JP5826406B2 - ストレプトマイセス、抗腫瘍化合物スピロインディマイシン(Spiro−Indimycin)A−D、その製造方法及び使用、並びに、該スピロインディマイシンを含む抗腫瘍剤及び薬物 - Google Patents
ストレプトマイセス、抗腫瘍化合物スピロインディマイシン(Spiro−Indimycin)A−D、その製造方法及び使用、並びに、該スピロインディマイシンを含む抗腫瘍剤及び薬物 Download PDFInfo
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Description
ストレプトマイセスSCSIO03032株は、グラム陽性の好気性放線菌である。その基生菌糸は僅かに黄色の分枝であり、気菌糸は灰色の分枝でコイル状の胞子鎖に分化する。胞子は、楕円状(図2)で、0.4−0.7μmの長さで、滑らかな表面を有している。PDA培地上での成長は弱い。ISP5上では成長がみられ、可溶性色素を産生する。カタラーゼ、ウレアーゼ、牛乳の凝固及びペプトン化反応は陽性であり、ゼラチン液化、メラニン産生、及びオキシダーゼ反応は陰性である。また、デンプン、セルロース、Tween20、40、80を加水分解することができ、硫化水素の生成と硝酸塩還元反応は陰性である。D−アラビノース、D−セロビオース、フルクトース、イノシトール、ピルビン酸ナトリウム、D−ラフィノース、L−ラムノース、D−マンニトール、D−グルコース、D−ソルボース、及びキシリトールを、唯一の炭素源およびエネルギー源として利用し成長できるが、D−ガラクトース、D−ラクトース、D−マンノース、D−リボース、D−トレハロース、及びD−キシロースを利用することはできない。メトキシピリミジン及びリンコマイシンへの感受性がある。pH、塩濃度、及び温度の許容範囲は、それぞれ、pH6.0−9.0、0−9%、及び15−40℃である。細胞壁にL−DAPを含有する。主なキノンはMK−9(H6)及びMK−11であり、主な脂肪酸はi−C15:0(8%)、i−C16:0(24%)、i−C16:1G(14%)、ai−C17:0(15%)、及びai−C17:1A(12%)である。G+Cのモル含有量は71.6(±0.5)%である。
SCSIO03032株の16S rDNAを従来のPCR法で増幅し配列を決定した。その配列をSEQ ID NO.1に示す。その後、GenBank中の16S rDNAヌクレオチド配列を用いてBLAST解析を行った。その結果、当株はストレプトマイセス・スペシャリス(Streptomyces specialis)GW41−1564T株と97%の類似性を示した。ストレプトマイセス属の進化系統樹を作成すると、そのグループの一つにSCSIO03032株がまとまることから、SCSIO03032株がストレプトマイセス属に所属することが分かった。図1に示すように、近隣結合法による結果は当株とストレプトマイセス属種との系統進化関係を明らかに表しており、当株がストレプトマイセス属の一種であることを示している。
b)エキスAとエキスBからなる粗抽出物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにかけ、クロロホルム/メタノールを溶離液として体積比100:0〜0:100で勾配溶出を行い、クロロホルム/メタノールの体積比が95:5の際に勾配溶出した留出物Fr.1を集める。Fr.1をODS逆相クロマトグラフィーにかけ、水/メタノールを溶離液として体積比100:0〜0:100で勾配溶出を行い、水/メタノールの体積比が30:70の際に勾配溶出した留出物Fr.1−1を集める。Fr.1−1をさらにLH−20ゲルカラムに通し、体積比1:1のクロロホルム/メタノールを流動相として溶出を行い、薄層クロマトグラフィーによるトラッキング分離を行う。薄層プレート上で、体積比9:1のクロロホルム/メタノールを展開剤とするとき、Rf値が0.8である留出物をスピロインディマイシンBとして、Rf値が0.6である留出物をスピロインディマイシンAとして、また、体積比40:60の石油エーテル/酢酸エチルを展開剤とするとき、Rf値が0.8である留出物をスピロインディマイシンCとして、体積比50:50の石油エーテル/酢酸エチルを展開剤とするとき、Rf値が0.8である留出物をスピロインディマイシンDとして、それぞれ、集める。
