RU2012131405A - Способы улучшения эффективности одновременно протекающих реакций осахаривания и ферментации - Google Patents

Способы улучшения эффективности одновременно протекающих реакций осахаривания и ферментации Download PDF

Info

Publication number
RU2012131405A
RU2012131405A RU2012131405/10A RU2012131405A RU2012131405A RU 2012131405 A RU2012131405 A RU 2012131405A RU 2012131405/10 A RU2012131405/10 A RU 2012131405/10A RU 2012131405 A RU2012131405 A RU 2012131405A RU 2012131405 A RU2012131405 A RU 2012131405A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
β
method
seq id
fermentation
xylosidase
Prior art date
Application number
RU2012131405/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Кристина ГУТИЭРРЕС
Колин МИТЧИНСОН
Том Т. ХУАН
Брюс А. ДАЙНЕР
Пол Джозеф ФАГАН
Уилльям Д. ХИТЦ
Original Assignee
ДАНИСКО ЮЭс ИНК.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority to US28991709P priority Critical
Priority to US61/289,917 priority
Application filed by ДАНИСКО ЮЭс ИНК. filed Critical ДАНИСКО ЮЭс ИНК.
Priority to PCT/US2010/061082 priority patent/WO2011079048A2/en
Publication of RU2012131405A publication Critical patent/RU2012131405A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • C12P7/06Ethanol, i.e. non-beverage
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/22Processes using, or culture media containing, cellulose or hydrolysates thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405Glucanases
    • C12N9/2434Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2477Hemicellulases not provided in a preceding group
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2477Hemicellulases not provided in a preceding group
    • C12N9/248Xylanases
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/02Monosaccharides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/44Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • C12P7/06Ethanol, i.e. non-beverage
    • C12P7/08Ethanol, i.e. non-beverage produced as by-product or from waste or cellulosic material substrate
    • C12P7/10Ethanol, i.e. non-beverage produced as by-product or from waste or cellulosic material substrate substrate containing cellulosic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • C12P7/16Butanols
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/02Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group
    • C12P7/04Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic
    • C12P7/18Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a hydroxy group acyclic polyhydric
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y302/00Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01037Xylan 1,4-beta-xylosidase (3.2.1.37)
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02EREDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
    • Y02E50/00Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
    • Y02E50/10Biofuels
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02EREDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
    • Y02E50/00Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
    • Y02E50/10Biofuels
    • Y02E50/16Cellulosic bio-ethanol
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02EREDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
    • Y02E50/00Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
    • Y02E50/10Biofuels
    • Y02E50/17Grain bio-ethanol

Abstract

1. Способ одновременных осахаривания и ферментации (SSF), включающий культивирование полной среды для ферментации, причем указанная полная среда для ферментации содержит по меньшей мере один ферментирующий микроорганизм, по меньшей мере одну ксилан-содержащую биомассу, по меньшей мере одну целлюлазу, по меньшей мере одну гемицеллюлазу и по меньшей мере один фермент с обращающей β-ксилозидазной активностью, в течение периода и при условиях, пригодных для получения продукта ферментации.2. Способ по п.1, где полная среда для ферментации содержит такое эффективное количество обращающей β-ксилозидазы, чтобы полная среда для ферментации давала меньше алкил-β-ксилопиранозида («AXP») с кототкой цепью по сравнению с контрольной средой для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.3. Способ по п.1 или 2, где полная среда для ферментации содержит такое эффективное количество обращающей β-ксилозидазы, чтобы полная среда для ферментации давала по меньшей мере на 40%, 50%, 60% или 70% меньше AXP по сравнению с контрольной средой для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.4. Способ по п.1, где AXP представляет собой метил-β-ксилопиранозид (“MXP”), этил-β-ксилопиранозид (“EXP”), пропил-β-ксилопиранозид (“PXP”) или бутил-β-ксилопиранозид (“BXP”).5. Способ по п.1, где полная среда для ферментации содержит эффективное количество обращающей β-ксилозидазы для увеличения выхода продукта ферментации, по сравнению с выходом продукта ферментации, при культивировании контрольной среды для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.6. Способ по п.5, где выход продукта ферментации увеличивается по меньшей мере на 1%, 2%, 5%, 7,5% или 10%.7. Способ по п.1, где продукт ферм

Claims (91)

