CN107506615A - 一种基因组学数据管理方法、服务器和系统 - Google Patents

一种基因组学数据管理方法、服务器和系统 Download PDF

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Abstract

本发明提供了一种基因组学数据管理方法、服务器和系统,该方法包括:获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;对基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;获取受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息,基于基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;将身份标识存储至身份标识数据库;将身份标识发送至受检者所对应的终端,以使受检者可以通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据或者用药安全风险评估报告;该方法对受检者的基因组学数据进行统一管理,数据可以被重复使用,进而可以提高基因组学数据的安全性。

Description

一种基因组学数据管理方法、服务器和系统
技术领域
本发明涉及生物信息技术领域,具体而言,涉及一种基因组学数据管理方法、服务器和系统。
背景技术
近年来,随着医学、生物信息学、分子生物学的发展,分子检测技术进入快速发展时期,并且检测成本在不断降低,使得人类基因组学数据的应用成为可能。
个体之间的基因多态性可造成药物代谢动力学和药物效应动力学的个体差异。个体间的基因型差异对药物的治疗效果会产生重要影响。不同基因型的个体对某种或者某些药物通常具有不同的代谢能力和药物响应,按照传统的千人一药,千人一量的用药模式,很可能会导致治疗效果不佳或者出现严重的药物不良反应,甚至危及生命,增加目前比较紧张的医患关系。
随着人类基因组学研究的深入,越来越多的药物基因组生物标记物被人们所发现。临床药理学实施联盟(CPIC)在Geneticsin Medicine杂志上发表药物基因组学应用指南,将药物基因组学相关基因分为三大类:药物代谢酶类(CYP家族,UGT1A1家族,DPYD和TPMT),药物转运体(如SLCO1B1),高风险基因型(如HLA-B),进一步规范指导药物基因组学在临床用药上的应用;基因组学数据代表了受检者的基因相关的数据,该数据属于受检者的个人隐私数据,其私密性很强,需要满足数据安全、不被他人随意获取得到的要求;因此基因组学数据在进行管理时如果直接由受检者自己进行保存则存在着数据丢失或者被窃取的风险,如果丢失则受检者在就医时需要重新进行基因检测。
发明内容
有鉴于此,本发明实施例的目的在于提供一种基因组学数据管理方法、服务器和系统,以解决上述问题。
第一方面,本发明实施例提供了一种基因组学数据管理方法,包括:
获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;
对所述基因测序原始数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;
获取所述受检者的基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息,基于所述受检者基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;
将所述身份标识存储至身份标识数据库;
将所述身份标识发送至所述受检者所对应的终端,以使所述受检者通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第一种可能的实施方式,其中:所述身份标识存储于条形码、序列号、二维码或者电子芯片中。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第二种可能的实施方式,其中:所述基本信息包括:受检者身份证号、姓名、出生日期、性别、地域、指纹信息、疾病史和用药禁忌中的任意一种或多种。
结合第一方面,本发明实施例提供了第一方面的第三种可能的实施方式,其中:所述方法,还包括:
接收配药终端发送的获取基因组学数据的请求,所述请求为该配药终端通过获取所述受检者的身份标识生成的,所述请求包含有:所述身份标识;所述配药终端为受检者就医时的医护工作人员所使用的终端设备;
检索所述身份标识数据库中是否存在该身份标识,如果是,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息;
基于所述加密后的数据存储的物理位置信息获取加密后的数据,对所述加密后的数据进行解密,得到基因组学数据;
将所述基因组学数据发送到所述配药终端进行显示。
结合第一方面的第三种可能的实施方式,本发明实施例提供了第一方面的第四种可能的实施方式,其中:所述方法,还包括:
根据所述基因组学数据,确定受检者的药物基因组学基因型;
从预先存储的用药方案列表中查找与所述药物基因组学基因型对应的药物的用药信息;
