JP2023095954A - ホスフェート誘導体の合成 - Google Patents
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Abstract
Description
NUC-3373
(S p )-NUC-3373
工程a)
式(IIa)
工程b)
P1が保護基である場合、任意に、式(IVa)の化合物から保護基P1を除去して、NUC-3373を、実質的にジアステレオマー的に純粋な形で提供する。
工程a)
式(IIb)
工程b)
P2、P3及びP4のいずれか1以上が保護基である場合、任意に、式(IVb)の化合物から保護基P2、P3及びP4を除去して、NUC-7738を、実質的にジアステレオマー的に純粋な形で提供する。
工程a)
式(IIa)
工程b)
P5、P6、P7及びP8のいずれか1以上が保護基である場合、任意に、式(IVc)の化合物から保護基P5、P6、P7及びP8を除去して、NUC-9701を、実質的にジアステレオマー的に純粋な形で提供する。
c)式(IIa)の化合物のX-ジアクリレート単量体又は式(IIa)の化合物のXR-及びY-ジアステレオマーの混合物を、溶媒(S2)に懸濁又は溶解し;
d)溶液又は懸濁液を塩基(B2)で処理して、X-ジアステレオマーを、実質的にジアステレオマー的に濃縮された形で得て;及び
e)式(IIa)のX-ジアステレオマーを単離する
ことを含んでなる。一般的には、X-ジアステレオマーは、(S)-ジアステレオマーであり、Y-ジアステレオマーは、(R)-ジアステレオマーである。
c)式(IIb)の化合物の(Rp)-ジアステレオマー、又は式(IIb)の化合物の(Rp)-及び(Sp)-ジアステレオマーの混合物を溶媒(S2)に懸濁又は溶解させ、
d)溶液又は懸濁液を塩基(B2)にて処理して、(Sp)-ジアステレオマーを、実質的にジアステレオマー的に濃縮された形で得て、
e)式(IIb)の化合物の(Sp)-ジアステレオマーを単離する
ことを含んでいてもよい。
ACN:アセトニトリル、AIBBr:臭化アセトキシイソブチリル、BOC:t-ブチルカーボネート、DCM:ジクロロメタン、DMAP:N,N-ジメチル-4-アミノピリジン、DMF:N,N-ジメチルホルムアミド、eq.:モル当量、FUDR:5-フルオロ-2’-デオキシウリジン、IPA:イソプロピルアルコール、MEM:2-メトキシエトキシメチル、MOM:メトキシメチル、MTBE:メチル-t-ブチルエーテル、NMP:N-メチル-2-ピロリドン、Np:1-ナフチル、PTSA:p-トルエンスルホン(トシル)酸、RT:室温、TBAF:フッ化テトラブチルアンモニウム、TBDMS :t-ブチルジメチルシリル、TEA:トリエチルアミン、Tf:トリフルオロメチルスルホネート(トリフレート)、TFA:トリフルオロ酢酸、THF:テトラヒドロフラン。
下記の実施例によって、本発明を更に説明するが、これら実施例は、単に説明のためのものであって、本発明の範囲を限定すること意図するものではない。
収量:210g
HPLCによるキラル純度(%面積):33.74:66.26%(RP:SP)
収量:112g
HPLCによるキラル純度(%面積):22.13:77.87%(RP:SP)
濾液を真空下で濃縮して、化合物5のジアステレオマー混合物(75g;RP:SP:65.43:34.57%)を得た。
式(IIb)の化合物のジアステレオマー混合物(112g; RP:SP:22.13:77.87%)に、25~35℃において、酢酸エチルの20%ヘキサン溶液(1.2L)を充填し、1時間、撹拌した。固体を濾過し、酢酸エチルの20%ヘキサン溶液(300 ml)にて洗浄して、化合物5の実質的に純粋なSp-ジアステレオマーを得た。
収量:80g
HPLCによるキラル純度(%面積):0.20:99.80%
1H NMR (300MHz, DMSO-d6):7.18-7.41(m, 10H), 6.91-6.99(d, 1H), 5.10(s, 2H), 4.01-4.11(m, 1H), 1.30-1.32(d, 3H)
ESI-MS (m/z):524 (M+1)
濾液を真空下で濃縮して、化合物5のジアステレオマー混合物を得た(28g;RP:SP:80.77:19.23%)。
収量:45g
HPLCによるキラル純度(%面積):91.29:8.71%(SP:RP)
得られた2-[(2,3,4,5,6-ペンタフルオロフェノキシ)-フェノキシ-ホスホリルアミノ]プロピオン酸ベンジルエステル5のRp及びSp-ジアステレオマー混合物(45g;Rp:Sp:8.71:91.29%)を、25~30℃において、酢酸エチルの20%ヘキサン溶液(1.1L)中でスラリー化し、同じ温度において、1時間、撹拌した。固体を濾過し、酢酸エチルの20%ヘキサン溶液(225 ml)にて洗浄して、題記化合物のSp-ジアステレオマーを、固体として得た。
