JP6012603B2 - バイオフィルムを除去するための組成物および方法 - Google Patents
バイオフィルムを除去するための組成物および方法 Download PDFInfo
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Description
この出願は、米国特許法§119(e)の下、2010年9月9日に出願された米国仮出願第61/381,377号(この内容は、その全体が本開示に参考として援用される)の利益を主張する。
本発明は概して、臨床上または工業上の細菌性バイオフィルムを減少させるおよび/または治癒するための方法および組成物に関する。
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド。
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド。
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド
の群の任意の1種または複数の薬剤と、使用指示書とを含むキットも提供される。一実施形態では、このキットは、1種または複数のアジュバント、抗原性ペプチド、または抗菌物質をさらに含む。さらに別の実施形態では、このキットは、液体担体、薬学的に受容可能な担体、固相担体、薬学的に受容可能な担体、インプラント、ステント、ペースト、ゲル、歯科用インプラント、または医療用インプラントの群から選択される担体をさらに含む。
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド。
たとえば、本発明は、以下の項目を提供する:
(項目1)
DNABIIポリペプチドまたはタンパク質と微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減するための方法であって、該DNABIIポリペプチドもしくはタンパク質または該微生物DNAを、HMGボックスドメインを含むポリペプチドと接触させ、それによって、該DNABIIタンパク質またはポリペプチドと該微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減する工程を含む、方法。
(項目2)
微生物バイオフィルムを阻害する、予防する、または破壊するための方法であって、該バイオフィルムを、HMGボックスドメインを含むポリペプチドと接触させ、それによって、該微生物バイオフィルムを阻害する、予防する、または破壊する工程を含む、方法。
(項目3)
上記接触させる工程が、in vitroまたはin vivoにおけるものである、項目1または2に記載の方法。
(項目4)
被験体においてバイオフィルムを阻害する、予防する、または破壊する方法であって、HMGボックスドメインを含む有効量のポリペプチドを該被験体に投与し、それによって、微生物バイオフィルムを阻害する、予防する、または破壊する工程を含む、方法。
(項目5)
被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染を阻害する、予防する、または処置するための方法であって、HMGボックスドメインを含む有効量のポリペプチドを該被験体に投与し、それによって、該被験体において該バイオフィルムを生じる微生物感染を阻害する、予防する、または処置する工程を含む、方法。
(項目6)
上記HMGボックスドメインを含むポリペプチドが、
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド
のうちの1つまたは複数を含む、項目1から5のいずれか一項に記載の方法。
(項目7)
上記HMGボックスドメインを含むポリペプチドが、1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1、HMGB1と少なくとも約70%同一であるポリペプチド、またはそれらのフラグメントを含む、項目1から6のいずれか一項に記載の方法。
(項目8)
上記単離されたまたは組み換え型のタンパク質が、翻訳後修飾されたもしくは翻訳後修飾されていない哺乳動物タンパク質、翻訳後にアルキル化されたもしくは翻訳後にアルキル化されていない哺乳動物のタンパク質、または非哺乳動物系において発現されたタンパク質の群から選択される、項目6または7に記載の方法。
(項目9)
上記哺乳動物タンパク質が、ヒトタンパク質である、項目8に記載の方法。
(項目10)
有効量の、抗菌物質、抗原性ペプチド、またはアジュバントのうちの1つまたは複数を上記被験体に投与する工程をさらに含む、項目4から9のいずれか一項に記載の方法。
(項目11)
上記被験体が、非ヒト動物またはヒト患者である、項目4から10のいずれか一項に記載の方法。
(項目12)
上記ポリペプチドが、局所的に、経皮的に、舌下に、直腸に、膣に、眼に、皮下に、筋肉内に、腹腔内に、尿道に、鼻腔内に、吸入によって、または経口的に、を含む方法によって投与される、項目4から11のいずれか一項に記載の方法。
(項目13)
