JP7037218B2 - Ｃｄ３９と結合する抗体及びその使用 - Google Patents

Ｃｄ３９と結合する抗体及びその使用 Download PDF

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Description

本出願は、２０１８年３月１４日に提出された米国仮出願番号６２／６４２，９３８、及び２０１９年２月８日に提出された米国仮出願番号６２／８０３，２３５の優先権の利益を主張し、これらは参照によりその全体が組み込まれる。
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩ形式にて電子提出された配列表を含有し、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。２０１９年３月１２日に作製された前記ＡＳＣＩＩコピーの名称は０１２１９－０００３－００ＰＣＴ＿ＳＴ２５．ｔｘｔであり、そのサイズは１７８，２４４バイトである。
がんは、免疫抑制経路を破壊することによって増殖し、悪性細胞が危険物または異物として認識されるのを防ぐことができる。このメカニズムが、免疫系によるがんの排除を防ぎ、病気が極めて早期の段階から致命的な状態へと進行することを可能にする。免疫療法は、拒絶型プロセスを直接刺激するか、または抑制経路を遮断することにより、がんと戦うように患者の免疫系を改変する新たに開発された介入である。エクトヌクレオチダーゼＣＤ３９及びＣＤ７３によって生成される細胞外アデノシンは、抗腫瘍免疫応答に干渉する新たに認識された「免疫チェックポイントメディエーター」である。アデノシンは、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）内の免疫調節代謝産物である。一部のがんでは、細胞外アデノシンが蓄積し、その後、Ｔ細胞、樹状細胞（ＤＣ）、及びＮＫ細胞を含む免疫細胞の機能を阻害し、それにより抗腫瘍免疫抑制に寄与し、腫瘍増殖を支持する。
エクトヌクレオチダーゼＣＤ３９は、細胞外アデノシン三リン酸（ＡＴＰ）及びアデノシン二リン酸（ＡＤＰ）を加水分解して、アデノシンを生成し、アデノシンは、アデノシン受容体に結合し、Ｔ細胞及びナチュラルキラー（ＮＫ）細胞などの免疫細胞を阻害し、それにより免疫系を抑制する。ＣＤ３９の過剰発現は、ある特定の種類のがんを有する患者における予後不良と関連する。ＴＭＥ内では、アデノシン経路とは、ＡＴＰのアデノシンへの細胞外変換及び、免疫細胞上のＡ２Ａ／Ａ２Ｂアデノシン受容体を通したアデノシンのシグナル伝達を指す。正常な条件下では、ＣＤ３９は、免疫抑制性アデノシン及び免疫刺激性ＡＴＰの細胞外レベルの均衡を維持するように機能する。健常組織では、ＡＴＰがＣＤ３９によって急速に分解されてアデノシン一リン酸、つまりＡＭＰを生成し、次にＣＤ７３によってアデノシンに変換されるため、ＡＴＰは細胞外環境ではほとんど検出されない。がんを含む、細胞ストレスの条件下では、細胞外ＡＴＰレベルが有意に上昇するが、ＡＴＰが急速に分解され、高レベルのアデノシンと相まって低レベルのＡＴＰをもたらすため、免疫系による腫瘍の認識、ゆえに腫瘍に対する免疫応答が、妨げられる。
新規のがん治療法の開発に対する満たされていない必要性が引き続き存在する。様々ながんとより効果的に闘うために、既存の治療法及び治療レジメンとの新しい組み合わせも必要とされている。
高い親和性及び特異性でヒトＣＤ３９（分化抗原群３９）に結合して拮抗する、抗体またはその抗原結合部分を、本明細書に開示する。開示する抗ＣＤ３９抗体は、ＣＤ３９の非競合的、アロステリック阻害剤である。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、基質（ＡＴＰ）結合は許容するが、そのＡＤＰ及び／またはアデノシンへの変換を不可能にする、ゆえに腫瘍微小環境（ＴＭＥ）内でのＡＴＰのレベルを維持もしくは増強する及び／またはＴＭＥ内でのアデノシンの望ましくないレベルを予防する。抗体分子をコードする核酸分子、発現ベクター、宿主細胞、及び抗体分子を作成する方法も提供する。抗体分子を含む医薬組成物も提供する。本明細書に開示する抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分を（単独で、または他の治療剤もしくは手技と組み合わせて）使用して、免疫障害及びがんを含む障害を、処置、予防及び／または診断することができる。ゆえに、抗ＣＤ３９抗体分子を使用して、がん及び免疫障害を含む様々な障害を、処置及び／または診断するための組成物及び方法を、本明細書に開示する。
一態様では、本開示は、抗ＣＤ３９抗体、例えば、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する抗体、またはその抗原結合部分を提供し、該抗体またはその抗原結合部分は、以下の特性：
（ａ）組換えヒトＣＤ３９に及び／また膜結合ヒトＣＤ３９に結合する；
（ｂ）ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合する；
（ｃ）ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する；
（ｄ）細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ｅＡＭＰ）へのヒトＣＤ３９による変換を阻害または低下する；
（ｅ）ｅＡＴＰのレベルを増加または増強する；
（ｆ）細胞外アデノシンのレベルを低減または低下する；
（ｇ）ｅＡＴＰの免疫刺激性レベルを維持、増加または増強する；
（ｈ）リンパ球の増殖を増加または増強する；
（ｉ）１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加または増強する；
（ｊ）樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増加または増強する；
（ｋ）腫瘍におけるマクロファージ浸潤を増加または増強する；
（ｌ）マクロファージを誘引するケモカインの分泌を増加または増強する；
（ｍ）組織の腫瘍微小環境においてヒトＣＤ３９に拮抗する；
（ｎ）カニクイザルＣＤ３９と交差反応する；ならびに
（ｏ）（ａ）～（ｎ）のいずれか１つの組み合わせのうちの１つまたは複数を呈する。
一部の実施形態では、単離された抗ＣＤ３９抗体は、以下：
ｉ）それぞれ、配列番号１、２及び３を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１、１２、及び１３を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｉ）それぞれ、配列番号４、５、及び６を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１５、１６、及び１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｉｉ）配列番号７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｉｖ）配列番号９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖ）配列番号２１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉ）配列番号２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉｉ）配列番号２５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号２７、２８、及び２９を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８、及び３９を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｘ）それぞれ、配列番号３０、３１、及び３２を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ配列番号４０、４１、及び４２を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘ）配列番号３３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号４３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｉ）配列番号３５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｉ）配列番号４７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｉｉ）配列番号４９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｖ）配列番号５１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｖ）それぞれ、配列番号５３、５４、及び５５を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６３、６４、及び６５を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５６、５７、及び５８を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ配列番号６６、６７、及び６８を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｖｉｉ）配列番号５９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号６９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｖｉｉｉ）配列番号６１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｘ）配列番号７３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘ）配列番号７５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉ）配列番号７７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号７９、８０、及び８１を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号８９、９０、及び９１を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号８２、８３、及び８４を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号９２、９３、及び９４を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｉｖ）配列番号８５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号９５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｘｖ）配列番号８７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉ）配列番号９９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉｉ）配列番号１０１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉｉｉ）配列番号１０３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号１０５、１０６、及び１０７を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１５、１１６、及び１１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｘ）それぞれ、配列番号１０８、１０９、１１０を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１８、１１９、及び１２０を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｘｉ）配列番号１１１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号１２１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｘｘｉｉ）配列番号１１３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｉｉｉ）配列番号１２５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｉｖ）配列番号１２７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｖ）配列番号１２９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖を含む、からなる、またはから本質的になる。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、段落０００８に記載する構造的特徴及び段落０００７に記載する機能的特徴のうちの１つまたは複数を含む。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントは、段落０００７または段落０００８に記載する参照抗体と実質的に同じエピトープに結合する。
一部の実施形態では、本開示は、それぞれ、配列番号２７、２８、及び２９を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８、及び３９を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含むまたはからなる、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分を提供する。
一部の実施形態では、本開示は、それぞれ、配列番号３０、３１、及び３２を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１、及び４２を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含むまたはからなる、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分を提供する。
一部の実施形態では、本開示は、配列番号３３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一である可変重鎖、及び配列番号４３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一である可変軽鎖を含むまたはからなる、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分を提供する。
一部の実施形態では、本開示は、配列番号４９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％同一である軽鎖を含むまたはからなる、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分を提供する。
一部の実施形態では、本開示は、それぞれ、配列番号２７、２８、及び２９を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８、及び３９を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；またはそれぞれ、配列番号４、５、及び６を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびに、それぞれ、配列番号１５、１６、及び１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含むまたはからなる、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する抗ＣＤ３９抗体を提供し、該抗体は、
ａ．リンパ球の増殖を増加させ、任意選択で、リンパ球は、腫瘍浸潤リンパ球、もしくはＣＤ４＋Ｔ細胞である、及び／または
ｂ．１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強し、任意選択で、樹状細胞活性化マーカーはＣＤ８６、ＨＬＡ－ＤＲ、もしくはＣＤ８６及びＨＬＡ－ＤＲの両方である；及び／または
ｃ．樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増強し、任意選択で、サイトカインはＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０、ＶＥＧＦＡ、もしくはそれらの任意の組み合わせである；及び／または
ｄ．ヒトＣＤ３９の拮抗作用が腫瘍微小環境内で生じ、任意選択で、拮抗作用は非競合的及び／またはアロステリックである；及び／または
ｅ．抗体もしくはその抗原結合部分は、カニクイザルＣＤ３９と交差反応する。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＭ、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤまたはＩｇＥ抗体を含む。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、野生型または突然変異型ＩｇＧ１またはＩｇＧ４抗体を含む。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含み、突然変異は、ｉ）半分子を形成するＩｇＧ４の能力を低下する、及び／またはｉｉ）Ｆｃ受容体への結合を最小限に抑える。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、Ｓ２２８Ｐ突然変異を含む突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５Ｅ突然変異を含む突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。
ＣＤ３９が抗ＰＤ１／抗ＰＤ－Ｌ１療法に耐性がある対象において増加することが以前に記載されている。例えば、Ｈｏｔｓｏｎ／Ｌｕｋｅｅｔ ａｌ．，Ｏｒａｌ ｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎ ａｔ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒａｐｙ ｏｆ Ｃａｎｃｅｒ（ＳＩＴＣ）３２ｎｄ Ａｎｎｕａｌ Ｍｅｅｔｉｎｇ（２０１７）［２０１９－０３－１３に取得］を参照されたい。インターネット：＜ＵＲＬ：ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｃｏｒｖｕｓｐｈａｒｍａ．ｃｏｍ／ｆｉｌｅ．ｃｆｍ／２３／ｄｏｃｓ／ＳＩＴＣ＿２０１７＿Ｓｌｉｄｅｓ．ｐｄｆ＞から取得。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体のいずれか１つを投与することを含む、抗ＰＤ１または抗ＰＤ－Ｌ１療法に耐性があるヒト対象を処置する方法を提供する。抗ＰＤ１または抗ＰＤ－Ｌ１に耐性がある対象には、抗ＰＤ１または抗ＰＤ－Ｌ１療法からの利益が、非耐性対照と比較して少なくとも１つの標準偏差で３ヶ月間を超えて減少したままの対象が含まれる。
一態様では、本開示は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に結合する、抗体またはその抗原結合部分を提供する。一態様では、本開示は、ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合する、抗体またはその抗原結合部分を提供する。一態様では、本開示は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する、抗体またはその抗原結合部分を提供する。一態様では、本開示は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する、抗体またはその抗原結合部分を提供する。一部の態様では、ヒトＣＤ３９の酵素活性は、ｅＡＴＰまたはｅＡＤＰの加水分解である。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ｅＡＴＰまたはｅＡＤＰのｅＡＭＰへの変換を阻害または低下する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰまたはｅＡＤＰのｅＡＭＰへの変換を阻害または低下する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ｅＡＴＰレベルを増加または増強する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰレベルを増加または増強する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下する。アデノシンレベルを評価する方法は、当該技術分野で公知であり、例えば、Ｂｌａｙ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５７：２６０２－２６０５ ａｔ Ｍａｔｅｒｉａｌｓ ａｎｄ Ｍｅｔｈｏｄｓにあり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ｅＡＴＰの免疫刺激レベルを維持、増加または増強する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰの免疫刺激レベルを維持、増加、または増強する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、リンパ球の増殖を増加する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、リンパ球の増殖を増加する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、リンパ球の増殖を増加する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰレベルを維持、増加、または増強し、リンパ球の増殖を増加する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰレベルを維持、増加、もしくは増強し、及び／またはアデノシンのレベルを低減もしくは低下し、リンパ球の増殖を増加する。一部の態様では、リンパ球は、腫瘍浸潤リンパ球である。一部の態様では、リンパ球は、Ｔ細胞である。一部の態様では、Ｔ細胞は、ＣＤ４＋Ｔ細胞である。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加もしくは増強する、及び／または樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増加もしくは増強する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加もしくは増強する、及び／または樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増加もしくは増強する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害もしくは低下し、１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加もしくは増強する、及び／または樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増加もしくは増強する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰレベルを維持、増加、もしくは増強し、１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加もしくは増強する、及び／または樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増加もしくは増強する。一部の態様では、抗体またはその抗原結合部分は、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、ｅＡＴＰレベルを維持、増加、もしくは増強し、及び／またはアデノシンのレベルを低減もしくは低下し、１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加もしくは増強する、及び／または樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増加もしくは増強する。一部の態様では、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーは、ＣＤ８６、ＨＬＡ－ＤＲ、またはそれらの組み合わせである。一部の態様では、１つまたは複数のサイトカインは、ＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０、ＶＥＧＦＡ、またはそれらの任意の組み合わせである。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、組織の腫瘍微小環境においてヒトＣＤ３９の拮抗作用を引き起こす。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、カニクイザルＣＤ３９及び／またはマウスＣＤ３９と交差反応する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、及びＩｇＧ３、ＩｇＧ４、及びＩｇＭ、及びＩｇＡ１、及びＩｇＡ２、及びＩｇＤ、及びＩｇＥ抗体から選択される。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ＩｇＧ１抗体またはＩｇＧ４抗体である。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、野生型ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、野生型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、少なくとも１つの突然変異を含むＦｃドメインを含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含み、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、ＥＵナンバリングに従って、置換Ｓ２２８Ｐ、Ｌ２３５Ｅ、Ｌ２３５Ａのいずれか１つ、またはそれらの組み合わせを含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含み、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、Ｓ２２８Ｐ置換を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含み、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５Ｅ置換を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含み、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５Ａ置換を含む。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、抗体が結合するエピトープの突然変異が、抗体及び配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分の両方への結合を、阻害、低下、または遮断する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する。一部の実施形態では、本開示の抗体または抗原結合部分が結合するエピトープの突然変異は、抗体と、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分との両方への結合を阻害、低下、または遮断する。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分が結合するエピトープの突然変異は、抗体またはその抗原結合部分と、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分との両方への結合を阻害、低下、または遮断する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号１、２及び３に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１、１２及び１３に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５３、５４及び５５に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６３、６４及び６５に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号７９、８０及び８１に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号８９、９０及び９１に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１０５、１０６及び１０７に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１５、１１６及び１１７に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含み、重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号２７、２８及び２９に記載され、軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号３７、３８及び３９に記載されている。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号４、５及び６に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１４、１５及び１６に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５６、５７及び５８に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６６、６７及び６８に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８２、８３及び８４に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号９２、９３及び９４に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１０８、１０９及び１１０に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１８、１１９及び１２０に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含み、重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号３０、３１及び３２に記載され、軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号４０、４１及び４２に記載されている。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域は、配列番号３３、７、５９、８５及び１１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖可変領域は、配列番号４３、１７、６９、９５及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の態様では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３３及び４３；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号７及び１７；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９及び６９；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８５及び９５；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１１及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の態様では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ配列番号３３及び４３に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域は、配列番号３３、７、５９、８５及び１１１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖可変領域は、配列番号４３、１７、６９、９５及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３３及び４３；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号７及び１７；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９及び６９；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８５及び９５；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１１及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の態様では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ配列番号３３及び４３に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号３５、９、６１、８７及び１１３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号３５、９、６１、８７及び１１３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４７、２１、７３、９９、及び１２５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４７、２１、７３、９９及び１２５からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４９、２３、７５、１０１及び１２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４９、２３、７５、１０１及び１２７からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号５１、２５、７７、１０３及び１２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号５１、２５、７７、１０３及び１２９からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３５及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号９及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８７及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１３及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３５及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号９及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８７及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１３及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４７及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２１及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７３及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号９９及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２５及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４７及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２１及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７３及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号９９及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２５及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４９及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２３及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７５及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０１及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４９及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２３及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７５及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０１及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５１及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２５及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７７及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０３及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２９及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５１及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２５及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７７及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０３及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２９及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号３５及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号３５及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４７及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４７及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４９及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４９及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号５１及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号５１及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の態様では、本開示は、本開示の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分、及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を提供する。
一部の態様では、本開示は、本開示の単離された抗体またはその抗原結合部分の軽鎖、重鎖、または軽鎖及び重鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。一部の態様では、本開示は、本開示の核酸を含む発現ベクターを提供する。一部の態様では、本開示は、本開示の発現ベクターで形質転換された細胞を提供する。
一部の態様では、本開示は、ヒトＣＤ３９と結合する抗体またはその抗原結合部分を産生する方法を提供し、該方法は、抗体またはその抗原結合部分の発現を可能にする条件下で本開示に従う細胞を維持することを含む。一部の態様では、本方法は、抗体またはその抗原結合部分を得ることをさらに含む。
一部の実施形態では、本開示は、対象の免疫応答を刺激する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含む。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含む。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、腫瘍微小環境におけるヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ＡＭＰ）への変換を阻害または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベルを増加または増強し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、モノクローナル抗体である。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗ＣＤ３９抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベルを増加または増強し、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）の免疫刺激レベルを維持、増加、または増強し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境におけるリンパ球の増殖を増加または増強し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増強する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、がんは、肺癌（例えば、非小細胞肺癌）、卵巣癌、腎臓癌、精巣癌、膵臓癌、乳癌（例えば、トリプルネガティブ乳癌）、黒色腫、頭頸部癌（例えば、扁平上皮性頭頸部癌）、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳癌、リンパ腫または腎癌（例えば、腎細胞癌）からなる群から選択される。
一部の態様では、本開示は、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物の、対象の免疫応答の刺激または対象のがんの処置における、任意選択で１つまたは複数の追加の治療剤または手技と組み合わせた、使用を提供する。
一部の態様では、本開示は、本開示により提供する、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物、ならびに対象の免疫応答の刺激または対象のがんの処置における使用説明書を、１つまたは複数の追加の治療剤または手技との併用説明書を任意選択で伴って含む、キットを提供する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示によって提供される、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体またはその抗原結合部分を、１つまたは複数の追加の治療剤または手技と組み合わせて投与することを含む。一部の態様では、第二の治療剤または手技は、化学療法、標的抗がん療法、腫瘍溶解薬、細胞傷害剤、免疫系療法、サイトカイン、外科的手技、放射線手技、共刺激分子の活性化剤、阻害分子の阻害剤、ワクチン、もしくは細胞性免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＰＤ－１アンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、ＣＤ７３阻害剤、ＣＴＬＡ－４阻害剤、ＴＩＭ－３阻害剤、ＬＡＧ－３阻害剤、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法、またはそれらの組み合わせである。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＣＤ７３阻害剤及びＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである。一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＰＤ－１アンタゴニスト及びアデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである。一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＰＤ－１アンタゴニストである。
一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤＲ００１、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１、及びＡＭＰ－２２４からなる群から選択される。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＦＡＺ０５３、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストである。一部の実施形態では、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストは、ＮＩＲ１７８、ＣＰＩ－４４４、ＡＺＤ４６３５、ビパデナント、ＧＢＶ－２０３４、及びＡＢ９２８からなる群から選択される。一部の実施形態では、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストは、ＣＰＩ－４４４である。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＣＤ７３阻害剤である。一部の実施形態では、ＣＤ７３阻害剤は、ＡＢ４２１、ＭＥＤＩ９４４７、及びＢＭＳ－９８６１７９からなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＣＴＬＡ－４阻害剤である。一部の実施形態では、ＣＴＬＡ－４阻害剤は、イピリムマブまたはトレメリムマブである。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＴＩＭ－３阻害剤である。一部の実施形態では、ＴＩＭ－３阻害剤は、ＭＧＢ４５３またはＴＳＲ－０２２である。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＬＡＧ－３阻害剤である。一部の実施形態では、ＬＡＧ－３阻害剤は、ＬＡＧ５２５、ＢＭＳ－９８６０１６、及びＴＳＲ－０３３からなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法である。一部の実施形態では、ＣＡＲ細胞療法は、ＣＴＬ０１９である。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、アントラサイクリンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、及びバルルビシンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシンである。
一部の実施形態では、本開示は、ＣＤ３９を、生体試料または対象において検出する方法であって、（ｉ）試料または対象（及び任意選択で、参照試料または対象）を、表１内の任意の抗体と、抗体分子及びＣＤ３９の相互作用の発生を可能にする条件下で、接触させること、ならびに（ｉｉ）抗体分子及び試料または対象（及び任意選択で、参照試料または対象）間での複合体の形成を検出することを含む、方法を提供する。
以下の実施形態を提供し、これらは非限定的である。
実施形態１．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下の特性：
（ｉ）組換えヒトＣＤ３９に及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に結合する；
（ｉｉ）ヒトＣＤ３９に、１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合する；
（ｉｉｉ）ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する；
（ｉｖ）細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ｅＡＭＰ）へのヒトＣＤ３９による変換を阻害または低下する；
（ｖ）ｅＡＴＰのレベルを増加または増強する；
（ｖｉ）細胞外アデノシンレベルを低減または低下する；
（ｖｉｉ）ｅＡＴＰの免疫刺激性レベルを維持、増加または増強する；
（ｖｉｉｉ）リンパ球の増殖を増加または増強する；
（ｉｘ）１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加または増強する；
（ｘ）樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増加または増強する；
（ｘｉ）腫瘍におけるマクロファージ浸潤を増加または増強する；
（ｘｉｉ）マクロファージを誘引するケモカインの分泌を増加または増強する；
（ｘｉｉｉ）組織の腫瘍微小環境においてヒトＣＤ３９に拮抗する；
（ｘｉｖ）カニクイザルＣＤ３９及び／またはマウスＣＤ３９と交差反応する；あるいは
