KR20230091788A - Adeno-associated virus vector capable of lung cell-specific gene delivery - Google Patents

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KR20230091788A
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Abstract

The present invention provides a mutant of an adeno-associated virus serotype 1 (AAV1) capsid protein, wherein the mutant is a mutant of the AAV1 capsid protein in which an amino acid at a specific position is substituted in comparison with an amino acid sequence of a wild-type AAV capsid protein, a nucleic acid encoding the mutant of the AAV1 capsid protein, a recombinant AAV1 vector containing the nucleic acid encoding the mutant of the AAV1 capsid protein, and a pharmaceutical composition containing the vector. According to the present invention, the recombinant viral vector containing the nucleic acid encoding the mutant of the AAV1 capsid protein increases transgene expression in lung cells when delivered through intratracheal injection, thereby being useful for preventing or treating lung diseases.

Description

폐 세포 특이적 유전자 전달이 가능한 아데노부속바이러스 벡터 {Adeno-associated virus vector capable of lung cell-specific gene delivery}Adeno-associated virus vector capable of lung cell-specific gene delivery}

본 발명은 아데노 부속 바이러스(AAV) 캡시드 단백질의 돌연변이체에 관한 것으로, 특히 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 포함하는 재조합 바이러스 벡터는 기관 기관 내 주사를 통해 폐 세포로의 유전자 전달에 유용하다.The present invention relates to mutants of the adeno-associated virus (AAV) capsid protein, and in particular, recombinant viral vectors comprising mutants of the AAV1 capsid protein are useful for gene transfer into lung cells via intratracheal injection.

유전자 치료를 효과적으로 하기 위해서는 치료 유전자를 원하는 표적세포로 전달하여 높은 발현 효율을 얻을 수 있도록 하는 유전자 전달 기술 개발이 가장 우선시 된다.In order to effectively perform gene therapy, the highest priority is to develop a gene transfer technology that can deliver a therapeutic gene to a desired target cell to obtain high expression efficiency.

이러한 유전자 전달 기술 중 AAV는 비병원성 바이러스로서 침투된 감염 세포에 부작용이 없으며 대상 세포 유전자 정보에 돌연변이를 일으키는 확률이 희박하므로 다른 유전자 치료기술 대비 안전성이 탁월하다.Among these gene delivery technologies, AAV is a non-pathogenic virus that has no side effects on infected cells and has a low probability of causing mutations in target cell genetic information, so it is superior in safety compared to other gene therapy technologies.

AAV(Adeno-Associated Virus)는 분열하거나 분열하지 않는 세포 모두에 감염시킬 수 있는 non-enveloped의 단일 가닥 DNA 바이러스이다. AAV는 헬퍼 바이러스가 존재 시에만 복제가 가능하며 인간에게는 비병원성이다. 이런 특징으로 다양한 세포에 유전자를 도입하는 유용한 방법이며 유전자 치료를 위한 유용한 벡터로 사용되고 있다. AAV (Adeno-Associated Virus) is a non-enveloped, single-stranded DNA virus that can infect both dividing and non-dividing cells. AAV can replicate only in the presence of a helper virus and is non-pathogenic to humans. Due to these characteristics, it is a useful method for introducing genes into various cells and is used as a useful vector for gene therapy.

AAV는 다양한 혈청형(serotype)이 존재하고 혈청형에 따라 host나 바이러스의 특징이 다른 것으로 알려져 있다. 혈청형 2 (AAV2)는 오래전부터 널리 연구되어 온 혈청형으로 다양한 세포를 감염시킬 수 있다. 혈청형 1 (AAV1), 혈청형 5 (AAV5),혈청형 6 (AAV6)은 보다 조직 감염특이성을 가진 혈청형으로, AAV1은 근육, 간, 기도, 중추신경계 등에, AAV5 는 중추신경계, 간, 망막 등에, AAV6는 심장, 근육, 간 등에 대한 유전자 도입효율이 높다고 알려져 있다. 특정 조직으로의 유전자 전달 특성이 혈청형에 따라 달라지기는 하지만 여전히 타 조직으로의 전달이 용이하기 때문에 조직 특이성을 향상시켜 안전성과 효율성을 개선시킬 수 있는 새로운 AAV 벡터의 개발이 필수적이라고 할 수 있다. It is known that AAV has various serotypes, and the characteristics of the host or virus are different depending on the serotype. Serotype 2 (AAV2) is a serotype that has been widely studied for a long time and can infect various cells. Serotype 1 (AAV1), serotype 5 (AAV5), and serotype 6 (AAV6) are serotypes with more tissue infection specificity. AAV6 is known to have high gene transduction efficiency into the heart, muscle, liver, etc. Although the characteristics of gene transfer to a specific tissue vary depending on the serotype, it is still easy to transfer to other tissues, so it is essential to develop a new AAV vector that can improve safety and efficiency by improving tissue specificity. .

AAV 캡시드 단백질을 변형시킴으로써 유전자 도입 효율을 향상시키는 시도가 이루어지고 있긴 하나, 폐 세포에만 특이적이고 효과적으로 유전자를 전달하는 아데노 부속 바이러스에 대한 연구는 아직까지 보고된 바 없다.Although attempts have been made to improve gene transfer efficiency by modifying the AAV capsid protein, studies on adeno-associated viruses that deliver genes specifically and effectively only to lung cells have not yet been reported.

국제 공개번호 제2017-201121호 (2017.11.23.)International Publication No. 2017-201121 (2017.11.23.) 일본 특허 공개 제2021-0010372호 (2021.02.04.)Japanese Patent Laid-Open No. 2021-0010372 (2021.02.04.)

이에, 본 발명자들은 상기 과제를 해결하기 위해서 예의 노력한 결과, 폐 질환의 근본적인 유전적 원인을 해결하는 유전자 치료제를 전달할 잠재력이 있는 폐 세포를 표적으로 하는 새로운 아데노 부속 바이러스(AAV) 혈청형 1의 캡시드를 기본 골격으로 하는 단백질 변이체를 개발함으로써 본 발명을 완성하게 되었다.Therefore, as a result of diligent efforts to solve the above problems, the inventors of the present invention have developed a novel adeno-associated virus (AAV) serotype 1 capsid targeting lung cells with the potential to deliver gene therapy to solve the fundamental genetic cause of lung disease. The present invention was completed by developing a protein variant having a basic skeleton.

따라서, 본 발명의 목적은 재조합 AAV에 의한 표적 조직 또는 세포로의 유전자 도입 효율의 향상 및/또는 유전정보 발현 효율의 향상을 위해서 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 제공하는 것이다.Accordingly, an object of the present invention is to provide a mutant of AAV1 capsid protein to improve gene transfer efficiency and/or genetic information expression efficiency by recombinant AAV into a target tissue or cell.

또한, 본 발명의 다른 목적은 상기 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a nucleic acid encoding a mutant of the AAV1 capsid protein.

또한, 본 발명의 다른 목적은 상기 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산을 포함하는 재조합 AAV1 벡터를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a recombinant AAV1 vector comprising a nucleic acid encoding a mutant of the AAV1 capsid protein.

또한, 본 발명의 또 다른 목적은 상기 재조합 AAV1 벡터를 포함하는 약제학적 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition comprising the recombinant AAV1 vector.

또한, 본 발명의 또 다른 목적은 상기 재조합 AAV1 벡터를 포함하는 유전자 전달체를 제공하는 것이다Another object of the present invention is to provide a gene delivery system comprising the recombinant AAV1 vector.

이하, 본 발명을 보다 상세히 설명하면 다음과 같다.Hereinafter, the present invention will be described in more detail as follows.

본 발명은 아데노 부속 바이러스 혈청형 1(AAV1) 캡시드 단백질의 돌연변이체에 관한 것이다.The present invention relates to mutants of the adeno-associated virus serotype 1 (AAV1) capsid protein.

