TW201736391A - 作為人類鼻病毒抑制劑之炔基核苷類似物 - Google Patents

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Abstract

本發明提供式(I)化合物或其鹽;□及該等化合物之治療用途。本發明進一步提供包含該等化合物之醫藥組合物,及包含該等化合物與治療助劑之組合物,及使用該等化合物及組合物治療病毒感染、尤其HRV之方法。

Description

作為人類鼻病毒抑制劑之炔基核苷類似物
本發明係關於抑制人類鼻病毒(HRV)複製且可用於治療經HRV感染之個體之化合物。
人類鼻病毒(HRV)係小核糖核酸病毒家族之腸病毒屬中之RNA病毒,且基於序列分析將其分為三個組HRV-A、HRV-B及HRV-C。該等病毒造成各種上下呼吸道感染(RTI)。通常,在健康個體中上部RTI並非特別嚴重,表明為普通感冒,但其可導致諸如急性中耳炎及鼻竇炎等更嚴重的病況。由HRV造成之下部RTI可能更加嚴重,特別是在易感人群中;例如,其可在患有COPD、氣喘或囊性纖維化之個體中造成嚴重惡化,且可在嬰兒、老人及免疫受損個體中造成嚴重(有時致命)肺炎。 儘管需要抗病毒治療劑來治療由HRV造成之疾病,但在U.S.無批准之HRV抗病毒藥。Mello等人,Antimicrobial Agents and Chemotherapy , 58(3), 1546-55 (2014)。已測試對抗HRV之具有不同作用模式之各種抗病毒劑,例如衣殼結合抑制劑(普來可那立(pleconaril)、吡羅達韋(pirodavir))、3C蛋白酶抑制劑(蘆平曲韋(rupintrivir))及核苷類似物(MK-0608,3D聚合酶之抑制劑)及PI4K-IIIβ抑制劑(PIK93),但其皆未通過臨床試驗。同上 。 具有抗病毒活性之核苷化合物在業內眾所周知;例如,AZT用於治療HIV感染。其充當反轉錄酶之抑制劑,抑制HIV合成DNA所需要之酶,因此抑制HIV複製。各種核苷類似物已顯示對C型肝炎病毒(HCV)具有活性,例如參見Smith等人之J. Med. Chem. 52(1), 219-23 (2009);WO2012/040124;WO2011/100131;及US2012/0070415。然而,尚未研發出治療人類鼻病毒感染之藥物。 治療HRV之困難之一係不同毒株之數量巨大:已知HRV超過160株,且若治療HRV之治療劑對大多數普通毒株無效,則將必須在治療之前確定患者具有哪種毒株。此在目前大多數情形下係不實際的,因此對各種HRV毒株具有光譜活性之抗病毒劑可能尤其有價值。 因此,業內需要可用於特別是在易遭受HRV感染之較嚴重效應之群體中治療HRV感染之抗病毒劑。本發明提供該等抗病毒化合物及含有該等化合物之醫藥組合物,以及使用該等化合物及組合物治療具有或處於HRV感染之風險之個體之方法。
本發明提供抑制人類鼻病毒(HRV)複製之化合物。該等化合物可減少或預防HRV傳播至未感染細胞,且因此可用於減少HRV感染之持續時間或嚴重性。藉由減少HRV感染之程度、嚴重性或持續時間,該等化合物在易感人群(例如嬰兒及老人或免疫受損個體及具有氣喘、COPD或囊性纖維化之個體)中保護對抗其他病況之惡化。高端化合物亦可用於抑制分離細胞或細胞培養物中HRV之複製。 在一個態樣中,本發明提供式(I)化合物:, 其如本文進一步闡述,以及包含該等化合物之醫藥組合及組合物及使用該等化合物、組合及組合物治療某些病毒感染之方法。 式(I)化合物係HRV複製之抑制劑,如藉由本文提供之數據所證實,且可用於治療由HRV造成之病況。此外,如藉由本文之數據所證實,式(I)化合物具有對抗寬範圍之HRV血清型之活性且在通常使用之毒物學模型測試中顯示極少活性。 在另一態樣中,本發明提供包含混合有至少一種醫藥上可接受之載劑或賦形劑、視情況混合有兩種或更多種醫藥上可接受之載劑或賦形劑之式(I)化合物之醫藥組合物。 在另一態樣中,本發明提供治療由人類鼻病毒造成之病況之方法,其包含向需要該治療之個體投與有效量之如本文所闡述之式(I)化合物或其任一亞類或種類或包含該化合物之醫藥組合物。個體可為哺乳動物,且較佳地為人類。通常,已診斷個體具有HRV感染。可由本文所闡述之化合物及方法治療之病況包括由鼻病毒感染觸發之普通感冒及併發症或惡化。 本發明包括本文所闡述之式(I)化合物及式(I)之亞類,及其所有同位素富集型式(包括氘取代)以及該等化合物之醫藥上可接受之鹽。本發明之化合物亦包含式(I)化合物(或其子式)之多形體及式(I)化合物之鹽及溶劑合物。
除非明確或上下文另有指示,否則以下定義適用。 如本文所用術語「鹵素」(或鹵)係指氟、溴、氯或碘,具體而言氟或氯。鹵素取代之基團及部分(例如經鹵素取代之烷基(鹵烷基))可為單鹵化、多鹵化或全鹵化。 除非另有提供,否則如本文所用術語「雜原子」係指氮(N)原子、氧(O)原子或硫(S)原子,具體而言氮或氧。 如本文所用術語「烷基」係指具有1至6個碳原子或1至4個碳原子之完全飽和的具支鏈或不具支鏈烴部分。通常,若未另外指定,則烷基具有1至6個碳原子。烷基之代表性實例包括(但不限於)甲基、乙基、正丙基、異丙基、正丁基、第二丁基、異丁基、第三丁基、正戊基、異戊基、新戊基、正己基及諸如此類。經取代之烷基係含有一或多個取代基(例如一個、兩個或三個取代基,至多未經取代之烷基上所存在氫之數量)代替氫之烷基。若未另外指定,則烷基之適宜取代基係選自鹵素、CN、側氧基(=O)、羥基、C1-4 烷氧基、經取代或未經取代之C3-6 環烷基、胺基、(C1-4 烷基)胺基、二(C1-4 烷基)胺基、C1-4 烷硫基、C1-4 烷基磺醯基、-C(=O)-C1- 4 烷基、COOH、COO(C1-4 烷基)、-O(C=O)-C1-4 烷基、-NHC(=O)C1-4 烷基及-NHC(=O)OC1-4 烷基。 如本文所用術語「烷氧基」係指烷基烷基-O-,其中烷基係如上文所定義。烷氧基之代表性實例包括(但不限於)甲氧基、乙氧基、丙氧基、2-丙氧基、丁氧基、第三丁氧基、戊氧基、己氧基及諸如此類。通常,烷氧基具有1至6個碳,更通常1至4個碳原子。 「取代之烷氧基」係在烷氧基之烷基部分上含有一或多個(例如一個、兩個或三個)取代基之烷氧基。除非另外指定,否則適宜取代基係選自上文針對烷基所列示之取代基,只是羥基及胺基通常不存在於直接連接至經取代「烷基-O」基團之氧之碳上。 以下所列舉實施例代表本發明之一些態樣。應認識到,在每一實施例中所指定之特徵可與其他指定特徵組合以提供本發明之其他實施例。 1. 一種式(I)化合物,其中: R1 係H、Me、Et、iPr或環丙基; R2 係H、磷酸酯、二磷酸酯、三磷酸酯、-P(=X)(OR4 )2 、-P(=X)(OR4 )(NR5 R6 )或-P(=X)(NR5 R6 )2 ,且R3 係H或-C(O)R; 或R3 及R2 一起形成-P(=X)(OR4 )-或-P(=X)(NR5 R6 )- ; X在每次出現時獨立地係O或S; R4 係選自H、視情況經一或兩個選自清單A之基團取代之苯基,及視情況經一或兩個選自鹵基、-OR、-OC(O)R、-OC(O)-OR、--NR2 、-C(O)R、COOR及-C(O)NR2 之基團取代之C1 -C4 烷基; 每一R5 獨立地係H、-C(O)R、COOR或視情況經OH、胺基或COOR取代之C1 -C4 烷基; 每一R6 獨立地選自H、視情況經一或兩個選自清單A之基團取代之苯基,及視情況經一或兩個選自清單B之基團取代之C1 -C4 烷基; 每一R獨立地係H或視情況經一至三個選自以下之基團取代之C1 -C4 烷基:鹵基、羥基、CN、胺基、C1 -C3 烷氧基、-C(O)R7 、-OC(O)R7 、-C(O)-OR7 或-OC(O)-OR7 ; R7 係選自H、視情況經一至三個選自鹵基、羥基、CN、胺基及C1 -C3 烷氧基之基團取代之C1 -C4 烷基,或視情況經一或兩個選自清單A之基團取代之苯基; 清單A係鹵基、羥基、-NO2 、CN、-OR8 、-OC(O)R8 、-OC(O)-OR8 、-N(R8 )2 、-C(O)R8 、COOR8 、-C(O)N(R8 )2 ,及視情況經一至三個選自以下之基團取代之C1 -C3 烷基:鹵基、羥基、CN、胺基及C1 -C3 烷氧基; 清單B係鹵基、羥基、側氧基、CN、-OR8 、-OC(O)R8 、-OC(O)-OR8 、-N(R8 )2 、-C(O)R8 、COOR8 及-C(O)N(R8 )2 ;且 R8 在每次出現時獨立地選自H及視情況經一至三個選自以下之基團取代之C1 -C4 烷基:鹵基、羥基、CN、胺基及C1 -C3 烷氧基, 且兩個連接至同一氮原子之R8 可視情況環化以形成3-7員雜環,該雜環視情況含有另一N、O或S作為環成員,且可經一或兩個選自側氧基、鹵基、-OH、胺基、C1 -C3 烷基、C1 -C3 烷氧基及C1 -C3 鹵烷基之基團取代; 或其醫藥上可接受之鹽。 2. 如實施例1之化合物,其中R1 係甲基。 3. 如實施例1或實施例2之化合物,其中R2 係H。 4. 如實施例1或2之化合物,其中R2 係磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯或其醫藥上可接受之鹽。 5. 如實施例1或實施例2之化合物,其中R2 係-P(=X)(OR4 )2 或其醫藥上可接受之鹽。 6. 如實施例5之化合物,其中每一R4 係選自-CH2 -O-C(O)-R及-CH2 -O-C(O)-OR,其中每一R獨立地係C1 -C4 烷基, 或其醫藥上可接受之鹽。 7. 如實施例1或2之化合物,其中R3 及R2 一起形成-P(=O)(OR4 )-或-P(=O)-(NR5 R6 )-,或其醫藥上可接受之鹽。 8. 如前述實施例中任一者之化合物,其中R3 係H。 9. 如實施例1之化合物,其係:其中R2 係H、磷酸酯基、二磷酸酯基或三磷酸酯基; 或其醫藥上可接受之鹽。 10.    如實施例1或2之化合物,其具有下式:,或其醫藥上可接受之鹽。 11.    如實施例1之化合物,其具有下式:,或其醫藥上可接受之鹽。 12.    如實施例1之化合物,其係選自:或其醫藥上可接受之鹽。 13.    一種醫藥組合物,其包含如前述實施例中任一者之化合物或其醫藥上可接受之鹽及一或多種醫藥上可接受之載劑。 14.    一種組合,其包含治療有效量之如實施例1至12中任一者之化合物或其醫藥上可接受之鹽及一或多種治療活性助劑。 15.    一種治療HRV感染之方法,其包含向需要其之個體投與治療有效量之如實施例1至12中任一者之化合物或其醫藥上可接受之鹽。 16.    如請求項1至12中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其係用作藥劑。 17.    如實施例1至12中任一者之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其用於治療人類鼻病毒感染。 18.    一種如實施例1至12中任一者之化合物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其用於製造用以治療人類鼻病毒感染之藥劑。 式(I)化合物包括此通式之核苷之某些衍生物及前藥:。 前藥係在活體內易於轉化為核苷之活性形式(例如游離核苷或其磷酸酯或三磷酸酯)之化合物。將其納入核苷類似物中之適宜前藥部分及方法在業內眾所周知,且本文提供闡釋性實例。式(I)化合物之實例性前藥包括以下各項:。 不受限於理論,據信式(I)化合物在活體內在轉化為C-5三磷酸酯之後提供其生物活性,該三磷酸酯係例如。 如本文所用術語「光學異構物」或「立體異構物」係指本發明給定化合物中可存在之各種立體異構物構形中之任一者且包括幾何異構物。應瞭解,取代基可連接至碳原子之對掌性中心。術語「對掌性」係指具有與其鏡像夥伴不重疊之性質的分子,而術語「非對掌性」係指與其鏡像夥伴可重疊之分子。本發明包括化合物之鏡像異構物、非鏡像異構物及外消旋物。「鏡像異構物」係一對彼此為非重疊鏡像之立體異構物。鏡像異構物對之1:1混合物為「外消旋」混合物。「非鏡像異構物」係具有至少兩個不對稱原子、但彼此不為鏡像之立體異構物。本發明化合物之絕對立體化學係根據關於化合物名稱之Cahn-lngold-Prelog 「R-S」系統來指定;倘若繪製結構,則通常顯示單一異構物,使用接受之繪製規定來顯示絕對立體化學。除非另外指定,否則以特定鏡像異構物繪製之化合物代表該鏡像異構物,且闡述為至少90%且較佳地至少95%鏡像異構物純之化合物。當化合物係純的鏡像異構物時,每一對掌性碳之立體化學可指定為R或S。絕對構形未知之拆分化合物可端視其在鈉D線波長下旋轉平面偏振光之方向(右旋或左旋)而指定為(+)或(-)。本文所闡述之某些化合物含有一或多個不對稱中心或軸且可由此產生鏡像異構物、非鏡像異構物及其他立體異構物形式,該等形式可根據絕對立體化學定義為(R)-或(S)-。 端視起始材料及合成程序之選擇,化合物可以一種可能異構物或其混合物之形式存在,例如純的光學異構物或異構物混合物,例如外消旋物及非鏡像異構物混合物,此端視不對稱碳原子之數量而定。本發明意欲包括所有該等可能的立體異構物,包括外消旋混合物、非鏡像異構物混合物及光學純形式。可使用對掌性合成子或對掌性試劑來製備光學活性(R)-及(S)-異構物或使用習用技術進行拆分。若化合物含有雙鍵,則除非指定,否則取代基可為E或Z構形。若化合物含有二取代之環烷基,則除非另外指定,否則環烷基取代基可具有順式或反式構形。本發明亦欲包括所有互變異構物形式。 在許多情形下,本發明化合物能夠藉助所存在胺基及/或羧基或其相似基團形成酸式及/或鹼式鹽。如本文所用,術語「鹽(salt或salts)」係指本發明化合物之酸加成鹽或鹼加成鹽。「鹽」具體而言包括「醫藥上可接受之鹽」。