HUT74247A - Human metabotropic glutamate receptor subtypes (hmr4, hmr6, hmr7) and related dna compounds - Google Patents
Human metabotropic glutamate receptor subtypes (hmr4, hmr6, hmr7) and related dna compounds Download PDFInfo
- Publication number
- HUT74247A HUT74247A HU9600692A HU9600692A HUT74247A HU T74247 A HUT74247 A HU T74247A HU 9600692 A HU9600692 A HU 9600692A HU 9600692 A HU9600692 A HU 9600692A HU T74247 A HUT74247 A HU T74247A
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- hmglur
- receptor
- subtype
- dna
- cells
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/286—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against neuromediator receptors, e.g. serotonin receptor, dopamine receptor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70571—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for neuromediators, e.g. serotonin receptor, dopamine receptor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Neurology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
Description
A humán metabotróp glutamát receptor altípusok (HMR4, HMR6, HMR7) és rokon DNS vegyületeik
A jelen találmány humán metabotróp glutamát receptor (hmGluR) proteinekkel kapcsolatos, valamint az ezeket kódoló izolált nukleinsavakkal, a találmány proteinjeit termelő gazdasejtekkel, az ilyen proteinek, nukleinsavak és gazdasejtek előállítására szolgáló módszerekkel, valamint ezek alkalmazásával. Továbbá, a jelen találmány a találmány hmGluR proteinjei ellen irányított antitesteket is biztosít.
A metabotróp glutamát receptorok (hmGluR) a G-protein (guanin nukleotid kötő protein) párosított receptorok osztályába tartoznak, melyek egy glutamáterg liogandum kötődése esetében egy extracelluláris jelet egy intracelluláris második messenger rendszeren keresztül - mint amilyen a kalcium ionok, egy ciklikus nukleotid, diacilglicerol és inozitol 1,4,5trifoszfát - egy fiziológiai válasszá alakítanak. A hét feltételezett transzmembránt áthidaló szegmentet tartalmazó melyet egy nagy extracelluláris amino-terminális dómén előz meg • · · · > t • · · · · · · • ······ · • · ····· ·· · ···· ··· · · a a a és melyet egy nagy karboxi-terminális dómén követ - metabotróp glutamát receptorok azonos szerkezettel jellemezhetők. Aminosav szinten a szekvencia azonosság mértékére alapozva az mGluR osztály különböző egyedi receptor altípusokat magába foglaló alcsaládokba sorolható (Nakanishi, Science 258, 597-603 (1992)). Az egyes mGluR altípusokat egy egyedi gén kódolja. Egy mGluR altípus egy eltérő alcsaládba tartozó másik altípussal való homológiáját tekintve az aminosav szekvenciák 50 %-nál kisebb homológiát mutatnak. Egy alcsaládon belül a szekvencia azonosság foka általában 70 %-nál kisebb. így egy adott altípus, különösen ugyanazon emlős faj altípusa, jellemezhető egy másik mGluR altípussal való aminosav szekvencia homológiájával. Továbbá, egy adott altípus jellemezhető régió és szövet megoszlásával is, celluláris vagy szubcelluláris mintájával vagy különböző fiziológiai profiljával, például elektrofiziológiai és farmakológiai tulajdonságaival is.
Mivel az aminosav L-glutamát az egyik fő serkentő neurotranszmitter, feltételezik, hogy a glutamát rendszerek fontos szerepet játszanak számos neuronális folyamatban ideértve a gyors serkentési szinaptikus transzmissziót, a neurotranszmitter felszabadulási szabályozást, a hosszú-távú potenciálást, a tanulást és emlékezést, a fejlődési szinaptikus plaszticitást, a hipoxiás-ischemiás sérülést és az idegsejt puszrulást, az epilepszia-szerű rohamokat, valamint számos neurodegeneratív rendellenesség patogenezisét. Ezideig nem állt rendelkezésre adat a humán metabotróp glutamát receptor (hmGluR) altípusokról, például aminosav szekvenciájukról, vagy szövet megoszlásukról. Ezen ismeretek hiánya különösen az olyan humán terápiás anyagok kutatását akadályozta, melyek •· · · · a ···· • · · · · · · • «····· « • · ····· ·· · specifikusan képesek befolyásolni a glutamát rendszer defektjenek tulajdonítható bármilyen rendellenességet. A metabotróp glutamát receptorok potenciális fiziológiai és pathológiai jelentőségének fényében szükség van a humán receptor altípusokra, valamint az ilyen altípusokat olyan mennyiségben termelő sejtekre, mely ezen proteinek elektrofiziológiai és farmakológiai tulajdonságait helyes megvilágításba helyezi. Például a gyógyszer szkrínelési vizsgálatokhoz aktív formában levő, tisztított humán receptor proteinekre van szükség, ez eddig nem volt megvalósítható.
A jelen találmány célja ezen igény kielégítése, nevezetesen egyértelmű hmGluR altípusok, ezeket kódoló nukleinsavak és az ilyen altípusokat termelő sejtek biztosítása. Részletesebben, a jelen találmány a hmGluR4 jelölésű altípust tartalmazó hmGluR alcsaládot, valamint az említett alcsalád egyes proteinjeit írja le. A következőkben az említett alcsaládra hmGluRi alcsaládként utalunk. Más hmGluR altípusokkal szemben ezen alcsalád tagjai hatékonyan aktiválhatok L-2-amino-4-foszfo-butánsavval (AP4) és expresszió esetén például kínai hörcsög ovarium (CHO) sejtekben vagy fiatal hörcsög vese (baby hamster kidney = BHK) sejtekben negatívan kapcsolódik az adenilát ciklázhoz a G-proteinen keresztül. A jelen találmány rekombináns hmGluR altípusát tartalmazó rendszert használva a hmGluR-lel szemben aktív gyógyszerek szkrínelésében többek között sejtenként! nagy számú receptor elérését teszi lehetővé, nagyobb hozamot és a zaj arány magasabb jelét biztosítva a vizsgálatokban, valamint megnövekedett receptor altípus specifitást eredményezve • · · t
(feltehetően nagyobb biológiai és betegség specifitást biztosít) .
Még specifikusabban, a jelen találmány egy olyan hmGluR altípussal kapcsolatos, mely azzal jellemezhető, hogy aminosav szekvenciája 65 %-nál nagyobb azonosságot mutat a hmGluR4 altípus szekvenciájával, melynek aminosav szekvenciáját a 2. számú szekvenciában adjuk meg.
A találmány szerint a hmGluR altípus kifejezés egy olyan tisztított proteinre vonatkozik, mely a G-protein-kapcsolt receptorok osztályába tartozik és mely egy glutamát ligandum kötődése során egy intarcelluláris második messenger rendszeren keresztül egy extracelluláris jelet transzdukál. Ilyen esetben a találmány altípusa úgy jellemezhető, hogy egy ciklikus nukleotid (cAMP, cGMP) szintjét módosítja. Másik lehetőségként, jel transzdukció következhet be a találmány egy receptor altípusához kapcsolódó G-protein más membrán proteinnel, mint például az ioncsatornával vagy más receptorral való közvetlen interakciója következtében. A találmány egy receptor altípusáról úgy vélik hogy egy olyan egyértelmű gén kódolja, mely nem kódol más metabotróp glutamát receptor altípust. A találmány egy adott altípusa eltérő fiziológiai profiljával, előnyösen jel transzdukciós és farmakológiai tulajdonságaival jellemezhető. A farmakológiai tulajdonságok közé tartoznak például az agonistákra való szelektivitás és az agonista válaszok.
A találmány meghatározása szerint egy glutamát ligandum például L-glutamát vagy más hmGluR altípussal reagáló más vegyület és különösen az ehhez glutamát-szerű módon kötődő más vegyület lehet, mint például az ACPD (IS,3R-1-amino-ciklof t
pentán-1,3-dikarboxilessav) egy ACPD-szerú ligandum például QUIS (quisqualát), AP4 és más hasonló vegyületek. Más ligandumok, például az (R,S)-alfa-metil-karboxi-fenil-glicin (MCPG) vagy az alfa-metil-L-AP4 reakcióba léphet a találmány receptorával oly módon, hogy megakadályozza a glutamát ligandum kötődését.
A találmány szerinti használatban a korábbiakban és a későbbiekben is a tisztított vagy izolált kifejezések a találmány egy olyan molekulájára vonatkoznak, mely egy természetes forrásból vagy a génsebészet segítségével dúsított vagy tiszta formában nyerhető. A találmány tisztított proteinjei, DNS-ei és RNS-ei, míg a természetes módon előforduló proteinek, DNS-ek és RNS-ek nem, addig ezek egy a találmány hmGluR expresszióját vagy aktivitását szelektíven módosító vegyületek azonosításában is hasznosak lehetnek.
A találmány tisztított hmGluR-je a hmGluR4 alcsalád egy olyan tagját jelenti, melyet azonosítottunk és mely a természetes környezetének egy vagy több alkotórészétől mentes. A tisztított hmGluR a találmány tisztított hmGluR-jét is magába foglalja rekombináns sejttenyészetben. A találmány altípusának dúsított formája egy olyan készítményre utal, mely a természetesnél nagyobb koncentrációban tartalmazza az említett altípust, például egy celluláris frakció az említett altípust tartalmazza. Ha az említett altípus tiszta formában van alapjában véve mentes más makromolekuláktól, különösen a temészetesen előforduló proteines szennyeződésektől. Ha kívánatos a találmány altípusa oldható formában van. A találmány előnyben részesített tisztított hmGluR altípusa egy rekombináns protein. Előnyösen a találmány altípusa aktív « * • · · · · · • · · · · • · · · · · · •··· ··· · ·· · · > 6 állapotban van, ami azt jelenti, hogy ligandum kötő és jel transzdukciós aktivitással is rendelkezik. A receptor aktivitást a tudomány e területén ismert módszerekkel mérjük, például egy kötési vizsgálatot vagy egy funkcionális vizsgálatot, például az alábbiakban leírt vizsgálatot használva.
A hmGluR alcsalád előnyben részesített hmGluR altípusa a hmGluR4, a hmGluR7 és hmGluR6 altípusok. A különösen előnyben részesített a hmGluR4 altípus, egy a későbbiekben bemutatott 2. számú aminosav szekvenciával rendelkező protein. A hmGluR7típus protein tartalmazhat egy a 4, 6, 8 és 10 számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező polipeptideket tartalmazó csoportból szelektált polipeptidet. Az ilyen hmGluR7 altípus előnyben részesül. A különösen előnyben részesített hmGluR7 altípusok a sorrendben a 12. és a 14. számú szekvenciákban bemutatott aminosav szekvenciákkal rendelkeznek. Egy előnyben részesített hmGluR6-típusú protein a
16. számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidet tartalmaz.
A találmány továbbá magába foglalja a találmány receptor altípusainak variánsait is. Például a találmány hmGluR altípus egy variánsa az említett altípussal funkcionálisan vagy immunológiailag azonos. Egy funkcionális ekvivalens egy olyan protein, különösen egy olyan humán protein, mely az említett adott altípus jellemzőivel alapjában véve azonos fiziológiai profillal rendelkezik. A fiziológiai prolfil in vitro és in vivő receptor effektor funkciókat, elektrofiziológiai és farmakológiai tulajdonságokat - például szelektív interakciót az agonistákkal és antagonistákkal szemben - jelent. A • · · ·
példaként szolgáló funkcionális ekvivalensek lehetnek a primer transzkript alternatív hasításával létrehozott mRNS által kódolt illesztési variánsok, aminosav mutánsok és glikozilációs variánsok. Egy adott hmGluR altípus immunológiai ekvivalense egy olyan protein vagy peptid, mely az említett altípussal szemben specifikus antitesteket képes létrehozni. A receptor extracelluláris doménjének részeit, például a legalább 6-8 aminosavat tartalmazó peptideket, különösen a 20 aminosavat tartalmazókat különösen hasznos immunológiai ekvivalenseknek tartjuk.
A találmányban szereplő további variánsok membránhoz kötött és oldódó fragmentek, valamint más kémiai egységek kovalens vagy teljes konjugátumai, ezek a variánsok egy vagy több receptor funkcióval rendelkeznek, mint például ligandum kötő vagy jel transzdukáló funkcióval. A találmány hmGluR altípusaira példaként szolgáló fragmentek sorrendben a 4., 6., 8., 10. és 16. számú szekvenciákban bemutatott aminosav szekvenciákkal rendelkező polipeptidek. A találmány fragmentjei előállíthatok természetes forrásokból, kémiai szintézissel vagy rekombináns technikákkal. A találmány hmGluR altípusa endogén ellenpárjával a ligandum kötő domént tartalmazó endogén ligandumokért, fragmentekért vagy ezek származékáért való versenyképességüknek köszönhetően ezeket terápiás anyagoknak tartj ák.
A kovalens származékok például alifás észtereket vagy egy receptor karboxil csoport amidjait, maradékokat tartalmazó hidroxil csoport 0-acil származékait és maradékokat tartalmazó aminocsoportok N-acil származékait foglalják magukba. Az ilyen származékok előállíthatok a funkcióscsoportok • · · · ·· ···· • · · · · · · • ······ · • · ····· · · · ···· ··· · >β reakciócsoportokhoz való kötésével, melyek az oldalláncokban találhatók, valamint a receptor dómén N- és C-terminusánál. A találmány proteinje jelölhető egy detektálható csoporttal, például radioaktív jelöléssel, kovalensen a ritka földkelátokhoz köthető vagy fluoreszcens egységgel konj ugálható.
A további származékok a találmány proteinjeinek más proteinekkel vagy peptidekkel (fúziós proteinek) való kovalens konjugátumai. Példaként a különböző glutamát receptorok különböző részeit tartalmazó fúziós proteinek szolgálnak. Az ilyen fúziós proteinek hasznosak lehetnek a G-proteinekhez való kapcsolódás megváltoztatásában és/vagy egy funkcionális vizsgálat érzékenységének fejlesztésében. Például az ilyen fúziós proteinekben vagy kiméra receptorokban a találmány egy altípusának intracelluláris doménjei egy másik mGluR altípus megfelelő doméjeivel helyettesíthető, különösen egy másik hmGluR altípuséval, például egy másik alcsaládba tartozó hmGluR altípussal. Egy ilyen kiméra receptor megszerkesztéséhez különösen megfelelőek az olyan receptor intracelluláris doménjei, melyek a foszfolipáz C/Ca2+ jelző reakcióutat aktiválják, például az mGluR (Masu et al., Natúré 349, 760-765) vagy az mGluR5. Egy ilyen cserére alkalmas intracelluláris dómén, például egy második intracelluáris hurok, melyre i2-ként (Pin et al., EMBO J. 13, 342-348 (1994)) is utalnak. így lehetővé válik egy teszt vegyület a találmány receptorának egy ligandum kötő doménjével való kölcsönhatásának vizsgálatára a kalcium ionok vizsgálatát használva. A találmány szerint a kiméra receptor rekombináns technikákkal szintetizálható vagy a • « tudomány e területén ismert anyagokkal, melyek a keresztkötéses proteinekhez megfelelőek.
Az aggregációs származékok például a sejtmembránnal képzett adszorpciós komplexek.
Egy másik megvalósulásban a jelen találmány egy olyan anyag összetételre vonatkozik, mely a találmány egy hmGluR altípusát tartalmazza.
A találmány proteinjei hasznosak például immunogénekként a gyógyszer szkrínelési vizsgálatokban, reagensekként immunovizsgálatokban és tisztítási eljárásokban, mint például egy kötő ligandum affinitás tisztítási eljárásában.
A találmány egy proteinje kinyerhető természetes forrásokból, például az agyszövetből való izolálással, vagy kémiai szintézissel vagy rekombináns technikákkal.
A találmány a továbbiakban a találmány egy hmGluR altípusának előállítására szolgáló módszert is biztosít, ami azzal jellemezhető, hogy a találmány egy receptor altípusát termelő megfelelő gazdasejtet in vitro vagy in vivő szaporítjuk. Előnyösen, a gazdasejtet egy az említett altípust kódoló DNS szekvenciát és promótert tartalmazó expressziós kazettát tartalmazó hibrid vektorral transzformáljuk (transzfektáljuk). A DNS-t az említett promóter szabályozza. Ezt követően a találmány hmGluR altípusát kinyerjük. A kinyerés például a találmány altípusának a gazdasejtböl való izolálását jelenti, vagy az altípust tartalmazó gazdasejt például tenyésztápközegből való izolálását. Különösen előnyös egy a funkcionálisan aktív receptor előállítására szolgáló módszer.
A találmány egy hmGluR proteinjét kódoló DNS-ből előállíthatok a hmGluR mutánsok, mely DNS-t például egy vagy • · • ······ ·· 4 ···· ··· · ·· ·· több aminosav addicióját, cseréjét és/vagy delécióját eredményező in vitro mutagenezisnek vetettük alá. Például a találmány egy hmGluR altípusának helyettesítési, deléciós és inzertációs variánsai előállíthatok rekombináns módszerekkel és a hmGluR natív formáival való immuno-keresztreaktivitásra szkrínelhetők.
A találmány egy proteinje származtatható in vitro módon a tudomány e területén ismert hagyományos módszerekkel.
A megfelelő gazdasejtek közé tartoznak az eukarióta sejtek például az állati sejtek, a növényi sejtek és fonalasgombák, valamint a prokarióta sejtek, mint például a gram pozitív és gram-negatív baktériumok, mint például a E. coli. Az eukarióta gazdasejetek közül előnyben részesülnek a kétéltű és emlős eredetű sejtek.
A találmány szerinti használatban az in vitro ex vivo-t jelent, így például a sejt tenyészet és szövettenyészet körülményeit is magába foglalja.
A találmány a továbbiakban vonatkozik egy a találmány altípusát kódoló tisztított, előnyösen rekombináns nukleinsavat (DNS, RNS) tartalmazó nukleinsavra (DNS, RNS) vagy egy ilyen nukleinsav egy fragmentjéré. Azon túl, hogy a fenti rekombináns hmGluR proteinek termelésében hasznos, ezek a nukleinsavak hasznosak próbákként is, így könnyen lehetővé teszik a tudomány e területén képzett szakember számára a találmány egy hmGluR proteinjét kódoló nukleinsav azonosítását és/vagy izolálását. A nukleinsav lehet jelöletlen, vagy egy detektálható egységgel jelölt. Továbbá, a találmány szerinti nukleinsav hasznos például a jelen hmGluR meghatározására szolgáló módszerben is, az említett módszer magába foglalja a hmGluR-t kódoló (vagy
azzal komplementer) DNS (vagy RNS) teszt minta nukleinsavhoz való hibridizálását és a hmGluR jelenlétének meghatározását.
A jelen találmány tisztított hmGluR-t kódoló nukleinsav olyan nukleinsavat foglal magába, mely mentes legalább egy szennyező nukleinsavtól és mellyel a hmGluR nukleinsav természetes forrásában rendszerint kapcsolatban áll. A tisztított nukleinsavak így tehát a természetben talált formától vagy kerettől eltérő módon vannak jelen. Azonban a tisztított hmGluR nukleinsav magába foglalja az általában hmGluR expresszáló sejtekben levő hmGluR nukleinsavat, ahol a nukleinsav a természetes sejtektől eltérő kromoszómás lokációban található vagy mely máskülönben a természetben találttól eltérő DNS szekvenciákkal határolt.
Részletesebben, a találmány egy tisztított vagy izolált DNS molekulát biztosít, mely a találmány egy hmGluR altípusát kódolja, vagy egy ilyen DNS fragmentet. A meghatározás értelmében egy ilyen DNS egy kódoló'egyedüli DNS-t egy az említett kódoló DNS-t tartalmazó kettősszálú DNS-t, valamint egy az ezzel komplementer DNS-t tartalmaz, vagy magát a komplementer (egyszálú) DNS-t. Előnyben részesül, a fent leírt előnyben részesített hmGluR altípust kódoló DNS, vagy ennek egy fragmentje. Továbbá, a találmány vonatkozik egy ilyen DNS-t tartalmazó DNS-re is.
Még specifikusabban előnyben részesül egy olyan DNS, mely egy hmGluR4 altípust vagy annak egy részét kódolja, különösen egy a 2. számú szekvenciában leírt aminosav szekvenciával rendelkező hmGluR4 altípust kódoló DNS, például az 1. számú szekvenciában leírt nukleiotid szekvenciával rendelkező DNS. A •· · · ·· ···· • · · · · · · • ······ · • ··«··· · · · ···· ··· · · · · · hmGluR4 egy részét kódoló példaként szolgáló DNS a cDNS cmR20 hmGluR4-et kódoló része, ahogy azt a Példákban leírtuk.
Hasonlóképpen előnyben részesül a hmGluR7-et kódoló DNS is, különösen a sorrendben a 12. és 14. számú szekvenciákban bemutatott aminosav szekvenciákkal rendelkező hmGluR7 altípusok bármelyikét kódoló DNS, például a sorrendben a 11. és 13. számú szekvenciákban bemutatott nukleotid szekvenciákkal rendelkező DNS-ek. A találmány a továbbiakban biztosítja a hmGluR7 altípus egy részét, különösen a fent előnyben részesítettként azonosított hmGluR-et kódoló részeket kódoló DNS fragmentet. A példaként szolgáló hmGluR7 DNS fragmentek közé tartoznak a Példákban leírt cDNS cmR2, cmR3, cmR5 és cR7PCRl hmGluR7-et kódoló részei, vagy egy olyan DNS fragment, mely alapjában véve ugyanazt az aminosav szekvenciát kódolja, melyet a cmR2 plazmid hmGluR7-et kódoló része kódol. A plazmid 1993 szept. 13-án került deponálásra a DSM-nél DSM 8550 katalógusszámon. Ezek a DNS-ek a hmGluR7 itt leírt altípusának feltételezett hasítási variánsait kódolják.
Előnyben részesül egy a hmGluR6 altípust vagy ennek egy részét kódoló DNS is, különösen a hmGluRő altípus részét kódoló DNS, melynek aminosav szekvenciáját a 16. számú szekvenciban mutatunk be, vagy egy olyan DNS, mely alapjában véve ugyanazt az aminosav szekvenciát kódolja, mint amit az 1993 szept. 13-án DSM-nél deponált (DSM 8549 katalógusszám) cmRl plazmid hmGluR6-ot kódoló része kódol. A példaként szolgáló DNS szekvenciát a 15. számú szekvenciában mutatjuk be.
A találmányban biztosított nukleinsav szekvenciák felhasználhatók további hmGluR altípusokat kódoló DNS-ek azonosítására. Például a találmány nukleinsav szekvenciái
• · felhasználhatók a hmGluR4et tartalmazó alcsaládba tartozó további hmGluR altípusokat kódoló DNS-ek azonosítására. Az ilyen DNS azonosítására szolgáló módszer a humán DNS a fent leírt nukleinsav próbával reagáltatható, majd a próbához hibridizáló DNS(ek) azonosíthatók.
A találmány példaként szolgáló nukleinsavai alternatív lehetőségként úgy is jellemezhetők, mint olyan nukleinsavak, melyek a találmány hmGluR altípusát kódolják és egy az 1., 3., 5., 7., 9., 11., 13. vagy 15. számú szekvenciákban bemutatott DNS szekvenciákhoz hibridizálódnak, vagy az említett DNS szekvencia szelektált részéhez (fragmentjéhez). Például, a hibridizálódáshoz használható szelektált fragmentek az említett DNS-ek protein kódoló részei. Előnyben részesülnek egy a találmány hmGluR-jét kódoló olyan DNS-ek, melyek erősen szigorú körülmények között az előbb említett DNS-ekhez hibridizálódnak.
A hibridizáció szigorúsága olyan körülményekre utal, melyek között a polinukleinsavak hibridjei stabilak. Az ilyen körülmények egyértelműek a tudomány e területén jártas szakemberek számára. A tudomány e területén képzett szakember számára ismert, hogy a hibridek stabilitását a hibrid olvadási hőmérséklete (Tm) tükrözi, mely megközelítően 1-1,5 C° hőmérséklet csökkenést jelent a szekvencia homológiában bekövetkező 1% csökkenéssel. Általában egy hibrid stabilitása a nátrium ion koncentráció és a hőmérséklet függvénye. Tipikusan a hibridizációs reakció erősen szigorú körülmények között megy végbe, melyet változó szigorúságű mosások követnek.
A találmány szerinti használatban az erősen szigorú körülmény olyan körülményt jelent, mely csupán azon nukleinsav szekvenciák hibridizációját teszi lehetővé, melyek 1 M Na+ • 4 · · • · «· 44 4 4 • 44 ·· • · 4 444· • ····· ·· » • · 4 4 44( » koncentrációban 65-68 C° hőmérsékleten képeznek stabil hibrideket. Az erősen szigorú körülmények például úgy biztosíthatók, hogy a hibridizáció 6 x SSC-t, 5x Denhardt-féle oldatot, 1% SDS-t (nátrium dódecil szulfát), 0,1 Na+ pirofoszfátot és 0,1 mg/ml denaturált lazac sperma DNS-t (nem specifikus kompétitorként) tartalmazó vizes oldatban megy végbe. A hibridizácoó után a szigorú körülmények között végzett mosások több lépésben is elvégezhetők, az utolsó mosás (körülbelül 30 perc) a hibridizációs hőmérsékleten és 0,2-0,1 x SSC, 0,1% SDS elegyében történik.
A mérsékelt szigorúság olyan körülményekre utal, mely a fent leírt oldatban végbemenő hibridizációval azonos, azonban a hőmérséklet körülbelül 60-62 C° hőmérsékletet jelent. Ebben az esetben a végső mosást a hibridizáció hőmérsékletén végezzük 1 x SSC és 0,1 % SDS elegyében.
A kevéssé szigorú körülmények olyan körülményeket jelentenek, ahol a hibridizáció a fent leírt oldatban játszódik le, de a hőmérséklet körülbelül 50-52 C° hőmérsékletet jelent. Ebben az esetben a végső mosást a hibridizáció hőmérsékletén hajtjuk végre 2 x SSC és 0,1% SDS elegyében.
Érthető, hogy ezek a körülmények adaptálhatók és különböző puffereket például formamid-alapú puffereket, és hőmérsékleteket használva megduplázhatok. A Denhardt-féle oldat és az SSC jól ismertek a tudomány e területén képzett szakemberek számára, akárcsak az egyéb hibridizációs pufferek (lásd például Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd edition), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, USA, vagy Ausubel, F.M. et al., (1993) Current protocols in
Molecular Biology, Greene and Wiley, USA). Az optimális hibridizációs körülményeket kísrleti úton kell meghatározni, mivel a próba hosszúsága és a GC tartalma szintén szerepet j átszanak.
A jelen találmány útmutatását megadva a találmány nukleinsavai a tudomány e területén jól ismert módszerek szerint szerezhetők meg. A jelen találmány a továbbiakban vonatkozik az ilyen nukleinsav előállítására szolgáló eljárásokra is.
Például, a találmány egy DNS-e előállítható kémiai szintézissel, rekombináns DNS technikával vagy polimeráz láncreakcióval (PCR). A rekombináns DNS technológiával való előállítás egy megfelelő cDNS vagy genom könyvtár szkrínelését is magába foglalja. Egy DNS vagy a találmány megvalósításához megfelelő módszer magába foglalja számos oligonukeotid szintézisét, ezek PCR módszerekkel való amplifikálását (kierősétését), valamint a kívánt DNS szekvencia előállításához ezek hasítását. A megfelelő könyvtárak, például a példákban szereplő könyvtárak, beszerezhetők a kereskedelemben, vagy előállíthatok neurális vagy neuronális szövet mintákból például a hippocampus és cerebellum szövetből, sejtvonalakból és más hasonlókból.
A találmány egyedi hmGluR altípusaihoz (és hasítási variánsaihoz) a neurális vagy neuronális szövet expressziós mintája eltérő lehet. így egy adott altípust (vagy hasítási variánst) kódoló cDNS izolálásához előnyös a különböző megfelelő szövetekből vagy sejtekből előállított könyvtárakat szkrínelni. Szkrínelési próbaként a jelen találmány hmGluR altípusának alapjában véve teljes kódoló régióját tartalmazó • · · · • · · · · · ···· ··· ·
DNS-t vagy RNS-t lehet alkalmazni vagy az említett DNS-re alapuló megfelelő oligonukleotidot. Egy megfelelő oligonukleotid próba (a szkríneléshez magába foglalja a hibridizációt) egy olyan egyszálú DNS vagy RNS mely olyan nukleotid szekvenciával rendelkezik, mely magába foglal legalább 14 szomszédos bázist, melyek megegyeznek, vagy komplementerek bármely az 1., 3., 5., 7., 9., 11., 13. és 15.
számú szekvenciákban bemutatott 14 vagy több szomszédos bázisokkal. A próba jelölhető egy megfelelő, könnyen detektálható kémiai egységgel. A próbaként szelektált nukleinsav szekvenciák megfelelő hosszúságúak és megfelelően egyértelműek kell legyenek azért, hogy a hamis pozitív eredményeket a minimálisra csökkentsük.
Az előnyben részesített régiók, melyekből a próbákat megszerkesztjük, magukba foglalják az 5' és/vagy 3' kódoló szekvenciákat, melyekről előre megmondható, hogy ligandum kötő helyeket és hasonlókat kódolnak. Például, bármely a találmányban leírt teljes hosszúságú cDNS kiónok vagy ezek fragmentjei is felhasználhatók próbaként. Előnyösen, a találmány nukleinsav próbáit megfelelő jelöléssel látjuk el, így a hibridizáció során könnyű a detektálásuk. Például egy megfelelő jelölés radioaktív jelölést jelenthet. Egy DNS fragment jelölésének egy előnyben részesített módszere a 32Pjelölésű alfa-dATP a DNS polimeráz Klenow fragmentjével való beépítése egy random primelési reakció során, amint az jól ismert a tudomány e területén. Az oligonukleotidok általában 32p-jeiölésü gamma-ATP és polinukleotid kináz végjelölést kapnak. Azonban, más módszerek is felhasználhatók a fragment • · · · ·· ···· • · · · · · · • ······ · • · ····· ·· · • · · · ··· · ·· ·· vagy az oligonukleotid jelölésére, ideértve az enzimes jelölést és a biotinilációt.
A könyvtár szkrínelése után, például alapjában véve az egész hmGluR-t kódoló szekvenciát magába foglaló DNS részlettel vagy egy az említett DNS részére alapuló oligonukleotiddal, a pozitív kiónok egy hibridizációs jel detektálása révén azonosíthatók; az azonosított kiónokat restrikciós térképezéssel és/vagy DNS szekvencia analízissel jellemezzük, majd vizsgáljuk, például a találmányban megadott szekvenciákkal való összehasonlítással, annak biztosítása céljából, hogy tartalmazzák-e a teljes hmGluR-t kódoló DNS-t (azaz vajon tartalmaznak-e tarnszlációs iniciációs és terminációs kódonokat). Ha a szelektált kiónok nem teljesek, ezek felhasználhatók ugyanezen vagy más könyvtárak újra szkrínelésére átfedő kiónok kinyerése céljából. Ha a könyvtár genom eredetű, akkor az átfedő kiónok exonokat és intronokat is magukba foglalhatnak. Ha a könyvtár cDNS könytár, akkor az átfedő kiónok egy nyílt leolvasási keretet is magába foglalnak. Mindkét esetben a teljes kiónok azonosíthatók, ha a találmányban biztosított DNS-ekkel és származtatott aminosav szekvenciákkal hasonlítjuk össze.
Továbbá, a találmány egy endogén hmGluR altípus bármilyen abnormalitásának detektálása céljából a genetikai szkrínelés elvégezhető a találmány nukleotid szekvenciáinak hibridizációs próbákként való felhasználásával. A találmányban biztosított nukleinsav szekvenciákra alapozva antisense típusú terápiás anyagok is megtervezhetők.
