RU2494146C2 - КЛЕТКА-ХОЗЯИН Trichoderma reesei ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКОЙ БЕЛКОВОЙ КОМПОЗИЦИИ, ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКАЯ БЕЛКОВАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СПОСОБЫ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ - Google Patents

КЛЕТКА-ХОЗЯИН Trichoderma reesei ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКОЙ БЕЛКОВОЙ КОМПОЗИЦИИ, ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКАЯ БЕЛКОВАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СПОСОБЫ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ Download PDF

Info

Publication number
RU2494146C2
RU2494146C2 RU2009149633/10A RU2009149633A RU2494146C2 RU 2494146 C2 RU2494146 C2 RU 2494146C2 RU 2009149633/10 A RU2009149633/10 A RU 2009149633/10A RU 2009149633 A RU2009149633 A RU 2009149633A RU 2494146 C2 RU2494146 C2 RU 2494146C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
sequence
polypeptide
mature polypeptide
conditions
Prior art date
Application number
RU2009149633/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2009149633A (ru
Inventor
Сандра МЕРИНО
Кейт МакФАРЛАНД
Джоэл ЧЕРРИ
Сара ТЕТЕР
Original Assignee
Новозаймз, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новозаймз, Инк. filed Critical Новозаймз, Инк.
Priority claimed from PCT/US2008/065417 external-priority patent/WO2008151079A2/en
Publication of RU2009149633A publication Critical patent/RU2009149633A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2494146C2 publication Critical patent/RU2494146C2/ru

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2437—Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/37—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2445—Beta-glucosidase (3.2.1.21)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/14—Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a carbohydrase (EC 3.2.x), e.g. by alpha-amylase, e.g. by cellulase, hemicellulase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/16—Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of an alpha-1, 6-glucosidase, e.g. amylose, debranched amylopectin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • C12P7/06—Ethanol, i.e. non-beverage
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • C12P7/06—Ethanol, i.e. non-beverage
    • C12P7/08—Ethanol, i.e. non-beverage produced as by-product or from waste or cellulosic material substrate
    • C12P7/10—Ethanol, i.e. non-beverage produced as by-product or from waste or cellulosic material substrate substrate containing cellulosic material
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01004—Cellulase (3.2.1.4), i.e. endo-1,4-beta-glucanase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01021—Beta-glucosidase (3.2.1.21)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01091—Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase (3.2.1.91)
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02E—REDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
    • Y02E50/00—Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
    • Y02E50/10—Biofuels, e.g. bio-diesel

Abstract

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к клетке-хозяину Trichoderma reesei для получения целлюлолитической белковой композиции, целлюлолитической белковой композиции, способам получения и применения композиции. Клетка-хозяин Trichoderma reesei содержит полинуклеотиды, кодирующие гетерологичный полипептид GH61, слитый белок бета-глюкозидазы, целлюлолитические ферменты. Способ получения композиции включает культивирование клетки-хозяина Trichoderma reesei и выделение композиции. Композиция содержит полипептид GH61, слитый белок бета-глюкозидазы и один или более целлюлолитических ферментов. Способ разложения материала, содержащего целлюлозу, характеризуется обработкой материала целлюлолитической белковой композицией. Способ получения продукта ферментации включает осахаривание материала, ферментацию осахаренного материала сбраживающими микроорганизмами и выделение продуктов ферментации. Представленные изобретения могут быть использованы для разложения или преобразования материала, содержащего целлюлозу. 5 н. и 7 з.п. ф-лы, 14 ил., 23 пр.

