JP2022544954A - 超高速pcr反応検出システム及び検出方法 - Google Patents
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Abstract
Description
又は、前記伝動装置は前記反応管固定装置に接続され、且つ前記反応管固定装置を駆動して移動させることで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられ、
又は、前記伝動装置は第1伝動機構と第2伝動機構とを含み、前記第1伝動機構は温度制御装置に接続され、且つ前記温度制御装置を駆動して移動させることができ、前記第2伝動機構は前記反応管固定装置に接続され、且つ前記反応管固定装置を駆動して移動させることができる。前記第1伝動機構と前記第2伝動機構が協働することで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられる。
又は、第2伝動機構は偏心輪の回転によって反応管固定装置を連れて上下に運動させる。
好ましくは、前記第1所定の温度の範囲は100~150℃であり、前記第2所定の温度の範囲は15~55℃である。
(1)装置をオンにして予熱し、被験サンプル及び試薬を反応管に入れて混合する、準備ステップと、
(2)反応管を反応管固定装置に固設し、伝動装置が動作して、反応管が高温モジュールに挿し込まれ、高温浴を行うステップと、
(3)反応管温度が所定の温度になった後、伝動装置が動作して、反応管が低温モジュールに挿し込まれ、冷却されるステップと、
(4)データ収集と、
(5)ステップ(2)~(4)の繰り返しとを含む。
又は/且つ、ステップ(3)で反応管が冷却された後は、第2伝動機構がリセットされ、中温モジュールが反応管の真下に移動し、一定の時間保持されるステップをさらに含む。
本発明の超高速PCR検出システムは、高温モジュールと、低温モジュールと、伝動装置、光学検出装置と、反応管固定装置とを含む。反応管を反応管固定装置に取り付けることができ、取り付けた後にプレスカバーで押し付け、実験中に反応管は反応管固定装置に従って運動することができる。高温モジュールは第1所定の温度を超える温度制御を提供して、反応管を迅速に目標温度に加熱することができ、低温モジュールは第2所定の温度の温度制御を提供して、反応管を迅速に目標温度に冷却することができる。通常の増幅サイクルの変性及びアニーリング工程の場合は、パススルー温度制御を採用し、予変性が特定の温度に一定の時間保持されるべき工程の場合は、当該温度制御モジュール(高温モジュール)において一定の周波数で上下に運動することによって持続的な温度を保持する。
前記温度制御装置は少なくとも2つの温度制御モジュールを含み、そのうち少なくとも1つの前記温度制御モジュールは高温モジュールで少なくとも1つの前記温度制御モジュールは低温モジュールであり、前記高温モジュールの加熱温度は第1所定の温度であり、前記低温モジュールの加熱温度は第2所定の温度であり、前記第1所定の温度は前記第2所定の温度より大きく、
前記伝動装置が前記温度制御装置及び前記反応管固定装置と協働することで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられる。
(1)装置をオンして予熱し、被験サンプル及び試薬を反応管に入れて混合する、準備ステップと、
(2)高温モジュールが反応管の真下に移動し、第2伝動機構が最低点に下降して、反応管の高温浴を行うステップと、
(3)反応管温度が所定の温度になった後、第2伝動機構がリセットされ、低温モジュールが反応管の真下に移動し、第2伝動機構が最低点に下降して、冷却するステップと、
(4)第2伝動機構がリセットされ、中温モジュールが反応管の真下に移動し、一定の時間保持されるステップと、
(5)データ収集と、
(6)ステップ(2)~(5)の繰り返しとを含む。
1.反応システムが安定的に移動し、構造がコンパクトであるため、装置の運動速度が向上している。
変性が88℃、1秒で、
アニーリングが66℃、1秒である。当該温度下で検出し、検出後に次のプロセスを開始する。
40サイクルである。
本実験で記録した温度曲線は、図5に示すとおりである。
コントロール群1:装置に使用するプレスカバーはアルミニウム金属材質
温度制御モジュールは左側から順に1番~8番と付番し、1番~8番の8つの位置で各1回試験を行って、異なる位置の穴の再現性を検討した。テスト前にはまとめて10×テスト系を調製し、8つの100μL透明反応管に分注し、各管に20μLを分注して混合した後、反応系に20μLのパラフィンオイルを加え、それぞれ1番~8番にセットしてテストし、温度制御プロセスは次のとおりである。
増幅条件設定:
予変性が88℃、2分で、
変性が88℃、1秒で、
アニーリングが64℃、1秒である。当該温度下で検出し、検出後に次のプロセスを開始する。
40サイクルである。
