KR20210142154A - 암 치료를 위한 키나제 억제제와 조합된 dbait 분자 - Google Patents

암 치료를 위한 키나제 억제제와 조합된 dbait 분자 Download PDF

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KR20210142154A
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프랑수아즈 보노
쥘레 파브르
올리비에 칼바야라크
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옹쎄오
엥스띠뛰 나씨오날 드 라 쌍떼 에 드 라 흐쉐르슈 메디깔 (인쎄름)
위니베르씨떼 뚤루즈 3 - 뽈 싸바띠에
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Abstract

본 발명은 암을 치료하기 위한 Dbait 분자와 단백질 키나제 억제제의 조합물에 관한 것이다.

Description

암 치료를 위한 키나제 억제제와 조합된 DBAIT 분자
본 발명은 의학, 특히 종양학(oncology) 분야에 관한 것이다.
표적 치료에 대한 다양한 내성 기전의 출현은 오늘날 암에서 가장 중요한 난제 중 하나이다. 다양한 약물-내성 기전은 치료 이전에 이미 존재하는 돌연변이로 인해 발생할 수 있으나, 암세포의 소규모 하위 집단이 선택적인 약물 압력 하에서도 생존할 수 있다는 증거가 점점 더 많아지고 있다. 이러한 생존 세포는 수 주 내지 수 개월 동안 집단 성장이 거의 없거나 전혀 없는 약물 내성 지속생존체(DTP: Drug Tolerant Persisters)가 되어, 종양 세포의 잠재적 저장소를 제공한다. DTP의 20%는 표현형이 변환되어 이들의 증식을 재개하는 약물 내성 확장(expended) 지속생존체가 되고, 환자에서 종양 재발의 원인이 되는 내성 유전적 변형(예를 들어, EGFR T790M)을 획득한다. 암 치료는 전통적으로 빠르게 성장하는 세포의 집단을 제거하는데 중점을 두었고, 이런 경우 우리는 새로운 패러다임에 접하게 된다. 표적 치료로 획득한 내성 기전에서의 지속생존체 또는 약물 내성 세포(DTP)의 역할에 대한 첫번째 증거는, 문헌[Sharma et al.(Cell 2010, 141, 69-80])에서 설명되었고, 몇몇 간행물에서 추가로 설명되었다(문헌[Hata et al. Nat Med 2016, 22(3): 262-269. doi:10.1038/nm.4040.], 문헌[Ramirez et al. Nat Comm 2016, DOI: 10.1038/ncomms10690], 문헌[Guler et al. Can Cell 2017, 32, 221-237]). 이러한 작업들은 약물-내성 기전이 최근의 단일 조상 세포로부터 유래되었고 동일한 선택적 압력 하에서 성장한 지속생존체로부터 발생할 수 있다는 사실을 입증한다. 이러한 이질성(heterogeneity)은 '개인화(personalized)' 치료에 대한 상당한 임상적 난제를 제시하며: 심지어 하나의 PERC(지속생존체-유래 에를로티닙-내성 군집)에 대한 효과적인 치료가 선택된다 해도, 이 약물이 다른 PERC에도 효과적일 것이라는 보장이 없고, 실제로 탐지되지 않을 수도 있다. 대규모 암 집단의 소규모 하위 집단인 지속가능체는, 임상 환경(clinical setting)에서는 연구하기 어렵고, 임상적으로 이 상태를 거쳐가는 알려진 분자 지표(molecular signature)도 없다. 그러나, 문헌[Hata et al.]은 임상적으로 관련된 약물 내성 암세포가 이미 존재하기도 하고, 또한 약물 내성 세포로부터 발달할 수도 있다는 증거를 제공하여, 임상에서 내성을 예방하거나 극복하기 위한 새로운 치료 기회에 대한 전략적 표적으로서 지속생존체를 주목한다.
따라서, 암세포 집단 내의 이러한 세포들과 치료에 내성을 갖는 암세포의 출현을 성공적으로 처리하기 위한 새로운 치료 방법이 필요하다. 확실히, 세포 사멸에 실패한 DTP의 저장소를 제거하고, DTEP로 변환하는 과정에서 발생하는 돌연변이를 예방하는 새로운 방식을 발견하는 것이, 환자들을 치료하는데 매우 중요하다.
본 발명의 개요
본 발명은 특히 키나제(kinase) 억제제에 대한 획득 내성의 발현(apparition)을 예방하거나 지연시키기 위한, 키나제 억제제와 조합된 암 치료용 치료제 DBait를 제공한다. 확실히, DBait 분자는 지속성 암세포에 대해 표적화된 효과를 나타냄으로써, 암의 재발을 예방하거나 지연시키고/거나, 키나제 억제제에 대한 획득 내성의 발현을 예방하거나 지연시킨다.
따라서, 본 발명은 Dbait 분자와 단백질 키나제 억제제를 포함하는 약학적 조성물, 조합물 또는 키트에 관한 것이다. 더욱 구체적으로, 상기 약학적 조성물, 상기 조합물 또는 상기 키트는 Dbait 분자와, 동일 또는 상이한 키나제를 표적화하는 하나 또는 수 개의 단백질 키나제 억제제를 포함한다.
일 양태에서, 키나제 억제제는 EGFR 패밀리, ALK, B-Raf, MEK, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, IGF1R, c-Met, JAK 패밀리, PDGFR α 및 β, RET, AXL, c-KIT, TrkA, TrkB, TrkC, ROS1, BTK 및 Syk로 이루어지는 목록에서 선택된 하나 또는 수 개의 대상을 표적화하는 억제제이다. 예를 들어, 상기 키나제 억제제는 게피티닙(gefitinib), 에를로티닙(erlotinib), 라파티닙(lapatinib), 반데타닙(vandetanib), 아파티닙(afatinib), 오시머티닙(osimertinib), 네라티닙(neratinib), 다코미티닙(dacomitinib), 브리가티닙(brigatinib), 카너티닙(canertinib), 나쿠오티닙(naquotinib), 나자르티닙(nazartinib), 펠리티닙(pelitinib), 로실레티닙(rociletinib), 이코티닙(icotinib), AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙(poziotinib), WZ4002, 크리조티닙(Crizotinib), 엔트렉티닙(entrectinib), 세리티닙(ceritinib), 알렉티닙(alectinib), 롤라티닙(lorlatinib), TSR-011, CEP-37440, 엔사르티닙(ensartinib), 베무라페닙(Vemurafenib), 다브라페닙(dabrafenib), 레고라페닙(regorafenib), PLX4720, 코비메티닙(Cobimetinib), 트라메티닙(Trametinib), 비니메티닙(Binimetinib), 셀루메티닙(Selumetinib), PD-325901, CI-1040, PD035901, U0126, TAK-733, 렌바티닙(Lenvatinib), 데비오-1347(Debio-1347), 도비티닙(dovitinib), BLU9931, 소라페닙(Sorafenib), 수니티닙(sunitinib), 레스타우티닙(lestaurtinib), 탄두티닙(tandutinib), 퀴자티닙(quizartinib), 크레놀라닙(crenolanib), 길테리티닙(gilteritinib), 포나티닙(ponatinib), 이브루티닙(ibrutinib), 린시티닙(Linsitinib), NVP-AEW541, BMS-536924, AG-1024, GSK1838705A, BMS-754807, PQ 401, ZD3463, NT157, 피크로포도필린(Picropodophyllin)(PPP), 티반티닙(Tivantinib), JNJ-38877605, PF-04217903, 포레티닙(foretinib)(GSK 1363089), 메레스티닙(Merestinib), 룩솔리티닙(Ruxolitinib), 토파시티닙(tofacitinib), 오클라시티닙(oclacitinib), 바리시티닙(baricitinib), 필고티닙(filgotinib), 세둘라티닙(cerdulatinib), 간도티닙(gandotinib), 모멜로티닙(momelotinib), 파크리티닙(pacritinib), PF-04965842, 우파다시티닙(upadacitinib), 페피시티닙(peficitinib), 페드라티닙(fedratinib), 이마티닙(imatinib), 파조파닙(pazopanib), 텔라티닙(Telatinib), 보수티닙(bosutinib), 닐로티닙(nilotinib), 카보잔티닙(cabozantinib), 벰센티닙(Bemcentinib), 아무바티닙(amuvatinib), 길테리티닙(gilteritinib)(ASP2215), 글레사티닙(glesatinib)(MGCD 265), SGI-7079, 라로트렉티닙(Larotrectinib), RXDX-102, 알티라티닙(altiratinib), LOXO-195, 시트라바티닙(sitravatinib), TPX-0005, DS-6051b, 포스타마티닙(fostamatinib), 엔토스플레티닙(entospletinib) 및 TAK-659로 이루어지는 군으로부터 선택될 수 있다.
특정 양태에서, 티로신 키나제 억제제는 EGFR, ALK 및 B-Raf로 이루어진 군으로부터 선택된 단백질 키나제의 억제제, 특히 게피티닙, 에를로티닙, 라파티닙, 반데타닙, 아파티닙, 오시머티닙, 네라티닙, 다코미티닙, 브리가티닙, 카너티닙, 나쿠오티닙, 나자르티닙, 펠리티닙, 로실레티닙, 이코티닙, AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙, WZ4002, 크리조티닙, 엔트렉티닙, 세리티닙, 알렉티닙, 롤라티닙, TSR-011, CEP-37440, 엔사르티닙, 베무라페닙, 다브라페닙, 레고라페닙 및 PLX4720로 이루어지는 군으로부터 선택된 단백질 키나제 억제제이다.
매우 특정한 양태에서, 상기 단백질 키나제 억제제는 EGFR 억제제, 특히 게피티닙, 에를로티닙, 라파티닙, 반데타닙, 아파티닙, 오시머티닙, 네라티닙, 다코미티닙, 브리가티닙, 카너티닙, 나쿠오티닙, 나자르티닙, 펠리티닙, 로실레티닙, 이코티닙, AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙 및 WZ4002로 이루어진 군으로부터 선택된 EGFR 억제제이다.
다른 매우 특정한 양태에서, 상기 단백질 키나제 억제제는 ALK 억제제, 특히 크리조티닙, 엔트렉티닙, 세리티닙, 알렉티닙, 브리가티닙, 롤라티닙, TSR-011, CEP-37440 및 엔사르티닙으로 이루어진 군으로부터 선택된 ALK 억제제이다. 일 양태에서, 상기 Dbait 분자는 적어도 하나의 자유 말단과, 인간 게놈 내의 임의의 유전자와 60% 미만의 서열 동일성을 갖는 20~200 bp의 DNA 이중 가닥 부분을 갖는다. 더욱 특히, 상기 Dbait 분자는 이하의 화학식들 중 하나를 갖는다:
Figure pct00001
.
상기 화학식들에서, N은 데옥시뉴클레오티드이고, n은 15 내지 195의 정수이고, 밑줄 친 N은 변형된 포스포디에스테르 골격을 갖거나 갖지 않는 뉴클레오티드를 지칭하고, L'은 링커이고, C는 친유성 분자, 또는 수용체 매개 엔도시토시스(receptor-mediated endocytosis)를 가능하게 하는 세포 수용체를 표적으로 하는 리간드로부터 선택된 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자이고, L은 링커이고, m 및 p는 독립적으로 0 또는 1의 정수이다.
바람직하게는, 상기 Dbait 분자는 이하의 화학식을 갖는다:
Figure pct00002
.
여기에서, N, N, n, L, L', C 및 m에 대해서는 화학식 (I), (II) 및 (III)과 동일한 정의를 갖는다.
매우 특정 양태에서, 상기 Dbait 분자는 이하의 화학식을 갖는다:
Figure pct00003
.
본 발명은 추가로 암의 치료에 사용하기 위한, 본 개시 내용에 따른 약학적 조성물, 조합물 또는 키트에 관한 것이다. 이는 또한 특히 본원에서 정의된 키나제 억제제와 조합된, 암의 치료에 사용하기 위한 본원에서 정의된 Dbait 분자에 관한 것이다. 또한, 이는 환자에서 키나제 억제제, 특히 본원에서 정의된 키나제 억제제에 내성을 갖는 암의 발달을 지연시키고/거나 예방하는데 사용하기 위한, 본원에서 정의된 Dbait 분자에 관한 것이다.
일 양태에서, 암은 백혈병, 림프종, 육종, 흑색종, 및 두경부암, 신장암, 난소암, 췌장암, 전립선암, 갑상선암, 폐암, 식도암, 유방암, 방광암, 뇌암, 결장직장암, 간암 및 자궁경부암으로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
특정 양태에서, 암은 폐암, 특히 비-소세포 폐암, 백혈병, 특히 급성 골수성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 림프종, 특히 말초 T-세포 림프종, 만성 골수기원(myelogenous) 백혈병, 두경부의 편평 세포 암종, BRAF 돌연변이를 갖는 진행된 흑색종, 직장결장암, 위장관 기질 종양, 유방암, 특히 HER2+ 유방암, 갑상선암, 특히 진행성 수질 갑상선암, 신장암, 특히 신세포 암종, 전립선암, 신경교종, 췌장암, 특히 췌장 신경내분비 암, 다발성 골수종, 및 간암, 특히 간세포성 암종으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 최종적으로, 본 발명은 암의 치료에서 암 지속성 세포(Cancer persister cells), 특히 본원에서 정의된 키나제 억제제에 대해 암 지속성 세포에 대해 표적화된 효과를 위해 사용하는, 본원에서 정의된 Dbait에 관한 것이다.
도 1a: AsiDNA는 단독으로 (EGFR)-중독 비-소세포 폐암(NSCLC) 세포주 PC9 및 HCC827의 세포 사멸을 유발하지 않았다.
도 1b: AsiDNA는 유도된 (EGFR)-중독 비-소세포 폐암(NSCLC) 세포주 PC9 및 HCC827의 세포 사멸에 대한 에를로티닙의 효능을 강화시키지 않았다.
도 1c: AsiDNA는 에를로티닙-내성 클론의 출현을 예방한다.
도 2: (EGFR)-중독 비-소세포 폐암(NSCLC) 모체 PC9와 서브클론 HCC827 sc2 및 NSCLC PC9-3에서의 에를로티닙 획득 내성에 대한 AsiDNA 치료의 장기적 효능. AsiDNA 치료는 단독으로 NSCLC 세포 생존에 영향을 미치지 않았다(도 2a-2c- 2e). AsiDNA는 2개의 서브클론 NSCLC HCC827 sc2에 대해서는 40일 동안(도 2b), 그리고 NSCLC PC9-3에 대해서는 70일 동안(도 2d) 에를로티닙 획득 내성을 완전히 없앤 반면, 이는 NSCLC PC9 모 세포주에 대한 내성은 부분적으로 그러나 유의하게 감소시켰다(도 2f).
도 3: (EGFR)-중독 비-소세포 폐암(NSCLC) PC9-3에서의 오시머티닙 획득 내성에 대한 AsiDNA 치료의 장기적 효능. AsiDNA 치료는 단독으로 세포 생존에 영향을 주지 않았다(도 3a). AsiDNA는 NSCLC PC9 모 세포주에 대한 오시머티닙 내성을 유의하게 감소시켰다(도 3b).
