RU98100214A - OPTIMIZED MINIMSIMS AND MINIRIBOZIMES AND THEIR APPLICATION - Google Patents

OPTIMIZED MINIMSIMS AND MINIRIBOZIMES AND THEIR APPLICATION

Info

Publication number
RU98100214A
RU98100214A RU98100214/13A RU98100214A RU98100214A RU 98100214 A RU98100214 A RU 98100214A RU 98100214/13 A RU98100214/13 A RU 98100214/13A RU 98100214 A RU98100214 A RU 98100214A RU 98100214 A RU98100214 A RU 98100214A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
compound according
oligonucleotide
compound
integer
nucleotides
Prior art date
Application number
RU98100214/13A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Дж.Маккол Максин
Хендри Филин
Локетт Тревор
Original Assignee
Коммонвелт Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Организейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Коммонвелт Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Организейшн filed Critical Коммонвелт Сайентифик Энд Индастриал Рисерч Организейшн
Publication of RU98100214A publication Critical patent/RU98100214A/en

Links

Claims (38)

1. Соединение, имеющее формулу (послед. N 3):
Figure 00000001

где каждый X и Q представляет неуклеотид, который может быть тем же самым или другим и может быть замещен или модифицирован по своему сахарному звену, основанию или фосфатной группе, и Q представляет гуанозин;
где каждый из (X)n и (X)n, представляет олигонуклеотид с предетерминированной последовательностью, которая способна к гибридизации с последовательностью РНК-мишени, которая расщепляется;
где каждый из n и n' представляет целое число, которое определяет число нуклеотидов в олигонуклеотиде;
где каждая сплошная линия представляет химическую связь, обеспечивающую ковалентные связи между нуклеотидами, расположенными на каждой ее стороне;
где а представляет целое число, которое определяет число нуклеотидов, при условии, что а может быть равно 0 или 1, и если а равно 0, А, расположенный в 5' (Х)а, связывается с G, расположенным в 3' (Ха); и где (T/U)b представляет олигонуклеотид, при условии, что b представляет целое число, которое равно 3 или 4.1. The compound having the formula (last. N 3):
Figure 00000001

where each X and Q represents a non-nucleotide which may be the same or different and may be substituted or modified at its sugar unit, base or phosphate group, and Q represents guanosine;
where each of (X) n and (X) n , represents an oligonucleotide with a predetermined sequence that is capable of hybridization with the sequence of the RNA target, which is cleaved;
where each of n and n 'represents an integer that determines the number of nucleotides in the oligonucleotide;
where each solid line represents a chemical bond providing covalent bonds between nucleotides located on each side thereof;
where a represents an integer that determines the number of nucleotides, provided that a can be 0 or 1, and if a is 0, A located in 5 '(X) a binds to G located in 3' (X a ); and where (T / U) b represents an oligonucleotide, provided that b represents an integer that is 3 or 4. 2. Соединение по п.1, отличающееся тем, что олигонуклеотид 3'-(Х)n-1-А представляет собой 3'-(Х)n-2-С-А -.2. The compound according to claim 1, characterized in that the oligonucleotide 3 '- (X) n-1 -A represents 3' - (X) n-2 -C-A -. 3. Соединение по п.1, отличающееся тем, что (X)а отсутствует.3. The compound according to claim 1, characterized in that (X) a is absent. 4. Соединение по п.1, отличающееся тем, что целое число b в (T/U)b равно 3.4. The compound according to claim 1, characterized in that the integer b in (T / U) b is 3. 5. Соединение по п.1, отличающееся тем, что целое число b в T/U)b равно 4.5. The compound according to claim 1, characterized in that the integer b in T / U) b is 4. 5. Соединение по п.1, отличающееся тем, что каждый Х и Q представляет собой дезоксирибонуклеотид. 5. The compound according to claim 1, characterized in that each X and Q represents a deoxyribonucleotide. 7. Соединение по п.1, отличающееся тем, что каждый Х представляет собой рибонуклеотид. 7. The compound according to claim 1, characterized in that each X represents a ribonucleotide. 8. Соединение по п.1, отличающееся тем, что (T/U)b представляет собой (T)b.8. The compound according to claim 1, characterized in that (T / U) b is (T) b . 9. Соединение по п.1, отличающееся тем, что (T/U)b представляет собой (U)b.9. The compound according to claim 1, characterized in that (T / U) b represents (U) b . 10. Соединение, имеющее формулу (послед. N 4)
Figure 00000002

