KR20240109655A - 담도암 진단용 바이오마커 - Google Patents

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KR20240109655A
KR20240109655A KR1020230001306A KR20230001306A KR20240109655A KR 20240109655 A KR20240109655 A KR 20240109655A KR 1020230001306 A KR1020230001306 A KR 1020230001306A KR 20230001306 A KR20230001306 A KR 20230001306A KR 20240109655 A KR20240109655 A KR 20240109655A
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이준규
장동기
정은경
이민학
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동국대학교 산학협력단
경희대학교 산학협력단
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Abstract

본 발명은 담도암 진단용 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 일 구체예에 따른 CEACAM6 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 담도암 진단용 조성물을 이용하면 개복술 없이 비침습적인 방법인 ERCP로 채취한 답즙을 이용하여 담도암을 조기에 진단할 수 있고, 불분명한 담도 협착증을 보이지만 담도암이 아닌 환자가 불필요하게 침습적인 치료를 받는 것을 예방할 수 있는 효과가 있다.

Description

담도암 진단용 바이오마커{Biomarker for cholangiocarcinoma diagnosis}
본 발명은 담도암 진단용 바이오마커에 관한 것이다.
담관은 간에서 생성되는 담즙을 십이지장으로 보내는 관으로, 간에서 나올 때 좌우 담관이 모여 하나의 줄기로 합류하게 된다. 담관은 간 속을 지나는 간내 담관과 간을 벗어나 십이지장까지 이어지는 간외 담관으로 나뉜다. 간외 담관 중 담즙을 일시적으로 저장하여 농축하는 주머니를 담낭이라 부르며, 이들 간내외 담관과 담낭을 통틀어 담도라고 부르나, 통상적으로 담도와 담관이라는 단어를 혼용하여 사용한다.
담도암은 담관암이라고도 하며, 담관의 상피에서 발생하는 악성종양으로, 발생 부위에 따라 간내 담도암 및 간외 담도암으로 분류된다. 담도암은 주위 조직에 스며들 듯이 퍼지는 경우가 많고, 명료한 종양 덩어리를 형성하지 않으므로, 담도암을 정확하게 진단하는 것은 쉽지 않다. 최근, 화상진단기술이 발달함에 따라 복부 초음파검사, 컴퓨터 단층촬영(CT), 자기공명영상(MRI), 경피경간 담도 조영술(PTC), 경피경간 담도 배액술(PTBD), 내시경 역행성 담췌관 조영술(ERCP) 또는 혈관조영검사 등의 기술을 이용하여 담도암을 진단할 수 있으나, 진단에 고비용이 들고 복잡하며, 조기 진단이 어렵다는 단점이 있다. 특히, 기존의 담도암 진단 기술은 수술적 방법으로 담즙 및 담도계 조직 샘플을 수집하여 이루어지는데, 이처럼 악성종양 여부가 불확실한 경우에도 다량의 담즙을 침습적 수술로 수집함에 따라 담관염이나 감염성 합병증 등 환자 신체에 치명적인 손상을 유발할 수 있으며, 불필요하게 대량의 시료를 채취하게 된다는 문제가 있다.
또한, 담도암의 예후는 유병율과 사망률이 비슷한 수준으로 매우 좋지 않으며, 아직까지 정립된 치료 방법도 없고, 근치적 절제가 완치를 기대할 수 있는 유일한 치료법이지만, 80% 이상에서 진단 당시 수술이 불가능하고 수술을 하더라도 재발이나 전이가 흔하기 때문에 5년 생존률이 5% 미만에 불과하여, 치료가 어려운 난치암 중의 하나이다. 따라서, 담도암을 조기에 간단하게 진단할 수 있는 바이오마커 및 예후 예측을 위한 바이오마커의 개발이 요구되어 왔다.
한편, 암태아성 항원-관련된 세포부착 분자 6(Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, CEACAM6)은 암태아성 항원(CEA)과에 속한다. CEACAM6은 글리코실 포스파티딜 이노시톨 (GPI) 고정된 세포 표면 당단백질이다. CEACAM6은 종양에서 발암유전자로서 작용하며 암 침투, 전이, 세포사멸내성 및 항암제내성을 촉진하고 분화를 억제한다.