1. Способ одновременных осахаривания и ферментации (SSF), включающий культивирование полной среды для ферментации, причем указанная полная среда для ферментации содержит по меньшей мере один ферментирующий микроорганизм, по меньшей мере одну ксилан-содержащую биомассу, по меньшей мере одну целлюлазу, по меньшей мере одну гемицеллюлазу и по меньшей мере один фермент с обращающей β-ксилозидазной активностью, в течение периода и при условиях, пригодных для получения продукта ферментации.
2. Способ по п.1, где полная среда для ферментации содержит такое эффективное количество обращающей β-ксилозидазы, чтобы полная среда для ферментации давала меньше алкил-β-ксилопиранозида («AXP») с кототкой цепью по сравнению с контрольной средой для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.
3. Способ по п.1 или 2, где полная среда для ферментации содержит такое эффективное количество обращающей β-ксилозидазы, чтобы полная среда для ферментации давала по меньшей мере на 40%, 50%, 60% или 70% меньше AXP по сравнению с контрольной средой для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.
4. Способ по п.1, где AXP представляет собой метил-β-ксилопиранозид (“MXP”), этил-β-ксилопиранозид (“EXP”), пропил-β-ксилопиранозид (“PXP”) или бутил-β-ксилопиранозид (“BXP”).
5. Способ по п.1, где полная среда для ферментации содержит эффективное количество обращающей β-ксилозидазы для увеличения выхода продукта ферментации, по сравнению с выходом продукта ферментации, при культивировании контрольной среды для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.
6. Способ по п.5, где выход продукта ферментации увеличивается по меньшей мере на 1%, 2%, 5%, 7,5% или 10%.
7. Способ по п.1, где продукт ферментации представляет собой спирт.
8. Способ по п.7, где спиртом является метанол, этанол, пропанол, пропан-1,3-диол или бутанол.
9. Способ по п.1, где обращающая β-ксилозидаза представляет собой фермент семейства GH43.
10. Способ по п.9, где обращающая β-ксилозидаза является полипептидом Fv43D, Pf43A, Fv43E, Fv43B, Af43A, Fo43A, Gz43A или XynB3.
11. Способ по п.10, где:
полипептид Fv43D имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, соответствующей SEQ ID NO:2 или остаткам с 21 по 350 SEQ ID NO:2;
полипептид Pf43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:8 или 21-445 остаткам SEQ ID NO:8;
полипептид Fv43E имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:10 или 19-530 остаткам SEQ ID NO:10;
полипептид Fv43B имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:12 или 17-574 остаткам SEQ ID NO:12;
полипептид Af43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:14 или 15-558 остаткам SEQ ID NO:14;
полипептид Fo43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:24 или 21-348 остаткам SEQ ID NO:24;
полипептид Gz43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:22 или 19-340 остаткам SEQ ID NO:22; и
полипептид XynB3 имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, соответствующей SEQ ID NO:25.
12. Способ по п.1, где обращающая β-ксилозидаза присутствует в полной среде для ферментации в концентрации от 0,3 мг до 10 мг, от 0,4 мг до 10 мг или от 0,3 мг до 3 мг на грамм ксилана в ксилан-содержащей биомассе.
13. Способ по п.1, который представляют в качестве непрерывного, периодического или с подпиткой процесса SSF.
14. Способ по п.1, дополнительно включающий этап образования полной среды для ферментации.
15. Способ по п.14, где этап образования полной среды для ферментации, включает комбинирование (a) ферментирующего микроорганизма, (b) ксилан-содержащей биомассы, (c) целлюлазы, (d) гемицеллюлазы, (e) обращающей β-ксилозидазы и (f) средой без одного или более компонентов (a)-(e).
16. Способ по п.15, где целлюлаза присутствует в форме препарата общей целлюлазы.
17. Способ по п.16, где препарат общей целлюлазы включает гемицеллюлазу.
18. Способ по п.16, где препарат общей целлюлазы является культуральной жидкостью, полученной в результате культивирования мицелиального гриба.
19. Способ по п.18, где мицелиальный гриб представляет собой T. reesei.
20. Способ по п.19, где T. reesei сконструирован так, чтобы нативный ген β-ксилозидазы был удален или инактивирован.
21. Способ по п.1, где ферментирующим микроорганизмом является гриб.
22. Способ по п.21, где грибом являются дрожжи Saccharomyces cerevisiae.
23. Способ по п.1, где ферментирующим микроорганизмом является бактерия.
24. Способ по п.23, где бактерией является Zymomonas mobilis.
25. Способ по п.1, где ксилан-содержащая биомасса представляет собой, например, кукурузную солому, багассы, сорго, арундо тростниковый, пеннисетум красный, мискантус, криптомерию японскую, солому пшеницы, просо прутьевидное, целлюлозу из лиственной древесины или целлюлозу из хвойной древесины.
26. Способ по п.25, где ксилан-содержащая биомасса находится в виде суспензии.
27. Способ по п.25, где ксилан-содержащую биомассу предварительно обработали.
28. Способ по п. 1 или 24, дополнительно включающий этап восстановления продукта ферментации.
29. Способ по п.1, где полная среда для ферментации включает большее количество обращающих β-ксилозидаз, чем количество сохраняющих β-ксилозидаз, в расчете на моль, в расчете на молекулярный вес или в расчете, и на моль, и на молекулярный вес.
30. Способ по п.29, где отношение обращающих β-ксилозидаз к сохраняющим β-ксилозидазам в полной среде для ферментации составляет по меньшей мере 2:1, в расчете на моль, в расчете на молекулярный вес, или в расчете, и на моль, и на молекулярный вес.
31. Клетка T. reesei, которая была сконструирована так, чтобы нативный ген β-ксилозидазы был удален или, чтобы она не обладала определяемой β-ксилозидазной активностью.
32. Клетка T. reesei по п.31, которая конструируют для рекомбинантной экспресии ферментов GH43 семейства.
33. Клетка T. reesei по п.31, которая конструируют для рекомбинантной экспресии полипептида Fv43D, Pf43A, Fv43E, Fv43B, Af43A, Fo43A, Gz43A или XynB3.
34. Клетка T. reesei по п.33, где:
полипептид Fv43D имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:2 или 21-350 остаткам SEQ ID NO:2;
полипептид Pf43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:8 или 21-445 остаткам SEQ ID NO:8;
полипептид Fv43E имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:10 или 19-530 остаткам SEQ ID NO:10;
полипептид Fv43B имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:12 или 17-574 остаткам SEQ ID NO:12;
полипептид Af43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:14 или 15-558 остаткам SEQ ID NO:14;
полипептид Fo43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:24 или 21-348 остаткам SEQ ID NO:24;
полипептид Gz43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:22 или 19-340 остаткам SEQ ID NO:22; и
полипептид XynB3 имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:25.
35. Способ получения препарата целлюлазы, содержащего культивирование клетки T. reesei по любому из пп.32-34 при условиях, которые приводят к получению препарата целлюлазы.
36. Способ по п.35, дополнительно включающий восстановление препарата целлюлазы.
37. Препарат целлюлазы, полученный способом по пп.35 или 36.
38. Культуральная жидкость, полученная с помощью культивирования клетки T. reesei по любому из пп.32-34.
39. Способ осахаривания биомассы, включающий контактирование биомассы с препаратом целлюлозы по п.37.
40. Способ осахаривания биомассы, включающий контактирование биомассы с культуральной жидкостью по п.38.
41. Композиция, включающая, по меньшей мере один ферментирующий микроорганизм, по меньшей мере одну ксилан-содержащую биомассу, по меньшей мере одну целлюлазу, по меньшей мере одну гемицеллюлазу и по меньшей мере одну обращающую β-ксилозидазу.
42. Композиция по п.41, где обращающая β-ксилозидаза представляет собой фермент семейства GH43.
43. Композиция по п.41, где обращающая β-ксилозидаза является полипептидом Fv43D, Pf43A, Fv43E, Fv43B, Af43A, Fo43A, Gz43A или XynB3.
44. Композиция по п.43, где:
полипептид Fv43D имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:2 или 21-350 остаткам SEQ ID NO:2;
полипептид Pf43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:8 или 21-445 остаткам SEQ ID NO:8;
полипептид Fv43E имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:10 или 19-530 остаткам SEQ ID NO:10;
полипептид Fv43B имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:12 или 17-574 остаткам SEQ ID NO:12;