Előre látható, hogy a találmány nukleinsava könnyen módosítható nukleotid helyettesítéssel, nukleotid delécióval, • · · · · · ···· • · · · · · · • ······ · • · ····· · · · •··· ··· · ·· · · nukleotid inzertációval vagy egy nukleotid szakasz inverziójával, valamint ezek bármilyen kombinációjával. Az ilyen módosított szekvenciák egy mutáns hmGluR altípus előállítására használhatók, mely a természteben megtalálható receptor altípustól eltérő. A mutagenezis lehet előre megtervezett (hely-specifikus) vagy véletlenszerű. A nem néma mutációk nem helyezhetnek szekvenciákat a nyílt leolvasási kereten kívülre és előnyösen nem hoznak létre olyan komplementer régiókat, melyek úgy hibridizálódnak, hogy másodlagos mRNS szerkezeteket hoznak létre, például hurkokat vagy túkanyarokat.
A találmány natív vagy mutáns hmGluR-jét kódoló cDNS vagy genom DNS beépíthető vektorokba a további felhasználáshoz. Továbbá, a találmány vonatkozik egy olyan rekombináns DNS-re is, mely egy a fent említett DNS-ek közül legalább egyet tartalmazó hibrid vektor.
A találmány hibrid vektorjai egy replikációs origót vagy egy autonóm módon replikálódó szekvenciát tartalmaznak, egy vagy több domináns marker szekvenciát és tetszés szerint expressziós szabályozó szekvenciákat, jel szekvenciákat valamint további restrikciós helyeket.
Előnyösen a találmány hibrid vektora egy fent leírt nukleinsav inzertet tartalmaz egy expressziós szabályozó szekvenciához működőképesen kapcsolva, különösen azokhoz kapcsolva, melyek a későbbiekben kerülnek leírásra.
A vektorok tipikusan két funkciót mutatnak a kompatibilis gazdasejttel együttműködésben. Az egyik funkció a találmány hmGluR altípusát kódoló nukleinsav klónozásának elősegítése, azaz a nukleinsavból (klónozó vektorok) használható mennyiség
• · előállítása. A másik funkció egy megfelelő gazdában a gén szerkezet replikációjának és expressziójának biztosítása, akár egy extrakromoszómális elemként való fenntartásán keresztül, vagy a gazda kromoszómába való beépülésen keresztül (expressziós vektorok). Egy klónozó vektor a fent leírtak szerint tartalmazza a DNS-eket, egy replikációs origót, vagy egy autonóm módon replikálódó szekvenciát, szelektálható marker szekvenciákat és tetszés szerint jel szekvenciákat és további restrikciós helyeket. Egy expressziós vektor továbbá tartalmaz expresziós szabályozó szekvenciákat, melyek alapvető fontosságúak a találmány DNS-ének transzkripciójához és transzlációjához. így egy expressziós vektor vonatkozik egy rekombináns DNS szerkezetre is, mint például egy plazmádra, egy fágra, rekombináns vírusra vagy más vektorra, mely egy megfelelő gazdasejtbe való bejuttatás során a klónozott DNS expresszióját eredményezi. A megfelelő expressziós vektorok jól ismertek a tudomány e területén és magukba foglalják azokat, melyek eukarióta és/vagy prokarióta sejtekben replikálhatók.
A legtöbb expressziós vektor képes a szervezetek legalább egy osztályában replikálódni, azonban transzfektálhatók az expresszió céljából más organizmusba is. Például egy vektor klónozható az E. coli-ba, majd ugyanezen vektor transzfektálható egy élesztőgombába vagy emlős sejtekbe, még akkor is, ha nem képes a gazdasejt kromoszómájától függetlenül replikálódni. A DNS amplifikálható (kierősíthető) a gazda genomba való ijnzertáción keresztül is. Azonban a hmGluR-t kódoló genom DNS kinyerése sokkal komplexebb, mint az exogén módon replikálódó vektor kinyerése, mivel a restrikciós enzimes emésztés szükséges a hmGluR DNS kimetszéséhez. A DNS • · • · · · • · • · · · · • · · · · · • «· amplifikálható (kierősíthető) PCR-ral is és transzfektálható közvetlenül a gazdasejtbe bármilyen replikációs komponens nélkül is.
Előnyösen, az expressziós és klónozó vektor tartalmaz egy szelekciós gént, melyre szelektálható markerként is szoktak utalni. Ez a gén egy olyan proteint kódol, melyre egy szelektív tenyésztápközegben szaporított transzformált gazdasejtek túléléséhez vagy szaporodásához van szükség. A szelekciós gént tartalmazó vektorral nem transzformált gazdasejtek nem maradnak életben a tenyésztápközegben. A tipikus szelekciós gének olyan proteineket kódolnak, melyek antibiotikumokkal és más toxinokkal például ampicillinnel, neomicinnel, methotrexáttal vagy tetraciklinnel szembeni rezisztenciát biztosítanak, komplementer auxotrófiás hiányokkal szembeni rezisztenciát, vagy olyan kritikus tápanyagokat biztosítanak, melyek a komplex tápközegből nem nyerhetők ki.
Mivel a vektorok amplifikálását (kierősítését) rendszerint E. coli-ban végzik egy E. coli genetikai marker és egy E. coli replikációs origó előnyösen használható fel. Ezeket E. coli plazmidokból lehet kinyerni, mint például a pBR322-böl, a Bluescript vektorból, vagy egy pUC plazmidból.
Az emlős sejtekhez való megfelelő szelekciós markerek azok, melyek lehetővé teszik a hmGluR nukleinsav felvételében kompetens sejtek azonosítását, mint például a dihidrofolát reduktáz (DHFR, methotroxát rezisztencia), timidin kináz vagy a G418cal vagy higromicinnel szembeni rezisztenciát biztosító gének. Az emlős transzfektánsokat szelekciós nyomás alá helyezzük, melyekhez csupán azok az egyedüli transzfektánsok • · · · · · · • · · • · · · · · • · · · · ·· · • · · · · adaptálódnak a túléléshez, melyek felvették és expresszálják a markert.
Az expressziós és klónozó vektorok általában taralmaznak egy olyan promótert, melyet a gazda szervezet ismer fel és mely működőképesen kapcsolódik a hmGluR nukleinsavhoz. Az ilyen promóter indukálható vagy konstitúciós promóter. A promóterek működőképesen kapcsolódnak a hmGluR-t kódoló DNS-hez, úgy, hogy a promótert a forrás DNS-től restrikciós enzimes hasítással eltávolítják és az izolált promóter szekvenciát a vektorba inzertálják. Mind a natív hmGluR promóter szekvencia és számos heterológ promóter felhasználható a direkt amplifikációhoz és/vagy a hmGluR DNS expressziójához. Azonban, a heterológ promóterek részesülnek előnyben, mivel ezek általában nagyobb transzkripciót és magasabb hmGluR expressziós hozamot tesznek lehetővé a natív hmGluR promóterhez viszonyítva.
A prokarióta gazdákhoz való megfelelő promóterek közé tartoznak például a béta-laktamáz és laktóz promóter rendszerek, az alkalikus foszfatáz, a triptofán (trp) promóter rendszer és hibrid promóterek mint amilyen a tac promóter. Ezek nukleotid szekvenciáját már publikálták, így a tudomány e területén képzett szakember számára lehetővé vált, hogy ezeket a hmGluR-t kódoló DNS-hez működőképesen ligáláják, kötők vagy adaptorok felhasználásával, hogy bármilyen szükséges restrikciós helyet felhasználjanak. A bakteriális rendszerekben való alkalmazásra megfelelő promóterek általában tartalmaznak egy Shine-Delgarno szekvenciát, mely működőképesen kapcsolódik a hmGluR-t kódoló DNS-hez.
Az emlősökben vektorokból való hmGluR gén transzkripció olyan promóterekkel szabályozható, melyek a gazdasejt • ······ · • · ····· ·· · ···· ··· t ·· · · rendszerrel kompatibilisek, például vírusok genomjából származó promóterek. A találmány egy hmGluR altípusának eukarióta gazdasejtekben, különösen emlős sejtekben való expressziójához a megfelelő plazmidok például a citomegalovírus (CMV) promótert tartalmazó vektorok, RSV promótert tartalmazó vektorok és az SV40 promótert tartalmazó vektorok, valamint az MMTV LTR promótert tartalmazó vektorok. Ezek szabályozásának természetétől függően a promóter lehetnek konstitutív vagy a kísérlet körülményei által szabályozható promóterek.
Egy a találmány szerinti hmGluR altípust kódoló DNS magasabbrendü eukarióták általi transzkripciója fokozható, ha a vektorba egy erősítő szekvenciát inzertálunk.
A vektor DNS különböző DNS szegmentjei működőképesen kapcsolódnak, azaz szomszédosak és egymáshoz viszonyítva funkcionális kapcsolatban helyezkednek el.
A találmány szerinti vektorok megszerkesztésekor hagyományos ligálási technikákat alkalmazunk. Az izolált plazmidokat vagy DNS fragmenteket hasítjuk, szabjuk és abban a formában ligáijuk újra, mely a kívánt plazmid létrehozásához szükséges. Ha kívánatos, a megszerkesztett plazmidokban levő helyes szekvenciák ellenőrzéséhez a tudomány e területén ismert módszerekkel analízist végzünk. Az expressziós vektorok megszerkesztéséhez való megfelelő módszerek, az in vitro transzkriptek előállítása, a DNS gazdasejtekbe való bejuttatása, valamint a hmGluR expresszió és funkció biztosításához az analízis elvégzése a tudomány e területén jártas szakember számára ismertek. A gén jelenléte, az amplifikáció (felerősítés) és/vagy az expresszió a mintában közvetlenül mérhető például a hagyományos Southern lenyomat • · • ······ · • · ····· ·· · technikával, northern lenyomat technikával az mRNS transzkripciójának mennyiségi vizsgálatához, pont lenyomat technikával (DNS vagy RNS analízis), in situ hibridizációval, egy megfelelően jelölt próbát használva a találmány során biztosított szekvenciára alapozva, kötési vizsálattal, immunodetektálással és funkcionálási vizsgálattal. A megfelelő módszerek közé tartoznak a részletesen a példákban leírt módszerek. A tudomány e területén képzett szakemberek számára egyértelmű, hogyan lehet ezeket a módszereket szükség esetén módosítani.
A találmány a továbbiakban biztosít a találmány egy hmGluR altípusának termelésére megfelelő gazdasejteket valamint az említett altípust kódoló heterológ (idegen) DNS-t.
A találmány nukleinsavai gazdasejtek széles körében expresszálhatók, például a fent említettekben, melyeket egy megfelelő expressziós vektorral transzformáltunk vagy transzfektáltunk. A találmány receptora (vagy ennek egy része) fúziós proteinként is expresszálható. Ezután a rekombináns sejtek olyan körülmények között tenyészthetők, ahol a találmány DNS-e által kódolt protein(ek) expresszálódik(nak).
A megfelelő prokarióták közé tartoznak az eubaktériumok, mint a Gram-negatív vagy Gram-pozitív szervezetek, például az E. coli, például az E. coli Κ-12-es törzs, a DH5alfa és a HB 101 törzs vagy a Bacillusok. További, a hmGluR-t kódoló vektorokhoz való megfelelő gazdasejtek közé tartoznak az eukarióta mikrobák, mint például a fonalasgombák vagy az élesztőgombák, mint például a Saccharomyces cerevisiae. A magasabbrendü eukarióta sejtek közé tartoznak a rovar, a kétéltűek, a gerincesek sejtjei és különösen az emlős sejtek, mint például a neuroblasztoma sejtvonalak vagy a fibroblaszt eredetű sejtvonalak. Az előnyben részesített sejtvonalakra példák például a HEK 293 sejtek a CHO sejtek, a CV1 sejtek, a BHK sejtek, az L sejtek, az LLCPK-1 sejtek, a GH3 sejtek, az L sejtek és a COS sejtek. Az utóbbi években a gerinces sejtek tenyészetekben (szövettenyészet) való szaporítása rutin eljárás lett. A jelen találmányban hivatkozott gazdasejtek in vitro tenyészetben levő sejteket valamint egy gazda állatban levő sejteket foglalnak magukba.
A találmány egy aktív rekombináns hmGluR-jének expressziójára szolgáló megfelelő gazdasejtek előnyösen endogén vagy rekombináns G-proteineket expresszálnak. Előnyben részesülnek az olyan sejtek, melyek kevés endogén metabotróp glutamát receptort termelnek, vagy egyáltalán nem termelnek. A DNS a sejtekbe lehet stabilan beépített, vagy lehet a megfelelő módszerek szerint tranziensen expresszálódó.
A stabilan transzfektált emlős sejtek előállíthatok a sejtek egy olyan expressziós vektorral való transzfektálásával, melyek egy szelektálható marker génnel rendelkeznek, és a transzfektált sejteket a marker gént expresszáló sejtekre szelektív körülmények között szaporítjuk. Az átmenetileg transzfektáns sejtek előállításához az emlős sejteket egy riporter génnel transzfektáljuk a transzfekció hatékonyságának nyomonkövetése céljából.
Az ilyen stabilan vagy átmenetileg transzfektált sejtek létrehozásához a sejteket megfelelő mennyiségű hmGluR-t kódoló nukleinsavval kell transzfektálni a találmány hmGluR-jének létrehozása céljából. A hmGluR-t kódoló DNS pontos mennyiségét • · · · · · · • ······ · • ♦·♦··· «« « ···· ··· · · · ·« kísérletileg lehet meghatározni és optimalizálni egy adott sejtre és vizsgálatra.
A találmány egy DNS-e expresszálható nem-humán transzgenikus állatokban is, különösen transzgenikus melegvérű állatokban. A transzgenikus állatok, ideértve az egereket, a patkányokat, nyulakat, birkákat és sertéseket, előállítására szolgáló módszerek jól ismertek a tudomány e területén és például Hammer et al (Natúré 315, 680-683, 1985) írják le. Egy expressziós egységet, mely magába foglalja a találmány egy hmGluR-t kódoló DNS-ét egy megfelelően pozícionált expressziós szabályozó szekvenciával együtt, megtermékenyített tojások pronukleuszaiba juttatjuk be. A bejuttatás elvégezhető például mikroinjektálással. Az injektált DNS integrációját például a megfelelő szövetmintákból származó DNS lenyomat analízisével detektáljuk. Előnyben részesül, ha a bejuttatott DNS az állat ivarvonalába épül be így átkerül az állat utódaiba. Előnyösen, egy transzgenikus állatot egy mutáció megcélzásával fejlesztünk ki egy hmGluR szekvencia megzavarása céljából. Egy ilyen állat hasznos lehet például egy metabotróp receptor metabolizmusban való szerepének tanulmányozásában.
Továbbá, egy hatástalanított (=knock-out = KO) állat fejleszthető ki úgy, hogy a hmGluR szekvenciába egy mutációt juttatunk be, így egy olyan állatot hozunk létre, mely a továbbiakban nem expresszálja a funkcionális hmGluR gént. Az ilyen KO állatok hasznosak a metabotróp receptorok metabolizmusban való szerepének tanulmányozásában. A KO egerek létrehozásának módszerei ismertek a tudomány e területén.
A gazdasejteket a találmány fent leírt expressziós vagy klónozási vektoraival transzfektáljuk vagy transzformáljuk , • · • · · ·«·· • · · • · · · 99 •9999 999 • 9999 majd olyan hagyományos tenyész tápkőzegben szaporítjuk, melyet úgy módosítottunk, hogy megfelelő legyen a promóterek indukálásához, a transzformánsok szelektálásához vagy a kívánt szekvenciákat kódoló gének amplifikálásához (kierösítéséhez). A heterológ DNS a tudomány e területén jól ismert módszerekkel juttatható be a gazdasejtbe, például egy heterológ DNS-t kódoló vektorral való transzfekcióval a kálcium foszfátos koprecipitációs technikát használva, elektroporációval vagy lipofektin által közvetítve. A tudomány e területén képzett szakember számára számos transzfekciós módszer ismert. Általában a sikeres transzfekció úgy ismerhető fel, hogy a vektor működésének bármilyen indikációja megmutatkozik a gazdasejten. A transzformáció olyan standard technikákkal végezhető el, melyek az adott felhasznált gazdasejt esetében megfelelőek.
Egy klónozott DNS egy megfelelő expressziós vektorba való beépítése, eukarióta sejtek plazmid vektorral, vagy plazmid vektorokkal kombinációjával - melyek mindegyike egy vagy több egyértelmű gént kódol- vagy egy lineáris DNS-sel való transzfektálása, és a transzfektált sejtek szelekciója jól ismert módszerek a tudomány e területén (lásd például Sambrook et al . , 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press).
A transzfektált vagy transzformált sejteket a tudomány e területén jól ismert tápközeget és tenyésztési módszereket használva tenyésztjük, előnyösen olyan körülmények között, ahol a DNS által kódolt hmGluR expresszálódik. A megfelelő tápközeg összetétele a tudomány e területén képzett szakember számára • ·
ismert, így ezek könnyen előállíthatok. A megfelelő tenyésztési tápközegek a kereskedelemben is beszerezhetők.
Míg a találmányban biztosított DNS bármilyen megfelelő gazdasejtben expresszálható, például a fent hivatkozottakban, a funkcionális hmGluR-t kódoló DNS expressziójához az eukarióta expressziós rendszereket részesítjük előnyben, különösen az emlős expressziós rendszereket, ideértve a kereskedelemben beszerezhető expressziós rendszereket és más olyan rendszereket, melyek a tudomány e területén jól ismertek.
A találmány humán mGluR DNS-ét egy vektorba ligáljuk és megfelelő gazdasejtekbe juttajuk be olyan transzformált sejtvonalak létrehozása céljából, melyek a találmány egy adott hmGluR altípusát, vagy az altípusok egy specifikus kombinációját expresszálják. Ezután a kapott sejtvonal olyan mennyiségben hozható létre, mely megfelelő egy receptor agonista, antagonista vagy alloszterikus modulátor reprodukálható minőségi és mennyiségi analíziséhez. Továbbá, az mRNS létrehozható a találmány egy altípusát kódoló DNS in vitro transzkripciójával. Ez az mRNS a Xenopus oocytes-be injektálható, ahol az mRNS az aktív receptor altípus szintézisét irányítja. Másik lehetőségként az altípust kódoló DNS közvetlenül injektálható az oocitákba. Ezután a transzfektált emlős sejtek vagy az injektált oociták használhatók a továbbiakban leírt drog (gyógyszer) szkrínelési vizsgálatokban. Az ilyen gyógyszerek hasznosak a találmány hmGluR altípusainak patogenezisével kapcsolatos betegségek esetében. Az ilyen betegségek közé tartoznak a glutamát, előnyösen a hmGluR-ek által közvetített túlzott működés következtében fellépő betegségek, mint például az agyi • · • · · · katasztrófa, az epilepszia valamint a krónikus neurogeneratív betegségek. Különösen hasznosak a vegyületek specifikus hmGluR altípusokkal való specifikus kölcsönhatásának értékelésében a találmány egy hmGluR-jét expresszáló stabilan transzfektált sej tvonalak.
így a találmány hmGluR-jét expresszáló gazdasejtek hasznosak a gyógyszer szkrínelésben és a jelen találmány egy további célja egy a hmGluR aktivitást módosító vegyület vagy jel azonosítására szolgáló módszer biztosítása, az említett módszer a következőket foglalja magába: a találmány hmGluR-jét kódoló heterológ DNS-t tartalmazó sejteket - mely sejtek funkcionális hmGluR-t termelnek - kitesszük legalább egy olyan vegyület vagy jel hatásának, melyeknek az említett hmGluR aktivitását módosító képességét meg szándékozunk határozni, valamint ezután az említett módosítások által okozott változásokat az említett sejtek esetében nyomonkövetjük. Egy ilyen vizsgálat lehetővé teszi a találmány egy hmGluR-ja agonistáinak, antagonistáinak és alloszterikus modulátorainak azonosítását.
Egy további megvalósulásban a találmány egy olyan vizsgálattal kapcsolatos, melyben a találmány hmGluR altípusa aktivitását módosító vegyületeket azonosítjuk, az említett vizsgálat a következő lépésekből áll:
- a találmány egy aktív hmGluR altípusát expresszáló és az említett hmGluR altípust kódoló heterológ DNS-t tartalmazó sejteket legalább egy az említett receptor aktivitásának módosítására való képességére tesztelendő vegyülettel hozzuk érintkezésbe, és
- a sejteket a második messenger szintbeli vagy receptor aktivitásbeli eltérésre analizáljuk.
Különösen, a találmány magába foglal egy olyan vizsgálatot, melyben a találmány hmGluR altípusa aktivitását módosító vegyületeket azonosítunk, az említett vizsgálat a kővetkező lépésekből áll:
- a találmány egy aktív hmGluR altípusát expresszáló és az említett hmGluR altípust kódoló heterológ DNS-t tartalmazó sejteket legalább egy az említett receptor aktivitásának módosítására való képességére tesztelendő vegyülettel hozzuk érintkezésbe, és
- a sejteket a kapott második messenger aktivitásbeli változásokra nyomon követjük. A vizsgálatban kapott eredményeket egy negatív kontrollnak megfelelő vizsgálathoz hasonlítjuk.
A vizsgálati módszerek általában különböző kontrollokhoz való hasonlítást tesznek szükségessé. Úgy tűnik, hogy a receptor aktivitásban vagy a második messenger szintben bekövetkező változást a teszt vegyület indukálja, ha egy ilyen hatás nem kövbetkezik be a teszt vegyület hiányában. Egy teszt vegyület a találmány receptor altípusára kifejtett hatása úgy tűnik az említett receptor által közvetített hatás, ha ezt a hatást a receptort nem expresszáló sejtek esetében nem lehet megfigyelni.
A találmány szerinti használatban a találmány hmGluR altípusát módosító vegyület vagy jel egy olyan vegyületre vagy jelre utal, mely megváltoztatja az említett hmGluR altípus által közvetített válasz reakcióutat a sejten belül (az említett hmGluR hiányához viszonyítva). A válasz reakcióutat egy extracelluláris inger aktiválja, ami a második messenger koncentrációját vagy enzim aktivitását változtatja meg, vagy egy membránhoz kötött protein, mint például egy receptor vagy az ioncsatorna aktivitását változtatja meg. Számos különböző válasz reakcióiét alkalmazható, ideértve például az adenilát cikláz válasz reakcióutat, a foszfolipáz C/intracelluláris kalcium ion válasz reakcióutat vagy egy ioncsatornához való kapcsolódást. Az adenilát cikláz aktivitás meghatározására szolgáló módszerek jól ismertek a tudomány e területén és ezek közé tartoznak például a Nakajima et al. (J. Bioi. Chem. 267, 2437-2442, 1992) által leírt vizsgálat.
így a találmány hmGluR-ját expresszáló sejtek vegyületek, különösen a glutainát agonistaként vagy antagonistaként hatni képes alacsony molekulasúlyú molekulák azonosítására használhatók. Különösen az 1000 Daltonnál kisebb alacsony molekulasúlyú molekulák részesülnek előnyben. A jelen találmány szövegösszefüggésében egy agonista egy olyan molekulára utal, mely egy receptorral kölcsönhatásba képes lépni, így az Lglutamát hatását képes utánozni. Különösen, egy glutamát agonistát azon képességén keresztül jellemezzük, hogy a találmány hmGluR-jával kapcsolatba lép és így a sejten belül egy válasz reakcióút stimulálását fokozza vagy csökkenti. Például, egy agonista a gazdasejten belül egy mérhető paramétert növel vagy csökkent, ilyen paraméter lehet például a második messenger koncentrációja, ahogy a természetes ligandum csökkenti vagy növeli az említett paramétert. Például, egy megfelelő teszt rendszerben, ahol a találmány hmGluR-je negatívan kapcsolódik az adenilát ciklázhoz, például a találmány egy hmGluR-jét expresszáló CHO vagy BHK sejtek, mint • · • · · · · · · • ······ · • ······ ·· ' • ··· ··· · ·· ·· például egy agonista képes az említett hmGluR funkciójának olyan módosítására, hogy a cAMP intracelluláris koncentrációja csökken.
Ezzel szemben, az olyan esetekben, amikor kívánatos a hmGluR aktivitásának csökkentése, antagonizáló molekulák lehetnek hasznosak. A jelen találmány szövegösszefüggésében egy antagonistán egy olyan molekulát értünk, mely képes egy receptorral vagy az L-glutamáttal kölcsönhatásba lépni, de ami nem stimulál egy válasz reakcióutat a sejten belül. Különösen, a glutamát antagonistákat azon képességük révén azonosítjuk, hogy a találmány egy hmGluR-jával képesek-e kölcsönhatásba lépni és így a temészetes ligandum sejten belüli válasz reakcióútjának stimulálási képességét csökkenteni, például beleavatkozik az L-glutamát a találmány egy hmGluR-jéhez való kötődésébe, vagy gátolja a hmGluR aktivitásához szükséges más celluláris funkciót. Például egy megfelelő vizsgálatban, például egy a találmány hmGluR altípusát expresszáló CHO vagy BHK sejteket magába foglaló vizsgálatban, egy glutamát antagonista a találmány egy hmGluR-je aktivitásának módosítására képes oly módon, hogy a természetes ligandum intracelluáris cAMP koncentrációjának csökkentési képességét gyöngíti. Egy az antagonista hatás elérésnek másik módja az antisense hmGluR RNS túlexpressziójára való hagyatkozás.
Előnyben az agonista vagy antagonista részesül, mely szelektíven hat a hmGluR4 alcsalád egy receptorára, például a hmGluR4-re, a hmGluR6-ra vagy a hmGluR7-re. Különösen egy olyan agonista vagy antagonista hasznos, mely specifikusan módosítja egy adott hmGluR altípus aktivitását, anélkül, hogy bármely más altípus aktivitására hatással lenne.
• * · · • · · · · • · ·♦ · · • ···«·· ·
A találmány egy hmGluR-jának alloszterikus modulátora az L-glutamáttói eltérő helyen levő receptor proteinnel lép kölcsönhatásba, így agonistaként vagy antagonistaként hat. Ezért az itt leírt szkrínelési eljárás megfelelő eljárás a találmány egy receptora alloszterikus modulátorának detektálására is. Például egy agonistaként ható alloszterikus modulátor fokozhatja a találmány egy hmGluR-je és az L-glutamát közötti specifikus kölcsönhatást is. Ha egy alloszterikus modulátor antagonistaként hat, akkor az, például a receptor proteinnel oly módon léphet kölcsönhatásba, hogy az agonista kötődése funkcionálisan kevésbé lesz hatékony.
Egy glutamát agonista vagy antagonista utáni in vitro vizsgálat szükségessé teheti, hogy a találmány egy hmGluR-je megfelelő mennyiségben termelődjön működőképes formában, rekombináns DNS módszereket használva. Egy olyan vizsgálatot tervezünk ezután, mellyel a hmGluR protein egy funkcionális tulajdonságát mérjük, például egy glutaterg ligandummal való kölcsönhatást. A találmány egy hmGluR-jenek termelésére úgy tekintjük, hogy akkor fordul elő megfelelő mennyiségben, ha az említett receptor aktivitása mérhető választ eredményez.
Például, az emlős sejteket, mint például a HEK293 sejtek, az L sejtek, a CH0-K1 sejtek, az LLCPK-1 sejtek vagy a GH3 sejtek (melyek az American Type Culture Collection-töl beszerezhetők) glutamát csökkentett, előnyösen glutamát-mentes tápközegben való szaporodáshoz adoptáljuk. Egy hmGluR expressziós plazmidot, például egy a példákban leírt plazmidot átmenetileg sejtekbe transzfektáljuk , például kálcium foszfátos precipitációval (Ausubel, F.M. et al. , 1993, Current Protocols in Molecular Biology, Greene and Wiley, USA). A • · · · találmány egy hmGluR-jét stabilan expresszáló sejtvonalak hozhatók létre például lipofektin által közvetített transzfekcióval, hmGluR expressziós plazmidokkal és egy szelektálható marker gént, például a pSV2-Neo plazmidot (Southern and Berg, J. Mól. Appl. Génét. 1, 327-341, 1982) ami a G-418 rezisztencia gént kódoló plazmid vektor tartalmazó plazmiddal. A szelekciót túlélő sejtekek izoláljuk és szelekciós tápközegben szaporítjuk. A rezisztens klónozott sejtvonalat analizáljuk például az altípus-specifikus hmGluR antitestekkel szembeni immunoreaktivitásra vagy az agonista hozzáadását követő hmGluR funkcionális válaszok utáni vizsgálatokkal. A kívánt hmGluR altípust termelő sejteket a találmány hmGluR-jéhez kötődő vegyületek detektálására szolgáló módszerben, vagy egy glutamát agonista vagy antagonista azonosítására szolgáló módszerben használjuk.
Egy további megvalósulásban, a találmány egy hmGluR altípushoz kötődő vegyületek azonosítására szolgáló módszert biztosít, mely módszer a következőket foglalja magába: a találmány egy hmGluR altípusát alkalmazzuk egy kompetíciós kötődési vizsgálatban. A kompetíciós kötődési vizsgálat elvi alapjai általánosságban ismertek a tudomány e területén. Röviden, a találmány szerinti kötődési vizsgálatot úgy végezzük el, hogy a hmGluR kötési képességre teszteledő vegyületet egy ismert megfelelően jelölt glutamaterg ligandummal versenyeztetjük a hmGluR célmolekula kötési helyénél. Egy megfelelően jelölt ligandum például egy radioaktívan jelölt ligandum, mint például a [3H]glutamát vagy egy az optikai tulajdonságai miatt detektálható ligandum, mint például az abszorbancia vagy fluoreszcvencia miatt detektálható. A nem ·· ···· kötött ligandum és a teszt vegyület eltávolítása után a hmGluRhez kötődő jelölt ligandum mennyiségét mérjük. Ha a jelölt ligandum mennyisége csökken a teszt vegyület jelenlétében, akkor azt módjuk, hogy ez a vegyület a célmolekulához kötődik. Egy kompetíciós kötődéi vizsgálat elvégezhető például a találmány hmGluR-jét, vagy a találmány hmGluR-jét tartalmazó membránszerü celluláris frakcióját expresszáló transzformált vagy transzfektált gazdasejtekkel.
A cél hmGluR-hez kötődő vegyület módosíthatja a hmGluR funkcionális tulajdonságait és így glutamát agonistaként vagy antagonistaként azonosítható egy funkcionális vizsgálatban.
A funkcionális vizsgálatokat a találmány hmGluR funkcionális aktivitásában bekövetkező változások detektálására használjuk, azaz egy funkcionális válasz detektálására, ami például az említett hmGluR és a tesztelendő vegyület kölcsönhatásának eredménye. Egy funkcionális válasz, például egy idevonatkozó második messenger koncentrációjában bekövetkező (eltérés) változás, vagy egy másik membránhoz kötött protein aktivitásában bekövetkező változás, melyet a találmány receptora befolyásol azokon a sejteken belül, amelyek a találmány funkcionális hmGluR-jét expresszálják (egy negatív kontrolihoz viszonyítva). A tudomány e területén képzett szakember számára könnyen megállapítható egy az aktív hmGluR expresszióját jelző intracelluláris második messenger szintjében bekövetkező változás detektálására szolgáló megfelelő módszer. A példák közé tartoznak a cAMP vizsgálatok (lásd például Nakajima et al., J. Bioi. Chem. 267, 2437-2442, 1992), a cGMP vizsgálatok (lásd például Steiner et al., J. Bioi. Chem. 247, 1106-1113, 1972), a foszfatidil inozitol (Pl) • · • · · · · · · • ······ · • ······ · · · ·♦·· ··· · ·· ·· átfordulás! vizsgálatok (Nakajima et al., J. Bioi. Chem. 267, 2437-2442), a kalcium ion flux vizsgálatok (Ito et al., J. Neurochem. 56, 531-540, 1991), az arachidonsav felszabadulási vizsgálatok (lásd például Felder et al., J. Bioi. Chem. 264, 20356-20362, 1989) és más hasonló vizsgálatok.
