JP2006504093A - 疾病の早期検出のためのシステム、及び疾病特異的なバイオマーカーの開発 - Google Patents
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Abstract
Description
活動性慢性肝炎
アレルギー
血管運動神経性浮腫
抗リン脂質症候群
抗リン脂質症候群
側頭動脈炎
毛細血管拡張性失調症
自己免疫性胃炎
自己免疫性溶血性貧血
自己免疫性肝炎
Cl-エステラーゼ欠損症
チェディアック・東症候群
慢性肉芽腫症(CGD)
慢性疲労症候群(CFS, ME)
慢性皮膚粘膜カンジダ症
慢性副鼻腔炎
潰瘍性大腸炎
補体欠損症
CREST症候群
クリオグロブリン血症
CVID(分類不能型免疫不全(Common variable immunodeficiency))
皮膚筋炎
I型糖尿病
円盤状エリテマトーデス
熱病e.c.i.(未知の起源の熱)
伴性連鎖無ガンマグロブリン血症(Sex-linked agammaglobulinemia)(XLA)
ホモシスチン尿症
高好酸球症候群
高IgM症候群
高IgD症候群
高IgE症候群
過敏性血管炎
低ガンマグロブリン血症
特発性血小板減少性紫斑病
IgA欠損症
IgGサブクラス欠損症
胸腺腫を伴う免疫不全
未知の起源の伝染病
間質性膀胱炎
乾性角結膜炎
未知の起源の白血球減少症
白血球接着不全
播種性紅斑性狼瘡(disseminated lupus erythematosus)
ループス様症候群(Lupus-like syndrome)
顕微鏡的多発性血管炎(MPA)
混合性結合組織病(MCTD)
多発性硬化症
重症筋無力症
ミエロペルオキシダーゼ(MPO)欠損症
天疱瘡
悪性貧血
多発性血管炎重複症候群
結節性多発性動脈炎(PAN)
リウマチ性多発性筋痛
多発性筋炎
原発性粘液水腫
原発性胆汁性肝硬変
原発性好中球減少症
進行性全身性硬化症
再発性多発性軟骨炎
慢性関節リウマチ
巨細胞性動脈炎
サルコイドーシス(ベニエー-ベック疾病)(Besnier-Boeck disease)
SCID(重症複合型免疫不全)
強皮症多発性筋炎(Scleroderma polymyositis)
強皮症
亜急性皮膚エリテマトーデス(Subacute cutaneous lupus erythematosus)
エーラー・ダンロス症候群
グッドパスチャー症候群
マルファン症候群
シェーグレン症侯群
スティックラー症候群
全身性紅斑性狼瘡(SLE)
ブドウ膜炎
脈管炎
ウィスコット・アルドリッチ症候群
ウィスコット・アルドリッチ症候群
X連鎖無ガンマグロブリン血症(X-linked agammaglobulinemia)
X連鎖リンパ増殖性症候群(X-linked lymphoproliferative syndrome)
アジソン病
ベーチェット病
チャーグ・ストラウス症候群
クローン病
眼科グレーブス病(Ophthalmic Graves' disease)
橋本病
ライター症候群
高安動脈炎
チーツェ病
ウェゲナー疾病(Wegener's disease)
癌
膵臓癌
子宮頚癌
子宮癌
膀胱癌
骨髄癌
乳癌
腸癌
結腸癌
皮膚癌
咽喉癌
白血病
肝臓癌
肺癌
胃癌
腎臓癌
膵臓癌
前立腺癌
甲状腺癌
睾丸癌
ホジキン病
カーレル病(Kahler's disease)
感染症
ウシブルセラ症
ブルーイヤー疾病(Blue ear disease)
放線菌症
リウマチ熱
アフリカウマ疫
アフリカ豚コレラ
AIDS
ウマの脳脊髄炎
アナプラスマ属感染(Anaplasma infection)
萎縮性鼻炎
バチルスのヘモグロビン血症(Bacillar hemoglobinemia)
伝染性アガラクシア
牛肺疫(Contagious bovine pleuropneumonia)
伝染性副睾丸炎
伝染性リンパ管炎症
伝染性ウマ子宮炎
伝染性胸膜肺炎
ブタ腸チフス
エキノコックス症/包虫症
出血性紫斑病(Purpura hemorrhagica)
ウシ悪性カタル
輸送熱
ボツリヌス中毒症
牛海綿状脳症(BSE)
ウシウイルス性下痢(BVD)
気管支炎
気管支肺炎
腸チフス
オウム病クラミジア(Chlamydophila abortus)
コレラ
コクシジウム症
結膜炎
コクサッキーウィルス伝染病
クリプトスポリジウム症
嚢尾虫症
サイトメガリア(Cytomegalia)
腸の感染症(Intestinal infection)
デルマトフィルス症
ジフテリア
媾疫
赤痢
脳炎
地方病性牛白血病
全腸炎
腸性毒血症
伝染性紅斑
腸チフス
ガス壊疽
胃炎
ジアルジア症(ランブル鞭毛虫症)
歯肉炎
インフルエンザ
心水症
肝炎
疱疹
帯状疱疹
HIV感染症
狂犬病
HPV感染症
感染性貧血
乳児の新生児敗血症
角結膜炎
ブタコレラ(Classical swine fever)