где каждый X и Q представляет собой нуклеотид, который может быть тем же самым или другим и может быть замещен или модифицирован по своему сахарному звену, основанию или фосфатной группе, и Q представляет гуанозин;
где каждый из (X)n и (X)n' представляет олигонуклеотид с предетерминированной последовательностью, которая способна к гибридизации с последовательностью РНК-мишени, которая расщепляется;
где каждый из n и n' представляет целое число, которое определяет число нуклеотидов в олигонуклеотиде;
где * представляет пару оснований между нуклеотидами, расположенными на каждой ее стороне;
где каждая сплошная линия представляет химическую связь, обеспечивающую ковалентные связи между нуклеотидами, расположенными на каждой ее стороне;
где а представляет целое число, которое определяет число нуклеотидов, при условии, что а может быть равно 0 или 1, и если а равно 0, А, расположенный в 5' (Х)а, связывается с G, расположенным в 3' (Ха);
где (T/U)b представляет олигонуклеотид, при условии, что b представляет целое число, которое равно 3 или 4.10. The compound having the formula (last. N 4)
Figure 00000002

where each X and Q represents a nucleotide that may be the same or different and may be substituted or modified at its sugar unit, base or phosphate group, and Q represents guanosine;
where each of (X) n and (X) n ' represents an oligonucleotide with a predetermined sequence that is capable of hybridization with the sequence of the target RNA that is cleaved;
where each of n and n 'represents an integer that determines the number of nucleotides in the oligonucleotide;
where * represents a pair of bases between nucleotides located on each side;
where each solid line represents a chemical bond providing covalent bonds between nucleotides located on each side thereof;
where a represents an integer that determines the number of nucleotides, provided that a can be 0 or 1, and if a is 0, A located in 5 '(X) a binds to G located in 3' (X a );
where (T / U) b represents an oligonucleotide, provided that b represents an integer that is 3 or 4. 11. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что олигонуклеотид 3'-(Х)n-представляет собой 3'-(Х)n-1-А-.11. The compound according to p. 10, characterized in that the oligonucleotide 3 '- (X) n - is 3' - (X) n-1 -A-. 12. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что олигонуклеотид 3'-(Х)n-представляет собой 3'-(Х)n-2-С-А-.12. The compound according to p. 10, characterized in that the oligonucleotide 3 '- (X) n - is 3' - (X) n-2 -C-A-. 13. Соединение по п.10, отличающееся тем, что (Х)а отсутствует.13. The compound according to claim 10, characterized in that (X) a is absent. 14. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что целое число b в (T/U)b равно 3.14. The compound of claim 10, wherein the integer b in (T / U) b is 3. 15. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что целое число b в (T/U)b равно 4.15. The compound of claim 10, wherein the integer b in (T / U) b is 4. 16. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что каждый Х представляет собой дезоксирибонуклеотид. 16. The compound according to p. 10, characterized in that each X represents a deoxyribonucleotide. 17. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что каждый Х представляет собой рибонуклеотид, а GUUU(U)C является РНК. 17. The compound according to p. 10, characterized in that each X represents a ribonucleotide, and GUUU (U) C is RNA. 18. Соединение по п.10, отличающееся тем, что (T/U)b представляет собой (T)b.18. The compound of claim 10, wherein (T / U) b represents (T) b . 19. Композиция, содержащая соединение по п.1 в сочетании с приемлемым носителем. 19. A composition comprising a compound according to claim 1 in combination with an acceptable carrier. 20. Композиция, содержащая соединение по п.10 в сочетании с приемлемым носителем. 20. A composition comprising a compound of claim 10 in combination with an acceptable carrier. 21. Олигонуклеотидный транспортный вектор, содержащий нуклеотидную последовательность, которая при транскрипции приводит к соединению по п.1 или по п.10. 21. Oligonucleotide transport vector containing a nucleotide sequence, which upon transcription leads to the compound according to claim 1 or claim 10. 22. Транспортный вектор по п.21, отличающийся тем, что является бактериальной плазмидой, бактериофаговой ДНК, космидой или эукариотной вирусной ДНК. 22. The transport vector according to item 21, characterized in that it is a bacterial plasmid, bacteriophage DNA, cosmid or eukaryotic viral DNA. 23. Олигонуклеотидный транспортный вектор по п.21, отличающийся тем, что является ДНК-вирусом растений, геминивирусом или инфекционной фаговой частицей. 23. The oligonucleotide transport vector according to item 21, characterized in that it is a plant DNA virus, a heminivirus or an infectious phage particle. 