WO2022145490A1 - iPS細胞を介する再生T細胞の製造方法 - Google Patents

iPS細胞を介する再生T細胞の製造方法 Download PDF

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良輔 五ノ坪
光次郎 大澤
泰道 等
和男 山下
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Kotaiバイオテクノロジーズ株式会社
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Definitions

  • the present invention introduces a T cell receptor obtained from a CD106-positive T cell population into non-T non-B cells or iPS cells derived from monocytes or T cells to produce tumor antigen-specific regenerated T cells.
  • T cells play a central role in the immune response to foreign pathogens such as bacteria or viruses or abnormal cells such as cancer cells. Therefore, it is considered that the functional deterioration of T cells contributes to pathogen infection and the development of cancer.
  • T cell replacement therapy or regenerative therapy for a patient having a disease caused by a decrease in T cell function can be an extremely effective means for improving or treating the pathological condition of the disease in the patient.
  • T cell replacement therapy for infectious diseases or cancer specifically recognizes antigens possessed by foreign pathogens such as bacteria or viruses or abnormal cells such as cancer cells. It is known that a high therapeutic effect can be obtained by using T cells. On the other hand, it is difficult to secure a sufficient amount of T cells, and exhaustion of T cells such as a decrease in proliferative ability in T cells and a decrease in immune response to antigens such as target cells becomes obstacles in T cell replacement therapy. ing. Also, how to obtain tumor-specific T cells is a major issue.
  • iPS cells artificial pluripotent stem cells
  • Cell replacement therapy has been proposed. Since the T cell receptor (TCR) for recognizing the target antigen is formed by gene rearrangement of the genome, the TCR gene possessed by the T cell before reprogramming is conserved in the iPS cell in which the T cell is reprogrammed. Has been done. Therefore, by using T cells specific to the target antigen as a raw material for producing iPS cells, it is possible to produce regenerated T cells exhibiting the same antigen specificity as the original T cells. (Patent Document 1 and Non-Patent Document 1).
  • Non-Patent Document 2 Strict antigen specificity is required for safe and efficient T cell replacement therapy.
  • Patent Document 2 It has been reported that in regenerated T cells obtained from T cells via iPS cells as described above, the frequency of appearance of T cells having the same gene rearrangement pattern as the original T cells is not necessarily high.
  • Patent Document 2 It has also been reported that CD8 ⁇ regenerated T cells obtained from human T cells via iPS cells lose antigen specificity due to additional rearrangement of the TCR ⁇ chain gene at the CD4 / CD8 double positive stage.
  • Nishimura T et al. Generation of rejuvenated antigen-specific T cells by reprogramming to pluripotency and redifferentiation.
  • Minagawa A et al. Enhancing T cell receptor stability in rejuvenated iPSC-derived T cells improves their use in cancer immunotherapy.
  • iPS-T cells regenerated T cells
  • iPS-T cells regenerated T cells
  • tumor cells or tumor tissues can be used. It is important to ensure the safety and efficacy of iPS-T cell replacement therapy in the treatment of cancer.
  • iPS-T cell replacement therapy when the onset or recurrence of cancer is detected, it is important to start iPS-T cell replacement therapy promptly in order to improve the treatment results.
  • An object of the present invention is to provide a method for rapidly producing TCR-introduced iPS-T cells isolated from tumor tissue infiltrating CD106-positive T cells and iPS-T cells produced by the method. Furthermore, it is an object of the present invention to provide iPS-T cells produced by the method, a pharmaceutical composition containing the iPS-T cells, and a method for preventing or treating cancer using the pharmaceutical composition. ..
  • T cell clones (5-10 clones) recognize antigens using different TCRs even for one antigen epitope.
  • the possibility that the clone differentiated to iPS-T cells is a T cell clone with optimal TCR to damage the target is also due to individual differences in the subjects who collect the cells for producing iPS-T cells or iPS. -Affected by T cell production batches.
  • T cells that specifically recognize a tumor it is necessary to administer the tumor antigen to a patient or co-culture the T cell and the tumor antigen in vitro, but the tumor antigen is used. If uncertain, it is extremely difficult to adopt such a method.
  • the CD106-positive T cell population isolated from tumor tissue is a T cell population that recognizes tumor-related antigens and has specific aggression against cancer cells.
  • iPS-T cells can be obtained by obtaining various TCR pools with antigen specificity, and by introducing TCR into non-T non-B cells or iPS cells established from monospheres or T cells.
  • the iPS-T cells can be rapidly produced, and the TCR pool and the non-T non-B cells or monospheres or T cells of the same origin or in separate bodies. We have found that it is possible to have it, and have completed the present invention.
  • T cell receptors obtained from a subject which are reactive to tumor-related antigens and which have a T cell receptor ⁇ chain and ⁇ chain for each single cell from a CD106-positive T cell population, respectively.
  • the process of preparing the cDNA to be encoded (2) Peripheral blood mononuclear cells of the subject, from which B cells and T cells have been removed, are initialized into iPS cells, and the obtained iPS cells are differentiated into T cells.
  • Steps to select high iPS cell clones (3) A step of introducing the cDNA into the iPS cell clone, a hematopoietic stem cell differentiated from the iPS cell clone, an immature T cell differentiated from the hematopoietic stem cell, or a mature T cell differentiated from the immature T cell, and (4). ) The step of differentiating the iPS cell clone into which the cDNA has been introduced, the hematopoietic stem cell or the immature T cell into mature T cells, and the proliferation of the mature T cells obtained in step (3). A method for producing regenerated T cells via iPS cells.
  • the present invention comprises a step of selecting T cells having no allo-reaction with respect to cells derived from a subject who is a target for cancer prevention or treatment from the T cells into which the cDNA obtained in step (4) has been introduced.
  • it comprises a step of selecting a cDNA encoding a T cell receptor that does not induce an allo reaction to cells derived from a subject to be prevented or treated for cancer from the cDNA prepared in step (1).
  • step (3) introduction of the cDNA into the iPS cell clone, the hematopoietic stem cell differentiated from the iPS cell clone, the immature T cell differentiated from the hematopoietic stem cell, or the mature T cell differentiated from the immature T cell.
  • a viral vector or a non-viral vector is used, or a genome editing technique is used.
  • step (4) the steps of differentiating the iPS cell clone into which the cDNA has been introduced, the hematopoietic stem cell or the immature T cell into mature T cells, and proliferating the mature T cells are the feeder cells and PHA (phytohemagglutinin).
  • Retronectin® and anti-CD3 antibody In the presence of Retronectin® and anti-CD3 antibody, or in the presence of anti-CD3 antibody and anti-CD28 antibody, according to any one of [1] to [13].
  • the feeder cells are autologous or allogeneic peripheral blood mononuclear cells.
  • the subject in step (1) or (2) is hepatocellular carcinoma, hepatoblastoma, gastric cancer, esophageal cancer, lung cancer, pancreatic cancer, renal cell carcinoma, breast cancer, ovarian cancer, malignant melanoma, etc.
  • the highly immunogenic cancer is hepatocellular carcinoma, hepatoblastoma, colon cancer, lung cancer or malignant melanoma.
  • iPS-T cells regenerated T cells
  • peripheral blood mononuclear cells non-T non-B cells or monocytes
  • T cells from which T cells and B cells have been removed are initially used.
  • iPS cell clones having good differentiation efficiency into T cells are selected in advance. Therefore, it is possible to secure a sufficient amount of iPS-T cells required for treatment according to the timing required for treatment.
  • iPS cell clones derived from non-T non-B cells or monocytes or T cells hematopoietic stem cells differentiated from the iPS cell clones, immature T cells differentiated from the hematopoietic stem cells or the immature T cells.
  • TCR TCR antigen
  • iPS cell clones with good differentiation efficiency into T cells are selected and used, so that the yield and degree of differentiation vary between iPS-T cell production batches, and the cells are used. It is possible to minimize the influence of individual differences of the subjects to be collected on the quality and the like of the obtained iPS-T cells. In addition, it becomes possible to efficiently produce T cells having a TCR that recognizes an antigen and efficiently kills a target.
  • the cDNA encoding the TCR is prepared for each single cell from the T cell population having genetic diversity, it is possible to prepare a cDNA group having various antigen specificities. .. Since the CD106-positive T cell population isolated from the tumor tissue is a T cell population that recognizes the tumor antigen, the tumor antigen-induced immunity or in vitro T cells are used to isolate the tumor-specific TCR in advance. There is no need for co-culture with tumor antigens. Therefore, according to the method of the present invention, the production period of iPS-T cells is shortened, and at the same time, tumor-specific iPS-T cells are produced even when the tumor antigen in a cancer patient is unknown. It is possible.
  • non-T non-B cell or monocyte-derived or T cell-derived iPS cell clones is performed prior to the preparation of the cDNA encoding the antigen-specific TCR or in parallel with the preparation of the cDNA. Therefore, iPS-T cells can be produced in a short period of time as compared with the method of sequentially performing these. Therefore, in cancer treatment to which iPS-T cell replacement therapy is applied, it is specific to the expressed antigen for tumor antigen change or development of treatment resistance or cancer recurrence in the cancer patient to be treated. It is possible to quickly prepare various iPS-T cells.
  • the subject from which the T cells used for preparing the cDNA encoding the TCR are collected is the same individual as the subject who is a cancer patient to be treated by iPS-T cell replacement therapy. It may be separate from each other. Therefore, it is possible to prepare a TCR pool corresponding to various antigens, and it is possible to select a TCR having optimal antigen specificity for each cancer patient.
  • the upper partial view shows a step of isolating the TCR gene from CD106-positive T cells and a step of verifying antigen-specific reactivity
  • the lower partial view shows a step of producing a TCR gene-introduced iPS cell and a step of producing the TCR gene-introduced iPS cell.
  • the step of producing the regenerated T cell from the iPS cell is shown. It is a figure which shows the step of introducing a TCR gene using a piggyBac® transposon vector. It is a figure which shows the phenotype of the regenerated T cell (tumor-related antigen-specific CD8 positive cytotoxic T cell) derived from iPS cell. It is a figure which shows the result of having analyzed the telomere as a cell senescence marker in a regenerated T cell. It is a figure which shows the result of having analyzed the expression of PD-1 and TIGHT molecules as a cell exhaustion marker in regenerated T cells.
  • IL-2 and IFN- ⁇ levels produced by stimulation with PMA and ionomycin in cytotoxic T cells (CD8 ⁇ chain / ⁇ chain double positive cells) and regenerated T cells in peripheral blood mononuclear cells of healthy subjects It is a figure. It is a figure which shows the expression of various markers in a tumor infiltrating T cell. In each panel, cells positive for the expression of the markers described within the panel are shown colored. The cells are clustered according to the expression pattern, and the circled part corresponds to the tumor-damaging T cell. It is a figure which shows the IFN- ⁇ production at the time of self-tumor stimulation in the cell subpopulation that tumor infiltrated T cells were sorted by marker expression.
  • IFN- ⁇ is produced by autotumor stimulation
  • marker-positive cell subpopulation other than CD106 IFN- ⁇ is produced by autotumor stimulation, but the marker-negative cell subpopulation. Since IFN- ⁇ is also produced in the population, it can be understood that the specificity is inferior to that of CD106.
  • the CD19 gene is a gene integrated into the same piggyBac® transposon vector in tandem with the TCR gene, and is used as a marker for gene insertion into the host chromosome and gene expression.
  • the "T cell” obtained from a subject is a cell expressing an antigen receptor called a T cell receptor (TCR) on the cell surface.
  • TCR includes a heterodimer consisting of an ⁇ chain and a ⁇ chain, and a heterodimer consisting of a ⁇ chain and a ⁇ chain.
  • T cells having a TCR consisting of an ⁇ chain and a ⁇ chain are called ⁇ type T cells, and T cells having a TCR consisting of a ⁇ chain and a ⁇ chain are called ⁇ type T cells.
  • the T cells of the present invention are preferably CD3 / ⁇ type T cells, but may be CD3 / ⁇ type T cells.
  • the TCR of T cells in the present invention is a gene-introduced one.
  • the "T cell population” refers to the above-mentioned T cell population in which the gene sequence of the T cell receptor (TCR) that recognizes an antigen is diverse as a whole. Therefore, T cells collected from a living body are a T cell population having specificity for various antigens. In the T cells existing in the living body, each T cell has a different TCR gene sequence due to the random recombination of the TCR gene when the T precursor cells develop and differentiate in the thymus, and for all antigens. It is possible to provoke an immune response.
  • CD106 is a highly specific marker for identifying T cells having aggression against cancer cells, and the TCR possessed by each CD106-positive T cell is tumor antigen-specific. Therefore, by treating CD106-positive T cells as a population, it can be understood that the T cell population is immune to various tumor antigens. Therefore, the CD106-positive T cell population collected from a living body is a T cell population having genetic diversity in that sense.
  • the "tumor-related antigen” is an antigen that is specifically or non-specifically expressed in a tumor, and is an antigen derived from a protein that is overexpressed in tumor cells and a variant thereof, an antigen derived from a tumor virus, and the like. Certain differentiation antigens and novel tumor-related antigens (neoantigens) due to gene mutations and splice abnormalities. T cells that respond to "tumor-related antigens" are recognized as CD106-positive T cells.
  • a tumor-related antigen may be referred to as a tumor antigen. When it is a protein antigen, it may be a peptide fragmented from this (peptide fragment).
  • Antigens expressed specifically or non-specifically to tumors include WT1, GPC3, XAGE1, MUC1, MUC5AC, MUC6, EGFRvIII, HER-2 / neu, MAGE A3, MAGE A1, telomerase, PRAME, SSX2 / 4, PSCA. , CTLA-4, gp100, GD2, GD3, fucosyl GM1, GM3, sLe (a), glycolipid F77, mesotelin, PD-L1, trp1, trp2, CD19, CD20, CD22, ROR1, CD33, c-Met, p53.
  • Viral antigens include inactivated viruses such as inactivated HBV and HPV, and proteins derived from various viruses EBV LMP1, EBV LMP2, EBNA (EBV nuclear antigen), HPV E1, HPV E2, HPV E6, HPV E7, HBV. Examples include, but are not limited to, HBs, HTLV-1Tax, HBZ (HTLV-1bZIPFactor), and the like.
  • T cells are tumor-related presented to major histocompatibility complex (MHC) class I or class II on antigen-presenting cells. It means that T cells have a reaction caused by selectively binding / joining to an epitope peptide derived from an antigen via TCR, and in binding / joining of T cells to something other than the epitope peptide, the T cells It means that no reaction occurs.
  • MHC major histocompatibility complex
  • the T cell response resulting from binding / conjugation to an epitope peptide derived from a tumor-related antigen presented in MHC class I or class II via the TCR is cytotoxic, IFN- ⁇ and granzyme production, T. Expression of cell activation markers and activation of transcription factors such as NF-AT can be mentioned.
  • the T cells are preferably ⁇ T cells.
  • the source of T cells is preferably, but not limited to, peripheral blood because of its low invasiveness.
  • Other preferred sources are cancer or tumor tissue, lymph nodes or other tissues or organs, or blood, umbilical cord blood, lymph, tissue fluid (interstitial fluid, interstitial fluid and interstitial fluid), body cavity fluid (abdominal fluid). , Chest fluid, heart sac fluid, cerebrospinal fluid, joint fluid and atriointerstitial fluid) and all sources in the body.
  • preferred T cells are tumor tissue-derived T cells. Tumor tissue-derived T cells are usually tumor-infiltrating T cells.
  • the cancer of the cancer patient is hepatocellular carcinoma, hepatoblastoma, gastric cancer, esophageal cancer, lung cancer, pancreatic cancer, renal cell carcinoma, breast cancer, ovarian cancer, Skin cancer such as malignant melanoma, bladder cancer, head and neck cancer, uterine cancer, cervical cancer, glioblastoma, prostate cancer, neuroblast tumor, chronic lymphocytic leukemia, papillary thyroid cancer, colon Selected from cancer, brain tumor, sarcoma or B-cell non-Hodgkin lymphoma.
  • the cancer is preferably hepatocellular carcinoma or hepatoblastoma.
  • iPS cells are preferably produced by reprogramming non-T non-B cells or monocytes or T cells, but are not limited to non-T non-B cells or monocytes or T cells.
  • Non-T non-B cell means a mononuclear cell that is not classified as a T cell and is not classified as a B cell.
  • non-T non-B cells or monocytes can be prepared by collecting as peripheral blood mononuclear cells of a subject and then removing T cells and B cells contained in the mononuclear cells. Peripheral blood mononuclear cells can be isolated from whole human blood with a mononuclear cell isolation solution.
  • Examples of the mononuclear cell separation solution include Lymphoprep (registered trademark).
  • B cells such as CD19, CD20, CD22 or B cell receptors
  • T cells such as CD3, CD4 or CD8.
  • the antibody may be utilized to use magnetic beads such as, for example, flow cytometry or MACS® beads.
  • T cells can be isolated from whole human blood with a mononuclear cell isolation solution.
  • Examples of the mononuclear cell separation solution include Lymphoprep (registered trademark). Purification of T cells can be performed by utilizing the surface antigens of T cells, CD3, CD4 or CD8, or T cell receptors. Magnetic beads such as, for example, flow cytometry or MACS® beads may be used.
  • iPS cells can preferably be induced by introducing a cell reprogramming factor into non-T non-B cells or monocytes or T cells.
  • cell reprogramming factors include Oct3 / 4, Sox2, Sox1, Sox3, Sox15, Sox17, klf4, klf2, c-Myc, N-Myc, L-Myc, Nanog, Lin28, Fbx15, ERAs, and ECAT15-2.
  • cell reprogramming factors may be used alone or in combination.
  • these cell reprogramming factors from the viewpoint of efficiently establishing iPS cells, Oct3 / 4, Sox2, Klf4 and c-Myc (so-called Yamanaka 4 factors) are used as the non-T non-B cells or monocytes. Alternatively, it is preferably introduced into T cells.
  • the method for introducing a cell reprogramming factor into the non-T non-B cell or monocyte or T cell is not particularly limited, and a method known in the art can be adopted.
  • the gene encoding the cell reprogramming factor for example, cDNA
  • the gene encoding the cell reprogramming factor is introduced into the non-T non-B cell or monocyte. It is inserted into an expression vector containing a promoter that functions in spheres or T cells, and the expression vector is subjected to non-T by infection, lipofection method, liposome method, calcium phosphate co-precipitation method, DEAE dextran method, microinjection method or electroporation method.
  • the cell reprogramming factor can be introduced into non-B cells or monocytes or T cells.
  • the cell reprogramming factor is in the form of a protein and the protein is introduced into the non-T non-B cells or monospheres or T cells, a method using a protein transfer reagent or a method using a protein transfer domain fusion protein. , Electroporation method and microinjection method.
  • mRNA messenger RNA
  • a method using an mRNA introduction reagent and a method of adding the mRNA to the culture medium are available. Can be mentioned.
  • the expression vector used for gene transfer by infection examples include viral vectors such as lentivirus, retrovirus, adenovirus, adeno-associated virus, herpesvirus, and Sendai virus, and animal cell expression plasmids, but insertion mutations are unlikely to occur.
  • viral vectors such as lentivirus, retrovirus, adenovirus, adeno-associated virus, herpesvirus, and Sendai virus
  • animal cell expression plasmids but insertion mutations are unlikely to occur.
  • the gene encoding the cell reprogramming factor is transferred to the non-T non-B cell or monosphere or T cell using Sendai virus. It is preferable to introduce it.
  • Examples of the promoter used in the expression vector used when introducing the gene encoding the cell reprogramming factor into non-T non-B cells or monospheres or T cells include SR ⁇ promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, and the like. Examples include the RSV promoter, HSV-TK promoter, ubiquitin promoter and the like. These promoters may be capable of controlling the expression of the gene inserted downstream of the promoter depending on the presence or absence of a drug such as tetracycline.
  • the expression vector can include an enhancer, a poly A addition signal, a selectable marker gene (for example, a neomycin resistance gene), an SV40 origin of replication, and the like.
  • the culture medium used for culturing iPS cells obtained by reprogramming non-T non-B cells or monocytes or T cells is not particularly limited, but the culture medium used for culturing animal cells is used as the basal culture medium. It can be prepared by adding cytokines for maintaining the undifferentiated ability of iPS cells.
  • the basal culture medium include Isove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM) culture medium, Medium 199 culture medium, Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM) culture medium, ⁇ MEM culture medium, Dulbecco's modified Eagle's Medium (DMEM) culture medium, and Ham.
  • IMDM Isove's Modified Dulbecco's Medium
  • EMEM Eagle's Minimum Essential Medium
  • DMEM Dulbecco's modified Eagle's Medium
  • cytokines include bFGF, and the concentration thereof in the culture medium is, for example, 1 to 100 ⁇ g / mL (preferably 50 ⁇ g / mL).
