JP2015210212A - 細胞生死判定システム、細胞生死判定方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得部と、細胞に関するテンプレート画像を取得するテンプレート画像取得部と、Huモーメントの特徴量評価値を線形結合するためのパラメータ取得するパラメータ取得部と、取得した各画像から細胞領域を抽出する細胞領域抽出部と、細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出部と、連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結部と、連続する画像における同一細胞の特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出部と、特徴量評価値をパラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定部とを備えた細胞生死判定システム。
【選択図】図1
Description
「色素で染色された細胞の吸光を測定する方法」
「色素で染色された細胞の蛍光、または内在性の蛍光物質を作る細胞の蛍光を測定する方法」
が代表的である。これらの方法は、例えば、図12に示す顕微鏡300を用いて行なわれる。
ここで、前記連続画像取得部は、各画像を取得した時刻を記録し、前記判定部は、この時刻に基づいて、生細胞が死細胞に変化した時刻を記録するようにしてもよい。
上記課題を解決するため、本発明の第2の態様である細胞生死判定システムは、基準データ作成用の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得部と、取得した画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付部と、受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成部と、取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出部と、抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出部と、連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結部と、連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出部と、算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出部と、を備えたことを特徴とする。
ここで、前記パラメータ算出部は、サポートベクターマシンを用いてパラメータの値を設定することができる。
上記課題を解決するため、本発明の第3の態様である細胞生死判定システムは、基準データ作成用の細胞の位相差画像および観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得部と、取得した基準データ作成用の細胞の位相差画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付部と、受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成部と、取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出部と、抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出部と、連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結部と、連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出部と、算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出部と、算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定部と、を備えたことを特徴とする。
上記課題を解決するため、本発明の第4の態様である細胞生死判定方法は、観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得ステップと、前記細胞に関するテンプレート画像を取得するテンプレート画像取得ステップと、前記細胞に関するHuモーメントの特徴量評価値を線形結合するためのパラメータ取得するパラメータ取得ステップと、取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、前記細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定ステップと、を有することを特徴とする。
上記課題を解決するため、本発明の第5の態様である細胞生死判定方法は、基準データ作成用の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得ステップと、取得した画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付ステップと、受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成ステップと、取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出ステップと、を有することを特徴とする。
上記課題を解決するため、本発明の第6の態様である細胞生死判定方法は、基準データ作成用の細胞の位相差画像を連続的に取得する基準データ作成用画像取得ステップと、取得した基準データ作成用画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付ステップと、受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成ステップと、取得した各基準データ作成用画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、連続する基準データ作成用画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、連続する基準データ作成用画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出ステップと、観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する観察対象画像取得ステップと、取得した各観察対象画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、前記細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、連続する観察対象画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、連続する観察対象画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定ステップと、を有することを特徴とする。
Claims (8)
- 観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得部と、
前記細胞に関するテンプレート画像を取得するテンプレート画像取得部と、
前記細胞に関するHuモーメントの特徴量評価値を線形結合するためのパラメータ取得するパラメータ取得部と、
取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出部と、
前記細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出部と、
連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結部と、
連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出部と、
算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定部と、
を備えたことを特徴とする細胞生死判定システム。 - 前記連続画像取得部は、各画像を取得した時刻を記録し、
前記判定部は、この時刻に基づいて、生細胞が死細胞に変化した時刻を記録することを特徴とする請求項1に記載の細胞生死判定システム。 - 基準データ作成用の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得部と、
取得した画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付部と、
受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成部と、
取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出部と、
抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出部と、
連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結部と、
連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出部と、
算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出部と、
を備えたことを特徴とする細胞生死判定システム。 - 前記パラメータ算出部は、サポートベクターマシンを用いてパラメータの値を設定することを特徴とする請求項3に記載の細胞生死判定システム。
- 基準データ作成用の細胞の位相差画像および観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得部と、
取得した基準データ作成用の細胞の位相差画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付部と、
受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成部と、
取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出部と、
抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出部と、
連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結部と、
連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出部と、
算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出部と、
算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定部と、を備えたことを特徴とする細胞生死判定システム。 - 観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得ステップと、
前記細胞に関するテンプレート画像を取得するテンプレート画像取得ステップと、
前記細胞に関するHuモーメントの特徴量評価値を線形結合するためのパラメータ取得するパラメータ取得ステップと、
取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、
前記細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、
連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、
連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、
算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定ステップと、
を有することを特徴とする細胞生死判定方法。 - 基準データ作成用の細胞の位相差画像を連続的に取得する連続画像取得ステップと、
取得した画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付ステップと、
受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成ステップと、
取得した各画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、
抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、
連続する画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、
連続する画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、
算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出ステップと、
を有することを特徴とする細胞生死判定方法。 - 基準データ作成用の細胞の位相差画像を連続的に取得する基準データ作成用画像取得ステップと、
取得した基準データ作成用画像の一部について、細胞領域および細胞の生死情報の入力を受け付ける細胞情報入力受付ステップと、
受け付けた細胞領域に基づいてテンプレート画像を生成するテンプレート画像生成ステップと、
取得した各基準データ作成用画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、
抽出された細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、
連続する基準データ作成用画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、
連続する基準データ作成用画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、
算出した特徴量評価値をパラメータで線形結合した値がその細胞の生死を表わすようにパラメータの値を設定するパラメータ算出ステップと、
観察対象の細胞の位相差画像を連続的に取得する観察対象画像取得ステップと、
取得した各観察対象画像から前記テンプレート画像を用いて細胞領域を抽出する細胞領域抽出ステップと、
前記細胞領域毎にHuモーメントの複数個の特徴量を算出する特徴量算出ステップと、
連続する観察対象画像に含まれる細胞領域について、同一の細胞を連結する同一細胞連結ステップと、
連続する観察対象画像における同一細胞の前記特徴量の分散に関する特徴量評価値を特徴量毎に算出する特徴量評価値算出ステップと、
算出した特徴量評価値を前記パラメータで線形結合した値に基づいて、細胞の生死を判定する判定ステップと、
を有することを特徴とする細胞生死判定方法。
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