JP2023052111A - ベクター媒介性疾患を防除するための組成物及び関連する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、2017年1月24日に出願された米国仮特許出願第62/450,032号明細書及び2017年11月9日に出願された米国仮特許出願第62/583,925号明細書に対する優先権を主張し、これらの仮特許出願の内容は、本明細書によって全体として参照により本明細書に援用される。
本明細書で使用されるとき、用語「バクテリオシン」は、抗微生物特性を備えたペプチド又はポリペプチドを指す。天然に存在するバクテリオシンは、ある種の原核生物によって生産されるものであり、その生産株に関連する生物に対抗して作用するが、生産株自体に対抗しない。本明細書で企図されるバクテリオシンとしては、限定はされないが、天然に存在するバクテリオシン、例えば細菌によって生産されるバクテリオシン及びその誘導体、例えば改変バクテリオシン、組換え発現バクテリオシン及び化学合成バクテリオシンが挙げられる。一部の例では、バクテリオシンは、本明細書に記載されるバクテリオシンの機能的に活性な変異体である。一部の例では、バクテリオシンの変異体は、例えば、特定の領域にわたり又は配列全体にわたり、本明細書に記載されるバクテリオシン又は天然に存在するバクテリオシンの配列と少なくとも70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有する。
i.昆虫
本明細書に提供される方法及び組成物は、ヒトに疾患を引き起こす能力を有する病原体のベクターと考えられる任意の昆虫宿主で用いられ得る。
本明細書に提供される方法及び組成物を使用して、本明細書に記載される任意の宿主の適応度を低下させることができる。適応度の低下は、宿主に常在する微生物の任意の変化によって生じ得、ここで、変化は、調節薬剤の投与がもたらす結果であり、宿主に有害な効果を有し得る。
本明細書に提供される調節薬剤は、ヒト病原体を保有する宿主昆虫の適応度を低下させることにより、ベクター媒介性疾患の蔓延を低減するのに有効である。調節薬剤は、本明細書に記載される任意の製剤及び送達方法を用いて、疾患の伝播を低減する、例えばベクター間の垂直又は水平伝播を低減する及び/又はヒトへの伝播を低減するのに有効な量で且つ有効な持続期間にわたって昆虫に送達され得る。例えば、本明細書に記載される調節薬剤は、調節薬剤を投与されていない宿主生物と比較して、ベクター媒介性病原体の垂直又は水平伝播を約2%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%又はそれを超えて低減することができる。別の例として、本明細書に記載される調節薬剤は、調節薬剤を投与されていない宿主生物と比較して、ベクター昆虫の媒介能力を約2%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%又はそれを超えて低減することができる。
本明細書に記載される調節薬剤の標的となる微生物には、限定はされないが、本明細書に記載される任意の細菌及び/又は真菌を含め、宿主内又は宿主上に常在する任意の微生物が含まれ得る。宿主に常在する微生物には、例えば、共生微生物(例えば、宿主に有益な栄養素又は酵素を提供する内部共生微生物)、片利共生微生物、病原性微生物又は寄生性微生物が含まれ得る。内部共生微生物は、一次内部共生体又は二次内部共生体であり得る。共生微生物(例えば、細菌又は真菌)は、宿主の偏性共生体又は宿主の通性共生体であり得る。宿主に常在する微生物は、垂直伝播、水平伝播又は複数の伝播起源を含め、任意の伝播様式によって獲得され得る。
本明細書に提供される方法及び組成物において標的となり得る例示的細菌としては、限定はされないが、ゼノラブダス属種(Xenorhabdus spp)、フォトラブダス属種(Photorhabdus spp)、カンディダトゥス属種(Candidatus spp)、ブフネラ属種(Buchnera spp)、ブラッタバクテリウム属種(Blattabacterium spp)、バウマンニア属種(Baumania spp)、ウィグルスウォーチア属種(Wigglesworthia spp)、ボルバキア属種(Wolbachia spp)、リケッチア属種(Rickettsia spp)、オリエンティア属種(Orientia spp)、ソーダリス属種(Sodalis spp)、バークホルデリア属種(Burkholderia spp)、カプリアビダス属種(Cupriavidus spp)、フランキア属種(Frankia spp)、シノリゾビウム属種(Snirhizobium spp)、ストレプトコッカス属種(Streptococcus spp)、ウォリネラ属種(Wolinella spp)、キシレラ属種(Xylella spp)、エルウィニア属種(Erwinia spp)、アグロバクテリウム属種(Agrobacterium spp)、バチルス属種(Bacillus spp)、パエニバチルス属種(Paenibacillus spp)、ストレプトミセス属種(Streptomyces spp)、ミクロコッカス属種(Micrococcus spp)、コリネバクテリウム属種(Corynebacterium spp)、アセトバクター属種(Acetobacter spp)、シアノバクテリア属種(Cyanobacteria spp)、サルモネラ属種(Salmonella spp)、ロドコッカス属種(Rhodococcus spp)、シュードモナス属種(Pseudomonas spp)、ラクトバチルス属種(Lactobacillus spp)、エンテロコッカス属種(Enterococcus spp)、アルカリゲネス属種(Alcaligenes spp)、クレブシエラ属種(Klebsiella spp)、パエニバチルス属種(Paenibacillus spp)、アルスロバクター属種(Arthrobacter spp)、コリネバクテリウム属種(Corynebacterium spp)、ブレビバクテリウム属種(Brevibacterium spp)、サーマス属種(Thermus spp)、シュードモナス属種(Pseudomonas spp)、クロストリジウム属種(Clostridium spp)及び大腸菌属種(Escherichia spp)が挙げられる。本明細書に提供される方法及び組成物による標的となり得る細菌の非限定的な例を表1に示す。一部の例では、調節薬剤が標的とする細菌の16S rRNA配列は、表1に挙げる配列と少なくとも50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、97%、99%、99.9%又は100%の同一性を有する。
本明細書に提供される方法及び組成物において標的となり得る例示的真菌としては、限定はされないが、アミロステレウム・アレオラツム(Amylostereum areolatum)、エピクロエ属種(Epichloe spp)、ピキア・ピヌス(Pichia pinus)、ハンゼヌラ・カプスラタ(Hansenula capsulate)、ダルディニア・デシピエンス(Daldinia decipien)、セラトシスチス属種(Ceratocytis spp)、オフィオストマ属種(Ophiostoma spp)及びアッタマイセス・ブロマティフィカス(Attamyces bromatificus)が挙げられる。昆虫に見られる酵母及び酵母様共生体の非限定的な例としては、カンジダ属(Candida)、メチニコウイア属(Metschnikowia)、デバロマイセス属(Debaromyces)、シェフェルソマイセス・シェハテ(Scheffersomyces shehatae)及びシェフェルソマイセス・スティピティス(Scheffersomyces stipites)、スターメレラ属(Starmerella)、ピキア属(Pichia)、トリコスポロン属(Trichosporon)、クリプトコッカス属(Cryptococcus)、シュードジマ属(Pseudozyma)及びチャワンタケ亜門(Pezizomycotina)からの酵母様共生者(例えば、シンビオタフリナ・ブクネリ(Symbiotaphrina bucneri)及びシンビオタフリナ・コッホイ(Symbiotaphrina kochii))が挙げられる。本明細書の方法及び組成物による標的となり得る酵母の非限定的な例を表2に挙げる。
本明細書に提供される方法及び組成物の調節薬剤には、ファージ、ポリペプチド、小分子、抗生物質、二次代謝産物、細菌若しくは真菌又はこれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
本明細書に記載される調節薬剤は、ファージ(例えば、溶菌性ファージ又は非溶菌性ファージ)を含み得る。一部の例では、本明細書に記載される任意のファージの有効濃度は、本明細書に記載される宿主(例えば、ヒト病原体のベクター、例えばカ、コダニ、ハジラミ又はマダニ)に常在する1つ以上の微生物(本明細書に記載されるとおり)のレベル、活動又は代謝を変化させることができ、この調節は、宿主の適応度(例えば、本明細書に概説されるとおりの)の低下をもたらし得る。一部の例では、調節薬剤には、テクティウイルス科(Tectiviridae)、マイオウイルス科(Myoviridae)、サイフォウイルス科(Siphoviridae)、ポドウイルス科(Podoviridae)、カウドウイルス目(Caudovirales)、リポスリクスウイルス科(Lipothrixviridae)、ルディウイルス科(Rudiviridae)又はリガメンウイルス目(Ligamenvirales)の目から選択される少なくとも1つのファージが含まれる。一部の例では、本組成物は、マイオウイルス科(Myoviridae)、サイフォウイルス科(Siphoviridae)、ポドウイルス科(Podoviridae)、リポスリクスウイルス科(Lipothrixviridae)、ルディウイルス科(Rudiviridae)、アンピュラウイルス科(Ampullaviridae)、ビカウダウイルス科(Bicaudaviridae)、クラバウイルス科(Clavaviridae)、コルチコウイルス科(Corticoviridae)、シストウイルス科(Cystoviridae)、フセロウイルス科(Fuselloviridae)、グロブロウイルス科(Gluboloviridae)、グッタウイルス科(Guttaviridae)、イノウイルス科(Inoviridae)、レビウイルス科(Leviviridae)、ミクロウイルス科(Microviridae)、プラズマウイルス科(Plasmaviridae)及びテクティウイルス科(Tectiviridae)から選択される少なくとも1つのファージを含む。本方法及び組成物において有用なファージの更なる非限定的な例を表3に挙げる。
本明細書に記載される組成物及び方法では、多くのポリペプチド(例えば、バクテリオシン、R型バクテリオシン、根粒Cリッチペプチド、抗微生物ペプチド、溶解素又はバクテリオサイト調節性ペプチド)を使用し得る。一部の例では、本明細書に記載される任意のペプチド又はポリペプチドの有効濃度は、宿主(例えば、ヒト病原体のベクター、例えばカ、コダニ、ハジラミ又はマダニ)に常在する1つ以上の微生物(本明細書に記載されるとおりの、例えばボルバキア属種(Wolbachia spp.)又はリケッチア属種(Rickettsia spp.))のレベル、活動又は代謝を変化させることができ、この調節は、宿主の適応度(例えば、本明細書に概説されるとおりの)の低下をもたらし得る。本明細書に含まれるポリペプチドには、天然に存在するポリペプチド又は組換え産生された変異体が含まれ得る。例えば、ポリペプチドは、例えば、特定の領域にわたり又は配列全体にわたり、本明細書に記載されるポリペプチド又は天然に存在するポリペプチドの配列と少なくとも70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%の同一性を有する本明細書に記載される任意のポリペプチドの機能的に活性な変異体であり得る。
本明細書に記載される調節薬剤は、バクテリオシンを含み得る。一部の例では、バクテリオシンは、シュードモナス属(Pseudomonas)、ストレプトミセス属(Streptomyces)、バチルス属(Bacillus)、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)又は乳酸菌(LAB、例えばラクトコッカス・ラクチス(Lactococcus lactis))などのグラム陽性細菌によって天然に生産される。一部の例では、バクテリオシンは、ハフニア・アルベイ(Hafnia alvei)、シトロバクター・フロインディ(Citrobacter freundii)、クレブシエラ・オキシトカ(Klebsiella oxytoca)、クレブシエラ・ニューモニエ(Klebsiella pneumonia)、エンテロバクター・クロアカ(Enterobacter cloacae)、セラチア・プリミチクム(Serratia plymithicum)、キサントモナス・カンペストリス(Xanthomonas campestris)、エルウィニア・カロトボラ(Erwinia carotovora)、ラルストニア・ソラナケアルム(Ralstonia solanacearum)又は大腸菌(Escherichia coli)などのグラム陰性細菌によって天然に生産される。例示的バクテリオシンとしては、限定はされないが、クラスI~IV LAB抗生物質(ランチビオティックなど)、コリシン、ミクロシン及びピオシンが挙げられる。バクテリオシンの非限定的な例を表4に挙げる。
本明細書に記載される調節薬剤は、溶解素(例えば、ムレイン加水分解酵素又はペプチドグリカン自己溶解素としても知られる)を含み得る。宿主に常在する細菌の阻害に好適な任意の溶解素を使用し得る。一部の例では、溶解素は、細菌細胞によって天然に生産され得るものである。一部の例では、溶解素は、バクテリオファージによって天然に生産され得るものである。一部の例では、溶解素は、宿主に常在する細菌を阻害するファージから入手される。一部の例では、溶解素は、天然に存在する溶解素をベースとして改変される。一部の例では、溶解素は、例えば、溶解素にシグナルペプチドを導入することにより、宿主細菌によって分泌されるように改変される。一部の例では、溶解素は、ファージホリンとの組み合わせで使用される。一部の例では、溶解素は、溶解素に敏感でない組換え細菌宿主によって発現される。一部の例では、溶解素を使用して、宿主に常在するグラム陽性又はグラム陰性細菌が阻害される。
本明細書に記載される調節薬剤は、抗微生物ペプチド(AMP)を含み得る。宿主に常在する微生物を阻害するのに好適な任意のAMPを使用し得る。AMPは、多様な分子の群であり、そのアミノ酸組成及び構造に基づいてサブ群に分けられる。AMPは、植物(例えば、コプシン)、昆虫(例えば、ドロソシン、サソリペプチド(例えば、Uy192、UyCT3、D3、D10、Uy17、Uy192)、マストパラン、ポネラトキシン、セクロピン、モリシン、メリチン)、カエル(例えば、マガイニン、ダーマセプチン、オーレイン)及び哺乳類(例えば、カテリシジン類、デフェンシン類及びプロテグリン類)に由来するAMPを含め、天然でAMPを生産する任意の生物に由来するか又はそれから生産され得る。例えば、AMPは、Uy192(5’-FLSTIWNGIKGLL-3’;配列番号227)、UyCT3(5’-LSAIWSGIKSLF-3;配列番号228)、D3(5’-LWGKLWEGVKSLI-3’;配列番号229)及びD10(5’-FPFLKLSLKIPKSAIKSAIKRL-3’;配列番号230)、Uy17(5’-ILSAIWSGIKGLL-3’;配列番号231)又はこれらの組み合わせなどのサソリペプチドであり得る。一部の例では、抗微生物ペプチドは、ヒト病原体のベクターに対する、以下:セクロピン(配列番号82)、メリチン、コプシン、ドロソマイシン(配列番号93)、ダームシジン(配列番号81)、アンドロピン(配列番号83)、モリシン(配列番号84)、セラトトキシン(配列番号85)、アバエシン(配列番号86)、アピダエシン(配列番号87)、プロフェニン(配列番号88)、インドリシジン(配列番号89)、プロテグリン(配列番号90)、タキプレシン(配列番号91)又はデフェンシン(配列番号92)の1つ以上と少なくとも90%の配列同一性(例えば、少なくとも90%、92%、94%、96%、98%又は100%の配列同一性)を有するものであり得る。AMPの非限定的な例を表6に挙げる。
本明細書に記載される調節薬剤は、根粒Cリッチペプチド(NCRペプチド)を含み得る。NCRペプチドは、ある種のマメ科植物で生産され、植物細胞が何千もの細胞内内部共生体を含有する根粒の形成をもたらすリゾビウム科(Rhizobiaceae)の細菌(根粒菌)との植物の相利共生的窒素固定共生において重要な役割を果たす。NCRペプチドは、細菌の不可逆的な最終分化過程を指図する抗微生物特性を備え、それにより例えば細菌膜を透過処理し、細胞分裂を破綻させるか又はタンパク質合成を阻害する。例えば、アルファルファ根粒菌(Sinorhizobium meliloti)に感染したメディカゴ・トルンカトゥラ(Medicago truncatula)根粒細胞では、高い倍数性の窒素固定バクテロイドへの細菌の不可逆的な分化を指図する何百ものNCRペプチドが生産される)。NCRペプチドの非限定的な例を表7に挙げる。
本明細書に記載される調節薬剤は、バクテリオサイト調節性ペプチド(BRP)を含み得る。BRPは、昆虫のバクテリオサイトに発現するペプチドである。この遺伝子は、初めに発育時点で共生体の取り込みと同時に発現し、そのバクテリオサイト特異的発現が昆虫の生涯にわたって維持される。一部の例では、BRPは、疎水性アミノ末端ドメインを有し、これは、シグナルペプチドであると予想されている。加えて、一部のBRPは、システインリッチドメインを有する。一部の例では、バクテリオサイト調節性ペプチドは、バクテリオサイト特異的システインリッチ(BCR)タンパク質である。バクテリオサイト調節性ペプチドは、長さが約40~150アミノ酸である。一部の例では、バクテリオサイト調節性ペプチドは、長さが約45~約145、約50~約140、約55~約135、約60~約130、約65~約125、約70~約120、約75~約115、約80~約110、約85~約105の範囲又はその間にある任意の範囲である。BRP及びその活性の非限定的な例を表8に挙げる。
多くの小分子(例えば、抗生物質又は代謝産物)を、本明細書に記載される組成物及び方法において使用し得る。一部の例では、本明細書に記載される小分子の有効濃度は、宿主に常在する1つ以上の微生物(本明細書に記載されるとおり)のレベル、活動又は代謝を変化させることができ、この変化が宿主の適応度の減少をもたらし得る。
本明細書に記載される調節薬剤は、抗生物質を含み得る。当該技術分野において公知の任意の抗生物質を使用し得る。抗生物質は、通常、その作用機構、化学構造又は活性スペクトルに基づいて分類される。
一部の例では、本明細書に記載される組成物及び方法の調節薬剤は、二次代謝産物を含む。二次代謝産物は、生物によって生産される有機分子に由来する。二次代謝産物は、(i)細菌、真菌、アメーバ、植物、昆虫及び大型動物に対して使用される競合薬剤;(ii)金属運搬薬剤;(iii)微生物と植物、昆虫及び高等動物との間の共生薬剤;(iv)性ホルモン;及び(v)分化エフェクターとして作用し得る。二次代謝産物の非限定的な例を表10に掲載する。
一部の例では、本明細書に記載される調節薬剤は、1つ以上の細菌を含む。多くの細菌は、本明細書に記載される組成物及び方法に有用である。一部の例では、薬剤は、宿主に内因的に見られる細菌種である。一部の例では、細菌性調節薬剤は、内部共生細菌種である。調節薬剤として使用し得る細菌の非限定的な例としては、本明細書で詳細な説明の第II節に記載されるあらゆる細菌種及び表1に挙げられるものが含まれる。例えば、調節薬剤は、ガンマプロテオバクテリア綱(Gammaproteobacteria)、アルファプロテオバクテリア(Alphaproteobacteria)、ベータプロテオバクテリア(Betaproteobacteria)、バクテロイデス門(Bacteroidetes)、フィルミクテス門(Firmicutes)(例えば、ラクトバチルス属(Lactobacillus)及びバチルス属種(Bacillus spp.))、クロストリジウム綱(Clostridia)、放線菌類(Actinomycetes)、スピロヘータ門(Spirochetes)、ウェルコミクロビウム門(Verrucomicrobia)及び放線菌門(Actinobacteria)を含め、昆虫の腸に存在する任意の細菌門からの細菌種であり得る。
(a)融合
本明細書に記載される調節薬剤のいずれも追加的な部分に融合又は連結し得る。一部の例では、調節薬剤には、1つ以上の追加的な部分(例えば、1つの追加的な部分、2、3、4、5、6、7、8、9、10又はそれを超える追加的な部分)の融合物が含まれる。一部の例では、追加的な部分は、本明細書に記載される調節薬剤(例えば、ペプチド、ポリペプチド、小分子又は抗生物質)のいずれか1つである。或いは、追加的な部分は、調節薬剤自体として作用しなくてもよく、代わりに二次的機能を果たし得る。例えば、追加的な部分は、宿主の標的部位(例えば、宿主の腸又は宿主バクテリオサイト)において又は宿主(例えば、ヒト病原体のベクター、例えばカ、コダニ、ハジラミ又はマダニ)に常在する標的微生物において調節薬剤が到達するか、結合するか、又は活性化された状態になることを促進し得る。
一部の例では、調節薬剤は、プレ又はプロアミノ酸配列を含み得る。例えば、調節薬剤は、プレ配列又はプロ配列の切断又は翻訳後修飾によって活性化され得る不活性なタンパク質又はペプチドであり得る。一部の例では、調節薬剤は、不活性化プレ配列又はプロ配列によって操作される。例えば、プレ配列又はプロ配列は、調節薬剤上の活性化部位、例えば受容体結合部位を隠し得るか又は調節薬剤のコンホメーション変化を誘導し得る。従って、プレ配列又はプロ配列の切断を受けると、調節薬剤が活性化される。
調節薬剤が追加的な部分に結び付いている例では、調節薬剤は、リンカーを更に含み得る。例えば、リンカーは、化学結合、例えば1つ以上の共有結合又は非共有結合であり得る。一部の例では、リンカーは、ペプチドリンカー(例えば、2、3、4、5、6、8、10、12、14、16、20、25、30、35、40アミノ酸又はそれを超えて長い)であり得る。リンカーには、本明細書に記載される任意のフレキシブルリンカー、リジッドリンカー又は切断可能リンカーが含まれ得る。
本明細書に記載される組成物は、純粋な形態で製剤化されるか(例えば、組成物は調節薬剤のみを含む)、又は組成物の施用若しくは送達を促進するため1つ以上の追加的な薬剤(賦形剤、送達媒体、担体、希釈剤、安定剤など)と共に製剤化され得る。好適な賦形剤及び希釈剤の例としては、限定はされないが、ラクトース、デキストロース、スクロース、ソルビトール、マンニトール、デンプン、アカシアゴム、リン酸カルシウム、アルギン酸塩、トラガカント、ゼラチン、ケイ酸カルシウム、微結晶性セルロース、ポリビニルピロリドン、セルロース、水、生理食塩水、シロップ、メチルセルロース、ヒドロキシ安息香酸メチル及びプロピル、タルク、ステアリン酸マグネシウム及び鉱油が挙げられる。
本明細書に提供される組成物は、液体製剤であり得る。液体製剤は、概して水と混合されるが、一部の例では、担体としての作物油、ディーゼル燃料、灯油又は他の軽油と共に使用され得る。活性成分の量は、多くの場合に約0.5~約80重量パーセントの範囲である。
乾燥製剤は、2つのタイプ:即時使用型及び散布剤として施用するために水と混合しなければならない濃縮物に分けることができる。ほとんどのダスト製剤は、即時使用型であり、低率の活性成分(約10重量パーセント未満)と、加えてタルク、チョーク、粘土、堅果の殻又は火山灰で作られた超微細な乾燥不活性担体とを含有する。個々のダスト粒子のサイズは、様々である。少数のダスト製剤は、濃縮物であり、高率の活性成分を含有する。これらを施用前に乾燥不活性担体と混合する。ダストは、常に乾燥して使用され、標的外の部位にドリフトし易い。
一部の例では、本組成物は、顆粒として製剤化される。顆粒状製剤は、ダスト製剤と同様であり、但し顆粒状粒子の方が大きくて重い。粗粒子は、粘土、トウモロコシの穂軸又はクルミ殻などの材料から作られ得る。活性成分は、顆粒の外面を被覆するか、又はその中に吸収されるかのいずれかである。活性成分の量は、比較的少ないことができ、通常、約0.5~約15重量パーセントの範囲である。顆粒状製剤は、ほとんどの場合、土壌、土壌中で生活する昆虫への施用に使用されるか、又は根から植物中に吸収される。顆粒状製剤は、時に、ドリフトを最小限に抑えるか、又は高密度の植生に浸透させるため、飛行機又はヘリコプターによって施用される。施用後、顆粒は、活性成分を徐々に放出し得る。一部の顆粒は、活性成分の放出に土壌水分を必要とする。顆粒状製剤は、幼虫のカ及び他の水生病害虫の防除にも使用される。顆粒は、農業、構造物、鑑賞植物、芝生、水生、道路用地及び公衆衛生(刺咬昆虫)のための病害虫防除活動において使用される。
一部の例では、本組成物は、粉末として製剤化される。一部の例では、本組成物は、水和性粉末として製剤化される。水和性粉末は、ダストに類似した微粉砕された乾燥製剤である。これは、通常、散布剤として施用するため、水と混合しなければならない。しかしながら、少数の製品は、ダストとしても、又は水和性粉末としても施用し得る - その選択は、施用者次第である。水和性粉末は、活性成分を約1~約95重量パーセント;場合により約50パーセント超有する。粒子は、水に溶解しない。粒子は、絶えず撹拌して懸濁しない限り直ちに沈降する。粒子は、ほとんどの病害虫問題及び撹拌が可能なほとんどのタイプの散布機器で使用することができる。水和性粉末は、優れた残効性を有する。その物理的特性を理由として、大部分の製剤は、加工された多孔質材料、例えばコンクリート、石膏及び未加工木材などの表面上に留まる。そのような場合、水のみが材料に浸透する。
一部の例では、本組成物は、ベイトを含む。ベイトは、固体、ペースト、ペレット又は粉末状形態など、任意の好適な形態であり得る。ベイトは、宿主によって運び去られ、前記宿主の個体群(例えば、コロニー又は巣箱)に持ち帰られることもある。ベイトは、次にコロニーの他のメンバーの飼料供給源としての役割を果たすことができ、従って多数の宿主、潜在的に宿主のコロニー全体に有効な調節薬剤を付与し得る。
一部の例では、本組成物は、誘引剤(例えば、化学誘引剤)を含む。誘引剤は、組成物の近傍に成虫宿主又は幼若宿主(例えば、幼虫)を誘引し得る。誘引剤としては、動物、特に昆虫によって分泌される、同じ種の他の動物の行動又は発育に影響を及ぼす化学物質であるフェロモン類が挙げられる。他の誘引剤としては、糖及びタンパク質加水分解物のシロップ、酵母及び腐りかけの肉が挙げられる。誘引剤は、活性成分と組み合わされ、茎葉又は処理範囲にある他の物品にも噴霧され得る。
一部の例では、本組成物は、マイクロカプセル化製剤で提供される。マイクロカプセル化製剤は、水と混合され、他の噴霧可能製剤と同じように噴霧される。噴霧後、プラスチックコーティングが破れ、活性成分が徐々に放出される。
本明細書に記載される組成物のいずれも、本明細書に記載される調節薬剤と不活性担体とを含むように製剤化され得る。かかる担体は、固体担体、液体担体、ゲル担体及び/又はガス担体であり得る。特定の例では、担体は、種子コーティングであり得る。種子コーティングは、種子の表面に全面的に又は部分的に付着する任意の天然に存在しない製剤である。製剤は、アジュバント又は界面活性剤を更に含み得る。製剤は、作用域を拡大するために1つ以上の調節薬剤も含み得る。
一部の例では、本明細書に提供される組成物は、アジュバントを含み得る。アジュバントは、活性を有しない化学物質である。アジュバントは、混合又は施用の向上のため、又はパフォーマンスの増強のため、製剤中に予め混合されるか又は噴霧タンクに加えられるかのいずれかである。アジュバントは、葉面施用向けに設計された製品に広く使用されている。アジュバントを使用すると、製剤を具体的な必要性に合わせてカスタマイズし、局所的条件を補うことができる。アジュバントは、濡れ、展着、粘着、蒸発の低減、揮発の低減、緩衝、乳化、分散、散布ドリフトの低減及び起泡の低減を含め、特定の機能を果たすように設計され得る。単一のアジュバントがこれらの全ての機能を果たすことはできず、多くの場合、適合性のあるアジュバントが組み合わされて複数の機能を同時に果たし得る。
一部の例では、本明細書に提供される組成物は、界面活性剤を含む。界面活性剤は、濡れ剤及び展着剤とも称され、噴霧液滴の表面張力を物理的に変化させる。製剤がその機能を正しく果たすには、噴霧液滴が茎葉を濡らし、葉の全面にわたって均一に広がることが可能でなければならない。界面活性剤は、製剤被覆面積を拡大し、それにより病害虫の化学物質への曝露を増加させる。界面活性剤は、製剤を蝋質の葉又は有毛の葉に施用するときに特に重要である。適切な濡れ性及び展着性がないと、往々にして噴霧液滴が流亡するか、又は葉の表面を十分に被覆することができない。しかしながら、界面活性剤が多過ぎると過剰な流亡が引き起こされ、有効性が低下し得る。
製剤において及びこれらの製剤から調製される使用形態において、調節薬剤は、農薬用薬剤(例えば、殺虫剤、滅菌剤、殺ダニ剤、殺線虫剤、殺軟体動物剤又は殺真菌剤;例えば、表12に挙げる農薬を参照されたい)、誘引剤、成長調整物質又は除草剤など、他の活性化合物との混合物であり得る。本明細書で使用されるとき、用語「農薬用薬剤」は、任意の病害虫を予防、駆逐、忌避又は軽減することを意図した任意の物質又は物質の混合物を指す。農薬は、食物に関してヒトと競合するか、所有物を破壊するか、疾患を蔓延させるか、又は不快害虫である昆虫、病原体、雑草及び微生物を含め、病害虫に対して使用される化学的物質又は生物学的薬剤であり得る。用語「農薬用薬剤」は、抗生物質、抗ウイルス薬 農薬、抗真菌薬、駆虫薬、栄養素、花粉、ショ糖及び/又は昆虫の動きを止める又は遅くする薬剤など、他の生物活性分子を更に包含し得る。
本明細書に記載される宿主は、昆虫への組成物の送達又は投与を可能にする任意の好適な方法において、本明細書に記載される組成物のいずれかに曝露され得る。調節薬剤は、単独で送達され得るか、或いは他の活性又は不活性物質と組み合わせて送達され得、有効濃度の調節薬剤を送達するように製剤化された濃縮液、ゲル、溶液、懸濁液、散布液、粉末、ペレット、ブリケット、ブリックなどの形態で例えば噴霧、マイクロインジェクション、植物経由、注入、浸漬によって施用され得る。本明細書に記載される組成物の施用量及び施用部位は、概して、宿主の習性、宿主の微生物が調節薬剤の標的となり得るのがいずれの生活環ステージであるか、施用が行われる部位並びに調節薬剤の物理的及び機能的特性によって決まる。本明細書に記載される調節薬剤は、昆虫に経口摂取によって投与され得るが、クチクラを通じた浸透又は昆虫の呼吸器系への浸透を可能にする手段によっても投与され得る。
本明細書では、宿主(例えば、昆虫)の微生物叢を変化させ、且つそれにより宿主適応度を低下させるのに有効な調節薬剤のスクリーニング方法が含まれる。本明細書に提供されるスクリーニングアッセイは、宿主に常在する共生微生物を標的とし、且つそれにより宿主の適応度を低下させる1つ以上の調節薬剤(例えば、ファージ)を同定するのに有効であり得る。例えば、同定された調節薬剤(例えば、ファージ)は、農薬分解性又はアレロケミカル分解性微生物(例えば、細菌、例えば表12に挙げられる農薬を分解する細菌)の生存能を低下させ、且つそれにより宿主の農薬に対する感度(例えば、表12に挙げられる農薬に対する感度)又はアレロケミカル薬剤に対する感度を増加させるのに有効であり得る。
本実施例は、比較的広域であるが、浅い抗細菌活性であるアジスロマイシンでの処理により、アノフェレス・コルッツィ(Anopheles coluzzii)蚊を死滅させるか又はその適応度を低下させ、及び寄生虫の伝播率を低下させることが可能であることを実証する。アジスロマイシンは、一部のグラム陽性細菌、一部のグラム陰性細菌及び多くの非定型細菌を阻害する。アジスロマイシンが蚊に及ぼす効果は、アジスロマイシンに敏感である、蚊にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介される。1つの標的となる細菌株は、アサイア属(Asaia)である。
処理の準備のため、蚊を実験室環境及び培地中で成長させる。実験は、アノフェレス・コルッツィ(Anopheles coluzzii)のゴウッソ(Ngousso)コロニーからの雌蚊で実施し、これは、当初、カメルーンで採集された野外蚊から樹立されたものであり、ヒト血液に維持し、成虫として5%フルクトースを供給する。幼虫にはテトラミン(tetramin)魚用飼料を与える。12時間明期/暗期サイクル下70~80%湿度において温度を28℃(±1℃)に維持する。
抗生物質不含の、50mg/Lヒポキサンチン、25mM HEPES+10%熱失活ヒト血清を補充した300mg L-1 L-グルタミンを含むRPMI培地(GIBCO)で熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falciparum)NF54生殖母細胞を培養する。6%v/v洗浄O+赤血球(RBC)中0.5%寄生虫血で感染させる17及び14日前に2つの25mL培養を開始する。培地は、毎日交換する。蚊を感染させる前に、遠心したRBCをプールし、20%の新鮮な洗浄RBC及びヒト血清(RBCと血清との間で2:3v/v比)を補充する。パラフィルムで覆い37℃に保ったメンブレン供給装置(2mlエッペンドルフ試験管)から蚊に血液ミールを与える。
解剖前に蚊を70%エタノールに5分間浸漬し、次に滅菌リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で3回リンスして、表在細菌を死滅させて取り除き、従って解剖中のサンプルのクチクラ細菌による汚染を最小限に抑える。各蚊(対照及びアジスロマイシン処理)の中腸を取り出し、直ちにドライアイスで凍結し、処理まで20℃で保存する。中腸が破裂して相当量の腸内容物が失われた場合に限り、それを分析から除外する。Precellys 24ホモジナイザー(Bertin)において、0.5mm幅ガラスビーズ(Bertin)を使用してサンプルをフェノール-クロロホルム中で6800rpmにおいて30秒間ホモジナイズし、デオキシリボ核酸(DNA)をフェノール-クロロホルムで抽出する。アサイア属(Asaia)の定量化に16SリボソームDNA(rDNA)を使用し、これは、ハマダラカ属(Anopheles)ハウスキーピング遺伝子40Sリボソームタンパク質S7(Vector-Base遺伝子ID AGAP010592)の比として示される。アサイア属(Asaia)のプライマー配列は、フォワード5’-GTGCCGATCTCTAAAAGCCGTCTCA-3’(配列番号219)及びリバース5’-TTCGCTCACCGGCTTCGGGT-3’(配列番号220)及びS7について:フォワード5’-GTGCGCGAGTTGGAGAAGA-3’(配列番号221)及びリバース5’-ATCGGTTTGGGCAGAATGC-3’(配列番号222)である。SYBR Premix Ex Taqキット(Takara)を製造者の指示に従って使用して、7500 Fastリアルタイムサーモサイクラー(Applied Biosystems)で定量的ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)を実施する。アジスロマイシン処理した蚊は、アサイア属(Asaia)特異的遺伝子の減少を示す。
この実施例は、タンパク質生成を阻害する広域スペクトル抗生物質であるドキシサイクリンを用いた処理によるアエデス・ベクサンス(Aedes vexans)を死滅させるか、又はその適応度を低下させる能力を実証する。カに対するドキシサイクリンの作用は、ドキシサイクリンに対して感受性であるカに内在性の細菌集団の修飾作用により媒介される。1つの標的となる細菌株は、ボルバキア属(Wolbachia)である。
処理の準備のために、実験室環境及び培地中でカを成長させる。実験は、アエデス・ベクサンス(Aedes vexans)の雌のカを用いて実施し、これは、当初、ミネソタ大学セントポールキャンパス(University of Minnesota St.Paul campus)の野外で採集した野外のカから樹立されたものであり、ヒト血液に維持し、成虫として5%フルクトースを供給する。ドキシサイクリン溶液は、ドキシサイクリン(SIGMA-ALDRICH,D9891)を滅菌水に溶解させることにより調製する。血液ミールの調製には、種々の容積のドキシサイクリン溶液を新鮮な血液に合計1mLとなるように添加する。最終的な血中ドキシサイクリン濃度は、約0(対照)、1、10又は50μg/mlである。
解剖前にカを70%エタノールに5分間浸漬し、次に滅菌リン酸緩衝食塩水(PBS)で3回すすいで、表面の細菌を死滅させて取り除き、このようにして解剖中のサンプルへのクチクラ細菌の混入を最小限に抑える。各カ(対照及びドキシサイクリン処理)の中腸を取り出し、直ちにドライアイス上で凍結させてから、処理まで20℃で保存する。中腸は、それらが破裂して腸内容物の実質的な量が失われた場合に限り、それらを分析から除外する。0.5mm幅のガラスビーズ(Bertin)を用い、サンプルをPrecelly24ホモジナイザー(Bertin)中のフェノール-クロロホルム中において6800rpmで30秒間ホモジナイズしてから、フェノール-クロロホルムでデオキシリボ核酸(DNA)を抽出する。ボルバキア属(Wolbachia)の定量のために16SリボソームDNA(rDNA)を使用し、これは、ヤブカ属(Aedes)ハウスキーピング遺伝子40Sリボソームタンパク質S7(Vector-Base遺伝子ID AAEL009496)の比として示す。ボルバキア属(Wolbachia)のプライマー配列は、次のとおりである:フォワードプライマー5’-TCAGCCACACTGGAACTGAG-3’(配列番号225)及びリバースプライマー5’-TAACGCTAGCCCTCTCCGTA-3’(配列番号226)並びにS7について:フォワード5’-AAGGTCGACACCTTCACGTC-3’(配列番号227)及びリバース5’-CCGTTTGGTGAGGGTCTTTA-3’(配列番号228)。定量的ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)は、製造者の指示に従い、SYBR Premix Ex Taqキット(Takara)を用いて、7500 Fast Real-Timeサーモサイクラー(Applied Biosystems)で実施する。ドキシサイクリンで処理したカは、ボルバキア属(Wolbachia)特異的遺伝子の減少を示す。
本実施例は、ウシにおける広範囲の細菌感染の治療によく使用される広域スペクトル抗生物質であるリカマイシンLA-200オキシテトラサイクリンで処理することにより、マダニのデルマセントル・アンデルソニ(Dermacentor andersoni)を死滅させるか又はその適応度を低下させることが可能であることを実証する。リカマイシンLA-200オキシテトラサイクリンがマダニに及ぼす効果は、リカマイシンLA-200オキシテトラサイクリンに敏感である、マダニにとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介される。1つの標的となる細菌株は、リケッチア属(Rickettsia)である。
オレゴン州バーンズ(Burns)及びモンタナ州コモ湖(Lake Como)の現地において、(Scoles et al.,J.Med.Entomol.42:153-162,2005)に記載されるとおり、対象の成虫D.アンデルソニ(D.andersoni)をフランネル法によって採集する。野外採集したマダニを使用して実験室コロニーを樹立する。マダニ細菌分析のため、各コロニーからの成虫F1又はF2雄マダニのコホートをホルスタイン仔ウシで育て、以下のとおりゲノムDNA単離及び細菌定量化のため、解剖して中腸(MG)及び唾液腺(SG)を採取する。
リケッチア属(Rickettsia)を定量化するため、未処理の及び抗生物質処理したF1及びF2マダニのSYBR Green定量的PCRを用いてrickA遺伝子コピー数を測定する。リケッチア属(Rickettsia)の定量化は、フォワード(5’-TACGCCACTCCCTGTGTCA-3’;配列番号229)及びリバース(5’-GATGTAACGGTATTACACCAACAG-3’;配列番号230)プライマーを使用して決定する。細菌定量化は、プールサンプルのF1及びF2 MG及びSGで測定する。SYBR Premix Ex Taqキット(Takara)を製造者の指示に従って使用して、7500 Fastリアルタイムサーモサイクラー(Applied Biosystems)で定量的ポリメラーゼ連鎖反応(qPCR)を実施する。リカマイシンLA-200オキシテトラサイクリン処理したマダニは、リケッチア属(Rickettsia)特異的遺伝子の減少を示す。
本実施例は、抗生物質溶液で処理することによりコダニを死滅させるか又はその適応度を低下させることが可能であることを実証する。本実施例は、オキシテトラサイクリンがコダニに及ぼす効果は、オキシテトラサイクリンに敏感である、バチルス属(Bacillus)などのコダニにとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されることを実証する。
繁殖期の成虫コダニが、便乗性ダニ又はその子孫と比較して、そのクチクラが硬化していないことに起因して異なる感受性を有するかどうかを決定するため、家畜に寄生しているコダニ並びに幼虫及び蛹に関連するコダニを採集する。このアッセイは、異なる種類のコダニで抗生物質溶液を試験し、バチルス属(Bacillus)などの内因性微生物を標的とすることによりその適応度がどのように変化するかを決定する。
・可動:その脚上を針でつつかれた後かどうかに関わらず、コダニは歩き回る。
・麻痺:コダニは、1つ以上の付属器を未刺激で又は刺激後に動かすが、歩き回ることはできない。
・死亡:動けず、3回の連続した刺激に反応しない。
本実施例は、環境サンプルからのファージコレクションの取得を実証する。
2週間にわたって複数の環境サンプル(土壌、池底質、下水)を滅菌1Lフラスコに採取し、採取後直ちに以下に記載するとおり処理し、その後、4℃で保存する。土壌サンプルは、最終容積が100mLになるように2mM CaCl2を補充した滅菌2倍濃度ディフコルリアブロス(LB)又はトリプトソイブロス(TSB)中でホモジナイズする。リン酸塩試験ストリップを使用してpH及びリン酸塩レベルを測定する。精製のため、全てのサンプルをMegafuge 1.0R、Heraeus又はEppendorf遠心機5702 Rにおいて3000~6000g、+4℃で10~15分間遠心し、0.2μm低タンパク質フィルタでろ過することにより、全ての残留細菌細胞を除去する。上清をガラスボトルに入れてクロロホルムの存在下において4℃で保存する。
本実施例は、異種ファージライブラリからの単一の標的特異的ファージの分離、精製及び同定を実証する。
20~30mlの実施例5に記載されるファージライブラリをLBブロスで30~40mlの容積に希釈する。標的細菌株、例えばブフネラ属(Buchnera)を加えて(LBブロスで成長させた50~200μl一晩培養物)、培養物中におけるこの特異的細菌株を標的とするファージを集積する。この培養物を230rpmで振盪して+37℃で一晩インキュベートする。この集積培養物から細菌を遠心(Megafuge 1.0R、Heraeus又はEppendorf遠心機5702 Rにおいて3000~6000g、15~20分、+4℃)及びろ過(0.2又は0.45μmフィルタ)によって除去する。2.5mlの細菌不含培養物を2.5mlのLBブロス及び50~100μlの標的細菌に加えてファージを集積する。集積培養物を上記のとおり一晩成長させる。この集積培養物からのサンプルを室温において13,000gで15分間遠心し、100~300μlの標的細菌及び3mlの融解した0.7%軟寒天と共にLB寒天が入ったペトリ皿に10μlの上清をプレーティングする。プレートを+37℃で一晩インキュベートする。菌叢に観察されるプラークの各々をピッキングし、500μlのLBブロスに移す。このプラークストックからのサンプルを標的細菌上に更にプレーティングする。見出される全てのファージについてプラーク精製を3回実施し、それにより不均質なファージ混合物から単一の均質なファージを分離する。
本実施例は、アブラムシをファージ溶液で処理することによりそれを死滅させるか又はその適応度を低下させることが可能であることを実証する。本実施例は、ファージがアブラムシに及ぼす効果が、ファージに敏感である、アブラムシにとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されることを実証する。1つの標的となる細菌株は、実施例6で同定されたファージによるブフネラ属(Buchnera)である。
0.5%ショ糖及び必須アミノ酸を含有する10mLの滅菌水中に0(陰性対照)、102、105又は108プラーク形成単位(pfu)/mlの実施例6からのファージでファージ溶液を製剤化する。
処理の準備のため、アブラムシを実験室環境及び培地中で成長させる。環境制御された室内において(16時間光周期;60±5%RH;20±2℃)、ソラマメ植物をバーミキュライトとパーライトとの混合物において16時間明期及び8時間暗期として24℃で成長させる。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させる。実験のため、健康植物から2齢及び3齢アブラムシを採集し、各処理が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取るように処理に分ける。
上流(NdeI)及び下流(XhoI)制限部位を有する特異的プライマーによるPCRによってDNAを作成する。フォワードプライマーGTATCTATTCCCGTCTACGAACATATGGAATTCC(配列番号236)及びリバースプライマーCCGCTCGAGCCATCTGACACTTCCTCCAA(配列番号237)。精製したPCR断片(Nucleospin Extract II-Macherey Nagel)をNdeI又はXhoIで消化し、次に断片をライゲートする。colAクローニングのため、ライゲートしたDNA断片をpcr2.1(GenBankデータベース受託番号EY122872)ベクターにクローニングする(Anselme et al.,BMC Biol.6:43,2008)。ヌクレオチド配列を系統的に確認する(Cogenics)。
ColAタンパク質配列:
本実施例は、アブラムシをバクテリオシン溶液で処理することによりそれを死滅させるか又はその適応度を低下させることが可能であることを実証する。本実施例は、バクテリオシンがアブラムシに及ぼす効果が、ColAバクテリオシンに敏感である、アブラムシにとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されることを実証する。1つの標的となる細菌株は、実施例8で作製されたバクテリオシンによるブフネラ属(Buchnera)である。
0.5%ショ糖及び必須アミノ酸を含有する10mLの滅菌水中に0(陰性対照)、0.6、1、50又は100mg/mlの実施例8からのColAでColA溶液を製剤化する。
処理の準備のため、アブラムシを実験室環境及び培地中で成長させる。環境制御された室内において(16時間光周期;60±5%RH;20±2℃)、植物をバーミキュライトとパーライトとの混合物で成長させて、アブラムシを寄生させる。同じ環境条件でホソヒラタアブ(E.balteatus)幼虫を大量生産から入手する。ハナアブは、糖、花粉及び水で育て;及び3時間中に飼育箱に寄生を受けた宿主植物を導入することにより産卵を誘発する。完全なライフサイクルが宿主植物上で行われ、植物は、毎日新しくアブラムシの寄生を受ける。
本実施例は、細菌RNAポリメラーゼの阻害によってDNA依存性RNA合成を阻害する狭域スペクトル抗生物質であるリファンピシンでアブラムシを処理することによりそれを死滅させるか又はその適応度を低下させることが可能であることを実証する。本実施例は、リファンピシンがアブラムシに及ぼす効果が、リファンピシンに敏感である、アブラムシにとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されることを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ属(Buchnera)である。
0.5%ショ糖及び必須アミノ酸を含有する10mLの滅菌水中に0(陰性対照)、1、10又は50μg/mlリファンピシンで抗生物質溶液を製剤化する。
処理の準備のため、アブラムシを実験室環境及び培地中で成長させる。環境制御された室内において(16時間光周期;60±5%RH;20±2℃)、ソラマメ植物をバーミキュライトとパーライトとの混合物において16時間明期及び8時間暗期として24℃で成長させる。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させる。実験のため、健康植物から2齢及び3齢アブラムシを採集し、各処理が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取るように処理に分ける。
本実施例は、ブフネラ属(Buchnera)を標的とする分子の同定を実証する。
本実施例は、ブフネラ属(Buchnera)のショ糖発酵を遮断し且つ細胞成長を阻害する、実施例11に記載される画分からの分離株の分離及び同定を実証する。
実施例11に記載される画分を90%水/メタノール中に再懸濁し、C18 SPEカラムに通して画分Iを得る。次に、このカラムをメタノールで洗浄して画分IIを得る。画分IIを、Agilent 1100シリーズHPLCで分取用フェニルヘキシルカラム(Phenomenex、Luna、25cm610mm、5mm粒径)により20%アセトニトリル/0.1%ギ酸含有水の溶出緩衝液を使用して2mL/分の流速で50分間分離する。これにより、異なる溶出時間で複数の化合物が得られる。Alpha FT-IR質量分析計(Bruker)、Ultrospec(商標)5300 pro紫外/可視光分光光度計(Amersham Biosciences)及びINOVA 600MHz核磁気共鳴分光計(Varian)で各化合物のスペクトルを入手する。
本実施例は、実施例12で同定された化合物の1つでアブラムシを処理することにより、その化合物に敏感である、アブラムシにとって内因性の細菌個体群の調節を通じてそれを死滅させるか又はその適応度を低下させることが可能であることを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ属(Buchnera)である。
0.5%ショ糖及び必須アミノ酸を含有する10mLの滅菌水中に実施例12からの各化合物を0(陰性対照)、0.6、1、20又は80μg/mlで製剤化する。
処理の準備のため、アブラムシを実験室環境及び培地中で成長させる。環境制御された室内において(16時間光周期;60±5%RH;20±2℃)、ソラマメ植物をバーミキュライトとパーライトとの混合物において16時間明期及び8時間暗期として24℃で成長させる。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させる。実験のため、健康植物から2齢及び3齢アブラムシを採集し、各処理が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取るように処理に分ける。
本実施例は、細菌RNAポリメラーゼの阻害によってDNA依存性RNA合成を阻害する狭域スペクトル抗生物質であるリファンピシンによるアブラムシの処理を実証する。本実施例は、リファンピシンがモデル昆虫種のアブラムシに及ぼす効果が、リファンピシンに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ属(Buchnera)である。
以下のとおり、送達手段に応じて抗生物質溶液を製剤化した(図1A~図1G):
1)経植物:必須アミノ酸(2mg/mlヒスチジン、2mg/mlイソロイシン、2mg/mlロイシン、2mg/mlリジン、1mg/mlメチオニン、1.62mg/mlフェニルアラニン、2mg/mlスレオニン、1mg/mlトリプトファン及び2mg/mlバリン)含有及び不含の人工食(Akey and Beck,1971をベースとする;実験計画を参照されたい)に製剤化した0(陰性対照)又は100μg/mlのリファンピシン含有。
2)葉面塗布:水中100μlの0.025%非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒Silwet L-77(陰性対照)又は溶媒溶液中に製剤化した100μlの50μg/mlのリファンピシンを葉の表面に直接塗って乾燥させた。
3)マイクロインジェクション:注入溶液は、水中0.025%非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒Silwet L-77(陰性対照)又は溶媒溶液中に製剤化した50μg/mlのリファンピシンのいずれかであった。
4)局所送達:30mL噴霧ボトルを使用して、100μlの0.025%非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒Silwet L-77(陰性対照)又は溶媒溶液中に製剤化した50μg/mlのリファンピシンを噴霧した。
5)葉への注入法A - 葉の灌流及び切断:食品着色料を含有する水中約1mlの50μg/mlのリファンピシン又は水及び食品着色料を含む約1mlの陰性対照を葉に注入した。葉を2×2cm四方の断片に切断し、葉の断片上にアブラムシを置いた。
6)葉の灌流及び経植物送達:水+食品着色料中約1mlの100μg/mlのリファンピシン又は水及び食品着色料を含む約1mlの陰性対照を葉に注入した。次に、1mlの100μg/mlのリファンピシン+水及び食品着色料又は水及び食品着色料のみを含む1mlの陰性対照が入ったエッペンドルフ試験管に、注入した葉の茎を入れた。
7)併用送達方法:a)アブラムシ及び植物への局所送達:水中0.025%非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒Silwet L-77(陰性対照)又は溶媒溶液中に製剤化した100μg/mlのリファンピシンを、30mLを使用してアブラムシ及び植物の両方に噴霧することによる、b)経植物送達:水のみ(陰性対照)又は水中に製剤化した100μg/mlのリファンピシン。
アブラムシ(LSR-1系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から初齢アブラムシを採集し、3つの異なる処理群に分割した:1)必須アミノ酸不含の人工食単独、2)必須アミノ酸不含の人工食単独及び100μg/mlリファンピシン、及び3)必須アミノ酸含有人工食及び100μg/mlリファンピシン)。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
LSR-1 1齢アブラムシを実験計画(上記)に定義されるとおりの3つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図2A)。リファンピシンで処理したアブラムシでは発育が遅れ、処理6日まで、ほとんどのアブラムシの成熟は、12日後であっても3齢期より先に進まなかったと共に、そのサイズが劇的に影響を受ける(図2A~図2C)。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシの大多数が処理後5日の時点で生存していた(図3)。5日以降、アブラムシは、徐々に死に始め、一部が処理後13日を超えて生き延びた。
処理下のアブラムシにおいて、繁殖力もモニタした。処理後7日目及び8日目までに、必須アミノ酸不含の人工食で処理した成虫アブラムシの大多数が繁殖し始めた。必須アミノ酸不含の人工食で処理したアブラムシによって成虫になった後に1日に産生される子孫の数の平均値は、約4であった(図4)。対照的に、必須アミノ酸含有又は不含のリファンピシンで処理したアブラムシは、成虫期に達して子孫を産生することができなかった。これらのデータは、リファンピシン処理がアブラムシの繁殖の消失を引き起こしたことを示している。
リファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、7日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、リファンピシンで処理したアブラムシは、約4分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーを有し(図5)、リファンピシン処理がブフネラ属(Buchnera)レベルを低下させたことが示された。
0.025%の非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒、Silwet L-77に、50μg/mlリファンピシンの終濃度に達するようにリファンピシンストック溶液を加えた。前の実施例に記載されるとおり、アブラムシ(eNASCO系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))をソラマメ植物上で育てた。実験のため、健康植物から初齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:葉に1)陰性対照(溶媒溶液のみ)、2)溶媒中50μg/mlリファンピシンを噴霧した。溶液を2×2cm断片のソラマメの葉に吸収させた。
葉面塗布処理時のアブラムシの生存率も測定した。リファンピシンを塗布した葉に置いたアブラムシは、対照を塗布した葉に置いたアブラムシよりも生存率が低かった(図7)。これらのデータは、リファンピシン処理を葉面塗布によって送達すると、アブラムシの生存が影響を受けたことを示している。
葉面塗布によって送達されるリファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、6日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
NanoJet IIIオートナノリットルインジェクタを使用して、インハウスの熱引きしたホウケイ酸ニードル(Drummond Scientific;カタログ番号3-000-203-G/XL)でマイクロインジェクションを実施した。前の実施例に記載されるとおり、アブラムシ(eNASCO系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))をソラマメ植物上で育てた。アブラムシを、絵筆を使用して、真空に接続されたチュービングシステムに移す(図1C)。注入部位は、アブラムシの腹側胸部であった。注入溶液は、水中の有機ケイ素系界面活性剤溶媒0.025%Silwet L-77(Lehle Seeds、カタログ番号VIS-01)(陰性対照)又は溶媒溶液中に製剤化した50μg/mlのリファンピシンのいずれかであった。注入容積は、若虫が10nl及び成虫が20nl(両方とも2nl/secの速度)であった。各処理群は、採集植物の各々からほぼ同じ数の注入された個体を有した。注入後、茎が2%寒天中にあるソラマメの葉が入ったペトリ皿にアブラムシを放した。
マイクロインジェクションによって送達されたリファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失をもたらすかどうか、及び前出の実施例で実証されたとおり、この消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼすことを試験するため、4日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、前の実施例に記載されるとおりqPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
前の実施例に記載されるとおり、アブラムシ(LSR-1系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))をソラマメ植物上で育てた。噴霧ボトルに2mlの対照(0.025%Silwet L-77)又はリファンピシン溶液(溶媒溶液中50μg/ml)を充填した。清浄なペトリ皿の底にアブラムシ(n=10)を移し、絵筆を使用してペトリ皿の隅に集めた。続いて、アブラムシを2つのコホートに分け、約100μlの対照又はリファンピシン溶液のいずれかを噴霧した。噴霧後直ちにペトリ皿を蓋で覆った。噴霧5分後、2%寒天中に茎があるソラマメの葉が入ったペトリ皿にアブラムシを放した。
局所送達によって送達されるリファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失をもたらすかどうか、及び前出の実施例で実証されたとおり、この消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼすことを試験するため、3日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、前の実施例に記載されるとおりqPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
実験計画:
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水+青色食品着色料を注入した葉)、及び2)水+青色食品着色料中50μg/mlリファンピシンを注入した葉。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。処理のため、リファンピシンストック溶液(100%メタノール中25mg/ml)を水+青色食品着色料中50μg/mlに希釈した。次に、この溶液で灌流したソラマメ茎が入った1.5mlエッペンドルフ試験管に溶液を入れ、パラフィルムを使用して管の口を閉じた。次に、この給餌システムを深底ペトリ皿(Fisher Scientific、カタログ番号FB0875711)内に置き、植物の葉にアブラムシを当てがった。各処理につき74~81匹のアブラムシを各葉の上に置いた。給餌システムは、実験全体を通じて2~3日毎に交換した。毎日生存に関してアブラムシをモニタし、死亡したアブラムシは、見付け次第、深底ペトリ皿から取り除いた。加えて、実験全体を通じて発育段階(1齢、2齢、3齢、4齢、5齢及び5R(繁殖済みの5齢))を毎日決定した。
LSR-1 1齢及び2齢アブラムシを葉への注入法A - 葉の灌流及び切断実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。水+食品着色料で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図11)。リファンピシンを注入した葉を摂餌するアブラムシでは発育が遅れ、処理6日まで、ほとんどのアブラムシの成熟は、4齢期より先に進まなかった。8日後でもなお、リファンピシンを注入した葉を摂餌するアブラムシの発育は、劇的に遅れていた(図11)。これらのデータは、葉の灌流によるリファンピシン処理がアブラムシの発育を妨げたことを示している。
葉の灌流実験時にアブラムシの生存率も測定した。リファンピシンを注入した葉上に置いたアブラムシは、対照溶液を注入した葉上に置いたアブラムシよりも生存率が低かった(図12)。これらのデータは、葉への注入によって送達されるリファンピシン処理がアブラムシの生存に影響を及ぼしたことを示している。
葉の灌流を用いて送達されるリファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失をもたらすかどうか、及び前出の実施例で実証されたとおり、この消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼすことを試験するため、8日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、前の実施例に記載されるとおりqPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
実験計画:
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。
LSR-1 1齢及び2齢アブラムシを葉の灌流及び経植物送達実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。対照溶液(水+食品着色料のみ)で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図14)。
葉の灌流及び経植物で送達される対照溶液又はリファンピシンのいずれかでアブラムシを処理した実験中にアブラムシの生存率も測定した。リファンピシンで灌流及び処理した葉を摂餌するアブラムシは、対照溶液で灌流及び処理した葉を摂餌するアブラムシよりも生存率が低かった(図15)。これらのデータは、葉の灌流及び経植物でリファンピシン処理を送達すると、アブラムシの生存に負の影響があったことを示している。
葉の灌流及び経植物を用いて送達されるリファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失をもたらすかどうか、及び前出の実施例で実証されたとおり、この消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼすことを試験するため、6及び8日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、前出の実施例に記載されるとおり、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
実験計画:
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;20±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。
