TWI840322B - 用於遞送核酸佐劑之細菌袖珍型細胞及其使用方法 - Google Patents

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Abstract

本發明提供完整細菌衍生之袖珍型細胞，其含有核酸佐劑或編碼核酸佐劑之質體，可在靶細胞中產生所需免疫反應。本發明進一步提供使用袖珍型細胞遞送核酸佐劑以用於治療包括贅生性疾病及癌症之疾病之方法。

Description

用於遞送核酸佐劑之細菌袖珍型細胞及其使用方法
本發明大體上係關於基於核酸之療法領域，且尤其係關於使用細菌衍生之完整袖珍型細胞將核酸佐劑遞送至哺乳動物靶細胞(例如T細胞、樹突狀細胞)。本發明在治療癌症(尤其在促進抗腫瘤免疫反應之情形中)及感染(例如病毒感染)方面尤其有用。
提供以下論述僅在於幫助讀者理解本發明且並不認為描述或構成其先前技術。 最近的進展已鑑別大量被哺乳動物細胞中之受體感測之核酸。核酸受體之參與以多種方式啟動先天免疫系統。舉例而言，某些核酸(亦即，核酸佐劑)與同源受體結合導致觸發I型及II型干擾素(IFN)。此等干擾素可充當藉由免疫系統增強抗腫瘤活性之佐劑(綜述於Junt及Barchet, 2015)。 除觸發細胞固有及IFN介導之效應機制以外，核酸感測器促效劑可活化樹突狀細胞(DC)、促進細胞介素分泌、成熟及抗原呈遞。此繼而提高且塑形適應性免疫反應之質量。由於其提高免疫之特性，寡核苷酸或核酸感測器之小分子促效劑正用於臨床試驗以提高對貧乏免疫原性癌症之免疫反應，且用作對癌症之治療性免疫中之佐劑或對感染之預防性疫苗中之佐劑。 已發現且測試大量核酸感測器之促效劑作為佐劑以刺激抗病毒免疫或提高抗腫瘤活性。儘管此等核酸感測器之促效劑作為佐劑具有前景，但實際上卻很少進入臨床研發。 此可歸因於若干因素。詳言之，需要將核酸促效劑遞送於特定細胞(諸如樹突狀細胞)中，但此等分子不具有導向特性以幫助定位或進入靶細胞中。另外，當活體內投與時，游離核酸在血清中不穩定且可快速由核酸酶降解。因此，核酸佐劑及核酸感測器之促效劑已歸入局部使用，或必須與蛋白質抗原共價連接。 因此，此項技術中迫切需要能夠將治療性核酸佐劑及核酸感測器之促效劑傳遞至靶細胞之遞送系統。本發明提供此類遞送系統。
本文中描述使用包含核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之細菌衍生之完整袖珍型細胞治療疾病的組合物及方法。一般而言，所揭示之袖珍型細胞遞送載體藉由將核酸佐劑或核酸感測器之促效劑傳輸至靶細胞(諸如T細胞或樹突狀細胞)以誘發免疫反應從而幫助對抗包括癌症及/或感染之各種疾病來起作用。 在一個態樣中，本發明提供組合物，其包含(a)完整袖珍型細胞，該袖珍型細胞包含至少一種核酸佐劑分子、包含編碼至少一種核酸佐劑分子之區段之質體，或核酸感測器之促效劑；及(b)醫藥學上可接受之載劑，因此，其中至少一種核酸佐劑分子或核酸受體之促效劑觸發自靶細胞之免疫反應。 在另一態樣中，本發明提供將核酸佐劑或核酸感測器之促效劑遞送至靶細胞之方法，其包含使靶細胞與完整袖珍型細胞接觸，該袖珍型細胞包含(i)至少一種核酸佐劑分子、(ii)由編碼至少一種核酸佐劑分子之區段組成之質體、或(iii)至少一種核酸感測器之促效劑，其中靶細胞吞噬袖珍型細胞。 在又一態樣中，本發明提供治療個體中之疾病的方法，其包含向患有疾病之個體投與完整袖珍型細胞，該袖珍型細胞包含(i)至少一種核酸佐劑分子、(ii)包含編碼至少一種核酸佐劑分子之區段之質體、或(iii)核酸受體之至少一種促效劑，其中袖珍型細胞在投與後被靶細胞吞噬。 在一些實施例中，靶細胞中所產生之免疫反應包含產生包括干擾素-α及/或干擾素-β之I型干擾素。 在一些實施例中，至少一種核酸佐劑包含與以下中之至少一者結合之核酸：TLR3、TLR7、TLR8、TLR9、RIG-I、MDA5、AIM2、cGAS或IFI16。 在一些實施例中，完整袖珍型細胞包含至少兩種核酸佐劑。在其他實施例中，至少一種核酸佐劑包含至少約40個核苷酸之序列，例如，至少一種核酸佐劑可為40聚體或50聚體雙股RNA或DNA。 在一些實施例中，完整袖珍型細胞包含核酸佐劑及核酸感測器之促效劑，且在一些實施例中，核酸感測器之至少一種促效劑包含PNPase1、聚(I:C)、聚-ICLC、咪喹莫特(imiquimod)、咪唑并喹啉瑞喹莫德(imidazoquinoline resiquimod)、CpG-ODN或2'3'環形GAMP (GMP-AMP)之聚核苷酸產物。 在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞可進一步包含雙特異性配位體。在一些實施例中，雙特異性配位體可包含攜帶針對袖珍型細胞表面結構之特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體之特異性之第二臂。舉例而言，袖珍型細胞表面結構可為袖珍型細胞表面上之脂多醣之O-多醣組分且哺乳動物細胞表面受體可能能夠活化袖珍型細胞之受體介導之胞飲作用或巨胞飲作用。在一些實施例中，雙特異性配位體包含抗體或抗體片段。 在一些實施例中，組合物包含每107 個袖珍型細胞、每108 個袖珍型細胞、每109 個袖珍型細胞、每1010 個袖珍型細胞或每1011 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞。 在一些實施例中，編碼核酸佐劑之質體包含可操作地連接於編碼至少一種核酸佐劑之區段的調節元件，且在一些實施例中，質體編碼多種核酸佐劑分子。 在一些實施例中，靶細胞係哺乳動物細胞，諸如人類免疫細胞。舉例而言，靶細胞可為單核球性細胞、巨噬細胞、T細胞或樹突狀細胞或NK細胞或iNKT細胞。在一些實施例中，靶細胞具有噬菌作用能力或胞飲作用能力或巨胞飲作用能力。 在一些實施例中，袖珍型細胞與哺乳動物細胞之間的接觸可在活體外或活體內發生。 在一些實施例中，所治療之疾病可為癌症或感染。 在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞之投藥可進一步包含向個體投與用於治療疾病之藥物，諸如化學治療藥物或抗病毒藥物或抗菌藥物。在此等實施例中，亦可將藥物封裝於完整袖珍型細胞內。在一些實施例中，治療可進一步包含輻射治療。 前文總體描述及以下詳細描述為例示性及解釋性的且不限制本發明。
相關申請案之交叉引用 本申請案主張2016年10月6日申請之美國臨時申請案第62/405,074號之優先權，該案之內容以全文引用之方式併入本文中。 本發明提供核酸佐劑及/或核酸感測器之促效劑之基於袖珍型細胞的新穎遞送載體及其使用方法。詳言之，本發明在提高對抗患者中之疾病(諸如贅生性疾病(例如癌症)或感染)之有益免疫反應方面具有效用。舉例而言，在單獨或與靶向雙特異性配位體、細胞毒性藥物或siRNA或miRNA封裝之袖珍型細胞組合投與於同一患者時，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可提高抗腫瘤功效。 先前，本發明人發現治療顯著濃度之siRNA或miRNA(~23個核苷酸長)可成功封裝於完整袖珍型細胞中。此為出人意料的，因為此等分子較大(~14,000道爾頓)且尚未知曉此類大分子可經由雙外膜進入完整袖珍型細胞中。另外，一旦封裝，此等siRNA或miRNA不會自袖珍型細胞活體外或活體內洩漏或擴散出來。 本發明人甚至更加出人意料地發現可將40個及50個核苷酸長(40聚體及50聚體)之大得多的雙股寡核苷酸傳輸於完整袖珍型細胞中且亦可以治療有效之濃度封裝此等寡核苷酸，該等寡核苷酸不會自袖珍型細胞擴散出來。本發明提供此等袖珍型細胞及使用其之詳細描述。 在本發明中，藉由識別引用參考各種出版物、專利及已出版之專利說明書。此等出版物、專利及已出版之專利說明書的揭示內容在此以引用的方式併入至本發明中以更充分地描述本發明所涉及之目前先進技術。 1.治療性袖珍型細胞組合物 本發明之袖珍型細胞組合物可用於將核酸佐劑遞送至哺乳動物，詳言之人類癌症患者中之靶細胞。 在本發明之情形中，投與所揭示之包含核酸佐劑之袖珍型細胞遞送載體以用於治療既定疾病(亦即癌症)視若干因素而定，與習知醫學實踐一致。此等因素包括但不限於患者年齡、疾病狀況及發展，以及患者可能已接受或正在接受之先前或當前療法。 a. 袖珍型細胞 如本文所用，「袖珍型細胞」係指細菌細胞之衍生物，其缺乏染色體(「無染色體」)且藉由在DNA分離之細胞分裂之二分裂期間干擾協調產生。袖珍型細胞不同於其他小囊泡，諸如所謂的「膜泡」(尺寸為~ 0.2 mm或更小)，其在某些情況下自發性產生及釋放但不歸因於特異性基因重排或游離型基因表現。同樣地，完整袖珍型細胞不同於細菌膜影，其不因特異性基因重排或游離型基因表現而產生。本發明中所採用之細菌衍生之袖珍型細胞完全完整且因此區別於以斷裂或降解，甚至移除之外膜或定義膜為特徵之細菌細胞衍生物的其他無染色體形式。參見 美國專利第7,183,105號第111欄，第54行及以下。表徵本發明之袖珍型細胞之完整膜允許在袖珍型細胞內保持治療性有效負載物(例如，核酸佐劑或核酸感測器之促效劑)直至在靶細胞內釋放、後攝取有效負載物。 本發明之袖珍型細胞可為大腸桿菌(E . coli )或其他細菌細胞(例如，鼠傷寒沙門氏菌(S . typhimurium ))之無核形式。在大腸桿菌中，例如min 基因之突變，諸如min CD可移除在細胞分裂期間在細胞極處隔膜形成之抑制，導致正常子細胞及無核袖珍型細胞產生。參見 de Boer等人 (1992)；Raskin & de Boer (1999)；Hu & Lutkenhaus (1999)；Harry (2001)。為實踐所揭示之方法，在一些實施例中，期望袖珍型細胞具有完整細胞壁(「完整袖珍型細胞」)。 