RU2017128518A - Способ определения зиготности гена fad3 в каноле - Google Patents
Способ определения зиготности гена fad3 в каноле Download PDFInfo
- Publication number
- RU2017128518A RU2017128518A RU2017128518A RU2017128518A RU2017128518A RU 2017128518 A RU2017128518 A RU 2017128518A RU 2017128518 A RU2017128518 A RU 2017128518A RU 2017128518 A RU2017128518 A RU 2017128518A RU 2017128518 A RU2017128518 A RU 2017128518A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- probe
- primer
- seq
- fad
- genomic dna
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
- C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Botany (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (18)
1. Способ определения зиготности растения канолы, содержащего ген fad-3c, где способ включает:
получение образца геномной ДНК из растения канолы;
гибридизацию образца геномной ДНК с первым праймером, вторым праймером, первым зондом, и вторым зондом, где первый праймер и второй праймер содержат SEQ ID NO: 2 и SEQ ID NO: 3, и первый зонд и второй зонд содержат SEQ ID NO: 5 и SEQ ID NO: 4, где каждый из упомянутого первого зонда и упомянутого второго зонда мечен флуоресцентным красителем и гасителем;
измерение флуоресценции первого зонда, второго зонда или их комбинации; и
определение зиготности растения канолы.
2. Способ по п. 1, в котором образец геномной ДНК содержит мутированную fad-3c последовательность, имеющую однонуклеотидный полиморфизм, где однонуклеотидный полиморфизм состоит из полиморфизма G->A.
3. Способ по п. 2, в котором образец геномной ДНК дополнительно содержит fad-3c последовательность дикого типа.
4. Способ по п. 1, в котором упомянутый способ применяют для верификации интрогрессии при селекции у кроссбредных растений канолы.
5. Способ по п. 1, в котором первый зонд содержит VIC в качестве флуоресцентного красителя на 5'-конце первого зонда и MGB-гаситель на 3'-конце первого зонда.
6. Способ по п. 1, в котором второй зонд помечен FAM на 5'-конце второго зонда и MGB-гасителем на 3'-конце упомянутого второго зонда.
7. Способ по п. 1, в котором измерение флуоресценции включает измерение и анализ флуоресценции непосредственно в планшет-ридере.
8. Способ по п. 1, в котором образец ДНК получают от растения канолы в поле.
9. Способ по п. 1, в котором первый зонд и второй зонд гибридизуется с образцом геномной ДНК в течение периода времени при температуре примерно 50-70ºС.
10. Способ по п. 9, дополнительно включающий повышение температуры после периода времени.
11. Способ по п. 10, в котором флуоресценция, генерируемая каждым из первого зонда и второго зонда во время стадии повышения температуры, измеряют приращениями.
12. Способ по п. 1, в котором первый зонд гибридизуется с областью fad-3c последовательности дикого типа, и второй зонд гибридизуется с областью мутированной fad-3c последовательности, имеющей однонуклеотидный полиморфизм (SNP).
13. Набор для осуществления способа по п. 1, где набор включает первый праймер, второй праймер, первый зонд и второй зонд.
14. Набор по п. 13, где первый праймер представляет собой SEQ ID NO:2, второй праймер представляет собой SEQ ID NO:3, первый зонд представляет собой SEQ ID NO:5, и второй зонд представляет собой SEQ ID NO:4.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201161550170P | 2011-10-21 | 2011-10-21 | |
| US61/550,170 | 2011-10-21 |
Related Parent Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014120420A Division RU2630998C2 (ru) | 2011-10-21 | 2012-10-19 | Способ определения зиготности гена fad3 в каноле |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2017128518A true RU2017128518A (ru) | 2019-02-04 |
Family
ID=48136263
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017128518A RU2017128518A (ru) | 2011-10-21 | 2012-10-19 | Способ определения зиготности гена fad3 в каноле |
| RU2014120420A RU2630998C2 (ru) | 2011-10-21 | 2012-10-19 | Способ определения зиготности гена fad3 в каноле |
