JP2005137202A - 多発性骨髄腫の分子診断方法 - Google Patents
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Abstract
【課題】疾患の状態、病期に特異的に発現の差異が見られる遺伝子マーカーを提供すること。
【解決手段】特定の多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なう多発性骨髄腫検査方法;該検査方法に基づく多発性骨髄腫病期判定方法;被検物質の有無に依存して、該遺伝子の発現が変動することを指標とする多発性骨髄腫治療又は予防に有効な化合物の評価方法;該化合物;該遺伝子のmRNAのアンチセンス核酸、該mRNAを特異的に切断するリボザイムまたは該遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有した治療又は予防剤;該抗体を含有した、多発性骨髄腫の研究試薬、遺伝子の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出する多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法;並びに該遺伝子によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出する、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法、。
【選択図】 なし
【解決手段】特定の多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なう多発性骨髄腫検査方法;該検査方法に基づく多発性骨髄腫病期判定方法;被検物質の有無に依存して、該遺伝子の発現が変動することを指標とする多発性骨髄腫治療又は予防に有効な化合物の評価方法;該化合物;該遺伝子のmRNAのアンチセンス核酸、該mRNAを特異的に切断するリボザイムまたは該遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有した治療又は予防剤;該抗体を含有した、多発性骨髄腫の研究試薬、遺伝子の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出する多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法;並びに該遺伝子によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出する、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法、。
【選択図】 なし
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、多発性骨髄腫の検査方法;多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法;該化合物;多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAに対するアンチセンス核酸;該mRNAを特異的に切断するリボザイム;該遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体;該化合物を有効成分として含有した、多発性骨髄腫の治療又は予防剤;及び多発性骨髄腫の易罹患性の判定方法に関する。
【0002】
【従来の技術】
多発性骨髄腫は、骨髄における形質細胞のクローン増殖により特徴づけられるB細胞の悪性疾患である。現在、メルファラン、プレドニゾン又は他の併用化学療法により、多発性骨髄腫患者の治療が行なわれている。しかしながら、前記療法により、通常、腫瘍荷重、骨病変、虚血及び単クローン性高ガンマグロブリン血症を寛解するが、完全な治癒はまれである。骨髄腫細胞は、化学療法剤に対して抵抗性になり、多発性骨髄腫患者の何症例かにおいては、形質細胞性白血病(PCL)に悪性転換する。
【0003】
多発性骨髄腫の原因を明らかにするための集中的な努力にもかかわらず、分子レベルにおいては、このプロセスへの限られた見識が得られているに過ぎないのが現状である。例えば、多発性骨髄腫細胞においては、しばしば、染色体領域14q32の免疫グロブリン重鎖(IgH)座に関与する多様な核型異常が見出されることが知られている〔ハレック(Hallek M.)ら、Blood 91, 3-21 (1998)〕。
【0004】
多発性骨髄腫におけるMonoclonal Gammopathy of Undetermined Significance(MGUS)は、骨髄における形成細胞数が増加することがない血清単クローン性高ガンマグロブリン血症により特徴づけられる。この状態は、以前、「良性単クローン性高ガンマグロブリン血症」として称されていた。前記MGUS期において、何人かの患者が、多発性骨髄腫期(Multiple myeloma期[MM期])さらには形質細胞性白血病期(Plasma Cell Leukemia[PCL期])に進行することが知られており、疾患の潜在的な悪性の性質を示すことが知られている。しかしながら、MGUSを罹患した多くの患者は、長年安定なままである。これらの観察は、MGUS患者が、良性疾患患者と、進行の遅い又は前臨床的な多発性骨髄腫患者とを含むであろうことを示唆する。良性ガンマグロブリン血症及び多発性骨髄腫のそれぞれの状態について、信頼できる分子マーカーがないため、現在、前記良性ガンマグロブリン血症と多発性骨髄腫とを分類することは困難である。多発性骨髄腫への移行の初期の検出を可能にする分子マーカーは、未だ同定されていないのが現状である。
【0005】
【発明が解決しようとする課題】
本発明は、疾患の状態、病期に特異的に発現の差異が見られる遺伝子マーカーを提供することを目的とする。具体的には、本発明の第1の目的は、多発性骨髄腫の検査方法を提供することにある。本発明の第2の目的は、迅速かつ簡便に、進行度又は病期を判定することが可能な多発性骨髄腫の病期の判定方法を提供することにある。本発明の第3の目的は、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤の評価方法を提供することにある。本発明の第4の目的は、前記発現調節剤を提供することにある。本発明の第5の目的は、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の薬理評価及びスクリーニングに適用しうる評価方法を提供することにある。本発明の第6の目的は、前記評価方法により得られる化合物を提供することにある。本発明の第7の目的は、前記遺伝子のmRNAのアンチセンス核酸を提供することにある。本発明の第8の目的は、前記mRNAを特異的に切断するリボザイムを提供することにある。本発明の第9の目的は、前記遺伝子にコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を提供することにある。本発明の第10の目的は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤を提供することにある。本発明の第11の目的は、多発性骨髄腫の罹患性のリスクの判定方法を提供することにある。
【0006】
【課題を解決するための手段】
本発明の要旨は、
〔1〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なうことを特徴とする、多発性骨髄腫の検査方法、
〔2〕 被検試料が、骨髄細胞である、前記〔1〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔3〕 骨髄細胞が、CD138陽性細胞である、前記〔2〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔4〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、mRNA量を指標として行なわれる、前記〔1〕〜〔3〕いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔5〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、遺伝子増幅法、DNAチップ、DNAマイクロアレイ及びノーザンブロットハイブリダイゼーション解析からなる群より選ばれた少なくとも1種の方法により行なわれる、前記〔4〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔6〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれる、前記〔1〕〜〔3〕いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔7〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、免疫学的方法及び/又はプロテインチップ解析により行なわれる、前記〔6〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔8〕 前記〔1〕〜〔7〕いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法により、多発性骨髄腫の病期を判定することを特徴とする、多発性骨髄腫の病期の判定方法、
〔9〕 以下のステップ:
(A) 被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させるステップ、並びに、
(B) 被検物質が、前記ステップ(A)で得られた試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法、
〔10〕 以下のステップ:
(A’) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させるステップ、並びに
(B’) 被検物質が、前記ステップ(A’)で得られた試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法、
〔11〕 以下のステップ:
(A”) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させるステップ、並びに、
(B”) 被検物質が、前記ステップ(A”)で得られたタンパク質の活性を調節するか否かを決定するステップ、
を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法、
〔12〕 前記〔9〕〜〔11〕いずれか1項に記載の評価方法により得られてなる、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物、
〔13〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAに特異的にハイブリダイズするアンチセンス核酸を含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、
〔14〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAを特異的に切断するリボザイムを含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、
〔15〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、
〔16〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有してなる、多発性骨髄腫の研究試薬、
〔17〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法、並びに
〔18〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法、
に関する。
【0007】
【発明の実施の形態】
本発明は、多発性骨髄腫において特異的に発現レベルが変動する遺伝子を見出し、該遺伝子により、多発性骨髄腫の検出、さらには、病期の判定が可能になるという知見に基づく。
【0008】
なお、本明細書においては、多発性骨髄腫において特異的に発現レベルが変動する遺伝子を、「多発性骨髄腫特異的遺伝子」という。
【0009】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子としては、下記遺伝子:
CDKチロシン15−キナーゼWEE1Hu(WEE1)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:U10564;Nature, 353, 80-93 (1991);EMBO J., 14, 1878-1891 (1995);塩基配列(配列番号:1)、アミノ酸配列(配列番号:2)]、
ヘルペスウイルスエントリーメディエーター(HVEM)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:U70321;Cell, 87, 427-736 (1996);塩基配列(配列番号:3)、アミノ酸配列(配列番号:4)]、
ヒストンH2A遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:L19779;DNA Cell Biol., 13, 161-170 (1994);塩基配列(配列番号:5)、アミノ酸配列(配列番号:6)]、
LD78α前駆体(LD78α)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:D90144;Mol. Cell. Biol., 10, 3646-3658 (1990);塩基配列(配列番号:7)、アミノ酸配列(配列番号:8)]、
グルコース依存性インスリン分泌ポリペプチドレセプター(GIPR)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:X81832;Diabetes, 44, 1202-1208 (1995);塩基配列(配列番号:9)、アミノ酸配列(配列番号:10)]、
結合組織増殖因子(CTGF)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:X78947;Circulation, 95, 831-839 (1997);塩基配列(配列番号:11)、アミノ酸配列(配列番号:12)]、
チトクロムb遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:M21186;Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 85, 3319-3323, (1988);塩基配列(配列番号:13)、アミノ酸配列(配列番号:14)]、
MHCホモログ遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:M24194;Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 86, 4594-4598, (1989);塩基配列(配列番号:15)、アミノ酸配列(配列番号:16)]、
Thyroid Hormone Binding Protein(THBP)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:J02783;J. Biol. Chem., 262, 11221-11227, (1987);塩基配列(配列番号:17)、アミノ酸配列(配列番号:18)]、
Cysteine-Rich Heart Protein (CRHP)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:AI017574、塩基配列(配列番号:19)]等が挙げられる。
【0010】
前記「多発性骨髄腫」とは、骨髄の形質細胞性腫瘍であり、免疫グロブリン異常、ベンズ・ジョーンズタンパク質(遊離の単クローン性κ鎖又はγ鎖)の過剰生産、骨変化等の所見により特徴付けられる進行性の悪性腫瘍性疾患をいう。本明細書において、前記多発性骨髄腫の病期は、MGUS期、MM期、PCL期に分けられる。
【0011】
MGUS期は、▲1▼骨病変が認められず、▲2▼単クローン性グロブリン血症が認められ、▲3▼骨髄中の腫瘍性形質細胞の量が10%未満であり、▲4▼異常免疫グロブリン(Mタンパク質)の量が、IgGに関して、3.5g/dl以下、IgAに関して、2.0g/dl以下、ベンズ・ジョーンズタンパク質に関して、1.0g/24時間以下であるという特徴を示す。MM期としては、▲1▼頭蓋骨、肋骨、脊椎骨等に多発性の溶骨性病変がX線写真上で認められ、▲2▼骨髄中の腫瘍性形質細胞の量が10%以上に増加、▲3▼Mタンパク質の量がMGUS期より増加することにより診断される。PCL期は、MM期に治療薬(プレドニゾン等)でコントロールできずに白血病状態を呈する。
【0012】
本発明の多発性骨髄腫の検査方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なうことを1つの大きな特徴とする。本発明の検査方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを指標とするため、迅速、かつ簡便に、多発性骨髄腫を検出することが可能になるという優れた効果を発揮する。また、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子は、病期に特異的に発現レベルが変動する遺伝子であるため、本発明の検査方法は、多発性骨髄腫の病期の判定にも適用されうる。
【0013】
本発明の検査方法は、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定を行なう場合、具体的には、
(a)少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における発現レベルを測定するステップ;並びに
(b)前記ステップ(a)で測定された該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、対照値として、健常者由来試料、多発性骨髄腫のMGUS期患者由来試料、多発性骨髄腫のMM期患者由来試料及び多発性骨髄腫のPCL期患者由来試料からなる群より選ばれた試料中における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとを比較するステップ;
を含むプロセスにより行なわれ、少なくとも2種の多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なう場合、具体的には、
(a’)少なくとも2種の多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルを決定するステップを含むプロセスにより行なわれる。
【0014】
本明細書において、前記「発現レベル」とは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子からなる群より選ばれた特定の遺伝子の転写産物の絶対量若しくは相対量、又は特定の遺伝子の翻訳産物の絶対量若しくは相対量をいう。前記転写産物の絶対量若しくは相対量を、以下、mRNAレベルともいう。前記翻訳産物の絶対量若しくは相対量を、以下、ポリペプチドレベル、又はタンパク質レベルともいう。
【0015】
前記「対照値を得るために用いられる試料」として、多発性骨髄腫に罹患していないことが予めわかっている健常者由来試料、多発性骨髄腫の各病期(MGUS期、MM期、PCL期)にあることが予め特定されているMGUS期患者由来試料、MM期患者由来試料及びPCL期患者由来試料が挙げられる。前記対照値は、予め、決定された値であってもよく、被検試料中の発現レベルの測定と同時に決定された値であってもよい。
【0016】