収量:19g
HPLCによるキラル純度(%面積):99.2:0.08%(Sp:Rp)
塩化メチレン(500 ml)におけるL-アラニンベンジルエステル塩酸塩1(50g)の混合物に、25~35℃において、撹拌しながら、フェニルジクロロホスフェート2(54g)を添加し、得られた混合物を-70~-78℃に冷却し、トリエチルアミン(65.2 ml)を添加し、同じ温度において、1時間、撹拌した。反応系の温度を25~35℃に上昇させ、2時間、撹拌した。反応完了後、反応系を、35℃以下において、減圧下で濃縮して、残渣を得た。得られた残渣に、25~35℃において、ジイソプロピルエーテル(1L)を添加し、同じ温度において、30分間、撹拌した。反応系を濾過し、ジイソプロピルエーテル(250 ml)にて洗浄し、続いて、濾液を、35℃以下において、真空下で濃縮して、フェニル-(ベンゾキシ-L-アラニニル)-クロロリン酸3を得た。得られた化合物を、25~35℃において、塩化メチレン(500 ml)に溶解し、-5~-10℃に冷却した。反応系に、同じ温度において、4-ニトロフェノール6(27.5g)、トリエチルアミン(65.2 ml)を添加し、2時間、撹拌した。反応完了後、反応系を、35℃以下において、真空下で濃縮し、25~35℃において、酢酸エチル(500 ml)を充填し、同じ温度において、30分間、撹拌した。固体を濾過し、酢酸エチル(500 ml)にて洗浄した。濾液を、水(500 ml)、10%炭酸ナトリウム(2×500 ml)、塩水(500 ml)での洗浄に供し、有機相を、無水の硫酸ナトリウムにて乾燥し、35~40℃において、真空下で濃縮して、題記化合物7のジアステレオマー混合物を、粘稠な油状液体として得た。
収量:90g
HPLCによるキラル(%面積):45.6:54.94%(RP:SP)
上記のように得られた2-[(4-ニトロフェノキシ)-フェノキシ-ホスホリルアミノ]プロピオン酸ベンジルエステル7のジアステレオマー混合物(40g;Rp:Sp:45.6:54.94%)を、分取HPLCによって、純粋なSp及びRp-ジアステレオマーに分離し、純粋なフラクションを、真空下で濃縮して、別々に、Sp及びRp-ジアステレオマーを得た。
収量;Sp-ジアステレオマー:8g
1H NMR (300MHz, CDCl3):8.15-8.19 (d, 2H), 7.15-7.37 (m, 12H), 5.12 (s, 2H), 4.02-4.24 (m, 2H), 1.39-1.42 (d, 3H)
ESI-MS (m/z):479 (M+Na)
Rp-ジアステレオマー:6g
1H NMR (300MHz, CDCl3):8.08-8.13 (d, 2H), 7.15-7.34 (m, 12H), 5.10 (s, 2H), 4.48-4.56 (m, 1H), 4.11-4.20 (m, 1H), 1.39-1.41 (d, 3H)
ESI-MS (m/z): 457 (M+1) +
Sp及びRp-ジアステレオマー混合物:20g
ペンタフルオロフェノール4(85.3 g)の二塩化メチレン(1000 ml)溶液を、ゆっくりと添加し、続いて、温度を10℃に維持しながら、トリメチルアミン(46.8 g)をゆっくりと添加した。窒素雰囲気下、10℃(10±5℃)において、トリエチルアミン46.9 gを、ゆっくりと反応系に添加した。混合物を、10℃において、2時間、撹拌し、ついで、温度を10℃に維持しながら、0.5N HCl溶液を、ゆっくりと添加することによってクエンチした。室温に加温した後、混合物を分離し、有機相を、飽和炭酸水素塩溶液、蒸留水、及び塩水にて洗浄し、ついで、真空濃縮した。
粗製の混合物を、25℃において、酢酸エチルの20%n-ヘプタン溶液1500 ml中に懸濁させた。トリエチルアミン(12.2 g)を添加し、混合物を、25℃において、撹拌した。混合物を濾過し、固体を、酢酸エチル2500 mlに溶解し、水及び塩水にて洗浄し、真空濃縮した。固体を、酢酸エチルの20%n-ヘプタン溶液1200 ml中に懸濁させ、45~60分間、撹拌し、濾過した。物質を、真空下で乾燥して、所望の生成物5-(Sp)を得た。収率は40~80%の範囲であり、ジアステレオマー純度は99%以上であった。