24. Олигонуклеотидный транспортный вектор по п.21, отличающийся тем, что является упакованным и содержит промоторные последовательности для РНК-полимеразы II или РНК-полимеразы III. 24. The oligonucleotide transport vector according to item 21, characterized in that it is packaged and contains promoter sequences for RNA polymerase II or RNA polymerase III. 25. Клетка-хозяин, трансформированная транспортным вектором по п.21. 25. A host cell transformed by the transport vector of claim 21. 26. Клетка-хозяин по п.25, отличающаяся тем, что является прокариотной клеткой-хозяином или эукариотной клеткой-хозяином. 26. The host cell according A.25, characterized in that it is a prokaryotic host cell or eukaryotic host cell. 27. Прокариотная клетка-хозяин по п.26, отличающаяся тем, что является клеткой E.coli. 27. A prokaryotic host cell according to claim 26, characterized in that it is an E. coli cell. 28. Эукариотная клетка-хозяин по п.26, отличающаяся тем, что является COS-клеткой обезьяны, клеткой яичника китайского хомячка, клеткой млекопитающего или клеткой растения. 28. The eukaryotic host cell according to claim 26, characterized in that it is a monkey COS cell, Chinese hamster ovary cell, mammalian cell or plant cell. 29. Способ расщепления мРНК-мишени у субъекта, включающий введение указанному субъекту эффективного количества соединения по пп.1 или 10. 29. A method for cleaving a target mRNA in a subject, comprising administering to said subject an effective amount of a compound according to claims 1 or 10. 30. Способ по п.29, отличающийся тем, что введение является локальным. 30. The method according to clause 29, wherein the introduction is local. 31. Способ по п.30, отличающийся тем, что вводимое локально количество находится между 1 нг и 10 мг. 31. The method according to p. 30, characterized in that the locally administered amount is between 1 ng and 10 mg. 32. Способ по п.29, отличающийся тем, что введение является системным. 32. The method according to clause 29, wherein the introduction is systemic. 33. Способ по п.32, отличающийся тем, что вводимое системно количество находится между 1 нг и 500 мкг на кг массы тела в день. 33. The method according to p, characterized in that the systemically administered amount is between 1 ng and 500 μg per kg of body weight per day. 34. Способ по п.29, отличающийся тем, что введение осуществляют с помощью аэрозоля. 34. The method according to clause 29, wherein the introduction is carried out using an aerosol. 35. Способ расщепления мРНК-мишени в клетке-хозяине, включающий введение в указанную клетку-хозяина эффективного количества соединения по пп.1 или 10 или транспортного вектора, который при транскрипции экспрессирует указанное соединение. 35. A method for cleaving a target mRNA in a host cell, comprising introducing into said host cell an effective amount of a compound according to claims 1 or 10 or a transport vector that expresses said compound upon transcription. 36. Соединение по п.1 или 10, отличающееся тем, что кроме того содержит антисмысловую нуклеиновую кислоту, способную к гибридизации с последовательностью РНК-мишени. 36. The compound according to claim 1 or 10, characterized in that it further comprises an antisense nucleic acid capable of hybridization with the target RNA sequence. 37. Соединение по п.1 или 10, отличающееся тем, что кроме того содержит, по меньшей мере, одно дополнительное, не встречающееся в природе олигонуклеотидное соединение, которое содержит нуклеотиды, чья последовательность определяет консервативную каталитическую область, и нуклеотиды, чья последовательность способна к гибридизации с предетерминированной последовательностью-мишенью. 37. The compound according to claim 1 or 10, characterized in that in addition it contains at least one additional, non-naturally occurring oligonucleotide compound that contains nucleotides, whose sequence defines a conservative catalytic region, and nucleotides, whose sequence is capable of hybridization with a predetermined target sequence. 38. Соединение по п.37, отличающееся тем, что дополнительное, не встречающееся в природе олигонуклеотидное соединение представляет собой молотообразный рибозим, минирибозим, минизим, шпилькообразный рибозим, рибозим гепатита дельта, рибозим РНКазы Р или их комбинацию. 38. The compound according to clause 37, wherein the additional non-naturally occurring oligonucleotide compound is a hammer-shaped ribozyme, miniribozyme, minisim, hairpin ribozyme, hepatitis delta ribozyme, RNase P ribozyme, or a combination thereof.
RU98100214/13A 1995-06-07 1996-06-07 OPTIMIZED MINIMSIMS AND MINIRIBOZIMES AND THEIR APPLICATION RU98100214A (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/574,396 1995-12-18
US08/488,181 1995-12-18