본 발명자들은 담도암 환자의 담즙에서 CEACAM6, IRF5 단백질이 고농도로 발현되는 것을 확인하였고, CEACAM6, IRF5를 담즙 중에서 비침습적으로 검출할 수 있는 기술을 개발함으로써, 담즙 내 CEACAM6, IRF5의 농도를 기반으로 원인 불명의 담도 협착 환자 중 담도암 환자를 조기에 진단할 수 있도록 본 발명을 완성하였다.
대한민국 등록특허 제10-2082344호
본 발명은 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 담도암 진단용 조성물을 제공하는 것을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 상기 조성물을 포함하는 담도암 진단용 키트를 제공하는 것을 목적으로 한다.
또한, 본 발명은 a) 환자로부터 생물학적 시료를 채취하는 단계; b) 상기 생물학적 시료로부터 CEACAM6 및/또는 IRF5유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 c) 상기 단계 b)의 유전자 또는 단백질 발현 수준을 정상 개체의 유전자 또는 단백질 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는 담도암 진단에 관한 정보를 제공하기 위한 방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
본 발명의 일 양상은 CEACAM6(Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6) 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 담도암 진단용 조성물을 제공한다.
상기 CEACAM6 단백질은 암태아성 항원-관련된 세포부착 분자 6으로, 암태아성 항원(CEA)과에 속한다. CEACAM6은 유방, 췌장, 결장 및 비-소세포 폐 암종을 포함한 다양한 암에서 과발현되는 것으로 관찰된 글리코실 포스파티딜 이노시톨 (GPI) 고정된 세포 표면 당단백질이다. CEACAM6은 종양에서 발암유전자로서 작용하며 암 침투, 전이, 세포사멸내성 및 항암제내성을 촉진하고 분화를 억제한다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 담도암은 불분명한 담도 협착을 수반하는 담도암일 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 제제는 CEACAM6 유전자 또는 단백질에 각각 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브, 항체, 앱타머 및 올리고펩티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있다.
본 발명에서 사용된 "특이적으로 결합하는"이란 결합에 의해 표적 물질의 존재 여부를 검출할 수 있을 정도로 다른 물질에 비해 표적 물질에 대한 결합력이 뛰어남을 의미한다.
본 발명에서 사용된 "프라이머(primer)"는 적합한 온도 및 완충액 내에서 적합한 조건 (즉, 4종의 다른 뉴클레오시드 트리포스페이트 및 중합반응 효소) 하에서 주형-지시 DNA 합성의 개시점으로 작용할 수 있는 단일 가닥 올리고뉴클레오티드(single strand oligonucleotide)를 의미한다. 프라이머의 적합한 길이는 다양한 요소, 예컨대, 온도와 프라이머의 용도에 따라 변화가 있지만, 전형적으로 15-30 뉴클레오티드로 구성된다.
본 발명에서 사용된 "프로브(probe)"는 자연의 또는 변형된 모노머(monomer) 또는 연쇄(linkages)의 선형 올리고머를 의미하며, 디옥시리보뉴클레오티드 및 리보뉴클레오티드를 포함하고, 표적 뉴클레오티드 서열에 특이적으로 혼성화할 수 있으며, 자연적으로 존재하거나 또는 인위적으로 합성된 것이다.
본 발명에서 사용된 "항체"는 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 의미한다. 본 발명에서는 CEACAM6 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 의미하며, 단클론 항체, 다클론 항체 및 재조합 항체를 모두 포함한다. 또한, 상기 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄(light chain) 및 2개의 전체 길이의 중쇄(heavy chain)를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2, Fv 등일 수 있다.
상기 항체는 당업계에 공지된 기술을 통해 용이하게 제조될 수 있다. 예를 들면, 단클론 항체는 당업계에 널리 공지된 하이브리도마 방법(hybridoma method) Kohler 및 Milstein (1976) European Jounral of Immunology 6:511-519 참조), 또는 파지 항체 라이브러리 (Clackson et al, Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991) 기술을 이용하여 제조될 수 있다. 다클론 항체는 표적 단백질 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 방법에 의해 생산할 수 있다. 이러한 다클론 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 소 개 등의 동물로부터 제조 가능하다.