본 발명에 사용된 용어 "아데노 부속 바이러스" 또는 "AAV"는 유전자 치료법에서 사용하는 모든 아데노 부속 바이러스를 이들의 유도체, 바이러스 아형 및 자연 발생 및 재조합 형태를 포함하여 지칭한다. AAV의 다양한 혈청형은 다수의 서로 다른 세포 유형을 형질 도입하기 위한 재조합 유전자 전달 바이러스로서 사용될 수 있다. AAV의 다양한 혈청형의 게놈 서열뿐만 아니라 천연 말단 반복체(terminal repeat: TR)의 서열, Rep 단백질 및 캡시드 서브유닛은 당업계에 공지되어 있다. 이러한 서열은 문헌에서 또는 진뱅크(GenBank)와 같은 공용 데이터베이스에서 찾을 수 있다. 예를 들어, 진뱅크(GenBank) 등록번호 NC_002077(AAV-1), AF063497(AAV-1)를 참조할 수 있다.As used herein, the term "adeno-associated virus" or "AAV" refers to all adeno-associated viruses for use in gene therapy, including their derivatives, viral subtypes, and naturally occurring and recombinant forms. Various serotypes of AAV can be used as recombinant gene transfer viruses to transduce a number of different cell types. The genomic sequences of the various serotypes of AAV as well as sequences of natural terminal repeats (TRs), Rep proteins and capsid subunits are known in the art. Such sequences can be found in the literature or in public databases such as GenBank. For example, GenBank registration numbers NC_002077 (AAV-1) and AF063497 (AAV-1) may be referred to.

본 발명에 사용된 용어 "혈청형"은 혈청학적 또는 DNA 서열분석 방법에 의해 동정될 수 있고 그의 항원 특성에 의해 구별될 수 있는 AAV의 세분된 한 부분을 의미한다. As used herein, the term "serotype" refers to a subdivision of AAV that can be identified by serological or DNA sequencing methods and distinguished by its antigenic properties.

본 발명에 사용된 용어 캡시드는 바이러스의 게놈에 존재하는 cap 유전자에 코딩되는 단백질로, 바이러스의 외각을 구성하는 단백질을 의미한다. 야생형 AAV 게놈 또는 cap 유전자는 3종류의 캡시드 단백질(VP1, VP2 및 VP3)을 코딩한다. 야생형 AAV1 캡시드 단백질은 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다. The term capsid used in the present invention is a protein encoded in the cap gene present in the genome of the virus, and refers to a protein constituting the outer shell of the virus. The wild-type AAV genome or cap gene encodes three types of capsid proteins (VP1, VP2 and VP3). The wild-type AAV1 capsid protein includes the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.

일 구현예에서, 본 발명은 아데노 부속 바이러스 혈청형 1(AAV1) 캡시드 단백질의 돌연변이체로서, 상기 돌연변이체는 야생형의 AAV1 캡시드 단백질의 서열번호 1의 아미노산 서열에서 516번, 583번 및 660번 중 하나 이상의 위치에 존재하는 아미노산이 치환된 것인 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 제공한다. In one embodiment, the present invention is a mutant of adeno-associated virus serotype 1 (AAV1) capsid protein, wherein the mutant is at positions 516, 583 and 660 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 of the wild-type AAV1 capsid protein. Provided are mutants of AAV1 capsid protein in which amino acids at one or more positions are substituted.

일 구현예에서, 본 발명은 아데노 부속 바이러스 혈청형 1(AAV1) 캡시드 단백질의 돌연변이체로서, 상기 돌연변이체는 야생형의 AAV1 캡시드 단백질의 서열번호 1의 아미노산 서열에서 516번 위치의 세린이 트레오닌으로 치환되고 583번 위치의 아스파라긴이 아스파르트산으로 치환되며, 660번 위치의 알라닌이 발린으로 치환된 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 포함한다. In one embodiment, the present invention is a mutant of adeno-associated virus serotype 1 (AAV1) capsid protein, wherein the mutant has serine at position 516 replaced with threonine in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 of the wild-type AAV1 capsid protein. and a mutant of AAV1 capsid protein in which asparagine at position 583 is substituted with aspartic acid and alanine at position 660 is substituted with valine.

일 구현예에서, 본 발명에 따른 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체는 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열을 포함하거나 이로 이루어진다. In one embodiment, the AAV1 capsid protein mutant according to the present invention comprises or consists of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2.

본 발명에 사용된 용어야생형은 종 가운데서, 야생의 집단에 가장 많이 볼 수 있는 형을 의미한다. 돌연변이형에 대해서, 야생형은 기본으로 생각되는 표현형 또는 그 개체를 가리킨다. 야생형은 별명으로서 정상형이라고도 불린다. 한편, 본 명세서에 있어서 돌연변이체란 돌연변이를 일으킨 유전자가 형질적인 변화로서 나타나 있는 단백질, 바이러스, 세포, 개체 등을 의미한다. 또, 본 명세서에 있어서 「돌연변이체」란 돌연변이를 일으킨 유전자 자체를 가리키는 경우도 있다.The term wild type used in the present invention refers to a type that is most commonly seen in wild populations among species. For mutant types, wild type refers to the phenotype or individual that is considered to be the underlying. The wild type is also called the normal type as a nickname. Meanwhile, in the present specification, a mutant means a protein, virus, cell, individual, etc. in which a mutated gene appears as a phenotypic change. In addition, in this specification, "mutant" may refer to the gene itself which caused a mutation.

일 구현예에 있어서, 본 발명은 상기 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산을 포함한다. 본 발명의 핵산은 상기 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩한다. 본 발명의 핵산은 AAV1 캡시드 단백질을 코딩하는 핵산(cap 유전자)의 염기서열에 있어서 적어도 1개의 염기가 다른 염기로 치환되는 것에 의해 제작된다. 본 발명의 핵산은 DNA의 형태로 존재할 수 있지만, 경우에 따라서는 RNA의 형태나, DNA와 RNA와의 키메라일 수도 있다. 또, 본 발명의 핵산에는 상보적인 핵산(예, cDNA)도 포함된다. 본 발명의 핵산은 싱글-스트랜드일 수도 있고, 더블-스트랜드일 수도 있지만, 바람직하게는 더블-스트랜드이다.In one embodiment, the present invention includes a nucleic acid encoding a mutant of the AAV1 capsid protein. The nucleic acids of the present invention encode mutants of the AAV1 capsid protein. The nucleic acid of the present invention is produced by replacing at least one base with another base in the base sequence of a nucleic acid encoding AAV1 capsid protein (cap gene). The nucleic acid of the present invention may exist in the form of DNA, but in some cases may be in the form of RNA or a chimera of DNA and RNA. Also, the nucleic acids of the present invention include complementary nucleic acids (eg, cDNA). The nucleic acids of the present invention may be single-stranded or double-stranded, but are preferably double-stranded.

본 발명은 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산으로서 특별하게 한정되지 않지만, 일 구현예로 서열번호 3으로 표시되는 염기서열을 가지는 핵산이 예시된다.The present invention is not particularly limited as a nucleic acid encoding a mutant of AAV1 capsid protein consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, but in one embodiment, a nucleic acid having the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3 is exemplified.

본 발명의 핵산은 적절한 제어서열과 작동 가능하게 연결할 수도 있다. 제어서열에는 프로모터 서열, 폴리아데닐화 시그널, 전사 종결 서열, 상류의 조절 도메인, 내부 리보솜 진입 부위(internal ribosome entry sites:IRES), 인핸서 등이 포함된다. 프로모터 서열에는 유도성 프로모터 서열, 구성적 프로모터 서열이 포함된다. 제어서열은 캡시드 단백질의 유래가 되는 AAV에 고유한 것일 수도 있고 외래성의 것일 수도 있고, 천연서열일 수도 있고, 합성 서열일 수도 있다. 본 발명의 핵산을 포함하는 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 발현 가능한 재조합 DNA도 본 발명에 포함된다.Nucleic acids of the present invention may be operably linked to appropriate control sequences. Control sequences include promoter sequences, polyadenylation signals, transcription termination sequences, upstream regulatory domains, internal ribosome entry sites (IRES), enhancers, and the like. Promoter sequences include inducible promoter sequences and constitutive promoter sequences. The control sequence may be native or exogenous to the AAV from which the capsid protein is derived, or may be a natural sequence or a synthetic sequence. Recombinant DNA capable of expressing a mutant of AAV1 capsid protein containing the nucleic acid of the present invention is also included in the present invention.

