JPH0614666A - 遺伝子組換え率決定方法 - Google Patents
遺伝子組換え率決定方法Info
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- JPH0614666A JPH0614666A JP32794491A JP32794491A JPH0614666A JP H0614666 A JPH0614666 A JP H0614666A JP 32794491 A JP32794491 A JP 32794491A JP 32794491 A JP32794491 A JP 32794491A JP H0614666 A JPH0614666 A JP H0614666A
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Abstract
(57)【要約】
【目的】染色体内における遺伝子の相対的位置を示す組
換え率を決定する遺伝子組換え率決定方法に関し、観測
で区別できない形質を表現する遺伝子であっても組換え
率を推定可能とすることを目的とする。 【構成】親Ｐ１,Ｐ２雑種第１世代Ｆ１から戻し交配で
子供ＢＣ１Ｆ１を作り、親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代
Ｆ１から２つの注目遺伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質又
は量的形質を表す観測値を求め、次に質的形質又は量的
形質の観測値から遺伝子Ｇの遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ個体群
の観測値の平均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型Ｈ
ｇ，ｈｈ個体群の観測値の平均値と分散を求め、この平
均値と分散から遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ，Ｈｈ，ｈｈ個体群
の観測値の確率密度関数ｆGg，ｆgg，ｆHh，ｆhhを求
め、更にＢＣ１Ｆ１の観測値の確率密度関数ｆBC1F1
を、ＢＣ１Ｆ１の組換え率ｐで表現された理論的分離比
と親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１の確率密度関数ｆ
Gg，ｆgg，ｆHh，ｆhhの積の一次結合で表現し、ＢＣ１
Ｆ１の観測値から尤度関数を求め最尤組換え率を導出す
る。
換え率を決定する遺伝子組換え率決定方法に関し、観測
で区別できない形質を表現する遺伝子であっても組換え
率を推定可能とすることを目的とする。 【構成】親Ｐ１,Ｐ２雑種第１世代Ｆ１から戻し交配で
子供ＢＣ１Ｆ１を作り、親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代
Ｆ１から２つの注目遺伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質又
は量的形質を表す観測値を求め、次に質的形質又は量的
形質の観測値から遺伝子Ｇの遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ個体群
の観測値の平均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型Ｈ
ｇ，ｈｈ個体群の観測値の平均値と分散を求め、この平
均値と分散から遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ，Ｈｈ，ｈｈ個体群
の観測値の確率密度関数ｆGg，ｆgg，ｆHh，ｆhhを求
め、更にＢＣ１Ｆ１の観測値の確率密度関数ｆBC1F1
を、ＢＣ１Ｆ１の組換え率ｐで表現された理論的分離比
と親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１の確率密度関数ｆ
Gg，ｆgg，ｆHh，ｆhhの積の一次結合で表現し、ＢＣ１
Ｆ１の観測値から尤度関数を求め最尤組換え率を導出す
る。
Description
【０００１】
【産業上の利用分野】本発明は、染色体内における遺伝
子の相対的位置を示す組換え率を決定する遺伝子組換え
率決定方法に関する。
子の相対的位置を示す組換え率を決定する遺伝子組換え
率決定方法に関する。
【０００２】
【従来の技術】従来、染色体内の２つの注目遺伝子の相
対的位置を示す遺伝子組換え率の計算方法としては、例
えば図１に示すようなものがある。図１におて、雄親Ｐ
１と雌親Ｐ２を交配し、雑種第１世代Ｆ１を採る。更
に、雄親Ｐ１と雌親の雑種第１世代Ｆ１との戻し交配を
行い、その結果に採れた子供ＢＣ１Ｆ１の遺伝子型がど
のように分離するかを調べる。
対的位置を示す遺伝子組換え率の計算方法としては、例
えば図１に示すようなものがある。図１におて、雄親Ｐ
１と雌親Ｐ２を交配し、雑種第１世代Ｆ１を採る。更
に、雄親Ｐ１と雌親の雑種第１世代Ｆ１との戻し交配を
行い、その結果に採れた子供ＢＣ１Ｆ１の遺伝子型がど
のように分離するかを調べる。
【０００３】具体的には、２つの遺伝子Ｇ，Ｈを考え、
親Ｐ１は遺伝子Ｇ，Ｈの双方について劣性ホモ接合（ｇ
ｇｈｈ）の遺伝子型、親Ｐ２は遺伝子Ｇ，Ｈの双方につ
いて優性ホモ接合（ＧＧＨＨ）の遺伝子型であるとす
る。この場合、雑種第１世代Ｆ１は必ずＧｇＨｈの遺伝
子型になる。ここでＧ−ｇ座、Ｈ−ｈ座の組換え率をｐ
とすると、戻し交配によるＢＣ１Ｆ１個体群における遺
伝子型と、その割合は次の表１のようになる。
親Ｐ１は遺伝子Ｇ，Ｈの双方について劣性ホモ接合（ｇ
ｇｈｈ）の遺伝子型、親Ｐ２は遺伝子Ｇ，Ｈの双方につ
いて優性ホモ接合（ＧＧＨＨ）の遺伝子型であるとす
る。この場合、雑種第１世代Ｆ１は必ずＧｇＨｈの遺伝
子型になる。ここでＧ−ｇ座、Ｈ−ｈ座の組換え率をｐ
とすると、戻し交配によるＢＣ１Ｆ１個体群における遺
伝子型と、その割合は次の表１のようになる。
【０００４】
【表１】
【０００５】遺伝子Ｇ，Ｈが色や形といった質的形質の
場合は、表１の４つの遺伝子型、すなわち、ＧｇＨｈ，
Ｇｇｈｈ，ｇｇＨｈ，ｇｇｈｈの区別がつけられる。従
って、戻し交配で得たＢＣ１Ｆ１の固体群を育成して直
接観測した結果と前記表１を見比べるこで組換え率ｐを
計算できる。また、別の方法として、戻し交配によるＢ
Ｃ１Ｆ１を用いるのではなく、図２に示すように、雑種
第１世代Ｆ１同志を交配して雑種第２世代Ｆ２を取り、
