SK76896A3 - A novel tumor suppressor gene - Google Patents
A novel tumor suppressor gene Download PDFInfo
- Publication number
- SK76896A3 SK76896A3 SK768-96A SK76896A SK76896A3 SK 76896 A3 SK76896 A3 SK 76896A3 SK 76896 A SK76896 A SK 76896A SK 76896 A3 SK76896 A3 SK 76896A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- protein
- nuc
- leu
- ser
- cells
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4736—Retinoblastoma protein
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Oblasť technikyTechnical field
Tento vynález sa týka tumor-supresorových génov (anti-onkogénov) a obecne metód a produktov pre praktické širokospektrálne použitie v tumor-supresorovej terapii ľudskej rakoviny. Obzvlášť sa vynález týka metód liečby nádorových buniek, ktoré spočívajú 1) v podávaní vektorov obsahujúcich nukleotidovú sekvenciu kódujúcu nový protein označený tu ako H-NUC alebo 2) v podávaní účinného množstva proteínu kódovaného touto nukleotidovou sekvenciou.The present invention relates to tumor suppressor genes (anti-oncogenes) and, in general, to methods and products for practical broad-spectrum use in tumor suppressor therapy of human cancer. In particular, the invention relates to methods of treating cancer cells comprising 1) administering vectors comprising a nucleotide sequence encoding a novel protein designated herein as H-NUC; or 2) administering an effective amount of a protein encoded by said nucleotide sequence.
Rakovina je v poradí druhá najčastejšia príčina smrti v USA, ročne jej podľahne 450 000 ľudí. U jedného z troch Američanov sa vyvinie rakovina a každý piaty na jej následky zomiera (Scientific Američan Medicíne, 12,1,1, 1987). Zatiaľčo v identifikácii vonkajších a genetických príčin spôsobujúcich rakovinu sa dosiahlo značného pokroku, štatistické údaje o úmrtnosti na rakovinu naznačujú nevyhnutnú potrebu zlepšenia terapií týkajúcich sa rakoviny a príbuzných chorôb a porúch.Cancer is the second leading cause of death in the US, with 450,000 people succumbing to it each year. One in three Americans develops cancer and one in five dies (Scientific American Medicine, 12,1,1, 1987). While considerable progress has been made in identifying the external and genetic causes of cancer, statistics on cancer mortality indicate an urgent need to improve therapies related to cancer and related diseases and disorders.
Rad takzvaných rakovinových génov, t.j. génov, ktoré sa spolupodieľajú na vzniku rakoviny, sa identifikoval pri štúdiu dedičných foriem rakoviny a tumorových buniek. Štúdium rakovinových buniek poskytuje poznanie mechanizmu tumorogenézie. Zatiaľčo ešte mnoho informácií o rakovinových génoch zostáva nepoznaných, v súčasnosti známe rakovinové gény slúžia ako užitočný model pre pochopenie tumorogenézie.A series of so-called cancer genes, i. genes that contribute to cancer have been identified in the study of hereditary forms of cancer and tumor cells. The study of cancer cells provides an understanding of the mechanism of tumorigenesis. While much information about cancer genes remains unknown, the currently known cancer genes serve as a useful model for understanding tumorigenesis.
Rakovinové gény sa všeobecne rozdeľujú na „onkogény“, které v prípade aktivácie navodzujú tumorogenéziu, a „tumor-supresorové gény“, ktoré v prípade svojho poškodenia zlyhávajú v procese supresie tumorogenézie. Je tiež možné, že určité gény môžu hrať rôzne úlohy v závislosti na svojich alelických formách, na regulačných elementoch, genetickom pozadí a na mieste svojho vyjadrenia.Cancer genes are generally divided into "oncogenes" which, upon activation, induce tumorogenesis, and "tumor suppressor genes", which fail to suppress tumorogenesis if damaged. It is also possible that certain genes may play different roles depending on their allelic forms, regulatory elements, genetic background, and location of expression.
Jedna z obecne známych pracovných hypotéz o vzniku rakoviny je táto: 1) Vačšina typov ľudskej rakoviny sú genetické choroby a 2) vyplývajú z expresie a/alebo neschopnosti expresie. špecifických génov (t.j mutantných verzii normálnych rastových regulačných génov alebo vírusových či iných cudzorodých génov v cicavčích bunkách, ktoié spôsobujú nenormálnu, nesprávne načasovanú alebo ektopickú expresiu ďalších tried rastových regulačných génovOne of the commonly known working hypotheses about cancer development is as follows: 1) Most types of human cancer are genetic diseases and 2) result from expression and / or inability to express. specific genes (i.e., mutant versions of normal growth regulatory genes or viral or other foreign genes in mammalian cells that cause abnormal, incorrect timed, or ectopic expression of other classes of growth regulatory genes
ΊΊ
Zjednodušený pohľad na biologický základ pre vznik novotvaru je, že existujú dve základné triedy onkogénov. Prvá trieda obsahuje mutantné alebo inak aberované alely normálnych rastových regulačných génov, ktoré sa zúčastňujú kontroly bunkového rastu alebo replikácie. Tieto gény sú bunkové protoonkogény. Pokiaľ sú mutované, môžu kódovať nové bunkové funkcie, ktoré narušujú normálny bunkový rast a replikáciu. Následkom týchto zmien je produkcia dominantne sa prejavujúceho tumorového fenotypu. V tomto modeli, ktorý prevažuje od doby vyslovenia názoru, že novotvary vznikajú na základe genetických a mutačných zmien, sa naznačuje, že existencia jedinej alely divokého (normálneho) typu nie je dostačujúca k zabráneniu nádorových zmien vo vývojovom programe alebo rastových vlastnostiach bunky. Na genetické udalosti zodpovedné za aktiváciu týchto onkogénov sa preto môže nahliadať ako na Jednozásahové“. Dôkazom pre zapojenie takýchto transformujúcich onkogénov v klinických prípadoch ľudskej rakoviny sú príklady aktivácie tumorogénových aktivít mye onkogénu u Burkittovho lymfómu, expresia bcr-abl chimerického génového produktu u pacientov s chronickou myelogénnou leukémiou, aktivácia H-ras a K-ras onkogénov v ďalších typoch tumorov. Geneticky založená liečba týchto typov rakovin by vyžadovala špecifické zničenie alebo inaktiváciu expresie príslušných zodpovedných génov.A simplified view of the biological basis for neoplasm formation is that there are two basic classes of oncogenes. The first class contains mutant or otherwise aberrant alleles of normal growth regulatory genes involved in cell growth or replication control. These genes are cellular proto-oncogenes. When mutated, they can encode new cellular functions that disrupt normal cell growth and replication. These changes result in the production of a dominant tumor phenotype. In this model, which has prevailed since it was thought that neoplasms are due to genetic and mutational changes, it is suggested that the existence of a single wild-type allele is not sufficient to prevent tumor changes in the developmental program or cell growth characteristics. The genetic events responsible for the activation of these oncogenes can therefore be regarded as single-intervention '. Evidence for the involvement of such transforming oncogenes in clinical cases of human cancer are examples of activation of mycogenic oncogenic tumor activities in Burkitt's lymphoma, expression of the bcr-abl chimeric gene product in patients with chronic myelogenous leukemia, activation of H-ras and K-ras oncogenes. Genetically based treatment of these types of cancers would require specific destruction or inactivation of the expression of the respective responsible genes.
Doterajší stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Nedávno objavená skupina génov rodiny rakovinových génov sú takzvané tumorsupresorové gény, niekedy označované ako anti-onkogény, rastové supresory alebo supresory rakovinových génov. Nedávne štúdie naznačujú, že mutácie, ktoré majú za následok stratu funkcie génov tejto triedy, sa pravdepodobne tiež zúčastňujú vo vysokom percente na vzniku ľudskej rakoviny. Ako príklad boli identifikované a klonované tumorsupresorové gény ktoré sa podieľajú na patogenézii retinoblastómu (rb), karcinómu prsníka, čreva (p53), Wilmsovho tumoru (wt) a karcinómu čreva (dcc) Niektoré aspekty ich účinku v tumorogenézii už boli objasnené.The recently discovered group of genes of the cancer gene family are the so-called tumor suppressor genes, sometimes referred to as anti-oncogenes, growth suppressors or cancer gene suppressors. Recent studies suggest that mutations that result in loss of function of genes of this class are also likely to be involved in a high percentage of human cancer. By way of example, tumorsuppressor genes that are involved in the pathogenesis of retinoblastoma (rb), breast, colon (p53), Wilms' tumor (wt), and colon carcinoma (dcc) have been identified and cloned. Some aspects of their effect in tumorigenesis have already been elucidated.
Gén zodpovedný za vznik retinoblastómu (RB) je prototyp tumor-supresoru.The gene responsible for the formation of retinoblastoma (RB) is a prototype tumor suppressor.
Mutácia tohto génu sa našla u najrôznejších typov ľudských tumorov (Bookstein a Lee,A mutation of this gene has been found in a variety of human tumor types (Bookstein and Lee,
Crit. Rev. Oncog., 2:211-227 (1991); Goodrích a lee, Biochim. Biophys. Acta., 1155: 433 (1993); Riley a kol., Annu. Rev. Celí Biol., 10: 1-29 (1994)). Znovuzavedenie jednej kópie normálneho Rb génu do myších tumorových buniek suprimuje ich schopnosť vyvinúť sa v tumory (Huang a kol., Science, 242: 1563-1566 (1988); Sumegi a kol., Celí Growth Differ., 1:247-250, (1990); Bookstein a kol., Science, 247:712-715 (1990); Chen a kol., Celí Growth Differ., 3:119-125 (1992); Goodrich a kol., Can. Res., 52:1968-1973 (1992); Takahashi a kol., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88:5257-5261 (1991) ). Mikroinjekcie nefosforylovaného Rb proteínu do buniek v skorej G1 fázi bunkového cyklu blokuje ich vstup do S fáze, čo naznačuje jeho priamu účasť v regulačných procesoch bunkového rastu (Goodrich a kol., Celí, 67:293-302 (1991). Tieto výsledky sú podporené pozorovaním u bunkových línií transgénnych myší. Nadprodukcia Rb proteínu z ľudského RB génu má za následok rastovú retardáciu na úrovni organizmu (Bignon a kol., Genes Dev , 7: 16541662 (1993).Crit. Rev. Oncog., 2: 211-227 (1991); Goodrich and Lee, Biochim. Biophys. Acta., 1155: 433 (1993); Riley et al., Annu. Rev. Cell Biol., 10: 1-29 (1994)). Re-introduction of a single copy of the normal Rb gene into murine tumor cells suppresses their ability to develop into tumors (Huang et al., Science, 242: 1563-1566 (1988); Sumegi et al., Cell Growth Differ., 1: 247-250, (1990); Bookstein et al., Science, 247: 712-715 (1990); Chen et al., Cell Growth Differ., 3: 119-125 (1992); Goodrich et al., Can. Res., 52 Takahashi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 5257-5261 (1991)). Microinjection of non-phosphorylated Rb protein into cells in the early G1 phase of the cell cycle blocks their entry into the S phase, indicating its direct involvement in cell growth regulatory processes (Goodrich et al., Cell, 67: 293-302 (1991). These results are supported. Overproduction of the Rb protein from the human RB gene results in growth retardation at the organism level (Bignon et al., Genes Dev, 7: 16541662 (1993)).
U myších embryí, ktoré nemajú funkčnú expresiu RB génu spôsobenú homozygotnou inaktiváciou RB génu, je ich prenatálny vývoj zastavený a embryá hynú (Lee a kol., Náture, 359:288-294, (1992); Jacks a kol., Náture, 359:328-300, (1992); Čiarke a kol., Náture, 359:328-330 (1992)). Tieto experimenty poskytujú dôležité údaje, ktoré objasňujú dôležitosť Rb proteínu v bunkovom raste a diferenciácii in vivo.In mouse embryos that do not have functional RB gene expression due to homozygous inactivation of the RB gene, their prenatal development is stopped and the embryos die (Lee et al., Nature, 359: 288-294, (1992); Jacks et al., Nature, 359 : 328-300, (1992); Čiarke et al., Nature, 359: 328-330 (1992)). These experiments provide important data to elucidate the importance of the Rb protein in cell growth and differentiation in vivo.
RB gén kóduje jadrový proteín, ktorý je fosforylovaný na serínovom a threoninovom zostatku v závislosti na postupe bunkovým cyklom (Lee a kol., Náture, 329:642-645 (1987); Buchkovich a kol., Celí, 58:1097-105 (1989); Chen a kol., Celí, 58:1193-1198 (1989); DeCaprio a kol., Celí, 58:1085-1095 (1989)). V priebehu G1 fáze bunkového cyklu, kedy je proteín v aktívnom stave, ako naznačujú mikroinjekčné experimenty, Rb proteín existuje v hyperfosforylovanom stave (Goodrich a kol., Celí, 67:293-302 (1991); Goodrich a Lee, Náture, 360:177-179 (1992)). Hyperfosforylovaný Rb proteín sa tiež vyskytuje v GO fázi. Zdá sa, že hraje rozhodujúcu úlohu v udržaní buniek v kľudovej fázi, v ktorej sa bunka rozhoduje, či vstúpi do nového bunkového cyklu alebo či dôjde k diferenciácii (Goodrich a Lee, Biochim. Biophys. Acta., 1155:43-61 (1993); Pardee, A. B., Science, 246:603-608 (1989)).The RB gene encodes a core protein that is phosphorylated on the serine and threonine residues depending on the cell cycle progression (Lee et al., Nature, 329: 642-645 (1987); Buchkovich et al., Cell, 58: 1097-105 ( Chen et al., Cell, 58: 1193-1198 (1989); DeCaprio et al., Cell, 58: 1085-1095 (1989)). During the G1 phase of the cell cycle, when the protein is in an active state, as indicated by microinjection experiments, the Rb protein exists in a hyperphosphorylated state (Goodrich et al., Cell, 67: 293-302 (1991); Goodrich and Lee, Nature, 360: 177-179 (1992)). The hyperphosphorylated Rb protein also occurs in the GO phase. It appears to play a critical role in keeping cells at rest, in which the cell decides whether to enter a new cell cycle or whether differentiation occurs (Goodrich and Lee, Biochim. Biophys. Acta., 1155: 43-61 (1993) Pardee, AB, Science, 246: 603-608 (1989)).
V priebehu neskorej Gl, S a M fáze je Rb proteín hyperfosforylovaný pravdepodobne niektorými z CDK kináz (Lees a kol, EMBO J., 10:4279-4290 (1991); Lin a kol, EMBO J., 10:857-864 (1991); Hu a kol., Mol Celí Biol., 12:971-980 (1992)). Zdá sa, že fosforylácia určitých aminokyselinových zostatkov dovoluje bunke prechod k proliferácii. Spôsob fosforylácie Rb proteínu má vzťah k jeho funkcii v inhibícii rastu, a preto bola nedávno prijatá hypotéza, že fosforyiácia negatívne reguluje rast-suprimujúci funkciu tohto proteínu (hollingsworth a kol., Curr. Opin. Genet. Dev., 3:55-62 (1993); Sherr, C. J., Trend Celí Biol., 4:15-18 (1994)). Defosforylácia Rb proteínu nastáva v priebehu M fáze a má za následok jeho reaktiváciu pred započatim nového bunkového cyklu. Potvrdzuje sa, že pre túto defosforyláciu je rozhodujúci protein-fosfatáza typu 1 (Alberts a kol., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:388-392 (1993); Durfee a kol., Genes Dev., 7:555-569 (1993)).During the late G1, S, and M phases, the Rb protein is hyperphosphorylated probably by some of the CDK kinases (Lees et al., EMBO J., 10: 4279-4290 (1991); Lin et al., EMBO J., 10: 857-864 ( Hu, et al., Mol Cell Biol., 12: 971-980 (1992)). Phosphorylation of certain amino acid residues appears to allow the cell to transition to proliferation. The method of phosphorylating an Rb protein is related to its function in inhibiting growth, and it has recently been hypothesized that phosphorylation negatively regulates the growth-suppressing function of this protein (hollingsworth et al., Curr. Opin. Genet. Dev., 3: 55-62 (1993); Sherr, CJ, Trend Cell Biol., 4: 15-18 (1994)). Dephosphorylation of the Rb protein occurs during the M phase and results in its reactivation before initiating a new cell cycle. Protein phosphatase type 1 is confirmed to be critical for this dephosphorylation (Alberts et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90: 388-392 (1993); Durfee et al., Genes Dev., 7: 555-569 (1993)).
Molekulárny mechanizmus, ktorým sa Rb proteín zúčastňuje na bunkových aktivitách, nie je doposiaľ úplne objasnený. Súčasná predstava tvrdí, že Rb proteín interaguje s mnohými rôznymi proteínmi a môže vyjadriť svoju funkciu v týchto komplexoch. Ak je funkciou Rb proteínu udržať bunku v G0/G1 fazi, musí inaktivovať ostatné proteíny, ktoré sú aktívne a nevyhnutné pre vstup do G1 fáze a jej postup (Lee a kol., CSHSOB, LVI:211-217 (1991)). Táto hypotéza je v súlade s nedávnymi pozorovaniami, ktoré uvádzajú, že dôležitý rast-podporujúci transkrípčný faktor E2F-1 je úzko negatívne regulovaný Rb proteinom (Helin a kol., Celí, 70:337-350 (1992); Kaelin a kol., Celí, 70:351-364 (1992); Shan a kol., Mol. Céll Biol., 13:6501-6508 (1993); Shan a kol., Mol. Celí Biol., 14:229-309 (1994)). Nedávno objavený proteín H-NUC sa viaže na Rb proteín a teda sa tiež zúčastňuje na regulácii mitózy.The molecular mechanism by which the Rb protein is involved in cellular activities is not yet fully understood. The present concept suggests that the Rb protein interacts with many different proteins and can express its function in these complexes. If the function of the Rb protein is to keep the cell in the G0 / G1 phase, it must inactivate other proteins that are active and necessary for entry into the G1 phase and its progression (Lee et al., CSHSOB, LVI: 211-217 (1991)). This hypothesis is consistent with recent observations suggesting that the important growth-promoting transcription factor E2F-1 is closely negatively regulated by the Rb protein (Helin et al., Cell, 70: 337-350 (1992); Kaelin et al., Cell, 70: 351-364 (1992); Shan et al., Mol Cell Biol., 13: 6501-6508 (1993); Shan et al., Mol Cell Biol., 14: 229-309 (1994) ). The recently discovered H-NUC protein binds to the Rb protein and thus also participates in the regulation of mitosis.
Gén BRCA-1, spôsobujúci karcinóm prsníka, bol mapovaním pomocou väzbovej analýzy lokalizovaný na chromozóm 17 q21-22. Nie je jasné, či sa tento gén chová ako tumor-supresor alebo ako dominantný onkogén. Gén p53, zúčastňujúci sa na vzniku LiFraumeniho syndrómu, však funguje ako klasický tumor-supresorový gén a podobne tiež strata RB génu súvisí s dedičným retinoblastómom.The BRCA-1 gene, causing breast cancer, was localized to chromosome 17 q21-22 by mapping by binding analysis. It is unclear whether this gene acts as a tumor suppressor or as a dominant oncogene. However, the p53 gene involved in the development of LiFraumeni syndrome functions as a classical tumor suppressor gene, and likewise, the loss of the RB gene is associated with hereditary retinoblastoma.
Medzi týmito extrémnymi príkladmi transformujúcich onkogénov a recesivnych tumor-supresorových génov leží rad prídavných mechanizmov zúčastňujúcich sa na vývoji novotvarov. Už veľa rokov sa predpokladá, že vačšina typov ľudskej rakoviny je pravdepodobne následok násobných, vzájomne interagujúcich genetických defektov, z ktorých žiadny ako jediný nie je dostačujúci pre vývoj tumoru. Skutočná úloha bunkových protoonkogénov a tumor-supresivnych génov regulujúca rast reprezentuje komplexnú sadu ich vzájomných interakcií.Among these extreme examples of transforming oncogenes and recessive tumor suppressor genes lie a number of additional mechanisms involved in the development of neoplasms. For many years, it has been assumed that most types of human cancer are likely to be the result of multiple, interacting genetic defects, none of which is sufficient for tumor development. The intrinsic role of growth-regulating cellular proto-oncogenes and tumor-suppressive genes represents a complex set of their interactions.
Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION
Tento vynález je založený na objavení molekuly nukleovej kyseliny kódujúcej proteín H-NUC, ktorý má tumor-supresorovú schopnosť. Gén bol lokalizovaný do oblasti q21-22 chromozómu 17. Vlastnosti H-NUC (aminokyselinová sekvencia odvodená z celkovej cDNA; schopnosť väzby na DNA a aktivovať transkripciu; zmena polohy alebo strata kódujúcej sekvencie v niektorých bunkových líniách karcinómu prsníka) sú v súlade s identifikáciou H-NUC ako jadrového proteínu a ako tumor-supresívneho proteínu. Novo popísaná celková cDNA kóduje proteín s dĺžkou 824 aminokyselín. Proteín obsahuje desať opakovaní s dĺžkou 34 aminokyselín charakteristické pre TPR (tetratrico peptide) proteínovú rodinu.The present invention is based on the discovery of a nucleic acid molecule encoding an H-NUC protein having tumor suppressor capability. The gene has been localized to region q21-22 of chromosome 17. The properties of H-NUC (amino acid sequence derived from total cDNA; ability to bind to DNA and activate transcription; change of position or loss of coding sequence in some breast cancer cell lines) are consistent with H -NUC as a core protein and as a tumor suppressor protein. The newly described total cDNA encodes a protein of 824 amino acids in length. The protein contains ten repeats, 34 amino acids in length, characteristic of the TPR (tetratrico peptide) protein family.
Diagnostické metódy používajúce nukleovú kyselinu a proteín H-NUC sú známe. Predkladaný vynález sa týka podávania divokého typu H-NUC tumor-supresorového génu alebo proteínu, ktorý je schopný suprimovať, zničiť alebo revertovať neoplastický fenotyp v rakovinových bunkách, ktoré samy neprodukujú H-NUC proteín. Tento vynález demonštruje prvýkrát podávanie divokého typu H-NUC génu do rakovinových buniek, ktorým chýba divoký typ H-NUC proteínu, pre supresiu alebo reverziu neoplastického fenotypu alebo pre zmenu ich vlastností. Táto supresia neoplastického fenotypu striedavo suprimovala alebo ničila abnormálnu masu týchto nádorových buniek, t.j. qimory, a teda redukovala počet tumorov (tumorová záťaž) testovaných organizmov a zvyšovala percento ich prežitia. Neoplastické vlastnosti, ktoré sú monitorované a ktoré môžu revertovať, sú morfológia, rast a ako najpodstatnejšia schopnosť vyvinúť sa v tumor. Zníženie tumorovej záťaže je teda následok supresie neoplastického fenotypu, ktoré nasleduje po podávaní divokého typu H-NUC génu Neoplastickým fenotypom rozumieme fenotypické zmeny v bunkových charakteristikách, ako napr. morfológia, rastová rýchlosť (t.j. doba zdvojenia), saturačná hustota, tvorba kolónii na agarových pôdach a schopnosť tvoriť tumory.Diagnostic methods using nucleic acid and H-NUC protein are known. The present invention relates to the administration of a wild-type H-NUC tumor suppressor gene or protein that is capable of suppressing, destroying or reversing a neoplastic phenotype in cancer cells that do not themselves produce the H-NUC protein. The present invention demonstrates for the first time the administration of the wild-type H-NUC gene to cancer cells lacking the wild-type H-NUC protein, for suppressing or reversing the neoplastic phenotype or for altering their properties. This suppression of the neoplastic phenotype alternately suppressed or destroyed the abnormal mass of these tumor cells, i. qimory, thus reducing the number of tumors (tumor burden) of the test organisms and increasing their survival rate. The neoplastic properties that are monitored and which can be reversed are morphology, growth and as the most essential ability to develop into a tumor. Thus, a reduction in tumor burden is a consequence of suppression of the neoplastic phenotype following administration of the wild-type H-NUC gene. Neoplastic phenotypes are understood to be phenotypic changes in cellular characteristics, such as e.g. morphology, growth rate (i.e., doubling time), saturation density, colony formation on agar media, and the ability to form tumors.
Vynález popisuje vektory kódujúce H-NUC protein a H-NUC proteiny. ktoré sa mozu využívať pri liečbe rakoviny, a metódy na prípravu H-NUC proleínov a vektorov vhodných pre toto využitieThe invention provides vectors encoding the H-NUC protein and H-NUC proteins. which can be used in the treatment of cancer and methods for the preparation of H-NUC proleins and vectors suitable for such use
Vynález popisuje ďalej metódy liečby nielen u človeka, ale aj obecne u cicavcov, metódy liečby abnormálne proliferujúcich buniek a suprimovanie neoplastického fenotypu. Obecne vynález uvažuje o liečbe abnormálne proliferujúcich buniek a chorôb, ktoré sa vyznačujú ich prítomnosťou, akoukoľvek vhodnou metódou, ktorá dovolí vstup H-NUC kódujúceho vektora do hostiteľských kompatibilných buniek alebo H-NUC proteínu do týchto buniek, ktoré majú byť liečené tak, aby bola dosiahnutá supresia proliferácie.The invention further provides methods of treating not only human but also generally mammals, methods of treating abnormally proliferating cells and suppressing the neoplastic phenotype. In general, the invention contemplates treating abnormally proliferating cells and diseases characterized by their presence by any suitable method that allows the entry of the H-NUC coding vector into host compatible cells or the H-NUC protein into these cells to be treated to be suppressed proliferation.