상기 재조합 DNA는 시험관 내, 생체 외 및 생체 내의 세포에 본 발명의 핵산을 전달하고, 당해 세포에 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 발현하는 능력을 부여하는데 유용하다. 그리고 본 발명의 핵산이 전달된 세포는 재조합 AAV 입자를 제조하는데도 유용하다. 당해 재조합 DNA는 특히 진핵세포, 바람직하게는 동물세포, 더 바람직하게는 포유류 세포에 본 발명의 핵산을 전달 또는 도입하는데 사용할 수 있다.The recombinant DNA is useful for delivering the nucleic acid of the present invention to cells in vitro, ex vivo and in vivo, and imparting the ability to express a mutant of the AAV1 capsid protein to the cell. In addition, cells to which the nucleic acid of the present invention has been delivered are also useful for producing recombinant AAV particles. The recombinant DNA can be used to deliver or introduce the nucleic acid of the present invention into a eukaryotic cell, preferably an animal cell, more preferably a mammalian cell.

본 발명에서는 벡터로서 사용되고 있는 DNA에 본 발명의 핵산을 보유시켜서 재조합 DNA를 제작할 수 있다. 예를 들면, 플라스미드, 파지, 트랜스포존, 코스미드, 에피소말 DNA, 바이러스 게놈 등을 사용할 수 있다.In the present invention, recombinant DNA can be produced by retaining the nucleic acid of the present invention in DNA used as a vector. For example, plasmids, phages, transposons, cosmids, episomal DNA, viral genomes and the like can be used.

예를 들면, 플라스미드에 본 발명의 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산(cap 유전자)을 보유시키는 것에 의해, 패키징 플라스미드를 제작할 수 있다. 패키징 플라스미드는 추가로 레플리카제(Rep) 단백질을 코딩하는 핵산(rep 유전자) 등, 임의의 핵산서열을 포함할 수 있다. 바람직하게 rep 유전자는 AAV2 유래 Rep를 추가할 수 있다.For example, a packaging plasmid can be constructed by retaining a nucleic acid (cap gene) encoding a mutant of the AAV1 capsid protein of the present invention in a plasmid. The packaging plasmid may further contain any nucleic acid sequence, such as a nucleic acid encoding a replicase (Rep) protein (rep gene). Preferably, the rep gene can add AAV2-derived Rep.

공지의 패키징 플라스미드에 탑재된 cap 유전자의 핵산서열에 있어서, PLA2 도메인 코딩 영역에서의 적어도 1개의 염기를 다른 염기로 치환하는 것에 의해서도, 본 발명의 핵산을 포함하는 재조합 DNA를 제작할 수 있다. 상기 패키징 플라스미드로서 특별하게 한정은 되지 않지만, cap 유전자를 탑재한 패키징 플라스미드, 적합하게는 cap 유전자와 rep 유전자를 탑재한 패키징 플라스미드가 예시된다. 일례로, 본 발명에서는 본 발명의 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산(cap 유전자)과 rep 유전자를 탑재한 패키징 플라스미드인 서열번호 4로 표시되는 재조합 AAV1 벡터를 제작하였다. Recombinant DNA containing the nucleic acid of the present invention can also be prepared by replacing at least one base in the PLA2 domain coding region with another base in the nucleic acid sequence of the cap gene loaded in a known packaging plasmid. Although not particularly limited as the above packaging plasmid, a packaging plasmid loaded with a cap gene, preferably a packaging plasmid loaded with a cap gene and a rep gene is exemplified. As an example, in the present invention, a recombinant AAV1 vector represented by SEQ ID NO: 4, which is a packaging plasmid loaded with a nucleic acid (cap gene) encoding a mutant of the AAV1 capsid protein of the present invention and a rep gene, was prepared.

핵산에 염기의 치환을 도입하는 방법은 공지의 방법에 의해 실시할 수 있고, 특별하게 한정은 없지만, 시판하고 있는 시약, 예를 들면 Mutagenesis Basal Kit(TAKARA BIO INC.)을 사용하여, 키트에 부속의 설명서에 따라서 PCR을 실시하는 것에 의해 달성할 수 있다.The method of introducing a base substitution into a nucleic acid can be carried out by a known method, and is not particularly limited, but is supplied with a kit using a commercially available reagent, for example, Mutagenesis Basal Kit (TAKARA BIO INC.) This can be achieved by performing PCR according to the instructions of

따라서, 본 발명은 상기 AAV1 캡시드 단백질 변이체를 코딩하는 핵산을 포함하는 재조합 AAV1 벡터를 제공한다. Accordingly, the present invention provides a recombinant AAV1 vector comprising a nucleic acid encoding the AAV1 capsid protein variant.

본 발명의 재조합 AAV 벡터는 표적 세포로의 유전자 도입에 유용하다. 본 발명의 재조합 AAV 벡터에 의해 도입된 유전자는 상기 표적 세포에서 강하게 발현된다.The recombinant AAV vectors of the present invention are useful for gene transfer into target cells. Genes introduced by the recombinant AAV vectors of the present invention are strongly expressed in the target cells.

본 명세서에 사용되고 있는 용어 "AAV 벡터"는 아데노-연관 바이러스(AAV)의 성분을 포함하거나 이들 성분으로부터 유래하고 뇌, 심장, 폐, 골격근, 간, 신장, 비장 또는 췌장과 같은 임의의 많은 조직 유형의 인간 세포를 포함한 포유류 세포를 시험관내 또는 생체 내 관계없이 감염시키기 적합한 임의의 벡터를 지칭한다. 용어 "AAV 벡터"는 관심 단백질을 코딩하는 적어도 핵산 분자를 포함하는 AAV형 바이러스 입자(또는 비리온)를 지칭하기 위해 사용될 수 있다. As used herein, the term "AAV vector" includes or is derived from components of adeno-associated virus (AAV) and is used in any of many tissue types, such as brain, heart, lung, skeletal muscle, liver, kidney, spleen or pancreas. refers to any vector suitable for infecting mammalian cells, including human cells, whether in vitro or in vivo. The term “AAV vector” may be used to refer to an AAV-like viral particle (or virion) comprising at least a nucleic acid molecule encoding a protein of interest.

본 명세서에 사용된 "AAV 바이러스" 또는 "AAV 바이러스 입자" 또는 "rAAV 벡터 입자"는 적어도 하나의 AAV 캡시드 단백질(야생형 AAV의 모든 캡시드 단백질에 의함) 및 캡시드 내 이입된(encapsidated) 폴리뉴클레오타이드 rAAV 벡터로 구성되는 바이러스 입자를 지칭한다. 입자가 이종성 폴리뉴클레오타이드(즉, 야생형 AAV 게놈 이외의 폴리뉴클레오타이드, 예컨대 포유류 세포에 전달되는 이식유전자)를 포함한다면, 이는 전형적으로 "rAAV 벡터 입자" 또는 간단하게 "rAAV 벡터"로서 지칭된다. 따라서, rAAV 입자의 생성은 필연적으로 rAAV의 생성을 포함하는데, 이러한 벡터가 rAAV 입자 내에 함유되기 때문이다.As used herein, "AAV virus" or "AAV virus particle" or "rAAV vector particle" refers to at least one AAV capsid protein (by all capsid proteins of wild-type AAV) and a polynucleotide rAAV vector encapsidated. refers to viral particles composed of If the particle comprises a heterologous polynucleotide (i.e., a polynucleotide other than the wild-type AAV genome, such as a transgene delivered to a mammalian cell), it is typically referred to as an "rAAV vector particle" or simply an "rAAV vector". Thus, production of rAAV particles necessarily includes production of rAAV, as such vectors are contained within rAAV particles.