50%IPA/水(2.4L)を粗製化合物に添加し、25℃において、1時間、撹拌した。固体化合物を濾過し、湿ったケーキを、50%IPA/水(500 ml)にて洗浄し、ついで、真空乾燥した。再度、50%IPA/水(2.4L)を粗製化合物に添加し、25℃において、1時間、撹拌し、ついで、濾過し、再度、ケーキを50%IPA/水(500 ml)にて洗浄し、ついで、真空乾燥した。半乾燥した化合物を、25~30℃において、シクロヘキサン(10v/w)にて、1時間、洗浄し、ついで、固体化合物を、シクロヘキサン(2L)にて洗浄し、湿った化合物12を、真空中、55~60℃において、12時間、乾燥した。
結果:
化合物の質量:252 g
全収率:66%
HPLC純度:98.31%(ジアステレオマー比:1:1)
31P NMR (202MHz, CDCl3):δP 1.35, -1.41;
1H NMR (500MHz, CDCl3):δH 8.13-8.10 (1H, m, H-Ar), 7.90-7.88 (1H, m, H-Ar), 7.73 (1H, 見掛けd, J= 8.5Hz, H-Ar), 7.62-7.55 (3H, m, H-Ar), 7.45-7.41 (1H, m, H-Ar), 7.36-7.28 (5H, m, H-Ar), 5.01 (1H, 見掛けs, CH2Ph), 5.12 (1H, q, J=12.5Hz, CH2Ph), 4.38-4.31 (1H, m, NHCHCH3), 4.17-4.08 (1H, m, NHCHCH3), 1.49, 1.47 (3H, 2 x d, J=3.5Hz, NHCHCH3);
MS (ES+) m/z:574 (M+Na+, 100%)、精密質量:C26H19F5NO5P理論値551.40、実測値574.05 (M+Na+);
逆相HPLC(H2O/MeOH(20/80)にて、F=1ml/分、35分で溶離、λ=254):2つのジアステレオマーについてのtR=12.96分、14.48分を有する2つのピーク
化合物12のジアステレオマーを、Biotage社のIsoleraでのHPLCによって分離した:溶離剤としてのMeOH/H2O(70/30)混合物とともに、C18 SNAP Ultra(30g)カートリッジを使用したところ、迅速に溶離される異性体(Rpジアステレオマーと考えられる)及びゆっくりと溶離される異性体(Spジアステレオマーと考えらえる)が得られた。
注:C18(逆相)カートリッジ及びHPLC分析カラムにおける保持時間に基づき、異性体を、迅速溶離(FE)及び遅速溶離(SE)と名付ける。
迅速溶離異性体(Rpジアステレオマーと考えられる):
31P NMR (202MHz, CDCl3):δP1.41;
1H NMR (500MHz, CDCl3):δH8.02 (1H, dd, J=7.0, 2.0Hz, H-Ar), 7.79 (1H, dd, J=6.5, 3.0Hz, H-Ar), 7.64 (1H, d, J=8.5Hz, H-Ar), 7.53-7.45 (3H, m, H-Ar), 7.33 (1H, t, J=8.0Hz, H-Ar), 7.28-7.23 (5H, m, H-Ar), 5.09 (s, 2H, CH2Ph), 4.29-4.21 (1H, m, NHCHCH3), 4.02-3.97 (1H, m, NHCHCH3), 1.38 (3H, d, J=7.0Hz, NHCHCH3);
MS (ES+) m/z:574 (M+Na+, 100%), 精密質量:C26H19F5NO5P理論値551.40、実測値574.05 (M+Na+);
逆相HPLC(H2O/MeOH(20/80)にて、F=1ml/分、35分で溶離、λ=254):tR=12.96
遅速溶離異性体(Spジアステレオマーと考えらえる):
31P NMR (202MHz, CDCl3):δP 1.36;
1H NMR (500MHz, CDCl3):δH 8.14-8.11 (1H, m, H-Ar), 7.90-7.87 (1H, m, H-Ar), 7.74 (1H, d, J=8.0Hz, H-Ar), 7.60 (1H, d, J=8.0Hz, H-Ar), 7.58-7.55 (2H, m, H-Ar), 7.44 (1H, t, J=8.0Hz, H-Ar), 7.34-7.30 (5H, m, H-Ar), 5.12 (2H, q, J=12.5Hz, CH2Ph), 4.35-4.29 (1H, m, NHCHCH3), 4.04-4.00 (1H, m, NHCHCH3), 1.48 (3H, d, J=7.0Hz, NHCHCH3);
MS (ES+) m/z: 574 (M+Na+, 100%), 精密質量:C26H19F5NO5P 理論値551.40、実測値574.05 (M+Na+);
逆相HPLC(H2O/MeOH(20/80)にて、F=1ml/分、35分で溶離、λ=254):tR=14.48.
