JP2020523553A - インデックス選別システム及び方法 - Google Patents
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Abstract
Description
1.ウェルのマトリックスからなる収集プレートのグラフィック表現204。これらのウェルには、ターゲット数の細胞「事象」が含まれている。各ウェルはプレートによって判定される最大数までゼロ事象を保持することができる。ウェルをクリックするか範囲を描くと、選択モデルは新しい選択インデックスで更新される。
2.分類取得中に収集されたデータを表示する二変量プロット206。細胞事象は、それらのチャネル情報に従ってプロット内に表示される。サポートされているプロットには、ドットプロット(散乱)、等高線、及び密度が含まれる。プロット上に選択ツールが描かれると、長方形領域内の事象がモデル内の選択された事象を変更する。
インデックス分析用インターフェースが低次の複雑さである1つの要因は、インターフェースを介して提示された情報の一貫性及び直感性を維持していることである。グラフィカル分析ワークフロー機能は、直感的で柔軟でありながら強力であると描写されるものである。以下の特徴についてさらに詳細に説明する。例示的な特性を次に挙げる。
・一貫した統一された入力装置のジェスチャ−プレート装置とプロットとは、クリックして選択し、ツール領域をドラッグして選択し、コントロールキーを押しながらクリック/ドラッグで追加し、何もない領域をクリックして選択を解除することを含む、同じツールとジェスチャとを使用してデータを選択し、選択に追加する複数の方法を可能にする。
・ツール−同じツールを使用して、ある範囲のデータ/ウェルを選択できる。
・複数のソースからの選択への追加−単一の装置で選択するか、複数のソースからの選択(プレート、及び複数のプロット)を組み合わせて選択を構築できる。これは二方向選択ジェスチャと呼ばれる。
・表示の強化−事象を選択すると、選択した事象を強調するために、プロットの選択されていないデータが色あせて描画される。
データがロードされると、実験に使用された収集装置の表現が表示され得る。収集装置は、粒子事象情報と共に含まれるメタデータとして識別できる。実験装置の一部のように、収集装置は収集前に識別されてもよい。使用者は、マウスなどの入力装置を使用することなどによって、特定のウェルに関連付けられたインターフェースの開始部分を起動することができる。
いくつかの実装形態では、選択プロセスは、収集プレートのウェルに対応するユーザインターフェースに示されている異なる領域を選択しながら、コントロールキーを押し続けることなどによってなされ、連続的または非連続的であり得る。複数のウェルを選択することができ、それらの対応する事象は、関連するウェルの色を用いてすべてのプロットにおいて示され得る。例えば、使用者は、ウェルA1に関連する制御要素を起動し、所定の入力シーケンスを使用して、選択に追加したいという希望を示すことができる。次いで、これによりその後の選択がAlの選択に追加される。
図5A〜図5Cは、いかにして連続的選択が実行され得るかを示す。図5Aでは、第1の範囲のウェル512が収集プレートインターフェース510から選択される。いくつかの実装形態では、隣接する選択は、対象のデルまたはウェルの周りに幾何学形状を描くことなどによって選択ツールを使用して達成され得る。コントロールキーを押したままにすると、さらなるウェルを選択に追加できる。
図2〜図5Cは、収集プレートインターフェースから始まる選択を論じているが、プロットの粒子事象はまた、他のプロット及び収集プレートインターフェースとの調整のために選択され得る。この二方向の選択は、適切な選択のみを許可する他の実装とは対照的である。
プロットを用いた事象の選択の場合、特定のウェルが、選択されたそのウェルの全事象を含んでいるとは限らない。この場合、部分的に選択されたウェルを示すためにわずかに異なる色が使用されてもよい。
図8は、粒子事象データを分析し表示するためのグラフィック制御システムの一例の機能ブロック図を示す。グラフィックスコントローラ900は、上下で説明されるものなどの粒子事象データのグラフィック表示を制御するための様々なプロセスを実装するように構成され得る。グラフィックスコントローラ900は、説明したグラフィックス制御機能の少なくとも一部を提供するように構成された独立型の処理装置とすることができる。