基于所述基因型、用药信息和所述受检者的个人信息生成用药安全风险评估报告;
将所述用药安全风险评估报告发送至所述配药终端进行显示。
第二方面,本发明实施例提供了一种服务器,包括:
获取模块,用于获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;
加密模块,用于对所述基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;
身份标识生成模块,用于获取所述受检者的基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息,基于所述受检者基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;
存储模块,用于将所述身份标识存储至身份标识数据库;
第一发送模块,用于将所述身份标识发送至所述受检者所对应的终端,以使所述受检者通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据。
结合第二方面,本发明实施例提供了第二方面的第一种可能的实施方式,其中:所述服务器,还包括:
接收模块,用于接收配药终端发送的获取基因组学数据的请求,所述请求为该配药终端通过获取所述受检者的身份标识生成的,所述请求包中含有:所述身份标识;所述配药终端为受检者就医时的医护工作人员所使用的终端设备;
查找模块,用于查找所述数据库中是否存在该身份标识,如果是,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息;
解密模块,用于基于所述加密后的数据存储的物理位置信息获取加密后的数据,对所述加密后的数据进行解密,得到基因组学数据;;
第二发送模块,用于将所述基因组学数据发送到所述配药终端进行显示。
结合第二方面的第一种可能的实施方式,本发明实施例提供了第二方面的第二种可能的实施方式,其中:所述服务器,还包括:用药安全风险评估报告生成模块;
所述用药安全风险评估报告生成模块,用于执行以下步骤:
根据所述基因组学数据,确定受检者的药物基因组学基因型;
从预先存储的用药方案列表中查找与所述药物基因组学基因型对应的药物的用药信息;
基于所述基因型、用药信息和所述受检者的个人信息生成用药安全风险评估报告;
所述第二发送模块,还用于将所述用药安全风险评估报告发送至所述配药终端进行显示。
第三方面,本发明实施例提供了一种基因组学数据管理系统,包括:第二方面任一个可能的实施方式中所述的服务器、信息采集终端和配药终端;
所述信息采集终端用于采集受检者的基本信息及基因组学数据,并将该数据发送至服务器;
所述配药终端用于向所述服务器发送获取基因组学数据的请求,并接收所述服务器发送的基因组学数据进行显示。
本发明实施例提供的一种基因组学数据管理方法、服务器和系统,方法中获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据,并对该数据按照预设的规则进行加密,存储该加密后的数据,进一步的获取该受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息,基于该受检者的基本信息和数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识,将该身份标识进行存储,同时发送该身份标识至受检者所对应的终端,以使受检者可以使用该身份标识查询或获取其对应的基因组学数据,该方法对受检者的基因组学数据进行统一管理,数据可以被重复使用,可以提高基因组学数据的安全性。
为使本发明的上述目的、特征和优点能更明显易懂,下文特举较佳实施例,并配合所附附图,作详细说明如下。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本发明的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术使用者来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
图1示出了本发明的实施例一所提供的一种基因组学数据管理方法的流程示意图;
图2示出了本发明的实施例一所提供的生成用药安全风险评估报告的流程示意图;
图3示出了本发明实施例二所提供的一种服务器的结构意图;
图4示出了本发明实施例三所提供的一种基因组学数据管理系统的结构示意图。
具体实施方式
为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将结合本发明实施例中附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。通常在此处附图中描述和示出的本发明实施例的组件可以以各种不同的配置来布置和设计。因此,以下对在附图中提供的本发明的实施例的详细描述并非旨在限制要求保护的本发明的范围,而是仅仅表示本发明的选定实施例。基于本发明的实施例,本领域技术人员在没有做出创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