Még specifikusabban, a találmány szerint egy glutamát agonista detektálására szolgáló módszer a következő lépésekből áll: (a) egy vegyületet egy válasz reakcióúthoz kapcsolódó, a találmány hmGluR altípusa hatásának teszünk ki, olyan körülmények között és annyi ideig, mely lehetővé teszi a vegyület receptorral való kölcsönhatását és egy kapcsolódó válasz kiváltását a reakcióúton keresztül, (b) a válasz reakcióút stimulálásában a vegyület és a hmGluR altípus kölcsönhatásának eredményeként bekövetkező növekedést vagy csökkenést - a tesztelt vegyület hiányához viszonyítva detektáljuk, és ebből meghatározzuk a glutamát agonista jelenlétét.
A találmány szerint egy glutamát agonista detektálására szolgáló módszer a következő lépésekből áll: (a) egy vegyületet egy válasz reakcióúthoz kapcsolódó, a találmány hmGluR altípusa hatásának teszünk ki egy ismert glutamát agonista jelenlétében, olyan körülmények között és annyi ideig, mely lehetővé teszi az agonista receptorral való kölcsönhatását és egy kapcsolódó válasz kiváltását a reakcióúton keresztül, (b) a válasz reakcióút stimulálásában a vegyület és a hmGluR altípus kölcsönhatásának eredményeként bekövetkező, az agonista által kiváltott gátlást - csak a glutamát agonista válasz reakcióútjának stimulálásához viszonyítva - detektáljuk, és ebből meghatározzuk a glutamát antagonista jelenlétét. A gátlás • · · · · · ···· • · · · · · · • ······ · • ······ · · · ···· ··· · ·· · t detektálható például, ha a teszt vegyület a találmány hmGluRjéért versenyez a glutamát agonistával. Azok a vegyületek melyek az ilyen módszerek felhasználásával szkrínelhetők például a hmGluR3 altípushoz specifikusan kötődő blokkoló antitestek. Továbbá, egy ilyen vizsgálat hasznos az Lglutamáttal, például a ligandum kötő dómén egy részét vagy egészét tartalmazó oldható hmGluR fragmentekekkel kölcsönhatásba lépő vegyületek szkrínelésében.
Előnyösen, egy agonista vagy antagonista a találmány hmGluR-jával való kölcsönhatása az agonista vagy antagonista az említett hmGluR-hez való kötődését jelzi.
A találmány szerinti alkalmazásban egy glutamát agonista vagy antagonista jelölt receptorral való megfelelő körülmények közötti és ideig tartó kölcsönhatása a receptor forrásától függően változik, azonban, általában a kötődéshez megfelelő körülmények 4 - 40 C° hőmérséklet között találhatók, előnyösen 4-37 C° hőmérséklet között, 0 - 2 M NaCl érték közötti puffer oldatban, előnyösen 0 és 0,9 M NaCl értékek között, legelőnyösebben 0,1 M NaCl értéknél, és a pH tartomány 5 és 9 értékek közötti, előnyösen 6,5 és 8 érték közötti. A kötődéshez a megfelelő kitettségi időtartam általában körülbelül 1 perc és 24 óra között található.
A találmány egy megvalósulásában a válasz reakcióút egy membrán-kötött adenilát cikláz reakcióút, és egy agonista esetében a detektálási lépés a membránhoz kötött adenilát cikláz reakcióút általi cAMP termelésben bekövetkező csökkenés vagy növekedés, előnyösen csökkenés mérését jelenti, a megfelelő kontroll felállás cAMP termeléséhez viszonyítva. A jelen találmány céljaihoz előnyben részesül ha a cAMP • · · · · · · • ······ · • ··«··· ·· · termelésbeli csökkenés vagy növekedés azonos vagy nagyobb, mint az IC50 koncentrációnak megfelelő koncentrációban alkalmazott L-glutamát által indukált csökkenés vagy növekedés. Az antagonista esetében a detektálás a membránhoz kötött adenilát cikláz válasz reakcióút általi és egy kisebb L-glutamát által indukált cAMP termelésben bekövetkező csökkenés vagy növekedés mérését jelenti, az antagonista hiányában bekövetkező cAMP termeléshez viszonyítva. A cAMP mérése elvégezhető a sejt roncsolás után vagy egy a sejtekhez adott cAMP érzékeny molekuláris próbával, mint például egy fluoreszcensz festék hozzáadásával, mely megváltoztatja tulajdonságait, például a cAMP kötődésekor fluoreszcensz tulajdonságait.
A ciklikus AMP termelés a tudomány e területén jól ismert módszerek felhasználásával mérhető, ideértve például a Nakajima és munkatársai által supra leírt módszerekkel, vagy a kereskedelemben beszerezhető kitekkel, például radioaktív jelölésű cAMP-t tartalmazó kitekkel, például [125j]CAMP-t vagy [^HjcAMP-t tartalmazó kitekkel. Ilyen kitekre példák a Scintillation Proximity Assay Kit (Amersham), ami a cAMP termelést a jódozott cAMP cAMP antitestekkel való versengésének mérésével határozza meg, vagy a Cyclic AMP pH] Assay Kit (Amersham).
Az adenilát cikláz reakcióúthoz negatívan kötődő receptor altípusokat - azaz stimulálás esetében a cAMP csökkenését okozza, és a stimulálás csökkentésekor a cAMP növekedését okozza - expresszáló sejteket felhasználó vizsgálati rendszerekben, előnyben részesül, ha a sejteket a (feltételezett) receptor agonista vagy antagoniusta hozzáadása előtt egy olyan vegyület hatásának tesszük ki, mely az adenilát • · · • · · · · • · · · ciklázt, például a forskolint reverzibilisen vagy irreverzibilisen stimulálja, vagy ami egy foszfodiészteráz inhibitor, mint például az izobutil-metil-xantin (IBMX).
A találmány egy másik megvalósulásában a válasz reakcióút a Pl hidrolízis/Ca2+ mobilizációs reakcióút. Egy ilyen a teszt vegyület a találmány egy hmGluR altípusával való specifikus kölcsönhatásának meghatározására szolgáló vizsgálat funkcionálisan kapcsolódhat az intracelluláris kalcium ion (Ca2+) koncentrációk változásaihoz. Számos módszer ismert a tudomány e területén a Ca2+ intracelluláris koncentrációjában bekövetkező változások meghatározására, például egy olyan módszer, mely magába foglalja egy kalcium ion érzékeny fluoreszcensz festék, mint a fura-2 (lásd Grynkiewisz et al., J. Bioi. Chem. 260, 3440-3450, 1985), a fluo-3 vagy az Indo-1, mint a Charest et al (J. Bioi. Chem. 259, 8679-8773, 1993) által leírt kalcium fluor QuinZ módszert, vagy a NakajimaShimada (proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88. 6878-6882 , 1991) által leírt aequorin fotoprotein módszet. A találmány egy megvalósulásában az intracelluáris kalcium ion koncentrációt mikrofluorometriával mérjük fluo-3 vagy fura-2 kalcium érzékeny fluoreszcensz festékekkel terhelt rekombináns sejtekben. Ezeket a méréseket fedőlemezen szaporított sejteket használva végezzük el, lehetővé téve egy inverz mikroszkóp és video-megjelenítéses technológiák vagy egy fluoreszcensz fotométer felhasználását az egyedüli sejt szinten való kalcium koncentrációk mérésére. Mindkét megközelítéshez a hmGluR-t expresszáló plazmiddal transzformált sejteket kalcium indukátorral kell terhelni. Ehhez, a tenyésztápközeget eltávolítjuk a sejtekről és fura-2-ot vagy fluo-3-at tartalmazó • · · oldattal helyettesítjük. A sejteket a kálciumos mérésekhez előnyösen a kővetkező 8 óra során felhasználjuk. A mikrofluorometria során standard eljárásokat használunk.
A vegyület célmolekulával való funkcionális kölcsönhatásából adódó Ca2 + jelek átmenetiek lehetnek, ha a vegyületet egy korlátozott ideig alkalmazzuk, például egy prefúziós rendszeren keresztül. Tranziens alkalmazást használva ugyanazokkal a sejtekkel számos mérés végezhető el, ez belső szabályozást és nagyobb számú tesztelt vegyületet jelent.
A találmány egy hmGluR-jének Ca2 + jelzéshez való funkcionális kapcsolása különböző módszerekkel érhető el, például CHO sejtekben:
(i) a találmány egy rekombináns hmGluR-jének és egy rekombináns feszültség-kivezetésü kation csatornával való koexpressziója, melynek aktivitása funkcionálisan kapcsolódik a hmGluR aktivitásához;
(ii) egy kiméra hmGluR receptor expressziója, mely közvetlenül stimulálja a PI/Ca2+ reakcióutat;
(iii) a találmány egy rekombináns hmGluR-jének egy rekombináns Ca2+-permeábilis cAMP függő kation csatornával való koexpressziój a.
Más expressziós rendszerekben egy hmGluR Ca2+ jelzéshez való funkcionális kapcsolása elérhető a találmány egy hmGluRjének transzfekciójával, ha ezek a sejtek természtes körülmények között (i) expresszálják a feszültség kivezetésű Ca csatornákat, melyek aktivitása funkcionálisan kapcsolódik az mGluR-ek aktivitásához vagy ha (ii) Ca2+-permeábilis cAMP függő ioncsatornákat expresszálnak. Például, a természetes körülmények között feszültség-kivezetésü Ca csatornákat ·* · · ·· ···· • · · · · · · • ······ · • · ····· · · · ···· ··· · ·· · a expresszáló CH3 sejtek közvetlenül lehetővé teszik a Ca2 + vizsgálatok alkalmazását a hmGluR funkcionális aktivitás hmGluR-ek kotranszfektálásával történő tesztelésére.
További sejt alapú szkrínelési vizsgálatok tervezhetők például olyan sejtvonalak megszerkesztésével, melyekben egy riporter protein azaz egy könnyen vizsgálható protein, mint amilyen a beta-galaktozidáz, kloramfenikol acetiltranszferáz (CAT) vagy a luciferáz expressziója a találmány egy hmGluRjének funkciójától függ. Például egy cAMP válasz elemet tartalmazó DNS szerkezet működőképesen kapcsolódik a luciferázt kódoló DNS-hez. Az enzim DNS-t tartalmazó kapott DNS szerkezet stabilan transzfektálható a gazdasejtbe. Ezután a gazdasejtet egy a találmány hmGluR-jét kódoló első DNS szegmentet tartalmazó második DNS szerkezettel transzfektáljuk, mely működőképesen kapcsolódik további a receptor expressziójához szükséges DNS szegmentekhez. Például, ha egy teszt vegyület a találmány hmGluR-jéhez való kötődése emelkedett cAMP szinteket eredményez a luciferáz expressziója indukálódik vagy csökken a választott promótertől függően. A luciferázt luciferin hatásának tesszük ki, és a luciferin luciferáz általi oxidációja során kibocsátott fotonokat mérjük.
A találmányban biztosított gyógyszer szkrínelési vizsgálatok lehetővé teszik a receptor altípus-specifikus vegyületek azonosítását és megtervezését, különösen a receptor proteinhez kapcsolódó ligandumokét, ez végül egy betegségspecifikus gyógyszer kifejlesztéséhez vezet. Ha csak egy adott hmGluR altípussal való nagyon specifikus kölcsönhatáshoz tervezzük (vagy egy hmGluR altípus előre meghatározott szelekciójához) az ilyen gyógyszer legnagyobb valószínűséggel ·· · · ·· ···· • · · · · · • ······ · • · ····· «· · ··· ··· · «· kevesebb nem kívánatos mellékhatást fog mutatni, mint egy olyan gyógyszer, melyet olyan sejtek szkrínelésével azonosítottunk, melyek (ismeretlen) receptor altípusokat expresszálnak. A találmány egy egyedüli receptor altípusának tesztelése, vagy különböző receptor altípusok specifikus kombinációinak számos potenciális agonistával vagy antagonistával való tesztelése további információkat szolgáltat az egyes altípusok funkcióját illetve aktivitását illetően és ez olyan vegyületek azonosításához és tervezéséhez kell vezessen, melyek egy vagy több altípussal való nagyon specifikus kölcsönhatásra képesek.
A találmány egy másik megvalósulásában a találmány egy hmGluR altípusával szembeni poliklonális és monoklonális antitesteket biztosítunk. Az ilyen antitestek hasznosak lehetnek például az immunohisztokémiát, valamint a diagnosztikai és terápiás alkalmazásokat is magába foglaló immunovizsgálatok során. Például, egy adott hmGluR altípus extracelluláris dóménjével, vagy annak részeivel szemben specifikus antitestek felhasználhatók az endogén hmGluR altípusok blokkolására.
A találmány antitestjei a tudomány e területén jól ismert módszerekkel előállíthatok antigénként a találmány egy hmGluR3 altípusát vagy ennek egy fragmentjét használva, vagy egy az adott altípus vagy fragment által expresszált sejtet használva. Az antigén a találmány receptorának aktív vagy inaktív formáját képviselheti. Az antitestek képesek lehetnek az aktív és az inaktív forma közötti különbségtételre. Az antigénként szolgáló altípus fragmentek (akár szintetikus peptid, vagy fúziós protein) szelektálásakor figyelembe veendő tényezők közé taroznak az antigenitás, az elérhetőség, (azaz extracelluláris és citoplazmás domének) és az a tény, hogy az adott altípussal szemben egyedülállóak-e.
Különösen hasznosak azok az antitestek, melyek szelektíven ismerik fel és kötik a fent leírt alcsalád receptor altípusait, anélkül, hogy egy másik alcsalád altípusához kötődnének, valamint olyan antitestek, melyek szelektíven ismerik fel és kötődnek egy adott altípushoz, anélkül, hogy bármely másikhoz kötődnének.
A találmány antitestjei standard módszerekkel egy erre rászoruló alanynak adhatók. A tudomány e területén képzett szakember könnyen meghatározhatja a dózis formákat, a kezelési előírást, stb. az alkalmazott kezelés módjától függően.
A találmány különösen a példákban leírt specifikus megvalósulásokra vonatkozik, mely példák a jelen találmány illusztrálását szolgálják és nem tekinthetők a találmány korlátozásának.
Rövidítések: hmGluR = humán metabotróp glutamát receptor, nt = nukleotid
1. példa: hmGluR4-et kódoló cDNS
A humán mGluR4 cDNS kiónokat humán magzati agy és humán cerebellum cDNS könyvtárakból izoláljuk alacsony szigorúságú hibridizációs körülmények között patkány agy cDNS-ből PCR-ral létrehozott radioaktív jelölésű patkány mGluR4 próbát használva.
1.1 Poli(A)+ RNS előállítása patkány eloagyból
Felnőtt hím Sprague-Dawley patkányokat fullasztással elpusztítunk, előagyukat eltávolítjuk és azonnal folyékony nitrogénben lefagyasztjuk. A teljes RNS-t guanidin tiocianátos eljárással (Chomczynski and Sacchi (1987), Anal. Biochem. 162, 156-159) izoláljuk. A poli(A)+ RNS dúsítását oligo(dT)cellulózon standard eljárásoknak megfelelően végzett (Sambrook, J. Fritsch, E.F. and Maniatis, T. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd edition), Cold Spring Habroe Laboratory Press, Cold Spring Harbor, USA) affinitás kromatografiával érjük el.
1.2 A cDNS első szálának szintézise PCR-hoz
A poli(A)+ RNS-t (mRNS) reverz transzkripcióval DNS-sé alakítjuk Moloney Murine Leukémia Vírus Reverse Transcriptasezal (M-MLV RT, BRL). Az 50 μΐ mennysiégben zajló reakciók a következők: 10 μΐ steril vízben levő 10 μg patkány előagy poli(A)+ RNS-t 70 C° hőmérsékletre hevítünk 10 percig majd gyorsan lehűtjük jégen. Ezután 10 μΐ 5x 250 mM Tris-HCl-t (pH 8,3), 375 mM KCl-t, 15 mM MgC12őt tartalmazó reakció puffért, 5 μΐ 0,1 M ditiotreitolt, 5 μΐ kevert dNTP-t (10 mM a dATP-ből, a dCTP-ből a dGTP-ből, a dTTP-ből, Pharmacia), 1,25 μΐ 2 mg/ml koncentrációjú oligo-dT]_2 _ ig (Pharmacia), 2,5 μΐ 40 U/μΙ koncentrációjú RNazint, 12,25 μΐ steril vizet és 4 μΐ 200 U/μΙ koncentrációjú M-MLV RT-t adunk a reakcióelegyhez. A reakció 37 C° hőmérsékleten játszódik le 60 perc alatt.
• ·
1.3 PCR körülmények a patkány mGluR4 fragment létrehozásához
A PCR-hoz használt oligonukleotid primereket a foszforamidit módszerrel szintetizáljuk. A szekvenciákat az 1. táblázatban soroljuk fel.
1. táblázat
Pl: 5'-GTCAAGGCCTCGGGCCGGGA-3' ez megfelel a patkány mGluR4 cDNS 1921-1940 bázispárjainak (Tanabe et al., (1992), Neuron 8, 169-179)
P2: 5'-CTAGATGGCATGGTTGGTGTA-3' ez megfelel a patkány mGluR4 cDNS 2788-2808 bázispárjainak (Tanabe et al., (1992), Neuron 8, 169-179)
100 μΐ reakcióelegyhez a standard PCR körülmények a következők: 30 ng patkány előagy cDNS, 50 pmol a Pl és P2 primerekből, 200 μιηοΐ a négy dezoxinukleotid trifoszfátok bármelyikéből (dATP, dCTP, dGTP, dTTP), 10% PCR pufferben (10 mM Tris-HCl, pH8,3, 1,5 mM MgCl2, 50 mM KC1, 10 mM betamerkaptoetanol, 0,05% Tween (súly/térfogat) 0,05% NP-40 (s/t) és 0,5 U AmpliTaq Polimeráz (Perkin Elmer Cetus)levő DMSO. Az amplifikálást a következő körülményeket használva hajtjuk végre: 30 másodperc 93 C° hőmérsékleten való denaturálás, 1,5 perc 56 C° hőmérsékleten való anneálás (primer beégetés) és 3 perc 72 C° hőmérsékleten való extenzió (lánchosszabbítás) összesen 40 cikluson keresztül. A kezdeti denaturálást 4 percig 94 C° hőmérsékleten végezzük.
1.4 A patkány mGluR4 PCR fragment szubklónozása
A restrikciós endonukleázos emésztést, a módosító enzimeket, a vektor előállítást (defoszforiláció, géltisztítás), a ligálást, az E. coli transzformálását és a plazmád DNS előállítást standard eljárásoknak (Sambrook et al., 1989, supra) megfelelően végezzük el.
Az 1.3 pontban leírt módszer szerint nyert 888 bázispár hosszúságú PCR fragmentet a Bluescript SK+ plazmid (Stratagene, La Jolla, USA) Smal helyére ligáljuk. A Bluescript vektorba inzertált fragmentet mindkét végén szekvenáljuk T7 és T3 (Stratagene, La Jolla, USA) primereket használva.
1.5 Egy radioaktív jelölésű próba előállítása
20-50 ng PCR-ral létrehozott patkány mGluR4 fragmentet géltisztítunk majd 22P-jelöljük egy DNS Jelölő Kitet (Boehringer Mannheim) használó random primeléssel.
1.6. cDNS könyvtár szkrínelés
Humán magzati agy könyvtárból (lambdaZAPII, Stratagen, La
Jolla, USA), humán hippocampus könyvtárból (lambdaZAP,
Stratagene, La Jolla, USA) és humán cerebellum cDNS könyvtárból (lambdaZAP, STrategene) származó körülbelül 1 x 106 fágot szkrínelünk a patkány mGluR4 fragmenthez való hibridizációhoz.
A hibridizáció 5 x SSC (s/t), Ficoll (400-as Típus), 0,02% (s/t) polivinilpirrolidon, 0,1% (s/t) SDS, 50 ^g/ml hering testis DNS elegyében hajtjuk végre. Az előhibridizációt 30 perc • · ···· és 3 óra közötti időtartamig végezzük 58 C° hőmérsékleten. A hibridizáció alacsony szigorúsági körülmények mellett megy végbe 58 C° hőmérsékleten egy éjszakán keresztül 1-3 x 105 cpm/ml koncentrációban levő 32P-jelölésű fragmentet tartalmazó ugyanilyen oldatban. A mosásokat háromszor végezzük egyenként 20 percig 58 C° hőmérsékleten 2 x SSC/0,1% SDS elegyében.
A patkány mGluR4 próbához hibridizálódó fágokat egy második és harmadik szkrínelési menettel tisztítjuk a fent leírt körülmények között. A tisztított fágokban található cDNS inzerteket in vivő kimetszéssel nyerjük ki ExAssist/SOLR rendszert (Stratagene, La Jolla, USA) használva.
1.7 Az izolált cDNS kiónok jellemezése
Restrikciós enzimes térképezéssel és DNS szekvencia analízissel számos cDNS inzertet jellemzünk. Ezek kiónok egyike a cDNS cmR20 (melyet humán cerebellum könyvtárból izoláltunk) megközelítően 3,3 kb hosszúságú inzertet tartalmaz. A cmR20 szekvencia analízise azt mutatja, hogy a humán mGluR4 szinte egész kódoló régióját tartalmazza, beleértve a transzlációs terminációs kódont is (nt 158-2739, vesd ősze az 1. számú szekvenciával), valamint megközelítően a 3' nem transziáit régió 750 nukleotidját. A transzlációs start kódont is tartalmazó 5'-vég hiányzik.
1.8 A humán mGluR4 5'-végének izolálása
A humán mGluR4 kódoló régiójának teljessé tételéhez a POR reakciókat templátként humán genom DNS-t vagy a humán agy RNS • · első szál cDNS-ét használva hajtjuk végre. A sense primer P3 megfelel a patkány mGluR4 cDNS 5'-végének, az antisense P4 primer a patkány mGluR4 cDNS 440-459 nukleotidjainak.
2. táblázat
P3: 51 -GCGGTGCAGGCGGCCGCAGGGCCTGCTAGGGCTAGGAGCGGGGC- 3' megfelel a patkány mGluR4 cDNS 11-37 nukleotidjának (Tanabe et al., (1992), Neuron, 8, 169-179)
P4: 5'-GCGGAATTCCCTCCGTGCCGTCCTTCTCG-3' megfelel a patkány mGluR4 cDNS 440-459 nukleotidjának (Tanabe et al., (1992), Neuron, 8, 169-179)
A. hozzáadott szekvenciákat aláhúzással, a restrikciós enzimekhez való helyeket vastag betűvel jelöljük
100 μΐ reakció elegyhez a PCR reakció a következőket tartalmazza: PCR pufferben (10 mM Tris-HCl, pH8,3, 1,5 mM
MgC12, 50 mM KC1 és 2 U AmpliTaq Polimeráz) levő 400 ng humán genom DNS, 1 μΜ az egyes printerekből, 2 mM az egyes dezoxinukleotid trifoszfátokból (dATP, dCTP, dGTP és dTTP). Az amplifikálást (kierösítést) a következő körülményeket használva hajtjuk végre: 1 perces 95 C° hőmérsékleten való denaturálás, 1 perces 56 C° hőmérsékleten végzett anneálás (primer beégetés), és 1 perces 72 C° hőmérsékleten végzett extenzió (lánchosszabbítás) 32 cikluson keresztül. A kezdeti denaturáció 3 percig tart 94 C° hőmérsékleten.
A különböző egymástól független PCR-ok termékeit a PstI és EcoRI restrikciós enzimekkel emésztjük, géltisztítjuk és a pBluescript SK (Stratagene) Pstl/EcoRI helyeire ligáljuk. A • · · · • · · · * • · · · · · · • ····· ·· · ··· ♦ ·· ·· különböző egymástól független PCR-ok szubklónozott fragmentjeit DNS szekvencia analízissel (cR4PCRl-4) analizáljuk. A szekvencia analízis felfedi, hogy a CR4PCR2 klón a hmGluR4 transzlációs iniciációs kódont (1-380 nt, vesd össze az 1. számú szekvenciával) is magába foglaló kódoló régiójának 380 nukleotidját kódolja. A cR4PCR2 átfedésben van a 3' végen 223 nt-dal a cmR20-szal.
A hmGluR4 protein teljes származtatott aminosav szekvenciáját a 2. számú szekvencia mutatja.
2. példa: A hmGluR7-et kódoló cDNS kiónok
A humán magzati agy és humán cerebellum cDNS könyvtárakat alacsony szigorúságú körülmények között végzett hibridizációval szkríneljük, melynek során radioaktív jelölésű patkány mGluR4 fragmentet használunk (ahogy azt az 1.5 és 1.6 pontokban leírtuk) ez lehetővé teszi olyan cDNS kiónok izolálását, melyek az mGluR7 altípusú humán metabotróp glutamát receptorokat azonosítják. A cDNS kiónok DNS szekvencia analízissel végzett jellemzése felfedi, hogy az izolált cDNS-ek a humán mGluR7 mRNS legalább két egyértelmű hasítási variánsát képviselik.
A humán magzati agy cDNS könyvtárból izolált cDNS cmR2 3804 nt méretű. A cmR2 klón a hmGluR7 transzlációs terminációs kódont is magába foglaló kódoló szekvencia 2604 nt-ját tartalmazza, melyet a 3' nem transziáit szekvencia 1200 nt-ja követ.
A humán hippocampus cDNS könyvtárból izolált cDNS cmR3 1399 nt méretű (5. számú szekvencia). A cmR3 klón a hmGluR7 transzlációs terminációs stop kódont (a származtatott aminosav • · szekvencia a 6. számú szekvenciában kerül bemutatásra) is magába foglaló 3' vég kódoló régió 270 nt-ját tartalmazza, melyet a 3' nem transziáit szekvencia 1129 nt-ja követ. A cmR3 szekvenciája teljes mértékben megtalálható a cmR2-ben, azonban a cmR2-től 92 nukleotidban különbözik, melyek a 3. számú szekvencia 2534 nt pozíciójától a 2625 nt pozícióig találhatók. A hmGluR7 ezen egyértelmű hasítási variánsa a származtatott hmGluR7 aminosav szekvencia eltérő 3' végét hozza létre.
A humán magzati agy cDNS könyvtárból izolált cDNS cmR5 1588 nt méretű (7. számú szekvencia). A cDNS cmR5 1424 nt-dal átfedésben van a cDNS cmR2-vel. Ez a 3' végnél pontosan a cmR2/cmR3 92 nt inzertációs/deléciós pozíciónál különbözik. A cmR5 további 164 nukleotidja vagy intron szekvenciákat kódol, ahogy azt egy konzervált hasítási donor szekvencia jelenléte jelzi, mely közvetlenül a cmR5 és cmR3 szekvencia eltérések helyeit követi, vagy egy harmadik hasítási variánst képvisel.
A cDNS cmR2, cmR3 és cmR5 kiónokból hiányzó hmGluR7 5' kódoló régiót a genom könyvtár szkrínelés és PCR technika kombinálásával izoláljuk. Egy Lambda-Fix genom könyvtárat (Stratagene) egy EcoRI/Smal restrikciós fragmenttel szkríneljük, mely a cDNS cmR2 1-1304 nt-jait tartalmazza, erősen szigorú hibridizációs körülmények között Sambrook leírásának megfelelően (1989, supra). A cDNS cmR2 klón 5' végéhez hibridizálódó lambda kiónokat tisztítjuk és restrikciós analízissel analizáljuk, majd DNS szekvenálásnak vetjük alá. Az ATG transzlációs iniciációs kódont is magába foglaló humán mGluR7 kódoló régiójának teljes 5' végét PCR-ral amplifikáljuk (kierösítjük) a humán agy cDNS-böl a klónozott genom fragmentekből származó primer szekvenciák felhasználásával. A • · · ·
PCR fragmentek mérete 557 nt. Ezt cR7PCRlként jelöljük és a 9. számú szekvenciában mutatjuk be. A származtatott aminosav szekvenciát a 10. számú szekvenciában mutatjuk be. A CR7PCR1 a 3' végen 392 nt-dal átfedést mutat a cmR2-vel.
A teljes hmGluR7a és b proteineket kódoló DNS szekvenciákat sorrendben a 11. és 13. számú szekvenciákban mutatjuk be. A származtatott aminosav szekvenciákat sorrendben a 12. és 14. számú szekvenciákban mutatjuk be. A származtatott aminosav szekvenciák összehasonlítása felfedi, hogy az 1. példában szereplő hmGluR4 altípussal megközelítően 70%-os szekvencia azonosságot mutat.
3. példa: A részleges hmGluR6-ot kódoló cDNS
Egy 1,0 kb hosszúságú inzertet tartalmazó egyedüli cDNS kiónt, a cmRl-et, alacsony szigorúságú hibridizációs körülmények mellett az 1.5 és 1.6 pontokban leírtak szerint a hmGluR fragmentet használva egy humán hippocampus könyvtárból izoláljuk. Megközelítően 630 nukleotid homológ a humán mGluR4gyel. A cmRl 5' és 3' végeinél található további szekvenciák egyértelműen intron szekvenciákat kódolnak, ahogy azt a feltételezett hasítási donor és hasítási akceptor hely szekvenciák jelenléte jelzi. A cDNS cmRl a humán metabotróp glutamát receptor hmGluR6 altípusának (15. számú szekvencia) egy részével azonos.
A hmGluR6 teljes kódoló régiója a cDNS és genom könyvtárak szkrínelésével izolálható erősen szigoró körülmények köztt próbaként cDNS cmRl-et használva. A származtatott aminosav • · · · • · · · · · « · • · · · • « · · • · · · szekvenciák összehasonlítása felfedi, hogy az 1. példa hmGluR4ével megközelítően 70% a szekvencia azonosság.
4. példa: A hmGluR cDNS-ek emlős sejtekben való expressziőja
4.1.Receptor expresszáló plazmidok
A fenti teljes hosszúságú hmGluR4-et, hmGluR6-ot és hmGluR7-et kódoló cDNS-eket cDNS fragmentekből hozzuk létre, majd konstitúciós promóterekre (CMV, SV40, RSV) vagy indukálható promóterekre alapuló emlős expressziós vektorokba ligáljuk ezeket. A pBK-CMV (Stratagene), a pBK-RSV (Stratagene), a pCMV-T7 (Sibia, Inc.) és a pICP4 (Novagen, USA) plazmidok ezekre a plazmidokra példák.
A hmGluR4 altípust kódoló teljes hosszúságú cDNSt az emlős pBK-CMV expressziós vektorba úgy juttatjuk be, hogy a hmGluR4 5' vég fragmentet (cR4PCR2 klón) a cDNS cm20-szal a hmGluR4 cDNS 346-351 nukleotidjainál elhelyezkedő egyedüli Xhol helyre ligáljuk. Specifikusan, a pBK-CMV-hmGluR4 plazmidot a CR4PCR2 Notl/Xhol fragmentének, a cDNS cmR20 XhoI/NotI fragmentjének, valamint a NőtI-gyei emészett pBK-CMV vektor három utas ligálásával hozzuk létre. A pCMV-T7-hmGluR4 plazmidot a CR4PCR4 Pstl/Xhol fragmentjének, a cmR20 Xhol/EcoRI fragmentjének és a Pstl/EcoRI-gyei meésztett pCMV-T7-2 vektor három utas ligálásával hozzuk létre. Mindkét expressziós szerkezet a hmGluR4 teljes kódoló régióját tartalmazza, valamint a 3' nemtranszlált szekvenciák megközelítően 750 nukleotidját.
A két hmGluR7 hasítási variánst - a hmGluR7a (12. számú szekvencia) és a hmGluR7b (14. számú szekvencia) jelölésű • · · variánsokat képviselő teljes hosszúságú cDNS-eket a pCMV-T7-2 plazmidba (SIBIA, Inc.) építjük be az átfedést mutató cmR2, cmR3 és hcR7PCRl cDNS kiónok felhasználásával. A pCMV-T7hmGluR7b-nek jelölt teljes hosszúságú hmGluR7b expressziós szerkezetet hcR7PCRl Pstl/Bsal fragmentjének, a cmR2 Bsal/EagI fragmentjének és a pCMV-T7-2 plazmid Pstl/NotI fragmentjének három utas ligálásával állítjuk elő. A pCMV-T7-hmGluR7b plazmid a hmGluR7b teljes kódoló régióját tartalmazza, valamint a 3' nemtranszlált szekvenciák 191 nukleotidját. Egy teljes hosszúságú hmGluR7a expressziós szerkezet létrehozásához pCMV-T7-hmGluR7a - a cmR2 egy 370 bázispár hosszúságú Hindlll/Eagl fragmentjét a cmR3 megfelelő fragmentjére cseréljük. A kapott klón Bsal/EagI fragmentjét a fentiek szerint leírt három utas ligáláshoz használjuk.