"패키징"은 AAV 입자의 조립체 및 캡시드 내 이입을 야기하는 일련의 세포내 사건을 지칭한다.“Packaging” refers to the series of intracellular events that lead to the assembly and encapsidation of AAV particles.

AAV "rep" 및 "cap" 유전자는 아데노-관련 바이러스의 복제 및 캡시드 내 이입 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 서열을 지칭한다. AAV rep 및 cap은 본 명세서에서 AAV "패키징 유전자"로서 지칭된다.The AAV "rep" and "cap" genes refer to polynucleotide sequences that encode replication and capsid entry proteins of adeno-associated viruses. AAV rep and cap are referred to herein as AAV "packaging genes".

AAV에 대한 "헬퍼 바이러스"는 AAV(예를 들어, 야생형 AAV)가 포유류 세포에 의해 복제되고, 패키징되게 하는 바이러스를 지칭한다. 아데노바이러스, 르페스바이러스, 및 백시니아와 같은 폭스바이러스를 포함하는, AAV에 대한 다양한 이러한 헬퍼 바이러스는 당업계에 공지되어 있다. 서브그룹 C의 아데노바이러스 5형이 가장 흔히 사용되지만, 아데노바이러스는 다수의 상이한 서브그룹을 포함한다. 인간, 비인간 포유류 및 조류 유래의 수많은 아데노바이러스는 공지되어 있고, ATCC와 같은 기탁기관으로부터 입수 가능하다. 헤르페스과의 바이러스는, 예를 들어 헤르페스 심플렉스 바이러스(herpes simplex viruses: HSV) 및 엡스타인-바르 바이러스(Epstein-Barr viruses: EBV)뿐만 아니라 사이토메칼로바이러스(cytomegaloviruses: CMV) 및 가성광견병 바이러스(pseudorabies viruses: PRV)를 포함하는데; 이들은 또한 ATCC와 같은 기탁기관으로부터 입수 가능하다.A “helper virus” for AAV refers to a virus that allows AAV (eg, wild-type AAV) to be replicated and packaged by mammalian cells. A variety of such helper viruses for AAV are known in the art, including adenovirus, lepesvirus, and poxviruses such as vaccinia. Adenoviruses include many different subgroups, although adenovirus type 5 of subgroup C is the most commonly used. Numerous adenoviruses of human, non-human mammalian and avian origin are known and are available from depositories such as the ATCC. Viruses of the herpes family include, for example, herpes simplex viruses (HSV) and Epstein-Barr viruses (EBV) as well as cytomegaloviruses (CMV) and pseudorabies viruses : PRV); They are also available from depositories such as the ATCC.

"헬퍼 바이러스 기능(들)"은 AAV 복제 및 패키징(본 명세서에 기재된 복제 및 패키징을 위한 다른 요구사항과 함께)을 허용하는 헬퍼 바이러스 게놈에서 암호화된 기능(들)을 지칭한다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, "헬퍼 바이러스 기능"은 헬퍼 바이러스를 제공하거나 또는, 예를 들어 트랜스로 생산자 세포에 필수 기능(들)을 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 서열을 제공함으로써 포함되는, 다양한 방법으로 제공될 수 있다. 예를 들어, 하나 이상의 아데노바이러스 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 플라스미드 또는 다른 발현 벡터는 rAAV 벡터와 함께 생산자 세포로 형질감염된다."Helper virus function(s)" refers to function(s) encoded in the helper virus genome that allow for AAV replication and packaging (along with other requirements for replication and packaging described herein). As described herein, "helper virus function" can be provided in a variety of ways, including by providing a helper virus or, for example, by providing a polynucleotide sequence that encodes the essential function(s) to a producer cell in trans. can For example, a plasmid or other expression vector containing nucleotide sequences encoding one or more adenoviral proteins is transfected into producer cells along with the rAAV vector.

일 구현예에 있어서, 본 발명에 따른 AAV1 벡터는 야생형 캡시드 단백질을 포함하는 AAV1 벡터와 비교할 때, 표적 조직에 대해서 향상된 형질도입 프로파일을 갖는다. 즉, 본 발명에 따른 AAV1 벡터는 명확한 조직 표적화 능력(예를 들어, 조직 향성(tissue tropism))을 갖고 있다. In one embodiment, the AAV1 vector according to the present invention has an improved transduction profile for the target tissue compared to an AAV1 vector comprising a wild-type capsid protein. That is, the AAV1 vector according to the present invention has a clear tissue-targeting ability (eg, tissue tropism).

본 명세서에서, 용어 "향성 (tropism)"은 특정 유형의 세포 또는 조직을 감염 또는 형질도입시키기 위한 AAV 바이러스 입자에 존재하는 AAV 캡시드 단백질의 특이성을 의미한다. As used herein, the term “tropism” refers to the specificity of an AAV capsid protein present in an AAV viral particle to infect or transduce a particular type of cell or tissue.

특정 유형의 세포 또는 조직에 대한 AAV 캡시드의 향성은 본 명세서의 실시예에 개시된 것과 같은 당업계에 잘 알려진 표준 분석법을 사용하여, AAV1 캡시드 단백질을 포함하여 특정 유형의 세포 또는 조직을 감염시키거나 형질도입하는 AAV 벡터 입자의 능력을 측정함으로써 결정될 수 있다. The tropism of an AAV capsid for a particular type of cell or tissue is determined by infecting or transfecting a particular type of cell or tissue, including the AAV1 capsid protein, using standard assays well known in the art, such as those described in the Examples herein. It can be determined by measuring the ability of AAV vector particles to transduce.

즉, "향성"은 하나 이상의 특정 세포 유형을 감염시키는 AAV 벡터 또는 비리온의 능력을 의미하지만, 벡터가 하나 이상의 특정 세포 유형에 세포를 형질 도입하도록 기능하는지를 포함할 수도 있는 바; 즉 향성은 특정 세포 또는 조직 유형(들)으로 AAV 벡터 또는 비리온의 우선적인 도입 및/또는 특정 세포 또는 조직 유형으로 진입을 용이하게 하는 세포 표면과의 우선적인 상호작용 후, 경우에 따라 그리고 바람직하게는 세포에서 AAV 벡터 또는 비리온에 의해 운반되는 서열의 발현(예를 들어, 전사 및 경우에 따라 번역), 예를 들어 재조합 바이러스의 경우에는 이종 뉴클레오티드 서열(들)의 발현을 의미한다. That is, "tropism" refers to the ability of an AAV vector or virion to infect one or more specific cell types, but may also include whether the vector functions to transduce cells into one or more specific cell types; That is, tropism occurs after preferential introduction of an AAV vector or virion into a particular cell or tissue type(s) and/or preferential interaction with a cell surface that facilitates entry into a particular cell or tissue type, where appropriate and preferred. Preferably it means the expression (eg transcription and optionally translation) of a sequence carried by an AAV vector or virion in a cell, eg the expression of a heterologous nucleotide sequence(s) in the case of a recombinant virus.

본 명세서에서 사용하는 용어 "형질 도입"은 하나 이상의 특정 세포 유형을 감염시키는 AAV 벡터 또는 비리온의 능력을 의미하는 바; 즉 형질 도입은 AAV 벡터 또는 비리온을 세포 내 도입하고 AAV 벡터 또는 비리온 내 함유된 유전 물질을 세포로 전달하여 벡터 게놈으로부터 발현을 얻는 것을 의미한다. 모든 경우는 아니지만 일부의 경우에는 형질 도입과 향성은 상관관계가 있을 수 있다.As used herein, the term “transduction” refers to the ability of an AAV vector or virion to infect one or more specific cell types; That is, transduction means introducing an AAV vector or virion into a cell and transferring the genetic material contained in the AAV vector or virion into the cell to obtain expression from the vector genome. In some, but not all, cases, transduction and enhancement may be correlated.

본원에 기재되는 AAV는 1 이상의 캡시드 단백질에 있어서 새로운 또는 증강된 조직 향성 특성을 부여하는 아미노산 변형을 포함한다. 본원발명에 따른 AAV1 변이체는 폐 세포를 표적으로 한다.The AAVs described herein include amino acid modifications in one or more capsid proteins that confer new or enhanced tissue tropism properties. AAV1 variants according to the present invention target lung cells.

