KR20100055413A - 안정화된 면역 조절성 rna(simra)화합물 - Google Patents

안정화된 면역 조절성 rna(simra)화합물 Download PDF

Info

Publication number
KR20100055413A
KR20100055413A KR1020107002897A KR20107002897A KR20100055413A KR 20100055413 A KR20100055413 A KR 20100055413A KR 1020107002897 A KR1020107002897 A KR 1020107002897A KR 20107002897 A KR20107002897 A KR 20107002897A KR 20100055413 A KR20100055413 A KR 20100055413A
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
artificial sequence
modified
base
rna
synthetic oligonucleotide
Prior art date
Application number
KR1020107002897A
Other languages
English (en)
Other versions
KR101343489B1 (ko
Inventor
에캄바르 알. 칸디말라
타오 란
다큉 왕
라크쉬미 바가트
수드히르 아그라왈
Original Assignee
이데라 파마슈티칼즈, 인코포레이티드
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 이데라 파마슈티칼즈, 인코포레이티드 filed Critical 이데라 파마슈티칼즈, 인코포레이티드
Publication of KR20100055413A publication Critical patent/KR20100055413A/ko
Application granted granted Critical
Publication of KR101343489B1 publication Critical patent/KR101343489B1/ko

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/39Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the immunostimulating additives, e.g. chemical adjuvants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7105Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • A61P11/06Antiasthmatics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/08Antiallergic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/02Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/117Nucleic acids having immunomodulatory properties, e.g. containing CpG-motifs
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/555Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by a specific combination antigen/adjuvant
    • A61K2039/55511Organic adjuvants
    • A61K2039/55561CpG containing adjuvants; Oligonucleotide containing adjuvants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/17Immunomodulatory nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/317Chemical structure of the backbone with an inverted bond, e.g. a cap structure
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30Chemical structure
    • C12N2310/31Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/318Chemical structure of the backbone where the PO2 is completely replaced, e.g. MMI or formacetal
    • C12N2310/3183Diol linkers, e.g. glycols or propanediols
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/50Physical structure
    • C12N2310/51Physical structure in polymeric form, e.g. multimers, concatemers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2320/00Applications; Uses
    • C12N2320/50Methods for regulating/modulating their activity
    • C12N2320/51Methods for regulating/modulating their activity modulating the chemical stability, e.g. nuclease-resistance

Abstract

본 발명은 면역 치료 적용을 위해 면역 조절제로서 신규한 안정화된 올리고리보누클레오티드의 치료학적 용도에 관한 것이다. 구체적으로, 본 발명은 TLR7 및/또는 TLR8을 통해 면역 조절 활성을 갖는 개선된 누클레아제 및 RN나아제 안정성을 갖는 신규한 RNA 기재의 올리고리보누클레오티드를 제공한다.