検出結果を図6に示し、図6からは8番の再現性がまだよいが、3番の再現性は優れないことが示されている。
温度制御モジュールの検出穴は左から順に1番~8番と付番し、3番、5番、7番でテストするのを3回繰り返すことで、合計で9つの曲線を得て、異なる位置の穴の再現性を検討した。
予変性が88℃、2分で、
変性が88℃、1秒で、
アニーリングが64℃、1秒である。当該温度下で検出し、検出後に次のプロセスを開始する。
40サイクルである。
テスト前にはまとめて10×テスト系を調製し、9つの100μL透明反応管に分注し、各管に20μLを分注して混合した後、反応系に20μLのパラフィンオイルを加え、それぞれ3番、5番、7番にセットしてテストした。検出結果は図7に示すとおりである。
検出プロセスは具体的に次のとおりである。
温度制御モジュールは左から順に1番~8番と付番し、2番と5番の2つの位置で各5回試験を繰り返すことで、再現性を検討した。テスト前にはまとめて10×テスト系を調製し、10の100μL透明反応管に分注し、各管に20μLを分注して混合した後、反応系に20μLのパラフィンオイルを加え、冷蔵庫(2~8℃)にセットして保存し、実験を行うたびに冷蔵庫から2つの反応管を取り出してそれぞれ2番と5番にセットしてテストし、温度制御プロセスは次のとおりである。
本検出で超高速PCR装置の温度制御モジュールの設定は、高温モジュールが120℃で、低温モジュールが47℃である。
予変性が88℃、2分で、
変性が88℃、1秒で、
アニーリングが64℃、1秒である。当該温度下で検出し、検出後に次のプロセスを開始する。
40サイクルである。
検出結果を図8、図9に示し、2番と5番の位置で各5回テストを繰り返した増幅曲線から、単独な穴でテストした場合に再現性が良好であることが分かった。
実験プロセスは次のとおりである。
予変性が90℃、2分で、
変性が90℃、1秒で、
アニーリングが60、7秒である。当該温度下で検出し、検出後に次のプロセスを開始する。
40サイクルである。
図11はコントロールとしてQPCR装置、及びFQPCRでテストした10^1~10^5コピーの増幅状況である。曲線からは、2つの装置でテストしたところ有意差がなく、異なる濃度のサンプルのCt値の間隔も同等であることが分かった。
11 中温モジュール
12 低温モジュール
13 高温モジュール
2 第1伝動機構
21 ねじモータ
22 ガイド駆動軸
3 光学検出装置
31 光学読取ヘッド
32 第3伝動機構
321 ステッピングモータI
322 ガードレール
323 ベルト
324 接続部品
3241 凹溝
3242 挟み板
4 第2伝動機構
41 ステッピングモータII
42 偏心輪
5 反応管固定装置
51 横支持板
52 反応管固定位置
53 プレスカバー
54 縦支持部品
55 カラム
56 ばね
6 制御システム。
Claims (10)
- 温度制御装置と、伝動装置と、反応管固定装置とを含み、
前記温度制御装置は少なくとも2つの温度制御モジュールを含み、そのうち少なくとも1つの前記温度制御モジュールは高温モジュールで少なくとも1つの前記温度制御モジュールは低温モジュールであり、前記高温モジュールの加熱温度は第1所定の温度であり、前記低温モジュールの加熱温度は第2所定の温度であり、前記第1所定の温度は前記第2所定の温度より大きく、
前記伝動装置が前記温度制御装置及び前記反応管固定装置と協働することで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられることを特徴とする超高速PCR反応検出システム。 - 前記伝動装置は前記温度制御装置に接続され、且つ前記高温モジュールと前記低温モジュールを駆動して移動させることで、前記反応管固定装置における反応管を前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えることができ、
又は、前記伝動装置は前記反応管固定装置に接続され、且つ前記反応管固定装置を駆動して移動させることで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられ、
又は、前記伝動装置は第1伝動機構と第2伝動機構とを含み、前記第1伝動機構は温度制御装置に接続され、且つ前記温度制御装置を駆動して移動させることができ、前記第2伝動機構は前記反応管固定装置に接続され、且つ前記反応管固定装置を駆動して移動させることができ、前記第1伝動機構と前記第2伝動機構が協働することで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられることを特徴とする請求項1に記載の超高速PCR反応検出システム。 - 前記伝動装置は第1伝動機構と第2伝動機構とを含み、前記第1伝動機構は温度制御装置に接続され、且つ前記温度制御装置を駆動して水平に移動させることができ、前記第2伝動機構は前記反応管固定装置に接続され、且つ前記反応管固定装置を駆動して垂直に移動させることができ、前記反応管固定装置は温度制御装置の上部に架設され、前記第1伝動機構と前記第2伝動機構が協働することで、前記反応管固定装置における反応管は前記高温モジュールと前記低温モジュールとで切り替えられることを特徴とする請求項1に記載の超高速PCR反応検出システム。