Description

Текст описания приведен в факсимильном виде.
Figure 00000001
Figure 00000002
Figure 00000003
Figure 00000004
Figure 00000005
Figure 00000006
Figure 00000007
Figure 00000008
Figure 00000009
Figure 00000010
Figure 00000011
Figure 00000012
Figure 00000013
Figure 00000014
Figure 00000015
Figure 00000016
Figure 00000017
Figure 00000018
Figure 00000019
Figure 00000020
Figure 00000021
Figure 00000022
Figure 00000023
Figure 00000024
Figure 00000025
Figure 00000026
Figure 00000027
Figure 00000028
Figure 00000029
Figure 00000030
Figure 00000031
Figure 00000032
Figure 00000033
Figure 00000034
Figure 00000035
Figure 00000036
Figure 00000037
Figure 00000038
Figure 00000039
Figure 00000040
Figure 00000041
Figure 00000042
Figure 00000043
Figure 00000044
Figure 00000045
Figure 00000046
Figure 00000047
Figure 00000048
Figure 00000049
Figure 00000050
Figure 00000051
Figure 00000052
Figure 00000053
Figure 00000054
Figure 00000055
Figure 00000056
Figure 00000057
Figure 00000058
Figure 00000059
Figure 00000060
Figure 00000061
Figure 00000062
Figure 00000063
Figure 00000064
Figure 00000065
Figure 00000066
Figure 00000067
Figure 00000068
Figure 00000069
Figure 00000070
Figure 00000071
Figure 00000072
Figure 00000073
Figure 00000074
Figure 00000075
Figure 00000076
Figure 00000077
Figure 00000078
Figure 00000079
Figure 00000080
Figure 00000081
Figure 00000082
Figure 00000083
Figure 00000084
Figure 00000085
Figure 00000086
Figure 00000087
Figure 00000088
Figure 00000089
Figure 00000090
Figure 00000091
Figure 00000092
Figure 00000093
Figure 00000094
Figure 00000095
Figure 00000096
Figure 00000097
Figure 00000098
Figure 00000099
Figure 00000100
Figure 00000101
Figure 00000102
Figure 00000103
Figure 00000104
Figure 00000105
Figure 00000106
Figure 00000107
Figure 00000108
Figure 00000109
Figure 00000110
Figure 00000111
Figure 00000112
Figure 00000113
Figure 00000114
Figure 00000115
Figure 00000116
Figure 00000117
Figure 00000118
Figure 00000119
Figure 00000120
Figure 00000121
Figure 00000122
Figure 00000123
Figure 00000124
Figure 00000125
Figure 00000126
Figure 00000127
Figure 00000128
Figure 00000129
Figure 00000130
Figure 00000131
Figure 00000132
Figure 00000133
Figure 00000134
Figure 00000135
Figure 00000136
Figure 00000137
Figure 00000138
Figure 00000139
Figure 00000140
Figure 00000141
Figure 00000142
Figure 00000143
Figure 00000144
Figure 00000145
Figure 00000146
Figure 00000147
Figure 00000148
Figure 00000149
Figure 00000150
Figure 00000151
Figure 00000152
Figure 00000153
Figure 00000154
Figure 00000155
Figure 00000156
Figure 00000157
Figure 00000158
Figure 00000159
Figure 00000160
Figure 00000161
Figure 00000162
Figure 00000163
Figure 00000164
Figure 00000165
Figure 00000166
Figure 00000167
Figure 00000168
Figure 00000169
Figure 00000170
Figure 00000171
Figure 00000172
Figure 00000173
Figure 00000174
Figure 00000175
Figure 00000176
Figure 00000177
Figure 00000178
Figure 00000179
Figure 00000180
Figure 00000181
Figure 00000182
Figure 00000183
Figure 00000184
Figure 00000185
Figure 00000186
Figure 00000187
Figure 00000188
Figure 00000189
Figure 00000190
Figure 00000191
Figure 00000192
Figure 00000193
Figure 00000194
Figure 00000195
Figure 00000196
Figure 00000197
Figure 00000198
Figure 00000199
Figure 00000200
Figure 00000201
Figure 00000202
Figure 00000203
Figure 00000204
Figure 00000205
Figure 00000206
Figure 00000207
Figure 00000208
Figure 00000209
Figure 00000210
Figure 00000211
Figure 00000212
Figure 00000213
Figure 00000214
Figure 00000215
Figure 00000216
Figure 00000217
Figure 00000218
Figure 00000219
Figure 00000220
Figure 00000221
Figure 00000222
Figure 00000223
Figure 00000224
Figure 00000225
Figure 00000226
Figure 00000227
Figure 00000228
Figure 00000229
Figure 00000230
Figure 00000231
Figure 00000232
Figure 00000233
Figure 00000234
Figure 00000235
Figure 00000236
Figure 00000237
Figure 00000238
Figure 00000239
Figure 00000240
Figure 00000241
Figure 00000242
Figure 00000243
Figure 00000244
Figure 00000245
Figure 00000246
Figure 00000247
Figure 00000248
Figure 00000249
Figure 00000250
Figure 00000251
Figure 00000252
Figure 00000253
Figure 00000254
Figure 00000255
Figure 00000256
Figure 00000257
Figure 00000258
Figure 00000259
Figure 00000260
Figure 00000261
Figure 00000262
Figure 00000263
Figure 00000264
Figure 00000265
Figure 00000266
Figure 00000267
Figure 00000268
Figure 00000269
Figure 00000270
Figure 00000271
Figure 00000272
Figure 00000273
Figure 00000274
Figure 00000275
Figure 00000276
Figure 00000277
Figure 00000278
Figure 00000279
Figure 00000280
Figure 00000281
Figure 00000282
Figure 00000283
Figure 00000285
Figure 00000286
Figure 00000287
Figure 00000288
Figure 00000289
Figure 00000290
Figure 00000291
Figure 00000292
Figure 00000293
Figure 00000294
Figure 00000295
Figure 00000296
Figure 00000297
Figure 00000298
Figure 00000299
Figure 00000300
Figure 00000301
Figure 00000302
Figure 00000303
Figure 00000304
Figure 00000305
Figure 00000306
Figure 00000307
Figure 00000308
Figure 00000309
Figure 00000310
Figure 00000311
Figure 00000312
Figure 00000313
Figure 00000314
Figure 00000315
Figure 00000316
Figure 00000317
Figure 00000318
Figure 00000319
Figure 00000320
Figure 00000321
Figure 00000322
Figure 00000323
Figure 00000324
Figure 00000325
Figure 00000326
Figure 00000327
Figure 00000328
Figure 00000329
Figure 00000330
Figure 00000331
Figure 00000332
Figure 00000333
Figure 00000334
Figure 00000335
Figure 00000336
Figure 00000337
Figure 00000338
Figure 00000339
Figure 00000340
Figure 00000341
Figure 00000342
Figure 00000343
Figure 00000344
Figure 00000345
Figure 00000346
Figure 00000347
Figure 00000348
Figure 00000349
Figure 00000350
Figure 00000351
Figure 00000352
Figure 00000353
Figure 00000354
Figure 00000355
Figure 00000356
Figure 00000357
Figure 00000358
Figure 00000359
Figure 00000360
Figure 00000361
Figure 00000362
Figure 00000363
Figure 00000364
Figure 00000365
Figure 00000366
Figure 00000367
Figure 00000368
Figure 00000369
Figure 00000370
Figure 00000371
Figure 00000372
Figure 00000373
Figure 00000374
Figure 00000375
Figure 00000376
Figure 00000377
Figure 00000378
Figure 00000379
Figure 00000380
Figure 00000381
Figure 00000382
Figure 00000383
Figure 00000384
Figure 00000385
Figure 00000386
Figure 00000387
Figure 00000388
Figure 00000389
Figure 00000390
Figure 00000391
Figure 00000392
Figure 00000393
Figure 00000394
Figure 00000395
Figure 00000396
Figure 00000397
Figure 00000398
Figure 00000399
Figure 00000400
Figure 00000401
Figure 00000402
Figure 00000403
Figure 00000404
Figure 00000405
Figure 00000406