Description

안정화된 면역 조절성 RNA(SIMRA)화합물{STABILIZED IMMUNE MODULATORY RNA (SIMRA) COMPOUNDS}
본 발명은 일반적으로 면역조절제로서 올리고리보누클레오티드를 사용하는 면역학 및 면역 치료 응용 분야에 관한 것이다. 더욱 구체적으로, 본 발명은 면역 조절용 RNA 조성물, 및 톨 유사(too-like) 수용체 8(TLR8), 톨 유사 수용체 7(TLR7), 및 TLR7 및 TLR8을 통해 면역 반응을 조절하기 위해 이들을 사용하는 방법에 관한 것이다.
면역 반응은 이 반응에 관여하는 세포의 서브셋(subset)에 근거하여 선천성 반응 및 후천성 반응 둘 모두를 포함한다. 예를 들어, 지연 타입 과민반응 및 세포독성 T 림프구(CTL)의 활성화와 같은 전통적인 세포 매개된 기능에 관련된 T 헬퍼(Th) 세포는 Th1 세포인 반면, B-세포 활성화에 대해 헬퍼 세포로서 관련된 Th 세포는 Th2 세포이다. 면역 반응의 타입은 항원 노출에 대한 반응으로 생성된 사이토카인(cytokine) 및 케모카인(chemokine)에 의해 영향받는다. 사이토카인은 T 헬퍼 1(Th1) 및 T 헬퍼 2(Th2) 세포의 균형을 맞춤으로써 면역 반응을 조절하기 위한 수단을 제공하며, 이것은 일어나는 면역 반응의 타입에 직접적인 영향을 준다. 상기 균형이 보다 많은 수의 Th1 세포 쪽으로 치우치면, 세포 매개된 면역 반응이 일어나고, 이것은 세포독성 T 세포(CTL)의 활성화를 포함한다. 상기 균형이 보다 많은 수의 Th2 세포 쪽으로 치우치면, 체액 또는 항체 면역 반응이 일어난다. 각각의 이러한 면역 반응은 상이한 일련의 사이토카인이 Th1 및 Th2 세포로부터 분비되게 한다. Th1 및 Th2 세포에 의해 분비된 사이토카인에서의 차이는 이들 두 T 세포 서브셋의 상이한 생물학적 기능의 결과일 수 있다.
Th1 세포는 항원에 대한 신체 고유 반응(예를 들어, 바이러스 감염, 세포내 병원균 및 종양 세포)에 관여한다. 항원에 대한 초기 반응은 항원 제공 세포(예를 들어, 활성화된 마크로파지 및 수지상 세포)로부터의 IL-12의 분비 및 이에 수반되는 Th1 세포의 활성화일 수 있다. Th1 세포 활성화 결과는 특정 사이토카인(예를 들어, IL-2, IFN-감마 및 그 밖의 사이토카인)의 분비 및 수반되는 항원 특이적 CTL의 활성화이다. Th2 세포는 박테리아, 기생충, 항원 및 알레르겐에 반응하여 활성화되는 것으로 공지되어 있으며, 특정 사이토카인(예를 들어, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-9, IL-10, IL-13 및 그 밖의 사이토카인) 및 케모카인의 분비를 통해 신체의 후천성 면역 반응(예를 들어, IgE 생성 및 호산구 활성화)을 조절할 수 있다. 이러한 특정 사이토카인의 분비는 B-세포 증식과 항체 생성 증가를 유도할 수 있다. 또한, 이러한 특정 사이토카인은 그 밖의 사이토카인의 방출을 자극하거나 억제할 수 있다(예를 들어, IL-10은 Th1 세포로부터 IFN-γ 분비를 억제하고, 수지상 세포로부터 IL-12 분비를 억제한다). 궁극적으로, 선택된 자극에 반응하여 방출되는 사이토카인 및 케모카인과 Th1 및 Th2 세포 간의 균형은 신체의 면역 시스템이 질병에 대해 반응하는 방법에 있어서 중요한 역할을 할 수 있다. 예를 들어, IFN-α는 C형 간염을 억제할 수 있고, MIP-1α 및 MIP-1β(이들은 또한 각각 CCL3 및 CCL4로서 공지되어 있음)은 HIV-1 감염을 억제할 수 있다. Th1/Th2 면역 반응의 최적의 균형화가 면역 시스템을 사용할 기회를 제공하여 다양한 질병을 치료하고 예방한다.
Th1 면역 반응은 예를 들어, 박테리아 또는 합성 DNA 함유 비메틸화 CpG 디누클레오티드의 도입에 의해 포유동물에서 유도될 수 있으며, 이러한 면역 반응은 패턴 인식 수용체(PRR)로 공지된 특정 면역 세포에 대한 수용체에 특이적인 올리고누클레오티드 서열(예를 들어, 비메틸화 CpG)을 제공하는 것으로부터 발생한다. 이러한 특정 PRR이 톨 유사 수용체(TLR)이다.
톨 유사 수용체(TLRs)는 미생물 감염에 반응하여 선천성 면역 반응을 유도하는데 긴밀하게 관여한다. 척추동물에 있어서, TLR은 병원균 관련된 분자 패턴을 인식하는 것으로 공지되어 있는 10개 단백질(TLRl 내지 TLRl0)의 패밀리로 구성된다. 상기 10개 중, TLR3, 7, 8, 및 9는 세포 내측 엔도솜(endosome)에 편재되어, 핵산(DNA 및 RNA) 및 소분자, 예컨대, 누클레오시드 및 핵산 대사물질을 인식하는 것으로 공지되어 있다. TLR3 및 TLR9은 바이러스 및 박테리아, 및 합성 DNA에 각각 존재하는 dsRNA 및 비메틸화된 CpG 디누클레오티드와 같은 핵산을 인식하는 것으로 공지되어 있다. 박테리아 DNA는 면역 시스템을 활성화시키고 항종양 활성을 발생시키는 것으로 확인되었다[참조: Tokunaga T et al., J. Natl. Cancer Inst. (1984) 72:955-962; Shimada S, et al., Jpn. H cancer Res, 1986, 77, 808-816; Yamamoto S, et al., Jpn. J. Cancer Res., 1986, 79, 866-73; Messina, J, et al., J. Immunolo. (1991) 147:1759-1764]. CpG 디누클레오티드를 함유하는 안티센스 올리고누클레오티드를 사용하는 다른 연구에서는 면역 반응의 자극이 입증되었다[참조: Zhao Q, et al., Biochem.Pharmacol. 1996, 26, 173-82]. 이후, 연구에서는, TLR9가 박테리아 및 합성 DNA에 존재하는 비메틸화 CpG 모티브(motif)를 인식하는 것으로 나타났다[참조: Hemmi H, et al., Nature. (2000) 408:740-5]. 또한, CpG 함유 포스포로티오에이트 올리고누클레오티드의 또 다른 변형부는 TLR9를 통해 작용하여 면역 반응을 조절하는 이들의 능력에 영향을 미칠 수 있다[참조예: Zhao et al, Biochem. Pharmacol. (1996) 51:173-182; Zhao et al, Biochem Pharmacol. (1996) 52:1537-1544; Zhao et al., Antisense Nucleic Acid Drug Dev. (1997) 7:495-502; Zhao et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. (1999) 9:3453-3458; Zhao et al. Bioorg. Med. Chem. Lett. (2000) 10:1051-1054; Yu et al, Bioorg. Med. Chem. Lett. (2000) 10:2585-2588; Yu etal, Bioorg. Med. Chem. Lett. (2001) 11:2263-2267; and Kandimalla et al, Bioorg. Med. Chem. (2001) 9:807-813]. 또한, 구조 활성 관련성 연구에서는, 비메틸화 CpG 디누클레오티드로부터 얻어지는 것들과는 별개의 특이적 면역 반응 프로파일을 유도하는 신규한 DNA 기재 구조물 및 합성 모티브를 확인할 수 있었다[참조: Kandimalla ER, et al, Proc Natl Acad Sci USA. (2005) 102:6925-30, Kandimalla ER, et al., Proc Natl Acad Sci USA. (2003) 100:14303-8. Cong YP, et al., Biochem Biophys Res Commun. (2003) 310:1133-9. Kandimalla ER, et al., Biochem Biophys Res Commun. (2003) 306:948-53. Kandimalla ER, et al., Nucleic Acids Res. (2003) 31:2393-400. Yu D, et al., Bioorg Med Chem. (2003) 11:459-64. Bhagat L, et al., Biochem Biophys Res Commun. (2003) 300:853-61. Yu D, et al., Nucleic Acids Res. (2002) 30:4460-9. Yu D, et al., J Med Chem. (2002) 45:4540-8. YuD, et al., Biochem Biophys Res Commun. (2002) 297:83-90. Kandimalla ER, et al., Bioconjug Chem. (2002) 13:966-74. Yu D, K et al., Nucleic Acids Res. (2002) 30:1613-9. Yu D, et al., Bioorg Med Chem. (2001) 9:2803-8. Yu D, et al., Bioorg Med Chem Lett. (2001) 11:2263-7. Kandimalla ER, et al., Bioorg Med Chem. (2001) 9:807-13. Yu D, et al., Bioorg Med Chem Lett. (2000) 10:2585-8, Putta MR, et al., Nucleic Acids Res. (2006) 34:3231-8]. 그러나, 최근까지, TLR7 및 TLR8에 대한 천연 리간드는 공지되어 있지 않다.
TLR 7 및 8이 바이러스 및 합성 단일 가닥 RNA, 및 다수의 누클레오시드를 포함하는 소분자를 인식하는 것으로 나타났다[참조: Diebold, S.S., et al. Science v: 303, 1529-1531 (2004)]. 디볼드(Diebold) 등의 문헌(Science, v303: 1529-1531 (2004))에서는, 인플루엔자 바이러스에 대한 IFN-α반응이 인플루엔자 게놈 RNA의 엔도솜 인식 및 TLR7 및 MyD88에 의한 시그널화를 필요로 한다는 것을 입증하고 있으며, TLR7에 대한 리간드로서 ssRNA를 확인하였다. 특정 합성 화합물인, 이미다조퀴놀론 이미퀴모드(imidazoquinolones imiquimod) (R-837) 및 레시퀴노드(resiquimod) (R-848)가 TLR7 및 TLR8의 리간드이다[참조: Hemmi H et al., (2002) Nat Immunol 3:196-200; Jurk M et al, (2002) Nat Immunol 3:499]. 또한, 특정 구아노신 유사체, 예컨대, 7-데아자-G, 7-티아-8-옥소-G(TOG), 및 7-알릴-8-옥소-G(록소리빈(loxoribine))은 높은 농도에서 TLR7를 활성화시키는 것으로 나타났다[참조: Lee J et al., Proc Natl Acad Sci USA. 2003, 100:6646-51]. 그러나, 이러한 소분자, 예를 들어, 이미퀴모드는 또한 다른 수용체를 통해 작용하는 것으로 공지되어 있다[참조: Schon MP, et al., J. Invest Dermatol., 2006, 126, 1338-47].
TLR7 또는 TLR8 인식을 위한 임의의 공지된 특이적 ssRNA 모티브 및 가능하게는 넓은 범위의 자극성 ssRNA 분자의 결여는, TLR7 및 TLR8이 자가 및 바이러스 RNA 둘 모두를 인식할 수 있음을 시사한다. 최근에는, 특정 GU-풍부 올리고리보누클레오티드가 N-[1-(2,3-디올레오일옥시)프로필]-N,N,N-트리메틸암모늄에틸설페이트(DOTAP) 또는 그 밖의 리간드 제제와 함께 착물형성된 경우, 면역자극성이며 TLR7 및 TLR8를 통해 작용하는 것으로 나타났다[참조:Heil et al. Science, 303: 1526-1529 (2004); Lipford et al. WO03/086280; Wagner et al. WO98/32462]. 그러나, RNA 분자는 오랫동안 예를 들어, 리보자임으로서 그리고 더욱 최근에는 siRNA 및 마이크로RNA로서 사용되어 왔고, 리보자임으로 사용된 RNA, siRNA 및 마이크로RNA는 GU 디누클레오티드를 함유한다. 또한, 다수의 이러한 RNA 분자는 지질의 존재 하에서 TLR 자극을 통해 면역 반응을 일으키는 것으로 나타났다[참조: Kariko et al., Immunity (2005) 23: 165-75; Ma Z et al., Biochem Biophys Res Commun., (2005) 330, 755-9]. 그러나, 이러한 RNA 분자의 불안정성이 많은 분야에서 이러한 분자를 사용하고 적용함(예를 들어, 사람 질병의 예방 및 치료)에 있어서의 발전을 방해하였다.
리보오스 또는 데옥시리보오스 당을 함유하는 올리고누클레오티드 및 올리고데옥시누클레오티드는 진단적 프로빙, PCR 프라이밍, 유전자 발현의 안티센스 억제, siRNA, 아프타머(aptamer), 리보자임, 및 톨 유사 수용체(TLR)에 기초한 면역치료제를 포함하나 이로 제한되는 것은 아닌 광범위한 분야에서 사용되어 왔다. 보다 최근에, 많은 문헌에서는, 단독 사용을 위한 면역 조절제로서 또는 애주번트로서 알레르기, 천식, 자가면역 질환, 암 및 감염성 질환과 같은 많은 질병에 대한 면역치료 용도에서 올리고데옥시누클레오티드의 사용을 입증하였다.
DAN 올리고누클레오티드가 TLR9에 의해 인식되고 RNA 올리고누클레오티드가 TLR7 및/또는 TLR8에 의해 인식된다는 사실은, 대개는 DNA와 RNA 간의 구조적 형태에서의 차이에 의한 것으로 보인다. 그러나, DNA와 RNA 간의 화학적 차이가 또한 DNA가 RNA보다 훨씬 더 화학적으로 그리고 효소적으로 안정하게 만든다.
RNA는 거의 존재하지 않거나, 존재할 경우 자가-ssRNA가 항원 제공 세포에 도달하도록 보장하는, 편재하는 세포외 리보누클레아제(RN아제)에 의해 급격히 분해된다. 핵산의 엑소누클레아제에 의한 분해는 3'-누클레아제에 의한 소화가 우세하며, 5'-엑소누클레아제 작용에 의해서는 작은 비율로 분해된다. 엑소누클레아제 소화작용 이외에, RNA는 또한 RN아제의 엔도누클레아제 활성에 의해 분해될 수 있다. RNA-기재 분자는 지금까지 지질과 착물형성하여 누클레아제에 대한 안정성을 제공하였다.
자가면역 반응성을 방해하는 본질적 기능을 제공하면서도, 이러한 리보누클레아제는 또한 이들이 합성 및 천연 ssRNA 둘 모두를 신속하게 분해시킬 것이기 때문에 면역치료를 위해 이용하고자 계획된 임의의 합성 ssRNA 분자에 대해 상당한 문제점을 제기한다. 이러한 장애를 극복하기 위해, 리포좀에서 ssRNA를 캡슐화시키고, 이것을 폴리에틸렌이민과 축합시키거나, 이것을 N-[1-(2,3-디올레오일옥시)-프로필]-N,N,N-트리메틸암모늄메틸-설페이트(DOTAP)와 같은 분자에 착물형성시킴으로써 ssRNA 분자를 분해로부터 보호하는 것이 시도되었다. 그러나, 이러한 보호 조치는 여전히 불안정한 ssRNA에 적용되는 2차 조치이며, ssRNA(천연 또는 합성)의 생체내 효능 및 면역 조절 활성에 대한 이러한 보호 조치의 효과는 여전히 불명료하다.
아그라월(Agrawal) 등 (11/697,422)은 신규 부류의 SIMRA 조성물을 기재하고 있다. 그러나, 네이키드(naked) RNA가 TLR7 및/또는 TLR 8에 대한 리간드로서 지속적으로 인식되도록 이 RNA를 유지하면서, 유용한 생체내 분자가 될 수 있도록 이의 안정성을 개선시키는 것이 문제로 남아있다. 이상적으로, 이러한 문제는 새로운 면역치료제로서 작용할 수 있는 본래 안정한 RNA 기재 분자의 설계를 통해 해결될 수 있는 데, 이 신규한 면역치료제는 많은 임상적으로 관련된 적용, 예컨대, 동시 투여되는 경우에 백신화의 효과를 개선시키거나, 면역 반응을 유발시키거나 증진시키는 것이 유리한 질병, 예를 들어, 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 염증성 질환, 감염성 질환, 피부 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질병을 치료 및/또는 예방하는 것에서 사용될 것이다.
발명의 요약
제 1 양태에서, 본 발명은 하기 추가로 규정된 신규 부류의 안정화된 면역 조절성 RNA("SIMRA") 화합물, 및 면역 반응을 유도하고/하거나 증가시키기 위한 이들의 용도를 제공한다. 본 발명에 따른 신규한 화학 물질은 면역 반응 유도에 실질적으로 더욱 효과적이며, 분해에 실질적으로 덜 민감한, 면역 반응 유도 및/또는 증강 화합물을 제공한다. 본 발명에 따른 방법은 SIMRA를 사용하여 면역치료 적용을 위해 사이토카인 및/또는 케모카인 프로파일을 변형시킬 수 있다.
제 1 양태의 구체예에서, 본 발명은 TLR8에 대한 효능제(agonist)로서 SIMRA 화합물을 제공한다.
제 1 양태의 추가 구체예에서, 본 발명은, TLR7 및 TLR8에 대한 효능제로서 SIMRA 화합물을 제공한다.
제 1 양태의 추가 구체예에서, 본 발명은 TLR7에 대한 효능제로서 SIMRA 화합물을 제공한다.
제 1 양태의 추가 구체예에서, 본 발명은 애주번트로서 SIMRA 화합물을 제공한다.
제 2 양태에서, 본 발명은 약제 조성물을 제공한다. 이들 조성물은 본 발명의 SIMRA 조성물 중 임의의 하나, 및 생리학적으로 허용되거나 약제학적으로 허용되는 담체를 포함한다.
제 3 양태에서, 본 발명은 약제학적 유효량의 본 발명에 따른 SIMRA 화합물중 하나 이상을 척추동물에 투여하는 것을 포함하여, 척추동물에서 면역반응을 생성시키는 방법을 제공한다.
제 4 양태에서, 본 발명은 면역 반응 유도 및/또는 증강이 유리한 질환 또는 질병 예를 들어, 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 염증 질환, 감염 질환, 피부 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환을 갖는 척추동물을 치료학적으로 치료하는 방법으로서, 이러한 질환 또는 질병에 걸린 환자에게 약제학적 유효량의 본 발명에 따른 SIMRA 화합물 중 하나 이상을 투여하는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
제 5 양태에서, 본 발명은 척추동물에서 면역 반응 유도 및/또는 증강이 유리한 질환 또는 질병 예를 들어, 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 염증 질환, 감염 질환, 피부 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환을 예방하는 방법으로서, 이러한 질환 또는 질병에 걸리기 쉬운 척추동물에게 약제학적 유효량의 본 발명에 따른 SIMRA 화합물 중 하나 이상을 투여하는 것을 포함하는 방법을 제공한다.
제 6 양태에서, 본 발명은 사이토카인 또는 케모카인(예를 들어, 면역 세포, PBMC)을 생성할 수 있는 세포를 분리하고, 이러한 세포를 표준 세포 배양 조건하에서 배양하고, 생체외에서 이러한 세포를 본 발명의 SIMRA 중 하나 이상으로 처리하여 분리된 세포가 증가된 수준의 사이토카인 또는 케모카인을 생성하거나 분비하도록 하고, 처리된 세포를 질환의 예방 또는 치료를 위해 사이토카인 또는 케모카인 치료가 필요한 환자에 투여 또는 재투여하는 방법을 제공한다.
본 발명의 이러한 양태의 추가 구체예에서, 질환의 예방 또는 치료를 위한 사이토카인 또는 케모카인 치료가 필요한 환자에게, 하나 또는 그 초과의 SIMRA 화합물과 함께, 분리된 SIMRA-처리된 세포가 투여된다.
본 발명의 SIMRA 화합물을 실시예 1에 따라 합성하였다. 도 1은 본 발명의 SIMRA 화합물의 평행 합성을 위한 합성 도식이다. DMTr = 4,4'-디메톡시트리틸; CE = 시아노에틸.
도 2a는 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, HEK293 세포를 18시간 동안 TLR8 효능제 150㎍/ml로 자극시키고, NF-κB의 수준을 SEAP(사람 배아 알칼리 포스파타아제의 분비된 형태) 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 2b는 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, HEK293 세포를 20시간 동안 TLR8 효능제 150㎍/ml로 자극시키고, NF-κB의 수준을 SEAP 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 2c 내지 2e는 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, HEK293 세포를 18시간 동안 TLR8 효능제 150㎍/ml로 자극시키고, NF-κB의 수준을 SEAP 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 2f는 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포를 18시간 동안 TLR8 효능제 0, 20, 50, 100, 200 또는 300㎍/ml로 자극시켰다. NF-κB의 수준을 SEAP 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 2g는 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR7을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, 사람 TLR7을 발현하는 HEK293 세포를 18시간 동안 TLR7 효능제 0, 20, 50, 100, 200 또는 300㎍/ml로 자극시켰다. NF-κB의 수준을 SEAP 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 2h, 2j 및 2l은 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, 사람 TLR8을 발현하는 HEK293 세포를 18시간 동안 TLR8 효능제 0, 20, 50, 100, 200 또는 300㎍/ml로 자극시켰다. NF-κB의 수준을 SEAP 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 2i, 2k 및 2m은 실시예 2에 따라 처리하고 분석한 사람 TLR7을 발현하는 HEK293 세포내에서의 NF-κB 활성을 나타낸다. 