373 in chimeric antigen receptor (CAR) modified T cells (CAR-T) for the treatment of cancer.

Ahtu-CD24 антитела реагируют с широким спектром раковых клеток и могут быть использованы для получения химерного рецептора антигена, который придает противораковую активность Т-клеткам. В одном варианте осуществления одноцепочечная последовательность Fv PP6373 (SEQ ID NO: 28) или другое одноцепочечное анти-CD24 mAb (alphaCD24SC) вставляют в вектор CAR-Т, известный в данной области, как показано на фиг. 23. Конструкцию затем вставляют в генные векторы, известные в данной области, включая векторы, полученные из ретровируса, лентивируса, аденоассоциированного вируса или аденовирусных векторов.Ahtu-CD24 antibodies react with a wide range of cancer cells and can be used to produce a chimeric antigen receptor that imparts anticancer activity to T cells. In one embodiment, a single chain Fv sequence of PP6373 (SEQ ID NO: 28) or another single chain anti-CD24 mAb (alphaCD24SC) is inserted into a CAR-T vector known in the art, as shown in FIG. 23. The construct is then inserted into gene vectors known in the art, including vectors derived from retrovirus, lentivirus, adeno-associated virus, or adenoviral vectors.

- 18 045813- 18 045813

Чтобы проверить активность CAR, РВМС от здорового донора были обогащены Т-клетками с использованием набора для выделения пан-Т-клеток человека (Miltenyl Biotec) (сутки 0). Пан-Т-клетки человека стимулировали с помощью анти-CD3 и анти-CD28 в течение 24 ч и культивировали с IL-2 в течение 2 суток. Активированные Т-клетки подвергали ложной обработке (контроль Т) или инфицировали лентивирусом, несущим CD24-CAR (сутки 2). Для тестирования противоопухолевой активности CAR-T контрольные Т-клетки или CD24 CAR-T-клетки культивировали совместно с опухолевыми клетками, меченными CellTrace Violet (Thermo Fisher), в течение ночи. Лизис опухолевых клеток измеряли окрашиванием Fixable Viability Dye eFluor™ 660 (eBioscience) и рассчитывали по формуле:To test CAR activity, PBMCs from a healthy donor were enriched for T cells using a human pan-T cell isolation kit (Miltenyl Biotec) (day 0). Human pan T cells were stimulated with anti-CD3 and anti-CD28 for 24 h and cultured with IL-2 for 2 days. Activated T cells were mock treated (control T) or infected with lentivirus carrying CD24-CAR (day 2). To test CAR-T antitumor activity, control T cells or CD24 CAR-T cells were cocultured with CellTrace Violet-labeled tumor cells (Thermo Fisher) overnight. Tumor cell lysis was measured by Fixable Viability Dye eFluor™ 660 staining (eBioscience) and calculated using the formula:

Лизис% = (мертвые% - автолиз%)/(1-автолиз%).Lysis% = (dead% - autolysis%)/(1-autolysis%).

Как показано на фиг. 24, в широком диапазоне соотношения эффектор/мишень (Е/Т) CD24 CAR-T проявляет сильную цитотоксичность по сравнению с линией клеток рака легкого А549.As shown in FIG. 24, over a wide range of effector/target (E/T) ratios, CD24 CAR-T exhibits potent cytotoxicity compared with the A549 lung cancer cell line.

Чтобы проверить, активируется ли CAR-T раковыми клетками, инкубировали 4х104 CAR-T или контрольные Т-клетки с опухолевыми клетками А549 в течение ночи и измерили IFNy в супернатантах. Как показано на фиг. 25, CAR-T, но не контрольные Т-клетки, продуцировали IFNy в ответ на стимуляцию опухолевыми клетками А549.To test whether CAR-T is activated by cancer cells, 4x10 4 CAR-T or control T cells were incubated with A549 tumor cells overnight and IFNy was measured in the supernatants. As shown in FIG. 25, CAR-T, but not control T cells, produced IFNy in response to stimulation by A549 tumor cells.

Поскольку CD24 широко экспрессируется среди множества типов рака. Как показано на фиг. 26, CD24 CAR-T проявляет широкую цитотоксичность в отношении многих типов рака, включая рак легкого, рак молочной железы, рак простаты, рак шейки матки, нейробластому и глиому.Because CD24 is widely expressed among many cancer types. As shown in FIG. 26, CD24 CAR-T exhibits broad cytotoxicity against many types of cancer, including lung cancer, breast cancer, prostate cancer, cervical cancer, neuroblastoma, and glioma.