LSR-1 1齢及び2齢アブラムシを併用送達方法実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。対照で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図17)。リファンピシンで処理したアブラムシでは発育が遅れ、処理6日まで、ほとんどのアブラムシの成熟は、3齢期より先に進まず、7日後であっても、その発育は、劇的に遅れていた(図17)。これらのデータは、リファンピシン処理の併用がアブラムシの発育を妨げたことを示している。
アブラムシをリファンピシン処理の併用で処理した実験中、アブラムシの生存率も測定した。リファンピシンで処理したアブラムシは、対照溶液で処理したアブラムシと比べて生存率がやや低かった(図18)。これらのデータは、処理の併用によって送達されたリファンピシン処理がアブラムシの生存に影響を及ぼしたことを示している。
方法の併用によって送達されたリファンピシンがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失をもたらすかどうか、及び前出の実施例で実証されたとおり、この消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼすことを試験するため、7日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、前の実施例に記載されるとおりqPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
本実施例は、キチンに由来する脱アセチル化β-1,4-D-グルコサミンの天然カチオン性線状多糖であるキトサンによるアブラムシの処理を実証する。キチンは、昆虫、甲殻類(主にエビ及びカニ)の外骨格及び真菌の細胞壁の構造要素であり、セルロースに次いで2番目に最も豊富な天然多糖である。本実施例は、キトサンが昆虫に及ぼす効果が、キトサンに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
葉の灌流及び経植物送達の組み合わせを用いてキトサン溶液を製剤化した(図20)。対照溶液は、水+青色食品着色料を注入した葉及び試験管内の水であった。葉への注入(青色食品着色料を含む)及び経植物(エッペンドルフ試験管内)を用いた水中300ug/mlキトサン(低分子量)による処理溶液。
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、2)処理溶液が水中300ug/mlキトサン(低分子量)を含んだ。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
LSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(上記)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。陰性対照単独で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図21)。キトサン溶液で処理したアブラムシでは発育が遅れ、キトサンによる処理6日までに、ほとんどのアブラムシの成熟は、4齢期より先に進まなかった。これらのデータは、キトサンによる処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めたことを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。対照単独で処理したアブラムシの大多数が処理後3日の時点で生存していた(図22)。4日以降、アブラムシは、徐々に死に始め、一部が処理後7日を超えて生き延びた。
キトサン溶液処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、8日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。対照単独で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、水中300ug/mlキトサンで処理したアブラムシは、約5分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーとなり(図23)、キトサン処理がブフネラ属(Buchnera)レベルを低下させたことが示された。
本実施例は、食品保存剤としてよく使用される細菌ラクトコッカス・ラクチス(Lactococcus lactis)によって産生される天然の「広域スペクトル」多環式抗細菌性ペプチドによるアブラムシの処理を実証する。ナイシンの抗細菌活性は、細菌細胞膜に孔を開け、特異的リピドII相互作用によって細菌細胞壁の生合成を妨害するその能力を通じて媒介される。本実施例は、ナイシンが昆虫適応度に及ぼす負の効果が、ナイシンに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されることを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
葉の灌流及び経植物送達の組み合わせを用いてナイシンを製剤化した。対照溶液(水)又は処理溶液(ナイシン)を葉に注入し、エッペンドルフ試験管に入れた。処理溶液は、水中1.6又は7mg/mlナイシンからなった。
LSR-1アブラムシ、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、2)水中1.6mg/ml又は7mg/mlのいずれかのナイシンによるナイシン処理。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
LSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(上記)に定義されるとおりの3つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。陰性対照溶液(水)で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始め、7日までに繁殖(5R期)し始めた(図24)。7mg/mlナイシンで処理したアブラムシでは、発育が重度に遅れた。7mg/mlナイシンで処理したアブラムシは、3日目までに2齢期までのみ発育し、6日目までに群内の全てのアブラムシが死亡した(図24)。低濃度のナイシン(1.6mg/ml)で処理したアブラムシでは生育がやや遅れ、評価したいずれの時点においても、水で処理した対照と比較して、発育しにくいアブラムシが多かった(図24)。これらのデータは、ナイシンによる処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めたと共に、この発育の遅れが投与したナイシンの用量に依存したことを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。対照単独で処理したアブラムシの約50%が8日間の実験を生き延びた(図25)。対照的に、7mg/mlナイシンで処理したアブラムシについては、生存率は、有意に低く(p<0.0001、ログ・ランク・マンテル・コックス検定による)、この群の全てのアブラムシが6日までに処理で死亡した(図25)。低用量のナイシン(1.6mg/ml)で処理したアブラムシは、対照処理のアブラムシと比較して死亡率が高かったが、この差は、統計的有意性に達しなかった(p=0.0501 ログ・ランク・マンテル・コックス検定による)。これらのデータは、ナイシンで処理したときに生存の用量依存的低下があったことを示している。
ナイシンによる処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、8日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。対照単独で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、1.6mg/mlナイシンで処理したアブラムシは、約8日間の処理後に約1.4分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーを有した(図26)。7mg/mlナイシンで処理した群に生きているアブラムシはなく、従って、この群ではブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーを評価しなかった。これらのデータは、ナイシン処理がブフネラ属(Buchnera)レベルを低下させたことを示している。
本実施例は、炭水化物をヘキソース(例えば、木、デンプン、コムギ、麦わら又はショ糖)と共に希鉱酸を加えて加熱することにより生じるケト酸であるレブリン酸でアブラムシを処理すると、昆虫の適応度が低下することを実証する。レブリン酸は、食肉生産において、大腸菌(Escherichia coli)及びサルモネラ属(Salmonella)に対する抗微生物剤として既に試験されている(Carpenter et al.,2010,Meat Science;Savannah G.Hawkins,2014,University of Tennessee Honors Thesis)。本実施例は、レブリン酸が昆虫に及ぼす効果が、レブリン酸に敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
葉の灌流及び経植物送達の組み合わせを用いてレブリン酸を製剤化した。対照溶液は、水を注入した葉であり、及びエッペンドルフ試験管に水を入れた。処理溶液は、(エッペンドルフ試験管内に)葉への注入及び経植物による水中0.03又は0.3%レブリン酸を含んだ。
実験計画:
eNASCOアブラムシ、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、2)処理溶液は、水中0.03又は0.3%レブリン酸を含んだ。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
eNASCO A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(上記)に定義されるとおりの3つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。陰性対照単独で処理したアブラムシは、約7日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図27)。レブリン酸で処理したアブラムシでは発育が遅れ、処理後11日までにほぼ全ての対照処理のアブラムシが成熟期に達した一方、0.03及び0.3%レブリン酸で処理したアブラムシのそれぞれ約23及び63%の成熟は、4齢期より先に進まなかった。これらのデータは、レブリン酸での処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めたと共に、この発育の遅れがレブリン酸の投与用量に依存することを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。対照単独で処理したアブラムシの約50%が11日間の実験を生き延びた(図28)。対照的に、0.3%レブリン酸(p<0.01)で処理したアブラムシについては、生存率は、有意に低かった。低用量のレブリン酸(0.03%)で処理したアブラムシは、対照処理のアブラムシと比較して死亡率が高かったが、この差は、統計的有意性に達しなかった。これらのデータは、レブリン酸で処理したときに生存の用量依存的低下があったことを示している。
レブリン酸での処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、7日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。対照単独で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、水中0.03又は0.3%レブリン酸で処理したアブラムシは、7日間の処理後に約6分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーを有した(図29、左側のパネル)。これらのデータは、レブリン酸処理によりブフネラ属(Buchnera)レベルが低下したことを示している。
本実施例は、細胞に透過し、且つ幾つかのデヒドロゲナーゼ酵素の阻害薬としての役割を果たす綿植物(ワタ属(Gossypium))に由来する天然フェノール、ゴシポール酢酸によるアブラムシの処理を実証する。本実施例は、ゴシポールが昆虫に及ぼす効果が、ゴシポールに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
1)経植物:必須アミノ酸(ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、スレオニン、トリプトファン及びバリン)不含の人工食(Akey and Beck,1971をベースとする;実験計画を参照されたい)に製剤化した0(陰性対照)又は0.5%、0.25%及び0.05%のゴシポール。
2)マイクロインジェクション:注入溶液は、0.5%のゴシポール又は人工食のみ(陰性対照)のいずれかであった。
アブラムシ(eNASCO(ブフネラ属(Buchnera)及びセラチア属(Serratia)一次及び二次共生者の両方をそれぞれ含む)又はLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)のいずれかの株、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、4つの異なる処理群に分割した:1)必須アミノ酸不含の人工食単独、2)必須アミノ酸不含の人工食単独及び0.05%のゴシポール、3)必須アミノ酸不含の人工食単独及び0.25%のゴシポール、及び4)必須アミノ酸不含の人工食単独及び0.5%のゴシポール。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
eNASCO及びLSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり4つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。人工食単独で処理したアブラムシは、約3日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図30A)。ゴシポールで処理したアブラムシでは発育が遅れ、0.5%のゴシポールによる5日間の処理までに、ほとんどのアブラムシの成熟は、3齢期より先に進まなかったと共に、そのサイズも影響を受ける(図30A及び図30B)。これらのデータは、ゴシポールによる処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めたこと、及びこの応答が用量依存的であったことを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシの大多数は、処理後2日の時点で生存していた(図31)。4日以降、アブラムシは、徐々に死に始め、一部が処理後7日を超えて生き延びた。
処理下のアブラムシにおいて、繁殖力もモニタした。処理後7日目及び8日目までに、必須アミノ酸不含の人工食で処理した成虫アブラムシの大多数が繁殖し始めた。必須アミノ酸不含の人工食で処理したアブラムシによって成虫になった後に1日に産生される子孫の数の平均値は、約5であった(図32A及び図32B)。
種々の濃度のゴシポールがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、5又は13日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシ(対照)は、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、0.25及び0.5%のゴシポールで処理したアブラムシは、約4分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーを有し(図33)、ゴシポール処理がブフネラ属(Buchnera)レベルを低下させたこと、及びこの低下が濃度依存的であったことが示された。
NanoJet IIIオートナノリットルインジェクタを使用してインハウスの熱引きしたホウケイ酸ニードル(Drummond Scientific;カタログ番号3-000-203-G/XL)でマイクロインジェクションを実施した。アブラムシ(LSR-1系統、A.ピスム(A.pisum))を前の実施例に記載されるとおりソラマメ植物上で育てた。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の注入された個体を有した。若虫アブラムシ(<3齢期)を、絵筆を使用して、真空に接続されたチュービングシステムに移し、必須アミノ酸不含の人工食(陰性対照)又は必須アミノ酸不含の人工食中0.05%のゴシポール溶液のいずれか20nlを腹側胸部にマイクロインジェクションした。注入後、アブラムシは、茎が2%寒天中にあるソラマメの葉が入った深底ペトリ皿に置いた。
マイクロインジェクションによって送達されたゴシポールがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失をもたらすかどうか、及び前出の実施例で実証されたとおり、この消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼすことを試験するため、4日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、前の実施例に記載されるとおりqPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。
本実施例は、桂皮(シナモマム・ゼイラニクム(Cinnamomum zeylandicum))の樹皮抽出物の主成分である天然芳香族アルデヒド、trans-シンナムアルデヒドによるアブラムシの処理により適応度の低下が引き起こされることを実証する。trans-シンナムアルデヒドは、グラム陰性生物及びグラム陽性生物の両方に対して抗微生物活性を有することが示されているが、しかし、その抗微生物活性の正確な作用機構は、依然として不明である。trans-シンナムアルデヒドは、細菌細胞膜に損傷を与え、特異的細胞過程又は酵素を阻害し得る(Gill and Holley,2004 Applied Environmental Microbiology)。本実施例は、trans-シンナムアルデヒドが昆虫に及ぼす効果が、trans-シンナムアルデヒドに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
trans-シンナムアルデヒドを水中0.05%、0.5%又は5%に希釈し、葉の灌流(約1mlを葉に注入した)及び経植物によって送達した。
アブラムシ(LSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、4つの異なる処理群に分割した:1)水で処理した対照、2)水中0.05%trans-シンナムアルデヒド、3)水中0.5%trans-シンナムアルデヒド、及び4)水中5%trans-シンナムアルデヒド。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
LSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり4つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。水単独で処理したアブラムシは、処理後3日で3齢期に達し始めた(図35)。trans-シンナムアルデヒドで処理したアブラムシでは発育が遅れ、3つのtrans-シンナムアルデヒド濃度の各々による3日間の処理までに、第2の齢期を超えて成熟したアブラムシはなかった(図35)。更に、最も高い濃度のtrans-シンナムアルデヒド(5%)で処理したアブラムシの全ては、実験の経過全体を通じて1齢期に留まった。これらのデータは、trans-シンナムアルデヒドによる処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めること、及びこの応答が用量依存的であることを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。水単独で処理したアブラムシの約75パーセントが処理後3日の時点で生きていた(図36)。対照的に、0.05%、0.5%及び5%trans-シンナムアルデヒドで処理したアブラムシは、水単独で処理したアブラムシと比べて生存率が有意に低かった(水で処理した対照と比較した各処理群についてp<0.0001)。これらのデータは、天然抗微生物性trans-シンナムアルデヒドで処理したときに生存の用量依存的低下があったことを示している。
種々の濃度のtrans-シンナムアルデヒドがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、3日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。水単独で処理したアブラムシ(対照)は、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。同様に、最も低い濃度のtrans-シンナムアルデヒド(0.5%)で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。
本実施例は、そのうちの幾つかがサソリのウロダクス・ヤシェンコイ(Urodacus yaschenkoi)の毒腺トランスクリプトームにおけるAMPと同定される(Luna-Ramirez et al.,2017,Toxins)、複数のサソリ抗微生物ペプチド(AMP)によるアブラムシの処理を実証する。AMPは、典型的には正味正電荷を有し、従って細菌膜に対して高親和性を有する。本実施例は、AMPが昆虫に及ぼす効果が、AMPペプチドに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、アブラムシの偏性共生者であるブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
葉の灌流及び経植物送達の組み合わせを用いてUy192溶液を製剤化した。対照溶液は、水+青色食品着色料を注入した葉及び試験管内の水であった。処理溶液は、葉への注入(青色食品着色料を含む)及び経植物(エッペンドルフ試験管内)による水中100ug/ml Uy192からなった。
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;20±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、2)水中100ug/ml AMPの処理溶液。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
LSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(上記)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。陰性対照単独で処理したアブラムシは、約6日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図38)。Uy192で処理したアブラムシでは発育が遅れ、8日間の処理後、アブラムシの成熟は、4齢期より先に進まなかった。これらのデータは、Uy192による処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めたことを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。対照単独で処理したアブラムシの大多数が処理後3日の時点で生存していた(図39)。4日以降、アブラムシは、徐々に死に始め、一部が処理後7日を超えて生き延びた。
Uy192による処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、8日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。対照単独で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、水中100ug/ml Uy192で処理したアブラムシは、約7分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーであったことから(図40)、Uy192処理がブフネラ属(Buchnera)レベルを低下させたことが示される。
本実施例は、最近になってサソリのウロダクス・ヤシェンコイ(Urodacus yaschenkoi)の毒腺トランスクリプトームにおいてAMPと同定された(Luna-Ramirez et al.,2017,Toxins)幾つかのサソリ抗微生物ペプチド(AMP)D10、D3、Uyct3及びUy17によるアブラムシの処理を実証する。AMPは、典型的には正味正電荷を有し、従って細菌膜に対して高親和性を有する。本実施例は、AMPが昆虫に及ぼす効果が、AMPペプチドに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、アブラムシの偏性共生者、ブフネラ・アフィディコラ(Buchnera aphidicola)である。
指示されるペプチド又はペプチドカクテル(詳細については以下のアブラムシマイクロインジェクション実験計画及び葉の灌流 - 植物実験計画の節を参照されたい)をアブラムシに直接マイクロインジェクションするか、又は葉の灌流と経植物送達との組み合わせを用いて送達した。陰性対照として、アブラムシに水をマイクロインジェクションするか(マイクロインジェクション実験について)、又は水を注入した葉上及び管内の水に置いた(葉の灌流及び植物送達実験について)。処理溶液は、水中に溶解した20nlの5μg/μlのD3又はD10(アブラムシマイクロインジェクションについて)、又は葉への注入及び経植物による水中40μg/mlのD10、Uy17、D3及びUyCt3のカクテル(エッペンドルフ試験管内)からなった。
NanoJet IIIオートナノリットルインジェクタを使用してインハウスの熱引きしたホウケイ酸ニードル(Drummond Scientific;カタログ番号3-000-203-G/XL)でマイクロインジェクションを実施した。アブラムシ(LSR-1系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の注入された個体を有した。成虫アブラムシの腹側胸部に20nlの水又は100ng(20ulの5ug/mlペプチドD3又はD10溶液のいずれかをマイクロインジェクションした。マイクロインジェクション速度は、5nl/secであった。注入後、茎が2%寒天中にあるソラマメの葉が入った深底ペトリ皿にアブラムシを置いた。
LSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢及び2齢アブラムシを実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり3つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、生存率を決定した。5日間の処理後、サソリペプチドを注入したアブラムシは、水を注入した対照と比較して生存率が低かった(D3、D10及び水の注入について、それぞれ9、35及び45%の生存)(図41)。これらのデータは、サソリAMP D3及びD10で処理したときに生存の低下があったことを示している。
サソリAMP D3及びD10の注入がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、注入後5日で各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。水単独を注入したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNA(47.4)比を有する一方、D3及びD10を注入したアブラムシは、低いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNA比を有した(それぞれ25.3及び30.9)(図42)。これらのデータは、サソリペプチドD3及びD10による処理が細菌共生者ブフネラ属(Buchnera)のレベルの低下を引き起こしたことを示している。
eNASCOアブラムシ(ブフネラ属(Buchnera)及びセラチア属(Serratia)を含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を上記に記載したとおりソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、2)処理溶液は、水中各40μg/mlのD10、Uy17、D3及びUyCt3からなった。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。6日間の処理後、ペプチドカクテルで処理したアブラムシは、水で処理したアブラムシと比較して生存率が低かった。9日後には、この効果が一層明らかである(ペプチドカクテル処理及び水処理について、それぞれ16及び29%生存)(図43)。これらのデータは、サソリAMPのカクテルで処理したときに生存の低下があったこと、及び前出の実施例に示されるとおり、これらのAMPがアブラムシの内部共生体レベルを低下させたことを示している。
本実施例は、ウイルスに由来する細胞透過性ペプチドとの融合サソリ抗微生物ペプチド(AMP)(Uy192)によるアブラムシの処理を実証する。AMP Uy192は、サソリのウロダクス・ヤシェンコイ(Urodacus yaschenkoi)の毒腺トランスクリプトームにおける幾つかの近年同定されたAMPの1つである(Luna-Ramirez et al.,2017,Toxins)。AMPは、典型的には正味正電荷を有し、従って細菌膜に対して高親和性を有する。アブラムシ細胞へのサソリペプチドUy192の送達を増強するため、ヒト免疫不全ウイルスI型(HIV-1)のトランス活性化転写因子(TAT)タンパク質の一部分に融合したペプチドを合成した。先行研究では、この細胞透過性ペプチド(CPP)を他の分子にコンジュゲートすると、形質導入を介した細胞への取り込みが増加したことが示されている(Zhou et al.,2015 Journal of Insect Science and Cermenati et al.,2011 Journal of Insect Physiology)。本実施例は、融合ペプチドが昆虫に及ぼす効果が、抗微生物ペプチドに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ属(Buchnera)である。
細胞透過性ペプチドにコンジュゲートし、且つ6FAMで蛍光タグを付加したサソリペプチド(Uy192+CPP+FAM)を、葉の灌流及び経植物送達の組み合わせを用いて製剤化した。対照溶液(水)又は処理溶液(Uy192+CPP+FAM)を葉に注入し、エッペンドルフ試験管に入れた。処理溶液は、水中100μg/ml Uy192+CPP+FAMを含んだ。
LSR-1アブラムシ、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から初齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、2)水中100μg/ml Uy192+CPP+FAMで処理したUy192+CPP+FAM。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
LSR-1 A.ピスム(A.pisum)1齢アブラムシを実験計画(上記)に定義されるとおり3つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。0日目及び1日目について、水で処理したアブラムシ及び細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドで処理したアブラムシの両方とも同様の発育であった(図44)。しかしながら、2日目までに対照処理のアブラムシは、2齢期又は3齢期のいずれかにまで発育した一方、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドで処理した一部のアブラムシは、初齢期のままであった(図44)。処理後3日においてもなお、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドで処理した一部のアブラムシは、初齢期のままであった(図44)。処理後7日までに、水で処理したアブラムシの大多数が5齢期又は5齢繁殖期まで発育した。対照的に、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドで処理したアブラムシは、50パーセントのみが5齢期まで発育した一方、約42及び約8パーセントのアブラムシは、それぞれ3齢期又は4齢期に留まった(図44)。これらのデータは、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドUy192による処理がアブラムシの発育の進行を遅らせ且つ止めたことを示している。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。対照単独で処理したアブラムシの約40%が7日間の実験を生き延びた(図45)。対照的に、100μg/ml Uy192+CPP+FAMで処理したアブラムシについて、生存率は、有意に低く(p=0.0036、ログ・ランク・マンテル・コックス検定による)、僅か16%のアブラムシのみが7日目まで生き延びた(図45)。これらのデータは、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドUy192で処理したときに生存の低下があったことを示している。
Uy192+CPP+FAMによる処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、5日間の処理後に各群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。水で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNA比(約134)を有した。対照的に、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドで処理したアブラムシは、5日間の処理後に約1.8分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーであった(図46)。これらのデータは、細胞透過性ペプチドに融合したサソリペプチドによる処理が内部共生体レベルを低下させたことを示している。
細胞透過性ペプチドがバクテリオサイトへのサソリペプチドの直接的な送達に役立つかどうかを試験するため、分離したバクテリオサイトを融合タンパク質に直接曝露し、イメージングした。1%w/v BSAを補充したシュナイダー培地(Schneider-BSA培地)でアブラムシからバクテリオサイトを解離し、20ulのシュナイダー培地が入ったイメージングウェルに置いた。サソリペプチドの100ug凍結乾燥アリコートを100ulのシュナイダー培地に再懸濁して1mg/ml溶液を作製し、バクテリオサイトが入ったウェルに5ulのこの溶液を混合した。室温で30分間インキュベートした後、バクテリオサイトを徹底的に洗浄して、溶液中のいかなる過剰な遊離ペプチドも除去した。インキュベーション前及びその後にバクテリオサイトの画像を取得した(図47)。融合ペプチドは、バクテリオサイト膜を通過し、ブフネラ属(Buchnera)に直接利用可能となった。
本実施例は、パントテン酸(ビタミンB5)のアルコール類似体であるプロビタミンのパントテノールによるアブラムシの処理を実証する。アブラムシは、偏性内部共生細菌、ブフネラ属(Buchnera)を有し、これは、アブラムシが必須アミノ酸及びビタミンB5を含めたビタミン類を作り出すことを促進する。先行研究では、パントテノールが特異的寄生虫キナーゼの阻害によって熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falciparium)の成長を阻害することが示されている(Saliba et al.,2005)。昆虫をパントテノールで処理すれば、細菌-昆虫共生にとって有害であり、従って昆虫適応度に影響するであろうと仮定された。本実施例は、パントテノールによる処理が昆虫適応度を低下させたことを実証する。
パントテノール溶液を送達方法に応じて製剤化した:
1)経植物人工食中:必須アミノ酸(2mg/mlヒスチジン、2mg/mlイソロイシン、2mg/mlロイシン、2mg/mlリジン、1mg/mlメチオニン、1.62mg/mlフェニルアラニン、2mg/mlスレオニン、1mg/mlトリプトファン及び2mg/mlバリン)不含の人工食(Akey and Beck,1971をベースとする;実験計画を参照されたい)に製剤化した0(陰性対照)又は10若しくは100uMパントテノール含有。
2)葉面塗布:水中100μlの0.025%非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒Silwet L-77(陰性対照)又は100μlの溶媒溶液中に製剤化した50μg/mlのリファンピシンを葉の表面に直接塗って乾燥させた。
アブラムシ(eNASCO、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から1齢及び2齢アブラムシを採集し、3つの異なる処理群に分割した:1)必須アミノ酸不含の人工食単独、2)必須アミノ酸不含の人工食単独及び10uMパントテノール、及び3)必須アミノ酸不含の人工食単独及び100uMパントテノール。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。
eNASCO1齢及び2齢アブラムシを植物送達実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり3つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシは、約5日で成虫期(5齢期)に達し始めた(図48A)。パントテノールで処理したアブラムシでは、特に処理後2及び3日目の時点で発育が遅れたことから(図48A)、パントテノールによる処理がアブラムシの発育を妨げることが指摘される。最終的には、各処理群のほとんどのアブラムシが成虫になり、繁殖し始めた。時間の経過に伴うアブラムシの発育段階をモニタすることに加えて、アブラムシをまたイメージングして、アブラムシの表面積を決定した。1日間の処理後は、全てのアブラムシが同じサイズであったが、しかしながら、処理後3日までに、パントテノールで処理したアブラムシは、未処理対照と比べて表面積が小さかった。更に、パントテノールで処理したアブラムシは、実験の経過にわたって必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシと比較して体のサイズ(表面積によって決定したとき)の増加が大幅に少なかった(図48B)。
処理時にアブラムシの生存率も測定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で飼育したアブラムシは、10又は100uMパントテノールで処理したアブラムシと比較してより高い生存率を有したことから(図49)、パントテノール処理がアブラムシ適応度に負の影響を及ぼしたことが指摘される。
処理下のアブラムシにおいて繁殖力もモニタした。成虫まで生き延びて繁殖するアブラムシの割合を決定した。必須アミノ酸不含の人工食で処理したアブラムシは、約4分の1が生き延びて処理後8日までに成虫になった(図50A)。対照的に、10又は100uMパントテノールで処理したうちの10分の1をごく僅かに超えるアブラムシが生き延びて処理後8日までに成虫になり、繁殖した。各処理群のアブラムシが繁殖し始める平均日数も測定し、全ての処理群について、アブラムシが繁殖し始める平均日数は、7日であった(図50B)。加えて、成虫の繁殖アブラムシによって産生される1日当たりの子孫の数の平均値もモニタした。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシは、約7子孫/日を産生した。対照的に、10及び100uMパントテノールで処理したアブラムシは、図50Cに示される、それぞれ約4及び5子孫/日を産生するに過ぎなかった。まとめると、これらのデータは、パントテノール処理がアブラムシの繁殖の消失を引き起こしたことを示している。
パントテノールがアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、8日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。必須アミノ酸不含の人工食単独で処理したアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有し、2つの濃度のパントテノールの各々で処理したアブラムシも同じであった(図51)。これらのデータは、パントテノール処理がブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー数に直接的な影響を及ぼさないことを示している。
0.025%の非イオン性有機ケイ素系界面活性剤溶媒、Silwet L-77に、10uMパントテノールの終濃度に達するようにパントテノール粉末を加えた。この処理液を、0.22umフィルタを使用してろ過滅菌し、4℃で保存した。前の実施例に記載されるとおり、アブラムシ(eNASCO系統、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum))をソラマメ植物上で育てた。実験のため、健康植物から初齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(溶媒溶液のみ)、及び2)溶媒中10uMパントテノール。100ulの溶液を2×2cm断片のソラマメの葉に吸収させた。
eNASCO 1齢アブラムシを本明細書に記載される実験計画に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。対照又はパントテノール溶液のいずれかで処理した塗布した葉に置いたアブラムシは、処理後2日まで同じ速度で成熟した(図52)。これらのデータは、パントテノールの葉面塗布がアブラムシの発育に影響を及ぼさなかったことを示している。
葉面塗布処理時にアブラムシの生存率も測定した。パントテノールを塗布した葉に置いたアブラムシは、対照溶液を塗布した葉に置いたアブラムシよりも生存率が低かった(図53)。これらのデータは、葉面塗布によって送達されるパントテノール処理がアブラムシの生存に有意に(p=0.0019)影響を及ぼしたことを示している。この実験では、全てのアブラムシが死亡し、DNAを抽出してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNA比を決定するためにとっておくアブラムシは残っていなかった。
本実施例は、アミノ酸類似体のカクテルによるアブラムシの処理を実証する。この処理の目的は、ApGLNT1グルタミントランスポーターを介したバクテリオサイトへのグルタミンの取り込みを阻害することであった。以前、アルギニンがグルタミントランスポーターによるグルタミン取り込みを阻害することが示されており(Price et al.,2014 PNAS)、本発明者らは、アルギニンの類似体又は他のアミノ酸類似体による処理もアブラムシバクテリオサイトへの必須アミノ酸の取り込みを阻害し得ると仮定した。本実施例は、処理時の適応度の低下が、アミノ酸類似体に敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、ブフネラ属(Buchnera)である。
葉の灌流及び経植物による送達のためにアミノ酸カクテルを製剤化した。この送達方法は、葉に水中約1mlのアミノ酸カクテル(カクテル中の成分のリストについては以下を参照されたい)又は水のみを含有する1mlの陰性対照溶液を注入することからなった。
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から初齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)、及び2)アミノ酸カクテル処理。アミノ酸カクテルは、以下の薬剤の各々を指示される終濃度で含有した:330μM L-NNA(N-ニトロ-L-アルギニン;Sigma)、0.1mg/ml L-カナバニン(Sigma)、0.5mg/ml D-アルギニン(Sigma)、0.5mg/ml D-フェニルアラニン(Sigma)、0.5mg/ml D-ヒスチジン(Sigma)、0.5mg/ml D-トリプトファン(Sigma)、0.5mg/ml D-スレオニン(Sigma)、0.5mg/ml D-バリン(Sigma)、0.5mg/ml D-メチオニン(Sigma)、0.5mg/ml D-ロイシン及び6μM L-NMMA(クエン酸塩)(Cayman Chemical)。約1mlの処理溶液を注入によってソラマメの葉に灌流し、植物の茎を、処理溶液が入った1.5mlエッペンドルフ試験管に入れた。パラフィルムを使用して管の口を閉じた。次に、この給餌システムを深底ペトリ皿(Fisher Scientific、カタログ番号FB0875711)内に置き、植物の葉にアブラムシを当てがった。各処理につき合計56~58匹のアブラムシを各葉の上に置いた(各処理は28~31匹のアブラムシの2レプリケートからなった)。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。給餌システムは、実験全体を通じて2~3日毎に交換した。毎日生存に関してアブラムシをモニタし、死亡したアブラムシは、見付け次第、深底ペトリ皿から取り除いた。実験全体を通じてアブラムシの発育段階(1齢、2齢、3齢、4齢及び5齢)を毎日決定し、5日目にアブラムシの顕微鏡画像を撮影してアブラムシの面積測定値を決定した。
LSR-1 1齢アブラムシを葉の灌流及び経植物送達実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。水で処理したアブラムシは処理後5日目に成虫期(5齢期)に達し始めた(図54A)。処理後6日までに、水で処理したアブラムシの約20パーセントが5齢期に達した。対照的に、アミノ酸カクテルで処理したアブラムシのうち、5齢期に達したのは、6日後であっても3パーセント未満であった(図54A)。アミノ酸カクテルで処理したときのこの発育の遅れは、処理後5日で取ったアブラムシのサイズ測定値により更に例証された。水単独で処理したアブラムシは、約0.45mm2であった一方、アミノ酸カクテルで処理したアブラムシは、約0.33mm2であった(図54B)。これらのデータは、アミノ酸カクテルによる処理がアブラムシの発育を遅らせ、アブラムシ適応度に負の影響を与えたことを示している。
アミノ酸類似体カクテルによる処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、6日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。対照溶液に置いたアブラムシは、高いブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピー比を有した。対照的に、AAカクテル処理に置いたアブラムシは、ブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNAコピーが劇的に減少したことから(図55)、AA類似体カクテル処理が内部共生体ブフネラ属(Buchnera)を除去したことが示される。
本実施例は、3つの抗微生物剤の併用-抗生物質(リファンピシン)、ペプチド(サソリペプチドUy192)及び天然抗微生物薬(低分子量キトサン)による昆虫の処理を実証する。他の実施例において、これらの薬剤の各々を個別に投与したところ、アブラムシ適応度が低下し、内部共生体レベルが減少した。本実施例は、併用処理を送達することにより、各個別の薬剤単独による処理と同様に又はそれよりも良好に昆虫適応度及び内部共生体レベルが減少したことを実証する。
葉の灌流及び経植物による送達のために併用処理を製剤化した。この送達方法は、水中約1mlの併用処理液(100μg/mlリファンピシン、100μg/ml Uy192及び300μg/mlキトサンの終濃度で)又は水のみを含有する1mlの陰性対照溶液を葉に注入することからなった。
アブラムシLSR-1(これは、ブフネラ属(Buchnera)のみを含む)、アキルトシフォン・ピスム(Acyrthosiphon pisum)を、環境制御されたインキュベーター(16時間明期/8時間暗期の光周期;60±5%RH;25±2℃)においてソラマメ植物(Johnny’s Selected Seedsからのブロマソラマメ(Vroma vicia faba))上で育てた。アブラムシの飼育に使用する前に、ソラマメ植物は、鉢植えのための土において24℃で16時間明期及び8時間暗期で成長させた。母性効果又は植物間の健康の差を抑制するため、異なる植物からの5~10匹の成虫を10本の2週齢植物に分配し、高密度になるまで5~7日間増殖させた。実験のため、健康植物から初齢アブラムシを採集し、2つの異なる処理群に分割した:1)陰性対照(水処理)及び2)100μg/mlリファンピシン、100μg/ml Uy192及び300μg/mlキトサン処理の併用。約1mlの処理溶液を注入によってソラマメの葉に灌流し、処理溶液が入った1.5mlエッペンドルフ試験管に植物の茎を入れた。パラフィルムを使用して管の口を閉じた。次に、この処理システムを深底ペトリ皿(Fisher Scientific、カタログ番号FB0875711)内に置き、植物の葉にアブラムシを当てがった。各処理につき合計56匹のアブラムシを各葉の上に置いた(各処理は28匹のアブラムシの2レプリケートからなった)。各処理群が採集植物の各々からほぼ同じ数の個体を受け取った。給餌システムは、実験全体を通じて2~3日毎に交換した。毎日生存に関してアブラムシをモニタし、死亡したアブラムシは、見付け次第、深底ペトリ皿から取り除いた。実験全体を通じてアブラムシの発育段階(1齢、2齢、3齢、4齢及び5齢)を毎日決定し、5日目にアブラムシの顕微鏡画像を撮影してアブラムシの面積測定値を決定した。
LSR-1 1齢アブラムシを葉の灌流及び経植物送達実験計画(本明細書に記載される)に定義されるとおり2つの別個の処理群に分割した。アブラムシを毎日モニタして、各発育段階にあるアブラムシの数を決定した。水で処理したアブラムシは処理後5日目で成虫期(5齢期)に達し始めた(図56A)。処理後6日までに、水で処理したアブラムシの約20パーセントが5齢期に達した。対照的に、3つの薬剤の併用で処理したアブラムシは、6日後であっても5齢期に達しなかった(図56A)。併用処理時のこの発育の遅れは、処理後5日で取ったアブラムシのサイズ測定値により更に例証された。水単独で処理したアブラムシは、約0.45mm2であった一方、3剤併用で処理したアブラムシは、約0.26mm2であった(図56B)。これらのデータは、薬剤の併用による処理がアブラムシの発育を遅らせ、アブラムシ適応度に負の影響を与えたことを示している。
処理後に生存も毎日モニタした。処理後2日で、水で処理したアブラムシの約75パーセントが生存していた一方、薬剤の併用で処理したアブラムシのうち、生存していたのは62パーセントのみであった。対照(水で処理した)群でより多くのアブラムシが処理を生き延びるというこの傾向は、実験の継続期間中にわたって続いた。処理後6日で、対照(水で処理した)アブラムシの64パーセントが生存した一方、リファンピシン、Uy192及びキトサンの併用で処理したアブラムシの58パーセントが生存した(図57)。これらのデータは、処理の併用がアブラムシの生存に負の影響を与えたことを示している。
ペプチド、抗生物質及び天然抗微生物性の併用による処理がアブラムシ内のブフネラ属(Buchnera)の消失を特異的に引き起こしたかどうか、及びこの消失がアブラムシの適応度に影響を及ぼしたことを試験するため、6日間の処理後に各処理群のアブラムシからDNAを抽出し、qPCRを実施してブフネラ属(Buchnera)/アブラムシコピー数を決定した。水単独で処理したアブラムシ、約2.3の比のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNA(図58)。対照的に、ペプチド、抗生物質及び天然抗微生物性の併用で処理したアブラムシは、約2分の1のブフネラ属(Buchnera)/アブラムシDNA比であった(図58)。これらのデータは、併用処理により内部共生体レベルが減少し、そのためアブラムシ適応度の低下が引き起こされたことを示している。
本実施例は、DNA複製に必須の2つの酵素、DNAジャイレース及びトポイソメラーゼの活性を阻害する殺菌性抗生物質であるシプロフロキサシンによるゾウムシの処理の効果を実証する。本実施例は、シプロフロキサシンが別のモデル昆虫ゾウムシに及ぼす表現型効果が、シプロフロキサシンに敏感である、昆虫にとって内因性の細菌個体群の調節を通じて媒介されたことを実証する。1つの標的となる細菌株は、コクゾウムシ属(Sitophilus)一次内部共生体(SPE、カンディダトゥス・ソダリス・ピエラントニウス(Candidatus Sodalis pierantonius))である。
コクゾウムシ属(Sitophilus)のコクゾウムシ(シトフィルス・ゼアマイス(Sitophilus zeamais))を有機トウモロコシ上、27.5℃及び70%相対湿度で飼育した。ゾウムシ飼育に使用する前に、トウモロコシは、7日間凍結し、次に滅菌水で10%湿度に調湿した。実験のため、成虫雄/雌交配対を3つの異なる処理群に分割し、これは、トリプリケートで行った:1)水対照、2)250μg/mlシプロフロキサシン、及び3)2.5mg/mlシプロフロキサシン。シプロフロキサシン(Sigma)ストック溶液を0.1N HCl中25mg/mlで作成し、0.22μmシリンジフィルタに通して滅菌し、-20℃で保存した。処理のため、適量のストック溶液を滅菌水で希釈した。
1.第1の処理は、25gのトウモロコシを上記に挙げた3つの処理群:1)水対照、2)250μg/mlシプロフロキサシン、及び3)2.5mg/mlシプロフロキサシンの各々に浸漬することを含んだ。簡潔に言えば、25gのトウモロコシを50mlコニカルチューブに入れ、処理の各々を加えてチューブを完全に満たした。チューブを振盪機に1.5時間かけ、その後、トウモロコシを取り出して深底ペトリ皿に置き、風乾させた。次に、各処理群に雄/雌交配対を加え、4日間摂餌させた。
2.4日後、交配対を取り出し、1)水対照、2)250μg/mlシプロフロキサシン、及び3)2.5mg/mlシプロフロキサシンで処理した25gの新しいトウモロコシに置くことにより第2の処理に供した。交配対は、このトウモロコシ上で7日間摂餌し、産卵した。第2の処理からのトウモロコシを子孫の羽化に関して評価した(以下の子孫の評価を参照されたい)
3.交配対を最終処理に供し、これには、交配対を処理液(1)水対照、2)250μg/mlシプロフロキサシン、及び3)2.5mg/mlシプロフロキサシンに5秒間沈めること、及び次に1mlの1)水対照、2)250μg/mlシプロフロキサシン、及び3)2.5mg/mlシプロフロキサシンでコーティングしておいた10粒のトウモロコシカーネルが入ったバイアルに入れることの組み合わせが含まれた。
25日後、成虫交配対の第2の処理からのトウモロコシカーネルの1つのレプリケートを切開し(上記の実験計画を参照されたい)、発育中の幼虫、蛹又は成虫ゾウムシの存在について確認した。コクゾウムシ属(Sitophilus)ゾウムシの発育のほとんどは、穀粒/コメ/トウモロコシの中で行われ、その発育が完了し次第、成虫は、カーネルから羽化する。トウモロコシカーネルをメスで静かに切開し、発育中のゾウムシを全て採集し、成虫、蛹及び幼虫の割合を決定した。次に、切開からのゾウムシを表面滅菌し、SPEのレベルをqPCRによって決定した。第2の処理からの群の各々の残りの2レプリケートのトウモロコシカーネルは、切開しなかったが、成虫ゾウムシの羽化に関して毎日確認した。
25mgのトウモロコシカーネルを50mlコニカルチューブに入れ、水又は水中2.5mg/ml若しくは0.25mg/mlシプロフロキサシンを加えてチューブを満たした。カーネルを本明細書に記載されるとおり1.5時間浸漬した。浸漬後、カーネルを風乾し、抗生物質がカーネルを被覆してそれに透過することが可能であったかどうかを決定するために評価した。これを試験するため、水中の大腸菌(Escherichia coli)DH5αの濃縮サンプルを5つのルリアブロス(LB)プレートに塗沫した。各プレートに対し、以下を行った、1)水中に浸漬したトウモロコシカーネルを加え、2)2.5又は0.25mg/mlシプロフロキサシンに浸漬しておいたトウモロコシカーネル全体を加え、及び3)2.5又は0.25mg/mlシプロフロキサシンに浸漬しておいたトウモロコシカーネルの半分を加え、内側を下にプレートに付けて置いた。プレートを37℃で一晩インキュベートし、翌日、細菌の成長及び/又は阻害領域を評価した。
シプロフロキサシンがカーネル後にトウモロコシカーネルの表面をコーティングすることができたかどうかを試験するため、トウモロコシカーネルを抗生物質不含の水又は2.5若しくは0.25mg/mlシプロフロキサシンを含有する水に(上記に記載したとおり)浸漬した。次に、大腸菌(E.coli)の濃縮培養物をLBプレートに塗り広げ、次にコーティングされたカーネルの1つをプレートの中央に置いた。プレートを一晩インキュベートし、翌日細菌の成長を評価した。
S.ゼアマイス(S.zeamais)交配対を実験計画(上記)に定義されるとおり3つの別個の処理群に分割した。ゾウムシを毎日モニタし、実験の経過中、全てのゾウムシが生き残った。18日間の処理後、ゾウムシを表面滅菌し、ゲノムDNAを抽出し、qPCRによってSPEレベルを測定した。水のみで処理したゾウムシは、250ug/ml及び2.5mg/mlシプロフロキサシンで処理したゾウムシと比較してSPE量がそれぞれ約4倍及び8倍であった(図57)。これらのデータは、ゾウムシをシプロフロキサシンで処理することによりSPEレベルが低下したことを示している。
7日間にF0交配対が卵を産み付け、続いて取り出されたトウモロコシカーネルを切開することにより、F1世代のゾウムシの発育を評価した。25日後、水/対照処理のトウモロコシには12の子孫が見られ、大多数(約67%)の子孫が蛹の形態であった(図58A)。250ug/ml及び2.5mg/mlシプロフロキサシンで処理したゾウムシでは、それぞれ13及び20の子孫が見られた。興味深いことに、抗生物質で処理したゾウムシは、対照処理のゾウムシと比較して発育の遅れを示し、大多数(250ug/ml及び2.5mg/mlシプロフロキサシンについて、それぞれ38及び65%)の子孫が幼虫の形態であった(図58A)。
第2の処理から当初の交配対を取り除いた後43日の間に羽化したゾウムシの数を繁殖力の尺度として使用した(図59A及び図59B)。最初のゾウムシは、29日目に羽化し、43日目までに羽化したゾウムシの総数をカウントした。水及び250ug/mlで処理したゾウムシは、同程度の量のF1子孫を有したが、2.5mg/ml処理群から羽化した子孫は、はるかに少なかったことから、抗生物質処理がSPEレベルを低下させ、ゾウムシの繁殖力に影響を及ぼしたことが示される。
本実施例は、細菌RNAポリメラーゼの阻害によってDNA依存性RNA合成を阻害する狭域スペクトル抗生物質、リファンピシン及びタンパク質合成の阻害によって細菌の繁殖を妨げる広域スペクトル抗生物質、ドキシサイクリンで処理することにより、ナミハダニを死滅させ、その適応度を低下させることが可能であることを実証する。リファンピシン及びドキシサイクリンがダニに及ぼす効果は、抗生物質に敏感である、ダニにとって内因性の細菌個体群の調節によって媒介された。
これらの実験には2つの処理、1)0.025%Silwet L-77(陰性対照)又は2)250μg/mlリファンピシンと500μg/mlドキシサイクリンとを含有する抗生物質のカクテルを用いた。リファンピシン(東京化成工業株式会社)ストック溶液は、メタノール中に25mg/mlで作成し、0.22μmシリンジフィルタに通して滅菌し、-20℃で保存した。ドキシサイクリン(製造者)ストック溶液は、水中50mg/mlで作成し、0.22μmシリンジフィルタに通して滅菌し、-20℃で保存した。
このアッセイでは、ナミハダニに対する抗生物質溶液を試験し、内因性微生物を標的とすることによりその適応度がどのように変化したかを決定した。
・生存:元気に歩き回り、又は絵筆でつつかれた後に動く。
・死亡:動かず、絵筆による刺激に反応しない。
抗生物質カクテルで処理したナミハダニの生存率を、陰性対照で処理したダニと比較した。カクテルで処理したダニの生存率は、対照と比較して低下した(図60)。
本実施例は、特定の昆虫細菌を標的とした環境サンプルからのファージの分離及び精製を実証する。本実施例は、プラークアッセイにより、その酸素消費速度及び細胞外酸性化速度を測定することにより、分離されたファージのインビトロでの標的細菌に対する有効性も実証する。最後に、本実施例は、細菌に対して分離されたファージでハエを処理することによるハエからの標的細菌に対するファージの能力を測定することにより、インビボでのファージの有効性を実証する。本実施例は、昆虫の適応度を低下させた病原性細菌の標的化にファージを使用してその細菌を除去し得ることを実証する。具体的には、園芸コンポストから分離されたファージを使用して、ハエの病原性細菌であるセラチア・マルセセンス(Serratia marcescens)を除去することができる。
天然サンプルからの特異的バクテリオファージの分離:
標的細菌に対するバクテリオファージを環境由来材料から分離した。簡潔に言えば、セラチア・マルセセンス(Serratia marcescens)の飽和培養物を新鮮な2倍濃度トリプトソイブロス(TSB)に希釈して24~26℃で対数期初期まで約120分間成長させるか、又は2倍濃度ルリア-ベルターニ(LB)ブロスに希釈して37℃で約90分間成長させた。園芸コンポストをPBS中にホモジナイズすることにより調製し、0.2μmろ過によって滅菌した。未処理の下水を0.2μmろ過によって滅菌した。1容積のろ過した原材料を対数期細菌培養物に加え、インキュベーションを24時間継続した。培養物をペレット化し、上清液を0.45μmメンブレンでろ過することにより、集積原材料を調製した。
上記のとおり分離及び精製したバクテリオファージを使用して、後続の実験に用いるファージライセートの増殖及び生成を実施した。簡潔に言えば、飽和細菌培養物を新鮮培地に100倍希釈し、60~120分間成長させて、有効なファージ感染のための初期対数増殖状態を実現した。対数期初期培養物にファージ懸濁液又はライセートを加え、ファージ増殖及び溶菌の指標である澄明なブロスが観察されるまで又は感染後最長24時間までインキュベーションを継続した。細胞を7,197×gで20分間ペレット化し、次に0.45又は0.2μmメンブレンで上清液をろ過することによりライセートを回収した。ろ過したライセートを4℃で保存した。
Seahorse XFe96アナライザー(Agilent)を使用して、感染中に酸素消費速度(OCR)及び細胞外酸性化速度(ECAR)をモニタすることによりファージが細菌に及ぼす効果を測定した。実験前日に、1ウェル当たり15μLの1mg/mL ポリ-L-リジンストックでXFe96プレートをコーティングし、28℃で一晩乾燥させ、及び200μLのXF Calibrantが入ったウェルに入れて暗所下室温でインキュベートすることによりXFe96プローブを平衡化した。翌日、ポリ-L-リジンでコートしたプレートをddH2Oで2回洗浄した。大腸菌(E.coli)BL21(LB、37℃)又はS.マルセセンス(S.marcescens)(TSB、25℃)の飽和一晩培養物を同じ培地に1:100で継代培養し、曝気しながら30℃で約2.5時間成長させた。次に、同じ培地を使用して培養物をO.D.600nm 約0.02に希釈した。処理液は、ストックをSM緩衝液に10×最終濃度で希釈し、20μLの10×溶液をプローブプレートの適切な注入ポートにロードすることにより調製した。XFe96フラックスアナライザーでプローブを平衡化している間、90μLの細菌懸濁液又は培地対照を加えることにより細菌プレートを調製し、3,000rpmで10分間スピンした。遠心後、ウェルに更なる90μLの適切な培地を、細菌付着を妨げないように静かに加え、1ウェル当たりの総容積を180μLにした。
ヌクレアーゼで前処理して、蛍光シグナル解釈を妨げ得るウイルス外核酸を取り除くことにより、バクテリオファージ調製物を染色のため調製した。簡潔に言えば、10mLのファージライセートに10mMの最終濃度でMgCl2を加え、RNase A(Qiagen)及びDNase I(Sigma)を両方とも10μg/mLの最終濃度となるように加えた。サンプルを室温で1時間インキュベートした。ヌクレアーゼ処理後、5mLのライセートを1μLのSYBR Gold(Thermo、10,000×)と合わせ、室温で約1.5時間インキュベートした。続いて、Amicon限外ろ過カラムを使用してサンプルから過剰な色素を取り除いた。簡潔に言えば、10mLのSM緩衝液を加え、5,000×g、4℃で5分間スピンすることにより、Amiconカラム(15mL、10k MWCO)を洗浄した。次に、標識したファージサンプルを、カラムを通じて5,000×g、4℃でスピンして、最終的に容積を約10倍低下させた(15~30分)。サンプルを洗浄するため、各リザーバに5mL SM緩衝液を加えてスピンを繰り返し、続いて更に2回洗浄した。3回目の洗浄後、Amiconリザーバから保持サンプルをピペッティングにより取り除き、SM緩衝液を使用して約1mLにした。より大きい夾雑物を取り除くため、洗浄及び標識したファージサンプルを10,000×gで2分間スピンし、続いて上清を0.2μmメンブレンでろ過して黒色マイクロチューブに入れ、4℃で保存した。