상기 방법으로 제조된 항체는 겔 전지영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등의 방법을 이용하여 분리 및 정제할 수 있다.
상기 담도암 진단용 조성물은 상기 서술한 바와 같은 제제 외에도 이들의 구조를 안정하게 유지시키는 증류수 또는 완충액을 포함할 수 있다.
본 발명의 다른 일 양상은, IRF5(Interferon Regulatory Factor5) 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 담도암 진단용 조성물을 제공한다. 보다 구체적으로, IRF5(Interferon Regulatory Factor5) 및/또는 CEACAM6(Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6) 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 담도암 진단용 조성물을 제공한다.
상기 유전자, 단백질, 제제, 담도암 진단용 조성물에 대해서는 상기 설명한 바와 같다.
본 발명의 다른 양상은, 상기 조성물을 포함하는 담도암 진단용 키트를 제공한다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 담도암은 불분명한 담도 협착을 수반하는 담도암일 수 있다.
상기 제제는 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질에 각각 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브, 항체, 앱타머 및 올리고펩티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 것일 수 있다.
본 명세서에서 "담도암 진단용 키트"란 검사 대상자로부터 채취한 생물학적 시료를 통해 담도암인지 여부를 진단할 수 있는 형태라면 제한이 없다. 본 발명에서는 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함한다. 상기 키트는 통상적인 유전자 및 단백질 정량 분석에 기반한 진단 키트를 제한 없이 포함할 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 키트는 PCR 키트, RT-PCR 키트, DNA 칩 키트, 단백질 키트 및 단백질 어레이 키트로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상인 것일 수 있다.
예를 들면, 상기 키트가 PCR 증폭 과정에 적용되는 경우, 본 발명의 키트는 선택적으로 PCR 증폭에 필요한 시약, 예컨대, 완충액, DNA 중합효소, DNA 중합 효소 보조인자 및 dNTPs를 포함할 수 있으며, 상기 키트가 면역 분석에 적용되는 경우, 본 발명의 키트는 선택적으로 이차항체 및 표지의 기질을 포함할 수 있다. 또한, 본 발명에 따른 키트는 상기한 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있으며, 본 발명의 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 진단용 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는, 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판, 및 형광표식 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한, 기판은 정량 대조구 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다.
본 발명의 또 다른 양상은, a) 환자로부터 생물학적 시료를 채취하는 단계; b) 상기 생물학적 시료로부터 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계; 및 c) 상기 단계 b)의 유전자 또는 단백질 발현 수준을 정상 개체의 유전자 또는 단백질 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는 담도암 진단에 관한 정보를 제공하기 위한 방법을 제공한다.
상기 a) 내지 c) 단계에 대해 다음에서 자세히 살펴보며, 전술한 내용과 공통된 내용은 과도한 복잡성을 회피하기 위하여 그 기재를 생략한다.
상기 a) 단계는 담도암인지 여부에 대한 검사가 필요한 환자로부터 생물학적 시료를 채취하는 과정이다. 상기 환자는 불분명한 담도 협착 증상을 보이는 환자일 수 있다.
상기 단계 a)의 시료는 소변, 혈액, 혈청, 혈장, 조직 또는 답즙 등 정상적인 상태와 구별될 수 있는 질환 특이적 폴리펩티드를 확인할 수 있는 생체 시료를 포함할 수 있다.
상기 생물학적 시료는 음이온 교환 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피, 크기별 배제 크로마토그래피, 액체 크로마토그래피, 연속추출, 원심분리 또는 젤 전기영동 등의 방법을 이용하여 전처리될 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 구체예에 따르면, 상기 시료는 담즙일 수 있다.
본 발명의 바람직한 일 실시예에 따른 담도암 진단에 관한 정보를 제공하기 위한 방법을 이용하면, 담즙만을 채취하여 담도암인지 여부를 진단할 수 있으므로, 개복술 없이 비침습적인 방법인 ERCP 시술로 채취한 소량의 담즙으로 담도암인지 여부를 진단할 수 있다. 따라서, 불분명한 담도 협착을 보이는 환자가 불필요한 침습적인 치료를 받는 것을 예방할 수 있다.