  • the method for culturing iPS cells may be adhesive culture or suspension culture, but adhesive culture is preferable.
  • the method for isolating iPS cells include a method of physically isolating with a cell scraper or the like, a dissociation solution having protease activity, a dissociation solution having collagenase activity, or a dissociation solution having protease activity and collagenase activity (for example,).
  • An isolation method using Accutase (registered trademark), Accumax (registered trademark), etc.) can be mentioned.
  • the iPS cells are preferably 1 ⁇ 10 3 to 1 ⁇ 10 4 cells / cm 2 , 1 ⁇ 10 4 to 1 ⁇ 10 5 cells / cm 2 or 1 ⁇ 10 5 to 1 ⁇ 10.
  • the number of passages may be any number as long as the required amount of iPS cells is obtained, preferably 1 to 5 times or 5 to 10 times.
  • the produced iPS cells consist of a large number of iPS cell clones.
  • the colony pickup method is not particularly limited, but a method using a pipette man under a microscope, a limiting dilution method, a method using a fully automated colony picker, and the like are used.
  • the obtained iPS cell clone may form a master cell bank after expansion culture.
  • the "master cell bank" composed of the iPS cell clones is a single pool of iPS cell clones that is dispensed and accumulated in an independent cell storage container.
  • cryopreserve iPS cell clones In the master cell bank, it is preferable to cryopreserve iPS cell clones. Methods of cryopreserving cells are well known to those of skill in the art. For example, cultured iPS cell clones are collected, washed with a buffer or culture medium, the number of cells is counted, concentrated by centrifugation or the like, and suspended in a frozen medium (for example, a culture medium containing 10% DMSO). After turbidity, it can be cryopreserved at low temperature.
  • the master cell bank of the present invention can be stored in any facility or storage that can be cryopreserved. In the case of cryopreservation, the storage temperature is not particularly limited as long as it is a temperature suitable for storing cells. For example, ⁇ 20 ° C., ⁇ 80 ° C. and ⁇ 120 to -196 ° C. are mentioned, but ⁇ 150 ° C. or lower is preferable.
  • “Differentiation efficiency” refers to the hematopoietic stem cells, immature T cells, and mature T cells in all surviving cells at each stage of differentiation from iPS cells to hematopoietic stem cells, from hematopoietic stem cells to immature T cells, and from immature T cells to mature T cells, respectively. Refers to the abundance ratio. Identification of differentiated cells at each stage of differentiation can be performed by FACS analysis of surface markers. The efficiency of differentiation into hematopoietic stem cells is the proportion of CD34 / CD43 double positive cells in all viable cells, and the efficiency of differentiation into immature T cells is the proportion of CD4 / CD8 double positive cells or CD5 positive cells in all viable cells. Also, the efficiency of differentiation into mature T cells is shown as the proportion of cells in all surviving cells in which all of the CD8 ⁇ , CD8 ⁇ , TCR ⁇ and TCR ⁇ chains are positive.
  • “High differentiation efficiency” or “good / good differentiation efficiency” means that the proportion of CD34 / CD43 double positive cells, which are hematopoietic stem cells, is 5 to 15% or more in the differentiation of iPS cells into hematopoietic stem cells. It means that the ratio of CD4 / CD8 double positive cells or CD5 positive cells, which are immature T cells, is 10% or more or 50% or more, respectively, in the differentiation of hematopoietic stem cells into immature T cells; In the differentiation from immature T cells to mature T cells, it means that the proportion of cells in which all of the CD8 ⁇ chain, CD8 ⁇ chain, TCR ⁇ chain and TCR ⁇ chain are positive is 50% or more.
  • the regenerated T cells of the present invention preferably first differentiate the iPS cell clone into hematopoietic stem cells, then differentiate the hematopoietic stem cells into immature T cells, and finally the immature T cells into CD8 single positive T cells. It is produced by differentiating into mature T cells.
  • the "hematopoietic stem cell” is a cell capable of differentiating into blood cell lineage cells such as lymphocytes, eosinophils, neutrophils, basophils, erythrocytes and megakaryocytes. It should be noted that hematopoietic stem cells and hematopoietic progenitor cells (HPC) are not distinguished and refer to the same cells unless otherwise specified. Hematopoietic stem cells / progenitor cells are recognized, for example, by the fact that the surface antigens CD34 and CD43 are double positive.
  • the "immature T cell” is a T cell that expresses TCR ⁇ chain and ⁇ chain from the stage of T cell in which both TCR ⁇ chain and ⁇ chain are not expressed, and CD8 single via CD4 / CD8 double positive cell. Refers to T cells at each stage up to positive cells.
  • the immature T cells are preferably CD8 ⁇ chain / ⁇ chain double positive.
  • the "mature T cell” refers to a T cell that expresses a TCR ⁇ chain and a ⁇ chain and reaches a CD8 single positive cell via a CD4 / CD8 double positive cell.
  • CD8 ⁇ chain / ⁇ chain double positive is preferable.
  • Hematopoietic stem cells are preferably produced by culturing iPS cells in a culture medium supplemented with vitamin Cs.
  • vitamin Cs refers to L-ascorbic acid and its derivatives
  • L-ascorbic acid derivatives means those that are converted to vitamin C by an enzymatic reaction in the living body.
  • L-ascorbic acid includes, for example, vitamin C phosphate, ascorbic acid glucoside, ascorbic ethyl, vitamin C ester, ascorbic tetrahexyldecanoate, ascorbic stearate and ascorbic acid-2 phosphate-6 palmitic acid.
  • the derivative of L-ascorbic acid is preferably vitamin C phosphate, and examples thereof include phosphate-L ascorbate such as sodium phosphate-L ascorbate or magnesium phosphate-L-ascorbate.
  • Vitamin Cs are contained, for example, in a culture solution at a concentration of 5 to 500 ⁇ g / mL.
  • the culture medium used for producing hematopoietic stem cells is not particularly limited, but can be prepared by using the culture medium used for culturing animal cells as the basal culture medium and adding vitamin C or the like to it.
  • the basal culture medium include Isove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM) culture medium, Medium 199 culture medium, Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM) culture medium, ⁇ MEM culture medium, Dulbecco's modified Eagle's Medium (DMEM) culture medium, and H12 culture medium.
  • IMDM Isove's Modified Dulbecco's Medium
  • EMEM Eagle's Minimum Essential Medium
  • DMEM Dulbecco's modified Eagle's Medium
  • H12 culture medium H12 culture medium.
  • Examples include broth, RPMI 1640 broth, Fischer's broth, Neurobasal Medium (Life Technologies), StemPro34 (Life Technologies) and mixed broths thereof.
  • the culture broth may contain serum or may be serum-free.
  • the basal culture medium may be, for example, albumin, insulin, transferase, selenium, fatty acids, trace elements, 2-mercaptoethanol, thiolglycerol, monothiolglycerol, lipids, amino acids, L-glutamine, non-essential amino acids, vitamins. , Growth factors, low molecular weight compounds, antibiotics, antioxidants, pyruvate, buffers, inorganic salts, cytokines and the like.
  • the culture medium used for the production of hematopoietic stem cells includes BMP4 (Bonemorphogenetic protein 4), VEGF (vascular endothelial growth factor), bFGF (basic fibroblast growth factor), SCF (stem cell factor), TPO (thrombopoietin), and FLT3L (FLT3L).
  • Cytokines selected from the group consisting of Flt3 ligand) may be further added. These concentrations are, for example, 1-100 ng / mL for BMP4, 1-100 ng / mL for VEGF, 1-100 ng / mL for bFGF, and 10-100 ng / mL for SCF.
  • TPO is 1 to 100 ng / mL
  • FLT3L is 1 to 100 ng / mL.
  • TGF ⁇ inhibitors are small molecule inhibitors that interfere with TGF ⁇ family signal transduction, such as SB431542 and SB202190 (R.K.Lindemann et al., Mol. Cancer 2: 20 (2003)), SB505124 (GlaxoSmithKline). , NPC30345, SD093, SD908 and SD208 (Scios), and LY2109761, LY364947 and LY580276 (Lilly Research Laboratories), and the concentration added to the culture solution is preferably 0.5 to 100 ⁇ M.
  • iPS cells are C3H10T1 / 2 (Takayama N., et al. J Exp Med. 2817-2830, 2010) or heterologous stromal cells (Niwa A et al. J Ce11 Physiol. 2009 Nov; 221 (2): It may be co-cultured with feeder cells such as 367-77).
  • the method for culturing iPS cells at the time of producing hematopoietic stem cells may be adhesive culture or suspension culture, but suspension culture is preferable.
  • iPS cells can be subjected to suspension culture after releasing colonies cultured to 80% confluence with respect to the dish used, dissociating them into single cells.
  • a method for isolating iPS cells for example, a method of physically isolating with a cell scraper or the like, a dissociation solution having protease activity and collagenase activity (for example, Accutase® and Accumax®), or An isolation method using a dissociation solution having collagenase activity can be mentioned.
  • Floating culture is to culture cells in a non-adherent state to the culture vessel.
  • the suspension culture is not particularly limited, but is a culture vessel that has not been artificially treated (for example, a coating treatment with an extracellular matrix or the like) for the purpose of improving adhesion to cells, or artificially suppresses adhesion. It can be carried out using a culture vessel which has been treated (for example, coated with polyhydroxyethyl methacrylate (po1y-HEMA) or a nonionic surfactant (Pluronic F-127, etc.)).
  • po1y-HEMA polyhydroxyethyl methacrylate
  • Pluronic F-127 nonionic surfactant
  • Hematopoietic stem cells can also be prepared from cyst-like structures (also referred to as iPS-sac) obtained by culturing iPS cells.
  • cyst-like structure also referred to as iPS-sac
  • the "cyst-like structure” is a three-dimensional sac-like (with space inside) structure derived from iPS cells, which is formed by an endothelial cell population or the like and contains hematopoietic stem cells inside. be.
  • the temperature conditions for culturing to produce hematopoietic stem cells from iPS cells are not particularly limited, but are, for example, about 37 ° C to about 42 ° C, preferably about 37 ° C to about 39 ° C. Further, the culture period can be appropriately determined by those skilled in the art while monitoring the number of hematopoietic stem cells and the like.
  • the number of culture days is not particularly limited as long as hematopoietic stem cells can be obtained, but for example, at least 6 days or more, 7 days or more, 8 days or more, 9 days or more, 10 days or more, 11 days or more, 12 days or more, 13 days or more, Or 14 days or more, preferably 14 days.
  • the long culture period is not a problem in the production of hematopoietic stem cells.
  • the cells may be cultured under low oxygen conditions, and in one embodiment of the present invention, the low oxygen conditions include, for example, 15%, 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5% or less. Oxygen concentration is mentioned.
  • CD4 / CD8 double positive T cells are T cells that are both positive for surface antigens CD4 and CD8 (CD8 + CD4 + ), and T cells are positive for surface antigens CD3 and CD45.
  • CD4 / CD8 double positive T cells can be identified as cells positive for CD4, CD8, CD3 and CD45.
  • CD4 / CD8 double positive T cells can be induced to differentiate into CD4 single positive cells or CD8 single positive cells.
  • CD4 / CD8 double positive T cells can be produced by a method comprising culturing hematopoietic stem cells in a culture medium supplemented with a p38 inhibitor and / or SDF-1.
  • P38 inhibitor is defined as a substance that inhibits the function of p38 protein (p38MAP kinase).
  • p38 inhibitors include, but are not limited to, chemical inhibitors of p38, dominant negative variants of p38, or nucleic acids encoding them.
  • Chemical inhibitors of p38 include SB203580 (4- (4-fluorophenyl) -2- (4-methylsulfonylphenyl) -5- (4-pyridyl) -1H-imidazole) and its derivatives, SB202190 (4-).
  • the p38 inhibitor is added to the culture medium, for example, in the range of about 1 ⁇ M to about 50 ⁇ M.
  • Dominant negative variants of p38 include p38T180A, which is a point mutation of threonine at position 180 located in the DNA binding region of p38 to alanine, and p38Y182F, which is a point mutation of tyrosine at position 182 of p38 to phenylalanine in humans and mice. Can be mentioned.
  • SDF-1 (Stromal cell-derived factor 1) is not only SDF-1 ⁇ or its mature form, but also isoforms such as SDF-1 ⁇ , SDF-1 ⁇ , SDF-1 ⁇ , SDF-1 ⁇ or SDF-1 ⁇ , or them. It may be a mature form of the above, or it may be a mixture of any proportions thereof and the like. Preferably SDF-1 ⁇ is used. SDF-1 may also be referred to as CXCL-12 or PBSF.
  • SDF-1 may be substituted, deleted and / or added with one or several amino acids in its amino acid sequence as long as it has activity as a chemokine, and similarly, sugar chains may be substituted or deleted. And / or may be added.
  • SDF-1 may be of a mammal, eg, a non-human mammal such as a monkey, sheep, cow, horse, pig, dog, cat, rabbit, rat, or mouse.
  • GenBank registration number: NP_954637 can be used as human SDF-1 ⁇
  • a protein registered with GenBank registration number: NP_000600 can be used as SDF-1 ⁇ .
  • SDF-1 a commercially available product may be used, a product purified from nature may be used, or a product manufactured by peptide synthesis or a genetic engineering method may be used. SDF-1 is added to the culture medium, for example, in the range of about 10 ng / mL to about 100 ng / mL.
  • the culture medium used for producing the CD4 / CD8 double positive T cells is not particularly limited, but the culture medium used for culturing animal cells is used as the basal culture medium, and p38 inhibitor and / or SDF-1 is more preferable. It can be prepared by adding vitamin Cs.
  • the types of vitamin C used in the production of CD4 / CD8 double positive T cells are as described above, for example, and the concentration of vitamin C is, for example, 5 to 200 ⁇ g / mL.
  • basal culture medium examples include Isove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM) culture medium, Medium 199 culture medium, Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM) culture medium, ⁇ MEM culture medium, Dulbecco's modified Eagle's Medium (DMEM) culture medium, and Ham. , RPMI 1640 culture medium, Fischer's Neurobasal Medium culture solution (Life Technologies), and a mixed culture solution thereof. Serum may be added to the culture broth, or serum-free.
  • IMDM Isove's Modified Dulbecco's Medium
  • EMEM Eagle's Minimum Essential Medium
  • DMEM Dulbecco's modified Eagle's Medium
  • Ham Ham.
  • RPMI 1640 culture medium Fischer's Neurobasal Medium culture solution (Life Technologies), and a mixed culture solution thereof. Serum may be added to the culture broth, or serum-free.
  • basal culture solutions include, for example, albumin, insulin, transferase, selenium, fatty acids, trace elements, 2-mercaptoethanol, thiolglycerols, lipids, amino acids, L-glutamine, non-essential amino acids, vitamins, growth factors. , Low molecular weight compounds, antibiotics, antioxidants, pyruvate, buffers, inorganic salts, and one or more substances selected from cytokines and the like.
  • Cytokines selected from the group consisting of SCF, TPO (thrombopoietin), FLT3L and IL-7 may be further added to the culture medium used for producing CD4 / CD8 double positive T cells. These concentrations are, for example, 10-100 ng / mL for SCF, 1O-200 ng / mL for TPO, 1-100 ng / mL for FLT3L, and 1-100 ng / mL for IL-7. Is.
  • Hematopoietic stem cells may be adherently cultured or suspension-cultured, but adherent culture is preferable.
  • the culture vessel may be coated and used.
  • Matrigel Niwa A, et al. PLoS One. 6 (7): e22261, 2011
  • collagen gelatin
  • laminin heparan sulfate proteoglycan
  • retronectin Fc-DLL4 or entactin
  • the culture temperature conditions for culturing hematopoietic stem cells for producing CD4 / CD8 double positive T cells are not particularly limited, but are preferably about 37 ° C to about 42 ° C, preferably about 37 ° C to about 39 ° C, for example. Is more preferable. Further, the culture period can be appropriately determined by those skilled in the art while monitoring the number of CD4 / CD8 double positive T cells and the like. As long as CD4 / CD8 double positive T cells can be obtained, the number of culture days is not particularly limited, but for example, at least 10 days or more, 12 days or more, 14 days or more, 16 days or more, 18 days or more, 20 days or more, 22 days or more. , Or 23 days or more, preferably 23 days.
  • the obtained CD4 / CD8 double positive T cells may be isolated and used, or may be used as a cell population containing other cell types.
  • isolation methods well known to those of skill in the art can be used. For example, a method of labeling with an antibody against CD4, CD8, CD3 and / or CD45 and isolation using a flow cytometer, or a method of purification using an affinity column on which a desired antigen is immobilized can be mentioned.
  • CD8 single positive T cells that is, mature T cells, are cells (CD8 + CD4- ) positive for the surface antigen CD8 among T cells, and are also called cytotoxic T cells. Since T cells can be recognized by being positive for the surface antigens CD3 and CD45, CD8 single positive T cells can be identified as cells positive for CD8, CD3 and CD45 and negative for CD4. ..
  • CD8 single positive T cells can be produced by a method including a step of culturing CD4 / CD8 double positive T cells in a culture medium supplemented with a corticohormonal agent.
  • the corticosteroid agent is preferably a glucocorticoid or a derivative thereof, and examples thereof include cortisone acetate, hydrocortisone, fludrocortisone acetate, prednisolone, triamcinolone, methylprednisolone, dexamethasone, betamethasone, or beclomethasone propionate.
  • the corticosteroid agent is dexamethasone. Its concentration in the culture medium is, for example, 1 to 100 nM.
  • the culture medium used for producing CD8 single positive T cells is not particularly limited, but can be prepared by using the culture medium used for culturing animal cells as the basal culture medium and adding an corticohormonal agent to it.
  • the basal culture medium include Isove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM) culture medium, Medium 199 culture medium, Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM) culture medium, ⁇ MEM culture medium, Dulbecco's modified Eagle's Medium (DMEM) culture medium, and H12 culture medium.
  • IMDM Isove's Modified Dulbecco's Medium
  • EMEM Eagle's Minimum Essential Medium
  • DMEM Dulbecco's modified Eagle's Medium
  • H12 culture medium examples thereof include a solution, RPMI 1640 culture solution, Fischer's Neurobasal Medium culture solution (Life Technologies), and a mixed culture solution thereof.
  • Serum may be added to the culture broth, or serum-free.
  • the basal culture medium may be, for example, albumin, insulin, transferase, selenium, fatty acid, trace elements, 2-mercaptoethanol, thiolglycerol, monothiolglycerol, lipid, amino acid, L-glutamine, non-essential amino acids, It may also contain one or more substances selected from vitamins, growth factors, low molecular weight compounds, antibiotics, antioxidants, pyruvate, buffers, inorganic salts, cytokines and the like.
  • the culture medium used for producing CD8 single positive T cells preferably further contains anti-CD3 antibodies, vitamin Cs, or cytokines.
  • cytokine examples include IL-2, IL-7, IL-15, IL-21 and the like.
  • the anti-CD3 antibody is not particularly limited as long as it is an antibody that specifically recognizes CD3, and examples thereof include an antibody produced from an OKT3 clone.
  • the concentration of the anti-CD3 antibody in the culture medium is, for example, 10 to 1000 ng / mL.
  • the vitamin Cs used for producing CD8 single positive T cells are, for example, those described above, and can be used under the same conditions as described above.
  • the concentration of cytokines used for the production of CD8 single positive T cells in the culture medium is, for example, 10 to 1000 U / mL for IL-2 and 1 to 100 ng / mL for IL-7.
  • the temperature conditions for culturing CD4 / CD8 double positive T cells for producing CD8 single positive T cells are not particularly limited, but are preferably about 37 ° C to about 42 ° C, preferably about 37 ° C to about 38 ° C, for example. About ° C is more preferable.
  • the culture period can be appropriately determined by those skilled in the art while monitoring the number of CD8 single positive T cells and the like. As long as CD8 single positive T cells can be obtained, the number of culture days is not particularly limited, but is, for example, at least 1 day or more, 2 days or more, 3 days or more, 4 days or more, or 5 days or more, preferably 3 days. ..
  • the cDNA encoding the TCR ⁇ chain and the ⁇ chain for each single cell.
  • the T cells collected from the subjects are a population of T cells with genetic diversity as a whole, but were identified as CD106-positive T cells without determining the antigen or peptide sequence recognized by the TCR of each individual T cell.
  • the antigen specificity of individual T cells is different. It is preferable to prepare the cDNA for each single cell in order to select the TCR that is optimal for each tumor-related antigen, that is, highly responsive to each tumor-related antigen.
  • a T cell population that responds to a tumor-related antigen may be isolated as a single cell by a cell sorter or the like using CD106 as a marker.
  • cell surface CD137 may be used as a marker for isolating cells.
  • Known techniques for isolating human T cells include, for example, flow cytometry using antibodies against T cell surface markers such as CD106, CD3 and CD137 and cell sorters.
