RU2015119238A - Способы, композиции и устройства для амплификации нуклеиновых кислот - Google Patents
Способы, композиции и устройства для амплификации нуклеиновых кислот Download PDFInfo
- Publication number
- RU2015119238A RU2015119238A RU2015119238A RU2015119238A RU2015119238A RU 2015119238 A RU2015119238 A RU 2015119238A RU 2015119238 A RU2015119238 A RU 2015119238A RU 2015119238 A RU2015119238 A RU 2015119238A RU 2015119238 A RU2015119238 A RU 2015119238A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- acid
- dna
- component
- composition
- chamber
- Prior art date
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract 24
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract 14
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract 14
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract 14
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims 10
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Malonic acid Chemical compound OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 8
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims abstract 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims abstract 8
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 6
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims abstract 6
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 claims abstract 6
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims abstract 5
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims abstract 5
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims abstract 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract 4
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 claims abstract 4
- WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N adipic acid Chemical compound OC(=O)CCCCC(O)=O WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- 239000012670 alkaline solution Substances 0.000 claims abstract 4
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 claims abstract 4
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- 239000000463 material Substances 0.000 claims abstract 4
- BDJRBEYXGGNYIS-UHFFFAOYSA-N nonanedioic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCCC(O)=O BDJRBEYXGGNYIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- WLJVNTCWHIRURA-UHFFFAOYSA-N pimelic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCC(O)=O WLJVNTCWHIRURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims abstract 4
- CXMXRPHRNRROMY-UHFFFAOYSA-N sebacic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCCCC(O)=O CXMXRPHRNRROMY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- TYFQFVWCELRYAO-UHFFFAOYSA-N suberic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCC(O)=O TYFQFVWCELRYAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 4
- BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N (S)-malic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-REOHCLBHSA-N 0.000 claims abstract 2
- RTBFRGCFXZNCOE-UHFFFAOYSA-N 1-methylsulfonylpiperidin-4-one Chemical compound CS(=O)(=O)N1CCC(=O)CC1 RTBFRGCFXZNCOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims abstract 2
- 241000269627 Amphiuma means Species 0.000 claims abstract 2
- AEMOLEFTQBMNLQ-AQKNRBDQSA-N D-glucopyranuronic acid Chemical compound OC1O[C@H](C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-AQKNRBDQSA-N 0.000 claims abstract 2
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 claims abstract 2
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- OTRAYOBSWCVTIN-UHFFFAOYSA-N OB(O)O.OB(O)O.OB(O)O.OB(O)O.OB(O)O.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N Chemical group OB(O)O.OB(O)O.OB(O)O.OB(O)O.OB(O)O.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N.N OTRAYOBSWCVTIN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 239000001361 adipic acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 235000011037 adipic acid Nutrition 0.000 claims abstract 2
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxysuccinic acid Natural products OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N anhydrous glutaric acid Natural products OC(=O)CCCC(O)=O JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 claims abstract 2
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 claims abstract 2
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 235000011087 fumaric acid Nutrition 0.000 claims abstract 2
- 229940097043 glucuronic acid Drugs 0.000 claims abstract 2
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 claims abstract 2
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 claims abstract 2
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 239000001630 malic acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 235000011090 malic acid Nutrition 0.000 claims abstract 2
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 claims abstract 2
- 238000005070 sampling Methods 0.000 claims abstract 2