본 명세서에서 사용된 용어 "폐 세포 향성은 폐 세포에 대한 향성을 의미한다. As used herein, the term "pulmonary cell tropism" means tropism for lung cells.

일부 구현예에서, 돌연변이된 AAV 캡시드 단백질을 포함하는 AAV 벡터의 폐 세포 향성은, 돌연변이를 갖지 않는 야생형 AAV 캡시드 단백질을 포함하는 AAV 벡터의 폐 세포 향성에 비해 적어도 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% 또는 그 이상 추가로 증가된다. In some embodiments, the pulmonary cell tropism of an AAV vector comprising a mutated AAV capsid protein is at least 5%, 10%, 20%, An additional increase of 30%, 40%, 50% or more.

또한, 본 발명은 상기 재조합 AAV1 벡터를 포함하는 약제학적 조성물을 포함한다. 상기 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함할 수 있다.In addition, the present invention includes a pharmaceutical composition comprising the recombinant AAV1 vector. The composition may further include a pharmaceutically acceptable carrier.

상기 "약학적으로 허용가능한 담체"는 조성물의 유효 성분과 조합될 때, 성분들이 의도되지 않은 면역 반응과 같은, 지장을 주는 생리학적 반응들을 야기하는 것 없이 생물학적 활성을 보유하는 것을 가능하게 하는, 임의의 물질을 포함한다. 약학적으로 허용가능한 담체들은 물, 인산 완충 식염수(phosphate buffered saline), 오일/물 에멀젼과 같은 에멀젼들, 및 습윤제들(wetting agent)을 포함한다. 이러한 담체들을 포함하는 조성물들은 Remington's Pharmaceutical Sciences, current Ed., Mack Publishing Co., Easton Pa. 18042, USA; A. Gennaro (2000) "Remington: The Science and Practice of Pharmacy", 20th edition, Lippincott, Williams, & Wilkins; Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems (1999) H. C. Ansel et al., 7th ed., Lippincott, Williams, & Wilkins; and Handbook of Pharmaceutical Excipients (2000) A. H. Kibbe et al., 3rd ed. Amer. Pharmaceutical Assoc 에 쓰인 것들과 같이 잘 알려진 종래의 방법들에 의하여 제형화된다.The "pharmaceutically acceptable carrier", when combined with the active ingredients of the composition, enables the ingredients to retain biological activity without causing disruptive physiological reactions, such as unintended immune responses, Including any substance. Pharmaceutically acceptable carriers include water, phosphate buffered saline, emulsions such as oil/water emulsions, and wetting agents. Compositions containing these carriers are described in Remington's Pharmaceutical Sciences, current Ed., Mack Publishing Co., Easton Pa. 18042, USA; A. Gennaro (2000) "Remington: The Science and Practice of Pharmacy", 20th edition, Lippincott, Williams, &Wilkins; Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems (1999) H. C. Ansel et al., 7th ed., Lippincott, Williams, &Wilkins; and Handbook of Pharmaceutical Excipients (2000) A. H. Kibbe et al., 3rd ed. Amer. It is formulated by well-known conventional methods such as those used in Pharmaceutical Assoc.

일 구현예에 있어서, 본 발명에 따른 약제학적 조성물은 폐 질환, 구체적으로 폐암, 폐섬유증 또는 만성 폐쇄성 폐질환의 예방 또는 치료를 위한 약제학적 조성물일 수 있다.In one embodiment, the pharmaceutical composition according to the present invention may be a pharmaceutical composition for preventing or treating lung diseases, specifically lung cancer, pulmonary fibrosis, or chronic obstructive pulmonary disease.

본 명세서에서 사용된 용어 “치료"는 질환 관련 증후군, 합병증, 증상 또는 생화학적 징후의 진행, 발달, 중증도 또는 재발을 반전, 완화, 개선, 저해 또는 지연 또는 예방하고자 하는 목적으로 대상에 대해 수행된 임의 유형의 개입 또는 과정 또는 대상에게 활성제를 투여하는 것을 말한다. 치료는 질환이 있는 대상체 또는 질환이 없는 대상체(예를 들어 예방용)에 대해 이루어질 수 있다.As used herein, the term "treatment" is performed on a subject for the purpose of reversing, alleviating, ameliorating, inhibiting, or delaying or preventing the progression, development, severity, or recurrence of a disease-related syndrome, complication, symptom, or biochemical sign. Refers to any type of intervention or process or administration of an active agent to a subject.Treatment can be made to a subject with a disease or to a subject without a disease (eg for prophylaxis).

또한, 일 구현예에 있어서, 본 발명은 치료 유효량의 상기 약제학적 조성물을 대상체에 투여하는 단계를 포함하는 폐 질환, 구체적으로 폐암, 폐섬유증 또는 만성 폐쇄성 폐질환의 예방 또는 치료방법을 포함한다.Further, in one embodiment, the present invention includes a method for preventing or treating lung diseases, specifically lung cancer, pulmonary fibrosis, or chronic obstructive pulmonary disease, comprising administering a therapeutically effective amount of the pharmaceutical composition to a subject.

본 명세서에서 사용하는 "투여"는 당업자에게 공지된 다양한 방법과 전달계 중 임의의 것을 사용하여 대상에 치료제 또는 치료제를 포함하는 조성물을 물리적으로 도입하는 것을 말한다. 본 명세서에 기재된 항체에 대한 바람직한 투여 경로는 기도, 정맥내, 복강내, 근육내, 피하, 척추, 유리체내, 또는 예를 들어 주사 또는 주입에 의한 다른 비경구 투여 경로를 포함한다. 본 명세서에서 사용하는 문구 "비경구 투여"는 일반적으로 주사에 의한 장내 및 국소 투여 이외의 투여 방식을 의미하고, 이에 제한되지는 않지만 기도, 정맥내, 복강내, 근육내, 동맥내, 척수강 내, 림프내, 병변내, 피막내, 안와내, 심장내, 피내, 경기관, 피하, 표피하, 유리체내, 관절내, 피막하, 지주막하, 척수내, 경막외 및 흉골내 주사 및 주입 뿐 아니라 생체 내 전기천공을 포함한다. 구체적인 일 실시예에서, 본 발명의 AAV 벡터는 마우스를 이용한 동물 실험에서 기관 내 주사로 투여함으로써 폐 세포 특이적으로 유전자 전달이 가능함을 확인하였다.As used herein, "administration" refers to the physical introduction of a therapeutic agent or composition comprising a therapeutic agent into a subject using any of a variety of methods and delivery systems known to those skilled in the art. Preferred routes of administration for the antibodies described herein include airway, intravenous, intraperitoneal, intramuscular, subcutaneous, spinal, intravitreal, or other parenteral routes of administration, for example by injection or infusion. As used herein, the phrase “parenteral administration” refers to modes of administration other than enteral and topical administration, generally by injection, including, but not limited to, airway, intravenous, intraperitoneal, intramuscular, intraarterial, intrathecal , intralymphatic, intralesional, intracapsular, intraorbital, intracardiac, intradermal, tracheal, subcutaneous, subepidermal, intravitreal, intraarticular, subcapsular, subarachnoid, intrathecal, epidural and intrasternal injections and infusions only but not including in vivo electroporation. In a specific embodiment, it was confirmed that the AAV vector of the present invention can deliver genes specifically to lung cells by intratracheal injection in animal experiments using mice.