上記被験体が、小児科の患者であり、上記ポリペプチドが、該小児科の患者用の処方物で投与される、項目4から12のいずれか一項に記載の方法。
(項目14)
上記バイオフィルムが、表1に特定される微生物由来の微生物DNAを含む、項目4から13のいずれか一項に記載の方法。
(項目15)
上記ポリペプチドが、上記微生物感染に対して局所的に投与される、項目4から14のいずれか一項に記載の方法。
(項目16)
免疫応答の誘発または提供を必要とする被験体において免疫応答を誘発するまたは提供するための方法であって、HMGボックスドメインを含む有効量のポリペプチドを該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目17)
上記投与が、上記免疫応答が所望される場所に限局的なものである、項目16に記載の方法。
(項目18)
上記HMGボックスドメインを含むポリペプチドが、
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド
のうちの1つまたは複数を含む:項目16または17に記載の方法。
(項目19)
上記HMGボックスドメインを含むポリペプチドが、1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1、HMGB1と少なくとも約70%同一であるポリペプチド、またはそれらのフラグメントを含む、項目16から18のいずれか一項に記載の方法。
(項目20)
上記単離されたまたは組み換え型のタンパク質が、哺乳動物タンパク質である、項目18または19に記載の方法。
(項目21)
上記哺乳動物タンパク質が、ヒトタンパク質である、項目20に記載の方法。
(項目22)
上記被験体が、非ヒト動物またはヒト患者である、項目16から21のいずれか一項に記載の方法。
(項目23)
バイオフィルムを破壊する、またはバイオフィルムを生じる微生物感染を阻害する、予防する、または処置するのに使用するための、
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド
の群の任意の1種または複数のポリペプチドと、指示書とを含む、キット
(項目24)
アジュバント、抗原性ペプチド、または抗菌物質のうちの1種または複数をさらに含む、項目23に記載のキット。
(項目25)
液体担体、薬学的に受容可能な担体、固相担体、薬学的に受容可能な担体、インプラント、ステント、ペースト、ゲル、歯科用インプラント、または医療用インプラントの群から選択される担体をさらに含む、項目23または24に記載のキット。
(項目26)
バイオフィルムを破壊する、またはバイオフィルムを生じる微生物感染を阻害する、予防する、または処置するための医薬品の製造における、
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%同一であるポリペプチド
の群のポリペプチドの使用。
「HMGドメイン」または「高移動度(high mobility group)(HMG)ボックスドメイン」は、DNAとの結合に関与するアミノ酸配列を指す(Strosら、「Cell Mol Life Sci.64(19−20):2590−606(2007))。一実施形態では、HMGボックスドメインの構造は、不規則に配列した3つのヘリックスからなる。別の実施形態では、HMGボックスドメインは、タンパク質が、(キンクしたまたは巻き戻された)非B型DNA構造と、高い親和性で結合することを可能にする。HMGボックスドメインは、高移動度タンパク質内に見ることができ、転写、複製、およびDNA修復などのDNA依存性プロセス(これらはすべて、クロマチンの構造の変化を必要とする)の調節に関与する(Thomas(2001)「Biochem.Soc.Trans.」29(Pt 4):395−401)。
本開示の一実施形態は、DNABIIポリペプチドまたはタンパク質と微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減するための方法であって、DNABIIポリペプチドもしくはタンパク質または微生物DNAを、HMGボックスドメインを含むポリペプチドと接触させ、それによって、DNABIIタンパク質またはポリペプチドと微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減する工程を含む方法を提供する。
(a)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、または本質的に1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる、または1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB1またはそのフラグメント;
(b)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、または本質的に1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる、または1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB2またはそのフラグメント;
