RU2020132524A - Способы лечения заболеваний, ассоциированных с впч - Google Patents

Способы лечения заболеваний, ассоциированных с впч Download PDF

Info

Publication number
RU2020132524A
RU2020132524A RU2020132524A RU2020132524A RU2020132524A RU 2020132524 A RU2020132524 A RU 2020132524A RU 2020132524 A RU2020132524 A RU 2020132524A RU 2020132524 A RU2020132524 A RU 2020132524A RU 2020132524 A RU2020132524 A RU 2020132524A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cell
paragraphs
composition
hpv
modified immune
Prior art date
Application number
RU2020132524A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2799784C2 (ru
Inventor
Скотт ЛОХХЕД
ЛиЭнн ТАЛАРИКО
Альфонсо ВИСЕНТЕ-СУАРЕС
Мэтт БУТИ
Говард БЕРНСТЕЙН
Катарина БЛАГОВИК
Армон Р. ШАРЕИ
Келан ХЛАВАТИ
Мелисса МАЙИНТ
Original Assignee
ЭсКьюЗед БАЙОТЕКНОЛОДЖИЗ КОМПАНИ
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ЭсКьюЗед БАЙОТЕКНОЛОДЖИЗ КОМПАНИ filed Critical ЭсКьюЗед БАЙОТЕКНОЛОДЖИЗ КОМПАНИ
Publication of RU2020132524A publication Critical patent/RU2020132524A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2799784C2 publication Critical patent/RU2799784C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12Viral antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K33/00Medicinal preparations containing inorganic active ingredients
    • A61K33/24Heavy metals; Compounds thereof
    • A61K33/243Platinum; Compounds thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4611T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4612B-cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4615Dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/462Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
    • A61K39/4622Antigen presenting cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464499Undefined tumor antigens, e.g. tumor lysate or antigens targeted by cells isolated from tumor
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/464838Viral antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/20Antivirals for DNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • C07K14/01DNA viruses
    • C07K14/025Papovaviridae, e.g. papillomavirus, polyomavirus, SV40, BK virus, JC virus
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/515Animal cells
    • A61K2039/5154Antigen presenting cells [APCs], e.g. dendritic cells or macrophages
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/545Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the dose, timing or administration schedule
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/555Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by a specific combination antigen/adjuvant
    • A61K2039/55511Organic adjuvants
    • A61K2039/55516Proteins; Peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/555Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by a specific combination antigen/adjuvant
    • A61K2039/55511Organic adjuvants
    • A61K2039/55561CpG containing adjuvants; Oligonucleotide containing adjuvants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/58Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation
    • A61K2039/585Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation wherein the target is cancer
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/31Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterized by the route of administration
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/39Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterised by a specific adjuvant, e.g. cytokines or CpG
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/46Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterised by the cancer treated
    • A61K2239/55Lung
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/20011Papillomaviridae
    • C12N2710/20034Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Claims (350)

1. Способ лечения заболевания, ассоциированного с вирусом папилломы человека (ВПЧ), у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно.
2. Способ профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно.
3. Способ модуляции иммунного ответа у субъекта с заболеванием, ассоциированным с ВПЧ, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно.
4. Способ лечения заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген и адъювант прошли через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ и адъювантом в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ и адъюванта в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
5. Способ профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ и адъювант прошли через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ и адъювантом в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ и адъюванта в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
6. Способ модуляции иммунного ответа у субъекта с заболеванием, ассоциированным с ВПЧ, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ и адъювант прошли через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ и адъювантом в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ и адъюванта в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
7. Способ по любому из пп. 4-6, где диаметр сужения меньше диаметра клетки.
8. Способ по любому из пп. 4-7, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до 99% от диаметра клетки.
9. Способ по любому из пп. 4-8, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до менее, чем приблизительно 60% от диаметра клетки.
10. Способ по любому из пп. 4-9, где сужение находится в канале.
11. Способ по любому из пп. 4-10, где к входной клетке прикладывается деформирующая сила, когда она проходит через сужение.
12. Способ по любому из пп. 1-11, где антиген ВПЧ и/или адъювант находятся в цитозоле и/или эндосомах.
13. Способ по любому из пп. 1-12, где антиген и/или адъювант находятся во многих компартментах клетки.
14. Способ по любому из пп. 1-13, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит антиген ВПЧ и/или адъювант вне клетки.
15. Способ по любому из пп. 1-14, где концентрация адъюванта, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
16. Способ по любому из пп. 1-15, где концентрация антигена ВПЧ, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
17. Способ по любому из пп. 4-16, где соотношение антигена ВПЧ и адъюванта, инкубированных с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
18. Способ по п.3 или 6, где иммунный ответ усиливается.
19. Способ по п.18, где иммунный ответ на антиген ВПЧ усиливается.
20. Способ по любому из пп. 1-19, где адъювант представляет собой CpG ODN, IFN-α, агонисты STING, агонисты RIG-I или поли I:C.
21. Способ по п.20, где адъювант представляет собой CpG ODN.
22. Способ по п.21, где CpG ODN представляет собой CpG ODN 1018, CpG ODN 1826 или CpG ODN 2006.
23. Способ по любому из пп. 1-22, где модифицированная иммунная клетка содержит более одного адъюванта.
24. Способ по любому из пп. 1-23, где антиген ВПЧ представляет собой пул множества полипептидов, которые вызывают ответ против одного и того же и/или разных антигенов ВПЧ.
25. Способ по п.24, где антиген в пуле множества антигенов не снижает иммунный ответ, направленный на другие антигены в пуле множества антигенов.
26. Способ по любому из пп. 1-25, где антиген ВПЧ представляет собой полипептид, содержащий антигенный эпитоп ВПЧ и одну или более гетерологичных пептидных последовательностей.
27. Способ по любому из пп. 1-26, где антиген ВПЧ образует комплекс с самим собой, с другими антигенами или с адъювантом.