본 명세서에서 사용하는 용어 "치료 유효량"은 대상의 질환 또는 장애를 "치료"하거나 질환 또는 장애(예를 들어, 폐 질환)의 위험, 잠재성, 가능성 또는 발생을 감소시키는 데 효과적인 약물 단독 또는 또 다른 치료제와 조합한 약물의 양을 지칭한다. "치료 유효량"은 질환 또는 장애(예를 들어 본 명세서에 개시된 폐동맥 고혈압)를 갖거나 가질 위험이 있는 대상체에 일부 개선 또는 실익을 제공하는 약물 또는 치료제의 양을 포함한다. 이에 따라 "치료 유효양"은 질환 또는 장애의 위험, 잠재성, 가능성 또는 발생을 감소시키거나 또는 일부 완화, 경감을 제공하고/또는 적어도 하나의 지표(예를 들어 폐 질환)를 감소시키고/또는 질환 또는 장애의 적어도 하나의 임상 증상을 감소시키는 양이다.As used herein, the term "therapeutically effective amount" refers to an agent alone or another drug effective to "treat" a disease or disorder in a subject or to reduce the risk, potential, likelihood, or incidence of a disease or disorder (eg, lung disease). Refers to the amount of a drug in combination with other therapeutic agents. A "therapeutically effective amount" includes an amount of a drug or therapeutic agent that provides some improvement or benefit to a subject having or at risk of having a disease or disorder (eg, pulmonary arterial hypertension as disclosed herein). Accordingly, a "therapeutically effective amount" reduces the risk, potential, likelihood, or incidence of a disease or disorder, or provides some relief, relief, and/or reduces at least one indicator (eg, lung disease) and/or An amount that reduces at least one clinical symptom of a disease or disorder.

본 명세서에서 사용하는 용어 "대상체"는 임의의 인간 또는 비-인간 동물을 포함한다. 용어 "비-인간 동물"은 모든 척추동물, 예를 들어 포유류 및 비-인간 영장류, 양, 개, 소, 닭, 양서류, 파충류 등과 같은 비-포유류를 포함한다.As used herein, the term “subject” includes any human or non-human animal. The term “non-human animal” includes all vertebrates, including mammals and non-mammals such as non-human primates, sheep, dogs, cows, chickens, amphibians, reptiles, and the like.

또한, 본 발명은 상기 재조합 AAV1 벡터를 포함하는 약물 전달체를 포함한다. 상기 조성물은 상기 용도로 이용하기 위한 공지된 약제학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함할 수 있다.In addition, the present invention includes a drug delivery system comprising the recombinant AAV1 vector. The composition may further include a known pharmaceutically acceptable carrier for use as described above.

본 발명의 AAV1 벡터는 폐 세포로의 향성을 나타내며, 폐 세포 특이적으로 유전자를 발현시키는 능력을 가지므로, 폐 세포로 약물 또는 유전자를 전달하는 전달체로써 이용할 수 있다. 구체적으로, 호흡기로 감염되는 감염성 물질에 대한 AAV1 백신으로 사용될 수 있다. 기존 정맥을 통해 주입하는 백신은 온 몸으로 퍼지게 되어 막상 폐 부근에서의 항체 생성 가능성이 감소되는 단점이 있으나, 본 발명의 벡터를 기관 내 주사를 통해 폐 세포로 유전자를 효과적으로 전달한다면 호흡기를 통해 유입되는 감염성 물질에 대한 면역성(immunity)를 높일 수 있다.The AAV1 vector of the present invention exhibits tropism to lung cells and has the ability to express genes specifically in lung cells, so it can be used as a delivery vehicle for delivering drugs or genes to lung cells. Specifically, it can be used as an AAV1 vaccine against infectious agents that infect the respiratory tract. Existing vaccines injected through a vein have the disadvantage of spreading throughout the body and reducing the possibility of antibody production in the vicinity of the lungs. It can increase immunity to infectious agents.

본 발명은 폐 세포를 특이적으로 표적화하여 고효율 유전자 전달능을 가진 재조합 AAV1 캡시드 변이체에 관한 것으로, AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산을 포함하는 재조합 바이러스 벡터는 기관 내 주사를 통해 전달 시 폐 세포에서의 도입 유전자의 발현에 유용하여 폐 질환의 예방 또는 치료에 효과적이다.The present invention relates to a recombinant AAV1 capsid variant having high-efficiency gene transfer ability by specifically targeting lung cells, and a recombinant viral vector comprising a nucleic acid encoding a mutant of AAV1 capsid protein is delivered to the lungs by intratracheal injection. It is useful for expression of transgenes in cells and is effective in preventing or treating lung diseases.

도 1은 야생형 AAV1과 본 발명의 재조합 AAV1 벡터의 패키징 효율(packaging efficiency)을 정량적 PCR 분석으로 게노믹 역가를 비교한 것이다.
도 2는 재조합 AAV1 벡터의 폐 세포 특이성을 확인하기 위하여, 8주령 C57BL/6 수컷 마우스로부터 적출된 폐에 전체 마운트 β-갈락토시다아제 염색하여 LacZ 발현을 확인한 폐 세포 내 효율적 국소 전달 결과를 나타낸 것이다.
도 3은 폐 세포 특이성을 확인하기 위하여, 재조합 AAV1 벡터에 의한 폐 세포에서의 LacZ 발현을 eosin / LacZ staining을 통하여 확인한 것이다.
도 4a는 본 발명의 재조합 AAV1 벡터의 개열지도를 나타낸 것이다.
도 4b는 pHelper 플라스미드 개열지도를 나타낸 것이다.
도 4c는 pCMV LacZ 플라스미드 개열지도를 나타낸 것이다.
Figure 1 compares the genomic potency of wild-type AAV1 and the packaging efficiency of the recombinant AAV1 vector of the present invention by quantitative PCR analysis.
Figure 2 shows the results of efficient local delivery into lung cells, in which LacZ expression was confirmed by whole mount β-galactosidase staining in the lungs excised from 8-week-old C57BL/6 male mice, in order to confirm the lung cell specificity of the recombinant AAV1 vector. will be.
Figure 3 confirms LacZ expression in lung cells by the recombinant AAV1 vector through eosin / LacZ staining in order to confirm lung cell specificity.
Figure 4a shows a cleavage map of the recombinant AAV1 vector of the present invention.
Figure 4b shows the pHelper plasmid cleavage map.
Figure 4c shows the pCMV LacZ plasmid cleavage map.

이하, 본 발명에 따르는 실시예를 통하여 본 발명을 보다 상세히 설명하나, 본 발명의 범위가 하기 제시된 실시예에 의해 제한되는 것은 아니다. Hereinafter, the present invention will be described in more detail through examples according to the present invention, but the scope of the present invention is not limited by the examples presented below.

[실시예][Example]

실시예 1: AAV1 캡시드 단백질 변이체 선별 및 제작Example 1: Selection and construction of AAV1 capsid protein variants

1) AAV1 캡시드 단백질 변이체 선별1) Selection of AAV1 capsid protein variants

야생형 AAV 변이체 (AAV1, AAV2, AAV4, AAV6, AAV8, AAV9)의 cap 유전자에 error-prone PCR을 이용한 랜덤 포인트 돌연변이 유도 및 각 혈청형의 3-fold protrusion에 random 7mer/9mer를 삽입하여 플라스미드 풀을 제작하였다. AAV 플라스미드 라이브러리 7-70ng, pBluescript 25μg, pHelper 25μg를 칼슘-포스페이트 복합체(calcium-phosphate complex)를 이뤄 AAV293 세포에 트랜스펙션하여 AAV 패키징을 진행하였고, 각 변이체의 cap 유전자 정보를 탑재한 AAV 라이브러리 풀을 제작하였다. A plasmid pool was created by inducing random point mutations in the cap gene of wild-type AAV variants (AAV1, AAV2, AAV4, AAV6, AAV8, AAV9) using error-prone PCR and inserting random 7mer/9mer into 3-fold protrusion of each serotype. produced. 7-70ng of the AAV plasmid library, 25μg of pBluescript, and 25μg of pHelper were formed in a calcium-phosphate complex and transfected into AAV293 cells to proceed with AAV packaging, and an AAV library pool loaded with the cap gene information of each variant. was produced.