полипептид Af43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:14 или 15-558 остаткам SEQ ID NO:14;
полипептид Fo43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:24 или 21-348 остаткам SEQ ID NO:24;
полипептид Gz43A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:22 или 19-340 остаткам SEQ ID NO:22; и
полипептид XynB3 имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:25.
45. Композиция по п.41, где ксилан-содержащая биомасса представляет собой, например, кукурузную солому, багассы, сорго, арундо тростниковый, пеннисетум красный, мискантус, криптомерию японскую, солома пшеницы, просо прутьевидное, целлюлозу из лиственной древесины или целлюлозу из хвойной древесины.
46. Композиция по п.41, где ферментирующим микроорганизмом является гриб или бактерия.
47. Композиция по п.46, где грибом являются дрожжи Saccharomyces cerevisiae.
48. Композиция по п.46, где бактерией является Zymomonas mobilis.
49. Композиция по п.41, где целлюлаза присутствует в форме препарата общей целлюлазы.
50. Композиция по п.49, где препарат целлюлазы включает гемицеллюлазу.
51. Композиция по п.41, где композиция по существу не содержит сохраняющую β-ксилозидазую или не обладает определяемой сохраняющей β-ксилозидазной активностью.
52. Способ получения продукта ферментации, включающий культивирование композиции по любому из пп.41-51 в течение периода времени.
53. Способ по п.52, где продуктом ферментации является спирт.
54. Способ по п.53, где спиртом является метанол, этанол, пропанол, пропан-1,3-диол или бутанол.
55. Способ одновременных осахаривания и ферментации (SSF), включающий культивирование полной среды для ферментации, указанная полная среда для ферментации, содержащая по меньшей мере один ферментирующий микроорганизм, по меньшей мере одну ксилан-содержащую биомассу, по меньшей мере одну целлюлазу, по меньшей мере одну гемицеллюлазу и по меньшей мере одну сохраняющую β-ксилозидазу, на время и при условиях, подходящих для образования алкил-β-ксилопиранозида («AXP»)
56. Способ по п.55, где полная среда для ферментации содержит такое эффективное количество сохраняющих β-ксилозидаз, чтобы полная среда для ферментации продуцировала больше AXP, чем контрольная среда для ферментации без обращающей β-ксилозидазы.
57. Способ по п.55, где AXP представляет собой метил-β-ксилопиранозид (“MXP”), этил-β-ксилопиранозид (“EXP”), пропил-β-ксилопиранозид (“PXP”) или бутил-β-ксилопиранозид (“BXP”).
58. Способ по п.55, где сохраняющая β-ксилозидаза является ферментом семейства GH3, GH30, GH31, GH39, GH52, GH54 или GH116.
59. Способ по п.55, где сохраняющая β-ксилозидаза является полипептидом XlnD, Fv30A, Fv30B, Fv39A, Fv39B или XynB.
60. Способ по п.59, где:
полипептид XlnD имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:40 или 18-804 остаткам SEQ ID NO:40;
полипептид Fv30A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:42, или 20-537 остаткам SEQ ID NO:42;
полипептид Fv30B имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:44 или 25-485 остаткам SEQ ID NO:44;
полипептид Fv39A имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:46 или 20-439 остаткам SEQ ID NO:46;
полипептид Fv39B имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:48 или 19-456 остаткам SEQ ID NO:48;
полипептид XynB имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:50;
полипептид XylA имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:52 или 19-705 остаткам SEQ ID NO:52; и
полипептид Xyl1 имеет по меньшей мере 90% идентичность последовательности с аминокислотной последовательностью, которая соответствует SEQ ID NO:54.
61. Способ по п.55, который представляют в качестве непрерывного, периодического или с подпиткой процесса SSF.
62. Способ по п.55, дополнительно включающий этап образования полной среды для ферментации.
63. Способ по п.62, где этап образования полной среды для ферментации, включающей комбинирование (a) ферментирующего микроорганизма, (b) ксилан-содержащей биомассы, (c) целлюлазы, (d) гемицеллюлазы, (e) сохраняющей β-ксилозидазы и (f) средой без одного или более компонентов (a)-(e).
64. Способ по п.63, где целлюлаза присутствуют в форме препарата общей целлюлазы.
65. Способ по п.64, где препарат общей целлюлазы содержит гемицеллюлазу.
66. Способ по п.64, где препарат общей целлюлазы является культуральной жидкостью, полученной в результате культивирования мицелиального гриба.
67. Способ по п.66, где мицелиальным грибом является T. reesei.
68. Способ по п.67, где T. reesei сконструирован для сверхэкспрессии нативного гена сохраняющей β-ксилозидазы или для экспрессии чужеродного гена сохраняющей β-ксилозидазы.
69. Способ по п.55, где ферментирующим микроорганизмом является гриб или бактерия.
70. Способ по п.55, где ксилан-содержащая биомасса представляет собой, например, кукурузную солому, багассы, сорго, арундо тростниковый, пеннисетум красный, мискантус, криптомерию японскую, солома пшеницы, просо прутьевидное, целлюлозу из лиственной древесины или целлюлозу из хвойной древесины.
71. Способ по п.70, где ксилан-содержащую биомассу предварительно обработали.
72. Способ по п.55 или 62, дополнительно содержащий этап восстановления AXP соединение.
73. Способ по п.55, где полная среда для ферментации содержит большее количество сохраняющих β-ксилозидаз, чем обращающих β-ксилозидаз, в расчете на моль, в расчете на молекулярный вес или в расчете, и на моль, и на молекулярный вес.
74. Клетка T. reesei, которая была сконструирована так, чтобы ее нативный ген β-ксилозидазы сверхэкспрессировался или, чтобы она экспрессировала чужеродный ген β-ксилозидазы.
75. Клетка T. reesei по п.74, которую конструируют для рекомбинантной экспресии фермента семейства GH3, GH30, GH31, GH39, GH52, GH54 или GH116.
76. Клетка T. reesei по п.75, которую конструируют для рекомбинантной экспресии полипептида XlnD, Fv30A, Fv30B, Fv39A, Fv39B, XynB, XylA или Xyl1.
77. Способ получения препарата целлюлазы, включающий культивирование клеток T. reesei по любому из пп.74-76 при условиях, которые приводят к получению препарата целлюлазы.
78. Способ по п.77, дополнительно включающий этап восстановления препарата целлюлазы.
79. Препарат целлюлазы полученный выполнением способа по п.77 или 78.
80. Культуральная жидкость, полученная при культивировании клетки T. reesei по одному из пп.74-76.
81. Способ осахаривания биомассы, включающий контактирование биомассы с препаратом целлюлозы по п.79.
82. Способ осахаривания биомассы, включающий контактирование биомассы с культуральной жидкостью по п.80.
83. Композиция, включающая, по меньшей мере один ферментирующий микроорганизм, по меньшей мере одну ксилан-содержащую биомассу, по меньшей мере одну целлюлазу, по меньшей мере одну гемицеллюлазу и по меньшей мере одну сохраняющую β-ксилозидазу.
84. Композиция по п.83, где сохраняющая β-ксилозидаза является ферментом семейства GH3, GH30, GH31, GH39, GH52, GH54 или GH116.
85. Композиция по п.83, где обращающая β-ксилозидаза является полипептидом XlnD, Fv30A, Fv30B, Fv39A, Fv39B, XynB, XylA или Xyl1.
86. Композиция по п.83, где ксилан-содержащая биомасса представляет собой, например, кукурузную солому, багассы, сорго, арундо тростниковый, пеннисетум красный, мискантус, криптомерию японскую, солома пшеницы, просо прутьевидное, целлюлозу из лиственной древесины или целлюлозу из хвойной древесины.
87. Композиция по п.83, где ферментирующим микроорганизмом является гриб или бактерия.
88. Композиция по п.83, где целлюлаза присутствуют в форме препарата общей целлюлазы.
89. Композиция по п.88, где препарат общей целлюлазы включает гемицеллюлазу.
90. Композиция по п.83, где композиция по существу не содержит обращающую β-ксилозидазу или не обладает определяемой обращающей β-ксилозидазной активностью.
91. Способ получения AXP соединения, включающий культивирование композиции по любому из пп.83-90 в течение периода времени.
RU2012131405/10A 2009-12-23 2010-12-17 Способы улучшения эффективности одновременно протекающих реакций осахаривания и ферментации RU2012131405A (ru)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US28991709P true 2009-12-23 2009-12-23
US61/289,917 2009-12-23
PCT/US2010/061082 WO2011079048A2 (en) 2009-12-23 2010-12-17 Methods for improving the efficiency of simultaneous saccharification and fermentation reactions

