JP6949845B2 - Rna分子組成物の作製方法 - Google Patents
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Description
a)単一の反応槽におけるm個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の混合物の並行した、即ち同時のRNAインビトロ転写ステップであって、m個の異なるDNA分子種の各々がn個の異なるRNA分子種のうちの1つ以上をコードし、それによりn個の異なるRNA分子種が作成されるステップ、及び
b)ステップa)で作成されたn個の異なるRNA分子種を含むRNA分子組成物を得るステップ
[nは少なくとも2の整数であり、及びmは少なくとも1又は好ましくは少なくとも2の整数である]を含む。
c1)細菌増幅を用いてm個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、
c2)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いてm個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、
c3)化学的DNA合成を用いてm個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、及び/又は
c4)酵素増幅を用いて、例えばローリングサークル増幅によってm個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、を更に含む。
d)細菌細胞培養物をm個の異なるDNAプラスミド種の混合物のうちの少なくとも1つの単一DNAプラスミド種で形質転換するステップであって、各DNAプラスミド種がn個の異なるRNA分子種のうちの1つ以上をコードするステップ、を含む。
d1)m個の単一細菌細胞培養物を各々、m個の異なるDNAプラスミド種のうちの単一DNAプラスミド種で形質転換するステップであって、単一DNAプラスミド種がn個の異なるRNA分子種のうちの1つ以上をコードするステップ、又は
d2)単一細菌細胞培養物をm個の異なるDNAプラスミド種の混合物で形質転換するステップであって、各DNAプラスミド種がn個の異なるRNA分子種のうちの1つ以上をコードするステップ、を含む。
e)m個の異なるDNAプラスミド種の混合物の各DNAプラスミド種につき少なくとも1つの単一細菌細胞クローンを単離するステップ、及び
f)ステップe)で単離した少なくとも1つの単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞クローン培養物において成長させるステップ、を含む。
e1)ステップd1)で形質転換したm個の単一細菌細胞培養物の各々の少なくとも1つの単一細菌細胞クローンを単離するステップ、
f1)ステップe1)で単離した単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞培養物において成長させるステップ、
g1)任意選択で、ステップf1)で成長させた細菌細胞クローン培養物の各々のDNAプラスミド種のアイデンティティを決定するステップ、
h1)m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき少なくとも1つの細菌細胞クローン培養物を選択するステップ、を更に含む。
e2)少なくともm個の単一細菌細胞クローンを単離するステップ、及び
f2)ステップe2)で単離した少なくともm個の単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞クローン培養物において成長させるステップ、
g2)ステップf2)で成長させた少なくともm個の単一細菌細胞クローン培養物の各々のDNAプラスミド種のアイデンティティを決定するステップ、
h2)m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物を選択するステップ、を更に含む。
i)少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物の少なくとも1つの成長動態パラメータ及び/又はプラスミドDNAの量を決定するステップ、及び
j)ステップi)で決定されたパラメータに応じてm個の異なるDNAプラスミド種の各々につき1つ以上の細菌細胞クローン培養物を選択するステップ、好ましくはm個の異なるDNAプラスミド種の各々につき1つの細菌細胞クローン培養物を選択するステップ、を含む。
i1)ある時間間隔後に細菌細胞クローン培養物の光学濃度を好ましくはマイクロプレートリーダーを使用して測定することによるか、又は散乱光オンライン測定によって成長動態パラメータを決定するステップ、及び/又は
i2)細菌細胞培養物の容積及び時間当たりに産生されたプラスミドの量を決定するステップ、を含む。
k1)ステップj)でm個の異なるDNAプラスミド種の各々について選択された1つ以上の細菌細胞クローン培養物のうちの少なくとも1つのある量を単一の反応槽において接種して成長させるステップ、又は
k2)ステップj)でm個の異なるDNAプラスミド種の各々について選択された1つ以上の細菌細胞クローン培養物のうちの少なくとも1つのある量をm個の異なるDNAプラスミド種の各々について別個の1つ以上の反応槽において接種して成長させるステップであって、任意選択でm個の異なるDNAプラスミド種の1つ以上の細菌細胞クローン培養物を単一の反応槽で一緒に成長させるステップ、を更に含む。任意選択で、等量の各細菌細胞クローン培養物が接種される。
l)ステップk1)及び/又はk2)で成長させた細菌細胞クローン培養物のm個の異なるDNAプラスミド種を得るステップ、
m)任意選択でステップl)で得られたm個の異なるDNAプラスミド種を線状化するステップ、及び
n)m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の混合物を得るステップ、を更に含む。
o)m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の各々の転写効率パラメータを決定するステップ、を更に含む。
p)n個の異なるRNA分子種を任意選択でHPLCによって精製するステップ、を含む。
q)ステップb)で得られたRNA分子組成物を定性的及び/又は定量的に分析するステップ、を更に含む。
更により好ましくは、病原体は、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)、アナプラズマ属(Anaplasma)、アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum)、ブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense)、ズビニ鉤虫(Ancylostoma duodenale)、溶血性アルカノバクテリア(Arcanobacterium haemolyticum)、回虫(Ascaris lumbricoides)、アスペルギルス属(Aspergillus)、アストロウイルス科(Astroviridae)、バベシア属(Babesia)、炭疽菌(Bacillus anthracis)、セレウス菌(Bacillus cereus)、バルトネラ・ヘンセラ菌(Bartonella henselae)、BKウイルス、ヒトブラストシスチス(Blastocystis hominis)、ブラストミセス・デルマチチジス(Blastomyces dermatitidis)、百日咳菌(Bordetella pertussis)、ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)、ボレリア属(Borrelia)、ボレリア属種(Borrelia spp)、ブルセラ属(Brucella)、マレー糸状虫(Brugia malayi)、ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)、バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)及び他のバークホルデリア属(Burkholderia)種、鼻疽菌(Burkholderia mallei)、類鼻疽菌(Burkholderia pseudomallei)、カリシウイルス科(Caliciviridae)、カンピロバクター属(Campylobacter)、カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ属種(Candida spp)、トラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)、肺炎クラミジア(Chlamydophila pneumoniae)、オウム病クラミジア(Chlamydophila psittaci)、CJDプリオン、肝吸虫(Clonorchis sinensis)、ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)、クロストリジウム・ディフィシル(Clostridium difficile)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、クロストリジウム属種(Clostridium spp)、破傷風菌(Clostridium tetani)、コクシジオイデス属種(Coccidioides spp)、コロナウイルス類、ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheriae)、Q熱コクシエラ(Coxiella burnetii)、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium)、サイトメガロウイルス(CMV)、デングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)、二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)、エボラウイルス(EBOV)、エキノコックス属(Echinococcus)、エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)、エーリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)、エーリキア属(Ehrlichia)、赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)、エンテロコッカス属(Enterococcus)、エンテロウイルス属(Enterovirus)、エンテロウイルス類、主にコクサッキーA型ウイルス及びエンテロウイルス71型(EV71)、エピデルモフィトン属種(Epidermophyton spp)、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111及びO104:H4、肝蛭(Fasciola hepatica)及び巨大肝蛭(Fasciola gigantica)、FFIプリオン、フィラリア上科(Filarioidea)、フラビウイルス類、野兎病菌(Francisella tularensis)、フゾバクテリウム属(Fusobacterium)、ゲオトリクム・カンジドゥム(Geotrichum candidum)、ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)、顎口虫属種(Gnathostoma spp)、GSSプリオン、グアナリトウイルス、軟性下疳菌(Haemophilus ducreyi)、インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)、ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ヘニパウイルス(ヘンドラウイルス、ニパウイルス)、A型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス(HBV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、D型肝炎ウイルス、E型肝炎ウイルス、単純ヘルペスウイルス1型及び2型(HSV−1及びHSV−2)、ヒストプラズマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)、ヒトボカウイルス(HBoV)、ヒトヘルペスウイルス6型(HHV−6)及びヒトヘルペスウイルス7型(HHV−7)、ヒトメタニューモウイルス(hMPV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)、日本脳炎ウイルス、JCウイルス、フニンウイルス、キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)、クレブシエラ・グラヌロマティス(Klebsiella granulomatis)、クーループリオン、ラッサウイルス、レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、リーシュマニア属(Leishmania)、レプトスピラ属(Leptospira)、リステリア菌(Listeria monocytogenes)、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、マチュポウイルス、マラセジア属種(Malassezia spp)、マールブルグウイルス、麻疹ウイルス、横川吸虫(Metagonimus yokagawai)、微胞子虫門(Microsporidia)、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ムンプスウイルス、らい菌(Mycobacterium leprae)及びマイコバクテリウム・レプロマトシス(Mycobacterium lepromatosis)、結核菌(Mycobacterium tuberculosis)、マイコバクテリウム・ウルセランス(Mycobacterium ulcerans)、肺炎マイコプラズマ(Mycoplasma pneumoniae)、フォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)、アメリカ鉤虫(Necator americanus)、淋菌(Neisseria gonorrhoeae)、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)、ノカルジア・アステロイデス(Nocardia asteroides)、ノカルジア属種(Nocardia spp)、回旋糸状虫(Onchocerca volvulus)、ツツガムシ病リケッチア(Orientia tsutsugamushi)、オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)(インフルエンザ)、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、肺吸虫属種(Paragonimus spp)、ウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)、パルボウイルスB19、パスツレラ属(Pasteurella)、プラスモジウム属(Plasmodium)、ニューモシスチス・イロベチ(Pneumocystis jirovecii)、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、ライノウイルス、ライノウイルス類、痘瘡リケッチア(Rickettsia akari)、リケッチア属(Rickettsia)、発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、ロッキー山紅斑熱リケッチア(Rickettsia rickettsii)、発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)、リフトバレー熱ウイルス、ロタウイルス、風疹ウイルス、サビアウイルス、サルモネラ属(Salmonella)、ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)、SARSコロナウイルス類、住血吸虫属(Schistosoma)、赤痢菌属(Shigella)、シンノンブレウイルス、ハンタウイルス、スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)、肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)、化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)、糞線虫(Strongyloides stercoralis)、テニア属(Taenia)、有鉤条虫(Taenia solium)、ダニ媒介性脳炎ウイルス(TBEV)、イヌ回虫(Toxocara canis)又はネコ回虫(Toxocara cati)、トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii)、梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)、旋毛虫(Trichinella spiralis)、膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)、白癬菌属種(Trichophyton spp)、鞭虫(Trichuris trichiura)、ブルーストリパノソーマ(Trypanosoma brucei)、クルーズトリパノソーマ(Trypanosoma cruzi)、ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、大痘瘡又は小痘瘡、vCJDプリオン、ベネズエラウマ脳炎ウイルス、コレラ菌(Vibrio cholerae)、ウエストナイルウイルス、西部ウマ脳炎ウイルス、バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)、黄熱病ウイルス、腸炎エルシニア(Yersinia enterocolitica)、ペスト菌(Yersinia pestis)、及び偽結核菌(Yersinia pseudotuberculosis)からなる群から選択され、好ましくは病原体は、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、プラスモジウム属(Plasmodium)、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、デングウイルス類、トラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)、サイトメガロウイルス(CMV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、結核菌(Mycobacterium tuberculosis)、狂犬病ウイルス、ロタウイルス及び黄熱病ウイルスからなる群から選択される。
タンパク質FliC、鞭毛タンパク質FliD;ライノウイルス類及びコロナウイルス類のライノウイルスカプシドタンパク質VP1、VP2、VP3、VP4;コロナウイルススパイクタンパク質(sprike protein)S、エンベロープタンパク質E、膜タンパク質M、ヌクレオカプシドタンパク質N;プリオンタンパク質Prp(CJDプリオン);クリミア・コンゴ出血熱ウイルスのエンベロープタンパク質Gc、エンベロープタンパク質Gn、ヌクレオカプシドタンパク質;クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)のビルレンス関連DEADボックスRNAヘリカーゼVAD1、ガラクトキシロマンナンタンパク質GalXM、グルクロノキシロマンナンGXM、マンノプロテインMP;クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium)の酸性リボソームタンパク質P2 CpP2、ムチン抗原Muc1、Muc2、Muc3Muc4、Muc5、Muc6、Muc7、表面接着タンパク質CP20、表面接着タンパク質CP23、表面タンパク質CP12、表面タンパク質CP21、表面タンパク質CP40、表面タンパク質CP60、表面タンパク質CP15、表面関連グリコペプチドgp40、表面関連グリコペプチドgp15、オーシスト壁タンパク質AB、プロフィリンPRF、アピラーゼ;例えばブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense)及びその他の皮膚幼虫移行症(CLM)などの病原体の脂肪酸及びレチノール結合タンパク質−1(FAR−1)、メタロプロテイナーゼ組織阻害因子(TIMP)、システインプロテイナーゼACEY−1、システインプロテイナーゼACCP−1、表面抗原Ac−16、分泌タンパク質2 ASP−2、メタロプロテアーゼ1MTP−1、アスパルチルプロテアーゼ阻害因子API−1、表面関連抗原SAA−1、成体特異的分泌第Xa因子セリンプロテアーゼ阻害因子抗凝固薬AP、カテプシンD様アスパラギン酸プロテアーゼARR−1;有鉤条虫(Taenia solium)のカテプシンL様プロテアーゼ、53/25kDa抗原、8kDaファミリーメンバー、辺縁トリプシン様活性を有する嚢虫タンパク質TsAg5、六鉤幼虫タンパク質TSOL18、六鉤幼虫タンパク質TSOL45−1A、乳酸デヒドロゲナーゼA LDHA、乳酸デヒドロゲナーゼB LDHB;サイトメガロウイルス(CMV)のpp65抗原、膜タンパク質pp15、カプシド基部テグメントタンパク質pp150、タンパク質M45、DNAポリメラーゼUL54、ヘリカーゼUL105、糖タンパク質gM、グリコールタンパク質gN、糖タンパク質H、糖タンパク質B gB、タンパク質UL83、タンパク質UL94、タンパク質UL99;デングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)−フラビウイルス類のカプシドタンパク質C、プレ膜タンパク質prM、膜タンパク質M、エンベロープタンパク質E(ドメインI、ドメインII、ドメインII)、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質NS2B、タンパク質NS3、タンパク質NS4A、タンパク質2K、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)の39kDaタンパク質;ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheriae)のジフテリア毒素前駆体Tox、ジフテリア毒素DT、ピリン特異的ソルターゼSrtA、シャフトピリンタンパク質SpaA、先端ピリンタンパク質SpaC、マイナーピリンタンパク質SpaB、表面結合タンパク質DIP1281;エボラウイルス(EBOV)の糖タンパク質GP、核タンパク質NP、マイナーマトリックスタンパク質VP24、メジャーマトリックスタンパク質VP40、転写活性化因子VP30、ポリメラーゼ補因子VP35、RNAポリメラーゼL;プリオンタンパク質(vCJDプリオン、vCJD、nvCJD);軟性下疳菌(Haemophilus ducreyi)のUvrABC系タンパク質B、タンパク質Flp1、タンパク質Flp2、タンパク質Flp3、タンパク質TadA、ヘモグロビン受容体HgbA、外膜タンパク質TdhA、タンパク質CpsRA、調節因子CpxR、タンパク質SapA、18kDa抗原、外膜タンパク質NcaA、タンパク質LspA、タンパク質LspA1、タンパク質LspA2、タンパク質LspB、外膜成分DsrA、レクチンDltA、リポタンパク質Hlp、主要外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質OmpA2;コクシジオイデス・イミチス(Coccidioides immitis)及びコクシジオイデス・ポサダシ(Coccidioides posadasii)のアスパルチルプロテアーゼ1 Pep1、ホスホリパーゼB PLB、α−マンノシダーゼ1 AMN1、グルカノシルトランスフェラーゼGEL1、ウレアーゼURE、ペルオキシソームマトリックスタンパク質Pmp1、プロリンリッチ抗原Pra、ヒトT細胞応答性タンパク質(humal T−cell reative protein)TcrP;例えば白癬菌属種(Trichophyton spp)、エピデルモフィトン属種(Epidermophyton spp.)、マラセジア属種(Malassezia spp.)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)のアレルゲンTri r 2、熱ショックタンパク質60 Hsp60、真菌アクチンAct、抗原Tri r2、抗原Tri r4、抗原Tri t1、タンパク質IV、グリセロール−3−リン酸デヒドロゲナーゼGpd1、浸透圧センサHwSho1A、浸透圧センサHwSho1B、ヒスチジンキナーゼHwHhk7B、アレルゲンMala s 1、アレルゲンMala s 11、チオレドキシンTrx Mala s 13、アレルゲンMala f、アレルゲンMala s;エキノコックス属(Echinococcus)のタンパク質EG95、タンパク質EG10、タンパク質EG18、タンパク質EgA31、タンパク質EM18、抗原EPC1、抗原B、抗原5、タンパク質P29、タンパク質14−3−3、8kDaタンパク質、ミオフィリン(myophilin)、熱ショックタンパク質20(HSP20)、糖タンパク質GP−89、脂肪酸結合タンパク質FAPB;エーリキア属(Ehrlichia)の主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質;エンテロコッカス属(Enterococcus)の分泌抗原SagA、sagA様タンパク質SalA及びSalB、コラーゲンアドヘシンScm、表面タンパク質Fms1 EbpA(fm)、Fms5 EbpB(fm)、Fms9 EpbC(fm)及びFms10、タンパク質EbpC(fm)、96kDa免疫保護糖タンパク質G1;エンテロウイルス属(Enterovirus)のゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C;外膜タンパク質OM、60kDa外膜タンパク質、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、134kDa外膜タンパク質、31kDa外膜タンパク質、29.5kDa外膜タンパク質、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質Adr1(RP827)、細胞表面タンパク質Adr2(RP828)、細胞表面タンパク質SCA1、侵入タンパク質invA、細胞分裂タンパク質fts、secファミリーの分泌タンパク質、ビルレンスタンパク質virB、tlyA、tlyC、パルブリン様タンパク質Plp、プレタンパク質トランスロカーゼSecA、120kDa表面タンパク質抗原SPA、138kD複合抗原、主要100kDタンパク質(タンパク質I)、細胞質内タンパク質D、防御表面タンパク質抗原SPA(発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、発疹チフス);エプスタイン・バーウイルス(EBV)のエプスタイン・バー核抗原(EBNA−1、EBNA−2、EBNA−3A、EBNA−3B、EBNA−3C、EBNA−リーダータンパク質(EBNA−LP))、潜伏性膜タンパク質(LMP−1、LMP−2A、LMP−2B)、早期抗原EBV−EA、膜抗原EBV−MA、ウイルスカプシド抗原EBV−VCA、アルカリ性ヌクレアーゼEBV−AN、糖タンパク質H、糖タンパク質gp350、糖タンパク質gp110、糖タンパク質gp42、糖タンパク質gHgL、糖タンパク質gB;パルボウイルスB19のカプシドタンパク質(cpasid protein)VP2、カプシドタンパク質VP1、主要タンパク質NS1;ヒトヘルペスウイルス6型(HHV−6)及びヒトヘルペスウイルス7型(HHV−7)のpp65抗原、糖タンパク質105、主要カプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質H、タンパク質U51;肝蛭(Fasciola hepatica)及び巨大肝蛭(Fasciola gigantica)のチオレドキシングルタチオンレダクターゼTGR、カテプシンL1及びL2、Kunitz型タンパク質KTM、ロイシンアミノペプチダーゼLAP、システインプロテイナーゼFas2、サポシン様タンパク質−2 SAP−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPx、Prx−1、Prx−2、カテプシンlシステインプロテイナーゼCL3、プロテアーゼカテプシンL CL1、ホスホグリセリン酸キナーゼPGK、27kDa分泌タンパク質、60kDaタンパク質HSP35α、グルタチオントランスフェラーゼGST、28.5kDa外被抗原28.5kDa TA、カテプシンB3プロテアーゼCatB3、I型シスタチンステフィン−1、カテプシンL5、カテプシンL1g及びカテプシンB、脂肪酸結合タンパク質FABP、ロイシンアミノペプチダーゼLAP;プリオンタンパク質FFIプリオン;フィラリア上科(Filarioidea)の毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、Cox−2;ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)のホスホリパーゼC PLC、易熱性エンテロトキシンB、イオタ毒素成分Ib、タンパク質CPE1281、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼ、伸長因子G EF−G、パーフリンゴリジンO Pfo、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGapC、フルクトース二リン酸アルドラーゼAlf2、ウェルシュ菌(Clostridium p
erfringens)エンテロトキシンCPE、アルファ毒素AT、αトキソイドATd、εトキソイドETd、タンパク質HP、大型細胞毒TpeL、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼNaglu、ホスホグリセロムターゼPgm;フゾバクテリウム属(Fusobacterium)のロイコトキシンlktA、付着FadA、外膜タンパク質RadD、高分子量アルギニン結合タンパク質;例えばウェルシュ菌(Clostridium perfringens)及び他のクロストリジウム属(Clostridium)種のホスホリパーゼC PLC、易熱性エンテロトキシンB、イオタ毒素成分Ib、タンパク質CPE1281、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼ、伸長因子G EF−G、パーフリンゴリジンO Pfo、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGapC、フルクトース二リン酸アルドラーゼAlf2、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)エンテロトキシンCPE、アルファ毒素AT、αトキソイドATd、εトキソイドETd、タンパク質HP、大型細胞毒TpeL、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼNaglu、ホスホグリセロムターゼPgm;ゲオトリクム・カンジドゥム(Geotrichum candidum)のリパーゼA、リパーゼB、ペルオキシダーゼDec1;プリオンタンパク質GSSプリオン;ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)の嚢胞壁タンパク質CWP1、CWP2、CWP3、変異表面タンパク質VSP、VSP1、VSP2、VSP3、VSP4、VSP5、VSP6、56kDa抗原、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼPFOR、アルコールデヒドロゲナーゼE ADHE、α−ジアルジン、α8−ジアルジン、α1−ジアルジン(alpha1−guiardin)、β−ジアルジン、システインプロテアーゼ、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、アルギニンデイミナーゼADI、フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼ(bisphosphat aldolase)FBA、ジアルジア・トロフォゾイテス(Giardia trophozoites)抗原GTA(GTA1、GTA2)、オルニチンカルボキシルトランスフェラーゼOCT、ストライエイトファイバーセンブリン様タンパク質(striated fiber−asseblin−like protein)SALP、ウリジンホスホリル様タンパク質UPL、α−チューブリン、β−チューブリン;鼻疽菌(Burkholderia mallei)のABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A BimA、細菌伸長因子−Tu EF−Tu、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質;有棘顎口虫(Gnathostoma spinigerum)及び剛棘顎口虫(Gnathostoma hispidum)のシクロフィリンCyP、24kDa第三期幼虫タンパク質(third−stage larvae protien)GS24、排出−分泌産物ESP(40、80、120及び208kDa);淋菌(Neisseria gonorrhoeae)のピリンタンパク質、マイナーピリン関連サブユニットpilC、メジャーピリンサブユニット及び変異体pilE、pilS、相変異タンパク質porA、ポーリンB PorB、タンパク質TraD、ナイセリア外膜抗原H.8、70kDa抗原、主要外膜タンパク質PI、外膜タンパク質PlA及びPlB、W抗原、表面タンパク質A NspA、トランスフェリン結合タンパク質TbpA、トランスフェリン結合タンパク質TbpB、PBP2、mtrRコードタンパク質、ponAコードタンパク質、膜透過酵素FbpBC、FbpABCタンパク質系、LbpABタンパク質、外膜タンパク質Opa、外膜トランスポーターFetA、鉄抑制調節因子MpeR;クレブシエラ・グラヌロマティス(Klebsiella granulomatis)の外膜タンパク質A OmpA、外膜タンパク質C OmpC、外膜タンパク質K17 OmpK17;化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)のフィブロネクチン結合タンパク質Sfb、フィブロネクチン/フィブリノゲン結合タンパク質FBP54、フィブロネクチン結合タンパク質FbaA、Mタンパク質1型Emm1、Mタンパク質6型Emm6、免疫グロブリン結合タンパク質35 Sib35、表面タンパク質R28 Spr28、スーパーオキシドジスムターゼSOD、C5aペプチダーゼScpA、抗原I/II AgI/II、アドヘシンAspA、G関連α2−マクログロブリン結合タンパク質GRAB、表面原線維タンパク質M5;ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)のCタンパク質β抗原、アルギニンデイミナーゼタンパク質、アドヘシンBibA、105kDAタンパク質BPS、表面抗原c、表面抗原R、表面抗原X、トリプシン耐性タンパク質R1、トリプシン耐性タンパク質R3、トリプシン耐性タンパク質R4、表面免疫原性タンパク質Sip、表面タンパク質Rib、ロイシンリッチリピートタンパク質LrrG、セリンリッチリピートタンパク質Srr−2、Cタンパク質α抗原Bca、Β抗原Bag、表面抗原Ε、α様タンパク質ALP1、α様タンパク質ALP5、表面抗原δ、α様タンパク質ALP2、α様タンパク質ALP3、α様タンパク質ALP4、Cβタンパク質Bac;インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)のトランスフェリン結合タンパク質2 Tbp2、ホスファターゼP4、外膜タンパク質P6、ペプチドグリカン結合リポタンパク質Pal、タンパク質D、タンパク質E、接着及び透過タンパク質Hap、外膜タンパク質26 Omp26、外膜タンパク質P5(フィンブリン)、外膜タンパク質D15、外膜タンパク質OmpP2、5’−ヌクレオチダーゼNucA、外膜タンパク質P1、外膜タンパク質P2、外膜リポタンパク質Pcp、リポタンパク質E、外膜タンパク質P4、フクロキナーゼFucK、[Cu,Zn]−スーパーオキシドジスムターゼSodC、プロテアーゼHtrA、タンパク質O145、α−ガラクトシルセラミド;ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C(エンテロウイルス類、主にコクサッキーA型ウイルス及びエンテロウイルス71型(EV71)、手足口病(HFMD));シンノンブレウイルス、ハンタウイルスのRNAポリメラーゼL、タンパク質L、糖タンパク質Gn、糖タンパク質Gc、ヌクレオカプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質G1、核タンパク質NP、タンパク質N、ポリタンパク質M;ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)の熱ショックタンパク質HspA、熱ショックタンパク質HspB、クエン酸シンターゼGltA、タンパク質UreB、熱ショックタンパク質Hsp60、好中球活性化タンパク質NAP、カタラーゼKatA、空胞化サイトトキシンVacA、ウレアーゼα UreA、ウレアーゼβ Ureb、タンパク質Cpn10、タンパク質groES、熱ショックタンパク質Hsp10、タンパク質MopB、細胞毒性関連10kDaタンパク質CAG、36kDa抗原、β−ラクタマーゼHcpA、β−ラクタマーゼHcpB;大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111及びO104:H4の内在性膜タンパク質、易凝集性タンパク質、O−抗原、毒素抗原Stx2B、毒素抗原Stx1B、接着抗原断片Int28、タンパク質EspA、タンパク質EspB、インチミン、タンパク質Tir、タンパク質IntC300、タンパク質Eae;ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)のRNAポリメラーゼL、タンパク質L、糖タンパク質Gn、糖タンパク質Gc、ヌクレオカプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質G1、核タンパク質NP、タンパク質N、ポリタンパク質M;ヘニパウイルス、ヘンドラウイルス又はニパウイルスの糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、核タンパク質N、融合タンパク質F、ポリメラーゼL、プロテインW、プロテインC、リンタンパク質p、非構造タンパク質V;A型肝炎ウイルスのポリタンパク質、糖タンパク質(glycoproten)Gp2、A型肝炎表面抗原HBAg、タンパク質2A、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、タンパク質P1B、タンパク質P2A、タンパク質P3AB、タンパク質P3D;B型肝炎ウイルス(HBV)のB型肝炎表面抗原HBsAg、B型肝炎コア抗原HbcAg、ポリメラーゼ、タンパク質Hbx、preS2ミドル表面タンパク質、表面タンパク質L、ラージSタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4;C型肝炎ウイルスのエンベロープ糖タンパク質E1 gp32 gp35、エンベロープ糖タンパク質E2 NS1 gp68 gp70、カプシドタンパク質C、コアタンパク質Core、ポリタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、抗原G、タンパク質NS3、タンパク質NS5A;D型肝炎ウイルスのウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、ラージデルタ肝炎抗原(hepaptitis delta antigen)、スモールデルタ肝炎抗原(hepaptitis delta antigen);E型肝炎ウイルスのウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、カプシドタンパク質E2;単純ヘルペスウイルス1型及び2型(HSV−1及びHSV−2)の糖タンパク質L UL1、ウラシル−DNAグリコシラーゼUL2、タンパク質UL3、タンパク質UL4、DNA複製タンパク質UL5、ポータルタンパク質UL6、ビリオン成熟タンパク質UL7、DNAヘリカーゼUL8、複製起点結合タンパク質UL9、糖タンパク質M UL10、タンパク質UL11、アルカリ性エキソヌクレアーゼUL12、セリン−スレオニンプロテインキナーゼUL13、テグメントタンパク質UL14、ターミナーゼUL15、テグメントタンパク質UL16、タンパク質UL17、カプシドタンパク質VP23 UL18、主要カプシドタンパク質VP5 UL19、膜タンパク質UL20、テグメントタンパク質UL21、糖タンパク質H(UL22)、チミジンキナーゼUL23、タンパク質UL24、タンパク質UL25、カプシドタンパク質P40(UL26、VP24、VP22A)、グリコールタンパク質B(UL27)、ICP18.5タンパク質(UL28)、主要DNA結合タンパク質ICP8(UL29)、DNAポリメラーゼUL30、核マトリックスタンパク質UL31、エンベロープグリコールタンパク質UL32、タンパク質UL33、核内膜タンパク質UL34、カプシドタンパク質VP26(UL35)、ラージテグメントタンパク質UL36、カプシド集合タンパク質UL37、VP19Cタンパク質(UL38)、リボヌクレオチド還元酵素(大サブユニット)UL39、リボヌクレオチド還元酵素(小サブユニット)UL40、テグメントタンパク質/ビリオン宿主シャットオフVHSタンパク質(UL41)、DNAポリメラーゼプロセシビティー因子UL42、膜タンパク質UL43、糖タンパク質C(UL44)、膜タンパク質UL45、テグメントタンパク質VP11/12(UL46)、テグメントタンパク質VP13/1
