JP2002515590A5 - - Google Patents
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Description
【特許請求の範囲】
【請求項1】 試料核酸中の標的核酸配列の存在または非存在を決定する方法であって、該方法は以下の工程:
(a)表面増強共鳴ラマン散乱SER(R)S活性種(SAS)及び標的結合種(TBS)と結合した金属表面を含む検出剤に、試料をさらす工程(TBSは標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものであり、本工程で検出剤は、各々異なるTBSを有する第1の薬剤と第2の薬剤を含み、各TBSは標的配列に結合することができるものであり、第1と第2のTBSの標的配列への結合により、各TBSに結合した金属表面を近接させ、それにより金属表面の一方または両方と結合したSASの表面増強をもたらす)、
(b)標識の何らかの表面増強を検出するために、SER(R)Sを用いて試料/薬剤混合物を観察する工程、
を含む方法。
【請求項2】 工程(a)の検出剤中に存在するとき、金属表面自体では表面増強が可能でない、請求項1記載の方法。
【請求項3】 検出剤が、2以上の別の成分として工程(a)中の試料にさらされるものである、請求項1又は2記載の方法。
【請求項4】 検出剤がTBSと結合したモノ分散非凝集コロイド金属粒子を含み、TBSは標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものである、請求項1ないし3のいずれか1項記載の方法。
【請求項5】 TBSがプロパルギルアミノ修飾核酸またはペプチド核酸を含むものである、請求項4記載の方法。
【請求項6】 金属コロイド粒子あたり1、2、3、4、5、10、または20を超えるTBSが存在する、請求項4または5記載の方法。
【請求項7】 金属表面に対するSAS及び/又はTBSの化学吸着を促進するために、表面探査基(SSG)が用いられるものである、請求項1ないし6のいずれか1項記載の方法。
【請求項8】 SSGがトリアゾール基、より好ましくはベンゾトリアゾール基を含むものである、請求項7記載の方法。
【請求項9】 SSGが、SASである染料により修飾されている請求項7又は8記載の方法。
【請求項10】 修飾SSGがアゾベンゾトリアゾールである、請求項9記載の方法。
【請求項11】 修飾SSGが、金属表面にTBSを結合させるために用いられる請求項9又は10記載の方法。
【請求項12】 修飾SSGが連結基を介してTBSに接合している請求項11記載の方法。
【請求項13】 SASがTBSよりも2、5、10、20、30、40、50又は100倍過剰を上回って存在する、請求項1ないし10のいずれか1項記載の方法。
【請求項14】 識別可能なSASを有する複合結合薬剤を用いて1つを上回る標的配列が決定されるものである、請求項1ないし13のいずれか1項記載の方法。
【請求項15】 標的配列が配列同一性を共有し、かつ共通の第1の薬剤が、残りの標的配列を識別することができる特異的識別可能な第2の薬剤とともに用いられる、請求項14記載の方法。
【請求項16】 生物の存在検出、選択、又は同定、又は系統的分類の方法であって、該方法は請求項1ないし15のいずれか1項記載の方法の使用を含み、標的核酸配列はその生物に関連している方法。
【請求項17】 請求項1ないし16のいずれか1項記載の方法の使用を含み、標的核酸配列はその疾患に関連している、疾患の診断方法。
【請求項18】 請求項1ないし17のいずれか1項記載の方法の使用を含み、標的核酸配列はその遺伝子に関連しているかその内部にある配列に相当するものである、特定の遺伝子をコードする核酸を単離する方法。
【請求項19】 非凝集金属粒子を表面増強共鳴ラマン散乱SER(R)S活性種(SAS)及びTBSと配合する工程(各TBSは標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものである)を含み、それにより上記SASとTBSは金属表面に対する化学吸着を促進するために用いられる表面探査基(SSG)を介して上記金属粒子に結合するものである、検出剤(検出剤は、各々異なる標的結合種(TBS)を有する第1の薬剤と第2の薬剤を含み、各TBSは標的配列の全部又は一部に結合することができるものである)を生産する方法。
【請求項20】 金属表面に対する化学吸着を促進するために用いられる表面探査基(SSG)を介してSER(R)S活性種(SAS)と標的結合種(TBS)に結合している非凝集金属粒子を含む(TBSは、標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものであり、本工程で検出剤は、各々異なるTBSを有する第1の薬剤と第2の薬剤を含み、それにより上記SASとTBSは金属表面に対する化学吸着を促進するために用いられる表面探査基(SSG)を介して上記金属粒子に結合するものである)、検出剤。
【請求項21】 各々が識別可能なSASを有する、請求項20記載の2つ以上の検出剤を含む組成物。
