WO2017145839A1 - 位相差顕微鏡および撮像方法 - Google Patents

位相差顕微鏡および撮像方法 Download PDF

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Definitions

  • the present invention relates to a phase contrast microscope for measuring a phase difference of an observation target in a liquid and an imaging method thereof.
  • phase difference measurement has been widely used as a method for observing cultured cultured cells such as stem cells without staining.
  • a phase contrast microscope is used to perform such phase difference measurement.
  • ring-shaped illumination light is irradiated onto an observation target, and direct light and diffracted light that have passed through the observation target are incident on a phase plate.
  • the direct light is attenuated by the ring part of the phase plate, and the diffracted light passes through the transparent part of the phase plate, and the direct light and the diffracted light are imaged to form an image with a contrast of light and dark. An image can be taken.
  • the liquid surface formed by the meniscus In order to compensate for the optical path shift due to the meniscus, information on the shape of the liquid surface formed by the meniscus is necessary. Compensation is possible if the liquid surface shape is known, but the liquid surface formed by the meniscus is formed from the relationship between the material on the surface of the container such as a well plate and the liquid contained in the container. It is difficult to compensate considering all possible combinations. Even within the same well, the liquid surface shape varies locally depending on the type and amount of liquid contained in the well and the surface state in the well, so it is only necessary to measure the liquid surface shape once. Instead, it is necessary to measure the liquid level shape every time it is observed. In addition, when performing time-lapse photography, the water level in the container changes due to the evaporation of the solution, which also changes the liquid surface shape.
  • Patent Document 1 measurement light is irradiated to a plurality of positions on the liquid level of the culture solution, the amount of deviation of the measurement light is detected, and the shape of the liquid level of the culture solution is calculated based on the amount of deviation.
  • Patent Document 1 requires a configuration for irradiating measurement light, and there is a problem that the apparatus becomes large and the cost increases.
  • the present invention provides a phase contrast microscope and an imaging method capable of estimating the liquid level shape of a liquid in a container without providing a new measurement system for determining the shape of the liquid level. For the purpose.
  • the phase contrast microscope of the present invention includes an illumination light irradiation unit that irradiates illumination light for phase difference measurement on a container in which a liquid and an observation target are stored, an imaging unit that images the observation target irradiated with the illumination light, Based on the adjustment optical system that adjusts the refraction of illumination light caused by the liquid surface shape of the liquid in the container, and the luminance distribution of the phase difference image of the observation target imaged by the imaging unit, the liquid surface shape of the liquid in the container A liquid surface shape estimation unit for estimating the liquid surface shape, and an adjustment information acquisition unit for acquiring adjustment information for adjusting the optical characteristics of the adjustment optical system based on the liquid surface shape estimated by the liquid surface shape estimation unit.
  • the phase contrast microscope of the present invention preferably includes an adjustment optical system control unit that adjusts the optical characteristics of the adjustment optical system based on the adjustment information acquired by the adjustment information acquisition unit.
  • the liquid level shape estimation unit is configured based on the luminance distribution of the phase difference image obtained by performing geometric optical simulation using a preset liquid level shape. It is preferable to estimate the liquid surface shape.
  • the liquid surface shape estimation unit includes a plurality of phase differences obtained by performing geometric optical simulations using a plurality of preset liquid surface shapes having different curvatures. It is preferable to estimate the liquid level shape of the liquid in the container based on the luminance distribution of the image.
  • the liquid surface shape estimation unit may correlate the luminance distribution of the phase difference image acquired by using geometric optical simulation and the luminance distribution of the phase difference image captured by the imaging unit. It is preferable to estimate the liquid level shape of the liquid in the container by obtaining the above.
  • the liquid surface shape estimation unit obtains the correlation using a correlation function.
  • the liquid surface shape estimation unit includes the luminance value of the inflection point in the luminance distribution of the phase difference image acquired using geometric optical simulation and the phase difference image captured by the imaging unit. It is preferable to obtain the correlation based on the luminance value of the inflection point in the luminance distribution.
  • the liquid surface shape estimation unit is at least one extending from the central part of the meniscus formed in the container toward the outer periphery of the container on the phase difference image captured by the imaging unit. It is preferable to set two straight lines and to estimate the liquid surface shape of the liquid in the container based on the luminance distribution of the phase difference image on the set straight lines.
  • the liquid surface shape estimation unit sets the straight lines extending in a plurality of different directions, and based on the luminance distribution of the phase difference images on the plurality of straight lines, It is preferable to estimate the liquid surface shape.
  • the liquid surface shape estimation unit performs a smoothing process on the phase difference image captured by the imaging unit, and the luminance distribution of the phase difference image subjected to the smoothing process. It is preferable to estimate the liquid level shape of the liquid in the container based on the above.
  • the imaging method of the present invention irradiates a container containing a liquid and an observation object with illumination light for phase difference measurement, images a phase difference image of the observation object, and luminance distribution of the imaged phase difference image
  • a container containing a liquid and an observation object with illumination light for phase difference measurement images a phase difference image of the observation object, and luminance distribution of the imaged phase difference image
  • the optical characteristics of the adjusting optical system that estimates the liquid level shape of the liquid and adjusts the refraction of light caused by the liquid level shape of the liquid in the container based on the estimated liquid level shape
  • the container is irradiated with illumination light, and the observation target irradiated with the illumination light is imaged.
  • the liquid level shape of the liquid in the container is estimated based on the luminance distribution of the phase-contrast image captured by the imaging unit that captures the phase-contrast image for observation. Therefore, the liquid surface shape of the liquid in the container can be estimated without providing a new measurement system for estimating the liquid surface shape.
  • the figure which shows typically the position of the optical element for adjustment, rotation of an optical axis, and adjustment of refractive power The figure which shows an example of the light and dark pattern which appears in a phase difference image
  • DELTA optical path shift
  • the figure which shows an example of luminance distribution G1 of the phase difference image acquired by geometric optical simulation, and luminance distribution G2 of the phase difference image imaged by the imaging part The flowchart for demonstrating the effect
  • the figure for demonstrating the example which set eight straight lines L1-L8 toward the outer periphery from the center part of a meniscus The figure which shows an example of the profile which matched the luminance value P (x) of the phase difference image, and the inclination-angle (theta) of a liquid level.
  • FIG. 1 is a diagram showing a schematic configuration of the microscope system of the present embodiment.
  • the microscope system includes an illumination light irradiation unit 10, an adjustment optical system 20, an imaging optical system 30, an imaging unit 40, a microscope control device 50, and a display device 70.
  • the input device 80 is provided.
  • a stage 61 is provided between the adjustment optical system 20 and the imaging optical system 30, and the culture medium C and the observation target S that are liquids are accommodated on the stage 61.
  • the cultured container 60 is installed.
  • the microscope system according to this embodiment includes a stage driving unit 62 that moves the stage 61 in the X direction, the Y direction, and the Z direction.
  • the X direction and the Y direction are directions orthogonal to each other on a plane parallel to the observation target installation surface P, and the Z direction is a direction orthogonal to the X direction and the Y direction.
  • a microscope main body is configured, and the microscope control device 50 controls the phase contrast microscope main body.
  • the microscope control device 50 controls the phase contrast microscope main body.
  • the illumination light irradiation unit 10 irradiates the observation target S accommodated in the culture vessel 60 with illumination light for so-called phase difference measurement.
  • illumination for the phase difference measurement is performed.
  • a ring-shaped illumination light is irradiated as light.
  • the illumination light irradiation unit 10 of the present embodiment includes a white light source 11 that emits white light and a ring-shaped slit, and the white light emitted from the white light source 11 is incident on the ring light.
  • a slit plate 12 that emits light and a condenser lens 13 that receives the ring-shaped illumination light emitted from the slit plate 12 and irradiates the incident ring-shaped illumination light onto the observation object S are provided.
  • the slit plate 12 is provided with a ring-shaped slit that transmits white light to the light-shielding plate that blocks the white light emitted from the white light source 11, and the ring shape is obtained when the white light passes through the slit. Illumination light is formed.
  • the ring-shaped illumination light is formed using the slit plate 12 as described above.
  • the method for forming the ring-shaped illumination light is not limited to this, for example, spatial light modulation.
  • Ring-shaped illumination light may be formed using an element or the like.
  • the ring-shaped illumination light is used as the phase difference measurement illumination light.
  • illumination light having a shape other than the ring shape may be used, and the shape may be a conjugate with the phase plate described later.
  • other shapes such as a triangular shape and a rectangular shape may be used.
  • the bottom surface of the culture vessel 60 installed on the stage 61 is the observation target installation surface P, and a cell group or the like is arranged as the observation target S on the observation target installation surface P.
  • the culture vessel 60 is filled with the culture solution C, and a concave meniscus is formed on the surface of the culture solution C.
  • Examples of the culture container 60 include a petri dish and a well plate in which a plurality of wells are arranged. In the case of a well plate, the observation object S and the culture medium C are accommodated in each well, and a meniscus is formed for each well.
  • the cell group cultured in the culture medium is the observation object S.
  • the observation object S is not limited to such a culture medium, and water, formalin, ethanol, and methanol. It is good also considering the cell fixed in liquids, such as the observation object S. FIG. Again, a meniscus is formed on the liquid level of these liquids in the container.
  • the adjusting optical system 20 adjusts the refraction of the illumination light for phase difference measurement caused by the liquid surface shape of the meniscus described above.
  • the adjustment optical system 20 of the present embodiment includes an adjustment optical element 21 and an adjustment optical system driving unit 22.
  • the adjustment optical element 21 is an optical element having refractive power, and specifically, a plano-convex lens having a curvature on the incident surface or the exit surface, a biconvex lens having a curvature on both the entrance surface and the exit surface, a voltage A liquid crystal lens whose refractive power changes by application, a liquid lens that can change the radius of curvature of the lens, a spatial light modulator that can change the focal length, and the like can be used.
  • the adjusting optical system driving unit 22 adjusts the focal length by changing the refractive power of the adjusting optical element 21 based on a control signal output from the adjusting optical system control unit 51 described later.
  • the adjustment optical system drive unit 22 includes a mechanism for changing the position of the adjustment optical element 21 and the optical axis direction.
  • the adjustment optical system drive unit 22 applies a voltage corresponding to a desired focal length to the liquid crystal lens or the spatial light modulator. Is.
  • the adjustment optical system drive unit 22 adjusts the amount of liquid in the liquid lens according to a desired focal length, thereby setting the radius of curvature of the liquid lens. To be adjusted.
  • FIG. 2I is a diagram schematically illustrating a change in the position of the adjustment optical element 21 in the X direction, the Y direction, and the Z direction.
  • FIG. 2II is a diagram schematically showing the change in the optical axis direction of the adjustment optical element 21.
  • the rotation adjustment around the X axis ( ⁇ ) of the optical axis of the adjustment optical element 21 It is a figure which shows typically the rotation adjustment around the Y-axis ( ⁇ ) and the rotation adjustment around the Z-axis ( ⁇ ).