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU98100214A true RU98100214A (en) 2000-02-20

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2093664C (en) Modified ribozymes
Heidenreich et al. Hammerhead ribozyme-mediated cleavage of the long terminal repeat RNA of human immunodeficiency virus type 1.
AU637800B2 (en) Chimeric dna-rna catalytic sequences
EP1097939B1 (en) Method for the synthesis of isoguanosine and of its 2'-derivatives
Ohkawa et al. Importance of independence in ribozyme reactions: kinetic behavior of trimmed and of simply connected multiple ribozymes with potential activity against human immunodeficiency virus.
Joseph et al. Substrate selection rules for the hairpin ribozyme determined by in vitro selection, mutation, and analysis of mismatched substrates.
US5877162A (en) Short external guide sequences
US5817635A (en) Modified ribozymes
EP0866865B1 (en) Chimeric oligomers having an rna-cleavage activity
US5595873A (en) T. thermophila group I introns that cleave amide bonds
Curtis et al. Studies on the structure of intracellular bacteriophage T4 DNA
Kierzek Hydrolysis of oligoribonucleotides: influence of sequence and length
US6063566A (en) Catalytic RNA molecules
EP0758386A1 (en) Novel enzymatic rna molecules
EP0594584A1 (en) Nucleic acid enzymes for cleaving dna
WO1998002583A9 (en) Novel catalytic rna molecules
Jones et al. Evaluating and enhancing ribozyme reaction efficiency in mammalian cells
WO2000060115A2 (en) Method for identifying accessible binding sites on rna
US20060036087A1 (en) 2'-deoxy-2'-fluoro modified RNA
KOIZUMI et al. Inhibition of c-Ha-ras gene expression by hammerhead ribozymes containing a stable C (UUCG) G hairpin loop
Nashimoto Specific cleavage of target RNAs from HIV-1 with 5'half tRNA by mammalian tRNA 3'processing endoribonuclease.
Rossi et al. Catalytic antisense RNA (ribozymes): their potential and use as anti-HIV-1 therapeutic agents
RU98100214A (en) OPTIMIZED MINIMSIMS AND MINIRIBOZIMES AND THEIR APPLICATION
Qiao et al. Interference with bacteriophage phi 6 genomic RNA packaging by hairpin structures
Komtsu et al. Cross-ligation and exchange reactions catalyzed by hairpin ribozymes