(c)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、または本質的に1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる、または1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB3またはそのフラグメント;
(d)1つまたは複数のHMGボックスドメインを含む、または本質的に1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる、または1つまたは複数のHMGボックスドメインからなる単離されたまたは組み換え型のタンパク質HMGB4またはそのフラグメント;または
(e)(a)、(b)、(c)、または(d)のいずれかと少なくとも約70%、または少なくとも約75%、または少なくとも約80%、または少なくとも約85%、または少なくとも約90%、または少なくとも約95%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%同一であるポリペプチド。
本発明によって処置することができる微生物感染および疾患としては、表1に特定される微生物、例えば、Streptococcus agalactiae、Neisseria meningitidis、Treponemes,denticola,pallidum、Burkholderia cepacia、またはBurkholderia pseudomalleiによる感染が挙げられる。一実施態様では、微生物感染は、Haemophilus influenzae(分類不能型)、Moraxella catarrhalis、Streptococcus pneumoniae、Streptococcus pyogenes、Pseudomonas aeruginosa、Mycobacterium tuberculosisのうちの1つまたは複数である。これらの微生物感染は、上気道、中気道、または下気道(耳炎、副鼻腔炎、または気管支炎)、そして慢性閉塞性肺疾患(COPD)の増悪、慢性の咳、嚢胞性線維症(CF)の合併症および/または主因、および院外感染性肺炎(CAP)にも存在する可能性がある。
本発明の組成物および関連する方法は、他の治療法の適用と組み合わせて使用することができる。こうした治療法としては、DNアーゼ酵素、抗生物質、抗菌物質、または他の抗体の投与が挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書に記述した通りのin vitroおよびin vivo方法を実施するのに必要な薬剤および指示書を含有するキットも主張する。したがって、本発明は、本発明の生物学的薬剤と、本発明の方法を実施する(組織を採集すること、および/または選別を実施すること、および/または結果を分析すること、および/または本明細書で定義される通りの有効量の生物学的薬剤の投与など)ための指示書とを含むことができる、こうした方法を実施するためのキットを提供する。これらは、単独で、または他の適切な抗菌剤と組み合わせて使用することができる。
ウェスタンブロットのための方法および材料
1.SDS−Pageゲル(Bio−Rad mini PROTEAN(商標)TGXゲル カタログ番号456−1093)上で、1μg/ウェルの次の精製タンパク質を泳動させた:IHF、HU、TBP、およびHMG1。
使用される1次抗体および希釈
−ウサギ未処理血清(1:5000)
−ウサギ抗IHF(1:10,000)
−ウサギ抗TBP(1:10,000)
6.TTBSで3回洗浄した;それぞれ5分の洗浄。
HMGB1は、バイオフィルムDNAとの結合に関してHUおよびIHFと競合する。
この実施例は、中耳感染の処置のための動物モデルを説明する。中耳感染(または中耳炎、OM)は、世界中に非常に蔓延している疾患であり、全世界で1年に5000万〜3億3000万人の子供達が悩まされている。OMの社会経済的負担も大きく、損害額は、米国だけで年間50〜60億ドルと推定される。OMの主な細菌性病原体の3種すべてが、in vitroとin vivoの両方で、バイオフィルムを形成することが知られており、最近、臨床医は、OMの慢性化および再発が、少なくともある程度、中耳腔内の細菌性バイオフィルムの形成によることを認識するようになってきた。OMのあるチンチラモデルでは、若いチンチラに、最初にウイルスによる「風邪」を引かせ、1週間後に生菌を鼻腔内に接種した。「私の子供が風邪をひき、1週間後に耳の感染症にかかった」というようなヒトの状態と同様に、チンチラも、接種の約1週間後に、ウイルス性上気道感染症に罹りながら、細菌性OMを発症するであろう。細菌は、一旦、(耳管の上昇、またはそれに続く中耳洞への直接的攻撃を介して)中耳に到達すると、強固なバイオフィルムを形成することとなる。したがって、本出願人等は、存在するバイオフィルムの迅速な消散をもたらす、本明細書に記述する通りの組成物および方法の予防的有効性を実証するために、チンチラモデルを考え、実際に既に使用している。このモデルはまた、抗DNABII抗体の受動送達を介する、またはIHFまたは他のDNABIIファミリーメンバーに結合することが知られている小分子もしくは他の薬剤の送達を介する、治療的手法に有用である。