  • FIG. 2III schematically shows the adjustment of the refractive power of the adjustment optical element 21. Note that FIG.
  • the refractive power is adjusted by adjusting the radius of curvature of the adjustment optical element 21, but the method for adjusting the refractive power is not limited to this.
  • the refractive power can be adjusted by adjusting the applied voltage.
  • the adjustment optical element 21 is moved in the X direction, the Y direction, and the Z direction.
  • an action equivalent to the optical action by the movement of the adjustment optical element 21 can be obtained.
  • the adjustment optical element 21 is not necessarily moved.
  • the adjustment optical element 21 when a liquid crystal lens or a spatial light modulator is used as the adjustment optical element 21, the same effect as the shift of the optical axis due to the movement of the adjustment optical element 21 is obtained by adjusting the applied voltage. May be.
  • the optical axis direction of the adjustment optical element 21 it is not always necessary to rotate the adjustment optical element 21 itself. By adjusting the applied voltage, the optical axis of the adjustment optical element 21 itself is rotated. You may make it acquire the effect similar to rotation.
  • the adjustment optical element 21 is moved in the X direction and the Y direction.
  • the adjustment optical element 21 is not limited to this, and the adjustment optical element 21 is moved by moving the stage 61 in the X direction and the Y direction. You may change the relative positional relationship about the X direction and the Y direction of 21 and the meniscus formed in the culture container 60. FIG.
  • one adjustment optical element 21 is used, but the refractive power may be adjusted by switching a plurality of adjustment optical elements 21 having different focal lengths.
  • the adjustment optical element 21 may be replaced automatically or manually.
  • the plurality of adjustment optical elements 21 are manually replaced, for example, based on the liquid surface shape estimated by the liquid surface shape estimation unit 54 described later, information on the appropriate type of the adjustment optical element 21 is displayed. 70, and the user may manually replace the adjustment optical element 21 based on the display.
  • the imaging optical system 30 includes an objective lens 31, a phase plate 32, an imaging lens 33, and an imaging optical system drive unit 34.
  • the phase plate 32 is obtained by forming a phase ring on a transparent plate that is transparent with respect to the wavelength of the ring-shaped illumination light. Note that the size of the slit of the slit plate 12 described above is in a conjugate relationship with this phase ring.
  • the phase ring is a ring in which a phase film that shifts the phase of incident light by a quarter wavelength and a neutral density filter that attenuates incident light are formed.
  • the phase is shifted by 1 ⁇ 4 wavelength, and the brightness is weakened.
  • most of the diffracted light diffracted by the observation object S passes through the transparent plate of the phase plate 32, and its phase and brightness do not change.
  • the objective lens 31 is moved in the Z direction by the imaging optical system driving unit 34.
  • autofocus control is performed by moving the objective lens 31 in the Z direction by the imaging optical system driving unit 34, and the contrast of the image captured by the imaging unit 40. Is adjusted.
  • the imaging lens 33 receives direct light and diffracted light that have passed through the phase plate 32 and forms an image of these lights on the imaging unit 40.
  • the imaging optical system drive unit 34 includes a mechanism for moving the objective lens 31 in the Z direction as described above.
  • the imaging unit 40 includes an imaging element that captures a phase difference image of the observation target S imaged by the imaging lens 33.
  • an imaging element that captures a phase difference image of the observation target S imaged by the imaging lens 33.
  • the image sensor a charge-coupled device (CCD) image sensor, a complementary metal-oxide semiconductor (CMOS) image sensor, or the like can be used.
  • CCD charge-coupled device
  • CMOS complementary metal-oxide semiconductor
  • phase contrast microscope main body configured as described above.
  • meniscus formed on the liquid surface of the culture solution C it is assumed that there is no influence of the meniscus formed on the liquid surface of the culture solution C.
  • the ring-shaped illumination light emitted from the illumination light irradiation unit 10 is irradiated to the observation object S.
  • the illumination light applied to the observation object S is divided into direct light that travels straight through the observation object S and diffracted light that is diffracted by the observation object S.
  • the direct light and the diffracted light transmitted through the observation object S are transmitted through the objective lens 31 and are incident on the phase plate 32.
  • the direct light transmitted through the observation object S is incident on the phase ring of the phase plate 32, the phase of which is shifted by 1 ⁇ 4 wavelength, and the brightness is weakened.
  • most of the diffracted light transmitted through the observation object S passes through a transparent portion of the phase plate 32.
  • the direct light and diffracted light transmitted through the phase plate 32 are imaged on the imaging surface of the image sensor by the imaging lens 33, and a phase difference image in which the contrast of the edge portion and the like is enhanced by interference between the direct light and the diffracted light. Imaged.
  • the stage 61 moves in the X direction and the Y direction, whereby the inside of the culture vessel 60 is scanned with illumination light, and the phase difference image for each region irradiated with the illumination light in the culture vessel 60 is obtained. Is imaged.
  • the microscope control device 50 shown in FIG. 1 includes a computer having a CPU (Central Processing Unit), a memory, a hard disk, and the like.
  • CPU Central Processing Unit
  • the microscope control device 50 includes an adjustment optical system control unit 51 that controls the adjustment optical system drive unit 22 and an imaging optical system control that controls the imaging optical system drive unit 34.
  • a surface shape estimation unit 54 and an adjustment information acquisition unit 55 that acquires adjustment information for adjusting the optical characteristics of the adjustment optical system 20 based on the liquid surface shape estimated by the liquid surface shape estimation unit 54 are provided. Yes.
  • the liquid surface shape estimation unit 54 estimates the liquid surface shape of the culture solution C in the culture vessel 60 based on the luminance distribution of the phase difference image captured by the imaging unit 40 as described above. First, the principle of estimating the liquid surface shape of the culture medium C based on the luminance distribution of the phase difference image will be described.
  • FIG. 3I shows an example of a phase difference image
  • FIG. 3II is an enlarged view of a part of the phase difference image shown in FIG. 3I (range surrounded by a square).
  • a light and dark pattern luminance distribution
  • FIG. 3II shows an example of a phase difference image
  • FIG. 3II is an enlarged view of a part of the phase difference image shown in FIG. 3I (range surrounded by a square).
  • a light and dark pattern luminance distribution
  • the direct light is incident on the phase ring of the phase plate 32.
  • the phase difference image of the center portion of the meniscus becomes an image darker than the surroundings (range indicated by arrow A in FIG. 3II).
  • the center portion of the meniscus is a portion of the bottom surface of the meniscus including the position closest to the bottom surface of the culture vessel 60 when the curved surface formed over the entire liquid surface in the culture vessel 60 is called a meniscus. It is.
  • the illumination light transmitted through the curved surface portion adjacent to the central portion of the meniscus is affected by refraction by the curved surface of the meniscus, so that the direct light is transmitted through the transparent portion without being incident on the phase ring of the phase plate 32.
  • the phase difference image of the curved surface portion becomes brighter than the phase difference image of the central portion (range indicated by arrow B in FIG. 3II).
  • the illumination light that has passed through a portion that is a certain distance from the central portion is largely refracted by the curved surface of the meniscus.
  • a dark phase difference image is formed (range indicated by an arrow C in FIG. 3II). Therefore, by the above-described action, a concentric light and dark pattern as shown in FIG. 3 is formed in the phase difference image.
  • the shape of the meniscus that is, the liquid surface shape is estimated using the light / dark pattern.
  • a geometrical optical simulation using parameters of a known optical system is performed to acquire a light / dark pattern (luminance distribution) appearing on the phase difference image, and acquired in advance by the geometrical optical simulation.
  • the liquid surface shape of the culture medium C is estimated based on the light / dark pattern.
  • a plurality of liquid surface shape (meniscus) models having different curvatures are set, the optical path deviation of incident light is calculated for each of the liquid surface shape models, and based on the optical path deviation.
  • the light / dark pattern appearing on the phase difference image is calculated.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining an example of a method of calculating an optical path deviation when the ring-shaped illumination light N is incident on the meniscus model M.
  • 60a is a culture vessel model
  • 31a is an objective lens model
  • 32a is a phase plate model
  • A is a plane at the position of the phase difference plate model 32a.
  • ⁇ 2 is calculated from Snell's law by the following equation.
  • ⁇ 3 is calculated from Snell's law using the following equation.
  • the optical path deviation ⁇ x from the optical axis can be calculated by the following equation. Note that f is the focal length of the objective lens model 31a, and the focal position of the objective lens model 31a is focused on the bottom surface of the culture vessel model 60a.
  • the range d na of the objective lens model 31a is a ring-shaped illumination light N incident can be calculated by the following equation
  • FIG. 5 shows the relationship between the optical path shift ⁇ x in the range d na and plane A Figure It is.
  • NA in the following expression is the numerical aperture of the objective lens model 31a.
  • ⁇ 1 and ⁇ 2 shown in FIG. 5 indicate the inner diameter and outer diameter of the image of the phase plate model 32a when there is no optical path deviation.
  • t 1 and t 2 shown in FIG. 5 indicate the inner diameter and outer diameter of the image of the ring-shaped illumination light N when the optical path deviation is ⁇ x.
  • the transmittance T (x, y) at each position (x, y) in the plane A can be expressed by the following equation.
  • incident light intensity P (x, y) at each position (x, y) on the plane A can be expressed by the following equation.
  • the incident light intensity P (x, y) may be expressed by a Gaussian distribution, in which case it can be expressed by the following equation.
  • the sum O ( ⁇ 1) of the intensity of light passing through the plane A when the liquid surface inclination of the meniscus model M is ⁇ 1 can be expressed by the following equation.
  • the liquid surface shape can be estimated with high accuracy by correcting the estimated position using the following equation.
  • FIG. 6 is a diagram illustrating an example of the luminance distribution of the phase difference image acquired by the geometric optical simulation.
  • the luminance distribution shown in FIG. 6 shows a linear luminance distribution extending from the center of the meniscus model M toward the outer periphery of the culture vessel model 60a, and the horizontal axis of FIG. Distance.
  • the center of the meniscus model M is the center position in the center portion of the meniscus described above, and in the case of geometric optical simulation, is the same position as the center position of the culture vessel model 60a.
  • the OD value on the vertical axis shown in FIG. 6 is a value obtained by normalizing the luminance value on the straight line with the luminance value at the center of the meniscus model M. As shown in FIG. 6, even in the result of the geometric optical simulation, a bright and dark pattern is formed outward from the central portion of the meniscus.
  • the liquid surface shape estimation unit 54 acquires the phase difference image captured by the imaging unit 40 before the adjustment by the adjustment optical system 20 described above, and acquires the luminance distribution of the phase difference image.
  • a phase difference image may be captured with the optical characteristics of the adjustment optical system 20 as an initial state, or the adjustment optical system 20 is used as illumination light.
  • a phase difference image may be taken in a state of being retracted from the optical path.
  • the optical parameters of the adjustment optical system 20 in the initial state are also considered in the geometric optical simulation described above.
  • FIG. 7 is a diagram illustrating an example of a phase difference image captured by the imaging unit 40 before adjustment by the adjustment optical system 20.
  • the liquid surface shape estimation unit 54 sets a straight line L extending from the central portion of the meniscus toward the outer periphery of the culture vessel 60 on the phase difference image captured by the imaging unit 40, and the setting is performed.
  • the luminance distribution of the phase difference image on the straight line L is acquired.
  • stretching direction of the straight line set on the phase difference image when acquiring luminance distribution in geometric optical simulation are the same directions.
  • the phase difference image is subjected to smoothing processing such as low-pass filter processing, and the luminance distribution of the phase difference image subjected to the smoothing processing is obtained. You may get it. Thereby, the brightness
