JPWO2021050991A5 - - Google Patents

Description

本出願は以下の図を含む。これらの図は、組成物及び方法のある特定の実施形態及び／または特色を例証すること、ならびに組成物及び方法の任意の記載（複数可）を補足することが意図される。書面による記載がかかるが事例であることを明示的に示さない限り、これらの図は組成物及び方法の範囲を限定するものではない。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
核酸構築物であって、
ヒトフラタキシン５’非翻訳領域（５’ＵＴＲ ＦＸＮ）を含む核酸配列と、
ヒトフラタキシン（ＦＸＮ）をコードする核酸配列と、を含み、前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、前記核酸構築物。
（項目２）
前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、配列番号２に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、項目１に記載の核酸構築物。
（項目３）
前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、コドン最適化されている、項目１または２に記載の核酸構築物。
（項目４）
前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、配列番号２を含む、項目１～３のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目５）
前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列の上流に位置する、項目１～４のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目６）
イントロンをさらに含み、前記イントロンが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮの下流及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸の上流に配置される、項目１～５のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目７）
前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、ＣＣＣＴＣ結合因子（ＣＴＣＦ）結合部位を含む、項目１～５のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目８）
前記ＣＴＣＦ結合部位が、配列番号３または１６～２１のうちのいずれか１つを含む、項目７に記載の核酸構築物。
（項目９）
ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列をさらに含む、項目１～８のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目１０）
核酸構築物であって、以下の順序で、
（ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
（ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、及び
（ｃ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、フラタキシンプロモーターではなく、前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、前記核酸構築物。
（項目１１）
前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、項目１０に記載の核酸構築物。
（項目１２）
前記ヒトＦＸＮが、配列番号６０を含む、項目１０または１１に記載の核酸構築物。
（項目１３）
前記核酸構築物が、以下の順序で、
（ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
（ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、及び
（ｃ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有し、前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、項目１～９のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目１４）
核酸構築物であって、以下の順序で、
（ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
（ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、
（ｃ）イントロン、及び
（ｄ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、前記核酸構築物。
（項目１５）
前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、項目１４に記載の核酸構築物。
（項目１６）
前記ヒトＦＸＮが、配列番号６０を含む、項目１４または１５に記載の核酸構築物。
（項目１７）
前記核酸構築物が、以下の順序で、
（ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
（ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、
（ｃ）イントロン、及び
（ｄ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
前記ヒトＦＸをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有し、前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、項目１～９のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目１８）
前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、デスミンプロモーターまたはＣＢＡプロモーターである、項目９～１７のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目１９）
前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、配列番号４または配列番号５を含む、項目１８に記載の核酸構築物。
（項目２０）
前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、空間的に制限されたプロモーターである、項目９～１７のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目２１）
