WO2018034289A1 - ヌクレオシダーゼ - Google Patents

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WO2018034289A1
WO2018034289A1 PCT/JP2017/029389 JP2017029389W WO2018034289A1 WO 2018034289 A1 WO2018034289 A1 WO 2018034289A1 JP 2017029389 W JP2017029389 W JP 2017029389W WO 2018034289 A1 WO2018034289 A1 WO 2018034289A1
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nucleosidase
amino acid
acid sequence
enzyme
seq
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PCT/JP2017/029389
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English (en)
French (fr)
Inventor
啓太 奥田
徹 片瀬
祐子 栗谷
松本 直樹
朋子 藤村
伊玖磨 水口
隆子 乾
Original Assignee
天野エンザイム株式会社
サントリーホールディングス株式会社
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2497Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing N- glycosyl compounds (3.2.2)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12CBEER; PREPARATION OF BEER BY FERMENTATION; PREPARATION OF MALT FOR MAKING BEER; PREPARATION OF HOPS FOR MAKING BEER
    • C12C5/00Other raw materials for the preparation of beer
    • C12C5/004Enzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10Cells modified by introduction of foreign genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y302/00Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/02Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2) hydrolysing N-glycosyl compounds (3.2.2)
    • C12Y302/02001Purine nucleosidase (3.2.2.1)

Definitions

  • the present invention relates to a novel nucleosidase. Specifically, the present invention relates to a nucleosidase useful for reducing purines in foods or beverages.
  • This application claims priority based on Japanese Patent Application No. 2016-160899 filed on Aug. 18, 2016, the entire contents of which are incorporated by reference.
  • hyperuricemia and gout based on it has been on the rise due to westernization of eating habits and increased alcohol intake.
  • purines in foods or beverages are regarded as a problem.
  • livers, larvae or fish eggs, some seafood and the like contain a large amount of purines.
  • alcoholic beverages, particularly brewed liquors (beer, wine, etc.) contain a relatively large amount of purines. Since alcoholic beverages are often taken on a daily basis, it is considered important as a risk factor for hyperuricemia and gout.
  • beer and beer beverages such as beer and sparkling liquor generally contain about 3 to 8 mg of purine derived from raw materials (malt, etc.) in 100 mL, and the beer / beer beverage has a reduced purine content.
  • the provision of (low-pudding beer / beer-based beverage) is eagerly desired.
  • Patent Document 1 an enzyme (purine nucleoside phosphorylase or nucleosidase) is allowed to act on wort in the production process, thereby converting purine nucleoside in wort into ribose and free purine base. Decompose. Free purine base is assimilated by yeast during fermentation. As a result, the amount of purines (free purine bases, nucleotides, nucleosides) in the beer product is reduced.
  • Patent Document 2 also reports a nucleosidase useful for reducing purine bodies in beer.
  • Patent Document 3 a method for removing purine bodies by using an adsorbent has also been proposed.
  • the present inventors screened a wide variety of microorganisms in order to find an enzyme useful for the production of low-purine beer.
  • four strains of microorganisms were identified as promising candidates.
  • the utilization in the general conditions of a preparation process was evaluated supposing the utilization in the preparation process (mashing) of beer.
  • the nucleosidase produced by the three strains was probably inhibited by degradation products (adenine, guanine, hypoxanthine, xanthine) and could not exert the desired effect.
  • nucleosidase produced by the remaining one strain was not subject to product inhibition and showed high degradation activity. Therefore, it was decided to obtain nucleosidase from the strain. As a result, we succeeded in purifying two kinds of nucleosidases excellent in practicality that are not affected by product inhibition and exhibit activity even in the presence of adenosine, adenine, inosine, hypoxanthine, guanosine, guanine and xanthine. .
  • the inventors succeeded in identifying the amino acid sequences of the two types of nucleosidases and the genes encoding them, as well as specifying the properties of each nucleosidase. These enzymes have been found to be suitable for use in the beer charging process, particularly in terms of optimum temperature and temperature stability. In addition, it showed stable activity in a wide pH range and temperature range and was found to be applicable to beers / beer-based beverages (for example, fermented foods such as yogurt and pickles). As described above, after intensive studies, we succeeded in obtaining a novel nucleosidase that is extremely useful for reducing purines in beverages and foods. Based on this result, the following invention is provided.
  • a nucleosidase comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence that is 85% or more identical to the amino acid sequence, or the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or an amino acid sequence that is 88% or more identical to the amino acid sequence.
  • a nucleosidase having the following enzymatic properties (1) Action: Catalyzes the hydrolysis of purine nucleoside into D-ribose and purine base, and exhibits activity even in the presence of adenosine, adenine, inosine, hypoxanthine, guanosine, guanine and xanthine. (2) Molecular weight: The molecular weight without N-type sugar chain is about 49 kDa (according to SDS-PAGE), (3) Optimal temperature: 55 °C -60 °C (4) Temperature stability: Stable at 55 ° C or lower (pH 6.0, 30 minutes).
  • nucleosidase according to [3], further having the following enzymatic properties: (5) Optimal pH: 3.5, (6) pH stability: Stable in the range of pH 3.5 to 7.5 (30 ° C, 30 minutes).
  • the nucleosidase according to any one of [1] to [8], the culture solution of the microorganism producing the nucleosidase according to any one of [1] to [8], or a purified product thereof A nucleosidase agent comprising: [10] A nucleosidase gene comprising any DNA selected from the group consisting of the following (a) to (c): (a) DNA encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2; (b) a DNA comprising any one of the nucleotide sequences of SEQ ID NOS: 3 to 6; (c) DNA encoding a protein having a base sequence equivalent to any one of SEQ ID NOs: 3 to 6 and having nucleosidase activity.
  • a recombinant DNA comprising the nucleosidase gene according to [10].
  • a method for producing a nucleosidase comprising the following steps (1) and (2): (1) culturing a microorganism that produces the nucleosidase according to any one of [1] to [8]; (2) A step of recovering nucleosidase from the culture solution and / or the cells after culturing.
  • a method for producing a nucleosidase comprising the following steps (i) and (ii): (i) culturing the microorganism according to [12] under conditions under which a protein encoded by the gene is produced; (ii) recovering the produced protein.
  • a method for producing a nucleosidase agent comprising the following steps (I) and (II): (I) culturing a microorganism that produces the nucleosidase according to any one of [1] to [8]; (II) A step of removing the cells after culturing.
  • the production method according to [16] further comprising the following steps: (III) A step of purifying the culture solution after removing the cells.
  • Reaction process of mashing test Comparison of the amount of purines in wort. The amount of each purine in the wort after mashing was analyzed by high performance liquid chromatography. Operating temperature range of nucleosidase derived from Penicillium multicolor IFO 7569. In the presence of seven types of purines, an enzyme reaction was carried out at each temperature condition to determine the free purine base ratio. The pH range of action of nucleosidase derived from Penicillium multicolor IFO 7569. In the presence of seven types of purines, an enzyme reaction was carried out under each pH condition to determine the free purine base ratio. Purification of nucleosidase from Penicillium multicolor IFO 7569. The results of DEAE HP column chromatography are shown.
  • the leftmost lanes are molecular weight markers (myosin (200 kDa), ⁇ -galactosidase (116.3 kDa), phosphorylase B (97.4 kDa), BSA (66.3 kDa), glutamate dehydrogenase (55.4 kDa), lactate dehydrogenase (36.5 kDa), carbonic acid dehydration Elementary enzyme (31.0 kDa), trypsin inhibitor (21.5 kDa), lysozyme (14.4 kDa), aprotinin (6.0 kDa), insulin B chain (3.5 kDa), insulin A chain (2.5 kDa)). Molecular weight of each purified enzyme (peaks 1-3).
  • Probe sequence used for gene cloning Upper row: for PN1 (SEQ ID NO: 18), lower row: for PN2 (SEQ ID NO: 19).
  • Results of gene cloning The genome sequence (upper part, SEQ ID NO: 4) encoding the enzyme (PN1) of peak 3 and the genomic sequence (lower part: SEQ ID NO: 6) encoding the enzyme (PN2) of peaks 1 and 2 are shown.
  • a cDNA sequence encoding the enzyme of peak 3 (PN1) (upper row, SEQ ID NO: 3) and a cDNA sequence encoding the enzyme of peak 1 and 2 (PN2) (lower row, SEQ ID NO: 5) are shown.
  • results of gene cloning The amino acid sequence of the enzyme of peak 3 (PN1) (upper row, SEQ ID NO: 1) and the amino acid sequence of the enzyme of peak 1 and 2 (PN2) (lower row, SEQ ID NO: 2) are shown. Results of gene cloning. The number of cDNA bases, number of introns, amino acid length, molecular weight and estimated pI were compared between the peak 3 enzyme (PN1) and the peak 1 and 2 enzymes (PN2). Optimum temperature of purified enzyme (PN1). Temperature stability of purified enzyme (PN1). Optimum pH of purified enzyme (PN1). PH stability of purified enzyme (PN1). Results of electrophoresis of recombinantly produced enzyme (PN2).
  • PN2 Optimum temperature of purified enzyme
  • PN2 Temperature stability of purified enzyme
  • PN2 Optimum pH of purified enzyme
  • PN2 PH stability of purified enzyme
  • isolated is used herein interchangeably with “purified”.
  • isolated is used to distinguish it from its natural state, ie, one that exists in nature. An artificial operation of isolation results in an “isolated state” that is different from the natural state. What has been isolated is clearly and critically different from the natural product itself.
  • the purity of the isolated enzyme is not particularly limited. However, if application to a use requiring high purity is planned, it is preferable that the purity of the isolated enzyme is high.
  • the first aspect of the present invention provides a nucleosidase and its producing bacterium.
  • the present inventors have selected from two types of nucleosidases (hereinafter referred to as “PN1” and “PN2” corresponding to the notations in the examples) from Penicillium multicolor, which are useful for reducing purines in foods and beverages.
  • these two nucleosidases were sometimes collectively referred to as “the present enzyme”), and their gene sequence and amino acid sequence were identified.
  • the present enzyme is characterized by comprising an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, an amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, or an amino acid sequence equivalent to any of these amino acid sequences.
  • the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 corresponds to PN1
  • the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 corresponds to PN2.
  • the “equivalent amino acid sequence” here is partially different from the reference sequence (the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2), but the difference is the function of the protein (here, the nucleoside).
  • the degree of activity is not particularly limited as long as it can function as a nucleosidase. However, it is preferable that the enzyme has a polypeptide chain having a standard sequence or higher than that of the enzyme.
  • “Partial difference in amino acid sequence” typically means deletion or substitution of 1 to several amino acids (upper limit is 3, 5, 7, 10) constituting an amino acid sequence, Alternatively, it means that a mutation (change) has occurred in the amino acid sequence due to addition, insertion, or a combination of 1 to several amino acids (upper limit is 3, 5, 7, 10), for example. Differences in the amino acid sequence here are permissible as long as nucleosidase activity is retained (there may be some variation in activity). As long as this condition is satisfied, the positions where the amino acid sequences are different are not particularly limited, and differences may occur at a plurality of positions.
  • the term “plurality” refers to a number corresponding to less than about 15% of the total amino acid, preferably a number corresponding to less than about 10%, more preferably about 5 with respect to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. %, Even more preferably a number corresponding to less than about 3%, and most preferably a number corresponding to less than about 1%.
  • the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 is a number corresponding to less than about 12% of all amino acids, preferably a number corresponding to less than about 10%, and more preferably a number corresponding to less than about 5%. Even more preferably a number corresponding to less than about 3%, most preferably a number corresponding to less than about 1%.
  • the equivalent protein is, for example, about 85% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, still more preferably about 98% or more, and most preferably Has about 99% or more identity
  • the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 is used as a reference, for example, about 88% or more, preferably about 90% or more, more preferably about 95% or more, and still more preferably about It has 98% or more identity, most preferably about 99% or more identity.
  • the difference in amino acid sequence may occur at a plurality of positions.
  • equivalent amino acid sequences are obtained by conservative amino acid substitutions occurring at amino acid residues that are not essential for nucleosidase activity.
  • conservative amino acid substitution refers to substitution of a certain amino acid residue with an amino acid residue having a side chain having the same properties.
  • a basic side chain eg lysine, arginine, histidine
  • an acidic side chain eg aspartic acid, glutamic acid
  • an uncharged polar side chain eg glycine, asparagine, glutamine, serine, threonine, tyrosine
  • Cysteine eg alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine, tryptophan
  • ⁇ -branched side chains eg threonine, valine, isoleucine
  • aromatic side chains eg tyrosine, phenylalanine, Like tryptophan and histidine.
  • a conservative amino acid substitution is preferably a substitution between amino acid residues within the same family.
  • the identity (%) of two amino acid sequences or two nucleic acid sequences can be determined, for example, by the following procedure.
  • two sequences are aligned for optimal comparison (eg, a gap may be introduced into the first sequence to optimize alignment with the second sequence).
  • a molecule amino acid residue or nucleotide
  • Gapped BLAST described in Altschul et al. (1997) Amino Acids Research 25 (17): 3389-3402 can be used.
  • the default parameters of the corresponding programs eg, XBLAST and NBLAST
  • gap weight 12, 10, 8, 6, or 4
  • the enzyme may be part of a larger protein (eg, a fusion protein).
  • a larger protein eg, a fusion protein
  • sequences added in the fusion protein include sequences useful for purification, such as multiple histidine residues, and additional sequences that ensure stability during recombinant production.
