JP2022096812A - 抗原ポリペプチド - Google Patents
抗原ポリペプチド Download PDFInfo
- Publication number
- JP2022096812A JP2022096812A JP2020210009A JP2020210009A JP2022096812A JP 2022096812 A JP2022096812 A JP 2022096812A JP 2020210009 A JP2020210009 A JP 2020210009A JP 2020210009 A JP2020210009 A JP 2020210009A JP 2022096812 A JP2022096812 A JP 2022096812A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- polypeptide
- amino acid
- acid sequence
- present disclosure
- seq
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 104
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 title claims abstract description 103
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 title claims abstract description 103
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title abstract description 12
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title abstract description 12
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title abstract description 9
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 66
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 11
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 33
- 230000003239 periodontal effect Effects 0.000 claims description 26
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims description 25
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 21
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims description 20
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 16
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 13
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 claims description 6
- 208000028169 periodontal disease Diseases 0.000 abstract description 13
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 abstract 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 9
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 8
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 8
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 8
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 6
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 6
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 5
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 5
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 5
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 5
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 4
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 description 4
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 4
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 4
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 4
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 4
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 4
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 4
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 3
- 238000002869 basic local alignment search tool Methods 0.000 description 3
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 3
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 3
- 239000000306 component Substances 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 2
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 2
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710175625 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein Proteins 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 108010064851 Plant Proteins Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 230000006229 amino acid addition Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 239000012503 blood component Substances 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 239000005018 casein Substances 0.000 description 2
- BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N casein, tech. Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CC(C)C)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(C(C)O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=O)N=C(O)C(COP(O)(O)=O)N=C(O)C(CCC(O)=N)N=C(O)C(N)CC1=CC=CC=C1 BECPQYXYKAMYBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 2
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 2
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- 208000008338 non-alcoholic fatty liver disease Diseases 0.000 description 2
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 2
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 2
- 235000021118 plant-derived protein Nutrition 0.000 description 2
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 2
- 235000004252 protein component Nutrition 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 2
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 2
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 2
- 108010018381 streptavidin-binding peptide Proteins 0.000 description 2
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 2
- 235000002198 Annona diversifolia Nutrition 0.000 description 1
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282832 Camelidae Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 1
- 206010012289 Dementia Diseases 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 108060002716 Exonuclease Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 241000282838 Lama Species 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 208000005888 Periodontal Pocket Diseases 0.000 description 1
- 241000605862 Porphyromonas gingivalis Species 0.000 description 1
- 208000005107 Premature Birth Diseases 0.000 description 1
- 206010036590 Premature baby Diseases 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 210000004381 amniotic fluid Anatomy 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N azane;(2e)-3-ethyl-2-[(e)-(3-ethyl-6-sulfo-1,3-benzothiazol-2-ylidene)hydrazinylidene]-1,3-benzothiazole-6-sulfonic acid Chemical compound [NH4+].[NH4+].S/1C2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N(CC)C\1=N/N=C1/SC2=CC(S([O-])(=O)=O)=CC=C2N1CC OHDRQQURAXLVGJ-HLVWOLMTSA-N 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000000740 bleeding effect Effects 0.000 description 1