Claims (12)

1. Клетка-хозяин Trichoderma reesei, использующаяся для получения целлюлолитической ферментной композиции, содержащая: (a) первый полинуклеотид, кодирующий гетерологичный полипептид GH61, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью; (b) второй полинуклеотид, кодирующий слитый белок бета-глюкозидазы с последовательностью SEQ ID NO:104 и SEQ ID NO:106; и (c) третий полинуклеотид, один или несколько, кодирующий целлюлолитические ферменты, выбранные из группы, состоящей из целлобиогидролазы I (CEL7A) Trichoderma reesei, целлобиогидролазы II (CEL6A) Trichoderma reesei и эндоглюканазы I (CEL7B) Trichoderma reesei, и их ортолога или варианта;
где Trichoderma reesei целлобиогидролаза I (CEL7A) или ее ортолог или ее вариант, кодируемые одним или несколькими третьими полинуклеотидами, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:52;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:51, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:51, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:52; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:52;
где целлобиогидролазы II (CEL6A) Trichoderma reesei или ее ортолог или ее вариант, кодируемые одним или несколькими третьими полинуклеотидами, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:54;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:53, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:53, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:54; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:54;
где эндоглюканаза Trichoderma reesei (CEL7B) или ее ортолог или вариант, кодируемые одним или несколькими третьими полинуклеотидами, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:56;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:55, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом белке с последовательностью SEQ ID NO:56; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:56;
где клетка-хозяин Trichoderma reesei трансформирована первым и вторым полинуклеотидом, а также одним или несколькими третьими полинуклеотидами, кодирующими указанный ортолог или вариант, где каждый функционально связан с контрольными последовательностями, которые контролируют их экспрессию; и
где клетка-хозяин Trichoderma reesei продуцирует целлюлолитическую ферментную композицию, содержащую полипептиды, которые кодируются первым, вторым или третьим нуклеотидами,
где полипептид GH61, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью, выбран из группы, состоящей из:
(a) полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащего [ILMV]-P-X(4,5)-G-X-Y-[ILMV]-X-R-X-[EQ]-X(4)-A-[HNQ] и [FW]-[TF]-K-[AIV], где X представляет собой любую аминокислоту, X(4,5) представляет собой любую аминокислоту в 4 или 5 смежных положениях и X(4) представляет собой любую аминокислоту в 4 смежных положениях;
(b) полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащего [ILMV]-P-x(4,5)-G-x-Y-[ILMV]-x-R-x-[EQ]-x(3)-A-[HNQ], где x означает любую аминокислоту, x(4,5) означает любую аминокислоту в 4 или 5 смежных положениях и x(3) означает любую аминокислоту в 3 смежных положениях;
где указанный полипептид, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащий [ILMV]-P-X(4,5)-G-X-Y-[ILMV]-X-R-X-[EQ]-X(4)-[HNQ] и [FW]-[TF]-K-[AIV], необязательно дополнительно содержит:
Н-Х(1,2)-G-P-X(3)-[YW]-[AILMV],
[EQ]-X-Y-X(2)-C-X-[EHQN]-[FILV]-X-[ILV] или
H-X(1,2)-G-P-X(3)-[YW]-[AILMV] и [EQ]-X-Y-X(2)-C-X-[EHQN]-[FILV]-X-[ILV],
где X представляет собой любую аминокислоту, X(1,2) представляет собой любую аминокислоту в 1 положении или 2 смежных положениях, X(3) представляет собой любую аминокислоту в 3 смежных положениях и X(2) представляет собой любую аминокислоту в 2 смежных положениях;
(c) полипептида GH61, содержащего аминокислотную последовательность, которая, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% и по меньшей мере на 95% или на 100% идентична последовательности зрелого полипептида SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8 или SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12 или SEQ ID NO:14;
(d) полипептида GH61, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется по меньшей мере в условиях умеренной жесткости, по меньшей мере в условиях умеренно-высокой жесткости, по меньшей мере в условиях высокой жесткости или по меньшей мере в условиях очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:11 или SEQ ID NO:13, или с их полноразмерными комплементарными цепями;
(e) полипептида GH61, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% идентична последовательности SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:11 или SEQ ID NO:13, кодирующей зрелый полипептид;
(f) варианта полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью, содержащего замену, делецию и/или инсерцию одной или нескольких аминокислот зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8 или SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12 или SEQ ID NO:14; и
(g) полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащего или состоящего из зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8 или SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12 или SEQ ID NO:14; или их фрагмента, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью.
2. Клетка-хозяин Trichoderma reesei по п.1, которая дополнительно содержит один или несколько четвертых полинуклеотидов, кодирующих целлюлолитические ферменты, выбранные из группы, состоящей из эндоглюканазы II (CEL5A) Trichoderma reesei, эндоглюканазы III (CEL12A) Trichoderma reesei и эндоглюканазы V (CEL45A) Trichoderma reesei, и их ортолога или варианта,
