JP6770654B2 - イネのウンカに対する虫害感受性遺伝子bgiosga015651及びその使用 - Google Patents
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Description
そのため、抗原材料を続いて深く選抜し研究し、新たな抵抗性遺伝子の探し、その関連する遺伝子マッピングとクローニングを行い、広範な地域で適用可能な、高抵抗性遺伝子材料を持つ新たなイネ品種を開発することは、非常に大きな意味がある。
Heenati(Bph3を持つ)の平均抵抗性レベルは4.61であり、Babawee(Bph4を持つ)の平均抵抗性レベルは8.14であり、虫害抵抗性品種BG1222の平均抵抗性レベルは1.07である。比較から分かるように、本発明に開示するイネのウンカに対する虫害感受性遺伝子BGIOSGA015651は、イネの育種及びイネのウンカ抵抗性を向上させる使用において大きな意味がある。
1)イネ試料の粉砕:極低温で凍結したイネサンプルを秤量した後、液体窒素で予備冷却した乳鉢に速やかに移し、乳棒で組織を粉砕し、その間に液体窒素を添加し続けて、粉末状に粉砕したら停止する。乳鉢に試料ホモジネート量に合わせた適量のRNAiso Plusを添加することができる。新鮮な組織試料の場合、直ちにRNAiso Plusを添加し、十分にホモジネートする。液体ホモジネートを遠心管に移し、室温(15〜30℃)で5分間静置する。12000g 4℃で5分間遠心する。上澄液を注意深く吸い取って、新しい遠心管に移す。
RNase−freeのDNase Iを用いて、以下のように反応液を調製する。
次に以下のステップにしたがって操作する。
1)等体積のフェノールを添加し、上下反転させ均一に混合させた後、10,000rpmで5min遠心し、上澄液を取り捨て、
2)等体積のクロロホルムを添加し、上下反転させ均一に混合させた後、10,000rpmで10min遠心し、上澄液を取り捨て、
3)等体積のイソプロパノールを添加し、緩和に十分に均一に混合させ、−20℃で15 min静置し、
4)4℃で10,000g 10min遠心し、RNA沈殿を採取し、上澄液を取り捨て、
5)75%のエタノールで2回洗浄し、クリーンベンチで風乾し、
6)10μlのDEPC処理水を添加して沈殿を溶解させる。
純度測定:2μlのRNA試料を60倍希釈し、微量分光光度計でOD値を測定し、OD260/OD280の比が1.8を超えていれば、調製したRNAが純粋であり、タンパク質汚染がないことを示す。
以下の成分に応じてRT反応液を調製する(反応液の調製は氷上で行ってください)。
上記10μlの反応溶液をTaKaRa−TP600 PCR機器において、37℃で15min、85℃で5sec反応させ、4℃で保温した後、−20℃で保存して使用に備える。
以下のプライマーを用いて、BGIOSGA015651の遺伝子発現量について分析を行い、その塩基配列は以下の通りである。
RE−f:TCCAGAGCAGGAAACAAGGAC(SEQ ID NO:7)、
RE−r:GCCTACGCCAGCACATGAAA(SEQ ID NO:8)。
1)反応系:
CFX96Real−Time(Bio−Rad)PCR機器で、95℃で30sec、95℃で5sec、60℃で30sec反応させ、40サイクル繰り返す。融解曲線解析:温度は60℃〜95℃である。
図1は、トビイロウンカに吸汁された後のイネ品種BG1222及びTN1におけるBGIOSGA015651の発現量の時間にそった変化である。
虫害抵抗性品種BG1222と虫害感受性品種TN1のBGIOSGA015651遺伝子に対して、それぞれクローニング、シークエンシング及び解析を行った。
BG1222とTN1との交雑によりF2後代集団を作製し、ここで、F2後代集団のサンプルn=512とした。その中から抵抗性スコア値が異なる60個の個体を選択して測定し、異なる抵抗性レベル及び表現型のF2後代個体に対して、それぞれそのBGIOSGA015651の発現量を測定し、BGIOSGA015651の発現量とイネの虫害抵抗性表現型との相関性を決定した。