【請求項22】 請求項20又は21記載の薬剤又は組成物に加えて核酸試料を含むシステム。
【請求項23】 SERRS分析器に加え、請求項20ないし22のいずれか1項記載の薬剤、組成物又はシステムを含む装置。
【請求項24】 含む請求項1ないし18のいずれか1項記載の方法における請求項23記載の装置の使用。
【請求項25】 請求項20又は21記載の薬剤又は組成物と、請求項1ないし18のいずれか1項記載の方法を実施するための1つの付加的な材料を含むキット。
【請求項1】 試料核酸中の標的核酸配列の存在または非存在を決定する方法であって、該方法は以下の工程:
(a)表面増強共鳴ラマン散乱SER(R)S活性種(SAS)及び標的結合種(TBS)と結合した金属表面を含む検出剤に、試料をさらす工程(TBSは標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものであり、本工程で検出剤は、各々異なるTBSを有する第1の薬剤と第2の薬剤を含み、各TBSは標的配列に結合することができるものであり、第1と第2のTBSの標的配列への結合により、各TBSに結合した金属表面を近接させ、それにより金属表面の一方または両方と結合したSASの表面増強をもたらす)、
(b)標識の何らかの表面増強を検出するために、SER(R)Sを用いて試料/薬剤混合物を観察する工程、
を含む方法。
【請求項2】 工程(a)の検出剤中に存在するとき、金属表面自体では表面増強が可能でない、請求項1記載の方法。
【請求項3】 検出剤が、2以上の別の成分として工程(a)中の試料にさらされるものである、請求項1又は2記載の方法。
【請求項4】 検出剤がTBSと結合したモノ分散非凝集コロイド金属粒子を含み、TBSは標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものである、請求項1ないし3のいずれか1項記載の方法。
【請求項5】 TBSがプロパルギルアミノ修飾核酸またはペプチド核酸を含むものである、請求項4記載の方法。
【請求項6】 金属コロイド粒子あたり1、2、3、4、5、10、または20を超えるTBSが存在する、請求項4または5記載の方法。
【請求項7】 金属表面に対するSAS及び/又はTBSの化学吸着を促進するために、表面探査基(SSG)が用いられるものである、請求項1ないし6のいずれか1項記載の方法。
【請求項8】 SSGがトリアゾール基、より好ましくはベンゾトリアゾール基を含むものである、請求項7記載の方法。
【請求項9】 SSGが、SASである染料により修飾されている請求項7又は8記載の方法。
【請求項10】 修飾SSGがアゾベンゾトリアゾールである、請求項9記載の方法。
【請求項11】 修飾SSGが、金属表面にTBSを結合させるために用いられる請求項9又は10記載の方法。
【請求項12】 修飾SSGが連結基を介してTBSに接合している請求項11記載の方法。
【請求項13】 SASがTBSよりも2、5、10、20、30、40、50又は100倍過剰を上回って存在する、請求項1ないし10のいずれか1項記載の方法。
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【請求項18】 請求項1ないし17のいずれか1項記載の方法の使用を含み、標的核酸配列はその遺伝子に関連しているかその内部にある配列に相当するものである、特定の遺伝子をコードする核酸を単離する方法。
【請求項19】 非凝集金属粒子を表面増強共鳴ラマン散乱SER(R)S活性種(SAS)及びTBSと配合する工程(各TBSは標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものである)を含み、それにより上記SASとTBSは金属表面に対する化学吸着を促進するために用いられる表面探査基(SSG)を介して上記金属粒子に結合するものである、検出剤(検出剤は、各々異なる標的結合種(TBS)を有する第1の薬剤と第2の薬剤を含み、各TBSは標的配列の全部又は一部に結合することができるものである)を生産する方法。
【請求項20】 金属表面に対する化学吸着を促進するために用いられる表面探査基(SSG)を介してSER(R)S活性種(SAS)と標的結合種(TBS)に結合している非凝集金属粒子を含む(TBSは、標的配列の全部または一部と相補する核酸または核酸アナログを含むものであり、本工程で検出剤は、各々異なるTBSを有する第1の薬剤と第2の薬剤を含み、それにより上記SASとTBSは金属表面に対する化学吸着を促進するために用いられる表面探査基(SSG)を介して上記金属粒子に結合するものである)、検出剤。
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【請求項22】 請求項20又は21記載の薬剤又は組成物に加えて核酸試料を含むシステム。
【請求項23】 SERRS分析器に加え、請求項20ないし22のいずれか1項記載の薬剤、組成物又はシステムを含む装置。
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