S.マルセセンス(S.marcescens)培養物をトリプトソイブロス(TSB)中30℃において200rpmで絶えず振盪しながら成長させた。
前述の本発明は、理解を明確にするために説明及び例として幾らか詳細に記載されているが、そうした記載及び例が本発明の範囲を限定するものと解釈されてはならない。本明細書に引用される全ての特許及び科学文献の開示は、全体として参照により明示的に援用される。
本発明は、例えば以下の実施形態を包含する:
[実施形態1]ヒト病原体のベクターの適応度を低下させる方法であって、
以下:セクロピン(配列番号82)、メリチン、コプシン、ドロソマイシン(配列番号93)、ダームシジン(配列番号81)、アンドロピン(配列番号83)、モリシン(配列番号84)、セラトトキシン(配列番号85)、アバエシン(配列番号86)、アピダエシン(配列番号87)、プロフェニン(配列番号88)、インドリシジン(配列番号89)、プロテグリン(配列番号90)、タキプレシン(配列番号91)又はデフェンシン(配列番号92)の1つ以上と少なくとも90%の配列同一性を有する抗微生物ペプチドを前記ベクターに送達すること
を含む方法。
[実施形態2]前記送達は、前記ベクターが成長、生活、繁殖、摂餌又は寄生する少なくとも1つの生息場所に前記抗微生物ペプチドを送達することを含む、実施形態1に記載の方法。
[実施形態3]前記抗微生物ペプチドは、前記ベクターによる摂取のための、昆虫が摂食可能な組成物で送達される、実施形態1又は2に記載の方法。
[実施形態4]前記抗微生物ペプチドは、液体、固体、エアロゾル、ペースト、ゲル又は気体組成物として製剤化される、実施形態1~3のいずれかに記載の方法。
[実施形態5]昆虫は、カ、小昆虫類、シラミ、スナバエ、マダニ、サシガメ、ツェツェバエ又はノミの少なくとも1つである、実施形態1~4のいずれかに記載の方法。
[実施形態6]ヒト病原体のベクター内の微生物を標的とするように製剤化される、以下:セクロピン、メリチン、コプシン、ドロソマイシン、ダームシジン、アンドロピン、モリシン、セラトトキシン、アバエシン、アピダエシン、プロフェニン、インドリシジン、プロテグリン、タキプレシン又はデフェンシンの1つ以上と少なくとも90%の配列同一性を有する抗微生物ペプチドを含む組成物。
[実施形態7]前記抗微生物ペプチドは、前記組成物中において約0.1ng/g~約100mg/gの濃度である、実施形態6に記載の組成物。
[実施形態8]前記抗微生物ペプチドは、ターゲティングドメインを更に含む、実施形態6又は7に記載の組成物。
[実施形態9]前記抗微生物ペプチドは、細胞透過性ペプチドを更に含む、実施形態6~8のいずれかに記載の組成物。
<110> FLAGSHIP PIONEERING INNOVATIONS V, INC.
<120> COMPOSITIONS AND RELATED METHODS FOR CONTROLLING VECTOR-BORNE
DISEASES
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<150> US 62/583,912
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<211> 1526
<212> DNA
<213> Carsonella ruddii
<400> 1
tatccagcca caggttcccc tacagctacc ttgttacgac ttcaccccag ttacaaatca 60
taccgttgta atagtaaaat tacttatgat acaatttact tccatggtgt gacgggcggt 120
gtgtacaagg ctcgagaacg tattcaccgt aacattctga tttacgatta ctagcgattc 180
caacttcatg aaatcgagtt acagatttca atccgaacta agaatatttt ttaagattag 240
cattatgttg ccatatagca tataactttt tgtaatactc attgtagcac gtgtgtagcc 300
ctacttataa gggccatgat gacttgacgt cgtcctcacc ttcctccaat ttatcattgg 360
cagtttctta ttagttctaa tatattttta gtaaaataag ataagggttg cgctcgttat 420
aggacttaac ccaacatttc acaacacgag ctgacgacag ccatgcagca cctgtctcaa 480
agctaaaaaa gctttattat ttctaataaa ttctttggat gtcaaaagta ggtaagattt 540
ttcgtgttgt atcgaattaa accacatgct ccaccgcttg tgcgagcccc cgtcaattca 600
tttgagtttt aaccttgcgg tcgtaatccc caggcggtca acttaacgcg ttagcttttt 660
cactaaaaat atataacttt ttttcataaa acaaaattac aattataata tttaataaat 720
agttgacatc gtttactgca tggactacca gggtatctaa tcctgtttgc tccccatgct 780
ttcgtgtatt agtgtcagta ttaaaataga aatacgcctt cgccactagt attctttcag 840
atatctaagc atttcactgc tactcctgaa attctaattt cttcttttat actcaagttt 900
ataagtatta atttcaatat taaattactt taataaattt aaaaattaat ttttaaaaac 960
aacctgcaca ccctttacgc ccaataattc cgattaacgc ttgcacccct cgtattaccg 1020
cggctgctgg cacgaagtta gccggtgctt cttttacaaa taacgtcaaa gataatattt 1080
ttttattata aaatctcttc ttactttgtt gaaagtgttt tacaacccta aggccttctt 1140
cacacacgcg atatagctgg atcaagcttt cgctcattgt ccaatatccc ccactgctgc 1200
cttccgtaaa agtttgggcc gtgtctcagt cccaatgtgg ttgttcatcc tctaagatca 1260
actacgaatc atagtcttgt taagctttta ctttaacaac taactaattc gatataagct 1320
cttctattag cgaacgacat tctcgttctt tatccattag gatacatatt gaattactat 1380
acatttctat atacttttct aatactaata ggtagattct tatatattac tcacccgttc 1440
gctgctaatt atttttttaa taattcgcac aacttgcatg tgttaagctt atcgctagcg 1500
ttcaatctga gctatgatca aactca 1526
<210> 2
<211> 1536
<212> DNA
<213> aleyrodidarum BT-B
<400> 2
aagagtttga tcatggctca gattgaacgc tagcggcaga cataacacat gcaagtcgag 60
cggcatcata caggttggca agcggcgcac gggtgagtaa tacatgtaaa tatacctaaa 120
agtggggaat aacgtacgga aacgtacgct aataccgcat aattattacg agataaagca 180
ggggcttgat aaaaaaaatc aaccttgcgc ttttagaaaa ttacatgccg gattagctag 240
ttggtagagt aaaagcctac caaggtaacg atccgtagct ggtctgagag gatgatcagc 300
cacactggga ctgagaaaag gcccagactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgga 360
caatgggggg aaccctgatc cagtcatgcc gcgtgtgtga agaaggcctt tgggttgtaa 420
agcactttca gcgaagaaga aaagttagaa aataaaaagt tataactatg acggtactcg 480
cagaagaagc accggctaac tccgtgccag cagccgcggt aagacggagg gtgcaagcgt 540
taatcagaat tactgggcgt aaagggcatg taggtggttt gttaagcttt atgtgaaagc 600
cctatgctta acataggaac ggaataaaga actgacaaac tagagtgcag aagaggaagg 660
tagaattccc ggtgtagcgg tgaaatgcgt agatatctgg aggaatacca gttgcgaagg 720
cgaccttctg ggctgacact gacactgaga tgcgaaagcg tggggagcaa acaggattag 780
ataccctggt agtccacgct gtaaacgata tcaactagcc gttggattct taaagaattt 840
tgtggcgtag ctaacgcgat aagttgatcg cctggggagt acggtcgcaa ggctaaaact 900
caaatgaatt gacgggggcc cgcacaagcg gtggagcatg tggtttaatt cgatgcaacg 960
cgcaaaacct tacctactct tgacatccaa agtactttcc agagatggaa gggtgcctta 1020
gggaactttg agacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgttgtgaa atgttgggtt 1080
aagtcccgta acgagcgcaa cccttgtcct tagttgccaa cgcataaggc gggaacttta 1140
aggagactgc tggtgataaa ccggaggaag gtggggacga cgtcaagtca tcatggccct 1200
taagagtagg gcaacacacg tgctacaatg gcaaaaacaa agggtcgcaa aatggtaaca 1260
tgaagctaat cccaaaaaaa ttgtcttagt tcggattgga gtctgaaact cgactccata 1320
aagtcggaat cgctagtaat cgtgaatcag aatgtcacgg tgaatacgtt ctcgggcctt 1380
gtacacaccg cccgtcacac catggaagtg aaatgcacca gaagtggcaa gtttaaccaa 1440
aaaacaggag aacagtcact acggtgtggt tcatgactgg ggtgaagtcg taacaaggta 1500
gctgtagggg aacctgtggc tggatcacct ccttaa 1536
<210> 3
<211> 1540
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)
<400> 3
agagtttgat catggctcag attgaacgct ggcggcaagc ctaacacatg caagtcgagc 60
ggcagcgaga agagagcttg ctctctttgt cggcaagcgg caaacgggtg agtaatatct 120
ggggatctac ccaaaagagg gggataacta ctagaaatgg tagctaatac cgcataatgt 180
tgaaaaacca aagtggggga ccttttggcc tcatgctttt ggatgaaccc agacgagatt 240
agcttgttgg tagagtaata gcctaccaag gcaacgatct ctagctggtc tgagaggata 300
accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360
attgcacaat gggcgaaagc ctgatgcagc tatgccgcgt gtatgaagaa ggccttaggg 420
ttgtaaagta ctttcagcgg ggaggaaaaa aataaaacta ataattttat ttcgtgacgt 480
tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540
aagcgttaat cagaattact gggcgtaaag agcgcgtagg tggtttttta agtcaggtgt 600
gaaatcccta ggctcaacct aggaactgca tttgaaactg gaaaactaga gtttcgtaga 660
gggaggtaga attctaggtg tagcggtgaa atgcgtagat atctggagga atacccgtgg 720
cgaaagcggc ctcctaaacg aaaactgaca ctgaggcgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780
gattagatac cctggtagtc catgccgtaa acgatgtcga cttggaggtt gtttccaaga 840
gaagtgactt ccgaagctaa cgcattaagt cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggct 900
aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960
gcaacgcgaa aaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ttctttagaa ataaagaagt 1020
gccttcggga gctgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080
tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcccctgt tgccagcggt tcggccggga 1140
actcagagga gactgccggt tataaaccgg aggaaggtgg ggacgacgtc aagtcatcat 1200
ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggttt atacaaagag aagcaaatct 1260
gcaaagacaa gcaaacctca taaagtaaat cgtagtccgg actggagtct gcaactcgac 1320
tccacgaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg 1380
ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag caggtatcct 1440
aaccctttaa aaggaaggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540
<210> 4
<211> 1552
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
<400> 4
aaactgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctggc ggcaagccta acacatgcaa 60
gtcgagcggc agcgaaaaga aagcttgctt tcttgtcggc gagcggcaaa cgggtgagta 120
atatctgggg atctgcccaa aagaggggga taactactag aaatggtagc taataccgca 180
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ctgagaggat aaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag 360
cagtggggaa tattgcacaa tgggcgaaag cctgatgcag ctatgccgcg tgtatgaaga 420
aggccttagg gttgtaaagt actttcagcg gggaggaaaa aattaaaact aataatttta 480
ttttgtgacg ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat 540
acggagggtg cgagcgttaa tcagaattac tgggcgtaaa gagcacgtag gtggtttttt 600
aagtcagatg tgaaatccct aggcttaacc taggaactgc atttgaaact gaaatgctag 660
agtatcgtag agggaggtag aattctaggt gtagcggtga aatgcgtaga tatctggagg 720
aatacccgtg gcgaaagcgg cctcctaaac gaatactgac actgaggtgc gaaagcgtgg 780
ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgtcg acttggaggt 840
tgtttccaag agaagtgact tccgaagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg 900
gccgcaaggc taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg 960
tttaattcga tgcaacgcga aaaaccttac ctggtcttga catccacaga attttttaga 1020
aataaaaaag tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg 1080
ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcccctg ttgccagcgg 1140
ttcggccggg aactcagagg agactgccgg ttataaaccg gaggaaggtg gggacgacgt 1200
caagtcatca tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggtt tatacaaaga 1260
gaagcaaatc tgtaaagaca agcaaacctc ataaagtaaa tcgtagtccg gactggagtc 1320
tgcaactcga ctccacgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga 1380
atacgttccc gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa 1440
gcagatttcc taaccacgaa agtggaaggc gtctaccact ttgtgattca tgactggggt 1500
gaagtcgtaa caaggtaacc gtaggggaac ctgcggttgg atcacctcct ta 1552
<210> 5
<211> 1566
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)
<400> 5
acttaaaatt gaagagtttg atcatggctc agattgaacg ctggcggcaa gcttaacaca 60
tgcaagtcga gcggcatcga agaaaagttt acttttctgg cggcgagcgg caaacgggtg 120
agtaacatct ggggatctac ctaaaagagg gggacaacca ttggaaacga tggctaatac 180
cgcataatgt ttttaaataa accaaagtag gggactaaaa tttttagcct tatgctttta 240
gatgaaccca gacgagatta gcttgatggt aaggtaatgg cttaccaagg cgacgatctc 300
tagctggtct gagaggataa ccagccacac tggaactgag atacggtcca gactcctacg 360
ggaggcagca gtggggaata ttgcacaatg ggctaaagcc tgatgcagct atgccgcgtg 420
tatgaagaag gccttagggt tgtaaagtac tttcagcggg gaggaaagaa ttatgtctaa 480
tatacatatt ttgtgacgtt acccgaagaa gaagcaccgg ctaactccgt gccagcagcc 540
gcggtaatac ggagggtgcg agcgttaatc agaattactg ggcgtaaaga gcacgtaggc 600
ggtttattaa gtcagatgtg aaatccctag gcttaactta ggaactgcat ttgaaactaa 660
tagactagag tctcatagag ggaggtagaa ttctaggtgt agcggtgaaa tgcgtagata 720
tctagaggaa tacccgtggc gaaagcgacc tcctaaatga aaactgacgc tgaggtgcga 780
aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc atgctgtaaa cgatgtcgac 840
ttggaggttg tttcctagag aagtggcttc cgaagctaac gcattaagtc gaccgcctgg 900
ggagtacggt cgcaaggcta aaactcaaat gaattgacgg gggcccgcac aagcggtgga 960
gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaag aaccttacct ggtcttgaca tccatagaat 1020
tttttagaga taaaagagtg ccttagggaa ctatgagaca ggtgctgcat ggctgtcgtc 1080
agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaacccct atcctttgtt 1140
gccatcaggt tatgctggga actcagagga gactgccggt tataaaccgg aggaaggtgg 1200
ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcat 1260
atacaaagag atgcaactct gcgaagataa gcaaacctca taaagtatgt cgtagtccgg 1320
actggagtct gcaactcgac tccacgaagt aggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg 1380
ccacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt 1440
gcaaaagaag caggtagctt aaccagatta ttttattgga gggcgcttac cactttgtga 1500
ttcatgactg gggtgaagtc gtaacaaggt aaccgtaggg gaacctgcgg ttggatcacc 1560
tcctta 1566
<210> 6
<211> 828
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola BCc
<400> 6
atgagatcat taatatataa aaatcatgtt ccaattaaaa aattaggaca aaatttttta 60
cagaataaag aaattattaa tcagataatt aatttaataa atattaataa aaatgataat 120
attattgaaa taggatcagg attaggagcg ttaacttttc ctatttgtag aatcattaaa 180
aaaatgatag tattagaaat tgatgaagat cttgtgtttt ttttaactca aagtttattt 240
attaaaaaat tacaaattat aattgctgat attataaaat ttgatttttg ttgttttttt 300
tctttacaga aatataaaaa atataggttt attggtaatt taccatataa tattgctact 360
atattttttt taaaaacaat taaatttctt tataatataa ttgatatgca ttttatgttt 420
caaaaagaag tagcaaagag attattagct actcctggta ctaaagaata tggtagatta 480
agtattattg cacaatattt ttataagata gaaactgtta ttaatgttaa taaatttaat 540
ttttttccta ctcctaaagt agattctact tttttacgat ttactcctaa atattttaat 600
agtaaatata aaatagataa acatttttct gttttagaat taattactag attttctttt 660
caacatagaa gaaaattttt aaataataat ttaatatctt tattttctac aaaagaatta 720
atttctttag atattgatcc atattcaaga gcagaaaatg tttctttaat tcaatattgt 780
aaattaatga aatattattt gaaaagaaaa attttatgtt tagattaa 828
<210> 7
<211> 921
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina)
<400> 7
ttatcttatt tcacatatac gtaatattgc gctgcgtgca cgaggatttt tttgaatttc 60
agatatattt ggtttaatac gtttaataaa acgtattttt ttttttattt ttcttatttg 120
caattcagta ataggaagtt ttttaggtat atttggataa ttactgtaat tcttaataaa 180
gttttttaca atcctatctt caatagaatg aaaactaata atagcaattt ttgatccgga 240
atgtaatatg ttaataataa tttttaatat tttatgtaat tcatttattt cttggttaat 300
atatattcga aaagcttgaa atgttctcgt agctggatgt ttaaatttgt catattttgg 360
gattgatttt tttatgattt gaactaactc taacgtgctt gttatggttt ttttttttat 420
ttgtaatatg atggctcggg atattttttt tgcgtatttt tcttcgccaa aattttttat 480
tacctgttct attgtttttt ggtttgtttt ttttaaccat tgactaactg atattccaga 540
tttagggttc atacgcatat ctaaaggtcc atcattcata aatgaaaatc ctcggatact 600
agaatttaac tgtattgaag aaatacctaa atctaataat attccatcta ttttatctct 660
atttttttct ttttttaata ttttttcaat attagaaaat ttacctaaaa atattttaaa 720
tcgcgaatct tttatttttt ttccgatttt tatagattgt gggtcttgat caatactata 780
taactttcca ttaaccccta attcttgaag aattgctttt gaatgaccac cacctccaaa 840
tgtacaatca acatatgtac cgtctttttt tatttttaag tattgtatga tttcttttgt 900
taaaacaggt ttatgaatca t 921
<210> 8
<211> 822
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola str. G002 (Myzus persicae)
<400> 8
atgaaaagta taaaaacttt taaaaaacac tttcctgtga aaaaatatgg acaaaatttt 60
cttattaata aagagatcat aaaaaatatt gttaaaaaaa ttaatccaaa tatagaacaa 120
acattagtag aaatcggacc aggattagct gcattaactg agcccatatc tcagttatta 180
aaagagttaa tagttattga aatagactgt aatctattat attttttaaa aaaacaacca 240
ttttattcaa aattaatagt tttttgtcaa gatgctttaa actttaatta tacaaattta 300
ttttataaaa aaaataaatt aattcgtatt tttggtaatt taccatataa tatctctaca 360
tctttaatta tttttttatt tcaacacatt agagtaattc aagatatgaa ttttatgctt 420
caaaaagaag ttgctgcaag attaattgca ttacctggaa ataaatatta cggtcgtttg 480
agcattatat ctcaatatta ttgtgatatc aaaattttat taaatgttgc tcctgaagat 540
ttttggccta ttccgagagt tcattctata tttgtaaatt taacacctca tcataattct 600
ccttattttg tttatgatat taatatttta agccttatta caaataaggc tttccaaaat 660
agaagaaaaa tattacgtca tagtttaaaa aatttatttt ctgaaacaac tttattaaat 720
ttagatatta atcccagatt aagagctgaa aatatttctg tttttcagta ttgtcaatta 780
gctaattatt tgtataaaaa aaattatact aaaaaaaatt aa 822
<210> 9
<211> 822
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi)
<400> 9
attataaaaa attttaaaaa acattttcct ttaaaaaggt atggacaaaa ttttcttgtc 60
aatacaaaaa ctattcaaaa gataattaat ataattaatc caaacaccaa acaaacatta 120
gtggaaattg gacctggatt agctgcatta acaaaaccaa tttgtcaatt attagaagaa 180
ttaattgtta ttgaaataga tcctaattta ttgtttttat taaaaaaacg ttcattttat 240
tcaaaattaa cagtttttta tcaagacgct ttaaatttca attatacaga tttgttttat 300
aagaaaaatc aattaattcg tgtttttgga aacttgccat ataatatttc tacatcttta 360
attatttctt tattcaatca tattaaagtt attcaagata tgaattttat gttacagaaa 420
gaggttgctg aaagattaat ttctattcct ggaaataaat cttatggccg tttaagcatt 480
atttctcagt attattgtaa aattaaaata ttattaaatg ttgtacctga agattttcga 540
cctataccga aagtgcattc tgtttttatc aatttaactc ctcataccaa ttctccatat 600
tttgtttatg atacaaatat cctcagttct atcacaagaa atgcttttca aaatagaagg 660
aaaattttgc gtcatagttt aaaaaattta ttttctgaaa aagaactaat tcaattagaa 720
attaatccaa atttacgagc tgaaaatatt tctatctttc agtattgtca attagctgat 780
tatttatata aaaaattaaa taatcttgta aaaatcaatt aa 822
<210> 10
<211> 822
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae)
<400> 10
atgatactaa ataaatataa aaaatttatt cctttaaaaa gatacggaca aaattttctt 60
gtaaatagag aaataatcaa aaatattatc aaaataatta atcctaaaaa aacgcaaaca 120
ttattagaaa ttggaccggg tttaggtgcg ttaacaaaac ctatttgtga atttttaaat 180
gaacttatcg tcattgaaat agatcctaat atattatctt ttttaaagaa atgtatattt 240
tttgataaat taaaaatata ttgtcataat gctttagatt ttaattataa aaatatattc 300
tataaaaaaa gtcaattaat tcgtattttt ggaaatttac catataatat ttctacatct 360
ttaataatat atttatttcg gaatattgat attattcaag atatgaattt tatgttacaa 420
caagaagtgg ctaaaagatt agttgctatt cctggtgaaa aactttatgg tcgtttaagt 480
attatatctc aatattattg taatattaaa atattattac atattcgacc tgaaaatttt 540
caacctattc ctaaagttaa ttcaatgttt gtaaatttaa ctccgcatat tcattctcct 600
tattttgttt atgatattaa tttattaact agtattacaa aacatgcttt tcaacataga 660
agaaaaatat tgcgtcatag tttaagaaat tttttttctg agcaagattt aattcattta 720
gaaattaatc caaatttaag agctgaaaat gtttctatta ttcaatattg tcaattggct 780
aataatttat ataaaaaaca taaacagttt attaataatt aa 822
<210> 11
<211> 816
<212> DNA
<213> Buchnera aphidicola (Aphis glycines)
<400> 11
atgaaaaagc atattcctat aaaaaaattt agtcaaaatt ttcttgtaga tttgagtgtg 60
attaaaaaaa taattaaatt tattaatccg cagttaaatg aaatattggt tgaaattgga 120
ccgggattag ctgctatcac tcgacctatt tgtgatttga tagatcattt aattgtgatt 180
gaaattgata aaattttatt agatagatta aaacagttct cattttattc aaaattaaca 240
gtatatcatc aagatgcttt agcatttgat tacataaagt tatttaataa aaaaaataaa 300
ttagttcgaa tttttggtaa tttaccatat catgtttcta cgtctttaat attgcattta 360
tttaaaagaa ttaatattat taaagatatg aattttatgc tacaaaaaga agttgctgaa 420
cgtttaattg caactccagg tagtaaatta tatggtcgtt taagtattat ttctcaatat 480
tattgtaata taaaagtttt attgcatgtg tcttcaaaat gttttaaacc agttcctaaa 540
gtagaatcaa tttttcttaa tttgacacct tatactgatt atttccctta ttttacttat 600
aatgtaaacg ttcttagtta tattacaaat ttagcttttc aaaaaagaag aaaaatatta 660
cgtcatagtt taggtaaaat attttctgaa aaagttttta taaaattaaa tattaatccc 720
aaattaagac ctgagaatat ttctatatta caatattgtc agttatctaa ttatatgata 780
gaaaataata ttcatcagga acatgtttgt atttaa 816
<210> 12
<211> 1463
<212> DNA
<213> Annandia pinicola
<400> 12
agattgaacg ctggcggcat gccttacaca tgcaagtcga acggtaacag gtcttcggac 60
gctgacgagt ggcgaacggg tgagtaatac atcggaacgt gcccagtcgt gggggataac 120
tactcgaaag agtagctaat accgcatacg atctgaggat gaaagcgggg gaccttcggg 180
cctcgcgcga ttggagcggc cgatggcaga ttaggtagtt ggtgggataa aagcttacca 240
agccgacgat ctgtagctgg tctgagagga cgaccagcca cactggaact gagatacggt 300
ccagactctt acgggaggca gcagtgggga atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca 360
gctatgtcgc gtgtatgaag aagaccttag ggttgtaaag tactttcgat agcataagaa 420
gataatgaga ctaataattt tattgtctga cgttagctat agaagaagca ccggctaact 480
ccgtgccagc agccgcggta atacgggggg tgctagcgtt aatcggaatt actgggcgta 540
aagagcatgt aggtggttta ttaagtcaga tgtgaaatcc ctggacttaa tctaggaact 600
gcatttgaaa ctaataggct agagtttcgt agagggaggt agaattctag gtgtagcggt 660
gaaatgcata gatatctaga ggaatatcag tggcgaaggc gaccttctgg acgataactg 720
acgctaaaat gcgaaagcat gggtagcaaa caggattaga taccctggta gtccatgctg 780
taaacgatgt cgactaagag gttggaggta taacttttaa tctctgtagc taacgcgtta 840
agtcgaccgc ctggggagta cggtcgcaag gctaaaactc aaatgaattg acgggggcct 900
gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gtaaaacctt acctggtctt 960
gacatccaca gaattttaca gaaatgtaga agtgcaattt gaactgtgag acaggtgctg 1020
catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc 1080
cttgtccttt gttaccataa gatttaagga actcaaagga gactgccggt gataaactgg 1140
aggaaggcgg ggacgacgtc aagtcatcat ggcccttatg accagggcta cacacgtgct 1200
acaatggcat atacaaagag atgcaatatt gcgaaataaa gccaatctta taaaatatgt 1260
cctagttcgg actggagtct gcaactcgac tccacgaagt cggaatcgct agtaatcgtg 1320
gatcagcatg ccacggtgaa tatgtttcca ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg 1380
gaagtggatt gcaaaagaag taagaaaatt aaccttctta acaaggaaat aacttaccac 1440
tttgtgactc ataactgggg tga 1463
<210> 13
<211> 1554
<212> DNA
<213> Moranella endobia
<400> 13
tctttttggt aaggaggtga tccaaccgca ggttccccta cggttacctt gttacgactt 60
caccccagtc atgaatcaca aagtggtaag cgccctccta aaaggttagg ctacctactt 120
cttttgcaac ccacttccat ggtgtgacgg gcggtgtgta caaggcccgg gaacgtattc 180
accgtggcat tctgatccac gattactagc gattcctact tcatggagtc gagttgcaga 240
ctccaatccg gactacgacg cactttatga ggtccgctaa ctctcgcgag cttgcttctc 300
tttgtatgcg ccattgtagc acgtgtgtag ccctactcgt aagggccatg atgacttgac 360
gtcatcccca ccttcctccg gtttatcacc ggcagtctcc tttgagttcc cgaccgaatc 420
gctggcaaaa aaggataagg gttgcgctcg ttgcgggact taacccaaca tttcacaaca 480
cgagctgacg acagccatgc agcacctgtc tcagagttcc cgaaggtacc aaaacatctc 540
tgctaagttc tctggatgtc aagagtaggt aaggttcttc gcgttgcatc gaattaaacc 600
acatgctcca ccgcttgtgc gggcccccgt caattcattt gagttttaac cttgcggccg 660
tactccccag gcggtcgatt taacgcgtta actacgaaag ccacagttca agaccacagc 720
tttcaaatcg acatagttta cggcgtggac taccagggta tctaatcctg tttgctcccc 780
acgctttcgt acctgagcgt cagtattcgt ccagggggcc gccttcgcca ctggtattcc 840
tccagatatc tacacatttc accgctacac ctggaattct acccccctct acgagactct 900
agcctatcag tttcaaatgc agttcctagg ttaagcccag ggatttcaca tctgacttaa 960
taaaccgcct acgtactctt tacgcccagt aattccgatt aacgcttgca ccctccgtat 1020
taccgcggct gctggcacgg agttagccgg tgcttcttct gtaggtaacg tcaatcaata 1080
accgtattaa ggatattgcc ttcctcccta ctgaaagtgc tttacaaccc gaaggccttc 1140
ttcacacacg cggcatggct gcatcagggt ttcccccatt gtgcaatatt ccccactgct 1200
gcctcccgta ggagtctgga ccgtgtctca gttccagtgt ggctggtcat cctctcagac 1260
cagctaggga tcgtcgccta ggtaagctat tacctcacct actagctaat cccatctggg 1320
ttcatctgaa ggtgtgaggc caaaaggtcc cccactttgg tcttacgaca ttatgcggta 1380
ttagctaccg tttccagcag ttatccccct ccatcaggca gatccccaga ctttactcac 1440
ccgttcgctg ctcgccggca aaaaagtaaa cttttttccg ttgccgctca acttgcatgt 1500
gttaggcctg ccgccagcgt tcaatctgag ccatgatcaa actcttcaat taaa 1554
<210> 14
<211> 1539
<212> DNA
<213> Ishikawaella capsulata Mpkobe
<400> 14
aaattgaaga gtttgatcat ggctcagatt gaacgctagc ggcaagctta acacatgcaa 60
gtcgaacggt aacagaaaaa agcttgcttt tttgctgacg agtggcggac gggtgagtaa 120
tgtctgggga tctacctaat ggcgggggat aactactgga aacggtagct aataccgcat 180
aatgttgtaa aaccaaagtg ggggacctta tggcctcaca ccattagatg aacctagatg 240
ggattagctt gtaggtgggg taaaggctca cctaggcaac gatccctagc tggtctgaga 300
ggatgaccag ccacactgga actgagatac ggtccagact cctacgggag gcagcagtgg 360
ggaatcttgc acaatgggcg caagcctgat gcagctatgt cgcgtgtatg aagaaggcct 420
tagggttgta aagtactttc atcggggaag aaggatatga gcctaatatt ctcatatatt 480
gacgttacct gcagaagaag caccggctaa ctccgtgcca gcagccgcgg taacacggag 540
ggtgcgagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagagcac gtaggtggtt tattaagtca 600
tatgtgaaat ccctgggctt aacctaggaa ctgcatgtga aactgataaa ctagagtttc 660
gtagagggag gtggaattcc aggtgtagcg gtgaaatgcg tagatatctg gaggaatatc 720
agaggcgaag gcgaccttct ggacgaaaac tgacactcag gtgcgaaagc gtggggagca 780
aacaggatta gataccctgg tagtccacgc tgtaaacaat gtcgactaaa aaactgtgag 840
cttgacttgt ggtttttgta gctaacgcat taagtcgacc gcctggggag tacggccgca 900
aggttaaaac tcaaatgaat tgacgggggt ccgcacaagc ggtggagcat gtggtttaat 960
tcgatgcaac gcgaaaaacc ttacctggtc ttgacatcca gcgaattata tagaaatata 1020
taagtgcctt tcggggaact ctgagacgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgccct tatcctctgt tgccagcggc atggccggga 1140
actcagagga gactgccagt attaaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200
ggcccttatg accagggcta cacacgtgct acaatggtgt atacaaagag aagcaatctc 1260
gcaagagtaa gcaaaactca aaaagtacat cgtagttcgg attagagtct gcaactcgac 1320
tctatgaagt aggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttctct 1380
ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtaagtt gcaaaagaag taggtagctt 1440
aacctttata ggagggcgct taccactttg tgatttatga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1500
ggtaactgta ggggaacctg tggttggatt acctcctta 1539
<210> 15
<211> 1561
<212> DNA
<213> Baumannia cicadellinicola
<400> 15
ttcaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggtaagct taacacatgc 60
aagtcgagcg gcatcggaaa gtaaattaat tactttgccg gcaagcggcg aacgggtgag 120
taatatctgg ggatctacct tatggagagg gataactatt ggaaacgata gctaacaccg 180
cataatgtcg tcagaccaaa atgggggacc taatttaggc ctcatgccat aagatgaacc 240
cagatgagat tagctagtag gtgagataat agctcaccta ggcaacgatc tctagttggt 300
ctgagaggat gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag 360
cagtggggaa tcttgcacaa tgggggaaac cctgatgcag ctataccgcg tgtgtgaaga 420
aggccttcgg gttgtaaagc actttcagcg gggaagaaaa tgaagttact aataataatt 480
gtcaattgac gttacccgca aaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa 540
gacggagggt gcaagcgtta atcggaatta ctgggcgtaa agcgtatgta ggcggtttat 600
ttagtcaggt gtgaaagccc taggcttaac ctaggaattg catttgaaac tggtaagcta 660
gagtctcgta gaggggggga gaattccagg tgtagcggtg aaatgcgtag agatctggaa 720
gaataccagt ggcgaaggcg cccccctgga cgaaaactga cgctcaagta cgaaagcgtg 780
gggagcaaac aggattagat accctggtag tccacgctgt aaacgatgtc gatttgaagg 840
ttgtagcctt gagctatagc tttcgaagct aacgcattaa atcgaccgcc tggggagtac 900
gaccgcaagg ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg 960
gtttaattcg atacaacgcg aaaaacctta cctactcttg acatccagag tataaagcag 1020
aaaagcttta gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt 1080
gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccaacg 1140
attaagtcgg gaactcaaag gagactgccg gtgataaacc ggaggaaggt gaggataacg 1200
tcaagtcatc atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggt gcatacaaag 1260
agaagcaatc tcgtaagagt tagcaaacct cataaagtgc atcgtagtcc ggattagagt 1320
ctgcaactcg actctatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tggatcagaa tgccacggtg 1380
aatacgttcc cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtgta ttgcaaaaga 1440
agttagtagc ttaactcata atacgagagg gcgcttacca ctttgtgatt cataactggg 1500
gtgaagtcgt aacaaggtaa ccgtagggga acctgcggtt ggatcacctc cttacactaa 1560
a 1561
<210> 16
<211> 1464
<212> DNA
<213> Sodalis like
<400> 16
attgaacgct ggcggcaggc ctaacacatg caagtcgagc ggcagcggga agaagcttgc 60
ttctttgccg gcgagcggcg gacgggtgag taatgtctgg ggatctgccc gatggagggg 120
gataactact ggaaacggta gctaataccg cataacgtcg caagaccaaa gtgggggacc 180
ttcgggcctc acaccatcgg atgaacccag gtgggattag ctagtaggtg gggtaatggc 240
tcacctaggc gacgatccct agctggtctg agaggatgac cagtcacact ggaactgaga 300
cacggtccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gggaaaccct 360
gatgcagcca tgccgcgtgt gtgaagaagg ccttcgggtt gtaaagcact ttcagcgggg 420
aggaaggcga tggcgttaat agcgctatcg attgacgtta cccgcagaag aagcaccggc 480
taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcga gcgttaatcg gaattactgg 540
gcgtaaagcg tacgcaggcg gtctgttaag tcagatgtga aatccccggg ctcaacctgg 600
gaactgcatt tgaaactggc aggctagagt ctcgtagagg ggggtagaat tccaggtgta 660
gcggtgaaat gcgtagagat ctggaggaat accggtggcg aaggcggccc cctggacgaa 720
gactgacgct caggtacgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca 780
cgctgtaaac gatgtcgatt tgaaggttgt ggccttgagc cgtggctttc ggagctaacg 840
tgttaaatcg accgcctggg gagtacggcc gcaaggttaa aactcaaatg aattgacggg 900
ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgatgc aacgcgaaga accttaccta 960
ctcttgacat ccagagaact tggcagagat gctttggtgc cttcgggaac tctgagacag 1020
gtgctgcatg gctgtcgtca gctcgtgttg tgaaatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc 1080
gcaaccctta tcctttattg ccagcgattc ggtcgggaac tcaaaggaga ctgccggtga 1140
taaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcatcatgg cccttacgag tagggctaca 1200
cacgtgctac aatggcgcat acaaagagaa gcgatctcgc gagagtcagc ggacctcata 1260
aagtgcgtcg tagtccggat tggagtctgc aactcgactc catgaagtcg gaatcgctag 1320
taatcgtgga tcagaatgcc acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc 1380
acaccatggg agtgggttgc aaaagaagta ggtagcttaa ccttcgggag ggcgcttacc 1440
actttgtgat tcatgactgg ggtg 1464
<210> 17
<211> 1465
<212> DNA
<213> Hartigia pinicola
<400> 17
agatttaacg ctggcggcag gcctaacaca tgcaagtcga gcggtaccag aagaagcttg 60
cttcttgctg acgagcggcg gacgggtgag taatgtatgg ggatctgccc gacagagggg 120
gataactatt ggaaacggta gctaataccg cataatctct gaggagcaaa gcaggggaac 180
ttcggtcctt gcgctatcgg atgaacccat atgggattag ctagtaggtg aggtaatggc 240
tcccctaggc aacgatccct agctggtctg agaggatgat cagccacact gggactgaga 300
cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tgcacaatgg gcgaaagcct 360
gatgcagcca tgccgcgtgt atgaagaagg ctttagggtt gtaaagtact ttcagtcgag 420
aggaaaacat tgatgctaat atcatcaatt attgacgttt ccgacagaag aagcaccggc 480
taactccgtg ccagcagccg cggtaatacg gagggtgcaa gcgttaatcg gaattactgg 540
gcgtaaagcg cacgcaggcg gttaattaag ttagatgtga aagccccggg cttaacccag 600
gaatagcata taaaactggt caactagagt attgtagagg ggggtagaat tccatgtgta 660
gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaat accagtggcg aaggcggccc cctggacaaa 720
aactgacgct caaatgcgaa agcgtgggga gcaaacagga ttagataccc tggtagtcca 780
tgctgtaaac gatgtcgatt tggaggttgt tcccttgagg agtagcttcc gtagctaacg 840
cgttaaatcg accgcctggg ggagtacgac tgcaaggtta aaactcaaat gaattgacgg 900
gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgatg caacgcgaaa aaccttacct 960
actcttgaca tccagataat ttagcagaaa tgctttagta ccttcgggaa atctgagaca 1020
ggtgctgcat ggctgtcgtc agctcgtgtt gtgaaatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt atcctttgtt gccagcgatt aggtcgggaa ctcaaaggag actgccggtg 1140
ataaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcatcatg gcccttacga gtagggctac 1200
acacgtgcta caatggcata tacaaaggga agcaacctcg cgagagcaag cgaaactcat 1260
aaattatgtc gtagttcaga ttggagtctg caactcgact ccatgaagtc ggaatcgcta 1320
gtaatcgtag atcagaatgc tacggtgaat acgttcccgg gccttgtaca caccgcccgt 1380
cacaccatgg gagtgggttg caaaagaagt aggtaactta accttatgga aagcgcttac 1440
cactttgtga ttcataactg gggtg 1465
<210> 18
<211> 1571
<212> DNA
<213> Tremblaya phenacola
<400> 18
aggtaatcca gccacacctt ccagtacggc taccttgtta cgacttcacc ccagtcacaa 60
cccttacctt cggaactgcc ctcctcacaa ctcaaaccac caaacacttt taaatcaggt 120
tgagagaggt taggcctgtt acttctggca agaattattt ccatggtgtg acgggcggtg 180
tgtacaagac ccgagaacat attcaccgtg gcatgctgat ccacgattac tagcaattcc 240
aacttcatgc actcgagttt cagagtacaa tccgaactga ggccggcttt gtgagattag 300
ctcccttttg caagttggca actctttggt ccggccattg tatgatgtgt gaagccccac 360