除min 操縱子突變以外，無核袖珍型細胞亦可在影響隔膜形成(例如在枯草桿菌(B . subtilis )中之div IVB1中)之一系列其他基因重組或突變產生。參見 Reeve及Cornett (1975)；Levin等人 (1992)。袖珍型細胞亦可在參與細胞分裂/染色體分離之蛋白質之基因表現水準擾動後形成。舉例而言，min E之過度表現導致極性分裂且產生袖珍型細胞。類似地，少染色體袖珍型細胞可由染色體分離之缺陷造成，例如枯草桿菌(Bacillus subtilis )之smc 突變(Britton等人 (1998))、枯草桿菌之spo OJ缺失(Ireton等人 (1994))、大腸桿菌之muk B突變(Hiraga等人 (1989))，及大腸桿菌之par C突變(Stewart及D'Ari (1992))。可提供反式基因產物。舉例而言，當自高拷貝數質體過度表現時，CafA在複製之後可提高細胞分裂速率及/或抑制染色體分區(Okada等人 (1994))，導致形成鏈式細胞及無核袖珍型細胞(Wachi等人 (1989)；Okada等人 (1993))。 因此，針對本發明，可由革蘭氏陽性或革蘭氏陰性來源之任何細菌細胞製備袖珍型細胞。此外，本發明中所用之袖珍型細胞可具有如上文所提及之完整細胞壁(亦即，「完整袖珍型細胞」)，且可區別於歸因於特異性基因重排或游離型基因表現之諸如膜泡之其他小囊泡。 因此，在一些實施例中，親代(源)細菌可包含一或多種選自以下之細菌：陸生菌/滑行菌(Glidobacteria) (BV1)、變形菌門(BV2)及包括螺旋體屬(Spirochaetes)、鞘脂桿菌門(Sphingobacteria)及浮游細菌(Planctobacteria)之BV4。在一些實施例中，細菌可包含選自以下中之一或多者：壁門菌屬(Firmicutes)(BV3)，諸如桿菌(Bacilli)、梭菌(Clostridia)或無壁菌(Tenericutes)/柔膜菌(Mollicutes)，或放線菌綱(Actinobacteria)(BV5)，諸如放線菌目(Actinomycetales)或雙歧桿菌目(Bifidobacteriales)。 在一些實施例中，細菌可包含選自以下中之一或多者：原細菌(Eobacteria)(綠彎菌門(Chloroflexi)、異常球菌-棲熱菌門(Deinococcus-Thermus))、藍細菌(Cyanobacteria)、熱脫硫桿菌門(Thermodesulfobacteria)、嗜熱菌(thermophiles) (產水菌門(Aquificae)、熱袍菌門(Thermotogae))、α、β、γ(腸桿菌科(Enterobacteriaceae))、δ或ε變形菌門(Proteobacteria)、螺旋體門(Spirochaetes)、纖維桿菌門(Fibrobacteres)、綠菌門(Chlorobi)/擬桿菌門(Bacteroidetes)、衣原體門(Chlamydiae)/疣微菌門(Verrucomicrobia)、浮黴菌門(Planctomycetes)、酸桿菌門(Acidobacteria)、產金菌門(Chrysiogenetes)、脫鐵桿菌門(Deferribacteres)、梭桿菌門(Fusobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、硝化螺旋菌門(Nitrospirae)、互養菌門(Synergistetes)、網團菌門(Dictyoglomi)、黏膠球形菌門芽孢桿菌目(Lentisphaerae Bacillales)、芽孢桿菌科(Bacillaceae)、李斯特菌科(Listeriaceae)、葡萄球菌科(Staphylococcaceae)、乳桿菌目(Lactobacillales)、腸球菌科(Enterococcaceae)、乳桿菌科(Lactobacillaceae)、明串珠菌科(Leuconostocaceae)、鏈球菌科(Streptococcaceae)、梭菌目(Clostridiales)、鹽厭氧菌目(Halanaerobiales)、嗜熱厭氧菌目(Thermoanaerobacterales)、支原體目(Mycoplasmatales)、蟲原體目(Entomoplasmatales)、厭氧漿菌目(Anaeroplasmatales)、非固醇漿菌目(Acholeplasmatales)、鹽漿菌目(Haloplasmatales)、放線菌亞目(Actinomycineae)、放線菌科(Actinomycetaceae)、棒桿菌亞目(Corynebacterineae)、分支桿菌科(Mycobacteriaceae)、諾卡氏菌科(Nocardiaceae)、棒狀桿菌科(Corynebacteriaceae)、弗蘭克氏菌亞目(Frankineae)、弗蘭克氏菌科(Frankiaceae)、微球菌亞目(Micrococcineae)、短桿菌科(Brevibacteriaceae)及雙歧桿菌科(Bifidobacteriaceae)。 對於醫藥用途，本發明之組合物可包含儘可能充分地與免疫原性組分及其他有毒污染物分離之袖珍型細胞。下文以及WO 2004/113507中進一步詳細描述用於純化細菌衍生之袖珍型細胞以移除游離內毒素及親代細菌細胞之方法，其全部內容在此以引用之方式併入。 衍生自革蘭氏陰性細菌之袖珍型細胞之另一結構元件為脂多醣(LPS)之O-多醣組分，其經由脂質A錨定物嵌入在外膜中。此組分為重複碳水化合物-殘基單元之鏈，其中每鏈多達70至100個四至五個糖之重複單元。因為此等鏈在液體環境中並不如活體內一般為剛性的，所以其可採納波狀撓性結構。 如下文所進一步詳細論述，本發明之袖珍型細胞可包含遞送所需之至少一種核酸佐劑或編碼核酸佐劑之質體，以及至少一種核酸感測器之促效劑。本發明之核酸佐劑及核酸感測器之促效劑可結合同源受體且產生所需之免疫反應(IFN免疫反應)。在下文更詳細地論述本發明之核酸佐劑及核酸感測器之促效劑兩者。 另外，在一些實施例中，本發明提供將至少一種核酸佐劑或核酸感測器之促效劑遞送至靶細胞之方法，其包含使靶細胞與完整袖珍型細胞接觸，該袖珍型細胞包含至少一種核酸佐劑分子、包含編碼至少一種核酸佐劑分子之區段之質體、或至少一種核酸感測器之促效劑，其中靶細胞吞噬袖珍型細胞。在袖珍型細胞由靶細胞吞噬之後，核酸佐劑分子或核酸感測器之促效劑釋放於靶細胞之細胞質中或由靶細胞表現。可經由雙特異性配位體使袖珍型細胞與靶細胞接觸，如WO 2005/056749所描述。袖珍型細胞與靶細胞之間的接觸可為活體外或活體內。 b. 核酸佐劑 出於本發明之目的，「核酸佐劑」係在靶細胞中與核酸感測器或受體(亦即，同源受體)結合或活化核酸感測器或受體且引發所需免疫反應之核酸(亦即，聚核苷酸或寡核苷酸)。核酸佐劑可包含DNA、RNA及/或合成核苷酸。另外，核酸佐劑可為單股(ss)或雙股(ds)且其可包含更加複雜之核酸構形，諸如髮夾環、三顯體及四鏈體。舉例而言，在一些實施例中，所揭示之核酸佐劑可為ssDNA、dsDNA、ssRNA或dsRNA。 另外，本發明之核酸佐劑之長度可不同。詳言之，核酸可極小，例如二核苷酸。換言之，核酸佐劑之長度可為約2個、約3個、約4個、約5個、約6個、約7個、約8個、約9個、約10個、約11個、約12個、約13個、約14個、約15個、約16個、約17個、約18個、約19個、約20個、約21個、約22個、約23個、約24個、約25個、約26個、約27個、約28個、約29個、約30個、約31個、約32個、約33個、約34個、約35個、約36個、約37個、約38個、約39個、約40個、約41個、約42個、約43個、約44個、約45個、約46個、約47個、約48個、約49個、約50個、約51個、約52個、約53個、約54個、約55個、約56個、約57個、約58個、約59個或約60個或超過60個核苷酸。 可替代地，核酸可具有大於約27個核苷酸長之尺寸且在單個完整袖珍型細胞中具有達至約4-約5KB。在本發明之一些實施例中，細菌袖珍型細胞中存在之核酸之長度可為約27個、約28個、約29個、約30個、約35個、約40個、約50個、約60個、約75個、約100個、約200個、約300個、約400個、約500個、約600個、約700個、約800個、約900個、約1000個、約1500個、約2000個、約2500個、約3000個、約3500個、約4000個、約4500個、或約5000個核苷酸。 最近的進展已鑑別大量被哺乳動物細胞中之受體感測之核酸。此等核酸與同源受體結合導致觸發I型及II型干擾素。此等干擾素可充當增強抗腫瘤功效之佐劑(回顧於Junt及Barchet, 2015)。 舉例而言，鐸樣受體(TLR)家族之核酸感測器受限於內體(Blasius及Beutler, 2010)且由若干細胞類型(主要為先天免疫系統中之彼等細胞類型)選擇性表現(參見 圖1)。TLR係由腔側上之胺基端富白胺酸重複序列(LRR)及胞溶質鐸/IL-1R (TIR)結構域組成。 詳言之，TLR3 由雙股RNA (dsRNA)活化。 TLR7 偵測單股RNA (ssRNA)及短dsRNA。 TLR8 結合短ssRNA及ssRNA分解產物(Tanji等人 (2015))。 TLR9 實際上感測含有通常在細菌DNA中發現之未甲基化CpG基元之DNA (Ohto等人 (2015))。 在TLR7、TLR8及TLR9中，TIR結構域藉由聚集接附蛋白骨髓分化原初反應蛋白88 (MYD88)起始信號傳遞。MYD88-依賴性信號級聯之活化最終引起核因子-κB (NF-κB)之活化及編碼促發炎細胞介素之基因之轉錄。 專門地，在漿細胞樣樹突狀細胞(pDC)中，MYD88信號傳遞錯合物能夠經由IFN-調節因子7 (IRF7)之直接活化誘導編碼各種干擾素-α (IFNα)亞型之基因之充分轉錄。 