雑種第２世代Ｆ２における個体分離比で計算する方法も
ある。
場合は、表１の４つの遺伝子型、すなわち、ＧｇＨｈ，
Ｇｇｈｈ，ｇｇＨｈ，ｇｇｈｈの区別がつけられる。従
って、戻し交配で得たＢＣ１Ｆ１の固体群を育成して直
接観測した結果と前記表１を見比べるこで組換え率ｐを
計算できる。また、別の方法として、戻し交配によるＢ
Ｃ１Ｆ１を用いるのではなく、図２に示すように、雑種
第１世代Ｆ１同志を交配して雑種第２世代Ｆ２を取り、
雑種第２世代Ｆ２における個体分離比で計算する方法も
ある。
【０００６】
【発明が解決しようとする課題】このように従来の遺伝
子組換え率の決定方法にあっては、遺伝子Ｇ，Ｈが表現
している形質が花色や血液型のような二者択一的な質的
形質である場合の組換え率の決定方法は提案されており
（例えば、Ｊ．Ｆ．クロー著 遺伝学概説、培風館 １
９９１年１月１５日第８版発行）、また遺伝子Ｇは二者
択一的な質的形質、遺伝子Ｈは種子の重量や身長といっ
た二者択一的でない量的形質である場合の遺伝子Ｇ，Ｈ
の組換え率の決定方法が、ここ数年行われてきている
（例えば、Theoretical and Applied Genetics (1989)
78:613-618 Estimation of recombination parameters
between a quantitative trait locus (QTL) and two m
arkergene loci , by J.Jensen ）。
子組換え率の決定方法にあっては、遺伝子Ｇ，Ｈが表現
している形質が花色や血液型のような二者択一的な質的
形質である場合の組換え率の決定方法は提案されており
（例えば、Ｊ．Ｆ．クロー著 遺伝学概説、培風館 １
９９１年１月１５日第８版発行）、また遺伝子Ｇは二者
択一的な質的形質、遺伝子Ｈは種子の重量や身長といっ
た二者択一的でない量的形質である場合の遺伝子Ｇ，Ｈ
の組換え率の決定方法が、ここ数年行われてきている
（例えば、Theoretical and Applied Genetics (1989)
78:613-618 Estimation of recombination parameters
between a quantitative trait locus (QTL) and two m
arkergene loci , by J.Jensen ）。
【０００７】しかし、注目している２つの遺伝子Ｇ，Ｈ
が共に量的形質を表現している時の組換え率の決定方法
はなかった。特に、２つの遺伝子Ｇ，Ｈが表現している
形質が重量や身長という量的形質であるために、個体を
観測しただけではその遺伝子型がわからず、質的形態を
前提とした従来方法をそのまま適用することはできない
という問題点があった。
が共に量的形質を表現している時の組換え率の決定方法
はなかった。特に、２つの遺伝子Ｇ，Ｈが表現している
形質が重量や身長という量的形質であるために、個体を
観測しただけではその遺伝子型がわからず、質的形態を
前提とした従来方法をそのまま適用することはできない
という問題点があった。
【０００８】本発明は、このような従来の問題点に鑑み
てなされたもので、量的形質等の固体観測で区別できな
い形質を表現する遺伝子であっても組換え率を推定する
ことができる遺伝子組換え率決定方法を提供することを
目的とする。
てなされたもので、量的形質等の固体観測で区別できな
い形質を表現する遺伝子であっても組換え率を推定する
ことができる遺伝子組換え率決定方法を提供することを
目的とする。
【０００９】
【課題を解決するための手段】この目的を達成するため
本発明は遺伝子組換え率決定方法は次のように構成す
る。まず本発明の基本は、染色体内の２つまたは３つ以
上の遺伝子の相対的位置を示す組換え率を決定する遺伝
子組換え率決定方法に於いて、 任意の被観測個体から量的形質または質的形質を表す
観測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた単数または複数の観測値から該観
測値の平均値と分散を求める第２過程と、 第２過程で求めた平均値と分散から前記単数または複
数の観測値が従う確率分布を推定する第３過程と、 ２つまたは３つ以上の遺伝子の組換え率を推定する関
係式を前記２つまたは３つ以上の遺伝子が表現している
形質の独立性を用いることにより第３過程で求めた単数
又は複数の確率分布の積の一次結合で表現する第４過程
と、 対象固体群の観測値と第４過程で求めた関係式から尤
度関数を求め、この尤度関数を最大とする最尤組換え率
を決定する第５過程と、を備え、必要なサンプル個体群
の分布が未知であっても組換え率を決定できることを特
徴とする。具体的には、親Ｐ１とＰ２の交配で雑種第１
世代Ｆ１を作り、更に雑種第１世代Ｆ１と親Ｐ１との戻
し交配で子供ＢＣ１Ｆ１を作り、子供ＢＣ１Ｆ１の染色
体内の２つの遺伝子Ｇ，Ｈの相対的位置を示す組換え率
を決定する遺伝子組換え率決定方法にとして、 親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代の各々について２つの
注目遺伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質または量的形質を
表す観測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた質的形質または量的形質の観測値
から遺伝子Ｇの遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ個体の該観測値の平
均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型Ｈｇ，ｈｈ個体の
該観測値の平均値と分散を求める第２過程と、 第２過程で求めた平均値と分散から遺伝子型Ｇｇ，ｇ
ｇ，Ｈｈ，ｈｈ個体の該観測値の確率密度関数ｆGg，ｆ
gg，ｆHh，ｆhhを求める第３過程と、 戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１個体の該観測値の確率
密度関数ｆBC1F1 を、ＢＣ１Ｆ１の組換え率ｐで表現さ
れた理論的分離比と第３過程で求めた親Ｐ１，Ｐ２及び
雑種第１世代Ｆ１の確率密度関数ｆGg，ｆgg，ｆHh，ｆ
hhの積の一次結合 ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgｆHh＋ｐｆGgｆhh＋ｐｆggｆHh＋（１−ｐ）ｆggｆhh で表現する第４過程と、 戻し交配による固体群ＢＣ１Ｆ１の観測値と第４過程