  • the present enzyme having the above amino acid sequence can be easily prepared by a genetic engineering technique. For example, it can be prepared by transforming a suitable host cell (for example, E. coli) with DNA encoding the present enzyme and recovering the protein expressed in the transformant. The recovered protein is appropriately purified according to the purpose. Thus, if this enzyme is obtained as a recombinant protein, various modifications are possible. For example, if a DNA encoding this enzyme and another appropriate DNA are inserted into the same vector and a recombinant protein is produced using the vector, the peptide consists of a recombinant protein linked to any peptide or protein. This enzyme can be obtained.
  • a suitable host cell for example, E. coli
  • modification may be performed so that addition of sugar chain and / or lipid, or processing of N-terminal or C-terminal may occur.
  • modification as described above, extraction of recombinant protein, simplification of purification, addition of biological function, and the like are possible.
  • PN1 is a nucleosidase and catalyzes a reaction of hydrolyzing a purine nucleoside into D-ribose and a purine base.
  • a purine nucleoside is a glycoside in which a purine base and a reducing group of a sugar are bonded by an N-glycoside bond.
  • purine nucleosides examples are adenosine, guanosine, inosine.
  • Purine base is a general term for bases having a purine skeleton, and specific examples are adenine, guanine, hypoxanthine, and xanthine.
  • compounds having a purine skeleton including purine nucleotides are collectively referred to as purines.
  • PN1 is active even in the presence of adenosine, adenine, inosine, hypoxanthine, guanosine, guanine and xanthine. That is, it is not substantially inhibited by the decomposition products. This feature is particularly important in applying this enzyme to the production of foods and beverages. According to PN1 showing this characteristic, purine nucleosides derived from raw materials can be efficiently decomposed in the production process of foods and beverages.
  • Molecular weight PN1 contained a sugar chain (that is, a glycoprotein) in the natural type, and the molecular weight before removal of the N-type sugar chain was about 53 kDa (molecular weight measured by SDS-PAGE). It was estimated to be about 126 kDa as measured by gel filtration chromatography, forming a dimer. On the other hand, when the molecular weight was measured by SDS-PAGE after removing the N-type sugar chain, it was about 49 kDa. Therefore, the molecular weight of this enzyme when it does not contain an N-type sugar chain is about 49 kDa (molecular weight measured by SDS-PAGE).
  • Optimum temperature The optimum temperature of PN1 is 55 °C -60 °C. Such a high optimum temperature is advantageous for application to the production of foods and beverages that undergo a treatment process at a relatively high temperature.
  • the optimum temperature can be evaluated by quantifying the reaction product ribose using acetate buffer (pH 4.3) and guanosine as a substrate.
  • PN1 maintains an activity of 80% or more at a temperature of 45 ° C or lower. Therefore, for example, if the temperature during the treatment is in the range of 5 ° C. to 45 ° C., the residual activity after the treatment is 80% or more.
  • PN1 when PN1 is treated in a phosphate buffer solution (pH 6.0) for 30 minutes, it maintains an activity of 80% or more at a temperature condition of 55 ° C. or lower. Therefore, for example, when the temperature during the treatment is in the range of 5 ° C. to 55 ° C., the residual activity after the treatment is 80% or more.
  • PN1 showing such excellent temperature stability can exhibit high activity even under relatively high temperature conditions such as a beer charging process.
  • PN1 can be further characterized by the following enzymological properties (5) and (6).
  • (5) Optimum pH The optimum pH of PN1 is 3.5.
  • the optimum pH is, for example, in citrate buffer in the pH range of pH 2.5 to 3.5, in acetate buffer in the pH range of pH 3.5 to 5.5, and in potassium phosphate buffer in the pH range of pH 5.5 to 6.5. Judgment is made based on the measurement results.
  • pH stability PN1 shows stable activity over a wide pH range. For example, if the pH of the enzyme solution to be treated is in the range of 3.5 to 7.5, it shows 80% or more of the maximum activity after 30 minutes at 30 ° C. Further, in the case of treatment at 50 ° C. for 60 minutes, if the pH of the enzyme solution to be treated is in the range of 3.5 to 7.5, it exhibits an activity of 80% or more of the maximum activity after the treatment.
  • the pH stability is, for example, citrate buffer in the pH range of 2.5 to 3.5, acetate buffer in the pH range of 3.5 to 5.5, and potassium phosphate buffer in the pH range of 5.5 to 6.5. It is judged based on the result measured in
  • PN2 is a nucleosidase and catalyzes a reaction of hydrolyzing a purine nucleoside into D-ribose and a purine base.
  • PN2 is active even in the presence of adenosine, adenine, inosine, hypoxanthine, guanosine, guanine and xanthine. That is, it is not substantially inhibited by the decomposition products. This feature is particularly important in applying this enzyme to the production of foods and beverages. According to PN1 showing this characteristic, purine nucleosides derived from raw materials can be efficiently decomposed in the production process of foods and beverages.
  • Molecular weight PN2 contained a sugar chain (that is, a glycoprotein) in the natural type, and the molecular weight before removal of the N-type sugar chain was about 51 kDa (molecular weight measured by SDS-PAGE). It was about 230 kDa as measured by gel filtration chromatography. On the other hand, when the molecular weight was measured by SDS-PAGE after removing the N-type sugar chain, it showed about 40 kDa. Therefore, the molecular weight of this enzyme when it does not contain an N-type sugar chain is about 40 kDa (molecular weight measured by SDS-PAGE).
  • Optimum temperature The optimum temperature of PN2 is 50 °C ⁇ 55 °C. Such a high optimum temperature is advantageous for application to the production of foods and beverages that undergo a treatment process at a relatively high temperature.
  • the optimum temperature can be evaluated by quantifying the reaction product ribose using acetate buffer (pH 4.3) and guanosine as a substrate.
  • PN2 maintains an activity of 80% or more at a temperature of 65 ° C or lower. Therefore, for example, if the temperature during the treatment is in the range of 5 ° C. to 65 ° C., the residual activity after the treatment is 80% or more.
  • PN2 when PN2 is treated in a phosphate buffer (pH 6.0) for 30 minutes, it maintains an activity of 80% or more at a temperature of 55 ° C. or lower. Therefore, for example, when the temperature during the treatment is in the range of 5 ° C. to 55 ° C., the residual activity after the treatment is 80% or more.
  • PN2 exhibiting such excellent temperature stability can exhibit high activity even under relatively high temperature conditions such as a beer charging process.
  • PN2 can be further characterized by the following enzymological properties (5) and (6).
  • (5) Optimum pH The optimum pH of PN2 is 4.5.
  • the optimum pH is, for example, in citrate buffer in the pH range of pH 2.5 to 3.5, in acetate buffer in the pH range of pH 3.5 to 5.5, and in potassium phosphate buffer in the pH range of pH 5.5 to 6.5. Judgment is made based on the measurement results.
  • pH stability PN2 shows stable activity over a wide pH range. For example, if the pH of the enzyme solution to be treated is in the range of 3.5 to 7.5, it shows 80% or more of the maximum activity after 30 minutes at 30 ° C. In addition, in the case of treatment at 50 ° C. for 60 minutes, if the pH of the enzyme solution to be treated is in the range of 4.5 to 7.5, the activity shows 80% or more of the maximum activity after the treatment.
  • the pH stability is, for example, citrate buffer in the pH range of 2.5 to 3.5, acetate buffer in the pH range of 3.5 to 5.5, and potassium phosphate buffer in the pH range of 5.5 to 6.5. It is judged based on the result measured in
  • the enzyme is preferably a nucleosidase derived from Penicillium multicolor.
  • nucleosidase derived from Penicillium multicolor means a nucleosidase produced by a microorganism (either wild or mutant) classified as Penicillium multicolor, or Penicillium It means a nucleosidase obtained by a genetic engineering technique using a multicolor (either wild or mutant) nucleosidase gene.
  • a recombinant produced by a host microorganism into which a nucleosidase gene obtained from Penicillium multicolor (or a gene obtained by modifying the gene) is also a “nucleosidase derived from Penicillium multicolor”.
  • the penicillium multicolor from which the enzyme is derived is referred to as the producing microorganism of the enzyme for convenience of explanation.
  • the Penicillium multicolor IFO 7569 strain is a strain preserved in the National Institute of Technology and Evaluation (2-5-8 Kazusa Kamashizu, Kisarazu City, Chiba Prefecture) (listed as NBRC 7569 in the NBRC Culture catalog) It can be obtained through a prescribed procedure.
  • the gene of the present invention comprises DNA encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2.
  • the gene of the present invention comprises DNA consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 3 (corresponding to the cDNA encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1), DNA consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 4 (coding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1).
  • DNA corresponding to the genome sequence of SEQ ID NO: 5 (corresponding to cDNA encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2), DNA consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 6 (amino acid sequence of SEQ ID NO: 2) Corresponding to the genomic DNA to be encoded).
  • the gene encoding this enzyme is typically used for the preparation of this enzyme. According to a genetic engineering preparation method using a gene encoding this enzyme, it is possible to obtain the enzyme in a more homogeneous state. This method can also be said to be a suitable method when preparing a large amount of the present enzyme.
  • the use of the gene encoding this enzyme is not limited to the preparation of this enzyme.
  • the gene can also be used as an experimental tool for elucidating the mechanism of action of the enzyme or as a tool for designing or preparing a mutant (modified) of the enzyme.
  • the “gene encoding the enzyme” refers to a nucleic acid from which the enzyme is obtained when it is expressed, not to mention a nucleic acid having a base sequence corresponding to the amino acid sequence of the enzyme. Also included are nucleic acids obtained by adding sequences that do not encode amino acid sequences to such nucleic acids. Codon degeneracy is also considered.
  • the gene of the present invention can be obtained by referring to sequence information disclosed in this specification or the attached sequence listing, using standard genetic engineering techniques, molecular biological techniques, biochemical techniques, chemical synthesis, PCR methods (for example, overexpression). Wrap PCR) or a combination thereof can be prepared in an isolated state.
  • the protein encoded by the modified DNA may have the same function as the protein encoded by the DNA before modification. That is, the modification of the DNA sequence does not substantially affect the function of the encoded protein, and the function of the encoded protein may be maintained before and after the modification. Therefore, as another embodiment of the present invention, a DNA encoding a protein having a base sequence equivalent to a reference base sequence (any one of SEQ ID NOs: 3 to 6) and having a nucleosidase activity (hereinafter, “equivalent” DNA ”).
  • the “equivalent base sequence” here is partially different from the nucleic acid shown in the base sequence as a reference, but the function of the protein encoded by it (in this case, nucleosidase activity) has a substantial effect.
  • a specific example of equivalent DNA is DNA that hybridizes under stringent conditions to a base sequence complementary to a reference base sequence.
  • the “stringent conditions” here are conditions under which so-called specific hybrids are formed and non-specific hybrids are not formed.
  • Such stringent conditions are known to those skilled in the art, such as Molecular Cloning (Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York) and Current protocols in molecular biology (edited by Frederick M. Ausubel et al., 1987) Can be set with reference to.
  • hybridization solution 50% formamide, 10 ⁇ SSC (0.15M NaCl, 15 mM sodium citrate, pH 7.0), 5 ⁇ Denhardt solution, 1% SDS, 10% dextran sulfate, 10 ⁇ g / ml denaturation
  • the conditions include incubation at about 50 ° C. using salmon sperm DNA, 50 mM phosphate buffer (pH 7.5), and then washing at about 65 ° C. using 0.1 ⁇ SSC, 0.1% SDS.
  • Further preferable stringent conditions include, for example, 50% formamide, 5 ⁇ SSC (0.15M NaCl, 15 mM sodium citrate, pH 7.0), 1 ⁇ Denhardt solution, 1% SDS, 10% dextran sulfate, 10 ⁇ g / ml as a hybridization solution. Of denatured salmon sperm DNA, 50 mM phosphate buffer (pH 7.5)).
  • equivalent DNA it consists of a base sequence including substitution, deletion, insertion, addition, or inversion of one or more (preferably 1 to several) bases with respect to a base base sequence
  • Examples include DNA encoding a protein having nucleosidase activity. Base substitution or deletion may occur at a plurality of sites.
  • the term “plurality” as used herein refers to, for example, 2 to 40 bases, preferably 2 to 20 bases, more preferably 2 to 10 bases, although it varies depending on the position and type of amino acid residues in the three-dimensional structure of the protein encoded by the DNA. It is a base.
  • the equivalent DNA is, for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably about 90% or more, and still more preferably 95% with respect to the base sequence (sequence of any of SEQ ID NOs: 3 to 6). As mentioned above, it has the identity of 99% or more most preferably.
  • Such equivalent DNAs include, for example, restriction enzyme treatment, treatment with exonuclease and DNA ligase, position-directed mutagenesis (MolecularMCloning, Third Edition, Chapter 13, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York) Includes substitutions, deletions, insertions, additions, and / or inversions of bases using mutation introduction methods (Molecular Cloning, ingThird Edition, Chapterhap13, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York) Thus, it can obtain by modifying DNA which has a base sequence used as a standard.
  • the equivalent DNA can also be obtained by other methods such as ultraviolet irradiation.
  • Still another example of equivalent DNA is DNA in which a base difference as described above is recognized due to a polymorphism represented by SNP (single nucleotide polymorphism).
  • Another aspect of the present invention relates to a nucleic acid having a base sequence complementary to the base sequence of a gene encoding the enzyme of the present invention. Still another embodiment of the present invention provides at least about 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 99% of the base sequence of the gene encoding the enzyme of the present invention or a base sequence complementary thereto. % Or 99.9% nucleic acid having the same base sequence is provided.
  • Still another aspect of the present invention relates to a recombinant DNA containing the gene of the present invention (gene encoding the enzyme).
  • the recombinant DNA of the present invention is provided, for example, in the form of a vector.
  • vector refers to a nucleic acid molecule capable of transporting a nucleic acid inserted therein into a target such as a cell.