  • Gene cloning can be performed from the obtained single T cells using the PCR method to amplify the cDNAs encoding the TCR ⁇ chain and ⁇ chain, respectively.
  • PCR fragments amplified using the isolated TCR cDNA as a template can be incorporated into viral or non-viral vectors using, for example, the Gibson assembly system.
  • a gene in which an isolated TCR ⁇ chain gene and a TCR ⁇ chain gene are linked via a T2A sequence is bound to the downstream of the ubiquitin promoter, and further downstream to the IRES (internal ribosome entry site) sequence.
  • a marker gene such as EGFR (EGFRt, truncated EGFR) excluding the ligand binding site and the intracellular domain or CD19 lacking the intracellular domain is ligated, and this construct is integrated into a viral vector or a non-viral vector.
  • a viral vector and a non-viral vector can be used, but a non-viral vector is preferable.
  • a transposon vector is preferable, and a piggyBac® transposon vector is further preferable.
  • the transposon method is a next-generation gene transfer method that is cheaper and safer than the conventional viral vector method.
  • a method for introducing a cDNA pair encoding a TCR ⁇ chain and a ⁇ chain into the mature T cell differentiated from a T cell a method using a viral vector, a method using a non-viral vector, or replacement of TCR using a genome editing technique is used. Any of these can be adopted.
  • virus vector examples include viral vectors such as lentivirus, retrovirus, adenovirus, adeno-associated virus, herpes virus and Sendai virus, and animal cell expression plasmids, with retrovirus or lentivirus being preferred.
  • viral vectors such as lentivirus, retrovirus, adenovirus, adeno-associated virus, herpes virus and Sendai virus, and animal cell expression plasmids, with retrovirus or lentivirus being preferred.
  • a spin infection method or the like When a non-viral vector is used, the transposon method is preferable.
  • the CRISPR / Cas9 method, the CRISPR / MAD method and the CRISPR / CAS3 method may be used to replace the TCR using the genome editing technique.
  • Examples of the method for introducing a gene of a non-viral vector or the method for introducing a guide RNA and donor DNA for genome editing include a lipofection method, a liposome method, a calcium phosphate co-precipitation method, a DEAE dextran method, a microinjection method and an electroporation method. .. PCR products can also be introduced directly into cells without the use of vectors. It is preferable to use an electroporation method for cell transfer of a transposon vector or PCR product. As the electroporation device, the gene transfer device ExPERT® system (MaxCyte) is preferable.
  • Genome editing techniques such as CRISPR / Cas9 and TALEN may be used as a method for introducing cDNA pairs encoding the TCR ⁇ chain and ⁇ chain, respectively.
  • the introduction of the TCR gene by CRISPR / Cas9 is, for example, homologous to an endogenous TCR ⁇ chain and a guide RNA designed in the gene for the ⁇ chain (guide RNA to the sense strand and guide RNA to the antisense strand), as well as the endogenous TCR ⁇ strand.
  • the promoter used in the expression vector used when introducing the cDNA pair into the cell examples include EF1 ⁇ promoter, SR ⁇ promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, RSV promoter, HSV-TK promoter, ubiquitin promoter and the like. Can be mentioned. These promoters may be capable of controlling the expression of the gene inserted downstream of the promoter depending on the presence or absence of a drug such as tetracycline.
  • the expression vector can include an enhancer, a poly A addition signal, a selectable marker gene (for example, a neomycin resistance gene), an SV40 origin of replication, and the like.
  • the iPS cell clone into which the cDNA pair has been introduced, the hematopoietic stem cell differentiated from the iPS cell clone, the immature T cell differentiated from the hematopoietic stem cell, or the mature T cell differentiated from the immature T cell is the above-mentioned culture medium.
  • culture conditions such as culture solution composition and culture temperature, regenerated T cells expressing TCR consisting of ⁇ -chain and ⁇ -chain encoded by the cDNA pair can be obtained.
  • feeder cells are preferably autologous or allogeneic peripheral blood mononuclear cells.
  • Autologous means that the subject from which the peripheral blood mononuclear cells and the iPS cell clone are derived is the same, and “allogeneic” means that the peripheral blood mononuclear cells and the iPS cell clone are derived from. It means that the subjects who do this are different.
  • the iPS cell into which the cDNA pair has been introduced, the hematopoietic stem cell, the immature T cell, or the mature T cell may be cloned.
  • a colony pickup method for cloning it is preferable to perform a colony pickup method for cloning.
  • the colony pickup method is not particularly limited, and examples thereof include a method using a pipette man under a microscope, a limiting dilution method, and a method using a fully automated colony picker.
  • TCRV ⁇ analysis kit BECKMAN COULTER: Catalog No. IM-3497. Since marker genes such as EGFRt (truncated EGFR) and CD19t (truncated CD19) are incorporated into the vector, the expression of TCR ⁇ chain and ⁇ chain can be inferred by analyzing the expression of the marker gene.
  • the iPS cell clone, the hematopoietic stem cell, the immature T cell or the mature T cell may form a master cell bank after expansion culture.
  • master cell bank means that the iPS cell clone, the hematopoietic stem cell, the immature T cell or the mature T cell is dispensed into a separate cell storage container for each single pool of a single clone. It is an accumulation. Usually, it is preferable to proliferate the cells within a range that does not change the properties of the cells and dispense them into a plurality of cell storage containers.
  • the cells stored in the master cell bank are cells into which a TCR gene or CAR (chimeric antigen receptor) gene is introduced and used as a starting material for producing regenerated T cells, and are mastered for each production of the regenerated T cells.
  • a cell storage container containing the required number of the cells can be taken out from the cell bank. Therefore, the regenerated T cells of the present invention can be repeatedly supplied with the same quality.
  • a master cell bank it is preferable to cryopreserve the cells dispensed into the cell storage container.
  • Methods of cryopreserving cells are well known to those of skill in the art. For example, a single clone of expanded-cultured cells is collected, washed with a buffer or culture medium, the number of cells is counted, concentrated by centrifugation or the like, and frozen medium (for example, a culture medium containing 10% DMSO). After suspending in, it can be cryopreserved at low temperature.
  • a master cell bank can be constructed by accumulating 200 to 1000 cell storage containers containing 1 ⁇ 10 6 to 10 7 cells per cell in a cell storage container stocker or the like.
  • the master cell bank of the present invention can be stored in any facility or storage that can be cryopreserved.
  • the storage temperature is not particularly limited as long as it is a temperature suitable for storing cells.
  • ⁇ 20 ° C., ⁇ 80 ° C. and ⁇ 120 to -196 ° C. are mentioned, but ⁇ 150 ° C. or lower is preferable.
  • the number of TCR pairs corresponding to tumor-related antigens is said to be 5 to 10 per epitope, and each TCR pair is predicted to have different susceptibility to point mutant variants of tumor-related antigens. There is. Therefore, for example, even when a point mutation occurs in a tumor-related antigen, there is a high possibility that there is a TCR capable of recognizing the epitope, and preparation of antigen-specific regenerated T cells for the point mutation variant is also possible. Can be done quickly.
  • TCRs that respond to those tumor-related antigens can be started from already acquired iPS cells having high differentiation potential into T cells or differentiated cells derived from iPS cells, it is possible to rapidly produce regenerated T cells. Is possible.
  • T cells from the TCR acquisition source The T cells that are the source of the TCR pair corresponding to the tumor-related antigen are preferably collected from the tumor tissue.
  • the collected T cells may be isolated using CD106 as a marker after amplifying a tumor-responsive cell population by co-culture with tumor tissue in vitro.
  • T cells for obtaining a TCR pair can be collected in advance at any time independently of the treatment time of the regenerated T cell replacement therapy, the regenerated T cell replacement therapy can be started promptly. ..
  • the obtained TCR pair is the subject to be treated. It is necessary to confirm that it does not show an allo reaction to cells.
  • the method of confirmation is a known method. For example, it can be confirmed by mixed lymphocyte culture (MLR) or the like that the obtained T cells having the TCR pair do not respond to the cells of the subject to be treated. Alternatively, it is confirmed that the T cells having the obtained TCR pair do not respond to the antigen in which one or more residues of the constituent amino acids of the antigen are replaced with other amino acids.
  • MLR mixed lymphocyte culture
  • the pharmaceutical composition containing the regenerated T cells of the present invention can be used for treating a cancer treatment target.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be produced by a method commonly used in the field of pharmaceutical technology, for example, the method described in the Japanese Pharmacopoeia.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain a pharmaceutically acceptable additive. Examples of the additive include a cell culture solution, a physiological saline solution, an appropriate buffer solution (for example, a phosphoric acid-based buffer solution), and the like.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be produced by suspending regenerated T cells in physiological saline, an appropriate buffer solution (for example, a phosphate-based buffer solution), or the like. It is preferable to contain, for example, 1 ⁇ 10 7 or more cells as a single dose so that the desired therapeutic effect is exhibited. A more preferable cell content is 1 ⁇ 10 8 or more, and even more preferably 1 ⁇ 10 9 or more. The cell content can be appropriately adjusted in consideration of the sex, age, body weight, condition of the affected area, cell condition, etc. of the administration subject.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may contain dimethyl sulfoxide (DMSO), serum albumin and the like for the purpose of protecting the cells.
  • DMSO dimethyl sulfoxide
  • antibiotics and the like may be contained, and vitamins and cytokines may be contained for the purpose of promoting cell activation and differentiation.
  • the pharmaceutical composition of the present invention contains other components (eg, carriers, excipients, disintegrants, buffers, emulsifiers, suspensions, soothing agents, stabilizers, preservatives, preservatives) that are acceptable for the formulation. , Physiological saline, etc.) may be contained.
  • the pharmaceutical composition containing the regenerated T cells of the present invention as an active ingredient can be cryopreserved.
  • the storage temperature is not particularly limited as long as it is a temperature suitable for storing cells.
  • ⁇ 20 ° C., ⁇ 80 ° C. and ⁇ 120 to -196 ° C. are mentioned, but ⁇ 150 ° C. or lower is preferable.
  • cells are preferably stored in suitable containers such as freezing vials and freezing bags. Procedures for minimizing the risk of cell damage during freezing and thawing of regenerated T cells are well known to those of skill in the art.
  • the T cells are recovered from the culture medium, washed with a buffer solution or a culture solution, the number of cells is counted, and then concentrated by centrifugation or the like to be concentrated in a frozen medium (for example, for example). After suspending in a culture medium containing 10% DMSO), it is cryopreserved at low temperature.
  • Regenerated T cells may be stored as individual clones or as a mixture of each clone.
  • the pharmaceutical composition containing the regenerated T cells of the present invention contains, for example, 5 ⁇ 10 4 to 9 ⁇ 10 10 regenerated T cells per container such as a freezing vial and a freezing bag, but for the cancer of interest. It can be changed according to the type, administration target, administration route, and the like.
  • Examples of the route of administration of the pharmaceutical composition containing the regenerated T cells of the present invention include infusion, intratumoral injection, intraarterial injection, portal vein injection, intraperitoneal administration and the like.
  • the route of administration is not limited to these as long as the regenerated T cells, which are the active ingredients in the pharmaceutical composition of the present invention, are delivered to the affected area.
  • the administration schedule may be a single dose or multiple doses. As the period of the multiple administration, for example, a method of repeating the administration once every 2 to 4 weeks, a method of repeating the administration once every 6 months to 1 year, and the like can be adopted.
  • the gender, age, body weight, pathological condition, etc. of the target patient can be taken into consideration.
  • the pharmaceutical composition containing the regenerated T cells of the present invention is used for the prevention or treatment of cancer in a cancer patient, if the TCR on the regenerated T cells is allogeneic, the allo in the body of the cancer patient.
  • a pharmaceutical composition containing regenerated T cells introduced with TCR that does not show an allo reaction to normal cells of a cancer patient is used.
  • the pharmaceutical composition of the present invention is used for the prevention or treatment of cancer.
  • Cancers include hepatocellular carcinoma, hepatoblastoma, gastric cancer, esophageal cancer, lung cancer, pancreatic cancer, renal cell carcinoma, breast cancer, ovarian cancer, skin cancer such as malignant melanoma, bladder cancer, Head and neck cancer, uterine cancer, cervical cancer, glioblastoma, prostate cancer, neuroblast tumor, chronic lymphocytic leukemia, papillary thyroid cancer, colon cancer, brain tumor, sarcoma and B-cell non-hodgkin lymphoma
  • cancers include hepatocellular carcinoma, hepatoblastoma, gastric cancer, esophageal cancer, lung cancer, pancreatic cancer, renal cell carcinoma, breast cancer, ovarian cancer, skin cancer such as malignant melanoma, bladder cancer, Head and neck cancer, uterine cancer, cervical cancer, glioblastoma, prostate cancer, neuroblast tumor, chronic lympho
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be suitably used for highly immunogenic cancers such as hepatocellular carcinoma, hepatoblastoma, colon cancer, lung cancer and malignant melanoma.
  • Highly immunogenic cancer is a cancer that has a high ability to induce an immune response, and many gene mutations are found in cancer cells (1000 or more per cell or 5000 or more), including T cells. It refers to cancer that is recognized by the immune cells, the immune checkpoint inhibitor is effective, and the tumor tissue is heavily infiltrated with many immune cells (many immune cells are found by histopathological staining).
  • FIG. 1 shows a manufacturing process of regenerated T cells of the present invention.
  • Mononuclear cells in the tumor tissue of a cancer patient (subject) being treated are collected, T cells that specifically react with the tumor antigen are isolated as CD106-positive T cells, and the TCR gene is isolated from the CD106-positive T cells.
  • Fig. 1- (2') A TCR gene that is expected to have a higher therapeutic effect than the TCR binding ability encoded by the TCR gene to a tumor was selected (FIG. 1- (3')).
  • TCR repertoire TCR repertoire
  • iPS cells were produced from non-T non-B cells or monocytes in the peripheral blood of the patient (FIGS. 1- (1) and (2)).
  • iPS cell clones having good differentiation efficiency from the obtained iPS cells to T cells were selected (Fig. 1- (3)). By this selection, it was confirmed that the variation in the induction efficiency to T cells due to the difference in iPS cell clones was remarkably reduced, and the robustness and efficiency of the production of regenerated T cells were improved.
  • the above-mentioned selected TCR gene group that reacts specifically with a tumor antigen is expressed in the iPS cell clone having good differentiation efficiency into T cells (Fig. 1- (4)), and each selected TCR gene is expressed. Differentiated and proliferated into mature T cells (Fig. 1- (5)).
  • the mature T cells are tumor antigen-specific cytotoxic T cells and are regenerated T cells. These regenerated T cells are administered to cancer patients (Fig. 1- (6)).
  • a step of producing iPS cells (FIGS. 1- (1) to (3)) and a step of acquiring a TCR gene that reacts with a tumor antigen (FIGS. 1- (2') and (3')). Since these steps can be performed in parallel, these steps can be completed in a shorter period (about 55 days) as compared with the case where these steps are sequentially performed.
  • Tumor antigen-specific TCR genes were isolated and antigen-specific reactivity was verified as follows (see the upper partial diagram of FIG. 2). After co-culturing a tumor (specimen) isolated from a cancer patient (subject) with CD8-positive cytotoxic T cells, CD106-positive cytotoxic T cells activated by a cell sorter (CD8-positive) And CD106-positive cells) were single-cell sorted (Fig. 2- (2)). TCR gene pairs (TCR ⁇ chain gene and TCR ⁇ chain gene) are isolated from isolated single cells by single cell PCR, sequence analysis is performed on the isolated TCR gene pairs, and tumor-reactive T cell types (TCR). Repatoa) and its frequency of appearance were analyzed (Fig. 2- (3)).
  • the isolated TCR gene pair was expressed in a TCR gene-deficient T cell line incorporating a reporter gene to reconstruct the TCR gene complex (Fig. 2- (4)). Subsequently, the reactivity (antigen-specific reactivity) between the reconstructed TCR gene complex and the tumor was verified (Fig. 2- (5)). That is, the T cell line expressing the TCR gene pair and the target tumor cell are co-cultured, but when the expressed TCR and the tumor are antigen-specifically bound, the TCR gene signal is activated and targeted. A reporter gene integrated downstream of the gene promoter is expressed. Then, the reporter gene activity was measured, and the antigen-specific reactivity was verified by evaluating the binding of the tumor antigen-specific TCR.
  • TCR gene pairs showing tumor-specific reactivity are selected with high frequency of appearance, and non-T non-B cells or monocyte-derived iPS cells (M-iPS) described later are selected. It was used as a transgene to cells).
  • TCR gene-introduced iPS cells and regenerated T cells was performed as follows (see the lower partial view of FIG. 2).
  • IPS cells were prepared from peripheral blood mononuclear cells of cancer patients (Fig. 2- (2')).
  • the M-iPS cells described in the figure are iPS cells that are not derived from T cells, and are cells that have not undergone gene rearrangement of the TCR gene.
  • M-iPS cell lines having good differentiation efficiency into T cells were selected (FIG. 2- (3')).
  • a tumor-specific TCR gene (both TCR ⁇ chain gene and TCR ⁇ chain gene, see FIG. 2- (3)) was introduced into the selected M-iPS cell line using a transposon vector (FIG. 2).
  • TCR-iPS cell line was selected.
  • hematopoietic stem progenitor cells were induced using the embryoid body method, and differentiation was induced into mature T cells via immature T cells by a stepwise differentiation induction method that mimics T cell development in vivo. ..
  • FIG. 4 shows the analysis results of the regenerated T cells using the cell surface antigen marker by the flow cytometer.
  • the expression of CD45 + TCR ⁇ + CD3 + CD4 - CD8 ⁇ + which is observed in mature cytotoxic T cells in vivo, was confirmed in the regenerated T cells derived from iPS cells.
  • FIG. 5 shows the results of analysis of telomeres (index of rejuvenation), which is a cell senescence marker, for regenerated T cells mediated by iPS cells of the present invention.
  • telomeres index of rejuvenation
  • A peripheral blood mononuclear cells
  • B tumor antigen-specific T cells
  • C iPS cells
  • D tumor antigen-specific regenerated T cells
  • regenerated T cells mediated by iPS cells of the present invention For regenerated T cells mediated by iPS cells of the present invention, the expression of PD-1 and TIGIT molecules, which are one of the cell exhaustion markers related to immune checkpoints, was stained with anti-TIGIT antibody and anti-PD-1 antibody, and flow cytometer was used. was analyzed by. For comparison, pre-regeneration tumor antigen-specific T cells were also analyzed. The results are shown in FIG. It was confirmed that the regenerated T cells of the present invention had significantly reduced expression of PD-1 and TIGIT molecules as compared with the tumor antigen-specific T cells before regeneration. Therefore, it is suggested that the regenerated T cells of the present invention have high cytotoxic activity.
  • Cytotoxic T cells CD8 ⁇ chain / ⁇ chain double positive cells
  • regenerated T cells of the present invention in peripheral blood mononuclear cells collected from healthy subjects were used as PMA (Phorbol 12-Myristate 13-Acetate) and ionomycin (Ionomycin).
  • PMA Phorbol 12-Myristate 13-Acetate
  • Ionomycin ionomycin Stimulated and produced IL-2 and IFN- ⁇ amounts were compared. The results are shown in FIG. It was confirmed that the number of cells producing IL-2 and IFN ⁇ was significantly increased in the regenerated T cells of the present invention as compared with the cytotoxic T cells obtained from healthy subjects.
  • Mononuclear cells were isolated from peripheral blood collected from patients with hepatocellular carcinoma or hepatoblastoma using a mononuclear cell separation solution Lymphoprep®. From the obtained mononuclear cells, CD19 / CD20-positive B cells and CD3 / CD4 / CD8-positive T cells were removed using FACS or MACS beads to obtain non-T non-B cells or monocytes.
  • Sendai virus (CytoTune® 2.0) and SV40Tag-encoded Sendai virus (CytoTune® 2.0) carrying Yamanaka 4 factors (Oct3 / 4, Sox2, Klf4 and c-Myc) in the obtained non-T non-B cell or monocyte cell population.
  • the virus was infected with a MOI (multiplicity of infection) of 5 to 20.
  • the SV40 may be excluded.
  • the obtained iPS cells consist of a large number of iPS cell clones. Therefore, a colony pick was performed and cloned. All cloned iPS cells were cryopreserved. The cloned iPS cells were cultured in a differentiation medium for about 10 days to induce hematopoietic stem cells, and CD34 / CD43 double positive hematopoietic stem cells were isolated. The isolated hematopoietic stem cells were cultured for about 21 days on a plate coated with FcDLL4, which is a fusion protein of the DLL4 protein and the Fc region of immunoglobulin, to induce differentiation into T cells.
  • FcDLL4 is a fusion protein of the DLL4 protein and the Fc region of immunoglobulin
  • the frequency of immature cytotoxic T cells obtained after culturing for the above 21 days was verified by the CD8 ⁇ chain / ⁇ chain double positive rate, and the clone with the highest frequency of appearance of CD8 ⁇ chain / ⁇ chain double positive cells was selected.