  • the liquid surface shape estimation unit 54 specifies the center portion of the meniscus based on the luminance of the phase difference image. Specifically, for example, by extracting a region having a luminance equal to or lower than a preset threshold value from the phase difference image, and identifying a circular region near the central portion of the phase difference image among the extracted regions, the center of the meniscus Identify the part. And the straight line L shown in FIG. 7 is set by setting the straight line extended toward the outer side from the center position in the center part of the specified meniscus.
  • a correlation function is used to obtain the correlation between these luminance distributions. What should I do?
  • inflection points in the luminance distribution of the liquid surface shape stored in advance and the luminance distribution of the phase difference image captured by the imaging unit 40 inflection points in the luminance distribution of the liquid surface shape stored in advance and the luminance distribution of the phase difference image captured by the imaging unit 40.
  • the sum of the differences between the luminance values (OD values) of the corresponding inflection points of these luminance distributions may be obtained for each of the plurality of liquid surface shape luminance distributions stored in advance, and the luminance distribution having the smallest total value may be specified as the luminance distribution having the highest correlation.
  • the liquid surface shape estimation unit 54 specifies the liquid surface shape with the curvature having the highest correlation with the luminance distribution of the phase difference image captured by the imaging unit 40, and determines the liquid surface shape with the specified curvature as the culture vessel 60. It is estimated as the liquid surface shape of the culture medium C inside.
  • the adjustment information acquisition unit 55 acquires adjustment information for adjusting the optical characteristics of the adjustment optical system 20 based on the liquid surface shape estimated by the liquid surface shape estimation unit 54 as described above. Is. Specifically, the adjustment information acquisition unit 55 of the present embodiment acquires the inclination angle of the liquid surface in the imaging region of the phase difference image based on the liquid surface shape estimated by the liquid surface shape estimation unit 54, Based on the inclination angle and the refractive index of the culture medium C, the refraction angle of the illumination light in the imaging region is calculated. In the present embodiment, as described above, the inside of the culture vessel 60 is scanned with illumination light, and phase difference images are taken for each of a plurality of imaging regions obtained by dividing the inside of the culture vessel 60. For, the refraction angle of the illumination light is calculated.
  • the adjustment information acquisition unit 55 outputs information on the refraction angle of illumination light in each imaging region to the adjustment optical system control unit 51 as adjustment information.
  • the adjustment optical system control unit 51 adjusts the optical characteristics of the adjustment optical system 20 based on the information on the refraction angle of the illumination light calculated by the adjustment information acquisition unit 55. Specifically, the adjustment optical system control unit 51 is preset with a lookup table that associates the refraction angle of the illumination light in the imaging region with the adjustment amount of the adjustment optical element 21 of the adjustment optical system 20. ing. Then, the adjustment optical system control unit 51 acquires the adjustment amount of the adjustment optical element 21 of the adjustment optical system 20 with reference to the lookup table based on the information on the refraction angle of the illumination light, and uses the adjustment amount as the adjustment amount. A corresponding control signal is output to the adjusting optical system driving unit 22. As described above, the adjustment amount of the adjustment optical element 21 of the adjustment optical system 20 includes the position, refractive power, optical axis direction, and the like of the adjustment optical element 21 in the X direction, Y direction, and Z direction.
  • the control signal output from the adjustment optical system control unit 51 is input to the adjustment optical system drive unit 22, and the adjustment optical system drive unit 22 uses the refractive power of the adjustment optical element 21 based on the input control signal.
  • the optical characteristics are adjusted by adjusting the positions in the X direction, the Y direction, and the Z direction, and the optical axis direction.
  • the adjustment information acquisition unit 55 is an optical according to the liquid surface shape estimated by the liquid surface shape estimation unit 54. Information specifying the type of the adjustment optical element 21 having characteristics is acquired as adjustment information. It is assumed that the adjustment information acquisition unit 55 is preset with a table in which the liquid level shape and information for specifying the type of the adjustment optical element 21 corresponding to the liquid level shape are associated with each other.
  • adjustment optical system control part 51 the information which specifies the kind of optical element 21 for adjustment acquired in adjustment information acquisition part 55 is outputted to adjustment optical system control part 51, and adjustment optical system control part 51 is based on the inputted information. It automatically switches to the adjusting optical element 21 corresponding to the liquid surface shape. The user may manually replace the adjustment optical element 21 by displaying information specifying the type of the adjustment optical element 21 on the display device 70 to notify the user of the information.
  • the imaging optical system control unit 52 moves the objective lens 31 in the Z direction by driving and controlling the imaging optical system driving unit 34. Specifically, the imaging optical system control unit 52 of the present embodiment performs autofocus control by moving the objective lens 31 in the Z direction by the imaging optical system driving unit 34 when capturing a phase difference image. It is.
  • the stage control unit 53 controls the stage driving unit 62 to move the stage 61 in the X direction, the Y direction, and the Z direction.
  • the stage controller 53 scans the inside of the culture vessel 60 with illumination light by moving the stage 61 in the X direction and the Y direction as described above, and is divided in the culture vessel 60 (for example, in one well). In addition, a phase difference image for each of a plurality of imaging regions is captured.
  • the input device 80 includes an input device such as a keyboard and a mouse, and accepts a setting input by a user.
  • the display device 70 is configured by a display device such as a liquid crystal display, and displays a phase difference image captured by the imaging unit 40.
  • the display device 70 may be configured with a touch panel, and the display device 70 may also serve as an input device.
  • the culture vessel 60 containing the observation object S and the culture medium C is placed on the stage 61.
  • a phase difference image of the observation target S before adjustment by the adjustment optical system 20 is captured and acquired by the liquid surface shape estimation unit 54 (S10).
  • the liquid surface shape estimation unit 54 sets a straight line L extending from the central portion of the meniscus toward the outer periphery of the culture vessel 60 on the phase difference image before adjustment as described above, and the phase difference on the set straight line L.
  • the luminance distribution of the image is acquired (S12).
  • the liquid surface shape luminance distribution having the highest correlation with the luminance distribution of the phase difference image before adjustment is specified, and the specified liquid surface shape is determined as the liquid surface shape of the culture liquid C in the culture vessel 60. (S14).
  • the estimation result of the liquid surface shape is output to the adjustment information acquisition unit 55, and the adjustment information acquisition unit 55 acquires adjustment information for adjusting the optical characteristics of the adjustment optical system 20 based on the estimated liquid surface shape. (S16).
  • the adjustment information acquired by the adjustment information acquisition unit 55 is output to the adjustment optical system control unit 51.
  • the adjustment optical system control unit 51 adjusts the optical characteristics of the adjustment optical system 20 based on the input adjustment information. (S18).
  • the optical characteristics of the adjustment optical system 20 are adjusted as described above, and thereby the influence of refraction due to the meniscus formed on the liquid surface of the culture medium C is removed, and then the phase difference image of the observation target S is again displayed. Is imaged by the imaging unit 40 (S20).
  • the phase difference image captured by the imaging unit 40 is output to the display device 70 and displayed by the display device 70.
  • the liquid surface shape of the culture medium C in the culture vessel 60 is estimated based on the luminance distribution of the phase difference image captured by the imaging unit 40 that captures the phase difference image for observation. Therefore, the liquid surface shape of the culture solution C in the culture vessel 60 can be estimated without providing a new measurement system for estimating the liquid surface shape. Then, based on the estimated liquid surface shape, the optical characteristics of the adjustment optical system 20 are adjusted, and then the phase difference image to be observed is captured, so that the phase difference image in which the influence of the meniscus is suppressed is obtained. An image can be taken.
  • one straight line L extending from the central portion of the meniscus toward the outer periphery of the culture vessel 60 is displayed on the phase difference image captured by the imaging unit 40.
  • the luminance distribution on the straight line L is used as a representative of the luminance distribution of the entire phase difference image
  • a plurality of straight lines extending from the central portion of the meniscus toward the outer periphery may be set. . That is, the meniscus formed in the culture vessel 60 is not necessarily formed with the same curvature in each direction from the center toward the outer periphery in the culture vessel 60.
  • each straight line L1 to L8 extending from the central portion of the meniscus toward the outer periphery may be set, and the luminance distribution for each straight line may be acquired. Then, by calculating the curvature of the liquid surface shape corresponding to the luminance distribution for each straight line, the curvature of the liquid surface shape may be obtained for each of the eight directions. Thereby, the liquid level shape can be estimated with higher accuracy.
  • the curvature R of the liquid surface shape is obtained on the assumption that the liquid surface shape is close to a sphere.
  • the meniscus depends on the size of the culture vessel 60. Since the flat bottom surface portion of the liquid becomes large, the liquid surface shape does not become spherical, and there is a possibility that the estimation accuracy of the liquid surface shape is lowered. Therefore, the liquid surface shape may be estimated as follows.
  • a profile associating the luminance value P (x) of the phase difference image with the inclination angle ⁇ of the liquid surface as shown in FIG. 11 is acquired.
  • the luminance value P (x) represents the luminance value at each position x between the central portion of the meniscus model M and the outer periphery of the culture vessel 60a.
  • the liquid surface inclination angle ⁇ is the inclination angle ⁇ 1 shown in FIG. Note that the profile shown in FIG. 11 can be acquired using the calculation result in the above embodiment.
  • the phase difference image captured by the imaging unit 40 is acquired, the phase difference image is normalized so that the luminance value of the center portion of the meniscus is 1, and the normalized level is obtained.
  • a smoothing process is performed on the phase difference image to remove high-frequency noise derived from cells.
  • a straight line extending from the center portion of the meniscus toward the outer periphery is set as shown in FIG. 12, and each position is scanned on the straight line from the center of the meniscus.
  • the luminance values at x 1 , x 2 ,..., x n are acquired.
  • the inclination angle ⁇ of the liquid level corresponding to the luminance value P (x) at each position x is obtained using the profile shown in FIG.
  • the inclination angle ⁇ of the liquid level at each position on the straight line shown in FIG. 12 can be obtained, and the shape of the liquid level on the straight line can be estimated.
  • the inclination angle ⁇ of the liquid surface is obtained using the profile shown in FIG. 11, two values are obtained for the same luminance value P (x) (1.5 in the example shown in FIG. 13) as shown in FIG.
  • the inclination angle ⁇ may be obtained. Therefore, as described above, when the luminance value is acquired in order from the center of the meniscus and the inclination angle ⁇ corresponding to the luminance value is sequentially obtained, the inclination angle of the liquid surface increases as the distance from the center of the meniscus increases. When there are a plurality of candidates for the inclination angle ⁇ , the smallest inclination angle ⁇ may be selected first.
  • the adjustment optical element 21 is provided to remove the influence of the refraction of illumination light caused by the meniscus formed on the liquid surface.
  • the optical element 21 may not be provided.
  • the slit plate 12 may be moved in the X direction and the Y direction, or the phase plate 32 may be moved in the X direction and the Y direction. You may make it remove the influence of the refraction of the illumination light which originates. That is, the slit plate 12 and the phase plate 32 may be used as the adjustment optical system in the present invention.
  • the adjustment optical element 21 is provided between the condenser lens 13 and the culture vessel 60.
  • the position of the adjustment optical element 21 is not limited to this position. It may be provided at other positions such as between the light source 11 and the slit plate 12, between the phase plate 32 and the condenser lens 13, and between the culture vessel 60 and the objective lens 31.