도 4: (EGFR)-중독 비-소세포 폐암(NSCLC) H3122에서 알렉티닙 획득 내성에 대한 AsiDNA 치료의 장기적 효능. AsiDNA 치료는 단독으로 세포 생존에 영향을 주지 않았다(도 4a). AsiDNA는 NSCLC H3122 세포에 대한 알렉티닙 획득 내성을 40 일간 완전히 없앴다(도 4b).
도 5: AsiDNA와 에를로티닙의 조합물은 생체 내에서 종양 성장을 유의하게 감소시켰다. 에를로티닙 치료는 단독으로 종양 성장을 일시적으로 조절하고(도 5b), AsiDNA 치료는 단독으로, 치료가 안된 경우(도 5a)에 비해 종양 성장을 약간 없앤다(도 5c). AsiDNA와 에를로티닙의 조합물은 종양 성장을 유의하게 감소시키고, 2회의 완전 관해를 유도한다(도 5d).
본 발명의 상세한 설명
본 발명은 지속성 암 세포, 특히 키나제 억제제에 내성을 갖는 암세포의 출현을 강하게 감소시키는 Dbait 분자의 능력에 관한 것이다.
따라서, 본 발명은 Dbait 분자, 및 특히 암의 치료에 사용하기 위한 키나제 억제제를 포함하는 약학적 조성물, 조합물 또는 키트(키트의 구성품)에 관한 것이다. 더욱 구체적으로, 상기 약학적 조성물, 상기 조합물 또는 상기 키트는 Dbait 분자, 및 동일 또는 상이한 키나제를 표적화하는 하나 또는 수 개의 단백질 키나제 억제제를 포함한다.
본 발명은 또한 Dbait 분자와 암의 치료에 사용하기 위한 키나제 억제제를 포함하는 약학적 조성물; 동시에, 개별적으로 또는 순차적으로 사용하기 위한, 특히 암의 치료 용도의 조합된 제제로서 Dbait 분자와 키나제 억제제를 포함하는 조합물 또는 키트(키트의 구성품)에 관한 것이다. 이는 추가로 암의 치료가 필요한 대상체에서 암을 치료하기 위한 방법에 관한 것으로, 치료 유효량의 Dbait 분자와 치료 유효량의 키나제 억제제, 및 선택적으로 약학적으로 허용 가능한 담체를 투여하는 단계를 포함한다. 이는 암 치료용 약물의 제조를 위한, Dbait 분자 및 키나제 억제제의 용도에 관한 것이다.
본 발명은 키나제 억제제와 조합하여 암의 치료에 사용하기 위한 Dbait 분자 또는 Dbait 분자를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 더욱 구체적으로, 이는 환자에서 키나제 억제제에 내성을 갖는 암의 발달을 지연시키고/거나 예방하는데 사용하기 위한, Dbait 분자 또는 Dbait 분자를 포함하는 약학적 조성물에 관한 것이다. 이는 환자의 암 치료에서 키나제 억제제에 대한 반응의 지속 시간을 연장시키는데 사용하기 위한 Dbait 분자에 관한 것이다. 이는 또한 환자에서 키나제 억제제에 내성을 갖는 암의 발달을 지연시키고/거나 예방하고/거나, 환자의 암 치료에서 키나제 억제제에 대한 반응의 지속 시간을 연장시키는 방법에 관한 것으로, 치료 유효량의 Dbait 분자와 치료 유효량의 키나제 억제제, 및 선택적으로 약학적으로 허용 가능한 담체를 투여하는 단계를 포함한다. 이는 환자에서 키나제 억제제에 내성을 갖는 암의 발달을 지연하고/거나 예방하고/거나, 환자의 암 치료에서 키나제 억제제에 대한 반응의 지속 시간을 연장하기 위한, 키나제 억제제와 조합한 암 치료용 약물의 제조를 위한 Dbait 분자의 용도에 관한 것이다.
최종적으로, 더욱 일반적으로, 본 발명은 지속성 암 세포의 증식 또는 지속성 암 세포의 콜로니의 형성을 억제하거나 예방함으로써, 암 재발 및/및 암 치료에 대한 획득 내성의 출현을 예방하거나 지연시키는데 사용하기 위한 Dbait 분자에 관한 것이다. 추가로, 지속성 암 세포에 대한 이러한 효과는 암 치료에 대한 완전 반응에 도달할 수 있게 한다. 확실히, Dbait 분자는 지속성 암 세포를 제거할 수 있을 것이다. 이는 지속성 암 세포 집단을 제거하거나 감소시키고/거나, 암 재발 및/및 암 치료에 대한 획득 내성의 출현을 예방하거나 지연시키기 위한 방법에 관한 것으로, 치료 유효량의 Dbait 분자를 투여함으로써, 지속성 암 세포 집단을 제거하거나 감소시키는 단계를 포함한다. Dbait 치료는 생존가능한 "지속 생존" 종양 세포를 표적화하는데 유리할 것이고, 따라서 특히 키나제 억제제와의 조합 치료의 맥락에서 약물-내성 클론(들)의 출현을 예방할 수 있다.
정의
본원에서 사용된 "키트", "제품", "조합물" 또는 "조합된 제제(combined preperation)"라는 용어들은, 상기에서 정의된 조합된 파트너들이 독립적으로 투여되거나, 구분된 양의 조합 파트너들과의 상이한 고정 조합물의 사용에 의해, 즉 동시에 또는 상이한 시점에 투여될 수 있다는 의미로 특히 "키트의 구성품(kit-of-parts)"을 한정한다. 이후, 상기 키트의 구성품의 일부는 예를 들어, 동시에 또는 연대순으로 시차를 두고, 즉 상이한 시점에, 그리고 키트의 구성품의 임의의 일부에 대해서는 동일 또는 상이한 시간 간격으로 투여될 수 있다. 조합된 제제 내의 투여될 조합 파트너들의 총량의 비는 변화될 수 있다. 조합 파트너는 동일한 경로 또는 상이한 경로에 의해 투여될 수 있다.
본 발명의 문맥 내에서, "치료"라는 용어는 치유적 치료, 증상 치료, 예방적 치료, 뿐만 아니라 유지 치료를 나타낸다. 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 제품 및 조합된 제제는 암 진행의 초기 또는 후기를 포함하는 기존의 암 또는 종양이 있는 인간에게 사용될 수 있다. 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 및 조합된 제제가, 암이 있는 환자를 반드시 치유하는 것은 아니지만, 질병의 진행을 지연시키거나, 늦추거나, 질병의 추가 진행을 예방할 것이고, 이로 인해 환자의 병태를 개선시킨다. 특히, 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 및 조합된 제제는 포유류 숙주에서 종양의 발달을 감소시키고, 종양 부담을 낮추고, 종양 관해를 생성하고/거나, 전이 발생 및 암의 재발을 예방한다. 본 발명에 의한 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 및 조합된 제제는 지속성 종양 세포 및/또는 약물-내성 확장 지속 생존체를 예방하거나, 이들의 출현 또는 발달을 지연시키거나, 이들을 감소시키거나, 제거하는 데 유리하다.
"치료 유효량"은 단독으로 또는 상기 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제의 다른 활성 성분과 조합하여, 인간을 포함하는 포유류에서 암의 유해성을 예방, 제거하거나 감소시키는 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제의 관심 대상 화합물의 양을 의미한다. 조성물 내의 각 화합물에 대하여 투여된 용량은, 단독으로 또는 본원에 기재된 조합이 아닌 다른 치료와 조합하여 사용된 각 화합물에 대해 정의된 "치료 유효량"보다 더 낮을 수 있다고 이해된다(It is understood that the administered dose may be lower for each compound in the composition to the "therapeutically effective amount" define for each compound used alone or in combination with other treatments than the combination described here). 상기 조성물의 "치료 유효량"은, 환자, 병리 현상, 투여 모드 등에 따라 당업계의 숙련자들이 조정할 수 있을 것이다.
본 명세서 전체에서, "암의 치료" 또는 "암을 치료하는" 등의 용어는, 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제와 관련하여 언급되어 있는데, a) 암을 치료하는 방법으로써, 이러한 치료가 필요한 환자에게 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제를 투여하는 단계를 포함하는 방법; b) 암의 치료를 위한 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제의 용도; c) 암 치료용 약제의 제조를 위한 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제의 용도; 및/또는 d) 암의 치료에 사용하기 위한 본 발명의 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제를 의미한다.
본원에서 고려된 약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제는, 활성 성분(들) 외에 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함할 수 있다. "약학적으로 허용 가능한 담체"라는 용어는, 활성 성분(들)의 생물학적 활성의 유효성을 방해하지 않고, 이들이 투여된 숙주에 독성이 없는 임의의 담체(예를 들어, 지지체, 물질, 용매 등)를 포괄하는 의미이다. 예를 들어, 경구 투여를 위해, 활성 화합물(들)은 비히클, 예컨대 식염수, 덱스트로스 용액, 혈청 알부민 및 링거 용액 내의 주사용 단위 투여 형태로 제형화될 수 있다.
약학적 조성물, 키트, 조합물, 제품 또는 조합된 제제는, 약학적으로 양립 가능한 용매 중의 용액으로서, 또는 적합한 약학적 용매 또는 비히클 중의 에멀전, 현탁액 또는 분산액으로서, 또는 고체 비히클을 당업계에 알려진 방식으로 함유하는 알약, 정제 또는 캡슐로서 제형화될 수 있다. 경구 투여에 적합한 본 발명의 제제는 캡슐, 샤세, 정제 또는 로젠지로서의 개별 단위의 형태로서, 각각이 소정량의 활성 성분(들)를 함유하는 형태; 분말 또는 과립의 형태; 수성 액체 또는 비-수성 액체 중의 용액 또는 현탁액의 형태; 또는 수-중-유 에멀전 또는 유-중-수 에멀전의 형태이다. 경구 투여에 적합한 제제는 바람직하게는 수여체의 혈액과 등장성인 활성 성분의, 멸균된 유성 또는 수성 제제를 포함하는 것이 편리하다. 이러한 모든 제제는 또한 다른 약학적으로 양립 가능하고 무독성인 보조제, 예컨대, 예를 들어 안정화제, 항산화제, 결합제, 염료, 유화제 또는 향미 물질을 함유할 수 있다. 본 발명의 제제는 따라서 약학적으로 허용 가능한 담체, 및 선택적으로 다른 치료 성분들과 회합된 활성 성분을 포함한다. 담체는 제제의 다른 성분과 양립 가능하고, 이들의 수여체에 해롭지 않다는 의미에서 "허용 가능"해야 한다. 상기 약학적 조성물, 상기 키트, 상기 조합물, 상기 제품 또는 상기 조합된 제제는, 적합한 멸균 용액의 주사 또는 정맥내 주입에 의해, 또는 소화관에 의한 경구 투여로서 적용되는 것이 유리하다. 이 치료제들 대부분의 안전하고 효과적인 투여를 위한 방법들은, 당업계의 숙련자들에게 알려져 있다. 추가로, 이들의 투여는 표준 문헌에도 기재되어 있다.
"지속성 세포", "지속성 암세포", "약물 내성 지속생존체" 또는 "DTP"는, 항암 표적화 처치 치료, 특히 키나제 억제제에 의한 치료 하에서도 생존능을 유지하는 암세포의 소규모 하위 집단을 지칭하는 것으로 의도된다. 더욱 특히, 이는 키나제 억제제가 IC50보다 100배 더 높은 농도로 사용될 때, 고농도의 키나제 억제제의 치료에 대한 내성을 갖는 암세포를 말한다. 이들 세포는 천천히 성장하고, 거의 휴지 상태이다(quiescent).
본원에서 사용된 "약물-내성 확장 지속생존체(drug-tolerent expanded persister)" 또는 "DTEP"라는 용어는, 고농도의 연속적인 암 약물 치료, 특히 키나제 억제제에 의한 치료에서 증식할 수 있는 암세포를 말한다.
Dbait 분자
또한 신호 교란 DNA(siDNA)라고도 알려진 본원에서 사용된 "Dbait 분자"라는 용어는, DNA 수선을 상쇄시키도록 고안된 핵산 분자, 바람직하게는 헤어핀 핵산 분자를 말한다. Dbait 분자는 적어도 하나의 자유 말단과, 인간 게놈 내의 임의의 유전자와 60% 미만의 서열 동일성을 갖는 20~200 bp의 DNA 이중 가닥 부분을 갖는다.
바람직하게는, 본 발명에서 사용하기 위한 Dbait 분자는, 접합되거나 접합되지 않는데, 이하의 화학식에 의해 기재할 수 있다:
Figure pct00004
.
상기 화학식들에서, N은 데옥시뉴클레오티드이고, n은 15 내지 195의 정수이고, 밑줄 친 N은 변형된 포스포디에스테르 골격을 갖거나 갖지 않는 뉴클레오티드를 지칭하고, L'은 링커이고, C는 바람직하게는 친유성 분자, 및 수용체 매개 엔도시토시스를 가능하게 하는 세포 수용체를 표적화하는 리간드로부터 선택된 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자이고, L은 링커이고, m 및 p는 독립적으로 0 또는 1의 정수이다.
바람직한 실시 형태에서, 화학식 (I), (II), 또는 (III)의 Dbait 분자는 이하의 특징들 중 하나 또는 수 개를 갖는다:
- N은 바람직하게는 A(아데닌), C(시토신), T(티민) 및 G(구아닌)으로 이루어진 군으로부터 선택되되, CpG 디뉴클레오티드의 발생을 피하고, 인간 게놈 내의 임의의 유전자와 80% 또는 70% 미만, 심지어 60% 또는 50% 미만의 서열 동일성을 갖도록 선택된 데옥시뉴클레오티드이고/거나,
- n은 15 내지 195, 19 내지 95, 21 내지 95, 27 내지 95, 15 내지 45, 19 내지 45, 21 내지 45, 또는 27 내지 45의 정수이고; 바람직하게는 n은 27이고/거나;
- 밑줄친 N은 포스포로티오에이트 또는 메틸포스포네이트 골격, 더욱 바람직하게는 포스포로티오에이트 골격을 갖거나 갖지 않는 뉴클레오티드를 지칭하고; 바람직하게는, 밑줄 친 N은 변형된 포스포디에스테르 골격을 갖는 뉴클레오티드를 지칭하고/거나;
- 링커 L'은 헥사에틸렌글리콜, 테트라데옥시티미딜레이트(T4), 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸; 및 2,19-비스(포스포르)-8-히드라자-1-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸으로 이루어진 군으로부터 선택되고/거나;
- m은 1이고, L은 카르복사미도 폴리에틸렌 글리콜, 더욱 바람직하게는 카르복사미도 트리에틸렌 또는 테트라에틸렌 글리콜이고/거나;
- C는 콜레스테롤, 단일 또는 이중 사슬 지방산, 예컨대 옥타데실, 올레산, 디올레오일 또는 스테아르산, 또는 세포 수용체를 표적화하는 리간드(펩티드, 단백질, 압타머 포함), 예컨대 엽산, 토코페롤, 당, 예컨대 갈락토스 및 만노스 및 이들의 올리고당, 펩티드, 예컨대 RGD 및 봄베신(bombesin), 및 단백질, 예컨대 트랜스페린(transferring) 및 인테그린(integrin)으로 이루어진 군으로부터 선택되고, 바람직하게는 콜레스테롤 또는 토코페롤, 더욱 더 바람직하게는 콜레스테롤이다.
