EA042821B1 - COMPOSITIONS AND METHODS FOR DIAGNOSTICS OF LUNG CANCER - Google Patents

COMPOSITIONS AND METHODS FOR DIAGNOSTICS OF LUNG CANCER Download PDF

Info

Publication number
EA042821B1
EA042821B1 EA201992317 EA042821B1 EA 042821 B1 EA042821 B1 EA 042821B1 EA 201992317 EA201992317 EA 201992317 EA 042821 B1 EA042821 B1 EA 042821B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
cdr
progastrin
seq
amino acid
antibody
Prior art date
Application number
EA201992317
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Александр Приёр
Original Assignee
Эсс-Прогастрин Са
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Эсс-Прогастрин Са filed Critical Эсс-Прогастрин Са
Publication of EA042821B1 publication Critical patent/EA042821B1/en

Links

Description

Изобретение относится к диагностике in vitro рака, более конкретно, оно относится к способам диагностики in vitro рака легкого. Композиции согласно данному изобретению содержат молекулу, связывающую прогастрин, в частности, антитело против hPG (человеческий прогастрин), тогда как способы согласно данному изобретению включают применение молекулы, связывающей прогастрин, и, в частности, антитела против hPG.The invention relates to in vitro diagnostics of cancer, more specifically, it relates to in vitro diagnostic methods for lung cancer. The compositions of the invention comprise a progastrin binding molecule, in particular an anti-hPG (human progastrin) antibody, while the methods of the invention comprise the use of a progastrin binding molecule, and in particular an anti-hPG antibody.

Рак легкого остается самой летальной злокачественной опухолью в мире. Несмотря на улучшения в хирургическом лечении, системной терапии и лучевой терапии, 5-летняя выживаемость для всех пациентов с диагнозом рака легкого остается от 15 до 20%.Lung cancer remains the most lethal malignant tumor in the world. Despite improvements in surgical treatment, systemic therapy, and radiotherapy, the 5-year survival rate for all patients diagnosed with lung cancer remains 15 to 20%.

Рак легкого включает два главных типа опухолей, а именно: мелкоклеточный рак легкого (SCLC) и немелкоклеточный рак легкого (NSCLC). SCLC предствляет 15-18% всех случаев рака легкого, тогда как NSCLC составляет примерно от 80% до 85% случаев рака легкого. Другие типы рака легкого, такие как аденокистозные карциномы, лимфомы и саркомы, а также доброкачественные опухоли легкого, такие как гамартомы, являются редкими.Lung cancer includes two main types of tumors, namely small cell lung cancer (SCLC) and non-small cell lung cancer (NSCLC). SCLC represents 15-18% of all lung cancers, while NSCLC accounts for approximately 80% to 85% of lung cancers. Other types of lung cancer, such as adenocystic carcinomas, lymphomas, and sarcomas, and benign lung tumors, such as hamartomas, are rare.

Мелкоклеточный и немелкоклеточный рак легкого лечат по-разному. В частности, SCLC является более отвечающим на химиотерапию и лучевую терапию, чем другие клеточные типы рака легкого. Однако сложно добиться излечения, так как SCLC имеет более выраженную тенденцию к широкой диссеминации ко времени постановки диагноза. К настоящему времени отсутствуют молекулярные биомаркеры, которые были переведены на широкораспространенную клиническую практику рака легкого. Способы лечения зависят от развития рака и обычно включают хирургию для маленьких локализованных опухолей или химиотерапию, возможно в комбинации с лучевой терапией.Small cell and non-small cell lung cancer are treated differently. In particular, SCLC is more responsive to chemotherapy and radiation therapy than other cell types of lung cancer. However, it is difficult to achieve a cure, as SCLC tends to be more widely disseminated by the time of diagnosis. To date, there are no molecular biomarkers that have been translated into widespread clinical practice in lung cancer. Treatment options depend on the development of the cancer and usually include surgery for small, localized tumors or chemotherapy, possibly in combination with radiation therapy.

Следовательно, все еще существует потребность в способах, обеспечивающих быструю, надежную и рентабельную диагностику рака легкого.Therefore, there is still a need for methods that provide rapid, reliable and cost-effective diagnosis of lung cancer.

Это является целью изобретения.This is the purpose of the invention.

Описание изобретенияDescription of the invention

Согласно настоящему изобретению теперь предложены способы диагностики in vitro рака легкого, где указанные способы включают выявление прогастрина в биологическом образце от субъекта. Предпочтительно определяется количество прогастрина в указанном образце, таким образом, обеспечивая количественное измерение прогастрина.The present invention now provides methods for diagnosing lung cancer in vitro, wherein said methods include detecting progastrin in a biological sample from a subject. Preferably, the amount of progastrin in said sample is determined, thus providing a quantitative measurement of progastrin.

Человеческий пре-прогастрин - пептид из 101 аминокислоты (эталонная аминокислотная последовательность: ААВ19304.1) - представляет собой первичный продукт трансляции гена гастрина. Прогастрин образуется отщеплением первых 21 аминокислот (сигнальный пептид) от препрогастрина. 80аминокислотная цепь прогастрина подвергается дальнейшему процессингу отщепляющими и модифицирующими ферментами до нескольких биологически активных гормональных форм гастрина: гастрина 34 (G34) и гастрина 34 с глициновым удлинением (G34-Gly), содержащих аминокислоты 38-71 прогастрина, гастрина 17 (G17) и гастрина 17 с глициновым удлинением (G17-Gly), содержащих аминокислоты 55-71 прогастрина.Human pre-progastrin, a 101 amino acid peptide (reference amino acid sequence: AAB19304.1), is the primary translation product of the gastrin gene. Progastrin is formed by cleavage of the first 21 amino acids (signal peptide) from preprogastrin. The 80 amino acid chain of progastrin is further processed by cleaving and modifying enzymes to several biologically active hormonal forms of gastrin: gastrin 34 (G34) and gastrin 34 with glycine extension (G34-Gly), containing amino acids 38-71 of progastrin, gastrin 17 (G17) and gastrin 17 with glycine extension (G17-Gly) containing progastrin amino acids 55-71.

Моноклональные антитела против человеческого прогастрина (антитела против hPG) и их применение для диагностики и терапии были описаны в следующих документах: WO 2011/083088 для колоректального рака, WO 2011/083090 для рака молочной железы, WO 2011/083091 для рака поджелудочной железы, WO 2011/116954 для колоректального и желудочно-кишечного рака, и WO 2012/013 609 и WO 2011/083089 для патологий печени.Monoclonal antibodies against human progastrin (anti-hPG antibodies) and their use in diagnosis and therapy have been described in the following documents: WO 2011/083088 for colorectal cancer, WO 2011/083090 for breast cancer, WO 2011/083091 for pancreatic cancer, WO 2011/116954 for colorectal and gastrointestinal cancers, and WO 2012/013 609 and WO 2011/083089 for liver pathologies.

Настоящее изобретение станет понятнее из подробного описания, приведенного в данном документе, и из сопровождающих графических материалов, которые приводятся лишь в качестве иллюстрации и не ограничивают намеченный объем данного изобретения.The present invention will become clearer from the detailed description provided herein and from the accompanying drawings, which are provided by way of illustration only and do not limit the intended scope of the present invention.

В первом аспекте настоящее изобретение относится к способу оценки in vitro риска присутствия рака легкого, где указанный способ включает стадию выявления прогастрина в биологическом образце от субъекта. Присутствие прогастрина в образце указывает на то, что есть риск присутствия рака легкого.In a first aspect, the present invention relates to a method for assessing the in vitro risk of the presence of lung cancer, which method includes the step of detecting progastrin in a biological sample from a subject. The presence of progastrin in the sample indicates that there is a risk of lung cancer being present.

Таким образом, в первом воплощении данное изобретение относится к способу оценки in vitro риска присутствия рака легкого у субъекта, причем указанный способ включает следующие стадии:Thus, in a first embodiment, this invention relates to a method for assessing the in vitro risk of lung cancer in a subject, said method comprising the following steps:

а) приведение в контакт биологического образца от указанного субъекта с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин, иa) contacting a biological sample from said subject with at least one progastrin-binding molecule, and

б) выявление связывания указанной молекулы, связывающей прогастрин, с прогастрином в указанном образце, где указанное связывание указывает на риск присутствия рака легкого.b) detecting the binding of said progastrin-binding molecule to progastrin in said sample, wherein said binding is indicative of a risk for the presence of lung cancer.

Связывание молекулы, связывающей прогастрин, может выявляться разными анализами, доступными специалисту. Несмотря на то, что в данное изобретение включаются любые подходящие способы проведения анализов, можно упомянуть, в частности, FACS (флуоресцентная сортировка клеток), ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ), RIA (радиоиммуноанализ), вестерн-блоттинг и IHC (иммуногистохимия).Binding of the progastrin binding molecule can be detected by various assays available to the skilled artisan. While any suitable assay methods are included in the present invention, mention may be made in particular of FACS (fluorescent cell sorting), ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), RIA (radioimmunoassay), Western blotting, and IHC (immunohistochemistry).

В предпочтительном воплощении способ по изобретению для оценки in vitro риска присутствия рака легкого у субъекта включает следующие стадии:In a preferred embodiment, the method of the invention for assessing the in vitro risk of having lung cancer in a subject comprises the following steps:

а) приведение в контакт указанного биологического образца от указанного субъекта с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин,a) contacting said biological sample from said subject with at least one progastrin-binding molecule,

- 1 042821- 1 042821

б) определение концентрации прогастрина в указанном биологическом образце, где концентрация прогастрина по меньшей мере 10 пМ в указанном биологическом образце указывает на риск присутствия рака легкого.b) determining the concentration of progastrin in the specified biological sample, where the concentration of progastrin at least 10 pM in the specified biological sample indicates the risk of the presence of lung cancer.

Как только определяется концентрация прогастрина, присутствующего в образце, данный результат можно сравнивать с результатами контрольного(ных) образца(цов), который(рые) получают аналогичным способом с опытными образцами, но от индивида(дов), для которого(рых) известно то, что он(они) не страдает(ют) от рака легкого. Если концентрация прогастрина значимо более высокая в опытном образце, можно сделать заключение о том, что имеется повышенная вероятность того, что субъект, от которого он был получен, имеет рак легкого.Once the concentration of progastrin present in the sample is determined, this result can be compared with the results of the control sample(s), which are obtained in a similar way to the experimental samples, but from the individual(s) for whom it is known that that he (they) does not suffer from lung cancer. If the concentration of progastrin is significantly higher in the test sample, it can be concluded that there is an increased likelihood that the subject from which it was obtained has lung cancer.

Таким образом, в более предпочтительном воплощении способ по изобретению включает следующие дополнительные стадии:Thus, in a more preferred embodiment, the method of the invention comprises the following additional steps:

в) определение контрольной концентрации прогастрина в контрольном образце,c) determination of the control concentration of progastrin in the control sample,

г) сравнение концентрации прогастрина в указанном биологическом образце с указанной контрольной концентрацией прогастрина,d) comparing the concentration of progastrin in the specified biological sample with the specified control concentration of progastrin,

д) оценка из сравнения стадии г) риска присутствия рака легкого.e) assessment from stage comparison d) risk of lung cancer presence.

Согласно другому аспекту данное изобретение относится к способу диагностики in vitro рака легкого у субъекта, причем указанный способ включает следующие стадии:In another aspect, the invention relates to a method for in vitro diagnosis of lung cancer in a subject, said method comprising the steps of:

а) приведение в контакт биологического образца от указанного субъекта с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин, иa) contacting a biological sample from said subject with at least one progastrin-binding molecule, and

б) выявление связывания указанной молекулы, связывающей прогастрин, с прогастрином в указанном образце, где указанное связывание указывает на присутствие рака легкого у указанного субъекта.b) detecting the binding of said progastrin-binding molecule to progastrin in said sample, wherein said binding indicates the presence of lung cancer in said subject.

В предпочтительном воплощении настоящее изобретение относится к способу диагностики in vitro рака легкого у субъекта, включающему следующие стадии:In a preferred embodiment, the present invention relates to a method for in vitro diagnosis of lung cancer in a subject, comprising the following steps:

а) приведение в контакт указанного биологического образца от указанного субъекта с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин,a) contacting said biological sample from said subject with at least one progastrin-binding molecule,

б) определение концентрации прогастрина в указанном биологическом образце, где концентрация прогастрина по меньшей мере 10 пМ в указанном биологическом образце указывает на присутствие рака легкого у указанного субъекта.b) determining the concentration of progastrin in said biological sample, wherein a progastrin concentration of at least 10 pM in said biological sample indicates the presence of lung cancer in said subject.

В более конкретном воплощении способа по изобретению концентрация прогастрина по меньшей мере 10 пМ, по меньшей мере 20 пМ, по меньшей мере 30 пМ в указанном биологическом образце указывает на присутствие рака легкого у указанного субъекта.In a more specific embodiment of the method of the invention, a progastrin concentration of at least 10 pM, at least 20 pM, at least 30 pM in said biological sample indicates the presence of lung cancer in said subject.

В более предпочтительном воплощении способ по изобретению включает следующие дополнительные стадии:In a more preferred embodiment, the method of the invention comprises the following additional steps:

а) определение контрольной концентрации прогастрина в контрольном образце,a) determination of the control concentration of progastrin in the control sample,

б) сравнение концентрации прогастрина в указанном биологическом образце с указанным контрольным уровнем или концентрацией прогастрина,b) comparing the concentration of progastrin in the specified biological sample with the specified control level or concentration of progastrin,

в) осуществление диагностики из сравнения по стадии г) присутствия рака легкого.c) making a diagnosis from a comparison by stage d) the presence of lung cancer.

Согласно другому аспекту данное изобретение относится к способу осуществления диагностики in vitro метастазирующего рака легкого у субъекта, причем указанный способ включает следующие стадии:In another aspect, the invention relates to a method for performing an in vitro diagnosis of metastatic lung cancer in a subject, said method comprising the steps of:

а) приведение в контакт биологического образца от указанного субъекта с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин, иa) contacting a biological sample from said subject with at least one progastrin-binding molecule, and

б) выявление связывания указанной молекулы, связывающей прогастрин, с прогастрином в указанном образце, где указанное связывание указывает на присутствие метастазирующего рака легкого у указанного субъекта.b) detecting the binding of said progastrin-binding molecule to progastrin in said sample, wherein said binding indicates the presence of metastatic lung cancer in said subject.

В предпочтительном воплощении настоящее изобретение относится к способу диагностики in vitro метастазирующего рака легкого у субъекта, от биологического образца указанного субъекта, включающему следующие стадии:In a preferred embodiment, the present invention relates to a method for in vitro diagnosis of metastatic lung cancer in a subject, from a biological sample of said subject, comprising the following steps:

а) приведение в контакт указанного биологического образца с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин,a) bringing said biological sample into contact with at least one progastrin-binding molecule,

б) определение посредством биохимического анализа уровня или концентрации прогастрина в указанном биологическом образце, где концентрация прогастрина по меньшей мере 10 пМ или выше в указанном биологическом образце указывает на присутствие метастазирующего рака легкого у указанного субъекта.b) determining by biochemical analysis a level or concentration of progastrin in said biological sample, wherein a progastrin concentration of at least 10 pM or higher in said biological sample indicates the presence of metastatic lung cancer in said subject.

В более конкретном воплощении способа по изобретению концентрация прогастрина по меньшей мере 10 пМ, по меньшей мере 20 пМ, по меньшей мере 30 пМ, по меньшей мере 40 пМ или по меньшей мере 50 пМ в указанном биологическом образце указывает на присутствие метастазирующего рака легкого у указанного субъекта.In a more specific embodiment of the method of the invention, a progastrin concentration of at least 10 pM, at least 20 pM, at least 30 pM, at least 40 pM, or at least 50 pM in said biological sample indicates the presence of metastatic lung cancer in said subject.

В более предпочтительном воплощении способ по изобретению включает следующие дополнительные стадии:In a more preferred embodiment, the method of the invention comprises the following additional steps:

а) определение контрольной концентрации прогастрина в контрольном образце,a) determination of the control concentration of progastrin in the control sample,

б) сравнение концентрации прогастрина в указанном биологическом образце с указанной контрольной концентрацией прогастрина,b) comparing the concentration of progastrin in the specified biological sample with the specified control concentration of progastrin,

- 2 042821- 2 042821

в) осуществление диагностики из сравнения по стадии г) присутствия метастазирующего рака легкого.c) making a diagnosis from the comparison by stage d) the presence of metastatic lung cancer.

В конкретном воплощении настоящее изобретение относится к способу диагностики in vitro рака легкого у субъекта, включающему определение концентрации прогастрина в биологическом образце и сравнение указанного полученного значения с концентрацией прогастрина в контрольном образце.In a specific embodiment, the present invention relates to a method for diagnosing lung cancer in vitro in a subject, comprising determining the concentration of progastrin in a biological sample and comparing this obtained value with the concentration of progastrin in a control sample.

В более конкретном воплощении в способе диагностики рака легкого согласно настоящему изобретению биологический образец указанного субъекта приводится в контакт с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин, где указанная молекула, связывающая прогастрин, представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.In a more specific embodiment, in the method for diagnosing lung cancer according to the present invention, a biological sample of said subject is brought into contact with at least one progastrin-binding molecule, wherein said progastrin-binding molecule is an antibody or an antigen-binding fragment thereof.

Выражение оценка риска присутствия рака легкого у субъекта обозначает определение относительной вероятности для данного субъекта страдания от рака легкого по сравнению с контрольным субъектом или значением. Согласно способу по изобретению представлено средство в оценке указанного риска, в комбинации с другими способами или индикаторами, такими как клиническое обследование, биопсия и определение уровня известного биомаркера рака легкого.The expression risk score for the presence of lung cancer in a subject means a determination of the relative likelihood for a given subject of suffering from lung cancer compared to a control subject or value. According to the method according to the invention, an agent is provided in the assessment of said risk, in combination with other methods or indicators, such as clinical examination, biopsy and determination of the level of a known lung cancer biomarker.

Выражение диагностика in vitro означает определение того, страдает ли субъект от конкретного заболевания. Известно то, что постановка диагноза рака легкого включает по меньшей мере клиническое наблюдение симптомов указанного субъекта, такое как, например, сканирование низкодозовой спиральной компьютерной томографией (СТ). Хотя некоторые биомаркеры и были идентифицированы в фазе открытия, важным вызовом все еще является их перенос в клиническую практику, главным образом, изза отсутствия способа систематической оценки (Li et al, Neoplasma. 2012, 59(5): 500-507).The expression in vitro diagnostics means determining whether a subject is suffering from a particular disease. It is known that the diagnosis of lung cancer involves at least clinical observation of the symptoms of said subject, such as, for example, a low-dose helical computed tomography (CT) scan. Although some biomarkers have been identified in the discovery phase, their transfer to clinical practice is still an important challenge, mainly due to the lack of a method for systematic evaluation (Li et al, Neoplasma. 2012, 59(5): 500-507).

Следовательно, способ диагностики in vitro рака легкого согласно настоящему изобретению может считаться средством в пределах процесса диагностики.Therefore, the in vitro diagnostic method for lung cancer according to the present invention can be considered as a tool within the diagnostic process.

Выражение рак легкого обозначает рак, который возникает в тканях легкого, обычно в клетках, выстилающих дыхательные пути. Термин рак легкого в том виде, в котором он используется в данном документе, охватывает, в частности, мелкоклеточный рак легкого (SCLC), включающий мелкоклеточную карциному и комбинированную мелкоклеточную карциному, и немелкоклеточные раковые заболевания легкого (NSCLC), включающие плоскоклеточную карциному, крупноклеточную карциному и аденокарциному. Другие типы рака легкого, такие как аденокистозные карциномы, лимфомы и саркомы, а также доброкачественные опухоли легкого, такие как гамартомы, также включаются в раковые заболевания легкого в том виде, в котором данный термин используется в данном документе.The expression lung cancer refers to cancer that occurs in lung tissue, usually in the cells that line the airways. The term lung cancer as used herein includes, in particular, small cell lung cancer (SCLC), including small cell carcinoma and combined small cell carcinoma, and non-small cell lung cancers (NSCLC), including squamous cell carcinoma, large cell carcinoma and adenocarcinoma. Other types of lung cancers, such as adenocystic carcinomas, lymphomas, and sarcomas, as well as benign lung tumors, such as hamartomas, are also included in lung cancers as the term is used herein.

