ES2959865T3 - Método y dispositivo para controlar un instrumento de preparación de composición de detección - Google Patents

Método y dispositivo para controlar un instrumento de preparación de composición de detección Download PDF

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Abstract

Se proporciona un método y dispositivo para controlar un instrumento de preparación que prepara una composición de detección usada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra usando un archivo de instrucciones integrado. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)

Description

DESCRIPCIÓN
Método y dispositivo para controlar un instrumento de preparación de composición de detección
Campo técnico
La presente divulgación se refiere a un método y dispositivo para controlar un instrumento de preparación de composición de detección que utiliza un archivo de procesamiento de trabajo integrado.
Técnica anterior
Una prueba de amplificación genética es una prueba de diagnóstico in vitro que amplifica un gen específico para determinar si ese gen existe. Para ejecutar la prueba de amplificación genética utilizando diversos especímenes obtenidos de diversos animales, plantas y similares, así como de humanos, se puede realizar un proceso de eliminación de una sustancia que inhibe una reacción de amplificación genética de una muestra biológica y extracción de un ácido nucleico requerido. El ácido nucleico extraído se utiliza para producir una solución de reacción para amplificación.
Al principio, los experimentadores realizaban manualmente un trabajo de preparación de la composición de detección, como la preparación de un ácido nucleico extraído, la preparación de una solución de reacción para la amplificación y similares. Sin embargo, debido a la ineficiencia desde la perspectiva de errores humanos, coste, tiempo y similares, las demandas de instrumentos de preparación automática (por ejemplo, instrumentos de manipulación de líquidos) que preparen automáticamente una composición de detección han aumentado gradualmente.
Un método para controlar un instrumento de preparación automática es un esquema para definir acciones unitarias mínimas que pueden realizarse mediante el instrumento de preparación automática y proceder con una acción de trabajo deseada al utilizar una combinación de acciones unitarias.
Por ejemplo, cuando el instrumento de preparación automática utiliza una pipeta que es un dispensador de solución, las acciones básicas mínimas pueden incluir una acción de mover la pipeta a una punta de pipeta, una acción de fijar la punta de la pipeta a la pipeta, una acción de mover la pipeta a la que se fija la punta de la pipeta en un lugar predeterminado, y una acción de sumergir la punta de la pipeta en un recipiente a una profundidad predeterminada. Cada acción se define como una acción unitaria. Además, cuando se utilizan pinzas, varias acciones básicas asociadas con sostener y mover un objeto pueden definirse como acciones unitarias, respectivamente. Cuando se utiliza un calentador, una acción de calentar durante un período de tiempo predeterminado puede definirse como una acción unitaria.
Cuando el trabajo de preparación que se desea ejecutar en el instrumento de preparación automática es la preparación de un extracto de ácido nucleico, el instrumento de preparación automática comienza a operar a partir de una acción de fraccionar una muestra en un tubo de muestra, una acción de dispensar una solución citolítica a la muestra fraccionada, y una acción de calentamiento, continúa con una serie de acciones para aislar y purificar un ácido nucleico, y finalmente realiza una acción de recolectar el ácido nucleico aislado.
Cuando se desea realizar una acción de trabajo, el método puede combinar selectivamente acciones unitarias requeridas entre las acciones unitarias definidas de manera que el instrumento de preparación automática pueda realizar la acción de trabajo deseada.
De acuerdo con el método de controlar el dispositivo de preparación automática, todas las acciones unitarias que puede proporcionar el instrumento de preparación automática pueden procesarse basándose en variables (variables de acción unitaria) que indican acciones unitarias.
Cuando se desea realizar una acción de trabajo, se seleccionan las variables de acción unitaria requeridas para la acción de trabajo y se asignan valores variables adecuados, de modo que los valores variables asignados para cada acción de trabajo puedan procesarse según el orden de las acciones de trabajo impulsadas, las acciones unitarias correspondientes a los valores variables seleccionados pueden ser ejecutadas y se realiza la acción de trabajo.
Un valor variable puede tener varias características. Por ejemplo, cuando una variable de acción unitaria corresponde a una acción unitaria que realiza movimiento a una ubicación predeterminada, el valor variable de la misma puede ser un valor correspondiente a las coordenadas de una ubicación objetivo. Cuando una variable de acción unitaria corresponde a una acción unitaria para subir o bajar una pipeta a una altura predeterminada, el valor de la variable de la misma puede ser un valor asociado a una altura. Un valor de variable puede ser un valor que indica si se selecciona una determinada variable de acción unitaria. Un valor variable puede tener varias características.
Las operaciones reales del instrumento de preparación automática pueden controlarse mediante un “archivo de procesamiento de trabajo”.
Generalmente, un operador del instrumento de preparación automático puede escribir un documento de gestión que incluya la información requerida para cada trabajo de preparación que el instrumento de preparación desee realizar.
El documento de gestión incluye una acción de trabajo requerida para preparar una composición de detección deseada, variables que indican acciones unitarias incluidas en cada acción de trabajo y valores de variables, y similares. Para ejecutar un trabajo de preparación en el instrumento de preparación automático, se realiza un trabajo de programación para ejecutar el trabajo de preparación en el instrumento de preparación con referencia al documento de gestión, y finalmente se produce un “archivo de procesamiento de trabajo”.
Cuando los tipos de trabajos de preparación son diferentes entre sí, las acciones de trabajo requeridas para los trabajos de preparación correspondientes son diferentes entre sí. De acuerdo con lo anterior , puede ser necesario elaborar un “expediente de procesamiento de trabajo” para cada tipo de trabajo de preparación.
Aunque los tipos de trabajos de preparación son los mismos entre sí, algunas de las acciones de trabajo requeridas pueden ser diferentes debido a un elemento seleccionado adicionalmente. Por ejemplo, en el caso de realizar un trabajo de preparación de un extracto de ácido nucleico, algunas acciones de trabajo pueden ser diferentes de acuerdo con el tipo de muestra o el tipo de secuencia de nucleótidos diana. En este caso, es necesario generar un “archivo de procesamiento de trabajo” para cada trabajo de preparación. Los trabajos de preparación que difieren ligeramente en las acciones de trabajo pueden requerir “archivos de procesamiento de trabajo”, respectivamente.
Es ineficaz producir un “archivo de procesamiento de trabajo” para cada caso, incluso cuando algunas acciones de trabajo son diferentes. Además, aumenta el número de “archivos de procesamiento de trabajo” que deben gestionarse, lo que también supone un inconveniente.
Es posible que sea necesario eliminar o agregar una acción de trabajo, o que sea necesario eliminar, agregar o modificar una variable de acción de unidad o un valor de variable requerido para ejecutar una acción de trabajo. Incluso cuando los tipos de trabajos de preparación son diferentes y las acciones de trabajo requeridas son diferentes debido a un elemento seleccionado adicionalmente, algunas acciones de trabajo pueden usarse en común. En particular, cuando es necesario editar una acción de trabajo común, resulta ineficiente realizar repetidamente el mismo trabajo para cada “archivo de procesamiento de trabajo”. Además, cuando un revelador original está ausente, es difícil para un nuevo revelador proporcionar mantenimiento eficientemente al mismo, por lo que aumenta la cantidad de tiempo requerido.
Por lo tanto, existe el deseo de un método para producir y operar eficientemente un “archivo de procesamiento de trabajo”.
Divulgación de la invención
Problema técnico
Los inventores han intentado mejorar un esquema para producir un archivo de procesamiento de trabajo que controle un instrumento de preparación, para cada trabajo de preparación. De acuerdo con lo anterior, los inventores han reconocido que un instrumento de preparación puede controlarse eficientemente y se pueden realizar varios trabajos de preparación utilizando un archivo de datos de trabajo para cada trabajo de preparación y un archivo de instrucciones integrado.
Por lo tanto, un aspecto de la presente divulgación es proporcionar un método para controlar un instrumento de preparación que prepara una composición de detección utilizada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra.
Otro aspecto de la presente divulgación es proporcionar un dispositivo para controlar un instrumento de preparación que prepara una composición de detección utilizada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra.