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2012131405A true RU2012131405A (ru) 2014-01-27

Family

ID=44196386

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012131405/10A RU2012131405A (ru) 2009-12-23 2010-12-17 Способы улучшения эффективности одновременно протекающих реакций осахаривания и ферментации

Country Status (12)

Country Link
US (2) US10138499B2 (ru)
EP (1) EP2516663A2 (ru)
JP (2) JP2013515482A (ru)
KR (1) KR20120106774A (ru)
CN (2) CN102686736B (ru)
AU (1) AU2010333801B2 (ru)
BR (1) BR112012018407A8 (ru)
CA (1) CA2784355A1 (ru)
CO (1) CO6551739A2 (ru)
MX (1) MX2012007224A (ru)
RU (1) RU2012131405A (ru)
WO (1) WO2011079048A2 (ru)

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20130177947A1 (en) 2009-09-23 2013-07-11 Danisco Us Inc. Novel glycosyl hydrolase enzymes and uses thereof
EP2516663A2 (en) 2009-12-23 2012-10-31 Danisco US Inc. Methods for improving the efficiency of simultaneous saccharification and fermentation reactions
JP2011160753A (ja) * 2010-02-12 2011-08-25 Univ Of Tokyo 糖の製造方法、エタノールの製造方法、及び乳酸の製造方法
AR085379A1 (es) * 2011-02-23 2013-09-25 Syngenta Participations Ag Potenciacion de sacarificacion enzimatica
RU2013146245A (ru) 2011-03-17 2015-04-27 ДАНИСКО ЮЭс ИНК. Способ уменьшения вязкости в процессе осахаривания
US20140289905A1 (en) * 2011-11-11 2014-09-25 Novozymes Inc. Polypeptides Having Xylanase Activity and Polynucleotides Encoding Same
BR112014008493A2 (pt) * 2011-11-11 2017-06-13 Novozymes Inc polipeptídeo isolado, composição, polinucleotídeo isolado, célula hospedeira recombinante, métodos para produção de um polipeptídeo, de um mutante ou célula de origem, e de uma proteína, planta transgênica, parte da planta ou célula vegetal, molécula de rna inibidora de fita dupla, método para inibir a expressão de um polipeptídeo, processos para degradar um material celulósico ou contendo xilano, para produzir um produto de fermentação, e para fermentação de um material celulósico ou contendo xilano, e, formulação de caldo completo ou composição de cultura de células
DK2785732T3 (da) 2011-12-01 2017-06-19 Novozymes Inc Polypeptider med beta-xylosidaseaktivitet og polynukleotider, der koder for dem
CN103060418A (zh) * 2012-12-06 2013-04-24 南昌大学 一种构建混合菌体系发酵稻草秸秆生产乙醇的方法
US9879245B2 (en) 2012-12-07 2018-01-30 Danisco Us Inc. Polypeptides having beta-mannanase activity and methods of use
JP2016533740A (ja) 2013-07-29 2016-11-04 ダニスコ・ユーエス・インク 酵素変異体
WO2015048087A1 (en) * 2013-09-25 2015-04-02 Novozymes A/S Processes of producing fermentation products
WO2015057520A1 (en) * 2013-10-16 2015-04-23 Novozymes A/S Processes of producing fermentation products
CA2933691C (en) * 2013-12-13 2019-03-12 Lantmannen Energi Integration of first and second generation bioethanol processes
KR101806223B1 (ko) * 2014-11-07 2017-12-07 한국과학기술연구원 리그닌-셀룰로오스 동시 분해 생촉매 및 이를 이용한 당화액과 바이오 연료의 제조방법
BR112018069854A2 (pt) * 2016-03-31 2019-01-29 Toray Industries métodos para produzir proteína, xilo-oligossacarídeos e glicose, método para suprimir a diminuição na saturação de oxigênio dissolvido ao cultivar um fungo e composição de celulase
CN109072222A (zh) * 2016-03-31 2018-12-21 东丽株式会社 具有突变型bxl1基因的木霉属真菌和使用该真菌制造低聚木糖和葡萄糖的制造方法
WO2019074828A1 (en) 2017-10-09 2019-04-18 Danisco Us Inc Cellobiose dehydrogenase variants and methods of use thereof