V prvej časti vynález obsahuje metódu liečby chorob cicavcov, vyznačujúcich sa abnormálne proliferujúcimi bunkami, ktorá spočíva v podávaní expresného vektoru kódujúceho H-NUC proteín, zavedením tohto vektoru do abnormálne proliferujúcich buniek a produkcii H-NUC proteínu v množstve účinnom pre supresiu proliferácie týchto buniek. Expresný vektor sa zavádza do buniek vírusovou infekciou alebo transdukciou, transfekciou pomocou lipozómov, transfekciou pomocou polybrénu, transfekciou pomocou CaPO4 a elektroporáciou. Liečba sa opakuje, pokiaľ je to potrebné.In a first aspect, the invention provides a method of treating a mammal disease characterized by an abnormally proliferating cell by administering an expression vector encoding the H-NUC protein, introducing the vector into the abnormally proliferating cell and producing the H-NUC protein in an amount effective to suppress proliferation of these cells. The expression vector is introduced into cells by viral infection or transduction, liposome transfection, polybrene transfection, CaPO4 transfection and electroporation. Treatment is repeated as necessary.
V ďaľšej časti vynález obsahuje metódu liečby cicavčích abnormálne proliferujúcich buniek zavedením H-NUC kódujúceho expresného vektoru do týchto buniek a jeho produkciou tu v množstve účinnom suprimovať proliferáciu týchto buniek. Liečba sa opakuje, pokiaľ trvá jej potreba.In another aspect, the invention provides a method of treating mammalian abnormally proliferating cells by introducing an H-NUC encoding expression vector into these cells and producing it there in an amount effective to suppress proliferation of the cells. Treatment is repeated as long as it is needed.
Vynález popisuje molekulu DNA schopnú suprimovať rast abnormálne proliferujúcich buniek. Molekula DNA kóduje Rb väzbový proteín, ktorý obsahuje sekvenciu s minimálne 66% homológiou s deviatimi repetíciami v C-koncovej oblasti proteínovej molekuly, za predpokladu, že DNA nekóduje proteín NUC 2 Schisosaccharomyces pombe alebo proteín bim A Aspergillus nidulans a proteín CDC27. Príkladom takéhoto Rb väzbového proteínu je H-NUC proteín, ktorý má aminokyselinovú sekvenciu v podstate podľa SEQ ID NO . Molekula DNA má nukleotidovú sekvenciu SEQ ID NO. 1 a jej expresia sa zaisťuje expresným vektorom. Expresný vektor môže byť akýkoľvek vektor kompatibilný pre hostiteľskú bunku. Vektor sa obvykle volí vo forme odvodenej od retrovírusových, adenovirusových a herpesvírusových vektorov.The invention provides a DNA molecule capable of suppressing the growth of abnormally proliferating cells. The DNA molecule encodes an Rb binding protein that contains a sequence with at least 66% homology with nine repeats in the C-terminal region of the protein molecule, provided that the DNA does not encode Schisosaccharomyces pombe NUC or Aspergillus nidulans bim A and CDC27. An example of such an Rb binding protein is an H-NUC protein having an amino acid sequence substantially according to SEQ ID NO. The DNA molecule has the nucleotide sequence of SEQ ID NO. 1 and its expression is provided by an expression vector. The expression vector may be any vector compatible with the host cell. The vector is usually selected in a form derived from retroviral, adenoviral and herpesviral vectors.
V ďaľšej časti vynález popisuje H-NUC proteín, ktorý má aminokyselinové sekvencie v podstate podľa SEQ ID NO. , a jeho biologicky aktívne fragmenty.In another aspect, the invention provides an H-NUC protein having amino acid sequences substantially according to SEQ ID NO. , and biologically active fragments thereof.
V ďaľšej časti vynález poskytuje metódu produkcie H-NUC proteínu, ktorá spočívá v týchto krokoch: zavedenie kompatibilného expresného vektoru obsahujúceho H-NUC kódujúcu sekvenciu do hostiteľskej bunky a navodenie podmienok, aby hostiteľská bunka produkovala H-NUC proteín.In another aspect, the invention provides a method of producing an H-NUC protein, comprising the steps of: introducing a compatible expression vector comprising an H-NUC coding sequence into a host cell and introducing conditions for the host cell to produce an H-NUC protein.
V d’aľšej časti vynález popisuje metódu liečby abnormálne proliferujúcich cicavčích buniek ex vivo týmito krokmi: odohranie tkanivovej vzorky, ktorý obsahuje abnormálne proliferujúce bunky, kontakt tkanivovej vzorky s účinnou dávkou H-NUC kódujúceho expresného vektoru, produkcia H-NUC proteínu v abnormálne proliferujúcich bunkách v množstve schopnom účinne suprimovať ich proliferáciu. Liečba sa opakuje, pokiaľ je to potrebné, a tkanivové vzorky sa vracajú do pôvodného alebo iného organizmu. S výhodou užívané tkanivá sú krv alebo kostná dreň.In another aspect, the invention provides a method of treating an abnormally proliferating mammalian cell ex vivo by the steps of: collecting a tissue sample comprising the abnormally proliferating cells, contacting the tissue sample with an effective dose of an H-NUC encoding expression vector, producing H-NUC protein in the abnormally proliferating cells in an amount capable of effectively suppressing their proliferation. Treatment is repeated as necessary and tissue samples are returned to the original or other organism. Preferably, the tissues used are blood or bone marrow.
V ďalšej časti vynález popisuje metódu liečby cicavčích chorob vyznačujúcich sa abnormálnou bunkovou proliferáciou, ktorá spočíva v týchto krokoch: podanie H-NUC proteínu v množstve účinnom suprimovať abnormálnu proliferáciu. S výhodou sa používa H-NUC proteín enkapsulovaný v lipozómových partikulách. Liečba sa opakuje, pokiaľ je to potrebné.In another aspect, the invention provides a method of treating a mammalian disease characterized by abnormal cell proliferation comprising the steps of: administering an H-NUC protein in an amount effective to suppress abnormal proliferation. Preferably, an H-NUC protein encapsulated in liposome particles is used. Treatment is repeated as necessary.
V ďalšej časti vynález popisuje oligonukleotidový fragment schopný hybridizácie s H-NUC génom a spôsoby jeho využitia. Tieto oligonukleotidy mozu obsahovať najmenej 5 nukleotidov, ale preferujú sa oligonukleotidy s dĺžkou 20 až 30 nukleotidov. Tieto oligonukleotidy sa môžu označovať rádioizotopmi (tritium, 32fosfor, 35síra), enzýmami (napr. alkalická fosfätáza, chrenová peroxidáza), fluorescenčnými značkami (napr. fluorescein, Ethidium, terbium chelát) alebo chemiluminiscenčnými značkami (napr. akridinové estery, isoluminol). Tieto a ďaľšie značky popisované v „Non-isotope DNA Próbe Techniques“, L.J.Kricka, Ed., Academic Press, New York, 1992 sa môžu použiť na rýchlu prípravu oligonukleotidov a pre konvenčné metódy ako sú southem a nothem blotting. Popisy týchto metód sú napr. v „Nucleid Acid Hybridisation - A Practical Approach“, B.D.Hames a S.J Higgins, Eds., IRL Press, Washington, D. C., 1985. S výhodou sa tieto sondy dajú použiť na hybridizáciu s H-NUC génom za stringentných podmienok. Tieto oligonukleotidy sa môžu použiť ako priméry pre PCR techniky (popísané napr v „PCR Technology“, H.A. Ehrlich, Ed., Stockton Press, New York, 1989).In another aspect, the invention provides an oligonucleotide fragment capable of hybridizing to the H-NUC gene and methods for its use. These oligonucleotides may contain at least 5 nucleotides, but oligonucleotides of 20 to 30 nucleotides in length are preferred. These oligonucleotides may be labeled with radioisotopes (tritium, 32 phosphorus, 35 sulfur), enzymes (e.g., alkaline phosphatase, horseradish peroxidase), fluorescent labels (e.g., fluorescein, Ethidium, terbium chelate), or chemiluminescent labels (e.g., acridine esters, isoluminol). . These and other labels described in the "Non-Isotope DNA Probe Techniques", LJ Krick, Ed., Academic Press, New York, 1992, can be used to rapidly prepare oligonucleotides and for conventional methods such as southem and nothem blotting. Descriptions of these methods are e.g. in "Nucleid Acid Hybridization - A Practical Approach," BDHames and SJ Higgins, Eds., IRL Press, Washington, DC, 1985. Preferably, these probes can be used to hybridize to the H-NUC gene under stringent conditions. These oligonucleotides can be used as primers for PCR techniques (described, for example, in "PCR Technology", HA Ehrlich, Ed., Stockton Press, New York, 1989).
Popisy obrázkovImage descriptions
Obrázky 1A a 1B ukazujú, že podobné úseky RB sú potrebné pre väzbu H-NUC a T-antigén u. Obrázok 1A je schéma Gal4-RB fúzie, ktorá sa používa na určenie väzbových domén. GaI4 DNA-väzbová doména (aminokyseliny 1 až 147) je fúzovaná s rôznymi mutantnými formami RB. T/E1A väzbové domény sú znázornené šrafované. Domény ovplyvnené mutáciami sú znázornené bodkované. Obrázok 1B ukazuje detekciu interakcií medzi H-NUC a RB mutantami in vivo. Yl 53 sa kotransformoval Gal4-Rb mutanty a buď s Gal4-(H-NUC) expresným klonom (Gal4-(C-49)), alebo s YIpPTGlO. Chlorofenyl-red-bD-galaktopyranosidový kolorimetrický test (CPRG) sa uskutočňoval pre kvantifikáciu pgalktosidázovej aktivity pre každú transformáciu (Durfee a kol, Genes Devel., 7:555-569 (1993)).Figures 1A and 1B show that similar regions of RB are required for H-NUC and T-antigen binding. Figure 1A is a scheme of the Gal4-RB fusion that is used to determine binding domains. The Ga14 DNA-binding domain (amino acids 1 to 147) is fused to various mutant forms of RB. The T / E1A binding domains are shown shaded. Domains affected by mutations are shown dotted. Figure 1B shows the detection of interactions between H-NUC and RB mutants in vivo. Y153 was co-transformed with Gal4-Rb mutants and either with the Gal4- (H-NUC) expression clone (Gal4- (C-49)) or with YIpPTG10. The chlorophenyl-red-bD-galactopyranoside colorimetric assay (CPRG) was performed to quantify the pgalctosidase activity for each transformation (Durfee et al., Genes Devel., 7: 555-569 (1993)).
Obrázky 2A a 2B ukazujú, že H-NUC sa viaže k nefosforylovanému RB. Obrázok 2A ukazuje GST a GST fúzovaný s cDNA kódujúci H-NUC (GST-419) a N-koncovým úsekom 273 aminokyselín SV40 T-antigénu, ktoré sa exprimovali v E.coli. GST a GST fuzované proteíny sa viazali na glutatión-sepharózové guličky a intenzívne premývali. Vzorky sa kvantifikovali pomocou Commasie modrej na SDS-polyakrylamidových géloch. Na každú dráhu sa nanášalo zhodné množstvo proteínu. Na obrázku 2B sú zobrazené extrakty získané z buniek WR2E3, ktoré sa zmiešali so vzorkami na dobu 30 minút pri izbovej teplote. Po intenzívnom premývaní sa komplexy rozdelili na SDSpolyakrylamidových géloch a imunoblotovali. Množstvo prítomného Rb proteínu a stupeň jeho fosforylácie sa určoval pomocou imunoprecipitácie anti-Rb monoklonálnou protilátkou 11D7 (dráha 1). Blot sa testoval tou istou protilátkou a vizualizoval fluorograficky.Figures 2A and 2B show that H-NUC binds to non-phosphorylated RB. Figure 2A shows GST and GST fused to the cDNA encoding H-NUC (GST-419) and the N-terminal region of 273 amino acids of the SV40 T-antigen that were expressed in E.coli. GST and GST fusion proteins bound to glutathione-sepharose beads and washed extensively. Samples were quantified using Commassie Blue on SDS-polyacrylamide gels. An equal amount of protein was loaded on each lane. Figure 2B shows extracts obtained from WR2E3 cells that were mixed with the samples for 30 minutes at room temperature. After extensive washing, the complexes were resolved on SDS polyacrylamide gels and immunoblotted. The amount of Rb protein present and the degree of phosphorylation thereof was determined by immunoprecipitation with anti-Rb monoclonal antibody 11D7 (lane 1). The blot was tested with the same antibody and visualized by fluorography.
Obrázok 3 je nukleotidová (SEQ. I.D. NO.: I) a predpokladaná aminokyselinová sekvencia (SEQ. I.D. NO.: 2) celkovej cDNA H-NUC génu a H-NUC proteínu.Figure 3 is the nucleotide (SEQ. I.D. NO .: I) and predicted amino acid sequence (SEQ. I.D. NO .: 2) of the total cDNA of the H-NUC gene and H-NUC protein.
Obrázky 4A a 4B ukazujú, že H-NUC kóduje produkt, ktorý je členom rodiny proteinov s tetratricopeptidovými opakovaniami (TPR). Obrázok 4A znázorňuje umiestnenie desiatich 34-aminokyselinových opakovaní v H-NUC, Schisosaccharomyces nuc2+ a Aspergillus nidulans bimA proteinoch. Jednotka opakovania 3 v týchto polypeptidoch (znázornená bodkované) nemá konzervatívny motív. Obrázok 4B znázorňuje zoradenie aminokyselinových sekvencii 9 TRP jednotiek opakovania (1-9) v proteinoch HNUC, nuc2+ a-bimA Konzervatívne úseky sú v obdĺžnikoch. TRP jednotka 6 u všetkých troch proteinov obsahuje glycín v pozícii 6. Zdá sa, že Gly6 v opakovaní 6 proteínu nuc2 je esenciálny.Figures 4A and 4B show that H-NUC encodes a product that is a member of the tetratricopeptide repeat (TPR) family of proteins. Figure 4A shows the location of ten 34-amino acid repeats in H-NUC, Schisosaccharomyces nuc2 +, and Aspergillus nidulans bimA proteins. The repeat unit 3 of these polypeptides (shown in dotted lines) does not have a conservative motif. Figure 4B shows the alignment of the amino acid sequences of 9 TRP repeat units (1-9) in the HNUC, nuc2 +, and -bimA proteins. The conserved regions are in rectangles. The TRP unit 6 of all three proteins contains glycine at position 6. Gly6 appears to be essential in the repeat 6 of the nuc2 protein.
Obrázky 5A a 5B znázorňujú väzbu C-koncových TRP opakovaní H-NUC na Rb proteín. Obrázok 5A je schematickým zobrazením Gal4-H-NUC fúzie, použitej na určenie väzbových domén. Gal4 transaktivačná doména sa fuzuje s rôznymi delečnými mutantnými formami H-NUC. TRP jednotky opakovania H-NUC sú znázornené šrafované. Obrázok 5B ukazuje detekciu interakcii medzi Rb a H-NUC delečnými mutantami in vivo. Y153 sa kotransformoval s uvedenými Gal4-H-NUC mutantami a buď s Gal4-RB2, alebo Gal4H209. Každá tranformácia sa kvantitatívne vyhodnocovala pomocou CPRG (zistenie/3galaktosidázovej aktivity).Figures 5A and 5B show binding of C-terminal TRP repeats of H-NUC to Rb protein. Figure 5A is a schematic representation of the Gal4-H-NUC fusion used to determine binding domains. The Gal4 transactivation domain is fused to various deletion mutant forms of H-NUC. TRP repeat units of H-NUC are shown shaded. Figure 5B shows the detection of interactions between Rb and H-NUC deletion mutants in vivo. Y153 was cotransformed with the indicated Gal4-H-NUC mutants and either with Gal4-RB2 or Gal4H209. Each transformation was quantitated by CPRG (detection of β-galactosidase activity).
Obrázky 6A a 6B znázorňujú mutáciu v esenciálnom Gly vytvorenú v teplotné senzitívnej H-NUC mutante, ktorá zmenšuje jej schopnosť väzby na Rb v nepermisívnej teplote. Obrázok 6A detailne ukazuje aminokyselinovú substitúciu v H-NUC (64OD). Esenciálny glycín (G) (aminokyselina 540) proteínu nuc2 sa v teplotné senzitívnej mutante substituoval asparágovou kyselinou (D). Glycín v polohe 640 H-NUC proteínu sa substitoval asparágovou kyselinou (D). Obrázok 6B znázorňuje interakcie medzi Rb a HNUC (640D) mutantnou formou v 37”C. Y153 sa kotransformoval Gal4-Rb2 a buď GA14H-NUC, alebo Gal4-H-NUC (640D). Transformanti rástli v tekutej kultúre v 28°C po dobu 24 hodín. Kultúra sa potom nariedila v čerstvom médiu a inkubovala v 37°C. Alikvóty kvasinkovej kultúry sa odoberali v rôznych časoch aby sa určila rýchlosť rastu a jQgalaktosidázovej aktivity. Táto aktivita sa stanovovala pomocou CRPG.Figures 6A and 6B show a mutation in essential Gly created in a temperature sensitive H-NUC mutant that diminishes its ability to bind to Rb at a non-permissive temperature. Figure 6A shows in detail the amino acid substitution in H-NUC (64OD). Essential glycine (G) (amino acid 540) of the nuc2 protein was substituted with aspartic acid (D) in a temperature sensitive mutant. Glycine at position 640 of the H-NUC protein was substituted with aspartic acid (D). Figure 6B shows the interactions between Rb and HNUC (640D) mutant form at 37 ° C. Y153 was cotransformed with Gal4-Rb2 and either GA14H-NUC or Gal4-H-NUC (640D). Transformants were grown in liquid culture at 28 ° C for 24 hours. The culture was then diluted in fresh medium and incubated at 37 ° C. Aliquots of yeast culture were taken at various times to determine growth rate and γgalactosidase activity. This activity was determined by CRPG.
Obrázky 7A a 7B znázorňujú prípravu antiséra proti H-NUC a detekciu H-NUC v ľudských bunkových líniách. Na obrázku 7A sú na imunizáciu myší použité Gst-491 fúzované proteíny. K precipitácii sa použilo preimúnne sérum (dráha 1), imúnne sérum (dráha 2), imúnne sérum preinkubované s Gst proteinom (dráha 3) a imúnne sérum preinkubované s Gst-491 (dráha 4). Z buniek K-562 sa pripravil bunkový lyzát označený S35. Na imunoprecipitáciu sa použilo rovnaké množstvo bunkového lyzátu. Výsledné imunoprecipitáty sa rozdelovali SDS-polyakrylamidovou elekroforézou. Na obrázku 7B sú S35 značené lyzáty pripravené z buniek CV-1. Rovnaké množstvo bunkového lyzátu sa imunoprecipitovalo preimúnnym sérom (dráha 1), alebo imúnnym sérom (dráhy 2 a 3). Výsledné imunoprecipitáty sa denaturovali varom v 200 ml roztoku obsahujúcom 2% SDS (dráha 3) a -riedili v 200ml NETN pufre. Imunoprecipitáty sa rozdelovali SDS polyakrylamidovou elektroforézou. Imúnnym sérom bol špecificky rozpoznaný proteín s molekulovou hmotnosťou 90 kDa (naznačený šípkou).Figures 7A and 7B depict the preparation of anti-H-NUC antisera and detection of H-NUC in human cell lines. In Figure 7A, Gst-491 fusion proteins are used to immunize mice. Pre-immune serum (lane 1), immune serum (lane 2), immune serum preincubated with Gst protein (lane 3), and immune serum preincubated with Gst-491 (lane 4) were used for precipitation. From the cells, K-562 cell lysate were prepared designated S 35th An equal amount of cell lysate was used for immunoprecipitation. The resulting immunoprecipitates were separated by SDS-polyacrylamide electrophoresis. In Figure 7B, S 35 labeled lysates are prepared from CV-1 cells. The same amount of cell lysate was immunoprecipitated with preimmune serum (lane 1) or immune serum (lanes 2 and 3). The resulting immunoprecipitates were denatured by boiling in 200 ml of a solution containing 2% SDS (lane 3) and diluted in 200 ml of NETN buffer. The immunoprecipitates were separated by SDS polyacrylamide electrophoresis. The protein with a molecular weight of 90 kDa (indicated by an arrow) was specifically recognized by the immune serum.
Obrázok 8 ukazuje, že H-NUC proteín má DNA-väzbovú aktivitu. Proteínový lyzát z K562 buniek označený S35-methionínom sa naniesol na kolónu s naviazanou dvojreťazcovou DNA z teľacieho thymu na celulóze a eluoval rastúcou koncentráciou NaCI. Vzorky sa po elúcii imunoprecipitovali buď (A) mAb 11D7 na zistenie Rb proteínu, alebo (B) imúnnym sérom rozoznávajúcim H-NUC. Alikvóty z eluovaných vzoriek sa tiež použili na inkubáciu s glutathión-sepharózou (C).Figure 8 shows that the H-NUC protein has DNA-binding activity. The 35- methionine-labeled protein lysate from K562 cells was loaded onto a column of bound double-stranded DNA from calf thymus on cellulose and eluted with increasing NaCl concentration. After elution, samples were immunoprecipitated with either (A) mAb 11D7 to detect Rb protein, or (B) immune serum recognizing H-NUC. Aliquots from the eluted samples were also used for incubation with glutathione-sepharose (C).
Obrázok 9 znázorňuje lokalizáciu génu kódujúceho H-NUC na oblasti q21-22 chromozómu 17.Figure 9 shows the location of the gene encoding H-NUC on the q21-22 region of chromosome 17.
Obrázky 10A a 10B sú výsledky Southem blotovej analýzy DNA z tumorových buniek prsníka s H-NUC ako sondou. DNA sa extrahovala z bunkových línií a štiepila EcoRI. Bloty z bunkových línii testované na obrázku 10A sú všetky normálne. Na obrázku 10B bola zrejmá homozygotná delécia H-NUC génu v bunkových líniách T47D a MB157. Heterozygotná mutácia, ktorá sa zrejme vyskytovala v bunkových líniách MB231, BTO0578-7 a BT549, sa vyznačovala zníženou hybridizáciou k 14 kbp EcoRI fragmentu.Figures 10A and 10B are the results of a Southern blot analysis of DNA from breast tumor cells with H-NUC as a probe. DNA was extracted from cell lines and digested with EcoRI. The cell line blots tested in Figure 10A are all normal. In Figure 10B, a homozygous deletion of the H-NUC gene in T47D and MB157 cell lines was evident. The heterozygous mutation that appeared to occur in the MB231, BTO0578-7 and BT549 cell lines was characterized by reduced hybridization to the 14 kbp EcoRI fragment.
Obrázok 11 znázorňuje inhibičný vplyv AC-H-NUC na bunkový rast v T-47D tumorových bunkách prsníka in vitro. Horný ľavý obrázok ukazuje MDA-MB-231 bunky infikované ACN (MOI 10) po dobu 3 dní a farbené kryštálovou violetovou. Horný pravý obrázok ukazuje T-47D bunky infikované ACN (MOI 10). Dolný ľavý obrázok ukazuje MDA-MB-231 bunky infikované AC-H-NUC (MOI 10). Dolný pravý obrázok ukazuje T47D bunky infikované AC-H-NUC . (+/-) naznačuje, že MDA-MB-231 bunky sú heterozygotné pre H-NUC. (-/-) naznačuje, že T-47D bunky sa vyznačujú homozygotnou deléciou H-NUC (ref. Lee, W.H.). AC-H-NUC je rekombinantný ľudský adenovírus obsahujúci H-NUC tumor-supresorový gén pod kontrolou ľudského CVM promotoru. ACN je ten istý rekombinantný ľudský adenovírusový vektor bez H-NUC tumorsupresorového génuFigure 11 shows the inhibitory effect of AC-H-NUC on cell growth in T-47D breast tumor cells in vitro. The upper left figure shows MDA-MB-231 cells infected with ACN (MOI 10) for 3 days and stained with crystal violet. The upper right figure shows ACN-infected T-47D cells (MOI 10). The lower left figure shows MDA-MB-231 cells infected with AC-H-NUC (MOI 10). The lower right figure shows T47D cells infected with AC-H-NUC. (+/-) indicates that MDA-MB-231 cells are heterozygous for H-NUC. (- / -) indicates that T-47D cells are characterized by a homozygous deletion of H-NUC (ref. Lee, W.H.). AC-H-NUC is a recombinant human adenovirus containing the H-NUC tumor suppressor gene under the control of the human CVM promoter. ACN is the same recombinant human adenoviral vector without the H-NUC of the tumor suppressor gene
Obrázok 12 ukazuje, že AC-H-NUC suprimuje rast T-47D tumorových buniek in vitro. T-47D (deletované pre H-NUC) a MDA-MB-231 (herozygotný pre H-NUC) bunky rakoviny prsníka sa vysiali na misky a ošetrili sa AC-H-NUC alebo ACN pri infekčnej multiplicite 10 a 100. Bunky rástli 5 dni a na meranie stupňa proliferácie sa používal 'Ήthymidin inkorporovaný do nukleových kyselín. Údaje pre AC-H-NUC sú znázornené ako percento z priemernej proliferácie ACN kontroly.Figure 12 shows that AC-H-NUC suppresses the growth of T-47D tumor cells in vitro. T-47D (deleted for H-NUC) and MDA-MB-231 (herozygous for H-NUC) breast cancer cells were plated and treated with AC-H-NUC or ACN at an infectious multiplicity of 10 and 100. The cells were grown 5 The thymidine incorporated into the nucleic acids was used to measure the degree of proliferation. Data for AC-H-NUC is shown as a percentage of the average proliferation of the ACN control.