  • An appropriate vector is selected according to the purpose of use (cloning, protein expression) and in consideration of the type of host cell.
  • Examples of vectors using insect cells as hosts include pAc and pVL, and examples of vectors using mammalian cells as hosts include pCDM8 and pMT2PC.
  • the vector of the present invention is preferably an expression vector.
  • “Expression vector” refers to a vector capable of introducing a nucleic acid inserted therein into a target cell (host cell) and allowing expression in the cell.
  • Expression vectors usually contain a promoter sequence necessary for the expression of the inserted nucleic acid, an enhancer sequence that promotes expression, and the like.
  • An expression vector containing a selectable marker can also be used. When such an expression vector is used, the presence / absence (and extent) of introduction of the expression vector can be confirmed using a selection marker.
  • Insertion of DNA into a vector, insertion of a selectable marker gene (if necessary), insertion of a promoter (if necessary), etc. are performed using standard recombinant DNA techniques (eg, Molecular Cloning, Third Edition, 1.84, Cold Spring Harbor Laboratory Can be performed using a known method using a restriction enzyme and DNA ligase), which can be referred to Press, “New York”.
  • the present invention further relates to a host cell (transformant) into which the recombinant DNA of the present invention (including the gene of the present invention) has been introduced.
  • the recombinant DNA of the present invention exists as an exogenous molecule.
  • the transformant of the present invention is preferably prepared by transfection or transformation using the vector of the present invention. For transfection and transformation, calcium phosphate coprecipitation method, electroporation (Potter, H. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 7161-7165 (1984)), lipofection (Felgner, PL et al. , Proc. Natl. Acad. Sci.
  • the host cell is not particularly limited as long as the present enzyme is expressed. Selected from yeasts such as Saccharomyces, Kluyveromyces, Candida, Torula and Torulopsis, Aspergillus genus such as Aspergillus eoryzae and Aspergillus niger, filamentous fungi such as the genus Penicillium, Trichoderma and Fusarium.
  • yeasts such as Saccharomyces, Kluyveromyces, Candida, Torula and Torulopsis
  • Aspergillus genus such as Aspergillus eoryzae and Aspergillus niger
  • filamentous fungi such as the genus Penicillium, Trichoderma and Fusarium.
  • the third aspect of the present invention provides a method for producing a nucleosidase.
  • a step of culturing a microorganism that produces the enzyme (step (1)) and a step of recovering nucleosidase from the culture solution and / or cells after the culture (step (2)) I do.
  • the microorganism producing this enzyme is, for example, Penicillium multicolor, preferably Penicillium multicolor IFO 7569 strain or a mutant thereof.
  • Mutant strains can be obtained by irradiation with ultraviolet rays, X-rays, ⁇ -rays, treatment with nitrous acid, hydroxylamine, N-methyl-N′-nitro-N-nitrosoguanidine, and the like.
  • Culture conditions and culture methods are not particularly limited as long as this enzyme is produced. That is, on the condition that the present enzyme is produced, a method and culture conditions suitable for culturing the microorganism to be used can be appropriately set.
  • the culture method may be either liquid culture or solid culture, but preferably liquid culture is used. Taking liquid culture as an example, the culture conditions will be described.
  • the medium is not particularly limited as long as the microorganism to be used can grow.
  • carbon sources such as glucose, sucrose, gentiobiose, soluble starch, glycerin, dextrin, molasses, organic acids, ammonium sulfate, ammonium carbonate, ammonium phosphate, ammonium acetate, or peptone, yeast extract, corn steep liquor, casein
  • Nitrogen sources such as hydrolysates, bran and meat extracts, and further added with inorganic salts such as potassium salts, magnesium salts, sodium salts, phosphates, manganese salts, iron salts and zinc salts can be used.
  • vitamins, amino acids and the like may be added to the medium.
  • the pH of the medium is adjusted to, for example, about 3 to 8, preferably about 4 to 7, and the culture temperature is usually about 20 to 40 ° C., preferably about 25 to 35 ° C. for 1 to 20 days, preferably 3 to Incubate for about 10 days under aerobic conditions.
  • the culture method for example, a shaking culture method or an aerobic deep culture method using a jar fermenter can be used.
  • the target enzyme is recovered from the culture broth or cells (step (2)).
  • the culture supernatant is filtered, centrifuged, etc. to remove insolubles, concentrated by ultrafiltration membrane, salting out such as ammonium sulfate precipitation, dialysis, ion exchange resin, etc.
  • the present enzyme can be obtained by performing separation and purification by appropriately combining various types of chromatography.
  • the microbial cells are crushed by pressure treatment, ultrasonic treatment, etc., and then separated and purified in the same manner as described above to obtain the enzyme.
  • recovering a microbial cell from a culture solution previously by filtration, a centrifugation process, etc. you may perform said series of processes (crushing, isolation
  • a nucleosidase is produced using the above transformant.
  • the above-mentioned transformant is cultured under the condition that a protein encoded by the gene introduced therein is produced (step (i)).
  • Culture conditions for transformants are known for various vector host systems, and those skilled in the art can easily set appropriate culture conditions.
  • the produced protein ie, nucleosidase
  • recovery and subsequent purification may be performed in the same manner as in the above embodiment.
  • the degree of purification of nucleosidase is not particularly limited.
  • the final form may be liquid or solid (including powder).
  • the purified enzyme obtained as described above can be provided by pulverization, for example, by freeze drying, vacuum drying or spray drying. At that time, the purified enzyme may be dissolved in advance in an acetate buffer, phosphate buffer, triethanolamine buffer, Tris-HCl buffer or GOOD buffer.
  • acetate buffer, phosphate buffer, and triethanolamine buffer can be used.
  • PIPES, MES, or MOPS is mentioned as a GOOD buffer here.
  • Enzyme Nucleosidase
  • This enzyme is provided, for example, in the form of an enzyme agent (nucleosidase agent).
  • the present enzyme agent may contain excipients, buffers, suspending agents, stabilizers, preservatives, preservatives, physiological saline and the like.
  • the degree of purification of the enzyme as an active ingredient is not particularly limited. That is, it may be a crude enzyme or a purified enzyme.
  • the excipient lactose, sorbitol, D-mannitol, maltodextrin, sucrose and the like can be used. Phosphate, citrate, acetate, etc. can be used as the buffer.
  • propylene glycol, ascorbic acid or the like can be used.
  • preservatives phenol, benzalkonium chloride, benzyl alcohol, chlorobutanol, methylparaben, and the like can be used.
  • preservatives benzalkonium chloride, paraoxybenzoic acid, chlorobutanol and the like can be used.
  • the enzyme agent in order to obtain a liquid enzyme agent by a simple operation, is produced by a production method including the following steps (I) and (II).
  • steps (I) and (II) Step of culturing a microorganism that produces this enzyme
  • steps (II) Step of removing cells after culturing
  • Step (I) is the same as the above step (1) in the method for producing the present enzyme, and therefore its description is omitted.
  • step (II) following step (I) the cells are removed using centrifugation, filtration, filter treatment, or the like.
  • the culture solution containing no bacterial cells thus obtained is used as an enzyme agent as it is or after undergoing a further treatment (ie, a step of purifying the culture solution after removing the bacterial cells (step (III)).
  • concentration by an ultrafiltration membrane can be mentioned.
  • a further aspect of the present invention provides use of the enzyme or the enzyme agent.
  • “Beer-based beverages” include “Happoshu”, which uses less malt, and beer-flavored alcoholic beverages (generally referred to as “Third Beer”). Included).
  • the third beer is roughly classified into one brewed without using malt as a raw material, and one obtained by mixing another alcoholic beverage (typically barley spirits) with happoshu. Under the current liquor tax law, the former is classified as other brewed liquor (foaming) (1), and the latter is classified as liqueur (foaming) (1).
  • the usage mode will be described by taking as an example the case of applying the present enzyme or the present enzyme agent to the production of beer. The same applies to the case of application to beer-based beverages.
  • this enzyme acts on wort during the beer production process, and the purine nucleoside in the wort is decomposed into D-ribose and purine base.
  • Yeasts used for beer fermentation usually cannot assimilate purine nucleosides but can assimilate free purine bases. Therefore, if purine nucleosides in wort are converted into free purine bases by the action of this enzyme, beer can be obtained in which yeast assimilates the free purine bases during the fermentation process and the total amount of purine bodies is reduced.
  • the present enzyme or the present enzyme agent is also useful for the purpose of reducing purines in foods or beverages other than beer or beer-based beverages.
  • a purine nucleoside derived from a raw material can be converted into a free purine base. If the free purine base is removed in the subsequent production process, a food / beverage with a reduced purine content can be obtained. Therefore, the present enzyme or the present enzyme agent can be applied to the production of foods or beverages from which free purine base can be removed during the production process.
  • Examples of such foods and beverages are foods and beverages utilizing fermentation by microorganisms capable of assimilating free purine bases, that is, fermented foods and fermented beverages.
  • Specific examples include various pickles, miso, soy sauce, yogurt, fermented milk, lactic acid bacteria beverages, Shaoxing liquor, wine and the like.
  • the enzyme / enzyme agent is added to the raw material before or during fermentation to act, and the purine nucleoside in the raw material is converted to D- Decomposes into ribose and purine base.
  • the purine base produced is typically assimilated by the microorganism during fermentation. As a result, a food or beverage with a reduced total amount of purines can be obtained.
  • Penicillium multicolor IFO 7569 strain was inoculated into 100 mL of the following culture medium B, and cultured with shaking in a 500 mL Sakaguchi flask at 27 ° C for 48 to 72 hours. This preculture was transferred to the following culture medium B 2 L and cultured with aeration and stirring at 27 ° C. for 120 to 188 hours. This culture solution was filtered through diatomaceous earth, and the culture supernatant from which the cells had been removed was concentrated with an ultrafiltration membrane to obtain a freeze-dried powder.
  • Nucleosidase activity was defined by quantifying ribose produced by a reaction using guanosine as a substrate. 1 mL of the reaction solution contains 0.1 M acetate buffer (pH 4.3), 8 mM guanosine and an appropriate amount of enzyme. The reaction was started by adding guanosine, and the reaction was carried out at 55 ° C. for 30 minutes. The reaction was stopped by adding 1.5 mL of 0.5% dinitrosalicylic acid solution, followed by boiling for 10 minutes. The absorbance at 540 nm of the reaction solution after cooling was measured, and the activity value was calculated from the value obtained by subtracting the absorbance of the reaction solution to which no enzyme was added. The amount of enzyme producing 1 ⁇ mol of ribose in 30 minutes was defined as 1 U of enzyme activity.
  • nucleosidase derived from Penicillium multicolor IFO 7569 strain In the wort added with nucleosidase derived from Penicillium multicolor IFO 7569 strain (P. multicolor), the purine nucleosides decreased and the purine base increased. In contrast, nucleosidases from Bacillus brevis IFO-15304, Brevibacillus linens IFO-12141, and Mucor javanicus 4068 are likely degradation products (adenine, guanine). , Hypoxanthine and xanthine), and the amount of purine nucleoside was not significantly changed.
  • nucleosidase derived from Penicillium multicolor IFO 7569 strain was purified by hydroxyapatite column, anion exchange column, hydrophobic column, and gel filtration column chromatography. A series of purification steps are shown below. First, 0.1 g of lyophilized powder prepared from the culture solution of Penicillium multicolor IFO 7569 strain was dissolved in 5 mL of buffer (5 mM potassium phosphate buffer (pH 6) +0.3 M NaCl) and equilibrated with this buffer. It applied to the apatite column (BioRad).
  • the adsorbed protein was eluted with a gradient of 5 mM to 300 mM phosphoric acid to recover the active fraction.
  • the obtained active fraction was dialyzed with a buffer (20 mM potassium phosphate buffer (pH 5.5)) and applied to a DEAE HP column (GE Healthcare) equilibrated with the same buffer.
  • a buffer (20 mM potassium phosphate buffer (pH 5.5))
  • DEAE HP column GE Healthcare
  • the collected peak 3 was dialyzed with a buffer (20 mM acetic acid buffer (pH 4.5) + 30% saturated ammonium sulfate) and applied to a Phenyl HP column (GE Healthcare) equilibrated with the same buffer.
  • the adsorbed protein was eluted with a gradient from 30% saturation to 0% ammonium sulfate to collect the active fraction.
  • the obtained active fraction was dialyzed against a buffer (20 mM sodium phosphate buffer (pH 6)) and then concentrated to 0.5 mL using an ultrafiltration membrane.
  • the concentrated active fraction was subjected to HiLoad 16/60 Superdex200 (GE Healthcare) equilibrated with the same buffer to collect the active fraction.
  • the obtained purified enzyme was confirmed to be a single band by SDS-PAGE (FIG. 6).
  • the molecular weight was estimated to be about 53 kDa by SDS-PAGE and about 126 kDa by gel filtration chromatography (FIG. 7).
  • the sugar chain of the obtained purified enzyme was removed with PNGase F (New England BioLabs).
  • the treatment method followed the attached protocol.
  • SDS-PAGE after treatment showed that the molecular weight was reduced from about 53 kDa to about 49 kDa by removing the N-type sugar chain (Figs. 6 and 7).
  • the recovered peaks 1 and 2 were similarly purified, and the molecular weight was determined by SDS-PAGE and gel filtration chromatography.
  • the molecular weight was estimated to be about 51 kDa by SDS-PAGE and about 230 kDa by gel filtration chromatography (FIG. 7).
  • the sugar chain of the obtained purified enzyme was removed with PNGase F (New England BioLabs).
  • SDS-PAGE after the treatment showed that the molecular weight was changed from about 51 kDa to about 40 kDa by removing the N-type sugar chain (FIGS. 6 and 7).