術語「醫藥上可接受之鹽」係指保留本發明化合物之生物有效性及性質且通常為生物上或其他方面合意之鹽。 可使用無機酸及有機酸來形成醫藥上可接受之酸加成鹽,例如,乙酸鹽、天冬胺酸鹽、苯甲酸鹽、苯磺酸鹽、溴化物/氫溴酸鹽、碳酸氫鹽/碳酸鹽、硫酸氫鹽/硫酸鹽、樟腦磺酸鹽、氯化物/鹽酸鹽、氯茶鹼、檸檬酸鹽、乙二磺酸鹽、富馬酸鹽、葡庚糖酸鹽、葡萄糖酸鹽、葡糖醛酸鹽、馬尿酸鹽、氫碘酸鹽/碘化物、羥乙磺酸鹽、乳酸鹽、乳糖酸鹽、月桂基硫酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、丙二酸鹽、扁桃酸鹽、甲磺酸鹽、甲基硫酸鹽、萘酸鹽、萘磺酸鹽、煙鹼酸鹽、硝酸鹽、十八烷酸鹽、油酸鹽、草酸鹽、棕櫚酸鹽、巴莫酸鹽、磷酸鹽/磷酸氫鹽/磷酸二氫鹽、聚半乳糖醛酸鹽、丙酸鹽、硬脂酸鹽、琥珀酸鹽、磺基水楊酸鹽、酒石酸鹽、甲苯磺酸鹽及三氟乙酸鹽。其他適宜鹽之清單可參見(例如)「Remington's Pharmaceutical Sciences」, 第20版, Mack Publishing Company, Easton, Pa., (1985);及Stahl及Wermuth之「Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use」 (Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2002)。 可自其衍生鹽之無機酸包括(例如)鹽酸、氫溴酸、硫酸、硝酸、磷酸及諸如此類。 可自其衍生鹽之有機酸包括(例如)乙酸、丙酸、羥乙酸、草酸、馬來酸、丙二酸、琥珀酸、富馬酸、酒石酸、檸檬酸、苯甲酸、扁桃酸、甲磺酸、乙磺酸、甲苯磺酸、磺基水楊酸及諸如此類。 醫藥上可接受之鹼加成鹽可利用無機或有機鹼形成且可具有無機或有機相對離子。 該等鹼式鹽之無機相對離子包括(例如)銨鹽及來自週期表第I行至第XII行之金屬。在某些實施例中,相對離子係選自鈉、鉀、銨、具有1至4個C1-C4烷基之烷基銨、鈣、鎂、鐵、銀、鋅及銅;特別適宜之鹽包括銨鹽、鉀鹽、鈉鹽、鈣鹽及鎂鹽。 可自其衍生鹽之有機鹼包括(例如)一級、二級及三級胺、包含天然經取代胺之經取代胺、環胺、鹼性離子交換樹脂及諸如此類。適宜有機胺包括異丙胺、苄星青黴素(benzathine)、膽酸鹽、二乙醇胺、二乙胺、離胺酸、葡甲胺、六氫吡嗪及胺丁三醇。 本發明之醫藥上可接受之鹽可自鹼性或酸性部分藉由習用化學方法來合成。通常,該等鹽可藉由使游離酸形式之該等化合物與化學計量量之適當鹼(例如Na、Ca、Mg或K氫氧化物、碳酸鹽、碳酸氫鹽或諸如此類)反應來製備,或藉由使游離鹼形式之該等化合物與化學計量量之適當酸反應來製備。該等反應通常係在水或有機溶劑或二者之混合物中實施。通常,若可行,則期望使用非水性介質,例如,醚、乙酸乙酯、四氫呋喃、甲苯、氯仿、二氯甲烷、甲醇、乙醇、異丙醇或乙腈。 本文中給定之任一式意欲代表未標記之形式(即,其中所有原子皆以天然同位素豐度存在且無同位素富集之化合物)以及化合物之同位素富集或標記之形式。同位素富集或標記之化合物具有藉由本文所給定式繪示之結構,只是化合物之至少一個原子由具有不同於天然存在之原子質量或原子質量之原子質量或質量數之原子替代。可納入本發明之經富集或經標記化合物中之同位素之實例包括氫、碳、氮、氧、磷、氟及氯之同位素,例如分別為2 H、3 H、11 C、13 C、14 C、15 N、18 F、31 P、32 P、35 S、36 Cl、125 I。本發明包括如本文所定義之各種經同位素標記之化合物,例如以顯著高於該等同位素之天然豐度之含量存在放射性同位素(例如3 H及14 C)之彼等或存在非放射性同位素(例如2 H及13 C)之彼等。該等經同位素標記之化合物可用於代謝研究(利用14 C)、反應動力學研究(利用(例如)2 H或3 H)、檢測或成像技術(例如,正電子發射斷層掃描術(PET)或單光子發射計算機化斷層顯像(SPECT),包括藥物或受質組織分佈分析)或患者之放射性治療。具體而言,18 F或經標記化合物對於PET或SPECT研究可特別合意。經同位素標記之式(I)化合物通常可藉由熟習此項技術者已知之習用技術來製備或可藉由與彼等闡述於隨附實例及製備中者類似之製程使用適當經同位素標記之試劑替代先前採用的未標記試劑來製備。 此外,使用較重同位素、特別氘(即,2 H或D)取代可提供某些治療優點,此歸因於較大代謝穩定性,例如活體內半衰期延長或劑量需求降低或治療指數改良。應瞭解,在此上下文中氘被視為式(I)化合物之取代基。此一較重同位素(特定而言氘)之濃度可定義為同位素富集因數。如本文所用術語「同位素富集因數」意指指定同位素之同位素豐度與天然豐度之比率。若本發明化合物中之取代基表示為氘,則該化合物每一指定氘原子之同位素富集因子為至少3500 (在每一指定氘原子處納入52.5%氘)、至少4000 (納入60%氘)、至少4500 (納入67.5%氘)、至少5000 (納入75%氘)、至少5500 (納入82.5%氘)、至少6000 (納入90%氘)、至少6333.3 (納入95%氘)、至少6466.7 (納入97%氘)、至少6600 (納入99%氘)或至少6633.3 (納入99.5%氘)。 本發明之醫藥上可接受之溶劑合物包括其中結晶溶劑可經同位素取代之彼等,例如D2 O、d6 -丙酮、d6 -DMSO,以及具有非富集溶劑之溶劑合物。 含有能夠起氫鍵之供體及/或受體作用之基團之本發明化合物(即式(I)化合物)可能夠利用適宜共晶體形成劑形成共晶體。該等共晶體可藉由已知共晶體形成程序自式(I)化合物製備。該等程序包括在結晶條件下在溶液中將式(I)化合物與共晶體形成劑一起研磨、加熱、共昇華、共熔融或接觸,並分離由此形成之共晶體。適宜共晶體形成劑包括闡述於WO 2004/078163中之彼等。因此,本發明進一步提供包含式(I)化合物之共晶體。 如本文所用術語「醫藥上可接受之載劑」包括如熟習此項技術者已知之任一及所有溶劑、分散介質、包衣、表面活性劑、抗氧化劑、防腐劑(例如,抗細菌劑、抗真菌劑)、等滲劑、吸收延遲劑、鹽、防腐劑、藥物、藥物穩定劑、黏合劑、賦形劑、崩解劑、潤滑劑、甜味劑、矯味劑、染料及諸如此類及其組合(例如,Remington's Pharmaceutical Sciences,第18版,Mack Printing Company,1990,第1289-1329頁)。除任何與活性成份不相容之習用載劑之外,本發明涵蓋其於治療或醫藥組合物中之用途。 術語本發明化合物之「治療有效量」係指本發明化合物將引發個體之期望生物學或醫學反應(例如降低或抑制酶或蛋白質活性)或將改善症狀、緩和病況、減緩或延遲疾病進展、或預防疾病等之量。在一個非限制性實施例中,術語「治療有效量」係指本發明化合物在投與個體時有效地至少部分地緩和、抑制、預防及/或改善由HRV造成之病況、病症或疾病、或降低或抑制HRV蛋白之活性、或降低到或抑制HRV之複製之量。 在另一非限制性實施例中,術語「治療有效量」係指本發明化合物在投與細胞或組織或非細胞生物材料或介質時有效地至少部分地降低或抑制HRV之複製之量。 如本文所用術語「個體」係指動物。通常,該動物係哺乳動物。例如,個體亦係指靈長類(例如,雄性或雌性人類)、牛、綿羊、山羊、馬、狗、貓、兔、大鼠、小鼠、魚、鳥及諸如此類。在某些實施例中,該個體係靈長類動物。在特定實施例中,該個體係人類。 如本文所用術語「抑制(inhibit、inhibition或inhibiting)」係指減少或阻抑給定病況、症狀或病症或疾病,或顯著降低生物活性或過程之基線活性。 在一個實施例中,如本文所用術語「治療(treat、treating或treatment)」任一疾病或病症係指改善該疾病或病症(即,減緩或阻止或降低該疾病或其至少一種臨床症狀之發展)。在另一實施例中,「治療(treat、treating或treatment)」係指減輕或改善至少一個物理參數(包括患者不可識別之彼等)。在又一實施例中,「治療(treat、treating或treatment)」係指在身體上(例如,穩定可認識的症狀)、生理上(例如,穩定身體參數)或二者上調節疾病或病症。在又一實施例中,「治療(treat、treating或treatment)」係指預防或延遲疾病或病症之發展或進展。 如本文所用,若個體可在生物學方面、醫學方面或生活品質方面受益於治療,則該個體「需要」該治療。 除非本文另外指明或上下文明顯矛盾,否則如本文所使用,在本發明上下文(尤其在申請專利範圍之上下文)中使用之術語「一(a、an)」、「該(the)」及類似術語皆理解為涵蓋單數及複數二者。 除非本文另有指示或另外上下文明顯矛盾,否則本文所述之所有方法皆可以任何適宜順序實施。除非另外主張,否則本文所提供之任何及所有實例或實例性語言(例如「諸如」)之使用僅意欲更好地說明本發明且並不對本發明範圍加以限制。 除非名稱或繪示指定一種構形,否則本發明化合物之任一不對稱原子(例如碳或諸如此類)可以外消旋或鏡像異構物富集之量存在,例如(R)-、(S)-或(R,S)-構形。在某些實施例中,每一不對稱原子具有至少50%鏡像異構物過量、至少60 %鏡像異構物過量、至少70 %鏡像異構物過量、至少80 %鏡像異構物過量、至少90 %鏡像異構物過量、至少95 %鏡像異構物過量或至少99 %鏡像異構物過量之(R)-或(S)-構形;亦即,對於光學活性化合物,通常較佳地使用一種鏡像異構物來實質排除另一鏡像異構物;因此經繪示、命名或闡述為單一鏡像異構物之化合物主要由該鏡像異構物組成,伴隨10%或更少且較佳地5%或更少之相對鏡像異構物。原子上具有不飽和雙鍵之取代基,若可能,可以順式-(Z)-或反式-(E)-形式存在。 因此,如本文所使用,本發明化合物可以可能的異構物、旋轉異構物、構型異構物(atropisomers)、互變異構物或其混合物中之一種形式存在,例如呈實質上純的幾何(順式或反式)異構物、非鏡像異構物、光學異構物(對映體)、外消旋物或其混合物形式。如本文所用,「實質上純」或「實質上不含其他異構物」意味相對於較佳異構物之量,該產物含有小於10重量%、通常小於5重量%且較佳小於2重量%之其他異構物。 異構物混合物可基於其成份之物理化學差異,例如藉由層析法及/或分段結晶,分離成純的或實質上純的幾何或光學異構物、非鏡像異構物、外消旋物。該分離方法在業內已充分確立。 若需要,則可藉由已知方法將最終產物或中間體之外消旋物拆分成光學對映體,例如藉由分離以光學活性酸或鹼獲得之其非鏡像異構物鹽及釋放光學活性酸性或鹼性化合物。特別地,由此可採用鹼性部分,例如藉由分段結晶以光學活性酸(例如酒石酸、二苯甲醯基酒石酸、二乙醯基酒石酸、二-O,O' -對-甲苯甲醯基酒石酸、苯乙醇酸、蘋果酸或樟腦-10-磺酸)形成之鹽,將本發明化合物拆分成其光學對映體。亦可使用對掌性吸附劑藉由對掌性層析(例如高壓液相層析(HPLC))來拆分外消旋產物。 此外,本發明化合物(包括其鹽)亦可以其水合物形式獲得,或包括其他用於其結晶之溶劑。本發明化合物可固有地或經設計與醫藥上可接受之溶劑(包括水)形成溶劑合物;因此,預計本發明涵蓋溶劑化及未溶劑化形式二者。術語「溶劑合物」係指本發明化合物(包括其醫藥上可接受之鹽)與一或多種溶劑分子之分子複合物。該等溶劑分子係在醫藥領域中常用且已知對接受者無害之彼等,例如,水、乙醇及諸如此類。術語「水合物」係指溶劑分子為水之複合物。 本發明化合物(包括其鹽、水合物及溶劑合物)可固有地或經設計形成多晶型物。 在另一態樣中,本發明提供包含本發明化合物或其醫藥上可接受之鹽及至少一種醫藥上可接受之載劑之醫藥組合物。在一些實施例中,醫藥組合物包含兩種醫藥上可接受之載劑或兩種以上醫藥上可接受之載劑。醫藥組合物可針對具體投與途徑(例如經口投與、非經腸投與及經直腸投與及諸如此類)來調配。在較佳實施例中,醫藥組合物經設計已經口遞送或吸入。另外,本發明之醫藥組合物可以固體形式(包括(但不限於)膠囊、錠劑、丸劑、顆粒、粉末或栓劑)或以液體形式(包括(但不限於)溶液、懸浮液或乳液)製成。可使醫藥組合物經受習用醫藥操作(例如滅菌)及/或可含有習用惰性稀釋劑、潤滑劑或緩衝液以及佐劑(例如防腐劑、穩定劑、潤濕劑、乳化劑及緩衝液等)。 在某些實施例中,本發明之醫藥組合物經調配用於經口遞送。通常,該等醫藥組合物係包含活性成分以及一或多種選自該等以下成分之賦形劑之錠劑或明膠膠囊: a)稀釋劑,例如乳糖、右旋醣、蔗糖、甘露醇、山梨醇、纖維素及/或甘胺酸; b)潤滑劑,例如二氧化矽、滑石粉、硬脂酸、其鎂或鈣鹽及/或聚乙二醇;對錠劑而言,亦包含 c)黏合劑,例如矽酸鎂鋁、澱粉膏糊、明膠、黃蓍膠、甲基纖維素、羧甲基纖維素鈉及/或聚乙烯吡咯啶酮;若需要則包含 d) 崩解劑,例如澱粉、瓊脂、海藻酸或其鈉鹽或泡騰合劑;及/或 e)吸收劑、著色劑、矯味劑及甜味劑。 錠劑可視情況藉由業內已知之方法經膜包覆或腸溶包覆。 適用於經口投與之組合物包括有效量之呈錠劑、菱形錠劑、水性或油性懸浮液、可分散粉末或顆粒、乳液、硬或軟膠囊或糖漿或酏劑形式的本發明化合物。意欲經口使用之組合物可根據業內已知用於製造醫藥組合物之任一方法來製備,且該等組合物可含有一或多種選自由甜味劑、矯味劑、著色劑及防腐劑組成之群的試劑,以便提供醫藥上美觀且可口之製劑。錠劑可含有活性成份與適於製造錠劑且醫藥上可接受之無毒賦形劑的混合物。例如,該等賦形劑為惰性稀釋劑,例如碳酸鈣、碳酸鈉、乳糖、磷酸鈣或磷酸鈉;造粒劑及崩解劑,例如玉米澱粉或海藻酸;黏合劑,例如澱粉、明膠或阿拉伯樹膠;及潤滑劑,例如硬脂酸鎂、硬脂酸或滑石粉。該等錠劑係未經包覆或藉由已知技術包覆以延遲在胃腸道中之崩解及吸收並藉此提供較長時段之持續作用。例如,可採用諸如單硬脂酸甘油酯或二硬脂酸甘油酯等延時材料。用於經口使用之調配物可呈現為硬明膠膠囊形式,其中將活性成份與惰性固體稀釋劑(例如,碳酸鈣、磷酸鈣或高嶺土)混合;或其可為軟明膠膠囊形式,其中將活性成份與水或油介質(例如,花生油、液體石蠟或橄欖油)混合。 