（ｘｖ）（ｉ）～（ｘｉｖ）のいずれか１つの組み合わせのうちの少なくとも１つまたは複数を呈する、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２．前記抗体またはその抗原結合部分が、ヒト組換えＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に結合する、実施形態１に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３．前記抗体またはその抗原結合部分が、１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）でヒトＣＤ３９に結合する、実施形態１または２に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４．前記抗体またはその抗原結合部分が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する、実施形態１～３のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５．ヒトＣＤ３９の前記酵素活性が、ｅＡＴＰまたはｅＡＤＰの加水分解である、実施形態４に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６．前記抗体またはその抗原結合部分が、ｅＡＴＰまたはｅＡＤＰのｅＡＭＰへの変換を阻害または低下する、実施形態１～５のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態７．前記抗体またはその抗原結合部分が、ｅＡＴＰのレベルを増加または増強する、実施形態１～６のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態８．前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下する、実施形態１～７のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態９．前記抗体またはその抗原結合部分が、ｅＡＴＰの免疫刺激レベルを維持、増加または増強する、実施形態１～８のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１０．前記抗体またはその抗原結合部分が、リンパ球の増殖を増加する、実施形態１～９のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１１．前記リンパ球が、腫瘍浸潤リンパ球である、実施形態１０に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１２．前記リンパ球が、Ｔ細胞である、実施形態１０または１１に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１３．前記Ｔ細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞である、実施形態１２に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１４．前記抗体またはその抗原結合部分が、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する、実施形態１～１３のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１５．前記１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーが、ＣＤ８６、ＨＬＡ－ＤＲ、またはそれらの組み合わせである、実施形態１４に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１６．前記抗体またはその抗原結合部分が、樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増強する、実施形態１～１５のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１７．前記１つまたは複数のサイトカインが、ＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０、ＶＥＧＦＡ、またはそれらの任意の組み合わせである、実施形態１６に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１８．ヒトＣＤ３９の前記拮抗作用が、組織の腫瘍微小環境内で生じる、実施形態１～１７のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態１９．前記抗体またはその抗原結合部分が、カニクイザルＣＤ３９及び／またはマウスＣＤ３９と交差反応する、実施形態１～１８のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２０．前記抗体が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、及びＩｇＧ３、ＩｇＧ４、及びＩｇＭ、及びＩｇＡ１、及びＩｇＡ２、及びＩｇＤ、及びＩｇＥ抗体からなる群から選択される、実施形態１～１９のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２１．前記抗体が、ＩｇＧ１抗体またはＩｇＧ４抗体である、実施形態２０に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２２．前記抗体が、野生型ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む、実施形態２０または２１に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２３．前記抗体が、野生型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む、実施形態２０または２１に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２４．前記抗体が、少なくとも１つの突然変異を含むＦｃドメインを含む、実施形態１～２１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２５．前記抗体が、突然変異型ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む、実施形態２４に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２６．前記抗体が、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む、実施形態２４に記載の単離されたモノクローナル抗体、またはその抗原結合部分。
実施形態２７．前記突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域が、ＥＵナンバリングに従って、置換Ｓ２２８Ｐ、Ｌ２３５Ｅ、Ｌ２３５Ａのいずれか１つ、またはそれらの組み合わせを含む、実施形態２６に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２８．前記抗体またはその抗原結合部分が、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む、実施形態１～２７のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態２９．前記抗体またはその抗原結合部分が、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する、実施形態１～２８のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３０．前記抗体またはその抗原結合部分が、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する、実施形態１～２９のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３１．前記抗体が結合する前記エピトープの突然変異が、前記抗体及び配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分の両方への結合を、阻害、低下、または遮断する、実施形態１～３０のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３２．前記抗体またはその抗原結合部分が、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する、実施形態１～３１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３３．前記抗体またはその抗原結合部分が、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する、実施形態１～３２のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３４．前記抗体が結合する前記エピトープの突然変異が、前記抗体と、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分との両方への結合を阻害、低下、または遮断する、実施形態１～３３のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３５．前記抗体またはその抗原結合部分が、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する、実施形態１～３１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３６．前記抗体またはその抗原結合部分が、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する、実施形態１～３１及び３５のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３７．前記抗体が結合する前記エピトープの突然変異が、前記抗体と、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分との両方への結合を阻害、低下、または遮断する、実施形態１～３１、３５、及び３６のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３８．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号１、２及び３に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１、１２及び１３に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５３、５４及び５５に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６３、６４及び６５に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号７９、８０及び８１に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号８９、９０及び９１に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１０５、１０６及び１０７に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１５、１１６及び１１７に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態３９．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含み、前記重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列が、それぞれ配列番号２７、２８及び２９に記載され、前記軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列が、それぞれ配列番号３７、３８及び３９に記載されている、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４０．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号４、５及び６に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１４、１５及び１６に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５６、５７及び５８に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６６、６７及び６８に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８２、８３及び８４に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号９２、９３及び９４に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１０８、１０９及び１１０に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１８、１１９及び１２０に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４１．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含み、前記重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列が、それぞれ配列番号３０、３１及び３２に記載され、前記軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列が、それぞれ配列番号４０、４１及び４２に記載されている、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４２．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域が、配列番号３３、７、５９、８５及び１１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み；前記軽鎖可変領域が、配列番号４３、１７、６９、９５及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４３．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３３及び４３；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号７及び１７；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９及び６９；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８５及び９５；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１１及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４４．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ配列番号３３及び４３に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４５．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域が、配列番号３３、７、５９、８５及び１１１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖可変領域が、配列番号４３、１７、６９、９５及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４６．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３３及び４３；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号７及び１７；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９及び６９；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８５及び９５；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１１及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４７．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ配列番号３３及び４３に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４８．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号３５、９、６１、８７及び１１３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態４９．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号３５、９、６１、８７及び１１３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５０．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号４７、２１、７３、９９、及び１２５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５１．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号４７、２１、７３、９９及び１２５からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５２．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号４９、２３、７５、１０１、及び１２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５３．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号４９、２３、７５、１０１及び１２７からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５４．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号５１、２５、７７、１０３、及び１２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５５．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、重鎖及び軽鎖を含み、前記重鎖が、配列番号５１、２５、７７、１０３及び１２９からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５６．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３５及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号９及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８７及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１３及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５７．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３５及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号９及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８７及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１３及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５８．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４７及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２１及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７３及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号９９及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２５及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態５９．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４７及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２１及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７３及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号９９及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２５及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６０．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４９及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２３及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７５及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０１及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６１．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４９及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２３及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７５及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０１及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６２．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５１及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２５及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７７及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０３及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２９及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６３．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５１及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２５及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７７及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０３及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２９及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６４．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号３５及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６５．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号３５及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６６．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号４７及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６７．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号４７及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６８．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号４９及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態６９．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号４９及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態７０．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号５１及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態７１．ヒトＣＤ３９に特異的に結合して拮抗する、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分であって、それぞれ、配列番号５１及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む、前記抗体またはその抗原結合部分。
実施形態７２．先行実施形態のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分、及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物。
実施形態７３．実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分の軽鎖、重鎖、または軽鎖及び重鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
実施形態７４．実施形態７３に記載の核酸を含む発現ベクター。
実施形態７５．実施形態７４に記載の発現ベクターで形質転換された細胞。
実施形態７６．ヒトＣＤ３９に特異的に結合するモノクローナル抗体またはその抗原結合部分を産生する方法であって、実施形態７５に記載の細胞を、前記モノクローナル抗体またはその抗原結合部分の発現を可能にする条件下で維持することを含む、前記方法。
実施形態７７．前記モノクローナル抗体またはその抗原結合部分を得ることをさらに含む、実施形態７６に記載の方法。
実施形態７８．対象の免疫応答を刺激する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
実施形態７９．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
実施形態８０．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、腫瘍微小環境におけるヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８１．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、腫瘍微小環境におけるｅＡＴＰまたはｅＡＤＰのＡＭＰへの変換を阻害または低下し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８２．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、腫瘍微小環境におけるｅＡＴＰのレベルを増加または増強し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８３．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、腫瘍微小環境における細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８４．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、腫瘍微小環境におけるｅＡＴＰのレベルを増加または増強し、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８５．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、腫瘍微小環境におけるｅＡＴＰの免疫刺激レベルを維持、増加、または増強し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８６．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、腫瘍微小環境におけるリンパ球の増殖を増加または増強し、それによってがんを処置する、前記方法。
実施形態８７．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する、前記方法。
実施形態８８．対象のがんを処置する方法であって、前記対象に、有効量の実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または実施形態７２に記載の医薬組成物を投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分、または前記医薬組成物が、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ヒトＣＤ３９の前記酵素活性の前記阻害または低下が、樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増強する、前記方法。
実施形態８９．前記がんが、肺癌（例えば、非小細胞肺癌）、卵巣癌、腎臓癌、精巣癌、膵臓癌、乳癌（例えば、トリプルネガティブ乳癌）、黒色腫、頭頸部癌（例えば、扁平上皮性頭頸部癌）、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳癌、リンパ腫または腎癌（例えば、腎細胞癌）からなる群から選択される、実施形態７９～８８のいずれか１項に記載の方法。
実施形態９０．前記単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分が、１つまたは複数の追加の治療剤または手技と組み合わせて投与され、前記第二の治療剤または手技が、化学療法、標的抗がん療法、腫瘍溶解薬、細胞傷害剤、免疫系療法、サイトカイン、外科的手技、放射線手技、共刺激分子の活性化剤、阻害分子の阻害剤、ワクチン、もしくは細胞性免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態７９～８９のいずれか１つに記載の方法。
実施形態９１．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、ＣＤ７３阻害剤、ＣＴＬＡ－４阻害剤、ＴＩＭ－３阻害剤、ＬＡＧ－３阻害剤、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法、アントラサイクリン、またはそれらの組み合わせである、実施形態９０に記載の方法。
実施形態９２．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＣＤ７３阻害剤及びＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである、実施形態９１に記載の方法。
実施形態９３．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニスト及びアデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである、実施形態９１に記載の方法。
実施形態９４．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニストである、実施形態９１に記載の方法。
実施形態９５．前記ＰＤ－１アンタゴニストが、ＰＤＲ００１、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１、ＡＭＰ－２２４、ＦＡＺ０５３、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される、実施形態９１、９３または９４のいずれか１項に記載の方法。
実施形態９６．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストである、実施形態９１に記載の方法。
実施形態９７．前記アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストが、ＮＩＲ１７８、ＣＰＩ－４４４、ＡＺＤ４６３５、ビパデナント、ＧＢＶ－２０３４、及びＡＢ９２８からなる群から選択される、実施形態９１～９３または９７のいずれか１項に記載の方法。
実施形態９８．前記アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストが、ＣＰＩ－４４４である、実施形態９７に記載の方法。
実施形態９９．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＣＤ７３阻害剤である、実施形態９１に記載の方法。
実施形態１００．前記ＣＤ７３阻害剤が、ＡＢ４２１、ＭＥＤＩ９４４７、及びＢＭＳ－９８６１７９からなる群から選択される、実施形態９１、９２または９９のいずれか１項に記載の方法。
実施形態１０１．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＣＴＬＡ－４阻害剤である、実施形態９１に記載の方法。
実施形態１０２．前記ＣＴＬＡ－４阻害剤が、イピリムマブまたはトレメリムマブである、実施形態１０１に記載の方法。
実施形態１０３．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＴＩＭ－３阻害剤である、実施形態９１に記載の方法。
実施形態１０４．前記ＴＩＭ－３阻害剤が、ＭＧＢ４５３またはＴＳＲ－０２２である、実施形態１０３に記載の方法。
実施形態１０５．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＬＡＧ－３阻害剤である、実施形態９１に記載の方法。
実施形態１０６．前記ＬＡＧ－３阻害剤が、ＬＡＧ５２５、ＢＭＳ－９８６０１６、及びＴＳＲ－０３３からなる群から選択される、実施形態１０５に記載の方法。
実施形態１０７．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法である、実施形態９１に記載の方法。
実施形態１０８．前記ＣＡＲ細胞療法が、ＣＴＬ０１９である、実施形態１０７に記載の方法。
実施形態１０９．ヒトＣＤ３９を、生体試料または対象において検出する方法であって、（ｉ）前記試料または前記対象（及び任意選択で、参照試料または対象）を、表１内の任意の抗体と、前記抗体分子及びヒトＣＤ３９の相互作用の発生を可能にする条件下で、接触させること、ならびに（ｉｉ）前記抗体分子及び前記試料または前記対象（及び任意選択で、前記参照試料または対象）間での複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
実施形態１１０．対象の免疫応答を刺激するため、または対象のがんの処置するため、任意選択で１つまたは複数の追加の治療剤または手技と組み合わせて使用するための、実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分、または実施形態７２に記載の医薬組成物の使用。
実施形態１１１．実施形態１～７１のいずれか１項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分、または実施形態７２に記載の医薬組成物、及び対象の免疫応答の刺激または対象のがんの処置における使用説明書を、１つまたは複数の追加の治療剤または手技との併用説明書を任意選択で伴って含む、キット。
実施形態１１２．前記第二の治療剤または手技が、化学療法、標的抗がん療法、腫瘍溶解薬、細胞傷害剤、免疫系療法、サイトカイン、外科的手技、放射線手技、共刺激分子の活性化剤、阻害分子の阻害剤、ワクチン、もしくは細胞性免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１１３．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、ＣＤ７３阻害剤、ＣＴＬＡ－４阻害剤、ＴＩＭ－３阻害剤、ＬＡＧ－３阻害剤、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法、アントラサイクリン、またはそれらの組み合わせである、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１１４．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＣＤ７３阻害剤及びＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１１５．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニスト及びアデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１１６．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニストである、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１１７．前記ＰＤ－１アンタゴニストが、ＰＤＲ００１、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１、及びＡＭＰ－２２４ＡＭＰからなる群から選択される、実施形態１１６に記載の使用または実施形態１１６に記載のキット。
実施形態１１８．前記ＰＤ－１アンタゴニストが、ＦＡＺ０５３、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される、実施形態１１６に記載の使用または実施形態１１６に記載のキット。
実施形態１１９．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストである、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１２０．前記アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストが、ＮＩＲ１７８、ＣＰＩ４４４、ＡＺＤ４６３５、ビパデナント、ＧＢＶ－２０３４、及びＡＢ９２８からなる群から選択される、実施形態１１９に記載の使用または実施形態１１９に記載のキット。
実施形態１２１．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＣＤ７３阻害剤である、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１２２．前記ＣＤ７３阻害剤が、ＡＢ４２１、ＭＥＤＩ９４４７、及びＢＭＳ－９８６１７９からなる群から選択される、実施形態１２１に記載の使用または実施形態１２１に記載のキット。
実施形態１２３．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＣＴＬＡ－４阻害剤である、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１２４．前記ＣＴＬＡ－４阻害剤が、イピリムマブまたはトレメリムマブである、実施形態１２３に記載の使用または実施形態１２３に記載のキット。
実施形態１２５．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＴＩＭ－３阻害剤である、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１２６．前記ＴＩＭ－３阻害剤が、ＭＧＢ４５３またはＴＳＲ－０２２である、実施形態１２５に記載の使用または実施形態１２５に記載のキット。
実施形態１２７．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＬＡＧ－３阻害剤である、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１２８．前記ＬＡＧ－３阻害剤が、ＬＡＧ５２５、ＢＭＳ－９８６０１６、及びＴＳＲ－０３３からなる群から選択される、実施形態１２７に記載の使用または実施形態１２７に記載のキット。
実施形態１２９．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法である、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１３０．前記ＣＡＲ細胞療法が、ＣＴＬ０１９である、実施形態１２９に記載の使用または実施形態１２９に記載のキット。
実施形態１３１．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、アントラサイクリンである、実施形態９１に記載の方法。
実施形態１３２．前記アントラサイクリンが、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、及びバルルビシンから選択される、実施形態１３１に記載の方法。
実施形態１３３．前記アントラサイクリンが、ドキソルビシンである、実施形態１３２に記載の方法。
実施形態１３４．前記１つまたは複数の追加の治療剤が、アントラサイクリンである、実施形態１１０に記載の使用または実施形態１１１に記載のキット。
実施形態１３５．前記アントラサイクリンが、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、及びバルルビシンから選択される、実施形態１３４に記載の使用または実施形態１３４に記載のキット。
実施形態１３６．前記アントラサイクリンが、ドキソルビシンである、実施形態１３５に記載の使用または実施形態１３５に記載のキット。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目１)
単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分であって、以下の特性：
ａ．組換えヒトＣＤ３９に及び／また膜結合ヒトＣＤ３９に結合する；
ｂ．ヒトＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（Ｋ Ｄ ）で結合する；
ｃ．ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する；
ｄ．細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ｅＡＭＰ）へのヒトＣＤ３９による変換を阻害または低下する；
ｅ．ｅＡＴＰのレベルを増加または増強する；
ｆ．細胞外アデノシンを低減または低下する；
ｇ．ｅＡＴＰの免疫刺激性レベルを維持、増加または増強する；
ｈ．リンパ球の増殖を増加または増強する；
ｉ．１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加または増強する；
ｊ．樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増加または増強する；
ｋ．腫瘍におけるマクロファージ浸潤を増加または増強する；
ｌ．マクロファージを誘引するケモカインの分泌を増加または増強する；
ｍ．組織の腫瘍微小環境においてヒトＣＤ３９に拮抗する；
ｎ．カニクイザルＣＤ３９と交差反応する；及び
ｏ．（ａ）～（ｎ）のいずれか１つの組み合わせのうちの１つまたは複数を呈する、前記抗体またはその抗原結合部分。
(項目２)
前記抗体またはその抗原結合部分が、以下：
ｉ）それぞれ、配列番号１、２及び３を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１、１２、及び１３を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｉ）それぞれ、配列番号４、５、及び６を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１５、１６、及び１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｉｉ）配列番号７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｉｖ）配列番号９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖ）配列番号２１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉ）配列番号２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉｉ）配列番号２５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号２７、２８、及び２９を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８、及び３９を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｘ）それぞれ、配列番号３０、３１、及び３２を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１、及び４２を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘ）配列番号３３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号４３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｉ）配列番号３５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｉ）配列番号４７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｉｉ）配列番号４９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；またはｘｉｖ）配列番号５１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｖ）それぞれ、配列番号５３、５４、及び５５を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６３、６４、及び６５を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５６、５７、及び５８を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６６、６７、及び６８を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｖｉｉ）配列番号５９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号６９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｖｉｉｉ）配列番号６１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｘ）配列番号７３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘ）配列番号７５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉ）配列番号７７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号７９、８０、及び８１を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号８９、９０、及び９１を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号８２、８３、及び８４を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号９２、９３、及び９４を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｉｖ）配列番号８５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号９５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｘｖ）配列番号８７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉ）配列番号９９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；またはｘｘｖｉｉ）配列番号１０１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉｉｉ）配列番号１０３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号１０５、１０６、及び１０７を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１５、１１６、及び１１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｘ）それぞれ、配列番号１０８、１０９、１１０を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１８、１１９、及び１２０を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｘｉ）配列番号１１１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号１２１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｘｘｉｉ）配列番号１１３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｉｉｉ）配列番号１２５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｉｖ）配列番号１２７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｖ）配列番号１２９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖を含む、からなる、またはから本質的になる、項目１に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目３)
前記抗体またはその抗原結合部分が、リンパ球の増殖を増加させ、任意選択で、前記リンパ球が、腫瘍浸潤リンパ球、またはＣＤ４＋Ｔ細胞である、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目４)
前記抗体またはその抗原結合部分が、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強し、任意選択で、前記樹状細胞活性化マーカーが、ＣＤ８６、ＨＬＡ－ＤＲ、またはＣＤ８６及びＨＬＡ－ＤＲの両方である、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目５)
前記抗体またはその抗原結合部分が、樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増強し、任意選択で、前記サイトカインが、ＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０、ＶＥＧＦＡ、またはそれらの任意の組み合わせである、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目６)
ヒトＣＤ３９の前記拮抗作用が腫瘍微小環境内で生じ、任意選択で、前記拮抗作用が、非競合的及び／またはアロステリックである、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目７)
前記抗体またはその抗原結合部分が、カニクイザルＣＤ３９と交差反応する、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目８)
前記抗体が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＭ、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤ、またはＩｇＥ抗体である、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目９)
前記抗体が、野生型または突然変異型ＩｇＧ１またはＩｇＧ４抗体である、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１０)
突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含み、前記突然変異が、ｉ）半分子を形成する前記ＩｇＧ４の能力を低下する、及び／またはｉｉ）Ｆｃ受容体への結合を最小限に抑える、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１１)
Ｓ２２８Ｐ突然変異を含む突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１２)
Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５Ｅ突然変異を含む突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１３)
前記抗体またはその抗原結合部分が、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１４)
前記抗体またはその抗原結合部分が、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１５)
前記抗体またはその抗原結合部分が、