Family Cites Families (124)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5366558A (en) 1979-03-23 1994-11-22 Brink David L Method of treating biomass material
US4797361A (en) 1983-10-24 1989-01-10 Lehigh University Microorganism and process
CA1333777C (en) 1988-07-01 1995-01-03 Randy M. Berka Aspartic proteinase deficient filamentous fungi
US5536655A (en) 1989-09-26 1996-07-16 Midwest Research Institute Gene coding for the E1 endoglucanase
DK16490D0 (da) 1990-01-19 1990-01-19 Novo Nordisk As Enzym
BR9106435A (pt) 1990-05-09 1993-05-04 Novo Nordisk As Preparado de celulase,enzima demonstrando atividade de andoglucanase,enzima de endoglucanase,construcao de dna,vetor de expressao celula,processo para produzir uma enzima de endoglucanase,aditivo composicao detergente,e processo para reduzir a taxa em que os tecidos contendo celulose,se tornam asperos,prover clareamento da cor de tecidos contendo celulose colorida,prover uma variacao localizada da cor de tecidos contendo colorida,e melhorar as propriedades de drenagem de polpa
DK115890D0 (da) 1990-05-09 1990-05-09 Novo Nordisk As Enzym
US5997913A (en) 1990-12-10 1999-12-07 Genencor International, Inc. Method enhancing flavor and aroma in foods by overexpression of β-glucosidase
WO1992010581A1 (en) 1990-12-10 1992-06-25 Genencor International, Inc. IMPROVED SACCHARIFICATION OF CELLULOSE BY CLONING AND AMPLIFICATION OF THE β-GLUCOSIDASE GENE OF TRICHODERMA REESEI
ES2120428T3 (es) 1991-03-18 1998-11-01 Gist Brocades Nv Clonacion y expresion de acetil-xilano esterasas de origen fungico.
US5405769A (en) 1993-04-08 1995-04-11 National Research Council Of Canada Construction of thermostable mutants of a low molecular mass xylanase
DK81293D0 (da) 1993-07-06 1993-07-06 Novo Nordisk As Enzym
DK83993D0 (ru) 1993-07-13 1993-07-13 Novo Nordisk As
US5705369A (en) 1994-12-27 1998-01-06 Midwest Research Institute Prehydrolysis of lignocellulose
US5437992A (en) 1994-04-28 1995-08-01 Genencor International, Inc. Five thermostable xylanases from microtetraspora flexuosa for use in delignification and/or bleaching of pulp
US6099844A (en) 1994-08-22 2000-08-08 Triarco Industries, Inc. Increasing yield of extractable substances from botanicals with an enzyme composition
CN102146362A (zh) 1995-03-17 2011-08-10 诺沃奇梅兹有限公司 新的内切葡聚糖酶
NZ311180A (en) 1995-06-23 2000-01-28 Danisco Ingredients As Nucleotide sequence encoding a peptide having beta-xylosidase activity and use thereof
US5811381A (en) 1996-10-10 1998-09-22 Mark A. Emalfarb Cellulase compositions and methods of use
US7883872B2 (en) 1996-10-10 2011-02-08 Dyadic International (Usa), Inc. Construction of highly efficient cellulase compositions for enzymatic hydrolysis of cellulose
WO1999002693A2 (en) 1997-07-11 1999-01-21 Genencor International, Inc. Microbial swollenin protein; dna sequences encoding such swollenins and method of producing such swollenins
US20020084046A1 (en) 1998-09-29 2002-07-04 Jay Chiehlung Hsu Enzymatic paper and process of making thereof
DK1117808T3 (da) 1998-10-06 2005-04-25 Mark Aaron Emalfarb Transformaationssystem inden jfjor området filamentöse svampeværter: I chrysosporium
US6409841B1 (en) 1999-11-02 2002-06-25 Waste Energy Integrated Systems, Llc. Process for the production of organic products from diverse biomass sources
US6248535B1 (en) 1999-12-20 2001-06-19 University Of Southern California Method for isolation of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens
AU7476600A (en) 1999-12-30 2001-07-16 Genencor International, Inc. Trichoderma reesei xylanase
ES2166316B1 (es) 2000-02-24 2003-02-16 Ct Investig Energeticas Ciemat Procedimiento de produccion de etanol a partir de biomasa lignocelulosica utilizando una nueva levadura termotolerante.
US7223575B2 (en) 2000-05-01 2007-05-29 Midwest Research Institute Zymomonas pentose-sugar fermenting strains and uses thereof
US6423145B1 (en) 2000-08-09 2002-07-23 Midwest Research Institute Dilute acid/metal salt hydrolysis of lignocellulosics
DE10043662A1 (de) 2000-08-30 2001-02-22 Saechsisches Inst Fuer Angewan Verfahren zur enzymatischen Aktivierung von lignocellulosen Faserstoffen zur Herstellung von Werkstoffen
WO2002095014A2 (en) 2001-05-18 2002-11-28 Novozymes A/S Polypeptides having cellobiase activity and polynucleotides encoding same
US6982159B2 (en) 2001-09-21 2006-01-03 Genencor International, Inc. Trichoderma β-glucosidase
US7045331B2 (en) 2001-12-18 2006-05-16 Genencor International, Inc. EGVII endoglucanase and nucleic acids encoding the same
US7056721B2 (en) 2001-12-18 2006-06-06 Genencor International, Inc. EGVI endoglucanase and nucleic acids encoding the same
US7005289B2 (en) 2001-12-18 2006-02-28 Genencor International, Inc. BGL5 β-glucosidase and nucleic acids encoding the same
US7045332B2 (en) 2001-12-18 2006-05-16 Genencor International, Inc. BGL4 β-glucosidase and nucleic acids encoding the same
US7049125B2 (en) 2001-12-18 2006-05-23 Genencor International, Inc. EGVIII endoglucanase and nucleic acids encoding the same
US20040005674A1 (en) 2002-04-30 2004-01-08 Athenix Corporation Methods for enzymatic hydrolysis of lignocellulose
DK2295559T3 (da) 2002-08-16 2015-12-14 Danisco Us Inc Hidtil ukendt hyprocrea jecorina cbh1-cellulasevariant med øget termisk stabilitet omfattende substitution eller deletion ved position t255