本明細書において、「発現プロファイル」とは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも2種を含む遺伝子群の発現レベルの増減及びその程度をパターン化したものをいう。
【0017】
多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定は、mRNA量、又は該多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれうる。
【0018】
前記被検試料としては、被検対象の個体(被検者ともいう)の骨髄細胞等が挙げられる。前記骨髄細胞としては、例えば、CD138陽性細胞等が挙げられ、本発明の検査方法においては、CD138陽性細胞が好ましい。
【0019】
前記CD138陽性細胞は、例えば、後述の実施例1に記載されるように、骨髄生検から、抗CD138抗体等を用いて、慣用の方法により得られる。
【0020】
被検試料の供給源である個体(被検者ともいう)としては、ヒトが挙げられる。
【0021】
遺伝子の発現レベルの測定又は発現プロファイルの決定は、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子に対応するmRNA量、又は該多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれうる。
【0022】
前記遺伝子のmRNAレベルでの発現レベルの測定又は発現プロファイルの決定は、遺伝子増幅法(例えば、PCR、リアルタイムRT−PCR)、DNAチップ、DNAマイクロアレイを用いる方法、ドットブロットハイブリダイゼーション、スロットブロットハイブリダイゼーション、ノーザンブロットハイブリダイゼーション等により行なわれうる。また、前記遺伝子のタンパク質レベルでの発現レベルの測定又は発現プロファイルの決定は、プロテインチップ解析、免疫学的方法(例えば、ELISA)等により行なわれうる。
【0023】
前記DNAチップ、DNAマイクロアレイ解析を行なうに際して、支持体に前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の配列を有する核酸の少なくとも1種を固定化したアレイを用いることができる。具体的には、前記アレイと、被検試料由来の標識された核酸と、任意に対照試料由来の標識された核酸とを接触させ、ハイブリダイゼーションを行なう。
【0024】
前記アレイに固定化される核酸としては、ストリンジェントな条件下に特異的にハイブリダイズする核酸であればよく、例えば、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の全配列を有する核酸であってもよく、各多発性骨髄腫特異的遺伝子において特徴的な配列からなる部分配列、からなる核酸であってもよい。ここで、「部分配列」とは、プライマー又はプローブとして使用するオリゴヌクレオチドが本発明のDNA配列をもとに少なくとも8個の対応する塩基配列からなり、好ましくは少なくとも10個の塩基配列、さらに好ましくは少なくとも約15〜25個の塩基配列からなる対応するポリヌクレオチドを意味する。
【0025】
前記アレイは、例えば、該核酸に、支持体表面への固定化を容易にしうる修飾基を導入し、ついで、得られた修飾核酸を、DNAアレイ作製装置、例えば、GMS社製のDNAチップ作製装置を用いて、予め定められた部位に整列、固定化すればよい。前記核酸の固定化量、固定化密度は、DNAチップハイブリダーゼションを行ないうる範囲で適宜選択されうる。また、GeneChipシステム[アフィメトリックス(Affymetrix)社製]のマイクロアレイを用いることもできる。
【0026】
前記支持体としては、ガラス(例えば、スライドグラス)、シリコンチップ等が挙げられる。
【0027】
前記DNAチップハイブリダイゼーション解析によれば、試料中に含まれる多種類の核酸分子の量を同時に測定することができ、少量の核酸試料でも測定できるという利点がある。また、被検試料と対照値を得るための試料(例えば、健常者由来試料、MGUS期患者由来試料、MM期由来試料、PCL期由来試料)とを異なる標識物質、具体的には、蛍光物質で標識した場合、同時に測定できるという利点がある。ここで、標識物質としては、放射性同位元素、蛍光物質、化学発光物質、発光団を有する物質等が挙げられる。例えば、前記蛍光物質としては、Cy2、FluorX、Cy3、Cy3.5、Cy5、Cy5.5、Cy7、イソチオシアン酸フルオレセイン(FITC)、テキサスレッド、ローダミン等が挙げられる。ここで、試料の標識は、試料中のmRNA、該mRNA由来のcDNAもしくは該cDNAより転写あるいは増幅された核酸を標識することによって実施される。前記Cy3及びCy5を標識物質として用いた場合、Cy3は532nm、Cy5は635nmの波長でスキャンすることにより検出されうる。なお、標識の強度を遺伝子の発現量の指標とする。
【0028】
前記DNAチップハイブリダイゼーション解析の場合、試料間で発現量の変動がない遺伝子、例えば、ハウスキーピング遺伝子等の発現量により、標識の強度を正規化してもよい。
【0029】
PCR、リアルタイムRT−PCRを行なうに際して、用いられるプライマーは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子において特徴的な配列を増幅可能な配列及び鎖長を有するオリゴヌクレオチドであればよい。プライマーの鎖長は、特に限定はないが、例えば、15塩基長以上であり、50塩基長以下であり、好ましくは、20塩基長以上以上であり、35塩基以下であることが望ましい。
【0030】
ノーザンブロットハイブリダイゼーション解析又はドットブロットハイブリダイゼーション解析を行なうに際して、用いられるプローブは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子にストリンジェントな条件下にハイブリダイズするオリゴヌクレオチド、好ましくは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子において特徴的な配列を有するオリゴヌクレオチドであればよく、前記プローブの鎖長は、特に限定はないが、非特異的なハイブリダイゼーションを防止する観点から、15塩基以上であり、好ましくは18塩基以上であることが望ましい。
【0031】
ポリペプチド量を指標とする場合、ポリペプチド量の測定手段としては、プロテインチップ解析、免疫測定法(例えば、ELISA等)等が挙げられる。
【0032】
前記プロテインチップ解析に用いられうるプロテインチップとしては、例えば、サイファージェン社のプロテインチップシステム等が挙げられる。
【0033】
前記免疫測定法においては、前記多発性骨髄腫遺伝子の翻訳産物であるポリペプチドに特異的に結合する抗体が用いられる。本発明の検査方法に用いられる抗体は、前記ポリペプチドに特異的に結合する能力を有するものであれば、特に限定はなく、ポリクローナル抗体又はモノクローナル抗体のいずれであってもよい。さらに、公知技術により修飾された抗体や抗体の誘導体、例えばヒト化抗体、Fabフラグメント、単鎖抗体等を使用することもできる。前記抗体は、例えば、カレント・プロトコルズ・イン・イムノロジー〔ジョン・E・コリガン(John E. Coligan)編集、Current Protocols in Immunology,John Wiely & Sons, Inc.発行(1992)〕等に記載の方法により、前記ポリペプチドの全部又は一部を用いてウサギやラット、マウス等を免疫することにより、容易に作製され得る。こうして得られた抗体を精製後、ペプチダーゼ等により処理することにより、抗体の断片が得られる。また、遺伝子工学的に抗体を作製することもできる。さらに、本発明の抗体又はその断片は、酵素免疫測定法、蛍光免疫測定法、発光免疫測定法等による検出を容易にするために、各種修飾をしてもよい。なお、前記ポリペプチドの発現は、モレキュラークローニング ア ラボラトリーマニュアル第2版〔ザンブルーク(Sambrook)ら、Molecular Cloning A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press発行(1980)〕、モレキュラークローニング ア ラボラトリーマニュアル 第3版〔ザンブルーク(Sambrook)ら、Molecular Cloning A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press発行(2001) 〕等に記載の慣用の遺伝子発現方法に従って発現させることができる。上記の抗体又はその断片には、ポリペプチド中における特徴的な配列からなる部分断片に特異的に結合しうる抗体も含まれる。
【0034】
本発明の検査方法において、多発性骨髄腫は、例えば、下記指標(1)〜(4):
(1)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種について、該被検試料中における発現レベルと健常者由来試料より得られた対照値との間に差異がある場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫に罹患していることの指標となる;
(2)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MGUS期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のMGUS期にあることの指標となる;
(3)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MM期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のMM期にあることの指標となる;
(4)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該PCL期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のPCL期にあることの指標となる;
に基づき、検出されうる。
【0035】
前記(1)の指標において、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルは、少なくとも1種、好ましくは、2種以上の遺伝子について測定されることが望ましい。また、前記(1)の指標において、[被検試料中における発現レベル−健常者由来試料より得られた対照値]の絶対値が、少なくとも0.5、好ましくは、1以上、より好ましくは、2以上である場合、該発現レベルと対照値との間に差異があると判断することができる。
【0036】
前記(2)〜(4)の指標において、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種、好ましくは、3種以上の遺伝子の発現プロファイルのパターンを比較し、解析することが望ましい。
【0037】
なお、発現プロファイルが実質的に同一であるか否かは、発現プロファイルの類似度により判別することができる。例えば、発現プロファイルを階層的クラスタリングにより、クラスタリングすることにより類似度がわかる。
【0038】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子は、多発性骨髄腫の病期に特異的に変動するため、かかる遺伝子の発現レベル、発現プロファイルを指標とする本発明の検査方法によれば、多発性骨髄腫の病期をも判定することが可能になる。本発明には、多発性骨髄腫の病期の判定方法も含まれる。
【0039】
本発明の多発性骨髄腫の病期の判定方法においては、前記検査方法を行ない、被検試料の供給源の個体について、下記基準(I)〜(III):
(I)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MGUS期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、MGUS期にあることの指標となる;
(II)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MM期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、MM期にあることの指標となる;及び
(III)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該PCL期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、PCL期にあることの指標となる
のいずれかにより、多発性骨髄腫の病期を判定することを1つの特徴とする。本発明の判定方法によれば、前記多発性骨髄腫遺伝子の発現プロファイルを指標としているため、多発性骨髄腫の病期を、被検試料、特に骨髄細胞組成の差異に影響されることがなく、高い信頼度で、迅速かつ簡便に、判定することができるという優れた効果を発揮する。
【0040】
本発明の判定方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の中でも、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子及びチトクロムb遺伝子の発現レベル又は発現プロファイルにより、被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のMM期又はPCL期にあることを判定することができる。また、WEE1遺伝子の遺伝子の発現レベル又は発現プロファイルにより、被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のPCL期にあることを判定することができる。
【0041】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子は、多発性骨髄腫の発症に関連することが予想されるため、かかる遺伝子の発現を調節しうる物質は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、病期の進行を抑制するための治療剤等への応用が期待される。本発明により、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤又は該遺伝子にコードされたタンパク質の活性調節剤の評価方法が提供される。
【0042】
本発明の発現調節剤又は活性調節剤の評価方法は、被検物質の有無に依存して、前記多発性骨髄特異的遺伝子の発現が変動することを、該被検物質が、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤であることの指標とする方法である。具体的には、本発明の発現調節剤の評価方法は、
A.前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種を保持した試験細胞又は試験動物を、被検物質の存在下及び非存在下にそれぞれ維持するステップ;並びに、
B.該試験細胞又は試験動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを測定するステップ;
を含み、被検物質存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、被検物質非存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとの間で差異がある場合、該被検物質が、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節能を有することの指標とすることを1つの大きな特徴とする。
【0043】
本発明の発現調節剤及び活性調節剤の評価方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種を保持した試験細胞又は試験動物を、被検物質の存在下及び非存在下にそれぞれ維持する[ステップAという]。
【0044】
ステップAにおいて、試験細胞を用いる場合、該試験細胞の培養時に、被検物質を含有した培地を用いることにより、試験細胞と被検物質とを接触させることができる。前記培地中における被検物質の量は、適宜選択されうる。
【0045】
また、前記ステップAにおいて、動物を用いる場合、経口投与、非経口投与等により、被検物質を動物に投与すればよい。被検物質の投与量は、適宜選択されうる。被検物質の投与の際、薬学的に許容されうる担体、助剤等とともに、該被検物質を投与してもよい。
【0046】
ついで、試験細胞又は試験動物における前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル及び生物学的活性を測定する[ステップBという]。
【0047】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定は、前記検査方法における発現レベルの測定手法と同様の手法により行なわれうる。すなわち、遺伝子の発現レベルを、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子に対応するmRNA量を指標として測定してもよく、該多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として測定してもよい。mRNA量を指標とする場合、DNAチップハイブリダイゼーション解析、RT−PCR、ノーザンブロットハイブリダイゼーション解析及びドットブロットハイブリダイゼーション解析等を用いることができる。また、ポリペプチド量を指標とする場合、プロテインチップ解析、又は前記多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチドに特異的に結合する抗体の少なくとも1種を用いた免疫測定法等を用いることができる。
【0048】
前記ステップBで測定された発現レベルについて、被検物質存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、被検物質非存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとの間で差異がある場合、該被検物質が、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節能を有することの指標とする。
【0049】
具体的には、被検物質存在下における前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、被検物質非存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとの間の差異が、絶対値として、0を超える場合、好ましくは0.5以上、より好ましくは1以上である場合、該被検物質が、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節能を有することの指標とする。
【0050】
なお、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のなかで、その翻訳産物であるポリペプチドの生物学的活性を測定することができる遺伝子については、被検物質を含有した生物学的活性測定系と、被検物質を含有しない生物学的活性測定系とにおける活性を比較することにより、評価を行なうこともできる。
【0051】
本明細書において、被検物質としては、ポリペプチド、核酸、化合物等が挙げられる。
【0052】
本明細書において、CD138陽性細胞とは、骨髄細胞のうち形質細胞(抗体産生B細胞)をいう。CD138は、正常な形質細胞及び癌化した形質細胞に認められ、MMは、この形質細胞が癌化した状態をいう。骨髄細胞の中で、CD138により免疫染色される細胞は、形質細胞のみであり、その他のタイプの細胞は、免疫染色されない〔チロシ(Chilosi M.)ら、Mod. Pathol., 12, 1101-1106 (1999)〕。従って、CD138陽性細胞を調べることは、骨髄細胞全体を調べるよりも、よりMMの病態を反映しているといえる。