いくつかの口内細菌(例えば、Aggregatibacter actinomycetemcomitans、Porphyromonas gingivalis)は、歯槽骨および歯肉を破壊する、歯周病およびインプラント周囲炎などの炎症性疾患の病原に関係している。これらの細菌の病原性の調査は、有効な動物モデルがないことによって阻まれてきた。特定の細菌の病原性を調査することの課題の一つは、外来性細菌が動物の口腔内に導入される場合にバイオフィルムを定着させる難しさである。歯周病の動物モデルは開発されているが、培養可能な細菌は、植え付けた動物の口腔から、めったに回収されない。特定の細菌の病原性を判定することができる有効な動物モデルを開発することは、それらの細菌の発病機構を解明する大いなる助けとなるであろう。
この実験は、ライム病を処置するための妨害剤の前臨床試験のためのマウスモデルを提供する。Dresserら、Pathogens 5(12)e1000680,Epub 2009 Dec.4を参照のこと。ライム病は、米国では最も一般的なダニ媒介疾患である。1992年から2006年までに、報告症例は2倍以上になっており、2008年には約29,000の新しい患者が確認されている。推定では、ライム病の患者の実数は、流行地域では、報告されている数を6〜12倍上回る可能性がある。当然のことながら、人々は都市から郊外に移動し続け、オジロジカ(マダニ(tick species Ixodes)を運ぶ)も次第にこれらの地域をうろつくようになるので、これらの流行地域は拡大している。ライム病は、微生物Borrelia burgdorferi、スピロヘータによって引き起こされる。B.burgdorferiは、マダニが噛むことを介して伝染し、その後、血流を通じて他の組織および器官に伝播する。
この実験は、嚢胞性線維症を処置するための薬剤の前臨床試験のためのブタモデルを提供する。Stoltzら(2010)Science Translational Medicine 2(29):29ra31を参照のこと。嚢胞性線維症は、CF膜コンダクタンス制御因子(CFTRと呼ばれる)アニオンチャネルをコードする遺伝子の突然変異が原因の常染色体劣性遺伝疾患である。このモデルでは、ブタは、「CFTR」と呼ばれる遺伝子の欠損を保有するように特別に育種されており、またCFブタと呼ばれ、複数の細菌種による下気道の感染を含めたCF肺疾患という顕著な特徴を自然発生的に示す。このブタは、1)こうしたCFブタをポリペプチドまたは他の免疫原で免疫化し、それによって、肺における細菌性バイオフィルムを根絶することとなる抗体の形成を誘発するために、こうした動物の肺に噴霧によって抗IHF(または他の妨害剤)を送達して、疾患の徴候および随伴する病状の改善を判定するために、妨害剤で免疫化することができる。
本出願人等はまた、結核(TB)のための前臨床モデルも提供する。Ordwayら(2010)Anti.Agents and Chemotherapy 54:1820を参照のこと。微生物Mycobacterium tuberculosisは世界的な伝染病の増大の原因である。現在の数字によれば、約800万人のTBの新規の患者が存在し、TBが原因で年間約270万人が死亡することが示されている。HIVに感染している個人の同時感染としてのこの微生物の役割に加えて(HIVに感染している約4500万人のうち、約1/3はM.tuberculosisにも同時感染していると推定される)、分離菌が非常に多剤耐性となりつつあり、TBのための新規の薬物が四半世紀にわたって導入されていないことが特に厄介である。この動物モデルでは、SPFモルモットが、障壁コロニー内に維持され、エアロゾル化した噴霧剤を介して感染させて、約20cfuのM.tuberculosis株Erdman K01 bacilliを肺に送達する。接種後25、50、75、100、125、および150日目の細菌負荷の決定および病理組織学的判定のための組織の回収と共に、動物を屠殺する。TBの典型的な徴候を示さないマウスとは異なり、このようにして接種したモルモットは、中心が壊死した十分に器質化された肉芽腫、すなわちヒト疾患の顕著な特徴を示す。さらに、ヒトと同様に、モルモットは、原発巣複合体の一部としての流入領域リンパ節の重い化膿性肉芽腫性および壊死性リンパ節炎を示す。このモデルの使用によって、生じるM.tuberculosisバイオフィルム(これは、接種後のこうした動物の肺に形成されることが認められており、疾患の病因と慢性化との両方に寄与すると考えられている)の減少および/または除去のための治療戦略と予防戦略を確認および特定するための前臨床スクリーニングが提供されることとなる。