結果:
化合物の質量:17g
全収率:68%
HPLC純度:97.66%
遅速溶離異性体(Spジアステレオマーと考えらえる):
31P NMR (202MHz, CDCl3):δP 1.36;
1H NMR (500MHz, CDCl3):δH 8.14-8.11 (1H, m, H-Ar), 7.90-7.87 (1H, m, H-Ar), 7.74 (1H, d, J=8.0Hz, H-Ar), 7.60 (1H, d, J=8.0Hz, H-Ar), 7.58-7.55 (2H, m, H-Ar), 7.44 (1H, t, J=8.0Hz, H-Ar), 7.34-7.30 (5H, m, H-Ar), 5.12 (2H, q, J=12.5Hz, CH2Ph), 4.35-4.29 (1H, m, NHCHCH3), 4.04-4.00 (1H, m, NHCHCH3), 1.48 (3H, d, J=7.0Hz, NHCHCH3);
MS (ES+) m/z:574 (M+Na+, 100%), 精密質量:C26H19F5NO5P理論値551.40、実測値574.05 (M+Na+);
逆相HPLC(H2O/MeOH(20/80)にて、F=1ml/分、35分で溶離、λ=254):tR=14.48
上記の2つの化合物12の異性体の立体化学(Rp対Sp)を、化合物12を使用して製造したNUC-3373の31P化学シフト、1H NMRスペクトル及びHPLC保持時間と、文献において公知の他のProTideのものとの比較に基づいて、仮に、割り当てた。上述のように、ホスフェート立体中心の立体化学は、本発明の方法の間に逆転され、式12の化合物の(Sp)-ジアステレオマーは、NUC-3373の(Sp)-ジアステレオマーを形成し、同様に、式12の化合物の(R)-ジアステレオマーは、NUC-3373の(R)-ジアステレオマーを生成する。立体化学の割り当ては、2つの化合物12の異性体について行った粉末X線回折及び示差走査熱量測定によって支持されるが、これは、それ自体、決定的ではない。
3’-BOC保護FUDR 16は、下記のスキームに従って生成される。
化合物17(1g)をDCM(5ml)に溶解し、10℃に冷却した。温度を20℃以下に維持しながら、混合物に、TFA(2ml)を、ゆっくりと添加した。混合物を30℃に加温し、6時間、撹拌した。混合物を10℃に冷却し、温度を20℃以下に維持しながら、脱イオン水(5ml)をゆっくりと添加した。10分間、撹拌した後、有機層を分離し、水層をDCM(5ml)にて抽出した。合わせた有機層を、脱イオン水(2×5ml)、7%炭酸水素ナトリウム溶液(2×5ml)、及び20%塩化ナトリウム溶液(5ml)にて洗浄し、ついで、無水の硫酸ナトリウム(1w/w)にて乾燥し、真空下で濃縮した。粗製化合物を、シリカゲル(100~200メッシュ)を使用する酢酸エチル/DCMにおけるカラムクロマトグラフィーにて精製した。純粋な化合物が、50%酢酸エチル/DCM~100%酢酸エチル中に溶離された。合わせた純粋なフラクションを真空下で濃縮し、ついで、化合物のスラリーをシクロヘキサン(5ml)にて洗浄した。
結果:
NUC-3373(Sp異性体)の質量:9.3g
全収率:70%
HPLC純度:96.86%
1H-NMR (500MHz, MeOD):δH 8.16-8.14 (m, 1H, H-Ar), 7.90-7.80 (m, 1H, H-Ar), 7.72-7.70 (m, 2H, H-Ar), 7.54-7.49 (m, 3H, H-Ar, H-6), 7.43 (見掛けt, 1H, J=8.0Hz, H-Ar), 7.35-7.27 (m, 5H, H-Ar), 6.16-6.13 (m, 1H, H-1’), 5.11 (AB系, J=12.0Hz, 2H, OCH2Ph), 4.35-4.33 (m, 2H, 2xH-5’), 4.30-4.28 (m, 1H, H-3’), 4.14-4.08 (m, H, CHCH3), 4.07-4.04 (m, 1H, H-4’), 2.14-2.09 (m, 1H, H-2’), 1.74-1.68 (m, 1H, H-2’), 1.35 (d, J=7.0Hz, 3H, CHCH3)