ｉ）それぞれ、配列番号１、２及び３を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１、１２、及び１３を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｉ）それぞれ、配列番号４、５、及び６を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１５、１６、及び１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｉｉ）配列番号７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｉｖ）配列番号９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖ）配列番号２１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉ）配列番号２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉｉ）配列番号２５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｖｉｉｉ）それぞれ、配列番号２７、２８、及び２９を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８、及び３９を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｉｘ）それぞれ、配列番号３０、３１、及び３２を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１、及び４２を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘ）配列番号３３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号４３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｉ）配列番号３５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｉ）配列番号４７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｉｉ）配列番号４９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；またはｘｉｖ）配列番号５１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｖ）それぞれ、配列番号５３、５４、及び５５を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６３、６４、及び６５を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｖｉ）それぞれ、配列番号５６、５７、及び５８を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６６、６７、及び６８を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｖｉｉ）配列番号５９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号６９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｖｉｉｉ）配列番号６１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｉｘ）配列番号７３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘ）配列番号７５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉ）配列番号７７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号７１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉｉ）それぞれ、配列番号７９、８０、及び８１を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号８９、９０、及び９１を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｉｉｉ）それぞれ、配列番号８２、８３、及び８４を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号９２、９３、及び９４を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｉｖ）配列番号８５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号９５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｘｖ）配列番号８７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉ）配列番号９９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；またはｘｘｖｉｉ）配列番号１０１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｖｉｉｉ）配列番号１０３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号９７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｉｘ）それぞれ、配列番号１０５、１０６、及び１０７を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１５、１１６、及び１１７を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｘ）それぞれ、配列番号１０８、１０９、１１０を含む重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１８、１１９、及び１２０を含む軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；または
ｘｘｘｉ）配列番号１１１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変重鎖、及び配列番号１２１のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である可変軽鎖；または
ｘｘｘｉｉ）配列番号１１３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｉｉｉ）配列番号１２５のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｉｖ）配列番号１２７のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖；または
ｘｘｘｖ）配列番号１２９のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である重鎖、及び配列番号１２３のアミノ酸配列に少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、もしくは１００％同一である軽鎖を含む、参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する、先行項目のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分。
(項目１６)
先行項目のいずれか１項に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分をコードする核酸。
(項目１７)
項目１６に記載の核酸を含む、発現ベクター。
(項目１８)
項目１７に記載の発現ベクターで形質転換された細胞。
(項目１９)
項目１～１５のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体もしくはその抗原結合部分、または項目１６に記載の核酸、及び医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
(項目２０)
対象のがんを処置する方法であって、前記対象に治療有効量の項目１～１５のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体もしくはその抗原結合部分または項目１９に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
(項目２１)
前記がんが、肺癌（例えば、非小細胞肺癌）、卵巣癌、腎臓癌、精巣癌、膵臓癌、乳癌（例えば、トリプルネガティブ乳癌）、黒色腫、頭頸部癌（例えば、扁平上皮性頭頸部癌）、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳癌、リンパ腫、腎癌（例えば、腎細胞癌）からなる群から選択される、項目２１に記載の方法。
(項目２２)
前記単離された抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分が、１つまたは複数の追加の治療剤または手技と組み合わせて投与され、前記追加の治療剤または手技が、化学療法、標的抗がん療法、腫瘍溶解薬、細胞傷害剤、免疫系療法、サイトカイン、外科的手技、放射線手技、共刺激分子の活性化剤、阻害分子の阻害剤、ワクチン、もしくは細胞性免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、項目２０～２１のいずれか１項に記載の方法。
(項目２３)
前記１つまたは複数の追加の治療剤が、ＰＤ－１アンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、ＣＤ７３阻害剤、ＣＴＬＡ－４阻害剤、ＴＩＭ－３阻害剤、ＬＡＧ－３阻害剤、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法、アントラサイクリン、またはそれらの組み合わせである、項目２２に記載の方法。
(項目２４)
ｉｎ ｖｉｖｏまたはｅｘ ｖｉｖｏで生体試料中のヒトＣＤ３９を検出する方法であって、（ｉ）前記試料（及び、任意選択で、参照／対照試料または対象）を、項目１～１５のいずれか１項に記載の抗体、または項目１９に記載の医薬組成物と、前記抗体分子及びヒトＣＤ３９の相互作用の発生を可能にする条件下で、接触させること、ならびに、（ｉｉ）前記抗体分子及び前記試料または前記対象（及び任意選択で、前記参照試料または対象）間での複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
(項目２５)
項目１～１５のいずれか１項に記載の単離された抗ＣＤ３９抗体もしくはその抗原結合部分、項目１６に記載の核酸、または項目１９に記載の医薬組成物、及び対象のがんの処置における使用説明書を、任意選択で１つまたは複数の追加の治療剤または手技と併用するための説明書を伴って含む、キット。
ＡＴＰの存在下または不在下で、図示の通りの抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した樹状細胞上でのＣＤ８６の発現を定量化したグラフを提供する。ＣＤ８６の発現は、フローサイトメトリー分析によって決定した。 ＡＴＰの存在下または不在下で、図示の通りの抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した樹状細胞上でのＣＤ８６及びＨＬＡ－ＤＲの発現を定量化したグラフを提供する。ＣＤ８６及びＨＬＡ－ＤＲの発現は、フローサイトメトリー分析によって決定した。 ＡＴＰの存在下または不在下で、図示の通りの抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した樹状細胞によるサイトカインＩＬ－１６の分泌を定量化したグラフを提供する。ＩＬ－１６の定量化は、ＭＳＤによって決定した。 ＡＴＰの存在下または不在下で、図示の通りの抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した樹状細胞によるサイトカインＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０の分泌を定量化したグラフを提供する。ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０の定量化は、ＭＳＤによって決定した。 ＡＴＰの存在下または不在下で、図示の通りの抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した樹状細胞によるサイトカインＶＥＧＦＡの分泌を定量化したグラフを提供する。ＶＥＧＦＡの定量化は、ＭＳＤによって決定した。 ＡＴＰの存在下で、図示の通りの抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置したＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖指数を示すグラフを提供する。細胞はセルトレースバイオレットを用いて染色し、増殖はフローサイトメトリー分析によって決定した。 図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置したＭＯＬＰ－８細胞の表面上でのＣＤ３９活性の阻害率（％）を示すグラフを提供する。ＡＴＰ変換の阻害は、マラカイトグリーンリン酸アッセイによって決定した。 図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置したヒトＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞の表面上でのＣＤ３９活性の阻害率（％）を示すグラフを提供する。ＡＴＰ変換の阻害は、マラカイトグリーンリン酸アッセイによって決定した。 図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した初代ヒトＢ細胞の表面上でのＣＤ３９活性の阻害率（％）を示すグラフを提供する。ＡＴＰ変換の阻害は、マラカイトグリーンリン酸アッセイによって決定した。 図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した初代ヒト単球の表面上でのＣＤ３９活性の阻害率（％）を示すグラフを提供する。ＡＴＰ変換の阻害は、マラカイトグリーンリン酸アッセイによって決定した。 ＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞の表面への抗ＣＤ３９抗体結合または対照抗体結合の程度を示すグラフを提供する。細胞を、図示の通りの様々な濃度の蛍光標識抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した。抗体結合の程度は、フローサイトメトリー分析によって決定した。 ＭＯＬＰ－８細胞の表面への抗ＣＤ３９抗体結合または対照抗体結合の程度を示すグラフを提供する。細胞を、図示の通りの様々な濃度の蛍光標識抗ＣＤ３９抗体または対照抗体を用いて処置した。抗体結合の程度は、フローサイトメトリー分析によって決定した。 Ａは、ＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞を移植され、アイソタイプ対照抗体を用いて処置されたマウスにおける腫瘍体積測定を示すグラフを提供する。 Ｂは、ＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞を移植され、図示の通りに抗ＣＤ３９抗体を用いて処置されたマウスにおける腫瘍体積測定を示すグラフを提供する。 フローサイトメトリー分析によって決定された、５人のヒトドナーに由来する免疫細胞上でのＣＤ３９の発現に対するニボルマブ処置の効果を示すグラフを提供する。線は、３種の異なる免疫細胞型にて、ドナーが一致する未処置ＣＤ３９レベルとニボルマブ処置ＣＤ３９レベルを結び付ける。 組換えヒトＣＤ３９に対する例示的な抗ＣＤ３９抗体に関するＦｏｒｔｅＢｉｏ及びＭＳＤ分析によって測定された親和性（ＫＤ）を示す表を提供する。 ＭＯＬＰ－８ヒト多発性骨髄腫細胞を移植され、図示の通りに抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６７－Ａ）を単独でまたはアントラサイクリンドキソルビシン（Ｄｏｘ）と組み合わせて用いて処置されたマウスにおける経時的な腫瘍体積測定を示すグラフを提供する。黒色の矢印は、抗体を用いた処置を示す。灰色の矢印は、ドキソルビシンを用いた処置を示す。アイソタイプ対照抗体を用いてまたはドキソルビシン単独を用いて処置されたマウスを、コンパレーターとして使用した。 １９日目での、図８Ａのように処置されたマウスの平均腫瘍体積を示すグラフを提供する。 ＭＯＬＰ－８ヒト多発性骨髄腫細胞を移植され、図示の通りに抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６７－Ａ）を単独でまたはアデノシンＡ２Ａ受容体（Ａ２ＡＲ）アンタゴニスト（ＣＰＩ－４４４）と組み合わせて用いて処置されたマウスにおける経時的な腫瘍体積測定を示すグラフを提供する。アイソタイプ対照抗体を用いてまたはＣＰＩ－４４４単独を用いて処置されたマウスを、コンパレーターとして使用した。
様々な疾患は、患者における進行性免疫抑制の発生を特徴とする。悪性腫瘍を有する患者における免疫応答不全の存在は、特に十分に実証されてる。がん患者は、遅延型過敏症の低減、リンパ球の溶解機能及び増殖応答の低減などの、様々な免疫機能の変化を呈する。がん患者の免疫機能を増大させることは、腫瘍制御に有益な効果をもたらし得る。
一態様では、本開示は、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体を提供する。他の態様では、本開示は、異常なＣＤ３９発現に関連する障害を処置するための方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、ヒトＣＤ３９に結合し、ヒトＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する、抗体またはその抗原結合部分を提供する。理論に束縛されないが、ヒトＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、患者の腫瘍微小環境における、細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベル（例えば、免疫刺激レベル）を維持、増加または増強し、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それにより患者に治療上の利益を提供すると考えられている。
定義
本特許請求の範囲及び明細書内で使用する用語は、別段の指定がない限り、下記のように定義される。
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用する場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、文脈上そうでないと明確に指示されない限り、複数形の指示対象を含むことに留意されなければならない。
本明細書で使用する場合、「約」は、当業者により理解され、それが使用される文脈に応じてある程度変動するだろう。当業者にとって明白ではない本用語の使用がある場合、それが使用される文脈を考慮して、「約」は、特定の値のプラスまたはマイナス１０％までを意味するだろう。
本出願では、「または」の使用は、別段の記載がない限り、「及び／または」を意味する。複数の従属クレームの文脈では、「または」の使用は、代替のみにおいて、複数の先行する独立または従属クレームに戻ることを指す。「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」及び「有する」という単語は、本明細書において互換可能に使用できる。本発明に従い、「単離された」分子は、その自然環境から取り出された分子である。従って、「単離された」という用語は、分子が精製された程度を必ずしも反映するものではない。
本明細書で使用する場合、「細胞外アデノシン三リン酸」または「細胞外ＡＴＰ」または「ｅＡＴＰ」という用語は、組織または組織試料内の細胞の外側の組織または組織試料内に位置し、プリン作動性シグナル伝達において機能するアデノシン５’－三リン酸を指す。本明細書で使用する場合、「細胞外アデノシン」という用語は、組織または組織試料内の細胞の外側の組織または組織試料内に位置し、プリン作動性シグナル伝達において機能するアデノシンを指す。組織または組織試料内では、細胞外ＡＴＰの量、濃度、またはレベル及び細胞外アデノシンの量、濃度、またはレベルの間に関連性がある。生理学的（つまり、正常）条件下では、ＡＴＰの定常状態細胞質（つまり、細胞内）濃度は、およそ３ｍＭからおよそ１０ｍＭの範囲であり、一方で細胞外ＡＴＰの量、濃度、またはレベルは、およそ１０ｎＭである。細胞外ＡＴＰのレベルは、細胞外アデノシン５’－二リン酸（ｅＡＤＰ）、細胞外アデノシン５’－一リン酸（ｅＡＭＰ）、及び細胞外アデノシンへと細胞外ＡＴＰを代謝または変換する細胞外酵素（例えば、エクトヌクレオチダーゼ、ＣＤ３９、ＣＤ７９）の活性の結果として維持される（Ｔｒａｕｔｍａｎｎ（２００９）Ｓｃｉ Ｓｉｇｎａｌ ２（５６）：ｐｅ６）。
細胞外ヌクレオシド（例えば、細胞外アデノシン）及びヌクレオチド（例えば、細胞外ＡＴＰ）は、細胞死、細胞増殖、遊走、及び／または分化の刺激（または阻害）ならびに細胞による増殖因子及び／または炎症性メディエーターの分泌を含むがこれらに限定されない、正常な生理的細胞応答の媒介に伴う、プリン作動性シグナル伝達に関与する。組織ホメオスタシス、創傷治癒、神経変性、抗腫瘍免疫、炎症及びがんなどの病態生理学的プロセスも、プリン作動性シグナル伝達によって調節される（Ｂｏｕｒｓｅｔ ａｌ．，（２０１１）Ｆｒｏｎｔ Ｂｉｏｓｃｉ（Ｓｃｈｏｌ Ｅｄ）３：１４４３－１４５６；Ｋｈａｋｈ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｎａｔｕｒｅ ４４２：５２７－５３２；Ｉｄｚｋｏ ｅｔ ａｌ．，（２０１４）５０９：３１０－３１７；Ａｎｔｏｎｉｏｌｉ ｅｔ ａｌ．，（２０１３）Ｒｅｖ Ｃａｎｃｅｒ １３：８４２－８５７）。組織内の休止細胞を取り巻く低濃度の細胞外ＡＴＰは、隣接する生存細胞の存在をシグナルとして伝達する。そして、細胞外ＡＴＰの一時的な増加は、例えば神経系及び血管系における正常な生理学的シグナル伝達に関連する。しかしながら、組織内の細胞外ＡＴＰレベルの有意な増加（例えば、免疫原性細胞死ＩＣＤ中）は、炎症プロセスの誘導及び免疫系応答（例えば、抗腫瘍応答）の調節をもたらす重要な「危険」信号として機能する（Ｍａｒｔｉｎｓ ｅｔ ａｌ．，（２０１４）Ｃｅｌｌ Ｄｅａｔｈ Ｄｉｆｆｅｒ ２１（１）：７９－９１）。
細胞外ＡＴＰレベルが比較的低い（およそ１０ｎＭ）健常組織とは対照的に、組織損傷、炎症部位での、及び腫瘍微小環境（ＴＭＥ）における細胞外ＡＴＰのレベルの上昇は、１００μＭを超える濃度に達し得る（Ｖｉｒｇｉｌｉｏ ａｎｄ Ａｄｉｎｏｌｆｉ（２０１７）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ３６：２９３－３０３）。損傷組織またはＴＭＥにおける細胞外ＡＴＰのレベルの上昇は、免疫調節作用及び免疫刺激作用をもたらすことが示されている（Ｖｉｊａｙａｎ ｅｔ ａｌ．，（２０１７）Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｃａｎｃｅｒ １７：７０９－７２４）。本明細書で使用する場合、「ＡＴＰの免疫刺激レベル」という用語は、免疫応答を誘導、刺激または増強する、細胞外ＡＴＰの量、数量、濃度、存在量またはレベルを指す。
一部のがんでは、ＴＭＥ内の条件により、細胞外ＡＴＰのレベルが上昇し、加水分解が加速された結果として、最終的に細胞外アデノシンの蓄積がもたらされ得る。細胞外ＡＴＰの上昇したレベルの免疫刺激効果とは対照的に、細胞外アデノシンは、例えば、一部のがんのＴＭＥにおいて免疫抑制効果を誘導すると知られている（Ｖｉｒｇｉｌｉｏ（２０１２）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ７２（２１）：５４４１－５４４７）。ＴＭＥにおける細胞外ＡＴＰから細胞外アデノシンへの変換を主に担う酵素は、エクトヌクレオチダーゼＣＤ３９及びＣＤ７３である。ＴＭＥでは、アデノシンの免疫抑制効果は、少なくとも部分的には、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の拡大、エフェクターＴ細胞応答の阻害、及び骨髄由来抑制細胞（ＭＤＳＣ）の拡大によって媒介されることが示されている（Ａｌｌａｒｄｅｔ ａｌ．，（２０１６）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ ２９：７－１６；Ａｌｌａｒｄ ｅｔ ａｌ．，（２０１６）Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒａｐｙ８：１４５－１６３）。
本明細書で使用する場合、「アラニンスキャニング」という用語は、所定のタンパク質またはポリペプチドの安定性または機能（複数可）（例えば、結合親和性）に対する特定の野生型残基の寄与を決定するために使用される技術を指す。この技術は、ポリペプチドの野生型残基のアラニン残基での置換、その後、アラニン置換誘導体または突然変異型ポリペプチドの安定性または機能（複数可）（例えば、結合親和性）の評価、及び野生型ポリペプチドとの比較を伴う。ポリペプチドの野生型残基をアラニンで置換する技術は、当該技術分野で公知である。
「回復する」という用語は、予防、重症度もしくは進行の緩和、寛解、または治癒を含む、疾患状態、例えば、がんの処置における任意の治療上有益な結果を指す。
本明細書で使用する場合、「アミノ酸」という用語は、天然に生じるアミノ酸及び合成アミノ酸、ならびに天然に生じるアミノ酸と同様の様式で機能するアミノ酸類似体及びアミノ酸模倣体を指す。天然に生じるアミノ酸は、遺伝暗号によってコードされるもの、ならびに後に修飾されたアミノ酸、例えば、ヒドロキシプロリン、γ－カルボキシグルタメート及びＯ－ホスホセリンである。アミノ酸類似体とは、天然に生じるアミノ酸と同じ塩基化学構造を有する化合物、すなわち、水素、カルボキシル基、アミノ基、及びＲ基に結合しているα炭素を有する化合物、例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチオニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウムを指す。このような類似体は、修飾されたＲ基を有するか（例えばノルロイシン）または修飾されたペプチド主鎖を有するが、天然に生じるアミノ酸と同じ塩基化学構造を保持している。アミノ酸模倣体とは、アミノ酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然に生じるアミノ酸と同様の様式で機能する化学化合物を指す。
アミノ酸は、本明細書では、一般に公知である三文字の記号、またはＩＵＰＡＣ－ＩＵＢ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎによって推奨されている一文字の記号のいずれかによって称することができる。ヌクレオチドも同様に、一般に認められている一文字の略号で称することができる。
本明細書で使用する場合、「アミノ酸置換」は、所定のアミノ酸配列（出発ポリペプチドのアミノ酸配列）における少なくとも１つの既存のアミノ酸残基の、第二の、異なる「置換」アミノ酸残基での置換を指す。「アミノ酸挿入」とは、少なくとも１つの追加のアミノ酸を所定のアミノ酸配列に組み込むことを指す。挿入は通常、１つまたは２つのアミノ酸残基の挿入からなり得るが、より大きな「ペプチド挿入」、例えば約３～約５、またさらには最大約１０、１５、または２０のアミノ酸残基の挿入もなされ得る。挿入された残基（複数可）は、上に開示するように、天然に生じても非天然に生じてもよい。「アミノ酸欠失」は、所定のアミノ酸配列からの少なくとも１つのアミノ酸残基の除去を指す。
本明細書で使用する場合、「量」または「レベル」という用語は、最も広い意味で使用され、物質（例えば、代謝産物、小分子、タンパク質、ｍＲＮＡ、マーカー）の数量、濃度または存在量を指す。代謝産物または小分子（例えば、アデノシン三リン酸（ＡＴＰ））に言及する場合、「量」、「レベル」、及び「濃度」という用語は、一般的に互換可能に使用され、一般的に生体試料中の検出可能な量を指す。「上昇したレベル」または「増加したレベル」とは、対照試料、例えば疾患もしくは障害（例えば、がん）に罹患していない１つもしくは複数の個体に由来するものまたは内部対照と比較した、試料内での物質の数量、濃度または存在量における増加を指す。一部の実施形態では、試料中の物質（例えば、ＡＴＰ）の上昇したレベルは、当該技術分野で公知の技術（例えば、マラカイトグリーンアッセイ）によって決定される、対照試料中の物質の量に対する約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の物質の量の増加を指す。「低下したレベル」とは、対照、例えば疾患もしくは障害（例えば、がん）に罹患していない１つもしくは複数の個体に由来するものまたは内部対照と比較した、個体内での物質（例えば、ＡＴＰ）の数量、濃度または存在量における低減を指す。一部の実施形態では、低下したレベルは、検出可能な数量、濃度または存在量がほとんどまたは全くない。一部の実施形態では、試料中の物質（例えば、ＡＴＰ）の低下したレベルは、当該技術分野で公知の技術（例えば、マラカイトグリーンアッセイ）によって決定される、対照試料中の物質の量に対する約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の物質の量の低減を指す。
本明細書に記載されているものなどのタンパク質、ｍＲＮＡまたはマーカーに言及するとき、「発現のレベル」または「発現レベル」という用語は、一般に互換可能に使用され、一般的に生体試料中のタンパク質、ｍＲＮＡまたはマーカーの検出可能な量を指す。一部の実施形態では、タンパク質、ｍＲＮＡまたはマーカーの検出可能な量または検出可能なレベルは、本明細書に記載されているものなどの作用物質に対する応答の尤度に関連する。「発現」は、一般的に、遺伝子内に含有された情報が、細胞内に存在し作動する構造体（例えば、ＣＤ８６などのタンパク質マーカー）へと転換される、プロセスを指す。それゆえ、本明細書で使用する場合、「発現」とは、ポリヌクレオチドへの転写、ポリペプチドへの翻訳、あるいはさらにはポリヌクレオチド及び／またはポリペプチド修飾（例えば、ポリペプチドの翻訳後修飾）を指し得る。転写されたポリヌクレオチド、翻訳されたポリペプチド、あるいはポリヌクレオチド及び／またはポリペプチド修飾（例えば、ポリペプチドの翻訳後修飾）のフラグメントも、それらが選択的スプライシングによって生成された転写物もしくは分解された転写物に由来するか、または例えばタンパク質分解によるポリペプチドの翻訳後プロセシングに由来するかどうかにかかわらず、発現されたものと見なされるべきである。「発現遺伝子」は、ｍＲＮＡとしてポリヌクレオチドに転写され、その後、ポリペプチドに翻訳される遺伝子を含み、ＲＮＡに転写されるが、ポリペプチドに翻訳されない遺伝子（例えば、トランスファーＲＮＡ及びリボソームＲＮＡ）も含む。「上昇した発現」、「上昇した発現レベル」、または「上昇したレベル」とは、対照試料、例えば疾患もしくは障害（例えば、がん）に罹患していない１つもしくは複数の個体または内部対照と比較した、試料内の物質の発現の増加またはレベルの増加を指す。一部の実施形態では、試料中の物質（例えば、ＣＤ８６などのタンパク質マーカー）の上昇した発現は、当該技術分野で公知の技術（例えば、ＦＡＣＳ）によって決定される、対照試料中の物質の量に対する約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の物質の量の増加を指す。「低下した発現」、「低下した発現レベル」、または「低下したレベル」とは、対照、例えば疾患もしくは障害（例えば、がん）に罹患していない１つもしくは複数の個体または内部対照と比較した、個体内の物質（例えば、タンパク質マーカー）の発現の低減またはレベルの低減を指す。一部の実施形態では、低下した発現は、発現がほとんどまたは全くない。一部の実施形態では、試料中の物質（例えば、タンパク質マーカー）の低下した発現は、当該技術分野で公知の技術（例えば、ＦＡＣＳ）によって決定される、対照試料中の物質の量に対する約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％の物質の量の低減を指す。
本明細書で使用する場合、「拮抗する（ａｎｔａｇｏｎｉｚｅ）」、「拮抗する（ａｎｔａｇｏｎｉｚｅｓ）」という用語、または名詞「アンタゴニスト」などに言及する場合、天然ポリペプチド（酵素を含む）の生物学的活性を、部分的または完全に遮断、阻害、または中和、排除、または除去することを指す。本明細書で使用する場合、「ヒトＣＤ３９に拮抗する」抗体は、ＣＤ３９酵素の酵素活性を、部分的または完全に遮断、阻害、中和、排除、または除去するものである。一部の実施形態では、拮抗活性は、用量依存様式にて観察される。一部の実施形態では、測定されたシグナル（例えば、生物学的活性）は、同等の条件下で陰性対照を用いて測定されたシグナルよりも、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、または少なくとも約１００％低い。本明細書では、本開示の方法における使用に好適なアンタゴニストを同定する方法も開示する。例えば、これらの方法には、ヒト３９に結合して拮抗する抗体を同定すること、例として、例えば、酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）、Ｆｏｒｔｅ Ｂｉｏ（著作権）システム、及びラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）などの結合アッセイが含まれる。これらのようなアッセイを使用して、目的のポリペプチド（例えば、ＣＤ３９）に結合する抗体の能力、ならびにポリペプチド（例えば、ＣＤ３９）に拮抗する抗体の能力を決定することができる。アンタゴニスト抗体の有効性は、ポリペプチドまたはアゴニストの機能を阻害するアンタゴニストの能力などの機能性アッセイを使用して決定することもできる。例えば、機能性アッセイは、ポリペプチドを候補アンタゴニスト分子と接触させること、及びポリペプチドに通常関連する１つまたは複数の生物学的活性における検出可能な変化を測定することを含み得る。アンタゴニストの効力は、そのＩＣ５０値（アゴニスト応答の５０％を阻害するために必要な濃度）によって定義され得る。ＩＣ５０値が低いほど、アンタゴニストの効力は大きくなり、最大の生物学的応答を阻害するために必要な濃度は低くなる。
本明細書で使用する場合、「抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体」（互換可能に「抗ＣＤ３９抗体」と称する）という用語は、本明細書、例えば、表１に記載する抗体を指す。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、ＣＤ３９（例えば、ヒトＣＤ３９）に結合し、ＣＤ３９の生物学的活性及び／またはＣＤ３９シグナル伝達によって媒介される下流経路（複数可）または他のＣＤ３９媒介機能、例えば、酵素活性に拮抗する。抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、受容体結合及び／またはＣＤ３９もしくはその代謝産物に対する細胞応答の誘発などのＣＤ３９シグナル伝達または機能によって媒介される下流経路を含む、ＣＤ３９の生物学的活性（リガンド結合、酵素活性）を遮断、拮抗、抑制、阻害、排除、または低下する抗体を包含する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、ＣＤ３９に特異的に結合する。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、その同族または正常リガンドへのＣＤ３９結合を防止または阻害する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、アデノシン三リン酸（ＡＴＰ）からアデノシン一リン酸（ＡＭＰ）への酵素的変換を阻害または低下する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、アデノシン二リン酸（ＡＤＰ）からアデノシン一リン酸（ＡＭＰ）への酵素的変換を阻害または低下する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、ＡＴＰの免疫刺激量を維持または増加する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、アデノシンレベルを低下または低減する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、抗腫瘍応答を刺激または増強する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、約５ｎＭ～２０ｎＭの親和性でＣＤ３９に結合する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体は、ＣＤ３９に結合し、野生型もしくは突然変異型ＩｇＧ１または野生型もしくは突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。抗ＣＤ３９アンタゴニスト抗体の例は、本明細書に提供する。
本明細書で使用する場合、「抗体」という用語は、２つの軽鎖ポリペプチド及び２つの重鎖ポリペプチドを含む全抗体を指す。全抗体には、ＩｇＭ、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、及びＩｇＥ抗体を含む異なる抗体アイソタイプが含まれる。「抗体」という用語は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ化抗体またはキメラ抗体、ヒト化抗体、霊長類化抗体、脱免疫化抗体、及び完全ヒト抗体を含む。抗体は、様々な種、例えば、哺乳動物、例えばヒト、非ヒト霊長類（例えば、オランウータン、ヒヒ、またはチンパンジー）、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、モルモット、スナネズミ、ハムスター、ラット及びマウスのいずれかにおいて作成するまたはこれに由来することができる。抗体は、単離、精製または組換え抗体であることができる。
本明細書で使用する場合、「抗体フラグメント」、「抗原結合フラグメント」という用語、または類似の用語は、標的抗原（例えば、ＣＤ３９）に結合し、標的抗原の活性を阻害する能力を保持するが、完全長より短い抗体のフラグメントを指す。このようなフラグメントには、例えば、一本鎖抗体、一本鎖Ｆｖフラグメント（ｓｃＦｖ）、Ｆｄフラグメント、Ｆａｂフラグメント、Ｆａｂ’フラグメント、またはＦ（ａｂ’）２フラグメントが含まれる。ｓｃＦｖフラグメントは、ｓｃＦｖが由来する抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域の両方を含む単一のポリペプチド鎖である。加えて、イントラボディ、ミニボディ、トリアボディ、及びダイアボディも抗体の定義に含まれ、本明細書に記載の方法での使用に適合する。例えば、Ｔｏｄｏｒｏｖｓｋａ ｅｔ ａｌ．，（２００１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２４８（１）：４７－６６；Ｈｕｄｓｏｎ ａｎｄ Ｋｏｒｔｔ，（１９９９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２３１（１）：１７７－１８９；Ｐｏｌｊａｋ，（１９９４）Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ２（１２）：１１２１－１１２３；Ｒｏｎｄｏｎ ａｎｄ Ｍａｒａｓｃｏ，（１９９７）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．５１：２５７－２８３を参照されたく、それぞれの開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書中で使用する場合、「抗体フラグメント」という用語は、例えば、ラクダ化単一ドメイン抗体などの単一ドメイン抗体も含む。例えば、Ｍｕｙｌｄｅｒｍａｎｓ ｅｔ ａｌ．，（２００１）Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．２６：２３０－２３５；Ｎｕｔｔａｌｌ ｅｔ ａｌ．，（２０００）Ｃｕｒｒ．Ｐｈａｒｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．１：２５３－２６３；Ｒｅｉｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，（１９９９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．２３１：２５－３８；ＰＣＴ出願公開番号ＷＯ９４／０４６７８及びＷＯ９４／２５５９１；ならびに米国特許第６，００５，０７９号を参照されたく、これらは全て、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、本開示は、単一ドメイン抗体が形成されるように修飾された２つのＶＨドメインを含む単一ドメイン抗体を提供する。
一部の実施形態では、抗原結合フラグメントは、重鎖ポリペプチドの可変領域及び軽鎖ポリペプチドの可変領域を含む。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗原結合フラグメントは、抗体の軽鎖及び重鎖ポリペプチドのＣＤＲを含む。
ダイアボディは、二価性または二重特異性であり得る、２つの抗原結合部位を伴う抗体フラグメントである。例えば、ＥＰ４０４，０９７；ＷＯ１９９３／０１１６１；Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）；及びＨｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８（１９９３）を参照されたい。トリアボディ及びテトラボディも、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）に記載されている。
抗体フラグメントは、本明細書に記載するように、インタクト抗体のタンパク質分解消化、ならびに組換え宿主細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉまたはファージ）による産生を含むが、これらに限定されない、様々な技術によって作成することができる。
「抗原提示細胞」または「ＡＰＣ」という用語は、ＭＨＣと複合体を形成した外来抗原をその表面上に提示する細胞である。Ｔ細胞は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）を使用してこの複合体を認識する。ＡＰＣの例としては、限定されないが、Ｂ細胞、樹状細胞（ＤＣ）、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、単球（ＴＨＰ－１など）、Ｂリンパ芽球細胞（Ｃ１Ｒ．Ａ２、１５１８ Ｂ－ＬＣＬなど）及び単球由来樹状細胞（ＤＣ）が挙げられる。一部のＡＰＣは、食作用または受容体を介したエンドサイトーシスのいずれかによって抗原を内在化させる。
「抗原提示」という用語は、ＡＰＣが抗原を捕捉し、例えば、ＭＨＣ－Ｉ及び／またはＭＨＣ－ＩＩコンジュゲートの成分としての、Ｔ細胞によるそれらの認識を可能にするプロセスを指す。
本明細書で使用する場合、「アポトーシス」という用語は、多細胞生物（例えば、ヒト）において生じるプログラムされた細胞死のプロセスを指す。アポトーシスをもたらす高度に制御された生化学的及び分子的事象は、細胞に観察可能及び特徴的な形態変化をもたらし、それには膜の小疱形成、細胞体積の収縮、染色体ＤＮＡの凝縮及びフラグメント化、ならびにｍＲＮＡの崩壊が含まれる。アポトーシスを起こしているＴ細胞を含む細胞を同定する一般的な方法は、細胞をフルオロフォアコンジュゲートタンパク質（アネキシンＶ）に曝露することである。アネキシンＶは、細胞がアポトーシスの過程にあることの初期の指標である、原形質膜の外側の小葉上のホスファチジルセリンに結合する能力によって、アポトーシス細胞を検出するために一般に使用される。
本明細書で使用する場合、「Ｂ細胞」（あるいは「Ｂリンパ球」）という用語は、リンパ球サブタイプの白血球細胞の一種を指す。Ｂ細胞は、抗体を分泌することにより、適応免疫系の体液性免疫成分中で機能する。Ｂ細胞はまた、抗原を提示し、サイトカインを分泌する。Ｂ細胞は、他の２つのクラスのリンパ球であるＴ細胞及びナチュラルキラー細胞とは異なり、その細胞膜上にＢ細胞受容体（ＢＣＲ）を発現する。ＢＣＲは、Ｂ細胞が特定の抗原に結合することを可能にし、それに対して抗体応答を開始することになる。
本明細書で使用する場合、「固定化ＣＤ３９に結合する」という用語は、例えば、細胞の表面上で発現しているか、または固体支持体に付着している、ＣＤ３９に結合する本開示の抗体の能力を指す。
本明細書で使用する場合、「二重特異性」または「二機能性抗体」という用語は、２つの異なる重／軽鎖対及び２つの異なる結合部位を有する人工ハイブリッド抗体を指す。二重特異性抗体は、ハイブリドーマの融合またはＦａｂ’フラグメントの連結を含む様々な方法によって生産することができる。例えば、Ｓｏｎｇｓｉｖｉｌａｉ＆Ｌａｃｈｍａｎｎ，（１９９０）Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．７９：３１５－３２１；Ｋｏｓｔｅｌｎｙ ｅｔ ａｌ．，（１９９２）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８：１５４７－１５５３を参照されたい。
従来、二重特異性抗体の組換え産生は、２つの免疫グロブリン重鎖／軽鎖対の共発現に基づき、この場合２つの重鎖／軽鎖対は、異なる特異性を有する（Ｍｉｌｓｔｅｉｎ ａｎｄ Ｃｕｅｌｌｏ，（１９８３）Ｎａｔｕｒｅ ３０５：５３７－５３９）。所望の結合特異性を伴う抗体可変ドメイン（抗体－抗原複合部位）は、免疫グロブリン定常ドメイン配列に融合することができる。重鎖可変領域の融合は、好ましくは、ヒンジ、ＣＨ２、及びＣＨ３領域の少なくとも一部を含む、免疫グロブリン重鎖定常ドメインとの融合である。二重特異性抗体を生成するための例示的な現在公知の方法のさらなる詳細については、例えば、Ｓｕｒｅｓｈ ｅｔ ａｌ．，（１９８６）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．１２１：２１０；ＰＣＴ公開番号ＷＯ９６／２７０１１；Ｂｒｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：８１；Ｓｈａｌａｂｙ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．（１９９２）１７５：２１７－２２５；Ｋｏｓｔｅｌｎｙ ｅｔ ａｌ．，（１９９２）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８（５）：１５４７－１５５３；Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８；Ｇｒｕｂｅｒ ｅｔ ａｌ．，（１９９４）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５２：５３６８；及びＴｕｔｔ ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：６０を参照されたい。二重特異性抗体には、架橋またはヘテロコンジュゲート抗体も含まれる。ヘテロコンジュゲート抗体は、任意の好都合な架橋方法を使用して作成され得る。好適な架橋剤が当該技術分野で周知であり、いくつかの架橋技術とともに、米国特許第４，６７６，９８０号に開示されている。
組換え細胞培養物から直接二重特異性抗体フラグメントを作成する及び単離するための様々な技術も記載されている。例えば、二重特異性抗体は、ロイシンジッパーを使用して産生されている。例えば、Ｋｏｓｔｅｌｎｙ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４８（５）：１５４７－１５５３を参照されたい。Ｆｏｓ及びＪｕｎタンパク質由来のロイシンジッパーペプチドを、遺伝子融合によって２つの異なる抗体のＦａｂ’部分に連結させ得る。抗体ホモ二量体をヒンジ領域にて還元して単量体を形成し、次に、再酸化して抗体ヘテロ二量体を形成し得る。この方法は、抗体ホモ二量体の産生にも利用することができる。Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８により記載される「ダイアボディ」技術は、二重特異性抗体フラグメントを作成するための代替的機序を提供している。フラグメントは、同じ鎖上で２つのドメイン間の対合を可能にするには短すぎるリンカーによって軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に連結した重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む。従って、１つのフラグメントのＶＨ及びＶＬドメインは別のフラグメントの相補的ＶＬ及びＶＨドメインと強制的に対合し、それにより２つの抗原結合部位が形成される。一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）二量体の使用による二重特異性抗体フラグメントを作成するための別の戦略も報告されている。例えば、Ｇｒｕｂｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９４）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５２：５３６８を参照されたい。あるいは、抗体は、例えば、Ｚａｐａｔａ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．８（１０）：１０５７－１０６２に記載されるように「線状抗体」であることができる。簡潔には、これらの抗体は、一対の抗原結合領域を形成する一対のタンデムＦｄセグメント（ＶＨ－ＣＨ１－ＶＨ－ＣＨ１）を含む。線状抗体は、二重特異性または単一特異性であることができる。
２つ以上の価数を伴う抗体（例えば、三重特異性抗体）は企図され、例えば、Ｔｕｔｔ ｅｔ ａｌ．（１９９１）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４７：６０に記載されている。
本開示はまた、Ｗｕ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２５（１１）：１２９０－１２９７に記載されている二重可変ドメイン免疫グロブリン（ＤＶＤ－Ｉｇ）分子などの多重特異性抗体の変異形態も包含する。ＤＶＤ－Ｉｇ分子は、２つの異なる親抗体からの２つの異なる軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）がタンデムに直接または短いリンカーを介して組換えＤＮＡ技術によって連結され、その後に軽鎖定常ドメインが続くように設計されている。同様に、重鎖は、タンデムに連結された２つの異なる重鎖可変ドメイン（ＶＨ）、続く定常ドメインＣＨ１及びＦｃ領域を含む。２つの親抗体からＤＶＤ－Ｉｇ分子を作成する方法は、例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ０８／０２４１８８及びＷＯ０７／０２４７１５にさらに記載されている。一部の実施形態では、二重特異性抗体は、第二の特異性を有する軽鎖可変領域が全抗体の重鎖可変領域に融合している、タンデム型Ｆａｂ免疫グロブリンである。そのような抗体は、例えば、国際特許出願公開番号ＷＯ２０１５／１０３０７２に記載されている。
本明細書で使用する場合、「がん抗原」または「腫瘍抗原」とは、（ｉ）腫瘍特異的抗原、（ｉｉ）腫瘍関連抗原、（ｉｉｉ）腫瘍特異的抗原を発現する細胞、（ｉｖ）腫瘍関連抗原を発現する細胞、（ｖ）腫瘍上の胚性抗原、（ｖｉ）自己腫瘍細胞、（ｖｉｉ）腫瘍特異的膜抗原、（ｖｉｉｉ）腫瘍関連膜抗原、（ｉｘ）増殖因子受容体、（ｘ）増殖因子リガンド、及び（ｘｉ）がんに関連する任意の他のタイプの抗原または抗原提示細胞もしくは物質を指す。
本明細書で使用する場合、「がん特異的免疫応答」という用語は、腫瘍、がん細胞、またはがん抗原の存在によって誘発される免疫応答を指す。ある特定の実施形態では、応答は、がん抗原特異的リンパ球の増殖を含む。ある特定の実施形態では、応答は、抗体及びＴ細胞受容体の発現及び上方制御、ならびにリンホカイン、ケモカイン、及びサイトカインの形成及び放出を含む。自然免疫系及び後天性免疫系の両方が相互作用して、腫瘍、がん細胞、またはがん抗原に対する抗原応答を開始する。ある特定の実施形態では、がん特異的免疫応答は、Ｔ細胞応答である。
「癌種」という用語は、当該技術分野で認識されており、呼吸器系癌、消化器系癌、泌尿生殖器系癌、精巣癌、乳癌、前立腺癌、内分泌系癌、及び黒色腫を含む上皮または内分泌組織の悪性腫瘍を指す。本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体を使用して、腎癌もしくは黒色腫を含む任意のタイプのがん、または任意のウイルス性疾患を有する、有する疑いがある、または発症するリスクが高い可能性がある患者を処置することができる。例示的な癌種には、子宮頸部、肺、前立腺、乳房、頭頸部、結腸及び卵巣の組織から形成されるものが含まれる。本用語は、癌性肉腫も含み、これには、癌性組織及び肉腫性組織から構成される悪性腫瘍が含まれる。「腺癌」は、腺組織に由来する癌種、または腫瘍細胞が認識可能な腺構造を形成する癌種を指す。
本明細書で使用する場合、「ＣＤ３９」という用語は、ＥＮＴＰＤ１遺伝子によってヒトにおいてコードされるエクトヌクレオシド三リン酸ジホスホリドロラーゼ１ポリペプチドを指す。ＣＤ３９の他の名前には、ＥＮＴＰＤ１、ＡＴＰＤａｓｅ、ＮＴＰＤａｓｅ－１、及びＳＰＧ６４が含まれる。ＣＤ３９は、細胞外ヌクレオシド三リン酸（ＮＴＰ；例えば、アデノシン三リン酸またはＡＴＰ）及びヌクレオシド二リン酸（ＮＤＰ；例えば、アデノシン二リン酸またはＡＤＰ）のγ－及びβ－リン酸残基の加水分解を触媒し、これらの分子をヌクレオシド一リン酸（ＮＭＰ；例えば、アデノシン一リン酸またはＡＭＰ）誘導体へと変換する。ＣＤ３９の例示的なアミノ酸配列は、配列番号１３８に、及びＮＣＢＩ参照配列ＮＰ＿００１７６７．３にても記載している。本開示は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する抗体を提供する。
本明細書で使用する場合、「ＣＤ８６」（Ｂ７０／Ｂ７－２）という用語は、約７５ｋＤの細胞表面タンパク質を指し、これはＣＤ２８及びＣＴＬＡ－４の２番目のリガンドであり、初期免疫応答におけるＴ細胞の共刺激において重要な役割を果たす（ＡｚｕｍａＭ．ｅｔ ａｌ．，１９９３，Ｎａｔｕｒｅ ３６６：７６；Ｎｏｚａｗａ Ｙ．ｅｔ ａｌ．，１９９３，Ｊ．Ｐａｔｈｏｌｏｇｙ １６９：３０９；Ｅｎｇｌｅ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．１９９４，Ｂｌｏｏｄ ８４：１４０２；Ｅｎｇｅｌ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．，ＣＤ８６ Ｗｏｒｋｓｈｏｐ Ｒｅｐｏｒｔ．Ｉｎ：Ｌｅｕｋｏｃｙｔｅ Ｔｙｐｉｎｇ Ｖ．Ｓｃｈｌｏｓｓｍａｎ，Ｓ．Ｆ．ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，１９９４，Ｏｘｆｏｒｄ ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ；Ｙａｎｇ，Ｘ．Ｆ．ｅｔ ａｌ．，１９９４，Ｕｐｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ＣＤ８６ ａｎｔｉｇｅｎ ｏｎ ＴＰＡ ｓｔｉｍｕｌａｔｅｄ Ｕ９３７ ｃｅｌｌｓ，１９９４，（ａｂｓｔｒａｃｔ）．Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｏｆ Ｈｅｍａｔｏｌｏｇｙ，Ｎａｓｈｖｉｌｌｅ，ＴＮ；Ｇｕｅｓｄｏｎ，Ｊ．－Ｌ．ｅｔ ａｌ．，１９７９，Ｊ．Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ．Ｃｙｔｏｃｈｅｍ．２７：１１３１－１１３９）。