ccataaaggc catgaggact tgacgtcatc cccaccttcc tccaacttat cgctggcagt 420
ctctttaagg taactgacta atccagtagc aattaaagac aggggttgcg ctcgttacag 480
gacttaaccc aacatctcac gacacgagct gacgacagcc atgcagcacc tgtgcactaa 540
ttctctttca agcactcccg cttctcaaca ggatcttagc catatcaaag gtaggtaagg 600
tttttcgcgt tgcatcgaat taatccacat catccactgc ttgtgcgggt ccccgtcaat 660
tcctttgagt tttaaccttg cggccgtact ccccaggcgg tcgacttgtg cgttagctgc 720
accactgaaa aggaaaactg cccaatggtt agtcaacatc gtttagggca tggactacca 780
gggtatctaa tcctgtttgc tccccatgct ttagtgtctg agcgtcagta acgaaccagg 840
aggctgccta cgctttcggt attcctccac atctctacac atttcactgc tacatgcgga 900
attctacctc cccctctcgt actccagcct gccagtaact gccgcattct gaggttaagc 960
ctcagccttt cacagcaatc ttaacaggca gcctgcacac cctttacgcc caataaatct 1020
gattaacgct cgcaccctac gtattaccgc ggctgctggc acgtagtttg ccggtgctta 1080
ttctttcggt acagtcacac caccaaattg ttagttgggt ggctttcttt ccgaacaaaa 1140
gtgctttaca acccaaaggc cttcttcaca cacgcggcat tgctggatca ggcttccgcc 1200
cattgtccaa gattcctcac tgctgccttc ctcagaagtc tgggccgtgt ctcagtccca 1260
gtgtggctgg ccgtcctctc agaccagcta ccgatcattg ccttgggaag ccattacctt 1320
tccaacaagc taatcagaca tcagccaatc tcagagcgca aggcaattgg tcccctgctt 1380
tcattctgct tggtagagaa ctttatgcgg tattaattag gctttcacct agctgtcccc 1440
cactctgagg catgttctga tgcattactc acccgtttgc cacttgccac caagcctaag 1500
cccgtgttgc cgttcgactt gcatgtgtaa ggcatgccgc tagcgttcaa tctgagccag 1560
gatcaaactc t 1571
<210> 19
<211> 1535
<212> DNA
<213> Tremblaya princeps
<400> 19
agagtttgat cctggctcag attgaacgct agcggcatgc attacacatg caagtcgtac 60
ggcagcacgg gcttaggcct ggtggcgagt ggcgaacggg tgagtaacgc ctcggaacgt 120
gccttgtagt gggggatagc ctggcgaaag ccagattaat accgcatgaa gccgcacagc 180
atgcgcggtg aaagtggggg attctagcct cacgctactg gatcggccgg ggtctgatta 240
gctagttggc ggggtaatgg cccaccaagg cttagatcag tagctggtct gagaggacga 300
tcagccacac tgggactgag acacggccca gactcctacg ggaggcagca gtggggaatc 360
ttggacaatg ggcgcaagcc tgatccagca atgccgcgtg tgtgaagaag gccttcgggt 420
cgtaaagcac ttttgttcgg gatgaagggg ggcgtgcaaa caccatgccc tcttgacgat 480
accgaaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg 540
agcgttaatc ggaatcactg ggcgtaaagg gtgcgcgggt ggtttgccaa gacccctgta 600
aaatcctacg gcccaaccgt agtgctgcgg aggttactgg taagcttgag tatggcagag 660
gggggtagaa ttccaggtgt agcggtgaaa tgcgtagata tctggaggaa taccgaaggc 720
gaaggcaacc ccctgggcca tcactgacac tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg 780
attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa ccatgtcgac tagttgtcgg ggggagccct 840
ttttcctcgg tgacgaagct aacgcatgaa gtcgaccgcc tggggagtac gaccgcaagg 900
ttaaaactca aaggaattga cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg 960
atgcaacgcg aaaaacctta cctacccttg acatggcgga gattctgccg agaggcggaa 1020
gtgctcgaaa gagaatccgt gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag 1080
atgttgggtt aagtcccata acgagcgcaa cccccgtctt tagttgctac cactggggca 1140
ctctatagag actgccggtg ataaaccgga ggaaggtggg gacgacgtca agtcatcatg 1200
gcctttatgg gtagggcttc acacgtcata caatggctgg agcaaagggt cgccaactcg 1260
agagagggag ctaatcccac aaacccagcc ccagttcgga ttgcactctg caactcgagt 1320
gcatgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagcatgc cacggtgaat acgttctcgg 1380
gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagtaagccg catcagaagc agcctcccta 1440
accctatgct gggaaggagg ctgcgaaggt ggggtctatg actggggtga agtcgtaaca 1500
aggtagccgt accggaaggt gcggctggat tacct 1535
<210> 20
<211> 1450
<212> DNA
<213> Nasuia deltocephalinicola
<400> 20
agtttaatcc tggctcagat ttaacgcttg cgacatgcct aacacatgca agttgaacgt 60
tgaaaatatt tcaaagtagc gtataggtga gtataacatt taaacatacc ttaaagttcg 120
gaataccccg atgaaaatcg gtataatacc gtataaaagt atttaagaat taaagcgggg 180
aaaacctcgt gctataagat tgttaaatgc ctgattagtt tgttggtttt taaggtaaaa 240
gcttaccaag actttgatca gtagctattc tgtgaggatg tatagccaca ttgggattga 300
aataatgccc aaacctctac ggagggcagc agtggggaat attggacaat gagcgaaagc 360
ttgatccagc aatgtcgcgt gtgcgattaa gggaaactgt aaagcacttt tttttaagaa 420
taagaaattt taattaataa ttaaaatttt tgaatgtatt aaaagaataa gtaccgacta 480
atcacgtgcc agcagtcgcg gtaatacgtg gggtgcgagc gttaatcgga tttattgggc 540
gtaaagtgta ttcaggctgc ttaaaaagat ttatattaaa tatttaaatt aaatttaaaa 600
aatgtataaa ttactattaa gctagagttt agtataagaa aaaagaattt tatgtgtagc 660
agtgaaatgc gttgatatat aaaggaacgc cgaaagcgaa agcatttttc tgtaatagaa 720
ctgacgctta tatacgaaag cgtgggtagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg 780
ccctaaacta tgtcaattaa ctattagaat tttttttagt ggtgtagcta acgcgttaaa 840
ttgaccgcct gggtattacg atcgcaagat taaaactcaa aggaattgac ggggaccagc 900
acaagcggtg gatgatgtgg attaattcga tgatacgcga aaaaccttac ctgcccttga 960
catggttaga attttattga aaaataaaag tgcttggaaa agagctaaca cacaggtgct 1020
gcatggctgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac 1080
ccctactctt agttgctaat taaagaactt taagagaaca gctaacaata agtttagagg 1140
aaggagggga tgacttcaag tcctcatggc ccttatgggc agggcttcac acgtcataca 1200
atggttaata caaaaagttg caatatcgta agattgagct aatctttaaa attaatctta 1260
gttcggattg tactctgcaa ctcgagtaca tgaagttgga atcgctagta atcgcggatc 1320
agcatgccgc ggtgaatagt ttaactggtc ttgtacacac cgcccgtcac accatggaaa 1380
taaatcttgt tttaaatgaa gtaatatatt ttatcaaaac aggttttgta accggggtga 1440
agtcgtaaca 1450
<210> 21
<211> 1536
<212> DNA
<213> Zinderia insecticola CARI
<400> 21
atataaataa gagtttgatc ctggctcaga ttgaacgcta gcggtatgct ttacacatgc 60
aagtcgaacg acaatattaa agcttgcttt aatataaagt ggcgaacggg tgagtaatat 120
atcaaaacgt accttaaagt gggggataac taattgaaaa attagataat accgcatatt 180
aatcttagga tgaaaatagg aataatatct tatgctttta gatcggttga tatctgatta 240
gctagttggt agggtaaatg cttaccaagg caatgatcag tagctggttt tagcgaatga 300
tcagccacac tggaactgag acacggtcca gacttctacg gaaggcagca gtggggaata 360
ttggacaatg ggagaaatcc tgatccagca ataccgcgtg agtgatgaag gccttagggt 420
cgtaaaactc ttttgttagg aaagaaataa ttttaaataa tatttaaaat tgatgacggt 480
acctaaagaa taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgca 540
agcgttaatc ggaattattg ggcgtaaaga gtgcgtaggc tgttatataa gatagatgtg 600
aaatacttaa gcttaactta agaactgcat ttattactgt ttaactagag tttattagag 660
agaagtggaa ttttatgtgt agcagtgaaa tgcgtagata tataaaggaa tatcgatggc 720
gaaggcagct tcttggaata atactgacgc tgaggcacga aagcgtgggg agcaaacagg 780
attagatacc ctggtagtcc acgccctaaa ctatgtctac tagttattaa attaaaaata 840
aaatttagta acgtagctaa cgcattaagt agaccgcctg gggagtacga tcgcaagatt 900
aaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat 960
gcaacacgaa aaaccttacc tactcttgac atgtttggaa ttttaaagaa atttaaaagt 1020
gcttgaaaaa gaaccaaaac acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat 1080
gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttgttatta tttgctaata aaaagaactt 1140
taataagact gccaatgaca aattggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc 1200
cttatgagta gggcttcaca cgtcatacaa tgatatatac aatgggtagc aaatttgtga 1260
aaatgagcca atccttaaag tatatcttag ttcggattgt agtctgcaac tcgactacat 1320
gaagttggaa tcgctagtaa tcgcggatca gcatgccgcg gtgaatacgt tctcgggtct 1380
tgtacacacc gcccgtcaca ccatggaagt gatttttacc agaaattatt tgtttaacct 1440
ttattggaaa aaaataatta aggtagaatt catgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag 1500
cagtatcgga aggtgcggct ggattacatt ttaaat 1536
<210> 22
<211> 1423
<212> DNA
<213> Hodgkinia
<400> 22
aatgctggcg gcaggcctaa cacatgcaag tcgagcggac aacgttcaaa cgttgttagc 60
ggcgaacggg tgagtaatac gtgagaatct acccatccca acgtgataac atagtcaaca 120
ccatgtcaat aacgtatgat tcctgcaaca ggtaaagatt ttatcgggga tggatgagct 180
cacgctagat tagctagttg gtgagataaa agcccaccaa ggccaagatc tatagctggt 240
ctggaaggat ggacagccac attgggactg agacaaggcc caaccctcta aggagggcag 300
cagtgaggaa tattggacaa tgggcgtaag cctgatccag ccatgccgca tgagtgattg 360
aaggtccaac ggactgtaaa actcttttct ccagagatca taaatgatag tatctggtga 420
tataagctcc ggccaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgaggggag cgagtattgt 480
tcggttttat tgggcgtaaa gggtgtccag gttgctaagt aagttaacaa caaaatcttg 540
agattcaacc tcataacgtt cggttaatac tactaagctc gagcttggat agagacaaac 600
ggaattccga gtgtagaggt gaaattcgtt gatacttgga ggaacaccag aggcgaaggc 660
ggtttgtcat accaagctga cactgaagac acgaaagcat ggggagcaaa caggattaga 720
taccctggta gtccatgccc taaacgttga gtgctaacag ttcgatcaag ccacatgcta 780
tgatccagga ttgtacagct aacgcgttaa gcactccgcc tgggtattac gaccgcaagg 840
ttaaaactca aaggaattga cggagacccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg 900
aagctacacg aagaacctta ccagcccttg acataccatg gccaaccatc ctggaaacag 960
gatgttgttc aagttaaacc cttgaaatgc caggaacagg tgctgcatgg ctgttgtcag 1020
ttcgtgtcgt gagatgtatg gttaagtccc aaaacgaaca caaccctcac ccatagttgc 1080
cataaacaca attgggttct ctatgggtac tgctaacgta agttagagga aggtgaggac 1140
cacaacaagt catcatggcc cttatgggct gggccacaca catgctacaa tggtggttac 1200
aaagagccgc aacgttgtga gaccgagcaa atctccaaag accatctcag tccggattgt 1260
actctgcaac ccgagtacat gaagtaggaa tcgctagtaa tcgtggatca gcatgccacg 1320
gtgaatacgt tctcgggtct tgtacacgcc gcccgtcaca ccatgggagc ttcgctccga 1380
tcgaagtcaa gttacccttg accacatctt ggcaagtgac cga 1423
<210> 23
<211> 1504
<212> DNA
<213> Wolbachia sp. wPip
<400> 23
aaatttgaga gtttgatcct ggctcagaat gaacgctggc ggcaggccta acacatgcaa 60
gtcgaacgga gttatattgt agcttgctat ggtataactt agtggcagac gggtgagtaa 120
tgtataggaa tctacctagt agtacggaat aattgttgga aacgacaact aataccgtat 180
acgccctacg ggggaaaaat ttattgctat tagatgagcc tatattagat tagctagttg 240
gtggggtaat agcctaccaa ggtaatgatc tatagctgat ctgagaggat gatcagccac 300
actggaactg agatacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa 360
tgggcgaaag cctgatccag ccatgccgca tgagtgaaga aggcctttgg gttgtaaagc 420
tcttttagtg aggaagataa tgacggtact cacagaagaa gtcctggcta actccgtgcc 480
agcagccgcg gtaatacgga gagggctagc gttattcgga attattgggc gtaaagggcg 540
cgtaggctgg ttaataagtt aaaagtgaaa tcccgaggct taaccttgga attgctttta 600
aaactattaa tctagagatt gaaagaggat agaggaattc ctgatgtaga ggtaaaattc 660
gtaaatatta ggaggaacac cagtggcgaa ggcgtctatc tggttcaaat ctgacgctga 720
agcgcgaagg cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga 780
tgaatgttaa atatggggag tttactttct gtattacagc taacgcgtta aacattccgc 840
ctggggacta cggtcgcaag attaaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg 900
tggagcatgt ggtttaattc gatgcaacgc gaaaaacctt accacttctt gacatgaaaa 960
tcatacctat tcgaagggat agggtcggtt cggccggatt ttacacaagt gttgcatggc 1020
tgtcgtcagc tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aaccctcatc 1080
cttagttgcc atcaggtaat gctgagtact ttaaggaaac tgccagtgat aagctggagg 1140
aaggtgggga tgatgtcaag tcatcatggc ctttatggag tgggctacac acgtgctaca 1200
atggtgtcta caatgggctg caaggtgcgc aagcctaagc taatccctaa aagacatctc 1260
agttcggatt gtactctgca actcgagtac atgaagttgg aatcgctagt aatcgtggat 1320
cagcatgcca cggtgaatac gttctcgggt cttgtacaca ctgcccgtca cgccatggga 1380
attggtttca ctcgaagcta atggcctaac cgcaaggaag gagttattta aagtgggatc 1440
agtgactggg gtgaagtcgt aacaaggtag cagtagggga atctgcagct ggattacctc 1500
ctta 1504
<210> 24
<211> 1532
<212> DNA
<213> Uzinura diaspidicola
<400> 24
aaaggagata ttccaaccac accttccggt acggttacct tgttacgact tagccctagt 60
catcaagttt accttaggca gaccactgaa ggattactga cttcaggtac ccccgactcc 120
catggcttga cgggcggtgt gtacaaggtt cgagaacata ttcaccgcgc cattgctgat 180
gcgcgattac tagcgattcc tgcttcatag agtcgaattg cagactccaa tccgaactga 240
gactggtttt agagattagc tcctgatcac ccagtggctg ccctttgtaa ccagccattg 300
tagcacgtgt gtagcccaag gcatagaggc catgatgatt tgacatcatc cccaccttcc 360
tcacagttta caccggcagt tttgttagag tccccggctt tacccgatgg caactaacaa 420
taggggttgc gctcgttata ggacttaacc aaacacttca cagcacgaac tgaagacaac 480
catgcagcac cttgtaatac gtcgtataga ctaagctgtt tccagcttat tcgtaataca 540
tttaagcctt ggtaaggttc ctcgcgtatc atcgaattaa accacatgct ccaccgcttg 600
tgcgaacccc cgtcaattcc tttgagtttc aatcttgcga ctgtacttcc caggtggatc 660
acttatcgct ttcgctaagc cactgaatat cgtttttcca atagctagtg atcatcgttt 720
agggcgtgga ctaccagggt atctaatcct gtttgctccc cacgctttcg tgcactgagc 780
gtcagtaaag atttagcaac ctgccttcgc tatcggtgtt ctgtatgata tctatgcatt 840
tcaccgctac accatacatt ccagatgctc caatcttact caagtttacc agtatcaata 900
gcaattttac agttaagctg taagctttca ctactgactt aataaacagc ctacacaccc 960
tttaaaccca ataaatccga ataacgcttg tgtcatccgt attgccgcgg ctgctggcac 1020
ggaattagcc gacacttatt cgtatagtac cttcaatctc ctatcacgta agatatttta 1080
tttctataca aaagcagttt acaacctaaa agaccttcat cctgcacgcg acgtagctgg 1140
ttcagagttt cctccattga ccaatattcc tcactgctgc ctcccgtagg agtctggtcc 1200
gtgtctcagt accagtgtgg aggtacaccc tcttaggccc cctactgatc atagtcttgg 1260
tagagccatt acctcaccaa ctaactaatc aaacgcaggc tcatcttttg ccacctaagt 1320
tttaataaag gctccatgca gaaactttat attatggggg attaatcaga atttcttctg 1380
gctatacccc agcaaaaggt agattgcata cgtgttactc acccattcgc cggtcgccga 1440
caaattaaaa atttttcgat gcccctcgac ttgcatgtgt taagctcgcc gctagcgtta 1500
attctgagcc aggatcaaac tcttcgttgt ag 1532
<210> 25
<211> 1470
<212> DNA
<213> Carsonella ruddii
<400> 25
ctcaggataa acgctagcgg agggcttaac acatgcaagt cgaggggcag caaaaataat 60
tatttttggc gaccggcaaa cgggtgagta atacatacgt aactttcctt atgctgagga 120
atagcctgag gaaacttgga ttaatacctc ataatacaat tttttagaaa gaaaaattgt 180
taaagtttta ttatggcata agataggcgt atgtccaatt agttagttgg taaggtaatg 240
gcttaccaag acgatgattg gtagggggcc tgagaggggc gttcccccac attggtactg 300
agacacggac caaacttcta cggaaggctg cagtgaggaa tattggtcaa tggaggaaac 360
tctgaaccag ccactccgcg tgcaggatga aagaaagcct tattggttgt aaactgcttt 420
tgtatatgaa taaaaaattc taattataga aataattgaa ggtaatatac gaataagtat 480
cgactaactc tgtgccagca gtcgcggtaa gacagaggat acaagcgtta tccggattta 540
ttgggtttaa agggtgcgta ggcggttttt aaagtcagta gtgaaatctt aaagcttaac 600
tttaaaagtg ctattgatac tgaaaaacta gagtaaggtt ggagtaactg gaatgtgtgg 660
tgtagcggtg aaatgcatag atatcacaca gaacaccgat agcgaaagca agttactaac 720
cctatactga cgctgagtca cgaaagcatg gggagcaaac aggattagat accctggtag 780
tccatgccgt aaacgatgat cactaactat tgggttttat acgttgtaat tcagtggtga 840
agcgaaagtg ttaagtgatc cacctgagga gtacgaccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa 900
ttgacggggg cccgcacaat cggtggagca tgtggtttaa ttcgatgata cacgaggaac 960
cttaccaaga cttaaatgta ctacgaataa attggaaaca atttagtcaa gcgacggagt 1020
acaaggtgct gcatggttgt cgtcagctcg tgccgtgagg tgtaaggtta agtcctttaa 1080
acgagcgcaa cccttattat tagttgccat cgagtaatgt caggggactc taataagact 1140
gccggcgcaa gccgagagga aggtggggat gacgtcaaat catcacggcc cttacgtctt 1200
gggccacaca cgtgctacaa tgatcggtac aaaagggagc gactgggtga ccaggagcaa 1260
atccagaaag ccgatctaag ttcggattgg agtctgaaac tcgactccat gaagctggaa 1320
tcgctagtaa tcgtgcatca gccatggcac ggtgaatatg ttcccgggcc ttgtacacac 1380
cgcccgtcaa gccatggaag ttggaagtac ctaaagttgg ttcgctacct aaggtaagtc 1440
taataactgg ggctaagtcg taacaaggta 1470
<210> 26
<211> 1761
<212> DNA
<213> Symbiotaphrina buchneri voucher JCM9740
<220>
<221> misc_feature
<222> (30)..(30)
<223> n is a, g, c, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (40)..(40)
<223> n is a, g, c, or t
<400> 26
agattaagcc atgcaagtct aagtataagn aatctatacn gtgaaactgc gaatggctca 60
ttaaatcagt tatcgtttat ttgatagtac cttactacat ggataaccgt ggtaattcta 120
gagctaatac atgctaaaaa ccccgacttc ggaaggggtg tatttattag ataaaaaacc 180
aatgcccttc ggggctcctt ggtgattcat gataacttaa cgaatcgcat ggccttgcgc 240
cggcgatggt tcattcaaat ttctgcccta tcaactttcg atggtaggat agtggcctac 300
catggtttta acgggtaacg gggaattagg gttcgattcc ggagagggag cctgagaaac 360
ggctaccaca tccaaggaag gcagcaggcg cgcaaattac ccaatcccga cacggggagg 420
tagtgacaat aaatactgat acagggctct tttgggtctt gtaattggaa tgagtacaat 480
ttaaatccct taacgaggaa caattggagg gcaagtctgg tgccagcagc cgcggtaatt 540
ccagctccaa tagcgtatat taaagttgtt gcagttaaaa agctcgtagt tgaaccttgg 600
gcctggctgg ccggtccgcc taaccgcgtg tactggtccg gccgggcctt tccttctggg 660
gagccgcatg cccttcactg ggtgtgtcgg ggaaccagga cttttacttt gaaaaaatta 720
gagtgttcaa agcaggccta tgctcgaata cattagcatg gaataataga ataggacgtg 780
cggttctatt ttgttggttt ctaggaccgc cgtaatgatt aatagggata gtcgggggca 840
tcagtattca attgtcagag gtgaaattct tggatttatt gaagactaac tactgcgaaa 900
gcatttgcca aggatgtttt cattaatcag tgaacgaaag ttaggggatc gaagacgatc 960
agataccgtc gtagtcttaa ccataaacta tgccgactag ggatcgggcg atgttattat 1020
tttgactcgc tcggcacctt acgagaaatc aaagtctttg ggttctgggg ggagtatggt 1080
cgcaaggctg aaacttaaag aaattgacgg aagggcacca ccaggagtgg agcctgcggc 1140
ttaatttgac tcaacacggg gaaactcacc aggtccagac acattaagga ttgacagatt 1200
gagagctctt tcttgattat gtgggtggtg gtgcatggcc gttcttagtt ggtggagtga 1260
tttgtctgct taattgcgat aacgaacgag accttaacct gctaaatagc ccggtccgct 1320
ttggcgggcc gctggcttct tagagggact atcggctcaa gccgatggaa gtttgaggca 1380
ataacaggtc tgtgatgccc ttagatgttc tgggccgcac gcgcgctaca ctgacagagc 1440
caacgagtaa atcaccttgg ccggaaggtc tgggtaatct tgttaaactc tgtcgtgctg 1500
gggatagagc attgcaatta ttgctcttca acgaggaatt cctagtaagc gcaagtcatc 1560
agcttgcgct gattacgtcc ctgccctttg tacacaccgc ccgtcgctac taccgattga 1620
atggctcagt gaggccttcg gactggcaca gggacgttgg caacgacgac ccagtgccgg 1680
aaagttggtc aaacttggtc atttagagga agtaaaagtc gtaacaaggt ttccgtaggt 1740
gaacctgcgg aaggatcatt a 1761
<210> 27
<211> 1801
<212> DNA
<213> Symbiotaphrina kochii voucher CBS 589.63
<220>
<221> misc_feature
<222> (1753)..(1755)
<223> n is a, g, c, or t
<400> 27
tacctggttg attctgccag tagtcatatg cttgtctcaa agattaagcc atgcaagtct 60
aagtataagc aatctatacg gtgaaactgc gaatggctca ttaaatcagt tatcgtttat 120
ttgatagtac cttactacat ggataaccgt ggtaattcta gagctaatac atgctaaaaa 180
cctcgacttc ggaaggggtg tatttattag ataaaaaacc aatgcccttc ggggctcctt 240
ggtgattcat gataacttaa cgaatcgcat ggccttgcgc cggcgatggt tcattcaaat 300
ttctgcccta tcaactttcg atggtaggat agtggcctac catggtttca acgggtaacg 360
gggaattagg gttcgattcc ggagagggag cctgagaaac ggctaccaca tccaaggaag 420
gcagcaggcg cgcaaattac ccaatcccga cacggggagg tagtgacaat aaatactgat 480
acagggctct tttgggtctt gtaattggaa tgagtacaat ttaaatccct taacgaggaa 540
caattggagg gcaagtctgg tgccagcagc cgcggtaatt ccagctccaa tagcgtatat 600
taaagttgtt gcagttaaaa agctcgtagt tgaaccttgg gcctggctgg ccggtccgcc 660
taaccgcgtg tactggtccg gccgggcctt tccttctggg gagccgcatg cccttcactg 720
ggtgtgtcgg ggaaccagga cttttacttt gaaaaaatta gagtgttcaa agcaggccta 780
tgctcgaata cattagcatg gaataataga ataggacgtg tggttctatt ttgttggttt 840
ctaggaccgc cgtaatgatt aatagggata gtcgggggca tcagtattca attgtcagag 900
gtgaaattct tggatttatt gaagactaac tactgcgaaa gcatttgcca aggatgtttt 960
cattaatcag tgaacgaaag ttaggggatc gaagacgatc agataccgtc gtagtcttaa 1020
ccataaacta tgccgactag ggatcgggcg atgttattat tttgactcgc tcggcacctt 1080
acgagaaatc aaagtctttg ggttctgggg ggagtatggt cgcaaggctg aaacttaaag 1140
aaattgacgg aagggcacca ccaggagtgg agcctgcggc ttaatttgac tcaacacggg 1200
gaaactcacc aggtccagac acattaagga ttgacagatt gagagctctt tcttgattat 1260
gtgggtggtg gtgcatggcc gttcttagtt ggtggagtga tttgtctgct taattgcgat 1320
aacgaacgag accttaacct gctaaatagc ccggtccgct ttggcgggcc gctggcttct 1380
tagagggact atcggctcaa gccgatggaa gtttgaggca ataacaggtc tgtgatgccc 1440
ttagatgttc tgggccgcac gcgcgctaca ctgacagagc caacgagtac atcaccttgg 1500
ccggaaggtc tgggtaatct tgttaaactc tgtcgtgctg gggatagagc attgcaatta 1560
ttgctcttca acgaggaatt cctagtaagc gcaagtcatc agcttgcgct gattacgtcc 1620
ctgccctttg tacacaccgc ccgtcgctac taccgattga atggctcagt gaggccttcg 1680
gactggcaca gggacgttgg caacgacgac ccagtgccgg aaagttcgtc aaacttggtc 1740
atttagagga agnnnaagtc gtaacaaggt ttccgtaggt gaacctgcgg aaggatcatt 1800
a 1801
<210> 28
<211> 1490
<212> DNA
<213> Burkholderia sp. SFA1
<400> 28
agtttgatcc tggctcagat tgaacgctgg cggcatgcct tacacatgca agtcgaacgg 60
cagcacgggg gcaaccctgg tggcgagtgg cgaacgggtg agtaatacat cggaacgtgt 120
cctgtagtgg gggatagccc ggcgaaagcc ggattaatac cgcatacgac ctaagggaga 180
aagcggggga tcttcggacc tcgcgctata ggggcggccg atggcagatt agctagttgg 240
tggggtaaag gcctaccaag gcgacgatct gtagctggtc tgagaggacg accagccaca 300
ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat tttggacaat 360
gggggcaacc ctgatccagc aatgccgcgt gtgtgaagaa ggcttcgggt tgtaaagcac 420
ttttgtccgg aaagaaaact tcgtccctaa tatggatgga ggatgacggt accggaagaa 480
taagcaccgg ctaactacgt gccagcagcc gcggtaatac gtagggtgcg agcgttaatc 540
ggaattactg ggcgtaaagc gtgcgcaggc ggtctgttaa gaccgatgtg aaatccccgg 600
gcttaacctg ggaactgcat tggtgactgg caggctttga gtgtggcaga ggggggtaga 660
attccacgtg tagcagtgaa atgcgtagag atgtggagga ataccgatgg cgaaggcagc 720
cccctgggcc aactactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata 780
ccctggtagt ccacgcccta aacgatgtca actagttgtt ggggattcat ttccttagta 840
acgtagctaa cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa 900
ggaattgacg gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa 960
aaaccttacc tacccttgac atggtcggaa ccctgctgaa aggtgggggt gctcgaaaga 1020
gaaccggcgc acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa 1080
gtcccgcaac gagcgcaacc cttgtcctta gttgctacgc aagagcactc taaggagact 1140
gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgggta 1200
gggcttcaca cgtcatacaa tggtcggaac agagggttgc caagccgcga ggtggagcca 1260
atcccagaaa accgatcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagctgga 1320
atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac 1380
cgcccgtcac accatgggag tgggtttcac cagaagtagg tagcctaacc gcaaggaggg 1440
cgcttaccac ggtgggattc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc 1490
<210> 29
<211> 1408
<212> DNA
<213> Burkholderia sp. KM-A
<400> 29
gcaaccctgg tggcgagtgg cgaacgggtg agtaatacat cggaacgtgt cctgtagtgg 60
gggatagccc ggcgaaagcc ggattaatac cgcatacgat ctacggaaga aagcggggga 120
tccttcggga cctcgcgcta taggggcggc cgatggcaga ttagctagtt ggtggggtaa 180
aggcctacca aggcgacgat ctgtagctgg tctgagagga cgaccagcca cactgggact 240
gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtgggga attttggaca atgggggcaa 300
ccctgatcca gcaatgccgc gtgtgtgaag aaggccttcg ggttgtaaag cacttttgtc 360
cggaaagaaa acgtcttggt taatacctga ggcggatgac ggtaccggaa gaataagcac 420
cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtagggt gcgagcgtta atcggaatta 480
ctgggcgtaa agcgtgcgca ggcggtctgt taagaccgat gtgaaatccc cgggcttaac 540
ctgggaactg cattggtgac tggcaggctt tgagtgtggc agaggggggt agaattccac 600
gtgtagcagt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccga tggcgaaggc agccccctgg 660
gccaacactg acgctcatgc acgaaagcgt ggggagcaaa caggattaga taccctggta 720
gtccacgccc taaacgatgt caactagttg ttggggattc atttccttag taacgtagct 780
aacgcgtgaa gttgaccgcc tggggagtac ggtcgcaaga ttaaaactca aaggaattga 840
cggggacccg cacaagcggt ggatgatgtg gattaattcg atgcaacgcg aaaaacctta 900
cctacccttg acatggtcgg aagtctgctg agaggtggac gtgctcgaaa gagaaccggc 960
gcacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca 1020
acgagcgcaa cccttgtcct tagttgctac gcaagagcac tctaaggaga ctgccggtga 1080
caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa gtcctcatgg cccttatggg tagggcttca 1140
cacgtcatac aatggtcgga acagagggtt gccaagccgc gaggtggagc caatcccaga 1200
aaaccgatcg tagtccggat cgcagtctgc aactcgactg cgtgaagctg gaatcgctag 1260
taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg tcttgtacac accgcccgtc 1320
acaccatggg agtgggtttc accagaagta ggtagcctaa ccgcaaggag ggcgcttacc 1380
acggtgggat tcatgactgg ggtgaagt 1408
<210> 30
<211> 1383
<212> DNA
<213> Burkholderia sp. KM-G
<400> 30
gcaaccctgg tggcgagtgg cgaacgggtg agtaatacat cggaacgtgt cctgtagtgg 60
gggatagccc ggcgaaagcc ggattaatac cgcatacgac ctaagggaga aagcggggga 120
tcttcggacc tcgcgctata ggggcggccg atggcagatt agctagttgg tggggtaaag 180
gcctaccaag gcgacgatct gtagctggtc tgagaggacg accagccaca ctgggactga 240
gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat tttggacaat gggggcaacc 300
ctgatccagc aatgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg ttgtaaagca cttttgtccg 360
gaaagaaaac ttcgaggtta atacccttgg aggatgacgg taccggaaga ataagcaccg 420
gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggtgc gagcgttaat cggaattact 480
gggcgtaaag cgtgcgcagg cggtctgtta agaccgatgt gaaatccccg ggcttaacct 540
gggaactgca ttggtgactg gcaggctttg agtgtggcag aggggggtag aattccacgt 600
gtagcagtga aatgcgtaga gatgtggagg aataccgatg gcgaaggcag ccccctgggc 660
caacactgac gctcatgcac gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt 720
ccacgcccta aacgatgtca actagttgtt ggggattcat ttccttagta acgtagctaa 780
cgcgtgaagt tgaccgcctg gggagtacgg tcgcaagatt aaaactcaaa ggaattgacg 840
gggacccgca caagcggtgg atgatgtgga ttaattcgat gcaacgcgaa aaaccttacc 900
tacccttgac atggtcggaa gtctgctgag aggtggacgt gctcgaaaga gaaccggcgc 960
acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac 1020
gagcgcaacc cttgtcctta gttgctacgc aagagcactc taaggagact gccggtgaca 1080
aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc cttatgggta gggcttcaca 1140
cgtcatacaa tggtcggaac agagggttgc caagccgcga ggtggagcca atcccagaaa 1200
accgatcgta gtccggatcg cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagctgga atcgctagta 1260
atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggtc ttgtacacac cgcccgtcac 1320
accatgggag tgggtttcac cagaagtagg tagcctaacc tgcaaaggag ggcgcttacc 1380
acg 1383
<210> 31
<400> 31
000
<210> 32
<400> 32
000
<210> 33
<211> 1505
<212> DNA
<213> Snodgrassella alvi
<400> 33
gagagtttga tcctggctca gattgaacgc tggcggcatg ccttacacat gcaagtcgaa 60
cggcagcacg gagagcttgc tctctggtgg cgagtggcga acgggtgagt aatgcatcgg 120
aacgtaccga gtaatggggg ataactgtcc gaaaggatgg ctaataccgc atacgccctg 180
agggggaaag cgggggatcg aaagacctcg cgttatttga gcggccgatg ttggattagc 240
tagttggtgg ggtaaaggcc taccaaggcg acgatccata gcgggtctga gaggatgatc 300
cgccacattg ggactgagac acggcccaaa ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt 360
ggacaatggg gggaaccctg atccagccat gccgcgtgtc tgaagaaggc cttcgggttg 420
taaaggactt ttgttaggga agaaaagccg ggtgttaata ccatctggtg ctgacggtac 480
ctaaagaata agcaccggct aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcgag 540
cgttaatcgg aattactggg cgtaaagcga gcgcagacgg ttaattaagt cagatgtgaa 600
atccccgagc tcaacttggg acgtgcattt gaaactggtt aactagagtg tgtcagaggg 660
aggtagaatt ccacgtgtag cagtgaaatg cgtagagatg tggaggaata ccgatggcga 720
aggcagcctc ctgggataac actgacgttc atgctcgaaa gcgtgggtag caaacaggat 780
tagataccct ggtagtccac gccctaaacg atgacaatta gctgttggga cactagatgt 840
cttagtagcg aagctaacgc gtgaaattgt ccgcctgggg agtacggtcg caagattaaa 900
actcaaagga attgacgggg acccgcacaa gcggtggatg atgtggatta attcgatgca 960
acgcgaagaa ccttacctgg tcttgacatg tacggaatct cttagagata ggagagtgcc 1020
ttcgggaacc gtaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080
gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc catcattaag ttgggcactc 1140
taatgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat gacgtcaagt cctcatggcc 1200
cttatgacca gggcttcaca cgtcatacaa tggtcggtac agagggtagc gaagccgcga 1260
ggtgaagcca atctcagaaa gccgatcgta gtccggattg cactctgcaa ctcgagtgca 1320
tgaagtcgga atcgctagta atcgcaggtc agcatactgc ggtgaatacg ttcccgggtc 1380
ttgtacacac cgcccgtcac accatgggag tgggggatac cagaattggg tagactaacc 1440
gcaaggaggt cgcttaacac ggtatgcttc atgactgggg tgaagtcgta acaaggtagc 1500
cgtag 1505
<210> 34
<211> 1541
<212> DNA
<213> Gilliamella apicola
<400> 34
ttaaattgaa gagtttgatc atggctcaga ttgaacgctg gcggcaggct taacacatgc 60
aagtcgaacg gtaacatgag tgcttgcact tgatgacgag tggcggacgg gtgagtaaag 120
tatggggatc tgccgaatgg agggggacaa cagttggaaa cgactgctaa taccgcataa 180
agttgagaga ccaaagcatg ggaccttcgg gccatgcgcc atttgatgaa cccatatggg 240
attagctagt tggtagggta atggcttacc aaggcgacga tctctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggggaa accctgatgc agccatgccg cgtgtatgaa gaaggccttc 420
gggttgtaaa gtactttcgg tgatgaggaa ggtggtgtat ctaataggtg catcaattga 480
cgttaattac agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcgagcgtt aatcggaatg actgggcgta aagggcatgt aggcggataa ttaagttagg 600
tgtgaaagcc ctgggctcaa cctaggaatt gcacttaaaa ctggttaact agagtattgt 660
agaggaaggt agaattccac gtgtagcggt gaaatgcgta gagatgtgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccttctgg acagatactg acgctgagat gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgatttggag tttgttgcct 840
agagtgatgg gctccgaagc taacgcgata aatcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctggtctt gacatccaca gaatcttgca gagatgcggg 1020
agtgccttcg ggaactgtga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccatc ggttaggccg 1140
ggaactcaaa ggagactgcc gttgataaag cggaggaagg tggggacgac gtcaagtcat 1200
catggccctt acgaccaggg ctacacacgt gctacaatgg cgtatacaaa gggaggcgac 1260
ctcgcgagag caagcggacc tcataaagta cgtctaagtc cggattggag tctgcaactc 1320
gactccatga agtcggaatc gctagtaatc gtgaatcaga atgtcacggt gaatacgttc 1380
ccgggccttg tacacaccgc ccgtcacacc atgggagtgg gttgcaccag aagtagatag 1440
cttaaccttc gggagggcgt ttaccacggt gtggtccatg actggggtga agtcgtaaca 1500
aggtaaccgt aggggaacct gcggttggat cacctcctta c 1541
<210> 35
<211> 1528
<212> DNA
<213> Bartonella apis
<400> 35
aagccaaaat caaattttca acttgagagt ttgatcctgg ctcagaacga acgctggcgg 60
caggcttaac acatgcaagt cgaacgcact tttcggagtg agtggcagac gggtgagtaa 120
cgcgtgggaa tctacctatt tctacggaat aacgcagaga aatttgtgct aataccgtat 180
acgtccttcg ggagaaagat ttatcggaga tagatgagcc cgcgttggat tagctagttg 240
gtgaggtaat ggcccaccaa ggcgacgatc catagctggt ctgagaggat gaccagccac 300
attgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattggacaa 360
tgggcgcaag cctgatccag ccatgccgcg tgagtgatga aggccctagg gttgtaaagc 420
tctttcaccg gtgaagataa tgacggtaac cggagaagaa gccccggcta acttcgtgcc 480
agcagccgcg gtaatacgaa gggggctagc gttgttcgga tttactgggc gtaaagcgca 540
cgtaggcgga tatttaagtc aggggtgaaa tcccggggct caaccccgga actgcctttg 600
atactggata tcttgagtat ggaagaggta agtggaattc cgagtgtaga ggtgaaattc 660
gtagatattc ggaggaacac cagtggcgaa ggcggcttac tggtccatta ctgacgctga 720
ggtgcgaaag cgtggggagc aaacaggatt agataccctg gtagtccacg ctgtaaacga 780
tgaatgttag ccgttggaca gtttactgtt cggtggcgca gctaacgcat taaacattcc 840
gcctggggag tacggtcgca agattaaaac tcaaaggaat tgacgggggc ccgcacaagc 900
ggtggagcat gtggtttaat tcgaagcaac gcgcagaacc ttaccagccc ttgacatccc 960
gatcgcggat ggtggagaca ccgtctttca gttcggctgg atcggtgaca ggtgctgcat 1020
ggctgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag cgcaaccctc 1080
gcccttagtt gccatcattt agttgggcac tctaagggga ctgccggtga taagccgaga 1140
ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg gcccttacgg gctgggctac acacgtgcta 1200
caatggtggt gacagtgggc agcgagaccg cgaggtcgag ctaatctcca aaagccatct 1260
cagttcggat tgcactctgc aactcgagtg catgaagttg gaatcgctag taatcgtgga 1320
tcagcatgcc acggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc acaccatggg 1380
agttggtttt acccgaaggt gctgtgctaa ccgcaaggag gcaggcaacc acggtagggt 1440
cagcgactgg ggtgaagtcg taacaaggta gccgtagggg aacctgcggc tggatcacct 1500
cctttctaag gaagatgaag aattggaa 1528
<210> 36
<211> 1390
<212> DNA
<213> Parasaccharibacter apium
<220>
<221> misc_feature
<222> (643)..(756)
<223> n is a, g, c, or t
<400> 36
ctaccatgca agtcgcacga aacctttcgg ggttagtggc ggacgggtga gtaacgcgtt 60
aggaacctat ctggaggtgg gggataacat cgggaaactg gtgctaatac cgcatgatgc 120
ctgagggcca aaggagagat ccgccattgg aggggcctgc gttcgattag ctagttggtt 180
gggtaaaggc tgaccaaggc gatgatcgat agctggtttg agaggatgat cagccacact 240
gggactgaga cacggcccag actcctacgg gaggcagcag tggggaatat tggacaatgg 300
gggcaaccct gatccagcaa tgccgcgtgt gtgaagaagg tcttcggatt gtaaagcact 360
ttcactaggg aagatgatga cggtacctag agaagaagcc ccggctaact tcgtgccagc 420
agccgcggta atacgaaggg ggctagcgtt gctcggaatg actgggcgta aagggcgcgt 480
aggctgtttg tacagtcaga tgtgaaatcc ccgggcttaa cctgggaact gcatttgata 540
cgtgcagact agagtccgag agagggttgt ggaattccca gtgtagaggt gaaattcgta 600
gatattggga agaacaccgg ttgcgaaggc ggcaacctgg ctnnnnnnnn nnnnnnnnnn 660
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 720
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnngagc taacgcgtta agcacaccgc 780
ctggggagta cggccgcaag gttgaaactc aaaggaattg acgggggccc gcacaagcgg 840
tggagcatgt ggtttaattc gaagcaacgc gcagaacctt accagggctt gcatggggag 900
gctgtattca gagatggata tttcttcgga cctcccgcac aggtgctgca tggctgtcgt 960
cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tgtctttagt 1020
tgccatcacg tctgggtggg cactctagag agactgccgg tgacaagccg gaggaaggtg 1080
gggatgacgt caagtcctca tggcccttat gtcctgggct acacacgtgc tacaatggcg 1140
gtgacagagg gatgctacat ggtgacatgg tgctgatctc aaaaaaccgt ctcagttcgg 1200
attgtactct gcaactcgag tgcatgaagg tggaatcgct agtaatcgcg gatcagcatg 1260
ccgcggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagttggtt 1320
tgaccttaag ccggtgagcg aaccgcaagg aacgcagccg accaccggtt cgggttcagc 1380
gactggggga 1390
<210> 37
<211> 1583
<212> DNA
<213> Lactobacillus kunkeei
<400> 37
ttccttagaa aggaggtgat ccagccgcag gttctcctac ggctaccttg ttacgacttc 60
accctaatca tctgtcccac cttagacgac tagctcctaa aaggttaccc catcgtcttt 120
gggtgttaca aactctcatg gtgtgacggg cggtgtgtac aaggcccggg aacgtattca 180
ccgtggcatg ctgatccacg attactagtg attccaactt catgcaggcg agttgcagcc 240
tgcaatccga actgagaatg gctttaagag attagcttga cctcgcggtt tcgcgactcg 300
ttgtaccatc cattgtagca cgtgtgtagc ccagctcata aggggcatga tgatttgacg 360
tcgtccccac cttcctccgg tttatcaccg gcagtctcac tagagtgccc aactaaatgc 420
tggcaactaa taataagggt tgcgctcgtt gcgggactta acccaacatc tcacgacacg 480
agctgacgac aaccatgcac cacctgtcat tctgtccccg aagggaacgc ccaatctctt 540
gggttggcag aagatgtcaa gagctggtaa ggttcttcgc gtagcatcga attaaaccac 600
atgctccacc acttgtgcgg gcccccgtca attcctttga gtttcaacct tgcggtcgta 660
ctccccaggc ggaatactta atgcgttagc tgcggcactg aagggcggaa accctccaac 720
acctagtatt catcgtttac ggcatggact accagggtat ctaatcctgt tcgctaccca 780
tgctttcgag cctcagcgtc agtaacagac cagaaagccg ccttcgccac tggtgttctt 840
ccatatatct acgcatttca ccgctacaca tggagttcca ctttcctctt ctgtactcaa 900
gttttgtagt ttccactgca cttcctcagt tgagctgagg gctttcacag cagacttaca 960
aaaccgcctg cgctcgcttt acgcccaata aatccggaca acgcttgcca cctacgtatt 1020
accgcggctg ctggcacgta gttagccgtg gctttctggt taaataccgt caaagtgtta 1080
acagttactc taacacttgt tcttctttaa caacagagtt ttacgatccg aaaaccttca 1140
tcactcacgc ggcgttgctc catcagactt tcgtccattg tggaagattc cctactgctg 1200
cctcccgtag gagtctgggc cgtgtctcag tcccaatgtg gccgattacc ctctcaggtc 1260
ggctacgtat catcgtcttg gtgggctttt atctcaccaa ctaactaata cggcgcgggt 1320
ccatcccaaa gtgatagcaa agccatcttt caagttggaa ccatgcggtt ccaactaatt 1380
atgcggtatt agcacttgtt tccaaatgtt atcccccgct tcggggcagg ttacccacgt 1440
gttactcacc agttcgccac tcgctccgaa tccaaaaatc atttatgcaa gcataaaatc 1500
aatttgggag aactcgttcg acttgcatgt attaggcacg ccgccagcgt tcgtcctgag 1560
ccaggatcaa actctcatct taa 1583
<210> 38
<211> 1395
<212> DNA
<213> Lactobacillus Firm-4
<400> 38
acgaacgctg gcggcgtgcc taatacatgc aagtcgagcg cgggaagtca gggaagcctt 60
cgggtggaac tggtggaacg agcggcggat gggtgagtaa cacgtaggta acctgcccta 120
aagcggggga taccatctgg aaacaggtgc taataccgca taaacccagc agtcacatga 180
gtgctggttg aaagacggct tcggctgtca ctttaggatg gacctgcggc gtattagcta 240
gttggtggag taacggttca ccaaggcaat gatacgtagc cgacctgaga gggtaatcgg 300
ccacattggg actgagacac ggcccaaact cctacgggag gcagcagtag ggaatcttcc 360
acaatggacg caagtctgat ggagcaacgc cgcgtggatg aagaaggtct tcggatcgta 420
aaatcctgtt gttgaagaag aacggttgtg agagtaactg ctcataacgt gacggtaatc 480
aaccagaaag tcacggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg taatacgtag gtggcaagcg 540
ttgtccggat ttattgggcg taaagggagc gcaggcggtc ttttaagtct gaatgtgaaa 600
gccctcagct taactgagga agagcatcgg aaactgagag acttgagtgc agaagaggag 660
agtggaactc catgtgtagc ggtgaaatgc gtagatatat ggaagaacac cagtggcgaa 720
ggcggctctc tggtctgtta ctgacgctga ggctcgaaag catgggtagc gaacaggatt 780
agataccctg gtagtccatg ccgtaaacga tgagtgctaa gtgttgggag gtttccgcct 840
ctcagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg agtacgaccg caaggttgaa 900
actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca 960
acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc tcctgcaagc ctaagagatt aggggttccc 1020
ttcggggaca ggaagacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080
gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt tactagttgc cagcattaag ttgggcactc 1140
tagtgagact gccggtgaca aaccggagga aggtggggac gacgtcaaat catcatgccc 1200
cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggatggtac aatgagaagc gaactcgcga 1260
ggggaagctg atctctgaaa accattctca gttcggattg caggctgcaa ctcgcctgca 1320
tgaagctgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc ggtgaatacg ttcccgggcc 1380
ttgtacacac cgccc 1395
<210> 39
<211> 1549
<212> DNA
<213> Enterococcus
<400> 39
aggtgatcca gccgcacctt ccgatacggc taccttgtta cgacttcacc ccaatcatct 60
atcccacctt aggcggctgg ctccaaaaag gttacctcac cgacttcggg tgttacaaac 120
tctcgtggtg tgacgggcgg tgtgtacaag gcccgggaac gtattcaccg cggcgtgctg 180
atccgcgatt actagcgatt ccggcttcat gcaggcgagt tgcagcctgc aatccgaact 240
gagagaagct ttaagagatt tgcatgacct cgcggtctag cgactcgttg tacttcccat 300
tgtagcacgt gtgtagccca ggtcataagg ggcatgatga tttgacgtca tccccacctt 360
cctccggttt gtcaccggca gtctcgctag agtgcccaac taaatgatgg caactaacaa 420
taagggttgc gctcgttgcg ggacttaacc caacatctca cgacacgagc tgacgacaac 480
catgcaccac ctgtcacttt gtccccgaag ggaaagctct atctctagag tggtcaaagg 540
atgtcaagac ctggtaaggt tcttcgcgtt gcttcgaatt aaaccacatg ctccaccgct 600
tgtgcgggcc cccgtcaatt cctttgagtt tcaaccttgc ggtcgtactc cccaggcgga 660
gtgcttaatg cgtttgctgc agcactgaag ggcggaaacc ctccaacact tagcactcat 720
cgtttacggc gtggactacc agggtatcta atcctgtttg ctccccacgc tttcgagcct 780
cagcgtcagt tacagaccag agagccgcct tcgccactgg tgttcctcca tatatctacg 840
catttcaccg ctacacatgg aattccactc tcctcttctg cactcaagtc tcccagtttc 900
caatgaccct ccccggttga gccgggggct ttcacatcag acttaagaaa ccgcctgcgc 960
tcgctttacg cccaataaat ccggacaacg cttgccacct acgtattacc gcggctgctg 1020
gcacgtagtt agccgtggct ttctggttag ataccgtcag gggacgttca gttactaacg 1080
tccttgttct tctctaacaa cagagtttta cgatccgaaa accttcttca ctcacgcggc 1140
gttgctcggt cagactttcg tccattgccg aagattccct actgctgcct cccgtaggag 1200
tctgggccgt gtctcagtcc cagtgtggcc gatcaccctc tcaggtcggc tatgcatcgt 1260
ggccttggtg agccgttacc tcaccaacta gctaatgcac cgcgggtcca tccatcagcg 1320
acacccgaaa gcgcctttca ctcttatgcc atgcggcata aactgttatg cggtattagc 1380
acctgtttcc aagtgttatc cccctctgat gggtaggtta cccacgtgtt actcacccgt 1440
ccgccactcc tctttccaat tgagtgcaag cactcgggag gaaagaagcg ttcgacttgc 1500
atgtattagg cacgccgcca gcgttcgtcc tgagccagga tcaaactct 1549
<210> 40
<211> 1541
<212> DNA
<213> Delftia
<400> 40
cagaaaggag gtgatccagc cgcaccttcc gatacggcta ccttgttacg acttcacccc 60
agtcacgaac cccgccgtgg taagcgccct ccttgcggtt aggctaccta cttctggcga 120
gacccgctcc catggtgtga cgggcggtgt gtacaagacc cgggaacgta ttcaccgcgg 180
catgctgatc cgcgattact agcgattccg acttcacgca gtcgagttgc agactgcgat 240
ccggactacg actggtttta tgggattagc tccccctcgc gggttggcaa ccctctgtac 300
cagccattgt atgacgtgtg tagccccacc tataagggcc atgaggactt gacgtcatcc 360
ccaccttcct ccggtttgtc accggcagtc tcattagagt gctcaactga atgtagcaac 420
taatgacaag ggttgcgctc gttgcgggac ttaacccaac atctcacgac acgagctgac 480
gacagccatg cagcacctgt gtgcaggttc tctttcgagc acgaatccat ctctggaaac 540
ttcctgccat gtcaaaggtg ggtaaggttt ttcgcgttgc atcgaattaa accacatcat 600
ccaccgcttg tgcgggtccc cgtcaattcc tttgagtttc aaccttgcgg ccgtactccc 660
caggcggtca acttcacgcg ttagcttcgt tactgagaaa actaattccc aacaaccagt 720
tgacatcgtt tagggcgtgg actaccaggg tatctaatcc tgtttgctcc ccacgctttc 780
gtgcatgagc gtcagtacag gtccagggga ttgccttcgc catcggtgtt cctccgcata 840
tctacgcatt tcactgctac acgcggaatt ccatccccct ctaccgtact ctagccatgc 900
agtcacaaat gcagttccca ggttgagccc ggggatttca catctgtctt acataaccgc 960
ctgcgcacgc tttacgccca gtaattccga ttaacgctcg caccctacgt attaccgcgg 1020
ctgctggcac gtagttagcc ggtgcttatt cttacggtac cgtcatgggc cccctgtatt 1080
agaaggagct ttttcgttcc gtacaaaagc agtttacaac ccgaaggcct tcatcctgca 1140
cgcggcattg ctggatcagg ctttcgccca ttgtccaaaa ttccccactg ctgcctcccg 1200
taggagtctg ggccgtgtct cagtcccagt gtggctggtc gtcctctcag accagctaca 1260
gatcgtcggc ttggtaagct tttatcccac caactaccta atctgccatc ggccgctcca 1320
atcgcgcgag gcccgaaggg cccccgcttt catcctcaga tcgtatgcgg tattagctac 1380
tctttcgagt agttatcccc cacgactggg cacgttccga tgtattactc acccgttcgc 1440
cactcgtcag cgtccgaaga cctgttaccg ttcgacttgc atgtgtaagg catgccgcca 1500
gcgttcaatc tgagccagga tcaaactcta cagttcgatc t 1541
<210> 41
<211> 1502
<212> DNA
<213> Pelomonas
<220>
<221> misc_feature
<222> (192)..(193)
<223> n is a, g, c, or t
<220>
<221> misc_feature
<222> (832)..(833)
<223> n is a, g, c, or t
<400> 41
atcctggctc agattgaacg ctggcggcat gccttacaca tgcaagtcga acggtaacag 60
gttaagctga cgagtggcga acgggtgagt aatatatcgg aacgtgccca gtcgtggggg 120
ataactgctc gaaagagcag ctaataccgc atacgacctg agggtgaaag cgggggatcg 180
caagacctcg cnngattgga gcggccgata tcagattagg tagttggtgg ggtaaaggcc 240
caccaagcca acgatctgta gctggtctga gaggacgacc agccacactg ggactgagac 300
acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatttt ggacaatggg cgcaagcctg 360
atccagccat gccgcgtgcg ggaagaaggc cttcgggttg taaaccgctt ttgtcaggga 420
agaaaaggtt ctggttaata cctgggactc atgacggtac ctgaagaata agcaccggct 480
aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt agggtgcaag cgttaatcgg aattactggg 540
cgtaaagcgt gcgcaggcgg ttatgcaaga cagaggtgaa atccccgggc tcaacctggg 600
aactgccttt gtgactgcat agctagagta cggtagaggg ggatggaatt ccgcgtgtag 660
cagtgaaatg cgtagatatg cggaggaaca ccgatggcga aggcaatccc ctggacctgt 720
actgacgctc atgcacgaaa gcgtggggag caaacaggat tagataccct ggtagtccac 780
gccctaaacg atgtcaactg gttgttggga gggtttcttc tcagtaacgt anntaacgcg 840
tgaagttgac cgcctgggga gtacggccgc aaggttgaaa ctcaaaggaa ttgacgggga 900
cccgcacaag cggtggatga tgtggtttaa ttcgatgcaa cgcgaaaaac cttacctacc 960
cttgacatgc caggaatcct gaagagattt gggagtgctc gaaagagaac ctggacacag 1020
gtgctgcatg gccgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc 1080
gcaacccttg tcattagttg ctacgaaagg gcactctaat gagactgccg gtgacaaacc 1140
ggaggaaggt ggggatgacg tcaggtcatc atggccctta tgggtagggc tacacacgtc 1200
atacaatggc cgggacagag ggctgccaac ccgcgagggg gagctaatcc cagaaacccg 1260
gtcgtagtcc ggatcgtagt ctgcaactcg actgcgtgaa gtcggaatcg ctagtaatcg 1320
cggatcagct tgccgcggtg aatacgttcc cgggtcttgt acacaccgcc cgtcacacca 1380
tgggagcggg ttctgccaga agtagttagc ctaaccgcaa ggagggcgat taccacggca 1440
gggttcgtga ctggggtgaa gtcgtaacaa ggtagccgta tcggaaggtg cggctggatc 1500
ac 1502
<210> 42
<211> 34
<212> PRT
<213> Lactococcus lactis
<400> 42
Ile Thr Ser Ile Ser Leu Cys Thr Pro Gly Cys Lys Thr Gly Ala Leu
1 5 10 15
Met Gly Cys Asn Met Lys Thr Ala Thr Cys His Cys Ser Ile His Val
20 25 30
Ser Lys
<210> 43
<211> 22
<212> PRT
<213> Staphylococcus epidermis
<400> 43
Ile Ala Ser Lys Phe Ile Cys Thr Pro Gly Cys Ala Lys Thr Gly Ser
1 5 10 15
Phe Asn Ser Tyr Cys Cys
20
<210> 44
<211> 44
<212> PRT
<213> Pediococcus acidilactici
<400> 44
Lys Tyr Tyr Gly Asn Gly Val Thr Cys Gly Lys His Ser Cys Ser Val
1 5 10 15
Asp Trp Gly Lys Ala Thr Thr Cys Ile Ile Asn Asn Gly Ala Met Ala
20 25 30
Trp Ala Thr Gly Gly His Gln Gly Asn His Lys Cys
35 40
<210> 45
<211> 44
<212> PRT
<213> Enterococcus faecium
<400> 45
Ala Thr Arg Ser Tyr Gly Asn Gly Val Tyr Cys Asn Asn Ser Lys Cys
1 5 10 15
Trp Val Asn Trp Gly Glu Ala Lys Glu Asn Ile Ala Gly Ile Val Ile
20 25 30
Ser Gly Trp Ala Ser Gly Leu Ala Gly Met Gly His
35 40
<210> 46
<211> 39
<212> PRT
<213> Streptococcus lactis
<400> 46
Gly Thr Trp Asp Asp Ile Gly Gln Gly Ile Gly Arg Val Ala Tyr Trp
1 5 10 15
Val Gly Lys Ala Met Gly Asn Met Ser Asp Val Asn Gln Ala Ser Arg
20 25 30
Ile Asn Arg Lys Lys Lys His
35
<210> 47
<211> 48
<212> PRT
<213> Lactobacillus johnsonii
<400> 47
Asn Arg Trp Gly Asp Thr Val Leu Ser Ala Ala Ser Gly Ala Gly Thr
1 5 10 15
Gly Ile Lys Ala Cys Lys Ser Phe Gly Pro Trp Gly Met Ala Ile Cys
20 25 30
Gly Val Gly Gly Ala Ala Ile Gly Gly Tyr Phe Gly Tyr Thr His Asn
35 40 45
<210> 48
<211> 70
<212> PRT
<213> Enterococcus faecalis
<400> 48
Met Ala Lys Glu Phe Gly Ile Pro Ala Ala Val Ala Gly Thr Val Leu
1 5 10 15
Asn Val Val Glu Ala Gly Gly Trp Val Thr Thr Ile Val Ser Ile Leu
20 25 30
Thr Ala Val Gly Ser Gly Gly Leu Ser Leu Leu Ala Ala Ala Gly Arg
35 40 45
Glu Ser Ile Lys Ala Tyr Leu Lys Lys Glu Ile Lys Lys Lys Gly Lys
50 55 60
Arg Ala Val Ile Ala Trp
65 70
<210> 49
<211> 51
<212> PRT
<213> Staphylococcus aureus
<400> 49
Met Ser Trp Leu Asn Phe Leu Lys Tyr Ile Ala Lys Tyr Gly Lys Lys
1 5 10 15
Ala Val Ser Ala Ala Trp Lys Tyr Lys Gly Lys Val Leu Glu Trp Leu
20 25 30
Asn Val Gly Pro Thr Leu Glu Trp Val Trp Gln Lys Leu Lys Lys Ile
35 40 45
Ala Gly Leu
50
<210> 50
<211> 43
<212> PRT
<213> Lactococcus garvieae
<400> 50
Ile Gly Gly Ala Leu Gly Asn Ala Leu Asn Gly Leu Gly Thr Trp Ala
1 5 10 15
Asn Met Met Asn Gly Gly Gly Phe Val Asn Gln Trp Gln Val Tyr Ala
20 25 30
Asn Lys Gly Lys Ile Asn Gln Tyr Arg Pro Tyr
35 40
<210> 51
<211> 103
<212> PRT
<213> Escherichia coli
<400> 51
Met Arg Thr Leu Thr Leu Asn Glu Leu Asp Ser Val Ser Gly Gly Ala
1 5 10 15
Ser Gly Arg Asp Ile Ala Met Ala Ile Gly Thr Leu Ser Gly Gln Phe
20 25 30
Val Ala Gly Gly Ile Gly Ala Ala Ala Gly Gly Val Ala Gly Gly Ala
35 40 45
Ile Tyr Asp Tyr Ala Ser Thr His Lys Pro Asn Pro Ala Met Ser Pro
50 55 60
Ser Gly Leu Gly Gly Thr Ile Lys Gln Lys Pro Glu Gly Ile Pro Ser
65 70 75 80
Glu Ala Trp Asn Tyr Ala Ala Gly Arg Leu Cys Asn Trp Ser Pro Asn
85 90 95
Asn Leu Ser Asp Val Cys Leu
100
<210> 52
<211> 339
<212> PRT
<213> Cp1
<400> 52
Met Val Lys Lys Asn Asp Leu Phe Val Asp Val Ser Ser His Asn Gly
1 5 10 15
Tyr Asp Ile Thr Gly Ile Leu Glu Gln Met Gly Thr Thr Asn Thr Ile
20 25 30
Ile Lys Ile Ser Glu Ser Thr Thr Tyr Leu Asn Pro Cys Leu Ser Ala
35 40 45
Gln Val Glu Gln Ser Asn Pro Ile Gly Phe Tyr His Phe Ala Arg Phe
50 55 60
Gly Gly Asp Val Ala Glu Ala Glu Arg Glu Ala Gln Phe Phe Leu Asp
65 70 75 80
Asn Val Pro Met Gln Val Lys Tyr Leu Val Leu Asp Tyr Glu Asp Asp
85 90 95
Pro Ser Gly Asp Ala Gln Ala Asn Thr Asn Ala Cys Leu Arg Phe Met
100 105 110
Gln Met Ile Ala Asp Ala Gly Tyr Lys Pro Ile Tyr Tyr Ser Tyr Lys
115 120 125
Pro Phe Thr His Asp Asn Val Asp Tyr Gln Gln Ile Leu Ala Gln Phe
130 135 140
Pro Asn Ser Leu Trp Ile Ala Gly Tyr Gly Leu Asn Asp Gly Thr Ala
145 150 155 160
Asn Phe Glu Tyr Phe Pro Ser Met Asp Gly Ile Arg Trp Trp Gln Tyr
165 170 175
Ser Ser Asn Pro Phe Asp Lys Asn Ile Val Leu Leu Asp Asp Glu Glu
180 185 190
Asp Asp Lys Pro Lys Thr Ala Gly Thr Trp Lys Gln Asp Ser Lys Gly
195 200 205
Trp Trp Phe Arg Arg Asn Asn Gly Ser Phe Pro Tyr Asn Lys Trp Glu
210 215 220
Lys Ile Gly Gly Val Trp Tyr Tyr Phe Asp Ser Lys Gly Tyr Cys Leu
225 230 235 240
Thr Ser Glu Trp Leu Lys Asp Asn Glu Lys Trp Tyr Tyr Leu Lys Asp
245 250 255
Asn Gly Ala Met Ala Thr Gly Trp Val Leu Val Gly Ser Glu Trp Tyr
260 265 270
Tyr Met Asp Asp Ser Gly Ala Met Val Thr Gly Trp Val Lys Tyr Lys
275 280 285
Asn Asn Trp Tyr Tyr Met Thr Asn Glu Arg Gly Asn Met Val Ser Asn
290 295 300
Glu Phe Ile Lys Ser Gly Lys Gly Trp Tyr Phe Met Asn Thr Asn Gly
305 310 315 320
Glu Leu Ala Asp Asn Pro Ser Phe Thr Lys Glu Pro Asp Gly Leu Ile
325 330 335
Thr Val Ala
<210> 53
<211> 296
<212> PRT
<213> Dp-1
<400> 53
Met Gly Val Asp Ile Glu Lys Gly Val Ala Trp Met Gln Ala Arg Lys
1 5 10 15
Gly Arg Val Ser Tyr Ser Met Asp Phe Arg Asp Gly Pro Asp Ser Tyr
20 25 30
Asp Cys Ser Ser Ser Met Tyr Tyr Ala Leu Arg Ser Ala Gly Ala Ser
35 40 45
Ser Ala Gly Trp Ala Val Asn Thr Glu Tyr Met His Ala Trp Leu Ile
50 55 60
Glu Asn Gly Tyr Glu Leu Ile Ser Glu Asn Ala Pro Trp Asp Ala Lys
65 70 75 80
Arg Gly Asp Ile Phe Ile Trp Gly Arg Lys Gly Ala Ser Ala Gly Ala
85 90 95
Gly Gly His Thr Gly Met Phe Ile Asp Ser Asp Asn Ile Ile His Cys
100 105 110
Asn Tyr Ala Tyr Asp Gly Ile Ser Val Asn Asp His Asp Glu Arg Trp
115 120 125
Tyr Tyr Ala Gly Gln Pro Tyr Tyr Tyr Val Tyr Arg Leu Thr Asn Ala
130 135 140
Asn Ala Gln Pro Ala Glu Lys Lys Leu Gly Trp Gln Lys Asp Ala Thr
145 150 155 160
Gly Phe Trp Tyr Ala Arg Ala Asn Gly Thr Tyr Pro Lys Asp Glu Phe
165 170 175
Glu Tyr Ile Glu Glu Asn Lys Ser Trp Phe Tyr Phe Asp Asp Gln Gly
180 185 190
Tyr Met Leu Ala Glu Lys Trp Leu Lys His Thr Asp Gly Asn Trp Tyr
195 200 205
Trp Phe Asp Arg Asp Gly Tyr Met Ala Thr Ser Trp Lys Arg Ile Gly
210 215 220
Glu Ser Trp Tyr Tyr Phe Asn Arg Asp Gly Ser Met Val Thr Gly Trp
225 230 235 240
Ile Lys Tyr Tyr Asp Asn Trp Tyr Tyr Cys Asp Ala Thr Asn Gly Asp
245 250 255
Met Lys Ser Asn Ala Phe Ile Arg Tyr Asn Asp Gly Trp Tyr Leu Leu
260 265 270
Leu Pro Asp Gly Arg Leu Ala Asp Lys Pro Gln Phe Thr Val Glu Pro
275 280 285
Asp Gly Leu Ile Thr Ala Lys Val
290 295
<210> 54
<211> 233
<212> PRT
<213> gamma
<400> 54
Met Glu Ile Gln Lys Lys Leu Val Asp Pro Ser Lys Tyr Gly Thr Lys
1 5 10 15
Cys Pro Tyr Thr Met Lys Pro Lys Tyr Ile Thr Val His Asn Thr Tyr
20 25 30
Asn Asp Ala Pro Ala Glu Asn Glu Val Ser Tyr Met Ile Ser Asn Asn
35 40 45
Asn Glu Val Ser Phe His Ile Ala Val Asp Asp Lys Lys Ala Ile Gln
50 55 60
Gly Ile Pro Leu Glu Arg Asn Ala Trp Ala Cys Gly Asp Gly Asn Gly
65 70 75 80
Ser Gly Asn Arg Gln Ser Ile Ser Val Glu Ile Cys Tyr Ser Lys Ser
85 90 95
Gly Gly Asp Arg Tyr Tyr Lys Ala Glu Asp Asn Ala Val Asp Val Val
100 105 110
Arg Gln Leu Met Ser Met Tyr Asn Ile Pro Ile Glu Asn Val Arg Thr
115 120 125
His Gln Ser Trp Ser Gly Lys Tyr Cys Pro His Arg Met Leu Ala Glu
130 135 140
Gly Arg Trp Gly Ala Phe Ile Gln Lys Val Lys Asn Gly Asn Val Ala
145 150 155 160
Thr Thr Ser Pro Thr Lys Gln Asn Ile Ile Gln Ser Gly Ala Phe Ser
165 170 175
Pro Tyr Glu Thr Pro Asp Val Met Gly Ala Leu Thr Ser Leu Lys Met
180 185 190
Thr Ala Asp Phe Ile Leu Gln Ser Asp Gly Leu Thr Tyr Phe Ile Ser
195 200 205
Lys Pro Thr Ser Asp Ala Gln Leu Lys Ala Met Lys Glu Tyr Leu Asp
210 215 220
Arg Lys Gly Trp Trp Tyr Glu Val Lys
225 230
<210> 55
<211> 481
<212> PRT
<213> MR11
<400> 55
Met Gln Ala Lys Leu Thr Lys Lys Glu Phe Ile Glu Trp Leu Lys Thr
1 5 10 15
Ser Glu Gly Lys Gln Phe Asn Val Asp Leu Trp Tyr Gly Phe Gln Cys
20 25 30
Phe Asp Tyr Ala Asn Ala Gly Trp Lys Val Leu Phe Gly Leu Leu Leu
35 40 45
Lys Gly Leu Gly Ala Lys Asp Ile Pro Phe Ala Asn Asn Phe Asp Gly
50 55 60
Leu Ala Thr Val Tyr Gln Asn Thr Pro Asp Phe Leu Ala Gln Pro Gly
65 70 75 80
Asp Met Val Val Phe Gly Ser Asn Tyr Gly Ala Gly Tyr Gly His Val
85 90 95
Ala Trp Val Ile Glu Ala Thr Leu Asp Tyr Ile Ile Val Tyr Glu Gln
100 105 110
Asn Trp Leu Gly Gly Gly Trp Thr Asp Arg Ile Glu Gln Pro Gly Trp
115 120 125
Gly Trp Glu Lys Val Thr Arg Arg Gln His Ala Tyr Asp Phe Pro Met
130 135 140
Trp Phe Ile Arg Pro Asn Phe Lys Ser Glu Thr Ala Pro Arg Ser Ile
145 150 155 160
Gln Ser Pro Thr Gln Ala Ser Lys Lys Glu Thr Ala Lys Pro Gln Pro
165 170 175
Lys Ala Val Glu Leu Lys Ile Ile Lys Asp Val Val Lys Gly Tyr Asp
180 185 190
Leu Pro Lys Arg Gly Gly Asn Pro Lys Gly Ile Val Ile His Asn Asp
195 200 205
Ala Gly Ser Lys Gly Ala Thr Ala Glu Ala Tyr Arg Asn Gly Leu Val
210 215 220
Asn Ala Pro Leu Ser Arg Leu Glu Ala Gly Ile Ala His Ser Tyr Val
225 230 235 240
Ser Gly Asn Thr Val Trp Gln Ala Leu Asp Glu Ser Gln Val Gly Trp
245 250 255
His Thr Ala Asn Gln Leu Gly Asn Lys Tyr Tyr Tyr Gly Ile Glu Val
260 265 270
Cys Gln Ser Met Gly Ala Asp Asn Ala Thr Phe Leu Lys Asn Glu Gln
275 280 285
Ala Thr Phe Gln Glu Cys Ala Arg Leu Leu Lys Lys Trp Gly Leu Pro
290 295 300
Ala Asn Arg Asn Thr Ile Arg Leu His Asn Glu Phe Thr Ser Thr Ser
305 310 315 320
Cys Pro His Arg Ser Ser Val Leu His Thr Gly Phe Asp Pro Val Thr
325 330 335
Arg Gly Leu Leu Pro Glu Asp Lys Gln Leu Gln Leu Lys Asp Tyr Phe
340 345 350
Ile Lys Gln Ile Arg Val Tyr Met Asp Gly Lys Ile Pro Val Ala Thr
355 360 365
Val Ser Asn Glu Ser Ser Ala Ser Ser Asn Thr Val Lys Pro Val Ala
370 375 380
Ser Ala Trp Lys Arg Asn Lys Tyr Gly Thr Tyr Tyr Met Glu Glu Asn
385 390 395 400
Ala Arg Phe Thr Asn Gly Asn Gln Pro Ile Thr Val Arg Lys Ile Gly
405 410 415
Pro Phe Leu Ser Cys Pro Val Ala Tyr Gln Phe Gln Pro Gly Gly Tyr
420 425 430
Cys Asp Tyr Thr Glu Val Met Leu Gln Asp Gly His Val Trp Val Gly
435 440 445
Tyr Thr Trp Glu Gly Gln Arg Tyr Tyr Leu Pro Ile Arg Thr Trp Asn
450 455 460
Gly Ser Ala Pro Pro Asn Gln Ile Leu Gly Asp Leu Trp Gly Glu Ile
465 470 475 480
Ser
<210> 56
<211> 239
<212> PRT
<213> B30
<400> 56
Met Val Ile Asn Ile Glu Gln Ala Ile Ala Trp Met Ala Ser Arg Lys
1 5 10 15
Gly Lys Val Thr Tyr Ser Met Asp Tyr Arg Asn Gly Pro Ser Ser Tyr
20 25 30
Asp Cys Ser Ser Ser Val Tyr Phe Ala Leu Arg Ser Ala Gly Ala Ser
35 40 45
Asp Asn Gly Trp Ala Val Asn Thr Glu Tyr Glu His Asp Trp Leu Ile
50 55 60
Lys Asn Gly Tyr Val Leu Ile Ala Glu Asn Thr Asn Trp Asn Ala Gln
65 70 75 80
Arg Gly Asp Ile Phe Ile Trp Gly Lys Arg Gly Ala Ser Ala Gly Ala
85 90 95
Phe Gly His Thr Gly Met Phe Val Asp Pro Asp Asn Ile Ile His Cys
100 105 110
Asn Tyr Gly Tyr Asn Ser Ile Thr Val Asn Asn His Asp Glu Ile Trp
115 120 125
Gly Tyr Asn Gly Gln Pro Tyr Val Tyr Ala Tyr Arg Tyr Ser Gly Lys
130 135 140
Gln Ser Asn Ala Lys Val Asp Asn Lys Ser Val Val Ser Lys Phe Glu
145 150 155 160
Lys Glu Leu Asp Val Asn Thr Pro Leu Ser Asn Ser Asn Met Pro Tyr
165 170 175
Tyr Glu Ala Thr Ile Ser Glu Asp Tyr Tyr Val Glu Ser Lys Pro Asp
180 185 190
Val Asn Ser Thr Asp Lys Glu Leu Leu Val Ala Gly Thr Arg Val Arg
195 200 205
Val Tyr Glu Lys Val Lys Gly Trp Ala Arg Ile Gly Ala Pro Gln Ser
210 215 220
Asn Gln Trp Val Glu Asp Ala Tyr Leu Ile Asp Ala Thr Asp Met
225 230 235
<210> 57
<211> 495
<212> PRT
<213> K
<400> 57
Met Ala Lys Thr Gln Ala Glu Ile Asn Lys Arg Leu Asp Ala Tyr Ala
1 5 10 15
Lys Gly Thr Val Asp Ser Pro Tyr Arg Val Lys Lys Ala Thr Ser Tyr
20 25 30
Asp Pro Ser Phe Gly Val Met Glu Ala Gly Ala Ile Asp Ala Asp Gly
35 40 45
Tyr Tyr His Ala Gln Cys Gln Asp Leu Ile Thr Asp Tyr Val Leu Trp
50 55 60
Leu Thr Asp Asn Lys Val Arg Thr Trp Gly Asn Ala Lys Asp Gln Ile
65 70 75 80
Lys Gln Ser Tyr Gly Thr Gly Phe Lys Ile His Glu Asn Lys Pro Ser
85 90 95
Thr Val Pro Lys Lys Gly Trp Ile Ala Val Phe Thr Ser Gly Ser Tyr
100 105 110
Glu Gln Trp Gly His Ile Gly Ile Val Tyr Asp Gly Gly Asn Thr Ser
115 120 125
Thr Phe Thr Ile Leu Glu Gln Asn Trp Asn Gly Tyr Ala Asn Lys Lys
130 135 140
Pro Thr Lys Arg Val Asp Asn Tyr Tyr Gly Leu Thr His Phe Ile Glu
145 150 155 160
Ile Pro Val Lys Ala Gly Thr Thr Val Lys Lys Glu Thr Ala Lys Lys
165 170 175
Ser Ala Ser Lys Thr Pro Ala Pro Lys Lys Lys Ala Thr Leu Lys Val
180 185 190
Ser Lys Asn His Ile Asn Tyr Thr Met Asp Lys Arg Gly Lys Lys Pro
195 200 205
Glu Gly Met Val Ile His Asn Asp Ala Gly Arg Ser Ser Gly Gln Gln
210 215 220
Tyr Glu Asn Ser Leu Ala Asn Ala Gly Tyr Ala Arg Tyr Ala Asn Gly
225 230 235 240
Ile Ala His Tyr Tyr Gly Ser Glu Gly Tyr Val Trp Glu Ala Ile Asp
245 250 255
Ala Lys Asn Gln Ile Ala Trp His Thr Gly Asp Gly Thr Gly Ala Asn
260 265 270
Ser Gly Asn Phe Arg Phe Ala Gly Ile Glu Val Cys Gln Ser Met Ser
275 280 285
Ala Ser Asp Ala Gln Phe Leu Lys Asn Glu Gln Ala Val Phe Gln Phe
290 295 300
Thr Ala Glu Lys Phe Lys Glu Trp Gly Leu Thr Pro Asn Arg Lys Thr
305 310 315 320
Val Arg Leu His Met Glu Phe Val Pro Thr Ala Cys Pro His Arg Ser
325 330 335
Met Val Leu His Thr Gly Phe Asn Pro Val Thr Gln Gly Arg Pro Ser
340 345 350
Gln Ala Ile Met Asn Lys Leu Lys Asp Tyr Phe Ile Lys Gln Ile Lys
355 360 365
Asn Tyr Met Asp Lys Gly Thr Ser Ser Ser Thr Val Val Lys Asp Gly
370 375 380
Lys Thr Ser Ser Ala Ser Thr Pro Ala Thr Arg Pro Val Thr Gly Ser
385 390 395 400
Trp Lys Lys Asn Gln Tyr Gly Thr Trp Tyr Lys Pro Glu Asn Ala Thr
405 410 415
Phe Val Asn Gly Asn Gln Pro Ile Val Thr Arg Ile Gly Ser Pro Phe
420 425 430
Leu Asn Ala Pro Val Gly Gly Asn Leu Pro Ala Gly Ala Thr Ile Val
435 440 445
Tyr Asp Glu Val Cys Ile Gln Ala Gly His Ile Trp Ile Gly Tyr Asn
450 455 460
Ala Tyr Asn Gly Asn Arg Val Tyr Cys Pro Val Arg Thr Cys Gln Gly
465 470 475 480
Val Pro Pro Asn Gln Ile Pro Gly Val Ala Trp Gly Val Phe Lys
485 490 495
<210> 58
<211> 281
<212> PRT
<213> A118
<400> 58
Met Thr Ser Tyr Tyr Tyr Ser Arg Ser Leu Ala Asn Val Asn Lys Leu
1 5 10 15
Ala Asp Asn Thr Lys Ala Ala Ala Arg Lys Leu Leu Asp Trp Ser Glu
20 25 30
Ser Asn Gly Ile Glu Val Leu Ile Tyr Glu Thr Ile Arg Thr Lys Glu
35 40 45
Gln Gln Ala Ala Asn Val Asn Ser Gly Ala Ser Gln Thr Met Arg Ser
50 55 60
Tyr His Leu Val Gly Gln Ala Leu Asp Phe Val Met Ala Lys Gly Lys
65 70 75 80
Thr Val Asp Trp Gly Ala Tyr Arg Ser Asp Lys Gly Lys Lys Phe Val
85 90 95
Ala Lys Ala Lys Ser Leu Gly Phe Glu Trp Gly Gly Asp Trp Ser Gly
100 105 110
Phe Val Asp Asn Pro His Leu Gln Phe Asn Tyr Lys Gly Tyr Gly Thr
115 120 125
Asp Thr Phe Gly Lys Gly Ala Ser Thr Ser Asn Ser Ser Lys Pro Ser
130 135 140
Ala Asp Thr Asn Thr Asn Ser Leu Gly Leu Val Asp Tyr Met Asn Leu
145 150 155 160
Asn Lys Leu Asp Ser Ser Phe Ala Asn Arg Lys Lys Leu Ala Thr Ser
165 170 175
Tyr Gly Ile Lys Asn Tyr Ser Gly Thr Ala Thr Gln Asn Thr Thr Leu
180 185 190
Leu Ala Lys Leu Lys Ala Gly Lys Pro His Thr Pro Ala Ser Lys Asn
195 200 205
Thr Tyr Tyr Thr Glu Asn Pro Arg Lys Val Lys Thr Leu Val Gln Cys
210 215 220
Asp Leu Tyr Lys Ser Val Asp Phe Thr Thr Lys Asn Gln Thr Gly Gly
225 230 235 240
Thr Phe Pro Pro Gly Thr Val Phe Thr Ile Ser Gly Met Gly Lys Thr
245 250 255
Lys Gly Gly Thr Pro Arg Leu Lys Thr Lys Ser Gly Tyr Tyr Leu Thr
260 265 270
Ala Asn Thr Lys Phe Val Lys Lys Ile
275 280
<210> 59
<211> 341
<212> PRT
<213> A511
<400> 59
Met Val Lys Tyr Thr Val Glu Asn Lys Ile Ile Ala Gly Leu Pro Lys
1 5 10 15
Gly Lys Leu Lys Gly Ala Asn Phe Val Ile Ala His Glu Thr Ala Asn
20 25 30
Ser Lys Ser Thr Ile Asp Asn Glu Val Ser Tyr Met Thr Arg Asn Trp
35 40 45
Lys Asn Ala Phe Val Thr His Phe Val Gly Gly Gly Gly Arg Val Val
50 55 60
Gln Val Ala Asn Val Asn Tyr Val Ser Trp Gly Ala Gly Gln Tyr Ala
65 70 75 80
Asn Ser Tyr Ser Tyr Ala Gln Val Glu Leu Cys Arg Thr Ser Asn Ala
85 90 95
Thr Thr Phe Lys Lys Asp Tyr Glu Val Tyr Cys Gln Leu Leu Val Asp
100 105 110
Leu Ala Lys Lys Ala Gly Ile Pro Ile Thr Leu Asp Ser Gly Ser Lys
115 120 125
Thr Ser Asp Lys Gly Ile Lys Ser His Lys Trp Val Ala Asp Lys Leu
130 135 140
Gly Gly Thr Thr His Gln Asp Pro Tyr Ala Tyr Leu Ser Ser Trp Gly
145 150 155 160
Ile Ser Lys Ala Gln Phe Ala Ser Asp Leu Ala Lys Val Ser Gly Gly
165 170 175
Gly Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ala Lys Pro Ser Thr Pro Ala Pro Lys
180 185 190
Pro Ser Thr Pro Ser Thr Asn Leu Asp Lys Leu Gly Leu Val Asp Tyr
195 200 205
Met Asn Ala Lys Lys Met Asp Ser Ser Tyr Ser Asn Arg Asp Lys Leu
210 215 220
Ala Lys Gln Tyr Gly Ile Ala Asn Tyr Ser Gly Thr Ala Ser Gln Asn
225 230 235 240
Thr Thr Leu Leu Ser Lys Ile Lys Gly Gly Ala Pro Lys Pro Ser Thr
245 250 255
Pro Ala Pro Lys Pro Ser Thr Ser Thr Ala Lys Lys Ile Tyr Phe Pro
260 265 270
Pro Asn Lys Gly Asn Trp Ser Val Tyr Pro Thr Asn Lys Ala Pro Val
275 280 285
Lys Ala Asn Ala Ile Gly Ala Ile Asn Pro Thr Lys Phe Gly Gly Leu
290 295 300
Thr Tyr Thr Ile Gln Lys Asp Arg Gly Asn Gly Val Tyr Glu Ile Gln
305 310 315 320
Thr Asp Gln Phe Gly Arg Val Gln Val Tyr Gly Ala Pro Ser Thr Gly
325 330 335
Ala Val Ile Lys Lys
340
<210> 60
<211> 289
<212> PRT
<213> A500
<400> 60
Met Ala Leu Thr Glu Ala Trp Leu Ile Glu Lys Ala Asn Arg Lys Leu
1 5 10 15
Asn Ala Gly Gly Met Tyr Lys Ile Thr Ser Asp Lys Thr Arg Asn Val
20 25 30
Ile Lys Lys Met Ala Lys Glu Gly Ile Tyr Leu Cys Val Ala Gln Gly
35 40 45
Tyr Arg Ser Thr Ala Glu Gln Asn Ala Leu Tyr Ala Gln Gly Arg Thr
50 55 60
Lys Pro Gly Ala Ile Val Thr Asn Ala Lys Gly Gly Gln Ser Asn His
65 70 75 80
Asn Tyr Gly Val Ala Val Asp Leu Cys Leu Tyr Thr Asn Asp Gly Lys
85 90 95
Asp Val Ile Trp Glu Ser Thr Thr Ser Arg Trp Lys Lys Val Val Ala
100 105 110
Ala Met Lys Ala Glu Gly Phe Lys Trp Gly Gly Asp Trp Lys Ser Phe
115 120 125
Lys Asp Tyr Pro His Phe Glu Leu Cys Asp Ala Val Ser Gly Glu Lys
130 135 140
Ile Pro Ala Ala Thr Gln Asn Thr Asn Thr Asn Ser Asn Arg Tyr Glu
145 150 155 160
Gly Lys Val Ile Asp Ser Ala Pro Leu Leu Pro Lys Met Asp Phe Lys
165 170 175
Ser Ser Pro Phe Arg Met Tyr Lys Val Gly Thr Glu Phe Leu Val Tyr
180 185 190
Asp His Asn Gln Tyr Trp Tyr Lys Thr Tyr Ile Asp Asp Lys Leu Tyr
195 200 205
Tyr Met Tyr Lys Ser Phe Cys Asp Val Val Ala Lys Lys Asp Ala Lys
210 215 220
Gly Arg Ile Lys Val Arg Ile Lys Ser Ala Lys Asp Leu Arg Ile Pro
225 230 235 240
Val Trp Asn Asn Ile Lys Leu Asn Ser Gly Lys Ile Lys Trp Tyr Ala
245 250 255
Pro Asn Val Lys Leu Ala Trp Tyr Asn Tyr Arg Arg Gly Tyr Leu Glu
260 265 270
Leu Trp Tyr Pro Asn Asp Gly Trp Tyr Tyr Thr Ala Glu Tyr Phe Leu
275 280 285
Lys
<210> 61
<211> 239
<212> PRT
<213> LambdaSa1 prophage
<400> 61
Met Val Ile Asn Ile Glu Gln Ala Ile Ala Trp Met Ala Ser Arg Lys
1 5 10 15