13C-NMR (125MHz, MeOD):δC 174.92 (d, 3JC-P=3.75Hz, C=O, エステル), 159.37 (d, 2JC-F=25.9Hz, C=O, 塩基), 150.54 (d, 4JC-F=4.0Hz, C=O, 塩基), 147.99 (d, 2JC-P=7.1Hz, C-Ar, Naph), 141.75 (d, 1JC-F=232.1Hz, CF-塩基), 137.18, 136.29 (C-Ar), 129.59, 129.36, 128.90, 127.91 (CH-Ar), 127.83 (d, 3JC-P=5.4Hz, C-Ar, Naph), 127.59, 126.52, 126.50, 126.18 (CH-Ar), 125.54 (d, 2JC-F=34.1Hz, CH-塩基), 122.64 (CH-Ar), 116.29 (d, 3JC-P=2.75Hz, CH-Ar, Naph), 86.95 (C-1’), 86.67 (d, 3JC-P=8.1Hz, C-4’), 72.12 (C-3’), 68.05 (OCH2Ph), 67.85 (d, 2JC-P=5.3 Hz, C-5’), 51.96 (CHCH3), 40.84 (C-2’), 20.52 (d, 3JC-P=7. Hz, CHCH3)
31P NMR (202MHz, MeOD):δP 4.62
19F NMR (470MHz, MeOD):δF 167.19
(ES+) m/z:実測値 (M+Na+) 636.1520、C29H29N3O9FNaP 理論値:(M+), 613.15
逆相HPLC(Varian Pursuit XRs 5 C18, 150x4.6 mm;H2O/AcCN(90/10から0/100へ)にて35分で溶離):tR=16.61分
NUC-3373のRp異性体は、上記の方法を実施することによって、ただし、化合物12のRpジアステレオマーを原料として得られる。
1H-NMR (500MHz, MeOD):δH 8.17-8.15 (m, 1H, H-Ar), 7.91-7.88 (m, 1H, H-Ar), 7.72-7.69 (m, 2H, H-Ar), 7.56-7.52 (m, 2H, H-Ar, H-6), 7.50-7.48 (m, 1H, H-Ar), 7.39 (見かけt, J=8.0Hz, 1H, H-Ar), 7.35-7.28 (m, 5H, H-Ar), 6.16-6.09 (m, 1H, H-1’), 5.13 (s, 2H, OCH2Ph), 4.35-4.25 (m, 3H, 2xH-5’, H-3’), 4.14-4.08 (m, 1H, CHCH3), 4.05-4.03 (m, 1H, H-4’), 2.15-2.10 (m, 1H, H-2’), 1.74-1.68 (m, 1H, H-2’), 1.36 (d, J= 7.0Hz, 3H, CHCH3);
13C-NMR (125MHz, MeOD):δC 174.58 (d, 3JC-P=5.0Hz, C=O, エステル), 159.38 (d, 2JC-F=26.3Hz, C=O), 150.48 (C=O 塩基), 147.80 (d, 2JC-P=6.5Hz, C-Ar, Naph), 141.67 (d, 1JC-F=232.5Hz, CF-塩基), 137.15, 136.26 (C-Ar), 129.62, 129.40, 129.36, 128.96, 127.89 (CH-Ar), 127.84 (d, 3JC-P=5.5Hz, C-Ar, Naph), 127.59, 126.57, 126.55, 126.21 (CH-Ar), 125.61 (d, 2JC-F=34.0Hz, CH-塩基), 122.62 (CH-Ar), 116.55 (d, 3JC-P=3.75Hz, CH-Ar, Naph), 86.97 (C-1’), 86.66 (d, 3JC-P=7.5Hz, C-4’), 72.01 (C-3’), 68.07 (OCH2Ph), 67.84 (d, 2JC-P=5.0Hz, C-5’), 51.83 (CHCH3), 40.89 (C-2’), 20.42 (d, 3JC-P=7.5Hz, CHCH3);
31P-NMR (202MHz, MeOD):δP 4.27;
19F NMR (470MHz, MeOD):δF 167.27;
(ES+) m/z: 実測値: (M+Na+) 636.1520、C29H29N3O9FNaP 理論値: (M+), 613.15;
逆相HPLC (Varian Pursuit XRs 5 C18, 150 x 4.6 mm);H2O/MeOH(35分で90/10から 0/100へ)にて溶離):tR=16.03分
上記の2つのNUC-3373の異性体の立体化学(Rp対Sp)を、31P化学シフト、1H NMRスペクトル及びHPLC保持時間と、文献において公知の他のProTideのものとの比較に基づいて、仮に、割り当てた。化合物12の立体化学は、化合物12を形成するNUC-3373のどちらかの異性体に基づいて、仮に、割り当てられている。