Термин прогастрин обозначает пептид прогастрина млекопитающего и, в частности, человеческого прогастрина. Во избежание сомнений, без какого-либо точного определения, выражение человеческий прогастрин относится к человеческому PG (прогастрин) последовательности SEQ ID NO: 1. А именно, человеческий прогастрин содержит N-концевой и С-концевой домены, которые не присутствуют в упомянутых выше биологически активных формах гормона гастрина. Предпочтительно последовательность указанного N-концевого домена представлена SEQ ID NO: 2. В другом предпочтительном воплощении последовательность указанного С-концевого домена представлена SEQ ID NO: 3.The term progastrin refers to the peptide of mammalian progastrin and in particular human progastrin. For the avoidance of doubt, without any precise definition, the expression human progastrin refers to the human PG (progastrin) sequence of SEQ ID NO: 1. Namely, human progastrin contains N-terminal and C-terminal domains that are not present in the biologically mentioned above. active forms of the hormone gastrin. Preferably, the sequence of said N-terminal domain is represented by SEQ ID NO: 2. In another preferred embodiment, the sequence of said C-terminal domain is represented by SEQ ID NO: 3.

Определение концентрации прогастрина в способе по изобретению осуществляется любым способом, известным специалисту в области биохимии.Determination of the concentration of progastrin in the method according to the invention is carried out by any method known to a person skilled in the field of biochemistry.

Предпочтительно определение уровней прогастрина в образце включает приведение в контакт указанного образца с молекулой, связывающей прогастрин, и измерение связывания указанной молекулы, связывающей прогастрин, с прогастрином.Preferably, determining the levels of progastrin in a sample comprises contacting said sample with a progastrin-binding molecule and measuring the binding of said progastrin-binding molecule to progastrin.

При измерении уровней экспрессии на уровне белка оно может, в частности, осуществляться с использованием специфичных молекул, связывающих прогастрин, таких как, например, антитела, в частности, с использованием хорошо известных технологий, таких как окрашивание клеточной мембраны с использованием биотинилирования или других эквивалентных методик, с последующим иммуноосаждением специфичными антителами, вестерн-блоттинг, ELISA или ELISPOT (метод иммуноферментных пятен), твердофазные иммуноферментные анализы (ELISA), радиоиммуноанализы (RIA), иммуногистохимия (IHC), иммунофлуоресценция (IF), биочипы с антителами или тканевые микрочипы в сочетании с иммуногистохимией. Другие подходящие методики включают FRET (резонансный перенос энергии флуоресценции) или BRET (резонансный перенос энергии биолюминисценции), микроскопические или гистохимические способы на одиночных клетках с использованием одиночных или многих длин волн возбуждения и применение любого из адаптированных оптических способов, таких как электрохимические способы (методики вольтаметрии и амперометрии), атомно-силовая микроскопия и радиочастотные способы, например, мультиполярная резонансная спектроскопия, конфокальная и неконфокальная микроскопия, выявление флуоресценции, люминисценции, хемилюминисценции, поглощения, отражательной способности, коэффициента пропускания и двойного лучепреломления или коэффициента преломления (например, поверхностный плазмонный резонанс, эллипсометрия, способ резонирующего зеркала, способ интерферометрии со световодом с решеточным выводом), клеточный ELISA, проточная цитометрия, радиоизотопная, магнитно-резонансная визуализация, анализ посредством гель-электрофореза в полиакриламидном геле (SDS-PAGE - электрофорез в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия); ВЭЖХ(высокоэффективная жидкостная хроматография)-масс-спектрометрия; жидкостная хроматогра- 3 042821 фия/масс-спектрометрия/масс-спектрометрия (ЖХ-МС/МС). Все данные методики хорошо известны в данной области, и их не нужно здесь дополнительно подробно описывать. Данные разные методики можно использовать для измерения уровней прогастрина.When measuring expression levels at the protein level, this can in particular be carried out using specific progastrin-binding molecules such as, for example, antibodies, in particular using well known techniques such as cell membrane staining using biotinylation or other equivalent techniques. , followed by immunoprecipitation with specific antibodies, Western blotting, ELISA or ELISPOT (enzymatic immunostain method), enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA), radioimmunoassays (RIA), immunohistochemistry (IHC), immunofluorescence (IF), antibody bioarrays or tissue microarrays in combination with immunohistochemistry. Other suitable techniques include FRET (fluorescence resonant energy transfer) or BRET (bioluminescence resonant energy transfer), microscopic or histochemical methods on single cells using single or multiple excitation wavelengths, and the use of any of the adapted optical methods such as electrochemical methods (voltametry techniques). and amperometry), atomic force microscopy, and radio frequency techniques, such as multipolar resonance spectroscopy, confocal and non-confocal microscopy, detection of fluorescence, luminescence, chemiluminescence, absorption, reflectivity, transmittance and birefringence or refractive index (for example, surface plasmon resonance, ellipsometry, resonating mirror method, grating lead light guide interferometry method), cellular ELISA, flow cytometry, radioisotope, magnetic resonance imaging, analysis by polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE - sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis); HPLC (high performance liquid chromatography)-mass spectrometry; liquid chromatography/mass spectrometry/mass spectrometry (LC-MS/MS). All of these techniques are well known in the art and need not be described in further detail here. These different techniques can be used to measure progastrin levels.

Указанный способ может, в частности, быть выбран среди следующих: способ, основанный на иммуновыявлении, способ на основе вестерн-блоттинга, способ на основе масс-спектрометрии, способ на основе хроматографии и способ на основе проточной цитометрии. Хотя в пределы данного изобретения и включаются любые подходящие способы для осуществления анализов, особенно полезными для проведения способа по изобретению являются такие способы, как FACS, ELISA, RIA, вестерн-блоттинг и IHC.Said method may in particular be selected from among the following: immunodetection method, Western blot method, mass spectrometry method, chromatography method and flow cytometry method. While any suitable methods for performing assays are included within the scope of this invention, methods such as FACS, ELISA, RIA, Western blot, and IHC are particularly useful for carrying out the method of the invention.

В более конкретном воплощении способ диагностики in vitro рака легкого по изобретению включает приведение в контакт биологического образца от субъекта с молекулой, связывающей прогастрин, с использованием иммуноферментного анализа, предпочтительно основанного на методиках, выбранных среди RIA и ELISA.In a more specific embodiment, the in vitro diagnostic method for lung cancer of the invention comprises contacting a biological sample from a subject with a progastrin binding molecule using an enzyme immunoassay, preferably based on techniques selected from RIA and ELISA.

Биологический образец в том виде, в котором он используется в данном документе, представляет собой образец биологической ткани или жидкости, который содержит нуклеиновые кислоты или полипептиды, например, белок, полинуклеотид или транскрипт рака легкого. Такой образец должен обеспечивать определение уровней экспрессии прогастрина. Известно то, что прогастрин является секретируемым белком. Предпочтительные биологические образцы для определения уровня белка прогастрина, таким образом, включают биологические жидкости. Термин биологическая жидкость в том виде, в котором он используется в данном документе, означает любую жидкость, которая включает вещество биологического происхождения. Предпочтительные биологические жидкости для применения в настоящем изобретении включают жидкости организма животного, например, млекопитающего, предпочтительно человеческого субъекта. Жидкость организма может представлять собой любую жидкость организма, включающую кровь, плазму, сыворотку, лимфу, спинномозговую жидкость (CSF), слюну, пот и мочу, но не ограничивающуюся ими. Предпочтительно указанные предпочтительные жидкие биологические образцы включают такие образцы, как образец крови, образец плазмы или образец сыворотки. Более предпочтительно, биологический образец представляет собой образец крови. В самом деле, такой образец крови может быть получен совершенно безвредным отбором крови у пациента и, таким образом, обеспечивает неинвазивную оценку рисков того, что у субъекта разовьется опухоль.A biological sample, as used herein, is a biological tissue or fluid sample that contains nucleic acids or polypeptides, such as a protein, polynucleotide, or lung cancer transcript. Such a sample should provide for the determination of progastrin expression levels. It is known that progastrin is a secreted protein. Preferred biological samples for determining progastrin protein levels thus include body fluids. The term biological fluid as used herein means any fluid that includes a substance of biological origin. Preferred biological fluids for use in the present invention include body fluids of an animal, eg a mammal, preferably a human subject. The body fluid can be any body fluid, including but not limited to blood, plasma, serum, lymph, cerebrospinal fluid (CSF), saliva, sweat, and urine. Preferably, said preferred liquid biological samples include samples such as a blood sample, a plasma sample, or a serum sample. More preferably, the biological sample is a blood sample. Indeed, such a blood sample can be obtained by completely harmless blood sampling from a patient and thus provides a non-invasive assessment of the risks that the subject will develop a tumor.

Термин биологический образец в том виде, в котором он используется в данном документе, также включает образец солидного рака пациента, подлежащего анализу, когда раковое заболевание представляет собой солидное раковое раболевание. Такой образец солидного рака обеспечивает проведение специалистом любого типа измерения уровня биомаркера по изобретению. В некоторых случаях способы по изобретению могут дополнительно включать предварительную стадию отбора образца солидного рака от пациента. Образцом солидного рака называется образец опухолевой ткани. Даже у ракового пациента ткань, которая является местом опухоли, все еще содержит неопухолевую здоровую ткань. Раковый образец, таким образом, должен ограничиваться опухолевой тканью, взятой от пациента. Указанный раковый образец может представлять собой образец биопсии или образец, отобранный в результате хирургической резекционной терапии.The term biological sample, as used herein, also includes the patient's solid cancer sample to be analyzed when the cancer is a solid cancer. Such a sample of solid cancer allows a specialist to perform any type of measurement of the level of the biomarker according to the invention. In some instances, the methods of the invention may further include the preliminary step of collecting a solid cancer sample from the patient. A sample of solid cancer is a sample of tumor tissue. Even in a cancer patient, the tissue that is the site of the tumor still contains non-tumor healthy tissue. The cancer sample should therefore be limited to tumor tissue taken from the patient. Said cancer sample may be a biopsy sample or a sample taken as a result of surgical resection therapy.

Биологический образец типично получают из эукариотического организма, наиболее предпочтительно млекопитающего или птицы, рептилии или рыбы. В самом деле, субъект, который может быть подвергнут способу, описанному в данном документе, может представлять собой любого млекопитающего животного, включая человека, собаку, кошку, крупный рогатый скот, козу, свинью, кабана, овцу и обезьяну; или птицу; рептилию; или рыбу. Предпочтительно субъект представляет собой человека; человеческий субъект может быть известен как пациент.The biological sample is typically obtained from a eukaryotic organism, most preferably a mammal or bird, reptile or fish. Indeed, the subject that can be subjected to the method described herein can be any mammalian animal, including human, dog, cat, cattle, goat, pig, boar, sheep and monkey; or a bird; reptile; or fish. Preferably the subject is a human; the human subject may be known as a patient.

Под получением биологического образца в данном документе подразумевается получение биологического образца для применения в способах, описанных в данном изобретении. Чаще всего это будет осуществляться удалением образца клеток из животного, но также может осуществляться применением ранее выделенных клеток (например, выделенных другим человеком, в другое время и/или для другой цели) или осуществлением способов по изобретению in vivo. Особенно полезными будут архивные ткани, имеющие историю лечения или результата.By obtaining a biological sample in this document means obtaining a biological sample for use in the methods described in this invention. This will most often be done by removing a sample of cells from the animal, but can also be done by using previously isolated cells (eg, isolated by another person, at a different time and/or for a different purpose) or by performing the methods of the invention in vivo. Archival tissues with a history of treatment or outcome will be especially useful.

Данный образец может быть получен и, при необходимости, приготовлен согласно способам, известным специалисту в данной области. В частности, в данной области хорошо известно то, образец следует отбирать у субъекта натощак.This sample can be obtained and, if necessary, prepared according to methods known to the person skilled in the art. In particular, it is well known in the art that the sample should be taken from the subject on an empty stomach.

Определение концентрации прогастрина относится к определению количества прогастрина в известном объеме образца. Концентрация прогастрина может быть выражена относительно контрольного образца, например, как отношение или процентная доля. Данная концентрация также может быть выражена как интенсивность или локализация сигнала, в зависимости от способа, использованного для определения указанной концентрации. Предпочтительно концентрация соединения в образце выражается после нормирования общей концентрации родственных соединений в указанном образце, например, уровень или концентрация белка выражается после нормирования общей концентрации белков в образце.Progastrin concentration determination refers to the determination of the amount of progastrin in a known volume of a sample. The concentration of progastrin can be expressed relative to the control sample, for example, as a ratio or percentage. A given concentration can also be expressed as signal intensity or localization, depending on the method used to determine said concentration. Preferably, the concentration of a compound in a sample is expressed after normalizing the total concentration of related compounds in said sample, for example, the level or concentration of a protein is expressed after normalizing the total concentration of proteins in the sample.

Предпочтительно риск того, что указанный субъект страдает от рака легкого, определяется сравне- 4 042821 нием уровня прогастрина, измеренного в указанном биологическом образце, с контрольным уровнем.Preferably, the risk that said subject suffers from lung cancer is determined by comparing the level of progastrin measured in said biological sample with a control level.

Термин контрольный уровень в том виде, в котором он используется в данном документе, относится к уровню экспрессии рассматриваемого маркера рака легкого, т.е. прогастрина, в контрольном образце. Контрольный образец в том виде, в котором данный термин используется в данном документе, означает образец, полученный от субъектов, предпочтительно двух или более чем двух субъектов, для которых известно то, что они не имеют заболевания или, в качестве альтернативы, происходят из общей популяции. Подходящие контрольные уровни экспрессии прогастрина могут быть определены измерением уровней экспрессии указанного маркера у нескольких подходящих субъектов, и такие контрольные уровни могут быть скорректированы по отношению к конкретным популяциям субъектов. Контрольное значение или контрольный уровень может представлять собой абсолютное значение; относительное значение; значение, которое имеет верхнюю или нижнюю границу; интервал значений; среднее значение; медианное значение; усредненное значение или значение, которое сравнивается с конкретным контрольным или исходным значением. Контрольное значение может быть основано на значении индивидуального образца таком как, например, значение, полученное от образца от анализируемого субъекта, но в более ранний момент времени. Контрольное значение может быть основано на большом числе образцов, как, например, из популяции субъектов хронологической соответсвующей по возрасту группы или основано на объединении образцов, включающем или исключающем образец, подлежащий анализу.The term reference level, as used herein, refers to the level of expression of the lung cancer marker in question, i.e. progastrin, in the control sample. Control sample, as the term is used herein, means a sample obtained from subjects, preferably two or more than two subjects, who are known not to have the disease or, alternatively, come from the general population. . Suitable control levels of progastrin expression can be determined by measuring the levels of expression of the specified marker in several suitable subjects, and such control levels can be adjusted in relation to specific populations of subjects. The reference value or reference level may be an absolute value; relative value; a value that has an upper or lower bound; range of values; average value; median value; an average value, or a value that is compared to a particular control or baseline value. The control value may be based on the value of an individual sample, such as, for example, the value obtained from a sample from an analyzed subject, but at an earlier point in time. The reference value may be based on a large number of samples, such as from a population of subjects in a chronologically age-matched group, or based on a pool of samples that includes or excludes the sample to be analyzed.

Преимущественно контрольный уровень представляет собой заданный уровень прогастрина, полученный от биологического образца от субъекта с известным конкретным статусом в отношении рака. В конкретных воплощениях контрольный уровень, использованный для сравнения с опытным образцом на стадии (б), возможно был получен от биологического образца от здорового субъекта или от биологического образца от субъекта, страдающего от рака; понятно то, что контрольный профиль экспрессии также может быть получен из объединения биологических образцов здоровых субъектов или из объединения биологических образцов здоровых субъектов, или из объединения образцов от субъектов, имеющих раковое заболевание.Preferably, the control level is a target level of progastrin obtained from a biological sample from a subject with known specific cancer status. In specific embodiments, the control level used for comparison with the test sample in step (b) may have been obtained from a biological sample from a healthy subject or from a biological sample from a subject suffering from cancer; it is clear that the control expression profile can also be obtained from the pool of biological samples of healthy subjects or from the pool of biological samples of healthy subjects, or from the pool of samples from subjects with cancer.

В конкретном воплощении способа по изобретению контрольный образец отбирают от субъектов, не имеющих какого-либо ракового заболевания и предпочтительно какой-либо патологии. Следует понимать то, что согласно природе биологического образца, отобранного у пациента, контрольный образец будет представлять собой биологический образец той же самой природы, что и указанный биологический образец.In a specific embodiment of the method of the invention, a control sample is taken from subjects free of any cancer and preferably no pathology. It should be understood that, according to the nature of the biological sample taken from the patient, the control sample will be a biological sample of the same nature as the specified biological sample.

Уровень прогастрина определяется в настоящем способе определением количества прогастрина, которое связывается молекулой, связывающей прогастрин, предпочтительно антителом, распознающим прогастрин.The level of progastrin is determined in the present method by determining the amount of progastrin that is bound by a progastrin-binding molecule, preferably a progastrin-recognizing antibody.

Молекулой, связывающей прогастрин в данном документе называется любая молекула, которая связывается с прогастрином, но не связывается с гастрином-17 (G17), гастрином-34 (G34), гастрином 17 с глициновым удлинением (G17-Gly) или гастрином 34 с глициновым удлинением (G34-Gly). Молекула, связывающая прогастрин, по настоящему изобретению может представлять собой любую молекулу, связывающую прогастрин, такую как, например, молекула антитела или молекула рецептора. Предпочтительно молекула, связывающая прогастрин, представляет собой антитело против прогастрина или его антигенсвязывающий фрагмент.A progastrin-binding molecule is defined herein as any molecule that binds to progastrin but does not bind to gastrin-17 (G17), gastrin-34 (G34), glycine-extended gastrin 17 (G17-Gly) or glycine-extended gastrin 34 (G34-Gly). The progastrin-binding molecule of the present invention may be any progastrin-binding molecule, such as, for example, an antibody molecule or a receptor molecule. Preferably, the progastrin-binding molecule is an anti-progastrin antibody, or an antigen-binding fragment thereof.

Согласно конкретному воплощению настоящее изобретение относится к способу диагностики in vitro рака легкого, включающему определение концентрации прогастрина в биологическом образце от субъекта, где указанный субъект демонстрирует по меньшей мере один клинический симптом рака легкого.According to a specific embodiment, the present invention relates to a method for diagnosing lung cancer in vitro, comprising determining the concentration of progastrin in a biological sample from a subject, where the specified subject shows at least one clinical symptom of lung cancer.

Согласно другому конкретному воплощению настоящее изобретение относится к способу диагностики in vitro рака легкого, включающему определение концентрации прогастрина в биологическом образце от субъекта, где указанный субъект демонстрирует по меньшей мере один клинический симптом рака и/или метастаза.According to another specific embodiment, the present invention relates to a method for diagnosing lung cancer in vitro, including determining the concentration of progastrin in a biological sample from a subject, where the specified subject shows at least one clinical symptom of cancer and/or metastasis.

Под терминами связывающий, связывается или тому подобными подразумевается то, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент образует комплекс с антигеном, который является относительно стабильным при физиологических условиях. Способы определения того, связываются ли две молекулы, хорошо известны в данной области и включают, например, равновесный диализ, поверхностный плазмонный резонанс и тому подобные. В конкретном воплощении указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается с прогастрином с аффинностью, которая по меньшей мере в два раза больше, чем его аффинность в отношении связывания с неспецифичной молекулой, такой как BSA (бычий сывороточный альбумин) или казеин. В более конкретном воплощении указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается только с прогастрином.By binding, binding, or the like, is meant that an antibody or antigen-binding fragment thereof forms a complex with an antigen that is relatively stable under physiological conditions. Methods for determining whether two molecules bind are well known in the art and include, for example, equilibrium dialysis, surface plasmon resonance, and the like. In a specific embodiment, said antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds to progastrin with an affinity that is at least two times greater than its binding affinity for a non-specific molecule such as BSA (bovine serum albumin) or casein. In a more specific embodiment, said antibody, or antigen-binding fragment thereof, binds only to progastrin.

В конкретном воплощении в способе диагностики рака легкого по изобретению биологический образец от субъекта приводится в контакт с по меньшей мере одной молекулой, связывающей прогастрин, где аффинность указанной молекулы в отношении прогастрина составляет по меньшей мере 100 нМ, по меньшей мере 90 нМ, по меньшей мере 80 нМ, по меньшей мере 70 нМ, по меньшей мере 60 нМ, по меньшей мере 50 нМ, по меньшей мере 40 нМ, по меньшей мере 30 нМ, по меньшей мере 20 нМ, поIn a specific embodiment, in the lung cancer diagnostic method of the invention, a biological sample from a subject is contacted with at least one progastrin-binding molecule, wherein said molecule has an affinity for progastrin of at least 100 nM, at least 90 nM, at least 80 nM, at least 70 nM, at least 60 nM, at least 50 nM, at least 40 nM, at least 30 nM, at least 20 nM, according to

- 5 042821 меньшей мере 10 нМ, по меньшей мере 5 нМ, по меньшей мере 1 нМ, по меньшей мере 100 пМ, по меньшей мере 10 пМ или по меньшей мере 1 пМ при определении таким способом, как вышеописанный способ.- 5 042821 at least 10 nM, at least 5 nM, at least 1 nM, at least 100 pM, at least 10 pM, or at least 1 pM when determined in a manner such as the method described above.