在其他實施例中,式(I)化合物之醫藥組合物適於非經腸投與,例如藉由注射或輸注。該等組合物中之某些包括水性等滲溶液或懸浮液。該等組合物可經滅菌及/或含有佐劑,例如防腐劑、穩定劑、潤濕劑或乳化劑、促溶劑、調節滲透壓之鹽及/或緩衝液。此外,其亦可含有其他在治療上有價值之物質。該等組合物分別係根據習用混合、造粒或塗覆方法來製備,且含有約0.1%至75%或含有約1%至50%的活性成份。 適用於經皮施用之組合物包括有效量之本發明化合物與適宜載劑。適用於經皮遞送之載劑包括可吸收之藥理上可接受之溶劑以輔助穿過宿主皮膚。例如,經皮裝置係呈繃帶形式,該繃帶包含背襯元件;含有該化合物(視情況具有載劑)之儲液器;視情況包括速度控制障壁以便以受控之預定速率長時間遞送化合物至宿主皮膚;及將裝置固定至皮膚之構件。 適用於局部施用(例如,施用至皮膚及眼睛)之組合物包括水溶液、懸浮液、軟膏、乳霜、凝膠或(例如)藉由氣溶膠遞送之可噴霧調配物或諸如此類。該等局部遞送系統具體而言將適於眼睛施用。該等可含有增溶劑、穩定劑、張力增強劑、緩衝液及防腐劑。 如本文所使用,局部施用亦可係關於吸入或鼻內施用。本發明化合物可有效治療通常侷限於上呼吸道之感染,且因此充分適用於經由吸入或鼻內方法遞送。本發明之化合物及組合物可在使用或不用適宜推進劑之情況下,以乾粉末之形式自乾粉末吸入器或以氣溶膠噴霧呈現之形式自加壓容器、幫浦、噴霧器、霧化器或噴灑器便捷地遞送。其可單獨、以混合物形式(例如具有乳糖之乾燥摻合物或例如具有磷脂之混合組份粒子)來投與。製備化合物及經由吸入遞送化合物之方法在業內已熟知。 可使用無水或含低水分之成份在低水分或低濕度條件下製備本發明之無水醫藥組合物及劑型。無水醫藥組合物可經製備及儲存以維持其無水性質。因此,使用已知材料包裝無水組合物以防止暴露於水以便其可納入適宜配方套組中。適宜包裝之實例包括(但不限於)氣密性密封箔、塑膠、單位劑量容器(例如,小瓶)、泡罩包裝及條帶包裝。 本發明進一步提供包含一或多種可降低作為活性成份之本發明化合物分解速率之試劑的醫藥組合物及劑型。本文稱為「穩定劑」之該等試劑包括(但不限於)抗氧化劑(例如抗壞血酸)、pH緩衝液或鹽緩衝液等。 呈游離形式或呈鹽形式之式I化合物展現有價值之藥理學性質,例如其抑制HRV之複製,如藉由以下部分所提供之測試數據所顯示,且因此適用於如本文所闡述之療法,且亦適於用作研究化學品,例如用作分析鼻病毒感染之效應之工具化合物。因此,該等化合物及含有其之組合物可用於在需要該治療之患者中治療由HRV造成之感染(包括普通感冒),及用於預防或抑制氣喘、COPD、囊性纖維化及通常由鼻病毒感染惡化之其他病況之併發症。 本文所闡述之化合物及組合物及方法尤其可用於可能經歷HRV感染之嚴重併發症之患者中。例如,患有氣喘、COPD或囊性纖維化之個體在經HRV感染時可具有嚴重併發症之風險。鼻病毒感染係氣喘惡化之常見觸發因素,且通常會使其他呼吸疾病(例如中耳炎、竇炎、肺炎及COPD及囊性纖維化之惡化)牽連其中。Q. J. Med. 94:1-3 (2001)。因此,儘管感冒對於在其他方面健康的人可為不便且可能不一定保證醫藥介入,但患有諸如氣喘、COPD或囊性纖維化等病況之個體、或免疫受損或免疫受抑之個體、或尤其易於發生繼發性呼吸道感染(如肺炎)之個體尤其適於利用本文所闡述之化合物及方法來治療;該治療可降低惡化事件之可能性及/或嚴重性。 因此,作為另一實施例,本發明提供如本文所闡述之式(I)化合物或在式(I)之範圍內之實施例中之任一者的用途,其用於療法中。在具體實施例中,該療法係用於由HRV之毒株造成之疾病。在另一實施例中,本發明之化合物可用於治療患有諸如氣喘、COPD或囊性纖維化等病況之個體、免疫受損或免疫受抑之個體及尤其易於發生嚴重繼發性呼吸道感染(如肺炎)之個體的鼻病毒感染、或降低該等敏感個體發生HRV感染之風險之療法中。 在另一實施例中,本發明提供治療藉由抑制HRV複製來治療之疾病之方法,其包含投與治療有效量之如本文所闡述之式(I)化合物或在式(I)之範圍內之實施例中之任一者。在另一實施例中,疾病係選自上文所提及之病況。該方法通常包含向需要該治療之個體投與有效量之如本文所闡述之化合物或包含該化合物之醫藥組合物。該化合物可藉由任一適宜方法(例如本文所闡述之彼等)來投與,且該投與可以治療醫師所選擇之間隔來重複。在一些實施例中,本發明之化合物或醫藥組合物係以經口方式投與。在其他實施例中,本發明之化合物或醫藥組合物係經鼻或藉由吸入來投與。 本發明之另一實施例提供式(I)化合物或本文所闡述之該等化合物之實施例中之任一者之用途,其用於製造藥劑。在具體實施例中,該藥劑係用於治療由HRV造成或由HRV惡化之疾病或病況。在特定實施例中,該疾病係鼻病毒感染,特別是在患有諸如氣喘、COPD或囊性纖維化等之個體、免疫受損或免疫受抑之個體或尤其易於發生繼發性呼吸道感染(如肺炎)之個體中。 本發明之醫藥組合物或組合可呈對於約50-70 kg之個體約1-5000 mg活性成分或約1-2000 mg或約1-500 mg或約1-250 mg或約0.5-100 mg或約1-50 mg活性成分之單位劑量。對於局部投與方法(包括鼻內或吸入投與)及對於注射或輸注可使用較低劑量(例如1-250 mg或1-50 mg),而對於經口投與可使用較高劑量(例如25-2500 mg或50-5000 mg)。化合物、醫藥組合或其組合之治療有效劑量亦取決於個體物種、體重、年齡及個體病況及所治療病症或疾病或其嚴重程度。一般熟練內科醫師、臨床醫師或獸醫可容易地確定治療或抑制病症或疾病之進展所需之各活性成份的有效量。 上文所舉劑量性質可經由活體外及活體內測試有利地使用哺乳動物(例如小鼠、兔、狗、猴或其經分離器官、組織及製備物)來證實。本發明化合物可在活體外以溶液(例如水溶液)之形式及在活體內以經腸、非經腸、有利地靜脈內方式例如以懸浮液或以水溶液來施用。活體外劑量可在約10-3 莫耳濃度與10-9 莫耳濃度之間之範圍內。 本發明化合物可與一或多種治療助劑同時或在其之前或之後投與。本發明化合物可藉由相同或不同的投與途徑分開投與,或在與助劑相同之醫藥組合物中共同投與。 在一個實施例中,本發明提供包含式(I)化合物及至少一種其他治療助劑之產品,其作為組合製劑同時、單獨或依序用於療法中。在一個實施例中,該療法係治療由HRV造成或惡化之疾病或病況。以組合製劑提供之產品包括組合物,其在同一醫藥組合物中共同包含式(I)化合物及其他治療助劑,或以單獨形式(例如以套組形式)包含式(I)化合物及其他治療劑。 在一個實施例中,本發明提供包含式(I)化合物及另一治療助劑之醫藥組合物。視情況,醫藥組合物可包含醫藥上可接受之載劑,如上文所述。 本文所闡述之化合物及組合物可與一或多種用作免疫調節劑之治療劑(例如共刺激分子之活化劑或免疫抑制分子之抑制劑或疫苗)組合使用或投與。程式化死亡1 (PD-1)蛋白係T細胞調節劑之經擴展CD28/CTLA4家族之抑制性成員(Okazaki等人(2002)Curr Opin Immunol 14: 391779-82;Bennett等人(2003)J. Immunol. 170:711-8)。PD-1係在活化B細胞、T細胞及單核球上表現。PD-1係負性調節TCR信號之免疫抑制性蛋白(Ishida, Y.等人(1992)EMBO J . 11:3887-3895;Blank, C.等人(Epub 2006年12月29日)Immunol. Immunother . 56(5):739-745)且在慢性感染中經上調。PD-1與PD-L1之間之相互作用可充當免疫檢查點,其可使得(例如)浸潤淋巴球減少、T細胞受體介導之增殖減少,及/或癌性或經感染細胞之免疫逃避(Dong等人(2003)J. Mol. Med . 81:281-7;Blank等人(2005)Cancer Immunol. Immunother . 54:307-314;Konishi等人(2004)Clin. Cancer Res . 10:5094-100)。免疫抑制可藉由抑制PD-1與PD-L1或PD-L2之局部相互作用來逆轉;當PD-1與PD-L2之相互作用亦經阻斷時該效應係加性的(Iwai等人(2002)Proc. Nat'l. Acad. Sci . USA 99:12293-7;Brown等人(2003)J. Immunol . 170:1257-66) 免疫調節可藉由結合至免疫抑制蛋白(例如,PD-1)或調節抑制蛋白之結合蛋白(例如,PD-L1、PD-L2)來達成。 在一個實施例中,本發明之組合療法包括為免疫檢查點分子之抑制分子之抑制劑或拮抗劑的免疫調節劑。在另一實施例中,免疫調節劑結合至通常抑制免疫抑制檢查點分子之蛋白質。當與抗細菌性化合物組合使用時,該等免疫調節劑可增強抗微生物反應,且因此相對於單獨使用抗細菌性化合物之治療增強效能。 術語「免疫檢查點」係指CD4及CD8 T細胞之細胞表面上之分子群。該等分子可有效地用作下調或抑制適應性免疫反應之「制動器」。免疫檢查點分子包括(但不限於)直接抑制免疫細胞之程式化死亡受體1 (PD-1)、細胞毒性T淋巴球抗原4 (CTLA-4)、B7H1、B7H4、OX-40、CD137、CD40及LAG3。可作為免疫檢查點抑制劑用於本發明方法中之免疫治療劑包括(但不限於)以下各項之抑制劑:PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及/或TGFR β。抑制分子之抑制可藉由在DNA、RNA或蛋白質層級上抑制來實施。在一些實施例中,可使用抑制核酸(例如,dsRNA、siRNA或shRNA)來抑制抑制分子之表現。在其他實施例中,抑制信號之抑制劑係多肽,例如結合至抑制分子之可溶性配體或抗體或其抗原結合片段。 「與……組合」並不意欲暗示療法或治療劑必須同時投與及/或經調配以一起遞送,但該等遞送方法在本文所述之範圍內。免疫調節劑可與一或多種本發明化合物及視情況一或多種其他療法或治療劑同步、在其之前或之後投與。呈組合形式之治療劑可以任一順序投與。一般而言,每一藥劑將以對該藥劑確定之劑量及/或時間表投與應進一步瞭解,用於此組合中之治療劑可以單一組合物一起投與或以不同組合物單獨投與。一般而言,預期用於組合中之每一治療劑系以不超過個別利用其時之量的量來使用。在一些實施例中,用於組合中之量將低於個別利用之彼等。 在某些實施例中,本文所述之抗細菌性化合物系與一或多種為PD-1、PD-L1及/或PD-L2之抑制劑之免疫調節劑組合投與。每一該抑制劑可系抗體、其抗原結合片段、免疫黏附素、融合蛋白或寡肽。該等免疫調節劑之實例為業內已知。 在一些實施例中,免疫調節劑係選自MDX-1106、Merck 3475或CT-011之抗PD-1抗體。 在一些實施例中,免疫調節劑係免疫黏附素(例如,包含融合至恆定區(例如,免疫球蛋白序列之Fc區)之PD-Ll或PD-L2之細胞外或PD-1結合部分之免疫黏附素)。 在一些實施例中,免疫調節劑係PD-1抑制劑,例如AMP-224。 在一些實施例中,免疫調節劑係PD-Ll抑制劑,例如抗PD-Ll抗體。 在一些實施例中,免疫調節劑係選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105之抗PD-Ll結合拮抗劑。MDX-1105亦稱為BMS-936559,其係闡述於WO2007/005874中之抗PD-Ll抗體。抗體YW243.55.S70係闡述於WO 2010/077634中之抗PD-Ll。 在一些實施例中,免疫調節劑係尼沃魯單抗(nivolumab,CAS登記號:946414-94-4)。尼沃魯單抗之替代名稱包括MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538或BMS-936558。尼沃魯單抗係特異性阻斷PD-1之完全人類IgG4單株抗體。尼沃魯單抗(純系5C4)及特異性結合至PD-1其他人類單株抗體揭示於US 8,008,449、EP2161336及WO2006/121168中。 在一些實施例中,免疫調節劑係抗PD-1抗體派姆單抗(Pembrolizumab)。派姆單抗(亦稱為蘭布魯珠單抗(Lambrolizumab)、MK-3475、MK03475、SCH-900475或KEYTRUDA®;Merck)係結合至PD-1之人類化IgG4單株抗體。派姆單抗及其他人類化抗PD-1抗體揭示於Hamid, O.等人(2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44、US 8,354,509、WO2009/114335及WO2013/079174中。 在一些實施例中,免疫調節劑係結合至PD1之人類化IgG1k單株抗體匹利珠單抗(Pidilizumab,CT-011;Cure Tech)。匹利珠單抗及其他人類化抗PD-1單株抗體揭示於WO2009/101611中。 可作為免疫調節劑用於本文所揭示方法中之其他抗PD1抗體包括AMP 514 (Amplimmune)以及US 8,609,089、US 2010028330及/或US 20120114649中所揭示之抗PD1抗體。在一些實施例中,抗PD-L1抗體係MSB0010718C。MSB0010718C (亦稱為A09-246-2;Merck Serono)係結合至PD-L1之單株抗體。 在一些實施例中,免疫調節劑係結合至PD-L1之人類Fc最佳化IgG1單株抗體MDPL3280A (Genentech / Roche)。針對PD-L1之MDPL3280A及其他人類單株抗體揭示於美國專利第7,943,743號及美國公開案第20120039906號中。