で求めた関係式から尤度関数を求め、この尤度関数の微
分値を零とする最尤組換え率を決定する第５過程と、を
備え、戻し交配による子供Ｆ２のサンプル個体群の分布
が未知であっても組換え率を決定できることを特徴とす
る。
本発明は遺伝子組換え率決定方法は次のように構成す
る。まず本発明の基本は、染色体内の２つまたは３つ以
上の遺伝子の相対的位置を示す組換え率を決定する遺伝
子組換え率決定方法に於いて、 任意の被観測個体から量的形質または質的形質を表す
観測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた単数または複数の観測値から該観
測値の平均値と分散を求める第２過程と、 第２過程で求めた平均値と分散から前記単数または複
数の観測値が従う確率分布を推定する第３過程と、 ２つまたは３つ以上の遺伝子の組換え率を推定する関
係式を前記２つまたは３つ以上の遺伝子が表現している
形質の独立性を用いることにより第３過程で求めた単数
又は複数の確率分布の積の一次結合で表現する第４過程
と、 対象固体群の観測値と第４過程で求めた関係式から尤
度関数を求め、この尤度関数を最大とする最尤組換え率
を決定する第５過程と、を備え、必要なサンプル個体群
の分布が未知であっても組換え率を決定できることを特
徴とする。具体的には、親Ｐ１とＰ２の交配で雑種第１
世代Ｆ１を作り、更に雑種第１世代Ｆ１と親Ｐ１との戻
し交配で子供ＢＣ１Ｆ１を作り、子供ＢＣ１Ｆ１の染色
体内の２つの遺伝子Ｇ，Ｈの相対的位置を示す組換え率
を決定する遺伝子組換え率決定方法にとして、 親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代の各々について２つの
注目遺伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質または量的形質を
表す観測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた質的形質または量的形質の観測値
から遺伝子Ｇの遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ個体の該観測値の平
均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型Ｈｇ，ｈｈ個体の
該観測値の平均値と分散を求める第２過程と、 第２過程で求めた平均値と分散から遺伝子型Ｇｇ，ｇ
ｇ，Ｈｈ，ｈｈ個体の該観測値の確率密度関数ｆGg，ｆ
gg，ｆHh，ｆhhを求める第３過程と、 戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１個体の該観測値の確率
密度関数ｆBC1F1 を、ＢＣ１Ｆ１の組換え率ｐで表現さ
れた理論的分離比と第３過程で求めた親Ｐ１，Ｐ２及び
雑種第１世代Ｆ１の確率密度関数ｆGg，ｆgg，ｆHh，ｆ
hhの積の一次結合 ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgｆHh＋ｐｆGgｆhh＋ｐｆggｆHh＋（１−ｐ）ｆggｆhh で表現する第４過程と、 戻し交配による固体群ＢＣ１Ｆ１の観測値と第４過程
で求めた関係式から尤度関数を求め、この尤度関数の微
分値を零とする最尤組換え率を決定する第５過程と、を
備え、戻し交配による子供Ｆ２のサンプル個体群の分布
が未知であっても組換え率を決定できることを特徴とす
る。
【００１０】また他の具体例としては、親Ｐ１とＰ２の
交配で雑種第１世代Ｆ１を作り、更に雑種第１世代Ｆ１
同志の交配で雑種第２世代Ｆ２を作り、雑種第２世代Ｆ
２の染色体内の２つの遺伝子Ｇ，Ｈの相対的位置を示す
組換え率を決定する遺伝子組換え率決定方法として、 親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１から２つの注目遺
伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質または量的形質を表す観
測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた質的形質または量的形質の観測値
から遺伝子Ｇの遺伝子型ｇｇ，Ｇｇ，ＧＧ個体の該観測
値の平均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型，ｈｈ，Ｈ
ｈ，ＨＨ個体の該観測値の平均値と分散を求める第２過
程と、 第２過程で求めた平均値と分散から遺伝子型ｇｇ，ｈ
ｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈｈ個体の該観測値の確率密度
関数ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆGg，ｆHhを求める第３
過程と、 雑種第２世代Ｆ２個体の該観測値の確率密度関数ｆF2
を、Ｆ２の組換え率ｐで表現された理論的分離比と第３
過程で求めた親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１の確率
密度関数ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆGg，ｆHhの積の一
次結合 ｆF2＝αｆGGｆHH＋２βｆGGｆHh＋γｆGGｆhh＋２βｆGgｆHH ＋２（α＋γ）ｆGgｆHh＋２βｆGgｆhh＋γｆggｆHH ＋２βｆggｆHh＋αｆggｆhh 但し、α＝（１−ｐ）2 ／４ β＝ｐ（１−ｐ）／４ γ＝ｐ2 ／４ で表現する第４過程と、 雑種第２世代Ｆ２の観測値と第４過程で求めた関係式
から尤度関数を求め、該尤度関数の微分値を零とする最
尤組換え率を決定する第５過程と、を備え、雑種第２世
代Ｆ２のサンプル個体群の分布が未知であっても組換え
率を決定できることを特徴とする。
交配で雑種第１世代Ｆ１を作り、更に雑種第１世代Ｆ１
同志の交配で雑種第２世代Ｆ２を作り、雑種第２世代Ｆ
２の染色体内の２つの遺伝子Ｇ，Ｈの相対的位置を示す
組換え率を決定する遺伝子組換え率決定方法として、 親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１から２つの注目遺
伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質または量的形質を表す観