本明細書で使用する場合、「ＣＤＲ」という用語は、相補性決定領域を意味する。「超可変領域」または「ＨＶＲ」という用語は、「ＣＤＲ」の代わりに使用する場合があり、これらの用語は両方とも、配列が超可変である（「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」）、及び／または構造的に定義されたループ（「超可変ループ」）を形成する、及び／または抗原接触残基（「抗原接触体」）を含有する、抗体可変ドメインの領域の各々を指す。一般的に、抗体は６つのＨＶＲ／ＣＤＲを含み、３つがＶＨにあり（Ｈ１、Ｈ２、Ｈ３）、３つがＶＬにある（Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３）。
本明細書で使用する場合、「細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答」という用語は、細胞傷害性Ｔ細胞によって誘導される免疫応答を指す。ＣＴＬ応答は、主にＣＤ８＋Ｔ細胞によって媒介される。
本明細書で使用する場合、「化学療法剤」（あるいは「細胞傷害性化学療法剤」）という用語は、がんの処置に有用であることが知られている化学的または薬理学的作用物質を指す。さらに、本明細書で使用する場合、本用語は、一般的に細胞傷害性、非特異的細胞内毒である薬理学的作用物質、特に有糸分裂として知られる細胞分裂の過程を阻害するように機能するものを意味し、がんの形成、発生及び／または維持の原因となるまたはこれに寄与すると知られている細胞成分をより選択的に標的とする薬理学的作用物質を除外する。化学療法剤は、ＡＴＰ放出をもたらし得る免疫原性細胞死を含む１つまたは複数の細胞死様式を誘発することができる。
本明細書で使用する場合、「競合する」という用語は、同じエピトープへの結合をめぐって競合する抗原結合タンパク質（例えば、免疫グロブリン、抗体、またはその抗原結合フラグメント）の文脈で使用される場合、アッセイ（例えば、競合結合アッセイ、クロスブロッキングアッセイ）によって決定される抗原結合タンパク質間の相互作用を指し、試験抗原結合タンパク質（例えば、試験抗体）は、参照抗原結合タンパク質（例えば、ＳＲＦ３６７などの参照抗体）の共通抗原（例えば、ＣＤ３９またはそのフラグメント）に対する特異的結合を阻害する（例えば、低下または遮断する）。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体は、ＳＲＦ３６７（すなわち、それぞれ、配列番号３３及び４３の重鎖可変配列及び軽鎖可変配列を含む抗体）と交差競合する。
指定されたポリペプチドまたはタンパク質「に由来する」ポリペプチドまたはアミノ酸配列は、ポリペプチドの起源を指す。好ましくは、特定の配列に由来するポリペプチドまたはアミノ酸配列は、その配列またはその一部分と本質的に同一であるアミノ酸配列を有し、その部分は、少なくとも１０～２０個のアミノ酸、好ましくは少なくとも２０～３０個のアミノ酸、より好ましくは少なくとも３０～５０個のアミノ酸からなるか、またはそうでなければ、配列にその起源を有するとして当業者に識別可能である。別のペプチドに由来するポリペプチドは、出発ポリペプチドに対して１つまたは複数の突然変異、例えば、別のアミノ酸残基で置換された、または１つもしくは複数のアミノ酸残基の挿入もしくは欠失を有する１つまたは複数のアミノ酸残基を有し得る。
ポリペプチドは、天然に生じないアミノ酸配列を含むことができる。このような変異体は、必然的に出発分子と１００％未満の配列同一性または類似性を有する。ある特定の実施形態では、変異体は、出発ポリペプチドのアミノ酸配列と、例えば、変異分子の長さにわたって、約７５％から１００％未満の、より好ましくは約８０％から約１００％未満、より好ましくは約８５％から１００％未満、より好ましくは約９０％から１００％未満（例えば、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）、そして最も好ましくは約９５％から１００％未満のアミノ酸配列同一性または類似性のアミノ酸配列を有するだろう。
ある特定の実施形態では、出発ポリペプチド配列及びそれに由来する配列との間に１個のアミノ酸の差異がある。この配列に関する同一性または類似性は、本明細書において、これらの配列をアライメントし、必要に応じてギャップを導入して、最大パーセント配列同一性を達成した後の、出発アミノ酸残基と同一（すなわち、同じ残基）である候補配列中のアミノ酸残基の割合（％）と定義される。ある特定の実施形態では、ポリペプチドは、表１に記載の配列から選択されるアミノ酸配列からなる、から本質的になる、またはそれを含む。ある特定の実施形態では、ポリペプチドは、表１に記載の配列から選択されたアミノ酸配列に、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、ポリペプチドは、表１に記載の配列から選択された連続するアミノ酸配列に、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％同一である連続したアミノ酸配列を含む。ある特定の実施形態では、ポリペプチドは、表１に記載の配列から選択されたアミノ酸配列の少なくとも１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、２００、３００、４００、または５００（またはこれらの数値内の任意の整数）の連続したアミノ酸を有するアミノ酸配列を含む。
ある特定の実施形態では、本開示の抗体は、ヌクレオチド配列によってコードされる。本発明のヌクレオチド配列は、多くの用途、例えば、クローニング、遺伝子治療、タンパク質発現及び精製、突然変異導入、それを必要とする宿主のＤＮＡワクチン接種、例えば、受動免疫のための抗体生成、ＰＣＲ、プライマー及びプローブの生成などに有用であることができる。ある特定の実施形態では、本発明のヌクレオチド配列は、表１に記載の配列から選択されるヌクレオチド配列を含む、からなる、またはから本質的になる。ある特定の実施形態では、ヌクレオチド配列は、表１に記載の配列から選択されたヌクレオチド配列に、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるヌクレオチド配列を含む。ある特定の実施形態では、ヌクレオチド配列は、表１に記載の配列から選択された連続するヌクレオチド配列に、少なくとも８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％同一である連続したヌクレオチド配列を含む。ある特定の実施形態では、ヌクレオチド配列は、表１に記載の配列から選択されたヌクレオチド配列の少なくとも１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、２００、３００、４００、または５００（またはこれらの数値内の任意の整数）の連続したヌクレオチドを有するヌクレオチド配列を含む。
本明細書に開示の方法における使用に好適な抗体は、天然配列の望ましい活性を保持しつつ、それらが由来する天然に生じるまたは天然配列とは配列が異なるように変更され得ることも当業者は理解するだろう。例えば、「非必須」アミノ酸残基にて保存的置換または変化をもたらすヌクレオチドまたはアミノ酸置換が行われ得る。突然変異は、標準的な技術、例えば部位特異的突然変異誘発及びＰＣＲを介した突然変異誘発によって導入され得る。
本明細書に開示の方法における使用に好適な抗体は、１つまたは複数のアミノ酸残基、例えば、必須または非必須アミノ酸残基にて保存的アミノ酸置換を含み得る。「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されている置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野において定義されており、塩基性側鎖（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、ベータ分岐側鎖（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）及び芳香族側鎖（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が挙げられる。ゆえに、結合ポリペプチド中の非必須アミノ酸残基は、好ましくは、同じ側鎖ファミリー由来の別のアミノ酸残基で置換される。ある特定の実施形態では、一連のアミノ酸は、側鎖ファミリーのメンバーの順序及び／または組成が異なる構造的に類似した連続鎖で置換され得る。あるいは、ある特定の実施形態では、突然変異を、飽和突然変異誘発法などにより、コード配列の全部または一部にわたってランダムに導入し、得られた突然変異体を本発明の結合ポリペプチドに組み入れて、所望の標的に結合するそれらの能力に関してスクリーニングすることができる。
本明細書で使用する場合、抗原「交差提示」という用語は、ＡＰＣ上のＭＨＣクラスＩ及びクラスＩＩ分子を介したＴ細胞への外因性タンパク質抗原の提示を指す。
本明細書で使用する場合、「交差反応する」という用語は、本開示の抗体が異なる種に由来するＣＤ３９に結合する能力を指す。例えば、ヒトＣＤ３９に結合する本開示の抗体はさらに、別の種のＣＤ３９に結合し得る。本明細書で使用する場合、交差反応性は、結合アッセイ（例えば、ＳＰＲ、ＥＬＩＳＡ）における精製抗原との特異的反応性またはＣＤ３９を生理学的に発現する細胞への結合、そうでなければ機能的相互作用の検出によって測定する。交差反応性の決定方法には、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ（商標）２０００ＳＰＲ装置（Ｂｉａｃｏｒｅ ＡＢ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）を使用したＢｉａｃｏｒｅ（商標）表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）分析による本明細書に記載するような標準的な結合アッセイ、またはフローサイトメトリー技術が含まれる。
本明細書で使用する場合、「細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答」という用語は、細胞傷害性Ｔ細胞によって誘導される免疫応答を指す。ＣＴＬ応答は、主にＣＤ８＋Ｔ細胞によって媒介される。
本明細書で使用する場合、「樹状細胞」または「ＤＣ」という用語は、骨髄（ＢＭ）由来の白血球であり、最も強力なタイプの抗原提示細胞である抗原提示細胞のタイプを指す。ＤＣは、抗原を捕捉して処理し、Ｔ細胞によって認識される主要組織適合複合体（ＭＨＣ）分子上に提示されるペプチドにタンパク質を変換する。ＤＣは、不均一であり、例えば骨髄及び形質細胞様ＤＣが挙げられ、全てのＤＣは、抗原の取り込み、処理、及びナイーブＴ細胞への提示が可能であるが、ＤＣサブタイプは別個のマーカーを有し、場所、遊走経路、詳細な免疫機能、及びそれらの生成に関する感染または炎症刺激への依存性が異なる。適応免疫応答の発達中に、ＤＣの表現型及び機能は、寛容、メモリー、及び極性化Ｔヘルパー１（Ｔｈ１）、Ｔｈ２、Ｔｈ１７分化の開始において役割を担う。
本明細書で使用する場合、「樹状細胞活性化」という用語は、未成熟樹状細胞から成熟樹状細胞への移行を指す。そして、活性化された樹状細胞は、成熟樹状細胞及び移行の過程中の樹状細胞を包含し、共刺激シグナルを誘導するＣＤ８０及びＣＤ８６の発現は、活性化刺激によって上昇する。成熟したヒト樹状細胞は、ＣＤ４０、ＣＤ８０、ＣＤ８６、及びＨＬＡクラスＩＩ（例えば、ＨＬＡ－ＤＲ）の発現に関して陽性である細胞である。未成熟樹状細胞は、例えば、ＣＤ８０及びＣＤ８６からなる群から選択されるマーカーに基づいて、成熟樹状細胞と区別することができる。未成熟樹状細胞はこれらのマーカーに関して弱陽性であり、好ましくは陰性であるが、一方で成熟樹状細胞は陽性である。成熟樹状細胞の識別は、当業者によって慣例的に行われており、上記のそれぞれのマーカー及びそれらの発現を測定するための方法も当業者に周知である。
本明細書で使用する場合、「ＥＣ５０」という用語は、最大応答の５０％である、つまり、最大応答及びベースラインの中間である、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏアッセイのいずれかにおいて応答を誘導する抗体またはその抗原結合部分の濃度を指す。
本明細書で使用する場合、「有効用量」または「有効投与量」という用語は、所望の効果を、達成するまたは少なくとも部分的に達成するために十分な量として定義される。「治療有効用量」という用語は、疾患に既に罹患している患者の疾患及びその合併症を、治癒するまたは少なくとも部分的に停止させるために十分な量として定義される。この使用に有効な量は、処置される障害の重症度、及び患者自身の免疫系の全体状態に依存するだろう。
本明細書で使用する場合、「エピトープ」または「抗原決定基」という用語は、免疫グロブリンまたは抗体が特異的に結合する抗原上の部位を指す。「エピトープマッピング」という用語は、その標的タンパク質抗原上の、抗体またはその抗原結合フラグメントの結合部位、つまりエピトープを同定するプロセスまたは方法を指す。エピトープマッピングの方法及び技術を本明細書に提供する。エピトープは、連続アミノ酸、及びタンパク質の３次折り畳みによって並置した非連続アミノ酸の両方から形成することができる。連続アミノ酸から形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒への曝露で保持され、一方で３次折り畳みによって形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒を用いた処理で失われる。エピトープは、典型的には、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４または１５個のアミノ酸を固有の空間構造にて含む。所与の抗体がどのエピトープに結合するかを決定する方法（すなわち、エピトープマッピング）は、当該技術分野で周知であり、例えば、免疫ブロット法及び免疫沈降アッセイが含まれ、この場合、ＣＤ３９からの重複または連続ペプチドを、所与の抗ＣＤ３９抗体との反応性に関して試験する。エピトープの空間構造を決定する方法には、当該技術分野における技術及び本明細書に記載する技術、例えば、Ｘ線結晶学及び２次元核磁気共鳴を含む（例えば、Ｅｐｉｔｏｐｅ Ｍａｐｐｉｎｇ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．６６，Ｇ．Ｅ．Ｍｏｒｒｉｓ，Ｅｄ．（１９９６）を参照されたい）。
また、本開示は、本明細書に記載の特定の抗体によって認識されるエピトープの全てまたは一部（例えば、同じもしくは重複領域または領域間の領域もしくは領域にまたがる領域）を含むＣＤ３９上のエピトープに結合する抗体を包含する。
本開示は、同じエピトープに結合する抗体及び／または本明細書に記載の抗体とヒトＣＤ３９への結合をめぐって競合する抗体も包含する。同じエピトープを認識する、または結合をめぐって競合する抗体は、通常の技術を使用して同定できる。そのような技術には、例えば、ある抗体が別の抗体の標的抗原への結合を遮断する能力を示すイムノアッセイ、すなわち競合結合アッセイが含まれる。競合結合は、試験中の免疫グロブリンがＣＤ３９などの共通の抗原に対する参照抗体の特異的結合を阻害するアッセイにて決定される。多くの種類の競合結合アッセイが公知であり、例えば、固相直接または間接ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、固相直接または間接酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）、サンドイッチ競合アッセイ（Ｓｔａｈｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ９：２４２（１９８３）を参照されたい）、固相直接ビオチン－アビジンＥＩＡ（Ｋｉｒｋｌａｎｄ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３７：３６１４（１９８６）を参照されたい）、固相直接標識アッセイ、固相直接標識サンドイッチアッセイ（Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ（１９８８））を参照されたい）、Ｉ－１２５標識を使用した固相直接標識ＲＩＡ（Ｍｏｒｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２５（１）：７（１９８８）を参照されたい）、固相直接ビオチン－アビジンＥＩＡ（Ｃｈｅｕｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １７６：５４６（１９９０））、及び直接標識ＲＩＡ（Ｍｏｌｄｅｎｈａｕｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃａｎｄ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．３２：７７（１９９０））である。典型的には、このようなアッセイは、非標識試験免疫グロブリン及び標識参照免疫グロブリンのいずれかを担持する固体表面または細胞に結合する精製抗原の使用を伴う。競合阻害は、試験免疫グロブリンの存在下で、固体表面または細胞に結合する標識の量を決定することによって測定する。通常、試験免疫グロブリンは過剰に存在する。通常、競合抗体が過剰に存在する場合、それは共通の抗原への参照抗体の特異的結合を少なくとも５０～５５％、５５～６０％、６０～６５％、６５～７０％、７０～７５％以上阻害するだろう。
他の技術には、例えば、エピトープマッピング法、例えば、エピトープの原子分解能を提供する抗原：抗体複合体の結晶のＸ線分析、ならびに抗原：抗体相互作用の立体構造及び動力学を試験する水素／重水素（Ｈ／Ｄ）交換と組み合わせた質量分析が含まれる。他の方法は、抗体の抗原フラグメントまたは抗原の突然変異させた変異体への結合をモニターし、ここでは、抗原配列内のアミノ酸残基の修飾に起因する結合の消失がエピトープ構成成分の指標であるとしばしばみなされる。加えて、エピトープマッピングのために計算論的なコンビナトリアル法も使用できる。これらの方法は、コンビナトリアルファージディスプレイペプチドライブラリから特定の短いペプチドを親和性単離する目的の抗体の能力に依存する。次に、ペプチドは、ペプチドライブラリをスクリーニングするために用いられる抗体に対応するエピトープの定義のための手掛かりと見なされる。エピトープマッピングに関しては、立体構造的に不連続なエピトープをマッピングすることが示されている計算アルゴリズムも開発されている。
本明細書で使用する場合、「Ｆｃ媒介エフェクター機能」または「Ｆｃエフェクター機能」という用語は、抗体の主要な機能及び目的以外の抗体の生物学的活性を指す。例えば、治療横断的（ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ａｇｎｏｓｔｉｃ）抗体のエフェクター機能は、標的タンパク質または経路の活性化以外の生物学的活性である。抗体のエフェクト機能の例としては、Ｃ１ｑ結合及び補体依存性細胞傷害性、Ｆｃ受容体結合、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）、ファゴサイトーシス、細胞表面受容体（例えば、Ｂ細胞受容体）の下方制御、Ｆｃ受容体を発現する血小板の活性化の欠如、ならびにＢ細胞活性化が挙げられる。多くのエフェクター機能は、Ｆｃγ受容体へのＦｃ結合で開始する。一部の実施形態では、腫瘍抗原標的化抗体は、エフェクター機能、例えば、ＡＤＣＣ活性を有する。一部の実施形態では、本明細書に記載の腫瘍抗原標的化抗体は、非修飾形態の定常領域と比較してエフェクター機能が増加した（例えば、ＡＤＣＣを媒介する能力が増加した）変異した定常領域を含む。
本明細書で使用する場合、「Ｆｃ受容体」という用語は、抗体のＦｃ領域によって結合される、免疫エフェクター細胞の表面上に見出されるポリペプチドを指す。一部の実施形態では、Ｆｃ受容体はＦｃγ受容体である。Ｆｃγ受容体には、ＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）、ＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）及びＦγｃＲＩＩＩ（ＣＤ１６）の３つのサブクラスがある。全ての４つのＩｇＧアイソタイプ（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４）は、Ｆｃ受容体のＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩＡ及びＦｃγＲＩＩＩＡと結合し、活性化する。ＦＣγＲＩＩＢは、阻害性受容体であり、それゆえこの受容体に結合する抗体は、補体及び細胞応答を活性化しない。ＦＣγＲＩは、ＩｇＧに単量体形態で結合する高親和性受容体であり、一方で、ＦｃγＲＩＩＡ及びＦｃγＲＩＩＡは、多量体形態でのみＩｇＧに結合し、わずかに低い親和性を有する、低親和性受容体である。Ｆｃ受容体及び／またはＣ１ｑへの抗体の結合は、Ｆｃ領域内の特定の残基またはドメインによって管理される。結合は、抗体のヒンジ領域内及びＣＨ２部分内に位置する残基にも依存する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体の作動性及び／または治療活性は、Ｆｃ受容体（例えば、ＦｃγＲ）へのＦｃ領域の結合に依存する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体の作動性及び／または治療活性は、Ｆｃ受容体（例えば、ＦｃγＲ）へのＦｃ領域の結合により増強される。
本明細書で使用する場合、「ヒト抗体」という用語は、ヒト生殖細胞免疫グロブリン配列の可変領域及び定常領域（存在する場合）を有する抗体を含む。本開示のヒト抗体は、ヒト生殖細胞免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基（例えば、ｉｎ ｖｉｔｒｏでのランダムもしくは部位特異的突然変異誘発によって、またはｉｎ ｖｉｖｏでの体細胞突然変異によって導入された突然変異）を含むことができる（例えば、Ｌｏｎｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ．，（１９９４）Ｎａｔｕｒｅ ３６８（６４７４）：８５６－８５９）；Ｌｏｎｂｅｒｇ，（１９９４）Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ １１３：４９－１０１；Ｌｏｎｂｅｒｇ＆Ｈｕｓｚａｒ，（１９９５）Ｉｎｔｅｒｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３：６５－９３、及びＨａｒｄｉｎｇ＆Ｌｏｎｂｅｒｇ，（１９９５）Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．７６４：５３６－５４６を参照されたい）。しかしながら、「ヒト抗体」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞に由来するＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列に移植されている抗体（すなわち、ヒト化抗体）を含まない。
本明細書で使用する場合、「異種抗体」という用語は、そのような抗体を産生するトランスジェニック非ヒト生物に関連して定義される。本用語は、トランスジェニック非ヒト動物からならない生物に見られるものに相当するアミノ酸配列またはコーディング核酸配列を有し、一般的にはトランスジェニック非ヒト動物の種以外の種を由来とする抗体を指す。
「免疫応答の誘導」及び「免疫応答の増強」という用語は、互換可能に使用され、特定の抗原に対する免疫応答（すなわち、受動的または適応的）の刺激を指す。ＣＤＣまたはＡＤＣＣを誘導することに関して使用される「誘導する」という用語は、特定の直接的な細胞殺滅機序の刺激を指す。
本明細書で使用する場合、「免疫原性細胞死」という（あるいは「免疫原性アポトーシス」としても知られる、用語は、腫瘍細胞と、化学的、生物学的、または薬理学的作用物質との接触が、腫瘍細胞の免疫原性の増加及び免疫原性様式での（例えば、食作用による）腫瘍細胞の死をもたらす、腫瘍細胞からのダメージ関連分子パターン（ＤＡＭＰ）分子（例えば、アデノシン三リン酸、ＡＴＰ）の死亡前発現及び放出を誘導する１つまたは複数のシグナル伝達経路の活性化に関連する細胞死様式を指す。ＩＣＤは、小胞体（ＥＲ）ストレスを誘導する細胞死の一形態であり、細胞表面の組成の変化、ならびに瀕死細胞の免疫原性可能性を高めるＤＡＭＰの放出を伴う。ＤＡＭＰには、カルレティキュリン、熱ショックタンパク質、分泌型アンフォテリン（ＨＭＧＢ１）、及びＡＴＰが含まれる。ＩＣＤ誘導に続いて、カルレティキュリンは、瀕死細胞の表面に移動し、そこで専門食細胞に対する「私を食べて」信号として機能する。ＨＳＰ７０及びＨＳＰ９０も、原形質膜に移動し、そこで抗原提示細胞（ＡＰＣ）と相互作用し、腫瘍抗原とＭＨＣクラスＩ分子の交差提示を促進し、ＣＤ８＋Ｔ細胞応答を引き起こす。ＨＭＧＢ１は、細胞外空間へと放出され、ここでＡＰＣ上のトール様受容体に結合し、Ｔ細胞への樹状細胞（専門ＡＰＣ）による腫瘍抗原の提示を促進する。ＡＴＰ分泌は、単球を細胞死の部位に動員する。腫瘍またはがん細胞のＩＣＤに関連する変化は、対象における樹状細胞の活性化、成熟及び抗原提示の強化、ならびに特定のＴ細胞応答の活性化を通して、効果的な抗腫瘍免疫応答を誘導できる。
本明細書で使用する場合、「免疫原性細胞死誘導剤」という用語は、免疫原性細胞死プロセス、経路、または様式を誘導する化学的、生物学的、または薬理学的作用物質を指す。
本明細書で使用する場合、治療的処置に関連して使用される「組み合わせて」という用語は、２つ（またはそれ以上）の異なる処置、例えば、２つ（またはそれ以上）の治療剤が、障害に罹患している経過中に、ある時点で患者に対する処置の効果が重なるように、対象に送達されることを意味すると理解される。ある特定の実施形態では、ある処置の送達は、他の処置の送達が始まる前に終了する（例えば、第一の処置は、第二または第三（後続）の処置の前である）。ある特定の他の実施形態では、ある処置の送達は、第二の送達の開始時にまだ生じており、それゆえ、投与に関して重複がある。これは、本明細書において「同時」または「同時並行送達」と称する場合がある。ある特定の実施形態では、併用療法の送達に際した、症状または障害に関連する他のパラメータの低下は、他方の不在下で送達される一処置で観察され得るものよりも大きい。
本明細書で使用する場合、「阻害する」または「遮断する」という用語（例えば、ヌクレオシド三リン酸（例えば、アデノシン三リン酸、ＡＴＰ）またはヌクレオシド二リン酸（例えば、アデノシン二リン酸、ＡＤＰ）からヌクレオシド一リン酸（例えば、アデノシン一リン酸、ＡＭＰ）へのヒトＣＤ３９が媒介する変換の阻害／遮断に言及する）は、互換可能に使用され、部分的及び完全な阻害／遮断の両方を含む。ＣＤ３９の阻害／遮断は、阻害または遮断を伴わない場合に生じる正常レベルまたはタイプの活性を低下または変化させる。阻害及び遮断はまた、抗ＣＤ３９抗体と接触していないＣＤ３９と比較して、抗ＣＤ３９抗体と接触している場合のＣＤ３９の結合親和性における任意の測定可能な低減を含むことを意図し、例えば、ＣＤ３９の結合を少なくとも約１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％阻害する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、ヌクレオシド三リン酸（例えば、ＡＴＰ）の変換を少なくとも約７０％阻害する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、ヌクレオシド三リン酸（例えば、ＡＴＰ）の変換を少なくとも８０％阻害する。
本明細書で使用する場合、「増殖を阻害する」（例えば、細胞に言及する）という用語は、細胞の増殖における任意の測定可能な低減、例えば、細胞の増殖の少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９９％、または１００％の阻害を含むことを意図する。
本明細書で使用する場合、「予防が必要」、「処置が必要」、または「それが必要」である対象は、適切な医療従事者（例えば、ヒトの場合は、医師、看護師、またはナース・プラクティショナー、非ヒト哺乳動物の場合は、獣医師）の判断により、所与の処置（例えば、抗ＣＤ３９抗体を含む組成物を用いた処置）から合理的に利益を得るだろうものを指す。
「ｉｎ ｖｉｖｏ」という用語は、生体内で生じるプロセスを指す。
本明細書で使用する場合、「単離された抗体」という用語は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指すことが意図される（例えば、ヒトＣＤ３９に結合する単離された抗体は、ＣＤ３９以外の抗原と結合する抗体を実質的に含まない）。しかしながら、エピトープに結合する単離された抗体は、異なる種に由来する他のＣＤ３９タンパク質に対する交差反応性を有し得る。しかしながら、抗体は、本明細書に記載するような特異的結合アッセイにおいて、ヒトＣＤ３９への特異的結合を提示し続ける。加えて、単離された抗体は、典型的には、他の細胞物質及び／または化学物質を実質的に含まない。一部の実施形態では、異なるＣＤ３９特異性を有する「単離された」抗体の組み合わせは、十分に定義された組成にて組み合わされる。
本明細書で使用する場合、「単離された核酸分子」という用語は、ＣＤ３９に結合する抗体または抗体部分（例えば、ＶＨ、ＶＬ、ＣＤＲ３）をコードする核酸を指し、抗体または抗体部分をコードするヌクレオチド配列が、ＣＤ３９以外の抗原に結合する抗体または抗体部分をコードする他のヌクレオチド配列を含まず、他の配列は、ヒトゲノムＤＮＡ中の核酸に自然に隣接し得る、核酸分子を指すと意図される。例えば、表１に記載の配列から選択される配列は、本明細書に記載される抗ＣＤ３９抗体抗体の重鎖（ＶＨ）及び軽鎖（ＶＬ）可変領域を含むヌクレオチド配列に対応する。
本明細書で使用する場合、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス（例えば、ＩｇＭまたはＩｇＧ１）を指す。一部の実施形態では、本開示のヒト抗体は、ＩｇＧ１アイソタイプのものである。一部の実施形態では、本開示のヒト抗体は、ＩｇＧ２アイソタイプのものである。一部の実施形態では、本開示のヒト抗体は、ＩｇＧ３アイソタイプのものである。一部の実施形態では、本開示のヒト抗体は、ＩｇＧ４アイソタイプのものである。一部の実施形態では、アイソタイプは野生型である。一部の実施形態では、アイソタイプは突然変異型である。本明細書で使用する場合、「Ａ」指定を有する抗体は、ＥＵナンバリングに従い、Ｓ２２８Ｐ突然変異を含むＩｇＧ４アイソタイプを有する。本明細書で使用する場合、「Ｂ」指定を有する抗体は、ＥＵナンバリングに従い、Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５Ｅ突然変異を含むＩｇＧ４アイソタイプを有する。本明細書で使用する場合、「Ｃ」指定を有する抗体は、「Ｃ」指定を有し、野生型ＩｇＧ１アイソタイプを有する。本明細書で使用する場合、「Ｄ」指定を有する抗体は、野生型ＩｇＧ４アイソタイプを有する。例えば、Ｖｉｄａｒｓｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｆｒｏｎｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ．（２０１４），５：５２０、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれ、Ｓ２２８Ｐ ＩｇＧ４突然変異の記載については、６頁、２列目、最初の段落全体を参照されたい。例えば、Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５Ｅ ＩｇＧ４突然変異の記載については、Ｎｅｗｍａｎ ｅｔ ａｌ．Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ．（２００１）９８（２）：１６４－１７４を参照されたく、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用する場合、「アイソタイプスイッチング」という用語は、抗体のクラスまたはアイソタイプが、１つのＩｇクラスから他のＩｇクラスの１つに変化する現象を指す。
本明細書で使用する場合、「ＫＤ」または「ＫＤ」という用語は、抗体及び抗原間の結合反応の平衡解離定数を指す。ＫＤの値は、抗体の会合速度定数（ｋａ）に対する抗体の解離速度定数（ｋｄ）の比率を数値で表したものである。ＫＤの値は、抗原に対する抗体の結合親和性に反比例する。ＫＤ値が小さいほど、その抗原に対する抗体の親和性が高くなる。親和性は、単一分子のそのリガンドに対する結合の強度であり、典型的には、平衡解離定数（ＫＤ）によって測定及び報告され、この平衡解離定数を使用して、二分子間相互作用の強度を評価し、順位決定する。
本明細書で使用する場合、「ｋｄ」または「ｋｄ」（あるいは「ｋｏｆｆ」または「ｋｏｆｆ」）という用語は、抗体／抗原複合体からの抗体の解離の解離速度定数を指すことを意図する。ｋｄの値は、１秒あたりに減衰または解離する複合体の割合を数値で表したものであり、秒－１の単位で表される。
本明細書で使用する場合、「ｋａ」または「ｋａ」（あるいは「ｋｏｎ」または「ｋｏｎ」）という用語は、抗原と抗体の会合の会合速度定数を指すことを意図する。ｋａの値は、１モル（１Ｍ）溶液の抗体及び抗原において１秒あたりに形成される抗体／抗原複合体の数を数値で表したものであり、Ｍ－１秒－１の単位で表される。
本明細書で使用する場合、「白血球」という用語は、感染性生物及び異物から身体を防御することに関与する白血球細胞の一種を指す。白血球は、骨髄にて産生される。白血球細胞には、５つの主要な種類があり、２つの主要な群：多形核白血球（好中球、好酸球、好塩基球）及び単核白血球（単球及びリンパ球）に分類される。
本明細書で使用する場合、「リンパ球」という用語は、身体の免疫防御に関与する白血球または白血球細胞の一種を指す。リンパ球には、２つの主要な種類：Ｂ細胞及びＴ細胞がある。
本明細書で使用する場合、「連結した」、「融合した」、または「融合」という用語は、互換可能に使用される。これらの用語は、化学的コンジュゲーションまたは組換え手段を含む任意の手段によって、２つ以上の要素または構成要素またはドメインを１つに結合することを指す。（例えば、ヘテロ二官能性架橋剤を使用する）化学的コンジュゲーションの方法は、当該技術分野で公知である。
本明細書で使用する場合、「局所投与」または「局所送達」は、血管系を介したその意図された標的組織または部位への組成物または作用物質の輸送に依存しない送達を指す。例えば、組成物は、組成物もしくは作用物質の注射もしくは移植によって、または組成物もしくは作用物質を含有するデバイスの注射もしくは移植によって送達され得る。標的組織または部位の近傍への局所投与に続いて、組成物もしくは作用物質、またはその１つもしくは複数の成分は、意図された標的組織または部位へと拡散し得る。
本明細書で使用する場合、「ＭＨＣ分子」は、２つのタイプの分子、ＭＨＣクラスＩ及びＭＨＣクラスＩＩを指す。ＭＨＣクラスＩ分子は特定のＣＤ８＋Ｔ細胞に抗原を提示し、ＭＨＣクラスＩＩ分子は特定のＣＤ４＋Ｔ細胞に抗原を提示する。ＡＰＣに外因的に送達された抗原は、主にＭＨＣクラスＩＩと会合するためにプロセシングされる。対照的に、ＡＰＣに内因的に送達された抗原は、主にＭＨＣクラスＩと会合するためにプロセシングされる。
本明細書で使用する場合、「モノクローナル抗体」という用語は、特定のエピトープに対して単一結合特異性及び親和性を示す抗体を指す。従って、「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、単一の結合特異性を示し、ヒト生殖細胞免疫グロブリン配列に由来する可変及び任意の定常領域を有する抗体を指す。一部の実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞に融合されたヒト重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する、トランスジェニック非ヒト動物、例えば、トランスジェニックマウスから得られたＢ細胞を含むハイブリドーマによって産生される。
本明細書で使用する場合、「単球」という用語は、白血球の一種を指し、マクロファージ及び樹状細胞に分化して免疫応答をもたらすことができる。
本明細書で使用する場合、「ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞」という用語は、細胞傷害性リンパ球の一種を指す。これらは大きく、通常は顆粒状で、非Ｔリンパ球、非Ｂリンパ球であり、ある特定の腫瘍細胞を殺滅し、ウイルス及び他の細胞内病原体に対する自然免疫において、ならびに抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）において重要である。
本明細書で使用する場合、「天然に生じる」という用語は、ある対象物に適用される場合、対象物を天然に見出すことができるという事実を指す。例えば、（ウイルスを含む）生物中に存在し、天然の源から単離でき、研究室で人為的に改変されていないポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列は天然に生じるものである。
本明細書で使用する場合、「非スイッチングアイソタイプ」は、アイソタイプスイッチングが生じない場合に生産される重鎖のアイソタイプクラスを指し、非スイッチングアイソタイプをコードするＣＨ遺伝子は典型的には、機能的再編成の起きるＶＤＪ遺伝子のすぐ下流にある１番目のＣＨ遺伝子である。アイソタイプスイッチングは、古典的または非古典的なアイソタイプスイッチングに分類される。古典的なアイソタイプスイッチングは、導入遺伝子中の少なくとも１つのスイッチ配列領域が関与する組換え事象によって生じる。非古典的なアイソタイプスイッチングは、例えば、ヒトσμ及びヒトΣμ間の相同的組換え（δ関連欠失）によって生じ得る。中でも、導入遺伝子間及び／または染色体間での組換えなどの代替的な非古典的なスイッチング機序が生じて、アイソタイプスイッチングにつながることもある。
本明細書で使用する場合、「核酸」という用語は、一本鎖または二本鎖形のいずれかのデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド及びそれらのポリマーを指す。特に限定しない限り、本用語は、参照核酸と同様の結合特性を有し、天然に生じるヌクレオチドと同様の様式で代謝される、天然ヌクレオチドの公知の類似体を含有する核酸を包含する。別段の指定がない限り、特定の核酸配列は、保存的に修飾されたその変異体（例えば、縮重コドン置換）及び相補的配列ならびに明示された配列も暗黙のうちに包含する。具体的には、縮重コドン置換は、１つまたは複数の選択された（または全ての）コドンの第三位が、混合塩基及び／またはデオキシイノシン残基で置換された配列を生成することによって達成することができる（Ｂａｔｚｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９：５０８１，１９９１；Ｏｈｔｓｕｋａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６０：２６０５－２６０８，１９８５；及びＣａｓｓｏｌ ｅｔ ａｌ，１９９２；Ｒｏｓｓｏｌｉｎｉ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ ８：９１－９８，１９９４）。アルギニン及びロイシンに関しては、第二の塩基での修飾も保存的であることができる。核酸という用語は、遺伝子、ｃＤＮＡ、及び遺伝子によってコードされるｍＲＮＡと互換可能に使用される。
本明細書で使用するポリヌクレオチドは、任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデオキシリボヌクレオチドで構成することができ、それらは非修飾ＲＮＡもしくはＤＮＡまたは修飾ＲＮＡもしくはＤＮＡであり得る。例えば、ポリヌクレオチドは、一本鎖ＤＮＡ、二本鎖ＤＮＡ、一本鎖領域及び二本鎖領域の混合物であるＤＮＡ、一本鎖ＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ、ならびに一本鎖領域及び二本鎖領域の混合物であるＲＮＡ、一本鎖またはより典型的には二本鎖であるもしくは一本鎖領域及び二本鎖領域の混合物であることができるＤＮＡ及びＲＮＡを含むハイブリッド分子から構成され得る。加えて、ポリヌクレオチドは、ＲＮＡもしくはＤＮＡ、またはＲＮＡ及びＤＮＡの両方を含む三本鎖領域から構成され得る。ポリヌクレオチドはまた、安定性または他の理由のために修飾された１つまたは複数の修飾された塩基またはＤＮＡもしくはＲＮＡ骨格を含有することができる。「修飾された」塩基には、例えば、トリチル化された塩基及びイノシンなどの微量塩基が含まれる。ＤＮＡ及びＲＮＡに様々な修飾を行うことができ、ゆえに、「ポリヌクレオチド」は、化学的、酵素的、または代謝的に修飾された形態を包含する。
核酸は、それが別の核酸配列と機能的な関係性に置かれるとき、「作動可能に連結」している。例えば、プロモータまたはエンハンサは、それがコード配列の転写に影響を及ぼす場合、そのコード配列に作動可能に連結している。転写制御配列に関する場合、作動可能に連結したとは、連結しているＤＮＡ配列が連続していることを意味し、２つのタンパク質コーディング領域を接合する必要がある場合には、連続し、リーディングフレーム内にあることを意味する。スイッチ配列に関しては、作動可能に連結したとは、当該配列がスイッチ組換えをもたらすことができることを指す。
本明細書で使用する場合、「非経口投与」、「非経口的に投与する」、及び他の文法的に等しい語句は、経腸及び局所投与以外の投与様式を指し、通常、注射によるものであり、限定されないが、静脈内、鼻腔内、眼内、筋肉内、動脈内、髄腔内、被膜内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、くも膜下、脊髄内、硬膜外、脳内、頭蓋内、頸動脈内及び胸骨内注射及び注入を含む。
本明細書で使用する場合、「患者」という用語は、「対象」及び「個体」と互換可能に使用され、予防的または治療的処置のいずれかを受けるヒト及び他の哺乳動物対象を含む。
本明細書で使用する場合、「ＰＤ－１アンタゴニスト」という用語は、ＰＤ－１シグナル伝達経路を阻害するか、さもなければ細胞（例えば、免疫細胞）におけるＰＤ－１機能を阻害する任意の化学化合物または生体分子を指す。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への及び／またはＰＤ－Ｌ２のＰＤ－１への結合を遮断する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１と結合する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１と結合する。
２つ以上の核酸またはポリペプチドの配列の文脈における、「パーセント同一性」という用語は、下記の配列比較アルゴリズム（例えば、ＢＬＡＳＴＰ及びＢＬＡＳＴＮまたは当業者に利用可能な他のアルゴリズム）の１つを用いて、または目視検査によって測定されるような、最大一致について比較及びアライメントしたときに、同一である特定の割合（％）のヌクレオチドまたはアミノ酸残基を有する２つ以上の配列または部分配列を指す。適用に応じて、「パーセント同一性」は、比較される配列のある領域にわたって、例えば、機能性ドメインにわたって存在し得る、あるいは比較される２つの配列の全長にわたって存在する。配列比較に関して、典型的には、一方の配列は、試験配列を比較する参照配列として役割を担う。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験配列及び参照配列をコンピュータにインプットし、必要であれば部分配列座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。次に、配列比較アルゴリズムが、指定されたプログラムパラメータに基づいて試験配列（複数可）の参照配列に対するパーセント配列同一性を算出する。
比較のための配列の最適なアライメントは、例えば、Ｓｍｉｔｈ＆Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２（１９８１）の局所的相同性アルゴリズムによって、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ＆Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３（１９７０）の相同性アライメントアルゴリズムによって、Ｐｅａｒｓｏｎ＆Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：２４４４（１９８８）の類似性検索法よって、これらのアルゴリズム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．のＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、及びＴＦＡＳＴＡ）のコンピュータ化実装によって、または目視検査（一般的に、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，下記を参照されたい）によって、行うことができる。
パーセント配列同一性及び配列類似性を決定するために適したアルゴリズムの一例は、ＢＬＡＳＴアルゴリズムであり、これは、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－４１０（１９９０）に記載されている。ＢＬＡＳＴ分析を行うためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎのウェブサイトを通して、公開されている。
一般的に本明細書で使用する場合、「医薬的に許容可能」とは、安全な医学的判断の範囲内にあり、ヒト及び動物の組織、臓器、及び／または体液と接触させて使用するのに好適な、過度の毒性、刺激、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症を伴わない、妥当な利益／リスク比に見合う、化合物、物質、組成物及び／または剤形を指す。
本明細書で使用する場合、「医薬的に許容可能な担体」は、生理学的に適合性のある、あらゆる及び全ての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤ならびに吸収遅延剤などを指し、含む。組成物は、医薬的に許容可能な塩、例えば、酸付加塩または塩基付加塩を含むことができる（例えば、Ｂｅｒｇｅ ｅｔ ａｌ．（１９７７）Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ ６６：１－１９を参照されたい）。
本明細書で使用する場合、「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語は、互換可能に使用され、アミノ酸残基のポリマーを指す。これらの用語は、１つまたは複数のアミノ酸残基が、対応する天然に生じるアミノ酸の人工的な化学的模倣体であるアミノ酸ポリマー、ならびに天然に生じるアミノ酸ポリマー及び非天然に生じるアミノ酸ポリマーに適用される。
本明細書で使用する場合、状態に関して使用される場合の「予防する」という用語は、組成物を受けない対象に比べて、対象における医学的状態の症状の頻度を低下する、または発症を遅延させる組成物の投与を指す。
本明細書で使用する場合、本明細書に記載のタンパク質（抗体またはフラグメント）のいずれかに適用される「精製」または「単離」という用語は、それに天然に付随する成分（例えば、タンパク質または他の天然に生じる生体分子もしくは有機分子）、例えば、他のタンパク質、脂質、及びタンパク質を発現する原核生物の核酸から、分離または精製されているポリペプチドを指す。典型的には、ポリペプチドが試料中の総タンパク質の、少なくとも６０（例えば、少なくとも６５、７０、７５、８０、８５、９０、９２、９５、９７、または９９）重量％を構成するとき、ポリペプチドは精製されている。
本明細書で使用する場合、「プログラムされた細胞死タンパク質１」または「ＰＤ－１」という用語は、ＣＤ２８ファミリーに属する免疫阻害性受容体である、プログラムされた細胞死タンパク質１ポリペプチドを指し、ヒトではＰＤＣＤ１遺伝子によってコードされる。ＰＤ－１の別名または同義語には、ＰＤＣＤ１、ＰＤ１、ＣＤ２７９及びＳＬＥＢ２が含まれる。ＰＤ－１は、ｉｎ ｖｉｖｏでは、前もって活性化されたＴ細胞、Ｂ細胞、骨髄細胞に主に発現し、２つのリガンドであるＰＤ－Ｌ１及びＰＤ－Ｌ２に結合する。本明細書で使用する場合、「ＰＤ－１」という用語は、ヒトＰＤ－１（ｈＰＤ－１）、ｈＰＤ－１の変異体、アイソフォーム、及び種ホモログ、ならびにｈＰＤ－１と少なくとも１つの共通のエピトープを有する類似体を含む。完全なｈＰＤ－１配列は、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＡＣ５１７７３に見出すことができる。
本明細書で使用する場合、「プログラムされた死リガンド－１」または「ＰＤ－Ｌ１」という用語は、ＰＤ－１に対する２つの細胞表面糖タンパク質リガンドの１つ（他方は、ＰＤ－Ｌ２）であり、ＰＤ－１への結合の際に、Ｔ細胞の活性化及びサイトカイン分泌を下方制御する。ＰＤ－Ｌ１の別名及び同義語には、ＰＤＣＤ１Ｌ１、ＰＤＬ１、Ｂ７Ｈ１、Ｂ７－４、ＣＤ２７４及びＢ７－Ｈが含まれる。本明細書で使用する場合、「ＰＤ－Ｌ１」という用語は、ヒトＰＤ－Ｌ１（ｈＰＤ－Ｌ１）、ｈＰＤ－Ｌ１の変異体、アイソフォーム、及び種ホモログ、ならびにｈＰＤ－Ｌ１と少なくとも１つの共通エピトープを有する類似体を含む。完全なｈＰＤ－Ｌ１配列は、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号Ｑ９ＮＺＱ７に見出すことができる。
ＰＤ－１は、ＴＣＲシグナルを負に制御する免疫阻害性タンパク質として知られている（Ｉｓｈｉｄａ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．（１９９２）ＥＭＢＯ Ｊ．１１：３８８７－３８９５；Ｂｌａｎｋ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．（Ｅｐｕｂ ２００６ Ｄｅｃ．２９）Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．５６（５）：７３９－７４５）。ＰＤ－１及びＰＤ－Ｌ１間の相互作用は、免疫チェックポイントとして機能することができ、これによりＴ細胞受容体を介した増殖の低減をもたらすことができる（Ｄｏｎｇ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｍｅｄ．８１：２８１－７；Ｂｌａｎｋ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．５４：３０７－３１４；Ｋｏｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．（２００４）Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１０：５０９４－１００）。ＰＤ－１とＰＤ－Ｌ１またはＰＤ－Ｌ２との局所的な相互作用を阻害することにより、免疫抑制を逆転させることができ、ＰＤ－１とＰＤ－Ｌ２の相互作用も同様に遮断される場合、その効果は相加的である（Ｉｗａｉ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９９：１２２９３－７；Ｂｒｏｗｎ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７０：１２５７－６６）。
いくつかのがんに関しては、腫瘍の生存及び増殖は、腫瘍を介した免疫チェックポイントの調節によって維持される。この調節は、抗がん免疫系機能の破壊をもたらし得る。例えば、最近の研究では、腫瘍細胞によるＰＤ－Ｌ１やＰＤ－Ｌ２などの免疫チェックポイント受容体リガンドの発現が、特にＴ細胞を抑制することにより、腫瘍微小環境における免疫系の活性を下方制御し、がん免疫回避を促進し得ることが示されている。ＰＤ－Ｌ１は、様々なヒトのがんによって多量に発現される（Ｄｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，（２００２）Ｎａｔ Ｍｅｄ ８：７８７－７８９）。ＰＤ－Ｌ１の受容体である、ＰＤ－１は、リンパ球（例えば、活性化Ｔ細胞）上に発現し、通常は、特にＴ細胞の抑制による、免疫系の下方制御及び自己寛容の促進に関与する。しかしながら、Ｔ細胞上で発現するＰＤ－１受容体が腫瘍細胞上の同族ＰＤ－Ｌ１リガンドに結合すると、結果として生じるＴ細胞抑制が、腫瘍に対する免疫応答不全（例えば、腫瘍浸潤リンパ球の低減またはがん細胞による免疫回避の確立）に寄与する。