Abstract

液面形状を求めるための新たな測定系を設けることなく、容器内の液体の液面形状を推定することができる位相差顕微鏡および撮像方法を提供する。液体および観察対象が収容された容器に対して位相差計測用の照明光を照射する照明光照射部(10)と、照明光を照射した観察対象を撮像する撮像部(40)と、容器内の液体の液面形状に起因する照明光の屈折を調整する調整光学系(20)と、撮像部(40)によって撮像された観察対象の位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定する液面形状推定部(54)と、液面形状推定部(54)によって推定された液面形状に基づいて、調整光学系(20)の光学特性を調整するための調整情報を取得する調整情報取得部(55)とを備える。

Description

位相差顕微鏡および撮像方法
 本発明は、液体中の観察対象を位相差計測する位相差顕微鏡およびその撮像方法に関するものである。
 近年、幹細胞などの培養された透明な細胞を非染色に観察する方法として位相差計測が広く使われ始めている。そして、このような位相差計測を行うものとして位相差顕微鏡が使用されている。
 一般的な位相差顕微鏡においては、リング状の照明光が観察対象に照射され、観察対象を通過した直接光と回折光が位相板に入射される。そして、直接光は位相板のリング部分によって減光され、回折光は位相板の透明な部分を通過し、この直接光と回折光とが結像されることによって明暗のコントラストのついた像を撮像することができる。
 ここで、位相差顕微鏡によって培養液中の細胞などを観察する場合、培養液の表面張力の影響によって培養液の液面にメニスカスが形成される。そして、このメニスカスのレンズ作用によってリング状の照明光の光路がずれてしまい、位相板に入射される直接光と回折光とに影響を及ぼして明瞭な位相差画像が得られない問題がある。
 このメニスカスによる光路ずれを補償するためには、メニスカスが形成する液面形状の情報が必要である。液面形状が分かっていれば補償することは可能であるが、メニスカスが形成する液面は、ウェルプレートなどの容器の表面の素材と容器内に収容される液体との関係から形成されるので、現実的にあり得るすべての組み合わせを考慮して補償することは難しい。また、同じウェル内であっても、ウェル内に収容される液体の種類および量並びにウェル内の表面の状態によって局所的に液面形状が異なるので、液面形状を1度計測すれば良い分けではなく、観察する度に液面形状を計測する必要がある。また、タイムラプス撮影を行う場合、溶液の蒸発により、容器内の水位が変化し、これによっても液面形状が変化する。
 そこで、たとえば特許文献1においては、培養液の液面の複数位置に計測光を照射し、その計測光のズレ量を検出し、そのズレ量に基づいて、培養液の液面の形状を算出することが開示されている。
特開2015-152650号公報
 しかしながら、特許文献1に記載の装置では、計測光を照射するための構成が必要となり、装置が大型化してコストアップになる問題がある。
 本発明は、上記の問題に鑑み、液面の形状を求めるための新たな測定系を設けることなく、容器内の液体の液面形状を推定することができる位相差顕微鏡および撮像方法を提供することを目的とする。
 本発明の位相差顕微鏡は、液体および観察対象が収容された容器に対して位相差計測用の照明光を照射する照明光照射部と、照明光を照射した観察対象を撮像する撮像部と、容器内の液体の液面形状に起因する照明光の屈折を調整する調整光学系と、撮像部によって撮像された観察対象の位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定する液面形状推定部と、液面形状推定部によって推定された液面形状に基づいて、調整光学系の光学特性を調整するための調整情報を取得する調整情報取得部とを備える。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡においては、調整情報取得部によって取得された調整情報に基づいて、調整光学系の光学特性を調整する調整光学系制御部を備えることが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、予め設定された液面形状を用いて幾何光学シミュレーションを行って取得された位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定することが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、互いに異なる曲率を有する、予め設定された複数の液面形状を用いてそれぞれ幾何光学シミュレーションを行って取得された複数の位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定することが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、幾何光学シミュレーションを用いて取得された位相差画像の輝度分布と撮像部によって撮像された位相差画像の輝度分布との相関関係を求めることによって、容器内の液体の液面形状を推定することが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、相関関数を用いて上記相関関係を求めることが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、幾何光学シミュレーションを用いて取得された位相差画像の輝度分布における変曲点の輝度値と撮像部によって撮像された位相差画像の輝度分布における変曲点の輝度値とに基づいて、相関関係を求めることが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、撮像部によって撮像された位相差画像上において、容器内に形成されるメニスカスの中心部分から容器の外周に向かって延びる少なくとも一つの直線を設定し、その設定した直線上の位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定することが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、互いに異なる複数の方向に延びる上記直線を設定し、その複数の直線上の位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定することが好ましい。
 また、上記本発明の位相差顕微鏡において、液面形状推定部は、撮像部によって撮像された位相差画像に対して平滑化処理を施し、その平滑化処理の施された位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定することが好ましい。
 本発明の撮像方法は、液体および観察対象が収容された容器に対して位相差計測用の照明光を照射して、観察対象の位相差画像を撮像し、その撮像した位相差画像の輝度分布に基づいて、液体の液面形状を推定し、その推定した液面形状に基づいて、容器内の液体の液面形状に起因する光の屈折を調整する調整光学系の光学特性を調整するための調整情報を取得し、その調整情報に基づいて、調整光学系の光学特性が調整された後、容器に対して照明光を照射し、照明光を照射した観察対象を撮像する。
 本発明の位相差顕微鏡および撮像方法によれば、観察用の位相差画像を撮像する撮像部によって撮像された位相差画像の輝度分布に基づいて、容器内の液体の液面形状を推定するようにしたので、液面形状を推定するための新たな測定系を設けることなく、容器内の液体の液面形状を推定することができる。
本発明の位相差顕微鏡の一実施形態を用いた顕微鏡システムの概略構成を示す図 調整用光学素子の位置、光軸の回転および屈折力の調整を模式的に示す図 位相差画像に現れる明暗パターンの一例を示す図 メニスカスモデルMに対してリング状照明光Nが入射した場合の光路ずれの算出方法の一例を説明するための図 対物レンズモデルにリング状照明光Nが入射する範囲dnaと平面Aにおける光路ずれΔxとの関係を示す図 幾何光学シミュレーションによって取得された位相差画像の輝度分布の一例を示す図 調整光学系による調整前に撮像部によって撮像された位相差画像の一例を示す図である。 幾何光学シミュレーションによって取得された位相差画像の輝度分布G1と、撮像部によって撮像された位相差画像の輝度分布G2の一例を示す図 本発明の位相差顕微鏡の一実施形態を用いた顕微鏡システムの作用を説明するためのフローチャート メニスカスの中心部分から外周に向かって8本の直線L1~L8を設定した例を説明するための図 位相差画像の輝度値P(x)と、液面の傾斜角θとを対応づけたプロファイルの一例を示す図 図11に示すプロファイルを用いて液面の傾斜角を算出する方法を説明するための図 液面の傾斜角の候補を複数存在する場合の傾斜角の決定方法を説明するための図
 以下、本発明の位相差顕微鏡および撮像方法の一実施形態を用いた顕微鏡システムについて、図面を参照しながら詳細に説明する。図1は、本実施形態の顕微鏡システムの概略構成を示す図である。
 本実施形態の顕微鏡システムは、図1に示すように、照明光照射部10と、調整光学系20と、結像光学系30と、撮像部40と、顕微鏡制御装置50と、表示装置70と、入力装置80とを備えている。
 本実施形態の顕微鏡システムにおいては、調整光学系20と結像光学系30との間に、ステージ61が設けられており、このステージ61上に、液体である培養液Cおよび観察対象Sが収容された培養容器60が設置される。そして、本実施形態の顕微鏡システムは、X方向、Y方向およびZ方向にステージ61を移動させるステージ駆動部62を備えている。X方向およびY方向は、観察対象設置面Pに平行な面上において互いに直交する方向であり、Z方向は、X方向およびY方向に直交する方向である。
 本実施形態の顕微鏡システムにおいては、上述した照明光照射部10、調整光学系20、結像光学系30、撮像部40、ステージ61、ステージ駆動部62および結像光学系駆動部34から位相差顕微鏡本体が構成され、顕微鏡制御装置50は、この位相差顕微鏡本体を制御するものである。以下、位相差顕微鏡本体の具体的な構成を説明する。
 照明光照射部10は、培養容器60内に収容された観察対象Sに対して、いわゆる位相差計測のための照明光を照射するものであり、本実施形態では、その位相差計測用の照明光としてリング状照明光を照射する。具体的には、本実施形態の照明光照射部10は、白色光を出射する白色光源11と、リング形状のスリットを有し、白色光源11から出射された白色光が入射されてリング状照明光を出射するスリット板12と、スリット板12から射出されたリング状照明光が入射され、その入射されたリング状照明光を観察対象Sに対して照射するコンデンサレンズ13とを備えている。
 スリット板12は、白色光源11から出射された白色光を遮光する遮光板に対して白色光を透過するリング形状のスリットが設けられたものであり、白色光がスリットを通過することによってリング状照明光が形成される。
 なお、本実施形態においては、上述したようにスリット板12を用いてリング状照明光を形成するようにしたが、リング状照明光を形成する方法としては、これに限らず、たとえば空間光変調素子などを用いてリング状照明光を形成するようにしてもよい。
 また、本実施形態においては、位相差計測用照明光としてリング状照明光を用いるようにしたが、リング状以外の形状を有する照明光でもよく、後述する位相板と共役な形状となっていれば三角形状や四角形状などその他の形状でもよい。