28. Способ по любому из пп. 1-27, где ВПЧ представляет собой антиген, полученный из клеточного лизата.
29. Способ по любому из пп. 1-28, где антиген ВПЧ представляет собой антиген ВПЧ-16 или ВПЧ-18.
30. Способ по п.29, где антиген ВПЧ состоит из HLA-A2-рестриктированного эпитопа.
31. Способ по любому из пп. 1-30, где антиген ВПЧ представляет собой антиген ВПЧ E6 или антиген ВПЧ E7.
32. Способ по любому из пп. 1-31, где модифицированная иммунная клетка содержит антиген ВПЧ E6 и антиген ВПЧ E7.
33. Способ по любому из пп. 1-32, где антиген ВПЧ представляет собой полипептид, содержащий антигенный эпитоп, который фланкирован на N-конце и/или C-конце одной или более гетерологичными пептидными последовательностями.
34. Способ по п.33, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-26.
35. Способ по п.34, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с SEQ ID NO: 23.
36. Способ по любому из пп. 1-35, где антиген ВПЧ способен процессироваться в пептид, рестриктированный классом I MHC.
37. Способ по любому из пп. 1-36, где антиген ВПЧ способен процессироваться в пептид, рестриктированный классом II MHC.
38. Способ по любому из пп. 1-37, где модифицированная иммунная клетка содержит адъювант в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
39. Способ по любому из пп. 1-38, где модифицированная иммунная клетка содержит антиген ВПЧ в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
40. Способ по любому из пп. 1-39, где соотношение антигена ВПЧ и адъюванта составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
41. Способ по любому из пп. 1-40, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит агент, который повышает жизнеспособность и/или функцию модифицированной иммунной клетки по сравнению с соответствующей модифицированной иммунной клеткой, которая не содержит агента.
42. Способ по п.41, где агент представляет собой соединение, усиливающее эндоцитоз, стабилизирующий агент или кофактор.
43. Способ по п.41, где агент представляет собой альбумин.
44. Способ по п.43, где альбумин представляет собой мышиный, бычий или человеческий альбумин.
45. Способ по п.41, где агент представляет собой катион двухвалентного металла, глюкозу, АТФ, калий, глицерин, трегалозу, D-сахарозу, PEG1500, L-аргинин, L-глутамин или ЭДТА.
46. Способ по п.41, где агент включает сывороточный альбумин мыши (MSA).
47. Способ по любому из пп. 1-46, где модифицированные иммунные клетки дополнительно модифицируют для повышения экспрессии одной или более костимулирующих молекул.
48. Способ по п.47, где костимулирующая молекула представляет собой B7-H2, B7-1, B7-2, CD70, LIGHT, HVEM, CD40, 4-1BBL, OX40L, TL1A, GITRL, CD30L, TIM4, SLAM, CD48, CD58, CD155 или CD112.
49. Способ по п. 47 или 48, где клетка содержит нуклеиновую кислоту, которая приводит к повышенной экспрессии одной или более костимулирующих молекул.
50. Способ по любому из пп. 1-49, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку, дендритную клетку, моноцит, макрофаг, миелоидную клетку, гранулоцит, нейтрофил, тучную клетку, естественную клетку-киллер, врожденную лимфоидную клетку, базофил или гемопоэтическую клетку-предшественник.
51. Способ по любому из пп. 1-50, в котором иммунная клетка не является B-клеткой.
52. Способ по любому из пп. 1-50, где иммунная клетка представляет собой В-клетку.
53. Способ по любому из пп. 1-51, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку.
54. Способ по любому из пп. 1-49, где иммунные клетки представляют собой смешанную популяцию клеток.
55. Способ по п. 54, где иммунные клетки представляют собой множество PBMC.
56. Способ по п.53, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для модуляции экспрессии молекул MHC класса I.
57. Способ по п.53, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для модуляции экспрессии молекул MHC класса II.
58. Способ по п.56 или 57, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для снижения экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II.
59. Способ по п.56 или 57, где дополнительная модификация включает снижение экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II с использованием siРНК, shРНК, CRISPR/Cas9, ZFN, TALEN, Cre-рекомбиназы или мегануклеазы.
60. Способ по п.56 или 57, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для повышения экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II.
61. Способ по п.56 или 57, где дополнительная модификация включает повышение экспрессии молекул МНС класса I и/или молекул МНС класса II с использованием РНК или плазмидной ДНК.
62. Способ по любому из пп. 53 и 56-59, где в аллогенном контексте врожденный иммунный ответ, развившийся у субъекта в ответ на введение дополнительно модифицированных Т-клеток, снижен, в аллогенном контексте, по сравнению с врожденным иммунным ответом, развившимся у субъекта в ответ на введение соответствующих модифицированных Т-клеток, которые не содержат дополнительную модификацию.
63. Способ по любому из пп. 53 и 56-59, где период полужизни в кровотоке дополнительно модифицированных Т-клеток у субъекта, которому они были введены, модулируется по сравнению с периодом полужизни в кровотоке соответствующих модифицированных Т-клеток, которые не содержат дополнительной модификации у субъекта, которому они были введены.
64. Способ по любому из пп. 53 и 56-63, где Т-клетка включает одно или более из Т-хелперов, цитотоксических Т-клеток, Т-клеток памяти, CIK-клеток и естественных Т-клеток-киллеров.
65. Способ по любому из пп. 53 и 56-63, где Т-клетка включает одно или более из CD3+ Т-клеток, CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток, CD45RA+ Т-клеток, CD45RO+ Т-клеток и γδ-Т-клеток.
66. Способ по любому из пп. 1-65, где модифицированная клетка является аллогенной для субъекта.
67. Способ по любому из пп. 1-65, где модифицированная клетка является аутологичной для субъекта.
68. Способ по любому из пп. 1-67, где субъект предварительно кондиционирован к модулированному воспалению и/или модулированному иммунному ответу.
69. Способ по любому из пп. 1-68, дополнительно включающий введение субъекту адъюванта.