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004327 boric acid Substances 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 102000013165 exonuclease Human genes 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 210000003731 gingival crevicular fluid Anatomy 0.000 description 1
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000019622 heart disease Diseases 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000003317 immunochromatography Methods 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 206010053219 non-alcoholic steatohepatitis Diseases 0.000 description 1
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 238000002559 palpation Methods 0.000 description 1
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 1
Images
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
【課題】安定性が向上した歯周病原菌抗原ポリペプチドの提供。【解決手段】（Ａ）特定のアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は（Ｂ）（Ａ）のアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。【選択図】なし
Description
本開示は、抗原ポリペプチド及びその応用技術等に関する。
歯周病は、歯周病原菌が歯周組織に感染することによって発症する炎症性疾患である。一般に、歯周病の診断は、歯周ポケット検査、触診・出血検査、動揺度検査、Ｘ線写真検査等の結果を総合して行われているが、これらの検査手法は歯科医師等の経験・技能等に基づいて行われるため、検査結果及び診断結果に差異が生じる可能性があり、客観性に欠くという問題がある。そのため、客観的に歯周病の診断を行う手法の開発が望まれている。
客観的に歯周病の診断を行う手法としては、例えば、歯周病原菌に対する血清中のＩｇＧ抗体価を歯周病の感染度又は重篤度の指標とする方法が報告されており、本発明者らが開発した手法では、歯周病原菌であるポルフィロモナス・ジンジバリス（Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｓ ｇｉｎｇｉｖａｌｉｓ）から単離された特定の１次構造を有するポリペプチド又はその改変ポリペプチド（歯周病原菌抗原ポリペプチド）を用いることにより、多様な免疫型を有する広範囲の患者の歯周病を高い精度で検査することができ、かつ自動化された機器等により高速処理を行うことが可能となる（特許文献１）。
本開示は、安定性が向上した歯周病原菌抗原ポリペプチドを提供することを課題とする。
本発明者らは、特定のアミノ酸配列を有するポリペプチドは、安定性が優れていることを見出し、さらに改良を重ねた。
本開示は、例えば以下の項に記載の主題を包含する。
項１．
（Ａ）配列番号１に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は
（Ｂ）配列番号１に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。
項２．
前記（Ｂ）のポリペプチドが、配列番号１に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２３個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドである、項１に記載のポリペプチド。
項３．
（Ｃ）配列番号２に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は
（Ｄ）配列番号２に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。
項４．
前記（Ｄ）のポリペプチドが、配列番号２に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２２６個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドである、項３に記載のポリペプチド。
項５．
さらに、タグを含む、項１～４のいずれかに記載のポリペプチド。
項６．
項１～５のいずれかに記載のポリペプチドを含む歯周病原菌抗体価測定用試薬。
項７．
項６に記載の歯周病原菌抗体価測定用試薬を含む歯周病原菌抗体価測定用キット。
項８．
生体試料を項１～５のいずれかに記載のポリペプチドと接触させることを含む、
生体試料中の歯周病原菌に対する抗体価を測定する方法。
項１．
（Ａ）配列番号１に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は
（Ｂ）配列番号１に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。
項２．
前記（Ｂ）のポリペプチドが、配列番号１に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２３個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドである、項１に記載のポリペプチド。
項３．
（Ｃ）配列番号２に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は
（Ｄ）配列番号２に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。
項４．
前記（Ｄ）のポリペプチドが、配列番号２に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２２６個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドである、項３に記載のポリペプチド。
項５．
さらに、タグを含む、項１～４のいずれかに記載のポリペプチド。
項６．
項１～５のいずれかに記載のポリペプチドを含む歯周病原菌抗体価測定用試薬。
項７．
項６に記載の歯周病原菌抗体価測定用試薬を含む歯周病原菌抗体価測定用キット。
項８．