4(UL47)、ビリオン成熟タンパク質VP16(UL48、α−TIF)、エンベロープタンパク質UL49、dUTPジホスファターゼUL50、テグメントタンパク質UL51、DNAヘリカーゼ/プライマーゼ複合タンパク質UL52、糖タンパク質K(UL53)、転写調節タンパク質IE63(ICP27、UL54)、タンパク質UL55、タンパク質UL56、ウイルス複製タンパク質ICP22(IE68、US1)、タンパク質US2、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼUS3、糖タンパク質G(US4)、糖タンパク質J(US5)、糖タンパク質D(US6)、糖タンパク質I(US7)、糖タンパク質E(US8)、テグメントタンパク質US9、カプシド/テグメントタンパク質US10、Vmw21タンパク質(US11)、ICP47タンパク質(IE12、US12)、主要転写活性化因子ICP4(IE175、RS1)、E3ユビキチンリガーゼICP0(IE110)、潜伏期関連タンパク質1 LRP1、潜伏期関連タンパク質2 LRP2、ニューロビルレンス因子RL1(ICP34.5)、潜伏期関連転写物LAT;ヒストプラズマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)の熱ショックタンパク質Hsp60、細胞表面タンパク質H1C、ジペプチジルペプチダーゼIV型DppIV、M抗原、70kDaタンパク質、17kDaヒストン様タンパク質;ズビニ鉤虫(Ancylostoma duodenale)及びアメリカ鉤虫(Necator americanus)の脂肪酸及びレチノール結合タンパク質−1 FAR−1、メタロプロテイナーゼ組織阻害因子TIMP(TMP)、システインプロテイナーゼACEY−1、システインプロテイナーゼACCP−1、表面抗原Ac−16、分泌タンパク質2 ASP−2、メタロプロテアーゼ1MTP−1、アスパルチルプロテアーゼ阻害因子API−1、表面関連抗原SAA−1、表面関連抗原SAA−2、成体特異的分泌第Xa因子、セリンプロテアーゼ阻害因子抗凝固薬AP、カテプシンD様アスパラギン酸プロテアーゼARR−1、グルタチオンS−トランスフェラーゼGST、アスパラギン酸プロテアーゼAPR−1、アセチルコリンエステラーゼAChE;ヒトボカウイルス(HBoV)のタンパク質NS1、タンパク質NP1、タンパク質VP1、タンパク質VP2、タンパク質VP3;エー・潟Lア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)の主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質;アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum)の主要表面タンパク質1〜5(MSP1a、MSP1b、MSP2、MSP3、MSP4、MSP5)、IV型分泌系(secreotion system)タンパク質VirB2、VirB7、VirB11、VirD4;ヒトメタニューモウイルス(hMPV)のタンパク質NS1、スモール疎水性タンパク質NS2、SHタンパク質、融合タンパク質F、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL;エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)の主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質;ヒトパピローマウイルス(HPV)の複製タンパク質E1、調節タンパク質E2、タンパク質E3、タンパク質E4、タンパク質E5、タンパク質E6、タンパク質E7、タンパク質E8、主要カプシドタンパク質L1、マイナーカプシドタンパク質L2;ヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)の融合タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼ(hemagglutinin−neuramidase)HN、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL;オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)、インフルエンザウイルス(流感)の赤血球凝集素(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)、核タンパク質(NP)、M1タンパク質、M2タンパク質、NS1タンパク質、NS2タンパク質(NEPタンパク質:核外輸送タンパク質)、PAタンパク質、PB1タンパク質(ポリメラーゼ塩基性1タンパク質)、PB1−F2タンパク質及びPB2タンパク質;日本脳炎ウイルスのゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C;キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)のRTX毒素、IV型線毛、主要線毛サブユニットPilA、調節性転写因子PilS及びPilR、タンパク質σ54、外膜タンパク質;プリオンタンパク質クーループリオン;ラッサウイルスの核タンパク質N、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質Z、糖タンパク質GP;レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)のペプチドグリカン結合リポタンパク質PAL、60kDaシャペロニンCpn60(groEL、HspB)、IV型ピリンPilE、外膜タンパク質MIP、主要外膜タンパク質MompS、亜鉛メタロプロテイナーゼMSP;リーシュマニア属(Leishmania)のP4ヌクレアーゼ、タンパク質WD、リボヌクレオチド還元酵素M2、表面膜糖タンパク質Pg46、システインプロテイナーゼCP、グルコース調節タンパク質78 GRP−78、ステージ特異的S抗原様タンパク質A2、ATPアーゼF1、β−チューブリン、熱ショックタンパク質70 Hsp70、KMP−11、糖タンパク質GP63、タンパク質BT1、ヌクレオシドヒドロラーゼNH、細胞表面タンパク質B1、リボソームタンパク質P1様タンパク質P1、ステロール24−c−メチルトランスフェラーゼSMT、LACKタンパク質、ヒストンH1、SPB1タンパク質、チオール特異的抗酸化剤TSA、タンパク質抗原STl1、シグナルペプチダーゼSP、ヒストンH2B、表面抗原(suface antigen)PSA−2、システインプロテイナーゼb Cpb;らい菌(Mycobacterium leprae)の主要膜タンパク質I、セリンリッチ抗原45kDa、10kDaシャペロニン(caperonin)GroES、HSP kDa抗原、アミノオキソノナノエートシンターゼAONS、タンパク質リコンビナーゼA RecA、アセチル−/プロピオニル−補酵素Aカルボキシラーゼα、アラニンラセマーゼ、60kDaシャペロニン2、ESAT−6様タンパク質EcxB(L−ESAT−6)、タンパク質Lsr2、タンパク質ML0276、ヘパリン結合赤血球凝集素HBHA、熱ショックタンパク質65 Hsp65、mycP1又はML0041コードタンパク質、htrA2又はML0176コードタンパク質、htrA4又はML2659コードタンパク質、gcp又はML0379コードタンパク質、clpC又はML0235コードタンパク質;レプトスピラ属(Leptospira)の外膜タンパク質LipL32、膜タンパク質LIC10258、膜タンパク質LP30、膜タンパク質LIC12238、Ompa様タンパク質Lsa66、表面タンパク質LigA、表面タンパク質LigB、主要外膜タンパク質OmpL1、外膜タンパク質LipL41、タンパク質LigAni、表面タンパク質LcpA、接着タンパク質LipL53、外膜タンパク質UpL32、表面タンパク質Lsa63、フラジェリンFlaB1、膜リポタンパク質(membran lipoprotein)LipL21、膜タンパク質pL40、レプトスピラ表面アドヘシンLsa27、外膜タンパク質OmpL36、外膜タンパク質OmpL37、外膜タンパク質OmpL47、外膜タンパク質OmpL54、アシルトランスフェラーゼLpxA;リステリア菌(Listeria monocytogenes)のリステリオリシンO前駆体Hly(LLO)、侵入関連タンパク質Iap(P60)、リステリオリシン調節タンパク質PrfA、亜鉛メタロプロテイナーゼMpl、ホスファチジルイノシトール特異的ホスホリパーゼC PLC(PlcA、PlcB)、O−アセチルトランスフェラーゼOat、ABCトランスポーター透過酵素Im.G_1771、接着タンパク質LAP、LAP受容体Hsp60、アドヘシンLapB、溶血毒素リステリオリシンO LLO、タンパク質ActA、インターナリンA InlA、タンパク質lnlB;例えばボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)及び他のボレリア属(Borrelia)種の細胞表層タンパク質A OspA、細胞表層タンパク質OspB、細胞表層タンパク質OspC、デコリン結合タンパク質A DbpA、デコリン結合タンパク質B DbpB、鞭毛繊維41kDaコアタンパク質Fla、塩基性膜タンパク質A BmpA(免疫優勢抗原P39)、表層22kDaリポタンパク質前駆体(抗原IPLA7)、変異性表層リポタンパク質vlsE;毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、タンパク質Cox−2(バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)及びマレー糸状虫(Brugia malayi)、リンパ管フィラリア症(象皮病));リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)の糖タンパク質GP、マトリックスタンパク質Z、ポリメラーゼL、核タンパク質N;トロンボスポンジン関連匿名タンパク質TRAP、SSP2スポロゾイト表面タンパク質2、頂端膜抗原1 AMA1、ロプトリー膜抗原RMA1、酸性塩基性リピート抗原ABRA、細胞通過タンパク質PF、タンパク質Pvs25、メロゾイト表面タンパク質1 MSP−1、メロゾイト表面タンパク質2 MSP−2、リング感染赤血球表面抗原RESA、肝ステージ抗原3 LSA−3、タンパク質Eba−175、セリンリピート抗原5 SERA−5、スポロゾイト周囲タンパク質CS、メロゾイト表面タンパク質3 MSP3、メロゾイト表面タンパク質8 MSP8、エノラ
ーゼPF10、肝細胞赤血球タンパク質17kDa HEP17、赤血球膜タンパク質1 EMP1、タンパク質Kβメロゾイト表面タンパク質4/5 MSP4/5、熱ショックタンパク質Hsp90、グルタミン酸リッチタンパク質GLURP、メロゾイト表面タンパク質4 MSP−4、タンパク質STARP、スポロゾイト周囲タンパク質関連抗原前駆体CRA(プラスモジウム属(Plasmodium)、マラリア);マールブルグウイルスの核タンパク質N、膜結合性タンパク質VP24、マイナー核タンパク質VP30、ポリメラーゼ補因子VP35、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質VP40、エンベロープ糖タンパク質GP;麻疹ウイルスのプロテインC、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、非構造タンパク質V、赤血球凝集素糖タンパク質H、ポリメラーゼL、核タンパク質N、融合タンパク質F;類鼻疽菌(Burkholderia pseudomallei)のABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A BimA、細菌伸長因子−Tu EF−Tu、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質、boaBコードタンパク質;髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)のピリンタンパク質、マイナーピリン関連サブユニットpilC、メジャーピリンサブユニット及び変異体pilE、pilS、相変異タンパク質porA、ポーリンB PorB、タンパク質TraD、ナイセリア外膜抗原H.8、70kDa抗原、主要外膜タンパク質PI、外膜タンパク質PlA及びPlB、W抗原、表面タンパク質A NspA、トランスフェリン結合タンパク質TbpA、トランスフェリン結合タンパク質TbpB、PBP2、mtrRコードタンパク質、ponAコードタンパク質、膜透過酵素FbpBC、FbpABCタンパク質系、LbpABタンパク質、外膜タンパク質Opa、外膜トランスポーターFetA、鉄抑制調節因子MpeR、H因子−結合タンパク質fHbp、アドヘシンNadA、タンパク質NhbA、リプレッサーFarR;例えば横川吸虫(Metagonimus yokagawai)の66kDaタンパク質、22kDaタンパク質;微胞子虫門(Microsporidia)の極管タンパク質(グルゲア属(Glugea)の34、75、及び170kDa、エンセファリトゾーン属(Encephalitozoon)の35、55及び150kDa)、キネシン関連タンパク質、RNAポリメラーゼIIラージストサブユニット、内在性膜タンパク質と類似YIPA、抗サイレンシングタンパク質1、熱ショック転写因子HSF、プロテインキナーゼ、チミジンキナーゼ、NOP−2様核小体タンパク質;伝染性軟属腫ウイルス(MCV)のCASP8及びFADD様アポトーシス調節因子、グルタチオンペルオキシダーゼGPX1、RNAヘリカーゼNPH−II NPH2、ポリ(A)ポリメラーゼ触媒サブユニットPAPL、主要エンベロープタンパク質P43K、早期転写因子70kDaサブユニットVETFS、早期転写因子82kDaサブユニットVETFL、メタロエンドペプチダーゼG1型、ヌクレオシドトリホスファターゼI NPH1、複製タンパク質A28様MC134L、RNAポリメラーゼ(RNA polymease)7kDaサブユニットRPO7;ムンプスウイルスのマトリックスタンパク質M、リンタンパク質P/V、スモール疎水性タンパク質SH、核タンパク質N、タンパク質V、融合糖タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼHN、RNAポリメラーゼL;発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)の外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D、結晶性表層タンパク質SLP、防御表面タンパク質抗原SPA;肺炎マイコプラズマ(Mycoplasma pneumoniae)のアドヘシンP1、アドヘシン(adhesion)P30、タンパク質p116、タンパク質P40、細胞骨格タンパク質HMW1、細胞骨格タンパク質HMW2、細胞骨格タンパク質HMW3、MPN152コードタンパク質、MPN426コードタンパク質、MPN456コードタンパク質、MPN−500コードタンパク質;例えばノカルジア・アステロイデス(Nocardia asteroides)及び他のノカルジア属(Nocardia)種のNocA、鉄依存性調節タンパク質、VapA、VapD、VapF、VapG、カゼイン分解プロテアーゼ、糸状体先端部関連43kDaタンパク質、タンパク質P24、タンパク質P61、15kDaタンパク質、56kDaタンパク質;回旋糸状虫(Onchocerca volvulus)の毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP、例えばペプチドN、N1、N2、及びN3、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、Cox−2;パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)の43kDa分泌型糖タンパク質、糖タンパク質gp0、糖タンパク質gp75、抗原Pb27、抗原Pb40、熱ショックタンパク質Hsp65、熱ショックタンパク質Hsp70、熱ショックタンパク質Hsp90、タンパク質P10、トリオースリン酸イソメラーゼTPI、N−アセチルグルコサミン結合レクチンパラコクシン(Paracoccin)、28kDaタンパク質Pb28;例えばウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)及び他の肺吸虫属(Paragonimus)種の28kDaクルジパイン様システインプロテアーゼPw28CCP;パスツレラ属(Pasteurella)の外膜タンパク質OmpH、外膜タンパク質Omp28、タンパク質PM1539、タンパク質PM0355、タンパク質PM1417、修復タンパク質MutL、タンパク質BcbC、タンパク質PM0305、ギ酸デヒドロゲナーゼ−N、タンパク質PM0698、タンパク質PM1422、DNAジャイレース、リポタンパク質PlpE、接着タンパク質Cp39、ヘム獲得システム受容体HasR、39kDa被膜タンパク質、鉄調節型OMP IROMP、外膜タンパク質OmpA87、線毛タンパク質Ptf、線毛サブユニットタンパク質PtfA、トランスフェリン結合タンパク質Tbpl、エステラーゼ酵素MesA、パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)毒素PMT、接着タンパク質Cp39;百日咳菌(Bordetella pertussis)の糸状赤血球凝集素FhaB、アデニル酸シクラーゼCyaA、百日咳毒素サブユニット4前駆体PtxD、パータクチン前駆体Prn、毒素サブユニット1 PtxA、タンパク質Cpn60、タンパク質brkA、百日咳毒素サブユニット2前駆体PtxB、百日咳毒素サブユニット3前駆体PtxC、百日咳毒素サブユニット5前駆体PtxE、パータクチンPrn、タンパク質Fim2、タンパク質Fim3;ペスト菌(Yersinia pestis)のF1カプセル抗原、ビルレンス関連V抗原、分泌型エフェクタータンパク質LcrV、V抗原、外膜プロテアーゼPla、分泌型エフェクタータンパク質YopD、推定分泌タンパク質−チロシンホスファターゼYopH、ニードル複合体主要サブユニットYscF、プロテインキナーゼYopO、推定オートトランスポータータンパク質YapF、内膜ABCトランスポーターYbtQ(Irp7)、推定糖結合タンパク質YPO0612、熱ショックタンパク質90 HtpG、推定スルファターゼタンパク質YdeN、外膜リポタンパク質キャリアータンパク質LolA、分泌シャペロンYerA、推定リポタンパク質YPO0420、溶血毒素アクチベータータンパク質HpmB、ペスチシン/エルシニアバクチン外膜受容体Psn、分泌型エフェクタータンパク質YopE、分泌型エフェクタータンパク質YopF、分泌型エフェクタータンパク質YopK、外膜タンパク質YopN、外膜タンパク質YopM、コアグラーゼ/フィブリノリジン前駆体Pla;肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)のタンパク質PhpA、表面アドヘシンPsaA、ニューモリシンPly、ATP依存性プロテアーゼClp、リポ酸−タンパク質リガーゼLplA、細胞壁表面アンカータンパク質psrP、ソルターゼSrtA、グルタミル−tRNAシンテターゼGltX、コリン結合タンパク質A CbpA、肺炎球菌表面タンパク質A PspA、肺炎球菌表面タンパク質C PspC、6−ホスホグルコン酸デヒドロゲナーゼGnd、鉄結合タンパク質PiaA、ムレインヒドロラーゼLytB、プロテオン(proteon)LytC、プロテアーゼA1;ニューモシスチス・イロベチ(Pneumocystis jirovecii)の主要表面タンパク質B、ケキシン様プロテアーゼKEX1、タンパク質A12、55kDa抗原P55、主要表面糖タンパク質Msg;ポリオウイルスのゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C;例えばフォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)のタンパク質Nfa1、エキセンディン−3、分泌性リパーゼ、カテプシンB様プロテアーゼ、システインプロテアーゼ、カテプシン、ペルオキシレドキシン、タンパク質Cry1Ac;JCウイルスのアグノプロテイン、ラージT抗原、スモールT抗原、主要カプシドタンパク質VP1、マイナーカプシドタンパク質Vp2;オウム病クラミジア(Chlamydophila psittaci)の低カルシウム応答タンパク質E LCrE、クラミジア外膜タンパク質N CopN、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼPknD、アシルキャリアータンパク質S−マロニルトランスフェラーゼFabD、一本鎖DNA結合タンパク質Ssb、主要外膜タンパク質MOMP、外膜タンパク質2(Omp2)、多形膜タンパク質ファミリー、例えば、Pmp1、Pmp2、Pmp3、Pmp4、Pmp5、Pmp6、Pmp7、Pmp8、Pmp9、Pmp10、Pmp11、Pmp12、Pmp13、Pmp14、Pmp15、Pmp16、Pmp17、Pmp18、Pmp19、Pmp20、Pmp21;Q熱コクシエラ(Coxiella burnetii)の外膜タンパク質P1、熱ショックタンパク質B HspB、ペプチドABCトランスポーター、GTP結合タンパク質、タンパク質IcmB、リボヌクレアーゼR、ホスファターゼ(phosphatas)SixA、タンパク質DsbD、外膜タンパク質TolC、DNA−結合タンパク質PhoB、ATPアーゼDotB、熱ショックタンパク質B(HspB)、膜タンパク質Com1、28kDaタンパク質、DNA−3−メチルアデニングリコシダーゼI、外膜タンパク質OmpH、外膜タン
パク質AdaA、グリシン切断系Tタンパク質;狂犬病ウイルスの核タンパク質N、ラージ構造タンパク質L、リンタンパク質(phophoprotein)P、マトリックスタンパク質M、糖タンパク質G;呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、核タンパク質N、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質P、スモール疎水性タンパク質SH、主要表面糖タンパク質G、ポリメラーゼL、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質2 NS2;ライノウイルスのゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C;リケッチア属(Rickettsia)の外膜(OM)タンパク質、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、タンパク質PS120、細胞質内タンパク質D、防御表面タンパク質抗原SPA;痘瘡リケッチア(Rickettsia akari)の外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D;リフトバレー熱ウイルスのエンベロープ糖タンパク質GP、ポリメラーゼL、核タンパク質N、非構造タンパク質NSS;ロッキー山紅斑熱リケッチア(Rickettsia rickettsii)の外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D;ロタウイルスの非構造タンパク質6 NS6、非構造タンパク質2 NS2、中間カプシドタンパク質VP6、内側カプシドタンパク質VP2、非構造タンパク質3 NS3、RNA指向性RNAポリメラーゼL、タンパク質VP3、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質5 NS5、外側カプシド糖タンパク質VP7、非構造糖タンパク質4 NS4、外側カプシドタンパク質VP4;風疹ウイルスのポリタンパク質P200、糖タンパク質E1、糖タンパク質E2、タンパク質NS2、カプシドタンパク質C;サルモネラ属(Salmonella)のシャペロニンGroEL(MopA)、イノシトールリン酸ホスファターゼSopB、熱ショックタンパク質HslU、シャペロンタンパク質DnaJ、タンパク質TviB、タンパク質IroN、フラジェリンFliC、侵入タンパク質SipC、糖タンパク質gp43、外膜タンパク質LamB、外膜タンパク質PagC、外膜タンパク質TolC、外膜タンパク質NmpC、外膜タンパク質FadL、輸送タンパク質SadA、トランスフェラーゼWgaP、エフェクタータンパク質SifA、SteC、SseL、SseJ及びSseF;SARSコロナウイルスのタンパク質14、非構造タンパク質NS7b、非構造タンパク質NS8a、タンパク質9b、タンパク質3a、核タンパク質N、非構造タンパク質NS3b、非構造タンパク質NS6、タンパク質7a、非構造タンパク質NS8b、膜タンパク質M、エンベロープスモール膜タンパク質EsM、レプリカーゼポリタンパク質1a、スパイク糖タンパク質S、レプリカーゼポリタンパク質1ab;ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)のセリンプロテアーゼ、異型ヒゼンダニ属(Sarcoptes)抗原1 ASA1、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、システインプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ、アポリポタンパク質;住血吸虫属(Schistosoma)のグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、パラミオシン、ヘモグルビナーゼ(hemoglbinase)SM32、主要虫卵抗原、14kDa脂肪酸結合タンパク質Sm14、主要幼虫表面抗原P37、22.6kDa外被抗原、カルパインCANP、三リン酸イソメラーゼ(triphospate isomerase)Tim、表面タンパク質9B、外側カプシドタンパク質VP2、23kDa内在性膜タンパク質Sm23、Cu/Zn−スーパーオキシドジスムターゼ、糖タンパク質Gp、ミオシン;ツツガムシ病リケッチア(Orientia tsutsugamushi)の60kDaシャペロニン、56kDa型特異的抗原、ピルビン酸リン酸ジキナーゼ、4−ヒドロキシ安息香酸オクタプレニルトランスフェラーゼ;赤痢菌属(Shigella)のデヒドロゲナーゼGuaB、侵入タンパク質Spa32、インベイシンIpaA、インベイシンIpaB、インベイシンIpaC、インベイシンIpaD、インベイシンIpaH、インベイシンIpaJ;水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)のタンパク質P53、ビリオンタンパク質US10ホモログ、転写調節因子IE63、転写トランス活性化因子IE62、プロテアーゼP33、αトランス誘導因子74kDaタンパク質、デオキシウリジン5’−三リン酸ヌクレオチドヒドロラーゼ、転写トランス活性化因子IE4、膜タンパク質UL43ホモログ、核リンタンパク質UL3ホモログ、核タンパク質UL4ホモログ、複製起点結合タンパク質、膜タンパク質2、リンタンパク質32、タンパク質57、DNAポリメラーゼプロセシビティー因子、ポータルタンパク質54、DNAプライマーゼ、テグメントタンパク質UL14ホモログ、テグメントタンパク質UL21ホモログ、テグメントタンパク質UL55ホモログ、トリパータイトターミナーゼサブユニットUL33ホモログ、トリパータイトターミナーゼサブユニットUL15ホモログ、カプシド結合タンパク質44、ビリオンパッケージングタンパク質43;大痘瘡及び小痘瘡のトランケート型3−βヒドロキシ−5−エンステロイドデヒドロゲナーゼホモログ、ビリオン膜タンパク質A13、タンパク質A19、タンパク質A31、トランケート型タンパク質A35ホモログ、タンパク質A37.5ホモログ、タンパク質A47、タンパク質A49、タンパク質A51、セマフォリン様タンパク質A43、セリンプロテアーゼ阻害因子1、セリンプロテアーゼ阻害因子2、セリンプロテアーゼ阻害因子3、タンパク質A6、タンパク質B15、タンパク質C1、タンパク質C5、タンパク質C6、タンパク質F7、タンパク質F8、タンパク質F9、タンパク質F11、タンパク質F14、タンパク質F15、タンパク質F16;スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)のアドヘシン/糖タンパク質gp70、プロテアーゼ;スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、例えば黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)のヘム鉄結合タンパク質IsdB、コラーゲンアドヘシンCna、クランピング因子A(ClfA)、タンパク質MecA、フィブロネクチン結合タンパク質A(FnbA)、エンテロトキシンA型(EntA)、エンテロトキシンB型(EntB)、エンテロトキシンC型EntC1、エンテロトキシンC型EntC2、エンテロトキシンD型(EntD)、エンテロトキシンE型(EntE)、毒素性ショック症候群毒素−1(TSST−1)、スタフィロキナーゼ、ペニシリン結合タンパク質2a(PBP2a、MecA)、分泌抗原SssA;糞線虫(Strongyloides stercoralis)の抗原Ss−IR、抗原NIE、ストロンギラスタシン、Na+−K+ ATPアーゼSseat−6、トロポマイシン(tropomysin)SsTmy−1、タンパク質LEC−5、41kDa抗原(aantigen)P5、41kDa幼虫タンパク質、31kDa幼虫タンパク質、28kDa幼虫タンパク質;梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)のグリセロホスホジエステルホスホジエステラーゼGlpQ(Gpd)、外膜タンパク質TmpB、タンパク質Tp92、抗原TpF1、リピートタンパク質Tpr、リピートタンパク質F TprF、リピートタンパク質G TprG、リピートタンパク質I TprI、リピートタンパク質J TprJ、リピートタンパク質K TprK、トレポネーマ膜タンパク質A(TmpA)、リポタンパク質、15kDa Tpp15、47kDa膜抗原、ミニフェリチンTpF1、アドヘシンTp0751、リポタンパク質TP0136、タンパク質TpN17、タンパク質TpN47、外膜タンパク質TP0136、外膜タンパク質TP0155、外膜タンパク質TP0326、外膜タンパク質TP0483、外膜タンパク質TP0956;テニア属(Taenia)のカテプシンL様プロテアーゼ、53/25kDa抗原、8kDaファミリーメンバー、辺縁トリプシン様活性を有する嚢虫タンパク質TsAg5、六鉤幼虫タンパク質TSOL18、六鉤幼虫タンパク質TSOL45−1A、乳酸デヒドロゲナーゼA LDHA、乳酸デヒドロゲナーゼB LDHB;破傷風菌(Clostridium tetani)の破傷風毒素TetX、破傷風毒素C TTC、140kDa S層タンパク質、フラビンタンパク質β−サブユニットCT3、ホスホリパーゼ(レシチナーゼ)、ホスホキャリアータンパク質HPr;ダニ媒介性脳炎ウイルス(TBEV)のゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C;イヌ回虫(Toxocara canis)又はネコ回虫(Toxocara cati)の58kDa抗原、68kDa抗原、トキソカラ属(Toxocara)幼虫排泄−分泌抗原TES、32kDa糖タンパク質、糖タンパク質TES−70、糖タンパク質GP31、排泄−分泌抗原TcES−57、腸周囲液抗原Pe、可溶性抽出物抗原Ex、排泄/分泌幼虫抗原ES、抗原TES−120、ポリタンパク質アレルゲンTBA−1、カテプシンL様システインプロテアーゼc−cpl−1、26kDaタンパク質;トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii)のミクロネームタンパク質、例えば、MIC1、MIC2、MIC3、MIC4、MIC5、MIC6、MIC7、又はMIC8、ロプトリータンパク質Rop2、ロプトリータンパク質、例えば、Rop1、Rop2、Rop3、Rop4、Rop5、Rop6、Rop7、Rop16、又はRjop17、タンパク質SR1、表面抗原P22、主要抗原p24、主要表面抗原p30、密顆粒タンパク質、例えば、GRA1、GRA2、GRA3、GRA4、GRA5、GRA6、GRA7、GRA8、GRA9、又はGRA10、28kDa抗原、表面抗原SAG1、SAG2関連抗原、ヌクレオシドトリホスファターゼ1、ヌクレオシドトリホスファターゼ2、タンパク質Stt3、HesB様ドメイン含有タンパク質、ロンボイド様プロテアーゼ5、トキソメプシン(toxomepsin)1;旋毛虫(Trichinella spiralis)の43kDa分泌型糖タンパク質、53kDa分泌型糖タンパク質、パラミオシン、抗原Ts21、抗原Ts87、抗原p46000、TSL−1抗原、カベオリン−1 CAV−1、49kDa新生幼虫抗原、プロサポシンホモログ、セリンプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ阻害因子、45kDa糖タンパク質Gp45;膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)のMyb様転写因子(Myb1、Myb2、Myb3)、接着タンパク質AP23、接着タンパク質AP33、アドヘシンタンパク質AP33−3、アドヘシンAP51、アドヘシンAP65、接着タンパク質AP65−1、α−アクチニン、キネシン関連タンパク質、テニューリン、62kDaプロテイナーゼ、サブチリシン様セリンプロテアーゼSUB1、システインプロテイナーゼ遺伝子3 CP3、α−エノラーゼEno1、システインプロテイナーゼCP30、熱ショックタンパク質Hsp70及びHsp60、免疫原性タンパク質P270;鞭虫(Trichuris trichiura)のβ−チューブリン、47kDaタンパク質、分泌白血球様プロテイナーゼ−1 SLP−1、50kDaタンパク質TT50、1
7kDa抗原、43/47kDaタンパク質;例えば結核菌(Mycobacterium tuberculosis)のタンパク質ESAT−6(EsxA)、10kDaろ過性抗原EsxB、分泌抗原85−B FBPB、フィブロネクチン結合タンパク質A FbpA(Ag85A)、セリンプロテアーゼPepA、PPEファミリータンパク質PPE18、フィブロネクチン結合タンパク質D FbpD、免疫原性タンパク質MPT64、分泌タンパク質MPT51、カタラーゼ−ペルオキシダーゼ−ペルオキシニトリターゼT KATG、ペリプラズムリン酸結合リポタンパク質PSTS3(PBP−3、Phos−1)、鉄調節ヘパリン結合赤血球凝集素Hbha、PPEファミリータンパク質PPE14、PPEファミリータンパク質PPE68、タンパク質Mtb72F、タンパク質Apa、免疫原性タンパク質MPT63、ペリプラズムリン酸結合リポタンパク質PSTS1(PBP−1)、分子シャペロンDnaK、細胞表面リポタンパク質Mpt83、リポタンパク質P23、リン酸輸送系透過酵素タンパク質pstA、14kDa抗原、フィブロネクチン結合タンパク質C FbpC1、アラニンデヒドロゲナーゼTB43、グルタミンシンテターゼ1、ESX−1タンパク質、タンパク質CFP10、TB10.4タンパク質、タンパク質MPT83、タンパク質MTB12、タンパク質MTB8、Rpf様タンパク質、タンパク質MTB32、タンパク質MTB39、クリスタリン、熱ショックタンパク質HSP65、タンパク質PST−S;野兎病菌(Francisella tularensis)の外膜タンパク質FobA、外膜タンパク質FobB、細胞内増殖遺伝子座lglC1、細胞内増殖遺伝子座IglC2、アミノトランスフェラーゼWbtl、シャペロニンGroEL、17kDa主要膜タンパク質TUL4、リポタンパク質LpnA、キチナーゼファミリー18タンパク質、イソクエン酸デヒドロゲナーゼ、Nif3ファミリータンパク質、IV型線毛グリコシル化タンパク質、外膜タンパク質tolC、FAD結合ファミリータンパク質、IV型ピリン多量体外膜タンパク質、二成分センサータンパク質KdpD、シャペロンタンパク質DnaK、タンパク質TolQ;ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)のMB抗原、ウレアーゼ、タンパク質GyrA、タンパク質GyrB、タンパク質ParC、タンパク質ParE、脂質結合膜タンパク質LAMP、チミジンキナーゼTK、ホスホリパーゼPL−A1、ホスホリパーゼPL−A2、ホスホリパーゼPL−C、表面発現96kDa抗原;ベネズエラウマ脳炎ウイルスの非構造ポリタンパク質、構造ポリタンパク質、カプシドタンパク質CP、タンパク質E1、タンパク質E2、タンパク質E3、プロテアーゼP1、プロテアーゼP2、プロテアーゼP3;グアナリトウイルスの糖タンパク質GP、マトリックスタンパク質Z、ポリメラーゼL、核タンパク質N;ウエストナイルウイルスのポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質(brotein)NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;西部ウマ脳炎ウイルスのカプシドタンパク質CP、タンパク質E1、タンパク質E2、タンパク質E3、プロテアーゼP2;黄熱病ウイルスのゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;偽結核菌(Yersinia pseudotuberculosis)の推定Yopターゲティングタンパク質YobB、エフェクタータンパク質YopD、エフェクタータンパク質YopE、タンパク質YopH、エフェクタータンパク質YopJ、タンパク質移行タンパク質YopK、エフェクタータンパク質YopT、タンパク質YpkA、鞭毛生合成タンパク質FlhA、ペプチダーゼM48、カリウム流出系KefA、転写調節因子RovA、アドヘシンIfp、トランスロケータータンパク質(translocator portein)LcrV、タンパク質PcrV、インベイシンInv、外膜タンパク質OmpF様ポーリン、アドヘシンYadA、プロテインキナーゼC、ホスホリパーゼC1、タンパク質PsaA、マンノシルトランスフェラーゼ様タンパク質WbyK、タンパク質YscU、抗原YPMa;腸炎エルシニア(Yersinia enterocolitica)のエフェクタータンパク質YopB、60kDaシャペロニン、タンパク質WbcP、チロシンタンパク質ホスファターゼ(tyrosin−protein phosphatase)YopH、タンパク質YopQ、エンテロトキシン、ガラクトシド透過酵素、レダクターゼ(reductaase)NrdE、タンパク質YasN、インベイシンInv、アドヘシンYadA、外膜ポーリンF OmpF、タンパク質UspA1、タンパク質EibA、タンパク質Hia、細胞表面タンパク質Ail、シャペロンSycD、タンパク質LcrD、タンパク質LcrG、タンパク質LcrV、タンパク質SycE、タンパク質YopE、調節タンパク質TyeA、タンパク質YopM、タンパク質YopN、タンパク質YopO、タンパク質YopT、タンパク質YopD、プロテアーゼClpP、タンパク質MyfA、タンパク質FilA、及びタンパク質PsaAからなる群から選択される異なる病原性抗原又はその断片若しくは変異体をコードする。
好ましい実施形態において、複合体型RNA分子と(遊離)RNA分子との比は、約5:1(w/w)〜約1:10(w/w)の範囲、より好ましくは約4:1(w/w)〜約1:8(w/w)の範囲、更により好ましくは約3:1(w/w)〜約1:5(w/w)又は1:3(w/w)の範囲から選択され、及び最も好ましくは複合体型RNA分子と遊離RNA分子との比は1:1(w/w)の範囲である。
好ましい実施形態において、本RNA分子組成物又は本医薬組成物は、遺伝病、アレルギー、自己免疫疾患、感染症、新生物、癌及び腫瘍関連疾患、炎症性疾患、血液及び造血臓器疾患、内分泌、栄養及び代謝疾患、神経系疾患、遺伝性疾患、循環系疾患、呼吸器系疾患、消化器系疾患、皮膚及び皮下組織疾患、筋骨格系及び結合組織疾患、及び泌尿生殖器系疾患(遺伝性か後天性かに関わらず)及びこれらの組み合わせからなる群から選択される疾患の治療又は予防に用いられる。
定義
明確さ及び読み易さのため、以下の定義を提供する。これらの定義に関して言及される任意の技術的特徴は、本発明のあらゆる実施形態に読み取ることができる。更なる定義及び説明がこれらの実施形態との関連において具体的に提供され得る。特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての科学技術用語は、概して本発明が属する技術分野の当業者が一般的に理解するのと同じ意味を有する。概して、本明細書で用いられる命名法並びに細胞培養、分子遺伝学、有機化学、及び核酸化学及びハイブリダイゼーションにおける実験室手順は周知であり、当該技術分野において広く用いられている。核酸及びペプチド合成には標準的な技法が用いられる。これらの技法及び手順は概して、当該技術分野における従来方法並びに本文書全体を通じて提供される様々な一般的文献(例えば、サムブルック(Sambrook)ら著、1989年、「分子クローニング:実験マニュアル(Molecular Cloning:A Laboratory Manual)」、第2版、コールド・スプリング・ハーバー研究所出版会(Cold Spring Harbor Laboratory Press)、ニューヨーク州コールド・スプリング・ハーバー(Cold Spring Harbor,NY))に従い実施される。
これに関連して、本明細書に定義するとおりの修飾RNA分子は、ヌクレオチド類似体/修飾、例えば、骨格修飾、糖修飾又は塩基修飾を含み得る。本発明との関連における骨格修飾は、本明細書に定義するとおりのRNA分子に含まれるヌクレオチドの骨格のリン酸が化学的に修飾される修飾である。本発明との関連における糖修飾は、本明細書に定義するとおりのRNA分子のヌクレオチドの糖の化学修飾である。更に、本発明との関連における塩基修飾は、本RNA分子のヌクレオチドの塩基部分の化学修飾である。これに関連して、ヌクレオチド類似体又は修飾は、好ましくは、転写及び/又は翻訳に適用可能なヌクレオチド類似体から選択される。
アミノ酸分子の配列/アミノ酸配列:タンパク質又はペプチドの配列は、典型的にはそのアミノ酸の並び順、即ち連なりであるものと理解される。
a)単一の反応槽におけるm個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の混合物の並行した、即ち同時のRNAインビトロ転写ステップであって、m個の異なるDNA分子種の各々がn個の異なるRNA分子種のうちの1つ以上をコードし、それによりn個の異なるRNA分子種が作成されるステップ、及び
b)ステップa)で作成されたn個の異なるRNA分子種を含むRNA分子組成物を得るステップ[nは少なくとも2の整数であり、及びmは少なくとも1の整数である]を含む。特に好ましい実施形態において、n個の異なるRNA分子種の各々は、異なるペプチド又はタンパク質、好ましくは本明細書において以下に言及するとおりの抗原をコードする。極めて好ましい実施形態において、RNA分子種はmRNA分子種である。
5’−UTR(特に、国際公開第2013/143700号パンフレット及び国際公開第2013/143699号パンフレットに係るTOP−UTRが好ましい);
コザック配列、又は別の翻訳開始エレメント(CCR(A/G)CCAUGG、式中、Rは開始コドン(AUG)の3塩基上流にあるプリン(アデニン又はグアニン)であり、開始コドンの後に別の「G」が続く。5’UTRはまた、伸長因子結合に関与する二次構造を形成することも知られている);
3’−UTR(特に、国際公開第2013/143700号パンフレットに係るアルブミン遺伝子、α−グロビン遺伝子、β−グロビン遺伝子、チロシンヒドロキシラーゼ遺伝子、リポキシゲナーゼ遺伝子、及びコラーゲンα遺伝子由来の安定RNAからのUTRが好ましい;ポリ(A)配列;ポリ(C)配列;及び/又はステム−ループ配列、例えば国際公開第2012/019780号パンフレットに係るヒストンステム−ループ配列。
ステップd1)の後に、以下の方法ステップ:
e1)ステップd1)で形質転換したm個の単一細菌細胞培養物の各々の少なくとも1つの単一細菌細胞クローンを単離するステップ、
f1)ステップe1)で単離した単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞培養物において成長させるステップ、
g1)任意選択で、ステップf1)で成長させた細菌細胞クローン培養物の各々のDNAプラスミド種のDNA配列を決定するステップ、