70. Способ по п.69, где адъювант представляет собой IFNα или CpG ODN.
71. Способ по п.69 или 70, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и адъювант, вводят одновременно.
72. Способ по п.69 или 70, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и адъювант, вводят последовательно.
73. Способ по п.72, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят до введения адъюванта.
74. Способ по п.72, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят после введения адъюванта.
75. Способ по любому из пп. 1-74, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят в комбинации с введением ингибитора иммунных контрольных точек.
76. Способ по п.75, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и ингибитор иммунных контрольных точек вводят одновременно.
77. Способ по п.75, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и ингибитор иммунных контрольных точек вводят последовательно.
78. Способ по п.77, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят до введения ингибитора иммунных контрольных точек.
79. Способ по п.77, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят после введения ингибитора иммунных контрольных точек.
80. Способ по любому из пп. 75-79, где ингибитор иммунных контрольных точек нацелен на одно или более из PD-1, PD-L1, CTLA-4, LAG3, TIM-3, TIGIT, VISTA, TIM1, B7-H4 (VTCN1) или BTLA.
81. Способ по любому из пп. 1-80, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят в комбинации с введением химиотерапевтического средства.
82. Способ по п.81, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и химиотерапевтическое средство вводят одновременно.
83. Способ по п.81, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и химиотерапевтическое средство вводят последовательно.
84. Способ по п.83, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят до введения химиотерапевтического средства.
85. Способ по п.83, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят после введения химиотерапевтического средства.
86. Способ по любому из пп. 81-85, где химиотерапия включает препарат на основе платины.
87. Способ по любому из пп. 81-86, где химиотерапия включает цисплатин.
88. Способ по любому из пп. 1-87, где введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, субъекту приводит к активации и/или экспансии цитотоксических Т-лимфоцитов (CTL), специфических для антигена ВПЧ.
89. Способ по любому из пп. 1-87, где введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, субъекту приводит к активации и/или экспансии Т(Th)-хелперов, специфических для антигена.
90. Способ по любому из пп. 1-89, где эффективное количество композиции содержит от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×1012 модифицированных иммунных клеток.
91. Способ по любому из пп. 1-90, где способ включает многократные введения композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки.
92. Способ по п.91, где способ включает первое введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, с последующим вторым введением композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки.
93. Способ по п.92, где второе введение проводят приблизительно через один месяц после первого введения.
94. Способ по любому из пп. 1-93, где заболевание, ассоциированное с ВПЧ, представляет собой собой рак, ассоциированный с ВПЧ.
95. Способ по п.94, где рак, ассоциированный с ВПЧ, представляет собой рак шейки матки, рак анального канала, орофарингеальный рак, рак влагалища, рак вульвы, рак полового члена, рак кожи или опухоли головы и шеи.
96. Способ по любому из пп. 1-95, где заболевание, ассоциированное с ВПЧ, представляет собой инфекционное заболевание, ассоциированное с ВПЧ.
97. Способ лечения заболевания, ассоциированного с вирусом папилломы человека (ВПЧ), у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, содержащий аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
98. Способ профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, содержащий аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
99. Способ модуляции иммунного ответа у субъекта с заболеванием, ассоциированным с ВПЧ, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, содержащий аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
100. Способ лечения заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, содержащий аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген прошел через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
101. Способ профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, содержащий аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ прошел через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
102. Способ модуляции иммунного ответа у субъекта с заболеванием, ассоциированным с ВПЧ, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, содержащий аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ прошел через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
103. Способ по любому из пп. 100-102, где диаметр сужения меньше диаметра клетки.
104. Способ по любому из пп. 100-103, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до 99% от диаметра клетки.
105. Способ по любому из пп. 100-104, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до менее, чем приблизительно 60% от диаметра клетки.
106. Способ по любому из пп. 100-105, где сужение находится в канале.
107. Способ по любому пп. 100-106, где к входной клетке прикладывается деформирующая сила, когда она проходит через сужение.
108. Способ по любому из пп. 86-107, дополнительно включающий введение субъекту адъюванта.
109. Способ по п.108, где адъювант представляет собой IFNα или CpG ODN.
110. Способ по п.108 или 109, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и адъювант вводят одновременно.
111. Способ по п.108 или 109, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и адъювант вводят последовательно.
112. Способ по п.111, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят до введения адъюванта.
113. Способ по п.111, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят после введения адъюванта.
114. Способ по любому из пп. 97-113, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит адъювант.
115. Способ по любому из пп. 100-113, где пертурбированную иммунную клетку на стадии b инкубируют с антигеном ВПЧ и адъювантом.
116. Способ по п.114 или 115, где антиген ВПЧ и/или адъювант находятся в цитозоле и/или эндосомах.
117. Способ по любому из пп. 114-116, где антиген и/или адъювант находятся во многих компартментах клетки.
118. Способ по любому из пп. 114-117, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит антиген ВПЧ и/или адъювант вне клетки.
119. Способ по любому из пп. 115-118, где концентрация адъюванта, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
120. Способ по любому из пп. 115-119, где концентрация антигена ВПЧ, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
121. Способ по любому из пп. 115-120, где соотношение антигена ВПЧ и адъюванта, инкубированных с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
122. Способ по п.99 или 102, где иммунный ответ усиливается.
123. Способ по п.122, где иммунный ответ на антиген ВПЧ усиливается.
124. Способ по любому из пп. 114-123, где адъювант представляет собой CpG ODN, IFN-α, агонисты STING, агонисты RIG-I или поли I:C.
125. Способ по п.124, где адъювант представляет собой CpG ODN.
126. Способ по п.125, где CpG ODN представляет собой CpG ODN 1018, CpG ODN 1826 или CpG ODN 2006.
127. Способ по любому из пп. 114-126, где модифицированная иммунная клетка содержит более одного адъюванта.