바람직하게는, C-Lm은 트리에틸렌글리콜 링커(10-O-[1-프로필-3-N-카바모일콜레스테릴]-트리에틸렌글리콜 라디칼이다. 대안적으로, C-Lm은 테트라에틸렌글리콜 링커(10-O-[1-프로필-3-N-카바모일콜레스테릴]-테트라에틸렌글리콜 라디칼이다.
바람직한 실시 형태에서, Dbait 분자는 이하의 화학식을 갖고:
Figure pct00005
N, N, n, L, L', C 및 m에 대해서는 화학식 (I), (II) 및 (III)와 동일한 정의를 갖는다.
특정 실시 형태에서, Dbait 분자는 PCT 특허 출원 WO2005/040378, WO2008/034866, WO2008/084087 및 WO2011/161075에 널리 기재된 것들인데, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다.
Dbait 분자는 이들의 치료 활성에 필요한 다수의 특징, 예컨대 이들의 최소 길이, 적어도 하나의 자유 말단의 존재, 및 이중 가닥 부분, 바람직하게는 DNA 이중 가닥 부분의 존재에 의해 정의될 수 있다. 이하에서 논의되는 바와 같이, Dbait 분자의 정확한 뉴클레오티드 서열이 이들의 활성에 대해 영향을 주지 않는다는 사실에 주의해야 한다. 나아가, Dbait 분자는 변형되고/거나 비-천연 골격을 함유할 수 있다.
바람직하게는, Dbait 분자는 비-인간 기원(즉, 이들의 뉴클레오티드 서열 및/또는 배열(예를 들어, 헤어핀)은 인간 세포에서 그대로 존재하지 않음), 가장 바람직하게는 합성 기원이다. Dbait 분자의 서열은 있다 해도 거의 역할을 하지 못하므로, Dbait 분자는 바람직하게는 알려진 유전자, 프로모터, 인핸서, 5'- 또는 3'-상류 서열, 엑손, 인트론 등에 대해 유의한 정도의 서열 상동성 또는 동일성을 갖지 않는다. 달리 말해, Dbait 분자는 인간 게놈 내의 임의의 유전자에 대해 80% 또는 70% 미만, 심지어 60% 또는 50% 미만의 서열 동일성을 갖는다. 서열 동일성을 결정하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있는데, 예를 들어, Blast를 포함한다. Dbait 분자는 엄격한 조건 하에서는 인간 게놈 DNA과 혼성화하지 않는다. 전형적인 엄격한 조건은, 부분적으로 상보적인 핵산과 완전 상보적인 핵산을 구분할 수 있다.
추가로, Dbait 분자의 서열은, 바람직하게는 잘-알려진 toll-유사 수용체-매개 면역 반응을 회피하기 위해, CpG가 없다.
Dbait 분자의 길이는, Ku 및 DNA-PKcs 단백질을 포함하는 Ku 단백질 복합체의 적합한 결합을 허용하는 한, 가변적일 수 있다. Dbait 분자의 길이는 이러한 Ku 복합체에 대한 결합과 DNA-PKcs 활성화를 보장하기 위해서는 20 bp 초과, 바람직하게는 약 32 bp 초과여야 한다는 것이 밝혀졌다. 바람직하게는, Dbait 분자는 20~200 bp, 더욱 바람직하게는 24~100 bp, 더욱 더 바람직하게는 26~100 bp, 가장 바람직하게는 24~200 bp, 25~200 bp, 26~200 bp, 27~200 bp, 28~200 bp, 30~200 bp, 32~200 bp, 24~100 bp, 25~100 bp, 26~100 bp, 27~100 bp, 28~100 bp, 30~100 bp, 32~200 bp 또는 32~100 bp를 포함한다. 예를 들어, Dbait 분자는 24~160 bp, 26~150 bp, 28~140 bp, 28~200 bp, 30~120 bp, 32~200 bp 또는 32~100 bp를 포함한다. "bp"는 분자가 지정된 길이의 이중 가닥 부분을 포함하는 것으로 의도된다.
특정 실시 형태에서, 적어도 32 pb, 또는 약 32 bp의 이중 가닥 부분을 갖는 Dbait 분자는, Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)와 동일한 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 선택적으로, Dbait 분자는 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)와 동일한 뉴클레오티드 조성을 갖지만, 이들의 뉴클레오티드 서열은 상이하다. 이후, Dbait 분자는 3개의 A, 6개의 C, 12개의 G 및 11개의 T를 갖는 이중 가닥 부분 중 한 가닥을 포함한다. 바람직하게는, Dbait 분자의 서열은 어떠한 CpG 디뉴클레오티드도 함유하지 않는다.
대안적으로, 이중 가닥 부분은 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)의 적어도 16개, 18개, 20개, 22개, 24개, 26개, 28개, 30개 또는 32개의 연속 뉴클레오티드를 포함한다. 더욱 특별한 실시 형태에서, 이중 가닥 부분은 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)의 20개, 22개, 24개, 26개, 28개, 30개 또는 32개의 연속 뉴클레오티드로 이루어진다.
본원에 개시된 Dbait 분자는, 이중 가닥 절단부(DSB)의 모방체로서의 적어도 하나의 자유 말단을 가져야 한다. 상기 자유 말단은 자유 무딘 말단(free blunt end) 또는 5'-/3'- 돌출 말단 중 하나일 수 있다. 본원에서 "자유 말단"은, 5' 말단과 3' 말단 둘 다를 갖거나, 3' 말단 또는 5' 말단 중 하나를 갖는 핵산 분자, 특히 이중-가닥 핵산 부분을 말한다. 선택적으로, 5' 말단과 3' 말단 중 하나는 핵산 분자를 접합시키는데 사용될 수 있거나, 차단기(blocking group), 또는 예를 들어 3'-3'뉴클레오티드 연결기에 연결될 수 있다.
특정 실시 형태에서, 이들은 단 하나의 자유 말단만을 함유한다. 바람직하게는, Dbait 분자는 이중-가닥 DNA 스템 및 루프를 갖는 헤어핀 핵산으로 구성된다. 상기 루프는 핵산, 또는 숙련자에게 알려진 다른 화학적 기 또는 이들의 혼합물일 수 있다. 뉴클레오티드 링커는 2 내지 10개의 뉴클레오티드, 바람직하게는, 3개, 4개 또는 5개의 뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 비-뉴클레오티드 링커는 비염기성(abasic) 뉴클레오티드, 폴리에테르, 폴리아민, 폴리아미드, 펩티드, 탄수화물, 지질, 다중 탄화수소, 또는 다른 중합성 화합물(예를 들어, 올리고에틸렌 글리콜, 예컨대 2 내지 10개의 에틸렌 글리콜 단위, 바람직하게는 3개, 4개, 5개, 6개, 7개 또는 8개의 에틸렌 글리콜 단위를 갖는 것들)을 포함하나, 이들이 다는 아니다. 바람직한 링커는 헥사에틸렌글리콜, 테트라데옥시티미딜레이트(T4), 및 다른 링커, 예컨대 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸 및 2,19-비스(포스포르)-8-히드라자-1-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 따라서, 특정 실시 형태에서, Dbait 분자는 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)의 적어도 16개, 18개, 20개, 22개, 24개, 26개, 28개, 30개 또는 32개의 연속 뉴클레오티드를 포함하는 이중 가닥 부분 또는 스템과, 헥사에틸렌글리콜 링커, 테트라데옥시티미딜레이트 링커(T4) 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸 또는 2,19-비스(포스포르)-8-히드라자-1-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸인 루프를 포함하는 헤어핀 분자일 수 있다. 더욱 특정한 실시 형태에서는, 이들 Dbait 분자는 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)의 20개, 22개, 24개, 26개, 28개, 30개 또는 32개의 연속 뉴클레오티드로 이루어지는 이중 가닥 부분을 가질 수 있다.
Dbait 분자는 바람직하게는 2'-데옥시뉴클레오티드 골격을 포함하고, 선택적으로 하나 또는 수 개(2개, 3개, 4개, 5개 또는 6개)의 변형된 뉴클레오티드 및/또는 아데닌, 시토신, 구아닌 및 티민이 아닌 핵염기를 포함한다. 따라서, Dbait 분자는 본질적으로 DNA 구조이다. 특히, Dbait 분자의 이중-가닥 부분 또는 스템은 데옥시리보뉴클레오티드로 구성된다.
바람직한 Dbait 분자는 특히 분해로부터 이들을 보호하기 위해, 각 가닥 중 하나 또는 각 가닥의 말단에 하나 또는 수 개의 화학적으로 변형된 뉴클레오티드(들) 또는 기(들)를 포함한다. 특히 바람직한 실시 형태에서, Dbait 분자의 자유 말단(들)은 각 가닥 또는 각 가닥 중 하나의 말단에 있는 1개, 2개 또는 3개의 변형된 포스포디에스테르 골격에 의해 보호된다. 바람직한 화학적 기, 특히 변형된 포스포디에스테르 골격은, 포스포로티오에이트를 포함한다. 대안적으로, 바람직한 Dbait는 3'-3' 뉴클레오티드 연결기, 또는 메틸포스포네이트 골격을 갖는 뉴클레오티드를 갖는다. 다른 변형된 골격은 당업계에 잘 알려져 있는데, 포스포라미데이트, 모르폴리노 핵산, 2'-0,4'-C 메틸렌/에틸렌 다리연결 고정 핵산(bridged locked nucleic acid), 펩티드 핵산(PNA), 및 단쇄 알킬, 또는 가변 길이의 시클로알킬 당간 연결기 또는 단쇄 헤테로원자 또는 헤테로사이클릭 당내 연결기, 또는 숙련자에게 알려진 임의의 변형된 뉴클레오티드를 포함한다. 제1 바람직한 실시 형태에서, Dbait 분자는 각 가닥 또는 각 가닥 중 하나의 말단에 있는 1개, 2개 또는 3개의 변형된 포스포디에스테르 골격에 의해, 더욱 바람직하게는 적어도 3' 말단에 있는, 더욱 더 바람직하게는 5' 말단과 3' 말단 모두에 있는 3개의 변형된 포스포디에스테르 골격(특히, 포스포로티오에이트 또는 메틸포스포네이트)에 의해 보호된 자유 말단(들)을 갖는다.
가장 바람직한 실시 형태에서, Dbait 분자는(예를 들어, 서열 번호 1~5로 이루어진 군으로부터 선택된 서열, 특히 서열 번호 4를 갖는) 32 bp의 DNA 이중-가닥 부분 또는 스템과, 헥사에틸렌글리콜, 테트라데옥시티미딜레이트(T4) 및 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸 및 2,19-비스(포스포르)-8-히드라자-1-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸으로 이루어진 군으로부터 선택된 링커를 포함하거나 이로서 이루어지는 2가닥의 DNA 이중-가닥 부분 또는 스템을 연결하는 루프를 포함하는 헤어핀 핵산 분자인데, 상기 DNA 이중-가닥 부분 또는 스템의 자유 말단(즉, 루프 반대 편)은 3개의 변형된 포스포디에스테르 골격(특히 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결)을 갖는다.
상기 핵산 분자는 화학적 합성, 반-생합성 또는 생합성, 임의의 증폭 방법 이후, 임의의 추출 및 제조 방법과 임의의 화학 변형에 의해 제조된다. 링커는 표준 핵산 화학적 합성에 의해 혼입화될 수 있도록 제공된다. 더욱 바람직하게는, 핵산 분자는 특별히 고안된 수렴성(convergent) 합성에 의해 제조되는데: 2개의 상보성 가닥들은 적합한 링커 전구체가 혼입되는 표준 핵산 화학적 합성에 의해 제조되고, 이들의 정제 후, 이들은 함께 공유적으로 커플링된다.
선택적으로, 핵산 분자는 엔도시토시스 또는 세포 흡수를 용이하게 하는 분자에 접합될 수 있다.
특히, 엔도시토시스 또는 세포 흡수를 용이하게 하는 분자는, 친유성 분자, 예컨대 콜레스테롤, 단일 또는 이중 사슬 지방산, 또는 수용체 매개 엔도시토시스를 가능하게 하는 세포 수용체를 표적화하는 리간드, 예컨대 엽산 및 폴레이트 유도체 또는 트랜스페린일 수 있다(문헌[Goldstein et al. Ann. Rev. Cell Biol. 1985 1:1-39]; 문헌[Leamon & Lowe, Proc Natl Acad Sci USA. 1991, 88: 5572-5576.]). 상기 분자는 또한 토코페롤, 당 예컨대 갈락토스 및 만노스 및 이들의 올리고당, 펩티드, 예컨대 RGD 및 봄베신 및 단백질, 예컨대 인테그린일 수 있다. 지방산은 포화 또는 비포화될 수 있고, C4-C28, 바람직하게는 C14-C22, 더욱 더 바람직하게는 C18의 것일 수 있는데, 예컨대 올레산 또는 스테아르산일 수 있다. 특히, 지방산은 옥타데실 또는 디올레오일일 수 있다. 지방산은 글리세롤, 포스파티딜콜린 또는 에탄올아민 등과 같은 적합한 링커에 의해 연결되거나, 또는 Dbait 분자에 부착시키는데 사용된 링커에 의해 함께 연결된 이중 사슬 형태로서 발견될 수 있다. 본원에서 사용된 "폴레이트(folate)"라는 용어는, 폴레이트 및 폴레이트 유도체를 지칭하도록 의도되며, 프테로산 유도체 및 유사체를 포함한다. 본 발명의 사용에 적합한 엽산의 유사체 및 유도체는, 안티폴레이트, 디히드로폴레이트, 테트라히드로폴레이트, 폴린산, 프테로폴리글루탐산, 1-데자(deza), 3-데아자(deaza), 5-데아자, 8-데아자, 10-데아자, 1,5-데아자, 5,10 디데아자, 8,10-디데아자, 및 5,8-디데아자 폴레이트, 안티폴레이트, 및 프테로산 유도체를 포함하나, 이에 제한되지 않는다. 추가적인 폴레이트 유사체는 US2004/242582에 기재되어 있다. 따라서, 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자는, 단일 또는 이중 사슬 지방산, 폴레이트 및 콜레스테롤로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다. 더욱 바람직하게는, 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자는, 디올레오일, 옥타데실, 엽산 및 콜레스테롤로 이루어진 군으로부터 선택된다. 가장 바람직한 실시 형태에서, 상기 핵산 분자는 콜레스테롤에 접합된다.