相比之下，TLR3經由含TIR結構域接附蛋白誘導IFNβ (TRIF)傳導信號，其活化NF-κB、有絲分裂原活化之蛋白激酶(MAPK)及IRF3信號傳遞且引起IFNB 及促發炎細胞介素之轉錄(Hornung (2014))。 因此，在一些實施例中，本發明之核酸佐劑可與TLR7、TLR8及/或TLR9結合且將其活化。核酸佐劑可在包括免疫細胞及非免疫細胞之各種細胞類型中與此等受體結合且將其活化。舉例而言，在一些實施例中，核酸佐劑可靶向諸如T細胞及/或單核球性細胞之免疫細胞，該等免疫細胞可包括但不限於單核球、巨噬細胞、樹突狀細胞(例如，pDC、習知樹突狀細胞或骨髓樹突狀細胞)。 在一些實施例中，本發明之核酸佐劑可與TLR3結合且將其活化。在此等實施例中，核酸佐劑亦可靶向免疫細胞或非免疫細胞。 可由所揭示之核酸佐劑活化之另一組RNA及DNA感測器廣泛地表現於免疫及非免疫細胞之胞溶質中(參見 圖1)。DExD/H-盒解螺旋酶視黃酸誘導基因I ( RIG - I ) 及黑素瘤分化相關蛋白質5 ( MDA5 )偵測互補dsRNA結構。RIG-I及MDA5兩者由羧基端配位體結合結構域、中心DEAxD/H-盒解螺旋酶結構域以及N端卡斯蛋白酶活化及募集結構域(CARD)組成。此等CARD接合外部粒線體膜上之信號傳導接附粒線體抗病毒信號傳導蛋白質(MAVS)之相似CARD，其引起MAVS之多聚化及MAVS信號傳導錯合物之活化(Hou等人 (2011))。 RIG-I由短dsRNA之5三磷酸化或5二磷酸化末端活化(Hornung等人 (2006)；Goubau等人(2014))。認為MDA5結合dsRNA及分支鏈高分子RNA形式(Kato等人 (2008)；Pichlmair等人 (2009))。 因此，在一些實施例中，本發明之核酸佐劑可與RIG-I及/或MDA5結合且將其活化。在此等實施例中，核酸佐劑亦可靶向免疫細胞或非免疫細胞。 可由所揭示之核酸佐劑活化之另一胞溶質感測器係環形GMP-AMP ( cGAMP )合成酶(cGAS) (Sun等人， (2013))，dsDNA之受體。在配位體結合時，cGAS產生非標準連接之環形二核苷酸(CDN) [G(2,5)pA(3,5)p] (2′3′-cGAMP)，其充當活化內質網(ER)上之IFN基因(STING)之刺激物的第二信使(Wu等人 (2013)；Gao等人 (2013))。 因此，在一些實施例中，本發明之核酸佐劑可與cGAS結合且將其活化。在此等實施例中，核酸佐劑亦可靶向免疫細胞或非免疫細胞。 相比之下，作為可由所揭示之核酸佐劑活化之dsDNA之另一胞溶質受體的黑素瘤2 (AIM2)之缺乏觸發IL-1β及IL-18而非IFN之釋放。 因此，在一些實施例中，本發明之核酸佐劑可與AIM2結合且將其活化。在此等實施例中，核酸佐劑亦可靶向免疫細胞或非免疫細胞。 近期研究已確定細胞DNA感測器之存在，該等感測器偵測細胞核內之dsDNA以觸發免疫信號傳導。儘管主要在胞溶質及內體中研究此等DNA感測器之作用，但新出現之證據將焦點轉移至細胞核。 IFI16 (干擾素誘導之蛋白16)係屬於以含有C端處之DNA結合域及N端處之PYRIN結構域之200個胺基酸基元為特徵之高度同源HIN-200 (造血表現-干擾素可誘導性-核定位)蛋白家族之DNA感測器(Dawson及Trapani (1995))，主要參與蛋白質-蛋白質相互作用。IFI16係展示在細胞核以及細胞質內起作用之第一病毒DNA感測器(Dawson及Trapani (1995)；Unterholzner等人 (2010))。IFI16亞細胞定位受細胞類型、轉譯後修飾及細胞治療之影響。 舉例而言，病原體入侵造成細胞質中IFI16病灶之形成且誘導干擾素β (IFNB)基因表現(Unterholzner等人 (2010))且UV光造成IFI16自細胞核轉移至細胞質(Costa等人 (2011))。 IFI16之DNA感測能力與經由與干擾素基因之刺激物相互作用活化干擾素β表現(Unterholzner等人 (2010))，及干擾素α表現(Thompson等人 (2014))有關。IFI16與DNA結合並非序列特異性或AT含量依賴性的，但強烈依賴DNA長度(Unterholzner等人 (2010))。 基於結晶研究，IFI16 HIN-B-雙股DNA界面經由帶負電磷酸糖類主鏈與帶正電蛋白質殘基之間的靜電相互作用完成(Jin等人 (2012))。研究IFI16與長質體DNA之結合且觀測超螺旋對線性形式之偏好及十字形結構對雙股DNA之偏好(Brazda等人 (2012))。 IFI16展示與四鏈體DNA之較佳結合，對四鏈體DNA形成及穩定性有積極影響(Haronikova等人 (2016))。在非免疫細胞類型中，IFI16主要定位至細胞核(Diner等人 (2015)；Li等人 (2012), (2013)；Orzalli等人 (2012))。 因此，在一些實施例中，本發明之核酸佐劑可與IFI16結合且將其活化。在此等實施例中，核酸佐劑亦可靶向免疫細胞或非免疫細胞。 除上述彼等核酸感測器以外，此項技術中亦已描述若干其他核酸感測器。熟練技術人員將瞭解，可使用包含經設計以與同源受體(亦即核酸感測器)結合之核酸佐劑之所揭示的袖珍型細胞遞送載體活化或靶向任何已知核酸感測器。因此，可由所揭示之組合物靶向或活化之核酸感測器不受特別限制。 出於本發明之目的，在一些實施例中，袖珍型細胞遞送載體可包含至少一種核酸佐劑。舉例而言，袖珍型細胞遞送載體可包含至少1種、至少2種、至少3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少9種、或至少10種不同核酸佐劑。在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可包含至少一種核酸佐劑及至少一種核酸感測器之促效劑兩者。 c. 核酸感測路徑促效劑 出於本發明之目的，「核酸感測器之促效劑」係自然或合成化合物，其能夠促效已知核酸感測器(包括但不限於先前部分中所揭示之彼等核酸感測器)，且可用於誘發所需免疫反應(亦即IFN反應)。 舉例而言，已將酶聚核苷酸磷酸化酶(PNPase 1)之聚核苷酸產物作為IFN活性之合成誘導物研究(Field等人 (1967))。類似地，dsRNA模擬聚肌胞苷酸：聚胞苷酸(聚(I:C))展示充當TLR3及MDA5兩者之促效劑(Alexopoulou等人 (2001)；Gitlin等人 (2006))。 用聚-l-離胺酸調配以提高RNA酶抗性之聚(I:C)之類似物聚-ICLC目前評估為有前景的癌症疫苗佐劑(回顧於Ammi等人 (2014))。 亦已研發核酸感測器之小分子促效劑。舉例而言，咪唑并喹啉衍生物咪喹莫特係TLR7之促效劑(Hemmi等人 (2002))。其已顯示在皮膚贅瘤形成，諸如基底細胞癌及光化性角化症之治療方面有效。促發炎細胞介素的局部誘導、免疫細胞的局部募集以及用於誘導T輔助細胞1(TH 1)及CD8+ T細胞反應的改良抗原呈遞皆由咪喹莫特之投藥引起，被認為對治療成功至關重要。 促效劑亦能夠與兩種或超過兩種核酸感測器結合。舉例而言，咪唑并喹啉瑞喹莫德係TLR7及TLR8之雙促效劑。在人類中，瑞喹莫德因此強力活化其他細胞類型且引發更廣範圍之細胞介素。一個缺點可能為其可能促成臨床試驗中所觀測到全身不良影響之更常發生率(Huen及Rook (2014))。 現正嘗試研發用於人類STING之促效劑，且正針對最近已顯示具有疫苗佐劑性質之生理促效劑2′3′-cGAMP進行模型化(Li等人(2013))。 合成寡核苷酸亦可經設計且用作核酸感測器之促效劑。舉例而言，基於相對於人類DNA富含未甲基化CpG基元之細菌DNA之免疫刺激性質設計TLR9刺激性合成CpG寡去氧核苷酸(CpG-ODNs)(Krieg等人 (1995)。序列特徵及主鏈修飾之優化產生優先活化B細胞或pDCs之CpG-ODN亞型。進行多種臨床試驗以確定CpG-ODNs與化學療法組合或於治療疫苗中之抗腫瘤活性。 不同促效劑之組合使用可證明為更有益，如最近資料已指示，多種核酸受體之共同參與在疫苗佐劑之臨床前試驗中引發最有效之免疫反應(Goff等人 (2015)；Temizoz等人 (2015))。 因此，在一些實施例中，袖珍型細胞遞送載體可包含至少一種核酸感測器之促效劑。舉例而言，袖珍型細胞遞送載體可包含至少1種、至少2種、至少3種、至少4種、至少5種、至少6種、至少7種、至少8種、至少9種、或至少10種不同核酸感測器促效劑。在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可包含至少一種核酸佐劑及至少一種核酸感測器促效劑兩者。 d. 編碼核酸佐劑之核酸 在本發明之一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可包含編碼至少一種核酸佐劑之核酸。舉例而言，質體可編碼在靶細胞(亦即哺乳動物細胞或免疫細胞)內部表現之核酸佐劑。此使核酸佐劑之內源性遞送成為可能，該內源性遞送在用於某些疾病之治療方面可優於外源性遞送之短暫性質。 因此，細菌衍生之完整袖珍型細胞可攜帶編碼一或多種核酸佐劑之質體DNA，包括但不限於可與TLR3、TLR7、TLR8、TLR9、RIG-I、MDA5、AIM2、cGAS或IFI16結合及/或將其活化之雙股或單股RNA或DNA。使用編碼多種核酸佐劑之袖珍型細胞，有可能在患者中產生強大的免疫反應。舉例而言，第一核酸佐劑可自U6啟動子表現且第二核酸佐劑可自H1啟動子表現。此等多種表現卡匣可攜帶於單一質體上，但亦可攜帶於不同質體上。 在一些實施例中，不同核酸佐劑可自單一啟動子表現，其中重組質體攜帶由多種核酸佐劑序列組成之表現卡匣，該等核酸佐劑序列經由非編碼聚核苷酸序列連接在一起。單一基因轉錄終止子可放置在完全表現卡匣之下游。 