간단히, 사람 TLR7을 발현하는 HEK293 세포를 18시간 동안 TLR7 효능제 0, 20, 50, 100, 200 또는 300㎍/ml로 자극시켰다. NF-κB의 수준을 SEAP 검정을 사용하여 측정하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 면역 반응 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 3a 내지 3c는 실시예 3에 따라 처리되고 분석된 사람 PBMC로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, PBMC를 건강한 사람 지원자로부터의 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 50㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스(Luminex multiplex) 검정으로 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 4a 내지 4c는 실시예 3에 따라 처리되고 분석된 사람 PBMC로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, PBMC를 건강한 사람 지원자로부터의 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 200㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 4d 내지 4g는 실시예 3에 따라 처리되고 분석된 사람 PBMC로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, PBMC를 건강한 사람 지원자로부터 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 증가하는 농도의 TLR7/8 효능제와 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 5a 내지 5c는 실시예 3에 따라 분리되고 처리되고 분석된 사람 형질세포양 수지상 세포(pDC)로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, pDC를 건강한 사람 지원자로부터의 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 50㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 5d는 실시예 3에 따라 분리되고 처리되고 분석된 사람 형질세포양 수지상 세포(pDC)로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, pDC를 건강한 사람 지원자로부터의 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 50㎍/ml 또는 200㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 6a, 6b, 6c, 6e 및 6f는 실시예 3에 따라 분리되고 처리되고 분석된 사람 형질세포양 수지상 세포(pDC)로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, pDC를 건강한 사람 지원자로부터 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 200㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 6d는 실시예 3에 따라 분리되고 처리되고 분석된 사람 형질세포양 수지상 세포(pDC)로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, pDC를 건강한 사람 지원자로부터 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 100㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 7a 내지 7c는 실시예 3에 따라 분리되고 처리되고 분석된 사람 형질세포양 수지상 세포(pDC)로부터의 사이토카인 및 케모카인 농도를 나타낸다. 간단히, mDC를 건강한 사람 지원자로부터 새로 채혈한 혈액으로부터 분리하고 24시간 동안 TLR7/8 효능제 50㎍/ml 용량과 함께 배양하고, 상청을 회수하고 루미넥스 멀티플렉스 검정에 의해 사이토카인 및 케모카인 수준을 분석하였다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 8a 및 8b는 실시예 4에 따라 처리하고 분석한 지 2시간 후에 C57BL/6 마우스(n=3)에서 혈청 사이토카인의 유도를 나타낸다. 간단히, C57BL/6 마우스에 TLR7/8 효능제 25㎍/ml 용량으로 피하 주사하고, 효능제 주사 2시간 후에, 혈청을 사이토카인 및 케모카인 수준에 대해 분석하고 IL-12 수준을 얻었다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 생체내 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 9a 및 9b는 실시예 4에 따라 처리하고 분석한 지 2시간 후에 BALB/c 마우스(n=3)에서 혈청 사이토카인의 유도를 나타낸다. 간단히, BALB/c 마우스에 TLR7/8 효능제 25㎍/ml 용량으로 피하 주사하고, 효능제 주사 2시간 후에, 혈청을 사이토카인 및 케모카인 수준에 대해 분석하고 IL-12 수준을 얻었다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 생체내 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 9c 내지 9f는 실시예 4에 따라 처리하고 분석한 지 2시간 후에 BALB/c 마우스(n=3)에서 혈청 사이토카인의 유도를 나타낸다. 간단히, BALB/c 마우스에 TLR7/8 효능제의 10㎍/ml 또는 25㎍/ml 용량으로 피하 주사하고, 효능제 주사 2시간 후에, 혈청을 사이토카인 및 케모카인 수준에 대해 분석하고 IL-12 수준을 얻었다. 상기 데이터로부터, 본 발명에 따른 SIMRA의 생체내 투여에 의해 독특한 TLR-매개된 사이토카인 및 케모카인 프로파일이 생성됨이 증명된다.
도 10a 내지 10h는 실시예 5에 따라 처리된 표 2로부터의 견본 SIMRA 화합물의 혈청 안정도를 나타낸다. 간단히, 대략 0.5OD의 견본 SIMRA 화합물을 개별적으로 37℃에서 30분 동안 PBS 중 1% 사람 혈청에서 인큐베이션하였다. 30분의 인큐베이션의 끝 무렵에, SIMRA 화합물을 음이온 교환 HPLC 상에서 분석하여, 혈청 처리 전에 제공된 SIMRA 화합물의 양과 비교하여 남아있는 전장 SIMRA 화합물의 비율(%)을 측정하였다.
본 발명은 면역치료 적용을 위한 면역 조절제로서의 올리고리보누클레오티드의 치료학적 용도에 관한 것이다. 특히, 본 발명은 TLR7 단독, TLR7과 TLR8, 또는 TLR8 단독을 통해 면역 반응을 조절하는 생체내 안정도가 증가된 RNA-기재 올리고누클레오티드(SIMRA 화합물)를 제공한다. 예를 들어, TLR7 및/또는 TLR8의 안정한 효능제 또는 SIMRA 화합물로 수지상 세포 및 기타 항원-제시 세포를 활성화시켜 다양한 선천성 및 후천성 면역 반응 메카니즘을 개시시킴으로써, 생성된 사이토카인 프로파일이 병원균, 감염된 세포 또는 종양 세포의 파괴 및 항원-특이적 항체 및 CTL 반응의 전개를 유도할 수 있다. 따라서, 본 발명은 각각이 고유한 독특한 면역 조절성을 갖는 다양한 서브셋의 SIMRA 화합물을 제공한다. 이와 관련하여, 면역 반응의 범위 및 특성은, 다양한 의학적 적응증에 대해 목적하는 서브셋의 면역 조절특성을 갖는 SIMRA 화합물을 제공함으로써, 상기 적응증에 대해 맞춰질 수 있다. 본원에 언급된 공개된 특허, 특허 출원 및 참고 문헌은 이들 각각이 참조로서 인용됨을 특정하고 개별적으로 기재한 것과 동일한 범위로 참조로서 인용된다. 인용된 참고문헌의 교시 내용과 본 명세서 간의 대립시 본 명세서를 기준으로 한다.
본 발명은 면역 반응을 증강시키기 위한 SIMRA 화합물의 사용 방법을 제공한다. 상기 방법은 면역치료 적용, 예컨대 그러나 비제한적으로 사람 성인 및 소아 및 가축 적용에서 암, 자가면역 질환, 천식, 호흡기 알레르기, 식품 알레르기, 피부 알레르기, 및 박테리아, 기생충 및 바이러스 감염의 치료에 사용될 것이다. 따라서, 본 발명은 추가로, 면역치료를 위한 최적 수준의 면역 조절 효과를 갖는 SIMRA 화합물, 및 이러한 화합물을 제조하고 이용하는 방법을 제공한다. 또한, 본 발명의 SIMRA 화합물은 질환의 예방 및 치료를 위한 SIMRA 화합물의 면역 조절 효과를 저하시키지 않는, 질환 또는 병태를 치료하는데 유용한 제제와 함께 애주번트로서 유용하다.
정의
용어 "2'-치환된 리보누클레오시드" 또는 "2'-치환된 아라비노시드"는 일반적으로, 펜토스 부분의 2'번 위치에 있는 히드록시기가 치환되어 2'-치환된 또는 2'-O-치환된 리보누클레오시드를 생성하는 리보누클레오시드 또는 아라비노누클레오시드를 포함한다. 특정 구체예에서, 이러한 치환은 1개 내지 6개의 포화 또는 불포화 탄소 원자를 함유하는 저급 히드로카르빌기, 할로겐 원자 또는 6 내지 10개의 탄소원자를 갖는 아릴기를 사용하여 이루어지며, 여기서, 상기 히드로카르빌 또는 아릴기는 비치환되거나, 예를 들어, 할로, 히드록시, 트리플루오로메틸, 시아노, 니트로, 아실, 아실옥시, 알콕시, 카르복실, 카르보알콕시, 또는 아미노기로 치환될 수 있다. 본 발명의 아라비노누클레오시드는 비제한적으로 아라비노-G, 아라비노-C, 아라비노-U, 아라비노-A를 포함한다. 2'-O-치환된 리보누클레오시드 또는 2'-O-치환된-아라비노시드의 예는 비제한적으로, 2'-아미노, 2'-플루오로, 2'-알릴, 2'-O-알킬 및 2'-프로파르길 리보누클레오시드 또는 아라비노시드, 2'-O-메틸리보누클레오시드 또는 2'-O-메틸아라비노시드 및 2'-O-메톡시에톡시리보누클레오시드 또는 2'-O-메톡시에톡시리보누클레오시드를 포함한다.
직접적으로 사용된 경우, 용어 "3'"은 일반적으로, 동일한 폴리누클레오티드 또는 올리고누클레오티드에서의 다른 영역 또는 위치로부터 폴리누클레오티드 또는 올리고누클레오티드 3'(당의 3' 위치 방향으로)에 있는 영역 또는 위치를 나타낸다.
본원에 직접적으로 사용된 경우, 용어 "5'"는 일반적으로, 동일한 폴리누클레오티드 또는 올리고누클레오티드에서의 다른 영역 또는 위치로부터 폴리누클레오티드 또는 올리고누클레오티드 5'(당의 5' 위치 방향으로)에 있는 영역 또는 위치를 나타낸다.
용어 "약"은 일반적으로, 정확한 수치가 결정적이지 않다는 것을 의미한다. 따라서, 올리고리보누클레오티드에서 리보누클레오시드 잔기의 수는 결정적이지 않으며, 1개 또는 2개 더 적은 리보누클레오시드 또는 아라비노누클레오시드 잔기를 갖거나, 1개 내지 수개의 추가의 리보누클레오시드 또는 아라비노누클레오시드 잔기를 갖는 올리고리보누클레오티드도 상기 기술된 각 구체예의 각각의 동등물로서 고려된다.
용어 "애주번트"는 일반적으로 면역원성 제제 예컨대, 백신 또는 항원에 첨가되는 경우, 이러한 혼합물에 노출시 수용 숙주에서 이 제제에 대한 면역 반응을 증강시키거나 효력을 증가시키는 물질을 나타낸다.
용어 "기도 염증"은 일반적으로, 비제한적으로, 천식을 포함하는 감염성 알레르기에 의해 초래된 호흡관 염증을 포함한다.
용어 "알레르겐"은 피검체에 노출시 알레르기 반응을 유도해내는 분자 일반적으로, 단백질의 항원 또는 항원부를 나타낸다. 전형적으로, 피검체는 예를 들어, 당업계에 공지된 방법 또는 힐 및 플레어 테스트(wheal and flare test)에 의해 나타나는 바와 같이 알레르겐에 대해 알레르기를 일으킨다. 피검체의 단지 작은 서브셋이 분자에 노출시 알레르기(예를 들어, IgE) 면역 반응을 나타내는 경우에도 상기 분자는 알레르겐으로 불린다.
용어 "알레르기"는 일반적으로, 식품 알레르기, 호흡기 알레르기 및 피부 알레르기를 포함하나 이에 제한되지 않는다.
용어 "항원"은 일반적으로, 항체 또는 T 세포 항원 수용체에 의해 인지되고 선택적으로 결합되는 물질을 나타낸다. 항원은 펩티드, 단백질, 누클레오시드, 누클레오티드 및 이의 조합물을 포함하나 이에 제한되지 않는다. 항원은 천연 항원 또는 합성 항원일 수 있으며, 일반적으로 이 항원에 특이적인 면역 반응을 유도한다.
용어 "자가면역 질환"은 일반적으로 "자가" 항원이 면역 시스템에 의해 공격받는 질환을 의미한다.
3' 또는 5' 분해 또는 "캡" 또는 "캡핑"은 올리고누클레오티드의 3' 또는 5' 말단이 또 다른 분자(예를 들어, 링커 또는 또 다른 비-RNA 누클레오티드)에 부착되어 누클레아제 분해(예를 들어, 3' 엑소누클레아제 분해)를 충분하게 억제함을 의미한다.
용어 "담체"는 일반적으로 부형제, 희석제, 충전제, 염, 완충제, 안정화제, 가용화제, 오일, 지질, 지질 함유 비히클, 미소구체, 리포좀, 캡슐화물 또는 약제학적 제형에 사용되는 당해 기술분야에 잘 알려져 있는 다른 물질을 포함한다. 담체, 부형제, 또는 희석제의 특징은 특정 용도에 대한 투여 경로에 따라 좌우되는 것으로 이해되어야 한다. 이들 물질을 함유하는 약제학적으로 허용가능한 제형의 제법은 문헌에 기술되어 있다(예를 들면, Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Edition, ed., A. Gennaro, Mack Publishing Co., Easton, PA, 1990).
용어 "공동-투여"는 일반적으로 면역 반응을 조절하기 위해 충분히 근접한 시간 내에 2개 이상의 상이한 물질을 투여하는 것을 의미한다. 공동-투여는 2개 이상의 상이한 물질의 동시 투여를 포함한다.
용어 "상보적인"은 일반적으로, 핵산에 하이브리드화되는 능력을 가짐을 의미한다. 이러한 하이브리드화는 보통 염기 스태킹(base stacking) 뿐만 아니라 그 밖의 수소결합 모드가 하이브리드화를 유도할 수 있지만, 바람직하게는, 왓슨-크릭(Watson-Crick) 또는 휴그스틴(Hoogsteen) 염기쌍을 형성하기 위한 상보적인 가닥 사이에서의 수소결합의 결과이다.
용어 "면역 조절성 올리고리보누클레오티드"는 일반적으로 척추동물 예컨대, 어류, 가금류 또는 포유동물에게 투여되는 경우에 면역 반응을 유도하거나 나타내는 올리고리보누클레오티드를 의미한다.
용어 "∼과 함께"는 일반적으로, 동일한 환자에서 동일한 질환을 치료하는 과정중에 있음을 의미하며, SIMRA 화합물, 및 SIMRA 화합물의 면역 조절 효과를 저하시키지 않는, 질환 또는 병태의 치료에 유용한 제제를 동시 투여 또는 병용 투여 , 및 수초에서 수일의 간격을 두어 일시적으로 구분된 순서를 포함하는 임의의 순서로 투여하는 것을 포함한다. 그러한 병용 치료는 또한 SIMRA 화합물 및/또는 독립적으로 제제의 1회 초과 투여를 포함할 수 있다. SIMRA 화합물 및 제제의 투여는 동일하거나 상이한 경로에 의해 이루어질 수 있다.
용어 "개체" 또는 "피검체"는 포유동물 예컨대, 사람을 나타낸다. 포유동물은 일반적으로, 사람, 비사람 영장류, 래트, 마우스, 고양이, 개, 말, 소, 젖소, 돼지, 양 및 토끼를 포함하나 이에 제한되지 않는다.
용어 "직렬 합성(linear synthesis)"은 일반적으로 면역 조절성 올리고리보누클레오티드의 한쪽 말단에서 개시하여 다른 말단으로 직렬로 진행하는 합성을 말한다. 직렬 합성은, 동일하거나 동일하지 않은(길이, 염기 조성 및/또는 혼입된 화학적 변형의 측면에서) 단량체 단위가 면역 조절성 올리고리보누클레오티드에 혼입되도록 한다.
용어 "링커"는 일반적으로 당, 염기 또는 주쇄를 통해 공유결합 또는 비공유결합에 의해 올리고리보누클레오티드에 부착될 수 있는 임의 부분을 나타낸다. 링커는 두개 또는 그 초과의 누클레오시드를 부착시키는데 사용될 수 있거나, 올리고리보누클레오티드에서 5' 및/또는 3' 말단 누클레오티드에 부착될 수 있다. 이러한 링커는 비-누클레오티드 링커 또는 누클레오티드 링커일 수 있다.
용어 "변형된 누클레오시드"는 일반적으로, 변형된 헤테로시클릭 염기, 변형된 당 잔기, 또는 이의 임의 조합물을 포함하는 누클레오시드이다. 일부 구체예에서, 변형된 누클레오시드는 본원에 기재된 비-천연 피리미딘 또는 퓨린 누클레오시드이다. 본 발명의 목적을 위해서, 변형된 누클레오시드, 피리미딘 또는 퓨린 유사체, 또는 비-자연 발생 피리미딘 또는 퓨린이 혼용되어 사용될 수 있으며, 이들은 비-자연 발생 염기 및/또는 비-자연 발생 당 부분을 포함하는 누클레오시드를 나타낸다. 본 발명의 목적을 위해서, 염기는 구아닌, 시토신, 아데닌 또는 우라실이 아닌 경우 비-자연적인 것으로 간주된다. 일부 구체예에서, 변형된 누클레오시드는 2'-치환된 리보누클레오시드, 아라비노누클레오시드 또는 2'-데옥시-2'-치환된-아라비노시드이며, 이는 올리고리보누클레오티드의 선택된 위치 내로 치환되어 TLR7 또는 TLR8 활성을 방해하지 않으면서 안정도를 향상시킬 수 있다.
용어 "조절" 또는 "자극"은 일반적으로 변화 예컨대, 반응에서의 증가 또는 반응에서의 정성적 차이를 나타내며, 이는 반응의 유도 및/또는 증강으로부터 발생할 수 있다.
용어 "비-누클레오티드 링커"는 일반적으로, 공유결합 또는 비공유결합에 의해 올리고리보누클레오티드에 부착될 수 있는 누클레오티드 연결부 이외의 화학적 부분을 나타낸다. 바람직하게는, 이러한 비누클레오티드 링커는 약 2 옹스트롬 내지 약 200 옹스트롬의 길이를 가지며, 시스 또는 트랜스 형일 수 있다.
용어 "누클레오티드 연결"은 일반적으로, 인접한 누클레오시드 사이에 인, 비인(non-phosphate), 하전된 또는 중성 기(예를 들어, 포스포디에스테르, 포스포로티오에이트 또는 포스포로디티오에이트)로 이루어진 이들의 당을 통해 두개의 누클레오시드를 연결시키는 화학 결합(예를 들어, 3'-3', 2'-3', 2'-5', 3'-5')을 나타낸다.
용어 "펩티드"는 일반적으로 펩티드가 합텐(hapten)인지의 여부에 상관없이 생물학적 반응 예를 들어, 항체 생성 또는 사이토카인 활성에 영향을 끼치는 충분한 길이 및 조성의 폴리펩티드를 나타낸다. 용어 "펩티드"는 변형된 아미노산(천연 또는 비-자연 발생)을 포함할 수 있으며, 여기서 이러한 변형은 비제한적으로, 포스포릴화, 글리코실화, 페길화, 지질화, 및 메틸화를 포함한다.
용어 "약제학적으로 허용되는" 또는 "생리학적으로 허용되는"은 일반적으로, 본 발명에 따른 화합물의 유효성을 방해하지 않으며, 생물학적 시스템 예컨대, 세포, 세포 배양물, 조직 또는 유기체와 친화성이 있는 물질을 나타낸다. 바람직하게는, 생물학적 시스템은 살아있는 유기체 예컨대, 척추동물이다.
용어 "약제학적 유효량"은 일반적으로, 유익한 결과와 같은 목적하는 생물학적 효과에 영향을 미치기에 충분한 양을 의미한다. 따라서, "약제학적 유효량"은 투여되는 상황에 의존적일 것이다. 약제학적 유효량은 1회 또는 그 초과의 예방적 또는 치료적 투여로 투여될 수 있다.
용어 "SIMRA"는 일반적으로, TLR7 및/또는 TLR8에 의해 리간드로서 인지된 안정화된 면역 조절성 RNA 화합물을 나타내며, 상기 화합물은 단일-가닥 RNA(ssRNA) 및/또는 이중-가닥 RNA(dsRNA), 및 이의 3' 말단을 보호 또는 안정화시키기 위한 변형부를 함유할 수 있으며(예를 들어, 3' 분해를 차단함으로써, 3' 말단을 캡핑함으로써, 또는 두개 또는 그 초과의 올리고리보누클레오티드의 3' 말단을 연결시킴으로써), 단 SIMRA는 비변형된 올리고리보누클레오티드보다 생체내에서 더 안정적일 것이며 이에 따라서 이의 면역 조절 성능에 영향을 미친다. SIMRA는 변형된 올리고리보누클레오티드를 함유할 수 있다. SIMRA 화합물은 또한, 이의 5' 말단을 보호하기 위한 변형부를 함유하여(예를 들어, 5' 분해를 차단하거나 5' 말단을 캡핑함으로써) 올리고리보누클레오티드의 안정도를 추가로 향상시킬 수 있다. SIMRA는 선형 또는 분지형일 수 있으며, 여기서 핵산은 예를 들어, 포스포디에스테르, 포스포로티오에이트, 또는 대안적 연결부를 통해 연결된 리보누클레오시드의 중합체이다. SIMRA는 리보오스 당 잔기 또는 이의 유도체에 공유결합으로 부착된 퓨린(아데닌 (A) 또는 구아닌 (G) 또는 이의 유도체(예를 들어, 7-데아자-G, 아라비노-G 및 아라비노-A)) 또는 피리미딘(시토신 (C) 또는 우라실 (U), 또는 이의 유도체(예를 들어, 아라비노-C 및 아라비노-U)) 염기로 이루어질 수 있다.
용어 "치료"는 유익하거나 목적하는 결과를 얻기 위한 방법으로서, 증상의 완화 또는 질환 진행의 지연 또는 개선을 포함할 수 있다.
용어 "바이러스 질환"은 일반적으로, B형 간염, C형 간염, 인플루엔자, 후천성 면역결핍 증후군(AIDS) 및 대상 포진을 포함하나 이에 제한되지 않는, 병인체(etiologic agent)로서 바이러스를 갖는 질환을 나타낸다.
제 1 양태에서, 본 발명은 신규한 SIMRA 화합물을 제공한다. 본 발명자들은 3' 말단을 보호하기 위한 면역 조절성 올리고리보누클레오티드의 변형부(예를 들어, 3' 분해를 차단함으로써, 3' 말단을 캡핑함으로써, 또는 두개 또는 그 초과의 올리고리보누클레오티드의 3' 말단을 연결시킴으로써)가 놀랍게도 이의 면역 조절 능력에 영향을 끼친다는 것을 발견하였다. 또한, 이러한 보호는 놀랍게도 올리고리보누클레오티드의 안정도를 향상시켜, 지질 결합 또는 기타 보호 수단에 대한 필요를 제거하였다. 또한, 3' 말단 보호에 추가하여 또는 이와 함께 5' 분해 차단 또는 5' 말단 캡핑이 올리고리보누클레오티드의 안정도를 또한 개선시킬 수 있다.
본 발명에서, 신규한 SIMRA 화합물을 사용한 TLR8 활성화 및 독특한 면역 반응(예를 들어, 사이토카인 및/또는 케모카인 프로파일에서의 변형)의 유도가 증명된다. 또한, RNA를 활성화하는 그러한 사람 TLR8에 특정의 화학적 변형부(들)를 혼입시키면 TLR7을 또한 활성화시킬 수 있고, 이에 의해 독특한 면역 반응(들) 및 사이토카인 및/또는 케모카인 프로파일에서의 변형이 일어난다. 따라서, 본 발명자들은 놀랍게도, TLR8 및/또는 TLR7의 활성화를 통한 이들과 관련된 사이토카인 및/또는 케모카인 프로파일이, 면역 조절성 올리고리보누클레오티드 부분으로서 변형된 염기, 변형된 당, 주쇄, 링커, 연결부 및/또는 캡을 포함하는 변형된 화학 구조를 사용함으로써 조절될 수 있음을 발견하였다.
일 구체예에서, 본 발명은 3' 말단에 연결된 2개 이상의 RNA-기재 올리고누클레오티드, 비-누클레오티드 링커에 대한 누클레오시드 연결부 또는 작용기화된 누클레오염기 또는 당을 포함하는 면역 조절성 화합물을 제공한다. 본 발명의 이러한 구체예는 하나 이상의 접근가능한 5' 말단을 가질 수 있고 이 5' 말단은 캡핑되거나 캡핑되지 않을 수 있다. 이러한 구조는 리피드 연결 또는 다른 보호를 필요로 하지 않고 SIMRA 화합물에 대해 추가의 안정성(예를 들어, 엑소누클레아제 활성의 억제)을 제공하는 것으로 측정되었다. SIMRA의 5'-말단은 SIMRA 화합물이 TLR7 및/또는 TLR8을 통한 면역 반응 조절을 억제하는 방식으로는 변형되지 않는다.
이러한 양태의 또 다른 구체예에서, 본 발명은 두개 이상의 올리고리보누클레오티드를 포함하며, 여기서 면역 조절성 화합물은 하기 표 1의 구조식 I-X로 상세하게 나타낸 구조를 갖지만 이들로 제한되지 않는다.
표 1: 올리고리보누클레오티드 구조식 I-X
Figure pct00001
Figure pct00002
도메인 A, B, C 및 D는 독립적으로 약 2 내지 약 35개의 리보누클레오티드일 수 있으며, 일부 구체예에서는, 약 2 내지 약 20개, 또는 약 2 내지 약 12개, 또는 약 2 내지 약 11개, 또는 약 2 내지 약 8개의 리보누클레오티드 길이이다. 도메인 A, B, C 및/또는 D는 동일하거나 상이할 수 있다. 도메인 A, B, C 및 D는 독립적으로, 자가-상보적 도메인, 동종 또는 이종 리보누클레오티드 서열, 또는 링커를 갖거나 갖지 않는 5'-3' 또는 2'-5' RNA일 수 있다. "n"은 1 내지 무한대일 수 있다.
"X"는 3' 또는 5' 연결부, 포스페이트기, 누클레오염기, 비-RNA 누클레오티드, 또는 지방족, 방향족, 아릴, 시클릭, 키랄, 아키랄(achiral), 펩티드, 탄수화물, 지질, 지방산, 모노- 트리- 또는 헥사폴리에틸렌 글리콜, 또는 헤테로시클릭 부분, 또는 이들의 조합일 수 있는 비-누클레오티드 링커를 통해 연결될 수 있는 도메인 A, B, C, 및/또는 D를 연결하거나 캡핑시키는 링커이다.
추가의 구체예에서, 본 발명은 비-누클레오티드 링커에 의해 연결된 2개 이상의 올리고리보누클레오티드를 포함하는 SIMRA 화합물로서, 면역 조절성 올리고리보누클레오티드의 서열이 적어도 부분적으로 자가-상보적일 수 있는 SIMRA 화합물을 제공한다. 당업자에 의해 인지되는 바와 같이, 올리고리보누클레오티드의 상보적 서열은 세포간 수소결합을 허용하여, 올리고리보누클레오티드 이차 구조를 제공한다. 추가적인 올리고리보누클레오티드는 함께 결합하여, 본 발명에 따른 올리고리보누클레오티드의 사슬 또는 멀티머를 생성시킬 수 있다.