生体試料を項１～５のいずれかに記載のポリペプチドと接触させることを含む、
生体試料中の歯周病原菌に対する抗体価を測定する方法。
安定性に優れた抗原ポリペプチドが提供される。
以下、本開示に包含される各実施形態について、さらに詳細に説明する。
本開示に包含されるポリペプチドは、（Ａ）配列番号１に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドである。本明細書において、当該ポリペプチドを、「本開示の（Ａ）のポリペプチド」と表記することがある。
配列番号１に示すアミノ酸配列は、配列番号３に示すアミノ酸配列の２４～８６０番目のアミノ酸配列に相当する。
本開示に包含されるポリペプチドは、（Ａ）配列番号１に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドである。本明細書において、当該ポリペプチドを、「本開示の（Ａ）のポリペプチド」と表記することがある。
配列番号１に示すアミノ酸配列は、配列番号３に示すアミノ酸配列の２４～８６０番目のアミノ酸配列に相当する。
また、本開示は、（Ｂ）配列番号１に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有するポリペプチドをも包含する。本明細書において、当該ポリペプチドを、「本開示の（Ｂ）のポリペプチド」と表記することがある。
また、本開示は、（Ｃ）配列番号２に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドをも包含する。本明細書において、当該ポリペプチドを、「本開示の（Ｃ）のポリペプチド」と表記することがある。
配列番号２に示すアミノ酸配列は、配列番号３に示すアミノ酸配列の２２７～８６０番目のアミノ酸配列に相当する。
配列番号２に示すアミノ酸配列は、配列番号３に示すアミノ酸配列の２２７～８６０番目のアミノ酸配列に相当する。
また、本開示は、（Ｄ）配列番号２に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有するポリペプチドをも包含する。本明細書において、当該ポリペプチドを、「本開示の（Ｄ）のポリペプチド」と表記することがある。
本明細書において、本開示の（Ａ）のポリペプチド、本開示の（Ｂ）のポリペプチド、本開示の（Ｃ）のポリペプチド、及び本開示の（Ｄ）のポリペプチドを総称して、「本開示のポリペプチド」と表記することがある。
本開示の（Ｂ）のポリペプチドは、配列番号１に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有するポリペプチドである。配列番号１に示すアミノ酸配列において、欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸の個数の上限は、例えば、２５０個、２００個、１５０個、１００個、５０個、４５個、４０個、３５個、３０個、２５個、２０個、１９個、１８個、１７個、１６個、１５個、１４個、１３個、１２個、１１個、１０個、９個、８個、７個、６個、５個、４個、３個、又は２個であってもよい。
アミノ酸の欠失、置換、又は付加などの変異を特定のアミノ酸配列に加える技術は当該技術分野において公知であり、任意の手法を用いて行うことができる。例えば、制限酵素処理、エキソヌクレアーゼやＤＮＡリガーゼ等による処理、位置指定突然変異導入法、ランダム突然変異導入法等を利用して行うことができる。
本開示の（Ｂ）のポリペプチドは、例えば、配列番号１に示すアミノ酸配列と８５％以上の同一性を示すアミノ酸配列からなるポリペプチドであってもよい。同一性は、９０％以上、９１％以上、９２％以上、９３％以上、９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、又は９９％以上であってもよい。
アミノ酸配列の同一性は、全米バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）の相同性アルゴリズムＢＬＡＳＴ（Ｂａｓｉｃ ｌｏｃａｌ ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｓｅａｒｃｈ ｔｏｏｌ）http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/においてデフォルトのパラメータを用いることにより、算出することができる。
また、本開示の（Ｂ）のポリペプチドは、配列番号１に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２３個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドであってもよい。換言すれば、本開示の（Ｂ）のポリペプチドは、配列番号１に示すアミノ酸配列のＮ末端側にアミノ酸の付加を有する場合、当該付加されたアミノ酸の個数が１～２２個のポリペプチドであってもよい。当該アミノ酸の個数の上限又は下限は、例えば、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、又は２１個であってもよい。より具体的には、例えば、２～２１個であってもよい。
本開示の（Ｄ）のポリペプチドは、配列番号２に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有するポリペプチドである。配列番号２に示すアミノ酸配列において、欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸の個数の上限は、例えば、２５０個、２００個、１５０個、１００個、５０個、４５個、４０個、３５個、３０個、２５個、２０個、１９個、１８個、１７個、１６個、１５個、１４個、１３個、１２個、１１個、１０個、９個、８個、７個、６個、５個、４個、３個、又は２個であってもよい。
本開示の（Ｄ）のポリペプチドは、例えば、配列番号２に示すアミノ酸配列と８５％以上の同一性を示すアミノ酸配列からなるポリペプチドであってもよい。同一性は、９０％以上、９１％以上、９２％以上、９３％以上、９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、又は９９％以上であってもよい。
また、本開示の（Ｄ）のポリペプチドは、配列番号２に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２２６個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドであってもよい。換言すれば、本開示の（Ｄ）のポリペプチドは、配列番号２に示すアミノ酸配列のＮ末端側にアミノ酸の付加を有する場合、当該付加されたアミノ酸の個数が１～２２５個のポリペプチドであってもよい。当該アミノ酸の個数の上限又は下限は、例えば、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、２０個、３０個、４０個、５０個、６０個、７０個、８０個、９０個、１００個、１１０個、１２０個、１３０個、１４０個、１５０個、１６０個、１７０個、１８０個、１９０個、２００個、２１０個、又は２２０個であってもよい。より具体的には、例えば、２～２２０個であってもよい。