В конкретном воплощении настоящее изобретение относится к способу диагностики рака легкого, включающему выявление концентрации прогастрина в биологическом образце от субъекта, где указанный биологический образец приводится в контакт с антителом против hPG или его антигенсвязывающим фрагментом.In a specific embodiment, the present invention relates to a method for diagnosing lung cancer, comprising detecting the concentration of progastrin in a biological sample from a subject, where the specified biological sample is brought into contact with an anti-hPG antibody or antigen-binding fragment.

Подразумевается то, что термин антитело в том виде, в котором он используется в данном документе, включает поликлональные и моноклональные антитела. Антитело (или иммуноглобулин) состоит из гликопротеина, содержащего по меньшей мере две тяжелые (Н) цепи и две легкие (L) цепи, взаимосвязанные дисульфидными связями. Каждая тяжелая цепь содержит вариабельную область (или домен) тяжелой цепи (сокращенные в данном документе как HCVR или VH) и константную область тяжелой цепи. Константная область тяжелой цепи содержит три домена: СН1, СН2 и СН3. Каждая легкая цепь содержит вариабельную область легкой цепи (сокращенную в данном документе как LCVR или VL) и константную область легкой цепи. Константная область легкой цепи содержит один домен: CL. Области VH и VL могут быть дополнительно подразделены на области гипервариабельности, именуемые областями, определяющими комплементарность (CDR) или гипервариабельными областями, которые, главным образом, отвечают за связывание с эпитопом антигена, и в которые вкрапляются области, которые являются более консервативными, именуемые каркасными областями (FR). Способ идентификации CDR в пределах легкой и тяжелой цепей антитела и определения их последовательности является хорошо известным специалисту. Во избежание сомнений, в отсутствие в тексте любого указания на противоположное, выражение CDR означает гипервариабельные области тяжелой и легкой цепей антитела, как определено IMGT, где уникальная нумерация IMGT обеспечивает стандартизированное ограничение каркасных областей и областей, определяющих комплементарность, CDR1-IMGT: 27-38, CDR2.The term antibody, as used herein, is intended to include polyclonal and monoclonal antibodies. An antibody (or immunoglobulin) consists of a glycoprotein containing at least two heavy (H) chains and two light (L) chains linked by disulfide bonds. Each heavy chain contains a heavy chain variable region (or domain) (abbreviated herein as HCVR or VH) and a heavy chain constant region. The heavy chain constant region contains three domains: CH1, CH2, and CH3. Each light chain contains a light chain variable region (abbreviated herein as LCVR or VL) and a light chain constant region. The light chain constant region contains one domain: CL. The VH and VL regions can be further subdivided into regions of hypervariability, referred to as complementarity determining regions (CDRs) or hypervariable regions, which are primarily responsible for binding to an antigen epitope, and interspersed with regions that are more conserved, referred to as framework regions. (FR). A method for identifying CDRs within the light and heavy chains of an antibody and determining their sequence is well known to those skilled in the art. For the avoidance of doubt, in the absence of any indication to the contrary in the text, the expression CDR means the hypervariable regions of the heavy and light chains of an antibody, as defined by IMGT, where the unique numbering of the IMGT provides a standardized delimitation of framework regions and complementarity determining regions, CDR1-IMGT: 27-38 , CDR2.

Уникальная нумерация IMGT была определена для сравнения вариабельных доменов, каким бы ни был рецептор антигена, тип цепи или вид [Lefranc M.-P., Immunology Today 18, 509 (1997)/ Lefranc M.-P., The Immunologist, 7, 132-136 (1999)/ Lefranc, M.-P., Pommie, C., Ruiz, M., Giudicelli, V., Foulquier, E., Truong, L., Thouvenin-Contet, V. and Lefranc, Dev. Сотр. Immunol., 27, 55-77 (2003)]. В уникальной нумерации IMGT консервативные аминокислоты всегда имеют то же самое положение, например, цистеин 23 (1-й CYS), триптофан 41 (КОНСЕРВАТИВНЫЙ TRP), гидрофобная аминокислота 89, цистеин 104 (2-й CYS), фенилаланин или триптофан 118 (J-PHE или J-TRP). Уникальная нумерация IMGT обеспечивает стандартизированное ограничение каркасных областей (FR1-IMGT: положения 1-26, FR2-IMGT: 39-55, FR3IMGT: 66-104 и FR4-IMGT: 118-128) и областей, определяющих комплементарность: CDR1-IMGT: 27-38, CDR2-IMGT: 56-65 и CDR3-IMGT: 105-117. Так как пробелы представляют собой незанятые положения, длины CDR-IMGT (показанные между скобками и разделенные точками, например [8.8.13]) становятся ключевой информацией. Уникальная нумерация IMGT используется в 2D (двумерных) графических представлениях, обозначенных как IMGT Colliers de Perles [Ruiz, M. and Lefranc, M.-P., Immunogenetics, 53, 857-883 (2002)/ Kaas, Q. and Lefranc, M.-P., Current Bioinformatics, 2, 21-30 (2007)], и в 3D (трехмерных) структурах в IMGT/3Dstructure-DB [Kaas, Q., Ruiz, M. and Lefranc, M.-P., T cell receptor and MHC structural data. Nucl. Acids. Res., 32, D208-D210 (2004)].A unique IMGT numbering has been defined to compare variable domains, whatever the antigen receptor, chain type, or species [Lefranc M.-P., Immunology Today 18, 509 (1997)/ Lefranc M.-P., The Immunologist, 7, 132-136 (1999)/ Lefranc, M.-P., Pommie, C., Ruiz, M., Giudicelli, V., Foulquier, E., Truong, L., Thouvenin-Contet, V. and Lefranc, Dev . Associate Immunol., 27, 55-77 (2003)]. In the unique IMGT numbering, conserved amino acids always have the same position, e.g. cysteine 23 (1st CYS), tryptophan 41 (CONSERVATIVE TRP), hydrophobic amino acid 89, cysteine 104 (2nd CYS), phenylalanine or tryptophan 118 (J -PHE or J-TRP). The unique IMGT numbering provides a standardized delimitation of the framework regions (FR1-IMGT: positions 1-26, FR2-IMGT: 39-55, FR3IMGT: 66-104 and FR4-IMGT: 118-128) and complementarity-determining regions: CDR1-IMGT: 27-38, CDR2-IMGT: 56-65 and CDR3-IMGT: 105-117. Since spaces represent unoccupied positions, the CDR-IMGT lengths (shown between brackets and separated by dots, eg [8.8.13]) become key information. The unique IMGT numbering is used in 2D (two-dimensional) graphical representations, designated as IMGT Colliers de Perles [Ruiz, M. and Lefranc, M.-P., Immunogenetics, 53, 857-883 (2002) / Kaas, Q. and Lefranc, M.-P., Current Bioinformatics, 2, 21-30 (2007)], and in 3D structures in IMGT/3Dstructure-DB [Kaas, Q., Ruiz, M. and Lefranc, M.-P. , T cell receptor and MHC structural data. Nucl. Acids. Res., 32, D208-D210 (2004)].

Каждая VH и VL состоит из трех CDR и четырех FR, организованных от аминоконца до карбоксиконца в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. Вариабельные области тяжелой и легкой цепей содержат связывающий домен, который взаимодействует с антигеном. Константные области антител могут опосредовать связывание иммуноглобулина с тканями хозяина или факторами, включая разные клетки иммунной системы (например, эффекторные клетки) и первый компонент (Clq) классической системы комплемента. Антитела могут быть разных изотипов (а именно IgA, IgD, IgE, IgG или IgM).Each VH and VL consists of three CDRs and four FRs, organized from amino to carboxy in the following order: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. The variable regions of the heavy and light chains contain a binding domain that interacts with an antigen. Antibody constant regions can mediate immunoglobulin binding to host tissues or factors, including various cells of the immune system (eg, effector cells) and the first component (Clq) of the classical complement system. Antibodies can be of different isotypes (namely IgA, IgD, IgE, IgG or IgM).

В конкретном воплощении указанное антитело, связывающееся с прогастрином, или его антигенсвязывающий фрагмент выбрано из группы, состоящей из: поликлональных антител, моноклональных антител, химерных антител, одноцепочечных антител, камелизированных антител, антител IgA1, антител IgA2, антител IgD, антител IgE, антител IgG1, антител IgG2, антител IgG3, антител IgG4 и антител IgM.In a particular embodiment, said progastrin-binding antibody or antigen-binding fragment thereof is selected from the group consisting of: polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, chimeric antibodies, single chain antibodies, camelized antibodies, IgA1 antibodies, IgA2 antibodies, IgD antibodies, IgE antibodies, IgG1 antibodies , IgG2 antibodies, IgG3 antibodies, IgG4 antibodies and IgM antibodies.

Поликлональное антитело представляет собой антитело, которое продуцировалось среди или в присутствии одного или более чем одного другого неидентичного антитела. В общем, поликлональные антитела продуцируются из В-лимфоцитов в присутствии нескольких других В-лимфоцитов, продуцирующих неидентичные антитела. Обычно поликлональные антитела получают непосредственно из иммунизированного животного.A polyclonal antibody is an antibody that has been produced among or in the presence of one or more other non-identical antibodies. In general, polyclonal antibodies are produced from B lymphocytes in the presence of several other B lymphocytes producing non-identical antibodies. Typically, polyclonal antibodies are obtained directly from the immunized animal.

Термин моноклональное антитело обозначает антитело, возникающее из почти гомогенной популяции антител, где данная популяция содержит идентичные антитела, за исключением нескольких возможных встречающихся в природе мутаций, которые могут находиться в минимальных пропорциях. Моноклональное антитело возникает в результате роста одного клона клеток, такого как гибридома, и отличается тяжелыми цепями одного класса и подкласса и легкими цепями одного типа.The term monoclonal antibody refers to an antibody arising from a nearly homogeneous population of antibodies, where this population contains identical antibodies, except for a few possible naturally occurring mutations, which may be in minimal proportions. A monoclonal antibody arises from the growth of a single cell clone, such as a hybridoma, and is distinguished by one class and subclass of heavy chains and one type of light chains.

Подразумевается то, что выражение антигенсвязывающий фрагмент антитела указывает любойThe expression antigen-binding fragment of an antibody is intended to indicate any

- 6 042821 пептид, полипептид или белок, сохраняющий способность связываться с мишенью (также обычно именуемой антигеном) указанного антитела, обычно с тем же самым эпитопом, и содержит аминокислотную последовательность из по меньшей мере 5 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 10 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 15 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 20 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 25 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 40 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 50 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 60 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 70 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 80 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 90 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 100 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 125 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 150 смежных аминокислотных остатков, по меньшей мере 175 смежных аминокислотных остатков или по меньшей мере 200 смежных аминокислотных остатков аминокислотной последовательности антитела.- 6 042821 peptide, polypeptide or protein that retains the ability to bind to the target (also commonly referred to as an antigen) of the specified antibody, usually with the same epitope, and contains an amino acid sequence of at least 5 contiguous amino acid residues, at least 10 contiguous amino acid residues , at least 15 contiguous amino acid residues, at least 20 contiguous amino acid residues, at least 25 contiguous amino acid residues, at least 40 contiguous amino acid residues, at least 50 contiguous amino acid residues, at least 60 contiguous amino acid residues, at least 70 contiguous amino acid residues, at least 80 contiguous amino acid residues, at least 90 contiguous amino acid residues, at least 100 contiguous amino acid residues, at least 125 contiguous amino acid residues, at least 150 contiguous amino acid residues, at least 175 contiguous amino acid residues or at least 200 contiguous amino acid residues of an antibody amino acid sequence.

В конкретном воплощении указанный антигенсвязывающий фрагмент содержит по меньшей мере одну CDR антитела, из которого она происходит. Кроме того, в предпочтительном воплощении указанный антигенсвязывающий фрагмент содержит 2, 3, 4 или 5 CDR, более предпочтительно 6 CDR антитела, из которого они происходят.In a specific embodiment, said antigen-binding fragment contains at least one CDR of the antibody from which it is derived. In addition, in a preferred embodiment, said antigen binding fragment contains 2, 3, 4 or 5 CDRs, more preferably 6 CDRs of the antibody from which they are derived.

Антигенсвязывающие фрагменты могут быть выбраны, без ограничения, в группе, состоящей из фрагментов Fv, scFv (sc обозначает одноцепочечный), Fab, F(ab')2, Fab', scFv-Fc или диател, или слитых белков с разупорядоченными пептидами, такими как XTEN (удлиненный рекомбинантный полипептид) или мотивы PAS, или любого фрагмента время полужизни которого было бы увеличено химической модификацией, такой как добавление поли(алкилен)гликоля, такого как поли(этилен)гликоль (PEGилирование) (пэгилированные фрагменты называются Fv-PEG, scFv-PEG, Fab-PEG, F(ab')2-PEG или Fab'-PEG) (PEG обозначает полиэтиленгликоль), или посредством включения в липосому, причем указанные фрагменты имеют по меньшей мере одну из характерных CDR антитела по изобретению. Предпочтительно указанные антигенсвязывающие фрагменты будут составлены или будут состоять из частичной последовательности вариабельной области тяжелой или легкой цепи антитела, из которого они происходят, причем указанная частичная последовательность является достаточной для сохранения такой же специфичности связывания, что и у антитела, из которого она происходит, и достаточной аффинности, предпочтительно по меньшей мере равной 1/100, более предпочтительно по меньшей мере - 1/10 аффинности антитела, из которого она происходит, в отношении мишени.Antigen binding fragments may be selected, without limitation, from the group consisting of Fv, scFv (sc stands for single chain), Fab, F(ab') 2 , Fab', scFv-Fc, or diabodies, or fusion proteins with disordered peptides such as as XTEN (extended recombinant polypeptide) or PAS motifs, or any fragment whose half-life would be increased by chemical modification such as the addition of a poly(alkylene) glycol such as poly(ethylene) glycol (PEGylation) (pegylated fragments are called Fv-PEG, scFv-PEG, Fab-PEG, F(ab') 2 -PEG or Fab'-PEG) (PEG is polyethylene glycol), or by incorporation into a liposome, said fragments having at least one of the characteristic CDRs of an antibody of the invention. Preferably, said antigen-binding fragments will be or will consist of a partial sequence of the heavy or light chain variable region of the antibody from which they are derived, said partial sequence being sufficient to retain the same binding specificity as the antibody from which it is derived and sufficient affinity, preferably at least equal to 1/100, more preferably at least - 1/10 of the affinity of the antibody from which it is derived, in relation to the target.

В другом конкретном воплощении в способе диагностики рака легкого согласно изобретению биологический образец от субъекта приводится в контакт с антителом, связывающимся с прогастрином, где указанное антитело было получено способом иммунизации, известным специалисту в данной области, где в качестве иммуногена используется пептид, аминокислотная последовательность которого содержит всю аминокислотную последовательность прогастрина или ее часть. Более конкретно, указанный иммуноген содержит пептид, выбранный среди пептида, аминокислотная последовательность которого содержит или состоит из аминокислотной последовательности полноразмерного прогастрина и, в частности, полноразмерного человеческого прогастрина SEQ ID NO: 1, пептида, аминокислотная последовательность которого соответствует части аминокислотной последовательности прогастрина и, в частности, полноразмерного человеческого прогастрина SEQ ID NO: 1, пептида, аминокислотная последовательность которого соответствует части или всей аминокислотной последовательности N-концевой части прогастрина и, в частности, пептидам, содержащим или состоящим из аминокислотной последовательности: SWKPRSQQPDAPLG (SEQ ID NO: 2), и пептида, аминокислотная последовательность которого соответствует части или всей аминокислотной последовательности С-концевой части прогастрина и, в частности, пептидам, содержащим или состоящим из аминокислотной последовательности: QGPWLEEEEEAYGWMDFGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 3), пептида, аминокислотная последовательность которого соответствует части аминокислотной последовательности С-концевой части прогастрина и, в частности, пептидам, содержащим аминокислотную последовательность FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40), соответствующую аминокислотам 71-80 прогастрина.In another specific embodiment, in the method for diagnosing lung cancer according to the invention, a biological sample from a subject is brought into contact with an antibody that binds to progastrin, where the specified antibody was obtained by an immunization method known to a person skilled in the art, where a peptide is used as an immunogen, the amino acid sequence of which contains all or part of the progastrin amino acid sequence. More specifically, said immunogen comprises a peptide selected from a peptide whose amino acid sequence contains or consists of the amino acid sequence of full length progastrin and in particular full length human progastrin of SEQ ID NO: 1, a peptide whose amino acid sequence corresponds to a portion of the amino acid sequence of progastrin and, in in particular full-length human progastrin SEQ ID NO: 1, a peptide whose amino acid sequence corresponds to part or all of the amino acid sequence of the N-terminal part of progastrin, and in particular peptides containing or consisting of the amino acid sequence: SWKPRSQQPDAPLG (SEQ ID NO: 2), and a peptide whose amino acid sequence corresponds to part or all of the amino acid sequence of the C-terminal portion of progastrin and, in particular, peptides containing or consisting of the amino acid sequence: QGPWLEEEEEAYGWMDFGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 3), a peptide whose amino acid sequence corresponds to part of the amino acid sequence C -terminal part of progastrin and, in particular, peptides containing the amino acid sequence FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40) corresponding to amino acids 71-80 of progastrin.

Специалисту будет понятно то, что такую иммунизацию можно использовать для получения либо поликлональных, либо моноклональных антител в зависимости от того, что является желательным. Способы получения каждого из данных типов антител хорошо известны в данной области. Таким образом, специалист легко выберет и применит способ получения поликлональных и/или моноклональных антител против любого данного антигена.The specialist will understand that such immunization can be used to obtain either polyclonal or monoclonal antibodies, depending on what is desired. Methods for obtaining each of these types of antibodies are well known in this field. Thus, one skilled in the art will readily select and use a method for producing polyclonal and/or monoclonal antibodies against any given antigen.

Примеры моноклональных антител, которые были получены с использованием иммуногена, содержащего аминокислотную последовательность SWKPRSQQPDAPLG, соответствующую аминокислотной последовательности 1-14 человеческого прогастрина (N-концевая оконечность), включают моноклональные антитела, обозначенные как mAb3, mAb4, mAb16, mAb19 и mAb20, как описано в следующихExamples of monoclonal antibodies that have been generated using an immunogen containing the amino acid sequence SWKPRSQQPDAPLG corresponding to amino acid sequence 1-14 of human progastrin (N-terminus) include the monoclonal antibodies designated mAb3, mAb4, mAb16, mAb19, and mAb20 as described in next

- 7 042821 табл. 1-4, но не ограничиваются ими. Были описаны другие моноклональные антитела, хотя и не ясно, связываются ли фактически данные антитела с прогастрином (WO 2006/032980). Экспериментальные результаты картирования эпитопов показывают то, что mAb3, mAb4, mAb16, mAb19 и mAb20 действительно специфично связываются с эпитопом в пределах указанной N-концевой аминокислотной последовательности hPG. Поликлональные антитела, специфично распознающие эпитоп в пределах N-конца прогастрина, представленного SEQ ID NO: 2, были описаны в данной области (см., например, WO 2011/083088).- 7 042821 tab. 1-4, but are not limited to them. Other monoclonal antibodies have been described, although it is not clear whether these antibodies actually bind to progastrin (WO 2006/032980). Experimental epitope mapping results show that mAb3, mAb4, mAb16, mAb19, and mAb20 indeed bind specifically to an epitope within the indicated N-terminal amino acid sequence of hPG. Polyclonal antibodies specifically recognizing an epitope within the N-terminus of progastrin represented by SEQ ID NO: 2 have been described in the art (see, for example, WO 2011/083088).