卵巣癌、腎癌、結腸直腸癌、膵臓癌、肝癌及び黒色腫の大規模な試料セットでは、ＰＤ－Ｌ１の発現が予後不良と相関し、その後の処置に関係なく全生存率を低下することが示された（例えば、Ｄｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，（２００２）Ｎａｔ Ｍｅｄ ８（８）：７９３－８００；Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ．，（２００８）Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ４９（６）：２５１８－２５２５；Ｇｈｅｂｅｈ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｎｅｏｐｌａｓｉａ ８：１９０－１９８；Ｈａｍａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｐｒｏｃ Ｎａｔ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １０４：３３６０－３３６５；Ｔｈｏｍｐｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｃｌｉｎ Ｇｅｎｉｔｏｕｒｉｎ Ｃａｎｃｅｒ ５：２０６－２１１；Ｎｏｍｉ ｅｔ ａｌ．，（２００５）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ １１：２９４７－２９５３；Ｉｎｍａｎ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｃａｎｃｅｒ １０９：１４９９－１５０５；Ｓｈｉｍａｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｉｎｔ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ １２１：２５８５－２５９０；Ｇａｏ ｅｔ ａｌ．，（２００９）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ １５：９７１－９７９；Ｎａｋａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ ５６：１１７３－１１８２；Ｈｉｎｏ ｅｔ ａｌ．，（２０１０）Ｃａｎｃｅｒ １１６（７）：１７５７－１７６６）。同様に、腫瘍リンパ球上のＰＤ－１発現は、乳癌（Ｋｉｔａｎｏ ｅｔ ａｌ．，（２０１７）ＥＳＭＯ Ｏｐｅｎ ２（２）：ｅ０００１５０）及び黒色腫（Ｋｌｅｆｆｅｌ ｅｔ ａｌ．，（２０１５）Ｃｅｌｌ １６２（６）：１２４２－１２５６）において機能不全Ｔ細胞を示すことが見出された。例えば、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１／ＰＤ－Ｌ２シグナル伝達軸の機能に影響を与えるもの、及び／またはＰＤ－１とＰＤ－Ｌ１及び／またはＰＤ－Ｌ２との間の相互作用を妨害するものなどのＰＤ－１アンタゴニストが、開発されており、免疫細胞－腫瘍細胞相互作用の調節を介して機能する新規クラスの抗腫瘍阻害剤を表す。
本明細書で使用する場合、「再編成された」という用語は、Ｖセグメントが、Ｄ－ＪまたはＪセグメントのすぐ隣に位置し、それぞれ完全ＶＨまたはＶＬドメインを本質的にコードする立体構造となっている重鎖または軽鎖免疫グロブリン遺伝子座の立体配置を指す。再編成された免疫グロブリン遺伝子座は、生殖細胞ＤＮＡに比較することによって同定でき、再編成された遺伝子座は少なくとも１つの組換え７量体／９量体相同エレメントを有するだろう。
本明細書で使用する場合、「組換え宿主細胞」（または単に「宿主細胞」）は、組換え発現ベクターが導入されている細胞を指すと意図される。このような用語は、特定の対象細胞だけでなく、このような細胞の後代も指すものと意図されていることが理解されたい。突然変異または環境的影響に起因して、ある特定の修飾が継代に起きる場合があるため、このような後代は実際には親細胞と同一でない可能性があるが、それでもなお、本明細書で用いる場合「宿主細胞」という用語の範囲内に含まれる。
本明細書で使用する場合、「組換えヒト抗体」という用語は、例えば（ａ）ヒト免疫グロブリン遺伝子に関してトランスジェニックもしくはトランスクロモソーマルである動物（例えばマウス）から、またはそれから調製されたハイブリドーマから単離された抗体、（ｂ）抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えばトランスフェクトーマから単離された抗体、（ｃ）組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリから単離された抗体、及び（ｄ）ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のＤＮＡ配列へのスプライシングを伴う何らかの他の手段により調製、発現、作製または単離された抗体など、組換え手段により調製、発現、作製または単離された全てのヒト抗体を含む。そのような組換えヒト抗体は、生殖細胞遺伝子によってコードされる特定のヒト生殖細胞免疫グロブリン配列を利用する可変領域及び定常領域を含むが、例えば、抗体成熟の間に起こるその後の再編成及び突然変異を含む。当該技術分野で知られているように（例えば、Ｌｏｎｂｅｒｇ（２００５）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．２３（９）：１１１７－１１２５）、可変領域は、抗原結合ドメインを含有し、これは、再編成して外来抗原に特異的な抗体を形成する様々な遺伝子によってコードされる。再編成に加えて、可変領域を、複数の単一アミノ酸の変化（体細胞突然変異または超突然変異と称する）によってさらに修飾して、外来抗原に対する抗体の親和性を増加することができる。定常領域は、抗原にさらに応答して変化するだろう（すなわち、アイソタイプスイッチ）。それゆえ、抗原に応答して軽鎖免疫グロブリンポリペプチド及び重鎖免疫グロブリンポリペプチドをコードする再編成された及び体細胞突然変異した核酸分子は、元の核酸分子と配列同一性を持たない可能性があるが、代わりに実質的に同一または類似するだろう（すなわち、少なくとも８０％の同一性を有する）。
本明細書で使用する場合、「参照抗体」（「参照ｍＡｂ」と互換可能に使用される）または「参照抗原結合タンパク質」という用語は、ＣＤ３９上の特定のエピトープに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントを指し、それ自体と１つまたは複数の別個の抗体との関係を確立するために使用され、この関係は、ＣＤ３９上の同じエピトープに対する参照抗体及び１つまたは複数の別個の抗体の結合である。本明細書で使用する場合、本用語は、本明細書に記載のものなどの試験またはアッセイ（例えば、競合結合アッセイ）において競合物質として有用である抗ＣＤ３９抗体を暗示し、アッセイは、同じエピトープに結合する１つまたは複数の別個の抗体の発見、同定または開発に有用である。例示的な参照抗体（ＳＲＦ３６７）の可変重鎖（ＶＨ）及び軽鎖（ＶＬ）アミノ酸配列を表１に提供する（ＶＨ、配列番号３３；ＶＬ、配列番号４３）。
本明細書で使用する場合、「特異的結合」、「選択的結合」、「選択的に結合する」、及び「特異的に結合する」という用語は、所定の抗原上のエピトープに結合する抗体を指す。典型的には、抗体は、組換えヒトＣＤ３９をアナライトとして及び抗体をリガンドとして使用してＢＩＡＣＯＲＥ ２０００機器にて表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）技術により決定した場合に、およそ１０－６Ｍ未満、例えばおよそ１０－７、１０－８Ｍ、１０－９Ｍもしくは１０－１０Ｍ未満またはさらに低い平衡解離定数（ＫＤ）で結合し、所定の抗原に、所定の抗原または密接に関連する抗原以外の非特異的抗原（例えば、ＢＳＡ、カゼイン）に対する結合の親和性より少なくとも２倍大きい親和性で結合する。「抗原を認識する抗体」及び「抗原に特異的な抗体」及び「結合する抗体」という語句は、本明細書では、ＣＤ３９などの「抗原に特異的に結合する抗体」という用語と互換可能に使用される。
本明細書で使用する場合、「スイッチ配列」という用語は、スイッチ組換えを担うＤＮＡ配列を指す。「スイッチドナー」配列は、典型的にはμスイッチ領域であり、スイッチ組換えの際に欠失するコンストラクト領域の５’側（すなわち上流）にあるだろう。「スイッチアクセプター」領域は、欠失することになるコンストラクト領域と、置換定常領域（例えばγ、ε、など）との間にあるだろう。組換えが常に起きるという特定の部位はないため、最終的な遺伝子配列は典型的にはコンストラクトからは予測不能だろう。
本明細書で使用する場合、「対象」という用語は、任意のヒトまたは非ヒト動物を含む。例えば、本発明の方法及び組成物は、免疫障害を有する対象を処置するために使用され得る。「非ヒト動物」という用語は、全ての脊椎動物、例えば、哺乳動物及び非哺乳動物、例えば、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ニワトリ、両性類、爬虫類などを含む。
核酸に関しては、「実質的な相同性」という用語は、２つの核酸またはそのうちの指定した配列が、最適にアライメント及び比較した場合、適切なヌクレオチド挿入または欠失を伴って、ヌクレオチドの少なくとも約８０％、通常は少なくとも約９０％～９５％、より好ましくは、ヌクレオチドの少なくとも約９８％～９９．５％において同一であることを示す。あるいは、セグメントが選択的ハイブリダイゼーション条件下で鎖の相補配列にハイブリダイズし得るときに、実質的な相同性が存在する。
２つの配列間のパーセント同一性は、配列によって共有される同一位置の数の関数（すなわち、パーセント相同性＝同一位置の数／位置の総数×１００）であり、２つの配列の最適なアライメントのために導入されることが必要なギャップの数及び各ギャップの長さが考慮される。配列の比較及び２つの配列間のパーセント同一性の決定は、以下の非限定的な例に記載するように、数学的アルゴリズムを使用して達成することができる。
２つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムを使用して決定することができ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｃｇ．ｃｏｍにて入手可能）、これは、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリックス、ならびに４０、５０、６０、７０または８０のギャップ加重及び１、２、３、４、５または６の長さ加重を使用する。２つのヌクレオチドまたはアミノ酸配列間のパーセント同一性はまた、Ｅ．Ｍｅｙｅｒｓ及びＷ．Ｍｉｌｌｅｒ（ＣＡＢＩＯＳ，４：１１－１７（１９８９））のアルゴリズムを使用して決定することができ、これは、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）に組み込まれており、ＰＡＭ１２０加重残基表、１２のギャップ長ペナルティー及び４のギャップペナルティーを使用する。加えて、２つのアミノ酸配列間のパーセント同一性は、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．（４８）：４４４－４５３（１９７０））アルゴリズムを使用して決定することができ、これは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムに組み込まれており（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｃｇ．ｃｏｍにて入手可能）、Ｂｌｏｓｓｕｍ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックスのいずれか、ならびに１６、１４、１２、１０、８、６または４のギャップ加重及び１、２、３、４、５または６の長さ加重を使用する。
本開示の核酸配列及びタンパク質配列を「クエリー配列」としてさらに使用して、例えば、関連する配列を同定するために公共のデータベースに対して検索を行うことができる。そのような検索は、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．（１９９０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－１０のＮＢＬＡＳＴ及びＸＢＬＡＳＴプログラム（バージョン２．０）を使用して行うことができる。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索を、ＮＢＬＡＳＴプログラム、スコア＝１００、ワード長＝１２を用いて行って、本発明の核酸分子に相同なヌクレオチド配列を得ることができる。ＢＬＡＳＴタンパク質検索を、ＸＢＬＡＳＴプログラム、スコア＝５０、ワード長＝３を用いて行って、本発明のタンパク質分子に相同なアミノ酸配列を得ることができる。比較目的のためのギャップアライメントを得るために、Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴを、Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５（１７）：３３８９－３４０２に記載のように利用することができる。ＢＬＡＳＴ及びＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム（例えば、ＸＢＬＡＳＴ及びＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメータを使用できる。ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ．を参照されたい。
核酸は全細胞中にあっても、細胞ライセート中にあっても、または部分的に精製されたもしくは実質的に純粋な形で存在してもよい。核酸は、アルカリ／ＳＤＳ処理、ＣｓＣｌバンディング、カラムクロマトグラフィ、アガロースゲル電気泳動法、及び当該技術分野で公知の他の技術を含む標準的な技術により、他の細胞成分または他の混入物質、例えば、他の細胞内核酸またはタンパク質を取り除いて精製されている場合に、「単離された」または「実質的に純粋にされた」ことになる。Ｆ．Ａｕｓｕｂｅｌ，ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇｒｅｅｎｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ ａｎｄ Ｗｉｌｅｙ Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８７）を参照されたい。
ｃＤＮＡ、ゲノムまたはこれらの混合物に由来する、本開示の核酸組成物は、しばしば天然配列（修飾された制限部位などを除き）であり、遺伝子配列を提供する標準的技術に従って突然変異させてよい。コード配列に関しては、これらの突然変異は、必要に応じてアミノ酸配列を左右してよい。具体的には、天然Ｖ、Ｄ、Ｊ、定常、スイッチ及び本明細書に記載する他のこのような配列に実質的に相同するまたは由来とするＤＮＡ配列が企図される（この場合、「由来する」は、ある配列が別の配列と同一であるかまたは別の配列から修飾されていることを示す）。
「Ｔ細胞」という用語は、細胞表面上のＴ細胞受容体の存在によって他の白血球細胞と区別できる白血球細胞の一種を指す。Ｔ細胞にはいくつかのサブセットがあり、Ｔヘルパー細胞（別名、ＴＨ細胞またはＣＤ４＋Ｔ細胞）ならびにサブタイプ、例えばＴＨ１、ＴＨ２、ＴＨ３、ＴＨ１７、ＴＨ９、及びＴＦＨ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞（別名、ＴＣ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞、細胞傷害性Ｔリンパ球、Ｔキラー細胞、キラーＴ細胞）、メモリーＴ細胞ならびにサブタイプ、例えばセントラルメモリーＴ細胞（ＴＣＭ細胞）、エフェクターメモリーＴ細胞（ＴＥＭ及びＴＥＭＲＡ細胞）、及びレジデントメモリーＴ細胞（ＴＲＭ細胞）、制御性Ｔ細胞（別名、Ｔｒｅｇ細胞またはサプレッサーＴ細胞）ならびにサブタイプ、例えばＣＤ４＋ＦＯＸＰ３＋Ｔｒｅｇ細胞、ＣＤ４＋ＦＯＸＰ３－Ｔｒｅｇ細胞、Ｔｒ１細胞、Ｔｈ３細胞、及びＴｒｅｇ１７細胞、ナチュラルキラーＴ細胞（別名、ＮＫＴ細胞）、粘膜関連インバリアントＴ細胞（ＭＡＩＴ）、ならびにガンマデルタＴ細胞（γδＴ細胞）、例えばＶγ９／Ｖδ２Ｔ細胞が含まれるがこれらに限定されない。前述のまたは言及していないＴ細胞の任意の１つまたは複数が、本発明の使用の方法の標的細胞型であり得る。
本明細書で使用する場合、「Ｔ細胞媒介性応答」という用語は、エフェクターＴ細胞（例えば、ＣＤ８＋細胞）及びヘルパーＴ細胞（例えば、ＣＤ４＋細胞）を含むがこれらに限定されない、Ｔ細胞により媒介される任意の応答を指す。Ｔ細胞媒介性応答には、例えば、Ｔ細胞細胞傷害性及び増殖が含まれる。
本明細書で使用する場合、「治療有効量」もしくは「治療有効用量」という用語、または本明細書で使用される同様の用語は、望ましい生物学的または医学的応答（例えば、がんの１つまたは複数の症状における改善）を引き出し得る作用物質（例えば、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメント）の量を意味することが意図される。
「処置する」、「処置すること」及び「処置」という用語は、処置されている個体の自然経過を改変することを目的とした臨床的介入を指し、予防のために、または臨床病理過程中に行うことができる。処置の望ましい効果には、疾患の発生または再発の予防、症状の軽減、疾患の任意の直接的または間接的な病理学的結果の減少、転移の予防、疾患進行速度の低減、病状の回復または緩和、及び寛解または予後の改善が含まれるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、本発明の抗体を使用して、疾患の発生を遅延させるか、または疾患の進行を減速させる。一部の実施形態では、本明細書で使用する処置は、治療的または予防的手段を指す。「処置」の方法は、障害もしくは再発性障害の１つもしくは複数の症状を、予防、治癒、遅延、重症度を軽減する、もしくは改善するため、またはかかる処置の不在下で予想されるものを超えて対象の生存を延長するために、本開示のヒト抗体の、そのような処置を必要とする対象、例えば、特定の抗原に対する免疫応答の増強を必要とする対象または最終的にそのような障害を得る可能性がある対象への投与を採用する。
本明細書で使用する場合、「腫瘍微小環境」（あるいは「がん微小環境」；略してＴＭＥ）という用語は、周囲の血管ならびに免疫細胞、線維芽細胞、骨髄由来炎症細胞及びリンパ球を含むがこれらに限定されない非がん性細胞を含む、腫瘍または新生物が存在する細胞環境（ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ）または環境（ｍｉｌｉｅｕ）を指す。シグナル伝達分子及び細胞外マトリックスもＴＭＥに含まれる。腫瘍及び周囲の微小環境は密接に関連しており、常に相互作用している。腫瘍は、細胞外シグナルを放出し、腫瘍の血管新生を促進し、末梢免疫寛容を誘導することにより、微小環境に影響を与えることができ、一方で、微小環境内の免疫細胞は、腫瘍細胞の増殖及び発展に影響を及ぼすことができる。
本明細書で使用する場合、Ｖセグメントに言及する「再編成のない」または「生殖細胞の配置」という用語は、ＶセグメントがＤまたはＪセグメントにすぐ隣接するように組換えられていない配置を指す。
本明細書で使用する場合、「ベクター」という用語は、それが連結している別の核酸を輸送できる核酸分子を指すことを意図する。ベクターの一種が「プラスミド」であり、これは付加的なＤＮＡセグメントが連結され得る環状の二本鎖ＤＮＡループを指す。ベクターの別種は、ウイルスベクターであり、付加的なＤＮＡセグメントは、ウイルスゲノム内に連結し得る。ある特定のベクターは、それらが導入される宿主細胞内で自律的複製が可能である（例えば、細菌由来の複製開始点を有する細菌ベクター及びエピソーム哺乳動物ベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター）は、宿主細胞への導入の際に、宿主細胞のゲノムに組み込まれ得、それにより、宿主ゲノムと一緒に複製される。さらに、ある特定のベクターは、それらが作動可能に連結された遺伝子の発現を命令することができる。そのようなベクターは、本明細書では、「組換え発現ベクター」（または単に「発現ベクター」）と称される。一般に、組換えＤＮＡ技術で実用性のある発現ベクターは、しばしばプラスミドの形態である。本明細書では、「プラスミド」及び「ベクター」は、プラスミドが最も一般的に使用されるベクターの形態であるため、互換可能に使用され得る。しかしながら、本発明には、ウイルスベクター（例えば、複製欠陥レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルス）などの、同等の機能を果たす他の形の発現ベクターを含むことが意図される。
別段の定義がない限り、本明細書で用いる全ての技術用語及び科学用語は、本開示が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。好ましい方法及び材料を後述するが、本明細書に記載するものと類似するまたは同等な方法及び材料も、本開示の方法及び組成物の実施または試験において使用できる。本明細書で言及される全ての刊行物、特許出願、特許、及び他の参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。
抗ＣＤ３９抗体及びその抗原結合フラグメント
本開示は、ＣＤ３９、特にヒトＣＤ３９に結合して拮抗する抗体及びその抗原結合部分を提供する。表１に記載の重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲならびに可変配列を含む、ヒトＣＤ３９に結合する単離された抗体またはその抗原結合部分を本明細書にて提供する。
アデノシン経路は、細胞間相互作用、サイトカイン及びケモカインの分泌、表面抗原の放出、細胞内病原体の除去、ならびに活性酸素種（ＲＯＳ）の生成など、免疫細胞機能を微調整するように機能するシグナル伝達系である。ＡＴＰ及びＡＤＰは、受容体の活性化を通して、炎症、免疫系の制御、及び組織ホメオスタシスに基本的な役割を担う（Ｅｌｔｚｓｃｈｉｇ ｅｔ ａｌ．，（２０１２）Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３６７：２３２２－２３３３）。ＡＴＰ及びアデノシンなどのメディエーターは、代謝障害または他の種類の侵襲に反応して細胞外空間に放出され、免疫反応を形作る感覚信号及び遠心性シグナルの両方として作用する。ＡＴＰは、細胞溶解によってまたは非溶解性メカニズムによって、例えば（ｉ）ＡＴＰ含有小胞のエキソサイトーシス、（ｉｉ）ヌクレオチド透過性チャネル（コネキシン／パネキシンヘミチャネル、マキシアニオンチャネル、容積調節アニオンチャネルまたはＰ２Ｘ７受容体チャネル）を通して、（ｉｉｉ）細胞膜にタンパク質を送達する輸送小胞を介して、及び（ｉｖ）リソソームを介して放出される。ＣＤ３９は、細胞外アデノシン三リン酸（ＡＴＰ）及びアデノシン二リン酸（ＡＤＰ）を加水分解して、アデノシンを生成する。
Ｐ１アデノシン受容体ファミリーには、Ａ１、Ａ２Ａ（Ｔ細胞によって発現される主要なアデノシン受容体）、Ａ２Ｂ、及びＡ３Ｇタンパク質共役受容体が包含される。アデノシンＡ２Ａ受容体軸は、炎症を弱め、免疫系が媒介する損傷から正常組織を保護する免疫抑制メカニズムを提供する（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ．，（２００１）Ｎａｔｕｒｅ ４１４：９１６－９２０）。一部のがんでは、この免疫抑制経路が異常に活性化され、免疫系からがん細胞を保護する（Ｓｉｔｋｏｖｓｋｙ ｅｔ ａｌ．，（２０１４）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｒｅｓ）２：５９８－６０５）。腫瘍において、この経路の活性化及び細胞外アデノシンの蓄積は、腫瘍増殖に有利な免疫抑制及び血管新生促進ニッチを生成する（Ａｎｔｏｎｉｏｌｉ ｅｔ ａｌ．，（２０１３）Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｃａｎｃｅｒ １３：８４２－８５７；Ｓｔａｇｇ ａｎｄ Ｓｍｉｔｈ（２０１０）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ２９：５３４６－５３５８；Ｓｉｔｋｏｖｓｋｙ ｅｔ ａｌ．，（２００８）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ １４：５９４７－５９５２；Ｍｕｌｌｅｒ－Ｈａｅｇｅｌｅ ｅｔ ａｌ．，（２０１４）Ｅｘｐｅｒｔ Ｒｅｖ Ｃｌｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ １０：８９７－９１４；Ａｎｔｏｎｉｏｌｉ ｅｔ ａｌ．，（２０１３）Ｔｒｅｎｄｓ Ｍｏｌ Ｍｅｄ １９：３５５－３６７）。がんの促進におけるこの経路の主な役割は、Ａ２ＡＲ欠損マウス（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ Ｓ Ａ １０３：１３１３２－１３１３７）ならびにＣＤ３９の腫瘍耐性表現型（Ｓｕｎ ｅｔ ａｌ．，（２０１０）Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ １３９：１０３０－１０４０）における大規模な免疫原性腫瘍の完全な拒絶によって証明されている。
経路内では、ＣＤ３９（エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ１、Ｅ－ＮＴＰＤａｓｅ１、及び分化抗原群３９としても知られる）及びＣＤ７３（エクト－５’－ヌクレオチダーゼ、Ｅｃｔｏ５’ＮＴａｓｅ、５’－ヌクレオチダーゼ（５’－ＮＴ）、及び分化抗原群７３としても知られる）は、免疫及び炎症を制御する主要なヌクレオチド代謝酵素である。ＣＤ３９及びＣＤ７３の活性は、細胞外アデノシンの主要な供給源を表す。ＣＤ３９は、細胞外ＡＴＰ及びＡＤＰを、アデノシン一リン酸（ＡＭＰ）へと加水分解する（Ｄｅａｇｌｉｏ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ ２０４：１２５７－１２６５；Ｂｏｒｓｅｌｌｉｎｏ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｂｌｏｏｄ １１０：１２２５－１２３２）。次に、ＡＭＰは、本質的にエクトヌクレオチダーゼＣＤ７３によって抗炎症性アデノシンへと処理される。Ｔ細胞上のＡ２Ａ受容体に結合すると、アデノシンは細胞内サイクリックＡＭＰの蓄積を誘導し、それによってＴＣＲ誘導性ＣＤ２５上方制御を防ぎ、エフェクターＴリンパ球の増殖及び炎症性サイトカイン分泌を阻害する（Ｈｕａｎｇ ｅｔ ａｌ．，（１９９７）Ｂｌｏｏｄ ９０－１６００－１６１０；Ｌｏｋｓｈｉｎ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ６６：７７５８－７７６５）。アデノシンはまた、活性化されたナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の細胞傷害活性及びサイトカイン産生を遮断する。
従って、本開示は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗する単離された抗体またはその抗原結合部分を提供し、抗体またはその抗原結合部分は、以下の特性：（ｉ）組換えヒトＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に結合する；（ｉｉ）ＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合する；（ｉｉｉ）ＣＤ３９の酵素活性を阻害するまたは低下する；（ｉｖ）細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ｅＡＭＰ）への変換を阻害するまたは低下する；（ｖ）細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベルを増加または増強する；（ｖｉ）細胞外アデノシンレベルを低減または低下する；（ｖｉｉ）細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）の免疫刺激性レベルを維持、増加または増強する；（ｖｉｉｉ）リンパ球の増殖を増加または増強する；（ｉｘ）１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増加または増強する；（ｘ）樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増加または増強する；（ｘｉ）腫瘍におけるマクロファージ浸潤を増加または増強する；（ｘｉｉ）マクロファージを誘引するケモカインの分泌を増加または増強する；（ｘｉｉｉ）組織の腫瘍微小環境においてヒトＣＤ３９に拮抗する；（ｘｉｖ）カニクイザルＣＤ３９及び／またはマウスＣＤ３９と交差反応する；あるいは（ｘｖ）（ｉ）～（ｘｉｖ）のいずれ１つの組み合わせのうちの少なくとも１つまたは複数を呈する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、組換えＣＤ３９及び／または膜結合ＣＤ３９に結合する。一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、組換えヒトＣＤ３９及び／または膜結合ヒトＣＤ３９に結合する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、ＣＤ３９に１０ｎＭ未満の平衡解離定数（ＫＤ）で結合する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性は、細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の加水分解である。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ｅＡＭＰ）への変換を阻害または低下する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベルを増加または増強する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）の免疫刺激レベルを増加または増強する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、リンパ球の増殖を増加する。一部の実施形態では、リンパ球は、腫瘍浸潤リンパ球である。一部の実施形態では、リンパ球は、Ｔ細胞である。一部の実施形態では、Ｔ細胞は、ＣＤ４＋Ｔ細胞である。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する。一部の実施形態では、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーは、ＣＤ８６、ＨＬＡ－ＤＲ、またはそれらの組み合わせである。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増強する。一部の実施形態では、１つまたは複数のサイトカインは、ＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０、ＶＥＧＦＡ、またはそれらの任意の組み合わせである。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、腫瘍におけるマクロファージ浸潤を増加または増強する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、マクロファージを誘引するケモカインの分泌を増加または増強する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、腫瘍微小環境においてヒトＣＤ３９に拮抗する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、カニクイザルＣＤ３９及び／またはマウスＣＤ３９と交差反応する。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、及びＩｇＧ３、ＩｇＧ４、及びＩｇＭ、及びＩｇＡ１、及びＩｇＡ２、及びＩｇＤ、及びＩｇＥ抗体からなる群から選択される。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、ＩｇＧ４抗体のＩｇＧ１抗体である。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、野生型ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、野生型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、少なくとも１つの突然変異を含むＦｃドメインを含む。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ１重鎖定常領域を含む。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。一部の実施形態では、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、ＥＵナンバリングに従って、置換Ｓ２２８Ｐ、Ｌ２３５Ｅ、Ｌ２３５Ａのいずれか１つ、またはそれらの組み合わせを含む。
一部の態様では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する。一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、抗体が結合するエピトープの突然変異が、抗体及び配列番号３に記載の重鎖ＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分の両方への結合を、阻害、低下、または遮断する。
一部の実施形態では、本開示の抗体または抗原結合部分は、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。一部の実施形態では、本開示の抗体または抗原結合部分は、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する。一部の実施形態では、本開示の抗体または抗原結合部分が結合するエピトープの突然変異は、抗体と、それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分との両方への結合を阻害、低下、または遮断する。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じエピトープに結合する。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分が結合するアミノ酸残基の少なくとも１つに結合する。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分が結合するエピトープの突然変異は、抗体と、それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列を含む参照抗体またはその抗原結合部分との両方への結合を阻害、低下、または遮断する。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号２７、２８及び２９に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号３７、３８及び３９に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号１、２及び３に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１、１２及び１３に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５３、５４及び５５に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６３、６４及び６５に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号７９、８０及び８１に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号８９、９０及び９１に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｖ）それぞれ、配列番号１０５、１０６及び１０７に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１５、１１６及び１１７に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含み、重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号２７、２８及び２９に記載され、軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号３７、３８及び３９に記載されている。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３０、３１及び３２に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号４０、４１及び４２に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号４、５及び６に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１４、１５及び１６に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５６、５７及び５８に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号６６、６７及び６８に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８２、８３及び８４に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号９２、９３及び９４に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列；
（ｖ）それぞれ、配列番号１０８、１０９及び１１０に記載の重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列、ならびにそれぞれ、配列番号１１８、１１９及び１２０に記載の軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列からなる群から選択される重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖ＣＤＲ及び軽鎖ＣＤＲを含み、重鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号３０、３１及び３２に記載され、軽鎖ＣＤＲ１、ＣＤＲ２及びＣＤＲ３配列は、それぞれ配列番号４０、４１及び４２に記載されている。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域は、配列番号３３、７、５９、８５及び１１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖可変領域は、配列番号４３、１７、６９、９５及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３３及び４３；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号７及び１７；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９及び６９；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８５及び９５；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１１及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ配列番号３３及び４３に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の態様では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域は、配列番号３３、７、５９、８５及び１１１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖可変領域は、配列番号４３、１７、６９、９５及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体または抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３３及び４３；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号７及び１７；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号５９及び６９；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８５及び９５；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１１及び１２１からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ配列番号３３及び４３に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号３５、９、６１、８７及び１１３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号３５、９、６１、８７及び１１３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４７、２１、７３、９９、及び１２５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４７、２１、７３、９９及び１２５からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４９、２３、７５、１０１及び１２７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号４９、２３、７５、１０１及び１２７からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号５１、２５、７７、１０３及び１２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖は、配列番号５１、２５、７７、１０３及び１２９からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖は、配列番号４５、１９、７１、９７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３５及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号９及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８７及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１３及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号３５及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号９及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号６１及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号８７及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１１３及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４７及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２１及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７３及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号９９及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２５及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４７及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２１及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７３及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号９９及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２５及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４９及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２３及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７５及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０１及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号４９及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２３及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７５及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０１及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２７及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５１及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２５及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７７及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０３及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２９及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、以下：
（ｉ）それぞれ、配列番号５１及び４５；
（ｉｉ）それぞれ、配列番号２５及び１９；
（ｉｉｉ）それぞれ、配列番号７７及び７１；
（ｉｖ）それぞれ、配列番号１０３及び９７；ならびに
（ｖ）それぞれ、配列番号１２９及び１２３からなる群から選択されるアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号３５及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号３５及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４７及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４７及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４９及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号４９及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号５１及び４５に記載のアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＣＤ３９に結合して拮抗し、それぞれ、配列番号５１及び４５に記載のアミノ酸配列に、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖を含む。
一部の実施形態では、単離された抗体またはその抗原結合部分は、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。一部の実施形態では、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、Ｓ２２８Ｐ置換を含む。一部の実施形態では、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、Ｓ２２８Ｐ置換及びＬ２３５Ｅ置換を含む。一部の実施形態では、突然変異型ＩｇＧ４重鎖定常領域は、Ｓ２２８Ｐ置換及びＬ２３５Ａ置換を含む。番号付けはＥＵナンバリングに従う。
抗ＣＤ３９抗体及びその抗原結合フラグメントを産生するための方法
本開示はまた、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントのいずれかを産生するための方法に関する。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体を調製するための方法は、適切な免疫原で対象（例えば、非ヒト哺乳動物）に免疫付与することを含むことができる。本明細書に記載の抗体のいずれかを生成するための好適な免疫原は、本明細書に記載する。例えば、ＣＤ３９に結合する抗体を生成するために、当業者は好適な対象（例えば、ラット、マウス、スナネズミ、ハムスター、イヌ、ネコ、ブタ、ヤギ、ウマ、または非ヒト霊長類などの非ヒト哺乳動物）に、配列番号１３８に示されるアミノ酸配列を含む完全長ヒトＣＤ３９ポリペプチドなどの完全長ＣＤ３９ポリペプチドを用いて、免疫付与することができる。
好適な対象（例えば、非ヒト哺乳動物）は、適切な抗原を、後続の追加免疫を伴って、哺乳動物による抗体の産生を誘発するのに十分な回数用いて、免疫付与することができる。免疫原は、アジュバントを伴って対象（例えば、非ヒト哺乳動物）に投与することができる。対象において抗体を産生するのに有用なアジュバントには、限定されないが、タンパク質アジュバント；細菌アジュバント、例えば全細菌（ＢＣＧ、Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐａｒｖｕｍまたはＳａｌｍｏｎｅｌｌａ ｍｉｎｎｅｓｏｔａ）及び細菌成分、例えば細胞壁骨格、トレハロースジミコレート、モノホスホリルリピドＡ、ｔｕｂｅｒｃｌｅ ｂａｃｉｌｌｕｓのメタノール抽出残渣（ＭＥＲ）、完全または不完全フロイントアジュバント；ウイルスアジュバント；化学的アジュバント、例えば、水酸化アルミニウム、ならびにヨードアセテート及びコレステリルヘミスクシネートが含まれる。免疫応答を誘導するための方法において使用することができる他のアジュバントには、例えば、コレラ毒素及びパラポックスウイルスタンパク質が含まれる。Ｂｉｅｇ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ａｕｔｏｉｍｍｕｎｉｔｙ ３１（１）：１５－２４も参照されたい。例えば、Ｌｏｄｍｅｌｌ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｖａｃｃｉｎｅ １８：１０５９－１０６６；Ｊｏｈｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ４２：４６４０－４６４９；Ｂａｌｄｒｉｄｇｅ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｍｅｔｈｏｄｓ １９：１０３－１０７；及びＧｕｐｔａ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｖａｃｃｉｎｅ １３（１４）：１２６３－１２７６も参照されたい。
一部の実施形態では、本方法は、免疫原に結合するモノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマ細胞株を調製することを含む。例えば、好適な哺乳動物、例えば実験用マウスに、上記のようにＣＤ３９ポリペプチドを用いて免疫付与する。免疫付与された哺乳動物の抗体産生細胞（例えば、脾臓のＢ細胞）は、免疫原を少なくとも１回追加免疫した２～４日後に単離され得、次に短時間培養して増殖させてから好適な骨髄腫細胞株の細胞と融合させる。これらの細胞は、融合促進剤、例えば、ワクシニアウイルスまたはポリエチレングリコールの存在下で融合することができる。融合において得られたハイブリッド細胞をクローニングし、所望の抗体を分泌する細胞クローンを選択する。例えば、好適な免疫原を用いて免疫付与されたＢａｌｂ／ｃマウスの脾臓細胞を、骨髄腫細胞株ＰＡＩまたは骨髄腫細胞株Ｓｐ２／０－Ａｇ１４の細胞と融合させることができる。融合後、細胞を、正常な骨髄腫細胞による所望のハイブリドーマ細胞の過剰増殖を防ぐために、一定間隔で選択培地、例えば、ＨＡＴ培地を補充した好適な培養培地中で拡大させる。得られたハイブリッド細胞を、次に、所望の抗体、例えば、ヒトＣＤ３９に結合する抗体の分泌についてスクリーニングし、一部の実施形態では、当業者は、例えば、米国特許第６，３００，０６４号（Ｋｎａｐｐｉｋ ｅｔ ａｌ．；Ｍｏｒｐｈｏｓｙｓ ＡＧ）及びＳｃｈｏｏｎｂｒｏｏｄｔ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ３３（９）：ｅ８１に記載されるように、非免疫バイアスライブラリから抗ＣＤ３９抗体を同定することができる。
一部の実施形態では、本明細書に記載の方法は、例えば、ファージディスプレイ技術、細菌ディスプレイ、酵母表面ディスプレイ、真核生物ウイルスディスプレイ、哺乳動物細胞ディスプレイ、及び無細胞（例えば、リボソームディスプレイ）抗体スクリーニング技術（例えば、Ｅｔｚ ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｊ Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ １８３：６９２４－６９３５；Ｃｏｒｎｅｌｉｓ（２０００）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １１：４５０－４５４；Ｋｌｅｍｍ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ １４６：３０２５－３０３２；Ｋｉｅｋｅ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ １０：１３０３－１３１０；Ｙｅｕｎｇ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ｐｒｏｇ １８：２１２－２２０；Ｂｏｄｅｒ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ３２８：４３０－４４４；Ｇｒａｂｈｅｒｒ ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｃｏｍｂ Ｃｈｅｍ Ｈｉｇｈ Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ Ｓｃｒｅｅｎ ４：１８５－１９２；Ｍｉｃｈａｅｌ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ ２：６６０－６６８；Ｐｅｒｅｂｏｅｖ ｅｔ ａｌ．（２００１）Ｊ Ｖｉｒｏｌ７５：７１０７－７１１３；Ｓｃｈａｆｆｉｔｚｅｌ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２３１：１１９－１３５；及びＨａｎｅｓ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １８：１２８７－１２９２を参照されたい）を伴うことができる、またはと合わせて使用することができる。