2’-TBDMS保護3’-デオキシアデノシン21は、下記のスキームに従って生成される。
アデノシン(18)1当量を、アセトニトリル10Vに溶解し、混合物を15℃に冷却した。臭化アセトキシイソブチリル3.0モル当量を、15℃において、ゆっくりと添加した。混合物を室温に加温し、8時間、撹拌した。炭酸水素ナトリウム溶液にて反応をクエンチし、酢酸エチルにて抽出した。合わせた有機相を、5%塩化ナトリウム溶液にて洗浄し、有機相を真空濃縮した。
生成物をメタノール15Vに溶解し、炭酸カリウム1当量を添加し、ついで、2時間、撹拌した。混合物を真空濃縮し、生成物を水で洗浄し、ついで、生成物を、真空下、60℃において乾燥して、2’,3’-アンヒドロアデノシンを、収率70~85%で得た。
2’,3’-アンヒドロアデノシン1当量及びイミダゾール1.6当量を、DMF 5Vに溶解した。混合物を15℃に冷却し、TBDMSCl 0.8当量を添加した。混合物を、30℃において、1~2時間、撹拌し、ついで、イミダゾール0.4当量及びTBDMSCl0.4当量を添加した。混合物を、30℃において、さらに1~2時間、撹拌し、ついで、水(5V)を添加した。混合物を、酢酸エチルにて抽出した。合わせた有機相を、7%炭酸水素ナトリウム溶液、水、及び5%塩化ナトリウム溶液にて、順次、洗浄し、ついで、真空濃縮した。生成物をヘプタンにて洗浄し、次いで、真空下、50℃において乾燥して、エポキシド19を、収率75~90%で得た。
エポキシド191当量を、DMSO(5V)及びTHF 5V)の混合物に溶解した。混合物を0℃に冷却し、混合物を、窒素ガスにて脱気した。1Mリチウムトリエチルボロヒドリッド(1eq)THF溶液を、0(±5)℃において、1~2時間で添加した。混合物を、0℃において、30分間、撹拌し、30℃に加温し、2時間、撹拌し、ついで、5℃において、メタノール(10V)を、ゆっくりと添加した。5℃において、10%水酸化ナトリウム10V、ついで、10%過酸化水素溶液10Vを滴加した。混合物を酢酸エチルにて抽出し、合わせた有機相を、連続して、10%メタ重亜硫酸ナトリウム溶液、反応基への水、7%炭酸水素ナトリウム溶液、及び10%塩化ナトリウム溶液にて洗浄し、ついで、真空濃縮した。生成物をヘプタンにて洗浄し、ついで、50℃において、真空濃縮して、2’-シリルコルジセピンを、収率70~100%で得た。
2’-シリルコルジセピン、イミダゾール2.5当量、及びDMAP 0.15当量を、DMF5Vに溶解した。混合物を15℃に冷却し、ついで、TBDMSCl 2.5当量を滴加した。反応系を、30℃において、4時間、撹拌した。水10Vを添加し、混合物を酢酸エチルにて抽出した。有機相を、7%炭酸水素ナトリウム溶液、水、及び5%塩化ナトリウム溶液にて洗浄し、真空濃縮した。
混合物を8Vに溶解し、水2Vを添加し、ついで、混合物を0℃に冷却した。反応混合物に、0℃において、30~60分間で、トリフルオロ酢酸2.5eqを添加した。反応混合物を10℃に加温し、10℃において、4~6時間、撹拌した。水を添加し、混合物を酢酸エチルにて抽出した。合わせた有機相を、7%炭酸水素ナトリウム溶液、水(2回)、及び5%塩化ナトリウム溶液にて洗浄し、ついで、真空濃縮した。生成物をヘプタンにて洗浄し、真空乾燥して、5’-シリルコルジセピン21を、収率40~70%で得た。
5’-シリルコルジセピン21を、0℃において、THF 10Vに溶解し、0℃に冷却した。2.0M t-BuMgCl(2.5当量)を添加し、混合物を、15分間、撹拌した。化合物5のSp-異性体(2.5eq)を、THF5Vに溶解し、0℃において、反応系に添加した。混合物を、0℃において、15分間、撹拌し、ついで、25℃に加温し、さらに2時間、撹拌した。10%塩化アンモニウム溶液(10容量)に注加して、反応をクエンチし、酢酸エチルにて抽出した。合わせた有機相を、水及び10%塩水にて洗浄し、ついで、真空濃縮した。
生成物を、THF(10V)に溶解し、ついで、0℃に冷却した。TFA及び水の(1:1)混合物10Vを、30分間で、反応系に添加し、ついで、混合物を、45分間、撹拌し、30℃に加温し、さらに16時間、撹拌した。0℃の7%NaHCO3溶液に注加して、反応をクエンチし、ついで、酢酸エチルにて抽出した。合わせた有機層を、水、7%炭酸水素ナトリウム溶液、及び10%塩水にて洗浄し、ついで、真空濃縮した。
生成物を、シリカゲル(100~200メッシュ)を使用するカラムクロマトグラフィーによって精製し、カラムを、MeOHの2~10%DCM溶液によって溶離して、Sp-NUC-7738を収率40%で得た。生成物のHPLC純度は99.50%であり、キラルHPLCは、Sp異性体が99.90%の量で存在し、及びRp異性体が0.10%の量で存在することを示した。