可作為免疫調節劑用於本發明方法之其他抗PD-L1結合劑包括YW243.55.S70 (參見WO2010/077634)、MDX-1105 (亦稱為BMS-936559)及WO2007/005874中所揭示之抗PD-L1結合劑。 在一些實施例中,免疫調節劑係AMP-224 (B7-DCIg;Amplimmune;例如WO2010/027827及WO2011/066342中所揭示),其係阻斷PD1與B7-H1之間之相互作用的PD-L2 Fc融合物可溶性受體。 在一些實施例中,免疫調節劑係抗LAG-3抗體(例如BMS-986016)。BMS-986016 (亦稱為BMS986016)係結合至LAG-3之單株抗體。BMS-986016及其他人類化抗LAG-3抗體揭示於US 2011/0150892、WO2010/019570及WO2014/008218中。 在某些實施例中,本文所揭示之組合療法包括共刺激分子或抑制分子(例如共抑制配體或受體)之調節劑。 在一個實施例中,共刺激分子之共刺激調節劑(例如激動劑)係選自以下之激動劑(例如,促效性抗體或其抗原結合片段或可溶性融合物):OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體。 在另一實施例中,本文所揭示之組合療法包括為共刺激分子之免疫調節劑,例如與包括CD28、CD27、ICOS及/或GITR之共刺激結構域之正信號相關之激動劑。 實例性GITR激動劑包括(例如) GITR融合蛋白及抗GITR抗體(例如二價抗GITR抗體),例如闡述於以下各項中之GITR融合蛋白美國專利第6,111,090號、歐洲專利第090505B1號、美國專利第8,586,023號、PCT公開案第WO 2010/003118及2011/090754號,或闡述於以下各項中之抗GITR抗體:例如美國專利第7,025,962號、歐洲專利第1947183B1號、美國專利第7,812,135號、美國專利第8,388,967號、美國專利第8,591,886號、歐洲專利第EP 1866339號、PCT公開案第WO 2011/028683號、PCT公開案第WO 2013/039954號、PCT公開案第WO2005/007190號、PCT公開案第WO 2007/133822號、PCT公開案第WO2005/055808號、PCT公開案第WO 99/40196號、PCT公開案第WO 2001/03720號、PCT公開案第WO99/20758號、PCT公開案第WO2006/083289號、PCT公開案第WO 2005/115451號、美國專利第7,618,632號及PCT公開案第WO 2011/051726號。 在一個實施例中,所用免疫調節劑係可溶性配體(例如,CTLA-4-Ig)或結合至PD-L1、PD-L2或CTLA4之抗體或抗體片段。舉例而言,抗PD-1抗體分子可與例如抗CTLA-4抗體(例如伊匹單抗(ipilimumab))組合投與。實例性抗CTLA4抗體包括曲美力木單抗(Tremelimumab) (IgG2單株抗體,可自Pfizer購得,先前稱為替西木單抗(ticilimumab)、CP-675,206);及伊匹單抗(CTLA-4抗體,亦稱為MDX-010,CAS編號477202-00-9)。 在一個實施例中,抗PD-1抗體分子係在使用如本文所述之本發明化合物治療後投與。 在另一實施例中,抗PD-1或PD-L1抗體分子係與抗LAG-3抗體或其抗原結合片段組合投與。在另一實施例中,抗PD-1或PD-L1抗體分子係與抗TIM-3抗體或其抗原結合片段組合投與。在其他實施例中,抗PD-1或PD-L1抗體分子係與抗LAG-3抗體及抗TIM-3抗體或其抗原結合片段組合投與。本文所列舉抗體之組合可單獨(例如作為單獨抗體)或結合(例如作為雙特異性或三特異性抗體分子)投與。在一個實施例中,投與包括抗PD-1或PD-L1抗體分子及抗TIM-3或抗LAG-3抗體或其抗原結合片段之雙特異性抗體。在某些實施例中,使用本文所列舉抗體之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如,實體腫瘤)。可在業內已知之動物模型中測試上述組合之效能。舉例而言,測試抗PD-1及抗LAG-3之協同效應之動物模型闡述於(例如) Woo等人(2012) Cancer Res. 72(4):917-27)中。 可用於組合療法中之實例性免疫調節劑包括(但不限於)例如阿夫土株單抗(afutuzumab,可自Roche®購得);聚乙二醇非格司亭(pegfilgrastim,Neulasta®);雷利竇邁(lenalidomide,CC-5013、瑞複美®);沙利竇邁(thalidomide,Thalomid®)、艾迪美(actimid,CC4047);及細胞介素,例如IL-21或IRX-2 (包括介白素1、介白素2及干擾素γ之人類細胞介素之混合物,CAS 951209-71-5,可自IRX Therapeutics購得)。 可與本發明之抗細菌性化合物組合使用之該等免疫調節劑的實例性劑量包括約1 mg/kg至10 mg/kg、例如3 mg/kg之抗PD-1抗體分子之劑量及約3 mg/kg之抗CTLA-4抗體(例如伊匹單抗)的劑量。 使用本發明之抗細菌性化合物與免疫調節劑之組合之方法實施例的實例包括該等: i.  一種治療個體之細菌感染之方法,其包含向個體投與如本文所述之式(I)化合物及免疫調節劑。 ii.如實施例i之方法,其中免疫調節劑係共刺激分子之活化劑或免疫檢查點分子之抑制劑。 iii.如實施例i及ii中之任一者之方法,其中共刺激分子之活化劑係以下中之一或多者之激動劑:OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1 (CD11a/CD18)、ICOS (CD278)、4-1BB (CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3及CD83配體。 iv.如上述實施例i至iii中任一者之方法,其中免疫檢查點分子之抑制劑選自PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4及TGFR β。 v. 如實施例i至iii中任一者之方法,其中免疫檢查點分子之抑制劑選自PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3或CTLA4之抑制劑或其任一組合。 vi.如實施例i至v中任一者之方法,其中免疫檢查點分子之抑制劑係結合至免疫檢查點分子之可溶性配體或抗體或其抗原結合片段。 vii.如實施例i至vi中任一者之方法,其中抗體或其抗原結合片段來自IgG1或IgG4 (例如,人類IgG1或IgG4)。 viii.根據實施例i至vii中任一者之方法,其中改變(例如突變)抗體或其抗原結合片段以增加或降低以下中之一或多者:Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基數、效應細胞功能或補體功能。 ix.如實施例i至viii中任一者之方法,其中抗體分子係具有針對PD-1或PD-L1之第一結合特異性及針對TIM-3、LAG-3或PD-L2之第二結合特異性的雙特異性或多特異性抗體分子。 x. 如實施例i至ix中任一者之方法,其中免疫調節劑係選自尼沃魯單抗、派姆單抗或匹利珠單抗之抗PD-1抗體。 xi.根據實施例i至x中任一者之方法,其中免疫調節劑係選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105之抗PD-L1抗體。 xii。根據實施例i至x中任一者之方法,其中免疫調節劑係抗LAG-3抗體分子。 xiii.如實施例xii之方法,其中抗LAG-3抗體分子係BMS-986016。 xiv.如實施例i至x中任一者之方法,其中免疫調節劑係以下列劑量藉由注射(例如,皮下或靜脈內)投與之抗PD-1抗體分子:約1 mg/kg至30 mg/kg,例如約5 mg/kg至25 mg/kg、約10 mg/kg至20 mg/kg、約1 mg/kg至5 mg/kg或約3 mg/kg,例如每週一次至每2週、每3週或每4週一次。 xv.如實施例xiv之方法,其中抗PD-1抗體分子係以約10 mg/kg至20 mg/kg之劑量每隔一週投與。 xvi.根據實施例xv之方法,其中抗PD-1抗體分子(例如尼沃魯單抗)係以約1 mg/kg至3 mg/kg、例如約1 mg/kg、2 mg/kg或3 mg/kg之劑量每兩週靜脈內投與。 xvii.如實施例xv之方法,其中抗PD-1抗體分子(例如尼沃魯單抗)係以約2 mg/kg之劑量以3週間隔靜脈內投與。 在本發明之組合療法中,本發明化合物及另一治療助劑可由相同或不同的製造商來製造及/或調配。另外,本發明化合物及另一治療劑可一起提供於組合療法中:(i) 在向醫師釋出組合產品之前(例如在包含本發明化合物及另一治療劑之套組之情形下);(ii)在即將投與前由醫師本身實施(或在醫師指導下);(iii)例如在依序投與本發明化合物及另一治療劑期間,由患者本身實施。 因此,本發明提供式(I)化合物用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之用途,其中該藥劑經製備以與另一治療劑一起投與。本發明亦提供另一治療助劑用於治療疾病或病況之用途,其中該藥劑係與式(I)化合物一起投與。適宜與本發明化合物組合使用之助劑包括3A抑制劑、3C蛋白酶抑制劑及影響HRV之衣殼黏合劑,包括恩韋肟(enviroxime)、普來可那立及蘆平曲韋。 本發明亦提供式(I)化合物用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之方法中,其中該式(I)化合物經製備以與另一治療劑一起投與。本發明亦提供另一治療助劑用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之方法中,其中該另一治療助劑經製備以與式(I)化合物一起投與。本發明亦提供式(I)化合物用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之方法中,其中該式(I)化合物係與另一治療助劑一起投與。本發明亦提供另一治療助劑用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之方法中,其中該另一治療助劑係與式(I)化合物一起投與。 本發明亦提供式(I)化合物用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之用途,其中該患者先前(例如在24小時內)已經另一治療劑治療。本發明亦提供另一治療劑用於治療由HRV造成或惡化之疾病或病況之用途,其中該患者先前(例如在24小時內)已經式(I)化合物治療。 在一個實施例中,該另一治療劑係選自3A抑制劑、3C蛋白酶抑制劑及影響HRV之衣殼黏合劑,包括恩韋肟(enviroxime)、普來可那立及蘆平曲韋。 實例 以下實例意欲闡釋本發明且並非視為限制本發明之範圍。溫度係以攝氏度給出。若無另外提及,則所有蒸發皆在通常介於約15 mm Hg與100 mm Hg (20-133毫巴(mbar))之間之減壓下實施。最終產物、中間體及起始材料之結構係藉由標準分析方法(例如微量分析法及光譜特徵分析法(例如MS、IR、NMR))來證實。所用縮寫係業內習用之彼等。 用於合成本發明化合物之所有起始材料、構造塊、試劑、酸、鹼、脫水劑、溶劑及觸媒皆有售或可藉由熟習此項技術者已知之有機合成方法來製造(例如參見Houben-Weyl第4版,1952,Methods of Organic Synthesis , Thieme, 第21卷)。此外,本發明化合物可藉由熟習此項技術者鑒於以下實例已知之有機合成方法來產生。實例 1. 實例1係藉由以下反應順序來製備。(3R,4R,5R)-4-((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 )-5-(((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 ) 甲基 )-2- 甲氧基 -3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成 . 經30 min之時段在-78℃下將0.5 M丙-1-炔基溴化鎂(144 mL, 0.072 mol)添加至(4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-2-甲氧基二氫呋喃-3(2H)-酮(CAS 636581-82-3, 11.5 g, 0.023 mol)於THF (150 mL)中之溶液中。使反應混合物緩慢達到室溫並攪拌4 h。在完成反應之後,使其冷卻至0℃並用飽和NH4 Cl水溶液淬滅。用EtOAc萃取反應混合物並相繼用水及鹽水溶液洗滌有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到(3R,4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-2-甲氧基-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3-醇(6.12 g, 0.012 mmol, 產率48%)。