 ステージ61上に設置された培養容器60は、その底面が観察対象設置面Pであり、観察対象設置面Pには観察対象Sとして細胞群などが配置される。培養容器60内には培養液Cが満たされており、この培養液Cの液面には、凹形状のメニスカスが形成される。培養容器60としては、シャーレおよび複数のウェルが配列されたウェルプレートなどがある。ウェルプレートの場合、各ウェルに観察対象Sおよび培養液Cが収容され、ウェル毎にメニスカスが形成される。
 また、本実施形態においては、培養液中で培養される細胞群を観察対象Sとしたが、観察対象Sとしてはこのような培養液中のものに限らず、水、ホルマリン、エタノール、およびメタノールなどの液体中において固定された細胞を観察対象Sとしてもよい。この場合も、容器内のこれらの液体の液面にメニスカスが形成される。
 調整光学系20は、上述したメニスカスの液面形状に起因する位相差計測用の照明光の屈折を調整するものである。本実施形態の調整光学系20は、調整用光学素子21と、調整光学系駆動部22とを備えている。
 調整用光学素子21は、屈折力を有する光学素子であり、具体的には、入射面または出射面に曲率を有する平凸面レンズ、入射面および出射面の両方に曲率を有する両凸面レンズ、電圧印加によって屈折力が変化する液晶レンズ、レンズの曲率半径を変更可能な液体レンズ、および焦点距離を変更可能な空間光変調器などを用いることができる。
 調整光学系駆動部22は、後述する調整光学系制御部51から出力された制御信号に基づいて、調整用光学素子21の屈折力を変更して焦点距離を調整するものである。具体的には、調整光学系駆動部22は、調整用光学素子21の位置および光軸方向を変更する機構を備えたものである。また、調整用光学素子21として液晶レンズまたは空間光変調器を用いる場合には、調整光学系駆動部22は、液晶レンズまたは空間光変調器に対して所望の焦点距離に応じた電圧を印加するものである。また、調整用光学素子21として液体レンズを用いる場合には、調整光学系駆動部22は、所望の焦点距離に応じて液体レンズ内の液体の量を調整し、これにより液体レンズの曲率半径を調整するものである。
 図2Iは、X方向、Y方向およびZ方向への調整用光学素子21の位置の変更を模式的に示す図である。また、図2IIは、調整用光学素子21の光軸方向の変更を模式的に示す図であり、具体的には、調整用光学素子21の光軸のX軸回り(θ)の回転調整、Y軸回り(φ)の回転調整およびZ軸回り(ρ)の回転調整を模式的に示す図である。また、図2IIIは、調整用光学素子21の屈折力の調整を模式的に示すものである。なお、図2IIIでは、調整用光学素子21の曲率半径を調整することによって屈折力を調整する例を示しているが、屈折力を調整する方法としては、これに限らず、たとえば、調整用光学素子21として液晶レンズや空間光変調器を用いる場合には、印加電圧を調整することによって、屈折力を調整することができる。
 また、本実施形態においては、調整用光学素子21をX方向、Y方向およびZ方向に移動させるようにしたが、この調整用光学素子21の移動による光学的な作用と同等の作用を得られるのであれば、必ずしも調整用光学素子21を移動させなくてもよい。たとえば、調整用光学素子21として液晶レンズや空間光変調器を用いる場合には、印加電圧を調整することによって、調整用光学素子21の移動による光軸のシフトと同様の作用効果を得るようにしてもよい。また、調整用光学素子21の光軸方向についても同様に、必ずしも調整用光学素子21自体を回転させる必要はなく、印加電圧を調整することによって、調整用光学素子21自体の回転による光軸の回転と同様の作用効果を得るようにしてもよい。
 また、本実施形態においては、調整用光学素子21をX方向およびY方向に移動するようにしたが、これに限らず、ステージ61をX方向およびY方向に移動させることによって、調整用光学素子21と培養容器60内に形成されたメニスカスとのX方向およびY方向についての相対的な位置関係を変更してもよい。
 また、本実施形態においては、1つの調整用光学素子21を用いるようにしたが、焦点距離の異なる複数の調整用光学素子21を切り替えることによって屈折力を調整してもよい。その場合、調整用光学素子21の交換は、自動で行ってもよいし、手動で行ってもよい。複数の調整用光学素子21を手動で交換する場合には、たとえば後述する液面形状推定部54によって推定された液面形状に基づいて、適切な調整用光学素子21の種類の情報を表示装置70に表示させ、その表示に基づいて、ユーザが手動で調整用光学素子21を交換してもよい。
 結像光学系30は、対物レンズ31と、位相板32と、結像レンズ33と、結像光学系駆動部34とを備えたものである。位相板32は、リング状照明光の波長に対して透明な透明板に対して位相リングを形成したものである。なお、上述したスリット板12のスリットの大きさは、この位相リングと共役な関係にある。
 位相リングは、入射された光の位相を1/4波長ずらす位相膜と、入射された光を減光する減光フィルタとがリング状に形成されたものである。位相板32に入射された直接光は位相リングを通過することによって位相が1/4波長ずれるとともに、その明るさが弱められる。一方、観察対象Sによって回折された回折光は大部分が位相板32の透明板を通過し、その位相および明るさは変化しない。
 対物レンズ31は、結像光学系駆動部34によってZ方向に移動するものである。観察対象Sの位相差画像を撮像する場合には、結像光学系駆動部34によって対物レンズ31をZ方向へ移動させることによってオートフォーカス制御が行われ、撮像部40によって撮像される画像のコントラストが調整される。
 結像レンズ33は、位相板32を通過した直接光および回折光が入射され、これらの光を撮像部40に結像するものである。
 結像光学系駆動部34は、上述したように対物レンズ31をZ方向に移動させる機構を備えたものである。
 撮像部40は、結像レンズ33によって結像された観察対象Sの位相差画像を撮像する撮像素子を備えたものである。撮像素子としては、CCD(charge-coupled device)イメージセンサやCMOS(Complementary Metal-Oxide Semiconductor)イメージセンサなどを用いることができる。
 ここで、上述したような構成の位相差顕微鏡本体による位相差画像の撮像について説明する。なお、ここでは培養液Cの液面に形成されたメニスカスの影響はないものとして説明する。
 まず、照明光照射部10から出射されたリング状照明光が、観察対象Sに照射される。観察対象Sに照射された照明光は、観察対象S内を直進した直接光と観察対象Sによって回折された回折光とに分かれる。そして、観察対象Sを透過した直接光と回折光は、対物レンズ31を透過して位相板32に入射される。観察対象Sを透過した直接光は、位相板32の位相リングに入射され、その位相が1/4波長ずれるとともに、その明るさが弱められる。一方、観察対象Sを透過した回折光は大部分が位相板32の透明な部分を通過する。
 位相板32を透過した直接光と回折光は、結像レンズ33によって撮像素子の撮像面に結像され、直接光と回折光との干渉によってエッジ部分などのコントラストが強調された位相差画像が撮像される。
 なお、本実施形態においては、ステージ61がX方向およびY方向に移動することによって、培養容器60内が照明光によって走査され、培養容器60内の照明光が照射された領域毎の位相差画像が撮像される。
 次に、図1に示す顕微鏡制御装置50は、CPU(Central Processing Unit)、メモリおよびハードディスクなどを備えたコンピュータから構成されるものである。
 顕微鏡制御装置50は、具体的には、図1に示すように、調整光学系駆動部22を制御する調整光学系制御部51と、結像光学系駆動部34を制御する結像光学系制御部52と、ステージ駆動部62を制御するステージ制御部53と、撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布に基づいて、培養容器60内の培養液Cの液面形状を推定する液面形状推定部54と、液面形状推定部54によって推定された液面形状に基づいて、調整光学系20の光学特性を調整するための調整情報を取得する調整情報取得部55とを備えている。
 ここで、本実施形態の液面形状推定部54による液面形状の推定について、詳細に説明する。液面形状推定部54は、上述したように撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布に基づいて、培養容器60内の培養液Cの液面形状を推定する。まず、このように位相差画像の輝度分布に基づいて、培養液Cの液面形状を推定する原理について説明する。
 図3Iは、位相差画像の一例を示すものであり、図3IIは、図3Iに示す位相差画像の一部(四角で囲まれる範囲)の拡大図である。位相差画像においては、図3に示すように、同心円状に明暗のパターン(輝度分布)が形成される。以下、このような明暗パターンが形成される理由を説明する。
 培養容器60内の培養液Cの液面に形成されたメニスカスの中心部分を透過した照明光は、メニスカスによる屈折の影響をほとんど受けないので、その直接光は位相板32の位相リングに入射されて減光され、その結果、メニスカスの中心部分の位相差画像は周囲より暗い画像となる(図3IIの矢印Aで示す範囲)。なお、メニスカスの中心部分とは、培養容器60内の液面全体に亘って形成される曲面のことをメニスカスといった場合に、培養容器60の底面に最も近い位置を含むメニスカスの底面の部分のことである。
 そして、メニスカスの中心部分に隣接する曲面部分を透過した照明光は、メニスカスの曲面による屈折の影響を受けるので、その直接光は位相板32の位相リングに入射されずに透明部分を透過する。その結果、曲面部分の位相差画像は、中心部分の位相差画像よりも明るくなる(図3IIの矢印Bで示す範囲)。ただし、メニスカスの中心部分より外側の曲面部分であっても、その中心部分からの距離がある程度離れた部分を透過した照明光については、メニスカスの曲面によって大きく屈折するので、その直接光は対物レンズ31の外側を通過して入射されなくなり、その結果、暗い位相差画像が形成される(図3IIの矢印Cで示す範囲)。したがって、上述したような作用によって、位相差画像においては、図3に示すような同心円状の明暗パターンが形成される。
 位相差画像に現れる明暗パターンは、メニスカスの形状によって変化することから、本実施形態においては、その明暗パターンを用いて、メニスカスの形状、すなわち液面形状を推定する。
 具体的には、本実施形態においては、既知の光学系のパラメータを用いた幾何光学シミュレーションを行って位相差画像上に現れる明暗パターン(輝度分布)を取得し、その幾何光学シミュレーショによって予め取得された明暗パターンに基づいて、培養液Cの液面形状を推定する。
 幾何光学シミュレーションについては、たとえば互いに異なる曲率を有する複数の液面形状(メニスカス)のモデルを設定し、その各液面形状のモデルについて、それぞれ入射光の光路ずれを算出し、その光路ずれに基づいて、位相差画像上に現れる明暗パターンを算出する。
 図4は、メニスカスモデルMに対してリング状照明光Nが入射した場合の光路ずれの算出方法の一例を説明するための図である。なお、図4に示す60aは培養容器のモデルであり、31aは対物レンズのモデルであり、32aは位相板のモデルであり、Aは位相差板モデル32aの位置における平面を表している。図4において空気の屈折率を1とし、培養液のモデルCaの屈折率を水と同じ1.33とすると、スネルの法則から、下式によりθが算出される。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000001