在一些實施例中，質體可編碼dsRNA或dsDNA之有義鏈及反義鏈作為兩種獨立的轉錄物，該等轉錄物在靶細胞內表現之後雜交以形成功能核酸佐劑。在一些實施例中，質體編碼各自表現為形成短髮夾莖環結構之單一轉錄物之一或多種dsRNA或dsDNA。髮夾結構可由細胞中之其他酶處理以產生功能核酸佐劑。 欲經由此部分中所描述之方法引入之編碼核酸佐劑分子的核酸亦可具有可操作地與調節元件(諸如啟動子、終止子、強化子及/或信號序列)連接之所需編碼區段。合適啟動子可為組織特異性或甚至細胞特異性的，如治療範圍所指示。 出於本發明之目的，可使用信號序列影響表現產物之分泌或表現產物對特定細胞隔室之定位。因此，經由完整袖珍型細胞遞送之編碼治療性核酸佐劑分子之核酸(亦即，質體)可在適當閱讀框架中包括信號序列，使得相關表現產物由吞噬細胞或其後代分泌，進而影響周圍細胞，與所選擇之治療範式表保持一致。說明性信號序列包括美國專利第5,143,830號中所描述之溶血素C端分泌序列、美國專利第5,037,743號中所揭示之BAR1分泌序列，及美國專利第6,025,197號中所描述之zsig32多肽之信號序列部分。 e. 報導元件 經由所揭示之袖珍型細胞遞送載體遞送之核酸佐劑分子或核酸感測器之促效劑可進一步包含報導元件。報導元件通常藉由編碼多肽賦予其標靶宿主細胞可輕易偵測之表型或特徵，不以其他方式藉由可在表現時由組織學或原位分析(諸如藉由活體內成像技術)偵測到之宿主產生。舉例而言，藉由根據本發明之完整袖珍型細胞遞送之報導元件可為在吞噬宿主細胞產生比色或螢光變化之蛋白質編碼，該比色或螢光變化可被原位分析偵測到且為轉錄活化之定量或半定量功能。此等蛋白質之說明性係酯酶、磷酸酶、蛋白酶及其他酶，其活性產生可偵測發色團或螢光團。 報導元件之較佳實例包括但不限於經由裂解靛藍基因受質影響顏色變化之大腸桿菌b-半乳糖、吲哚基-b-D-半乳糖苷，及伴隨發光，氧化長鏈醛之螢光素酶(細菌螢光素酶)或氧化雜環羧酸之螢光素酶(蟲螢光素)。編碼水母維多利亞多管水母(Aequorea victoria )之綠光螢光蛋白(GFP)之報導元件亦適用於此情形，如Prasher等人 (1995)所描述。GFP相關之技術領域由兩個出版之PCT應用-WO 95/21191 (揭示編碼238個胺基酸GFP缺輔基蛋白之聚核苷酸序列，其含有由胺基酸65至胺基酸67形成之發色團)及WO 95/21191 (揭示維多利亞多管水母GFP之脫輔基肽之cDNA的修飾，提供具有改變之螢光特性的肽)說明，且由突變體GFP之Heim等人 (1994)之報告說明，該報告以激勵振幅之4倍至6倍提高為特徵。 用作報導元件之其他基因包括可轉換袖珍型細胞遞送載體之靶細胞以表現區別性細胞表面抗原之彼等基因，例如可被免疫分析輕易偵測到之病毒包膜蛋白，諸如HIV gp120或疱疹gD。 f. 將核酸佐劑封裝於袖珍型細胞中 可由核酸編碼之核酸佐劑可藉由將編碼核酸轉換於載體中之親代細菌細胞中引入至袖珍型細胞中，諸如編碼核酸佐劑之質體。當袖珍型細胞由親代細菌細胞形成時，袖珍型細胞保留某些質體及/或表現產物、核酸佐劑之複本。將表現產物封裝於袖珍型細胞中之更多細節提供於WO 03/033519中，其內容以全文引用之方式併入本發明中。 核酸佐劑亦可直接封裝於袖珍型細胞中。因此，核酸佐劑可藉由在緩衝液中使多種完整袖珍型細胞與核酸佐劑共同培育直接封裝於完整袖珍型細胞中。緩衝液組合物可取決於本領域中所熟知之條件而變化，以最佳化核酸佐劑於完整袖珍型細胞中之負載。緩衝液亦可取決於待裝載於袖珍型細胞中之核酸佐劑之核苷酸序列及長度而變化。一旦封裝，核酸即保持在袖珍型細胞內部且受保護免於降解。使siRNA封裝之袖珍型細胞在無菌生理鹽水中培育之延長培育研究展示例如無siRNA之洩漏。 在一些實施例中，多種核酸佐劑可封裝於同一袖珍型細胞內。此類方法可用於在患者中產生強大的免疫反應。舉例而言，癌症患者通常表現為能夠躲避先天性免疫反應之腫瘤。為對抗此逃避，袖珍型細胞可用治療顯著濃度之核酸佐劑或核酸感測器之促效劑封裝於免疫細胞(例如，T細胞、樹突狀細胞或單核球)以刺激免疫系統，從而偵測及摧毀癌細胞。此外，將多種核酸佐劑或核酸感測器之促效劑封裝於同一袖珍型細胞中可提高治療成效，因為許多同源受體屬於相異信號傳遞路徑且可誘導包括IFNα或IFNβ之各種細胞介素或趨化激素之產生及分泌。將核酸直接封裝於袖珍型細胞中之更多細節提供於WO 2009/027830中，其內容以全文引用之方式併入本發明中。 可藉由在含有袖珍型細胞之細胞外介質與袖珍型細胞細胞質之間建立藥物之濃度梯度將包括核酸感測器之促效劑之小分子藥物(無論親水性或疏水性)封裝於袖珍型細胞內。當時細胞外介質含有比袖珍型細胞細胞質高之藥物濃度時，藥物自然使此濃度梯度向下移動至袖珍型細胞細胞質中。然而，當濃度梯度顛倒時，藥物不會移動出袖珍型細胞。 g. 將袖珍型細胞引導至靶細胞 出於本發明之目的，可經由配位體將如上所述之組合物之袖珍型細胞引導至靶細胞。靶細胞可包括哺乳動物細胞及尤其人類細胞。靶細胞可為免疫細胞或非免疫細胞，但在較佳實施例中，靶細胞係免疫細胞，諸如T細胞、單核球、樹突狀細胞及/或巨噬細胞。 在一些實施例中，配位體為「雙特異性」的。亦即，配位體對袖珍型細胞及標靶(例如，免疫)細胞組分兩者呈現特異性，使得其造成既定袖珍型細胞結合至靶細胞，其中後者吞噬前者。使用雙特異性配位體將袖珍型細胞靶向至腫瘤細胞進一步描述於WO 05/056749及WO 05/079854中，其各別內容在此以全文引用之方式併入。一旦此類配位體附著至袖珍型細胞，配位體之未佔用特異性(「單一特異性」)涉及直至其與靶細胞相互作用。 配位體可自袖珍型細胞或其親代內表現且隨後呈現於袖珍型細胞表面上。可替代地，配位體可例如藉助於配位體-受體相互作用附著至(「塗佈於」)袖珍型細胞之細胞膜。在任一情況下，配位體不需要對袖珍型細胞之特異性且僅對表徵靶細胞之組分呈現特異性。亦即，此類組分本身對於靶細胞不必為唯一的，或甚至對所靶向之特定種類之免疫細胞為唯一的，只要靶細胞在其細胞表面上表現組分。 在一些實施例中，包含於本發明之投與組合物中之袖珍型細胞遞送載體可接觸且與靶向類型之細胞結合，誘發其攝取至細胞中，其隨後受治療有效負載物之影響。彼有效負載物可為至少一種核酸佐劑及/或至少一種核酸感測器之促效劑。 本發明人發現，此靶向遞送途徑廣泛適用於哺乳動物靶細胞之範圍，包括通常抗拒袖珍型細胞之特異性黏附及胞飲作用之細胞。因此，所靶向之細胞類型不受特定限制。實際上，袖珍型細胞與靶細胞之結合藉由甚至非吞噬細胞在袖珍型細胞之快速胞飲作用之前發生。然而，在一些實施例中，本發明之合適靶細胞以表現在配位體結合時促進胞飲作用或巨胞飲作用之細胞表面受體為特徵。 術語「胞飲作用」涵蓋(1)吞噬作用及(2)胞飲作用(自身類別包括(2a)巨胞飲作用)，其皆傾向於進入晚期內體/溶酶體路徑。本發明人發現之袖珍型細胞上之配位體與哺乳動物細胞表面受體之間的相互作用活化特定胞飲作用路徑，涉及對晚期內體/溶酶體隔室之受體介導之胞飲作用(rME)。藉助於此類胞飲作用路徑，本發明人進一步發現袖珍型細胞能夠將其有效負載物釋放於靶哺乳動物細胞之細胞質中。在有效負載物係編碼核酸之情況下，核酸不僅並非完全在晚期內體/溶酶體隔室中降解，而且在靶哺乳動物細胞中表現。 根據本發明之適用於上述靶向遞送途徑之配位體包括與靶細胞上之表面組分及袖珍型細胞上之表面組分結合之任何試劑。在一些實施例中，靶細胞上之表面組分係受體。配位體可包含多肽及/或碳水化合物組分。在一些實施例中，抗體係較佳的配位體。 舉例而言，標靶哺乳動物細胞上之攜帶針對表面組分之特異性的抗體(諸如免疫細胞標記物)可有效用於將袖珍型細胞靶向靶細胞以產生免疫反應。 在一些實施例中，較佳的配位體包含抗體及/或抗體衍生物。在其當前用途中，術語「抗體」涵蓋藉由免疫原性反應之活體外或活體內產生獲得之免疫球蛋白分子。因此，「抗體」類別包括單株抗體及人類化抗體以及抗體衍生物，諸如單鏈抗體片段(scFv)、雙特異性抗體等。大量不同雙特異性蛋白及基於抗體之配位體為已知的，如Caravella及Lugovskoy (2010)之回顧文章所證明，其在此處以全文引用之方式併入。適用於本發明之抗體及抗體衍生物亦可藉由重組DNA技術獲得。 本發明提供一種組合物，其包含靶向雙特異性配位體，核酸受體封裝之袖珍型細胞之核酸佐劑及/或促效劑，該等袖珍型細胞能夠將治療顯著濃度之核酸佐劑或核酸受體之促效劑遞送於哺乳動物宿主之所需細胞中，使得在宿主中引發所需有益免疫反應。 2.治療方法 本文提供使用所揭示之袖珍型細胞遞送載體治療或預防各種疾病或病況之方法。在一些實施例中，待治療或預防之疾病包含腫瘤、癌症、惡病或癌細胞增殖。在一些實施例中，待治療或預防之疾病係感染，諸如病毒感染。更具體而言，本發明提供活化IFN免疫反應及尤其產生干擾素I型之方法。此類方法可包含投與治療有效量之含有至少一種核酸佐劑及/或至少一種核酸感測器之促效劑的所揭示之袖珍型細胞遞送載體。 所揭示之方法可用於藉由投與含有至少一種核酸佐劑、編碼至少一種核酸佐劑之核酸或核酸感測器之促效劑之完整袖珍型細胞刺激免疫系統以識別及/或摧毀內異物或病原性細胞(亦即病毒、感染病毒之細胞、癌細胞等)。 在一些實施例中，含有核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之所揭示的袖珍型細胞之投藥並非意欲直接殺死內異物或病原性細胞。相反，此類袖珍型細胞之投藥意欲輔助另一治療劑之治療功效。 舉例而言，可將第一劑量之含有核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之所揭示的袖珍型細胞及第二劑量之含有另一治療劑(亦即siRNA或另一生物化合物)或藥物之袖珍型細胞投與個體。在一些實施例中，第二次給藥可包含諸如化學治療劑之細胞毒性藥物，且在一些實施例中，第一次給藥和第二次給藥可靶向不同細胞類型。