WO2025199704A1 - 上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统 - Google Patents

上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统

Info

Publication number
WO2025199704A1
WO2025199704A1 PCT/CN2024/083657 CN2024083657W WO2025199704A1 WO 2025199704 A1 WO2025199704 A1 WO 2025199704A1 CN 2024083657 W CN2024083657 W CN 2024083657W WO 2025199704 A1 WO2025199704 A1 WO 2025199704A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
sub
sequencing
scheduling
sample
redundant
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
PCT/CN2024/083657
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
姜胜平
田毅
唐兵
吕建雨
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
MGI Tech Co Ltd
Original Assignee
MGI Tech Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by MGI Tech Co Ltd filed Critical MGI Tech Co Ltd
Priority to PCT/CN2024/083657 priority Critical patent/WO2025199704A1/zh
Publication of WO2025199704A1 publication Critical patent/WO2025199704A1/zh
Pending legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing

Definitions

  • the present invention relates to the field of sequencing technology, and in particular to a method, device, computer-readable storage medium, computer program product, and sequencing system.
  • the main purpose of the present disclosure is to provide a method, apparatus, computer-readable storage medium, computer program product and sequencing system to at least solve the problem of inflexible sample loading methods of sequencing systems in the prior art.
  • the first subsystem and the second subsystem can both execute the sequencing process on the sample, so that when the above-mentioned first subsystem executes the above-mentioned sequencing process, the above-mentioned second sequencing carrier can be set to the above-mentioned second subsystem, and the two are independent of each other.
  • the user perceives that they do not interfere with each other, thereby improving the sequencing efficiency, that is, improving the throughput of the sequencing system, and solving the problem of the inflexible sample on-boarding method of the sequencing system in the prior art.
  • FIG7 shows a schematic flow chart of another computer access method provided according to an embodiment of the present disclosure.
  • FIG8 shows a flow chart of another computer access method according to an embodiment of the present disclosure.
  • FIG9 shows a schematic flow chart of another computer access method provided according to an embodiment of the present disclosure.
  • Sequencing system generally refers to a system used to determine the sequence of the genetic material of a sample, and can be a sequencer, a sequencer and its associated peripherals, or a device used in conjunction with the sequencer to perform the sequencing process, or a sequencing platform or sequencing software.
  • FIG1 is only for illustration and does not limit the structure of the mobile terminal.
  • the mobile terminal may also include more or fewer components than those shown in FIG1 , or have the same structure as that shown in FIG1 Different configurations.
  • the memory 104 can be used to store computer programs, such as software programs and modules of application software, such as the computer program corresponding to the method for displaying device information in the embodiment of the present invention.
  • the processor 102 executes various functional applications and data processing by running the computer programs stored in the memory 104, that is, implementing the method.
  • the memory 104 may include high-speed random access memory and may also include non-volatile memory, such as one or more magnetic storage devices, flash memory, or other non-volatile solid-state memory.
  • the memory 104 may further include memory remotely located relative to the processor 102, and these remote memories may be connected to the mobile terminal via a network. Examples of networks include, but are not limited to, the Internet, corporate intranets, local area networks, mobile communication networks, and combinations thereof.
  • networks used by the transmission device 106 to receive or transmit data via a network may include a wireless network provided by the mobile terminal's communications provider.
  • the transmission device 106 includes a network interface controller (NIC), which can be connected to other network devices via a base station to enable communication with the Internet.
  • the transmission device 106 may be a radio frequency (RF) module for communicating with the Internet wirelessly.
  • NIC network interface controller
  • RF radio frequency
  • a method for loading a sequence on a mobile terminal, a computer terminal, or a similar computing device includes a first subsystem and a second subsystem, each of which is used to execute the same or different sequencing processes.
  • the second subsystem is used to execute the sequencing process including loading a second sequencing slide.
  • Loading the second sequencing slide includes setting the second sequencing slide to the second subsystem.
  • Step S201 placing the second sequencing slide in the second subsystem, is independent of the first subsystem executing the sequencing process.
  • the above-mentioned sequencing method is used for a sequencing system, which includes a first subsystem and a second subsystem, each of which is used to execute the same or different sequencing processes.
  • the sequencing process executed by the second subsystem includes loading a second sequencing slide, and loading the second sequencing slide includes setting the second sequencing slide to the second subsystem, wherein: the step of setting the second sequencing slide to the second subsystem is independent of the execution of the sequencing process by the first subsystem.
  • This method can execute the sequencing process on the sample through both the first and second subsystems, so that when the first subsystem executes the sequencing process, the second sequencing slide can be set to the second subsystem. The two are independent of each other. Through the cooperation of the subsystems, the user perceives that they do not interfere with each other, thereby improving sequencing efficiency, that is, increasing the throughput of the sequencing system, and solving the problem of inflexible sample loading methods in sequencing systems in the prior art.
  • the first subsystem includes a first scheduling device
  • the second subsystem includes a second scheduling device
  • the sequencing system further includes multiple sub-devices
  • the first scheduling device and the second scheduling device are communicatively connected
  • the sequencing process of the sequencing system includes multiple sequencing process nodes
  • one of the sub-devices corresponds to at least one of the sequencing process nodes.
  • step S201 includes:
  • Step S2011 The second scheduling device receives a sequencing request for the second sample, where the sequencing request is used to request the sequencing system to execute a sequencing process on the second sample.
  • Step S2012 Based on the second scheduling device receiving the sequencing request for the second sample, the second scheduling device determines that the first scheduling device is in a sequencing state, where the sequencing state is a state in which a sub-device is called to execute a sequencing step corresponding to a sequencing process node on the first sample.
  • Step S402 Based on the second scheduling device determining that the onboard sub-device is an occupied sub-device, the second scheduling device determines that there is no idle redundant device in the occupied sub-device;
  • the sequencing status includes a sequencing preparation state and a sequencing state.
  • Step S701 When the first scheduling device is in a sequencing preparation state and the loading sub-device is a reaction chamber, the second scheduling device determines that the occupied sub-device is not the first sub-device, the reaction chamber is the sub-device corresponding to the sequencing process node for loading a reagent kit or a slide for a first sample, the first sub-device is one of a pre-sequencing self-test sub-device and a fluid control sub-device, the pre-sequencing self-test sub-device is the sub-device corresponding to the sequencing process node for the pre-sequencing self-test, and the fluid control sub-device is the sub-device corresponding to the sequencing process node for the fluid pipeline pre-filling stage;
  • the sequencing status includes a sequencing preparation status and a sequencing status.
  • Step S802 Based on the second scheduling device determining that the occupied sub-device is a reaction chamber and the chamber door of the reaction chamber is not closed, the second scheduling device issues an alarm to remind the user to close the chamber door.
  • step S803 based on the second scheduling device determining that the occupied sub-device is a reaction chamber and the chamber door of the reaction chamber is closed, the second scheduling device calls the corresponding first sub-device, so that the second sample enters the pre-sequencing self-test or fluid pipeline pre-filling stage to complete the loading.
  • the sub-device on the machine is a pre-sequencing self-test sub-device or a fluid control sub-device, indicating that the second scheduling device is ready to execute the process of 1.2 pre-sequencing self-test in the sequencing preparation stage or the process of 1.4 fluid pipeline pre-filling stage.
  • the second scheduling device determines that the occupied sub-device is the reaction chamber, that is, the first scheduling device is executing the process of 1.3 reagent cartridge loading interface or 1.7 slide loading interface in the sequencing preparation stage.
  • the second scheduling device cannot execute the process of 1.2 pre-sequencing self-test in the sequencing preparation stage or the process of 1.4 fluid pipeline pre-filling stage, and an alarm is issued to remind the user to close the chamber door. If the chamber door is closed, it will not affect the second scheduling device's execution of the process of 1.2 pre-sequencing self-test in the sequencing preparation stage or the process of 1.4 fluid pipeline pre-filling stage, and the device can be directly on the machine.
  • Step S902 Based on the second scheduling device determining that the occupied sub-device is a camera, the second scheduling device waits until the occupied sub-device is no longer a camera, and then calls the onboarding sub-device to execute the corresponding sequencing process node on the second sample to complete the onboarding.
  • the occupied sub-device is a camera, indicating that the first scheduling device is in the process of the photographing stage of the sequencing stage, and it is necessary to wait for the first scheduling device to complete the process of the photographing stage before it can be put on the machine to prevent affecting the photographing. Furthermore, if the second sample of the second scheduling device has been put on the machine, the second scheduling device is also required to complete the sequencing preparation stage before the first scheduling device enters the photographing stage to prevent affecting the photographing.
  • the sequencing status includes a sequencing preparation state and a sequencing state.
  • Step S1001 When the first scheduling device is in a sequencing state, the second scheduling device determines whether the first sample of the first scheduling device is in a state of sequencing completion, sequencing termination, or automatic cleaning completion;
  • Step S1002 Based on the second scheduling device determining that the first sample of the first scheduling device is in one of the states of sequencing completion, sequencing termination, and automatic cleaning completion, and the sub-device for loading the machine is a reaction chamber, wait for the reagent tank of the first sample of the first scheduling device to descend to the descending position, and the second scheduling device calls the reaction chamber to open the chamber door to load the reagent kit or slide of the second sample to complete the loading.
  • the descending position is the position where the first sample is taken out from the reagent tank, and the reaction chamber is the sub-device corresponding to the sequencing process node for loading the reagent kit or slide of the first sample.
  • Step S1102 If the number of times the sub-device is blocked is greater than a predetermined number, the sub-device is determined to be a second sub-device and a corresponding redundant device is configured for the second sub-device.
  • the above method further includes:
  • Step S1201 obtaining a call request from each sub-device
  • Step S1202 sort the call requests of each sub-device to generate multiple call request queues, and establish a corresponding loop thread for each call request queue;
  • Step S1203 Control the sub-devices to execute the corresponding Invocation request of the invocation request queue.
  • each sub-device generates a call request queue, sorts the call requests from sub-devices, stores time and other information necessary for sorting, and implements blocking services when request space is occupied.
  • An infinite loop thread is established to process call requests and allocate them, thereby controlling the sub-devices to sequentially execute the call requests in the corresponding call request queue.
  • a loop thread typically has a fixed number of loops, while an infinite loop thread does not stop and has no loop limit.
  • a thread encompasses queues, processes, and more.
  • step S1202 includes:
  • Step S12022 Repeat the sorting step at least once until the call request queues of all sub-devices are obtained.
  • the occupancy signal of this module is notified after the request processing is completed in the loop thread.
  • the business process performs the subsequent business process after receiving this notification, and other requests that have not yet occupied the module block the business process in which they are located, and the call requests can be executed in sequence.
  • the call requests are executed in a first-come, first-served order to improve efficiency.
  • step S12021 includes:
  • Step S120211 obtaining the type of the call request of the third sub-device, which includes expedited and non-expedited;
  • Step S120212 sort the expedited call requests in descending order of storage time to obtain a first call request sub-queue
  • step S2014 includes:
  • both the on-board sub-device and the redundant devices of the on-board sub-device can execute call requests, realize parallel processing of multiple call requests, improve the processing efficiency of call requests, and thus improve the efficiency of batch sequencing.
  • step S20141 includes:
  • Step S201411 When there is only one redundant device of the upper sub-device and both the upper sub-device and the redundant device are idle, the upper sub-device and one redundant device of the upper sub-device are controlled by a circular thread to place two call requests respectively;
  • Step S201412 If there is only one redundant device in the upper sub-device and the redundant device is the only idle one, the redundant device is controlled by a circular thread to execute the next call request;
  • Step S201413 When there is only one redundant device of the upper-machine sub-device and only the upper-machine sub-device is idle, the upper-machine sub-device is controlled by a circular thread to execute the next call request.
  • step S2041 further includes:
  • Step S201414 If there is only one redundant device in the upper sub-device and both the upper sub-device and the redundant device are not idle, monitoring the upper sub-device and the redundant device for receiving a abandon instruction, where the abandon instruction is an instruction to abandon execution of the current call request or an instruction generated when the current call request fails to execute;
  • Step S201415 When the upper-computer sub-device receives the abandon instruction, the upper-computer sub-device is controlled to stop executing the current call request through the loop thread, and is controlled to execute the next call request;
  • Step S201416 When the redundant device receives the abandonment instruction, the redundant device is controlled by the loop thread to stop executing the current call request and execute the next call request of the redundant device;
  • Step S201417 when both the upper sub-device and the redundant device receive the abandon instruction, the upper sub-device and the redundant device are controlled by the loop thread to stop executing the current call request, and the upper sub-device and the redundant device are controlled to execute the next call request respectively.
  • the sequencing process can be paused or disconnected at any time by simply sending a abandon instruction to the sub-device and redundant device that executes the call request corresponding to the second sample that needs to be disconnected to complete the pause. After the pause, the first sample can be taken out to complete the disconnection.
  • the method before controlling the loading sub-device and the redundant device of the loading sub-device to execute the corresponding call request to load the plurality of second samples, the method further includes:
  • Step S1301 when a release request is received, the call request queue corresponding to the on-machine sub-device is cleared through a circular thread.
  • the release request is a request generated when a condition that affects the operation of the on-machine sub-device occurs.
  • step S1201 includes:
  • the second sample can call the corresponding sub-device to execute the sequencing steps in sequence according to the sequencing process, and can also be continued, that is, starting from the sequencing step where the sequencing was last paused, calling the corresponding sub-device to continue executing the sequencing step without restarting the sequencing, thereby improving the flexibility of sequencing.
  • B While A is performing sequencing, B performs other operations, such as cleaning and continued testing.
  • A While B is performing sequencing, A performs other operations, such as cleaning and continued sequencing.
  • the embodiments of the present disclosure also provide a computer-on-demand device.