図2は、交雑F2後代におけるBGIOSGA015651の発現量とイネの虫害抵抗性スコア値との関係である。
遺伝子編集技術を利用して、遺伝子ノックアウト試験(knockout)でBGIOSGA015651遺伝子をノックアウトすることにより、虫害感受性イネ品種TN1にはイネ品種BG1222と同様の虫害抵抗性が得られる。
BGIOSGA015651遺伝子cDNA配列から、その先端の配列を標的配列として選択し、gRNA(guide RNA)配列を設計し合成する(配列は以下のとおりであるが、標的配列と対応するgRNA配列はこの配列に限定されない)。gRNA配列断片を、ハイグロマイシン抵抗性マーカーを含むpBWA(V)Hベクター(武漢伯遠公司)に組み込む。このCRISPR/Cas9ゲノムでベクターシステムを編集し、標的配列のうちの1つの塩基を変異させる(1つの塩基を、標的配列から削除するかまたは標的配列に添加する)。BGIOSGA015651遺伝子cDNA配列にフレームシフト変異を発生させて、その発現する産物が元のアミノ酸産物ではなくなるようにし、BGIOSGA015651遺伝子をノックアウトするという目的を達成する。
標的配列:5′−ACATCTCTCAGTGCACGGCTGGG−3′(SEQ ID NO:10)。
1)虫害感受性イネTN1の成熟胚を材料としてカルスを誘導する:培養したアグロバクテリウム(EHA105)菌液を遠心管に入れ、遠心して上澄液を取り捨て、アグロバクテリウム懸濁液に調製し、一定の大きさに成長したカルスを選出し、アグロバクテリウム懸濁液に入れて感染させ、カルスを共存培地に置く。
Hyg−f:5′−ACGGTGTCGTCCATCACAGTTTGCC−3′(SEQ ID NO:11)、
Hyg−r:5′−TTCCGGAAGTGCTTGACATTGGGA−3′(SEQ ID NO:12)。
虫害感受性イネTN1のBGIOSGA015651遺伝子をノックアウトしたホモ接合苗に対して、幼苗期虫害抵抗性を検定する。
本発明は、虫害感受性イネ品種TN1(抵抗性レベル9)のBGIOSGA015651遺伝子をノックアウトした後、その抵抗性レベルが0〜1(高抵抗性レベル)まで顕著に向上し、虫害抵抗性品種BG1222の抵抗性(抵抗性レバルが1.07)と相当するか、またはそれよりもましになった。
本発明は、虫害感受性イネ品種TN1(抵抗性レベル9)のBGIOSGA015651遺伝子をノックアウトした後、幼苗期検定の方法により、そのセジロウンカに対する抵抗性レベルを検定する。
Claims (6)
- BGIOSGA015651遺伝子をノックアウトするかまたはその発現量を低減することにより、イネのウンカ抵抗性能を向上させ、遺伝子BGIOSGA015651のヌクレオチド配列が配列番号1または配列番号2に示すとおりであることを特徴とするイネのウンカ抵抗性能を向上させる方法。
- 分子育種法または遺伝子工学の方法により、BGIOSGA015651遺伝子をノックアウトするかまたはその発現量を低減することを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 遺伝子工学の方法はRNA干渉と遺伝子編集とを含むことを特徴とする請求項2に記載の方法。
- 前記ウンカは、トビイロウンカとセジロウンカを含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。
- イネのウンカ抵抗性タンパク質の発現量を抑制または低減することにより、イネのウンカ抵抗性能を向上させ、前記イネのウンカ抵抗性タンパク質のアミノ酸配列が配列番号5または配列番号6に示すとおりであることを特徴とするイネのウンカ抵抗性能を向上させる方法。
- 前記ウンカは、トビイロウンカとセジロウンカを含むことを特徴とする請求項5に記載の方法。
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