  • N-terminal amino acid sequence of peak 1 ADKHYAIMDNDWYTA (SEQ ID NO: 7)
  • N-terminal amino acid sequence of peak 2 ADKHYAIMDNDWYTA (SEQ ID NO: 8)
  • N-terminal amino acid sequence of peak 3 VETKLIFLT (SEQ ID NO: 9)
  • Peak 1 and peak 2 had the same molecular weight and N-terminal amino acid sequence, and were estimated to be the same enzyme (FIG. 7).
  • the enzyme was called PN2, and the peak 3 enzyme was called PN1.
  • the obtained amplified fragment was subcloned into pMD20-T (TaKaRa) and sequenced, and Southern blotting and colony hybridization were performed using the probe shown in FIG.
  • the obtained fragments were sequenced to identify the nucleotide sequences (FIG. 9) in the genomes of PN1 and PN2.
  • cDNA was prepared from mRNA prepared from P. multicolor genomic DNA using SMARTER RACE 5 ′ / 3 ′ (TaKaRa). Then, PCR was performed using the following primers, the amplified fragments were sequenced, and the nucleotide sequences of PN1 and PN2 in the cDNA were determined (FIG. 10). Moreover, the amino acid sequence of PN1 and PN2 was identified from the determined base sequence (FIG. 11). In FIG. 12, PN1 and PN2 were compared.
  • ⁇ PCR primer for PN1> FW: ATGGCACCTAAGAAAATCATCATTG (SEQ ID NO: 14) RV: TTAGTGGAAGATTCTATCGATGAGG (SEQ ID NO: 15)
  • ⁇ PCR primer for PN2> FW: ATGCATTTCCCTGTTTCATTGCCGC (SEQ ID NO: 16) RV: TCAACGCTCATTTCTCAGGTCGG (SEQ ID NO: 17)
  • the nucleosidase of peak 3 recovered from the DEAE HP column was analyzed for pH stability when treated at 30 ° C. for 30 minutes and at 50 ° C. for 60 minutes at each pH.
  • the buffer used was the same as that used in the examination of the optimum pH, and a potassium phosphate buffer was used for pH 7.5.
  • pH 3.5 to 7.5 When treated at 30 ° C. for 30 minutes, the pH was 3.5 to 7.5, and when treated at 50 ° C. for 60 minutes, pH 3.5 to 7.5 showed a residual activity of 80% or more (FIG. 16).
  • the nucleosidase of the present invention is characterized in that it exhibits activity even in the presence of a degradation product purine.
  • the present invention can be used to produce various low-purine foods or beverages such as low-purine beer.

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Abstract

低プリン体食品又は飲料の製造に有用な新規酵素を提供することを課題とする。配列番号1のアミノ酸配列若しくは当該アミノ酸配列と85%以上同一のアミノ酸配列、又は配列番号2のアミノ酸配列若しくは当該アミノ酸配列と88%以上同一のアミノ酸配列、を含む、ヌクレオシダーゼが開示される。

Description

ヌクレオシダーゼ
 本発明は新規ヌクレオシダーゼに関する。詳しくは、食品又は飲料中のプリン体の低減に有用なヌクレオシダーゼに関する。本出願は、2016年8月18日に出願された日本国特許出願第2016-160899号に基づく優先権を主張するものであり、当該特許出願の全内容は参照により援用される。
 食生活の欧米化やアルコール摂取量の増加により、高尿酸血症及びそれを基盤とした痛風の有病率は上昇傾向にある。これらの疾患の原因の一つとして食品又は飲料中のプリン体が問題視されている。例えば、レバー類、白子又は魚卵、一部の魚介類などはプリン体を多く含有する。また、アルコール飲料、特に醸造酒(ビール、ワイン等)にもプリン体が比較的多く含まれる。アルコール飲料は日常的に摂取されることが多いことから、高尿酸血症及び痛風のリスク要因として重要と考えられる。例えば、ビールや発泡酒などのビール系飲料には、一般に、原料(麦芽等)由来のプリン体が100mL中に3~8mg程度含まれており、プリン体含有量の低減したビール/ビール系飲料(低プリン体ビール/ビール系飲料)の提供が切望されている。
 これまでにも、ビール中のプリン体を低減させることが試みられている。例えば、特許文献1に記載された方法では、製造工程において、麦汁に酵素(プリンヌクレオシド・フォスフォリラーゼ又はヌクレオシダーゼ)を作用させることにより、麦汁中のプリンヌクレオシドをリボースと遊離プリン塩基に分解する。遊離プリン塩基は発酵中に酵母によって資化される。その結果、ビール製品中のプリン体(遊離プリン塩基、ヌクレオチド、ヌクレオシド)の量が低減する。特許文献2にも、ビール中のプリン体低減に有用なヌクレオシダーゼが報告されている。また、吸着剤の使用によってプリン体を除去する方法も提案されている(特許文献3)。
特許第3824326号公報 特許第3824353号公報 特開2004-113189号公報
 以上のように、ビール中のプリン体を除去するための各種技術が報告されているものの、実用化された例はなく、低プリン体ビールを製造する技術に対するニーズは依然として高い。また、発泡酒などのビール系飲料については、麦芽使用率を低減させることや麦芽以外の原料を使用することによってプリン体含有量を少なくすることが可能ではあるが、使用する原料が制約されることから、根本的な解決策とはいえない。そこで本発明は、特にビール又はビール系飲料中のプリン体低減に有用な新規酵素を提供することを課題とする。また、当該酵素の各種用途を提供することも課題とする。
 上記課題の下で本発明者らは、低プリン体ビールの製造に有用な酵素を見出すべく、広範な種類の微生物を対象にスクリーニングを実施した。一万種を超える微生物について検討した結果、4株の微生物が有望な候補として同定された。これらの微生物の産生するヌクレオシダーゼについて、ビールの仕込(マッシング)工程での利用を想定し、仕込工程の一般的な条件での作用・効果を評価した。その結果、3株の産生するヌクレオシダーゼは、おそらく分解生成物(アデニン、グアニン、ヒポキサンチン、キサンチン)による阻害を受け、所望の効果を発揮できないことが判明した。その一方で、残りの1株(ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株)の産生するヌクレオシダーゼは生成物阻害を受けず、高い分解活性を示した。そこで、当該菌株からヌクレオシダーゼの取得を試みることにした。その結果、生成物阻害を受けず、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示すという、実用性に優れた2種類のヌクレオシダーゼを精製することに成功した。更なる検討によって、当該2種類のヌクレオシダーゼのアミノ酸配列及びそれをコードする遺伝子の同定に成功するととともに、各ヌクレオシダーゼの諸性質を特定することにも成功した。これらの酵素は、特に至適温度及び温度安定性の点において、ビールの仕込工程での使用に適することが明らかとなった。また、広いpH域及び温度帯で安定した活性を示し、ビール/ビール系飲料以外(例えばヨーグルトや漬物等の発酵食品)へも適用可能であることが判明した。
 以上のように、鋭意検討の末、飲料・食品中のプリン体低減に極めて有用な新規ヌクレオシダーゼの取得に成功した。この成果に基づき、以下の発明を提供する。
 [1]配列番号1のアミノ酸配列若しくは該アミノ酸配列と85%以上同一のアミノ酸配列、又は配列番号2のアミノ酸配列若しくは該アミノ酸配列と88%以上同一のアミノ酸配列、を含む、ヌクレオシダーゼ。
 [2]アミノ酸配列が、配列番号1のアミノ酸配列又は配列番号2のアミノ酸配列と90%以上同一のアミノ酸配列である、[1]に記載のヌクレオシダーゼ。
 [3]下記の酵素学的性質を有するヌクレオシダーゼ、
 (1)作用:プリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に加水分解する反応を触媒し、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示す、
 (2)分子量:N型糖鎖を含まない場合の分子量が約49 kDa(SDS-PAGEによる)、
 (3)至適温度:55℃~60℃、
 (4)温度安定性:55℃以下で安定(pH6.0、30分間)。
 [4]下記の酵素学的性質を更に有する、[3]に記載のヌクレオシダーゼ、
 (5)至適pH:3.5、
 (6)pH安定性:pH3.5~7.5の範囲で安定(30℃、30分間)。
 [5]下記の酵素学的性質を有するヌクレオシダーゼ、
 (1)作用:プリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に加水分解する反応を触媒し、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示す、
 (2)分子量:N型糖鎖を含まない場合の分子量が約40 kDa(SDS-PAGEによる)、
 (3)至適温度:50℃~55℃、
 (4)温度安定性:65℃以下で安定(pH4.5、60分間)。
 [6]下記の酵素学的性質を更に有する、[5]に記載のヌクレオシダーゼ、
 (5)至適pH:4.5、
 (6)pH安定性:pH3.5~7.5の範囲で安定(30℃、30分間)。
 [7]ペニシリウム・マルチカラー由来である、[1]~[6]のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼ。
 [8]ペニシリウム・マルチカラーがIFO 7569株又はその変異株である、[7]に記載のヌクレオシダーゼ。
 [9][1]~[8]のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼ、又は[1]~[8]のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼを産生する微生物の培養液若しくはその精製物を含有するヌクレオシダーゼ剤。
 [10]以下の(a)~(c)からなる群より選択されるいずれかのDNAからなるヌクレオシダーゼ遺伝子:
 (a)配列番号1又は2のアミノ酸配列をコードするDNA;
 (b)配列番号3~6いずれかの塩基配列からなるDNA;
 (c)配列番号3~6のいずれかの塩基配列と等価な塩基配列を有し、且つヌクレオシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするDNA。
 [11][10]に記載のヌクレオシダーゼ遺伝子を含む組換えDNA。
 [12][11]に記載の組換えDNAを保有する微生物。
 [13]以下のステップ(1)及び(2)を含む、ヌクレオシダーゼの製造方法:
 (1)[1]~[8]のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼを産生する微生物を培養するステップ;
 (2)培養後の培養液及び/又は菌体より、ヌクレオシダーゼを回収するステップ。
 [14]微生物がペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株又はその変異株である、[13]に記載の製造方法。
 [15]以下のステップ(i)及び(ii)を含む、ヌクレオシダーゼの製造法:
 (i)[12]に記載の微生物を、前記遺伝子がコードするタンパク質が産生される条件下で培養するステップ;
 (ii)産生された前記タンパク質を回収するステップ。
 [16]以下のステップ(I)及び(II)を含む、ヌクレオシダーゼ剤の製造方法:
 (I)[1]~[8]のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼを産生する微生物を培養するステップ;
 (II)培養後に菌体を除去するステップ。
 [17]以下のステップを更に含む、[16]に記載の製造方法:
 (III)菌体除去後の培養液を精製するステップ。
 [18]微生物がペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株又はその変異株である、[16]又は[17]に記載の製造方法。