カテーテル/留置器具バイオフィルム感染の複数の動物モデルが知られている。Otto(2009)Nature Reviews Microbiology,7:555を参照のこと。微生物Staphylococcus epidermidisは、通常は正常な皮膚の細菌叢と考えられるが、多くの人が重要な日和見病原体とみなすものとなりつつあり、院内感染の原因菌の第一位である。第一に、この細菌は、器具挿入中に、通常のこの皮膚生着菌によって汚染された留置医療器具上で発生する大多数の感染の原因である。一般的には生命を脅かすものではないが、こうしたバイオフィルム感染の処置に伴う困難は、処置の頻度と相まって、深刻な公的健康保険の負担となる。S.epidermidisが原因である、血管カテーテルに伴われる血流感染単独の処置に伴う現在の費用は、米国では年間20億ドルに達する。S.epidermidisの他に、E.faecalisおよびS.aureusも、留置医療器具上に見られるコンタミネーションである。ウサギ、マウス、モルモット、およびラットを含めた、カテーテルに伴われるS.epidermidis感染の数種の動物モデルが存在し、これらはすべて、病因の分子機構を研究するために使用され、かつ、予防法および/または治療法の研究に適している。E.faecalis、S.aureus、およびS.epidermidisバイオフィルム形成を妨害する治療法を評価するために、ラット頸静脈カテーテルが使用されている。バイオフィルム減少は、多くの場合、3通りの方式で測定される−(i)カテーテルを超音波処理してCFUを算出する、(ii)カテーテルを薄切りにするもしくは単純にプレート上に置いて点数化する、または(iii)バイオフィルムをクリスタルバイオレットまたは別の色素で染色し、溶出し、CFUに代わるものとしてOD測定することができる。
本明細書に記述する方法は、ヒトおよび動物における免疫応答を引き起こすために使用することができる。免疫原性組成物は、限定はされないがアルミニウム塩およびリポソームなどのアジュバントの存在下で、ヒトおよび動物被験体に投与することができる。当業者であれば、任意の数の薬学的に受容可能なアジュバントも使用することができることを理解するであろう。免疫原性組成物は、筋肉内に、皮下に、鼻腔内に、または任意他の適切な経路を介して、ヒトまたは動物被験体に投与することができる。免疫原性組成物は、選択された投与様式に一致した方式で調製することができる。免疫原性組成物は、ポリペプチド、核酸、またはこれらの組み合わせの形をとることもできるし、全長または部分抗原を含むこともできる。さらに、またはあるいは、免疫原性組成物は、ある特定の抗原でパルスしたAPC、またはある特定の抗原をコードする1つまたは複数のポリヌクレオチドで形質移入したAPCの形をとることができる。投与は、免疫原性組成物の単回投与、または初回投与とそれに続く1回または複数回の追加免疫投与を含むことができる。追加免疫投与は、初回投与の、1日、2日、3日、1週間、2週間、3週間、1か月、2か月、3か月、6か月、もしくは12か月後、または他の任意の時点で提供することができる。追加免疫投与は、被験体の抗体力価の評価後に投与することができる。
本明細書に記述する方法は、免疫のない被験体に受動免疫を与えるために使用することができる。ある抗原に対する受動免疫は、ある特定の抗原を特異的に認識するまたはある特定の抗原と特異的に結合する抗体または抗原結合フラグメントの移入を介して与えることができる。抗体の供与者および受容者は、ヒトまたはヒトでない被験体であり得る。さらに、またはあるいは、抗体組成物は、ある特定の抗原を特異的に認識するまたはある特定の抗原と特異的に結合する抗体または抗原結合フラグメントをコードする単離されたまたは組み換え型のポリヌクレオチドを含むことができる。
Claims (13)
- 被験体における微生物バイオフィルムを阻害する、予防する、破壊するまたは処置するための方法において使用するための、HMGボックスドメインを含むポリペプチドを含む組成物であって、該ポリペプチドは、以下:
高移動度ボックス2タンパク質(HMGB2)、高移動度ボックス3タンパク質(HMGB3)、高移動度ボックス4タンパク質(HMGB4)、クロマチンSRY(性別決定領域Yタンパク質)の非ヒストン性成分、転写因子のSOXファミリー、配列特異的LEF1(リンパ系エンハンサー結合因子1)、TCF−1(T細胞因子1)、転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP;MTF1ミトコンドリア転写因子、RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小体転写因子UBF1/2(上流結合因子)、Abf2酵母ARS結合因子、lxr1、Rox1、Nhp6bおよびSpp41の群より選択される酵母転写因子;真菌の有性生殖に関与する接合型タンパク質(MAT)、YABBY植物特異的転写因子の群より選択されるポリペプチドの高移動度ボックスドメインを含むポリペプチド、または