- 前記温度制御装置の下部は第1伝動機構に接続され、第1伝動機構の働きで温度制御装置は前後に運動し、
好ましくは、前記第1伝動機構はねじモータと2つのガイド駆動軸とを含み、2つのガイド駆動軸はねじモータの前部に固定され、温度制御モジュールはガイド駆動軸に沿って前後に運動することができ、
又は、第2伝動機構は偏心輪の回転によって反応管固定装置を連れて上下に運動させることを特徴とする請求項3に記載の超高速PCR反応検出システム。 - 前記反応管固定装置は前記反応管固定装置の下部に固定して取り付けられた横支持板をさらに含み、前記第2伝動機構はステッピングモータIIと偏心輪とを含み、前記偏心輪はステッピングモータIIに固定され、偏心輪は上部に位置する横支持板を支持し、ステッピングモータIIは偏心輪を連れて回転させて、横支持板を連れて上下に運動させることによって反応管固定装置の上下運動を実現し、
好ましくは、前記反応管固定装置は縦支持ロッドと、カラムとをさらに含み、前記縦支持ロッドは反応管固定位置の両側に固定され、カラムは縦支持ロッドを垂直に通し、カラムは縦支持ロッドにスライド可能に接続され、前記カラムの上端部はばねが嵌設され且つ縦支持ロッドに受け止められることを特徴とする請求項3に記載の超高速PCR反応検出システム。 - 制御システムをさらに含み、前記制御システムは制御回路で、温度制御装置、第1伝動機構、光学検出装置、反応管固定装置に対してリアルタイムな制御と信号伝送を行うことを特徴とする請求項3に記載の超高速PCR反応検出システム。
- 前記反応検出システムは、温度制御装置の前部に位置する光学検出装置をさらに含み、
好ましくは、前記光学検出装置は光学読取ヘッドと第3伝動機構とを含み、前記光学読取ヘッドは第3伝動機構の上部に取り付けられ、第3伝動機構に連れられて左右に移動し、
好ましくは、前記第3伝動機構はステッピングモータIと、ガードレールと、ベルトと、接続部品とを含み、前記接続部品の上部に光学読取ヘッドが固定され、接続部品の中部にはガードレールにスライド可能に接続された凹溝が設けられ、接続部品の下部にはベルトに接続された挟み板が設けられ、又は/且つ前記反応管固定装置は反応管固定位置と、プレスカバーとを含み、前記プレスカバーは反応管固定位置を覆うために用いられ、
好ましくは、前記プレスカバーの材質はステンレス鋼であることを特徴とする請求項1に記載の超高速PCR反応検出システム。 - 前記第1所定の温度は100℃以上であり、前記第2所定の温度は55℃以下であり、
好ましくは、前記第1所定の温度の範囲は100~150℃であり、前記第2所定の温度の範囲は15~55℃であり、
好ましくは、前記温度制御装置は中温モジュールをさらに含み、前記中温モジュールの加熱温度範囲は前記第1所定の温度と前記第2所定の温度との間であり、
好ましくは、前記温度制御モジュールにおいて前方から順に中温モジュール、低温モジュール、高温モジュールであり、
好ましくは、最も前方の前記中温モジュールの側壁に検出穴が開けられ、前記中温モジュール、低温モジュール、高温モジュールの上部にいずれもサンプル穴が設けられ、
好ましくは、温度制御モジュールは温度を一定に保つか又は温度を変えることができることを特徴とする請求項1~7のいずれか一項に記載の超高速PCR反応検出システム。 - 操作ステップとして、
(1)装置をオンして予熱し、被験サンプル及び試薬を反応管に入れて混合する、準備ステップと、
(2)反応管を反応管固定装置に固設し、伝動装置が動作して、反応管が高温モジュールに挿し込まれ、高温浴を行うステップと、
(3)反応管温度が所定の温度になった後、伝動装置が動作して、反応管が低温モジュールに挿し込まれ、冷却されるステップと、
(4)データ収集と、
(5)ステップ(2)~(4)の繰り返しとを含むことを特徴とする超高速PCR検出方法。 - 前記伝動装置は第2伝動機構を含み、ステップ(2)は、高温モジュールが反応管の真下に移動し、垂直伝動機構なる第2伝動機構が最低点に下降して、反応管の高温浴を行うことをさらに含み、ステップ(3)は、反応管温度が所定の温度になった後、垂直伝動機構なる第2伝動機構がリセットされ、低温モジュールが反応管の真下に移動し、垂直伝動機構なる第2伝動機構が最低点に下降して、冷却することをさらに含み、
又は/且つ、ステップ(3)で反応管が冷却された後は、第2伝動機構がリセットされ、中温モジュールが反応管の真下に移動するステップをさらに含むことを特徴とする請求項9に記載の超高速PCR検出方法。
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