8주령의 C57BL/6 수컷 마우스를 이소플루란(isoflurane)으로 호흡 마취한 후 기도 부위의 피부를 1cm 가량 절개하였다. PenWu micro-aerosolizer (BioJane, Shanghai, China) (1.25 length of intratracheal portion, 700μm of outer diameter, 430μm of inner diameter)에 PBS 중 1x1011 vg/100 μl의 AAV 라이브러리 풀을 로딩하여 기도로 니들이 통과하는 모습을 확인하며 기관 내 주사(intratracheal injection)를 진행하였다. 8-week-old C57BL/6 male mice were respiratory anesthetized with isoflurane, and then a 1 cm incision was made in the skin of the airway area. PenWu micro-aerosolizer (BioJane, Shanghai, China) (1.25 length of intratracheal portion, 700μm of outer diameter, 430μm of inner diameter) loaded with 1x10 11 vg/100 μl of AAV library pool in PBS and passing the needle through the airway , and intratracheal injection was performed.

일주일 후 0.9% 생리식염수를 심장을 통해 흘려주어 관류(perfusion)를 진행하였고 폐를 적출하였다. 균질화(Homogenization) 후 DNA 미니 킷 (Qiagen)을 이용해 폐 전체에서 DNA를 추출하였고, AAV cap 유전자 특이적 정방향 프라이머(forward primer) 5´-GCGGAAGCTTCGATCAACTACG-3´(서열번호 5), 역방향 프라이머(reverse primer) 5´-CGCAGAGACCAAAGTTCAACTGA-3´ (서열번호 6)를 이용하여 폐 전체에 향성(tropism)을 보이는 AAV 변이체들의 cap 유전자를 증폭하였다. 최종적으로 증폭된 cap gene 유전자는 양 말단에 HindIII와 NotI 서열을 포함하여 이를 pSub2 플라스미드에 HindIII/NotI restriction 및 ligation을 통해 서브클로닝하여 DH10β에 electroporation 후 플라스미드를 정제하여(Qiagen Plasmid Maxi Kit) 폐 조직(세포) 향성 플라스미드 풀(pool) 형태로 보관하였다. (pSub2는 pSub201(ATCC)를 기반으로 UC Berkeley, David Schaffer Lab에서 제작한 플라스미드로 HindIII와 NotI을 이용해 cap gene을 subcloning 할 수 있도록 제작됨, Reference 1. Narendra Maheshri et al., Nature Biotechnology, 2006; 2. James T Koerber, Nature Protocols, 2006)After one week, 0.9% physiological saline was flowed through the heart to perform perfusion, and the lungs were removed. After homogenization, DNA was extracted from the whole lung using a DNA mini kit (Qiagen), and AAV cap gene-specific forward primer 5'-GCGGAAGCTTCGATCAACTACG-3' (SEQ ID NO: 5), reverse primer ) 5'-CGCAGAGACCAAAGTTCAACTGA-3' (SEQ ID NO: 6) was used to amplify the cap gene of AAV variants showing tropism in the entire lung. The finally amplified cap gene gene, including HindIII and NotI sequences at both ends, was subcloned into the pSub2 plasmid through HindIII/NotI restriction and ligation, electroporated into DH10β, and the plasmid was purified (Qiagen Plasmid Maxi Kit) to lung tissue ( cells) were stored in the form of a plasmid pool. (pSub2 is a plasmid prepared by David Schaffer Lab, UC Berkeley, based on pSub201 (ATCC), and is designed to subclon the cap gene using HindIII and NotI, Reference 1. Narendra Maheshri et al., Nature Biotechnology, 2006; 2. James T Koerber, Nature Protocols, 2006)

2) 재조합 AAV1 벡터의 제작2) Construction of recombinant AAV1 vector

① 패키징 플라스미드 돌연변이체의 제작① Production of packaging plasmid mutants

혈관 향성 플라스미드 풀에서 HindIII/NotI restriction을 통해 다수의 폐 세포 향성 cap 유전자를 cap 유전자 삽입을 위해 HindIII 및 NotI이 도입되어 있는 pXX2(UC Berkeley, David Schaffer Lab)에 subcloning하여 reporter gene 탑재를 위한 다수의 폐 세포 특이적 플라스미드 돌연변이체의 제작을 완료하였다.In the angiogenic plasmid pool, a number of lung cell-specific cap genes were subcloned into pXX2 (UC Berkeley, David Schaffer Lab) into which HindIII and NotI were introduced for cap gene insertion through HindIII/NotI restriction, resulting in a number of reporter gene loadings. Construction of lung cell specific plasmid mutants was completed.

② AAV293 세포로의 플라스미드 도입② Plasmid introduction into AAV293 cells

AAV1 변이체의 제작Construction of AAV1 variants

돌연변이체 플라스미드 17 μg, ITR flanked reporter gene (pCMV-GFP 또는 pCMV-LacZ 또는 pCMV-FGF12-IRES-GFP) 17 μg, pHelper 17μg을 calcium-phosphate complex를 이뤄 AAV293 세포에 트랜스펙션하였고, 약 48시간 후 세포 펠렛만을 모아 동결-해동(freezing-thawing)을 통해 세포 내부의 AAV를 추출하였다. 이후 원심분리를 통해 세포 파괴물(cell debris)을 제거하고 벤조나아제(benzonase) 10 U/mL를 37 ℃에서 30분간 인큐베이션하여 바이러스 생산 세포로부터 나온 핵산을 제거하였다. AAV293 cells were transfected with 17 μg of mutant plasmid, 17 μg of ITR flanked reporter gene (pCMV-GFP or pCMV-LacZ or pCMV-FGF12-IRES-GFP), and 17 μg of pHelper in a calcium-phosphate complex, followed by about 48 hours. After collecting only the cell pellets, AAV inside the cells was extracted through freezing-thawing. Thereafter, cell debris was removed by centrifugation, and nucleic acids from virus-producing cells were removed by incubation with 10 U/mL of benzonase at 37° C. for 30 minutes.

제작된 AAV1 변이체의 개열지도는 도 4a에 나타내었으며, 전체 염기서열은 다음과 같다(서열번호 4).The cleavage map of the prepared AAV1 mutant is shown in FIG. 4a, and the entire base sequence is as follows (SEQ ID NO: 4).

Figure pat00001
Figure pat00001

Figure pat00002
Figure pat00002

Figure pat00003
Figure pat00003

야생형 AAV1의 제작Construction of wild-type AAV1

AAV2의 rep 유전자와 AAV1의 cap 유전자를 포함하는 패키징 플라스미드 17 μg, ITR flanked reporter gene (pCMV-GFP 또는 pCMV-LacZ 또는 pCMV-FGF12-IRES-GFP) 17 μg, pHelper 17μg을 calcium-phosphate complex를 이뤄 AAV293 세포에 트랜스펙션하였고, 약 48시간 후 세포 펠렛만을 모아 동결-해동(freezing-thawing)을 통해 세포 내부의 AAV를 추출하였다. 이후 원심분리를 통해 세포 파괴물(cell debris)을 제거하고 벤조나아제(benzonase) 10 U/mL를 37 ℃에서 30분간 인큐베이션하여 바이러스 생산 세포로부터 나온 핵산을 제거하였다.17 μg of packaging plasmid containing the rep gene of AAV2 and the cap gene of AAV1, 17 μg of ITR flanked reporter gene (pCMV-GFP or pCMV-LacZ or pCMV-FGF12-IRES-GFP), and 17 μg of pHelper form a calcium-phosphate complex. AAV293 cells were transfected, and after about 48 hours, only cell pellets were collected and AAV inside the cells was extracted through freezing-thawing. Thereafter, cell debris was removed by centrifugation, and nucleic acids from virus-producing cells were removed by incubation with 10 U/mL of benzonase at 37° C. for 30 minutes.