Таблица 1Table 1

Депонирование гибридомы Deposition of hybridoma mAb mAb Аминокислотные последовательности Amino acid sequences SEQ ID NO SEQID NO 6В5В11С10 6V5V11S10 тАЬЗ tal3 CDR 1 VH CDR 1 VH GYIFTSYW GYIFTSYW SEQ ID NO 4 SEQID NO 4 CDR 2 VH CDR 2 VH FYPGNSDS FYPGNSDS SEQ ID NO 5 SEQID NO 5 CDR3VH CDR3VH TRRDSPQY TRRDSPQY SEQ ID NO 6 SEQ ID NO 6 CDR 1 VL CDR 1 VL QSIVHSNGNTY QSIVHSNGNTY SEQ ID NO 7 SEQ ID NO 7 CDR 2 VL CDR2 VL KVS KVS SEQ ID NO 8 SEQID NO 8 CDR3VL CDR3VL FQGSHVPFT FQGSHVPFT SEQ ID NO 9 SEQ ID NO 9 mVH 3 mVH 3 EVQLQQSGTVLARPGASVKMS CKASGYIFTSYWVHWVKQRPG QGLEWIGGFYPGNSDSRYNQ KFKGKATLTAVTSASTAYMDLS SLTNEDSAVYFCTRRDSPQYW GQGTTLTVSS EVQLQQSGTVLARPGASVKMS CKASGYIFTSYWVHWVKQRPG QGLEWIGGFYPGNSDSRYNQ KFKGKATLTAVTSASTAYMDLS SLTNEDSAVYFCTRRDSPQYW GQGTTLTVSS SEQ ID NO 41 SEQ ID NO 41 mVL 3 mvl 3 DVLMTQTPLSLPVSLGDQASIS CRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQ KPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPD RFSGSGSGTDFTLKISRLEAED LGVYYCFQGSHVPFTFGGGTK LEIK DVLMTQTPLSLPVSLGDQASIS CRSSQSIVHSNGNTYLEWYLQ KPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPD RFSGSGSGTDFTLKISRLEAED LGVYYCFQGSHVPFTFGGGTK SEQ ID NO 42 SEQ ID NO 42 huVH 3 huVH 3 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYI FTSYWVHWVRQAPG QRLEWMGGFYPGNSDSRYSQ KFQGRVTITRDTSASTAYMELS SLRSEDTAVYYCTRRDSPQYW GQGTLVTVSS QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYI FTSYWVHWVRQAPG QRLEWMGGFYPGNSDSRYSQ KFQGRVTITRDTSASTAYMELS SLRSEDTAVYYCTRRDSPQYW GQGTLVTVSS SEQ ID NO 53 SEQ ID NO 53 huVL 3 huVL 3 DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSIVHSNGNTYLEWFQQ RPGQSPRRLIYKVSNRFSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCFQGSHVPFTFGGGT KVEIK DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSIVHSNGNTYLEWFQQ RPGQSPRRLIYKVSNRFSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCFQGSHVPFTFGGGT KVEIK SEQ ID NO 54 SEQ ID NO 54

- 8 042821- 8 042821

Таблица 2table 2

20D2C3G2 20D2C3G2 тАЬ4 taL4 CDR 1 VH CDR 1 VH GYTFSSW GYTFSSW SEQ ID NO 10 SEQID NO 10 CDR 2 VH CDR 2 VH FLPGSGST FLPGSGST SEQ ID NO 11 SEQ ID NO 11 CDR3VH CDR3VH ATDGNYDWFAY ATDGNYDWFAY SEQ ID NO 12 SEQ ID NO 12 CDR 1 VL CDR 1 VL QSLVHSSGVTY QSLVHSSGVTY SEQ ID NO 13 SEQ ID NO 13 CDR 2 VL CDR2 VL KVS KVS SEQ ID NO 14 SEQ ID NO 14 CDR 3 VL CDR 3 VL SQSTHVPPT SQSTHVPPT SEQ ID NO 15 SEQ ID NO 15 mVH 4 mvh 4 QVQLQQSGAELMKPGASVKIS CKATGYTFSSSWIEWLKQRPG HGLEWIGEFLPGSGSTDYNEK FKGKATFTADTSSDTAYMLLSS LTSEDSAVYYCATDGNYDWFA YWGQGTLVTVSA QVQLQQSGAELMKPGASVKIS CKATGYTFSSSWIEWLKQRPG HGLEWIGEFLPGSGSTDYNEK FKGKATFTADTSSDTAYMLLSS LTSEDSAVYYCATDGNYDWFA YWGQGTLVTVSA SEQ ID NO 43 SEQ ID NO 43 mVL 4 mvl 4 DLVMTQTPLSLPVSLGDQASIS CRSSQSLVHSSGVTYLHWYLQ KPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPD RFSGSGSGTDFTLKISRVEAED LGVYFCSQSTHVPPTFGSGTK LEIK DLVMTQTPLSLPVSLGDQASIS CRSSQSLVHSSGVTYLHWYLQ KPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPD RFSGSGSGTDFTLKISRVEAED LGVYFCSQSTHVPPTFGSGTK LEIK SEQ ID NO 44 SEQ ID NO 44 huVH 4 huVH 4 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFSSSWMHWVRQAP GQGLEWMGIFLPGSGSTDYAQ KFQGRVTMTRDTSTSTVYMEL SSLRSEDTAVYYCATDGNYDW FAYWGQGTLVTVSS QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFSSSWMHWVRQAP GQGLEWMGIFLPGSGSTDYAQ KFQGRVTMTRDTSTSTVYMEL SSLRSEDTAVYYCATDGNYDW FAYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO 55 SEQ ID NO 55 huVL4 huVL4 DIVMTQTPLSLSVTPGQPASIS CKSSQSLVHSSGVTYLYWYLQ KPGQSPQLLIYKVSNRFSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCSQSTHVPPTFGQGT KLEIK DIVMTQTPLSLSVTPGQPASIS CKSSQSLVHSSGVTYLYWYLQ KPGQSPQLLIYKVSNRFSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCSQSTHVPPTFGQGT KLEIK SEQ ID NO 56 SEQ ID NO 56

Таблица 3Table 3

Депонирование гибридомы Deposition of hybridoma mAb mAb Аминокислотные последовательности Amino acid sequences SEQ ID NO SEQID NO 1E9D9B6 1E9D9B6 тАЬ16 taL16 CDR 1 VH CDR 1 VH GYTFTSYY GYTFTSYY SEQ ID NO 16 SEQ ID NO 16 CDR 2 VH CDR 2 VH INPSNGGT INPSNGGT SEQ ID NO 17 SEQ ID NO 17 CDR 3 VH CDR 3 VH TRGGYYPFDY TRGGYYPFDY SEQ ID NO 18 SEQ ID NO 18 CDR 1 VL CDR 1 VL QSLLDSDGKTY QSLLDSDGKTY SEQ ID NO 19 SEQ ID NO 19 CDR 2 VL CDR2 VL LVS LVS SEQ ID NO 20 SEQID NO 20 CDR3VL CDR3VL WQGTHSPYT WQGTHSPYT SEQ ID NO 21 SEQ ID NO 21 mVH 16 mvh 16 QVQLQQSGAELVKPGASVKLS CKASGYTFTSYYMYWVKQRP GQGLEWIGEINPSNGGTNFNE KFKSKATLTVDKSSSTAYMQLS SLTSEDSAVYYCTRGGYYPFD YWGQGTTLTVSS QVQLQQSGAELVKPGASVKLS CKASGYTFTSYYMYWVKQRP GQGLEWIGEINPSNGGTNFNE KFKSKATLTVDKSSSTAYMQLS SLTSEDSAVYYCTRGGYYPFD YWGQGTTLTVSS SEQ ID NO 45 SEQ ID NO 45 mVL 16 mvl 16 DWMTQTPLTLSVTIGRPASIS CKSSQSLLDSDGKTYLYWLLQ RPGQSPKRLIYLVSELDSGVPD RITGSGSGTDFTLKISRVEAED LGVYYCWQGTHSPYTFGGGT KLEIK DWMTQTPLTLSVTIGRPASIS CKSSQSLLDSDGKTYLYWLLQ RPGQSPKRLIYLVSELDSGVPD RITGSGSGTDFTLKISRVEAED LGVYYCWQGTHSPYTFGGGT KLEIK SEQ ID NO 46 SEQ ID NO 46 huVH 16a huVH 16a QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFTSYYMYWVRQAP GQGLEWMGIINPSNGGTSYAQ KFQGRVTMTRDTSTSTVYMEL SSLRSEDTAVYYCTRGGYYPF DYWGQGTTVTVSS QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFTSYYMYWVRQAP GQGLEWMGIINPSNGGTSYAQ KFQGRVTMTRDTSTSTVYMEL SSLRSEDTAVYYCTRGGYYPF DYWGQGTTVTVSS SEQ ID NO 57 SEQ ID NO 57 huVH 16b huVH 16b QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFTSYYMHWVRQAP GQGLEWMGIINPSNGGTSYAQ KFQGRVTMTRDTSTSTVYMEL SSLRSEDTAVYYCTRGGYYPF QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFTSYYMHWVRQAP GQGLEWMGIINPSNGGTSYAQ KFQGRVTMTRDTSTSTVYMEL SSLRSEDTAVYYCTRGGYYPF SEQ ID NO 58 SEQ ID NO 58

- 9 042821- 9 042821

DYWGQGTTVTVSS DYWGQGTTVTVSS huVH 16с huVH 16s QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFTSYYMYWVRQAP GQGLEWMGEINPSNGGTNYA QKFQGRVTMTRDTSTSTVYME LSSLRSEDTAVYYCTRGGYYP FDYWGQGTTVTVSS QVQLVQSGAEVKKPGASVKVS CKASGYTFTSYYMYWVRQAP GQGLEWMGEINPSNGGTNYA QKFQGRVTMTRDTSTSTVYME LSSLRSEDTAVYYCTRGGYYP FDYWGQGTTVTVSS SEQ ID NO 59 SEQ ID NO 59 huVL 16а huVL 16a DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSLLDSDGKTYLYWFQQ RPGQSPRRLIYLVSNRDSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCWQGTHSPYTFGQG TKLEIK DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSLLDSDGKTYLYWFQQ RPGQSPRRLIYLVSNRDSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCWQGTHSPYTFGQG TKLEIK SEQ ID NO 60 SEQ ID NO 60 huVL 16b huVL 16b DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSLLDSDGKTYLNWFQQ RPGQSPRRLIYLVSNRDSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCWQGTHSPYTFGQG TKLEIK DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSLLDSDGKTYLNWFQQ RPGQSPRRLIYLVSNRDSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCWQGTHSPYTFGQG TKLEIK SEQ ID NO 61 SEQ ID NO 61 huVL 16c huVL 16c DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSLLDSDGKTYLYWFQQ RPGQSPRRLIYLVSERDSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCWQGTHSPYTFGQG TKLEIK DWMTQSPLSLPVTLGQPASIS CRSSQSLLDSDGKTYLYWFQQ RPGQSPRRLIYLVSERDSGVP DRFSGSGSGTDFTLKISRVEAE DVGVYYCWQGTHSPYTFGQG TKLEIK SEQ ID NO 62 SEQ ID NO 62

Таблица 4Table 4

Депонирование гибридомы Deposition of hybridoma mAb mAb Аминокислотные последовательности Amino acid sequences SEQ ID NO SEQID NO 1B3B4F11 1B3B4F11 mAb19 mAb19 CDR 1 VH CDR 1 VH GYSITSDYA GYSITSDYA SEQ ID NO 22 SEQ ID NO 22 CDR 2 VH CDR 2 VH ISFSGYT ISFSGYT SEQ ID NO 23 SEQ ID NO 23 CDR3VH CDR3VH AREVNYGDSYHFDY AREVNYGDSYHFDY SEQ ID NO 24 SEQ ID NO 24 CDR 1 VL CDR 1 VL SQHRTYT SQHRTYT SEQ ID NO 25 SEQ ID NO 25 CDR 2 VL CDR2 VL VKKDGSH VKKDGSH SEQ ID NO 26 SEQ ID NO 26 CDR3VL CDR3VL GVGDAIKGQSVFV GVGDAIKGQSVFV SEQ ID NO 27 SEQ ID NO 27 mVH 19 mvh 19 DVQLQESGPGLVKPSQSLSLT CTVTGYSITSDYAWNWIRQFP GNKLEWMGYISFSGYTSYNPS LKSRISVTRDTSRNQFFLQLTS VTTEDTATYYCAREVNYGDSY HFDYWGQGTIVTVSS DVQLQESGPGLVKPSQSLSLT CTVTGYSITSDYAWNWIRQFP GNKLEWMGYISFSGYTSYNPS LKSRISVTRDTSRNQFFLQLTS VTTEDTATYYCAREVNYGDSY HFDYWGQGTIVTVSS SEQ ID NO 47 SEQ ID NO 47 mVL 19 mvl 19 QLALTQSSSASFSLGASAKLTC TLSSQHRTYTIEWYQQQSLKP PKYVMEVKKDGSHSTGHGIPD RFSGSSSGADRYLSISNIQPED EAIYICGVGDAIKGQSVFVFGG GTKVTVL QLALTQSSSASFSLGASAKLTC TLSSQHRTYTIEWYQQQSLKP PKYVMEVKKDGSHSTGHGIPD RFSGSSSGADRYLSISNIQPED EAIYICGVGDAIKGQSVFVFGG GTKVTVL SEQ ID NO 48 SEQ ID NO 48 huVH 19a huVH 19a QVQLQESGPGLVKPSQTLSLT CTVSGYSITSDYAWNWIRQHP GKGLEWIGYISFSGYTYYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSV TAADTAVYYCAREVNYGDSYH FDYWGQGTLVTVSS QVQLQESGPGLVKPSQTLSLT CTVSGYSITSDYAWNWIRQHP GKGLEWIGYISFSGYTYYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSV TAADTAVYYCAREVNYGDSYH FDYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO 63 SEQ ID NO 63 huVH 19b huVH 19b QVQLQESGPGLVKPSQTLSLT CTVSGYSITSDYAWSWIRQHP GKGLEWIGYISFSGYTYYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSV TAADTAVYYCAREVNYGDSYH FDYWGQGTLVTVSS QVQLQESGPGLVKPSQTLSLT CTVSGYSITSDYAWSWIRQHP GKGLEWIGYISFSGYTYYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSV TAADTAVYYCAREVNYGDSYH FDYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO 64 SEQ ID NO 64 huVH 19c huVH 19c QVQLQESGPGLVKPSQTLSLT CTVSGYSITSDYAWNWIRQHP GKGLEWIGYISFSGYTSYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSV TAADTAVYYCAREVNYGDSYH FDYWGQGTLVTVSS QVQLQESGPGLVKPSQTLSLT CTVSGYSITSDYAWNWIRQHP GKGLEWIGYISFSGYTSYNPSL KSRVTISVDTSKNQFSLKLSSV TAADTAVYYCAREVNYGDSYH FDYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO 65 SEQ ID NO 65 huVL 19a huVL 19a QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSQHRTYTIEWHQQQPEKG PRYLMKVKKDGSHSKGDGIPD QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSQHRTYTIEWHQQQPEKG PRYLMKVKKDGSHSKGDGIPD SEQ ID NO 66 SEQ ID NO 66

- 10 042821- 10 042821

RFSGSSSGAERYLTISSLQSED EADYYCGVGDAIKGQSVFVFG GGTKVEIK RFSGSSSGAERYLTISSLQSED EADYYCGVGDAIKGQSVFVFG GGTKVEIK huVL 19b huVL 19b QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSQHRTYTIAWHQQQPEKG PRYLMKVKKDGSHSKGDGIPD RFSGSSSGAERYLTISSLQSED EADYYCGVGDAIKGQSVFVFG GGTKVEIK QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSQHRTYTIAWHQQQPEKG PRYLMKVKKDGSHSKGDGIPD RFSGSSSGAERYLTISSLQSED EADYYCGVGDAIKGQSVFVFG GGTKVEIK SEQ ID NO 67 SEQ ID NO 67 huVL 19с huVL 19s QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSQHRTYTIEWHQQQPEKG PRYLMEVKKDGSHSKGDGIPD RFSGSSSGAERYLTISSLQSED EADYYCGVGDAIKGQSVFVFG GGTKVEIK QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSQHRTYTIEWHQQQPEKG PRYLMEVKKDGSHSKGDGIPD RFSGSSSGAERYLTISSLQSED EADYYCGVGDAIKGQSVFVFG GGTKVEIK SEQ ID NO 68 SEQ ID NO 68

Примеры моноклональных антител, которые могут быть получены с использованием иммуногена, содержащего аминокислотную последовательность QGPWLEEEEEAYGWMDFGRRSAEDEN (Сконцевая часть прогастрина), соответствующую аминокислотной последовательности 55-80 человеческого прогастрина, включают антитела, обозначенные в следующих табл. 5 и 6 как mAb8 и mAb13, но не ограничиваются ими. Экспериментальные результаты картирования эпитопов показывают то, что mAb13 действительно специфично связывается с эпитопом в пределах указанной С-концевой аминокислотной последовательности hPG. Другим примером моноклинального антитела, которое может быть получено таким образом, является антитело mAb14, продуцируемое гибридомой 2H9F4B7, описанной в WO 2011/083088. Гибридома 2H9F4B7 была депонирована согласно Будапештскому соглашению в CNCM, Институт Пастера, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Париж CEDEX 15, Франция, 27 декабря 2016 г., согласно ссылке I-5158 (см. WO 2017/114973).Examples of monoclonal antibodies that can be obtained using an immunogen containing the amino acid sequence QGPWLEEEEEAYGWMDFGRRSAEDEN (C-terminal part of progastrin) corresponding to the amino acid sequence 55-80 of human progastrin include the antibodies indicated in the following table. 5 and 6 as but not limited to mAb8 and mAb13. The experimental results of epitope mapping show that mAb13 indeed specifically binds to an epitope within the indicated C-terminal amino acid sequence of hPG. Another example of a monoclinal antibody that can be obtained in this way is the mAb14 antibody produced by the 2H9F4B7 hybridoma described in WO 2011/083088. Hybridoma 2H9F4B7 was deposited under the Budapest Agreement at CNCM, Institut Pasteur, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris CEDEX 15, France on December 27, 2016, according to reference I-5158 (see WO 2017/114973).

Таблица 5Table 5

Депонирование гибридомы Deposition of hybridoma mAb mAb Аминокислотные последова- Amino acid sequences SEQ ID NO SEQID NO тельности validity 1C10D3B9 1C10D3B9 mAb8 mAb8 CDR 1 VH CDR 1 VH GFTFTTYA GFTFTTYA SEQ ID NO 28 SEQ ID NO 28 CDR 2 VH CDR 2 VH ISSGGTYT ISSGGTYT SEQ ID NO 29 SEQ ID NO 29 CDR3VH CDR3VH ATQGNYSLDF ATQGNYSLDF SEQ ID NO 30 SEQID NO 30 CDR 1 VL CDR 1 VL KSLRHTKGITF KSLRHTKGITF SEQ ID NO 31 SEQ ID NO 31 CDR 2 VL CDR2 VL QMS QMS SEQ ID NO 32 SEQ ID NO 32 CDR3VL CDR3VL AQNLELPLT AQNLELPLT SEQ ID NO 33 SEQ ID NO 33 mVH 8 mVH 8 EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVATISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSS EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVATISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSS SEQ ID NO 49 SEQ ID NO 49 mVL 8 mvl 8 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNLASG VPDRFSSSGSGTDFTLKISRV EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIK DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNLASG VPDRFSSSGSGTDFTLKISRV EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIK SEQ ID NO 50 SEQ ID NO 50 VH hZ8CV1 VH hZ8CV1 EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVSSISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSS EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVSSISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSS SEQ ID NO 69 SEQ ID NO 69 VL hZ8CV1 VL hZ8CV1 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNRASG VPDRFSGSGSGTDFTLKISRV EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIK DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNRASG VPDRFSGSGSGTDFTLKISRV EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIK SEQ ID NO 70 SEQ ID NO 70 VH hZ8CV2 VH hZ8CV2 EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVATISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVATISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL SEQ ID NO 71 SEQ ID NO 71

- 11 042821- 11 042821

QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSS QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSS VL hZ8CV2 VL hZ8CV2 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNLASG VPDRFSSSGSGTDFTLKISRV EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIK DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNLASG VPDRFSSSGSGTDFTLKISRV EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIK SEQ ID NO 72 SEQ ID NO 72 CH hZ8CV2 CH hZ8CV2 EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVATISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAA LGCLVKDYFPEPVTVSWNSG ALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL SSVVTVPSSSLGTQTYICNVN HKPSNTKVDKRVEPKSCDKT HTCPPCPAPELLGGPSVFLFP PKPKDTLMISRTPEVTCWVD VSHEDPEVKFNWYVDGVEV HNAKTKPREEQYNSTYRWS VLTVLHQDWLNGKEYKCKVS NKALPAPIEKTISKAKGQPRE PQVYTLPPSREEMTKNQVSL TCLVKGFYPSDIAVEWESNG QPENNYKTTPPVLDSDGSFF LYSKLTVDKSRWQQGNVFSC SVMHEALHNHYTQKSLSLSP GK EVQLVESGGGLVKPGGSLRL SCAASGFTFTTYAMSWVRQA PGKGLEWVATISSGGTYTYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCATQGN YSLDFWGQGTTVTVSSASTK GPSVFPLAPSSKSTSGGTAA LGCLVKDYFPEPVTVSWNSG ALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL SSVVTVPSSSLGTQTYICNVN HKPSNTKVDKRVEPKSCDKT HTCPPCPAPELLGGPSVFLFP PKPKDTLMISRTPEVTCWVD VSHEDPEVKFNWYVDGVEV HNAKTKPREEQYNSTYRWS VLTVLHQDWLNGKEYKCKVS NKALPAPIEKTISKAKGQPRE PQVYTLPPSREEMTKNQVSL TCLVKGFYPSDIAVEWESNG QPENNYKTTPPVLDSDGSFF LYSKLTVDKSRWQQGNVFSC SVMHEALHNHYTQKSLSLSP GK SEQ ID NO 73 SEQ ID NO 73 CL hZ8CV2 CL hZ8CV2 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNLASG VPDRFSSSGSGTDFTLKISRV DIVMTQSPLSLPVTPGEPASI SCRSSKSLRHTKGITFLYWYL QKPGQSPQLLIYQMSNLASG VPDRFSSSGSGTDFTLKISRV SEQ ID NO 74 SEQ ID NO 74 EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIKRTVAAPSVFIFP PSDEQLKSGTASWCLLNNF YPREAKVQWKVDNALQSGN SQESVTEQDSKDSTYSLSST LTLSKADYEKHKVYACEVTH QGLSSPVTKSFNRGEC EAEDVGVYYCAQNLELPLTF GGGTKVEIKRTVAAPSVFIFP PSDEQLKSGTASWCLLNNF YPREAKVQWKVDNALQSGN SQESVTEQDSKDSTYSLSST LTLSKADYEKHKVYACEVTH QGLSSPVTKSFNRGEC