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 claims abstract 2
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 claims abstract 2
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 4
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 3
- WMFOQBRAJBCJND-UHFFFAOYSA-M Lithium hydroxide Chemical compound [Li+].[OH-] WMFOQBRAJBCJND-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 claims 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 2
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 claims 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims 1
- 238000011901 isothermal amplification Methods 0.000 claims 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 claims 1
Classifications
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0809—Geometry, shape and general structure rectangular shaped
- B01L2300/0816—Cards, e.g. flat sample carriers usually with flow in two horizontal directions
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0861—Configuration of multiple channels and/or chambers in a single devices
- B01L2300/087—Multiple sequential chambers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0475—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure
- B01L2400/0481—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure squeezing of channels or chambers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/13—Plant traits
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Botany (AREA)
- Mycology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
1. Композиция, содержащая смесь деоксинуклеотидов (dNTP), двухвалентных катионов, фермента, способного к амплификации ДНК, и праймеров, пригодных для амплификации нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, или ДНК, представляющей интерес, отличающаяся тем, что указанная смесь имеет буферную емкость при достаточно низкой ионной силе для достаточной нейтрализации щелочного раствора, содержащего матричную нуклеиновую кислоту или ДНК, чтобы сделать возможным функционирование фермента для амплификации, где смесь содержит:a. соль, содержащую аммоний в качестве катиона, и анион слабой кислоты, иb. органическую кислоту, предпочтительно, дикарбоновую кислоту.2. Композиция по п. 1, где указанная соль представляет собой аммоний пентаборат.3. Композиция по п. 1 или 2, где органическая кислота представляет собой яблочную кислоту.4. Композиция по п. 1, где органическую кислоту выбирают из щавелевой кислоты, малоновой кислоты, янтарной кислоты, глутаровой кислоты, адипиновой кислоты, пимелиновой кислоты, субериновой кислоты, азелаиновой кислоты, себациновой кислоты, глюкуроновой кислоты, молочной кислоты, винной кислоты, фумаровой кислоты, малеиновой кислоты или их смеси.5. Набор, содержащий композицию по любому из пп. 1-4.6. Устройство, содержащее набор по п. 5, указанное устройство дополнительно содержит:a. средства для отбора образцов растительного материала;b. резервуар для жидкости, содержащий щелочной экстракционный раствор;c. соответствующие каналы для направления щелочного экстракционного раствора, при активировании, на растительный материал в смеси; иd. необязательно, средства для детектирования амплификации нуклеиновых кислот.7. Картридж, содержащий набор
Claims (15)
1. Композиция, содержащая смесь деоксинуклеотидов (dNTP), двухвалентных катионов, фермента, способного к амплификации ДНК, и праймеров, пригодных для амплификации нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, или ДНК, представляющей интерес, отличающаяся тем, что указанная смесь имеет буферную емкость при достаточно низкой ионной силе для достаточной нейтрализации щелочного раствора, содержащего матричную нуклеиновую кислоту или ДНК, чтобы сделать возможным функционирование фермента для амплификации, где смесь содержит:
a. соль, содержащую аммоний в качестве катиона, и анион слабой кислоты, и
b. органическую кислоту, предпочтительно, дикарбоновую кислоту.
2. Композиция по п. 1, где указанная соль представляет собой аммоний пентаборат.
3. Композиция по п. 1 или 2, где органическая кислота представляет собой яблочную кислоту.
4. Композиция по п. 1, где органическую кислоту выбирают из щавелевой кислоты, малоновой кислоты, янтарной кислоты, глутаровой кислоты, адипиновой кислоты, пимелиновой кислоты, субериновой кислоты, азелаиновой кислоты, себациновой кислоты, глюкуроновой кислоты, молочной кислоты, винной кислоты, фумаровой кислоты, малеиновой кислоты или их смеси.
5. Набор, содержащий композицию по любому из пп. 1-4.
6. Устройство, содержащее набор по п. 5, указанное устройство дополнительно содержит:
a. средства для отбора образцов растительного материала;
b. резервуар для жидкости, содержащий щелочной экстракционный раствор;
c. соответствующие каналы для направления щелочного экстракционного раствора, при активировании, на растительный материал в смеси; и
d. необязательно, средства для детектирования амплификации нуклеиновых кислот.