高移動度ボックス2タンパク質(HMGB2)、高移動度ボックス3タンパク質(HMGB3)、高移動度ボックス4タンパク質(HMGB4)、クロマチンSRY(性別決定領域Yタンパク質)の非ヒストン性成分、転写因子のSOXファミリー、配列特異的LEF1(リンパ系エンハンサー結合因子1)、TCF−1(T細胞因子1)、転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP;MTF1ミトコンドリア転写因子、RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小体転写因子UBF1/2(上流結合因子)、Abf2酵母ARS結合因子、lxr1、Rox1、Nhp6bおよびSpp41の群より選択される酵母転写因子;真菌の有性生殖に関与する接合型タンパク質(MAT)、YABBY植物特異的転写因子の群より選択されるポリペプチドのHMGボックスドメインに対して少なくとも90%同一であるHMGボックスドメインを含むポリペプチド、
であり、
ここで、該ポリペプチドは、デオキシリボ核酸BII(DNABII)ポリペプチドまたはタンパク質と微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減する、組成物。 - 前記ポリペプチドが、前記被験体における前記微生物バイオフィルムのDNA/タンパク質マトリックス構成成分の形成を減少させる、請求項1に記載の組成物。
- 前記ポリペプチドが、翻訳後修飾されたもしくは翻訳後修飾されていない哺乳動物タンパク質、翻訳後にアルキル化されたもしくは翻訳後にアルキル化されていない哺乳動物のタンパク質、または非哺乳動物系において発現されたタンパク質の群から選択される、請求項1に記載の組成物。
- 前記タンパク質がヒトタンパク質である、請求項3に記載の組成物。
- 前記ポリペプチドが、有効量の、抗菌物質、抗原性ペプチド、またはアジュバントのうちの1つまたは複数と組み合わせて投与されることを特徴とする、請求項1から4のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記被験体が、小児科の患者であり、前記ポリペプチドが、該小児科の患者用の処方物で投与される、請求項1から5のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記バイオフィルムが、S.sobrinus、S.pyogenes、S.gordonii Challis、S.agalactiae、S.mutans、S.pneumoniae、S.gallolyticus、S.aureus、S.epidermidis、E.coli、H.influenza、Salmonella enteric serovar typhi、Aggregatibacter actinomycetemcomitans、YP 003255304、P.gingivalis、N.gonorrhoeae、N.meningitides、NMB 1302、P.aeruginosa、H.pylori、B.burgdorferi、Moraxella catarrhalis、V.cholera El Tor、Burkholderia cenocepacia、Burkholderia pseudomallei、Mycobacterium tuberculosis、Mycobacterium smegmatis、Treponema denticola、Treponema palladium Nichols、Prevotella melaninogenica、Prevotella intermedia、Bordetella pertusis Tohama、および、Enterococcus faecalisから選択される微生物由来の微生物DNAを含む、請求項1から6のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ポリペプチドが、局所的に、経皮的に、舌下に、直腸に、膣に、眼に、皮下に、筋肉内に、腹腔内に、尿道に、鼻腔内に、吸入によって、または経口的に、を含む方法によって投与される、請求項1から7のいずれか一項に記載の組成物。
- 被験体における微生物バイオフィルムを阻害する、予防するまたは処置するための方法における使用のためのキットであって、該キットは、請求項1に記載の任意の1種または複数のポリペプチドと、バイオフィルムを破壊する、またはバイオフィルムを生じる微生物感染を阻害する、予防する、もしくは処置するのに使用するための指示書とを含む、キット。
- アジュバント、抗原性ペプチド、または抗菌物質のうちの1種または複数をさらに含む、請求項9に記載の使用のためのキット。
- インビトロにおける微生物バイオフィルムを阻害する、予防するまたは処置するための方法における使用のためのキットであって、該キットは、請求項1に記載の任意の1種または複数のポリペプチドと、バイオフィルムを破壊する、またはバイオフィルムを生じる微生物感染を阻害する、予防する、もしくは処置するのに使用するための指示書とを含む、キット。