前記空間的に制限されたプロモーターが、ニューロン特異的プロモーター、心筋細胞特異的プロモーター、骨格筋特異的プロモーター、肝臓特異的プロモーター、星状細胞特異的プロモーター、ミクログリア特異的プロモーター、及びオリゴデンドロサイト特異的プロモーターからなる群から選択される、項目２０に記載の核酸構築物。
（項目２２）
一対の逆方向末端反復（ＩＴＲ）をさらに含み、前記核酸構築物が、前記ＩＴＲによって各々に隣接する、項目１～２１のいずれか一項に記載の核酸構築物。
（項目２３）
項目１～２２のいずれか一項に記載の核酸構築物を含む、組換えウイルスベクター。
（項目２４）
前記ベクターが、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターである、項目２３に記載の組換えウイルスベクター。
（項目２５）
前記ＡＡＶベクターが、ＡＡＶ１血清型ベクター、ＡＡＶ２血清型ベクター、ＡＡＶ３血清型ベクター、ＡＡＶ４血清型ベクター、ＡＡＶ５血清型ベクター、ＡＡＶ６血清型ベクター、ＡＡＶ７血清型ベクター、ＡＡＶ８血清型ベクター、ＡＡＶ９血清型ベクター、ＡＡＶ Ｒｈ７４血清型ベクター、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される、項目２４に記載の組換えＡＡＶベクター。
（項目２６）
前記組換えＡＡＶベクターが、一本鎖または自己相補的ＡＡＶベクターである、項目２４または２５に記載の組換えＡＡＶベクター。
（項目２７）
前記組換えＡＡＶベクターが、配列番号６～８、１３～１５、または２４～２８のうちのいずれか１つに対して少なくとも８５％の配列同一性を有する核酸配列を含む、項目２４～２６のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクター。
（項目２８）
前記組換えＡＡＶベクターが、配列番号６～８、１３～１５、または２４～２８のうちのいずれか１つを含む、項目２４～２６のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクター。
（項目２９）
項目２４～２８のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクターを含む、核酸。
（項目３０）
前記核酸が、プラスミドである、項目２９に記載の核酸。
（項目３１）
項目２３～２８のいずれか一項に記載の組換えウイルスベクターを含む、組換えＡＡＶ粒子。
（項目３２）
項目３１に記載の粒子を含む、薬学的組成物。
（項目３３）
前記組成物が、複数の粒子を含む、項目３２に記載の薬学的組成物。
（項目３４）
項目１～２２のいずれか一項に記載の核酸構築物、または項目２３～２８のいずれか一項に記載の組換えウイルスベクターを含む、遺伝子改変細胞。
（項目３５）
前記遺伝子改変細胞が、ヒト幹細胞、ヒトニューロン、ヒト心筋細胞、ヒト平滑筋細胞、ヒト骨格筋細胞、及びヒト肝細胞からなる群から選択される、項目３４に記載の遺伝子改変細胞。
（項目３６）
フリードライヒ運動失調症（ＦＡ）を有する患者を治療する方法であって、治療有効量の項目３１に記載の組換えＡＡＶ粒子を前記患者に投与することを含む、前記方法。
（項目３７）
ヒト細胞におけるＦＸＮの発現を調節する方法であって、前記ヒト細胞に、項目２４～２８のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクターを導入することを含む、前記方法。
（項目３８）
ヒト細胞におけるＦＸＮの発現を調節する方法であって、前記ヒト細胞に、項目２９または３０に記載の核酸を導入することを含む、前記方法。
（項目３９）
ＦＡを有する対象のヒト細胞におけるアデノシン三リン酸（ＡＴＰ）濃度を増加させる方法であって、治療有効量の項目３１に記載の組換えＡＡＶ粒子を前記患者に投与することを含む、前記方法。
（項目４０）
ＦＡを有する対象のヒト細胞におけるＡＴＰ濃度を増加させる方法であって、治療有効量の項目３１に記載の組換えＡＡＶ粒子を前記患者に投与することを含む、前記方法。
（項目４１）
前記ヒト細胞が、ニューロン、心筋細胞、平滑筋細胞、骨格筋細胞、及び肝細胞からなる群から選択される、項目３８～４０のいずれか一項に記載の方法。

Claims (41)

1. 核酸構築物であって、
   ヒトフラタキシン５’非翻訳領域（５’ＵＴＲ ＦＸＮ）を含む核酸配列と、
   ヒトフラタキシン（ＦＸＮ）をコードする核酸配列と、を含み、前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、前記核酸構築物。
2. 前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、配列番号２に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、請求項１に記載の核酸構築物。
3. 前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、コドン最適化されている、請求項１または２に記載の核酸構築物。
4. 前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、配列番号２を含む、請求項１～３のいずれか一項に記載の核酸構築物。
5. 前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列の上流に位置する、請求項１～４のいずれか一項に記載の核酸構築物。
6. イントロンをさらに含み、前記イントロンが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮの下流及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸の上流に配置される、請求項１～５のいずれか一項に記載の核酸構築物。
7. 前記５’ＵＴＲ ＦＸＮが、ＣＣＣＴＣ結合因子（ＣＴＣＦ）結合部位を含む、請求項１～５のいずれか一項に記載の核酸構築物。
8. 前記ＣＴＣＦ結合部位が、配列番号３または１６～２１のうちのいずれか１つを含む、請求項７に記載の核酸構築物。
9. ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列をさらに含む、請求項１～８のいずれか一項に記載の核酸構築物。
10. 核酸構築物であって、以下の順序で、
    （ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
    （ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、及び
    （ｃ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
    前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、フラタキシンプロモーターではなく、前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、前記核酸構築物。
11. 前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、請求項１０に記載の核酸構築物。