Solución al problema
De acuerdo con un aspecto de la presente divulgación, se proporciona un método para controlar un instrumento de preparación que prepara una composición de detección usada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra, el método incluye: mostrar una pluralidad de campos de opción que incluyen un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana que se desea detectar en una pantalla para determinar una composición de detección deseada, en el que la composición de detección incluye un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción para la amplificación de ácido nucleico; recibir información de selección de usuario de cada uno de la pluralidad de campos de opción; determinar un archivo de datos de trabajo basándose en la información de selección, en el que el archivo de datos de trabajo incluye una lista de trabajo que incluye acciones de trabajo de series temporales requeridas para preparar el extracto de ácido nucleico y/o una lista de trabajo que incluye acciones de trabajo de series temporales requeridas para preparar la solución de reacción para amplificación de ácido nucleico, e incluye información del nombre de la instrucción e información de procesamiento de la instrucción utilizada para implementar las acciones de trabajo en el instrumento de preparación; buscar una instrucción que coincida con la información del nombre de la instrucción asignada a una acción de trabajo desde un archivo de instrucciones integrado, de acuerdo con el orden de las acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo determinado, en el que el archivo de instrucciones integrado incluye todas las instrucciones utilizadas para implementar todas las acciones de trabajo que se desean operar en el instrumento de preparación, y las instrucciones incluyen instrucciones para mover una pipeta, que realiza el pipeteo en el instrumento de preparación, hacia arriba y hacia abajo, hacia la izquierda y hacia la derecha, y hacia adelante y hacia atrás, y para dispensar, aspirar o transferir un líquido; y realizar control de manera que las instrucciones recuperadas se procesen de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones y las acciones de trabajo se implementen en el instrumento de preparación.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, la determinación del archivo de datos de trabajo puede incluir: generar un archivo de datos de trabajo al utilizar la información de selección y uno o más archivos de datos de gestión seleccionados en base a la información de selección, en el que los archivos de datos de gestión se clasifican y almacenan de acuerdo con un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana, e incluyen acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo requeridas de acuerdo con la información de selección, y la información del nombre de la instrucción y la información del procesamiento de la instrucción asociados a cada acción de trabajo.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, la generación del archivo de datos de trabajo puede incluir: generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en un único archivo de datos de gestión, o generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en cada uno de los dos o más archivos de datos de gestión y combinar las acciones de trabajo extraídas.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, la información de procesamiento de instrucciones puede incluir: variables de acción unitaria que indican acciones unitarias de acciones de trabajo implementadas por las instrucciones recuperadas y valores variables asignados a las variables de acción unitaria.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, cada instrucción en el archivo de instrucciones integrado incluye variables de acción unitaria definidas para una instrucción correspondiente, las variables de acción unitaria indican acciones unitarias de una acción de trabajo implementada por una instrucción, y cada instrucción se procesa al utilizar variables de acción unitaria cuyos valores variables se proporcionan de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones entre las variables de acción unitaria definidas para cada instrucción.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, al menos una instrucción en el archivo de instrucciones integrado implementa dos o más acciones de trabajo.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, las variables de acción unitaria que se utilizarán entre las variables de acción unitaria definidas para al menos una instrucción se configuran para que sean diferentes, de modo que se implementen dos o más acciones de trabajo.
El método para controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación puede incluir además: mostrar, en la pantalla, una ventana de trabajo para mostrar o editar acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo antes de controlar el instrumento de preparación.
En el método de controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, cuando el trabajo se suspende mientras el instrumento de preparación funciona, el método puede incluir además mostrar, en la pantalla, una ventana de trabajo para mostrar información de estado de la acción de trabajo suspendida o editar una acción de trabajo posterior.
El método para controlar el instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación, puede incluir además: generar un archivo de datos de configuración en el que se registra la información de selección, en el que la información de selección registrada en el archivo de datos de configuración se procesa mediante interoperación con el archivo de instrucciones integrado.
De acuerdo con un aspecto de la presente divulgación, se proporciona un dispositivo para controlar un instrumento de preparación que prepara una composición de detección utilizada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra, el dispositivo incluye: una pantalla, uno o más procesadores, y una memoria, en el que el procesador está configurado para realizar: mostrar una pluralidad de campos de opción que incluyen un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana que se desea detectar en una pantalla para determinar una composición de detección deseada, en el que la detección de la composición incluye un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción para la amplificación de ácido nucleico; recibir información de selección del usuario de cada uno de la pluralidad de campos de opción para determinar un archivo de datos de trabajo basado en la información de selección, en el que el archivo de datos de trabajo incluye una lista de trabajo que incluye acciones de trabajo de series temporales requeridas para preparar el extracto de ácido nucleico y/ o una lista de trabajo que incluye acciones de trabajo de series temporales requeridas para preparar la solución de reacción para la amplificación de ácido nucleico, e incluye información del nombre de la instrucción e información de procesamiento de instrucciones utilizadas para implementar las acciones de trabajo en el instrumento de preparación; buscar una instrucción que coincida con la información del nombre de la instrucción asignada a una acción de trabajo desde un archivo de instrucciones integrado, de acuerdo con el orden de las acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo determinado, en el que el archivo de instrucciones integrado incluye todas las instrucciones utilizadas para implementar todas las acciones de trabajo que se desean operar en el instrumento de preparación, y las instrucciones incluyen instrucciones para mover una pipeta, que realiza el pipeteo en el instrumento de preparación, hacia arriba y hacia abajo, hacia la izquierda y hacia la derecha, y hacia adelante y hacia atrás, y para dispensar, aspirar o transferir un líquido; y realizar control de manera que las instrucciones recuperadas se procesen de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones y las acciones de trabajo se implementen en el instrumento de preparación.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, la memoria está configurada para almacenar un archivo de datos de gestión que incluye acciones de trabajo incluidas en un archivo de datos de trabajo requerido de acuerdo con la información de selección, e información de nombre de instrucción e información de procesamiento de instrucción asociada con cada acción de trabajo, en el que el archivo de datos de gestión se clasifica y almacena de acuerdo con el tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana; y el procesador está configurado para generar el archivo de datos de trabajo al utilizar la información de selección y uno o más archivos de datos de gestión seleccionados en base a la información de selección e implementos que determinan el archivo de datos de trabajo.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, el procesador está configurado para generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en un único archivo de datos de gestión, o generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en cada uno de los dos o más archivos de datos de gestión y combinando las acciones de trabajo extraídas.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, la información de procesamiento de instrucciones incluye variables de acción unitaria que indican acciones unitarias de acciones de trabajo implementadas por las instrucciones recuperadas y valores variables asignados a las variables de acción unitaria.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, cada instrucción en el archivo de instrucciones integrado incluye variables de acción unitaria definidas para una instrucción correspondiente, las variables de acción unitaria indican acciones unitarias de una acción de trabajo implementada por una instrucción; y el procesador está configurado para procesar cada instrucción al utilizar variables de acción unitaria cuyos valores variables se proporcionan de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones entre las variables de acción unitaria definidas para cada instrucción.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, el procesador está configurado para permitir que al menos una de las instrucciones en el archivo de instrucciones integrado implemente dos o más acciones de trabajo.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, el procesador está configurado para establecer variables de acción unitaria, que se utilizarán entre variables de acción unitaria definidas para al menos una instrucción, para que sean diferentes, de modo que se implementen dos o más acciones de trabajo.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, el procesador está configurado para visualizar, en la pantalla, una ventana de trabajo para mostrar o editar acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo antes de controlar el instrumento de preparación.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, cuando el trabajo se suspende mientras el instrumento de preparación funciona, el procesador está configurado para visualizar, en la pantalla, una ventana de trabajo para visualizar información de estado de la acción de trabajo suspendida o editar una acción de trabajo posterior.
En el dispositivo para controlar el instrumento de preparación, el procesador está configurado para generar un archivo de datos de configuración en el que se registra la información de selección, y procesar la información de selección registrada en el archivo de datos de configuración mediante la interoperación con el archivo de instrucciones integrado.
Efectos ventajosos de la invención
Las características y ventajas de la presente divulgación se resumen a continuación.
Un método y dispositivo para controlar un instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación puede producir un único archivo de instrucciones integrado, en lugar de producir un archivo de procesamiento de trabajo para cada trabajo de preparación, y puede usar el archivo de instrucciones integrado mediante interoperación con un archivo de datos de trabajo al realizar así de manera eficiente y sencilla diversos trabajos de preparación requeridos por los usuarios.