舉例而言，用於第一次給藥之含有核酸佐劑或核酸感測器之促效劑的袖珍型細胞可靶向免疫細胞，而用於第二次給藥之含有化學治療劑藥物之袖珍型細胞可靶向腫瘤細胞。共同投與或在投與包含核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之所揭示的袖珍型細胞之前或之後投與之化學治療劑及藥物可封裝於另一袖珍型細胞或另一類型之靶向粒子中，或化學治療劑或藥物可以未囊封之游離形式投與。 另外，可將包含核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之所揭示的袖珍型細胞投與正在接受、已接受、或將接受用於治療癌症之輻射療法之個體。實際上，包含核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之所揭示的袖珍型細胞可藉由例如提高個體之先天性抗腫瘤免疫防禦強化任何已知形式之癌症治療。 實際上，所揭示之方法允許投與在單個完整袖珍型細胞中長度大於約27個核苷酸且達約4至約5KB之寡核苷酸。在其他實施例中，核酸可極小，具有長度大小為至少約2個、約3個、約4個、約5個、約6個、約7個、約8個、約9個、約10個、約11個、約12個、約13個、約14個、約15個、約16個、約17個、約18個、約19個、約20個、約21個、約22個、約23個、約24個、約25個、約26個、約27個、約28個、約29個、約30個、約31個、約32個、約33個、約34個、約35個、約36個、約37個、約38個、約39個、約40個、約41個、約42個、約43個、約44個、約45個、約46個、約47個、約48個、約49個、約50個、約51個、約52個、約53個、約54個、約55個、約56個、約57個、約58個、約59個，或約60個或超過60個核苷酸。 此等寡核苷酸可觸發產生I型干擾素(IFNα及IFNβ)形式之免疫調節。I型干擾素之產生已顯示產生佐劑效果且幫助治療癌症及/或感染。因此，在一些實施例中，投與所揭示含有核酸佐劑或核酸感測器促效劑之袖珍型細胞聯合另一治療劑或藥物將產生比單獨投與其他治療劑或藥物更強之抗腫瘤功效。 所揭示之方法比先前技術顯著改進，因為已知難以直接投與I型干擾素。干擾素具有短暫的循環半衰期，且干擾素之IV投藥通常引起嚴重的副作用。因此，所揭示之方法提供一種以生理上可接受之方式促進產生治療有效量之干擾素的新穎方法。 所揭示之袖珍型細胞可直接靶向特異性免疫細胞，或其可為非靶向的。在一些實施例中，非靶向之完整袖珍型細胞經吞噬入巨噬細胞或其他單核球細胞中且藉此在此等細胞中誘發所需免疫調節。 不受理論束縛，認為所揭示之方法係藉由活化干擾素I型之產生起作用，其繼而用以刺激能夠殺死癌細胞或感染細胞之免疫細胞。已知免疫系統在癌症患者中常常受抑制，且所揭示之方法可提供「喚醒」癌症患者免疫系統之方法。 因此，一旦癌症患者之免疫系統具活性，細胞毒性一線療法之成效將更加有效。將含有核酸佐劑或核酸感測器之促效劑之所揭示的袖珍型細胞與包含細胞毒性藥物之完整袖珍型細胞配對提供優於單獨藥物治療之功效，如實例1及2中所示。 如下文更詳細地論述，本發明之調配物可經由各種途徑投與且投與至哺乳動物體中之各種位點，以獲得所需之局部或全身性治療效果。可例如藉由經口投藥、藉由將調配物施用至體腔、藉由吸入或吹入、或藉由非經腸、肌肉內、靜脈內、門靜脈內、肝內、腹膜、皮下、瘤內或皮內投藥完成遞送。投藥之方式及位點視靶細胞之位置而定。 a. 純度 本發明之袖珍型細胞實質上不含污染性親代細菌細胞。因此，本發明之含袖珍型細胞之調配物較佳地含有每107 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞、更優選地含有每108 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞、甚至更佳含有每109 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞、仍更優選地含有每1010 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞且最佳含有每1011 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞。 純化袖珍型細胞之方法為此項技術中已知且描述於PCT/IB02/04632、WO 2004/113507及美國專利第8,591,862號中。一種此類方法結合交叉流動過濾(進料流平行於膜表面；Forbes, 1987)與終端過濾(進料流垂直於膜表面)。視情況，過濾組合之前可為低離心力之差速離心，從而移除細菌細胞之某些部分且藉此富集袖珍型細胞之上清液。 另一純化方法在生物相容性介質中採用密度梯度離心。在離心之後，自梯度收集袖珍型細胞帶，且視情況，使袖珍型細胞經受另一輪密度梯度離心以使純度最大化。該方法可進一步包括對含袖珍型細胞之樣品進行差速離心之預備步驟。當在低離心力下進行時，差速離心將移除親代細菌細胞之某些部分，進而富集袖珍型細胞之上清液。 尤其有效之純化方法採用細菌成絲以提高袖珍型細胞純度。因此，袖珍型細胞純化方法可包括以下步驟：(a)使含有袖珍型細胞之樣品經受誘導親代細菌細胞採用絲狀形式之條件，之後為(b)過濾樣品以獲得純化之袖珍型細胞製劑。 亦可組合已知的袖珍型細胞純化方法。舉例而言，一種高度有效之方法組合如下： 步驟A：產生袖珍型細胞之細菌細胞培養物之差速離心。此步驟可在2000 g下進行約20分鐘，其移除大多數親代細菌細胞，同時將袖珍型細胞留在上清液中。 步驟B：使用等張及無毒密度梯度介質之密度梯度離心。此步驟使袖珍型細胞與包括親代細菌細胞之許多污染物分離，伴隨最少之袖珍型細胞損失。較佳地，此步驟在純化方法內重複。 步驟C：經由0.45 mm過濾器之交叉流過濾以進一步減少親代細菌細胞污染。 步驟D：殘餘親代細菌細胞之應力誘導之成絲。此可藉由使袖珍型細胞懸浮液經受若干應力誘導之環境條件中之任一者完成。 步驟E：殺死親代細菌細胞之抗生素處理。 步驟F：移除小污染物(諸如膜泡、膜片段、細菌碎片、核酸、介質組分等等)且濃縮袖珍型細胞之交叉流動過濾。可採用0.2 mm過濾器使袖珍型細胞與小污染物分離，且可採用0.1 mm過濾器濃縮袖珍型細胞。 步驟G：去除絲狀死亡細菌細胞之終端過濾。對此步驟可採用0.45 um過濾器。 步驟H：自袖珍型細胞製劑中移除內毒素。對此步驟可採用抗脂質A塗佈之磁珠。 在一些實施例中，純化製程實現移除以下各者：(a)較小囊泡，諸如膜泡，其尺寸通常為小於約0.2 μm；(b)自細胞膜釋放之游離內毒素；及(c)親代細菌，無論活的或死的及其碎片，其同樣為游離內毒素之來源。此類移除可尤其利用0.2 μm過濾器執行以移除較小囊泡及細胞碎片，利用0.45 μm過濾器執行以在誘導親代細胞形成長絲後移除親代細胞；殺死活細菌細胞之抗生素及抗游離內毒素之抗體。 在所揭示之純化程序下，本發明人發現，儘管其細菌來源差異，但所有完整袖珍型細胞尺寸均為大致400 nm，亦即，大於膜泡及其他較小囊泡且仍小於親代細菌。可藉由使用固態(諸如電子顯微法)或藉由基於液體之技術(例如動態光散射)來實現袖珍型細胞之尺寸測定。藉由各此類技術產生之尺寸值可具有誤差範圍，且技術之間該等值可能略微不同。因此，在乾燥狀態中之袖珍型細胞之尺寸可經由電子顯微法量測為大致400 nm±50 nm。另一方面，動態光散射可量測相同袖珍型細胞之尺寸為大致500 nm ±50 nm。此外，同樣可使用動態光散射量測封裝藥物、靶向配位體之袖珍型細胞為大致500 nm ± 50 nm。 實際上易於調節此尺寸值之分散，例如出於將袖珍型細胞與如上文所描述之免疫原性組分及其他有毒污染物分離之目的。亦即，細菌衍生之完整微細胞之特徵在於藉由剛性膜包圍之細胞質，該剛性膜為袖珍型細胞提供剛性球形結構。此結構在透射電子顯微圖中顯而易見，其中跨越袖珍型細胞，在剛性膜之外部界限之間量測袖珍型細胞直徑。此測量提供上文所提及之400 nm ± 50 nm之尺寸值。 衍生自革蘭氏陰性細菌之袖珍型細胞之另一結構元件為脂多醣(LPS)之O-多醣組分，其經由脂質A錨定物嵌入在外膜中。該組分為重複碳水化合物-殘基單元之鏈，其中每鏈多達70至100個四至五個糖之重複單元。因為此等鏈在液體環境中並不如活體內一般為剛性的，所以其可採納提供珊瑚海環境中之海藻之一般外觀的波狀可撓性結構；亦即，該等鏈隨液體移動，同時其餘部分錨定於袖珍型細胞膜上。 受O-多醣組分之影響，動態光散射可提供如上所述之尺寸為約500 nm之袖珍型細胞的值。然而，來自革蘭氏陰性及革蘭氏陽性細菌之袖珍型細胞以同樣的方式容易地通過0.45 µm過濾器，其證實了400 nm ± 50 nm之有效袖珍型細胞尺寸。本發明涵蓋上文所提及之尺寸分散且尤其藉由片語「尺寸為大致400 nm」及其類似者中之限定詞「大致」表示。 相對於有毒污染物，本發明之組合物可含有小於約350 EU游離內毒素。在此方面之說明性為分別約250 EU、約200 EU、約150 EU、約100 EU、約90 EU、約80 EU、約70 EU、約60 EU、約50 EU、約40 EU、約30 EU、約20 EU、約15 EU、約10 EU、約9 EU、約8 EU、約7 EU、約6 EU、約5 EU、約4 EU、約3 EU、約2 EU、約1 EU、約0.9 EU、約0.8 EU、約0.7 EU、約0.6 EU、約0.5 EU、約0.4 EU、約0.3 EU、約0.2 EU、約0.1 EU、約0.05 EU及約0.01 EU之游離內毒素含量。 本發明之組合物亦可含有至少約108 個袖珍型細胞，例如至少約5 × 108 個。可替代地，組合物可含有約109 個或約1010 個囊泡之數量級，例如約5 × 109 個、約1 × 1010 個或約5 × 1010 個囊泡。