유사한 고려가 상이한 염기 서열의 면역 조절성 올리고리보누클레오티드간의 분자간 염기 쌍에 적용된다. 따라서, 다수의 면역 조절성 올리고리보누클레오티드가 함께 사용되는 경우, 다수의 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 반드시는 아니나, 적어도 부분적으로 서로 상보적인 서열을 포함할 수 있다. 일 구체예에서, 다수의 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 제 1 서열을 갖는 면역 조절성 올리고리보누클레오티드 및 제 2 서열을 갖는 면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 포함하며, 여기서 제 1 서열 및 제 2 서열은 50% 이상 상보적이다. 예를 들어, 50% 이상 상보적인 두개의 8-머 간에서와 같이, 이들은 4, 5, 6, 7 또는 8 G-C, A-U 및/또는 G-U 불안정 염기쌍을 형성할 수 있다. 이러한 염기쌍은 반드시는 아니나, 상보적 면역 조절성 올리고리보누클레오티드의 한 말단에 위치한 염기를 포함할 수 있다. 상보성 정도는 면역 조절성 올리고리보누클레오티드 사이의 정렬에 의존적일 수 있으며, 이러한 정렬은 단일- 또는 다중-누클레오시드 오버행(overhang)을 포함하거나 포함하지 않을 수 있다. 또 다른 구체예에서, 상보성 정도는 60% 이상, 70% 이상, 80% 이상, 90% 이상 또는 심지어 100%이다.
당업자에게 인지되듯이, 기술된 면역 조절성 화합물은 도메인의 서열이 상보적이어서 분자간 수소결합을 허용하기 때문에 이차 구조를 가질 수 있다. 게다가, 구조식 I 내지 X로부터 추측할 수 있는 바와 같이, 추가적으로 결합된 RNA-기재 올리고누클레오티드는 분자간 수소결합을 통해 결합하여 사슬 또는 멀티머를 생성시킬 수 있으며, 여기에 임의의 수의 결합된 RNA-기재 올리고누클레오티드가 혼입될 수 있다.
또 다른 구체예에서, 본 발명은 3' 또는 5' 말단에서, 또는 누클레오시드간 연결부 또는 작용기화된 누클레오염기 또는 당을 통해 비-누클레오티드 링커에 연결된 2개 이상의 RNA-기재 올리고누클레오티드를 포함하는 면역 조절성 화합물을 제공하며, 여기서, 링커(예를 들어, 캡)는 하나 이상의 5' 말단에 부착된다. 이러한 구조는 SIMRA 화합물에 대한 안정도(예를 들어, 엑소누클레아제 활성의 억제)를 추가로 제공하는 것으로 입증되었다. SIMRA의 5'-말단은 SIMRA 화합물이 TLR7 및/또는 TLR8을 통한 면역 반응 조절을 억제하는 방식으로는 변형되지 않는다.
일부 구체예에서, 올리고리보누클레오티드는 각각 독립적으로, 약 2 내지 약 35개의 리보누클레오시드 잔기를 갖는다. 따라서, 특정 구체예에서, 올리고리보누클레오티드는 독립적으로, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 또는 35개 리보누클레오티드 길이일 수 있다. 바람직하게는, 올리고리보누클레오티드는 약 4 내지 약 30개 리보누클레오시드 잔기, 더욱 바람직하게는, 약 4 내지 약 20개 리보누클레오시드 잔기 또는 약 4 내지 약 11개의 리보누클레오시드 잔기이다. 일부 구체예에서, 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 약 1 내지 약 18개, 또는 약 1 내지 약 11개, 또는 약 5 내지 약 14개 리보누클레오시드 잔기를 갖는 올리고리보누클레오티드를 포함한다. 일부 구체예에서, 하나 이상의 올리고리보누클레오티드는 11개 누클레오티드를 갖는다. 면역 조절성 올리고리보누클레오티드에 있어서, 바람직한 구체예는 약 1 내지 약 35개 리보누클레오티드, 바람직하게는, 약 5 내지 약 26개 누클레오티드, 더욱 바람직하게는, 약 13 내지 약 26개 리보누클레오티드를 갖는다. 바람직하게는, 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 하나 이상의 포스포디에스테르, 포스포티오에이트, 또는 포스포로디티오에이트 리보누클레오시드간 결합을 포함한다.
바람직한 구체예에서, 각 누클레오시드 단위는 헤테로시클릭 염기 및 펜토푸라노실, 트레할로스, 아라비노스, 2'-데옥시-2'-치환된 아라비노스, 2'-O-치환된 리보스 또는 아라비노스, 또는 헥소스 당 기를 포함한다. 리보누클레오시드 잔기는 공지된 수많은 누클레오시드간 연결부 중 어느 하나에 의해 상호간에 연결될 수 있다. 그러한 누클레오시드간 연결부로는 비제한적으로, 포스포디에스테르, 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트, 알킬포스포네이트, 알킬포스포노티오에이트, 포스포트리에스테르, 포스포르아미데이트, 실록산, 카보네이트, 카르보알콕시, 아세트아미데이트, 카바메이트, 모르폴리노, 보라노, 티오에테르, 가교된 포스포르아미데이트, 가교된 메틸렌 포스포네이트, 가교된 포스포로티오에이트, 및 설폰 리보누클레오시드간 연결을 포함한다. 리보누클레오티드에 대한 컨쥬게이션 가능한 부위는 하기 화학식 XI에 표시되어 있으며, 여기서 B는 헤테로시클릭 염기이다.
Figure pct00003
본 발명의 SIMRA 화합물은 자연 발생 리보누클레오시드, 변형된 리보누클레오시드 또는 이의 혼합물을 포함할 수 있다.
본 발명에서, 신규한 SIMRA 화합물은 사람 TLR8에 의해 인지되며, 이러한 사람 TLR8 활성화 RNA에서 특정 화학적 변형부(들)의 혼입은 이들이 사람 TLR7에 의해 인지되게 하고, 면역 반응을 유도한다. 이러한 화학적 변형부는 비제한적으로, 구아닌 유사체 예컨대, 7-데아자-G, 아라-G, 6-티오-G, 이노신, 이소-G, 록소리빈(loxoribine), TOG(7-티오-8-옥소)-G, 8-브로모-G, 8-히드록시-G, 5-아미노포르마이신 B, 옥소포르마이신, 7-메틸-G, 9-p-클로로페닐-8-아자-G, 9-페닐-G, 9-헥실-구아닌, 7-데아자-9-벤질-G, 6-클로로-7-데아자구아닌, 6-메톡시-7-데아자구아닌, 8-아자-7-데아자-G(PPG), 2-(디메틸아미노)구아노신, 7-메틸-6-티오구아노신, 8-벤질옥시구아노신, 9-데아자구아노신 및 1-(B-D-리보푸라노실)-2-옥소-7-데아자-8-메틸-퓨린을 포함한다. 상기 화학적 변형부는 비제한적으로, 아데닌 유사체 예컨대, 9-벤질-8-히드록시-2-(2-메톡시에톡시)아데닌, 2-아미노-N2-O-, 메틸아데노신, 8-아자-7-데아자-A, 7-데아자-A, 아라-A, 비다라빈(Vidarabine), 2-아미노아데노신, N1-메틸아데노신, 8-아자아데노신, 5-요오도투베르시딘(Iodotubercidin)을 포함한다. 상기 화학적 변형부는 또한 비제한적으로, 시토신 유사체 및 우라실 유사체 예컨대, 유사우리딘, 아라-C, 아라-U, 5-메틸시토신, 4-티오우리딘, N4-에틸우리딘, 제불아린, 5-아미노알릴우리딘, N3-메틸우리딘, 5-플루오로우리딘을 포함한다.
본 발명에 따른 "면역 조절성 올리고누클레오티드"는 비-누클레오티드 또는 누클레오티드 링커를 통해 작용기화된 리보오스 또는 작용기화된 리보누클레오염기에서 또는 3'- 또는 2'-말단에서 공유결합에 의해 또는 비-공유결합에 의해 결합된 2개 이상의 올리고리보누클레오티드를 포함하는 SIMRA 화합물이다. 링커의 여러 예가 하기 제시되어 있다. 비공유결합은 비제한적으로, 정전기적 상호작용, 소수성 상호작용, π-스태킹 상호작용 및 수소결합을 포함한다.
또 다른 구체예에서, 비-누클레오티드 링커는 올리고리보누클레오티드로의 부착을 허용하는 작용기를 갖는 유기 부분이다. 이러한 부착은 바람직하게는, 안정한 공유결합에 의해서 달성된다. 비제한적 예로서, 링커는 누클레오티드상의 임의의 적합한 위치에 부착될 수 있다. 일부 바람직한 구체예에서, 링커는 3'-히드록실에 부착된다. 이러한 구체예에서, 링커는 바람직하게는, 히드록실 작용기를 포함하며, 이는 바람직하게는 유사한 포스페이트-기재 결합 예컨대, 포스포디에스테르, 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트, 메틸포스포네이트 또는 비-포스페이트 기재 결합에 의해 3'-히드록실에 부착된다.
일부 구체예에서, 비-누클레오티드 링커는 비제한적으로, 폴리펩티드, 항체, 지질, 항원, 알레르겐 및 올리고사카라이드를 포함하는 소분자, 거대분자 또는 생분자이다. 일부 다른 구체예에서, 비-누클레오티드 링커는 소분자이다. 본 발명의 목적을 위해, 소분자는 1,000Da 미만의 분자량을 갖는 유기 부분이다. 일부 구체예에서, 소분자는 750Da 미만의 분자량을 갖는다.
일부 구체예에서, 소분자는 지방족 또는 방향족 탄화수소이며, 이중 하나는 선택적으로, 올리고리보누클레오티드를 연결시키거나 여기에 부착된 선형 사슬에, 히드록시, 아미노, 티올, 티오에테르, 에테르, 아미드, 티오아미드, 에스테르, 우레아 또는 티오우레아를 포함하나 이에 제한되지 않는 하나 이상의 작용기를 포함할 수 있다. 소분자는 시클릭 또는 아시클릭(acyclic)일 수 있다. 소분자 링커의 예로는 비제한적으로, 아미노산, 탄수화물, 시클로덱스트린, 아다만탄, 콜레스테롤, 합텐 및 항생제를 포함하나 이에 제한되지 않는다. 그러나, 비-누클레오티드 링커를 기술하기 위한 용어 "소분자"는 누클레오시드를 포함하는 것으로 의도되지 않는다.
일부 구체예에서, 비-누클레오티드 링커는 알킬 링커 또는 아미노 링커이다. 알킬 링커는 분지형 또는 비분지형, 시클릭 또는 아시클릭, 치환된 또는 비치환된, 포화된 또는 불포화된, 키랄, 아키랄 또는 라세미체 혼합물일 수 있다. 알킬 링커는 약 2 내지 약 18개의 탄소 원자를 가질 수 있다. 일부 구체예에서, 이러한 알킬 링커는 약 3 내지 약 9개의 탄소 원자를 가질 수 있다. 일부 알킬 링커는 히드록시, 아미노, 티올, 티오에테르, 에테르, 아미드, 티오아미드, 에스테르, 우레아 및 티오에테르를 포함하나 이에 제한되지 않는 하나 이상의 작용기를 포함한다. 이러한 알킬 링커는 1-프로판올, 1,2-프로판디올, 1,3-프로판디올, 1,2,3-프로판트리올, 트리에틸렌 글리콜, 헥사에틸렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜링커(예를 들어, [-O-CH2-CH2-]n(n = 1-9)), 메틸 링커, 에틸 링커, 프로필 링커, 부틸 링커 또는 헥실 링커를 포함하나 이에 제한되지 않는다. 일부 구체예에서, 이러한 알킬 링커는 펩티드 또는 아미노산을 포함할 수 있다.
일부 구체예에서, 비-누클레오티드 링커는 표 2에 기술된 것을 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
표 2: 대표적인 비- 누클레오티드 링커
Figure pct00004
Figure pct00005
Figure pct00006
Figure pct00007
Figure pct00008
Figure pct00009
일부 구체예에서, 소분자 링커는 화학식 HO-(CH2) o -CH(OH)-(CH2) p -OH의 글리세롤 또는 글리세롤 유사체이며, 여기서 op는 독립적으로, 1 내지 약 6, 1 내지 약 4, 또는 1 내지 약 3의 정수이다. 일부 다른 구체예에서, 소분자 링커는 1,3-디아미노-2-히드록시프로판의 유도체이다. 일부 이러한 유도체는 화학식 HO-(CH2) m -C(O)NH-CH2-CH(OH)-CH2-NHC(O)-(CH2) m -OH를 가지며, 여기서 m은 0 내지 약 10, 0 내지 약 6, 2 내지 약 6, 또는 2 내지 약 4의 정수이다.
본 발명에 따른 일부 비-누클레오티드 링커는 표 1에 도시된 바와 같이 두개 초과의 올리고리보누클레오티드의 부착을 허용한다. 일부 예에서, 소분자 링커 글리세롤은 3개의 히드록실기를 가지며, 여기에 올리고리보누클레오티드가 공유결합에 의해 부착될 수 있다. 따라서, 본 발명에 따른 일부 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 3' 말단에서 비-누클레오티드 링커에 연결된 2개 초과의 올리고리보누클레오티드(예를 들어, 도메인 C 등, 추가적인 도메인은 도메인 A, B, C 및 D에 대해 상기 규정된 올리고리보누클레오티드를 포함함)를 포함한다.
본 발명의 이러한 양태의 추가적 구체예에서, SIMRA는 3' 또는 5' 말단에서, 또는 표 1에 표시된 누클레오시드간 연결 또는 작용기화된 누클레오염기 또는 당을 통해 2개 또는 그 초과의 링커에 연결된 3개 또는 그 초과의 올리고리보누클레오티드를 함유할 수 있다. 본 발명의 이러한 양태의 올리고리보누클레오티드는 동일하거나 상이한 서열을 가질 수 있다. 본 발명의 이러한 양태의 링커는 동일하거나 상이할 수 있다.
본 발명의 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 자동화된 합성기 및 포스포르아미다이트 방법을 이용하여 편리하게 합성될 수 있다. 일부 구체예에서, 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 직렬 합성법에 의해 합성된다.
대안적인 합성 방법은 "평행 합성(parallel synthesis)"이며, 여기서 합성은 중심 링커 잔기로부터 밖으로 진행된다(도 1 참조). 고체 지지체에 부착된 링커가 미국 특허 제5,912,332호에 기술된 바와 같이 평행 합성을 위해 사용될 수 있다. 다르게는,(조절된 공극 유리에 부착된 포스페이트와 같은) 일반적인 고체 지지체를 사용할 수 있다.
면역 조절성 올리고리보누클레오티드의 평행 합성은 직렬 합성에 비해 여러 장점을 갖는다: (1) 평행 합성은 동일한 단량체 단위의 혼입을 허용한다; (2) 직렬 합성과는 달리, 양쪽 (또는 모든) 단량체 단위가 동시에 합성되므로, 합성 단계의 수 및 합성에 요구되는 시간이 단량체 단위의 것과 동일하다; 및 (3) 합성 단계의 감소는 최종 면역 조절성 올리고리보누클레오티드 생성물의 순도 및 수율을 개선시킨다.
직렬 합성 또는 평행 합성 프로토콜에 의한 합성 마지막에, 변형된 누클레오시드가 혼입되는 경우, 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 진한 암모니아 용액을 사용하여 또는 포스포르아미다이트 공급업자에 의해 권고되는 바에 따라 편리하게 탈보호될 수 있다. 생성물인 면역 조절성 올리고리보누클레오티드는 바람직하게는 역상 HPLC에 의해 정제되고, 탈트리틸화되며, 탈염되고 투석된다.
표 3은 본 발명에 따른 RNA-기재 면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 나타낸다. 달리 명시되지 않는 한, 모든 누클레오시드는 리보누클레오시드이다.
표 3. 안정화된 RNA-기재 면역 조절성 올리고누클레오티드(SIMRA ) 서열
Figure pct00010
Figure pct00011
Figure pct00012
Figure pct00013
Figure pct00014
Figure pct00015
상기 표 목록에서, G1 = 7-데아자-rG; G2 = 아라-G; G3 = 7-데아자-아라-G; C1 = 아라-C; C2 = 2'-F-C; C4 = 5-메틸-C; A1 = 아라-A; U1 = 아라-U; U2 = 2'-F-U; M = 시스,시스-시클로헥산트리올 링커; m = 시스,트랜스-시클로헥산트리올; Z = 1,3,5-펜탄 트리올 링커; X = 글리세롤 링커; X1 = 1,2,4-부탄트리올 링커; X2 = 시아누르산; X3 = 이소부탄트리올 링커; Y = 1,3-프로판디올; L = 1,5-펜탄디올; L1 = 1',2'-디데옥시리보스; 6Eg = 헥사에틸렌 글리콜 링커; 3Eg = 트리에틸렌 글리콜 링커; 4Eg = 테트라에틸렌 글리콜 링커; P = 포스포로티오에이트; E = 에틸렌 디올이다.
제 2 양태에서, 본 발명은 본 발명에 따른 SIMRA 화합물 및 약제학적으로 허용되는 담체를 포함하는 약제 제형을 제공한다.
제 3 양태에서, 본 발명은 척추동물에서 TLR7 및/또는 TLR8 매개된 면역 반응을 생성시키는 방법으로서, 척추동물에게 본 발명에 따른 SIMRA 화합물을 투여하는 것을 포함하는 방법을 제공한다. 일부 구체예에서, 척추동물은 포유동물이다. 바람직한 구체예에서, SIMRA 화합물은 면역 조절이 필요한 척추동물에게 투여된다.
제 4 양태에서, 본 발명은 질환 또는 질병을 앓는 환자를 치료학적으로 처치하는 방법으로서, 상기 환자에게 본 발명에 따른 SIMRA 화합물을 투여하는 것을 포함하는 방법을 제공한다. 다양한 구체예에서, 치료할 질환 또는 질병은 면역 조절이 바람직할 수 있는 것들이다. 예를 들어, 이로 제한되는 것은 아니나 암, 자가면역 질환, 감염성 질환, 기도 염증, 염증 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환이 있다. 병원균은 박테리아, 기생충, 진균류, 바이러스, 비로이드 및 프리온을 포함한다.
제 5 양태에서, 본 발명은 질환 또는 질병을 예방하는 방법으로서, 환자에게 본 발명에 따른 SIMRA 화합물을 투여하는 것을 포함하는 방법을 제공한다. 다양한 구체예에서, 예방할 질환 또는 질병은 면역 조절이 바람직할 수 있는 것들이다. 예를 들어, 이로 제한되는 것은 아니나 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 감염성 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환이다. 병원균은 박테리아, 기생충, 진균류, 바이러스, 비로이드 및 프리온을 포함한다.
제 6 양태에서, 본 발명은 면역 세포, B-세포, T-조절 세포, PBMC, pDC 및 림프구 세포를 포함하나 이에 제한되지 않는 사이토카인 또는 케모카인을 생성시킬 수 있는 세포를 분리하고; 이러한 세포를 표준 세포 배양 조건하에 배양하고, 이러한 세포를, 분리된 세포가 증가된 수준의 사이토카인 또는 케모카인을 생성하거나 분비하도록 생체외에서 SIMRA로 처리하고; 처리된 세포를 질환의 예방 또는 치료를 위해 사이토카인 또는 케모카인 치료가 필요한 환자에게 투여하거나 재투여하는 것을 포함하여, 질환 또는 질병을 예방하거나 치료하는 방법을 제공한다. 본 발명의 이러한 양태는 활성화된 면역 세포를 생성하기 위한 표준 입양 세포 면역치료 기술에 따른 것일 것이다.
본 발명의 이러한 양태의 일부 구체예에서, 사이토카인 또는 케모카인을 생성할 수 있는 세포는 질환 또는 질병을 앓거나 앓지 않는 피검체로부터 분리될 수 있다. 이러한 분리는 확인 및 선택을 포함할 수 있으며, 하기 특정 실시예에서 제시된 과정을 포함하여, 표준 세포 분리 과정을 이용하여 수행될 수 있다. 이러한 분리된 세포는 표준 세포 배양 과정에 따라 그리고 표준 세포 배양 조건을 이용하여 배양되며, 이는 하기 특정 실시예에 제시된 배양 과정 및 조건을 포함할 수 있다. 본 발명의 이러한 구체예의 추가의 양태에서, 분리된 세포는, 하나 이상의 SIMRA의 부재하에 배양된 분리된 세포와 비교하여, 사이토카인 및/또는 케모카인의 생성 및/또는 분비를 유도하거나 증가시키거나 증대시키기에 충분한 기간 동안 그리고 충분한 양의 하나 이상의 SIMRA의 존재하에 배양된다. 이러한 시간은 수분 내지 수시간 내지 수일일 수 있다. 이러한 분리된 SIMRA-처리된 세포는 도너로의 재투여 후 또는 제 2의 조직학적으로 적합한 환자로의 투여 후 사용될 수 있고, 여기서 상기 도너 또는 제 2 환자는 사이토카인 및/또는 케모카인의 유도되거나 증가되거나 증대된 생성 및/또는 분비를 필요로 한다. 예를 들어, 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 염증 질환, 감염성 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환을 갖는 도너로의 재투여 또는 제 2 환자로의 투여가 고려된다. 이러한 재투여 또는 투여는 카테터 또는 주사 투여 또는 다른 유효한 경로를 포함하는 다양한 방식을 이용하여 이루어질 수 있다. 본 발명의 이러한 양태는 면역 반응을 증가시키는데 제한되거나 불완전한 능력을 가질 수 있거나 면역이 손상된(예를 들어, HIV 감염된 환자 및 골수 이식 환자) 환자에게서 이용될 수 있다.
본 발명에 따른 상기 방법 중 하나에서, SIMRA 화합물은 단독으로 및/또는 SIMRA 화합물의 면역 조절 효과를 저하시키지 않는, 질환 또는 질병을 치료하거나 예방하기에 유효한 다른 제제와 함께 직접적인 면역 조절 효과를 유도함으로써 다양하게 작용할 수 있다. 본 발명에 따른 하나의 방법에서, 질환 또는 질병을 치료하거나 예방하는데 유용한 제제(들)는 비제한적으로, 백신, 항원, 항체, 바람직하게는 모노클로날 항체, 세포독성 제제, 알레르겐, 항생제, siRNA, 마이크로RNA, 안티센스 올리고누클레오티드, TLR 효능제(예를 들어, TLR9의 효능제 및/또는 TLR7 및/또는 TLR8의 효능제), 화학요법제(전통적인 화학요법제 및 현대적인 표적 치료제), 표적 치료제, 활성화된 세포, 펩티드, 단백질, 유전자 치료 벡터, 펩티드 백신, 단백질 백신, DNA 백신, 애주번트 및 공동-자극 분자(예컨대, 사이토카인, 케모카인, 단백질 리간드, 트랜스-활성화 인자, 펩티드, 또는 변형된 아미노산을 포함하는 펩티드), 또는 이의 조합물을 포함한다. 예를 들어, 암 치료에서, SIMRA 화합물은 하나 이상의 화학치료 화합물, 표적 치료제 및/또는 모노클로날 항체와 함께 투여될 수 있음이 고려된다. 대안적으로, 제제는 항원 또는 알레르겐을 엔코딩하는 DNA 벡터를 포함할 수 있다. 대안적으로, SIMRA 화합물은 다른 애주번트와 함께 투여되어 SIMRA 화합물에 대한 면역 반응의 특이성 또는 정도를 향상시킬 수 있다.
본 발명에 따른 방법에서, 단독의 또는 다른 제제와의 SIMRA 화합물의 투여는 비제한적으로, 비경구, 점막 전달, 경구, 설하, 경피, 국소, 흡입, 비내, 에어로졸, 안내, 기관내, 직장내, 질, 유전자 총(gene gun), 피부 패치 또는 안약 또는 구강세정제 형태를 포함하는 임의의 적합한 경로에 의해 수행될 수 있다. SIMRA 화합물의 치료학적 조성물의 투여는 질환의 증상 또는 대리 마커를 감소시키는데 효과적인 약제학적 투여량 및 기간 동안 공지된 과정을 이용하여 수행될 수 있다. 예를 들어, 질환 및/또는 질병을 치료하기 위한 약제학적 유효량의 SIMRA 화합물은 증상을 완화시키거나 저하시키거나, 종양, 암, 또는 박테리아, 바이러스 또는 진균 감염을 지연시키거나 경감시키는데 필요한 양일 수 있다. 백신 애주번트로서 사용하기 위한 약제학적 유효량은 백신 또는 항원에 대한 피검체의 면역 반응을 부스팅하는데 유용한 양일 수 있다. 공동 투여된 항원에 대한 면역 반응을 조절하는 조성물 투여에 있어서, 약제학적 유효량의 SIMRA 화합물 및 항원은, 항원이 단독으로 투여되는 경우 달성된 면역 반응과 비교하여 목적하는 조절을 달성하는데 효과적인 양이다. 임의의 특정 적용에 유효한 양은 치료할 질환 또는 병태, 투여될 특정 올리고누클레오티드, 피검체의 크기, 또는 질환 또는 병태의 중증도와 같은 인자에 따라 달라질 수 있다. 당업자는 과도한 실험을 요하지 않고 특정 올리고누클레오티드의 약제학적 유효량을 경험적으로 결정할 수 있다.
전신 투여되는 경우, 치료학적 조성물은 바람직하게는, 약 0.0001 마이크로몰 내지 약 10 마이크로몰의 SIMRA 화합물의 혈중 수준을 달성하기에 충분한 투여량으로 투여된다. 국소화된 투여에 있어서, 이보다 훨씬 더 적은 농도가 효과적일 수 있으며, 훨씬 더 높은 농도도 허용될 수 있다. 바람직하게는, SIMRA 화합물의 전체 용량은 일당 환자 체중 kg당 약 0.001mg 내지 약 200mg이다. 단일 치료 요법으로서 치료학적 유효량의 본 발명의 하나 이상의 치료 조성물이 개체에게 동시에 또는 순차적으로 투여되는 것이 바람직할 수 있다.
SIMRA 화합물은 선택적으로, 하나 이상의 알레르겐 및/또는 항원(자가 또는 이종), 면역원성 단백질 또는 펩티드, 예컨대, 키홀 림펫 헤모시아닌(KLH), 콜레라 독소 B 서브유닛, 또는 임의의 기타 면역원성 담체 단백질에 연결될 수 있다. SIMRA는 또한, 비제한적으로, TLR 효능제(예를 들어, TLR2 효능제 및 TLR9 효능제), 프레운드 불완전 애주번트(Freund's incomplete adjuvant), KLH, 모노포스포릴 지질 A(MPL), 알룸, 및 QS-21 및 이미퀴모드를 포함하는 사포닌, 또는 이들의 조합물을 포함하는 기타 화합물(예를 들어, 애주번트)과 함께 사용될 수 있다.