本開示のポリペプチドは、配列番号３に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドを含まないことが好ましい。本開示のポリペプチドは、配列番号３に示すアミノ酸配列を含むポリペプチドを含まないことが好ましい。
本開示の（Ｂ）のポリペプチド及び（Ｄ）のポリペプチドは、抗原性を有することが好ましい。
本明細書において、「抗原性を有する」とは、歯周病原菌に対する抗体と、抗原抗体反応することを意味する。抗体としては、例えば、ＩｇＧ抗体、ＩｇＭ抗体、ＩｇＡ抗体等のイムノグロブリン抗体が挙げられ、イムノグロブリン抗体のいずれかと抗原抗体反応すればよい。中でもＩｇＧ抗体が好ましい。
抗原性は、ＥＬＩＳＡ法により評価することができる。より具体的には、後述する実施例に示すように、抗原性を評価するポリペプチドを抗原、歯周病原菌に対する抗体を含む歯周病患者の陽性血清を１次抗体として、これらの抗原抗体反応がＥＬＩＳＡ法により検出された場合には、当該ポリペプチドは抗原性を有すると判断される。
本開示のポリペプチドは、配列番号１又は配列番号２に示すアミノ酸配列の情報に基づいて、一般的なタンパク質の化学合成法（例えば、液相法及び固相法）を用いて製造することができる。また、上述したポリペプチドは、当該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを利用して、遺伝子工学的な手法で製造することができる。
本開示のポリペプチドは、さらに、タグを含んでいてもよい。タグとしては、例えば、Ｈｉｓタグ、ＳＢＰ（Streptavidin Binding Peptide）タグ等のペプチドタグ；ＧＳＴ（Glutathione-S-transferase）タグ、ＭＢＰ（Maltose Binding Protein）タグ等のポリペプチドタグ等が挙げられる。中でもポリペプチドタグが好ましく、ＧＳＴタグがより好ましい。
タグは、本開示のポリペプチドのＮ末端側に結合していてもよく、Ｃ末端側に結合していてもよい。中でも、タグは、本開示のポリペプチドのＮ末端側に結合していることが好ましい。
タグを含む好ましいポリペプチドとしては、例えば、本開示の（Ａ）、（Ｂ）、（Ｃ）、及び（Ｄ）のポリペプチドのＮ末端側又はＣ末端側に、更にタグを含むポリペプチドが挙げられる。
タグを含む好ましいポリペプチドとしては、例えば、本開示の（Ａ）、（Ｂ）、（Ｃ）、及び（Ｄ）のポリペプチドのＮ末端側又はＣ末端側に、更にタグを含むポリペプチドが挙げられる。
タグを付加する方法としては、特に限定されず、慣用の方法および反応条件を採用することができる。
本開示のポリペプチドは、さらに、標識物質を有していてもよい。標識物質としては、例えば、西洋ワサビ由来ペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリフォスファターゼ（ＡＬＰ）、β－Ｄ－ガラクトシダーゼ、ビオチン、金コロイド、ラテックスビーズなどが挙げられる。
本開示のポリペプチドは、配列番号３に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドと比較して、向上した安定性を有することが好ましい。安定性は、後述した実施例に示すように、ＥＬＩＳＡ法により測定される吸光度の経時的な変化により評価される。本開示のポリペプチドは、配列番号３に示すアミノ酸配列からなるポリペプチドと比較して、吸光度の経時的な減少が抑制されていることが好ましい。
本開示は、本開示のポリペプチドを含む歯周病原菌抗体価測定用試薬をも包含する。本明細書において、当該試薬を、「本開示の試薬」と表記することがある。
本開示の試薬は、本開示のポリペプチドの他、他の成分を含有してもよい。他の成分としては、生理食塩水、ＰＢＳ、リン酸緩衝液、トリス緩衝液、ホウ酸緩衝液、Ｇｏｏｄ Ｂｕｆｆｅｒなどの溶媒；カゼイン、スキムミルク、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、ゼラチン、血液タンパク質又は植物タンパク質を有効成分とするもの、マウス、ウサギ、ヤギ、牛胎児等の正常動物血液成分、正常ヒト血清成分などのタンパク成分安定化剤；各種防腐剤；界面活性剤；亜鉛やマグネシウム等の金属の塩などの酵素の活性化剤などが挙げられる。
本開示は、本開示のポリペプチドを含む歯周病原菌抗体価測定用試薬を含む歯周病原菌抗体価測定キットをも包含する。本明細書において、当該キットを、「本開示のキット」と表記することがある。
当該キットには、本開示の試薬の他、必要に応じてその他の試薬、器具等が含まれていてもよい。例えば、ブロッキング液、洗浄液、標識物質を含む抗体、基質液（発色・蛍光・発光）などが挙げられる。また、当該キットは、本開示の試薬の他、ブロッキング液、洗浄液、標識物質を含む抗体、基質液（発色・蛍光・発光）などを含む部材（メンブレン等）等を含むものであってもよい。
本開示は、生体試料を本開示のポリペプチドと接触させることを含む、生体試料中の歯周病原菌に対する抗体価を測定する方法をも包含する。本明細書において、当該測定方法を、「本開示の測定方法」と表記することがある。
生体試料としては、特に限定されず、例えば、歯周病原菌に対する抗体（例えば、ＩｇＧ抗体、ＩｇＡ抗体、ＩｇＭ抗体等）を含み得る試料が挙げられる。採取の容易さ、取扱い易さ等の観点からは、生体試料としては、血液、唾液、歯肉溝滲出液、糞便、涙液、鼻腔ぬぐい液、又は羊水が好ましい。また、歯周病原菌に対する抗体を含み得る試料としては、肝臓などの臓器を用いることもできる。
血液を生体試料として用いる場合には、血漿又は血清がより好ましく、血清がさらにより好ましい。血漿を生体試料として用いる場合には、ろ紙や血漿分離機等により分離された血漿であってもよい。なお、対象から採取した生体試料を保存する方法、条件等については特に制限されず、常法に従って行うことができる。
血液を生体試料として用いる場合には、血漿又は血清がより好ましく、血清がさらにより好ましい。血漿を生体試料として用いる場合には、ろ紙や血漿分離機等により分離された血漿であってもよい。なお、対象から採取した生体試料を保存する方法、条件等については特に制限されず、常法に従って行うことができる。