В совокупности, представленные данные демонстрируют, что CD24 CAR-T на основе раскрытого в данном документе антитела имеет большой потенциал в лечении рака. Типы рака, на которые можно воздействовать, включают, помимо прочего, опухоли головного мозга, рак головы и шеи, саркому, рак легкого, рак желудочно-кишечного тракта, рак молочной железы, рак яичка, рак простаты, рак поджелудочной железы, рак печени или гематологические злокачественные новообразования.Taken together, the data presented demonstrate that CD24 CAR-T based on the antibody disclosed herein has great potential in the treatment of cancer. Types of cancer that can be targeted include, but are not limited to, brain tumors, head and neck cancer, sarcoma, lung cancer, gastrointestinal cancer, breast cancer, testicular cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, liver cancer or hematological malignancies.

Пример 8. Гуманизация РР6373 для лечения рака.Example 8: Humanization of PP6373 for the treatment of cancer.

Модель гомологии Fv PP6373 была построена с использованием структуры pdb 4PB0 в качестве модельной структуры. И VH, и VL имеют более 90 % гомологии с таковыми у 4РВ0. При запросе базы данных человеческого Ig, последовательность V-области человеческой зародышевой линии IGHV3-73*01 и последовательность J-области IGHJ4*01 были идентифицированы как подходящие структуры и использовались как человеческая акцепторная каркасная область для CDR-областей тяжелой цепи (Onc-1 VH). V-область человеческой зародышевой линии IGKV2-29*02 и последовательность J-области IGKJ4*01 применяли в качестве человеческого акцепторного каркаса для CDR-областей легкой цепи (Onc-1 VL). Были сконструированы четыре последовательности VH и четыре последовательности VL (SEQ ID NO: 29-36). Новые продукты улучшают показатели гуманизации с 73 % до более 83 % в VH и с 80 % до более 83 % в VL. Структурное выравнивание мышиного Fv PP6373 и Fv гуманизированной версии РР6373 (huVHv1VLv1; SEQ ID NO: 29 и 33) продемонстрировало высокую степень сходства (фиг. 27). Чтобы выбрать лучшую рабочую комбинацию HuVH и HuVL для связывания CD24, различные комбинации подвергали совместной трансфекции в клетки 293 в течение 72 ч. Затем проводили два ELISA с экспрессионной средой. ELISA 1: 96-луночный планшет покрывали очищенным козьим античеловеческим поликлональным IgG (GAH) и после блокирования добавляли экспрессионную среду или очищенные контрольные IgG, и использовали козье античеловеческое антитело IgG-HRP в качестве детектирующего антитела. ELISA 2: 96-луночный планшет покрывали белком CD24-GST и после блокирования добавляли экспрессионную среду или очищенные контрольные IgG, и в качестве детектирующего антитела использовали козий античеловеческий IgG-HRP. Если рассматривать связывание химерного антитела РР6373 как 100% в обоих ELISA, различные комбинации VH и VL, проявляющие разную степень связывания, будут сравниваться с таковыми химерного антитела и ранжироваться по относительному связыванию (кандидаты, выбранные после предварительного скрининга, будут сравниваться еще раз после очистки). Данные первого раунда предварительного скрининга суммированы на фиг. 28, и данные этого эксперимента свидетельствуют о том, что: a) L3 показал высокую связывающую способность на единицу белка, что сделало L3 кандидатом; и b) H1L3 (SEQ ID NO: 29 и 35), H2L3 (SEQ ID NO: 30 и 35), H3L3 (SEQ ID NO: 31 и 35) и H4L3 (SEQ ID nO: 32 и 35) -четыре кандидата гуманизации для РР6373.A homology model of Fv PP6373 was constructed using the pdb structure of 4PB0 as a model structure. Both VH and VL share more than 90% homology with those of 4PB0. When querying the human Ig database, the human germline V region sequence of IGHV3-73*01 and the J region sequence of IGHJ4*01 were identified as suitable structures and used as the human acceptor framework for the heavy chain CDR regions (Onc-1 VH ). The human germline V region IGKV2-29*02 and the J region sequence IGKJ4*01 were used as the human acceptor framework for the light chain CDR regions (Onc-1 VL). Four VH sequences and four VL sequences were designed (SEQ ID NO: 29-36). New products improve humanization rates from 73% to over 83% in VH and from 80% to over 83% in VL. The structural alignment of mouse Fv PP6373 and the humanized version of PP6373 Fv (huVHv1VLv1; SEQ ID NOs: 29 and 33) demonstrated a high degree of similarity (Fig. 27). To select the best working combination of HuVH and HuVL for CD24 binding, different combinations were co-transfected into 293 cells for 72 hours. Two ELISAs were then performed with expression medium. ELISA 1: A 96-well plate was coated with purified goat anti-human polyclonal IgG (GAH) and after blocking, expression medium or purified control IgG was added and goat anti-human IgG-HRP antibody was used as the detection antibody. ELISA 2: A 96-well plate was coated with CD24-GST protein and after blocking, expression medium or purified control IgG was added and goat anti-human IgG-HRP was used as the detection antibody. If binding of the chimeric antibody PP6373 is considered to be 100% in both ELISAs, different combinations of VH and VL exhibiting different degrees of binding will be compared with those of the chimeric antibody and ranked by relative binding (candidates selected after pre-screening will be compared again after purification) . Data from the first round of prescreening are summarized in FIG. 28, and the data from this experiment suggest that: a) L3 showed high binding capacity per unit protein, making L3 a candidate; and b) H1L3 (SEQ ID NOs: 29 and 35), H2L3 (SEQ ID NOs: 30 and 35), H3L3 (SEQ ID NOs: 31 and 35) and H4L3 (SEQ ID nos: 32 and 35) - four humanization candidates for PP6373.