  • iPS cell clones with good differentiation efficiency into T cells are expanded and cultured in iPS cell maintenance medium for 2 weeks, then dispensed into a cell storage container and cryopreserved to construct a master cell bank. did.
  • T cell receptor ⁇ -chain and ⁇ -chain with confirmed tumor antigen specificity for iPS cell clones derived from non-T non-B cells or monocytes with good differentiation efficiency into T cells obtained in Example 2.
  • a piggyBac® transposon vector having the gene encoding the above was introduced using the electroporation method.
  • iPS cells expressing the target T cell receptor ⁇ chain and ⁇ chain were isolated by a cell sorter using the expression of the marker molecule CD19 as an index.
  • the isolated iPS cells were cultured in a differentiation medium for about 10 days to induce CD34 / CD43 double-positive hematopoietic stem cells, and isolated by a cell sorter.
  • the isolated blood stem cells were cultured on a plate coated with FcDLL4 for about 21 days to induce differentiation into T cells.
  • Immature T cells with double positive CD8 ⁇ chain / ⁇ chain obtained after the above 21-day culture were isolated and purified using a cell sorter. Immature T cells were then co-located as PHA (phytohemagglutinin) and feeder cells in the presence of peripheral blood mononuclear cells, in the presence of Retronectin® and anti-CD3 antibody, or in the presence of anti-CD3 and anti-CD28 antibodies. It was cultured and induced into mature cytotoxic T cells. These stimuli were given more than once. The performance of the obtained T cells was confirmed by the cytotoxic activity, IFN- ⁇ production and antigen-binding ability of GPC3-specific target cells.
  • PHA phytohemagglutinin
  • Tumor tissues were obtained from surgical specimens before the start of treatment with anti-PD-1 antibody in melanoma patients for whom anti-PD-1 antibody was significantly effective. Collagenase and DNase were added to the obtained tumor tissue, and the cells were separated by enzymatic treatment by stirring at 37 ° C. for 30 minutes. From a cell mixture of tumor tissue-derived cells and tumor-infiltrating immune cells, CD3-positive cells were sorted using a BD FACSAria III® cell sorter (BD Biosciences) to obtain cells expressing TCR. rice field.
  • BD FACSAria III® cell sorter BD Biosciences
  • T cells For each of the obtained T cells, a single sequence was used for both the gene expression of the marker candidate and the TCR sequence using the Chromium system (10X Genomics) 5-prime kit and V (D) J enrichment kit. Cell gene expression analysis was performed. HiSeq3000 (Illumina) was used as the sequencer.
  • Fig. 8 The results are shown in Fig. 8.
  • cells positive for the expression of the marker described in the panel are shown colored.
  • the cells are clustered according to the expression pattern, and the circled part corresponds to the tumor-damaging T cell.
  • CD106 VCAM1 positive cells are highly specific to the tumor-damaging T cell population. It is shown that CD106 can be used as a selectable marker for tumor-damaging T cells with higher specificity than surface markers other than CD106.
  • the TCR sequence was obtained in cells having a ⁇ chain of 90% or more and cells having an ⁇ chain of 60 to 90%.
  • T cells of tumor tissue were separated, CD3-positive cells were sorted from the obtained cell mixture using BD FACSAria III, and T cells expressing TCR were designated as tumor-infiltrating T cells. Obtained.
  • the tumor-infiltrating T cells and a cell line established from an autologous tumor as a stimulant were co-cultured, and IFN- ⁇ production was compared with the case of no stimulation. IFN- ⁇ production was measured by intracellular staining with an anti-IFN- ⁇ antibody.
  • Cell staining was performed using anti-PD-1 antibody, anti-TIGIT antibody, anti-LAG3 antibody, and anti-CD106 antibody. As a negative control, an isotype control antibody against the anti-CD106 antibody was used.
  • IFN- ⁇ is produced by stimulation with the autotumor cell line, and in the marker-positive cell subpopulation other than CD106, IFN- ⁇ is produced by autotumor stimulation, but the marker. Since IFN- ⁇ is also produced in the negative cell subpopulation, it can be understood that the specificity is inferior to that of CD106.
  • TCR gene into mature T cells differentiated from iPS cell clones From the non-T non-B cell or monocyte-derived iPS cell clones obtained in Example 2 having good differentiation efficiency into T cells, to mature T cells differentiated via hematopoietic stem cells and immature T cells.
  • a gene (cDNA) encoding a GPC3 antigen-specific T cell receptor ⁇ -chain ⁇ -chain was introduced using the piggyBac® system in the same manner as in Example 3.
  • FIG. 10 shows the results of analysis of the phenotype of mature T cells derived from gene-introduced iPS cells by a flow cytometer.
  • “No EP” is the analysis result of the mature T cell used for gene transfer and expressing the WT1 antigen-specific T cell receptor ⁇ chain ⁇ chain; “EGFP”.
  • EGFP enhanced green fluorescent protein
  • TCR-CD19 is a GPC3 antigen-specific T cell receptor ⁇ -chain ⁇ -chain gene and intracellular.
  • the analysis result of the mature T cell which introduced the piggyBac® transposon vector in which the defective human CD19 gene was integrated into the tandem is shown.
  • GPC3 antigen specificity In mature T cells derived from iPS cells represented by "TCR-CD19", in addition to the expression of the CD3 gene and the intracellular defective human CD19 gene, which is a tracer gene integrated into the piggyBac® transposon vector, GPC3 antigen specificity. Binding to the GPC3 peptide / HLA complex (GPC3-Dex) recognized by the target T cell receptor ⁇ chain ⁇ chain was detected. That is, GPC3 antigen-specific T expressed on the cells by introducing the GPC3 antigen-specific T cell receptor ⁇ -chain ⁇ -chain gene into mature T cells derived from iPS cells using the piggyBac® system.
  • the cell receptor ⁇ -chain ⁇ -chain functions as a molecule that recognizes the GPC3 peptide / HLA complex (GPC3-Dex). Therefore, a novel tumor-related antigen (neoantigen) and other tumor-related antigen-specific T cell receptor ⁇ -chain ⁇ -chain genes should be used as the T-cell receptor ⁇ -chain ⁇ -chain gene to be introduced into mature T cells derived from iPS cells. It was shown that mature T cells derived from iPS cells that recognize these antigens can be produced.
  • FIG. 11 shows a method for selecting iPS cell clones having high efficiency of differentiation into T cells in the step of producing regenerated T cells from iPS cells reprogrammed with peripheral blood T cells.
  • Mononuclear cells are isolated from the peripheral blood of subjects infected with EBV (Epstein-Barr virus), and the isolated mononuclear cells are stimulated with the EBV antigen in vitro to obtain a CD8-positive T cell population that recognizes the EBV antigen. Isolated.
  • EBV Epstein-Barr virus
  • Yamanaka 4 factors (Oct3 / 4, Sox2, Klf4 and c-Myc) and SV40T antigen were introduced into the isolated CD8-positive T cell population using a Sendai virus vector to obtain an iPS cell population.
  • the iPS cell clones were separated from the obtained iPS cell population, the ability to differentiate into T cells was examined for each clone, and the iPS cell clones having high differentiation efficiency into T cells were selected.
  • T cells that recognize the EBV antigen are cells that are unlikely to cause an allo reaction even when allogeneic transplantation is performed.
  • iPS cell clones selected as cells having high differentiation efficiency into T cells, and regenerated T cells were performed.
  • the method for producing cells is shown.
  • the iPS cell clones derived from CD8-positive T cells that recognize EBV antigens and have high differentiation efficiency into T cells are ⁇ 2M genes and CIITA genes involved in the expression of MHC class I and MHC class II, and natural killer (NK) cells.
  • the PVR gene involved in the activation of NK cells and the Rag2 gene involved in the rearrangement of T cell receptors were deleted using CRISPR / Cas9, while ⁇ 2 ⁇ / binding peptide / HLA, which is an inhibitory ligand for NK cells.
  • the -E fusion gene (HLA-E * ) was expressed to obtain iPS cells that were not attacked by host T cells and NK cells.
  • cells are expressed after in vivo administration by expressing a suicide gene such as drug-induced caspase-9 and / or a specific marker gene (EGFR (epidermal growth factor receptor), CD19, CD20, etc.). It can also be removed.
  • the regenerated T cells differentiated and proliferated from iPS cells are host T cells for producing regenerated T cells for cancer treatment, and a master cell bank may be constructed from the host T cells.
  • the host T cells can be used as a material for producing regenerated T cells into which a TCR gene or a CAR (chimeric antigen receptor) gene has been introduced. Since the host T cell is a T cell that recognizes an EBV antigen, it is unlikely to cause an allo reaction even if it is transferred into a living body.
  • "Host T cells” are used as starting materials for the production of prophylactic or therapeutic agents for cancers containing regenerated T cells as an active ingredient, although the cells themselves are not used to treat patients. Means T cells.
  • FIG. 13 shows a method for producing regenerated T cells that recognize cancer antigens from the host T cells.
  • T cell receptor ⁇ chains that recognize reconstituted EBV antigens by gene replacement by genome editing using CRISPR / Cas9 and T cells that recognize cancer antigens, respectively. It was replaced with a T2a-mediated conjugate of the receptor ⁇ chain and the T cell receptor ⁇ chain.
  • the T cell receptor ⁇ chain that recognizes the EBV antigen was removed by genome editing using CRISPR / Cas9.
  • FIG. 13 it was possible to produce regenerated T cells that recognize cancer antigens.
  • FIG. 14 collectively describes the methods shown in FIGS. 11 to 13.
  • Regenerated T cells iPS-T cells
  • iPS-T cells Regenerated T cells produced from the same type of universal iPS cells in which peripheral blood T cells have been reprogrammed can be used as a starting material for producing T cells into which a TCR gene or CAR gene has been introduced.
  • Universal iPS cells have very low immunogenicity, so they do not cause rejection in patients with any type of MHC (Major Histocompatibility Complex). Means iPS cells that can be used. That is, iPS cells that can be administered to patients without considering MHC matching. Universal iPS cells can be produced by knocking out MHC class I or MHC class II molecules and expressing a ligand that suppresses NK cells.
  • the viral vector used for the production of T cells used in conventional T cell replacement therapy or regeneration therapy may be used.
  • iPS-T cells as a starting material, it becomes possible to produce desired T cells as an active ingredient of a preventive or therapeutic agent for cancer in a short period of time.

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Abstract