目前,在生物信息技术领域,随着分子检测成本的降低,通过使用人体的基因组学数据进行疾病的诊断、治疗也出现在了医学领域当中,将基因组学数据应用于疾病诊疗,需要满足该基因组学数据可以被重复获取使用,且由于人体的基因组学数据属于个人的隐私数据,其存储和数据的获取都要求具有十分严格的安全性和私密性;基于此,本发明实施例提供了一种基因组学数据管理方法、服务器和系统;下面通过实施例进行描述。
实施例一
参照图1所示的实施例,本发明实施例中提供了一种基因组学数据管理方法,该方法可以是应用于数据管理服务器,该方法包括如下步骤:
S101、获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;
该信息采集终端可以为基因检测仪,该基因检测仪在进行人体基因检测得到受检者的基因组学数据以后,将该数据传输至服务器。
S102、对基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;
此处,对基因组学数据按照预设的加密规则进行加密可以采用以下方式进行:预先建立一个加密规则数据库,在加密规则数据库中存储多套加密算法,在进行对基因组学数据加密时随机挑选该加密规则数据库中的任意一套算法执行加密过程,以进一步提高对基因组学数据进行加密的安全性。
S103、获取受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息,基于该受检者基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;
该身份标识可以是存储于序列号、条形码、二维码或者电子芯片;
S104、将身份标识存储至身份标识数据库;
S105、将身份标识发送至受检者所对应的终端;以使该受检者通过使用身份标识进行获取该受检者的基因组学数据。
上述受检者的基本信息包括但不限于:受检者身份证号、姓名、出生日期、性别、地域、疾病史和用药禁忌;服务器可以根据受检者的基本信息和数据存储的物理位置生成身份标识,当受检者在以后进行就医时,可以通过使用就医时的配药终端获取序列号、条形码、二维码或者电子芯片中存储的该身份标识,并将该身份标识发送至服务器请求获取基因组学数据,服务接收到该请求以后,检索其数据库中是否预先存储有该身份标识,如果有,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息,进一步根据该数据存储的物理位置信息获取该数据。
在某一实施例中,为进一步提高基因组学数据的安全性,可以设置使该基本信息包括:受检者的指纹信息;此时,需要说明的是信息采集终端应当具有采集受检者指纹信息的功能,并具有将该指纹信息发送至服务器的功能,进而服务器可以根据该受检者的指纹信息生成身份标识,当受检者在以后进行就医时,可以通过使用就医时的配药终端现场采集该就医人员的指纹信息,配药终端进一步将该指纹信息与其获取的身份标识中的指纹信息进行匹配,如果匹配成功则向服务器发送获取基因组学数据的请求,该请求中包含有:就医人员的身份标识,服务接收到该请求以后,检索其数据库中是否预先存储有该身份标识,如果有,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息,进一步根据该数据存储的物理位置信息获取该数据,并将数据进行解密后发送至配药终端;以此可以避免身份标识丢失后,该身份标识被他人使用进而导致的基因组学数据被他人窃取的现象发生。
进一步的,在某一具体实施例中,上述生成的身份标识也可以是存储在电子芯片中,将收集到的基因测序原始数据存储至药物基因组学卡(Pharmacard),该药物基因组学卡由受检者持有;进一步的,将收集到的基因组学数据存储至药物基因组学卡中,本实施例中的配药终端应该具备通过使用近场通信技术读取该药物基因组学卡的数据的功能。
进一步的,上述方法,还包括:
接收配药终端发送的获取基因组学数据的请求,该请求为该配药终端通过获取受检者的身份标识生成的,该身份标识可以是存储于条形码、二维码或者序列号中,进而该获取受检者身份标识的过程可以是通过读取该条形码、二维码或者是序列号得到的;该请求中包含有:所述身份标识;所述配药终端为受检者就医时的医护工作人员所使用的终端设备,该医护人员可以是医生或者药剂师等工作人员;
当上述所生成的身份标识为二维码时,配药终端通过扫描该二维码生成获取基因组学数据的请求;扫描二维码之后提取到二维码中存储的身份标识,并将该身份标识发送至服务器,请求获取基因组学数据;
服务器接收到上述请求以后,检索身份标识数据库中是否存在该身份标识,如果是,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息;
如果不是,则服务器会发送错误提示的消息至配药终端;
进一步的,服务器基于上述加密后的数据存储的物理位置信息获取加密后的数据,对该加密后的数据进行解密,得到基因组学数据;
服务器将上述得到的基因组学数据发送到配药终端进行显示。
进而受检者在就医时,医护工作人员可以根据该配药终端显示的内容,进行对受检者配药,从基因层面识别个体差异指导临床用药,为医护工作人员开药进行辅助决策;本实施例所提供的方法,可以实现基因组学数据的重复获取和使用,不用就医人员多次进行基因检测,节约就医人员的费用,并且具有较高的数据安全性。