7. Картридж, содержащий набор по п. 5, где указанный картридж дополнительно содержит:
a) первый компонент, предпочтительно, компонент, являющийся основой, предпочтительно, покрытый на обеих сторонах прозрачными покрытиями, с формированием тем самым каналов и камер (1), и второй компонент, предпочтительно, компонент, являющийся крышкой (2), совмещаемые вместе для закрывания, предпочтительно, посредством накладывания двух структур вместе, предпочтительно, вокруг шарнирной секции (3); причем
b) указанные первый и второй компоненты или указанные компоненты, являющиеся основой и крышкой, содержат вставляемую и соответствующую принимающую часть (4) и (5), которые, когда первый и второй компоненты или компоненты, являющиеся основой и крышкой, совмещаются, формируют камеру A, подходящую для приема биологического образца; где камера A предпочтительно является герметичной;
c) указанный первый компонент или указанный компонент, являющийся основой, дополнительно содержит соединенный с ним резервуар (9) для жидкости, содержащий щелочной раствор; где указанный резервуар для жидкости соединен с камерой A посредством канала (10);
d) указанный первый компонент или указанный компонент, являющийся основой, дополнительно содержит, по меньшей мере, одну, предпочтительно, две камеры B (11) (12), соединенные с указанной камерой A или с указанной частью (4) камеры A, расположенной на основе, посредством, по меньшей мере, одного канала (13);
e) указанный первый компонент или указанный компонент, являющийся основой, дополнительно содержит, по меньшей мере, одну, предпочтительно, две камеры C (15) (16), каждая из них соединена с указанной, по меньшей мере, одной камерой B посредством канала (17) (18);
f) указанный первый компонент или указанный компонент, являющийся основой, дополнительно, необязательно содержит, по меньшей мере, одну, предпочтительно, две камеры D (19)(20), каждая из них соединена с указанной, по меньшей мере, одной камерой C посредством канала (21) (22);
g) указанный второй компонент или указанный компонент, являющийся крышкой, предпочтительно имеет физический доступ (23), предпочтительно, отверстие, чтобы сделать возможным взаимодействие с резервуаром (9) для жидкости;
h) указанный второй компонент или компонент, являющийся крышкой, дополнительно, необязательно содержит, по меньшей мере, одну, предпочтительно, две оптически прозрачных области над областью указанной камеры B или указанных двух камер C, делая возможным мониторинг камеры B или C (24) (25); где указанная композиция содержится внутри указанной камеры B.
8. Способ амплификации нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, или ДНК, представляющей интерес, включающий использование композиции по любому из пп. 1-4, или набора по п. 5, или устройства по п. 6, или картриджа по п. 7.
9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что амплификация ДНК представляет собой изотермический способ амплификации.
10. Способ по любому из пп. 8 или 9, в котором матричная нуклеиновая кислота или ДНК приготавливается в щелочном растворе.
11. Способ по любому из пп. 8 или 9, в котором матричная нуклеиновая кислота дополнительно содержит ДНК-носитель.
12. Способ амплификации нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, или ДНК, представляющей интерес, включающий стадии:
a. выделения матричной нуклеиновой кислоты или ДНК из образца растения с использованием щелочного экстракционного раствора,
b. приготовления ингредиентов и условий для амплификации указанной нуклеиновой кислоты или ДНК,
где указанная выделенная матричная нуклеиновая кислота или ДНК в указанном щелочном экстракционном растворе не разбавляют или не нейтрализуют перед указанной стадией b).
13. Способ по п. 12, в котором щелочной экстракционный раствор содержит KOH, NaOH или LiOH, или где щелочной экстракционный раствор содержит KOH при концентрации 25-100 мМ, в частности, при концентрации примерно 50 мМ.
14. Способ по п. 13, в котором указанные ингредиенты составляет композицию по любому из пп. 1-4.