Además, cuando existe un archivo de procesamiento de trabajo para cada trabajo de preparación, cada archivo de procesamiento de trabajo puede editarse para realizar una acción de gestión, tal como modificación, eliminación, adición y similares, con respecto a un elemento común. La presente divulgación puede operar con un único archivo de instrucciones integrado y puede usar un archivo de datos de trabajo cuya edición se realiza fácilmente, por lo que se puede mejorar la eficiencia de la gestión.
La presente divulgación puede ejecutar dos o más acciones de trabajo al utilizar una sola instrucción al controlar los valores variables proporcionados a las variables de acción unitaria asignadas a la instrucción, mediante lo cual se puede producir y utilizar de manera eficiente un archivo de instrucciones integrado.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 es un diagrama que ilustra un sistema de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación;
La Figura 2 es un diagrama de flujo que ilustra un método (S200) para controlar un instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación;
La Figura 3 es un diagrama que ilustra la totalidad de un dispositivo 300 para controlar un instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación;
La Figura 4 es un diagrama que ilustra un ejemplo de generación de un archivo de datos de trabajo a partir de un archivo de datos de gestión de acuerdo con una realización de la presente divulgación; y
La Figura 5 es un diagrama que ilustra las configuraciones de un archivo de datos de trabajo y un archivo de instrucciones integrado, y un proceso de procesamiento de una instrucción mediante interacción de acuerdo con una realización de la presente divulgación.
Modo de la invención
De aquí en adelante, la presente divulgación se describirá en detalle con referencia a realizaciones. Las realizaciones se proporcionan para describir más concretamente la presente divulgación. Es evidente para los expertos en la técnica que el alcance de la presente divulgación de acuerdo con el objeto de la presente divulgación no se limita a las realizaciones.
<Realización>
La Figura 1 es un diagrama que ilustra un instrumento 100 de preparación de composición de detección y un dispositivo 300 de control de instrumento de preparación de acuerdo con una realización de la presente divulgación. Con referencia a la Fig. 1, un sistema de preparación de composición de detección incluye el instrumento 100 de preparación de composición de detección y el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación que controla el instrumento de preparación. En el sistema de preparación de la composición de detección, el instrumento 100 de preparación de la composición de detección realiza automáticamente un proceso de preparación de una composición de detección usada para detectar una secuencia de nucleótidos diana en una muestra de acuerdo con una señal de control del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación.
En la presente divulgación, el proceso de preparación de la composición de detección incluye un proceso de extracción de un ácido nucleico de una muestra, un proceso de producción de una solución de reacción para la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y un proceso que combina la extracción de un ácido nucleico y la producción de una solución de reacción para PCR.
El método (S200) de controlar el instrumento 100 de preparación de la composición de detección de acuerdo con la presente divulgación puede implementarse mediante el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación, y el funcionamiento de cada etapa puede controlarse mediante cada elemento del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación.
El dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de acuerdo con la presente divulgación puede incluir una pantalla 310, uno o más procesadores 320 y una memoria 330 que almacena programas y/o datos, como se ilustra en la Fig. 3.
Además, aunque no se ilustra en la Fig. 3, el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación puede incluir además un almacenamiento permanente tal como una unidad de disco o similar, un puerto de comunicación que comunica con un dispositivo externo y un dispositivo de interfaz de usuario tal como un panel táctil, una tecla, un botón y similares.
El dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de acuerdo con la presente divulgación puede controlarse basándose en software. El método para controlar el instrumento 100 de preparación de la composición de detección puede controlarse mediante software de acuerdo con la presente divulgación. Los métodos implementados por software o algoritmos son códigos o instrucciones de programa legibles por ordenador, que son ejecutables por el procesador 320, y pueden almacenarse en un medio de grabación legible por ordenador.
Aquí, el medio de grabación legible por ordenador puede incluir un medio de almacenamiento magnético (por ejemplo, una memoria de sólo lectura (ROM), una memoria de acceso aleatorio (RAM), un disquete, un disco duro o similar), un medio óptico -medio legible (por ejemplo, un CD-ROM o un disco versátil digital (DVD), y similares. El medio de grabación legible por ordenador se distribuye en sistemas informáticos conectados entre sí a través de una red, de modo que el código legible por ordenador pueda almacenarse y ejecutarse en un esquema de distribución. El medio puede ser legible por un ordenador, puede almacenarse en la memoria 330 y puede ejecutarse en el procesador 320.
El procesador 320 puede incluir partes, tales como un procesador 322 de archivo de datos de trabajo/archivo de instrucciones integrado, un generador 324 de archivos de datos de trabajo y un generador 326 de archivos de datos de configuración.
La memoria 330 puede incluir partes, tales como un almacenamiento 332 de archivos de datos de trabajo, un almacenamiento 334 de archivos de datos de gestión y un almacenamiento 336 de archivos de instrucciones integrado.
Cada elemento se distingue funcionalmente para describir claramente el funcionamiento del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación. Por lo tanto, cada parte no puede necesariamente distinguirse como un único elemento físicamente separado. Por ejemplo, cada parte puede implementarse como un conjunto de instrucciones informáticas de algunos de los programas. Alternativamente, la función de una parte correspondiente puede implementarse mediante un dispositivo de procesamiento de operaciones a medida que se ejecuta un programa. Se puede utilizar un almacenamiento separado para distinguir el tipo de datos que se almacenan.
Además, los elementos del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación pueden implementarse como programas/aplicaciones ejecutadas por un único terminal de procesamiento de información, tal como un ordenador de usuario. Alternativamente, algunos elementos pueden implementarse mediante el terminal, y otros elementos pueden implementarse mediante el instrumento 100 de preparación que está conectado con el terminal. Alternativamente, los elementos pueden implementarse como un conjunto de circuitos lógicos incluidos en un procesador semiconductor.
El instrumento 100 de preparación implementado por el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación puede ser un aparato automatizado de manipulación de líquidos. El aparato automatizado de manipulación de líquidos puede aspirar y/o dispensar de forma automática y programática una cantidad deseada de reactivo, muestra u otro líquido desde/hacia un recipiente designado, para la automatización de experimentos químicos o bioquímicos. Los expertos en la técnica conocen diversas configuraciones del aparato automatizado de manipulación de líquidos.
Todos los elementos del instrumento 100 de preparación están diseñados como un dispositivo integrado y se encuentran en una carcasa.
Un módulo de pipeteo que es capaz de moverse automáticamente hacia arriba, hacia abajo, hacia la izquierda, hacia la derecha, hacia adelante y hacia atrás está ubicado sobre una plataforma del instrumento 100 de preparación automatizado. El módulo de pipeteo incluye una o más pipetas que se mueven y operan de forma independiente o dependiente. Se acopla una punta o aguja al extremo de la pipeta y se utiliza para aspirar y dispensar una solución.
El instrumento 100 de preparación de acuerdo con la presente divulgación es, por ejemplo, un dispositivo fabricado por la empresa Hamilton ubicada en Suiza. Por ejemplo, el instrumento 100 de preparación puede ser Hamilton STAR, Hamilton NIMBUS, Hamilton STARplus) y Hamilton STARlet.
En lo sucesivo, con referencia a las Figs. 2 y 3, se describirá el funcionamiento de cada etapa del método (S200) de controlar un instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación, y cada elemento del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación que controla el funcionamiento de cada etapa.
La Figura 2 es un diagrama de flujo que ilustra un método (S200) para controlar un instrumento de preparación de composición de detección de acuerdo con la presente divulgación.
Como se ilustra en la Fig. 2, el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación específica una composición de detección deseada en la operación S210. Con este fin, el procesador 320 del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación puede visualizar, en una pantalla 310, una pluralidad de campos de opciones para seleccionar opciones que incluyen el tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana.
La composición de detección incluye un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción para la amplificación de ácido nucleico (por ejemplo, solución de reacción de PCR).
El instrumento 100 de preparación puede realizar un trabajo de preparación de extracto de ácido nucleico o un trabajo de preparación de solución de reacción de amplificación de ácido nucleico. Alternativamente, el instrumento 100 de preparación puede realizar un trabajo de preparación en el que se realizan al mismo tiempo un trabajo de preparación de un extracto de ácido nucleico y un trabajo de preparación de una solución de reacción de amplificación de ácido nucleico.