본 발명의 이러한 양태에 따른 방법은 면역 시스템의 모델 연구에 유용하다. 본 방법은 또한, 사람 또는 동물 질환의 예방학적 또는 치료학적 처치에 유용하다. 예를 들어, 본 방법은 소아 및 가축 백신 적용에 유용하다.
하기 예는 본 발명의 특정 바람직한 구체예를 추가로 설명하고자 하는 것이며, 본 발명의 범위를 제한하고자 하는 것은 아니다.
실시예
실시예 1
면역 조절성 올리고리보누클레오티드의 합성
면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 자동화된 DNA/RNA 합성기에서 포스포르아미다이트 화학성을 이용하여 화학적으로 합성하였다. N-아세틸 보호된(U 제외) 2'-O-TBDMS RNA 단량체, A, G, C 및 U를 시그마-알드리히로부터 구입하였다. 7-데아자-G, 이노신 및 록소리빈 모노머를 켐진스 코포레이션(ChemGenes Corporation)으로부터 구입하였다. 0.25M 5-에틸티오-1H-테트라졸, PAC-언히드라이드 캡 A 및 캡 B는 글렌 리서치(Glen Research)로부터 구입하였다. 디클로로메탄(DCM)중의 3% 트리클로로아세트산(TCA) 및 5% 3H-1,2-벤조디티올-3-온-1,1-디옥시드(뷰케이지 시약(Beaucage reagent))를 자체 제조하였다.
면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 표준 RNA 합성 프로토콜을 사용하여 1-2μM 스케일로 합성하였다.
절단 및 염기 탈보호
면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 고체 지지체로부터 절단하고, 메틸아민 및 암모늄 히드록사이드 용액 중에서 엑소-시클릭-아민의 보호기를 제거하였다. 생성된 용액을 스피드백(SpeedVac)에서 완전하게 건조시켰다.
IE HPLC 정제
면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 이온 교환 HPLC에 의해 정제하였다.
디오넥스 DNAPac 100 칼럼을 사용함. 미정제 면역 조절성 올리고리보누클레오티드 용액을 HPLC로 주입하였다. 상기 구배를 수행하고, 분획을 수집하였다. 90% 초과의 목적하는 생성물을 함유하는 모든 분획을 혼합한 후, 용액을 로토밥(RotoVap)에 의해 농축하여 거의 건조시켰다. RNAse-비함유 물을 첨가하여 최종 부피를 10ml가 되게 하였다.
C-18 역상 탈염화
워터스(Waters)로부터 구입한 tC-16 셉-팍(Sep-Pak) 카트리지를, 먼저 10ml 아세토니트릴 및 이어서 10ml의 0.5M 나트륨 아세테이트를 이 카트리지로 통과시킴으로써 조절하였다. 그 후, 10ml의 면역 조절성 올리고리보누클레오티드 용액을 카트리지 상으로 로딩하였다. 그 후, 15ml의 물을 사용하여 염을 세척으로 제거하였다. 면역 조절성 올리고리보누클레오티드를 물중의 50% 아세토니트릴 1ml를 사용하여 최종적으로 용리시켰다. 용액을 30분 동안 스피드박(SpeedVac)에 위치시켰다. 나머지 용액을 0.2 마이크로 필터를 통해 여과시키고, 동결 건조시켰다. 그 후, 고형물을 RNA아제 비함유 물에 재용해시켜 목적하는 농도가 되게 하였다. 최종 용액을 0℃ 미만에서 저장하였다. 올리고리보누클레오티드를 순도에 대해서는 모세관 전기영동, 이온 교환 HPLC 및 PAGE 분석으로, 분자량에 대해서는 MALDI-ToF 질량 분광계로 분석하였다.
실시예 2
TLR 을 발현하는 HEK293 세포의 분석 프로토콜
HEK293 또는 HEK293XL/사람 TLR7 또는 HEK293 또는 HEK293XL/사람 TLR8 세포(Invivogen, San Diego, CA)를, 5% CO2 인큐베이터에서 10% 열-불활성화된 FBS가 공급된 250㎕/웰 DMEM중의 48-웰 플레이트에서 배양하였다.
리포터 유전자 형질전환
사람 TLR7 또는 8을 안정하게 발현하는 HEK293 또는 HEK293XL 세포(Invivogen, San Diego, CA)를 5% CO2 인큐베이터에서 10% 열-불활성화된 FBS가 공급된 250㎕/웰 DMEM중에서 48-웰 플레이트에서 배양하였다. 80% 컨플루언스에서, 배양물을 배양 배지중에 4㎕/ml의 리포펙타민(Invitrogen, Carlsbad, CA)의 존재하에 400ng/ml의 SEAP(사람 배아 알칼리성 포스파타아제의 형태로 분비됨) 리포터 플라스미드(pNifty2-Seap)(Invivogen)로 일시적으로 형질감염시켰다. 플라스미드 DNA 및 리포펙타민을 무혈청 배지중에서 별도로 희석하고, 실온에서 5분 동안 인큐베이션하였다. 인큐베이션 후, 희석된 DNA 및 리포펙타민을 혼합하고, 혼합물을 실온에서 20분 동안 인큐베이션하였다. 100ng의 플라스미드 DNA 및 1㎕의 리포펙타민을 함유하는 25㎕의 DNA/리포펙타민 혼합물의 분취물을 세포 배양 플레이트의 각 웰에 첨가하고, 배양을 4시간 동안 계속하였다.
IMO-처리
형질감염 후, 배지를 새로운 배양 배지로 대체하였다. 사람 TLR7 또는 TLR8을 발현하는 HEK293 또는 HEK293XL 세포를 0, 20, 50, 100, 150, 200 또는 300㎍/ml의 TLR7 또는 TLR8 효능제, SIMRA로 자극시키고, 배양물을 18시간 내지 20시간 동안 지속시켰다. SIMRA 처리 마지막 무렵에, 30㎕의 배양 상청을 각각의 처리물로부터 취하고, 이것을 제조업자의 프로토콜(Invitrogen)에 따라 SEAP 검정을 위해 사용하였다.
SEAP (분비된 형태의 사람 배아 알칼리성 포스파타아제) 검정
간단하게는, 배양 상청을 p-니트로피닐 포스페이트 기질과 함께 인큐베이션하고, 생성된 황색물을 405nm에서 플레이트 해독기로 측정하였다. 데이터는 PBS 대조군에 대한 NF-κB 활성에서의 배수 증가(fold increase)로서 나타났다(Putta MR et al, Nucleic Acids Res., 2006, 34:3231-8).
실시예 3
사람 세포 배양 프로토콜
사람 PBMC 분리
건강한 지원자로부터 새로 채취한 혈액(메사추세츠 보스톤에 소재한 CBR 라보라토리스)으로부터의 말초혈 단핵 세포(PBMC)를 피콜 밀도 구배 원심분리법(Ficoll density gradient centrifugation method: Histopaque-1077, Sigma)에 의해 분리하였다.
사람 pDC 분리
건강한 지원자로부터 새로 채취한 혈액(메사추세츠 보스톤에 소재한 CBR 라보라토리스)으로부터의 말초혈 단핵 세포(PBMC)를 피콜 밀도 구배 원심분리법(Histopaque-1077, Sigma)에 의해 분리하였다. pDC를 제조업자의 지시에 따라 BDCA4 세포 분리 키트(Miltenyi Biotec)를 사용하여 양성 선택에 의해 PBMC로부터 분리하였다.
사람 mDC 분리
건강한 지원자로부터 새로 채취한 혈액(메사추세츠 보스톤에 소재한 CBR 라보라토리스)으로부터의 말초혈 단핵 세포(PBMC)를 피콜 밀도 구배 원심분리법(Histopaque-1077, Sigma)에 의해 분리하였다. 골수 수지상 세포(mDC)를 제조업자의 지시에 따라 BDCA4 세포 분리 키트(Miltenyi Biotec)를 사용하여 양성 선택에 의해 PBMC로부터 분리하였다.
멀티플렉스 사이토카인 검정
사람 PBMC를 5 x 106 세포/ml를 이용하여 48-웰 플레이트에 플레이팅하였다. pDC를 1 x 106 세포/ml를 이용하여 96-웰 디쉬에 플레이팅하였다. DPBS(pH 7.4; 메디아테크(Mediatech))에 용해된 SIMRA를 세포 배양물에 최종 농도 20, 50, 100, 200 또는 300㎍/ml가 되도록 또는 도면에 표시된 바와 같이 첨가하였다. 그 후, 세포를 37℃에서 24 시간 동안 인큐베이션시키고, 상청을 루미넥스 멀티플렉스(luminex multiplex) 또는 ELISA 검정을 위해 수집하였다. 실험은 삼중 웰에서 실시하였다. IFN-α, IL-6 또는 TNF-α의 수준을 샌드위치 ELISA로 측정하였다. 사이토카인 항체 및 표준을 포함하는 요구되는 시약을 파르밍겐(PharMingen)으로부터 구입하였다.
루미넥스 멀티플렉스 검정을 루미넥스 100/200 장치상의 바이오소스 사람 멀티플렉스 사이토카인 검정 키트(Biosource human multiplex cytokine assay kit)를 이용하여 수행하고, 데이타는 어플라이드 사이노메트리 시스템즈(Applied Cytometyr Systems: Sacramento, CA)에 의해 공급된 스타스테이션(StarStation) 소프트웨어를 사용하여 분석하였다.
실시예 4
TLR9 효능제 화합물로 처리된 마우스 모델에서 생체내 사이토카인 분비
5 내지 6주령의 C57BL/5 마우스 및 BALB/c 마우스를 뉴욕 저먼타운에 소재한 타코닉 팜스(Taconic Farms)로부터 입수하고, 이것을 이데라 파마슈티컬스의 IACUC 승인된 동물 프로토콜에 따라 유지하였다. 표 3으로부터의 개별적인 안정화된 면역 조절성 RNA 기재의 올리고누클레오티드를 마우스(n = 3)에게 25mg/kg(1회 용량)으로 피하(s.c.) 주사하였다. 면역 조절성 올리고누클레오티드 투여 2시간 후에 안와후방의 출혈(retro-orbital bleeding)에 의해 혈청을 수집하고, 사이토카인 및 케모카인 수준을 샌드위치 ELISA 또는 루미넥스 멀티플렉스 검정으로 측정하였다. 그 결과가 도 8a, 8b, 9a 및 9b에 도시되어 있고, 이로부터 본 발명에 따른 SIMRA 올리고누클레오티드의 생체내 투여가 독특한 사이토카인 및 케모카인 프로파일을 생성시킴이 증명된다. 사이토카인 및 케모카인 항체 및 표준을 포함하는 모든 시약은 파밍젠(PharMingen; 캘리포니아 샌디에고에 소재함)으로부터 구입하였다.
실시예 5
혈청 안정도 검사
표 3으로부터의 표본 SIMRA 화합물의 대략 0.5OD를 37℃에서 30분 동안 PBS 중의 1% 사람 혈청 중에서 개별적으로 인큐베이션하였다. 1% 사람 혈청 중에서 30분 동안 인큐베이션한 후에, SIMRA 화합물을 음이온 교환 HPLC로 분석하여, 혈청 처리 전에 존재하는 SIMRA 화합물의 양과 비교하여 남아있는 전장 SIMRA 화합물의 비율(%)을 측정하였다. 그 결과가 도 10a 내지 10h에 도시되어 있는데, 이로부터 RNA 기재 화합물에 대해 이루어진 본 발명에 따른 화학적 변형이 이들의 안정도를 증강시킬 수 있음이 증명된다.
등가물
전술한 발명은 명확성 및 이해를 목적으로 일부 상세하게 기술되었으나, 본 발명의 진정한 범위 및 첨부된 청구범위를 벗어나지 않으면서 형태 및 상세 사항에 있어서의 다양한 변화가 수행될 수 있음이 당업자는 이해할 것이다.
SEQUENCE LISTING <110> IDERA PHARMACEUTICALS, INC. <120> STABILIZED IMMUNE MODULATORY RNA (SIMRA) COMPOUNDS <130> IDR-046PCT <140> PCT/US2008/069335 <141> 2008-07-07 <150> 60/948,529 <151> 2007-07-09 <150> 60/957,195 <151> 2007-08-22 <150> 60/981,161 <151> 2007-10-19 <150> 61/015,284 <151> 2007-12-20 <160> 192 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 1 uucugcuucu g 11 <210> 2 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 2 ugcugccuuu g 11 <210> 3 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 3 ugcugccuuu g 11 <210> 4 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 4 guccuuugcu g 11 <210> 5 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 5 ugcugcuugu g 11 <210> 6 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 6 ugcugccuuu g 11 <210> 7 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (7)..(7) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 7 guccuugcuu g 11 <210> 8 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 8 uucugcuucu g 11 <210> 9 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 9 guccuuugcu g 11 <210> 10 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 10 uugacguuga c 11 <210> 11 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 11 gugccugaug a 11 <210> 12 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 12 augcugcgcu g 11 <210> 13 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-G <400> 13 ugcugcuugu g 11 <210> 14 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <400> 14 ugcugcuugu g 11 <210> 15 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 15 ugcugcuugu g 11 <210> 16 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 16 ugcugcuugu g 11 <210> 17 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 17 ugcugcuugu g 11 <210> 18 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 18 ugcugccuuu g 11 <210> 19 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 19 ugcugccuuu g 11 <210> 20 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 20 ugcugccuuu g 11 <210> 21 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Ara-C <400> 21 ugcugcuugu g 11 <210> 22 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Ara-C <400> 22 ugcugcuugu g 11 <210> 23 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Ara-C <400> 23 ugcugcuugu g 11 <210> 24 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-C <400> 24 ugcugcuucu g 11 <210> 25 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(7) <223> Ara-C <400> 25 ugcugccuuu g 11 <210> 26 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(7) <223> Ara-C <400> 26 ugcugccuuu g 11 <210> 27 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(7) <223> Ara-C <400> 27 ugcugccuuu g 11 <210> 28 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (7)..(8) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> Ara-U <400> 28 ugcugcuucu g 11 <210> 29 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (7)..(8) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> Ara-U <400> 29 ugcugcuucu g 11 <210> 30 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> Ara-A <400> 30 uguuguguga c 11 <210> 31 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 31 ugcugcuugu g 11 <210> 32 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Ara-C <400> 32 ugcugcuugu g 11 <210> 33 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(7) <223> Ara-C <400> 33 ugcugccuuu g 11 <210> 34 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 34 gauugugacg u 11 <210> 35 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 35 cugaagcuug u 11 <210> 36 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 36 ugcugcuugu g 11 <210> 37 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 37 ugcugcuugu g 11 <210> 38 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 38 ugcugcuucu g 11 <210> 39 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-ara-G <400> 39 ugcugcuucu g 11 <210> 40 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-ara-G <400> 40 ugcugccuuu g 11 <210> 41 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 41 ugacgaugag u 11 <210> 42 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (7)..(8) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> Ara-U <400> 42 ugcugcuucu g 11 <210> 43 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(7) <223> Ara-C <400> 43 ugcugccuuu g 11 <210> 44 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 44 ugcugcuucu g 11 <210> 45 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 45 ugacgacgcu u 11 <210> 46 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 46 ugacgacugc u 11 <210> 47 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 47 ugacgacuug c 11 <210> 48 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 48 ugcgcgaacu u 11 <210> 49 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (4)..