同じ方法を実施することにより、Rp-NUC-7738を提供できる。
Rp-NUC-7738:
1H NMR (500MHz, CDCl3):δH8.26 (s, 1H, H8), 8.22 (s, 1H, H2), 7.37-7.25 (m, 7H, Ar), 7.22-7.12 (m, 3H, Ar), 6.01 (d, J=1.5Hz, 1H, H1’), 5.12 (AB q, JAB=12.0Hz, AB= 0.04, 2H, CH2Ph), 4.74-4.70 (m, 1H, H2’), 4.69-4.62 (m, 1H, H4’), 4.44-4.38 (m, 1H, H5’), 4.28-4.21 (m, 1H, H5’), 3.99-3.90 (m, 1H, CHCH3 L-Ala), 2.35-2.27 (m, 1H, H3’), 2.09-2.02 (m, 1H, H3’), 1.29 (d, J=7.0Hz, 3H, CHCH3 L-Ala)
31P NMR (202MHz, CD3OD):δP3.91
MS (ES+) m/z:実測値569.2 [M+H+], 591.2 [M+Na+], 1159.4 [2M+Na+]、C26H29N6O7P理論値m/z 568.2 [M]
逆相HPLC (Varian Pursuit XRs 5 C18, 150x4.6mm、H2O/CH3CN(30分で、90/10から0/100へ)にて溶離、F=1ml/分、λ=200 nm):tR 14.02分を有する1つのピークを示す
Sp-NUC-7738:
1H NMR (500MHz, CDCl3):δH 8.24 (s, 1H, H8), 8.22 (s, 1H, H2), 7.36-7.26 (m, 7H, Ar), 7.22-7.13 (m, 3H, Ar), 6.01 (d, J=1.5Hz, 1H, H1’), 5.08 (AB q, JAB=12.0Hz, AB=0.01, 2H, CH2Ph), 4.70-4.67 (m, 1H, H2’), 4.66-4.60 (m, 1H, H4’), 4.41-4.35 (m, 1H, H5’), 4.26-4.19 (m, 1H, H5’), 4.02-3.94 (m, 1H, CHCH3 L-Ala), 2.36-2.27 (m, 1H, H3’), 2.08-2.01 (m, 1H, H3’), 1.34-1.30 (m, 3H, CHCH3 L-Ala)
31P NMR (202MHz, CD3OD):δP 3.73
MS (ES+) m/z 実測値569.2 [M+H+], 591.2 [M+Na+], 1159.4 [2M+Na+]、C26H29N6O7P理論値m/z 568.2 [M]
逆相HPLC (Varian Pursuit XRs 5 C18, 150x4.6mm、H2O/CH3CN(30分で90/10~0/100)にて溶離、F=1ml/分, λ=200nm):tR 14.26分を有する1つのピークを示す
上記の2つのNUC-7738異性体の立体化学(Rp対Sp)を、一般的なX線結晶解析によって確認した。
8-クロロ-アデノシン24のジメチルアセタール25は、下記のスキームに従って生成される(国際公開第2017/207989号)。
得られた生成物に60%ギ酸水溶液600 ml(20V)を添加し、反応系を、25℃において、65~70時間、撹拌し、ついで、酢酸エチル(600 ml;20V)を、ゆっくりと添加した。20%塩化ナトリウム溶液600 ml(20V)を添加し、層を分離した。水層を酢酸エチルにて抽出し、ついで、合わせた有機層に、10%アンモニア溶液を滴加し、層を分離した。有機相を、水(3回)及び20%塩化ナトリウム溶液にて洗浄し、無水硫酸ナトリウム30g(1w/w)にて乾燥し、濾過し、ついで、真空濃縮した。粗製生成物を、カラムクロマトグラフィーにて精製して、NUC-9701 20~45gを得た。
Sp-NUC-9701:
1H-NMR (500MHz; MeOD-d4):δH 8.07 (1H, d J=8.5Hz, H-Napht), 8.05 (1H, s, 2-H), 7.87 (1H, d J=8.5Hz, H-Napht), 7.67 (1H, d J=8.5Hz, H-Napht) 7.54-7.48 (2H, m, H-Napht), 7.41-7.30 (1H, m, H-Napht), 7.36-7.33 (1H, m, H-Napht), 7.26-7.22 (5H, m, -CH2Ph), 6.03 (1H, d J=5.0Hz, H-1’), 5.33 (1H, t J=5.0Hz, H-2’), 5.01, 4.98 (AB, JAB=12.3Hz, CH2Ph), 4.65 (1H t J=5.5Hz, H-3’), 4.49-4.45 (1H, m, Ha-5’), 4.41-4.36 (1H, m, Hb-5’), 4.22-4.20 (1H, m, H-4’), 3.94-3.90 (1H, m, -CHCH3), 1.17 (1H, d J=7.0Hz, CH3)