様々なファージディスプレイ法を使用する抗体を同定するための方法は当該技術分野で公知である。ファージディスプレイ法では、機能的抗体ドメインは、それをコードするポリヌクレオチド配列を運ぶファージ粒子の表面上に提示される。このようなファージを利用して、レパートリーまたはコンビナトリアル抗体ライブラリ（例えば、ヒトまたはマウス）から発現される、Ｆａｂ、Ｆｖ、またはジスルフィド結合安定化Ｆｖ抗体フラグメントなどの抗体の抗原結合ドメインを提示することができる。これらの方法で使用されるファージは、典型的には、ｆｄ及びＭ１３などの繊維状ファージである。抗原結合ドメインは、ファージコートタンパク質ｐＩＩＩ、ｐＶＩＩＩ、またはｐＩＸのいずれかに組換えて融合されたタンパク質として発現される。例えば、Ｓｈｉ ｅｔ ａｌ．（２０１０）ＪＭＢ ３９７：３８５－３９６を参照されたい。本明細書に記載の免疫グロブリンまたはそのフラグメントを作成するために使用できるファージディスプレイ法の例としては、Ｂｒｉｎｋｍａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ １８２：４１－５０；Ａｍｅｓ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ １８４：１７７－１８６；Ｋｅｔｔｌｅｂｏｒｏｕｇｈ ｅｔ ａｌ．（１９９４）Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２４：９５２－９５８；Ｐｅｒｓｉｃ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｇｅｎｅ １８７：９－１８；Ｂｕｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９４）Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ５７：１９１－２８０；ならびにＰＣＴ公開番号ＷＯ９０／０２８０９、ＷＯ９１／１０７３７、ＷＯ９２／０１０４７、ＷＯ９２／１８６１９、ＷＯ９３／１１２３６、ＷＯ９５／１５９８２、及びＷＯ９５／２０４０１に開示されるものが挙げられる。好適な方法は、例えば、米国特許第５，６９８，４２６号、同第５，２２３，４０９号、同第５，４０３，４８４号、同第５，５８０，７１７号、同第５，４２７，９０８号、同第５，７５０，７５３号、同第５，８２１，０４７号、同第５，５７１，６９８号、同第５，４２７，９０８号、同第５，５１６，６３７号、同第５，７８０，２２５号、同第５，６５８，７２７号、同第５，７３３，７４３号及び同第５，９６９，１０８号にも記載されている。
一部の実施形態では、ファージディスプレイ抗体ライブラリは、免疫付与された哺乳動物からのＢ細胞から収集したｍＲＮＡを使用して生成することができる。例えば、Ｂ細胞を含む脾臓細胞試料は、上記のようにＣＤ３９ポリペプチドを用いて免疫付与したマウスから単離することができる。ｍＲＮＡを細胞から分離し、標準的な分子生物学技術を使用してｃＤＮＡに変換することができる。例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．（１９８９）“Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，２ｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，”Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．；Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｌａｎｅ（１９８８）、上記；Ｂｅｎｎｙ Ｋ．Ｃ．Ｌｏ（２００４）、上記；及びＢｏｒｒｅｂａｅｋ（１９９５）、上記を参照されたい。免疫グロブリンの重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの可変領域をコードするｃＤＮＡを使用して、ファージディスプレイライブラリを構築する。そのようなライブラリを生成するための方法は、例えば、Ｍｅｒｚ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｍｅｔｈｏｄｓ ６２（１－２）：２１３－９；Ｄｉ Ｎｉｒｏ ｅｔ ａｌ．（２００５）Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ ３８８（Ｐｔ３）：８８９－８９４；及びＥｎｇｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ．（１９９５）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ５１：３５５－３７６に記載されている。
一部の実施形態では、選択及びスクリーニングの組み合わせを採用して、目的の抗体を、例えば、ハイブリドーマ由来の抗体の集団またはファージディスプレイ抗体ライブラリから同定することができる。好適な方法が当該技術分野で公知であり、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ（１９９７）Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １５：６２－７０；Ｂｒｉｎｋｍａｎ ｅｔ ａｌ．（１９９５）、上記；Ａｍｅｓ ｅｔ ａｌ．（１９９５）、上記；Ｋｅｔｔｌｅｂｏｒｏｕｇｈ ｅｔ ａｌ．（１９９４）、上記；Ｐｅｒｓｉｃ ｅｔ ａｌ．（１９９７）、上記；及びＢｕｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９４）、上記に記載されている。例えば、それぞれがバクテリオファージコートタンパク質（例えば、Ｍ１３ファージのｐＩＩＩ、ｐＶＩＩＩ、またはｐＩＸ）及び異なる抗原複合領域の融合タンパク質をコードする複数のファージミドベクターが、標準的な分子生物学技術を使用して産生され、細菌（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）の集団へと導入される。細菌におけるバクテリオファージの発現は、一部の実施形態では、ヘルパーファージの使用を必要とし得る。一部の実施形態では、ヘルパーファージは必要とされない（例えば、Ｃｈａｓｔｅｅｎ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ３４（２１）：ｅ１４５を参照されたい）。細菌から産生されたファージを回収し、例えば、固体支持体に結合した（固定化された）標的抗原に接触させる。ファージを溶液中の抗原に接触させてもよく、続いて、複合体を固体支持体に結合させる。
上記の方法を使用してスクリーニングされた抗体の亜集団は、当該技術分野で公知の任意の免疫学または生化学に基づく方法を使用して、特定の抗原（例えば、ヒトＣＤ３９）に対するそれらの特異性及び結合親和性について特徴決定することができる。例えば、ＣＤ３９への抗体の特異的結合は、例えば、上記のＥＬＩＳＡアッセイ、ＳＰＲアッセイ、免疫沈降アッセイ、アフィニティークロマトグラフィー、及び平衡透析などであるがこれらに限定されない免疫学または生化学に基づく方法を使用して決定され得る。抗体の免疫特異的結合及び交差反応性を解析するために使用できるイムノアッセイには、ウエスタンブロット、ＲＩＡ、ＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着アッセイ）などの技術を使用する競合及び非競合アッセイ系、「サンドイッチ」イムノアッセイ、免疫沈降アッセイ、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体固定アッセイ、免疫放射定量アッセイ、蛍光イムノアッセイならびにプロテインＡイムノアッセイが含まれるが、これらに限定されない。このようなアッセイは慣習的であり、当該技術分野において周知である。
上記の方法を使用して、例えば、抗ＣＤ３９抗体が、完全長、ヒトＣＤ３９及び／またはＣＤ３９タンパク質に結合しないか否かを決定することもできることが理解されたい。
選択されたＣＤＲアミノ酸配列が短い配列（例えば、１０～１５アミノ酸長未満）である実施形態では、ＣＤＲをコードする核酸は、例えば、Ｓｈｉｒａｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ Ｓｅｒｉｅｓ ５１（１）：１２９－１３０及び米国特許第６，９９５，２５９号に記載のように化学合成することができる。アクセプター抗体をコードする所与の核酸配列に関しては、ＣＤＲをコードする核酸配列の領域は、標準的な分子生物学技術を使用して化学合成された核酸で置き換えることができる。化学合成された核酸の５’及び３’末端を合成して、核酸をドナー抗体の可変領域をコードする核酸へとクローニングする際に使用するための粘着末端制限酵素部位を含むことができる。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体は、その対応する未改変の定常領域と比較してエフェクター機能が低下した（または有さない）改変された重鎖定常領域を含む。抗ＣＤ３９抗体の定常領域を伴うエフェクター機能は、定常またはＦｃ領域の特性を改変することにより調節され得る。改変されたエフェクター機能は、例えば、以下の活性：抗体依存性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）、補体依存性細胞傷害性（ＣＤＣ）、アポトーシス、１つまたは複数のＦｃ受容体への結合、及び炎症促進反応のうちの１つまたは複数の調節を含む。調節は、未改変形態の定常領域の活性と比較して、改変定常領域を含有する対象抗体によって呈されるエフェクター機能活性の増加、低減、または排除を指す。特定の実施形態では、調節は、活動が廃止されるか、または完全に存在しない状況を含む。
一実施形態では、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体は、ＩｇＧ４重鎖定常領域を含む。一実施形態では、ＩｇＧ４重鎖定常領域は、野生型ＩｇＧ４重鎖定常領域である。別の実施形態では、ＩｇＧ４定常領域は、突然変異、例えば、ＥＵナンバリング（Ｋａｂａｔ，Ｅ．Ａ．，ｅｔ ａｌ．，上記）に従って、例えば、Ｓ２２８Ｐ及びＬ２３５ＥまたはＬ２３５Ａの一方または両方を含む。野生型及び突然変異型ＩｇＧ４定常領域の本開示の抗体で使用するための代表的な配列を表１に記載する。一実施形態では、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体は、ＩｇＧ１定常領域を含む。一実施形態では、ＩｇＧ１重鎖定常領域は、野生型ＩｇＧ１重鎖定常領域である。別の実施形態では、ＩｇＧ１重鎖定常領域は、突然変異を含む。野生型及び突然変異型ＩｇＧ４定常領域の本開示の抗体で使用するための代表的な配列を表１に記載する。
改変ＦｃＲ結合親和性及び／またはＡＤＣＣ活性及び／または改変ＣＤＣ活性を有する改変定常領域は、未改変形態の定常領域と比較して、増強または減少したＦｃＲ結合活性及び／またはＡＤＣＣ活性及び／またはＣＤＣ活性を有するポリペプチドである。ＦｃＲへの結合の増加を提示する改変定常領域は、未改変ポリペプチドよりも大きい親和性で少なくとも１つのＦｃＲと結合する。ＦｃＲへの結合の低減を提示する改変定常領域は、未改変形態の定常領域よりも低い親和性で少なくとも１つのＦｃＲと結合する。ＦｃＲへの結合の低減を提示するかかる変異体は、ＦｃＲへの認識できる結合をほとんどまたは全く有しない場合があり、例えば、ＦｃＲへの天然配列免疫グロブリン定常領域またはＦｃ領域の結合レベルと比較して、０～５０％（例えば、５０、４９、４８、４７、４６、４５、４４、４３、４２、４１、４０、３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、２０、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１％未満）のＦｃＲへの結合である。同様に、調節されたＡＤＣＣ及び／またはＣＤＣ活性を提示する改変定常領域は、未改変定常領域と比較して、増加または低下したＡＤＣＣ及び／またはＣＤＣ活性を呈し得る。例えば、一部の実施形態では、改変定常領域を含む抗ＣＤ３９抗体は、未改変形態の定常領域のおよそ０～５０％（例えば、５０、４９、４８、４７、４６、４５、４４、４３、４２、４１、４０、３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、２０、１９、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１％未満）のＡＤＣＣ及び／またはＣＤＣ活性を呈し得る。低下したＡＤＣＣ及び／またはＣＤＣを提示する改変定常領域を含む本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体は、低下したＡＤＣＣ及び／またはＣＤＣ活性を呈するか、または全く呈さない場合がある。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体は、低下したエフェクター機能を呈するか、または全く呈さない。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、ハイブリッド定常領域またはその一部、例えば、Ｇ２／Ｇ４ハイブリッド定常領域を含む（例えば、Ｂｕｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ａｄｖ Ｉｍｍｕｎ ５１：１－１８；Ｃａｎｆｉｅｌｄ ｅｔ ａｌ．（１９９１）Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ １７３：１４８３－１４９１；及びＭｕｅｌｌｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ ３４（６）：４４１－４５２を参照されたい）。上記を参照されたい。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、増強または低下した補体依存性細胞傷害性（ＣＤＣ）を呈する改変定常領域を含有し得る。調節されたＣＤＣ活性は、１つまたは複数のアミノ酸置換、挿入、または欠失を、抗体のＦＣ領域に導入することによって達成され得る。例えば、米国特許第６，１９４，５５１号を参照されたい。あるいはまたは加えて、システイン残基（複数可）を、Ｆｃ領域に導入し、それにより、この領域における鎖間ジスルフィド結合形成を可能にし得る。このように生成されたホモ二量体抗体は、改善もしくは低下した内部移行能力及び／または増加したもしくは低減した補体媒介性細胞殺滅性を有し得る。例えば、Ｃａｒｏｎ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ １７６：１１９１－１１９５及びＳｈｏｐｅｓ（１９９２）Ｉｍｍｕｎｏｌ １４８：２９１８－２９２２；ＰＣＴ公開番号ＷＯ９９／５１６４２及びＷＯ９４／２９３５１；Ｄｕｎｃａｎ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ ３２２：７３８－４０；ならびに米国特許第５，６４８，２６０号及び同第５，６２４，８２１号を参照されたい。
組換え抗体発現及び精製
本明細書に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントは、分子生物学及びタンパク質化学の技術分野において公知の様々な技術を使用して産生することができる。例えば、抗体の重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの一方または両方をコードする核酸は、例えば、プロモータ配列、リボソーム結合部位、転写開始及び停止配列、翻訳開始及び停止配列、転写ターミネータシグナル、ポリアデニル化シグナル、ならびにエンハンサまたはアクチベータ配列を含む、転写及び翻訳制御配列を含有する発現ベクターに挿入することができる。制御配列は、プロモータ、ならびに転写開始及び停止配列を含む。加えて、発現ベクターは、それが２つの異なる生物において、例えば、発現のために哺乳動物または昆虫細胞において、ならびにクローニング及び増幅のために原核宿主において維持され得るように、複数の複製系を含むことができる。
いくつかの可能性のあるベクター系が、哺乳動物細胞中の核酸からのクローン化された重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの発現のために利用可能である。ベクターの１つのクラスは、所望の遺伝子配列の宿主細胞ゲノムへの統合に依存する。安定的に統合されたＤＮＡを有する細胞は、Ｅ．ｃｏｌｉ ｇｐｔ（Ｍｕｌｌｉｇａｎ ａｎｄ Ｂｅｒｇ（１９８１）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ７８：２０７２）またはＴｎ５ｎｅｏ（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ａｎｄ Ｂｅｒｇ（１９８２）Ｍｏｌ Ａｐｐｌ Ｇｅｎｅｔ １：３２７）などの薬物耐性遺伝子を同時に導入することによって選択することができる。選択可能なマーカー遺伝子は、発現されるＤＮＡ遺伝子配列に連結され得るか、または同時形質移入によって同じ細胞に導入され得るかのいずれかである（Ｗｉｇｌｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９７９）Ｃｅｌｌ １６：７７）。ベクターの２番目のクラスは、染色体外プラスミドに自律複製能力を与えるＤＮＡエレメントを利用する。これらのベクターは、動物ウイルス、例えばウシパピローマウイルス（Ｓａｒｖｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９８２）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，７９：７１４７）、サイトメガロウイルス、ポリオーマウイルス（Ｄｅａｎｓ ｅｔ ａｌ．（１９８４）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８１：１２９２）、またはＳＶ４０ウイルス（Ｌｕｓｋｙ ａｎｄ Ｂｏｔｃｈａｎ（１９８１）Ｎａｔｕｒｅ ２９３：７９）から誘導することができる。
発現ベクターは、核酸のその後の発現のために好適な様式で細胞に導入することができる。導入方法は、以下で説明するように、標的とする細胞の種類によって大きく左右される。例示的な方法としては、ＣａＰＯ４沈殿、リポソーム融合、カチオン性リポソーム、エレクトロポレーション、ウイルス感染、デキストラン媒介トランスフェクション、ポリブレン媒介トランスフェクション、プロトプラスト融合、及び直接マイクロインジェクションが挙げられる。
抗体またはその抗原結合フラグメントの発現に適切な宿主細胞には、酵母、細菌、昆虫、植物、及び哺乳動物細胞が含まれる。特に興味深いのは、Ｅ．ｃｏｌｉなどの細菌、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ及びＰｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓなどの真菌、ＳＦ９などの昆虫細胞、哺乳動物細胞株（例えば、ヒト細胞株）、ならびに初代細胞株である。
一部の実施形態では、抗体またはそのフラグメントは、トランスジェニック動物（例えば、トランスジェニック哺乳動物）において発現することができる、及びそれから精製することができる。例えば、抗体は、例えば、Ｈｏｕｄｅｂｉｎｅ（２００２）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １３（６）：６２５－６２９；ｖａｎ Ｋｕｉｋ－Ｒｏｍｅｉｊｎ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ Ｒｅｓ ９（２）：１５５－１５９；及びＰｏｌｌｏｃｋ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２３１（１－２）：１４７－１５７に記載されるように、トランスジェニック非ヒト哺乳動物（例えば、げっ歯類）において産生することができ、乳汁から単離することができる。
抗体及びそのフラグメントは、抗体またはフラグメントをコードする核酸を含有する発現ベクターで形質転換された宿主細胞を、タンパク質の発現を可能にするのに十分な条件下及び時間量をかけて培養することにより、細胞から産生することができる。タンパク質発現のためのそのような条件は、発現ベクター及び宿主細胞の選択によって変動し、慣例的な実験を通して当業者によって容易に確認されるだろう。例えば、Ｅ．ｃｏｌｉで発現された抗体は、封入体からリフォールディングすることができる（例えば、Ｈｏｕ ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ｃｙｔｏｋｉｎｅ １０：３１９－３０を参照されたい）。細菌発現系及びそれらの使用方法は、当該技術分野で周知である（Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、及びＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ－－Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ－－３ｒｄ Ｅｄ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（２００１）を参照されたい）。コドン、好適な発現ベクター及び好適な宿主細胞の選択は、いくつかの要因に応じて変動し得、必要に応じて容易に最適化され得る。本明細書に記載の抗体（またはそのフラグメント）は、哺乳動物細胞、または他の発現系、例えば限定されないが酵母、バキュロウイルス、及びｉｎ ｖｉｔｒｏ発現系において発現することができる（例えば、Ｋａｓｚｕｂｓｋａ ｅｔ ａｌ．（２０００）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｎｄ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ １８：２１３－２２０を参照されたい）。
発現後、抗体及びそのフラグメントを単離することができる。抗体またはそのフラグメントは、試料中に存在する他の成分に応じて、当業者に公知の様々な方法において単離または精製することができる。標準的な精製方法には、電気泳動、分子、免疫学、ならびにクロマトグラフィー技術、例えばイオン交換、疎水性、アフィニティー、及び逆相ＨＰＬＣクロマトグラフィーが含まれる。例えば、抗体は、標準的な抗抗体カラム（例えば、プロテインＡまたはプロテインＧカラム）を使用して精製することができる。タンパク質濃縮と組み合わせた、限外濾過及びダイアフィルトレーション技術も有用である。例えば、Ｓｃｏｐｅｓ（１９９４）“Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，３ｒｄ ｅｄｉｔｉｏｎ，”Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ Ｃｉｔｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋを参照されたい。必要な精製の程度は、所望の用途に応じて変動するだろう。一部の例では、発現された抗体またはそのフラグメントの精製は必要ないだろう。
精製された抗体またはそのフラグメントの収率または純度を決定するための方法は、当該技術分野で公知であり、例えば、ブラッドフォードアッセイ、紫外分光法、ビウレットタンパク質アッセイ、ローリータンパク質アッセイ、アミドブラックタンパク質アッセイ、高圧液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）、質量分析（ＭＳ）、及びゲル電気泳動法（例えば、クマシーブルーまたはコロイド銀染色などのタンパク質染色を使用する）が含まれる。
抗体またはその抗原結合フラグメントの修飾
抗体またはその抗原結合フラグメントは、それらの発現及び精製の後に修飾することができる。修飾は、共有結合修飾または非共有結合修飾であることができる。そのような修飾は、例えば、ポリペプチドの標的アミノ酸残基を、選択された側鎖または末端残基と反応することができる有機誘導体化剤と反応させることによって、抗体またはフラグメントに導入することができる。修飾のための好適な部位は、例えば、抗体またはフラグメントの構造分析またはアミノ酸配列分析を含む、様々な基準のいずれかを使用して選択することができる。
一部の実施形態では、抗体またはその抗原結合フラグメントは、異種部分にコンジュゲートすることができる。異種部分は、例えば、異種ポリペプチド、治療剤（例えば、毒素または薬物）、または検出可能な標識、例えば、限定されないが、放射性標識、酵素標識、蛍光標識、重金属標識、発光標識、またはビオチンもしくはストレプトアビジンなどの親和性タグであることができる。好適な異種ポリペプチドには、例えば、抗体またはフラグメントの精製に使用するための、抗原タグ（ＦＬＡＧ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ（配列番号１３５））、ポリヒスチジン（６－Ｈｉｓ；ＨＨＨＨＨＨ（配列番号１３６）、ヘマグルチニン（ＨＡ；ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ（配列番号１３７））、グルタチオン－Ｓ－トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、またはマルトース結合タンパク質（ＭＢＰ））が含まれる。異種ポリペプチドには、診断または検出可能マーカーとして有用であるポリペプチド（例えば、酵素）、例えば、ルシフェラーゼ、蛍光タンパク質（例えば、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ））、またはクロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ（ＣＡＴ）も含まれる。好適な放射性標識には、例えば、３２Ｐ、３３Ｐ、１４Ｃ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓ、及び３Ｈが含まれる。好適な蛍光標識には、限定されないが、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）、ＤｙＬｉｇｈｔ（商標）４８８、フィコエリトリン（ＰＥ）、ヨウ化プロピジウム（ＰＩ）、ＰｅｒＣＰ、ＰＥ－Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ（登録商標）７００、Ｃｙ５、アロフィコシアニン、及びＣｙ７が含まれる。発光標識には、例えば、様々な発光ランタニド（例えば、ユーロピウムまたはテルビウム）キレートのいずれかが含まれる。例えば、好適なユーロピウムキレートには、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）またはテトラアザシクロドデカン－１，４，７，１０－四酢酸（ＤＯＴＡ）のユーロピウムキレートが含まれる。酵素標識には、例えば、アルカリホスファターゼ、ＣＡＴ、ルシフェラーゼ、及び西洋ワサビペルオキシダーゼが含まれる。
２つのタンパク質（例えば、抗体及び異種部分）は、いくつかの公知の化学的架橋剤のいずれかを使用して架橋することができる。そのような架橋剤の例は、２つのアミノ酸残基を「障害された」ジスルフィド結合を含む連結を介して連結するものである。これらの連結において、架橋単位内のジスルフィド結合は、例えば、還元型グルタチオンまたは酵素ジスルフィド還元酵素の作用による還元から、（ジスルフィド結合の両側の障害基によって）保護されている。ある好適な試薬、４－スクシンイミジルオキシカルボニル－α－メチル－α（２－ピリジルジチオ）トルエン（ＳＭＰＴ）は、一方のタンパク質の末端リジン及びもう一方の末端システインを利用して、２つのタンパク質間にこのような結合を形成する。各タンパク質上の異なるカップリング部分によって架橋するヘテロ二官能性試薬も使用できる。他の有用な架橋剤には、限定されないが、２つのアミノ基を連結する試薬（例えば、Ｎ－５－アジド－２－ニトロベンゾイルオキシスクシンイミド）、２つのスルフヒドリル基を連結する試薬（例えば、１，４－ビス－マレイミドブタン）、アミノ基及びスルフヒドリル基を連結する試薬（例えば、ｍ－マレイミドベンゾイル－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル）、アミノ基及びカルボキシル基を連結する試薬（例えば、４－［ｐ－アジドサリチルアミド］ブチルアミン）、ならびにアミノ基及びアルギニンの側鎖に存在するグアニジニウム基を連結する試薬（例えば、ｐ－アジドフェニルグリオキサール一水和物）が含まれる。
一部の実施形態では、放射性標識は、抗体のアミノ酸骨格に直接コンジュゲートすることができる。あるいは、放射性標識を、遊離アミノ基に結合して関連タンパク質のメタヨードフェニル（ｍＩＰ）誘導体を形成するより大きな分子（例えば、メタ－［１２５Ｉ］ヨードフェニル－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミド（［１２５Ｉ］ｍＩＰＮＨＳ）中の１２５Ｉ）（例えば、Ｒｏｇｅｒｓ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｊ Ｎｕｃｌ Ｍｅｄ ３８：１２２１－１２２９を参照されたい）またはキレート（例えば、ＤＯＴＡもしくはＤＴＰＡ）の一部として含めることができ、次にそれをタンパク質骨格に結合する。放射性標識またはそれらを含有するより大きな分子／キレートを本明細書に記載の抗体または抗原結合フラグメントにコンジュゲートする方法は当該技術分野で公知である。そのような方法は、放射性標識またはキレートのタンパク質への結合を促進する条件（例えば、ｐＨ、塩濃度及び／または温度）下でタンパク質を放射性標識とインキュベートすることを伴う（例えば、米国特許第６，００１，３２９号を参照されたい）。
蛍光標識（「フルオロフォア」と称する場合がある）をタンパク質（例えば、抗体）にコンジュゲートするための方法はタンパク質化学の分野において公知である。例えば、フルオロフォアを、フルオロフォアに付着したスクシンイミジル（ＮＨＳ）エステルまたはテトラフルオロフェニル（ＴＦＰ）エステル部分を使用してタンパク質の遊離アミノ基（例えばリジンの）またはスルフヒドリル基（例えばシステイン）にコンジュゲートすることができる。一部の実施形態では、フルオロフォアを、スルホ－ＳＭＣＣなどのヘテロ二官能性架橋剤部分にコンジュゲートすることができる。好適なコンジュゲート方法は、抗体またはそのフラグメントを、フルオロフォアのタンパク質への結合を促進する条件下で、フルオロフォアとインキュベートすることを伴う。例えば、Ｗｅｌｃｈ ａｎｄ Ｒｅｄｖａｎｌｙ（２００３）“Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｒａｄｉｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ：Ｒａｄｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，”Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ（ＩＳＢＮ ０４７１４９５６０３）を参照されたい。
一部の実施形態では、抗体またはフラグメントは、例えば、循環中、例えば、血液、血清または他の組織中の抗体の安定化及び／または保持を改善する部分を用いて修飾することができる。例えば、抗体またはフラグメントは、例えば、Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．（１９９９）Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ Ｃｈｅｍ １０（６）：９７３－８；Ｋｉｎｓｔｌｅｒ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｉｅｓ Ｒｅｖｉｅｗｓ ５４：４７７－４８５；及びＲｏｂｅｒｔｓ ｅｔ ａｌ．（２００２）Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｒｅｖｉｅｗｓ ５４：４５９－４７６に記載のようにＰＥＧ化する、またはＨＥＳ化することができる（Ｆｒｅｓｅｎｉｕｓ Ｋａｂｉ，Ｇｅｒｍａｎｙ；例えば、Ｐａｖｉｓｉｃ ｅｔ ａｌ．（２０１０）Ｉｎｔ Ｊ Ｐｈａｒｍ ３８７（１－２）：１１０－１１９を参照されたい）。安定化部分は、抗体（またはフラグメント）の安定性または保持を少なくとも１．５（例えば、少なくとも２、５、１０、１５、２０、２５、３０、４０または５０以上）倍改善することができる。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントは、グリコシル化することができる。一部の実施形態では、本明細書に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントは、抗体またはフラグメントのグリコシル化が低下または存在しないように、酵素処理もしくは化学処理に供されるか、または細胞から産生されることができる。グリコシル化が低下した抗体を産生するための方法は、当該技術分野で公知であり、例えば、米国特許第６，９３３，３６８号；Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．（１９９１）ＥＭＢＯ Ｊ １０（１０）：２７１７－２７２３；及びＣｏ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ ３０：１３６１に記載されている。
医薬組成物及び製剤
ある特定の実施形態では、本発明は、抗ＣＤ３９抗体を、医薬的に許容可能な希釈剤、担体、可溶化剤、乳化剤、防腐剤及び／またはアジュバントと共に含む医薬組成物を提供する。
ある特定の実施形態では、許容可能な製剤材料は、好ましくは、採用される投与量及び濃度にてレシピエントに対して非毒性である。ある特定の実施形態では、製剤材料（複数可）は、皮下及び／または静脈内投与用である。ある特定の実施形態では、医薬組成物は、例えば、組成物のｐＨ、オスモル濃度、粘度、透明度、色、等張性、匂い、滅菌性、安定性、溶解速度もしくは放出速度、吸着または浸透を改変する、維持する、または保存するための製剤材料を含有することができる。ある特定の実施形態では、好適な製剤材料には、アミノ酸（グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、またはリジンなど）；抗菌剤；酸化防止剤（アスコルビン酸、亜硫酸ナトリウム、または亜硫酸水素ナトリウムなど）；緩衝剤（ホウ酸塩、重炭酸塩、トリス－ＨＣｌ、クエン酸塩、リン酸塩または他の有機酸など）；増量剤（マンニトールまたはグリシンなど）、キレート剤（エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）など）；錯化剤（カフェイン、ポリビニルピロリドン、ベータ－シクロデキストリン、またはヒドロキシプロピル－ベータ－シクロデキストリンなど）；充填剤；単糖；二糖；ならびに他の炭水化物（グルコース、マンノース、またはデキストリン類など）；タンパク質（血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリンなど）；着色剤；香味剤及び希釈剤；乳化剤；親水性ポリマー（ポリビニルピロリドンなど）；低分子量ポリペプチド；塩形成対イオン（ナトリウムなど）；防腐剤（塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸、または過酸化水素など）；溶媒（グリセリン、プロピレングリコール、またはポリエチレングリコールなど）；糖アルコール（マンニトールまたはソルビトールなど）；懸濁剤；界面活性剤もしくは湿潤剤（プルロニック（登録商標）、ＰＥＧ、ソルビタンエステル、ポリソルベート２０、ポリソルベート８０などのポリソルベート、トリトン、トロメタミン、レシチン、コレステロール、チロキサパール（ｔｙｌｏｘａｐａｌ）など）；安定性増強剤（スクロースまたはソルビトールなど）；等張化増強剤（アルカリ金属ハロゲン化物、好ましくは塩化ナトリウムまたは塩化カリウム、マンニトールソルビトールなど）；送達ビヒクル；希釈剤；賦形剤、及び／または医薬アジュバントが含まれるが、これらに限定されない。（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ，ｅｄ．，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ（１９９５）。ある特定の実施形態では、製剤は、ＰＢＳ；２０ｍＭ ＮａＯＡＣ、ｐＨ５．２、５０ｍＭ ＮａＣｌ；及び／または１０ｍＭ ＮＡＯＡＣ、ｐＨ５．２、９％スクロースを含む。ある特定の実施形態では、最適な医薬組成物は、例えば、意図される投与経路、送達形式及び所望の投与量に応じて、当業者によって決定されるだろう。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、上記を参照されたい。ある特定の実施形態では、そのような組成物は、抗ＣＤ３９抗体の物理状態、安定性、ｉｎ ｖｉｖｏ放出速度及び／またはｉｎ ｖｉｖｏクリアランス速度に影響を及ぼし得る。
ある特定の実施形態では、医薬組成物中の主要なビヒクルまたは担体は、本質的に水性または非水性のいずれでもあることができる。例えば、ある特定の実施形態では、好適なビヒクルまたは担体は、注射用水、生理食塩水溶液または人工脳脊髄液であることができ、非経口投与用の組成物に一般的な他の材料が補充されている可能性がある。ある特定の実施形態では、生理食塩水は、等張リン酸緩衝生理食塩水を含む。ある特定の実施態様では、中性緩衝生理食塩水または血清アルブミンと混合された生理食塩水が、さらなる例示的なビヒクルである。ある特定の実施形態では、医薬組成物は、約ｐＨ７．０～８．５のトリス緩衝液、または約ｐＨ４．０～５．５の酢酸緩衝液を含み、これらはさらにソルビトールまたはその好適な代替物を含むことができる。ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体を含む組成物は、所望の純度を有する選択された組成物を、凍結乾燥ケーキまたは水溶液の形態の任意選択の製剤作用物質（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、上記）と混合することによって、貯蔵用に調製することができる。さらに、ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体を含む組成物は、スクロースなどの適切な賦形剤を使用して、凍結乾燥物として製剤化することができる。
ある特定の実施形態では、医薬組成物は、非経口送達用に選択することができる。ある特定の実施形態では、組成物は、吸入または消化管を通じた送達、例えば経口用に選択することができる。そのような医薬的に許容可能な組成物の調製は、当業者の能力の範囲内である。
ある特定の実施形態では、製剤成分は、投与部位に対して許容可能な濃度で存在する。ある特定の実施形態では、緩衝剤を使用して、組成物を生理学的ｐＨまたはわずかに低いｐＨ、典型的には約５～約８のｐＨ範囲内に維持する。
ある特定の実施形態では、非経口投与が企図される場合、治療組成物は、医薬的に許容可能なビヒクル中に、抗ＣＤ３９抗体を含む、発熱物質を含まない非経口的に許容可能な水溶液の形態であり得る。ある特定の実施形態では、非経口注射用のビヒクルは、抗ＣＤ３９抗体が滅菌等張性溶液として製剤化され、適正に保存される滅菌蒸留水である。ある特定の実施形態では、調製は、所望の分子の、その後デポ注射を介して送達することができる産物の制御放出または持続放出を提供できる作用物質、例えば、注射可能なマイクロスフェア、生体浸食性粒子、ポリマー化合物（例えば、ポリ乳酸またはポリグリコール酸）、ビーズまたはリポソームなどとの製剤化を伴う。ある特定の実施形態では、ヒアルロン酸も使用することができ、循環中の持続期間を促進する効果を有することができる。ある特定の実施形態では、移植可能な薬物送達デバイスを使用して、所望の分子を導入することができる。
ある特定の実施形態では、医薬組成物は、吸入用に製剤化され得る。ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、吸入用乾燥粉末として製剤化され得る。ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体を含む吸入溶液は、エアロゾル送達のための噴霧剤と共に製剤化され得る。ある特定の実施形態では、溶液を噴霧化することができる。肺投与は、ＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９４／００１８７５においてさらに記載されており、これは化学的に修飾されたタンパク質の肺送達について記載している。
ある特定の実施形態では、製剤を経口投与できることが企図される。ある特定の実施形態では、この様式で投与される抗ＣＤ３９抗体は、錠剤及びカプセルなどの固体剤形の配合において慣習的に使用される担体を用いて、または用いずに製剤化され得る。ある特定の実施形態では、カプセルは、バイオアベイラビリティが最大化され、前全身分解が最小化されるときに、胃腸管内のポイントで製剤の活性部分を放出するように設計され得る。ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体の吸収を促進するために、少なくとも１つの追加の作用物質を含めることができる。ある特定の実施形態では、希釈剤、香味剤、低融点ワックス、植物油、潤滑剤、懸濁剤、錠剤崩壊剤、及び結合剤も採用することができる。
ある特定の実施形態では、医薬組成物は、錠剤の製造に好適な非毒性の賦形剤との混合物中に有効量の抗ＣＤ３９抗体を伴うことができる。ある特定の実施形態では、錠剤を滅菌水または別の適切なビヒクルに溶解することにより、溶液を単位剤形にて調製することができる。ある特定の実施形態では、好適な賦形剤には、不活性希釈剤、例えば炭酸カルシウム、炭酸ナトリウムもしくは炭酸水素ナトリウム、ラクトース、もしくはリン酸カルシウム；または結合剤、例えばデンプン、ゼラチン、もしくはアラビアゴム；または潤滑剤、例えばステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、もしくはタルクなどが含まれるがこれらに限定されない。
抗ＣＤ３９抗体を持続送達製剤または制御送達製剤中に伴う製剤を含む、追加的な医薬組成物は、当業者には明らかだろう。ある特定の実施形態では、リポソーム担体、生体浸食性微粒子または多孔質ビーズ及びデポ注射などの様々な他の持続送達手段または制御送達手段を製剤化するための技術も当業者には公知である。例えば、ＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９３／００８２９号を参照されたく、これは、医薬組成物の送達のための多孔質ポリマー微粒子の制御放出について記載している。ある特定の実施形態では、持続放出調製物は、半透過性ポリマーマトリックスを、造形品、例えば、フィルム、またはマイクロカプセルの形態で含むことができる。持続放出マトリックスには、ポリエステル、ヒドロゲル、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号及びＥＰ０５８，４８１）、Ｌ－グルタミン酸及びガンマエチル－Ｌ－グルタメートの共重合体（Ｓｉｄｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ，２２：５４７－５５６（１９８３））、ポリ（２－ヒドロキシエチル－メタクリレート）（Ｌａｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｍａｔｅｒ．Ｒｅｓ．，１５：１６７－２７７（１９８１）及びＬａｎｇｅｒ，Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈ．，１２：９８－１０５（１９８２））、エチレン酢酸ビニル（Ｌａｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，上記）またはポリ－Ｄ（－）－３－ヒドロキシ酪酸（ＥＰ１３３，９８８）が含まれる。ある特定の実施形態では、持続放出組成物は、当該技術分野で公知のいくつかの方法のいずれかによって調製され得るリポソームも含むことができる。例えば、Ｅｐｐｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８２：３６８８－３６９２（１９８５）；ＥＰ０３６，６７６；ＥＰ０８８，０４６及びＥＰ１４３，９４９を参照されたい。
ｉｎ ｖｉｖｏ投与に使用される医薬組成物は、典型的には滅菌である。ある特定の実施形態では、これは、滅菌濾過膜を通す濾過によって達成することができる。ある特定の実施形態では、組成物が凍結乾燥される場合、この方法を使用する滅菌は、凍結乾燥及び再構成の前後で行うことができる。ある特定の実施形態では、非経口投与用の組成物は、凍結乾燥形態または溶液にて保存することができる。ある特定の実施形態では、非経口組成物は、一般的に、滅菌アクセスポートを有する容器、例えば、皮下注射針によって穿刺可能なストッパーを有する静脈内輸液バッグまたはバイアルに入れられる。
ある特定の実施形態では、医薬組成物は製剤化されると、溶液、懸濁液、ゲル、乳濁液、固体として、または脱水もしくは凍結乾燥粉末として滅菌バイアル中に保存することができる。ある特定の実施形態では、そのような製剤は、すぐに使用できる形態または投与前に再構成される形態（例えば、凍結乾燥）のいずれかで保存することができる。
ある特定の実施形態では、単回投与単位を産生するためのキットを提供する。ある特定の実施形態では、キットは、乾燥タンパク質を有する第一の容器及び水性製剤を有する第二の容器の両方を含有することができる。ある特定の実施形態では、単一チャンバー及びマルチチャンバーのプレフィルドシリンジ（例えば、液体シリンジ及びリオシリンジ）を含有するキットが含まれる。
ある特定の実施形態では、治療的に採用される抗ＣＤ３９抗体を含む医薬組成物の有効量は、例えば、治療の状況及び目的に依存するだろう。当業者は、ある特定の実施形態に従って、処置のための適切な投与量レベルが、部分的に、送達される分子、抗ＣＤ３９抗体が使用されている適応症、投与経路、ならびに患者のサイズ（体重、体表面積または臓器サイズ）及び／または状態（年齢及び全身健康状態）に依存して、変動するだろうことを理解するだろう。特定の実施形態では、臨床医は、最適な治療効果を得るように、投与量を滴定する及び投与経路を変更することができる。
る特定の実施形態では、投薬の頻度は、使用される製剤中の抗ＣＤ３９抗体の薬物動態パラメータを考慮に入れるだろう。ある特定の実施形態では、臨床医は、所望の効果を達成する投与量に達するまで組成物を投与するだろう。ある特定の実施形態では、組成物は、それゆれ、単回用量として、または２回以上の用量（同じ量の所望の分子を含んでも含まなくてもよい）として経時的に、または移植デバイスもしくはカテーテルを介した持続注入として投与され得る。適切な投与量のさらなる改良は、当業者によって日常的に行われ、彼らが日常的に実施するタスクの範囲内である。ある特定の実施形態では、適切な投与量は、適切な用量反応データの使用を通して確認することができる。
ある特定の実施形態では、医薬組成物の投与経路は、公知の方法に従う、例えば、経口的な、静脈内、腹腔内、脳内（実質内）、脳室内、筋肉内、皮下、眼内、動脈内、門脈内または病巣内経路による注射を通した；持続放出システムによるかまたは移植デバイスによるものである。ある特定の実施形態では、組成物は、ボーラス注射により、または注入により継続的に、または移植デバイスにより投与することができる。ある特定の実施形態では、併用療法の個々の要素は、異なる経路によって投与され得る。
ある特定の実施形態では、組成物を、所望の分子をその上に吸着しているまたはカプセル化している膜、スポンジまたは別の適切な材料の移植を介して局所的に投与することができる。ある特定の実施形態では、移植デバイスを使用する場合、デバイスを、任意の好適な組織または臓器に移植することができ、所望の分子の送達は、拡散、時限放出ボーラス、または連続投与を介することができる。ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体を含む医薬組成物をｅｘ ｖｉｖｏ様式で使用することが望ましい場合がある。そのような場合、患者から取り出された細胞、組織及び／または臓器は、抗ＣＤ３９抗体を含む医薬組成物に曝露され、その後、細胞、組織及び／または臓器は続いて患者の体内に移植し戻される。
ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体は、ポリペプチドを発現及び分泌するように、本明細書に記載するような方法を使用して遺伝子操作されているある特定の細胞を移植することにより、送達することができる。ある特定の実施形態では、そのような細胞は、動物またはヒト細胞であり得、自己、異種（ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ）、または異種（ｘｅｎｏｇｅｎｅｉｃ）であり得る。ある特定の実施形態では、細胞を不死化することができる。ある特定の実施形態では、免疫学的応答の可能性を低減するために、細胞をカプセル化して、周囲の組織の浸潤を回避することができる。ある特定の実施形態では、カプセル化材料は、典型的には、タンパク質産物（複数可）の放出を可能にするが、患者の免疫系による、または周囲組織からの他の有害な因子による、細胞の破壊を防ぐ、生体適合性、半透過性のポリマーエンクロージャまたは膜である。
適用
本明細書に記載の組成物は、多くの診断及び治療用途で使用できる。例えば、検出可能に標識された抗原結合分子は、試料（例えば、生物学的試料）中の標的抗原の存在または量を検出するためのアッセイにおいて使用できる。組成物は、標的抗原機能の阻害を研究するためのｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイにおいて使用できる。例えば、組成物が補体タンパク質に結合して阻害する一部の実施形態では、組成物は、補体活性を阻害するか、さもなければ補体関連障害の処置に有用である、追加の新規化合物を同定するために設計されたアッセイにおける陽性対照として使用できる。例えば、ＣＤ３９阻害性組成物を、ＣＤ３９産生を低下または抑止する追加の化合物（例えば、小分子、アプタマー、または抗体）を同定するためのアッセイにおける陽性対照として使用できる。組成物は、以下に詳述するような治療方法においても使用できる。
一部の実施形態では、本開示は、ＣＤ３９を、生体試料または対象において検出する方法であって、（ｉ）試料または対象（及び任意選択で、参照試料または対象）を、表１内の任意の抗体と、抗体分子及びＣＤ３９の相互作用の発生を可能にする条件下で、接触させること、ならびに（ｉｉ）抗体分子及び試料または対象（及び任意選択で、参照試料または対象）間での複合体の形成を検出することを含む、方法を提供する。
キット
一部の実施形態では、本開示は、本明細書に開示する抗ＣＤ３９抗体、及び使用説明書を含むキットを提供する。一部の実施形態では、本開示は、本明細書に記載するものなどのヒトＣＤ３９に結合する単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分を含む医薬組成物、及び対象の免疫応答の刺激または対象のがんの処置における使用説明書を、１つまたは複数の追加の治療剤または手技との併用説明書を任意選択で伴って含む、キットを提供する。一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤または手技は、化学療法、標的抗がん療法、腫瘍溶解薬、細胞傷害剤、免疫系療法、サイトカイン、外科的手技、放射線手技、共刺激分子の活性化剤、阻害分子の阻害剤、ワクチン、もしくは細胞性免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
一部の実施形態では、キットは、ＰＤ－１アンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、ＣＤ７３阻害剤、ＣＴＬＡ－４阻害剤、ＴＩＭ－３阻害剤、ＬＡＧ－３阻害剤、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法、アントラサイクリン、またはそれらの組み合わせと併用するための説明書を提供する。
一部の実施形態では、キットは、ＣＤ７３阻害剤及びＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせと併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、キットは、ＰＤ－１アンタゴニスト及びアデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせと併用するための説明書を提供する。
一部の実施形態では、キットは、ＰＤ－１アンタゴニストと併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤＲ００１、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１、及びＡＭＰ－２２４からなる群から選択される。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＦＡＺ０５３、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される。
一部の実施形態では、キットは、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストと併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストは、ＮＩＲ１７８、ＣＰＩ－４４４、ＡＺＤ４６３５、ビパデナント、ＧＢＶ－２０３４、及びＡＢ９２８からなる群から選択される。一部の実施形態では、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストは、ＣＰＩ－４４４である。
一部の実施形態では、キットは、ＣＤ７３阻害剤と併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、ＣＤ７３阻害剤は、ＡＢ４２１、ＭＥＤＩ９４４７、及びＢＭＳ－９８６１７９からなる群から選択される。
一部の実施形態では、キットは、ＣＴＬＡ－４阻害剤と併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、ＣＴＬＡ－４阻害剤は、イピリムマブまたはトレメリムマブである。
