JPWO2019003441A1 - 予測装置、予測方法、予測プログラム、及び、遺伝子推定装置 - Google Patents
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Abstract
Description
解析対象となりうる生体が有する遺伝子配列を表す配列情報と、該遺伝子配列によって発現しうる機能を表す機能情報との関連性を表す第1モデル情報に基づき、解析対象が有する遺伝子配列についての前記機能情報を作成する第1モデル処理手段と、
前記生体に関する前記機能情報、前記生体の周囲の環境を表す環境情報、及び、前記生体に関して観測される観測情報の間における関連性を表す第2モデル情報と、前記第1モデル処理手段によって前記解析対象に関する前記遺伝子配列について作成された前記機能情報とに基づき、前記解析対象について予測された前記観測情報を表す予測情報を作成する第2モデル処理手段と
を備える。
情報処理装置によって、解析対象となりうる生体が有する遺伝子配列を表す配列情報と、該遺伝子配列によって発現しうる機能を表す機能情報との関連性を表す第1モデル情報に基づき、解析対象が有する遺伝子配列についての前記機能情報を作成し、前記生体に関する前記機能情報、前記生体の周囲の環境を表す環境情報、及び、前記生体に関して観測される観測情報の間における関連性を表す第2モデル情報と、前記解析対象に関する前記遺伝子配列について作成された前記機能情報とに基づき、前記解析対象について予測された前記観測情報を表す予測情報を作成する。
解析対象となりうる生体が有する遺伝子配列を表す配列情報と、該遺伝子配列によって発現しうる機能を表す機能情報との関連性を表す第1モデル情報に基づき、解析対象が有する遺伝子配列についての前記機能情報を作成する第1モデル処理機能と、
前記生体に関する前記機能情報、前記生体の周囲の環境を表す環境情報、及び、前記生体に関して観測される観測情報の間における関連性を表す第2モデル情報と、前記第1モデル処理機能によって前記解析対象に関する前記遺伝子配列について作成された前記機能情報とに基づき、前記解析対象について予測された前記観測情報を表す予測情報を作成する第2モデル処理機能と
をコンピュータに実現させる。
P(T=D|S=C)・・・(式A)。
P(T=TD|S=SC)・・・(式B)。
P(TD|SC)・・・(式C)。
図1を参照しながら、本発明の第1の実施形態に係る予測装置101が有する構成について詳細に説明する。図1は、本発明の第1の実施形態に係る予測装置101が有する構成を示すブロック図である。
ただし、NDVIは、正の大きな値であるほど植生が濃いことを表す。
Yt=h(xpheno t,wt)・・・(式7)。
ただし、k(kは、1≦k≦Nなる自然数を表す)は、1つのアンサンブルメンバを指し示す。Nは、アンサンブル集合に含まれているアンサンブルメンバの個数を表す。たとえば、Ccrop,k tは、Ccrop tに基づき算出されたアンサンブルに含まれている機能情報を表す。
次に、本発明の第2の実施形態について説明する。
上述した本発明の各実施形態に係る予測装置、または、遺伝子推定装置を、1つの計算処理装置(情報処理装置、コンピュータ)を用いて実現するハードウェア資源の構成例について説明する。但し、係る予測装置、または、係る遺伝子推定装置は、物理的または機能的に少なくとも2つの計算処理装置を用いて実現されてもよい。また、係る予測装置、または、係る遺伝子推定装置は、専用の装置として実現されてもよい。
102 遺伝子モデル処理部
103 作物モデル処理部
104 更新部
105 遺伝子モデル情報記憶部
106 作物モデル情報記憶部
107 機能情報記憶部
108 観測情報記憶部
109 環境情報記憶部
110 基準情報記憶部
111 関連性情報記憶部
151 遺伝子推定装置
152 予測装置
153 出力部
154 ドローン
155 人工衛星
156 配列情報
201 予測装置
202 第1モデル処理部
203 第2モデル処理部
204 第1モデル情報記憶部
205 第2モデル情報記憶部
20 計算処理装置
21 CPU
22 メモリ
23 ディスク
24 不揮発性記録媒体
25 入力装置
26 出力装置
27 通信IF
Claims (10)