  • the computer-on-demand device of the embodiments of the present disclosure can be used to execute the computer-on-demand method provided by the embodiments of the present disclosure.
  • the device is used to implement the embodiments and preferred implementation modes, and the details that have been explained will not be repeated here.
  • the term "module" can be a combination of software and/or hardware that implements a predetermined function.
  • the devices described in the following embodiments are preferably implemented in software, the implementation of hardware, or a combination of software and hardware, is also possible and conceivable.
  • the step of placing the second sequencing slide on the second subsystem by the onboard unit is independent of the step of executing the sequencing process by the first subsystem.
  • the aforementioned sequencing device is used in a sequencing system, comprising a first subsystem and a second subsystem, each of which is configured to execute the same or different sequencing processes.
  • the second subsystem is configured to execute the sequencing process including loading a second sequencing slide, which includes placing the second sequencing slide on the second subsystem.
  • the step of placing the second sequencing slide on the second subsystem is independent of the execution of the sequencing process by the first subsystem.
  • the device can execute sequencing processes on samples through both the first and second subsystems, enabling the second sequencing slide to be placed on the second subsystem while the first subsystem executes the sequencing process.
  • the two subsystems are independent of each other, and the coordination of the subsystems allows the user to perceive no interference with each other, thereby improving sequencing efficiency and, in other words, increasing the throughput of the sequencing system. This addresses the issue of inflexible sample loading methods in sequencing systems in the prior art.
  • the first subsystem includes a first scheduling device
  • the second subsystem includes a second scheduling device
  • the sequencing system further includes a plurality of sub-devices, the first scheduling device and the second scheduling device are communicatively connected
  • the sequencing process of the sequencing system includes a plurality of sequencing process nodes
  • one of the sub-devices corresponds to at least one of the sequencing process nodes
  • the onboarding unit includes:
  • a receiving subunit configured for the second scheduling device to receive a sequencing request for the second sample, wherein the sequencing request is used to request the sequencing system to execute a sequencing process on the second sample;
  • a first determining subunit is configured to determine, based on the second scheduling apparatus receiving a request for sequencing the second sample, that the first scheduling apparatus is in an on-machine sequencing state, where the on-machine sequencing state is a state in which a sub-device is called to execute a sequencing step of a corresponding sequencing process node on the first sample;
  • a second determining subunit is configured to determine, based on the second scheduling device, that the first scheduling device is in an on-machine sequencing state, and the second scheduling device determines that the on-machine sub-device is not an occupied sub-device, the on-machine sub-device being a sub-device corresponding to at least one sequencing process node executed after the second sample corresponding to the on-machine request is loaded onto the machine, and the occupied sub-device being the sub-device currently called by the first scheduling device;
  • the calling subunit is configured to, based on the fact that the onboarding sub-device is not an occupied sub-device, cause the second scheduling device to call the onboarding sub-device to execute the corresponding sequencing process node on the second sample to complete the onboarding.
  • the second scheduling device when the second scheduling device receives a request for the second sample to be put on the machine, if the first scheduling device is in the state of being put on the machine for sequencing, and the sub-device to be called by the second scheduling device is not the occupied sub-device called by the first scheduling device, then it can be put on the machine directly, and the first scheduling device and the second scheduling device independently sequence different samples.
  • the cooperation of the two subsystems makes the user feel that they do not interfere with each other, and multiple samples are sequenced in batches. If a problem occurs with one sample, it can be handled at any time without affecting other samples. There is no need to wait for the sequencing of other samples to be completed before processing, which improves the sequencing efficiency, that is, improves the throughput of the sequencing system, and solves the problem of inflexible sample loading method of the sequencing system in the prior art.
  • the above device further includes:
  • a first determining unit configured to, after the second scheduling apparatus receives a request for sequencing the second sample, determine that the first scheduling apparatus is not in a sequencing state based on the second scheduling apparatus receiving the request for sequencing the second sample;
  • the first calling unit is configured to determine, based on the second scheduling device, that the first scheduling device is not in an on-machine sequencing state, and the second scheduling device calls the on-machine sub-device to execute a corresponding sequencing process node on the second sample to complete the on-machine sequencing.
  • the first scheduling device when the second scheduling device receives the request for sequencing the second sample, the first scheduling device is not in the sequencing state, which has no impact on the sequencing of the second sample, and the second sample can be directly sequenced.
  • the sequencing system further includes a redundant device, and at least one sub-device has a corresponding redundant device.
  • the apparatus further includes:
  • a second determining unit configured to, after the second scheduling apparatus determines that the first scheduling apparatus is in an on-machine sequencing state, determine that the on-machine sub-device is an occupied sub-device based on the second scheduling apparatus's determination that the first scheduling apparatus is in an on-machine sequencing state;
  • a third determining unit configured to determine, based on the second scheduling apparatus, that the onboard sub-device is an occupied sub-device, and the second scheduling apparatus determining that the occupied sub-device does not have an idle redundant device;
  • the first processing unit is configured to determine, based on the second scheduling device, that there is no idle redundant device in the occupied sub-device, and the second scheduling device waits.
  • the second scheduling device when the second scheduling device receives a request for the second sample to be put on the machine, if the first scheduling device is in the on-machine sequencing state, and the on-machine sub-device to be called by the second scheduling device is the occupied sub-device called by the first scheduling device, it is further determined whether there is an idle redundant device in the occupied sub-device. If not, it waits until the on-machine sub-device to be called by the second scheduling device is not the occupied sub-device called by the first scheduling device, and then it can be put on the machine directly without interfering with each other.
  • the sequencing system further includes a redundant device, and at least one sub-device has a corresponding redundant device.
  • the above apparatus further includes:
  • a fifth determining unit configured to determine, based on the second scheduling apparatus, that the onboard sub-device is an occupied sub-device, and the second scheduling apparatus determining that an idle redundant device exists in the occupied sub-device;
  • the second calling unit is used to determine, based on the second scheduling device, that there is an idle redundant device in the occupied sub-device, and the second scheduling device calls the idle redundant device to execute the corresponding sequencing process node on the second sample to complete the on-boarding.
  • the on-machine sequencing state includes a sequencing preparation state and a sequencing state
  • the above-mentioned apparatus further includes:
  • the sub-device on the machine is a pre-sequencing self-test sub-device or a fluid control sub-device, indicating that the second scheduling device is ready to execute the process of 1.2 pre-sequencing self-test in the sequencing preparation stage or the process of 1.4 fluid pipeline pre-filling stage.
  • the second scheduling device determines that the occupied sub-device is the reaction chamber, that is, the first scheduling device is executing the process of 1.3 reagent cartridge loading interface or 1.7 slide loading interface in the sequencing preparation stage.
  • the sequencing status includes the sequencing preparation status and the sequencing status.
  • the above-mentioned device further includes:
  • a ninth determining unit is configured to, after the second scheduling apparatus receives a request for loading the second sample, determine, when the first scheduling apparatus is in a sequencing state, that the occupied sub-device is a camera, the camera being a sub-device corresponding to a sequencing process node in a photographing phase;
  • the third processing unit is configured to determine, based on the second scheduling device, that the occupied sub-device is a camera, and wait until the occupied sub-device is no longer a camera.
  • the second scheduling device then calls the on-boarding sub-device to execute a corresponding sequencing process node on the second sample to complete the on-boarding.
  • the on-machine sequencing state includes a sequencing preparation state and a sequencing state
  • the above-mentioned apparatus further includes:
  • a tenth determining unit configured to, after the second scheduling apparatus receives the request for loading the second sample, determine, when the first scheduling apparatus is in a sequencing state, whether the first sample of the first scheduling apparatus is in a sequencing completion state, sequencing termination state, or automatic cleaning completion state;
  • the first sample of the first scheduling device is in one of the states of sequencing completion, sequencing termination and automatic cleaning completion, that is, the first scheduling device is in one of the processes of 2.5 sequencing completion, 2.8 sequencing termination and 2.9 automatic cleaning.
  • the sub-device on the machine is a reaction chamber, that is, the second scheduling device is ready to execute the process of 1.3 reagent reagent loading interface or 1.7 loading slide interface in the sequencing preparation stage. It is necessary to wait for the reagent tank of the first sample of the first scheduling device to descend to the descending position before the second scheduling device can call the reaction chamber to open the door to load the reagent tank or slide of the second sample to complete the loading, prevent the reagent tank from returning to its position and causing loading failure, and ensure normal sequencing.
  • the present disclosure also provides a computer program product, which, when executed on a data processing device, is adapted to execute a program for initializing at least the following method steps:
  • Step S201 placing the second sequencing slide in the second subsystem, is independent of the first subsystem executing the sequencing process.
  • modules or steps of the present invention can be implemented by a general-purpose computing device, they can be concentrated on a single computing device, or distributed on a network composed of multiple computing devices, they can be implemented by program codes executable by the computing device, so that they can be stored in a storage device and executed by the computing device, and in some cases, the steps shown or described can be executed in a different order than here, or the steps can be replaced. They are made into individual integrated circuit modules, or multiple modules or steps therein are made into a single integrated circuit module for implementation. Thus, the present invention is not limited to any specific combination of hardware and software.
  • the embodiments of the present disclosure may be provided as methods, systems, or computer program products. Therefore, the present disclosure may take the form of a complete hardware embodiment, a complete software embodiment, or an embodiment combining software and hardware. Furthermore, the present disclosure may take the form of a computer program product implemented on one or more computer-usable storage media (including but not limited to magnetic disk storage, CD-ROM, optical storage, etc.) containing computer-usable program code.
  • a computer-usable storage media including but not limited to magnetic disk storage, CD-ROM, optical storage, etc.
  • These computer program instructions may also be stored in a computer-readable memory capable of directing a computer or other programmable data processing device to operate in a specific manner, such that the instructions stored in the computer-readable memory produce an article of manufacture comprising an instruction device that implements the functions specified in one or more processes of the flowchart and/or one or more blocks of the block diagram.
  • These computer program instructions may also be loaded onto a computer or other programmable data processing device so that a series of operating steps are executed on the computer or other programmable device to produce a computer-implemented process, whereby the instructions executed on the computer or other programmable device provide steps for implementing the functions specified in one or more processes of the flowchart and/or one or more blocks of the block diagram.
  • the memory may include non-permanent memory in a computer-readable medium, random access memory (RAM) and/or non-volatile memory in the form of read-only memory (ROM) or flash RAM.
  • RAM random access memory
  • ROM read-only memory
  • flash RAM flash random access memory
  • Computer-readable media includes permanent and non-permanent, removable and non-removable media that can be implemented by any method or technology to store information.
  • the information can be computer-readable instructions, data structures, program modules or other data.
  • Examples of computer storage media include, but are not limited to, phase-change memory (PRAM), static random access memory (SRAM), dynamic random access memory (DRAM), other types of random access memory (RAM), read-only memory (ROM), electrically erasable programmable read-only memory (EEPROM), flash memory or other memory technology, compact disc read-only memory (CD-ROM), digital versatile disc (DVD) or other optical storage, magnetic cassettes, magnetic disk storage or other magnetic storage devices or any other non-transmission media that can be used to store information that can be accessed by a computing device.
  • computer-readable media does not include transitory media such as modulated data signals and carrier waves.
  • the above-mentioned sequencing system includes a first subsystem and a second subsystem.
  • the above-mentioned first subsystem and the above-mentioned second subsystem are respectively used to execute the same or different sequencing processes.
  • the above-mentioned sequencing process executed by the above-mentioned second subsystem includes the on-line installation of the second sequencing carrier.
  • the on-line installation of the above-mentioned second sequencing carrier includes setting the above-mentioned second sequencing carrier to the above-mentioned second subsystem, wherein: the step of setting the above-mentioned second sequencing carrier to the above-mentioned second subsystem is independent of the execution of the above-mentioned sequencing process by the above-mentioned first subsystem.
  • This method can execute the sequencing process on the sample through the first subsystem and the second subsystem, so that when the above-mentioned first subsystem executes the above-mentioned sequencing process, the above-mentioned second sequencing carrier can be set to the above-mentioned second subsystem.
  • the two are independent of each other, and the cooperation of the subsystems allows the user to perceive that they do not interfere with each other, thereby improving the sequencing efficiency, that is, improving the throughput of the sequencing system, and solving the problem of inflexible sample on-line installation methods of the sequencing system in the prior art.
  • the cooperation of the subsystems allows the user to perceive that they do not interfere with each other,
  • the on-board device disclosed in the present invention is used for a sequencing system, and the sequencing system includes a first subsystem and a second subsystem.
  • the first subsystem and the second subsystem are respectively used to execute the same or different sequencing processes.
  • the sequencing process executed by the second subsystem includes the loading of the second sequencing carrier.
  • the loading of the second sequencing carrier includes setting the second sequencing carrier to the second subsystem, wherein: the step of setting the second sequencing carrier to the second subsystem is independent of the execution of the sequencing process by the first subsystem.
  • the device can execute the sequencing process on the sample through the first subsystem and the second subsystem, so that when the first subsystem executes the sequencing process, the second sequencing carrier can be set to the second subsystem.
  • the two are independent of each other, and the cooperation of the subsystems allows the user to perceive that they do not interfere with each other, thereby improving the sequencing efficiency, that is, improving the throughput of the sequencing system, and solving the problem of inflexible sample loading methods of the sequencing system in the prior art.
  • the cooperation of the subsystems allows the user to perceive that they do not interfere with each other,