Таблица 6Table 6

Депонирование гибридомы Deposition of hybridoma mAb mAb Аминокислотные последовательности Amino acid sequences SEQ ID NO SEQID NO 2C6C3C7 2C6C3C7 тАЫЗ TAYZ CDR 1 VH CDR 1 VH GFIFSSYG GFIFSSYG SEQ ID NO 34 SEQ ID NO 34 CDR 2 VH CDR 2 VH INTFGDRT INTFGDRT SEQ ID NO 35 SEQ ID NO 35 CDR 3 VH CDR 3 VH ARGTGTY ARGTGTY SEQ ID NO 36 SEQ ID NO 36 CDR 1 VL CDR 1 VL QSLLDSDGKTY QSLLDSDGKTY SEQ ID NO 37 SEQ ID NO 37 CDR 2 VL CDR2 VL LVS LVS SEQ ID NO 38 SEQ ID NO 38 CDR3VL CDR3VL WQGTHFPQT WQGTHFPQT SEQ ID NO 39 SEQ ID NO 39 mVH 13 mvh 13 EVQLVESGGGLVQPGGSLKL SCAASGFIFSSYGMSWVRQS PDRRLELVASINTFGDRTYYP DSVKGRFTISRDNAKNTLYLQ MTSLKSEDTAIYYCARGTGTY WGQGTTLTVSS EVQLVESGGGLVQPGGSLKL SCAASGFIFSSYGMSWVRQS PDRRLELVASINTFGDRTYYP DSVKGRFTISRDNAKNTLYLQ MTSLKSEDTAIYYCARGTGTY WGQGTTLTVSS SEQ ID NO 51 SEQ ID NO 51 mVL 13 mvl 13 DVVLTQTPLTLSVTIGQPASIS CKSSQSLLDSDGKTYLNWLL QRPGQSPKRLIYLVSKLDSGV PDRFTGSGSGTDFTLKISRVE AEDLGVYYCWQGTHFPQTF GGGTKLEIK DVVLTQTPLTLSVTIGQPASIS CKSSQSLLDSDGKTYLNWLL QRPGQSPKRLIYLVSKLDSGV PDRFTGSGSGTDFTLKISRVE AEDLGVYYCWQGTHFPQTF GGGTKLEIK SEQ ID NO 52 SEQ ID NO 52 huVH 13a huVH 13a EVQLVESGGGLVQPGGSLRL SCAASGFIFSSYGMSWVRQA PGKGLEWVANINTFGDRTYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYL EVQLVESGGGLVQPGGSLRL SCAASGFIFSSYGMSWVRQA PGKGLEWVANINTFGDRTYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYL SEQ ID NO 75 SEQ ID NO 75

- 12042821- 12042821

QMNSLRAEDTAVYYCARGTG TYWGQGTLVTVSS QMNSLRAEDTAVYYCARGTG TYWGQGTLVTVSS huVH 13b huVH 13b EVQLVESGGGLVQPGGSLRL SCAASGFIFSSYGMSWVRQA PGKGLEWVASINTFGDRTYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCARGTG TYWGQGTLVTVSS EVQLVESGGGLVQPGGSLRL SCAASGFIFSSYGMSWVRQA PGKGLEWVASINTFGDRTYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYL QMNSLRAEDTAVYYCARGTG TYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO 76 SEQ ID NO 76 huVL 13а huVL 13a DVVMTQSPLSLPVTLGQPASI SCRSSQSLLDSDGKTYLNWF QQRPGQSPRRLIYLVSNRDS GVPDRFSGSGSGTDFTLKIS RVEAEDVGVYYCWQGTHFP QTFGGGTKVEIK DVVMTQSPLSLPVTLGQPASI SCRSSQSLLDSDGKTYLNWF QQRPGQSPRRLIYLVSNRDS GVPDRFSGSGSGTDFTLKIS RVEAEDVGVYYCWQGTHFP QTFGGGTKVEIK SEQ ID NO 77 SEQ ID NO 77 huVL 13b huVL 13b DVVMTQSPLSLPVTLGQPASI SCRSSQSLLDSDGKTYLNWF QQRPGQSPRRLIYLVSKRDS GVPDRFSGSGSGTDFTLKIS RVEAEDVGVYYCWQGTHFP QTFGGGTKVEIK DVVMTQSPLSLPVTLGQPASI SCRSSQSLLDSDGKTYLNWF QQRPGQSPRRLIYLVSKRDS GVPDRFSGSGSGTDFTLKIS RVEAEDVGVYYCWQGTHFP QTFGGGTKVEIK SEQ ID NO 78 SEQ ID NO 78

Другие примеры включают моноклоналыные и/или поликлональные антитела против hPG, полученные с использованием иммуногена, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40.Other examples include anti-hPG monoclonal and/or polyclonal antibodies produced using an immunogen containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40.

В более конкретном воплощении в способе по изобретению указанный биологический образец приводится в контакт с антителом против hPG или его антигенсвязывающим фрагментом, где указанное антитело против hPG выбрано среди антител против N-конца hPG и антител против С-конца hPG.In a more specific embodiment, in the method of the invention, said biological sample is contacted with an anti-hPG antibody or an antigen-binding fragment thereof, wherein said anti-hPG antibody is selected from anti-hPG N-terminal antibodies and anti-hPG C-terminal antibodies.

Термины антитела против N-конца hPG и антитела против С-конца hPG обозначают антитела, связывающиеся с эпитопом, содержащим аминокислоты, расположенной в N-концевой части hPG, или с эпитопом, содержащим аминокислоты, расположенной в С-концевой части hPG, соответственно. Предпочтительно термин антитела против N-конца hPG относится к антителам, связывающимся с эпитопом, расположенным в домене прогастрина, последовательность которого представлена SEQ ID NO: 2. В другом предпочтительном воплощении термин антитела против С-конца hPG относится к антителам, связывающимся с эпитопом, расположенным в домене прогастрина, последовательность которого представлена SEQ ID NO: 3.The terms anti-hPG N-terminal antibody and anti-hPG C-terminal antibody refer to antibodies that bind to an amino acid-containing epitope located at the N-terminal portion of hPG or an amino acid-containing epitope located at the C-terminal portion of hPG, respectively. Preferably, the term antibodies against the N-terminus of hPG refers to antibodies that bind to an epitope located in the progastrin domain, the sequence of which is shown by SEQ ID NO: 2. In another preferred embodiment, the term antibodies against the C-terminus of hPG refers to antibodies that bind to an epitope located in the progastrin domain, the sequence of which is presented by SEQ ID NO: 3.

Термин эпитоп относится к области антигена, с которой связывается антитело. Эпитопы могут быть определены как структурные или функциональные. Функциональные эпитопы обычно представляют собой поднабор структурных эпитопов, и они содержат те аминокислоты, которые непосредственно содействуют аффинности взаимодействия. Эпитопы также могут быть конформационными. В некоторых воплощениях эпитопы могут включать детерминанты, которые представляют собой химически активные поверхностные группировки молекул, такие как аминокислоты, боковые сахарые цепи, фосфорильные группы или сульфонильные группы, и в некоторых воплощениях они могут иметь специфические трехмерные структурные характеристики и/или специфические характеристики заряда. Определение эпитопа, связанного антителом, может осуществляться любой методикой картирования эпитопа, известной специалисту в данной области. Эпитоп может содержать разные аминокислоты, которые расположены последовательно в пределах аминокислотной последовательности белка. Эпитоп также может содержать аминокислоты, которые не расположены последовательно в пределах аминокислотной последовательности белка.The term epitope refers to the region of an antigen to which an antibody binds. Epitopes can be defined as structural or functional. Functional epitopes are usually a subset of structural epitopes, and they contain those amino acids that directly contribute to the affinity of the interaction. Epitopes can also be conformational. In some embodiments, epitopes may include determinants that are reactive surface groupings of molecules, such as amino acids, side sugar chains, phosphoryl groups, or sulfonyl groups, and in some embodiments they may have specific three-dimensional structural characteristics and/or specific charge characteristics. Determination of an epitope bound by an antibody can be performed by any epitope mapping technique known to one of skill in the art. An epitope may contain different amino acids that are consecutive within the amino acid sequence of a protein. An epitope may also contain amino acids that are not sequential within the amino acid sequence of the protein.

В конкретном воплощении указанное антитело представляет собой моноклональное антитело, выбранное в группе, состоящей из следующих:In a specific embodiment, said antibody is a monoclonal antibody selected from the group consisting of the following:

моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 4, 5 и 6, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 4, 5 и 6, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 7, 8 и 9, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 7, 8 и 9, соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 10, 11 и 12, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 10, 11 и 12, соответственно, и легкуюa monoclonal antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 4, 5 and 6, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 4, 5 and 6, respectively, and a light chain, containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NO: 7, 8 and 9, respectively, or sequences with at least 80% , preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 7, 8 and 9, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 10, 11 and 12, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85% -th, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 10, 11 and 12, respectively, and easy

- 13 042821 цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 13, 14 и 15, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO:- 13 042821 chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NO: 13, 14 and 15, respectively, or sequences with at least at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO:

13, 14 и 15, соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 16, 17 и 18, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 16, 17 и 18, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 19, 20 и 21, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 19, 20 и 21, соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 22, 23 и 24, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 22, 23 и 24, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 25, 26 и 27, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 25, 26 и 27, соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно по меньшей мере три из CDR-H1, CDR-H2 и CDRН3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 28, 29 и 30, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 28, 29 и 30, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 31, 32 и 33, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 31, 32 и 33, соответственно, и моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 34, 35 и 36, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 34, 35 и 36, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 37, 38 и 39, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 37, 38 и 39 соответственно.13, 14 and 15, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOS: 16, 17 and 18, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 16, 17 and 18, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOS: 19, 20 and 21, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 19, 20 and 21, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 22, 23 and 24, respectively, or sequences with at least 80 %, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 22, 23 and 24, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 25, 26 and 27, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85% 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 25, 26 and 27, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least at least two, preferably at least three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDRN3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 28, 29 and 30, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90 %, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 28, 29 and 30, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 31, 32 and 33, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% identity and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 31, 32 and 33, respectively, and a monoclonal antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of CDR-H1 , CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 34, 35 and 36, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98 % identity after optimal alignment with SEQ ID NOs: 34, 35 and 36, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of CDR-L1, CDR-L2 and CDR- L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 37, 38 and 39, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with sequences of SEQ ID NO: 37, 38 and 39, respectively.

В другом воплощении антитело представляет собой моноклональное антитело, продуцируемое гибридомой, депонированной в CNCM, Институт Пастера, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Париж CEDEX 15, Франция, 27 декабря 2016 г., согласно ссылке I-5158 (см. WO 2017/114973).In another embodiment, the antibody is a monoclonal antibody produced by a hybridoma deposited with CNCM, Institut Pasteur, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris CEDEX 15, France, December 27, 2016, according to reference I-5158 (see WO 2017 /114973).

В значении по настоящему изобретению процентная доля идентичности или % идентичности между двумя последовательностями нуклеиновых кислот или аминокислот означает процентную долю идентичных нуклеотидов или аминокислотных остатков между двумя последовательностями, подлежащими сравнению, полученную после оптимального выравнивания, причем данная процентная доля является чисто статистической и различия между двумя данными последовательностями распределяются по их длине случайным образом. Сравнение двух последовательностей нуклеиновых кислот или аминокислот традиционно проводится посредством сравнения последовательностей после их оптимального выравнивания, причем указанное сравнение возможно проводить по отрезкам или с использованием окна выравнивания. Оптимальное выравнивание последовательностей для сравнения может проводиться, помимо сравнения вручную, посредством способов, известных специалисту в данной области.In the meaning of the present invention, percentage identity or % identity between two nucleic acid or amino acid sequences means the percentage of identical nucleotides or amino acid residues between two sequences to be compared, obtained after optimal alignment, this percentage being purely statistical and the difference between the two data sequences are randomly distributed along their length. The comparison of two nucleic acid or amino acid sequences is traditionally carried out by comparing the sequences after their optimal alignment, and this comparison can be carried out in segments or using an alignment window. Optimal alignment of sequences for comparison can be carried out, in addition to manual comparison, by methods known to the person skilled in the art.

Для аминокислотной последовательности, демонстрирующей по меньшей мере 80%-ную, предпочтительно 85%-ную, 90%-ную, 95%-ную и 98%-ную идентичность с контрольной аминокислотной последовательностью, предпочтительные примеры включают последовательности, содержашие эталонную последовательность, определенные модификации, а именно: делецию, присоединение или замену поFor an amino acid sequence showing at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity with the control amino acid sequence, preferred examples include sequences containing a reference sequence, certain modifications , namely: deletion, addition or replacement by

- 14 042821 меньшей мере одной аминокислоты, усечение или удлинение. В случае замены одной или более чем одной последовательной или непоследовательной аминокислоты, предпочтительными являются замены, при которых замененные аминокислоты заменяются эквивалентными аминокислотами. Здесь подразумевается то, что выражение эквивалентные аминокислоты указывает любые аминокислоты, которые вероятно подлежат замене одной из структурных аминокислот, однако, без модификации биологических активностей соответствующих антител, и данные конкретные примеры определены ниже.- 14 042821 at least one amino acid, truncation or extension. In the case of substitution of one or more consecutive or non-sequential amino acids, substitutions are preferred in which the replaced amino acids are replaced with equivalent amino acids. It is understood here that the expression equivalent amino acids indicates any amino acids that are likely to be replaced by one of the structural amino acids, however, without modifying the biological activities of the respective antibodies, and these specific examples are defined below.

Эквивалентные аминокислоты можно определять либо по их структурной гомологии с аминокислотами, которые они заменяют, либо по результатам сравнительных анализов биологической активности между разными антителами, которые вероятно будут генерированы.Equivalent amino acids can be determined either by their structural homology with the amino acids they replace, or by comparisons of biological activity between different antibodies that are likely to be generated.

В более конкретном воплощении указанное антитело представляет собой моноклональное антитело, выбранное в группе, состоящей из следующих:In a more specific embodiment, said antibody is a monoclonal antibody selected from the group consisting of the following:

моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 41 и легкую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 42;a monoclonal antibody containing the heavy chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 41 and the light chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42;

моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 43 и легкую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 44;a monoclonal antibody containing the heavy chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43 and the light chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44;

моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 45 и легкую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 46;a monoclonal antibody containing the heavy chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45 and the light chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46;

моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 47 и легкую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 48;a monoclonal antibody containing the heavy chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 and the light chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48;

моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 49 и легкую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 50; и моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 51 и легкую цепь аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 52.a monoclonal antibody containing the heavy chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 49 and the light chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50; and a monoclonal antibody comprising the heavy chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51 and the light chain of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52.

В другом конкретном воплощении антитело, использованное в способе по изобретению, представляет собой гуманизированное антитело.In another specific embodiment, the antibody used in the method of the invention is a humanized antibody.

Выражение гуманизированное антитело в том виде, в котором оно используется в данном документе, означает антитело, которое содержит области CDR, происходящие из антитела, происходящего не от человека, причем другие части данной молекулы антитела происходят от одного или нескольких человеческих антител. Кроме того, некоторые из остатков скелетных сегментов (именуемых FR, что обозначает каркас) могут быть модифицированы для сохранения аффинности связывания согласно методикам, известным специалисту в данной области (Jones et al, Nature, 321:522-525, 1986). Целью гуманизации является уменьшение иммуногенности ксеногенного антитела, такого как мышиное антитело, для введения человеку, при сохранении полной аффинности связывания с антигеном и специфичности антитела.The expression humanized antibody, as used herein, means an antibody that contains CDR regions derived from a non-human antibody, with other portions of that antibody molecule derived from one or more human antibodies. In addition, some of the residues of the skeletal segments (referred to as FR, which stands for frame) can be modified to maintain binding affinity according to techniques known to the person skilled in the art (Jones et al, Nature, 321:522-525, 1986). The goal of humanization is to reduce the immunogenicity of a xenogeneic antibody, such as a mouse antibody, for administration to a human while maintaining the full antigen binding affinity and specificity of the antibody.

Гуманизированные антитела по изобретению или их фрагменты можно получать методиками, известными специалисту в данной области (такими как, например, методики, описанные в документах Singer et al., J. Immun., 150:2844-2857, 1992). Такие гуманизированные антитела являются предпочтительными для их применения в способах, включающих диагностику in vitro или предупредительное и/или терапевтическое лечение in vivo. Другие методики гуманизации также известны специалисту в данной области. В самом деле, антитела могут быть гуманизированы с использованием целого ряда методик, включая пересадку CDR (ЕР 0451261; ЕР 0682040; ЕР 0939127; ЕР 0566647; US 5530101; US 6180370; US 5585089; US 5693761; US 5639641; US 6054297; US 5886152 и US 5877293), маскировку поверхностных остатков (венирование) или изменение поверхности (ЕР 0592106; ЕР 0519596; Padlan E. А., 1991, Molecular Immunology 28(4/5): 489-498; Studnicka G. M. et al., 1994, Protein Engineering 7(6): 805814; Roguska M.A. et al., 1994, Proc. Natl. Acad. ScL U.S.A., 91:969-973) и перетасовку цепей (патент США № 5565332). Человеческие антитела могут быть получены целым рядом способов, известных в данной области, включая способы фагового дисплея. См. также патенты США № 4444887, 4716111, 5545806 и 5814318; и международные патентные заявки с номерами публикации WO 98/46645, WO 98/50433, WO 98/24893, WO 98/16654, WO 96/34096, WO 96/33735 и WO 91/10741.Humanized antibodies of the invention, or fragments thereof, can be prepared by techniques known to those skilled in the art (such as, for example, those described in Singer et al., J. Immun., 150:2844-2857, 1992). Such humanized antibodies are preferred for use in methods involving in vitro diagnostics or prophylactic and/or therapeutic treatment in vivo. Other humanization techniques are also known to the person skilled in the art. Indeed, antibodies can be humanized using a variety of techniques, including CDR grafting (EP 0451261; EP 0682040; EP 0939127; EP 0566647; US 5530101; US 6180370; US 5585089; US 5693761; US 5639641; US 6054297; and US 5877293), masking of surface residues (venation) or surface modification (EP 0592106; EP 0519596; Padlan E. A., 1991, Molecular Immunology 28(4/5): 489-498; Studnicka G. M. et al., 1994, Protein Engineering 7(6): 805814; Roguska M.A. et al., 1994, Proc. Natl. Acad. ScL U.S.A., 91:969-973) and strand shuffling (US Pat. No. 5,565,332). Human antibodies can be generated by a variety of methods known in the art, including phage display methods. See also US patent No. 4444887, 4716111, 5545806 and 5814318; and international patent applications with publication numbers WO 98/46645, WO 98/50433, WO 98/24893, WO 98/16654, WO 96/34096, WO 96/33735 and WO 91/10741.