家禽ペスト(Classical fowl plague)
ウシの伝染性鼻気管炎
在郷軍人病菌(Legionella pneumonia)
レプトスピラ症
肝臓ジストマ
リステリア症
ロンガデノマトシス(Longadenomatosis)
肺炎
ライム病
マラリア
波状熱(ブルセラ症)
乳腺炎
髄(脳)膜炎
髄膜脳炎
子宮筋層炎
脾脱疽
口蹄疫
流行性筋痛性
筋炎
粘液腫病
ナイロビ羊病
壊死桿菌症
結節性皮膚症(Nodulardermatosis)
ウマのインフルエンザ
パラドンティティス(Paradontitis)
寄生虫症
パラ結核性感染(Paratuberculosis infection)
パラチフス熱
腹膜炎
ピロプラズマ症
胸膜肺炎
足皮膚炎
天然痘
灰白髄炎
多発性関節炎
汎漿膜炎(Polyserositis)
偽口蹄疫
偽膜性腸炎(Pseudo membranous enteritis)
偽結核症
ニューカッスル病
髄様腎炎(Pulpy nephritis)
Q熱
鼻炎
リノニューモニア(Rhinopneumonia)
リフトバレー熱
牛疫
菌性伝染病
スクレピー
新生児の敗血症
性感染症
A群レンサ球菌感染症
B群レンサ球菌感染症
亜急性細菌性心内膜炎
テッシェン病
破傷風(Tetanos)
破傷風(Tetanus)
タイレリア症
毒素性ショック症候群
トキソプラズマ症
旋毛虫症(trichinellosis)
旋毛虫症(trichinosis)
トリコモナス感染症
トリパノソーマ症
結核
野兎病
精のう(嚢)炎
ウイルス性出血熱
ウイルス性心筋炎
斑点熱
ブタ丹毒
丹毒
ボーンホールム病
カレ病
クロイツフェルト・ヤコブ病
グラッサー病(Glasser's disease)
皮膚粘膜リンパ節症候群(川崎病)(Mucocutaneous lymph node syndrome)
腺熱
チザー病(Tyzzer's disease)
ワイル病(Weil's disease)
ズーノーシス(人獣共通感染症)
羊慢性進行性肺炎(Maedi-Visna)
変性疾患
筋萎縮性側索硬化症(シャルコー病)
アテローム性動脈硬化症
17番染色体架橋痴呆(Chromosome 17-linked dementia)
大脳皮質基底核変性症
嚢胞性線維症/ムコビシドーシス
びまん性レヴィ小体病(Diffuse Lewy body diseases)
椎間板症
前頭側頭型痴呆
レヴィ小体型痴呆(Lewy body dementia)
変形性関節症
骨髄炎
骨粗鬆症
原発性進行性失語症
進行性核上性麻痺(PSP)
進行性筋ジストロフィー(デュシェンヌ型筋ジストロフィー)
脊椎関節症
血管性痴呆
アルツハイマー病
ビンスワンガー病
クロイツフェルト-ヤコブ病
ゴーシェ病
ハンチントン病
コルサコフ病
パーキンソン病
ピック病
ポンペ病
NMR分光分析の前に、1 mlの尿サンプルが凍結乾燥され、そして内部標準としてトリメチルシリル-[2,2,3,3,2H4]-1-プロピオン酸(TMSP) 1 mMを有する1 mlのリン酸ナトリウムバッファー(pH 6.0、D20に基づく)中にもどされた。
NMRスペクトルは、プロトンNMRセットアップを備えたバリアン(Varian) UNITY 400 MHz分光計で、293 Kの作業温度で、完全に自動化された様式で三回記録された。自由誘導減衰(FID)は、8,000 Hzのスペクトルバンド幅を有する64 Kデータポイントとして集められた;45度のパルスが4.10秒の測定時及び2秒の緩和遅延で使用された。スペクトルが、128 FIDの蓄積によって決定された。残余の水の信号は、水ピークが測定パルスの前に一定の頻度で2秒間照射された前飽和技術によって除去された。
400 MHzのNMR分光計によって、健康な個体の及び変形性関節症が診断された個体の尿サンプルが試験された。スペクトルが処理され、そしてライン・リストが内部標準への参照後に標準のバリアン・ソフトウェアによって編集された。NMRデータ換算ファイルが、Winlin VI. 10内にインポートされた。種々のNMRスペクトルにおける比較可能な信号の小さな変化が、国際公開第02/13228号に記載されたような部分的線形適合アルゴリズムを使用することによって調節され、そして該線が解像度の損失無しにフィットされた。データのスケールは自動的に調節され、そして単位強度へと「正規化」された。内因的及び外因的代謝物質が、NMRスペクトルから除去され、それは特定の及び「有意的な」変形性関節症に関連した変化へのデータの減少をもたらした。この目的のために、それによってスペクトル線位置の80〜90%が除去されたところの閾値が使用された。
Claims (26)