Family Applications After (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014120420A RU2630998C2 (ru) | 2011-10-21 | 2012-10-19 | Способ определения зиготности гена fad3 в каноле |
Country Status (17)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US9663832B2 (ru) |
| EP (2) | EP2768984B1 (ru) |
| JP (1) | JP2014530624A (ru) |
| CN (1) | CN104011225A (ru) |
| AR (1) | AR088407A1 (ru) |
| AU (1) | AU2012325990B2 (ru) |
| CA (1) | CA2852934C (ru) |
| ES (1) | ES2660976T3 (ru) |
| HK (1) | HK1201076A1 (ru) |
| HU (1) | HUE037107T2 (ru) |
| IN (1) | IN2014DN03017A (ru) |
| NO (1) | NO2823060T3 (ru) |
| PL (1) | PL2768984T3 (ru) |
| PT (1) | PT2768984T (ru) |
| RU (2) | RU2017128518A (ru) |
| UA (1) | UA114301C2 (ru) |
| WO (1) | WO2013059578A1 (ru) |
Family Cites Families (15)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4965188A (en) | 1986-08-22 | 1990-10-23 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences using a thermostable enzyme |
| US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
| US5176995A (en) | 1985-03-28 | 1993-01-05 | Hoffmann-La Roche Inc. | Detection of viruses by amplification and hybridization |
| US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
| ZA973565B (en) * | 1996-04-26 | 1998-10-26 | Du Pont | Soybean oil having high oxidative stability |
| WO2001014538A2 (en) * | 1999-08-26 | 2001-03-01 | Calgene Llc | Plants with modified polyunsaturated fatty acids |
| CA2284246A1 (en) * | 1999-10-01 | 2001-04-01 | Agriculture And Agrifood Canada Of Agriculture And Agri-Food | Plant fatty acid desaturases and alleles therefor |
| AU2004210965C1 (en) * | 2003-02-11 | 2014-10-16 | Corteva Agriscience Llc | Altered FAD2 and FAD3 genes in brassica and the molecular marker-assisted detection thereof |
| US20080227663A1 (en) * | 2007-01-19 | 2008-09-18 | Biodot, Inc. | Systems and methods for high speed array printing and hybridization |
| CN101591697A (zh) | 2008-05-27 | 2009-12-02 | 北京华安佛医药研究中心有限公司 | 一种检测巯基嘌呤甲基转移酶基因a719g多态性位点基因型的试剂盒、方法和用途 |
| CA2781278C (en) * | 2009-11-20 | 2021-07-27 | Bayer Cropscience Nv | Brassica plants comprising mutant fad3 alleles |
| EP2513319A4 (en) * | 2009-12-17 | 2013-05-08 | Univ Missouri | PLANT GENES ASSOCIATED WITH SEED OIL CONTENT AND METHODS OF USE |
| US20110151441A1 (en) * | 2009-12-18 | 2011-06-23 | Dow Agrosciences Llc | Endpoint taqman methods for determining zygosity of corn comprising tc1507 events |
| CN101818196B (zh) * | 2009-12-28 | 2012-02-08 | 华中农业大学 | 甘蓝型油菜低亚麻酸分子标记及其制备方法与应用 |
| US9493786B2 (en) * | 2010-10-12 | 2016-11-15 | Monsanto Technology Llc | Soybean plant and seed corresponding to transgenic event MON87712 comprising a B-box zinc finger protein 32, and methods for detection thereof |
-
2012
- 2012-10-19 EP EP12841612.0A patent/EP2768984B1/en not_active Not-in-force
- 2012-10-19 AR ARP120103918A patent/AR088407A1/es active IP Right Grant
- 2012-10-19 WO PCT/US2012/061000 patent/WO2013059578A1/en active Application Filing
- 2012-10-19 JP JP2014537282A patent/JP2014530624A/ja not_active Ceased
- 2012-10-19 EP EP17205337.3A patent/EP3342882A1/en not_active Withdrawn
- 2012-10-19 HU HUE12841612A patent/HUE037107T2/hu unknown
- 2012-10-19 UA UAA201405393A patent/UA114301C2/uk unknown
- 2012-10-19 AU AU2012325990A patent/AU2012325990B2/en active Active
- 2012-10-19 PL PL12841612T patent/PL2768984T3/pl unknown
- 2012-10-19 RU RU2017128518A patent/RU2017128518A/ru not_active Application Discontinuation
- 2012-10-19 PT PT128416120T patent/PT2768984T/pt unknown
- 2012-10-19 CN CN201280063464.6A patent/CN104011225A/zh active Pending
- 2012-10-19 US US13/656,270 patent/US9663832B2/en active Active
- 2012-10-19 ES ES12841612.0T patent/ES2660976T3/es active Active
- 2012-10-19 RU RU2014120420A patent/RU2630998C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2012-10-19 IN IN3017DEN2014 patent/IN2014DN03017A/en unknown