엔도시토시스를 용이하게 하는 Dbait 분자는, 바람직하게는 링커를 통해 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자에 접합될 수 있다. 당업계에 알려진 임의의 링커는, 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자를 Dbait 분자에 부착시키는데 사용될 수 있다. 예를 들어, WO09/126933은 페이지 38~45에서 편리한 링커에 대한 방대한 리뷰를 제공한다. 링커는 지방족 사슬, 폴리에테르, 폴리아민, 폴리아미드, 펩티드, 탄수화물, 지질, 다중 탄화수소, 또는 다른 중합성 화합물(예를 들어, 올리고에틸렌 글리콜, 예컨대 2개 내지 10개의 에틸렌 글리콜 단위, 바람직하게는 3개, 4개, 5개, 6개, 7개 또는 8개의 에틸렌 글리콜 단위, 더욱 더 바람직하게는 3개의 에틸렌 글리콜 단위를 갖는 것들)일 수 있으나, 이들이 다는 아니고, 뿐만 아니라, 화학적 또는 효소적 방식에 의해, 예컨대 디설파이드 연결기, 보호된 디설파이드 연결기, 산 취약성 연결기(예를 들어, 히드라존 연결기), 에스테르 연결기, 오르토 에스테르 연결기, 폴리포스폰아미드 연결기, 생체절단성 펩티드 연결기, 아조 연결기 또는 알데히드 연결기에 의해 파괴될 수 있는 임의의 결합을 포함시킬 수 있다. 이러한 절단성 링커는 WO2007/040469의 페이지 12~14, WO2008/022309의 페이지 22~28에 상술되어 있다.
특정 실시 형태에서, 핵산 분자는 엔도시토시스를 용이하게 하는 하나의 분자에 연결될 수 있다. 대안적으로, 엔도시토시스를 용이하게 하는 수 개(예를 들어, 2개, 3개 또는 4개)의 분자가 하나의 핵산 분자에 연결될 수도 있다.
특정 실시 형태에서, 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자, 특히 콜레스테롤과 핵산 분자 사이의 링커는 CO-NH-(CH2-CH2-O)n인데, 상기 화학식에서 n은 1 내지 10의 정수이고, 바람직하게는 n은 3, 4, 5 및 6으로 이루어지는 군으로부터 선택된다. 매우 특별한 실시 형태에서, 링커는 CO-NH-(CH2-CH2-O)4(카르복사미도 테트라에틸렌 글리콜) 또는 CO-NH-(CH2-CH2-O)3(카르복사미도 트리에틸렌 글리콜)이다. 링커는 핵산 분자의 활성을 변형시키지 않는 임의의 편리한 위치에서 핵산 분자에 연결될수 있다. 특히, 링커는 5' 말단에 연결될 수 있다. 따라서, 바람직한 실시 형태에서, 고려된 접합된 Dbait 분자는 헤어핀 구조를 갖고, 바람직하게는 링커를 통해 이의 5' 말단에서 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자에 접합된 Dbait 분자이다.
다른 특정 실시 형태에서, 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자, 특히 콜레스테롤과 핵산 분자 간의 링커는 디알킬-디설파이드{예를 들어, (CH2)r-S-S-(CH2)s, 여기에서 r 및 s는 1 내지 10, 바람직하게는 3 내지 8, 예를 들어 6의 정수임}이다.
가장 바람직한 실시 형태에서, 접합된 Dbait 분자는 32 bp의 DNA 이중-가닥 부분 또는 스템과, 헥사에틸렌글리콜, 테트라데옥시티미딜레이트(T4), 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸 및 2,19-비스(포스포르)-8-히드라자-1-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸으로 이루어진 군으로부터 선택된 링커를 포함하거나, 이로서 이루어진 2 가닥의 DNA 이중-가닥 부분 또는 스템을 연결하는 루프를 포함하는 헤어핀 핵산 분자이고, 상기 DNA 이중-가닥 부분 또는 스템의 자유 말단(즉 루프의 반대 편)은 3개의 변형된 포스포디에스테르 골격(특히 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 링크)을 갖고, 상기 Dbait 분자는 이의 5' 말단에서, 바람직하게는 링커(예를 들어, 카르복사미도 올리고에틸렌 글리콜, 바람직하게는 카르복사미도 트리에틸렌 또는 테트라에틸렌 글리콜)를 통해 콜레스테롤에 접합된다.
특정 실시 형태에서, Dbait 분자는 PCT 특허 출원WO2011/161075에 광범위하게 기재된 것들과 같은 접합된 Dbait 분자들일 수 있는데, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다.
바람직한 실시 형태에서, NNNN-(N)n-N은 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5)의 적어도 6개, 8개, 10개, 12개, 14개, 16개, 18개, 20개, 22개, 24개, 26개, 28개, 30개 또는 32개의 연속 뉴클레오티드를 포함하거나, 또는 Dbait32, Dbait32Ha, Dbait32Hb, Dbait32Hc 또는 Dbait32Hd의 20개, 22개, 24개, 26개, 28개, 30개 또는 32개의 연속 뉴클레오티드로 이루어진다. 특정 실시 형태에서, NNNN-(N)n-N은 Dbait32(서열 번호 1), Dbait32Ha(서열 번호 2), Dbait32Hb(서열 번호 3), Dbait32Hc(서열 번호 4) 또는 Dbait32Hd(서열 번호 5), 더욱 바람직하게는 Dbait32Hc(서열 번호 4)를 포함하거나, 또는 이들로 이루어진다.
따라서(According), 접합된 Dbait 분자는 이하의 것들로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다:
서열 번호 1인 NNNN-(N)n-N을 갖는 것;
서열 번호 2인 NNNN-(N)n-N을 갖는 것;
서열 번호 3인 NNNN-(N)n-N을 갖는 것;
서열 번호 4인 NNNN-(N)n-N을 갖는 것; 또는
서열 번호 5인 NNNN-(N)n-N을 갖는 것.
하나의 바람직한 실시 형태에서, Dbait 분자는 이하의 화학식을 갖고:
Figure pct00006
상기 화학식에서,
- NNNN-(N)n-N은 28개, 30개 또는 32개의 뉴클레오티드, 바람직하게는 32개의 뉴클레오티드를 포함하고/거나;
- 밑줄 친 뉴클레오티드는 포스포로티오에이트 또는 메틸포스포네이트 골격, 더욱 바람직하게는 포스포로티오에이트 골격을 갖거나 갖지 않는 뉴클레오티드를 지칭하고; 바람직하게는, 밑줄 친 뉴클레오티드는 포스포로티오에이트 또는 메틸포스포네이트 골격, 더욱 바람직하게는 포스포로티오에이트 골격를 갖는 뉴클레오티드를 지칭하고/거나;
- 링커 L'은 헥사에틸렌글리콜, 테트라데옥시티미딜레이트(T4), 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸 또는 2,19-비스(포스포르)-8-히드라자-1-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸으로 이루어진 군으로부터 선택되고/거나;
- m은 1이고, L은 카르복사미도 폴리에틸렌 글리콜, 더욱 바람직하게는 카르복사미도 트리에틸렌 또는 테트라에틸렌 글리콜이고/거나;
- C는 콜레스테롤, 단일 또는 이중 사슬 지방산, 예컨대 옥타데실, 올레산, 디올레오일 또는 스테아르산, 또는 세포 수용체를 표적화하는 리간드(펩티드, 단백질, 압타머 포함), 예컨대 엽산, 토코페롤, 당, 예컨대 갈락토스 및 만노스 및 이들의 올리고당, 펩티드, 예컨대 RGD 및 봄베신, 및 단백질, 예컨대 트랜스페린(transferring) 및 인테그린으로 이뤄진 군으로부터 선택되며, 바람직하게는 콜레스테롤이다.
매우 특별한 실시 형태에서, Dbait 분자(본원에서 AsiDNA라고도 또한 지칭됨)는 이하의 화학식을 갖고:
Figure pct00007
(IIa)(서열 번호 6), 상기 화학식에서, C는 콜레스테릴이고, Lm은 테트라에틸렌 글리콜이고, L'는 1,19-비스(포스포)-8-히드라자-2-히드록시-4-옥사-9-옥소-노나데칸이고; 또한 이하의 화학식으로 나타내며:
Figure pct00008
"s"는 2개의 뉴클레오티드 사이의 포스포로티오에이트 링크를 지칭한다.
키나제 억제제
본 발명의 키나제 억제제는 암의 치료를 위한 키나제 억제제이다. 특히, 상기 키나제는 티로신 키나제, 세린/트레오닌 키나제, 또는 이중 특이성을 갖는 키나제일 수 있다. 특정 양태에서, 상기 키나제 억제제는 암 치료 동안 획득된 내성과 관련된 것으로 알려졌다. 매우 특별한 양태에서, 상기 키나제 억제제는 이 키나제 억제제에 의한 암의 치료 동안 암 지속성 세포의 발생과 관련된다.
상기 키나제 억제제는 이하의 키나제들 중 임의의 하나를 표적화할 수 있다: EGFR 패밀리, ALK, B-Raf, MEK, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, IGF1R, c-Met, JAK 패밀리, PDGFR α 및 β, RET, AXL, c-KIT, TrkA, TrkB, TrkC, ROS1, BTK 및 Syk.
일 양태에서, 상기 키나제 억제제는 수용체 티로신 키나제, 특히 EGFR 패밀리, ALK, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, c-Met, RET, IGF1R, PDGFR α 및 β, c-KIT, FLT3, AXL, TrkA, TrkB, TrkC, 및 ROS1로 이루어진 군으로부터 선택된 것을 표적화하는 억제제이다.
특정 양태에서, 상기 키나제 억제제는 EGFR, ALK, B-Raf, MEK, c-Met, JAK, PDGFR α 및 β, RET 및 BTK로 이루어진 군으로부터 선택된 티로신 키나제를 표적화하는 억제제이다. 예를 들어, 진화적이고 구조적으로 ALK에 관련된 티로신 키나제의 그룹은, RET, ROS1, AXL 및 Trk 패밀리 키나제이다.
상기 키나제 억제제는 작은 유기 분자이다. 상기 용어는 생물학적 거대 분자(예를 들어; 단백질, 핵산 등)는 배제한다. 바람직한 작은 유기 분자는 최대 2000 Da, 가장 바람직하게는 최대 약 1000 Da의 크기 범위이다.
상기 키나제 억제제는 또한 ErbB-1 및 HER1(UniprotKB - P00533 참고)이라고도 불리는 EGFR(상피 성장 인자 수용체)를 표적화할 수 있다. EGFR 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 EGFR 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Expert Opinion on Therapeutic Patents Dec 2002, 12권, No. 12, 페이지 1903-1907]; 문헌[Kane, Expert Opinion on Therapeutic Patents Feb 2006, 16권, No. 2, 페이지 147-164]; 문헌[Traxler, Expert Opinion on Therapeutic Patents Dec 1998, 8권, No. 12, 페이지 1599-1625]; 문헌[Singh et al, Mini Rev Med Chem. 2016;16(14):1134-66]; 문헌[Cheng et al, Curr Med Chem. 2016;23(29):3343-3359]; 문헌[Milik et al, Eur J Med Chem. 2017 Dec 15;142:131-151.]; 문헌[Murtuza et al, Cancer Res. 2019 Feb 15;79(4):689-698]; 문헌[Tan et al, Onco Target Ther. 2019 Jan 18;12:635-645]; 문헌[Roskoski, Pharmacol Res. 2019 Jan;139:395-411]; 문헌[Mountzios, Ann Transl Med. 2018 Apr;6(8):140]; 문헌[Tan et al, Mol Cancer. 2018 Feb 19;17(1):29]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 EGFR 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO19010295, WO19034075, WO18129645, WO18108064, WO18050052, WO18121758, WO18218963, WO17114383, WO17049992, WO17008761, WO17015363, WO17016463, WO17117680, WO17205459, WO16112847, WO16054987, WO16070816, WO16079763, WO16125186, WO16123706, WO16050165, WO15081822, WO12167415, WO13138495, WO10129053, WO10076764, WO09143389, WO05065687, WO05018677, WO05027972, WO04011461, WO0134574가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. EGFR 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 ALK(또한 ALK 티로신 키나제 수용체 또는 CD246라고도 알려진 역형성(Anaplastic) 림프종 키나제; UniprotKB - Q9UM73)를 표적화할 수 있다. ALK 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 ALK 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Beardslee et al, J Adv Pract Oncol. 2018 Jan-Feb;9(1):94-101]; 문헌[Pacenta et al, Drug Des Devel Ther. 2018 Oct 23;12:3549-3561]; 문헌[Spagnuolo et al, Expert Opin Emerg Drugs. 2018 Sep;23(3):231-241]; 문헌[Peters et al, Curr Treat Options Oncol. 2018 May 28;19(7):37]; 문헌[Goldings et al, Mol Cancer. 2018 Feb 19;17(1):52]; 문헌[Karachaliou et al, Expert Opin Investig Drugs. 2017 Jun;26(6):713-722]; 문헌[Liu et al, Curr Med Chem. 2017;24(6):590-613]; 문헌[Crescenzo et al, Curr Opin Pharmacol. 2015 Aug;23:39-44]; 문헌[Sgambato et al, Expert Rev Anticancer Ther. 2018 Jan;18(1):71-80]; 문헌[Michellys et al, Bioorg Med Chem Lett. 2016 Feb 1;26(3):1090-1096]; 문헌[Straughan et al, Curr Drug Targets. 2016;17(6):739-45]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 ALK 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO04080980, WO05016894, WO05009389, WO09117097, WO09143389, WO09132202, WO10085597, WO10143664, WO11138751, WO12037155, WO12017239, WO12023597, WO13013308, WO14193932, WO15031666, WO15127629, WO15180685, WO15194764, WO17076355, WO18001251, WO18044767, WO18094134, WO18127184가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. ALK 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 B-Raf(또한 원-종양 유전자 B-Raf라고도 알려진 세린/트레오닌-단백질 키나제 B-raf, p94 또는 v-Raf 쥣과 육종 바이러스 종양 유전자 동족체 B1; UniprotKB - P15056)를 표적화할 수 있다. B-Raf 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 B-Raf 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Tsai et al, PNAS February 26, 2008 105(8) 3041-3046], 문헌[Garnett et Marais, 2004 Cancer Cell, 6권, Issue 4, 페이지 313-319]; 문헌[Wilmott et al 2012, Cancer Therapy: Clinical, 18권, Issue 5]; 문헌[Fujimura et al, Expert Opin Investig Drugs. 2019 Feb;28(2):143-148]; 문헌[Trojaniello et al, Expert Rev Clin Pharmacol. 2019 Mar;12(3):259-266]; 문헌[Kakadia et al, Onco Targets Ther. 2018 Oct 17;11:7095-7107]; 문헌[Roskoski, Pharmacol Res. 2018 Sep;135:239-258]; 문헌[Eroglu et al, Ther Adv Med Oncol. 2016 Jan;8(1):48-56]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 B-Raf 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO14164648, WO14164648, WO14206343, WO13040515, WO11147764, WO11047238, WO11025968, WO11025951, WO11025938, WO11025965, WO11090738, WO09143389, WO09111280, WO09111279, WO09111278, WO09111277, WO08068507, WO08020203, WO07119055, WO07113558, WO07071963, WO07113557, WO06079791, WO06067446, WO06040568, WO06024836, WO06024834, WO06003378, WO05123696이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. B-Raf 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 MEK(또한 MAP2K, MP2K, MAPKK, MAPK/ERK 키나제, JNK-활성화 키나제, c-Jun N-말단 키나제 키나제(JNKK), 스트레스-활성화 단백질 키나제 키나제(SAPKK)라고도 알려진 마이토겐(mitogen)-활성화 단백질 키나제 키나제; UniprotKB - Q02750(MP2K1), P36507(MP2K2), P46734(MP2K3), P45985(MP2K4), Q13163(MP2K5), P52564(MP2K6), O14733(MP2K7))을 표적화할 수 있다. 바람직하게는, 상기 키나제 억제제는 MEK-1(또한, MAP2K1, MP2K1, MAPKK 1 또는 MKK1라고도 알려짐) 및/또는 MEK-2(또한, MAP2K2, MP2K2, MAPKK 2 또는 MKK2라고도 알려짐)을 표적화한다. MEK-1과 MEK-2는 둘 다 특히 MAPK/ERK 캐스케이드(cascade)에 작용한다. MEK 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 MEK 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Kakadia et al, Onco Target Ther. 2018 Oct 17;11:7095-7107]; 문헌[Steeb et al, Eur J Cancer. 2018 Nov;103:41-51]; 문헌[Sarkisian and Davar, Drug Des Devel Ther. 2018 Aug 20;12:2553-2565]; 문헌[Roskoski, Pharmacol Res. 2018 Sep;135:239-258]; 문헌[Eroglu et al, Ther Adv Med Oncol. 2016 Jan;8(1):48-56]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 MEK 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO15022662, WO15058589, WO14009319, WO14204263, WO13107283, WO13136249, WO13136254, WO12095505, WO12059041, WO11047238, WO11047055, WO11054828, WO10017051, WO10108652, WO10121646, WO10145197, WO09129246, WO09018238, WO09153554, WO09018233, WO09013462, WO09093008, WO08089459, WO07014011, WO07044515, WO07071951, WO07022529, WO07044084, WO07088345, WO07121481, WO07123936, WO06011466, WO06011466, WO06056427, WO06058752, WO06133417, WO05023251, WO05028426, WO05051906, WO05051300, WO05051301, WO05051302, WO05023759, WO04005284, WO03077855, WO03077914, WO02069960, WO0168619, WO0176570, WO0041994, WO0042022, WO0042003, WO0042002, WO0056706, WO0068201, WO9901426이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. MEK 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 FGFR(섬유아세포 성장 인자 수용체; UniprotKB - P11362(FGFR1), P21802(FGFR2), P22607(FGFR3), P22455(FGFR4))를 표적화할 수 있다. FGFR 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 FGFR 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Katoh, Int J Mol Med. 2016 Jul;38(1):3-15]; 문헌[Rizvi et Borad, J Gastrointest Oncol. 2016 Oct;7(5):789-796]; 문헌[Tan et al, Onco Target Ther. 2019 Jan 18;12:635-645], 문헌[Shen et al, J Hematol Oncol. 2018 Sep 19;11(1):120)]; 문헌[Porta et al, Crit Rev Oncol Hematol. 2017 May;113:256-267]; 문헌[Cheng et al, Eur J Med Chem. 2017 Jan 27;126:476-490]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 FGFR 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO19034075, WO19034076, WO19001419, WO18028438, WO18049781, WO18121650, WO18153373, WO18010514, WO17028816, WO17070708, WO16091849, WO16134320, WO16054483, WO15059668, WO14007951, WO14026125, WO14129477, WO14162039, WO14172644, WO13108809, WO13129369, WO13144339, WO13179033, WO13053983, WO12008563, WO12008564, WO12047699, WO09153592, WO08078091, WO08075068, WO06112479, WO04056822가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. FGFR 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다. FGFR 키나제 억제제는 선택적인 하나 또는 수 개의 FGFR 패밀리 구성원, 특히 FGFR1, FGFR2, FGFR3 및 FGFR4로부터 선택된 구성원일 수 있다.