測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた質的形質または量的形質の観測値
から遺伝子Ｇの遺伝子型ｇｇ，Ｇｇ，ＧＧ個体の該観測
値の平均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型，ｈｈ，Ｈ
ｈ，ＨＨ個体の該観測値の平均値と分散を求める第２過
程と、 第２過程で求めた平均値と分散から遺伝子型ｇｇ，ｈ
ｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈｈ個体の該観測値の確率密度
関数ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆGg，ｆHhを求める第３
過程と、 雑種第２世代Ｆ２個体の該観測値の確率密度関数ｆF2
を、Ｆ２の組換え率ｐで表現された理論的分離比と第３
過程で求めた親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１の確率
密度関数ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆGg，ｆHhの積の一
次結合 ｆF2＝αｆGGｆHH＋２βｆGGｆHh＋γｆGGｆhh＋２βｆGgｆHH ＋２（α＋γ）ｆGgｆHh＋２βｆGgｆhh＋γｆggｆHH ＋２βｆggｆHh＋αｆggｆhh 但し、α＝（１−ｐ）2 ／４ β＝ｐ（１−ｐ）／４ γ＝ｐ2 ／４ で表現する第４過程と、 雑種第２世代Ｆ２の観測値と第４過程で求めた関係式
から尤度関数を求め、該尤度関数の微分値を零とする最
尤組換え率を決定する第５過程と、を備え、雑種第２世
代Ｆ２のサンプル個体群の分布が未知であっても組換え
率を決定できることを特徴とする。
【００１１】
【作用】本発明によれば、例えば親Ｐ１，Ｐ２、雑種第
１世代Ｆ１の個体群において、注目した２つの遺伝子
Ｇ，Ｈが従っている確率分布をそれぞれ求め、Ｐ１とＦ
１による戻し交配して得られたＢＣ１Ｆ１における分離
比を遺伝子Ｇ，Ｈの組換え率ｐによって表現しておく。
１世代Ｆ１の個体群において、注目した２つの遺伝子
Ｇ，Ｈが従っている確率分布をそれぞれ求め、Ｐ１とＦ
１による戻し交配して得られたＢＣ１Ｆ１における分離
比を遺伝子Ｇ，Ｈの組換え率ｐによって表現しておく。
【００１２】そして、遺伝子Ｇ，Ｈが表現している形質
の独立性を用いて戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１におけ
る観測値が従う確率分布を、固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の
遺伝子Ｇが表現する形質の観測値に関する確率分布と、
固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の遺伝子Ｈが表現する形質の観
測値に関する確率分布の積の一次結合で表現して、組換
え率ｐの最尤推定量を計算する。
の独立性を用いて戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１におけ
る観測値が従う確率分布を、固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の
遺伝子Ｇが表現する形質の観測値に関する確率分布と、
固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の遺伝子Ｈが表現する形質の観
測値に関する確率分布の積の一次結合で表現して、組換
え率ｐの最尤推定量を計算する。
【００１３】即ち、固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１について遺
伝子Ｇ，Ｈが表現する観測値の確率分布を独立に計算し
ておき、組換え率ｐをパラメータとして戻し交配の子供
ＢＣ１Ｆ１の遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質の観測値ｘ
１，ｘ２，ｘ３，・・・，ｘｎから尤度関数Ｌ（ｐ）を
求め、ｄＬ／ｄｐ＝０を解いてｐの最尤推定量ｐを求め
る。
伝子Ｇ，Ｈが表現する観測値の確率分布を独立に計算し
ておき、組換え率ｐをパラメータとして戻し交配の子供
ＢＣ１Ｆ１の遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質の観測値ｘ
１，ｘ２，ｘ３，・・・，ｘｎから尤度関数Ｌ（ｐ）を
求め、ｄＬ／ｄｐ＝０を解いてｐの最尤推定量ｐを求め
る。
【００１４】従って遺伝子Ｇ，Ｈが表現している形質に
関係なく最尤推定量ｐを求めることができ、従来は不可
能であった二者択一的でない量的形質を表現する遺伝子
同志の組換え率も求めることができ、量的形質の遺伝子
連鎖地図の作成が可能になる。
関係なく最尤推定量ｐを求めることができ、従来は不可
能であった二者択一的でない量的形質を表現する遺伝子
同志の組換え率も求めることができ、量的形質の遺伝子
連鎖地図の作成が可能になる。
【００１５】
１．戻し交配によるＢＣ１Ｆ１の遺伝子組換え率決定 まず図１の戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１を対象とした
遺伝子組換え率の決定方法の第１実施例を説明する。
遺伝子組換え率の決定方法の第１実施例を説明する。
【００１６】図１に示す雄親Ｐ１の遺伝子型をｇｇｈ
ｈ、雌親Ｐ２の遺伝子型をＧＧＨＨとする。雑種第１世
代Ｆ１と雌親Ｐ１の戻し交配で得られた子供ＢＣ１Ｆ１
における遺伝子型ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨｈ，ｇｇ
ｈｈの分離比は理論的には前記表１のようになる。遺伝
子Ｇについて遺伝子型ｇｇ，ＧＧ，Ｇｇである個体の遺
伝子Ｇが表現している形質の観測値の分布は、それぞれ
Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の遺伝子Ｇが表現している形質の観測
値についての分布に等しい。遺伝子Ｈについても同じこ
とがいえる。
ｈ、雌親Ｐ２の遺伝子型をＧＧＨＨとする。雑種第１世
代Ｆ１と雌親Ｐ１の戻し交配で得られた子供ＢＣ１Ｆ１
における遺伝子型ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨｈ，ｇｇ