ES2356526T3 (es) 2002-10-04 2011-04-08 E.I. Du Pont De Nemours And Company Procedimiento para la producción biológica de 1,3-propanodiol con elevado rendimiento.
AU2003291395A1 (en) 2002-11-07 2004-06-03 Genencor International, Inc. Bgl6 beta-glucosidase and nucleic acids encoding the same
US7407788B2 (en) 2002-11-21 2008-08-05 Danisco A/S, Genencor Division BGL7 beta-glucosidase and nucleic acids encoding the same
US7449550B2 (en) 2003-02-27 2008-11-11 Alliance For Sustainable Energy, Llc Superactive cellulase formulation using cellobiohydrolase-1 from Penicillium funiculosum
US20040231060A1 (en) 2003-03-07 2004-11-25 Athenix Corporation Methods to enhance the activity of lignocellulose-degrading enzymes
JP2007534294A (ja) 2003-03-21 2007-11-29 ジェネンコー・インターナショナル・インク Cbh1相同体及び変異体cbh1セルラーゼ
ES2430825T3 (es) 2003-04-01 2013-11-21 Danisco Us Inc. CBH1.1 de Humicola grisea variante
EP1862626B1 (en) 2003-05-29 2011-09-14 Genencor International, Inc. Novel trichoderma genes
ES2501190T3 (es) 2003-09-15 2014-10-01 Danisco Us Inc. Enzimas modificadas, métodos para producir enzimas modificadas y usos de las mismas
WO2005054475A1 (ja) 2003-12-03 2005-06-16 Meiji Seika Kaisha, Ltd. エンドグルカナーゼstceおよびそれを含むセルラーゼ調製物
WO2006011901A2 (en) 2003-12-18 2006-02-02 Trustees Of Princeton University Radionuclide detector and software for controlling same
ES2468366T3 (es) 2004-01-30 2014-06-16 Novozymes Inc. Polip�ptidos con actividad de mejora celulol�tica y polinucle�tidos que los codifican
MXPA06008745A (es) 2004-02-06 2007-01-23 Novozymes Inc Polipeptidos que tienen actividad celulolitica potenciada y polinucleotidos que codifican a los mismos.
EP1735454B1 (en) * 2004-03-25 2017-05-10 Novozymes, Inc. Methods for degrading or converting plant cell wall polysaccharides
US8097445B2 (en) 2004-03-25 2012-01-17 Danisco Us Inc. Exo-endo cellulase fusion protein
EP1735447A2 (en) 2004-03-25 2006-12-27 Genencor International, Inc. Cellulase fusion protein and heterologous cellulase fusion construct encoding the same
CN1997735B (zh) 2004-05-27 2012-02-22 金克克国际有限公司 白曲霉酸稳定性α淀粉酶和在颗粒淀粉水解中的应用
CA2586779A1 (en) 2004-06-03 2005-12-15 Novozymes A/S Mashing process and enzyme composition useful therein
US20060075522A1 (en) 2004-07-31 2006-04-06 Jaclyn Cleveland Genes and uses for plant improvement
ES2554467T3 (es) 2004-12-30 2015-12-21 Danisco Us Inc. Variantes de celulasas CBH2 de Hypocrea jecorina
WO2006110899A2 (en) 2005-04-12 2006-10-19 E. I. Du Pont De Nemours And Company Integration of alternative feedstreams in biomass treatment and utilization
US7781191B2 (en) 2005-04-12 2010-08-24 E. I. Du Pont De Nemours And Company Treatment of biomass to obtain a target chemical
AU2006239644B2 (en) 2005-04-26 2012-03-29 Novozymes A/S Hydrolysis of arabinoxylan
AR053066A1 (es) * 2005-04-26 2007-04-18 Novozymes As Arabinofuranosidasas
CA2623908A1 (en) 2005-09-30 2007-08-09 Novozymes, Inc. Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material
US7256032B2 (en) 2005-12-22 2007-08-14 Ab Enzymes Oy Enzymes
FI120045B (fi) 2005-12-22 2009-06-15 Roal Oy Selluloosamateriaalin käsittely ja siinä käyttökelpoiset entsyymit
EP2444490B1 (en) 2006-02-10 2014-02-12 Verenium Corporation Cellulolytic enzymes, nucleic acids encoding them and methods for making and using them
WO2008008793A2 (en) * 2006-07-10 2008-01-17 Dyadic International Inc. Methods and compositions for degradation of lignocellulosic material
US8017373B2 (en) 2006-08-31 2011-09-13 Iogen Energy Corporation Process for enzymatic hydrolysis of pretreated lignocellulosic feedstocks
WO2008039370A1 (en) 2006-09-22 2008-04-03 Danisco Us, Inc., Genencor Division Acetolactate synthase (als) selectable marker from trichoderma reesei
US7741119B2 (en) 2006-09-28 2010-06-22 E. I. Du Pont De Nemours And Company Xylitol synthesis mutant of xylose-utilizing zymomonas for ethanol production
US7993884B2 (en) * 2006-10-10 2011-08-09 The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture Beta-xylosidase for conversion of plant cell wall carbohydrates to simple sugars
CN101600804A (zh) 2006-11-13 2009-12-09 丹尼斯科美国公司 改善纤维素转化过程产率的方法
CN104962537A (zh) 2007-05-10 2015-10-07 诺维信股份有限公司 用于增强含纤维素材料的降解或转化的组合物和方法
US8450098B2 (en) 2007-05-21 2013-05-28 Danisco Us Inc. Method for introducing nucleic acids into fungal cells
MX2009012845A (es) 2007-05-31 2009-12-15 Novozymes Inc Metodos para aumentar la actividad celulosica mejorada de un polipeptido.
BRPI0812267A2 (pt) 2007-05-31 2014-10-14 Novozymes Inc Célula hospedeira fúngica filamentosa, método para produzir uma composição de proteína celulolítica, composição de proteína celulolítica, e, métodos para degradar ou converter um material, contendo celulose e para produzir um produto de fermentação
EA201300048A1 (xx) 2007-06-08 2013-09-30 ДАНИСКО ЮЭс, ИНК., ДЖЕНЕНКОР ДИВИЖН Система экспрессии гетерологичных и гомологичных целлюлаз
CN105063099A (zh) 2007-06-27 2015-11-18 诺维信公司 产生发酵产物的方法
EP2380988A3 (en) 2007-07-10 2012-04-11 Mosanto Technology LLC Transgenic plants with enhanced agronomic traits
US7819976B2 (en) 2007-08-22 2010-10-26 E. I. Du Pont De Nemours And Company Biomass treatment method
MX2010002474A (es) 2007-09-07 2010-03-29 Danisco Us Inc Composiciones de celulasa completa fungica filamentosa mejoradas de beta-glucosidasa y metodos de uso.
CA2736661A1 (en) * 2007-09-07 2009-03-12 Dyadic International, Inc. Novel fungal enzymes