128. Способ по любому из пп. 97-127, где антиген ВПЧ представляет собой пул множества полипептидов, которые вызывают ответ против одного и того же и/или разных антигенов ВПЧ.
129. Способ по п.128, где антиген в пуле множества антигенов не снижает иммунный ответ, направленный на другие антигены в пуле множества антигенов.
130. Способ по любому из пп. 97-129, где антиген ВПЧ представляет собой полипептид, содержащий антигенный эпитоп ВПЧ и одну или более гетерологичных пептидных последовательностей.
131. Способ по любому из пп. 97-130, где антиген ВПЧ образует комплекс с самим собой, с другими антигенами или с адъювантом.
132. Способ по любому из пп. 97-131, где антиген ВПЧ состоит из HLA-A2-рестриктированного эпитопа.
133. Способ по любому из пп. 97-132, где антиген ВПЧ способен процессироваться в пептид, рестриктированный классом I MHC.
134. Способ по любому из пп. 97-133, где антиген ВПЧ способен процессироваться в пептид, рестриктированный классом II MHC.
135. Способ по любому из пп. 114-134, где модифицированная иммунная клетка содержит адъювант в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
136. Способ по любому из пп. 97-135, где модифицированная иммунная клетка содержит антиген ВПЧ в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
137. Способ по любому из пп. 114-136, где соотношение антигена ВПЧ и адъюванта составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
138. Способ по любому из пп. 97-137, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит агент, который повышает жизнеспособность и/или функцию модифицированной иммунной клетки по сравнению с соответствующей модифицированной иммунной клеткой, которая не содержат агента.
139. Способ по п.138, где агент представляет собой соединение, усиливающее эндоцитоз, стабилизирующий агент или кофактор.
140. Способ по п.138, где агент представляет собой альбумин.
141. Способ по п.140, где альбумин представляет собой мышиный, бычий или человеческий альбумин.
142. Способ по п.138, где агент представляет собой катион двухвалентного металла, глюкозу, АТФ, калий, глицерин, трегалозу, D-сахарозу, PEG1500, L-аргинин, L-глутамин или ЭДТА.
143. Способ по п.138, где агент включает MSA.
144. Способ по любому из пп. 97-143, где клетки дополнительно модифицированы для повышения экспрессии одной или более костимулирующих молекул.
145. Способ по п.144, где костимулирующая молекула представляет собой B7-H2 (ICOSL), B7-1 (CD80), B7-2 (CD86), CD70, LIGHT, HVEM, CD40, 4-1BBL, OX40L, TL1A, GITRL, CD30L, TIM4, SLAM, CD48, CD58, CD155 или CD112.
146. Способ по п. 144 или 145, где клетка содержит нуклеиновую кислоту, которая приводит к повышенной экспрессии одной или более костимулирующих молекул.
147. Способ по любому из пп. 97-146, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку, дендритную клетку, моноцит, макрофаг, миелоидную клетку, гранулоцит, нейтрофил, тучную клетку, естественную клетку-киллер, врожденную лимфоидную клетку, базофил или гемопоэтическую клетку-предшественник.
148. Способ по любому из пп. 97-147, где иммунная клетка не является B-клеткой.
149. Способ по любому из пп. 97-148, где иммунная клетка представляет собой B-клетку.
150. Способ по любому из пп. 97-148, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку.
151. Способ по любому из пп. 97-148, где иммунная клетка представляет собой смешанную популяцию клеток.
152. Способ по п.151, где иммунная клетка представляет собой множество PBMC.
153. Способ по п.150, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для модуляции экспрессии молекул MHC класса I.
154. Способ по п.150, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для модуляции экспрессии молекул MHC класса II.
155. Способ по п.153 или 154, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для уменьшения экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II.
156. Способ по п.153 или 154, где дополнительная модификация включает снижение экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II с использованием siРНК, shРНК, CRISPR/Cas9, ZFN, TALEN, Cre-рекомбиназы или мегануклеазы.
157. Способ по п.153 или 154, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для увеличения экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II.
158. Способ по п.153 или 154, где дополнительная модификация включает повышение экспрессии молекул МНС класса I и/или молекул МНС класса II с использованием РНК или плазмидной ДНК.
159. Способ по любому из пп. 150 и 153-156, где в аллогенном контексте врожденный иммунный ответ, развившийся у субъекта в ответ на введение дополнительно модифицированных Т-клеток, снижен, в аллогенном контексте, по сравнению с врожденным иммунным ответом, развившимся у субъекта в ответ на введение соответствующих модифицированных Т-клеток, которые не содержат дополнительную модификацию.
160. Способ по любому из пп. 150 и 153-156, где период полужизни в кровотоке дополнительно модифицированных Т-клеток у субъекта, которому они были введены, модулируется по сравнению с периодом полужизни в кровотоке соответствующих модифицированные Т-клетки, которые не содержат дополнительной модификации у субъекта, которому они были введены.
161. Способ по любому из пп. 150 и 153-160, где Т-клетка включает одно или более из Т-хелперов, цитотоксических Т-клеток, Т-клеток памяти, CIK-клеток и естественных Т-клеток-киллеров.
162. Способ по любому из пп. 150 и 153-160, где Т-клетка включает одно или более из CD3+ Т-клеток, CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток, CD45RA+ Т-клеток, CD45RO+ Т-клеток и γδ-Т-клеток.
163. Способ по любому из пп. 97-162, где модифицированная клетка является аллогенной для субъекта.
164. Способ по любому из пп. 97-162, где модифицированная клетка является аутологичной для субъекта.
165. Способ по любому из пп. 97-164, где субъект предварительно кондиционирован к модулированному воспалению и/или модулированному иммунному ответу.
166. Способ по любому из пп. 97-165, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят в комбинации с введением ингибитора иммунных контрольных точек.
167. Способ по п.166, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и ингибитор иммунных контрольных точек вводят одновременно.
168. Способ по п.166, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и ингибитор иммунных контрольных точек вводят последовательно.