ｈｈの分離比は理論的には前記表１のようになる。遺伝
子Ｇについて遺伝子型ｇｇ，ＧＧ，Ｇｇである個体の遺
伝子Ｇが表現している形質の観測値の分布は、それぞれ
Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の遺伝子Ｇが表現している形質の観測
値についての分布に等しい。遺伝子Ｈについても同じこ
とがいえる。
【００１７】ここで、説明のため固体群がある遺伝子型
をとる確率分布は連続的であるとすると、前記表１にお
ける遺伝子型ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨｈ，ｇｇｈｈ
をもつ個体群の該形質の観測値の確率密度関数は
ｆGgHh，ｆGghh，ｆggHh，ｆgghhと書ける。確率密度関
数ｆGgHh，ｆGghh，ｆggHh，ｆgghhの平均および分散は
固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１を観測して計算することができ
る。
をとる確率分布は連続的であるとすると、前記表１にお
ける遺伝子型ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨｈ，ｇｇｈｈ
をもつ個体群の該形質の観測値の確率密度関数は
ｆGgHh，ｆGghh，ｆggHh，ｆgghhと書ける。確率密度関
数ｆGgHh，ｆGghh，ｆggHh，ｆgghhの平均および分散は
固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１を観測して計算することができ
る。
【００１８】遺伝子ＧとＨが表現する形質は独立である
と仮定すると、遺伝子型ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨ
ｈ，ｇｇｈｈをもつ個体群の確率密度関数ｆGgHh，ｆ
Gghh，ｆ ggHh，ｆgghhは、 ｆGgHh＝ｆGg・ｆHh ｆGghh＝ｆGg・ｆhh ｆggHh＝ｆgg・ｆHh ・・・（１） ｆgghh＝ｆgg・ｆhh と表現することができる。
と仮定すると、遺伝子型ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨ
ｈ，ｇｇｈｈをもつ個体群の確率密度関数ｆGgHh，ｆ
Gghh，ｆ ggHh，ｆgghhは、 ｆGgHh＝ｆGg・ｆHh ｆGghh＝ｆGg・ｆhh ｆggHh＝ｆgg・ｆHh ・・・（１） ｆgghh＝ｆgg・ｆhh と表現することができる。
【００１９】また前記表１から、戻し交配による子供Ｂ
Ｃ１Ｆ１の理論的分離比は、 ＧｇＨｈ：Ｇｇｈｈ：ｇｇＨｈ：ｇｇｈｈ＝（１−ｐ）：ｐ：ｐ：（１−Ｐ） となる。従って、理論的なＢＣ１Ｆ１の確率密度関数ｆ
BC1F1 は ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgHh＋ｐｆGghh＋ｐｆggHh＋（１−ｐ）ｆgghh となり、（１）を代入すると ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgｆHh＋ｐｆGgｆhh＋ｐｆggｆHh ＋（１−ｐ）ｆggｆhh ・・・（２） となる。この（２）式の右辺は、組換え率ｐの関数とし
て書くことができる。
Ｃ１Ｆ１の理論的分離比は、 ＧｇＨｈ：Ｇｇｈｈ：ｇｇＨｈ：ｇｇｈｈ＝（１−ｐ）：ｐ：ｐ：（１−Ｐ） となる。従って、理論的なＢＣ１Ｆ１の確率密度関数ｆ
BC1F1 は ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgHh＋ｐｆGghh＋ｐｆggHh＋（１−ｐ）ｆgghh となり、（１）を代入すると ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgｆHh＋ｐｆGgｆhh＋ｐｆggｆHh ＋（１−ｐ）ｆggｆhh ・・・（２） となる。この（２）式の右辺は、組換え率ｐの関数とし
て書くことができる。
【００２０】従って、戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１の
固体群を育成して採取したｎ個のサンプル｛ｚｉ；ｉ＝
１，２，・・・，ｎ｝の遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質の
観測値をそれぞれ｛ｘｉ；ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝お
よび｛ｙｉ；Ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝とすれば、尤度
関数Ｌ（ｐ）は、
固体群を育成して採取したｎ個のサンプル｛ｚｉ；ｉ＝
１，２，・・・，ｎ｝の遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質の
観測値をそれぞれ｛ｘｉ；ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝お
よび｛ｙｉ；Ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝とすれば、尤度
関数Ｌ（ｐ）は、
【００２１】
【数１】
【００２２】となり、ｄＬ／ｄｐ＝０の解が最尤推定量
ｐとなる。実際の処理は、計算機で（３）式の数値計算
する際に組換え率ｐを適当な刻みで変化させて、ｄＬ／
ｄｐ＝０又は０に最も使い値となる組換え率ｐの値を求
めればよい。このように組換え率ｐを変化させてｄＬ／
ｄｐ＝０を調べる場合、遺伝子Ｇ，Ｈの相対距離を示す
組換え率ｐの値が図３（ａ）（ｂ）（ｃ）のように中、
小、大となった場合、図３（ｃ）のように組換え率ｐが
ある値を超えると染色体が切れて遺伝子Ｇ，Ｈの交差組
換えの確率が大きくなることから、組換え率ｐをｐ＝０
〜０．５の幅で変化させてｄＬ／ｄｐ＝０となる最尤推
定量ｐを求める。 ２．雑種第２世代Ｆ２の遺伝子組換え率決定 次に図２に示す雑種第２世代Ｆ２を対象とした本発明の
遺伝子組換え率決定方法の第２実施例を説明する。
ｐとなる。実際の処理は、計算機で（３）式の数値計算
する際に組換え率ｐを適当な刻みで変化させて、ｄＬ／
ｄｐ＝０又は０に最も使い値となる組換え率ｐの値を求
めればよい。このように組換え率ｐを変化させてｄＬ／
ｄｐ＝０を調べる場合、遺伝子Ｇ，Ｈの相対距離を示す
組換え率ｐの値が図３（ａ）（ｂ）（ｃ）のように中、