A pBK-CMV-hmGluR6 plazmidot analóg módon hozzuk létre hagyományos technikákat használva (Sambrook et al., supra).
4.2 Az emlős sejtek transzfektálása
Emlős sejteket (például CHO-K1, GH3; American Tissue Type Culture Collection) adoptálunk glutamát mentes tápközegben (Lglutamát mentes Dulbecco-féle módosított Eagle-féle tápközeg, mely csökkent koncentrációjú 2mM L-glutamint tartalmaz, valamint 0,046 mg/ml prolinnal, és 10 % dializált magzati szarvasmarha szérummal (Gibco-BRL) van kiegészítve) való szaporodáshoz. A hmGluR expressziós plazmidokat tranziens módon kálcium-foszfátos kicsapatással a sejtekbe transzfektáljukk (Ausubel, F.M. et al., (1993) Current protocols in Molecular Biology, Greene and Wiley, USA).
• · · · • · • · · · • · · · ·· ··
A hmGluR-eket stabilan expresszáló sejtvonalakat a CH0-K1 sejtek lipofektin-által közvetített (Gibco-BRL) hmGluR expressziós plazmidokkal és a pSV2-Neo (Southern and Berg, 1982) plazmid - egy a G-418 rezisztencia gént kódoló plazmid vektor - való transzfekciójával hozzuk létre. A sejteket 48 óráig szaporítjuk 1 mg/ml G-418 szulfát (Genetin, Gibco) hozzáadása előtt. A tápközeget minden második vagy harmadik napon cseréljük. A G-418-as szelekciót túlélő sejteket izoláljuk és szelekciós tápközegben szaporítjuk. 32 G-418 rezisztens klónos sejtvonalat vizsgálunk a kezdeti transzfekciót követő 6-8 hét eltelte után a hmGluR protein expresszióra az anti-hmGluR7 antitesttel szembeni immunoreaktivitással (immunodetektálás, vesd össze a 4.3. infra), valamint az agonista hozzáadása után funkcionális válaszokon keresztül cAMP radioimmunovizsgálaton keresztül (vesd össze az 5.1. infra).
Hasonlóképpen, a pBK-CMV-hmGluR4, pCMV-T7-hmGluR4, pCMVT7-hmGluR7b és pCMV-T7-hmGluR7a hmGluR expressziós szerkezeteket is tranziens módon és stabilan expresszáljuk az emlős sejtekben (CV1, CHO, HEK293, COS) standard eljárásoknak megfelelően (Ausubel, F.M. et al., (1993) Current protocols in
Molecular Biology, Greene and Wiley, USA). A transzfektált sejteket hmGluR expresszióra különböző vizsgálatokkal analizáljuk:[3H]-glutamát kötési vizsgálatokkal, hmGluR altípus specifikus antitesteket használó immunocitokémiával, valamint a cAMP ([cAMPa]) intracelluláris koncentrációjában bekövetkező változás mérésével.
• · • « · · · · * • ······ · • · ···«« ·· · ·«·· ··· · ·· ♦·
4.3. A hmGluR protein expresszió altípus-specifikus hmGluR antitestekkel való immunodetektálása
A hmGluR protein expressziót altípus-specifikus hmGluR antitesteket használva immunocitokémiával analizáljuk (lásd a 7. példát). A transzfekció után 1-3 nappal a sejteket kétszer mossuk foszfát puffereit sóoldattal (PBS), PBS/4% paraformaldehiddel 10 percig rögzítjük, majd PBS-sel mossuk. A sejteket PBS/0.4% Triton Χ-100-zal permeabilizáljuk, ezt PBS/10 mM glicerinnel és PBS-sel való mosás követi. A sejteket 1 órán keresztül PBSTB-vel (1 x PBS/0,1% Triton X-100/1% BSA elegye) blokkoljuk, majd ezt követően az immunotisztított hmGluR antiszérummal (0,5-2,0 ^g/ml PBSTB-ben) 1 órán keresztül inkubáljuk. PBS-sel történő háromszori mosás után a sejteket 1 órán keresztül alkalikus peroxidázzal konjugált kecske antinyúl IgG-vel ( 1:200 PBS-ben; Jackson Immuno Research) inkubáljuk. A sejteket háromszor mossuk PBS-sel és az immunoreaktivitást 0,4 mg/ml naftolfoszfát (Biorad)/1 mg/ml Fást Red (Biorad)/10 mM Levamisol (Sigma)/100 mM Tris/HCl pH 8,8/100 mM NaCl/50 mM MgC12 elegyével mérjük. A festési reakciót 15 perc után leállítjuk PBS-sel való további mosással. 2-4 sejtvonalat - melyek mindegyike homogén módon expresszálja a hmGluR4-et, a hmGluR6-ot vagy a hmGluR7-et - azonosítunk az immunofestéssel.
·
5. példa: A hmGluR-eket expresszáló stabil sejtvonalak felhasználása a receptor aktivitás modulátorainak szkrínelésében
A hmGluR4-et, a hmGluR6-ot és a hmGluR7-et expresszió stabil sejtvonalakat használunk agonisták, antagonisták és alloszterikus modulátorok utáni szkríneléshez. Az ilyen vegyületek [^H]glutamátot felhasználó kötési vizsgálatokkal és/vagy az intracelluláris második messenger szintekben ([cAMP], [Ca2+]) bekövetkező változások mérésével határozható meg.
5.1. cAMP radioimmunovizsgálat
A forskolin által stimulált cAMP agonista-indukálta depressziót és ligandum kötést a cAMP radioimmunovizsgálatával (Amersham) analizáljuk. A sejteket 12 üregű lemezekre oltjuk 0,5-2,0 x 105 sejt/üreg sűrűségben és 2-4 napig szaporítjuk konfluenciáig. Ekkor a sejteket kétszer mossuk PBS-ben és 20 recig 1 mM 3-izobutil-l-metil-xantint (IBMX) tartalmazó PBS-ben inkubáljuk. A sejteket friss, 10 μΐ forskolint, 1 mM IBMX-et és egy ismert hmGluR agonistát tartalmazó PBS-ben inkubáljuk 20 percig. Az agonista hatást leállítjuk és a sejtek által termelt cAMP-t 1 ml etanol-víz-HCl elegyének (100 ml etanol, 50 ml víz, 1 ml 1 M HC1) hozzáadásával szabadítjuk fel a drogot tartalmazó tápközeg elpárologtatása után. A cAMP szinteket cAMP radioimmunovizsgálattal határozzuk meg, melynek során [^h]cAMPt (Amershma) használunk.
• ·
A 4-es, 6-os és 7-es hmGluR altípusok negatívan kapcsolódnak az adenilát ciklázhoz, a CHO sejtekben való expresszáláskor. Az agonista kötés a forskolin által indukált cAMP akkumuláció gátlásához vezet. Az összes altípus AP-4 érzékeny, ami azt jelenti, hogy az AP-4 agonista hatású 1 mMnál kisebb koncentrációban.
5.2. Az intracelluláris [Ca2+] mérése
Az egyik fent említett expressziós plazmiddal transzformált sejteket kalcium érzékeny fluoreszcens festékkel, mint például fura-2-vel vagy fluro-3-mal terheljük. Ennek eléréséhez a sejteket egyedüli üregekbe helyezzük, az egyedüli üregek fedőlemezzel ellátottak, vagy 96-üregü lemezekbe helyezzük és 1-5 napig szaporítjuk az 50-100 %-os konfluencia eléréséig. Az üregeket háromszor mossuk az egyensúlyi sóoldattal (BBS) és a BBS-ben 1 órán keresztül inkubáljuk, majd BBS-sel további három alkalommal mossuk. A sejteket 50 μg fura2-AM-at (vagy fluro3-AM)(Molecular probes, Inc.), 4,99 ml BBSt, 75 μΐ DMSO-t és 6,25 μΆ Pluronic-ot (Molecular Probes, Inc) tartalmazó oldatban inkubáljuk 20-60 percig. A sejteket 2 mg/ml szarvasmarha albumint tartalmazó BBS-ben mossuk háromszor, melyet BBS-ben történő háromszori mosás követ. A sejtek legalább 10 percig tartó regenerációja után ezeket [Ca2 + ] mikrofluorometriás méréséhez használjuk.
A sejteket a fluorometriához való készülékbe helyezzük, mint például egy inverz mikroszkópba, egy fluoroszcens olvasó spektrofluorométerébe. A kalcium indikátor (például fura-2 vagy fluo-3) fluoreszcenciáját a festék serkentés! spektrumát fedő hullámhoszúsággal (fura-2:340-380 nm, fluo-3 3 480 nm) való besugárzással indukáljuk. Az intracelluláris szabad kalcium ion koncentráció növekedését sorrendben a 340 nm-en és 480 nm-en való serkentés hatására bekövetkezett fura-2 vagy fluo-3 fluoreszcenciában bekövetkezett növekedésként követjük nyomon vagy a 380 nm hullámhosszon serkentett fura-2 fluoreszcenciában bekövetkezett csökkenés ként.
Pozitív kontrollként az L-glutamátot használjuk a sejtekre kifejtett EC50 értéknek megfelelő koncentrációban, így az intracelluláris kalcium ion koncentrációban bekövetkező mérhető növekedést indukálunk. A teszt vegyület agonistának mondható, ha a glutamát által indukált Ca2 + jelhez hasonlítható indukciót eredményez. A teszt vegyület antagonistának tartható, ha a glutamát által indukált kalcium jel kisebb a teszt vegyület jelenlétében mint annak hiányában.
6. példa: Kiméra hmGluR4,6 és 7 receptorok
Az mGluRl intracelluláris doménjeit, különösen a második intracelluláris hurkot (i2) és a C-terminális régiót, kritikus fontosságúnak vélik a G-proteinek kötéséhez, mely a foszfolipáz C/Ca2+ jelölő reakcióutat aktiválja, anélkül, hogy a receptor farmakológiai profilját megváltoztatná (Pin et al., EMBO J. 13, 342-348 (1994)). Hagyományos PCR mutagenezises technikákat használunk a hmGluR4,6 és 7 intracelluáris domének a hmGluRl megfelelő doménjeivel való kicseréléséhez. A stabil CHO sejtvonalakat hmGluR4/l, 6/1 és 7/1 kiméra expressziós szerkezetekkel hozzuk létre, lehetővé téve a receptor aktivitás (hmGluR4,6,7) modulátorok hatásának Ca2+-fűggö vizsgálatot felhasználó analizálását. A következőkben leírjuk egy kiméra hmGluR7/l receptor létrehozását. A kiméra hmGluR4/l és hmGluR6/l-et tartalmazó expressziós szerkezeteket analóg klónozási és PCR technikákat felhasználva hozzuk létre.
(i) A pCMV-hmGluR7b expressziós szerkezetet Eagl-gyel emésztjük, így felszabadítjuk a teljes cDNS inzertet. A cDNS-t a pBluescript-Nőt - mely a pBluescript II egy olyan származéka, ahol az egyedüli KpnI és NotI helyek között a polikötő szekvenciákat delécióval eltávolítottuk - NotI helyére klónozzuk. Ezt a kapott kiónt nevezzük pBluescript-Nőt-hmGluR7 plazmidnak.
(ii) A hmGluRl transzmembrán régióját PCR-ral klónozzuk, a Masu et al (1991, supra) származó primereket használva. Az
5'-TATCTTGAGTGGAGTGACATAG-3' szekvenciával rendelkező oligonukleotidot (mely a Masu szekvencia 1753-1774 nukleotidjának felel meg) használjuk sense primerként. Az antisense primer az
5'-ACTGCGGACGTTCCTCTCAGG-3' szekvenciával rendelkezik, ami megfelel a Masu szekvencia 2524-2544 nukletidjának. Az la, lb és le hasítási variánsok Cterminális végét PCR-ral hasítjuk sorrendben a Masu és munkatársaitól (1991), Tanabe és munkatársaitól (1992 supra) valamint Pin és munkatársaitól (1992, Proc. natl. Acad. Sci. USA, 89, 10331-10335 (1992) származó primereket használva. Az
5'-AAACCTGAGAGGAACGTCCGCAG-3 ' szekvenciával rendelkező oligonukleotidot (a Masu szekvencia 2521-2543 nukleotidjainak felel meg) használjuk sense primerként. A sorrendben a hmGluRla, lb és lc-hez antisense primerekként az
5'-CTACAGGGTGGAAGAGCTTTGCTT-3 ' szekvenciával rendelkező oligonukleotidot (mely a Masu szekvencia 3577-3600 nt-jainak felel meg), az
5'-TCAAAGCTGCGCATGTGCCGACGG-3' szekvenciával rendelkező oligonukleotidot (mely a Tanabe szekvencia 2698-2721 nt-jainak felel meg), valamint az
5'-TCAATAGACAGTGTTTTGGCGGTC-3' szekvenciával rendelkező oligonukleotidot (mely a Pin szekvencia 2671-2694 nt-jának felel meg) használjuk. A PCR fragmentet a pBluescript II plazmidba klónozzuk és teljesen szekvenáljuk.
(iii) Egy kiméra cDNS fragmentet, ahol a hmGluR7a, vagy a hmGluR7b (sorrendben a 11. és 13. számú szekvenciák 2035-2106 nukleotidjai) i2-hurkát a hmGluRl megfelelő szekvenciáival helyettesítjük PCR-ral hozunk létre (Pin et al., 1994, supra leírásának megfelelően). A fragmentet Smal-gyel és BglII-vel emésztjük, melyek az i2-hurkot szegélyező egyedüli restrikciós helyeket hasítják. A kiméra Smal/BglII fragmentet a pBluescript-Nőt-mGluR7 Smal/BglII fragmentjeire cseréljük.
(iv) A hmGluR7b vagy hmGluR7a C-terminális doménjének a fent említett hmGluRl megfelelő szekvenciáival való további helyettesítésével hasítási variánsok hozhatók létre a hmGluR7 C-terminális végét szegélyező egyedüli BglII és SacII restrikciós helyeket használva.
(v) A kapott kiméra hmGluR7/hmGluRl cDNS-t szekvenáljuk és Eagl-gyel emésztjük, így a pBluescript-Not plazmidból a teljes cDNS-eket. felszabadítjuk. A CHO sejtekben való stabil expresszióhoz a kiméra cDNS-eket pCMV-T7-2 emlős expressziós vektor egyedüli NotI helyére klónozzuk.
7. példa: Az anti-hmGluR antitestek létrehozása és alkalmazása
A hmGluR4 és hmGluR7 származtatott C-terminális aminosav szekvenciáinak megfelelő peptideket szintetizáljuk és ovalbuminhoz vagy Tentagel-hez kapcsoljuk A poliklonális antiszérumot nyulakban termeltetjük. A humán mGluR specifikus antitesteket az antiszérumból immunoaffinitási kromatográfiával peptid oszlopokon tisztítjuk. A hmGluR specifikus antitesteket ELISA módszerrel és glutation-S-transzferáz/hmGluR fúziós preoteinekkel végzett immunolenyomat technikával jellemezzük. Sorrendben a hmGluR4-re és a hmGluR7-re specifikus antitesteket a transzfektált sejtekben levő hmGluR receptorok detektálására használjuk, valamint a humán agy szövet szekcióiban levő hmGluR receptor proteinek celluláris és szubcelluláris mintázatának analizálására használjuk. A különböző, E. coli-ban expresszált 20 aminosavat és fúziós proteineket expresszáló hmGluRspecifikus peptidekkel szemben antitesteket hozunk létre. A peptideket szilárd fázisú szintézissel szintetizáljuk, kacsakagyló (keyhole limpet) hemocianinhoz (KLH) kapcsoljuk vagy ovalbuminhoz glutáraldehiddel. A hmGluR-ek teljes feltételezett intracelluláris C-terminusát tartalmazó PCR fragmenteket BamHl/EcoRI fragmentekként a pGEX-2T E. coli expressziós plazmidba (Guan and Dixon, Analytical Biochemistry, 192, 262-267 (1991)) klónozzuk, glutation-S-transzferáz (GST)/hmGluR fúziós géneket hozva létre. Expressziós plazmidokat hordozó E. coli DH5a sejteket (Gibco-BRL) 37 C° hőmérsékleten LB tápközegben/100 mg/ml ampicillinnel GST/hmGluR fúziós génekkel egy éjszakán át szaporítunk. A tenyészeteket
LB-ben 1:30 arányban hígítjuk és 2 órán keresztül 30 C° hőmérsékleten szaporítjuk. A fúziós proteinek expresszióját 0,1 mM izopropil-b-D-tio-galakto-piranoziddal való kezeléssel indukáljuk 3 órán keresztül 30 C° hőmérsékleten. A sejteket 5000 x g való centrifugálással gyűjtjük össze. A fúziós proteint glutation affinitás kromatográfiát használva izoláljuk.
Deponálási adatok
A következő plazmidokat deponáljuk a Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen Gmbh (DMS) gyűjteménynél (Mascheroder Weg lb, D-38124, Braunkschweig) 1993 szeptember 13-án:
cmRl plazmid: DSM 8549 katalógusszám cmR2 plazmid: DSM 8550 katalógusszám
SZEKVENCIA LISTA
ÁLTALÁNOS | INFORMÁCIÓ: | |
(i) FELTALÁLÓ: | ||
(A) | NÉV: CIBA-GEIGY AG | |
(B) | UTCA: klybeckstr. 141 | |
(C) | VÁROS: Basel | |
(E) | ORSZÁG: Svájc | |
(F) | IRÁNYÍTÓSZÁM: 4002 | |
(G) | TELEFON: +41 61 69 | 11 11 |
(H) | TELEFAX: +41 61 696 | 79 76 |
(I) | TELEX: 962 991 |
(ii) A TALÁLMÁNY CÍME: Humán receptor proteinek (iii) A SZEKVENCIÁK SZÁMA: 16 (iv) SZÁMÍTÓGÉPES OLVASÁSI FORMA:
(A) A HORDOZÓ TÍPUSA: Floppy disk (B) SZÁMÍTÓGÉP: IBM PC kompatibilis (C) OPERÁCIÓS RENDSZER: PC-DOS/MS-DOS (D) SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, #1.25 verzió (EPO) (2) AZ 1. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) | HOSSZÚSÁG: | 2739 bázispár |
(B) | TÍPUS: nukleinsav | |
(C) | SZÁLTÍPUS: | egyszálú |
(D) | TOPOLÓGIA: | lineáris |
(ii) A MOLEKULA TÍPUSA: cDNS ···· • · · ··
1. SZÁMÚ SZEKVENCIA
ATG | CCT | GGG | AAG | AGA | GGC | TTG | GGC | TGG | TGG | TGG | GCC | CGG | CTG | CCC | CTT | 48 |
Met | Pro | Gly | Lys | Arg | Gly | Leu | Gly | Trp | Trp | Trp | Alá | Arg | Leu | Pro | Leu | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
TGC | CTG | CTC | CTC | AGC | CTT | TAC | GGC | CCC | TGG | ATG | CCT | TCC | TCC | CTG | GGA | 96 |
Cys | Leu | Leu | Leu | Ser | Leu | Tyr | Gly | Pro | trp | Met | Pro | Ser | Ser | Leu | Gly | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
AAG | CCC | AAA | GGC | CAC | CCT | CAC | ATG | AAT | TCC | ATC | CGC | ATA | GAT | GGG | GAC | 144 |
Lys | Pro | Lys | Gly | His | Pro | His | Met | Asn | Ser | Ile | Arg | Ile | Asp | Gly | Asp | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
ATC | ACA | CTG | GGA | GGC | CTG | TTC | CCG | GTG | CAT | GGC | CGG | GGC | TCA | GAG | GGC | 192 |
Ile | The | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro | Val | His | Gly | Arg | Gly | Ser | Glu | Gly | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
AAG | CCC | TGT | GGA | GAA | CTT | AAG | AAG | GAA | AAG | GGC | ATC | CAC | CGG | CTG | GAG | 240 |
Lys | Pro | Cys | Gly | Glu | Leu | Lys | Lys | Glu | Lys | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GCC | ATG | CTG | TTC | GCC | CTG | GAT | CGC | ATC | AAC | AAC | GAC | CCG | GAC | CTG | CTG | 288 |
Alá | Met | Leu | Phe | Alá | Leu | Asp | Arg | Ile | Asn | Asn | Asp | Pro | Asp | Leu | Leu |
CCT AAC | ATC Ile | ACG Thr 100 | CTG Leu | GGC Gly | GCC Alá | CGC Arg | ATT Ile 105 | CTG Leu | GAC Asp | ACC Thr | TGC Cys | TCC Ser 110 | AGG Arg | GAC Asp | 336 | |
Pro | Asn | |||||||||||||||
ACC | CAT | GCC | CTC | GAG | CAG | TCG | CTG | ACC | TTT | GTG | CAG | GCG | CTC | ATC | GAG | 384 |
Thr | His | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu | Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Glu | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
AAG | GAT | GGC | ACA | GAG | GTC | CGC | TGT | GGC | AGT | GGC | GGC | CCA | CCC | ATC | ATC | 432 |
Lys | Asp | Gly | Thr | Glu | Val | Arg | Cys | Gly | Ser | Gly | Gly | Pro | Pro | Ile | Ile | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
ACC | AAG | CCT | GAA | CGT | GTG | GTG | GGT | GTC | ATC | GGT | GCT | TCA | GGG | AGC | TCG | 480 |
Thr | Lys | Pro | Glu | Arg | Val | Val | Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
GTC | TCC | ATC | ATG | GTG | GCC | AAC | ATC | CTT | CGC | CTC | TTC | AAG | ATA | CCC | CAG | 528 |
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Lys | Ile | Pro | Gin | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
ATC | AGC | TAC | GCC | TCC | ACA | GCG | CCA | GAC | CTG | AGT | GAC | AAC | AGC | CGC | TAC | 576 |
Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | Pro | Asp | Leu | Ser | Asp | Asn | Ser | Arg | Tyr | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GAC | TTC | TTC | TCC | CGC | GTG | GTG | CCC | TCG | GAC | ACG | TAC | CAG | GCC | CAG | GCC | 624 |
Asp | Phe | Phe | Ser | Arg | Val | Val | Pro | Ser | Asp | Thr | Tyr | Gin | Alá | Gin | Alá | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
ATG | GTG | GAC | ATC | GTC | CGT | GCC | CTC | AAG | TGG | AAC | TAT | GTG | TCC | ACA | GTG | 672 |
Met | Val | Asp | Ile | Val | Arg | Alá | Leu | Lys | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Val | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
GCC | TCG | GAG | GGC | AGC | TAT | GGT | GAG | AGC | GGT | GTG | GAG | GCC | TTC | ATC | CAG | 720 |
Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | Glu | Ser | Gly | Val | Glu | Alá | Phe | Ile | Gin |
225 230
235
240 ····
AAG Lys | TCC Ser | CGT A.rg | GAG Glu | GAC Asp 245 | GGG Gly | GGC Gly | GTG Val | TGC Cys | ATC Ile 250 | GCC Alá | CAG Gin | TCG Ser | GTG Val | AAG Lys 255 | ATA Ile | 768 |
CCA | CGG | GAG | CCC | AAG | GCA | GGC | GAG | TTC | GAC | AAG | ATC | ATC | CGC | CGC | CTC | 816 |
Pro | Arg | Glu | Pro | Lys | Alá | Gly | Glu | Phe | Asp | Lys | Ile | Ile | Arg | Arg | Leu | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
CTG | GAG | ACT | TCG | AAC | GCC | AGG | GCA | GTC | ATC | ATC | TTT | GCC | AAC | GAG | GAT | 864 |
Leu | Glu | Thr | Ser | Asn | Alá | Arg | Alá | Val | Ile | Ile | Phe | Alá | Asn | Glu | Asp | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
GAC | ATC | AGG | CGT | GTG | CTG | GAG | GCA | GCA | CGA | AGG | GCC | AAC | CAG | ACA | GGC | 912 |
Asp | Ile | A.rg | Arg | Val | Leu | Glu | Alá | Alá | Arg | Arg | Alá | Asn | Gin | Thr | Gly | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
CAT | TTC | TTC | TGG | ATG | GGC | GAC | AGC | TGG | GGC | TCC | AAG | ATT | GCA | CCT | 960 | |
His | Phe | Phe | Trp | Met | Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile | Alá | Pro | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
GTG | CTG | CAC | CTG | GAG | GAG | GTG | GCT | GAG | GGT | GCT | GTC | ACG | ATC | CTC | CCC | 1008 |
Val | Leu | His | Leu | Glu | Glu | Val | Alá | Glu | Gly | Alá | Val | Thr | Ile | Leu | Pro | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
AAG | AGG | ATG | TCC | GTA | CGA | GGC | TTC | GAC | CGC | TAC | TTC | TCC | AGC | CGC | ACG | 1056 |
Lys | Arg | Met | Ser | Val | Arg | Gly | Phe | Asp | Arg | Tyr | Phe | Ser | Ser | Arg | Thr | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
CTG | GAC | AAC | AAC | CGG | CGC | AAC | ATC | TGG | TTT | GCC | GAG | TTC | TGG | GAG | GAC | 1104 |
Leu | Asp | A.sn | Asn | A.rg | Arg | Asn | Ile | Trp | Phe | Alá | Glu | Phe | Trp | Glu | Asp | |
3 55 | 360 | 365 | ||||||||||||||
AAC | TTC | CAC | TGC | AAG | CTG | AGC | CGC | CAC | GCC | CTC | AAG | AAG | GGC . | AGC | CAC | 1152 |
Asn | Phe | His | Cys | Lys | Leu | Ser | Arg | His | Alá | Leu | Lys | Lys | Gly | Ser | His | |
370 | 375 | 380 |
GTC Val 385 | AAG Lys | AAG Lys | TGC Cys | ACC Thr | AAC Asn 390 | CGT Arg | GAG Glu | CGA Arg | ATT Ile | GGG Gly 395 | CAG Gin | GAT Asp | TCA Ser | GCT Alá | TAT Tyr 400 | 1200 |
GAG | CAG | GAG | GGG | AAG | GTG | CAG | TTT | GTG | ATC | GAT | GCC | GTG | TAC | GCC | ATG | 1248 |
Glu | Gin | Glu | Gly | Lys | Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr | Alá | Met | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
GGC | CAC | GCG | CTG | CAC | GCC | ATG | CAC | CGT | GAC | CTG | TGT | CCC | GGC | CGC | GTG | 1296 |
Gly | His | Alá | Leu | His | Alá | Met | His | Arg | Asp | Leu | Cys | Pro | Gly | Arg | Val | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
GGQ | CTC | TGC | CCG | CGC | ATG | GAC | CCT | GTA | GAT | GGC | ACC | CAG | CTG | CTT | AAG | 1344 |
Gly | Leu | Cys | Pro | Arg | Met | Asp | Pro | Val | Asp | Gly | Thr | Gin | Leu | Leu | Lys | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
TAC | ATC | CGA | AAC | GTC | AAC | TTC | TCA | GGC | ATC | GCA | GGG | AAC | CCT | GTG | ACC | 1392 |
Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe | Ser | Gly | He | Alá | Gly | Asn | Pro | Val | Thr | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
TTC | AAT | GAG | AAT | GGA | GAT | GCG | CCT | GGG | CGC | TAT | GAC | ATC | TAC | CAA | TAC | 1440 |
Phe | Asn | Glu | Asn | Gly | Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Tyr | Gin | Tyr | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
CAG | CTG | CGC | AAC | GAT | TCT | GCC | GAG | TAC | AAG | GTC | ATT | GGC | TCC | TGG | ACT | 1488 |
Gin | Leu | Arg | Asn | Asp | Ser | Alá | Glu | Tyr | Lys | Val | ile | Gly | Ser | Trp | Thr | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
GAC | CAC | CTG | CAC | CTT | AGA | ATA | GAG | CGG | ATG | CAC | TGG | CCG | GGG | AGC | GGG | 1536 |
Asp | His | Leu | His | Leu | Arg | Ile | Glu | Arg | Met | His | Trp | Pro | Gly | Ser | Gly | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
CAG | CAG | CTG | CCC | CGC | TCC | ATC | TGC | AGC | CTG | CCC | TGC | CAA | CCG | GGT | GAG | 1584 |
Gin | Gin | Leu | Pro | Arg | Ser | Ile | Cys | Ser | Leu | Pro | Cys | Gin | Pro | Gly | Glu |
515 520 525 «· « · ·· ···· * · ·· · , * , · « · ··· · • · · · · · · · · * »··· ··· · ·· ··
CGG Arg | AAG Lys 530 | AAG Lys | ACA Thr | GTG Val | AAG Lys | GGC Gly 535 | ATG Met | CCT Pro | TGC Cys | TGC Cys | TGG Trp 540 | CAC HÍS | TGC Cys | GAG Glu | CCT Pro | 1632 |
TGC | ACA | GGG | TAC | CAG | TAC | CAG | GTG | GAC | CGC | TAC | ACC | TGT | AAG | ACG | TGT | 1680 |
Cys | Thr | Gly | Tyr | Gin | Tyr | Gin | Val | Asp | Arg | Tyr | Thr | Cys | Lys | Thr | Cys | |
545 | 550 | 555 | 560 | |||||||||||||
CCC | TAT | GAC | ATG | CGG | CCC | ACA | GAG | AAC | CGC | ACG | GGC | TGC | CGG | CCC | ATC | 1728 |
Pro | Tyr | Asp | Met | Arg | Pro | Thr | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys | Arg | Pro | Ile | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
CCC | ATC | ATC | AAG | CTT | GAG | TGG | GGC | TCG | CCC | TGG | GCC | GTG | CTG | CCC | CTC | 1776 |
Pro | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu | Trp | Gly | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | Leu | Pro | Leu | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
TTC | CTG | GCC | GTG | GTG | GGC | ATC | GCT | GCC | ACG | TTG | TTC | GTG | GTG | ATC | ACC | 1824 |
Phe | Leu | Alá | Val | Val | Gly | Ile | Alá | Alá | Thr | Leu | Phe | Val | Val | Ile | Thr | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
TTT | GTG | CGC | TAC | AAC | GAC | ACG | CCC | ATC | GTC | AAG | GCC | TCG | GGC | CGT | GAA | 1872 |
Phe | Val | Arg | Tyr | Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Lys | Alá | Ser | Gly | Arg | Glu | |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
CTG | AGC | TAC | GTG | CTG | CTG | GCA | GGC | ATC | TTC | CTG | TGC | TAT | GCC | ACC | ACC | 1920 |
Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu | Alá | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | Alá | Thr | Thr | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
TTC | CTC | ATG | ATC | GCT | GAG | CCC | GAC | CTT | GGC | ACC | TGC | TCG | CTG | CGC | CGA | 1968 |
Phe | Leu | Met | Ile | Alá | Glu | Pro | Asp | Leu | Gly | Thr | Cys | Ser | Leu | Arg | Arg | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
ATC | TTC | CTG | GGA | CTA | GGG | ATG | AGC | ATC | AGC | TAT | GCA | GCC | CTG | CTC | ACC | 2016 |
Ile | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Met | Ser | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | Leu | Leu | Thr |
660 665 670
AAG Lys | ACC Thr | AAC Asn 675 | CGC Arg | ATC Ile | TAC Tyr | CGC ATC | TTC GAG | CAG Gin | GGC Gly | AAG Lys 685 | CGC Arg | TCG Ser | GTC Val | 2064 | ||
Arg | Ile 680 | Phe | Glu | |||||||||||||
AGT | GCC | CCA | CGC | TTC | ATC | AGC | CCC | GCC | TCA | CAG | CTG | GCC | ATC | ACC | TTC | 2112 |
Ser | Alá | Pro | Arg | Phe | Ile | Ser | Pro | Alá | Ser | Gin | Leu | Alá | Ile | Thr | Phe | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
AGC | CTC | ATC | TCG | CTG | CAG | CTG | CTG | GGC | ATC | TGT | GTG | TGG | TTT | GTG | GTG | 2160 |
Ser | Leu | Ile | Ser | Leu | Gin | Leu | Leu | Gly | Ile | Cys | Val | Trp | Phe | Val | Val | |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||||
GAC | CCC | TCC | CAC | TCG | GTG | GTG | GAC | TTC | CAG | GAC | CAG | CGG | ACA | CTC | GAC | 2208 |
Asp | Pro | Ser | His | Ser | Val | Val | Asp | Phe | Gin | Asp | Gin | Arg | Thr | Leu | Asp | |
725 | 730 | 735 | ||||||||||||||
CCC | CGC | TTC | GCC | AGG | GGT | GTG | CTC | AAG | TGT | GAC | ATC | TCG | GAC | CTG | TCG | 2256 |
Pro | Arg | Phe | Alá | Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Ser | Asp | Leu | Ser | |
740 | 745 | 750 | ||||||||||||||
CTC | ATC | TGC | CTG | CTG | GGC | TAC | AGC | ATG | CTG | CTC | ATG | GTC | ACG | TGC | ACC | 2304 |
Leu | Ile | Cys | Leu | Leu | Gly | Tyr | Ser | Met | Leu | Leu | Met | Val | Thr | Cys | Thr | |
755 | 760 | 765 | ||||||||||||||
GTG | TAT | GCC | ATC | AAG | ACA | CGC | GGC | GTG | CCC | GAG | ACC | TTC | AAT | GAG | GCC | 2352 |
Val | Tyr | Alá | Ile | Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | G1U | Thr | Phe | Asn | Glu | Alá | |
770 | 775 | 780 | ||||||||||||||
AAG | CCC | ATT | GGC | TTC | ACC | ATG | TAC | ACC | ACT | TGC | ATC | GTC | TGG | CTG | GCC | 2400 |
Lys | Pro | He | Gly | Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Trp | Leu | Alá | |
785 | 790 | 795 | 800 | |||||||||||||
TTC | ATC | CCC | ATC | TTC | TTT | GGC | ACC | TCG | CAG | TCG | GCC | GAC | AAG | CTG | TAC | 2448 |
Phe | He | Pro | Ile | Phe | Phe | Gly | Thr | Ser | Gin | Ser | Alá | Asp | Lys | Leu | Tyr |
805 810
815 ····
ATC | CAG | ACG | ACG | ACG | CTG | AGC | GTC | TCG | GTG | AGT | CTG | AGC | GCC | TCG | GTC | 2496 |
Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu | Thr | Val | Ser | Val | Ser | Leu | Ser | Alá | Ser | Val | |
820 | 825 | 830 | ||||||||||||||
TCC | CTG | GGA | ATG | CTC | TAC | ATG | CCC | AAA | GTC | TAC | ATC | ATC | CTC | TTC | CAC | 2544 |
Ser | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Leu | Phe | His | |
835 | 840 | 845 | ||||||||||||||
CCG | GAG | CAG | AAC | GTG | CCC | AAG | CGC | AAG | CGC | AGC | CTC | AAA | GCC | GTC | GTT | 2592 |
Pro | Glu | Gin | Asn | Val | Pro | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Leu | Lys | Alá | Val | Val | |
850 | 855 | 860 | ||||||||||||||
ACG | GCG | GCC | ACC | ATG | TCC | AAC | AAG | TTC | ACG | CAG | AAG | GGC | AAC | TTC | CGG | 2640 |
Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Asn | Lys | Phe | Thr | Gin | Lys | Gly | Asn | Phe | Arg | |
865 | 870 | 875 | 880 | |||||||||||||
CCC | AAC | GGA | GAG | GCC | AAG | TCT | GAG | CTC | TGC | GAG | AAC | CTT | GAG | GCC | CAA | 2688 |
Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Ser | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Leu | Glu | Alá | Pro | |
885 | 890 | 985 | ||||||||||||||
GCG | CTG | GCC | ACC | AAA | CAG | ACT | TAC | GTC | ACT | TAC | ACC | AAC | CAT | GCA | ATC | 2736 |
Alá | Leu | Alá | Thr | Lys | Gin | Thr | Tyr | Val | Thr | Tyr | Thr | Asn | His | Alá | Ile |
900 905 910
ΤΑ
2739 (2) A 2. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) | HOSSZÚSÁG: 912 aminosav | |
(B) | TÍPUS: aminosav | |
(C) | TOPOLÓGIA: lineáris | |
(ii) | A MOLEKULA TÍPUSA: protein | |
(xi) | A 2 | . SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA |
Met Pro Gly Lys Arg Gly Leu Gly Trp Trp Trp Alá Arg Leu Pro Leu
1 | 5 | ||||||
Cys | Leu | Leu | Leu | Ser | Leu | Tyr | Gly |
20 | |||||||
Lys | Pro | Lys | Gly | His | Pro | His | Met |
35 | 40 | ||||||
Ile | Thr | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro |
50 | 55 | ||||||
Lys | Pro | Cys | Gly | Glu | Leu | Lys | Lys |
65 | 70 | ||||||
Alá | Met | Leu | Phe | Alá | Leu | Asp | Arg |
85 | |||||||
Pro | Asn | Ile | Thr | Leu | Gly | Alá | Arg |
100 | |||||||
Thr | His | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu |
115 | 120 | ||||||
Lys | Asp | Gly | Thr | Glu | Val | Arg | Cys |
130 | 135 | ||||||
Thr | Lys | Pro | Glu | Arg | Val | Val | Gly |
145 | 150 | ||||||
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile |
165
10 | 15 | ||||||
Pro | Trp | Met | Pro | Ser | Ser | Leu | Gly |
25 | 30 | ||||||
Asn | Ser | Ile | Arg | Ile | Asp | Gly | Asp |
45 | |||||||
Val | His | Gly | Arg | Gly | Ser | Glu | Gly |
60 | |||||||
Glu | Lys | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu |
75 | 80 | ||||||
Ile | Asn | Asn | Asp | Pro | Asp | Leu | Leu |
90 | 95 | ||||||
Ile | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser | Arg | Asp |
105 | 110 | ||||||
Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Glu |
125 | |||||||
Gly | Ser | Gly | Gly | Pro | Pro | Ile | Ile |
140 | |||||||
Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser |
155 | 160 | ||||||
Leu | Arg | Leu | Phe | Lys | Ile | Pro | Gin |
170
175
He | Ser | Tyr Alá 180 | Ser | Thr | Alá | Pro | Asp 185 | Leu | Ser | Asp | Asn | Ser 190 | Arg | Tyr | |