Obrázok 13 ukazuje, že AC-H-NUC suprimuje T-47D tumorový rast v myších bunkách. T-47D bunky ľudskej rakoviny prsiifsa ošetrovali ex-vi vo pomocou ACN alebo AC-H-NUC pri infekčnej multiplicite 30. Približne 107 buniek sa subkutánne injekovalo do boku myší, u každej sa urobilo injekovanie ACN ošetrenými a AC-H-NUC ošetrenými bunkami (každý typ do jedného boku). Merala sa veľkosť tumorov a objemy tumorov sa vypočítavali pomocou odhadov sférickej geometrie. Priemerné objemy tumorov pre ACN a pre AC-H-NUC bunky sú vynesené v grafe. Priemerné objemy tumorov z neošetrovaných buniek sú uvedené pre porovnanie.Figure 13 shows that AC-H-NUC suppresses T-47D tumor growth in mouse cells. T-47D human breast cancer cells were treated ex-vi with ACN or AC-H-NUC at infectious multiplicity of 30. Approximately 10 7 cells were injected subcutaneously into the flank of mice, each injected with ACN treated and AC-H-NUC treated cells (each type to one side). Tumor size was measured and tumor volumes were calculated using spherical geometry estimates. Mean tumor volumes for ACN and AC-H-NUC cells are plotted. Mean tumor volumes from untreated cells are given for comparison.
Detailný popis vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Tento vynález popisuje nový cicavčí protein označený H-NUC. H-NUC sa skladá z 824 aminokyselín (obr. 3) a má molekulovú hmotnosť okolo 95 kD a nachádza sa v interakcii s nefosforylovaným retinoblastómovým proteínom (RB). H-NUC deriváty (napr. skrátené verzie proteínu, obsahujúce posledných 6 TPR oblastí (tetratricopeptidy, 34aminokyselinové opakovania) v C-koncovej oblasti, inými slovami verzie s dĺžkou 559 namiesto 770) viaže divoký typ Rb-proteínu. Mutácia v proteíne, ktorá vedie k neschopnosti viazať sa na retinoblastómový protein, prispieva k hyperproliferačnej aktivite, ktorá je charakteristická pre Rb negatívne bunky, napr. bunky rakoviny prsníka.The present invention describes a novel mammalian protein designated H-NUC. H-NUC consists of 824 amino acids (Fig. 3) and has a molecular weight of about 95 kD and interacts with non-phosphorylated retinoblastoma protein (RB). H-NUC derivatives (e.g., truncated versions of a protein containing the last 6 TPR regions (tetratricopeptides, 34 amino acid repeats) in the C-terminal region, in other words, a version of 559 instead of 770) bind the wild type Rb protein. A mutation in a protein that results in the inability to bind to a retinoblastoma protein contributes to the hyperproliferative activity that is characteristic of Rb negative cells, e.g. breast cancer cells.
H-NUC protein je ľudský protein a môže sa teda izolovať a purifikovať z ľudských tkanív. Ako purifikovaný protein alebo nukleová kyselina sa označuje protein alebo nukleová kyselina neobsahujúca iné proteíny alebo iné molekuly normálne asociované alebo vyskytujúce sa s H-NUC proteínom alebo s DNA kódujúce H-NUC v prirodzenom stave. Termín „natívny“ označuje formu DNA, proteínu, polypeptidu, protilátky alebo fragmentu, ktorý sa izoluje v prirodzenom stave alebo ktorý neobsahuje žiadnu zámernú zmenu v aminokyselinovom zložení, napr. substitúciu, deléciu alebo adíciu. Purifikácia 95 kD H-NUC proteínu z SDS gélov sa môže robiť rôznymi metódami, napr. pri ktorej sa bunkový extrakt obsahujúci H-NUC precipituje anti-H-NUC protilátkou (detailne popísané ďalej) a komplex proteín-protilátka sa po oddelení od ostatných zložiek pomocou SDS gelovej elektroforézy eluuje z gélov podľa Fischer a kol., Techniques in Protein Chemistry, ed. T.E. Hugli,-Acedemic Press, Inc., 36-41 (1989).The H-NUC protein is a human protein and can thus be isolated and purified from human tissues. A purified protein or nucleic acid is a protein or nucleic acid not containing other proteins or other molecules normally associated with or occurring with the H-NUC protein or with the DNA encoding H-NUC in the natural state. The term "native" refers to a form of DNA, protein, polypeptide, antibody, or fragment that is isolated in its natural state or that contains no deliberate change in the amino acid composition, e.g. substitution, deletion or addition. Purification of the 95 kD H-NUC protein from SDS gels can be accomplished by a variety of methods, e.g. wherein the H-NUC-containing cell extract is precipitated with an anti-H-NUC antibody (described in detail below) and the protein-antibody complex is eluted from the gels according to Fischer et al., Techniques in Protein Chemistry after separation from the other components by SDS gel electrophoresis. ed. T.E. Hugli, Acedemic Press, Inc., 36-41 (1989).
Termín hyperproliferujúce bunky označuje (ale neobmedzuje sa len na ne) bunky, ktoré sa vyznačujú schopnosťou autonómneho rastu, t.j. existencie a reprodukcie nezávisle na normálnych regulačných mechanizmoch. Hyperproliferačné choroby sa môžu deliť na patologické, t.j. vyvíjajúce sa z normálnych buniek, vyznačujú sa patologickými príznakmi, a nepatologické, t.j. ktoré sa nevyznačujú príznakmi choroby. Patologické hyperproliferujúce bunky sú charakteristické pre nasledujúce choroby: thyroidná hyperplazia (Gravesova choroba), psoriáza, benígna hypertrofia prostaty, Li-Fraumeniho syndróm, rakoviny prsníka, sarkómy a dalsie neoplazmy, rakovina močového mechúra, čreva, pľúc rôzne leukémie a lymfómy. Ako príklady nepatologických hyperproliferujúcich buniek je možné uviesť bunky, ktoré sa nachádzajú v mliečnych žlazách v priebehu laktácie a tiež bunky podieľajúce sa na hojení rán. Patologické hyperproliferujúce bunky obvykle vykazujú stratu kontaktnej inhibície a strácajú schopnosť na selektívnu adherenciu, čo svedčí o zmenách povrchových vlastností buniek a ďalších poškodeniach medzibunkovej komunikácie. Tieto zmeny ďalej zahŕňajú stimuláciu delenia a schopnosť sekretovať proteolytické enzýmy. Znovuobnovenie alebo doplnenie funkcie H-NUC zavedením proteínu alebo nukleovej kyseliny kódujúcej tento proteín do buniek môže navrátiť bunky do neproliferujúceho stavu a malígna proliferácia sa tak môže zastaviť.The term hyperproliferating cells refers to, but is not limited to, cells that are characterized by the ability to grow autonomously, i. existence and reproduction independent of normal regulatory mechanisms. Hyperproliferative diseases can be divided into pathological, i. developing from normal cells, characterized by pathological symptoms, and non-pathological, i. which do not show signs of disease. Pathological hyperproliferating cells are characteristic of the following diseases: thyroid hyperplasia (Graves disease), psoriasis, benign prostatic hypertrophy, Li-Fraumeni syndrome, breast cancer, sarcomas and other neoplasms, bladder cancer, intestine, lung various leukemias and lymphomas. Examples of non-pathological hyperproliferating cells include cells that are found in the mammary glands during lactation, as well as cells involved in wound healing. Pathological hyperproliferating cells usually show a loss of contact inhibition and lose the ability to selectively adherence, suggesting changes in the cell surface properties and other intercellular communication damage. These changes further include stimulation of division and the ability to secrete proteolytic enzymes. Restoring or complementing the function of H-NUC by introducing a protein or nucleic acid encoding this protein into the cells can return the cells to a non-proliferating state, and the malignant proliferation can thus be stopped.
Termín „proteín“ označuje lineárny polymér aminokyselín spojených navzájom peptidovou väzbou. Termín „aminokyselina“ označuje buď D, alebo L stereoizomerickú formu aminokyseliny (ak nie je inak špecificky označená). H-NUC deriváty označujú látky odvodené od lineárnej sekvencie pôvodného proteínu alebo polypeptidu, ale ktoré majú navyše aminokyselinovú zmenu vo svojej sekvencii (substitúcia, delécia, insercia), takú, aby H-NUC derivátu ponechala povodne biologické aktivity. Biologická aktivita znamená schopnosť viazať sa na nefbsforylovaný retinoblastómový proteín pl 10“ H-NUC väzbová schopnosť sa stráca pri 37°C, ak sa napr. vysoko konzervatívny glycin (aminokyselina 640) zamení za asparágovú kyselinu. Tieto H-NUC deriváty sa môžu odlíšiť od pôvodnej sekvencie deléciami, inserciami alebo substitúciami jednej alebo viacerých aminokyselín za príbuzné aminokyseliny, napr. podobne nabité aminokyseliny, alebo substitúciou alebo modifikáciou postranných reťazcov alebo funkčných skupín.The term "protein" refers to a linear polymer of amino acids linked together by a peptide bond. The term "amino acid" refers to either the D or L stereoisomeric form of the amino acid (unless otherwise specifically designated). H-NUC derivatives refer to substances derived from the linear sequence of the original protein or polypeptide, but which additionally have an amino acid change in their sequence (substitution, deletion, insertion) such that the H-NUC derivative retains flooding biological activity. Biological activity means the ability to bind to the non-phosphorylated retinoblastoma protein p110-H-NUC binding ability is lost at 37 ° C if e.g. highly conserved glycine (amino acid 640) is replaced by aspartic acid. These H-NUC derivatives can be distinguished from the original sequence by deletions, insertions, or substitutions of one or more amino acids for related amino acids, e.g. similarly charged amino acids, or by substitution or modification of side chains or functional groups.
Je známe, že len obmedzené modifikácie sa môžu zavádzať do primárnej sekvencieIt is known that only limited modifications can be introduced into the primary sequence
H-NUC bez zničenia jeho biologickej funkce a že len malý podiel úplnej primárnej štruktúry je potrebný na vykonávanie biologických aktivít (napr väzba pl 10RH). Sekvencia nukleovej kyseliny kódujúca pilo“1 je publikovaná v Lee, W., H., a kol., Science 235:1394-1399 (1989). Ďaľšou biologickou aktivitou H-NUC je jeho schopnosť väzby na DNA. Schopnosť väzby na DNA sa môže zistiť metódami uvedenými v Lee, w.,H., a kol., Náture (London) 329 642-645 (1987). Jedným z biologicky aktívnych derivátov H-NUC je proteín obsahujúci posledných 6 TPR oblasti na C-koncovom úseku a fúzny Gal4-C49 proteín. Gal4-C49 derivát má sekvenciu naznačenú na obr. 3 od aminokyselinovej pozície 559 do konca sekvencie. TPR obsahujúci derivát má sekvenciu naznačenú na obr. 3 od aminokyselinovej pozície 559 do 770. Fragmenty sekvcncii na obr. 3, u ktorých sa zachováva pôvodná funkcia proteínu, sa tiež zahŕňajú do definície H-NUC derivátov. Tieto H-NUC deriváty mohli vznikať štiepením nukleovej kyseliny reštrikčnými enzýmami a rekombinantnou expresiou výsledných fragmentov. Minoritná modifikácia primárnej aminokyselinovej sekvencie má za následok v podstate ekvivalentnú alebo zvýšenú funkciu v porovnaní so sekvenciou uvedenou na obr. 3. Tieto modifikácie môžu byť zámerné, ako napr. cielená mutagenézia, alebo môžu byť náhodné vďaka mutáciám v hostiteľskom organizme, ktorý produkuje H-NUC. U všetkých zahrnutých modifikácií zostáva zachovaná H-NUC biologická aktivita.H-NUC without destroying its biological function and that only a small fraction of the complete primary structure is required to perform biological activities (e.g., p110 RH binding). The pilo- 1 encoding nucleic acid sequence is published in Lee, W., H., et al., Science 235: 1394-1399 (1989). Another biological activity of H-NUC is its ability to bind to DNA. DNA-binding capacity can be determined by the methods of Lee, W., H., et al., Nature (London) 329 642-645 (1987). One of the biologically active derivatives of H-NUC is a protein comprising the last 6 TPR regions on the C-terminal region and a Gal4-C49 fusion protein. The Gal4-C49 derivative has the sequence outlined in FIG. 3 from amino acid position 559 to the end of the sequence. The TPR containing derivative has the sequence shown in FIG. 3 from amino acid position 559 to 770. The fragment fragments of FIG. 3, which retain the original function of the protein, are also included in the definition of H-NUC derivatives. These H-NUC derivatives could be produced by nucleic acid cleavage by restriction enzymes and recombinant expression of the resulting fragments. Minor modification of the primary amino acid sequence results in a substantially equivalent or increased function compared to the sequence shown in FIG. These modifications may be intentional, such as e.g. targeted mutagenesis, or may be random due to mutations in a host organism that produces H-NUC. For all modifications included, H-NUC biological activity is retained.
Ako inhibične aktívne sa označujú fragmenty alebo mutantné formy H-NUC, ktoré dominantne negatívnym spôsobom inhibujú normálnu funkciu proteínu, a tým teda rušia jeho biologickú úlohu a spôsobujú delenie hostiteľských buniek a/alebo ich proliferáciu. Tieto proteíny alebo fragmenty sa môžu tvoriť dobre známymi chemickými spôsobmi účinkom rôznych látok. Mutantné proteíny a fragmenty sa používajú terapeuticky na vyvolanie hyperproliferácie a na tvorbu diagnostických látok ako napr. protilátok.Fragments or mutant forms of H-NUC which inhibit the normal function of a protein in a negative way and thereby disrupt its biological role and cause host cell division and / or proliferation are termed inhibitory active. These proteins or fragments can be produced by well known chemical methods by the action of various substances. Mutant proteins and fragments are used therapeutically to induce hyperproliferation and to generate diagnostic agents such as e.g. antibodies.
Tieto látky sa používajú na podporu alebo potlačenie rastu alebo proliferácie buniek ich kontaktom in vitro a in vivo podľa metódy uvedenej nižšie. Tento vynález tiež popisuje metódu inhibície rastu alebo proliferácie buniek, napr. buniek rakoviny prsníka, metódu liečenia patologických stavov charakterizovaných hypeproliferatívnym bunkovým rastom (rakovina prsníka) podávaním týchto látok v účinnej koncentrácii, ktorá je schopná inhibovať proliferáciu, vhodného objektu. Vhodnými objektami pre túto metódu sú obratlovci obecne, vrátane primátov a ľudských pacientov.These agents are used to promote or suppress cell growth or proliferation by contacting them in vitro and in vivo according to the method below. The invention also provides a method of inhibiting cell growth or proliferation, e.g. breast cancer cells, a method of treating a pathological condition characterized by hypeproliferative cell growth (breast cancer) by administering said compounds at an effective concentration capable of inhibiting proliferation of a suitable object. Suitable objects for this method are vertebrates in general, including primates and human patients.
Vynález popisuje farmaceutické prostriedky obsahujúce ktorúkoľvek zo zložiek popisovaných vyššie a jeden alebo viac vhodných farmaceutických nosičov. Farmaceutický vhodné nosiče sú napríklad fyziologické pufrované solné roztoky alebo niektoré rozpúšťadlá alebo vehikula ako glycerol, glykol, rastlinný olej (napr. olivový olej) a injekovateľné organické estery. Farmaceutický vhodný nosič sa používa k podávaniu HNUC alebo jeho derivátov do buniek in vitro alebo objektu in vi vo.The invention provides pharmaceutical compositions comprising any of the ingredients described above and one or more suitable pharmaceutical carriers. Pharmaceutically acceptable carriers are, for example, physiological buffered saline solutions or certain solvents or vehicles such as glycerol, glycol, vegetable oil (e.g. olive oil) and injectable organic esters. A pharmaceutically acceptable carrier is used to administer HNUC or derivatives thereof to cells in vitro or an object in vivo.
Farmaceutický vhodný nosič obsahuje fyziologicky prijateľnú zložku, ktorá funguje napr. v udržaní stability proteinu alebo polypeptidu alebo zvyšuje či znižuje absorbciu látky. Môžu sa použiť napr. karbohydráty (napr. glukóza, dextrany), antioxidanty (napr. askorbová kyselina, glutathión), chelatačné činidlá, nizkomolekuláme proteíny alebo iné . stabilizátory. Ďalej sú obsiahnuté d’aľšie fyziologicky vhodné zložky (zvlhčovadlá, emulgujúce a dispergujúce činidlá, ochranné prostriedky, ktoré sú obzvlášť výhodné na * potlačenie rastu a pôsobenia mikroorganizmov). Ako ochranné prostriedky sa používajú napr. fenol a askorbová kyselina. Výber farmaceutický vhodného nosiča a ďaľšich zložiek závisí na predpísanom spôsobe podávania polypeptidu a na jeho špecifických fyzikálnochemických vlastnostiach. Napr. alumínium monosterát alebo želatína predlžujú dobu absorbcie farmaceutického prostriedku do objektu. Ďaľšie príklady nosičov, stabilizačných a adjuvantných činidiel sú uvedené v Martin, Remingtons. Pharm. Sci., 15th Ed. (Mack Publ. Co., Easton, 1975). Farmaceutický prostriedok sa môže, ak je to žiadúce, inkorporovať do lipozómových váčkov, mikroguličiek alebo iných polymémych matríc (Gregoriadis, Liposome Technology, Vol. 1 (CRC Press, Boca Raton, Florida 1984). Lipozómy, ktoré sa skladajú z fosfolipidov alebo iných typov lipidov, sú netoxické, fyziologicky vhodné a metabolizovateľné nosiče, relatívne jednoduché na prípravu a na podávanie.The pharmaceutically acceptable carrier comprises a physiologically acceptable component which functions, e.g. in maintaining the stability of a protein or polypeptide, or increasing or decreasing the absorption of a substance. They may be used e.g. carbohydrates (e.g. glucose, dextrans), antioxidants (e.g. ascorbic acid, glutathione), chelating agents, low molecular weight proteins or others. stabilizers. Further included are other physiologically acceptable ingredients (humectants, emulsifying and dispersing agents, preservatives which are particularly useful for inhibiting the growth and action of microorganisms). As protective agents, e.g. phenol and ascorbic acid. The choice of a pharmaceutically acceptable carrier and other ingredients will depend upon the prescribed route of administration of the polypeptide and its specific physicochemical properties. E.g. aluminum monosterate or gelatin prolongs the absorption time of the pharmaceutical composition into the object. Additional examples of carriers, stabilizing and adjuvant agents are given in Martin, Remingtons. Pharm. Sci., 15th Ed. (Mack Publ. Co., Easton, 1975). The pharmaceutical composition can, if desired, be incorporated into liposome vesicles, microspheres, or other polymer matrices (Gregoriadis, Liposome Technology, Vol. 1 (CRC Press, Boca Raton, Florida 1984). Liposomes, which consist of phospholipids or other types. lipids are non-toxic, physiologically acceptable and metabolizable carriers, relatively easy to prepare and to administer.
Purifikovaný H-NUC (proteín) alebo H-NUC (nukleová kyselina) ako farmaceutické • prostriedky sa môžu použiť k inhibicii rastu rakovinových buniek, kontaktom týchto buniek s purífikovaným H-NUC alebo s aktívnym fragmentom alebo s prostriedkom, obsahujúcim tieto polypeptidy alebo proteíny.Purified H-NUC (protein) or H-NUC (nucleic acid) as a pharmaceutical composition may be used to inhibit the growth of cancer cells by contacting these cells with purified H-NUC or an active fragment or composition comprising these polypeptides or proteins.
Tento kontakt mohol byť zaistený in vitro, ex vivo alebo in vivo. Ak sa bunky inhibujú in vitro, kontakt sa zaisťuje zmiešaním prostriedku obsahujúceho nukleovú kyselinu alebo proteín podľa tohto vynálezu s bunkovou kultúrou a pridávaním tohto prostriedku do média. Metódy na určenie účinného množstva prostriedku sú známe.This contact could be ensured in vitro, ex vivo or in vivo. When cells are inhibited in vitro, contact is ensured by mixing the composition comprising the nucleic acid or protein of the invention with cell culture and adding the composition to the medium. Methods for determining the effective amount of the composition are known.
Táto metóda je tiež vhodná na liečbu alebo prevenciu patologických stavov vyznačujúcich sa abnormálne proliferujúcimi bunkami v objekte in vivo. V tomto prípade sa účinné množstvo prostriedku na inhibiciu proliferácie podáva priamo objektu (v prípade tohto vynálezu obratlovci obecne, napr. cicavci, ľudský pacienti) Táto metóda je obzvlášť vhodná na liečbu alebo prevenciu rakoviny prsníka u pacientov s nefunkčnou produkciou H-NUC proteinu.The method is also suitable for treating or preventing pathological conditions characterized by abnormally proliferating cells in an object in vivo. In this case, an effective amount of an agent for inhibiting proliferation is administered directly to the subject (in the present invention vertebrates in general, e.g., mammals, human patients). This method is particularly useful for treating or preventing breast cancer in patients with non-functional H-NUC protein production.
Podávanie môže prebiehať orálne, intravenózne, intramuskuláme alebo intraperitoneálne. Môže prebiehať kontinuálne alebo v pravidelných či nepravidelných intervaloch a môže sa meniť podľa typu objektu, rovnako ako podľa typu rekombinantných proteínov (Landmann a kol., J. Interferon Res., 12 (2) :103-11 (1992); Aulitzky a kol., Eur.Administration can be oral, intravenous, intramuscular or intraperitoneal. It may proceed continuously or at regular or irregular intervals and may vary according to the type of object as well as the type of recombinant proteins (Landmann et al., J. Interferon Res., 12 (2): 103-11 (1992); Aulitzky et al. ., Eur.
j. Cancer, 2 (6): 462-467 (1991); Lantz akol., Cytokine 2(6): 402-406 (1990); Supersaxo a kol., Pharm. Res., 5(8) : 472-476 (1988), Demetri a kol., J. Clin. Oncol. 7 (10) : 15451553 (1989); LeMaistre a kol., Lancet 337 : 1124-1125 (1991)).j. Cancer, 2 (6): 462-467 (1991); Lantz et al., Cytokine 2 (6): 402-406 (1990); Supersaxo et al., Pharm. Res., 5 (8): 472-476 (1988); Demetri et al., J. Clin. Oncol. 7 (10): 1545- 1553 (1989); LeMaistre et al., Lancet 337: 1124-1125 (1991)).
Vynález popisuje izolované nukleové kyseliny, ktoré kódujú aminokyselinovú sekvenciu zodpovedajúcu purifikovanému cicavčiemu H-NUC proteinu, H-NUC deriváty, H-NUC mutantné formy, aktívne fragmenty a protilátku proti H-NUC. Termín „nukleové kyseliny“ tu znamená jedno- alebo dvojreťazcovú molekulu DNA, cDNA alebo mRNA. Sekvencia nukleovej kyseliny kódujúcej H-NUC protein alebo jeho fragmenty je uvedená na obr. 3. Ďalej sa uvádzajú molekuly nukleových kyselín, ktoré hybridizujú za strigentných podmienok s molekulou DNA uvedenou na obr. 3. Hybridizujúce molekuly alebo sondy sa pripravili napr. posunom utajeného prerušenia v molekule nukleovej kyseliny, a takto vzniknuté hybridizujúce molekuly boli náhodnými fragmentárni pôvodnej molekuly uvedenej na obr. 3. Metodológiu na prípravu týchto fragmentov uvádza Sambrook a kol., Miolecular Cloning: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Press, Cold Sprig Harbor, N.Y. (1989). Fragmenty s dĺžkou najmenej 10 nukleotidov sa môžu používať ako hybridizačné sondy. Izolované fragmenty nukleových kyselín sa tiež môžu použiť na tvorbu nových peptidov. Tieto peptidy je možné použiť ako imunogény k tvorbe polyklonálnych a monoklonálnych protilátok.The invention provides isolated nucleic acids that encode an amino acid sequence corresponding to a purified mammalian H-NUC protein, H-NUC derivatives, H-NUC mutant forms, active fragments, and an anti-H-NUC antibody. The term "nucleic acids" as used herein means a single- or double-stranded DNA, cDNA or mRNA molecule. The nucleic acid sequence encoding the H-NUC protein or fragments thereof is shown in FIG. 3. Nucleic acid molecules that hybridize under stringent conditions to the DNA molecule shown in FIG. 3. Hybridizing molecules or probes were prepared e.g. by shifting the stealth discontinuity in the nucleic acid molecule, and the hybridizing molecules thus formed were random fragmentary of the parent molecule shown in FIG. 3. Methodology for the preparation of these fragments is provided by Sambrook et al., Miolecular Cloning: A Laboratory Manual of Cold Spring Harbor Press, Cold Sprig Harbor, N.Y. (1989). Fragments of at least 10 nucleotides in length can be used as hybridization probes. Isolated nucleic acid fragments can also be used to generate new peptides. These peptides can be used as immunogens to generate polyclonal and monoclonal antibodies.