La pantalla 310 puede ser controlada por el procesador 320 y puede mostrar datos o imágenes, tales como la pluralidad de campos de opciones almacenados en la memoria 330.
La memoria 330 puede almacenar programas o datos para procesar y controlar el procesador 320 (por ejemplo, un archivo de datos de gestión, un archivo de datos de trabajo y un archivo de instrucciones integrado), y puede almacenar datos de entrada/salida (por ejemplo, información de selección de usuario asociada con la pluralidad de campos de opción, información de selección tal como información adicional que un usuario ingresa manualmente mediante un código de barras y un dispositivo de entrada tal como un mouse, y similares).
La memoria 330 puede incluir al menos un tipo de medio de almacenamiento de entre un tipo de memoria flash, un tipo de disco duro, una tarjeta multimedia de tipo micro, una memoria de tipo tarjeta (por ejemplo, una memoria SD, una memoria XD o similares), una memoria de acceso aleatorio (RAM), una RAM estática (SRAM), una memoria de sólo lectura (ROM), una ROM programable borrable eléctricamente (EEPROM), una PROM, una memoria magnética, un disco magnético y un disco óptico.
Un usuario puede ser capaz de ingresar información de selección con respecto a la pluralidad de campos de opción mostrados en la pantalla 310. La pantalla 310 puede implementarse como un dispositivo de interfaz humana para permitir que un usuario seleccione un campo de opción, por ejemplo, una pantalla táctil, un panel táctil o similar.
En la operación S220, el procesador 320 puede recibir información de selección del usuario ingresada a través de la pantalla 310. En este caso, los campos de opción pueden proporcionarse de diversas formas de acuerdo con el trabajo que se vaya a preparar utilizando el instrumento 100 de preparación.
El procesador 320 puede mostrar, en la pantalla 310, una pluralidad de campos de opciones para seleccionar una pluralidad de objetos (por ejemplo, el tipo de composición de detección, el tipo de molécula de ácido nucleico diana, un producto para prueba, consumibles y similares) establecidos para un trabajo de preparación de composición de detección, y la lista de una pluralidad de elementos proporcionados para cada campo de opción, mediante el cual un usuario puede seleccionar un elemento de cada campo de opción.
Además, el procesador 320 puede mostrar, en la pantalla 310, una ventana de configuración a través de la cual se ingresa un carácter o un número, o se ingresa información al utilizar una interfaz de entrada externa, mediante la cual se puede configurar la información.
Por ejemplo, herramientas para realizar el trabajo para cada tipo de composición de detección, por ejemplo, información del código de barras de un recipiente que contiene un reactivo de extracción de ácido nucleico (kit de extracción) o un reactivo necesario para la solución de reacción de PCR (la denominada mezcla maestra), el número de ciclos en los que se realiza la mezcla cuando se produce la mezcla maestra, el número de muestras, el volumen de líquido como el reactivo, la solución de reacción de PCR y una muestra, el número de controles positivos (PC), controles negativos (NC) , o controles internos (IC) para identificar un problema en la realización del trabajo y verificar la confiabilidad, se puede ingresar como selección información que indique si se debe usar una función de monitoreo de coágulos e información que indique si se debe usar una función de control anticaída (ADC) puede ser ingresada como información en los campos de opción. Los reactivos y controles están contenidos de antemano en el instrumento 100 de preparación, y pueden indicarse como códigos de barras de modo que el instrumento 100 de preparación identifique los reactivos y controles.
Parte de la información de selección recibida puede usarse para especificar el trabajo a ejecutar por el instrumento 100 de preparación, y para seleccionar o generar un archivo de datos de trabajo requerido. Además, parte de la información de selección recibida puede usarse como información (por ejemplo, un valor variable) para realizar una determinación lógica o para controlar detalles de un dispositivo mientras se realiza un trabajo.
En la operación S230, el procesador 320 puede determinar un archivo de datos de trabajo entre los archivos de datos de trabajo almacenados en el almacenamiento 332 de archivos de datos de trabajo de la memoria 330 de acuerdo con la información de selección recibida. Además, la determinación del archivo de datos de trabajo mediante el procesador 320 se puede ejecutar generando el archivo de datos de trabajo mediante el generador 324 de archivos de datos de trabajo de acuerdo con la información de selección recibida.
El archivo de datos de trabajo incluye una lista de trabajo que incluye acciones de trabajo de series temporales requeridas para la preparación de extractos de ácido nucleico y/o una lista de trabajo que incluye acciones de trabajo de series temporales requeridas para la preparación de la solución de reacción de amplificación de ácidos nucleicos. Además, el archivo de datos de trabajo incluye información de nombre de instrucción e información de procesamiento de instrucción utilizada para implementar las acciones de trabajo incluidas en la lista de trabajo en el instrumento 100 de preparación.
Las acciones de trabajo de series de tiempo incluyen acciones de trabajo respectivas implementadas a lo largo del tiempo por el procesador 320 en el instrumento 100 de preparación.
Aunque no se ilustra, el instrumento 100 de preparación de la presente divulgación puede incluir una ubicación de reactivo de extracto de ácido nucleico, una ubicación de reactivo de amplificación de ácido nucleico, una ubicación de muestra, una ubicación de extracto de ácido nucleico, una ubicación de extracto de ácido nucleico, un productor de solución de reacción de amplificación de ácido nucleico y una parte de pipeteo.
Cuando una composición de detección que la instrucción 100 de preparación desea preparar es un extracto de ácido nucleico, el instrumento 100 de preparación puede controlar una pipeta de la parte de pipeteo para realizar una acción de trabajo de preparación de extracto de ácido nucleico de acuerdo con una instrucción, en una plataforma que incluye una ubicación de muestra, una ubicación de reactivo de extracto de ácido nucleico y una ubicación de extracción de ácido nucleico o.
Cuando la composición de detección que el instrumento 100 de preparación desea preparar es una reacción de PCR, el instrumento 100 de preparación controla la pipeta de la parte de pipeteo para realizar una acción de trabajo de preparación de reacción de PCR de acuerdo con una instrucción en una plataforma que incluye una ubicación de reactivo de PCR, una ubicación de extracto de ácido nucleico y una ubicación de solución de reacción de PCR.
Las acciones de trabajo de la serie temporal se enumeran en una lista de trabajo en orden de ocurrencia real de las acciones de trabajo. Alternativamente, las acciones de trabajo de series temporales pueden enumerarse en una lista de trabajo en un orden diferente al orden de ocurrencia real de las acciones de trabajo. En este caso, cuando el trabajo lo realiza el procesador, se debe proporcionar información a través de la cual el procesador reconoce el orden de las acciones de trabajo. Por ejemplo, cuando las acciones de trabajo se enumeran en la lista de trabajo, la información que indica el orden de ejecución de las acciones de trabajo se escribe en conjunto.
De acuerdo con una realización de la presente divulgación, un archivo de datos de trabajo incluye una pluralidad de áreas que incluyen información única. Más particularmente, el archivo de datos de trabajo incluye desde una primera área hasta una tercera área.
La primera área del archivo de datos de trabajo incluye información de acción de trabajo asociada con una lista de trabajo requerida para preparar una composición de detección deseada. En la primera área, las acciones de trabajo para preparar la composición de detección deseada se pueden organizar en una serie de tiempo de acuerdo con el orden de las acciones de trabajo ejecutadas en el instrumento 100 de preparación.
Por ejemplo, cuando un trabajo de preparación deseado es la extracción de un ácido nucleico de una muestra, una lista de trabajo puede incluir acciones de trabajo detalladas en orden cronológico basadas en un proceso de lisis, un proceso de unión de perlas y un proceso de lavado. Más particularmente, el proceso de lisis puede incluir acciones de trabajo, tales como dispensar Protenasa K, dispensar un control interno (CI), mover una placa de un imán a un calentador, dispensar un tampón de lisis y dispensar una muestra. Las acciones de trabajo pueden escribirse como 'PK_Dispense', 'IC_Dispense', 'Move DWP from Magnet to Heater_1', 'Lysis_Buffer_Dispense' y 'Sample_Dispense', respectivamente.