Чтобы проверить, сохраняют ли антитела-кандидаты H2L3 и H3L3 свою способность связывать опухолевые клетки, биотинилировали гуманизированные антитела наряду с РР6373. Как показано на фиг. 29, хотя РР6373 имел лучшее связывание с двумя протестированными раковыми клетками человека, как H2L3, так и H3L3 демонстрируют сильное связывание в наномолярном диапазоне IC50.To test whether the H2L3 and H3L3 antibody candidates retained their ability to bind tumor cells, the humanized antibodies were biotinylated along with PP6373. As shown in FIG. 29, although PP6373 had the best binding to the two human cancer cells tested, both H2L3 and H3L3 exhibited strong binding in the nanomolar IC50 range.

Проводили анализы ADCC с использованием либо PBL (фиг. 30, 31) или очищенных NK-клеток (фиг. 32) из PBL в качестве эффекторов и клеток А549 в качестве клеток-мишеней. Удивительно, что хотя H2L3 и H3L3 хуже связываются с опухолевыми клетками (фиг. 29), они являются более мощными эффекторами в ADCC при использовании низкой концентрации антител (фиг. 30). Как и ожидалось, дефукозилированный РР6373 (d6373) более активен в ADCC (фиг. 31, 32).ADCC assays were performed using either PBL (FIG. 30, 31) or purified NK cells (FIG. 32) from PBL as effectors and A549 cells as target cells. Surprisingly, although H2L3 and H3L3 bind poorly to tumor cells (Fig. 29), they are more potent effectors in ADCC when using low concentrations of antibodies (Fig. 30). As expected, defucosylated PP6373 (d6373) is more active in ADCC (Figs. 31, 32).

В совокупности, представленные здесь данные продемонстрировали, что гуманизированные клоны РР6373 проявляют значительное связывание с раковыми клетками человека и неожиданно высокую акTaken together, the data presented here demonstrate that humanized PP6373 clones exhibit significant binding to human cancer cells and an unexpectedly high a.c.

--

Claims (13)