(4) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 49 aguguuuucu g 11 <210> 50 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 50 ugcugcuuuu g 11 <210> 51 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 51 uguuguuugu g 11 <210> 52 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <400> 52 ugaugaagcu u 11 <210> 53 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 53 ugcugcuuga a 11 <210> 54 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 54 uugacugaug a 11 <210> 55 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 55 ugcugcuuuu g 11 <210> 56 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 56 uguuguuugu g 11 <210> 57 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 57 uguucgaaca c 11 <210> 58 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 58 uugacguuga c 11 <210> 59 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 59 uugacguuga c 11 <210> 60 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 60 uugacguuga c 11 <210> 61 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 61 uugacguuga c 11 <210> 62 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 62 gugccugaug a 11 <210> 63 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 63 ccgaugccga c 11 <210> 64 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 64 ccgaugcauc g 11 <210> 65 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 65 gugccugaug a 11 <210> 66 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 66 gugccugaug a 11 <210> 67 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 67 gugccugaug a 11 <210> 68 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 68 ccgaugccga c 11 <210> 69 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 69 ccgaugccga c 11 <210> 70 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 70 ccgaugccga c 11 <210> 71 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 71 ccgaugcauc g 11 <210> 72 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 72 ccgaugcauc g 11 <210> 73 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 73 ccgaugcauc g 11 <210> 74 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 74 agcacaacug u 11 <210> 75 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 75 aaaaaaaaaa a 11 <210> 76 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 76 cacuguugag a 11 <210> 77 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 77 aacuguugac c 11 <210> 78 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 78 caacgaccug u 11 <210> 79 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> 7-deaza-rG <400> 79 cacuguugag a 11 <210> 80 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <400> 80 aacuguugac c 11 <210> 81 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> 7-deaza-rG <400> 81 caacgaccug u 11 <210> 82 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 82 augcugcgcu g 11 <210> 83 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 83 augcugcgcu g 11 <210> 84 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 84 augcugcgcu g 11 <210> 85 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 85 aacuguugac c 11 <210> 86 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 86 cacuguugag a 11 <210> 87 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 87 gcacacuugu u 11 <210> 88 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 88 uguuguguga c 11 <210> 89 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 89 ccgaugcauc g 11 <210> 90 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 90 aacgaaccga c 11 <210> 91 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 91 caacgaccug u 11 <210> 92 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 92 caacgaccug u 11 <210> 93 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 93 cguugugaug a 11 <210> 94 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 94 acgauuguga c 11 <210> 95 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 95 acuuugacga u 11 <210> 96 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 96 cgaugcgaug a 11 <210> 97 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 97 acgucugacg a 11 <210> 98 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 98 aacugcugga u 11 <210> 99 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 99 uuggacucca g 11 <210> 100 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 100 ucgacuucca g 11 <210> 101 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 101 ccgacuugga c 11 <210> 102 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 102 aagacugaac u 11 <210> 103 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 103 ugcugccuuu g 11 <210> 104 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 104 ugcugccuuu g 11 <210> 105 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 105 ugcugccuuu g 11 <210> 106 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 106 ugcugccuuu g 11 <210> 107 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 107 ugcugccuuu g 11 <210> 108 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 108 ugcugccuuu g 11 <210> 109 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 109 ugcugccuuu g 11 <210> 110 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 110 ugcugccuuu g 11 <210> 111 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> Ara-G <400> 111 ugcugccuuu g 11 <210> 112 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (7)..(7) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 112 guccuugcuu g 11 <210> 113 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 113 uucugcuucu g 11 <210> 114 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 114 ugcugccuuu g 11 <210> 115 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 115 ugccuuugcu g 11 <210> 116 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 116 ugcugcuucu g 11 <210> 117 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (6)..(7) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 117 ugcugccuuu g 11 <210> 118 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 118 ugcugcuucu g 11 <210> 119 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 119 ugcugcuucu g 11 <210> 120 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 120 uggcuugacg c 11 <210> 121 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 121 ugcugcuuga a 11 <210> 122 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 122 ugacgaugag u 11 <210> 123 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 123 ugaugaggac u 11 <210> 124 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 124 uguugaggaa c 11 <210> 125 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 125 ugcgagacug c 11 <210> 126 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 126 guugaacgac u 11 <210> 127 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 127 ugacugauga c 11 <210> 128 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 128 uguugaacga c 11 <210> 129 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 129 ugagcgugaa c 11 <210> 130 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(3) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (7)..(7) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> 7-deaza-rG <400> 130 uggcuugacg c 11 <210> 131 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> 7-deaza-rG <400> 131 ugacgaugag u 11 <210> 132 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (7)..(8) <223> 7-deaza-rG <400> 132 uguugaggaa c 11 <210> 133 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> 7-deaza-rG <400> 133 uguugaacga c 11 <210> 134 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 134 ugcgagacug c 11 <210> 135 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 135 ugagcgugaa c 11 <210> 136 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 136 uugagcugga c 11 <210> 137 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 137 guugaggaac u 11 <210> 138 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 138 ugaugaagcu u 11 <210> 139 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 139 uugacgauga g 11 <210> 140 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 140 uuguugaacg a 11 <210> 141 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 141 uugaacgacu u 11 <210> 142 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 142 ugauggaacg a 11 <210> 143 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 143 ugcugccuuu g 11 <210> 144 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 144 ugcugccuuu g 11 <210> 145 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 145 ugcugccuuu g 11 <210> 146 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 146 ugcugccuuu g 11 <210> 147 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 147 ugcugccuuu g 11 <210> 148 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 148 ugcugcuugu g 11 <210> 149 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 149 ugcugcuugu g 11 <210> 150 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 150 ugcugcuugu g 11 <210> 151 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 151 caacgaaccc u 11 <210> 152 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 152 ugcugcugcu g 11 <210> 153 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 153 ugaagcuuga a 11 <210> 154 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 154 ugaacgugaa c 11 <210> 155 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> 5-methyl-C <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> 5-methyl-C <400> 155 ugcugcuugu g 11 <210> 156 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (3)..(3) <223> 5-methyl-C <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (6)..(6) <223> 5-methyl-C <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> 5-methyl-C <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 156 ugcugcuucu g 11 <210> 157 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> 7-deaza-rG <400> 157 ugacgaugag u 11 <210> 158 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (7)..(7) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 158 guccuugcuu g 11 <210> 159 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 159 uucugcuucu g 11 <210> 160 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 160 ugccuuugcu g 11 <210> 161 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 161 ugcugcuucu g 11 <210> 162 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 162 uucugcuucu g 11 <210> 163 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 163 ugccuuugcu g 11 <210> 164 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 164 ugcugcuucu g 11 <210> 165 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Ara-C <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 165 ugcugcuucu g 11 <210> 166 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> 2'-F-C <220> <221> modified_base <222> (7)..(7) <223> 2'-F-C <400> 166 cugaagcuug u 11 <210> 167 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 2'-F-U <220> <221> modified_base <222> (8)..(9) <223> 2'-F-U <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 2'-F-U <400> 167 cugaagcuug u 11 <210> 168 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (8)..(8) <223> Ara-G <400> 168 aacuguugac c 11 <210> 169 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(3) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (7)..(7) <223> Ara-G <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> Ara-G <400> 169 uggcuugacg c 11 <210> 170 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 170 ugacgcugac u 11 <210> 171 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 171 ugacugcgac u 11 <210> 172 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 172 ugcgaacgcu u 11 <210> 173 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 173 ugcgacugac u 11 <210> 174 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 174 ugcgcugaac u 11 <210> 175 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 175 ugcugacgac u 11 <210> 176 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 176 ugcuugaacg c 11 <210> 177 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 177 uugcugaacg c 11 <210> 178 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (11)..(11) <223> 7-deaza-rG <400> 178 ugcugccuuu g 11 <210> 179 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 179 uguuguguga c 11 <210> 180 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 180 ugcugccuuu g 11 <210> 181 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 181 ugcugcugcu g 11 <210> 182 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 182 uguuguguga c 11 <210> 183 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 183 uugaacgacu u 11 <210> 184 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 184 uguuguguga c 11 <210> 185 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 185 ugcugccuuu g 11 <210> 186 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 186 ugcugcugcu g 11 <210> 187 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> Ara-U <400> 187 ugcugcuugu g 11 <210> 188 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Ara-U <400> 188 ugcugcuugu g 11 <210> 189 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (1)..(1) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (7)..(8) <223> Ara-U <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> Ara-U <400> 189 ugcugcuugu g 11 <210> 190 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 190 uugacuguug a 11 <210> 191 <211> 11 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 191 ucagucgcag u 11 <210> 192 <211> 10 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (2)..(2) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (5)..(5) <223> 7-deaza-rG <220> <221> modified_base <222> (10)..(10) <223> 7-deaza-rG <400> 192 ugcugccuug 10