US8486680B2 (en) 2007-10-03 2013-07-16 Bp Corporation North America Inc. Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them
US20110039320A1 (en) 2007-10-12 2011-02-17 Mian Li Methods and Compositions for Enhanced Production of Organic Substances From Fermenting Microorganisms
WO2009058927A1 (en) 2007-10-30 2009-05-07 E. I. Du Pont De Nemours And Company Zymomonas with improved ethanol production in medium containing concentrated sugars and acetate
WO2009074685A1 (en) 2007-12-12 2009-06-18 Novozymes A/S Enzymatic degradation of biomass substrates comprising mannan
US8288148B2 (en) 2007-12-13 2012-10-16 Danisco Us Inc. Compositions and methods for producing isoprene
BRPI0821048A2 (pt) 2007-12-19 2015-06-16 Novozymes As Polipeptídeo e polinucleotídeo isolados, construção de ácido nucléico, célula hospedeira recombinante, métodos para produzir o polipeptídeo, um mutante de uma célula precursora, uma proteína e um produto de fermentação, para inibir a expressão de um polipeptídeo, para degradar ou converter um material celulósico, e para fermentar um material celulósico, planta trangênica, parte vegetal ou célula vegetal, e, melécula de rna inibidora
CN102016041A (zh) * 2008-02-29 2011-04-13 中央佛罗里达大学研究基金会有限公司 植物降解材料的合成和应用
MY152105A (en) 2008-03-21 2014-08-15 Danisco Us Inc Hemicellulase enriched compositions for enhancing hydrolysis of biomass
JP2011515107A (ja) 2008-03-27 2011-05-19 アライアンス フォア サステイナブル エナジー エルエルシー 改善されたキシロース資化能を有するザイモモナス(Zymomonas)
CA2722189A1 (en) 2008-04-21 2009-10-29 Chromatin, Inc. Methods and materials for processing a feedstock
US20110136182A1 (en) * 2008-04-29 2011-06-09 Danisco Us Inc. Swollenin compositions and methods of increasing the efficiency of a cellulase
EP2288698B1 (en) 2008-06-06 2016-12-21 Danisco US Inc. Compositions and methods comprising cellulase variants with reduced affinity to non-cellulosic materials
EP2358872A2 (en) 2008-11-18 2011-08-24 Novozymes Inc. Methods and compositions for degrading cellulosic material
MX2011008495A (es) 2009-02-20 2011-09-21 Danisco Us Inc Formulaciones de caldo de fermentacion.
CA2750920A1 (en) 2009-02-27 2010-09-02 Iogen Energy Corporation Novel lignin-resistant cellulase enzymes
EP2435561B1 (en) 2009-05-29 2018-08-08 Novozymes Inc. Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material
US8679816B2 (en) 2009-06-03 2014-03-25 Danisco Us Inc. Cellulase variants with improved expression, activity and stability, and use thereof
EP2443235A4 (en) 2009-06-16 2013-07-31 Codexis Inc ß-GLUCOSIDASE VARIANTS
US20130177947A1 (en) 2009-09-23 2013-07-11 Danisco Us Inc. Novel glycosyl hydrolase enzymes and uses thereof
EP2501806B1 (en) 2009-11-20 2017-08-02 Danisco US Inc. Beta-glucosidase i variants with improved properties
US8647850B2 (en) 2009-12-23 2014-02-11 E I Du Pont De Nemours And Company Process for simultaneous saccharification and fermentation for production of ethanol
EP2516663A2 (en) 2009-12-23 2012-10-31 Danisco US Inc. Methods for improving the efficiency of simultaneous saccharification and fermentation reactions
US8906235B2 (en) 2010-04-28 2014-12-09 E I Du Pont De Nemours And Company Process for liquid/solid separation of lignocellulosic biomass hydrolysate fermentation broth
US8721794B2 (en) 2010-04-28 2014-05-13 E I Du Pont De Nemours And Company Production of high solids syrup from lignocellulosic biomass hydrolysate fermentation broth
US8962295B2 (en) 2010-06-01 2015-02-24 California Institute Of Technology Stable, functional chimeric cellobiohydrolase class I enzymes
EP2397491A1 (en) 2010-06-21 2011-12-21 Technische Universität Wien LeaA from Trichoderma reesei
WO2013028701A1 (en) 2011-08-22 2013-02-28 Codexis, Inc. Gh61 glycoside hydrolase protein variants and cofactors that enhance gh61 activity
US8629325B2 (en) 2010-08-30 2014-01-14 Novozymes A/S Polypeptides having beta-glucosidase activity and polynucleotides encoding same
US8476048B2 (en) 2010-12-17 2013-07-02 E I Du Pont De Nemours And Company Xylose utilizing zymomonas mobilis with improved ethanol production in biomass hydrolysate medium
AU2012228968B2 (en) 2011-03-17 2017-05-18 Danisco Us Inc. Cellulase compositions and methods of using the same for improved conversion of lignocellulosic biomass into fermentable sugars
RU2013146240A (ru) 2011-03-17 2015-04-27 ДАНИСКО ЮЭс ИНК. Ферменты гликозил-гидролазы и их применение для гидролиза биомассы
RU2013146245A (ru) 2011-03-17 2015-04-27 ДАНИСКО ЮЭс ИНК. Способ уменьшения вязкости в процессе осахаривания
US9410140B2 (en) 2011-05-10 2016-08-09 Danisco Us Inc Thermostable carbonic anhydrases and methods of use thereof
DK2791350T3 (da) 2011-12-13 2019-05-06 Danisco Us Inc Enzymcocktails fremstillet af blandede kulturer
KR20150079676A (ko) 2012-10-31 2015-07-08 다니스코 유에스 인크. 마그나포르테 그리세아로부터의 베타-글루코시다제
EP2914719A1 (en) 2012-10-31 2015-09-09 Danisco US Inc. Compositions and methods of use
US9938551B2 (en) 2012-12-12 2018-04-10 Danisco Us Inc Variants of cellobiohydrolases
WO2014188012A1 (es) 2013-05-20 2014-11-27 Abengoa Bioenergía Nuevas Tecnologías, S. A. Expresión de enzimas beta-xilosidasas recombinantes
EP2824428A1 (en) 2013-07-11 2015-01-14 Itron France Coaxial flow meter
JP2016533740A (ja) 2013-07-29 2016-11-04 ダニスコ・ユーエス・インク 酵素変異体
BR112016012627A2 (pt) 2013-12-04 2017-09-26 Danisco Us Inc composições compreendendo um polipeptídeo de beta-glicosidase e métodos de uso