Asp | Phe | Phe | Ser | Arg | Val | Val | Pro | Ser | Asp | Thr | Tyr | Gin | Alá | Gin | Alá |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Met | Val | Asp | Ile | Val | Arg | Alá | Leu | Lys | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Val |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | Glu | Ser | Gly | Val | Glu | Alá | Phe | Ile | Gin |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Lys | Ser | Arg | Glu | Asp | Gly | Gly | Val | Cys | Ile | Alá | Gin | Ser | Val | Lys | Ile |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Pro | Arg | Glu | Pro | Lys | Alá | Gly | Glu | Phe | Asp | Lys | Ile | Ile | Arg | Arg | Leu |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Leu | Glu | Thr | Ser | Asn | Alá | Arg | Alá | Val | Ile | Ile | Phe | Alá | Asn | Glu | Asp |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Asp | Ile | Arg | Arg | Val | Leu | Glu | Alá | Alá | Arg | Arg | Alá | Asn | Gin | Thr | Gly |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
His | Phe | Phe | Trp | Met | Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile | Alá | Pro |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Val | Leu | His | Leu | Glu | Glu | Val | Alá | Glu | Gly | Alá | Val | Thr | Ile | Leu | Pro |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Lys | Arg | Met | Ser | Val | Arg | Gly | Phe | Asp | Arg | Tyr | Phe | Ser | Ser | Arg | Thr |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Leu | Asp | Asn | Asn | Arg | Arg | Asn | Ile | Trp | Phe | Alá | Glu | Phe | Trp | Glu | Asp |
355 | 360 | 365 |
Asn | Phe 370 | His | Cys | Lys | Leu | Ser 375 | Arg | His | Alá | Leu | Lys 380 | Lys | Gly | Ser | His |
Val | Lys | Lys | Cys | Thr | Asn | Arg | Glu | Arg | Ile | Gly | Gin | Asp | Ser | Alá | Tyr |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Glu | Gin | Glu | Gly | Lys | Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr | Alá | Met |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Gly | His | Alá | Leu | His | Alá | Met | His | Arg | Asp | Leu | Cys | Pro | Gly | Arg | Val |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Gly | Leu | Cys | Pro | Arg | Met | Asp | Pro | Val | Asp | Gly | Thr | Gin | Leu | Leu | Lys |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe | Ser | Gly | Ile | Alá | Gly | Asn | Pro | Val | Thr |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Phe | Asn | Glu | Asn | Gly | Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Tyr | Gin | Tyr |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Gin | Leu | Arg | Asn | Asp | Ser | Alá | Glu | Tyr | Lys | Val | Ile | Gly | Ser | Trp | Thr |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Asp | His | Leu | His | Leu | Arg | Ile | Glu | Arg | Met | His | Trp | Pro | Gly | Ser | Gly |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Gin | Gin | Leu | Pro | Arg | Ser | Ile | Cys | Ser | Leu | Pro | Cys | Gin | Pro | Gly | Glu |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Arg | Lys | Lys | Thr | Val | Lys | Gly | Met | Pro | Cys | Cys | Trp | His | Cys | Glu | Pro |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Cys | Thr | Gly | Tyr | Gin | Tyr | Gin | Val | Asp | Arg | Tyr | Thr | Cys | Lys | Thr | Cys |
545 | 550 | 555 | 560 |
• · · · • · · · · · · • ······ · • · ····· ·· · • · · · ··· · ·· ··
Pro Tyr | Asp | Met | Arg 565 | Pro | Thr | Glu | Asn | Arg 570 | Thr | Gly | Cys | Arg | Pro 575 | Ile |
Pro Ile | Ile | Lys | Leu | Glu | Trp | Gly | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | Leu | Pro | Leu |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||
Phe Leu | Alá | Val | Val | Gly | Ile | Alá | Alá | Thr | Leu | Phe | Val | Val | Ile | Thr |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||
Phe Val | Arg | Tyr | Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Lys | Alá | Ser | Gly | Arg | Glu |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||
Leu Ser | Tyr | Val· | Leu | Leu | Alá | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | Alá | Thr | Thr |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||
Phe Leu | Met | Ile | Alá | Glu | Pro | Asp | Leu | Gly | Thr | Cys | Ser | Leu | Arg | Arg |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||
Ile Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Met | Ser | Tle | Ser | Tyr | Alá | Alá | Leu | Leu | Thr |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||
Lys Thr | Asn | Arg | Ile | Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys | Arg | Ser | Val |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||
Ser Alá | Pro | Arg | Phe | Ile | Ser | Pro | Alá | Ser | Gin | Leu | Alá | Ile | Thr | Phe |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||
Ser Leu | Ile | Ser | Leu | Gin | Leu | Leu | Gly | He | Cys | Val | Trp | Phe | Val | Val |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||
Asp Pro | Ser | His | Ser | Val | Val | Asp | Phe | Gin | Asp | Gin | Arg | Thr | Leu | Asp |
725 | 730 | 735 | ||||||||||||
Pro Arg | Phe | Alá | Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Ser | Asp | Leu | Ser |
740 | 745 | 750 |
• · · • ······ · * ······ «· · • · · · ··· · ·· ··
Leu | Ile | Cys 755 | Leu | Leu | Gly | Tyr | Ser 760 | Met | Leu | Leu | Met | Val 765 | Thr | Cys | Thr |
Val | Tyr | Alá | Ile | Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Thr | Phe | Asn | Glu | Alá |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Trp | Leu | Alá |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | Phe | Gly | Thr | Ser | Gin | Ser | Alá | Asp | Lys | Leu | Tyr |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu | Thr | Val | Ser | Val | Ser | Leu | Ser | Alá | Ser | Val |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Ser | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Leu | Phe | His |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Pro | Glu | Gin | Asn | Val | Pro | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Leu | Lys | Alá | Val | Val |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Asn | Lys | Phe | Thr | Gin | Lys | Gly | Asn | Phe | Arg |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Ser | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Leu | Glu | Alá | Pro |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
Alá | Leu | Alá | Thr | Lys | Gin | Thr | Tyr | Val | Thr | Tyr | Thr | Asn | His | Alá | Ile |
900 | 905 | 910 |
• ·
(2) A 3. | SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: | |
(i) | A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI: | |
(A) | HOSSZÚSÁG: 3804 bázispár | |
(B) | TÍPUS: nukleinsav | |
(C) | SZÁLAZOTTSÁG: egyszálú | |
(D) | TOPOLÓGIA: lineáris | |
(ii) | A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (genom) | |
(ix) | JELLEMZŐK: | |
(A) | NÉV/KULCS: CDS | |
(B) | LOKÁCIÓ: 1..2604 | |
(D) | EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = a cmR2 hmGluR7-őt | |
kódoló régiója | ||
(xi) | A 3 | . SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA: |
CCC | GTA | CAC | GCC | AAG | GGT | CCC | AGC | GGA | GTG | CCC | TGC | GGC | GAC | ATC | AAG | 48 |
Pro | Val | Hí s | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly | Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
AGG | GAA | AAC | GGG | ATC | CAC | AGG | CTG | GAA | GCG | ATG | CTC | TAC | GCC | CTG | GAC | 96 |
Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu | Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CAG | ATC | AAC | AGT | GAT | CCC | AAC | CTA | CTG | CCC | AAC | GTG | ACG | CTG | GGC | GCG | 144 |
Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu | Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá |
• · · ·
CGG Arg | ATC Ile 50 | CTG Leu | GAC ACT | TGT Cys | TCC Ser 55 | AGG Arg | GAC Asp | ACT Thr | TAC Tyr | GCG Alá 60 | CTC Leu | GAA Glu | CAG Gin | TCG Ser | 192 | |
Asp | Thr | |||||||||||||||
CTT | ACT | TTC | GTC | CAG | GCG | CTC | ATC | CAG | AAG | GAC | ACC | TCC | GAC | GTG | CGC | 240 |
Leu | Thr | Phe | val | Gin | Alá | Leu | Ile | Gin | Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
TGC | ACC | AAC | GGC | GAA | CCG | CCG | GTT | TTC | GTC | AAG | CCG | GAG | AAA | GTA | GTT | 288 |
Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | Pro | Val | Phe | Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
GGA | GTG | ATT | GGG | GCT | TCG | GGG | AGT | TCG | GTC | TCC | ATC | ATG | GTA | GCC | AAC | 336 |
Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
ATC | CTG | AGG | CTC | TTC | CAG | ATC | CCC | CAG | ATT | AGT | TAT | GCA | TCA | ACG | GCA | 384 |
Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin | Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
CCC | GAG | CTA | AGT | GAT | GAC | CGG | CGC | TAT | GAC | TTC | TTC | TCT | CGC | GTG | GTG | 432 |
Pro | Glu | Leu | Ser | Asp | Asp | Arg | Arg | Tyr | Asp | Phe | Phe | Ser | Arg | Val | Val | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
CCA | CCC | GAT | TCC | TTC | CAA | GCC | CAG | GCC | ATG | GTA | GAC | ATT | GTA | AAG | GCC | 480 |
Pro | Pro | Asp | Ser | Phe | Gin | Alá | Gin | Alá | Met | Val | Asp | He | Val | Lys | Alá | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
CTA | GGC | TGG | AAT | TAT | GTG | TCT | ACC | CTC | GCA | TCG | GAA | GGA | AGT | TAT | GGA | 528 |
Leu | Gly | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Leu | Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
GAG | AAA | GGT | GTG | GAG | TCC | TTC | ACG | CAG | ATT | TCC | AAA | GAG | GCA | GGT | GGA | 576 |
Glu | Lys | Gly | Val | Glu | Ser | Phe | Thr | Gin | Ile | Ser | Lys | Glu | Alá | Gly | Gly |
180
185
190
CTC Leu | TGC Cys | ATT Ile 195 | GCC Alá | CAG Gin | TCC Ser | GTG Val | AGA Arg 200 | ATC Ile | CCC Pro | CAG Gin | GAA Glu | CGC Arg 205 | AAA Lys | GAC Asp | AGG Arg | 624 |
ACC | ATT | GAC | TTT | GAT | AGA | ATT | ATC | AAA | CAG | CTC | CTG | GAC | ACC | CCC | AAC | 672 |
Thr | Ile | Asp | Phe | Asp | Arg | Ile | Ile | Lys | Gin | Leu | Leu | Asp | Thr | Pro | Asn | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
TCC | AGG | GCC | GTC | GTG | ATT | TTT | GCC | AAC | GAT | GAG | GAT | ATA | AAG | CAG | ATC | 720 |
Ser | Arg | Alá | Val | Val | Ile | Phe | Alá | Asn | Asp | Glu | Asp | Ile | Lys | Gin | Ile | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
CTT | GCA | GCA | GCC | AAA | AGA | GCT | GAC | CAA | GTT | GGC | CAT | TTT | CTT | TGG | GTG | 768 |
Leu | Alá | Alá | Alá | Lvs | Arg | Alá | Asp | Gin | Val | Gly | His | Phe | Leu | Trp | Val | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
GGA | TCA | GAC | AGC | TGG | GGA | TCC | AAA | ATA | AAC | CCA | CTG | CAC | CAG | CAT | GAA | 816 |
Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile | Asn | Pro | Leu | His | Gin | His | Glu | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
GAT | ATC | GCA | GAA | GGG | GCC | ATC | ACC | ATT | CAG | CCC | AAG | CGA | GCC | ACG | GTG | 864 |
Asp | Ile | Alá | Glu | Gly | Alá | Ile | Thr | Ile | Gin | Pro | Lys | Arg | Alá | Thr | Val | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
GAA | GGG | TTT | GAT | GCC | TAC | TTT | ACG | TCC | CGT | ACA | CTT | GAA | AAC | AAC | AGA | 912 |
Glu | Gly | Phe | Asp | Alá | Tyr | Phe | Thr | Ser | Arg | Thr | Leu | Glu | Asn | Asn | Arg | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
AGA | AAT | GTA | TGG | TTT | GCC | GAA | TAC | TGG | GAG | GAA | AAC | TTC | AAC | TGC | AAG | 960 |
Arg | Asn | Val | Trp | Phe | Alá | Glu | Tyr | Trp | Glu | Glu | Asn | Phe | Asn | Cys | Lys | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
TTG | ACG | ATT | AGT | GGG | TCA | AAA | AAA | GAA | GAC | ACA | GAT | CGC | AAA | TGC | ACA | 1008 |
Leu | Thr | Ile | Ser | Gly | Ser | Lys | Lys | Glu | Asp | Thr | Asp | Arg | Lys | Cys | Thr |
325 330 335 • · · · · ·· ·· · • · · ·
GGA Gly | CAG Gin | GAG AGA ATT | GGA AAA | GAT Asp | TCC Ser 345 | AAC Asn | TAT Tyr | GAG Glu | CAG Gin | GAG Glu 350 | GGT Gly | AAA Lys | 1056 | |||
Glu | Arg 340 | Ile | Gly | Lys | ||||||||||||
GTC | CAG | TTC | GTG | ATT | GAC | GCA | GTC | TAT | GCT | ATG | GCT | CAC | GCC | CTT | CAC | 1104 |
Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr | Alá | Met | Alá | His | Alá | Leu | His | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
CAC | ATG | AAC | AAG | GAT | CTC | TGT | GCT | GAC | TAC | CGG | GGT | GTC | TGC | CCA | GAG | 1152 |
His | Met | Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp | Tyr | Arg | Gly | Val | Cys | Pro | Glu | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
ATG | GAG | CAA | GCT | GGA | GGC | AAG | AAG | TTG | CTG | AAG | TAT | ATA | CGC | AAT | GTT | 1200 |
Met | Glu | Gin | Alá | Gly | Gly | Lys | Lys | Leu | Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
AAT | TTC | AAT | GGT | AGT | GCT | GGC | ACT | CCA | GTG | ATG | TTT | AAC | AAG | AAC | GGG | 1248 |
Asn | Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro | Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
GAT | GCA | CCT | GGG | CGT | TAT | GAC | ATC | TTT | CAG | TAC | CAG | ACC | ACA | AAC | ACC | 1296 |
Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe | Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
AGC | AAC | CCG | GGT | TAC | CGT | CTG | ATC | GGG | CAG | TGG | ACA | GAC | GAA | CTT | CAG | 1344 |
Ser | Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly | Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
CTC | AAT | ATA | GAA | GAC | ATG | CAG | TGG | GGT | AAA | GGA | GTC | CGA | GAG | ATA | CCC | 1392 |
Leu | Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly | Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
GCC | TCA | GTG | TGC | ACA | CTA | CCA | TGT | AAG | CCA | GGA | CAG | AGA | AAG | AAG | ACA | 1440 |
Alá | Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys | Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | |
465 | 470 | 475 | 480 |
CAG Gin | AAA Lys | GGA ACT | CCT Pro 485 | TGC Cys | TGT TGG | ACC Thr | TGT Cys 490 | GAG Glu | CCT TGC | GAT Asp | GGT Gly 495 | TAC Tyr | 1488 | |||
Gly | Thr | Cys | Trp | Pro | Cys | |||||||||||
CAG | TAC | CAG | TTT | GAT | GAG | ATG | ACA | TGC | CAG | CAT | TGC | CCC | TAT | GAC | CAG | 1536 |
Gin | Tyr | Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys | Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
AGG | CCC | AAT | GAA | AAT | CGA | ACC | GGA | TGC | CAG | GAT | ATT | CCC | ATC | ATC | AAA | 1584 |
Arg | Pro | Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys | Gin | Asp | Ile | Pro | Ile | Ile | Lys | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
CTG | GAG | TGG | CAC | TCC | CCC | TGG | GCT | GTG | ATT | CCT | GTC | TTC | CTG | GCA | ATG | 1632 |
Leu | Glu | Trp | His | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | |
530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
TTG | GGG | ATC | ATT | GCC | ACC | ATC | TTT | GTC | ATG | GCC | ACT | TTC | ATC | CGC | TAC | 1680 |
Leu | Gly | Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val | Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | |
545 | 550 | 555 | 560 | |||||||||||||
AAT | GAC | ACG | CCC | ATT | GTC | CGG | GCA | TCT | GGG | CGG | GAA | CTC | AGC | TAT | GTT | 1728 |
Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
CTT | TTG | ACG | GGC | ATC | TTT | CTT | TGC | TAC | ATC | ATC | ACT | TTC | CTG | ATG | ATT | 1776 |
Leu | Leu | Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
GCC | AAA | CCA | GAT | GTG | GCA | GTG | TGT | TCT | TTC | CGG | CGA | GTT | TTC | TTG | GGC | 1824 |
Alá | Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser | Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
TTG | GGT | ATG | TGC | ATC | AGT | TAT | GCA | GCC | CTC | TTG | ACG | AAA | ACA | AAT | CGG | 1872 |
Leu | Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg |
610 615
620
ΑΤΤ Ile 625 | TAT Tyr | CGC ATA | TTT Phe | GAG Glu 630 | CAG Gin | GGC Gly | AAG AAA | TCA Ser 635 | GTA Val | ACA Thr | GCT Alá | CCC Pro | AGA Arg 640 | 1920 | ||
Arg | Ile | Lys | Lys | |||||||||||||
CTC | ATA | AGC | CCA | ACA | TCA | CAA | CTG | GCA | ATC | ACT | TCC | AGT | TTA | ATA | TCA | 1968 |
Leu | Ile | Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Alá | Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
GTT | CAG | CTT | CTA | GGG | GTG | TTC | ATT | TGG | TTT | GGT | GTT | GAT | CCA | CCC | AAC | 2016 |
Val | Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp | Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
ATC | ATC | ATA | GAC | TAC | GAT | GAA | CAC | AAG | ACA | ATG | AAC | CCT | GAG | CAA | GCC | 2064 |
Ile | Ile | Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys | Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||||
AGA | GGG | GTT | CTC | AAG | TGT | GAC | ATT | ACA | GAT | CTC | CAA | ATC | ATT | TGC | TCC | 2112 |
Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr | Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
TTG | GGA | TAT | AGC | ATT | CTT | CTC | ATG | GTC | ACA | TGT | ACT | GTG | TAT | GCC | ATC | 2160 |
Leu | Gly | Tyr | Ser | Ile | Leu | Leu | Met | Val | Thr | Cys | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile | |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||||
AAG | ACT | CGG | GGT | GTA | ccc | GAG | AAT | TTT | AAC | GAA | GCC | AAG | CCC | ATT | GGA | 2208 |
Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe | Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | |
725 | 730 | 735 | ||||||||||||||
TTC | ACT | ATG | TAC | ACG | ACA | TGT | ATA | GTA | TGG | CTT | GCC | TTC | ATT | CCA | ATT | 2256 |
Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | |
740 | 745 | 750 | ||||||||||||||
TTT | TTT | GGC | ACC | GCT | CAA | TCA | GCG | GAA | AAG | CTC | TAC | ATA | CAA | ACT | ACC | 2304 |
Phe | Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu | Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr |
755 760 765
ACG Thr | CTT Leu 770 | ACA ATC | TCC Ser | ATG Met | AAC Asn 775 | CTA AGT | GCA Alá | TCA GTG | GCG Alá | CTG Leu | GGG Gly | ATG Met | 2352 | |||
Thr | Ile | Leu | Ser | Ser | Val 780 | |||||||||||
CTA | TAC | ATG | CCG | AAA | GTG | TAC | ATC | ATC | ATT | TTC | CAC | CCT | GAA | CTC | AAT | 2400 |
Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | |
785 | 790 | 795 | 800 | |||||||||||||
GTC | CAG | AAA | CGG | AAG | CGA | AGC | TTC | AAG | GCG | GTA | GTC | ACA | GCA | GCC | ACC | 2448 |
Val | Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | |
805 | 810 | 815 | ||||||||||||||
ATG | TCA | TCG | AGG | CTG | TCA | CAC | AAA | CCC | AGT | GAC | AGA | CCC | AAC | GGT | GAG | 2496 |
Met | Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | |
820 | 825 | 830 | ||||||||||||||
GCA | AAG | ACC | GAG | CTC | TGT | GAA | AAC | GTA | GAC | CCA | AAC | AAC | TGT | ATA | CCA | 2544 |
Alá | Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val | Asp | Pro | Asn | Asn | Cys | Ile | Pro | |
835 | 840 | 845 | ||||||||||||||
CCA | GTA | AGA | AAG | AGT | GTA | CAA | AAG | TCT | GTT | ACT | TGG | TAC | ACT | ATC | CCA | 2592 |
Pro | Val | Arg | Lys | Ser | Val | Gin | Lys | Ser | Val | Thr | Trp | Tyr | Thr | Ile | Pro | |
850 | 855 | 860 |
CCA ACA GTA TAGCTTTTGA CTGCTTTCCC AAAGGCCCTG CTGCAAAAAA
Pro Thr Val
865
2641
GAAGTATGTC | AGTTATAATA | ACCTGGTTAT | CTAACCTGTT | CCATTCCATG | GAACCATGGA | 2701 |
GGAGGAAGAC | CCTCAGTTAT | TTTGTCACCC | AACCTGGCAT | AGGACTCTTT | GGTCCTACCC | 2761 |
GCTTCCCATC | ACCGGAGGAG | CTTCCCCGGC | CGGGAGACCA | GTGTTAGAGG | ATCCAAGCGA | 2821 |
CCTAAACAGC TGCTTTATGA AATATCCTTA CTTTATCTGG GCTTAATAAG TCACTGACAT 2881
CAGCACTGCC | AACTTGGCTG | CAATTGTGGA | CCTTCCCTAC | CAAAGGGAGT | GTTGAAACTC | 2941 |
AAGTCCCGCC | CCGGCTCTTT | AGAATGGACC | ACTGAGAGCC | ACAGGACCGT | TTTGGGGCTG | 3001 |
ACCTGTCTTA | TTACGTATGT | ACTTCTAGGT | TGCAAGGTTT | TGAAATTTTC | TGTACAGTTT | 3061 |
GTGAGGACCT | TTGCACTTTG | CCATCTGATG | TCGTACCTCG | GTTCACTGTT | TGTTTTCGAA | 3121 |
TGCCTTGTTT | TCATAGAGCC | CTATTCTCTC | AGACGGTGGA | ATATTTGGAA | aaattttaaa | 3181 |
ACAATTAAAA | TTTTAAAGCA | ATCTTGGCAG | ACTAAAACAA | GTACATCTGT | ACATGACTGT | 3241 |
ATAATTACGT | TATAGTACCA | CTGCACATCA | TGTTTTTTTT | TTTAAGACAA | AAAAGATGTT | 3301 |
TAAAGACCAA | AAACTGTGCT | GAGNAAGTAT | GCCCCACCTA | TCTTTNGNAT | ATGATAGGTT | 3361 |
ACATAAAAGG | AAGGTATTGG | CTGAACTGNA | TAGAGGTCTT | GATCTTTGGA | ATGCATGCCA | 3421 |
GTAATGTATT | TACAGTACAT | GTTTATTATG | TTCAATATTT | GTATTTGTGT | TCTCTTTTGT | 3481 |
TATTTTTAAT | TAGNGTATAT | GAATATTTTG | CAATAATTTT | AATAATTATT | AAGCTGTTTG | 3541 |
AAGGAAAGAA | TATGGATTTT | TCATGTCTTG | AGGTTTTGTT | CATGCCCCCT | TTGACTGATC | 3601 |
AGTGTGATAA | GGACTTTAGG | AAAAAAAGCA | TGTATGTTTT | TTACTGTTTG | TAATAAGTAC | 3661 |
TTTCGTTAAT | CTTGCTGCTT | ATGTGCCAAT | TTAGTGGAAA | AGAACAACCC | TTGCTGAAAA | 3721 |
ATTCCCTCTT | TCCATTCTCT | TTCAATTCTG | TGATATTGTC | CAAGAATGTA | TCAATAAAAT | 3781 |
ACTTTGGTTA ACTTTAAAAA AAA
3804 (2) A 4. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 867 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 4. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Pro | Val | His | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly | val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu | Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu | Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Arg | Ile | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser | Arg | ASp | Thr | Tyr | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Leu | Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Gin | Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | pro | Val | Phe | Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser | Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin | Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá |
115
120
125 ' · «
« · ·
Pro | Glu 130 | Leu | Ser | Asp | Asp | Arg 135 | Arg | Tyr | Asp | Phe | Phe 140 | Ser | Arg | Val | Val |
Pro | Pro | Asp | Ser | Phe | Gin | Alá | Gin | Alá | Met | Val | Asp | Ile | Val | Lys | Alá |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Leu | Gly | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Leu | Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Glu | Lys | Gly | Val | Glu | Ser | Phe | Thr | Gin | Ile | Ser | Lys | Glu | Alá | Gly | Gly |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Leu | Cys | Ile | Alá | Gin | Ser | Val | Arg | Ile | Pro | Gin | Glu | Arg | Lys | Asp | Arg |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Thr | Ile | Asp | Phe | Asp | Arg | Ile | Ile | Lys | Gin | Leu | Leu | Asp | Thr | Pro | Asn |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ser | Arg | Alá | Val | Val | Ile | Phe | Alá | Asn | Asp | Glu | Asp | Ile | Lys | Gin | Ile |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Leu | Alá | Alá | Alá | Lys | Arg | Alá | Asp | Gin | Val | Gly | His | Phe | Leu | Trp | Val |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile | Asn | Pro | Leu | His | Gin | His | Glu |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Asp | Ile | Alá | Glu | Gly | Alá | Ile | Thr | Ile | Gin | Pro | Lys | Arg | Alá | Thr | Val |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Glu | Gly | Phe | Asp | Alá | Tyr | Phe | Thr | Ser | Arg | Thr | Leu | Glu | Asn | Asn | Arg |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Arg | Asn | Val | Trp | Phe | Alá | Glu | Tyr | Trp | Glu | Glu | Asn | Phe | Asn | Cys | Lys |
305 | 310 | 315 | 320 |
• · • · · · ·· · ·
Leu | Thr | Ile | Ser | Gly 325 | Ser | Lys | Lys | Glu Asp 330 | Thr | Asp | Arg | Lys | Cys 335 | Thr | |
Gly | Gin | Glu | Arg | Ile | Gly | Lys | Asp | Ser | Asn | Tyr | Glu | Gin | Glu | Gly | Lys |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr | Alá | Met | Alá | His | Alá | Leu | His |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
His | Met | Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp | Tyr | Arg | Gly | Val | Cys | Pro | Glu |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Met | Glu | Gin | Alá | Gly | Gly | Lys | Lys | Leu | Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Asn | Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro | Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe | Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Ser | Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly | Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Leu | Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly | Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Alá | Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys | Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Gin | Lys | Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr | Cys | Glu | Pro | Cys | Asp | Gly | Tyr |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Gin | Tyr | Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys | Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin |
500 | 505 | 510 |
·· ··
V • ·· • · · ·
Arg | Pro | Asn 515 | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly 520 | Cys | Gin | Asp | Ile | Pro 525 | Ile | Ile | Lys |
Leu | Glu | Trp | His | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Leu | Gly | Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val | Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Leu | Leu | Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Alá | Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser | Phe | Arg | Arg | val | Phe | Leu | Gly |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Leu | Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Ile | Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys | Lys | Ser | Val | Thr | Alá | Pro | Arg |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Leu | Ile | Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Alá | Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Val | Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp | Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Ile | Ile | Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys | Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr | Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser |
690 | 695 | 700 |
• · · · • · ··· · ··· · • · · · ·· ·4
Leu 705 | Gly | Tyr | Ser | Ile | Leu 710 | Leu | Met | Val | Thr | Cys 715 | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile 720 |
Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe | Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Phe | Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu | Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Thr | Leu | Thr | Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser | Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Val | Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
Met | Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Alá | Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val | Asp | Pro | Asn | Asn | Cys | Ile | Pro |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Pro | Val | Arg | Lys | Ser | Val | Gin | Lys | Ser | Val | Thr | Trp | Tyr | Thr | Ile | Pro |
850 | 855 | 860 |
Pro Thr Val
865 • · · · • · · · * » · • ·····» · • · ····· ·· · ···· ··· · ·· ·· (2) AZ 5. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 1399 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAZOTTSÁG: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: cDNS (ix) JELLEMZŐK:
(A) NÉV/KULCS: CDS (B) LOKÁCIÓ: 1..270 (D) EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = a cmR3 hmGluR7-et kódoló régiója (xi) AZ 5. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATC | TCC | ATG | AAC | CTA | AGT | GCA | TCA | GTG | GCG | CTG | GGG | ATG | CTA | TAC | ATG | 48 |
Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser | Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CCG | AAA | GTG | TAC | ATC | ATC | ATT | TTC | CAC | CCT | GAA | CTC | AAT | GTC | CAG | AAA | 96 |
pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin | Lys | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CGG | AAG | CGA | AGC | TTC | AAG | GCG | GTA | GTC | ACA | GCA | GCC | ACC | ATG | TCA | TCG | 144 |
Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Ser | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
AGG | CTG | TCA | CAC | AAA | CCC | AGT | GAC | AGA | CCC | AAC | GGT | GAG | GCA | AAG | ACC | 192 |
Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Thr |
·· ···· • · ··» · • · · · *· ·· ··· ♦ ·« ··
GAG Glu 65 | CTC Leu | TGT Cys | GAA Glu | AAC Asn | GTA Val 70 | GAC Asp | CCA Pro | AAC Asn | AGC Ser | CCT GCT GCA AAA | AAG Lys | AAG Lys 80 | 240 | |||
Pro 75 | Alá Alá | Lys | ||||||||||||||
TAT | GTC | AGT | TAT | AAT | AAC | CTG | GTT | ATC | TAACCTGTTC ι | CATTCCATGG | 287 | |||||
Tyr | Val | Ser | Tyr | Asn | Asn | Leu | Val | Ile |
90
AACCATGGAG | GAGGAAGACC | CTCAGTTATT | TTGTCACCCA | ACCTGGCATA | GGACTCTTTG | 347 |
GTCCTACCCG | CTTCCCATCA | CCGGAGGAGC | TTCCCCGGCC | GGGAGACCAG | TGTTAGAGGA | 407 |
TCCAAGCGAC | CTAAACAGCT | GCTTTATGAA | ATATCCTTAC | TTTATCTGGG | CTTAATAAGT | 467 |
CACTGACATC | AGCACTGCCA | ACTTGGCTGC | AATTGTGGAC | CTTCCCTACC | AAAGGGAGTG | 527 |
TTGAAACTCA | AGTCCCGCCC | CGGCTCTTTA | GAATGGACCA | CTGAGAGCCA | CAGGACCGTT | 587 |
TTGGGGCTGA | CCTGTCTTAT | TACGTATGTA | CTTCTAGGTT | GCAAGGTTTT | GAAATTTTCT | 647 |
GTACAGTTTG | TGAGGACCTT | TGCACTTTGC | CATCTGATGT | CGTACCTCGG | TTCACTGTTT | 707 |
GTTTTCGAAT | GCCTTGTTTT | CATAGAGCCC | TATTCTCTCA | GACGGTGGAA | TATTTGGAAA | 767 |
AATTTTAAAA | CAATTAAAAT | TTTAAAGCAA | TCTTGGCAGA | CTAAAACAAG | TACATCTGTA | 827 |
CATGACTGTA | TAATTACGTT | ATAGTACCAC | TGCACATCAT | GTTTTTTTTT | TTAAGACAAA | 887 |
AAAGATGTTT | AAAGACCAAA | AACTGTGCTG | AGNAAGTATG | CCCCACCTAT | CTTTNGNATA | 947 |
TGATAGGTTA | CATAAAAGGA | AGGTATTGGC | TGAACTGNAT | AGAGGTCTTG | ATCTTTGGAA | 1007 |
TGCATGCCAG | TAATGTATTT | ACAGTACATG | TTTATTATGT | TCAATATTTG | TATTTGTGTT | 1067 |
CTCTTTTGTT ATTTTTAATT AGNGTATATG AATATTTTGC AATAATTTTA ATAATTATTA 1127 ·· ···· • · ···«
AGCTGTTTGA AGGAAAGAAT ATGGATTTTT CATGTCTTGA GGTTTTGTTC ATGCCCCCTT
1187
TGACTGATCA GTGTGATAAG GACTTTAGGA AAAAAAGCAT GTATGTTTTT TACTGTTTGT
1247
AATAAGTACT TTCGTTAATC TTGCTGCTTA TGTGCCAATT TAGTGGAAAA GAACAACCCT
1307
TGCTGAAAAA TTCCCTCTTT CCATTCTCTT TCAATTCTGT GATATTGTCC AAGAATGTAT
1367
ΟΆΑΤΆΆΆΆΤΆ CTTTGGTTAA CTTTAAAAAA AA
1399 (2) A 6. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 89 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 6. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser | Alá | Ser |
1 | 5 | ||||||
Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Ile | Phe |
20 | |||||||
Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | Alá | Val |
35 | 40 | ||||||
Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | Ser | Asp |
50 | 55 | ||||||
Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val | Asp | Pro |
65 | 70 |
Val | Alá 10 | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr 15 | Met |
His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin | Lys |
25 | 30 | ||||||
Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Ser |