1 H NMR (CDCl3 , 400 MHz) δ 1.83 (s, 3H), 3.40 (s, 1H), 3.49 (s, 3H), 3.70 (dd,J = 4.8, 2.0 Hz, 2H), 3.86 (d,J = 4.4 Hz, 1H), 4.21 (q,J = 4.8 Hz, 1H), 4.61 (ABq,J = 13.2 Hz, 2H), 4.70 (d,J = 13.2 Hz, 1H), 4.88 (s, 1H), 4.89 (d,J = 12.0 Hz, 1H), 7.18-7.24 (m, 2H), 7.35 (dd,J = 6.8, 2.0 Hz, 2H), 7.40 (dd,J = 8.0, 2.8 Hz, 2H)。(3R,4R,5R)-4-((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 )-5-(((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 ) 甲基 )-3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -2,3- 二醇之合成 . 在0℃下將於水(11.6 mL)中之三氟乙酸(164.25 mL)添加至(3R,4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-2-甲氧基-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3-醇(50.0 g, 0.096 mol)中。將反應混合物加熱至55℃並保持4 h。在減壓下濃縮混合物隨後與甲苯共蒸餾兩次。藉由矽膠管柱層析純化所獲得之粗製物,以得到(3R,4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-2,3-二醇(40.10 g, 0.079 mol, 產率82%)。1 H NMR (CDCl3 , 400 MHz) δ 1.86, 1.92 (s × 2, 3H), 3.44, 3.90 (brs × 2, 1H), 3.58-3.65 (m, 1H), 3.69-3.74 (m, 1H), 4.10-4.15 (m, 2H), 4.59 (ABq,J = 13.2 Hz, 2H), 4.75 (d,J = 12.4 Hz, 1H), 4.95 (d,J = 12.8 Hz, 1H), 5.10, 5.31 (s × 2, 1H), 7.22-7.25 (m, 2H), 7.33-7.40 (m, 4H)。(1R,3R,4R,5R)-4-((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 )-3-(((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 ) 甲基 )-5-( -1- -1- )-2,6- 二氧雜二環 [3.1.0] 己烷之合成 . 在室溫下向(3R,4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-2,3-二醇(1.0 g, 1.9 mmol)於CH2 Cl2 (50 mL)中之溶液中添加Et3 N ( 0.9 mL, 0.0059 mol)隨後DMAP (cat)。使反應混合物冷卻至0℃且然後一次性添加p- TsCl (0.615 g, 2.9 mol)。將所得反應混合物在室溫下攪拌3 h。在完成反應之後,用CH2 Cl2 稀釋反應混合物並用水及鹽洗滌水有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾,並在真空中濃縮,以得到(1R,3R,4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-3-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-5-(丙-1-炔基)-2,6-二氧雜二環[3.1.0]己烷(1.2 g)。此粗製化合物直接用於下一步驟。(2R,3R,4R,5R)-2-(4- -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-4-((2,4- 二氯 - 苄基 ) 氧基 )-5-(((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 ) 甲基 )-3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成 . 在0℃下向4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(0.374 g, 2.4 mol)於CH3 CN (10 mL)中之溶液中添加NaH (60%懸浮液,0.176 g,4.0 mol)並將混合物在室溫下攪拌1 h。將於CH3 CN (10 mL)中之(1R,3R,4R,5R)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-3-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-5-(丙-1-炔基)-2,6-二氧雜二環[3.1.0]己烷(1.20 g, 2.4 mol)添加至反應混合物中。將所得反應混合物加熱至50℃並保持16 h。在完成反應之後,在減壓下濃縮混合物並將其倒入冰冷水中。用EtOAc萃取混合物並用水及鹽水洗滌有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到(2S,3R,4R,5R)-2-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3-醇(0.72 g, 1.12 mmol, 經兩個步驟產率57%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.35 (s, 3H), 3.78 (dd,J = 11.2, 3.6 Hz, 1H), 3.92 (dd,J = 11.2, 2.4 Hz, 1H), 4.20 (dt,J = 8.4, 3.6 Hz, 1H), 4.37 (d,J = 8.4 Hz, 1H), 4.60 (ABq,J = 12.8 Hz, 2H), 4.75 (d,J = 13.2 Hz, 1H), 4.94 (d,J = 12.8 Hz, 1H), 6.36 (s, 1H), 6.56 (s, 1H), 6.65 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 7.42-7.48 (m, 3H), 7.54 (d,J = 8.0 Hz, 1H), 7.63 (dd,J = 12.8, 1.6 Hz, 2H), 7.87 (d,J = 3.2 Hz, 1H), 8.68 (s, 1H);LC-MS: m/z 640.05 (M+H)+(2R,3R,4R,5R)-2-(4- 胺基 -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-4-((2,4- 二氯 - 苄基 ) 氧基 )-5-(((2,4- 二氯苄基 ) 氧基 ) 甲基 )-3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3- 醇之合成 . 在鋼製反應釜中向(2S,3R,4R,5R)-2-(4-氯-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3-醇(18.0 g, 0.028 mol)於液體NH3 (200 mL)中之攪拌溶液中,將所得反應混合物在60℃下攪拌48 h。在完成反應之後,在減壓下去除液體NH3 。藉由在中性氧化鋁上進行管柱層析純化所獲得之粗製物,用MeOH於CH2 Cl2 中之5%梯度溶析,以得到(2S,3R,4R,5R)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3-醇(12.1 g, 0.019 mol, 產率69%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.40 (s, 3H), 3.75 (dd,J = 11.2, 4.0 Hz, 1H), 3.87 (dd,J = 13.2, 2.4 Hz, 1H), 4.11-4.13 (m, 1H), 4.35 (d,J = 8.4 Hz, 1H), 4.57 (ABq,J = 12.8 Hz, 2H), 4.77 (d,J = 13.2 Hz, 1H), 4.96 (d,J = 13.2 Hz, 1H), 6.25 (s, 1H), 6.36 (s, 1H), 6.50 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 6.96 (s, 2H), 7.27 (d,J = 3.6 Hz, 1H), 7.39-7.47 (m, 3H), 7.56 (d,J = 8.4 Hz, 1H), 7.61 (dd,J = 5.6, 2.0 Hz, 2H), 8.06 (s, 1H);LC-MS: m/z 621.13 (M+H)+(2R,3R,4R,5R)-2-(4- 胺基 -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-5-( 羥基甲基 )-3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3,4- 二醇之合成 . 在-78℃下向(2S,3R,4R,5R)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-4-(2,4-二氯苄基氧基)-5-((2,4-二氯苄基氧基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3-醇(12.0 g, 19 mmol)於CH2 Cl2 (1200 mL)中之攪拌溶液中添加於CH2 Cl2 中之1.0 M BCl3 溶液(193 mL, 19 mmol)。將反應混合物在-78℃下攪拌2 h,隨後在-20℃下攪拌6 h。在完成反應之後,在-30℃下用於CH2 Cl2 (300 mL)中之MeOH (200mL)淬滅反應物並將混合物攪拌30 min。在-20℃下用甲醇NH3 中和反應混合物,並過濾所得沈澱物,並在真空中濃縮濾液。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到(3R,4R,5R)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(羥基甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3,4-二醇(4.0 g, 13.1 mmol, 產率60%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.40 (s, 3H), 3.60-3.62 (m, 1H), 3.75-3.82 (m, 2H), 4.23 (t,J = 7.6 Hz, 1H), 5.07 (br, 1H), 5.44 (d,J = 7.2 Hz, 1H), 5.90 (s, 1H), 6.19 (s, 1H), 6.55 (d,J = 3.6 Hz, 1H), 6.95 (s, 2H), 7.39 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 8.05 (s, 1H);LC-MS: m/z 305.28 (M+H)+((3aR,4R,6R,6aR)-6-(4- 胺基 -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-2,2- 二甲基 -6a-( -1- -1- ) 四氫呋喃并 [ 3,4-d][1,3] 二氧雜環戊烯 -4- ) 甲醇之合成 在室溫下向(3R,4R,5R)-2-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-5-(羥基甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-3,4-二醇(0.95 g, 3.1 mmol)於丙酮中之攪拌溶液中添加p-TsOH.H2 O (0.71 g, 3.7 mmol),隨後2,2-二甲氧基丙烷(7.6 mL, 62.5 mmol)。將所得混合物在室溫下攪拌16 h。用EtOAc稀釋反應混合物並用飽和NaHCO3 水溶液、水及鹽水洗滌有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到((3aR,4R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-6a-(丙-1-炔基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-基)甲醇(0.79 g, 3.0 mmol, 產率73%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.45 (s, 3H), 1.56 (s, 3H), 1.58 (s, 3H), 3.64-3.69 (m, 2H), 4.05 (dd,J = 8.8, 4.4 Hz, 1H), 4.84 (d,J = 4.4 Hz, 1H), 5.21 (t,J = 6.0 Hz, 1H), 6.40 (s, 1H), 6.59 (d,J = 3.2 Hz, 1H), 7.01 (s, 2H), 7.33 (d,J = 3.2 Hz, 1H), 8.06 (s, 1H);LC-MS: m/z 345.29 (M+H)+N-(7-((3aR,4R,6R,6aR)-6-( 羥基甲基 )-2,2- 二甲基 -3a-( -1- -1- ) 四氫呋喃并 [ 3,4-d][1,3] 二氧雜環戊烯 -4- )-7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -4- ) 苯甲醯胺之合成 在室溫下向((3aR,4R,6aR)-6-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2,2-二甲基-6a-(丙-1-炔基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-基)甲醇(0.20 g, 0.58 mmol)於吡啶(2.0 mL)中之攪拌溶液中添加TMSCl (0.23 mL, 1.8 mmol)並將混合物在室溫下攪拌3 h。