- 解析対象となりうる生体が有する遺伝子配列を表す配列情報と、該遺伝子配列によって発現しうる機能を表す機能情報との関連性を表す第1モデル情報に基づき、解析対象が有する遺伝子配列についての前記機能情報を作成する第1モデル処理手段と、
前記生体に関する前記機能情報、前記生体の周囲の環境を表す環境情報、及び、前記生体に関して観測される観測情報の間における関連性を表す第2モデル情報と、前記第1モデル処理手段によって前記解析対象に関する前記遺伝子配列について作成された前記機能情報とに基づき、前記解析対象について予測された前記観測情報を表す予測情報を作成する第2モデル処理手段と
を備える予測装置。 - 更新手段
をさらに備え、
前記第2モデル処理手段は、前記生体の状態と、前記生体に関して観測される観測情報との間における関連性を表す第3モデル情報に従い、前記解析対象についての前記観測情報が予測された情報を表す予測情報を作成し、
前記更新手段は、前記解析対象について観測された観測情報と、前記予測情報との差異に基づき、前記第2モデル情報を更新する
請求項1に記載の予測装置。 - 前記更新手段は、更新した後の前記第2モデル情報を用いて、前記予測情報を作成する場合における前記機能情報を推定し、推定された前記機能情報と、前記第1モデル情報に基づき前記第1モデル処理手段が作成した前記機能情報との差異に基づき、前記第1モデル情報を更新する
請求項2に記載の予測装置。 - 前記更新手段は、前記生体についての前記配列情報と、前記生体に関して観測された観測情報とが関連付けされた関連性情報に基づき、前記解析対象についての前記観測情報に関連付けされた前記配列情報を特定する
請求項2または請求項3に記載の予測装置。 - 前記更新手段は、前記関連性情報のうち、前記解析対象についての前記観測情報との類似度が所定の条件を満たしている関連性情報を特定し、特定した前記関連性情報に含まれている前記配列情報を特定する
請求項4に記載の予測装置。 - 前記更新手段は、前記解析対象について特定した前記配列情報と、前記解析対象についての当該観測情報とが関連付けされた前記関連性情報を作成する
請求項4または請求項5に記載の予測装置。 - 請求項4乃至請求項6のいずれかに記載の予測装置と、
前記更新手段によって特定された前記配列情報のうち、少なくとも一部の配列情報を出力する出力手段と
を備える遺伝子推定装置。 - 情報処理装置によって、解析対象となりうる生体が有する遺伝子配列を表す配列情報と、該遺伝子配列によって発現しうる機能を表す機能情報との関連性を表す第1モデル情報に基づき、解析対象が有する遺伝子配列についての前記機能情報を作成し、前記生体に関する前記機能情報、前記生体の周囲の環境を表す環境情報、及び、前記生体に関して観測される観測情報の間における関連性を表す第2モデル情報と、前記解析対象に関する前記遺伝子配列について作成された前記機能情報とに基づき、前記解析対象について予測された前記観測情報を表す予測情報を作成する予測方法。
- 解析対象となりうる生体が有する遺伝子配列を表す配列情報と、該遺伝子配列によって発現しうる機能を表す機能情報との関連性を表す第1モデル情報に基づき、解析対象が有する遺伝子配列についての前記機能情報を作成する第1モデル処理機能と、
前記生体に関する前記機能情報、前記生体の周囲の環境を表す環境情報、及び、前記生体に関して観測される観測情報の間における関連性を表す第2モデル情報と、前記第1モデル処理機能によって前記解析対象に関する前記遺伝子配列について作成された前記機能情報とに基づき、前記解析対象について予測された前記観測情報を表す予測情報を作成する第2モデル処理機能と
をコンピュータに実現させる予測プログラムが記録された記録媒体。 - 更新機能
をさらにコンピュータに実現させ、
前記第2モデル処理機能において、前記生体の状態と、前記生体に関して観測される観測情報との間における関連性を表す第3モデル情報に従い、前記解析対象についての前記観測情報が予測された情報を表す予測情報を作成し、
前記更新機能において、前記解析対象について観測された観測情報と、前記予測情報との差異に基づき、前記第2モデル情報を更新する
請求項9に記載の予測プログラムが記録された記録媒体。
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