상기 b) 단계는 생물학적 시료에서 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 과정으로, CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 발현 수준을 측정하기 위해 증폭 반응을 이용할 수 있으며, 단백질 발현 수준을 측정하기 위해 항원-항체 반응을 이용할 수 있다. 본 발명에서는 전술한 담도암 진단용 조성물 또는 키트를 사용하는 것이 바람직하다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 단계 b)의 유전자 발현 수준은 중합효소 연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소 연쇄반응(RT-PCR), 경쟁적 RT-PCR, 실시간 RT-PCR, 핵산분해효소 보호 분석(nuclease protection assay), in situ 교잡법, DNA 마이크로어레이 및 노던 블롯으로 구성된 군으로부터 선택된 1종 이상의 방법으로 측정되는 것일 수 있다.
또한, 본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 단계 b)의 단백질 발현 수준은 효소면역분석법(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA), 방사능면역분석법(radioimmunoassays), 샌드위치 효소면역분석법, 웨스턴 블롯, 면역침강법(immunoprecipitation), 면역조직화학염색법(immunohistochemistry) 및 형광면역법(fluoroimmunoassay)으로 구성된 군으로부터 선택된 1종 이상의 방법으로 측정되는 것일 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 단계 c)는 측정된 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하여 담도암인지 여부를 진단하는 것이다.
상기 대조군은 정상인 또는 불분명한 담도 협착을 보이지만 담도암이 아닌 환자일 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따르면, 상기 단계 c)는 측정된 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하여 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준이 대조군에 비해 높은 경우, 담도암인 것으로 판별하는 것일 수 있다.
본 발명의 일 구체예에 따른 CEACAM6 및/또는 IRF5 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는 담도암 진단용 조성물을 이용하면 개복술 없이 비침습적인 방법인 ERCP로 채취한 답즙을 이용하여 담도암을 조기에 진단할 수 있고, 불분명한 담도 협착증을 보이지만 담도암이 아닌 환자가 불필요한 침습적인 치료를 받는 것을 예방할 수 있는 효과가 있다.
도 1은 담도암 환자의 병기에 따른 IRF5와 CEACAM6의 발현량의 차이를 나타낸 것이다.
도 2는 다양한 암 세포주에서 CEACAM6의 발현량을 비교한 결과이다.
도 3은 담도암 세포주에서 IRF5와 CEACAM6의 관계를 나타낸 것이다.
도 4는 담도암 환자의 담즙과 대조군의 담즙에서의 CEACAM6의 발현량을 비교한 결과이다.
이하 하나 이상의 구체예를 실시예를 통해 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실시예는 하나 이상의 구체예를 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예 1: 담도암에 특이적인 바이오마커의 선별
R 언어를 사용하여 담도암 환자를 병기(grade)별로 분류하였고, 담도암 환자의 grade에 따른 IRF5(Interferon Regulatory Factor5) 및 CEACAM6의 발현을 분석하여 box plot으로 나타내었다. 담도암 환자의 데이터는 GEO(Gene Expression Omnibus)의 'GSE89749'를 사용하였다.
그 결과, 도 1에 나타낸 바와 같이, grade1에 비해 grade 2 내지 4에서 IRF5의 발현이 증가하였다. CEACAM6 발현은 grade1, grade2, grade3 순으로 증가하였고, 또한 grade1에 비하여 grade4에서 증가하여, CEACAM6를 바이오마커로 선별하였다.
실험예 1. 세포 준비 및 배양
담도암 세포주인 SNU-245를 사용하였다. 또한, 비교를 위해 A549 (lung cancer cell), SN12C, CAKI2, ACHN, UOK(Renal cell carcinoma cell line), 253J-BV (Bladder cancer cell line), Hey8A, SKOV3 (Ovarian cancer cell line), DU145 (prostate cancer cell line), Hep3B (HCC cell line), MDA-MB-231(Breast cancer cell line), SK-N-SH (Neuroblastoma) 를 사용하였다.