h1)m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき少なくとも1つの細菌細胞クローン培養物を選択するステップ。
e2)少なくともm個の単一細菌細胞クローンを単離するステップ、及び
f2)ステップe2)で単離した少なくともm個の単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞クローン培養物において成長させるステップ、
g2)ステップf2)で成長させた少なくともm個の単一細菌細胞クローン培養物の各々のDNAプラスミド種のDNA配列を決定するステップ、
h2)m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物を選択するステップ。
(I)各プラスミド種が異なる標的RNA種をコードするにしても、プラスミド配列の違いはあくまでも最小限であることが好ましい。これは、m個の異なるDNAプラスミド及び分子種の配列が均一である、即ち互いに少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%又は好ましくは少なくとも99%同一であることを意味する。プラスミド骨格は、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、好ましくは少なくとも99%及び最も好ましくは100%同一であり、及びm個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)プラスミド又は分子種のオープンリーディングフレーム(ORF)は同様の長さでなければならず、即ちその長さのばらつきが最大100ヌクレオチド、50ヌクレオチド、40ヌクレオチド、30ヌクレオチド、好ましくは最大20ヌクレオチド、より好ましくは最大10ヌクレオチド、7ヌクレオチド又は更により好ましくは最大5ヌクレオチドで、ヌクレオチド配列の互いの変化はあくまでも最小限、即ち少なくとも80%でなければならない。別の好ましい実施形態において、n個の異なるRNA分子種のRNA配列は互いに少なくとも80%同一、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%又は好ましくは少なくとも99%同一である。
(II)RNAインビトロ転写に十分な各DNA分子種を産生するため共培養でプラスミドDNAを産生する前に、全てのクローンをその個々の成長及び産生挙動に関して独立したスクリーニングで分析し、即ち少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物の少なくとも1つの成長動態パラメータ及び/又はプラスミドDNAの量を決定する。従って、本発明の方法は、i)少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物の少なくとも1つの成長動態パラメータ及び/又はプラスミドDNAの量を決定するステップ、及びj)ステップi)で決定されたパラメータに応じてm個の異なるDNAプラスミド種の各々につき1つ以上の細菌細胞クローン培養物を選択するステップ、好ましくはm個の異なるDNAプラスミド種の各々につき1つの細菌細胞クローン培養物を選択するステップを更に含む。任意選択でステップi)は、i1)ある時間間隔後に細菌細胞クローン培養物の光学濃度を好ましくはマイクロプレートリーダーを使用して測定することによるか、又は散乱光オンライン測定によって成長動態パラメータを決定するステップ、及び/又はi2)細菌細胞培養物の容積及び時間当たりに産生されたプラスミドの量を決定するステップを含む。
(I)グリセロールストック(一様に成長するクローンのグリセロールストック;DNAプラスミド種1つにつき1つのクローン)から接種したミネラル又は複合培地(LB、TB、又はM9培地など)を適用する振盪フラスコ(例えば100、250又は500mLの培養容積を有する)又は小型バイオリアクターにおけるプレ培養ステップ、
(II)プレ培養物から接種したミネラル又は複合培地、例えばLB、TB、又はM9を適用する生産規模のバイオリアクターにおける本培養。この本培養は初期バイオマス生成段階から始まり、温度シフトによって惹起される成長制限プラスミド産生段階が続き得る。或いは、当該技術分野において一般に知られている他のあらゆる高収率発酵手順を適用し得る。全てのクローンが同じ成長及び産生挙動を示すため、全てのプラスミドDNA変異体が潜在的に同様の量で産生される。生産規模のバイオリアクターの培養容積は主として限定はされず、典型的な容積は1L〜1000Lの範囲である。
1反応物の組成:
1μgプラスミドDNA
0.5μl反応緩衝液
3単位 制限酵素
追加。WFI(注射用水)で5μl
組成は、線状化に使用されるプラスミドDNAの量(少なくとも1000反応物、好ましくは10000反応物)に基づき計算する。この反応物を37℃で4〜5時間インキュベートする。
本発明のステップn)後のDNA断片の例示的分析方法、例えば、アガロースゲル電気泳動、ポリアクリルアミドゲル電気泳動、チップゲル電気泳動、キャピラリー電気泳動、蛍光ベースの自動DNA断片分析及びHPLC(例えばWAVE(商標)DNA断片分析システム)。特に、サムブルック(Sambrook)ら著、「分子クローニング、実験マニュアル(Molecular Cloning,a laboratory manual)」、第2版、コールド・スプリング・ハーバー研究所出版会(Cold Spring Harbor Laboratory Press)、1989年6月に記載されるとおりのアガロースゲル電気泳動が好ましい。
0.5μgプラスミドDNA(0.2〜2μgプラスミドDNA)
1.5μl 10×反応緩衝液
1μl制限酵素(1μlは通常1uを含む)
追加。15μl WFI(注射用水)
2つの制限酵素による制限酵素反応に好ましい条件は、以下である:
0.5μgプラスミドDNA(0.2〜2μgプラスミドDNA)
1.5μl 10×反応緩衝液
1μl制限酵素1(1μlは通常1uを含む)
1μl制限酵素2(1μlは通常1uを含む)
追加。15μl WFI(注射用水)
制限酵素反応物は、典型的には上記に示すとおり混合され、好ましくは37℃で1〜4時間インキュベートされる。
1〜20μg鋳型DNA、好ましくは10〜15μg鋳型DNAを1μl RNアーゼA(1g/l)と37℃で1時間インキュベートする。
好ましくは、単離した鋳型DNAの、好ましくはRNアーゼA消化後の濃度は、260nmにおける吸光の測定値(OD260)(上記参照)による核酸の標準的な測光法によって決定する。
鋳型DNA調製物の無菌性を決定するには、ユニバーサルな細菌プライマー(細菌に普遍的に存在する遺伝子を検出する)を使用したPCRを実施し得る。更に、プレーティングアッセイが行われてもよい。
残留大腸菌(E coli)DNAは、大腸菌(E.coli)遺伝子に特異的なプライマー及びプローブを使用したPCR、好ましくは定量的PCR(qPCR)によって検出し得る。これに関連して、それぞれの細菌株(例えば大腸菌(E.coli)株)に含まれる任意のゲノム配列又は遺伝子に特異的なプライマー及びプローブが、残留細菌DNAを決定するためのPCR又はqPCRの実施に特に有用である。
得られたm個の異なるDNAプラスミド/分子種の混合物の品質管理として、従来の市販のプラスミド調製キット又は当業者に公知の種々のろ過及びクロマトグラフィーステップを適用するカスタマイズした精製プロセスを用いてDNAプラスミド/分子が細菌細胞から抽出される。
RNAインビトロ転写は、好ましくは、ヌクレオチド混合物の存在下でDNA依存性T7 RNAポリメラーゼを用いて実施される。n個の異なるRNA分子種が極めて類似した配列(同様のG:C:U:A比)を有する好ましい実施形態については、開示されるとおり、RNA/NTP収率を最適化するため配列最適化NTP混合物が適用され得る。
転写緩衝液としては、以下の緩衝液が好ましい:40mM トリス pH7.5又は80mM HEPES。
天然に存在するヌクレオチド(例えばヌクレオチドATP、CTP、UTP及びGTPのうちの少なくとも1つ)及び/又は修飾ヌクレオチド、好ましくは本明細書に記載されるとおりの修飾ヌクレオチド、又はこれらの任意の組み合わせを含め、所望のケミストリーのヌクレオチド三リン酸が用いられる。好ましくはATP、CTP、UTP及びGTPが0.5〜10mMの濃度、好ましくは3〜5mMの濃度、及び最も好ましくは4mMの濃度で用いられる。
任意選択で転写反応にジチオスレイトール(DTT)が、好ましくは1〜100mM、より好ましくは10〜100mM、最も好ましくは40mMの濃度で加えられてもよい。
任意選択で転写反応に大腸菌(E.coli)ピロホスファターゼが、好ましくは1〜10U/μg鋳型DNAの濃度、及び最も好ましくは5U/μg鋳型DNAの濃度で加えられてもよい。これにより、転写に不可欠なマグネシウムが溶液中に留まり、ピロリン酸マグネシウムとして沈殿しないことが確実となる。
鋳型DNA混合物
4mM ATP、CTP及びUTP
1.45mM GTP
5.8mM CAPアナログ
80mM HEPES又はトリスHCl
24mM MgCl2
2mM スペルミジン
40mM DTT
5u ピロホスファターゼ
4u RNアーゼ阻害剤
100u T7 RNAポリメラーゼ
RNAインビトロ転写反応物は好ましくは37℃で、より好ましくは少なくとも4時間インキュベートされる。
試験転写の収率は260nmにおける吸光の測定値(OD260)で評価される。
i)転写物長さ及び転写物のユニークさの決定
好ましくは、本発明の方法のステップb)において得られたRNAのアイデンティティ及び純度を検証するため、正しい転写物長さ及び転写物のユニークさが確認される。
アガロースゲルの調製には、1×ランニング緩衝液中に0.5〜3%(w/v)アガロース又はより好ましくは1.2%(w/v)アガロースを融解する。
ii)RNアーゼ処理と続く分解産物の分析によるRNAアイデンティティの決定
好ましい実施形態では、本発明の方法のステップb)で得られたRNAの試料のRNアーゼA消化を用いる試験によってRNAアイデンティティが確認される。消化されたRNAは、好ましくはRNAゲル電気泳動で未処理試料と比較される。
iii)RT−PCRと続く産物のアガロースゲル電気泳動分析によるRNAアイデンティティの決定
第1のステップにおいて、好ましくはRNAが酵素リバーストランスクリプターゼを用いて相補DNA(cDNA)に変換される。第2のステップにおいて、得られたcDNAを適切なプライマーを用いたPCR(ポリメラーゼ連鎖反応)によって増幅すると、特定のサイズのPCR産物が提供される。このPCR産物は、アガロースゲル電気泳動によってバンドサイズの正しさに関して分析される。
その後、産生されたcDNAが標的特異的プライマーで増幅され、従来のDNAアガロースゲル電気泳動で産物のバンドサイズが分析される。
RNA転写物は逆転写シーケンシングによって特徴付けることができる。RNA産物が一般的なリバーストランスクリプターゼ、一組のプライマー、及びdNTPとインキュベートされ、cDNA試料が得られる。このcDNAをPCRの鋳型として供することによりcDNAが増幅される。次にこのPCR産物は、サンガーシーケンシング又は双方向シーケンシングなどの本明細書に定義するとおりのシーケンシング手順を用いた分析によって特徴付けられる。
本発明の方法のステップb)で得られたRNAは、好ましくは、プローブがRNAとハイブリダイズして二重鎖を形成することを可能にするのに十分な条件下で様々なヌクレオチドプローブとインキュベートされ、ここでヌクレオチドプローブの各々は、RNA転写物の異なる領域に相補的な配列を含む。
好ましい実施形態において、RNAのアイデンティティはRNAシーケンシングによって決定されてもよい。RNA配列解析方法は当該技術分野において公知であり、本明細書において用いることができる。
本発明のステップb)で得られたRNAの相対的完全性は、好ましくは、RNAの総量(即ち完全長RNAと分解されたRNA断片(ゲル電気泳動でスメアとして現れる))に対する完全長RNA(即ち分解されていないRNA)の割合として決定される。
好ましくは、欧州薬局方(european pharmacopedia)(PhEur)2.2.3に従う従来の電圧計を使用したpH含有量の電位差測定を用いてRNA調製物のpH値が決定される。
好ましい実施形態において、本発明の方法のステップb)で得られたRNAのオスモル濃度が決定される。オスモル濃度の計測は、PhEur 2.2.35に従う従来の浸透圧測定装置を用いて実施される。
RNA調製物の無菌性を決定するには、ユニバーサルな細菌プライマー(細菌に普遍的に存在する遺伝子を検出する)を使用したRT−PCRを実施し得る。更に、プレーティングアッセイが行われてもよい。
バイオバーデンの決定には、RNAを寒天プレート及び/又はグルコースプレートにプレーティングし、数日間(例えば、それぞれ5及び7日間)インキュベートした後、好気性菌及び嫌気性菌条件下で細菌の存在/非存在が試験される。バイオバーデンは、細菌プレート上で成長した細菌クローンをカウントすることによって評価される。
好ましくは、カブトガニ(リムルス・ポリフェムス(Limulus polyphemus)又はタキプレウス・トリデンタツス(Tachypleus tridentatus))からの変形細胞ライセートを使用することにより、細菌エンドトキシンの決定を用いてグラム陰性菌由来のエンドトキシンが検出又は定量化される。この原理は、レビン(Levin)によって発見された(レビン・J(Levin,J)著、1979年、「細菌エンドトキシンと変形細胞ライセートとの間の反応(The reaction between bacterial endotoxin and amebocyte lysate)」、p.131〜146、E・コーエン(E.Cohen)編、「カブトガニ(カブトガニ科)の生物医学的応用(Biomedical Applications of the Horseshoe Crab(Limulidae))」、臨床及び生物学研究の進歩(Progress in Clinical and Biological Research)、第29巻、アラン・R・リス社(Alan R.Liss,Inc.)、ニューヨーク州)。
本発明の方法のステップb)で得られたRNAの容積当たりの総タンパク質含有量が計算される。タンパク質の検出には、280nmでのUV吸光度測定(芳香族アミノ酸の存在に起因する)、ローリーアッセイ、ビウレットアッセイ、ブラッドフォードアッセイ、及びBCA(ビシンコニン酸(bichinonic acid))アッセイを含め、当該技術分野において幾つかの異なる方法が公知である。
xiii)プラスミドDNA汚染の決定:
任意選択で、RNAインビトロ転写に用いられるDNAプラスミドに対する特異的プライマー及びプローブを使用した本明細書に記載されるとおりのPCR又は定量的PCRにより、残留プラスミドDNAが決定され得る。産生ベクターを宿主とするアンピシリン遺伝子に対する特異的プライマー及びプローブを使用した本明細書に記載されるとおりの定量的PCRによる残留プラスミドDNAの検出が特に好ましい。プローブは陽性対照として使用され、従ってプラスミドDNA濃度の計算に用いられる。
任意選択で、例えば、細菌ゲノム配列に対する特異的プライマー及びプローブを使用したPCR又は定量的PCRにより、残留細菌DNAが決定され得る。大腸菌(E.coli)遺伝子用の特異的プライマー及びプローブを使用した定量的PCRによって検出される残留細菌DNAの検出が特に好ましい。プローブは好ましくは陽性対照として使用され、従って細菌DNA濃度の計算に用いられる。
好ましくは、標準的な付加方法を用いたヘッドスペースガスクロマトグラフィーによるPhEur 2.2.28方法に基づき残留溶媒が分析される。試料が80℃に加熱され、平衡化され、及び気相が注入され、FID(水素炎イオン化検出)を用いて分析される。
上記に概説したとおり、任意選択で特定の品質管理が実施されてもよく、それにより例えば細菌クローンの成長特徴を分析し、又はプラスミドDNA、若しくはRNAインビトロ転写における他のDNA鋳型(例えば、PCRを用いて作成したもの)のパフォーマンスを特徴付けることができる。更に、任意選択で品質管理が実施されてもよく、それによりDNA鋳型混合物及び/又はインビトロ転写RNA分子組成物の組成を定量的にも定性的にも分析することができる。加えて、PCT/EP2015/000959号明細書及び国際公開第2014/144039号パンフレット(両方ともに参照により本明細書に援用される)に開示されるとおり、本発明との関連において鋳型作製及びRNA作製過程で好適な品質管理が用いられ得る。RNA分子混合物の精製方法については、例えば、PCT/EP2015/000959号明細書、PCT/EP2015/062002号明細書、国際公開第2008/077592号パンフレット(これらの内容は参照により本明細書に援用される)を参照することができる。
好ましくは、病原体は、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)、アナプラズマ属(Anaplasma)、アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum)、ブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense)、ズビニ鉤虫(Ancylostoma duodenale)、溶血性アルカノバクテリア(Arcanobacterium haemolyticum)、回虫(Ascaris lumbricoides)、アスペルギルス属(Aspergillus)、アストロウイルス科(Astroviridae)、バベシア属(Babesia)、炭疽菌(Bacillus anthracis)、セレウス菌(Bacillus cereus)、バルトネラ・ヘンセラ菌(Bartonella henselae)、BKウイルス、ヒトブラストシスチス(Blastocystis hominis)、ブラストミセス・デルマチチジス(Blastomyces dermatitidis)、百日咳菌(Bordetella pertussis)、ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)、ボレリア属(Borrelia)、ボレリア属種(Borrelia spp)、ブルセラ属(Brucella)、マレー糸状虫(Brugia malayi)、ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)、バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)及び他のバークホルデリア属(Burkholderia)種、鼻疽菌(Burkholderia mallei)、類鼻疽菌(Burkholderia pseudomallei)、カリシウイルス科(Caliciviridae)、カンピロバクター属(Campylobacter)、カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ属種(Candida spp)、トラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)、肺炎クラミジア(Chlamydophila pneumoniae)、オウム病クラミジア(Chlamydophila psittaci)、CJDプリオン、肝吸虫(Clonorchis sinensis)、ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)、クロストリジウム・ディフィシル(Clostridium difficile)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、クロストリジウム属種(Clostridium spp)、破傷風菌(Clostridium tetani)、コクシジオイデス属種(Coccidioides spp)、コロナウイルス類、ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheriae)、Q熱コクシエラ(Coxiella burnetii)、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium)、サイトメガロウイルス(CMV)、デングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)、二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)、エボラウイルス(EBOV)、エキノコックス属(Echinococcus)、エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)、エーリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)、エーリキア属(Ehrlichia)、赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)、エンテロコッカス属(Enterococcus)、エンテロウイルス属(Enterovirus)、エンテロウイルス類、主にコクサッキーA型ウイルス及びエンテロウイルス71型(EV71)、エピデルモフィトン属種(Epidermophyton spp)、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111及びO104:H4、肝蛭(Fasciola hepatica)及び巨大肝蛭(Fasciola gigantica)、FFIプリオン、フィラリア上科(Filarioidea)、フラビウイルス類、野兎病菌(Francisella tularensis)、フゾバクテリウム属(Fusobacterium)、ゲオトリクム・カンジドゥム(Geotrichum candidum)、ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)、顎口虫属種(Gnathostoma spp)、GSSプリオン、グアナリトウイルス、軟性下疳菌(Haemophilus ducreyi)、インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)、ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ヘニパウイルス(ヘンドラウイルス、ニパウイルス)、A型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス(HBV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、D型肝炎ウイルス、E型肝炎ウイルス、単純ヘルペスウイルス1型及び2型(HSV−1及びHSV−2)、ヒストプラズマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)、ヒトボカウイルス(HBoV)、ヒトヘルペスウイルス6型(HHV−6)及びヒトヘルペスウイルス7型(HHV−7)、ヒトメタニューモウイルス(hMPV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)、日本脳炎ウイルス、JCウイルス、フニンウイルス、キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)、クレブシエラ・グラヌロマティス(Klebsiella granulomatis)、クーループリオン、ラッサウイルス、レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、リーシュマニア属(Leishmania)、レプトスピラ属(Leptospira)、リステリア菌(Listeria monocytogenes)、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、マチュポウイルス、マラセジア属種(Malassezia spp)、マールブルグウイルス、麻疹ウイルス、横川吸虫(Metagonimus yokagawai)、微胞子虫門(Microsporidia)、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ムンプスウイルス、らい菌(Mycobacterium leprae)及びマイコバクテリウム・レプロマトシス(Mycobacterium lepromatosis)、結核菌(Mycobacterium tuberculosis)、マイコバクテリウム・ウルセランス(Mycobacterium ulcerans)、肺炎マイコプラズマ(Mycoplasma pneumoniae)、フォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)、アメリカ鉤虫(Necator americanus)、淋菌(Neisseria gonorrhoeae)、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)、ノカルジア・アステロイデス(Nocardia asteroides)、ノカルジア属種(Nocardia spp)、回旋糸状虫(Onchocerca volvulus)、ツツガムシ病リケッチア(Orientia tsutsugamushi)、オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)(インフルエンザ)、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、肺吸虫属種(Paragonimus spp)、ウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)、パルボウイルスB19、パスツレラ属(Pasteurella)、プラスモジウム属(Plasmodium)、ニューモシスチス・イロベチ(Pneumocystis jirovecii)、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、ライノウイルス、ライノウイルス類、痘瘡リケッチア(Rickettsia akari)、リケッチア属(Rickettsia)、発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、ロッキー山紅斑熱リケッチア(Rickettsia rickettsii)、発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)、リフトバレー熱ウイルス、ロタウイルス、風疹ウイルス、サビアウイルス、サルモネラ属(Salmonella)、ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)、SARSコロナウイルス類、住血吸虫属(Schistosoma)、赤痢菌属(Shigella)、シンノンブレウイルス、ハンタウイルス、スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)、肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)、化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)、糞線虫(Strongyloides stercoralis)、テニア属(Taenia)、有鉤条虫(Taenia solium)、ダニ媒介性脳炎ウイルス(TBEV)、イヌ回虫(Toxocara canis)又はネコ回虫(Toxocara cati)、トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii)、梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)、旋毛虫(Trichinella spiralis)、膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)、白癬菌属種(Trichophyton spp)、鞭虫(Trichuris trichiura)、ブルーストリパノソーマ(Trypanosoma brucei)、クルーズトリパノソーマ(Trypanosoma cruzi)、ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、大痘瘡又は小痘瘡、vCJDプリオン、ベネズエラウマ脳炎ウイルス、コレラ菌(Vibrio cholerae)、ウエストナイルウイルス、西部ウマ脳炎ウイルス、バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)、黄熱病ウイルス、腸炎エルシニア(Yersinia enterocolitica)、ペスト菌(Yersinia pestis)、及び偽結核菌(Yersinia pseudotuberculosis)からなる群から選択され、好ましくは病原体は、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、単純ヘルペスウイルス(HSV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、プラスモジウム属(Plasmodium)、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)、デングウイルス類、トラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)、サイトメガロウイルス(CMV)、B型肝炎ウイルス(HBV)、結核菌(Mycobacterium tuberculosis)、狂犬病ウイルス、ロタウイルス及び黄熱病ウイルスからなる群から選択される。
PCC、14−3−3タンパク質、プロヒビチン、システインプロテアーゼ類、グルタチオントランスフェラーゼ類、ゲルゾリン、カテプシンLプロテイナーゼCatL、テグメントタンパク質20.8kDa TP20.8、テグメントタンパク質31.8kDa TP31.8、リゾホスファチジン酸ホスファターゼLPAP(肝吸虫(Clonorchis sinensis)、肝吸虫症);表層タンパク質SLP、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ抗原GDH、毒素A、毒素B、システインプロテアーゼCwp84、システインプロテアーゼCwp13、システインプロテアーゼCwp19、細胞壁タンパク質CwpV、鞭毛タンパク質FliC、鞭毛タンパク質FliD(クロストリジウム・ディフィシル(Clostridium difficile)、クロストリジウム・ディフィシル感染症);ライノウイルス類:カプシドタンパク質VP1、VP2、VP3、VP4;コロナウイルス類:スパイクタンパク質(sprike protein)S、エンベロープタンパク質E、膜タンパク質M、ヌクレオカプシドタンパク質N(通常ライノウイルス類及びコロナウイルス類、かぜ(急性ウイルス性鼻咽頭炎;急性コリーザ));プリオンタンパク質Prp(CJDプリオン、クロイツフェルトヤコブ病(CJD));エンベロープタンパク質Gc、エンベロープタンパク質Gn、ヌクレオカプシドタンパク質(クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、クリミア−コンゴ出血熱(CCHF));ビルレンス関連DEADボックスRNAヘリカーゼVAD1、ガラクトキシロマンナンタンパク質GalXM、グルクロノキシロマンナンGXM、マンノプロテインMP(クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、クリプトコッカス症);酸性リボソームタンパク質P2 CpP2、ムチン抗原Muc1、Muc2、Muc3Muc4、Muc5、Muc6、Muc7、表面接着タンパク質CP20、表面接着タンパク質CP23、表面タンパク質CP12、表面タンパク質CP21、表面タンパク質CP40、表面タンパク質CP60、表面タンパク質CP15、表面関連グリコペプチドgp40、表面関連グリコペプチドgp15、オーシスト壁タンパク質AB、プロフィリンPRF、アピラーゼ(クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium)、クリプトスポリジウム症);脂肪酸及びレチノール結合タンパク質−1 FAR−1、メタロプロテイナーゼ組織阻害因子TIMP(TMP)、システインプロテイナーゼACEY−1、システインプロテイナーゼACCP−1、表面抗原Ac−16、分泌タンパク質2 ASP−2、メタロプロテアーゼ1MTP−1、アスパルチルプロテアーゼ阻害因子API−1、表面関連抗原SAA−1、成体特異的分泌第Xa因子セリンプロテアーゼ阻害因子抗凝固薬AP、カテプシンD様アスパラギン酸プロテアーゼARR−1(通常ブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense);他の複数の寄生虫、皮膚幼虫移行症(CLM));カテプシンL様プロテアーゼ、53/25kDa抗原、8kDaファミリーメンバー、辺縁トリプシン様活性を有する嚢虫タンパク質TsAg5、六鉤幼虫タンパク質TSOL18、六鉤幼虫タンパク質TSOL45−1A、乳酸デヒドロゲナーゼA LDHA、乳酸デヒドロゲナーゼB LDHB(有鉤条虫(Taenia solium)、嚢虫症);pp65抗原、膜タンパク質pp15、カプシド基部テグメントタンパク質pp150、タンパク質M45、DNAポリメラーゼUL54、ヘリカーゼUL105、糖タンパク質gM、糖タンパク質gN、糖タンパク質H(glcoprotein H)、糖タンパク質B gB、タンパク質UL83、タンパク質UL94、タンパク質UL99(サイトメガロウイルス(CMV)、サイトメガロウイルス感染症);カプシドタンパク質C、プレ膜タンパク質prM、膜タンパク質M、エンベロープタンパク質E(ドメインI、ドメインII、ドメインII)、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質NS2B、タンパク質NS3、タンパク質NS4A、タンパク質2K、タンパク質NS4B、タンパク質NS5(デングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)−フラビウイルス類、デング熱);39kDaタンパク質(二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)、二核アメーバ症);ジフテリア毒素前駆体Tox、ジフテリア毒素DT、ピリン特異的ソルターゼSrtA、シャフトピリンタンパク質SpaA、先端ピリンタンパク質SpaC、マイナーピリンタンパク質SpaB、表面結合タンパク質DIP1281(ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheriae)、ジフテリア);糖タンパク質GP、核タンパク質NP、マイナーマトリックスタンパク質VP24、メジャーマトリックスタンパク質VP40、転写活性化因子VP30、ポリメラーゼ補因子VP35、RNAポリメラーゼL(エボラウイルス(EBOV)、エボラ出血熱);プリオンタンパク質(vCJDプリオン、変異型クロイツフェルトヤコブ病(vCJD、nvCJD));UvrABC系タンパク質B、タンパク質Flp1、タンパク質Flp2、タンパク質Flp3、タンパク質TadA、ヘモグロビン受容体HgbA、外膜タンパク質TdhA、タンパク質CpsRA、調節因子CpxR、タンパク質SapA、18kDa抗原、外膜タンパク質NcaA、タンパク質LspA、タンパク質LspA1、タンパク質LspA2、タンパク質LspB、外膜成分DsrA、レクチンDltA、リポタンパク質Hlp、主要外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質OmpA2(軟性下疳菌(Haemophilus ducreyi)、軟性下疳);アスパルチルプロテアーゼ1 Pep1、ホスホリパーゼB PLB、α−マンノシダーゼ1 AMN1、グルカノシルトランスフェラーゼGEL1、ウレアーゼURE、ペルオキシソームマトリックスタンパク質Pmp1、プロリンリッチ抗原Pra、ヒトT細胞応答性タンパク質TcrP(コクシジオイデス・イミチス(Coccidioides immitis)及びコクシジオイデス・ポサダシ(Coccidioides posadasii)、コクシジオイデス症);アレルゲンTri r 2、熱ショックタンパク質60 Hsp60、真菌アクチンAct、抗原Tri r2、抗原Tri r4、抗原Tri t1、タンパク質IV、グリセロール−3−リン酸デヒドロゲナーゼGpd1、浸透圧センサHwSho1A、浸透圧センサHwSho1B、ヒスチジンキナーゼHwHhk7B、アレルゲンMala s 1、アレルゲンMala s 11、チオレドキシンTrx Mala s 13、アレルゲンMala f、アレルゲンMala s(通常白癬菌属種(Trichophyton spp)、エピデルモフィトン属種(Epidermophyton spp.)、マラセジア属種(Malassezia spp.)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)、皮膚糸状菌症);タンパク質EG95、タンパク質EG10、タンパク質EG18、タンパク質EgA31、タンパク質EM18、抗原EPC1、抗原B、抗原5、タンパク質P29、タンパク質14−3−3、8kDaタンパク質、ミオフィリン(myophilin)、熱ショックタンパク質20 HSP20、糖タンパク質GP−89、脂肪酸結合タンパク質FAPB(エキノコックス属(Echinococcus)、エキノコックス症);主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質(エーリキア属(Ehrlichia)、エーリキア症);分泌抗原SagA、sagA様タンパク質SalA及びSalB、コラーゲンアドヘシンScm、表面タンパク質Fms1(EbpA(fm)、Fms5(EbpB(fm)、Fms9(EpbC(fm)及びFms10、タンパク質EbpC(fm)、96kDa免疫保護糖タンパク質G1(エンテロコッカス属(Enterococcus)、エンテロコッカス感染症);ゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C(エンテロウイルス属(Enterovirus)、エンテロウイルス感染症);外膜タンパク質OM、60kDa外膜タンパク質、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、134kDa外膜タンパク質、31kDa外膜タンパク質、29.5kDa外膜タンパク質、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質Adr1(RP827)、細胞表面タンパク質Adr2(RP828)、細胞表面タンパク質SCA1、侵入タンパク質invA、細胞分裂タンパク質fts、分泌タンパク質sec 0ファミリー、ビルレンスタンパク質virB、tlyA、tlyC、パルブリン様タンパク質Plp、プレタンパク質トランスロカーゼSecA、120kDa表面タンパク質抗原SPA、138kD複合抗原、主要100kDタンパク質(タンパク質I)、細胞質内タンパク質D、防御表面タンパク質抗原SPA(発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、発疹チフス);エプスタイン・バー核抗原(EBNA−1、EBNA−2、EBNA−3A、EBNA−3B、EBNA−3C、EBNA−リーダータンパク質(EBNA−LP))、潜伏性膜タンパク質(LMP−1、LMP−2A、LMP−2B)、早期抗原EBV−EA、膜抗原EBV−MA、ウイルスカプシド抗原EBV−VCA、アルカリ性ヌクレアーゼEBV−AN、糖タンパク質H、糖タンパク質gp350、糖タンパク質gp110、糖タンパク質gp42、糖タンパク質gHgL、糖タンパク質gB(エプスタイン・バーウイルス(EBV)、エプスタイン・バーウイルス伝染性単核球症);カプシドタンパク質(cpasid protein)VP2、カプシドタンパク質VP1、主要タンパク質NS1(パルボウイルスB19、伝染性紅斑(第五病));pp65抗原、糖タンパク質105、主要カプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質H、タンパク質U51(ヒトヘルペスウイルス6型(HHV−6)及びヒトヘルペスウイルス7型(HHV−7)、突発性発疹);チオレドキシングルタチオンレダクターゼTGR、カテプシンL1及びL2、Kunitz型タンパク質KTM、ロイシンアミノペプチダーゼLAP、システインプロテイナーゼFas2、サポシン様タンパク質−2 SAP−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPx、Prx−1、Prx−2、カテプシンlシステインプロテイナーゼCL3、プロテアーゼカテプシンL CL1、ホスホグリセリン酸キナーゼPGK、27kDa分泌タンパク質、60kDaタンパク質HSP35α、グルタチオントランスフェラーゼGST、28.5kDa外被抗原28.5kDa TA、カテプシンB3プロテアーゼCatB3、I型シスタチンステフィン−1、カテプシンL5、カテプシンL1g及びカテプシンB、脂肪酸結合タンパク質FABP、ロイシンアミノペプチダーゼLAP(肝蛭(Fasciola hepatica)及び巨大肝蛭(Fasciola gigantica)、肝蛭症);プリオンタンパク質(FFIプリオン、致死性家族性不眠症(FFI));毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダー
ゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、Cox−2(フィラリア上科(Filarioidea)、フィラリア症);ホスホリパーゼC PLC、易熱性エンテロトキシンB、イオタ毒素成分Ib、タンパク質CPE1281、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼ、伸長因子G EF−G、パーフリンゴリジンO Pfo、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGapC、フルクトース二リン酸アルドラーゼAlf2、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)エンテロトキシンCPE、アルファ毒素AT、αトキソイドATd、εトキソイドETd、タンパク質HP、大型細胞毒TpeL、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼNaglu、ホスホグリセロムターゼPgm(ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、ウェルシュ菌食中毒);ロイコトキシンlktA、付着FadA、外膜タンパク質RadD、高分子量アルギニン結合タンパク質(フゾバクテリウム属(Fusobacterium)、フソバクテリウム感染症);ホスホリパーゼC PLC、易熱性エンテロトキシンB、イオタ毒素成分Ib、タンパク質CPE1281、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼ、伸長因子G EF−G、パーフリンゴリジンO Pfo、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGapC、フルクトース二リン酸アルドラーゼAlf2、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)エンテロトキシンCPE、アルファ毒素AT、αトキソイドATd、εトキソイドETd、タンパク質HP、大型細胞毒TpeL、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼNaglu、ホスホグリセロムターゼPgm(通常ウェルシュ菌(Clostridium perfringens);他のクロストリジウム属(Clostridium)種、ガス壊疽(クロストリジウム筋壊死));リパーゼA、リパーゼB、ペルオキシダーゼDec1(ゲオトリクム・カンジドゥム(Geotrichum candidum)、ゲオトリクム症);プリオンタンパク質(GSSプリオン、ゲルストマン・ストロイスラー・シャインカー症候群(GSS));嚢胞壁タンパク質CWP1、CWP2、CWP3、変異表面タンパク質VSP、VSP1、VSP2、VSP3、VSP4、VSP5、VSP6、56kDa抗原、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼPFOR、アルコールデヒドロゲナーゼE ADHE、α−ジアルジン、α8−ジアルジン、α1−ジアルジン(alpha1−guiardin)、β−ジアルジン、システインプロテアーゼ、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、アルギニンデイミナーゼADI、フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼ(bisphosphat aldolase)FBA、ジアルジア・トロフォゾイテス(Giardia trophozoites)抗原GTA(GTA1、GTA2)、オルニチンカルボキシルトランスフェラーゼOCT、ストライエイトファイバーセンブリン様タンパク質(striated fiber−asseblin−like protein)SALP、ウリジンホスホリル様タンパク質UPL、α−チューブリン、β−チューブリン(ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)、ジアルジア症);ABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A BimA、細菌伸長因子−Tu EF−Tu、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質(鼻疽菌(Burkholderia mallei)、鼻疽);シクロフィリンCyP、24kDa第三期幼虫タンパク質(third−stage larvae protien)GS24、排出−分泌産物ESP(40、80、120及び208kDa)(有棘顎口虫(Gnathostoma spinigerum)及び剛棘顎口虫(Gnathostoma hispidum)、顎口虫症);ピリンタンパク質、マイナーピリン関連サブユニットpilC、メジャーピリンサブユニット及び変異体pilE、pilS、相変異タンパク質porA、ポーリンB PorB、タンパク質TraD、ナイセリア外膜抗原H.8、70kDa抗原、主要外膜タンパク質PI、外膜タンパク質PlA及びPlB、W抗原、表面タンパク質A NspA、トランスフェリン結合タンパク質TbpA、トランスフェリン結合タンパク質TbpB、PBP2、mtrRコードタンパク質、ponAコードタンパク質、膜透過酵素FbpBC、FbpABCタンパク質系、LbpABタンパク質、外膜タンパク質Opa、外膜トランスポーターFetA、鉄抑制調節因子MpeR(淋菌(Neisseria gonorrhoeae)、淋疾);外膜タンパク質A OmpA、外膜タンパク質C OmpC、外膜タンパク質K17 OmpK17(クレブシエラ・グラヌロマティス(Klebsiella granulomatis)、鼠径部肉芽腫(ドノバン症));フィブロネクチン結合タンパク質Sfb、フィブロネクチン/フィブリノゲン結合タンパク質FBP54、フィブロネクチン結合タンパク質FbaA、Mタンパク質1型Emm1、Mタンパク質6型Emm6、免疫グロブリン結合タンパク質35 Sib35、表面タンパク質R28 Spr28、スーパーオキシドジスムターゼSOD、C5aペプチダーゼScpA、抗原I/II AgI/II、アドヘシンAspA、G関連α2−マクログロブリン結合タンパク質GRAB、表面原線維タンパク質M5(化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)、A群連鎖球菌感染症);Cタンパク質β抗原、アルギニンデイミナーゼタンパク質、アドヘシンBibA、105kDAタンパク質BPS、表面抗原c、表面抗原R、表面抗原X、トリプシン耐性タンパク質R1、トリプシン耐性タンパク質R3、トリプシン耐性タンパク質R4、表面免疫原性タンパク質Sip、表面タンパク質Rib、ロイシンリッチリピートタンパク質LrrG、セリンリッチリピートタンパク質Srr−2、Cタンパク質α抗原Bca、Β抗原Bag、表面抗原Ε、α様タンパク質ALP1、α様タンパク質ALP5、表面抗原δ、α様タンパク質ALP2、α様タンパク質ALP3、α様タンパク質ALP4、Cβタンパク質Bac(ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)、B群連鎖球菌感染症);トランスフェリン結合タンパク質2 Tbp2、ホスファターゼP4、外膜タンパク質P6、ペプチドグリカン結合リポタンパク質Pal、タンパク質D、タンパク質E、接着及び透過タンパク質Hap、外膜タンパク質26 Omp26、外膜タンパク質P5(フィンブリン)、外膜タンパク質D15、外膜タンパク質OmpP2、5’−ヌクレオチダーゼNucA、外膜タンパク質P1、外膜タンパク質P2、外膜リポタンパク質Pcp、リポタンパク質E、外膜タンパク質P4、フクロキナーゼFucK、[Cu,Zn]−スーパーオキシドジスムターゼSodC、プロテアーゼHtrA、タンパク質O145、α−ガラクトシルセラミド(インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)、インフルエンザ菌感染症);ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C(エンテロウイルス類、主にコクサッキーA型ウイルス及びエンテロウイルス71型(EV71)、手足口病(HFMD));RNAポリメラーゼL、タンパク質L、糖タンパク質Gn、糖タンパク質Gc、ヌクレオカプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質G1、核タンパク質NP、タンパク質N、ポリタンパク質M(シンノンブレウイルス、ハンタウイルス、ハンタウイルス肺症候群(HPS));熱ショックタンパク質HspA、熱ショックタンパク質HspB、クエン酸シンターゼGltA、タンパク質UreB、熱ショックタンパク質Hsp60、好中球活性化タンパク質NAP、カタラーゼKatA、空胞化サイトトキシンVacA、ウレアーゼα UreA、ウレアーゼβ Ureb、タンパク質Cpn10、タンパク質groES、熱ショックタンパク質Hsp10、タンパク質MopB、細胞毒性関連10kDaタンパク質CAG、36kDa抗原、β−ラクタマーゼHcpA、Β−ラクタマーゼHcpB(ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ヘリコバクター・ピロリ感染症);内在性膜タンパク質、易凝集性タンパク質、O−抗原、毒素抗原Stx2B、毒素抗原Stx1B、接着抗原断片Int28、タンパク質EspA、タンパク質EspB、インチミン、タンパク質Tir、タンパク質IntC300、タンパク質Eae(大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111及びO104:H4、溶血性尿毒症候群(HUS));RNAポリメラーゼL、タンパク質L、糖タンパク質Gn、糖タンパク質Gc、ヌクレオカプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質G1、核タンパク質NP、タンパク質N、ポリタンパク質M(ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)、腎症候性出血熱(HFRS));糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、核タンパク質N、融合タンパク質F、ポリメラーゼL、プロテインW、プロテインC、リンタンパク質p、非構造タンパク質V(ヘニパウイルス(ヘンドラウイルス、ニパウイルス)、ヘニパウイルス感染症);ポリタンパク質、糖タンパク質(glycoproten)Gp2、A型肝炎表面抗原HBAg、タンパク質2A、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、タンパク質P1B、タンパク質P2A、タンパク質P3AB、タンパク質P3D(A型肝炎ウイルス、A型肝炎);B型肝炎表面抗原HBsAg、B型肝炎コア抗原HbcAg、ポリメラーゼ、タンパク質Hbx、preS2ミドル表面タンパク質、表面タンパク質L、ラージSタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4(B型肝炎ウイルス(HBV)、B型肝炎);エンベロープ糖タンパク質E1 gp32 gp35、エンベロープ糖タンパク質E2 NS1 gp68 gp70、カプシドタンパク質C、コアタンパク質Core、ポリタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、抗原G、タンパク質NS3、タンパク質NS5A(C型肝炎ウイルス、C型肝炎);ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、ラージデルタ肝炎抗原(hepaptitis delta antigen)、スモールデルタ肝炎抗原(hepaptitis delta antigen)(D型肝炎ウイルス、D型肝炎);ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2
、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、カプシドタンパク質E2(E型肝炎ウイルス、E型肝炎);糖タンパク質L UL1、ウラシル−DNAグリコシラーゼUL2、タンパク質UL3、タンパク質UL4、DNA複製タンパク質UL5、ポータルタンパク質UL6、ビリオン成熟タンパク質UL7、DNAヘリカーゼUL8、複製起点結合タンパク質UL9、糖タンパク質M UL10、タンパク質UL11、アルカリ性エキソヌクレアーゼUL12、セリン−スレオニンプロテインキナーゼUL13、テグメントタンパク質UL14、ターミナーゼUL15、テグメントタンパク質UL16、タンパク質UL17、カプシドタンパク質VP23 UL18、主要カプシドタンパク質VP5 UL19、膜タンパク質UL20、テグメントタンパク質UL21、糖タンパク質H(UL22)、チミジンキナーゼUL23、タンパク質UL24、タンパク質UL25、カプシドタンパク質P40(UL26、VP24、VP22A)、糖タンパク質B(UL27)、ICP18.5タンパク質(UL28)、主要DNA結合タンパク質ICP8(UL29)、DNAポリメラーゼUL30、核マトリックスタンパク質UL31、エンベロープ糖タンパク質UL32、タンパク質UL33、核内膜タンパク質UL34、カプシドタンパク質VP26(UL35)、ラージテグメントタンパク質UL36、カプシド集合タンパク質UL37、VP19Cタンパク質(UL38)、リボヌクレオチド還元酵素(大サブユニット)UL39、リボヌクレオチド還元酵素(小サブユニット)UL40、テグメントタンパク質/ビリオン宿主シャットオフVHSタンパク質(UL41)、DNAポリメラーゼプロセシビティー因子UL42、膜タンパク質UL43、糖タンパク質C(UL44)、膜タンパク質UL45、テグメントタンパク質VP11/12(UL46)、テグメントタンパク質VP13/14(UL47)、ビリオン成熟タンパク質VP16(UL48、α−TIF)、エンベロープタンパク質UL49、dUTPジホスファターゼUL50、テグメントタンパク質UL51、DNAヘリカーゼ/プライマーゼ複合タンパク質UL52、糖タンパク質K(UL53)、転写調節タンパク質IE63(ICP27、UL54)、タンパク質UL55、タンパク質UL56、ウイルス複製タンパク質ICP22(IE68、US1)、タンパク・ソUS2、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼUS3、糖タンパク質G(US4)、糖タンパク質J(US5)、糖タンパク質D(US6)、糖タンパク質I(US7)、糖タンパク質E(US8)、テグメントタンパク質US9、カプシド/テグメントタンパク質US10、Vmw21タンパク質(US11)、ICP47タンパク質(IE12、US12)、主要転写活性化因子ICP4(IE175、RS1)、E3ユビキチンリガーゼICP0(IE110)、潜伏期関連タンパク質1 LRP1、潜伏期関連タンパク質2 LRP2、ニューロビルレンス因子RL1(ICP34.5)、潜伏期関連転写物LAT(単純ヘルペスウイルス1型及び2型(HSV−1及びHSV−2)、単純ヘルペス);熱ショックタンパク質Hsp60、細胞表面タンパク質H1C、ジペプチジルペプチダーゼIV型DppIV、M抗原、70kDaタンパク質、17kDaヒストン様タンパク質(ヒストプラズマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)、ヒストプラスマ症);脂肪酸及びレチノール結合タンパク質−1 FAR−1、メタロプロテイナーゼ組織阻害因子TIMP(TMP)、システインプロテイナーゼACEY−1、システインプロテイナーゼACCP−1、表面抗原Ac−16、分泌タンパク質2 ASP−2、メタロプロテアーゼ1MTP−1、アスパルチルプロテアーゼ阻害因子API−1、表面関連抗原SAA−1、表面関連抗原SAA−2、成体特異的分泌第Xa因子、セリンプロテアーゼ阻害因子抗凝固薬AP、カテプシンD様アスパラギン酸プロテアーゼARR−1、グルタチオンS−トランスフェラーゼGST、アスパラギン酸プロテアーゼAPR−1、アセチルコリンエステラーゼAChE(ズビニ鉤虫(Ancylostoma duodenale)及びアメリカ鉤虫(Necator americanus)、鉤虫感染症);タンパク質NS1、タンパク質NP1、タンパク質VP1、タンパク質VP2、タンパク質VP3(ヒトボカウイルス(HBoV)、ヒトボカウイルス感染症);主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質(エーリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)、ヒトエウィンギイエーリキア症);主要表面タンパク質1〜5(MSP1a、MSP1b、MSP2、MSP3、MSP4、MSP5)、IV型分泌系(secreotion system)タンパク質VirB2、VirB7、VirB11、VirD4(アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum)、ヒト顆粒球アナプラズマ症(HGA));タンパク質NS1、スモール疎水性タンパク質NS2、SHタンパク質、融合タンパク質F、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL(ヒトメタニューモウイルス(hMPV)、ヒトメタニューモウイルス感染症);主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質(エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)、ヒト単球性エーリキア症);複製タンパク質E1、調節タンパク質E2、タンパク質E3、タンパク質E4、タンパク質E5、タンパク質E6、タンパク質E7、タンパク質E8、主要カプシドタンパク質L1、マイナーカプシドタンパク質L2(ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)感染);融合タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼ(hemagglutinin−neuramidase)HN、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL(ヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)、ヒトパラインフルエンザウイルス感染症);赤血球凝集素(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)、核タンパク質(NP)、M1タンパク質、M2タンパク質、NS1タンパク質、NS2タンパク質(NEPタンパク質:核外輸送タンパク質)、PAタンパク質、PB1タンパク質(ポリメラーゼ塩基性1タンパク質)、PB1−F2タンパク質及びPB2タンパク質(オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)、インフルエンザウイルス(流感));ゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C(日本脳炎ウイルス、日本脳炎);RTX毒素、IV型線毛、主要線毛サブユニットPilA、調節性転写因子PilS及びPilR、タンパク質σ54、外膜タンパク質(キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)、キンゲラ・キンゲ感染症);プリオンタンパク質(クーループリオン、クールー);核タンパク質N、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質Z、糖タンパク質GP(ラッサウイルス、ラッサ熱);ペプチドグリカン結合リポタンパク質PAL、60kDaシャペロニンCpn60(groEL、HspB)、IV型ピリンPilE、外膜タンパク質MIP、主要外膜タンパク質MompS、亜鉛メタロプロテイナーゼMSP(レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、レジオネラ症(レジオネラ病、ポンティアック熱));P4ヌクレアーゼ、タンパク質WD、リボヌクレオチド還元酵素M2、表面膜糖タンパク質Pg46、システインプロテイナーゼCP、グルコース調節タンパク質78 GRP−78、ステージ特異的S抗原様タンパク質A2、ATPアーゼF1、β−チューブリン、熱ショックタンパク質70 Hsp70、KMP−11、糖タンパク質GP63、タンパク質BT1、ヌクレオシドヒドロラーゼNH、細胞表面タンパク質B1、リボソームタンパク質P1様タンパク質P1、ステロール24−c−メチルトランスフェラーゼSMT、LACKタンパク質、ヒストンH1、SPB1タンパク質、チオール特異的抗酸化剤TSA、タンパク質抗原STl1、シグナルペプチダーゼSP、ヒストンH2B、表面抗原(suface antigen)PSA−2、システインプロテイナーゼb Cpb(リーシュマニア属(Leishmania)、リーシュマニア症);主要膜タンパク質I、セリンリッチ抗原45kDa、10kDaシャペロニン(caperonin)GroES、HSP kDa抗原、アミノオキソノナノエートシンターゼAONS、タンパク質リコンビナーゼA RecA、アセチル−/プロピオニル−補酵素Aカルボキシラーゼα、アラニンラセマーゼ、60kDaシャペロニン2、ESAT−6様タンパク質EcxB(L−ESAT−6)、タンパク質Lsr2、タンパク質ML0276、ヘパリン結合赤血球凝集素HBHA、熱ショックタンパク質65 Hsp65、mycP1又はML0041コードタンパク質、htrA2又はML0176コードタンパク質、htrA4又はML2659コードタンパク質、gcp又はML0379コードタンパク質、clpC又はML0235コードタンパク質(らい菌(Mycobacterium leprae)及びマイコバクテリウム・レプロマトシス(Mycobacterium lepromatosis)、らい);外膜タンパク質LipL32、膜タンパク質LIC10258、膜タンパク質LP30、膜タンパク質LIC12238、Ompa様タンパク質Lsa66、表面タンパク質LigA、表面タンパク質LigB、主要外膜タンパク質OmpL1、外膜タンパク質LipL41、タンパク質LigAni、表面タンパク質LcpA、接着タンパク質LipL53、外膜タンパク質UpL32、表面タンパク質Lsa63、フラジェリンFlaB1、膜リポタンパク質(membran lipoprotein)LipL21、膜タンパク質pL40、レプトスピラ表面アドヘシンLsa27、外膜タンパク質OmpL36、外膜タンパク質OmpL37、外膜タンパク質OmpL47、外膜タンパク質OmpL54、アシルトランスフェラーゼLpxA(レプトスピラ属(Leptospira)、レプトスピラ症);リステリオリシンO前駆体Hly(LLO)、侵入関連タンパク質Iap(P60)、リステリオリシン調節タンパク質PrfA、亜鉛メタロプロテイナーゼMpl、ホスファチジルイノシトール特異的ホスホリパーゼC PLC(PlcA、PlcB)、O−アセチルトランスフェラーゼOat、ABCトランスポーター透過酵素Im.G_1771、接着タンパク質LAP、LAP受容体Hsp60、アドヘシンLapB、溶血毒素リステリオリシンO LLO、タンパク質ActA、インターナリンA InlA、タンパク質lnlB
(リステリア菌(Listeria monocytogenes)、リステリア症);細胞表層タンパク質A OspA、細胞表層タンパク質OspB、細胞表層タンパク質OspC、デコリン結合タンパク質A DbpA、デコリン結合タンパク質B DbpB、鞭毛繊維41kDaコアタンパク質Fla、塩基性膜タンパク質A BmpA(免疫優勢抗原P39)、表層22kDaリポタンパク質前駆体(抗原IPLA7)、変異性表層リポタンパク質vlsE(通常ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)及び他のボレリア属(Borrelia)種、ライム病(ライムボレリア症));毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、タンパク質Cox−2(バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)及びマレー糸状虫(Brugia malayi)、リンパ管フィラリア症(象皮病));糖タンパク質GP、マトリックスタンパク質Z、ポリメラーゼL、核タンパク質N(リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、リンパ球性脈絡髄膜炎);トロンボスポンジン関連匿名タンパク質TRAP、SSP2スポロゾイト表面タンパク質2、頂端膜抗原1 AMA1、ロプトリー膜抗原RMA1、酸性塩基性リピート抗原ABRA、細胞通過タンパク質PF、タンパク質Pvs25、メロゾイト表面タンパク質1 MSP−1、メロゾイト表面タンパク質2 MSP−2、リング感染赤血球表面抗原RESA、肝ステージ抗原3 LSA−3、タンパク質Eba−175、セリンリピート抗原5 SERA−5、スポロゾイト周囲タンパク質CS、メロゾイト表面タンパク質3 MSP3、メロゾイト表面タンパク質8 MSP8、エノラーゼPF10、肝細胞赤血球タンパク質17kDa HEP17、赤血球膜タンパク質1 EMP1、タンパク質Kβメロゾイト表面タンパク質4/5 MSP4/5、熱ショックタンパク質Hsp90、グルタミン酸リッチタンパク質GLURP、メロゾイト表面タンパク質4 MSP−4、タンパク質STARP、スポロゾイト周囲タンパク質関連抗原前駆体CRA(プラスモジウム属(Plasmodium)、マラリア);核タンパク質N、膜結合性タンパク質VP24、マイナー核タンパク質VP30、ポリメラーゼ補因子VP35、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質VP40、エンベロープ糖タンパク質GP(マールブルグウイルス、マールブルグ熱(MHF));プロテインC、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、非構造タンパク質V、赤血球凝集素糖タンパク質H、ポリメラーゼL、核タンパク質N、融合タンパク質F(麻疹ウイルス、麻疹);ABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A BimA、細菌伸長因子−Tu EF−Tu、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質、boaBコードタンパク質(類鼻疽菌(Burkholderia pseudomallei)、類鼻疽(ホイットモーア病));ピリンタンパク質、マイナーピリン関連サブユニットpilC、メジャーピリンサブユニット及び変異体pilE、pilS、相変異タンパク質porA、ポーリンB PorB、タンパク質TraD、ナイセリア外膜抗原H.8、70kDa抗原、主要外膜タンパク質PI、外膜タンパク質PlA及びPlB、W抗原、表面タンパク質A NspA、トランスフェリン結合タンパク質TbpA、トランスフェリン結合タンパク質TbpB、PBP2、mtrRコードタンパク質、ponAコードタンパク質、膜透過酵素FbpBC、FbpABCタンパク質系、LbpABタンパク質、外膜タンパク質Opa、外膜トランスポーターFetA、鉄抑制調節因子MpeR、H因子−結合タンパク質fHbp、アドヘシンNadA、タンパク質NhbA、リプレッサーFarR(髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)、髄膜炎菌性疾患);66kDaタンパク質、22kDaタンパク質(通常横川吸虫(Metagonimus yokagawai)、メタゴニムス症);極管タンパク質(グルゲア属(Glugea)の34、75、及び170kDa、エンセファリトゾーン属(Encephalitozoon)の35、55及び150kDa)、キネシン関連タンパク質、RNAポリメラーゼIIラージストサブユニット、内在性膜タンパク質と類似YIPA、抗サイレンシングタンパク質1、熱ショック転写因子HSF、プロテインキナーゼ、チミジンキナーゼ、NOP−2様核小体タンパク質(微胞子虫門(Microsporidia)、微胞子虫症);CASP8及びFADD様アポトーシス調節因子、グルタチオンペルオキシダーゼGPX1、RNAヘリカーゼNPH−II NPH2、ポリ(A)ポリメラーゼ触媒サブユニットPAPL、主要エンベロープタンパク質P43K、早期転写因子70kDaサブユニットVETFS、早期転写因子82kDaサブユニットVETFL、メタロエンドペプチダーゼG1型、ヌクレオシドトリホスファターゼI NPH1、複製タンパク質A28様MC134L、RNAポリメラーゼ(RNA polymease)7kDaサブユニットRPO7(伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、伝染性軟属腫(MC));マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P/V、スモール疎水性タンパク質SH、核タンパク質N、タンパク質V、融合糖タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼHN、RNAポリメラーゼL(ムンプスウイルス、ムンプス);外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D、結晶性表層タンパク質SLP、防御表面タンパク質抗原SPA(発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)、ネズミチフス(発疹熱));アドヘシンP1、アドヘシン(adhesion)P30、タンパク質p116、タンパク質P40、細胞骨格タンパク質HMW1、細胞骨格タンパク質HMW2、細胞骨格タンパク質HMW3、MPN152コードタンパク質、MPN426コードタンパク質、MPN456コードタンパク質、MPN−500コードタンパク質(肺炎マイコプラズマ(Mycoplasma pneumoniae)、マイコプラズマ肺炎);NocA、鉄依存性調節タンパク質、VapA、VapD、VapF、VapG、カゼイン分解プロテアーゼ、糸状体先端部関連43kDaタンパク質、タンパク質P24、タンパク質P61、15kDaタンパク質、56kDaタンパク質(通常ノカルジア・アステロイデス(Nocardia asteroides)及び他のノカルジア属(Nocardia)種、ノカルジア症);毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、Cox−2(回旋糸状虫(Onchocerca volvulus)、オンコセルカ症(河川盲目症));43kDa分泌型糖タンパク質、糖タンパク質gp0、糖タンパク質gp75、抗原Pb27、抗原Pb40、熱ショックタンパク質Hsp65、熱ショックタンパク質Hsp70、熱ショックタンパク質Hsp90、タンパク質P10、トリオースリン酸イソメラーゼTPI、N−アセチルグルコサミン結合レクチンパラコクシン(Paracoccin)、28kDaタンパク質Pb28(パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、パラコクシジオイデス症(南アメリカブラストミセス症));28kDaクルジパイン様システインプロテアーゼPw28CCP(通常ウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)及び他の肺吸虫属(Paragonimus)種、肺吸虫症);外膜タンパク質OmpH、外膜タンパク質Omp28、タンパク質PM1539、タンパク質PM0355、タンパク質PM1417、修復タンパク質MutL、タンパク質BcbC、タンパク質(prtein)PM0305、ギ酸デヒドロゲナーゼ−N、タンパク質PM0698、タンパク質PM1422、DNAジャイレース、リポタンパク質PlpE、接着タンパク質Cp39、ヘム獲得システム受容体HasR、39kDa被膜タンパク質、鉄調節型OMP IROMP、外膜タンパク質OmpA87、線毛タンパク質Ptf、線毛サブユニットタンパク質PtfA、トランスフェリン結合タンパク質Tbpl、エステラーゼ酵素MesA、パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)毒素PMT、接着タンパク質Cp39(パスツレラ属(Pasteurella)、パスツレラ症);”糸状赤血球凝集素FhaB、アデニル酸シクラーゼCyaA、百日咳毒素サブユニット4前駆体PtxD、パータクチン前駆体Prn、毒素サブユニット1 PtxA、タンパク質Cpn60、タンパク質brkA、百日咳毒素サブユニット2前駆体PtxB、百日咳毒素サブユニット3前駆体PtxC、百日咳毒素サブユニット5前駆体PtxE、パータクチンPrn、タンパク質Fim2、タンパク質Fim3;”(百日咳菌(Bordetella pertussis)、百日咳(Pertussis)(百日咳(Whooping cough)));”F1カプセル抗原、ビルレンス関連V抗原、分泌型エフェクタータンパク質LcrV、V抗原、外膜プロテアーゼPla、分泌型エフェクタータンパク質YopD、推定分泌タンパク質−チロシンホスファターゼYopH、ニードル複合体主要サブユニットYscF、プロテインキナーゼYopO、推定オートトランスポータータンパク質YapF、内膜ABCトランスポーターYbtQ(Irp7)、推定糖結合タンパク質YPO0612、熱ショックタンパク質90 HtpG、推定スルファターゼタンパク質YdeN、外膜リポタンパク質キャリアータンパク質LolA、分泌シャペロンYerA、推定リポタンパク質YPO0420、溶血毒素アクチベータータンパク質HpmB、ペスチシン/エルシニアバクチン外膜受容体Psn、分泌型エフェクタータンパク質YopE、分泌
型エフェクタータンパク質YopF、分泌型エフェクタータンパク質YopK、外膜タンパク質YopN、外膜タンパク質YopM、コアグラーゼ/フィブリノリジン前駆体Pla;”(ペスト菌(Yersinia pestis)、ペスト);タンパク質PhpA、表面アドヘシンPsaA、ニューモリシンPly、ATP依存性プロテアーゼClp、リポ酸−タンパク質リガーゼLplA、細胞壁表面アンカータンパク質psrP、ソルターゼSrtA、グルタミル−tRNAシンテターゼGltX、コリン結合タンパク質A CbpA、肺炎球菌表面タンパク質A PspA、肺炎球菌表面タンパク質C PspC、6−ホスホグルコン酸デヒドロゲナーゼGnd、鉄結合タンパク質PiaA、ムレインヒドロラーゼLytB、プロテオン(proteon)LytC、プロテアーゼA1(肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)、肺炎球菌感染症);主要表面タンパク質B、ケキシン様プロテアーゼKEX1、タンパク質A12、55kDa抗原P55、主要表面糖タンパク質Msg(ニューモシスチス・イロベチ(Pneumocystis jirovecii)、ニューモシスチス肺炎(PCP));ゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C(ポリオウイルス、灰白髄炎);タンパク質Nfa1、エキセンディン−3、分泌性リパーゼ、カテプシンB様プロテアーゼ、システインプロテアーゼ、カテプシン、ペルオキシレドキシン、タンパク質Cry1Ac(通常フォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)、原発性アメーバ性髄膜脳炎(PAM));アグノプロテイン、ラージT抗原、スモールT抗原、主要カプシドタンパク質VP1、マイナーカプシドタンパク質Vp2(JCウイルス、進行性多巣性白質脳症);低カルシウム応答タンパク質E LCrE、クラミジア外膜タンパク質N CopN、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼPknD、アシルキャリアータンパク質S−マロニルトランスフェラーゼFabD、一本鎖DNA結合タンパク質Ssb、主要外膜タンパク質MOMP、外膜タンパク質2 Omp2、多形膜タンパク質ファミリー(Pmp1、Pmp2、Pmp3、Pmp4、Pmp5、Pmp6、Pmp7、Pmp8、Pmp9、Pmp10、Pmp11、Pmp12、Pmp13、Pmp14、Pmp15、Pmp16、Pmp17、Pmp18、Pmp19、Pmp20、Pmp21)(オウム病クラミジア(Chlamydophila psittaci)、オウム病);外膜タンパク質P1、熱ショックタンパク質B HspB、ペプチドABCトランスポーター、GTP結合タンパク質、タンパク質IcmB、リボヌクレアーゼR、ホスファターゼ(phosphatas)SixA、タンパク質DsbD、外膜タンパク質TolC、DNA−結合タンパク質PhoB、ATPアーゼDotB、熱ショックタンパク質B HspB、膜タンパク質Com1、28kDaタンパク質、DNA−3−メチルアデニングリコシダーゼI、外膜タンパク質(pouter membrane protein)OmpH、外膜タンパク質AdaA、グリシン切断系Tタンパク質(Q熱コクシエラ(Coxiella burnetii)、Q熱);核タンパク質N、ラージ構造タンパク質L、リンタンパク質(phophoprotein)P、マトリックスタンパク質M、糖タンパク質G(狂犬病ウイルス、狂犬病);融合タンパク質F、核タンパク質N、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質(phophoprotein)P、スモール疎水性タンパク質SH、主要表面糖タンパク質G、ポリメラーゼL、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質2 NS2(呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、呼吸器合胞体ウイルス感染症);ゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C(ライノウイルス、ライノウイルス感染症);外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、タンパク質PS120、細胞質内タンパク質D、防御表面タンパク質抗原SPA(リケッチア属(Rickettsia)、リケッチア感染症);外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D(痘瘡リケッチア(Rickettsia akari)、リケッチア痘);エンベロープ糖タンパク質GP、ポリメラーゼL、核タンパク質N、非構造タンパク質NSS(リフトバレー熱ウイルス、リフトバレー熱(RVF));外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D(ロッキー山紅斑熱リケッチア(Rickettsia rickettsii)、ロッキー山紅斑熱(RMSF));”非構造タンパク質6 NS6、非構造タンパク質2 NS2、中間カプシドタンパク質VP6、内側カプシドタンパク質VP2、非構造タンパク質3 NS3、RNA指向性RNAポリメラーゼL、タンパク質VP3、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質5 NS5、外側カプシド糖タンパク質VP7、非構造糖タンパク質4 NS4、外側カプシドタンパク質VP4;;”(ロタウイルス、ロタウイルス感染症);ポリタンパク質P200、糖タンパク質E1、糖タンパク質E2、タンパク質NS2、カプシドタンパク質C(風疹ウイルス、風疹);シャペロニンGroEL(MopA)、イノシトールリン酸ホスファターゼSopB、熱ショックタンパク質HslU、シャペロンタンパク質DnaJ、タンパク質TviB、タンパク質IroN、フラジェリンFliC、侵入タンパク質SipC、糖タンパク質gp43、外膜タンパク質LamB、外膜タンパク質PagC、外膜タンパク質TolC、外膜タンパク質NmpC、外膜タンパク質FadL、輸送タンパク質SadA、トランスフェラーゼWgaP、エフェクタータンパク質SifA、SteC、SseL、SseJ及びSseF(サルモネラ属(Salmonella)、サルモネラ症);”タンパク質14、非構造タンパク質NS7b、非構造タンパク質NS8a、タンパク質9b、タンパク質3a、核タンパク質N、非構造タンパク質NS3b、非構造タンパク質NS6、タンパク質7a、非構造タンパク質NS8b、膜タンパク質M、エンベロープスモール膜タンパク質EsM、レプリカーゼポリタンパク質1a、スパイク糖タンパク質S、レプリカーゼポリタンパク質1ab;”(SARSコロナウイルス類、SARS(重症急性呼吸器症候群));セリンプロテアーゼ、異型ヒゼンダニ属(Sarcoptes)抗原1 ASA1、グルタチオンS−トランスフェラーゼGST、システインプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ、アポリポタンパク質(ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)、疥癬);グルタチオンS−トランスフェラーゼGST、パラミオシン、ヘモグルビナーゼ(hemoglbinase)SM32、主要虫卵抗原、14kDa脂肪酸結合タンパク質Sm14、主要幼虫表面抗原P37、22.6kDa外被抗原、カルパインCANP、三リン酸イソメラーゼ(triphospate isomerase)Tim、表面タンパク質9B、外側カプシドタンパク質VP2、23kDa内在性膜タンパク質Sm23、Cu/Zn−スーパーオキシドジスムターゼ、糖タンパク質Gp、ミオシン(住血吸虫属(Schistosoma)、住血吸虫症(ビルハルツ住血吸虫症));60kDaシャペロニン、56kDa型特異的抗原、ピルビン酸リン酸ジキナーゼ、4−ヒドロキシ安息香酸オクタプレニルトランスフェラーゼ(ツツガムシ病リケッチア(Orientia tsutsugamushi)、ツツガムシ病);デヒドロゲナーゼGuaB、侵入タンパク質Spa32、インベイシンIpaA、インベイシンIpaB、インベイシンIpaC、インベイシンIpaD、インベイシンIpaH、インベイシンIpaJ(赤痢菌属(Shigella)、シゲラ症(細菌性赤痢));タンパク質P53、ビリオンタンパク質US10ホモログ、転写調節因子IE63、転写トランス活性化因子IE62、プロテアーゼP33、αトランス誘導因子74kDaタンパク質、デオキシウリジン5’−三リン酸ヌクレオチドヒドロラーゼ、転写トランス活性化因子IE4、膜タンパク質UL43ホモログ、核リンタンパク質UL3ホモログ、核タンパク質UL4ホモログ、複製起点結合タンパク質、膜タンパク質2、リンタンパク質32、タンパク質57、DNAポリメラーゼプロセシビティー因子、ポータルタンパク質54、DNAプライマーゼ、テグメントタンパク質UL14ホモログ、テグメントタンパク質UL21ホモログ、テグメントタンパク質UL55ホモログ、トリパータイトターミナーゼサブユニットUL33ホモログ、トリパータイトターミナーゼサブユニットUL15ホモログ、カプシド結合タンパク質44、ビリオンパッケージングタンパク質43(水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、帯状疱疹(帯状疱疹));トランケート型3−βヒドロキシ−5−エンステロイドデヒドロゲナーゼホモログ、ビリオン膜タンパク質A13、タンパク質A19、タンパク質A31、トランケート型タンパク質A35ホモログ、タンパク質A37.5ホモログ、タンパク質A47、タンパク質A49、タンパク質A51、セマフォリン様タンパク質A43、セリンプロテアーゼ阻害因子1、セリンプロテアーゼ阻害因子2、セリンプロテアーゼ阻害因子3、タンパク質A6、タンパク質B15、タンパク質C1、タンパク質C5、タンパク質C6、タンパク質F7、タンパク質F8、タンパク質F9、タンパク質F11、タンパク質F14、タンパク質F15、タンパク質F16(大痘瘡又は小痘瘡、天然痘(痘瘡));アドヘシン/糖タンパク質gp70、プロテアーゼ(スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)、スポロトリコーシス);ヘム鉄結合タンパク質IsdB、コラーゲンアドヘシンCna、クランピング因子A ClfA、タンパク質MecA、フィブロネクチン結合タンパク質A FnbA、エンテロトキシンA型EntA、エンテロトキシンB型EntB、エンテロトキシンC型EntC1、エンテロトキシンC型EntC2、エンテロトキシンD型EntD、エンテロトキシンE型EntE、毒素性ショック症候群毒素−1 TSST−1、スタフィロキナーゼ、ペニシリン結合タンパク質2a PBP2a(MecA)、分泌抗原SssA(スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、ブドウ球菌食中毒);ヘム鉄結合タンパク質IsdB、コラーゲンアドヘシンCna、クランピング因子A ClfA、タンパク質MecA、フィブロネクチン結合タンパク質A FnbA、エンテロトキシンA型EntA、エンテロトキシンB型EntB、エンテロトキシンC型EntC1、エンテロトキシンC型EntC2、エンテロトキシンD型EntD、エンテロトキシンE型EntE、毒素性ショック症候群毒素−1 TSST−1、スタフィロキナーゼ、ペニシリン結合タンパク質2a PBP2a(MecA)、分泌抗原SssA(スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、例えば黄色ブドウ球菌(aureus)、ブドウ球菌感染症);抗原Ss−IR、抗原NIE、ストロンギラスタシン、Na+−K+ ATPアーゼSseat−6、トロポマイシン(tropomysin)SsTmy−1、タンパク質LEC−5、41kDa抗原(aantigen