키나제 억제제는 FLT3(또한, FL 사이토카인 수용체로도 알려진 수용체-타입 티로신-단백질 키나제 FLT3, 태아의 간 키나제-2(FLK-2), Fms-유사 티로신 키나제 3(FLT-3), 줄기 세포 티로신 키나제 1(STK-1) 또는 CD 항원: CD135; UniprotKB - P36888)을 표적화할 수 있다. FLT3 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 FLT3 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Stone, Best Pract Res Clin Haematol. 2018 Dec;31(4):401-404]; 문헌[Wu et al, J Hematol Oncol. 2018 Dec 4;11(1):133]; 문헌[Short et al, Ther Adv Hematol. 2019 Feb 15;10:2040620719827310]; 문헌[Elstimesy et al, Expert Rev Anticancer Ther. 2019 Mar;19(3):273-286]; 문헌[Zhi et al, Eur J Med Chem. 2018 Jul 15;155:303-315]; 문헌[Tiong IS, Wei AH, Genes Chromosomes Cancer. 2019 Mar 12], 문헌[Gallogly et Lazarus, J Blood Med. 2016 Apr 19;7:73-83]; 문헌[Pitoia et Jerkovich, Drug Des Devel Ther. 2016 Mar 11;10:1119-31]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 XX 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO19034538, WO17148440, WO15056683, WO13170671, WO13124869, WO13142382, WO13157540, WO11086085, WO09095399, WO09143389, WO08111441, WO08046802, WO06020145, WO06106437, WO06135719가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. FLT3 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 IGF1R(또한 인슐린-유사 성장 인자 I 수용체(IGF-I 수용체)라고도 알려진 인슐린-유사 성장 인자 1 수용체, 또는 CD 항원: CD221; UniprotKB - P08069 또는 C9J5X1)을 표적화할 수 있다. IGF1R 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 IGF1R 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Qu et al, Oncotarget. 2017 Apr 25;8(17):29501-29518]; 문헌[Chen 등, Curr Top Med Chem. 2017 Nov 20;17(28):3099-3130]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 IGF1R 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO16082713, WO08076415, WO08000922, WO08076143, WO07121279, WO07083017, WO07075554, WO06080450, WO05095399, WO05097800, WO05037836, WO02092599가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. IGF1R 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 c-Met(또한, HGF/SF 수용체로도 알려진 간세포 성장 인자 수용체, 원-종양 유전자 c-Met, 산란 인자(Scatter factor) 수용체 또는 티로신-단백질 키나제 Met; UniprotKB - P08581)를 표적화할 수 있다. c-Met 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 c-Met 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Zhang et al, Expert Opin Ther Pat. 2019 Jan;29(1):25-41]; 문헌[
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-Spychalska et al, Curr Treat Options Oncol. 2014 Dec;15(4):670-82]; 문헌[Bahrami et al, J Cell Physiol. 2017 Oct;232(10):2657-2673]; 문헌[Zhang et al, Eur J Med Chem. 2016 Jan 27;108:495-504]; 문헌[Qi et al, World J Gastroenterol. 2015 May 14;21(18):5445-53]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 c-Met 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO18153293, WO18187355, WO14000713, WO14032498, WO14067417, WO14180182, WO1307089, WO13107285, WO13149581, WO12006960, WO12015677, WO12034055, WO12048258, WO12075683, WO11039527, WO11079142, WO11121223, WO11143646, WO11149878, WO10007317, WO10007316, WO10007318, WO10019899, WO10059668, WO10089508, WO10089509, WO09143389, WO09143211, WO09056692, WO09093049, WO09068955, WO13013308, WO08023698, WO08008310, WO08102870, WO07036630, WO07066185, WO07023768, WO07002254, WO07002258, WO07111904, WO06104161, WO05082854, WO05082855, WO0160814가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. c-Met 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 JAK(또한, Janus 키나제 2로도 알려진 티로신-단백질 키나제 JAK2; UniprotKB - O60674)를 표적화할 수 있다. JAK 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 JAK 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[He et al, Expert Opin Ther Pat. 2019 Feb;29(2):137-149]; 문헌[Hobbs et al, Hematol Oncol Clin North Am. 2017 Aug;31(4):613-626]; 문헌[Senkevitch et Durum, Cytokine. 2017 Oct;98:33-41]; 문헌[Leroy et Constantinescu, Leukemia. 2017 May;31(5):1023-1038]; 문헌[Jin et al, Pathol Oncol Res. 2019 Jan 31]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 JAK 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO19034153, WO18215389, WO18215390, WO18204238, WO17006968, WO17079205, WO17091544, WO17097224, WO17129116, WO17140254, WO17215630, WO16027195, WO16032209, WO16116025, WO16173484, WO16191524, WO16192563, WO15174376, WO15039612, WO14111037, WO14123167, WO14146492, WO14186706, WO13091539, WO13188184, WO11076419, WO10085597, WO10051549, WO10083283, WO10135621, WO10142752, WO10149769, WO11003065, WO09132202, WO09143389, WO09062258, WO09114512, WO09145856, WO09155565, WO09155551, WO08047831, WO08109943, WO08116139, WO08157207, WO07070514, WO07084557, WO07117494, WO07007919, WO06034116, WO06056399, WO06069080, WO05095400, WO04058753, WO04041789, WO04041814, WO04041810, WO03101989, WO0152892가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. JAK 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 PDGFR(또한, 혈소판-유래 성장 인자 수용체로도 알려진 혈소판-유래 성장 인자 수용체, CD140 항원-유사 패밀리 구성원; UniprotKB - P16234(PGFRA) P09619(PGFRB))을 표적화할 수 있다. PDGFR 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 PDGFR 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Roskoski, Pharmacol Res. 2018 Mar;129:65-83]; 문헌[Andrick et Gandhi, Ann Pharmacother. 2017 Dec;51(12):1090-1098]; 문헌[Khalique et Banerjee, Expert Opin Investig Drugs. 2017 Sep;26(9):1073-1081]; 문헌[Miyamoto et al, Jpn J Clin Oncol. 2018 Jun 1;48(6):503-513]; 문헌[Gallogly et Lazarus, J Blood Med. 2016 Apr 19;7:73-83]; 문헌[Pitoia et Jerkovich, Drug Des Devel Ther. 2016 Mar 11;10:1119-31]; 문헌[Chen et Chen, Drug Des Devel Ther. 2015 Feb 9;9:773-9]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 PDGFR 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO11119894, WO08016192, WO07004749, WO03077892, WO03077892, WO0164200, WO0125238, WO0172711, WO0172758, WO9957117, 및 WO9928304가 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. PDGFR 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 RET(또한 캐드헤린(cadherin) 패밀리 구성원 12 또는 원-종양 유전자 c-Ret로도 알려진 원-종양 유전자 티로신-단백질 키나제 수용체 Ret; UniprotKB - P07949)를 표적화할 수 있다. RET 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 RET 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Roskoski et Sadeghi-Nejad, Pharmacol Res. 2018 Feb;128:1-17]; 문헌[
Figure pct00010
et
Figure pct00011
; Recent Results Cancer Res. 2018;211:187-198]; 문헌[
Figure pct00012
, Recent Results Cancer Res. 2018;211:67-75]; 문헌[Pitoia et Jerkovich, Drug Des Devel Ther. 2016 Mar 11;10:1119-31]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 RET 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO18071454, WO18136663, WO18136661, WO18071447, WO18060714, WO18022761, WO18017983, WO17146116, WO17161269, WO17146116, WO17043550, WO17011776, WO17026718, WO14050781, WO07136103, WO06130673이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. RET 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 AXL(또한, AXL 종양 유전자로도 알려진 티로신-단백질 키나제 수용체 UFO; UniprotKB - P30530)를 표적화할 수 있다. AXL 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 AXL 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Myers et al, J Med Chem. 2016 Apr 28;59(8):3593-608]; 문헌[
Figure pct00013
, Recent Results Cancer Res. 2018;211:67-75]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 AXL 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO18121228, WO17059280, WO17028797, WO16166250, WO16104617, WO16097918, WO16006706, WO15143692, WO15119122, WO15100117, WO15068767, WO15017607, WO15012298, WO13115280, WO13074633, WO12135800, WO12028332, WO10090764, WO10083465, WO10005876, WO10005879, WO09127417, WO09054864, WO08128072, WO08098139, WO08083353, WO08083357, WO08083354, WO08083356, WO08083367, WO08080134, WO08045978, WO07030680이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. AXL 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 c-KIT(또한, Piebald trait 단백질(PBT)이라고도 알려진 비만/줄기 세포 성장 인자 수용체 kit, 원-종양 유전자 c-Kit, 티로신-단백질 키나제 kit 또는 p145 c-kit; UniprotKB - P10721)를 표적화할 수 있다. c-KIT 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 c-KIT 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Abbaspour Babaei et al, Drug Des Devel Ther. 2016 Aug 1;10:2443-59], 문헌[
Figure pct00014
; Recent Results Cancer Res. 2018;211:187-198]; 문헌[Miyamoto et al, Jpn J Clin Oncol. 2018 Jun 1;48(6):503-513]; 문헌[Chen et al, Curr Top Med Chem. 2017 Nov 20;17(28):3099-3130]; 문헌[Gallogly et Lazarus, J Blood Med. 2016 Apr 19;7:73-83]; 문헌[Pitoia et Jerkovich, Drug Des Devel Ther. 2016 Mar 11;10:1119-31], 문헌[Chen et Chen, Drug Des Devel Ther. 2015 Feb 9;9:773-9]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 c-KIT 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO19034128, WO18112136, WO18112140, WO17167182, WO17121444, WO14202763, WO13033116, WO13033203, WO13033167, WO13033070, WO13014170, WO09105712, WO08011080, WO08005877, WO07124369, WO07092403, WO07038669, WO07026251, WO06106437, WO06135719, WO06060381, WO05073225, WO05021531, WO05021537, WO05021544, WO04080462, WO04014903, WO03035049, WO03002114, WO03003006, WO03004006이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. c-KIT 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 Trk(또한, 고 친화성 신경 성장 인자 수용체라고도 알려진 트로포마이오신 수용체 키나제, 신경영양성 티로신 키나제 수용체, 또는 TRK-형질전환 티로신 키나제 단백질; UniprotKB - P04629(Trk1), Q16620(Trk2), Q16288(Trk3))를 표적화할 수 있다. Trk 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 Trk 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Bhangoo et Sigal, Curr Oncol Rep. 2019 Feb 4;21(2):14], 문헌[Pacenta et Macy, Drug Des Devel Ther. 2018 Oct 23;12:3549-3561]; 문헌[Cocco et al, Nat Rev Clin Oncol. 2018 Dec;15(12):731-747]; 문헌[Lange et Lo, Cancers(Basel). 2018 Apr 4;10(4)]; 문헌[Rolfo et al, Expert Opin Investig Drugs. 2015;24(11):1493-500]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 Trk 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO18199166, WO18079759, WO17135399, WO17087778, WO17006953, WO16164286, WO16161572, WO16116900, WO16036796, WO16021629, WO15200341, WO15175788, WO15143653, WO15148350, WO15148344, WO15143654, WO15148373, WO15148354, WO15143652, WO15089139, WO15039334, WO15042085, WO15039333, WO15017533, WO14129431, WO14105958, WO14078417, WO14078408, WO14078378, WO14078372, WO14078331, WO14078328, WO14078325, WO14078322, WO14078323, WO13183578, WO13176970, WO13161919, WO13088257, WO13088256, WO13009582, WO12158413, WO12137089 WO12116217, WO12034091, WO12037155, WO11006074, WO10048314, WO10033941, WO09054468, WO08135785, WO07123269, WO06135719, WO06123113, WO06087538, WO06087530, WO06082392, WO05049033, WO03027111이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. Trk 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