45 | |||||||
Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Thr |
60 | |||||||
Asn | Ser | Pro | Alá | Alá | Lys | Lys | Lys |
75 | 80 |
Tyr Val Ser Tyr Asn Asn Leu Val Ile (2) A 7. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 1588 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAZOTTSÁG: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: cDNS (ix) JELLEMZŐK:
(A) NÉV/KULCS: CDS (B) LOKÁCIÓ: 1..1447 (D) EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = a cmR5 hmGluR7-et kódoló régiója
(xi | ) A | 7 . | SZÁMÚ | SZEKVENCIA | LEÍRÁSA: | |||||
G AAC | AAG | GAT | CTC | TGT GCT | GAC TAC CGG | GGT GTC TGC | CCA | GAG | ATG | 46 |
Asn | Lys | Asp | Leu | Cys Alá | Asp Tyr Arg | Gly Val Cys | Pro | Glu | Met | |
1 | 5 | 10 | 15 |
GAG | CAA | GCT | GGA | GGC | AAG | AAG | TTG | CTG | AAG | TAT | ΑΤΆ | CGC | AAT | GTT | AAT | 94 |
Glu | Gin | Alá | Gly | Gly | Lys | Lys | Leu | Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
TTC | ΑΆΤ | GGT | AGT | GCT | GGC | ACT | CCA | GTG | ATG | TTT | AAC | AAG | AAC | GGG | GAT | 142 |
Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro | Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | Asp |
• ·
GCA CCT | GGG Gly 50 | CGT TAT Arg Tyr | GAC Asp | ATC Ile | TTT Phe 55 | CAG Gin | TAC Tyr | CAG ACC | ACA Thr 60 | AAC Asn | ACC Thr | AGC Ser | 190 | |||
Alá | Pro | Gin | Thr | |||||||||||||
AAC | CCG | GGT | TAC | CGT | CTG | ATC | GGG | CAG | TGG | ACA | GAC | GAA | CTT | CAG | CTC | 238 |
Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly | Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | Leu | |
65 | 70 | 75 | ||||||||||||||
AAT | ATA | GAA | GAC | ATG | CAG | TGG | GGT | AAA | GGA | GTC | CGA | GAG | ATA | CCC | GCC | 286 |
Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly | Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro | Alá | |
80 | 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
TCA | GTG | TGC | ACA | CTA | CCA | TGT | AAG | CCA | GGA | CAG | AGA | AAG | AAG | ACA | CAG | 334 |
Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys | Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | Gin | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
AAA | GGA | ACT | CCT | TGC | TGT | TGG | ACC | TGT | GAG | CCT | TGC | GAT | GGT | TAC | CAG | 382 |
Lys | Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr | Cys | Glu | Pro | Cys | Asp | Gly | Tyr | Gin | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
TAC | CAG | TTT | GAT | GAG | ATG | ACA | TGC | CAG | CAT | TGC | CCC | TAT | GAC | CAG | AGG | 430 |
Tyr | Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys | Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | Arg | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
CCC | AAT | GAA | JVAT | CGA | ACC | GGA | TGC | CAG | GAT | ATT | CCC | ATC | ATC | AAA | CTG | 478 |
Pro | Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys | Gin | Asp | Ile | Pro | Ile | Ile | Lys | Leu | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||||||
GAG | TGG | CAC | TCC | CCC | TGG | GCT | GTG | ATT | CCT | GTC | TTC | CTG | GCA | ATG | TTG | 526 |
Glu | Trp | His | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | Leu | |
160 | 165 | 170 | 175 | |||||||||||||
GGG | ATC | ATT | GCC | ACC | ATC | TTT | GTC | ATG | GCC | ACT | TTC | ATC | CGC | TAC | AAT | 574 |
Gly | He | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val | Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | Asn |
180 . 185 190 • · • · · ·
GAC ACG CCC | ATT GTC | CGG Arg | GCA Alá | TCT GGG CGG | GAA Glu | CTC Leu | AGC TAT | GTT Val | CTT Leu | 622 | ||||||
Asp | Thr | Pro | Ile 195 | Val | Ser | Gly 200 | Arg | Ser | Tyr 205 | |||||||
TTG | ACG | GGC | ATC | TTT | CTT | TGC | TAC | ATC | ATC | ACT | TTC | CTG | ATG | ATT | GCC | 670 |
Leu | Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | He | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | Alá | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
AAA | CCA | GAT | GTG | GCA | GTG | TGT | TCT | TTC | CGG | CGA | GTT | TTC | TTG | GGC | TTG | 718 |
Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser | Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | Leu | |
225 | 230 | 235 | ||||||||||||||
GGT | ATG | TGC | ATC | AGT | TAT | GCA | GCC | CTC | TTG | ACG | AAA | ACA | AAT | CGG | ATT | 766 |
Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | Ile | |
240 | 245 | 250 | 255 | |||||||||||||
TAT | CGC | ATA | TTT | GAG | CAG | GGC | AAG | AAA | TCA | GTA | ACA | GCT | CCC | AGA | CTC | 814 |
Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys | Lys | Ser | Val | Thr | Alá | Pro | Arg | Leu | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
ATA | AGC | CCA | ACA | TCA | CAA | CTG | GCA | ATC | ACT | TCC | AGT | TTA | ATA | TCA | GTT | 862 |
Ile | Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Alá | Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser | Val | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
CAG | CTT | CTA | GGG | GTG | TTC | ATT | TGG | TTT | GGT | GTT | GAT | CCA | CCC | AAC | ATC | 910 |
Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp | Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn | Ile | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
ATC | ATA | GAC | TAC | GAT | GAA | CAC | AAG | ACA | ATG | AAC | CCT | GAG | CAA | GCC | AGA | 958 |
Ile | Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys | Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | Arg | |
305 | 310 | 315 | ||||||||||||||
GGG | GTT | CTC | AAG | TGT | GAC | ATT | ACA | GAT | CTC | CAA | ATC | ATT | TGC | TCC | TTG | 1006 |
Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr | Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | Leu |
320 325 330 335
GGA Gly | TAT Tyr | AGC Ser | ATT CTT | CTC ATG Leu Met | GTC Val | ACA Thr | TGT Cys 345 | ACT Thr | GTG Val | TAT Tyr | GCC Alá | ATC Ile 350 | AAG Lys | 1054 | ||
Ile | Leu 340 | |||||||||||||||
ACT | CGG | GGT | GTA | CCC | GAG | AAT | TTT | AAC | GAA | GCC | AAG | CCC | ATT | GGA | TTC | 1102 |
Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe | Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
ACT | ATG | TAC | ACG | ACA | TGT | ATA | GTA | TGG | CTT | GCC | TTC | ATT | CCA | ATT | TTT | 1150 |
Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
TTT | GGC | ACC | GCT | CAA | TCA | GCG | GAA | AAG | CTC | TAC | ATA | CAA | ACT | ACC | ACG | 1198 |
Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu | Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | |
385 | 390 | 395 | ||||||||||||||
CTT | ACA | ATC | TCC | ATG | AAC | CTA | AGT | GCA | TCA | GTG | GCG | CTG | GGG | ATG | CTA | 1246 |
Leu | Thr | Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser | Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | |
400 | 405 | 410 | 415 | |||||||||||||
TAC | ATG | CCG | AAA | GTG | TAC | ATC | ATC | ATT | TTC | CAC | CCT | GAA | CTC | AAT | GTC | 1294 |
Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
CAG | AAA | CGG | AAG | CGA | AGC | TTC | AAG | GCG | GTA | GTC | ACA | GCA | GCC | ACC | ATG | 1342 |
Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
TCA | TCG | AGG | CTG | TCA | CAC | AAA | CCC | AGT | GAC | AGA | CCC | AAC | GGT | GAG | GCA | 1390 |
Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
AAG | ACC | GAG | CTC | TGT | GAA | AAC | GTA | GAC | CCA | AAC | AGT | GAG | AAG | TGC | AAC | 1438 |
Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val | Asp | Pro | Asn | Ser | Glu | Lys | Cys | Asn |
465 470 475
TGC TAC TGACCATCTG CACTGGCATC TAGTCAAGCG ATTGTCTGAG GAAAGGATTT
Cys Tyr
480
TGGAGATTCC CATCTGATAT TCTTCTATTT GGTCTCTTGT ACCCATTGTC ATCCTGTACC
1554
ACACATAATA AAGTTTAAGA ATGTCAAGCA AAAG (2) A 8. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 481 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 8. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
1494
1588
Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp | Tyr | Arg | Gly | Val | Cys | Pro | Glu | Met | Glu |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Gin | Alá | Gly | Gly | Lys | Lys | Leu | Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro | Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | Asp | Alá |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe | Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly | Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | Leu | Asn |
• · · ·
Ile Glu | Asp | Met | Gin 85 | Trp | Gly | Lys | Gly | Val 90 | Arg | Glu | Ile | Pro | Alá 95 | Ser | |
Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys | Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | Gin | Lys |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr | Cys | Glu | Pro | Cys | Asp | Gly | Tyr | Gin | Tyr |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys | Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | Arg | Pro |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | .Gly | Cys | Gin | Asp | Ile | Pro | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Trp | His | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | Leu | Gly |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val | Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | Asn | Asp |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | Alá | Lys |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser | Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | Ile | Tyr |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys | Lys | Ser | Val | Thr | Alá | Pro | Arg | Leu | Ile |
260 | 265 | 270 |
Ser | Pro | Thr 275 | Ser | Gin | Leu | Alá | Ile 280 | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile 285 | Ser | Val | Gin |
Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp | Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn | Ile | Ile |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys | Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | Arg | Gly |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr | Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | Leu | Gly |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Tyr | Ser | Ile | Leu | Leu | Met | Val | Thr | Cys | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile | Lys | Thr |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe | Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | Thr |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | Phe |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu | Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Thr | Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser | Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys |
450 455 460
Thr Glu Leu Cys Glu Asn Val Asp Pro Asn Ser Glu Lys Cys Asn Cys
465 470 475 480
Tyr (2)
A 9.
SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i)
A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A)
HOSSZÚSÁG: 558 bázispár (B)
TÍPUS: nukleinsav (C)
SZALAZOTTSAG: egyszálú (D)
TOPOLÓGIA: lineáris (ii)
A MOLEKULA TÍPUSA: cDNS (ix)
JELLEMZŐK:
(A)
NÉV/KULCS: CDS (B)
LOKACIO: 1..558 (D)
EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = a
CR7PCR1 hmGluR7-et kódoló része
A 9. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEIRASA:
ATG | GTC | CAG | CTG | AGG | AAG | CTG | CTC | CGC | GTC | CTG | ACT | TTG | ATG | AAG | TTC | 48 |
Met | Val | Gin | Leu | Arg | Lys | Leu | Leu | Arg | Val | Leu | Thr | Leu | Met | Lys | Phe | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CCC | TGC | TGC | GTG | CTG | GAG | GTG | CTC | CTG | TGC | GCG | CTG | GCG | GCG | GCG | GCG | 96 |
Pro | Cys | Cys | Val | Leu | Glu | Val | Leu | Leu | Cys | Alá | Leu | Alá | Alá | Alá | Alá |
• · • <* · · · • · · · · • · · • ·
CGC Arg | GGC Gly | CAG Gin 35 | GAG Glu | ATG Met | TAC Tyr | GCC Alá | CCG Pro 40 | CAC His | TCA ATC | CGG Arg | ATC Ile 45 | GAG Glu | GGG Gly | GAC Asp | 144 | |
Ser | Ile | |||||||||||||||
GTC | ACC | CTC | GGG | GGG | CTG | TTC | CCC | GTA | CAC | GCC | AAG | GGT | CCC | AGC | GGÁ | 192 |
Val | Thr | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro | Val | His | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
GTG | CCC | TGC | GGC | GAC | ATC | AAG | AGG | GAA | AAC | GGG | ATC | CAC | AGG | CTG | GAA | 240 |
Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GCG | ATG | CTC | TAC | GCC | CTG | GAC | CAG | ATC | AAC | AGT | GAT | CCC | AAC | CTA | CTG | 288 |
Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
CCC | AAC | GTG | ACG | CTG | GGC | GCG | CGG | ATC | CTG | GAC | ACT | TGT | TCC | AGG | GAC | 336 |
Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá | Arg | Ile | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser | Arg | Asp | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
ACT | TAC | GCG | CTC | GAA | CAG | TCG | CTT | ACT | TTC | GTC | CAG | GCG | CTC | ATC | CAG | 384 |
Thr | Tyr | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu | Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Gin | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
AAG | GAC | ACC | TCC | GAC | GTG | CGC | TGC | ACC | AAC | GGC | GAA | CCG | CCG | GTT | TTC | 432 |
Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | Pro | Val | Phe | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
GTC | AAG | CCG | GAG | AAA | GTA | GTT | GGA | GTG | ATT | GGG | GCT | TCG | GGG | AGT | TCG | 480 |
Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val | Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
GTC | TCC | ATC | ATG | GTA | GCC | AAC | ATC | CTG | AGG | CTC | TTC | CAG | ATC | CCC | CAG | 528 |
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin |
165 170
175
100
ATT AGT TAT GCA TCA ACG GCA CCC GAG CTA | 558 | ||||
Ile | Ser Tyr | Alá Ser 180 | Thr Alá Pro | Glu Leu 185 | |
(2) | A 10 . | SZÁMÚ | SZEKVENCIA | ADATAI: |
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 186 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 10. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met | Val | Gin | Leu | Arg | Lys | Leu | Leu | Arg | Val | Leu | Thr | Leu | Met | Lys | Phe |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Pro | Cys | Cys | Val | Leu | Glu | Val | Leu | Leu | Cys | Alá | Leu | Alá | Alá | Alá | Alá |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Arg | Gly | Gin | Glu | Met | Tyr | Alá | Pro | His | Ser | Ile | Arg | Ile | Glu | Gly | Asp |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Val | Thr | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro | Val | His | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu |
101
Pro | Asn | Val | Thr 100 | Leu | Gly | Alá | Arg | Ile 105 | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser Arg 110 | Asp | |
Thr | Tyr | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu | Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Gin |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | Pro | Val | Phe |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val | Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | Pro | Glu | Leu | ||||||
180 | 185 |
(2) A 11. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 2748 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAZOTTSÁG: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: cDNS (ix) JELLEMZŐK:
(A) NÉV/KULCS : CDS (B) LOKÁCIÓ: 1..2748 (D) EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = hmGluR7a (xi) A 11. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATG GTC CAG CTG AGG AAG CTG CTC CGC GTC CTG ACT TTG ATG AAG TTC
102
Met 1 | Val | Gin | Leu | Arg 5 | Lys | Leu | Leu | Arg | Val 10 | Leu | Thr | Leu | Met | Lys 15 | Phe | |
CCC | TGC | TGC | GTG | CTG | GAG | GTG | CTC | CTG | TGC | GCG | CTG | GCG | GCG | GCG | GCG | 96 |
Pro | Cys | Cys | Val | Leu | Glu | Val | Leu | Leu | Cys | Alá | Leu | Alá | Alá | Alá | Alá | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CGC | GGC | CAG | GAG | ATG | TAC | GCC | CCG | CAC | TCA | ATC | CGG | ATC | GAG | GGG | GAC | 144 |
Arg | Gly | Gin | Glu | Met | Tyr | Alá | Pro | His | Ser | Ile | Arg | Ile | Glu | Gly | Asp | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
GTC | ACC | CTC | GGG | GGG | CTG | TTC | CCC | GTA | CAC | GCC | AAG | GGT | CCC | AGC | GGA | 192 |
Val | Thr | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro | Val | His | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
GTG | CCC | TGC | GGC | GAC | ATC | AAG | AGG | GAA | AAC | GGG | ATC | CAC | AGG | CTG | GAA | 240 |
Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GCG | ATG | CTC | TAC | GCC | CTG | GAC | CAG | ATC | AAC | AGT | GAT | CCC | AAC | CTA | CTG | 288 |
Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
CCC | AAC | GTG | ACG | CTG | GGC | GCG | CGG | ATC | CTG | GAC | ACT | TGT | TCC | AGG | GAC | 336 |
Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá | Arg | Ile | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser | Arg | Asp | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
ACT | TAC | GCG | CTC | GAA | CAG | TCG | CTT | ACT | TTC | GTC | CAG | GCG | CTC | ATC | CAG | 384 |
Thr | Tyr | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu | Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Gin | |
115 | 120 | 125 |
AAG | GAC | ACC | TCC | GAC | GTG | CGC | TGC | ACC | AAC | GGC | GAA | CCG | CCG | GTT | TTC |
Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | Pro | Val | Phe |
130 | 135 | 140 |
103
GTC Val 145 | AAG Lys | CCG Pro | GAG Glu | AAA Lys | GTA GTT | GGA Gly | GTG Val | ATT GGG GCT | TCG Ser | GGG Gly | AGT Ser | TCG Ser 160 | 480 | |||
Val 150 | Val | Ile | Gly 155 | Alá | ||||||||||||
GTC | TCC | ATC | ATG | GTA | GCC | AAC | ATC | CTG | AGG | CTC | TTC | CAG | ATC | CCC | CAG | 528 |
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
ATT | AGT | TAT | GCA | TCA | ACG | GCA | CCC | GAG | CTA | AGT | GAT | GAC | CGG | CGC | TAT | 576 |
Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | Pro | Glu | Leu | Ser | Asp | Asp | Arg | Arg | Tyr | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GAC | TTC | TTC | TCT | CGC | GTG | GTG | CCA | CCC | GAT | TCC | TTC | CAA | GCC | CAG | GCC | 624 |
Asp | Phe | Phe | Ser | Arg | Val | Val | Pro | Pro | Asp | Ser | Phe | Gin | Alá | Gin | Alá | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
ATG | GTA | GAC | ATT | GTA | AAG | GCC | CTA | GGC | TGG | AAT | TAT | GTG | TCT | ACC | CTC | 672 |
Met | Val | Asp | Ile | Val | Lys | Alá | Leu | Gly | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Leu | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
GCA | TCG | GAA | GGA | AGT | TAT | GGA | GAG | AAA | GGT | GTG | GAG | TCC | TTC | ACG | CAG | 720 |
Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | Glu | Lys | Gly | Val | Glu | Ser | Phe | Thr | Gin | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
ATT | TCC | AAA | GAG | GCA | GGT | GGA | CTC | TGC | ATT | GCC | CAG | TCC | GTG | AGA | ATC | 768 |
Ile | Ser | Lys | Glu | Alá | Gly | Gly | Leu | Cys | Ile | Alá | Gin | Ser | Val | Arg | Ile | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
CCC | CAG | GAA | CGC | AAA | GAC | AGG | ACC | ATT | GAC | TTT | GAT | AGA | ATT | ATC | AAA | 816 |
Pro | Gin | Glu | Arg | Lys | Asp | Arg | Thr | Ile | Asp | Phe | Asp | Arg | Ile | Ile | Lys | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
CAG | CTC | CTG | GAC | ACC | CCC | AAC | TCC | AGG | GCC | GTC | GTG | ATT | TTT | GCC | AAC | 864 |
Gin | Leu | Leu | Asp | Thr | Pro | Asn | Ser | Arg | Alá | Val | Val | Ile | Phe | Alá | Asn |
275 280 285
104
GAT GAG | GAT ATA | AAG Lys | CAG Gin | ATC Ile 295 | CTT GCA Leu Alá | GCA Alá | GCC AAA | AGA GCT | GAC Asp | CAA Gin | 912 | |||||
Asp | Glu 290 | Asp | Ile | Alá | Lys 300 | Arg | Alá | |||||||||
GTT | GGC | CAT | TTT | CTT | TGG | GTG | GGA | TCA | GAC | AGC | TGG | GGA | TCC | AAA | ATA | 960 |
Val | Gly | His | Phe | Leu | Trp | Val | Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
AAC | CCA | CTG | CAC | CAG | CAT | GAA | GAT | ATC | GCA | GAA | GGG | GCC | ATC | ACC | ATT | 1008 |
Asn | Pro | Leu | His | Gin | His | Glu | Asp | Ile | Alá | Glu | Gly | Alá | Ile | Thr | Ile | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
CAG | CCC | AAG | CGA | GCC | ACG | GTG | GAA | GGG | TTT | GAT | GCC | TAC | TTT | ACG | TCC | 1056 |
Gin | Pro | Lys | Arg | Alá | Thr | Val | Glu | Gly | Phe | Asp | Alá | Tyr | Phe | Thr | Ser | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
CGT | ACA | CTT | GAA | AAC | AAC | AGA | AGA | AAT | GTA | TGG | TTT | GCC | GAA | TAC | TGG | 1104 |
Arg | Thr | Leu | Glu | Asn | Asn | Arg | Arg | Asn | Val | Trp | Phe | Alá | Glu | Tyr | Trp | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
GAG | GAA | AAC | TTC | AAC | TGC | AAG | TTG | ACG | ATT | AGT | GGG | TCA | AAA | AAA | GAA | 1152 |
Glu | Glu | Asn | Phe | Asn | Cys | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Gly | Ser | Lys | Lys | Glu | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
GAC | ACA | GAT | CGC | AAA | TGC | ACA | GGA | CAG | GAG | AGA | ATT | GGA | AAA | GAT | TCC | 1200 |
Asp | Thr | Asp | Arg | Lys | Cys | Thr | Gly | Gin | Glu | Arg | Ile | Gly | Lys | Asp | Ser | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
AAC | TAT | GAG | CAG | GAG | GGT | AAA | GTC | CAG | TTC | GTG | ATT | GAC | GCA | GTC | TAT | 1248 |
Asn | Tyr | Glu | Gin | Glu | Gly | Lys | Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
GCT | ATG | GCT | CAC | GCC | CTT | CAC | CAC | ATG | AAC | AAG | GAT | CTC | TGT | GCT | GAC | 1296 |
Alá | Met | Alá | His | Alá | Leu | His | His | Met | Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp | |
420 | 425 | 430 |
·* · ·
105
TAC Tyr | CGG Arg | GGT Gly 435 | GTC Val | TGC Cys | CCA Pro | GAG Glu | ATG Met 440 | GAG CAA | GCT Alá | GGA Gly | GGC Gly 445 | AAG Lys | AAG Lys | TTG Leu | 1344 | |
Glu | Gin | |||||||||||||||
CTG | AAG | TAT | ATA | CGC | AAT | GTT | AAT | TTC | AAT | GGT | AGT | GCT | GGC | ACT | CCA | 1392 |
Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
GTG | ATG | TTT | AAC | AAG | AAC | GGG | GAT | GCA | CCT | GGG | CGT | TAT | GAC | ATC | TTT | 1440 |
Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
CAG | TAC | CAG | ACC | ACA | AAC | ACC | AGC | AAC | CCG | GGT | TAC | CGT | CTG | ATC | GGG | 1488 |
Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
CAG | TGG | ACA | GAC | GAA | CTT | CAG | CTC | AAT | ATA | GAA | GAC | ATG | CAG | TGG | GGT | 1536 |
Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | Leu | Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
AAA | GGA | GTC | CGA | GAG | ATA | CCC | GCC | TCA | GTG | TGC | ACA | CTA | CCA | TGT | AAG | 1584 |
Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro | Alá | Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
CCA | GGA | CAG | AGA | AAG | AAG | ACA | CAG | AAA | GGA | ACT | CCT | TGC | TGT | TGG | ACC | 1632 |
Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | Gin | Lys | Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr | |
530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
TGT | GAG | CCT | TGC | GAT | GGT | TAC | CAG | TAC | CAG | TTT | GAT | GAG | ATG | ACA | TGC | 1680 |
Cys | Glu | Pro | Cys | Asp | Gly | Tyr | Gin | Tyr | Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys | |
545 | 550 | 555 | 560 | |||||||||||||
CAG | CAT | TGC | CCC | TAT | GAC | CAG | AGG | CCC | AAT | GAA | AAT | CGA | ACC | GGA | TGC | 1728 |
Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | Arg | Pro | Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys | |
565 | 570 | 575 |
• · • · • · • · · ·
106
CAG Gin | GAT Asp | ATT CCC | ATC Ile | ATC He | AAA Lys | CTG GAG TGG | CAC His | TCC Ser | CCC Pro | TGG Trp 590 | GCT Alá | GTG Val | 1776 | |||
Ile | Pro 580 | Leu | Glu 585 | Trp | ||||||||||||
ATT | CCT | GTC | TTC | CTG | GCA | ATG | TTG | GGG | ATC | ATT | GCC | ACC | ATC | TTT | GTC | 1824 |
Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | Leu | Gly | Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
ATG | GCC | ACT | TTC | ATC | CGC | TAC | AAT | GAC | ACG | CCC | ATT | GTC | CGG | GCA | TCT | 1872 |
Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
GGG | CGG | GAA | CTC | AGC | TAT | GTT | CTT | TTG | ACG | GGC | ATC | TTT | CTT | TGC | TAC | 1920 |
Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu | Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
ATC | ATC | ACT | TTC | CTG | ATG | ATT | GCC | AAA | CCA | GAT | GTG | GCA | GTG | TGT | TCT | 1968 |
Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | Alá | Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
TTC | CGG | CGA | GTT | TTC | TTG | GGC | TTG | GGT | ATG | TGC | ATC | AGT | TAT | GCA | GCC | 2016 |
Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
CTC | TTG | ACG | AAA | ACA | AAT | CGG | ATT | TAT | CGC | ATA | TTT | GAG | CAG | GGC | AAG | 2064 |
Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | He | Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys | |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||||
AAA | TCA | GTA | ACA | GCT | CCC | AGA | CTC | ATA | AGC | CCA | ACA | TCA | CAA | CTG | GCA | 2112 |
Lys | Ser | Val | Thr | Alá | Pro | Arg | Leu | Ile | Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Alá | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
ATC | ACT | TCC | AGT | TTA | ATA | TCA | GTT | CAG | CTT | CTA | GGG | GTG | TTC | ATT | TGG | 2160 |
Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | He | Ser | Val | Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp |
705 710 715 720
107
TTT GGT | GTT Val | GAT Asp | CCA Pro 725 | CCC Pro | AAC Asn | ATC Ile | ATC Ile | ATA GAC | TAC Tyr | GAT Asp | GAA Glu | CAC His 735 | AAG Lys | 2208 | ||
Phe | Gly | Ile 730 | Asp | |||||||||||||
ACA | ATG | AAC | CCT | GAG | CAA | GCC | AGA | GGG | GTT | CTC | AAG | TGT | GAC | ATT | ACA | 2256 |
Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr | |
740 | 745 | 750 | ||||||||||||||
GAT | CTC | CAA | ATC | ATT | TGC | TCC | TTG | GGA | TAT | AGC | ATT | CTT | CTC | ATG | GTC | 2304 |
Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | Leu | Gly | Tyr | Ser | Ile | Leu | Leu | Met | Val | |
755 | 760 | 765 | ||||||||||||||
ACA | TGT | ACT | GTG | TAT | GCC | ATC | AAG | ACT | CGG | GGT | GTA | CCC | GAG | AAT | TTT | 2352 |
Thr | Cys | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile | Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe | |
770 | 775 | 780 | ||||||||||||||
AAC | GAA | GCC | AAG | CCC | ATT | GGA | TTC | ACT | ATG | TAC | ACG | ACA | TGT | ATA | GTA | 2400 |
Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | |
785 | 790 | 795 | 800 | |||||||||||||
TGG | CTT | GCC | TTC | ATT | CCA | ATT | TTT | TTT | GGC | ACC | GCT | CAA | TCA | GCG | GAA | 2448 |
Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu | |
805 | 810 | 815 | ||||||||||||||
AAG | CTC | TAC | ATA | CAA | ACT | ACC | ACG | CTT | ACA | ATC | TCC | ATG | AAC | CTA | AGT | 2496 |
Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu | Thr | Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser | |
820 | 825 | 830 | ||||||||||||||
GCA | TCA | GTG | GCG | CTG | GGG | ATG | CTA | TAC | ATG | CCG | AAA | GTG | TAC | ATC | ATC | 2544 |
Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | |
835 | 840 | 845 | ||||||||||||||
ATT | TTC | CAC | CCT | GAA | CTC | AAT | GTC | CAG | AAA | CGG | AAG | CGA | AGC | TTC | AAG | 2592 |
Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | |
850 | 855 | 860 |
108
GCG | GTA | GTC | ACA | GCA | GCC | ACC | ATG | TCA | TCG | AGG | CTG | TCA | CAC | AAA | CCC | 2640 |
Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | |
865 | 870 | 875 | 880 | |||||||||||||
AGT | GAC | AGA | CCC | AAC | GGT | GAG | GCA | AAG | ACC | GAG | CTC | TGT | GAA | AAC | GTA | 2688 |
Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val | |
885 | 890 | 895 | ||||||||||||||
GAC | CCA | AAC | AGC | CCT | GCT | GCA | ΑΆΑ | AAG | AAG | TAT | GTC | AGT | TAT | AAT | AAC | 2736 |
Asp | Pro | Asn | Ser | Pro | Alá | ALa | Lys | Lys | Lys | Tyr | Val | Ser | Tyr | Asn | Asn |
900 905 910
CTG GTT ATC TA | 2748 | ||
Leu | Val Ile | ||
915 | |||
(2) | A 12 . | SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI: |
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 915 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 12. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met | Val | Gin | Leu | Arg | Lys | Leu | Leu | Arg | Val | Leu | Thr | Leu | Met | Lys | Phe |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Pro | Cys | Cys | Val | Leu | Glu | Val | Leu | Leu | Cys | Alá | Leu | Alá | Alá | Alá | Alá |
Arg Gly Gin Glu Met Tyr Alá Pro His
Ser He Arg
Ile Glu Gly Asp ·· · ·
109 ···· ·· • · · • ·
Val | Thr 50 | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe 55 | Pro |
Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | Arg |
65 | 70 | ||||||
Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | Gin |
85 | |||||||
Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá | Arg |
100 | |||||||
Thr | Tyr | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu |
115 | 120 | ||||||
Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | Cys |
130 | 135 | ||||||
Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val | Gly |
145 | 150 | ||||||
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile |
165 | |||||||
Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | Pro |
180 | |||||||
Asp | Phe | Phe | Ser | Arg | Val | Val | Pro |
195 | 200 | ||||||
Met | Val | Asp | Ile | Val | Lys | Alá | Leu |
210 | 215 | ||||||
Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | Glu |
225 | 230 |
Val His Alá Lys Gly Pro Ser Gly
Glu Asn Gly Ile His Arg Leu Glu
7580
Ile Asn Ser Asp Pro Asn Leu Leu
9095
Ile Leu Asp Thr Cys Ser Arg Asp
105110
Thr Phe Val Gin Alá Leu Ile Gin
125
Thr Asn Gly Glu Pro Pro Val Phe
140
Val Ile Gly Alá Ser Gly Ser Ser
155160
Leu Arg Leu Phe Gin Ile Pro Gin
170175
Glu Leu Ser Asp Asp Arg Arg Tyr
185190
Pro Asp Ser Phe Gin Alá Gin Alá
205
Gly Trp Asn Tyr Val Ser Thr Leu
220
Lys Gly Val Glu Ser Phe Thr Gin
235
240
Ile | Ser Lys | Glu | Alá Gly 245 | Gly | Leu | Cys | Ile Alá Gin Ser 250 | Val | Arg 255 | Ile | |||||