【課題】腫瘍組織浸潤CD106陽性T細胞より単離されたTCRを導入したiPS細胞を介する、再生T細胞を製造する方法の提供。 【解決手段】1:被験者から得られるT細胞であって、腫瘍関連抗原に対して反応性を有し、かつCD106陽性T細胞集団から、単一細胞ごとに、TCRα鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNAを調製する工程、2:被験者の末梢血単核球であって、B細胞およびT細胞が除去された末梢血単核球またはT細胞をiPS細胞に初期化し、得られたiPS細胞からT細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別する工程、3:前記cDNAを、前記iPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した未熟T細胞または前記未成熟T細胞から分化した成熟T細胞に導入する工程、および、4:工程3において得られた、前記cDNAが導入された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞または前記未熟T細胞の成熟T細胞への分化および前記成熟T細胞の増殖を行う工程、を含む、iPS細胞を介する再生T細胞の製造方法。

Description

iPS細胞を介する再生T細胞の製造方法
 本発明は、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に由来するiPS細胞に対して、CD106陽性T細胞集団から得られるT細胞受容体を導入し、腫瘍抗原特異的な再生T細胞を製造する方法、該方法により製造された再生T細胞、該再生T細胞を有効成分とする、がんの予防または治療剤、該再生T細胞を含有する医薬組成物および該医薬組成物を使用するがんの予防または治療方法に関する。
 T細胞は、細菌もしくはウイルス等の外来病原体またはがん細胞等の異常な細胞に対する免疫応答において中心的な役割を果たしている。このため、T細胞の機能低下は、病原体感染やがんの発生に寄与すると考えられている。T細胞の機能低下に起因する疾患を有する患者に対するT細胞の補充療法または再生療法は、患者における疾患の病態改善や治療に極めて有効な手段となり得る。
 ヒトおよびマウスを用いた研究において、感染症またはがんに対してT細胞補充療法を行う場合、細菌もしくはウイルス等の外来病原体またはがん細胞等の異常な細胞が有する抗原を特異的に認識するT細胞を用いることにより、高い治療効果が得られることが知られている。一方で、T細胞を十分量確保することが難しいこと、またT細胞における増殖能の低下および標的細胞等の抗原に対する免疫反応の低下などのT細胞の疲弊化がT細胞補充療法における障害となっている。また、腫瘍に特異的なT細胞をどのようにして取得するかは大きな課題である。
 T細胞補充療法における上記の障害を克服するため、抗原特異的なT細胞から人工多能性幹細胞(iPS細胞)を樹立し、増殖させた後、T細胞へ分化させた再生T細胞を用いるT細胞補充療法が提案されている。標的抗原を認識するためのT細胞受容体(TCR)は、ゲノムの遺伝子再構成により形成されるため、T細胞を初期化したiPS細胞には、初期化前のT細胞が持つTCR遺伝子が保存されている。したがって、iPS細胞を製造するための原料として、標的抗原に対して特異的なT細胞を使用することにより、元のT細胞と同じ抗原特異性を示す再生T細胞を製造することが可能である(特許文献1および非特許文献1)。
 厳密な抗原特異性は、安全かつ効率的なT細胞補充療法に必要である。しかしながら、上記のようにT細胞からiPS細胞を経由して得られた再生T細胞において、元のT細胞と同じ遺伝子再構成パターンを有するT細胞の出現頻度は必ずしも高くないことが報告されている(特許文献2)。また、ヒトT細胞からiPS細胞を経由して得られたCD8αβ再生T細胞が、CD4/CD8ダブルポジティブ段階でのTCRα鎖遺伝子の追加的な再構成により、抗原特異性を失うことも報告されている(非特許文献2)。
WO2011/096482号パンフレット WO2013/176197号パンフレット
Nishimura T, et al. Generation of rejuvenated antigen-specific T cells by reprogramming to pluripotency and redifferentiation. Cell Stem Cell. 2013; 12:114-126. Minagawa A, et al. Enhancing T cell receptor stability in rejuvenated iPSC-derived T cells improves their use in cancer immunotherapy. Cell Stem Cell. 2018; 23: 850-858.
 iPS細胞を介して製造された再生T細胞(iPS-T細胞)を用いるがん治療において、腫瘍細胞または腫瘍組織に存在する標的抗原を特異的に認識するiPS-T細胞を使用することは、がん治療におけるiPS-T細胞補充療法の安全性および有効性を担保する上で重要である。また、がんの発症またはがんの再発が検出された場合、速やかにiPS-T細胞補充療法を開始することが、治療成績を向上させるために重要である。
 本発明は、腫瘍組織浸潤CD106陽性T細胞より単離されたTCRを導入したiPS-T細胞を迅速に製造する方法および該方法により製造されたiPS-T細胞を提供することを目的とする。さらに本発明は、該方法により製造されたiPS-T細胞、該iPS-T細胞を含有する医薬組成物および該医薬組成物を使用するがんの予防または治療方法を提供することを目的とする。
 最近の研究で、1つの抗原エピトープに対しても、複数のT細胞クローン(5~10クローン)がそれぞれ異なるTCRを用いて抗原を認識していることが明らかになっている。現時点では、患者から得られた細胞からiPS-T細胞を得るまでの過程において、抗原特異的なすべてのT細胞クローンを維持することは極めて難しい。iPS-T細胞まで分化したクローンが、標的を傷害するのに最適なTCRを有するT細胞クローンである可能性についても、iPS-T細胞を製造するための細胞を採取する被験者の個体差またはiPS-T細胞の製造バッチによって影響を受ける。また、腫瘍を特異的に認識するT細胞を単離するためには、腫瘍抗原の患者への投与、または試験管内において、T細胞と腫瘍抗原との共培養が必要であるが、腫瘍抗原が不明である場合には、そのような方法を採用することは極めて難しい。
 現状では、患者から得られた細胞由来のiPS細胞クローンを用いてiPS-T細胞を製造する場合、その製造に要する期間は長期にわたる。iPS-T細胞補充療法を、それが必要な患者に速やかに提供するためには、製造期間の短縮が大きな課題となっている。
 本発明者らは、腫瘍組織より単離されたCD106陽性T細胞集団が、腫瘍関連抗原を認識するT細胞集団であって、がん細胞に対する特異的な攻撃性を有すること、腫瘍関連抗原を認識するこれらT細胞集団から、抗原特異性を持つ種々のTCRプールを取得できること、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞から樹立したiPS細胞にTCRを導入することにより、iPS-T細胞を製造することができること、予めT細胞への分化効率の良いiPS細胞クローンを選択することにより、再生T細胞の品質の均一化および製造期間の短縮ができること、同時に前記TCRプールの取得およびiPS細胞の樹立のタイミングを調整することにより、前記iPS-T細胞の製造を迅速に行うことができること、ならびに前記TCRプールおよび前記非T非B細胞もしくは単球またはT細胞の起源が同一個体または別個体であってもよいことを見出し、本発明を完成するに至った。
 すなわち、本発明の目的は、以下の発明により達成される。
 〔1〕
 (1)被験者から得られるT細胞であって、腫瘍関連抗原に対して反応性を有し、かつCD106陽性T細胞集団から、単一細胞ごとに、T細胞受容体α鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNAを調製する工程、
 (2)被験者の末梢血単核球であって、B細胞およびT細胞が除去された末梢血単核球またはT細胞をiPS細胞に初期化し、得られたiPS細胞からT細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別する工程、
 (3)前記cDNAを、前記iPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した成熟T細胞に導入する工程、および
 (4)工程(3)において得られた、前記cDNAが導入された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞または前記未熟T細胞の成熟T細胞への分化および前記成熟T細胞の増殖を行う工程、 
を含む、iPS細胞を介する再生T細胞の製造方法。
 〔2〕
 工程(2)の実施が、工程(1)の実施に先行する、または工程(1)の実施と並行する、〔1〕に記載の方法。
 〔3〕
 工程(1)および(2)における被験者が、同一個体であって、がんの予防または治療対象である、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
 〔4〕
 工程(1)および(2)における被験者が、互いに別個体であって、工程(2)における被験者が、がんの予防または治療対象である、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
 〔5〕
 工程(1)および(2)における被験者が、互いに別個体であって、工程(1)における被験者が、がんの予防または治療対象である、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
 〔6〕
 工程(1)および(2)における被験者が、同一個体または互いに別個体であって、工程(1)および(2)における被験者とは異なる被験者が、がんの予防または治療対象である、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
 〔7〕
 さらに、工程(4)において得られる前記cDNAが導入されたT細胞から、がんの予防または治療対象である被験者に由来する細胞に対してアロ反応を示さないT細胞を選別する工程を含む、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
 〔8〕
 さらに、工程(1)で調製されたcDNAから、がんの予防または治療対象である被験者に由来する細胞に対してアロ反応を誘導しないT細胞受容体をコードするcDNAを選別する工程を含む、〔1〕または〔2〕に記載の方法。
 〔9〕
 がんの予防または治療対象である被験者に由来する前記細胞が、末梢血単核球である、〔7〕または〔8〕に記載の方法。
 〔10〕
 工程(3)において、前記iPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した前記造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した前記未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した前記成熟T細胞への前記cDNAの導入が、ウイルスベクターもしくは非ウイルスベクターを用いる、またはゲノム編集技術を用いる、〔1〕~〔9〕のいずれかに記載の方法。
 〔11〕
 前記ゲノム編集技術が、CRISPR/Cas9またはTALENである、〔10〕に記載の方法。
 〔12〕
 前記非ウイルスベクターが、トランスポゾンベクターである、〔10〕に記載の方法。
 〔13〕
 前記トランスポゾンベクターが、piggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターである、〔12〕に記載の方法。
 〔14〕
 工程(4)において、前記cDNAが導入された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞または前記未熟T細胞の成熟T細胞への分化および前記成熟T細胞の増殖を行う工程が、フィーダー細胞およびPHA(phytohemagglutinin)の存在下、レトロネクチン(登録商標)および抗CD3抗体の存在下、または抗CD3抗体および抗CD28抗体の存在下で行われる、〔1〕~〔13〕のいずれかに記載の方法。
 〔15〕
 前記フィーダー細胞が、自家または他家の末梢血単核球である、〔14〕に記載の方法。
 〔16〕
 工程(1)または(2)における前記被験者が、肝細胞がん、肝芽腫、胃がん、食道がん、肺がん、膵臓がん、腎細胞がん、乳がん、卵巣がん、悪性黒色腫などの皮膚がん、膀胱がん、頭頸部がん、子宮がん、子宮頸がん、膠芽腫、前立腺がん、神経芽腫瘍、慢性リンパ性白血病、甲状腺乳頭がん、大腸がん、脳腫瘍、肉腫またはB細胞非ホジキンリンパ腫の患者である、〔1〕~〔15〕のいずれかに記載の方法。
 〔17〕
 工程(1)または(2)における前記被験者が、免疫原性の高いがんの患者である、〔1〕~〔15〕のいずれかに記載の方法。
 〔18〕
 前記免疫原性の高いがんが、肝細胞がん、肝芽腫、大腸がん、肺がんまたは悪性黒色腫である、〔17〕に記載の方法。
 〔19〕
 工程(1)における前記T細胞集団が、CD3/CD106ダブルポジティブである、〔1〕~〔18〕のいずれかに記載の方法。
 〔20〕
 前記造血幹細胞が、CD34/CD43ダブルポジティブである、〔1〕~〔19〕のいずれかに記載の方法。
 〔21〕
 前記未熟T細胞が、CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブである、〔1〕~〔20〕のいずれかに記載の方法。
 〔22〕
 工程(2)において選別された、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローン、または工程(3)における前記iPS細胞クローンから分化した造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した成熟T細胞を保存し、マスターセルバンクを構成する、〔1〕~〔21〕のいずれかに記載の方法。
 
 〔23〕
 前記保存が凍結保存である、〔22〕に記載の方法。
 〔24〕
 前記マスターセルバンクに保存された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞に対して、工程(3)および(4)を行う、〔22〕に記載の方法。
 〔25〕前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞を含む、〔22〕に記載のマスターセルバンク。
 〔26〕
 〔1〕~〔24〕のいずれかに記載の方法により製造された再生T細胞。
 〔27〕
 〔26〕に記載の再生T細胞を含有する医薬組成物。
 〔28〕
 〔27〕に記載の医薬組成物を用いる、がんの予防または治療方法。
 本発明のiPS細胞を介する再生T細胞(iPS-T細胞)の製造方法では、T細胞およびB細胞が除去された末梢血単核球(非T非B細胞または単球)またはT細胞を初期化し、iPS細胞を得た後、T細胞への分化効率が良いiPS細胞クローンを予め選別する。このため、治療に必要とされるタイミングに合わせて、治療に必要なiPS-T細胞を十分量確保することができる。また本発明の方法では、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞から誘導されたiPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した成熟T細胞に対してTCRを導入するため、これらの細胞をiPS-T細胞へ分化させた後、拡大培養した場合に、TCR遺伝子の再構成が起きにくく、導入されたTCRの抗原特異性が維持される。さらに、拡大培養に起因する疲弊化が少ないiPS-T細胞を製造することができる。さらに、iPS-T細胞を製造する際には、T細胞への分化効率が良いiPS細胞クローンを選別して用いるため、iPS-T細胞の製造バッチ間における収量および分化程度の変動、ならびに細胞を採取する被験者の個体差が、得られるiPS-T細胞の品質等に及ぼす影響を最小にすることが可能となる。また抗原を認識し、標的を効率よく殺傷するTCRを持つT細胞を、効率よく製造することが可能となる。
 本発明の方法によれば、TCRをコードするcDNAの調製は、遺伝的多様性を有するT細胞集団から単一細胞ごとに行うため、多様な抗原特異性を持つcDNA群を準備することができる。腫瘍組織より単離されたCD106陽性T細胞集団は、腫瘍抗原を認識するT細胞集団であるため、腫瘍特異的なTCRを単離するにあたり、予め腫瘍抗原による免疫または試験管内でのT細胞と腫瘍抗原との共培養の必要がない。このため、本発明の方法によれば、iPS-T細胞の製造期間が短縮されると同時に、がん患者における腫瘍抗原が不明である場合においても、腫瘍特異的なiPS-T細胞を製造することが可能である。また、非T非B細胞もしくは単球由来またはT細胞由来のiPS細胞クローンの作製および保存を、抗原特異的TCRをコードするcDNAの調製に先行して、または前記cDNAの調製と並行して行うため、これらを順次行う方法に比べて、iPS-T細胞を短期間に製造することができる。このため、iPS-T細胞補充療法を適用するがん治療において、治療対象のがん患者における腫瘍の抗原変化もしくは治療耐性の発現またはがんの再発に対して、発現している抗原に特異的なiPS-T細胞の準備を迅速に行うことが可能となる。
 本発明の方法によれば、TCRをコードするcDNAの調製するために使用するT細胞を採取する被験者は、iPS-T細胞補充療法による治療対象のがん患者である被験者と同一個体であってもよく、また互いに別個体であってもよい。このため、多様な抗原に対応するTCRプールを作製することが可能となり、個々のがん患者に最適な抗原特異性を有するTCRを選択することができる。
末梢血の非T非B細胞または単球を初期化したiPS細胞から再生T細胞を製造する工程の概略を示す図である。 末梢血の非T非B細胞または単球を初期化したiPS細胞から再生T細胞を製造する工程の詳細を示す図である。図2において、上段部分図は、CD106陽性T細胞からTCR遺伝子を単離する工程および抗原特異的反応性の検証を行う工程を示し、下段部分図は、TCR遺伝子導入iPS細胞を製造する工程および前記iPS細胞から再生T細胞を製造する工程を示す。 piggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターを使用して、TCR遺伝子を導入する工程を示す図である。 iPS細胞から誘導された再生T細胞(腫瘍関連抗原特異的CD8陽性細胞傷害性T細胞)の表現型を示す図である。 再生T細胞における細胞老化マーカーとして、テロメアを解析した結果を示す図である。 再生T細胞における細胞疲弊マーカーとして、PD-1およびTIGHT分子の発現を解析した結果を示す図である。 健常者の末梢血単核球中の細胞傷害性T細胞(CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブ細胞)および再生T細胞において、PMAおよびイオノマイシンによる刺激により産生されるIL-2およびIFN-γ量を比較した図である。 腫瘍浸潤T細胞における、種々のマーカーの発現を示す図である。各パネルにおいて、パネル内に記載されるマーカーの発現が陽性である細胞が着色して示される。細胞は発現パターンによりクラスタリングされており、丸で囲まれた部分が腫瘍傷害性T細胞に対応する。 腫瘍浸潤T細胞を、マーカー発現によりソートした細胞亜集団において、自己腫瘍刺激を行った場合のIFN-γ産生を示す図である。CD106陽性細胞亜集団においてのみ、自己腫瘍刺激によりIFN-γが産生されること、また、CD106以外のマーカー陽性細胞亜集団では、自己腫瘍刺激によりIFN-γが産生されるものの、マーカー陰性細胞亜集団においてもIFN-γが産生されることから、特異性がCD106より劣ることが理解できる。 GPC3抗原特異的TCR遺伝子を導入した、iPS細胞由来の成熟T細胞の表現型を示す図である。CD19遺伝子は、同一のpiggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターに、前記TCR遺伝子とタンデムに組み込まれた遺伝子であり、宿主染色体への遺伝子挿入および遺伝子発現のマーカーとして使用される。 末梢血T細胞を初期化したiPS細胞から再生T細胞を製造する工程において、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別する方法を説明する図である。 末梢血T細胞を初期化したiPS細胞から再生T細胞を製造する工程において、T細胞への分化効率が高い細胞として選別されたiPS細胞クローンに対してゲノム編集を行い、再生T細胞を製造する方法を説明する図である。 ホストT細胞から、がん抗原を認識する再生T細胞を製造する方法を説明する図である。 末梢血T細胞を初期化した同種のiPS細胞から、再生T細胞を製造する工程の概略を示す図である。
〔T細胞〕
 本発明において、被験者から得られる「T細胞」とは、細胞表面にT細胞受容体(T cell receptor:TCR)と呼ばれる抗原受容体を発現している細胞である。TCRには、α鎖およびβ鎖からなるヘテロ二量体と、γ鎖およびδ鎖からなるヘテロ二量体がある。α鎖およびβ鎖からなるTCRを有するT細胞は、αβ型T細胞と呼ばれ、またγ鎖およびδ鎖からなるTCRを有するT細胞は、γδ型T細胞と呼ばれる。本発明の一態様において、本発明のT細胞は、CD3/αβ型T細胞が好ましいが、CD3/γδ型T細胞であってもよい。本発明におけるT細胞のTCRは、遺伝子導入したものである。
 本発明において、「T細胞集団」とは、上記のT細胞であって、抗原を認識するT細胞受容体(TCR)の遺伝子配列が全体として多様な細胞集団を指す。従って、生体から採取されたT細胞は、多様な抗原に対する特異性を有するT細胞集団である。生体内に存在するT細胞は、T前駆細胞が胸腺内で発生分化する際に、TCR遺伝子のランダムな組み換えが生じることにより、個々のT細胞が異なるTCR遺伝子配列を有し、あらゆる抗原に対して免疫反応を引き起こすことが可能となっている。本発明において、CD106は、がん細胞に対する攻撃性を有するT細胞を同定するための特異性の高いマーカーであり、個々のCD106陽性T細胞が有するTCRは、腫瘍抗原特異的である。このため、CD106陽性T細胞を集団として捉えることにより、そのT細胞集団が、多様な腫瘍抗原を免疫対象とすることが理解できる。従って、生体から採取されたCD106陽性T細胞集団は、その意味で遺伝的多様性を有するT細胞集団である。
 本発明において、「腫瘍関連抗原」とは、腫瘍に特異的または非特異的に発現する抗原であって、腫瘍細胞で過剰発現しているタンパク質由来の抗原およびその変異体、腫瘍ウイルス由来抗原、ある種の分化抗原および遺伝子変異およびスプライス異常による新規腫瘍関連抗原(ネオアンチゲン)などである。「腫瘍関連抗原」に反応するT細胞は、CD106陽性T細胞として認識される。本明細書においては、腫瘍関連抗原を腫瘍抗原と記載する場合もある。タンパク質抗原である場合には、これを断片化したペプチド(ペプチド断片)であってもよい。腫瘍に特異的または非特異的に発現する抗原としては、WT1、GPC3、XAGE1、MUC1、MUC5AC、MUC6、EGFRvIII、HER-2/neu、MAGE A3、MAGE A1、テロメラーゼ、PRAME、SSX2/4、PSCA、CTLA-4、gp100、GD2、GD3、フコシルGM1、GM3、sLe(a)、糖脂質F77、メソテリン、PD-L1、trp1、trp2、CD19、CD20、CD22、ROR1、CD33、c-Met、p53、p53変異体、NY-ESO-1、PSMA、ETV6-AML、CEA、PSA、AFP、hTERT、EpCAM、ALK、アンドロゲン受容体、EphA2、CYP1B1、OY-TES-1、MAD-CT-2、MelanA/MART1、サバイビン、Ras、Ras変異体、ERG、bcr-abl、XBP1などが挙げられるが、これらに限定されない。ウイルス抗原としては、不活化HBVおよびHPV等の不活化ウイルス、ならびに各種ウイルス由来のタンパク質であるEBV LMP1、EBV LMP2、EBNA(EBV nuclear antigen)、HPV E1、HPV E2、HPV E6、HPV E7、HBV HBs、HTLV-1 TaxおよびHBZ(HTLV-1 bZIP Factor)等が挙げられるが、これらに限定されない。
 本発明において、「腫瘍関連抗原に対して反応性を有する」とは、T細胞が、抗原提示細胞上の主要組織適合抗原(major histocompatibility complex:MHC)クラスIまたはクラスIIに提示された腫瘍関連抗原に由来するエピトープペプチドに、TCRを介して選択的に結合/接合して生じる反応をT細胞が有することを意味し、前記エピトープペプチド以外のものへのT細胞の結合/接合ではT細胞の反応が生じないことを指す。TCRを介して、MHCクラスIまたはクラスIIに提示された腫瘍関連抗原に由来するエピトープペプチドへの結合/接合により生じるT細胞の反応には、細胞傷害性、IFN-γおよびグランザイムの産生、T細胞活性化マーカーの発現、ならびにNF-AT等の転写因子の活性化が挙げられる。