키나제 억제제는 ROS1(또한, 원-종양 유전자 c-Ros라고도 알려진 원-종양 유전자 티로신-단백질 키나제 ROS, 원-종양 유전자 c-Ros-1, 수용체 티로신 키나제 c-ros 종양 유전자 1 및 c-Ros 수용체 티로신 키나제; UniprotKB - P08922)을 표적화할 수 있다. ROS1 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 ROS1 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Lin et Shaw, J Thorac Oncol. 2017 Nov;12(11):1611-1625]; 문헌[Facchinetti et al, Cancer Treat Rev. 2017 Apr;55:83-95]; 문헌[Rolfo et al, Expert Opin Investig Drugs. 2015;24(11):1493-500], 문헌[Yang et Gong, Expert Rev Clin Pharmacol. 2019 Mar;12(3):173-178], 문헌[Liu et al, Ther Clin Risk Manag. 2018 Jul 20;14:1247-1252]; 문헌[Sgambato et al, Expert Rev Anticancer Ther. 2018 Jan;18(1):71-80]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 ROS1 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO13183578, WO13180183, WO13158859, WO12037155, WO12005299, WO14141129, WO15144801, WO15144799, WO18170381이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. ROS1 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
상기 키나제 억제제는 BTK(또한, 무감마글로불린혈증(Agammaglobulinemia) 티로신 키나제(ATK)라고도 알려진 티로신-단백질 키나제 BTK, B-세포 전구체 키나제(BPK) 및 브루톤(Bruton) 티로신 키나제; UniprotKB - Q06187)를 표적화할 수 있다. BTK 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 BTK 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Kim HO, Arch Pharm Res. 2019 Feb;42(2):171-181]; 문헌[Liang et al, Eur J Med Chem. 2018 May 10;151:315-326], 문헌[Aw et Brown, Drugs Aging. 2017 Jul;34(7):509-527]; 문헌[Wu et al, Oncotarget. 2017 Jan 24;8(4):7201-7207], 문헌[Wu et al, J Hematol Oncol. 2016 Sep 2;9(1):80]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 BTK 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO18002958, WO18001331, WO18009017, WO18035080, WO18088780, WO18090792, WO18095398, WO18133151, WO18145525, A1WO18154131, WO18175512, A1WO18192536, WO18192532, WO18196757, WO18208132, WO18233655, WO19034009, WO17007987, WO17046604, WO17066014, WO17077507, WO17123695, WO17127371, WO17128917, WO17190048, WO17106429,WO16019233, WO16057500, WO16065222, WO16066726, WO16106628, WO16106626, WO16106629, WO16109215, WO16106627, WO16106623, WO16106624, WO16106652, WO16112637, WO16161571, WO16161570, WO16196776, WO16196840, WO16192074, WO16210165, WO16109220, WO15017502, WO15002894, WO15022926, WO15048689, WO15048662, WO15061247, WO15084998, WO15095102, WO15095099, WO15116485, WO15169233, WO15165279, WO15132799, WO15039612, WO14104757, WO14113932, WO14114185, WO14113942, WO14116504, WO14130693, WO14164558, WO14151620, WO14152114, WO14161799, WO14187319, WO14210255, WO14005217, WO14025976, WO14039899, WO14055928, WO14055934, WO14068527, WO14078578, WO14082598, WO14082598, WO13067264, WO13081016, WO13102059, WO13116382, WO13148603, WO13152135, WO13185084, WO13067277, WO13067274, WO13059738, WO13010869, WO13010380, WO13010868, WO12170976, WO12135801, WO12021444, WO11153514, WO11152351, WO11029043, WO11029046, WO10126960, WO10056875, WO10009342, WO09156284, WO09098144, WO09053269, WO08121742, WO08039218, WO9954286이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. BTK 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
상기 키나제 억제제는 Syk(또한, 비장 티로신 키나제라고도 알려진 티로신-단백질 키나제 SYK, p72-Syk; UniprotKB - P43405)를 표적화할 수 있다. Syk 키나제 억제제는 잘 알려져 있다. 예를 들어, 이러한 Syk 키나제 억제제에 대해 개시하는 리뷰가 이하에 공개되어 있고(문헌[Bartaula-Brevik et al, Expert Opin Investig Drugs. 2018 Apr;27(4):377-387]; 문헌[Liu et Mamorska-Dyga, J Hematol Oncol. 2017; 10: 145, Geahlen, Trends Pharmacol Sci. 2014 Aug;35(8):414-22]; 문헌[Norman Expert Opin Ther Pat. 2014 May;24(5):573-95]), 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. 특허 출원들도 또한 Syk 키나제 억제제에 대해 개시하는데, 예를 들어, WO19034153, WO18053189, WO18053190, WO18108083, WO18228475, WO17046302, WO16010809, WO15138273, WO15140051, WO15140054, WO15140055, WO15144614, WO15017610, WO15061369, WO15094997, WO15095444, WO15095445, WO15100217, WO14051654, WO14048065, WO14060371, WO14064134, WO14074422, WO14086032, WO14093191, WO14100314, WO14176210, WO14176216, WO14023385, WO14027300, WO14031438, WO14029732, WO14045029, WO13192125, WO13192128, WO13192098, WO13192088, WO13047813, WO13052391, WO13052394, WO13052393, WO13064445, WO13099041, WO13104573, WO13104575, WO13109882, WO13124026, WO13126132, WO13124025, WO12002577 WO12025187 WO12025186, WO12061418, WO12123311, WO12123312, WO12130780, WO12151137, WO12154519, WO12154520, WO12154518, WO12167423, WO12167733, WO11086085, WO11014795, WO11014515, WO11075515, WO11075560, WO11079051, WO11092128, WO11112995, WO11117160, WO11134971, WO11144584, WO11144585, WO10068257, WO10068258, WO10097248, WO10147898, WO09131687, WO09136995, WO09145856, WO09031011, WO08033798, WO07129226, WO07042298, WO07042299, WO07028445, WO07009681, WO07009681, WO07085540, WO06093247, WO05033316, WO05026158, WO03063794, WO03057695, WO0183485, WO0147922, WO0109134, WO0075113이 있으나, 이들이 다는 아니고, 상기 문헌의 개시 내용은 본원에 참조로서 포함된다. Syk 키나제 억제제의 구체적인 예는 이하의 표에 개시되어 있다.
매우 특별한 양태에서, 상기 키나제 억제제는 이하의 표에서 선택될 수 있다:
Figure pct00015
Figure pct00016
키나제 억제제에 의한 치료는, 또한 동일한 키나제 또는 상이한 키나제를 표적화하는 몇몇 키나제 억제제들의 조합물일 수도 있다. 예를 들어, 상이한 키나제를 표적화하는 몇몇 키나제 억제제들을 포함하는 치료는, B-raf 키나제 억제제와 MEK 키나제 억제제, 바람직하게는 베무라페닙, 다브라페닙, 레고라페닙 및 PLX4720으로 이루어진 군으로부터 선택된 B-raf 키나제 억제제와, 코비메티닙, 트라메티닙, 비니메티닙, 셀루메티닙, PD-325901, CI-1040, PD035901, U0126 및 TAK-733으로 이루어진 군으로부터 선택된 MEK 키나제 억제제의 조합물, 예컨대 베무라페닙과 트라메티닙의 조합물일 수 있다. 대안적으로, 키나제 억제제는 상이한 키나제들을 표적화할 수 있다.
특정 양태에서, 키나제 억제제는 EGFR 억제제이다. 예를 들어, 이는 게피티닙, 에를로티닙, 라파티닙, 반데타닙, 아파티닙, 오시머티닙, 네라티닙, 다코미티닙, 브리가티닙, 카너티닙, 나쿠오티닙, 나자르티닙, 펠리티닙, 로실레티닙, 이코티닙, AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙, WZ4002로 이루어진 군으부터 선택될 수 있고, 더욱 바람직하게는 에를로티닙이다.
치료될 암 또는 종양
"암", "암의" 또는 "악성(malignant)"이라는 용어는, 전형적으로 비조절된 세포 성장을 특징으로 하는 포유류의 생리학적 상태를 지칭하거나, 설명한다. 암의 예는, 예를 들어, 백혈병(leukemia), 림프종(lymphoma), 아세포종(blastoma), 암종(carcinoma) 및 육종(sarcoma)을 포함한다.
이하의 것들을 포함하나, 이에 제한되지 않는 다양한 암들이 또한 본 발명의 범주에 포함된다: 방광 암종(가속된 전이성 방광암 포함), 유방 암종, 결장 암종(직장결장암 포함), 신장 암종, 간 암종, 폐 암종(소세포 및 비-소세포 폐암 및 폐 선암종 포함), 난소 암종, 전립선 암종, 정소 암종, 비뇨생식관 암종, 림프계 암종, 직장 암종, 후두 암종, 췌장 암종(외분비성 췌장암종 포함), 식도 암종, 위 암종, 담낭 암종, 자궁경부 암종, 갑상선 암종, 및 피부 암종(편평 세포 암종 포함)을 포함하는 암종; 백혈병, 급성 림프구성 백혈병, 급성 림프아구성 백혈병, B-세포 림프종, T-세포 림프종(피부 또는 말초 T-세포 림프종 포함), 호지킨 림프종, 비-호지킨 림프종, 모발 세포 림프종, 조직구성 림프종, 및 버킷 림프종을 포함하는 림프 계열의 조혈성 종양; 급성 및 만성 골수 기원 백혈병, 골수이형성 증후군, 골수성 백혈병, 및 전골수성 백혈병을 포함하는 골수 계열의 조혈성 종양; 성상세포종(astrocytoma), 신경아세포종(neuroblastoma), 신경교종(glioma), 및 신경초종(schwannoma)을 포함하는 중추신경계 및 말초신경계의 종양; 섬유육종(fibrosarcoma), 횡문근육종(rhabdomyosarcoma), 및 골육종(osteosarcoma)을 포함하는 간엽 기원의 종양; 흑색종, 색소 건피증(xenoderma pigmentosum), 각질가시세포종(keratoactanthoma), 정상피종(seminoma), 갑상선 여포암(follicular cancer), 및 기형암종(teratocarcinoma)을 포함하는 기타 종양; 흑색종, 절개불가능 III 또는 IV기 악성 흑색종, 편평 세포 암종, 소-세포 폐암, 비-소세포 폐암, 신경교종, 위장관 암, 신장암, 난소암, 간암, 직장결장암, 자궁내막암, 신장암, 전립선암, 갑상선암, 신경아세포종, 췌장암, 다형성 교모세포종(glioblastoma multiforme), 자궁경부암, 위암(stomach cancer), 방광암, 간암종, 유방암, 결장 암종, 및 두경부 암, 망막아세포종(retinoblastoma), 위암(gastric cancer), 생식 세포 종양, 골암, 골 종양, 성인 악성 뼈 섬유 조직구종(fibrous histiocytoma); 소아 악성 뼈 섬유 조직구종, 육종, 소아 육종; 골수이형성 증후군; 신경아세포종; 정소 생식 세포 종양, 안구내 흑색종, 골수이형성 증후군; 골수이형성/골수증식성 질환, 활막 육종.
본 발명의 바람직한 실시 형태에서, 암은 고형 종양이다. 예를 들어, 암은 육종 및 골육종, 예컨대 카포시 육종, AIDS-관련 카포시 육종, 흑색종, 특히 포도막 흑색종, 및 두경부암, 신장암, 난소암, 췌장암, 전립선암, 갑상선암, 폐암, 식도암, 유방암 특히 삼중 음성 유방암(TNBC), 방광암, 결장직장암, 간 및 담도 암, 자궁암, 맹장암 및 자궁경부암, 정소암, 위장관 암, 및 자궁내막 및 복막 암일 수 있다. 바람직하게는, 암은 육종, 흑색종, 특히 포도막 흑색종, 및 두경부의 암, 신장암, 난소암, 췌장암, 전립선암, 갑상선암, 폐암, 식도암, 유방암, 특히(TNBC), 방광암, 결장직장암, 간암, 자궁경부암, 및 자궁내막 및 복막 암일 수 있다.
특정 양태에서, 암은 백혈병, 림프종, 육종, 흑색종, 및 두경부의 암, 신장암, 난소암, 췌장암, 전립선암, 갑상선암, 폐암, 식도암, 유방암, 방광암, 뇌암, 결장직장암, 간암, 및 자궁경부암으로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
다른 양태에서, 암은 폐암, 특히 비-소세포 폐암, 백혈병, 특히 급성 골수성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 림프종, 특히 말초 T-세포 림프종, 만성 골수성 백혈병, 두경부의 편평 세포 암종, BRAF 돌연변이를 갖는 진행성 흑색종, 직장결장암, 위장관 기질 종양, 유방암, 특히 HER2+ 유방암, 갑상선암, 특히 진행성 수질 갑상선암, 신장암, 특히 신세포 암종, 전립선암, 신경교종, 췌장암, 특히 췌장 신경내분비 암, 다발성 골수종, 및 간암, 특히 간세포성 암종으로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
예를 들어, 키나제 억제제가 EGFR 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 폐암, 특히 비-소세포 폐암, 췌장암, 유방암, 특히 초기 유방암, 갑상선암, 특히 수질 갑상선암, 직장결장암, 특히 전이성 또는 진행성 직장결장암, 두경부의 편평 세포 암종 및 신경교종으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 특정 양태에서, 키나제 억제제가 EGFR 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 폐암, 특히 비-소세포 폐암이다. 키나제 억제제가 ALK 억제제인 경우, 암은 바람직하게는, 폐암, 특히 비-소세포 폐암이다. 키나제 억제제가 B-Raf 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 흑색종, 폐암, 직장결장암 및 위-장관기질 암으로 이루어진 군으로부터 선택되고, 특히 BRAF 돌연변이를 갖는 진행성 흑색종이다. 키나제 억제제가 MEK 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 흑색종 또는 폐암, 특히 BRAF 돌연변이를 갖는 진행성 흑색종이다. 키나제 억제제가 FGFR 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 갑상선 암종, 직장결장암 및 위-장관 기질 암으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 FLT3 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 신장암, 췌장암, 특히 췌장 신경내분비계 종양, 위-장관 기질 암, 다발성 골수종, 전립선암, 백혈병, 예컨대 급성 골수성 백혈병 및 만성 림프구성 백혈병, 및 림프종으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 JAK 억제제인 경우, 암은 림프종, 특히 말초 T-세포 림프종, 골수증식성 신생물, 다발성 골수종, 췌장암, 및 전립선암으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 PDGFR 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 백혈병, 예컨대 필라델피아-염색체-양성 만성 골수성 백혈병, 위-장관 기질 암, 골수이형성 및 골수증식 증후군, 직장결장암, 신장암, 췌장암, 특히 췌장 신경내분비계 종양, 간암, 유방암, 및 갑상선 암종으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 RET 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 신장암 또는 갑상선암, 예컨대 수질 갑상선암이다. 키나제 억제제가 AXL 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 백혈병, 특히 급성 백혈병, 예컨대 급성 골수성 백혈병 또는 필라델피아-염색체-양성 만성 골수성 백혈병, 신장암, 및 폐암, 예컨대 NSCLC로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 Trk 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 전이성 고형 암이다. 키나제 억제제가 ROS1 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 폐암, 예컨대 NSCLC 및 신장암으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 BTK 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 B 세포 암, 예컨대 만성 림프구성 백혈병(CLL) 및 비-호지킨 림프종으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 키나제 억제제가 Syk 억제제인 경우, 암은 바람직하게는 림프종, 특히 말초 T-세포 림프종이다.