169. Способ по п.168, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят до введения ингибитора иммунных контрольных точек.
170. Способ по п.168, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят после введения ингибитора иммунных контрольных точек.
171. Способ по любому из пп. 152-156, где ингибитор иммунных контрольных точек нацелен на одно или более из PD-1, PD-L1, CTLA-4, LAG3, TIM-3, TIGIT, VISTA, TIM1, B7-H4 (VTCN1) или BTLA.
172. Способ по любому из пп. 97-171, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят в комбинации с введением химиотерапевтического средства.
173. Способ по п.172, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и химиотерапевтическое средство вводят одновременно.
174. Способ по п.172, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, и химиотерапевтическое средство вводят последовательно.
175. Способ по п.174, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят до введения химиотерапевтического средства.
176. Способ по п.174, где композицию, содержащую модифицированные иммунные клетки, вводят после введения химиотерапевтического средства.
177. Способ по любому из пп. 172-176, где химиотерапия включает цисплатин.
178. Способ по любому из пп. 97-177, где введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, субъекту приводит к активации и/или экспансии цитотоксических Т-лимфоцитов (CTL), специфических для антигена ВПЧ.
179. Способ по любому из пп. 97-177, где введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, субъекту приводит к активации и/или экспансии T(Th)-хелперов, специфических для антигена ВПЧ.
180. Способ по любому из пп. 97-179, где эффективное количество композиции включает от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×1012 модифицированных иммунных клеток.
181. Способ по любому из пп. 97-180, где способ включает многократные введения композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки.
182. Способ по п.181, где способ включает первое введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, с последующим вторым введением композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки.
183. Способ по п.182, где второе введение проводят приблизительно через один месяц после первого введения.
184. Способ по любому из пп. 97-183, где заболевание, ассоциированное с ВПЧ, представляет собой собой рак, ассоциированный с ВПЧ.
185. Способ по п.184, где рак, ассоциированный с ВПЧ, представляет собой рак шейки матки, рак анального канала, орофарингеальный рак, рак влагалища, рак вульвы, рак полового члена, рак кожи или опухоли головы и шеи.
186. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат внутриклеточно CpG ODN и антиген ВПЧ с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
187. Композиция по п.186, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с SEQ ID NO: 23.
188. Композиция по п.186 или 187, где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ и CpG ODN прошли через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ и CpG ODN в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ и CpG ODN в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
189. Композиция по п.188, где диаметр сужения меньше диаметра клетки.
190. Композиция по п.188 или 189, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до приблизительно 99% от диаметра клетки.
191. Композиция по любому из пп. 188-190, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до менее, чем приблизительно 60% от диаметра клетки.
192. Композиция по любому из пп. 188-191, где сужение находится в канале.
193. Композиция по любому из пп. 188-192, где к входной клетке прикладывается деформирующая сила, когда она проходит через сужение.
194. Композиция по любому из пп. 186-193, где композиция дополнительно содержит адъювант.
195. Композиция по любому из пп. 186-194, где антиген ВПЧ и/или CpG ODN находится в цитозоле и/или эндосомах.
196. Композиция по любому из пп. 186-195, где антиген и/или CpG ODN находится во многих компартментах клетки.
197. Композиция по любому из пп. 186-196, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит антиген ВПЧ и/или CpG ODN на поверхности клетки.
198. Композиция по любому из пп. 188-197, где концентрация CpG ODN, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
199. Композиция по любому из пп. 188-198, где концентрация антигена ВПЧ, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
200. Композиция по любому из пп. 188-199, где соотношение антигена ВПЧ и CpG ODN, инкубированных с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
201. Композиция по любому из пп. 186-200, где CpG ODN представляет собой CpG ODN 1018, CpG ODN 1826 или CpG ODN 2006.
202. Композиция по любому из пп. 186-201, где модифицированная иммунная клетка содержит более одного адъюванта.
203. Композиция по п.202, где адъювант включает CpG ODN, IFN-α, агонисты STING, агонисты RIG-I или поли I:C.
204. Композиция по любому из пп. 186-203, где антиген ВПЧ представляет собой пул множества полипептидов, которые вызывают ответ против одного и того же или разных антигенов ВПЧ.
205. Композиция по п.204, где антиген в пуле множества антигенов не снижает иммунный ответ, направленный на другие антигены в пуле множества антигенов.
206. Композиция по любому из пп. 186-205, где антиген ВПЧ представляет собой полипептид, содержащий антигенный эпитоп ВПЧ и одну или более гетерологичных пептидных последовательностей.
207. Композиция по любому из пп. 186-206, где антиген ВПЧ образует комплекс с самим собой, с другими антигенами, с адъювантом или с CpG ODN.
208. Композиция по пп. 186-207, где антиген ВПЧ состоит из HLA-A2-рестриктированного эпитопа.
209. Композиция по любому из пп.186-208, где антиген ВПЧ представляет собой полипептид, содержащий антигенный эпитоп, фланкированный на N-конце и/или C-конце одной или более гетерологичными пептидными последовательностями.
210. Композиция по любому из пп. 186-209, где модифицированная иммунная клетка содержит CpG ODN в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
211. Композиция по любому из пп. 186-210, где модифицированная иммунная клетка содержит CpG ODN в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
212. Композиция по любому из пп. 186-211, где соотношение антигена ВПЧ и CpG ODN составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
213. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
214. Композиция по п.213, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с SEQ ID NO: 23.
215. Композиция по п.213 или 214, где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ прошел через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
216. Композиция по п.215, где диаметр сужения меньше диаметра клетки.
217. Композиция по любому из пп. 215-216, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до приблизительно 99% от диаметра клетки.
218. Композиция по любому из пп. 215-217, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до менее, чем приблизительно 60% от диаметра клетки.
219. Композиция по любому из пп. 215-218, где сужение находится в канале.
220. Композиция по любому из пп. 215-219, где к входной клетке прикладывается деформирующая сила, когда она проходит через сужение.