Cuando un trabajo de preparación deseado es un trabajo de preparación de solución de reacción de PCR, una lista de trabajo puede incluir acciones de trabajo, tales como producir una mezcla maestra, dispensar la mezcla maestra en un tubo y dispensar un ácido nucleico extraído en el tubo. Las acciones de trabajo pueden escribirse como 'Construir mezcla maestra', 'Distribuir mezcla maestra al tubo' y 'Transferir ácido nucleico extraído al tubo', respectivamente.
La información en la primera área se puede usar para identificar una acción de trabajo requerida para preparar una composición de detección deseada, y se puede usar para que el procesador 320 proporcione al usuario una guía asociada con una acción de trabajo que se ejecuta actualmente en la pantalla 310, cuando la acción de trabajo identificada se implementa realmente en el instrumento 100 de preparación.
La segunda área incluye información del nombre de la instrucción asociada con una instrucción que se asigna a cada acción de trabajo para controlar el instrumento 100 de preparación y realizar cada acción de trabajo dispuesta en la primera área.
La instrucción puede indicar una instrucción que permite ejecutar una acción de trabajo en el instrumento 100 de preparación. La instrucción se usa para controlar realmente una acción de trabajo ejecutada en el instrumento 100 de preparación, y puede incluirse en el almacenamiento 336 de archivos de instrucciones integrado.
En la presente divulgación, un archivo de procesamiento de trabajo que realmente controla una acción de trabajo en un instrumento de preparación conocido por los expertos en la técnica se define y se utiliza como un archivo de instrucciones integrado para realizar la idea técnica de la presente divulgación.
La información del nombre de la instrucción indica al menos una instrucción incluida en el archivo de instrucciones integrado para ejecutar acciones de trabajo de un archivo de datos de trabajo al utilizar el archivo de instrucciones integrado, mediante el cual dos archivos se conectan a través de la información del nombre de la instrucción y realizan la interacción.
Por ejemplo, utilizando la información del nombre de la instrucción en el archivo de datos de trabajo, el archivo de datos de trabajo puede conectarse a una instrucción definida por el nombre en el archivo de instrucciones integrado.
'Disp_PKmix' se puede utilizar como nombre de instrucción para una acción de trabajo de dispensación de protenasa K incluida en el proceso de lisis. 'Disp_IC' se puede utilizar como nombre de instrucción para una acción de trabajo de dispensación de un control interno (IC). 'Move_DWP' se puede utilizar como nombre de instrucción para una acción de trabajo que consiste en mover una placa de un imán a un calentador. 'Disp_Buffer' se puede utilizar como nombre de instrucción para una acción de trabajo de dispensar un tampón de lisis. Se puede utilizar 'Disp_Sample' como nombre de instrucción para una acción de trabajo de dispensar una muestra.
La tercera área puede incluir información de procesamiento de instrucciones conectada a la información del nombre de la instrucción de la segunda área.
La información de procesamiento de instrucciones puede incluir variables que indican acciones unitarias incluidas en una acción de trabajo y valores variables asignados a las variables de acción unitaria.
Una única acción de trabajo puede implementarse combinando una pluralidad de acciones unitarias. Por ejemplo, dispensar una muestra (Sample_Dispense), que es una de las acciones de trabajo en el proceso de lisis, puede implementarse mediante una pluralidad de acciones unitarias, tales como una acción de mover un dispensador de solución a un tubo de muestra, una acción de controlar una punta que se colocará a una altura predeterminada desde el fondo del tubo de muestra, una acción de aspirar una muestra del tubo de muestra, una acción de mover a una placa de lisis, y similares.
Es posible que se requiera información adicional para ejecutar cada acción de la unidad. Por ejemplo, las acciones de la unidad pueden requerir información de ubicación del tubo de muestra, información de altura asociada con una altura desde el fondo de un tubo de muestra cuando se realiza la aspiración de la muestra y el volumen de una muestra que se va a aspirar, e información de ubicación asociada con una placa de lisis.
La tercera área incluye acciones unitarias de una acción de trabajo e información adicional asociada con las acciones unitarias, y proporciona información requerida cuando se ejecuta una instrucción correspondiente al nombre de instrucción de la segunda área entre el archivo de instrucciones integrado.
En la presente divulgación, las acciones unitarias pueden indicarse mediante variables de acción unitaria, y la información adicional requerida para implementar una acción unitaria puede procesarse como un valor variable. 'Start_Location' se puede utilizar como nombre de variable para una acción de mover un dispensador de solución a un tubo de muestra. 'Asp_Bottom_Height' se puede utilizar como nombre de variable para una acción de controlar que una punta se coloque a una altura predeterminada desde el fondo del tubo de muestra. 'Asp_position' se puede utilizar como nombre de variable para una acción de aspirar una muestra del tubo de muestra.
De manera representativa, un valor de variable es un valor numérico. Una acción de trabajo puede implementarse cuando se lee un valor numérico que indica el grado de implementación de una acción unitaria correspondiente a una variable de acción unitaria. Un valor de variable puede ser un carácter.
Se puede utilizar un determinado valor numérico o un determinado carácter como información que indica que es necesario realizar el procesamiento de manera que no se ejecute una acción unitaria indicada por la variable de acción unitaria correspondiente.
En un archivo de datos de trabajo, la información tal como una lista de trabajo, información de nombre de instrucción e información de procesamiento de instrucciones se puede organizar en el eje X y el eje Y En este caso, en el eje X, se pueden disponer variables de acción unitaria que indican acciones unitarias incluidas en cada una de todas las acciones de trabajo que se desea ejecutar mediante el instrumento de preparación. En el eje Y se pueden organizar acciones de trabajo en series temporales. En este caso, en cada pieza de información de procesamiento de instrucciones registrada en el eje X para una acción de trabajo correspondiente dispuesta en el eje Y, se puede registrar 0 o nulo como valores variables para las variables de acción unitaria restantes después de excluir las variables de acción unitaria correspondientes a acciones unitarias de cada acción de trabajo.
Organizar todas las posibles variables de acción unitaria en el eje X permite al usuario editar fácilmente variables de acción unitaria requeridas para una acción de trabajo sin eliminar o agregar variables de acción unitaria en un archivo de datos de trabajo y proporcionar mantenimiento eficientemente al mismo.
Para determinar el archivo de datos de trabajo en la operación S230, el procesador 320 puede llamar a un archivo de datos de trabajo almacenado en la memoria 330, o puede generar un archivo de datos de trabajo mediante el generador 324 de archivos de datos de trabajo.
El procesador 320 puede almacenar, en la memoria 330, archivos de datos de trabajo para cada uno de los trabajos que pueden combinarse basándose en información de selección. Cuando se recibe información de selección ingresada en un campo de opción, el procesador 320 puede seleccionar un archivo de datos de trabajo que coincida con la información de selección del almacenamiento 332 de archivos de datos de trabajo, y puede determinar el archivo de datos de trabajo seleccionado como el archivo de datos de trabajo.
Puede haber varias combinaciones de información de selección para campos de opción dependiendo del usuario cuando se realiza un trabajo de preparación. Es posible que sea necesario proporcionar varios archivos de datos de trabajo adecuados para las diversas combinaciones de información de selección.
Generalmente, en el caso de un instrumento de preparación de composición de detección, se puede determinar una lista de trabajo de un trabajo de preparación casi basándose en una combinación del tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana. Es decir, las acciones de trabajo de la lista de trabajo pueden determinarse basándose en el tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana, y otra información de selección puede actuar como información que se requiere adicionalmente para realizar una acción de trabajo.
Por ejemplo, cuando los tipos de composición de detección que se pueden preparar son un “extracto de ácido nucleico” y una “solución de reacción de PCR”; los tipos de moléculas de ácido nucleico diana son “panel 1 de microorganismos de infecciones respiratorias (RP1)” y “panel 1 de microorganismos de enfermedades de transmisión sexual (STI P1)”; los racks de muestras seleccionables son Rack de 32 muestras, Rack de 5 * 12 y Rack de 5 * 18; y el material de laboratorio de muestra seleccionable son un tubo de 1.5 ml, un tubo de 1.2 ml, un tubo de 1.6 ml, tubos de 1.5 ml y 1.2 ml, tubos de 1.5 ml y 1.6 ml, tubos de 1.2 ml y 1.6 ml y tubos de 1.5 ml y 1.2 ml y 1.6 ml. Los tubos de ml, los tipos de composiciones de detección que se pueden preparar y los tipos de moléculas de ácido nucleico diana se pueden tener en cuenta cuando se produce un archivo de datos de trabajo (en particular, una lista de trabajo), pero las gradillas de muestras o el material de laboratorio de muestras pueden no ser tomado en consideración.