在使反應混合物冷卻至10℃之後,添加苯甲醯氯(0.08 mL, 0.69 mmol)並將混合物在室溫下攪拌16 h。用EtOAc稀釋反應混合物並用飽和KHSO4 水溶液、水及鹽水洗滌有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。用氨水溶液處理此粗製物質並將混合物在室溫下攪拌4 h。用EtOAc稀釋反應混合物並用水及鹽水洗滌有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到N-(7-((3aR,6R,6aR)-6-(羥基甲基)-2,2-二甲基-3a-(丙-1-炔基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(0.11 g, 0.25 mmol, 產率42%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.46 (s, 3H), 1.57 (s, 3H), 1.59 (s, 3H), 3.68-3.73 (m, 2H), 4.13 (dd,J = 9.6, 5.2 Hz, 1H), 4.89 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 5.21 (t,J = 6.0 Hz, 1H), 6.59 (s, 1H), 6.70 (d,J = 3.6 Hz, 1H), 7.55 (t,J = 7.6 Hz, 2H), 7.65 (t,J = 7.2 Hz, 1H), 7.69 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 8.08 (d,J = 7.6 Hz, 2H), 8.63 (s, 1H), 11.13 (s, 1H);LC-MS: m/z 449.52 (M+H)+N-(7-((2R,3R,4R,5S)-3,4- 二羥基 -5-(((2- 硝基苯基 ) 硒基 ) 甲基 )-3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -2- )-7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -4- ) 苯甲醯胺之合成 在室溫下向N-(7-((3aR,6R,6aR)-6-(羥基甲基)-2,2-二甲基-3a-(丙-1-炔基)四氫呋喃并[3,4-d][1,3]二氧雜環戊烯-4-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(1.60 g, 3.5 mmol)於THF (25 mL)中之攪拌溶液中相繼添加1-硝基-2-硒基氰醯基苯(1.62 g, 7.1 mol)及n-Bu3 P (2.80 mL, 14 mol),並將混合物在室溫下攪拌6 h。在完成反應之後,用EtOAc稀釋反應混合物並用飽和NaHCO3 水溶液、水及鹽水洗滌有機層。將有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。將所獲得之產物溶解於三氟乙酸(18 mL)及水(2 mL)中並將混合物在室溫下攪拌4 h。在完成反應之後,在減壓下蒸發溶劑並藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到N-(7-((3R,4R,5S)-3,4-二羥基-5-((2-硝基苯基硒基)甲基)-3-(丙-1-炔基)四氫呋喃-2-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(2.0 g, 3.38 mmol, 產率95%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.45 (s, 3H), 3.44-3.55 (m, 2H), 4.13-4.17 (m, 1H), 4.26-4.29 (m, 1H), 5.81 (d,J = 6.8 Hz, 1H), 6.10 (s, 1H), 6.37 (s, 1H), 6.70 (d,J = 3.6 Hz, 1H), 7.42 (t,J = 7.2 Hz, 1H), 7.53-7.59 (m, 2H), 7.60-7.66 (m, 3H), 7.81 (d,J = 8.4 Hz, 1H), 8.08 (d,J = 7.6 Hz, 2H), 8.24 (d,J = 8.0 Hz, 1H), 8.61 (s, 1H), 11.3 (s, 1H);LC-MS: m/z 594.45 (M+H)+ N -(7-((3R,4S)-3,4- 二羥基 -5- 亞甲基 -3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -2- )-7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -4- ) 苯甲醯胺之合成 . N -(7-((3R,4R,5S)-3,4-二羥基-5-(((2-硝基苯基)硒基)甲基)-3-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-2-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(1.31 g, 2.21 mmol)於THF (15 mL)中之溶液中添加30%H2 O2 水溶液(1.4 mL, 13.9 mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌1.5 h。向反應混合物中添加Et3 N (1.9 mL, 13.9 mmol)及吡啶(5 mL)。將反應混合物在50℃下攪拌35 h。在濃縮大部分溶劑之後,用EtOAc稀釋殘餘物。用水及鹽水洗滌混合物,經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到N -(7-((3R,4S)-3,4-二羥基-5-亞甲基-3-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-2-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(340 mg, 0.871 mmol, 產率39%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.75 (s, 3H), 4.25 (s, 1H), 4.42 (s, 1H), 4.92 (d,J = 7.6 Hz, 1H), 5.91 (d,J = 7.2 Hz, 1H), 6.31 (s, 1H), 6.59 (s, 1H), 6.74 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 7.54-7.57 (m, 3H), 7.65 (t,J = 7.2 Hz, 1H), 8.08 (d,J = 7.2 Hz, 2H), 8.65 (s, 1H), 11.16 (s, 1H);LC-MS: m/z 391.1 (M+H)+ N -(7-((3R,4S,5R)-5- -3,4- 二羥基 -5-( 碘甲基 )-3-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -2- )-7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -4- ) 苯甲醯胺之合成 . 在0℃下向N -(7-((3R,4S)-3,4-二羥基-5-亞甲基-3-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-2-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(359 mg, 0.92 mmol)於CH3 CN (4 mL)中之懸浮液中緩慢相繼添加三乙胺三氫氟化物(0.15 mL, 0.92 mmol)及N -碘琥珀醯亞胺(259 mg, 1.15 mmol)於CH3 CN (4 mL)中之溶液。將反應混合物在0℃下攪拌45 min且在室溫下攪拌40 min。在0℃下添加額外三乙胺三氫氟化物(0.05 mL, 0.31 mmol)及N -碘琥珀醯亞胺(100 mg, 0.39 mmol)於CH3 CN (1 mL)中之溶液,並將混合物在0℃下攪拌20 min且在室溫下攪拌30 min。將反應混合物倒入NaHCO3 及Na2 S2 O3 之水溶液中。藉由過濾收集所得沈澱物並用EtOAc及水洗滌,並乾燥以獲得期望產物。使用EtOAc萃取濾液。用水及鹽水洗滌有機萃取物,經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮。用EtOAc-環己烷研磨殘餘物並藉由過濾收集固體,以得到額外產物。濃縮濾液且藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,得到額外產物。合併所獲得產物,以得到N -(7-((3R,4S,5R)-5-氟-3,4-二羥基-5-(碘甲基)-3-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-2-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(434 mg, 0.809 mmol, 產率88%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.43 (s, 3H), 3.63 (dd,J = 11.6, 4.0 Hz, 1H), 3.79 (dd,J = 26.8, 11.6 Hz, 1H), 4.72 (dd,J = 18.4, 9.2 Hz, 1H), 6.01 (d,J = 8.8 Hz, 1H), 6.25 (s, 1H), 6.61 (s, 1H), 6.73 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 7.55 (t,J = 7.2 Hz, 1H), 7.62-7.67 (m, 2H), 8.07 (d,J = 7.2 Hz, 2H), 8.65 (s, 1H), 11.16 (s, 1H);LC-MS: m/z 537.1 (M+H)+(2R,3S,4R)- 二苯甲酸 5-(4-(N - 苯甲醯基苯甲醯胺基 )-7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-2- -2-( 碘甲基 )-4-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3,4- 二基酯之合成 . 在0℃下向N -(7-((3R,4S,5R)-5-氟-3,4-二羥基-5-(碘甲基)-3-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-2-基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-4-基)苯甲醯胺(434 mg, 0.809 mmol)於吡啶(4 mL)中之溶液中添加苯甲醯氯(0.94 mL, 8.09 mmol)。將反應混合物在0℃下攪拌5 min且在室溫下攪拌10 h。在用EtOAc稀釋之後,用KHSO4 (×2)、飽和NaHCO3 水溶液(×2)、水及鹽水洗滌混合物,經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮 藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到(2R,3S,4R)-二苯甲酸5-(4-(N -苯甲醯基苯甲醯胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(碘甲基)-4-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3,4-二基酯(725 mg, 0.854 mmol, 產率100%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.38 (s, 3H), 3.89-3.94 (m, 2H), 6.62 (d,J = 4.0 Hz, 1H), 6.77 (d,J = 16.0 Hz, 1H), 7.22 (s, 1H), 7.46-7.64 (m, 9H), 7.70-7.75 (m, 2H), 7.82-7.86 (m, 4H), 7.92-7.95 (m, 2H), 8.00-8.04 (t,J = 7.6 Hz, 4H), 8.69 (s, 1H);LC-MS: m/z 849.5 (M+H)+(2S,3S,4R,5R)- 二苯甲酸 5-(4- 苯甲醯胺基 -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-2-(( 苯甲醯基氧基 ) 甲基 )-2- -4-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3,4- 二基酯之合成 . 