Nukleová kyselina je tiež vhodná na inhibiciu bunkového delenia a proliferácie. Nukleová kyselina sa zavedie do buniek, bunky sa pestujú v podmienkach, ktoré dovolia produkciu H-NUC proteinu v účinnej koncentrácii pre inhibiciu rastu buniek. Nukleová kyselina sa môže vnášať pomocou lipozómových váčkov, v lipidovanom stave alebo pomocou d'aľšich génových nosičov ako sú vírusové vektory (Sambrook a kol.). S výhodou je možné túto metódu použiť u buniek rakoviny prsníka, ktoré majú mutantnú produkciu H-NUC proteinuThe nucleic acid is also useful for inhibiting cell division and proliferation. The nucleic acid is introduced into the cells, and the cells are grown under conditions that allow the production of the H-NUC protein at an effective concentration to inhibit cell growth. The nucleic acid can be delivered by liposome vesicles, in a lipidized state, or by other gene carriers such as viral vectors (Sambrook et al.). Preferably, the method is applicable to breast cancer cells having mutant H-NUC protein production
Liečenie ľudských chorob génovým prenosom sa v posledných rokoch prenieslo z oblasti teórie do praktického použitia. Ako prvý prípad v ľudskej terapii sa popisuje prípad prenosu génu pre adenozín deaminázu (ADA) do lymfocytov pacienta trpiaceho létálnym poškodením tohto génu, ktoré malo za následok ťažkú imunodeficienciu (september 1990). Výsledky boli veľmi povzbudzujúce a podnietili d’aľšie klinické skúšky (Culver, K.W., Anderson, W.F., Blaese, R.M., Hum. Gene. Ther., 1991 2:107).In recent years, the treatment of human diseases by gene transfer has been transferred from theory to practice. As the first case in human therapy, the case of the transfer of the adenosine deaminase (ADA) gene to the lymphocytes of a patient suffering from lethal damage to the gene, which resulted in severe immunodeficiency, is described (September 1990). The results were very encouraging and encouraged further clinical trials (Culver, K.W., Anderson, W.F., Blaese, R.M., Hum. Gene. Ther., 1991 2: 107).
. Doposiaľ najviac uskutočnených prenosov génov u ľudských pacientov je zlaožených na systéme prenosu pomocou retrovimsovej transformácie. Retrovírusové * vektory sú retrovirusy, z ktorých boli odstránené všetky vírusové gény alebo ktoré boli pozmenené tak, aby nemohli byť produkované v infikovaných bunkách. Replikačná schopnosť vírusu sa zaisťuje pomocou „zabalovacích“ buniek, ktoré produkujú všetky vírusové proteíny, bez toho aby vytvárali infekčné vírusové partikule. Zavedenie retrovírusových vektorov do „zabalovacích“ buniek má za následok produkciu viriónov, ktoré nesú vektor vo forme RNA a môžu infikovať cielové bunky, ale súčasne nedochádza k ďaľšiemu šíreniu vírusu po infekcii. Z dôvodu rozlíšenia procesu prirodzenej infekcie, kedy dochádza k replikách a ďaľšiemu šíreniu vírusu, sa radšej používa termín transdukcia než infekcia.. So far, most gene transfers in human patients have been based on a retrovims transformation system. Retroviral * vectors are retroviruses from which all viral genes have been removed or altered so that they cannot be produced in infected cells. The replication ability of the virus is assured by the "packaging" cells that produce all the viral proteins without forming infectious viral particles. The introduction of retroviral vectors into "packaging" cells results in the production of virions that carry the vector in the form of RNA and can infect target cells, but at the same time there is no further spread of the virus after infection. To distinguish between the natural infection process, where replicas occur and the virus spreads further, the term transduction is preferred to infection.
Systém schopný zaistiť dopravenie DNA do bunky je replikačne nekompletný retrovírusový vektor. Termín „retrovírusový“ zahŕňa, ale nie je obmedzený, na vektor alebo iný dopravovaci systém schopný zaistiť selektívne zvolenie cieľových buniek a zavedenie • nukleových kyselín do týchto deliacich sa buniek. Termín „replikačne nekompletný* sa definuje ako neschopnosť produkovať vírusové proteíny, nevyhnutné na šírenie vektoru v infikovaných hostiteľských bunkách.A system capable of providing DNA delivery to a cell is a replication incomplete retroviral vector. The term "retroviral" includes, but is not limited to, a vector or other delivery system capable of providing selective selection of target cells and introduction of nucleic acids into these dividing cells. The term "replication incomplete" is defined as the inability to produce the viral proteins necessary to propagate the vector in infected host cells.
Príkladom replikačne nekompletného retrovírusového vektoru je LNL6 (Miller, A.,D., a kol., BioTechniques 7 :980-990 (1989)). Metódy použitia replikačne nekompletných retrovírusových vektorov sa uvádza v Correll, P.,H. PNAS USA 86 : 8912 (1989), Bordignon, C., a kol., PNAS USA 86 : 8912-52 (1989), Culver, K. a kol., PNAS USA 88 : 3155 (1991), Rill, D.,R. a kol., Blood 79 : 2694-700 (1991). Klinické skúšky ukázali, že sa v spojení s použitím vírusových vektorov nevyskytovali žiadne alebo len malé nepriaznivé účinky (Anderson, Science 256 : 808-13 (1992)).An example of a replication incomplete retroviral vector is LNL6 (Miller, A., D., Et al., BioTechniques 7: 980-990 (1989)). Methods for using replication incomplete retroviral vectors are disclosed in Correll, P., H. PNAS USA 86: 8912 (1989), Bordignon, C., et al., PNAS USA 86: 8912-52 (1989), Culver, K. et al., PNAS USA 88: 3155 (1991), Rill, D. , R. et al., Blood 79: 2694-700 (1991). Clinical trials have shown that there were no or only minor adverse effects associated with the use of viral vectors (Anderson, Science 256: 808-13 (1992)).
Hlavnou výhodou retrovírusových vektorov pre génovú terapiu je vysoká účinnosť génového prenosu do replikujúcich sa buniek, presná integrácia prenášaných génov do bunkovej DNA a neschopnosť ďaľšieho šírenia vírusu po génovej transdukcii (Miller, A.,D., Náture, 1992, 357 : 455-460).The main advantages of retroviral vectors for gene therapy are the high efficiency of gene transfer into replicating cells, the precise integration of the transferred genes into cell DNA, and the inability of the virus to spread further after gene transduction (Miller, A., D., Nature, 1992, 357: 455-460 ).
Potenciálna produkcia pomocných replikačne kompetentných vírusov v priebehu tvorby retrovírusových vektorov zostáva v úvahe, aj keď pre praktické účely už bol tento problém vyriešený. Doposiaľ sa všetky retrovírusové vektory schválené FDA tvorili pomocou PA317 amfotrofhých „zabalujúcich“ buniek (Miller, A.D., Buttimore, C , Molec. Celí Biol. 1986 6 : 2895-2902). Použitie vektorov, ktoré majú len malý alebo žiadny prekrývajúci sa úsek s vírusovou sekvenciou PA317 v bunkách eliminuje produkciu pomocných vírusov (Lynch, C.M., Miller, A.D., J. Viral., 1991, 65 : 3887-3890). Je možné používať ďaľšie línie zabalovacíc buniek , napr. bunkové línie odvodené na oddeľovanie rôznych retrovírusových kódujúcich oblastí do rôznych plazmidov by mali redukovať produkciu pomocných vírusov rekombináciou. Vektory tvorené týmito bunkovými líniami tiež poskytujú účinný systém pre ľudskú génovú terapiu (Miller, A.D., 1992 Náture, 357 : 455-460).The potential production of helper-replication competent helper during the production of retroviral vectors remains under consideration, although for practical purposes this problem has been solved. To date, all FDA-approved retroviral vectors have been generated using PA317 amphotrophic "packaging" cells (Miller, A.D., Buttimore, C, Molec. Cell Biol. 1986 6: 2895-2902). The use of vectors having little or no overlapping region with the PA317 viral sequence in cells eliminates helper virus production (Lynch, C.M., Miller, A.D., J. Viral., 1991, 65: 3887-3890). Other cell packaging lines may be used, e.g. cell lines derived to separate different retroviral coding regions into different plasmids should reduce helper virus production by recombination. Vectors generated by these cell lines also provide an efficient system for human gene therapy (Miller, A.D., 1992 Nature, 357: 455-460).
V génovej terapii sa tiež používajú neretrovírusové vektory. Jednou z alternatív je adenovirus (Rosenfeld, M.A. a kol., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89 : 6482-6884). Hlavnou výhodou adenovírusových vektorov je ich schopnosť prenášať veľké úseky DNA (36 kb génom), vysoký titr (10n/ml), schopnosť infikovať tkanivá in situ (obzvlášť pľúcne). Doposiaľ najpresvedčivejším príkladom použitia takéhoto vektora je zavedenie génu pre ľudský transmembránový regulátor súvisiaci s cystickou fibrózou (CFTR) intracheálne do dýchacích ciest krýs (Rosenfeld, M.A., a kol., Celi, 1991, 63 : 143-155). Tiež herpes vírusy sa môžu použiť pre ľudskú génovú terapiu (Wolfe, J.H., a kol., Náture Genetics, 1 - 379384).Non-retroviral vectors are also used in gene therapy. One alternative is adenovirus (Rosenfeld, MA et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 6482-6884). The main advantages of adenoviral vectors are their ability to transmit large stretches of DNA (36 kb gene), high titer (10 n / ml), the ability to infect tissues in situ (especially lung). To date, the most convincing example of using such a vector is to introduce the human cystic fibrosis (CFTR) -related transmembrane regulator (CFTR) gene intra-nasally into rat airways (Rosenfeld, MA, et al., Celi, 1991, 63: 143-155). Also, herpes viruses can be used for human gene therapy (Wolfe, JH, et al., Nature Genetics, 1-379384).
Ďaľšou metódou génového prenosu je prenos plazmidovej DNA v lipozómových váčkoch priamo do ľudských buniek in situ (Nabel, E.G., a kol., Science, 1990, 249 . 12851288). Plazmidová DNA by mala ľahko získať certifikát pre použitie v ľudskej terapii, pretože, na rozdiel od retrovírusových vektorov, sa môže purifikovať do úplnej homogenity. Okrem prenosu sprostredkovaného lipozómami existujú ďaľšie spôsoby prenosu DNA, napr. naviazanie DNA na bunkové receptory, ak pred tým boli vytvorené komplexy plazmidov s vhodnými proteinami, ktoré sú vhodné na použitie v ľudskej génovej terapii (Wu, G.Y., a kol., J. Biol. Chem., 1991, 266 : 14338-14342, Curiel, D.T., a kol, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 1991, 88 : 8850-8854).Another method of gene transfer is the transfer of plasmid DNA in liposome vesicles directly to human cells in situ (Nabel, E.G., et al., Science, 1990, 249, 12851288). Plasmid DNA should readily be certified for use in human therapy because, unlike retroviral vectors, it can be purified to homogeneity. In addition to liposome-mediated transmission, there are other methods of DNA transfer, e.g. DNA binding to cellular receptors, if previously plasmid complexes with suitable proteins have been formed which are suitable for use in human gene therapy (Wu, GY, et al., J. Biol. Chem., 1991, 266: 14338-14342, Curiel, DT, et al., Proc. Natl. Acad Sci. USA, 1991, 88: 8850-8854).
H-NUC kódujúci gén sa môže vložiť pri použití známych metód do expresného vektoru (plazmidového alebo vírusového). Plazmidový expresný vektor sa môže zaviesť do tumorových buniek transfekciou v prítomnosti fosfátu vápenatého, pomocou lipozómov (napr. LIPOFECTIN), transfekciou sprostredkovanou DEAE dextranom, elektroporáciou a ďaľšími metódami vhodnými pre vstup DNA do bunky.The H-NUC coding gene can be inserted into known expression vectors (plasmid or viral) using known methods. The plasmid expression vector can be introduced into tumor cells by transfection in the presence of calcium phosphate, using liposomes (e.g., LIPOFECTIN), transfection mediated by DEAE dextran, electroporation, and other methods suitable for DNA entry into the cell.
Vírusový expresný vektor môže vstupovať do cieľovej bunky vo forme schopnej samostatnej exprexie infekciou alebo transdukciou. Používajú sa retrovírusové, adenovírusové vektory a vektory odvodené od herpes a avipox vírusov. Ak je H-NUC exprimovaný v akejkoľvek abnormálne proliferujúcej bunke, bunkový cyklus sa zastavuje, bunky stámu a umierajú a výsledné sa tedy znižuje množstvo abnormálneho tkaniva. Vektor schopný zaviesť génový konštrukt do cieľovej bunky a schopný zaistiť expresiu H-NUC v množstve suprimujúcom bunkovú proliferáciu sa môže podávať akýmkoľvek účinným spôsobom.The viral expression vector may enter the target cell in a form capable of selfexpression by infection or transduction. Retroviral, adenoviral and herpes and avipox virus-derived vectors are used. When H-NUC is expressed in any abnormally proliferating cell, the cell cycle is stopped, the cells stasis and die, resulting in a reduction in the amount of abnormal tissue. A vector capable of introducing a gene construct into a target cell and capable of expressing H-NUC in an amount that suppresses cell proliferation can be administered by any effective means.
Fyziologicky vhodný roztok obsahujúci účinnú koncentráciu aktívneho vektoru sa môže podávať intraokuláme, parenterálne, orálne, intranasálne, intravenózne, intramuskuláme, subkutánne alebo akýmkoľvek iným účinným spôsobom. Vektor môže byť priamo injekovaný do cieľového tumorového tkaniva v množstve účinnom na liečbu tumorových buniek tohto tkaniva.A physiologically acceptable solution containing an effective concentration of the active vector can be administered intraocularly, parenterally, orally, intranasally, intravenously, intramuscularly, subcutaneously, or by any other effective means. The vector may be directly injected into the target tumor tissue in an amount effective to treat the tumor cells of that tissue.
Alternatívne, tumory vyskytujúce sa v telových dutinách (oči, gastrointestinálny trakt, genitourinálny trakt (napr. močový mechúr), pulmonámy a bronchiálny systém) môžu byť ošetrované fyziologicky vhodným prostriedkom (fyziologický roztok soli alebo fosfátového pufiu, suspenzia alebo emulzia, ktorá je sterilná) obsahujúcim účinnú koncentráciu aktívneho vektoru priamou injekáciou alebo katetrizáciou do postihnutého orgánu. Pre riadenie presného zásahu je možné použiť rentgenové paprsky, sonografiu alebo fiberooptický vizualizačný systém.Alternatively, tumors occurring in the body cavities (eyes, gastrointestinal tract, genitourinal tract (e.g., bladder), pulmonary, and bronchial system) may be treated with a physiologically acceptable composition (saline or phosphate buffer, suspension or emulsion that is sterile) containing an effective concentration of the active vector by direct injection or catheterization into the affected organ. X-rays, sonography, or a fiberooptical visualization system can be used to control precise intervention.
Fyziologicky vhodný roztok obsahujúci účinnú koncentráciu aktívneho vektoru sa môže podávať sústavne do krvného obehu. Tento spôsob je vhodný v prípadoch, kedy tumory nie sú priamo dosiahnuteľné alebo nemôžu byť anatomicky izolované.A physiologically acceptable solution containing an effective concentration of the active vector can be administered continuously into the bloodstream. This method is useful in cases where tumors are not directly achievable or cannot be anatomically isolated.
Cieľové tumorové bunky sa môžu ošetrovať priamo vnášaním H-NUC proteinu, napr. v lipozómových váčkoch, ktoré sú vhodné na dopravovanie liekov, proteinov a plazmidových vektorov in vitro a in vivo (Mannini, R.J., a kol, Biotechiques, 1988, 6 : 682690) do cieľových buniek (Newton, A.C., Huestis, W.H., Biochimica et Biophysica Acta,Target tumor cells can be treated directly by introducing the H-NUC protein, e.g. in liposome vesicles suitable for delivery of drugs, proteins and plasmid vectors in vitro and in vivo (Mannini, RJ, et al., Biotechiques, 1988, 6: 682690) to target cells (Newton, AC, Huestis, WH, Biochimica et. Biophysica Acta,
1990, 1044 : 269-274, Ceccoll, J., a kol., Joumal of lnvestigative Dermatology, 1989, 93 : 190-194). H-NUC proteín sa enkapsuluje do lipozómových váčkov a zavádza sa do cicavčích buniek s vysokou účinnosťou.1990, 1044: 269-274, Ceccoll, J., et al., Joumal of Investigative Dermatology, 1989, 93: 190-194). The H-NUC protein is encapsulated into liposome vesicles and introduced into high efficiency mammalian cells.
Enkapsulovaný H-NUC proteín sa môže podávať intraokulárne, parenterálne, intranasálne, intratracheálne, subkutánne atď. v množstve účinnom na liečbu abnormálne proliferujúcich buniek v cieľovom tkanive. Lipozómy sa môžu podávať v akomkoľvek fyziologicky vhodnom prostriedku obsahujúcom účinnú koncentráciu enkapsulovaného HNUC proteínu.The encapsulated H-NUC protein may be administered intraocularly, parenterally, intranasally, intratracheally, subcutaneously, etc. in an amount effective to treat abnormally proliferating cells in the target tissue. Liposomes can be administered in any physiologically acceptable composition comprising an effective concentration of the encapsulated HNUC protein.
Na vnášanie nukleovej kyseliny kódujúcej H-NUC gén je vhodný celý rad ďaľších typov vektorov. Ako nukleová kyselina môže figurovať DNA, cDNA alebo RNA.A variety of other types of vectors are suitable for introducing the nucleic acid encoding the H-NUC gene. The nucleic acid may be DNA, cDNA or RNA.
Izolovaná molekula nukleovej kyseliny popisovaná v tomto vynáleze sa účinne môže vložiť za promótor riadiaci RNA traskripciu. Tieto molekuly sú vhodné na produkciu rekombinantného H-NUC proteínu alebo ako vektory používané v génovej terapii.The isolated nucleic acid molecule described herein can be effectively inserted after a promoter directing RNA transcription. These molecules are suitable for the production of recombinant H-NUC protein or as vectors used in gene therapy.
Vynález popisuje vektor, ktorý obsahuje vloženú izolovanú molekulu nukleovej kyseliny popísanú vyššie. S výhodou sa môžu používať kozmidy, plazmidové alebo vírusové vektory. Rad vhodných vektorov je popísaný v Sambrook a kol., supra a Zhu a kol., Science, 261 : 209-211 (1993). Po vložení do vhodnej hostiteľskej bunky (prokaryotickej alebo eukaryotickej) dochádza k produkcii rekombinantného H-NUC proteínu. Ako vhodné hostiteľské bunky je možné použiť bunky cicavčie, hmyzie, kvasinkové a bakteriálne (Sambrook a kol., supra).The invention provides a vector comprising the inserted isolated nucleic acid molecule described above. Preferably cosmids, plasmid or viral vectors may be used. A variety of suitable vectors are described in Sambrook et al., Supra and Zhu et al., Science, 261: 209-211 (1993). Upon introduction into a suitable host cell (prokaryotic or eukaryotic), recombinant H-NUC protein is produced. Suitable host cells include mammalian, insect, yeast, and bacterial cells (Sambrook et al., Supra).
Vynález popisuje metódu produkcie rekombinantného H-NUC proteínu alebo jeho derivátov rastúcimi hostiteľskými bunkami za vhodných podmienok pre expresiu nukleovej kyseliny kódujúcej H-NUC alebo jeho fragmenty. Vhodné podmienky môžu byť určené pomocou najrôznejších metód, viz Sambrook a kol., supra.The present invention provides a method for producing recombinant H-NUC protein or derivatives thereof by growing host cells under suitable conditions for expression of a nucleic acid encoding H-NUC or fragments thereof. Suitable conditions can be determined using a variety of methods, see Sambrook et al., Supra.
Vynález popisuje protilátku schopnú tvoriť komplex s H-NUC proteinom alebo jeho fragmenty. Termín „protilátka“ tu zahŕňa polyklonálne a monoklonálne protilátky. Obvykle sa jedná o krysie, myšie, králičie alebo ľudské protilátky.The invention provides an antibody capable of complexing with the H-NUC protein or fragments thereof. The term "antibody" includes polyclonal and monoclonal antibodies herein. They are usually rat, mouse, rabbit or human antibody.
Termín „protilátka alebo polyklonálna protilátka“ znamená proteín, ktorý sa tvory ako odpoved' na imunizáciu antigénom alebo receptorom. Termín „monoklonálna protilátka“ označuje imunoglobulín odvodený z jediného klonu buniek. Všetky monokloálne protilátky odvodené z jediného klonu sú chemicky a štrukturálne identické a špecifické pre jednu antigénovú determinantu.The term "antibody or polyclonal antibody" means a protein that is produced in response to immunization with an antigen or receptor. The term "monoclonal antibody" refers to an immunoglobulin derived from a single cell clone. All monoclonal antibodies derived from a single clone are chemically and structurally identical and specific for a single antigenic determinant.
Laboratórne metódy popisujúce prípravu monoklonálnych a polyklonálnych protilátok sú obsiahnuté napr. v Harlow a Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York (1989). Monoklonálne protilátky sa môžu biologicky produkovať vnesením H- NUC alebo jeho fragmentov do organizmu, napr. králika alebo myši. Bunky tvoriace protilátky v organizme sa izolujú a fuzujú s myelomovými alebo hetcromyelomovými bunkami a týmto spôsobom vznikajú hybridómy produkujúce monoklonálnu protilátku. Vynález popisuje hybridom produkujúci monoklonálnu protilátku tu používanú.Laboratory methods describing the preparation of monoclonal and polyclonal antibodies are exemplified by e.g. in Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York (1989). Monoclonal antibodies can be biologically produced by introducing H-NUC or fragments thereof into an organism, e.g. rabbit or mouse. Antibody-producing cells in the body are isolated and fused with myeloma or hetcromyeloma cells to produce monoclonal antibody-producing hybridomas. The invention provides hybridomas producing the monoclonal antibody used herein.
Vynález popisuje biologicky aktívne fragmenty polyklonálnych a monoklonálnych protilátok uvedených vyššie. Tieto „protilátkové fragmenty“ si ponechávajú určitú schopnosť selektívne viazať sa na antigén alebo imunogén. Medzi tieto protilátkové fragmenty patri:The invention provides biologically active fragments of the polyclonal and monoclonal antibodies listed above. These "antibody fragments" retain some ability to selectively bind to an antigen or immunogen. These antibody fragments include:
1) Fab, fragment, ktorý obsahuje monovalentný antigén-väzbový fragment pôvodnej protilátkovej molekuly získaný enzýmovou digesciou (pomocou enzýmu papain) tak, aby vznikol intaktný ľahký a časť jedného ťažkého reťazca molekuly protilátky,1) Fab, a fragment that contains a monovalent antigen-binding fragment of the original antibody molecule obtained by enzyme digestion (using the papain enzyme) to form an intact light and part of one heavy chain of the antibody molecule,
2) Fab', fragment protilátky získaný pôsobením pepsínu a následnou redukciou tak, aby vznikol intaktný ľahký reťazec a časť ťažkého reťazca; dva Fab* fragmenty sa získajú na jednu molekulu protilátky,2) Fab ', an antibody fragment obtained by treatment with pepsin and subsequent reduction to produce an intact light chain and part of the heavy chain; two Fab * fragments are obtained per antibody molecule,
3) (Fab'fe, fragment získaný pôsobením pepsínu bez následnej redukcie, F(ab*)2 je dimér dvoch Fab* spojených dvomi disulfidickými väzbami,3) (Fab'fe, a fragment obtained by treatment with pepsin without subsequent reduction, F (ab *) 2 is a dimer of two Fab * linked by two disulfide bonds,
4) Fv, fragment vytvorený technikami génového inžinierstva, ktorý obsahuje variabilnú oblasť ľahkého reťazca a variabilnú oblasť ťažkého reťazca, exprimovanými ako dva reťazce,4) Fv, a fragment generated by genetic engineering techniques that comprises a light chain variable region and a heavy chain variable region expressed as two chains,
5) SCA, molekula vytvorená technikami génového inžinierstva, ktorá obsahuje variabilnú oblasť ľahkého reťazca a variabilnú oblasť ťažkého reťazca, spojených vhodným polypeptidovým spojovníkom do jedinej fuzovanej molekuly.5) SCA, a molecule produced by genetic engineering techniques that comprises a light chain variable region and a heavy chain variable region linked by a suitable polypeptide linker to a single fused molecule.