각 세포주에서 SNu-245, A549, DU145, Hey8A는 10% 소태아혈청(fetal bovine serum, FBS)과 1%의 페니실린/스트렙토마이신(penicillin/streptomycin, P/S) 항생제가 첨가된 RPMI 배지에서 배양하였다. SN12C, CAKI2, ACHN, UOK, 253J-BV, SKOV3, Hep3B, MDA-MB-231, SK-N-SH는 10% FBS와 1% P/S가 첨가된 DMEM 배지에서 배양하였다. 계대 배양은 세포 밀집도가 90%인 시점에, 0/25% Tripsin/EDTA 용액을 이용하여 배양 플레이트(culture plate)에서 탈락시킨 뒤 40 내지 50%의 밀집도로 나누어 실시하였다.
실험예 2. 다양한 암 세포주에서 CEACAM6 단백질 발현 수준 비교
다양한 암 세포주에서 CEACAM6의 발현량을 면역블랏(immunoblot)으로 측정하였다. 세포를 RIPA 버퍼에서 4℃로 20분 동안 배양한 뒤, 12,000RPM, 4℃에서 10분 동안 원심분리하여 펠렛(pellet)을 제거하였다. 상층액에 5x 샘플 버퍼를 정량으로 첨가하였다. 단백질 정량 샘플을 확보한 뒤, CEACAM6의 발현 수준을 측정하였다.
그 결과, 도 2에 나타난 바와 같이, 다른 암 세포주에 비해 담도암 유래 암세포인 SNU-245에서 CEACAM6가 현저하게 과발현한 것을 확인할 수 있었다.
실험예 3. CEACAM6 유전자의 상위 인자 확인
CEACAM6 유전자의 상위 조절 전사 인자를 알아보기 위해, 예상되는 상위 조절 전사 인자인 IRF5(Interferon Regulatory Factor5) 와 ID3 (Inhibitor Of DNA Binding 3, HLH Protein)의 과발현 백터를 세포에 형질감염시킨 다음 CEACAM6의 발현량을 알아보기 위해 실시간 PCR을 수행하였다.
하기 표 1과 같은 프라이머를 사용하여 95℃에서 5분간 반응 후 95℃에서 20초, 60℃에서 20초, 72℃에서 30초 반응하여 40회 반복하고, 72℃에서 5분간 반응시켜 각 유전자를 증폭하였다.
프라이머 명칭 프라이머 서열 (5'-3') 서열번호
CEACAM6 정방향(F) cattttatcccatggaaccact 1
역방향(R) gttttgacatcttgggaaaagc 2
IRF5 정방향(F) ttattctgcatcccctggag 3
역방향(R) gctcttgttaagggcacagc 4
ID3 정방향(F) actcagcttagccaggtgga 5
역방향(R) aagctccttttgtcgttgga 6
그 결과, 도 3에 나타난 바와 같이, 담도암의 원인 유전자로 선별된 CEACAM6의 상위 전사 인자로 예상되는 IRF5와 ID3 중 IRF5가 유의하게 CEACAM6를 낮추는 상위 조절 인자인 것으로 확인되었다.
실시예 2. 담도암 환자의 답즙 내 CEACAM6의 발현수준 확인
담도암 환자군과 담도암이 아닌 대조군 간의 CEACAM6 발현 수준의 비교를 통해 바이오마커로서의 활용 가치를 판단하기 위하여, 임상증상, 검사실 소견 및 영상 검사 등을 통해 담도 협착이 관찰된 만 18세 이상의 남녀 환자를 모집하였다. 이 중 조직학적 검사를 통해 담도계에 악성 종양 조직이 관찰된 환자를 담도암 환자군(12명), 기타 선별 검사를 통해 담도암이 배제되고 담도 담석증 및 담관염이 있는 환자를 대조군(6명)으로 분류하였다. 환자들의 담즙을 ERCP(내시경역행담췌관조영술)로 채취하고, CEACAM6의 발현 수준을 확인하였다.