221. Композиция по любому из пп. 213-220, где композиция дополнительно содержит адъювант.
222. Композиция по любому из пп. 213-221, где антиген ВПЧ и/или адъювант находится в цитозоле и/или эндосомах.
223. Композиция по любому из пп. 213-222, где антиген и/или адъювант находится во многих компартментах клетки.
224. Композиция по любому из пп. 213-223, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит антиген ВПЧ и/или адъювант на поверхности клетки.
225. Композиция по любому из пп. 215-224, где концентрация адъюванта, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
226. Композиция по любому из пп. 215-225, где концентрация антигена ВПЧ, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
227. Композиция по любому из пп. 215-226, где соотношение антигена ВПЧ и адъюванта, инкубированных с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
228. Композиция по любому из пп. 213-227, где адъювант представляет собой CpG ODN, IFN-α, агонисты STING, агонисты RIG-I или поли I:C.
229. Композиция по п.228, где адъювант представляет собой CpG ODN.
230. Композиция по п.229, где CpG ODN представляет собой CpG ODN 1018, CpG ODN 1826 или CpG ODN 2006.
231. Композиция по любому из пп. 213-230, где модифицированная иммунная клетка включает более одного адъюванта.
232. Композиция по любому из пп. 213-231, где антиген ВПЧ представляет собой пул множества полипептидов, которые вызывают ответ против одного и того же или разных антигенов ВПЧ.
233. Композиция по п.232, где антиген в пуле множества антигенов не снижает иммунный ответ, направленный на другие антигены в пуле множества антигенов.
234. Композиция по любому из пп. 213-233, где антиген ВПЧ представляет собой полипептид, содержащий антигенный эпитоп ВПЧ и одну или более гетерологичных пептидных последовательностей.
235. Композиция по любому из пп. 213-234, где антиген ВПЧ образует комплекс с самим собой, с другими антигенами или с адъювантом.
236. Композиция по пп. 213-235, где антиген ВПЧ состоит из HLA-A2-рестриктированного эпитопа.
237. Композиция по любому из пп. 213-236, где модифицированная иммунная клетка содержит адъювант в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
238. Композиция по любому из пп. 213-237, где модифицированная иммунная клетка содержит антиген ВПЧ в концентрации от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
239. Композиция по любому из пп. 213-238, где соотношение антигена ВПЧ и адъюванта составляет от приблизительно 10000:1 до приблизительно 1:10000.
240. Композиция по любому из пп. 186-239, где антиген ВПЧ способен процессироваться в пептид, рестриктированный классом I MHC.
241. Композиция по любому из пп. 186-240, где антиген ВПЧ способен процессироваться в пептид, рестриктированный классом II MHC.
242. Композиция по любому из пп. 186-241, где модифицированная иммунная клетка дополнительно содержит агент, который повышает жизнеспособность и/или функцию модифицированной иммунной клетки по сравнению с соответствующей модифицированной иммунной клеткой, которая не содержат агента.
243. Композиция по п.242, где агент представляет собой соединение, усиливающее эндоцитоз, стабилизирующий агент или кофактор.
244. Композиция по п.242, где агент представляет собой альбумин.
245. Композиция по п.244, где альбумин представляет собой мышиный, бычий или человеческий альбумин.
246. Композиция по п.242, где агент представляет собой двухвалентный катион металла, глюкозу, АТФ, калий, глицерин, трегалозу, D-сахарозу, PEG1500, L-аргинин, L-глутамин или ЭДТА.
247. Композиция по п.242, где агент включает MSA.
248. Композиция по любому из пп. 186-247, где клетки дополнительно модифицированы для повышения экспрессии одной или более костимулирующих молекул.
249. Композиция по п.248, где костимулирующая молекула представляет собой B7-H2 (ICOSL), B7-1 (CD80), B7-2 (CD86), CD70, LIGHT, HVEM, CD40, 4-1BBL, OX40L, TL1A, GITRL, CD30L, TIM4, SLAM, CD48, CD58, CD155 или CD112.
250. Композиция по п. 248 или 249, где клетка содержит нуклеиновую кислоту, которая приводит к повышенной экспрессии одной или более костимулирующих молекул.
251. Композиция по любому из пп. 186-250, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку, дендритную клетку, моноцит, макрофаг, миелоидную клетку, гранулоцит, нейтрофил, тучную клетку, естественную клетку-киллер, врожденную лимфоидную клетку, базофил или гемопоэтическую клетку-предшественник.
252. Композиция по любому из пп. 186-251, где иммунная клетка не является В-клеткой.
253. Композиция по любому из пп. 186-252, где иммунная клетка представляет собой Т-клетку.
254. Композиция по п.253, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для модуляции экспрессии молекул MHC класса I.
255. Композиция по п.253, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для модуляции экспрессии молекул MHC класса II.
256. Композиция по п.254 или 255, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для уменьшения экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II.
257. Композиция по п.254 или 255, где дополнительная модификация включает снижение экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II с использованием siРНК, shРНК, CRISPR/Cas9, ZFN, TALEN, Cre-рекомбиназы или мегануклеазы.
258. Композиция по п.254 или 255, где Т-клетка содержит дополнительную модификацию для увеличения экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II.
259. Композиция по п.254 или 255, где дополнительная модификация включает повышение экспрессии молекул MHC класса I и/или молекул MHC класса II с использованием РНК или плазмидной ДНК.
260. Композиция по любому из пп. 253-257, где в аллогенном контексте врожденный иммунный ответ, развившийся у субъекта в ответ на введение дополнительно модифицированных Т-клеток, снижен, в аллогенном контексте, по сравнению с врожденным иммунным ответом, развившимся у субъекта в ответ на введение соответствующих модифицированных Т-клеток, которые не содержат дополнительную модификацию.