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

提供了一种上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统，该方法包括：第二调度装置接收到第二样品的上机请求；第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，上机测序状态为调用子设备对第一样品执行对应的测序流程节点的测序步骤的状态；基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备不是占用子设备，上机子设备为上机请求对应的第二样品上机后，执行的至少一个测序流程节点对应的子设备，占用子设备为第一调度装置当前调用的子设备；基于上机子设备不是占用子设备，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机，解决了测序系统的样品上机方式不灵活的问题。

Description

上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统 技术领域
本发明涉及测序技术领域，具体而言，涉及一种上机方法、装置、计算机可读存储介质、计算机程序产品和测序系统。
背景技术
基因测序仪，是测定遗传物质或样品的剪辑顺序、种类和定量的仪器，主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等领域。
但是，现有的基因测序仪存在以下缺点：
1、只能测序单张测序芯片时，过程中无法上其他测序芯片；
2、同时测序两张测序芯片时，一个失败，用户无法处理，只能等两个都结束；
3、一个测序失败时无法立即进行续测，且无法取出，一方面可能导致损坏，另一方面导致通量降低。
发明内容
本公开的主要目的在于提供一种上机方法、装置、计算机可读存储介质、计算机程序产品和测序系统，以至少解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
为了实现上述目的，根据本公开的一个方面，提供了一种上机方法，用于测序系统，所述测序系统包括第一子系统和第二子系统，所述第一子系统和所述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，所述第二子系统用于执行的所述测序流程包括第二测序载片的上机，所述第二测序载片的上机包括将所述第二测序载片设置到所述第二子系统，其中：将所述第二测序载片设置到所述第二子系统的步骤，与所述第一子系统执行所述测序流程相互独立。
根据本公开的另一方面，提供了一种上机装置，设于测序系统或与所述测序系统连接，其中，所述测序系统包括第一子系统和第二子系统，所述第一子系统和所述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，所述第二子系统用于执行的所述测序流程包括第二测序载片的上机，所述第二测序载片的上机包括将所述第二测序载片设置到所述第二子系统，其中：上机单元，用于执行所述将所述第二测序载片设置到所述第二子系统的步骤，并与所述第一子系统执行所述测序流程相互独立。
根据本公开的再一方面，提供了一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质包括存储的程序，其中，在所述程序运行时控制所述计算机可读存储介质所在设备执行任意一种所述的方法。
根据本公开的又一方面，提供了一种计算机程序产品，包括计算机程序/指令，该计算机程序/指令被处理器执行时实现任意一种所述的方法。
根据本公开的再一方面，提供了一种测序系统，包括：测序系统、一个或多个处理器，存储器，以及一个或多个程序，其中，所述一个或多个程序被存储在所述存储器中，并且被配置为由所述一个或多个处理器执行，所述一个或多个程序包括用于执行任意一种所述的方法。
应用本公开的技术方案，上述上机方法中，用于测序系统，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，其中：将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。该方法第一子系统和第二子系统均可以对样品执行测序流程，使得上述第一子系统执行上述测序流程时，可以将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，两者相互独立，通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
附图说明
图1示出了根据本公开的实施例中提供的一种执行上机方法的移动终端的硬件结构框图；
图2示出了根据本公开的实施例提供的一种上机方法的流程示意图；
图3示出了根据本公开的实施例提供的另一种上机方法的流程示意图；
图4示出了根据本公开的实施例提供的一种上机方法的页面交互示意图；
图5示出了根据本公开的实施例提供的另一种上机方法的页面交互示意图；
图6示出了根据本公开的实施例提供的再一种上机方法的流程示意图；
图7示出了根据本公开的实施例提供的又一种上机方法的流程示意图；
图8示出了根据本公开的实施例提供的再一种上机方法的流程示意图；
图9示出了根据本公开的实施例提供的又一种上机方法的流程示意图。
其中，上述附图包括以下附图标记：
102、处理器；104、存储器；106、传输设备；108、输入输出设备。
具体实施方式
需要说明的是，在不冲突的情况下，本公开中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。 下面将参考附图并结合实施例来详细说明本公开。
为了使本技术领域的人员更好地理解本公开方案，下面将结合本公开实施例中的附图，对本公开实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本公开一部分的实施例，而不是全部的实施例。基于本公开中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本公开保护的范围。
需要说明的是，本公开的说明书和权利要求书及附图中的术语“第一”、“第二”等是用于区别类似的对象，而不必用于描述特定的顺序或先后次序。应该理解这样使用的数据在适当情况下可以互换，以便这里描述的本公开的实施例。此外，术语“包括”和“具有”以及他们的任何变形，意图在于覆盖不排他的包含，例如，包含了一系列步骤或单元的过程、方法、系统、产品或设备不必限于清楚地列出的那些步骤或单元，而是可包括没有清楚地列出的或对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤或单元。
为了便于描述，以下对本公开实施例涉及的部分名词或术语进行说明：
上机：多个测序芯片可以随时互不干扰地上机测序实现批量测序的功能。
正如背景技术中所介绍的，现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活，为解决该问题，本公开的实施例提供了一种上机方法、装置、计算机可读存储介质、计算机程序产品和测序系统。
测序系统：通常指用于确定一个样品的遗传材料的序列，可以是测序仪，也可以是测序仪及其延伸的外设或用于配合使用完成测序过程的设备，也可以指一种测序平台或测序软件。测序系统可以用多种方式并且基于多种技术来发挥作用，包括使用经标记或未经标记的核苷酸通过引物延伸进行测序，如边测序边连接或者焦磷酸测序等，例如使用Sanger双脱氧法、纳米孔或本领域的“NexGen”测序方法中的任一种(例如，使用MGI的测序平台、ROCHE 454测序平台、ILLUMINATM SOLEXATM测序平台、LIFE TECHNOLOGIES/APPLIED BIOSYSTEMS的SOLIDTM测序平台、PACIFIC BIOSCIENCES的SMRTTM测序平台、POLLONATOR Polony测序平台、COMPLETE GENOMICS测序平台、INTELLIGENT BIOSYSTEMS的测序平台、HELICOS测序平台或本领域的任何其它测序仪和系统)实现。
下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。
本公开实施例中所提供的方法实施例可以在移动终端、计算机终端或者类似的运算装置中执行。以运行在移动终端上为例，图1是本发明实施例的一种上机方法的移动终端的硬件结构框图。如图1所示，移动终端可以包括一个或多个(图1中仅示出一个)处理器102(处理器102可以包括但不限于微处理器MCU或可编程逻辑器件FPGA等的处理装置)和用于存储数据的存储器104，其中，移动终端还可以包括用于通信功能的传输设备106以及输入输出设备108。本领域普通技术人员可以理解，图1所示的结构仅为示意，其并不对移动终端的结构造成限定。例如，移动终端还可包括比图1中所示更多或者更少的组件，或者具有与图1所示 不同的配置。
存储器104可用于存储计算机程序，例如，应用软件的软件程序以及模块，如本发明实施例中的设备信息的显示方法对应的计算机程序，处理器102通过运行存储在存储器104内的计算机程序，从而执行各种功能应用以及数据处理，即实现的方法。存储器104可包括高速随机存储器，还可包括非易失性存储器，如一个或者多个磁性存储装置、闪存、或者其他非易失性固态存储器。在一些实例中，存储器104可进一步包括相对于处理器102远程设置的存储器，这些远程存储器可以通过网络连接至移动终端。网络的实例包括但不限于互联网、企业内部网、局域网、移动通信网及其组合。传输设备106用于经由一个网络接收或者发送数据的网络具体实例可包括移动终端的通信供应商提供的无线网络。在一个实例中，传输设备106包括一个网络适配器(Network Interface Controller，简称为NIC)，其可通过基站与其他网络设备相连从而可与互联网进行通讯。在一个实例中，传输设备106可以为射频(Radio Frequency，简称为RF)模块，其用于通过无线方式与互联网进行通讯。
在本实施例中提供了一种运行于移动终端、计算机终端或者类似的运算装置的上机方法，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，需要说明的是，在附图的流程图示出的步骤可以在诸如一组计算机可执行指令的计算机系统中执行，并且，虽然在流程图中示出了逻辑顺序，但是在某些情况下，可以以不同于此处的顺序执行所示出或描述的步骤。该方法包括以下步骤：
步骤S201，将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。
上述上机方法中，用于测序系统，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，其中：将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。该方法通过第一子系统和第二子系统均可以对样品执行测序流程，使得上述第一子系统执行上述测序流程时，可以将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，两者相互独立，通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
为了方便上机，一种可选的实施方式中，上述第一子系统包括第一调度装置，上述第二子系统包括第二调度装置、上述测序系统还包括多个子设备，上述第一调度装置和上述第二调度装置通信连接，上述测序系统的测序流程包括多个测序流程节点，一个上述子设备对应至少一个上述测序流程节点，如图2所示，上述步骤S201包括：
步骤S2011，第二调度装置接收到第二样品的上机请求，上机请求用于请求测序系统对第二样品执行测序流程；
步骤S2012，基于第二调度装置接收到第二样品的上机请求，第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，上机测序状态为调用子设备对第一样品执行对应的测序流程节点的测序步骤的状态；
步骤S2013，基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备不是占用子设备，上机子设备为上机请求对应的第二样品上机后，执行的至少一个测序流程节点对应的子设备，占用子设备为第一调度装置当前调用的子设备；
步骤S2014，基于上机子设备不是占用子设备，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，通过第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，若第一调度装置处于上机测序状态，且第二调度装置预备调用的上机子设备不是第一调度装置调用的占用子设备，则可以直接上机，第一调度装置和第二调度装置独立测序不同的样品，两者通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，批量测序多个样品，且一个样品出现问题，随时处理不会影响另外的样品，无需等待另外的样品测序完成再处理，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
为了方便上机，一种可选的实施方式中，如图3所示，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，上述方法还包括：
步骤S301，基于第二调度装置接收到第二样品的上机请求，第二调度装置确定第一调度装置未处于上机测序状态；
步骤S302，基于第二调度装置确定第一调度装置未处于上机测序状态，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，第一调度装置未处于上机测序状态，则对第二样品的上机无影响，直接上机即可。
为了方便上机，一种可选的实施方式中，如图3所示，测序系统还包括冗余设备，至少一个子设备存在对应的冗余设备，在第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态之后，上述方法还包括：
步骤S401，基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备是占用子设备；
步骤S402，基于第二调度装置确定上机子设备是占用子设备，第二调度装置确定占用子设备不存在空闲的冗余设备；
步骤S403，基于第二调度装置确定占用子设备不存在空闲的冗余设备，第二调度装置等待。
上述实施方式中，第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，若第一调度装置处于上机测序状态，且第二调度装置预备调用的上机子设备是第一调度装置调用的占用子设备，进 一步确定占用子设备是否存在空闲的冗余设备，若不存在则等待，直至第二调度装置预备调用的上机子设备不是第一调度装置调用的占用子设备，即可直接上机，两者互不干扰。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，如图3所示，测序系统还包括冗余设备，至少一个子设备存在对应的冗余设备，在第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态之后，上述方法还包括：
步骤S501，基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备是占用子设备；
步骤S502，基于第二调度装置确定上机子设备是占用子设备，第二调度装置确定占用子设备存在空闲的冗余设备；
步骤S503，基于第二调度装置确定占用子设备存在空闲的冗余设备，第二调度装置调用空闲的冗余设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，若第一调度装置处于上机测序状态，且第二调度装置预备调用的上机子设备是第一调度装置调用的占用子设备，进一步确定占用子设备是否存在空闲的冗余设备，若存在则直接上机，两者互不干扰。
另外，在一些实施方式中，除了上机节点，上述测序流程还包括以下步骤：
1测序准备阶段