где эндоглюканаза II Trichoderma reesei (CEL5A) или ее ортолог или ее вариант, кодируемые одним или несколькими четвертыми полинуклеотидами, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:58;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:57, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:57, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:58; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:58;
где эндоглюканаза III Trichoderma reesei (CEL12A) или ее ортолог, или ее вариант, кодируемые одним или несколькими четвертыми полинуклеотидами, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:60;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:59, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:59, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:60; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:60; и
где эндоглюканаза V Trichoderma reesei (CEL45A) или ее ортолог, или ее вариант, кодируемые одним или несколькими четвертыми полинуклеотидами, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:62;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:61, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:61, кодирующий зрелый полипептид; и
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:62; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:62.
3. Клетка-хозяин Trichoderma reesei по п.1, которая продуцирует целлюлолитическую белковую композицию, содержащую полипептид GH61, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:12, бета-глюкозидазный слитый белок с последовательностью SEQ ID NO:104 и SEQ ID NO:106; целлобиогидролазу I (CEL7A) Trichoderma reesei зрелого полипептида SEQ ID NO:52, целлобиогидролазу II (CEL6A) Trichoderma reesei зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:54 и эндоглюканазу I (CEL7B) Trichoderma reesei зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:56.
4. Клетка-хозяин Trichoderma reesei по п.3, которая дополнительно продуцирует один или более ферментов, выбранных из группы, состоящей из эндонуклеазы II (CEL5A) Trichoderma reesei SEQ ID NO:58, эндоглюканазы V (CEL45A) Trichoderma reesei с последовательностью SEQ ID NO:62 и эндоглюканазы III (CEL12A) Trichoderma reesei с последовательностью SEQ ID NO:60.
5. Способ получения целлюлолитической белковой композиции, включающий: (а) культивирование клетки-хозяина Trichoderma reesei по любому из пп.1-4 в условиях, способствующих получению указанной композиции; и (b) выделение указанной композиции.
6. Целлюлолитическая белковая композиция, содержащая: (a) полипептид GH61, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью; (b) слитый белок бета-глюкозидазы с последовательностью SEQ ID NO:104 или SEQ ID NO:106; и (c) один или более целлюлолитических ферментов, выбранных из группы, состоящей из целлобиогидролазы I (CEL7A) Trichoderma reesei, целлобиогидролазы II (CEL6A) Trichoderma reesei и эндоглюканазы I (CEL7B) Trichoderma reesei, и его ортолог или вариант;
где целлобиогидролаза I Trichoderma reesei (CEL7A) или ее ортолог или ее вариант выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:52;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:51, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:51, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:52; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:52;
где целлобиогидролаза II Trichoderma reesei (CEL6A) или ее ортолог или ее вариант выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:54;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:53, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:53, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:54; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:54;
где эндоглюканаза I Trichoderma reesei (CEL7B) или ее ортолог или ее вариант выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:56;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:55, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:55, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:56; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:56.
7. Целлюлолитическая белковая композиция по п.6, где полипептид GH61, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью, выбран из группы, состоящей из:
(a) полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащего [ILMV]-P-X(4,5)-G-X-Y-[ILMV]-X-R-X-[EQ]-X(4)-[HNQ] и [FW]-[TF]-K-[AIV], где Х представляет собой любую аминокислоту, Х(4,5) представляет собой любую аминокислоту в 4 или 5 смежных положениях и Х(4) представляет собой любую аминокислоту в 4 смежных положениях;
(b) полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащего [ILMV]-P-x(4,5)-G-x-Y-[ILMV]-x-R-x-[EQ]-x(3)-A-[HNQ], где x означает любую аминокислоту, x(4,5) означает любую аминокислоту в 4 или 5 смежных положениях и x(3) означает любую аминокислоту в 3 смежных положениях;
где указанный полипептид, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащий [ILMV]-P-X(4,5)-G-X-Y-[ILMV]-X-R-X-[EQ]-X(4)-[HNQ] и [FW]-[TF]-K-[AIV], необязательно дополнительно содержит:
H-X(1,2)-G-P-X(3)-[YW]-[AILMV],
[EQ]-X-Y-X(2)-C-X-[EHQN]-[FILV]-X-[ILV] или
H-X(1,2)-G-P-X(3)-[YW]-[AILMV]H[EQ]-X-Y-X(2)-C-X-[EHQN]-[FILV]-X-[ILV],
где X представляет собой любую аминокислоту, Х(1,2) представляет собой любую аминокислоту в 1 положении или 2 смежных положениях, Х(3) представляет собой любую аминокислоту в 3 смежных положениях и Х(2) представляет собой любую аминокислоту в 2 смежных положениях;
(c) полипептида GH61, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% и по меньшей мере на 95% или на 100% идентична последовательности зрелого полипептида SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8 или SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12 или SEQ ID NO:14;