- 2012-10-19 CA CA2852934A patent/CA2852934C/en active Active
-
2013
- 2013-03-04 NO NO13757482A patent/NO2823060T3/no unknown
-
2015
- 2015-02-12 HK HK15101548.8A patent/HK1201076A1/xx unknown
-
2017
- 2017-04-24 US US15/495,937 patent/US20170298451A1/en not_active Abandoned
-
2019
- 2019-09-17 US US16/573,484 patent/US20200140962A1/en active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| UA114301C2 (uk) | 2017-05-25 |
| HUE037107T2 (hu) | 2018-08-28 |
| CN104011225A (zh) | 2014-08-27 |
| JP2014530624A (ja) | 2014-11-20 |
| US20200140962A1 (en) | 2020-05-07 |
| HK1201076A1 (en) | 2015-08-21 |
| EP2768984A1 (en) | 2014-08-27 |
| RU2014120420A (ru) | 2015-11-27 |
| IN2014DN03017A (ru) | 2015-05-08 |
| US20170298451A1 (en) | 2017-10-19 |
| PT2768984T (pt) | 2018-04-17 |
| WO2013059578A1 (en) | 2013-04-25 |
| AR088407A1 (es) | 2014-05-28 |
| EP2768984B1 (en) | 2018-01-10 |
| EP2768984A4 (en) | 2015-07-01 |
| US20130102002A1 (en) | 2013-04-25 |
| NO2823060T3 (ru) | 2018-07-14 |
| EP3342882A1 (en) | 2018-07-04 |
| PL2768984T3 (pl) | 2018-07-31 |
| US9663832B2 (en) | 2017-05-30 |
| RU2630998C2 (ru) | 2017-09-15 |
| CA2852934C (en) | 2023-01-03 |
| CA2852934A1 (en) | 2013-04-25 |
| AU2012325990B2 (en) | 2018-04-19 |
| ES2660976T3 (es) | 2018-03-26 |
| AU2012325990A1 (en) | 2014-04-24 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Huang et al. | Detection of genetically modified maize MON810 and NK603 by multiplex and real-time polymerase chain reaction methods | |
| Xu et al. | Event-specific detection of seven genetically modified soybean and maizes using multiplex-PCR coupled with oligonucleotide microarray | |
| RU2012110253A (ru) | Детекция aad-1 объекта das-40278-9 | |
| RU2015128103A (ru) | Способы обнаружения днк для сайт-специфической нуклеазной активности | |
| TWI527905B (zh) | 透過利用基因檢測技術與微珠微流道結合進行單核苷酸多態性檢測之方法 | |
| RU2012130431A (ru) | Способы по конечной точке таqvan для определения зиготности кукурузы, включающей события тс1507 | |
| Qiu et al. | A novel fluorescent biosensor for detection of target DNA fragment from the transgene cauliflower mosaic virus 35S promoter | |
| RU2014126423A (ru) | Высокопроизводительный анализ однонуклеотидных полиморфизмов | |
| RU2012126088A (ru) | Детектирование aad-12-события 416 у сои | |
| CN103451292B (zh) | 应用rpa技术对转基因水稻华恢1号品系特异性鉴定 | |
| CN103740702B (zh) | 一种与海湾扇贝热耐受性相关的snp标记及其鉴定方法和潜在应用 | |
| CN103525936B (zh) | 应用rpa技术对转基因水稻科丰6号品系特异性鉴定 | |
| Zhao et al. | Universal Exponential Amplification Confers Multilocus Detection of Mutation-Prone Virus | |
| Chaouachi et al. | A strategy for designing multi-taxa specific reference gene systems. Example of application––ppi Phosphofructokinase (ppi-PPF) used for the detection and quantification of three taxa: maize (Zea mays), cotton (Gossypium hirsutum) and rice (Oryza sativa) | |
| CN101974618B (zh) | 转cry1C基因水稻品系T1c-19的转化体特异性PCR检测方法 | |
| KR20100019645A (ko) | Ｒｅａｌ-ｔｉｍｅ ＰＣＲ을 이용한 소나무재선충(Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓ)과 유사재선충(Ｂｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓ ｍｕｃｒｏｎａｔｕｓ)의 분석 방법 | |
| CN103509875B (zh) | 应用RPA技术检测CaMV35S启动子和nos终止子 | |
| RU2017128518A (ru) | Способ определения зиготности гена fad3 в каноле | |
| JP2005261354A (ja) | 核酸の蛍光検出法 | |
| Zhu et al. | A microfluidic system integrated one-step PCR and high-resolution melting analysis for rapid rice mutant detection | |
| RU2017143585A (ru) | Способ определения зиготности гена fad-2 канолы с использованием пцр с детекцией по конечной точке | |
| EP3613049B1 (en) | Methods for preparing optimal combination of oligonucleotides | |
| JP2011155912A (ja) | 特定カビ検出用マイクロアレイ、及び特定カビ検出用マイクロアレイの使用方法 | |
| CN104450968B (zh) | 用于猪细小病毒5型实时荧光定量pcr方法的引物及探针 | |
| Li et al. | A Colorimetric RT-LAMP Assay for Rapid Detection of Soybean mosaic Virus SC15 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20200811 |