De acuerdo con una realización, la presente divulgación puede producir archivos de datos de trabajo de acciones de trabajo deseadas, basándose en la combinación del tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana entre la información de selección.
De acuerdo con una realización, se puede producir y clasificar un archivo de datos de trabajo basándose en el tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana.
De acuerdo con una realización, el número de archivos de datos de trabajo producidos y clasificados es el mismo que el número de combinaciones del número de tipos de composiciones de detección deseadas y el número de tipos de moléculas de ácido nucleico diana.
De acuerdo con una realización, cuando las composiciones de detección deseadas son las mismas y los tipos de ácidos nucleicos diana son diferentes, los trabajos asociados con algunas moléculas de ácido nucleico diana se pueden realizar basándose en la misma lista de trabajo. En este caso, se podrá generar un único archivo de datos de trabajo.
Para realizar un trabajo de preparación deseado basándose en la información de selección, el procesador 320 puede generar un archivo de datos de trabajo mediante el generador 324 de archivos de datos de trabajo, y puede proporcionar el archivo de datos de trabajo generado.
En la presente especificación, el término “determinar un archivo de datos de trabajo” incluye una acción de generar un archivo de datos de trabajo.
Para generar un archivo de datos de trabajo mediante el generador 324 de archivos de datos de trabajo, el procesador 320 puede usar un archivo de datos de gestión almacenado en el almacenamiento 334 de archivos de datos de gestión de la memoria 330.
El archivo de datos de gestión incluye acciones de trabajo incluidas en un archivo de datos de trabajo requerido en base a información de selección e información de nombre de instrucción e información de procesamiento de instrucción para cada acción de trabajo.
Además, el archivo de datos de gestión incluye básicamente información incluida en el archivo de datos de trabajo, y adicionalmente incluye información asociada con una condición ambiental de un instrumento de preparación (por ejemplo, una temperatura, un recuento de códigos de barras (barcode_count), y un rango de tiempo) e información de descripción. asociados a cada acción de trabajo. Es decir, el archivo de datos de gestión es un archivo de datos asociado con un archivo de datos de trabajo, y puede incluir además información adicional además del archivo de datos de trabajo.
El archivo de datos de gestión también puede producirse y clasificarse según el tipo de composición de detección y el tipo de molécula de ácido nucleico diana, de la misma manera que un archivo de datos de trabajo. El archivo de datos de gestión puede almacenarse en el almacenamiento 334 de archivos de datos de gestión.
El método (S200) de controlar el instrumento de preparación de la composición de detección de acuerdo con la presente divulgación puede implementarse mediante el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación, y el funcionamiento de cada etapa puede controlarse mediante cada elemento del dispositivo 300 de control del instrumento de preparación.
La Figura 4 es un diagrama que ilustra un ejemplo de generación de un archivo de datos de trabajo a partir de un archivo de datos de gestión de acuerdo con una realización de la presente divulgación.
La Figura 4A es un ejemplo de generación de un único archivo 412 y 422 de datos de trabajo de preparación a partir de un único archivo 410 y 420 de datos de gestión.
Un método para producir un archivo de datos de gestión y generar un archivo de datos de trabajo utilizando el archivo de datos de gestión puede tener la ventaja de que este método puede producir un número menor de archivos que el caso de utilizar un archivo de datos de trabajo. Por ejemplo, cuando un trabajo de preparación deseado es un trabajo de preparación (i) de producir un extracto de ácido nucleico, un trabajo de preparación (ii) de producir una solución de reacción de PCR, y un trabajo de preparación (iii) de producir un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción de PCR al mismo tiempo, es posible que sea necesario preparar tres archivos de datos de trabajo para los tres tipos. Sin embargo, en el caso del método de generar un archivo de datos de trabajo al utilizar un archivo de datos de gestión, el método puede generar un archivo de datos de trabajo para el trabajo de preparación (iii) utilizar la combinación del trabajo de preparación (i) y el trabajo de preparación (ii) al preparar solo dos archivos de datos de gestión asociados con el trabajo de preparación (i) de producir un extracto de ácido nucleico y el trabajo de preparación (ii) de producir una solución de reacción de PCR. La Figura 4B es un ejemplo de generación de un archivo de datos de trabajo 432 a partir de dos archivos 410 y 420 de datos de gestión.
Como otro ejemplo, cuando un trabajo de preparación deseado es un trabajo de preparación para producir una solución de reacción de PCR, el trabajo se puede realizar una vez o se puede realizar adicionalmente un trabajo similar una vez más, de acuerdo con el número de muestras. En el caso de utilizar un archivo de datos de trabajo, es necesario producir dos archivos de datos de trabajo teniendo en cuenta el número de veces que se realiza el trabajo. Por el contrario, en el caso de utilizar un archivo de datos de gestión, se pueden incluir dos casos en un único archivo de datos de gestión y se puede producir un archivo de datos de trabajo adecuado en función del número de muestras proporcionadas a partir de la información de selección. La Figura 4C es un ejemplo de generación de un archivo 442 de datos de trabajo, que repite el mismo trabajo, al utilizar el único archivo 410 de datos de gestión.
El archivo de datos de gestión se utiliza para gestionar, almacenar y transferir información. De acuerdo con lo anterior, el archivo de datos de gestión puede producirse de manera más eficiente y sencilla que un archivo de procesamiento de trabajo que controla directamente un instrumento basándose en la información. Además, parte de la información incluida en el archivo de datos de gestión puede extraerse y parte de la información incluida en el archivo de datos de gestión puede combinarse con información incluida en otro archivo de datos de gestión.
El procesador 320 puede extraer todas o algunas de las acciones de trabajo en una lista de trabajo incluida en un único archivo de datos de gestión y puede generar un archivo de datos de trabajo. Es decir, se pueden generar dos o más archivos 452 y 462 de datos de trabajo que tienen diferentes listas de trabajo a partir del único archivo 410 de datos de gestión (consulte la Fig. 4D).
Opcionalmente, el procesador 320 puede extraer todas o algunas de las acciones de trabajo en cada uno de dos o más archivos de datos de gestión, y puede combinar las acciones de trabajo extraídas para generar un archivo de datos de trabajo.
De acuerdo con una realización, una acción de trabajo puede extraerse según el orden de las acciones de trabajo escritas en una lista de trabajo, o puede extraerse en un orden diferente. También se puede extraer la información del nombre de la instrucción, la información del procesamiento de la instrucción y similares asignadas a la acción de trabajo extraída.
Un archivo de datos de trabajo puede ser reconocido por un dispositivo de control y puede ser necesario que sea capaz de realizar interacción con un archivo de procesamiento de trabajo que incluye una instrucción (es decir, un archivo de instrucciones integrado). De acuerdo con una realización, se puede producir un archivo de datos de trabajo para que sea adecuado a un marco previamente definido. De acuerdo con una realización, la información incluida en un archivo de datos de trabajo puede estar en un formato que pueda procesarse mediante un archivo de instrucciones integrado.
Por lo tanto, el método de producir directamente un archivo de datos de trabajo, que tiene la limitación descrita anteriormente, puede ser relativamente ineficaz. El método y el dispositivo de acuerdo con la presente divulgación pueden proporcionar eficientemente archivos de datos de trabajo necesarios para diversos trabajos de preparación utilizando archivos de datos de gestión a través de los cuales la entrada, gestión y procesamiento de información es relativamente fácil.
Posteriormente, el procesador 320 busca una instrucción que coincida con la información del nombre de la instrucción asignada a una acción de trabajo de un archivo de instrucciones integrado almacenado en el almacenamiento 336 de archivos de instrucciones integrado en la operación S240, de acuerdo con el orden de las acciones de trabajo de series temporales incluidas en el archivo de datos de trabajo determinado en la operación S230.