活性化されたストレプトマイセスSCSIO03032株を種培地に接種し、28℃、200rpmの条件で48時間培養して種液を獲得する。種液を10%の接種量で発酵培地に接種し、28℃、200rpmの条件で120時間振とう培養して発酵培養物を得る。種培地と発酵培地は、共に1リットルの培地当たり、デンプン10g、酵母パウダー5g、ペプトン4g、炭酸カルシウム2g、粗塩30g、残量の水を含み、pHは7.2である。
I.ストレプトマイセスSCSIO03032株の分離と同定
本発明の新規ストレプトマイセス属菌、SCSIO03032株は、インド洋(E87°59.7’、N9°59.3’)の深さ3412メートルの海底堆積物から分離して獲得した。分離培地は、周知技術に基づいて最適化したISP2培地であり、1リットルの培地に、酵母エキス2.0g、モルトエキス2.0g、グルコース1.0g、寒天20.0g、蒸留水500ml、天然海水500mlを含有し、pHは7.2である。分離培養の条件は28℃、14日である。それによって、海底堆積物からSCSIO03032株(ストレプトマイセス属菌(Streptomyces sp.)SCSIO03032株)を分離純化して獲得した。
ストレプトマイセスSCSIO03032株は、グラム陽性の好気性放線菌である。その基生菌糸は僅かに黄色の分枝であり、気菌糸は灰色の分枝でコイル状の胞子鎖に分化する。胞子は、楕円状(図2)で、0.4−0.7μmの長さで、滑らかな表面を有している。PDA培地上での成長は弱い。ISP5上では成長がみられ、可溶性色素を産生する。カタラーゼ、ウレアーゼ、牛乳の凝固及びペプトン化反応は陽性であり、ゼラチン液化、メラニン産生、及びオキシダーゼ反応は陰性である。また、デンプン、セルロース、Tween20、40、80を加水分解することができ、硫化水素の生成と硝酸塩還元反応は陰性である。D−アラビノース、D−セロビオース、フルクトース、イノシトール、ピルビン酸ナトリウム、D−ラフィノース、L−ラムノース、D−マンニトール、D−グルコース、D−ソルボース、及びキシリトールを、唯一の炭素源およびエネルギー源として利用し成長できるが、D−ガラクトース、D−ラクトース、D−マンノース、D−リボース、D−トレハロース、及びD−キシロースを利用することはできない。メトキシピリミジン及びリンコマイシンへの感受性がある。pH、塩濃度、及び温度の許容範囲は、それぞれ、pH6.0−9.0、0−9%、及び15−40℃である。細胞壁にL−DAPを含有する。主なキノンはMK−9(H6)及びMK−11であり、主な脂肪酸はi−C15:0(8%)、i−C16:0(24%)、i−C16:1G(14%)、ai−C17:0(15%)、及びai−C17:1A(12%)である。G+Cのモル含有量は71.6(±0.5)%である。
ストレプトマイセスSCSIO03032株を同定するにあたって、ゲノムDNAの抽出、16S rDNAのPCR増幅、配列比較、及び進化系統樹の構築、並びに、生理学的、化学的、及び形態学的同定などについては、文献[Tian, X.P.,Zhi,X.Y.,Qiu、Y.Q.,Zhang,Y.Q.,Tang,S.K.,Xu,L.H.,Zhang,S.,Li,W.J.Sciscionella marina gen.nov.,sp.nov.,a marine actinomycete isolated from a sediment in the northern South China Sea. Int J Syst Evol Microbiol, 2009, 59(Pt2):222−228]を参考にして行った。
1.培地(種培地と発酵培地)
1リットル培地あたり、デンプン10g、酵母パウダー5g、ペプトン4g、炭酸カルシウム2g、粗塩30g、及び、残量の水を含有し、pHは7.2。121℃で、30分の滅菌を行った。
2.1.種培養
シャーレ上の活性化されたストレプトマイセスSCSIO03032株の単一コロニーを、50mLの培地がそれぞれ入っている250ml三角フラスコ、計18本に接種し、28°C、200r・min−1で48時間培養して、種液900mLを得た。