261. Композиция по любому из пп. 253-257, где период полужизни в кровотоке дополнительно модифицированных Т-клеток у субъекта, которому они были введены, модулируется по сравнению с периодом полужизни в кровотоке соответствующих модифицированных Т-клеток, которые не содержат дополнительной модификации у субъекта, которому они были введены.
262. Композиция по любому из пп. 253-261, где Т-клетка включает одно или более из Т-хелперов, цитотоксических Т-клеток, Т-клеток памяти, CIK-клеток и естественных Т-клеток-киллеров.
263. Композиция по любому из пп. 253-261, где Т-клетка включает одно или более из CD3+ Т-клеток, CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток, CD45RA+ Т-клеток, CD45RO+ Т-клеток и γδ-Т-клеток.
264. Композиция по любому из пп. 186-263, где модифицированная клетка является аллогенной для субъекта.
265. Композиция по любому из пп. 186-263, где модифицированная клетка является аутологичной для субъекта.
266. Композиция по любому из пп. 186-265, где субъект предварительно кондиционирован к модулированному воспалению и/или модулированному иммунному ответу.
267. Композиция по любому из пп. 186-266, где композиция дополнительно содержит ингибитор иммунных контрольных точек.
268. Композиция по п.267, где ингибитор иммунных контрольных точек нацелен на одно или более из PD-1, PD-L1, CTLA-4, LAG3, TIM-3, TIGIT, VISTA, TIM1, B7-H4 (VTCN1) или BTLA.
269. Композиция по любому из пп. 186-268, где введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, субъекту приводит к активации и/или экспансии цитотоксических Т-лимфоцитов (CTL), специфических для антигена ВПЧ.
270. Композиция по любому из пп. 186-268, где введение композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, субъекту приводит к активации и/или экспансии Т(Th)-хелперов, специфических для антигена.
271. Композиция по любому из пп. 186-270, где эффективное количество композиции включает от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×1012 модифицированных иммунных клеток.
272. Композиция, содержащая антиген, где антиген содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с SEQ ID NO: 23.
273. Композиция по п.272, где антиген содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23.
274. Способ лечения или профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, содержащую антиген ВПЧ, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген и адъювант прошли через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с адъювантом в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения адъюванта в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
275. Способ лечения или профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества композиции, содержащей модифицированные иммунные клетки, где модифицированные иммунные клетки содержат антиген ВПЧ и адъювант, где адъювант присутствует внутриклеточно;
где модифицированные иммунные клетки получают:
а) пропусканием клеточной суспензии, содержащей входную клетку, содержащую адъювант, через деформирующее клетку сужение, где диаметр сужения является функцией диаметра входной клетки в суспензии, тем самым вызывая пертурбации входной клетки, достаточно большие для того, чтобы антиген ВПЧ прошел через них, с образованием пертурбированной входной клетки; и
b) инкубацией пертурбированной входной клетки с антигеном ВПЧ и адъювантом в течение достаточного периода времени для обеспечения проникновения антигена ВПЧ в пертурбированную входную клетку;
с получением, тем самым, модифицированных иммунных клеток.
276. Способ по п.274 или 275, где диаметр сужения меньше диаметра клетки.
277. Способ по любому из пп. 274-276, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до 99% от диаметра клетки.
278. Способ по любому из пп. 274-277, где диаметр сужения составляет от приблизительно 20% до менее, чем приблизительно 60% от диаметра клетки.
279. Способ по любому из пп. 274-278, где сужение находится в канале.
280. Способ по любому из пп. 274-279, где к входной клетке прикладывается деформирующая сила, когда она проходит через сужение.
281. Способ по любому из пп. 274-280, где антиген ВПЧ и/или адъювант находятся в цитозоле и/или эндосомах.
282. Способ по любому из пп. 274-281, где антиген и/или адъювант находятся во многих компартментах клетки.
283. Способ по п.274, где концентрация адъюванта, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
284. Способ по п.275, где концентрация антигена ВПЧ, инкубированного с пертурбированной входной клеткой, составляет от приблизительно 0,1 мкМ до приблизительно 1 мМ.
285. Способ по любому из пп. 274-285, где адъювант представляет собой CpG ODN, IFN-α, агонисты STING, агонисты RIG-I или поли I:C.
286. Способ по п.285, где адъювант представляет собой CpG ODN.
287. Способ по п.286, где CpG ODN представляет собой CpG ODN 1018, CpG ODN 1826 или CpG ODN 2006.
288. Способ по любому из пп. 274-287, где антиген ВПЧ происходят из клеточного лизата.
289. Способ по любому из пп. 274-288, где антиген ВПЧ представляет собой антиген ВПЧ-16 или ВПЧ-18.
290. Способ по любому из пп. 274-289, где антиген ВПЧ представляет собой антиген ВПЧ E6 или антиген ВПЧ E7.
291. Способ по п.290, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
292. Способ по п.289, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность из любой из SEQ ID NO: 18-25.
293. Способ по п.290, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с SEQ ID NO: 23.
294. Способ по п.290, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23.
295. Способ лечения или профилактики заболевания, ассоциированного с ВПЧ, у субъекта, включающий введение субъекту модифицированной иммунной клетки, ассоциированной с антигеном ВПЧ, где модифицированная иммунная клетка получена с помощью способа, включающего стадии:
а) инкубация входной клетки с антигеном ВПЧ и/или адъювантом в течение достаточного периода времени для обеспечения связывания антигена ВПЧ с входной клеткой;
с получением, тем самым, модифицированной иммунной клетки, ассоциированной с антигеном.
296. Способ по п.295, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность с по меньшей мере 90% сходством с любой из SEQ ID NO: 18-25.
297. Способ по п.296, где антиген ВПЧ содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23.
298. Способ по любому из пп. 295-297, где адъювант представляет собой CpG ODN.
299. Способ по п.298, где CpG ODN представляет собой CpG ODN 1018, CpG ODN 1826 или CpG ODN 2006.
300. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки по любому из пп. 186-273, для применения в качестве лекарственного средства.
301. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки по любому из пп. 186-273, для применения в способе лечения организма человека или животного хирургическим путем, терапии или диагностики.
302. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки по любому из пп. 186-273, для применения в лечении рака, инфекционного заболевания или заболевания, ассоциированного с вирусом.
303. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки по любому из пп. 186-273, где рак представляет собой опухоли головы и шеи, рак шейки матки, рак вульвы, рак влагалища, рак полового члена, рак анального канала, рак перианальной области, аногенитальный рак, рак ротовой полости или рак слюнной железы.
304. Композиция, содержащая модифицированные иммунные клетки по любому из пп. 300-303, где модифицированные PBMC вводят до, одновременно или после введения ингибитора иммунных контрольных точек.
305. Композиция по п.304, где ингибитор иммунных контрольных точек нацелен на любое из PD-1, PD-L1, CTLA-4, LAG3, VISTA и TIM-3.
306. Композиция по п.305, где ингибитор иммунных контрольных точек нацелен на PD-1.
307. Композиция по п.305, где ингибитор иммунных контрольных точек нацелен на PD-L1.
308. Композиция по любому из пп. 300-307, где модифицированные PBMC вводят до, одновременно или после введения терапевтического агента.
309. Композиция по п.308, где терапевтический агент представляет собой химиотерапевтический препарат.
310. Композиция по п.309, где инфекционное заболевание ассоциировано с ВИЧ, ВПЧ, EBV, MCV, HBV или HCV.
RU2020132524A 2018-03-12 2019-03-11 Способы лечения заболеваний, ассоциированных с впч RU2799784C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201862641988P 2018-03-12 2018-03-12
US62/641,988 2018-03-12
US201962794517P 2019-01-18 2019-01-18
US62/794,517 2019-01-18
US201962812225P 2019-02-28 2019-02-28
US62/812,225 2019-02-28
PCT/US2019/021703 WO2019178005A2 (en) 2018-03-12 2019-03-11 Methods for treating hpv-associated diseases

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2020132524A true RU2020132524A (ru) 2022-04-13
RU2799784C2 RU2799784C2 (ru) 2023-07-11

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
KR20200130371A (ko) 2020-11-18
SG11202008863XA (en) 2020-10-29
MX2020009441A (es) 2021-01-08
PE20201201A1 (es) 2020-11-11
CA3093826A1 (en) 2019-09-19
CR20200461A (es) 2021-03-11
PH12020551437A1 (en) 2021-09-06
MA52003A (fr) 2021-01-20
AU2019234549A1 (en) 2020-10-08
EP3765073A2 (en) 2021-01-20
CO2020012583A2 (es) 2020-10-30
CN112105383A (zh) 2020-12-18
TW202003025A (zh) 2020-01-16
WO2019178005A2 (en) 2019-09-19
JP2021517895A (ja) 2021-07-29
BR112020018609A2 (pt) 2020-12-29
WO2019178005A3 (en) 2019-10-17
IL277190A (en) 2020-10-29
US20210038709A1 (en) 2021-02-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11136562B2 (en) Conditionally active heterodimeric polypeptides and methods of use thereof
Riemer et al. A conserved E7-derived cytotoxic T lymphocyte epitope expressed on human papillomavirus 16-transformed HLA-A2+ epithelial cancers
Ramos da Silva et al. Single immunizations of self-amplifying or non-replicating mRNA-LNP vaccines control HPV-associated tumors in mice
Bachmann et al. TRANCE, a tumor necrosis factor family member critical for CD40 ligand–independent T helper cell activation
Frazer et al. Potential strategies utilised by papillomavirus to evade host immunity
Bevan Helping the CD8+ T-cell response
Chen et al. Boosting with recombinant vaccinia increases HPV-16 E7-specific T cell precursor frequencies of HPV-16 E7-expressing DNA vaccines
Stanley Potential mechanisms for HPV vaccine-induced long-term protection
KR20210019993A (ko) Τ 세포 수용체 및 이를 발현하는 조작된 세포
Salek-Ardakani et al. OX40 drives protective vaccinia virus-specific CD8 T cells
Blachere et al. IL-2 is required for the activation of memory CD8+ T cells via antigen cross-presentation
TW201300418A (zh) 用於抗c型肝炎病毒免疫之組合物及方法
Tellam et al. mRNA Structural constraints on EBNA1 synthesis impact on in vivo antigen presentation and early priming of CD8+ T cells
Remy-Ziller et al. Immunological characterization of a modified vaccinia virus Ankara vector expressing the human papillomavirus 16 E1 protein
Bachmann et al. Cutting edge: distinct roles for T help and CD40/CD40 ligand in regulating differentiation of proliferation-competent memory CD8+ T cells
AU2005268646A2 (en) HPV vaccine comprising peptides from host cell proteins
JP2019514417A (ja) グルタミンシンセターゼ遺伝子内相補ベクターを用いた高レベルのヘテロマータンパク質発現細胞の直接選択
JPWO2019178006A5 (ru)
Bach et al. Vesicular stomatitis virus glycoprotein displaying retrovirus-like particles induce a type I IFN receptor-dependent switch to neutralizing IgG antibodies
Liu et al. Production of transmembrane and secreted forms of tumor necrosis factor (TNF)-alpha by HIV-1-specific CD4+ cytolytic T lymphocyte clones. Evidence for a TNF-alpha-independent cytolytic mechanism.
RU2020132524A (ru) Способы лечения заболеваний, ассоциированных с впч
US6838084B1 (en) Cytotoxic T-cell epitopes of the papilloma virus l1-protein and use thereof in diagnosis and therapy
Schell et al. Cytotoxic T lymphocytes from HLA-A2. 1 transgenic mice define a potential human epitope from simian virus 40 large T antigen
CN116406283A (zh) 用于使用有核细胞刺激对蛋白质的hla未知免疫应答的方法
Keller et al. Follicular and marginal zone B cells fail to cross-present MHC class I-restricted epitopes derived from viral particles