【0053】
本明細書において、「多発性骨髄腫特異的遺伝子を保持した試験細胞又は試験動物」は、本質的に(すなわち、天然の状態において)該多発性骨髄腫特異的遺伝子を有する細胞又は動物であってもよく、人為的に該多発性骨髄腫特異的遺伝子を導入して得られた形質転換細胞又はトランスジェニック動物、例えば、トランスジェニック非ヒト動物であってもよい。
【0054】
前記形質転換細胞は、例えば、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を細胞導入用担体等により、慣用の遺伝子導入方法により細胞に導入することにより得られうる。
【0055】
前記細胞導入用担体としては、細胞への導入に適した生物学的ベクター(例えば、慣用のプラスミドベクター、ウイルスベクター等)、金属粒子、正電荷ポリマー、リン酸カルシウム、DEAEデキストラン等が挙げられる。また、前記細胞導入用担体には、前記プラスミドベクター又はウイルスベクターをリポソーム、金属粒子、正電荷ポリマー、リン酸カルシウム、DEAEデキストラン等に保持せしめたものも含まれる。前記生物学的ベクターは、用いられる細胞の種類に応じて、適宜選択されうる。
【0056】
哺乳動物細胞における発現ベクターに用いられるプロモーターの例としては、HTLV−LTRプロモーター、SV40初期及び後期プロモーター、CMVプロモーター、マウス・メタロチオネインプロモーター等が挙げられる。
【0057】
生物学的ベクターとしては、pcDNA3.1、pSV2dhfr ATCC37145、プラスミドpSV2neo ATCC37149、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター等が挙げられる。
【0058】
前記細胞としては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を発現することが可能な細胞であればよく、例えば、CHO細胞、COS-1細胞、Jarkat細胞、白血病細胞等が挙げられる。
【0059】
前記遺伝子導入方法としては、リポフェクション法、リン酸カルシウム法、微小ガラス管を用いた直接注入法内包型リポソームによる遺伝子導入法、静電気型リポソームによる遺伝子導入法、HVJ−リポソーム法、受容体介在性遺伝子導入法、パーティクル銃による遺伝子導入法、naked−DNAの直接導入法、正電荷ポリマーによる導入法等が挙げられる。
【0060】
前記トランスジェニック動物、特にマウス、ラットは、例えば、分子生物学プロトコール(南江堂、1994)等に記載の作製方法に従い、得られうる。具体的には、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を保持した細胞導入用担体等を動物、特に、非ヒト動物の受精卵にマイクロインジェクションすることにより得ることができる。具体的には、例えば、トランスジェニック動物は、下記のように作製されうる。まず、過排卵誘起した雌と種雄とを交配させる。交配後約12時間(動物種により異なる)を経た雌から卵管を取り出し、1細胞期(前核期)の受精卵を採取し、適切な培養液に入れる。ついで、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を保持した細胞導入用担体を受精卵の前核にマイクロインジェクションする。一方、性成熟に達した雌に精管切除した雄を交尾させて、偽妊娠雌を作製する。マイクロインジェクション後、生存した受精卵を前記偽妊娠雌の卵管内に移植する。その後、卵管内に移植された受精卵より発生した胎仔を自然分娩又は切開手術により取り出す。得られた仔の尾の一部からゲノムDNAを調製する。得られたDNAを分析して、得られた仔がトランスジェニック動物であるか否かを調べる。得られたトランスジェニック動物を交配して該トランスジェニック動物の系統を樹立する。
【0061】
前記動物としては、ヒト以外の哺乳動物、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ブタ、イヌ、ヒツジ、ヤギ等の哺乳動物等が挙げられる。
【0062】
なお、導入対象となる多発性骨髄腫特異的遺伝子の代わりに、該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域の配列と、該配列の下流にレポーター遺伝子とを含む核酸を用いることにより、レポーター遺伝子の発現の有無及び発現の強度を指標として、より迅速かつ簡便に評価を行なうことができる。
【0063】
また、前記評価方法により得られた発現調節能を有する物質のなかでも、特に前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを正常なレベルに近づけうる物質は、多発性骨髄腫の治療又は予防に有用であることが期待される。したがって、本発明により、多発性骨髄腫の治療又は予防に有用な化合物の評価方法が提供される。
【0064】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有用な化合物の評価方法は、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル、該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域からの転写、及び該多発性骨髄腫特異的遺伝子にコードされたタンパク質の生物学的活性からなる群より選ばれた1種に及ぼす被検物質の作用を指標とすることに1つの特徴がある。
【0065】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有用な化合物の評価方法は、具体的には、
(A) 被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させるステップ、並びに、
(B) 被検物質が、前記ステップ(A)で得られた試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む方法(方法1);
(A’) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させるステップ、並びに
(B’) 被検物質が、前記ステップ(A’)で得られた試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む方法(方法2)、並びに
(A'') 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させるステップ、並びに、
(B'') 被検物質が、前記ステップ(A'')で得られたタンパク質の活性を調節するか否かを決定するステップ、
を含む方法(方法3)が挙げられる。
【0066】
本発明の治療又は予防に有用な化合物の評価方法によれば、多発性骨髄腫における前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル、又は生物学的活性を、被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルに近づけることができる化合物を評価することができるという優れた効果を発揮する。
【0067】
なお、本明細書において、被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを、「正常レベル」とも称す。
【0068】
本発明の化合物の評価方法(方法1)においては、被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させる〔ステップ(A)という〕。
【0069】
本発明の化合物の評価方法(方法1)における被検物質としては、前記発現調節剤及び活性調節剤の評価方法における被検物質と同様の物質が挙げられる。試験動物又は試験細胞としては、前記と同様の動物又は細胞が挙げられる。
【0070】
被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させる際、例えば、被検物質を含有した培地又は被検物質を含有しない培地を用いて試験細胞を培養してもよく、前記発現調節剤の評価方法と同様の手法により、被検物質を、試験動物に投与してもよい。
【0071】
ついで、被検物質が、試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定する〔ステップ(B)という〕。
【0072】
前記ステップ(B)において、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定は、前記検査方法における発現レベルの測定手法と同様の手法により行なわれうる。すなわち、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子に対応するmRNA量又はポリペプチド量を、前記と同様に測定することにより、発現レベルを決定できる。
【0073】
判断基準としては、例えば、下記指標等が挙げられる。すなわち、
被検物質を投与又は接触させた、試験細胞又は試験動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルAと、
被検物質を投与していないか、あるいは接触させてない、該試験細胞又は試験動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルBと
被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル(正常レベル)と
を測定する。ついで、発現レベルAと発現レベルBと正常レベルとを比較する。ここで、[発現レベルB−発現レベルA]の絶対値が、0を超え、かつ
(i)発現レベルAと正常レベルとが実質的に同一である場合、又は
(ii)[正常レベル−発現レベルA]の絶対値が、[発現レベルB−発現レベルA]の絶対値よりも小さい場合、
該被検物質が、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物であることの指標となる。
【0074】
本発明の化合物の評価方法(方法2)においては、被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させる〔ステップ(A’)という〕。
【0075】
被検物質としては、前記方法1における被検物質と同様の物質が挙げられる。試験動物又は試験細胞は、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む動物又は細胞であればよく、該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域の配列と、該配列の下流にレポーター遺伝子とを含む核酸等を導入された動物又は細胞等が挙げられる。
【0076】
前記レポーター遺伝子としては、β−ガラクトシダーゼ遺伝子、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子、緑色蛍光タンパク質遺伝子、β−グルコニダーゼ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、エクオリン遺伝子等が挙げられる。
【0077】
多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域の配列は、該多発性骨髄腫特異的遺伝子のプロモーター領域を含む配列が挙げられる。
【0078】
被検物質が、試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定する〔ステップ(B’)という〕。
【0079】
前記レポーター遺伝子の発現レベルは、用いたレポーター遺伝子の発現産物の活性測定等により測定されうる。例えば、前記ルシフェラーゼ遺伝子を用いた場合、発現産物であるルシフェラーゼの酵素活性を測定すればよい。
【0080】
判断基準としては、例えば、下記指標等が挙げられる。すなわち、
被検物質を投与又は接触させた、試験細胞又は試験動物におけるレポーター遺伝子産物の活性Aと、
被検物質を投与していないか、あるいは接触させてない、該試験細胞又は試験動物におけるレポーター遺伝子産物の活性Bと
被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物におけるレポーター遺伝子産物の活性(正常レベル)と
を測定する。ついで、活性Aと活性Bと正常レベルとを比較する。ここで、[活性B−活性A]の絶対値が、0を超え、かつ
(i)活性Aと正常レベルとが実質的に同一である場合、又は
(ii)[正常レベル−活性A]の絶対値が、[活性B−活性A]の絶対値よりも小さい場合、
該被検物質が、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物であることの指標となる。
【0081】
本発明の化合物の評価方法(方法3)においては、被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させる〔ステップ(A'')という〕。
【0082】
多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質は、該多発性骨髄腫特異的遺伝子を慣用の方法により宿主に導入して得られた形質転換体を、該タンパク質の発現に適した条件下に培養し、得られた培養物から、慣用のタンパク質精製方法(例えば、塩析、イオン交換クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、エレクトロフォーカシング等)により精製することにより、得られうる。また、用いる宿主、培養条件等により、目的のタンパク質が、不溶性の封入体として得られる場合があるが、慣用のリフォールディング技術により、活性を有するタンパク質を得ることができる。
【0083】
ついで、被検物質が、前記タンパク質の活性を調節するか否かを決定する〔ステップ(B'')という〕。かかるステップにおいては、タンパク質の種類に応じた活性測定法により、該タンパク質の活性を測定する。
【0084】
判断基準としては、例えば、下記指標等が挙げられる。すなわち、
被検物質を投与又は接触させた、試験細胞又は試験動物における多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現産物(タンパク質)の活性A’と、
被検物質を投与していないか、あるいは接触させてない、該試験細胞又は試験動物におけるレポーター遺伝子産物の活性B’
被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現産物(タンパク質)の活性(正常レベル)と
を測定する。ついで、活性A’と活性B’と正常レベルとを比較する。ここで、[活性B’−活性A’]の絶対値が、0を超え、かつ
(i)活性Aと正常レベルとが実質的に同一である場合、又は
(ii)[正常レベル−活性A’]の絶対値が、[活性B’−活性A’]の絶対値よりも小さい場合、
該被検物質が、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物であることの指標となる。
【0085】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法は、該化合物のスクリーニング及び多発性骨髄腫の治療又は予防剤の薬理評価に適用されうる。また、本発明の化合物の評価方法によりスクリーニングされうる化合物は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤への応用が期待される。したがって、本発明の化合物の評価方法により得られた化合物も本発明に含まれる。
【0086】
また、本発明の検査方法、判定方法、発現調節剤の評価方法及び化合物の評価方法に用いられる多発性骨髄腫特異的遺伝子は、多発性骨髄腫の発症に関連することが予想されるため、かかる遺伝子の発現を調節しうる物質は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、病期の進行を抑制するための治療剤等への応用が期待される。したがって、本発明により、多発性骨髄腫の治療又は予防剤が提供される。
【0087】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防剤としては、
▲1▼前記化合物の評価方法により得られた化合物を有効成分として含有した剤、
▲2▼前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のうち、多発性骨髄腫の発症又は病期又は病期の進行に応じて発現が増大する遺伝子、すなわち、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれのmRNAに特異的にハイブリダイズするアンチセンス核酸を有効成分として含有した剤、
▲3▼前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のうち、多発性骨髄腫の発症又は病期又は病期の進行に応じて発現が増大する遺伝子、すなわち、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれのmRNAを特異的に切断するリボザイムを有効成分として含有した剤、
▲4▼前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のうち、多発性骨髄腫の発症又は病期又は病期の進行に応じて発現が増大する遺伝子、すなわち、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれによりコードされたポリペプチドに特異的に結合する抗体を有効成分として含有した剤、
等が挙げられる。
【0088】
本発明の治療又は予防剤の薬理評価は、前記化合物の評価方法により行なわれうる。
【0089】
本発明の治療又は予防剤における有効成分の量は、該有効成分の種類、投与対象の個体の年齢、体重等により適宜選択されうる。例えば、前記有効成分の量は、通常成人1日当たり約0.1〜1000mgの範囲となる量とすることができ、例えば、1日1〜4回に分けて投与してもよく、1回/1日〜1回/数日又はそれ以上の間隔で投与してもよい。
【0090】
前記▲4▼の治療又は予防剤において、抗体は、前記検査方法における抗体と同様のものが用いられうる。
【0091】
本発明の治療又は予防剤の投与経路としては、例えば、経口、静脈、動脈、皮下、皮内、筋肉内等への投与するか、又は病変の認められる組織そのものに直接局所投与することができる。
【0092】
本発明の治療又は予防剤の製剤形態は、上記の各投与形態に合った種々の製剤形態であればよく、注射剤、錠剤、カプセル剤、顆粒剤、散剤、液剤等が挙げられる。例えば、注射剤の場合、該注射剤は常法により調製することができ、例えば、前記有効成分を適切な溶剤(PBS等の緩衝液、生理食塩水、滅菌水等)に溶解し、任意に安定化剤、等張剤、局所麻酔剤等を添加し、フィルター等で濾過滅菌し、次いで無菌的な容器に充填することにより、皮下、筋肉内、静脈内用注射剤等を得ることができる。前記注射剤には必要に応じて慣用の担体等を加えても良い。また、HVJ−リポソーム等のリポソームにおいては、懸濁剤、凍結剤、遠心分離濃縮凍結剤等のリポソーム製剤の形態とすることができる。また、徐放性の製剤であってもよい。
【0093】
また、製剤形態に応じて、任意に、慣用の賦形剤、結合剤、滑沢剤、その他着色剤、崩壊剤等を用いてもよい。前記賦形剤としては、例えば、乳糖、デンプン、タルク、ステアリン酸マグネシウム、結晶セルロース、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、グリセリン、アルギン酸ナトリウム、アラビアゴム等が挙げられ、結合剤としてはポリビニルアルコール、ポリビニルエーテル、エチルセルロース、アラビアゴム、シエラック、白糖等が挙げられ、滑沢剤としてはステアリン酸マグネシウム、タルク等が挙げられる。
【0094】