- 哺乳動物における疾病の検出のための差プロファイルであって、NMRスペクトル線の複数のスペクトル線位置及び任意的に、対応する信号強度を含み、哺乳動物の1以上の健康な個体の体液中の代謝物質の1以上のNMRスペクトルと、疾患が診断されている前記哺乳動物の1以上の個体の対応する体液中の代謝物質の1以上の対応するNMRスペクトルとの間の正規化された差を表す、差プロファイル。
- 前記哺乳動物が、霊長類、イヌ及びげっ歯動物から成る群から選択されている、請求項1に記載の差プロファイル。
- 前記体液が尿である、請求項1又2に記載の差プロファイル。
- 前記疾病が、免疫性疾患、(慢性)炎症性疾患、変性疾患、癌、感染症及び/又は全身性疾患である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の差プロファイル。
- 前記疾病が変形性関節症である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の差プロファイル。
- 表1に従うスペクトル線及びそれに対応する値を含む、請求項5に記載の差プロファイル。
- 請求項1〜6のいずれか一項に記載の1以上の差プロファイルを含むデータベース。
- 前記哺乳動物がヒトである、請求項7に記載のデータベース。
- 哺乳動物における疾病の検出のための方法であって、前記疾病が疑われている前記哺乳動物の個体の体液中の代謝物質のNMRスペクトルを用意すること、及び前記NMRスペクトルを請求項7又は8に記載のデータベースからの差プロファイルと比較することのステップを含み、該差プロファイルが対応する哺乳動物からの対応する体液のために決定されている方法。
- 前記哺乳動物が、霊長類、イヌ及びげっ歯動物から成る群から選択されている、請求項9に記載の方法。
- 前記体液が尿である、請求項9又は10に記載の方法。
- 前記疾病が変形性関節症である、請求項9〜11のいずれか一項に記載の方法。
- 哺乳動物における疾病の検出のための差プロファイルを作成する方法であって、a)哺乳動物の1以上の健康な個体の体液中の代謝物質から記録された1以上のNMRスペクトルのスペクトル線の位置及び対応する信号強度の正規化された第1のセットを用意すること;b)疾病が診断されている前記哺乳動物の1以上の個体の対応する体液中の代謝物質から記録された1以上のNMRスペクトルのスペクトル線の位置及び対応する信号強度の正規化された第2のセットを用意すること;及びc)前記差プロファイルを得るために、信号強度が前記第1セットと前記第2セットとの間で異なるスペクトル線を検出することを含む、方法。
- 信号強度が前記第1セットと前記第2セットとの間で異なる前記スペクトル線を検出することが、国際公開第02/13228号に記載の方法の使用を含む、請求項13に記載の方法。
- 前記疾病が変形性関節症である、請求項13又は14に記載の方法。
- 疾病のためのバイオマーカーを識別する方法であって、請求項1〜6のいずれか一項に記載の差プロファイルを作成すること、及び前記差プロファイルにおける1以上の定義されたスペクトル線によって特徴付けられる1以上の代謝物質を同定することを含み、該1以上の代謝物質は単独で又は組み合わせで、前記バイオマーカーを特徴付ける、方法。
- 前記1以上の代謝物質が、正の回帰を有する1以上の定義されたスペクトル線によって特徴付けられる、請求項16に記載の方法。
- 前記疾病が変形性関節症である、請求項16又は17に記載の方法。
- 哺乳動物における疾病の検出のためのバイオマーカーであって、請求項1〜6のいずれか一項に記載の差プロファイルにおける1以上の定義されたスペクトル線によって特徴付けられる1以上の代謝物質又はそれらの部分を含む、バイオマーカー。
- 変形性関節症の検出のためのバイオマーカーであって、ラクテート、マレエート、β−アラニン、ヒポキサンチン、3,4-ジヒドロキシマンデレート、3−ヒドロキシ桂皮酸、アラニン、アスパラギン及びN-アセチルアスパルテート、及びそれの組合せから成る群から選択される1以上の代謝物質又はそれらの部分を含む、バイオマーカー。
- 哺乳動物における疾病の検出のために、請求項19に記載のバイオマーカーを使用する方法。
- 哺乳動物における変形性関節症の検出のために、請求項20に記載のバイオマーカーを使用する方法。
- 前記哺乳動物の個体の体液中の請求項19又は20に記載のバイオマーカーを測定することを含む、哺乳動物における疾病の検出のための方法。
- 前記体液が尿である、請求項23に記載の方法。
- 前記バイオマーカーのための1以上の固定化された結合パートナーを有する固体担体を含む、請求項23又は24に記載の方法を使用するための装置。
- 前記バイオマーカーと前記1以上の固定化された結合パートナーとの間に結合の定量的検出のためのシステムをさらに含む、請求項25に従う装置。
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