(d) полипептида GH61, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется по меньшей мере в условиях умеренной жесткости, по меньшей мере в условиях умеренно-высокой жесткости, по меньшей мере в условиях высокой жесткости или по меньшей мере в условиях очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:11 или SEQ ID NO:13, или с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(e) полипептида GH61, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% идентична последовательности SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:9, SEQ ID NO:11 или SEQ ID NO:13, кодирующей зрелый полипептид;
(f) варианта полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью, содержащего замену, делецию и/или инсерцию одной или нескольких аминокислот зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8 или SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12 или SEQ ID NO:14; и
(g) полипептида GH61, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью и содержащего или состоящего из зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:8 или SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:12 или SEQ ID NO:14; или его фрагмента, обладающего усиливающей целлюлолитическое действие активностью.
8. Целлюлолитическая белковая композиция по п.6, которая дополнительно содержит один или несколько целлюлолитических ферментов, выбранных из группы, состоящей из эндоглюканазы II (CEL5A) Trichoderma reesei, эндоглюканазы III (CEL12A) Trichoderma reesei и эндоглюканазы V(CEL45A) Trichoderma reesei, и его ортолог или его вариант;
где целлобиогидролаза II Trichoderma reesei (CEL5A) или ее ортолог или ее вариант выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:58;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:57, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:57, кодирующий зрелый полипептид;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:58; и
(е) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:58;
где эндоглюканаза III Trichoderma reesei (CEL12A) или ее ортолог или ее вариант, выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:60;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:59, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду, кодирующегося последовательностью SEQ ID NO:59;
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом белке с последовательностью SEQ ID NO:60; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:60; и
где эндоглюканаза V Trichoderma reesei (CEL45A) или ее ортолог или ее вариант выбраны из группы, состоящей из:
(a) полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична зрелому полипептиду с последовательностью SEQ ID NO:62;
(b) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, который гибридизуется в условиях по меньшей мере средней жесткости, в условиях по меньшей мере жесткости выше средней, в условиях по меньшей мере высокой жесткости или в условиях по меньшей мере очень высокой жесткости с последовательностью SEQ ID NO:61, кодирующей зрелый полипептид, и с ее полноразмерной комплементарной цепью;
(c) полипептида, кодируемого полинуклеотидом, содержащим нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 65%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 75%, по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 97% идентична последовательности SEQ ID NO:61, кодирующей зрелый полипептид; и
(d) варианта, содержащего замену, делецию и/или вставку одной или нескольких аминокислот в зрелом полипептиде с последовательностью SEQ ID NO:62; и
(e) полипептида, содержащего зрелый полипептид с последовательностью SEQ ID NO:62.
9. Целлюлолитическая белковая композиция по п.6, которая содержит полипептид, обладающий усиливающей целлюлолитическое действие активностью зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:12; бета-глюкозидазный слитый белок SEQ ID NO:104 или SEQ ID NO:106; целлобиогидролазу I (CEL7A) Trichoderma reesei зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:52, целлобиогидролазу II (CEL6A) Trichoderma reesei зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:54 и эндоглюканазу I (CEL7B) Trichoderma reesei зрелого полипептида с последовательностью SEQ ID NO:56.
10. Целлюлолитическая белковая композиция по п.9, которая дополнительно содержит один или более ферментов, выбранных из группы, состоящей из эндоглюканазы II (CEL5A) Trichoderma reesei SEQ ID NO:58, эндоглюканазы V (CEL45A) Trichoderma reesei с последовательностью SEQ ID NO:62 и эндоглюканазы III (CEL12A) Trichoderma reesei с последовательностью SEQ ID NO:60.
11. Способ разложения материала, содержащего целлюлозу, включающий обработку материала, содержащего целлюлозу, эффективным количеством композиции целлюлолитического белка по любому из пп.6-10.
12. Способ получения продукта ферментации материала, содержащего целлюлозу, включающий:
(a) осахаривание материала, содержащего целлюлозу, указанной композицией целлюлолитического белка по любому из пп.6-10;
(b) ферментацию содержащего целлюлозу осахаренного материала одним или более сбраживающими микроорганизмами с получением продукта ферментации; и
(c) выделение продукта ферментации, полученного в результате реакции ферментации.
RU2009149633/10A 2007-05-31 2008-05-30 КЛЕТКА-ХОЗЯИН Trichoderma reesei ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКОЙ БЕЛКОВОЙ КОМПОЗИЦИИ, ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКАЯ БЕЛКОВАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СПОСОБЫ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ RU2494146C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US94125107P 2007-05-31 2007-05-31
US60/941,251 2007-05-31
PCT/US2008/065417 WO2008151079A2 (en) 2007-05-31 2008-05-30 Compositions for degrading cellulosic material