一部の実施形態では、キットは、ＴＩＭ－３阻害剤と併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、ＴＩＭ－３阻害剤は、ＭＧＢ４５３またはＴＳＲ－０２２である。
一部の実施形態では、キットは、ＬＡＧ－３阻害剤と併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、ＬＡＧ－３阻害剤は、ＬＡＧ５２５、ＢＭＳ－９８６０１６、及びＴＳＲ－０３３からなる群から選択される。
一部の実施形態では、キットは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法と併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、ＣＡＲ細胞療法は、ＣＴＬ０１９である。
一部の実施形態では、キットは、アントラサイクリンと併用するための説明書を提供する。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、及びバルルビシンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシンである。
キットは、本明細書に開示する抗ＣＤ３９抗体、及び使用説明書を含み得る。キットは、好適な容器内に、抗ＣＤ３９抗体、１つまたは複数の対照、及び当該技術分野で周知の様々な緩衝剤、試薬、酵素及び他の標準的な成分を含み得る。一部の態様では、本開示は、本明細書に開示する抗ＣＤ３９抗体または抗原結合部分、及び対象の免疫応答の刺激または対象のがんの処置における使用説明書を、本明細書に開示する１つまたは複数の追加の治療剤または手技との併用説明書を任意選択で伴って含む、キットを提供する。
容器は、少なくとも１つのバイアル、ウェル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジ、または他の容器手段を含むことができ、その中に抗ＣＤ３９抗体を入れ、場合によっては好適に分注し得る。追加の成分が提供される場合、キットは、この成分を入れ得る追加の容器を含有することができる。キットはさらに、商業的販売のために密閉した状態で、抗ＣＤ３９抗体を含有するための手段及び他の試薬容器を含むことができる。そのような容器は、所望のバイアルが保持される射出またはブロー成形プラスチック容器を含み得る。容器及び／またはキットは、使用説明書及び／または注意書きを伴うラベルを含むことができる。
使用方法
本発明の組成物は、ＣＤ３９及び／またはＣＤ３９機能の拮抗作用の検出及び／または定量化を伴う多数のｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏでの有用性を有する。
一部の実施形態では、本開示は、対象の免疫応答を刺激する方法及び使用を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含む。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法及び使用を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含む。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、腫瘍微小環境におけるＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）または細胞外アデノシン二リン酸（ｅＡＤＰ）の細胞外アデノシン一リン酸（ＡＭＰ）への変換を阻害または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベルを増加または増強し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）のレベルを増加または増強し、細胞外アデノシンのレベルを低減または低下し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境における細胞外アデノシン三リン酸（ｅＡＴＰ）の免疫刺激レベルを維持、増加、または増強し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、腫瘍微小環境におけるリンパ球の増殖を増加または増強し、それによってがんを処置する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、１つまたは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分、または医薬組成物は、ＣＤ３９の酵素活性を阻害または低下し、ＣＤ３９の酵素活性の阻害または低下は、樹状細胞からの１つまたは複数のサイトカインの分泌を増強する。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、がんは、肺癌（例えば、非小細胞肺癌）、卵巣癌、腎臓癌、精巣癌、膵臓癌、乳癌（例えば、トリプルネガティブ乳癌）、黒色腫、頭頸部癌（例えば、扁平上皮性頭頸部癌）、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳癌、リンパ腫または腎癌（例えば、腎細胞癌）からなる群から選択される。
上記の組成物は、とりわけ、対象における様々ながんを処置または予防するための方法において有用である。組成物は、対象、例えばヒト対象に、投与経路に一部依存する様々な方法を使用して、投与することができる。経路は、例えば、静脈内注射もしくは注入（ＩＶ）、皮下注射（ＳＣ）、腹腔内（ＩＰ）注射、筋肉内注射（ＩＭ）、または髄腔内注射（ＩＴ）であり得る。注射は、ボーラスまたは持続注入であり得る。
投与は、例えば、局所注入、注射によって、またはインプラントを用いることによって達成することができる。インプラントは、多孔性、非多孔性、またはゼラチン性材料のものであり得、膜、例えばシアラスティック（ｓｉａｌａｓｔｉｃ）膜、または繊維のものが含まれる。インプラントは、対象への組成物の持続的または周期的な放出のために構成され得る。例えば、米国特許出願公開第２００８０２４１２２３号；米国特許第５，５０１，８５６号；同第４，８６３，４５７号；及び同第３，７１０，７９５号；ＥＰ４８８４０１；及びＥＰ４３０５３９を参照されたく、このそれぞれの開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。組成物は、例えば、拡散システム、侵食システム、または対流システムに基づく移植可能デバイス、例えば、浸透圧ポンプ、生体分解性インプラント、電気拡散システム、電気浸透システム、蒸気圧ポンプ、電解ポンプ、気泡ポンプ、圧電ポンプ、侵食ベースのシステム、または電子機械システムにより、対象に送達することができる。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントは、局所投与によって対象に治療的に送達される。
本明細書に記載の抗体またはそのフラグメントの好適な用量であって、対象のがんを処置または予防することができる用量は、例えば、処置される対象の年齢、性別、及び体重、ならびに用いられる特定の阻害剤化合物を含む様々な因子に依存し得る。例えば、がんを有する対象を処置するには、同じ対象を処置するのに必要とされるＣＤ３９結合Ｆａｂ’抗体フラグメントの用量と比較して、異なる用量の全抗ＣＤ３９抗体が必要とされ得る。対象に投与される用量に影響を与える他の因子には、例えば、がんの種類または重症度が含まれる。例えば、転移性黒色腫を有する対象は、神経膠芽腫を有する対象とは異なる投与量の抗ＣＤ３９抗体の投与を必要とし得る。他の因子には、例えば、同時にまたは以前に対象が罹患した他の医学的障害、対象の全身健康状態、対象の遺伝的性質、食事、投与時間、排出速度、併用薬物、及び対象に投与される任意の他の追加の治療剤が含まれ得る。また、任意の特定の対象に対する特定の投与量及び処置計画は、処置を行う医療従事者（例えば、医師または看護師）の判断にも依存するだろうことが理解されたい。好適な投与量は、本明細書に記載する。
医薬組成物は、治療有効量の本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントを含むことができる。そのような有効量は、投与される抗体の効果、または複数の作用物質が使用される場合、抗体及び１つまたは複数の追加の活性剤のコンビナトリアル効果に一部基づいて、当業者によって容易に決定され得る。本明細書に記載の抗体またはそのフラグメントの治療有効量はまた、個体の疾患状態、年齢、性別及び体重ならびに個体における所望の応答、例えば、腫瘍増殖の低下を誘発する抗体（及び１つまたは複数の活性剤）の能力などの因子に従って変動し得る。例えば、抗ＣＤ３９抗体の治療有効量は、当該技術分野で公知であるまたは本明細書に記載する特定の障害及び／または特定の障害の症状のいずれか１つを阻害する（重症度を緩和するまたは発症を取り除く）及び／または予防することができる。治療有効量は、組成物の任意の毒性効果または有害効果を治療的に有益な効果が上回る量でもある。
本明細書に記載の抗体またはそのフラグメントのいずれかの好適なヒト用量は、例えば、第Ｉ相用量漸増研究においてさらに評価することができる。例えば、ｖａｎ Ｇｕｒｐ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ａｍ Ｊ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ ８（８）：１７１１－１７１８；Ｈａｎｏｕｓｋａ ｅｔ ａｌ．（２００７）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ １３（２，ｐａｒｔ １）：５２３－５３１；及びＨｅｔｈｅｒｉｎｇｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（２００６）Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ａｇｅｎｔｓ ａｎｄ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ ５０（１０）：３４９９－３５００を参照されたい。
一部の実施形態では、組成物が全体として治療上有効であるように、本明細書に記載の抗体またはその抗原結合フラグメントのいずれか及び１つまたは複数（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１１以上）の追加の治療剤を含有する。例えば、組成物は、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体及びアルキル化剤を含有することができ、抗体及び作用物質はそれぞれ、組み合わせた場合に、対象のがん（例えば、黒色腫）の処置または予防に治療上有効な濃度である。
そのような組成物の毒性及び治療効果は、細胞培養または実験動物（例えば、本明細書に記載のがんのいずれかの動物モデル）における公知の薬学的手順によって決定することができる。これらの手順は、例えば、ＬＤ５０（集団の５０％に対する致死量）及びＥＤ５０（集団の５０％に対する治療有効用量）を決定するために使用され得る。毒性効果及び治療効果との間の用量比は治療指数であり、ＬＤ５０／ＥＤ５０の比率として表すことができる。高い治療指数を示す抗体またはその抗原結合フラグメントが好ましい。有毒な副作用を呈する組成物を使用してよいが、そのような化合物を患部組織の部位に標的化し、正常細胞への潜在的な損傷を最小限に抑え、それによって副作用を減らす送達システムを設計するように注意するべきである。
細胞培養アッセイ及び動物研究から得られたデータは、ヒトにおける使用のための投与量の範囲の策定に使用できる。そのような抗体または抗原結合フラグメントの投与量は、一般的には、毒性をほとんどまたは全く伴わないＥＤ５０を含む抗体またはフラグメントの循環濃度の範囲内に収まる。投与量は、採用される剤形及び利用される投与経路に依存して、この範囲内で変動し得る。本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体について、治療有効用量は、最初に細胞培養アッセイから推定することができる。用量は、細胞培養で決定されるＩＣ５０（すなわち、症状の最大の半分の阻害を達成する抗体の濃度）を含む循環血漿濃度範囲を達成するように、動物モデルにおいて策定され得る。このような情報を使用して、ヒトにおける有用な用量をより正確に決定することができる。血漿中のレベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーによって測定され得る。例えば、（例えば、目または関節への）局所投与が望ましい一部の実施形態では、細胞培養または動物モデリングを使用して、局所部位内で治療有効濃度を達成するために必要な用量を決定することができる。
一部の実施形態では、本方法は、がんの他の治療と併せて実施することができる。例えば、組成物は、対象に、放射線、手術、標的化もしくは細胞傷害性化学療法、化学放射線療法、ホルモン療法、免疫療法、遺伝子療法、細胞移植療法、精密医療、ゲノム編集療法、または他の薬物療法と同時に、その前または後に、投与することができる。
上記のように、本明細書に記載の組成物（例えば、抗ＣＤ３９組成物）を使用して、様々ながん、例えば限定されないが、カポジ肉腫、白血病、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、骨髄芽球前骨髄球性骨髄単球性単球性赤白血病、慢性白血病、慢性骨髄性（顆粒球性）白血病、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、バーキットリンパ腫及び辺縁帯Ｂ細胞性リンパ腫、真性赤血球増加症リンパ腫、ホジキン病、非ホジキン病、多発性骨髄腫、ウォルデンストレームマクログロブリン血症、重鎖疾患、固形腫瘍、肉腫、及び癌種、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、骨肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、滑膜腫、中皮腫、ユーイング腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸肉腫、結腸直腸癌、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、乳頭癌、乳頭腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、肝癌、胆管癌、絨毛癌、精上皮腫、胎児性癌、ウィルムス腫瘍、子宮頸癌、子宮癌、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫、乏突起神経膠腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、上咽頭癌、食道癌、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳及び中枢神経系（ＣＮＳ）癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸直腸癌、結合組織癌、消化器系癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌、上皮内腫瘍、腎臓癌、喉頭癌、肝癌、肺癌（小細胞、大細胞）、黒色腫、神経芽細胞腫；口腔癌（例えば、唇、舌、口、咽頭）、卵巣癌、膵臓癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌；呼吸器系癌、肉腫、カポジ肉腫、皮膚癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌、ならびに泌尿器系癌を処置することができる。
優先される適応症は、様々なタンパク質発現パターンに基づいて選択され得る：１）ごくわずかなＣＤ３９を正常細胞で発現し、腫瘍組織（肺癌、卵巣癌、膵臓癌、腎臓癌、精巣癌）における上方制御を伴う、２）造血器癌（Ｂ細胞リンパ腫、急性骨髄原性白血病、急性骨髄性白血病）でのＣＤ３９発現を維持、及び３）骨髄性またはＴｒｅｇが豊富な癌（乳癌、胃癌、頭頸部癌、食道癌）での陽性ＣＤ３９発現。
併用療法
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、１つまたは複数の追加の治療法または処置、例えば、がんの別の治療法または処置と組み合わせることができる。例えば、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、対象（例えば、ヒト患者）に、１つまたは複数の追加の治療剤と組み合わせて投与することができ、その組み合わせは、がんを有する、または発症のリスクがある対象に対して治療上の利益を提供する。
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分、及び１つまたは複数の追加の治療剤は、同じ時に（例えば、同時に）投与される。他の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、時間に関して最初に投与され、１つまたは複数の追加の治療剤が時間に関して２番目に投与される（例えば、順次）。一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤が時間に関して最初に投与され、抗ＣＤ３９抗体が時間に関して２番目に投与される。
本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントは、以前または現在施されている治療を、置き換えるか、または増大させることができる。例えば、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントを用いて処置する際、１つまたは複数の追加の治療剤の投与を中止または減少させる、例えば、より低いレベルで投与することができる。一部の実施形態では、以前の治療の投与を維持することができる。一部の実施形態では、以前の治療は、抗ＣＤ３９抗体のレベルが治療効果を提供するのに十分なレベルに達するまで、維持されるだろう。
一部の実施形態では、本開示は、対象のがんを処置する方法を提供し、該方法は、対象に、本開示により提供する、ＣＤ３９に結合して拮抗する、有効量の単離された抗体またはその抗原結合部分を、１つまたは複数の追加の治療剤または手技と組み合わせて投与することを含み、第二の治療剤または手技は、化学療法、標的抗がん療法、腫瘍溶解薬、細胞傷害剤、免疫系療法、サイトカイン、外科的手技、放射線手技、共刺激分子の活性化剤、阻害分子の阻害剤、ワクチン、もしくは細胞性免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＰＤ－１アンタゴニスト、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニスト、ＣＤ７３阻害剤、ＣＴＬＡ－４阻害剤、ＴＩＭ－３阻害剤、ＬＡＧ－３阻害剤、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法、アントラサイクリン、またはそれらの組み合わせである。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＣＤ７３阻害剤及びＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである。一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＰＤ－１アンタゴニスト及びアデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストの組み合わせである。一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＰＤ－１アンタゴニストである。
一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤＲ００１、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、ピディリズマブ、ＭＥＤＩ０６８０、ＲＥＧＮ２８１０、ＴＳＲ－０４２、ＰＦ－０６８０１５９１、及びＡＭＰ－２２４からなる群から選択される。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＦＡＺ０５３、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びＢＭＳ－９３６５５９からなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストである。一部の実施形態では、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストは、ＮＩＲ１７８、ＣＰＩ－４４４、ＡＺＤ４６３５、ビパデナント、ＧＢＶ－２０３４、及びＡＢ９２８からなる群から選択される。一部の実施形態では、アデノシンＡ２ＡＲアンタゴニストは、ＣＰＩ－４４４である。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＣＤ７３阻害剤である。一部の実施形態では、ＣＤ７３阻害剤は、ＡＢ４２１、ＭＥＤＩ９４４７、及びＢＭＳ－９８６１７９からなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＣＴＬＡ－４阻害剤である。一部の実施形態では、ＣＴＬＡ－４阻害剤は、イピリムマブまたはトレメリムマブである。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＴＩＭ－３阻害剤である。一部の実施形態では、ＴＩＭ－３阻害剤は、ＭＧＢ４５３またはＴＳＲ－０２２である。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、ＬＡＧ－３阻害剤である。一部の実施形態では、ＬＡＧ－３阻害剤は、ＬＡＧ５２５、ＢＭＳ－９８６０１６、及びＴＳＲ－０３３からなる群から選択される。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）細胞療法である。一部の実施形態では、ＣＡＲ細胞療法は、ＣＴＬ０１９である。
一部の実施形態では、１つまたは複数の追加の治療剤は、アントラサイクリンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、及びバルルビシンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシンである。
化学療法剤との組み合わせ
一部の実施形態では、化学療法剤は、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体と組み合わせて使用される。例示的な化学療法剤としては、アントラサイクリン（例えば、ドキソルビシン、イダルビシン、ダウノルビシン、シタラビン、エピルビシン、バルルビシン及びミトキサントロン）（例えば、Ｍｉｎｏｔｔｉ ｅｔ ａｌ．，（２００４）Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｒｅｖ ５６（２）：１８５－２２９を参照されたい）、トポイソメラーゼ阻害剤（例えば、トポテカン；ハイカムチン、カンプトテシン、エトポシド）（例えば、Ｐｏｍｍｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，（２０１０）Ｃｈｅｍ Ｂｉｏｌ １７（５）：４２１－４３３を参照されたい；これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）、ブレオマイシン（Ｋｉｍｕｒａ ｅｔ ａｌ．，（１９７２）Ｃａｎｃｅｒ ２９（１）：５８－６０）、ゲムシタビン（Ｐｌｕｎｋｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，（１９９５）Ｓｅｍｉｎ Ｏｎｃｏｌ ２２（４ Ｓｕｐｐｌ １１）：３－１０）、プラチン類（例えば、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン、サトラプラチン、ピコプラチン）（Ｋｅｌｌａｎｄ（２００７）Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｃａｎｃｅｒ ７（８）：５７３－５８４）、タキサン類（例えば、ドセタキセル、パクリタキセル、アブラキサン）（Ａｂａｌ ｅｔ ａｌ．，（２００３）Ｃｕｒｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇｅｔｓ ３（３）：１９３－２０３）、ＤＮＡアルキル化剤（例えば、シクロホスファミド、ベンダムスチン）（Ｌｅｏｎｉ ｅｔ ａｌ．，（２００８）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ １４（１）：３０９－３１７）、ＣＨＯＰ（シクロホスファミド、塩酸ドキソルビシン、ビンクリスチン及びプレドニゾンの薬物組み合わせ）（Ｄｕｎｌｅａｖｙ（２０１４）Ｈｅｍａｔｏｌｏｇｙ Ａｍ Ｓｏｃ Ｈｅｍａｔｏｌ Ｅｄｕｃ Ｐｒｏｇｒａｍ ２０１４（１）：１０７－１１２）、ならびにフルオロウラシル及びその誘導体（Ａｌｖａｒｅｚ ｅｔ ａｌ．，（２０１２）Ｅｘｐｅｒｔ Ｏｐｉｎ Ｔｈｅｒ Ｐａｔ ２２（２）：１０７－１２３、これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）が挙げられるが、これらに限定されない。
最近の研究は、特定の化学療法剤（例えば、アントラサイクリン）を用いた治療結果が、がん細胞における免疫原性細胞死（ＩＣＤ）のプロセスを誘発する能力と強く相関することを実証している。このプロセスは、免疫系を刺激して腫瘍細胞を認識し排除する、一連のシグナルを生成する。広範な研究により、化学療法誘発性ＩＣＤが、カルレティキュリン（ＣＡＬＲ）、ＡＴＰ、ケモカイン（Ｃ－Ｘ－Ｃモチーフ）リガンド１０（ＣＸＣＬ１０）及び高移動度グループボックス１（ＨＭＧＢ１）の曝露／放出を介して生じることが明らかにされている（Ｇｅｂｒｅｍｅｓｋｅｌ ａｎｄ Ｊｏｈｎｓｔｏｎ（２０１５）６（３９）：４１６００－４１６１９）。一部の実施形態では、化学療法剤は、免疫原性細胞死（ＩＣＤ）を誘発する。一部の実施形態では、ＩＤＣを誘発する作用物質は、アントラサイクリンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシン、ダウノルビシン、エピルビシン、イダルビシン、及びバルルビシンである。一部の実施形態では、アントラサイクリンは、ドキソルビシンである。一部の実施形態では、ＩＣＤを誘発する作用物質は、白金誘導体である。一部の実施形態では、白金誘導体は、オキサリプラチン、カルボプラチン、及びシスプラチンから選択される。一部の実施形態では、白金誘導体は、オキサリプラチンである。
本発明の組成物と組み合わせて及び／または同時投与するのに好適な他の化学療法剤には、例えば、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭素エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルチシン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１－デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、及びピュロマイシン、ならびにそれらの類似体または相同体が含まれる。さらなる作用物質としては、例えば、代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサート、６－メルカプトプリン、６－チオグアニン、シタラビン、５－フルオロウラシル、デカルバジン）、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオテパ、クロランブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）、ロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、シス－ジクロロジアミンプラチナ（ＩＩ）（ＤＤＰ）、プロカルバジン、アルトレタミン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、サトラプラチン、または四硝酸トリプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（以前のダウノマイシン）及びドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（以前のアクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシン、及びアントラマイシン（ＡＭＣ））、及び抗有糸分裂剤（例えば、ビンクリスチン及びビンブラスチン）、及びテモゾロミドが含まれる。
ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストとの組み合わせ
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ヒトＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に結合して、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１生物学的活性及び／またはヒトＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達により媒介される下流経路（複数可）及び／または細胞プロセスまたは他のヒトＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１媒介機能を阻害する１つまたは複数のＰＤ－１アンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
従って、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１生物学的活性、例えば、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達により媒介される下流経路及び／または細胞プロセス、例えばＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１に対する受容体結合及び／または細胞反応の誘発を、直接またはアロステリックに遮断、拮抗、抑制、阻害または低下するＰＤ－１アンタゴニストを本明細書に提供する。細胞または対象によって産生されるヒトＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１の数量または量を低下するＰＤ－１アンタゴニストも本明細書に提供する。
一部の実施形態では、本開示は、ヒトＰＤ－１と結合し、ＰＤ－１へのＰＤ－Ｌ１結合を防止、阻害または低下するＰＤ－１アンタゴニストを提供する。一部の態様では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１をコードするｍＲＮＡに結合し、翻訳を防止する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１をコードするｍＲＮＡに結合し、分解及び／または代謝回転を引き起こす。
一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１シグナル伝達または機能を阻害する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、またはＰＤ－Ｌ１及びＰＤ－Ｌ２の両方への結合を遮断する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ１への結合を遮断する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ２への結合を遮断する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ１及びＰＤ－Ｌ２への結合を遮断する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１と結合する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１と結合する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ２と結合する。
一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１の、その同族リガンドへの結合を阻害する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ１への結合、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ２への結合、またはＰＤ－１のＰＤ－Ｌ１及びＰＤ－Ｌ２の両方への結合を阻害する。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１の、その同族リガンドへの結合を阻害しない。
一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に結合する単離された抗体（ｍＡｂ）またはその抗原結合フラグメントである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－Ｌ１に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－Ｌ１に結合し、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への結合を阻害する抗体または抗原結合フラグメントである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１に結合し、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への結合を阻害する抗体または抗原結合フラグメントである。
ＰＤ－１ならびにそのリガンドＰＤ－Ｌ１及びＰＤ－Ｌ２のいずれか一方または両方の間の相互作用を阻害または妨害するいくつかの免疫チェックポイントアンタゴニストは、臨床開発中である、またはがんを処置するために臨床医が現在利用可能である。
本開示が提供する組成物、方法、及び使用のいずれかにおいてＰＤ－１アンタゴニストを含み得る抗ヒトＰＤ－１抗体またはその抗原結合フラグメントの例としては、限定はされないが：ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペムブロリズマブ、ＭＫ－３４７５、ｈ４０９Ａ１１；ＵＳ８９５２１３６、ＵＳ８３５４５０９、ＵＳ８９００５８７、及びＥＰ２１７０９５９を参照されたく、これらは全て参照によりその全体が本明細書に含まれる；Ｍｅｒｃｋ）、ＯＰＤＩＶＯ（登録商標）（ニボルマブ、ＢＭＳ－９３６５５８、ＭＤＸ－１１０６、ＯＮＯ－４５３８；ＵＳ７５９５０４８、ＵＳ８７２８４７４、ＵＳ９０７３９９４、ＵＳ９０６７９９９、ＥＰ１５３７８７８、ＵＳ８００８４４９、ＵＳ８７７９１０５、及びＥＰ２１６１３３６を参照されたく、これらは全て参照によりその全体が本明細書に含まれる；Ｂｒｉｓｔｏｌ Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）、ＭＥＤＩ０６８０（ＡＭＰ－５１４）、ＢＧＢ－Ａ３１７及びＢＧＢ－１０８（ＢｅｉＧｅｎｅ）、２４４Ｃ８及び３８８Ｄ４（ＷＯ２０１６１０６１５９を参照されたく、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；Ｅｎｕｍｅｒａｌ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ）、ＰＤＲ００１（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ならびにＲＥＧＮ２８１０（Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ）が挙げられる。従って、一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ペムブロリズマブである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ニボルマブである。
本開示が提供する組成物、方法、及び使用のいずれかにおいてＰＤ－１アンタゴニストを含み得る抗ヒトＰＤ－Ｌ１抗体またはその抗原結合フラグメントの例としては、限定されないが：ＢＡＶＥＮＣＩＯ（登録商標）（アベルマブ、ＭＳＢ００１０７１８Ｃ、ＷＯ２０１３／７９１７４を参照されたく、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；Ｍｅｒｃｋ／Ｐｆｉｚｅｒ）、ＩＭＦＩＮＺＩ（登録商標）（デュルバルマブ、ＭＥＤＩ４７３６）、ＴＥＣＥＮＴＲＩＱ（登録商標）（アテゾリズマブ、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＲＧ７４４６；ＷＯ２０１０／０７７６３４を参照されたく、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；Ｒｏｃｈｅ）、ＭＤＸ－１１０５（ＢＭＳ－９３６５５９、１２Ａ４；ＵＳ７９４３７４３及びＷＯ２０１３／１７３２２３を参照されたく、これらは両方とも参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；Ｍｅｄａｒｅｘ／ＢＭＳ）、及びＦＡＺ０５３（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）が挙げられる。従って、一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、アベルマブである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、デュルバルマブである。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、アテゾリズマブである。
一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１またはヒトＰＤ－Ｌ１に結合するイムノアドヘシン、例えば、免疫グロブリン分子のＦｃ領域などの定常領域に融合したＰＤ－Ｌ１またはＰＤ－Ｌ２の細胞外またはＰＤ－１結合部分を含有する融合タンパク質である。ＰＤ－１に結合するイムノアドヘシン分子の例は、ＷＯ２０１０／０２７８２７及びＷＯ２０１１／０６６３４２に記載されており、これらは両方とも、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、ＰＤ－１アンタゴニストは、ヒトＰＤ－１に結合するＰＤ－Ｌ２－ＦＣ融合タンパク質であるＡＭＰ－２２４（Ｂ７－ＤＣＩｇとしても知られる）である。
ＰＤ－１またはＰＤ－Ｌ１に結合し、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達経路を破壊する任意のＰＤ－１アンタゴニストが、本明細書に開示する組成物、方法、及び使用に好適であることが当業者によって理解されるだろう。
一部の実施形態では、ＰＤ－１／ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、小分子、核酸、ペプチド、ペプチド模倣物、タンパク質、炭水化物、炭水化物誘導体、または糖ポリマーである。例示的な小分子ＰＤ－１阻害剤は、Ｚｈａｎ ｅｔ ａｌ．，（２０１６）Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｔｏｄａｙ ２１（６）：１０２７－１０３６に記載されている。
ＣＤ７３阻害剤との組み合わせ
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＣＤ７３阻害剤と組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。ＣＤ７３阻害剤の非限定的な例としては、ＡＢ４２１（Ａｒｃｕｓ）、ＣＤ７３に結合する抗体またはその抗原結合部分、例えばＭＥＤＩ９４４７（Ｍｅｄｉｍｍｕｎｅ）、ＢＭＳ－９８６１７９（Ｂｒｉｓｔｏｌ Ｍｅｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）、または参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＵＳ２０１８／０００９８９９（Ｃｏｒｖｕｓ）に記載のものが挙げられる。
アデノシンＡ２Ａ受容体アンタゴニストとの組み合わせ
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、アデノシンＡ２Ａ受容体（Ａ２ＡＲ）アンタゴニストと組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。Ａ２ＡＲアンタゴニストの非限定的な例としては、プレラデナント／ＳＣＨ４２０８１４（Ｍｅｒｃｋ／Ｓｃｈｅｒｉｎｇ、ＣＡＳ登録番号：３７７７２７－８７－２）、これはＨｏｄｇｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，（２００９）Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｅｘｐ Ｔｈｅｒ ３３０（１）：２９４－３０３に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；ＳＴ－４２０６（Ｌｅａｄｉａｎｔ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、これは米国特許第９，１３３，１９７号に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；ＫＷ－６３５６（Ｋｙｏｗａ Ｈａｋｋｏ Ｋｏｇｙｏ）、トザデナント／ＳＹＮ－１１５（Ａｃｏｒｄａ）、イストラデフィリン／ＫＷ－６００２（Ｋｙｏｗａ Ｈａｋｋｏ Ｋｏｇｙｏ、ＣＡＳ登録番号：１５５２７０－９９－８）、これはＬｅ Ｗｉｔｔ ｅｔ ａｌ．，（２００８）Ａｎｎ Ｎｅｕｒｏｌ ６３（３）：２９５－３０２に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；テオフィリン（ＣＡＳ登録番号：５８－５５－９）、ＮＩＲ１７８（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）；ＡＢ９２８（Ａｒｃｕｓ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、ＧＢＶ－２０３４（Ｇｌｏｂａｖｉｒ）、ビパデナント（Ｒｅｄｏｘ／Ｊｕｎｏ）、ＡＺＤ４６３５／ＨＴＬ－１０７１（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ／Ｈｅｐｔａｒｅｓ）、これはＷＯ２０１１／０９５６２５に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；ＣＰＩ－４４４／Ｖ８１４４４（Ｃｏｒｖｕｓ／Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、これはＷＯ２００９／１５６７３７に記載されおり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる；及びＰＢＦ５０９（Ｐａｌｏｂｉｏｆａｒｍａ／Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、これはＵＳ８，７９６，２８４及びＷＯ２０１７／０２５９１８に記載されており、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、が挙げられる。一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＣＰＩ－４４４と組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。
一部の実施形態では、Ａ２ＡＲアンタゴニストは、ＵＳ８１１４８４５、ＵＳ９０２９３９３、ＵＳ２０１７００１５７５８、またはＵＳ２０１６０１２９１０８に記載されているＡ２ＡＲアンタゴニストであり、これらは全て、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
他の例示的なＡ２ＡＲアンタゴニストとしては、ＡＴＬ－４４４、ＭＳＸ－３、ＳＣＨ－５８２６１、ＳＣＨ－４１２，３４８、ＳＣＨ－４４２，４１６、ＶＥＲ－６６２３、ＶＥＲ－６９４７、ＶＥＲ－７８３５、ＣＧＳ－１５９４３、またはＺＭ－２４１，３８５が挙げられる。
ＣＴＬＡ－４阻害剤との組み合わせ
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＣＴＬＡ－４阻害剤と組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。一部の実施形態では、ＣＴＬＡ－４阻害剤は、抗体、その抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドである。一部の実施形態では、ＣＴＬＡ－４阻害剤は、イピリムマブ（Ｙｅｒｖｏｙ（登録商標）、Ｂｒｉｓｔｏｌ－Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）である。一部の実施形態では、ＣＴＬＡ－４阻害剤は、トレメリムマブ（Ｐｆｉｚｅｒ）である。抗体イピリムマブ及び他の抗ＣＴＬＡ－４抗体は、ＵＳ６，９８４，７２０に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。抗体トレメリムマブ及び他の抗ＣＴＬＡ－４抗体は、ＵＳ７，４１１，０５７に開示されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ＴＩＭ－３阻害剤との組み合わせ
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＴＩＭ－３阻害剤と組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。ＴＩＭ－３阻害剤は、抗体、その抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。一部の実施形態では、ＴＩＭ－３阻害剤は、ＭＧＢ４５３（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＴＳＲ－０２２（Ｔｅｓａｒｏ）、またはＬＹ３３２１３６７（Ｅｌｉ Ｌｉｌｌｙ）から選択される。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＭＧＢ４５３と組み合わせて投与される。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＴＳＲ－０２２と組み合わせて投与される。
ＬＡＧ－３阻害剤との組み合わせ
一部の実施形態では、本開示により提供する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、ＬＡＧ－３阻害剤と組み合わされる（例えば、組み合わせて投与される）。ＬＡＧ－３阻害剤は、抗体、その抗原結合フラグメント、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。一部の実施形態では、ＬＡＧ－３阻害剤は、ＬＡＧ５２５（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＢＭＳ－９８６０１６（Ｂｒｉｓｔｏｌ－Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）、ＴＳＲ－０３３（Ｔｅｓａｒｏ）、ＭＫ－４２８０（Ｍｅｒｃｋ＆Ｃｏ）、またはＲＥＧＮ３７６７（Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ）から選択される。
ＣＡＲ細胞療法との組み合わせ
一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合部分は、１つまたは複数の追加の治療剤と組み合わされ（例えば、組み合わせて投与される）、ここで、１つまたは複数の追加の治療剤は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含む細胞、例えば、免疫エフェクター細胞を含む。一部の実施形態では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む。一部の実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、一次シグナル伝達ドメイン及び共刺激シグナル伝達ドメインの一方または両方を含む。一部の実施形態では、ＣＡＲは、リーダー配列、任意選択でヒンジ配列をさらに含み得る。一部の実施形態では、抗原結合ドメインは、腫瘍抗原に結合する。
一部の実施形態では、ＣＡＲを含む抗原結合ドメインは、限定されないが例えば、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、組換え抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、及びその機能性フラグメントまたは部分の抗原に結合する任意のドメインであることができ、それには、限定されないが、ラクダ科由来ナノボディの重鎖可変ドメイン（ＶＨ）、軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）及び可変ドメイン（ＶＨＨ）などの単一ドメイン抗体、ならびに抗原結合ドメインとして機能することが当該技術分野で知られている代替の足場が含まれる。一部の実施形態では、ＣＡＲの抗体結合ドメインは、ｓｃＦｖ抗体フラグメントである。
一部の実施形態では、ＣＡＲは、ＣＤ１９；ＣＤ１２３；ＣＤ２２；ＣＤ３０；ＣＤ１７１；ＣＳ－１（ＣＤ２サブセット１、ＣＲＡＣＣ、ＳＬＡＭＦ７、ＣＤ３１９及び１９Ａ２４とも称される）；Ｃ型レクチン様分子－１（ＣＬＬ－１またはＣＬＥＣＬ１）；ＣＤ３３；上皮増殖因子受容体変異体ＩＩＩ（ＥＧＦＲｖＩＩＩ）；ガングリオシドＧ２（ＧＤ２）；ガングリオシドＧＤ３（ａＮｅｕ５Ａｃ（２－８）ａＮｅｕ５Ａｃ（２－３）ｂＤＧａｌｐ（１－４）ｂＤＧｌｃｐ（１－１）Ｃｅｒ）；ＴＮＦ受容体ファミリーメンバーＢ細胞成熟（ＢＣＭＡ）；Ｔｎ抗原（（Ｔｎ Ａｇ）または（ＧａｌＮＡｃａ－Ｓｅｒ／Ｔｈｒ））；前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）；受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体１（ＲＯＲ１）；Ｆｍｓ様チロシンキナーゼ３（ＦＬＴ３）；腫瘍関連糖タンパク質７２（ＴＡＧ７２）；ＣＤ３８；ＣＤ４４ｖ６；がん胎児性抗原（ＣＥＡ）；上皮細胞接着分子（ＥＰＣＡＭ）；Ｂ７Ｈ３（ＣＤ２７６）；ＫＩＴ（ＣＤ１１７）；インターロイキン－１３受容体サブユニットアルファ－２（ＩＬ－１３Ｒａ２またはＣＤ２１３Ａ２）；メソテリン；インターロイキン１１受容体アルファ（ＩＬ－１１Ｒａ）；前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）；プロテアーゼセリン２１（テスチシンまたはＰＲＳＳ２１）；血管内皮増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）；ルイス（Ｙ）抗原；ＣＤ２４；血小板由来増殖因子受容体ベータ（ＰＤＧＦＲ－ベータ）；ステージ特異的胎児抗原－４（ＳＳＥＡ－４）；ＣＤ２０；葉酸受容体アルファ；受容体チロシン－プロテインキナーゼＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ２／ｎｅｕ）；ムチン１、細胞表面関連（ＭｕＣ１）；上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）；神経細胞接着分子（ＮＣＡＭ）；プロスターゼ；前立腺酸性ホスファターゼ（ＰＡＰ）；伸長因子２突然変異型（ＥＬＦ２Ｍ）；エフリンＢ２；線維芽細胞活性化タンパク質アルファ（ＦＡＰ）；インスリン様増殖因子１受容体（ＩＧＦ－Ｉ受容体）、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）；プロテアソーム（プロソーム、マクロパイン）サブユニット、ベータ型、９（ＬＭＰ２）；糖タンパク質１００（ｇｐ１００）；切断点クラスター領域（ＢＣＲ）及びエーベルソンマウス白血病ウイルスがん遺伝子ホモログ１（Ａｂｌ）からなるがん遺伝子融合タンパク質（ｂｃｒ－ａｂｌ）；チロシナーゼ；エフリンＡ型受容体２（ＥｐｈＡ２）；フコシルＧＭ１；シアリルルイス接着分子（ｓＬｅ）；ガングリオシドＧＭ３（ａＮｅｕ５Ａｃ（２－３）ｂＤＧａｌｐ（１－４）ｂＤＧｌｃｐ（１－１）Ｃｅｒ）；トランスグルタミナーゼ５（ＴＧＳ５）；高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷＭＡＡ）；ｏ－アセチル－ＧＤ２ガングリオシド（ＯＡｃＧＤ２）；葉酸受容体ベータ；腫瘍内皮マーカー１（ＴＥＭ１／ＣＤ２４８）；腫瘍内皮マーカー７関連物（ＴＥＭ７Ｒ）；クローディン６（ＣＬＤＮ６）；甲状腺刺激ホルモン受容体（ＴＳＨＲ）；Ｇタンパク質共役受容体クラスＣグループ５、メンバーＤ（ＧＰＲＣ５Ｄ）；染色体Ｘオープンリーディングフレーム６１（ＣＸＯＲＦ６１）；ＣＤ９７；ＣＤ１７９ａ；未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）；ポリシアル酸；胎盤特異的１（ＰＬＡＣ１）；ｇｌｏｂｏＨグリコセラミド（ＧｌｏｂｏＨ）の六糖部分；乳腺分化抗原（ＮＹ－ＢＲ－１）；ウロプラキン２（ＵＰＫ２）；Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体１（ＨＡＶＣＲ１）；アドレナリン受容体ベータ３（ＡＤＲＢ３）；パンネキシン３（ＰＡＮＸ３）；Ｇタンパク質共役受容体２０（ＧＰＲ２０）；リンパ球抗原６複合体、座位Ｋ９（ＬＹ６Ｋ）；嗅覚受容体５１Ｅ２（ＯＲ５１Ｅ２）；ＴＣＲガンマ選択的リーディングフレームタンパク質（ＴＡＲＰ）；ウィルムス腫瘍タンパク質（ＷＴ１）；がん／精巣抗原１（ＮＹ－ＥＳＯ－１）；がん／精巣抗原２（ＬＡＧＥ－１ａ）；黒色腫関連抗原１（ＭＡＧＥ－Ａ１）；染色体１２ｐに位置するＥＴＳ転座変異体遺伝子６（ＥＴＶ６－ＡＭＬ）；精子タンパク質１７（ＳＰＡ１７）；Ｘ抗原ファミリー、メンバー１Ａ（ＸＡＧＥ１）；アンジオポエチン結合細胞表面受容体２（Ｔｉｅ２）；黒色腫がん精巣抗原－１（ＭＡＤ－ＣＴ－１）；黒色腫がん精巣抗原－２（ＭＡＤ－ＣＴ－２）；Ｆｏｓ関連抗原１；腫瘍タンパク質ｐ５３（ｐ５３）；ｐ５３突然変異体；プロステイン；サバイビン（ｓｕｒｖｉｖｉｎｇ）；テロメラーゼ；前立腺がん腫瘍抗原－１（ＰＣＴＡ－１またはガレクチン８）、Ｔ細胞１によって認識される黒色腫抗原（メランＡまたはＭＡＲＴ１）；ラット肉腫（Ｒａｓ）突然変異体；ヒトテロメラーゼ逆転写酵素（ｈＴＥＲＴ）；肉腫転座切断点；アポトーシスの黒色腫阻害因子（ＭＬ－ＩＡＰ）；ＥＲＧ（膜貫通型プロテアーゼ、セリン２（ＴＭＰＲＳＳ２）ＥＴＳ融合遺伝子）；Ｎ－アセチルグルコサミニル－トランスフェラーゼＶ（ＮＡ１７）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ－３（ＰＡＸ３）；アンドロゲン受容体；サイクリンＢ１；ｖ－ｍｙｃトリ骨髄細胞腫ウイルスがん遺伝子神経芽腫由来ホモログ（ＭＹＣＮ）；ＲａｓホモログファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）；チロシナーゼ関連タンパク質２（ＴＲＰ－２）；シトクロムＰ４５０ １Ｂ１（ＣＹＰ１Ｂ１）；ＣＣＣＴＣ結合因子（ジンクフィンガータンパク質）様（ＢＯＲＩＳまたはＢｒｏｔｈｅｒ ｏｆ ｔｈｅ Ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ｏｆ Ｉｍｐｒｉｎｔｅｄ Ｓｉｔｅｓ）、Ｔ細胞３によって認識される扁平上皮細胞癌抗原（ＳＡＲＴ３）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ－５（ＰＡＸ５）；プロアクロシン結合タンパク質ｓｐ３２（ＯＹ－ＴＥＳ１）；リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）；Ａキナーゼアンカータンパク質４（ＡＫＡＰ－４）；滑膜肉腫、Ｘ切断点２（ＳＳＸ２）；終末糖化産物受容体（ＲＡＧＥ－１）；腎臓ユビキタス１（ＲＵ１）；腎臓ユビキタス２（ＲＵ２）；レグマイン；ヒト乳頭腫ウイルスＥ６（ＨＰＶ Ｅ６）；ヒト乳頭腫ウイルスＥ７（ＨＰＶ Ｅ７）；腸管カルボキシルエステラーゼ；熱ショックタンパク質７０－２突然変異体（ｍｕｔ ｈｓｐ７０－２）；ＣＤ７９ａ；ＣＤ７９ｂ；ＣＤ７２；白血球関連免疫グロブリン様受容体１（ＬＡＩＲ１）；ＩｇＡ受容体のＦｃ断片（ＦＣＡＲまたはＣＤ８９）；白血球免疫グロブリン様受容体サブファミリーＡメンバー２（ＬＩＬＲＡ２）；ＣＤ３００分子様ファミリーメンバーｆ（ＣＤ３００ＬＦ）；Ｃ型レクチンドメインファミリー１２メンバーＡ（ＣＬＥＣ１２Ａ）；骨髄間質細胞抗原２（ＢＳＴ２）；ＥＧＦ様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様２（ＥＭＲ２）；リンパ球抗原７５（ＬＹ７５）；グリピカン－３（ＧＰＣ３）；Ｆｃ受容体様５（ＦＣＲＬ５）；及び免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド１（ＩＧＬＬ１）からなる群から選択される腫瘍抗原に結合する抗原結合ドメインを含む。