)P5、41kDa幼虫タンパク質、31kDa幼虫タンパク質、28kDa幼虫タンパク質(糞線虫(Strongyloides stercoralis)、糞線虫症);グリセロホスホジエステルホスホジエステラーゼGlpQ(Gpd)、外膜タンパク質TmpB、タンパク質Tp92、抗原TpF1、リピートタンパク質Tpr、リピートタンパク質F TprF、リピートタンパク質G TprG、リピートタンパク質I TprI、リピートタンパク質J TprJ、リピートタンパク質K TprK、トレポネーマ膜タンパク質A TmpA、リポタンパク質、15kDa Tpp15、47kDa膜抗原、ミニフェリチンTpF1、アドヘシンTp0751、リポタンパク質TP0136、タンパク質TpN17、タンパク質TpN47、外膜タンパク質TP0136、外膜タンパク質TP0155、外膜タンパク質TP0326、外膜タンパク質TP0483、外膜タンパク質TP0956(梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)、梅毒);カテプシンL様プロテアーゼ、53/25kDa抗原、8kDaファミリーメンバー、辺縁トリプシン様活性を有する嚢虫タンパク質TsAg5、六鉤幼虫タンパク質TSOL18、六鉤幼虫タンパク質TSOL45−1A、乳酸デヒドロゲナーゼA LDHA、乳酸デヒドロゲナーゼB LDHB(テニア属(Taenia)、条虫症);破傷風毒素TetX、破傷風毒素C TTC、140kDa S層タンパク質、フラビンタンパク質β−サブユニットCT3、ホスホリパーゼ(レシチナーゼ)、ホスホキャリアータンパク質HPr(破傷風菌(Clostridium tetani)、破傷風(牙関緊急));ゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C(ダニ媒介性脳炎ウイルス(TBEV)、ダニ媒介脳炎);58kDa抗原、68kDa抗原、トキソカラ属(Toxocara)幼虫排泄−分泌抗原TES、32kDa糖タンパク質、糖タンパク質TES−70、糖タンパク質GP31、排泄−分泌抗原TcES−57、腸周囲液抗原Pe、可溶性抽出物抗原Ex、排泄/分泌幼虫抗原ES、抗原TES−120、ポリタンパク質アレルゲンTBA−1、カテプシンL様システインプロテアーゼc−cpl−1、26kDaタンパク質(イヌ回虫(Toxocara canis)又はネコ回虫(Toxocara cati)、トキソカラ症(眼幼虫移行症(OLM)及び内臓幼虫移行症(VLM)));ミクロネームタンパク質(MIC1、MIC2、MIC3、MIC4、MIC5、MIC6、MIC7、MIC8)、ロプトリータンパク質Rop2、ロプトリータンパク質(Rop1、Rop2、Rop3、Rop4、Rop5、Rop6、Rop7、Rop16、Rjop17)、タンパク質SR1、表面抗原P22、主要抗原p24、主要表面抗原p30、密顆粒タンパク質(GRA1、GRA2、GRA3、GRA4、GRA5、GRA6、GRA7、GRA8、GRA9、GRA10)、28kDa抗原、表面抗原SAG1、SAG2関連抗原、ヌクレオシドトリホスファターゼ1、ヌクレオシドトリホスファターゼ2、タンパク質Stt3、HesB様ドメイン含有タンパク質、ロンボイド様プロテアーゼ5、トキソメプシン(toxomepsin)1(トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii)、トキソプラズマ症);43kDa分泌型糖タンパク質、53kDa分泌型糖タンパク質、パラミオシン、抗原Ts21、抗原Ts87、抗原p46000、TSL−1抗原、カベオリン−1 CAV−1、49kDa新生幼虫抗原、プロサポシンホモログ、セリンプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ阻害因子、45kDa糖タンパク質Gp45(旋毛虫(Trichinella spiralis)、旋毛虫症);Myb様転写因子(Myb1、Myb2、Myb3)、接着タンパク質AP23、接着タンパク質AP33、アドヘシンタンパク質AP33−3、アドヘシンAP51、アドヘシンAP65、接着タンパク質AP65−1、α−アクチニン、キネシン関連タンパク質、テニューリン、62kDaプロテイナーゼ、サブチリシン様セリンプロテアーゼSUB1、システインプロテイナーゼ遺伝子3 CP3、α−エノラーゼEno1、システインプロテイナーゼCP30、熱ショックタンパク質(Hsp70、Hsp60)、免疫原性タンパク質P270(膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)、トリコモナス症);β−チューブリン、47kDaタンパク質、分泌白血球様プロテイナーゼ−1 SLP−1、50kDaタンパク質TT50、17kDa抗原、43/47kDaタンパク質(鞭虫(Trichuris trichiura)、鞭虫症(鞭虫感染));タンパク質ESAT−6(EsxA)、10kDaろ過性抗原EsxB、分泌抗原85−B FBPB、フィブロネクチン結合タンパク質A FbpA(Ag85A)、セリンプロテアーゼPepA、PPEファミリータンパク質PPE18、フィブロネクチン結合タンパク質D FbpD、免疫原性タンパク質MPT64、分泌タンパク質MPT51、カタラーゼ−ペルオキシダーゼ−ペルオキシニトリターゼT KATG、ペリプラズムリン酸結合リポタンパク質PSTS3(PBP−3、Phos−1)、鉄調節ヘパリン結合赤血球凝集素Hbha、PPEファミリータンパク質PPE14、PPEファミリータンパク質PPE68、タンパク質Mtb72F、タンパク質Apa、免疫原性タンパク質MPT63、ペリプラズムリン酸結合リポタンパク質PSTS1(PBP−1)、分子シャペロンDnaK、細胞表面リポタンパク質Mpt83、リポタンパク質P23、リン酸輸送系透過酵素タンパク質pstA、14kDa抗原、フィブロネクチン結合タンパク質C FbpC1、アラニンデヒドロゲナーゼTB43、グルタミンシンテターゼ1、ESX−1タンパク質、タンパク質CFP10、TB10.4タンパク質、タンパク質MPT83、タンパク質MTB12、タンパク質MTB8、Rpf様タンパク質、タンパク質MTB32、タンパク質MTB39、クリスタリン、熱ショックタンパク質HSP65、タンパク質PST−S(通常結核菌(Mycobacterium tuberculosis)、結核);外膜タンパク質FobA、外膜タンパク質FobB、細胞内増殖遺伝子座lglC1、細胞内増殖遺伝子座IglC2、アミノトランスフェラーゼWbtl、シャペロニンGroEL、17kDa主要膜タンパク質TUL4、リポタンパク質LpnA、キチナーゼファミリー18タンパク質、イソクエン酸デヒドロゲナーゼ、Nif3ファミリータンパク質、IV型線毛グリコシル化タンパク質、外膜タンパク質tolC、FAD結合ファミリータンパク質、IV型ピリン多量体外膜タンパク質、二成分センサータンパク質KdpD、シャペロンタンパク質DnaK、タンパク質TolQ(野兎病菌(Francisella tularensis)、野兎病);”MB抗原、ウレアーゼ、タンパク質GyrA、タンパク質GyrB、タンパク質ParC、タンパク質ParE、脂質結合膜タンパク質LAMP、チミジンキナーゼTK、ホスホリパーゼPL−A1、ホスホリパーゼPL−A2、ホスホリパーゼPL−C、表面発現96kDa抗原;”(ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)、ウレアプラズマ・ウレアリチカム感染症);非構造ポリタンパク質、構造ポリタンパク質、カプシドタンパク質CP、タンパク質E1、タンパク質E2、タンパク質E3、プロテアーゼP1、プロテアーゼP2、プロテアーゼP3(ベネズエラウマ脳炎ウイルス、ベネズエラウマ脳炎);糖タンパク質GP、マトリックスタンパク質Z、ポリメラーゼL、核タンパク質N(グアナリトウイルス、ベネズエラ出血熱);ポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5(ウエストナイルウイルス、西ナイル熱);カプシドタンパク質(cpasid protein)CP、タンパク質E1、タンパク質E2、タンパク質E3、プロテアーゼP2(西部ウマ脳炎ウイルス、西部ウマ脳炎);ゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5(黄熱病ウイルス、黄熱);推定Yopターゲティングタンパク質YobB、エフェクタータンパク質YopD、エフェクタータンパク質YopE、タンパク質YopH、エフェクタータンパク質YopJ、タンパク質移行タンパク質YopK、エフェクタータンパク質YopT、タンパク質YpkA、鞭毛生合成タンパク質FlhA、ペプチダーゼM48、カリウム流出系KefA、転写調節因子RovA、アドヘシンIfp、トランスロケータータンパク質(translocator portein)LcrV、タンパク質PcrV、インベイシンInv、外膜タンパク質OmpF様ポーリン、アドヘシンYadA、プロテインキナーゼC、ホスホリパーゼC1、タンパク質PsaA、マンノシルトランスフェラーゼ様タンパク質WbyK、タンパク質YscU、抗原YPMa(偽結核菌(Yersinia pseudotuberculosis)、偽結核菌感染症);エフェクタータンパク質YopB、60kDaシャペロニン、タンパク質WbcP、チロシンタンパク質ホスファターゼ(tyrosin−protein phosphatase)YopH、タンパク質YopQ、エンテロトキシン、ガラクトシド透過酵素、レダクターゼNrdE、タンパク質YasN、インベイシンInv、アドヘシンYadA、外膜ポーリンF OmpF、タンパク質UspA1、タンパク質EibA、タンパク質Hia、細胞表面タンパク質Ail、シャペロンSycD、タンパク質LcrD、タンパク質LcrG、タンパク質LcrV、タンパク質SycE、タンパク質YopE、調節タンパク質TyeA、タンパク質YopM、タンパク質YopN、タンパク質YopO、タンパク質YopT、タンパク質YopD、プロテアーゼClpP、タンパク質MyfA、タンパク質FilA、及びタンパク質PsaA(腸炎エルシニア(Yersinia enterocolitica)、エルシニア症)からなる群から選択される異なる病原性抗原をコードする(括弧内には、1つ又は複数の抗原が由来する特定の病原体又は病原体ファミリー及びその病原体が関連する感染症を示す)。
・感染症がHIV、好ましくはヒト免疫不全ウイルスによる感染である場合、HIV p24抗原、HIVエンベロープタンパク質(Gp120、Gp41、Gp160)、ポリタンパク質GAG、陰性因子タンパク質Nef、トランス転写活性化因子Tat、
・感染症がトラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)による感染である場合、主要外膜タンパク質MOMP、推定外膜タンパク質PMPC、外膜複合タンパク質B OmcB、熱ショックタンパク質Hsp60 HSP10、タンパク質IncA、III型分泌装置からのタンパク質、リボヌクレオチド還元酵素スモール鎖タンパク質NrdB、プラスミドタンパク質Pgp3、クラミジア外膜タンパク質N CopN、抗原CT521、抗原CT425、抗原CT043、抗原TC0052、抗原TC0189、抗原TC0582、抗原TC0660、抗原TC0726、抗原TC0816、抗原TC0828、
・感染症がサイトメガロウイルス感染、好ましくはサイトメガロウイルス(CMV)による感染である場合、pp65抗原、膜タンパク質pp15、カプシド基部テグメントタンパク質pp150、タンパク質M45、DNAポリメラーゼUL54、ヘリカーゼUL105、糖タンパク質gM、糖タンパク質gN、糖タンパク質H、糖タンパク質B gB、タンパク質UL83、タンパク質UL94、タンパク質UL99;
・感染症がデング熱、好ましくはデングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)−フラビウイルス類による感染である場合、カプシドタンパク質C、プレ膜タンパク質prM、膜タンパク質M、エンベロープタンパク質E(ドメインI、ドメインII、ドメインII)、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質NS2B、タンパク質NS3、タンパク質NS4A、タンパク質2K、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;
・感染症がB型肝炎(Hepatits B)、好ましくはB型肝炎ウイルス(HBV)による感染である場合、B型肝炎表面抗原HBsAg、B型肝炎コア抗原HbcAg、ポリメラーゼ、タンパク質Hbx、preS2ミドル表面タンパク質、表面タンパク質L、ラージSタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4;
・感染症がヒトパピローマウイルス(HPV)感染、好ましくはヒトパピローマウイルス(HPV)による感染である場合、複製タンパク質E1、調節タンパク質E2、タンパク質E3、タンパク質E4、タンパク質E5、タンパク質E6、タンパク質E7、タンパク質E8、メジャーカプシドタンパク質L1、マイナーカプシドタンパク質L2;
・感染症がヒトパラインフルエンザウイルス感染、好ましくはヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)による感染である場合、融合タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼ(hemagglutinin−neuramidase)HN、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL;
・赤血球凝集素(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)、核タンパク質(NP)、M1タンパク質、M2タンパク質、NS1タンパク質、NS2タンパク質(NEPタンパク質:核外輸送タンパク質)、PAタンパク質、PB1タンパク質(ポリメラーゼ塩基性1タンパク質)、PB1−F2タンパク質及びPB2タンパク質(オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)、インフルエンザウイルス(流感));
・感染症が狂犬病、好ましくは狂犬病ウイルスによる感染である場合、核タンパク質N、ラージ構造タンパク質L、リンタンパク質P、マトリックスタンパク質M、糖タンパク質G;
・感染症が呼吸器合胞体ウイルス感染、好ましくは呼吸器合胞体ウイルス(RSV)による感染である場合、融合タンパク質F、核タンパク質N、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質P、スモール疎水性タンパク質SH、主要表面糖タンパク質G、ポリメラーゼL、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質2 NS2;
・感染症が結核、好ましくは結核菌(Mycobacterium tuberculosis)による感染である場合、分泌抗原SssA(スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、ブドウ球菌食中毒);分泌抗原SssA(スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、例えば黄色ブドウ球菌(aureus)、ブドウ球菌感染症);分子シャペロンDnaK、細胞表面リポタンパク質Mpt83、リポタンパク質P23、リン酸輸送系透過酵素タンパク質pstA、14kDa抗原、フィブロネクチン結合タンパク質C FbpC1、アラニンデヒドロゲナーゼTB43、グルタミンシンテターゼ1、ESX−1タンパク質、タンパク質CFP10、TB10.4タンパク質、タンパク質MPT83、タンパク質MTB12、タンパク質MTB8、Rpf様タンパク質、タンパク質MTB32、タンパク質MTB39、クリスタリン、熱ショックタンパク質HSP65、タンパク質PST−S;
・感染症が黄熱、好ましくは黄熱病ウイルスによる感染である場合、ゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5。
n個の異なるRNA分子種はまた、各々、異なる自己免疫性自己抗原(self−antigen)(自己抗原(autoantigen))もコードし得る。
n個の異なるRNA分子種はまた、各々、アジュバントタンパク質の異なるアイソフォーム又は変異体もコードし得る。
脆弱性ニューロパチー);エピロイア(結節性硬化症);EPP(赤血球生成性プロトポルフィリン症);赤芽球性貧血(βサラセミア);赤芽球性肝性プロトポルフィリン症(赤血球生成性プロトポルフィリン症);赤血球5−アミノレブリン酸合成酵素欠損症(X連鎖性鉄芽球性貧血);赤血球生成性ポルフィリン症(先天性赤芽球性ポルフィリン症);赤血球生成性プロトポルフィリン症;赤血球生成性ウロポルフィリン症(先天性赤芽球性ポルフィリン症);眼癌(網膜芽細胞腫FA−フリードライヒ失調症);ファブリー病;顔面傷害及び障害;第V因子ライデン血栓形成傾向;FALS(筋萎縮性側索硬化症);家族性聴神経腫(神経線維腫症II型);家族性腺腫性ポリポーシス;家族性アルツハイマー病(FAD)(アルツハイマー病);家族性筋萎縮性側索硬化症(筋萎縮性側索硬化症);家族性自律神経失調症;家族性脂肪誘導性高トリグリセリド血症(リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性);家族性ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス);家族性LPL欠損症(リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性);家族性非ポリポーシス結腸癌(遺伝性非ポリポーシス結腸直腸癌);家族性発作性多漿膜炎(地中海熱、家族性);家族性PCT(晩発性皮膚ポルフィリン症);家族性圧力感受性ニューロパチー(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー);家族性原発性肺高血圧症(FPPH)(原発性肺高血圧症);家族性ターナー症候群(ヌーナン症候群);家族性血管性白質脳症(CADASIL);FAP(家族性腺腫性ポリポーシス);FD(家族性自律神経失調症);女性プソイドターナー症候群(ヌーナン症候群);フェロケラターゼ欠損症(赤血球生成性プロトポルフィリン症);フェロポーチン疾患(ヘモクロマトーシス4型);発熱(地中海熱、家族性);FG症候群;FGFR3関連冠状縫合癒合(ミュエンク症候群);星状細胞のフィブリノイド変性(アレキサンダー病);膵臓の線維嚢胞性疾患(嚢胞性線維症);FMF(地中海熱、家族性);フォリング病(フェニルケトン尿症);fra(X)症候群(脆弱X症候群);脆弱X症候群;骨脆弱症(骨形成不全症);FRAXA症候群(脆弱X症候群);FRDA(フリードライヒ失調症);フリードライヒ失調症(Friedreich ataxia)(フリードライヒ失調症(Friedreich’s ataxia));フリードライヒ失調症;FXS(脆弱X症候群);G6PD欠損症;ガラクトキナーゼ欠損疾患(ガラクトース血症);ガラクトース−1−リン酸ウリジルトランスフェラーゼ欠乏性疾患(ガラクトース血症);ガラクトース血症;ガラクトシルセラミダーゼ欠損疾患(クラッベ病);ガラクトシルセラミドリピドーシス(クラッベ病);ガラクトシルセレブロシダーゼ欠損症(クラッベ病);ガラクトシルスフィンゴシンリピドーシス(クラッベ病);GALC欠損症(クラッベ病);GALT欠損症(ガラクトース血症);ゴーシェ病;ゴーシェ様疾患(偽ゴーシェ病);GBA欠損症(ゴーシェ病1型);GD(ゴーシェ病);遺伝的脳障害;遺伝性気腫(α1−アンチトリプシン欠乏症);遺伝性ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス);巨細胞肝炎、新生児(新生児ヘモクロマトーシス);GLA欠損症(ファブリー病);膠芽腫、網膜(網膜芽細胞腫);神経膠腫、網膜(網膜芽細胞腫);グロボイド細胞型白質ジストロフィー(GCL、GLD)(クラッベ病);グロボイド細胞型白質脳症(クラッベ病);グルコセレブロシダーゼ欠損症(ゴーシェ病);グルコセレブロシドーシス(ゴーシェ病);グルコシルセレブロシドリピドーシス(ゴーシェ病);グルコシルセラミダーゼ欠損症(ゴーシェ病);グルコシルセラミドβ−グルコシダーゼ欠損症(ゴーシェ病);グルコシルセラミドリピドーシス(ゴーシェ病);グリセリン酸尿症(高シュウ酸尿症、原発性);グリシン脳症(非ケトン性高グリシン血症);グリコール酸尿症(高シュウ酸尿症、原発性);GM2ガングリオシドーシス、1型(テイ・サックス病);甲状腺腫−難聴症候群(ペンドレッド症候群);グレーフェ・アッシャー症候群(アッシャー症候群);グレンブラッド・ストランドベリー症候群(弾性線維性仮性黄色腫);ギュンターポルフィリン症(先天性赤芽球性ポルフィリン症);ギュンター病(先天性赤芽球性ポルフィリン症);ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス);ハルグレン症候群(アッシャー症候群);道化師様魚鱗癬;Hb S疾患(鎌状赤血球貧血);HCH(軟骨低形成症);HCP(遺伝性コプロポルフィリン症);頭部・脳形成異常;聴覚障害及び難聴;小児の聴覚問題;HEF2A(ヘモクロマトーシス2型);HEF2B(ヘモクロマトーシス2型);ヘマトポルフィリン症(ポルフィリン症);ヘム合成酵素欠損症(赤血球生成性プロトポルフィリン症);ヘモクロマトーシス群(ヘモクロマトーシス);ヘモクロマトーシス;ヘモグロビンM症(メトヘモグロビン血症β−グロビン型);ヘモグロビンS症(鎌状赤血球貧血);血友病;HEP(骨髄肝性ポルフィリン症);肝AGT欠損症(高シュウ酸尿症、原発性);骨髄肝性ポルフィリン症;肝レンズ核変性症候群(ウィルソン病);遺伝性関節眼症(スティックラー症候群);遺伝性コプロポルフィリン症;遺伝性異所性リピドーシス(ファブリー病);遺伝性ヘモクロマトーシス(HHC)(ヘモクロマトーシス);遺伝性封入体ミオパチー(骨格筋再生);遺伝性鉄負荷貧血(X連鎖性鉄芽球性貧血);遺伝性運動感覚性ニューロパチー(シャルコー・マリー・トゥース病);遺伝性運動神経細胞障害(脊髄筋萎縮症);遺伝性運動神経細胞障害、V型(遠位型脊髄性筋萎縮症、V型);遺伝性多発性外骨腫;遺伝性非ポリポーシス結腸直腸癌;遺伝性周期熱症候群(地中海熱、家族性);遺伝性大腸ポリポーシス(家族性腺腫性ポリポーシス);遺伝性肺気腫(α1−アンチトリプシン欠乏症);遺伝性活性化プロテインC抵抗性(第V因子ライデン血栓形成傾向);遺伝性感覚・自律神経性ニューロパチーIII型(家族性自律神経失調症);遺伝性痙性対麻痺(乳児期発症型上行性遺伝性痙性麻痺);遺伝性脊髄性運動失調症(フリードライヒ失調症);遺伝性脊髄硬化症(フリードライヒ失調症);ヘリック貧血(鎌状赤血球貧血);ヘテロ接合性OSMED(ワイセンバーチャー・ツバイミューラー症候群);ヘテロ接合性耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成(ワイセンバーチャー・ツバイミューラー症候群);HexA欠損症(テイ・サックス病);ヘキソサミニダーゼA欠損症(テイ・サックス病);ヘキソサミニダーゼα−サブユニット欠損症(バリアントB)(テイ・サックス病);HFE関連ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス);HGPS(早老症);ヒッペル・リンダウ病(フォン・ヒッペル・リンドウ病);HLAH(ヘモクロマトーシス);HMN V(遠位型脊髄性筋萎縮症、V型);HMSN(シャルコー・マリー・トゥース病);HNPCC(遺伝性非ポリポーシス結腸直腸癌);HNPP(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー);ホモシスチン尿症;ホモゲンチジン酸酸化酵素欠損症(アルカプトン尿症);ホモゲンチジン酸尿(アルカプトン尿症);ホモ接合性晩発性皮膚ポルフィリン症(骨髄肝性ポルフィリン症);HP1(高シュウ酸尿症、原発性);HP2(高シュウ酸尿症、原発性);HPA(高フェニルアラニン血症);HPRT−ヒポキサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ欠損症(レッシュ・ナイハン症候群);HSAN III型(家族性自律神経失調症);HSAN3(家族性自律神経失調症);HSN−III(家族性自律神経失調症);ヒト皮膚脆弱症(エーラース・ダンロス症候群#皮膚脆弱型);ハンチントン病;ハッチンソン・ギルフォード早老症候群(早老症);アンドロゲン過剰症、非古典型、21−ヒドロキシラーゼ欠損症に起因(21−ヒドロキシラーゼ欠損症);高カイロミクロン血症、家族性(リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性);ケトアシドーシス及び白血球減少症を伴う高グリシン血症(プロピオン酸血症);高リポタンパク血症I型(リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性);高シュウ酸尿症、原発性;高フェニルアラニン血症(hyperphenylalaninaemia)(高フェニルアラニン血症(hyperphenylalaninemia));高フェニルアラニン血症;軟骨異低形成(軟骨低形成症);軟骨低発生症;軟骨低形成症;低色素性貧血(X連鎖性鉄芽球性貧血);低銅血症、先天性;メンケス症候群);ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ(hypoxanthine phosphoribosyltransferse)(HPRT)欠損症(レッシュ・ナイハン症候群);IAHSP(乳児期発症型上行性遺伝性痙性麻痺);特発性ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス、3型);特発性新生児ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス、新生児);特発性肺高血圧症(原発性肺高血圧症);免疫系障害(X連鎖性重症複合免疫不全症);色素失調症;脳性小児ゴーシェ病(ゴーシェ病2型);乳児ゴーシェ病(ゴーシェ病2型);乳児期発症型上行性遺伝性痙性麻痺;不妊症;遺伝性気腫(α1−アンチトリプシン欠乏症);遺伝性ヒト伝染性海綿状脳症(プリオン病);遺伝的圧脆弱性傾向(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー);インスレイ・アスレイ(Insley−Astley)症候群(耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成);急性間欠性ポルフィリン症候群(急性間欠性ポルフィリン症);腸ポリポーシス−皮膚色素沈着症候群(ポイツ・ジェガース症候群);IP(色素失調症);鉄蓄積障害(ヘモクロマトーシス);同腕二動原体15番染色体(idic15);単独難聴(非症候性難聴);ジャクソン・ワイス症候群;JH(ヘモクロマトーシス2型);ジュベール症候群;JPLS(若年性原発性側索硬化症);若年性筋萎縮性側索硬化症(筋萎縮性側索硬化症2型);若年性痛風、舞踏アテトーゼ、精神遅滞症候群(レッシュ・ナイハン症候群);若年性高尿酸血症候群(レッシュ・ナイハン症候群);JWS(ジャクソン・ワイス症候群);KD(X連鎖性脊髄延髄性筋萎縮症);ケネディ病(X連鎖性脊髄延髄性筋萎縮症);ケネディ脊髄延髄性筋萎縮症(X連鎖性脊髄延髄性筋萎縮症);ケラシン組織球増殖症(ゴーシェ病);ケラシンリポイドーシス(ゴーシェ病);ケラシン蓄積症(ゴーシェ病);ケトーシス型グリシン血症(プロピオン酸血症);ケトーシス型高グリシン血症(プロピオン酸血症);腎疾患(高シュウ酸尿症、原発性);クラインフェルター症候群;クラインフェルター症候群;クニースト骨異形成;クラッベ病;まだら認知症(CADASIL);ランガー・サルディーノ軟骨無発生症(軟骨無発生症、II型);ランガー・サルディーノ異形成(軟骨無発生症、II型);遅発性アルツハイマー病(アルツハイマー病2型);遅発性家族性アルツハイマー病(AD2)(アルツハイマー病2型);遅発性クラッベ病(LOKD)(クラッベ病);学習障害(学習能力障害);黒子症、口囲(ポイツ・ジェガース症候群);レッシュ・ナイハン症候群;白質ジストロフィー;ローゼンタール線維を伴う白質ジストロフィー(アレキサンダー病);白質ジストロフィー、海綿状(カナバン病);LFS(リー・フラウメニ症候群);リー・フラウメニ症候群;リパーゼD欠損症(リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性);LIPD欠損症(リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性);リピドーシス、セレブロシド(ゴーシェ病);リピドーシス、ガングリオシド、乳児(テイ・サックス病);類脂質性組織球増殖症(ケラシン型)(ゴーシェ病);リポタンパク質リパーゼ欠損症、家族性;肝疾患(ガラクトース血症);ルー・ゲーリック病(筋萎縮性側索硬化症);ルイ・バール症候群(毛細血管拡張性運動失調症);リンチ症候群(遺伝性非ポリポーシス結腸直腸癌);リシルヒドロキシラーゼ欠損症(エーラース・ダンロス症候群脊柱後側弯症型);マシャド・ジョセフ病(脊髄小脳失調症3型);男性乳癌(乳癌);男性生殖器障害;男性ターナー症候群(ヌーナン症候群);乳房の悪性新生物(乳癌);乳
房の悪性腫瘍(乳癌);膀胱の悪性腫瘍(膀胱癌);乳癌(mammary cancer)(乳癌(breast cancer));マルファン症候群15;マーカーX症候群(脆弱X症候群);マーチン・ベル症候群(脆弱X症候群);マッキューン・オルブライト症候群;マクラウド症候群;MEDNIK;地中海貧血(βサラセミア);地中海熱、家族性;巨大骨端小人症(耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成);メンケア症候群(Menkea syndrome)(メンケス症候群);メンケス症候群;骨軟骨異常を伴う精神遅滞(コフィン・ローリー症候群);代謝障害;遡及性小人症、II型(クニースト骨異形成);変容性骨異形成II型(クニースト骨異形成);メトヘモグロビン血症β−グロビン型;メチルマロン酸血症;MFS(マルファン症候群);MHAM(カウデン症候群);MK(メンケス症候群);ミクロ症候群;小頭症;MMA(メチルマロン酸血症);MNK(メンケス症候群);モノソミー1p36症候群(1p36欠失症候群);モノソミーX(ターナー症候群);運動ニューロン疾患、筋萎縮性側索硬化症(筋萎縮性側索硬化症);運動障害;モワット・ウィルソン症候群;ムコ多糖症(MPS I);ムコヴィスイドーシス(嚢胞性線維症);ミュエンク症候群;多発脳梗塞性認知症(CADASIL);マルチプルカルボキシラーゼ欠損症、遅発性(ビオチニダーゼ欠損症);多発性過誤腫症候群(カウデン症候群);多発性神経線維腫症(神経線維腫症);筋ジストロフィー;筋ジストロフィー、デュシェンヌ型及びベッカー型;萎縮性筋緊張症(筋強直性ジストロフィー);異栄養性ミオトニー(筋強直性ジストロフィー);筋強直性ジストロフィー;粘液水腫、先天性(先天性甲状腺機能低下症);ナンス・インスレー(Nance−Insley)症候群(耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成);ナンス・スウィーニー(Nance−Sweeney)軟骨異形成(耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成);NBIA1(パントテン酸キナーゼ関連神経変性症);ニール・ディグワール症候群(コケイン症候群);神経芽細胞腫、レチナール(網膜芽細胞腫);脳鉄蓄積を伴う神経変性1型(パントテン酸キナーゼ関連神経変性症);神経線維腫症I型;神経線維腫症II型;神経疾患;神経筋障害;神経細胞障害、遠位遺伝性運動性、V型(遠位型脊髄性筋萎縮症V型);神経細胞障害、遠位遺伝性運動性、錐体路特徴を伴う(筋萎縮性側索硬化症4型);NF(神経線維腫症);ニーマン・ピック(ニーマン・ピック病);ノアク症候群(パイフェル症候群);非ケトン性高グリシン血症(グリシン脳症);非神経細胞障害性ゴーシェ病(ゴーシェ病1型);非フェニルケトン尿症高フェニルアラニン血症(テトラヒドロビオプテリン欠損症);非症候性難聴;ヌーナン症候群;ノルボットン型ゴーシェ病(ゴーシェ病3型);オクロノーシス(アルカプトン尿症);アルカプトン尿性関節炎(アルカプトン尿症);OI(骨形成不全症);OSMED(耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成);骨形成不全症;骨脆弱症(骨形成不全症);先天性骨硬化症(軟骨無形成症);耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成(Oto−spondylo−megaepiphyseal dysplasia)(耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成(otospondylomegaepiphyseal dysplasia));耳・脊椎・巨大骨端軟骨異形成;シュウ酸症(高シュウ酸尿症、原発性);シュウ酸塩尿、原発性(高シュウ酸尿症、原発性);パントテン酸キナーゼ関連神経変性症;パトー症候群(13トリソミー);PBGD欠損症(急性間欠性ポルフィリン症);PCC欠損症(プロピオン酸血症);PCT(晩発性皮膚ポルフィリン症);PDM(筋強直性ジストロフィー#2型);ペンドレッド症候群;周期性疾患(地中海熱、家族性);周期性腹膜炎(地中海熱、家族性);開口周辺部黒子症候群(ポイツ・ジェガース症候群);末梢神経障害(家族性自律神経失調症);末梢性神経線維腫症(神経線維腫症1型);腓骨筋萎縮症(シャルコー・マリー・トゥース病);ペルオキシソームアラニン:グリオキシル酸アミノトランスフェラーゼ欠損症(高シュウ酸尿症、原発性);ポイツ・ジェガース症候群;パイフェル症候群;フェニルアラニンヒドロキシラーゼ欠損疾患(フェニルケトン尿症);フェニルケトン尿症;褐色細胞腫(フォン・ヒッペル・リンドウ病);胎児軟骨異形成を伴うピエール・ロバン症候群(ワイセンバーチャー・ツバイミューラー症候群);色素沈着性肝硬変(ヘモクロマトーシス);PJS(ポイツ・ジェガース症候群);PKAN(パントテン酸キナーゼ関連神経変性症);PKU(フェニルケトン尿症);鉛ポルフィリン症(ALA欠損性ポルフィリン症);PMA(シャルコー・マリー・トゥース病);多骨性線維性骨異形成(マッキューン・オルブライト症候群);大腸ポリポージス(家族性腺腫性ポリポーシス);ポリポーシス、過誤腫性大腸(ポイツ・ジェガース症候群);ポリポーシス、大腸、II型(ポイツ・ジェガース症候群);ポリープ・スポット症候群(ポイツ・ジェガース症候群);ポルホビリノーゲンシンターゼ欠損症(ALA欠損性ポルフィリン症);ポルフィリン症;ポルフィリン障害(ポルフィリン症);PPH(原発性肺高血圧症);PPOX欠損症(多彩性ポルフィリン症);プラダー・ラブハート・ウィリー症候群(プラダー・ウィリー症候群);プラダー・ウィリー症候群;初老期及び老年性認知症(アルツハイマー病);原発性ヘモクロマトーシス(ヘモクロマトーシス);原発性高尿酸血症候群(レッシュ・ナイハン症候群);原発性肺高血圧症;原発性老年性変性認知症(アルツハイマー病);プリオン病;プロコラーゲンEDS VII型、突然変異型(エーラス・ダンロス症候群関節弛緩型);早老症(ハッチンソン・ギルフォード早老症候群);早老症様症候群(コケイン症候群);早老性小人症(コケイン症候群);進行性舞踏病、慢性遺伝性(ハンチントン)(ハンチントン病);進行性筋萎縮症(脊髄性筋萎縮症);正常な強膜を伴う進行性変形性骨形成不全症(骨形成不全症III型);PROMM(筋強直性ジストロフィー2型);プロピオン酸血症(propionic academia);プロピオニル−CoAカルボキシラーゼ欠損症(プロピオン酸血症);プロテインC欠乏症;プロテインS欠乏症;プロトポルフィリン症(赤血球生成性プロトポルフィリン症);プロトポルフィリノーゲンオキシダーゼ欠損症(多彩性ポルフィリン症);近位型筋強直性ジストロフィー(筋強直性ジストロフィー2型);近位型筋強直性ミオパチー(筋強直性ジストロフィー2型);偽ゴーシェ病;偽ウルリッヒ・ターナー症候群(ヌーナン症候群);弾性線維性仮性黄色腫;サイコシンリピドーシス(クラッベ病);肺動脈高血圧症(原発性肺高血圧症);肺高血圧症(原発性肺高血圧症);PWS(プラダー・ウィリー症候群);PXE−弾性線維性仮性黄色腫(弾性線維性仮性黄色腫);Rb(網膜芽細胞腫);レックリングハウゼン病、神経(神経線維腫症1型);再発性多漿膜炎(地中海熱、家族性);網膜障害;網膜色素変性症−難聴症候群(アッシャー症候群);網膜芽細胞腫;レット症候群;RFALS 3型(筋萎縮性側索硬化症2型);リッカー症候群(筋強直性ジストロフィー2型);ライリー・デイ症候群(家族性自律神経失調症);ルシー・レヴィ症候群(シャルコー・マリー・トゥース病);RSTS(ルビンシュタイン・テイビ症候群);RTS(レット症候群)(ルビンシュタイン・テイビ症候群);RTT(レット症候群);ルビンシュタイン・テイビ症候群;サック・バラバス症候群(エーラース・ダンロス症候群、血管型);SADDAN;リー・フラウメニの肉腫ファミリー症候群(リー・フラウメニ症候群);肉腫、乳房、白血病、及び副腎(SBLA)症候群(リー・フラウメニ症候群);SBLA症候群(リー・フラウメニ症候群);SBMA(X連鎖性脊髄延髄性筋萎縮症);SCD(鎌状赤血球貧血);シュワン腫、聴覚性、両側性(神経線維腫症2型);SCIDX1(X連鎖性重症複合免疫不全症);結節性硬化症(sclerosis tuberosa)(結節性硬化症(tuberous sclerosis));SDAT(アルツハイマー病);先天性SED(先天性脊椎骨端異形成);ストラドウィック型SED(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);SEDc(先天性脊椎骨端異形成);SEMD、ストラドウィック型(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);老年性認知症(アルツハイマー病2型);発育遅延及び黒色表皮腫を伴う重度軟骨無形成症(SADDAN);シュプリンツェン症候群(22q11.2欠失症候群);鎌状赤血球貧血;骨格・皮膚・脳症候群(SADDAN);皮膚色素沈着障害;SMA(脊髄性筋萎縮症);SMED、ストラドウィック型(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);SMED、I型(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);スミス・レムリ・オピッツ症候群;南アフリカ遺伝性ポルフィリン症(多彩性ポルフィリン症);痙性麻痺、乳児期発症型上行性(乳児期発症型上行性遺伝性痙性麻痺);発話及びコミュニケーション障害;スフィンゴリピドーシス、テイ・サックス(テイ・サックス病);脊髄延髄性筋萎縮症;脊髄性筋萎縮症;脊髄性筋萎縮症、遠位V型(遠位型脊髄性筋萎縮症V型);脊髄性筋萎縮症、遠位型、上肢優位(遠位型脊髄性筋萎縮症V型);脊髄小脳失調症;脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型;先天性脊椎骨端異形成;脊椎骨端異形成(コラーゲン異常症、II型及びXI型);先天性脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);脊椎骨端骨幹端異形成(SMD)(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);中枢神経系海綿状変性症(カナバン病);脳海綿状変性症(カナバン病);乳児期における白質の海綿状変性(カナバン病);散発性原発性肺高血圧症(原発性肺高血圧症);SSB症候群(SADDAN);剛毛症候群(メンケス症候群);シュタイネルト病(筋強直性ジストロフィー);シュタイネルト筋強直性ジストロフィー症候群(筋強直性ジストロフィー);スティックラー症候群;脳卒中(CADASIL);ストラドウィック症候群(脊椎骨端骨幹端異形成、ストラドウィック型);亜急性ニューロノパチーゴーシェ病(ゴーシェ病3型);スウェーデン型遺伝性ポルフィリン症(急性間欠性ポルフィリン症);スウェーデン型ポルフィリン症(急性間欠性ポルフィリン症);スイスチーズ様軟骨異形成(クニースト骨異形成);テイ・サックス病;TD−致死性小人症(致死性骨異形成);真っ直ぐな大腿骨及びクローバー葉頭蓋を伴うTD(致死性骨異形成2型);毛細血管拡張症、小脳眼皮膚(毛細血管拡張性運動失調症);精巣性女性化症候群(アンドロゲン不感性症候群);テトラヒドロビオプテリン欠損症;TFM−精巣性女性化症候群(アンドロゲン不感性症候群);中間型サラセミア(βサラセミア);重症型サラセミア(βサラセミア);致死性骨異形成;真性糖尿病及び感音難聴を伴うチアミン応答性巨赤芽球性貧血;活性化プロテインCの補因子欠損に起因する血栓形成傾向、ライデン型(第V因子ライデン血栓形成傾向);甲状腺疾患;ソーセージ様ニューロパチー(遺伝性圧脆弱性ニューロパチー);HPRT完全欠損症(レッシュ・ナイハン症候群);ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ完全欠損症(レッシュ・ナイハン症候群);トゥレット症候群;伝播性認知症(プリオン病);伝達性海綿状脳症(プリオン病);トリーチャー・コリンズ症候群;骨脆弱症(Trias fragilitis ossium)(骨形成不全症I型);トリプルX症候群;トリプロX症候群(Triplo X syndrome)(トリプルX症候群);21トリソミー(ダウン症候群);X染色体トリソミー(トリプルX症候群);トロアジェ・アノー・ショファール症候群(ヘモクロマトーシス);TS
(ターナー症候群);TSD(テイ・サックス病);TSE(プリオン病);結節性硬化症(tuberose sclerosis)(結節性硬化症(tuberous sclerosis));結節性硬化症;ターナー症候群;X染色体に伴う女性ターナー症候群(ヌーナン症候群);ターナー表現型、正常核型(ヌーナン症候群);ターナー症候群(Turner’s syndrome)(ターナー症候群(Turner syndrome));ターナー様症候群(ヌーナン症候群);2型ゴーシェ病(ゴーシェ病2型);3型ゴーシェ病(ゴーシェ病3型);UDP−ガラクトース−4−エピメラーゼ欠損疾患(ガラクトース血症);UDPグルコース4−エピメラーゼ欠損疾患(ガラクトース血症);UDPグルコースヘキソース−1−リン酸ウリジリルトランスフェラーゼ欠損症(ガラクトース血症);ウールリッヒ・ヌーナン症候群(ヌーナン症候群);ウルリッヒ・ターナー症候群(ターナー症候群);非特定難聴(非症候性難聴);UPS欠損症(急性間欠性ポルフィリン症);膀胱癌(urinary bladder cancer)(膀胱癌(bladder cancer));UROD欠損症(晩発性皮膚ポルフィリン症);ウロポルフィリノーゲン脱炭酸酵素欠損症(晩発性皮膚ポルフィリン症);ウロポルフィリノーゲン合成酵素欠損症(急性間欠性ポルフィリン症);UROS欠損症(先天性赤芽球性ポルフィリン症);アッシャー症候群;UTPヘキソース−1−リン酸ウリジリルトランスフェラーゼ欠損症(ガラクトース血症);ヴァンボゲール・ベルトラン症候群(カナバン病);ヴァンデルヘーヴェ症候群(骨形成不全症I型);多彩性ポルフィリン症;口蓋心臓顔面症候群(22q11.2欠失症候群);VHL症候群(フォン・ヒッペル・リンドウ病);視力障害及び失明(アルストレーム症候群);ヴァンボゲール・ベルトラン病(Von Bogaert−Bertrand disease)(カナバン病);フォン・ヒッペル・リンドウ病;フォンレックリングハウゼン・アップルバウム病(ヘモクロマトーシス);フォンレックリングハウゼン病(神経線維腫症1型);VP(多彩性ポルフィリン症);フロリク病(骨形成不全症);ワールデンブルグ症候群;ワールブルグ・ショー・フレデリウス症候群(Warburg Sjo Fledelius Syndrome)(ミクロ症候群);W・c(ウィルソン病);ワイセンバーチャー・ツバイミューラー症候群;ウィルソン病;ウィルソン病(Wilson’s disease)(ウィルソン病(Wilson disease));ウォルフ・ヒルシュホーン症候群;ウォルフ周期性疾患(地中海熱、家族性);WZS(ワイセンバーチャー・ツバイミューラー症候群);色素性乾皮症;X連鎖性精神遅滞及び巨精巣症(脆弱X症候群);X連鎖性原発性高尿酸血症(レッシュ・ナイハン症候群);X連鎖性重症複合免疫不全症;X連鎖性鉄芽球性貧血;X連鎖性脊髄延髄性筋萎縮症(ケネディ病);X連鎖性尿酸尿酵素欠損(レッシュ・ナイハン症候群);X−SCID(X連鎖性重症複合免疫不全症);XLSA(X連鎖性鉄芽球性貧血);XSCID(X連鎖性重症複合免疫不全症);XXX症候群(トリプルX症候群);XXXX症候群(48,XXXX);XXXXX症候群(49,XXXXX);XXY症候群(クラインフェルター症候群);XXYトリソミー(クラインフェルター症候群);XYY核型(47,XYY症候群);XYY症候群(47,XYY症候群);及びYY症候群(47,XYY症候群)から選択される遺伝性疾患が特に好ましい。