- 微生物バイオフィルムを阻害する、予防する、破壊するまたは処置するためのインビトロでの方法における、HMGボックスドメインを含むポリペプチドの使用であって、該ポリペプチドは、インビトロで該バイオフィルムと接触させられ、ここで、該ポリペプチドは、以下:
高移動度ボックス2タンパク質(HMGB2)、高移動度ボックス3タンパク質(HMGB3)、高移動度ボックス4タンパク質(HMGB4)、クロマチンSRY(性別決定領域Yタンパク質)の非ヒストン性成分、転写因子のSOXファミリー、配列特異的LEF1(リンパ系エンハンサー結合因子1)、TCF−1(T細胞因子1)、転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP;MTF1ミトコンドリア転写因子、RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小体転写因子UBF1/2(上流結合因子)、Abf2酵母ARS結合因子、lxr1、Rox1、Nhp6bおよびSpp41の群より選択される酵母転写因子;真菌の有性生殖に関与する接合型タンパク質(MAT)、YABBY植物特異的転写因子の群より選択されるポリペプチドの高移動度ボックスドメインを含むポリペプチド、または
高移動度ボックス2タンパク質(HMGB2)、高移動度ボックス3タンパク質(HMGB3)、高移動度ボックス4タンパク質(HMGB4)、クロマチンSRY(性別決定領域Yタンパク質)の非ヒストン性成分、転写因子のSOXファミリー、配列特異的LEF1(リンパ系エンハンサー結合因子1)、TCF−1(T細胞因子1)、転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP;MTF1ミトコンドリア転写因子、RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小体転写因子UBF1/2(上流結合因子)、Abf2酵母ARS結合因子、lxr1、Rox1、Nhp6bおよびSpp41の群より選択される酵母転写因子;真菌の有性生殖に関与する接合型タンパク質(MAT)、YABBY植物特異的転写因子の群より選択されるポリペプチドのHMGボックスドメインに対して少なくとも90%同一であるHMGボックスドメインを含むポリペプチド、
であり、
ここで、該ポリペプチドは、デオキシリボ核酸BII(DNABII)ポリペプチドまたはタンパク質と微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減する、使用。 - 微生物バイオフィルムを阻害する、予防する、破壊するまたは処置するためのインビトロでの方法であって、該方法は、HMGボックスドメインを含むポリペプチドを、インビトロで該バイオフィルムと接触させる工程を包含し、ここで、該ポリペプチドは、以下:
高移動度ボックス2タンパク質(HMGB2)、高移動度ボックス3タンパク質(HMGB3)、高移動度ボックス4タンパク質(HMGB4)、クロマチンSRY(性別決定領域Yタンパク質)の非ヒストン性成分、転写因子のSOXファミリー、配列特異的LEF1(リンパ系エンハンサー結合因子1)、TCF−1(T細胞因子1)、転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP;MTF1ミトコンドリア転写因子、RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小体転写因子UBF1/2(上流結合因子)、Abf2酵母ARS結合因子、lxr1、Rox1、Nhp6bおよびSpp41の群より選択される酵母転写因子;真菌の有性生殖に関与する接合型タンパク質(MAT)、YABBY植物特異的転写因子の群より選択されるポリペプチドの高移動度ボックスドメインを含むポリペプチド、または
高移動度ボックス2タンパク質(HMGB2)、高移動度ボックス3タンパク質(HMGB3)、高移動度ボックス4タンパク質(HMGB4)、クロマチンSRY(性別決定領域Yタンパク質)の非ヒストン性成分、転写因子のSOXファミリー、配列特異的LEF1(リンパ系エンハンサー結合因子1)、TCF−1(T細胞因子1)、転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP;MTF1ミトコンドリア転写因子、RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小体転写因子UBF1/2(上流結合因子)、Abf2酵母ARS結合因子、lxr1、Rox1、Nhp6bおよびSpp41の群より選択される酵母転写因子;真菌の有性生殖に関与する接合型タンパク質(MAT)、YABBY植物特異的転写因子の群より選択されるポリペプチドのHMGボックスドメインに対して少なくとも90%同一であるHMGボックスドメインを含むポリペプチド、
であり、
ここで、該ポリペプチドは、デオキシリボ核酸BII(DNABII)ポリペプチドまたはタンパク質と微生物DNAとの結合を阻害する、競合する、または低減する、方法。
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