マッシング(仕込)試験の反応工程。 麦汁中のプリン体量の比較。マッシング後の麦汁中の各プリン体量を高速液体クロマトグラフィーで分析した。 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株由来のヌクレオシダーゼの作用温度域。7種類のプリン体存在下、各温度条件で酵素反応を行い、遊離プリン塩基比率を求めた。 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株由来のヌクレオシダーゼの作用pH域。7種類のプリン体存在下、各pH条件で酵素反応を行い、遊離プリン塩基比率を求めた。 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株からのヌクレオシダーゼの精製。DEAE HPカラムクロマトグラフィーの結果を示す。 各精製酵素(ピーク1~3)の分子量の測定結果(SDS-PAGE)。左はピーク1、2の結果。右はピーク3の結果。PNGase F処理後のサンプル(「糖鎖なし」のレーン)と無処理のサンプル(「糖鎖あり」のレーン)を電気泳動し、CBB染色した。左端のレーンは分子量マーカー(ミオシン(200 kDa)、β-ガラクトシダーゼ(116.3 kDa)、ホスホリラーゼB(97.4 kDa)、BSA(66.3 kDa)、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ(55.4 kDa)、乳酸デヒドロゲナーゼ(36.5 kDa)、炭酸脱水素酵素(31.0 kDa)、トリプシンインヒビター(21.5 kDa)、リゾチーム(14.4 kDa)、アプロチニン(6.0 kDa)、インスリンB鎖(3.5 kDa)、インスリンA鎖(2.5 kDa))。 各精製酵素(ピーク1~3)の分子量。N末端アミノ酸分析の結果も示した。 遺伝子クローニングに使用したプローブの配列。上段:PN1用(配列番号18)、下段:PN2用(配列番号19)。 遺伝子クローニングの結果。ピーク3の酵素(PN1)をコードするゲノム配列(上段。配列番号4)とピーク1、2の酵素(PN2)をコードするゲノム配列(下段。配列番号6)を示す。 遺伝子クローニングの結果。ピーク3の酵素(PN1)をコードするcDNA配列(上段。配列番号3)とピーク1、2の酵素(PN2)をコードするcDNA配列(下段。配列番号5)を示す。 遺伝子クローニングの結果。ピーク3の酵素(PN1)のアミノ酸配列(上段。配列番号1)とピーク1、2の酵素(PN2)のアミノ酸配列(下段。配列番号2)を示す。 遺伝子クローニングの結果。cDNA塩基数、イントロン数、アミノ酸長、分子量及び推定pIをピーク3の酵素(PN1)とピーク1、2の酵素(PN2)の間で比較した。 精製酵素(PN1)の至適温度。 精製酵素(PN1)の温度安定性。 精製酵素(PN1)の至適pH。 精製酵素(PN1)のpH安定性。 組換え生産した酵素(PN2)の電気泳動の結果。 精製酵素(PN2)の至適温度。 精製酵素(PN2)の温度安定性。 精製酵素(PN2)の至適pH。 精製酵素(PN2)のpH安定性。 組換え生産した酵素(PN2)を用いたマッシング(仕込)試験の結果。 マッシング(仕込)試験の反応工程。 麦汁中のプリン体量の比較。pH4.5~5.5でマッシング試験を行った。マッシング後の麦汁中の各プリン体量を高速液体クロマトグラフィーで分析した。
1.用語
 本明細書において用語「単離された」は「精製された」と交換可能に使用される。用語「単離された」は、天然の状態、即ち、自然界において存在している状態のものと区別するために使用される。単離するという人為的操作によって、天然の状態とは異なる状態である、「単離された状態」となる。単離されたものは、天然物自体と明確且つ決定的に相違する。
 単離された酵素の純度は特に限定されない。但し、純度の高いことが要求される用途への適用が予定されるのであれば、単離された酵素の純度は高いことが好ましい。
2.ヌクレオシダーゼ及びその生産菌
 本発明の第1の局面はヌクレオシダーゼ及びその生産菌を提供する。本発明者らは、ペニシリウム・マルチカラー(Penicillium multicolor)から、食品・飲料中のプリン体低減に有用な2種類のヌクレオシダーゼ(以下、実施例での表記に対応させて「PN1」及び「PN2」と呼ぶ。また、これら二つのヌクレオシダーゼをまとめて「本酵素」と呼ぶことがある)を取得することに成功し、その遺伝子配列及びアミノ酸配列を同定した。当該成果に基づき、本酵素は配列番号1のアミノ酸配列又は配列番号2のアミノ酸配列、或いは、これらのアミノ酸配列のいずれかと等価なアミノ酸配列を含むという、特徴を備える。尚、配列番号1のアミノ酸配列はPN1に対応し、配列番号2のアミノ酸配列はPN2に対応する。
 ここでの「等価なアミノ酸配列」とは、基準となる配列(配列番号1のアミノ酸配列、又は配列番号2のアミノ酸配列)と一部で相違するが、当該相違がタンパク質の機能(ここではヌクレオシダーゼ活性)に実質的な影響を与えていないアミノ酸配列のことをいう。従って、等価なアミノ酸配列からなるポリペプチド鎖を有する酵素はヌクレオシダーゼ活性を示す。活性の程度は、ヌクレオシダーゼとしての機能を発揮できる限り特に限定されない。但し、基準となる配列からなるポリペプチド鎖を有する酵素と同程度又はそれよりも高いことが好ましい。
 「アミノ酸配列の一部の相違」とは、典型的には、アミノ酸配列を構成する1~数個(上限は例えば3個、5個、7個、10個)のアミノ酸の欠失、置換、若しくは1~数個(上限は例えば3個、5個、7個、10個)のアミノ酸の付加、挿入、又はこれらの組合せによりアミノ酸配列に変異(変化)が生じていることをいう。ここでのアミノ酸配列の相違はヌクレオシダーゼ活性が保持される限り許容される(活性の多少の変動があってもよい)。この条件を満たす限り、アミノ酸配列が相違する位置は特に限定されず、また複数の位置で相違が生じていてもよい。ここでの「複数」とは、配列番号1のアミノ酸配列に関しては、全アミノ酸の約15%未満に相当する数であり、好ましくは約10%未満に相当する数であり、さらに好ましくは約5%未満に相当する数であり、より一層好ましくは約3%未満に相当する数であり、最も好ましくは約1%未満に相当する数である。一方、配列番号2のアミノ酸配列に関しては、全アミノ酸の約12%未満に相当する数であり、好ましくは約10%未満に相当する数であり、さらに好ましくは約5%未満に相当する数であり、より一層好ましくは約3%未満に相当する数であり、最も好ましくは約1%未満に相当する数である。即ち、等価タンパク質は、配列番号1のアミノ酸配列が基準となる場合、例えば約85%以上、好ましくは約90%以上、さらに好ましくは約95%以上、より一層好ましくは約98%以上、最も好ましくは約99%以上の同一性を有し、配列番号2のアミノ酸配列が基準となる場合、例えば約88%以上、好ましくは約90%以上、さらに好ましくは約95%以上、より一層好ましくは約98%以上、最も好ましくは約99%以上の同一性を有する。尚、アミノ酸配列の相違は複数の位置で生じていてもよい。
 好ましくは、ヌクレオシダーゼ活性に必須でないアミノ酸残基において保存的アミノ酸置換が生じることによって等価なアミノ酸配列が得られる。ここでの「保存的アミノ酸置換」とは、あるアミノ酸残基を、同様の性質の側鎖を有するアミノ酸残基に置換することをいう。アミノ酸残基はその側鎖によって塩基性側鎖(例えばリシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えばアスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えばグリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えばアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β分岐側鎖(例えばスレオニン、バリン、イソロイシン)、芳香族側鎖(例えばチロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)のように、いくつかのファミリーに分類されている。保存的アミノ酸置換は好ましくは、同一のファミリー内のアミノ酸残基間の置換である。
 ところで、二つのアミノ酸配列又は二つの核酸配列(以下、これらを含む用語として「二つの配列」を使用する)の同一性(%)は例えば以下の手順で決定することができる。まず、最適な比較ができるよう二つの配列を並べる(例えば、第一の配列にギャップを導入して第二の配列とのアライメントを最適化してもよい)。第一の配列の特定位置の分子(アミノ酸残基又はヌクレオチド)が、第二の配列における対応する位置の分子と同じであるとき、その位置の分子が同一であるといえる。二つの配列の同一性は、その二つの配列に共通する同一位置の数の関数であり(すなわち、同一性(%)=同一位置の数/位置の総数 × 100)、好ましくは、アライメントの最適化に要したギャップの数およびサイズも考慮に入れる。
 二つの配列の比較及び同一性の決定は数学的アルゴリズムを用いて実現可能である。配列の比較に利用可能な数学的アルゴリズムの具体例としては、KarlinおよびAltschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264-68に記載され、KarlinおよびAltschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-77において改変されたアルゴリズムがあるが、これに限定されることはない。このようなアルゴリズムは、Altschulら (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10に記載のNBLASTプログラムおよびXBLASTプログラム(バージョン2.0)に組み込まれている。等価なヌクレオチド配列を得るには例えば、NBLASTプログラムでscore = 100、wordlength = 12としてBLASTヌクレオチド検索を行えばよい。等価なアミノ酸配列を得るには例えば、XBLASTプログラムでscore = 50、wordlength = 3としてBLASTポリペプチド検索を行えばよい。比較のためのギャップアライメントを得るためには、Altschulら (1997) Amino Acids Research 25(17):3389-3402に記載のGapped BLASTが利用可能である。BLASTおよびGapped BLASTを利用する場合は、対応するプログラム(例えばXBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメータを使用することができる。詳しくはhttp://www.ncbi.nlm.nih.govを参照されたい。配列の比較に利用可能な他の数学的アルゴリズムの例としては、MyersおよびMiller (1988) Comput Appl Biosci. 4:11-17に記載のアルゴリズムがある。このようなアルゴリズムは、例えばGENESTREAMネットワークサーバー(IGH Montpellier、フランス)またはISRECサーバーで利用可能なALIGNプログラムに組み込まれている。アミノ酸配列の比較にALIGNプログラムを利用する場合は例えば、PAM120残基質量表を使用し、ギャップ長ペナルティ=12、ギャップペナルティ=4とすることができる。
 二つのアミノ酸配列の同一性を、GCGソフトウェアパッケージのGAPプログラムを用いて、Blossom 62マトリックスまたはPAM250マトリックスを使用し、ギャップ加重=12、10、8、6、又は4、ギャップ長加重=2、3、又は4として決定することができる。また、二つの核酸配列の相同度を、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで利用可能)のGAPプログラムを用いて、ギャップ加重=50、ギャップ長加重=3として決定することができる。
 本酵素が、より大きいタンパク質(例えば融合タンパク質)の一部であってもよい。融合タンパク質において付加される配列としては、例えば多重ヒスチジン残基のような精製に役立つ配列、組換え生産の際の安定性を確保する付加配列等が挙げられる。
 上記アミノ酸配列を有する本酵素は、遺伝子工学的手法によって容易に調製することができる。例えば、本酵素をコードするDNAで適当な宿主細胞(例えば大腸菌)を形質転換し、形質転換体内で発現されたタンパク質を回収することにより調製することができる。回収されたタンパク質は目的に応じて適宜精製される。このように組換えタンパク質として本酵素を得ることにすれば種々の修飾が可能である。例えば、本酵素をコードするDNAと他の適当なDNAとを同じベクターに挿入し、当該ベクターを用いて組換えタンパク質の生産を行えば、任意のペプチドないしタンパク質が連結された組換えタンパク質からなる本酵素を得ることができる。また、糖鎖及び/又は脂質の付加や、あるいはN末端若しくはC末端のプロセッシングが生ずるような修飾を施してもよい。以上のような修飾により、組換えタンパク質の抽出、精製の簡便化、又は生物学的機能の付加等が可能である。
 本発明者らは取得に成功した新規ヌクレオシダーゼPN1及びPN2の酵素学的特性を明らかにした。そこで、本酵素であるPN1及びPN2を以下の酵素学性質で特徴付けることもできる。
<PN1の酵素学的性質>
 (1)作用
 PN1はヌクレオシダーゼであり、プリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に加水分解する反応を触媒する。プリンヌクレオシドとは、プリン塩基と糖の還元基がN-グリコシド結合で結合した配糖体である。プリンヌクレオシドの例は、アデノシン、グアノシン、イノシンである。また、プリン塩基とは、プリン骨格を有する塩基の総称であり、具体例はアデニン、グアニン、ヒポキサンチン、キサンチンである。尚、プリンヌクレオシド及びプリン塩基の他、プリンヌクレオチド等を含め、プリン骨格を有する化合物をプリン体と総称する。
 PN1は、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示す。即ち、分解生成物による実質的な阻害を受けない。この特徴は、食品や飲料の製造に本酵素を適用する上で特に重要である。この特徴を示すPN1によれば、食品や飲料の製造過程において、原料に由来するプリンヌクレオシドを効率的に分解することが可能となる。
 (2)分子量
 PN1は天然型では糖鎖を含み(即ち、糖タンパク質である)、N型糖鎖除去前の分子量は約53 kDa(SDS-PAGEで測定した分子量)であった。ゲルろ過クロマトグラフィーで測定すると約126 kDaであり、2量体を形成していると推定される。一方、N型糖鎖除去後にSDS-PAGEで分子量を測定すると約49k Daを示した。従って、N型糖鎖を含まない場合の本酵素の分子量は約49 kDa(SDS-PAGEで測定した分子量)である。
 (3)至適温度
 PN1の至適温度は55℃~60℃である。このように至適温度が高いことは、比較的高温での処理工程を経る、食品や飲料の製造への適用に有利である。至適温度は、酢酸緩衝液(pH4.3)を用い、グアノシンを基質とし、反応生成物であるリボースを定量することによって評価することができる。
 (4)温度安定性
 PN1は酢酸緩衝液(pH4.5)中、60分間処理した場合、45℃以下の温度条件で80%以上の活性を維持する。従って、例えば処理時の温度が5℃~45℃の範囲であれば、処理後の残存活性が80%以上となる。
 一方、PN1をリン酸緩衝液(pH6.0)中、30分間処理した場合には、55℃以下の温度条件で80%以上の活性を維持する。従って、例えば処理時の温度が5℃~55℃の範囲であれば、処理後の残存活性が80%以上となる。
 このように優れた温度安定性を示すPN1は、ビールの仕込工程など、比較的高温の条件においても高い活性を示すことができる。
 PN1を以下の酵素学的性質(5)及び(6)で更に特徴付けることができる。
 (5)至適pH
 PN1の至適pHは3.5である。至適pHは、例えば、pH2.5~3.5のpH域ではクエン酸緩衝液、pH3.5~5.5のpH域では酢酸緩衝液、pH5.5~6.5のpH域ではリン酸カリウム緩衝液中で測定した結果を基に判断される。
 (6)pH安定性
 PN1は広いpH域で安定した活性を示す。例えば、処理に供する酵素溶液のpHが3.5~7.5の範囲内にあれば、30℃、30分の処理後、最大活性の80%以上の活性を示す。また、50℃、60分の処理の場合、処理に供する酵素溶液のpHが3.5~7.5の範囲内にあれば、処理後、最大活性の80%以上の活性を示す。尚、pH安定性は、例えば、pH2.5~3.5のpH域ではクエン酸緩衝液、pH3.5~5.5のpH域では酢酸緩衝液、pH5.5~6.5のpH域ではリン酸カリウム緩衝液中で測定した結果を基に判断される。