なお、本発明の治療又は予防剤において、WEE1遺伝子に関するアンチセンス核酸、リボザイム、又は該WEE1遺伝子にコードされたポリペプチド又はその断片に対する抗体によれば、PCL期への移行の予防又はPCL期の多発性骨髄腫の治療が期待される。また、本発明の治療又は予防剤において、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれに関するアンチセンス核酸、リボザイム、又は該HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれににコードされたポリペプチドに対する抗体又はその断片に対する抗体によれば、MM期及び/又はPCL期への移行の予防又はMM期又はPCL期の多発性骨髄腫の治療が期待される。
【0095】
本発明の治療又は予防剤によれば、多発性骨髄腫の治療及び病期の進行又は発症の予防が可能になる。したがって、本発明により、多発性骨髄腫の治療又は予防方法が提供される。
【0096】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防方法は、治療上有効量の前記治療又は予防剤を、治療又は予防が必要な個体に投与することを1つの特徴とする。投与方法、投与経路は、前記と同様に適宜選択されうる。
【0097】
また、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種によりコードされたポリペプチドに特異的に結合する抗体、前記発現調節剤の評価方法により得られた発現調節剤は、多発性骨髄腫研究用試薬としても有用である。したがって本発明により、多発性骨髄腫研究用試薬が提供される。
【0098】
さらに、本発明の検査方法、判定方法、発現調節剤の評価方法及び化合物の評価方法に用いられる多発性骨髄腫特異的遺伝子は、塩基配列の変異により、発現レベルの異常を引き起こしている可能性があり、それにより多発性骨髄腫の発症に関連することが予想される。したがって、塩基配列の変異、具体的には、核酸多型を検出することにより、多発性骨髄腫易罹患性のリスクを判定することが可能になる。したがって、本発明により、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法が提供される。
【0099】
本発明の多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法としては、具体的には、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする方法[リスク判定方法1という]、又は前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする方法[リスク判定方法2という]が挙げられる。本発明の多発性骨髄腫の罹患性のリスクの判定方法によれば、症状が見られない個体において、予め多発性骨髄腫の罹患性のリスクを予想することが可能になる。
【0100】
本明細書において、核酸多型とは、同じ種の個体間、生物の同一個体間若しくは生物間において見出される場合がある差異又は変化であり、多発性骨髄腫において、特異的に発現レベルが変動する範囲における核酸の構造、形質又は形態の差異あるいは変化をいう。かかる核酸多型としては、ミニサテライトDNA、マイクロサテライトDNA、一塩基多型(SNP)が挙げられ、より具体的には、アミノ酸置換を生じるcSNP、アミノ酸置換を伴わないsSNP、ゲノムにおける多型であるgSNP、調節領域における多型であるrSNP等が挙げられる。本発明のリスク判定方法において検出対象となる核酸多型は、1種であってもよく、複数種共存してもよい。
【0101】
前記リスク判定方法1において、発現レベルの異常をもたらす核酸多型としては、例えば、調節領域における多型であるrSNP等が挙げられる。本発明のリスク判定方法1において検出対象となる核酸多型は、正常レベルと異なる発現レベルを示す多型であり、健常者に比べ、多発性骨髄腫患者において出現頻度の高い核酸多型であればよい。
【0102】
前記リスク判定方法2において、ポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型としては、例えば、アミノ酸置換を生じるcSNP等が挙げられる。本発明のリスク判定方法2において検出対象となる核酸多型は、ポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす多型であり、健常者に比べ、多発性骨髄腫患者において出現頻度の高い核酸多型であればよい。
【0103】
本発明のリスク判定方法において、検出対象となる前記核酸多型は、以下のようにして同定されうる。すなわち、健常者集団及び多発性骨髄腫患者集団を対象として、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子及び当該遺伝子の発現レベルの増減に関連し得る領域(例えば、調節領域等)をシークエンシングし、多型部位を検出する。検出された多型部位の対立遺伝子頻度を算出し、健常者集団に比べ、患者集団において有意に増加している対立遺伝子を見いだすことにより、多発性骨髄腫と相関する多型を同定することができる。
【0104】
前記リスク判定方法2において検出対象となる核酸多型は、さらに、健常者集団及び患者集団のそれぞれ由来の多発性骨髄腫特異的遺伝子にコードされたポリペプチドの生物学的活性を測定して、健常者集団における前記ポリペプチドの生物学的活性と、患者集団における生物学的活性との間で差異があるものを選別することにより得られうる。
【0105】
本発明のリスク判定方法において、前記核酸多型の検出手法としては、前記核酸多型を検出しうる方法であればよく、公知の各種の方法が広く採用されうる。かかる検出手法としては、被検者由来のゲノムDNAについて、例えば、多型部位の塩基配列を決定し、得られた配列情報を指標として核酸多型を検出する方法;多型部位に存在する塩基の種類に依存して変化するDNA試料の物理化学的性質の差又は制限酵素認識部位の相違を指標として核酸多型を検出する方法(例えば、多型部位を含むDNA試料のゲル電気泳動やキャピラリー電気泳動等の各種電気泳動手段等における挙動の差を利用する方法);当該多型部位の検出に適した検出用プローブにより、核酸多型を検出する方法及び質量分析法により質量の相違を指標として核酸多型を検出する方法等が挙げられる。
【0106】
質量分析法により核酸多型を検出する場合、例えば、MALDI−TOF MS(マトリックス支援レーザー脱離イオン化/飛行時間型質量分析計)等が用いられうる。
【0107】
本発明のリスク判定方法1においては、被検試料は、DNAを含有した試料であればよく、ゲノムDNA精製試料であってもよく、未精製試料であってもよい。また、前記被検試料としては、例えば、ヒト由来試料、具体的には、血液、骨髄、体液、皮膚、筋肉、臓器等の生検から得られた試料等が挙げられる。なお、ゲノムDNA精製試料は、前記ゲノムDNAは、前記生検より常法に従い抽出、精製し、調製されうる。
【0108】
本発明のリスク判定方法2においては、被検試料は、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子にコードされたポリペプチドの生物学的活性を呈しうる状態の試料であれば、精製試料であってもよく、未精製試料であってもよい。前記披検試料としては、例えば、ヒト由来試料、具体的には、血液、骨髄、CD138陽性細胞、体液、皮膚、筋肉、臓器等の生検から得られた試料等が挙げられる。
【0109】
本発明のリスク判定方法において、多発性骨髄腫において高い頻度で見出される核酸多型が、多く検出される場合、被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫に罹患する危険性が高いと判断されうる。
【0110】
なお、本発明の多発性骨髄腫の検査方法、病期の評価方法及び易罹患性のリスク判定方法により得られた情報は、慣用の情報記録媒体、例えば、CD−R、FD等に代表される電子媒体、紙等の記録媒体を介して、多発性骨髄腫の治療を必要とする個体に、適切な診断のための情報や適切な治療の選択のための情報を提供することができる。かかる情報の提供方法も本発明の範囲に含まれる。
【0111】
【実施例】
以下、本発明を実施例により更に具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例によって限定されるものではない。
【0112】
実施例1 CD138陽性細胞の精製
インフォームドコンセントの下、3人の健常者ボランティア、3人のMGUS患者、7人のMM患者及び2人のPCL患者の各患者から骨髄(BM)吸引物を得た。単核細胞(MNC)をBM生検から精製した。抗CD138+ MicroBeads(登録商標)[ミルテニー バイオテク(Miltenyi Biotec)社製]を用いて、該MNCを標識し、得られた標識MNCをminiMACS(登録商標)磁気細胞分離カラム[ミルテニー バイオテク(Miltenyi Biotec)社製]によるクロマトグラフィーに供した。得られたCD138陽性細胞画分を適量に分割し、−80℃で保存した。
【0113】
実施例2 RNA調製及びDNAマイクロアレイ解析
酸性グアニジニウム法により、全RNAを、CD138陽性細胞標品から抽出した。得られた全RNAを、T7 RNAポリメラーゼを用いた増幅に供した。全試料を、2回増幅した。第1段階増幅及び第2段階増幅のそれぞれ由来のRNAにより得られたDNAマイクロアレイデータの相関係数は、0.93であると算出された。
【0114】
1μgの増幅cRNAを、二本鎖cDNAに変換してから、ハイブリダイゼーション用ビオチン標識cRNAを調製した。得られたビオチン標識cRNAを用いて、12,625遺伝子が検出可能なGeneChip HU95Avs2マイクロアレイ[アフィメトリックス(Affymetrix)社製]のハイブリダイゼーションを行った。続いて、洗浄操作を行ない、アレイ上におけるシグナルの検出を、GeneChipシステム[アフィメトリックス(Affymetrix)社製]を用いて行なった。数値化されたデータの統計学的解析を、GeneSpring3.2.2ソフトウェア[シリコンジェネティックス(Silicon Genetics)]を用いて行なった。
【0115】
12,000を超えるヒト遺伝子の発現レベルを、15検体由来のCD138陽性細胞標品について、解析した。異なる患者における形質細胞のトランスクリプトームを比較するため、各遺伝子の発現レベルを、GeneChipハイブリダイゼーションごとの全遺伝子の平均発現強度により正規化した。類似度が分離比0.5の標準相関により測定されるクラスター解析によりデンドログラム(遺伝子樹形図)を作成した。具体的には、各ハイブリダイゼーションにおいて、全てのスポットのシグナル強度をデジタル化し、平均スポット強度について正規化した。このデータをクラスター分析することにより、その発現プロファイルが類似している遺伝子同士を1つのツリーに近接して配置した遺伝子遺伝子ツリー(又はデンドログラムともいう)を得た。これにより、ある特定の病期又は病期のサブグループにおいてのみ活性な幾つかの遺伝子のクラスターを見出した。また、多発性骨髄腫における病期特異的遺伝子を視覚化するために、MGUS期、MM期又はPCL期群の間で各遺伝子の平均発現強度を算出し、これらの値に基づいて遺伝子ツリーを再度描いた。この平均ツリーから、MGUS期、MM期又はPCL期に特異的に発現レベルの変動する遺伝子を見出した。
【0116】
それらの遺伝子及び多発性骨髄腫患者における遺伝子発現レベルを表1に示す。表1に記載の発現量は任意単位であり、0.6以下は検出限界以下である。数値は絶対的なものではなく患者の状態、mRNAの調製、DNAマイクロアレイの状態により変動し得る。
【0117】
【表1】
【0118】
MM期とMGUS期とを区別する分子マーカーを同定する試みとして、健常者又はMGUS患者における発現に比べてMM患者又はPCL患者において発現が増加する遺伝子を検索した。
【0119】
表1に示すように、平均樹形図からMM患者又はPCL患者において特異的に発現する遺伝子として、13個の遺伝子を見出した。特に、注目すべき遺伝子として、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子があげられる。
【0120】
これらの遺伝子は、健常者由来の細胞及びMGUS期患者由来の細胞の両方において不活化し、MM期患者由来の細胞又はPCL期患者由来の細胞に広い範囲に誘導される。したがって、これらの遺伝子は、多発性骨髄腫のMM期及びPCL期に特異的な分子マーカーの強力な候補である。
【0121】
ヒストンH2Aの過剰発現は、Rossらの報告〔ロス(Ross DT)ら、Nature Genet., 24, 227-235 (2000)〕によると、MM細胞の増殖速度の増加に影響すると考えられる。
【0122】
LD78αは、著しい破骨細胞活性化活性を有するタンパク質であるマウスマクロファージ炎症タンパク質(MIP)−1α〔ダバテリス(Davatelis G)ら、J. Exp. Med., 167, 1939-1944(1988)〕と75%の配列同一性を示した。ヒトゲノムによりコードされた未知もしくは推定タンパク質がLD78αよりもマウスMIP−1αに対して、より高い配列同一性を示したという事実は、LD78αが、マウスMIP−1αのヒトオルトログであろうことを示唆する。以前、MM期患者のBM形質細胞は、MIP−1αの量の増加と、タンパク質への中和抗体の添加によりブロックされる破骨細胞刺激活性とを含むことが示されている〔チョイ(Choi SJ)ら、Blood, 96, 671-675(2000)〕。したがって、MIP−1αが、MM期患者の骨溶解特性に重要な役割を果たすと考えられる。LD78αが、マウスMIP−1αのヒトオルトログであるならば、本タンパク質のMM期特異的発現及びPCL期特異的発現は、骨溶解が、これらの病期の患者に起こり、MGUS期患者に起こらないのかを説明すると考えられる。
【0123】
CTGFは、マイトジェニック活性を有し、かつインスリン様増殖因子結合タンパク質(IGFBP)スーパーファミリーのメンバーと類似した配列を有する。したがって、本タンパク質は、IGFBP8としても知られている。CTGFの発現は、以前、比較的広範であることが示されていたが、本実施例のデータによれば、少なくとも形質細胞において、CTGFタンパク質の発現が、トランスフォーメーションに関連することが示される。発現が、ランゲルハンス島のβ細胞に限定されると思われるGIPRは、グルコースのプラズマ濃度における増加に応答して、これらの細胞からのインスリン放出に機能する。しかしながら、ウスディン(Usdin)〔ウスディン(Usdin, TB)ら、Endocrinology, 133, 2861-2870 (1993)〕らは、GIPRの発現が、より広範であり、GIPRタンパク質が、さらなる同化応答にも貢献するであろうことを示唆している。
【0124】
MM細胞及びPCL細胞におけるGIPRの役割は、いまだ決定されないままであるが、GIPRに対する抗体は、フローサイトメトリー解析によりMM-PCL期とMGUS期とを区別化するための臨床的用途を証明するであろう。
【0125】
PCL患者において特異的に発現する遺伝子として、4個の遺伝子を見出した。特に、注目すべき遺伝子として、WEE1遺伝子があげられる。WEE-1はdual-specificity protein kinase 〔ワタナベ(Watanabe N.)ら、 EMBO J. 14, 1878-1891 (1995)〕として知られているが、多発性骨髄腫との関係は知られていない。
【0126】
近年、ヒト8型ヘルペス(HHV−8)は、MMの病因に影響を与えることが示唆されている〔レティック(Rettig MB)ら、Science, 276, 1851-1854 (1997)〕。HHV−8によるBM細胞の感染は、MM患者においては検出されるが、正常細胞においては、検出されない。ある研究によれば、この観察を再現していないが、他は、MM患者のBMにおける樹状突起細胞におけるHHV−8感染を確認している〔ブロウッゼット(Brousset P)ら、Br. J. Haematol., 108, 197-198 (2000)〕。HHV−8感染とMMへのトランスフォーメーションとの間の関連性を調べるため、アフィメトリックス(Affymetrix)社製HU95Avs2チップを用いて、ヘルペスウイルス関連遺伝子の発現を調べた。
【0127】
腫瘍壊死因子レセプター及び神経増殖因子レセプターファミリーのタンパク質のメンバーであるヘルペスウイルスエントリーメディエーター(HVEM)遺伝子の発現は、正常対照又はMGUS患者の細胞における発現に比べて、MM及びPCL患者の形質細胞において増加した。前記レティック(Rettig)ら〔Science, 276, 1851-1854 (1997)〕は、MM患者の樹状突起細胞においてのみ、HHV−8を検出したが、本発明者のデータは、悪性化したMMクローン自体が、HHV−8感染の標的であるか、HHV−8が、MGUS期からMM期へのトランスフォーメーションの直接的原因の役割を果たすことを示唆する。
【0128】
【発明の効果】
本発明の多発性骨髄腫及び病期の判定方法によれば、迅速かつ簡便に、疾患の状態、病期を判定することができるという優れた効果を奏する。また、本発明の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤の評価方法によれば、多発性骨髄腫の治療又は予防に有用であり、多発性骨髄腫研究用試薬にも有用である、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤を得ることができるという優れた効果を奏する。本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法は、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の薬理評価及びスクリーニングに適用することができる。本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物は、多発性骨髄腫の治療又は進行及び発症の予防への適用が期待される。また、本発明のアンチセンス核酸、リボザイム及び抗体は、多発性骨髄腫の治療又は進行及び発症の予防への応用が期待される。本発明の治療又は予防剤によれば、多発性骨髄腫の治療又は進行及び発症の予防を行なうことができるという優れた効果を奏する。さらに、本発明の多発性骨髄腫の罹患性のリスクの判定方法によれば、症状が見られない個体において、予め多発性骨髄腫の罹患性のリスクを予想することが可能になるという優れた効果を奏する。
【0129】
【配列表】
【0130】
【0131】
【0132】
【0133】
【0134】
【0135】
【0136】
【0137】
【0138】
【0139】
【0140】
【0141】
【0142】
【0143】
【0144】
【0145】
【0146】
【0147】
【発明の属する技術分野】
本発明は、多発性骨髄腫の検査方法;多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法;該化合物;多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAに対するアンチセンス核酸;該mRNAを特異的に切断するリボザイム;該遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体;該化合物を有効成分として含有した、多発性骨髄腫の治療又は予防剤;及び多発性骨髄腫の易罹患性の判定方法に関する。
【0002】
【従来の技術】
多発性骨髄腫は、骨髄における形質細胞のクローン増殖により特徴づけられるB細胞の悪性疾患である。現在、メルファラン、プレドニゾン又は他の併用化学療法により、多発性骨髄腫患者の治療が行なわれている。しかしながら、前記療法により、通常、腫瘍荷重、骨病変、虚血及び単クローン性高ガンマグロブリン血症を寛解するが、完全な治癒はまれである。骨髄腫細胞は、化学療法剤に対して抵抗性になり、多発性骨髄腫患者の何症例かにおいては、形質細胞性白血病(PCL)に悪性転換する。