向(2R,3S,4R,5R)-二苯甲酸5-(4-(N -苯甲醯基苯甲醯胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(碘甲基)-4-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3,4-二基酯(725 mg, 0.854 mmol)於DMSO (8 mL)中之溶液中添加苯甲酸鈉(1.23 g, 8.54 mmol)及15-冠-5 (1.7 mL, 8.54 mmol)。將反應混合物在100℃下攪拌22 h。添加額外苯甲酸鈉(0.6 g, 4.16 mmol)及15-冠-5 (0.7 mL, 3.53 mmol)。在100℃下攪拌22 h之後,添加額外苯甲酸鈉(0.6 g, 4.16 mmol)及15-冠-5 (0.7 mL, 3.53 mmol)。在100℃下攪拌7 h之後,用EtOAc稀釋混合物,藉助矽藻土墊過濾。用飽和NaHCO3 水溶液(×2)及水洗滌濾液,並經Na2 SO4 乾燥,過濾,並在真空中濃縮。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到(2S,3S,4R)-二苯甲酸5-(4-苯甲醯胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2-((苯甲醯基氧基)甲基)-2-氟-4-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3,4-二基酯(541 mg, 0.498 mmol, 產率58%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.46 (s, 3H), 4.90 (t,J = 11.6 Hz, 1H), 5.02 (dd,J = 18.0, 12.0 Hz, 1H), 5.75 (s, 1H), 6.79 (d,J = 3.2 Hz, 1H), 6.97 (d,J = 15.2 Hz, 1H), 7.32-7.37 (m, 3H), 7.52-7.78 (m, 10H), 7.89 (d,J = 7.6 Hz, 2H), 8.00 (d,J = 8.0 Hz, 2H), 8.05 (d,J = 7.2 Hz, 2H), 8.10 (d,J = 7.2 Hz, 2H), 8.68 (s, 1H), 11.25 (s, 1H);LC-MS: m/z 739.4 (M+H)+(2S,3S,4R,5R)-5-(4- 胺基 -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-2- -2-( 羥基甲基 )-4-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -3,4- 二醇 ( 實例 1) 之合成 . 將(2S,3S,4R,5R)-二苯甲酸5-(4-苯甲醯胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2-((苯甲醯基氧基)甲基)-2-氟-4-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3,4-二基酯(541 mg, 0.732 mmol)溶解於存於乙醇中之33%甲胺溶液中。在將所得混合物在室溫下攪拌16 h之後,在真空中濃縮大部分溶劑。藉由矽膠管柱層析純化殘餘物,以得到(2S,3S,4R)-5-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羥基甲基)-4-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3,4-二醇(183 mg, 0.568 mmol, 產率78%)。1 H NMR (DMSO-d6 , 400 MHz) δ 1.39 (s, 3H), 3.56-3.62 (m, 2H), 4.51 (dd,J = 19.3, 6.8 Hz, 1H), 5.62 (t,J = 5.6 Hz, 1H), 5.69 (d,J = 7.9 Hz, 1H), 6.10 (s, 1H), 6.52 (s, 1H), 6.60 (d,J = 3.6 Hz, 1H), 7.02 (s, 2H), 7.26 (d,J = 3.8 Hz, 1H), 8.09 (s, 1H);19 F NMR (DMSO-d6 , 376 MHz) δ -119.96;LC-MS: m/z 323.3 (M+H)+實例 2. ((2S,3S,4R,5R)- (((1- 異丙氧基羰基 ) 氧基 ) 甲基 ) 磷酸 5-(4- 胺基 -7H- 吡咯并 [ 2,3-d] 嘧啶 -7- )-2- -3,4- 二羥基 -4-( -1- -1- ) 四氫呋喃 -2- ) 甲基酯 ( 實例 2) 之合成 . 在閃爍小瓶中,將起始膦酸(200 mg, 0.61 mmol, (二碳酸(羥基磷醯基)雙(氧基))雙(亞甲基)二異丙基酯)及實例1之核苷(64 mg, 0.20 mmol, (2S,3S,4R,5R)-5-(4-胺基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-7-基)-2-氟-2-(羥基甲基)-4-(丙-1-炔-1-基)四氫呋喃-3,4-二醇)懸浮於吡啶(2 mL)中。添加1-甲基咪唑(247 mg, 3.0 mmol)並將混合物超音處理30秒。然後藉由旋轉蒸發20分鐘將混合物蒸發成殘餘物。然後將殘餘物再懸浮於CH3 CN (2 mL)中並超音處理30秒。將反應裝配有攪拌棒並開始攪拌。然後以固體添加BOP-Cl (280 mg, 1.1 mmol, 雙(2-側氧基噁唑啶-3-基)次磷醯氯)並將反應在室溫下攪拌3 h。藉由LC/MS監測反應。當認為反應完成時,添加水(1 mL)以淬滅。將反應攪拌10分鐘且然後冷凍並凍乾至乾燥。藉由製備型HPLC純化殘餘物,以得到期望產物(60 mg, 0.076 mmol, 產率38%)。1 H NMR (CD3 OD, 400 MHz) δ 1.28 (d,J = 12 Hz, 12H), 1.47 (s, 3H), 4.34-4.42 (m, 2H), 4.66 (d,J = 16 Hz, 1H), 4.86-4.93 (m, 2H), 5.62-5.69 (m, 4H), 6.63 (s, 1H), 6.95 (d,J = 4 Hz, 1H), 7.47 (d,J = 4 Hz, 1H), 8.31 (s, 1H);31 P NMR (CD3 OD, 162 MHz) δ -5.22;LC-MS: m/z 635.2 (M+H)+實例 3. 在室溫下向於P(=O)(OMe)3 (0.3 mL)中之實例1之化合物(9 mg, 0.028 mmol)中添加POCl3 (0.031 mL, 0.335 mmol),並將混合物攪拌2 min。添加Proton Sponge® (1,8-雙(二甲基胺基)萘:20.95 mg, 0.098 mmol)並將反應在室溫下攪拌30min (第一批)或2hr (第二批),然後藉由添加於1ml DMF中之焦磷酸酯(250 mg, 0.456 mmol)及Bu3 N (0.106 mL, 0.447 mmol)之混合物淬滅。將反應攪拌15min。在完成三磷酸酯轉化之後,將粗製反應混合物添加至0.2N三乙基碳酸氫銨(TEAB)緩衝液(20ml)中並攪拌10min,然後凍乾成半固體並如下文所闡述進行純化。以相同規模重複反應,併合併兩批批料用於純化。純化: 藉由PREP離子交換層析使用三磷酸酯純化梯度(PREP離子交換層析,流速為8ml/min)純化合併之粗製三磷酸酯:自100%水開始,在30min內0%至80% TEA碳酸氫鹽緩衝液(0.5 N)/水之梯度,隨後80% TEA碳酸氫鹽緩衝液(0.5 N)/水保持5min,然後100%水保持5min。期望之三磷酸酯在27 min溶析為寬峰(3次注入)。將期望之產物流份凍乾,然後將其溶解於水中用於藉由C18管柱(PREP C18反相層析,流速為20ml/min)使用如下梯度進行另一純化:自100% TEA碳酸氫鹽緩衝液(0.2 N)開始,隨後在20min內0%至30%之乙腈/TEA碳酸氫鹽緩衝液(0.2 N)之梯度。期望之產物在約11 min溶析。由於自第二C18純化獲得之產物含有似乎二磷酸酯及過磷酸化雜質,故藉由第三PREP離子交換層析、隨後第四上述C18管柱純化對其再進行純化,以得到001 (實例3:8.7 mg, 9.85 μmol, 15.79%產率)。1 H NMR (400 MHz, 氧化氘)1 H NMR (400 MHz, 氧化氘) δ 8.14 (s, 1H), 7.42 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 6.68 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 6.60 (s, 1H), 4.75 (d, J = 1.4 Hz, 1H), 4.30 (ddd, J = 11.4, 6.2, 2.7 Hz, 1H), 4.24 - 4.14 (m, 1H), 3.13 (q, J = 7.3 Hz, 18H), 1.29 (s, 3H), 1.21 (t, J = 7.3 Hz,29H)。31P:-9.42、-9.55、-12.07、-12.19、-22.78、-22.90、-23.02 基於1 H NMR,鹽中核苷三磷酸對Et3 N之比率為1/3.0。式量為865.801。生物分析及數據 可藉由業內已知之方法評價本發明化合物之活性;使用以下方法產生下表中之數據。HRV 細胞病變效應 (CPE) 分析 . 在半對數步驟中在DMSO中自5 mM開始連續稀釋化合物。在每次稀釋中,將0.5 µL轉移至分析板。將H1-HeLa細胞在補充有0.1% BSA (Gibco, 15260)、1× 青黴素/鏈黴素(penicillin/streptomycin)溶液(CellGro/Mediatech, Manassas, VA;30-002-CI)及1× 非必需胺基酸(CellGro;25-025-CI)之45 µL DMEM中以5000個細胞/孔添加至備好分析之化合物板中至一式三份384孔板中並在33℃下培育6小時。對照孔包括單獨DMSO (100%抑制)及DMSO加病毒(0%抑制)。在33℃下培育6 h後,在72小時內添加5 µL在有效殺死99%細胞之MOI下之人類鼻病毒原液。然後將板在33℃下培育72 h。使用CellTiter-Glo® Luminescent Cell Viability Assay (Promega, G7573)根據製造商之方案及POLARstar Omega光度計(BMG Labtech)測定細胞存活率。HRV 複製子分析 . 此分析係基於先前所闡述之C組複製子(Mello等人,Antimicrobial Agents and Chemotherapy , 2014),其中進行如下修飾:用編碼奈米螢光素酶(Nanoluciferase)之cDNA (Promeg Corporation, Madiso, WI)替代P1區。在半對數步驟中在DMSO中自5 mM開始連續稀釋化合物。在每次稀釋中,將0.5 µL轉移至分析板。將H1-HeLa細胞胰蛋白酶化,用冰冷OptiMem® Gibco, 31985)洗滌兩次,以1.5× 107 個細胞/ml在懸浮於OptiMem®中,並在冰上儲存。用25ng活體外轉錄之RNA對總共6× 106 個細胞實施電穿孔(270 V, 950µF, 無窮大電阻)並容許在冰上靜置10 min。然後在補充有0.1% BSA (Gibco, 15260)、1× 青黴素/鏈黴素溶液(CellGro/Mediatech, Manassas, VA;30-002-CI)之DMEM中將經電穿孔之細胞稀釋至最終濃度4× 105 個細胞/ml。然後將50µl細胞添加至化合物中,然後在33℃下培育72 h。然後在48 h後使用NanoGlo®檢測套組分析(Promega, N1150)根據製造商之方案及POLARstar Omega光度計(BMG Labtech)量測螢光素酶信號。MT4 PC3 細胞毒性分析 . 在半對數步驟中在DMSO中自10mM開始連續稀釋化合物。將0.5 µL連續稀釋化合物轉移至分析板(Greiner目錄號781080)。在50µL補充有10% FBS (NCS Lot OS-161071)、1× 青黴素/鏈黴素溶液(CellGro/Mediatech, Manassas, VA;30-002-CI)之RPMI 1640培養基中將細胞添加至備好分析之化合物板中,並在37℃下培育3天或5天。對照孔包括單獨DMSO (100%抑制)。