此外，在任何此類數目之袖珍型細胞之中，本發明之組合物可含有少於約10個污染性活/親代細菌細胞，例如少於約9個、約8個、約7個、約6個、約5個、約4個、約3個、約2個、或約1個活/親代細菌細胞。 b. 調配物 適用於本文所述之方法之醫藥組合物可包括所揭示之袖珍型細胞遞送載劑及醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑。 本發明在其範疇內包括組合物或調配物，其包含(a)完整袖珍型細胞及(b)其醫藥學上可接受之載劑，其中袖珍型細胞含有至少一種核酸佐劑分子、包含編碼至少一種核酸佐劑分子之區段之質體，及/或至少一種核酸感測器之促效劑。該至少核酸佐劑或核酸感測器之促效劑可包含本文所述之核酸佐劑或核酸感測器之促效劑中之任一者或其組合。 在一些實施例中，調配物亦可進一步包含如本文所述之藥物。較佳地，調配物之袖珍型細胞含有藥物。可替代地，袖珍型細胞可含有核酸分子，諸如編碼藥物之質體。 含袖珍型細胞之調配物較佳地含有每107 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞、更優選地含有每108 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞、甚至更佳含有每109 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞、仍更優選地含有每1010 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞且最佳含有每1011 個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞。 調配物亦視情況含有將袖珍型細胞靶向至靶細胞之雙特異性配位體。袖珍型細胞及配位體可為本文所述之彼等中之任一者。因此，在一些實施例中，袖珍型細胞含有至少一種核酸佐劑、編碼核酸佐劑之核酸，及/或至少一種核酸感測器之促效劑及能夠與袖珍型細胞之表面組分及標靶哺乳動物細胞之表面組分結合之雙特異性配位體。 本發明之包含袖珍型細胞及視情況選用之藥物及雙特異性配位體之調配物可以習知方式使用一或多種醫藥學上可接受之載劑或賦形劑調配。 調配物可以單位劑型提供，例如安瓿或小瓶，或多劑量容器，在添加或不添加防腐劑之情況下。調配物可為含油或含水媒劑中之溶液、懸浮液或乳液，且可含有調配劑，諸如懸浮劑、穩定劑及/或分散劑。適合的溶液用接受者之血液等張，且藉由生理鹽水、林格氏溶液(Ringer's solution)及右旋糖溶液說明。可替代地，調配物可呈凍乾粉末形式，以便用適合的媒劑，例如無菌、無熱原質水或生理鹽水復原。調配物亦可呈積存製劑形式。此類長效調配物可藉由植入(例如皮下或肌肉內)或藉由肌肉內注射來投與。 在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可經調配以與另一治療劑或藥物同時投與。在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可經調配以與另一治療劑或藥物依序投與。舉例而言，在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可在患者已接收用於治療癌症之化學療法治療之前或之後投與。可替代地，在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可在患者已接收預防感染之疫苗之前或之後投與。 c. 投藥進度 一般而言，可以藉由常規測試所界定之合適劑量使用本文所揭示之調配物，以獲得最佳生理效果，同時使任何潛在毒性減至最小。可根據多種因素選擇給藥方案，該等因素包括患者之壽命、重量、性別、醫學病況；待治療之條件之嚴重程度；投藥途徑；及患者之腎及肝功能。 獲得在最小副作用下產生最大功效之範圍內之袖珍型細胞的濃度之最佳精度可需要基於對標靶位點及靶細胞之袖珍型細胞可用性之動力學的療程。可在測定治療療程之最佳濃度時考慮袖珍型細胞或藥物之分佈、平衡及消除。可在組合使用時調節袖珍型細胞及藥物之劑量以獲得所需效果。 此外，可使用藥物動力學/藥效學建模系統使調配物之劑量投藥最佳化。因此，可選擇一或多個劑量療程且可使用藥物動力學/藥效學模型來測定一或多個劑量療程之藥物動力學/藥效學分佈。隨後，可基於特定藥物動力學/藥效學分佈選擇實現所需藥物動力學/藥效學反應之用於投藥之劑量療程中的一者。參見 例如WO 00/67776。 具體言之，在歷經若干週之過程中，可至少一週一次投與調配物。在一些實施例中，可在歷經若干週至若干個月中至少一週一次投與調配物。在一些實施例中，在歷經若干週至若干月中至少一週兩次投與調配物。在一些實施例中，在歷經若干週至若干個月中至少一週三次投與調配物。在一些實施例中，在歷經若干週至若干個月中至少一週四次投與調配物。在一些實施例中，在歷經若干週至若干個月中至少一週五次投與調配物。在一些實施例中，在歷經若干週至若干個月中至少一週六次投與調配物。 更具體而言，調配物可至少一日一次投與為期約2天、約3天、約4天、約5天、約6天、約7天、約8天、約9天、約10天、約11天、約12天、約13天、約14天、約15天、約16天、約17天、約18天、約19天、約20天、約21天、約22天、約23天、約24天、約25天、約26天、約27天、約28天、約29天、約30天或約31天。可替代地，調配物可約每日一次投與，約每2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天、10天、11天、12天、13天、14天、15天、16天、17天、18天、19天、20天、21天、22天、23天、24天、25天、26天、27天、28天、29天、30天或31天或超過31天一次投與。 調配物可以可替代地約每週一次投與，約每2週、3週、4週、5週、6週、7週、8週、9週、10週、11週、12週、13週、14週、15週、16週、17週、18週、19週或20週或超過20週投與一次。可替代地，調配物可至少一週一次投與，為期約2週、3週、4週、5週、6週、7週、8週、9週、10週、11週、12週、13週、14週、15週、16週、17週、18週、19週或約20週或超過20週。 可替代地，調配物可約每月一次投與，約每2個月、3個月、4個月、5個月、6個月、7個月、8個月、9個月、10個月、11個月、或12個月或超過12個月一次投與。 調配物可以單次日劑量投與，或每日總劑量可以每日兩次、三次或四次分次劑量投與。 在袖珍型細胞在另一治療劑或藥物之前投與之方法中，治療劑或藥物之投藥可在袖珍型細胞之投藥之前或之後的若干分鐘至數小時之任何時間發生。其他治療劑或藥物可以可替代地在數小時至若干天之任何時間投與，可能在袖珍型細胞之前或之後的若干週達至若干月投與。 更具體而言，袖珍型細胞可在另一治療劑或藥物之前或之後至少約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23或約24小時投與。此外，袖珍型細胞可在另一治療劑或藥物之投藥之前或之後至少約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19、約20、約21、約22、約23、約24、約25、約26、約27、約28、約29、約30或約31天投與。在又一實施例中，袖珍型細胞可在另一治療劑或藥物投藥之前或之後至少約1、約2、約3、約4、約5、約6、約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、約18、約19或約20週或超過20週投與。在另一實施例中，袖珍型細胞可在另一治療劑或藥物投藥之前或之後至少約1個、約2個、約3個、約4個、約5個、約6個、約7個、約8個、約9個、約10個、約11個或約12個月投與。 可調節劑量療程以提供最佳所需反應(例如，如腫瘤消退或緩解之治療反應)。舉例而言，在一些實施例中，可投與袖珍型細胞遞送載體之單一藥團，而在一些實施例中，可隨著時間推移投與若干分次劑量或劑量可根據情況指示按比例減少或增加。舉例而言，在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可藉由皮下、肌肉內或靜脈內注射每週一次或兩次投與。在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可藉由皮下、肌肉內或靜脈內注射每月一次或兩次投與。在一些實施例中，所揭示之袖珍型細胞遞送載體可每週一次、每隔一週一次、每三種週一次、每四週一次、每隔一個月一次、每三個月一次、每四個月一次、每五個月一次或每六個月一次投與。 可根據特定治療方案是否將改善既定患者之結果對其進行評估，改善既定患者之結果意謂治療將降低既定癌症或感染之復發風險或提高既定癌症或感染之無進展存活期之可能性。 因此，出於本發明之目的，若獲得包括所需臨床結果之一或多種有益或所需結果，則治療個體。舉例而言，有益或所需臨床結果包括但不限於以下中之一或多者：降低由疾病引起之一或多種症狀、提高罹患疾病者之生活品質、降低治療疾病所需之其他藥品的劑量、延緩疾病進展及/或延長個體存活。 此外，在方法之個體通常係患有某些類型之癌症或感染之患者時，患者年齡不受限制。所揭示之方法適用於治療遍及所有年齡組及群體之伴有各種復發及預後結果之腫瘤、癌症、惡病或癌細胞增殖。所揭示之方法亦適用於在感染過程之前或感染過程中，治療或預防包括細菌感染及病毒感染兩者之各種感染。另外，在一些實施例中，個體可為兒童個體，而在其他實施例中，個體可為成人個體。 3.定義 除非另外定義，否則本文所用之技術及科學術語具有一般熟習此項技術者通常所瞭解之含義，除非另外定義。一般熟習此項技術者已知之任何合適之材料及/或方法可用於進行本文所述之方法。 