 同様に、スネルの法則から、下式によりθが算出される。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000002

 そして、光軸からの光路ずれΔxは、下式により算出することができる。なお、fは、対物レンズモデル31aの焦点距離であり、対物レンズモデル31aの焦点位置は、培養容器モデル60aの底面に合焦しているものとする。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000003

 また、対物レンズモデル31aにリング状照明光Nが入射する範囲dnaは、下式により算出することができ、図5は、この範囲dnaと平面Aにおける光路ずれΔxとの関係を示す図である。なお、下式におけるNAは対物レンズモデル31aの開口数である。また、図5に示すφおよびφは、光路ずれがない場合における位相板モデル32aの像の内径および外径を示している。また、図5に示すtおよびtは、光路ずれがΔxの場合におけるリング状照明光Nの像の内径および外径を示している。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000004

 そして、位相差板モデル32aの減光率をND(定数)とすると、平面Aにおける(x,y)の位置毎の透過率T(x,y)は、下式で表すことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000005

 また、平面Aにおける(x,y)の位置毎の入射光強度P(x,y)は、下式で表すことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000006

 なお、このとき、入射光強度P(x,y)をガウス分布で表現してもよく、その場合は、下式で表すことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000007

 以上より、メニスカスモデルMの液面の傾斜がθ1のときの平面Aを通過する光の強度の総和O(θ1)は、下式で表すことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000008

 上述したような演算に基づく幾何光学シミュレーションを行うことによって、メニスカスモデルMの液面上の各位置を通過した光の強度の分布、すなわち位相差画像の輝度分布を取得することができる。
 なお、図4から明らかなように、位相差画像の位置と液面傾斜θの位置とは、わずかにΔxだけずれている。したがって、下式を用いて推定位置を補正することによって、高精度に液面形状の推定を行うことができる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000009