Metódy tvorby fragmentov sú uvedené napr. v Harlow a Lane, supra. Špecifické príklady „biologicky aktívneho protilátkového fragmentu“ zahŕňajú CDR oblasti protilátok.Methods for generating fragments are disclosed, e.g. in Harlow and Lane, supra. Specific examples of a "biologically active antibody fragment" include the CDR regions of antibodies.
Vynález popisuje anti-idiotypické peptidy špecificky reagujúce s protilátkami alebo ich biologicky aktívnymi fragmentárni. Termín „anti-idiotypické pepdidy“ označuje purifikované protilátky z jedného druhu, ktoré sa injekujú do evolučné vzdialeného druhu a tu sú rozpoznané ako cudzorodé a vyvolávajú silnú humorálnu imunitnú odpoveď (Harlow a Lane, supra).The invention provides anti-idiotypic peptides specifically reacting with antibodies or biologically active fragment thereof. The term "anti-idiotypic peptides" refers to purified antibodies from one species that are injected into an evolutionary distant species and are recognized here as foreign and elicit a strong humoral immune response (Harlow and Lane, supra).
Súčasťou vynálezu sú proteiny alebo polypeptidy, ktoré boli produkované rekombinantnou cestou, biochemický alebo chemicky syntetizované alebo chemicky modifikované tak, aby zostala zachovaná ich schopnosť väzby H-NUC alebo jeho fragmentov. Schopnosť viazať antigén alebo imunogén sa určuje testami pre antigénnu väzbu (Harlow a Lane, supra).Proteins or polypeptides that have been produced by the recombinant pathway are biochemical or chemically synthesized or chemically modified so as to retain their ability to bind H-NUC or fragments thereof. The ability to bind antigen or immunogen is determined by antigen binding assays (Harlow and Lane, supra).
Protilátka alebo nukleová kyselina je naviazaná na detekovateľnú látku, ktorá umožňuje detekovať H-NUc proteín alebo jeho fragmenty vo vzorke s použitím štandardných imunochemických technik (napr. imunohistochémia), viz Harlow a Lane, supra, „Principles and Practice of Immunoassays, eds. C.J. Price a D.J. Newman, Stockton Press, New York, (1991).The antibody or nucleic acid is coupled to a detectable agent that allows the H-NUc protein or fragments thereof to be detected in a sample using standard immunochemical techniques (e.g., immunohistochemistry), see Harlow and Lane, supra, Principles and Practice of Immunoassays, eds. CJ Price and D.J. Newman, Stockton Press, New York, (1991).
Podávaná protilátka sa môže viazať na H-NUC a meniť jeho funkciu v bunke. Protilátka sa podáva v účinnej koncentrácii tak, aby funkcia H-NUC bola obnoviteľná. Protilátka sa tiež môže použiť terapeuticky na inhibíciu bunkového rastu naviazaním sa na H-NUC, ktorý tak stráca svoju schopnosť väzby na retinoblastómový proteín. Protilátka sa viaže na H-NUC a spôsobuje jeho preskladanie do aktívnej konfigurácie.The antibody administered can bind to H-NUC and alter its function in the cell. The antibody is administered at an effective concentration such that H-NUC function is recoverable. The antibody can also be used therapeutically to inhibit cell growth by binding to H-NUC, thereby losing its ability to bind to retinoblastoma protein. The antibody binds to H-NUC and causes it to fold into an active configuration.
Protilátky a molekuly nukleových kyselín uvedené v tomto vynáleze je možné použiť na detekciu a určenie prítomnosti či neprítomnosti H-NUC proteínu, alebo alternatívne zmeneného H-NUC génu v bunke alebo vo vzorke odobranej pacientovi. Týmto spôsobom je možné diagnostikovať rakovinu prsníka alebo zvýšenú citlivosť k jej výskytu.The antibodies and nucleic acid molecules disclosed herein can be used to detect and determine the presence or absence of an H-NUC protein, or alternatively, an altered H-NUC gene in a cell or sample taken from a patient. In this way it is possible to diagnose breast cancer or an increased sensitivity to its occurrence.
Vyššie uvedené proteiny, polypeptidy, nukleové kyseliny a fragmenty sa môžu použiť na prípravu liečiv vhodných k terapii.The aforementioned proteins, polypeptides, nucleic acids, and fragments can be used to prepare drugs useful in therapy.
Vynález bude teraz popísaný vo väčších detailoch pomocou nasledujúcich príkladov. Tieto príklady slúžia len ako ilustrativne a použitie uvedeného vynálezu sa nimi neobmedzuje.The invention will now be described in greater detail by the following examples. These examples are illustrative only and are not to be construed as limiting the invention.
Príklady vyhotovenia vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Experimentálne metódy a výsledkyExperimental methods and results
Za použitia kvasinkového dvoj-hybridného systému sa izolovalo 25 klonov, ktoré interagovali s C-koncovou oblasťou RB (p56-RB). Jedným z týchto klonov je kloň C49 (Durfee a kol., Gene Devel., 7:555-569 (1993)). C-koncová oblasť RB proteínu má dve nedotýkajúce sa domény potrebné pre väzbu onkoproteínov z rôznych vírusov DNA tumorov a oblasť podieľajúcu sa na DNA väzobnej aktivite. Jeden z proteínov asociovaných s RB má primárnu štruktúru a biochemické vlastnosti podobné proteínu nuc2 S pombe a proteínu bim A rodu Aspergillus. Mutácia týchto dvoch génov u nižších eukaryot spôsobuje zastavenie bunkového cyklu v metafazi, čo nasvedčuje dôležitosti úlohy týchto proteínov v priebehu mitózy. Tieto proteíny obsahujú repetitivny aminokyselinový motív (34 aminokyselín), označovaný ako TRP motív. Funkcia týchto repetíc nie je známa, ale je pravdepodobné, že tvorí amfipatické alfa-helixy, ktoré by mohli riadiť proteínové interakcie. Proteín tu popisovaný je prvý ľudský TRP proteín, ktorý bol izolovaný a charakterizovaný.Using the yeast two-hybrid system, 25 clones were isolated that interacted with the C-terminal region of RB (p56-RB). One of these clones is the C49 clone (Durfee et al., Gene Devel., 7: 555-569 (1993)). The C-terminal region of the RB protein has two non-touching domains necessary for binding of oncoproteins from different tumor DNA viruses and a region involved in DNA binding activity. One of the RB-associated proteins has a primary structure and biochemical properties similar to the nuc2 S pombe protein and the bim A protein of the genus Aspergillus. Mutation of these two genes in lower eukaryotes causes cell cycle arrest in metaphase, suggesting the importance of the role of these proteins during mitosis. These proteins contain a repetitive amino acid motif (34 amino acids), referred to as the TRP motif. The function of these repeats is unknown, but is likely to form amphipathic alpha-helices that could direct protein interactions. The protein described herein is the first human TRP protein to be isolated and characterized.
Testovanie cDNA knižníc a sekvenčné analýzyTesting of cDNA libraries and sequence analysis
Z dôvodu izolácie celkovej dĺžky H-NUC cDNA sa BglII fragment C-49 s dĺžkou 1,5 kb , pripravený podľa Durfee a kol., označil metódou posunu utajeného prerušenia a použil sa na testovanie ľudskej fibroblastovej cDNA knižnice plakovou hybridizáciou. cDNA inserty sa subklonovali do EcoRI miesta pBSK+ vektoru (Stragene, San Diego, Ca), aby sa uľahčilo Dna sekvencovanie. Vlastné sekvencovanie sa uskutočňovalo s použitím dideoxy-NTP a Sequenasy 2.0 podľa špecifikácie výrobcu (Biochemicals). K analýze sekvencie a hľadaniu homológií sa použil DNASTAR software (DNASTAR, In c., Madison, WI).To isolate the total length of the H-NUC cDNA, the 1.5 kb BglII fragment of C-49, prepared by Durfee et al., Was labeled with the stealth discontinuity method and used to test the human fibroblast cDNA library by plaque hybridization. The cDNA inserts were subcloned into the EcoRI site of the pBSK + vector (Stragene, San Diego, Ca) to facilitate DNA sequencing. Self sequencing was performed using dideoxy-NTP and Sequenase 2.0 according to the manufacturer's specification (Biochemicals). DNASTAR software (DNASTAR, In c., Madison, WI) was used for sequence analysis and homology search.
Konštrukcia GST fuznych proteínov, príprava proteínu a jeho väzba in vitroConstruction of GST fusion proteins, protein preparation and its binding in vitro
Z dôvodu konštrukcie GST-491 sa plazmid C-49 štiepil pomocou BglII a vzniknutý fragment s dĺžkou 1,3 kb sa subklonoval do BamHI miesta na plazmide pGEX-3X (Pharmacia, Piscataway, N.J.). GST-T sa pripravil štiepením pomocou HindlII. vzniknuté konce sa doplnili na tupo pomocou Klenow fragmentu a fragment s dĺžkou 823 bp sa subklonoval do pGEX-3X do Smal miesta. Expresia GST fúzneho proteínu v E coli (Smith a Johnson, Gene, 67 : 31-40 (1988)) se indukovala 0.1 mM IPTG. Bunky sa zcentrifugovali a pelet sa resuspendoval v Lysis 250 pufre (250 mM NaCl, 5 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8,0), 0,1% NP40, 1 mM phenylmethylsulfonylfluorid (PMSF), 8mm leupeptin, 8 mm antipain). Po pridaní 4 mg lysozymu a 30 minútovej inkubácii v 4°C sa bunky lyžovali sonikáciou. Hrubé zostatky sa odstránili centrifugáciou a supematant sa pridal k sefarózovým guličkám s naviazaným glutathiónom.Due to the construction of GST-491, plasmid C-49 was digested with BglII and the resulting 1.3 kb fragment was subcloned into the BamHI site on plasmid pGEX-3X (Pharmacia, Piscataway, N.J.). GST-T was prepared by digestion with HindIII. the resulting ends were blunt-ended with the Klenow fragment and the 823 bp fragment was subcloned into pGEX-3X at the SmaI site. Expression of the GST fusion protein in E. coli (Smith and Johnson, Gene, 67: 31-40 (1988)) was induced with 0.1 mM IPTG. Cells were centrifuged and the pellet was resuspended in Lysis 250 buffer (250 mM NaCl, 5 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.0), 0.1% NP40, 1 mM phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), 8mm leupeptin, 8mm antipain). . After 4 mg of lysozyme was added and incubated for 30 min at 4 ° C, the cells were lysed by sonication. The coarse residues were removed by centrifugation and the supernatant was added to the glutathione-bound sepharose beads.
Pre testy väzbovej aktivity in vitro sa extrakty pripravené z 2x106 buniek 2E3 (Chen a kol., 1992, infŕa) inkubovali so sefarózovými guličkami, ktoré obsahovali 2-3 mg GST alebo GST lužného proteínu v Lysis 150 pufre (50 mM Tris (pH 7,4), 150 mM NaCI, 5 mM EDTA, 0,1% NP-40, 50 mM NaF, 1 mM PMSF, 1 mg leupeptín na ml, 1 mg antipain na ml), po dobu 30 minút pri izbovej teplote. Komplexy sa dôkladne premývali v Lysis 150 pufre a po povarení v nanášacom pufre sa rozdelovali SDS-PAGE elektroforézou. Gély sa preniesli na nitrocelulózové membrány a po preblotovaní sa inkubovali s anti-RB monoklonálnou protilátkou 11D7. Ako sekundárna sa použila protilátka s naviazanou alkalickou fosfatázou, ktorá v prítomnosti 5-bromo-4-chloro-3-indolylfosfátu (toluidinová soľ) a tetrazoliovej modrej vizualizovala naviazaný RB proteín (BCIP, NBT, Promega, Madison, WI).For in vitro binding activity assays, extracts prepared from 2 x 10 6 2E3 cells (Chen et al., 1992, infra) were incubated with sepharose beads containing 2-3 mg GST or GST alluvial protein in Lysis 150 buffer (50 mM Tris (pH) 7.4), 150 mM NaCl, 5 mM EDTA, 0.1% NP-40, 50 mM NaF, 1 mM PMSF, 1 mg leupeptin per ml, 1 mg antipain per ml), for 30 minutes at room temperature. The complexes were washed extensively in Lysis 150 buffer and, after boiling in loading buffer, were separated by SDS-PAGE by electrophoresis. The gels were transferred to nitrocellulose membranes and incubated with anti-RB monoclonal antibody 11D7 after blotting. As a secondary, an alkaline phosphatase-linked antibody was used which, in the presence of 5-bromo-4-chloro-3-indolylphosphate (toluidine salt) and tetrazolium blue, visualized the bound RB protein (BCIP, NBT, Promega, Madison, WI).
Tvorba protilátok a identifikácia proteínuAntibody formation and protein identification
Anti-H-NUC protilátky sa pripravovali podľa Harlow a Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory (1988). 100 mg GST-491 fúzneho proteínu sa použilo na imunizáciu myši. Odobrané sérum sa priamo použilo na imunoprecipitačné experimenty. Približne 107 buniek z každej bunkovej línie sa metabolický označilo (3SS)-methionínom a následne lyžovalo vo vychladenom Lysis 150 pufre. Prečistený lyzát sa inkuboval s rôznymi protilátkami pri 4°C po dobu 1 hodiny, potom sa pridal proteín A naviazaný na sefaróze a inkubácia prebiehala ďaľšich 30 minút pri tej istej teplote. Po premytí lyzačným pufrom a povarení v SDS vzorkovom pufri sa imunoprecipitáty rozdelovali pomocou SDS elektroforézy. V prípade dvojitých imunoprecipitácii sa vzniknuté imunokomplexy povarili v 200 ml disociačného pufru I (20 mM Tris-Cl, pH 7,4, 50 mM NaCI, 1% SDS, 5 mM DDT), aby došlo k denaturácii proteínov. Denaturované proteíny sa rozpustili v 200 ml disociačného pufru II (20 mM TrisCl, pH 7,4, 50 mM NaCI, 1% NP-40, 1% Na-deoxycholát) a znovu imunoprecipitovali s protilátkou.Anti-H-NUC antibodies were prepared according to Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory (1988). 100 mg of the GST-491 fusion protein was used to immunize mice. Collected serum was directly used for immunoprecipitation experiments. Approximately 10 7 cells from each cell line were metabolically labeled with ( 3 S) -methionine and subsequently lysed in cold Lysis 150 buffer. The purified lysate was incubated with various antibodies at 4 ° C for 1 hour, then Sepharose-bound protein A was added and incubated for an additional 30 minutes at the same temperature. After washing with lysis buffer and boiling in SDS sample buffer, immunoprecipitates were separated by SDS electrophoresis. In the case of double immunoprecipitation, the resulting immunocomplexes were boiled in 200 ml dissociation buffer I (20 mM Tris-Cl, pH 7.4, 50 mM NaCl, 1% SDS, 5 mM DDT) to denature the proteins. The denatured proteins were dissolved in 200 ml dissociation buffer II (20 mM TrisCl, pH 7.4, 50 mM NaCl, 1% NP-40, 1% Na-deoxycholate) and immunoprecipitated with the antibody again.
Bunkové frakcionácieCell fractionation
Metóda na oddelenie membránových, jadrových a cytoplazmatických frakcii je upravená podľa Lee, H.W., Náture, (1987). Všetky tri frakcie sa testovali na prítomnosť RB a H-NUC proteínov pomocou imunoprecipitácie a alikvót z každej frakcie sa inkuboval s glutathiónovými sefarózovými guličkami na overenie jej zloženia.The method for separating membrane, nuclear and cytoplasmic fractions is adapted according to Lee, H.W., Nature, (1987). All three fractions were tested for the presence of RB and H-NUC proteins by immunoprecipitation, and aliquots from each fraction were incubated with glutathione sepharose beads to verify its composition.
DNA väzbový test lxlO7 K526 buniek ( ľudská chronická myelogénna leukémia (ATCC)) sa označili 35S-methionínom a lyžovali v Lysis 250 pufŕe. Lyzáty sa prečistili centrifugáciou a rozpustili v dvoch objemoch nanášacieho pufru (10 mM KH2PO4, pH 6,2, 1 mM MgCfe, 0,5% NP40, 1 mM DTT, 10% glycerol). Rozpustené extrakty sa naniesli na kolónu obsahujúcu celulózu s naviazanou DNA (DNA teľacieho thymu, Pharmacia, Piscataway, NJ). Inkubácia prebiehala po dobu 1 hodiny pri 4°C za jemného trepania. Kolóna sa premývala 5 objemami nanášacieho pufru a eluovala rovnakým pufrom, ktorý obsahoval ďalej sa zvyšujúcu koncentráciu NaCl. Jednotlivé frakcie sa analyzovali imunoprecipitáciami buď s anti-RB protilátkou, alebo s anti-H-NUC protilátkou podľa postupu popísaného vyššie. Alikvóty z každej frakcie sa inkubovali s glutathiónovými guličkami, aby sa overila prítomnosť glutathión transferázy.DNA binding assay of 1x10 7 K526 cells (human chronic myelogenous leukemia (ATCC)) was labeled with 35 S-methionine and lysed in Lysis 250 buffer. The lysates were clarified by centrifugation and dissolved in two volumes of loading buffer (10 mM KH 2 PO 4 , pH 6.2, 1 mM MgCl 2, 0.5% NP40, 1 mM DTT, 10% glycerol). The dissolved extracts were applied to a DNA-bound cellulose column (calf thymus DNA, Pharmacia, Piscataway, NJ). Incubate for 1 hour at 4 ° C with gentle shaking. The column was washed with 5 volumes of loading buffer and eluted with the same buffer containing a further increasing concentration of NaCl. Individual fractions were analyzed by immunoprecipitation with either anti-RB antibody or anti-H-NUC antibody according to the procedure described above. Aliquots from each fraction were incubated with glutathione beads to verify the presence of glutathione transferase.
Kvasinkový H-NUC expresný vektor, delečné mutantyYeast H-NUC expression vector, deletion mutants
DNA fragmenty odvodené z H-NUC cDNA sa subklonovali do pSEl 107 (Durfee akol., 1993). Kloň 491 je pôvodný kloň izolovaný pomocou dvojhybridného kvasinkového systému. H-NUC sa konštruoval vložením 3,3 kb Xhol fragmentu do modifikovaného pSE1107, aby vznikol fuzny proteín. RV obsahuje N-koncový Xhol-EcoRV fragment. BR208, BR207, B5 a B6 sú parciálne produkty po štiepení Sau3A. Gal4 fuzny proteín odvodený z týchto konštruktov obsahuje aminokyselinové sekvencie : 1-824 pre H-NUC, 559-824 pre 491, -1-663 pre RV, 699-824 pre BR2-8, 797-824 pre BR2-7, 559-769 pre B5, 597-796 pre B6. Teplotné senzitívna mutanta sa vytvorila vložením Nsil fragmentu z HNUC s pripojenými primérmi. Priméry sú nasledujúce :DNA fragments derived from H-NUC cDNA were subcloned into pSE1107 (Durfee et al., 1993). Stem 491 is the original stem isolated by a two-hybrid yeast system. H-NUC was constructed by inserting a 3.3 kb XhoI fragment into the modified pSE1107 to produce a fusion protein. The RV contains an N-terminal XhoI-EcoRV fragment. BR208, BR207, B5 and B6 are partial products after cleavage of Sau3A. The Gal4 fusion protein derived from these constructs comprises the amino acid sequences: 1-824 for H-NUC, 559-824 for 491, -1-663 for RV, 699-824 for BR2-8, 797-824 for BR2-7, 559- 769 for B5, 597-796 for B6. A temperature sensitive mutant was generated by inserting a Nsil fragment from HNUC with the primers attached. The primers are as follows:
Primér 1 .Primer 1.
TGGTATGACCTAGGAATGATTTATTACAAGCAAGAAAAATTCAGCCTTGCAGAATGGTATGACCTAGGAATGATTTATTACAAGCAAGAAAAATTCAGCCTTGCAGAA
ATGCAATGC
Primér 2 .Primer 2.
TTTCTGCAAGGCTGAATTTTTCTTGCTTGTAATAAATCATTCCTGGTCATACCAT GCATTTCTGCAAGGCTGAATTTTTCTTGCTTGTAATAAATCATTCCTGGTCATACCAT GCA
Všetky konštrukty sa overovali DNA sekvenčnou analýzou.All constructs were verified by DNA sequence analysis.
Kvasinková transformácia a kvantifikácia β-galaktosidázo vej aktivityYeast transformation and quantification of β-galactosidase activity
Kvasinková transformácia sa robila LiOAC metódou popísanou vyššie (Durfee a kol., 1993, supra). Po transformácii sa bunky vysiali na misky so syntetickým médiom bez tryptofanu a leucinu. Toto médium zaistilo selekciu na prítomnosť plazmidu. Po 2 až 3 dennom raste v 30°C sa jednotlivé kolónie z každej transformácie inokulovali do vhodného selekčného média a nechali rásť do OD 6oo 1,0-1,2. Bunky sa d'alej zpracovávali podľa Guarente, L., Methods Enzymol., 101 : 181-191 (1983). Kvantifikácia sa robila pomocou chlorofenyl-ŕj-galaktopyranozidu (CPRG, Boehringer Mannheim) podľa Duďee, 1993, supra.Yeast transformation was performed by the LiOAC method described above (Durfee et al., 1993, supra). After transformation, the cells were seeded in tryptophan and leucine-free synthetic medium dishes. This medium ensured selection for the presence of the plasmid. After 2-3 days growth at 30 ° C, individual colonies from each transformation were inoculated into a suitable selection medium and grown to an OD 600 of 1.0-1.2. Cells were further processed according to Guarente, L., Methods Enzymol., 101: 181-191 (1983). Quantification was performed with chlorophenyl-N-galactopyranoside (CPRG, Boehringer Mannheim) according to Duee, 1993, supra.
H-NUC sa viaže na nefosforylovaný RB proteín v oblasti podobnej SV40 T-antigén väzbovej doméneH-NUC binds to non-phosphorylated RB protein in SV40-like region of T-antigen binding domain
Zkonštruované delečné mutácie RB proteínu, pôvodne používané na popis Tväzbovej domény, sa subklonovali do plazmidov obsahujúcich Gal4 DNA väzbovú doménu, pASl (Durfee, 1993, supra). Dva z týchto DNA konštruktov, expresný plazmid obsahujúci fuzny proteín Gal4-aktivačná doména-C-49 a Yl pPTIO (indikačný plazmid obsahujúci beta-galaktosidázu), sa použili na kotransformáciu kvasinkového kmeňa Y153 (Durfee, 1993, supra). Úroveň expresie RB fuznych proteínov sa stanovovala analýzou Westem blotov podľa Sambrook a kol., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989). Úroveň expresie sa nelíšila viac ako 23 krát Výsledné transformanty sa testovali na beta-galaktosidázovú aktivitu podľa postupu uvedeného vyššie. Ako je ukázané na obr. 1, väzba C-49 fuzneho proteínu na Gal-4-RB sa zmenšuje u mnohých takých istých mutácií RB proteínu, vrátane bodovej mutácie, ktorá zamieňa Cys 706 za Phe a ktorá eliminuje väzbu SV 40 T-antigénu Je tu jedna výnimka, C49 nie je schopný viazať Ssp mutanty, ktoré nemajú C-koncový úsek RB proteínu s dĺžkou 160 aminokyselín, napriek tomu, že väzba T-antigénu pretrváva, aj keď s menšou afinitou. Ml delécia (aminokyseliny 612-632) , ktorá postihuje spojovaciu oblasť medzi dvomi väzobnými doménami, je jediná mutácia, ktorej produkt je schopný viazať ako H-NUC, tak aj T-antigén. Je teda jasné, že pre väzbu T-antigénu a C-49 sú nutné podobné, ale nie identické oblasti.The engineered deletion mutations of the RB protein originally used to describe the Binding Domain were subcloned into plasmids containing the Gal4 DNA binding domain, pAS1 (Durfee, 1993, supra). Two of these DNA constructs, an expression plasmid containing the Gal4-activating domain-C-49 fusion protein and Y1 pPTIO (indicating plasmid containing beta-galactosidase), were used to co-transform the yeast strain Y153 (Durfee, 1993, supra). The expression level of RB fusion proteins was determined by Westem blot analysis according to Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989). The expression level did not differ more than 23 times. The resulting transformants were tested for beta-galactosidase activity according to the procedure above. As shown in FIG. 1, the binding of C-49 fusion protein to Gal-4-RB diminishes in many of the same RB protein mutations, including a point mutation that confers Cys 706 to Phe and that eliminates SV 40 T-antigen binding There is one exception, C49 no is capable of binding Ssp mutants that do not have the 160 amino acid C-terminal region of the RB protein, although T-antigen binding persists, albeit with less affinity. The M1 deletion (amino acids 612-632) that affects the linker region between the two binding domains is the only mutation whose product is capable of binding both H-NUC and T-antigen. Thus, it is clear that similar but not identical regions are required for T-antigen and C-49 binding.