Claims (23)

  1. SIMRA#1 내지 SIMRA#189로 이루어지는 군으로부터 선택된 SIMRA(Stabilized Immune Modulatory RNA: 안정화된 면역 조절성 RNA) 화합물.
  2. 제 1항의 SIMRA 화합물, 및 생리학적으로 허용되는 담체를 포함하는 조성물.
  3. 척추동물에서 면역 반응을 생성시키는 방법으로서,
    제 1항의 SIMRA 화합물을 척추동물에게 투여하는 것을 포함하는 방법.
  4. 면역 반응의 조절이 유익하게 작용할 것인 질환 또는 질병을 앓는 척추동물을 치료학적으로 처치하는 방법으로서,
    제 1항의 SIMRA 화합물을 약제학적 유효량으로 상기 척추동물에게 투여하는 것을 포함하는 방법.
  5. 제 4항에 있어서, 질환 또는 질병이 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 염증 질환, 감염성 질환, 피부 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환인 방법.
  6. 제 4항에 있어서, 하나 또는 그 초과의 화학요법성 화합물을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  7. 제 4항에 있어서, 표적 치료제를 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  8. 제 4항에 있어서, 항체를 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  9. 제 4항에 있어서, DNA 백신을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  10. 제 4항에 있어서, 단백질 백신을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  11. 제 4항에 있어서, 펩티드 백신을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  12. 제 4항에 있어서, 항원을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  13. 제 4항에 있어서, 애주번트(adjuvant)를 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  14. 면역 반응의 조절이 유익하게 작용할 것인 질환 또는 질병을 앓는 척추동물을 예방학적으로 처치하는 방법으로서,
    제 1항의 SIMRA 화합물을 약제학적 유효량으로 상기 척추동물에게 투여하는 것을 포함하는 방법.
  15. 제 14항에 있어서, 질환 또는 질병이 암, 자가면역 질환, 기도 염증, 염증 질환, 감염성 질환, 피부 질환, 알레르기, 천식, 또는 병원균에 의해 유발된 질환인 방법.
  16. 제 15항에 있어서, 하나 또는 그 초과의 화학요법성 화합물을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  17. 제 15항에 있어서, 표적 치료제를 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  18. 제 15항에 있어서, 항체를 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  19. 제 15항에 있어서, DNA 백신을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  20. 제 15항에 있어서, 단백질 백신을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  21. 제 15항에 있어서, 펩티드 백신을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  22. 제 15항에 있어서, 항원을 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
  23. 제 15항에 있어서, 애주번트를 투여하는 것을 추가로 포함하는 방법.
KR1020107002897A 2007-07-09 2008-07-07 안정화된 면역 조절성 rna(simra)화합물 KR101343489B1 (ko)