Pro | Gin | Glu | Arg | Lys | Asp | Arg | Thr | Ile | Asp | Phe | Asp | Arg | Ile | Ile | Lys |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Gin | Leu | Leu | Asp | Thr | Pro | Asn | Ser | Arg | Alá | Val | Val | Ile | Phe | Alá | Asn |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Asp | Glu | Asp | Ile | Lys | Gin | Ile | Leu | Alá | Alá | Alá | Lys | Arg | Alá | Asp | Gin |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Val | Gly | His | Phe | Leu | Trp | Val | Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Asn | Pro | Leu | His | Gin | His | Glu | Asp | Ile | Alá | Glu | Gly | Alá | Ile | Thr | Ile |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Gin | Pro | Lys | Arg | Alá | Thr | Val | Glu | Gly | Phe | Asp | Alá | Tyr | Phe | Thr | Ser |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Arg | Thr | Leu | Glu | Asn | Asn | Arg | Arg | Asn | Val | Trp | Phe | Alá | Glu | Tyr | Trp |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Glu | Glu | Asn | Phe | Asn | Cys | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Gly | Ser | Lys | Lys | Glu |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Asp | Thr | Asp | Arg | Lys | Cys | Thr | Gly | Gin | Glu | Arg | Ile | Gly | Lys | Asp | Ser |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Asn | Tyr | Glu | Gin | Glu | Gly | Lys | Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Alá | Met | Alá | His | Alá | Leu | His | His | Met | Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp |
420 | 425 | 430 |
111
Tyr Arg | Gly 435 | Val | Cys | Pro | Glu | Met 440 | Glu | Gin Alá | Gly Gly 445 | Lys | Lys | Leu | |||
Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | Leu | Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro | Alá | Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | Gin | Lys | Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Cys | Glu | Pro | Cys | Asp | Gly | Tyr | Gin | Tyr | Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | Arg | Pro | Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Gin | Asp | Ile | Pro | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu | Trp | His | Ser | Pro | Trp | Alá | Val |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | Leu | Gly | Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser |
610 | 615 | 620 |
·· ····
Gly 625 | Arg Glu | Leu | Ser | Tyr 630 | Val | Leu | Leu Thr | Gly 635 | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr 640 | ||
Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | Alá | Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | Ile | Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Lys | Ser | Val | Thr | Alá | Pro | Arg | Leu | Ile | Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Alá |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser | Val | Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn | Ile | Ile | Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | Leu | Gly | Tyr | Ser | Ile | Leu | Leu | Met | Val |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Thr | Cys | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile | Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu |
805 | 810 | 815 |
«· ···· • · • · ···· « ···· ♦ ·· ··
113
Lys | Leu | Tyr | Ile 820 | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu 825 | Thr | Ile | Ser | Met | Asn 830 | Leu | Ser |
Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
Asp | Pro | Asn | Ser | Pro | Alá | Alá | Lys | Lys | Lys | Tyr | Val | Ser | Tyr | Asn | Asn |
900 905 910
Leu Val Ile
915 (2) A 13. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 2769 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAZOTTSÁG: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: CDNS (ix) JELLEMZŐK:
• ·· ···· • · · • · ··· · ·«·· · · · · • ·· ··
114 (A) NÉV/KULCS: CDS (B) LOKÁCIÓ: 1..2769 (D) EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = hmGluR7b (xi) A 13. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATG | GTC | CAG | CTG | AGG | AAG | CTG | CTC | CGC | GTC | CTG | ACT | TTG ATG | AAG | TTC | 48 | |
Met | Val | Gin | Leu | Arg | Lys | Leu | Leu | Arg | Val | Leu | Thr | Leu | Met | Lys | Phe | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CCC | TGC | TGC | GTG | CTG | GAG | GTG | CTC | CTG | TGC | GCG | CTG | GCG | GCG | GCG | GCG | 96 |
Pro | Cys | Cys | Val | Leu | Glu | Val | Leu | Leu | Cys | Alá | Leu | Alá | Alá | Alá | Alá | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CGC | GGC | CAG | GAG | ATG | TAC | GCC | CCG | CAC | TCA | ATC | CGG | ATC | GAG | GGG | GAC | 144 |
Arg | Gly | Gin | Glu | Met | Tyr | Alá | Pro | His | Ser | Ile | Arg | Ile | Glu | Gly | Asp | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
GTC | ACC | CTC | GGG | GGG | CTG | TTC | CCC | GTA | CAC | GCC | AAG | GGT | CCC | AGC | GGA | 192 |
Val | Thr | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro | Val | His | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
GTG | CCC | TGC | GGC | GAC | ATC | AAG | AGG | GAA | AAC | GGG | ATC | CAC | AGG | CTG | GAA | 240 |
Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
GCG | ATG | CTC | TAC | GCC | CTG | GAC | CAG | ATC | AAC | AGT | GAT | CCC | AAC | CTA | CTG | 288 |
Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
CCC | AAC | GTG | ACG | CTG | GGC | GCG | CGG | ATC | CTG | GAC | ACT | TGT | TCC | AGG | GAC | 336 |
Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá | Arg | Ile | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser | Arg | Asp |
100
105
110 ···· ·· • · ··· · ···· · · · ·
115
ACT Thr | TAC Tyr | GCG Alá 115 | CTC Leu | GAA Glu | CAG Gin | TCG Ser | CTT Leu 120 | ACT TTC | GTC Val | CAG Gin | GCG Alá 125 | CTC Leu | ATC Ile | CAG Gin | 384 | |
Thr | Phe | |||||||||||||||
AAG | GAC | ACC | TCC | GAC | GTG | CGC | TGC | ACC | AAC | GGC | GAA | CCG | CCG | GTT | TTC | 432 |
Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | Pro | Val | Phe | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
GTC | AAG | CCG | GAG | AAA | GTA | GTT | GGA | GTG | ATT | GGG | GCT | TCG | GGG | AGT | TCG | 480 |
Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val | Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
GTC | TCC | ATC | ATG | GTA | GCC | AAC | ATC | CTG | AGG | CTC | TTC | CAG | ATC | CCC | CAG | 528 |
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
ATT | AGT | TAT | GCA | TCA | ACG | GCA | CCC | GAG | CTA | AGT | GAT | GAC | CGG | CGC | TAT | 576 |
He | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | Pro | Glu | Leu | Ser | Asp | Asp | Arg | Arg | Tyr | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
GAC | TTC | TTC | TCT | CGC | GTG | GTG | CCA | CCC | GAT | TCC | TTC | CAA | GCC | CAG | GCC | 624 |
Asp | Phe | Phe | Ser | Arg | Val | Val | Pro | Pro | Asp | Ser | Phe | Gin | Alá | Gin | Alá | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
ATG | GTA | GAC | ATT | GTA | AAG | GCC | CTA | GGC | TGG | AAT | TAT | GTG | TCT | ACC | CTC | 672 |
Met | Val | Asp | Ile | Val | Lys | Alá | Leu | Gly | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Leu | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
GCA | TCG | GAA | GGA | AGT | TAT | GGA | GAG | AAA | GGT | GTG | GAG | TCC | TTC | ACG | CAG | 720 |
Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | Glu | Lys | Gly | Val | Glu | Ser | Phe | Thr | Gin | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
ATT | TCC | AAA | GAG | GCA | GGT | GGA | CTC | TGC | ATT | GCC | CAG | TCC | GTG | AGA | ATC | 768 |
Ile | Ser | Lys | Glu | Alá | Gly | Gly | Leu | Cys | Ile | Alá | Gin | Ser | Val | Arg | Ile | |
245 | 250 | 255 |
• · · · • · *
• · · • · · ·
116
CCC Pro | CAG GAA Gin Glu | CGC Arg 260 | AAA Lys | GAC Asp | AGG ACC | ATT GAC | TTT Phe | GAT AGA | ATT Ile 270 | ATC Ile | AAA Lys | 816 | ||||
Arg | Thr | Ile 265 | Asp | Asp | Arg | |||||||||||
CAG | CTC | CTG | GAC | ACC | CCC | AAC | TCC | AGG | GCC | GTC | GTG | ATT | TTT | GCC | AAC | 864 |
Gin | Leu | Leu | Asp | Thr | Pro | Asn | Ser | Arg | Alá | Val | Val | Ile | Phe | Alá | Asn | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
GAT | GAG | GAT | ATA | AAG | CAG | ATC | CTT | GCA | GCA | GCC | AAA | AGA | GCT | GAC | CAA | 912 |
Asp | Glu | Asp | Ile | Lys | Gin | Ile | Leu | Alá | Alá | Alá | Lys | Arg | Alá | Asp | Gin | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
GTT | GGC | CAT | TTT | CTT | TGG | GTG | GGA | TCA | GAC | AGC | TGG | GGA | TCC | AAA | ATA | 960 |
Val | Gly | His | Phe | Leu | Trp | Val | Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
AAC | CCA | CTG | CAC | CAG | CAT | GAA | GAT | ATC | GCA | GAA | GGG | GCC | ATC | ACC | ATT | 1008 |
Asn | Pro | Leu | His | Gin | His | Glu | Asp | Ile | Alá | Glu | Gly | Alá | Ile | Thr | Ile | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
CAG | CCC | AAG | CGA | GCC | ACG | GTG | GAA | GGG | TTT | GAT | GCC | TAC | TTT | ACG | TCC | 1056 |
Gin | Pro | Lys | Arg | Alá | Thr | Val | Glu | Gly | Phe | Asp | Alá | Tyr | Phe | Thr | Ser | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
CGT | ACA | CTT | GAA | AAC | AAC | AGA | AGA | AAT | GTA | TGG | TTT | GCC | GAA | TAC | TGG | 1104 |
Arg | Thr | Leu | Glu | Asn | Asn | Arg | Arg | Asn | Val | Trp | Phe | Alá | Glu | Tyr | Trp | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
GAG | GAA | AAC | TTC | AAC | TGC | AAG | TTG | ACG | ATT | AGT | GGG | TCA | AAA | AAA | GAA | 1152 |
Glu | Glu | Asn | Phe | Asn | Cys | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Gly | Ser | Lys | Lys | Glu | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
GAC | ACA | GAT | CGC | AAA | TGC | ACA | GGA | CAG | GAG | AGA | ATT | GGA | AAA | GAT | TCC | 1200 |
Asp | Thr | Asp | Arg | Lys | Cys | Thr | Gly | Gin | Glu | Arg | Ile | Gly | Lys | Asp | Ser |
385 390 395
400 « · · · · · · • · · • · · · · · «···· ·· · • · · ··
117
AAC Asn | TAT Tyr | GAG Glu | CAG GAG | GGT AAA | GTC Val | CAG Gin | TTC Phe 410 | GTG Val | ATT Ile | GAC Asp | GCA Alá | GTC Val 415 | TAT Tyr | 1248 | ||
Gin | Glu 405 | Gly | Lys | |||||||||||||
GCT | ATG | GCT | CAC | GCC | CTT | CAC | CAC | ATG | AAC | AAG | GAT | CTC | TGT | GCT | GAC | 1296 |
Alá | Met | Alá | His | Alá | Leu | His | His | Met | Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
TAC | CGG | GGT | GTC | TGC | CCA | GAG | ATG | GAG | CAA | GCT | GGA | GGC | AAG | AAG | TTG | 1344 |
Tyr | Arg | Gly | Val | Cys | Pro | Glu | Met | Glu | Gin | Alá | Gly | Gly | Lys | Lys | Leu | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
CTG | AAG | TAT | ATA | CGC | AAT | GTT | AAT | TTC | AAT | GGT | AGT | GCT | GGC | ACT | CCA | 1392 |
Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
GTG | ATG | TTT | AAC | AAG | AAC | GGG | GAT | GCA | CCT | GGG | CGT | TAT | GAC | ATC | TTT | 1440 |
Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
CAG | TAC | CAG | ACC | ACA | AAC | ACC | AGC | AAC | CCG | GGT | TAC | CGT | CTG | ATC | GGG | 1488 |
Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
CAG | TGG | ACA | GAC | GAA | CTT | CAG | CTC | AAT | ATA | GAA | GAC | ATG | CAG | TGG | GGT | 1536 |
Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | Leu | Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
AAA | GGA | GTC | CGA | GAG | ATA | CCC | GCC | TCA | GTG | TGC | ACA | CTA | CCA | TGT | AAG | 1584 |
Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro | Alá | Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
CCA | GGA | CAG | AGA | AAG | AAG | ACA | CAG | AAA | GGA | ACT | CCT | TGC | TGT | TGG | ACC | 1632 |
Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | Gin | Lys | Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr |
530
535
540
118
TGT Cys 545 | GAG Glu | CCT TGC Pro Cys | GAT Asp | GGT TAC | CAG Gin | TAC CAG TTT | GAT Asp | GAG ATG Glu Met | ACA Thr | TGC Cys 560 | 1680 | |||||
Gly 550 | Tyr | Tyr | Gin | Phe 555 | ||||||||||||
CAG | CAT | TGC | CCC | TAT | GAC | CAG | AGG | CCC | AAT | GAA | AAT | CGA | ACC | GGA | TGC | 1728 |
Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | Arg | Pro | Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
CAG | GAT | ATT | CCC | ATC | ATC | AAA | CTG | GAG | TGG | CAC | TCC | CCC | TGG | GCT | GTG | 1776 |
Gin | Asp | Ile | Pro | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu | Trp | His | Ser | Pro | Trp | Alá | Val | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
ATT | CCT | GTC | TTC | CTG | GCA | ATG | TTG | GGG | ATC | ATT | GCC | ACC | ATC | TTT | GTC | 1824 |
Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | Leu | Gly | Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
ATG | GCC | ACT | TTC | ATC | CGC | TAC | AAT | GAC | ACG | CCC | ATT | GTC | CGG | GCA | TCT | 1872 |
Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
GGG | CGG | GAA | CTC | AGC | TAT | GTT | CTT | TTG | ACG | GGC | ATC | TTT | CTT | TGC | TAC | 1920 |
Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu | Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
ATC | ATC | ACT | TTC | CTG | ATG | ATT | GCC | AAA | CCA | GAT | GTG | GCA | GTG | TGT | TCT | 1968 |
Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | Alá | Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
TTC | CGG | CGA | GTT | TTC | TTG | GGC | TTG | GGT | ATG | TGC | ATC | AGT | TAT | GCA | GCC | 2016 |
Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
CTC | TTG | ACG | AAA | ACA | AAT | CGG | ATT | TAT | CGC | ATA | TTT | GAG | CAG | GGC | AAG | 2064 |
Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | Ile | Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys |
675
680
685
119
ΑΛΑ Lys | TCA Ser 690 | GTA Val | ACA Thr | GCT CCC | AGA Arg 695 | CTC Leu | ATA AGC | CCA Pro | ACA Thr 700 | TCA Ser | CAA Gin | CTG Leu | GCA Alá | 2112 | ||
Alá | Pro | Ile | Ser | |||||||||||||
ATC | ACT | TCC | AGT | TTA | ATA | TCA | GTT | CAG | CTT | CTA | GGG | GTG | TTC | ATT | TGG | 2160 |
Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser | Val | Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp | |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||||
TTT | GGT | GTT | GAT | CCA | CCC | AAC | ATC | ATC | ATA | GAC | TAC | GAT | GAA | CAC | AAG | 2208 |
Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn | Ile | Ile | Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys | |
725 | 730 | 735 | ||||||||||||||
ACA | ATG | AAC | CCT | GAG | CAA | GCC | AGA | GGG | GTT | CTC | AAG | TGT | GAC | ATT | ACA | 2256 |
Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr | |
740 | 745 | 750 | ||||||||||||||
GAT | CTC | CAA | ATC | ATT | TGC | TCC | TTG | GGA | TAT | AGC | ATT | CTT | CTC | ATG | GTC | 2304 |
Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | Leu | Gly | Tyr | Ser | He | Leu | Leu | Met | Val | |
755 | 760 | 765 | .. | |||||||||||||
ACA | TGT | ACT | GTG | TAT | GCC | ATC | AAG | ACT | CGG | GGT | GTA | CCC | GAG | AAT | TTT | 2352 |
Thr | Cys | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile | Lys | Thr | Arg | Gly | Val | Pro | Glu | Asn | Phe | |
770 | 775 | 780 | ||||||||||||||
AAC | GAA | GCC | AAG | CCC | ATT | GGA | TTC | ACT | ATG | TAC | ACG | ACA | TGT | ATA | GTA | 2400 |
Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val | |
785 | 790 | 795 | 800 | |||||||||||||
TGG | CTT | GCC | TTC | ATT | CCA | ATT | TTT | TTT | GGC | ACC | GCT | CAA | TCA | GCG | GAA | 2448 |
Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu | |
805 | 810 | 815 | ||||||||||||||
AAG | CTC | TAC | ATA | CAA | ACT | ACC | ACG | CTT | ACA | ATC | TCC | ATG | AAC | CTA | AGT | 2496 |
Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu | Thr | Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser |
820 825 830 • · · · • · ·
120
GCA | TCA | GTG | GCG | CTG | GGG | ATG | CTA | TAC | ATG | CCG | AAA | GTG | TAC | ATC | ATC | 2544 |
Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile | |
835 | 840 | 845 | ||||||||||||||
ATT | TTC | CAC | CCT | GAA | CTC | AAT | GTC | CAG | AAA | CGG | AAG | CGA | AGC | TTC | AAG | 2592 |
Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys | |
850 | 855 | 860 | ||||||||||||||
GCG | GTA | GTC | ACA | GCA | GCC | ACC | ATG | TCA | TCG | AGG | CTG | TCA | CAC | AAA | CCC | 2640 |
Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro | |
865 | 870 | 875 | 880 | |||||||||||||
AGT | GAC | AGA | CCC | AAC | GGT | GAG | GCA | AAG | ACC | GAG | CTC | TGT | GAA | AAC | GTA | 2688 |
Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val | |
885 | 890 | 895 | ||||||||||||||
GAC | CCA | AAC | AAC | TGT | ATA | CCA | CCA | GTA | AGA | AAG | AGT | GTA | CAA | AAG | TCT | 2736 |
Asp | Pro | Asn | Asn | Cys | Ile | Pro | Pro | Val | Arg | Lys | Ser | Val | Gin | Lys | Ser | |
900 | 905 | 910 | ||||||||||||||
GTT | ACT | TGG | TAC | ACT | ATC | CCA | CCA | ACA | GTA | TA | 2769 | |||||
Val | Thr | Trp | Tyr | Thr | Ile | Pro | Pro | Thr | Val |
915 920 (2) A 14. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 922 aminosav (B) TÍPUS: aminosav • · • « ♦ · • · · ·
121 (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 14. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Met 1 | Val | Gin | Leu | Arg 5 | Lys | Leu | Leu | Arg Val 10 | Leu | Thr | Leu | Met | Lys 15 | Phe | |
Pro | Cys | Cys | Val | Leu | Glu | Val | Leu | Leu | Cys | Alá | Leu | Alá | Alá | Alá | Alá |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Arg | Gly | Gin | Glu | Met | Tyr | Alá | Pro | His | Ser | Ile | Arg | Ile | Glu | Gly | Asp |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Val | Thr | Leu | Gly | Gly | Leu | Phe | Pro | Val | His | Alá | Lys | Gly | Pro | Ser | Gly |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Val | Pro | Cys | Gly | Asp | Ile | Lys | Arg | Glu | Asn | Gly | Ile | His | Arg | Leu | Glu |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Alá | Met | Leu | Tyr | Alá | Leu | Asp | Gin | Ile | Asn | Ser | Asp | Pro | Asn | Leu | Leu |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Pro | Asn | Val | Thr | Leu | Gly | Alá | Arg | Ile | Leu | Asp | Thr | Cys | Ser | Arg | Asp |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Thr | Tyr | Alá | Leu | Glu | Gin | Ser | Leu | Thr | Phe | Val | Gin | Alá | Leu | Ile | Gin |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Lys | Asp | Thr | Ser | Asp | Val | Arg | Cys | Thr | Asn | Gly | Glu | Pro | Pro | Val | Phe |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Val | Lys | Pro | Glu | Lys | Val | Val | Gly | Val | Ile | Gly | Alá | Ser | Gly | Ser | Ser |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Val | Ser | Ile | Met | Val | Alá | Asn | Ile | Leu | Arg | Leu | Phe | Gin | Ile | Pro | Gin |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Ile | Ser | Tyr | Alá | Ser | Thr | Alá | Pro | Glu | Leu | Ser | Asp | Asp | Arg | Arg | Tyr |
180 | 185 | 190 |
122
Asp | Phe | Phe 195 | Ser | Arg Val Val | Pro 200 | Pro | Asp | Ser | Phe | Gin Alá 205 | Gin | Alá | |||
Met | Val | Asp | Ile | Val | Lys | Alá | Leu | Gly | Trp | Asn | Tyr | Val | Ser | Thr | Leu |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Alá | Ser | Glu | Gly | Ser | Tyr | Gly | Glu | Lys | Gly | Val | Glu | Ser | Phe | Thr | Gin |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ile | Ser | Lys | Glu | Alá | Gly | Gly | Leu | Cys | Ile | Alá | Gin | Ser | Val | Arg | Ile |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Pro | Gin | Glu | Arg | Lys | Asp | Arg | Thr | Ile | Asp | Phe | Asp | Arg | Ile | Ile | Lys |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Gin | Leu | Leu | Asp | Thr | Pro | Asn | Ser | Arg | Alá | Val | Val | Ile | Phe | Alá | Asn |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Asp | Glu | Asp | Ile | Lys | Gin | Ile | Leu | Alá | Alá | Alá | Lys | Arg | Alá | Asp | Gin |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Val | Gly | His | Phe | Leu | Trp | Val | Gly | Ser | Asp | Ser | Trp | Gly | Ser | Lys | Ile |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Asn | Pro | Leu | His | Gin | His | Glu | Asp | Ile | Alá | Glu | Gly | Alá | Ile | Thr | Ile |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Gin | Pro | Lys | Arg | Alá | Thr | Val | Glu | Gly | Phe | Asp | Alá | Tyr | Phe | Thr | Ser |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Arg | Thr | Leu | Glu | Asn | Asn | Arg. Arg | Asn | Val | Trp | Phe | Alá | Glu | Tyr | Trp | |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Glu | Glu | Asn | Phe | Asn | Cys | Lys | Leu | Thr | Ile | Ser | Gly | Ser | Lys | Lys | Glu |
370 | 375 | 380 |
• ·
123
Asp 385 | Thr Asp | Arg Lys | Cys 390 | Thr Gly Gin Glu Arg 395 | Ile | Gly | Lys | Asp | Ser 400 | ||||||
Asn | Tyr | Glu | Gin | Glu | Gly | Lys | Val | Gin | Phe | Val | Ile | Asp | Alá | Val | Tyr |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Alá | Met | Alá | His | Alá | Leu | His | His | Met | Asn | Lys | Asp | Leu | Cys | Alá | Asp |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Tyr | Arg | Gly | Val | Cys | Pro | Glu | Met | Glu | Gin | Alá | Gly | Gly | Lys | Lys | Leu |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Leu | Lys | Tyr | Ile | Arg | Asn | Val | Asn | Phe | Asn | Gly | Ser | Alá | Gly | Thr | Pro |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Val | Met | Phe | Asn | Lys | Asn | Gly | Asp | Alá | Pro | Gly | Arg | Tyr | Asp | Ile | Phe |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Gin | Tyr | Gin | Thr | Thr | Asn | Thr | Ser | Asn | Pro | Gly | Tyr | Arg | Leu | Ile | Gly |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Gin | Trp | Thr | Asp | Glu | Leu | Gin | Leu | Asn | Ile | Glu | Asp | Met | Gin | Trp | Gly |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Lys | Gly | Val | Arg | Glu | Ile | Pro | Alá | Ser | Val | Cys | Thr | Leu | Pro | Cys | Lys |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Pro | Gly | Gin | Arg | Lys | Lys | Thr | Gin | Lys | Gly | Thr | Pro | Cys | Cys | Trp | Thr |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Cys | Glu | Pro | Cys | Asp | Gly | Tyr | Gin | Tyr | Gin | Phe | Asp | Glu | Met | Thr | Cys |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Gin | His | Cys | Pro | Tyr | Asp | Gin | Arg | Pro | Asn | Glu | Asn | Arg | Thr | Gly | Cys |
565 | 570 | 575 |
• ·
124
Gin | Asp | Ile | Pro 580 | Ile | Ile | Lys | Leu | Glu 585 | Trp | His | Ser | Pro | Trp 590 | Alá | Val |
Ile | Pro | Val | Phe | Leu | Alá | Met | Leu | Gly | Ile | Ile | Alá | Thr | Ile | Phe | Val |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Met | Alá | Thr | Phe | Ile | Arg | Tyr | Asn | Asp | Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu | Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Cys | Tyr |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Ile | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Ile | Alá | Lys | Pro | Asp | Val | Alá | Val | Cys | Ser |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Phe | Arg | Arg | Val | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | Met | Cys | Ile | Ser | Tyr | Alá | Alá |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | Ile | Tyr | Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Lys | Ser | Val | Thr | Alá | Pro | Arg | Leu | Ile | Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Alá |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Ile | Thr | Ser | Ser | Leu | Ile | Ser | Val | Gin | Leu | Leu | Gly | Val | Phe | Ile | Trp |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Phe | Gly | Val | Asp | Pro | Pro | Asn | Ile | Ile | Ile | Asp | Tyr | Asp | Glu | His | Lys |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Thr | Met | Asn | Pro | Glu | Gin | Alá | Arg | Gly | Val | Leu | Lys | Cys | Asp | Ile | Thr |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Asp | Leu | Gin | Ile | Ile | Cys | Ser | Leu | Gly | Tyr | Ser | Ile | Leu | Leu | Met | Val |
755 760 765
125
Thr | Cys 770 | Thr | Val | Tyr | Alá | Ile 775 | Lys | Thr Arg Gly | Val 780 | Pro | Glu | Asn | Phe | ||
Asn | Glu | Alá | Lys | Pro | Ile | Gly | Phe | Thr | Met | Tyr | Thr | Thr | Cys | Ile | Val |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Trp | Leu | Alá | Phe | Ile | Pro | Ile | Phe | Phe | Gly | Thr | Alá | Gin | Ser | Alá | Glu |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
Lys | Leu | Tyr | Ile | Gin | Thr | Thr | Thr | Leu | Thr | Ile | Ser | Met | Asn | Leu | Ser |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Alá | Ser | Val | Alá | Leu | Gly | Met | Leu | Tyr | Met | Pro | Lys | Val | Tyr | Ile | Ile |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Ile | Phe | His | Pro | Glu | Leu | Asn | Val | Gin | Lys | Arg | Lys | Arg | Ser | Phe | Lys |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
Alá | Val | Val | Thr | Alá | Alá | Thr | Met | Ser | Ser | Arg | Leu | Ser | His | Lys | Pro |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
Ser | Asp | Arg | Pro | Asn | Gly | Glu | Alá | Lys | Thr | Glu | Leu | Cys | Glu | Asn | Val |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
Asp | Pro | Asn | Asn | Cys | Ile | Pro | Pro | Val | Arg | Lys | Ser | Val | Gin | Lys | Ser |
900 | 905 | 910 | |||||||||||||
Val | Thr | Trp | Tyr | Thr | Ile | Pro | Pro | Thr | Val |
915 920 (2) A 15. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
126 (i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 630 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLAZOTTSÁG: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: cDNS (ix) JELLEMZŐK:
(A) NÉV/KULCS: CDS (B) LOKÁCIÓ: 1..630 (D) EGYÉB INFORMÁCIÓ: /termék = részleges hmGluR6 (xi) A 15. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
GTG | GAG | GCC | CTG | CAG | TGG | TCT | GGC | GAC | CCC | CAC | GAG | GTG | CCC | TCG | TCT | 48 |
Val | Glu | Alá | Leu | Gin | Trp | Ser | Gly | Asp | Pro | His | Glu | Val | Pro | Ser | Ser | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
CTG | TGC | AGC | CTG | CCC | TGC | GGG | CCG | GGG | GAG | CGG | AAG | AAG | ATG | GTG | AAG | 96 |
Leu | Cys | Ser | Leu | Pro | Cys | Gly | Pro | Gly | Glu | Arg | Lys | Lys | Met | Val | Lys | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
GGC | GTC | CCC | TGC | TGT | TGG | CAC | TGC | GAG | GCC | TGT | GAC | GGG | TAC | CGC | TTC | 144 |
Gly | Val | Pro | Cys | Cys | Trp | His | Cys | Glu | Alá | Cys | Asp | Gly | Tyr | Arg | Phe | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
CAG | GTG | GAC | GAG | TTC | ACA | TGC | GAG | GCC | TGT | CCT | GGG | TAC | ATG | AGG | CCC | 192 |
Gin | Val | Asp | Glu | Phe | Thr | Cys | Glu | Alá | Cys | Pro | Gly | Tyr | Met | Arg | Pro | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ACN | CCC | AAC | CAC | ATC | NNA | CTT | NNG | CCC | ACA | CCT | GTG | GTG | CGC | CTG | AGC | 240 |
Xaa | Pro | Asn | His | Ile | Xaa | Leu | Xaa | Pro | Thr | Pro | Val | Val | Arg | Leu | Ser |
TGG TCC | TCC Ser | CCC Pro | TGG Trp 85 | GCA Alá | GCC Alá | CCG Pro | CCG Pro | CTC Leu 90 | CTC Leu | CTG Leu | GCC Alá | GTG Val | CTG Leu 95 | GGC Gly | 288 | |
Trp | Ser | |||||||||||||||
ATC | GTG | GCC | ACT | ACC | ACG | GTG | GTG | GCC | ACC | TTC | GTG | CGG | TAC | AAC | AAC | 336 |
Ile | Val | Alá | Thr | Thr | Thr | Val | Val | Alá | Thr | Phe | Val | Arg | Tyr | Asn | Asn | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
ACG | CCC | ATC | GTC | CGG | GCC | TCG | GGC | CGA | GAG | CTC | AGC | TAC | GTC | CTC | CTC | 384 |
Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | Gly | Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
ACC | GGC | ATC | TTC | CTC | ATC | TAC | GCC | ATC | ACC | TTC | CTC | ATG | GTG | GCT | GAG | 432 |
Thr | Gly | Ile | Phe | Leu | Ile | Tyr | Alá | Ile | Thr | Phe | Leu | Met | Val | Alá | Glu | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
CCT | GGG | GCA | GCG | GTC | TGT | GCC | GCC | CGC | AGG | CTC | TTC | CTG | GGC | CTG | GGC | 480 |
Pro | Gly | Alá | Alá | Val | Cys | Alá | Alá | Arg | Arg | Leu | Phe | Leu | Gly | Leu | Gly | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
ACG | ACC | CTC | AGC | TAC | TCT | GCC | CTG | CTC | ACC | AAG | ACC | AAC | CGT | ATC | TAC | 528 |
Thr | Thr | Leu | Ser | Tyr | Ser | Alá | Leu | Leu | Thr | Lys | Thr | Asn | Arg | Ile | Tyr | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
CGC | ATC | TTT | GAG | CAG | GGC | AAG | CGC | TCG | GTC | ACA | CCC | CCT | CCC | TTC | ATC | 576 |
Arg | Ile | Phe | Glu | Gin | Gly | Lys | Arg | Ser | Val | Thr | Pro | Pro | Pro | Phe | Ile | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
AGC | CCC | ACC | TCA | CAG | CTG | GTC | ATC | ACC | TTC | AGC | CTC | ACC | TCC | CTG | CAG | 624 |
Ser | Pro | Thr | Ser | Gin | Leu | Val | Ile | Thr | Phe | Ser | Leu | Thr | Ser | Leu | Gin |
195 200 205
GTG GGG
Val Gly
210
630
128 (2) A 16. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 210 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (xi) A 16. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
Val | Glu | Alá | Leu | Gin | Trp | Ser | Gly |
1 | 5 | ||||||
Leu | Cys | Ser | Leu | Pro | Cys | Gly | Pro |
20 | |||||||
Gly | Val | Pro | Cys | Cys | Trp | His | Cys |
35 | 40 | ||||||
Gin | Val | Asp | Glu | Phe | Thr | Cys | Glu |
50 | 55 | ||||||
Xaa | Pro | Asn | His | Ile | Xaa | Leu | Xaa |
65 | 70 | ||||||
Trp | Ser | Ser | Pro | Trp | Alá | Alá | Pro |
85 | |||||||
Ile | Val | Alá | Thr | Thr | Thr | Val | Val |
100 | |||||||
Thr | Pro | Ile | Val | Arg | Alá | Ser | Gly |
115
120
Asp | Pro 10 | His | Glu | Val | Pro | Ser 15 | Ser |
Gly | Glu | Arg | Lys | Lys | Met | Val | Lys |
25 | 30 | ||||||
Glu | Alá | Cys | Asp | Gly | Tyr | Arg | Phe |
45 | |||||||
Alá | Cys | Pro | Gly | Tyr | Met | Arg | Pro |
60 | |||||||
Pro | Thr | Pro | Val | Val | Arg | Leu | Ser |
75 | 80 | ||||||
Pro | Leu | Leu | Leu | Alá | Val | Leu | Gly |
90 | 95 | ||||||
Alá | Thr | Phe | Val | Arg | Tyr | Asn | Asn |
105 | 110 | ||||||
Arg | Glu | Leu | Ser | Tyr | Val | Leu | Leu |
125 • · · · · · · • · · • · ··· · ····· ♦ · ·
Claims (33)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1. Tisztított humán metabotróp glutamát receptor (hmGluR), azzal jellemezve, hogy a hmGluR4, a hmGluR6 és a hmGluR7 altípusokat tartalmazó csoportból cselektált hmGluR4 alcsalád tagja, ahol a hmGluR4a 2. számú szekvenciában leírt aminosav szekvenciával rendelkezik; a hmGluR7-et a 12. számú szekvenciában leírt aminosav szekvenciával rendelkező hmGluR7at, a 14. számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező hmGluR7b-t, valamint a sorrendben a 6., 8., vagy a10. számú aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidet tartalmazó hmGluR7et tartalmazó csoportból szelektáljuk; és a hmGluRő egy a 16. számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidet tartalmaz.