<PN2の酵素学的性質>
 (1)作用
 PN2はヌクレオシダーゼであり、プリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に加水分解する反応を触媒する。
 PN2は、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示す。即ち、分解生成物による実質的な阻害を受けない。この特徴は、食品や飲料の製造に本酵素を適用する上で特に重要である。この特徴を示すPN1によれば、食品や飲料の製造過程において、原料に由来するプリンヌクレオシドを効率的に分解することが可能となる。
 (2)分子量
 PN2は天然型では糖鎖を含み(即ち、糖タンパク質である)、N型糖鎖除去前の分子量は約51 kDa(SDS-PAGEで測定した分子量)であった。ゲルろ過クロマトグラフィーで測定すると約230 kDaであった。一方、N型糖鎖除去後にSDS-PAGEで分子量を測定すると約40 kDaを示した。従って、N型糖鎖を含まない場合の本酵素の分子量は約40 kDa(SDS-PAGEで測定した分子量)である。
 (3)至適温度
 PN2の至適温度は50℃~55℃である。このように至適温度が高いことは、比較的高温での処理工程を経る、食品や飲料の製造への適用に有利である。至適温度は、酢酸緩衝液(pH4.3)を用い、グアノシンを基質とし、反応生成物であるリボースを定量することによって評価することができる。
 (4)温度安定性
 PN2は酢酸緩衝液(pH4.5)中、60分間処理した場合、65℃以下の温度条件で80%以上の活性を維持する。従って、例えば処理時の温度が5℃~65℃の範囲であれば、処理後の残存活性が80%以上となる。
 一方、PN2をリン酸緩衝液(pH6.0)中、30分間処理した場合には、55℃以下の温度条件で80%以上の活性を維持する。従って、例えば処理時の温度が5℃~55℃の範囲であれば、処理後の残存活性が80%以上となる。
 このように優れた温度安定性を示すPN2は、ビールの仕込工程など、比較的高温の条件においても高い活性を示すことができる。
 PN2を以下の酵素学的性質(5)及び(6)で更に特徴付けることができる。
 (5)至適pH
 PN2の至適pHは4.5である。至適pHは、例えば、pH2.5~3.5のpH域ではクエン酸緩衝液、pH3.5~5.5のpH域では酢酸緩衝液、pH5.5~6.5のpH域ではリン酸カリウム緩衝液中で測定した結果を基に判断される。
 (6)pH安定性
 PN2は広いpH域で安定した活性を示す。例えば、処理に供する酵素溶液のpHが3.5~7.5の範囲内にあれば、30℃、30分の処理後、最大活性の80%以上の活性を示す。また、50℃、60分の処理の場合、処理に供する酵素溶液のpHが4.5~7.5の範囲内にあれば、処理後、最大活性の80%以上の活性を示す。尚、pH安定性は、例えば、pH2.5~3.5のpH域ではクエン酸緩衝液、pH3.5~5.5のpH域では酢酸緩衝液、pH5.5~6.5のpH域ではリン酸カリウム緩衝液中で測定した結果を基に判断される。
 本酵素は好ましくはペニシリウム・マルチカラー(Penicillium multicolor)に由来するヌクレオシダーゼである。ここでの「ペニシリウム・マルチカラーに由来するヌクレオシダーゼ」とは、ペニシリウム・マルチカラーに分類される微生物(野生株であっても変異株であってもよい)が生産するヌクレオシダーゼ、或いはペニシリウム・マルチカラー(野生株であっても変異株であってもよい)のヌクレオシダーゼ遺伝子を利用して遺伝子工学的手法によって得られたヌクレオシダーゼであることを意味する。従って、ペニシリウム・マルチカラーより取得したヌクレオシダーゼ遺伝子(又は当該遺伝子を改変した遺伝子)を導入した宿主微生物によって生産された組み換え体も、「ペニシリウム・マルチカラーに由来するヌクレオシダーゼ」に該当する。
 本酵素がそれに由来することになるペニシリウム・マルチカラーのことを、説明の便宜上、本酵素の生産菌という。
 後述の実施例に示す通り、本発明者らはペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株から上記性質を備えるヌクレオシダーゼを単離・精製することに成功した。尚、ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株は独立行政法人製品評価技術基盤機構(千葉県木更津市かずさ鎌足2-5-8)に保存された菌株(NBRC CultureカタログにNBRC 7569として掲載されている)であり、所定の手続を経ることにより、入手することができる。
3.ヌクレオシダーゼをコードする遺伝子、組換えDNA、形質転換体
 本発明の第2の局面は本酵素をコードする遺伝子に関する。一態様において本発明の遺伝子は、配列番号1又は2のアミノ酸配列をコードするDNAを含む。当該態様の具体例は、配列番号3の塩基配列からなるDNA(配列番号1のアミノ酸配列をコードするcDNAに対応する)、配列番号4の塩基配列からなるDNA(配列番号1のアミノ酸配列をコードするゲノムDNAに対応する)、配列番号5の塩基配列からなるDNA(配列番号2のアミノ酸配列をコードするcDNAに対応する)、配列番号6の塩基配列からなるDNA(配列番号2のアミノ酸配列をコードするゲノムDNAに対応する)である。
 本酵素をコードする遺伝子は典型的には本酵素の調製に利用される。本酵素をコードする遺伝子を用いた遺伝子工学的調製法によれば、より均質な状態の本酵素を得ることが可能である。また、当該方法は大量の本酵素を調製する場合にも好適な方法といえる。尚、本酵素をコードする遺伝子の用途は本酵素の調製に限られない。例えば、本酵素の作用機構の解明などを目的とした実験用のツールとして、或いは本酵素の変異体(改変体)をデザイン又は作製するためのツールとして、当該遺伝子を利用することもできる。
 本明細書において「本酵素をコードする遺伝子」とは、それを発現させた場合に本酵素が得られる核酸のことをいい、本酵素のアミノ酸配列に対応する塩基配列を有する核酸は勿論のこと、そのような核酸にアミノ酸配列をコードしない配列が付加されてなる核酸をも含む。また、コドンの縮重も考慮される。
 本発明の遺伝子は、本明細書又は添付の配列表が開示する配列情報を参考にし、標準的な遺伝子工学的手法、分子生物学的手法、生化学的手法、化学合成、PCR法(例えばオーバーラップPCR)或いはこれらの組合せによって、単離された状態に調製することができる。
 一般に、あるタンパク質をコードするDNAの一部に改変を施した場合において、改変後のDNAがコードするタンパク質が、改変前のDNAがコードするタンパク質と同等の機能を有することがある。即ちDNA配列の改変が、コードするタンパク質の機能に実質的に影響を与えず、コードするタンパク質の機能が改変前後において維持されることがある。そこで本発明は他の態様として、基準となる塩基配列(配列番号3~6のいずれかの配列)と等価な塩基配列を有し、ヌクレオシダーゼ活性をもつタンパク質をコードするDNA(以下、「等価DNA」ともいう)を提供する。ここでの「等価な塩基配列」とは基準となる塩基配列に示す核酸と一部で相違するが、当該相違によってそれがコードするタンパク質の機能(ここではヌクレオシダーゼ活性)が実質的な影響を受けていない塩基配列のことをいう。
 等価DNAの具体例は、基準となる塩基配列に相補的な塩基配列に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAである。ここでの「ストリンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。このようなストリンジェントな条件は当業者に公知であって例えばMolecular Cloning(Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York)やCurrent protocols in molecular biology(edited by Frederick M. Ausubel et al., 1987)を参照して設定することができる。ストリンジェントな条件として例えば、ハイブリダイゼーション液(50%ホルムアミド、10×SSC(0.15M NaCl, 15mM sodium citrate, pH 7.0)、5×Denhardt溶液、1% SDS、10% デキストラン硫酸、10μg/mlの変性サケ精子DNA、50mMリン酸バッファー(pH7.5))を用いて約50℃でインキュベーションし、その後0.1×SSC、0.1% SDSを用いて約65℃で洗浄する条件を挙げることができる。更に好ましいストリンジェントな条件として例えば、ハイブリダイゼーション液として50%ホルムアミド、5×SSC(0.15M NaCl, 15mM sodium citrate, pH 7.0)、1×Denhardt溶液、1%SDS、10%デキストラン硫酸、10μg/mlの変性サケ精子DNA、50mMリン酸バッファー(pH7.5))を用いる条件を挙げることができる。
 等価DNAの他の具体例として、基準となる塩基配列に対して1若しくは複数(好ましくは1~数個)の塩基の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含む塩基配列からなり、ヌクレオシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするDNAを挙げることができる。塩基の置換や欠失などは複数の部位に生じていてもよい。ここでの「複数」とは、当該DNAがコードするタンパク質の立体構造におけるアミノ酸残基の位置や種類によっても異なるが、例えば2~40塩基、好ましくは2~20塩基、より好ましくは2~10塩基である。
 等価DNAは、基準となる塩基配列(配列番号3~6のいずれかの配列)に対して、例えば70%以上、好ましくは80%以上、さらに好ましくは約90%以上、より一層好ましくは95%以上、最も好ましくは99%以上の同一性を有する。
 以上のような等価DNAは例えば、制限酵素処理、エキソヌクレアーゼやDNAリガーゼ等による処理、位置指定突然変異導入法(Molecular Cloning, Third Edition, Chapter 13 ,Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York)やランダム突然変異導入法(Molecular Cloning, Third Edition, Chapter 13 ,Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York)による変異の導入などを利用して、塩基の置換、欠失、挿入、付加、及び/又は逆位を含むように、基準となる塩基配列を有するDNAを改変することによって得ることができる。また、紫外線照射など他の方法によっても等価DNAを得ることができる。等価DNAの更に他の例として、SNP(一塩基多型)に代表される多型に起因して上記のごとき塩基の相違が認められるDNAを挙げることができる。
 本発明の他の態様は、本発明の本酵素をコードする遺伝子の塩基配列に対して相補的な塩基配列を有する核酸に関する。本発明の更に他の態様は、本発明の本酵素をコードする遺伝子の塩基配列、或いはそれに相補的な塩基配列に対して少なくとも約60%、70%、80%、90%、95%、99%又は99.9%同一な塩基配列を有する核酸を提供する。
 本発明のさらに他の局面は、本発明の遺伝子(本酵素をコードする遺伝子)を含む組換えDNAに関する。本発明の組換えDNAは例えばベクターの形態で提供される。本明細書において用語「ベクター」は、それに挿入された核酸を細胞等のターゲット内へと輸送することができる核酸性分子をいう。
 使用目的(クローニング、タンパク質の発現)に応じて、また宿主細胞の種類を考慮して適当なベクターが選択される。大腸菌を宿主とするベクターとしてはM13ファージ又はその改変体、λファージ又はその改変体、pBR322又はその改変体(pB325、pAT153、pUC8など)等、酵母を宿主とするベクターとしてはpYepSec1、pMFa、pYES2等、昆虫細胞を宿主とするベクターとしてはpAc、pVL等、哺乳類細胞を宿主とするベクターとしてはpCDM8、pMT2PC等を例示することができる。
 本発明のベクターは好ましくは発現ベクターである。「発現ベクター」とは、それに挿入された核酸を目的の細胞(宿主細胞)内に導入することができ、且つ当該細胞内において発現させることが可能なベクターをいう。発現ベクターは通常、挿入された核酸の発現に必要なプロモーター配列や、発現を促進させるエンハンサー配列等を含む。選択マーカーを含む発現ベクターを使用することもできる。かかる発現ベクターを用いた場合には、選択マーカーを利用して発現ベクターの導入の有無(及びその程度)を確認することができる。
 DNAのベクターへの挿入、選択マーカー遺伝子の挿入(必要な場合)、プロモーターの挿入(必要な場合)等は標準的な組換えDNA技術(例えば、Molecular Cloning, Third Edition, 1.84, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New Yorkを参照することができる、制限酵素及びDNAリガーゼを用いた周知の方法)を用いて行うことができる。
 本発明は更に、本発明の組換えDNA(本発明の遺伝子を含む)が導入された宿主細胞(形質転換体)に関する。本発明の形質転換体では、本発明の組換えDNAが外来性の分子として存在することになる。本発明の形質転換体は、好ましくは、上記本発明のベクターを用いたトランスフェクション乃至はトランスフォーメーションによって調製される。トランスフェクション、トランスフォーメーションはリン酸カルシウム共沈降法、エレクトロポーレーション(Potter, H. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81, 7161-7165(1984))、リポフェクション(Felgner, P.L. et al.,  Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84,7413-7417(1984))、マイクロインジェクション(Graessmann, M. & Graessmann,A., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 73,366-370(1976))、Hanahanの方法(Hanahan, D., J. Mol. Biol. 166, 557-580(1983))、酢酸リチウム法(Schiestl, R.H. et al., Curr. Genet. 16, 339-346(1989))、プロトプラスト-ポリエチレングリコール法(Yelton, M.M. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 81, 1470-1474(1984))等によって実施することができる。