보다 구체적으로, 채취된 환자의 담즙을 희석하기 위해 pre-coating된 ELISA 96웰-플레이트에 37.5ul의 PBS를 넣은 후, 12.5ul의 담즙 샘플을 넣은 뒤 피페팅 하였다. 스탠다드(S0 : 0ng/ml, S1 : 0.83ng/ml, S2 : 1.67ng/ml, S3 : 5ng/ml, S4 : 10ng/ml, S5 : 20ng/ml) 및 샘플 50ul을 96 웰-플레이트에 넣고 30분간 37℃ 에서 인큐베이션 하였다. 다음으로, 20x의 wash buffer를 정제수를 이용하여 1x wash buffer로 희석한 후, 각 well당 200ul의 wash buffer로 30초간 총 5번 세척을 진행하였다. HRP-conjugate solution을 50ul씩 각 well에 뿌린 뒤, 피페팅으로 잘 섞어준 후 20분간 37℃에서 인큐베이션 하였다. 각 well당 200ul의 wash buffer로 30초간 총 5번 세척을 진행하였다. Substrate A와 Substrate B 각각 50ul씩 well에 넣어준 후 피페팅으로 잘 섞어준 후10분간 RT에서 빛을 차단하여 인큐베이션 하였다. stop solution을 50ul씩 각 well에 넣어준 다음 plate를 조금씩 쳐서 solution이 잘 섞이게 해주었다. 마지막으로 microplate reader (FLUOstar omega microplate reader, BMG labtech, Germany) 를 이용하여 450nm의 파장으로 standard와 sample의 파장값을 확인하였다.
그 결과, 도 4에 나타난 바와 같이, 담도암 환자군에서 유의하게 CEACAM6의 수준이 높은 것을 확인할 수 있었다.
이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허청구범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.
서열목록 전자파일 첨부

Claims (9)

  1. CEACAM6(Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6) 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는,
    담도암 진단용 조성물.
  2. 청구항 1에 있어서,
    상기 담도암은 불분명한 담도 협착을 수반하는 담도암인,
    담도암 진단용 조성물.
  3. 청구항 1에 있어서,
    상기 제제는 CEACAM6 유전자 또는 단백질에 각각 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브, 항체, 앱타머 및 올리고펩티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 것인,
    담도암 진단용 조성물.
  4. 청구항 1 내지 3 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는,
    담도암 진단용 키트.
  5. a) 환자로부터 생물학적 시료를 채취하는 단계;
    b) 상기 생물학적 시료로부터 CEACAM6 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 측정하는 단계; 및
    c) 상기 단계 b)의 유전자 또는 단백질 발현 수준을 정상 개체의 유전자 또는 단백질 발현 수준과 비교하는 단계를 포함하는,
    담도암 진단에 관한 정보를 제공하기 위한 방법.
  6. 청구항 5에 있어서,
    상기 단계 a)의 시료는 담즙인,
    담도암 진단에 관한 정보를 제공하기 위한 방법.
  7. 청구항 5에 있어서,
    상기 단계 b)의 유전자 발현 수준은 중합효소 연쇄반응(PCR), 역전사 중합효소 연쇄반응(RT-PCR), 경쟁적 RT-PCR, 실시간 RT-PCR, 핵산분해효소 보호 분석(nuclease protection assay), in situ 교잡법, DNA 마이크로어레이 및 노던 블롯으로 구성된 군으로부터 선택된 1종 이상의 방법으로 측정되는 것인,
    담도암 진단에 관한 정보를 제공하는 방법.
  8. 청구항 5에 있어서,
    상기 단계 b)의 단백질 발현 수준은 효소면역분석법(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA), 방사능면역분석법(radioimmunoassays), 샌드위치 효소면역분석법, 웨스턴 블롯, 면역침강법(immunoprecipitation), 면역조직화학염색법(immunohistochemistry) 및 형광면역법(fluoroimmunoassay)으로 구성된 군으로부터 선택된 1종 이상의 방법으로 측정되는 것인,
    담도암 진단에 관한 정보를 제공하는 방법.
  9. 청구항 5에 있어서,
    상기 단계 c)는 측정된 CEACAM6 유전자 또는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하여 담도암인지 여부를 진단하는 것인,
    담도암 진단에 관한 정보를 제공하는 방법.
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