1.1新建测序；1.2测序前自检；1.3试剂盒加载界面；1.4流体管路预填充阶段(生化反应进行准备的阶段)；1.5进入测序信息录入阶段；1.6测序信息回顾界面；1.7加载载片界面；
2测序阶段
2.1生化阶段；2.2拍照阶段；2.4测序过程；2.5测序完成；2.6写FastQ格式文件+生信分析(可选)；2.7测序暂停；2.8测序终止；2.9自动清洗。
如图4所示，展示了第一样品在页面上实现滚动上机，测序第一样品即为放置在芯片上的待测序对象，其中，New Sequence为第一样品新建测序，Resume Sequence为第一样品续测，Wash为第一样品进行清洗，即第一样品上机的三种类型，左边展示各测序步骤的执行情况和提示信息。
其中，滚动上机是指依靠调度方法，通过软件或者软件与硬件配合的方式，来实现在提供部分冗余设备而非整个冗余系统的情况下，达到为用户提供多条独立业务执行途径的方法。此外，滚动上机还可以定义为是一种高效的调度策略，它允许在不影响当前执行测序流程的前提下，通过软件和硬件的协同工作，实现对测序设备的动态管理，对多个测序流程进行处理，提高测序系统的吞吐量和资源利用率。例如，若用一套测序系统使用户感知为实现1条业务管线，则滚动上机是用一套测序系统使用户感知为实现2条以上的业务管线，而无需用2套以上的测序系统实现。例如，在一个基因测序仪中，正在分析一组DNA样品，即测序过程A。与此同时，负责调度的装置获悉另一组样品已经准备好待上机以执行测序过程B，并且获 悉测序过程A的当前运行过程即将到达一个可中断的节点，甚至无需获悉或中断任何节点，负责调度的装置立即指示另一组样品上机。也可是若获悉测序过程A的当前运行过程即将到达一个可中断的节点，负责调度的装置将测序过程A暂停并保存状态，然后迅速切换到另一组样品的上机过程，并开始测序过程A和测序过程B同步或异步的测序。这种滚动上机策略确保了测序资源的最大化利用，提高了测序的工作效率。
如图5所示，展示了一个测序步骤详细的信息，第一调度装置和第二调度装置的状态，测序步骤预估时间等。
为了防止影响测序效果，一种可选的实施方式中，如图6所示，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，上述方法还包括：
步骤S601，在第一调度装置处于测序准备状态且上机子设备为反应仓的情况下，第二调度装置确定占用子设备是第一子设备，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备，第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，测序前自检子设备为测序前自检的测序流程节点对应的子设备，流体控制子设备为流体管路预填充阶段的测序流程节点对应的子设备，流体管路预填阶段为生化反应进行准备的阶段；
步骤S602，基于第二调度装置确定占用子设备是第一子设备，等待至占用子设备不是第一子设备。
上述实施方式中，测序准备状态即处于测序准备阶段的状态，测序状态即处于测序阶段的状态，在上机子设备为反应仓的情况下，即第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，占用子设备是测序前自检子设备或者流体控制子设备，表明第一调度装置在执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，这个时候需要等待第一调度装置完成1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，才可以打开仓门加载第二样品的试剂盒，防止影响测序导致测序失败，保证测序效果。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，如图6所示，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，上述方法还包括：
步骤S701，在第一调度装置处于测序准备状态且上机子设备为反应仓的情况下，第二调度装置确定占用子设备不是第一子设备，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备，第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，测序前自检子设备为测序前自检的测序流程节点对应的子设备，流体控制子设备为流体管路预填充阶段的测序流程节点对应的子设备；
步骤S702，基于第二调度装置确定占用子设备不是第一子设备，第二调度装置调用反应仓开仓门加载第二样品的试剂盒或者载片，完成上机。
上述实施方式中，测序准备状态即处于测序准备阶段的状态，测序状态即处于测序阶段的状态，在上机子设备为反应仓的情况下，即第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.3试剂 盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，第二调度装置确定占用子设备不是第一子设备，表明第一调度装置不在执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，可以打开仓门加载第二样品的试剂盒，不会影响测序效果，无需等待，提高测序效率。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，如图7所示，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，上述方法还包括：
步骤S801，在第一调度装置处于测序准备状态且上机子设备为第一子设备的情况下，第二调度装置确定占用子设备是反应仓，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备，第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，测序前自检子设备为测序前自检的测序流程节点对应的子设备，流体控制子设备为流体管路预填充阶段的测序流程节点对应的子设备；
步骤S802，基于第二调度装置确定占用子设备是反应仓，且反应仓的仓门未关的情况下，第二调度装置发出报警以提醒关闭仓门；
步骤S803，基于第二调度装置确定占用子设备是反应仓，且反应仓的仓门关闭的情况下，第二调度装置调用对应的第一子设备，使得第二样品进入测序前自检或者流体管路预填充阶段，完成上机。
上述实施方式中，上机子设备是测序前自检子设备或者流体控制子设备，表明第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，第二调度装置确定占用子设备是反应仓，即第一调度装置正执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，若仓门未关，则第二调度装置无法执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，发出报警以提醒关闭仓门，若仓门关闭，不影响第二调度装置执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，直接上机即可。
为了保证测序效果，一种可选的实施方式中，如图8所示，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，上述方法还包括：
步骤S901，在第一调度装置处于测序状态的情况下，第二调度装置确定占用子设备是相机，相机为拍照阶段的测序流程节点对应的子设备；
步骤S902，基于第二调度装置确定占用子设备是相机，等待至占用子设备不是相机，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，占用子设备是相机，表明第一调度装置处于测序阶段的拍照阶段的流程，需要等待第一调度装置完成拍照阶段的流程，即可上机，防止影响拍照，进一步地，若第二调度装置的第二样品已上机，对第一调度装置进入拍照阶段前也需要第二调度装置完成测序准备阶段，防止影响拍照。
为了保证测序正常运行，一种可选的实施方式中，如图9所示，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，上述方法还包括：
步骤S1001，在第一调度装置处于测序状态的情况下，第二调度装置确定第一调度装置的第一样品处于测序完成、测序终止或者自动清洗完成的状态；
步骤S1002，基于第二调度装置确定第一调度装置的第一样品处于测序完成、测序终止和自动清洗完成的状态中的一个，且上机子设备为反应仓的情况下，等待第一调度装置的第一样品的试剂槽下降至下降位，第二调度装置调用反应仓开仓门加载第二样品的试剂盒或者载片，完成上机，下降位为从试剂槽取出第一样品的位置，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备。
上述实施方式中，第一调度装置的第一样品处于测序完成、测序终止和自动清洗完成的状态中的一个，即第一调度装置处于2.5测序完成、2.8测序终止和2.9自动清洗中的一个的流程，在上机子设备为反应仓的情况下，即第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，需要等待第一调度装置的第一样品的试剂槽下降至下降位，第二调度装置才可以调用反应仓开仓门加载第二样品的试剂盒或者载片，完成上机，防止试剂槽未归位导致加载失败，保证测序正常进行。
需要说明的是，除了这些特殊情况，其他情况均可直接上机，两边通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，提高测序效率。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之前，上述方法还包括：
步骤S1101，获取历史记录中各子设备的堵塞次数，堵塞次数为子设备满足预定条件的次数，预定条件为子设备的调用请求的数量大于预定数量或者子设备的任意一个调用请求的保存时间大于预定时长，保存时间为截止当前时刻调用请求等待执行的持续时长；
步骤S1102，在子设备的堵塞次数大于预定次数的情况下，确定子设备为第二子设备并提示为第二子设备配置对应的冗余设备。
上述实施方式中，有些子设备数量少会导致测序流程堵塞，即至少一个第一样品等待调用该子设备进行测序，如果堵塞次数做够多，为满足滚动上机需要，在测序系统上拥有一套或者多套冗余的子设备，冗余子设备根据业务流程设计，如某些小型测序仪的生化和流体模块需要做至少一个冗余，来使用户感知到测序系统仍然实现两条独立的业务流程。
为了保证测序正常运行，一种可选的实施方式中，在完成上机之后，上述方法还包括：
步骤S1201，获取各子设备的调用请求；
步骤S1202，对各子设备的调用请求进行排序生成多个调用请求队列，并为各调用请求队列建立对应的循环线程；
步骤S1203，通过循环线程按照对应的调用请求队列的顺序，控制子设备依次执行对应的 调用请求队列的调用请求。
上述实施方式中，每一种子设备生成一个调用请求队列，对子设备的调用请求进行排序，保存时间等其他需要进行排序的信息，且实现请求空间占用时的阻塞所在业务，建立一个无限循环线程，此线程处理调用请求和实现调用请求分配，即可控制子设备依次执行对应的调用请求队列的调用请求。其中，循环线程通常是有确定的循环次数的，无线循环线程是不停止，没有循环次数限制，线程包含了队列，流程等。
为了保证测序正常运行，一种可选的实施方式中，上述步骤S1202包括：
步骤S12021，排序步骤，按照保存时间由大至小的顺序对第三子设备的调用请求进行排序，得到第三子设备的调用请求队列，第三子设备为任意一个子设备，保存时间为截止当前时刻调用请求等待执行的持续时长；
步骤S12022，重复排序步骤至少一次，直至得到所有的子设备的调用请求队列。
上述实施方式中，循环线程内实现请求处理结束后对本模块的占用信号的通知，业务流程在收到此通知后进行后续业务流程，而其他未实现占用模块的请求实现对其所在业务流程的阻塞，即可依次执行调用请求，另外，调用请求按照先来先执行的顺序执行，以提高效率。
为了保证满足用户需求，一种可选的实施方式中，上述步骤S12021包括：
步骤S120211，获取第三子设备的调用请求的类型，类型包括加急和不加急；
步骤S120212，按照保存时间由大至小的顺序对类型为加急的调用请求进行排序，得到第一调用请求子队列；
步骤S120213，按照保存时间由大至小的顺序对类型为不加急的调用请求进行排序，得到第二调用请求子队列；
步骤S120214，将第二调用请求子队列的调用请求按照顺序排列在第一调用请求子队列的队尾，得到第三子设备的调用请求队列。
上述实施方式中，调用请求按照先来先执行的顺序执行的基础上，存在加急的调用请求则按照先来先执行的顺序优先执行加急的调用请求，加急的调用请求全部执行完毕后，再按照先来先执行的顺序优先执行不加急的调用请求，满足用户加急的需求。
为了提高效率，一种可选的实施方式中，上述步骤S2014包括：
步骤S20141，按照上机子设备对应的调用请求队列的顺序，通过循环线程将调用请求分配至上机子设备和上机子设备的冗余设备进行执行，实现多个第二样品的上机。
上述实施方式中，上机子设备和上机子设备的冗余设备均可以执行调用请求，实现多个调用请求并行处理，提高调用请求的处理效率，从而提高批量测序的效率。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，上述步骤S20141包括：
步骤S201411，在上机子设备的冗余设备只有一个且上机子设备和冗余设备均空闲的情况下，通过循环线程控制上机子设备和上机子设备的一个冗余设备分别下两个调用请求；
步骤S201412，在上机子设备的冗余设备只有一个且只有冗余设备空闲的情况下，通过循环线程控制冗余设备执行下一个调用请求；
步骤S201413，在上机子设备的冗余设备只有一个且只有上机子设备空闲的情况下，通过循环线程控制上机子设备执行下一个调用请求。
上述实施方式中，上机子设备和冗余设备是否空闲存在多种情况，任何情况均调用空闲的设备依次执行调用请求即可，防止上机子设备和冗余设备的长时间空闲，提高效率。
为了使用方便，一种可选的实施方式中，上述步骤S2041还包括：
步骤S201414，在上机子设备的冗余设备只有一个且上机子设备和冗余设备均不空闲的情况下，监测上机子设备和冗余设备接收放弃指令，放弃指令为放弃执行当前的调用请求的指令或者当前的调用请求执行失败生成的指令；
步骤S201415，在上机子设备接收到放弃指令的情况下，通过循环线程控制上机子设备停止执行当前的调用请求，并控制上机子设备执行下一个调用请求；
步骤S201416，在冗余设备接收到放弃指令的情况下，通过循环线程控制冗余设备停止执行当前的调用请求，并执行控制冗余设备下一个调用请求；
步骤S201417，在上机子设备和冗余设备均接收到放弃指令的情况下，通过循环线程控制上机子设备和冗余设备均停止执行当前的调用请求，并控制上机子设备和冗余设备分别执行后一个调用请求。
上述实施方式中，测序过程中，可以随时暂停或者下机，只需对需要下机的第二样品对应的调用请求执行的上机子设备和冗余设备发送放弃指令即可，完成暂停，暂停后可以取出第一样品完成下机。
为了保证测序系统的正常运行，一种可选的实施方式中，在控制上机子设备和上机子设备的冗余设备执行对应的调用请求，实现多个第二样品的上机之前，上述方法还包括：
步骤S1301，在接收到释放请求的情况下，通过循环线程清空上机子设备对应的调用请求队列，释放请求为出现影响上机子设备工作的状况时生成的请求。
上述实施方式中，上机子设备可能出现故障或者工作异常，此时生成释放请求来清空调用请求队列，防止继续执行出现测序失败导致第一样品损伤，上机子设备检修之后再重新上机测序，保证测序系统的正常运行。
为了实现测序自动化，一种可选的实施方式中，在第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机之前，上述方法还包括：
步骤S1401，控制测序系统对第二样品执行准备工作，准备工作包括将第二样品移动至目 标位置、固定第二样品和加热第二样品中的一个或者多个。
上述实施方式中，循环线程内根据排序信息接收请求后告知业务流程可以处理流动对象到达目标位置前的一些动作，例如，将第二样品移动至目标位置、固定第二样品和加热第二样品等，实现测序自动化。