(Arg)l;(Lys)j;(His)h;(Orn)o;(Xaa)x、(式(I))
[式中、l+j+h+o+x=8〜15、及びl、j、h又はoは、互いに独立に、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14又は15から選択される任意の数であってよく、但し、Arg、Lys、His及びOrnの全含有量がこのオリゴペプチドの全アミノ酸の少なくとも50%を占めるものとし;及びXaaは、Arg、Lys、His又はOrnを除く未変性の(=天然に存在する)又は非天然のアミノ酸から選択される任意のアミノ酸であってよく;及びxは、0、1、2、3又は4から選択される任意の数であってよく、但し、Xaaの全含有量がこのオリゴペプチドの全アミノ酸の50%を超えないものとする]を有する以下のタンパク質又はペプチドから選択され得る。これに関連して特に好ましいカチオン性ペプチドは、例えば、Arg7、Arg8、Arg9、H3R9、R9H3、H3R9H3、YSSR9SSY、(RKH)4、Y(RKH)2R等である。これに関連して、国際公開第2009/030481号パンフレットの開示が本明細書によって参照により援用される。
L−P1−S−[S−P2−S]k−S−P3−L 式(II)
[式中、
P1及びP3は、互いに異なるか又は同一であり、線状又は分枝状親水性ポリマー鎖を表し、各P1及びP3は、成分P2との、或いはかかる成分をP1とP2との間又はP3とP2との間のリンカーとして使用した場合に(AA)、(AA)x、又は[(AA)x]z)との、及び/又は更なる成分(例えば(AA)、(AA)x、[(AA)x]z又はL)との縮合時にジスルフィド結合を形成する能力を有する少なくとも1つの−SH部分を呈し、線状又は分枝状親水性ポリマー鎖は、互いに独立に、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ−N−(2−ヒドロキシプロピル)メタクリルアミド、ポリ−2−(メタクリロイルオキシ)エチルホスホリルコリン類、ポリ(ヒドロキシアルキルL−アスパラギン)、ポリ(2−(メタクリロイルオキシ)エチルホスホリルコリン)、ヒドロキシエチルデンプン又はポリ(ヒドロキシアルキルL−グルタミン)から選択され、ここで親水性ポリマー鎖は、約1kDa〜約100kDa、好ましくは約2kDa〜約25kDa;又はより好ましくは約2kDa〜約10kDa、例えば約5kDa〜約25kDa又は5kDa〜約10kDaの分子量を呈し;
P2は、例えば上記にジスルフィド架橋カチオン性成分によって形成されるポリマー担体に関して定義するとおりの、且つ好ましくは約3〜約100アミノ酸の長さを有する、より好ましくは約3〜約50アミノ酸の長さを有する、更により好ましくは約3〜約25アミノ酸の長さ、例えば約3〜10、5〜15、10〜20又は15〜25アミノ酸の長さ、より好ましくは約5〜約20の長さ及び更により好ましくは約10〜約20の長さを有する、カチオン性又はポリカチオン性ペプチド又はタンパク質であるか;又は
例えば上記にジスルフィド架橋カチオン性成分によって形成されるポリマー担体に関して定義するとおりの、典型的には約0.5kDa〜約30kDaの分子量、例えば約1kDa〜約20kDa、更により好ましくは約1.5kDa〜約10kDaの分子量を有する、又は約0.5kDa〜約100kDaの分子量、例えば約10kDa〜約50kDa、更により好ましくは約10kDa〜約30kDaの分子量を有する、カチオン性又はポリカチオン性ポリマーであり;
各P2は、更なる成分P2又は成分P1及び/又はP3との、或いは更なる成分(例えば(AA)、(AA)x、又は[(AA)x]z)との縮合時にジスルフィド結合を形成する能力を有する少なくとも2つの−SH部分を呈し;
−S−S−は、(可逆的)ジスルフィド結合(読み易くするため括弧は省略する)であり、式中、Sは好ましくは、(可逆的)ジスルフィド結合を形成している硫黄又は−SH担持部分を表す。(可逆的)ジスルフィド結合は、好ましくは、成分P1及びP2、P2及びP2、又はP2及びP3のいずれか、又は任意選択で本明細書に定義するとおりの更なる成分(例えばL、(AA)、(AA)x、[(AA)x]z等)の−SH−部分の縮合によって形成され;−SH部分はこれらの成分の構造の一部であっても、又は以下に定義するとおりの修飾によって付加されてもよく;
Lは、存在しても又はしなくてもよい任意選択のリガンドであり、RGD、トランスフェリン、葉酸塩、シグナルペプチド又はシグナル配列、局在性シグナル又は配列、核移行シグナル又は配列(NLS)、抗体、細胞透過性ペプチド(例えばTAT又はKALA)、受容体のリガンド(例えば、サイトカイン、ホルモン、成長因子等)、小分子(例えばマンノース若しくはガラクトースなどの炭水化物又は合成リガンド)、受容体の小分子アゴニスト、阻害因子又はアンタゴニスト(例えばRGDペプチドミメティクス類似体)、又は本明細書に定義するとおりの任意の更なるタンパク質等から他と独立に選択されてもよく;
kは、典型的には、約1〜50の範囲、好ましくは約1、2又は3〜30の範囲、より好ましくは約1、2、3、4、又は5〜25の範囲、又は約1、2、3、4、又は5〜20の範囲、又は約1、2、3、4、又は5〜15の範囲、又は約1、2、3、4、又は5〜10の範囲、例えば、約4〜9、4〜10、3〜20、4〜20、5〜20、又は10〜20の範囲、又は約3〜15、4〜15、5〜15、又は10〜15の範囲、又は約6〜11又は7〜10の範囲から選択される整数である。最も好ましくは、kは、約1、2、3、4、又は5〜10の範囲、より好ましくは約1、2、3、又は4〜9の範囲、約1、2、3、又は4〜8の範囲、又は約1、2、又は3〜7の範囲である]に係るポリマー担体分子から選択され得る。
(実施例)
以下の例は本発明を別の方法で例示することを意図している。これらは単に例示に過ぎず、本発明の主題を限定する意図はない。
この例のため、インフルエンザウイルス(A型インフルエンザ及びB型インフルエンザ)の表面に見られる糖タンパク質である種々の赤血球凝集素(heamagglutin)タンパク質をコードするDNA配列を作成した。この例には、様々な血清型の幾つかのHAタンパク質を使用した(以下の表1を参照)。DNA配列は、GC最適化配列の導入によって安定化させることにより野生型コードDNA配列を修飾して調製した。配列は同じベクター骨格、pUC19由来ベクターに導入し、32L4リボソームタンパク質由来の5’−UTR(32L4 TOP 5’−UTR)及びアルブミン由来の3’−UTR、ヒストンステムループ構造、及び3’側末端にある64個のアデノシンのストレッチを含むように修飾した。それぞれのプラスミドDNA配列並びに対応するRNA配列を配列プロトコルに提供する(配列番号1〜14(RNA配列)及び配列番号15〜28(プラスミドDNA配列)。作成した配列は高い配列類似性を示す(図1に提供するプラスミドDNA配列の配列及び予想RNA配列の同一性行列)。得られたプラスミドDNAコンストラクトは当該技術分野において公知の一般的なプロトコルを用いて細菌(大腸菌(Escherichia coli))において形質転換及び増殖し、グリセロールストックを調製した。
この実験の目標は、実施例1で得られたプラスミドを担持する細菌培養物の個々の成長及び産生挙動を評価することである。この分析は、HAプラスミドDNA(表1を参照)から、全てのプラスミドDNA変異体が同様の量で産生されることを保証する(実施例3を参照)一様に成長するクローンを同定するために必要である。
各細菌クローンについて、1ml LB培地(100μg/mlアンピシリン含有)にそれぞれのグリセロールストックを接種し、振盪インキュベーターにおいて37℃で16時間インキュベートする。その後、10μlの個々の細菌培養物を固体LB培地(100μg/mlアンピシリン補足)に移し、37℃で16時間インキュベートして単一個別コロニーを得る。各プレートから単一個別コロニーを取り、1mlの液体LB培地(100μg/mlアンピシリン含有)に接種してプレ培養した後、本培養物をスクリーニングする。このようにして、最初の成長同期を実現する。
プレートリーダーでの光学濃度測定によってプレ培養物のバイオマス濃度を決定した後、各クローンのそれぞれの容積を1mLの液体TB培地(100μg/mlアンピシリン含有)に移し、0.1の一様な初期細胞密度となるように接種する。透明底の特殊なマイクロタイタープレートでオンライン測定(散乱光及び溶存酸素圧(DOT)測定)を用いて個々のクローンの成長をモニタする。記録されたオンラインシグナルにより、誘導期の持続期間、成長速度、及び最終的なバイオマス形成など、成長動態を詳細に決定することが可能である。培養後、プラスミド力価の定量化及び次世代シーケンシングを実施する。一様に成長するクローンが同定され、それを用いてグリセロールストックを作成する。続いて、これらのクローンは大規模プラスミドDNA産生に用いられる。
DNAプラスミドをEcoRIを用いて酵素的に線状化し、それぞれの緩衝液条件下にヌクレオチド混合物の存在下でDNA依存性T7 RNAポリメラーゼを用いてインビトロで転写する。個々のクローンの経時的な転写効率を評価するため、種々の時点で取った試料を定量的に分析する。
・個々のmRNAの発現解析(インビトロ翻訳、インビトロ発現並びにウエスタンブロット、FACS、及びELISAによる分析。
実施例3:大規模プラスミドDNA産生
各HA抗原(表1を参照)から、1つの一様に成長する予め選択したクローンを取り(グリセロールストック)、振盪フラスコ(100μg/mlアンピシリンを含有する200ml LB培地)において異種プレ培養物(各抗原からのクローンを含有する)を37℃で16時間接種する。100mlの当該のプレ培養物を取り、生産規模の発酵槽(エッペンドルフ(Eppendorf)バイオフロ(BioFlo)415、容積15リットル)に接種する。
実施例4:プラスミドDNA調製及び品質管理
得られた細菌細胞ペレット(実施例3を参照)を用いることにより、市販のエンドトキシン不含プラスミドDNAギガ調製キット(マッハライ・ナーゲル(Macherey Nagel))を使用してプラスミドを調製する。精製後、プラスミドDNA混合物をそのアイデンティティ及び分量に関して次世代シーケンシング(NGS)、qPCR又は制限酵素マッピングによって分析し、各個別の抗原コードプラスミドがそれぞれの量で存在することを確認する。
実施例5:RNAインビトロ転写
DNAプラスミド混合物をEcoRIを用いて酵素的に線状化し、それぞれの緩衝液条件下にヌクレオチド混合物の存在下でDNA依存性T7 RNAポリメラーゼを用いてインビトロで転写する。得られたmRNA混合物をピュアメッセンジャー(登録商標)(PureMessenger(登録商標))(キュアバック(CureVac)、独国テュービンゲン;国際公開第2008/077592 A1号パンフレット)を使用して精製し、インビトロ及びインビボ実験に使用する。
6.1.プロタミンとの製剤化
mRNA混合物は、インビボワクチン接種で使用する前にプロタミンと更に複合体化する。mRNA製剤は、遊離mRNA50%とmRNAがプロタミンと2:1の重量比で複合体化したもの50%との混合物からなる(国際公開第2010/037539号パンフレットによる)。初めに、プロタミン−乳酸リンゲル液をmRNAに加えることにより、mRNAをプロタミンと複合体化する。10分間インキュベートした後、複合体が安定的に生成されたところで遊離mRNAを加え、ワクチンの最終濃度を乳酸リンゲル液で調整する。
イオン化可能なアミノ脂質(カチオン性脂質)、リン脂質、コレステロール及びPEG化脂質を用いて脂質ナノ粒子(LNP)封入mRNA混合物を調製する。LNPは以下のとおり調製する。カチオン性脂質、DSPC、コレステロール及びPEG脂質をエタノール中に可溶化する。簡潔に言えば、mRNA混合物を50mMクエン酸塩緩衝液、pH4中0.05mg/mLの総濃度となるように希釈する。シリンジポンプを使用してエタノール脂質溶液をmRNA混合物と約1:6〜1:2(vol/vol)の比で混合する。次にエタノールを除去し、透析によって外部緩衝液をPBSと交換する。最後に、脂質ナノ粒子を0.2μm細孔滅菌フィルタでろ過する。脂質ナノ粒子の粒子直径サイズをマルバーン・ゼータサイザー・ナノ(Malvern Zetasizer Nano)(マルバーン(Malvern)、英国)を用いた準弾性光散乱によって決定する。
12個の異なるHA pDNAコンストラクト(実施例1により得られた)をDH5α及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))大腸菌(E.coli)株で増殖させて、それらの成長挙動に関して特徴付けた。
インフルエンザ抗原コード配列(配列番号1〜11、13)を有するpDNA(実施例1により得られた)の再形質転換のため、123μl SOC培地を調製し、37℃で維持した。25μlコンピテントセル(DH5α及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標)))を氷上で解凍し、混合し、及び2μLのそれぞれのpDNAを加えた。氷上で30分間インキュベートした後、細胞に42℃で30秒間熱の熱ショックを与えた。次に、細胞を氷上で2分間冷却した。123μL SOC培地を加えた後、細胞を500rpm及び37℃で60分間インキュベートした。その後、細胞を1.5%アガロースLB APSアンピシリン[100mg/L]にプレーティングし、37℃で一晩インキュベートして個別コロニーを成長させた。
クローンの成長特徴をスクリーニングするため、pH及びDOのオプトードを備える48マルチウェルBOHフラワープレートを使用した。DH5α及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))宿主上の本培養物で培養及び成長の特徴付けを実施した。プレ培養物を接種するため、1回の形質転換当たり2つの個別のコロニーを選び取り、別個のウェル内の1.2mL LB APSアンピシリン[100mg/L]に移した。48ウェルフラワープレートを低蒸発性のガス透過性シーリングフォイルで密閉し、バイオレクター(登録商標)(Biolector(登録商標))(m2pラボ(m2p−labs))マイクロバイオリアクターで培養した(条件:37℃;1200rpm振盪数;20.95%O2;85%湿度;ウェルの読取り:サイクル時間10分;バイオマスゲイン25;pO2ゲイン38;pHゲイン22)。OD600が0.4〜0.7に達するまでプレートをインキュベートした。本培養物にプレ培養物を1.1ml LB APSアンピシリン[100mg/L]中0.05〜0.1の最終OD600となるように接種し、コピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))クローンは誘導溶液で更に処理した。全てのクローンが定常期に達するまで、同じ培養セッティングで培養を継続した。pDNA調製用に細胞を回収した。DH5α及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))クローンを特徴付けた後、更なる実験用に1.0の最終OD600の全クローンのグリセロールストックを調製した。図2は、DH5α及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))株について各個別の本培養物の成長特徴を示す。図2は、DH5α及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))株についてpDNAコンストラクト毎の2つの異なるクローンに関するプレ培養物及び本培養物の成長動態の比較を示す。
図2の結果は、DH5α株及びコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))株の両方について、分析した幾つかのクローンが同様の成長特徴を示すことを示している。例えば、DH5αクローンは、潜在的に一緒に培養し得る3つの特徴グループにまとめることができる(g1、g2、g3)。コピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))クローンは、より均衡のとれた均一な成長特徴を示す。これらのクローンは潜在的に一緒にまとめて培養し得る。このデータは、RNAインビトロ転写用のpDNA鋳型混合物を作製するためのクローンの共培養物の作成が実現可能であることを示唆しており、これはRNA作製プロセスを劇的に効率化及び合理化し得る。
実施例8:種々のクローン混合物の共培養及び特徴付け
実施例7の結果に基づき、同様の成長特徴を有するコピーカッター(商標)(CopyCutter(商標))クローンを選択し、それらを使用して種々のインフルエンザ抗原クローンを共培養し、pDNA鋳型混合物を作製した。一つのセットアップでは、共培養に4つの異なるpDNA(「4−mix」)を選択し(A;B;C;D)、もう一つのセットアップでは、共培養に5つの異なるpDNA(「5−mix」)を選択した(A;B;C;D;E);選択したコンストラクトは、RNAレベルで配列長さ、GC含量及び配列類似性の点で高い類似性を示す(表2及び表3を参照)。
図4は、試験したそれぞれのセットアップ(CoInoc戦略、CoStock戦略、4−mix、及び5−mix)に大きな違いが認められなかったことを示しており、それぞれの共培養物の全体的な成長特徴が互いに同等であったことが示唆される。この実験では、CoStock培養レプリケートが極めて均一な成長挙動を示し、試料間のばらつきが極めて小さかった。
この実験の目標は、pDNAカクテルを鋳型として使用したRNAインビトロ転写によってmRNA混合物を1つの反応で作成し得ることを示すことであった。本例では、4−mix及び5−mix RNA混合物を作製した(表2及び表3を参照)。
初めに、mix−4及びmix−5のpDNA(表2を参照)をそれぞれの消化緩衝液中で60μL EcoRI(10U/μL)酵素を使用して別個に線状化した(各200μgのpDNA)。これらの反応物を37℃で4〜5時間インキュベートした。線状化したpDNAをイソプロパノール沈殿を用いて回収した。得られた線状化pDNA試料をWFI中に再溶解し、アガロースゲル電気泳動を用いて線状化の完全性に関して分析した。これらの線状化pDNA鋳型を使用してpDNA mix−4及びmix−5混合物を作成した(各0.09μg/μLの線状化pDNA)。
トリスHCl転写緩衝液中のキャップアナログ(4×GTP)、2500U/mL T7ポリメラーゼ、24mM MgCl2、5U/mLピロホスファターゼ(PPase)、及び0.2U/μLリボロック(Ribolock)を含む配列最適化NTP−mix(13.45mM)の存在下においてそれぞれのmix−4及びmix−5 pDNA混合物(合計25μg/mL DNA)でRNAインビトロ転写を実施した。これらの反応物を37℃でインキュベートした。90分間のインキュベーション時間後、トリスHCl転写緩衝液及びNTPを加え(26.9mM最終NTP濃度)、37℃で更に5時間インキュベートした。その後、DNアーゼI消化を用いてDNA鋳型を除去した。この消化反応を25mM EDTAで停止させ、試料をLiCl沈殿に供した。沈殿したRNAをWFI中に再溶解した。その後RNAアガロースゲル電気泳動を用いてRNAを分析した(図5を参照)。RNA混合物の組成を定量的及び定性的に分析した(図6を参照)。更に、得られたRNA組成物はNGS及びqPCRを用いて特徴付けられる。得られたmRNA混合物は更に実施例6に従い製剤化されてもよい。
RNAアガロースゲル電気泳動(図5Aを参照)から、対照反応(単一RNA調製物)、mix−4反応物及びmix−5反応物についてRNAが同等の量で作製されたことが示された。標準、mix−4及びmix−5について予想されたサイズで定義付けられたバンドが現れた。更に、副産物を決定することはできず、それぞれのデュプリケートにおけるバンド強度のばらつきは認めることができなかった。このデータは、pDNA混合物を鋳型として使用した1つのRNAインビトロ転写反応でのRNA混合物の作成が実現可能であることを実証している。更にこのデータは、このRNAインビトロ反応が予想産物をロバストでクリーンな且つ再現性のある形で生じさせることを実証している。
この実験の目標は、DNA混合物に対するPCRがRNAインビトロ転写用のDNA鋳型混合物の作成に好適かどうかを評価することであった。
PCR鋳型として、4−mix pDNA混合物を使用した(実施例9.1を参照)。WFI中の全ての成分の最終濃度は、1×KAPAハイファイ・ホットスタート・レディミックス(KAPA HiFi HotStart ReadyMix)、1ng 4−mix DNA混合物、1Mベタイン、0.3μM T7フォワードプライマー、及び0.3μMリバースプライマーであった。PCRは市販のサーモサイクラーを使用して実施した。得られたPCR産物混合物をアジェンコート(登録商標)(Agencourt(登録商標))エーエムピュア(登録商標)(AMPure(登録商標))XPキットを(製造者の指示に従い)使用して精製し、4−mix PCR産物に対する制限酵素分析で分析すると、各産物が同程度に増幅されたことが明らかになった(図7を参照)。加えて、NGSを用いてPCR産物を分析した(図9)。
得られた精製4−mix PCR増幅DNA混合物を実施例9.2に記載するとおりのRNAインビトロ転写に使用した。作製されたRNA混合物の組成物をRNAアガロースゲル電気泳動(図8を参照)及びNGS(図9を参照)を用いて定量的及び定性的に分析した。更に、得られたRNA分子組成物はqPCRを用いて特徴付けられる。得られたmRNA混合物は更に実施例6に従い製剤化されてもよい。
図7は、RNAインビトロ転写によるRNA混合物の作製用鋳型として使用することのできるDNA混合物の増幅及び作成にPCRが好適であることを示している。得られた4−mix PCR増幅DNA混合物中には各PCR産物が存在した。
固定化した合成DNAの混合物を有するチップを調製用PCRの鋳型として使用する(DNAチップはツイスト・バイオサイエンス(TWIST bioscience)から入手)。調製用PCRは本質的に実施例10に従い実施する。得られたPCR産物を精製し、RNAインビトロ転写に使用してRNAの混合物を作成し(本質的に実施例10に従い実施する)、定量的及び定性的測定(例えば、RNA AGE、RT−qPCR、NGS、及び分光法)に供する。その後、精製ステップ(例えばピュアメッセンジャー(登録商標)(PureMessenger(登録商標));国際公開第2008077592号パンフレット)、及び任意選択で製剤化ステップ(例えば、プロタミン複合体形成、LNP封入)を実施する。
DNA鋳型を増幅し、増幅されたDNAを閉じた線状の「ドギーボーン」DNA(dbDNA)に変換するインビトロ無細胞プロセスを行い、続くRNAインビトロ転写用のDNA混合物を作成する。ローリングサークルDNA鋳型増幅及びdbDNAの作成は、国際公開第2010/086626号パンフレットに従い実施する。得られたdbDNA鋳型を適切な制限酵素(例えばEcoRI)を使用して個別に線状化し、精製して混合することにより、線状化鋳型混合物(例えば、mix−4、mix−5;例えば表2を参照)を作成する。これらの線状化鋳型混合物を使用してRNAインビトロ転写し(本質的に実施例9に従い実施する)、定量的及び定性的測定(例えば、RNA AGE、RT−qPCR、NGS、及び分光法)に供する。その後、精製ステップ(例えばピュアメッセンジャー(登録商標)(PureMessenger(登録商標));国際公開第2008077592号パンフレット)及び任意選択で製剤化ステップ(例えば、プロタミン複合体形成、LNP封入)を実施する。
Claims (29)
- n個の異なるRNA分子種を含むリボ核酸(RNA)分子組成物を作製する方法であって、前記組成物が、同一量または20%以下で異なる同様量であるn個の異なる前記RNA分子種を含み、以下のステップ:
a)単一の反応槽におけるm個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の混合物の同時RNAインビトロ転写ステップであって、前記m個の異なるDNA分子種の各々が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードし、それにより前記n個の異なるRNA分子種が作成され、前記m個のDNA分子種の各々の量が同一であるか20%以下で異なる、ステップ、及び
b)ステップa)で作成されたn個の異なるRNA分子種を含む前記RNA分子組成物を得るステップを含み、
nは少なくとも2の整数であり、mは少なくとも2の整数であり、mはnと同一であり、前記RNA分子種がmRNA分子種である、方法。 - ステップa)の前に、
c1)細菌増幅を用いて前記m個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、
c2)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いて前記m個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、
c3)化学的DNA合成を用いて前記m個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、及び
c4)酵素増幅を用いて前記m個の異なるDNA分子種の混合物を作成するステップ、の少なくとも1つを更に含む、請求項1に記載の方法。 - ステップc1)が、
d)細菌細胞培養物をm個の異なるDNAプラスミド種の混合物のうちの少なくとも1つの単一DNAプラスミド種で形質転換するステップであって、各DNAプラスミド種が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードするステップを含む、請求項2に記載の方法。 - ステップc1)が、
d1)m個の単一細菌細胞培養物を各々、前記m個の異なるDNAプラスミド種のうちの単一DNAプラスミド種で形質転換するステップであって、前記単一DNAプラスミド種が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードするステップ、又は
d2)単一細菌細胞培養物をm個の異なるDNAプラスミド種の混合物で形質転換するステップであって、各DNAプラスミド種が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードするステップを含む、請求項3に記載の方法。 - e)前記m個の異なるDNAプラスミド種の混合物の各DNAプラスミド種につき少なくとも1つの単一細菌細胞クローンを単離するステップ、及び
f)ステップe)で単離した前記少なくとも1つの単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞クローン培養物において成長させるステップを更に含む、請求項3又は4に記載の方法。 - ステップd1)の後に、以下のステップ:
e1)ステップd1)で形質転換した前記m個の単一細菌細胞培養物の各々の少なくとも1つの単一細菌細胞クローンを単離するステップ、
f1)ステップe1)で単離した前記単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞培養物において成長させるステップ、
g1)ステップf1)で成長させた前記細菌細胞クローン培養物の各々の前記DNAプラスミド種のアイデンティティを決定するステップ、
h1)前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき少なくとも1つの細菌細胞クローン培養物を選択するステップを更に含む、請求項4に記載の方法。 - ステップd2)の後に、以下のステップ:
e2)少なくともm個の単一細菌細胞クローンを単離するステップ、及び
f2)ステップe2)で単離した前記少なくともm個の単一細菌細胞クローンの各々を別個の細菌細胞クローン培養物において成長させるステップ、
g2)ステップf2)で成長させた前記少なくともm個の単一細菌細胞クローン培養物の各々の前記DNAプラスミド種のアイデンティティを決定するステップ、
h2)前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物を選択するステップを更に含む、請求項4に記載の方法。 - i)前記少なくとも1つの単一細菌細胞クローン培養物の少なくとも1つの成長動態パラメータ及びプラスミドDNAの量の少なくとも一方を決定するステップ、及び
j)前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々につき1つ以上の細菌細胞クローン培養物をステップi)で決定された前記パラメータに応じて選択するステップを更に含む、請求項5〜7のいずれか一項に記載の方法。 - ステップi)が、
i1)ある時間間隔後に前記細菌細胞クローン培養物の光学濃度を測定することによって成長動態パラメータを決定するステップ、及び
i2)細菌細胞培養物の容積及び時間当たりに産生されたプラスミドの量を決定するステップ、の少なくとも一方を含む、請求項8に記載の方法。 - 前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々について前記選択された1つ以上の細菌細胞クローン培養物が、同様又は同一の成長動態及び同様又は同一のDNA産生レベルの少なくとも一方を呈する、請求項8又は9に記載の方法。
- ステップc1)が、
k1)ステップj)で前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々について選択された前記1つ以上の細菌細胞クローン培養物のうちの少なくとも1つのある量を単一の反応槽において接種して成長させるステップ、又は
k2)ステップj)で前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々について選択された前記1つ以上の細菌細胞クローン培養物のうちの少なくとも1つのある量を前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々について別個の1つ以上の反応槽において接種して成長させるステップを更に含む、請求項8〜10のいずれか一項に記載の方法。 - 等量の各細菌細胞クローン培養物を接種する、請求項11に記載の方法。
- ステップk1又はk2)で接種に使用される各細菌細胞クローン培養物の量が、前記m個の異なるDNAプラスミド種の各々が等しい又は同様の量で得られるように選択される、請求項11又は12に記載の方法。
- ステップc1)が、
l)ステップk1)及びk2)の少なくとも一方で成長させた前記細菌細胞クローン培養物の前記m個の異なるDNAプラスミド種を得るステップ、
m)ステップl)で得られた前記m個の異なるDNAプラスミド種を線状化するステップ、及び
n)前記m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の混合物を得るステップ
を更に含む、請求項11〜13のいずれか一項に記載の方法。 - ステップa)の前に、
o)前記m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の各々の転写効率パラメータを決定するステップを更に含む、請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。 - 前記RNA分子組成物中の前記n個の異なるRNA分子種の各々の量が、前記m個の異なるDNA分子種の混合物中の対応するDNA分子種の量に比例する又は少なくとも90%比例する、請求項1〜15のいずれか一項に記載の方法。
- ステップb)が、
p)前記n個の異なるRNA分子種を精製するステップ
を含む、請求項1〜16のいずれか一項に記載の方法。 - q)ステップb)で得られた前記RNA分子組成物を定性的及び定量的の少なくとも一方で分析するステップを更に含む、請求項1〜17のいずれか一項に記載の方法。
- 前記m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種のDNA配列が互いに少なくとも80%同一である、請求項1〜18のいずれか一項に記載の方法。
- 前記m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の前記DNAプラスミド種が同じプラスミド骨格を有する、請求項3〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の前記DNAプラスミド種のオープンリーディングフレームが互いに少なくとも80%同一である、請求項3〜14及び20のいずれか一項に記載の方法。
- 前記m個の異なるデオキシリボ核酸(DNA)分子種の前記DNAプラスミド種のオープンリーディングフレームが、その長さのばらつきが最大で100又は50ヌクレオチドである、請求項3〜14及び21のいずれか一項に記載の方法。
- 前記n個の異なるRNA分子種のRNA配列が互いに少なくとも80%同一である、請求項1〜22のいずれか一項に記載の方法。
- 前記m個の異なるDNA分子種の各々が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードし、前記n個の異なるRNA分子種の各々が、ある病原体の異なる血清型又は株の抗原、異なるアレルゲン、異なる自己免疫抗原、ある病原体の異なる抗原、異なるアジュバントタンパク質、癌又は腫瘍抗原の異なるアイソフォーム又は変異体、1人の患者の異なる腫瘍抗原、タンパク質又はタンパク質群の異なるエピトープを標的とする抗体群の中の1つの抗体、ある代謝経路の異なるタンパク質、対象の欠陥であるタンパク質群の中の単一のタンパク質、又はある分子療法用タンパク質の異なるアイソフォームをコードする、請求項1〜23のいずれか一項に記載の方法。
- 前記病原体が、ウイルス、細菌、プリオン、真菌、原生動物、ウイロイド、及び寄生虫からなる群から選択される、請求項24に記載の方法。
- 前記病原体が、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)、アナプラズマ属(Anaplasma)、アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum)、ブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense)、ズビニ鉤虫(Ancylostoma duodenale)、溶血性アルカノバクテリア(Arcanobacterium haemolyticum)、回虫(Ascaris lumbricoides)、アスペルギルス属(Aspergillus)、アストロウイルス科(Astroviridae)、バベシア属(Babesia)、炭疽菌(Bacillus anthracis)、セレウス菌(Bacillus cereus)、バルトネラ・ヘンセラ菌(Bartonella henselae)、BKウイルス、ヒトブラストシスチス(Blastocystis hominis)、ブラストミセス・デルマチチジス(Blastomyces dermatitidis)、百日咳菌(Bordetella pertussis)、ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)、ボレリア属(Borrelia)、ボレリア属種(Borrelia spp)、ブルセラ属(Brucella)、マレー糸状虫(Brugia malayi)、ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)、バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)及び他のバークホルデリア属(Burkholderia)種、鼻疽菌(Burkholderia mallei)、類鼻疽菌(Burkholderia pseudomallei)、カリシウイルス科(Caliciviridae)、カンピロバクター属(Campylobacter)、カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ属種(Candida spp)、トラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)、肺炎クラミジア(Chlamydophila pneumoniae)、オウム病クラミジア(Chlamydophila psittaci)、CJDプリオン、肝吸虫(Clonorchis sinensis)、ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)、クロストリジウム・ディフィシル(Clostridium difficile)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、クロストリジウム属種(Clostridium spp)、破傷風菌(Clostridium tetani)、コクシジオイデス属種(Coccidioides spp)、コロナウイルス類、ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheriae)、Q熱コクシエラ(Coxiella burnetii)、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium)、サイトメガロウイルス(CMV)、デングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)、二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)、エボラウイルス(EBOV)、エキノコックス属(Echinococcus)、エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)、エーリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)、エーリキア属(Ehrlichia)、赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)、エンテロコッカス属(Enterococcus)、エンテロウイルス属(Enterovirus)、エンテロウイルス類、主にコクサッキーA型ウイルス及びエンテロウイルス71型(EV71)、エピデルモフィトン属種(Epidermophyton spp)、エプスタイン・バーウイルス(EBV)、大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111及びO104:H4、肝蛭(Fasciola hepatica)及び巨大肝蛭(Fasciola gigantica)、FFIプリオン、フィラリア上科(Filarioidea)、フラビウイルス類、野兎病菌(Francisella tularensis)、フゾバクテリウム属(Fusobacterium)、ゲオトリクム・カンジドゥム(Geotrichum candidum)、ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)、顎口虫属種(Gnathostoma spp)、GSSプリオン、グアナリトウイルス、軟性下疳菌(Haemophilus ducreyi)、インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)、ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ヘニパウイルス(ヘンドラウイルス、ニパウイルス)、A型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス(HBV)、C型肝炎ウイルス(HCV)、D型肝炎ウイルス、E型肝炎ウイルス、単純ヘルペスウイルス1型及び2型(HSV−1及びHSV−2)、ヒストプラズマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)、ヒトボカウイルス(HBoV)、ヒトヘルペスウイルス6型(HHV−6)及びヒトヘルペスウイルス7型(HHV−7)、ヒトメタニューモウイルス(hMPV)、ヒトパピローマウイルス(HPV)、ヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)、日本脳炎ウイルス、JCウイルス、フニンウイルス、キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)、クレブシエラ・グラヌロマティス(Klebsiella granulomatis)、クーループリオン、ラッサウイルス、レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、リーシュマニア属(Leishmania)、レプトスピラ属(Leptospira)、リステリア菌(Listeria monocytogenes)、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)、マチュポウイルス、マラセジア属種(Malassezia spp)、マールブルグウイルス、麻疹ウイルス、横川吸虫(Metagonimus yokagawai)、微胞子虫門(Microsporidia)、伝染性軟属腫ウイルス(MCV)、ムンプスウイルス、らい菌(Mycobacterium leprae)及びマイコバクテリウム・レプロマトシス(Mycobacterium lepromatosis)、結核菌(Mycobacterium tuberculosis)、マイコバクテリウム・ウルセランス(Mycobacterium ulcerans)、肺炎マイコプラズマ(Mycoplasma pneumoniae)、フォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)、アメリカ鉤虫(Necator americanus)、淋菌(Neisseria gonorrhoeae)、髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)、ノカルジア・アステロイデス(Nocardia asteroides)、ノカルジア属種(Nocardia spp)、回旋糸状虫(Onchocerca volvulus)、ツツガムシ病リケッチア(Orientia tsutsugamushi)、オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)(インフルエンザ)、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、肺吸虫属種(Paragonimus spp)、ウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)、パルボウイルスB19、パスツレラ属(Pasteurella)、プラスモジウム属(Plasmodium)、ニューモシスチス・イロベチ(Pneumocystis jirovecii)、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、ライノウイルス、ライノウイルス類、痘瘡リケッチア(Rickettsia akari)、リケッチア属(Rickettsia)、発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、ロッキー山紅斑熱リケッチア(Rickettsia rickettsii)、発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)、リフトバレー熱ウイルス、ロタウイルス、風疹ウイルス、サビアウイルス、サルモネラ属(Salmonella)、ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)、SARSコロナウイルス類、住血吸虫属(Schistosoma)、赤痢菌属(Shigella)、シンノンブレウイルス、ハンタウイルス、スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)、ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)、肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)、化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)、糞線虫(Strongyloides stercoralis)、テニア属(Taenia)、有鉤条虫(Taenia solium)、ダニ媒介性脳炎ウイルス(TBEV)、イヌ回虫(Toxocara canis)又はネコ回虫(Toxocara cati)、トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii)、梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)、旋毛虫(Trichinella spiralis)、膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)、白癬菌属種(Trichophyton spp)、鞭虫(Trichuris trichiura)、ブルーストリパノソーマ(Trypanosoma brucei)、クルーズトリパノソーマ(Trypanosoma cruzi)、ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)、大痘瘡又は小痘瘡、vCJDプリオン、ベネズエラウマ脳炎ウイルス、コレラ菌(Vibrio cholerae)、ウエストナイルウイルス、西部ウマ脳炎ウイルス、バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)、黄熱病ウイルス、腸炎エルシニア(Yersinia enterocolitica)、ペスト菌(Yersinia pestis)、及び偽結核菌(Yersinia pseudotuberculosis)からなる群から選択される、請求項25に記載の方法。