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2009149633A RU2009149633A (ru) 2011-07-10
RU2494146C2 true RU2494146C2 (ru) 2013-09-27

Family

ID=40088716

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009149633/10A RU2494146C2 (ru) 2007-05-31 2008-05-30 КЛЕТКА-ХОЗЯИН Trichoderma reesei ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКОЙ БЕЛКОВОЙ КОМПОЗИЦИИ, ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКАЯ БЕЛКОВАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СПОСОБЫ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ

Country Status (8)

Country Link
US (2) US9969993B2 (ru)
JP (1) JP2010528624A (ru)
KR (1) KR20100029088A (ru)
CN (1) CN101970651B (ru)
BR (1) BRPI0812267A2 (ru)
MX (1) MX2009012844A (ru)
NZ (1) NZ581257A (ru)
RU (1) RU2494146C2 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2696074C1 (ru) * 2018-11-16 2019-07-30 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Федеральный исследовательский центр питания, биотехнологии и безопасности пищи Штамм мицелиального гриба trichoderma reesei - продуцент комплекса эндоглюканазы, ксиланазы и пектиназ для получения белковых добавок на основе зернового и зернобобового сырья для применения в кормопроизводстве

Families Citing this family (33)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NZ581257A (en) * 2007-05-31 2012-03-30 Novozymes Inc Compositions for degrading cellulosic material
US20090246844A1 (en) * 2007-10-26 2009-10-01 Arbor Fuel Inc. Methods for the production of ethanol
WO2010080527A1 (en) * 2008-12-19 2010-07-15 Novozymes, Inc. Methods for determining cellulolytic enhancing activity of a polypeptide
JP5618478B2 (ja) * 2008-12-25 2014-11-05 Ｍｅｉｊｉ Ｓｅｉｋａファルマ株式会社 新規セルラーゼ遺伝子
US20120047601A1 (en) 2009-02-17 2012-02-23 The Regents Of The University Of California Method of Reducing Acetylation in Plants to Improve Biofuel Production
US20100233775A1 (en) * 2009-03-13 2010-09-16 Tech V, LLC System for the production of methane and other useful products and method of use
WO2010110773A1 (en) * 2009-03-27 2010-09-30 Tech V. Llc Methanogenic reactor
US20100248344A1 (en) * 2009-03-27 2010-09-30 Tech V, LLC Methanogenic reactor
US9012186B2 (en) 2009-04-27 2015-04-21 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Hemicellulose-degrading enzymes
EP3269804B1 (en) 2009-09-17 2020-11-11 Novozymes, Inc. Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same
UA115219C2 (uk) 2009-09-23 2017-10-10 Даніско Юес Інк. Глікозилгідролазні ферменти і їх застосування
ES2560805T3 (es) 2009-09-29 2016-02-22 Novozymes Inc. Polipéptidos con actividad mejoradora celulolítica y polinucleótidos que los codifican
CN102918200A (zh) 2009-12-04 2013-02-06 佐治亚技术研究公司 用于酶促水解的改良的处理生物质的方法
KR20120106774A (ko) 2009-12-23 2012-09-26 다니스코 유에스 인크. 동시 당화 발효 반응의 효율을 향상시키는 방법
US20120058534A1 (en) * 2010-03-09 2012-03-08 Stover & Associates, Inc. Optimized biogas (biomethane) production process
US10053679B2 (en) 2010-03-31 2018-08-21 Meiji Seika Pharma Co., Ltd. Cellulase gene
BR112013002377B1 (pt) 2010-08-06 2020-12-29 Novozymes A/S método para degradar ou hidrolisar um polissacarídeo, para produzir sacarídeos solúveis e para produzir uma substância orgânica, e, processo para produzir um produto de fermentação
WO2012042544A1 (en) * 2010-09-29 2012-04-05 Beta Renewables S.P.A. Pre-treated biomass having enhanced enzyme accessibility
MX2013010512A (es) 2011-03-17 2013-10-07 Danisco Inc Metodo para reducir la viscosidad en un proceso de sacarificacion.