тивность ADCC. В одном варианте осуществления антитела можно использовать для лечения рака. В другом варианте гуманизированное антитело можно использовать в качестве ключевого компонента биспецифического антитела. Чтобы исследовать эту активность, создали две конструкции, содержащие Н3 и L3, для получения биспецифических антител на основе технологии FIT-Ig. Последовательности гуманизированных FIT-Ig-антител перечислены в SEQ ID NO: 37 и 38 и используются вместе с SEQ ID NO: 27. Кроме того, также внесли некоторые мутации для оптимизации гуманизированных последовательностей FIT-Ig, и они были перечислены в SEQ ID NO: 39-41. В частности: все три последовательности содержат сигнальную последовательность на N-конце для очистки и синтеза белка; в SEQ ID NO: 39: мутация (замена D на А) была введена в область Fc для предотвращения ADCC; в SEQ ID NO: 27 есть один дополнительный остаток R между VLOKT3 и CL, появление которого было вызвано сайтом для рестриктазы во время конструирования, а в SEQ ID NO: 41 лишний остаток R был удален.activity of ADCC. In one embodiment, the antibodies can be used to treat cancer. In another embodiment, the humanized antibody can be used as a key component of a bispecific antibody. To investigate this activity, two constructs containing H3 and L3 were generated to generate bispecific antibodies based on FIT-Ig technology. The sequences of the humanized FIT-Ig antibodies are listed in SEQ ID NO: 37 and 38 and are used in conjunction with SEQ ID NO: 27. In addition, some mutations were also introduced to optimize the humanized FIT-Ig sequences and they were listed in SEQ ID NO: 39-41. Specifically: all three sequences contain a signal sequence at the N-terminus for protein purification and synthesis; in SEQ ID NO: 39: a mutation (D to A substitution) was introduced into the Fc region to prevent ADCC; in SEQ ID NO: 27 there is one additional R residue between VLOKT3 and CL, which was caused by the restriction enzyme site during construction, and in SEQ ID NO: 41 the extra R residue was removed. В еще одном варианте осуществления гуманизированные антитела можно использовать в качестве ключевого компонента CAR-T для терапии рака с применением способов, известных в данной области.In yet another embodiment, humanized antibodies can be used as a key component of CAR-T for cancer therapy using methods known in the art. Пример 9. Ahtu-CD24 антитела, связывающие экранируемые гликаном эпитопы, не связываются с нормальными клетками с высокой экспрессией CD24.Example 9: Ahtu-CD24 antibodies that bind glycan-screened epitopes do not bind to normal cells with high CD24 expression. Ключевым требованием иммунотерапии на основе антител является минимальная реактивность в нормальных тканях. Поскольку CD24 обильно экспрессируется на гемопоэтических клетках, особенно гранулоцитах, В-клетках, части эритроцитов и части моноцитов, сравнили РР6373 и два его гуманизированных клона, H2L3 и H3L3, с обычными анти-CD24 mAb, ML5. Как показано на фиг. 33, в то время как ML5 демонстрирует сильное связывание с клетками, которые обычно экспрессируют высокие уровни CD24, H2L3 и H3L3 не связываются с В-клетками и эритроцитами и плохо связываются с гранулоцитами. Этот результат демонстрирует минимальное связывание с другими типами клеток, такими как макрофаги, и с фракцией не-В-лимфоцитов.A key requirement of antibody-based immunotherapy is minimal reactivity in normal tissues. Because CD24 is abundantly expressed on hematopoietic cells, especially granulocytes, B cells, some erythrocytes and some monocytes, PP6373 and its two humanized clones, H2L3 and H3L3, were compared with a conventional anti-CD24 mAb, ML5. As shown in FIG. 33, while ML5 exhibits strong binding to cells that typically express high levels of CD24, H2L3 and H3L3 do not bind to B cells and red blood cells and bind poorly to granulocytes. This result demonstrates minimal binding to other cell types such as macrophages and to the non-B lymphocyte fraction. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯCLAIM 1. Ahtu-CD24 антитело для лечения рака, содержащее: (а) вариабельную область тяжелой цепи из последовательности, указанной в SEQ ID NO: 6, и вариабельную область легкой цепи из последовательности, указанной в SEQ ID NO: 16, или (б) вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31 или 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.1. An Ahtu-CD24 antibody for the treatment of cancer, comprising: (a) a heavy chain variable region from the sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and a light chain variable region from the sequence set forth in SEQ ID NO: 16, or (b) a heavy chain variable region containing the sequence shown in SEQ ID NO: 31 or 30, and a light chain variable region containing the sequence shown in SEQ ID NO: 35. 2. Ahtu-CD24 антитело по п.1, где антитело является одноцепочечным.2. Ahtu-CD24 antibody according to claim 1, wherein the antibody is single chain. 3. Ahtu-CD24 антитело по п.1 или 2, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 30, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.3. Ahtu-CD24 antibody according to claim 1 or 2, containing a heavy chain variable region containing the sequence specified in SEQ ID NO: 30, and a light chain variable region containing the sequence specified in SEQ ID NO: 35. 4. Ahtu-CD24 антитело по п.1 или 2, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 31, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность, указанную в SEQ ID NO: 35.4. Ahtu-CD24 antibody according to claim 1 or 2, containing a heavy chain variable region containing the sequence specified in SEQ ID NO: 31, and a light chain variable region containing the sequence specified in SEQ ID NO: 35. 5. Ahtu-CD24 антитело по любому из пп.1-4, дополнительно включающее константную область (Fc) иммуноглобулина человека.5. Ahtu-CD24 antibody according to any one of claims 1-4, further comprising a human immunoglobulin constant region (Fc). 6. Биспецифическое антитело для лечения рака, содержащее первый домен антитела, содержащий анти-CD24 антитело по любому из пп.1-5, и второй домен антитела, содержащий второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.6. A bispecific antibody for treating cancer, comprising a first antibody domain comprising an anti-CD24 antibody according to any one of claims 1 to 5, and a second antibody domain comprising a second antibody or an antigen binding fragment thereof. 7. Биспецифическое антитело по п.6, где второй домен антитела привлекает иммунные эффекторные Т-клетки к раковым клеткам для иммунотерапии рака и/или связывает CD3, α-цепь TCR (Т-клеточный рецептор), β-цепь TCR, γ-цепь TCR или δ-цепь TCR.7. The bispecific antibody of claim 6, wherein the second domain of the antibody recruits immune effector T cells to cancer cells for cancer immunotherapy and/or binds CD3, TCR α chain (T cell receptor), TCR β chain, γ chain TCR or TCR δ chain. 8. Биспецифическое антитело по п.7, где второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывает CD3.8. The bispecific antibody of claim 7, wherein the second antibody or antigen binding fragment thereof binds CD3. 9. Биспецифическое антитело по п.8, содержащее второй домен антитела, содержащий последовательность, указанную в SEQ ID NO: 18.9. The bispecific antibody of claim 8, comprising a second antibody domain comprising the sequence set forth in SEQ ID NO: 18. 10. Химерный рецептор антигена, содержащий одноцепочечное антитело по любому из пп.1-5.10. A chimeric antigen receptor containing a single chain antibody according to any one of claims 1 to 5. 11. Конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC), содержащий анти-CD24 антитело по любому из пп.1-5, связанное с эффекторным фрагментом, выбранным из группы, состоящей из цитотоксического лекарственного средства, белкового токсина и радионуклида.11. An antibody-drug conjugate (ADC) comprising an anti-CD24 antibody according to any one of claims 1 to 5, associated with an effector moiety selected from the group consisting of a cytotoxic drug, a protein toxin and a radionuclide. 12. Композиция для лечения рака, содержащая анти-CD24 антитело, как определено в любом из пп.1-5, биспецифическое антитело по любому из пп.6-9, химерный рецептор антигена по п.10 или конъюгат антитело-лекарственное средство по п.11 и второе противораковое средство.12. A composition for the treatment of cancer comprising an anti-CD24 antibody as defined in any one of claims 1 to 5, a bispecific antibody as defined in any one of claims 6 to 9, a chimeric antigen receptor as defined in claim 10, or an antibody-drug conjugate as claimed in claim 12. .11 and a second anti-cancer agent. 13. Композиция по п.12, где второе противораковое средство включает анти-PD-1 антитело, антиCTLA-4 антитело или LAG3.13. The composition of claim 12, wherein the second anticancer agent comprises an anti-PD-1 antibody, an anti-CTLA-4 antibody, or a LAG3. --
EA202092306 2018-05-14 2019-05-13 ANTI-CD24 COMPOSITIONS AND THEIR APPLICATIONS EA045813B1 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/671,193 2018-05-14