Ďalej sa testovala schopnosť C-49 fuzneho proteínu viazať sa na pl 10™ in vitro. Aminokyselinová sekvencia pllO™ je uvedená v Lee, W.H., Science 235 . 1394-1399 (1987). cDNA kloň s dĺžkou 1,3 kb (obr. 3) sa exprimoval ako glutathión-S-transferázový (GST) fuzny protein v E.coli (Smith a Johnson, Gene 67 : 31-40 (1988). Glutathiónové guličky obsahujúce rovnaké množstvo GST-C-49 proteínu a dve kontroly, GST samotný a GST-T-antigén (obr. 2) sa inkubovali s celkovým bunkovým extraktom z ľudských retinoblastómových bunkových línií (WERI RB27), v ktorých bol rekonštituovaný RB gén (Chen a kol, Celí Growth Differ. 3 :119-125 (1992)). Pri štandardných podmienkach tieto WERI (RB+) bunky exprimovali rozdielne izoformy RB proteínu, ktoré reprezentovali rôzne fosforylované stavy (viz obr. 2B, dráha 2). Po premytí sa naviazané proteíny analyzovali pomocou SDS-PAGE a Westem blotingom podľa Sambrook, supra. Blot sa testoval anti-RB protilátkou 11D7 (Shan a kol., Mol. Celí. Biol, 12 : 5620-5631 (1992)). Za týchto podmienok sa H-NUC bol schopný viazať len na nefosforylovanú formu pl 10™ s afinitou podobnou GST-T, ktorý slúžil ako pozitívna kontrola. GST samotný neviaže žiadny RB protein (viz obr. IA, dráhy 2-4). Tieto výsledky ukazujú, že H-NUC protein je schopný tvoriť komplex len s nefosforylovaným, natívnym a úplným RB proteínom.Further, the ability of the C-49 fusion protein to bind to p110 ™ in vitro was tested. The amino acid sequence of p110 ™ is set forth in Lee, W.H., Science 235. 1394-1399 (1987). The 1.3 kb cDNA clone (Figure 3) was expressed as a glutathione-S-transferase (GST) fusion protein in E. coli (Smith and Johnson, Gene 67: 31-40 (1988). Glutathione beads containing the same amount GST-C-49 protein and two controls, GST alone and GST-T-antigen (Fig. 2) were incubated with total cell extract from human retinoblastoma cell lines (WERI RB27) in which the RB gene was reconstituted (Chen et al, Cell Growth Differ. 3: 119-125 (1992)) Under standard conditions, these WERI (RB +) cells expressed different isoforms of RB protein, representing different phosphorylated states (see Figure 2B, lane 2). by SDS-PAGE and West blotting according to Sambrook, supra. The blot was tested with anti-RB antibody 11D7 (Shan et al., Mol. Cell. Biol, 12: 5620-5631 (1992)). capable of binding only to the non-phosphorylated form of p110 ™ with an affinity similar to GST-T, which GST alone does not bind any RB protein (see FIG. IA, lanes 2-4). These results indicate that the H-NUC protein is only able to complex with non-phosphorylated, native, and complete RB protein.
Celková cDNA a jej sekvencieTotal cDNA and its sequences
Aby sa mohol nový protein dôkladne charakterizovať, cDNA kloň s dĺžkou 1,3 kb sa použil ako sonda na testovanie ľudskej fibroblastovej cDNA knižnice. Z 12 izolovaných klonov sa kompletne osekvenoval najdlhší cDNA kloň, s dĺžkou 3,3 kb. Otvorený čítací rámec kóduje protein s dĺžkou 824 aminokyselín (obr. 3). Protein má 35% homológiu s dvomi známymi proteínmi, nuc2 S pombe a bimA Aspergillus nidulans. Proteíny oboch týchto nižších eukaryot sa zúčastňujú v mitóze, u teplotné senzitívnych mutácii v týchto génoch sa bunky zastavujú v metafázi. Nuc2 a bimA obsahujú desať repetitivnych sekvencii s dĺžkou 34 aminokyselín, usporiadaných tak, že jedna repetícia je lokalizovaná v Nkoncovej časti molekuly a zostávajúcich deväť v C-koncovej časti (viz obr. 4). Podobné repetitívne usporiadanie sa nachádzalo aj u nového proteínu asociovaného s RB proteínom. Ak sa porovnáva len deväť repetitivnych oblasti, sekvenčná identita je 60% (obr 4B). Sekvencie medzi prvou a druhou repetíciou u nuc2 a bimA majú však veľmi nízku homológiu. Táto nízka homológia je tiež charakteristická pre proteíny z klonu C-49. Podľa tejto sekvenčnej homológie je pravdepodobné, že izolovaný kloň je ľudským homológom kvasinkového nuc2 a bimA z Aspergillus nidulans. Preto bol tento proteín označený ako HNUC.To characterize the new protein thoroughly, a 1.3 kb cDNA clone was used as a probe to test the human fibroblast cDNA library. Of the 12 isolated clones, the longest 3.3 kb cDNA clone was completely sequenced. The open reading frame encodes a protein of 824 amino acids (Fig. 3). The protein has 35% homology to two known proteins, nuc2 S pombe and bimA Aspergillus nidulans. Proteins of both of these lower eukaryotes are involved in mitosis, and in temperature sensitive mutations in these genes, cells arrest in metaphase. Nuc2 and bimA contain ten 34 amino acid repeat sequences arranged such that one repeat is located in the N-terminal portion of the molecule and the remaining nine in the C-terminal portion (see Figure 4). A similar repetitive pattern was also found for the novel protein associated with the RB protein. If only nine repeat regions are compared, the sequence identity is 60% (FIG. 4B). However, the sequences between the first and second repeats of nuc2 and bimA have very low homology. This low homology is also characteristic of proteins from clone C-49. According to this sequence homology, the isolated clone is likely to be a human homolog of yeast nuc2 and bimA from Aspergillus nidulans. Therefore, this protein was designated as HNUC.
C-koncové repetitivne sekvencie H-NUC proteinu sa viažu na RB proteínThe C-terminal repeat sequences of the H-NUC protein bind to the RB protein
H-NUC proteín neobsahuje ani známy L-X-C-X-E motív, ktorým sa T-antigén a adenovirus E1A viaže na RB, ani 18 aminokyselinovú sekvenciu EF2, ktorá je tiež dôležitá pre naviazanie RB proteinu. Tieto nálezy naznačujú, že H-NUC proteín používa rozdielny motív pre väzbu RB proteinu. Aby sa uľahčilo nájdenie a definovanie tohto väzbového motívu, skonštruovala sa séria delečných mutánť z ktorých každá obsahovala rozdielnu oblasť cDNA H-NUC a exprimovala Gal4-fuzny proteín (víz obr. 5). Na určenie oblasti proteinu, ktorá obsahuje väzbový motív, sa použil kvasinkový dvojhybridný systém (Durfee, 1993, supra). Celý proteín a pôvodný kloň (obsahujúci 6 repetitívnych sekvencií) viažu RB proteín rovnako dobre. N-koncová oblasť, ktorá obsahuje prvú repetitívnu sekvenciu, však schopnosť väzby nemá. Delečné mutanty odvodené z rôznych časti pôvodného klonu tiež nedokážu viazať RB proteín. Tieto údaje naznačujú, že H-NUC sa môže viazať na RB novým spôsobom, snáď väčším úsekom so špecifickou sekundárnou štruktúrou.The H-NUC protein contains neither the known L-X-C-X-E motif by which the T-antigen and the E1A adenovirus bind to RB, nor the 18 amino acid sequence of EF2, which is also important for RB protein binding. These findings suggest that the H-NUC protein uses a different motif for RB protein binding. To facilitate locating and defining this binding motif, a series of deletion mutants were constructed, each containing a different region of H-NUC cDNA and expressing the Gal4-fusion protein (see Fig. 5). A yeast two-hybrid system was used to determine the region of the protein that contains the binding motif (Durfee, 1993, supra). The whole protein and the original clone (containing 6 repeat sequences) bind the RB protein equally well. However, the N-terminal region that contains the first repeat sequence does not have the ability to bind. Deletion mutants derived from different portions of the original clone also fail to bind the RB protein. These data suggest that H-NUC may bind to RB in a novel manner, perhaps by a larger region with a specific secondary structure.
Zámena Gly 640 za Asp vytvára H-NUC teplotné senzitívnu mutantu, ktorá má v nepermisívnej teplote nižšiu schopnosť väzby RBChanging Gly 640 to Asp creates an H-NUC temperature sensitive mutant that has a lower RB binding ability at a non-permissive temperature
Aby sa potvrdila fyziologická významnosť väzby H-NUC na RB protein, skonštruoval sa mutantný H-NUC proteín s jedinou bodovou mutáciou, ktorá spôsobila zámenu Gly 640 za Asp. Podobná zmena (Gly 504 za Asp) u nuc2 je zodpovedná za teplotné senzitívny fenotyp, ktorý zastavuje postup bunkového cyklu v metafázi u S. pombe (Hirano, T.Y., Hiaoka a M.Yanagida, J. Celí Biol. 106 : 1171-1183 (1988)). Gly je konzervatívny v H-NUC, rovnako ako v jeho kvasinkovom homológu, bolo by teda možné testovať, či mutácia zamieňajúca Gly za Asp spôsobí defekty vo väzbe na RB protein v nepermisívnej teplote. Podľa obr. 6 H-NUC protein s Gly 604 mutáciou v nepermisívnej teplote (37°C)' nie je schopný sa viazať, ale v permisívnej teplote (22°C) sa táto schopnosť obnovuje. Tieto údaje ukazujú väzbu medzi teplotné senzitívnym fenotypom predpokladaného zastavenia postupu bunkového cyklu v metafázi a schopnosti viazať RB proteín.To confirm the physiological significance of H-NUC binding to the RB protein, a mutant H-NUC protein was constructed with a single point mutation that caused the Gly 640 to be switched to Asp. A similar change (Gly 504 for Asp) in nuc2 is responsible for the temperature-sensitive phenotype that stops the cell cycle progression in metaphase in S. pombe (Hirano, TY, Hiaoka and M. Yanagida, J. Cell Biol. 106: 1171-1183 ( 1988)). Gly is conserved in H-NUC, as well as in its yeast homology, so it would be possible to test whether a mutation which replaced Gly with Asp would cause defects in binding to the RB protein at a non-permissive temperature. According to FIG. The 6 H-NUC protein with the Gly 604 mutation at the non-permissive temperature (37 ° C) is unable to bind, but at the permissive temperature (22 ° C) this ability is restored. These data show the linkage between the temperature-sensitive phenotype of putative cell cycle progression in metaphase and the ability to bind RB protein.
Príprava anti-H-NUC protilátky a identifikácia H-NUC proteínuPreparation of anti-H-NUC antibody and identification of H-NUC protein
Z dôvodu identifikácie H-NUC proteínu v proteínových géloch a Western blotoch sa pripravila anti-H-NUC protilátka. GST-C-49 sa exprímoval v E.coli (Smith a Johnson, 1988, supra, Shan a kol., 1992, supra) , purifikoval za pomoci glutathiónových guličiek a použil ako antigén, ktorý indukoval protilátkovú odpoveď u myši. Sérum obsahovalo polyklonálnu anti-H-NUC protilátku. Erytroleukemická bunková línia (K562) sa metabolický označila 3SS-methionínom a použila na prípravu bunkových lyzátov. Tieto lyzáty sa imunoprecipitovali polyklonálnou protilátkou. Ako je vidieť na obr. 6A, imúnnym sérom sa precipitoval špecifický proteín s molekulovou hmotnosťou 95 kD (dráha 2), s preimúnnym sérom se podobnej reakcie nedosiahlo. 95 kD proteín sa tiež identifikoval, pokiaľ bol použitý GST-fuzny proteín, ale nie v prípade GST samotného. Pôvodný antigén je ale schopný kompeticie s endogénnymi bunkovými proteinami a 95 kD proteínový pás sa stáva neidentifikovateľný (dráhy 3 a 4). Špecificita danej protilátky sa ďalej potvrdila, ak sa prvé imunoprecipitáty podrobili denaturácii a následnej reimunoprecipitácii. Ako je vidieť na obr. 6B, 95 kD proteín je jediný detekovateľný proteínový pás a pozadie je čisté. Všetky imunologické dôkazy nasvedčujú tomu, že 95 kD proteín je produkt H-NUC génu.To identify the H-NUC protein in protein gels and Western blots, an anti-H-NUC antibody was prepared. GST-C-49 was expressed in E. coli (Smith and Johnson, 1988, supra, Shan et al., 1992, supra), purified using glutathione beads, and used as an antigen that induced an antibody response in mice. The serum contained a polyclonal anti-H-NUC antibody. The erythroleukemic cell line (K562) was metabolically labeled with 3S S-methionine and used to prepare cell lysates. These lysates were immunoprecipitated with a polyclonal antibody. As can be seen in FIG. 6A, a specific protein with a molecular weight of 95 kD (lane 2) was precipitated by the immune serum, with no similar reaction with the pre-immune serum. The 95 kD protein was also identified when a GST-fusion protein was used, but not in the case of GST alone. However, the parent antigen is capable of competing with endogenous cellular proteins and the 95 kD protein band becomes unidentifiable (lanes 3 and 4). The specificity of the antibody was further confirmed when the first immunoprecipitates were subjected to denaturation and subsequent re-immunoprecipitation. As can be seen in FIG. The 6B, 95 kD protein is the only detectable protein band and the background is clear. All immunological evidence suggests that the 95 kD protein is the product of the H-NUC gene.
H-NUC proteín má DNA väzbovú aktivituThe H-NUC protein has DNA binding activity
Približne lxlO7 buniek označených 3SS-methionínom sa lyžovalo v Lysis 250 pufre (250 mM NaCl, 5 mM methionín, 50 mM Tris (pH 8,0), 0,1% NP40, 1 mM phenylmethylsulfonyl fluorid (PMSF), 8mg/ml leupeptin, 8 ml/ml antipaín). Lyzáty sa prečistili centrifugáciou a rozriedili dvomi objemami nanášacieho pufru (10 mM KH2PO4, pH 6,2, 1 mM MgCl2, 0,5% NP40, 1 mM DTT, 10% glycerol). Zriedené lyzáty sa naniesli na kolónu obsahujúcu celulózu s naviazanou DNA (DNA teľacieho thymu, Pharmacia, Poscantawas, NJ) a zmes sa inkubovala po dobu 1 hodiny pri teplote 4°C za mierneho trepania. Kolóna sa potom premyla 5 objemami nanášacieho pufru a eluovala tým istým roztokom so zvyšujúcou sa koncentráciou NaCl.Approximately 1x10 7 cells labeled with 3S S-methionine were lysed in Lysis 250 buffer (250 mM NaCl, 5 mM methionine, 50 mM Tris (pH 8.0), 0.1% NP40, 1 mM phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF), 8mg / ml. ml leupeptin, 8 ml / ml antipain). The lysates were clarified by centrifugation and diluted with two volumes of loading buffer (10 mM KH 2 PO 4, pH 6.2, 1 mM MgCl 2 , 0.5% NP40, 1 mM DTT, 10% glycerol). The diluted lysates were loaded onto a DNA-coupled cellulose column (veal thymus DNA, Pharmacia, Poscantawas, NJ) and incubated for 1 hour at 4 ° C with gentle shaking. The column was then washed with 5 volumes of loading buffer and eluted with the same solution with increasing NaCl concentration.
Frakcionácia každej z eluovaných vzoriek sa analyzovala imunoprecipitáciou s protilátkou proti retinoblastómovému proteínu (11D7, obr 7A), proti H-NUC (obr. 7B) alebo s glutathiónovými (GST) guličkami (obr. 7C). Alikvóty z každej frakcie sa tiež inkubovali s GST guličkami aby sa zistila glutathión transferáza. RB proteín má DNA väzbovú aktivitu a slúži ako pozitívna kontrola. H-NUC proteín má podobnú DNA väzbovú aktivitu, zatiaľčo glutatión transferáza samotná nevykazovala žiadnu podobnú aktivitu. Analýza sekvenčnej homológie naznačuje, že DNA väzbová oblasť H-NUC proteínu leží mimo TRP oblasť.Fractionation of each eluted sample was analyzed by immunoprecipitation with antibody to retinoblastoma protein (11D7, Figure 7A), against H-NUC (Figure 7B) or glutathione (GST) beads (Figure 7C). Aliquots from each fraction were also incubated with GST beads to detect glutathione transferase. The RB protein has DNA binding activity and serves as a positive control. The H-NUC protein has similar DNA binding activity, whereas glutathione transferase alone did not show any similar activity. Sequence homology analysis suggests that the DNA binding region of the H-NUC protein lies outside the TRP region.
H-NUC leží na chromozóme 17q21-22H-NUC lies on chromosome 17q21-22
In situ hybridizácia 3H-označenou sondou (3,3 kb H-NUC cDNA) na ľudských chromozómoch ukázala špecifické označenie oblasti q21-22 na chromozóme 17 (obr. 9). Vyhodnocovalo sa 320 pozitívnych signálov na 150 bunkách a z tohto počtu sa 42 (13,1) nachádzalo v oblasti q21-22 chromozómu 17. Pretože časť použitej sondy obsahuje sekvencie homologné ku svojím pseudogénom, v každej testovanej bunke sa detekovala násobná hybridizácia ku krátkym ramenám akrocentrických chromozómov. Tieto výsledky sa neanalyzovali. Podobných výsledkov sa dosiahlo aj hybridizáciou somatických buniek, kedy H-NUC bol tiež lokalizovaný na chromozóm 17. Lokalizácia H-NUC je zaujímavá, pretože známy gén rakoviny prsníka bol zmapovaný do tej istej oblasti.In situ hybridization with a 3 H-labeled probe (3.3 kb H-NUC cDNA) on human chromosomes revealed specific labeling of the q21-22 region on chromosome 17 (Fig. 9). 320 positive signals were evaluated on 150 cells, of which 42 (13.1) were in the q21-22 region of chromosome 17. Since part of the probe used contained sequences homologous to its pseudogenes, multiple hybridizations to short arms of acrocentric cells were detected in each cell tested. chromosomes. These results were not analyzed. Similar results were obtained by hybridization of somatic cells, where H-NUC was also localized to chromosome 17. The location of H-NUC is interesting because the known breast cancer gene has been mapped to the same region.
Tumor-supresorová aktivita H-NUCTumor-suppressor activity of H-NUC
Tumor-supresorová aktivita H-NUC sa testovala jak in vitro v podmienkach bunkovej kultúry, tak aj v živočíšnych modeloch (myši). Použili sa tieto bunkové línie: MDA-MB-231, ktorá obsahuje jednu funkčnú alelu H-NUC, a T-47D, ktorá je homozygotná mutanta v H-NUC iokuse.Tumor suppressor activity of H-NUC was tested both in vitro in cell culture conditions and in animal models (mice). The following cell lines were used: MDA-MB-231, which contains one functional allele of H-NUC, and T-47D, which is a homozygous mutant in the H-NUC ectus.
Účinok H-NUC na proliferáciu vyššie uvedených bunkových línií sa testoval expresiou H-NUC pomocou adenovírusového expresného vektoru. ACN je kontrolný adenovírusový vektor, ktorý neobsahuje cDNA insert, AC-H-NUC je adenovírusový vektor exprimujúci H-NUC pod kontrolou ľudského CMV promotora.The effect of H-NUC on the proliferation of the above cell lines was tested by expression of H-NUC using an adenoviral expression vector. ACN is a control adenoviral vector that does not contain a cDNA insert, AC-H-NUC is an adenoviral vector expressing H-NUC under the control of the human CMV promoter.
Adenovírusový vektor obsahujúci H-NUCAdenoviral vector containing H-NUC
Na skonštruovanie adenovírusového expresného vektora bolo nutné namnožiť fragment (2520 bp) zahŕňajúci celkovú H-NUC cDNA pomocou PCR z Quick Clone ds placentálnej cDNA (Clontech). Priméry použité na amplifikáciu pridali Κρη I reštrikčné miesto na 5' koniec fragmentu a Xho I reštrikčné miesto na 3' koniec. Tieto reštrikčné miesta dovoiovali priame klonovanie do násobného klonovacieho miesta plazmidu pBluescript II KS+ (5 primér 5CGCGGTACCATGACGGTGCTGCAGGAA3', 3 primér 5' ATCGGCTCGAGCAGAAGTTAAAATTCATC3 ). PCR cykly prebiehali takto: 1 cyklus 94“C 1 minutá, 30 cyklov 94°C 1 minutá, 53°C 11,5 minúty, 72°C 2 minúty, 1 cyklus 72°C 7 minút. Klony sa testovali na schopnosť produkovať KD proteín v TnT retikulocytámom lysačnom systéme (Promega). T3 promotor v Bluescript vektore dovoloval transkripciu a transláciu H-NUC kódujúcej sekvencie v králičích retikulocytoch. 1 mg minilyzátu DNA sa pridal na jednu retikulocytámu reakciu a inkuboval po dobu 1 hodiny pri 30°C. K 10 ml reakčnej zmesi sa pridal nanášaci pufor a vzorka sa naniesla na 10% polyakrylamidový gel (Novex) a delila sa pri 165 V po dobu 1,5 hodiny. Gel sa usušil, priložil sa film a nechal exponovať cez noc. Sekvencovali sa 4 klony tvoriace kompletný proteín. H-NUC insert sa vyštiepil z vektoru pomocou Κρη I a Hind Π a subklonoval do Kpn I-Bgl 11 miesta plazmidového vektoru pAdCMV (Bgl II tvoiý tupé konce). Všetky 4 klony obsahovali nejaké mutácie, preto sa správna sekvencia divokého typu vytvorila ligáciou fragmentov z dvoch klonov.To construct an adenoviral expression vector, it was necessary to amplify a fragment (2520 bp) comprising total H-NUC cDNA by PCR from Quick Clone ds placental cDNA (Clontech). The primers used for amplification added a Iρη I restriction site at the 5 'end of the fragment and an Xho I restriction site at the 3' end. These restriction sites allowed direct cloning into the multiple cloning site of plasmid pBluescript II KS + (5 primer 5CGCGGTACCATGACGGTGCTGCAGGAA3 ', 3 primer 5' ATCGGCTCGAGCAGAAGTTAAAATTCATC3). PCR cycles were run as follows: 1 cycle of 94 ° C for 1 minute, 30 cycles of 94 ° C for 1 minute, 53 ° C for 11.5 minutes, 72 ° C for 2 minutes, 1 cycle of 72 ° C for 7 minutes. Clones were tested for the ability to produce KD protein in the TnT reticulocyte lysis system (Promega). The T3 promoter in the Bluescript vector allowed transcription and translation of the H-NUC coding sequence in rabbit reticulocytes. 1 mg of minilyzate DNA was added per reticulocyte reaction and incubated for 1 hour at 30 ° C. To the 10 ml reaction mixture, a loading buffer was added and the sample was applied to a 10% polyacrylamide gel (Novex) and separated at 165 V for 1.5 hours. The gel was dried, film was applied and exposed overnight. Four complete protein clones were sequenced. The H-NUC insert was excised from the vector by ηρη I and Hind Π and subcloned into the Kpn I-Bgl 11 site of the plasmid vector pAdCMV (Bgl II blunt ends). All 4 clones contained some mutations, so the correct wild-type sequence was generated by ligating fragments from the two clones.
Z dôvodu skonštruovania rekombinantného adenovírusu sa vyššie uvedený plazmid linearizoval pomocou Nru I a kotransfektoval veľkým fragmentom dl309 mutanty štiepenej Cla I (Jones a Shenk, Celí 17 : 683-689 (1979) za použitia CaPO4 transfekčného systému (Stratagene). Vírusové plaky sa izolovali a rekombinantné formy sa identifikovali jednak analýzou štiepením a jednak pomocou PCR s použitím primérov proti H-NUC cDNA sekvencii. Rekombinantný vírus sa ďalej purifikoval a titroval štandardnými metódami (Graham a van der Erb, Virology, 52 : 456-457 (1973), Graham a Prevec, manipulation of adenovirus vectors. In: Methods in Molecular Biology Vol. 7, GeneTransfer and Expression Protocols, Munay E.J., (ed.) The Humana Press, lnc., Clifton N.J., 7: 109-128 (1991)).To construct a recombinant adenovirus, the above plasmid was linearized with Nru I and cotransfected with a large fragment of Cla30 cleaved mutants dl309 (Jones and Shenk, Cell 17: 683-689 (1979) using the CaPO 4 transfection system (Stratagene)). and recombinant forms were identified by both cleavage analysis and PCR using primers against the H-NUC cDNA sequence. The recombinant virus was further purified and titrated by standard methods (Graham and van der Erb, Virology, 52: 456-457 (1973), Graham and Prevec, manipulation of adenovirus vectors In: Methods in Molecular Biology Vol 7, GeneTransfer and Expression Protocols, Munay EJ, (ed.) The Humana Press, Inc., Clifton NJ, 7: 109-128 (1991)).