本实施例中所提供的一种基因组学数据的管理方法,对受检者的基因组学数据进行统一管理,避免了将基因组学数据直接转给受检者,由于受检者保存不当,或者不够重视这些数据,造成数据丢失的问题;该方法中通过按照预设的加密规则进行对基因组学数据进行加密,然后存储该加密后的数据,并基于该受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理地址信息生成该受检者所对应的一个身份标识,并将该身份标识存储于二维码或者条形码中发送给受检者,受检者再次就医时可以通过使用该身份标识获取其基因组学数据,将基因组学数据进行统一管理,可以重复获取和使用,受检者无需再次进行基因测序,降低成本,且具有安全性高和私密性高的积极效果。
本实施例中所提供的一种基因组学数据管理方法中,参照图2所示,还包括如下步骤:
S201、服务器根据基因组学数据,确定受检者的药物基因组学基因型;
S202、从预先存储的用药方案列表中查找与上述药物基因组学基因型对应的药物的用药信息;其中,该用药方案列表中存储有各个药物基因组学基因型与用药方案的对应关系,服务器可以根据受检者的基因组学数据,确定药物基因组学基因型,进一步的基于该药物基因组学基因型在用药方案列表中查找与该基因型对应的用药信息;
上述基因型指的是一个生物体内DNA(Deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸)所包含的基因,也就是说该生物的细胞内所包含的、它所特有的一组基因,一个细胞的基因信息的总和被称为个体基因型。
进一步的,根据上述受检者的基因组数据,确定受检者的基因变异信息;根据上述受检者的基因变异信息,确定受检者的基因型;在本发明实施例中,上述根据基因组学数据确定用户的基因变异信息的过程可以通过以下方式实现:
当服务器获取到用户的基因组测序数据后,去掉上述基因组测序得到的短片段序列中包含的接头序列和低质量的碱基,得到一系列的clean短序列,将上述得到的短序列与参考基因组进行比对,确定出上述基因短序列在基因组上的位置;其中,上述将短序列与参考基因组进行比对是通过比对软件如BWA(Burrows-Wheeler Alignment tool,生物序列对比工具)软件实现的。
使用Samtools软件调整上述比对到人类基因组中的短序列按比对到基因组上的位置进行排序,并进行数据格式转换,即将原来的Sam格式转换成bam文件。
接下来,如果采用的为捕获测序法得到的基因组学数据,需采用Picard软件把上述得到的数据中的PCR重复去掉。
之后,使用GATK等变异识别软件在上述数据中寻找上述数据与参考序列的差异,最后,对上述变异信息进行注释,生成包括变异所在的染色体、变异在所述染色体上的起始物理位置、变异在所述染色体上的终止物理位置、参考序列信息和观察到的序列信息的列表在内的基因变异信息,并且将不同位点的变异信息按照药物基因组学基因型命名标准转换为相应的基因型信息,相关信息存储格式为csv。
其中,上述基因组学数据包括多个短片段序列。
S203、基于上述基因型、用药信息和上述受检者的个人信息生成用药安全风险评估报告;
其中,上述用药信息包括待用药品的标识信息和药品的用量信息;
S204、将上述用药安全风险评估报告发送至配药终端进行显示;
需要说明的是,服务器可以是在配药终端的请求下生成上述的用药安全风险评估报告;也可以是在获取基因组学数据以后自动生成上述的用药安全风险评估报告,并在接收到配药终端发送的获取基因组学数据请求以后,将用药安全风险评估报告发送至配药终端;上述的步骤的顺序在实际应用时可以根据情况进行调整,因此,上述实施例仅为本申请的一个具体实施例,不应当看作是对本申请的限制。
本实施例中,医护工作人员可以参考该用药安全风险评估报告进行配药;进一步的,本实施例中,也可以由受检者根据该用药安全风险评估报告进行自主择药。
实施例二
参照图3所示,本发明实施例中提供了一种服务器,包括:
获取模块301,用于获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;
加密模块302,用于对基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;
身份标识生成模块303,用于获取所述受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息,基于受检者基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;该身份标识由受检者保存,通过该身份标识可以获取查阅上述基因组学数据的权限。
存储模块304,用于将上述身份标识存储至身份标识数据库;
第一发送模块305,用于将所述身份标识发送至所述受检者所对应的终端,以使所述受检者通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据。
本发明实施例所提供的服务器,通过首先对数据进行加密得到加密后的数据,然后存储该加密后的数据,并基于该加密后的数据存储的物理位置信息和受检者的基本信息生成该受检者所对应的身份标识,将该身份标识以某种方式进行存储以后发送至受检者,以使受检者在以后需要使用基因组学数据的时候通过该身份标识获取其对应的基因组学数据,该服务器可以实现对基因组学数据进行统一管理,安全性和私密性高。