В более конкретном воплощении указанное антитело представляет собой гуманизированное антитело, выбранное в группе, состоящей из следующих:In a more specific embodiment, said antibody is a humanized antibody selected from the group consisting of the following:

гуманизированное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 4, 5 и 6, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 4, 5 и 6, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 7, 8 и 9, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 7, 8 и 9, соответственно, гуманизированное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предa humanized antibody comprising a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 4, 5 and 6, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 4, 5 and 6, respectively, and a light chain, containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NO: 7, 8 and 9, respectively, or sequences with at least 80% , preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 7, 8 and 9, respectively, a humanized antibody containing a heavy chain containing at least one, before

- 15 042821 почтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 10, 11 и 12, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 10, 11 и 12, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 13, 14 и 15, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 13, 14 и 15, соответственно, гуманизированное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 16, 17 и 18, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 16, 17 и 18, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 19, 20 и 21, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 19, 20 и 21, соответственно, гуманизированное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 22, 23 и 24, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 22, 23 и 24, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 25, 26 и 27, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 25, 26 и 27, соответственно, гуманизированное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 28, 29 и 30, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 28, 29 и 30, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 31, 32 и 33, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 31, 32 и 33, соответственно, и гуманизированное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 34, 35 и 36, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%-ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 34, 35 и 36, соответственно, и легкую цепь, содержащую по меньшей мере одну, предпочтительно по меньшей мере две, предпочтительно три из CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 37, 38 и 39, соответственно, или последовательностей с по меньшей мере 80%-ной, предпочтительно 85%-ной, 90%-ной, 95%ной и 98%-ной идентичностью после оптимального выравнивания с последовательностями SEQ ID NO: 37, 38 и 39 соответственно, где указанное антитело также содержит константные области легкой цепи и тяжелой цепи, происходящие из человеческого антитела.- 15 042821 respectfully at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 10, 11 and 12, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85 %, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 10, 11 and 12, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 13, 14 and 15, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90% 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 13, 14 and 15, respectively, a humanized antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 16, 17 and 18, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% identical and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 16, 17 and 18, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 19, 20 and 21, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 19, 20 and 21, respectively, a humanized antibody containing a heavy chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acids sequences of SEQ ID NO: 22, 23 and 24, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with sequences SEQ ID NOs: 22, 23 and 24, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NO: 25, 26 and 27, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 25, 26 and 27, respectively, a humanized heavy chain antibody comprising at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2, and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOS: 28, 29, and 30, respectively. , or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 28, 29 and 30, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 31, 32 and 33, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 31, 32 and 33, respectively, and a humanized antibody containing a heavy chain, containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 34, 35 and 36, respectively, or sequences with at least 80% , preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NO: 34, 35 and 36, respectively, and a light chain containing at least one, preferably at least two, preferably three of the CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 37, 38 and 39, respectively, or sequences with at least 80%, preferably 85%, 90%, 95% and 98% identity after optimal alignment with the sequences of SEQ ID NOS: 37, 38 and 39, respectively, where the specified antibody also contains constant regions of the light chain and heavy chain derived from a human antibody.

В другом более конкретном воплощении указанное антитело представляет собой гуманизированное антитело, выбранное в группе, состоящей из следующих:In another more specific embodiment, said antibody is a humanized antibody selected from the group consisting of the following:

гуманизированное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 53 и вариабельную область легкой цепи аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 54;a humanized antibody comprising the heavy chain variable region of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53 and the light chain variable region of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;

гуманизированное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 55 и вариабельную область легкой цепи аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 56;a humanized antibody comprising the heavy chain variable region of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55 and the light chain variable region of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56;

гуманизированное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 57, 58 и 59, и вариабельную область легкой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 60, 61 и 62;a humanized antibody comprising a heavy chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 57, 58 and 59 and a light chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 60, 61 and 62;

гуманизированное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи аминокислотной по- 16 042821 следовательности, выбранной между SEQ ID NO: 63, 64 и 65, и вариабельную область легкой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 66, 67 и 68;a humanized antibody comprising a heavy chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 63, 64 and 65 and a light chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 66, 67 and 68;

гуманизированное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 69 и 71, и вариабельную область легкой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 70 и 72; и гуманизированное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 75 и 76, и вариабельную область легкой цепи аминокислотной последовательности, выбранной между SEQ ID NO: 77 и 78;a humanized antibody comprising a heavy chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 69 and 71 and a light chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 70 and 72; and a humanized antibody comprising a heavy chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 75 and 76 and a light chain variable region of an amino acid sequence selected between SEQ ID NOs: 77 and 78;

где указанное антитело также содержит константные области легкой цепи и тяжелой цепи, происходящие из человеческого антитела.wherein said antibody also contains light chain and heavy chain constant regions derived from a human antibody.

В первом воплощении способ по изобретению включает приведение в контакт биологического образца с антителом против hPG, связывающимся с эпитопом hPG, где указанный эпитоп располагается в пределах С-концевой части hPG, или с эпитопом, расположенным в пределах N-концевой части hPG.In a first embodiment, the method of the invention comprises contacting a biological sample with an anti-hPG antibody that binds to an hPG epitope, where said epitope is located within the C-terminal portion of hPG, or an epitope located within the N-terminal portion of hPG.

В более конкретном воплощении способ по изобретению включает приведение в контакт биологического образца с антителом против hPG, связывающимся с эпитопом hPG, где указанный эпитоп включает аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности Nконцевой части прогастрина, выбранной среди аминокислотной последовательности, соответствующей аминокислотам 10-14 hPG, аминокислотам 9-14 hPG, аминокислотам 4-10 hPG, аминокислотам 2-10 hPG и аминокислотам 2-14 hPG, где аминокислотная последовательность hPG представляет собой SEQ ID NO: 1.In a more specific embodiment, the method of the invention comprises contacting a biological sample with an anti-hPG antibody that binds to an hPG epitope, wherein said epitope comprises an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of the N-terminal portion of progastrin, selected from the amino acid sequence corresponding to hPG amino acids 10-14, amino acids hPG amino acids 9-14, hPG amino acids 4-10, hPG amino acids 2-10, and hPG amino acids 2-14, wherein the hPG amino acid sequence is SEQ ID NO: 1.

В более конкретном воплощении способ по изобретению включает приведение в контакт биологического образца с антителом против hPG, связывающимся с эпитопом hPG, где указанный эпитоп включает аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности Сконцевой части прогастрина, выбранной среди аминокислотной последовательности, соответствующей аминокислотам 71-74 hPG, аминокислотам 69-73 hPG, аминокислотам 71-80 hPG (SEQ ID NO: 40), аминокислотам 76-80 hPG и аминокислотам 67-74 hPG, где аминокислотная последовательность hPG представляет собой SEQ ID NO: 1.In a more specific embodiment, the method of the invention comprises contacting a biological sample with an anti-hPG antibody that binds to an hPG epitope, wherein said epitope comprises an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of the C-terminal portion of progastrin selected from the amino acid sequence corresponding to hPG amino acids 71-74, amino acids 69-73 hPG, hPG amino acids 71-80 (SEQ ID NO: 40), hPG amino acids 76-80, and hPG amino acids 67-74, wherein the hPG amino acid sequence is SEQ ID NO: 1.

В первом воплощении композиция согласно изобретению содержит антитело, распознающее эпитоп, включающий аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности прогастрина.In a first embodiment, the composition of the invention comprises an antibody that recognizes an epitope comprising an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of progastrin.

В более конкретном воплощении композиция по изобретению содержит антитело, распознающее эпитоп прогастрина, где указанный эпитоп включает аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности N-концевой части прогастрина, где указанная аминокислотная последовательность может включать остатки 10-14 hPG, остатки 9-14 hPG, остатки 4-10 hPG, остатки 2-10 hPG или остатки 2-14 hPG, где аминокислотная последовательность hPG представляет собой SEQ ID NO: 1.In a more specific embodiment, the composition of the invention comprises an antibody recognizing a progastrin epitope, wherein said epitope comprises an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of the N-terminal portion of progastrin, where said amino acid sequence may include hPG residues 10-14, hPG residues 9-14, residues 4 -10 hPG, hPG residues 2-10, or hPG residues 2-14, wherein the hPG amino acid sequence is SEQ ID NO: 1.

В более конкретном воплощении композиция по изобретению содержит антитело, распознающее эпитоп прогастрина, где указанный эпитоп включает аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности С-концевой части прогастрина, где указанная аминокислотная последовательность может включать остатки 71-74 hPG, остатки 69-73 hPG, остатки 71-80 hPG (SEQ ID NO: 40), остатки 76-80 hPG или остатки 67-74 hPG, где аминокислотная последовательность hPG представляет собой SEQ ID NO: 1.In a more specific embodiment, the composition of the invention comprises an antibody that recognizes a progastrin epitope, wherein said epitope comprises an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of the C-terminal portion of progastrin, where said amino acid sequence may include hPG residues 71-74, hPG residues 69-73, residues 71 -80 hPG (SEQ ID NO: 40), hPG residues 76-80, or hPG residues 67-74, wherein the hPG amino acid sequence is SEQ ID NO: 1.

В конкретном воплощении способа диагностики in vitro рака легкого по изобретению указанный способ включает стадию приведения в контакт биологического образца от субъекта с первой молекулой, которая связывается с первой частью прогастрина, и со второй молекулой, которая связывается со второй частью прогастрина. В более конкретном воплощении, в котором указанная молекула, связывающая прогастрин, представляет собой антитело, биологический образец от субъекта приводится в контакт с антителом, которое связывается с первым эпитопом прогастрина, и со вторым антителом, которое связывается со вторым эпитопом прогастрина.In a specific embodiment of the method for diagnosing lung cancer in vitro according to the invention, said method comprises the step of contacting a biological sample from a subject with a first molecule that binds to a first portion of progastrin and a second molecule that binds to a second portion of progastrin. In a more specific embodiment, wherein said progastrin-binding molecule is an antibody, a biological sample from the subject is contacted with an antibody that binds to a first progastrin epitope and a second antibody that binds to a second progastrin epitope.

В конкретном воплощении способа по изобретению указанный способ включает стадию приведения в контакт биологического образца от субъекта с первым агентом, который связывается с первой частью прогастрина, и со вторым агентом, который связывается со второй частью прогастрина. В более конкретном воплощении, в котором указанная молекула, связывающая прогастрин, представляет собой антитело, биологический образец от субъекта приводится в контакт с антителом, которое связывается с первым эпитопом прогастрина, и со вторым антителом, которое связывается со вторым эпитопом прогастрина.In a specific embodiment of the method of the invention, said method includes the step of contacting a biological sample from a subject with a first agent that binds to a first portion of progastrin and a second agent that binds to a second portion of progastrin. In a more specific embodiment, wherein said progastrin-binding molecule is an antibody, a biological sample from the subject is contacted with an antibody that binds to a first progastrin epitope and a second antibody that binds to a second progastrin epitope.

Согласно предпочтительному воплощению указанное первое антитело связывается с нерастворимым или частично растворимым носителем. Связывание прогастрина указанным первым антителом приводит к захвату прогастрина из указанного биологического образца. Предпочтительно указанное первое антитело представляет собой антитело, связывающееся с эпитопом hPG, где указанный эпитоп включает аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности Сконцевой части прогастрина, как описано выше. Более предпочтительно указанное первое антителоAccording to a preferred embodiment, said first antibody is bound to an insoluble or partially soluble carrier. Binding of progastrin by said first antibody results in capture of progastrin from said biological sample. Preferably, said first antibody is an antibody that binds to an hPG epitope, wherein said epitope comprises an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of the C-terminal portion of progastrin, as described above. More preferably said first antibody

- 17 042821 представляет собой моноклональное антитело mAb14, продуцируемое гибридомой 2H9F4B7, описанное в WO 2011/083088. Гибридома 2H9F4B7 была депонирована согласно Будапештскому соглашению в- 17 042821 is a mAb14 monoclonal antibody produced by 2H9F4B7 hybridoma described in WO 2011/083088. Hybridoma 2H9F4B7 was deposited under the Budapest Agreement in

CNCM, Институт Пастера, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Париж CEDEX 15, Франция, 27 декабряCNCM, Institut Pasteur, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris CEDEX 15, France, December 27

2016 г., согласно ссылке I-5158 (см. WO 2017/114973).2016 according to reference I-5158 (see WO 2017/114973).

Согласно другому предпочтительному воплощению указанное второе антитело метится выявляемой группировкой, как описано ниже. Связывание прогастрина вторым антителом обеспечивает выявление молекул прогастрина, которые присутствовали в биологическом образце. Кроме того, связывание прогастрина вторым антителом обеспечивает количественное измерение молекул прогастрина, которые присутствовали в биологическом образце. Предпочтительно указанное второе антитело представляет собой антитело, связывающееся с эпитопом hPG, где указанный эпитоп включает аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотной последовательности N-концевой части прогастрина, как описано выше. Более предпочтительно указанное антитело к N-концу представляет собой поликлональное антитело, как описано выше. В качестве альтернативы, также можно применять моноклональное антитело, связывающееся с эпитопом в пределах N-конца прогастрина, такое как, например, моноклональные антитела к N-концу, описанные выше, а именно: моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 16, 17 и 18, соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 19, 20 и 21.In another preferred embodiment, said second antibody is labeled with a detectable moiety as described below. Binding of progastrin by the second antibody allows detection of progastrin molecules that were present in the biological sample. In addition, the binding of progastrin by the second antibody provides a quantitative measurement of the progastrin molecules that were present in the biological sample. Preferably, said second antibody is an antibody that binds to an hPG epitope, wherein said epitope comprises an amino acid sequence corresponding to the amino acid sequence of the N-terminal portion of progastrin, as described above. More preferably, said N-terminal antibody is a polyclonal antibody as described above. Alternatively, it is also possible to use a monoclonal antibody that binds to an epitope within the N-terminus of progastrin, such as, for example, the N-terminal monoclonal antibodies described above, namely: a monoclonal antibody containing a heavy chain containing CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOS: 16, 17 and 18, respectively, and a light chain containing CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOS: 19, 20 and 21.

В особенно предпочтительном воплощении первое антитело связывается с нерастворимым или частично растворимым носителем, и второе антитело метится выявляемой группировкой.In a particularly preferred embodiment, the first antibody is bound to an insoluble or partially soluble carrier and the second antibody is labeled with a detectable moiety.

В предпочтительном воплощении способ по настоящему изобретению для диагностики рака легкого включает выявление прогастрина в биологическом образце от человеческого субъекта.In a preferred embodiment, the method of the present invention for diagnosing lung cancer comprises detecting progastrin in a biological sample from a human subject.

В более предпочтительном воплощении способ по настоящему изобретению для диагностики рака легкого включает определение концентрации прогастрина в биологическом образце от человеческого субъекта.In a more preferred embodiment, the method of the present invention for diagnosing lung cancer comprises determining the concentration of progastrin in a biological sample from a human subject.

В другом конкретном воплощении способ по настоящему изобретению для диагностики рака легкого включает определение концентрации прогастрина в биологическом образце от человеческого субъекта, где указанный биологический образец выбран из крови, сыворотки и плазмы.In another specific embodiment, the method of the present invention for diagnosing lung cancer includes determining the concentration of progastrin in a biological sample from a human subject, where the specified biological sample is selected from blood, serum and plasma.

В другом предпочтительном воплощении способ по настоящему изобретению включает приведение в контакт образца от указанного субъекта с антителом против hPG, как описано выше, где связывание указанного антитела против hPG в образце указывает на присутствие у указанного субъекта рака легкого.In another preferred embodiment, the method of the present invention comprises contacting a sample from said subject with an anti-hPG antibody as described above, wherein binding of said anti-hPG antibody in the sample is indicative of said subject having lung cancer.

В более конкретном воплощении способ по настоящему изобретению включает приведение в контакт образца от указанного субъекта с антителом против hPG, как описано выше, где концентрация прогастрина выше 10 пМ в указанной плазме указывает на присутствие у указанного субъекта рака легкого.In a more specific embodiment, the method of the present invention comprises contacting a sample from said subject with an anti-hPG antibody as described above, wherein said plasma concentration of progastrin greater than 10 pM is indicative of said subject having lung cancer.

Более предпочтительно способ по настоящему изобретению включает приведение в контакт образца от указанного субъекта с антителом против hPG, как описано выше, где концентрация прогастрина выше 10 пМ, 20 пМ, 30 пМ или 40 пМ в указанном образце указывает на присутствие у указанного субъекта рака легкого.More preferably, the method of the present invention comprises contacting a sample from said subject with an anti-hPG antibody as described above, wherein a progastrin concentration greater than 10 pM, 20 pM, 30 pM, or 40 pM in said sample is indicative of the presence of lung cancer in said subject.

Еще более предпочтительно способ по настоящему изобретению включает приведение в контакт образца от указанного субъекта с антителом против hPG, как описано выше, где концентрация прогастрина выше 10 пМ, предпочтительно выше 20 пМ, более предпочтительно выше 30 пМ, еще более предпочтительно выше 40 пМ, даже более предпочтительно выше 50 пМ в указанном образце указывает на присутствие у указанного субъекта метастазирующего рака легкого.Even more preferably, the method of the present invention comprises contacting a sample from said subject with an anti-hPG antibody as described above, wherein the progastrin concentration is greater than 10 pM, preferably greater than 20 pM, more preferably greater than 30 pM, even more preferably greater than 40 pM, even more preferably, greater than 50 pM in said sample indicates the presence of metastatic lung cancer in said subject.

Настоящее изобретение также относится к способам отслеживания эффективности лечения рака легкого у пациента, такого как химиотерапия, биологическая терапия, иммунотерапия или терапия антителами, посредством определения концентрации прогастрина в первом образце, таком как жидкость организма или биопсия рака легкого, полученная от пациента до лечения рака легкого, и затем сравнения концентрации прогастрина в первом образце с концентрацией во втором образце, полученном от того же самого пациента после лечения, где уменьшение концентрации прогастрина в указанном втором образце по сравнению с указанным первым образцом указывает на то, что лечение было эффективным.The present invention also relates to methods for monitoring the effectiveness of a lung cancer treatment in a patient, such as chemotherapy, biological therapy, immunotherapy, or antibody therapy, by determining the concentration of progastrin in a first sample, such as a body fluid or a lung cancer biopsy obtained from the patient prior to lung cancer treatment. , and then comparing the concentration of progastrin in the first sample with the concentration in the second sample obtained from the same patient after treatment, where the decrease in the concentration of progastrin in said second sample compared to said first sample indicates that the treatment was effective.

В конкретном воплощении способ по изобретению включает сравнение концентрации прогастрина в биологическом образце, полученном от пациента, с заданным значением концентрации прогастрина в образце, в более конкретном воплощении указанное заданное значение выбрано среди: среднего или усредненного значений образца на основе среднего или усредненного определения значения в популяции не имеющих рака легкого, значения концентрации прогастрина, полученной, когда было известно то, что пациент не имеет рака легкого.In a specific embodiment, the method of the invention comprises comparing the concentration of progastrin in a biological sample obtained from a patient with a target value for the concentration of progastrin in the sample, in a more specific embodiment, said target value is selected from: the average or average of the sample based on the average or average determination of the value in the population without lung cancer, progastrin concentration values obtained when the patient was known to be free of lung cancer.

В конкретном воплощении способ по изобретению для диагностики in vitro рака легкого включает определение концентрации прогастрина в образце от указанного пациента и второй диагностический анализ рака легкого. В более конкретном воплощении способ по изобретению для диагностики in vitro рака легкого включает определение концентрации прогастрина в образце от указанного пациента и второй диагностический анализ рака легкого, где указанный второй диагностический анализ включает выявление конкретного биомаркера, выбранного среди следующих: карциноэмбриональный антиген (СЕА),In a specific embodiment, the method of the invention for in vitro diagnosis of lung cancer comprises determining the concentration of progastrin in a sample from said patient and a second diagnostic assay for lung cancer. In a more specific embodiment, the method of the invention for in vitro diagnosis of lung cancer comprises determining the concentration of progastrin in a sample from said patient and a second lung cancer diagnostic assay, wherein said second diagnostic assay comprises detecting a specific biomarker selected from the following: carcinoembryonic antigen (CEA),

- 18 042821 нейронспецифичная енолаза (NSE), цитокератин 19 (CYFRA-21-1), альфа-фетопротеин, углеводный антиген-125 (СА-125), углеводный антиген-19.9 (СА-19.9) и ферритин, независимо или в комбинации (Li et al, 2012).- 18 042821 neuron specific enolase (NSE), cytokeratin 19 (CYFRA-21-1), alpha-fetoprotein, carbohydrate antigen-125 (CA-125), carbohydrate antigen-19.9 (CA-19.9) and ferritin, alone or in combination ( Li et al, 2012).

В конкретном воплощении изобретения способ по настоящему изобретению включает определение уровня прогастрина с течением времени в образцах от пациента, которого лечили или лечат от рака легкого.In a specific embodiment of the invention, the method of the present invention includes determining the level of progastrin over time in samples from a patient who has been treated or is being treated for lung cancer.

Характеристики воплощений данного изобретения станут очевиднее из следующего подробного описания приведенных ниже примеров.The characteristics of the embodiments of the present invention will become clearer from the following detailed description of the examples below.

Легенды графических материаловGraphics Legends

На чертеже концентрацию прогастрина измеряли в 40 образцах плазмы от пациентов с раком легкого и в 119 образцах плазмы от здоровых доноров с использованием набора ELISA DECODE Lab (захватывающее антитело: mAb14, выявляющее антитело: поликлональное против hPG).In Figure 1, progastrin concentration was measured in 40 plasma samples from lung cancer patients and 119 plasma samples from healthy donors using the DECODE Lab ELISA kit (capture antibody: mAb14, detection antibody: polyclonal against hPG).