2.2.発酵培養
種液を10%(体積パーセント)の接種量で9Lの発酵培地(50mLの培地がそれぞれ入っている250mL三角フラスコ、計180本)となるよう接種し、28°C、200r・min−1で120時間振とう培養して発酵培養物9Lを得た。
まず、発酵培養物を遠心分離して(3500r・min−1、8分)、9Lの上澄み液(発酵液)と菌糸体を得た。発酵液をマクロポーラス型樹脂XAD16で固相抽出してから、マクロポーラス型樹脂からアセトンで3回溶出を行い、溶出液からアセトンを回収し、残った残液を酢酸エチルで3回抽出して、その酢酸エチル層を蒸留濃縮してエキスA(4.1g)を獲得した。菌糸体を2Lアセトンで室温下に3回(各回3時間)浸出し、浸出液をまとめ、減圧してアセトンを回収し、残った残液を6Lの酢酸エチルで抽出し、酢酸エチル層を減圧蒸留して菌糸体抽出物、エキスB(0.9g)を得た。
4.1スピロインディマイシンA−Dの抽出分離と同定
エキスAとエキスBのサンプルをそれぞれ少量はかり、100μLのメタノールに溶かし、遠心分離により上澄み10μLを取り、HPLC測定を行った。その結果、エキスAは、化合物1(1)と2(2)を含有し、エキスBは化合物3(3)と4(4)を含有することが示唆された(図3)。エキスAとエキスBを1つにまとめた。このまとめた粗抽出物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(300−400メッシュ)にかけ、クロロホルム/メタノールを溶離液として体積比100:0−0:100で勾配溶出を行い、クロロホルム/メタノールの体積比が95:5の際に勾配溶出した留出物Fr.1(3.03g)を集め、蒸発させた。Fr.1をODS逆相クロマトグラフィー(YMC*GEL ODS−Aボール型充填剤、孔径120A,粒径50um,240×4.0cm I.D.)にかけ、流速25ml/minで、水/メタノールを溶離液として体積比100:0−0:100で勾配溶出を行い、水/メタノールの体積比が30:70の際に勾配溶出した留出物Fr.1−1(1.57g)を集めた。Fr1−1をさらにLH−20ゲルカラム(2.5*100cm)に通し、体積比1:1のクロロホルム/メタノールを流動相として溶出を行い、流速1ml/minで、100ml毎に集め合併して1セットとし、順次にFr.1−1−A〜Gの7つのサンプルを得た。その中で、Fr.1−1−Cは331mg、Fr.1−1−Dは626mg、Fr.1−1−Eは27mgであった。Fr.1−1−Cについて、体積比9:1のクロロホルム/メタノールを展開剤として薄層調製により、Rf値が0.8であるストリップを集め、酢酸エチル溶出により化合物2(18.0mg)(スピロインディマイシンB)を得、Rf値が0.6であるストリップを集め、酢酸エチル溶出により化合物1(5.0mg)(スピロインディマイシンA)を得た。Fr.1−1−Dについて、体積比40:60の石油エーテル/酢酸エチルを展開剤として薄層調製により、Rf値が0.8であるストリップを収集し、酢酸エチル溶出により化合物3(22.0mg)(スピロインディマイシンC)を得た。Fr.1−1−Eについて、体積比50:50の石油エーテル/酢酸エチルを展開剤として薄層調製により、Rf値が0.8であるストリップを収集し、酢酸エチル溶出により化合物4(6.6mg)(スピロインディマイシンD)を得た。
既知の化合物リナミシンAとの違いとして、化合物2は珍しい5/5スピロを形成していることが挙げられる。スピロ構造を形成することは、H−2′[δH 3.63(d)]からC−3[δC 140.1(s)]との間、H−2′[δH 4.06(d)]からC−2″[δC 154.5(s)]との間、及びH−2[δH 6.91(d)]からC−3″[δC 112.1(s)]との間の重要なHMBC相関から支持される。この化合物2に関する推測は、X線測定結果(図5)によっても裏付けられている。また、分子中に存在する塩素原子により、X線測定結果から化合物2のC−3′の絶対配置はR配置であることが確定された。化合物2の構造を式(II)に示す。化合物2をスピロインディマイシンBと命名した。