Applications Claiming Priority (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US94852907P 2007-07-09 2007-07-09
US60/948,529 2007-07-09
US95719507P 2007-08-22 2007-08-22
US60/957,195 2007-08-22
US98116107P 2007-10-19 2007-10-19
US60/981,161 2007-10-19
US1528407P 2007-12-20 2007-12-20
US61/015,284 2007-12-20

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20100055413A true KR20100055413A (ko) 2010-05-26
KR101343489B1 KR101343489B1 (ko) 2013-12-20

Family

ID=40282076

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020107002897A KR101343489B1 (ko) 2007-07-09 2008-07-07 안정화된 면역 조절성 rna(simra)화합물

Country Status (8)

Country Link
US (2) US8188261B2 (ko)
EP (3) EP2178567A4 (ko)
JP (1) JP5737937B2 (ko)
KR (1) KR101343489B1 (ko)
CN (2) CN101795715A (ko)
AU (1) AU2008279509B2 (ko)
CA (1) CA2692161C (ko)
WO (1) WO2009014887A2 (ko)

Families Citing this family (132)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MXPA05013658A (es) * 2003-06-11 2006-03-02 Hybridon Inc Oligonucleotidos inmunomoduladores estabilizados.
MXPA06000619A (es) * 2003-07-15 2006-04-11 Hybridon Inc Estimulacion sinergistica del sistema inmune usando oligonucleotidos inmunoestimuladores y/o compuestos inmunomeros en conjunto con citocinas y/o agentes quimioterapeuticos o terapia de radiacion.
EP2370451B1 (en) 2008-12-02 2016-11-16 Wave Life Sciences Japan, Inc. Method for the synthesis of phosphorus atom modified nucleic acids
AU2010213795A1 (en) * 2009-02-10 2011-08-04 Idera Pharmaceuticals, Inc. Synthetic RNA-based agonists of TLR7
KR101141544B1 (ko) 2009-03-13 2012-05-03 한국과학기술원 에스아이알엔에이 다중 접합체 및 이의 제조방법
SG177564A1 (en) 2009-07-06 2012-02-28 Ontorii Inc Novel nucleic acid prodrugs and methods of use thereof
JP5868324B2 (ja) 2010-09-24 2016-02-24 株式会社Wave Life Sciences Japan 不斉補助基
RU2014105311A (ru) 2011-07-19 2015-08-27 Уэйв Лайф Сайенсес Пте. Лтд. Способы синтеза функционализованных нуклеиновых кислот
KR20150021489A (ko) 2011-11-18 2015-03-02 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 변형된 RNAi 제제
CN104080794B (zh) 2011-11-18 2018-03-16 阿尔尼拉姆医药品有限公司 RNAi试剂、组合物及其用于治疗甲状腺素运载蛋白(TTR)相关疾病的使用方法
CA2873766A1 (en) * 2012-05-16 2013-11-21 Rana Therapeutics Inc. Compositions and methods for modulating atp2a2 expression
US9982257B2 (en) 2012-07-13 2018-05-29 Wave Life Sciences Ltd. Chiral control
SG11201500243WA (en) * 2012-07-13 2015-04-29 Shin Nippon Biomedical Lab Ltd Chiral nucleic acid adjuvant
SG11201500239VA (en) 2012-07-13 2015-03-30 Wave Life Sciences Japan Asymmetric auxiliary group
CA2879683C (en) 2012-08-03 2023-02-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Modified rnai agents
US9868955B2 (en) 2012-09-29 2018-01-16 Dynavax Technologies Corporation Human toll-like receptor inhibitors and methods of use thereof
US9228184B2 (en) 2012-09-29 2016-01-05 Dynavax Technologies Corporation Human toll-like receptor inhibitors and methods of use thereof
ES2657608T3 (es) 2012-12-05 2018-03-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Composiciones de arni de pcsk9 y métodos de uso de las mismas
US9260719B2 (en) * 2013-01-08 2016-02-16 Idera Pharmaceuticals, Inc. Immune regulatory oligonucleotide (IRO) compounds to modulate toll-like receptor based immune response
KR102605775B1 (ko) 2013-03-14 2023-11-29 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 보체 성분 C5 iRNA 조성물 및 그 이용 방법
RS57418B1 (sr) 2013-05-22 2018-09-28 Alnylam Pharmaceuticals Inc Serpina1 irnk sastavi i postupci njihove primene
TWI727917B (zh) 2013-05-22 2021-05-21 美商阿尼拉製藥公司 TMPRSS6iRNA 組成物及其使用方法
AR097738A1 (es) 2013-09-23 2016-04-13 Alnylam Pharmaceuticals Inc Métodos para tratar o prevenir enfermedades asociadas con la transtiretina (ttr)
IL282401B (en) 2013-12-12 2022-08-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Complementary component irna compositions and methods for using them
WO2015106128A2 (en) 2014-01-09 2015-07-16 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. MODIFIED RNAi AGENTS
JPWO2015108046A1 (ja) 2014-01-15 2017-03-23 株式会社新日本科学 抗アレルギー作用を有するキラル核酸アジュバンド及び抗アレルギー剤
JPWO2015108047A1 (ja) 2014-01-15 2017-03-23 株式会社新日本科学 免疫誘導活性を有するキラル核酸アジュバンド及び免疫誘導活性剤
US10149905B2 (en) 2014-01-15 2018-12-11 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having antitumor effect and antitumor agent
DK3094728T3 (da) 2014-01-16 2022-05-16 Wave Life Sciences Ltd Kiralt design
WO2015123264A1 (en) 2014-02-11 2015-08-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (khk) irna compositions and methods of use thereof
WO2015175510A1 (en) 2014-05-12 2015-11-19 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating a serpinc1-associated disorder
EA201692370A1 (ru) 2014-05-22 2017-03-31 Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. КОМПОЗИЦИИ иРНК АНГИОТЕНЗИНОГЕНА (AGT) И СПОСОБЫ ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ
KR102494171B1 (ko) 2014-08-20 2023-02-02 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 변형 이중-가닥 rna 제제
JOP20200115A1 (ar) 2014-10-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc تركيبات وطرق لتثبيط التعبير الجيني عن hao1 (حمض أوكسيداز هيدروكسيلي 1 (أوكسيداز جليكولات))
JOP20200092A1 (ar) 2014-11-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc تركيبات iRNA لفيروس الكبد B (HBV) وطرق لاستخدامها
CN107250362B (zh) 2014-11-17 2021-10-22 阿尔尼拉姆医药品有限公司 载脂蛋白C3(APOC3)iRNA组合物及其使用方法
CN107106493A (zh) 2014-11-21 2017-08-29 西北大学 球形核酸纳米颗粒缀合物的序列特异性细胞摄取
JP2018504380A (ja) 2014-12-18 2018-02-15 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドAlnylam Pharmaceuticals, Inc. Reversir(商標)化合物
CA2976445A1 (en) 2015-02-13 2016-08-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Patatin-like phospholipase domain containing 3 (pnpla3) irna compositions and methods of use thereof
EP3307316A1 (en) 2015-06-12 2018-04-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c5 irna compositions and methods of use thereof
MX2017016088A (es) 2015-06-15 2018-04-11 Mpeg La Llc Oligonucleotidos multi-conjugados definidos.
US10494632B2 (en) 2015-07-10 2019-12-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit (IGFALS) compositions and methods of use thereof
MA43072A (fr) 2015-07-22 2018-05-30 Wave Life Sciences Ltd Compositions d'oligonucléotides et procédés associés
CN114525280A (zh) 2015-09-02 2022-05-24 阿尔尼拉姆医药品有限公司 程序性细胞死亡1配体1(PD-L1)的iRNA组合物及其使用方法
US20190256845A1 (en) 2016-06-10 2019-08-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. COMPLEMENT COMPONENT C5 iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF FOR TREATING PAROXYSMAL NOCTURNAL HEMOGLOBINURIA (PNH)
US11364304B2 (en) 2016-08-25 2022-06-21 Northwestern University Crosslinked micellar spherical nucleic acids
TWI788312B (zh) 2016-11-23 2023-01-01 美商阿尼拉製藥公司 絲胺酸蛋白酶抑制因子A1 iRNA組成物及其使用方法
KR20230166146A (ko) 2016-12-16 2023-12-06 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 트랜스티레틴(TTR) iRNA 조성물을 사용하여 TTR-관련 질병을 치료하거나 예방하는 방법
WO2018209270A1 (en) 2017-05-11 2018-11-15 Northwestern University Adoptive cell therapy using spherical nucleic acids (snas)
WO2019014530A1 (en) 2017-07-13 2019-01-17 Alnylam Pharmaceuticals Inc. LACTATE DEHYDROGENASE A (LDHA) RNAI COMPOSITIONS AND METHODS OF USE
US20200385719A1 (en) 2017-11-16 2020-12-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Kisspeptin 1 (kiss1) irna compositions and methods of use thereof
EP3714054A1 (en) 2017-11-20 2020-09-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serum amyloid p component (apcs) irna compositions and methods of use thereof
AU2018388484A1 (en) 2017-12-18 2020-07-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. High mobility group box-1 (HMGB1) iRNA compositions and methods of use thereof
BR112020022546A8 (pt) 2018-05-07 2022-05-17 Alnylam Pharmaceuticals Inc Entrega extra-hepática
TW202016304A (zh) 2018-05-14 2020-05-01 美商阿尼拉製藥公司 血管收縮素原(AGT)iRNA組成物及其使用方法
US20210332367A1 (en) 2018-09-18 2021-10-28 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. KETOHEXOKINASE (KHK) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
TW202028465A (zh) 2018-09-28 2020-08-01 美商阿尼拉製藥公司 甲狀腺素運載蛋白(TTR)iRNA組成物及其治療或預防TTR相關眼部疾病之使用方法
JP2022532652A (ja) 2019-05-17 2022-07-15 アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド オリゴヌクレオチドの経口送達
WO2021022108A2 (en) 2019-08-01 2021-02-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. CARBOXYPEPTIDASE B2 (CPB2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2021022109A1 (en) 2019-08-01 2021-02-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. SERPIN FAMILY F MEMBER 2 (SERPINF2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2021030522A1 (en) 2019-08-13 2021-02-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. SMALL RIBOSOMAL PROTEIN SUBUNIT 25 (RPS25) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
US20220389429A1 (en) 2019-10-04 2022-12-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing ugt1a1 gene expression
WO2021076828A1 (en) 2019-10-18 2021-04-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Solute carrier family member irna compositions and methods of use thereof
AU2020369515A1 (en) 2019-10-22 2022-04-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component C3 iRNA compositions and methods of use thereof
TW202132567A (zh) 2019-11-01 2021-09-01 美商阿尼拉製藥公司 亨汀頓蛋白(HTT)iRNA劑組成物及其使用方法
EP4051796A1 (en) 2019-11-01 2022-09-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing dnajb1-prkaca fusion gene expression
KR20220110749A (ko) 2019-11-06 2022-08-09 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 간외 전달
WO2021092145A1 (en) 2019-11-06 2021-05-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transthyretin (ttr) irna composition and methods of use thereof for treating or preventing ttr-associated ocular diseases
WO2021096763A1 (en) 2019-11-13 2021-05-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating an angiotensinogen- (agt-) associated disorder
US20230056569A1 (en) 2019-11-22 2023-02-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ataxin3 (atxn3) rnai agent compositions and methods of use thereof
MX2022006433A (es) 2019-12-13 2022-06-23 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de agentes de acido ribonucleico de interferencia (arni) del marco de lectura abierto 72 del cromosoma 9 humano (c9orf72) y metodos de uso de los mismos.
WO2021126734A1 (en) 2019-12-16 2021-06-24 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Patatin-like phospholipase domain containing 3 (pnpla3) irna compositions and methods of use thereof
WO2021154941A1 (en) 2020-01-31 2021-08-05 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c5 irna compositions for use in the treatment of amyotrophic lateral sclerosis (als)
CN115427571A (zh) 2020-02-10 2022-12-02 阿尔尼拉姆医药品有限公司 沉默vegf-a表达的组合物和方法
MX2022010052A (es) 2020-02-18 2022-09-05 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de acido ribonucleico de interferencia (arni) contra la apolipoproteina c3 (apoc3) y metodos para su uso.
EP4114947A1 (en) 2020-03-05 2023-01-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c3 irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing complement component c3-associated diseases
CA3174725A1 (en) 2020-03-06 2021-09-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (khk) irna compositions and methods of use thereof
EP4121534A1 (en) 2020-03-18 2023-01-25 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating subjects having a heterozygous alanine-glyoxylate aminotransferase gene (agxt) variant
WO2021195307A1 (en) 2020-03-26 2021-09-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Coronavirus irna compositions and methods of use thereof
US20230190785A1 (en) 2020-03-30 2023-06-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing dnajc15 gene expression
US20230295622A1 (en) 2020-04-06 2023-09-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing myoc expression
EP4133077A1 (en) 2020-04-07 2023-02-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transmembrane serine protease 2 (tmprss2) irna compositions and methods of use thereof
CN116134135A (zh) 2020-04-07 2023-05-16 阿尔尼拉姆医药品有限公司 用于沉默scn9a表达的组合物和方法
WO2021206917A1 (en) 2020-04-07 2021-10-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME 2 (ACE2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
BR112022021813A2 (pt) 2020-04-27 2023-01-17 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições de agente de apolipoproteína e (apoe) irna e métodos de uso das mesmas
IL297680A (en) 2020-04-30 2022-12-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc IRNA compounds complement factor b (cfb) and methods of using them
EP4153746A1 (en) 2020-05-21 2023-03-29 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting marc1 gene expression
EP4162050A1 (en) 2020-06-09 2023-04-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Rnai compositions and methods of use thereof for delivery by inhalation
BR112022024420A2 (pt) 2020-06-18 2023-01-17 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições de irna de xantina desidrogenase (xdh) e métodos de uso das mesmas
WO2022011214A1 (en) 2020-07-10 2022-01-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Circular sirnas
EP4217489A1 (en) 2020-09-24 2023-08-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Dipeptidyl peptidase 4 (dpp4) irna compositions and methods of use thereof
TW202229552A (zh) 2020-10-05 2022-08-01 美商艾拉倫製藥股份有限公司 G蛋白-偶合受體75(GPR75)iRNA組成物及其使用方法
EP4232581A1 (en) 2020-10-21 2023-08-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating primary hyperoxaluria
EP4232582A1 (en) 2020-10-23 2023-08-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Mucin 5b (muc5b) irna compositions and methods of use thereof
JP2023549500A (ja) 2020-11-13 2023-11-27 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 凝固第V因子(F5)iRNA組成物およびその使用方法
CA3201452A1 (en) 2020-12-01 2022-06-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for inhibition of hao1 (hydroxyacid oxidase 1 (glycolate oxidase)) gene expression
EP4259795A1 (en) 2020-12-08 2023-10-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Coagulation factor x (f10) irna compositions and methods of use thereof
AU2021411579A1 (en) 2020-12-31 2023-07-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs
EP4271695A2 (en) 2020-12-31 2023-11-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified nucleoside based oligonucleotide prodrugs
WO2022150260A1 (en) 2021-01-05 2022-07-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. COMPLEMENT COMPONENT 9 (C9) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
TW202305131A (zh) 2021-02-12 2023-02-01 美商艾拉倫製藥股份有限公司 用於治療或預防超氧歧化酶1-(SOD1-)相關的神經退化疾病的超氧歧化酶1(SOD1)iRNA組成物及其使用方法
CN117222739A (zh) 2021-02-25 2023-12-12 阿尔尼拉姆医药品有限公司 朊病毒蛋白(prnp)irna组合物和其使用方法
WO2022182574A1 (en) 2021-02-26 2022-09-01 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. KETOHEXOKINASE (KHK) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
AU2022231003A1 (en) 2021-03-04 2023-09-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (angptl3) irna compositions and methods of use thereof
WO2022192519A1 (en) 2021-03-12 2022-09-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Glycogen synthase kinase 3 alpha (gsk3a) irna compositions and methods of use thereof
JP2024512635A (ja) 2021-03-29 2024-03-19 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド ハンチンチン(HTT)iRNA剤組成物およびその使用方法
WO2022212153A1 (en) 2021-04-01 2022-10-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Proline dehydrogenase 2 (prodh2) irna compositions and methods of use thereof
WO2022221736A2 (en) * 2021-04-16 2022-10-20 Genentech, Inc. Optimized tlr7 ligands and uses thereof
KR20240001207A (ko) 2021-04-26 2024-01-03 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 막관통 프로테아제, 세린 6(TMPRSS6) iRNA 조성물 및 이의 사용 방법
WO2022232343A1 (en) 2021-04-29 2022-11-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Signal transducer and activator of transcription factor 6 (stat6) irna compositions and methods of use thereof
WO2022245583A1 (en) 2021-05-18 2022-11-24 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Sodium-glucose cotransporter-2 (sglt2) irna compositions and methods of use thereof
WO2022256395A1 (en) 2021-06-02 2022-12-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Patatin-like phospholipase domain containing 3 (pnpla3) irna compositions and methods of use thereof
WO2022256290A2 (en) 2021-06-04 2022-12-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. HUMAN CHROMOSOME 9 OPEN READING FRAME 72 (C9ORF72) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
AR126070A1 (es) 2021-06-08 2023-09-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para tratar o prevenir la enfermedad de stargardt y/o trastornos asociados con la proteína transportadora de retinol 4 (rbp4)
CA3225469A1 (en) 2021-06-30 2023-01-05 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating an angiotensinogen- (agt-) associated disorder
WO2023283403A2 (en) 2021-07-09 2023-01-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Bis-rnai compounds for cns delivery
TW202333748A (zh) 2021-07-19 2023-09-01 美商艾拉倫製藥股份有限公司 用於處置具有或有風險發展非原發性高草酸鹽尿疾病或病症的個體的方法及組成物
CA3226887A1 (en) 2021-07-21 2023-01-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Metabolic disorder-associated target gene irna compositions and methods of use thereof
IL309905A (en) 2021-07-23 2024-03-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc IRNA compositions in β-catenin (CTNNB1) and methods of using them
WO2023009687A1 (en) 2021-07-29 2023-02-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coa reductase (hmgcr) irna compositions and methods of use thereof
IL310244A (en) 2021-08-03 2024-03-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Transthyretin (TTR) IRNA compositions and methods of using them
CA3228255A1 (en) 2021-08-04 2023-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Irna compositions and methods for silencing angiotensinogen (agt)
AU2022328347A1 (en) 2021-08-13 2024-02-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Factor xii (f12) irna compositions and methods of use thereof
WO2023044370A2 (en) 2021-09-17 2023-03-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Irna compositions and methods for silencing complement component 3 (c3)
CA3232420A1 (en) 2021-09-20 2023-03-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Inhibin subunit beta e (inhbe) modulator compositions and methods of use thereof
WO2023064530A1 (en) 2021-10-15 2023-04-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Extra-hepatic delivery irna compositions and methods of use thereof
TW202334418A (zh) 2021-10-29 2023-09-01 美商艾拉倫製藥股份有限公司 杭丁頓(HTT)iRNA劑組成物及其使用方法
WO2023076451A1 (en) 2021-10-29 2023-05-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement factor b (cfb) irna compositions and methods of use thereof
WO2023141314A2 (en) 2022-01-24 2023-07-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Heparin sulfate biosynthesis pathway enzyme irna agent compositions and methods of use thereof
WO2024006999A2 (en) 2022-06-30 2024-01-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs
WO2024059165A1 (en) 2022-09-15 2024-03-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 17b-hydroxysteroid dehydrogenase type 13 (hsd17b13) irna compositions and methods of use thereof
WO2024073732A1 (en) 2022-09-30 2024-04-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Modified double-stranded rna agents

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5912332A (en) 1996-07-26 1999-06-15 Hybridon, Inc. Affinity-based purification of oligonucleotides using soluble multimeric oligonucleotides
EP0855184A1 (en) 1997-01-23 1998-07-29 Grayson B. Dr. Lipford Pharmaceutical composition comprising a polynucleotide and an antigen especially for vaccination
US6248539B1 (en) * 1997-09-05 2001-06-19 The Scripps Research Institute Porous semiconductor-based optical interferometric sensor
EP1499187B1 (en) * 2002-04-04 2015-06-17 Zoetis Belgium S.A. Immunostimulatory g,u-containing oligoribonucleotides
MXPA05013658A (es) * 2003-06-11 2006-03-02 Hybridon Inc Oligonucleotidos inmunomoduladores estabilizados.
AU2005230938A1 (en) * 2004-02-19 2005-10-20 Coley Pharmaceutical Gmbh Immunostimulatory viral RNA oligonucleotides
US7776834B2 (en) * 2005-11-07 2010-08-17 Idera Pharmaceuticals, Inc. Immunostimulatory properties of oligonucleotide-based compounds comprising modified immunostimulatory dinucleotides
JP5184366B2 (ja) * 2005-11-07 2013-04-17 イデラ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド 修飾された免疫刺激性ジヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチドに基づく化合物の免疫刺激特性
BRPI0618857B1 (pt) * 2005-11-25 2022-07-19 Zoetis Belgium S.A Oligonucleotídeo de rna isolado, e método para regular negativamente células reguladoras cd4+ imunossupressoras
ES2564303T3 (es) 2006-04-07 2016-03-21 Idera Pharmaceuticals, Inc. Compuestos de ARN inmunomodulador estabilizado (SIMRA) para TLR7 y TLR8

Also Published As

Publication number Publication date
CA2692161A1 (en) 2009-01-29
CN102921003B (zh) 2014-11-26
EP2348112A3 (en) 2015-09-02
US8188261B2 (en) 2012-05-29
EP2348112A2 (en) 2011-07-27
US20090053205A1 (en) 2009-02-26
KR101343489B1 (ko) 2013-12-20
US20120183530A1 (en) 2012-07-19
AU2008279509B2 (en) 2011-07-21
CN101795715A (zh) 2010-08-04
JP2010532996A (ja) 2010-10-21
JP5737937B2 (ja) 2015-06-17
EP2178567A4 (en) 2010-11-03
CN102921003A (zh) 2013-02-13
WO2009014887A2 (en) 2009-01-29
US8362233B2 (en) 2013-01-29
EP2348112B1 (en) 2018-11-28
WO2009014887A3 (en) 2009-12-30
AU2008279509A1 (en) 2009-01-29
EP2178567A2 (en) 2010-04-28
EP2357231A2 (en) 2011-08-17
CA2692161C (en) 2015-09-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101343489B1 (ko) 안정화된 면역 조절성 rna(simra)화합물
KR101221589B1 (ko) Tlr7 및 tlr8에 대한 안정화된 면역 조절성 rna〔simra〕 화합물
US8202974B2 (en) Synthetic RNA-based agonists of TLR7
KR101455081B1 (ko) 톨―유사 수용체 기초 면역 반응을 조절하기 위한 면역조절 올리고누클레오티드 (iro)
EP2437791B1 (en) Potentiation of autoimmune and inflammatory disease treatments by immune regulatory oligonucleotide (iro) antagonists of tlr7 and tlr9
KR20140009258A (ko) 톨-유사 수용체 기반 면역 반응을 조절하기 위한 면역 조절 올리고뉴클레오타이드(iro) 화합물
KR20100066512A (ko) 톨 유사 수용체 조절자
EP2588143B1 (en) Novel agonists of toll-like receptor 3 and methods of their use

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
A302 Request for accelerated examination
E902 Notification of reason for refusal
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant
FPAY Annual fee payment

Payment date: 20161128

Year of fee payment: 4

FPAY Annual fee payment

Payment date: 20171130

Year of fee payment: 5

FPAY Annual fee payment

Payment date: 20181127

Year of fee payment: 6