El archivo de instrucciones integrado incluye todas las instrucciones utilizadas para implementar todas las acciones de trabajo que se desea ejecutar mediante un instrumento de preparación, y el procesador 320 puede realizar control de manera que las acciones de trabajo sean implementadas por el instrumento de preparación utilizando el archivo de instrucciones integrado. Por ejemplo, cuando el instrumento de preparación es capaz de producir un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción de PCR, el archivo de instrucciones integrado puede incluir todas las instrucciones utilizadas para implementar todas las acciones de trabajo relacionadas con la producción.
Las instrucciones pueden incluir instrucciones para mover una pipeta que realiza el pipeteo hacia arriba y hacia abajo, hacia la izquierda y hacia la derecha, o hacia adelante y hacia atrás, e instrucciones para dispensar, aspirar o transferir líquido mediante el instrumento de preparación.
En la operación S250, el procesador 320 procesa la instrucción recuperada del archivo de instrucciones integrado de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones del archivo de datos de trabajo determinado.
El procesador 320 procesa instrucciones recuperadas de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones y controla el instrumento de preparación de manera que las acciones de trabajo sean implementadas por el instrumento de preparación en la operación S260.
De acuerdo con una realización, la memoria 330 puede incluir el almacenamiento 336 de archivos de instrucciones integrado que incluye un archivo de instrucciones integrado.
Cada instrucción incluida en el archivo de instrucciones integrado puede incluir variables de acción unitaria declaradas para cada instrucción.
En la presente divulgación, las acciones unitarias pueden indicarse mediante variables de acción unitaria.
Se designa una única instrucción para acciones de unidad relacionadas y se configuran diferentes instrucciones para incluir diferentes grupos de acciones de unidad.
En la presente especificación, el término “variables de acción unitaria declaradas para una instrucción” puede indicar “variables de acción unitaria designadas, asignadas o definidas para una instrucción” o “variables de acción unitaria asociadas con una instrucción”.
El archivo de datos de trabajo/procesador de archivos 322 de instrucciones integrados del procesador 320 puede buscar una instrucción coincidente del archivo de instrucciones integrado al utilizar información de nombre de instrucción asignada a una acción de trabajo de un archivo de datos de trabajo, puede proporcionar información de procesamiento de instrucciones conectada a la información de nombre de instrucción a la instrucción recuperada, y puede realizar control de manera que la acción de trabajo correspondiente sea ejecutada por la instrucción recuperada.
La instrucción puede indicar al procesador 320 que una acción unitaria indicada por una variable de acción unitaria correspondiente debe implementarse de acuerdo con valores variables de variables de acción unitaria definidas para una instrucción.
La información de procesamiento de instrucciones puede incluir variables de acción unitaria que indican acciones unitarias incluidas en una acción de trabajo implementada por la instrucción recuperada, y valores variables asignados a las variables de acción unitaria.
Cada instrucción incluida en el archivo de instrucciones integrado puede incluir variables de acción unitaria definidas para una instrucción correspondiente. El procesador 320 puede procesar cada instrucción al utilizar variables de acción unitaria cuyos valores variables se proporcionan de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones entre las variables de acción unitaria definidas para una instrucción correspondiente, mediante lo cual el instrumento de preparación implementa una acción de trabajo correspondiente.
El archivo de instrucciones integrado incluye una pluralidad de instrucciones, y cada una de la pluralidad de instrucciones puede implementarse como una combinación de un bucle que ejecuta una de la pluralidad de instrucciones durante un período de tiempo y una estructura de control tal como if, then, u otra similar.
De aquí en adelante, se describirá un proceso de procesamiento de una instrucción mediante la interacción entre un archivo de datos de trabajo y un archivo de instrucciones integrado con referencia a la Fig. 5.
Cuando se recibe información de selección para ejecutar un primer trabajo de preparación que incluye acciones de trabajo de series temporales A, C, D y F a través de la pantalla 310, el procesador 320 puede determinar un primer archivo 510 de datos de trabajo.
El primer archivo 510 de datos de trabajo incluye una primera área que indica una lista de trabajos que incluye acciones de trabajo de series temporales A, C, D y F, una segunda área que indica información del nombre de las instrucciones I1, I3, I4 e I6 para controlar las acciones de trabajo respectivas y una tercera área que indica las variables de acción unitaria correspondientes a acciones unitarias relacionadas con la ejecución de cada instrucción. Aunque no se ilustran, los valores de las variables se asignan a variables de acción unitaria, respectivamente.
En el caso de la acción de trabajo A, la acción de trabajo A se implementa mediante la instrucción I1 y, de acuerdo con lo anterior, se asigna la información del nombre de la instrucción I1. Además, las acciones unitarias asociadas con la instrucción I1 son la acción 01 unitaria, la acción 03 unitaria, la acción 06 unitaria, la acción 09 unitaria, la acción 12 unitaria y la acción 15 unitaria, y se asigna un valor variable para cada variable de acción unitaria.
En la Fig. 5, un archivo I 540 de instrucciones integrado incluye las instrucciones I1 a I10 asociadas con todas las acciones de trabajo que se desea ejecutar mediante el instrumento de preparación, y se definen variables de acción unitaria para cada instrucción. Por ejemplo, las variables definidas para la instrucción I1 son acción 01 unitaria, acción 03 unitaria, acción 06 unitaria, acción 09 unitaria, acción 12 unitaria y acción 15 unitaria.
El procesador 320 reconoce que la información del nombre de instrucción asignada a “A”, que es una primera acción de trabajo en el primer archivo 510 de datos de trabajo es “I1”, y busca la instrucción I1 que coincida con “ I1” de las instrucciones I1 a 110 del archivo I 540 de instrucciones integradas. Posteriormente, el procesador 320 puede proporcionar información variable de acción unitaria (es decir, acción 01 unitaria, acción 03 unitaria, acción 06 unitaria, acción 09 unitaria, acción 12 unitaria y acción 15 unitaria) y valores variables de los mismos, que son la información de procesamiento de instrucciones asociada con la información del nombre de la instrucción “I1”, a la instrucción “I1” del archivo I 540 de instrucciones integrado.
El procesador 320 puede procesar la instrucción “I1” de acuerdo con la acción 01 unitaria, la acción 03 unitaria, la acción 06 unitaria, la acción 09 unitaria, la acción 12 unitaria y la acción 15 unitaria y sus valores variables, que se proporcionan a través de la información de procesamiento de instrucciones de entre las variables de acción unitaria definidas para la instrucción “ I1”, y puede realizar un control de manera que la acción de trabajo A sea implementada por el instrumento de preparación.
El procesador 320 reconoce que la información del nombre de instrucción asignada a “C”, que es una siguiente acción de trabajo en el primer archivo 510 de datos de trabajo, es “I3”, y busca la instrucción “I3” que coincida con “ I3” de las instrucciones I1 a I10 del archivo I 540 de instrucciones integrado . Posteriormente, el procesador 320 procesa la instrucción “ I3” de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones asociada con la información del nombre de la instrucción “I3”, y permite que la instrucción “ I3” implemente la acción de trabajo “C”. El procesador 320 repite la operación descrita anteriormente de acuerdo con el orden de las acciones de trabajo en el primer archivo de datos de trabajo, por lo que el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación puede realizar el primer trabajo de preparación deseado.
El archivo I 540 de instrucciones integrado se puede utilizar para realizar un trabajo de preparación diferente al primer trabajo de preparación.
Cuando se recibe información de selección para ejecutar un segundo trabajo de preparación que incluye acciones de trabajo de series temporales A, B, F y H a través de la pantalla 310, el procesador 320 puede determinar un segundo archivo 520 de datos de trabajo de la Fig. 5. Se reconoce que las acciones de trabajo de series temporales A, B, F y H en el segundo archivo 520 de datos de trabajo se implementan mediante las instrucciones I1, I2, I6 e I8, respectivamente. El dispositivo 300 de control del instrumento de preparación puede implementar el segundo trabajo de preparación utilizando el segundo archivo 520 de datos de trabajo y el archivo I 540 de instrucciones integrado que incluye las instrucciones I1, I2, I6 e I8.