Gly Lys Val Thr Tyr Ser Met Asp Tyr Arg Asn Gly Pro Ser Ser Tyr
20 25 30
Asp Cys Ser Ser Ser Val Tyr Phe Ala Leu Arg Ser Ala Gly Ala Ser
35 40 45
Asp Asn Gly Trp Ala Val Asn Thr Glu Tyr Glu His Asp Trp Leu Ile
50 55 60
Lys Asn Gly Tyr Val Leu Ile Ala Glu Asn Thr Asn Trp Asn Ala Gln
65 70 75 80
Arg Gly Asp Ile Phe Ile Trp Gly Lys Arg Gly Ala Ser Ala Gly Ala
85 90 95
Phe Gly His Thr Gly Met Phe Val Asp Pro Asp Asn Ile Ile His Cys
100 105 110
Asn Tyr Gly Tyr Asn Ser Ile Thr Val Asn Asn His Asp Glu Ile Trp
115 120 125
Gly Tyr Asn Gly Gln Pro Tyr Val Tyr Ala Tyr Arg Tyr Ala Arg Lys
130 135 140
Gln Ser Asn Ala Lys Val Asp Asn Gln Ser Val Val Ser Lys Phe Glu
145 150 155 160
Lys Glu Leu Asp Val Asn Thr Pro Leu Ser Asn Ser Asn Met Pro Tyr
165 170 175
Tyr Glu Ala Thr Ile Ser Glu Asp Tyr Tyr Val Glu Ser Lys Pro Asp
180 185 190
Val Asn Ser Thr Asp Lys Glu Leu Leu Val Ala Gly Thr Arg Val Arg
195 200 205
Val Tyr Glu Lys Val Lys Gly Trp Ala Arg Ile Gly Ala Pro Gln Ser
210 215 220
Asn Gln Trp Val Glu Asp Ala Tyr Leu Ile Asp Ala Thr Asp Met
225 230 235
<210> 62
<211> 468
<212> PRT
<213> LambdaSa2 prophage
<400> 62
Met Glu Ile Asn Thr Glu Ile Ala Ile Ala Trp Met Ser Ala Arg Gln
1 5 10 15
Gly Lys Val Ser Tyr Ser Met Asp Tyr Arg Asp Gly Pro Asn Ser Tyr
20 25 30
Asp Cys Ser Ser Ser Val Tyr Tyr Ala Leu Arg Ser Ala Gly Ala Ser
35 40 45
Ser Ala Gly Trp Ala Val Asn Thr Glu Tyr Met His Asp Trp Leu Ile
50 55 60
Lys Asn Gly Tyr Glu Leu Ile Ala Glu Asn Val Asp Trp Asn Ala Val
65 70 75 80
Arg Gly Asp Ile Ala Ile Trp Gly Met Arg Gly His Ser Ser Gly Ala
85 90 95
Gly Gly His Val Val Met Phe Ile Asp Pro Glu Asn Ile Ile His Cys
100 105 110
Asn Trp Ala Asn Asn Gly Ile Thr Val Asn Asn Tyr Asn Gln Thr Ala
115 120 125
Ala Ala Ser Gly Trp Met Tyr Cys Tyr Val Tyr Arg Leu Lys Ser Gly
130 135 140
Ala Ser Thr Gln Gly Lys Ser Leu Asp Thr Leu Val Lys Glu Thr Leu
145 150 155 160
Ala Gly Asn Tyr Gly Asn Gly Glu Ala Arg Lys Ala Val Leu Gly Asn
165 170 175
Gln Tyr Glu Ala Val Met Ser Val Ile Asn Gly Lys Thr Thr Thr Asn
180 185 190
Gln Lys Thr Val Asp Gln Leu Val Gln Glu Val Ile Ala Gly Lys His
195 200 205
Gly Asn Gly Glu Ala Arg Lys Lys Ser Leu Gly Ser Gln Tyr Asp Ala
210 215 220
Val Gln Lys Arg Val Thr Glu Leu Leu Lys Lys Gln Pro Ser Glu Pro
225 230 235 240
Phe Lys Ala Gln Glu Val Asn Lys Pro Thr Glu Thr Lys Thr Ser Gln
245 250 255
Thr Glu Leu Thr Gly Gln Ala Thr Ala Thr Lys Glu Glu Gly Asp Leu
260 265 270
Ser Phe Asn Gly Thr Ile Leu Lys Lys Ala Val Leu Asp Lys Ile Leu
275 280 285
Gly Asn Cys Lys Lys His Asp Ile Leu Pro Ser Tyr Ala Leu Thr Ile
290 295 300
Leu His Tyr Glu Gly Leu Trp Gly Thr Ser Ala Val Gly Lys Ala Asp
305 310 315 320
Asn Asn Trp Gly Gly Met Thr Trp Thr Gly Gln Gly Asn Arg Pro Ser
325 330 335
Gly Val Thr Val Thr Gln Gly Ser Ala Arg Pro Ser Asn Glu Gly Gly
340 345 350
His Tyr Met His Tyr Ala Ser Val Asp Asp Phe Leu Thr Asp Trp Phe
355 360 365
Tyr Leu Leu Arg Ala Gly Gly Ser Tyr Lys Val Ser Gly Ala Lys Thr
370 375 380
Phe Ser Glu Ala Ile Lys Gly Met Phe Lys Val Gly Gly Ala Val Tyr
385 390 395 400
Asp Tyr Ala Ala Ser Gly Phe Asp Ser Tyr Ile Val Gly Ala Ser Ser
405 410 415
Arg Leu Lys Ala Ile Glu Ala Glu Asn Gly Ser Leu Asp Lys Phe Asp
420 425 430
Lys Ala Thr Asp Ile Gly Asp Gly Ser Lys Asp Lys Ile Asp Ile Thr
435 440 445
Ile Glu Gly Ile Glu Val Thr Ile Asn Gly Ile Thr Tyr Glu Leu Thr
450 455 460
Lys Lys Pro Val
465
<210> 63
<211> 236
<212> PRT
<213> (ATCC700407) prophage
<400> 63
Met Thr Asp Ser Ile Gln Glu Met Arg Lys Leu Gln Ser Ile Pro Val
1 5 10 15
Arg Tyr Asp Met Gly Asp Arg Tyr Gly Asn Asp Ala Asp Arg Asp Gly
20 25 30
Arg Ile Glu Met Asp Cys Ser Ser Ala Val Ser Lys Ala Leu Gly Ile
35 40 45
Ser Met Thr Asn Asn Thr Glu Thr Leu Gln Gln Ala Leu Pro Ala Ile
50 55 60
Gly Tyr Gly Lys Ile His Asp Ala Val Asp Gly Thr Phe Asp Met Gln
65 70 75 80
Ala Tyr Asp Val Ile Ile Trp Ala Pro Arg Asp Gly Ser Ser Ser Leu
85 90 95
Gly Ala Phe Gly His Val Leu Ile Ala Thr Ser Pro Thr Thr Ala Ile
100 105 110
His Cys Asn Tyr Gly Ser Asp Gly Ile Thr Glu Asn Asp Tyr Asn Tyr
115 120 125
Ile Trp Glu Ile Asn Gly Arg Pro Arg Glu Ile Val Phe Arg Lys Gly
130 135 140
Val Thr Gln Thr Gln Ala Thr Val Thr Ser Gln Phe Glu Arg Glu Leu
145 150 155 160
Asp Val Asn Ala Arg Leu Thr Val Ser Asp Lys Pro Tyr Tyr Glu Ala
165 170 175
Thr Leu Ser Glu Asp Tyr Tyr Val Glu Ala Gly Pro Arg Ile Asp Ser
180 185 190
Gln Asp Lys Glu Leu Ile Lys Ala Gly Thr Arg Val Arg Val Tyr Glu
195 200 205
Lys Leu Asn Gly Trp Ser Arg Ile Asn His Pro Glu Ser Ala Gln Trp
210 215 220
Val Glu Asp Ser Tyr Leu Val Asp Ala Thr Glu Met
225 230 235
<210> 64
<211> 481
<212> PRT
<213> Phi11 and Phi12
<400> 64
Met Gln Ala Lys Leu Thr Lys Asn Glu Phe Ile Glu Trp Leu Lys Thr
1 5 10 15
Ser Glu Gly Lys Gln Phe Asn Val Asp Leu Trp Tyr Gly Phe Gln Cys
20 25 30
Phe Asp Tyr Ala Asn Ala Gly Trp Lys Val Leu Phe Gly Leu Leu Leu
35 40 45
Lys Gly Leu Gly Ala Lys Asp Ile Pro Phe Ala Asn Asn Phe Asp Gly
50 55 60
Leu Ala Thr Val Tyr Gln Asn Thr Pro Asp Phe Leu Ala Gln Pro Gly
65 70 75 80
Asp Met Val Val Phe Gly Ser Asn Tyr Gly Ala Gly Tyr Gly His Val
85 90 95
Ala Trp Val Ile Glu Ala Thr Leu Asp Tyr Ile Ile Val Tyr Glu Gln
100 105 110
Asn Trp Leu Gly Gly Gly Trp Thr Asp Gly Ile Glu Gln Pro Gly Trp
115 120 125
Gly Trp Glu Lys Val Thr Arg Arg Gln His Ala Tyr Asp Phe Pro Met
130 135 140
Trp Phe Ile Arg Pro Asn Phe Lys Ser Glu Thr Ala Pro Arg Ser Val
145 150 155 160
Gln Ser Pro Thr Gln Ala Pro Lys Lys Glu Thr Ala Lys Pro Gln Pro
165 170 175
Lys Ala Val Glu Leu Lys Ile Ile Lys Asp Val Val Lys Gly Tyr Asp
180 185 190
Leu Pro Lys Arg Gly Ser Asn Pro Lys Gly Ile Val Ile His Asn Asp
195 200 205
Ala Gly Ser Lys Gly Ala Thr Ala Glu Ala Tyr Arg Asn Gly Leu Val
210 215 220
Asn Ala Pro Leu Ser Arg Leu Glu Ala Gly Ile Ala His Ser Tyr Val
225 230 235 240
Ser Gly Asn Thr Val Trp Gln Ala Leu Asp Glu Ser Gln Val Gly Trp
245 250 255
His Thr Ala Asn Gln Ile Gly Asn Lys Tyr Tyr Tyr Gly Ile Glu Val
260 265 270
Cys Gln Ser Met Gly Ala Asp Asn Ala Thr Phe Leu Lys Asn Glu Gln
275 280 285
Ala Thr Phe Gln Glu Cys Ala Arg Leu Leu Lys Lys Trp Gly Leu Pro
290 295 300
Ala Asn Arg Asn Thr Ile Arg Leu His Asn Glu Phe Thr Ser Thr Ser
305 310 315 320
Cys Pro His Arg Ser Ser Val Leu His Thr Gly Phe Asp Pro Val Thr
325 330 335
Arg Gly Leu Leu Pro Glu Asp Lys Arg Leu Gln Leu Lys Asp Tyr Phe
340 345 350
Ile Lys Gln Ile Arg Ala Tyr Met Asp Gly Lys Ile Pro Val Ala Thr
355 360 365
Val Ser Asn Glu Ser Ser Ala Ser Ser Asn Thr Val Lys Pro Val Ala
370 375 380
Ser Ala Trp Lys Arg Asn Lys Tyr Gly Thr Tyr Tyr Met Glu Glu Ser
385 390 395 400
Ala Arg Phe Thr Asn Gly Asn Gln Pro Ile Thr Val Arg Lys Val Gly
405 410 415
Pro Phe Leu Ser Cys Pro Val Gly Tyr Gln Phe Gln Pro Gly Gly Tyr
420 425 430
Cys Asp Tyr Thr Glu Val Met Leu Gln Asp Gly His Val Trp Val Gly
435 440 445
Tyr Thr Trp Glu Gly Gln Arg Tyr Tyr Leu Pro Ile Arg Thr Trp Asn
450 455 460
Gly Ser Ala Pro Pro Asn Gln Ile Leu Gly Asp Leu Trp Gly Glu Ile
465 470 475 480
Ser
<210> 65
<211> 481
<212> PRT
<213> (Phi)H5
<400> 65
Met Gln Ala Lys Leu Thr Lys Lys Glu Phe Ile Glu Trp Leu Lys Thr
1 5 10 15
Ser Glu Gly Lys Gln Tyr Asn Ala Asp Gly Trp Tyr Gly Phe Gln Cys
20 25 30
Phe Asp Tyr Ala Asn Ala Gly Trp Lys Ala Leu Phe Gly Leu Leu Leu
35 40 45
Lys Gly Val Gly Ala Lys Asp Ile Pro Phe Ala Asn Asn Phe Asp Gly
50 55 60
Leu Ala Thr Val Tyr Gln Asn Thr Pro Asp Phe Leu Ala Gln Pro Gly
65 70 75 80
Asp Met Val Val Phe Gly Ser Asn Tyr Gly Ala Gly Tyr Gly His Val
85 90 95
Ala Trp Val Ile Glu Ala Thr Leu Asp Tyr Ile Ile Val Tyr Glu Gln
100 105 110
Asn Trp Leu Gly Gly Gly Trp Thr Asp Gly Val Gln Gln Pro Gly Ser
115 120 125
Gly Trp Glu Lys Val Thr Arg Arg Gln His Ala Tyr Asp Phe Pro Met
130 135 140
Trp Phe Ile Arg Pro Asn Phe Lys Ser Glu Thr Ala Pro Arg Ser Val
145 150 155 160
Gln Ser Pro Thr Gln Ala Ser Lys Lys Glu Thr Ala Lys Pro Gln Pro
165 170 175
Lys Ala Val Glu Leu Lys Ile Ile Lys Asp Val Val Lys Gly Tyr Asp
180 185 190
Leu Pro Lys Arg Gly Ser Asn Pro Asn Phe Ile Val Ile His Asn Asp
195 200 205
Ala Gly Ser Lys Gly Ala Thr Ala Glu Ala Tyr Arg Asn Gly Leu Val
210 215 220
Asn Ala Pro Leu Ser Arg Leu Glu Ala Gly Ile Ala His Ser Tyr Val
225 230 235 240
Ser Gly Asn Thr Val Trp Gln Ala Leu Asp Glu Ser Gln Val Gly Trp
245 250 255
His Thr Ala Asn Gln Ile Gly Asn Lys Tyr Gly Tyr Gly Ile Glu Val
260 265 270
Cys Gln Ser Met Gly Ala Asp Asn Ala Thr Phe Leu Lys Asn Glu Gln
275 280 285
Ala Thr Phe Gln Glu Cys Ala Arg Leu Leu Lys Lys Trp Gly Leu Pro
290 295 300
Ala Asn Arg Asn Thr Ile Arg Leu His Asn Glu Phe Thr Ser Thr Ser
305 310 315 320
Cys Pro His Arg Ser Ser Val Leu His Thr Gly Phe Asp Pro Val Thr
325 330 335
Arg Gly Leu Leu Pro Glu Asp Lys Arg Leu Gln Leu Lys Asp Tyr Phe
340 345 350
Ile Lys Gln Ile Arg Ala Tyr Met Asp Gly Lys Ile Pro Val Ala Thr
355 360 365
Val Ser Asn Asp Ser Ser Ala Ser Ser Asn Thr Val Lys Pro Val Ala
370 375 380
Ser Ala Trp Lys Arg Asn Lys Tyr Gly Thr Tyr Tyr Met Glu Glu Ser
385 390 395 400
Ala Arg Phe Thr Asn Gly Asn Gln Pro Ile Thr Val Arg Lys Val Gly
405 410 415
Pro Phe Leu Ser Cys Pro Val Gly Tyr Gln Phe Gln Pro Gly Gly Tyr
420 425 430
Cys Asp Tyr Thr Glu Val Met Leu Gln Asp Gly His Val Trp Val Gly
435 440 445
Tyr Thr Trp Glu Gly Gln Arg Tyr Tyr Leu Pro Ile Arg Thr Trp Asn
450 455 460
Gly Ser Ala Pro Pro Asn Gln Ile Leu Gly Asp Leu Trp Gly Glu Ile
465 470 475 480
Ser
<210> 66
<211> 477
<212> PRT
<213> (Phi)WMY
<400> 66
Met Lys Thr Lys Ala Gln Ala Lys Ser Trp Ile Asn Ser Lys Ile Gly
1 5 10 15
Lys Gly Ile Asp Trp Asp Gly Met Tyr Gly Tyr Gln Cys Met Asp Glu
20 25 30
Ala Val Asp Tyr Ile His His Val Thr Asp Gly Lys Val Thr Met Trp
35 40 45
Gly Asn Ala Ile Asp Ala Pro Lys Asn Asn Phe Gln Gly Leu Cys Thr
50 55 60
Val Tyr Thr Asn Thr Pro Glu Phe Arg Pro Ala Tyr Gly Asp Val Ile
65 70 75 80
Val Trp Ser Tyr Gly Thr Phe Ala Thr Tyr Gly His Ile Ala Ile Val
85 90 95
Val Asn Pro Asp Pro Tyr Gly Asp Leu Gln Tyr Ile Thr Val Leu Glu
100 105 110
Gln Asn Trp Asn Gly Asn Gly Ile Tyr Lys Thr Glu Phe Ala Thr Ile
115 120 125
Arg Thr His Asp Tyr Thr Gly Val Ser His Phe Ile Arg Pro Lys Phe
130 135 140
Ala Asp Glu Val Lys Glu Thr Ala Lys Thr Val Asn Lys Leu Ser Val
145 150 155 160
Gln Lys Lys Ile Val Thr Pro Lys Asn Ser Val Glu Arg Ile Lys Asn
165 170 175
Tyr Val Lys Thr Ser Gly Tyr Ile Asn Gly Glu His Tyr Glu Leu Tyr
180 185 190
Asn Arg Gly His Lys Pro Lys Gly Val Val Ile His Asn Thr Ala Gly
195 200 205
Thr Ala Ser Ala Thr Gln Glu Gly Gln Arg Leu Thr Asn Met Thr Phe
210 215 220
Gln Gln Leu Ala Asn Gly Val Ala His Val Tyr Ile Asp Lys Asn Thr
225 230 235 240
Ile Tyr Glu Thr Leu Pro Glu Asp Arg Ile Ala Trp His Val Ala Gln
245 250 255
Gln Tyr Gly Asn Thr Glu Phe Tyr Gly Ile Glu Val Cys Gly Ser Arg
260 265 270
Asn Thr Asp Lys Glu Gln Phe Leu Ala Asn Glu Gln Val Ala Phe Gln
275 280 285
Glu Ala Ala Arg Arg Leu Lys Ser Trp Gly Met Arg Ala Asn Arg Asn
290 295 300
Thr Val Arg Leu His His Thr Phe Ser Ser Thr Glu Cys Pro Asp Met
305 310 315 320
Ser Met Leu Leu His Thr Gly Tyr Ser Met Lys Asn Gly Lys Pro Thr
325 330 335
Gln Asp Ile Thr Asn Lys Cys Ala Asp Tyr Phe Met Lys Gln Ile Asn
340 345 350
Ala Tyr Ile Asp Gly Lys Gln Pro Thr Ser Thr Val Val Gly Ser Ser
355 360 365
Ser Ser Asn Lys Leu Lys Ala Lys Asn Lys Asp Lys Ser Thr Gly Trp
370 375 380
Asn Thr Asn Glu Tyr Gly Thr Leu Trp Lys Lys Glu His Ala Thr Phe
385 390 395 400
Thr Cys Gly Val Arg Gln Gly Ile Val Thr Arg Thr Thr Gly Pro Phe
405 410 415
Thr Ser Cys Pro Gln Ala Gly Val Leu Tyr Tyr Gly Gln Ser Val Asn
420 425 430
Tyr Asp Thr Val Cys Lys Gln Asp Gly Tyr Val Trp Ile Ser Trp Thr
435 440 445
Thr Ser Asp Gly Tyr Asp Val Trp Met Pro Ile Arg Thr Trp Asp Arg
450 455 460
Ser Thr Asp Lys Val Ser Glu Ile Trp Gly Thr Ile Ser
465 470 475
<210> 67
<211> 443
<212> PRT
<213> (Phi)NCTC 11261
<400> 67
Met Ala Thr Tyr Gln Glu Tyr Lys Ser Arg Ser Asn Gly Asn Ala Tyr
1 5 10 15
Asp Ile Asp Gly Ser Phe Gly Ala Gln Cys Trp Asp Gly Tyr Ala Asp
20 25 30
Tyr Cys Lys Tyr Leu Gly Leu Pro Tyr Ala Asn Cys Thr Asn Thr Gly
35 40 45
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50 55 60
Tyr Phe Asp Glu Val Glu Val Met Gln Ala Gly Asp Val Ala Ile Phe
65 70 75 80
Met Val Val Asp Gly Val Thr Pro Tyr Ser His Val Ala Ile Phe Asp
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Ser Asp Ala Gly Gly Gly Tyr Gly Trp Phe Leu Gly Gln Asn Gln Gly
100 105 110
Gly Ala Asn Gly Ala Tyr Asn Ile Val Lys Ile Pro Tyr Ser Ala Thr
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Tyr Pro Thr Ala Phe Arg Pro Lys Val Phe Lys Asn Ala Val Thr Val
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Thr Gly Asn Ile Gly Leu Asn Lys Gly Asp Tyr Phe Ile Asp Val Ser
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165 170 175
Thr Lys Thr Ile Ile Lys Val Ser Glu Ser Ile Ala Trp Leu Ser Asp
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Phe Gly Arg Phe Gly Gly Asp Ser Ala Leu Ala Gln Arg Glu Ala Asp
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Leu Phe Leu Ser Asn Leu Pro Ser Lys Lys Val Ser Tyr Leu Val Ile
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Asp Tyr Glu Asp Ser Ala Ser Ala Asp Lys Gln Ala Asn Thr Asn Ala
245 250 255
Val Ile Ala Phe Met Asp Lys Ile Ala Ser Ala Gly Tyr Lys Pro Ile
260 265 270
Tyr Tyr Ser Tyr Lys Pro Phe Thr Leu Asn Asn Ile Asp Tyr Gln Lys
275 280 285
Ile Ile Ala Lys Tyr Pro Asn Ser Ile Trp Ile Ala Gly Tyr Pro Asp
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50 55 60
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65 70 75 80
Asn Ser Tyr Ser Tyr Ala Gln Val Glu Leu Cys Arg Thr Ser Asn Ala
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100 105 110
Leu Ala Lys Lys Ala Gly Ile Pro Ile Thr Leu Asp Ser Gly Ser Lys
115 120 125
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195 200 205
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85 90 95
Cys Thr Gly Asp Ile Thr Asp Ala Cys Leu Ala Phe Leu Asn Ile Val
100 105 110
Ala Lys Lys Phe Lys Cys Val Val Tyr Cys Asn Ser Ser Phe Ile Lys
115 120 125
Glu His Leu Asn Ser Lys Ile Cys Ala Tyr Pro Leu Trp Ile Ala Asn
130 135 140
Tyr Gly Val Ala Thr Pro Ala Phe Thr Leu Trp Thr Lys Tyr Ala Met
145 150 155 160
Trp Gln Phe Thr Glu Lys Gly Gln Val Ser Gly Ile Ser Gly Tyr Ile
165 170 175
Asp Phe Ser Tyr Ile Thr Asp Glu Phe Ile Lys Tyr Ile Lys Gly Glu
180 185 190
Asp Glu Val Glu Asn Leu Val Val Tyr Asn Asp Gly Ala Asp Gln Arg
195 200 205
Ala Ala Glu Tyr Leu Ala Asp Arg Leu Ala Cys Pro Thr Ile Asn Asn
210 215 220
Ala Arg Lys Phe Asp Tyr Ser Asn Val Lys Asn Val Tyr Ala Val Gly
225 230 235 240
Gly Asn Lys Glu Gln Tyr Thr Ser Tyr Leu Thr Thr Leu Ile Ala Gly
245 250 255
Ser Thr Arg Tyr Thr Thr Met Gln Ala Val Leu Asp Tyr Ile Lys Asn
260 265 270
Leu Lys
<210> 77
<211> 628
<212> PRT
<213> Staphylococcus virus 187
<400> 77
Met Ala Leu Pro Lys Thr Gly Lys Pro Thr Ala Lys Gln Val Val Asp
1 5 10 15
Trp Ala Ile Asn Leu Ile Gly Ser Gly Val Asp Val Asp Gly Tyr Tyr
20 25 30
Gly Arg Gln Cys Trp Asp Leu Pro Asn Tyr Ile Phe Asn Arg Tyr Trp
35 40 45
Asn Phe Lys Thr Pro Gly Asn Ala Arg Asp Met Ala Trp Tyr Arg Tyr
50 55 60
Pro Glu Gly Phe Lys Val Phe Arg Asn Thr Ser Asp Phe Val Pro Lys
65 70 75 80
Pro Gly Asp Ile Ala Val Trp Thr Gly Gly Asn Tyr Asn Trp Asn Thr
85 90 95
Trp Gly His Thr Gly Ile Val Val Gly Pro Ser Thr Lys Ser Tyr Phe
100 105 110
Tyr Ser Val Asp Gln Asn Trp Asn Asn Ser Asn Ser Tyr Val Gly Ser
115 120 125
Pro Ala Ala Lys Ile Lys His Ser Tyr Phe Gly Val Thr His Phe Val
130 135 140
Arg Pro Ala Tyr Lys Ala Glu Pro Lys Pro Thr Pro Pro Ala Gln Asn
145 150 155 160
Asn Pro Ala Pro Lys Asp Pro Glu Pro Ser Lys Lys Pro Glu Ser Asn
165 170 175
Lys Pro Ile Tyr Lys Val Val Thr Lys Ile Leu Phe Thr Thr Ala His
180 185 190
Ile Glu His Val Lys Ala Asn Arg Phe Val His Tyr Ile Thr Lys Ser
195 200 205
Asp Asn His Asn Asn Lys Pro Asn Lys Ile Val Ile Lys Asn Thr Asn
210 215 220
Thr Ala Leu Ser Thr Ile Asp Val Tyr Arg Tyr Arg Asp Glu Leu Asp
225 230 235 240
Lys Asp Glu Ile Pro His Phe Phe Val Asp Arg Leu Asn Val Trp Ala
245 250 255
Cys Arg Pro Ile Glu Asp Ser Ile Asn Gly Tyr His Asp Ser Val Val
260 265 270
Leu Ser Ile Thr Glu Thr Arg Thr Ala Leu Ser Asp Asn Phe Lys Met
275 280 285
Asn Glu Ile Glu Cys Leu Ser Leu Ala Glu Ser Ile Leu Lys Ala Asn
290 295 300
Asn Lys Lys Met Ser Ala Ser Asn Ile Ile Val Asp Asn Lys Ala Trp
305 310 315 320
Arg Thr Phe Lys Leu His Thr Gly Lys Asp Ser Leu Lys Ser Ser Ser
325 330 335
Phe Thr Ser Lys Asp Tyr Gln Lys Ala Val Asn Glu Leu Ile Lys Leu
340 345 350
Phe Asn Asp Lys Asp Lys Leu Leu Asn Asn Lys Pro Lys Asp Val Val
355 360 365
Glu Arg Ile Arg Ile Arg Thr Ile Val Lys Glu Asn Thr Lys Phe Val
370 375 380
Pro Ser Glu Leu Lys Pro Arg Asn Asn Ile Arg Asp Lys Gln Asp Ser
385 390 395 400
Lys Ile Asp Arg Val Ile Asn Asn Tyr Thr Leu Lys Gln Ala Leu Asn
405 410 415
Ile Gln Tyr Lys Leu Asn Pro Lys Pro Gln Thr Ser Asn Gly Val Ser
420 425 430
Trp Tyr Asn Ala Ser Val Asn Gln Ile Lys Ser Ala Met Asp Thr Thr
435 440 445
Lys Ile Phe Asn Asn Asn Val Gln Val Tyr Gln Phe Leu Lys Leu Asn
450 455 460
Gln Tyr Gln Gly Ile Pro Val Asp Lys Leu Asn Lys Leu Leu Val Gly
465 470 475 480
Lys Gly Thr Leu Ala Asn Gln Gly His Ala Phe Ala Asp Gly Cys Lys
485 490 495
Lys Tyr Asn Ile Asn Glu Ile Tyr Leu Ile Ala His Arg Phe Leu Glu
500 505 510
Ser Ala Asn Gly Thr Ser Phe Phe Ala Ser Gly Lys Thr Gly Val Tyr
515 520 525
Asn Tyr Phe Gly Ile Gly Ala Phe Asp Asn Asn Pro Asn Asn Ala Met
530 535 540
Ala Phe Ala Arg Ser His Gly Trp Thr Ser Pro Thr Lys Ala Ile Ile
545 550 555 560
Gly Gly Ala Glu Phe Val Gly Lys Gly Tyr Phe Asn Val Gly Gln Asn
565 570 575
Thr Leu Tyr Arg Met Arg Trp Asn Pro Gln Lys Pro Gly Thr His Gln
580 585 590
Tyr Ala Thr Asp Ile Ser Trp Ala Lys Val Gln Ala Gln Met Ile Ser
595 600 605
Ala Met Tyr Lys Glu Ile Gly Leu Thr Gly Asp Tyr Phe Ile Tyr Asp
610 615 620
Gln Tyr Lys Lys
625
<210> 78
<211> 291
<212> PRT
<213> (Phi)P35
<400> 78
Met Ala Arg Lys Phe Thr Lys Ala Glu Leu Val Ala Lys Ala Glu Lys
1 5 10 15
Lys Val Gly Gly Leu Lys Pro Asp Val Lys Lys Ala Val Leu Ser Ala
20 25 30
Val Lys Glu Ala Tyr Asp Arg Tyr Gly Ile Gly Ile Ile Val Ser Gln
35 40 45
Gly Tyr Arg Ser Ile Ala Glu Gln Asn Gly Leu Tyr Ala Gln Gly Arg
50 55 60
Thr Lys Pro Gly Asn Ile Val Thr Asn Ala Lys Gly Gly Gln Ser Asn
65 70 75 80
His Asn Phe Gly Val Ala Val Asp Phe Ala Ile Asp Leu Ile Asp Asp
85 90 95
Gly Lys Ile Asp Ser Trp Gln Pro Ser Ala Thr Ile Val Asn Met Met
100 105 110
Lys Arg Arg Gly Phe Lys Trp Gly Gly Asp Trp Lys Ser Phe Thr Asp
115 120 125
Leu Pro His Phe Glu Ala Cys Asp Trp Tyr Arg Gly Glu Arg Lys Tyr
130 135 140
Lys Val Asp Thr Ser Glu Trp Lys Lys Lys Glu Asn Ile Asn Ile Val
145 150 155 160
Ile Lys Asp Val Gly Tyr Phe Gln Asp Lys Pro Gln Phe Leu Asn Ser
165 170 175
Lys Ser Val Arg Gln Trp Lys His Gly Thr Lys Val Lys Leu Thr Lys
180 185 190
His Asn Ser His Trp Tyr Thr Gly Val Val Lys Asp Gly Asn Lys Ser
195 200 205
Val Arg Gly Tyr Ile Tyr His Ser Met Ala Lys Val Thr Ser Lys Asn
210 215 220
Ser Asp Gly Ser Val Asn Ala Thr Ile Asn Ala His Ala Phe Cys Trp
225 230 235 240
Asp Asn Lys Lys Leu Asn Gly Gly Asp Phe Ile Asn Leu Lys Arg Gly
245 250 255
Phe Lys Gly Ile Thr His Pro Ala Ser Asp Gly Phe Tyr Pro Leu Tyr
260 265 270
Phe Ala Ser Arg Lys Lys Thr Phe Tyr Ile Pro Arg Tyr Met Phe Asp
275 280 285
Ile Lys Lys
290
<210> 79
<211> 342
<212> PRT
<213> (Phi)CP-7
<400> 79
Met Val Lys Lys Asn Asp Leu Phe Val Asp Val Ala Ser His Gln Gly
1 5 10 15
Tyr Asp Ile Ser Gly Ile Leu Glu Glu Ala Gly Thr Thr Asn Thr Ile
20 25 30
Ile Lys Val Ser Glu Ser Thr Ser Tyr Leu Asn Pro Cys Leu Ser Ala
35 40 45
Gln Val Ser Gln Ser Asn Pro Ile Gly Phe Tyr His Phe Ala Trp Phe
50 55 60
Gly Gly Asn Glu Glu Glu Ala Glu Ala Glu Ala Arg Tyr Phe Leu Asp
65 70 75 80
Asn Val Pro Thr Gln Val Lys Tyr Leu Val Leu Asp Tyr Glu Asp His
85 90 95
Ala Ser Ala Ser Val Gln Arg Asn Thr Thr Ala Cys Leu Arg Phe Met
100 105 110
Gln Ile Ile Ala Glu Ala Gly Tyr Thr Pro Ile Tyr Tyr Ser Tyr Lys
115 120 125
Pro Phe Thr Leu Asp Asn Val Asp Tyr Gln Gln Ile Leu Ala Gln Phe
130 135 140
Pro Asn Ser Leu Trp Ile Ala Gly Tyr Gly Leu Asn Asp Gly Thr Ala
145 150 155 160
Asn Phe Glu Tyr Phe Pro Ser Met Asp Gly Ile Arg Trp Trp Gln Tyr
165 170 175
Ser Ser Asn Pro Phe Asp Lys Asn Ile Val Leu Leu Asp Asp Glu Lys
180 185 190
Glu Asp Asn Ile Asn Asn Glu Asn Thr Leu Lys Ser Leu Thr Thr Val
195 200 205
Ala Asn Glu Val Ile Gln Gly Leu Trp Gly Asn Gly Gln Glu Arg Tyr
210 215 220
Asp Ser Leu Ala Asn Ala Gly Tyr Asp Pro Gln Ala Val Gln Asp Lys
225 230 235 240
Val Asn Glu Ile Leu Asn Ala Arg Glu Ile Ala Asp Leu Thr Thr Val
245 250 255
Ala Asn Glu Val Ile Gln Gly Leu Trp Gly Asn Gly Gln Glu Arg Tyr
260 265 270
Asp Ser Leu Ala Asn Ala Gly Tyr Asp Pro Gln Ala Val Gln Asp Lys
275 280 285
Val Asn Glu Ile Leu Asn Ala Arg Glu Ile Ala Asp Leu Thr Thr Val
290 295 300
Ala Asn Glu Val Ile Gln Gly Leu Trp Gly Asn Gly Gln Glu Arg Tyr
305 310 315 320
Asp Ser Leu Ala Asn Ala Gly Tyr Asp Pro Gln Ala Val Gln Asp Lys
325 330 335
Val Asn Glu Leu Leu Ser
340
<210> 80
<211> 328
<212> PRT
<213> (Phi)EFAP-1
<400> 80
Met Lys Leu Lys Gly Ile Leu Leu Ser Val Val Thr Thr Phe Gly Leu
1 5 10 15
Leu Phe Gly Ala Thr Asn Val Gln Ala Tyr Glu Val Asn Asn Glu Phe
20 25 30
Asn Leu Gln Pro Trp Glu Gly Ser Gln Gln Leu Ala Tyr Pro Asn Lys
35 40 45
Ile Ile Leu His Glu Thr Ala Asn Pro Arg Ala Thr Gly Arg Asn Glu
50 55 60
Ala Thr Tyr Met Lys Asn Asn Trp Phe Asn Ala His Thr Thr Ala Ile
65 70 75 80
Val Gly Asp Gly Gly Ile Val Tyr Lys Val Ala Pro Glu Gly Asn Val
85 90 95
Ser Trp Gly Ala Gly Asn Ala Asn Pro Tyr Ala Pro Val Gln Ile Glu
100 105 110
Leu Gln His Thr Asn Asp Pro Glu Leu Phe Lys Ala Asn Tyr Lys Ala
115 120 125
Tyr Val Asp Tyr Thr Arg Asp Met Gly Lys Lys Phe Gly Ile Pro Met
130 135 140
Thr Leu Asp Gln Gly Gly Ser Leu Trp Glu Lys Gly Val Val Ser His
145 150 155 160
Gln Trp Val Thr Asp Phe Val Trp Gly Asp His Thr Asp Pro Tyr Gly
165 170 175
Tyr Leu Ala Lys Met Gly Ile Ser Lys Ala Gln Leu Ala His Asp Leu
180 185 190
Ala Asn Gly Val Ser Gly Asn Thr Ala Thr Pro Thr Pro Lys Pro Asp
195 200 205
Lys Pro Lys Pro Thr Gln Pro Ser Lys Pro Ser Asn Lys Lys Arg Phe
210 215 220
Asn Tyr Arg Val Asp Gly Leu Glu Tyr Val Asn Gly Met Trp Gln Ile
225 230 235 240
Tyr Asn Glu His Leu Gly Lys Ile Asp Phe Asn Trp Thr Glu Asn Gly
245 250 255
Ile Pro Val Glu Val Val Asp Lys Val Asn Pro Ala Thr Gly Gln Pro
260 265 270
Thr Lys Asp Gln Val Leu Lys Val Gly Asp Tyr Phe Asn Phe Gln Glu
275 280 285
Asn Ser Thr Gly Val Val Gln Glu Gln Thr Pro Tyr Met Gly Tyr Thr
290 295 300
Leu Ser His Val Gln Leu Pro Asn Glu Phe Ile Trp Leu Phe Thr Asp
305 310 315 320
Ser Lys Gln Ala Leu Met Tyr Gln
325
<210> 81
<211> 48
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 81
Ser Ser Leu Leu Glu Lys Gly Leu Asp Gly Ala Lys Lys Ala Val Gly
1 5 10 15
Gly Leu Gly Lys Leu Gly Lys Asp Ala Val Glu Asp Leu Glu Ser Val
20 25 30
Gly Lys Gly Ala Val His Asp Val Lys Asp Val Leu Asp Ser Val Leu
35 40 45
<210> 82
<211> 37
<212> PRT
<213> Hyalophora cecropia
<400> 82
Lys Trp Lys Leu Phe Lys Lys Ile Glu Lys Val Gly Gln Asn Ile Arg
1 5 10 15
Asp Gly Ile Ile Lys Ala Gly Pro Ala Val Ala Val Val Gly Gln Ala
20 25 30
Thr Gln Ile Ala Lys
35
<210> 83
<211> 62
<212> PRT
<213> Drosophila teissieri
<400> 83
Met Lys Tyr Phe Ser Val Leu Val Val Leu Thr Leu Ile Leu Ala Ile
1 5 10 15
Val Asp Gln Ser Asp Ala Phe Ile Asn Leu Leu Asp Lys Val Glu Asp
20 25 30
Ala Leu His Thr Gly Ala Gln Ala Gly Phe Lys Leu Ile Arg Pro Val
35 40 45
Glu Arg Gly Ala Thr Pro Lys Lys Ser Glu Lys Pro Glu Lys
50 55 60
<210> 84
<211> 66
<212> PRT
<213> Bombyx mori
<400> 84
Met Asn Ile Leu Lys Phe Phe Phe Val Phe Ile Val Ala Met Ser Leu
1 5 10 15
Val Ser Cys Ser Thr Ala Ala Pro Ala Lys Ile Pro Ile Lys Ala Ile
20 25 30
Lys Thr Val Gly Lys Ala Val Gly Lys Gly Leu Arg Ala Ile Asn Ile
35 40 45
Ala Ser Thr Ala Asn Asp Val Phe Asn Phe Leu Lys Pro Lys Lys Arg
50 55 60
Lys His
65
<210> 85
<211> 71
<212> PRT
<213> Ceratitis capitata
<400> 85
Met Ala Asn Leu Lys Ala Val Phe Leu Ile Cys Ile Val Ala Phe Ile
1 5 10 15
Ala Leu Gln Cys Val Val Ala Glu Pro Ala Ala Glu Asp Ser Val Val
20 25 30
Val Lys Arg Ser Ile Gly Ser Ala Leu Lys Lys Ala Leu Pro Val Ala
35 40 45
Lys Lys Ile Gly Lys Ile Ala Leu Pro Ile Ala Lys Ala Ala Leu Pro
50 55 60
Val Ala Ala Gly Leu Val Gly
65 70
<210> 86
<211> 53
<212> PRT
<213> Apis mellifera
<400> 86
Met Lys Val Val Ile Phe Ile Phe Ala Leu Leu Ala Thr Ile Cys Ala
1 5 10 15
Ala Phe Ala Tyr Val Pro Leu Pro Asn Val Pro Gln Pro Gly Arg Arg
20 25 30
Pro Phe Pro Thr Phe Pro Gly Gln Gly Pro Phe Asn Pro Lys Ile Lys
35 40 45
Trp Pro Gln Gly Tyr
50
<210> 87
<211> 283
<212> PRT
<213> Apis mellifera
<400> 87
Lys Asn Phe Ala Leu Ala Ile Leu Val Val Thr Phe Val Val Ala Val
1 5 10 15
Phe Gly Asn Thr Asn Leu Asp Pro Pro Thr Arg Pro Thr Arg Leu Arg
20 25 30
Arg Glu Ala Lys Pro Glu Ala Glu Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr
35 40 45
Ile Pro Gln Pro Arg Pro Pro His Pro Arg Leu Arg Arg Glu Ala Glu
50 55 60
Pro Glu Ala Glu Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr Ile Pro Gln Pro
65 70 75 80
Arg Pro Pro His Pro Arg Leu Arg Arg Glu Ala Glu Leu Glu Ala Glu
85 90 95
Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr Ile Ser Gln Pro Arg Pro Pro His
100 105 110
Pro Arg Leu Arg Arg Glu Ala Glu Pro Glu Ala Glu Pro Gly Asn Asn
115 120 125
Arg Pro Val Tyr Ile Pro Gln Pro Arg Pro Pro His Pro Arg Leu Arg
130 135 140
Arg Glu Ala Glu Leu Glu Ala Glu Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr
145 150 155 160
Ile Ser Gln Pro Arg Pro Pro His Pro Arg Leu Arg Arg Glu Ala Glu
165 170 175
Pro Glu Ala Glu Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr Ile Pro Gln Pro
180 185 190
Arg Pro Pro His Pro Arg Leu Arg Arg Glu Ala Glu Pro Glu Ala Glu
195 200 205
Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr Ile Pro Gln Pro Arg Pro Pro His
210 215 220
Pro Arg Leu Arg Arg Glu Ala Glu Pro Glu Ala Glu Pro Gly Asn Asn
225 230 235 240
Arg Pro Val Tyr Ile Pro Gln Pro Arg Pro Pro His Pro Arg Leu Arg
245 250 255
Arg Glu Ala Lys Pro Glu Ala Lys Pro Gly Asn Asn Arg Pro Val Tyr
260 265 270
Ile Pro Gln Pro Arg Pro Pro His Pro Arg Ile
275 280
<210> 88
<211> 228
<212> PRT
<213> Sus scrofa
<400> 88
Met Glu Thr Gln Arg Ala Ser Leu Cys Leu Gly Arg Trp Ser Leu Trp
1 5 10 15
Leu Leu Leu Leu Ala Leu Val Val Pro Ser Ala Ser Ala Gln Ala Leu
20 25 30
Ser Tyr Arg Glu Ala Val Leu Arg Ala Val Asp Arg Leu Asn Glu Gln
35 40 45
Ser Ser Glu Ala Asn Leu Tyr Arg Leu Leu Glu Leu Asp Gln Pro Pro
50 55 60
Lys Ala Asp Glu Asp Pro Gly Thr Pro Lys Pro Val Ser Phe Thr Val
65 70 75 80
Lys Glu Thr Val Cys Pro Arg Pro Thr Arg Arg Pro Pro Glu Leu Cys
85 90 95
Asp Phe Lys Glu Asn Gly Arg Val Lys Gln Cys Val Gly Thr Val Thr
100 105 110
Leu Asp Gln Ile Lys Asp Pro Leu Asp Ile Thr Cys Asn Glu Gly Val
115 120 125
Arg Arg Phe Pro Trp Trp Trp Pro Phe Leu Arg Arg Pro Arg Leu Arg
130 135 140
Arg Gln Ala Phe Pro Pro Pro Asn Val Pro Gly Pro Arg Phe Pro Pro
145 150 155 160
Pro Asn Val Pro Gly Pro Arg Phe Pro Pro Pro Asn Phe Pro Gly Pro
165 170 175
Arg Phe Pro Pro Pro Asn Phe Pro Gly Pro Arg Phe Pro Pro Pro Asn
180 185 190
Phe Pro Gly Pro Pro Phe Pro Pro Pro Ile Phe Pro Gly Pro Trp Phe
195 200 205
Pro Pro Pro Pro Pro Phe Arg Pro Pro Pro Phe Gly Pro Pro Arg Phe
210 215 220
Pro Gly Arg Arg
225
<210> 89
<211> 144
<212> PRT
<213> Bos taurus
<400> 89
Met Gln Thr Gln Arg Ala Ser Leu Ser Leu Gly Arg Trp Ser Leu Trp
1 5 10 15
Leu Leu Leu Leu Gly Leu Val Val Pro Ser Ala Ser Ala Gln Ala Leu
20 25 30
Ser Tyr Arg Glu Ala Val Leu Arg Ala Val Asp Gln Leu Asn Glu Leu
35 40 45
Ser Ser Glu Ala Asn Leu Tyr Arg Leu Leu Glu Leu Asp Pro Pro Pro
50 55 60
Lys Asp Asn Glu Asp Leu Gly Thr Arg Lys Pro Val Ser Phe Thr Val
65 70 75 80
Lys Glu Thr Val Cys Pro Arg Thr Ile Gln Gln Pro Ala Glu Gln Cys
85 90 95
Asp Phe Lys Glu Lys Gly Arg Val Lys Gln Cys Val Gly Thr Val Thr
100 105 110
Leu Asp Pro Ser Asn Asp Gln Phe Asp Leu Asn Cys Asn Glu Leu Gln
115 120 125
Ser Val Ile Leu Pro Trp Lys Trp Pro Trp Trp Pro Trp Arg Arg Gly
130 135 140
<210> 90
<211> 149
<212> PRT
<213> Sus scrofa
<400> 90
Met Glu Thr Gln Arg Ala Ser Leu Cys Leu Gly Arg Trp Ser Leu Trp
1 5 10 15
Leu Leu Leu Leu Ala Leu Val Val Pro Ser Ala Ser Ala Gln Ala Leu
20 25 30
Ser Tyr Arg Glu Ala Val Leu Arg Ala Val Asp Arg Leu Asn Glu Gln
35 40 45
Ser Ser Glu Ala Asn Leu Tyr Arg Leu Leu Glu Leu Asp Gln Pro Pro
50 55 60
Lys Ala Asp Glu Asp Pro Gly Thr Pro Lys Pro Val Ser Phe Thr Val
65 70 75 80
Lys Glu Thr Val Cys Pro Arg Pro Thr Arg Gln Pro Pro Glu Leu Cys
85 90 95
Asp Phe Lys Glu Asn Gly Arg Val Lys Gln Cys Val Gly Thr Val Thr
100 105 110
Leu Asp Gln Ile Lys Asp Pro Leu Asp Ile Thr Cys Asn Glu Val Gln
115 120 125
Gly Val Arg Gly Gly Arg Leu Cys Tyr Cys Arg Arg Arg Phe Cys Val
130 135 140
Cys Val Gly Arg Gly
145
<210> 91
<211> 17
<212> PRT
<213> Tachypleus gigas
<400> 91
Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys
1 5 10 15
Arg
<210> 92
<211> 102
<212> PRT
<213> Anopheles gambiae
<400> 92
Met Lys Cys Ala Thr Ile Val Cys Thr Ile Ala Val Val Leu Ala Ala
1 5 10 15
Thr Leu Leu Asn Gly Ser Val Gln Ala Ala Pro Gln Glu Glu Ala Ala
20 25 30
Leu Ser Gly Gly Ala Asn Leu Asn Thr Leu Leu Asp Glu Leu Pro Glu
35 40 45
Glu Thr His His Ala Ala Leu Glu Asn Tyr Arg Ala Lys Arg Ala Thr
50 55 60
Cys Asp Leu Ala Ser Gly Phe Gly Val Gly Ser Ser Leu Cys Ala Ala
65 70 75 80
His Cys Ile Ala Arg Arg Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Asn Ser Lys Ala
85 90 95
Val Cys Val Cys Arg Asn
100
<210> 93
<211> 70
<212> PRT
<213> Drosophila melanogaster
<400> 93
Met Met Gln Ile Lys Tyr Leu Phe Ala Leu Phe Ala Val Leu Met Leu
1 5 10 15
Val Val Leu Gly Ala Asn Glu Ala Asp Ala Asp Cys Leu Ser Gly Arg
20 25 30
Tyr Lys Gly Pro Cys Ala Val Trp Asp Asn Glu Thr Cys Arg Arg Val
35 40 45
Cys Lys Glu Glu Gly Arg Ser Ser Gly His Cys Ser Pro Ser Leu Lys
50 55 60
Cys Trp Cys Glu Gly Cys
65 70
<210> 94
<211> 63
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 94
Met Thr Lys Ile Val Val Phe Ile Tyr Val Val Ile Leu Leu Leu Thr