Pre zistenie, či H-NUC vektor uvedený vyššie exprimuje proteín zodpovedajúcej veľkosti, sa T-49 bunky infikovali buďto kontrolným, alebo rekombinantným adenovirusovým vektorom v intervale 24 hodín so zvyšujúcou sa multiplicitou infekcie (MO1, počet plaky tvoriacich jednotiek/bunka). Bunky sa premyli jeden krát v PBS a lyžovali v lyzačnom pufre (50 mM tris-HCl, pH 7,5, 250 mM NaCl, 0,1% NP40, 50 mM NaF, 5 mM EDTA, 10 mg/ml aprotinin, 10 ml/g leupeptín, 1 mM PMSF). Bunkové proteiny sa rozdelili SDS-PAGE elektroforézou a preniesli na nitrocelulózovú membránu.To determine whether the H-NUC vector above expresses a protein of the appropriate size, T-49 cells were infected with either control or recombinant adenovirus vectors at 24-hour intervals with increasing multiplicity of infection (MO1, plaque forming unit / cell number). Cells were washed once in PBS and lysed in lysis buffer (50 mM tris-HCl, pH 7.5, 250 mM NaCl, 0.1% NP40, 50 mM NaF, 5 mM EDTA, 10 mg / ml aprotinin, 10 ml (g leupeptin, 1 mM PMSF). Cell proteins were resolved by SDS-PAGE by electrophoresis and transferred to a nitrocellulose membrane.
Membrány sa inkubovali s anti-H-NUC protilátkou a potom s ovčou anti-myšou IgG konjugovanou s chrenovou peroxidázou. Expresia H-NUC proteinu sa vizualizovala chemiluminiscenciou (ECL kit, Amersham) na filme Kodak XAR-5.Membranes were incubated with anti-H-NUC antibody and then with sheep anti-mouse IgG conjugated with horseradish peroxidase. Expression of H-NUC protein was visualized by chemiluminescence (ECL kit, Amersham) on Kodak XAR-5 film.
In vitroIn vitro
Bunky tumorov prsníka línií MDA-MB-231 a T-47D sa vysiali približne v počte lxlO6 buniek na 100 mm misku na Kaighnovo F12/DME médium (Irvine Scientific) doplnené 10% FBS a 0,2 IU inzulínu (Sigma) pre T-47D bunky. Misky sa inkubovali 24 hodín pri 37°C v 7% CO?. Nasledujúci deň sa bunky prekryli 10 ml rastového média a infikovali buď ACN kontrolným vírusovým Iyzátom (MOI 10), alebo ACH-H-NUC vírusovým Iyzátom (MOI 10) a inkubovali pri 37’C. Po troch dňoch sa médium odstránilo a bunky sa fixovali roztokom kyselina octová/metanol v pomere 1:5. Bunky sa zafarbili roztokom 20% metanol/0,5% kryštálová violetová po dobu 30 minút a potom opláchli vodou, aby sa odstránil nadbytok farbiva.MDA-MB-231 and T-47D breast tumor cells were seeded at approximately 1x10 6 cells per 100 mm dish on Kaighn F12 / DME medium (Irvine Scientific) supplemented with 10% FBS and 0.2 IU insulin (Sigma) for T -47D cells. Plates were incubated for 24 hours at 37 ° C in 7% CO 2. The following day, cells were overlaid with 10 ml of growth medium and infected with either ACN control virus lysate (MOI 10) or ACH-H-NUC virus lysate (MOI 10) and incubated at 37 ° C. After three days the medium was removed and the cells were fixed with a 1: 5 acetic acid / methanol solution. Cells were stained with 20% methanol / 0.5% crystal violet for 30 minutes and then rinsed with water to remove excess dye.
Infekcia buniek T-47D ACN-H-NUC mala za následok inhibiciu rastu týchto buniek spôsobenú expresiou H-NUC proteinu. Priame pozorovanie T-47D buniek, infikovaných ACN-H-NUC, farbených kryštálovou violetovou ukazovalo zmenšujúci sa počet buniek (zhruba na 50%) v porovnaní s kotrolnými bunkami infikovanými ACN. Ďalej tiež došlo ku zmene v morfológii buniek T-47D. Bunky sa stávali viac kondenzované a strácali svoje rastové charakteristiky. K žiadnym takýmto zmenám nedošlo, pokiaľ boli bunky infikované ACN. Heterozygotné bunky MDA-MB-231 nevykazovali zrejmé ovplyvnenie ani pri infekcii ACN, ani ACN-H-NUC in vitro.Infection of T-47D cells with ACN-H-NUC resulted in inhibition of the growth of these cells caused by expression of the H-NUC protein. Direct observation of crystal violet stained T-47D cells infected with ACN-H-NUC showed a decreasing number of cells (about 50%) compared to control cells infected with ACN. Furthermore, there was a change in the morphology of T-47D cells. The cells became more condensed and lost their growth characteristics. No such changes occurred when the cells were infected with ACN. The heterozygous MDA-MB-231 cells showed no apparent effect on either ACN or ACN-H-NUC infection in vitro.
K odhadnutiu účinku H-NUC na bunkovú proliferáciu sa ďalej využívala thymidinová inkorporácia. Približne 3x10' MDA-MB-231 a T-47D buniek sa nanieslo na jednu jamku 96-jamkovej doštičky (Costar) a inkubovalo 24 hodín pri 37°C v 7% CO? Riadiaca rada ACN alebo ACN-H-NUC sa pripravila v DME:F12/15% FBS/1% glutamin a bunky sa infikovali s multiplicitnou infekciou 10 a 100 (4 jamky v každej MOI). Polovička objemu média sa menila 24 hodín po infekcii a každých 48 hodín do skončenia inkubácie. 18 hodín pred skončením inkubácie sa do každej jamky pridalo ImC ’H-thymidin (Amersham). 5 dni po infekcii sa bunky zachytili na sklenené filtre a 3H-thymidin inkorporovaný do nukleových kyselín sa detekoval kvapalinovou scintiláciou (TopCount, Packard Instruments). Stupeň bunkovej proliferácie (cpm/jamka) sa vyjadril ako percentá priemernej proliferácie neošetrovaných kontrolných buniek.Thymidine incorporation was further used to estimate the effect of H-NUC on cell proliferation. Approximately 3x10 5 MDA-MB-231 and T-47D cells were plated per well of a 96-well plate (Costar) and incubated for 24 hours at 37 ° C in 7% CO 2? The ACN or ACN-H-NUC control board was prepared in DME: F12 / 15% FBS / 1% glutamine and cells were infected with a multiplicity of 10 and 100 infection (4 wells per MOI). Half the volume of the medium was changed 24 hours after infection and every 48 hours until the end of incubation. 18 hours before the end of incubation, ImC'H-thymidine (Amersham) was added to each well. 5 days after infection, cells were harvested on glass filters and 3 H-thymidine incorporated into nucleic acids was detected by liquid scintillation (TopCount, Packard Instruments). The degree of cell proliferation (cpm / well) was expressed as a percentage of the average proliferation of untreated control cells.
Získané výsledky naznačujú, že proliferácia MDA-MB-231 buniek (heterozygotných pre H-NUC) bola podobná po infekcii ako ACN, tak aj ACN-H-NUC (obr. 12). V bunkách T-47D (delécia H-NUC) však došlo ku špecifickej odpovedi na infekciu ACN-H-NUC, • ktorá sa zvyšovala s rastúcou MOI. Tieto údaje ukazujú anti-proliferatívny účinok vyvolaný prenosom H-NUC génu sprostredkovaný adenovirusovim vektorom do buniek H-NUC mutantných.The results obtained indicate that the proliferation of MDA-MB-231 cells (heterozygous for H-NUC) was similar after infection with both ACN and ACN-H-NUC (Fig. 12). However, T-47D cells (H-NUC deletion) had a specific response to ACN-H-NUC infection, which increased with increasing MOI. These data show the anti-proliferative effect induced by adenoviral vector-mediated H-NUC gene transfer into mutant H-NUC cells.
Ex vivo génová terapiaEx vivo gene therapy
Aby sa mohol určiť vplyv H-NUC expresie na tumorogenicitu, testovali sa vyššie uvedené tumorové bunkové línie na schopnosť tvoriť tumory v modelovom organizme (myš). Približne 2xl07 T-47D buniek sa ošetrilo sucrosovým pufrom obsahujúcim ACN alebo ACN-H-NUC v MOI 3 alebo 30. Po cca 12 hodinovej infekcii sa 107 buniek injekovalo subkutánne do ľavého a pravého boku BALB/c myši, ktoré pred tým obdržali subkutánne pelety 17b-estradiolu. Jeden bok sa injekoval bunkami ošetrenými ACN, druhý bunkami ošetrenými ACN-H-NUC; každý organizmus teda slúžil ako vlastná kontrola. Zvieratá, ktoré obdržali bilaterálne neošetrené bunky, slúžili ako prídavná kontrola pre tumorový rast. Rozmery tumorov (dĺžka, šírka, výška) a hmotnosť sa merali dvakrát * týždenne. Objem tumorov sa odhadoval pomocou sférickej geometrie s polomerom zodpovedajúcim jednej polovičke priemeru nameraných tumorových veľkosti.To determine the effect of H-NUC expression on tumorigenicity, the above tumor cell lines were tested for their ability to form tumors in a model organism (mouse). Approximately 2x10 7 T-47D cells were treated with sucrose buffer containing ACN or ACN-H-NUC at an MOI of 3 or 30. After about 12 hours of infection, 10 7 cells were injected subcutaneously into the left and right flanks of BALB / c mice previously received subcutaneous pellets of 17b-estradiol. One flank was injected with ACN-treated cells, the other with ACN-H-NUC-treated cells; each organism therefore served as its own control. Animals receiving bilaterally untreated cells served as an additional control for tumor growth. Tumor dimensions (length, width, height) and weight were measured twice a week. Tumor volume was estimated by spherical geometry with a radius corresponding to one half the diameter of the measured tumor sizes.
aand
Výsledky tohto experimentu sú uvedené na obr. 13 a naznačujú významný úbytok tumorového rastu u buniek exprimujúcich H-NUC. 21 dní po inokulácii buniek sa merali tumory u všetkých živočíchov. Tumory vzniknuté z buniek ošetrených ACN-H-NUC (MOI = 30) boli menšie ako tumory z buniek ošetrených ACN (MOI = 30) v 4 prípadoch zo 4. Priemerná tumorová veľkosť pre ACN-H-NUC (MOI = 3%) ošetrené bunky zostávala menšia v porovnaní s ACN (MOI = 30) ošetrenými bunkami v 21-dennej perióde (viz obr.The results of this experiment are shown in FIG. 13 and indicate a significant loss of tumor growth in cells expressing H-NUC. 21 days after cell inoculation, tumors were measured in all animals. Tumors from ACN-H-NUC-treated cells (MOI = 30) were smaller than ACN-H-NUC-treated cells (MOI = 30) in 4 out of 4. Mean tumor size for ACN-H-NUC (MOI = 3%) treated cells remained smaller compared to ACN (MOI = 30) treated cells over a 21-day period (see FIG.
3). Tieto údaje ďalej potvrdzujú tumor-supresorovú aktivitu H-NUC proteínu prezentovanú v tomto vynáleze.3). These data further confirm the tumor suppressor activity of the H-NUC protein presented in the present invention.
In Vivo tumor-supresia H-NUCIn Vivo tumor suppression H-NUC
Bunky ľudskej rakoviny prsníka línie T-47D sa subkutánne injekovali samiciam BALB/c myší. Tumory sa vyvíjali 32 dni. Potom sa do peritumorálneho priestoru obklopujúceho tumor injekoval buď ACN adenovírusový vektor (ako kontrola), alebo ACN-H-NUC adenovírusový vektor (obsahujúci H-NUC gén). Tumory sa potom odobrali buď druhý, alebo siedmy deň po adenovirusovej infekcii a z každého tumoru sa izolovala poly-A+ RNA. K detekcii H-NUC RNA v ošetrovaných tumoroch slúžila PCR reakcia s reverznou transkriptázou (RT-PCR) pri použití H-NUC špecifických primérov. Ako kontrola RT-PCR slúžila amplifikácia s aktinovými primérami, plazmid obsahujúci rekombinantnú H-NUC sekvenciu poskytoval pozitívnu kontrolu pozície rekombinantného H-NUC pásu.T-47D human breast cancer cells were injected subcutaneously into female BALB / c mice. Tumors developed for 32 days. Then, either the ACN adenoviral vector (as a control) or the ACN-H-NUC adenoviral vector (containing the H-NUC gene) was injected into the peritumoral space surrounding the tumor. Tumors were then harvested either on the second or seventh day after the adenovirus infection and poly-A + RNA was isolated from each tumor. Reverse transcriptase PCR (RT-PCR) using H-NUC specific primers served to detect H-NUC RNA in treated tumors. As an RT-PCR control, amplification with actin primers served, a plasmid containing the recombinant H-NUC sequence provided a positive control of the position of the recombinant H-NUC band.
V oddelenom experimente sa T-47D bunky injekujú subkutánne do pravého boku myši a tumory sa nechávajú rásť po dobu dvoch týždňov. Myši dostávajú peritumorálne injekcie pufru alebo rekombinantného vírusu dvakrát týždenne do celkového počtu 8 dávok. Tumorový rast sa monitoruje u organizmov kontrolných, ktoré obdržali len ACN a pufor a u organizmov, ktoré obdržali ACN-H-NUC. Ďalej sa monitoruje ich telesná hmotnosť a doba prežitia.In a separate experiment, T-47D cells are injected subcutaneously into the right flank of the mouse, and tumors are allowed to grow for two weeks. Mice receive peritumoral injections of buffer or recombinant virus twice a week for a total of 8 doses. Tumor growth is monitored in control organisms that only received ACN and buffer, and in organisms that received ACN-H-NUC. Further, their body weight and survival are monitored.
Expresia exogénneho H-NUC v bunkách rakoviny prsníka línie T-47DExpression of Exogenous H-NUC in T-47D Breast Cancer Cells
Rakovinové bunky línie T-47D, ktoré neobsahujú žiadny endogénny H-NUC vďaka homozygotnej mutácii, poskytujú jasnú kontrolu pre funkčné štúdium H-NUC. T-47D bunky sa infikujú porovnateľným titrom buď ACN-H-NUC, alebo kontrolným ACN vektorom. Vačšina kolónii sa individuálne vyvíja na tkanivovú kultúru.Cancer cells of the T-47D line, which contain no endogenous H-NUC due to homozygous mutation, provide clear control for the functional study of H-NUC. T-47D cells are infected with a comparable titer with either ACN-H-NUC or a control ACN vector. Most colonies are individually developed for tissue culture.
Infikované bunky sa metabolický označujú 3SS-methionínom a použivají na prípravu lyzátov, ktoré slúžia na zhodnotenie množstva produkovaného proteínu. ACN-H-NUC infikované kultúry sa porovnávajú s kontrolnými bunkami čo sa týka morfológie, rastovej rýchlosti (t.j. čas zdvojenia), saturačnej hustoty, tvorby kolónii na agare a tumorogenicity.Infected cells are metabolically labeled with 3S S-methionine and used to prepare lysates to assess the amount of protein produced. ACN-H-NUC infected cultures are compared to control cells for morphology, growth rate (ie, doubling time), saturation density, agar colony formation, and tumorigenicity.
Priemyselná využiteľnosťIndustrial usability
Vynález popisuje diagnostické metódy používajúce nukleovú kyselinu kódujúcu HNUC proteín a H-NUC proteín. Predkladaný vynález sa týka podávania divokého typu HNUC tumor-supresorového génu alebo proteínu, ktorý je schopný suprimovať, zničiť alebo revertovať neoplastický fenotyp v rakovinových bunkách, ktoré sami neprodukujú H-NUC proteín. Vynález popisuje vektory kódujúce H-NUC proteín a H-NUC proteíny, ktoré sa môžu využívať pri liečbe rakoviny a metódy pre prípravu H-NUC proteínu a vektorov vhodných pre toto využitie.The invention provides diagnostic methods using a nucleic acid encoding an HNUC protein and an H-NUC protein. The present invention relates to the administration of a wild-type HNUC tumor suppressor gene or protein that is capable of suppressing, destroying or reversing the neoplastic phenotype in cancer cells that do not themselves produce the H-NUC protein. The invention provides vectors encoding an H-NUC protein and H-NUC proteins that can be used in the treatment of cancer and methods for preparing the H-NUC protein and vectors suitable for such use.
II
3f3f
Sekvenciasequence
1) obecné údaje1) general information
i) prihlasovatcT: Lcc, Wen - Hwa(i) applicant: Lcc, Wen - Hwa
Chen, Phang - Lang ii) názov vynálezu: Nový tumor - supresorový gén iii) počet sekvencii: 35 iv) Korešpondenčná adresa:Chen, Phang - Lang ii) Title of the invention: Novel tumor suppressor gene iii) Number of sequences: 35 iv) Mailing address:
A) adresa: Campbell a Flores , B) ulica: 4370 La Jolla Village Drivc, suite 700A) Address: Campbell and Flores, B) Street: 4370 La Jolla Village Drivc, suite 700
Q mesto: San Diego , D) štát: KaliforniaQ City: San Diego, D) State: California
E) krajina: USAE) country: USA
F) smerovacie äslo: 92122F) routing number: 92122
v) počítačová jednotka(v) computer unit
A) médium: floppy didcA) medium: floppy didc
B) poätač: IBM PCB) Computer: IBM PC
C) operačný systém: PC * DOS/MS - DOSC) Operating System: PC * DOS / MS - DOS
D) software: PatcntlnRdcasc 1.0, verzia 1.25 vi) súčasné údaje o prihláškeD) software: PatcntlnRdcasc 1.0, version 1.25 vi) current application details
A) prihláška äslo: US 08/170,586A) Application number: US 08 / 170,586
B) dátum plnenia: 20.12.1992(B) Date of performance: 20.12.1992
Ohodnotenie vii) predchádzajúce údaje o prihláškeEvaluation (vii) previous application data
A) prihláška äslo: US 08/170,586A) Application number: US 08 / 170,586
B) dátum plnenia: 20.12.1992 • viii) zástupcaB) Date of performance: 20.12.1992 • viii) Representative
A) meno: Campbell, Cathiyn AName: Campbell, Cathiyn
B) registračné äslo: 31,815 ix) telefón: (619) 535 - 9001 telefax: (619) 535 - 89B) Registration number: 31,815 ix) Phone: (619) 535 - 9001 Fax: (619) 535 - 89
2) SEQ ID No: 1:2) SEQ ID No: 2:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 3320 bpA) length: 3320 bp
B) typ: nukleová kyselinaB) type: nucleic acid
C) reťazec: dvojret'azccváC) string: double chains
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: cDNA iii) ďaľšie charakteristiky:D) topology: linear ii) molecular type: cDNA iii) other characteristics:
A) meno/kód: CDS(A) Name / code: CDS
B) umiestnenie: 101......2572 iv) sekvencia: SEQIDNo: 1:B) location: 101 ...... 2572 iv) sequence: SEQIDNo: 1:
CGGAATTCGC GGCCGCGTTT AAATGAGCTG GGGCTGGCCG GGCCGGAGCC GCTACAGGGGCGGAATTCGC GGCCGCGTTT AAATGAGCTG GGGCTGGCCG GGCCGGAGCC GCTACAGGGG
GGGCCTGAGG CACTGCAGAA AGTGGGCCTG AGCCTCGAGG ATG Met 1GGGCCTGAGG CACTGCAGAA AGTGGGCCTG AGCCTCGAGG ATG Met 1
ACC GTG CTG CAGACC GTG CTG CAG
Thr Val lcu GinThr Val lcu Gin
115115
295 300 305295 300 305
ZiGC SerZiGC Ser
AGC SerAGC Ser
ATG MetATG Met
ACA GAT GCG GAT GAC ACAACA GAT GCG
Thr Asd Ala Asp Asp Thr 81*0Asp Asp Thr 81 * 0
CAA CTT CAT GCA GCT Gin Leu His Ala Ala 815CAA CTT CAT GCA GCT Gin Leu His Ala Ala 815
GAA AGT Glu Ser S20GAA AGT Glu Ser S20
25632563
2) SEQ ID No: 2:2) SEQ ID No: 1:
i) sdkven&né charakteristiky:(i) wooden characteristics:
A) dĺžka: 824 aminokyselínA) length: 824 amino acids
B) typ: aminokysetinový reťazecB) type: amino acid chain
C) topológia: lineárna ii) molekulový typ: protdn xi) sekvencia: SEQ ID No: 2:C) topology: linear ii) molecular type: protdn xi) sequence: SEQ ID No: 2:
*fO* fO
26C 265 2'226C 265 2'2
Asp Ser Ser Thr Thr Lys Glu Αε.ί ser Lys Lys Leu Lvj Ľ.· ľ p.-. 395 390 395 ' 40 i!1 OAsp Ser Ser Thr Thr Lys Glu Αε.ί Ser Lys Lys Leu Lvj. · P p.-. 395 390 395 '40 i! 1 O
B05 g 10 2L5 i!-s Ala Ala Glu Ser Asp Glu PheB05 g 10 2L5 µ-Ala Ala Glu Ser Asp Glu Phe
820820
W /W /
//
2) SEQ ID No: 3:(2) SEQ ID No: 3:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 212 aminokyselínA) length: 212 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 3:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 3:
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 4:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 4:
Leu Leu Lys Leu 1Leu Leu Lys Leu 2
Leu Arg Glu AlaLeu Arg Glu Ala
Asn ThrAsn Thr
Phe Gly Lys GlyPhy Gly Lys Gly
Leu Asn Cys Phe val Tyr Leu LeuLeu Asn Cys Phe val
Gin Ser Leu ProGin Ser Leu Pro
Ala Gin Tyr Lys íle Glu Gin GinAla Gin Tyr Lys White Glu Gin Gin
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazoovýC) chains: single chain
D)topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: S:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: S:
Leu LeuLeu Leu
Cys LysCys Lys
Arg GluArg Glu
Glu AlaGlu Ala
Met Gly íle AsnMet Gly White Asn
Lys Gly \le LeuLys Gly Le leu
Tyr Leu ser HisTyr Leu ser His
Ala LeuAla Leu
Leu Pro cys SerLeu Pro Cys Ser
Ser HjlsSer Hjls
Tyr Asn cis TyrTyr Asn cis Tyr
Asn ThrAsn Thr
2)SEQIDNo: 6:2) SEQ ID NO: 6:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokysdinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 6:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 6:
Glu ThrGlu Thr
2) SEQ ID No: 7:(2) SEQ ID No: 7:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazoovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ Π) No: 7:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ Π) No: 7:
Tyr serTyr ser
2) SEQ ID No: 8:(2) SEQ ID No: 8:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťäzcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sdcvenda: SEQIDNo: 8:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sdcvenda: SEQIDNo: 8:
2) SEQIDNo: 9:2) SEQ ID NO: 9:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťázecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi)sdcvenda:SEQIDNo: 9:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sdcvenda: SEQIDNo: 9:
2) SEQIDNo: 10:2) SEQ ID NO: 10:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
Q reťazce: jednoreťazcovýQ strings: single string
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sckvcnda: SEQ ID No: 10:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 10:
<ι5<ι5
Arg UjsArg Ujs
2) SEQ ID No: 11:(2) SEQ ID No: 11:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazec Qreťhzce: jednoreťázcovýB) type: amino acid chain Q chain: single chain
D) topológia: lineárna ti) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 11:D) topology: linear thi) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 11:
Arg HisArg His
2) SEQ ID No: 12:(2) SEQ ID No: 12:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselinA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťázcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ti) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 12:D) topology: linear thi) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 12:
AlaAla
Tyr GlyTyr Gly
PhePhe
Thr Leu Glr. 5Thr Leu Glr. 5