31P NMR (202MHz, MeOD-d4):δP 3.93 (1P, s)
逆相HPLC(H2O/CH3CN(30分で90/10から0/100)にて溶離、1ml/分、λ=254nm): tR=16.43分を有するピークを示す
Rp-NUC-9701:
1H-NMR (500MHz; MeOD-d4):δH 8.10 (1H, s, H-2), 8.08 (1H, d J=8.5Hz, H-Napht), 7.87 (1H, d J=8.5Hz, H-Napht), 7.67 (1H, d J=8.5Hz, H-Napht), 7.53-7.50 (1H, m, H-Napht), 7.48-7.44 (1H, m, H-Napht), 7.40-7.38 (1H, m, H-Napht), 7.33-7.27 (6H, m, H-Napht及び-CH2Ph), 6.02 (1H, d J=5.0Hz, H-1’), 5.28 (1H, t J=5.0Hz, H-2’), 5.04, 5.02 (AB, JAB=12.2 Hz, CH2Ph), 4.63 (1H t J=5.5Hz, H-3’), 4.48-4.46 (1H, m, Ha-5’), 4.38-4.35 (1H, m, Hb-5’), 4.23-4.20 (1H, m, H-4’),4.05-4.01 (1H, m, -CHCH3), 1.17 (1H, d J=7.0Hz, CH3)
31P NMR (202MHz, MeOD-d4):δP 3.83 (1P, s)
逆相HPLC(H2O/CH3CN(30分で90/10から0/100)にて溶離、1ml/分、λ=254nm): tR=16.59分を有するピークを示す
上記のNUC-9701の2つの異性体の立体化学(Rp対Sp)を、31P化学シフト、1H NMRスペクトル及びHPLC保持時間と、文献において公知の他のProTideのものとの比較に基づいて、仮に、割り当てた。
Claims (17)
- 式(Ib)
工程a)
式(IIb)
工程b)
式(IVb)の化合物から保護基P2、P3及び/又はP4を除去して、NUC-7738を、実質的にジアステレオマー的に純粋な形で提供する。 - P2がt-ブチルジメチルシリルである請求項1に記載の方法。
- P3及びP4が、それぞれ、Hである請求項1又は2に記載の方法。
- B1がグリニャール化合物である請求項1~3のいずれかに記載の方法。
- B1がtBuMgClである請求項4に記載の方法。
- 工程a)を、エーテル溶媒中で行う請求項1~5のいずれかに記載の方法。
- 工程a)を、THF中で行う請求項6に記載の方法。
- 式(IIb)の化合物が実質的にジアステレオマー的に純粋な形であり、方法が、NUC-7738の(Sp)-ジアステレオマーを、実質的にジアステレオマー的に純粋な形で製造する方法である請求項1~7のいずれかに記載の方法。
- c)式(IIb)の化合物の(Rp)-ジアステレオマー、又は式(IIb)の化合物の(Rp)-及び(Sp)-ジアステレオマーの混合物を、溶媒(S2)に懸濁又は溶解し;
d)溶液又は懸濁液を塩基(B2)にて処理して、(Sp)-ジアステレオマーを、実質的にジアステレオマー的に濃縮された形で得て;及び
e)式(IIb)の(Sp)-ジアステレオマーを単離する
ことを含んでなる請求項8に記載の方法。 - B2が3級アミンである請求項9に記載の方法。
- B2がトリエチルアミンである請求項10に記載の方法。
- S2が、炭化水素又は炭化水素を含んでなる混合物である請求項9~11のいずれかに記載の方法。
- S2が、ヘキサン又はヘプタンと極性有機溶媒との混合物であり、前記混合物は、ヘキサン又はヘプタン50容量%以上を含んでなる請求項12に記載の方法。
- S2が、ヘキサン又はヘプタンと酢酸エチルとの混合物であり、前記混合物は、ヘキサン又はヘプタン50容量%以上を含んでなる請求項13に記載の方法。
- 工程d)が、式(IIb)の化合物及び塩基(B2)の混合物を、6時間以上、撹拌することを含んでなる請求項9~14のいずれかに記載の方法。
- 工程d)が、式(IIb)の化合物及び塩基(B2)の混合物を、温度0~50℃において撹拌することを含んでなる請求項9~15のいずれかに記載の方法。
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