为了防止测序流程错乱，一种可选的实施方式中，测序系统还包括机械臂，在按照上机子设备对应的调用请求队列的顺序，通过循环线程将调用请求分配至上机子设备和上机子设备的冗余设备进行执行，实现多个第二样品的上机之前，方法还包括：
步骤S1501，控制机械臂按照上机子设备对应的调用请求队列的顺序，将调用请求对应的第二样品移动至目标位置。
上述实施方式中，调用请求是按照调用请求队列的顺序执行的，对应的第二样品也要按照这个顺序移动至目标位置，保证调用请求与第二样品一一匹配，防止测序流程错乱导致第一样品漏掉测序步骤或者多次重复同一测序步骤，保证测序的正常进行。
为了方便测序，一种可选的实施方式中，步骤S1201包括：
步骤S12011，在第二样品的当前测序流程节点测序结束且第二样品的下一个测序流程节点对应的子设备为第四子设备的情况下，生成第四子设备的调用请求，第四子设备为任意一个子设备；
步骤S12012，在第二样品进行续测且第二样品的至少一个测序流程节点对应的子设备为第四子设备的情况下，生成第四子设备的调用请求，至少一个测序流程节点为第二样品上一次测序没有测序完成的测序流程节点，或者第二样品上一次测序完成的测序流程节点的下一个测序流程节点。
上述实施方式中，第二样品可以按照测序流程依次调用相应的子设备执行测序步骤，还可以进行续测，即从上一次暂停测序的测序步骤开始，调用相应的子设备继续执行测序步骤，无需重新开始测序，提高了测序的灵活性。
需要说明的是，第一调度装置和第二调度装置对应的测序系统执行测序的业务流程采用A和B代指，上机方法可以实现以下效果：
1)用户同时对A与B两边芯片进行上机。
2)在A已经执行测序过程中对B芯片进行上机。
3)在B已经执行测序过程中对A芯片进行上机。
4)在A与B同时执行测序过程中，停止B，并更换芯片上机。
5)在A与B同时执行测序过程中，停止A，并更换芯片上机。
6)在A与B同时执行测序过程中，停止A并且停止B，并更换芯片上机。
7)在A执行测序过程中，B进行其他操作，如清洗，续测。
8)在B执行测序过程中，A进行其他操作，如清洗，续测。
本公开实施例还提供了一种上机装置，需要说明的是，本公开实施例的上机装置可以用于执行本公开实施例所提供的用于上机方法。该装置用于实现实施例及优选实施方式，已经进行过说明的不再赘述。如以下所使用的，术语“模块”可以实现预定功能的软件和/或硬件的组合。尽管以下实施例所描述的装置较佳地以软件来实现，但是硬件，或者软件和硬件的组合的实现也是可能并被构想的。
以下对本公开实施例提供的上机装置进行介绍，上机装置设于测序系统或与测序系统连接，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统。该装置包括：
上机单元，用于将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。
上述上机装置中，用于测序系统，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，其中：将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。该装置通过第一子系统和第二子系统均可以对样品执行测序流程，使得上述第一子系统执行上述测序流程时，可以将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，两者相互独立，通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
为了方便上机，一种可选的实施方式中，上述第一子系统包括第一调度装置，上述第二子系统包括第二调度装置、上述测序系统还包括多个子设备，上述第一调度装置和上述第二调度装置通信连接，上述测序系统的测序流程包括多个测序流程节点，一个上述子设备对应至少一个上述测序流程节点，上述上机单元包括：
接收子单元，用于第二调度装置接收到第二样品的上机请求，上机请求用于请求测序系统对第二样品执行测序流程；
第一确定子单元，用于基于第二调度装置接收到第二样品的上机请求，第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，上机测序状态为调用子设备对第一样品执行对应的测序流程节点的测序步骤的状态；
第二确定子单元，用于基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备不是占用子设备，上机子设备为上机请求对应的第二样品上机后，执行的至少一个测序流程节点对应的子设备，占用子设备为第一调度装置当前调用的子设备；
调用子单元，用于基于上机子设备不是占用子设备，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，通过第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，若第一调度装置处于上机测序状态，且第二调度装置预备调用的上机子设备不是第一调度装置调用的占用子设备，则可以直接上机，第一调度装置和第二调度装置独立测序不同的样品，两者通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，批量测序多个样品，且一个样品出现问题，随时处理不会影响另外的样品，无需等待另外的样品测序完成再处理，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
为了方便上机，一种可选的实施方式中，上述装置还包括：
第一确定单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，基于第二调度装置接收到第二样品的上机请求，第二调度装置确定第一调度装置未处于上机测序状态；
第一调用单元，用于基于第二调度装置确定第一调度装置未处于上机测序状态，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，第一调度装置未处于上机测序状态，则对第二样品的上机无影响，直接上机即可。
为了方便上机，一种可选的实施方式中，测序系统还包括冗余设备，至少一个子设备存在对应的冗余设备，上述装置还包括：
第二确定单元，用于在第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态之后，基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备是占用子设备；
第三确定单元，用于基于第二调度装置确定上机子设备是占用子设备，第二调度装置确定占用子设备不存在空闲的冗余设备；
第一处理单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备不存在空闲的冗余设备，第二调度装置等待。
上述实施方式中，第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，若第一调度装置处于上机测序状态，且第二调度装置预备调用的上机子设备是第一调度装置调用的占用子设备，进一步确定占用子设备是否存在空闲的冗余设备，若不存在则等待，直至第二调度装置预备调用的上机子设备不是第一调度装置调用的占用子设备，即可直接上机，两者互不干扰。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，测序系统还包括冗余设备，至少一个子设备存在对应的冗余设备，上述装置还包括：
第四确定单元，用于在第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态之后，基于第二调度装置确定第一调度装置处于上机测序状态，第二调度装置确定上机子设备是占用子设备；
第五确定单元，用于基于第二调度装置确定上机子设备是占用子设备，第二调度装置确定占用子设备存在空闲的冗余设备；
第二调用单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备存在空闲的冗余设备，第二调度装置调用空闲的冗余设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，第二调度装置接收到第二样品的上机请求时，若第一调度装置处于上机测序状态，且第二调度装置预备调用的上机子设备是第一调度装置调用的占用子设备，进一步确定占用子设备是否存在空闲的冗余设备，若存在则直接上机，两者互不干扰。
另外，上述测序流程包括以下步骤：
1测序准备阶段
1.1新建测序；1.2测序前自检；1.3试剂盒加载界面；1.4流体管路预填充阶段(生化反应进行准备的阶段)；1.5进入测序信息录入阶段；1.6测序信息回顾界面；1.7加载载片界面；
2测序阶段
2.1生化阶段；2.2拍照阶段；2.4测序过程；2.5测序完成；2.6写FQ+生信分析；2.7测序暂停；2.8测序终止；2.9自动清洗。
为了防止影响测序效果，一种可选的实施方式中，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，上述装置还包括：
第六确定单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，在第一调度装置处于测序准备状态且上机子设备为反应仓的情况下，第二调度装置确定占用子设备是第一子设备，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备，第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，测序前自检子设备为测序前自检的测序流程节点对应的子设备，流体控制子设备为流体管路预填充阶段的测序流程节点对应的子设备；
第二处理单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备是第一子设备，等待至占用子设备不是第一子设备。
上述实施方式中，测序准备状态即处于测序准备阶段的状态，测序状态即处于测序阶段的状态，在上机子设备为反应仓的情况下，即第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，占用子设备是测序前自检子设备或者流体控制子设备，表明第一调度装置在执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，这个时候需要等待第一调度装置完成1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，才可以打开仓门加载第二样品的试剂盒，防止影响测序导致测序失败，保证测序效果。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，上述装置还包括：
第七确定单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，在第一调度装置处于测序准备状态且上机子设备为反应仓的情况下，第二调度装置确定占用子设备不是第一子设备，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备，第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，测序前自检子设备为测序前自检的测序流程节点对应的子设备，流体控制子设备为流体管路预填充阶段的测序流程节点对应的子设备；
第三调用单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备不是第一子设备，第二调度装置调用反应仓开仓门加载第二样品的试剂盒或者载片，完成上机。
上述实施方式中，测序准备状态即处于测序准备阶段的状态，测序状态即处于测序阶段的状态，在上机子设备为反应仓的情况下，即第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，第二调度装置确定占用子设备不是第一子设备，表明第一调度装置不在执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，可以打开仓门加载第二样品的试剂盒，不会影响测序效果，无需等待，提高测序效率。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，装置还包括：
第八确定单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，在第一调度装置处于测序准备状态且上机子设备为第一子设备的情况下，第二调度装置确定占用子设备是反应仓，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备，第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，测序前自检子设备为测序前自检的测序流程节点对应的子设备，流体控制子设备为流体管路预填充阶段的测序流程节点对应的子设备；
报警单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备是反应仓，且反应仓的仓门未关的情况下，第二调度装置发出报警以提醒关闭仓门；
第四调用单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备是反应仓，且反应仓的仓门关闭的情况下，第二调度装置调用对应的第一子设备，使得第二样品进入测序前自检或者流体管路预填充阶段，完成上机。
上述实施方式中，上机子设备是测序前自检子设备或者流体控制子设备，表明第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，第二调度装置确定占用子设备是反应仓，即第一调度装置正执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，若仓门未关，则第二调度装置无法执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，发出报警以提醒关闭仓门，若仓门关闭，不影响第二调度装置执行测序准备阶段的1.2测序前自检的流程或者1.4流体管路预填充阶段的流程，直接上机即可。
为了保证测序效果，一种可选的实施方式中，上机测序状态包括测序准备状态和测序状 态，上述装置还包括：
第九确定单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，在第一调度装置处于测序状态的情况下，第二调度装置确定占用子设备是相机，相机为拍照阶段的测序流程节点对应的子设备；
第三处理单元，用于基于第二调度装置确定占用子设备是相机，等待至占用子设备不是相机，第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机。
上述实施方式中，占用子设备是相机，表明第一调度装置处于测序阶段的拍照阶段的流程，需要等待第一调度装置完成拍照阶段的流程，即可上机，防止影响拍照，进一步地，若第二调度装置的第二样品已上机，对第一调度装置进入拍照阶段前也需要第二调度装置完成测序准备阶段，防止影响拍照。
为了保证测序正常运行，一种可选的实施方式中，上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，上述装置还包括：
第十确定单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，在第一调度装置处于测序状态的情况下，第二调度装置确定第一调度装置的第一样品处于测序完成、测序终止或者自动清洗完成的状态；
第四处理单元，用于基于第二调度装置确定第一调度装置的第一样品处于测序完成、测序终止和自动清洗完成的状态中的一个，且上机子设备为反应仓的情况下，等待第一调度装置的第一样品的试剂槽下降至下降位，第二调度装置调用反应仓开仓门加载第二样品的试剂盒或者载片，完成上机，下降位为从试剂槽取出第一样品的位置，反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的测序流程节点对应的子设备。