 そして、互いに異なる曲率を有する複数の液面形状のそれぞれの位相差画像の輝度分布が取得され、液面形状推定部54にこれらの輝度分布が予め記憶される。図6は、幾何光学シミュレーションによって取得された位相差画像の輝度分布の一例を示す図である。図6に示す輝度分布は、メニスカスモデルMの中心から培養容器モデル60aの外周に向かって延びる直線上の輝度分布を示したものであり、図6の横軸は、メニスカスモデルMの中心からの距離である。なお、メニスカスモデルMの中心とは、上述したメニスカスの中心部分の中の中央位置のことであり、幾何光学シミュレーションの場合には、培養容器モデル60aの中心位置と同じ位置となる。また、図6に示す縦軸のOD値は、上述した直線上の輝度値を、メニスカスモデルMの中心の輝度値によって規格化した値である。図6に示すように、幾何光学シミュレーションによる結果においても、メニスカスの中央部分から外側に向かって明暗パターンが形成される。
 液面形状推定部54は、互いに異なる曲率を有する複数の液面形状のそれぞれについて、図6に示すような輝度分布を記憶している。具体的には、たとえば曲率R=3、R=4、R=5およびR=6に対応する輝度分布を記憶している。
 一方、液面形状推定部54は、上述した調整光学系20による調整前に撮像部40によって撮像された位相差画像を取得し、その位相差画像の輝度分布を取得する。なお、調整光学系20による調整前の位相差画像の撮像方法としては、調整光学系20の光学特性を初期状態として位相差画像を撮像するようにしてもよいし、調整光学系20を照明光の光路から退避させた状態で位相差画像を撮像するようにしてもよい。調整光学系20の光学特性を初期状態として位相差画像を撮像する場合には、上述した幾何光学シミュレーションにおいてもその初期状態の調整光学系20の光学パラメータが考慮されるものとする。
 図7は、調整光学系20による調整前に撮像部40によって撮像された位相差画像の一例を示す図である。液面形状推定部54は、図7に示すように、撮像部40によって撮像された位相差画像上において、メニスカスの中心部分から培養容器60の外周に向かって延びる直線Lを設定し、その設定した直線L上の位相差画像の輝度分布を取得する。なお、ここで設定する直線Lの延伸方向と、幾何光学シミュレーションにおいて輝度分布を取得する際に位相差画像上において設定した直線の延伸方向とは同じ方向である。
 また、上述したように位相差画像の輝度分布を取得する前に、位相差画像に対してローパスフィルタ処理などの平滑化処理を施し、その平滑化処理の施された位相差画像の輝度分布を取得してもよい。これにより、細胞由来の輝度変化を取り除くことができ、より高精度に液面形状の推定を行うことができる。
 また、撮像部40によって撮像された位相差画像上において上述した直線Lを設定する場合、幾何光学シミュレーションの場合と違ってメニスカスがどのように形状で形成されているか不明なので、メニスカスの中心部分を特定する必要がある。なお、実際に培養容器60内の液面に形成されるメニスカスの形状は、培養容器60の種類、培養液Cの量および培養期間などによって異なり、メニスカスの中心部分は必ずしも培養容器60の中心部分と一致する訳ではない。
 そこで、液面形状推定部54は、位相差画像の輝度に基づいて、メニスカスの中心部分を特定する。具体的には、たとえば予め設定された閾値以下の輝度の領域を位相差画像から抽出し、その抽出された領域のうち位相差画像の中央部分に近い円形の領域を特定することによってメニスカスの中心部分を特定する。そして、特定されたメニスカスの中心部分の中の中央位置から外側に向かって延びる直線を設定することによって、図7に示す直線Lを設定する。
 次に、液面形状推定部54は、幾何光学シミュレーションによって取得された位相差画像の輝度分布と、撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布との相関関係を求める。具体的には、液面形状推定部54は、予め記憶した曲率R=3、R=4、R=5およびR=6の液面形状の輝度分布と、撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布との相関関係をそれぞれ求め、最も相関が高い液面形状の輝度分布を特定する。図8は、曲率R=4の液面形状の輝度分布G1と、撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布G2との一例を示す図である。
 予め記憶した液面形状の輝度分布と、撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布との相関関係を求める方法としては、たとえば相関関数を用いて、これらの輝度分布の相関関係を求めるようにすればよい。また、相関関数を用いた方法に限らず、たとえば、図8に矢印で示すように、予め記憶した液面形状の輝度分布と撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布における変曲点を求め、これらの輝度分布の対応する変曲点の輝度値(OD値)の差の合計値を求める。そして、予め記憶した複数の液面形状の輝度分布のそれぞれについて上述した合計値を求め、その合計値が最も小さい輝度分布を最も相関が高い輝度分布として特定するようにしてもよい。
 そして、液面形状推定部54は、撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布との相関が最も高い曲率の液面形状を特定し、その特定した曲率の液面形状を培養容器60内の培養液Cの液面形状として推定する。
 以上が、本実施形態の液面形状推定部54による液面形状の推定についての説明である。
 図1に戻り、調整情報取得部55は、上述したように液面形状推定部54によって推定された液面形状に基づいて、調整光学系20の光学特性を調整するための調整情報を取得するものである。具体的には、本実施形態の調整情報取得部55は、液面形状推定部54によって推定された液面形状に基づいて、位相差画像の撮像領域内における液面の傾斜角を取得し、その傾斜角と培養液Cの屈折率とに基づいて、撮像領域内における照明光の屈折角を算出する。なお、本実施形態においては、上述したように培養容器60内が照明光によって走査され、培養容器60内を分割した複数の撮像領域毎の位相差画像の撮像が行われるため、その撮像領域毎について、照明光の屈折角が算出される。
 調整情報取得部55は、各撮像領域内の照明光の屈折角の情報を調整情報として調整光学系制御部51に出力する。
 調整光学系制御部51は、調整情報取得部55によって算出された照明光の屈折角の情報に基づいて、調整光学系20の光学特性を調整するものである。具体的には、調整光学系制御部51には、撮像領域内の照明光の屈折角と、調整光学系20の調整用光学素子21の調整量とを対応付けたルックアップテーブルが予め設定されている。そして、調整光学系制御部51は、照明光の屈折角の情報に基づいて、上記ルックアップテーブルを参照して調整光学系20の調整用光学素子21の調整量を取得し、その調整量に応じた制御信号を調整光学系駆動部22に出力するものである。なお、調整光学系20の調整用光学素子21の調整量としては、上述したように調整用光学素子21のX方向、Y方向およびZ方向の位置、屈折力並びに光軸方向などがある。
 調整光学系制御部51から出力された制御信号は、調整光学系駆動部22に入力され、調整光学系駆動部22は、入力された制御信号に基づいて、調整用光学素子21の屈折力、X方向、Y方向およびZ方向の位置、並びに光軸方向を調整することによって光学特性を調整する。
 なお、複数の調整用光学素子21を交換することによってメニスカスに起因する屈折を調整する場合には、調整情報取得部55は、液面形状推定部54によって推定された液面形状に応じた光学特性を有する調整用光学素子21の種類を特定する情報を調整情報として取得する。調整情報取得部55には、液面形状とその液面形状に対応する調整用光学素子21の種類を特定する情報とが対応づけられたテーブルが予め設定されているものとする。
 そして、調整情報取得部55において取得された調整用光学素子21の種類を特定する情報は、調整光学系制御部51に出力され、調整光学系制御部51は、入力された情報に基づいて、液面形状に応じた調整用光学素子21に自動的に切り替える。なお、調整用光学素子21の種類を特定する情報を表示装置70に表示させてユーザに報知させることによって、ユーザが手動で調整用光学素子21を交換するようにしてもよい。
 結像光学系制御部52は、結像光学系駆動部34を駆動制御することによって対物レンズ31をZ方向に移動させるものである。具体的には、本実施形態の結像光学系制御部52は、位相差画像を撮像する際、結像光学系駆動部34によって対物レンズ31をZ方向へ移動させることによってオートフォーカス制御するものである。
 ステージ制御部53は、ステージ駆動部62を駆動制御することによってステージ61をX方向、Y方向およびZ方向に移動させるものである。ステージ制御部53は、上述したようにステージ61をX方向およびY方向に移動させることによって、培養容器60内を照明光で走査し、培養容器60内(たとえば、1つのウェル内)で分割された複数の撮像領域毎の位相差画像を撮像するものである。
 また、顕微鏡制御装置50には、入力装置80と表示装置70とが接続されている。入力装置80は、キーボードやマウスなどの入力デバイスを備えたものであり、ユーザによる設定入力を受け付けるものである。
 表示装置70は、液晶ディスプレイなどの表示デバイスから構成されるものであり、撮像部40において撮像された位相差画像などを表示するものである。なお、表示装置70をタッチパネルで構成し、表示装置70が入力装置を兼ねてもよい。
 次に、本実施形態の顕微鏡システムの作用について、図9に示すフローチャートを参照しながら説明する。
 まず、観察対象Sおよび培養液Cが収容された培養容器60がステージ61上に設置される。そして、まず、調整光学系20による調整前の観察対象Sの位相差画像が撮像され、液面形状推定部54によって取得される(S10)。
 液面形状推定部54は、上述したように調整前の位相差画像上において、メニスカスの中心部分から培養容器60の外周に向かって延びる直線Lを設定し、その設定した直線L上の位相差画像の輝度分布を取得する(S12)。
 そして、液面形状推定部54は、その調整前の位相差画像の輝度分布と、予め記憶された曲率R=3、R=4、R=5およびR=6の液面形状の輝度分布との相関関係をそれぞれ求め、調整前の位相差画像の輝度分布と最も相関が高い液面形状の輝度分布を特定し、その特定した液面形状を培養容器60内の培養液Cの液面形状として推定する(S14)。
 液面形状の推定結果は調整情報取得部55に出力され、調整情報取得部55は、推定された液面形状に基づいて、調整光学系20の光学特性を調整するための調整情報を取得する(S16)。
 そして、調整情報取得部55によって取得された調整情報は調整光学系制御部51に出力され、調整光学系制御部51は、入力された調整情報に基づいて、調整光学系20の光学特性を調整する(S18)。
 そして、上記のようにして調整光学系20の光学特性が調整されて、これにより培養液Cの液面に形成されたメニスカスによる屈折の影響が取り除かれた後、再び観察対象Sの位相差画像が撮像部40によって撮像される(S20)。
 撮像部40によって撮像された位相差画像は表示装置70に出力され、表示装置70によって表示される。
 上記実施形態の顕微鏡システムによれば、観察用の位相差画像を撮像する撮像部40によって撮像された位相差画像の輝度分布に基づいて、培養容器60内の培養液Cの液面形状を推定するようにしたので、液面形状を推定するための新たな測定系を設けることなく、培養容器60内の培養液Cの液面形状を推定することができる。そして、その推定した液面形状に基づいて、調整光学系20の光学特性を調整し、その後、観察対象の位相差画像の撮像を行うようにしたので、メニスカスの影響を抑制した位相差画像を撮像することができる。
 なお、上記実施形態においては、液面形状の推定を行う際、撮像部40によって撮像された位相差画像上において、メニスカスの中心部分から培養容器60の外周に向かって延びる1本の直線Lを設定し、その直線L上の輝度分布を位相差画像全体の輝度分布を代表するものとして用いるようにしたが、メニスカスの中心部分から外周に向かって延びる直線を複数本設定するようにしてもよい。すなわち、培養容器60内に形成されるメニスカスは、必ずしもその中心から培養容器60内の外周に向かう各方向について、全て同じ曲率で形成されているとは限らない。
 したがって、たとえば、図10に示すように、メニスカスの中心部分から外周に向かって延びる8本の直線L1~L8を設定し、その直線毎の輝度分布を取得するようにしてもよい。そして、直線毎の輝度分布に対応する液面形状の曲率を求めることによって、8方向についてそれぞれ液面形状の曲率を求めるようにしてもよい。これにより、液面形状をより高精度に推定することができる。
 このように複数の方向について液面形状の曲率を求めるようにした場合には、これらの曲率の平均値または最頻値などを代表値として求め、その代表値の曲率に基づいて、調整光学系20の調整情報を取得してもよい。または、各方向について求められた曲率を用いて、その方向毎に分割された領域毎について調整光学系20の調整情報を取得してもよい。方向毎の領域の分割方法としては、たとえば各方向に延びる直線をそれぞれ円弧の中心に含む扇形の領域に分割するようにすればよい。
 また、上記実施形態においては、液面形状を推定する際、液面形状が球形に近いことを前提に、液面形状の曲率Rを求めるようにしたが、たとえば培養容器60の大きさによってメニスカスの平坦な底面部分が大きくなるので、液面形状は球形にならず、液面形状の推定精度が下がる可能性がある。そこで、以下のようにして、液面形状を推定してもよい。
 まず、幾何光学シミュレーションを用いて、図11に示すような、位相差画像の輝度値P(x)と、液面の傾斜角θとを対応づけたプロファイルを取得する。輝度値P(x)は、メニスカスモデルMの中心部分から培養容器60aの外周までの間の各位置xにおける輝度値を表している。また、液面の傾斜角θとは、図4に示す傾斜角θである。なお、図11に示すプロファイルは、上記実施形態における演算結果を用いて取得することができる。
 次に、上記実施形態と同様に、撮像部40によって撮像された位相差画像を取得し、メニスカスの中心部分の輝度値が1となるように位相差画像を規格化し、その規格化された位相差画像に対して平滑化処理を施して細胞由来の高周波ノイズを除去する。
 そして、その平滑化処理の施された位相差画像上において、図12に示すようにメニスカスの中心部分から外周に向けて延びる直線を設定し、その直線上をメニスカスの中心から走査して各位置x,x、・・・、xにおける輝度値を取得する。そして、図11に示したプロファイルを用いて、各位置xの輝度値P(x)に対応する液面の傾斜角θを求める。これにより、図12に示す直線上の各位置における液面の傾斜角θを求めることができ、上記直線上の液面の形状を推定することができる。
 なお、図11に示すプロファイルを用いて液面の傾斜角θを求める際、図13に示すように同一の輝度値P(x)(図13に示す例では1.5)に対して2つの傾斜角θが求まる場合がある。したがって、上述したようにメニスカスの中心から順に輝度値を取得して、その輝度値に対応する傾斜角θを順次求める場合には、メニスカスの中心から離れるほど液面の傾斜角は大きくなるものとし、傾斜角θの候補が複数ある場合には、最も小さい傾斜角θを先に選択するようにすればよい。
 また、上記実施形態の顕微鏡システムにおいては、液面上に形成されたメニスカスに起因する照明光の屈折の影響を取り除くために調整用光学素子21を設けるようにしたが、必ずしもこのような調整用光学素子21を設けなくてもよく、たとえば、調整情報に基づいて、スリット板12をX方向およびY方向に移動させたり、位相板32をX方向およびY方向に移動させたりして、メニスカスに起因する照明光の屈折の影響を取り除くようにしてもよい。すなわち、本発明における調整光学系として、スリット板12や位相板32を用いるようにしてもよい。
 また、上記実施形態の顕微鏡システムにおいては、調整用光学素子21をコンデンサレンズ13と培養容器60との間に設けるようにしたが、調整用光学素子21の位置はこの位置に限らず、たとえば白色光源11とスリット板12との間、位相板32とコンデンサレンズ13との間、および培養容器60と対物レンズ31との間などその他の位置に設けるようにしてもよい。
10  照明光照射部
11  白色光源
12  スリット板
12a スリット板モデル
13  コンデンサレンズ
13a コンデンサレンズモデル
20  調整光学系
21  調整用光学素子
22  調整光学系駆動部
30  結像光学系
31  対物レンズ
31a 対物レンズモデル
32  位相板
32a 位相板モデル
33  結像レンズ
34  結像光学系駆動部
40  撮像部
50  顕微鏡制御装置
51  調整光学系制御部
52  結像光学系制御部
53  ステージ制御部
54  液面形状推定部
55  調整情報取得部
60  培養容器
60a 培養容器モデル
61  ステージ
62  ステージ駆動部
70  表示装置
80  入力装置
C   培養液
Ca  培養液モデル
G1  輝度分布
G2  輝度分布
L   直線
L1-L8   直線
M   メニスカスモデル
N   リング状照明光
P   観察対象設置面