15. Способ по любому из пп. 12-14, в котором указанный образец растения выбирают из части растения, органа или ткани, листа растения, семени, гранулированных семян, отдельных семян или кусочков семян.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP12189381 | 2012-10-22 | ||
| EP12189381.2 | 2012-10-22 | ||
| PCT/EP2013/071830 WO2014064002A1 (en) | 2012-10-22 | 2013-10-18 | Methods, compositions and devices for amplification of nucleic acids |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015119238A true RU2015119238A (ru) | 2016-12-10 |
| RU2666988C2 RU2666988C2 (ru) | 2018-09-13 |
Family
ID=47046465
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015119238A RU2666988C2 (ru) | 2012-10-22 | 2013-10-18 | Способы, композиции и устройства для амплификации нуклеиновых кислот |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US10087491B2 (ru) |
| EP (1) | EP2909338B1 (ru) |
| AR (1) | AR093086A1 (ru) |
| BR (1) | BR112015008268A2 (ru) |
| CA (1) | CA2888720A1 (ru) |
| CO (1) | CO7400880A2 (ru) |
| RU (1) | RU2666988C2 (ru) |
| UA (1) | UA117921C2 (ru) |
| UY (1) | UY35093A (ru) |
| WO (1) | WO2014064002A1 (ru) |
Families Citing this family (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN107636173A (zh) | 2014-11-05 | 2018-01-26 | 加州理工学院 | 生物体对药物的响应的微流体测量 |
| WO2018058078A1 (en) | 2016-09-23 | 2018-03-29 | California Institute Of Technology | Digital quantification of dna replication and/or chromosome segregation based determination of antimicrobial susceptibility |
| US20210254139A1 (en) * | 2016-11-10 | 2021-08-19 | Talis Biomedical Corporation | Probe detection of loop-mediated amplification products |
| WO2019075264A1 (en) | 2017-10-11 | 2019-04-18 | California Institute Of Technology | ANTIBIOSENSITIVITY OF MICROORGANISMS AND COMPOSITIONS, METHODS AND ASSOCIATED SYSTEMS |
| US10450616B1 (en) | 2018-05-09 | 2019-10-22 | Talis Biomedical Corporation | Polynucleotides for the amplification and detection of Chlamydia trachomatis |
| JP7329912B2 (ja) * | 2018-10-09 | 2023-08-21 | 公益財団法人筑波メディカルセンター | 微生物の検出方法 |
| US10954572B2 (en) | 2019-07-25 | 2021-03-23 | Talis Biomedical Corporation | Polynucleotides for the amplification and detection of Neisseria gonorrhoeae |
| US11891662B2 (en) | 2019-12-02 | 2024-02-06 | Talis Biomedical Corporation | Polynucleotides for amplification and detection of human beta actin |
| CN112813150A (zh) * | 2021-03-04 | 2021-05-18 | 重庆大学 | 谷子叶片直接pcr扩增的方法 |
Family Cites Families (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6300075B1 (en) | 1999-02-03 | 2001-10-09 | Ortho-Clinical Diagnostics, Inc | Enhancement of the specificity of nucleic acid amplification by carrier nucleic acid |
| WO2002088296A1 (en) | 2001-04-26 | 2002-11-07 | Boston Biomedica, Inc. | Multichamber device and uses thereof for processing of biological samples |
| EP1452593B1 (en) * | 2001-11-14 | 2009-04-08 | Toyo Boseki Kabushiki Kaisha | Dna synthesis promoters, dna polymerase-associated factors and utilization thereof |
| WO2003048391A1 (en) | 2001-12-04 | 2003-06-12 | Bio3 Research Srl | Double buffer system for polymerase chain reaction buffers |
| ATE534465T1 (de) * | 2005-06-23 | 2011-12-15 | Biocartis Sa | Kartusche, system und verfahren für automatisierte medizinische diagnosen |
| US8921073B2 (en) | 2006-06-23 | 2014-12-30 | Illumina, Inc. | Devices and systems for creation of DNA cluster arrays |
| GB0618966D0 (en) | 2006-09-26 | 2006-11-08 | Iti Scotland Ltd | Cartridge system |
| EP2077337A1 (en) * | 2007-12-26 | 2009-07-08 | Eppendorf Array Technologies SA | Amplification and detection composition, method and kit |
| JP5572943B2 (ja) * | 2008-12-17 | 2014-08-20 | 株式会社島津製作所 | 血液検体からのｄｎａ増幅方法及びｄｎａ増幅キット |
-
2013