키나제 억제제 치료가 B-Raf 키나제 억제제와 MEK1/2 키나제 억제제의 조합물, 예컨대 베무라페닙과 트라메티닙의 조합물인 경우, 치료될 암은 흑색종, 더욱 특히 BRAF 돌연변이를 갖는 진행성 흑색종일 수 있다.
특정 양태에서, 본 발명은 Dbait 분자와 몇몇 키나제 억제제, 특히 B-Raf와 MEK1/2 억제제의 조합물을 포함하는 약학적 조성물, 조합물 또는 키트에 대해 개시한다. 특정 실시 형태에서, 상기 조합물은 베무라페닙과 트라메티닙의 조합물일 수 있다.
따라서, 본 발명은 흑색종, 더욱 특히 BRAF 돌연변이를 갖는 진행성 흑색종을 치료하는데 사용하기 위한, 본원에서 정의된 Dbait 분자, 및 베무라페닙과 트라메티닙을 포함하는 약학적 조성물, 조합물 또는 키트를 개시한다.
본 발명에 기재된 약학적 조성물 및 제품, 키트, 조합물 또는 조합된 제제는, 고체 종양의 성장을 억제하고, 종양 부피를 감소시키고, 종양의 전이성 전파와 미세전이의 성장 및 발달을 예방하고, 종양 재발(recurrence)을 예방하고, 종양 악화(relapse)를 예방하는데 유용할 수 있다. 본 발명에 기재된 약학적 조성물 및 제품, 키트, 조합물, 또는 조합된 제제는 징후가 나쁜 환자의 치료 또는 방사선-내성 또는 화학치료-내성 종양의 치료에 특히 적합하다. 특정 실시 형태에서, 암은 고-등급 또는 진행성 암이거나, 전이성 암이다.
요법, 투여량 및 투여 경로
본 발명의 조합된 제제에 이용된 각각의 조합 파트너의 효과적인 투여량은, 이용된 특정 화합물 또는 약학적 조성물, 투여 모드, 치료될 질환, 치료될 질환의 심각성에 따라 달라질 수 있다. 따라서, 본 발명의 조합된 제제의 투여 요법은 투여의 경로와 환자 상태를 포함하는 다양한 요인들에 따라 선택된다. 통상의 숙련된 의사, 임상의 또는 수의사는 질환의 진행을 예방, 상쇄하거나 저지하는데 필요한 유효량의 단일 활성 성분을 용이하게 결정하고 처방할 수 있다. 독성 없이 효능을 얻는 범위 내로 활성 성분의 농도를 달성하는데 있어서 최적의 정밀도는, 표적 부위에 대한 활성 성분의 이용가능성의 역학에 기초한 요법이 필요하다.
본 발명의 조합물의 약리 활성은 예를 들어, 임상 연구에서, 또는 더욱 바람직하게는 시험 과정에서 입증될 수 있다. 적합한 임상 연구는 예를 들어, 진행성 종양이 있는 환자에서의 개방 라벨 비-무작위화, 용량 증량 연구이다. 이러한 연구는 본 발명의 조합물의 활성 성분들의 상승 작용을 증명할 수 있다. 증식성 질환에 대한 이로운 효과는 이러한 연구의 결과를 통해 또는 당업계의 숙련자에게 그대로 알려져 있는 연구 디자인을 변형하여 직접 결정될 수 있다. 이러한 연구는 특히, 활성 성분을 사용하는 단독 치료와 본 발명의 조합물의 효과를 비교하는데 적합하다. 바람직하게는, 조합 파트너 (a)는 고정 용량으로 투여되고, 조합 파트너 (b)의 용량이 최대 수인 용량(maximum tolerated dosage)에 도달할 때까지 증량된다. 대안적으로, 조합 파트너 (b)는 고정 용량으로 투여되고, 조합 파트너(a)의 용량이 최대 수인 용량에 도달할 때까지 증량된다.
일부 실시 형태에서, "조합 치료(combination therapy)"는 이 치료제들을 순차적인 방식으로 투여하는 것을 포함하는 것으로 의도되며, 여기에서 각 치료제는 상이한 시점에서 투여되고, 뿐만 아니라 이들 치료제, 또는 상기 치료제들 중 적어도 2개의 투여는 동시에(concurrently), 또는 실질적으로 동시적인(simultaneous) 방식으로 투여된다. 바람직하게는, Dbait 분자와 키나제 억제제는 부수적으로 또는 동시에 투여된다.
"부수적으로(concomitantly)"라는 용어는, 둘 이상의 치료제의 투여를 지칭하는데 사용되며, 이들의 개별적인 치료 효과가 제 시간에 중복되는 경우 일시적인 충분한 밀접 근접성을 제공한다. 따라서, 동시 투여는 하나 이상의 다른 제제(들)의 투여를 중단한 이후에도 하나 이상의 제제(들)의 투여가 계속될 때의 투여 요법을 포함한다.
Dbait 분자와 키나제 억제제는 동일 또는 상이한 투여 요법을 가질 수 있다. 특정 실시 형태에서, 제1 제제는 제2 치료제 또는 이들의 임의의 조합물의 투여 이전에(예를 들어, 5분, 15분, 30분, 45분, 1시간, 2시간, 4시간, 6시간, 12시간, 24시간, 48시간, 72시간, 96시간, 1주, 2주, 3주, 4주, 5주, 6주, 8주, 또는 12주 전에), 본질적으로 그와 동시에 또는 이 후에(예를 들어, 5분, 15분, 30분, 45분, 1시간, 2시간, 4시간, 6시간, 12시간, 24시간, 48시간, 72시간, 96시간, 1주, 2주, 3주, 4주, 5주, 6주, 8주, 또는 12주 후에) 투여될 수 있다. 예를 들어, 일 실시 형태에서, 제1 제제는 제2 치료제 이전에, 예를 들어 1주간 투여될 수 있다. 다른 경우, 제1 제제는 제2 치료제 이전(예를 들어 1 일 전에) 투여된 후, 제2 치료제와 동시에 투여될 수 있다.
Dbait 분자와 키나제 억제제는 동일한 경로 또는 개별적인 경로로 투여될 수 있다. 예를 들어, 선택된 조합물의 제1 치료제는 정맥내 주사에 의해 투여될 수 있으나, 조합물의 다른 치료제는 경구 투여될 수 있다. 대안적으로, 예를 들어, 모든 치료제가 경구 투여될 수 있거나, 모든 치료제가 정맥내 주사에 의해 투여될 수도 있다. 치료제는 또한 교대로 투여될 수도 있다. 투여 경로는 경구, 비경구, 정맥내, 종양내, 피하, 두개내, 동맥내, 국소, 직장, 경피, 피내, 비강, 근육내, 골강내 등일 수 있다.
치료는 한번 또는 여러번의 주기, 예를 들어 2회 내지 10회의 주기, 특히 2회, 3회, 4회 또는 5회의 주기를 포함할 수 있다. 주기는 연속되거나, 분리될 수 있다. 예를 들어, 각 주기는 1주 내지 8주, 바람직하게는 3주 내지 4주의 기간을 두고 구분된다.
본 발명의 추가적인 양태와 장점은 이하의 실시예에서 설명될 것인데, 이는 예시적인 것이며, 제한적인 것으로 간주되지 않아야 한다.
실시예
실시예 1
재료 및 방법
지속성 세포에 대한 AsiDNA의 특이적인 효과를 입증하기 위해, 본 발명자들은 모델 시스템으로써, 2개의 잘-알려진 상피 성장 인자 수용체(EGFR)-중독 비-소세포 폐암(NSCLC) 세포주인 PC9 및 HCC827을 선택하였다.
EGFR T790 돌연변이는 PC9 모 세포주에 이미 존재한다(Hata et al, Nat. Med. 2016). PC9-3 세포주는 PC9의 서브 블로닝의 결과이며, 이미 존재하는 T790 돌연변이가 없다. HCC827 sc2 및 sc3도 또한 HCC827의 서브 클로닝의 결과로서, 이미 존재하는 T790 돌연변이가 없다. 따라서, PC9-3 및 HCC827 sc2 세포주에서, 에를로티닙 치료 하의 증식은 지속성 세포로부터의 적응 메커니즘 때문이다.
세포 배양
인간 NSCLC 세포주인 HCC827 세포주(CRL-2868, EGFR del E749-A750) 및 PC9 세포주(EGFR del E746-A750)는, Antonio Maraver(IRCM, 프랑스 몽펠리에 소재)로부터 친절하게 선물을 받았다. 상기 세포주를 10% 소 태아 혈청(FBS)을 함유하는 RPMI 1640 배지에 배양하고, 37℃의 5% CO2를 함유하는 습윤 챔버 내에 유지하였다. 세포주는 PowerPlex 16 HS(Promega)를 사용하는 짧은 회문 반복부(STR: short tandem repeat) 분석에 의해 검증하였다.
세포 증식 검정
PC9 세포를 치료 24시간 전에 20000개 세포/㎠의 밀도로 96 웰 플레이트에 분주하였다. 세포를 1 μM, 5 μM 또는 10 μM로, AsiDNA와 함께 또는 이의 부재 하에 몇몇 용량의 에를로티닙으로 5일간 처리하고, 제조사가 권고한 바와 같이 MTS 시약(Promega의 CellTiter 96® Aqueous One 용액 세포 증식 검정)과 함께 세포를 배양함으로써, 생존가능한 세포의 상대적인 수를 측정하였다. 약물의 존재 하에서의 상대적인 세포 생존을 백그라운드 보정 후 비처리된 세포에 대해 정규화하였다.
약물 치료, 지속성 AsiDNA 반응
세포를 6-웰 배양 플레이트에 적당한 밀도로 분주하고, 37℃에서 24 h 동안 배양한 후, 에를로티닙(1 μM), 또는 AsiDNA(1 μM, 또는 5 μm, 또는 10μM) 또는 두 약물의 조합물을 첨가하였다. 세포에 21일 동안 처리하고, 대조 배지뿐만 아니라 약물-함유 배지는 주당 2회 교체하였다. 생존하는 세포를 씻어내고, PFA-고정시키고, 크리스탈 바이올렛(Crystal violet)에 의해 염색하였다. ChemiDoc Imaging System(Bio-Rad)을 사용하여 플레이트를 스캐닝하고, 생존하는 세포의 백분율을 Nikon NIS Elements Imaging 소프트웨어를 사용하여 정량화하였다.
결과
AsiDNA 치료 단독으로는 세포 생존에 영향을 미치지 않았다(도 1a). AsiDNA는 에를로티닙-매개 세포 사멸을 강화시키지 않지만(도 1b), AsiDNA는 PC9-3 및 HCC827 sc2 세포주에서 에를로티닙-내성 클론 세포주가 출현하는 비율을 강하게 감소시켰는데(도 1c), 이는 지속성 세포 재성장에 대한 AsiDNA의 효능을 입증하였다.
실시예 2
재료 및 방법
세포 배양
인간 NSCLC 세포주 HCC827(CRL-2868, EGFR del E749-A750)은 American Type Culture Collection(ATCC, 미국 버지니아주 마나사스 소재)로부터 입수하였다. 인간 NSCLC 세포 PC9(EGFR del E746-A750)는 Antonio Maraver(IRCM, 몽펠리에 소재)로부터의 친절한 선물이었다. NSCLC 세포주를 10% 소 태아 혈청(FBS)을 함유하는 RPMI 1640 배지에서 배양하고, 이를 37℃에서 5% CO2를 함유하는 습윤 챔버 내에 유지하였다. 세포주를 PowerPlex 16 HS(Promega)를 사용하는 짧은 회문 반복부(STR) 분석에 의해 검증하였다.
세포주는 이미 존재하는 내성 하위 집단을 포함할 수 있으므로, 모든 세포주를 서브클로닝하여(즉, 단일 세포로부터 유래되게 하고, 제한된 수의 계대로 약물 압력 없이 증폭하여), 약물-내성 상태와 새로운(de novo) 내성 기전의 출현에 특히 중점을 두었다.
형광 모니터링을 위해, 모든 세포를 GFP 렌티바이러스(MOI=2)로 형질도입시키고, 녹색 형광 집단을 FACS에 의해 분류하였다.
약물 치료, 지속생존체 생존의 측정
세포주에 AsiDNA(10 μM)와 함께 또는 이의 부재 하에 에를로티닙(1 μM)을 처리하거나 처리하지 않았고, 생존 곡선(약물 반응 및 재발)을 분광형광계(Synergy 2, BioTek)를 사용하는 형광 탐지에 의해 모니터링하였다. 배지를 주 2회 교환하고, 형광 측정은 배지 교환 직후에 실시하였다.
결과
AsiDNA 치료는 단독으로는 세포 생존에 영향을 주지 않았다(도 2a-2c-2e). AsiDNA는 2개의 서브클론 HCC827 sc2(도 2b) 및 PC9-3(도 2d)에서 에를로티닙 획득 내성을 완전히 없앴으나, PC9 모 세포주에 대한 내성은 부분적으로 그러나 유의하게 감소시켜(도 2f), 지속성 세포에 대한 AsiDNA의 장기적 효능을 추가로 입증하였다.
실시예 3
세포 배양
인간 NSCLC 세포 PC9(EGFR del E746-A750)는 Antonio Maraver(IRCM, 몽펠리에 소재)로부터의 친절한 선물이었다. NSCLC 세포 PC9를 10% 소 태아 혈청(FBS)을 함유하는 RPMI 1640 배지에 배양하고, 37℃의 5% CO2를 함유하는 습윤 챔버에서 유지하였다. 세포주를 PowerPlex 16 HS(Promega)를 사용하는 짧은 회문 반복부(STR) 분석에 의해 검증하였다.