Claims (11)

  1.  液体および観察対象が収容された容器に対して位相差計測用の照明光を照射する照明光照射部と、
     前記照明光を照射した前記観察対象を撮像する撮像部と、
     前記容器内の液体の液面形状に起因する前記照明光の屈折を調整する調整光学系と、
     前記撮像部によって撮像された前記観察対象の位相差画像の輝度分布に基づいて、前記容器内の液体の液面形状を推定する液面形状推定部と、
     前記液面形状推定部によって推定された液面形状に基づいて、前記調整光学系の光学特性を調整するための調整情報を取得する調整情報取得部とを備えたことを特徴とする位相差顕微鏡。
  2.  前記調整情報取得部によって取得された調整情報に基づいて、前記調整光学系の光学特性を調整する調整光学系制御部を備えた請求項1記載の位相差顕微鏡。
  3.  前記液面形状推定部が、予め設定された液面形状を用いて幾何光学シミュレーションを行って取得された位相差画像の輝度分布に基づいて、前記容器内の液体の液面形状を推定する請求項1または2記載の位相差顕微鏡。
  4.  前記液面形状推定部が、互いに異なる曲率を有する、予め設定された複数の液面形状を用いてそれぞれ幾何光学シミュレーションを行って取得された複数の位相差画像の輝度分布に基づいて、前記容器内の液体の液面形状を推定する請求項3記載の位相差顕微鏡。
  5.  前記液面形状推定部が、前記幾何光学シミュレーションを用いて取得された位相差画像の輝度分布と前記撮像部によって撮像された位相差画像の輝度分布との相関関係を求めることによって、前記容器内の液体の液面形状を推定する請求項3または4記載の位相差顕微鏡。
  6.  前記液面形状推定部が、相関関数を用いて前記相関関係を求める請求項5記載の位相差顕微鏡。
  7.  前記液面形状推定部が、前記幾何光学シミュレーションを用いて取得された位相差画像の輝度分布における変曲点の輝度値と前記撮像部によって撮像された位相差画像の輝度分布における変曲点の輝度値とに基づいて、前記相関関係を求める請求項5記載の位相差顕微鏡。
  8.  前記液面形状推定部が、前記撮像部によって撮像された位相差画像上において、前記容器内に形成されるメニスカスの中心部分から前記容器の外周に向かって延びる少なくとも一つの直線を設定し、該設定した直線上の前記位相差画像の輝度分布に基づいて、前記容器内の液体の液面形状を推定する請求項1から7いずれか1項記載の位相差顕微鏡。
  9.  前記液面形状推定部が、互いに異なる複数の方向に延びる前記直線を設定し、該複数の直線上の位相差画像の輝度分布に基づいて、前記容器内の液体の液面形状を推定する請求項8記載の位相差顕微鏡。
  10.  前記液面形状推定部が、前記撮像部によって撮像された位相差画像に対して平滑化処理を施し、該平滑化処理の施された位相差画像の輝度分布に基づいて、前記容器内の液体の液面形状を推定する請求項1から9いずれか1項記載の位相差顕微鏡。
  11.  液体および観察対象が収容された容器に対して位相差計測用の照明光を照射して、前記観察対象の位相差画像を撮像し、
     該撮像した位相差画像の輝度分布に基づいて、前記液体の液面形状を推定し、
     前記推定した液面形状に基づいて、前記容器内の液体の液面形状に起因する光の屈折を調整する調整光学系の光学特性を調整するための調整情報を取得し、
     該調整情報に基づいて、前記調整光学系の光学特性が調整された後、前記容器に対して前記照明光を照射し、
     前記照明光を照射した前記観察対象を撮像することを特徴とする撮像方法。
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