小、大となった場合、図３（ｃ）のように組換え率ｐが
ある値を超えると染色体が切れて遺伝子Ｇ，Ｈの交差組
換えの確率が大きくなることから、組換え率ｐをｐ＝０
〜０．５の幅で変化させてｄＬ／ｄｐ＝０となる最尤推
定量ｐを求める。 ２．雑種第２世代Ｆ２の遺伝子組換え率決定 次に図２に示す雑種第２世代Ｆ２を対象とした本発明の
遺伝子組換え率決定方法の第２実施例を説明する。
【００２３】図２において、雄親Ｐ１の遺伝子型をｇｇ
ｈｈ、雌親Ｐ２の遺伝子型をＧＧＨＨとすると、雑種第
一世代Ｆ１の遺伝子型は必ずＧｇＨｈになる。雑種第１
世代Ｆ１同志の交配で得られた雑種第２世代Ｆ２におい
て遺伝子型ｇｇ，ｈｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈｈである
個体の該遺伝子が表現する形質の観測値の確率分布は、
雄親Ｐ１の遺伝子Ｇ，Ｈに関する形質の観測値の確率分
布、雌親Ｐ２の遺伝子Ｇ，Ｈに関する形質の観測値の確
率分布、雑種第１世代Ｆ１の遺伝子Ｇ，Ｈに関する形質
の観測値の確率分布に等しい。
ｈｈ、雌親Ｐ２の遺伝子型をＧＧＨＨとすると、雑種第
一世代Ｆ１の遺伝子型は必ずＧｇＨｈになる。雑種第１
世代Ｆ１同志の交配で得られた雑種第２世代Ｆ２におい
て遺伝子型ｇｇ，ｈｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈｈである
個体の該遺伝子が表現する形質の観測値の確率分布は、
雄親Ｐ１の遺伝子Ｇ，Ｈに関する形質の観測値の確率分
布、雌親Ｐ２の遺伝子Ｇ，Ｈに関する形質の観測値の確
率分布、雑種第１世代Ｆ１の遺伝子Ｇ，Ｈに関する形質
の観測値の確率分布に等しい。
【００２４】ここで説明のため確率分布は連続的である
とすると、遺伝子型ｇｇ，ｈｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈ
ｈ個体の該形質の観測値が従う確率密度関数は、ｆgg，
ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆGg，ｆHhとかける。確率密度関数
ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆ Gg，ｆHhの平均および分散
は固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１を観測して計算することがで
きる。
とすると、遺伝子型ｇｇ，ｈｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈ
ｈ個体の該形質の観測値が従う確率密度関数は、ｆgg，
ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆGg，ｆHhとかける。確率密度関数
ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆ Gg，ｆHhの平均および分散
は固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１を観測して計算することがで
きる。
【００２５】更に、固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の観測値か
ら正規分布なのか、一様分布なのかといった分布の形を
推定できる。雑種第２世代Ｆ２の遺伝子型の違いによる
発生頻度は、次の表２のようになる。
ら正規分布なのか、一様分布なのかといった分布の形を
推定できる。雑種第２世代Ｆ２の遺伝子型の違いによる
発生頻度は、次の表２のようになる。
【００２６】
【表２】
【００２７】従って、雑種第２世代Ｆ２の個体群を観測
すると、遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質が量的形質である
ため、明確な遺伝子型はわからないが、 α＝１／４（１−ｐ）2 ，β＝１／４ｐ（１−ｐ），γ
＝１／４ｐ2 とおけば、各遺伝子型の理論的分離比は ＧＧＨＨ：ＧＧＨｈ：ＧＧｈｈ：ＧｇＨＨ ：ＧｇＨｈ：Ｇｇｈｈ：ｇｇＨＨ：ｇｇＨｈ：ｇｇｈｈ ＝α：２β：γ：２β：２（α＋γ）：２β：γ：２β：α となり、この比率で遺伝子型が出現する。
すると、遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質が量的形質である
ため、明確な遺伝子型はわからないが、 α＝１／４（１−ｐ）2 ，β＝１／４ｐ（１−ｐ），γ
＝１／４ｐ2 とおけば、各遺伝子型の理論的分離比は ＧＧＨＨ：ＧＧＨｈ：ＧＧｈｈ：ＧｇＨＨ ：ＧｇＨｈ：Ｇｇｈｈ：ｇｇＨＨ：ｇｇＨｈ：ｇｇｈｈ ＝α：２β：γ：２β：２（α＋γ）：２β：γ：２β：α となり、この比率で遺伝子型が出現する。
【００２８】遺伝子ＧとＨが表現している形質は互いに
独立であると仮定すると、遺伝子ＧとＨの同時分布を考
えた場合、遺伝子型ＧＧＨＨ，ＧＧＨｈ，ＧＧｈｈ，Ｇ
ｇＨＨ，ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨＨ，ｇｇＨｈ，ｇ
ｇｈｈ個体の該遺伝子が表現する形質の観測値の確率密
度関数は、両者の分布の積になる。即ち、 ｆGGHH＝ｆGG・ｆHH ｆGGHh＝ｆGG・ｆHh ｆGGhh＝ｆGG・ｆhh ｆGgHH＝ｆGg・ｆHH ・・・（４） ｆGgHh＝ｆGg・ｆHh ｆGghh＝ｆGg・ｆhh ｆggHh＝ｆgg・ｆHh ｆgghh＝ｆgg・ｆhh ｆggHH＝ｆgg・ｆHH ここで、確率密度関数ｆGG，ｆGg，ｆgg，ｆHH，ｆHh，
ｆhhは、それぞれ固体群Ｐ２，Ｆ１，Ｐ１の遺伝子Ｇが
表現する形質の観測値の分布、また固体群Ｐ２，Ｆ１，
Ｐ１の遺伝子Ｈが表現する形質の観測値の分布として、
固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１を観測して計算することができ
る。
独立であると仮定すると、遺伝子ＧとＨの同時分布を考
えた場合、遺伝子型ＧＧＨＨ，ＧＧＨｈ，ＧＧｈｈ，Ｇ
ｇＨＨ，ＧｇＨｈ，Ｇｇｈｈ，ｇｇＨＨ，ｇｇＨｈ，ｇ
ｇｈｈ個体の該遺伝子が表現する形質の観測値の確率密
度関数は、両者の分布の積になる。即ち、 ｆGGHH＝ｆGG・ｆHH ｆGGHh＝ｆGG・ｆHh ｆGGhh＝ｆGG・ｆhh ｆGgHH＝ｆGg・ｆHH ・・・（４） ｆGgHh＝ｆGg・ｆHh ｆGghh＝ｆGg・ｆhh ｆggHh＝ｆgg・ｆHh ｆgghh＝ｆgg・ｆhh ｆggHH＝ｆgg・ｆHH ここで、確率密度関数ｆGG，ｆGg，ｆgg，ｆHH，ｆHh，