使用CellTiter-Glo® Luminescent Cell Viability Assay (Promega, G7573)根據製造商之方案及POLARstar Omega光度計(BMG Labtech)測定細胞存活率。人類 DNA 聚合酶 γ 分析 . 自Clark等人(Discovery of beta-D-20-deoxy-20-a-fluoro-40-a-cyano-5-aza-7,9-dideaza adenosine as a potent nucleoside inhibitor of respiratory syncytial virus with excellent selectivity over mitochondrial RNA and DNA polymerases. BMCL, 25: 2484-2487)改編人類DNA聚合酶γ單一核苷酸納入分析。短暫地,將200 nM重組體人類DNA聚合酶γ(大亞單位;POLG)及400 nM重組體人類DNA聚合酶輔助亞單位(POLG2)在冰上預培育2 min。藉由在室溫(RT)下在分析緩衝液(50mM Tris/HCl, pH 8, 10mM MgCl2 , 50mM NaCl, 1mM DTT)中添加150 nM退火DNA引子/DNA模板雙鏈體並保持1.5 min而形成具有RNA之延伸複合物,隨後與100 µM核苷三磷酸受質或抑制劑快速混合。自大腸桿菌(E. coli )純化重組體POLG (aa 30-1239)及POLG2 (aa 26-485)蛋白質並將其分別於5 mM Tris pH7.5、250 mM NaCl、10 %甘油、0.005 % NP40及POLG2 (aa 26-485)及50 mM Tris pH7.5、150 mM NaCl、1 mM TCEP、0.005 % NP40、10%甘油下儲存。添加至任一反應之POLRMT之體積總小於或等於總體積之十分之一。引子-模板由5’-FAM標記之18-mer DNA寡核苷酸引子(5’-TTTTGTCTTTGTACTAGGAGGC-3’)組成,其退火成適當34-mer DNA模板以容許單一添加A、C、G或U去氧-或核糖核苷酸(Clark等人2012)。在RT下使反應繼續進行1 min並藉由添加EDTA (50 mM)淬滅。藉由變性PAGE使產物與受質分離。將等體積之裝載緩衝液(95%甲醯胺、18 mM EDTA及0.025% SDS、二甲苯靛藍及溴酚藍;Ambion, USA)添加至經淬滅反應混合物中並將其加熱至65℃並保持5 min,之後將其裝載於含有1 × TBE (89 mM Tris鹼,89 mM硼酸,2 mM EDTA)及7 M尿素之變性20%聚丙烯醯胺凝膠上。在1× TBE緩衝液中在600 V下實施電泳。用Typhoon Imager在螢光檢測模式下可視化凝膠並用Image QuantTM TL軟體(GE Healthcare, Piscataway, NJ)定量。DNA寡核苷酸係自Sigma Aldrich, USA訂購的。人類粒線體 RNA 聚合酶分析 . 自Arnold等人(Sensitivity of mitochondrial transcription and resistance of RNA polymerase II dependent nuclear transcription to antiviral ribonucleosides. PloS Pathogen 8(11):e1003030.)改編人類粒線體RNA聚合酶(POLRMT)單一核苷酸納入分析。短暫地,藉由在室溫(RT)下將500 nM POLRMT與250 nM退火DNA模板/ RNA引子雙鏈體在分析緩衝液(25 mM Tris-HCl (pH 8)、50 mM KCl、10 mM MgCl2 、1 mM二硫蘇糖醇、0.2 U/µL RNasin)一起培育1.5 min而形成延伸複合物,隨後與500 µM核苷三磷酸受質或抑制劑快速混合。將經純化全長POLRMT (Enzymax, USA)儲存於10 mM Tris-HCl (pH 8.0)、1 mM DTT、100 mM NaCl及20 %甘油中。添加至任一反應之POLRMT之體積總小於或等於總體積之十分之一。引子-模板由8-mer RNA寡核苷酸引子(5’-UUUUGCCGCGCC-3’)組成,其退火成適當18-mer DNA模板之5’-FAM標記以容許單一添加A、C、G或U核糖核苷酸(Arnold等人2012)。在RT下使反應繼續進行5 min且藉由添加EDTA (50 mM)淬滅。藉由變性PAGE使產物與受質分離。將等體積之裝載緩衝液(95%甲醯胺、18 mM EDTA及0.025% SDS、二甲苯靛藍及溴酚藍;Ambion, USA)添加至經淬滅反應混合物中並將其加熱至65℃並保持5 min,之後將其裝載於含有1 × TBE (89 mM Tris鹼,89 mM硼酸,2 mM EDTA)及7 M尿素之變性23%聚丙烯醯胺凝膠上。在1× TBE緩衝液中在600 V下實施電泳。用Typhoon Imager在螢光檢測模式下可視化凝膠且用Image Quant TL軟體(GE Healthcare, Piscataway, NJ)定量。DNA及RNA寡核苷酸係自Sigma Aldrich, USA訂購的。針對 HTS DENV 聚合酶從頭起始及延伸分析1) 從頭的基於螢光之鹼性磷酸酶偶合之聚合酶分析 ( 從頭 FAPA) :短暫地,在20 μL最終體積中如下依序實施分析:將溶解於90% DMSO及10%水中之0.25 uL化合物衝壓至384孔高基礎培養基結合性黑板中,對照孔僅接受DMSO/水混合物。將於酶分析緩衝液中之5 μL 200 nM DENV4 RdRp蛋白原液分配至分析板並在25℃下在濕度受控型培育器中預培育15分鐘。為起始酶反應,將5 μL 200 nM DENV4 IVT RNA受質及40 μM GTP、ATP、UTP及10 μM Atto-CTP受質添加至所有孔中,在該點將各板在濕度受控型培育器中在25℃下培育2小時。在酶分析緩衝液中以類似方式製備RNA及NTP受質混合物。最終反應條件含有100 nM酶、100 nM RNA、20 μM NTP及5 μM ATTO-CTP。中性對照(高活性對照)由100 nM酶、100 nM RNA、20 μM NTP及5 μM ATTO-CTP組成。活性對照(低活性基線對照)由1×分析緩衝液、100 nM RNA、20 μM NTP及5 μM ATTO-CTP組成。為結束反應,將含有20 nM CIP (牛小腸磷酸酶)之10 μL終止溶液分配至所有孔中並在25℃下將各板培育1小時。在具有額外20 mM MgCl2 及160 mM NaCl之AttoPhos®緩衝液(2.4 M DEA pH 10, 0.057 mM MgCl2 及0.85 mM NaN3 )中製備用於稀釋CIP之終止溶液並將其儲存在4℃下。使用Tecan Infinite® M6讀取器,使用420 nm之激發波長及560 nm之發射波長及255之增益、閃爍次數:50進行螢光信號讀出。HepG2 K562 中之細胞毒性 (CC50 分析 ) 用於90%DMSO/10%水中之0.5ul化合物衝壓白色TC級Greiner 384孔分析板。將HepG2細胞胰蛋白酶化並收集至50ml falcon管中。在50ml falcon管中收集K562懸浮液細胞。將含有細胞之兩個管在臺式離心機中以1200rpm旋轉5min。棄去上清液並將細胞糰粒再懸浮於新鮮培養基(HepG2:DMEM:F12混合物+ 10%FBS+ 1% Pen/Strep及K562:IMDM + 10% FBS + 1% Pen-Strep)中。使用血球計數器對細胞進行計數並在工作懸浮液中以對於HepG2而言50,000個細胞/ml及對於K562而言20,000個細胞/ml稀釋細胞。將50ul細胞懸浮液添加至384分析板之每一孔中。在37℃、5% CO2 、90%濕度培育器中將分析板培育72小時。然後用25ul Promega之Cell -Titer Glo®試劑處理分析板,並在室溫下培育10min。在PolarStar-Omega上使用發光設置及3300之增益讀取板。 使用上述分析,本發明之化合物展現如下表中所匯總之抗病毒效能。使用此4’-疊氮基-胞苷作為對照:實例 2 之化合物之活性及細胞毒性 . 實例 1 之衍生物之活性 . 上述數據證實式(I)之核苷提供有效對抗各種HRV血清型以及其他病毒之活性,同時對哺乳動物細胞(如所量測藉由常用細胞毒性模型(MT4、PC-3等))展現低毒性可能性、低粒線體毒性可能性(如藉由人類粒線體聚合酶納入分析(DNA聚合酶γ及RNA聚合酶)所量測)及低細胞培養粒線體毒性(基於Cox/SDH比率分析)。

Claims (17)

  1. 一種式(I)化合物,其中: R1 係H、Me、Et、iPr或環丙基; R2 係H、磷酸酯基、二磷酸酯基、三磷酸酯基、-P(=X)(OR4 )2 、-P(=X)(OR4 )(NR5 R6 )或-P(=X)(NR5 R6 )2 ,且R3 係H或-C(O)R; 或R3 及R2 一起形成-P(=X)(OR4 )-或-P(=X)(NR5 R6 )-; X在每次出現時獨立地係O或S; R4 係選自H、視情況經一或兩個選自清單A之基團取代之苯基,及視情況經一或兩個選自鹵基、-OR、-OC(O)R、-OC(O)-OR、--NR2 、-C(O)R、COOR及-C(O)NR2 之基團取代之C1 -C4 烷基; 每一R5 獨立地係H、-C(O)R、COOR,或視情況經OH、胺基或COOR取代之C1 -C4 烷基; 每一R6 獨立地選自H、視情況經一或兩個選自清單A之基團取代之苯基,及視情況經一或兩個選自清單B之基團取代之C1 -C4 烷基; 每一R獨立地係H或視情況經一至三個選自以下之基團取代之C1 -C4 烷基:鹵基、羥基、CN、胺基、C1 -C3 烷氧基、-C(O)R7 、-OC(O)R7 、-C(O)-OR7 或-OC(O)-OR7 ; R7 係選自H,視情況經一至三個選自鹵基、羥基、CN、胺基及C1 -C3 烷氧基之基團取代之C1 -C4 烷基,或視情況經一或兩個選自清單A之基團取代之苯基; 清單A係鹵基、羥基、-NO2 、CN、-OR8 、-OC(O)R8 、-OC(O)-OR8 、-N(R8 )2 、-C(O)R8 、COOR8 、-C(O)N(R8 )2 ,及視情況經一至三個選自以下之基團取代之C1 -C3 烷基:鹵基、羥基、CN、胺基及C1 -C3 烷氧基; 清單B係鹵基、羥基、側氧基(oxo)、CN、-OR8 、-OC(O)R8 、-OC(O)-OR8 、-N(R8 )2 、-C(O)R8 、COOR8 及-C(O)N(R8 )2 ;且 R8 在每次出現時獨立地選自H及視情況經一至三個選自以下之基團取代之C1 -C4 烷基:鹵基、羥基、CN、胺基及C1 -C3 烷氧基, 且連接至同一氮原子之兩個R8 可視情況環化以形成3至7員雜環,該雜環視情況含有另一N、O或S作為環成員,且可經一或兩個選自側氧基、鹵基、-OH、胺基、C1 -C3 烷基、C1 -C3 烷氧基及C1 -C3 鹵烷基之基團取代; 或其醫藥上可接受之鹽。
  2. 如請求項1之化合物,其中R1 係甲基。
  3. 如請求項1或請求項2之化合物,其中R2 係H。
  4. 如請求項1或2之化合物,其中R2 係磷酸酯基、二磷酸酯基或三磷酸酯基,或其醫藥上可接受之鹽。
  5. 如請求項1或請求項2之化合物,其中R2 係-P(=X)(OR4 )2 , 或其醫藥上可接受之鹽。
  6. 如請求項5之化合物,其中每一R4 係選自-CH2 -O-C(O)-R及-CH2 -O-C(O)-OR,其中每一R獨立地係C1 -C4 烷基, 或其醫藥上可接受之鹽。
  7. 如請求項1或2之化合物,其中R3 及R2 一起形成-P(=O)(OR4 )-或-P(=O)-(NR5 R6 )-,或其醫藥上可接受之鹽。
  8. 如請求項1或請求項2之化合物,其中R3 係H。
  9. 如請求項1之化合物,其係:其中R2 係H、磷酸酯基、二磷酸酯基或三磷酸酯基; 或其醫藥上可接受之鹽。
  10. 如請求項1或2之化合物,其具有下式:,或其醫藥上可接受之鹽。
  11. 如請求項1之化合物,其具有下式:,或其醫藥上可接受之鹽。
  12. 如請求項1之化合物,其係選自: 或其醫藥上可接受之鹽。
  13. 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至12中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽及一或多種醫藥上可接受之載劑。
  14. 一種組合,其包含治療有效量之如請求項1至12中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽及一或多種治療活性助劑。
  15. 一種如請求項1至12中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其用於製造用以治療HRV感染或屈公病感染(chikungunya infection)之藥劑。
  16. 2、9、11及12中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其用作藥劑。
  17. 2、9、11及12中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽,其用於治療人類鼻病毒感染。
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