1 5 10 15
Ile Phe His Val Ser Ala Lys Lys Lys Arg Tyr Ile Glu Cys Glu Thr
20 25 30
His Glu Asp Cys Ser Gln Val Phe Met Pro Pro Phe Val Met Arg Cys
35 40 45
Val Ile His Glu Cys Lys Ile Phe Asn Gly Glu His Leu Arg Tyr
50 55 60
<210> 95
<211> 76
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 95
Met Ala Lys Ile Met Lys Phe Val Tyr Asn Met Ile Pro Phe Leu Ser
1 5 10 15
Ile Phe Ile Ile Thr Leu Gln Val Asn Val Val Val Cys Glu Ile Asp
20 25 30
Ala Asp Cys Pro Gln Ile Cys Met Pro Pro Tyr Glu Val Arg Cys Val
35 40 45
Asn His Arg Cys Gly Trp Val Asn Thr Asp Asp Ser Leu Phe Leu Thr
50 55 60
Gln Glu Phe Thr Arg Ser Lys Gln Tyr Ile Ile Ser
65 70 75
<210> 96
<211> 76
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 96
Met Tyr Lys Val Val Glu Ser Ile Phe Ile Arg Tyr Met His Arg Lys
1 5 10 15
Pro Asn Met Thr Lys Phe Phe Lys Phe Val Tyr Thr Met Phe Ile Leu
20 25 30
Ile Ser Leu Phe Leu Val Val Thr Asn Ala Asn Ala His Asn Cys Thr
35 40 45
Asp Ile Ser Asp Cys Ser Ser Asn His Cys Ser Tyr Glu Gly Val Ser
50 55 60
Leu Cys Met Asn Gly Gln Cys Ile Cys Ile Tyr Glu
65 70 75
<210> 97
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 97
Met Val Glu Thr Leu Arg Leu Phe Tyr Ile Met Ile Leu Phe Val Ser
1 5 10 15
Leu Cys Leu Val Val Val Asp Gly Glu Ser Lys Leu Glu Gln Thr Cys
20 25 30
Ser Glu Asp Phe Glu Cys Tyr Ile Lys Asn Pro His Val Pro Phe Gly
35 40 45
His Leu Arg Cys Phe Glu Gly Phe Cys Gln Gln Leu Asn Gly Pro Ala
50 55 60
<210> 98
<211> 67
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 98
Met Ala Lys Ile Val Asn Phe Val Tyr Ser Met Ile Val Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Thr Lys Ala Ala Arg Gly Tyr Leu Cys Val Thr
20 25 30
Asp Ser His Cys Pro Pro His Met Cys Pro Pro Gly Met Glu Pro Arg
35 40 45
Cys Val Arg Arg Met Cys Lys Cys Leu Pro Ile Gly Trp Arg Lys Tyr
50 55 60
Phe Val Pro
65
<210> 99
<211> 96
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 99
Met Gln Ile Gly Lys Asn Met Val Glu Thr Pro Lys Leu Asp Tyr Val
1 5 10 15
Ile Ile Phe Phe Phe Leu Tyr Phe Phe Phe Arg Gln Met Ile Ile Leu
20 25 30
Arg Leu Asn Thr Thr Phe Arg Pro Leu Asn Phe Lys Met Leu Arg Phe
35 40 45
Trp Gly Gln Asn Arg Asn Ile Met Lys His Arg Gly Gln Lys Val His
50 55 60
Phe Ser Leu Ile Leu Ser Asp Cys Lys Thr Asn Lys Asp Cys Pro Lys
65 70 75 80
Leu Arg Arg Ala Asn Val Arg Cys Arg Lys Ser Tyr Cys Val Pro Ile
85 90 95
<210> 100
<211> 65
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 100
Met Leu Arg Leu Tyr Leu Val Ser Tyr Phe Leu Leu Lys Arg Thr Leu
1 5 10 15
Leu Val Ser Tyr Phe Ser Tyr Phe Ser Thr Tyr Ile Ile Glu Cys Lys
20 25 30
Thr Asp Asn Asp Cys Pro Ile Ser Gln Leu Lys Ile Tyr Ala Trp Lys
35 40 45
Cys Val Lys Asn Gly Cys His Leu Phe Asp Val Ile Pro Met Met Tyr
50 55 60
Glu
65
<210> 101
<211> 79
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 101
Met Ala Glu Ile Leu Lys Phe Val Tyr Ile Val Ile Leu Phe Val Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Ile Val Val Ala Ser Glu Arg Glu Cys Val Thr Asp Asp
20 25 30
Asp Cys Glu Lys Leu Tyr Pro Thr Asn Glu Tyr Arg Met Met Cys Asp
35 40 45
Ser Gly Tyr Cys Met Asn Leu Leu Asn Gly Lys Ile Ile Tyr Leu Leu
50 55 60
Cys Leu Lys Lys Lys Lys Phe Leu Ile Ile Ile Ser Val Leu Leu
65 70 75
<210> 102
<211> 95
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 102
Met Ala Glu Ile Ile Lys Phe Val Tyr Ile Met Ile Leu Cys Val Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Ile Glu Val Ala Gly Glu Glu Cys Val Thr Asp Ala Asp
20 25 30
Cys Asp Lys Leu Tyr Pro Asp Ile Arg Lys Pro Leu Met Cys Ser Ile
35 40 45
Gly Glu Cys Tyr Ser Leu Tyr Lys Gly Lys Phe Ser Leu Ser Ile Ile
50 55 60
Ser Lys Thr Ser Phe Ser Leu Met Val Tyr Asn Val Val Thr Leu Val
65 70 75 80
Ile Cys Leu Arg Leu Ala Tyr Ile Ser Leu Leu Leu Lys Phe Leu
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<211> 100
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 103
Met Ala Glu Ile Leu Lys Asp Phe Tyr Ala Met Asn Leu Phe Ile Phe
1 5 10 15
Leu Ile Ile Leu Pro Ala Lys Ile Arg Gly Glu Thr Leu Ser Leu Thr
20 25 30
His Pro Lys Cys His His Ile Met Leu Pro Ser Leu Phe Ile Thr Glu
35 40 45
Val Phe Gln Arg Val Thr Asp Asp Gly Cys Pro Lys Pro Val Asn His
50 55 60
Leu Arg Val Val Lys Cys Ile Glu His Ile Cys Glu Tyr Gly Tyr Asn
65 70 75 80
Tyr Arg Pro Asp Phe Ala Ser Gln Ile Pro Glu Ser Thr Lys Met Pro
85 90 95
Arg Lys Arg Glu
100
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<211> 78
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 104
Met Val Glu Ile Leu Lys Asn Phe Tyr Ala Met Asn Leu Phe Ile Phe
1 5 10 15
Leu Ile Ile Leu Ala Val Lys Ile Arg Gly Ala His Phe Pro Cys Val
20 25 30
Thr Asp Asp Asp Cys Pro Lys Pro Val Asn Lys Leu Arg Val Ile Lys
35 40 45
Cys Ile Asp His Ile Cys Gln Tyr Ala Arg Asn Leu Pro Asp Phe Ala
50 55 60
Ser Glu Ile Ser Glu Ser Thr Lys Met Pro Cys Lys Gly Glu
65 70 75
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<211> 72
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 105
Met Phe His Ala Gln Ala Glu Asn Met Ala Lys Val Ser Asn Phe Val
1 5 10 15
Cys Ile Met Ile Leu Phe Leu Ala Leu Phe Phe Ile Thr Met Asn Asp
20 25 30
Ala Ala Arg Phe Glu Cys Arg Glu Asp Ser His Cys Val Thr Arg Ile
35 40 45
Lys Cys Val Leu Pro Arg Lys Pro Glu Cys Arg Asn Tyr Ala Cys Gly
50 55 60
Cys Tyr Asp Ser Asn Lys Tyr Arg
65 70
<210> 106
<211> 78
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 106
Met Gln Met Arg Gln Asn Met Ala Thr Ile Leu Asn Phe Val Phe Val
1 5 10 15
Ile Ile Leu Phe Ile Ser Leu Leu Leu Val Val Thr Lys Gly Tyr Arg
20 25 30
Glu Pro Phe Ser Ser Phe Thr Glu Gly Pro Thr Cys Lys Glu Asp Ile
35 40 45
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50 55 60
Met Phe Glu Cys His Cys Lys Tyr Ile Pro Thr Thr Leu Lys
65 70 75
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<211> 71
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 107
Met Ala Thr Ile Leu Met Tyr Val Tyr Ile Thr Ile Leu Phe Ile Ser
1 5 10 15
Ile Leu Thr Val Leu Thr Glu Gly Leu Tyr Glu Pro Leu Tyr Asn Phe
20 25 30
Arg Arg Asp Pro Asp Cys Arg Arg Asn Ile Asp Cys Pro Ser Tyr Leu
35 40 45
Cys Val Ala Pro Lys Val Pro Arg Cys Ile Met Phe Glu Cys His Cys
50 55 60
Lys Asp Ile Pro Ser Asp His
65 70
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<211> 57
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 108
Met Thr Thr Ser Leu Lys Phe Val Tyr Val Ala Ile Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Val Val Met Gly Gly Ile Arg Arg Phe Glu Cys Arg Gln
20 25 30
Asp Ser Asp Cys Pro Ser Tyr Phe Cys Glu Lys Leu Thr Val Pro Lys
35 40 45
Cys Phe Trp Ser Lys Cys Tyr Cys Lys
50 55
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<211> 57
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 109
Met Thr Thr Ser Leu Lys Phe Val Tyr Val Ala Ile Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Val Val Met Gly Gly Ile Arg Lys Lys Glu Cys Arg Gln
20 25 30
Asp Ser Asp Cys Pro Ser Tyr Phe Cys Glu Lys Leu Thr Ile Ala Lys
35 40 45
Cys Ile His Ser Thr Cys Leu Cys Lys
50 55
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<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 110
Met Gln Ile Gly Lys Asn Met Val Glu Thr Pro Lys Leu Val Tyr Phe
1 5 10 15
Ile Ile Leu Phe Leu Ser Ile Phe Leu Cys Ile Thr Val Ser Asn Ser
20 25 30
Ser Phe Ser Gln Ile Phe Asn Ser Ala Cys Lys Thr Asp Lys Asp Cys
35 40 45
Pro Lys Phe Gly Arg Val Asn Val Arg Cys Arg Lys Gly Asn Cys Val
50 55 60
Pro Ile
65
<210> 111
<211> 57
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 111
Met Thr Ala Ile Leu Lys Lys Phe Ile Asn Ala Val Phe Leu Phe Ile
1 5 10 15
Val Leu Phe Leu Ala Thr Thr Asn Val Glu Asp Phe Val Gly Gly Ser
20 25 30
Asn Asp Glu Cys Val Tyr Pro Asp Val Phe Gln Cys Ile Asn Asn Ile
35 40 45
Cys Lys Cys Val Ser His His Arg Thr
50 55
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<211> 74
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 112
Met Gln Lys Arg Lys Asn Met Ala Gln Ile Ile Phe Tyr Val Tyr Ala
1 5 10 15
Leu Ile Ile Leu Phe Ser Pro Phe Leu Ala Ala Arg Leu Val Phe Val
20 25 30
Asn Pro Glu Lys Pro Cys Val Thr Asp Ala Asp Cys Asp Arg Tyr Arg
35 40 45
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50 55 60
Phe Ile Asp Tyr His His Asp Pro Tyr Pro
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<211> 76
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 113
Met Gln Met Arg Lys Asn Met Ala Gln Ile Leu Phe Tyr Val Tyr Ala
1 5 10 15
Leu Leu Ile Leu Phe Thr Pro Phe Leu Val Ala Arg Ile Met Val Val
20 25 30
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35 40 45
His Lys Leu Ala Thr Arg Met Ile Cys Asn Gln Gly Phe Cys Leu Met
50 55 60
Asp Phe Thr His Asp Pro Tyr Ala Pro Ser Leu Pro
65 70 75
<210> 114
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 114
Met Asn His Ile Ser Lys Phe Val Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Ile Tyr Leu Val Val Leu Asp Gly Leu Pro Ile Ser Cys Lys Asp His
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<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 115
Met Gln Arg Glu Lys Asn Met Ala Lys Ile Phe Glu Phe Val Tyr Ala
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50 55 60
Ala Lys Lys
65
<210> 116
<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 116
Met Ala Gly Ile Ile Lys Phe Val His Val Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
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50 55 60
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<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 117
Met Ala Asn Thr His Lys Leu Val Ser Met Ile Leu Phe Ile Phe Leu
1 5 10 15
Phe Leu Ala Ser Asn Asn Val Glu Gly Tyr Val Asn Cys Glu Thr Asp
20 25 30
Ala Asp Cys Pro Pro Ser Thr Arg Val Lys Arg Phe Lys Cys Val Lys
35 40 45
Gly Glu Cys Arg Trp Thr Arg Met Ser Tyr Ala
50 55
<210> 118
<211> 63
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 118
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1 5 10 15
Leu Ile Ile Cys Ile Tyr Leu Phe Ile Val Ile Thr Thr Arg Lys Thr
20 25 30
Asp Ile Arg Cys Arg Phe Tyr Tyr Asp Cys Pro Arg Leu Glu Tyr His
35 40 45
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50 55 60
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<211> 57
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 119
Met Ala Lys Val Tyr Met Phe Val Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Val Ser
1 5 10 15
Pro Phe Leu Leu Ala Thr Phe Arg Thr Arg Leu Pro Cys Glu Lys Asp
20 25 30
Asp Asp Cys Pro Glu Ala Phe Leu Pro Pro Val Met Lys Cys Val Asn
35 40 45
Arg Phe Cys Gln Tyr Glu Ile Leu Glu
50 55
<210> 120
<211> 77
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 120
Met Ile Lys Gln Phe Ser Val Cys Tyr Ile Gln Met Arg Arg Asn Met
1 5 10 15
Thr Thr Ile Leu Lys Phe Pro Tyr Ile Met Val Ile Cys Leu Leu Leu
20 25 30
Leu His Val Ala Ala Tyr Glu Asp Phe Glu Lys Glu Ile Phe Asp Cys
35 40 45
Lys Lys Asp Gly Asp Cys Asp His Met Cys Val Thr Pro Gly Ile Pro
50 55 60
Lys Cys Thr Gly Tyr Val Cys Phe Cys Phe Glu Asn Leu
65 70 75
<210> 121
<211> 73
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 121
Met Gln Arg Ser Arg Asn Met Thr Thr Ile Phe Lys Phe Ala Tyr Ile
1 5 10 15
Met Ile Ile Cys Val Phe Leu Leu Asn Ile Ala Ala Gln Glu Ile Glu
20 25 30
Asn Gly Ile His Pro Cys Lys Lys Asn Glu Asp Cys Asn His Met Cys
35 40 45
Val Met Pro Gly Leu Pro Trp Cys His Glu Asn Asn Leu Cys Phe Cys
50 55 60
Tyr Glu Asn Ala Tyr Gly Asn Thr Arg
65 70
<210> 122
<211> 85
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 122
Met Thr Ile Ile Ile Lys Phe Val Asn Val Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe His Val Ala Lys Asn Asp Asp Asn Lys Leu Leu Leu Ser Phe
20 25 30
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35 40 45
Met Cys Pro Ser Pro Leu Lys Glu Met Cys Tyr Phe Ile Lys Cys Val
50 55 60
Cys Gly Val Tyr Gly Pro Ile Arg Glu Arg Arg Leu Tyr Gln Ser His
65 70 75 80
Asn Pro Met Ile Gln
85
<210> 123
<211> 69
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 123
Met Arg Lys Asn Met Thr Lys Ile Leu Met Ile Gly Tyr Ala Leu Met
1 5 10 15
Ile Phe Ile Phe Leu Ser Ile Ala Val Ser Ile Thr Gly Asn Leu Ala
20 25 30
Arg Ala Ser Arg Lys Lys Pro Val Asp Val Ile Pro Cys Ile Tyr Asp
35 40 45
His Asp Cys Pro Arg Lys Leu Tyr Phe Leu Glu Arg Cys Val Gly Arg
50 55 60
Val Cys Lys Tyr Leu
65
<210> 124
<211> 58
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 124
Met Ala His Lys Leu Val Tyr Ala Ile Thr Leu Phe Ile Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Ile Ala Asn Asn Ile Glu Asp Asp Ile Phe Cys Ile Thr Asp Asn
20 25 30
Asp Cys Pro Pro Asn Thr Leu Val Gln Arg Tyr Arg Cys Ile Asn Gly
35 40 45
Lys Cys Asn Leu Ser Phe Val Ser Tyr Gly
50 55
<210> 125
<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 125
Met Asp Glu Thr Leu Lys Phe Val Tyr Ile Leu Ile Leu Phe Val Ser
1 5 10 15
Leu Cys Leu Val Val Ala Asp Gly Val Lys Asn Ile Asn Arg Glu Cys
20 25 30
Thr Gln Thr Ser Asp Cys Tyr Lys Lys Tyr Pro Phe Ile Pro Trp Gly
35 40 45
Lys Val Arg Cys Val Lys Gly Arg Cys Arg Leu Asp Met
50 55 60
<210> 126
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 126
Met Ala Lys Ile Ile Lys Phe Val Tyr Val Leu Ala Ile Phe Phe Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Lys Asn Val Asn Gly Trp Thr Cys Val Glu Asp
20 25 30
Ser Asp Cys Pro Ala Asn Ile Cys Gln Pro Pro Met Gln Arg Met Cys
35 40 45
Phe Tyr Gly Glu Cys Ala Cys Val Arg Ser Lys Phe Cys Thr
50 55 60
<210> 127
<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 127
Met Val Lys Ile Ile Lys Phe Val Tyr Phe Met Thr Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Met Leu Leu Val Thr Thr Lys Glu Asp Gly Ser Val Glu Cys Ile Ala
20 25 30
Asn Ile Asp Cys Pro Gln Ile Phe Met Leu Pro Phe Val Met Arg Cys
35 40 45
Ile Asn Phe Arg Cys Gln Ile Val Asn Ser Glu Asp Thr
50 55 60
<210> 128
<211> 67
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 128
Met Asp Glu Ile Leu Lys Phe Val Tyr Thr Leu Ile Ile Phe Phe Ser
1 5 10 15
Leu Phe Phe Ala Ala Asn Asn Val Asp Ala Asn Ile Met Asn Cys Gln
20 25 30
Ser Thr Phe Asp Cys Pro Arg Asp Met Cys Ser His Ile Arg Asp Val
35 40 45
Ile Cys Ile Phe Lys Lys Cys Lys Cys Ala Gly Gly Arg Tyr Met Pro
50 55 60
Gln Val Pro
65
<210> 129
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 129
Met Gln Arg Arg Lys Asn Met Ala Asn Asn His Met Leu Ile Tyr Ala
1 5 10 15
Met Ile Ile Cys Leu Phe Pro Tyr Leu Val Val Thr Phe Lys Thr Ala
20 25 30
Ile Thr Cys Asp Cys Asn Glu Asp Cys Leu Asn Phe Phe Thr Pro Leu
35 40 45
Asp Asn Leu Lys Cys Ile Asp Asn Val Cys Glu Val Phe Met
50 55 60
<210> 130
<211> 65
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 130
Met Val Asn Ile Leu Lys Phe Ile Tyr Val Ile Ile Phe Phe Ile Leu
1 5 10 15
Met Phe Phe Val Leu Ile Asp Val Asp Gly His Val Leu Val Glu Cys
20 25 30
Ile Glu Asn Arg Asp Cys Glu Lys Gly Met Cys Lys Phe Pro Phe Ile
35 40 45
Val Arg Cys Leu Met Asp Gln Cys Lys Cys Val Arg Ile His Asn Leu
50 55 60
Ile
65
<210> 131
<211> 74
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 131
Met Ile Ile Gln Phe Ser Ile Tyr Tyr Met Gln Arg Arg Lys Leu Asn
1 5 10 15
Met Val Glu Ile Leu Lys Phe Ser His Ala Leu Ile Ile Phe Leu Phe
20 25 30
Leu Ser Ala Leu Val Thr Asn Ala Asn Ile Phe Phe Cys Ser Thr Asp
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Glu Asp Cys Thr Trp Asn Leu Cys Arg Gln Pro Trp Val Gln Lys Cys
50 55 60
Arg Leu His Met Cys Ser Cys Glu Lys Asn
65 70
<210> 132
<211> 58
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 132
Met Asp Glu Val Phe Lys Phe Val Tyr Val Met Ile Ile Phe Pro Phe
1 5 10 15
Leu Ile Leu Asp Val Ala Thr Asn Ala Glu Lys Ile Arg Arg Cys Phe
20 25 30
Asn Asp Ala His Cys Pro Pro Asp Met Cys Thr Leu Gly Val Ile Pro
35 40 45
Lys Cys Ser Arg Phe Thr Ile Cys Ile Cys
50 55
<210> 133
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 133
Met His Arg Lys Pro Asn Met Thr Lys Phe Phe Lys Phe Val Tyr Thr
1 5 10 15
Met Phe Ile Leu Ile Ser Leu Phe Leu Val Val Thr Asn Ala Asn Ala
20 25 30
Asn Asn Cys Thr Asp Thr Ser Asp Cys Ser Ser Asn His Cys Ser Tyr
35 40 45
Glu Gly Val Ser Leu Cys Met Asn Gly Gln Cys Ile Cys Ile Tyr Glu
50 55 60
<210> 134
<211> 69
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 134
Met Gln Met Lys Lys Met Ala Thr Ile Leu Lys Phe Val Tyr Leu Ile
1 5 10 15
Ile Leu Leu Ile Tyr Pro Leu Leu Val Val Thr Glu Glu Ser His Tyr
20 25 30
Met Lys Phe Ser Ile Cys Lys Asp Asp Thr Asp Cys Pro Thr Leu Phe
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Cys Val Leu Pro Asn Val Pro Lys Cys Ile Gly Ser Lys Cys His Cys
50 55 60
Lys Leu Met Val Asn
65
<210> 135
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 135
Met Val Glu Thr Leu Arg Leu Phe Tyr Ile Met Ile Leu Phe Val Ser
1 5 10 15
Leu Tyr Leu Val Val Val Asp Gly Val Ser Lys Leu Ala Gln Ser Cys
20 25 30
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35 40 45
Gln Leu Arg Cys Phe Glu Gly Tyr Cys Gln Arg Leu Asp Lys Pro Thr
50 55 60
<210> 136
<211> 63
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 136
Met Thr Thr Phe Leu Lys Val Ala Tyr Ile Met Ile Ile Cys Val Phe
1 5 10 15
Val Leu His Leu Ala Ala Gln Val Asp Ser Gln Lys Arg Leu His Gly
20 25 30
Cys Lys Glu Asp Arg Asp Cys Asp Asn Ile Cys Ser Val His Ala Val
35 40 45
Thr Lys Cys Ile Gly Asn Met Cys Arg Cys Leu Ala Asn Val Lys
50 55 60
<210> 137
<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 137
Met Arg Ile Asn Arg Thr Pro Ala Ile Phe Lys Phe Val Tyr Thr Ile
1 5 10 15
Ile Ile Tyr Leu Phe Leu Leu Arg Val Val Ala Lys Asp Leu Pro Phe
20 25 30
Asn Ile Cys Glu Lys Asp Glu Asp Cys Leu Glu Phe Cys Ala His Asp
35 40 45
Lys Val Ala Lys Cys Met Leu Asn Ile Cys Phe Cys Phe
50 55 60
<210> 138
<211> 54
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 138
Met Ala Glu Ile Leu Lys Ile Leu Tyr Val Phe Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Ile Leu Ala Val Ile Ser Gln His Pro Phe Thr Pro Cys Glu Thr
20 25 30
Asn Ala Asp Cys Lys Cys Arg Asn His Lys Arg Pro Asp Cys Leu Trp
35 40 45
His Lys Cys Tyr Cys Tyr
50
<210> 139
<211> 65
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 139
Met Arg Lys Ser Met Ala Thr Ile Leu Lys Phe Val Tyr Val Ile Met
1 5 10 15
Leu Phe Ile Tyr Ser Leu Phe Val Ile Glu Ser Phe Gly His Arg Phe
20 25 30
Leu Ile Tyr Asn Asn Cys Lys Asn Asp Thr Glu Cys Pro Asn Asp Cys
35 40 45
Gly Pro His Glu Gln Ala Lys Cys Ile Leu Tyr Ala Cys Tyr Cys Val
50 55 60
Glu
65
<210> 140
<211> 58
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 140
Met Asn Thr Ile Leu Lys Phe Ile Phe Val Val Phe Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Ile Phe Leu Ser Ala Gly Asn Ser Lys Ser Tyr Gly Pro Cys Thr Thr
20 25 30
Leu Gln Asp Cys Glu Thr His Asn Trp Phe Glu Val Cys Ser Cys Ile
35 40 45
Asp Phe Glu Cys Lys Cys Trp Ser Leu Leu
50 55
<210> 141
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 141
Met Ala Glu Ile Ile Lys Phe Val Tyr Ile Met Ile Leu Cys Val Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Ile Ala Glu Ala Ser Gly Lys Glu Cys Val Thr Asp Ala
20 25 30
Asp Cys Glu Asn Leu Tyr Pro Gly Asn Lys Lys Pro Met Phe Cys Asn
35 40 45
Asn Thr Gly Tyr Cys Met Ser Leu Tyr Lys Glu Pro Ser Arg Tyr Met
50 55 60
<210> 142
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 142
Met Ala Lys Ile Ile Lys Phe Val Tyr Ile Met Ile Leu Cys Val Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Ile Val Glu Ala Gly Gly Lys Glu Cys Val Thr Asp Val
20 25 30
Asp Cys Glu Lys Ile Tyr Pro Gly Asn Lys Lys Pro Leu Ile Cys Ser
35 40 45
Thr Gly Tyr Cys Tyr Ser Leu Tyr Glu Glu Pro Pro Arg Tyr His Lys
50 55 60
<210> 143
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 143
Met Ala Lys Val Thr Lys Phe Gly Tyr Ile Ile Ile His Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Phe Leu Ala Met Asn Val Ala Gly Gly Arg Glu Cys His Ala
20 25 30
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35 40 45
Glu Cys Trp Asn Tyr Ala Cys Val Cys Tyr Asp Ser Asn Lys Tyr Arg
50 55 60
<210> 144
<211> 55
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 144
Met Ala Lys Ile Phe Asn Tyr Val Tyr Ala Leu Ile Met Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Met Gly Thr Ser Gly Met Lys Asn Gly Cys Lys His Thr
20 25 30
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35 40 45
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<210> 145
<211> 69
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 145
Met Thr Glu Ile Leu Lys Phe Val Cys Val Met Ile Ile Phe Ile Ser
1 5 10 15
Ser Phe Ile Val Ser Lys Ser Leu Asn Gly Gly Gly Lys Asp Lys Cys
20 25 30
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35 40 45
Ala Lys Cys Ile Asn Arg Leu Cys Arg Cys Arg Arg Pro Glu Leu Gln
50 55 60
Val Gln Leu Asn Pro
65
<210> 146
<211> 69
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 146
Met Ala His Ile Ile Met Phe Val Tyr Ala Leu Ile Tyr Ala Leu Ile
1 5 10 15
Ile Phe Ser Ser Leu Phe Val Arg Asp Gly Ile Pro Cys Leu Ser Asp
20 25 30
Asp Glu Cys Pro Glu Met Ser His Tyr Ser Phe Lys Cys Asn Asn Lys
35 40 45
Ile Cys Glu Tyr Asp Leu Gly Glu Met Ser Asp Asp Asp Tyr Tyr Leu
50 55 60
Glu Met Ser Arg Glu
65
<210> 147
<211> 77
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 147
Met Tyr Arg Glu Lys Asn Met Ala Lys Thr Leu Lys Phe Val Tyr Val
1 5 10 15
Ile Val Leu Phe Leu Ser Leu Phe Leu Ala Ala Lys Asn Ile Asp Gly
20 25 30
Arg Val Ser Tyr Asn Ser Phe Ile Ala Leu Pro Val Cys Gln Thr Ala
35 40 45
Ala Asp Cys Pro Glu Gly Thr Arg Gly Arg Thr Tyr Lys Cys Ile Asn
50 55 60
Asn Lys Cys Arg Tyr Pro Lys Leu Leu Lys Pro Ile Gln
65 70 75
<210> 148
<211> 56
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 148
Met Ala His Ile Phe Asn Tyr Val Tyr Ala Leu Leu Val Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Met Val Thr Asn Gly Ile His Ile Gly Cys Asp Lys Asp
20 25 30
Arg Asp Cys Pro Lys Gln Met Cys His Leu Asn Gln Thr Pro Lys Cys
35 40 45
Leu Lys Asn Ile Cys Lys Cys Val
50 55
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<211> 77
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 149
Met Ala Glu Ile Leu Lys Cys Phe Tyr Thr Met Asn Leu Phe Ile Phe
1 5 10 15
Leu Ile Ile Leu Pro Ala Lys Ile Arg Glu His Ile Gln Cys Val Ile
20 25 30
Asp Asp Asp Cys Pro Lys Ser Leu Asn Lys Leu Leu Ile Ile Lys Cys
35 40 45
Ile Asn His Val Cys Gln Tyr Val Gly Asn Leu Pro Asp Phe Ala Ser
50 55 60
Gln Ile Pro Lys Ser Thr Lys Met Pro Tyr Lys Gly Glu
65 70 75
<210> 150
<211> 70
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 150
Met Ala Tyr Ile Ser Arg Ile Phe Tyr Val Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Phe Val Val Ile Asn Gly Val Lys Ser Leu Leu Leu Ile Lys
20 25 30
Val Arg Ser Phe Ile Pro Cys Gln Arg Ser Asp Asp Cys Pro Arg Asn
35 40 45
Leu Cys Val Asp Gln Ile Ile Pro Thr Cys Val Trp Ala Lys Cys Lys
50 55 60
Cys Lys Asn Tyr Asn Asp
65 70
<210> 151
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 151
Met Ala Asn Val Thr Lys Phe Val Tyr Ile Ala Ile Tyr Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Phe Ile Ala Lys Asn Asp Ala Thr Ala Thr Phe Cys His Asp
20 25 30
Asp Ser His Cys Val Thr Lys Ile Lys Cys Val Leu Pro Arg Thr Pro
35 40 45
Gln Cys Arg Asn Glu Ala Cys Gly Cys Tyr His Ser Asn Lys Phe Arg
50 55 60
<210> 152
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 152
Met Gly Glu Ile Met Lys Phe Val Tyr Val Met Ile Ile Tyr Leu Phe
1 5 10 15
Met Phe Asn Val Ala Thr Gly Ser Glu Phe Ile Phe Thr Lys Lys Leu
20 25 30
Thr Ser Cys Asp Ser Ser Lys Asp Cys Arg Ser Phe Leu Cys Tyr Ser
35 40 45
Pro Lys Phe Pro Val Cys Lys Arg Gly Ile Cys Glu Cys Ile
50 55 60
<210> 153
<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 153
Met Gly Glu Met Phe Lys Phe Ile Tyr Thr Phe Ile Leu Phe Val His
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Val Ile Phe Glu Asp Ile Gly His Ile Lys Tyr Cys
20 25 30
Gly Ile Val Asp Asp Cys Tyr Lys Ser Lys Lys Pro Leu Phe Lys Ile
35 40 45
Trp Lys Cys Val Glu Asn Val Cys Val Leu Trp Tyr Lys
50 55 60
<210> 154
<211> 63
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 154
Met Ala Arg Thr Leu Lys Phe Val Tyr Ser Met Ile Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Asn Gly Leu Lys Ile Phe Cys Ile Asp Val Ala
20 25 30
Asp Cys Pro Lys Asp Leu Tyr Pro Leu Leu Tyr Lys Cys Ile Tyr Asn
35 40 45
Lys Cys Ile Val Phe Thr Arg Ile Pro Phe Pro Phe Asp Trp Ile
50 55 60
<210> 155
<211> 66
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 155
Met Ala Asn Ile Thr Lys Phe Val Tyr Ile Ala Ile Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Phe Ile Gly Met Asn Asp Ala Ala Ile Leu Glu Cys Arg Glu
20 25 30
Asp Ser His Cys Val Thr Lys Ile Lys Cys Val Leu Pro Arg Lys Pro
35 40 45
Glu Cys Arg Asn Asn Ala Cys Thr Cys Tyr Lys Gly Gly Phe Ser Phe
50 55 60
His His
65
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<211> 68
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 156
Met Gln Arg Val Lys Lys Met Ser Glu Thr Leu Lys Phe Val Tyr Val
1 5 10 15
Leu Ile Leu Phe Ile Ser Ile Phe His Val Val Ile Val Cys Asp Ser
20 25 30
Ile Tyr Phe Pro Val Ser Arg Pro Cys Ile Thr Asp Lys Asp Cys Pro
35 40 45
Asn Met Lys His Tyr Lys Ala Lys Cys Arg Lys Gly Phe Cys Ile Ser
50 55 60
Ser Arg Val Arg
65
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<211> 72
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 157
Met Gln Ile Arg Lys Ile Met Ser Gly Val Leu Lys Phe Val Tyr Ala
1 5 10 15
Ile Ile Leu Phe Leu Phe Leu Phe Leu Val Ala Arg Glu Val Gly Gly
20 25 30
Leu Glu Thr Ile Glu Cys Glu Thr Asp Gly Asp Cys Pro Arg Ser Met
35 40 45
Ile Lys Met Trp Asn Lys Asn Tyr Arg His Lys Cys Ile Asp Gly Lys
50 55 60
Cys Glu Trp Ile Lys Lys Leu Pro
65 70
<210> 158
<211> 54
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 158
Met Phe Val Tyr Asp Leu Ile Leu Phe Ile Ser Leu Ile Leu Val Val
1 5 10 15
Thr Gly Ile Asn Ala Glu Ala Asp Thr Ser Cys His Ser Phe Asp Asp
20 25 30
Cys Pro Trp Val Ala His His Tyr Arg Glu Cys Ile Glu Gly Leu Cys
35 40 45
Ala Tyr Arg Ile Leu Tyr
50
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<211> 69
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 159
Met Gln Arg Arg Lys Lys Ser Met Ala Lys Met Leu Lys Phe Phe Phe
1 5 10 15
Ala Ile Ile Leu Leu Leu Ser Leu Phe Leu Val Ala Thr Glu Val Gly
20 25 30
Gly Ala Tyr Ile Glu Cys Glu Val Asp Asp Asp Cys Pro Lys Pro Met
35 40 45
Lys Asn Ser His Pro Asp Thr Tyr Tyr Lys Cys Val Lys His Arg Cys
50 55 60
Gln Trp Ala Trp Lys
65
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<211> 140
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 160
Met Phe Val Tyr Thr Leu Ile Ile Phe Leu Phe Pro Ser His Val Ile
1 5 10 15
Thr Asn Lys Ile Ala Ile Tyr Cys Val Ser Asp Asp Asp Cys Leu Lys
20 25 30
Thr Phe Thr Pro Leu Asp Leu Lys Cys Val Asp Asn Val Cys Glu Phe
35 40 45
Asn Leu Arg Cys Lys Gly Lys Cys Gly Glu Arg Asp Glu Lys Phe Val
50 55 60
Phe Leu Lys Ala Leu Lys Lys Met Asp Gln Lys Leu Val Leu Glu Glu
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Asp Tyr Asp Asp Asp Asp Glu Glu Glu Glu Glu Glu Glu Asp Asp Val
115 120 125
Asp Met Trp Phe His Leu Pro Asp Val Val Cys His
130 135 140
<210> 161
<211> 60
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 161
Met Ala Lys Phe Ser Met Phe Val Tyr Ala Leu Ile Asn Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Glu Thr Ala Ile Thr Asn Ile Arg Cys Val Ser Asp
20 25 30
Asp Asp Cys Pro Lys Val Ile Lys Pro Leu Val Met Lys Cys Ile Gly
35 40 45
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50 55 60
<210> 162
<211> 58
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 162
Met Ala His Lys Phe Val Tyr Ala Ile Ile Leu Phe Ile Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Val Ala Lys Asn Val Lys Gly Tyr Val Val Cys Arg Thr Val Asp
20 25 30
Asp Cys Pro Pro Asp Thr Arg Asp Leu Arg Tyr Arg Cys Leu Asn Gly
35 40 45
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50 55
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<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 163
Met Gln Arg Lys Lys Asn Met Gly Gln Ile Leu Ile Phe Val Phe Ala
1 5 10 15
Leu Ile Asn Phe Leu Ser Pro Ile Leu Val Glu Met Thr Thr Thr Thr
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 164
Met Ala Gln Thr Leu Met Leu Val Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Thr Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Val Ile Ser Arg Gln Thr Asp Ile Pro Cys Lys Ser
20 25 30
Asp Asp Ala Cys Pro Arg Val Ser Ser His His Ile Glu Cys Val Lys
35 40 45
Gly Phe Cys Thr Tyr Trp Lys Leu Asp
50 55
<210> 165
<211> 77
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 165
Met Leu Arg Arg Lys Asn Thr Val Gln Ile Leu Met Phe Val Ser Ala
1 5 10 15
Leu Leu Ile Tyr Ile Phe Leu Phe Leu Val Ile Thr Ser Ser Ala Asn
20 25 30
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35 40 45
Tyr Arg Cys Asn Asp Gly Phe Cys Val Tyr Lys Ser Ile Asp Pro Ser
50 55 60
Thr Ile Pro Gln Tyr Met Thr Asp Leu Ile Phe Pro Arg
65 70 75
<210> 166
<211> 59
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 166
Met Ala Val Ile Leu Lys Phe Val Tyr Ile Met Ile Ile Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Leu Tyr Val Val Asn Gly Thr Arg Cys Asn Arg Asp Glu Asp Cys
20 25 30
Pro Phe Ile Cys Thr Gly Pro Gln Ile Pro Lys Cys Val Ser His Ile
35 40 45
Cys Phe Cys Leu Ser Ser Gly Lys Glu Ala Tyr
50 55
<210> 167
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 167
Met Asp Ala Ile Leu Lys Phe Ile Tyr Ala Met Phe Leu Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Phe Val Thr Thr Arg Asn Val Glu Ala Leu Phe Glu Cys Asn Arg
20 25 30
Asp Phe Val Cys Gly Asn Asp Asp Glu Cys Val Tyr Pro Tyr Ala Val
35 40 45
Gln Cys Ile His Arg Tyr Cys Lys Cys Leu Lys Ser Arg Asn
50 55 60
<210> 168
<211> 67
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 168
Met Gln Ile Gly Arg Lys Lys Met Gly Glu Thr Pro Lys Leu Val Tyr
1 5 10 15
Val Ile Ile Leu Phe Leu Ser Ile Phe Leu Cys Thr Asn Ser Ser Phe
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65
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<211> 76
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 169