ｆhhは、それぞれ固体群Ｐ２，Ｆ１，Ｐ１の遺伝子Ｇが
表現する形質の観測値の分布、また固体群Ｐ２，Ｆ１，
Ｐ１の遺伝子Ｈが表現する形質の観測値の分布として、
固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１を観測して計算することができ
る。
【００２９】このような遺伝子ＧとＨが表現している形
質の独立性を用いて、雑種第２世代Ｆ２の確率密度関数
ｆF2は、 ｆF2＝αｆGGｆHH＋２βｆGGｆHh＋γｆGGｆhh＋２βｆGgｆHH ＋２（α＋γ）ｆGgｆHh＋２βｆGgｆhh＋γｆggｆHH ＋２βｆggｆHh＋αｆggｆhh ・・・（５） であることがわかる。これは組換え率ｐの関数として次
式で表わされる。
質の独立性を用いて、雑種第２世代Ｆ２の確率密度関数
ｆF2は、 ｆF2＝αｆGGｆHH＋２βｆGGｆHh＋γｆGGｆhh＋２βｆGgｆHH ＋２（α＋γ）ｆGgｆHh＋２βｆGgｆhh＋γｆggｆHH ＋２βｆggｆHh＋αｆggｆhh ・・・（５） であることがわかる。これは組換え率ｐの関数として次
式で表わされる。
【００３０】即ち、雑種第２世代Ｆ２の個体群からとっ
たｎ個のサンプル｛ｚｉ；ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝の
遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質の観測値をそれぞれ｛ｘ
ｉ；ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝および｛ｙｉ；Ｉ＝１，
２，・・・，ｎ｝とすると、組換え率ｐを推定するため
に必要な尤度関数Ｌ（ｐ）は
たｎ個のサンプル｛ｚｉ；ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝の
遺伝子Ｇ，Ｈが表現する形質の観測値をそれぞれ｛ｘ
ｉ；ｉ＝１，２，・・・，ｎ｝および｛ｙｉ；Ｉ＝１，
２，・・・，ｎ｝とすると、組換え率ｐを推定するため
に必要な尤度関数Ｌ（ｐ）は
【００３１】
【数２】
【００３２】となる。最尤推定量ｐはｄＬ／ｄｐ＝０を
解けば良い。実際の処理は、計算機で（６）式の数値計
算する際に組換え率ｐを適当な刻みで変化させて、ｄＬ
／ｄｐ＝０又は０に最も使い値となる組換え率ｐの値を
求めればよい。また遺伝子Ｇ，Ｈの交差組換えの確率が
意味のある範囲で抑えるために、組換え率ｐをｐ＝０〜
０．５の範囲で変化させる。
解けば良い。実際の処理は、計算機で（６）式の数値計
算する際に組換え率ｐを適当な刻みで変化させて、ｄＬ
／ｄｐ＝０又は０に最も使い値となる組換え率ｐの値を
求めればよい。また遺伝子Ｇ，Ｈの交差組換えの確率が
意味のある範囲で抑えるために、組換え率ｐをｐ＝０〜
０．５の範囲で変化させる。
【００３３】尚、固体群Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１の分布の形
は、正規分布に限定されず、２項分布のようなに離散形
であっても良い。また上記の実施例は染色体内の２つの
遺伝子Ｇ，Ｈに注目して組換え率を推定しているが、３
以上の遺伝子に注目して同様に組換え率を推定するよう
にしてもよい。
は、正規分布に限定されず、２項分布のようなに離散形
であっても良い。また上記の実施例は染色体内の２つの
遺伝子Ｇ，Ｈに注目して組換え率を推定しているが、３
以上の遺伝子に注目して同様に組換え率を推定するよう
にしてもよい。
【００３４】
【発明の効果】以上説明してきたように本発明によれ
ば、以下に列挙する効果が得られる。まず遺伝子Ｇ，Ｈ
が重量や形といった明確に識別できる形質でなくても、
２つの遺伝子間の組換え率が計算できる。そのため、育
種上有用な遺伝子を単離するために強力な武器になる遺
伝子連鎖地図が、量的形質についても作ることができ
る。
ば、以下に列挙する効果が得られる。まず遺伝子Ｇ，Ｈ
が重量や形といった明確に識別できる形質でなくても、
２つの遺伝子間の組換え率が計算できる。そのため、育
種上有用な遺伝子を単離するために強力な武器になる遺
伝子連鎖地図が、量的形質についても作ることができ
る。
【００３５】また、本方法を用いれば、遺伝子Ｇ，Ｈの
分布を特殊なもの、具体的には１点に集中する分布にす
ることにより、従来行われている質的形質同志の組換え
率の決定にも、また質的形質と量的形質の組換え率の決
定にも使うことができる最も一般的な方法である。
分布を特殊なもの、具体的には１点に集中する分布にす
ることにより、従来行われている質的形質同志の組換え
率の決定にも、また質的形質と量的形質の組換え率の決
定にも使うことができる最も一般的な方法である。
【図１】戻り交配による子供ＢＣ１Ｆ１を得るための交
配説明図
配説明図
【図２】雑種第２世代Ｆ２を得るための交配説明図
【図３】組換え率ｐの大きさによる交配時の染色体の状
態を示した説明図
態を示した説明図
Ｐ１：雄親 Ｐ１：雌親 Ｆ１：雑種第１世代 ＢＣ１Ｆ１：戻し交配による子供 Ｆ２：雑種第２世代
Claims (3)
- 【請求項１】染色体内の２つまたは３つ以上の遺伝子の
相対的位置を示す組換え率を決定する遺伝子組換え率決
定方法に於いて、 任意の被観測個体から量的形質または質的形質を表す観
測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた単数または複数の観測値から該観測
値の平均値と分散を求める第２過程と、 該第２過程で求めた平均値と分散から前記単数または複
数の観測値が従う確率分布を推定する第３過程と、 前記２つまたは３つ以上の遺伝子の組換え率を推定する
関係式を前記２つまたは３つ以上の遺伝子が表現してい
る形質の独立性を用いることにより前記第３過程で求め
た単数又は複数の確率分布の積の一次結合で表現する第
４過程と、 対象固体群の観測値と第４過程で求めた関係式から尤度
関数を求め、該尤度関数を最大とする最尤組換え率を決
定する第５過程と、を備え、必要なサンプル個体群の分
布が未知であっても組換え率を決定できることを特徴と
する遺伝子組換え率決定方法。 - 【請求項２】親Ｐ１とＰ２の交配で雑種第１世代Ｆ１を
作り、更に雑種第１世代Ｆ１と親Ｐ１との戻し交配で子
供ＢＣ１Ｆ１を作り、該子供ＢＣ１Ｆ１の染色体内の２
つの遺伝子Ｇ，Ｈの相対的位置を示す組換え率を決定す