7種の腫瘍細胞株:ヒト乳癌MCF−7細胞、ヒト膵癌1990細胞、ヒト肝細胞癌細胞HepG2細胞、ヒト子宮頚癌Hela細胞、マウス黒色腫B16細胞、ヒト肺癌H460細胞、及びヒト急性リンパ芽球性白血病Tリンパ細胞CCRF−CEM細胞への、スピロインディマイシンA−Dの活性を測定した。実験方法は、文献[Wu,Z.C.;Li,D.L.;Chen,Y.C.;Zhang,W.M.,A new isofuranonaphthalenone and benzopyrans from the endophytic fungus Nodulisporium sp.A4 from Aquilaria sinensis.Helv.Chim.Acta 2010,93,(5),920−924]を参考にした。対照としてスタウロスポリンを用いた。
Claims (10)
- 受託番号CCTCC NO.M2011258として寄託されたストレプトマイセスSCSIO03032株。
- 請求項2に記載のスピロインディマイシンを含む抗腫瘍剤。
- 請求項2に記載のスピロインディマイシンのうち前記スピロインディマイシンAを含む、ヒト急性リンパ芽球性白血病を治療するための薬物。
- 請求項2に記載のスピロインディマイシンのうち前記スピロインディマイシンBを含む、ヒト黒色腫、ヒト肺癌、またはヒト急性リンパ芽球性白血病を治療するための薬物。
- 請求項2に記載のスピロインディマイシンのうち前記スピロインディマイシンCを含む、ヒト肝細胞癌またはヒト肺癌を治療するための薬物。
- 請求項2に記載のスピロインディマイシンのうち前記スピロインディマイシンDを含む、ヒト黒色腫、ヒト肝細胞癌、またはヒト肺癌を治療するための薬物。
- スピロインディマイシンA、B、C、またはDの製造における、請求項1に記載のストレプトマイセスSCSIO03032株の使用。
- 請求項1に記載のストレプトマイセスSCSIO03032株の発酵培養物から単離してスピロインディマイシンA、B、C、またはDを得ることを特徴とするスピロインディマイシンA、B、C、またはDの製造方法。
- a)ストレプトマイセスSCSIO03032株の発酵培養物を培養し、前記発酵培養物から発酵液と菌糸体を分離し、
前記発酵液をマクロポーラス型樹脂に吸着させ、前記マクロポーラス型樹脂からアセトンで溶出を行い、該溶出液からアセトンを回収して残った残液を酢酸エチルで抽出し、該酢酸エチル相を蒸留濃縮してエキスAを獲得し、
前記菌糸体をアセトンで浸出し,該浸出液からアセトンを回収し残った残液をさらに酢酸エチルで抽出し、該酢酸エチル相を蒸留濃縮してエキスBを獲得し、
b)前記エキスA及び前記エキスBを含む粗抽出物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにかけ、クロロホルム/メタノールを溶離液として体積比100:0−0:100で勾配溶出を行い、クロロホルム/メタノールの体積比が95:5の際に勾配溶出した留出物Fr.1を集め、ODS逆相クロマトグラフィーにかけ、水/メタノールを溶離液として体積比100:0−0:100で勾配溶出を行い、水/メタノールの体積比が30:70の際に勾配溶出した留出物Fr.1−1を集め、さらにLH−20ゲルカラムに通し、体積比1:1のクロロホルム/メタノールを流動相として溶出を行い、薄層クロマトグラフィーによるトラッキング分離を行い、薄層プレート上で、体積比9:1のクロロホルム/メタノールを展開剤とするとき、Rf値が0.8である留出物をスピロインディマイシンBとして、Rf値が0.6である留出物をスピロインディマイシンAとして集め、
また、薄層プレート上で、体積比40:60の石油エーテル/酢酸エチルを展開剤とするときRf値が0.8である留出物をスピロインディマイシンCとして集め、体積比50:50の石油エーテル/酢酸エチルを展開剤とするときRf値が0.8である留出物をスピロインディマイシンDとして集める、
ことを特徴とする請求項9に記載の製造方法。
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