Also Published As

Publication number Publication date
US20130143277A1 (en) 2013-06-06
KR20120106774A (ko) 2012-09-26
CN107287250A (zh) 2017-10-24
US20190161772A1 (en) 2019-05-30
MX2012007224A (es) 2012-07-30
EP2516663A2 (en) 2012-10-31
JP2016154548A (ja) 2016-09-01
WO2011079048A9 (en) 2011-08-25
AU2010333801A1 (en) 2012-06-07
CN102686736B (zh) 2017-05-31
JP2013515482A (ja) 2013-05-09
BR112012018407A8 (pt) 2018-11-27
CO6551739A2 (es) 2012-10-31
WO2011079048A2 (en) 2011-06-30
WO2011079048A3 (en) 2012-06-14
CN102686736A (zh) 2012-09-19
CA2784355A1 (en) 2011-06-30
BR112012018407A2 (pt) 2015-10-06
AU2010333801B2 (en) 2015-12-17
US10138499B2 (en) 2018-11-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ghimire et al. A review on dark fermentative biohydrogen production from organic biomass: process parameters and use of by-products
Bai et al. Ethanol fermentation technologies from sugar and starch feedstocks
Guo et al. Hydrogen production from agricultural waste by dark fermentation: a review
Park et al. Use of Gelidium amansii as a promising resource for bioethanol: a practical approach for continuous dilute-acid hydrolysis and fermentation
Qureshi et al. Butanol production from wheat straw by simultaneous saccharification and fermentation using Clostridium beijerinckii: Part I—Batch fermentation
Ezeji et al. Bioproduction of butanol from biomass: from genes to bioreactors
CN101932715B (zh) 使用海藻生产生物燃料的方法
Harun et al. Influence of acid pre-treatment on microalgal biomass for bioethanol production
Zhang et al. Biodetoxification of toxins generated from lignocellulose pretreatment using a newly isolated fungus, Amorphotheca resinae ZN1, and the consequent ethanol fermentation
Dębowski et al. Algae biomass as an alternative substrate in biogas production technologies
US20100268000A1 (en) Compositions and Methods for Fermentation of Biomass
Ho et al. Bioethanol production using carbohydrate-rich microalgae biomass as feedstock
Bothast et al. Ethanol production from agricultural biomass substrates
Brethauer et al. Continuous hydrolysis and fermentation for cellulosic ethanol production
Ellis et al. Acetone, butanol, and ethanol production from wastewater algae
Zhang et al. Current progress on butyric acid production by fermentation
Divya et al. A review on current aspects and diverse prospects for enhancing biogas production in sustainable means
Gaurav et al. Utilization of bioresources for sustainable biofuels: a review
Mehrabadi et al. Wastewater treatment high rate algal ponds (WWT HRAP) for low-cost biofuel production
Urbaniec et al. Biomass residues as raw material for dark hydrogen fermentation–A review
Sivagurunathan et al. A critical review on issues and overcoming strategies for the enhancement of dark fermentative hydrogen production in continuous systems
Fangkum et al. Biohydrogen production from sugarcane bagasse hydrolysate by elephant dung: effects of initial pH and substrate concentration
EP2173889A1 (en) Concurrent saccharification and fermentation of fibrous biomass
WO2009058471A1 (en) Systems and processes for cellulosic ethanol production
Ngo et al. High-yield biohydrogen production from biodiesel manufacturing waste by Thermotoga neapolitana

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20150324