WO2012125937A2 (en) * 2011-03-17 2012-09-20 Danisco Us Inc. Glycosyl hydrolase enzymes and uses thereof for biomass hydrolysis
SG192097A1 (en) * 2011-03-17 2013-08-30 Danisco Us Inc Cellulase compositions and methods of using the same for improved conversion of lignocellulosic biomass into fermentable sugars
AU2012298799B2 (en) * 2011-08-24 2018-02-01 Novozymes, Inc. Methods for producing multiple recombinant polypeptides in a filamentous fungal host cell
US20140329284A1 (en) * 2011-09-30 2014-11-06 Novozymes, Inc. Chimeric Polypeptides Having Beta-Glucosidase Activity and Polynucleotides Encoding Same
WO2013096244A1 (en) * 2011-12-20 2013-06-27 Codexis, Inc. Endoglucanase 1b (eg1b) variants
MX2015007234A (es) 2012-12-12 2015-10-29 Danisco Us Inc Variantes de celobiohidrolasas.
CN106190874B (zh) * 2015-05-06 2020-06-26 中国科学院天津工业生物技术研究所 一种强化丝状真菌蛋白质生产的方法
CN107988127B (zh) * 2017-11-02 2021-09-03 南京农业大学 里氏木霉木质纤维素酶基因工程乳酸菌组合在调制优质苜蓿青贮饲料中的应用
EP3488854A1 (en) * 2017-11-22 2019-05-29 Technische Universität München Method for preparing xyloglucan-oligosaccharides
CN108048430B (zh) * 2018-01-08 2021-03-26 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 内切葡聚糖酶NfEG12A突变体及其编码基因和应用
AU2019200694B2 (en) * 2018-02-09 2019-10-10 Department Of Biotechnology Additive composition useful for improved production of fermentable sugars from lignocellulosic biomass
CN110819582B (zh) * 2019-11-28 2021-04-06 华派生物工程集团有限公司 大肠杆菌表达口蹄疫病毒样颗粒抗原的发酵培养基及培养方法
CN112062616A (zh) * 2020-09-29 2020-12-11 东北农业大学 一种促进农作物秸秆原位还田的腐熟剂及其应用
WO2023225459A2 (en) 2022-05-14 2023-11-23 Novozymes A/S Compositions and methods for preventing, treating, supressing and/or eliminating phytopathogenic infestations and infections

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2005074656A2 (en) * 2004-02-06 2005-08-18 Novozymes, Inc. Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same
US20050191736A1 (en) * 2004-01-30 2005-09-01 Novozymes Biotech, Inc. Polypeptides having cellulolytic enhancing activity andpolynucleotides encoding same
RU2261910C2 (ru) * 1998-05-06 2005-10-10 Адиссео Франс С.А.С. ШТАММ Penicillium funiculosum, ПРОДУЦИРУЮЩИИЙ КОМПЛЕКС ФЕРМЕНТОВ - ЦЕЛЛЮЛАЗУ, ЭНДО-1,4-β-КСИЛАНАЗУ, ЦЕЛЛОБИОГИДРОЛАЗУ, β-ГЛЮКОЗИДАЗУ, ЭНДО-1,3(4)- β-ГЛЮКАНАЗУ, ФЕРУЛОИЛ-ЭСТЕРАЗУ, ЖИДКАЯ КОРМОВАЯ ДОБАВКА И СУХОЙ КОРМ ДЛЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЖИВОТНЫХ
US20070077630A1 (en) * 2005-09-30 2007-04-05 Novozymes, Inc. Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5275944A (en) * 1989-09-26 1994-01-04 Midwest Research Institute Thermostable purified endoglucanas from acidothermus cellulolyticus ATCC 43068
US7375197B2 (en) 2002-01-14 2008-05-20 Midwest Research Institute Cellobiohydrolase I gene and improved variants
CA2411479A1 (en) * 2000-06-26 2002-01-03 Lonnie O. Ingram Methods and compositions for simultaneous saccharification and fermentation
DK2305800T3 (en) * 2002-08-16 2015-08-24 Danisco Us Inc NOVEL Hypocrea JECORINA CBH CELLULASEVARIANTER
EP1622921B1 (en) * 2003-05-02 2010-06-16 Novozymes Inc. Variants of beta-glucosidases
DK2617826T3 (en) 2003-08-25 2015-10-12 Novozymes Inc Variants of glucosidhydrolase
EP1702059B1 (en) 2003-12-09 2012-11-14 Novozymes Inc. Methods for eliminating or reducing the expression of genes in filamentous fungal strains
NZ581257A (en) * 2007-05-31 2012-03-30 Novozymes Inc Compositions for degrading cellulosic material