- 前記m個の異なるDNA分子種の各々が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードし、前記n個の異なるRNA分子種の各々が、アシネトバクター・バウマンニ(Acinetobacter baumannii)及びアシネトバクター感染症のインフルエンザ赤血球凝集素、インフルエンザノイラミニダーゼ、インフルエンザ核タンパク質、コロナウイルス糖タンパク質、前立腺特異抗原、外膜タンパク質A OmpA、バイオフィルム関連タンパク質Bap、輸送タンパク質MucK;ブルーストリパノソーマ(Trypanosoma brucei)の可変表面糖タンパク質(VSG)、微小管結合タンパク質MAPP15、トランスシアリダーゼ(TSA);HIVのHIV p24抗原、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)エンベロープタンパク質Gp120、Gp41、及びGp160、ポリタンパク質GAG、陰性因子タンパク質Nef、転写トランス活性化因子(Tat);赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)のガラクトース阻害性接着タンパク質(GIAP)、29kDa抗原Eh29、Gal/GalNAcレクチン、タンパク質CRT、125kDa免疫優性抗原、タンパク質M17、アドヘシンADH112及びタンパク質STIRP;アナプラズマ属(Anaplasma)の主要表面タンパク質1〜5(MSP1a、MSP1b、MSP2、MSP3、MSP4、MSP5)、IV型分泌系(secreotion system)タンパク質(VirB2、VirB7、VirB11、VirD4);炭疽菌(Bacillus anthracis)の防御抗原PA、浮腫因子EF、致死因子LF、S層相同性タンパク質(SLH);溶血性アルカノバクテリア(Arcanobacterium haemolyticum)のアクラノリシン(acranolysin)、ホスホリパーゼD、コラーゲン結合タンパク質CbpA;フニンウイルスのヌクレオカプシドタンパク質(NP)、糖タンパク質前駆体GPC、糖タンパク質GP1、糖タンパク質GP2;回虫(Ascaris lumbricoides)のキチンタンパク質層タンパク質、14kDa表面抗原(suarface antigen)A14、主要精子タンパク質(MSP)、MSP重合オーガナイズタンパク質(MPOP)、MSP線維タンパク質2(MFP2)、MSP重合活性化キナーゼ(MPAK)、ABA−1様タンパク質(ALB)、タンパク質ABA−1、クチクリン(CUT−1);アスペルギルス属(Aspergillus)の41kDaアレルゲンAsp v13、アレルゲンAsp f3、主要分生子表面タンパク質ロッドレットA、プロテアーゼPep1p、GPIアンカー型タンパク質Gel1p、GPIアンカー型タンパク質Crf1p;アストロウイルス科(Astroviridae)のファミリーVP26タンパク質、VP29タンパク質;バベシア属(Babesia)の桿小体結合タンパク質1(RAP−1)、メロゾイト表面抗原MSA−1、MSA−2(a1、a2、b、c)、12D3、11C5、21B4、P29、変異赤血球表面抗原VESA1、頂端膜抗原1(AMA−1);セレウス菌(Bacillus cereus)の溶血毒素、エンテロトキシンC、PXO1−51、グリコール酸オキシダーゼ、ABCトランスポーター、ペニシリン結合(penicillin−bingdn)タンパク質、亜鉛トランスポーターファミリータンパク質、プソイドウリジンシンターゼRsu、プラスミド複製タンパク質RepX、オリゴエンドペプチダーゼF、プロファージ膜タンパク質、タンパク質HemK、鞭毛抗原H、28.5kDa細胞表面抗原;BKウイルスのラージT抗原LT、スモールT抗原、カプシドタンパク質VP1、カプシドタンパク質VP2;ヒトブラストシスチス(Blastocystis hominis)の29kDaタンパク質、カスパーゼ−3様抗原、糖タンパク質類;ブラストミセス・デルマチチジス(Blastomyces dermatitidis)の酵母表面アドヘシンWI−1;マチュポウイルスの核タンパク質N、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質Z、糖タンパク質(GP);ボレリア属(Borrelia)の細胞表層タンパク質A(OspA)、細胞表層タンパク質B(OspB)、細胞表層タンパク質C(OspC)、デコリン結合タンパク質A(DbpA)、デコリン結合タンパク質B(DbpB)、鞭毛繊維41kDaコアタンパク質Fla、塩基性膜タンパク質A前駆体(BmpA)(免疫優勢抗原P39)、表層22kDaリポタンパク質前駆体(抗原IPLA7)、変異性表層リポタンパク質vlsE;ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)のボツリヌス神経毒素BoNT/A1、BoNT/A2、BoNT/A3、BoNT/B、BoNT/C、BoNT/D、BoNT/E、BoNT/F、BoNT/G、組換えボツリヌス毒素F Hcドメイン(FHc);サビアウイルスのヌクレオカプシド、糖タンパク質前駆体;ブルセラ属(Brucella)の銅/亜鉛スーパーオキシドジスムターゼ(SodC)、バクテリオフェリチン(Bfr)、50Sリボソームタンパク質RplL、OmpA様膜貫通ドメイン含有タンパク質Omp31、免疫原性39kDaタンパク質M5 P39、亜鉛ABCトランスポーターペリプラズム亜鉛結合タンパク質(zinc−bnding protein)znuA、ペリプラズム免疫原性タンパク質Bp26、30Sリボソームタンパク質S12 RpsL、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼギャップ、25kDa外膜免疫原性タンパク質前駆体Omp25、侵入タンパク質B lalB、トリガー因子Tig、分子シャペロンDnaK、推定ペプチジル−プロリルシス−トランスイソメラーゼSurA、リポタンパク質Omp19、外膜タンパク質MotY Omp16、保存外膜タンパク質D15、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ(Mdh)、IV型分泌系(T4SS)の成分VirJ、未知機能のリポタンパク質BAB1_0187;バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)及び他のバークホルデリア属(Burkholderia)種のABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A(BimA)、細菌伸長因子−Tu(EF−Tu)、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質、boaBコードタンパク質;マイコバクテリウム・ウルセランス(Mycobacterium ulcerans)のミコリルトランスフェラーゼAg85A、熱ショックタンパク質65(Hsp65)、タンパク質TB10.4、19kDa抗原、タンパク質PstS3、熱ショックタンパク質70(Hsp70);カリシウイルス科(Caliciviridae)、ノロウイルス及びサポウイルスのノロウイルスメジャー及びマイナーウイルスカプシドタンパク質VP1及びVP2、ゲノムポリタンパク質、サポウイルスカプシドタンパク質VP1、タンパク質Vp3、ゲノムポリタンパク質(geome polyprotein);カンピロバクター属(Campylobacter)の主要外膜タンパク質PorA、フラジェリンFlaA、表面抗原CjaA、フィブロネクチン結合タンパク質CadF、アスパラギン酸/グルタミン酸結合ABCトランスポータータンパク質Peb1A、タンパク質FspA1、タンパク質FspA2;カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)及び他のカンジダ属(Candida)種の解糖酵素エノラーゼ、分泌型アスパルチルプロテイナーゼSAP1−10、グリコホスファチジルイノシトール(GPI)結合細胞壁タンパク質、タンパク質Hyr1、補体受容体3関連タンパク質(CR3−RP)、アドヘシンAls3p、熱ショックタンパク質90kDa(Hsp90)、細胞表面疎水性タンパク質(CSH);バルトネラ・ヘンセラ菌(Bartonella henselae)の17kDa抗原、タンパク質P26、三量体オートトランスポーターアドヘシンTAA、バルトネラ属(Bartonella)アドヘシンA BadA、可変発現外膜タンパク質Vomps、タンパク質Pap3、タンパク質HbpA、エンベロープ結合プロテアーゼHtrA、タンパク質OMP89、タンパク質GroEL、タンパク質LalB、タンパク質OMP43、ジヒドロリポアミドスクシニルトランスフェラーゼSucB;クルーズトリパノソーマ(Trypanosoma cruzi)のアマスチゴート表面タンパク質−2、アマスチゴート特異的表面タンパク質SSP4、クルジパイン、トランスシアリダーゼTS、トリポマスチゴート表面糖タンパク質TSA−1、補体調節タンパク質CRP−10、タンパク質G4、タンパク質G2、パラキソネマルロッドタンパク質(paraxonemal rod protein)PAR2、パラフラジェラーロッド成分(paraflagellar rod component)Par1、ムチン結合表面タンパク質MPSP;水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)のエンベロープ糖タンパク質(gB、gC、gE、gH、gI、gK、gL);トラコーマクラミジア(Chlamydia trachomatis)の主要外膜タンパク質MOMP、推定外膜タンパク質PMPC、外膜複合タンパク質B OmcB、熱ショックタンパク質Hsp60及びHSP10、タンパク質IncA、III型分泌装置からのタンパク質、リボヌクレオチド還元酵素スモール鎖タンパク質NrdB、プラスミドタンパク質Pgp3、クラミジア外膜タンパク質N(CopN)、抗原CT521、抗原CT425、抗原CT043、抗原TC0052、抗原TC0189、抗原TC0582、抗原TC0660、抗原TC0726、抗原TC0816、抗原TC0828;肺炎クラミジア(Chlamydophila pneumoniae)、肺炎クラミジア感染症の低カルシウム応答タンパク質E(LCrE)、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼPknD、アシルキャリアータンパク質S−マロニルトランスフェラーゼFabD、一本鎖DNA結合タンパク質Ssb、主要外膜タンパク質(MOMP)、外膜タンパク質2(Omp2)、多形膜タンパク質ファミリー;コレラ菌(Vibrio cholerae)のコレラ毒素B(CTB)、毒素共調節ピリンA(TcpA)、毒素共調節ピリン(TcpF)、毒素共調節線毛生合成タンパク質F(TcpF)、コレラエンテロトキシンサブユニットA、コレラエンテロトキシンサブユニットB、耐熱性エンテロトキシンST、マンノース感受性赤血球凝集素(MSHA)、外膜タンパク質Uポーリン(ompU)、ポーリングBタンパク質(Poring B protein)、多形膜タンパク質−D;肝吸虫(Clonorchis sinensis)のプロピオニル−CoAカルボキシラーゼPCC、14−3−3タンパク質、プロヒビチン、システインプロテアーゼ類、グルタチオントランスフェラーゼ類、ゲルゾリン、カテプシンLプロテイナーゼCatL、テグメントタンパク質20.8kDa TP20.8、テグメントタンパク質31.8kDa TP31.8、リゾホスファチジン酸ホスファターゼLPAP;クロストリジウム・ディフィシル(Clostridium difficile)の表層タンパク質SLP、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ抗原GDH、毒素A、毒素B、システインプロテアーゼCwp84、システインプロテアーゼCwp13、システインプロテアーゼCwp19、細胞壁タンパク質CwpV、鞭毛タンパク質FliC、鞭毛タンパク質FliD;ライノウイルス類及びコロナウイルス類のライノウイルスカプシドタンパク質VP1、VP2、VP3、VP4;コロナウイルススパイクタンパク質(sprike protein)S、エンベロープタンパク質E、膜タンパク質M、ヌクレ
オカプシドタンパク質N;プリオンタンパク質Prp(CJDプリオン);クリミア・コンゴ出血熱ウイルスのエンベロープタンパク質Gc、エンベロープタンパク質Gn、ヌクレオカプシドタンパク質;クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)のビルレンス関連DEADボックスRNAヘリカーゼVAD1、ガラクトキシロマンナンタンパク質GalXM、グルクロノキシロマンナンGXM、マンノプロテインMP;クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium)の酸性リボソームタンパク質P2 CpP2、ムチン抗原Muc1、Muc2、Muc3Muc4、Muc5、Muc6、Muc7、表面接着タンパク質CP20、表面接着タンパク質CP23、表面タンパク質CP12、表面タンパク質CP21、表面タンパク質CP40、表面タンパク質CP60、表面タンパク質CP15、表面関連グリコペプチドgp40、表面関連グリコペプチドgp15、オーシスト壁タンパク質AB、プロフィリンPRF、アピラーゼ;ブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense)及びその他の皮膚幼虫移行症(CLM)病原体の脂肪酸及びレチノール結合タンパク質−1(FAR−1)、メタロプロテイナーゼ組織阻害因子(TIMP)、システインプロテイナーゼACEY−1、システインプロテイナーゼACCP−1、表面抗原Ac−16、分泌タンパク質2 ASP−2、メタロプロテアーゼ1MTP−1、アスパルチルプロテアーゼ阻害因子API−1、表面関連抗原SAA−1、成体特異的分泌第Xa因子セリンプロテアーゼ阻害因子抗凝固薬AP、カテプシンD様アスパラギン酸プロテアーゼARR−1;有鉤条虫(Taenia solium)のカテプシンL様プロテアーゼ、53/25kDa抗原、8kDaファミリーメンバー、辺縁トリプシン様活性を有する嚢虫タンパク質TsAg5、六鉤幼虫タンパク質TSOL18、六鉤幼虫タンパク質TSOL45−1A、乳酸デヒドロゲナーゼA LDHA、乳酸デヒドロゲナーゼB LDHB;サイトメガロウイルス(CMV)のpp65抗原、膜タンパク質pp15、カプシド基部テグメントタンパク質pp150、タンパク質M45、DNAポリメラーゼUL54、ヘリカーゼUL105、糖タンパク質gM、糖タンパク質gN、糖タンパク質H、糖タンパク質B gB、タンパク質UL83、タンパク質UL94、タンパク質UL99;デングウイルス類(DEN−1、DEN−2、DEN−3及びDEN−4)−フラビウイルス類のカプシドタンパク質C、プレ膜タンパク質prM、膜タンパク質M、エンベロープタンパク質E(ドメインI、ドメインII、ドメインII)、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質NS2B、タンパク質NS3、タンパク質NS4A、タンパク質2K、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)の39kDaタンパク質;ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheriae)のジフテリア毒素前駆体Tox、ジフテリア毒素DT、ピリン特異的ソルターゼSrtA、シャフトピリンタンパク質SpaA、先端ピリンタンパク質SpaC、マイナーピリンタンパク質SpaB、表面結合タンパク質DIP1281;エボラウイルス(EBOV)の糖タンパク質GP、核タンパク質NP、マイナーマトリックスタンパク質VP24、メジャーマトリックスタンパク質VP40、転写活性化因子VP30、ポリメラーゼ補因子VP35、RNAポリメラーゼL;プリオンタンパク質(vCJDプリオン、vCJD、nvCJD);軟性下疳菌(Haemophilus ducreyi)のUvrABC系タンパク質B、タンパク質Flp1、タンパク質Flp2、タンパク質Flp3、タンパク質TadA、ヘモグロビン受容体HgbA、外膜タンパク質TdhA、タンパク質CpsRA、調節因子CpxR、タンパク質SapA、18kDa抗原、外膜タンパク質NcaA、タンパク質LspA、タンパク質LspA1、タンパク質LspA2、タンパク質LspB、外膜成分DsrA、レクチンDltA、リポタンパク質Hlp、主要外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質OmpA2;コクシジオイデス・イミチス(Coccidioides immitis)及びコクシジオイデス・ポサダシ(Coccidioides posadasii)のアスパルチルプロテアーゼ1 Pep1、ホスホリパーゼB PLB、α−マンノシダーゼ1 AMN1、グルカノシルトランスフェラーゼGEL1、ウレアーゼURE、ペルオキシソームマトリックスタンパク質Pmp1、プロリンリッチ抗原Pra、ヒトT細胞応答性タンパク質(humal T−cell reative protein)TcrP;白癬菌属種(Trichophyton spp)、エピデルモフィトン属種(Epidermophyton spp.)、マラセジア属種(Malassezia spp.)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)のアレルゲンTri r 2、熱ショックタンパク質60 Hsp60、真菌アクチンAct、抗原Tri r2、抗原Tri r4、抗原Tri t1、タンパク質IV、グリセロール−3−リン酸デヒドロゲナーゼGpd1、浸透圧センサHwSho1A、浸透圧センサHwSho1B、ヒスチジンキナーゼHwHhk7B、アレルゲンMala s 1、アレルゲンMala s 11、チオレドキシンTrx Mala s 13、アレルゲンMala f、アレルゲンMala s;エキノコックス属(Echinococcus)のタンパク質EG95、タンパク質EG10、タンパク質EG18、タンパク質EgA31、タンパク質EM18、抗原EPC1、抗原B、抗原5、タンパク質P29、タンパク質14−3−3、8kDaタンパク質、ミオフィリン(myophilin)、熱ショックタンパク質20(HSP20)、糖タンパク質GP−89、脂肪酸結合タンパク質FAPB;エーリキア属(Ehrlichia)の主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質;エンテロコッカス属(Enterococcus)の分泌抗原SagA、sagA様タンパク質SalA及びSalB、コラーゲンアドヘシンScm、表面タンパク質Fms1 EbpA(fm)、Fms5 EbpB(fm)、Fms9 EpbC(fm)及びFms10、タンパク質EbpC(fm)、96kDa免疫保護糖タンパク質G1;エンテロウイルス属(Enterovirus)のゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C;外膜タンパク質OM、60kDa外膜タンパク質、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、134kDa外膜タンパク質、31kDa外膜タンパク質、29.5kDa外膜タンパク質、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質Adr1(RP827)、細胞表面タンパク質Adr2(RP828)、細胞表面タンパク質SCA1、侵入タンパク質invA、細胞分裂タンパク質fts、secファミリーの分泌タンパク質、ビルレンスタンパク質virB、tlyA、tlyC、パルブリン様タンパク質Plp、プレタンパク質トランスロカーゼSecA、120kDa表面タンパク質抗原SPA、138kD複合抗原、主要100kDタンパク質(タンパク質I)、細胞質内タンパク質D、防御表面タンパク質抗原SPA(発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、発疹チフス);エプスタイン・バーウイルス(EBV)のエプスタイン・バー核抗原(EBNA−1、EBNA−2、EBNA−3A、EBNA−3B、EBNA−3C、EBNA−リーダータンパク質(EBNA−LP))、潜伏性膜タンパク質(LMP−1、LMP−2A、LMP−2B)、早期抗原EBV−EA、膜抗原EBV−MA、ウイルスカプシド抗原EBV−VCA、アルカリ性ヌクレアーゼEBV−AN、糖タンパク質H、糖タンパク質gp350、糖タンパク質gp110、糖タンパク質gp42、糖タンパク質gHgL、糖タンパク質gB;パルボウイルスB19のカプシドタンパク質(cpasid protein)VP2、カプシドタンパク質VP1、主要タンパク質NS1;ヒトヘルペスウイルス6型(HHV−6)及びヒトヘルペスウイルス7型(HHV−7)のpp65抗原、糖タンパク質105、主要カプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質H、タンパク質U51;肝蛭(Fasciola hepatica)及び巨大肝蛭(Fasciola gigantica)のチオレドキシングルタチオンレダクターゼTGR、カテプシンL1及びL2、Kunitz型タンパク質KTM、ロイシンアミノペプチダーゼLAP、システインプロテイナーゼFas2、サポシン様タンパク質−2 SAP−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPx、Prx−1、Prx−2、カテプシンlシステインプロテイナーゼCL3、プロテアーゼカテプシンL CL1、ホスホグリセリン酸キナーゼPGK、27kDa分泌タンパク質、60kDaタンパク質HSP35α、グルタチオントランスフェラーゼGST、28.5kDa外被抗原28.5kDa TA、カテプシンB3プロテアーゼCatB3、I型シスタチンステフィン−1、カテプシンL5、カテプシンL1g及びカテプシンB、脂肪酸結合タンパク質FABP、ロイシンアミノペプチダーゼLAP;プリオンタンパク質FFIプリオン;フィラリア上科(Filarioidea)の毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、Cox−2;ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)のホスホリパーゼC PLC、易熱性エンテロトキシンB、イオタ毒素成分Ib、タンパク質CPE1281、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼ、伸長因子G EF−G、パーフリンゴリジンO Pfo、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGapC、フルクトース二リン酸アルドラーゼAlf2、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)エンテロトキシンCPE、アルファ毒素AT、αトキソイドATd、εトキソイドETd、タンパク質HP、大型細胞毒TpeL、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼNaglu、ホスホグリセロムターゼPgm;フゾバクテリウム属(Fusobacteri
um)のロイコトキシンlktA、付着FadA、外膜タンパク質RadD、高分子量アルギニン結合タンパク質;ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)及び他のクロストリジウム属(Clostridium)種のホスホリパーゼC PLC、易熱性エンテロトキシンB、イオタ毒素成分Ib、タンパク質CPE1281、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼ、伸長因子G EF−G、パーフリンゴリジンO Pfo、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGapC、フルクトース二リン酸アルドラーゼAlf2、ウェルシュ菌(Clostridium perfringens)エンテロトキシンCPE、アルファ毒素AT、αトキソイドATd、εトキソイドETd、タンパク質HP、大型細胞毒TpeL、エンド−β−N−アセチルグルコサミニダーゼNaglu、ホスホグリセロムターゼPgm;ゲオトリクム・カンジドゥム(Geotrichum candidum)のリパーゼA、リパーゼB、ペルオキシダーゼDec1;プリオンタンパク質GSSプリオン;ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)の嚢胞壁タンパク質CWP1、CWP2、CWP3、変異表面タンパク質VSP、VSP1、VSP2、VSP3、VSP4、VSP5、VSP6、56kDa抗原、ピルビン酸フェレドキシンオキシドレダクターゼPFOR、アルコールデヒドロゲナーゼE ADHE、α−ジアルジン、α8−ジアルジン、α1−ジアルジン(alpha1−guiardin)、β−ジアルジン、システインプロテアーゼ、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、アルギニンデイミナーゼADI、フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼ(bisphosphat aldolase)FBA、ジアルジア・トロフォゾイテス(Giardia trophozoites)抗原GTA(GTA1、GTA2)、オルニチンカルボキシルトランスフェラーゼOCT、ストライエイトファイバーセンブリン様タンパク質(striated fiber−asseblin−like protein)SALP、ウリジンホスホリル様タンパク質UPL、α−チューブリン、β−チューブリン;鼻疽菌(Burkholderia mallei)のABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A BimA、細菌伸長因子−Tu EF−Tu、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質;有棘顎口虫(Gnathostoma spinigerum)及び剛棘顎口虫(Gnathostoma hispidum)のシクロフィリンCyP、24kDa第三期幼虫タンパク質(third−stage larvae protien)GS24、排出−分泌産物ESP(40、80、120及び208kDa);淋菌(Neisseria gonorrhoeae)のピリンタンパク質、マイナーピリン関連サブユニットpilC、メジャーピリンサブユニット及び変異体pilE、pilS、相変異タンパク質porA、ポーリンB PorB、タンパク質TraD、ナイセリア外膜抗原H.8、70kDa抗原、主要外膜タンパク質PI、外膜タンパク質PlA及びPlB、W抗原、表面タンパク質A NspA、トランスフェリン結合タンパク質TbpA、トランスフェリン結合タンパク質TbpB、PBP2、mtrRコードタンパク質、ponAコードタンパク質、膜透過酵素FbpBC、FbpABCタンパク質系、LbpABタンパク質、外膜タンパク質Opa、外膜トランスポーターFetA、鉄抑制調節因子MpeR;クレブシエラ・グラヌロマティス(Klebsiella granulomatis)の外膜タンパク質A OmpA、外膜タンパク質C OmpC、外膜タンパク質K17 OmpK17;化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)のフィブロネクチン結合タンパク質Sfb、フィブロネクチン/フィブリノゲン結合タンパク質FBP54、フィブロネクチン結合タンパク質FbaA、Mタンパク質1型Emm1、Mタンパク質6型Emm6、免疫グロブリン結合タンパク質35 Sib35、表面タンパク質R28 Spr28、スーパーオキシドジスムターゼSOD、C5aペプチダーゼScpA、抗原I/II AgI/II、アドヘシンAspA、G関連α2−マクログロブリン結合タンパク質GRAB、表面原線維タンパク質M5;ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae)のCタンパク質β抗原、アルギニンデイミナーゼタンパク質、アドヘシンBibA、105kDAタンパク質BPS、表面抗原c、表面抗原R、表面抗原X、トリプシン耐性タンパク質R1、トリプシン耐性タンパク質R3、トリプシン耐性タンパク質R4、表面免疫原性タンパク質Sip、表面タンパク質Rib、ロイシンリッチリピートタンパク質LrrG、セリンリッチリピートタンパク質Srr−2、Cタンパク質α抗原Bca、Β抗原Bag、表面抗原Ε、α様タンパク質ALP1、α様タンパク質ALP5、表面抗原δ、α様タンパク質ALP2、α様タンパク質ALP3、α様タンパク質ALP4、Cβタンパク質Bac;インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae)のトランスフェリン結合タンパク質2 Tbp2、ホスファターゼP4、外膜タンパク質P6、ペプチドグリカン結合リポタンパク質Pal、タンパク質D、タンパク質E、接着及び透過タンパク質Hap、外膜タンパク質26 Omp26、外膜タンパク質P5(フィンブリン)、外膜タンパク質D15、外膜タンパク質OmpP2、5’−ヌクレオチダーゼNucA、外膜タンパク質P1、外膜タンパク質P2、外膜リポタンパク質Pcp、リポタンパク質E、外膜タンパク質P4、フクロキナーゼFucK、[Cu,Zn]−スーパーオキシドジスムターゼSodC、プロテアーゼHtrA、タンパク質O145、α−ガラクトシルセラミド;ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C(エンテロウイルス類、主にコクサッキーA型ウイルス及びエンテロウイルス71型(EV71)、手足口病(HFMD));シンノンブレウイルス、ハンタウイルスのRNAポリメラーゼL、タンパク質L、糖タンパク質Gn、糖タンパク質Gc、ヌクレオカプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質G1、核タンパク質NP、タンパク質N、ポリタンパク質M;ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)の熱ショックタンパク質HspA、熱ショックタンパク質HspB、クエン酸シンターゼGltA、タンパク質UreB、熱ショックタンパク質Hsp60、好中球活性化タンパク質NAP、カタラーゼKatA、空胞化サイトトキシンVacA、ウレアーゼα UreA、ウレアーゼβ Ureb、タンパク質Cpn10、タンパク質groES、熱ショックタンパク質Hsp10、タンパク質MopB、細胞毒性関連10kDaタンパク質CAG、36kDa抗原、β−ラクタマーゼHcpA、β−ラクタマーゼHcpB;大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111及びO104:H4の内在性膜タンパク質、易凝集性タンパク質、O−抗原、毒素抗原Stx2B、毒素抗原Stx1B、接着抗原断片Int28、タンパク質EspA、タンパク質EspB、インチミン、タンパク質Tir、タンパク質IntC300、タンパク質Eae;ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)のRNAポリメラーゼL、タンパク質L、糖タンパク質Gn、糖タンパク質Gc、ヌクレオカプシドタンパク質、エンベロープ糖タンパク質G1、核タンパク質NP、タンパク質N、ポリタンパク質M;ヘニパウイルス、ヘンドラウイルス又はニパウイルスの糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、核タンパク質N、融合タンパク質F、ポリメラーゼL、プロテインW、プロテインC、リンタンパク質p、非構造タンパク質V;A型肝炎ウイルスのポリタンパク質、糖タンパク質(glycoproten)Gp2、A型肝炎表面抗原HBAg、タンパク質2A、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、タンパク質P1B、タンパク質P2A、タンパク質P3AB、タンパク質P3D;B型肝炎ウイルス(HBV)のB型肝炎表面抗原HBsAg、B型肝炎コア抗原HbcAg、ポリメラーゼ、タンパク質Hbx、preS2ミドル表面タンパク質、表面タンパク質L、ラージSタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4;C型肝炎ウイルスのエンベロープ糖タンパク質E1 gp32 gp35、エンベロープ糖タンパク質E2 NS1 gp68 gp70、カプシドタンパク質C、コアタンパク質Core、ポリタンパク質、ウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、抗原G、タンパク質NS3、タンパク質NS5A;D型肝炎ウイルスのウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、ラージデルタ肝炎抗原(hepaptitis delta antigen)、スモールデルタ肝炎抗原(hepaptitis delta antigen);E型肝炎ウイルスのウイルスタンパク質VP1、ウイルスタンパク質VP2、ウイルスタンパク質VP3、ウイルスタンパク質VP4、カプシドタンパク質E2;単純ヘルペスウイルス1型及び2型(HSV−1及びHSV−2)の糖タンパク質L UL1、ウラシル−DNAグリコシラーゼUL2、タンパク質UL3、タンパク質UL4、DNA複製タンパク質UL5、ポータルタンパク質UL6、ビリオン成熟タンパク質UL7、DNAヘリカーゼUL8、複製起点結合タンパク質UL9、糖タンパク質M UL10、タンパク質UL11、アルカリ性エキソヌクレアーゼUL12、セリン−スレオニンプロテインキナーゼUL13、テグメントタンパク質UL14、ターミナーゼUL15、テグメントタンパク質UL16、タンパク質UL17、カプシドタンパク質VP23 UL18、主要カプシドタンパク質VP5 UL19、膜タンパク質UL20、テグメントタンパク質UL21、糖タンパク質H(UL22)、チミジンキナーゼUL23、タンパク質UL24、タンパク質UL25、カプシドタンパク質P40(UL26、VP24、VP22A)、糖タンパク質B(UL27)、ICP18.5タンパク質(UL28)、主要DNA結合タンパク質ICP8(UL29)、DNAポリメラーゼUL30、核マトリックスタンパク質UL31、エンベロープ糖タンパク質UL32、タンパク質UL33、核内膜タンパク質UL34、カプシドタンパク質VP26(UL35)、ラージテグメントタンパク質UL36、カプシド集合タンパク質UL37、VP19Cタンパク質(UL38)、リボヌクレオチド還元酵素(大サブユニット)UL39、リボヌクレオチド還元酵素(小サブユニット)UL40、テグメントタンパク質/ビリオン宿主シャットオフVHSタンパク質(UL41)、DNAポリメラーゼプロセシビティー因子UL42、膜タンパク質UL43、糖タンパク質C(UL44)、膜タンパク質UL45、テグメントタンパク質VP11/12(UL46)、テグメントタンパク質VP13/14(UL47)、ビリオン成熟タンパク質VP16(UL48、α−TIF)、エンベロープタンパク質UL49、dUTPジホスファターゼUL50、テグメントタンパク質UL51、DNAヘリカーゼ/プライマーゼ複合タンパク質UL52、糖タンパク質K(UL53)、転写調節タンパク質IE63(I