上述实施方式中，第一调度装置的第一样品处于测序完成、测序终止和自动清洗完成的状态中的一个，即第一调度装置处于2.5测序完成、2.8测序终止和2.9自动清洗中的一个的流程，在上机子设备为反应仓的情况下，即第二调度装置预备执行测序准备阶段的1.3试剂盒加载界面的流程或者1.7加载载片界面的流程，需要等待第一调度装置的第一样品的试剂槽下降至下降位，第二调度装置才可以调用反应仓开仓门加载第二样品的试剂盒或者载片，完成上机，防止试剂槽未归位导致加载失败，保证测序正常进行。
需要说明的是，除了这些特殊情况，其他情况均可直接上机，两边互补干扰，提高测序效率。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，上述装置还包括：
第一获取单元，用于在第二调度装置接收到第二样品的上机请求之前，获取历史记录中各子设备的堵塞次数，堵塞次数为子设备满足预定条件的次数，预定条件为子设备的调用请求的数量大于预定数量或者子设备的任意一个调用请求的保存时间大于预定时长，保存时间为截止当前时刻调用请求等待执行的持续时长；
第十一确定单元，用于在子设备的堵塞次数大于预定次数的情况下，确定子设备为第二子设备并提示为第二子设备配置对应的冗余设备。
上述实施方式中，有些子设备数量少会导致测序流程堵塞，即至少一个第一样品等待调用该子设备进行测序，如果堵塞次数做够多，为满足滚动上机需要，在测序系统上拥有一套或者多套冗余的子设备，冗余子设备根据业务流程设计。
为了保证测序正常运行，一种可选的实施方式中，上述装置还包括：
第二获取单元，用于在完成上机之后，获取各子设备的调用请求；
第四处理单元，用于对各子设备的调用请求进行排序生成多个调用请求队列，并为各调用请求队列建立对应的循环线程；
第一控制单元，用于通过循环线程按照对应的调用请求队列的顺序，控制子设备依次执行对应的调用请求队列的调用请求。
上述实施方式中，每一种子设备生成一个调用请求队列，对子设备的调用请求进行排序，保存时间等其他需要进行排序的信息，且实现请求空间占用时的阻塞所在业务，建立一个无限循环线程，此线程处理调用请求和实现调用请求分配，即可控制子设备依次执行对应的调用请求队列的调用请求。
为了保证测序正常运行，一种可选的实施方式中，上述第四处理单元包括：
处理模块，用于排序步骤，按照保存时间由大至小的顺序对第三子设备的调用请求进行排序，得到第三子设备的调用请求队列，第三子设备为任意一个子设备，保存时间为截止当前时刻调用请求等待执行的持续时长；
重复模块，用于重复排序步骤至少一次，直至得到所有的子设备的调用请求队列。
上述实施方式中，循环线程内实现请求处理结束后对本模块的占用信号的通知，业务流程在收到此通知后进行后续业务流程，而其他未实现占用模块的请求实现对其所在业务流程的阻塞，即可依次执行调用请求，另外，调用请求按照先来先执行的顺序执行，以提高效率。
为了保证满足用户需求，一种可选的实施方式中，上述处理模块包括：
获取子模块，用于获取第三子设备的调用请求的类型，类型包括加急和不加急；
第一处理子模块，用于按照保存时间由大至小的顺序对类型为加急的调用请求进行排序，得到第一调用请求子队列；
第二处理子模块，用于按照保存时间由大至小的顺序对类型为不加急的调用请求进行排序，得到第二调用请求子队列；
第三处理子模块，用于将第二调用请求子队列的调用请求按照顺序排列在第一调用请求子队列的队尾，得到第三子设备的调用请求队列。
上述实施方式中，调用请求按照先来先执行的顺序执行的基础上，存在加急的调用请求则按照先来先执行的顺序优先执行加急的调用请求，加急的调用请求全部执行完毕后，再按照先来先执行的顺序优先执行不加急的调用请求，满足用户加急的需求。
为了提高效率，一种可选的实施方式中，上述调用子单元包括：
调用模块，用于按照上机子设备对应的调用请求队列的顺序，通过循环线程将调用请求分配至上机子设备和上机子设备的冗余设备进行执行，实现多个第二样品的上机。
上述实施方式中，上机子设备和上机子设备的冗余设备均可以执行调用请求，实现多个调用请求并行处理，提高调用请求的处理效率，从而提高批量测序的效率。
为了提高测序效率，一种可选的实施方式中，上述调用模块包括：
第一调用子模块，用于在上机子设备的冗余设备只有一个且上机子设备和冗余设备均空闲的情况下，通过循环线程控制上机子设备和上机子设备的一个冗余设备分别下两个调用请求；
第二调用子模块，用于在上机子设备的冗余设备只有一个且只有冗余设备空闲的情况下，通过循环线程控制冗余设备执行下一个调用请求；
第三调用子模块，用于在上机子设备的冗余设备只有一个且只有上机子设备空闲的情况下，通过循环线程控制上机子设备执行下一个调用请求。
上述实施方式中，上机子设备和冗余设备是否空闲存在多种情况，任何情况均调用空闲的设备依次执行调用请求即可，防止上机子设备和冗余设备的长时间空闲，提高效率。
为了使用方便，一种可选的实施方式中，上述调用模块还包括：
监测模块，用于在上机子设备的冗余设备只有一个且上机子设备和冗余设备均不空闲的情况下，监测上机子设备和冗余设备接收放弃指令，放弃指令为放弃执行当前的调用请求的指令或者当前的调用请求执行失败生成的指令；
第一控制模块，用于在上机子设备接收到放弃指令的情况下，通过循环线程控制上机子设备停止执行当前的调用请求，并控制上机子设备执行下一个调用请求；
第二控制模块，用于在冗余设备接收到放弃指令的情况下，通过循环线程控制冗余设备停止执行当前的调用请求，并执行控制冗余设备下一个调用请求；
第三控制模块，用于在上机子设备和冗余设备均接收到放弃指令的情况下，通过循环线程控制上机子设备和冗余设备均停止执行当前的调用请求，并控制上机子设备和冗余设备分别执行后一个调用请求。
上述实施方式中，测序过程中，可以随时暂停或者下机，只需对需要下机的第二样品对应的调用请求执行的上机子设备和冗余设备发送放弃指令即可，完成暂停，暂停后可以取出第一样品完成下机。
为了保证测序系统的正常运行，一种可选的实施方式中，上述装置还包括：
第四处理单元，用于在控制上机子设备和上机子设备的冗余设备执行对应的调用请求，实现多个第二样品的上机之前，在接收到释放请求的情况下，通过循环线程清空上机子设备对应的调用请求队列，释放请求为出现影响上机子设备工作的状况时生成的请求。
上述实施方式中，上机子设备可能出现故障或者工作异常，此时生成释放请求来清空调用请求队列，防止继续执行出现测序失败导致第一样品损伤，上机子设备检修之后再重新上机测序，保证测序系统的正常运行。
为了实现测序自动化，一种可选的实施方式中，上述装置还包括：
第二控制单元，用于在第二调度装置调用上机子设备对第二样品执行对应的测序流程节点以完成上机之前，控制测序系统对第二样品执行准备工作，准备工作包括将第二样品移动至目标位置、固定第二样品和加热第二样品中的一个或者多个。
上述实施方式中，循环线程内根据排序信息接收请求后告知业务流程可以处理流动对象到达目标位置前的一些动作，例如，将第二样品移动至目标位置、固定第二样品和加热第二样品等，实现测序自动化。
为了防止测序流程错乱，一种可选的实施方式中，测序系统还包括机械臂，上述装置还包括：
第三控制单元，用于在按照上机子设备对应的调用请求队列的顺序，通过循环线程将调用请求分配至上机子设备和上机子设备的冗余设备进行执行，实现多个第二样品的上机之前，控制机械臂按照上机子设备对应的调用请求队列的顺序，将调用请求对应的第二样品移动至目标位置。
上述实施方式中，调用请求是按照调用请求队列的顺序执行的，对应的第二样品也要按照这个顺序移动至目标位置，保证调用请求与第二样品一一匹配，防止测序流程错乱导致第一样品漏掉测序步骤或者多次重复同一测序步骤，保证测序的正常进行。值得说明的是，能够实现机械臂同样功能的转移设备，例如滑台、XY平台、XYZ平台都可以作为机械臂的替代方案，执行上述方法或配合上述单元使用，机械臂不应成为本公开的限制。
为了方便测序，一种可选的实施方式中，上述第二获取单元包括：
第一生成模块，用于在第二样品的当前测序流程节点测序结束且第二样品的下一个测序流程节点对应的子设备为第四子设备的情况下，生成第四子设备的调用请求，第四子设备为任意一个子设备；
第二生成模块，用于在第二样品进行续测且第二样品的至少一个测序流程节点对应的子设备为第四子设备的情况下，生成第四子设备的调用请求，至少一个测序流程节点为第二样品上一次测序没有测序完成的测序流程节点，或者第二样品上一次测序完成的测序流程节点的下一个测序流程节点。
上述实施方式中，第二样品可以按照测序流程依次调用相应的子设备执行测序步骤，还可以进行续测，即从上一次暂停测序的测序步骤开始，调用相应的子设备继续执行测序步骤，无需重新开始测序，提高了测序的灵活性。
上机装置包括处理器和存储器，上机单元等均作为程序单元存储在存储器中，由处理器执行存储在存储器中的程序单元来实现相应的功能。模块均位于同一处理器中；或者，各个模块以任意组合的形式分别位于不同的处理器中。
处理器中包含内核，由内核去存储器中调取相应的程序单元。内核可以设置一个或以上，通过调整内核参数来解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。
存储器可能包括计算机可读介质中的非永久性存储器，随机存取存储器(RAM)和/或非易失性内存等形式，如只读存储器(ROM)或闪存(flashRAM)，存储器包括至少一个存储芯片。
本发明实施例提供了一种计算机可读存储介质，计算机可读存储介质包括存储的程序，其中，在程序运行时控制计算机可读存储介质所在设备执行上机方法。
具体地，上机方法包括：
步骤S201，将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。
本发明实施例提供了一种处理器，处理器用于运行程序，其中，程序运行时执行上机方法。
具体地，上机方法包括：
步骤S201，将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。
本发明实施例提供了一种测序系统，测序系统包括测序仪、处理器、存储器及存储在存储器上并可在处理器上运行的程序，处理器执行程序时实现至少以下步骤：
步骤S201，将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。
本公开还提供了一种计算机程序产品，当在数据处理设备上执行时，适于执行初始化有至少如下方法步骤的程序：
步骤S201，将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。
显然，本领域的技术人员应该明白，的本发明的各模块或各步骤可以用通用的计算装置来实现，它们可以集中在单个的计算装置上，或者分布在多个计算装置所组成的网络上，它们可以用计算装置可执行的程序代码来实现，从而，可以将它们存储在存储装置中由计算装置来执行，并且在某些情况下，可以以不同于此处的顺序执行所示出或描述的步骤，或者将 它们分别制作成各个集成电路模块，或者将它们中的多个模块或步骤制作成单个集成电路模块来实现。这样，本发明不限制于任何特定的硬件和软件结合。
本领域内的技术人员应明白，本公开的实施例可提供为方法、系统、或计算机程序产品。因此，本公开可采用完全硬件实施例、完全软件实施例、或结合软件和硬件方面的实施例的形式。而且，本公开可采用在一个或多个其中包含有计算机可用程序代码的计算机可用存储介质(包括但不限于磁盘存储器、CD-ROM、光学存储器等)上实施的计算机程序产品的形式。
本公开是参照根据本公开实施例的方法、设备(系统)、和计算机程序产品的流程图和/或方框图来描述的。应理解可由计算机程序指令实现流程图和/或方框图中的每一流程和/或方框、以及流程图和/或方框图中的流程和/或方框的结合。可提供这些计算机程序指令到通用计算机、专用计算机、嵌入式处理机或其他可编程数据处理设备的处理器以产生一个机器，使得通过计算机或其他可编程数据处理设备的处理器执行的指令产生用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的装置。
这些计算机程序指令也可存储在能引导计算机或其他可编程数据处理设备以特定方式工作的计算机可读存储器中，使得存储在该计算机可读存储器中的指令产生包括指令装置的制造品，该指令装置实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能。这些计算机程序指令也可装载到计算机或其他可编程数据处理设备上，使得在计算机或其他可编程设备上执行一系列操作步骤以产生计算机实现的处理，从而在计算机或其他可编程设备上执行的指令提供用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的步骤。
在一个典型的配置中，计算设备包括一个或多个处理器(CPU)、输入/输出接口、网络接口和内存。
存储器可能包括计算机可读介质中的非永久性存储器，随机存取存储器(RAM)和/或非易失性内存等形式，如只读存储器(ROM)或闪存(flashRAM)。存储器是计算机可读介质的示例。
计算机可读介质包括永久性和非永久性、可移动和非可移动媒体可以由任何方法或技术来实现信息存储。信息可以是计算机可读指令、数据结构、程序的模块或其他数据。计算机的存储介质的例子包括，但不限于相变内存(PRAM)、静态随机存取存储器(SRAM)、动态随机存取存储器(DRAM)、其他类型的随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、电可擦除可编程只读存储器(EEPROM)、快闪记忆体或其他内存技术、只读光盘只读存储器(CD-ROM)、数字多功能光盘(DVD)或其他光学存储、磁盒式磁带，磁带磁盘存储或其他磁性存储设备或任何其他非传输介质，可用于存储可以被计算设备访问的信息。按照本文中的界定，计算机可读介质不包括暂存电脑可读媒体(transitory media)，如调制的数据信号和载波。
还需要说明的是，术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含，从而使得包括一系列要素的过程、方法、商品或者设备不仅包括那些要素，而且还包括没有明确列出的其他要素，或者是还包括为这种过程、方法、商品或者设备所固有的要素。在没 有更多限制的情况下，由语句“包括一个……”限定的要素，并不排除在包括要素的过程、方法、商品或者设备中还存在另外的相同要素。
从以上的描述中，可以看出，本公开的实施例实现了如下技术效果：
1)、本公开的上机方法中，用于测序系统，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，其中：将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。该方法通过第一子系统和第二子系统均可以对样品执行测序流程，使得上述第一子系统执行上述测序流程时，可以将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，两者相互独立，通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，
2)、本公开的上机装置中，用于测序系统，上述测序系统包括第一子系统和第二子系统，上述第一子系统和上述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，上述第二子系统用于执行的上述测序流程包括第二测序载片的上机，上述第二测序载片的上机包括将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，其中：将上述第二测序载片设置到上述第二子系统的步骤，与上述第一子系统执行上述测序流程相互独立。该装置通过第一子系统和第二子系统均可以对样品执行测序流程，使得上述第一子系统执行上述测序流程时，可以将上述第二测序载片设置到上述第二子系统，两者相互独立，通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，提高了测序效率，即提高了测序系统的通量，解决现有技术中测序系统的样品上机方式不灵活的问题。通过子系统的配合让用户感知为互不干扰，
以上所述仅为本公开的优选实施例而已，并不用于限制本公开，对于本领域的技术人员来说，本公开可以有各种更改和变化。凡在本公开的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本公开的保护范围之内。