る遺伝子組換え率決定方法に於いて、 親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代の各々について２つの注
目遺伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質または量的形質を表
す観測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた質的形質または量的形質を表す観測
値から遺伝子Ｇの遺伝子型Ｇｇ，ｇｇ個体の該形質を表
わす観測値の平均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型Ｈ
ｈ，ｈｈ個体の該形質を表わす観測値の平均値と分散を
求める第２過程と、 該第２過程で求めた平均値と分散から遺伝子型Ｇｇ，ｇ
ｇ，Ｈｈ，ｈｈ個体の該形質を表わす観測値の確率密度
関数ｆGg，ｆgg，ｆHh，ｆhhを求める第３過程と、 前記前記戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１固体の該観測値
の確率密度関数ｆBC1F 1 を、遺伝子Ｇと遺伝子Ｈの組換
え率ｐで表現された理論的分離比と前記第３過程で求め
た親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１の確率密度関数ｆ
Gg，ｆgg，ｆHh，ｆhhの積の一次結合 ｆBC1F1 ＝（１−ｐ）ｆGgｆHh＋ｐｆGgｆhh＋ｐｆggｆHh＋（１−ｐ）ｆggｆhh で表現する第４過程と、 戻し交配による固体群ＢＣ１Ｆ１の観測値と第４過程で
求めた関係式から尤度関数を求め、該尤度関数の微分値
を零とする最尤組換え率を決定する第５過程と、を備
え、戻し交配による子供ＢＣ１Ｆ１のサンプル個体群の
分布が未知であっても組換え率を決定できることを特徴
とする遺伝子組換え率決定方法。 - 【請求項３】親Ｐ１とＰ２の交配で雑種第１世代Ｆ１を
作り、更に雑種第１世代Ｆ１同志の交配で雑種第２世代
Ｆ２を作り、該雑種第２世代Ｆ２の染色体内の２つの遺
伝子Ｇ，Ｈの相対的位置を示す組換え率を決定する遺伝
子組換え率決定方法に於いて、 親Ｐ１，Ｐ２及び雑種第１世代Ｆ１の各々について２つ
の注目遺伝子Ｇ，Ｈに起因した質的形質または量的形質
を表す観測値を得る第１過程と、 第１過程で得られた質的形質または量的形質の観測値か
ら遺伝子Ｇの遺伝子型ｇｇ，Ｇｇ，ＧＧ個体の該形質の
観測値の平均値と分散および遺伝子Ｈの遺伝子型ｈｈ，
Ｈｈ，ＨＨ個体の該形質の観測値の平均値と分散を求め
る第２過程と、 該第２過程で求めた平均値と分散から遺伝子型ｇｇ，ｈ
ｈ，ＧＧ，ＨＨ，Ｇｇ，Ｈｈ個体の該形質を表わす観測
値の確率密度関数ｆgg，ｆhh，ｆGG，ｆHH，ｆ Gg，ｆHh
を求める第３過程と、 前記雑種第２世代Ｆ２個体の該観測値の確率密度関数ｆ
F2を、遺伝子Ｇと遺伝子Ｈの組換え率ｐで表現された理
論的分離比と前記第３過程で求めた親Ｐ１，Ｐ２及び雑
種第１世代Ｆ１の確率密度関数ｆgg，ｆhh，ｆGG，
ｆHH，ｆGg，ｆHhの積の一次結合 ｆF2＝αｆGGｆHH＋２βｆGGｆHh＋γｆGGｆhh＋２βｆGgｆHH ＋２（α＋γ）ｆGgｆHh＋２βｆGgｆhh＋γｆggｆHH ＋２βｆggｆHh＋αｆggｆhh 但し、α＝（１−ｐ）2 ／４ β＝ｐ（１−ｐ）／４ γ＝ｐ2 ／４ で表現する第４過程と、 雑種第２世代Ｆ２の観測値と第４過程で求めた関係式か
ら尤度関数を求め、該尤度関数の微分値を零とする最尤
組換え率を決定する第５過程と、を備え、雑種第２世代
Ｆ２のサンプル個体群の分布が未知であっても組換え率
を決定できることを特徴とする遺伝子組換え率決定方
法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP32794491A JPH0614666A (ja) | 1991-12-12 | 1991-12-12 | 遺伝子組換え率決定方法 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP32794491A JPH0614666A (ja) | 1991-12-12 | 1991-12-12 | 遺伝子組換え率決定方法 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH0614666A true JPH0614666A (ja) | 1994-01-25 |
Family
ID=18204758
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP32794491A Pending JPH0614666A (ja) | 1991-12-12 | 1991-12-12 | 遺伝子組換え率決定方法 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH0614666A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1995017524A3 (en) * | 1993-12-23 | 1995-07-13 | Molecular Tool Inc | Automatic genotype determination |
-
1991
- 1991-12-12 JP JP32794491A patent/JPH0614666A/ja active Pending
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1995017524A3 (en) * | 1993-12-23 | 1995-07-13 | Molecular Tool Inc | Automatic genotype determination |
| EP1352973A2 (en) * | 1993-12-23 | 2003-10-15 | Beckman Coulter, Inc. | Automatic genotype determination |
| EP1352973A3 (en) * | 1993-12-23 | 2004-01-02 | Beckman Coulter, Inc. | Automatic genotype determination |
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