データ事象ストリームは、選択された事象を表すインターフェースをレンダリングするために必要な全情報を含むことができる。1ウェルあたりの事象の量が多い大きなプレートの場合、事象を表すために必要なメモリは相当多大になる可能性がある。このため、説明されている機能はデータの1つのコピーに依存し、それによって、事象データのグラフィカル分析のためのリソースの使用を改善する。選択はインデックスをデータ内へ使用して実行される。
・X、Yの位置
・各データの点がどのプロットに属しているか
・ウェルの情報
・事象IDの情報
本願は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、2017年6月12日に出願された米国仮出願第62/518512号に対する優先権を主張する。出願データシートに記載されているいずれか及びあらゆる優先権の主張、またはそれに対するいずれかの補正はまた、37 C.F.R.§1.57の下での参照により本明細書に組み込まれる。
Claims (20)
- 整合グラフィックス制御用のシステムであって、
1つ以上の処理装置と、
前記1つ以上の処理装置のうちの少なくとも1つによって実行されるとき、前記システムに少なくとも
試料の粒子を受け取るための収集容器の識別子を受信すること、
収集インターフェースを表示させることであって、前記収集インターフェースが複数の対話型要素を含み、前記複数の対話型要素の各対話型要素が前記収集容器の収集位置に対応する、前記収集インターフェースを表示させること、
選択事象を検出することであって、前記選択事象が、前記複数の対話型要素に含まれる対話型要素を識別する、前記検出すること、及び
前記試料の粒子についての測定値を提示するための第2のインターフェースを表示させることであって、前記測定値が前記試料の前記粒子の部分に対応し、前記粒子の前記部分が前記収集位置に選別されて前記粒子を含む、前記第2のインターフェースを表示させること
を惹起させる命令を格納する非一時的コンピュータ可読媒体と
を備える、システム。 - 前記収集容器の前記識別子が、前記粒子の前記測定値を含むファイルのメタデータとして受信され、前記識別子を受信することは、前記ファイルを粒子分析器から受信することを含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記命令がさらに、前記システムに入力装置からのメッセージを少なくとも受信させ、前記メッセージは前記選択事象を含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記命令がさらに、
少なくとも、第1のグラフィック方式に従って前記粒子の部分を表示させること、及び、第2のグラフィック方式に従って前記粒子の別の部分を表示させることであって、前記第1のグラフィック方式が前記第2のグラフィック方式と知覚的に異なる、前記前記粒子の別の部分を表示させることによって、
前記システムに前記第2のインターフェースを表示させる、
請求項1に記載のシステム。 - 前記命令がさらに、前記システムに、少なくとも
前記収集インターフェース用の第1の登録メッセージを受信させ、
前記第2のインターフェース用の第2の登録メッセージを受信させ、また
前記選択事象を検出すると、前記第2のインターフェースまたは前記収集インターフェースのうちの少なくとも一方に前記選択事象を通知させる、
請求項1に記載のシステム。 - 前記命令がさらに、前記システムに、少なくとも
入力装置から、第2の選択事象が受信されることを示す選択制御信号を受信させ、
前記入力装置から、前記粒子の第2の部分を識別する前記第2の選択事象を受信させ、
前記粒子の前記第2の部分を前記粒子の前記部分に加えさせ、また
前記粒子の第2の部分を識別するために、前記第2のインターフェースまたは前記収集インターフェースのうちの少なくとも一方を更新させる、
請求項1に記載のシステム。 - 前記第2の選択事象は、どのインターフェースが前記第2の選択事象を収集するために使用されたかを示すインターフェース識別子を含む、請求項6に記載のシステム。