【0003】
多発性骨髄腫の原因を明らかにするための集中的な努力にもかかわらず、分子レベルにおいては、このプロセスへの限られた見識が得られているに過ぎないのが現状である。例えば、多発性骨髄腫細胞においては、しばしば、染色体領域14q32の免疫グロブリン重鎖(IgH)座に関与する多様な核型異常が見出されることが知られている〔ハレック(Hallek M.)ら、Blood 91, 3-21 (1998)〕。
【0004】
多発性骨髄腫におけるMonoclonal Gammopathy of Undetermined Significance(MGUS)は、骨髄における形成細胞数が増加することがない血清単クローン性高ガンマグロブリン血症により特徴づけられる。この状態は、以前、「良性単クローン性高ガンマグロブリン血症」として称されていた。前記MGUS期において、何人かの患者が、多発性骨髄腫期(Multiple myeloma期[MM期])さらには形質細胞性白血病期(Plasma Cell Leukemia[PCL期])に進行することが知られており、疾患の潜在的な悪性の性質を示すことが知られている。しかしながら、MGUSを罹患した多くの患者は、長年安定なままである。これらの観察は、MGUS患者が、良性疾患患者と、進行の遅い又は前臨床的な多発性骨髄腫患者とを含むであろうことを示唆する。良性ガンマグロブリン血症及び多発性骨髄腫のそれぞれの状態について、信頼できる分子マーカーがないため、現在、前記良性ガンマグロブリン血症と多発性骨髄腫とを分類することは困難である。多発性骨髄腫への移行の初期の検出を可能にする分子マーカーは、未だ同定されていないのが現状である。
【0005】
【発明が解決しようとする課題】
本発明は、疾患の状態、病期に特異的に発現の差異が見られる遺伝子マーカーを提供することを目的とする。具体的には、本発明の第1の目的は、多発性骨髄腫の検査方法を提供することにある。本発明の第2の目的は、迅速かつ簡便に、進行度又は病期を判定することが可能な多発性骨髄腫の病期の判定方法を提供することにある。本発明の第3の目的は、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤の評価方法を提供することにある。本発明の第4の目的は、前記発現調節剤を提供することにある。本発明の第5の目的は、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の薬理評価及びスクリーニングに適用しうる評価方法を提供することにある。本発明の第6の目的は、前記評価方法により得られる化合物を提供することにある。本発明の第7の目的は、前記遺伝子のmRNAのアンチセンス核酸を提供することにある。本発明の第8の目的は、前記mRNAを特異的に切断するリボザイムを提供することにある。本発明の第9の目的は、前記遺伝子にコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を提供することにある。本発明の第10の目的は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤を提供することにある。本発明の第11の目的は、多発性骨髄腫の罹患性のリスクの判定方法を提供することにある。
【0006】
【課題を解決するための手段】
本発明の要旨は、
〔1〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なうことを特徴とする、多発性骨髄腫の検査方法、
〔2〕 被検試料が、骨髄細胞である、前記〔1〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔3〕 骨髄細胞が、CD138陽性細胞である、前記〔2〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔4〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、mRNA量を指標として行なわれる、前記〔1〕〜〔3〕いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔5〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、遺伝子増幅法、DNAチップ、DNAマイクロアレイ及びノーザンブロットハイブリダイゼーション解析からなる群より選ばれた少なくとも1種の方法により行なわれる、前記〔4〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔6〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれる、前記〔1〕〜〔3〕いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔7〕 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、免疫学的方法及び/又はプロテインチップ解析により行なわれる、前記〔6〕記載の多発性骨髄腫の検査方法、
〔8〕 前記〔1〕〜〔7〕いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法により、多発性骨髄腫の病期を判定することを特徴とする、多発性骨髄腫の病期の判定方法、
〔9〕 以下のステップ:
(A) 被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させるステップ、並びに、
(B) 被検物質が、前記ステップ(A)で得られた試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法、
〔10〕 以下のステップ:
(A’) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させるステップ、並びに
(B’) 被検物質が、前記ステップ(A’)で得られた試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法、
〔11〕 以下のステップ:
(A”) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させるステップ、並びに、
(B”) 被検物質が、前記ステップ(A”)で得られたタンパク質の活性を調節するか否かを決定するステップ、
を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法、
〔12〕 前記〔9〕〜〔11〕いずれか1項に記載の評価方法により得られてなる、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物、
〔13〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAに特異的にハイブリダイズするアンチセンス核酸を含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、
〔14〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAを特異的に切断するリボザイムを含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、
〔15〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、
〔16〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有してなる、多発性骨髄腫の研究試薬、
〔17〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法、並びに
〔18〕 WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法、
に関する。
【0007】
【発明の実施の形態】
本発明は、多発性骨髄腫において特異的に発現レベルが変動する遺伝子を見出し、該遺伝子により、多発性骨髄腫の検出、さらには、病期の判定が可能になるという知見に基づく。
【0008】
なお、本明細書においては、多発性骨髄腫において特異的に発現レベルが変動する遺伝子を、「多発性骨髄腫特異的遺伝子」という。
【0009】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子としては、下記遺伝子:
CDKチロシン15−キナーゼWEE1Hu(WEE1)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:U10564;Nature, 353, 80-93 (1991);EMBO J., 14, 1878-1891 (1995);塩基配列(配列番号:1)、アミノ酸配列(配列番号:2)]、
ヘルペスウイルスエントリーメディエーター(HVEM)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:U70321;Cell, 87, 427-736 (1996);塩基配列(配列番号:3)、アミノ酸配列(配列番号:4)]、
ヒストンH2A遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:L19779;DNA Cell Biol., 13, 161-170 (1994);塩基配列(配列番号:5)、アミノ酸配列(配列番号:6)]、
LD78α前駆体(LD78α)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:D90144;Mol. Cell. Biol., 10, 3646-3658 (1990);塩基配列(配列番号:7)、アミノ酸配列(配列番号:8)]、
グルコース依存性インスリン分泌ポリペプチドレセプター(GIPR)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:X81832;Diabetes, 44, 1202-1208 (1995);塩基配列(配列番号:9)、アミノ酸配列(配列番号:10)]、
結合組織増殖因子(CTGF)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:X78947;Circulation, 95, 831-839 (1997);塩基配列(配列番号:11)、アミノ酸配列(配列番号:12)]、
チトクロムb遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:M21186;Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 85, 3319-3323, (1988);塩基配列(配列番号:13)、アミノ酸配列(配列番号:14)]、
MHCホモログ遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:M24194;Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 86, 4594-4598, (1989);塩基配列(配列番号:15)、アミノ酸配列(配列番号:16)]、
Thyroid Hormone Binding Protein(THBP)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:J02783;J. Biol. Chem., 262, 11221-11227, (1987);塩基配列(配列番号:17)、アミノ酸配列(配列番号:18)]、
Cysteine-Rich Heart Protein (CRHP)遺伝子[ジーンバンクアクセッション番号:AI017574、塩基配列(配列番号:19)]等が挙げられる。
【0010】
前記「多発性骨髄腫」とは、骨髄の形質細胞性腫瘍であり、免疫グロブリン異常、ベンズ・ジョーンズタンパク質(遊離の単クローン性κ鎖又はγ鎖)の過剰生産、骨変化等の所見により特徴付けられる進行性の悪性腫瘍性疾患をいう。本明細書において、前記多発性骨髄腫の病期は、MGUS期、MM期、PCL期に分けられる。
【0011】
MGUS期は、▲1▼骨病変が認められず、▲2▼単クローン性グロブリン血症が認められ、▲3▼骨髄中の腫瘍性形質細胞の量が10%未満であり、▲4▼異常免疫グロブリン(Mタンパク質)の量が、IgGに関して、3.5g/dl以下、IgAに関して、2.0g/dl以下、ベンズ・ジョーンズタンパク質に関して、1.0g/24時間以下であるという特徴を示す。MM期としては、▲1▼頭蓋骨、肋骨、脊椎骨等に多発性の溶骨性病変がX線写真上で認められ、▲2▼骨髄中の腫瘍性形質細胞の量が10%以上に増加、▲3▼Mタンパク質の量がMGUS期より増加することにより診断される。PCL期は、MM期に治療薬(プレドニゾン等)でコントロールできずに白血病状態を呈する。
【0012】
本発明の多発性骨髄腫の検査方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なうことを1つの大きな特徴とする。本発明の検査方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを指標とするため、迅速、かつ簡便に、多発性骨髄腫を検出することが可能になるという優れた効果を発揮する。また、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子は、病期に特異的に発現レベルが変動する遺伝子であるため、本発明の検査方法は、多発性骨髄腫の病期の判定にも適用されうる。
【0013】
本発明の検査方法は、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定を行なう場合、具体的には、
(a)少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における発現レベルを測定するステップ;並びに
(b)前記ステップ(a)で測定された該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、対照値として、健常者由来試料、多発性骨髄腫のMGUS期患者由来試料、多発性骨髄腫のMM期患者由来試料及び多発性骨髄腫のPCL期患者由来試料からなる群より選ばれた試料中における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとを比較するステップ;
を含むプロセスにより行なわれ、少なくとも2種の多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なう場合、具体的には、
(a’)少なくとも2種の多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルを決定するステップを含むプロセスにより行なわれる。
【0014】
本明細書において、前記「発現レベル」とは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子からなる群より選ばれた特定の遺伝子の転写産物の絶対量若しくは相対量、又は特定の遺伝子の翻訳産物の絶対量若しくは相対量をいう。前記転写産物の絶対量若しくは相対量を、以下、mRNAレベルともいう。前記翻訳産物の絶対量若しくは相対量を、以下、ポリペプチドレベル、又はタンパク質レベルともいう。
【0015】
前記「対照値を得るために用いられる試料」として、多発性骨髄腫に罹患していないことが予めわかっている健常者由来試料、多発性骨髄腫の各病期(MGUS期、MM期、PCL期)にあることが予め特定されているMGUS期患者由来試料、MM期患者由来試料及びPCL期患者由来試料が挙げられる。前記対照値は、予め、決定された値であってもよく、被検試料中の発現レベルの測定と同時に決定された値であってもよい。
【0016】
本明細書において、「発現プロファイル」とは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも2種を含む遺伝子群の発現レベルの増減及びその程度をパターン化したものをいう。
【0017】
多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定は、mRNA量、又は該多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれうる。
【0018】
前記被検試料としては、被検対象の個体(被検者ともいう)の骨髄細胞等が挙げられる。前記骨髄細胞としては、例えば、CD138陽性細胞等が挙げられ、本発明の検査方法においては、CD138陽性細胞が好ましい。
【0019】
前記CD138陽性細胞は、例えば、後述の実施例1に記載されるように、骨髄生検から、抗CD138抗体等を用いて、慣用の方法により得られる。
【0020】
被検試料の供給源である個体(被検者ともいう)としては、ヒトが挙げられる。
【0021】
遺伝子の発現レベルの測定又は発現プロファイルの決定は、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子に対応するmRNA量、又は該多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれうる。
【0022】
前記遺伝子のmRNAレベルでの発現レベルの測定又は発現プロファイルの決定は、遺伝子増幅法(例えば、PCR、リアルタイムRT−PCR)、DNAチップ、DNAマイクロアレイを用いる方法、ドットブロットハイブリダイゼーション、スロットブロットハイブリダイゼーション、ノーザンブロットハイブリダイゼーション等により行なわれうる。また、前記遺伝子のタンパク質レベルでの発現レベルの測定又は発現プロファイルの決定は、プロテインチップ解析、免疫学的方法(例えば、ELISA)等により行なわれうる。
【0023】
前記DNAチップ、DNAマイクロアレイ解析を行なうに際して、支持体に前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の配列を有する核酸の少なくとも1種を固定化したアレイを用いることができる。具体的には、前記アレイと、被検試料由来の標識された核酸と、任意に対照試料由来の標識された核酸とを接触させ、ハイブリダイゼーションを行なう。
【0024】
前記アレイに固定化される核酸としては、ストリンジェントな条件下に特異的にハイブリダイズする核酸であればよく、例えば、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の全配列を有する核酸であってもよく、各多発性骨髄腫特異的遺伝子において特徴的な配列からなる部分配列、からなる核酸であってもよい。ここで、「部分配列」とは、プライマー又はプローブとして使用するオリゴヌクレオチドが本発明のDNA配列をもとに少なくとも8個の対応する塩基配列からなり、好ましくは少なくとも10個の塩基配列、さらに好ましくは少なくとも約15〜25個の塩基配列からなる対応するポリヌクレオチドを意味する。
【0025】
前記アレイは、例えば、該核酸に、支持体表面への固定化を容易にしうる修飾基を導入し、ついで、得られた修飾核酸を、DNAアレイ作製装置、例えば、GMS社製のDNAチップ作製装置を用いて、予め定められた部位に整列、固定化すればよい。前記核酸の固定化量、固定化密度は、DNAチップハイブリダーゼションを行ないうる範囲で適宜選択されうる。また、GeneChipシステム[アフィメトリックス(Affymetrix)社製]のマイクロアレイを用いることもできる。
【0026】
前記支持体としては、ガラス(例えば、スライドグラス)、シリコンチップ等が挙げられる。
【0027】