进一步的,上述的服务器,还包括:
接收模块,用于接收配药终端发送的获取基因组学数据的请求,该请求为该配药终端通过获取受检者的身份标识生成的,此处的受检者也可以称为就医者,该请求包中含有:就医者的身份标识;配药终端为受检者就医时的医护工作人员所使用的终端设备;
查找模块,用于查找数据库中是否存在该身份标识,如果是,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息;
解密模块,用于基于加密后的数据存储的物理位置信息获取加密后的数据,对该加密后的数据进行解密,得到基因组学数据;;
第二发送模块,用于将上述基因组学数据发送到配药终端进行显示。进而医护工作人员可以参照该基因组学数据为就医者进行诊断或者配药,进而提高了就医效率。
进一步的,在某一具体实施例中,上述的服务器,还包括:用药安全风险评估报告生成模块;
该用药安全风险评估报告生成模块,用于根据基因组学数据,确定受检者的药物基因组学基因型;
从预先存储的用药方案列表中查找与药物基因组学基因型对应的药物的用药信息;
基于基因型、用药信息和受检者的个人信息生成用药安全风险评估报告;
进一步的,上述的第二发送模块,还用于将所述用药安全风险评估报告发送至所述配药终端进行显示;
进而医护工作人员可以参照该用药安全风险评估报告进行对就医者配药,或者就医者可以直接参考该用药安全风险评估报告进行自助取药;本实施例中,服务器结合基因组学数据进行生成用药安全风险评估报告,可以节省医护工作人员的大量工作,提高门诊效率,更重要的是结合基因组学数据进行配药,从基因层面识别个体差异指导临床用药,可以提高药物疗效、减少毒副反应的发生,具有重要的临床意义。
实施例三
本发明实施例中提供了一种基因组学数据管理系统,参照图4所示,包括:上述任一实施例中所述的服务器402、信息采集终端401和配药终端403;
其中,对应于同一台服务器,信息采集终端和配药终端的数量可以是多个;
信息采集终端用于采集受检者的基本信息及基因组学数据,并将该数据发送至服务器;该信息采集终端可以是基因检测仪;
配药终端用于通过获取身份标识向服务器发送获取基因组学数据的请求,并接收所述服务器发送的基因组学数据进行显示。
上述服务器用于获取信息采集终端发送的基因组学数据,并对该基因组学数据进行加密,存储该加密后的数据,并获取该加密后的数据存储的物理位置信息,基于受检者的个人信息和加密后的数据的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识,该身份标识可以以序列号或者二维码的形式进行存储,并将该以某种形式存储后的身份标识发送至受检者所使用的终端;
受检者再次进行就医时,可以通过让配药终端获取该身份标识向服务器发送获取基因组学数据的请求,服务器获取该请求以后进行检索身份标识数据库,如果该身份标识存在于数据库中,则根据该身份标识中所包含的加密后的数据的存储的物理位置信息获取该加密后的数据,进一步对该加密后的户数进行解密,将解密后的数据发送至配药终端进行显示,以使医护工作人员根据该基因组学数据进行诊断。
上述服务器还用于生成用药安全风险评估报告,并将该用药安全风险报告发送至配药终端进行显示。
所属领域的技术人员可以清楚地了解到,为描述的方便和简洁,上述描述的服务器、系统的具体工作过程,可以参考前述系统实施例中的对应方法部分,在此不再赘述。
本发明实施例所提供的一种基因组学数据管理方法的计算机程序产品,包括存储了程序代码的计算机可读存储介质,所述程序代码包括的指令可用于执行前面方法实施例中所述的方法,具体实现可参见方法实施例,在此不再赘述。
在本申请所提供的几个实施例中,应该理解到,所揭露的方法、服务器和系统,可以通过其它的方式实现。以上所描述的装置实施例仅仅是示意性的,例如,所述模块、单元的划分,仅仅为一种逻辑功能划分,实际实现时可以有另外的划分方式,又例如,多个单元可以结合或者可以集成到另一个系统,或一些特征可以忽略,或不执行。
所述功能如果以软件功能单元的形式实现并作为独立的产品销售或使用时,可以存储在一个计算机可读取存储介质中。基于这样的理解,本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分或者该技术方案的部分可以以软件产品的形式体现出来,该计算机软件产品存储在一个存储介质中,包括若干指令用以使得一台计算机设备(可以是个人计算机,服务器,或者网络设备等)执行本发明各个实施例所述方法的全部或部分步骤。而前述的存储介质包括:U盘、移动硬盘、只读存储器(ROM,Read-Only Memory)、随机存取存储器(RAM,Random Access Memory)、磁碟或者光盘等各种可以存储程序代码的介质。
以上所述,仅为本发明的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术使用者在本发明揭露的技术范围内,可轻易想到变化或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应所述以权利要求的保护范围为准。