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA045813B1 true EA045813B1 (en) 2023-12-28

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7294758B2 (en) Anti-CD24 compositions and uses thereof
JP7153626B2 (en) Anti-human 4-1BB antibody and uses thereof
TWI645858B (en) Antibodies reactive with b7-h3, immunologically active fragments thereof and uses thereof
WO2020098734A1 (en) Anti-tigit antibody and use thereof
JP7225135B2 (en) Compounds and methods for tumor-specific cell depletion
CN113645996B (en) Anti-claudin 18 antibodies and methods of use thereof
KR20170132793A (en) Constructs targeting AFP peptide / MHC complexes and uses thereof
US20240052044A1 (en) Non-blocking human ccr8 binders
US20240076391A1 (en) Human ccr8 binders
CA2997809A1 (en) Il-7r-alpha specific antibodies for treating acute lymphoblastic leukemia
WO2020244526A1 (en) Ceacam5-resistant monoclonal antibody and preparation method thereof and use thereof
CN111699195A (en) Mutant anti-CTLA-4 antibodies with improved immunotherapeutic effect but reduced adverse effects
US20240052045A1 (en) Murine cross-reactive human ccr8 binders
EP4286410A1 (en) Single-domain antibody against cd16a and use thereof
WO2022116079A1 (en) Humanized anti-ceacam5 antibody, and preparation method therefor and use thereof
TWI835794B (en) Anti-cd24 compositions and uses thereof
EA045813B1 (en) ANTI-CD24 COMPOSITIONS AND THEIR APPLICATIONS
CN114096559A (en) Engineered IGA antibodies and methods of use thereof
US11932693B2 (en) Monoclonal antibodies directed against programmed death-1 protein and their use in medicine
TW202305005A (en) Anti-siglec compositions and uses thereof