為方便起見，下文提供本說明書、實例及隨附申請專利範圍中所採用之某些術語及片語之含義。在整個說明書中定義其他術語及片語。 除非本文另外明確指示，否則單數形式「一(a)、(an)」及「該」包括複數個參考物。 如本文所使用，術語「約」將為一般熟習此項技術者理解且將在一定程度上視使用其之上下文而變化。若使用一般熟習此項技術者並不清楚的術語，則給定使用該術語之上下文，「約」將意謂特定術語至多加或減10%。 如本文中所用，術語「包含」欲意謂組合物及方法包括所述要素，但不排除其他要素。當用於定義組合物及方法時，「主要由…組成」應意謂不包括對於該組合物或方法具有任何基本意義的其他要素。「由…組成」應意謂所主張之組合物及大體方法步驟不包括超過痕量要素的其他成分。由此等過渡術語中之每一者定義之實施例在本發明之範疇內。因此，希望該等方法及組合物可包括另外的步驟及組分(包含)，或替代地包括無意義之步驟及組合物(主要由…組成)，或替代地僅希望所陳述之方法步驟或組合物(由…組成)。 如本文所用，「序列」係指聚核苷酸或多肽序列之所有或一部分。 本文中可互換使用之「癌症」、「贅瘤」、「腫瘤」、「惡性腫瘤」及「癌瘤」係指展現特徵為明顯失去細胞增殖控制之異常生長表型之細胞或組織。本發明之方法及組合物尤其適用於癌變前、惡性、轉移性前、轉移性及非轉移性細胞。 「互補」係指兩個分子之相互作用表面之拓樸相容性或匹配在一起，諸如互補核苷酸序列之鹼基配對。因此，分子可描述為互補，且此外接觸表面特徵係彼此互補。 「細胞介素」為由一種細胞群體釋放而作用於另一種細胞群體之蛋白質(如細胞間介體)之通用術語。 「藥物」係指在動物，尤其哺乳動物及人類中產生局部或全身性效果之任何生理學上或藥理學上活性的物質。 「表現」通常係指聚核苷酸序列進行成功轉錄及轉譯使得表現可偵測含量之胺基酸序列或蛋白質之過程。在本文中之某些情況下，表現係指產生核酸序列(亦即，核酸佐劑)，而非蛋白質或胺基酸之表現。在其他情況下，表現係指產生蛋白質。 「宿主細胞」係指可用作或已用作聚核苷酸之重組載體或其他轉移之受體且包括已轉染之原始細胞後代的細胞。由於自然、偶然或目的性突變，單細胞之後代在形態或基因組或總DNA互補方面可不必與原始親代完全相同。 「雜交」係指聚核苷酸序列經由鹼基配對與互補序列結合之任何過程。 如本文所用，片語「治療有效量」意謂所揭示之珠粒粒子之劑量提供將藥物投與需要此類治療之個體中所實現之特定藥理學效果，例如減少、改善或去除癌症/腫瘤生長、進展或復發。強調治療有效量之含有核酸佐劑或核酸感測器之促效劑的袖珍型細胞在治療每一個別個體之癌症/腫瘤方面將並非總是有效的，即使熟習此項技術者認為此類劑量為治療有效量。熟習此項技術者可視需要根據標準操作調節所認為之治療有效量以治療特定個體及/或特定類型之疾病，亦即給定癌症或感染。治療有效量可視投藥途徑及劑型、個體年齡及重量、及/或個體病症(包括在治療時疾病之進展、階段及/或類別)而變化。 術語「治療(treatment)或(treating)」係指針對活動性疾病獲得所需藥理學及/或生理學效果。舉例而言，效果可為完全或部分減少、改善或去除疾病，例如抑制癌症/腫瘤生長及/或進展，或引起癌症/腫瘤細胞死亡。「治療」覆蓋哺乳動物尤其人類之疾病之任何治療，且包括：(1)抑制疾病症狀，亦即遏制其發展；或(2)緩解疾病症狀，亦即引起疾病或症狀之消退。 如本文所用之術語「預防(prevent)或(preventing)」係指防止疾病或症狀在可易患該疾病或症狀及/或尚未診斷出患有該疾病或症狀之個體中產生。「預防」疾病可包括阻止癌症/腫瘤細胞之形成或抑制癌症/腫瘤生長之復發或預防性阻止感染個體。 在本文中可互換地使用「個體(Individual)」、「個體(subject)」、「宿主」及「患者」且其係指需要診斷、治療或療法之任何哺乳動物個體。在一個較佳實施例中，個體(individual)、個體(subject)、宿主或患者係人類。其他個體可包括但不限於牛、馬、狗、貓、天竺鼠、兔、大鼠、靈長類及小鼠。 「寡核苷酸」係指包含例如約10個核苷酸(nt)至約1000 nt之聚核苷酸。用於本發明之寡核苷酸較佳為約10 nt至約150 nt。寡核苷酸可為天然存在之寡核苷酸或合成寡核苷酸。寡核苷酸可經修飾。 「袖珍型細胞」係指細菌細胞之無核形式，藉由在具有DNA分離之細胞分裂二分裂期間干擾協調產生。袖珍型細胞不同於在某些情況下自發性產生及釋放且相比於袖珍型細胞，不歸因於特定基因重排或游離型基因表現之其他小囊泡。為實踐本發明，期望袖珍型細胞具有完整細胞壁(「完整袖珍型細胞」)。 「經修飾之寡核苷酸」及「經修飾之聚核苷酸」係指具有一或多種以鹼、糖部分、核苷間磷酸酯鍵聯之所有或中之任一者之自然分子結構的分子含量化學修飾之寡核苷酸或聚核苷酸，以及係指在此等位點具有添加之取代或修飾組合之分子。核苷間磷酸酯鍵聯可為磷酸二酯、磷酸三酯、胺基磷酸酯、矽氧烷、碳酸酯、羧基甲酯、乙醯胺化物(acetamidate)、胺基甲酸酯、硫醚、橋連胺基磷酸酯、橋連膦酸亞甲酯、硫代磷酸酯、甲基膦酸酯、二硫代磷酸酯、橋連硫代磷酸酯或碸核苷酸間鍵聯或3'-3'鍵聯、5'-3'鍵聯或5'-5'鍵聯，及此類相似鍵聯之組合。磷酸二酯鍵聯可經取代鍵置換，諸如經硫代磷酸酯、甲基胺基、甲基膦酸酯、胺基磷酸酯及胍置換，且聚核苷酸之核糖子單元亦可經取代(例如，己醣磷酸二酯；肽核酸)。修飾可為寡核苷酸分子之內部(單一或重複)或處於寡核苷酸分子之末端，且可包括核苷間磷酸酯鍵聯分子之添加物，諸如裂解或交聯相反鏈或相關酶或其他蛋白質之去氧核糖及磷酸酯修飾。術語「經修飾之寡核苷酸」及「經修飾之聚核苷酸」亦包括包含糖部分之修飾之寡核苷酸或聚核苷酸(例如，3'-取代之核糖核苷酸或去氧核糖核苷酸單體)，其中任一者經由5'鍵聯至3'鍵聯結合在一起。 片語「核酸分子」及術語「聚核苷酸」指代任何長度之核苷酸(核糖核苷酸或去氧核苷酸)之聚合形式。其包括單股、雙股或多鏈DNA或RNA、基因組DNA、cDNA、DNA-RNA雜種或包含嘌呤及嘧啶鹼或其他化學或生物化學修飾或衍生之天然、非天然核苷酸鹼之聚合物。聚核苷酸之主鏈可包含糖及磷酸酯基團(如通常可於RNA或DNA中發現)，或經修飾或取代之糖或磷酸酯基團。可替代地，聚核苷酸之主鏈可包含合成子單元之聚合物，諸如胺基磷酸酯且因此可為寡聚脫氧核苷酸胺基磷酸酯或混合胺基磷酸酯-磷酸二酯寡聚物。聚核苷酸可包含經修飾之核苷酸，諸如甲基化核苷酸及核苷酸類似物、尿嘧啶基、其他糖及鍵聯基團，諸如氟核糖及硫醇鹽(thioate)，及核苷酸分支。可諸如藉由與標記組分結合進一步修飾聚核苷酸。其他類型之修飾包括封蓋、一或多種具有類似物之天然存在之核苷酸的取代，及引入用於將聚核苷酸附著至蛋白質、金屬離子、標記組分、其他聚核苷酸或固體支撐物之構件。 「醫藥學上可接受」係指生理相容性。醫藥學上可接受之載劑或賦形劑不消除所投與之組合物之生物活性，具有化學惰性且對其所投與之生物無毒。 在本文中可互換使用之「多肽」及「蛋白質」係指任何長度胺基酸之聚合形式，其可包括經轉譯、未經轉譯、經化學修飾、經生物化學修飾及衍生之胺基酸。多肽或蛋白質可為天然存在、重組或合成或此等之任何組合。此外，多肽或蛋白質可包含天然存在之蛋白質或肽之片段。多肽或蛋白質可為單分子或可為多分子錯合物。另外，此類多肽或蛋白質可具有經修飾之肽主鏈。該等術語包括融合蛋白，該等融合蛋白包括具有異源胺基酸序列之融合蛋白、具有異源及同源前導序列之融合，具有或不具有N端甲硫胺酸殘基、免疫標籤之蛋白質等。 「純化」係指自其自然環境移除之化合物且不含至少約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、約99.9%或約99.99%與其自然相關之其他組分。 「序列一致性」係指相似性或互補程度。可能存在部分一致性或完全一致性。部分互補序列係至少部分地抑制與標靶聚核苷酸雜交之相同序列的一者；使用功能術語「實質上相同」稱該部分互補序列。可在低嚴格度之條件下使用雜交分析(南方墨點或北方墨點、溶液雜交等)檢測完全互補序列與標靶序列之雜交之抑制。在低嚴格度條件下，實質上相同之序列或探針將競爭且抑制完全相同序列或探針與標靶序列之結合(亦即，雜交)。此並非指低嚴格度條件使得允許非特異性結合；低嚴格度條件需要兩個序列之彼此結合為特異性(亦即，選擇性)相互作用。非特異性結合之缺失可藉由使用甚至缺乏部分互補度(例如，低於約30%一致性)之第二標靶序列測試；在無非特異性結合存在下，探針將不與第二非互補標靶序列雜交。 在兩個核酸或多肽序列之情形中，觀察序列一致性之另一方式需要參考在針對指定區域上之最大一致性對準時相同的兩個序列之殘基。如此處所使用，「序列一致性百分比」意謂藉由在比較窗比較兩個最佳比對序列來測定，其中比較窗中之聚核苷酸序列部分相比於用於最佳比對兩個序列的參考序列(其不包含添加或缺失)可包含添加或缺失(亦即，空隙)。藉由如下步驟計算百分比：測定兩個序列中存在之一致核酸鹼基的位置數，得到匹配位置數；將匹配位置數除以比較窗中之總位置數且將結果乘以100，得到序列一致性百分比。 本發明之組合物及方法可在不存在本文中未特定揭示之任何要素、限制或多個限制之情況下合適地實踐。因此，舉例而言，術語「包含」、「包括」、「含有」等應解讀為廣泛性且非限制性地。另外，本文中所採用之術語及表達已用作描述而非限制之術語，且在使用此類術語及表達時不存在排除所展示及所描述之特徵或其部分之任何等效者的意圖，但應認識到，所主張的本發明之範疇內的各種修改為可能的。 參考文獻 Alexopoulou, L., Holt, A. 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圖1展示內體及胞溶質核酸感測路徑(選自Junt及Barchet, 2015)。圖式指示本文所述之一些主要核酸感測路徑。