ПримерыExamples

Пример 1. Определение плазматической концентрации прогастрина с использованием поликлональных антител.Example 1 Determination of plasma concentration of progastrin using polyclonal antibodies.

Плазматические уровни прогастрина количественно измеряли ELISA посредством применения двух специфичных антител против прогастрина: захватывающими антителами покрывают лунки планшета, тогда как обнаруживающие антитела используются для выявления прогастрина и опосредуют обнаружение сигнала.Plasma progastrin levels were quantified by ELISA using two specific anti-progastrin antibodies: capture antibodies coat the wells of the plate, while detection antibodies are used to detect progastrin and mediate signal detection.

В настоящем примере количественное измерение основывается на способе ELISA, который обеспечивает, посредством применения субстрата, реакция которого испускает свет, приписывание значения, пропорционального люминисценции, количеству антител, связавшихся с антигеном, удерживаемым захватывающими антителами.In the present example, the quantitative measurement is based on the ELISA method, which provides, through the use of a substrate whose reaction emits light, attributing a value proportional to luminescence to the amount of antibodies bound to the antigen retained by the capture antibodies.

Материал.Material.

Реактивы и прибор перечисляются в табл. 7.Reagents and instrument are listed in Table. 7.

Обозначение Designation Продавец Salesman Ссылка Link Белые планшеты MaxiSORP Nunc, 96 лунок MaxiSORP Nunc white plates, 96 wells Dutscher Dutscher # 055221 #055221 Карбонат/бикарбонат натрия Sodium carbonate/bicarbonate Sigma Sigma #21851 #21851 DPBS 1х DPBS 1x Lonza Lonza # P04-36500 # P04-36500 Tween-20 Tween-20 Biosolve Biosolve # 20452335 #20452335 BSA BSA Euromedex Euromedex #04-100-810-C #04-100-810-C Стрептавидин-НРР(пероксидаза хрена) Streptavidin-HPP (horseradish peroxidase) Pierce (Thermo) Pierce (Thermo) #21130 #21130 Субстрат для максимальной чувствительности SuperSignal ELISA Femto Substrate for maximum sensitivity SuperSignal ELISA Femto Pierce (Thermo) Pierce (Thermo) # 37074 #37074 Поликлональное антитело против прогастрина Polyclonal antibody against progastrin Eurogentec Eurogentec / /

Таблица 7.Table 7

Поликлональные антитела получали иммунизированием кролика N-концом прогастрина (SEQ ID NO: 2) или С-концом прогастрина, соответствующим аминокислотам 71-80 hPG и имеющим последовательность FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40), согласно стандартным протоколам.Polyclonal antibodies were obtained by immunizing a rabbit with the N-terminus of progastrin (SEQ ID NO: 2) or the C-terminus of progastrin corresponding to hPG amino acids 71-80 and having the sequence FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40) according to standard protocols.

Характеристики связывания поликлональных антител против прогастрина, используемых в данном анализе, являются следующими: отсутствие связывания с G34-Gly, G34, G17-Gly, G17, связывание с полноразмерным прогастрином.The binding characteristics of the anti-progastrin polyclonal antibodies used in this assay are: no binding to G34-Gly, G34, G17-Gly, G17, binding to full length progastrin.

96-Луночные планшеты покрывают получением 50 мМ раствора карбоната-бикарбоната натрия, рН 9,6, растворением содержимого одной капсулы в 100 мл воды MilliQ. Раствор захватывающего антитела (3 мкг/мл), соответствующего поликлональным антителам, полученным с использованием С-конца прогастрина FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40), готовят в карбонатном буфере. 100 мкл раствора антител добавляют в каждую лунку и инкубируют при 4°С в течение 16 ч (1 ночь). Планшеты затем блокируют устранением раствора антител и промывкой 3 раза 300 мкл 1х PBS (фосфатно-солевой буферный раствор)/0,1% Tween-20, затем добавлением 200 мкл блокирующего буфера (1х PBS/0,1% Tween-20/0,1% BSA) на лунку и инкубированием 2 ч при 22°С. Блокирующий буфер затем устраняют, лунки промывают 3 раза 300 мкл 1х PBS/0,1% Tween-20.96-well plates are coated with a 50 mM sodium carbonate-bicarbonate pH 9.6 solution by dissolving the contents of one capsule in 100 ml MilliQ water. A solution of a capture antibody (3 μg/ml) corresponding to polyclonal antibodies prepared using the C-terminus of progastrin FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40) is prepared in carbonate buffer. 100 μl of antibody solution is added to each well and incubated at 4° C. for 16 h (1 night). The plates are then blocked by removing the antibody solution and washing 3 times with 300 µl 1x PBS/0.1% Tween-20, then adding 200 µl blocking buffer (1x PBS/0.1% Tween-20/0, 1% BSA) per well and incubated for 2 hours at 22°C. The blocking buffer is then discarded, the wells are washed 3 times with 300 μl 1x PBS/0.1% Tween-20.

Разведение плазмы проводится следующим образом: плазма используется в чистом виде, разведенной 1/2, 1/5 и 1/10. Разведения проводятся из чистой плазмы в 1х PBS/0,1% Tween-20/0,1% BSA.Plasma dilution is carried out as follows: plasma is used in its pure form, diluted 1/2, 1/5 and 1/10. Dilutions are made from pure plasma in 1x PBS/0.1% Tween-20/0.1% BSA.

Для контрольного анализа проводится ELISA в присутствии известной концентрации прогастрина, разведение прогастрина получают следующим образом: маточный рекомбинантный PG (полноразмерный человеческий прогастрин, продуцированный в Е. coli и аффинно очищенный с использованием глутатиона-агарозы/удаления метки (Tev)/очистки на IMAC Counter/диализа, от Института Пастера, Париж, Франция) готовят в концентрации 0,45 мг/мл (45 мкМ) в тройной повторности. Интервалы концентраций прогастрина получали следующим образом:For control analysis, ELISA is performed in the presence of a known concentration of progastrin, progastrin dilution is prepared as follows: uterine recombinant PG (full-length human progastrin produced in E. coli and affinity purified using glutathione-agarose/tag removal (Tev)/purification on the IMAC Counter/ dialysis, from the Institut Pasteur, Paris, France) are prepared at a concentration of 0.45 mg/ml (45 μM) in triplicate. Progastrin concentration intervals were obtained as follows:

раствор А: предварительное разведение 1/10, 2 мкл маточного раствора плюс 18 мкл буфера, раствор В: предварительное разведение 1/100, 10 мкл А плюс 90 мкл буфера, раствор С: предварительное разведение 1/1000, 10 мкл В плюс 90 мкл буфера, раствор D: 500 пМ, 5,55 мкл С плюс 494,5 мкл разбавителя,solution A: pre-dilution 1/10, 2 µl stock solution plus 18 µl buffer, solution B: pre-dilution 1/100, 10 µl A plus 90 µl buffer, solution C: pre-dilution 1/1000, 10 µl B plus 90 µl buffer solution D: 500 pM, 5.55 µl C plus 494.5 µl diluent,

- 19 042821 раствор Е: 250 пМ, 250 мкл D плюс 250 мкл разбавителя, раствор F: 100 пМ, 200 мкл Е плюс 300 мкл разбавителя, раствор G: 50 пМ, 250 мкл F плюс 250 мкл разбавителя, раствор Н: 25 пМ, 200 мкл G плюс 200 мкл разбавителя, раствор I:10 пМ, 100 мкл Н плюс 150 мкл разбавителя.- 19 042821 solution E: 250 pM, 250 µl D plus 250 µl diluent, solution F: 100 pM, 200 µl E plus 300 µl diluent, solution G: 50 pM, 250 µl F plus 250 µl diluent, solution H: 25 pM , 200 µl G plus 200 µl diluent, solution I: 10 pM, 100 µl H plus 150 µl diluent.

Интервал концентрации рекомбинантного PG является линейным и, следовательно, может быть более или менее широким согласно используемому антителу.The recombinant PG concentration range is linear and therefore can be more or less wide according to the antibody used.

Для получения опытных образцов приблизительно 500 мкл каждого образца откладывают и хранят до анализа (и подтверждения, если это необходимо) результатов. 100 мкл каждой точки интервала и/или плазмы анализируют в чистом виде, разведенными 1/2, 1/5 и 1/10, и инкубируют в течение 2 ч при 22°С на планшетах.To obtain prototype samples, approximately 500 µl of each sample is set aside and stored until analysis (and confirmation, if necessary) of the results. 100 μl of each interval point and/or plasma are analyzed in pure form, diluted 1/2, 1/5 and 1/10, and incubated for 2 hours at 22°C on the plates.

Для обнаружения результатов анализа планшеты 3 раза промывают 300 мкл 1х PBS / 0,1% Tween20. Раствор поликлонального кроличьего антитела против прогастрина, где указанные антитела получали с использованием N-концевой части прогастрина в качестве иммуногена, связанного с биотином, в концентрации 0,5 мкг/мл получали разведением в 1х PBS/0,1% Tween-20/0,1% BSA. 100 мкл данного раствора добавляют в каждую лунку. Инкубация происходит в течение 1 ч при 22°С. Обнаружение стрептавидин-HRP осуществляется удалением выявляющего антитела и промывкой 3 раза 300 мкл 1х PBS/0,1% Tween-20, затем получением раствора стрептавидин-HRP в концентрации 20 нг/мл, разведенного в 1х PBS/0,1% Tween-20/0,1% BSA, где 100 мкл данного раствора добавляют в каждую лунку перед инкубацией в течение 1 ч при 22°С.Wash the plates 3 times with 300 µl 1x PBS / 0.1% Tween20 to detect assay results. A solution of a polyclonal rabbit antibody against progastrin, where these antibodies were obtained using the N-terminal part of progastrin as biotin-bound immunogen, at a concentration of 0.5 μg/ml, was diluted in 1x PBS/0.1% Tween-20/0, 1% BSA. 100 µl of this solution is added to each well. Incubation takes place for 1 hour at 22°C. Detection of streptavidin-HRP is performed by removing the detecting antibody and washing 3 times with 300 µl 1x PBS/0.1% Tween-20, then obtaining a solution of streptavidin-HRP at a concentration of 20 ng/ml diluted in 1x PBS/0.1% Tween-20 /0.1% BSA, where 100 μl of this solution is added to each well before incubation for 1 h at 22°C.

Выявление заключается в устранении стрептавидин-HRP и промывке 3 раза 300 мкл 1х PBS/0,1% Tween-20, затем добавлении 100 мкл раствора хемилюминисцентного субстрата на лунку. Раствор субстрата получают смешиванием равных объемов двух растворов набора SuperSignal ELISA Femto, 20 мл плюс 20 мл, за 30 мин до применения, и хранят его при комнатной температуре в темноте. Люминисценция считывается после 5 мин инкубации при комнатной температуре в темноте.Detection consists of removing streptavidin-HRP and washing 3 times with 300 µl 1x PBS/0.1% Tween-20, then adding 100 µl chemiluminescent substrate solution per well. Substrate solution is prepared by mixing equal volumes of two SuperSignal ELISA Femto kit solutions, 20 ml plus 20 ml, 30 min prior to use and stored at room temperature in the dark. Luminescence is read after 5 min incubation at room temperature in the dark.

Для каждого условия анализ проводится в тройной повторности, и результаты по интервалам будут представлены в виде графика, показывающего изменение люминисценции, в зависимости от концентрации прогастрина. Для каждого разведения плазмы определяется концентрация прогастрина с использованием уравнения прямой линейной регрессии соответствующего интервала (интервал 1/10-й для образца, разведенного до 1/10-й).For each condition, the assay is run in triplicate and the interval results will be presented as a graph showing the change in luminescence as a function of progastrin concentration. For each plasma dilution, the progastrin concentration is determined using a direct linear regression equation for the corresponding interval (interval 1/10th for sample diluted to 1/10th).

Способы и результаты.Methods and results.

Медианная плазматическая концентрация прогастрина составляет 0 пМ у контрольных пациентов (n равно 103), тогда как у пациентов, имеющих рак легкого, может быть выявлена значимая плазматическая концентрация прогастрина. Таким образом, пациенты с раком легкого имеют более высокие уровни прогастрина в их плазме по сравнению со здоровыми контрольными индивидами.The median plasma concentration of progastrin is 0 pM in control patients (n is 103), while in patients with lung cancer, a significant plasma concentration of progastrin can be detected. Thus, patients with lung cancer have higher levels of progastrin in their plasma compared to healthy controls.

Пример 2. Выявление концентрации прогастрина с использованием моноклональных антител против прогастрина.Example 2 Progastrin Concentration Detection Using Anti-Progastrin Monoclonal Antibodies.

Лунки 96-луночных планшетов Nunc MaxiSORP покрывают первым прогастринспецифичным антителом следующим образом. Моноклональные антитела против прогастрина, специфичные в отношении карбоксиконцевой области прогастрина, разводят до концентрации 3 мкг/мл в растворе 50 мМ натрий карбонатного/бикарбонатного буфера, рН 9,6, в воде MilliQ.The wells of Nunc MaxiSORP 96-well plates are coated with the first progastrin-specific antibody as follows. Anti-progastrin monoclonal antibodies specific for the carboxy-terminal region of progastrin are diluted to a concentration of 3 μg/ml in a solution of 50 mM sodium carbonate/bicarbonate buffer, pH 9.6, in MilliQ water.

Всего 100 мкл раствора антитела затем добавляют в каждую лунку 96-луночных планшетов и инкубируют в течение ночи при 4°С. После связывания раствор антитела удаляют из лунок, которые затем три раза промывают 100 мкл промывочного буфера (1 х PBS/0,1% Tween-20). Затем в каждую лунку добавляют всего 100 мкл блокирующего буфера (1х PBS/0,1% Tween-20/0,1% BSA) и инкубируют в течение 2 ч при 22°С. Блокирующий буфер затем удаляют, и лунки три раза промывают промывочным буфером. Затем добавляют в лунки образцы плазмы или сыворотки, выделенные от пациентов, в объеме 100 мкл в серии разведения - типично разведениях 1:1, 1:2, 1:5 и 1:10 - и затем инкубируют в течение 2 ч при 22°С. Образцы плазмы или сыворотки анализируются в двойной повторности.A total of 100 μl of antibody solution is then added to each well of 96-well plates and incubated overnight at 4°C. After binding, the antibody solution is removed from the wells, which are then washed three times with 100 μl of wash buffer (1 x PBS/0.1% Tween-20). Then a total of 100 μl blocking buffer (1x PBS/0.1% Tween-20/0.1% BSA) is added to each well and incubated for 2 hours at 22°C. The blocking buffer is then removed and the wells are washed three times with wash buffer. Plasma or serum samples isolated from patients are then added to the wells in a volume of 100 µl in a series of dilutions - typically 1:1, 1:2, 1:5 and 1:10 dilutions - and then incubated for 2 hours at 22°C. . Plasma or serum samples are analyzed in duplicate.

Анализы также включают две стандартные кривые. Первую стандартную кривую получают с использованием разведений рекомбинантного прогастрина до конечного количества 1 нг, 0,5 нг, 0,25 нг, 0,1 нг, 0,05 нг, 0,01 нг и 0 нг на лунку. Вторую стандартную кривую, которая служит в качестве негативного контроля, получают из негативной в отношении прогастрина человеческой сыворотки, разведенной в блокирующем буфере в таких же разведениях, что и опытные образцы, т.е. 1:1, 1:2, 1:5 и 1:10. В качестве альтернативы, при анализе образцов плазмы, вторую стандартную кривую, которая служит в качестве негативного контроля, получают из негативной в отношении прогастрина человеческой плазмы, разведенной в блокирующем буфере в таких же разведениях, что и опытные образцы, т.е. 1:1, 1:2, 1:5 и 1:10.The analyzes also include two standard curves. A first standard curve was prepared using dilutions of recombinant progastrin to a final amount of 1 ng, 0.5 ng, 0.25 ng, 0.1 ng, 0.05 ng, 0.01 ng and 0 ng per well. A second standard curve, which serves as a negative control, is prepared from progastrin-negative human serum diluted in blocking buffer at the same dilutions as the test samples, ie. 1:1, 1:2, 1:5 and 1:10. Alternatively, when analyzing plasma samples, a second standard curve, which serves as a negative control, is prepared from progastrin-negative human plasma diluted in blocking buffer at the same dilutions as the test samples, i. 1:1, 1:2, 1:5 and 1:10.

После завершения инкубации с образцами плазмы или сыворотки содержимое лунок удаляют, и лунки три раза промывают промывочным буфером, 100 мкл/лунку, после чего прогастрин, связавшийся с первым антителом, выявляют с использованием второго антитела, специфичного в отношении прогастрина, следующим образом.After completion of incubation with plasma or serum samples, the contents of the wells are discarded and the wells are washed three times with wash buffer, 100 μl/well, after which the progastrin bound to the first antibody is detected using the second progastrin-specific antibody as follows.

- 20 042821- 20 042821

Связанные с биотином моноклональные антитела против прогастрина, специфичные в отношении аминоконцевой области прогастрина, разводят в блокирующем буфере до концентрации от 0,1 до мкг/мл, в зависимости от антитела. В каждую лунку затем добавляют всего 100 мкл раствора антитела и инкубируют в течение 1 ч при 22°С.Biotin-bound anti-progastrin monoclonal antibodies specific for the amino-terminal region of progastrin are diluted in blocking buffer to a concentration of 0.1 to μg/ml, depending on the antibody. A total of 100 μl of antibody solution is then added to each well and incubated for 1 hour at 22°C.

После завершения связывания вторичного антитела планшеты три раза промывают промывочным буфером, 100 мкл/лунку, после чего в каждую лунку добавляют 100 мкл раствора стрептавидин-HRP (25 нг/мл в блокирующем буфере) и инкубируют в течение 1 ч при 22°С. После завершения инкубации с раствором стрептавидин-HRP планшеты три раза промывают промывочным буфером, 100 мкл/лунку. Затем добавляют на лунку 100 мкл хемилюминисцентного субстрата, приготовленного с использованием набора хемилюминисцентного субстрата для максимальной чувствительности Pierce SuperSignal ELISA Femto, инкубируют в течение 5 мин при комнатной температуре в темноте и затем считывают на люминометре.After binding of the secondary antibody is complete, the plates are washed three times with wash buffer, 100 µl/well, after which 100 µl of streptavidin-HRP solution (25 ng/ml in blocking buffer) is added to each well and incubated for 1 hour at 22°C. After completion of incubation with streptavidin-HRP solution, the plates are washed three times with wash buffer, 100 μl/well. Then, 100 µl of chemiluminescent substrate prepared using the Pierce SuperSignal ELISA Femto Maximum Sensitivity Chemiluminescent Substrate Kit is added per well, incubated for 5 minutes at room temperature in the dark, and then read on a luminometer.

На основе показаний люминометра для получения уравнения прямых, соответствующих данным стандартной кривой, используют линейный регрессионный анализ. С использованием данного уравнения затем рассчитывается концентрация прогастрина в разных образцах пациентов.Based on the luminometer readings, a linear regression analysis is used to derive the equation of lines corresponding to the standard curve data. Using this equation, the concentration of progastrin in different patient samples is then calculated.

Медианная плазматическая концентрация прогастрина рассчитывается у пациентов, имеющих рак легкого, и сравнивается с медианной плазматической концентрацией прогастрина в плазме контрольных пациентов. Пациенты с раком легкого имеют повышенные уровни прогастрина в их плазме по сравнению со здоровыми контрольными индивидами.The median plasma concentration of progastrin is calculated in patients with lung cancer and compared with the median plasma concentration of progastrin in the plasma of control patients. Patients with lung cancer have elevated levels of progastrin in their plasma compared to healthy controls.

Пример 3. Выявление плазматической концентрации прогастрина с использованием комбинации поликлональных антител и моноклональных антител.Example 3 Detection of plasma concentration of progastrin using a combination of polyclonal antibodies and monoclonal antibodies.

В настоящем примере плазматические уровни прогастрина количественно измеряются ELISA посредством применения антитела, специфичного в отношении человеческого прогастрина (hPG), которым покрыт 96-луночный планшет. Стандарты и образцы добавляют в лунки, и любой присутствующий hPG связывается с иммобилизованным захватывающим антителом. Лунки промывают, и добавляют конъюгат выявляющего антитела против hPG с пероксидазой хрена (HRP), получая сэндвич антитело-антигенантитело. После второй промывки добавляют раствор субстрата ТМВ (тетраметилбензидин), который дает синее окрашивание в прямой пропорции количеству hPG, присутствующего в исходном образце. Останавливающий раствор изменяет окраску от синей до желтой, и лунки считываются при 450 нм с использованием микропланшет-ридера.In the present example, plasma progastrin levels are quantified by ELISA using an antibody specific for human progastrin (hPG) coated on a 96-well plate. Standards and samples are added to the wells and any hPG present is bound to the immobilized capture antibody. The wells are washed and a horseradish peroxidase (HRP) detecting antibody against hPG is added to form an antibody-antigen sandwich. After the second wash, a TMB (tetramethylbenzidine) substrate solution is added, which gives a blue color in direct proportion to the amount of hPG present in the original sample. The stop solution turns blue to yellow and the wells are read at 450 nm using a microplate reader.