前記DNAチップハイブリダイゼーション解析によれば、試料中に含まれる多種類の核酸分子の量を同時に測定することができ、少量の核酸試料でも測定できるという利点がある。また、被検試料と対照値を得るための試料(例えば、健常者由来試料、MGUS期患者由来試料、MM期由来試料、PCL期由来試料)とを異なる標識物質、具体的には、蛍光物質で標識した場合、同時に測定できるという利点がある。ここで、標識物質としては、放射性同位元素、蛍光物質、化学発光物質、発光団を有する物質等が挙げられる。例えば、前記蛍光物質としては、Cy2、FluorX、Cy3、Cy3.5、Cy5、Cy5.5、Cy7、イソチオシアン酸フルオレセイン(FITC)、テキサスレッド、ローダミン等が挙げられる。ここで、試料の標識は、試料中のmRNA、該mRNA由来のcDNAもしくは該cDNAより転写あるいは増幅された核酸を標識することによって実施される。前記Cy3及びCy5を標識物質として用いた場合、Cy3は532nm、Cy5は635nmの波長でスキャンすることにより検出されうる。なお、標識の強度を遺伝子の発現量の指標とする。
【0028】
前記DNAチップハイブリダイゼーション解析の場合、試料間で発現量の変動がない遺伝子、例えば、ハウスキーピング遺伝子等の発現量により、標識の強度を正規化してもよい。
【0029】
PCR、リアルタイムRT−PCRを行なうに際して、用いられるプライマーは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子において特徴的な配列を増幅可能な配列及び鎖長を有するオリゴヌクレオチドであればよい。プライマーの鎖長は、特に限定はないが、例えば、15塩基長以上であり、50塩基長以下であり、好ましくは、20塩基長以上以上であり、35塩基以下であることが望ましい。
【0030】
ノーザンブロットハイブリダイゼーション解析又はドットブロットハイブリダイゼーション解析を行なうに際して、用いられるプローブは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子にストリンジェントな条件下にハイブリダイズするオリゴヌクレオチド、好ましくは、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子において特徴的な配列を有するオリゴヌクレオチドであればよく、前記プローブの鎖長は、特に限定はないが、非特異的なハイブリダイゼーションを防止する観点から、15塩基以上であり、好ましくは18塩基以上であることが望ましい。
【0031】
ポリペプチド量を指標とする場合、ポリペプチド量の測定手段としては、プロテインチップ解析、免疫測定法(例えば、ELISA等)等が挙げられる。
【0032】
前記プロテインチップ解析に用いられうるプロテインチップとしては、例えば、サイファージェン社のプロテインチップシステム等が挙げられる。
【0033】
前記免疫測定法においては、前記多発性骨髄腫遺伝子の翻訳産物であるポリペプチドに特異的に結合する抗体が用いられる。本発明の検査方法に用いられる抗体は、前記ポリペプチドに特異的に結合する能力を有するものであれば、特に限定はなく、ポリクローナル抗体又はモノクローナル抗体のいずれであってもよい。さらに、公知技術により修飾された抗体や抗体の誘導体、例えばヒト化抗体、Fabフラグメント、単鎖抗体等を使用することもできる。前記抗体は、例えば、カレント・プロトコルズ・イン・イムノロジー〔ジョン・E・コリガン(John E. Coligan)編集、Current Protocols in Immunology,John Wiely & Sons, Inc.発行(1992)〕等に記載の方法により、前記ポリペプチドの全部又は一部を用いてウサギやラット、マウス等を免疫することにより、容易に作製され得る。こうして得られた抗体を精製後、ペプチダーゼ等により処理することにより、抗体の断片が得られる。また、遺伝子工学的に抗体を作製することもできる。さらに、本発明の抗体又はその断片は、酵素免疫測定法、蛍光免疫測定法、発光免疫測定法等による検出を容易にするために、各種修飾をしてもよい。なお、前記ポリペプチドの発現は、モレキュラークローニング ア ラボラトリーマニュアル第2版〔ザンブルーク(Sambrook)ら、Molecular Cloning A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press発行(1980)〕、モレキュラークローニング ア ラボラトリーマニュアル 第3版〔ザンブルーク(Sambrook)ら、Molecular Cloning A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press発行(2001) 〕等に記載の慣用の遺伝子発現方法に従って発現させることができる。上記の抗体又はその断片には、ポリペプチド中における特徴的な配列からなる部分断片に特異的に結合しうる抗体も含まれる。
【0034】
本発明の検査方法において、多発性骨髄腫は、例えば、下記指標(1)〜(4):
(1)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種について、該被検試料中における発現レベルと健常者由来試料より得られた対照値との間に差異がある場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫に罹患していることの指標となる;
(2)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MGUS期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のMGUS期にあることの指標となる;
(3)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MM期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のMM期にあることの指標となる;
(4)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該PCL期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のPCL期にあることの指標となる;
に基づき、検出されうる。
【0035】
前記(1)の指標において、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルは、少なくとも1種、好ましくは、2種以上の遺伝子について測定されることが望ましい。また、前記(1)の指標において、[被検試料中における発現レベル−健常者由来試料より得られた対照値]の絶対値が、少なくとも0.5、好ましくは、1以上、より好ましくは、2以上である場合、該発現レベルと対照値との間に差異があると判断することができる。
【0036】
前記(2)〜(4)の指標において、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種、好ましくは、3種以上の遺伝子の発現プロファイルのパターンを比較し、解析することが望ましい。
【0037】
なお、発現プロファイルが実質的に同一であるか否かは、発現プロファイルの類似度により判別することができる。例えば、発現プロファイルを階層的クラスタリングにより、クラスタリングすることにより類似度がわかる。
【0038】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子は、多発性骨髄腫の病期に特異的に変動するため、かかる遺伝子の発現レベル、発現プロファイルを指標とする本発明の検査方法によれば、多発性骨髄腫の病期をも判定することが可能になる。本発明には、多発性骨髄腫の病期の判定方法も含まれる。
【0039】
本発明の多発性骨髄腫の病期の判定方法においては、前記検査方法を行ない、被検試料の供給源の個体について、下記基準(I)〜(III):
(I)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MGUS期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、MGUS期にあることの指標となる;
(II)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該MM期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、MM期にあることの指標となる;及び
(III)該多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも2種について、該被検試料中における発現プロファイルと、該PCL期患者由来試料における発現プロファイルとが実質的に同一である場合、該被検試料の供給源である個体が、PCL期にあることの指標となる
のいずれかにより、多発性骨髄腫の病期を判定することを1つの特徴とする。本発明の判定方法によれば、前記多発性骨髄腫遺伝子の発現プロファイルを指標としているため、多発性骨髄腫の病期を、被検試料、特に骨髄細胞組成の差異に影響されることがなく、高い信頼度で、迅速かつ簡便に、判定することができるという優れた効果を発揮する。
【0040】
本発明の判定方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の中でも、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子及びチトクロムb遺伝子の発現レベル又は発現プロファイルにより、被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のMM期又はPCL期にあることを判定することができる。また、WEE1遺伝子の遺伝子の発現レベル又は発現プロファイルにより、被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫のPCL期にあることを判定することができる。
【0041】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子は、多発性骨髄腫の発症に関連することが予想されるため、かかる遺伝子の発現を調節しうる物質は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、病期の進行を抑制するための治療剤等への応用が期待される。本発明により、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤又は該遺伝子にコードされたタンパク質の活性調節剤の評価方法が提供される。
【0042】
本発明の発現調節剤又は活性調節剤の評価方法は、被検物質の有無に依存して、前記多発性骨髄特異的遺伝子の発現が変動することを、該被検物質が、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤であることの指標とする方法である。具体的には、本発明の発現調節剤の評価方法は、
A.前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種を保持した試験細胞又は試験動物を、被検物質の存在下及び非存在下にそれぞれ維持するステップ;並びに、
B.該試験細胞又は試験動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを測定するステップ;
を含み、被検物質存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、被検物質非存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとの間で差異がある場合、該被検物質が、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節能を有することの指標とすることを1つの大きな特徴とする。
【0043】
本発明の発現調節剤及び活性調節剤の評価方法においては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種を保持した試験細胞又は試験動物を、被検物質の存在下及び非存在下にそれぞれ維持する[ステップAという]。
【0044】
ステップAにおいて、試験細胞を用いる場合、該試験細胞の培養時に、被検物質を含有した培地を用いることにより、試験細胞と被検物質とを接触させることができる。前記培地中における被検物質の量は、適宜選択されうる。
【0045】
また、前記ステップAにおいて、動物を用いる場合、経口投与、非経口投与等により、被検物質を動物に投与すればよい。被検物質の投与量は、適宜選択されうる。被検物質の投与の際、薬学的に許容されうる担体、助剤等とともに、該被検物質を投与してもよい。
【0046】
ついで、試験細胞又は試験動物における前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル及び生物学的活性を測定する[ステップBという]。
【0047】
前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定は、前記検査方法における発現レベルの測定手法と同様の手法により行なわれうる。すなわち、遺伝子の発現レベルを、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子に対応するmRNA量を指標として測定してもよく、該多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として測定してもよい。mRNA量を指標とする場合、DNAチップハイブリダイゼーション解析、RT−PCR、ノーザンブロットハイブリダイゼーション解析及びドットブロットハイブリダイゼーション解析等を用いることができる。また、ポリペプチド量を指標とする場合、プロテインチップ解析、又は前記多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチドに特異的に結合する抗体の少なくとも1種を用いた免疫測定法等を用いることができる。
【0048】
前記ステップBで測定された発現レベルについて、被検物質存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、被検物質非存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとの間で差異がある場合、該被検物質が、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節能を有することの指標とする。
【0049】
具体的には、被検物質存在下における前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルと、被検物質非存在下における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルとの間の差異が、絶対値として、0を超える場合、好ましくは0.5以上、より好ましくは1以上である場合、該被検物質が、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節能を有することの指標とする。
【0050】
なお、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のなかで、その翻訳産物であるポリペプチドの生物学的活性を測定することができる遺伝子については、被検物質を含有した生物学的活性測定系と、被検物質を含有しない生物学的活性測定系とにおける活性を比較することにより、評価を行なうこともできる。
【0051】
本明細書において、被検物質としては、ポリペプチド、核酸、化合物等が挙げられる。
【0052】
本明細書において、CD138陽性細胞とは、骨髄細胞のうち形質細胞(抗体産生B細胞)をいう。CD138は、正常な形質細胞及び癌化した形質細胞に認められ、MMは、この形質細胞が癌化した状態をいう。骨髄細胞の中で、CD138により免疫染色される細胞は、形質細胞のみであり、その他のタイプの細胞は、免疫染色されない〔チロシ(Chilosi M.)ら、Mod. Pathol., 12, 1101-1106 (1999)〕。従って、CD138陽性細胞を調べることは、骨髄細胞全体を調べるよりも、よりMMの病態を反映しているといえる。
【0053】
本明細書において、「多発性骨髄腫特異的遺伝子を保持した試験細胞又は試験動物」は、本質的に(すなわち、天然の状態において)該多発性骨髄腫特異的遺伝子を有する細胞又は動物であってもよく、人為的に該多発性骨髄腫特異的遺伝子を導入して得られた形質転換細胞又はトランスジェニック動物、例えば、トランスジェニック非ヒト動物であってもよい。
【0054】
前記形質転換細胞は、例えば、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を細胞導入用担体等により、慣用の遺伝子導入方法により細胞に導入することにより得られうる。
【0055】
前記細胞導入用担体としては、細胞への導入に適した生物学的ベクター(例えば、慣用のプラスミドベクター、ウイルスベクター等)、金属粒子、正電荷ポリマー、リン酸カルシウム、DEAEデキストラン等が挙げられる。また、前記細胞導入用担体には、前記プラスミドベクター又はウイルスベクターをリポソーム、金属粒子、正電荷ポリマー、リン酸カルシウム、DEAEデキストラン等に保持せしめたものも含まれる。前記生物学的ベクターは、用いられる細胞の種類に応じて、適宜選択されうる。
【0056】
哺乳動物細胞における発現ベクターに用いられるプロモーターの例としては、HTLV−LTRプロモーター、SV40初期及び後期プロモーター、CMVプロモーター、マウス・メタロチオネインプロモーター等が挙げられる。
【0057】
生物学的ベクターとしては、pcDNA3.1、pSV2dhfr ATCC37145、プラスミドpSV2neo ATCC37149、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター等が挙げられる。
【0058】
前記細胞としては、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を発現することが可能な細胞であればよく、例えば、CHO細胞、COS-1細胞、Jarkat細胞、白血病細胞等が挙げられる。
【0059】
前記遺伝子導入方法としては、リポフェクション法、リン酸カルシウム法、微小ガラス管を用いた直接注入法内包型リポソームによる遺伝子導入法、静電気型リポソームによる遺伝子導入法、HVJ−リポソーム法、受容体介在性遺伝子導入法、パーティクル銃による遺伝子導入法、naked−DNAの直接導入法、正電荷ポリマーによる導入法等が挙げられる。
【0060】
前記トランスジェニック動物、特にマウス、ラットは、例えば、分子生物学プロトコール(南江堂、1994)等に記載の作製方法に従い、得られうる。具体的には、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を保持した細胞導入用担体等を動物、特に、非ヒト動物の受精卵にマイクロインジェクションすることにより得ることができる。具体的には、例えば、トランスジェニック動物は、下記のように作製されうる。まず、過排卵誘起した雌と種雄とを交配させる。交配後約12時間(動物種により異なる)を経た雌から卵管を取り出し、1細胞期(前核期)の受精卵を採取し、適切な培養液に入れる。ついで、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子を保持した細胞導入用担体を受精卵の前核にマイクロインジェクションする。一方、性成熟に達した雌に精管切除した雄を交尾させて、偽妊娠雌を作製する。マイクロインジェクション後、生存した受精卵を前記偽妊娠雌の卵管内に移植する。その後、卵管内に移植された受精卵より発生した胎仔を自然分娩又は切開手術により取り出す。得られた仔の尾の一部からゲノムDNAを調製する。得られたDNAを分析して、得られた仔がトランスジェニック動物であるか否かを調べる。得られたトランスジェニック動物を交配して該トランスジェニック動物の系統を樹立する。
【0061】
前記動物としては、ヒト以外の哺乳動物、例えば、マウス、ラット、ウサギ、ブタ、イヌ、ヒツジ、ヤギ等の哺乳動物等が挙げられる。
【0062】