Gly HisGly His
Glu TyrGlu Tyr
Val Ala A s.-. Glu GluVal Ala A. s.-. Glu Glu
TyrTyr
Asp LysAsp Lys
AlaAla
Leu Asp AlaLeu Asp Ala
Tvr ArgTvr Arg
Ser Gly íle As a Asp Ser rSer Gly White As and Asp Ser r
Arg HisArg His
2) SEQ ID No: 13:2) SEQ ID No: 12:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 13:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 13:
ser val Leu íle Thr Cvs íle Gly Het íle Tyr Glu Arg cys Lys Aspser val Leu clay Thr Cvs clay Gly Het clay Tyr Glu Arg cys Lys Asp
5 10 155 10 15
Tyr Lvs Lys Ala Leu Aso Phe Tvr Aso Arg Ala cvs Lys Leu Asp Glu ‘ ' 25' 30Tyr Lvs Lys Ala Le Aso Phe Tvr Aso Arg Ala cvs Lys Leu Asp Glu 25 '25' 30
Lys SerLys Ser
2) SEQ ID No: 14:(2) SEQ ID No: 14:
i) sekvenčné charalrtMictiIry·i) sequential charalrtMictiIry ·
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyseliinvý reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcový DjtopoMgia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 14:C) chains: single chain DjtopoMgia: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 14:
Ser Val Leu Leu cys His íle Gly val Val Cys His Ala Leu Lys Lys 15 10 15Ser Val Leu Leu Cys His White Gly val Val Cys His Ala Leu Lys Lys 15 10 15
Ser Glu Lys Ala Leu Asp Thr Leu Asn Lys Ala íle Val íle Asp Pro 20 25 30Ser Glu Lys Ala Leu Asp Thr Leu Asn Lys Ala White Val White Asp Pro 20 25 30
Lys AsnLys Asn
2) SEQ ID No: 15:(2) SEQ ID No: 15:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazec: jednoreťazcovýC) string: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 15:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 15:
His ser ttHis ser tt
2) SEQ ID No: 16:(2) SEQ ID No: 16:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka; 66 aminokyselínA) length; 66 amino acids
B) typ: amindkysdinový reťazecB) type: amindkyddín chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 16:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 16:
Glu ThrGlu Thr
2) SEQ Π> No: 17:2) SEQ Π> No: 17:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 88 aminokyselínA) length: 88 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ JD No: 17:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ JD No: 17:
His Ala Ala Glu Ser Asp Glu PheHis Ala Ala Glu Ser Glu Phe
2) SEQ ID No: 18:(2) SEQ ID No: 18:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 56 aminokyselínA) length: 56 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazec : B) type: amino acid chain :
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 18:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 18:
2) SEQ ID No: 19:(2) SEQ ID No: 19:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreftzoový(C) chains: single-phase
D) topológia: lineárna ii) moidadovýtyp: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 19:D) topology: linear ii) moid type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 19:
Pro Phe Val Leu Ala Lys Leu Gly Zle Thr Tyr Phe Glu Leu ValAscPro Phe Val Leu Gly Zle Thr Tyr Phe Glu Leu ValAsc
5 10 15‘5 10 15
Tyr Glu Lys Ser Glu Glu val Phe Gin Lys Leu Arg Asp Leu SerPreTyr Glu Lys Ser Glu Glu Val Phe Gin Lys Leu Arg Asp Leu SerPre
25302530
Ser ArgSer Arg
2) SEQ ID No: 20:(2) SEQ ID NO: 20:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 20:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 20:
Gly Trp val Leu Cys Gin íle Gly Arg Ala Tyr Phe Glu l.cu ser GluGly Trp val Leu Cys Gin White Gly Arg Ala Tyr Phe Glu l.cu ser Glu
10 i510 i5
Tyr Het Gin Ala Glu Arg íle Phe Ser Glu val Arg Arg íle Glu Asn 20 25 30Tyr Het Gin Ala Glu Arg Phe Ser Glu val Arg Arg Glu Asn 20 25 30
Tyr ArgTyr Arg
2) SEQ ID No: 21:(2) SEQ ID No: 21:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazec : B) type: amino acid chain :
C) reťazce: jednoreťázcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 21:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 21:
Pro Trp val Leu Ala Gin íle Gly Arg Ala Tyr Tyr Glu Gin Ala Met 15 10 15Pro Trp val Leu Ala Gin White Gly Arg Ala Tyr Tyr Glu Gin Ala Met 15 10 15
Tyr Thr Glu Ala Glu Lys Tyr Phe Val Arg val Lys Ala Met Ala Pro 20 25 30Tyr Thr Glu Ala Glu Lys
Ser ArgSer Arg
2) SEQ ID No: 22:2) SEQ ID No: 23:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: anunokyselinový reťazecB) type: anunoacid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 22:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 22:
2) SEQ ID No: 23:(2) SEQ ID No: 23:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 23:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 23:
Pro Glu Ala Trp Cys Ala Ala Gly Asn Cys Phe Ser Leu Gin Arg Glu 15 10 15Pro Glu Ala Trp Cys Ala Ala Gly Asn Cys Phe Ser Leu Gin Arg Glu 15 10 15
His Asp íle Ala íle Lys phe Phe Gin Arg Ala íle Gin val Asp pro 20 25 30His Asp Goals Ala Lys phe Phe Gin Arg Ala Goals Gin val Asp for 20 25 30
Asn TyrAsn Tyr
2) SEQ ID No: 24:2) SEQ ID No: 25:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 24:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 24:
pro Glu Ala Trp cys Ala val Gly Asn ser Phe ser His Gin Arg Asp 1 5 10 -15for Glu Ala Trp cys Ala val Gly Asn ser Phe ser His Gin Arg Asp 1 5 10 -15
His Asp Gin Ala Leu Lys cys Phe Lys Arg Ala Thr Gin Leu Asp Pro 20 25 30His Asp Gin Ala Leu Lys cys Phe Lys Arg
His PheHis Phe
2) SEQ ID No: 25:(2) SEQ ID No: 25:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťtazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 25:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 25:
Tyr Asn Ala Trp Tyr Gly Leu Gly Met Val Tyr Leu Lys Thr Glv ArgTyr Asn Ala Trp Tyr Gly Leu Lys Thr Glv Arg
5 10 15*5 10 15 *
Asn Asp Gin Ala Asp Phe His Phe Gin Arg Ala Ala Glu íle Asn ProAsn Asp Gin Ala Asp Phe His Phe Gin Arg Ala Ala Glu White Asn Pro
25 3025 30
Asn AsnAsn Asn
2) SEQ ID No: 26:2) SEQ ID No: 25:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 26:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 26:
Gin SerGin Ser
2) SEQ ID No: 27:(2) SEQ ID No: 27:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťázecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednorefrzcovýC) chains: single-chain
D) topoMgia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ IDNo: 27:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ IDNo: 27:
Ser AsnSer Asn
2) SEQ IDNo: 28:2) SEQ ID NO: 28:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednorcftzcovýC) chains: single-stranded
D) Urológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 28:D) Urology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 28:
Asp GluAsp Glu
2) SEQ IDNo: 29:2) SEQ ID NO: 29:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťhzcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 29:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 29:
Pro Leu Cys Lys Phe His Arg Ale ser val Leu Phe Ala Asn Glu Lys 15 10 15Pro Leu Cys Lys Phe His Arg But ser val Leu Phe Ala Asn Glu Lys 15 10 15
Tyr Lys ser Ala Leu Gin Glu Leu Glu Glu Leu Lys Gin íle val Pro 20 25 30Tyr Lys ser Ala Leu Glu Glu Leu Glu Glu Leu Lys Gin White val Pro 20 25 30
Lys GluLys Glu
2) SEQ ID No: 30:(2) SEQ ID No: 30:
i) sekvenCné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 34 aminokyselínA) length: 34 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topoMgia: lineárna ii) molekiik>výtyp: peptid xi) sdcvenda: SEQ ID No: 30:D) topology: linear ii) molecule> type: peptide xi) sdcvenda: SEQ ID No: 30:
2) SEQ ID No: 31:2) SEQ ID No: 32:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 27 aminokyselínA) length: 27 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topdógia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvenda: SEQ ID No: 31:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 31:
Phe Arg Lys Ala Zle Arg Val Asn Val Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr 15 10 15Phe Arg Lys Ala Zle Arg Asn Val Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr 15 10 15
Gly Leu Gly Met val Tyr Leu Lys Thr Gly ArgGly Leu Gly Met val. Tyr Leu Lys Thr Gly Arg
2525
2) SEQ ID No: 32:2) SEQ ID No: 33:
i) sekvenCné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 27 aminokyselínA) length: 27 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 32:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 32:
ssss
Phe Arg Asn Ala íle Arg Val Asn Pro Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr 15 10 15Phe Arg Asn Ala ile Arg Val Asn Pro Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr 15 10 15
Gly Leu Gly Met íle Tyr Tyr Lys Gin Glu LysGly Leu Gly Met I Tyr Tyr Lys Gin Glu Lys
2525
2)SEQIDNó: 33:2) SEQ ID NO: 33:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 27 aminokyselínA) length: 27 amino acids
B) typ: amirnkyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťazcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: peptid xi) sekvencia: SEQ ID No: 33:D) topology: linear ii) molecular type: peptide xi) sequence: SEQ ID No: 33:
Phe Arg Asn Ala íle Arg val Asn Pro Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr 15 10 15Phe Arg Asn Ala ile Arg val Asn For Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr 15 10 15
Asp Leu Gly Het íle Tyr Tyr Lys Gin Glu LysAsp Leu Gly Het White Tyr Tyr Lys Gin Glu Lys
2525
2) SEQ ID No: 34:(2) SEQ ID No: 34:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 3320 bpA) length: 3320 bp
B) typ: nukleová kyselinaB) type: nucleic acid
C) reťázce: dvgrcťäzcováC) chain: double-stranded
DJtopológia: lineárna ii) mddmlovýtyp: cDNA ix) ďaTSie charakteristiky:DJtopology: linear ii) mddml type: cDNA ix) other characteristics:
A) menoAád: CDSA) nameAad: CDS
B) umiestnenie: 101......2572 xi) sekvencia: SEQ ID No: 34:B) location: 101 ...... 2572 xi) sequence: SEQ ID No: 34:
CGGAATTCGC GGCCGCGTTT AAATGAGCTG GGGCTGGCCG GGCCGGAGCC GCTACAGGGG 60CGGAATTCGC GGCCGCGTTT AAATGAGCTG GGGCTGGCCG GGCCGGAGCC GCTACAGGGG 60
S*fS * f
ACT GAA GAA TTG GAC AAA GCA TTA GCT TGT TTT CGA AAT GCT ATC AGA1987ACT GAA GAA TTG GAC AAA GCA ATA AGA1987
Thr Glu Glu Leu Asp Lys Ala Leu Ala Cys Phe Arg Asn Ala ÍleArgThr Glu Glu Leu Asp Lys Ala Leu Ala Cys Phe Arg Asn Ala IleArg
615 620625615 620625
GTC AAT CCT AGA CAT TAT AAT GCA TGG TAT GGT TTA GGA ATG ATT TAT2035GTC AAT CCT AGA CAT TAT AAT GCA TGG TAT GGT TTA GGA ATG ATT TAT2035
Val Asn Pro Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr Gly Leu Gly Met íleTyrVal Asn Pro Arg His Tyr Asn Ala Trp Tyr Gly Leu Gly Met WhiteTyr
630 635 640645630 635 640645
TAC AAG CAA GAA AAA TTC AGC CTT GCA GAA ATG CAT TTC CAA AAA GCC2083TAC AAG CAA GAA AAA TTC AGC GTC2083
Tyr Lys Gin Glu Lys Phe Ser Leu Ala Glu Met His Phe Gin LysAlaTyr Lys Gin Lys Phe Ser Leu Ala Glu Met His Phe Gin LysAla
650 655660650 655660
CTT GAT ATC AAC CCT CAA AGT TCA GTT TTA CTT TGC CAC ATT GGA G? A2131CTT GAT ATC AAC CCT CAA AGT TCA GTT TTA A2131
Leu Asp Xle Asn Pro Gin Ser Ser Val Leu Leu Cys His íle GlyvalLeu Asp Xle Asn For Gin Ser Ser Val Leu Leu Cys His White Glyval
665 670675665 670675
GTT CAA CAT GCA CTG AAA AAA TCA GAG AAG GCT TTG GAT ACC CTA AAC2179 val Gin His Ala Leu Lys Lys Ser Glu Lys Ala Leu Asp Thr LeuAsnGTT CAA CAT GCA ACC GTA AAC2179 val Gin Lys Lys Ser Glu Lys Ala
680 685690680 685690
AAA GCC ATT GTC ATT GAT CCC AAG AAC CCT CTA TGC AAA TTT CAC AGA2227AAA GCC ATT GTC ATT GAT
Lys Ala Xle val íle Aso Pro Lys Asn Pro Leu Cys Lys Phe HisArgLys Ala Xle val Aso Pro Lys Asn Pro Leu Cys Lys Phe HisArg
695 ' 700705695 '700705
GCC TCA GTT TTA TTT GCA AAT GAA AAA TAT AAG TCT GCT TTA CAA GAA2275GCC TCA GTA TAT GTA TAT GAT AAT GAA AAA TAT AAG TCT
Ala Ser val Leu Phe' Ala Asn Glu Lys Tyr Lys Ser Ala Leu GinGluAla Ser val Leu Phe 'Ala Asn Glu Lys Tyr Lys Ser Ala Leu GinGlu
710 715 720'725710 715 720'725
CTT GAA GAA TTG AAA CAA ATT GTT CCC AAA GAA TCC CTC GTT TAC TTC2323CTT GAA GAA TTG AAA CAA ATT GTT TTC2323
Leu Glu Glu Leu Lys Gin Xle val Pro Lys Glu Ser Leu val TyrPheLeu Glu Glu Leu Lys Gin Xle val For Lys Glu Ser Leu val TyrPhe
730 735740730 735740
TTA ATA GGA AAG GTT TAC AAG AAG TTA GGT CAA ACG CAC CTC GCC CTG2371TTA ATA GGA AAG GTT TAC AAG AAG TTA GGT CAA ACG CAC CTC GCC CTG2371
Leu íle Gly Lys Val Tyr Lys Lys Leu Gly Gin Thr His Leu AlaLeuLeu Gly Lys Val Tyr Lys Leys Gly Gin Thr His Leu AlaLeu
745 750755745 750755
ATG AAT TTC TCT TGG GCT ATG GAT TTA GAT CCT AAA GGA GCC AAT AAC2419ATG AAT TTC TCT TGG GCT ATG GAT TAT GAT CCT AAA GGA GCC AAT AAC2419
Met Asn Phe ser Trp Ala Met asd Leu Asp Pro Lys Gly Ala AsnAsr.Met Asn Phe Ser Trp Ala Met Asd Leu Asp Pro Lys Gly Ala AsnAsr.
760 765770760 765770
CAG ATT AAA GAG GCA ATT GAT AAG CGT TAT CTT CCA GAT GAT GAG GAG2467CAG GAT GAT GAG GAT GAT GAG GAT GAT
Gin íle Lys clu Ala íle Asp Lys Arg Tyr Leu Pro Asp Asp GluGluGin White Lys Clu Ala White Asp Lys Arg Tyr Leu For Asp Asp GluGlu
775 780785775 780785
CCA ATA ACC CAA GAA GAA CAG ATC ATG GGA ACA GAT GAA TCC CAG GAG2515 ?ro Xle Thr Gin Glu Glu Gin íle Met Gly Thr Asp Glu Ser Gin GluCCA ATA ACC CAA GAA GAA CAG ATC ATG GGA ACA GAT GAA TCC CAG GAG2515? Ro Xle Thr Gin Glu Glu White Met Gly Thr Asp Glu Ser Gin Glu
790 795 800e05790 795 800 e05
AGC AGC ATG ACA GAT GCG GAT GAC ACA CAA CTT CAT GCA GCT GAA AGT2563 ser Ser Met Thr Asp Ala Asp Aso Thr Gin Leu His Ala Ala Glu SerAGC AGC ATG ACA GAT GCG GAT GAC ACA CAA CTT CAT GCA GCT GAA AGT2563 Ser Ser Thr Asp Ala Asp Aso Thr Gin Leu His Ala Ala Glu Ser
810 815820810 815820
GAT GAA TTT TAACTTCTGG AAATCAGACT TTTACAACTG GATGTGTGAC2612GAT GAA TTT TAATTCTGG AAATCAGACT TTTACAACTG GATGTGTGAC2612
Asp Glu PheAsp Glu Phe
TAGTGCTGAC GTGTTTCTTG TCCCTC7GTA TACTGAGTCT TTACTCTTG/ι GCTGGCGGTG2672TAGTGCTGAC GTGTTTCTTG TCCCTC7GTA TACTGAGTCT TTACTCTTG / ι GCTGGCGGTG2672
7CATCGTCCG TCACTTATAC CATGAG7GTG CCACTTTCAT TGGACCCTGA CTGTATACAG27327CATCGTCCG TCACTTATAC CATGAG7GTG CCACTTTCAT TGGACCCTGA CTGTATACAG2732
AATGAAAGGC AGTGCAATAT TTAGCTGC7A ACAAGACTGG CTCTTTTACC AGTATGAÄTG2792AATGAAAGGC AGTGCAATAT TTAGCTGC7A ACAAGACTGG CTCTTTTACC AGTATGAÄTG2792
ACAATTTATG GGGGGTAGGG TGGGGAAC77 TCTTTTCTGT TTTTC7TTAA TCTCCC7TTG2852ACAATTTATG GGGGGTAGGG TGGGGAAC77 TCTTTTCTGT TTTTC7TTAA TCTCCC7TTG2852
77GGAAAG7A TCATGAAGGA AGAGTTATGC TTTATCTTGA AGGAACCATT AGATATGGAA291277GGAAAG7A TCATGAAGGA AGAGTTATGC TTTATCTTGA AGGAACCATT AGATATGGAA2912
AATAGTGA7G AACCAGAGTT TCTTGGTTGC TTTTTCAAAA ATTTGTTTTT ATTTGGT7CT 2972AATAGTGA7G AACCAGAGTT TCTTGGTTGC TTTTTCAAAA ATTTGTTTTT ATTTGGT7CT 2972
ŠGŠG
425 430 435425 430 435
520 525 530520 525 530
600 605 610600 605 610
2) SEQ ID No: 35:2) SEQ ID No: 36:
i) sekvenčné charakteristiky:(i) sequence characteristics:
A) dĺžka: 824 aminokyselínA) length: 824 amino acids
B) typ: aminokyselinový reťazecB) type: amino acid chain
C) reťazce: jednoreťázcovýC) chains: single chain
D) topológia: lineárna ii) molekulový typ: proteín xi) sekvencia: SEQ ID No: 35:D) topology: linear ii) molecular type: protein xi) sequence: SEQ ID No: 35:
Met Thr Val Leu Gin Glu Pro Val Gin Ala Ala I_= Trp Gin Ala Leu 1 5 10 15 .Met Thr Val Leu Gin Glu Pro Val Gin Ala Ala I = Trp Gin Ala Leu 1 5 10 15.
Asn His Tyr Ala Tyr Arg Asp Ala val ?he Leu Ala Glu Arg Leu TyrAsn His Tyr Ala
5Ô5o
420 425 430420 425 430
Asp Ser Ser íle íle ser Clu Gly Lys íle ser Thr íle Thr Pro Gin 435 440 445 íle Gin Ala Phe Asn Leu Gin Lys Ala Ala Ala Glu Gly Leu Het ser 450 455 460Asp Ser Ser White Glu Lys White Ser Thr White Thr Pro Gin 435 440 445 White Gin Ala Phe Asn Leu
ssss
Phe Ser Leu Gin Arg clu His Asp Zle Ala Zle Lys Phe Phe Gin Arg 580 585590Phe Ser Leu Gin Arg Clu His Asp Zle Ala Zle Lys Phe Phe Gin Arg 580 585590
Ala íle Gin Val Asp Pro Asn Tyr Ala Tyr Ala Tyr Thr Leu Leu Gly 595 600605Ala White Gin Val Asp Pro Asn Tyr Ala Tyr Thr Leu Leu Leu Gly 595 600605
His Glu Phe Val Leu Thr Glu Glu Leu Asp Lys Ala Leu Ala Cys Phe 610 615620His Glu Phe Val Thu Glu Glu Leu Asp Lys Ala Leu Ala Cys Phe 610 615620
Arg Asn Ala íle Arg Val Asn Pro Ara His Tyr Asn Ala Trp Tyr Gly 625 630 635640Arg Asn Ala White Arg Val Asn Pro Ara His Tyr Asn Ala Trp Tyr Gly 625 630 635640
T>V g-C8 - fCT > g-C8-fC
Claims (31)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US17058693A | 1993-12-20 | 1993-12-20 | |
PCT/US1994/014813 WO1995017198A1 (en) | 1993-12-20 | 1994-12-20 | A novel tumor suppressor gene |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK76896A3 true SK76896A3 (en) | 1997-02-05 |
Family
ID=22620468
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK768-96A SK76896A3 (en) | 1993-12-20 | 1994-12-20 | A novel tumor suppressor gene |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0735889A4 (en) |
JP (1) | JPH09510343A (en) |
CN (1) | CN1138295A (en) |
AU (1) | AU1517495A (en) |
BR (1) | BR9408357A (en) |
CA (1) | CA2178745A1 (en) |
CZ (1) | CZ178396A3 (en) |
FI (1) | FI962558A0 (en) |
HU (1) | HUT74413A (en) |
NO (1) | NO962596L (en) |
NZ (1) | NZ278745A (en) |
PL (1) | PL315172A1 (en) |
SK (1) | SK76896A3 (en) |
WO (1) | WO1995017198A1 (en) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5747282A (en) * | 1994-08-12 | 1998-05-05 | Myraid Genetics, Inc. | 17Q-linked breast and ovarian cancer susceptibility gene |
CN1054399C (en) * | 1997-11-07 | 2000-07-12 | 中国科学院上海生物化学研究所 | Human gene P53BP3 interacting with anti-cancer gene P53 |
US6399373B1 (en) | 1998-06-30 | 2002-06-04 | Genset | Nucleic acid encoding a retinoblastoma binding protein (RBP-7) and polymorphic markers associated with said nucleic acid |
ATE419359T1 (en) * | 1999-07-05 | 2009-01-15 | Cropdesign Nv | CDC27 HOMOLOGUE FROM ARABIDOPSIS THALIANA |
WO2001029229A1 (en) * | 1999-10-18 | 2001-04-26 | Shanghai Bio Road Gene Development Ltd. | Novel polypeptide, human retinoblastoma binding protein 20 and polynucleotide encoding it |
CN1333255A (en) * | 2000-07-07 | 2002-01-30 | 上海博德基因开发有限公司 | Novel polypeptide--human retina tumor conjugated protein 19.91 and polynucleotide for encoding said polypeptide |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4358535A (en) * | 1980-12-08 | 1982-11-09 | Board Of Regents Of The University Of Washington | Specific DNA probes in diagnostic microbiology |
-
1994
- 1994-12-20 JP JP7517608A patent/JPH09510343A/en active Pending
- 1994-12-20 CN CN94194569A patent/CN1138295A/en active Pending
- 1994-12-20 SK SK768-96A patent/SK76896A3/en unknown
- 1994-12-20 CZ CZ961783A patent/CZ178396A3/en unknown
- 1994-12-20 BR BR9408357A patent/BR9408357A/en not_active Application Discontinuation
- 1994-12-20 AU AU15174/95A patent/AU1517495A/en not_active Abandoned
- 1994-12-20 CA CA002178745A patent/CA2178745A1/en not_active Abandoned
- 1994-12-20 WO PCT/US1994/014813 patent/WO1995017198A1/en not_active Application Discontinuation
- 1994-12-20 HU HU9601686A patent/HUT74413A/en unknown
- 1994-12-20 NZ NZ278745A patent/NZ278745A/en not_active IP Right Cessation
- 1994-12-20 EP EP95906694A patent/EP0735889A4/en not_active Withdrawn
- 1994-12-20 PL PL94315172A patent/PL315172A1/en unknown
-
1996
- 1996-06-19 FI FI962558A patent/FI962558A0/en unknown
- 1996-06-19 NO NO962596A patent/NO962596L/en not_active Application Discontinuation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN1138295A (en) | 1996-12-18 |
BR9408357A (en) | 1997-08-26 |
AU1517495A (en) | 1995-07-10 |
HUT74413A (en) | 1996-12-30 |
NO962596D0 (en) | 1996-06-19 |
FI962558A (en) | 1996-06-19 |
CZ178396A3 (en) | 1997-03-12 |
CA2178745A1 (en) | 1995-06-29 |
EP0735889A1 (en) | 1996-10-09 |
JPH09510343A (en) | 1997-10-21 |
NO962596L (en) | 1996-08-19 |
NZ278745A (en) | 1997-09-22 |
FI962558A0 (en) | 1996-06-19 |
WO1995017198A1 (en) | 1995-06-29 |
PL315172A1 (en) | 1996-10-14 |
EP0735889A4 (en) | 1999-04-14 |
HU9601686D0 (en) | 1996-08-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US7582439B2 (en) | Therapeutic molecules | |
JP5490343B2 (en) | Cell penetrating peptide inhibitors of the JNK signal transduction pathway | |
JPH09504959A (en) | Mammalian cell cycle protein | |
US20100199368A1 (en) | Bcl-2-modifying factor (bmf) sequences and their use in modulating apoptosis | |
SK76896A3 (en) | A novel tumor suppressor gene | |
MAGOULAS et al. | The Surf-6 gene of the mouse surfeit locus encodes a novel nucleolar protein | |
CZ53196A3 (en) | Isolated and purified dna sequence encoding suppressor protein of prostate tumor and a recombinant vector and an expression vector containing thereof, system host-vector for producing polypeptide or protein, pharmaceutical preparation, dna probe, isolated and purified protein and method of its production, antibody and method of detecting absence of ptsg protein in tumorous cells in vitro, and rna probe | |
Colombo et al. | cDNA cloning and Escherichia coli expression of UK114 tumor antigen | |
US7138509B2 (en) | GANP protein | |
EP1180525B1 (en) | Transcriptional activation inhibitory protein | |
US8404806B2 (en) | Isolated BRCA1 peptides and method of use | |
AU2002304971B2 (en) | Bcl-2-modifying factor (Bmf) sequences and their use in modulating apoptosis | |
US20040235769A1 (en) | Anti-tumor effects of prostage Carcinoma Tumor Antigen-1 | |
AU752360B2 (en) | Novel therapeutic molecules | |
AU2002304971A1 (en) | Bcl-2-modifying factor (Bmf) sequences and their use in modulating apoptosis | |
WO2004037857A1 (en) | Bfk protein as therapeutic molecules | |
JPH0998790A (en) | New prostate/colon tumor suppressor gene positioned in humaneighth chromosome | |
WO2010083573A1 (en) | The treatment or prophylaxis of organ and tissue fibrosis via modulation of cell division autoantigen (cda1) |