12. 前記ヒトＦＸＮが、配列番号６０を含む、請求項１０または１１に記載の核酸構築物。
13. 前記核酸構築物が、以下の順序で、
    （ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
    （ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、及び
    （ｃ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
    前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有し、前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、請求項１～９のいずれか一項に記載の核酸構築物。
14. 核酸構築物であって、以下の順序で、
    （ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
    （ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、
    （ｃ）イントロン、及び
    （ｄ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
    前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、前記核酸構築物。
15. 前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、請求項１４に記載の核酸構築物。
16. 前記ヒトＦＸＮが、配列番号６０を含む、請求項１４または１５に記載の核酸構築物。
17. 前記核酸構築物が、以下の順序で、
    （ａ）ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターを含む核酸配列、
    （ｂ）５’ＵＴＲ ＦＸＮを含む核酸配列、
    （ｃ）イントロン、及び
    （ｄ）ヒトＦＸＮをコードする核酸配列、を含み、
    前記ヒトＦＸをコードする核酸配列が、配列番号１に対して少なくとも８５％の配列同一性を有し、前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、前記５’ＵＴＲ ＦＸＮ及び前記ヒトＦＸＮをコードする核酸配列に作動可能に連結される、請求項１～９のいずれか一項に記載の核酸構築物。
18. 前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、デスミンプロモーターまたはＣＢＡプロモーターである、請求項９～１７のいずれか一項に記載の核酸構築物。
19. 前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、配列番号４または配列番号５を含む、請求項１８に記載の核酸構築物。
20. 前記ＲＮＡポリメラーゼＩＩプロモーターが、空間的に制限されたプロモーターである、請求項９～１７のいずれか一項に記載の核酸構築物。
21. 前記空間的に制限されたプロモーターが、ニューロン特異的プロモーター、心筋細胞特異的プロモーター、骨格筋特異的プロモーター、肝臓特異的プロモーター、星状細胞特異的プロモーター、ミクログリア特異的プロモーター、及びオリゴデンドロサイト特異的プロモーターからなる群から選択される、請求項２０に記載の核酸構築物。
22. 一対の逆方向末端反復（ＩＴＲ）をさらに含み、前記核酸構築物が、前記ＩＴＲによって各々に隣接する、請求項１～２１のいずれか一項に記載の核酸構築物。
23. 請求項１～２２のいずれか一項に記載の核酸構築物を含む、組換えウイルスベクター。
24. 前記ベクターが、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターである、請求項２３に記載の組換えウイルスベクター。
25. 前記ＡＡＶベクターが、ＡＡＶ１血清型ベクター、ＡＡＶ２血清型ベクター、ＡＡＶ３血清型ベクター、ＡＡＶ４血清型ベクター、ＡＡＶ５血清型ベクター、ＡＡＶ６血清型ベクター、ＡＡＶ７血清型ベクター、ＡＡＶ８血清型ベクター、ＡＡＶ９血清型ベクター、ＡＡＶ Ｒｈ７４血清型ベクター、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項２４に記載の組換えＡＡＶベクター。
26. 前記組換えＡＡＶベクターが、一本鎖または自己相補的ＡＡＶベクターである、請求項２４または２５に記載の組換えＡＡＶベクター。
27. 前記組換えＡＡＶベクターが、配列番号６～８、１３～１５、または２４～２８のうちのいずれか１つに対して少なくとも８５％の配列同一性を有する核酸配列を含む、請求項２４～２６のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクター。
28. 前記組換えＡＡＶベクターが、配列番号６～８、１３～１５、または２４～２８のうちのいずれか１つを含む、請求項２４～２６のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクター。
29. 請求項２４～２８のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクターを含む、核酸。
30. 前記核酸が、プラスミドである、請求項２９に記載の核酸。
31. 請求項２３～２８のいずれか一項に記載の組換えウイルスベクターを含む、組換えＡＡＶ粒子。
32. 請求項３１に記載の粒子を含む、薬学的組成物。
33. 前記組成物が、複数の粒子を含む、請求項３２に記載の薬学的組成物。
34. 請求項１～２２のいずれか一項に記載の核酸構築物、または請求項２３～２８のいずれか一項に記載の組換えウイルスベクターを含む、遺伝子改変細胞。
35. 前記遺伝子改変細胞が、ヒト幹細胞、ヒトニューロン、ヒト心筋細胞、ヒト平滑筋細胞、ヒト骨格筋細胞、及びヒト肝細胞からなる群から選択される、請求項３４に記載の遺伝子改変細胞。
36. 請求項３１に記載の組換えＡＡＶ粒子を含む、フリードライヒ運動失調症（ＦＡ）を有する患者を治療するための組成物。
37. 請求項２４～２８のいずれか一項に記載の組換えＡＡＶベクターを含む、ヒト細胞におけるＦＸＮの発現を調節する方法における使用のための組成物であって、前記方法は、前記ヒト細胞に、前記組換えＡＡＶベクターを導入することを含む、組成物。
38. 請求項２９または３０に記載の核酸を含む、ヒト細胞におけるＦＸＮの発現を調節する方法における使用のための組成物であって、前記方法は、前記ヒト細胞に、前記核酸を導入することを含む、組成物。
39. 請求項３１に記載の組換えＡＡＶ粒子を含む、ＦＡを有する対象のヒト細胞におけるアデノシン三リン酸（ＡＴＰ）濃度を増加させるための組成物。
40. 請求項３１に記載の組換えＡＡＶ粒子を含む、ＦＡを有する対象のヒト細胞におけるＡＴＰ濃度を増加させるための組成物。
41. 前記ヒト細胞が、ニューロン、心筋細胞、平滑筋細胞、骨格筋細胞、及び肝細胞からなる群から選択される、請求項３８～４０のいずれか一項に記載の組成物。