형광 모니터링을 위해, 모든 세포를 GFP 렌티바이러스(MOI=2)로 형질도입시키고, 녹색 형광 집단을 FACS에 의해 분류하였다.
약물 치료, 지속생존체 생존의 측정
PC9 세포에 AsiDNA(10 μM)와 함께 또는 이의 부재 하에 오시머티닙(1 μM)을 처리하거나, 처리하지 않았고, 분광형광계(Synergy 2, BioTek)를 사용하는 형광 탐지에 의해 생존 곡선(약물 반응 및 재발)을 모니터링하였다. 배지를 주 2회 교환하고, 형광 측정은 배지 교환 직후에 실시하였다.
결과
AsiDNA 치료 단독으로는 세포 생존에 영향을 주지 않았다(도 3a). AsiDNA는 PC9 모 세포주에서 오시머티닙 내성을 유의하게 감소시켰다(도 3b). 이들 결과는 다른 TKi 에를로티닙에 의해 선행적으로 얻은 결과를 확실히 하였다.
실시예 4
재료 및 방법
세포 배양
인간 NSCL 암 세포주 H3122(EML4-ALK를 발현하는 NSCL 암 모델)는, Antonio Maraver(IRCM, 몽펠리에 소재)로부터의 친절한 선물이었다. NSCLC 세포주 H3122를 10% 소 태아 혈청(FBS)을 함유하는 RPMI 1640 배지에 배양하고, 37℃의 5% CO2를 함유하는 습윤 챔버 내에 유지하였다. 세포주를 PowerPlex 16 HS(Promega)를 사용하는 짧은 회문 반복부(STR) 분석에 의해 검증하였다.
형광 모니터링을 위해, 세포를 GFP 렌티바이러스(MOI=2)로 형질도입시키고, 녹색 형광 집단을 FACS에 의해 분류하였다.
약물 치료, 지속생존체 생존의 측정
세포주에 AsiDNA(10 μM)와 함께 또는 이의 부재 하에 알렉티닙(2 μM)을 처리하거나, 처리하지 않았고, 분광형광계(Synergy 2, BioTek)를 사용하는 형광 탐지에 의해 생존 곡선(약물 반응 및 재발)을 모니터링하였다. 배지를 주 2회 교환하고, 형광 측정은 배지 교환 직후에 실시하였다.
결과
AsiDNA 치료 단독으로는 세포 생존에 영향을 주지 않았다(도 4a). AsiDNA는 알렉티닙 획득 내성(도 4b)을 완전히 없애어, 약물 내성 세포에 의해 유발된 TKi에 대한 내성의 일반적인 메커니즘에 대한 AsiDNA의 효능을 입증하였다. AsiDNA는 H3122 세포에서 알렉티닙에 대한 내성을 없애어, 지속성 세포에 대한 이의 세포독성 활성을 확인하였다
실시예 5:
재료 및 방법
마우스 모델
6-주령 암컷 NMRI 누드 마우스(Crl:NMRI-Foxn1nu)는 프랑스 소재의 Charles River Laboratories로부터 구입하였다. 연구를 개시하기 전에 적어도 5일간 동물들을 적응시켰다. 모든 생체내 연구는 동물 보호 및 윤리 위원회(Animal Care and Ethical Committee)의 승인(#4181-2016040116494282)을 받아서, CREFRE(INSERM U006)에서 수행하였다. 동물들을 조절된 온도와 조명(12/12 h 명/암 주기) 하에서 수용하였고, 상업적인 동물 사료와 물을 임의로 제공하였다. 동물 및 이들의 관리에 관한 모든 과정은 생의학적 연구에서의 동물의 사용에 대한 기관의 지침을 따랐다.
PC9 이종이식편(xenograft)
PC9 세포를 모아서, 5×106 개의 세포를 NMRI 누드 마우스의 좌측 옆구리에 피하 이식하였다.
약물 치료, 종양 부피의 측정
종양이 평균 250±50 ㎣에 도달할 때, 마우스를 무작위로 할당하여 비히클, 또는 10 mg/kg 에를로티닙, 또는 10 mg AsiDNA(10 마우스/그룹) 중 하나를 주었다. 에를로티닙은 비히클로서의 0.1% Tween 80과 함께 0.5% 히드록시프로필 메틸셀룰로스(HPMC)를 사용하는 현탁액으로서, 1일 1회, 5일/주로 경구 투여하였다. AsiDNA는 NaCl 0.9% 용액 중에 제조하고, -20℃에서 보관하고, 투여 전 37℃로 가온시켰다. AsiDNA는 단독으로 또는 에를로티닙과 조합하여 치료의 1일차, 2일차 및 3일차에, 그 이후에는 주 1회 복막내 주사(10 mg/마우스)에 의해 투여하였다. 대조군 비히클을 처리한 마우스는 경구 투여된 0.1% Tween 80과 함께 0.5% HPMC를 받았다. 마우스에 10 주간 처리하였고, 종양 부피는 화학식 V=(길이×너비2)/2를 사용하여 캘리퍼 측정에 의해 주 2회 결정하였다.
결과
에를로티닙에 의한 치료 단독으로는, 단지 임상적 상황에서 종양 성장 가능성을 일시적으로 조절할 수 있을 뿐이다(도 5b). AsiDNA에 의한 치료는 종양 성장을 약간 감소시키는 반면(도 5c), 두 약물의 조합물은 종양 성장을 유의하게 감소시키고, 2회의 완전 관해를 유발하여(도 5d), 생체내 환경에서 EGFR-TKi 획득 내성을 조절하는 AsiDNA의 가능성을 입증하였다.
SEQUENCE LISTING <110> ONXEO et al <120> A DBAIT MOLECULE IN COMBINATION WITH KINASE INHIBITOR FOR THE TREATMENT OF CANCER <130> B2973PC <160> 6 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 32 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> Dbait32 <400> 1 acgcacgggt gttgggtcgt ttgttcggat ct 32 <210> 2 <211> 32 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> Dbait32Ha <400> 2 cgtaggtctg tttggtggct ttgcagtggc ac 32 <210> 3 <211> 32 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> Dbait32Hb <400> 3 gctaggcttg tttgctgggt tgtaggcaca gc 32 <210> 4 <211> 32 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> Dbait32Hc <400> 4 gctgtgccca caacccagca aacaagccta ga 32 <210> 5 <211> 32 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> Dbait32Hd <400> 5 gctaggtctg tttggtggct ttgcagtggc ac 32 <210> 6 <211> 32 <212> DNA <213> artificial sequence <220> <223> Dbait molecule IIa <220> <221> misc_feature <223> at the 3' end of the complementary strand the three last nucleotides with phosphorothioate or methylphosphonate backbone <220> <221> misc_feature <222> (1)..(1) <223> at the 5' end, Lm = carboxamido oligoethylene glycol + C = single or double chain fatty acids, cholesterol, sugars, peptides or proteins <220> <221> misc_feature <222> (1)..(1) <223> at the 5' end, Lm = tetraethyleneglycol + C = cholesterol <220> <221> stem_loop <222> (1)..(32) <220> <221> modified_base <222> (1)..(3) <223> mod_base= phosphorothioate or methylphosphonate backbone <220> <221> misc_feature <222> (32)..(32) <223> loop L' = 1,19-bis(phospho)-8-hydraza-2-hydroxy-4-oxa-9-oxo-nonadecane <400> 6 gctgtgccca caacccagca aacaagccta ga 32

Claims (16)

  1. Dbait 분자 및 단백질 키나제 억제제를 포함하는, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  2. 제1항에 있어서, 상기 키나제 억제제는 EGFR 패밀리, ALK, B-Raf, MEK, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, IGF1R, c-Met, JAK 패밀리, PDGFR α 및 β, RET, AXL, c-KIT, TrkA, TrkB, TrkC, ROS1, BTK 및 Syk로 이루어지는 목록에서 선택된 하나 또는 수 개의 대상을 표적화하는 억제제인, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 Dbait 분자는 적어도 하나의 자유 말단과, 인간 게놈 내의 임의의 유전자와 60% 미만의 서열 동일성을 갖는 20~200 bp의 DNA 이중 가닥 부분을 갖는, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 Dbait 분자는 이하의 화학식들 중 하나를 갖고:
    Figure pct00017
    .
    상기에서, N은 데옥시뉴클레오티드이고, n은 15 내지 195의 정수이고, 밑줄 친 N은 변형된 포스포디에스테르 골격을 갖거나, 갖지 않는 뉴클레오티드이고, L'은 링커이고, C는 친유성 분자, 또는 수용체 매개 엔도시토시스를 가능하게 하는 세포 수용체를 표적화하는 리간드로부터 선택된 엔도시토시스를 용이하게 하는 분자이고, L은 링커이고, m 및 p는 독립적으로 0 또는 1의 정수인, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 Dbait 분자는 이하의 화학식을 갖고:
    Figure pct00018
    .
    N, N, n, L, L', C 및 m에 대해서는 화학식 (I), (II) 및 (III)에서와 동일한 정의를 갖는, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 Dbait 분자는 이하의 화학식을 갖는, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트:
    Figure pct00019
    .
  7. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 키나제 억제제는 게피티닙, 에를로티닙, 라파티닙, 반데타닙, 아파티닙, 오시머티닙, 네라티닙, 다코미티닙, 브리가티닙, 카너티닙, 나쿠오티닙, 나자르티닙, 펠리티닙, 로실레티닙, 이코티닙, AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙, WZ4002, 크리조티닙, 엔트렉티닙, 세리티닙, 알렉티닙, 롤라티닙, TSR-011, CEP-37440, 엔사르티닙, 베무라페닙, 다브라페닙, 레고라페닙, PLX4720, 코비메티닙, 트라메티닙, 비니메티닙, 셀루메티닙, PD-325901, CI-1040, PD035901, U0126, TAK-733, 렌바티닙, 데비오-1347, 도비티닙, BLU9931, 소라페닙, 수니티닙, 레스타우티닙, 탄두티닙, 퀴자티닙, 크레놀라닙, 길테리티닙, 포나티닙, 이브루티닙, 린시티닙, NVP-AEW541, BMS-536924, AG-1024, GSK1838705A, BMS-754807, PQ 401, ZD3463, NT157, 피크로포도필린(PPP), 티반티닙, JNJ-38877605, PF-04217903, 포레티닙(GSK 1363089), 메레스티닙, 룩솔리티닙, 토파시티닙, 오클라시티닙, 바리시티닙, 필고티닙, 세둘라티닙, 간도티닙, 모멜로티닙, 파크리티닙, PF-04965842, 우파다시티닙, 페피시티닙, 페드라티닙, 이마티닙, 파조파닙, 텔라티닙, 보수티닙, 닐로티닙, 카보잔티닙, 벰센티닙, 아무바티닙, 길테리티닙(ASP2215), 글레사티닙(MGCD 265), SGI-7079, 라로트렉티닙, RXDX-102, 알티라티닙, LOXO-195, 시트라바티닙, TPX-0005, DS-6051b, 포스타마티닙, 엔토스플레티닙 및 TAK-659로 이루어지는 군으로부터 선택된, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  8. 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 티로신 키나제 억제제는 EGFR, ALK 및 B-Raf로 이루어지는 군으로부터 선택된 단백질 키나제의 억제제, 특히 게피티닙, 에를로티닙, 라파티닙, 반데타닙, 아파티닙, 오시머티닙, 네라티닙, 다코미티닙, 브리가티닙, 카너티닙, 나쿠오티닙, 나자르티닙, 펠리티닙, 로실레티닙, 이코티닙, AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙, WZ4002, 크리조티닙, 엔트렉티닙, 세리티닙, 알렉티닙, 롤라티닙, TSR-011, CEP-37440, 엔사르티닙, 베무라페닙, 다브라페닙, 레고라페닙 및 PLX4720으로 이루어지는 군으로부터 선택된 단백질 키나제 억제제인, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단백질 키나제 억제제는 EGFR 억제제, 특히 게피티닙, 에를로티닙, 라파티닙, 반데타닙, 아파티닙, 오시머티닙, 네라티닙, 다코미티닙, 브리가티닙, 카너티닙, 나쿠오티닙, 나자르티닙, 펠리티닙, 로실레티닙, 이코티닙, AZD3759, AZ5104(CAS No. 1421373-98-9), 포지오티닙 및 WZ4002로 이루어지는 군으로부터 선택된 EGFR 억제제인, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  10. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단백질 키나제 억제제는 ALK 억제제, 특히 크리조티닙, 엔트렉티닙, 세리티닙, 알렉티닙, 브리가티닙, 롤라티닙, TSR-011, CEP-37440 및 엔사르티닙으로 이루어지는 군으로부터 선택된 ALK 억제제인, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 암의 치료에 사용하기 위한, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트.
  12. 특히 제2항 및 제7항 내지 제10항 중 어느 한 항에서 정의된 키나제 억제제와 조합된, 암의 치료에 사용하기 위한 제1항 및 제3항 내지 제6항 중 어느 한 항에서 정의된 Dbait 분자.
  13. 환자에서 키나제 억제제, 특히 제2항 및 제7항 내지 제10항 중 어느 한 항에서 정의된 키나제 억제제에 내성을 갖는 암의 발달을 지연시키고/거나 예방하는데 사용하기 위한, 제1항 및 제3항 내지 제6항 중 어느 한 항에서 정의된 Dbait 분자.
  14. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 암은 백혈병, 림프종, 육종, 흑색종, 및 두경부암, 신장암, 난소암, 췌장암, 전립선암, 갑상선암, 폐암, 식도암, 유방암, 방광암, 뇌암, 결장직장암, 간암 및 자궁경부암으로 이루어지는 군으로부터 선택되는, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트 또는 Dbait 분자.
  15. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 암은 폐암, 특히 비-소세포 폐암, 백혈병, 특히 급성 골수성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 림프종, 특히 말초 T-세포 림프종, 만성 골수 기원 백혈병, 두경부의 편평 세포 암종, BRAF 돌연변이를 갖는 진행성 흑색종, 직장결장암, 위장관 기질 종양, 유방암, 특히 HER2+ 유방암, 갑상선암, 특히 진행성 수질 갑상선암, 신장암, 특히 신세포 암종, 전립선암, 신경교종, 췌장암, 특히 췌장 신경내분비 암, 다발성 골수종, 및 간암, 특히 간세포성 암종으로 이루어지는 군으로부터 선택되는, 약학적 조성물, 조합물 또는 키트 또는 Dbait 분자.
  16. 암의 치료에서 암 지속상 세포에 대한 표적 효과, 특히 제2항 및 제7항 내지 제10항 중 어느 한 항에서 정의된 키나제 억제제에서 암 지속성 세포에 대한 표적 효과에 사용하기 위한, 제1항 및 제3항 내지 제6항 중 어느 한 항에서 정의된 Dbait 분자.
KR1020217033652A 2019-03-21 2020-03-19 암 치료를 위한 키나제 억제제와 조합된 dbait 분자 KR20210142154A (ko)

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