Claims (25)

  1. 一种上机方法，用于测序系统，其中，所述测序系统包括第一子系统和第二子系统，所述第一子系统和所述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，所述第二子系统用于执行的所述测序流程包括第二测序载片的上机，所述第二测序载片的上机包括将所述第二测序载片设置到所述第二子系统，其中：
    将所述第二测序载片设置到所述第二子系统的步骤，与所述第一子系统执行所述测序流程相互独立。
  2. 根据权利要求1所述的方法，其中，所述第一子系统包括第一调度装置，所述第二子系统包括第二调度装置、所述测序系统还包括多个子设备，所述第一调度装置和所述第二调度装置通信连接，所述测序系统的测序流程包括多个测序流程节点，一个所述子设备对应至少一个所述测序流程节点，所述方法包括：
    所述第二调度装置接收到第二样品的上机请求，所述上机请求用于请求所述测序系统对所述第二样品执行所述测序流程；
    基于所述第二调度装置接收到所述第二样品的上机请求，所述第二调度装置确定所述第一调度装置处于上机测序状态，所述上机测序状态为调用所述多个子设备的至少一个对第一样品执行对应的至少一个所述测序流程节点的状态；
    基于所述第二调度装置确定所述第一调度装置处于所述上机测序状态，所述第二调度装置确定上机子设备不是占用子设备，所述上机子设备为所述上机请求对应的所述第二样品上机后，执行的至少一个所述测序流程节点对应的子设备，所述占用子设备为所述第一调度装置当前调用的子设备；
    基于所述上机子设备不是所述占用子设备，所述第二调度装置调用所述上机子设备对所述第二样品执行对应的所述测序流程节点以完成上机。
  3. 根据权利要求2所述的方法，其中，在所述第二调度装置接收到第二样品的上机请求之后，所述方法还包括：
    基于所述第二调度装置接收到所述第二样品的所述上机请求，所述第二调度装置确定所述第一调度装置未处于所述上机测序状态；
    基于所述第二调度装置确定所述第一调度装置未处于所述上机测序状态，所述第二调度装置调用所述上机子设备对所述第二样品执行对应的所述测序流程节点以完成上机。
  4. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述测序系统还包括冗余设备，至少一个所述子设备存在对应的所述冗余设备，在所述第二调度装置确定所述第一调度装置处于上机测序状态之后，所述方法还包括：
    基于所述第二调度装置确定所述第一调度装置处于所述上机测序状态，所述第二调度装置确定所述上机子设备是所述占用子设备；
    基于所述第二调度装置确定所述上机子设备是所述占用子设备，所述第二调度装置确定所述占用子设备不存在空闲的所述冗余设备；
    基于所述第二调度装置确定所述占用子设备不存在空闲的所述冗余设备，所述第二调度装置等待。
  5. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述测序系统还包括冗余设备，至少一个所述子设备存在对应的所述冗余设备，在所述第二调度装置确定所述第一调度装置处于上机测序状态之后，所述方法还包括：
    基于所述第二调度装置确定所述第一调度装置处于所述上机测序状态，所述第二调度装置确定所述上机子设备是所述占用子设备；
    基于所述第二调度装置确定所述上机子设备是所述占用子设备，所述第二调度装置确定所述占用子设备存在空闲的所述冗余设备；
    基于所述第二调度装置确定所述占用子设备存在空闲的所述冗余设备，所述第二调度装置调用空闲的所述冗余设备对所述第二样品执行对应的所述测序流程节点以完成上机。
  6. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在所述第二调度装置接收到第二样品的所述上机请求之后，所述方法还包括：
    在所述第一调度装置处于所述测序准备状态且所述上机子设备为反应仓的情况下，所述第二调度装置确定所述占用子设备是第一子设备，所述反应仓为加载所述第一样品的试剂盒或者载片的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，所述测序前自检子设备为所述测序前自检的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述流体控制子设备为流体管路预填充阶段的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述流体管路预填充阶段为生化反应进行准备的阶段；
    基于所述第二调度装置确定所述占用子设备是所述第一子设备，等待至所述占用子设备不是所述第一子设备。
  7. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在所述第二调度装置接收到第二样品的所述上机请求之后，所述方法还包括：
    在所述第一调度装置处于所述测序准备状态且所述上机子设备为反应仓的情况下，所述第二调度装置确定所述占用子设备不是第一子设备，所述反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，所述测序前自检子设备为所述测序前自检的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述流体控制子设备为流体管路预填充阶段的所述测序流程节点对应的所述子设备；
    基于所述第二调度装置确定所述占用子设备不是所述第一子设备，所述第二调度装 置调用所述反应仓开仓门加载所述第二样品的所述试剂盒或者所述载片，完成上机。
  8. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在所述第二调度装置接收到第二样品的所述上机请求之后，所述方法还包括：
    在所述第一调度装置处于所述测序准备状态且所述上机子设备为第一子设备的情况下，所述第二调度装置确定所述占用子设备是反应仓，所述反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述第一子设备为测序前自检子设备和流体控制子设备中的一个，所述测序前自检子设备为所述测序前自检的所述测序流程节点对应的所述子设备，所述流体控制子设备为流体管路预填充阶段的所述测序流程节点对应的所述子设备；
    基于所述第二调度装置确定所述占用子设备是所述反应仓，且所述反应仓的仓门关闭的情况下，所述第二调度装置调用对应的所述第一子设备，使得所述第二样品进入所述测序前自检或者所述流体管路预填充阶段，完成上机。
  9. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在所述第二调度装置接收到第二样品的所述上机请求之后，所述方法还包括：
    在所述第一调度装置处于所述测序状态的情况下，所述第二调度装置确定所述占用子设备是相机，所述相机为拍照阶段的所述测序流程节点对应的所述子设备；
    基于所述第二调度装置确定所述占用子设备是所述相机，等待至所述占用子设备不是所述相机，所述第二调度装置调用所述上机子设备对所述第二样品执行对应的所述测序流程节点以完成上机。
  10. 根据权利要求2所述的方法，其中，所述上机测序状态包括测序准备状态和测序状态，在所述第二调度装置接收到第二样品的所述上机请求之后，所述方法还包括：
    在所述第一调度装置处于所述测序状态的情况下，所述第二调度装置确定所述第一调度装置的所述第一样品处于测序完成、测序终止或者自动清洗完成的状态；
    基于所述第二调度装置确定所述第一调度装置的所述第一样品处于测序完成、测序终止和自动清洗完成的状态中的一个，且所述上机子设备为反应仓的情况下，等待所述第一调度装置的所述第一样品的试剂槽下降至下降位，所述第二调度装置调用所述反应仓开仓门加载所述第二样品的试剂盒或者载片，完成上机，所述下降位为从所述试剂槽取出所述第一样品的位置，所述反应仓为加载第一样品的试剂盒或者载片的所述测序流程节点对应的所述子设备。
  11. 根据权利要求4所述的方法，其中，在所述第二调度装置接收到第二样品的所述上机请求之前，所述方法还包括：
    获取历史记录中各所述子设备的堵塞次数，所述堵塞次数为所述子设备满足预定条件的次数，所述预定条件为所述子设备的调用请求的数量大于预定数量或者所述子设备 的任意一个所述调用请求的保存时间大于预定时长，所述保存时间为截止当前时刻所述调用请求等待执行的持续时长；
    在所述子设备的堵塞次数大于预定次数的情况下，确定所述子设备为第二子设备并提示为所述第二子设备配置对应的所述冗余设备。
  12. 根据权利要求11所述的方法，其中，在完成上机之后，所述方法还包括：
    获取各所述子设备的调用请求；
    对各所述子设备的所述调用请求进行排序生成多个调用请求队列，并为各所述调用请求队列建立对应的循环线程；
    通过所述循环线程按照对应的所述调用请求队列的顺序，控制所述子设备依次执行对应的所述调用请求队列的所述调用请求。
  13. 根据权利要求12所述的方法，其中，对各所述子设备的所述调用请求进行排序生成多个调用请求队列，包括：
    排序步骤，按照保存时间由大至小的顺序对第三子设备的所述调用请求进行排序，得到所述第三子设备的调用请求队列，所述第三子设备为任意一个所述子设备，所述保存时间为截止当前时刻所述调用请求等待执行的持续时长；
    重复所述排序步骤至少一次，直至得到所有的所述子设备的所述调用请求队列。
  14. 根据权利要求13所述的方法，其中，按照保存时间由大至小的顺序对第三子设备的所述调用请求进行排序，得到所述第三子设备的调用请求队列，包括：
    获取所述第三子设备的所述调用请求的类型，所述类型包括加急和不加急；
    按照所述保存时间由大至小的顺序对所述类型为加急的所述调用请求进行排序，得到第一调用请求子队列；
    按照所述保存时间由大至小的顺序对所述类型为不加急的所述调用请求进行排序，得到第二调用请求子队列；
    将所述第二调用请求子队列的所述调用请求按照顺序排列在所述第一调用请求子队列的队尾，得到所述第三子设备的调用请求队列。
  15. 根据权利要求12所述的方法，其中，所述第二调度装置调用所述上机子设备对所述第二样品执行对应的所述测序流程节点以完成上机，包括：
    按照所述上机子设备对应的所述调用请求队列的顺序，通过所述循环线程将所述调用请求分配至所述上机子设备和所述上机子设备的所述冗余设备进行执行，实现多个所述第二样品的上机。
  16. 根据权利要求15所述的方法，其中，按照所述上机子设备对应的所述调用请求队列的顺序，通过所述循环线程将所述调用请求分配至所述上机子设备和所述上机子设备的所述冗余设备进行执行，实现多个所述第二样品的上机，包括：
    在所述上机子设备的所述冗余设备只有一个且所述上机子设备和所述冗余设备均空闲的情况下，通过所述循环线程控制对所述上机子设备和所述上机子设备的一个所述冗余设备分别下达两个所述调用请求；
    在所述上机子设备的所述冗余设备只有一个且只有所述冗余设备空闲的情况下，通过所述循环线程控制所述冗余设备执行下一个所述调用请求；
    在所述上机子设备的所述冗余设备只有一个且只有所述上机子设备空闲的情况下，通过所述循环线程控制所述上机子设备执行下一个所述调用请求。
  17. 根据权利要求15所述的方法，其中，按照所述上机子设备对应的所述调用请求队列的顺序，通过所述循环线程将所述调用请求分配至所述上机子设备和所述上机子设备的所述冗余设备进行执行，实现多个所述第二样品的上机，包括：
    在所述上机子设备的所述冗余设备只有一个且所述上机子设备和所述冗余设备均不空闲的情况下，监测所述上机子设备和所述冗余设备接收到放弃指令，所述放弃指令为放弃执行当前的所述调用请求的指令或者当前的所述调用请求执行失败生成的指令；
    在所述上机子设备接收到所述放弃指令的情况下，通过所述循环线程控制所述上机子设备停止执行当前的所述调用请求，并控制所述上机子设备执行下一个所述调用请求；
    在所述冗余设备接收到所述放弃指令的情况下，通过所述循环线程控制所述冗余设备停止执行当前的所述调用请求，并执行控制所述冗余设备下一个所述调用请求；
    在所述上机子设备和所述冗余设备均接收到所述放弃指令的情况下，通过所述循环线程控制所述上机子设备和所述冗余设备均停止执行当前的所述调用请求，并控制所述上机子设备和所述冗余设备分别执行后一个所述调用请求。
  18. 根据权利要求12所述的方法，其中，在控制所述上机子设备和所述上机子设备的所述冗余设备执行对应的所述调用请求，实现多个所述第二样品的上机之前，所述方法还包括：
    在接收到释放请求的情况下，通过所述循环线程清空所述上机子设备对应的所述调用请求队列，所述释放请求为出现影响所述上机子设备工作的状况时生成的请求。
  19. 根据权利要求12所述的方法，其中，在所述第二调度装置调用所述上机子设备对所述第二样品执行对应的所述测序流程节点以完成上机之前，所述方法还包括：
    控制所述测序系统对所述第二样品执行准备工作，所述准备工作包括将所述第二样品移动至目标位置、固定所述第二样品和加热所述第二样品中的一个或者多个。
  20. 根据权利要求15所述的方法，其中，所述测序系统还包括机械臂，在按照所述上机子设备对应的所述调用请求队列的顺序，通过所述循环线程将所述调用请求分配至所述上机子设备和所述上机子设备的所述冗余设备进行执行，实现多个所述第二样品的上机之前，所述方法还包括：
    控制所述机械臂按照所述上机子设备对应的所述调用请求队列的顺序，将所述调用请求对应的所述第二样品移动至目标位置。
  21. 根据权利要求12所述的方法，其中，获取各所述子设备的调用请求，包括：
    在所述第二样品的当前所述测序流程节点测序结束且所述第二样品的下一个所述测序流程节点对应的所述子设备为第四子设备的情况下，生成所述第四子设备的所述调用请求，所述第四子设备为任意一个所述子设备；
    在所述第二样品进行续测且所述第二样品的至少一个测序流程节点对应的所述子设备为所述第四子设备的情况下，生成所述第四子设备的所述调用请求，所述至少一个测序流程节点为所述第二样品上一次测序没有测序完成的所述测序流程节点，或者所述第二样品上一次测序完成的所述测序流程节点的下一个所述测序流程节点。
  22. 一种上机装置，设于测序系统或与所述测序系统连接，其中，所述测序系统包括第一子系统和第二子系统，所述第一子系统和所述第二子系统分别用于执行相同或不同的测序流程，所述第二子系统用于执行的所述测序流程包括第二测序载片的上机，所述第二测序载片的上机包括将所述第二测序载片设置到所述第二子系统，其中：
    上机单元，用于执行将所述第二测序载片设置到所述第二子系统的步骤，并与所述第一子系统执行所述测序流程相互独立。
  23. 一种计算机可读存储介质，其中，所述计算机可读存储介质包括存储的程序，其中，在所述程序运行时控制所述计算机可读存储介质所在设备执行权利要求1至21中任意一项所述的方法。
  24. 一种计算机程序产品，包括计算机程序/指令，其中，该计算机程序/指令被处理器执行时实现权利要求1至21中任意一项所述的方法。
  25. 一种测序系统，其中，包括：测序仪、一个或多个处理器，存储器，以及一个或多个程序，其中，所述一个或多个程序被存储在所述存储器中，并且被配置为由所述一个或多个处理器执行，所述一个或多个程序包括用于执行权利要求1至21中任意一项所述的方法。
PCT/CN2024/083657 2024-03-25 2024-03-25 上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统 Pending WO2025199704A1 (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2024/083657 WO2025199704A1 (zh) 2024-03-25 2024-03-25 上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2024/083657 WO2025199704A1 (zh) 2024-03-25 2024-03-25 上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2025199704A1 true WO2025199704A1 (zh) 2025-10-02