生体試料を採取される対象としては、ヒトのみならず、歯周病原菌の感染が起こり得る生体であれば特に制限されず、非ヒト哺乳動物であってもよい。ヒトとしては特に制限されず、健常者であってもよく、歯周病に罹患したヒト（歯周病患者）であってもよく、歯周病の罹患が疑われるヒトであってもよい。歯周病または歯周病原菌との関連性のある疾患（例えば、関節リウマチ、心疾患、動脈硬化性疾患、糖尿病、認知症、非アルコール性脂肪肝（NASH/NAFLD）、肥満、早産など）を有するヒトやその疑いがあるヒトであってもよい。また、非ヒト哺乳動物としては、ペット、家畜、実験動物等として飼育される哺乳動物が例示される。例えば、イヌ、ネコ、サル、ウシ、ウマ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウサギ、マウス、ラット、ラクダ、リャマ等が挙げられる。
対象から生体試料を採取する方法としては特に制限されず、常法に従って行えばよい。また、採取した生体試料は、そのまま用いてもよく、凍結乾燥等して保存した後、当該凍結乾燥物を後述する適当な溶媒に溶解して用いてもよく、また、採取した生体試料を、そのまま冷凍保存した後、あるいは後述する適当な溶媒に溶解する等して冷凍保存した後、使用時に解凍して用いてもよい。
生体試料を溶解させる溶媒としては、例えば、生理食塩水、ＰＢＳ、リン酸緩衝液、トリス緩衝液、ホウ酸緩衝液、Ｇｏｏｄ Ｂｕｆｆｅｒなどが挙げられる。これらの溶媒は、カゼイン、スキムミルク、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、ゼラチン、血液タンパク質又は植物タンパク質を有効成分とするもの、マウス、ウサギ、ヤギ、牛胎児等の正常動物血液成分、正常ヒト血清成分などのタンパク成分安定化剤；各種防腐剤；界面活性剤；亜鉛やマグネシウム等の金属の塩などの酵素の活性化剤などを含むものであってもよい。
本開示の測定方法によれば、本開示のポリペプチドと生体試料とを接触させることにより、生体試料中に存在する歯周病原菌に対する抗体（例えば、ＩｇＧ抗体、ＩｇＡ抗体、ＩｇＭ抗体等）を、本開示のポリペプチドとの抗原抗体反応を利用して検出することができる。
本開示の測定方法は、さらに、生体試料を本開示のポリペプチドと接触させることにより生じる生体試料中に存在する歯周病原菌に対する抗体と本開示のポリペプチドとの抗原抗体反応物（抗体及び本開示のポリペプチドを含む複合体）を検出する工程を含んでいてもよい。
抗原抗体反応物を検出する方法は、特に限定されず、慣用の方法および反応条件を採用することができる。例えば、当該抗原抗体反応物に、標識物質を含む抗イムノグロブリン抗体（例えば、抗ＩｇＧ抗体等）を接触させ当該標識物質を検出する方法や、本開示のポリペプチドが標識物質を含む場合、当該標識物質を検出する方法などが挙げられる。
本開示の測定方法は、必要に応じて、例えば、抗原の固相への固定化工程、洗浄工程、ブロッキング工程、基質反応工程などを含んでいてもよい。これらは、慣用の方法および反応条件を採用することができる。
本開示の測定方法は、ＥＬＩＳＡ法やドットブロット法、イムノクロマト法などの免疫学的手法が好ましく用いられる。
なお、本明細書において「含む」とは、「本質的にからなる」と、「からなる」をも包含する（The term "comprising" includes "consisting essentially of” and "consisting of."）。また、本開示は、本明細書に説明した構成要件を任意の組み合わせを全て包含する。
また、上述した本開示の各実施形態について説明した各種特性（性質、構造、機能等）は、本開示に包含される主題を特定するにあたり、どのように組み合わせられてもよい。すなわち、本開示には、本明細書に記載される組み合わせ可能な各特性のあらゆる組み合わせからなる主題が全て包含される。
本開示の内容を以下の実験例を用いて具体的に説明する。しかし、本開示はこれらに何ら限定されるものではない。下記において、特に言及する場合を除いて、実験は大気圧及び常温条件下で行っている。また特に言及する場合を除いて、「％」は「体積％」を意味する。
ELISA
以下の3種の抗原タンパク質をELISAに付した。なお、いずれの抗原タンパク質もＮ末端側にＧＳＴタグを付加したものを使用した。
35N（配列番号３）
No. 15（配列番号１）（35Nにおける24～860番目のアミノ酸に相当）
No. 7（配列番号２）（35Nにおける227～860番目のアミノ酸に相当）
以下の3種の抗原タンパク質をELISAに付した。なお、いずれの抗原タンパク質もＮ末端側にＧＳＴタグを付加したものを使用した。
35N（配列番号３）
No. 15（配列番号１）（35Nにおける24～860番目のアミノ酸に相当）
No. 7（配列番号２）（35Nにおける227～860番目のアミノ酸に相当）
抗原タンパク質の量は35Nを0.25または0.5ng/100μlに調製し、他のタンパク質は35Nと同等のモル数となるように調製した。
タンパク質固相用のGlutathione を固相した96wellプレートをTween20（0.05～0.1%）を含むPBSにて3回洗浄した後、調製したタンパク溶液100μlを添加し室温で1時間反応させた。Tween20（0.05～0.1%）を含むPBSにて3回洗浄した後、500～620倍に希釈した陽性血清（歯周病患者の血清）を100μl添加し室温で1時間反応させた。Tween20（0.05～0.1%）を含むPBSにて3回洗浄した後、1000～2000倍に希釈した、西洋ワサビペルオキシダーゼ（以下、HRP）結合ヤギ抗ヒトIgG抗体反応液（MILLIPORE）を100μl添加し室温で反応させた。Tween20（0.05～0.1%）を含むPBSにて3回洗浄した後、発色基質のABTS150μlを添加し、室温で反応させた後、プレートリーダーを用いて405nmの吸光度を測定した。なお、STEP2_6、STEP2_7、STEP3_11の各測定のタイミングでは、抗原や試薬の濃度等同じ条件で実施した。吸光度の測定は、最初の測定を初期値とし、初期から2年までの間で3回の試験で測定した(STEP2_6、STEP2_7、STEP3_11)。結果を、図１及び２に示す。なお、図１及び２には、STEP2_6、STEP2_7、STEP3_11におけるNo. 15あるいはNo. 7の吸光度を1とした時の35Nの吸光度の比率を示す。
STEP2_6、STEP2_7、STEP3_11の測定の間には、抗原タンパクの凍結融解が行われており、35Nは、No. 15及びNo. 7と比較して、保管期間や凍結融解の回数に伴う反応性の低下が大きいことが分かった。
Claims (8)
- （Ａ）配列番号１に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は
（Ｂ）配列番号１に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。 - 前記（Ｂ）のポリペプチドが、配列番号１に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２３個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドである、請求項１に記載のポリペプチド。