Claims (9)

1.一种基因组学数据管理方法,其特征在于,包括:
获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;
对所述基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;
获取所述受检者的基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息,基于所述受检者基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;
将所述身份标识存储至身份标识数据库;
将所述身份标识发送至所述受检者所对应的终端,以使所述受检者可以通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述身份标识存储于条形码、序列号、二维码或者电子芯片中。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基本信息包括:受检者身份证号、姓名、出生日期、性别、地域、指纹信息、疾病史和用药禁忌中的任意一种或多种。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括:
接收配药终端发送的获取基因组学数据的请求,所述请求为该配药终端通过获取所述受检者的身份标识生成的,所述请求包含有:所述身份标识;所述配药终端为受检者就医时的医护工作人员所使用的终端设备;
检索所述身份标识数据库中是否存在该身份标识,如果是,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息;
基于所述加密后的数据存储的物理位置信息获取加密后的数据,对所述加密后的数据进行解密,得到基因组学数据;
将所述基因组学数据发送到所述配药终端进行显示。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,还包括:
根据所述基因组学数据,确定受检者的药物基因组学基因型;
从预先存储的用药方案列表中查找与所述药物基因组学基因型对应的药物的用药信息;
基于所述基因型、用药信息和所述受检者的个人信息生成用药安全风险评估报告;
将所述用药安全风险评估报告发送至所述配药终端进行显示。
6.一种服务器,其特征在于,包括:
获取模块,用于获取信息采集终端输入的受检者的基因组学数据;
加密模块,用于对所述基因组学数据按照预设的加密规则进行加密处理得到加密后的数据,并存储该加密后的数据;
身份标识生成模块,用于获取所述受检者的基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息,基于所述受检者基本信息和所述加密后的数据存储的物理位置信息生成该受检者所对应的身份标识;
存储模块,用于将所述身份标识存储至身份标识数据库;
第一发送模块,用于将所述身份标识发送至所述受检者所对应的终端,以使所述受检者通过使用所述身份标识进行获取该受检者的基因组学数据。
7.根据权利要求6所述的服务器,其特征在于,还包括:
接收模块,用于接收配药终端发送的获取基因组学数据的请求,所述请求为该配药终端通过获取所述受检者的身份标识生成的,所述请求包中含有:所述身份标识;所述配药终端为受检者就医时的医护工作人员所使用的终端设备;
查找模块,用于查找所述数据库中是否存在该身份标识,如果是,则对该身份标识进行解码得到受检者的基本信息和加密后的数据存储的物理位置信息;
解密模块,用于基于所述加密后的数据存储的物理位置信息获取加密后的数据,对所述加密后的数据进行解密,得到基因组学数据;
第二发送模块,用于将所述基因组学数据发送到所述配药终端进行显示。
8.根据权利要求7所述的服务器,其特征在于,还包括:用药安全风险评估报告生成模块;
所述用药安全风险评估报告生成模块,用于执行以下步骤:
根据所述基因组学数据,确定受检者的药物基因组学基因型;
从预先存储的用药方案列表中查找与所述药物基因组学基因型对应的药物的用药信息;
基于所述基因型、用药信息和所述受检者的个人信息生成用药安全风险评估报告;
所述第二发送模块,还用于将所述用药安全风险评估报告发送至所述配药终端进行显示。
9.一种基因组学数据管理系统,其特征在于,包括:如权利要求6~8任一所述的服务器、信息采集终端和配药终端;
所述信息采集终端用于采集受检者的基本信息及基因组学数据,并将该数据发送至服务器;
所述配药终端用于向所述服务器发送获取基因组学数据的请求,并接收所述服务器发送的基因组学数据进行显示。
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Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108877916A (zh) * 2018-06-12 2018-11-23 湖北文理学院 信息安全保存方法及装置
CN109545379A (zh) * 2018-12-05 2019-03-29 易必祥 基于基因大数据的治疗方法及系统