縮寫包括：cGAMP =環形GMP-AMP；cGAS = cGAMP合成酶；DC =樹突狀細胞；dsRNA =雙股RNA；ER =內質網；IL =介白素；IRAK = IL-1受體相關之激酶；IRF = IFN-調節因子；MAVS =粒線體抗病毒信號傳遞蛋白；MDA5 =黑素瘤分化相關蛋白5；MYD88 =骨髓分化原初反應蛋白88；NF-κB =核因子-κB；pDC =漿細胞樣DC；RIG-I =視黃酸誘導基因I；ssRNA =單股RNA；STING =IFN基因之刺激物；TBK1 = TANK結合激酶1；TRIF =含TIR結構域接附蛋白誘導IFNβ；以及XCR1 = XC-趨化細胞素受體1。 圖2展示細胞核中之核酸感測路徑(取自Diner, Lumm, 及Christea, 2015)。在雙股外源DNA進入宿主細胞中之後，其直接與DNA感測器IFI16及IFIX結合(1)。IFI16經由尚待闡明之機制傳導信號至STING(2)。在活化及二聚STING時，TBK-1經磷酸化(3)，引起IRF3及NF-κB之磷酸化(4)，IRF3及NF-κB易位返回於細胞核中以誘導細胞介素之表現(5)。 圖3展示在小鼠異種移植腫瘤模型中，比較單獨封裝藥物之袖珍型細胞與藥物-(PNU159682)及核酸佐劑-(40聚體)封裝之袖珍型細胞之組合治療的功效之活體內研究之結果。如圖中所示，接收EGFR 袖珍型細胞PNU - 159682 + 袖珍型細胞40 聚體 之小鼠(第3組)在總計6次給藥之後到第44天展示高度顯著之腫瘤消退，而接收單獨EGFR 袖珍型細胞PNU - 159682 之小鼠(第2組)僅為穩定的。第1組表示僅接受鹽水之對照小鼠。 圖4展示小鼠異種移植模型中核酸佐劑40聚體及50聚體之抗腫瘤功效之比較結果。第1組(對照)接受無菌生理鹽水。其他組經投與如下：第2組E GFR 袖珍型細胞PNU - 159682 、第3組EGFR 袖珍型細胞PNU - 159682 +袖珍型細胞40 聚體 、第4組EGFR 袖珍型細胞PNU - 159682 +袖珍型細胞50 聚體 、第5組EGFR 袖珍型細胞PNU - 159682 +袖珍型細胞。

Claims (30)

  1. 一種組合物，其包含：(a)完整細菌袖珍型細胞，其包含：(i)至少一種核酸佐劑分子，(ii)至少一種包含編碼至少一種核酸佐劑分子之區段之質體，或(iii)至少一種核酸感測器之促效劑，及(b)醫藥學上可接受之載劑，其中該至少一種核酸佐劑分子包含具有約40個核苷酸至約50個核苷酸長度之dsRNA，及其中該核酸佐劑分子或核酸感測器之促效劑產生來自靶細胞之干擾素免疫反應。
  2. 如請求項1之組合物，其中來自該靶細胞之免疫反應包含產生I型干擾素。
  3. 如請求項1或2之組合物，其中該至少一種核酸佐劑分子包含與TLR3、TLR7、TLR8、TLR9、RIG-I、MDA5、AIM2、cGAS或IFI16中之至少一者結合之核酸。
  4. 如請求項1或2之組合物，其中：(a)該完整細菌袖珍型細胞包含至少兩種核酸佐劑分子；及/或(b)該完整細菌袖珍型細胞包含核酸佐劑分子及核酸感測器之促效劑。
  5. 如請求項1或2之組合物，其中該至少一種核酸佐劑分子包含介於40個核苷酸及50個核苷酸之間之序列。
  6. 如請求項1或2之組合物，其中該至少一種核酸感測器之促效劑包含PNPase1、聚(I：C)、聚-ICLC、咪喹莫特(imiquimod)、咪唑并喹啉瑞喹莫德(imidazoquinoline resiquimod)或CpG-ODN之聚核苷酸產物。
  7. 如請求項1或2之組合物，其進一步包含雙特異性配位體。
  8. 如請求項7之組合物，其中該雙特異性配位體包含攜帶針對袖珍型細胞表面結構特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體特異性之第二臂。
  9. 如請求項1或2之組合物，其中：(a)該組合物包含每107個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞；或(b)該組合物包含每108個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞；或(c)該組合物包含每109個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞；或(d)該組合物包含每1010個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞；或 (e)該組合物包含每1011個袖珍型細胞少於約1個污染性親代細菌細胞。
  10. 如請求項1或2之組合物，其中：(a)該質體包含調節元件可操作地連接於該編碼至少一種核酸佐劑分子之區段；及/或(b)該質體編碼超過一種核酸佐劑分子。
  11. 一種活體外將核酸佐劑遞送至靶細胞之方法，其包含使靶細胞與包含以下之完整袖珍型細胞接觸：(a)至少一種核酸佐劑分子，(b)包含編碼至少一種核酸佐劑分子之區段之質體，或(c)至少一種核酸感測器之促效劑，其中該靶細胞吞噬該袖珍型細胞，其中該至少一種核酸佐劑分子包含具有約40個核苷酸至約50個核苷酸長度之dsRNA，及其中該核酸佐劑分子或核酸感測器之促效劑產生來自靶細胞之干擾素免疫反應。
  12. 如請求項11之方法，其中該靶細胞係哺乳動物細胞。
  13. 如請求項11或12之方法，其中：(a)該至少一種核酸佐劑分子結合該靶細胞上之受體；及/或 (b)該至少一種核酸佐劑分子包含與TLR3、TLR7、TLR8、TLR9、RIG-I、MDA5、AIM2、cGAS或IFI16中之至少一者結合之核酸。
  14. 如請求項11或12之方法，其中：(a)該完整袖珍型細胞包含至少兩種核酸佐劑分子；及/或(b)該完整袖珍型細胞包含核酸佐劑分子及核酸感測器之促效劑。
  15. 如請求項11或12之方法，其中該至少一種核酸佐劑分子包含至少40個核苷酸之序列。
  16. 如請求項11或12之方法，其中該至少一種核酸感測器之促效劑包含PNPase1、聚(I：C)、聚-ICLC、咪喹莫特、咪唑并喹啉瑞喹莫德或CpG-ODN之聚核苷酸產物。
  17. 如請求項11或12之方法，其中：(a)該質體包含調節元件可操作地連接於該編碼至少一種核酸佐劑分子之區段；及/或(b)該質體編碼多種核酸佐劑分子。
  18. 如請求項11或12之方法，其進一步包含雙特異性配位體。
  19. 如請求項18之方法，其中該雙特異性配位體包含攜帶針對袖珍型細 胞表面結構特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體特異性之第二臂。
  20. 如請求項11或12之方法，其中該靶細胞勝任吞噬作用或胞飲作用。
  21. 一種如請求項1至10中任一項之組合物之用途，其係用於製備治療個體癌症或感染之醫藥品，其中該完整細菌袖珍型細胞在投與後由靶細胞吞噬。
  22. 如請求項21之用途，其中該組合物與以下組合投與：(a)用於治療該個體癌症或感染之藥物，其中該藥物係化學治療劑；及/或(b)用於治療該個體癌症或感染之藥物，其中該藥物係抗病毒藥；及/或(c)用於治療該個體癌症或感染之藥物，其中該藥物封裝於完整袖珍型細胞中。
  23. 如請求項1之組合物，其中該來自該靶細胞之免疫反應包含產生I型干擾素，其中該I型干擾素包含干擾素-α或干擾素-β。
  24. 如請求項1或2之組合物，其中該至少一種核酸佐劑分子係40聚體或50聚體。
  25. 如請求項7之組合物，其中該雙特異性配位體包含攜帶針對袖珍型細胞表面結構特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體特異性之第二臂，其中該袖珍型細胞表面結構係該袖珍型細胞表面上之脂多醣之O-多醣組分；及/或該雙特異性配位體包含攜帶針對袖珍型細胞表面結構特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體特異性之第二臂，其中該哺乳動物細胞表面受體能夠活化該袖珍型細胞之受體介導之胞飲作用；及/或該雙特異性配位體包含抗體或抗體片段。
  26. 如請求項11之方法，其中該靶細胞係人類細胞。
  27. 如請求項11之方法，其中該靶細胞係人類免疫細胞。
  28. 如請求項11之方法，其中該靶細胞係為單核球性細胞、巨噬細胞、T細胞或樹突狀細胞之人類免疫細胞。
  29. 如請求項11或12之方法，其中該至少一種核酸佐劑分子係40聚體或50聚體。
  30. 如請求項18之方法，其中該雙特異性配位體包含攜帶針對袖珍型細胞表面結構特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體特異性之第二臂，其中該袖珍型細胞表面結構係該袖珍型細胞表面上之脂多醣之O-多醣組分；及/或 該雙特異性配位體包含攜帶針對袖珍型細胞表面結構特異性之第一臂及攜帶針對非吞噬哺乳動物細胞表面受體特異性之第二臂，其中該哺乳動物細胞表面受體能夠活化該袖珍型細胞之受體介導之胞飲作用；及/或該雙特異性配位體包含抗體或抗體片段。
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期刊 Jennifer A MacDiarmid et al. Sequential treatment of drug-resistant tumors with targeted minicells containing siRNA or a cytotoxic drug. Nature Biotechnology. 27(7). Nature America Inc. 2009 Jun 28. 643-651. *

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