 宿主細胞は、本酵素が発現する限りにおいて特に限定されず、例えばBacillus subtilis、Bacillus licheniformis、Bacillus circulansなどのBacillus属細菌、Lactococcus、Lactobacillus、Streptococcus、Leuconostoc、Bifidobacteriumなどの乳酸菌、Escherichia、Streptomycesなどのその他の細菌、Saccharomyces、Kluyveromyces、Candida、Torula、Torulopsis、などの酵母、Aspergillus oryzae、Aspergillus nigerなどのAspergillus属、Penicillium属、Trichoderma属、Fusarium属などの糸状菌(真菌)などより選択される。
4.ヌクレオシダーゼの製造方法
 本発明の第3の局面はヌクレオシダーゼの製造方法を提供する。本発明の製造方法の一態様では、本酵素を産生する微生物を培養するステップ(ステップ(1))と培養後の培養液及び/又は菌体よりヌクレオシダーゼを回収するステップ(ステップ(2))を行う。本酵素を産生する微生物は例えばペニシリウム・マルチカラーであり、好ましくは、ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株又はその変異株である。変異株は、紫外線、X線、γ線などの照射、亜硝酸、ヒドロキルアミン、N-メチル-N'-ニトロ-N-ニトロソグアニジンなどによる処理等によって得ることができる。
 培養条件や培養法は、本酵素が生産されるものである限り特に限定されない。即ち、本酵素が生産されることを条件として、使用する微生物の培養に適合した方法や培養条件を適宜設定できる。培養法としては液体培養、固体培養のいずれでも良いが、好ましくは液体培養が利用される。液体培養を例にとり、その培養条件を説明する。
 培地としては、使用する微生物が生育可能な培地であれば、特に限定されない。例えば、グルコース、シュクロース、ゲンチオビオース、可溶性デンプン、グリセリン、デキストリン、糖蜜、有機酸等の炭素源、更に硫酸アンモニウム、炭酸アンモニウム、リン酸アンモニウム、酢酸アンモニウム、あるいは、ペプトン、酵母エキス、コーンスティープリカー、カゼイン加水分解物、ふすま、肉エキス等の窒素源、更にカリウム塩、マグネシウム塩、ナトリウム塩、リン酸塩、マンガン塩、鉄塩、亜鉛塩等の無機塩を添加したものを用いることができる。使用する形質転換体の生育を促進するためにビタミン、アミノ酸などを培地に添加してもよい。培地のpHは例えば約3~8、好ましくは約4~7程度に調整し、培養温度は通常約20~40℃、好ましくは約25~35℃程度で、1~20日間、好ましくは3~10日間程度好気的条件下で培養する。培養法としては例えば振盪培養法、ジャー・ファーメンターによる好気的深部培養法が利用できる。
 以上の条件で培養した後、培養液又は菌体より目的の酵素を回収する(ステップ(2))。培養液から回収する場合には、例えば培養上清をろ過、遠心処理等することによって不溶物を除去した後、限外ろ過膜による濃縮、硫安沈殿等の塩析、透析、イオン交換樹脂等の各種クロマトグラフィーなどを適宜組み合わせて分離、精製を行うことにより本酵素を得ることができる。他方、菌体内から回収する場合には、例えば菌体を加圧処理、超音波処理などによって破砕した後、上記と同様に分離、精製を行うことにより本酵素を得ることができる。尚、ろ過、遠心処理などによって予め培養液から菌体を回収した後、上記一連の工程(菌体の破砕、分離、精製)を行ってもよい。
 本発明の他の態様では、上記の形質転換体を用いてヌクレオシダーゼを製造する。この態様の製造法ではまず、それに導入された遺伝子によってコードされるタンパク質が産生される条件下で上記の形質転換体を培養する(ステップ(i))。様々なベクター宿主系に関して形質転換体の培養条件が公知であり、当業者であれば適切な培養条件を容易に設定することができる。培養ステップに続き、産生されたタンパク質(即ち、ヌクレオシダーゼ)を回収する(ステップ(ii))。回収及びその後の精製については、上記態様の場合と同様に行えばよい。
 ヌクレオシダーゼの精製度は特に限定されない。最終的な形態は液体状であっても固体状(粉体状を含む)であってもよい。
上記のようにして得られた精製酵素を、例えば凍結乾燥や真空乾燥或いはスプレードライなどにより粉末化して提供することも可能である。その際、精製酵素を予め酢酸緩衝液、リン酸緩衝液、トリエタノールアミン緩衝液、トリス塩酸緩衝液やGOODの緩衝液に溶解させておいてもよい。好ましくは、酢酸緩衝液、リン酸緩衝液、トリエタノールアミン緩衝液を使用することができる。尚、ここでGOODの緩衝液としてはPIPES、MES又はMOPSが挙げられる。
5.酵素剤(ヌクレオシオシダーゼ剤)
 本酵素は例えば酵素剤(ヌクレオシダーゼ剤)の形態で提供される。本酵素剤は、有効成分(即ち、本酵素)の他、賦形剤、緩衝剤、懸濁剤、安定剤、保存剤、防腐剤、生理食塩水などを含有していてもよい。有効成分である本酵素の精製度は特に問わない。即ち、粗酵素であっても精製酵素であってもよい。賦形剤としては乳糖、ソルビトール、D-マンニトール、マルトデキストリン、白糖等を用いることができる。緩衝剤としてはリン酸塩、クエン酸塩、酢酸塩等を用いることができる。安定剤としてはプロピレングリコール、アスコルビン酸等を用いることができる。保存剤としてはフェノール、塩化ベンザルコニウム、ベンジルアルコール、クロロブタノール、メチルパラベン等を用いることができる。防腐剤としては塩化ベンザルコニウム、パラオキシ安息香酸、クロロブタノール等と用いることができる。
 本酵素剤の一態様では、液状の酵素剤を簡便な操作で得るために、以下のステップ(I)及び(II)を含む製造方法で酵素剤を製造する。
 (I)本酵素を産生する微生物を培養するステップ
 (II)培養後に菌体を除去するステップ
 ステップ(I)は、本酵素の製造法における上記ステップ(1)と同様であるため、その説明を省略する。ステップ(I)に続くステップ(II)では、遠心分離、ろ過、フィルター処理等を利用して菌体を除去する。このようにして得られた、菌体を含まない培養液はそのまま又は更なる処理(即ち、菌体除去後の培養液を精製するステップ(ステップ(III))を経た後、酵素剤として用いられる。ここでの更なる処理としては、例えば、限外ろ過膜による濃縮を挙げることができる。
6.ヌクレオシダーゼの用途
 本発明の更なる局面は本酵素又は本酵素剤の用途を提供する。第1の用途としてビール又はビール系飲料の製造方法が提供される。「ビール系飲料」には、麦芽の使用率を減らした「発泡酒」、ビールや発泡酒とは異なる原料、製法でつくられるビール風味の発泡アルコール飲料(一般に「第3のビール」と称される)が含まれる。第3のビールは、原料に麦芽を使用せずに醸造したものと、発泡酒に別のアルコール飲料(代表は大麦スピリッツ)を混ぜたものに大別される。現在の酒税法上では、前者はその他の醸造酒(発泡性)(1)に分類され、後者はリキュール(発泡性)(1)に分類される。以下、ビールの製造に本酵素又は本酵素剤を適用する場合を例として使用態様を説明する。尚、ビール系飲料へ適用する場合もこれに準ずる。
 本酵素又は本酵素剤をビールの製造に適用する場合には、ビールの製造過程において本酵素を麦汁に作用させ、麦汁中のプリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に分解することになる。ビールの発酵に使用する酵母は通常、プリンヌクレオシドを資化できないが、遊離プリン塩基については資化することが可能である。従って、本酵素の作用によって麦汁中のプリンヌクレオシドを遊離プリン塩基に変換すれば、発酵工程中で酵母が遊離プリン塩基を資化し、プリン体の総量が低減したビールが得られる。
 本酵素又は本酵素剤は、ビール又はビール系飲料以外の食品又は飲料中のプリン体を低減する目的にも有用である。本酵素又は本酵素剤を食品又は飲料の製造過程で使用すると、原料由来のプリンヌクレオシドを遊離プリン塩基に変換することができる。遊離プリン塩基がその後の製造過程において除去されれば、プリン体含有量が低減した食品・飲料が得られる。従って、製造過程において遊離プリン塩基が除去され得る食品又は飲料の製造に対して本酵素又は本酵素剤を適用可能である。該当する食品・飲料の例は、遊離プリン塩基を資化可能な微生物による発酵を利用した食品及び飲料、即ち発酵食品及び発酵飲料である。具体的には、各種漬物、味噌、醤油、ヨーグルト、発酵乳、乳酸菌飲料、紹興酒、ワイン等が挙げられる。これらの食品や飲料の製造への本酵素/本酵素剤の適用に際しては、例えば、本酵素/酵素剤を発酵前又は発酵中の原料に添加して作用させ、原料中のプリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に分解する。生成したプリン塩基は典型的には発酵中に微生物によって資化される。その結果、プリン体の総量が低減した食品又は飲料が得られる。
1.新規ヌクレオシダーゼの取得
 低プリン体ビールの製造に有用な酵素を見出すべく、一万種を超える微生物を対象にスクリーニングを実施した。その結果、4株の微生物、即ち、ペニシリウム・マルチカラー(Penicillium multicolor)IFO 7569株、バチルス・ブレビス(Bacillus brevis)IFO 15304株、ブレビバチルス・リネンズ(Brevibacillus linens)IFO 12141株、ムコール・ヤバニカス(Mucor javanicus) 4068株が有望な候補として同定された。これらの微生物の産生するヌクレオシダーゼについて、ビールの仕込工程での利用を想定し、仕込工程の一般的な条件(マッシング試験)での作用・効果を評価した。
(1)ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株の培養方法
 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株を、下記の培養培地B 100mLに植菌し、500mL容坂口フラスコにて27℃、48~72時間振盪培養した。この前培養液を下記培養培地B 2Lに移して27℃、120~188時間通気撹拌培養した。この培養液を珪藻土ろ過して菌体を除いた培養上清を限外ろ過膜にて濃縮し、凍結乾燥粉末を得た。
<培養培地A>
 1% ラスターゲンFK (日澱化学)
 1% 酵母エキス(Difco  )
 0.5% NaCl
 pH7.0
<培養培地B>
 1% ラスターゲンFK (日澱化学)
 1% 酵母エキス(Difco)
 2% コーンミール(松本ノーサン)
 0.5% NaCl
 pH6.5
(2)バチルス・ブレビスIFO 15304株、ブレビバチルス・リネンズIFO 12141株、ムコール・ヤバニカス 4068株の培養方法
 バチルス・ブレビスIFO 15304株とブレビバチルス・リネンズIFO 12141株を上記培養培地A 10mLに植菌し、試験管にて30℃、48時間振盪培養した。一方、ムコール・ヤバニカスIFO 4068株を上記培養培地B 10mLに植菌し、同条件で培養した。培養液をそれぞれ同組成の本培養培地50mLに移して30℃、120時間振盪培養した。この培養液を遠心分離にて菌体除去した上清から凍結乾燥粉末を得た。
(3)ヌクレオシダーゼ活性の測定
 ヌクレオシダーゼ活性は、グアノシンを基質とした反応によって生成するリボースを定量することで定義した。反応液1mL中には0.1M 酢酸緩衝液(pH4.3)、8mM グアノシンと適当量の酵素を含む。反応はグアノシン添加で開始し、55℃にて30分間反応させた。1.5mLの0.5%ジニトロサリチル酸溶液を添加して反応を停止した後、10分間煮沸処理した。冷却後の反応溶液の540nmの吸光度を測定し、酵素無添加の反応溶液の吸光度を差し引いた値より活性値を算出した。30分間に1μmolのリボースを生成する酵素量を酵素活性1Uと定義した。
(4)マッシング試験
 粉砕麦芽80g、水320mLとともにヌクレオシダーゼ320U相当量を添加してマッシング試験を行い、麦汁を調製した。反応工程を図1に示す。マッシング後の麦汁中の各プリン体量は高速液体クロマトグラフィーにて下記条件で定量的に分析した。
<HPLC条件>
 カラム:Asahipak GS-220HQ
 移動相:150mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH2.5)
 温度:35℃
 流速:0.5mL/分
 検出:260nm
 分析結果を図2に示した。図中には、以下の計算式で遊離プリン塩基比率も示した。
 遊離プリン塩基比率(%)={プリン塩基/(プリンヌクレオシド+プリン塩基)}×100
 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株(P.multicolor)由来のヌクレオシダーゼを添加した麦汁はプリンヌクレオシドが減少し、プリン塩基が増加していた。対照的に、バチルス・ブレビス(Bacillus brevis)IFO 15304株、ブレビバチルス・リネンズ(Brevibacillus linens)IFO 12141株、ムコール・ヤバニカス(Mucor javanicus) 4068株由来のヌクレオシダーゼは、おそらく分解生成物(アデニン、グアニン、ヒポキサンチン、キサンチン)による阻害を受けたと思われ、プリンヌクレオシドの量に大きな変化はなかった。
(5)ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株由来ヌクレオシダーゼ(P.multicolorヌクレオシダーゼ)の特性の検討
 P.multicolorヌクレオシダーゼの特性を調べるため、以下の組成の溶液(以下、模擬麦汁)を用い、作用温度域と作用pH域を検討した。
 アデノシン 0.08 mmol/L
 アデニン 0.43 mmol/L
 イノシン 0.49 mmol/L
 ヒポキサンチン 0.08 mmol/L
 グアノシン 0.67 mmol/L
 グアニン 1.45 mmol/L
 キサントシン 0.00 mmol/L
 キサンチン 0.08 mmol/L
(5-1)作用温度域
 模擬麦汁2mLにP.multicolorヌクレオシダーゼを9U添加し、各温度にてpH5.5下で1時間反応させた後、HPLCの移動相150mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH2.5)で10倍に希釈して高速液体クロマトグラフィーにて定量的に分析した。以下の計算式で遊離プリン塩基比率を算出した。50℃~60℃の反応温度で遊離プリン塩基比率が90%以上となった(図3)。
 遊離プリン塩基比率(%)={プリン塩基/(プリンヌクレオシド+プリン塩基)}×100
(5-2)作用pH域
 模擬麦汁2mLにP.multicolorヌクレオシダーゼを9U添加し、各pHにて55℃で1時間反応させた後、HPLCの移動相150mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH2.5)で10倍に希釈して高速液体クロマトグラフィーにて定量的に分析した。pH4.5~pH6.0はクエン酸緩衝液、pH6.0~6.5はMES緩衝液を使用した。作用温度域の検討の場合と同様に、遊離プリン塩基比率を算出した。クエン酸緩衝液ではpH4.5~pH5.5で遊離プリン体比率が80%以上となった。MES緩衝液ではpH6.0~pH6.5で遊離プリン体比率が80%以上となった(図4)。
(6)ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株由来ヌクレオシダーゼの精製