Met Gln Met Arg Lys Asn Met Ala Gln Ile Leu Phe Tyr Val Tyr Ala
1 5 10 15
Leu Leu Ile Leu Phe Ser Pro Phe Leu Val Ala Arg Ile Met Val Val
20 25 30
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35 40 45
His Lys Leu Ala Thr Arg Met Val Cys Asn Ile Gly Phe Cys Leu Met
50 55 60
Asp Phe Thr His Asp Pro Tyr Ala Pro Ser Leu Pro
65 70 75
<210> 170
<211> 77
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 170
Met Tyr Val Tyr Tyr Ile Gln Met Gly Lys Asn Met Ala Gln Arg Phe
1 5 10 15
Met Phe Ile Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Leu Ser Gln Phe Phe Val Val
20 25 30
Ile Asn Thr Ser Asp Ile Pro Asn Asn Ser Asn Arg Asn Ser Pro Lys
35 40 45
Glu Asp Val Phe Cys Asn Ser Asn Asp Asp Cys Pro Thr Ile Leu Tyr
50 55 60
Tyr Val Ser Lys Cys Val Tyr Asn Phe Cys Glu Tyr Trp
65 70 75
<210> 171
<211> 67
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 171
Met Ala Lys Ile Val Asn Phe Val Tyr Ser Met Ile Ile Phe Val Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Thr Lys Gly Gly Ser Lys Pro Phe Leu Thr Arg
20 25 30
Pro Tyr Pro Cys Asn Thr Gly Ser Asp Cys Pro Gln Asn Met Cys Pro
35 40 45
Pro Gly Tyr Lys Pro Gly Cys Glu Asp Gly Tyr Cys Asn His Cys Tyr
50 55 60
Lys Arg Trp
65
<210> 172
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 172
Met Val Arg Thr Leu Lys Phe Val Tyr Val Ile Ile Leu Ile Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Lys Gly Gly Gly Lys Lys Ile Tyr Cys Glu Asn
20 25 30
Ala Ala Ser Cys Pro Arg Leu Met Tyr Pro Leu Val Tyr Lys Cys Leu
35 40 45
Asp Asn Lys Cys Val Lys Phe Met Met Lys Ser Arg Phe Val
50 55 60
<210> 173
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 173
Met Ala Arg Thr Leu Lys Phe Val Tyr Ala Val Ile Leu Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Lys Gly Asp Asp Val Lys Ile Lys Cys Val Val
20 25 30
Ala Ala Asn Cys Pro Asp Leu Met Tyr Pro Leu Val Tyr Lys Cys Leu
35 40 45
Asn Gly Ile Cys Val Gln Phe Thr Leu Thr Phe Pro Phe Val
50 55 60
<210> 174
<211> 65
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 174
Met Ser Asn Thr Leu Met Phe Val Ile Thr Phe Ile Val Leu Val Thr
1 5 10 15
Leu Phe Leu Gly Pro Lys Asn Val Tyr Ala Phe Gln Pro Cys Val Thr
20 25 30
Thr Ala Asp Cys Met Lys Thr Leu Lys Thr Asp Glu Asn Ile Trp Tyr
35 40 45
Glu Cys Ile Asn Asp Phe Cys Ile Pro Phe Pro Ile Pro Lys Gly Arg
50 55 60
Lys
65
<210> 175
<211> 76
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 175
Met Lys Arg Val Val Asn Met Ala Lys Ile Val Lys Tyr Val Tyr Val
1 5 10 15
Ile Ile Ile Phe Leu Ser Leu Phe Leu Val Ala Thr Lys Ile Glu Gly
20 25 30
Tyr Tyr Tyr Lys Cys Phe Lys Asp Ser Asp Cys Val Lys Leu Leu Cys
35 40 45
Arg Ile Pro Leu Arg Pro Lys Cys Met Tyr Arg His Ile Cys Lys Cys
50 55 60
Lys Val Val Leu Thr Gln Asn Asn Tyr Val Leu Thr
65 70 75
<210> 176
<211> 66
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 176
Met Lys Arg Gly Lys Asn Met Ser Lys Ile Leu Lys Phe Ile Tyr Ala
1 5 10 15
Thr Leu Val Leu Tyr Leu Phe Leu Val Val Thr Lys Ala Ser Asp Asp
20 25 30
Glu Cys Lys Ile Asp Gly Asp Cys Pro Ile Ser Trp Gln Lys Phe His
35 40 45
Thr Tyr Lys Cys Ile Asn Gln Lys Cys Lys Trp Val Leu Arg Phe His
50 55 60
Glu Tyr
65
<210> 177
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 177
Met Ala Lys Thr Leu Asn Phe Met Phe Ala Leu Ile Leu Phe Ile Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ser Lys Asn Val Ala Ile Asp Ile Phe Val Cys Gln
20 25 30
Thr Asp Ala Asp Cys Pro Lys Ser Glu Leu Ser Met Tyr Thr Trp Lys
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Cys Ile Asp Asn Glu Cys Asn Leu Phe Lys Val Met Gln Gln Met Val
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<210> 178
<211> 59
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 178
Met Ala Asn Thr His Lys Leu Val Ser Met Ile Leu Phe Ile Phe Leu
1 5 10 15
Phe Leu Val Ala Asn Asn Val Glu Gly Tyr Val Asn Cys Glu Thr Asp
20 25 30
Ala Asp Cys Pro Pro Ser Thr Arg Val Lys Arg Phe Lys Cys Val Lys
35 40 45
Gly Glu Cys Arg Trp Thr Arg Met Ser Tyr Ala
50 55
<210> 179
<211> 59
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 179
Met Ala His Phe Leu Met Phe Val Tyr Ala Leu Ile Thr Cys Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Glu Met Gly His Leu Ser Ile His Cys Val Ser Val
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35 40 45
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<210> 180
<211> 66
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 180
Met Asn Gln Ile Pro Met Phe Gly Tyr Thr Leu Ile Ile Phe Phe Ser
1 5 10 15
Leu Phe Pro Val Ile Thr Asn Gly Asp Arg Ile Pro Cys Val Thr Asn
20 25 30
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Arg Ile
65
<210> 181
<211> 61
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 181
Met Arg Lys Asp Met Ala Arg Ile Ser Leu Phe Val Tyr Ala Leu Ile
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Ile Phe Phe Ser Leu Phe Phe Val Leu Thr Asn Gly Glu Leu Glu Ile
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<210> 182
<211> 60
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 182
Met Ala Gln Ile Leu Met Phe Val Tyr Phe Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Glu Ser Ile Lys Ile Phe Thr Glu His Arg Cys Arg
20 25 30
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50 55 60
<210> 183
<211> 56
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 183
Met Ala Arg Val Ile Ser Leu Phe Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ala Thr Asn Gly Asp Leu Ser Pro Cys Leu Arg Ser
20 25 30
Gly Asp Cys Ser Lys Asp Glu Cys Pro Ser His Leu Val Pro Lys Cys
35 40 45
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50 55
<210> 184
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 184
Met Gln Arg Arg Lys Asn Met Ala Gln Ile Leu Leu Phe Ala Tyr Val
1 5 10 15
Phe Ile Ile Ser Ile Ser Leu Phe Leu Val Val Thr Asn Gly Val Lys
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<210> 185
<211> 66
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 185
Met Asn His Ile Ser Lys Phe Val Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
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50 55 60
Val Pro
65
<210> 186
<211> 86
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 186
Met Lys Ser Gln Asn His Ala Lys Phe Ile Ser Phe Tyr Lys Asn Asp
1 5 10 15
Leu Phe Lys Ile Phe Gln Asn Asn Asp Ser His Phe Lys Val Phe Phe
20 25 30
Ala Leu Ile Ile Phe Leu Tyr Thr Tyr Leu His Val Thr Asn Gly Val
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Phe Val Ser Cys Asn Ser His Ile His Cys Arg Val Asn Asn His Lys
50 55 60
Ile Gly Cys Asn Ile Pro Glu Gln Tyr Leu Leu Cys Val Asn Leu Phe
65 70 75 80
Cys Leu Trp Leu Asp Tyr
85
<210> 187
<211> 62
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 187
Met Thr Tyr Ile Ser Lys Val Val Tyr Ala Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Ile Tyr Val Gly Val Asn Asp Cys Met Leu Val Thr Cys Glu Asp His
20 25 30
Phe Asp Cys Arg Gln Asn Val Gln Gln Val Gly Cys Ser Phe Arg Glu
35 40 45
Ile Pro Gln Cys Ile Asn Ser Ile Cys Lys Cys Met Lys Gly
50 55 60
<210> 188
<211> 63
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 188
Met Thr His Ile Ser Lys Phe Val Phe Ala Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Ile Tyr Val Gly Val Asn Asp Cys Lys Arg Ile Pro Cys Lys Asp Asn
20 25 30
Asn Asp Cys Asn Asn Asn Trp Gln Leu Leu Ala Cys Arg Phe Glu Arg
35 40 45
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50 55 60
<210> 189
<211> 60
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 189
Met Val Gln Thr Pro Lys Leu Val Tyr Val Ile Val Leu Leu Leu Ser
1 5 10 15
Ile Phe Leu Gly Met Thr Ile Cys Asn Ser Ser Phe Ser His Phe Phe
20 25 30
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35 40 45
Asn Val Arg Cys Arg Lys Gly Gln Cys Val Gln Ile
50 55 60
<210> 190
<211> 77
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 190
Met Thr Lys Ile Leu Met Leu Phe Tyr Ala Met Ile Val Phe His Ser
1 5 10 15
Ile Phe Leu Val Ala Ser Tyr Thr Asp Glu Cys Ser Thr Asp Ala Asp
20 25 30
Cys Glu Tyr Ile Leu Cys Leu Phe Pro Ile Ile Lys Arg Cys Ile His
35 40 45
Asn His Cys Lys Cys Val Pro Met Gly Ser Ile Glu Pro Met Ser Thr
50 55 60
Ile Pro Asn Gly Val His Lys Phe His Ile Ile Asn Asn
65 70 75
<210> 191
<211> 64
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 191
Met Ala Lys Thr Leu Asn Phe Val Cys Ala Met Ile Leu Phe Ile Ser
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Ser Lys Asn Val Ala Leu Tyr Ile Ile Glu Cys Lys
20 25 30
Thr Asp Ala Asp Cys Pro Ile Ser Lys Leu Asn Met Tyr Asn Trp Arg
35 40 45
Cys Ile Lys Ser Ser Cys His Leu Tyr Lys Val Ile Gln Phe Met Val
50 55 60
<210> 192
<211> 72
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 192
Met Gln Lys Glu Lys Asn Met Ala Lys Thr Phe Glu Phe Val Tyr Ala
1 5 10 15
Met Ile Ile Phe Ile Leu Leu Phe Leu Val Glu Asn Asn Phe Ala Ala
20 25 30
Tyr Ile Ile Glu Cys Gln Thr Asp Asp Asp Cys Pro Lys Ser Gln Leu
35 40 45
Glu Met Phe Ala Trp Lys Cys Val Lys Asn Gly Cys His Leu Phe Gly
50 55 60
Met Tyr Glu Asp Asp Asp Asp Pro
65 70
<210> 193
<211> 57
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 193
Met Ala Ala Thr Arg Lys Phe Ile Tyr Val Leu Ser His Phe Leu Phe
1 5 10 15
Leu Phe Leu Val Thr Lys Ile Thr Asp Ala Arg Val Cys Lys Ser Asp
20 25 30
Lys Asp Cys Lys Asp Ile Ile Ile Tyr Arg Tyr Ile Leu Lys Cys Arg
35 40 45
Asn Gly Glu Cys Val Lys Ile Lys Ile
50 55
<210> 194
<211> 75
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 194
Met Gln Arg Leu Asp Asn Met Ala Lys Asn Val Lys Phe Ile Tyr Val
1 5 10 15
Ile Ile Leu Leu Leu Phe Ile Phe Leu Val Ile Ile Val Cys Asp Ser
20 25 30
Ala Phe Val Pro Asn Ser Gly Pro Cys Thr Thr Asp Lys Asp Cys Lys
35 40 45
Gln Val Lys Gly Tyr Ile Ala Arg Cys Arg Lys Gly Tyr Cys Met Gln
50 55 60
Ser Val Lys Arg Thr Trp Ser Ser Tyr Ser Arg
65 70 75
<210> 195
<211> 102
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 195
Met Lys Phe Ile Tyr Ile Met Ile Leu Phe Leu Ser Leu Phe Leu Val
1 5 10 15
Gln Phe Leu Thr Cys Lys Gly Leu Thr Val Pro Cys Glu Asn Pro Thr
20 25 30
Thr Cys Pro Glu Asp Phe Cys Thr Pro Pro Met Ile Thr Arg Cys Ile
35 40 45
Asn Phe Ile Cys Leu Cys Asp Gly Pro Glu Tyr Ala Glu Pro Glu Tyr
50 55 60
Asp Gly Pro Glu Pro Glu Tyr Asp His Lys Gly Asp Phe Leu Ser Val
65 70 75 80
Lys Pro Lys Ile Ile Asn Glu Asn Met Met Met Arg Glu Arg His Met
85 90 95
Met Lys Glu Ile Glu Val
100
<210> 196
<211> 59
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 196
Met Ala Gln Phe Leu Met Phe Ile Tyr Val Leu Ile Ile Phe Leu Tyr
1 5 10 15
Leu Phe Tyr Val Glu Ala Ala Met Phe Glu Leu Thr Lys Ser Thr Ile
20 25 30
Arg Cys Val Thr Asp Ala Asp Cys Pro Asn Val Val Lys Pro Leu Lys
35 40 45
Pro Lys Cys Val Asp Gly Phe Cys Glu Tyr Thr
50 55
<210> 197
<211> 70
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 197
Met Lys Met Arg Ile His Met Ala Gln Ile Ile Met Phe Phe Tyr Ala
1 5 10 15
Leu Ile Ile Phe Leu Ser Pro Phe Leu Val Asp Arg Arg Ser Phe Pro
20 25 30
Ser Ser Phe Val Ser Pro Lys Ser Tyr Thr Ser Glu Ile Pro Cys Lys
35 40 45
Ala Thr Arg Asp Cys Pro Tyr Glu Leu Tyr Tyr Glu Thr Lys Cys Val
50 55 60
Asp Ser Leu Cys Thr Tyr
65 70
<210> 198
<211> 41
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 198
Thr Arg Met Leu Thr Ile Pro Cys Thr Ser Asp Asp Asn Cys Pro Lys
1 5 10 15
Val Ile Ser Pro Cys His Thr Lys Cys Phe Asp Gly Phe Cys Gly Trp
20 25 30
Tyr Ile Glu Gly Ser Tyr Glu Gly Pro
35 40
<210> 199
<211> 69
<212> PRT
<213> Medicago truncatula
<400> 199
Met Ala Gln Phe Leu Leu Phe Val Tyr Ser Leu Ile Ile Phe Leu Ser
1 5 10 15
Leu Phe Phe Gly Glu Ala Ala Phe Glu Arg Thr Glu Thr Arg Met Leu
20 25 30
Thr Ile Pro Cys Thr Ser Asp Asp Asn Cys Pro Lys Val Ile Ser Pro
35 40 45
Cys His Thr Lys Cys Phe Asp Gly Phe Cys Gly Trp Tyr Ile Glu Gly
50 55 60
Ser Tyr Glu Gly Pro
65
<210> 200
<211> 78
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 200
Met Lys Leu Leu His Gly Phe Leu Ile Ile Met Leu Thr Met His Leu
1 5 10 15
Ser Ile Gln Tyr Ala Tyr Gly Gly Pro Phe Leu Thr Lys Tyr Leu Cys
20 25 30
Asp Arg Val Cys His Lys Leu Cys Gly Asp Glu Phe Val Cys Ser Cys
35 40 45
Ile Gln Tyr Lys Ser Leu Lys Gly Leu Trp Phe Pro His Cys Pro Thr
50 55 60
Gly Lys Ala Ser Val Val Leu His Asn Phe Leu Thr Ser Pro
65 70 75
<210> 201
<211> 77
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 201
Met Lys Leu Leu Tyr Gly Phe Leu Ile Ile Met Leu Thr Ile His Leu
1 5 10 15
Ser Val Gln Tyr Phe Glu Ser Pro Phe Glu Thr Lys Tyr Asn Cys Asp
20 25 30
Thr His Cys Asn Lys Leu Cys Gly Lys Ile Asp His Cys Ser Cys Ile
35 40 45
Gln Tyr His Ser Met Glu Gly Leu Trp Phe Pro His Cys Arg Thr Gly
50 55 60
Ser Ala Ala Gln Met Leu His Asp Phe Leu Ser Asn Pro
65 70 75
<210> 202
<211> 86
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 202
Met Ser Val Arg Lys Asn Val Leu Pro Thr Met Phe Val Val Leu Leu
1 5 10 15
Ile Met Ser Pro Val Thr Pro Thr Ser Val Phe Ile Ser Ala Val Cys
20 25 30
Tyr Ser Gly Cys Gly Ser Leu Ala Leu Val Cys Phe Val Ser Asn Gly
35 40 45
Ile Thr Asn Gly Leu Asp Tyr Phe Lys Ser Ser Ala Pro Leu Ser Thr
50 55 60
Ser Glu Thr Ser Cys Gly Glu Ala Phe Asp Thr Cys Thr Asp His Cys
65 70 75 80
Leu Ala Asn Phe Lys Phe
85
<210> 203
<211> 69
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 203
Met Arg Leu Leu Tyr Gly Phe Leu Ile Ile Met Leu Thr Ile Tyr Leu
1 5 10 15
Ser Val Gln Asp Phe Asp Pro Thr Glu Phe Lys Gly Pro Phe Pro Thr
20 25 30
Ile Glu Ile Cys Ser Lys Tyr Cys Ala Val Val Cys Asn Tyr Thr Ser
35 40 45
Arg Pro Cys Tyr Cys Val Glu Ala Ala Lys Glu Arg Asp Gln Trp Phe
50 55 60
Pro Tyr Cys Tyr Asp
65
<210> 204
<211> 77
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 204
Met Arg Leu Leu Tyr Gly Phe Leu Ile Ile Met Leu Thr Ile His Leu
1 5 10 15
Ser Val Gln Asp Ile Asp Pro Asn Thr Leu Arg Gly Pro Tyr Pro Thr
20 25 30
Lys Glu Ile Cys Ser Lys Tyr Cys Glu Tyr Asn Val Val Cys Gly Ala
35 40 45
Ser Leu Pro Cys Ile Cys Val Gln Asp Ala Arg Gln Leu Asp His Trp
50 55 60
Phe Ala Cys Cys Tyr Asp Gly Gly Pro Glu Met Leu Met
65 70 75
<210> 205
<211> 108
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 205
Met Lys Leu Phe Val Val Val Val Leu Val Ala Val Gly Ile Met Phe
1 5 10 15
Val Phe Ala Ser Asp Thr Ala Ala Ala Pro Thr Asp Tyr Glu Asp Thr
20 25 30
Asn Asp Met Ile Ser Leu Ser Ser Leu Val Gly Asp Asn Ser Pro Tyr
35 40 45
Val Arg Val Ser Ser Ala Asp Ser Gly Gly Ser Ser Lys Thr Ser Ser
50 55 60
Lys Asn Pro Ile Leu Gly Leu Leu Lys Ser Val Ile Lys Leu Leu Thr
65 70 75 80
Lys Ile Phe Gly Thr Tyr Ser Asp Ala Ala Pro Ala Met Pro Pro Ile
85 90 95
Pro Pro Ala Leu Arg Lys Asn Arg Gly Met Leu Ala
100 105
<210> 206
<211> 178
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 206
Met Val Ala Cys Lys Val Ile Leu Ala Val Ala Val Val Phe Val Ala
1 5 10 15
Ala Val Gln Gly Arg Pro Gly Gly Glu Pro Glu Trp Ala Ala Pro Ile
20 25 30
Phe Ala Glu Leu Lys Ser Val Ser Asp Asn Ile Thr Asn Leu Val Gly
35 40 45
Leu Asp Asn Ala Gly Glu Tyr Ala Thr Ala Ala Lys Asn Asn Leu Asn
50 55 60
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65 70 75 80
Phe Glu Gly Lys Ala Ser Ala Ser Asp Val Phe Lys Glu Ser Thr Lys
85 90 95
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100 105 110
Leu Thr Leu Lys Asp Phe Thr Glu Lys Ser Glu Gln Ala Leu Lys Tyr
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Leu Ile Gly Gln Gly Lys Ala Leu Gln Ala Lys Ile Ala Glu Ala Lys
165 170 175
Lys Ala
<210> 207
<211> 311
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 207
Met Lys Thr Ser Ser Ser Lys Val Phe Ala Ser Cys Val Ala Ile Val
1 5 10 15
Cys Leu Ala Ser Val Ala Asn Ala Leu Pro Val Gln Lys Ser Val Ala
20 25 30
Ala Thr Thr Glu Asn Pro Ile Val Glu Lys His Gly Cys Arg Ala His
35 40 45
Lys Asn Leu Val Arg Gln Asn Val Val Asp Leu Lys Thr Tyr Asp Ser
50 55 60
Met Leu Ile Thr Asn Glu Val Val Gln Lys Gln Ser Asn Glu Val Gln
65 70 75 80
Ser Ser Glu Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Glu Gln Ser Asn Glu
85 90 95
Gly Gln Asn Ser Glu Gln Ser Asn Glu Val Gln Ser Ser Glu His Ser
100 105 110
Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Glu
115 120 125
Gln Ser Asn Glu Val Gln Ser Ser Glu His Ser Asn Glu Gly Gln Asn
130 135 140
Ser Glu Gln Ser Asn Glu Val Gln Ser Ser Glu His Ser Asn Glu Gly
145 150 155 160
Gln Asn Ser Lys Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys Gln Ser Asn
165 170 175
Glu Val Gln Ser Ser Glu His Trp Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys Gln
180 185 190
Ser Asn Glu Asp Gln Asn Ser Glu Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser
195 200 205
Lys Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys Gln Ser Asn Glu Asp Gln
210 215 220
Asn Ser Glu Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys Gln Ser Asn Glu
225 230 235 240
Val Gln Ser Ser Glu Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys Gln Ser
245 250 255
Asn Glu Gly Gln Ser Ser Glu Gln Ser Asn Glu Gly Gln Asn Ser Lys
260 265 270
Gln Ser Asn Glu Val Gln Ser Pro Glu Glu His Tyr Asp Leu Pro Asp
275 280 285
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290 295 300
Gly Asp Asp Ser Glu His Arg
305 310
<210> 208
<211> 431
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 208
Met Lys Thr Ile Ile Leu Gly Leu Cys Leu Phe Gly Ala Leu Phe Trp
1 5 10 15
Ser Thr Gln Ser Met Pro Val Gly Glu Val Ala Pro Ala Val Pro Ala
20 25 30
Val Pro Ser Glu Ala Val Pro Gln Lys Gln Val Glu Ala Lys Pro Glu
35 40 45
Thr Asn Ala Ala Ser Pro Val Ser Asp Ala Lys Pro Glu Ser Asp Ser
50 55 60
Lys Pro Val Asp Ala Glu Val Lys Pro Thr Val Ser Glu Val Lys Ala
65 70 75 80
Glu Ser Glu Gln Lys Pro Ser Gly Glu Pro Lys Pro Glu Ser Asp Ala
85 90 95
Lys Pro Val Val Ala Ser Glu Ser Lys Pro Glu Ser Asp Pro Lys Pro
100 105 110
Ala Ala Val Val Glu Ser Lys Pro Glu Asn Asp Ala Val Ala Pro Glu
115 120 125
Thr Asn Asn Asp Ala Lys Pro Glu Asn Ala Ala Ala Pro Val Ser Glu
130 135 140
Asn Lys Pro Ala Thr Asp Ala Lys Ala Glu Thr Glu Leu Ile Ala Gln
145 150 155 160
Ala Lys Pro Glu Ser Lys Pro Ala Ser Asp Leu Lys Ala Glu Pro Glu
165 170 175
Ala Ala Lys Pro Asn Ser Glu Val Pro Val Ala Leu Pro Leu Asn Pro
180 185 190
Thr Glu Thr Lys Ala Thr Gln Gln Ser Val Glu Thr Asn Gln Val Glu
195 200 205
Gln Ala Ala Pro Ala Ala Ala Gln Ala Asp Pro Ala Ala Ala Pro Ala
210 215 220
Ala Asp Pro Ala Pro Ala Pro Ala Ala Ala Pro Val Ala Ala Glu Glu
225 230 235 240
Ala Lys Leu Ser Glu Ser Ala Pro Ser Thr Glu Asn Lys Ala Ala Glu
245 250 255
Glu Pro Ser Lys Pro Ala Glu Gln Gln Ser Ala Lys Pro Val Glu Asp
260 265 270
Ala Val Pro Ala Ala Ser Glu Ile Ser Glu Thr Lys Val Ser Pro Ala
275 280 285
Val Pro Ala Val Pro Glu Val Pro Ala Ser Pro Ser Ala Pro Ala Val
290 295 300
Ala Asp Pro Val Ser Ala Pro Glu Ala Glu Lys Asn Ala Glu Pro Ala
305 310 315 320
Lys Ala Ala Asn Ser Ala Glu Pro Ala Val Gln Ser Glu Ala Lys Pro
325 330 335
Ala Glu Asp Ile Gln Lys Ser Gly Ala Val Val Ser Ala Glu Asn Pro
340 345 350
Lys Pro Val Glu Glu Gln Lys Pro Ala Glu Val Ala Lys Pro Ala Glu
355 360 365
Gln Ser Lys Ser Glu Ala Pro Ala Glu Ala Pro Lys Pro Thr Glu Gln
370 375 380
Ser Ala Ala Glu Glu Pro Lys Lys Pro Glu Ser Ala Asn Asp Glu Lys
385 390 395 400
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405 410 415
Pro Thr Asp Ser Ile Met Lys Lys Gln Lys Gln Lys Lys Ala Asn
420 425 430
<210> 209
<211> 160
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 209
Met Asn Gly Lys Ile Val Leu Cys Phe Ala Val Val Phe Ile Gly Gln
1 5 10 15
Ala Met Ser Ala Ala Thr Gly Thr Thr Pro Glu Val Glu Asp Ile Lys
20 25 30
Lys Val Ala Glu Gln Met Ser Gln Thr Phe Met Ser Val Ala Asn His
35 40 45
Leu Val Gly Ile Thr Pro Asn Ser Ala Asp Ala Gln Lys Ser Ile Glu
50 55 60
Lys Ile Arg Thr Ile Met Asn Lys Gly Phe Thr Asp Met Glu Thr Glu
65 70 75 80
Ala Asn Lys Met Lys Asp Ile Val Arg Lys Asn Ala Asp Pro Lys Leu
85 90 95
Val Glu Lys Tyr Asp Glu Leu Glu Lys Glu Leu Lys Lys His Leu Ser
100 105 110
Thr Ala Lys Asp Met Phe Glu Asp Lys Val Val Lys Pro Ile Gly Glu
115 120 125
Lys Val Glu Leu Lys Lys Ile Thr Glu Asn Val Ile Lys Thr Thr Lys
130 135 140
Asp Met Glu Ala Thr Met Asn Lys Ala Ile Asp Gly Phe Lys Lys Gln
145 150 155 160
<210> 210
<211> 415
<212> PRT
<213> Buchnera aphidicola
<400> 210
Met His Leu Phe Leu Ala Leu Gly Leu Phe Ile Val Cys Gly Met Val
1 5 10 15
Asp Ala Thr Phe Tyr Asn Pro Arg Ser Gln Thr Phe Asn Gln Leu Met
20 25 30
Glu Arg Arg Gln Arg Ser Ile Pro Ile Pro Tyr Ser Tyr Gly Tyr His
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50 55 60
Gly Leu Asp Ser Arg Ile Asn Thr Phe Lys Pro Ile Tyr Gln Asn Val
65 70 75 80
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85 90 95
Pro Lys Asn Ser Leu Tyr Asp Ser Glu Tyr Ile Ser Ala Lys Asp Ile
100 105 110
Pro Ser Leu Phe Pro Glu Glu Asp Ser Tyr Asp Tyr Lys Tyr Leu Gly
115 120 125
Ser Pro Leu Asn Lys Tyr Leu Thr Arg Pro Ser Thr Gln Glu Ser Gly
130 135 140
Ile Ala Ile Asn Leu Val Ala Ile Lys Glu Thr Ser Val Phe Asp Tyr
145 150 155 160
Gly Phe Pro Thr Tyr Lys Ser Pro Tyr Ser Ser Asp Ser Val Trp Asn
165 170 175
Phe Gly Ser Lys Ile Pro Asn Thr Val Phe Glu Asp Pro Gln Ser Val
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Glu Ser Asp Pro Asn Thr Phe Lys Val Ser Ser Pro Thr Ile Lys Ile
195 200 205
Val Lys Leu Leu Pro Glu Thr Pro Glu Gln Glu Ser Ile Ile Thr Thr
210 215 220
Thr Lys Asn Tyr Glu Leu Asn Tyr Lys Thr Thr Gln Glu Thr Pro Thr
225 230 235 240
Glu Ala Glu Leu Tyr Pro Ile Thr Ser Glu Glu Phe Gln Thr Glu Asp
245 250 255
Glu Trp His Pro Met Val Pro Lys Glu Asn Thr Thr Lys Asp Glu Ser
260 265 270
Ser Phe Ile Thr Thr Glu Glu Pro Leu Thr Glu Asp Lys Ser Asn Ser
275 280 285
Ile Thr Ile Glu Lys Thr Gln Thr Glu Asp Glu Ser Asn Ser Ile Glu
290 295 300
Phe Asn Ser Ile Arg Thr Glu Glu Lys Ser Asn Ser Ile Thr Thr Glu
305 310 315 320
Glu Asn Gln Lys Glu Asp Asp Glu Ser Met Ser Thr Thr Ser Gln Glu
325 330 335
Thr Thr Thr Ala Phe Asn Leu Asn Asp Thr Phe Asp Thr Asn Arg Tyr
340 345 350
Ser Ser Ser His Glu Ser Leu Met Leu Arg Ile Arg Glu Leu Met Lys
355 360 365
Asn Ile Ala Asp Gln Gln Asn Lys Ser Gln Phe Arg Thr Val Asp Asn
370 375 380
Ile Pro Ala Lys Ser Gln Ser Asn Leu Ser Ser Asp Glu Ser Thr Asn
385 390 395 400
Gln Gln Phe Glu Pro Gln Leu Val Asn Gly Ala Asp Thr Tyr Lys
405 410 415
<210> 211
<211> 126
<212> PRT
<213> Sitophilus zeamais
<400> 211
Met Thr Arg Thr Met Leu Phe Leu Ala Cys Val Ala Ala Leu Tyr Val
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Cys Ile Ser Ala Thr Ala Gly Lys Pro Glu Glu Phe Ala Lys Leu Ser
20 25 30
Asp Glu Ala Pro Ser Asn Asp Gln Ala Met Tyr Glu Ser Ile Gln Arg
35 40 45
Tyr Arg Arg Phe Val Asp Gly Asn Arg Tyr Asn Gly Gly Gln Gln Gln
50 55 60
Gln Gln Gln Pro Lys Gln Trp Glu Val Arg Pro Asp Leu Ser Arg Asp
65 70 75 80
Gln Arg Gly Asn Thr Lys Ala Gln Val Glu Ile Asn Lys Lys Gly Asp
85 90 95
Asn His Asp Ile Asn Ala Gly Trp Gly Lys Asn Ile Asn Gly Pro Asp
100 105 110
Ser His Lys Asp Thr Trp His Val Gly Gly Ser Val Arg Trp
115 120 125
<210> 212
<211> 220
<212> PRT
<213> Acyrthosiphon pisum
<400> 212
Met Lys Glu Thr Thr Val Val Trp Ala Lys Leu Phe Leu Ile Leu Ile
1 5 10 15
Ile Leu Ala Lys Pro Leu Gly Leu Lys Ala Val Asn Glu Cys Lys Arg
20 25 30
Leu Gly Asn Asn Ser Cys Arg Ser His Gly Glu Cys Cys Ser Gly Phe
35 40 45
Cys Phe Ile Glu Pro Gly Trp Ala Leu Gly Val Cys Lys Arg Leu Gly
50 55 60
Thr Pro Lys Lys Ser Asp Asp Ser Asn Asn Gly Lys Asn Ile Glu Lys
65 70 75 80
Asn Asn Gly Val His Glu Arg Ile Asp Asp Val Phe Glu Arg Gly Val
85 90 95
Cys Ser Tyr Tyr Lys Gly Pro Ser Ile Thr Ala Asn Gly Asp Val Phe
100 105 110
Asp Glu Asn Glu Met Thr Ala Ala His Arg Thr Leu Pro Phe Asn Thr
115 120 125
Met Val Lys Val Glu Gly Met Gly Thr Ser Val Val Val Lys Ile Asn
130 135 140
Asp Arg Lys Thr Ala Ala Asp Gly Lys Val Met Leu Leu Ser Arg Ala
145 150 155 160
Ala Ala Glu Ser Leu Asn Ile Asp Glu Asn Thr Gly Pro Val Gln Cys
165 170 175
Gln Leu Lys Phe Val Leu Asp Gly Ser Gly Cys Thr Pro Asp Tyr Gly
180 185 190
Asp Thr Cys Val Leu His His Glu Cys Cys Ser Gln Asn Cys Phe Arg
195 200 205
Glu Met Phe Ser Asp Lys Gly Phe Cys Leu Pro Lys
210 215 220
<210> 213
<211> 16
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Penetratin
<400> 213
Arg Gln Ile Lys Ile Trp Phe Gln Asn Arg Arg Met Lys Trp Lys Lys
1 5 10 15
<210> 214
<211> 13
<212> PRT
<213> Human immunodeficiency virus type 1
<400> 214
Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Pro Pro Gln
1 5 10
<210> 215
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> pVEC
<400> 215
Leu Leu Ile Ile Leu Arg Arg Arg Ile Arg Lys Gln Ala His Ala His
1 5 10 15
Ser Lys
<210> 216
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Transportan
<400> 216
Gly Trp Thr Leu Asn Ser Ala Gly Tyr Leu Leu Gly Lys Ile Asn Leu
1 5 10 15
Lys Ala Leu Ala Ala Leu Ala Lys Lys Ile Leu
20 25
<210> 217
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MPG
<400> 217
Gly Ala Leu Phe Leu Gly Phe Leu Gly Ala Ala Gly Ser Thr Met Gly
1 5 10 15
Ala Trp Ser Gln Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val
20 25
<210> 218
<211> 21
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Pep-1
<400> 218
Lys Glu Thr Trp Trp Glu Thr Trp Trp Thr Glu Trp Ser Gln Pro Lys
1 5 10 15
Lys Lys Arg Lys Val
20
<210> 219
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MAP
<400> 219
Lys Leu Ala Leu Lys Leu Ala Leu Lys Ala Leu Lys Ala Ala Leu Lys
1 5 10 15
Leu Ala
<210> 220
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> R6W3
<400> 220
Arg Arg Trp Trp Arg Arg Trp Arg Arg
1 5
<210> 221
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Asaia forward primer
<400> 221
gtgccgatct ctaaaagccg tctca 25
<210> 222
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Asaia reverse primer
<400> 222
ttcgctcacc ggcttcgggt 20
<210> 223
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> S7 forward primer
<400> 223
gtgcgcgagt tggagaaga 19
<210> 224
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> S7 reverse primer
<400> 224
atcggtttgg gcagaatgc 19
<210> 225
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Wolbachia forward primer
<400> 225
tcagccacac tggaactgag 20
<210> 226
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Wolbachia reverse primer
<400> 226
taacgctagc cctctccgta 20
<210> 227
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> S7 forward primer
<400> 227
aaggtcgaca ccttcacgtc 20
<210> 228
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> S7 reverse primer
<400> 228
ccgtttggtg agggtcttta 20
<210> 229
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Rickettsia forward primer
<400> 229
tacgccactc cctgtgtca 19
<210> 230
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Rickettsia reverse primer
<400> 230
gatgtaacgg tattacacca acag 24
<210> 231
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Bacillus forward primer
<400> 231
gaggtagacg aagcgacctg 20
<210> 232
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Bacillus reverse primer
<400> 232
ttccctcacg gtactggttc 20
<210> 233
<211> 17
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Buchnera forward primer
<400> 233
gtcggctcat cacatcc 17
<210> 234
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Buchnera reverse primer
<400> 234
ttccgtctgt attatctcct 20
<210> 235
<211> 390
<212> DNA
<213> Sitophilus zeamais
<400> 235
catatgatga cccgcaccat gctgtttctg gcgtgcgtgg cggcgctgta tgtgtgcatt 60
agcgcgaccg cgggcaaacc ggaagaattt gcgaaactga gcgatgaagc gccgagcaac 120
gatcaggcga tgtatgaaag cattcagcgc tatcgccgct ttgtggatgg caaccgctat 180
aacggcggcc agcagcagca gcagcagccg aaacagtggg aagtgcgccc ggatctgagc 240
cgcgatcagc gcggcaacac caaagcgcag gtggaaatta acaaaaaagg cgataaccat 300
gatattaacg cgggctgggg caaaaacatt aacggcccgg atagccataa agatacctgg 360
catgtgggcg gcagcgtgcg ctggctcgag 390
<210> 236
<211> 34
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ColA forward primer
<400> 236
gtatctattc ccgtctacga acatatggaa ttcc 34
<210> 237
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ColA reverse primer
<400> 237
ccgctcgagc catctgacac ttcctccaa 29
<210> 238
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Buch_groES_18F forward primer
<400> 238
catgatcgtg tgcttgttaa g 21
<210> 239
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Buch_groES_98R reverse primer
<400> 239
ctgttcctcg agtcgatttc c 21
<210> 240
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ApEF1a 107F forward primer
<400> 240
ctgattgtgc cgtgcttatt g 21
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<211> 21
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<223> ApEF1a 246R reverse primer
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Sod_F forward primer
<400> 242
atagctgtcc agacgcttcg 20
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<223> Sod_R reverse primer
<400> 243
atgtcgtcga ggcgattacc 20
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<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SACT144_FOR forward primer
<400> 244
ggtgttggcg tacaagtcct 20
<210> 245
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SACT314_REV reverse primer
<400> 245
gaattgcctg atggacaggt 20
Claims (9)
- ヒト病原体のベクターの適応度を低下させる方法であって、
以下:セクロピン(配列番号82)、メリチン、コプシン、ドロソマイシン(配列番号93)、ダームシジン(配列番号81)、アンドロピン(配列番号83)、モリシン(配列番号84)、セラトトキシン(配列番号85)、アバエシン(配列番号86)、アピダエシン(配列番号87)、プロフェニン(配列番号88)、インドリシジン(配列番号89)、プロテグリン(配列番号90)、タキプレシン(配列番号91)又はデフェンシン(配列番号92)の1つ以上と少なくとも90%の配列同一性を有する抗微生物ペプチドを前記ベクターに送達すること
を含む方法。 - 前記送達は、前記ベクターが成長、生活、繁殖、摂餌又は寄生する少なくとも1つの生息場所に前記抗微生物ペプチドを送達することを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記抗微生物ペプチドは、前記ベクターによる摂取のための、昆虫が摂食可能な組成物で送達される、請求項1又は2に記載の方法。
- 前記抗微生物ペプチドは、液体、固体、エアロゾル、ペースト、ゲル又は気体組成物として製剤化される、請求項1~3のいずれか一項に記載の方法。
- 昆虫は、カ、小昆虫類、シラミ、スナバエ、マダニ、サシガメ、ツェツェバエ又はノミの少なくとも1つである、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
- ヒト病原体のベクター内の微生物を標的とするように製剤化される、以下:セクロピン、メリチン、コプシン、ドロソマイシン、ダームシジン、アンドロピン、モリシン、セラトトキシン、アバエシン、アピダエシン、プロフェニン、インドリシジン、プロテグリン、タキプレシン又はデフェンシンの1つ以上と少なくとも90%の配列同一性を有する抗微生物ペプチドを含む組成物。
- 前記抗微生物ペプチドは、前記組成物中において約0.1ng/g~約100mg/gの濃度である、請求項6に記載の組成物。
- 前記抗微生物ペプチドは、ターゲティングドメインを更に含む、請求項6又は7に記載の組成物。
- 前記抗微生物ペプチドは、細胞透過性ペプチドを更に含む、請求項6~8のいずれか一項に記載の組成物。
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