CN110659587A (zh) * 2019-09-02 2020-01-07 广东虚拟现实科技有限公司 标记物、标记物识别方法、装置、终端设备及存储介质
CN111999288A (zh) * 2020-08-31 2020-11-27 北京连接时代科技有限公司 一种用于移动终端的病原体和抗体检测系统
CN112820373A (zh) * 2020-10-23 2021-05-18 中南大学湘雅三医院 基于基因的信息处理方法、装置、设备及存储介质
CN112951363A (zh) * 2021-02-24 2021-06-11 大禹(上海)医疗健康科技有限公司 一种儿童用药建议方法、系统及计算机存储介质
CN114627968A (zh) * 2022-03-18 2022-06-14 四川大学华西医院 一种多模态组学数据管理系统

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102870086A (zh) * 2010-03-29 2013-01-09 卡尼股份有限公司 具有隐私保护控制的个人属性、倾向、推荐行为和历史事件的数字简档系统
CN103198238A (zh) * 2012-01-06 2013-07-10 深圳华大基因科技有限公司 药物相关基因型别数据库、基因分型及药物反应检测
CN104054084A (zh) * 2011-10-17 2014-09-17 英特托拉斯技术公司 用于保护和管理基因组及其它信息的系统和方法
CN105074765A (zh) * 2013-03-13 2015-11-18 康尔福盛303公司 患者特有的用药管理系统
CN105190636A (zh) * 2013-03-28 2015-12-23 三菱宇宙软件株式会社 基因信息存储装置、基因信息检索装置、基因信息存储程序、基因信息检索程序、基因信息存储方法、基因信息检索方法以及基因信息检索系统

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102870086A (zh) * 2010-03-29 2013-01-09 卡尼股份有限公司 具有隐私保护控制的个人属性、倾向、推荐行为和历史事件的数字简档系统
CN104054084A (zh) * 2011-10-17 2014-09-17 英特托拉斯技术公司 用于保护和管理基因组及其它信息的系统和方法
CN103198238A (zh) * 2012-01-06 2013-07-10 深圳华大基因科技有限公司 药物相关基因型别数据库、基因分型及药物反应检测
CN105074765A (zh) * 2013-03-13 2015-11-18 康尔福盛303公司 患者特有的用药管理系统
CN105190636A (zh) * 2013-03-28 2015-12-23 三菱宇宙软件株式会社 基因信息存储装置、基因信息检索装置、基因信息存储程序、基因信息检索程序、基因信息存储方法、基因信息检索方法以及基因信息检索系统

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
李伟、黄彬: "《分子诊断学》", 30 September 2015, 中国医药科技出版社 *

Cited By (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108877916A (zh) * 2018-06-12 2018-11-23 湖北文理学院 信息安全保存方法及装置
CN109545379A (zh) * 2018-12-05 2019-03-29 易必祥 基于基因大数据的治疗方法及系统
CN109545379B (zh) * 2018-12-05 2021-11-09 易必祥 基于基因大数据的治疗系统
CN110659587A (zh) * 2019-09-02 2020-01-07 广东虚拟现实科技有限公司 标记物、标记物识别方法、装置、终端设备及存储介质
CN111999288A (zh) * 2020-08-31 2020-11-27 北京连接时代科技有限公司 一种用于移动终端的病原体和抗体检测系统
CN112820373A (zh) * 2020-10-23 2021-05-18 中南大学湘雅三医院 基于基因的信息处理方法、装置、设备及存储介质
WO2022083021A1 (zh) * 2020-10-23 2022-04-28 中南大学湘雅三医院 基于基因的信息处理方法、装置、设备及存储介质
CN112951363A (zh) * 2021-02-24 2021-06-11 大禹(上海)医疗健康科技有限公司 一种儿童用药建议方法、系统及计算机存储介质
CN114627968A (zh) * 2022-03-18 2022-06-14 四川大学华西医院 一种多模态组学数据管理系统
CN114627968B (zh) * 2022-03-18 2023-10-20 四川大学华西医院 一种多模态组学数据管理系统

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