CP27、UL54)、タンパク質UL55、タンパク質UL56、ウイルス複製タンパク質ICP22(IE68、US1)、タンパク質US2、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼUS3、糖タンパク質G(US4)、糖タンパク質J(US5)、糖タンパク質D(US6)、糖タンパク質I(US7)、糖タンパク質E(US8)、テグメントタンパク質US9、カプシド/テグメントタンパク質US10、Vmw21タンパク質(US11)、ICP47タンパク質(IE12、US12)、主要転写活性化因子ICP4(IE175、RS1)、E3ユビキチンリガーゼICP0(IE110)、潜伏期関連タンパク質1 LRP1、潜伏期関連タンパク質2 LRP2、ニューロビルレンス因子RL1(ICP34.5)、潜伏期関連転写物LAT;ヒストプラズマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)の熱ショックタンパク質Hsp60、細胞表面タンパク質H1C、ジペプチジルペプチダーゼIV型DppIV、M抗原、70kDaタンパク質、17kDaヒストン様タンパク質;ズビニ鉤虫(Ancylostoma duodenale)及びアメリカ鉤虫(Necator americanus)の脂肪酸及びレチノール結合タンパク質−1 FAR−1、メタロプロテイナーゼ組織阻害因子TIMP(TMP)、システインプロテイナーゼACEY−1、システインプロテイナーゼACCP−1、表面抗原Ac−16、分泌タンパク質2 ASP−2、メタロプロテアーゼ1MTP−1、アスパルチルプロテアーゼ阻害因子API−1、表面関連抗原SAA−1、表面関連抗原SAA−2、成体特異的分泌第Xa因子、セリンプロテアーゼ阻害因子抗凝固薬AP、カテプシンD様アスパラギン酸プロテアーゼARR−1、グルタチオンS−トランスフェラーゼGST、アスパラギン酸プロテアーゼAPR−1、アセチルコリンエステラーゼAChE;ヒトボカウイルス(HBoV)のタンパク質NS1、タンパク質NP1、タンパク質VP1、タンパク質VP2、タンパク質VP3;エーリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)の主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質;アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum)の主要表面タンパク質1〜5(MSP1a、MSP1b、MSP2、MSP3、MSP4、MSP5)、IV型分泌系(secreotion system)タンパク質VirB2、VirB7、VirB11、VirD4;ヒトメタニューモウイルス(hMPV)のタンパク質NS1、スモール疎水性タンパク質NS2、SHタンパク質、融合タンパク質F、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL;エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)の主要表面タンパク質2 MSP2、主要表面タンパク質4 MSP4、MSP変異体SGV1、MSP変異体SGV2、外膜タンパク質OMP、外膜タンパク質(outer membrande protein)19 OMP−19、主要抗原タンパク質MAP1、主要抗原タンパク質MAP1−2、主要抗原タンパク質MAP1B、主要抗原タンパク質MAP1−3、Erum2510コードタンパク質、タンパク質GroEL、タンパク質GroES、30kDA主要外膜タンパク質、GE 100kDaタンパク質、GE 130kDaタンパク質、GE 160kDaタンパク質;ヒトパピローマウイルス(HPV)の複製タンパク質E1、調節タンパク質E2、タンパク質E3、タンパク質E4、タンパク質E5、タンパク質E6、タンパク質E7、タンパク質E8、主要カプシドタンパク質L1、マイナーカプシドタンパク質L2;ヒトパラインフルエンザウイルス類(HPIV)の融合タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼ(hemagglutinin−neuramidase)HN、糖タンパク質G、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、核タンパク質N、ポリメラーゼL;オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)、インフルエンザウイルス(流感)の赤血球凝集素(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)、核タンパク質(NP)、M1タンパク質、M2タンパク質、NS1タンパク質、NS2タンパク質(NEPタンパク質:核外輸送タンパク質)、PAタンパク質、PB1タンパク質(ポリメラーゼ塩基性1タンパク質)、PB1−F2タンパク質及びPB2タンパク質;日本脳炎ウイルスのゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C;キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)のRTX毒素、IV型線毛、主要線毛サブユニットPilA、調節性転写因子PilS及びPilR、タンパク質σ54、外膜タンパク質;プリオンタンパク質クーループリオン;ラッサウイルスの核タンパク質N、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質Z、糖タンパク質GP;レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)のペプチドグリカン結合リポタンパク質PAL、60kDaシャペロニンCpn60(groEL、HspB)、IV型ピリンPilE、外膜タンパク質MIP、主要外膜タンパク質MompS、亜鉛メタロプロテイナーゼMSP;リーシュマニア属(Leishmania)のP4ヌクレアーゼ、タンパク質WD、リボヌクレオチド還元酵素M2、表面膜糖タンパク質Pg46、システインプロテイナーゼCP、グルコース調節タンパク質78 GRP−78、ステージ特異的S抗原様タンパク質A2、ATPアーゼF1、β−チューブリン、熱ショックタンパク質70 Hsp70、KMP−11、糖タンパク質GP63、タンパク質BT1、ヌクレオシドヒドロラーゼNH、細胞表面タンパク質B1、リボソームタンパク質P1様タンパク質P1、ステロール24−c−メチルトランスフェラーゼSMT、LACKタンパク質、ヒストンH1、SPB1タンパク質、チオール特異的抗酸化剤TSA、タンパク質抗原STl1、シグナルペプチダーゼSP、ヒストンH2B、表面抗原(suface antigen)PSA−2、システインプロテイナーゼb Cpb;らい菌(Mycobacterium leprae)の主要膜タンパク質I、セリンリッチ抗原45kDa、10kDaシャペロニン(caperonin)GroES、HSP kDa抗原、アミノオキソノナノエートシンターゼAONS、タンパク質リコンビナーゼA RecA、アセチル−/プロピオニル−補酵素Aカルボキシラーゼα、アラニンラセマーゼ、60kDaシャペロニン2、ESAT−6様タンパク質EcxB(L−ESAT−6)、タンパク質Lsr2、タンパク質ML0276、ヘパリン結合赤血球凝集素HBHA、熱ショックタンパク質65 Hsp65、mycP1又はML0041コードタンパク質、htrA2又はML0176コードタンパク質、htrA4又はML2659コードタンパク質、gcp又はML0379コードタンパク質、clpC又はML0235コードタンパク質;レプトスピラ属(Leptospira)の外膜タンパク質LipL32、膜タンパク質LIC10258、膜タンパク質LP30、膜タンパク質LIC12238、Ompa様タンパク質Lsa66、表面タンパク質LigA、表面タンパク質LigB、主要外膜タンパク質OmpL1、外膜タンパク質LipL41、タンパク質LigAni、表面タンパク質LcpA、接着タンパク質LipL53、外膜タンパク質UpL32、表面タンパク質Lsa63、フラジェリンFlaB1、膜リポタンパク質(membran lipoprotein)LipL21、膜タンパク質pL40、レプトスピラ表面アドヘシンLsa27、外膜タンパク質OmpL36、外膜タンパク質OmpL37、外膜タンパク質OmpL47、外膜タンパク質OmpL54、アシルトランスフェラーゼLpxA;リステリア菌(Listeria monocytogenes)のリステリオリシンO前駆体Hly(LLO)、侵入関連タンパク質Iap(P60)、リステリオリシン調節タンパク質PrfA、亜鉛メタロプロテイナーゼMpl、ホスファチジルイノシトール特異的ホスホリパーゼC PLC(PlcA、PlcB)、O−アセチルトランスフェラーゼOat、ABCトランスポーター透過酵素Im.G_1771、接着タンパク質LAP、LAP受容体Hsp60、アドヘシンLapB、溶血毒素リステリオリシンO LLO、タンパク質ActA、インターナリンA InlA、タンパク質lnlB;ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)及び他のボレリア属(Borrelia)種の細胞表層タンパク質A OspA、細胞表層タンパク質OspB、細胞表層タンパク質OspC、デコリン結合タンパク質A DbpA、デコリン結合タンパク質B DbpB、鞭毛繊維41kDaコアタンパク質Fla、塩基性膜タンパク質A BmpA(免疫優勢抗原P39)、表層22kDaリポタンパク質前駆体(抗原IPLA7)、変異性表層リポタンパク質vlsE;毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP(ペプチドN、N1、N2、及びN3)、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、タンパク質Cox−2(バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)及びマレー糸状虫(Brugia malayi)、リンパ管フィラリア症(象皮病));リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(LCMV)の糖タンパク質GP、マトリックスタンパク質Z、ポリメラーゼL、核タンパク質N;トロンボスポンジン関連匿名タンパク質TRAP、SSP2スポロゾイト表面タンパク質2、頂端膜抗原1 AMA1、ロプトリー膜抗原RMA1、酸性塩基性リピート抗原ABRA、細胞通過タンパク質PF、タンパク質Pvs25、メロゾイト表面タンパク質1 MSP−1、メロゾイト表面タンパク質2 MSP−2、リング感染赤血球表面抗原RESA、肝ステージ抗原3 LSA−3、タンパク質Eba−175、セリンリピート抗原5 SERA−5、スポロゾイト周囲タンパク質CS、メロゾイト表面タンパク質3 MSP3、メロゾイト表面タンパク質8 MSP8、エノラーゼPF10、肝細胞赤血球タンパク質17kDa HEP17、赤血球膜タンパク質1 EMP1、タンパク質Kβメロゾイト表面タンパク質4/5 MSP4/5、熱ショックタンパク質Hsp90、グルタミン酸リッチタンパク質GLURP、メロゾイト表面タンパク質4 MSP−4、タンパク質
STARP、スポロゾイト周囲タンパク質関連抗原前駆体CRA(プラスモジウム属(Plasmodium)、マラリア);マールブルグウイルスの核タンパク質N、膜結合性タンパク質VP24、マイナー核タンパク質VP30、ポリメラーゼ補因子VP35、ポリメラーゼL、マトリックスタンパク質VP40、エンベロープ糖タンパク質GP;麻疹ウイルスのプロテインC、マトリックスタンパク質M、リンタンパク質P、非構造タンパク質V、赤血球凝集素糖タンパク質H、ポリメラーゼL、核タンパク質N、融合タンパク質F;類鼻疽菌(Burkholderia pseudomallei)のABCトランスポーターファミリーのメンバー(LolC、OppA、及びPotF)、推定リポタンパク質放出系膜貫通タンパク質LolC/E、フラジェリンFliC、バークホルデリア属(Burkholderia)細胞内運動A BimA、細菌伸長因子−Tu EF−Tu、17kDa OmpA様タンパク質、boaAコードタンパク質、boaBコードタンパク質;髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)のピリンタンパク質、マイナーピリン関連サブユニットpilC、メジャーピリンサブユニット及び変異体pilE、pilS、相変異タンパク質porA、ポーリンB PorB、タンパク質TraD、ナイセリア外膜抗原H.8、70kDa抗原、主要外膜タンパク質PI、外膜タンパク質PlA及びPlB、W抗原、表面タンパク質A NspA、トランスフェリン結合タンパク質TbpA、トランスフェリン結合タンパク質TbpB、PBP2、mtrRコードタンパク質、ponAコードタンパク質、膜透過酵素FbpBC、FbpABCタンパク質系、LbpABタンパク質、外膜タンパク質Opa、外膜トランスポーターFetA、鉄抑制調節因子MpeR、H因子−結合タンパク質fHbp、アドヘシンNadA、タンパク質NhbA、リプレッサーFarR;横川吸虫(Metagonimus yokagawai)の66kDaタンパク質、22kDaタンパク質;微胞子虫門(Microsporidia)の極管タンパク質(グルゲア属(Glugea)の34、75、及び170kDa、エンセファリトゾーン属(Encephalitozoon)の35、55及び150kDa)、キネシン関連タンパク質、RNAポリメラーゼIIラージストサブユニット、内在性膜タンパク質と類似YIPA、抗サイレンシングタンパク質1、熱ショック転写因子HSF、プロテインキナーゼ、チミジンキナーゼ、NOP−2様核小体タンパク質;伝染性軟属腫ウイルス(MCV)のCASP8及びFADD様アポトーシス調節因子、グルタチオンペルオキシダーゼGPX1、RNAヘリカーゼNPH−II NPH2、ポリ(A)ポリメラーゼ触媒サブユニットPAPL、主要エンベロープタンパク質P43K、早期転写因子70kDaサブユニットVETFS、早期転写因子82kDaサブユニットVETFL、メタロエンドペプチダーゼG1型、ヌクレオシドトリホスファターゼI NPH1、複製タンパク質A28様MC134L、RNAポリメラーゼ(RNA polymease)7kDaサブユニットRPO7;ムンプスウイルスのマトリックスタンパク質M、リンタンパク質P/V、スモール疎水性タンパク質SH、核タンパク質N、タンパク質V、融合糖タンパク質F、赤血球凝集素ノイラミニダーゼHN、RNAポリメラーゼL;発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)の外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D、結晶性表層タンパク質SLP、防御表面タンパク質抗原SPA;肺炎マイコプラズマ(Mycoplasma pneumoniae)のアドヘシンP1、アドヘシン(adhesion)P30、タンパク質p116、タンパク質P40、細胞骨格タンパク質HMW1、細胞骨格タンパク質HMW2、細胞骨格タンパク質HMW3、MPN152コードタンパク質、MPN426コードタンパク質、MPN456コードタンパク質、MPN−500コードタンパク質;ノカルジア・アステロイデス(Nocardia asteroides)及び他のノカルジア属(Nocardia)種のNocA、鉄依存性調節タンパク質、VapA、VapD、VapF、VapG、カゼイン分解プロテアーゼ、糸状体先端部関連43kDaタンパク質、タンパク質P24、タンパク質P61、15kDaタンパク質、56kDaタンパク質;回旋糸状虫(Onchocerca volvulus)の毒アレルゲンホモログ様タンパク質VAL−1、大量幼虫転写物ALT−1、大量幼虫転写物ALT−2、チオレドキシンペルオキシダーゼTPX、スズメバチアレルゲンホモログVAH、チオレドキシンペルオキシダーゼ(thiordoxin peroxidase)2 TPX−2、抗原タンパク質SXP、活性化関連タンパク質−1 ASP−1、チオレドキシンTRX、トランスグルタミナーゼBmTGA、グルタチオン−S−トランスフェラーゼGST、ミオシン、スズメバチアレルゲンホモログVAH、175kDaコラゲナーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼGAPDH、クチクラコラーゲンCol−4、分泌型幼虫酸性タンパク質SLAP、キチナーゼCHI−1、マルトース結合タンパク質MBP、解糖酵素フルクトース−1,6−二リン酸アルドラーゼFba、トロポミオシンTMY−1、線虫特異的遺伝子産物OvB20、オンコシスタチンCPI−2、Cox−2;パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)の43kDa分泌型糖タンパク質、糖タンパク質gp0、糖タンパク質gp75、抗原Pb27、抗原Pb40、熱ショックタンパク質Hsp65、熱ショックタンパク質Hsp70、熱ショックタンパク質Hsp90、タンパク質P10、トリオースリン酸イソメラーゼTPI、N−アセチルグルコサミン結合レクチンパラコクシン(Paracoccin)、28kDaタンパク質Pb28;ウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)及び他の肺吸虫属(Paragonimus)種の28kDaクルジパイン様システインプロテアーゼPw28CCP;パスツレラ属(Pasteurella)の外膜タンパク質OmpH、外膜タンパク質Omp28、タンパク質PM1539、タンパク質PM0355、タンパク質PM1417、修復タンパク質MutL、タンパク質BcbC、タンパク質PM0305、ギ酸デヒドロゲナーゼ−N、タンパク質PM0698、タンパク質PM1422、DNAジャイレース、リポタンパク質PlpE、接着タンパク質Cp39、ヘム獲得システム受容体HasR、39kDa被膜タンパク質、鉄調節型OMP IROMP、外膜タンパク質OmpA87、線毛タンパク質Ptf、線毛サブユニットタンパク質PtfA、トランスフェリン結合タンパク質Tbpl、エステラーゼ酵素MesA、パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)毒素PMT、接着タンパク質Cp39;百日咳菌(Bordetella pertussis)の糸状赤血球凝集素FhaB、アデニル酸シクラーゼCyaA、百日咳毒素サブユニット4前駆体PtxD、パータクチン前駆体Prn、毒素サブユニット1 PtxA、タンパク質Cpn60、タンパク質brkA、百日咳毒素サブユニット2前駆体PtxB、百日咳毒素サブユニット3前駆体PtxC、百日咳毒素サブユニット5前駆体PtxE、パータクチンPrn、タンパク質Fim2、タンパク質Fim3;ペスト菌(Yersinia pestis)のF1カプセル抗原、ビルレンス関連V抗原、分泌型エフェクタータンパク質LcrV、V抗原、外膜プロテアーゼPla、分泌型エフェクタータンパク質YopD、推定分泌タンパク質−チロシンホスファターゼYopH、ニードル複合体主要サブユニットYscF、プロテインキナーゼYopO、推定オートトランスポータータンパク質YapF、内膜ABCトランスポーターYbtQ(Irp7)、推定糖結合タンパク質YPO0612、熱ショックタンパク質90 HtpG、推定スルファターゼタンパク質YdeN、外膜リポタンパク質キャリアータンパク質LolA、分泌シャペロンYerA、推定リポタンパク質YPO0420、溶血毒素アクチベータータンパク質HpmB、ペスチシン/エルシニアバクチン外膜受容体Psn、分泌型エフェクタータンパク質YopE、分泌型エフェクタータンパク質YopF、分泌型エフェクタータンパク質YopK、外膜タンパク質YopN、外膜タンパク質YopM、コアグラーゼ/フィブリノリジン前駆体Pla;肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)のタンパク質PhpA、表面アドヘシンPsaA、ニューモリシンPly、ATP依存性プロテアーゼClp、リポ酸−タンパク質リガーゼLplA、細胞壁表面アンカータンパク質psrP、ソルターゼSrtA、グルタミル−tRNAシンテターゼGltX、コリン結合タンパク質A CbpA、肺炎球菌表面タンパク質A PspA、肺炎球菌表面タンパク質C PspC、6−ホスホグルコン酸デヒドロゲナーゼGnd、鉄結合タンパク質PiaA、ムレインヒドロラーゼLytB、プロテオン(proteon)LytC、プロテアーゼA1;ニューモシスチス・イロベチ(Pneumocystis jirovecii)の主要表面タンパク質B、ケキシン様プロテアーゼKEX1、タンパク質A12、55kDa抗原P55、主要表面糖タンパク質Msg;ポリオウイルスのゲノムポリタンパク質、ポリメラーゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C;フォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)のタンパク質Nfa1、エキセンディン−3、分泌性リパーゼ、カテプシンB様プロテアーゼ、システインプロテアーゼ、カテプシン、ペルオキシレドキシン、タンパク質Cry1Ac;JCウイルスのアグノプロテイン、ラージT抗原、スモールT抗原、主要カプシドタンパク質VP1、マイナーカプシドタンパク質Vp2;オウム病クラミジア(Chlamydophila psittaci)の低カルシウム応答タンパク質E LCrE、クラミジア外膜タンパク質N CopN、セリン/スレオニン−プロテインキナーゼPknD、アシルキャリアータンパク質S−マロニルトランスフェラーゼFabD、一本鎖DNA結合タンパク質Ssb、主要外膜タンパク質MOMP、外膜タンパク質2(Omp2)、多形膜タンパク質ファミリー;Q熱コクシエラ(Coxiella burnetii)の外膜タンパク質P1、熱ショックタンパク質B HspB、ペプチドABCトランスポーター、GTP結合タンパク質、タンパク質IcmB、リボヌクレアーゼR、ホスファターゼ(phosphatas)SixA、タンパク質DsbD、外膜タンパク質TolC、DNA−結合タンパク質PhoB、ATPアーゼDotB、熱ショックタンパク質B(HspB)、膜タンパク質Com1、28kDaタンパク質、DNA−3−メチルアデニングリコシダーゼI、外膜タンパク質OmpH、外膜タンパク質AdaA、グリシン切断系Tタンパク質;狂犬病ウイルスの核タンパク質N、ラージ構造タンパク質L、リンタンパク質(phophoprotein)P、マトリックスタンパク質M、糖タンパク質G;呼吸器合胞体ウイルス(RSV)の融合タンパク質F、核タンパク質N、マトリックスタンパク質M、マトリックスタンパク質M2−1、マトリックスタンパク質M2−2、リンタンパク質P、スモール疎水性タンパク質SH、主要表面糖タンパク質G、ポリメラーゼL、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質2 NS2;ライノウイルスのゲノムポリタンパク質、ポリメラー
ゼ3D、ウイルスカプシドタンパク質VP1、ウイルスカプシドタンパク質VP2、ウイルスカプシドタンパク質VP3、ウイルスカプシドタンパク質VP4、プロテアーゼ2A、プロテアーゼ3C;リケッチア属(Rickettsia)の外膜(OM)タンパク質、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、タンパク質PS120、細胞質内タンパク質D、防御表面タンパク質抗原SPA;痘瘡リケッチア(Rickettsia akari)の外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D;リフトバレー熱ウイルスのエンベロープ糖タンパク質GP、ポリメラーゼL、核タンパク質N、非構造タンパク質NSS;ロッキー山紅斑熱リケッチア(Rickettsia rickettsii)の外膜タンパク質OM、細胞表面抗原OmpA、細胞表面抗原OmpB(sca5)、細胞表面タンパク質SCA4、細胞表面タンパク質SCA1、細胞質内タンパク質D;ロタウイルスの非構造タンパク質6 NS6、非構造タンパク質2 NS2、中間カプシドタンパク質VP6、内側カプシドタンパク質VP2、非構造タンパク質3 NS3、RNA指向性RNAポリメラーゼL、タンパク質VP3、非構造タンパク質1 NS1、非構造タンパク質5 NS5、外側カプシド糖タンパク質VP7、非構造糖タンパク質4 NS4、外側カプシドタンパク質VP4;風疹ウイルスのポリタンパク質P200、糖タンパク質E1、糖タンパク質E2、タンパク質NS2、カプシドタンパク質C;サルモネラ属(Salmonella)のシャペロニンGroEL(MopA)、イノシトールリン酸ホスファターゼSopB、熱ショックタンパク質HslU、シャペロンタンパク質DnaJ、タンパク質TviB、タンパク質IroN、フラジェリンFliC、侵入タンパク質SipC、糖タンパク質gp43、外膜タンパク質LamB、外膜タンパク質PagC、外膜タンパク質TolC、外膜タンパク質NmpC、外膜タンパク質FadL、輸送タンパク質SadA、トランスフェラーゼWgaP、エフェクタータンパク質SifA、SteC、SseL、SseJ及びSseF;SARSコロナウイルスのタンパク質14、非構造タンパク質NS7b、非構造タンパク質NS8a、タンパク質9b、タンパク質3a、核タンパク質N、非構造タンパク質NS3b、非構造タンパク質NS6、タンパク質7a、非構造タンパク質NS8b、膜タンパク質M、エンベロープスモール膜タンパク質EsM、レプリカーゼポリタンパク質1a、スパイク糖タンパク質S、レプリカーゼポリタンパク質1ab;ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)のセリンプロテアーゼ、異型ヒゼンダニ属(Sarcoptes)抗原1 ASA1、グルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、システインプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ、アポリポタンパク質;住血吸虫属(Schistosoma)のグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、パラミオシン、ヘモグルビナーゼ(hemoglbinase)SM32、主要虫卵抗原、14kDa脂肪酸結合タンパク質Sm14、主要幼虫表面抗原P37、22.6kDa外被抗原、カルパインCANP、三リン酸イソメラーゼ(triphospate isomerase)Tim、表面タンパク質9B、外側カプシドタンパク質VP2、23kDa内在性膜タンパク質Sm23、Cu/Zn−スーパーオキシドジスムターゼ、糖タンパク質Gp、ミオシン;ツツガムシ病リケッチア(Orientia tsutsugamushi)の60kDaシャペロニン、56kDa型特異的抗原、ピルビン酸リン酸ジキナーゼ、4−ヒドロキシ安息香酸オクタプレニルトランスフェラーゼ;赤痢菌属(Shigella)のデヒドロゲナーゼGuaB、侵入タンパク質Spa32、インベイシンIpaA、インベイシンIpaB、インベイシンIpaC、インベイシンIpaD、インベイシンIpaH、インベイシンIpaJ;水痘帯状疱疹ウイルス(VZV)のタンパク質P53、ビリオンタンパク質US10ホモログ、転写調節因子IE63、転写トランス活性化因子IE62、プロテアーゼP33、αトランス誘導因子74kDaタンパク質、デオキシウリジン5’−三リン酸ヌクレオチドヒドロラーゼ、転写トランス活性化因子IE4、膜タンパク質UL43ホモログ、核リンタンパク質UL3ホモログ、核タンパク質UL4ホモログ、複製起点結合タンパク質、膜タンパク質2、リンタンパク質32、タンパク質57、DNAポリメラーゼプロセシビティー因子、ポータルタンパク質54、DNAプライマーゼ、テグメントタンパク質UL14ホモログ、テグメントタンパク質UL21ホモログ、テグメントタンパク質UL55ホモログ、トリパータイトターミナーゼサブユニットUL33ホモログ、トリパータイトターミナーゼサブユニットUL15ホモログ、カプシド結合タンパク質44、ビリオンパッケージングタンパク質43;大痘瘡及び小痘瘡のトランケート型3−βヒドロキシ−5−エンステロイドデヒドロゲナーゼホモログ、ビリオン膜タンパク質A13、タンパク質A19、タンパク質A31、トランケート型タンパク質A35ホモログ、タンパク質A37.5ホモログ、タンパク質A47、タンパク質A49、タンパク質A51、セマフォリン様タンパク質A43、セリンプロテアーゼ阻害因子1、セリンプロテアーゼ阻害因子2、セリンプロテアーゼ阻害因子3、タンパク質A6、タンパク質B15、タンパク質C1、タンパク質C5、タンパク質C6、タンパク質F7、タンパク質F8、タンパク質F9、タンパク質F11、タンパク質F14、タンパク質F15、タンパク質F16;スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)のアドヘシン/糖タンパク質gp70、プロテアーゼ;スタフィロコッカス属(Staphylococcus)のヘム鉄結合タンパク質IsdB、コラーゲンアドヘシンCna、クランピング因子A(ClfA)、タンパク質MecA、フィブロネクチン結合タンパク質A(FnbA)、エンテロトキシンA型(EntA)、エンテロトキシンB型(EntB)、エンテロトキシンC型EntC1、エンテロトキシンC型EntC2、エンテロトキシンD型(EntD)、エンテロトキシンE型(EntE)、毒素性ショック症候群毒素−1(TSST−1)、スタフィロキナーゼ、ペニシリン結合タンパク質2a(PBP2a、MecA)、分泌抗原SssA;糞線虫(Strongyloides stercoralis)の抗原Ss−IR、抗原NIE、ストロンギラスタシン、Na+−K+ ATPアーゼSseat−6、トロポマイシン(tropomysin)SsTmy−1、タンパク質LEC−5、41kDa抗原(aantigen)P5、41kDa幼虫タンパク質、31kDa幼虫タンパク質、28kDa幼虫タンパク質;梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)のグリセロホスホジエステルホスホジエステラーゼGlpQ(Gpd)、外膜タンパク質TmpB、タンパク質Tp92、抗原TpF1、リピートタンパク質Tpr、リピートタンパク質F TprF、リピートタンパク質G TprG、リピートタンパク質I TprI、リピートタンパク質J TprJ、リピートタンパク質K TprK、トレポネーマ膜タンパク質A(TmpA)、リポタンパク質、15kDa Tpp15、47kDa膜抗原、ミニフェリチンTpF1、アドヘシンTp0751、リポタンパク質TP0136、タンパク質TpN17、タンパク質TpN47、外膜タンパク質TP0136、外膜タンパク質TP0155、外膜タンパク質TP0326、外膜タンパク質TP0483、外膜タンパク質TP0956;テニア属(Taenia)のカテプシンL様プロテアーゼ、53/25kDa抗原、8kDaファミリーメンバー、辺縁トリプシン様活性を有する嚢虫タンパク質TsAg5、六鉤幼虫タンパク質TSOL18、六鉤幼虫タンパク質TSOL45−1A、乳酸デヒドロゲナーゼA LDHA、乳酸デヒドロゲナーゼB LDHB;破傷風菌(Clostridium tetani)の破傷風毒素TetX、破傷風毒素C TTC、140kDa S層タンパク質、フラビンタンパク質β−サブユニットCT3、ホスホリパーゼ(レシチナーゼ)、ホスホキャリアータンパク質HPr;ダニ媒介性脳炎ウイルス(TBEV)のゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C;イヌ回虫(Toxocara canis)又はネコ回虫(Toxocara cati)の58kDa抗原、68kDa抗原、トキソカラ属(Toxocara)幼虫排泄−分泌抗原TES、32kDa糖タンパク質、糖タンパク質TES−70、糖タンパク質GP31、排泄−分泌抗原TcES−57、腸周囲液抗原Pe、可溶性抽出物抗原Ex、排泄/分泌幼虫抗原ES、抗原TES−120、ポリタンパク質アレルゲンTBA−1、カテプシンL様システインプロテアーゼc−cpl−1、26kDaタンパク質;トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii)のミクロネームタンパク質、ロプトリータンパク質Rop2、ロプトリータンパク質、タンパク質SR1、表面抗原P22、主要抗原p24、主要表面抗原p30、密顆粒タンパク質、28kDa抗原、表面抗原SAG1、SAG2関連抗原、ヌクレオシドトリホスファターゼ1、ヌクレオシドトリホスファターゼ2、タンパク質Stt3、HesB様ドメイン含有タンパク質、ロンボイド様プロテアーゼ5、トキソメプシン(toxomepsin)1;旋毛虫(Trichinella spiralis)の43kDa分泌型糖タンパク質、53kDa分泌型糖タンパク質、パラミオシン、抗原Ts21、抗原Ts87、抗原p46000、TSL−1抗原、カベオリン−1 CAV−1、49kDa新生幼虫抗原、プロサポシンホモログ、セリンプロテアーゼ、セリンプロテアーゼ阻害因子、45kDa糖タンパク質Gp45;膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)のMyb様転写因子(Myb1、Myb2、Myb3)、接着タンパク質AP23、接着タンパク質AP33、アドヘシンタンパク質AP33−3、アドヘシンAP51、アドヘシンAP65、接着タンパク質AP65−1、α−アクチニン、キネシン関連タンパク質、テニューリン、62kDaプロテイナーゼ、サブチリシン様セリンプロテアーゼSUB1、システインプロテイナーゼ遺伝子3 CP3、α−エノラーゼEno1、システインプロテイナーゼCP30、熱ショックタンパク質Hsp70及びHsp60、免疫原性タンパク質P270;鞭虫(Trichuris trichiura)のβ−チューブリン、47kDaタンパク質、分泌白血球様プロテイナーゼ−1 SLP−1、50kDaタンパク質TT50、17kDa抗原、43/47kDaタンパク質;結核菌(Mycobacterium tuberculosis)のタンパク質ESAT−6(EsxA)、10kDaろ過性抗原EsxB、分泌抗原85−B FBPB、フィブロネクチン結合タンパク質A FbpA(Ag85A)、セリンプロテアーゼPepA、PPEファミリータンパク質PPE18、フィブロネクチン結合タンパク質D FbpD、免疫原性タンパク質MPT64、分泌タンパク質MPT51、カタラーゼ−ペルオキシダーゼ−ペルオキシニトリターゼT KATG、ペリプラズムリン酸結合リポタンパク質PSTS3(PBP−3、Phos−1)、鉄調節ヘパリン結合赤血球凝集素Hbha、PPEファミリータンパク質PPE14、PPEファミリータンパク質PPE68、タンパク質Mtb72F、タンパク質Apa、免疫原性タンパク質MPT63、ペリプラズムリン酸結合リポタンパク質PSTS1(PBP−1)、分子シャペロンDnaK、細胞表面リポタンパク質Mpt83、リポタンパ
ク質P23、リン酸輸送系透過酵素タンパク質pstA、14kDa抗原、フィブロネクチン結合タンパク質C FbpC1、アラニンデヒドロゲナーゼTB43、グルタミンシンテターゼ1、ESX−1タンパク質、タンパク質CFP10、TB10.4タンパク質、タンパク質MPT83、タンパク質MTB12、タンパク質MTB8、Rpf様タンパク質、タンパク質MTB32、タンパク質MTB39、クリスタリン、熱ショックタンパク質HSP65、タンパク質PST−S;野兎病菌(Francisella tularensis)の外膜タンパク質FobA、外膜タンパク質FobB、細胞内増殖遺伝子座lglC1、細胞内増殖遺伝子座IglC2、アミノトランスフェラーゼWbtl、シャペロニンGroEL、17kDa主要膜タンパク質TUL4、リポタンパク質LpnA、キチナーゼファミリー18タンパク質、イソクエン酸デヒドロゲナーゼ、Nif3ファミリータンパク質、IV型線毛グリコシル化タンパク質、外膜タンパク質tolC、FAD結合ファミリータンパク質、IV型ピリン多量体外膜タンパク質、二成分センサータンパク質KdpD、シャペロンタンパク質DnaK、タンパク質TolQ;ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)のMB抗原、ウレアーゼ、タンパク質GyrA、タンパク質GyrB、タンパク質ParC、タンパク質ParE、脂質結合膜タンパク質LAMP、チミジンキナーゼTK、ホスホリパーゼPL−A1、ホスホリパーゼPL−A2、ホスホリパーゼPL−C、表面発現96kDa抗原;ベネズエラウマ脳炎ウイルスの非構造ポリタンパク質、構造ポリタンパク質、カプシドタンパク質CP、タンパク質E1、タンパク質E2、タンパク質E3、プロテアーゼP1、プロテアーゼP2、プロテアーゼP3;グアナリトウイルスの糖タンパク質GP、マトリックスタンパク質Z、ポリメラーゼL、核タンパク質N;ウエストナイルウイルスのポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質(brotein)NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;西部ウマ脳炎ウイルスのカプシドタンパク質CP、タンパク質E1、タンパク質E2、タンパク質E3、プロテアーゼP2;黄熱病ウイルスのゲノムポリタンパク質、タンパク質E、タンパク質M、カプシドタンパク質C、プロテアーゼNS3、タンパク質NS1、タンパク質NS2A、タンパク質AS2B、タンパク質NS4A、タンパク質NS4B、タンパク質NS5;偽結核菌(Yersinia pseudotuberculosis)の推定Yopターゲティングタンパク質YobB、エフェクタータンパク質YopD、エフェクタータンパク質YopE、タンパク質YopH、エフェクタータンパク質YopJ、タンパク質移行タンパク質YopK、エフェクタータンパク質YopT、タンパク質YpkA、鞭毛生合成タンパク質FlhA、ペプチダーゼM48、カリウム流出系KefA、転写調節因子RovA、アドヘシンIfp、トランスロケータータンパク質(translocator portein)LcrV、タンパク質PcrV、インベイシンInv、外膜タンパク質OmpF様ポーリン、アドヘシンYadA、プロテインキナーゼC、ホスホリパーゼC1、タンパク質PsaA、マンノシルトランスフェラーゼ様タンパク質WbyK、タンパク質YscU、抗原YPMa;腸炎エルシニア(Yersinia enterocolitica)のエフェクタータンパク質YopB、60kDaシャペロニン、タンパク質WbcP、チロシンタンパク質ホスファターゼ(tyrosin−protein phosphatase)YopH、タンパク質YopQ、エンテロトキシン、ガラクトシド透過酵素、レダクターゼ(reductaase)NrdE、タンパク質YasN、インベイシンInv、アドヘシンYadA、外膜ポーリンF OmpF、タンパク質UspA1、タンパク質EibA、タンパク質Hia、細胞表面タンパク質Ail、シャペロンSycD、タンパク質LcrD、タンパク質LcrG、タンパク質LcrV、タンパク質SycE、タンパク質YopE、調節タンパク質TyeA、タンパク質YopM、タンパク質YopN、タンパク質YopO、タンパク質YopT、タンパク質YopD、プロテアーゼClpP、タンパク質MyfA、タンパク質FilA、及びタンパク質PsaAからなる群から選択される異なる病原性抗原又はその断片若しくは変異体をコードする、請求項1〜26のいずれか一項に記載の方法。 - 前記癌又は腫瘍が、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、AIDS関連癌、AIDS関連リンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、基底細胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、骨肉腫/悪性線維性組織球腫、脳幹神経膠腫、脳腫瘍、小脳星状細胞腫、大脳星状細胞腫/悪性神経膠腫、上衣腫、髄芽腫、テント上未分化神経外胚葉性腫瘍、視覚伝導路及び視床下部神経膠腫、乳癌、気管支腺腫/カルチノイド、バーキットリンパ腫、小児カルチノイド腫瘍、消化管カルチノイド腫瘍、原発不明癌腫、原発性中枢神経系リンパ腫、小児小脳星細胞腫、小児大脳星細胞腫/悪性神経膠腫、子宮頸癌、小児癌、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性疾患、結腸癌、皮膚T細胞リンパ腫、線維形成性小円形細胞腫瘍、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、ユーイング肉腫ファミリー腫瘍、小児頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管癌、眼球内黒色腫、網膜芽細胞腫、胆嚢癌、胃癌(gastric cancer)(胃癌(stomach cancer))、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、頭蓋外、性腺外、又は卵巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性腫瘍、脳幹神経膠腫、小児大脳星細胞腫、小児視覚伝導路及び視床下部神経膠腫、胃カルチノイド、ヘアリー細胞白血病、頭頸部癌、心臓癌、肝細胞癌(肝癌)、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、小児視床下部及び視覚伝導路神経膠腫、眼球内黒色腫、膵島細胞癌(膵内分泌部)、カポジ肉腫、腎癌(腎細胞癌)、喉頭癌、白血病、急性リンパ芽球性白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、ヘアリー細胞白血病、口唇・口腔癌、脂肪肉腫、肝癌、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、リンパ腫、AIDS関連リンパ腫、バーキットリンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、骨悪性線維性組織球腫/骨肉腫、小児髄芽腫、黒色腫、眼球内(眼球)黒色腫、メルケル細胞癌、成人悪性中皮腫、小児中皮腫、原発不明の頸部転移性扁平上皮癌、口腔癌、小児多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞腫瘍、菌状息肉症、骨髄異形成候群、骨髄異形成/骨髄増殖性疾患、慢性骨髄性白血病、成人急性骨髄性白血病、小児急性骨髄性白血病、多発性骨髄腫(骨髄癌)、慢性骨髄増殖性疾患、鼻腔・副鼻腔癌、上咽頭癌、神経芽細胞腫、口腔癌、中咽頭癌、骨肉腫/骨悪性線維性組織球腫、卵巣癌、卵巣上皮癌(表層上皮性・間質性腫瘍)、卵巣胚細胞腫瘍、卵巣低悪性度腫瘍、膵癌、膵島細胞膵癌、副鼻腔・鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、松果体星細胞腫、松果体胚細胞腫、小児松果体芽細胞腫及びテント上未分化神経外胚葉性腫瘍、下垂体腺腫、形質細胞新形成/多発性骨髄腫、胸膜肺芽腫、原発性中枢神経系リンパ腫、前立腺癌、直腸癌、腎細胞癌(腎癌)、腎盂・尿管癌、網膜芽細胞腫、小児横紋筋肉腫、唾液腺癌、ユーイング肉腫ファミリー腫瘍、カポジ肉腫、軟部組織肉腫、子宮肉腫、セザリー症候群、皮膚癌(非黒色腫)、皮膚癌(黒色腫)、メルケル細胞皮膚癌、小腸癌、扁平上皮癌、原発不明の頸部転移性扁平上皮癌、小児テント上未分化神経外胚葉性腫瘍、精巣癌、咽喉癌、小児胸腺腫、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、小児甲状腺癌、腎盂尿管移行上皮癌、妊娠性絨毛性腫瘍、尿道癌、子宮内膜子宮癌、子宮肉腫、腟癌、小児視覚伝導路及び視床下部神経膠腫、外陰癌、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、及び小児ウィルムス腫瘍(腎癌)からなる群から選択される、請求項24に記載の方法。
- 前記m個の異なるDNA分子種の各々が前記n個の異なるRNA分子種のうちの1つをコードし、前記n個の異なるRNA分子種の各々が、5T4、707−AP、9D7、AFP、AlbZIP HPG1、α−5−β−1−インテグリン、α−5−β−6−インテグリン、α−アクチニン−4/m、α−メチルアシル補酵素Aラセマーゼ、ART−4、ARTC1/m、B7H4、BAGE−1、BCL−2、bcr/abl、β−カテニン/m、BING−4、BRCA1/m、BRCA2/m、CA 15−3/CA 27−29、CA 19−9、CA72−4、CA125、カルレティキュリン、CAMEL、CASP−8/m、カテプシンB、カテプシンL、CD19、CD20、CD22、CD25、CDE30、CD33、CD4、CD52、CD55、CD56、CD80、CDC27/m、CDK4/m、CDKN2A/m、CEA、CLCA2、CML28、CML66、COA−1/m、コアクトシン様タンパク質、コラーゲン(collage)XXIII、COX−2、CT−9/BRD6、Cten、サイクリンB1、サイクリンD1、cyp−B、CYPB1、DAM−10、DAM−6、DEK−CAN、EFTUD2/m、EGFR、ELF2/m、EMMPRIN、EpCam、EphA2、EphA3、ErbB3、ETV6−AML1、EZH2、FGF−5、FN、Frau−1、G250、GAGE−1、GAGE−2、GAGE−3、GAGE−4、GAGE−5、GAGE−6、GAGE7b、GAGE−8、GDEP、GnT−V、gp100、GPC3、GPNMB/m、HAGE、HAST−2、ヘプシン、Her2/neu、HERV−K−MEL、HLA−A*0201−R17I、HLA−A11/m、HLA−A2/m、HNE、ホメオボックスNKX3.1、HOM−TES−14/SCP−1、HOM−TES−85、HPV−E6、HPV−E7、HSP70−2M、HST−2、hTERT、iCE、IGF−1R、IL−13Ra2、IL−2R、IL−5、未熟ラミニン受容体、カリクレイン−2、カリクレイン−4、Ki67、KIAA0205、KIAA0205/m、KK−LC−1、K−Ras/m、LAGE−A1、LDLR−FUT、MAGE−A1、MAGE−A2、MAGE−A3、MAGE−A4、MAGE−A6、MAGE−A9、MAGE−A10、MAGE−A12、MAGE−B1、MAGE−B2、MAGE−B3、MAGE−B4、MAGE−B5、MAGE−B6、MAGE−B10、MAGE−B16、MAGE−B17、MAGE−C1、MAGE−C2、MAGE−C3、MAGE−D1、MAGE−D2、MAGE−D4、MAGE−E1、MAGE−E2、MAGE−F1、MAGE−H1、MAGEL2、マンマグロビンA、MART−1/メラン−A、MART−2、MART−2/m、マトリックスタンパク質22、MC1R、M−CSF、ME1/m、メソテリン、MG50/PXDN、MMP11、MN/CA IX抗原、MRP−3、MUC−1、MUC−2、MUM−1/m、MUM−2/m、MUM−3/m、ミオシンクラスI/m、NA88−A、N−アセチルグルコサミン転移酵素−V、Neo−PAP、Neo−PAP/m、NFYC/m、NGEP、NMP22、NPM/ALK、N−Ras/m、NSE、NY−ESO−B、NY−ESO−1、OA1、OFA−iLRP、OGT、OGT/m、OS−9、OS−9/m、オステオカルシン、オステオポンチン、p15、p190マイナーbcr−abl、p53、p53/m、PAGE−4、PAI−1、PAI−2、PAP、PART−1、PATE、PDEF、Pim−1−キナーゼ、Pin−1、Pml/PARα、POTE、PRAME、PRDX5/m、プロステイン、プロテイナーゼ−3、PSA、PSCA、PSGR、PSM、PSMA、PTPRK/m、RAGE−1、RBAF600/m、RHAMM/CD168、RU1、RU2、S−100、SAGE、SART−1、SART−2、SART−3、SCC、SIRT2/m、Sp17、SSX−1、SSX−2/HOM−MEL−40、SSX−4、STAMP−1、STEAP−1、サバイビン、サバイビン−2B、SYT−SSX−1、SYT−SSX−2、TA−90、TAG−72、TARP、TEL−AML1、TGFbeta、TGFbetaRII、TGM−4、TPI/m、TRAG−3、TRG、TRP−1、TRP−2/6b、TRP/INT2、TRP−p8、チロシナーゼ、UPA、VEGFR1、VEGFR−2/FLK−1、及びWT1からなる群から選択される異なる癌又は腫瘍抗原をコードする、請求項1〜24及び28のいずれか一項に記載の方法。
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