- 前記インターフェース識別子が前記第2のインターフェースを識別し、前記第2の選択事象が粒子測定値の範囲を定義する、請求項7に記載のシステム。
- 前記第2のインターフェースは二変量プロットを含み、前記範囲が、前記二変量プロットの領域に対する幾何学形状を使用して定義される、請求項8に記載のシステム。
- 前記命令がさらに、前記システムに、少なくとも
前記収集位置に含まれる粒子の測定値(i)、または、前記収集位置に含まれる粒子の数(ii)の少なくとも1つに少なくとも部分的に基づいて、前記収集位置の表示プロパティを生成させる、
請求項1に記載のシステム。 - 整合グラフィックス制御のためのコンピュータ実施方法であって、
1つ以上の処理装置の制御下で、
試料の粒子を受け取るための収集容器の識別子を受信すること、
収集インターフェースを表示させることであって、前記収集インターフェースが複数の対話型要素を含み、各対話型要素が前記収集容器の収集位置に対応する、前記収集インターフェースを表示させること、
選択事象を検出することであって、前記選択事象が、前記複数の対話型要素に含まれる対話型要素を識別する、前記検出すること、及び
前記試料の粒子についての測定値を提示するための第2のインターフェースを表示させることであって、前記測定値が前記収集位置に選別される前記粒子の部分に対応し、前記粒子の前記部分が前記収集位置に選別されて前記粒子を含む、前記第2のインターフェースを表示させること
を有する、コンピュータ実施方法。 - 前記収集容器の前記識別子が、前記粒子の前記測定値を含むファイルのメタデータとして受信され、前記識別子を受信することは、粒子分析器から前記ファイルを受信することを含む、請求項11に記載のコンピュータ実施方法。
- 入力装置からのメッセージを受信することであって、前記メッセージが前記選択事象を含む、前記受信することをさらに有する、請求項11に記載のコンピュータ実施方法。
- 前記第2のインターフェースを表示させることが、
第1のグラフィック方式に従って前記粒子の部分を表示させること、及び
第2のグラフィック方式に従って前記粒子の別の部分を表示させることであって、この場合、前記第1のグラフィック方式が前記第2のグラフィック方式と知覚的に異なる、前記前記粒子の別の部分を表示させること
を含む、
請求項11に記載のコンピュータ実施方法。 - 前記収集インターフェース用の第1の登録メッセージを受信すること、
前記第2のインターフェース用の第2の登録メッセージを受信すること、及び
前記選択事象を検出すると、前記第2のインターフェースまたは前記収集インターフェースのうちの少なくとも1つに前記選択事象を通知すること
をさらに有する、請求項11に記載のコンピュータ実施方法。 - 入力装置から、第2の選択事象が送信されることを示す選択制御信号を受信すること、
前記入力装置から、前記粒子の第2の部分を識別する前記第2の選択事象を受信すること、
前記粒子の前記第2の部分を前記粒子の前記部分に加えること、及び
前記粒子の第2の部分を識別するために、前記第2のインターフェースまたは前記収集インターフェースのうちの少なくとも一方を更新すること
をさらに有する、請求項11に記載のコンピュータ実施方法。 - 前記第2の選択事象は、どのインターフェースが前記第2の選択事象を収集するために使用されたかを示すインターフェース識別子を含む、請求項16に記載のコンピュータ実施方法。
- 前記インターフェース識別子が前記第2のインターフェースを識別し、前記第2の選択事象が粒子測定値の範囲を定義する、請求項17に記載のコンピュータ実施方法。
- 前記第2のインターフェースは二変量プロットを含み、前記範囲が、前記二変量プロットの領域に対する幾何学形状を使用して定義される、請求項18に記載のコンピュータ実施方法。
- 前記収集位置に含まれる粒子の測定値(i)、または、前記収集位置に含まれる粒子の数(ii)の少なくとも1つに少なくとも部分的に基づいて前記収集位置の表示プロパティを生成すること
をさらに有する、請求項11に記載のコンピュータ実施方法。
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