なお、導入対象となる多発性骨髄腫特異的遺伝子の代わりに、該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域の配列と、該配列の下流にレポーター遺伝子とを含む核酸を用いることにより、レポーター遺伝子の発現の有無及び発現の強度を指標として、より迅速かつ簡便に評価を行なうことができる。
【0063】
また、前記評価方法により得られた発現調節能を有する物質のなかでも、特に前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを正常なレベルに近づけうる物質は、多発性骨髄腫の治療又は予防に有用であることが期待される。したがって、本発明により、多発性骨髄腫の治療又は予防に有用な化合物の評価方法が提供される。
【0064】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有用な化合物の評価方法は、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル、該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域からの転写、及び該多発性骨髄腫特異的遺伝子にコードされたタンパク質の生物学的活性からなる群より選ばれた1種に及ぼす被検物質の作用を指標とすることに1つの特徴がある。
【0065】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有用な化合物の評価方法は、具体的には、
(A) 被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させるステップ、並びに、
(B) 被検物質が、前記ステップ(A)で得られた試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む方法(方法1);
(A’) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させるステップ、並びに
(B’) 被検物質が、前記ステップ(A’)で得られた試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む方法(方法2)、並びに
(A'') 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させるステップ、並びに、
(B'') 被検物質が、前記ステップ(A'')で得られたタンパク質の活性を調節するか否かを決定するステップ、
を含む方法(方法3)が挙げられる。
【0066】
本発明の治療又は予防に有用な化合物の評価方法によれば、多発性骨髄腫における前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル、又は生物学的活性を、被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルに近づけることができる化合物を評価することができるという優れた効果を発揮する。
【0067】
なお、本明細書において、被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを、「正常レベル」とも称す。
【0068】
本発明の化合物の評価方法(方法1)においては、被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させる〔ステップ(A)という〕。
【0069】
本発明の化合物の評価方法(方法1)における被検物質としては、前記発現調節剤及び活性調節剤の評価方法における被検物質と同様の物質が挙げられる。試験動物又は試験細胞としては、前記と同様の動物又は細胞が挙げられる。
【0070】
被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させる際、例えば、被検物質を含有した培地又は被検物質を含有しない培地を用いて試験細胞を培養してもよく、前記発現調節剤の評価方法と同様の手法により、被検物質を、試験動物に投与してもよい。
【0071】
ついで、被検物質が、試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定する〔ステップ(B)という〕。
【0072】
前記ステップ(B)において、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定は、前記検査方法における発現レベルの測定手法と同様の手法により行なわれうる。すなわち、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子に対応するmRNA量又はポリペプチド量を、前記と同様に測定することにより、発現レベルを決定できる。
【0073】
判断基準としては、例えば、下記指標等が挙げられる。すなわち、
被検物質を投与又は接触させた、試験細胞又は試験動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルAと、
被検物質を投与していないか、あるいは接触させてない、該試験細胞又は試験動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルBと
被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベル(正常レベル)と
を測定する。ついで、発現レベルAと発現レベルBと正常レベルとを比較する。ここで、[発現レベルB−発現レベルA]の絶対値が、0を超え、かつ
(i)発現レベルAと正常レベルとが実質的に同一である場合、又は
(ii)[正常レベル−発現レベルA]の絶対値が、[発現レベルB−発現レベルA]の絶対値よりも小さい場合、
該被検物質が、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物であることの指標となる。
【0074】
本発明の化合物の評価方法(方法2)においては、被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させる〔ステップ(A’)という〕。
【0075】
被検物質としては、前記方法1における被検物質と同様の物質が挙げられる。試験動物又は試験細胞は、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む動物又は細胞であればよく、該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域の配列と、該配列の下流にレポーター遺伝子とを含む核酸等を導入された動物又は細胞等が挙げられる。
【0076】
前記レポーター遺伝子としては、β−ガラクトシダーゼ遺伝子、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ遺伝子、緑色蛍光タンパク質遺伝子、β−グルコニダーゼ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、エクオリン遺伝子等が挙げられる。
【0077】
多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域の配列は、該多発性骨髄腫特異的遺伝子のプロモーター領域を含む配列が挙げられる。
【0078】
被検物質が、試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定する〔ステップ(B’)という〕。
【0079】
前記レポーター遺伝子の発現レベルは、用いたレポーター遺伝子の発現産物の活性測定等により測定されうる。例えば、前記ルシフェラーゼ遺伝子を用いた場合、発現産物であるルシフェラーゼの酵素活性を測定すればよい。
【0080】
判断基準としては、例えば、下記指標等が挙げられる。すなわち、
被検物質を投与又は接触させた、試験細胞又は試験動物におけるレポーター遺伝子産物の活性Aと、
被検物質を投与していないか、あるいは接触させてない、該試験細胞又は試験動物におけるレポーター遺伝子産物の活性Bと
被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物におけるレポーター遺伝子産物の活性(正常レベル)と
を測定する。ついで、活性Aと活性Bと正常レベルとを比較する。ここで、[活性B−活性A]の絶対値が、0を超え、かつ
(i)活性Aと正常レベルとが実質的に同一である場合、又は
(ii)[正常レベル−活性A]の絶対値が、[活性B−活性A]の絶対値よりも小さい場合、
該被検物質が、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物であることの指標となる。
【0081】
本発明の化合物の評価方法(方法3)においては、被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させる〔ステップ(A'')という〕。
【0082】
多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質は、該多発性骨髄腫特異的遺伝子を慣用の方法により宿主に導入して得られた形質転換体を、該タンパク質の発現に適した条件下に培養し、得られた培養物から、慣用のタンパク質精製方法(例えば、塩析、イオン交換クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、エレクトロフォーカシング等)により精製することにより、得られうる。また、用いる宿主、培養条件等により、目的のタンパク質が、不溶性の封入体として得られる場合があるが、慣用のリフォールディング技術により、活性を有するタンパク質を得ることができる。
【0083】
ついで、被検物質が、前記タンパク質の活性を調節するか否かを決定する〔ステップ(B'')という〕。かかるステップにおいては、タンパク質の種類に応じた活性測定法により、該タンパク質の活性を測定する。
【0084】
判断基準としては、例えば、下記指標等が挙げられる。すなわち、
被検物質を投与又は接触させた、試験細胞又は試験動物における多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現産物(タンパク質)の活性A’と、
被検物質を投与していないか、あるいは接触させてない、該試験細胞又は試験動物におけるレポーター遺伝子産物の活性B’
被検物質非存在下における非骨髄腫細胞又は正常動物における多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現産物(タンパク質)の活性(正常レベル)と
を測定する。ついで、活性A’と活性B’と正常レベルとを比較する。ここで、[活性B’−活性A’]の絶対値が、0を超え、かつ
(i)活性Aと正常レベルとが実質的に同一である場合、又は
(ii)[正常レベル−活性A’]の絶対値が、[活性B’−活性A’]の絶対値よりも小さい場合、
該被検物質が、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物であることの指標となる。
【0085】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法は、該化合物のスクリーニング及び多発性骨髄腫の治療又は予防剤の薬理評価に適用されうる。また、本発明の化合物の評価方法によりスクリーニングされうる化合物は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤への応用が期待される。したがって、本発明の化合物の評価方法により得られた化合物も本発明に含まれる。
【0086】
また、本発明の検査方法、判定方法、発現調節剤の評価方法及び化合物の評価方法に用いられる多発性骨髄腫特異的遺伝子は、多発性骨髄腫の発症に関連することが予想されるため、かかる遺伝子の発現を調節しうる物質は、多発性骨髄腫の治療又は予防剤、病期の進行を抑制するための治療剤等への応用が期待される。したがって、本発明により、多発性骨髄腫の治療又は予防剤が提供される。
【0087】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防剤としては、
▲1▼前記化合物の評価方法により得られた化合物を有効成分として含有した剤、
▲2▼前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のうち、多発性骨髄腫の発症又は病期又は病期の進行に応じて発現が増大する遺伝子、すなわち、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれのmRNAに特異的にハイブリダイズするアンチセンス核酸を有効成分として含有した剤、
▲3▼前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のうち、多発性骨髄腫の発症又は病期又は病期の進行に応じて発現が増大する遺伝子、すなわち、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれのmRNAを特異的に切断するリボザイムを有効成分として含有した剤、
▲4▼前記多発性骨髄腫特異的遺伝子のうち、多発性骨髄腫の発症又は病期又は病期の進行に応じて発現が増大する遺伝子、すなわち、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれによりコードされたポリペプチドに特異的に結合する抗体を有効成分として含有した剤、
等が挙げられる。
【0088】
本発明の治療又は予防剤の薬理評価は、前記化合物の評価方法により行なわれうる。
【0089】
本発明の治療又は予防剤における有効成分の量は、該有効成分の種類、投与対象の個体の年齢、体重等により適宜選択されうる。例えば、前記有効成分の量は、通常成人1日当たり約0.1〜1000mgの範囲となる量とすることができ、例えば、1日1〜4回に分けて投与してもよく、1回/1日〜1回/数日又はそれ以上の間隔で投与してもよい。
【0090】
前記▲4▼の治療又は予防剤において、抗体は、前記検査方法における抗体と同様のものが用いられうる。
【0091】
本発明の治療又は予防剤の投与経路としては、例えば、経口、静脈、動脈、皮下、皮内、筋肉内等への投与するか、又は病変の認められる組織そのものに直接局所投与することができる。
【0092】
本発明の治療又は予防剤の製剤形態は、上記の各投与形態に合った種々の製剤形態であればよく、注射剤、錠剤、カプセル剤、顆粒剤、散剤、液剤等が挙げられる。例えば、注射剤の場合、該注射剤は常法により調製することができ、例えば、前記有効成分を適切な溶剤(PBS等の緩衝液、生理食塩水、滅菌水等)に溶解し、任意に安定化剤、等張剤、局所麻酔剤等を添加し、フィルター等で濾過滅菌し、次いで無菌的な容器に充填することにより、皮下、筋肉内、静脈内用注射剤等を得ることができる。前記注射剤には必要に応じて慣用の担体等を加えても良い。また、HVJ−リポソーム等のリポソームにおいては、懸濁剤、凍結剤、遠心分離濃縮凍結剤等のリポソーム製剤の形態とすることができる。また、徐放性の製剤であってもよい。
【0093】
また、製剤形態に応じて、任意に、慣用の賦形剤、結合剤、滑沢剤、その他着色剤、崩壊剤等を用いてもよい。前記賦形剤としては、例えば、乳糖、デンプン、タルク、ステアリン酸マグネシウム、結晶セルロース、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、グリセリン、アルギン酸ナトリウム、アラビアゴム等が挙げられ、結合剤としてはポリビニルアルコール、ポリビニルエーテル、エチルセルロース、アラビアゴム、シエラック、白糖等が挙げられ、滑沢剤としてはステアリン酸マグネシウム、タルク等が挙げられる。
【0094】
なお、本発明の治療又は予防剤において、WEE1遺伝子に関するアンチセンス核酸、リボザイム、又は該WEE1遺伝子にコードされたポリペプチド又はその断片に対する抗体によれば、PCL期への移行の予防又はPCL期の多発性骨髄腫の治療が期待される。また、本発明の治療又は予防剤において、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれに関するアンチセンス核酸、リボザイム、又は該HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子のそれぞれににコードされたポリペプチドに対する抗体又はその断片に対する抗体によれば、MM期及び/又はPCL期への移行の予防又はMM期又はPCL期の多発性骨髄腫の治療が期待される。
【0095】
本発明の治療又は予防剤によれば、多発性骨髄腫の治療及び病期の進行又は発症の予防が可能になる。したがって、本発明により、多発性骨髄腫の治療又は予防方法が提供される。
【0096】
本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防方法は、治療上有効量の前記治療又は予防剤を、治療又は予防が必要な個体に投与することを1つの特徴とする。投与方法、投与経路は、前記と同様に適宜選択されうる。
【0097】
また、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種によりコードされたポリペプチドに特異的に結合する抗体、前記発現調節剤の評価方法により得られた発現調節剤は、多発性骨髄腫研究用試薬としても有用である。したがって本発明により、多発性骨髄腫研究用試薬が提供される。
【0098】
さらに、本発明の検査方法、判定方法、発現調節剤の評価方法及び化合物の評価方法に用いられる多発性骨髄腫特異的遺伝子は、塩基配列の変異により、発現レベルの異常を引き起こしている可能性があり、それにより多発性骨髄腫の発症に関連することが予想される。したがって、塩基配列の変異、具体的には、核酸多型を検出することにより、多発性骨髄腫易罹患性のリスクを判定することが可能になる。したがって、本発明により、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法が提供される。
【0099】
本発明の多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法としては、具体的には、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする方法[リスク判定方法1という]、又は前記多発性骨髄腫特異的遺伝子の少なくとも1種によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする方法[リスク判定方法2という]が挙げられる。本発明の多発性骨髄腫の罹患性のリスクの判定方法によれば、症状が見られない個体において、予め多発性骨髄腫の罹患性のリスクを予想することが可能になる。
【0100】
本明細書において、核酸多型とは、同じ種の個体間、生物の同一個体間若しくは生物間において見出される場合がある差異又は変化であり、多発性骨髄腫において、特異的に発現レベルが変動する範囲における核酸の構造、形質又は形態の差異あるいは変化をいう。かかる核酸多型としては、ミニサテライトDNA、マイクロサテライトDNA、一塩基多型(SNP)が挙げられ、より具体的には、アミノ酸置換を生じるcSNP、アミノ酸置換を伴わないsSNP、ゲノムにおける多型であるgSNP、調節領域における多型であるrSNP等が挙げられる。本発明のリスク判定方法において検出対象となる核酸多型は、1種であってもよく、複数種共存してもよい。
【0101】
前記リスク判定方法1において、発現レベルの異常をもたらす核酸多型としては、例えば、調節領域における多型であるrSNP等が挙げられる。本発明のリスク判定方法1において検出対象となる核酸多型は、正常レベルと異なる発現レベルを示す多型であり、健常者に比べ、多発性骨髄腫患者において出現頻度の高い核酸多型であればよい。
【0102】