 本発明において、T細胞は、αβT細胞が好ましい。T細胞の採取源としては、侵襲性が低いことから末梢血が好ましいが、それに限定されない。その他の好ましい採取源として、がん組織もしくは腫瘍組織、リンパ節もしくはその他の組織もしくは臓器、または血液、臍帯血、リンパ液、組織液(組織間液、細胞間液および間質液)、体腔液(腹水、胸水、心嚢液、脳脊髄液、関節液および眼房水)等の体内のすべての採取源が挙げられる。本発明の一態様において、好ましいT細胞は、腫瘍組織由来T細胞である。腫瘍組織由来T細胞は、通常、腫瘍浸潤T細胞である。
 被験者ががん患者である場合、前記がん患者のがんは、肝細胞がん、肝芽腫、胃がん、食道がん、肺がん、膵臓がん、腎細胞がん、乳がん、卵巣がん、悪性黒色腫などの皮膚がん、膀胱がん、頭頸部がん、子宮がん、子宮頸がん、膠芽腫、前立腺がん、神経芽腫瘍、慢性リンパ性白血病、甲状腺乳頭がん、大腸がん、脳腫瘍、肉腫またはB細胞非ホジキンリンパ腫から選ばれる。前記がんは、好ましくは肝細胞がんまたは肝芽腫である。
〔iPS細胞クローン〕
 本発明において、iPS細胞は、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞を初期化して作製することが好ましいが、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に限定されるわけではない。「非T非B細胞」とは、T細胞として分類されず、かつB細胞とも分類されない単核球を意味する。本発明において、非T非B細胞または単球は、被験者の末梢血単核球として採取した後、単核球に含まれるT細胞およびB細胞を除去することにより調製することができる。末梢血単核球は、ヒト全血から単核球分離溶液により単離することができる。単核球分離溶液としては、例えばLymphoprep(登録商標)が挙げられる。単核球よりB細胞およびT細胞を除去するためには、B細胞の持つ表面抗原であるCD19、CD20、CD22またはB細胞受容体、およびT細胞の持つ表面抗原であるCD3、CD4またはCD8に対する抗体を利用して、例えばフローサイトメトリーまたはMACS(登録商標)ビーズなどの磁気ビーズを使用してもよい。T細胞は、ヒト全血から単核球分離溶液により単離することができる。単核球分離溶液としては、例えばLymphoprep(登録商標)が挙げられる。T細胞の精製は、T細胞の持つ表面抗原であるCD3、CD4もしくはCD8またはT細胞受容体を利用して行うことができるする。例えばフローサイトメトリーまたはMACS(登録商標)ビーズなどの磁気ビーズを使用してもよい。
 iPS細胞の製造方法は当該分野で公知である。本発明において、iPS細胞は、好ましくは、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に細胞初期化因子を導入することにより誘導することができる。細胞初期化因子としては、例えば、Oct3/4、Sox2、Sox1、Sox3、Sox15、Sox17、klf4、klf2、c-Myc、N-Myc、L-Myc、Nanog、Lin28、Fbx15、ERas、ECAT15-2、Tcl1、β-catenin、Lin28b、Sall1、Sall4、Esrrb、Nr5a2、Tbx3およびGlis1等の遺伝子または遺伝子産物が挙げられる。これらの細胞初期化因子は、単独で用いてもよく、また組み合わせて用いてもよい。これらの細胞初期化因子の中で、効率良くiPS細胞を樹立できるという観点からは、Oct3/4、Sox2、Klf4およびc-Myc(いわゆる山中4因子)を、前記非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に導入することが好ましい。
 前記非T非B細胞もしくは単球またはT細胞への細胞初期化因子を導入する方法としては特に制限はなく、当該分野で公知の方法を採用することができる。例えば、前記細胞初期化因子をコードする遺伝子を前記非T非B細胞または単球に導入する場合においては、前記細胞初期化因子をコードする遺伝子(例えばcDNA)を、非T非B細胞もしくは単球またはT細胞内で機能するプロモーターを含む発現ベクターに挿入し、該発現ベクターを、感染、リポフェクション法、リポソーム法、リン酸カルシウム共沈殿法、DEAEデキストラン法、マイクロインジェクション法またはエレクトロポレーション法により非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に導入することができる。前記細胞初期化因子がタンパク質の形態にあって、該タンパク質を前記非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に導入する場合においては、タンパク質導入試薬を用いる方法、タンパク質導入ドメイン融合タンパク質を用いる方法、エレクトロポレーション法およびマイクロインジェクション法が挙げられる。前記細胞初期化因子がメッセンジャーRNA(mRNA)の形態にあって、該mRNAを前記非T非B細胞または単球に導入する場合においては、mRNA導入試薬を用いる方法および培養液に添加する方法が挙げられる。
 感染による遺伝子導入に用いる発現ベクターとしては、例えば、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、センダイウイルス等のウイルスベクター、動物細胞発現プラスミドが挙げられるが、挿入変異が生じにくく、また遺伝子導入効率が高く、導入される遺伝子のコピー数も多いという観点から、センダイウイルスを用いて、前記細胞初期化因子をコードする遺伝子を前記非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に導入することが好ましい。
 前記細胞初期化因子をコードする遺伝子を非T非B細胞もしくは単球またはT細胞に導入する場合に用いる発現ベクターにおいて使用されるプロモーターとしては、例えばSRαプロモーター、SV40プロモーター、LTRプロモーター、CMVプロモーター、RSVプロモーター、HSV-TKプロモーター、ユビキチンプロモーター等が挙げられる。これらのプロモーターは、テトラサイクリン等の薬剤の有無等によって、該プロモーターの下流に挿入された遺伝子の発現を制御できるものであってもよい。発現ベクターは、プロモーターに加えて、エンハンサー、ポリA付加シグナル、選択マーカー遺伝子(例えば、ネオマイシン耐性遺伝子)、SV40複製起点等を含むことができる。
 非T非B細胞もしくは単球またはT細胞を初期化して得られたiPS細胞の培養に用いられる培養液としては、特に限定されないが、動物細胞の培養に用いられる培養液を基礎培養液とし、これにiPS細胞の未分化能を維持するためのサイトカイン類を添加して調製することができる。基礎培養液としては、例えばIscove's Modified Dulbecco's Medium(IMDM)培養液、Medium 199培養液、Eagle's Minimum Essential Medium(EMEM)培養液、αMEM培養液、Dulbecco's modified Eagle's Medium(DMEM)培養液、Ham's F12培養液、RPMI 1640培養液、Fischer'培養液、Neurobasal Medium (ライフテクノロジーズ社)、StemFit(登録商標)AK03N(味の素ヘルシーサプライ社)およびこれらの混合培養液が挙げられる。培養液には、血清を添加してもよく、または無血清であってもよい。サイトカイン類としては、好ましくは、bFGFが挙げられ、培養液中におけるその濃度は、例えば、1~100μg/mL(好ましくは50μg/mL)である。
 本発明の一態様において、iPS細胞の培養方法は、接着培養または浮遊培養であってもよいが、接着培養が好ましい。iPS細胞の単離方法としては、例えば、セルスクレーパー等により物理的に単離する方法、プロテアーゼ活性を有する解離溶液、コラゲナーゼ活性を有する解離溶液、またはプロテアーゼ活性およびコラゲナーゼ活性を有する解離溶液(例えば、Accutase(登録商標)およびAccumax(登録商標)等)を用いた単離方法が挙げられる。
 本発明の一態様において、iPS細胞は、好ましくは、1×10~1×10 cells/cm2、1×10~1×10 cells/cm2または1×10~1×10 cells/cm2の細胞密度に到達した場合に、別の培養器に継代される。継代の回数は、必要な量のiPS細胞が得られれば何回でもよく、好ましくは、1~5回または5~10回である。
 製造したiPS細胞は多数のiPS細胞クローンからなる。後述するが、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別するために、コロニーピックアップ法によりiPS細胞のクローン化を行うことが好ましい。コロニーピックアップ法としては、特に制限はされないが、顕微鏡下にピペットマンを用いる方法、限界希釈法および全自動コロニーピッカーを用いた方法等が用いられる。得られたiPS細胞クローンは、拡大培養後、マスターセルバンクを構成してもよい。前記iPS細胞クローンにより構成される「マスターセルバンク」とは、単一のiPS細胞クローンの単一プールごとに、独立した細胞保存容器に分注して集積したものである。前記マスターセルバンクでは、iPS細胞クローンを凍結保存することが好ましい。細胞の凍結保存方法は、当業者に周知である。例えば、培養したiPS細胞クローンを回収し、緩衝液または培養液により洗浄し、細胞数を計数し、遠心分離等により濃縮して、凍結媒質(例えば、10% DMSOを含む培養液)中に懸濁した後、低温凍結保存することができる。本発明のマスターセルバンクは、凍結保存ができる任意の施設または貯蔵庫に保管することができる。凍結保存する場合、保存温度は、細胞の保存に適した温度であれば特に限定されない。例えば、-20℃、-80℃および-120~-196℃が挙げられるが、-150℃以下が好ましい。
 「分化効率」とは、iPS細胞から造血幹細胞、造血幹細胞から未熟T細胞および未熟T細胞から成熟T細胞への各分化段階において、全生存細胞におけるそれぞれ造血幹細胞、未熟T細胞および成熟T細胞の存在割合を指す。各分化段階における分化細胞の同定は、表面マーカーのFACS解析により行うことができる。造血幹細胞への分化効率は、全生存細胞におけるCD34/CD43ダブルポジティブ細胞の割合として、未熟T細胞への分化効率は、全生存細胞におけるCD4/CD8ダブルポジティブ細胞の割合またはCD5ポジティブ細胞の割合として、また成熟T細胞への分化効率は、全生存細胞におけるCD8α鎖、CD8β鎖、TCRα鎖およびTCRβ鎖のすべてがポジティブである細胞の割合として示される。
 「分化効率が高い」または「分化効率が良い/良好」とは、iPS細胞から造血幹細胞への分化において、造血幹細胞であるCD34/CD43ダブルポジティブ細胞の割合が5~15%またはそれ以上であることを指し;造血幹細胞から未熟T細胞への分化において、未熟T細胞であるCD4/CD8ダブルポジティブ細胞の割合またはCD5ポジティブ細胞の割合が、それぞれ10%以上または50%以上であることを指し;未熟T細胞から成熟T細胞への分化において、CD8α鎖、CD8β鎖、TCRα鎖およびTCRβ鎖のすべてがポジティブである細胞の割合が50%以上であることを指す。
 本発明の再生T細胞は、好ましくは、前記iPS細胞クローンを、先ず造血幹細胞に分化させ、次に前記造血幹細胞を未熟T細胞に分化させ、最終的に、未熟T細胞をCD8シングルポジティブT細胞である成熟T細胞に分化させることにより製造する。
 本発明において、「造血幹細胞」とは、リンパ球、好酸球、好中球、好塩基球、赤血球および巨核球等の血球系細胞に分化可能な細胞である。なお造血幹細胞と造血前駆細胞(hematopoietic progenitor cells、HPC)とは区別されるものではなく、特に断らない限り同一の細胞を指す。造血幹細胞/前駆細胞は、例えば、表面抗原であるCD34およびCD43がダブルポジティブであることによって認識される。
 本発明において、「未熟T細胞」とは、TCRα鎖およびβ鎖の両方ともが発現していないT細胞の段階から、TCRα鎖およびβ鎖を発現し、CD4/CD8ダブルポジティブ細胞を経てCD8シングルポジティブ細胞までの各段階のT細胞を指す。未熟T細胞としては、CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブであることが好ましい。
 本発明において、「成熟T細胞」とは、TCRα鎖およびβ鎖を発現し、CD4/CD8ダブルポジティブ細胞を経てCD8シングルポジティブ細胞に至ったT細胞を指す。成熟T細胞としては、CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブであることが好ましい。
〔造血幹細胞および未熟T細胞の培養〕
 造血幹細胞は、好ましくは、ビタミンC類を添加した培養液中でiPS細胞を培養することによって製造される。ここで、「ビタミンC類」とは、L-アスコルビン酸およびその誘導体を指し、「L-アスコルビン酸誘導体」とは、生体内で酵素反応によりビタミンCに変換されるものを意味する。L-アスコルビン酸の誘導体としては、例えば、リン酸ビタミンC、アスコルビン酸グルコシド、アスコルビルエチル、ビタミンCエステル、テトラヘキシルデカン酸アスコルビル、ステアリン酸アスコルビルおよびアスコルビン酸-2リン酸-6パルミチン酸が挙げられる。L-アスコルビン酸の誘導体は、好ましくは、リン酸ビタミンCであり、例えば、リン酸-Lアスコルビン酸ナトリウムまたはリン酸-L-アスコルビン酸マグネシウム等のリン酸-Lアスコルビン酸塩が挙げられる。ビタミンC類は、例えば、培養液において、5~500μg/mLの濃度で含有される。
 造血幹細胞の製造に用いる培養液は、特に限定されないが、動物細胞の培養に用いられる培養液を基礎培養液とし、これにビタミンC類等を添加して調製することができる。基礎培養液としては、例えば、Iscove's Modified Dulbecco's Medium(IMDM)培養液、Medium 199培養液、Eagle's Minimum Essential Medium(EMEM)培養液、αMEM培養液、Dulbecco's modified Eagle's Medium(DMEM)培養液、Ham's F12培養液、RPMI 1640培養液、Fischer's培養液、Neurobasal Medium(ライフテクノロジーズ社)、StemPro34(ライフテクノロジーズ社)およびこれらの混合培養液が挙げられる。培養液には、血清が含有されていてもよく、または無血清であってもよい。必要に応じて、基礎培養液は、例えば、アルブミン、インスリン、トランスフェリン、セレン、脂肪酸、微量元素、2-メルカプトエタノール、チオールグリセロール、モノチオールグリセロール、脂質、アミノ酸、L-グルタミン、非必須アミノ酸、ビタミン、増殖因子、低分子化合物、抗生物質、抗酸化剤、ピルビン酸、緩衝剤、無機塩類、およびサイトカイン等から選ばれる1つ以上の物質も含有し得る。
 造血幹細胞の製造に用いる培養液には、BMP4(Bone morphogenetic protein 4)、VEGF(vascular endothelial growth factor)、bFGF(basic fibroblast growth factor)、SCF(stem cell factor)、TPO(トロンボポエチン)、およびFLT3L(Flt3 ligand)からなる群より選ばれるサイトカインをさらに添加してもよい。これらの濃度は、例えば、BMP4は1~100 ng/mLであり、VEGFは1~100 ng/mLであり、bFGFは1~100 ng/mLであり、SCFは10~100 ng/mLであり、TPOは1~100 ng/mLであり、またFLT3Lは1~100 ng/mLである。
 造血幹細胞の培養液には、TGFβ阻害剤を培養液に添加してもよい。「TGFβ阻害剤」とは、TGFβファミリーのシグナル伝達に干渉する低分子阻害剤であり、例えば、SB431542およびSB202190(R.K.Lindemann et al., Mol. Cancer 2: 20 (2003))、SB505124 (GlaxoSmithKline)、NPC30345、SD093、SD908およびSD208 (Scios)、ならびにLY2109761、LY364947およびLY580276(Lilly Research Laboratories)が挙げられ、培養液への添加濃度は、好ましくは0.5~100μMである。
 iPS細胞は、C3H10T1/2(Takayama N., et al. J Exp Med. 2817-2830, 2010)、または異種由来のストローマ細胞(Niwa A et al. J Ce11 Physiol. 2009 Nov; 221 (2) :367-77)等のフィーダー細胞と共培養してもよい。
 造血幹細胞の製造時のiPS細胞の培養方法は、接着培養または浮遊培養であってもよいが、浮遊培養が好ましい。例えば、iPS細胞は、使用したディッシュに対して80%コンフルエントになるまで培養されたコロニーを遊離し、単細胞に解離させたのちに、浮遊培養に供することができる。iPS細胞の単離方法としては、例えば、セルスクレーパー等で物理的に単離する方法、プロテアーゼ活性およびコラゲナーゼ活性を有する解離溶液(例えば、Accutase(登録商標)およびAccumax(登録商標)等)、またはコラゲナーゼ活性を有する解離溶液を用いた単離方法が挙げられる。
 浮遊培養とは、細胞を培養容器に対して非接着の状態で培養することである。浮遊培養は、特に限定はされないが、細胞との接着性を向上させる目的で人工的な処理(例えば、細胞外マトリックス等によるコーティング処理)が施されていない培養容器、または人工的に接着を抑制する処理(例えば、ポリヒドロキシエチルメタクリル酸(po1y-HEMA)もしくは非イオン性の界面活性ポリオール(Pluronic F-127等)によるコーティング処理)した培養容器を使用して行うことができる。浮遊培養の際には、胚様体(EB)を形成させて培養することが好ましい。胚様体を浮遊培養して造血幹細胞を得た場合は、これを単細胞に解離させたのちに、接着培養を行うことが好ましい。
 造血幹細胞は、iPS細胞を培養することにより得られる嚢胞様構造物(iPS-sacとも称する)から調製することもできる。ここで、「嚢胞様構造物」とは、iPS細胞由来の立体的な嚢状(内部に空間を伴うもの)構造体で、内皮細胞集団等で形成され、内部に造血幹細胞を含む構造体である。
 iPS細胞から造血幹細胞を製造するために培養する際の温度条件は、特に限定されないが、例えば、約37℃~約42℃程度、好ましくは約37℃~約39℃程度である。また、培養期間については、当業者であれば造血幹細胞の細胞数等をモニターしながら、適宜決定することが可能である。造血幹細胞が得られる限り、培養日数は特に限定されないが、例えば、少なくとも6日以上、7日以上、8日以上、9日以上、10日以上、11日以上、12日以上、13日以上、または14日以上であり、好ましくは14日である。培養期間が長いことについては、造血幹細胞の製造において問題とされない。また、低酸素条件で培養してもよく、本発明の一態様において、低酸素条件としては、例えば、15%、10%、9%、8%、7%、6%、5%またはそれら未満の酸素濃度が挙げられる。
 「CD4/CD8ダブルポジティブT細胞」は、T細胞のうち、表面抗原のCD4およびCD8が共に陽性である細胞(CD8 CD4)であり、T細胞は、表面抗原であるCD3およびCD45が陽性であることによって認識できることから、CD4/CD8ダブルポジティブT細胞は、CD4、CD8、CD3およびCD45が陽性である細胞として同定することができる。CD4/CD8ダブルポジティブT細胞は、誘導によってCD4シングルポジティブ細胞またはCD8シングルポジティブ細胞へと分化させることができる。
 CD4/CD8ダブルポジティブT細胞は、p38阻害剤および/またはSDF-1を添加した培養液中で、造血幹細胞を培養する工程を含む方法によって製造することができる。
 「p38阻害剤」とは、p38タンパク質(p38MAPキナーゼ)の機能を阻害する物質として定義される。p38阻害剤は、例えば、p38の化学的阻害剤、p38のドミナントネガティブ変異体、またはそれをコードする核酸が挙げられるが、これらに限定されない。
 p38の化学的阻害剤としては、SB203580(4-(4-フルオロフェニル)-2-(4-メチルスルホニルフェニル)-5-(4-ピリジル)-1H-イミダゾール)およびその誘導体、SB202190 (4-(4-フルオロフェニル)-2-(4-ヒドロキシフェニル)-5-(4-ピリジル)-1H-イミダゾール)およびその誘導体、SB239063 (trans-4-[4-(4-フルオロフェニル)-5-(2-メトキシ-4-ピリミジニル)-1H-イミダゾール-1-イル]シクロヘキサノール)およびその誘導体、SB220025およびその誘導体、PD169316、RPR200765A、AMG-548、BIRB-796、SCl0-469、SCIO-323、VX-702、またはFR167653が挙げられるが、これらに限定されない。これらの化合物は市販されており、例えば、SB203580、SB202190、SC239063、SB220025およびPD169316についてはCalbiochem社、SCl0-469およびSCIO-323についてはScios社等から入手可能である。p38阻害剤は、例えば、約1μM~約50μMの範囲で培養液に添加される。
 p38のドミナントネガティブ変異体としては、p38のDNA結合領域に位置する180位のスレオニンをアラニンに点変異させたp38T180A、ならびにヒトおよびマウスにおけるp38の182位のチロシンをフェニルアラニンに点変異させたp38Y182F等が挙げられる。
 SDF-1(Stromal cell-derived factor 1)は、SDF-1αまたはその成熟型だけでなく、SDF-1β、SDF-1γ、SDF-1δ、SDF-1εもしくはSDF-1φ等のアイソフォーム、またはそれらの成熟型であってもよく、もしくはこれらの任意の割合の混合物等であってもよい。好ましくは、SDF-1αが使用される。なお、SDF-1は、CXCL-12またはPBSFと称される場合もある。
 SDF-1は、そのケモカインとしての活性を有する限り、そのアミノ酸配列中の1または数個のアミノ酸が置換、欠失および/または付加されていてもよく、また同様に糖鎖が置換、欠失および/または付加されていてもよい。SDF-1において少なくとも4つのシステイン残基(ヒトSDF-1αの場合、Cys30、Cys32、Cys55およびCys71)が保持されており、かつ天然体のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有する範囲であれば、アミノ酸変異が許容される。SDF-1は、哺乳動物、例えば、ヒト、例えば、サル、ヒツジ、ウシ、ウマ、ブタ、イヌ、ネコ、ウサギ、ラット、またはマウス等の非ヒト哺乳動物のものであってもよい。例えば、ヒトのSDF-1αとして、GenBank登録番号:NP_954637で登録されているタンパク質が使用でき、SDF-1βとして、GenBank登録番号:NP_000600で登録されているタンパク質が使用できる。
 SDF-1は、市販のものを使用してもよいし、天然から精製されたものを使用してもよいし、またはペプチド合成や遺伝子工学的手法によって製造されたものを使用してもよい。SDF-1は、例えば、約10 ng/mL~約100 ng/mLの範囲で培養液に添加される。
 CD4/CD8ダブルポジティブT細胞の製造に用いる培養液は、特に限定されないが、動物細胞の培養に用いられる培養液を基礎培養液とし、これにp38阻害剤および/またはSDF-1、さらに好ましくはビタミンC類を添加して調製することができる。なお、CD4/CD8ダブルポジティブT細胞の製造において使用されるビタミンC類の種類は、例えば上述のとおりであるが、ビタミンC類の濃度は、例えば、5~200μg/mLである。基礎培養液としては、例えばIscove's Modified Dulbecco's Medium(IMDM)培養液、Medium 199培養液、Eagle's Minimum Essential Medium(EMEM)培養液、αMEM培養液、Dulbecco's modified Eagle's Medium(DMEM)培養液、Ham's F12培養液、RPMI 1640培養液、Fischer's Neurobasal Medium培養液(ライフテクノロジーズ社)、およびこれらの混合培養液が挙げられる。培養液には、血清を添加してもよく、または無血清であってもよい。必要に応じて、基礎培養液には、例えば、アルブミン、インスリン、トランスフェリン、セレン、脂肪酸、微量元素、2-メルカプトエタノール、チオールグリセロール、脂質、アミノ酸、L-グルタミン、非必須アミノ酸、ビタミン、増殖因子、低分子化合物、抗生物質、抗酸化剤、ピルビン酸、緩衝剤、無機塩類、およびサイトカイン等から選ばれる1つ以上の物質も含有し得る。
 CD4/CD8ダブルポジティブT細胞の製造に用いる培養液には、SCF、TPO(トロンボポエチン)、FLT3LおよびIL-7からなる群より選ばれるサイトカインをさらに添加してもよい。これらの濃度は、例えば、SCFは10~100 ng/mLであり、TPOは1O~200 ng/mLであり、FLT3Lは1~100 ng/mLであり、IL-7は1~100 ng/mLである。
