WO2009102459A3 - Analyse génétique pour identifier des mutants d’échappement du virus de la maladie de newcastle - Google Patents

Analyse génétique pour identifier des mutants d’échappement du virus de la maladie de newcastle Download PDF

Info

Publication number
WO2009102459A3
WO2009102459A3 PCT/US2009/000907 US2009000907W WO2009102459A3 WO 2009102459 A3 WO2009102459 A3 WO 2009102459A3 US 2009000907 W US2009000907 W US 2009000907W WO 2009102459 A3 WO2009102459 A3 WO 2009102459A3
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
ndv
strains
wild
escape
escape mutants
Prior art date
Application number
PCT/US2009/000907
Other languages
English (en)
Other versions
WO2009102459A2 (fr
Inventor
Harmen Jacob Geerligs
Cindy Aleida Maria Meinders
Original Assignee
Wyeth
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Wyeth filed Critical Wyeth
Publication of WO2009102459A2 publication Critical patent/WO2009102459A2/fr
Publication of WO2009102459A3 publication Critical patent/WO2009102459A3/fr

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
    • C12Q1/683Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism involving restriction enzymes, e.g. restriction fragment length polymorphism [RFLP]

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

La présente invention concerne des procédés permettant de distinguer des mutants d’échappement du virus de la maladie de Newcastle (NDV) (également connus sous le nom de souches de marqueurs) à partir de souches NDV de type sauvage. Les mutants d’échappement sont des souches qui contiennent des modifications génétiques qui amènent les mutants à échapper à la détection par des anticorps qui se lient normalement aux souches NDV du type sauvage. Les procédés de l’invention concernent en général une analyse de polymorphisme de restriction (RFLP) qui utilise des enzymes de restriction qui reconnaissent des sites de clivage d’enzymes de restriction uniques. De tels sites de clivage d’enzymes de restriction uniques sont présents dans les mutants d’échappement NDV, mais pas dans les souches NDV du type sauvage, ou vice-versa, et sont causés par une ou plusieurs mutations qui rendent les mutants d’échappement capables d’échapper à la détection par des anticorps anti-NDV. Les motifs des fragments de restriction produits par les procédés de la présente invention vont identifier de manière fiable la souche NDV sous forme d’un mutant d’échappement ou d’une souche de type sauvage, en fonction du motif de bande spécifique produit.
PCT/US2009/000907 2008-02-13 2009-02-12 Analyse génétique pour identifier des mutants d’échappement du virus de la maladie de newcastle WO2009102459A2 (fr)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US6553308P 2008-02-13 2008-02-13
US61/065,533 2008-02-13

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2009102459A2 WO2009102459A2 (fr) 2009-08-20
WO2009102459A3 true WO2009102459A3 (fr) 2009-11-12

Family

ID=40842682

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/US2009/000907 WO2009102459A2 (fr) 2008-02-13 2009-02-12 Analyse génétique pour identifier des mutants d’échappement du virus de la maladie de newcastle

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2009102459A2 (fr)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2016507225A (ja) * 2012-12-18 2016-03-10 メリアル インコーポレイテッド Ibv、csfv及びndvの高解像度融解遺伝子型決定

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040131640A1 (en) * 2002-12-06 2004-07-08 Wyeth Escape mutants of newcastle disease virus as marker vaccines

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040131640A1 (en) * 2002-12-06 2004-07-08 Wyeth Escape mutants of newcastle disease virus as marker vaccines

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
KOU YIN-TAI ET AL: "Restriction fragment length polymorphism analysis of the F gene of Newcastle disease viruses isolated from chickens and an owl in Taiwan", JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE, vol. 61, no. 11, November 1999 (1999-11-01), pages 1191 - 1195, XP002536893, ISSN: 0916-7250 *
UJVARI D ET AL: "Identification and subgrouping of pigeon type Newcastle disease virus strains by restriction enzyme cleavage site analysis", JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS, ELSEVIER BV, NL, vol. 131, no. 2, 1 February 2006 (2006-02-01), pages 115 - 121, XP025030342, ISSN: 0166-0934, [retrieved on 20060201] *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2009102459A2 (fr) 2009-08-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2006031644A3 (fr) Sondes immobilisees et methodes de detection de proteines prions modifiees de maniere conformationnelle
PH12015501735B1 (en) Rice whole genome breeding chip and application thereof
JP2011512817A5 (fr)
WO2007022768A3 (fr) Procede et dispositif d'enrichissement en listeria, de suppression de listeria et de detection de listeria
WO2009115615A3 (fr) Détection et pronostic du cancer du col de l’utérus
WO2008094525A3 (fr) Détection du virus grippal
WO2010093222A3 (fr) Aptamère d'acide nucléique se liant spécifiquement au bisphénol a
NZ601652A (en) Set of probes for the detection and typing of 46 human papillomavirus mucosal types
WO2009049007A3 (fr) Compositions, procédés et systèmes pour une identification rapide d'acides nucléiques pathogènes
WO2009074328A3 (fr) Methodes et acides nucleiques permettant d'analyser les troubles de la proliferation cellulaire
WO2011082325A3 (fr) Séquences du génome d'e. coli 055:h7
WO2007142763A8 (fr) Polymorphismes génétiques associés à une fibrose du foie, leurs procédés de détection et leurs utilisations
WO2008124091A3 (fr) Compositions et procédés de détection
WO2011055968A3 (fr) Nécessaire de détection d'une infection bactérienne comprenant des anticorps monoclonaux inédits
WO2010052214A3 (fr) Nouveau procédé
WO2006105415A3 (fr) Procedes et compositions pour la detection in situ de micro-organismes sur une surface
WO2008157299A3 (fr) Analyse de profil d'expression différentielle de phénotypes de culture cellulaire et ses utilisations
WO2009061799A3 (fr) Polymorphismes génétiques associés à une fibrose du foie, leurs procédés de détection et leurs utilisations
WO2008104985A3 (fr) Procédés pour distinguer un carcinome squameux du poumon d'autres cancers du poumon à non-petites cellules
WO2009102459A3 (fr) Analyse génétique pour identifier des mutants d’échappement du virus de la maladie de newcastle
WO2009047280A3 (fr) Marqueur polypeptidique pour le diagnostic du cancer de la prostate
WO2012020965A3 (fr) Procédé de détection de mutation pik3ca et trousse utilisant le clampage par pcr de pna en temps réel
WO2011043823A3 (fr) Polypeptides migrant vers la plaque d'athérosclérose
WO2010123283A3 (fr) Marqueur à base de cohésine marquée par fluorescence et procédé de détection d'enzymes incorporées dans les cellulosomes associé
WO2006028565A3 (fr) Procedes pour analyse de site haut rendement au niveau du genome

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 09710840

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 09710840

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2