- 2. Az 1. igénypont szerinti receptor azzal jellemezve, hogy a hmGluR4 altípus a 2. számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkezik.
- 3. Az 1. igénypont szerinti receptor azzal jellemezve, hogy a hmGluR7 altípust a 12. számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező hmGluR7a-t és a 14. számú131 • ······ · • ·«···· ·· · ···· ··· · · · ·· szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező hmGluR7b-t tartalmazó csoportból szelktáljuk.
- 4. Az 1. igénypont szerinti receptor azzal jellemezve, hogy a hmGluR7 altípus sorrendben egy a 6., 8. és 10. számú szekvenciákban bemutatott aminosav szekvenciákkal rendelkező polipeptideket tartalmazó csoportból szelektált polipeptidet tartalmaz.
- 5. Az 1. igénypont szerinti receptor azzal jellemezve, hogy a hmGluR6 altípus egy a 16. számú szekvenciában bemutatott aminosav szekvenciával rendelkező polipeptidet tartalmaz.
- 6. Az 1. igénypont szerinti receptor variánsa azzal jellemezve, hogy hasítási variánsokat, aminosav mutánsokat, glikozilációs variánsokat, membránhoz kötött és oldható fragmenteket valamint kovalens vagy aggregációs egységeket valamint más kémiai egységeket tartalmazó csoportból szelektáljuk.
- 7. Az 1. igénypont szerinti receptor előállítására szolgáló eljárás azzal jellemezve, hogy az ilyen receptort kódoló DNS-t és promótert (a DNS-t az említett promóter szabályozza) tartalmazó expressziós kazettát magába foglaló hibrid vektorral transzformált megfelelő gazdasejtet in vitro vagy in vivő szaporítjuk.
- 8. Az 1. igénypont szerinti receptor azzal jellemezve, hogy az említett receptor aktivitását módosító vegyület szkrínelésére használjuk.• · · ·« ·« · · · • · • · · ·132
- 9. Nukleinsav azzal jellemezve, hogy az izolált nukleinsav az1. igénypont szerinti receptort vagy az említett nukleinsav egy fragmentjét kódoló nukleinsavat tartalmaz.
- 10. A 9. igénypont szerinti nukleinsav azzal jellemezve, hogy a nukleinsavat egy DNS molekula képviseli.
- 11. A 10. igénypont szerinti DNS azzal jellemezve, hogy alapjában véve sorrendben az 1., 3., 5., 7., 9., 11., 13. és15. számú szekvenciákban bemutatott nukleotid szekvenciákkal rendelkező DNS-eket tartalmazó csoportból szelektáljuk.
- 12. Nukleinsav próba azzal jellemezve, hogy a 10. vagy a 11. igénypontok szerinti DNS legalább 14 szomszédos bázisát vagy ezek komplementjeit tartalmazza.
- 13. A 10. igénypont szerinti nukleinsav előállítására szolgáló módszer azzal jellemezve, hogy az eljárás kémiai szintézist, rekombináns DNS technológiát vagy polimeráz láncreakciót (PCR) j elent.
- 14. A 10. igénypont szerinti DNS azzal jellemezve, hogy egy hibrid vektort jelent.
- 15. Egy gazdasejt azzal jellemezve, hogy a 10. igénypont szerinti DNS-t tartalmazza.····133
- 16. Egy eukarióta gazdasejt azzal jellemezve, hogy a 10. igénypont szerinti DNS-t expresszálja.
- 17. A 15. és 16. igénypontok szerinti gazdasejt azzal jellemezve, hogy egy emlős sejtet jelent.
- 18. A 15. igénypont szerinti gazdasejt használata azzal jellemezve, hogy az 1. igénypont szerinti receptor aktivitását módosító vegyület szkrínelésére használjuk.
- 19. A 15. igénypont szerinti gazdasejt előállítására szolgáló módszer azzal jellemezve, hogy a gazdasejtet a 14. igénypont szerinti hibrid vektorral transzfektáljuk vagy transzformáljuk.
- 20. Tisztított mRNS azzal jellemezve, hogy a 11. igénypont szerinti DNS-sel komplementer mRNS-t jelent.
- 21. Egy az 1. igénypont szerinti hmGluR altípust kódoló DNS azonosítására szolgáló módszer azzal jellemezve, hogy egy humán DNS-t a 12. igénypont szerinti próbával hozunk kapcsolatba, majd az említett próbához alapjában véve hibridizáló DNS(eke)t azonosítjuk.
- 22. Egy a hmGluR altípushoz kapcsolódó vegyületek azonosítására szolgáló módszer azzal jellemezve, hogy az 1. igénypont szerinti receptort egy kompetíciós kötődési vizsgálatban alkalmazzuk.·· ·« fi134
- 23. Egy az 1. igénypont szerinti hmGluR altípus aktivitását módosító vegyületek azonosítására szolgáló eljárás azzal jellemezve, hogy- a 16. igénypont szerinti sejteket legalább egy olyan vegyúlettel vagy jellel hozzuk kapcsolatba, melynek az említett receptor altípus aktivitásának módosítására való képességét meg szándékozunk határozni, majd ezt követően- a sejteket a funkcionális válaszukban bekövetkezett eltérésekre, mely eltérések az említett receptornak köszönhetőek analizáljuk.
- 24. A 23. igénypont szerinti vizsgálat azzal jellemezve, hogy-a 16. igénypont szerinti sejteket legalább egy olyan vegyülettel vagy jellel hozzuk kapcsolatba, melynek a találmány receptor altípus második messenger aktivitásának módosítására való képességét meg szándékozunk határozni, majd ezt követően- az említett sejteket az adott második messenger szintjének változása céljából nyomon követjük.
- 25. Egy az 1. igénypont szerinti hmGluR altípus jel transzdukciós aktivitásának módosítására szolgáló eljárás azzal jellemezve, hogy az említett altípust legalább egy a 24. igénypont szerinti vizsgálatban azonosított vegyület hatékony mennyiségével kapcsolatba hozzuk.
- 26. Egy az 1. igénypont szerinti agonista aktivitással rendelkező hmGluR altípus glutamát agonistájának vagy alloszterikus modulátorának detektálására szolgáló módszer ···« ····135 azzal jellemezve, hogy a módszer a következő két lépésből áll:(a) egy vegyületet kiteszünk egy az 1. igénypont szerinti hmGluR altípus válasz hatásának olyan körülmények között és annyi ideig, mely elegendő ahhoz, hogy a vegyület a receptorral kölcsönhatásba lépjen és egy kölcsönös választ adjon a reakció révén, és (b) a válasz stimulálásának növekedését vagy csökkenését detektáljuk, mely válasz a vegyület hmGluR altípussal való kölcsönhatásának eredménye, és ezt viszonyítjuk ahhoz az esethez, amikor a tesztelt vegyület nincs jelen, és ezen adatokból az agonista-szerű aktivitással rendelkező agonista vagy alloszterikus modulátor jelenlétét meghatározzuk.
- 27. Egy az 1. igénypont szerinti antagonista aktivitással rendelkező hmGluR altípus glutamát antagonistájának vagy alloszterikus modulátorának azonosítására szolgáló módszer azzal jellemezve, hogy a módszer a következő két lépésből áll: (a) egy vegyületet kiteszünk egy az 1. igénypont szerinti hmGluR altípus egy ismert glutamát agonistaja hatásának olyan körülmények között és annyi ideig, mely elegendő ahhoz, hogy az agonista a receptorral kölcsönhatásba lépjen és egy kölcsönös választ adjon a reakció révén, és (b) az agonista által adott válasz stimulálásának gátlását detektáljuk, mely válasz a vegyület hmGluR altípussal való kölcsönhatásának eredménye, és ezt viszonyítjuk ahhoz a válasz stimuláláshoz, melyet csupán a glutamát agonista indukál, és ezen adatokból az antagonistaszerű aktivitással rendelkező glutamát antagonista vagy alloszterikus modulátor jelenlétét meghatározzuk.·· ···· • · ♦· · · · • · · · ··· · • ········· ···· ··· · ·· ··136
- 28. Egy antitest azzal jellemezve, hogy az 1. igénypont szerinti protein ellen irányítjuk.
- 29. A 28 igénypont szerinti antitest azzal jellemezve, hogy egy poliklonális antitestet jelent.
- 30. A 28 igénypont szerinti antitest azzal jellemezve, hogy egy monoklonális antitestet jelent.
- 31. Az 1. igénypont szerinti hmGluR altípus jel transzdukciós aktivitásának módosítására szolgáló módszer azzal jellemezve, hogy az említett receptort a 28. igénypont szerinti antitesttel hozzuk érintkezésbe.
- 32. Az 1. igénypont szerinti receptor azzal jellemezve, hogy rekombináns DNS technológiával nyerjük.
- 33. Egy fúziós protein azzal jellemezve, hogy az 1. igénypont szerinti receptort tartalmazza.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP93810663 | 1993-09-20 | ||
GB9416553A GB9416553D0 (en) | 1993-09-20 | 1994-08-19 | Novel receptor proteins |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9600692D0 HU9600692D0 (en) | 1996-05-28 |
HUT74247A true HUT74247A (en) | 1996-11-28 |
Family
ID=26134839
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9600692A HUT74247A (en) | 1993-09-20 | 1994-09-07 | Human metabotropic glutamate receptor subtypes (hmr4, hmr6, hmr7) and related dna compounds |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US6228610B1 (hu) |
EP (2) | EP1199359B1 (hu) |
JP (1) | JPH09503913A (hu) |
AT (2) | ATE522610T1 (hu) |
AU (1) | AU695641B2 (hu) |
CA (1) | CA2171206A1 (hu) |
DE (1) | DE69434166T2 (hu) |
FI (1) | FI961251A (hu) |
HU (1) | HUT74247A (hu) |
NO (1) | NO961115D0 (hu) |
NZ (1) | NZ273015A (hu) |
WO (1) | WO1995008627A1 (hu) |
Families Citing this family (48)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5912122A (en) * | 1993-06-04 | 1999-06-15 | Sibia Neurosciences, Inc. | Nucleic acids encoding and method for detecting nucleic acid encoding human metabotropic glutamate receptor subtype mGluR6 |
US6274330B1 (en) | 1993-12-30 | 2001-08-14 | Zymogenetics, Inc. | L-AP4 sensitive glutamate receptors |
WO1995022609A2 (en) * | 1994-02-21 | 1995-08-24 | The Wellcome Foundation Limited | Human glutamate receptor proteins |
IL120424A0 (en) * | 1995-07-26 | 1997-07-13 | Nps Pharma Inc | Chimeric receptors and methods for identifying compounds active at metabotropic glutamate receptors and the use of such compounds in the treatment of neurological disorders and diseases |
US6084084A (en) * | 1996-02-21 | 2000-07-04 | Nps Pharmaceuticals, Inc. | Human metabotropic glutamate receptor |
US6384205B1 (en) * | 1996-03-12 | 2002-05-07 | Eli Lilly And Company | Metabotropic glutamate receptor 4 nucleic acid |
US6221609B1 (en) * | 1996-07-03 | 2001-04-24 | Eli Lilly And Company | Isolate nucleic acid encoding human MGLUR8 |
WO1998011242A2 (en) | 1996-09-13 | 1998-03-19 | Novartis Ag | Neurological disease model |
US6248542B1 (en) * | 1997-12-09 | 2001-06-19 | Massachusetts Institute Of Technology | Optoelectronic sensor |
US7262280B1 (en) | 1998-04-03 | 2007-08-28 | Nps Pharmaceuticals, Inc. | G-protein fusion receptors and constructs encoding same |
US6103524A (en) * | 1998-07-30 | 2000-08-15 | Eli Lilly And Company | Metabotropic glutamate receptor protein and nucleic acid |
TW201006846A (en) * | 2000-03-07 | 2010-02-16 | Senomyx Inc | T1R taste receptor and genes encidung same |
TW201022287A (en) | 2001-01-03 | 2010-06-16 | Senomyx Inc | T1R taste receptors and genes encoding same |
US8216797B2 (en) * | 2001-02-07 | 2012-07-10 | Massachusetts Institute Of Technology | Pathogen detection biosensor |
CN101551337B (zh) * | 2001-02-07 | 2013-06-19 | 麻省理工学院 | 光电子探测系统 |
US7422860B2 (en) | 2001-02-07 | 2008-09-09 | Massachusetts Institute Of Technology | Optoelectronic detection system |
US7301009B2 (en) | 2001-06-26 | 2007-11-27 | Senomyx, Inc. | Isolated (T1R1/T1R3) umami taste receptors that respond to umami taste stimuli |
US7368285B2 (en) | 2001-03-07 | 2008-05-06 | Senomyx, Inc. | Heteromeric umami T1R1/T1R3 taste receptors and isolated cells that express same |
US20080244761A1 (en) | 2001-03-07 | 2008-10-02 | Senomyx, Inc. | T1r hetero-oligomeric taste receptors and cell lines that express said receptors and use thereof for identification of taste compounds |
DK2327985T3 (en) | 2001-06-26 | 2016-09-05 | Senomyx Inc | H1 Oligomeric T1R Taste Receptors and Cell Lines Expressing the Receptors, and Their Use to Identify Taste Compounds |
EP2293067B1 (en) | 2001-06-26 | 2016-04-20 | Senomyx, Inc. | T1R hetero-oligomeric taste receptors and cell lines that express said receptors and use thereof for identification of taste compounds |
US20040253635A1 (en) * | 2001-08-06 | 2004-12-16 | Sylvie Luria | Methods of identifying functional analogs of peptide regulators of biological pathways |
AU2002360695A1 (en) * | 2001-12-19 | 2003-07-09 | Nmt Medical, Inc. | Septal occluder and associated methods |
EP1487965A4 (en) | 2002-02-25 | 2006-11-15 | Mpex Pharmaceuticals Inc | MINI COMPOSITIONS AND METHODS |
AU2003240549A1 (en) * | 2002-06-05 | 2003-12-22 | Nmt Medical, Inc. | Patent foramen ovale (pfo) closure device with radial and circumferential support |
AU2003284976A1 (en) * | 2002-10-25 | 2004-05-13 | Nmt Medical, Inc. | Expandable sheath tubing |
AU2003294682A1 (en) | 2002-12-09 | 2004-06-30 | Nmt Medical, Inc. | Septal closure devices |
EP1651116B1 (en) | 2003-07-14 | 2013-06-26 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Tubular patent foramen ovale (pfo) closure device with catch system |
US9861346B2 (en) | 2003-07-14 | 2018-01-09 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Patent foramen ovale (PFO) closure device with linearly elongating petals |
US8480706B2 (en) | 2003-07-14 | 2013-07-09 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Tubular patent foramen ovale (PFO) closure device with catch system |
US20050186658A1 (en) * | 2003-10-17 | 2005-08-25 | Nps Pharmaceuticals, Inc. | Chimeric metabotropic glutamate receptors and uses thereof |
WO2005075988A1 (en) * | 2004-01-28 | 2005-08-18 | Bayer Healthcare Ag | Diagnostics and therapeutics for diseases associated with human metabotropic glutamate receptor 7 (mglur7) |
US7842053B2 (en) * | 2004-05-06 | 2010-11-30 | Nmt Medical, Inc. | Double coil occluder |
US8257389B2 (en) | 2004-05-07 | 2012-09-04 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Catching mechanisms for tubular septal occluder |
DE102004026744A1 (de) * | 2004-05-28 | 2005-12-29 | Philipps-Universität Marburg | Erfindung betreffend cDNA-Herstellung aus Zellen nach Laser-Mikrodissektion |
EP1868507A1 (en) | 2005-03-18 | 2007-12-26 | NMT Medical, Inc. | Catch member for pfo occluder |
US8870913B2 (en) | 2006-03-31 | 2014-10-28 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Catch system with locking cap for patent foramen ovale (PFO) occluder |
WO2008124603A1 (en) | 2007-04-05 | 2008-10-16 | Nmt Medical, Inc. | Septal closure device with centering mechanism |
CN101687927B (zh) * | 2007-05-15 | 2013-10-30 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | 针对g蛋白偶联的受体(gpcr)的抗体 |
US20130165967A1 (en) | 2008-03-07 | 2013-06-27 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Heart occlusion devices |
US8956389B2 (en) | 2009-06-22 | 2015-02-17 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Sealing device and delivery system |
US20120029556A1 (en) | 2009-06-22 | 2012-02-02 | Masters Steven J | Sealing device and delivery system |
US9770232B2 (en) | 2011-08-12 | 2017-09-26 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Heart occlusion devices |
US10828019B2 (en) | 2013-01-18 | 2020-11-10 | W.L. Gore & Associates, Inc. | Sealing device and delivery system |
US9804157B1 (en) | 2013-03-15 | 2017-10-31 | Senomyx, Inc. | Screening assays to identify compounds which modulate T1R associated taste modalities which eliminate false positives |
US9808230B2 (en) | 2014-06-06 | 2017-11-07 | W. L. Gore & Associates, Inc. | Sealing device and delivery system |
SG10201913625XA (en) | 2015-08-07 | 2020-03-30 | Imaginab Inc | Antigen binding constructs to target molecules |
WO2018147960A1 (en) | 2017-02-08 | 2018-08-16 | Imaginab, Inc. | Extension sequences for diabodies |
Family Cites Families (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US3829583A (en) * | 1971-02-20 | 1974-08-13 | Hayashibara Ken | Mixture of maltobionic acid and monosodium glutamate as a food seasoning |
WO1991006648A1 (en) * | 1989-10-27 | 1991-05-16 | The Salk Institute For Biological Studies | Glutamate receptor compositions and methods |
NZ240921A (en) | 1990-12-12 | 1994-06-27 | Zymogenetics Inc | G protein coupled glutamate receptor (neurotransmitters), recombinant production |
US5385831A (en) | 1990-12-12 | 1995-01-31 | Zymogenetics, Inc. | Method for producing a mammalian G protein coupled glutamate receptor |
CA2094987A1 (en) | 1992-05-01 | 1993-11-02 | James P. Burnett, Jr. | Human glutamate receptor proteins and associated dna compounds |
IL105587A0 (en) | 1992-05-08 | 1993-09-22 | Lilly Co Eli | Human metabotropic glutamate receptor and related dna compounds |
DK68592D0 (da) | 1992-05-25 | 1992-05-25 | Novo Nordisk As | Celle |
CA2098054A1 (en) | 1992-06-10 | 1993-12-11 | Rajender Kamboj | Ampa-binding human glutamate receptors |
WO1994027602A1 (en) | 1993-06-01 | 1994-12-08 | Cortex Pharmaceuticals, Inc. | Use of metabotropic receptor agonists in progressive neurodegenerative deseases |
US5521297A (en) * | 1993-06-04 | 1996-05-28 | Salk Institute Biotechnology/Industrial Associates | Nucleic acids encoding human metabotropic glutamate receptors |
US6274330B1 (en) | 1993-12-30 | 2001-08-14 | Zymogenetics, Inc. | L-AP4 sensitive glutamate receptors |
WO1995022609A2 (en) | 1994-02-21 | 1995-08-24 | The Wellcome Foundation Limited | Human glutamate receptor proteins |
GB9416554D0 (en) | 1994-08-19 | 1994-10-12 | Ciba Geigy Ag | Glutamate receptor |
US6017697A (en) | 1994-11-14 | 2000-01-25 | Eli Lilly And Company | Excitatory amino acid receptor protein and related nucleic acid compounds |
FR2765591B1 (fr) * | 1997-07-01 | 2002-08-09 | Pasteur Institut | Procede de diagnostic de la maladie d'alzheimer |
-
1994
- 1994-09-07 AU AU76159/94A patent/AU695641B2/en not_active Ceased
- 1994-09-07 EP EP01124391A patent/EP1199359B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-07 EP EP94926247A patent/EP0720650B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-07 JP JP7509529A patent/JPH09503913A/ja active Pending
- 1994-09-07 NZ NZ273015A patent/NZ273015A/en unknown
- 1994-09-07 US US08/617,785 patent/US6228610B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-07 AT AT01124391T patent/ATE522610T1/de active
- 1994-09-07 AT AT94926247T patent/ATE283916T1/de not_active IP Right Cessation
- 1994-09-07 DE DE69434166T patent/DE69434166T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-09-07 WO PCT/EP1994/002991 patent/WO1995008627A1/en active IP Right Grant
- 1994-09-07 HU HU9600692A patent/HUT74247A/hu unknown
- 1994-09-07 CA CA002171206A patent/CA2171206A1/en not_active Abandoned
-
1996
- 1996-03-18 FI FI961251A patent/FI961251A/fi unknown
- 1996-03-19 NO NO961115A patent/NO961115D0/no unknown
-
2001
- 2001-03-26 US US09/817,464 patent/US6515107B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2002
- 2002-12-30 US US10/331,289 patent/US7253257B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO1995008627A1 (en) | 1995-03-30 |
EP1199359A1 (en) | 2002-04-24 |
US6228610B1 (en) | 2001-05-08 |
EP1199359B1 (en) | 2011-08-31 |
NO961115L (no) | 1996-03-19 |
US7253257B2 (en) | 2007-08-07 |
EP0720650A1 (en) | 1996-07-10 |
FI961251A0 (fi) | 1996-03-18 |
US6515107B2 (en) | 2003-02-04 |
AU695641B2 (en) | 1998-08-20 |
DE69434166T2 (de) | 2005-11-10 |
HU9600692D0 (en) | 1996-05-28 |
CA2171206A1 (en) | 1995-03-30 |
US20030113868A1 (en) | 2003-06-19 |
DE69434166D1 (de) | 2005-01-05 |
ATE522610T1 (de) | 2011-09-15 |
EP0720650B1 (en) | 2004-12-01 |
ATE283916T1 (de) | 2004-12-15 |
AU7615994A (en) | 1995-04-10 |
NO961115D0 (no) | 1996-03-19 |
US20020127638A1 (en) | 2002-09-12 |
FI961251A (fi) | 1996-03-18 |
JPH09503913A (ja) | 1997-04-22 |
NZ273015A (en) | 1997-09-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
HUT74247A (en) | Human metabotropic glutamate receptor subtypes (hmr4, hmr6, hmr7) and related dna compounds | |
JP3628693B2 (ja) | ヒトカルシウムチャンネル組成物及びその使用方法 | |
AU719841B2 (en) | Novel human metabotropic glutamate receptor | |
US6664375B2 (en) | Human neuronal nicotinic acetylcholine receptor & subunit methods employing same | |
WO1996006167A1 (en) | Glutamate receptor | |
EP1042460B1 (en) | Brain or heart cyclic nucleotide gated ion channel compounds and uses thereof | |
US6534287B1 (en) | Human metabotropic glutamate receptor | |
US20030199042A1 (en) | Novel morphogenic protein | |
US6274330B1 (en) | L-AP4 sensitive glutamate receptors | |
US6294355B1 (en) | Synaptic activation protein compositions and method | |
US6465210B1 (en) | Nucleic acid molecules encoding CASPR/p190 | |
ES2372808T3 (es) | Subtipos del receptor metabotrópico de glutamato humano (hmr6) y compuestos de adn relacionados. | |
WO1999038975A2 (en) | Polynucleotide and polypeptide sequences associated with cns depressant sensitivity and methods of use thereof | |
US20030022282A1 (en) | Novel polypeptide | |
MXPA97001267A (en) | Glutam receiver | |
US20030166882A1 (en) | Novel polypeptide | |
JPH10117791A (ja) | ヒトgタンパク質結合受容体hlyaz61 | |
CA2284857A1 (en) | G protein coupled receptor a4 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
DGB9 | Succession in title of applicant |
Owner name: NOVARTIS AG, CH |
|
DFD9 | Temporary protection cancelled due to non-payment of fee |