 造血幹細胞は、接着培養しても、または浮遊培養してもよいが、接着培養することが好ましい。接着培養の場合、培養容器をコーティングして用いてもよい。例えば、コーティング剤としては、マトリゲル(Niwa A, et al. PLoS One. 6(7):e22261, 2011)、コラーゲン、ゼラチン、ラミニン、ヘパラン硫酸プロテオグリカン、レトロネクチン、Fc-DLL4またはエンタクチン、およびこれらの組み合わせが挙げられる。
 CD4/CD8ダブルポジティブT細胞を製造するために造血幹細胞を培養する際の培養温度条件は、特に限定されないが、例えば、約37℃~約42℃程度が好ましく、約37℃~約39℃程度がより好ましい。また、培養期間については、当業者であれば、CD4/CD8ダブルポジティブT細胞の細胞数等をモニターしながら、適宜決定することが可能である。CD4/CD8ダブルポジティブT細胞が得られる限り、培養日数は特に限定されないが、例えば、少なくとも10日以上、12日以上、14日以上、16日以上、18日以上、20日以上、22日以上、または23日以上であり、好ましくは23日である。
 得られたCD4/CD8ダブルポジティブT細胞は、単離して用いても良く、他の細胞種が含有される細胞集団として用いても良い。単離する場合、当業者に周知の方法を用いることができる。例えば、CD4、CD8、CD3および/またはCD45に対する抗体により標識し、フローサイトメーターを用いて単離する方法、または所望の抗原を固定化したアフィニティカラム等を用いて精製する方法が挙げられる。
 「CD8シングルポジティブT細胞」、すなわち成熟T細胞は、T細胞のうち、表面抗原のCD8が陽性である細胞(CD8 CD4)であり、細胞傷害性T細胞とも呼ばれる。T細胞は、表面抗原であるCD3およびCD45が陽性であることによって認識できることから、CD8シングルポジティブT細胞は、CD8、CD3およびCD45が陽性であり、CD4が陰性である細胞として同定することができる。
 CD8シングルポジティブT細胞は、副腎皮質ホルモン剤を添加した培養液中で、CD4/CD8ダブルポジティブT細胞を培養する工程を含む方法によって製造することができる。
 副腎皮質ホルモン剤は、好ましくは、糖質コルチコイドまたはその誘導体であり、例えば、酢酸コルチゾン、ヒドロコルチゾン、酢酸フルドロコルチゾン、プレドニゾロン、トリアムシノロン、メチルプレドニゾロン、デキサメタゾン、ベタメタゾン、またはプロピオン酸ベクロメタゾンが挙げられる。好ましくは、副腎皮質ホルモン剤は、デキサメタゾンである。培養液中におけるその濃度は、例えば、1~100 nMである。
 CD8シングルポジティブT細胞の製造に用いる培養液は、特に限定されないが、動物細胞の培養に用いられる培養液を基礎培養液とし、これに副腎皮質ホルモン剤を添加して調製することができる。基礎培養液としては、例えば、Iscove's Modified Dulbecco's Medium(IMDM)培養液、Medium 199培養液、Eagle's Minimum Essential Medium(EMEM)培養液、αMEM培養液、Dulbecco's modified Eagle's Medium(DMEM)培養液、Ham's F12培養液、RPMI 1640培養液、Fischer's Neurobasal Medium培養液(ライフテクノロジーズ社)、およびこれらの混合培養液が挙げられる。培養液には、血清を添加してもよく、または無血清であってもよい。必要に応じて、基礎培養液は、例えば、アルブミン、インスリン、トランスフェリン、セレン、脂肪酸、微量元素、2-メルカプトエタノール、チオールグリセロール、モノチオールグリセロール、脂質、アミノ殿、L-グルタミン、非必須アミノ酸、ビタミン、増殖因子、低分子化合物、抗生物質、抗酸化剤、ピルビン酸、緩衝剤、無機塩類、およびサイトカイン等から選ばれる1つ以上の物質も含有し得る。
 CD8シングルポジティブT細胞の製造に用いる培養液は、抗CD3抗体、ビタミンC類、またはサイトカインをさらに含有することが好ましい。当該サイトカインとしては、例えば、IL-2、IL-7、IL-15およびIL-21等が挙げられる。
 抗CD3抗体としては、CD3を特異的に認識する抗体であれば特に限定されないが、例えば、OKT3クローンから産生される抗体が挙げられる。抗CD3抗体の培養液中における濃度は、例えば、10~1000 ng/mLである。
 CD8シングルポジティブT細胞の製造に用いるビタミンC類は、例えば上述したものであり、上述と同じ条件で用いることができる。
 CD8シングルポジティブT細胞の製造に用いるサイトカインの培養液中における濃度は、例えば、IL-2は10~1000 U/mLであり、IL-7は1~100 ng/mLである。
 CD8シングルポジティブT細胞を製造するためのCD4/CD8ダブルポジティブT細胞を培養する際の温度条件は、特に限定されないが、例えば、約37℃~約42℃程度が好ましく、約37℃~約38℃程度がより好ましい。また、培養期間については、当業者であればCD8シングルポジティブT細胞の細胞数等をモニターしながら、適宜決定することが可能である。CD8シングルポジティブT細胞が得られる限り、培養日数は特に限定されないが、例えば、少なくとも1日以上、2日以上、3日以上、4日以上、または5日以上であり、好ましくは3日である。
〔TCRをコードするcDNAの調製〕
 本発明において、TCRα鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNAの調製は、単一細胞ごとに行うことが好ましい。被験者から採取されるT細胞は、全体として遺伝的多様性を有するT細胞集団であるが、個々のT細胞が有するTCRが認識する抗原またはペプチド配列が決定されないままCD106陽性T細胞として同定されたものであり、個々のT細胞の抗原特異性は異なる。個々の腫瘍関連抗原に対して最適な、すなわち個々の腫瘍関連抗原に対する反応性が高いTCRを選択するために、単一細胞ごとにcDNAを調製することが好ましい。
被験者から得られたT細胞から、腫瘍関連抗原に応答するT細胞集団を、CD106をマーカーとして用いて、セルソーターなどにより単一の細胞として単離してもよい。細胞を単離するマーカーとして、CD106に加えて、細胞表面CD137を用いてもよい。ヒトT細胞を単離するための公知の手法としては、例えば、CD106、CD3およびCD137等のT細胞表面マーカーに対する抗体とセルソーターとを用いたフローサイトメトリーが挙げられる。得られた単一T細胞よりPCR法を用いて遺伝子クローニングを行い、TCRα鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNAを増幅することができる。
〔ベクターの構築〕   
 単離したTCRのcDNAを鋳型として増幅したPCR断片を、例えばギブソン・アッセンブリー・システムを用いて、ウイルスベクターまたは非ウイルスベクターに組み込むことができる。具体的には、ユビキチンプロモーターの下流に、単離したTCRα鎖遺伝子とTCRβ鎖遺伝子とをT2A配列を介して連結した遺伝子を結合し、さらにその下流に、IRES(internal ribosome entry site)配列に対してリガンド結合部位および細胞内ドメインを除いたEGFR(EGFRt、truncated EGFR)または細胞内ドメインを欠損するCD19等のマーカー遺伝子を連結し、この構築物をウイルスベクターまたは非ウイルスベクターに組み込む。ベクターとしては、ウイルスベクターおよび非ウイルスベクターを用いることができるが、非ウイルスベクターが好ましい。非ウイルスベクターとしては、トランスポゾンベクターが好ましく、piggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターがさらに好ましい。トランスポゾン法は、従来のウイルスベクター法と比較して、安価で安全な次世代の遺伝子導入法である。
〔TCR cDNAの細胞導入〕
 T細胞への分化状態が良好な非T非B細胞もしくは単球またはT細胞由来のiPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した前記造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した前記未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した前記成熟T細胞へのTCRα鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNA対を導入する方法としては、ウイルスベクターを用いる方法もしくは非ウイルスベクターを用いる方法またはゲノム編集技術を用いるTCRの置き換えのいずれも採用することができる。ウイルスベクターとしては、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルスおよびセンダイウイルス等のウイルスベクター、ならびに動物細胞発現プラスミドが挙げられるが、レトロウイルスまたはレンチウイルスが好ましい。レトルウイルスまたはレンチウイルス感染を行う場合は、スピンインフェクション法等を用いることが好ましい。非ウイルスベクターを用いる場合は、トランスポゾン法が好ましい。ゲノム編集技術を用いるTCRの置き換えには、CRISPR/Cas9法、CRISPR/MAD法およびCRISPR/CAS3法を用いてもよい。非ウイルスベクターの遺伝子導入方法またはゲノム編集のためのガイドRNAおよびドナーDNAの導入方法としては、リポフェクション法、リポソーム法、リン酸カルシウム共沈殿法、DEAEデキストラン法、マイクロインジェクション法およびエレクトロポレーション法が挙げられる。ベクターを用いずに、PCR産物を直接細胞に導入することもできる。トランスポゾンベクターまたはPCR産物の細胞導入には、エレクトロポレーション法を用いることが好ましい。エレクトロポレーション機器としては、遺伝子導入装置ExPERT(登録商標)システム(MaxCyte社)が好ましい。TCRα鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNA対を導入する方法としては、CRISPR/Cas9およびTALEN等のゲノム編集技術を用いてもよい。CRISPR/Cas9によるTCR遺伝子の導入は、例えば、内在性TCRα鎖およびβ鎖の遺伝子中にデザインされたガイドRNA(センス鎖に対するガイドRNAおよびアンチセンス鎖に対するガイドRNA)、ならびに内在性TCRα鎖の相同組み換え部を5’側と3’側とに持つ目的のTCRα鎖およびβ鎖遺伝子をP2A配列 (自己切断部位)でつないだ遺伝子を、Cas9をコードするベクターとともに目的の細胞へ導入することにより達成される。この場合は、目的のTCRα鎖およびβ鎖遺伝子の発現に、内在性のプロモーターおよびエンハンサーが用いられる。
 前記cDNA対を前記細胞に導入する場合に用いる発現ベクターにおいて使用されるプロモーターとしては、例えばEF1αプロモーター、SRαプロモーター、SV40プロモーター、LTRプロモーター、CMVプロモーター、RSVプロモーター、HSV-TKプロモーターおよびユビキチンプロモーター等が挙げられる。これらのプロモーターは、テトラサイクリン等の薬剤の有無等によって、該プロモーターの下流に挿入された遺伝子の発現を制御できるものであってもよい。発現ベクターは、プロモーターに加えて、エンハンサー、ポリA付加シグナル、選択マーカー遺伝子(例えば、ネオマイシン耐性遺伝子)、SV40複製起点等を含むことができる。
 前記cDNA対が導入されたiPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した前記造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した前記未熟T細胞または前記未熟T細胞より分化した前記成熟T細胞は、上述した培養液、培養液組成、培養温度等の培養条件で培養することにより、前記cDNA対がそれぞれコードするα鎖およびβ鎖からなるTCRを発現する再生T細胞が得られる。この培養において、これらの細胞の増殖を行う場合には、フィーダー細胞およびPHA(phytohemagglutinin)の存在下、レトロネクチン(登録商標)および抗CD3抗体の存在下、または抗CD3抗体および抗CD28抗体の存在下で行うことが好ましい。前記フィーダー細胞は、自家または他家の末梢血単核球が好ましい。「自家の」とは、末梢血単核球および前記iPS細胞クローンが由来する被験者が同一であることを意味し、「他家の」とは、末梢血単核球および前記iPS細胞クローンが由来する被験者が異なることを意味する。
 前記cDNA対が導入された前記iPS細胞、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞は、クローン化してもよい。クローンの選別には、コロニーピックアップ法を行いてクローン化を行うことが好ましい。コロニーピックアップ法としては、特に制限はされないが、顕微鏡下にピペットマンを用いる方法、限界希釈法および全自動コロニーピッカーを用いた方法等が挙げられる。
 目的のTCRが発現しているか否かは、例えば、TCRVβ解析キット(BECKMAN COULTER社:カタログ番号IM-3497)を用いるTCRβ遺伝子のレパトア解析に基づき、確認することができる。ベクターには、EGFRt(truncated EGFR)およびCD19t(truncated CD19)等のマーカー遺伝子が組み込まれているため、マーカー遺伝子の発現を解析することにより、TCRα鎖およびβ鎖の発現を推測することができる。
 前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞は、拡大培養後、マスターセルバンクを構成してもよい。ここで言及する「マスターセルバンク」とは、前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞を、単一クローンの単一プールごとに、独立した細胞保存容器に分注して集積したものである。通常、細胞の性質に変化が生じない範囲で前記細胞を増殖させ、複数の細胞保存容器に分注することが好ましい。マスターセルバンクに保存された前記細胞は、TCR遺伝子またはCAR(chimeric antigen receptor)遺伝子を導入し、再生T細胞を製造するための出発原料となる細胞であり、前記再生T細胞の製造ごとに、マスターセルバンクから必要数の前記細胞を含む細胞保存容器を取り出すことができる。したがって、本発明の再生T細胞を、同一品質で、繰り返し供給することができる。
 前記マスターセルバンクでは、細胞保存容器に分注された前記細胞を凍結保存することが好ましい。細胞の凍結保存方法は、当業者に周知である。例えば、拡大培養した細胞の単一クローンを回収し、緩衝液または培養液により洗浄し、細胞数を計数し、遠心分離等により濃縮して、凍結媒質(例えば、10% DMSOを含む培養液)中に懸濁した後、低温凍結保存することができる。例えば、1本あたり1×10~10個の細胞を含む細胞保存容器を、細胞保存容器ストッカー等に200~1000本集積して、マスターセルバンクを構築することができる。本発明のマスターセルバンクは、凍結保存ができる任意の施設または貯蔵庫に保管することができる。凍結保存する場合、保存温度は、細胞の保存に適した温度であれば特に限定されない。例えば、-20℃、-80℃および-120~-196℃が挙げられるが、-150℃以下が好ましい。
〔iPS細胞からの再生T細胞の製造〕
 腫瘍関連抗原に対応するTCR対は、1エピトープあたりに5~10個と言われており、それぞれのTCR対は、腫瘍関連抗原の点変異変異体に対して異なる感受性を持つことが予測されている。したがって、例えば腫瘍関連抗原に点変異が起こった場合でも、前記エピトープを認識することのできるTCRが存在する可能性が高く、点変異変異体に対しても抗原に特異的な再生T細胞の準備を迅速に行うことができる。また、変異の結果、腫瘍関連抗原がまったく変化した場合であって、再生T細胞補充療法によるがん治療に耐性が生じた場合であっても、複数の腫瘍抗原に対する患者の反応性を解析し、それらの腫瘍関連抗原に応答するTCRを、すでに取得されているT細胞への分化能の高いiPS細胞またはiPS細胞由来の分化細胞から製造を開始できるため、迅速に再生T細胞を製造することが可能である。
〔TCR取得源のT細胞〕
 腫瘍関連抗原に対応するTCR対の取得源となるT細胞は、腫瘍組織から採取することが好ましい。採取されたT細胞は、試験管内で腫瘍組織との共培養により腫瘍応答性の細胞集団を増幅した後、CD106をマーカーとして用いた細胞単離を行ってもよい。
 TCR対を得るためのT細胞を採取する被験者と、再生T細胞補充療法によるがん治療の対象となる被験者が互いに別個体である場合には、治療対象被験者から抗原特異的T細胞を採取する必要はない。したがって、再生T細胞補充療法の治療時期とは独立して、任意の時期に予めTCR対を得るためのT細胞を採取することができるので、再生T細胞補充療法を迅速に開始することができる。
 TCR対を得るためのT細胞を採取する被験者と、再生T細胞補充療法によるがん治療の対象となる被験者とが互いに別個体である場合には、得られたTCR対が、治療対象被験者の細胞に対するアロ反応を示さないことの確認が必要である。確認の方法は、既知の方法によって行われる。例えば、得られたTCR対を持つT細胞が治療対象被験者の細胞に対して応答しないことを、混合リンパ球培養(MLR)等で確認することができる。または、抗原の構成アミノ酸の一残基もしくは複数残基を他のアミノ酸で置換した抗原に対して、得られたTCR対を持つT細胞が応答しないことによって確認される。
〔医薬組成物〕
 本発明の再生T細胞を含有する医薬組成物は、がん治療対象を処置するために使用することができる。本発明の医薬組成物は、製剤技術分野において慣用の方法、例えば、日本薬局方に記載の方法等により製造することができる。本発明の医薬組成物は、薬学的に許容される添加剤を含んでいてもよい。該添加剤としては、例えば、細胞培養液、生理食塩水や適当な緩衝液(例えば、リン酸系緩衝液)等が挙げられる。
 本発明の医薬組成物は、再生T細胞を生理食塩水や適当な緩衝液(例えばリン酸系緩衝液)等に懸濁することによって製造することができる。所望の治療効果が発揮されるように、一回投与分の量として、例えば1×10個以上の細胞を含有することが好ましい。より好ましい細胞含有量は1×10個以上、さらに好ましくは1×10個以上である。細胞の含有量は、投与対象の性別、年齢、体重、患部の状態、細胞の状態等を考慮して適宜調整することができる。本発明の医薬組成物は、再生T細胞の他、細胞を保護する目的でジメチルスルフォキシド(DMSO)および血清アルブミン等を含有してもよい。また、細菌の混入を防止するために、抗生物質等ならびに細胞の活性化および分化を促す目的でビタミン類やサイトカイン等を含有してもよい。さらに本発明の医薬組成物は、製剤上許容される他の成分(例えば、担体、賦形剤、崩壊剤、緩衝剤、乳化剤、懸濁剤、無痛化剤、安定剤、保存剤、防腐剤、生理食塩水等)を含有してもよい。
本発明の再生T細胞を有効成分として含む医薬組成物は、凍結保存することができる。凍結保存する場合、保存温度は、細胞の保存に適した温度であれば特に限定されない。例えば、-20℃、-80℃および-120~-196℃が挙げられるが、-150℃以下が好ましい。凍結保存する場合、細胞は、凍結バイアルおよび凍結バッグ等の適切な容器中で保存することが好ましい。再生T細胞の凍結時および解凍時の細胞損傷リスクを最小限にするための操作は、当業者に周知である。
 本発明の再生T細胞の冷凍保存においては、前記T細胞を培養液から回収し、緩衝液または培養液により洗浄し、細胞数を計数した後、遠心分離等により濃縮して、凍結媒質(例えば、10%DMSOを含む培養液)中に懸濁した後、低温凍結保存する。再生T細胞はクローンごとまたは各クローンを混合して保存してもよい。本発明の再生T細胞を含む医薬組成物は、凍結バイアルおよび凍結バッグ等の容器当たり、例えば、5×10個~9×1010個の再生T細胞を含むが、対象とするがんの種類、投与対象、投与経路等に応じて変更することができる。
 本発明の再生T細胞を含む医薬組成物の投与経路としては、例えば、輸注、腫瘍内注射、動注、門脈注、腹腔内投与等が挙げられる。ただし、本発明の医薬組成物中の有効成分である再生T細胞が患部に送達される限り、投与経路はこれらに限られるものではない。投与スケジュールとしては、単回投与または複数回投与とすることができる。複数回投与の期間は、例えば、2~4週に1回投与を繰り返す方法または半年から1年に1回投与を繰り返す方法等を採用することができる。投与スケジュールの作成においては、対象患者の性別、年齢、体重、病態等を考慮することができる。
 本発明の再生T細胞を含む医薬組成物を、がん患者におけるがんの予防または治療に使用する場合において、再生T細胞上のTCRが他家である場合、がん患者の体内でのアロ反応を避けるため、がん患者の正常細胞に対してアロ反応を示さないTCRを導入した再生T細胞を含有する医薬組成物が使用される。
 本発明の医薬組成物は、がんの予防または治療のために用いられる。がんとしては、肝細胞がん、肝芽腫、胃がん、食道がん、肺がん、膵臓がん、腎細胞がん、乳がん、卵巣がん、悪性黒色腫などの皮膚がん、膀胱がん、頭頸部がん、子宮がん、子宮頸がん、膠芽腫、前立腺がん、神経芽腫瘍、慢性リンパ性白血病、甲状腺乳頭がん、大腸がん、脳腫瘍、肉腫およびB細胞非ホジキンリンパ腫が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の医薬組成物は、免疫原性の高いがん、例えば、肝細胞がん、肝芽腫、大腸がん、肺がんおよび悪性黒色腫に対して好適に用いることができる。「免疫原性の高いがん」とは、免疫応答を誘導する能力が高いがんであり、がん細胞に遺伝子変異が多く認められ(細胞あたり1000以上、または5000以上)、T細胞をはじめとする免疫細胞により認識され、免疫チェックポイント阻害剤が効果を示し、かつ腫瘍組織に免疫細胞が多く浸潤をしている(病理組織染色により多くの免疫細胞を認める)がんを指す。
 以下、実施例により本発明を説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。
〔末梢血の非T非B細胞または単球を初期化したiPS細胞からの再生T細胞の製造〕
 図1は、本発明の再生T細胞の製造工程を示す。治療を受けているがん患者(被験者)の腫瘍組織中の単核球を採取し、腫瘍抗原に特異的に反応するT細胞をCD106陽性T細胞として単離し、前記CD106陽性T細胞からTCR遺伝子を単離した(図1-(2'))。前記TCR遺伝子がコードするTCRの腫瘍への結合能より、より高い治療効果が期待されるTCR遺伝子を選択した(図1-(3'))。治療を受けている患者において腫瘍の再発および腫瘍細胞の変異が生じた場合には、治療に有効なTCR遺伝子を再度選択することが可能である。十分な治療効果を得るためには、TCRの種類(TCRレパトア)を多く取得することが重要である。
 別途、前記患者の末梢血の非T非B細胞または単球より、iPS細胞を製造した(図1-(1)および(2))。次に、得られたiPS細胞からT細胞への分化効率が良好なiPS細胞クローンの選別を行った(図1-(3))。この選別により、iPS細胞クローンの違いによるT細胞への誘導効率のばらつきが顕著に低減され、再生T細胞製造の堅牢性・効率性が向上することが確認された。上記の、腫瘍抗原特異的に反応する選択されたTCR遺伝子群を、前記のT細胞への分化効率が良好なiPS細胞クローンに発現させ(図1-(4))、選択されたTCR遺伝子ごとに成熟T細胞への分化および増殖を行った(図1-(5))。なお、前記成熟T細胞は、腫瘍抗原特異的細胞傷害性T細胞であって、再生T細胞である。この再生T細胞は、がん患者に投与される(図1-(6))。
 本発明の方法においては、iPS細胞の製造工程(図1-(1)~(3))と腫瘍抗原に反応するTCR遺伝子を取得する工程(図1-(2')および(3'))とを並行して行うことができるため、これらの工程を順次行う場合と比較してより短期間(約55日)でこれらの工程を完了することができる。
 上記をより詳細に説明する。下記の通りに、腫瘍抗原特異的TCR遺伝子の単離および抗原特異的反応性の検証を行った(図2上段部分図を参照)。がん患者(被験者)から単離された腫瘍(検体)とCD8陽性の細胞傷害性T細胞との共培養を行った後、セルソーターにより、活性化されたCD106陽性細胞傷害性T細胞(CD8陽性およびCD106陽性の細胞)の単一細胞ソーティングを行った(図2-(2))。単離された単一細胞から、シングルセルPCR によりTCR遺伝子対(TCRα鎖遺伝子およびTCRβ鎖遺伝子)を単離し、単離したTCR遺伝子対についてシークエンス解析を行い、腫瘍反応性T細胞の種類(TCRレパトア)とその出現頻度の解析を行った(図2-(3))。単離されたTCR遺伝子対は、レポーター遺伝子を組み込んだTCR遺伝子欠損T細胞株に発現させて、TCR遺伝子複合体を再構築した(図2-(4))。続いて、再構築したTCR遺伝子複合体と、腫瘍との反応性(抗原特異的反応性)について検証を行った(図2-(5))。すなわち、前記TCR遺伝子対を発現させたT細胞株および目的とする腫瘍細胞を共培養するが、発現した前記TCRと腫瘍とが抗原特異的に結合した場合、TCR遺伝子シグナルが活性化され、標的遺伝子プロモーターの下流に組み込まれたレポーター遺伝子が発現される。その後、レポーター遺伝子活性の測定を行い、腫瘍抗原特異的なTCRの結合評価を行うことにより、抗原特異的反応性を検証した。以上の工程を経て、腫瘍に特異的な反応性を示したTCR遺伝子対の中から、出現頻度が高いものを複数選択し、後述の非T非B細胞または単球由来iPS細胞(M-iPS細胞)への導入遺伝子として用いた。