- （Ｃ）配列番号２に示すアミノ酸配列からなるポリペプチド、又は
（Ｄ）配列番号２に示すアミノ酸配列において、１個若しくは２個以上のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を有し、かつ抗原性を有するポリペプチド。 - 前記（Ｄ）のポリペプチドが、配列番号２に示すアミノ酸配列のＮ末端側に２２６個以上のアミノ酸の付加を有しないポリペプチドである、請求項３に記載のポリペプチド。
- さらに、タグを含む、請求項１～４のいずれかに記載のポリペプチド。
- 請求項１～５のいずれかに記載のポリペプチドを含む歯周病原菌抗体価測定用試薬。
- 請求項６に記載の歯周病原菌抗体価測定用試薬を含む歯周病原菌抗体価測定用キット。
- 生体試料を請求項１～５のいずれかに記載のポリペプチドと接触させることを含む、
生体試料中の歯周病原菌に対する抗体価を測定する方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2020210009A JP2022096812A (ja) | 2020-12-18 | 2020-12-18 | 抗原ポリペプチド |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2020210009A JP2022096812A (ja) | 2020-12-18 | 2020-12-18 | 抗原ポリペプチド |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2022096812A true JP2022096812A (ja) | 2022-06-30 |
Family
ID=82165091
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2020210009A Pending JP2022096812A (ja) | 2020-12-18 | 2020-12-18 | 抗原ポリペプチド |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP2022096812A (ja) |
-
2020
- 2020-12-18 JP JP2020210009A patent/JP2022096812A/ja active Pending
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US7258994B2 (en) | Saliva immunoassay for detection of antibodies for cardiovascular disease | |
| AU2008334976B2 (en) | Compositions and methods for early pregnancy diagnosis | |
| JP5855094B2 (ja) | 腎疾患のためのマーカー | |
| EP1051626B1 (en) | Prognostic allergy or inflammation test | |
| JP2006284567A (ja) | ヘリコバクター・ピロリ感染の診断方法及び診断キット | |
| Vanzini et al. | Evaluation of an indirect ELISA for the diagnosis of bovine brucellosis in milk and serum samples in dairy cattle in Argentina | |
| JP4568841B2 (ja) | アレルギー疾患の判定方法及びアレルギー疾患の判定キット | |
| Gottstein et al. | An international study on the serological differential diagnosis of human cystic and alveolar echinococcocis | |
| WO2024026384A1 (en) | Assays for detection and quantitation of human endotrophin | |
| JP2022096812A (ja) | 抗原ポリペプチド | |
| JP2022096814A (ja) | 抗原ポリペプチド | |
| JP2022096815A (ja) | 抗原ポリペプチド | |
| JP2022096817A (ja) | 歯周病原菌に対する抗体価を測定する方法 | |
| JP6514714B2 (ja) | エーリキア属の種を同定するための組成物及び方法 | |
| JP2002512531A (ja) | 自己免疫内耳疾患抗原および診断アッセイ | |
| JP2021098746A (ja) | 遺伝子組み換えトリパノソーマ・クルージｊｌ７抗原変異型およびシャーガス病を検出するためのその使用 | |
| US20030100035A1 (en) | Saliva immunoassay for detection of antibodies for autoimmune disease | |
| US6703208B1 (en) | Immunological assay for detection of antibodies in celiac disease | |
| WO1990007114A1 (en) | Solid phase immuno-assay with labelled conjugate | |
| JP4619580B2 (ja) | 抗体捕捉法による抗体の免疫学的測定方法 | |
| CN110741099B (zh) | 评估个体的登革热病毒感染严重程度的方法、检测装置及检测试剂盒 | |
| JP2003252899A (ja) | 家畜血清アルブミンの免疫学的反応性を有するエピトープ | |
| WO1997010508A1 (en) | Method for the diagnosis of coeliac disease | |
| Ikushima et al. | Antibody response to OspC-I synthetic peptide derived from outer surface protein C of Borrelia burgdorferi in sera from Japanese forestry workers | |
| CN112180096A (zh) | 用于诊断线虫感染的新测定法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20231113 |