Поликлональные антитела получают иммунизированием кролика N-концом прогастрина (SEQ ID NO: 2) или С-концом прогастрина, соответствующим аминокислотам 71-80 hPG и имеющим последовательность FGRRSAEDEN (SEQ ID NO 40), согласно стандартным протоколам.Polyclonal antibodies are obtained by immunizing a rabbit with the N-terminus of progastrin (SEQ ID NO: 2) or the C-terminus of progastrin corresponding to hPG amino acids 71-80 and having the sequence FGRRSAEDEN (SEQ ID NO 40) according to standard protocols.

Моноклональные антитела получают с использованием гибридом, продуцирующих антитела против N-конца прогастрина (SEQ ID NO: 2) или против С-конца прогастрина, соответствующего аминокислотам 71-80 hPG и имеющего последовательность FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40), согласно стандартным протоколам.Monoclonal antibodies are generated using hybridomas producing antibodies against the N-terminus of progastrin (SEQ ID NO: 2) or against the C-terminus of progastrin corresponding to hPG amino acids 71-80 and having the sequence FGRRSAEDEN (SEQ ID NO: 40) according to standard protocols.

Характеристики связывания поликлональных и моноклональных антител против прогастрина, использованных в данном анализе, являются следующими: отсутствие связывания с G34-Gly, G34, G17Gly, G17, связывание с полноразмерным прогастрином.The binding characteristics of the polyclonal and monoclonal antibodies against progastrin used in this assay are as follows: no binding to G34-Gly, G34, G17Gly, G17, binding to full length progastrin.

Для контрольного анализа проводится ELISA в присутствии известной концентрации прогастрина, разведение прогастрина получают следующим образом: маточный рекомбинантный PG (полноразмерный человеческий прогастрин, продуцированный в Е. coli и аффинно очищенный с использованием глутатиона-агарозы/удаления метки (Tev)/очистки на IMAC Counter/диализа, от Института Пастера, Париж, Франция) готовят в концентрации 0,45 мг/мл (45 микроМ) в тройной повторности. Интервалы концентраций прогастрина получают следующим образом:For control analysis, ELISA is performed in the presence of a known concentration of progastrin, progastrin dilution is prepared as follows: uterine recombinant PG (full-length human progastrin produced in E. coli and affinity purified using glutathione-agarose/tag removal (Tev)/purification on the IMAC Counter/ dialysis, from the Pasteur Institute, Paris, France) are prepared at a concentration of 0.45 mg/ml (45 microM) in triplicate. Intervals of progastrin concentrations are obtained as follows:

раствор А: предварительное разведение 1/10, 2 мкл маточного раствора плюс 18 мкл буфера, раствор В: предварительное разведение 1/100, 10 мкл А плюс 90 мкл буфера, раствор С: предварительное разведение 1/1000, 10 мкл В плюс 90 мкл буфера, раствор D: 500 пМ, 5,55 мкл С плюс 494,5 мкл разбавителя, раствор Е: 250 пМ, 250 мкл D плюс 250 мкл разбавителя, раствор F: 100 пМ, 200 мкл Е плюс 300 мкл разбавителя, раствор G: 50 пМ, 250 мкл F плюс 250 мкл разбавителя, раствор Н: 25 пМ, 200 мкл G плюс 200 мкл разбавителя, раствор I: 10 пМ, 100 мкл Н плюс 150 мкл разбавителя.solution A: pre-dilution 1/10, 2 µl stock solution plus 18 µl buffer, solution B: pre-dilution 1/100, 10 µl A plus 90 µl buffer, solution C: pre-dilution 1/1000, 10 µl B plus 90 µl buffer solution D: 500 pM, 5.55 µl C plus 494.5 µl diluent, solution E: 250 pM, 250 µl D plus 250 µl diluent, solution F: 100 pM, 200 µl E plus 300 µl diluent, solution G : 50 pM, 250 µl F plus 250 µl diluent, solution H: 25 pM, 200 µl G plus 200 µl diluent, solution I: 10 pM, 100 µl H plus 150 µl diluent.

Интервал концентрации рекомбинантного PG является линейным и, следовательно, может быть более или менее широким согласно используемому антителу.The recombinant PG concentration range is linear and therefore can be more or less wide according to the antibody used.

Способы и результаты.Methods and results.

Уровни прогастрина определяются в образцах плазмы от субъектов, для которых позднее стало известно, что у них развился рак легкого. Прогастрин захватывается моноклональным антителом mAb 14 против С-конца, продуцируемым гибридомой 2H9F4B7, описанной в WO 2011/083088 (гибридомаProgastrin levels are determined in plasma samples from subjects later known to have developed lung cancer. Progastrin is captured by the anti-C-terminal monoclonal antibody mAb 14 produced by the 2H9F4B7 hybridoma described in WO 2011/083088 (hybridoma

- 21 042821- 21 042821

2H9F4B7 депонируется согласно Будапештскому соглашению в CNCM, Институт Пастера, 25-28 rue du2H9F4B7 deposited under the Budapest Agreement at CNCM, Pasteur Institute, 25-28 rue du

Docteur Roux, 75724 Париж CEDEX 15, Франция, 27 декабря 2016 г., согласно ссылке I-5158). Выявление осуществляется мечеными поликлональными антителами, специфичными в отношении N-конца.Docteur Roux, 75724 Paris CEDEX 15, France, December 27, 2016, reference I-5158). Detection is carried out with labeled polyclonal antibodies specific for the N-terminus.

Контроль составлен образцами плазмы из общей популяции.The control is composed of plasma samples from the general population.

Данные демонстрируют то, что пациенты с раком легкого имеют выявляемые уровни прогастрина в их плазме, тогда как здоровые контрольные индивиды не имеют его.The data demonstrate that patients with lung cancer have detectable levels of progastrin in their plasma, while healthy controls do not.

Пример 4. Выявление плазматической концентрации прогастрина с использованием набора DECODE Lab.Example 4 Determination of Plasma Concentration of Progastrin Using the DECODE Lab Kit.

Данный анализ обеспечвает измерение hPG в плазме-EDTA (этилендиаминтетрауксусная кислота) посредством ELISA.This assay provides a measurement of plasma hPG-EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid) by ELISA.

В данном наборе используется захватывающее антитело, специфичное в отношении hPG, которым предварительно покрыт 96-луночный планшет. hPG, присутствующий в стандартах и образцах, добавленных в лунки, связывается с иммобилизованным захватывающим антителом. Данные лунки промывают, и добавляют конъюгат выявляющего антитела против hPG с пероксидазой хрена (HRP), приводя к образованию комплекса антитело-антиген-антитело. После второй промывки в лунку добавляют раствор субстрата 3,3',5,5'-тетраметилбензидина (ТМВ), получая синее окрашивание в прямой пропорции количеству hPG, присутствующему в исходном образце. Цвет останавливающего раствора изменяется от синего до желтого, и лунки считывают при 450 нм с использованием микропланшет-ридера.This kit uses an hPG-specific capture antibody that is pre-coated on a 96-well plate. hPG present in the standards and samples added to the wells binds to the immobilized capture antibody. These wells are washed and a horseradish peroxidase (HRP) conjugate of anti-hPG detecting antibody is added, resulting in the formation of an antibody-antigen-antibody complex. After the second wash, 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine (TMB) substrate solution is added to the well, producing a blue color in direct proportion to the amount of hPG present in the original sample. The color of the stop solution changes from blue to yellow and the wells are read at 450 nm using a microplate reader.

Способы и результаты.Methods and results.

Для измерения концентрации прогастрина использовали 40 образцов плазмы от пациентов с раком легкого и 119 образцов плазмы от здоровых доноров с использованием набора ELISA DECODE Lab (захватывающее антитело: mAb14, выявляющее антитело: поликлональное против hPG), следуя рекомендации изготовителя.To measure progastrin concentration, 40 plasma samples from patients with lung cancer and 119 plasma samples from healthy donors were used using the DECODE Lab ELISA kit (capture antibody: mAb14, detection antibody: polyclonal against hPG) following the manufacturer's recommendation.

Вкратце.Briefly.

1. Приготовить все реактивы, контроли и образцы, как указано в предыдущем разделе, за исключением 1х конъюгата.1. Prepare all reagents, controls, and samples as described in the previous section, except for the 1x conjugate.

2. Удалить избыточную полоску из рамки планшета для микротитрования, возвратить его в упаковку для планшета и хранить при 2-8°С.2. Remove the excess strip from the frame of the microtiter plate, return it to the plate package and store at 2-8°C.

3. Образцы и контроли должны анализироваться в двойных повторностях. Приготовить предварительную загрузку контролей и образцов добавлением 65 мкл/повторность в лунки 96-луночных глубоколуночных полипропиленовых микропланшетов.3. Samples and controls should be analyzed in duplicate. Prepare preload controls and samples by adding 65 µl/rep to wells of 96-well deep well polypropylene microplates.

4. Добавить 50 мкл буфера для разведения образцов во все лунки, которые будут использоваться, из полосок предварительно покрытого 96-луночного планшета, включенного в набор.4. Add 50 µl of sample dilution buffer to all wells to be used from strips of the pre-coated 96-well plate included in the kit.

5. Перенести 50 мкл контролей и образцов многоканальной пипеткой (8 каналов) из предварительно загруженных 96-луночных глубоколуночных полипропиленовых микропланшетов в полоски предварительно покрытого 96-луночного планшета, включенного в набор. Время загрузки не должно превышать 10 минут.5. Transfer 50 µl of controls and samples with a multichannel pipette (8 channels) from the preloaded 96-well deep-well polypropylene microplates to the strips of the pre-coated 96-well plate included in the kit. Download time should not exceed 10 minutes.

6. Покрыть планшет пластичным парафином и инкубирвать в течение 3 ч плюс/минус 5 мин при 37°С (плюс/минус 2°С).6. Cover the plate with plastic paraffin and incubate for 3 hours plus/minus 5 minutes at 37°C (plus/minus 2°C).

7. Приготовить 1х конъюгат, как описано в разделе 10.2.7. Prepare 1x conjugate as described in section 10.2.

8. В конце стадии инкубации отбросить всю жидкость из лунок посредством переворачивания планшета. Перейти к стадии тщательной промывки добавлением 300 мкл на лунку 1х промывочного раствора. Отбросить 1х промывочный раствор посредством переворачивания планшета и тщательно промокнуть рамку планшета для микротитрования на поглощающей бумаге, перевернув его вверх дном. Повторить стадию промывки 6 раз. В конце стадий промывки убедиться в полном удалении жидкости из лунок: вся жидкость была успешно удалена, когда на бумажном полотенце не остается признаков жидкости. Процедура промывки является критически важной. Недостаточная промывка может приводить к плохой точности и ложно повышенным показателям поглощения.8. At the end of the incubation step, discard all liquid from the wells by inverting the plate. Proceed to the thorough washing step by adding 300 µl per well of 1x wash solution. Discard the 1x wash solution by inverting the plate and thoroughly blot the frame of the microtiter plate on absorbent paper by turning it upside down. Repeat the washing step 6 times. At the end of the wash steps, ensure that all liquid has been removed from the wells: all liquid has been successfully removed when no sign of liquid remains on the paper towel. The flushing procedure is critical. Insufficient washing can lead to poor accuracy and falsely elevated absorbances.

9. Добавить 100 мкл 1х конъюгата в каждую лунку.9. Add 100 µl of 1x conjugate to each well.

10. Покрыть планшет пластичным парафином и инкубировать 30 мин плюс/минус 3 мин при 21 °С (плюс/минус 5°С).10. Cover the plate with plastic paraffin and incubate for 30 min plus/minus 3 min at 21°C (plus/minus 5°C).

11. В конце стадии инкубации отбросить всю жидкость из лунок посредством переворачивания планшета. Перейти к стадии тщательной промывки посредством добавления 300 мкл на лунку 1х промывочного раствора. Отбросить 1х промывочный раствор посредством переворачивания планшета и тщательно промокнуть рамку планшета для микротитрования на поглощающей бумаге, перевернув его вверх дном. Повторить стадию промывки 6 раз. В конце стадий промывки убедиться в полном удалении жидкости из лунок: вся жидкость была успешно удалена, когда на бумажном полотенце не остается признаков жидкости. Процедура промывки является критически важной. Недостаточная промывка будет приводить к плохой точности и ложно повышенным показателям поглощения.11. At the end of the incubation step, discard all liquid from the wells by inverting the plate. Proceed to the thorough washing step by adding 300 µl per well of 1x wash solution. Discard the 1x wash solution by inverting the plate and thoroughly blot the frame of the microtiter plate on absorbent paper by turning it upside down. Repeat the washing step 6 times. At the end of the wash steps, ensure that all liquid has been removed from the wells: all liquid has been successfully removed when no sign of liquid remains on the paper towel. The flushing procedure is critical. Insufficient washing will result in poor accuracy and falsely elevated absorbances.

12. Добавить 100 мкл раствора субстрата в каждую лунку. При добавлении раствора субстрата содержимое лунок позитивного контроля 1 и позитивного контроля 2 должно стать синим.12. Add 100 µl of substrate solution to each well. When the substrate solution is added, the contents of the positive control 1 and positive control 2 wells should turn blue.

--

Claims (4)

13. Инкубировать в течение 15 мин плюс/минус 2 мин при 21 °С (плюс/минус 5°С) в темноте.13. Incubate for 15 min plus/minus 2 min at 21°C (plus/minus 5°C) in the dark. 14. Без удаления содержимого лунок добавить 100 мкл останавливающего раствора в каждую лунку для того, чтобы остановить реакцию. При добавлении останавливающего раствора содержимое лунок позитивного контроля 1 и позитивного контроля 2 должно стать желтым.14. Without removing the contents of the wells, add 100 µl of stop solution to each well to stop the reaction. When the stop solution is added, the contents of the positive control 1 and positive control 2 wells should turn yellow. 15. Считать и записать ОП (оптическая плотность) при 450 нм.15. Read and write down the OD (optical density) at 450 nm. Как показано на фиг. 1, медианная плазматическая концентрация прогастрина составляла 0 пМ у контрольных пациентов (n равно 119), тогда как у пациентов, имеющих рак легкого (n равно 40), могла быть выявлена значимая плазматическая концентрация прогастрина. Таким образом, пациенты с раком легкого имеют более высокие уровни прогастрина в их плазме по сравнению со здоровыми контрольными индивидами.As shown in FIG. 1, the median plasma progastrin concentration was 0 pM in control patients (n = 119), while in patients with lung cancer (n = 40), a significant plasma progastrin concentration could be detected. Thus, patients with lung cancer have higher levels of progastrin in their plasma compared to healthy controls. Библиографические ссылкиBibliographic references Yanaoka et al., Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 2008, 17(4).Yanaoka et al., Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 2008, 17(4). Pepe et al., J Natl Cancer Inst, 2008, Oct., 100(20).Pepe et al., J Natl Cancer Inst, 2008, Oct., 100(20). Leja et al., Best Practice & Research Clinical Gastroenterology, 2014, Dec, 28(6).Leja et al., Best Practice & Research Clinical Gastroenterology, 2014, Dec, 28(6). ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯCLAIM 1. Способ диагностики in vitro рака легкого у субъекта, включающий стадии, на которых:1. A method for diagnosing lung cancer in vitro in a subject, comprising the steps of: а) приводят в контакт биологический образец от указанного субъекта по меньшей мере с одним антителом, связывающимся с прогастрином, или его антигенсвязывающим фрагментом, где биологический образец выбран из следующего: кровь, сыворотка и плазма;a) contacting a biological sample from said subject with at least one progastrin-binding antibody or antigen-binding fragment thereof, wherein the biological sample is selected from the following: blood, serum and plasma; б) выявляют связывание указанного антитела, связывающегося с прогастрином, или его антигенсвязывающего фрагмента, с прогастрином в указанном образце, где указанное связывание указывает на наличие рака легкого у указанного субъекта и указанное антитело, связывающееся с прогастрином, представляет собой моноклональное антитело, выбранное в группе, состоящей из следующих:b) detecting the binding of said progastrin-binding antibody, or antigen-binding fragment thereof, to progastrin in said sample, wherein said binding indicates the presence of lung cancer in said subject and said progastrin-binding antibody is a monoclonal antibody selected from the group, consisting of the following: моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 4, 5 и 6 соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 7, 8 и 9 соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 10, 11 и 12 соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 13, 14 и 15 соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 16, 17 и 18 соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 19, 20 и 21 соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 22, 23 и 24 соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 25, 26 и 27 соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 28, 29 и 30 соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 31, 32 и 33 соответственно, моноклональное антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую CDR-H1, CDR-H2 и CDR-H3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 34, 35 и 36 соответственно, и легкую цепь, содержащую CDR-L1, CDR-L2 и CDR-L3 аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 37, 38 и 39 соответственно, и моноклональное антитело, продуцированное гибридомой, депонированной в CNCM, Институт Пастера, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Париж CEDEX 15, Франция, 27 декабря 2016 г., согласно ссылке I5158.monoclonal antibody containing a heavy chain containing CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences SEQ ID NO: 4, 5 and 6, respectively, and a light chain containing CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences SEQ ID NOs: 7, 8 and 9, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 10, 11 and 12, respectively, and a light chain containing CDR- L1, CDR-L2 and CDR-L3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 13, 14 and 15, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 16, 17 and 18, respectively, and a light chain containing CDR-L1, CDR-L2, and CDR-L3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 19, 20, and 21, respectively; a heavy chain-containing monoclonal antibody containing CDR-H1, CDR-H2, and CDR -H3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 22, 23, and 24, respectively, and a light chain containing CDR-L1, CDR-L2, and CDR-L3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 25, 26, and 27, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing CDR-H1, CDR-H2 and CDR-H3 amino acid sequences SEQ ID NO: 28, 29 and 30, respectively, and a light chain containing CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 amino acid sequences SEQ ID NO: 31, 32 and 33, respectively, a monoclonal antibody containing a heavy chain containing CDR-H1, CDR-H2, and CDR-H3 of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 34, 35, and 36, respectively, and a light chain containing CDR-L1, CDR-L2, and CDR-L3 amino acid sequences of SEQ ID NOs: 37, 38 and 39, respectively, and a monoclonal antibody produced by a hybridoma deposited with CNCM, Institut Pasteur, 25-28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris CEDEX 15, France, December 27, 2016. , according to reference I5158. 2. Способ по п.1, в котором на стадии б) дополнительно определяют концентрацию прогастрина и где концентрация прогастрина по меньшей мере 10 пМ в указанном биологическом образце указывает на наличие рака легкого у указанного субъекта.2. The method of claim 1, wherein in step b) the progastrin concentration is further determined, and wherein a progastrin concentration of at least 10 pM in said biological sample indicates the presence of lung cancer in said subject. 3. Способ по п.2, включающий дополнительные стадии, на которых:3. The method according to claim 2, including additional stages, in which: в) определяют контрольную концентрацию прогастрина в контрольном образце,c) determine the control concentration of progastrin in the control sample, г) сравнивают концентрации прогастрина в указанном биологическом образце с указанной контрольной концентрацией прогастрина,d) comparing the concentrations of progastrin in the specified biological sample with the specified control concentration of progastrin, д) определяют из сравнения стадии г) наличие рака легкого.e) determine from the comparison stage d) the presence of lung cancer. 4. Способ по любому из пп.1-3, в котором указанное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент выбраны среди моноклональных антител против N-конца прогастрина и моноклональных антител против С-конца прогастрина.4. The method according to any one of claims 1 to 3, wherein said antibody or antigen-binding fragment thereof is selected from monoclonal antibodies against the N-terminus of progastrin and monoclonal antibodies against the C-terminus of progastrin. --
EA201992317 2017-03-30 2018-03-30 COMPOSITIONS AND METHODS FOR DIAGNOSTICS OF LUNG CANCER EA042821B1 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP17305382.8 2017-03-30

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA042821B1 true EA042821B1 (en) 2023-03-28

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11614448B2 (en) Compositions and methods for detecting prostate cancer
US20210373027A1 (en) Compositions and methods for assessing the risk of cancer occurrence
US11913958B2 (en) Compositions and methods for detecting lung cancer
JP7018885B2 (en) Compositions and Methods for Detection and Treatment of Esophageal Cancer
EA042821B1 (en) COMPOSITIONS AND METHODS FOR DIAGNOSTICS OF LUNG CANCER
EA041328B1 (en) COMPOSITIONS AND METHODS FOR PROSTATE CANCER DIAGNOSIS
EA043033B1 (en) METHOD FOR CANCER RISK ASSESSMENT, CORRESPONDING SET, DATA STORAGE UNIT AND PROCESSING SYSTEM