一部の実施形態では、ＣＡＲの抗原結合ドメインは、ＣＤ１９に結合する。ＣＤ１９に結合する例示的なＣＡＲは、ＵＳ２０１５／０２８３１７８に記載されており（例えば、ＣＴＬ０１９）、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、ＣＤ１９ＣＡＲは、ＵＳ２０１５／０２８３１７８に示されるアミノ酸配列またはそれに対して実質的に同一である配列（例えば、それに対して少なくとも約８５％、９０％、または９５％の配列同一性を有する配列）を含む。
一実施形態では、ＣＡＲは、Ｔ細胞受容体のアルファ、ベータまたはゼータ鎖、ＣＤ２８、ＣＤ３イプシロン、ＣＤ４５、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ８、ＣＤ９、ＣＤ１６、ＣＤ２２、ＣＤ３３、ＣＤ３７、ＣＤ６４、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４、ＣＤ１３７及びＣＤ１５４からなる群から選択されるタンパク質に由来する膜貫通ドメインを含む。
一部の実施形態では、ＣＡＲは、ＭＨＣクラスＩ分子、ＴＮＦ受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ球活性化分子（ＳＬＡＭタンパク質）、活性化ＮＫ細胞受容体、ＢＴＬＡ、トールリガンド受容体、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ７、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ－１、ＬＦＡ－１（ＣＤＬｌａ／ＣＤ１８）、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、Ｂ７－Ｈ３、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ－１、ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）、ＧＩＴＲ、ＢＡＦＦＲ、ＬＩＧＨＴ、ＨＶＥＭ（ＬＩＧＨＴＲ）、ＫＩＲＤＳ２、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０（ＫＬＲＦ１）、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４６、ＣＤ１９、ＣＤ４、ＣＤ８アルファ、ＣＤ８ベータ、ＩＬ２Ｒベータ、ＩＬ２Ｒガンマ、ＩＬ７Ｒアルファ、ＩＴＧＡ４、ＶＬＡ１、ＣＤ４９ａ、ＩＴＧＡ４、ＩＡ４、ＣＤ４９Ｄ、ＩＴＧＡ６、ＶＬＡ－６、ＣＤ４９ｆ、ＩＴＧＡＤ、ＣＤＬｌｄ、ＩＴＧＡＥ、ＣＤ１０３、ＩＴＧＡＬ、ＣＤＬｌａ、ＬＦＡ－１、ＩＴＧＡＭ、ＣＤＬｌｂ、ＩＴＧＡＸ、ＣＤＬｌｃ、ＩＴＧＢ１、ＣＤ２９、ＩＴＧＢ２、ＣＤ１８、ＬＦＡ－１、ＩＴＧＢ７、ＮＫＧ２Ｄ、ＮＫＧ２Ｃ、ＴＮＦＲ２、ＴＲＡＮＣＥ／ＲＡＮＫＬ、ＤＮＡＭ１（ＣＤ２２６）、ＳＬＡＭＦ４（ＣＤ２４４、２Ｂ４）、ＣＤ８４、ＣＤ９６（タクタイル）、ＣＥＡＣＡＭｌ、ＣＲＴ ＡＭ、Ｌｙ９（ＣＤ２２９）、ＣＤ１６０（ＢＹ５５）、ＰＳＧＬ１、ＣＤ１００（ＳＥＭＡ４Ｄ）、ＣＤ６９、ＳＬＡＭＦ６（ＮＴＢ－Ａ、Ｌｙｌ０８）、ＳＬＡＭ（ＳＬＡＭＦ１、ＣＤ１５０、ＩＰＯ－３）、ＢＬＡＭＥ（ＳＬＡＭＦ８）、ＳＥＬＰＬＧ（ＣＤ１６２）、ＬＴＢＲ、ＬＡＴ、ＧＡＤＳ、ＳＬＰ－７６、ＰＡＧ／Ｃｂｐ、及びＣＤ１９ａからなる群から選択されるタンパク質に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
本明細書に記載の方法及び組成物のいずれかの実施形態では、ＣＡＲを含む細胞は、ＣＡＲをコードする核酸を含む。一実施形態では、ＣＡＲをコードする核酸は、レンチウイルスベクターである。一実施形態では、ＣＡＲをコードする核酸は、レンチウイルス形質導入によって細胞へと導入される。一実施形態では、ＣＡＲをコードする核酸は、ＲＮＡ、例えば、ｉｎ ｖｉｔｒｏ転写されたＲＮＡである。一実施形態では、ＣＡＲをコードする核酸は、エレクトロポレーションによって細胞へと導入される。
Ｔ細胞などの免疫エフェクター細胞は、一般的に、例えば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第６，３５２，６９４号；同第６，５３４，０５５号；同第６，９０５，６８０号；同第６，６９２，９６４号；同第５，８５８，３５８号；同第６，８８７，４６６号；同第６，９０５，６８１号；同第７，１４４，５７５号；同第７，０６７，３１８号；同第７，１７２，８６９号；同第７，２３２，５６６号；同第７，１７５，８４３号；同第５，８８３，２２３号；同第６，９０５，８７４号；同第６，７９７，５１４号；同第６，８６７，０４１号；及び米国特許出願公開番号２００６／０１２１００５に記載の方法を使用して、活性化及び拡大され得る。
免疫エフェクター細胞の例としては、Ｔ細胞、例えば、アルファ／ベータＴ細胞及びガンマ／デルタＴ細胞、Ｂ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、マスト細胞、ならびに骨髄由来食細胞が挙げられる。
ＣＡＲ発現細胞を作成する方法は、例えば、参照により本明細書に組み込まれるＵＳ２０１６／０１８５８６１に記載されている。
本明細書で定義するように、がんの改善に関して対象（例えば、ヒト患者）をモニタリングすることは、対象を疾患パラメータにおける変化、例えば、腫瘍増殖の低下に関して評価することを意味する。一部の実施形態では、評価は、投与の、少なくとも１時間、例えば、少なくとも２、４、６、８、１２、２４、もしくは４８時間、または少なくとも１日、２日、４日、１０日、１３日、２０日以上、または少なくとも１週間、２週間、４週間、１０週間、１３週間、２０週間以上後に行われる。対象は、以下の期間：処置の開始前；処置中；または処置の１つもしくは複数の要素が施された後のうちの、１つまたは複数において評価することができる。評価には、さらなる処置の必要性を評価すること、例えば、投与量、投与頻度、または処置期間を変更すべきか否かを評価することを含むことができる。選択された治療法を追加または削除する必要性を評価すること、例えば、本明細書に記載のがんのための処置のいずれかを追加または削除することも含むことができる。
一部の実施形態では、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントは、生体試料中のヒトＣＤ３９の検出及び／または定量化の方法において採用することができる。例えば、ＣＤ３９は、疾患の潜在的な診断、予後、及び進行バイオマーカーとして同定されている（Ｐｕｌｔｅ ｅｔ ａｌ．，（２０１１）Ｃｌｉｎ Ｌｙｍｐｈｏｍａ Ｍｙｅｌｏｍａ Ｌｅｕｋ １１：３６７－３７２；Ｆａｎ ｅｔ ａｌ．，（２０１７）Ｂｉｏｍａｒｋ Ｍｅｄ １１：１０７－１１６；Ｚｈａｏ ｅｔ ａｌ．，（２０１７）Ｆｒｏｎｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ ８：７２７）。
従って、本明細書に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合フラグメントは、患者の疾患（例えば、がん）の診断、予後診断及び／または進行決定に有用である。
本開示を、その特定の実施形態を参照して説明してきたが、当業者は、本開示の真の主旨及び範囲から逸脱することなく、様々な変更が行われてもよく、等価物が置き換えられてもよいことを理解されたい。加えて、特定の状況、材料、物質の組成、プロセス、１つまたは複数のプロセスステップを、本開示の目的、主旨及び範囲に適応させるために、多くの修正が行われてもよい。全てのそのような修正は、本開示の範囲内であることが意図される。
実施例１：方法
抗原調製
ＣＤ３９抗原（組換えＣＤ３９；Ｒ＆Ｄ ｓｙｓｔｅｍｓカタログ番号４３９７－ＥＮ）を、Ｐｉｅｒｃｅ製のＥＺ－Ｌｉｎｋ Ｓｕｌｆｏ－ＮＨＳ－ビオチン化キットを使用してビオチン化した。ヤギＦ（ａｂ’）２抗ヒトカッパ－ＦＩＴＣ（ＬＣ－ＦＩＴＣ）、エキストラビジン－ＰＥ（ＥＡ－ＰＥ）及びストレプトアビジン－ＡＦ６３３（ＳＡ－６３３）を、それぞれ、Ｓｏｕｔｈｅｒｎ Ｂｉｏｔｅｃｈ、Ｓｉｇｍａ、及びＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓから入手した。ストレプトアビジンマイクロビーズ及びＭＡＣＳ ＬＣ分離カラムは、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃから購入した。ヤギ抗ヒトＩｇＧ－ＰＥ（ヒト－ＰＥ）は、Ｓｏｕｔｈｅｒｎ Ｂｉｏｔｅｃｈから入手した。
プライマリ探索研究
約１０９の多様性をそれぞれ有する８つのナイーブヒト合成酵母ライブラリを、以前に記載されているとおりに増殖させた（例えば、Ｙ．Ｘｕ ｅｔ ａｌ，Ａｄｄｒｅｓｓｉｎｇ ｐｏｌｙｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｏｆ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｆｒｏｍ ａｎ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ｙｅａｓｔ ｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ：ａ ＦＡＣＳ－ｂａｓｅｄ，ｈｉｇｈ－ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ａｎｄ ａｎａｌｙｔｉｃａｌ ｔｏｏｌ．ＰＥＤＳ ２６．１０，６６３－７０（２０１３）；ＷＯ２００９０３６３７９；ＷＯ２０１０１０５２５６；及びＷＯ２０１２００９５６８を参照されたい）。選択の最初の２ラウンドには、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ ＭＡＣＳシステムを利用する磁気ビーズソーティング法を、以前に記載されているとおりに実施した（例えば、Ｓｉｅｇｅｌ ｅｔ ａｌ，Ｈｉｇｈ ｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙ ｒｅｃｏｖｅｒｙ ａｎｄ ｅｐｉｔｏｐｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｓｏｒｔｉｎｇ ｏｆ ａｎ ｓｃＦｖ ｙｅａｓｔ ｄｉｓｐｌａｙ ｌｉｂｒａｒｙ．“Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８６（１－２），１４１－１５３（２００４）を参照されたい）。簡潔に言えば、酵母細胞（約１０１０個の細胞／ライブラリ）を、洗浄緩衝液（リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）／０．１％ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ））中、５ｍｌの１００ｎＭビオチン化抗原と３０分間３０℃にてインキュベートした。４０ｍｌの氷冷洗浄緩衝液を用いて１回洗浄した後、細胞ペレットを２０ｍＬの洗浄緩衝液に再懸濁し、ストレプトアビジンマイクロビーズ（５００μｌ）を酵母に加え、１５分間４℃にてインキュベートした。次に、酵母をペレット化し、２０ｍＬの洗浄緩衝液に再懸濁し、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ ＬＳカラム上に充填した。２０ｍＬを充填した後、カラムを３ｍｌの洗浄緩衝液を用いて３回洗浄した。カラムを、次に、磁場から取り出し、酵母を５ｍＬの増殖培地で溶離し、次に一晩増殖させた。次の選択ラウンドを、フローサイトメトリーを使用して実施した。およそ２×１０７個の酵母をペレット化し、洗浄緩衝液を用いて３回洗浄し、３０℃にて、平衡条件下にて漸減濃度のビオチン化抗原（２００から５ｎＭ）、種交差反応性を得るためにマウス種の２００ｎＭビオチン化抗原、または選択から非特異的抗体を除去するために多特異性除去試薬（ＰＳＲ）のいずれかとインキュベートした。ＰＳＲを枯渇させるために、以前に記載されているように（例えば、Ｙ．Ｘｕ ｅｔ ａｌ，Ａｄｄｒｅｓｓｉｎｇ ｐｏｌｙｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ ｏｆ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｆｒｏｍ ａｎ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ｙｅａｓｔ ｐｒｅｓｅｎｔａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ：ａ ＦＡＣＳ－ｂａｓｅｄ，ｈｉｇｈ－ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ａｎｄ ａｎａｌｙｔｉｃａｌ ｔｏｏｌ．ＰＥＤＳ ２６．１０，６６３－７０（２０１３）を参照されたい）、ライブラリをビオチン化ＰＳＲ試薬の１：１０希釈液とインキュベートした。次に、酵母を、洗浄緩衝液を用いて２回洗浄し、ＬＣ－ＦＩＴＣ（１：１００に希釈）及びＳＡ－６３３（１：５００に希釈）またはＥＡＰＥ（１：５０に希釈）のいずれかの二次試薬を用いて１５分間４℃にて染色した。洗浄緩衝液を用いて２回洗浄した後、細胞ペレットを０．３ｍＬ洗浄緩衝液に再懸濁し、ストレーナーキャップ付きのソートチューブに移した。ＦＡＣＳ ＡＲＩＡソーター（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用してソーティングを行い、所望の特徴を持つ抗体を選択するためにソートゲートを決定した。所望の特徴を全て備えた集団が得られるまで、選択ラウンドを繰り返した。ソーティングの最終ラウンドの後、酵母をプレーティングし、特徴決定のために個々のコロニーを精選した。
軽鎖バッチシャッフル
抗体のさらなる探索研究及び改善のために、プライマリ探索研究段階中に、軽鎖多様化プロトコルを使用した。
軽鎖バッチ多様化プロトコル：ナイーブ選択出力からの重鎖プラスミドを、スマッシュアンドグラブを介して酵母から抽出し、Ｅ．ｃｏｌｉにて増殖させてから精製し、５×１０６の多様性を有する軽鎖ライブラリに形質転換した。選択を、ナイーブ探索研究において記載するように１ラウンドのＭＡＣＳ及び３ラウンドのＦＡＣＳを用いて実施した。異なるＦＡＣＳラウンドでは、ライブラリを、ＰＳＲ結合、種交差反応性、及び抗原滴定による親和性圧力について調べた。所望の特徴を有する集団を得るために、ソーティングを実施した。
抗体最適化
抗体の最適化を、下記のように重鎖可変領域へと多様性を導入することにより実施した。
ＣＤＲＨ１及びＣＤＲＨ２選択：単一抗体のＣＤＲＨ３を、１×１０８の多様性のＣＤＲＨ１変異体及びＣＤＲＨ２変異体を有する既製のライブラリ中に組換え、ナイーブ探索研究において記載するように１ラウンドのＭＡＣＳ及び４ラウンドのＦＡＣＳを用いて選択を実施した。異なるＦＡＣＳラウンドでは、ライブラリを、ＰＳＲ結合、種交差反応性、滴定による親和性圧力について調べ、所望の特徴を有する集団を得るために、ソーティングを実施した。
抗体産生及び精製
酵母クローンを飽和状態まで増殖させ、次に４８時間３０℃にて振とうしながら誘導した。誘導後、酵母細胞をペレット化し、上清を精製のために回収した。プロテインＡカラムを使用してＩｇＧを精製し、酢酸、ｐＨ２．０で溶出した。Ｆａｂフラグメントを、パパイン消化によって生成し、ＫａｐｐａＳｅｌｅｃｔ（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ ＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅｓ）上で精製した。
ＦｏｒｔｅＢｉｏ ＫＤ測定
ＦｏｒｔｅＢｉｏ親和性測定を、一般的に、以前に記載されているようにＯｃｔｅｔ ＲＥＤ３８４で実施した（例えば、Ｅｓｔｅｐ ｅｔ ａｌ，Ｈｉｇｈ ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｏｌｕｔｉｏｎ－ｂａｓｅｄ ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔ ｏｆ ａｎｔｉｂｏｄｙ－ａｎｔｉｇｅｎ ａｆｆｉｎｉｔｙ ａｎｄ ｅｐｉｔｏｐｅ ｂｉｎｎｉｎｇ．Ｍａｂｓ ５（２），２７０－２７８（２０１３）を参照されたい）。簡潔には、ＦｏｒｔｅＢｉｏ親和性測定を、ＩｇＧをＡＨＱセンサー上にオンラインで充填することによって実施した。センサーをアッセイ緩衝液中で３０分間にわたりオフラインで平衡化した後、ベースライン確立のために、オンラインで６０秒間モニタリングした。ＩｇＧを充填したセンサーを１００ｎＭ抗原に３分間曝露し、その後、アッセイ緩衝液に３分間移して、解離速度を測定した。全ての反応速度を、１：１結合モデルを使用して分析した。
ＦｏｒｔｅＢｉｏエピトープビニング／リガンドブロッキング
エピトープビニング／リガンドブロッキングを、標準的なサンドイッチ形式のクロスブロッキングアッセイを使用して実施した。対照抗標的ＩｇＧをＡＨＱセンサー上に充填し、センサー上の非占有Ｆｃ結合部位を無関連ヒトＩｇＧ１抗体でブロッキングした。次に、センサーを１００ｎＭ標的抗原に曝露し、続いて、二次抗標的抗体またはリガンドに曝露した。抗原会合後の二次抗体またはリガンドによる追加的結合は、非占有エピトープ（非競合物質）を示し、一方で結合無しはエピトープブロッキング（競合物質またはリガンドブロッキング）を示す。
ＭＳＤ－ＳＥＴ反応速度アッセイ
以前に記載されている（Ｅｓｔｅｐ ｅｔ ａｌ．，２０１３）通りに平衡親和性測定を実施した。溶液平衡滴定（ＳＥＴ）を、抗原を１０～１００ｐＭで一定に保持したＰＢＳ＋０．１％ＩｇＧ不含ＢＳＡ（ＰＢＳＦ）中で実施し、５～１００ｎＭにて開始する抗体の３倍～５倍の連続希釈物とインキュベートした（実験条件は試料に依存する）。抗体（ＰＢＳ中２０ｎＭ）を、標準的な結合ＭＳＤ－ＥＣＬプレート上へと一晩４℃にてまたは室温にて３０分間コーティングした。次に、プレートを７００ｒｐｍにて振とうしながら３０分間ブロックし、その後、洗浄緩衝液（ＰＢＳＦ＋０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）を用いて３回洗浄した。ＳＥＴ試料を適用し、プレート上で７００ｒｐｍにて振とうしながら１５０秒間インキュベートした後、１回洗浄した。プレート上に捕捉された抗原を、ＰＢＳＦ中２５０ｎｇ／ｍＬスルホタグ標識ストレプトアビジンを用いて、プレート上で３分間インキュベートすることにより検出した。プレートを、洗浄緩衝液を用いて３回洗浄し、次に界面活性剤を伴う１×リード緩衝液Ｔを使用してＭＳＤ Ｓｅｃｔｏｒ Ｉｍａｇｅｒ ２４００測定器で読み取った。遊離抗原の割合（％）を、滴定された抗体の関数としてＰｒｉｓｍにプロットし、二次方程式に当てはめてＫＤを抽出した。スループットを向上させるために、ＳＥＴ試料調製を含む、ＭＳＤ－ＳＥＴ実験を通して、液体処理ロボットを使用した。
細胞結合分析
抗原を過剰発現するおよそ１００，０００個の細胞を、洗浄緩衝液を用いて洗浄し、１００ｕｌの１００ｎＭ ＩｇＧと５分間室温にてインキュベートした。次に、細胞を、洗浄緩衝液を用いて２回洗浄し、１００ｕｌの１：１００ヒトＰＥと１５分間氷上でインキュベートした。次に、細胞を、洗浄緩衝液を用いて２回洗浄し、ＦＡＣＳ Ｃａｎｔｏ ＩＩアナライザー（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）で分析した。
実施例２：樹状細胞に対する抗ＣＤ３９抗体の効果
樹状細胞に対する抗ＣＤ３９抗体の効果を決定するために、Ｔ細胞の活性化及び生存に必要な共刺激シグナルを提供する膜貫通タンパク質であるＣＤ８６の発現レベルを決定した。３人の健常ドナーからの単球を、ＧＭ－ＣＳＦ（５０ｎｇ／ｍＬ）（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）及びＩＬ－４（１０ｎｇ／ｍＬ）（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて４日間３７℃にて、ＲＰＭＩ－１６４０＋１０％ＦＢＳ＋１％ペニシリン－ストレプトマイシン（Ｒ１０）（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）中で処置して、未成熟樹状細胞を生成した。樹状細胞を、ＧＭ－ＣＳＦ（５０ｎｇ／ｍＬ）及びＩＬ－４（１０ｎｇ／ｍＬ）を補充したＲ１０を用いて洗浄し、これに再懸濁した。５×１０４個の樹状細胞を９６ウェルＵボトムプレートの各ウェルに加えた。樹状細胞を、アイソタイプ対照抗体または抗ＣＤ３９抗体（１０ｕｇ／ｍＬ）と、図１Ａに示すように、１時間３７℃にてインキュベートした。１時間後、ＡＴＰ補充を伴うまたは伴わないＲ１０を細胞に加え、２４時間さらにインキュベートした。樹状細胞を、ＣＤ８６及びＣＤ１１ｃ（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ）に対する抗体を用いて染色した。細胞を、ＬＳＲＦｏｒｔｅｓｓａ Ｘ－２０（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用して取得し、ＦｌｏｗＪｏソフトウェア（Ｔｒｅｅ Ｓｔａｒ）を用いて分析した。各ドナー由来の樹状細胞上でのＣＤ８６発現の定量化（幾何平均）を示す。
図１Ａに示すように、ＡＴＰの存在下で抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３７０－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６５－Ａ、及びＳＲＦ３６７－Ｂを用いた樹状細胞の処置は、ＣＤ８６の発現の増加をもたらし、これはアイソタイプ対照抗体ＤＮＰ－Ａ及びＤＮＰ－Ｂを用いた処置よりも高かった。これらの結果は、抗ＣＤ３９抗体を用いた樹状細胞の処置が、ＣＤ８６のＡＴＰ誘導性発現を増強することを実証する。
樹状細胞に対する抗ＣＤ３９抗体の効果をさらに評価するために、ＣＤ８６及びＭＨＣクラスＩＩ細胞表面受容体であるヒト白血球抗原－抗原Ｄ関連（ＨＬＡ－ＤＲ）の両方の発現レベルを、本質的に上記のように決定した。図１Ｂに示すように、樹状細胞を、ＡＴＰの存在下または不在下で抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａまたはアイソタイプ対照抗体（ＤＮＰ－Ａ）を用いて処置した。
図１Ｂに示すように、ＡＴＰの存在下で抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａを用いた樹状細胞の処置は、ＨＬＡ－ＤＲ及びＣＤ８６の発現の増加をもたらし、これはアイソタイプ対照抗体ＤＮＰ－Ａを用いた処置よりも高かった。図１Ａに示す結果と一致して、図１Ｂに示すこれらの結果は、抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａを用いた樹状細胞の処置が、ＣＤ８６及びＨＬＡ－ＤＲのＡＴＰ誘導性発現を増強することを実証する。
抗ＣＤ３９抗体が、サイトカイン分泌に与える効果を決定するために、図１Ｂと同じ樹状細胞からのサイトカインＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０及びＶＥＧＦＡの分泌を決定した。処置された樹状細胞培養物からの上清を、１：２に希釈し、Ｍｅｓｏ Ｓｃａｌｅ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ（ＭＳＤ）Ｕ－ｐｌｅｘキットプロトコルは、製造業者の指示に従った。ＶＥＧＦ－Ａ、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０及びＩＬ－１６の分泌を、製造業者の指示に従ってＭＳＤソフトウェアを使用して定量化した。
図１Ｃ、１Ｄ、及び１Ｅに示すように、ＡＴＰの存在下で抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａを用いた樹状細胞の処置は、ＩＬ－１６（図１Ｃ）、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０（図１Ｄ）及びＩＬ－１６（図１Ｅ）の分泌の増加をもたらし、これはアイソタイプ対照抗体ＤＮＰ－Ａの処置よりも高かった。図１Ｃ、１Ｄ、及び１Ｅに示すこれらの結果は、抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａを用いた樹状細胞の処置が、それぞれ、サイトカインＩＬ－１６、ＩＬ－１２／ＩＬ－２３ｐ４０及びＶＥＧＦＡのＡＴＰ誘導性分泌を増強することを実証する。
実施例３：ＣＤ４＋Ｔ細胞増殖に対する抗ＣＤ３９抗体の効果
ＣＤ４＋Ｔ細胞に対する抗ＣＤ３９抗体を用いた処置の効果を決定するために、様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ｂ及びＳＲＦ３７０－Ａ）またはアイソタイプ対照抗体（ＤＮＰ－Ａ及びＤＮＰ－Ｂ）を用いた処置に応答するｉｎ ｖｉｔｒｏでのＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖の量を決定した。ヒトドナー血液からの新鮮なＰＢＭＣからのＣＤ４＋細胞を、セルトレースバイオレット染色を用いて染色してから、９６ウェルプレートに播種した。Ｔ細胞を刺激するために、細胞を、２５０μＭ ＡＴＰ、抗ＣＤ３／ＣＤ２８ビーズとインキュベートし、図２に示すように、抗ＣＤ３９抗体またはアイソタイプ対照抗体と３日間インキュベートして、各抗体処置に関する増殖指数を、細胞内に残存するセルトレースバイオレットの量を測定することによってフローサイトメトリーにより定量化した。細胞をＣＤ４に関しても染色して、Ｔ細胞系統を確認した。図２に示すように、ＡＴＰに応答するＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖指数は、抗ＣＤ３９抗体の存在下で増加する。
実施例４：悪性細胞及び免疫細胞でのＣＤ３９活性に対する抗ＣＤ３９抗体の効果
ＣＤ３９は、アデノシン三リン酸（ＡＴＰ）及びアデノシン二リン酸（ＡＤＰ）をアデノシン一リン酸（ＡＭＰ）に変換する膜結合型エクトヌクレオシダーゼである。悪性細胞株及び初代免疫細胞でのＣＤ３９の酵素活性を阻害する抗ＣＤ３９抗体の能力を、マラカイトグリーンリン酸アッセイを使用して測定した。簡潔には、細胞を６０分間、抗ＣＤ３９抗体または対照抗体及び２５μＭ ＡＴＰを使用して処置した。ＡＴＰからの無機リン酸の放出を、マラカイトグリーンリン酸アッセイキット（Ｅｎｚｏ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、カタログ番号ＢＭＬ－ＡＫ１１１）を使用して測定した。正規化した阻害率（％ＩＮＨ）を、１００％阻害を表す「時間ゼロ対照」及び０％ＩＮＨを表す「抗体無し対照」を使用して決定した。「時間ゼロ対照」は、リン酸塩が生成されず、ＣＤ３９が完全に阻害される状態を模倣するために反応が即座に停止される全ての試薬を伴うウェルである。「抗体無し対照」は、全ての試薬及び細胞が添加されているが、抗体が存在しないウェルである。このウェルは、最大量のリン酸が放出され、ＣＤ３９の阻害がない状態を模倣している。阻害率を決定するには、「抗体無し対照」値をアッセイ値から差し引き、「時間ゼロ対照」値から差し引いた「抗体無し対照」値で割る。結果得られる値に１００を掛けて、百分率値が得られる。このアッセイでは、ＭＯＬＰ－８（ヒト多発性骨髄腫細胞株）、ＳＫ－ＭＥＬ－２８、初代ヒトＢ細胞（全血から単離）、または初代ヒト単球（全血から単離）を使用した。
図３Ａに示すように、図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６０－Ａ、ＳＲＦ３６０－Ｂ、ＳＲＦ３６５－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ｂ、及びＳＲＦ３７０－Ａ）または対照抗体を、ＡＴＰの存在下で用いたＭＯＬＰ－８細胞（ヒト多発性骨髄腫細胞株）の処置は、試験された全ての抗ＣＤ３９抗体によるＣＤ３９活性の用量依存性阻害をもたらした。ＣＤ３９活性の阻害は、無機リン酸の放出の程度によって決定し、阻害率（％ＩＮＨ）として表した。
図３Ｂに示すように、図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６０－Ａ、ＳＲＦ３６０－Ｂ、ＳＲＦ３６５－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ｂ、及びＳＲＦ３７０－Ａ）または対照抗体を、ＡＴＰの存在下で用いたＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞（ヒト黒色腫細胞株）の処置は、試験された全ての抗ＣＤ３９抗体によるＣＤ３９活性の用量依存性阻害をもたらし、図３Ａに示す結果と一致した。ＣＤ３９活性の阻害は、無機リン酸の放出の程度によって決定し、阻害率（％ＩＮＨ）として表した。
図３Ｃに示すように、図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６０－Ｃ、ＳＲＦ３６５－Ｃ、ＳＲＦ３６７－Ｃ及びＳＲＦ３７０－Ｃ）または対照抗体を、ＡＴＰの存在下で用いた全血から単離された初代ヒトＢ細胞の処置は、試験された全ての抗ＣＤ３９抗体によるＣＤ３９活性の用量依存性阻害をもたらし、図３Ａ及び図３Ｂに見られる結果と一致した。ＣＤ３９活性の阻害は、無機リン酸の放出の程度によって決定し、阻害率（％ＩＮＨ）として表した。
図３Ｄに示すように、図示の通りの様々な濃度の抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６０－Ｃ、ＳＲＦ３６５－Ｃ、ＳＲＦ３６７－Ｃ及びＳＲＦ３７０－Ｃ）または対照抗体を、ＡＴＰの存在下で用いた全血から単離された初代ヒト単球の処置は、試験された全ての抗ＣＤ３９抗体によるＣＤ３９活性の用量依存性阻害をもたらし、図３Ａ及び図３Ｂに見られる結果と一致した。ＣＤ３９活性の阻害は、無機リン酸の放出の程度によって決定し、阻害率（％ＩＮＨ）として表した。
まとめると、これらの結果は、抗ＣＤ３９抗体を用いた悪性細胞及び免疫細胞の処置が、ＣＤ３９酵素活性を阻害することを実証する。
実施例５：抗ＣＤ３９抗体は、ヒトがん細胞に結合する
抗ＣＤ３９抗体の細胞への相対的な結合の程度を決定するために、ＭＯＬＰ－８またはＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞を、図４Ａ及び４Ｂに示す通りの様々な濃度の蛍光標識抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６０－Ａ、ＳＲＦ３６０－Ｂ、ＳＲＦ３６５－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ｂ、及びＳＲＦ３７０－Ａ）またはアイソタイプ対照抗体（ＤＮＰ－Ａ及びＤＮＰ－Ｂ）を用いて処置した。細胞への結合の程度を決定し、平均蛍光強度（ＭＦＩ）として表した。細胞を、ＦＡＣＳ緩衝液（２ｍＭ ＥＤＴＡ、２％ＦＢＳ）を用いて洗浄し、遠心分離によりペレット化した。細胞を、フルオロフォアＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８（ＡＦ４８８）を用いて直接標識した用量範囲の抗ＣＤ３９抗体またはアイソタイプ対照抗体を含有するＦＡＣＳ緩衝液に再懸濁し、３０分間室温にてインキュベートした。次に、細胞を、ＦＡＣＳ緩衝液を用いて２回洗浄し、その後、４％パラホルムアルデヒド（ＰＦＡ）内に固定し、ＦＡＣＳ緩衝液に再懸濁し、ＦＡＣＳ Ｃａｎｔｏ ＩＩアナライザー（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）で分析した。
図４Ａに示すように、抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６０－Ａ及びＳＲＦ３６０－Ｂは、用量依存性様式にてＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞に結合した。抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６５－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ｂ、及びＳＲＦ３７０－Ａは、ＳＫ－ＭＥＬ－２８に、ＳＲＦ３６０－Ａ及びＳＲＦ３６０－Ｂと比べて低い程度で結合したが、アイソタイプ対照と比べて大きい程度で結合した。図４Ｂに示すように、抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６０－Ａ及びＳＲＦ３６０－Ｂは、用量依存性様式にてＭＯＬＰ－８細胞に結合した。抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６５－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ａ、ＳＲＦ３６７－Ｂ、及びＳＲＦ３７０－Ａは、ＳＫ－ＭＥＬ－２８に、ＳＲＦ３６０－Ａ及びＳＲＦ３６０－Ｂと比べて低い程度で結合したが、アイソタイプ対照と比べて大きい程度で結合し、図４Ａに示す結果と一致した。
実施例６：担がんマウスにおける抗ＣＤ３９抗体の有効性
実施例１～４に示すように、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの悪性細胞及び免疫細胞に対する抗ＣＤ３９抗体の効果を考慮して、抗ＣＤ３９抗体を、ｉｎ ｖｉｖｏで確立した腫瘍に対する抗腫瘍活性について試験した。ＳＫ－ＭＥＬ－２８腫瘍を有するマウスを、図５Ａ及び５Ｂに示す通りのＳＲＦ３６７－Ｂまたはアイソタイプ対照抗体のいずれかを用いて処置し、腫瘍増殖を測定した。高量のＣＤ３９を発現するために、ＳＫ－ＭＥＬ－２８ヒト異種移植片モデルを選択した。ＣＢ１７ＳＣＩＤマウス（ｎ＝９／群）（Ｃｈａｒｌｅｓ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｓ）の右脇腹に、５０％マトリゲル（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）中の５×１０６個のＳＫ－ＭＥＬ－２８腫瘍細胞を皮下移植した。腫瘍異種移植片を、垂直方向の腫瘍直径（ｍｍ）を測定することで週３回測定し、腫瘍体積は、式Ｖ＝（（Ｌ×Ｗ×Ｗ）×０．５２）、式中Ｖは腫瘍体積（ｍｍ３）、Ｌは長径、及びＷは短径である、を使用して計算した。ＳＫ－ＭＥＬ－２８腫瘍の平均サイズが１００ｍｍ３に達したとき、動物を９匹のマウスの２つの群に分け、ＳＲＦ３６７－ＢまたはポリクローナルヒトＩｇＧアイソタイプ対照抗体のいずれかを投与した。全ての抗体を、１００μｌのＰＢＳ中４００μｇ／マウス、週二回で、合計５回（１、５、８、１２、及び１５日目）にわたって、腹腔内（ｉ．ｐ．）注射した。
ＳＲＦ３６７－Ｂを用いて処置されたマウスからのＳＫ－ＭＥＬ－２８腫瘍の平均増殖速度（図５Ｂ）は、アイソタイプ対照を用いて処置された動物からの腫瘍（図５Ａ）と比較して一貫して遅かった。これらの結果は、抗ＣＤ３９抗体を用いた担がんマウスの処置が、確立されたＣＤ３９発現ヒト異種移植片腫瘍の増殖を遅延させることを実証する。
実施例７：ヒトＰＢＭＣにおけるＣＤ３９発現に対する抗ＰＤ－１抗体の効果
ＰＢＭＣ由来の免疫細胞集団におけるＣＤ３９発現に対するＰＤ－１阻害の効果を決定するために、ＰＢＭＣを、５人の別々のヒトドナーの全血から単離した。ＰＢＭＣを、完全細胞培養培地（１０％ＦＢＳ、ＲＰＭＩ、または１０ｕｇ／ｍｌ抗ＰＤ－１抗体ニボルマブを補充した完全細胞培養培地）にて９６時間インキュベートした。細胞を洗浄し、染色し、固定してフローサイトメトリー分析を行い、ＣＤ３９陽性細胞の割合（％）を決定した。系統マーカーを使用して、Ｔｒｅｇ（ＣＤ３、ＣＤ４、及びＦｏｘＰ３）；単球（ＣＤ１４）；及びＢ細胞（ＣＤ１９）を識別した。図６に示すように、ＣＤ３９発現は、ニボルマブの存在下では全ての細胞型、全てのドナーにわたって増加し、これは抗ＰＤ－１抗体を用いた処置がヒト細胞でのＣＤ３９の発現を増加することを示す。ゆえに、抗ＰＤ１（または抗ＰＤ－Ｌ１）を用いて処置された対象におけるＣＤ３９の発現の増加は、対象が抗ＰＤ１療法に耐性を持つようになるメカニズムであり得る。本明細書に開示する抗ＣＤ３９抗体を用いたこれらの対象の処置を提供する。
実施例８：抗ＣＤ３９抗体の結合親和性の分布
抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６０、ＳＲＦ３６５、ＳＲＦ３６７、ＳＲＦ３７０、ＳＲＦ３９９）の結合親和性を、概ね以前に記載されている（Ｅｓｔｅｐ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｍａｂｓ ５（２）：２７０－２７８、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）通りにＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｏｃｔｅｔ ＲＥＤ３８４（Ｐａｌｌ Ｆｏｒｔｅ Ｂｉｏ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｍｅｎｌｏ Ｐａｒｋ，ＣＡ）を使用して、それらの反応速度定数（ｋａ、ｋｄ、ＫＤ）を測定することによって決定した。
簡潔には、ＦｏｒｔｅＢｉｏ親和性測定を、ＩｇＧをＡＨＱセンサー上にオンラインで充填することによって実施した。センサーをアッセイ緩衝液中で３０分間にわたりオフラインで平衡化した後、ベースライン確立のために、オンラインで６０秒間モニタリングした。ＩｇＧを充填したセンサーを１００ｎＭ抗原に３分間曝露し、その後、アッセイ緩衝液に３分間移して、解離速度を測定した。全ての反応速度を、１：１結合モデルを使用して分析した。膜貫通ドメインを欠く担体不含ヒトＣＤ３９－Ｈｉｓを抗原として使用した（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓカタログ番号：４３９７－ＥＮ－０１０）。
以前に記載されている（Ｅｓｔｅｐ ｅｔ ａｌ．，（２０１３）Ｍａｂｓ ５（２）：２７０－２７８）通りに平衡親和性測定を実施した。溶液平衡滴定（ＳＥＴ）を、抗原を１０～１００ｐＭで一定に保持したＰＢＳ＋０．１％ＩｇＧ不含ＢＳＡ（ＰＢＳＦ）中で実施し、５～１００ｎＭにて開始する抗体の３倍～５倍の連続希釈物とインキュベートした（実験条件は試料に依存する）。抗体（ＰＢＳ中２０ｎＭ）を、標準的な結合ＭＳＤ－ＥＣＬプレート上へと一晩４℃にてまたは室温にて３０分間コーティングした。次に、プレートを７００ｒｐｍにて振とうしながら３０分間ブロックし、その後、洗浄緩衝液（ＰＢＳＦ＋０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）を用いて３回洗浄した。ＳＥＴ試料を適用し、プレート上で７００ｒｐｍにて振とうしながら１５０秒間インキュベートした後、１回洗浄した。プレート上に捕捉された抗原を、ＰＢＳＦ中２５０ｎｇ／ｍＬスルホタグ標識ストレプトアビジンを用いて、プレート上で３分間インキュベートすることにより検出した。プレートを、洗浄緩衝液を用いて３回洗浄し、次に界面活性剤を伴う１×リード緩衝液Ｔを使用してＭＳＤ Ｓｅｃｔｏｒ Ｉｍａｇｅｒ ２４００測定器で読み取った。遊離抗原の割合（％）を、滴定された抗体の関数としてＧｒａｐｈｐａｄ Ｐｒｉｓｍにプロットし、二次方程式に当てはめてＫＤを抽出した。スループットを向上させるために、ＳＥＴ試料調製を含む、ＭＳＤ－ＳＥＴ実験を通して、液体処理ロボットを使用した。膜貫通ドメインを欠く担体不含ヒトＣＤ３９－Ｈｉｓをビオチン化し、抗原として使用した（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓカタログ番号：４３９７－ＥＮ－０１０）。抗ＣＤ３９抗体のＦｏｒｔｅｂｉｏ及びＭＳＤ親和性測定値を、図７に提供する。
実施例９：ヒト多発性骨髄腫のＭＯＬＰ－８マウスモデルにおける抗ＣＤ３９抗体及びドキソルビシンの相乗効果
ＣＤ３９阻害と免疫原性細胞死剤を組み合わせた抗腫瘍効果（複数可）を決定するために、ドキソルビシンと組み合わせた抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａを、重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）マウスの皮下異種移植片ＭＯＬＰ－８ヒト多発性骨髄腫モデルにおいて評価した。簡潔には、６～８週齢のＳＣＩＤマウス（Ｃｈａｒｌｅｓ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｓ）の右脇腹に、マトリゲルと混合した０．１ｍＬのＰＢＳ中の１×１０７個のＭＯＬＰ－８腫瘍細胞（１：１）を、皮下注射により接種し、腫瘍がおよそ１００ｍｍ３の平均体積に達したときに、４つの処置群へと無作為化した。群（ｎ＝各１０マウス）を、アイソタイプ対照抗体（ＤＮＰ－Ａ）、抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６７－Ａ）単独（４００μｇまたは２０ｍｇ／ｋｇ）を週２回３週間、アルドキソルビシン単独（腫瘍環境内で遊離ドキソルビシンを放出するドキソルビシンプロドラッグ）（２００μｇまたは１０ｍｇ／ｋｇ）を週１回３週間、またはＳＲＦ３６７－Ａ及びアルドキソルビシンの両方を組み合わせて用いて、腹腔（ｉ．ｐ）内処置した。試験した全ての抗体は、ＰＢＳ（Ｇｉｂｃｏ）中に製剤化した。アルドキソルビシンストック溶液（１００ｍｇ／ｍＬ）は、ＤＭＳＯ中に調製し、ＰＢＳ中１ｍｇ／ｍＬに希釈した。抗腫瘍活性を、一部、ノギスを使用して腫瘍サイズ（長さ及び幅）を測定することによって決定し、腫瘍体積は、次の式：（Ｌ＊Ｗ＊Ｗ）／２を使用することにより計算した。体重（データは示さず）及び腫瘍体積は、１９日目まで週２回決定した。腫瘍体積分析に関しては、一元配置Ａｎｏｖａ分析を実施して、対照と比較した各群に関する統計学的有意性を検査した（ｐ＜０．００５）。
図８Ａは、図示の通りの処置後の経時的なマウスの平均腫瘍体積を示す。黒色矢印は、ＳＲＦ３６７－Ａを用いた処置を示し、灰色矢印は、アルドキソルビシンを用いた処置を示す。図８Ｂは、図示の通りの処置後１９日目のマウスの平均腫瘍体積を示す。
単独またはドキソルビシンと組み合わせた抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａを用いた処置は、図８Ｂに示すように、１９日目で、アイソタイプ対照抗体ＤＮＰ－Ａを用いた処置と比較して腫瘍体積における統計学的に有意な低下を実証した（ｐ＜０．００５）。ドキソルビシン単独群では３回の投与後にいくらかの体重低下が観察されたが、コンボ群ではドキソルビシン単独と比較して有意な体重低下は観察されず、抗ＣＤ３９抗体処置単独では、体重低下は生じなかった（データは示さず）。
これらのデータは、ドキソルビシンと組み合わせて抗ＣＤ３９抗体を用いた処置が相乗的な抗腫瘍効果をもたらし、抗ＣＤ３９抗体またはドキソルビシン単独による処置と比較した場合、腫瘍体積をより大きい程度に低下することを実証する。
実施例１０：ヒト多発性骨髄腫のＭＯＬＰ－８異種移植片モデルにおける抗ＣＤ３９抗体及びアデノシンＡ２Ａ受容体（Ａ２ＡＲ）アンタゴニストの相乗効果
ＣＤ３９阻害とアデノシン経路を遮断する別の作用物質とを組み合わせた抗腫瘍効果（複数可）を決定するために、Ａ２ＡＲアンタゴニストＣＰＩ－４４４と組み合わせた抗ＣＤ３９抗体ＳＲＦ３６７－Ａの抗腫瘍活性を、重症複合免疫不全（ＳＣＩＤ）マウスの皮下異種移植片ＭＯＬＰ－８ヒト多発性骨髄腫モデルにおいて評価した。簡潔には、６～８週齢のＳＣＩＤマウス（Ｃｈａｒｌｅｓ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｓ）の右脇腹に、マトリゲルと混合した０．１ｍＬのＰＢＳ中の１×１０７個のＭＯＬＰ－８腫瘍細胞（１：１）を、皮下注射により接種し、腫瘍がおよそ１００ｍｍ３の平均体積に達したときに、４つの処置群へと無作為化した。群（ｎ＝各８マウス）を、アイソタイプ対照（ＤＮＰ－Ａ）、抗ＣＤ３９抗体単独（４００μｇまたは２０ｍｇ／ｋｇ）を週２回３週間、またはＣＰＩ－４４４と組み合わせて用いて、腹腔（ｉ．ｐ）内処置した。ＣＰＩ－４４４は、１００ｍｇ／ｋｇの用量にて週５日、３週間にわたって経口投与した。試験した全ての抗体は、ＰＢＳ（Ｇｉｂｃｏ）中に製剤化した。ＣＰＩ－４４４ストック溶液（１０ｍｇ／ｍｌ）は、０．１Ｎ塩酸中の４０％ヒドロキシプロピルｂ－シクロデキストリン中に調製し、スターラープレート上で混合し、０．４５ｍｍフィルターを通して濾過した。溶液を、１．０Ｎ水酸化ナトリウム及び１．０ｍｏｌ／Ｌクエン酸を用いてｐＨ３～４に調整した。抗腫瘍活性を、一部、ノギスを使用して腫瘍サイズ（長さ及び幅）を測定することによって決定し、腫瘍体積は、次の式：（Ｌ＊Ｗ＊Ｗ）／２を使用することにより計算した。体重（データは示さず）及び腫瘍体積は、２８日目まで週３回決定した。腫瘍体積分析に関しては、一元配置Ａｎｏｖａ分析を実施して、対照及び単一作用物質単独処置群と比較した各群に関する統計学的有意性を検査した（ｐ＜０．００５）。
処置されたマウスの平均腫瘍体積を図９に示す。これらのデータは、Ａ２ＡＲアンタゴニスト（ＣＰＩ－４４４）と組み合わせた抗ＣＤ３９抗体（ＳＲＦ３６７－Ａ）を用いた処置が相乗的な抗腫瘍効果をもたらし、抗ＣＤ３９抗体またはＣＰＩ－４４４いずれかを単独で用いた処置と比較した場合に腫瘍体積を低下することを示す。全ての試験剤（抗ＣＤ３９抗体及びＣＰＩ－４４４）を、単独または組み合わせて用いた処置は、アイソタイプ対照と比較して統計学的に有意な抗腫瘍効果を実証した（ｐ＜０．００５）。ＣＰＩ－４４４単独投与群では１週間の投与後にいくらかの体重低下が観察されたが、ＣＰＩ－４４４単独と比較してコンボ群では有意な体重低下は観察されず、抗ＣＤ３９抗体処置単独では、体重低下は生じなかった（データは示さず）。
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Claims (19)

  1. 単離された抗ＣＤ３９抗体であって、
    ｉ（ａ）配列番号２７のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ１、（ｂ）配列番号２８のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ２、（ｃ）配列番号２９のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ３、（ｄ）配列番号３７のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ１、（ｅ）配列番号３８のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ２、および（ｆ）配列番号３９のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ３、または
    ｉｉ（ａ）配列番号３０のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ１、（ｂ）配列番号３１のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ２、（ｃ）配列番号３２のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ３、（ｄ）配列番号４０のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ１、（ｅ）配列番号４１のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ２、および（ｆ）配列番号４２のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ３
    を含む、抗体。
  2. 重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、
    前記ＶＨは配列番号３３のアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であり、前記ＶＬは配列番号４３のアミノ酸配列に少なくとも９０％同一である、請求項１に記載の抗体。
  3. 重鎖および軽鎖を含み、前記重鎖が配列番号３５、４７、４９または５１のアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であり、前記軽鎖が配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％同一である、請求項１に記載の抗体。
  4. 重鎖および軽鎖を含み、前記重鎖が配列番号３５、４７、４９または５１のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が配列番号４５のアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の抗体。
  5. ａ 前記抗体はリンパ球の増殖を増加させ、任意選択で前記リンパ球は腫瘍浸潤リンパ球、もしくはＣＤ４＋Ｔ細胞である、および／または、
    ｂ 前記抗体は１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する、および／または、
    ｃ 前記抗体が樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増強する、および／または、
    ｄ 前記抗体がカニクイザルＣＤ３９と交差反応する、
    請求項１に記載の抗体。
  6. 前記抗体はモノクローナル抗体である、請求項１に記載の抗体。
  7. 前記抗体は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆｖ、ｓｃＦｖまたは（Ｆａｂ’）２フラグメントから選択される抗体断片である、請求項１に記載の抗体。
  8. 前記抗体は、完全長抗体である、請求項１に記載の抗体。
  9. 請求項１に記載の抗ＣＤ３９抗体および医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
  10. 請求項１に記載抗ＣＤ３９抗体を含む、キット。
  11. ＣＤ３９に結合する単離された抗体であって、重鎖可変領域（ＶＨ）および軽鎖可変領域（ＶＬ）を含み、
    前記ＶＨは配列番号３３のアミノ酸配列を含み、前記ＶＬは配列番号４３のアミノ酸配列を含む、
    抗体。
  12. 重鎖および軽鎖を含み、前記重鎖が配列番号３５、４７、４９または５１のアミノ酸配列に少なくとも９０％同一であり、前記軽鎖が配列番号４５のアミノ酸配列に少なくとも９０％同一である、請求項１１に記載の抗体。
  13. 重鎖および軽鎖を含み、前記重鎖が配列番号３５、４７、４９または５１のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が配列番号４５のアミノ酸配列を含む、請求項１１に記載の抗体。
  14. ａ 前記抗体はリンパ球の増殖を増加させ、任意選択で前記リンパ球は腫瘍浸潤リンパ球、もしくはＣＤ４＋Ｔ細胞である、および／または、
    ｂ 前記抗体は１つもしくは複数の樹状細胞活性化マーカーの発現を増強する、および／または、
    ｃ 前記抗体が樹状細胞からの１つもしくは複数のサイトカインの分泌を増強する、および／または、
    ｄ 前記抗体がカニクイザルＣＤ３９と交差反応する、
    請求項１１に記載の抗体。
  15. 前記抗体はモノクローナル抗体である、請求項１１に記載の抗体。
  16. 前記抗体は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆｖ、ｓｃＦｖまたは（Ｆａｂ’）２フラグメントから選択される抗体断片である、請求項１１に記載の抗体。
  17. 前記抗体は、完全長抗体である、請求項１１に記載の抗体。
  18. 請求項１１に記載の抗ＣＤ３９抗体および医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
  19. 請求項１１に記載の抗ＣＤ３９抗体を含む、キット。
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