 ハイドロキシアパタイトカラム、陰イオン交換カラム、疎水カラム、ゲルろ過カラムクロマトグラフィーによってヌクレオシダーゼを精製した。以下に一連の精製工程を示す。まず、ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株の培養液より調製した凍結乾燥粉末0.1gを5mLのバッファー(5mMリン酸カリウム緩衝液(pH6)+0.3M NaCl)で溶解し、同バッファーで平衡化したハイドロキシアパタイトカラム(BioRad)に供した。吸着したタンパク質を5mMから300mMのリン酸のグラジエントで溶出して活性画分を回収した。得られた活性画分をバッファー(20mM リン酸カリウム緩衝液(pH5.5))で透析し、同バッファーで平衡化したDEAE HPカラム(GEヘルスケア)に供した。吸着したタンパク質を0mMから500mMのNaClのグラジエントで溶出したところ、3つのピークを認めた(図5)。Fr.2をピーク1、Fr.8,9をピーク2、Fr.14,15をピーク3と定めた。
 回収したピーク3をバッファー(20mM 酢酸緩衝液(pH4.5)+30%飽和硫酸アンモニウム)で透析し、同バッファーで平衡化したPhenyl HPカラム(GEヘルスケア)に供した。吸着したタンパク質を30%飽和から0%の硫酸アンモニウムのグラジエントで溶出して活性画分を回収した。得られた活性画分をバッファー(20mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH6))で透析した後、限外ろ過膜を用いて0.5mLに濃縮した。濃縮した活性画分を同バッファーで平衡化したHiLoad 16/60 Superdex200(GEヘルスケア)に供して活性画分を回収した。得られた精製酵素はSDS-PAGEにより単一バンドであることを確認した(図6)。分子量はSDS-PAGEで約53 kDa、ゲルろ過クロマトグラフィーで約126 kDaと推定された(図7)。得られた精製酵素の糖鎖をPNGaseF(New England BioLabs)で除去した。処理方法は添付プロトコールに従った。処理後のSDS-PAGEより、N型糖鎖除去によって分子量が約53k Daから約49k Daになったことが示された(図6、7)。回収したピーク1、2についても同様に精製し、SDS-PAGE及びゲルろ過クロマトグラフィーで分子量を決定した。分子量はSDS-PAGEで約51 kDa、ゲルろ過クロマトグラフィーで約230 kDaと推定された(図7)。得られた精製酵素の糖鎖をPNGaseF(New England BioLabs)で除去した。処理後のSDS-PAGEより、N型糖鎖除去によって分子量が約51 kDaから約40 kDaになったことが示された(図6、7)。
 各精製酵素(ピーク1~3)のN末端アミノ酸配列をプロテインシーケンサー(島津製作所)で分析したところ、以下に示す配列が推定された。
 ピーク1のN末端アミノ酸配列:ADKHYAIMDNDWYTA(配列番号7)
 ピーク2のN末端アミノ酸配列:ADKHYAIMDNDWYTA(配列番号8)
 ピーク3のN末端アミノ酸配列:VETKLIFLT(配列番号9)
 ピーク1とピーク2は分子量とN末端アミノ酸配列が一致し、同一の酵素であると推定された(図7)。以降の検討では、当該酵素をPN2と呼び、ピーク3の酵素をPN1と呼ぶことした。
2.遺伝子クローニング
 決定したN末端アミノ酸配列及びヌクレオシダーゼ保存配列から以下の縮重プライマーを設計し、P.multicolorゲノムDNAを鋳型にしてPCRを実施した。
<PN1用縮重プライマー>
 FW:ACIAARTAYMGNTTYYTIAC(配列番号10)
 RV:CATNCCNCKNGTCCAYTGNCC(配列番号11)
<PN2用縮重プライマー>
 FW:GCNATHATGGAYAAYGAYTGGTAYAC(配列番号12)
 RV:GCNGCNGTYTCRTCCCARAANGG(配列番号13)
 得られた増幅断片をpMD20-T(TaKaRa)にサブクローニングしてシーケンスし、図8に示すプローブを用いてサザンブロッティング及びコロニーハイブリダイゼーションを実施した。得られた断片をシーケンスしてPN1とPN2のゲノム中での塩基配列(図9)を同定した。
 次に、P.multicolorのゲノムDNAより調製したmRNAからSMARTER RACE5'/3' (TaKaRa)を用いてcDNAを調製した。そして、以下のプライマーを用いてPCRを行い、増幅断片をシーケンスし、cDNA中のPN1とPN2の塩基配列を決定した(図10)。また、決定した塩基配列から、PN1とPN2のアミノ酸配列を同定した(図11)。尚、図12においてPN1とPN2を比較した。
<PN1用PCRプライマー>
 FW:ATGGCACCTAAGAAAATCATCATTG(配列番号14)
 RV:TTAGTGGAAGATTCTATCGATGAGG(配列番号15)
<PN2用PCRプライマー>
 FW:ATGCATTTCCCTGTTTCATTGCCGC(配列番号16)
 RV:TCAACGCTCATTTCTCAGGTCGG(配列番号17)
3.酵素PN1の諸性質の検討
(1)至適温度
 DEAE HPカラムより回収されたピーク3のヌクレオシダーゼ(PN1)の至適温度を分析した。各温度における結果を図13に示す。当該条件下での至適温度は55℃~60℃であった。
(2)温度安定性
 DEAE HPカラムより回収されたピーク3のヌクレオシダーゼの温度安定性を分析した。各温度でpH4.5にて60分間処理した場合は45℃まで、pH6.0にて30分間処理した場合は55℃までは残存活性80%を示した(図14)。
(3)至適pH
 DEAE HPカラムより回収されたピーク3のヌクレオシダーゼの至適pHを分析した。pH2.5とpH3.5はクエン酸緩衝液、pH3.5とpH4.5とpH5.5は酢酸緩衝液、pH5.5とpH6.5はリン酸カリウム緩衝液を用いた。至適pHはpH3.5であった(図15)。
(4)pH安定性
 DEAE HPカラムより回収されたピーク3のヌクレオシダーゼを各pHにて30℃で30分間処理した場合と50℃で60分間処理した場合のpH安定性を分析した。緩衝液は至適pHの検討の場合と同じものを使用し、pH7.5についてはリン酸カリウム緩衝液を用いた。30℃で30分間処理した場合はpH3.5~7.5で、50℃で60分間処理した場合はpH3.5~7.5で80%以上の残存活性を示した(図16)。
4.酵素PN2の組換え生産
 PN2のcDNA断片を発現用ベクターのクローニングサイトに挿入し、PN2発現ベクターを構築した。当該発現ベクターでアスペルギルス・オリゼ(A.oryzae(pyrG-))を形質転換した。得られた形質転換体を4日間液体培養した(30℃、300rpm)。培養上清を回収し、ヌクレオシダーゼ活性を測定した。その結果、活性を示す形質転換体が得られていた。また、培養上清を糖鎖除去処理し、電気泳動したところ、推定される分子量と一致するサイズのバンドが確認された(図17)。
5.酵素PN2の諸性質の検討
 組換え生産したPN2を用い、諸性質を検討した。実験方法、条件等はPN1の検討の場合と同様とした。
(1)至適温度
 至適温度は50℃~55℃であった(図18)。
(2)温度安定性
 各温度でpH4.5にて60分間処理した場合は65℃まで、pH6.0にて30分間処理した場合は55℃までは残存活性80%を示した(図19)。
(3)至適pH
 pH2.5とpH3.5はクエン酸緩衝液、pH3.5とpH4.5とpH5.5は酢酸緩衝液、pH5.5とpH6.5はリン酸カリウム緩衝液を用いた。至適pHはpH4.5であった(図20)。
(4)pH安定性
 各pHにて30℃で30分間処理した場合と50℃で60分間処理した場合のpH安定性を分析した。緩衝液は至適pHの検討の場合と同じものを使用した。30℃で30分間処理した場合はpH3.5~7.5で、50℃で60分間処理した場合はpH4.5~7.5で80%以上の残存活性を示した(図21)。
6.酵素PN2のマッシング試験
 組換え生産したPN2を用いたマッシング試験を行った。試験方法、条件等は上記1.(4)と同様とした。マッシング後の麦汁中の各プリン体量を高速液体クロマトグラフィーで定量分析した。分析結果を図22に示した。PN2(ヌクレオシダーゼ)を添加した麦汁はプリンヌクレオシドが減少し、プリン塩基が増加しているのがわかる。
7.低pH条件下でのマッシング試験
 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株由来のヌクレオシダーゼのビール又はビール系飲料の製造における有用性を更に確認するため、当該酵素の至適pH付近(pH4.5~5.5)でマッシング試験を行い、所望の効果(即ち、プリン体低減)が得られるか検討した。粉砕麦芽80g、水320mLとともにヌクレオシダーゼ2400U相当量を添加して、初発(52℃)および60℃工程のpHをpH4.5、pH5.0又はpH5.5に調整してマッシング試験を行い、麦汁を調製した。反応工程を図23に示す。マッシング後の麦汁中の各プリン体量は高速液体クロマトグラフィーにて下記条件で定量的に分析した。分析結果を図24に示した。本ヌクレオシダーゼはpH4.5~5.5でマッシングを行っても遊離プリン塩基比率が90%以上となり、十分プリンヌクレオシドが減少し、プリン塩基が増加しているのがわかる。(図24)
<HPLC条件>
 カラム:Asahipak GS-220HQ
 移動相:150mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH2.5)
 温度:35℃
 流速:0.5mL/分
 検出:260nm
8.まとめ
 ペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株由来のヌクレオシダーゼは、ビールの仕込工程での使用に適した至適温度及び温度安定性を示した。また、pH安定性及び温度安定性に優れ、ビール又はビール系飲料の製造に限らず、様々な用途への適用が可能であることが判明した。このように、飲料・食品中のプリン体低減に極めて有用な新規ヌクレオシダーゼの取得に成功した。
 本発明のヌクレオシダーゼは、分解生成物のプリン体存在下でも活性を示すという特徴を示す。低プリン体ビール等、各種低プリン体食品又は飲料の製造に本発明を利用することができる。
 この発明は、上記発明の実施の形態及び実施例の説明に何ら限定されるものではない。特許請求の範囲の記載を逸脱せず、当業者が容易に想到できる範囲で種々の変形態様もこの発明に含まれる。本明細書の中で明示した論文、公開特許公報、及び特許公報などの内容は、その全ての内容を援用によって引用することとする。

Claims (18)

  1.  配列番号1のアミノ酸配列若しくは該アミノ酸配列と85%以上同一のアミノ酸配列、又は配列番号2のアミノ酸配列若しくは該アミノ酸配列と88%以上同一のアミノ酸配列、を含む、ヌクレオシダーゼ。
  2.  アミノ酸配列が、配列番号1のアミノ酸配列又は配列番号2のアミノ酸配列と90%以上同一のアミノ酸配列である、請求項1に記載のヌクレオシダーゼ。
  3.  下記の酵素学的性質を有するヌクレオシダーゼ、
     (1)作用:プリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に加水分解する反応を触媒し、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示す、
     (2)分子量:N型糖鎖を含まない場合の分子量が約49 kDa(SDS-PAGEによる)、
     (3)至適温度:55℃~60℃、
     (4)温度安定性:55℃以下で安定(pH6.0、30分間)。
  4.  下記の酵素学的性質を更に有する、請求項3に記載のヌクレオシダーゼ、
     (5)至適pH:3.5、
     (6)pH安定性:pH3.5~7.5の範囲で安定(30℃、30分間)。
  5.  下記の酵素学的性質を有するヌクレオシダーゼ、
     (1)作用:プリンヌクレオシドをD-リボースとプリン塩基に加水分解する反応を触媒し、アデノシン、アデニン、イノシン、ヒポキサンチン、グアノシン、グアニン及びキサンチンの存在下でも活性を示す、
     (2)分子量:N型糖鎖を含まない場合の分子量が約40 kDa(SDS-PAGEによる)、
     (3)至適温度:50℃~55℃、
     (4)温度安定性:65℃以下で安定(pH4.5、60分間)。
  6.  下記の酵素学的性質を更に有する、請求項5に記載のヌクレオシダーゼ、
     (5)至適pH:4.5、
     (6)pH安定性:pH3.5~7.5の範囲で安定(30℃、30分間)。
  7.  ペニシリウム・マルチカラー由来である、請求項1~6のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼ。
  8.  ペニシリウム・マルチカラーがIFO 7569株又はその変異株である、請求項7に記載のヌクレオシダーゼ。
  9.  請求項1~8のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼ、又は請求項1~8のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼを産生する微生物の培養液若しくはその精製物を含有するヌクレオシダーゼ剤。
  10.  以下の(a)~(c)からなる群より選択されるいずれかのDNAからなるヌクレオシダーゼ遺伝子:
     (a)配列番号1又は2のアミノ酸配列をコードするDNA;
     (b)配列番号3~6いずれかの塩基配列からなるDNA;
     (c)配列番号3~6のいずれかの塩基配列と等価な塩基配列を有し、且つヌクレオシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするDNA。
  11.  請求項10に記載のヌクレオシダーゼ遺伝子を含む組換えDNA。
  12.  請求項11に記載の組換えDNAを保有する微生物。
  13.  以下のステップ(1)及び(2)を含む、ヌクレオシダーゼの製造方法:
     (1)請求項1~8のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼを産生する微生物を培養するステップ;
     (2)培養後の培養液及び/又は菌体より、ヌクレオシダーゼを回収するステップ。
  14.  微生物がペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株又はその変異株である、請求項13に記載の製造方法。
  15.  以下のステップ(i)及び(ii)を含む、ヌクレオシダーゼの製造法:
     (i)請求項12に記載の微生物を、前記遺伝子がコードするタンパク質が産生される条件下で培養するステップ;
     (ii)産生された前記タンパク質を回収するステップ。
  16.  以下のステップ(I)及び(II)を含む、ヌクレオシダーゼ剤の製造方法:
     (I)請求項1~8のいずれか一項に記載のヌクレオシダーゼを産生する微生物を培養するステップ;
     (II)培養後に菌体を除去するステップ。
  17.  以下のステップを更に含む、請求項16に記載の製造方法:
     (III)菌体除去後の培養液を精製するステップ。
  18.  微生物がペニシリウム・マルチカラーIFO 7569株又はその変異株である、請求項16又は17に記載の製造方法。
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