3) AAV1 변이체 정제3) AAV1 variant purification

AAV 용액을 이오딕사놀 기울기(gradient)를 이용해 초원심분리를 진행하였다. 이오딕사 용액을 15%, 25%, 40%, 54%로 제작하여 차례로 초원심분리 튜브에 로딩하였고, 그 위로 AAV 용액을 로딩하였다. 튜브 실링(Tube sealing) 후 Optima XE-90 Ultracentrifuge (BECKMAN COULTER) 및 Vti65.2 rotor를 이용해 초원심분리를 진행(42,000 RPM, 18 ℃, 2시간)하였다. 54%와 40% 이오딕사놀 중간에 위치한 AAV 층을 추출하였고, 이를 Amicon Ultra-15 Centrifugal Filter (MWCO 100,000)를 이용해 0.01% 트윈 20을 함유한 PBS 버퍼로 버퍼 교환(buffer exchange)을 진행하였다.The AAV solution was subjected to ultracentrifugation using an iodixanol gradient. Iodixa solutions were prepared in 15%, 25%, 40%, and 54% and sequentially loaded into ultracentrifugation tubes, and the AAV solution was loaded thereon. After tube sealing, ultracentrifugation was performed using an Optima XE-90 Ultracentrifuge (BECKMAN COULTER) and a Vti65.2 rotor (42,000 RPM, 18 °C, 2 hours). The AAV layer located in the middle of 54% and 40% iodixanol was extracted, and buffer exchange was performed with a PBS buffer containing 0.01% Tween 20 using an Amicon Ultra-15 Centrifugal Filter (MWCO 100,000).

4) AAV1 변이체 역가 측정 4) Measurement of AAV1 mutant titer

CMV-FGF12-IRES-GFP를 탑재하고 있는 야생형 AAV1과 AAV1 변이체의 역가는 Dnase I(5U)에 저항성을 지닌 바이러스를 프로테이나제 K 처리하여 바이러스 게놈을 추출한 후, CMV에 대한 정량적 PCR (qPCR) 프라이머(5-ATGGTGATGCGGTTTTGGCAG-3: 서열번호 7 및 5-GGCGGAGTTGTTACGACATTTTGG-3: 서열번호 8)를 이용하여 각각의 standard와 함께 qPCR를 진행하여 정량하였다. The titer of wild-type AAV1 and AAV1 mutants carrying CMV-FGF12-IRES-GFP was determined by extracting the viral genome by treating a virus resistant to Dnase I (5U) with proteinase K, and then quantitative PCR (qPCR) for CMV. ) using primers (5-ATGGTGATGCGGTTTTGGCAG-3: SEQ ID NO: 7 and 5-GGCGGAGTTGTTACGACATTTTGG-3: SEQ ID NO: 8), qPCR was performed with each standard for quantification.

야생형 AAV1과 재조합 AAV1 벡터의 패키징 효율(packaging efficiency)을 genomic titer 비교하여 도 1에 나타내었다. 이는 AAV1 변이체가 야생형 AAV1에 비해 packaging 효율이 향상된 것으로 진화론적으로 우수하게 개체가 유지될 수 있는 가능성을 의미한다.The packaging efficiencies of wild-type AAV1 and recombinant AAV1 vectors were compared by genomic titers and shown in FIG. 1 . This means that AAV1 mutants have improved packaging efficiency compared to wild-type AAV1, which means that the organism can be maintained with excellent evolutionary characteristics.

실시예 2: 재조합 AAV1 변이체 감염 확인Example 2: Confirmation of Recombinant AAV1 Variant Infection

CMV-LacZ를 탑재한 AAV1 야생형과 AAV1 변이체를 각각 패키징하여 8주령의 C57BL/6 male 마우스에 기관 내 에어로졸 형태로 주입 (1x1011 vg/100μl)하였다.AAV1 wild-type and AAV1 mutants loaded with CMV-LacZ were individually packaged and injected into 8-week-old C57BL/6 male mice in the form of an intratracheal aerosol (1x10 11 vg/100 μl).

재조합 AAV1 벡터의 폐 세포 특이성을 확인하기 위하여, 8주령 C57BL/6 수컷 마우스를 주입 1주일 후 적출된 폐에 전체 마운트 β-갈락토시다아제 염색하여 LacZ 발현을 확인한 결과, 도 2에 나타나는 바와 같이 폐 세포에 특이적으로 국소 전달되었음을 확인하였다.In order to confirm the lung cell specificity of the recombinant AAV1 vector, LacZ expression was confirmed by whole mount β-galactosidase staining in the lungs extracted 1 week after injection of 8-week-old C57BL/6 male mice, as shown in FIG. It was confirmed that it was specifically delivered locally to lung cells.

또한, 재조합 AAV1 벡터의 폐 세포 특이성을 확인하기 위하여, 8주령 C57BL/6 수컷 마우스를 주입 1주일 후 폐 적출하여 eosin / LacZ staining을 통해서 폐 세포에서의 LacZ 발현 여부를 확인하였으며, 그 결과, 도 3에 나타나는 바와 같이, 폐 세포에 특이적으로 전달되었음을 확인하였다.In addition, in order to confirm the lung cell specificity of the recombinant AAV1 vector, 8-week-old C57BL/6 male mice were excised 1 week after injection, and LacZ expression in lung cells was confirmed through eosin / LacZ staining. As a result, FIG. As shown in 3, it was confirmed that it was delivered specifically to lung cells.

Claims (10)

아데노 부속 바이러스 혈청형 1(AAV1) 캡시드 단백질의 돌연변이체로서,
상기 돌연변이체는 서열번호 1로 표시되는 야생형의 AAV1 캡시드 단백질의 아미노산 서열에서 516번, 583번 및 660번 중 하나 이상의 위치에 존재하는 아미노산이 치환된 것인 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체.
As a mutant of the adeno-associated virus serotype 1 (AAV1) capsid protein,
The mutant is an AAV1 capsid protein mutant in which amino acids present at one or more positions among positions 516, 583, and 660 in the amino acid sequence of the wild-type AAV1 capsid protein represented by SEQ ID NO: 1 are substituted.
제 1항에 있어서,
상기 돌연변이체는 서열번호 1로 표시되는 야생형의 AAV1 캡시드 단백질의 아미노산 서열 중 516번 위치의 세린이 트레오닌으로 치환되고 583번 위치의 아스파라긴이 아스파르트산으로 치환되며, 660번 위치의 알라닌이 발린으로 치환된 것인 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체.
According to claim 1,
In the mutant, in the amino acid sequence of the wild-type AAV1 capsid protein represented by SEQ ID NO: 1, serine at position 516 is substituted with threonine, asparagine at position 583 is substituted with aspartic acid, and alanine at position 660 is substituted with valine. mutants of the AAV1 capsid protein.
제 2항의 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산.
A nucleic acid encoding a mutant of the AAV1 capsid protein of claim 2.
제 3 항에 있어서,
상기 핵산은 서열번호 3로 표시되는 염기서열을 포함하는 핵산.
According to claim 3,
The nucleic acid is a nucleic acid comprising the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 3.
제 3항 또는 제 4항의 AAV1 캡시드 단백질의 돌연변이체를 코딩하는 핵산을 포함하는 재조합 AAV1 벡터.
A recombinant AAV1 vector comprising a nucleic acid encoding a mutant of the AAV1 capsid protein of claim 3 or 4.
제 5항에 있어서,
상기 AAV1 벡터는 AAV1 야생형 바이러스 벡터와 비교할 때, 폐 세포에 대해 향상된 형질도입 프로파일을 갖는, 재조합 AAV 벡터.
According to claim 5,
wherein the AAV1 vector has an improved transduction profile for lung cells when compared to an AAV1 wild-type viral vector.
제 5항에 따른 재조합 AAV1 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
A pharmaceutical composition comprising the recombinant AAV1 vector according to claim 5.
제 7항에 있어서,
상기 조성물은 약제학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 포함하는 약제학적 조성물.
According to claim 7,
The pharmaceutical composition further comprises a pharmaceutically acceptable carrier.
제 7항에 있어서,
상기 조성물은 폐암, 폐섬유증 또는 만성 폐쇄성 폐질환의 예방 또는 치료를 위한 것인 약제학적 조성물.
According to claim 7,
The composition is a pharmaceutical composition for the prevention or treatment of lung cancer, pulmonary fibrosis or chronic obstructive pulmonary disease.
제 5항에 따른 재조합 AAV1 벡터를 포함하는 유전자 전달체.
A gene delivery system comprising the recombinant AAV1 vector according to claim 5.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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