Family

ID=97219580

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/CN2024/083657 Pending WO2025199704A1 (zh) 2024-03-25 2024-03-25 上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2025199704A1 (zh)

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2021056206A1 (zh) * 2019-09-24 2021-04-01 深圳华大智造科技有限公司 调度系统与方法、调度控制系统、生化物质分析系统、装置及存储介质
CN114317703A (zh) * 2020-09-29 2022-04-12 深圳市真迈生物科技有限公司 核酸序列测定方法、系统、存储介质和计算机程序产品
CN114676665A (zh) * 2022-05-23 2022-06-28 飞腾信息技术有限公司 一种时序调整方法、装置、设备以及存储介质
CN115577997A (zh) * 2022-12-12 2023-01-06 上海奔曜科技有限公司 排程控制方法、装置、设备及计算机可读存储介质
CN115895865A (zh) * 2022-12-23 2023-04-04 郑州思昆生物工程有限公司 一种测序仪控制系统
CN116024079A (zh) * 2023-03-16 2023-04-28 深圳市真迈生物科技有限公司 控制芯片加载的方法、装置、测序系统和存储介质

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2021056206A1 (zh) * 2019-09-24 2021-04-01 深圳华大智造科技有限公司 调度系统与方法、调度控制系统、生化物质分析系统、装置及存储介质
CN114317703A (zh) * 2020-09-29 2022-04-12 深圳市真迈生物科技有限公司 核酸序列测定方法、系统、存储介质和计算机程序产品
CN114676665A (zh) * 2022-05-23 2022-06-28 飞腾信息技术有限公司 一种时序调整方法、装置、设备以及存储介质
CN115577997A (zh) * 2022-12-12 2023-01-06 上海奔曜科技有限公司 排程控制方法、装置、设备及计算机可读存储介质
CN115895865A (zh) * 2022-12-23 2023-04-04 郑州思昆生物工程有限公司 一种测序仪控制系统
CN116024079A (zh) * 2023-03-16 2023-04-28 深圳市真迈生物科技有限公司 控制芯片加载的方法、装置、测序系统和存储介质

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
"Chinese Master’s Dissertations Full-text Database, Basic Sciences", 12 October 2016, article LV DAN: "Rearch on Task Modeling and Scheduling of Gene Sequencing Workflow", XP093359793 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7158964B2 (en) Queue management
KR100509794B1 (ko) 데이터베이스 관리시스템을 이용하는 작업들의 실시간 처리를 위한 스케줄링 방법
CN115454589A (zh) 一种任务调度方法、装置及Kubernetes调度器
US4965716A (en) Fast access priority queue for managing multiple messages at a communications node or managing multiple programs in a multiprogrammed data processor
US4794526A (en) Microcomputer with priority scheduling
EP2742426B1 (en) Network-aware coordination of virtual machine migrations in enterprise data centers and clouds
US11514296B2 (en) Output method and apparatus for multiple neural network, server and computer readable storage medium
US7080377B2 (en) Method for effective utilizing of shared resources in computerized system
CN104978261B (zh) 应用程序的测试方法、装置及系统
EP2176773A2 (en) Data packet processing method for a multi core processor
CN115204399B (zh) 一种量子计算任务计算方法、装置及量子计算机操作系统
US20110255543A1 (en) Method and system for processing data
Kaubisch et al. Quasiparallel programming
CN106776032B (zh) 分布式块存储的io请求的处理方法和装置
WO2025199704A1 (zh) 上机方法、装置、计算机程序产品和测序系统
Nikolić et al. Worst-case communication delay analysis for many-cores using a limited migrative model
CN102013993B (zh) 物理拓扑使用管理方法和系统
CN117369991A (zh) Gpu资源调度方法及相关装置
CN116205023A (zh) 机器人智能实验室的设计方法、装置、设备和存储介质
CN105242915B (zh) 一种数据操作的处理方法及装置
CN110968420A (zh) 一种多爬虫平台的调度方法、装置、存储介质及处理器
CN119066002A (zh) 多通道dma控制方法、系统、电子设备及存储介质
CN114138626B (zh) 用于自动化固件测试的水平可扩展分布式系统及其方法
CN115858097A (zh) 一种资源处理方法及设备
JP2025504858A (ja) 検査室システムを動作させるための方法および検査室システム

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 24931278

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1