 TCR遺伝子導入iPS細胞および再生T細胞の製造を下記の通りに行った(図2下段部分図を参照)。がん患者の末梢血単核球よりiPS細胞を作製した(図2-(2'))。図内に記載されるM-iPS細胞は、T細胞に由来しないiPS細胞であり、TCR遺伝子の遺伝子再構成が行われていない細胞である。次に、作製したM-iPS細胞株群から、T細胞への分化効率が良好なM-iPS細胞株を選別した(図2-(3'))。選別したM-iPS細胞株に対して、腫瘍特異的TCR遺伝子(TCRα鎖遺伝子およびTCRβ鎖遺伝子の両遺伝子、図2-(3)を参照)を、トランスポゾンベクターを用いて遺伝子導入し(図2-(6)および図3を参照)、マーカー分子であるCD19の発現を指標に、セルソーター(MACSQuant Tyto(登録商標)セルソーター、Miltenyi Biotec社)を用いて、TCR遺伝子を発現するM-iPS細胞株(TCR-iPS細胞株)の選別を行った。次に、胚様体法を用いて造血幹前駆細胞を誘導し、生体内でのT細胞発生を模倣した段階的分化誘導法により、未熟T細胞を経て成熟T細胞への分化誘導を行った。
 上記のようにしてiPS細胞より誘導された再生T細胞(腫瘍抗原特異的CD8陽性細胞傷害性T細胞)の表現型を解析した。細胞表面抗原マーカーによる再生T細胞のフローサイトメーターによる解析結果を図4に示す。iPS細胞より誘導された再生T細胞は、生体内の成熟した細胞傷害性T細胞において発現が認められるCD45TCRαβCD3CD4CD8αβの発現が確認された
 本発明のiPS細胞を介する再生T細胞について、細胞老化マーカーであるテロメア(若返りの指標)を解析した結果を図5に示す。患者末梢血単核球(A)および再生前の腫瘍抗原特異的T細胞(B)のテロメア長に比較して、前記腫瘍抗原特異的T細胞から作製されたiPS細胞(C)では約3倍、また本発明の腫瘍抗原特異的再生T細胞(D)では約2倍のテロメア長であり、CおよびDにおいてテロメア長の回復が確認された。すなわち、本発明の再生T細胞においては、細胞老化の改善が示唆される。
 本発明のiPS細胞を介する再生T細胞について、免疫チェックポイントに関連する細胞疲弊マーカーのひとつあるPD-1およびTIGIT分子の発現を、抗TIGIT抗体および抗PD-1抗体で染色し、フローサイトメーターにより解析した。比較として、再生前の腫瘍抗原特異的T細胞についても解析した。結果を図6に示す。本発明の再生T細胞は、再生前の腫瘍抗原特異的T細胞に比べて、PD-1およびTIGIT分子の発現が大きく低下していることが確認された。したがって、本発明の再生T細胞は、高い細胞傷害活性を有することが示唆される。
 細胞傷害性能の重要な指標となるサイトカイン産生能解析を行った。健常人から採取した末梢血単核球中の細胞傷害性T細胞(CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブ細胞)および本発明の再生T細胞を、PMA(Phorbol 12-Myristate 13-Acetate)およびイオノマイシン(Ionomycin)により刺激し、産生されるIL-2およびIFN-γ量を比較した。結果を図7に示す。健常人から得られた細胞傷害性T細胞に比べ、本発明の再生T細胞では、IL-2およびIFNγを産生する細胞が顕著に増加していることが確認された。
〔iPS細胞クローンの作製〕
 肝細胞がんまたは肝芽腫患者から採取された末梢血から、単核球分離溶液Lymphoprep(登録商標)を用いて単核球を単離した。得られた単核球から、CD19/CD20陽性のB細胞およびCD3/CD4/CD8陽性のT細胞を、FACSまたはMACSビーズを用いて除去し、非T非B細胞または単球を得た。得られた非T非B細胞または単球細胞集団に、山中4因子(Oct3/4、Sox2、Klf4およびc-Myc)を搭載したセンダイウイルス(CytoTune(登録商標)2.0)およびSV40Tagをコードしたセンダイウイルスを、5~20のMOI(multiplicity of infection)で感染させた。なおSV40は除いてもよい。
 得られたiPS細胞は、数多くのiPS細胞クローンからなる。このため、コロニーピックを行い、クローン化した。すべてのクローン化されたiPS細胞は凍結保存した。クローン化されたiPS細胞を、分化培地により約10日培養して造血幹細胞を誘導し、CD34/CD43ダブルポジティブ造血幹細胞を単離した。単離した造血幹細胞は、DLL4タンパク質と免疫イムノグロブリンのFc領域との融合タンパク質であるFcDLL4でコートされたプレート上で約21日間培養し、T細胞への分化誘導を行った。
 上記21日間培養後に得られる未熟細胞傷害性T細胞の頻度を、CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブ率で検証し、CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブ細胞の出現頻度が最も高いクローンを選別した。
 T細胞への分化効率が良好ないくつかのiPS細胞クローンは、iPS細胞維持培地により2週間の拡大培養を行った後、細胞保存容器に分注し、凍結保存することにより、マスターセルバンクを構築した。
〔iPS細胞クローンに対するTCR遺伝子の導入〕
 実施例2において得られた、T細胞への分化効率が良好な非T非B細胞または単球由来のiPS細胞クローンに対し、腫瘍抗原特異性が確認されたT細胞受容体α鎖およびβ鎖をコードした遺伝子を有するpiggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターを、エレクトロポレーション法を用いて導入した。次に、目的のT細胞受容体α鎖およびβ鎖を発現するiPS細胞を、マーカー分子であるCD19の発現を指標に、セルソーターにより単離した。単離されたiPS細胞は、分化培地により約10日培養し、CD34/CD43ダブルポジティブの造血幹細胞を誘導し、セルソーターにより単離した。単離した血幹細胞は、FcDLL4でコートされたプレート上で約21日間培養し、T細胞への分化誘導を行った。
 上記21日間培養後に得られるCD8α鎖/β鎖ダブルポジティブの未熟T細胞を、セルソーターを用いて単離精製した。次に、未熟T細胞を、PHA(phytohemagglutinin)およびフィーダー細胞として末梢血単核球の存在下、レトロネクチン(登録商標)および抗CD3抗体の存在下または抗CD3抗体および抗CD28抗体の存在下で共培養し、成熟細胞傷害性T細胞へと誘導した。これらの刺激は1回以上行った。得られたT細胞の性能は、GPC3特異的な標的細胞の細胞傷害活性、IFN-γ産生および抗原結合能で確認した。
〔腫瘍傷害性T細胞におけるCD106発現の特異性〕
 抗PD-1抗体が著効したメラノーマ患者において、抗PD-1抗体による治療開始前の手術検体から腫瘍組織を得た。得られた腫瘍組織に対してコラゲナーゼおよびDNaseを加え、37℃で30分間撹拌することにより酵素処理し、細胞を分離させた。腫瘍組織に由来する細胞と腫瘍浸潤免疫細胞との細胞混合物から、BD FACSAria III(登録商標)セルソーター(BD Biosciences社)を用いて、CD3陽性細胞をソートし、TCRを発現している細胞を得た。
 得られたT細胞のそれぞれに対して、Chromiumシステム(10X Genomics社)の5プライムキットおよびV(D)Jエンリッチメントキットを用いて、マーカー候補の遺伝子発現およびTCR配列の両方について、シークエンスによりシングルセル遺伝子発現解析を行った。シークエンサーとして、HiSeq 3000(イルミナ社)を用いた。
 得られたfastgファイルから、Pythonのumapライブラリを用いてUMAPプロットを作成した。得られたUMAPプロット上に、各遺伝子の表示をマッピングした。
 結果を図8に示す。図8の各パネルにおいて、パネル内に記載されるマーカーの発現が陽性である細胞が着色して示される。細胞は発現パターンによりクラスタリングされており、丸で囲まれた部分が腫瘍傷害性T細胞に対応する。CD106(VCAM1)陽性細胞は、腫瘍傷害性T細胞の集団に高い特異性をもって発現していることが理解される。CD106は、CD106以外の表面マーカーよりも高い特異性を有する腫瘍傷害性T細胞の選択マーカーとして使用できることが示される。TCR配列は、β鎖が9割以上の細胞で、またα鎖が6~9割の細胞で取得された。
〔CD106陽性細胞集団の腫瘍攻撃性〕
 実施例5と同様にして、腫瘍組織の細胞を分離し、得られた細胞混合物から、BD FACSAria IIIを用いてCD3陽性細胞をソートし、TCRを発現しているT細胞を腫瘍浸潤T細胞として得た。この腫瘍浸潤T細胞と、刺激剤として自己腫瘍から樹立した細胞株とを共培養し、IFN-γ産生を無刺激の場合と比較した。IFN-γ産生は、抗IFN-γ抗体を用いた細胞内染色により測定した。細胞染色は、抗PD-1抗体、抗TIGIT抗体、抗LAG3抗体、および抗CD106抗体を用いて行った。ネガティブコントロールとして、抗CD106抗体に対するアイソタイプ・コントロール抗体を用いた。
 結果を図9に示す。CD106陽性細胞亜集団においてのみ、自己腫瘍細胞株による刺激によりIFN-γが産生されること、また、CD106以外のマーカー陽性細胞亜集団では、自己腫瘍刺激によりIFN-γが産生されるものの、マーカー陰性細胞亜集団においてもIFN-γが産生されることから、特異性がCD106より劣ることが理解できる。
〔iPS細胞クローンから分化した成熟T細胞に対するTCR遺伝子の導入〕
 実施例2において得られた、T細胞への分化効率が良好な非T非B細胞または単球由来のiPS細胞クローンから、造血幹細胞および未熟T細胞を経由して分化した成熟T細胞に対し、GPC3抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖をコードする遺伝子(cDNA)を、piggyBac(登録商標)システムを用いて、実施例3と同様にして導入した。
 遺伝子導入したiPS細胞由来の成熟T細胞の表現型を、フローサイトメーターにより解析した結果を図10に示す。図10において、「No EP」は、遺伝子導入に用いた前記成熟T細胞であって、WT1抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖を発現させた前記成熟T細胞の解析結果;「EGFP」は、遺伝子導入操作の指標とするトレーサー遺伝子(EGFP(enhanced green fluorescent protein)遺伝子)を組み込んだ発現ベクターを導入した前記成熟T細胞の解析結果;「Empty‐CD19」は、トレーサー遺伝子として細胞内欠損型ヒトCD19遺伝子のみを組込んだpiggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターを導入した前記成熟T細胞の解析結果;「TCR‐CD19」は、GPC3抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖遺伝子および細胞内欠損型ヒトCD19遺伝子をタンデムに組込んだpiggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターを導入した前記成熟T細胞の解析結果を示す。
 「No EP」で示されるiPS細胞由来の成熟T細胞では、T細胞マーカーであるCD3のみが検出された。すなわち、遺伝子導入に用いた細胞は、T細胞であることが確認された。
 「EGFP」で示されるiPS細胞由来の成熟T細胞では、CD3遺伝子およびEGFP遺伝子の発現が検出された。すなわち、遺伝子導入操作は適切に行われたことが分かる。
 「Empty‐CD19」で示されるiPS細胞由来の成熟T細胞では、CD3遺伝子およびpiggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターに組み込まれたトレーサー遺伝子である細胞内欠損型ヒトCD19遺伝子の発現が検出された。すなわち、遺伝子導入操作は適切に行われたことが分かる。
 「TCR‐CD19」で示されるiPS細胞由来の成熟T細胞では、CD3遺伝子およびpiggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターに組み込まれたトレーサー遺伝子である細胞内欠損型ヒトCD19遺伝子の発現に加え、GPC3抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖が認識するGPC3ペプチド/HLA複合体(GPC3‐Dex)との結合が検出された。すなわち、piggyBac(登録商標)システムを用いて、iPS細胞由来の成熟T細胞にGPC3抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖遺伝子を導入することにより、前記細胞上に発現したGPC3抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖が、GPC3ペプチド/HLA複合体(GPC3‐Dex)を認識する分子として機能することが示された。したがって、iPS細胞由来の成熟T細胞に導入するT細胞受容体α鎖β鎖遺伝子として、新規腫瘍関連抗原(ネオアンチゲン)およびその他の腫瘍関連抗原特異的T細胞受容体α鎖β鎖遺伝子を用いることにより、これらの抗原を認識するiPS細胞由来の成熟T細胞を作製することができることが示された。
〔末梢血T細胞を初期化したiPS細胞からの再生T細胞の製造〕
 図11は、末梢血T細胞を初期化したiPS細胞から再生T細胞を製造する工程において、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別する方法を示す。EBV(Epstein-Barrウイルス)に感染者した被験者の末梢血より単核球を分離し、分離した単核球を、試験管内でEBV抗原により刺激し、EBV抗原を認識するCD8陽性T細胞集団を単離した。単離したCD8陽性T細胞集団に、山中4因子(Oct3/4、Sox2、Klf4およびc-Myc)およびSV40T抗原を、センダイウイルスベクターを用いて導入し、iPS細胞集団を得た。得られたiPS細胞集団からiPS細胞クローンを分取し、それぞれのクローンについて、T細胞への分化能を調べ、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別した。EBV抗原を認識するT細胞は、同種移植を行った場合であっても、アロ反応を生じにくい細胞である。
 図12は、末梢血T細胞を初期化したiPS細胞から再生T細胞を製造する工程において、T細胞への分化効率が高い細胞として選別されたiPS細胞クローンに対してゲノム編集を行い、再生T細胞を製造する方法を示す。EBV抗原を認識するCD8陽性T細胞に由来し、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンは、MHCクラスIおよびMHCクラスIIの発現に関与するβ2M遺伝子およびCIITA遺伝子、ナチュラルキラー(NK)細胞の活性化に関与するPVR遺伝子ならびにT細胞受容体の再々構成に関与するRag2遺伝子を、CRISPR/Cas9を用いて削除し、一方で、NK細胞の抑制性のリガンドであるβ2Μ/結合ペプチド/HLA-Eの融合遺伝子(HLA-E)を発現させて、宿主のT細胞およびNK細胞からの攻撃を受けないiPS細胞とした。このゲノム編集において、薬剤誘導型カスパーゼ9などの自殺遺伝子および/または特異的なマーカー遺伝子(EGFR(epidermal growth factor receptor)、CD19およびCD20など)を発現させることにより、生体内への投与後に細胞を除去することも可能となる。ゲノム編集後に再クローン化を行い、T細胞への分化効率が高いことを確認後、iPS細胞由来の再生T細胞のクローンとして保存し、マスターセルバンクを構築してもよい。iPS細胞から分化および増殖させた再生T細胞は、がん治療用再生T細胞を製造するためのホストT細胞であり、前記ホストT細胞によりマスターセルバンクを構築してもよい。前記ホストT細胞は、TCR遺伝子またはCAR(chimeric antigen receptor)遺伝子を導入した再生T細胞を作製する材料として使用することができる。前記ホストT細胞は、EBV抗原を認識するT細胞であるため、生体内に移入されてもアロ反応を起こしにくい。「ホストT細胞」とは、この細胞そのものは患者の治療に供されることはないが、再生T細胞を有効成分とするがんの予防または治療剤を製造するための出発原料として使用されるT細胞を意味する。
 図13は、前記ホストT細胞から、がん抗原を認識する再生T細胞を製造する方法を示す。EBV抗原を認識するホストT細胞において、CRISPR/Cas9を用いたゲノム編集による遺伝子置換により、再構成を生じたEBV抗原を認識するT細胞受容体β鎖を、それぞれがん抗原を認識するT細胞受容体β鎖とT細胞受容体α鎖とのT2aを介する連結体に置換した。一方、EBV抗原を認識するT細胞受容体α鎖は、CRISPR/Cas9を用いたゲノム編集により除去した。図13に記載された方法により、がん抗原を認識する再生T細胞の製造を行うことが可能であった。
 図14は、図11~13に示された方法をまとめて説明するものである。末梢血T細胞を初期化した同種のユニバーサルiPS細胞から製造された再生T細胞(iPS-T細胞)は、TCR遺伝子またはCAR遺伝子を導入したT細胞を作製するための出発原料とすることができる。「ユニバーサルiPS細胞」とは、免疫原性が非常に低いため、どのような種類のMHC(Major Histocompatibility Complex;主要組織適合性複合体)を持つ患者に対しても、拒絶反応を招来することなく使用することができるiPS細胞を意味する。即ち、MHCのマッチングを考慮することなく、患者に投与することができるiPS細胞である。MHCクラスIまたはMHCクラスII分子をノックアウトし、NK細胞を抑制するリガンドを発現させることにより、ユニバーサルiPS細胞を作製することができる。
 TCR遺伝子またはCAR遺伝子の導入には、従来のT細胞の補充療法または再生療法に用いられるT細胞の製造に使用されるウイルスベクターを用いてもよい。iPS-T細胞を出発原料とすることにより、がんの予防または治療剤の有効成分となる所望のT細胞を短期間に製造することが可能となる。またネオアンチゲンを認識するTCRの導入も容易であり、異なるネオアンチゲンを認識する複数のTCR遺伝子を導入することにより、多クローン性を維持したままのiPS-T細胞の製造も可能である。

 

Claims (28)

  1.  (1)被験者から得られるT細胞であって、腫瘍関連抗原に対して反応性を有し、かつCD106陽性T細胞集団から、単一細胞ごとに、T細胞受容体α鎖およびβ鎖をそれぞれコードするcDNAを調製する工程、
     (2)被験者の末梢血単核球であって、B細胞およびT細胞が除去された末梢血単核球またはT細胞をiPS細胞に初期化し、得られたiPS細胞からT細胞への分化効率が高いiPS細胞クローンを選別する工程、
     (3)前記cDNAを、前記iPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した成熟T細胞に導入する工程、および
     (4)工程(3)において得られた、前記cDNAが導入された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞または前記未熟T細胞の成熟T細胞への分化および前記成熟T細胞の増殖を行う工程、
    を含む、iPS細胞を介する再生T細胞の製造方法。
  2.  工程(2)の実施が、工程(1)の実施に先行する、または工程(1)の実施と並行する、請求項1に記載の方法。
  3.  工程(1)および(2)における被験者が、同一個体であって、がんの予防または治療対象である、請求項1または2に記載の方法。
  4.  工程(1)および(2)における被験者が、互いに別個体であって、工程(2)における被験者が、がんの予防または治療対象である、請求項1または2に記載の方法。
  5.  工程(1)および(2)における被験者が、互いに別個体であって、工程(1)における被験者が、がんの予防または治療対象である、請求項1または2に記載の方法。
  6.  工程(1)および(2)における被験者が、同一個体または互いに別個体であって、工程(1)および(2)における被験者とは異なる被験者が、がんの予防または治療対象である、請求項1または2記載の方法。
  7.  さらに、工程(4)において得られる前記cDNAが導入されたT細胞から、がんの予防または治療対象である被験者に由来する細胞に対してアロ反応を示さないT細胞を選別する工程を含む、請求項1または2に記載の方法。
  8.  さらに、工程(1)で調製されたcDNAから、がんの予防または治療対象である被験者に由来する細胞に対してアロ反応を誘導しないT細胞受容体をコードするcDNAを選別する工程を含む、請求項1または2に記載の方法。
  9.  がんの予防または治療対象である被験者に由来する前記細胞が、末梢血単核球である、請求項7または8に記載の方法。
  10.  工程(3)において、前記iPS細胞クローン、前記iPS細胞クローンから分化した前記造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した前記未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した前記成熟T細胞への前記cDNAの導入が、ウイルスベクターもしくは非ウイルスベクターを用いる、またはゲノム編集技術を用いる、請求項1~9のいずれか1項に記載の方法。
  11.  前記ゲノム編集技術が、CRISPR/Cas9またはTALENである、請求項10に記載の方法。
  12.  前記非ウイルスベクターが、トランスポゾンベクターである、請求項10に記載の方法。
  13.  前記トランスポゾンベクターが、piggyBac(登録商標)トランスポゾンベクターである、請求項12に記載の方法。
  14.  工程(4)において、前記cDNAが導入された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞または前記未熟T細胞の成熟T細胞への分化および前記成熟T細胞の増殖を行う工程が、フィーダー細胞およびPHA(phytohemagglutinin)の存在下、レトロネクチン(登録商標)および抗CD3抗体の存在下、または抗CD3抗体および抗CD28抗体の存在下で行われる、請求項1~13のいずれか1項に記載の方法。
  15.  前記フィーダー細胞が、自家または他家の末梢血単核球である、請求項14に記載の方法。
  16.  工程(1)または(2)における前記被験者が、肝細胞がん、肝芽腫、胃がん、食道がん、肺がん、膵臓がん、腎細胞がん、乳がん、卵巣がん、悪性黒色腫などの皮膚がん、膀胱がん、頭頸部がん、子宮がん、子宮頸がん、膠芽腫、前立腺がん、神経芽腫瘍、慢性リンパ性白血病、甲状腺乳頭がん、大腸がん、脳腫瘍、肉腫またはB細胞非ホジキンリンパ腫の患者である、請求項1~15のいずれか1項に記載の方法。
  17.  工程(1)または(2)における前記被験者が、免疫原性の高いがんの患者である、請求項1~15のいずれか1項に記載の方法。
  18.  前記免疫原性の高いがんが、肝細胞がん、肝芽腫、大腸がん、肺がんまたは悪性黒色腫である、請求項17に記載の方法。
  19.  工程(1)における前記T細胞集団が、CD3/CD106ダブルポジティブである、請求項1~18のいずれか1項に記載の方法。
  20.  前記造血幹細胞が、CD34/CD43ダブルポジティブである、請求項1~19のいずれか1項に記載の方法。
  21.  前記未熟T細胞が、CD8α鎖/β鎖ダブルポジティブである、請求項1~20のいずれか1項に記載の方法。
  22.  工程(2)において選別された、T細胞への分化効率が高いiPS細胞クローン、または工程(3)における前記iPS細胞クローンから分化した造血幹細胞、前記造血幹細胞から分化した未熟T細胞または前記未熟T細胞から分化した成熟T細胞を保存し、マスターセルバンクを構成する、請求項1~21のいずれか1項に記載の方法。
  23.  前記保存が凍結保存である、請求項22に記載の方法。
  24.  前記マスターセルバンクに保存された前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞に対して、工程(3)および(4)を行う、請求項22に記載の方法。
  25.  前記iPS細胞クローン、前記造血幹細胞、前記未熟T細胞または前記成熟T細胞を含む、請求項22に記載のマスターセルバンク。
  26.  請求項1~24のいずれか1項に記載の方法により製造された再生T細胞。
  27.  請求項26に記載の再生T細胞を含有する医薬組成物。
  28.  請求項27に記載の医薬組成物を用いる、がんの予防または治療方法。
     

     
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