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2261910C2 (ru) * 1998-05-06 2005-10-10 Адиссео Франс С.А.С. ШТАММ Penicillium funiculosum, ПРОДУЦИРУЮЩИИЙ КОМПЛЕКС ФЕРМЕНТОВ - ЦЕЛЛЮЛАЗУ, ЭНДО-1,4-β-КСИЛАНАЗУ, ЦЕЛЛОБИОГИДРОЛАЗУ, β-ГЛЮКОЗИДАЗУ, ЭНДО-1,3(4)- β-ГЛЮКАНАЗУ, ФЕРУЛОИЛ-ЭСТЕРАЗУ, ЖИДКАЯ КОРМОВАЯ ДОБАВКА И СУХОЙ КОРМ ДЛЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЖИВОТНЫХ
US20050191736A1 (en) * 2004-01-30 2005-09-01 Novozymes Biotech, Inc. Polypeptides having cellulolytic enhancing activity andpolynucleotides encoding same
WO2005074656A2 (en) * 2004-02-06 2005-08-18 Novozymes, Inc. Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same
US20070077630A1 (en) * 2005-09-30 2007-04-05 Novozymes, Inc. Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
YASUYA FUJITA et al., Synergistic Saccharification, and Direct Fermentation to Ethanol, of Amorphous Cellulose by Use of an Engineered Yeast Strain Codisplaying Three Types of Cellulolytic Enzyme, Appl. Environ. Microbiol. February 2004 vol.70 no. 2 1207-1212. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2696074C1 (ru) * 2018-11-16 2019-07-30 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Федеральный исследовательский центр питания, биотехнологии и безопасности пищи Штамм мицелиального гриба trichoderma reesei - продуцент комплекса эндоглюканазы, ксиланазы и пектиназ для получения белковых добавок на основе зернового и зернобобового сырья для применения в кормопроизводстве

Also Published As

Publication number Publication date
CN101970651A (zh) 2011-02-09
CN101970651B (zh) 2013-10-09
US9969993B2 (en) 2018-05-15
BRPI0812267A2 (pt) 2014-10-14
MX2009012844A (es) 2009-12-15
JP2010528624A (ja) 2010-08-26
KR20100029088A (ko) 2010-03-15
US20080299613A1 (en) 2008-12-04
US20180237759A1 (en) 2018-08-23
NZ581257A (en) 2012-03-30
RU2009149633A (ru) 2011-07-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2494146C2 (ru) КЛЕТКА-ХОЗЯИН Trichoderma reesei ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКОЙ БЕЛКОВОЙ КОМПОЗИЦИИ, ЦЕЛЛЮЛОЛИТИЧЕСКАЯ БЕЛКОВАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СПОСОБЫ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ
RU2008117116A (ru) Способы усиления деградации или превращения целлюлозного материала
Mohanram et al. Novel perspectives for evolving enzyme cocktails for lignocellulose hydrolysis in biorefineries
Ezeilo et al. Enzymatic breakdown of lignocellulosic biomass: the role of glycosyl hydrolases and lytic polysaccharide monooxygenases
RU2013105003A (ru) Способы повышения усиливающей целлюлолитической активности полипептида
Kuhad et al. Revisiting cellulase production and redefining current strategies based on major challenges
JP2009509546A5 (ru)
Wilson Cellulases and biofuels
Cheng et al. Hydrolysis of lignocellulosic feedstock by novel cellulases originating from Pseudomonas sp. CL3 for fermentative hydrogen production
Peng et al. Characterization of hemicellulase and cellulase from the extremely thermophilic bacterium Caldicellulosiruptor owensensis and their potential application for bioconversion of lignocellulosic biomass without pretreatment
Dashtban et al. Fungal bioconversion of lignocellulosic residues; opportunities & perspectives
CN103429749B (zh) 用于从含木素纤维素材料产生发酵产物的方法
Edeh Bioethanol production: An overview
Shukla et al. Process development for the production of bioethanol from waste algal biomass of Gracilaria verrucosa
Akhtar et al. Characterization of cellulase producing Bacillus sp. for effective degradation of leaf litter biomass
Orencio-Trejo et al. Assessing the performance of bacterial cellulases: the use of Bacillus and Paenibacillus strains as enzyme sources for lignocellulose saccharification
Liu et al. Producing bioethanol from cellulosic hydrolyzate via co-immobilized cultivation strategy
EP2748313B1 (en) Cellulolytic enzyme compositions and uses thereof
Aarti et al. Saccharification of alkali pre-treated aquatic weeds biomass using partially purified cellulase immobilized on different matrices
Ballesteros Enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass
CN102517355A (zh) 一种联合降解木质纤维素的方法
Hobdey et al. New insights into microbial strategies for biomass conversion
Sun et al. Insights into Ionic liquids-resistance mechanism and lignocellulose-degradation model of Aspergillus terreus in 1-ethyl-3-methylimidazolium acetate
Saini et al. Microbial cellulases: role in second-generation ethanol production
Shawky et al. Enzymes in Fuel Biotechnology

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20170531