- 2013-10-18 WO PCT/EP2013/071830 patent/WO2014064002A1/en active Application Filing
- 2013-10-18 EP EP13780343.3A patent/EP2909338B1/en active Active
- 2013-10-18 RU RU2015119238A patent/RU2666988C2/ru active
- 2013-10-18 US US14/437,394 patent/US10087491B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2013-10-18 UA UAA201505034A patent/UA117921C2/uk unknown
- 2013-10-18 CA CA2888720A patent/CA2888720A1/en not_active Abandoned
- 2013-10-18 BR BR112015008268A patent/BR112015008268A2/pt active Search and Examination
- 2013-10-22 UY UY0001035093A patent/UY35093A/es not_active Application Discontinuation
- 2013-10-22 AR ARP130103816A patent/AR093086A1/es active IP Right Grant
-
2015
- 2015-04-08 CO CO15078128A patent/CO7400880A2/es unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AR093086A1 (es) | 2015-05-20 |
| EP2909338B1 (en) | 2018-08-15 |
| UY35093A (es) | 2014-05-30 |
| CO7400880A2 (es) | 2015-09-30 |
| US10087491B2 (en) | 2018-10-02 |
| WO2014064002A1 (en) | 2014-05-01 |
| EP2909338A1 (en) | 2015-08-26 |
| US20150267266A1 (en) | 2015-09-24 |
| RU2666988C2 (ru) | 2018-09-13 |
| BR112015008268A2 (pt) | 2017-11-28 |
| CA2888720A1 (en) | 2014-05-01 |
| UA117921C2 (uk) | 2018-10-25 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2015119238A (ru) | Способы, композиции и устройства для амплификации нуклеиновых кислот | |
| SG10201807736SA (en) | Composition and method for stabilizing nucleic acids in biological samples | |
| ES2535541T3 (es) | Integración de almacenamiento de muestras y gestión de muestras para las ciencias biológicas | |
| MX2022012148A (es) | Metodos para cultivar celulas y kits y aparatos para ello. | |
| HK1123960A1 (en) | Container system for releasably storing a substance | |
| WO2008008515A3 (en) | Methods and compositions for detecting rare cells from a biological sample | |
| EP4219747A3 (en) | Method of preparing sterilized compositions for stabilization of extracellular nucleic acids | |
| EP2598660A2 (en) | Compositions for stabilizing dna, rna and proteins in blood and other biological samples during shipping and storage at ambient temperatures | |
| DE102017201810B4 (de) | Getrocknete amplifikationszusammensetzungen | |
| WO2010031007A3 (en) | Matrices and media for storage and stabilization of biomolecules | |
| JP2010524505A (ja) | ライフサイエンスのための試料貯蔵 | |
| WO2007053245A3 (en) | Methods and composition to generate unique sequence dna probes, iabeling of dna probes and the use of these probes | |
| EP2641911A3 (en) | Compositions and methods for re-programming cells without genetic modification | |
| ATE480324T1 (de) | Mikrofluidische vorrichtung zur untersuchung zellen | |
| WO2010144683A3 (en) | Compositions and methods for dehydrated storage of on-board reagents in microfluidic devices | |
| EP2636453A3 (en) | Spotting plate and process for its production | |
| CN104004513A (zh) | 一种检测锌离子的荧光分子探针及其制备方法 | |
| GB202105390D0 (en) | Methods, devices and kits for preparing nucleic acid samples for storage and analysis | |
| WO2020148640A3 (en) | Soil analysis compositions and methods | |
| IN2015KN00254A (ru) | ||
| Buckley et al. | The influence of sucrose on soil nitrogen availability–A root exudate simulation using microdialysis | |
| WO2010003037A3 (en) | Compositions, systems, and methods for stabilization of a cell and/or macromolecule | |
| RU2014135538A (ru) | Способ изготовления микрочипа для реакции амплификации нуклеиновых кислот | |
| GB201121959D0 (en) | Assay of functional cell viability | |
| WO2008132861A1 (ja) | 培養用容器、細胞又は組織の培養方法、及び細胞又は組織の解析方法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HE9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| PC41 | Official registration of the transfer of exclusive right |
Effective date: 20200512 |