前記リスク判定方法2において、ポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型としては、例えば、アミノ酸置換を生じるcSNP等が挙げられる。本発明のリスク判定方法2において検出対象となる核酸多型は、ポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす多型であり、健常者に比べ、多発性骨髄腫患者において出現頻度の高い核酸多型であればよい。
【0103】
本発明のリスク判定方法において、検出対象となる前記核酸多型は、以下のようにして同定されうる。すなわち、健常者集団及び多発性骨髄腫患者集団を対象として、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子及び当該遺伝子の発現レベルの増減に関連し得る領域(例えば、調節領域等)をシークエンシングし、多型部位を検出する。検出された多型部位の対立遺伝子頻度を算出し、健常者集団に比べ、患者集団において有意に増加している対立遺伝子を見いだすことにより、多発性骨髄腫と相関する多型を同定することができる。
【0104】
前記リスク判定方法2において検出対象となる核酸多型は、さらに、健常者集団及び患者集団のそれぞれ由来の多発性骨髄腫特異的遺伝子にコードされたポリペプチドの生物学的活性を測定して、健常者集団における前記ポリペプチドの生物学的活性と、患者集団における生物学的活性との間で差異があるものを選別することにより得られうる。
【0105】
本発明のリスク判定方法において、前記核酸多型の検出手法としては、前記核酸多型を検出しうる方法であればよく、公知の各種の方法が広く採用されうる。かかる検出手法としては、被検者由来のゲノムDNAについて、例えば、多型部位の塩基配列を決定し、得られた配列情報を指標として核酸多型を検出する方法;多型部位に存在する塩基の種類に依存して変化するDNA試料の物理化学的性質の差又は制限酵素認識部位の相違を指標として核酸多型を検出する方法(例えば、多型部位を含むDNA試料のゲル電気泳動やキャピラリー電気泳動等の各種電気泳動手段等における挙動の差を利用する方法);当該多型部位の検出に適した検出用プローブにより、核酸多型を検出する方法及び質量分析法により質量の相違を指標として核酸多型を検出する方法等が挙げられる。
【0106】
質量分析法により核酸多型を検出する場合、例えば、MALDI−TOF MS(マトリックス支援レーザー脱離イオン化/飛行時間型質量分析計)等が用いられうる。
【0107】
本発明のリスク判定方法1においては、被検試料は、DNAを含有した試料であればよく、ゲノムDNA精製試料であってもよく、未精製試料であってもよい。また、前記被検試料としては、例えば、ヒト由来試料、具体的には、血液、骨髄、体液、皮膚、筋肉、臓器等の生検から得られた試料等が挙げられる。なお、ゲノムDNA精製試料は、前記ゲノムDNAは、前記生検より常法に従い抽出、精製し、調製されうる。
【0108】
本発明のリスク判定方法2においては、被検試料は、前記多発性骨髄腫特異的遺伝子にコードされたポリペプチドの生物学的活性を呈しうる状態の試料であれば、精製試料であってもよく、未精製試料であってもよい。前記披検試料としては、例えば、ヒト由来試料、具体的には、血液、骨髄、CD138陽性細胞、体液、皮膚、筋肉、臓器等の生検から得られた試料等が挙げられる。
【0109】
本発明のリスク判定方法において、多発性骨髄腫において高い頻度で見出される核酸多型が、多く検出される場合、被検試料の供給源である個体が、多発性骨髄腫に罹患する危険性が高いと判断されうる。
【0110】
なお、本発明の多発性骨髄腫の検査方法、病期の評価方法及び易罹患性のリスク判定方法により得られた情報は、慣用の情報記録媒体、例えば、CD−R、FD等に代表される電子媒体、紙等の記録媒体を介して、多発性骨髄腫の治療を必要とする個体に、適切な診断のための情報や適切な治療の選択のための情報を提供することができる。かかる情報の提供方法も本発明の範囲に含まれる。
【0111】
【実施例】
以下、本発明を実施例により更に具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例によって限定されるものではない。
【0112】
実施例1 CD138陽性細胞の精製
インフォームドコンセントの下、3人の健常者ボランティア、3人のMGUS患者、7人のMM患者及び2人のPCL患者の各患者から骨髄(BM)吸引物を得た。単核細胞(MNC)をBM生検から精製した。抗CD138+ MicroBeads(登録商標)[ミルテニー バイオテク(Miltenyi Biotec)社製]を用いて、該MNCを標識し、得られた標識MNCをminiMACS(登録商標)磁気細胞分離カラム[ミルテニー バイオテク(Miltenyi Biotec)社製]によるクロマトグラフィーに供した。得られたCD138陽性細胞画分を適量に分割し、−80℃で保存した。
【0113】
実施例2 RNA調製及びDNAマイクロアレイ解析
酸性グアニジニウム法により、全RNAを、CD138陽性細胞標品から抽出した。得られた全RNAを、T7 RNAポリメラーゼを用いた増幅に供した。全試料を、2回増幅した。第1段階増幅及び第2段階増幅のそれぞれ由来のRNAにより得られたDNAマイクロアレイデータの相関係数は、0.93であると算出された。
【0114】
1μgの増幅cRNAを、二本鎖cDNAに変換してから、ハイブリダイゼーション用ビオチン標識cRNAを調製した。得られたビオチン標識cRNAを用いて、12,625遺伝子が検出可能なGeneChip HU95Avs2マイクロアレイ[アフィメトリックス(Affymetrix)社製]のハイブリダイゼーションを行った。続いて、洗浄操作を行ない、アレイ上におけるシグナルの検出を、GeneChipシステム[アフィメトリックス(Affymetrix)社製]を用いて行なった。数値化されたデータの統計学的解析を、GeneSpring3.2.2ソフトウェア[シリコンジェネティックス(Silicon Genetics)]を用いて行なった。
【0115】
12,000を超えるヒト遺伝子の発現レベルを、15検体由来のCD138陽性細胞標品について、解析した。異なる患者における形質細胞のトランスクリプトームを比較するため、各遺伝子の発現レベルを、GeneChipハイブリダイゼーションごとの全遺伝子の平均発現強度により正規化した。類似度が分離比0.5の標準相関により測定されるクラスター解析によりデンドログラム(遺伝子樹形図)を作成した。具体的には、各ハイブリダイゼーションにおいて、全てのスポットのシグナル強度をデジタル化し、平均スポット強度について正規化した。このデータをクラスター分析することにより、その発現プロファイルが類似している遺伝子同士を1つのツリーに近接して配置した遺伝子遺伝子ツリー(又はデンドログラムともいう)を得た。これにより、ある特定の病期又は病期のサブグループにおいてのみ活性な幾つかの遺伝子のクラスターを見出した。また、多発性骨髄腫における病期特異的遺伝子を視覚化するために、MGUS期、MM期又はPCL期群の間で各遺伝子の平均発現強度を算出し、これらの値に基づいて遺伝子ツリーを再度描いた。この平均ツリーから、MGUS期、MM期又はPCL期に特異的に発現レベルの変動する遺伝子を見出した。
【0116】
それらの遺伝子及び多発性骨髄腫患者における遺伝子発現レベルを表1に示す。表1に記載の発現量は任意単位であり、0.6以下は検出限界以下である。数値は絶対的なものではなく患者の状態、mRNAの調製、DNAマイクロアレイの状態により変動し得る。
【0117】
【表1】
【0118】
MM期とMGUS期とを区別する分子マーカーを同定する試みとして、健常者又はMGUS患者における発現に比べてMM患者又はPCL患者において発現が増加する遺伝子を検索した。
【0119】
表1に示すように、平均樹形図からMM患者又はPCL患者において特異的に発現する遺伝子として、13個の遺伝子を見出した。特に、注目すべき遺伝子として、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子があげられる。
【0120】
これらの遺伝子は、健常者由来の細胞及びMGUS期患者由来の細胞の両方において不活化し、MM期患者由来の細胞又はPCL期患者由来の細胞に広い範囲に誘導される。したがって、これらの遺伝子は、多発性骨髄腫のMM期及びPCL期に特異的な分子マーカーの強力な候補である。
【0121】
ヒストンH2Aの過剰発現は、Rossらの報告〔ロス(Ross DT)ら、Nature Genet., 24, 227-235 (2000)〕によると、MM細胞の増殖速度の増加に影響すると考えられる。
【0122】
LD78αは、著しい破骨細胞活性化活性を有するタンパク質であるマウスマクロファージ炎症タンパク質(MIP)−1α〔ダバテリス(Davatelis G)ら、J. Exp. Med., 167, 1939-1944(1988)〕と75%の配列同一性を示した。ヒトゲノムによりコードされた未知もしくは推定タンパク質がLD78αよりもマウスMIP−1αに対して、より高い配列同一性を示したという事実は、LD78αが、マウスMIP−1αのヒトオルトログであろうことを示唆する。以前、MM期患者のBM形質細胞は、MIP−1αの量の増加と、タンパク質への中和抗体の添加によりブロックされる破骨細胞刺激活性とを含むことが示されている〔チョイ(Choi SJ)ら、Blood, 96, 671-675(2000)〕。したがって、MIP−1αが、MM期患者の骨溶解特性に重要な役割を果たすと考えられる。LD78αが、マウスMIP−1αのヒトオルトログであるならば、本タンパク質のMM期特異的発現及びPCL期特異的発現は、骨溶解が、これらの病期の患者に起こり、MGUS期患者に起こらないのかを説明すると考えられる。
【0123】
CTGFは、マイトジェニック活性を有し、かつインスリン様増殖因子結合タンパク質(IGFBP)スーパーファミリーのメンバーと類似した配列を有する。したがって、本タンパク質は、IGFBP8としても知られている。CTGFの発現は、以前、比較的広範であることが示されていたが、本実施例のデータによれば、少なくとも形質細胞において、CTGFタンパク質の発現が、トランスフォーメーションに関連することが示される。発現が、ランゲルハンス島のβ細胞に限定されると思われるGIPRは、グルコースのプラズマ濃度における増加に応答して、これらの細胞からのインスリン放出に機能する。しかしながら、ウスディン(Usdin)〔ウスディン(Usdin, TB)ら、Endocrinology, 133, 2861-2870 (1993)〕らは、GIPRの発現が、より広範であり、GIPRタンパク質が、さらなる同化応答にも貢献するであろうことを示唆している。
【0124】
MM細胞及びPCL細胞におけるGIPRの役割は、いまだ決定されないままであるが、GIPRに対する抗体は、フローサイトメトリー解析によりMM-PCL期とMGUS期とを区別化するための臨床的用途を証明するであろう。
【0125】
PCL患者において特異的に発現する遺伝子として、4個の遺伝子を見出した。特に、注目すべき遺伝子として、WEE1遺伝子があげられる。WEE-1はdual-specificity protein kinase 〔ワタナベ(Watanabe N.)ら、 EMBO J. 14, 1878-1891 (1995)〕として知られているが、多発性骨髄腫との関係は知られていない。
【0126】
近年、ヒト8型ヘルペス(HHV−8)は、MMの病因に影響を与えることが示唆されている〔レティック(Rettig MB)ら、Science, 276, 1851-1854 (1997)〕。HHV−8によるBM細胞の感染は、MM患者においては検出されるが、正常細胞においては、検出されない。ある研究によれば、この観察を再現していないが、他は、MM患者のBMにおける樹状突起細胞におけるHHV−8感染を確認している〔ブロウッゼット(Brousset P)ら、Br. J. Haematol., 108, 197-198 (2000)〕。HHV−8感染とMMへのトランスフォーメーションとの間の関連性を調べるため、アフィメトリックス(Affymetrix)社製HU95Avs2チップを用いて、ヘルペスウイルス関連遺伝子の発現を調べた。
【0127】
腫瘍壊死因子レセプター及び神経増殖因子レセプターファミリーのタンパク質のメンバーであるヘルペスウイルスエントリーメディエーター(HVEM)遺伝子の発現は、正常対照又はMGUS患者の細胞における発現に比べて、MM及びPCL患者の形質細胞において増加した。前記レティック(Rettig)ら〔Science, 276, 1851-1854 (1997)〕は、MM患者の樹状突起細胞においてのみ、HHV−8を検出したが、本発明者のデータは、悪性化したMMクローン自体が、HHV−8感染の標的であるか、HHV−8が、MGUS期からMM期へのトランスフォーメーションの直接的原因の役割を果たすことを示唆する。
【0128】
【発明の効果】
本発明の多発性骨髄腫及び病期の判定方法によれば、迅速かつ簡便に、疾患の状態、病期を判定することができるという優れた効果を奏する。また、本発明の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤の評価方法によれば、多発性骨髄腫の治療又は予防に有用であり、多発性骨髄腫研究用試薬にも有用である、多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節剤を得ることができるという優れた効果を奏する。本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法は、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の薬理評価及びスクリーニングに適用することができる。本発明の多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物は、多発性骨髄腫の治療又は進行及び発症の予防への適用が期待される。また、本発明のアンチセンス核酸、リボザイム及び抗体は、多発性骨髄腫の治療又は進行及び発症の予防への応用が期待される。本発明の治療又は予防剤によれば、多発性骨髄腫の治療又は進行及び発症の予防を行なうことができるという優れた効果を奏する。さらに、本発明の多発性骨髄腫の罹患性のリスクの判定方法によれば、症状が見られない個体において、予め多発性骨髄腫の罹患性のリスクを予想することが可能になるという優れた効果を奏する。
【0129】
【配列表】
【0130】
【0131】
【0132】
【0133】
【0134】
【0135】
【0136】
【0137】
【0138】
【0139】
【0140】
【0141】
【0142】
【0143】
【0144】
【0145】
【0146】
【0147】
Claims (18)
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた多発性骨髄腫特異的遺伝子について、被検試料中における少なくとも1種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定、又は少なくとも2種の該多発性骨髄腫特異的遺伝子を含む遺伝子群の発現プロファイルの決定を行なうことを特徴とする、多発性骨髄腫の検査方法。
- 被検試料が、骨髄細胞である、請求項1記載の多発性骨髄腫の検査方法。
- 骨髄細胞が、CD138陽性細胞である、請求項2記載の多発性骨髄腫の検査方法。
- 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、mRNA量を指標として行なわれる、請求項1〜3いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法。
- 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、遺伝子増幅法、DNAチップ、DNAマイクロアレイ及びノーザンブロットハイブリダイゼーション解析からなる群より選ばれた少なくとも1種の方法により行なわれる、請求項4記載の多発性骨髄腫の検査方法。
- 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド量を指標として行なわれる、請求項1〜3いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法。
- 多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの測定又は遺伝子群の発現プロファイルの決定が、免疫学的方法及び/又はプロテインチップ解析により行なわれる、請求項6記載の多発性骨髄腫の検査方法。
- 請求項1〜7いずれか1項に記載の多発性骨髄腫の検査方法により、多発性骨髄腫の病期を判定することを特徴とする、多発性骨髄腫の病期の判定方法。
- 以下のステップ:
(A) 被検物質を、試験動物又は試験細胞に、投与又は接触させるステップ、並びに、
(B) 被検物質が、前記ステップ(A)で得られた試験動物又は試験細胞中で、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法。 - 以下のステップ:
(A’) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現調節領域とレポーター遺伝子との融合遺伝子を含む試験動物又は該融合遺伝子を含む試験細胞に接触させるステップ、並びに
(B’) 被検物質が、前記ステップ(A’)で得られた試験動物又は試験細胞中でのレポーター遺伝子の発現レベルを調節するか否かを決定するステップ、
を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法。 - 以下のステップ:
(A”) 被検物質を、WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群から選択された少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によってコードされるタンパク質に接触させるステップ、並びに、
(B”) 被検物質が、前記ステップ(A”)で得られたタンパク質の活性を調節するか否かを決定するステップ、
を含む、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物の評価方法。 - 請求項9〜11いずれか1項に記載の評価方法により得られてなる、多発性骨髄腫の治療又は予防に有効な化合物。
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAに特異的にハイブリダイズするアンチセンス核酸を含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤。
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子のmRNAを特異的に切断するリボザイムを含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤。
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有してなる、多発性骨髄腫の治療又は予防剤。
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチド又はその断片に特異的に結合する抗体を含有してなる、多発性骨髄腫の研究試薬。
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子の発現レベルの異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法。
- WEE1遺伝子、HVEM遺伝子、ヒストンH2A遺伝子、LD78α遺伝子、GIPR遺伝子、CTGF遺伝子、チトクロムb遺伝子、MHCホモログ遺伝子、THBP遺伝子及びCRHP遺伝子からなる群より選ばれた少なくとも1種の多発性骨髄腫特異的遺伝子によりコードされたポリペプチドの生物学的活性の異常をもたらす核酸多型を検出することを特徴とする、多発性骨髄腫易罹患性のリスク判定方法。
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