Convencionalmente, para ejecutar el primer trabajo de preparación y el segundo trabajo de preparación, es necesario producir por separado un primer archivo de procesamiento de trabajo y un segundo archivo de procesamiento de trabajo, cada uno de los cuales incluye instrucciones para ejecutar acciones de trabajo incluidas en un trabajo de preparación correspondiente.
El método de control del instrumento de preparación (S200) de la presente divulgación produce un “archivo de instrucciones integrado” una vez, en lugar de producir archivos de procesamiento de trabajo individuales. En cambio, el método de control del instrumento de preparación opera un archivo de datos de trabajo, para gestionar una lista de trabajo que se cambia para cada trabajo de preparación, y la información asociada con las acciones de trabajo incluidas en la lista de trabajo. Al utilizar el archivo de datos de trabajo y el archivo de instrucciones integrado, se implementan de manera eficiente y sencilla diversos trabajos de preparación.
Al menos una instrucción en el archivo I 540 de instrucciones integrado puede implementar dos o más acciones de trabajo.
Por ejemplo, Con referencia a la información asociada con un tercer archivo 530 de datos de trabajo para un tercer trabajo de preparación en la Fig. 5, el tercer trabajo de preparación incluye las acciones de trabajo H, D, E y G, en el que cuando la acción de trabajo H usa la instrucción i8, la acción de trabajo D usa la instrucción I4, y la acción de trabajo E usa la instrucción I5, y la acción de trabajo G utiliza la instrucción I8.
De acuerdo con una realización, el procesador 320 implementa dos o más acciones de trabajo utilizando diferentes variables de acción unitaria entre variables de acción unitaria definidas para una instrucción.
Por ejemplo, en el archivo I 540 de instrucciones integrado de la Fig. 5, las variables de acción unitaria que incluyen “acción 28 unitaria, acción 32 unitaria, acción 36 unitaria, acción 40 unitaria, acción 48 unitaria, acción 49 unitaria, acción 53 unitaria, acción 54 unitaria y acción 55 unitaria” se definen para la instrucción “I8”.
La información del nombre de instrucción asignada a la acción de trabajo “H” en el tercer archivo 530 de datos de trabajo es “I8”, y la información de procesamiento de instrucciones conectada incluye variables de acción unitaria que incluyen acción 28 unitaria, acción 32 unitaria, acción 36 unitaria, acción 40 unitaria, acción 48 unitaria, acción 49 unitaria y acción 53 unitaria, e información de valor variable de las mismas.
La información del nombre de la instrucción asignada a la acción de trabajo “G” también es “ I8”, pero la información de procesamiento de instrucciones conectada incluye variables de acción unitaria que incluyen acción 28 unitaria, acción 32 unitaria, acción 36 unitaria, acción 49 unitaria, acción 53 unitaria, acción 54 unitaria y acción 55 unitaria, e información de valor variable de las mismas.
Es decir, la acción de trabajo H y la acción de trabajo G están controladas por la misma instrucción “I8”, pero tienen diferentes combinaciones de variables de acción unitaria relacionadas (es decir, acciones unitarias). De acuerdo con lo anterior, se ejecutan diferentes acciones de trabajo.
De acuerdo con una realización, el software (o un programa) que se encarga de producir, gestionar y utilizar un archivo de datos de gestión y/o un archivo de datos de trabajo, y el software que se encarga de producir, gestionar y utilizar una instrucción integrada pueden existir como una sola pieza de software o pueden existir como piezas de software separadas. De acuerdo con una realización, las (partes de) software pueden ejecutarse en un procesador, o pueden ejecutarse en dos o más procesadores.
En algunos casos, es necesario identificar si las acciones de trabajo deseadas están organizadas con precisión antes de que comience un trabajo de acuerdo con un archivo de datos de trabajo después de que se proporciona el archivo de datos de trabajo de acuerdo con la información de selección. Además, un usuario desea realizar manualmente una acción de trabajo de dispensación de IC (IC_Dispense) incluida en una lista de trabajo del tipo de composición de detección extraída antes de que comience un trabajo de preparación, o desea omitir, en la lista de trabajo, una acción de trabajo considerada como una acción de trabajo innecesaria debido a las características del tipo de composición de detección.
El dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de la presente divulgación puede controlar el instrumento de preparación, para proporcionar una ventana de trabajo para mostrar (notificar) o editar acciones de trabajo incluidas en un archivo de datos de trabajo en la pantalla 310, antes de comenzar el trabajo de preparación. A través de lo anterior, un usuario puede identificar la lista de trabajo y puede realizar selectivamente sólo una acción de trabajo necesaria.
Además, cuando el trabajo se suspende mientras funciona el instrumento de preparación, el dispositivo 300 de control del instrumento de preparación de acuerdo con la presente divulgación puede proporcionar información de estado asociada con la acción de trabajo suspendida o puede proporcionar una ventana de trabajo para editar una acción de trabajo posterior.
Por ejemplo, en el caso en el que se realicen acciones de trabajo de preparación asociadas con el tipo de composición de detección extraída, cuando se detecte un coágulo o se realice de manera anormal una acción de aspiración o dispensación en el proceso de aspiración y dispensación de una muestra o un reactivo, se puede visualizar una ventana separada en la pantalla 310 de manera que un usuario identifica la ubicación de una muestra y dispensa el volumen exacto de la muestra a un tubo de muestra. Además, la acción de trabajo suspendida se indica en la lista de trabajo del archivo de datos de trabajo, y se proporcionan opciones de acción de trabajo de modo que se realicen las acciones de trabajo restantes, por lo que sólo se realizan las acciones de trabajo necesarias.
El procesador 320 de acuerdo con la presente divulgación puede realizar además la generación de un archivo de datos de configuración utilizando la información de selección de la operación S220.
De acuerdo con una realización, el procesador 320 puede incluir el generador 326 de archivos de datos de configuración que genera un archivo de datos de configuración.
El archivo de datos de configuración incluye información de selección que incluye el tipo de trabajo de preparación basado en el tipo de composición de detección, el tipo de molécula de ácido nucleico diana que se desea detectar al utilizar un producto de prueba e información asociada con las herramientas (consumibles) necesarias para realizar un trabajo mediante el instrumento de preparación (un material de laboratorio que contiene un ácido nucleico extraído, un tubo o placa que contiene una mezcla de reacción de PCR, y similares).
Además, la información de selección, tal como información adicional (kit de extracción, PC, NC, recuento de cartuchos y similares) que se establece de antemano o que un usuario ingresa manualmente a través de un código de barras o un dispositivo de entrada como un mouse, y similares, pueden incluirse además.
La información asociada con el archivo de datos de configuración generado puede ser información asociada con un archivo de datos de trabajo que se va a determinar (o que se ha determinado), o se puede utilizar como una variable de acción unitaria, un valor de variable o similar requerido para el procesamiento de una instrucción al utilizar un archivo de instrucciones integrado.
Por ejemplo, el archivo de datos de configuración incluye información asociada con el tipo de composición de detección basada en la información de selección recibida, un producto para una prueba y el tipo de molécula de ácido nucleico diana que un usuario desea detectar al utilizar el producto para una prueba, por lo que el archivo de datos de configuración puede soportar información para determinar un archivo de datos de trabajo correspondiente.
El procesador 320 puede procesar información de selección registrada en el archivo de datos de configuración mediante la interoperación con un archivo de instrucciones interoperado.
De acuerdo con una realización, cuando se procesa una instrucción de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones de acuerdo con la información de selección registrada en el archivo de datos de configuración, se puede cambiar una secuencia de procesamiento de variables de acción unitaria. De acuerdo con una realización, en la información de selección basada en la intención de un usuario, los valores variables pueden asignarse de manera diferente de acuerdo con las herramientas (consumibles). Por ejemplo, en el caso de un material de laboratorio de muestra, los valores variables se pueden asignar de forma diferente de acuerdo con el tipo de tubo.
En el caso de una variable que indique una acción de aspirar una muestra de un tubo de muestra entre las variables que indican acciones unitarias de una acción de trabajo, el volumen de una muestra aspirada debe cambiarse de acuerdo con el tipo de tubo.
Por lo tanto, en el caso en el que las acciones unitarias se realizan utilizando herramientas, cuando el procesamiento de instrucciones se realiza de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones, la secuencia de procesamiento de las variables de acción unitaria se puede cambiar de acuerdo con el tipo de herramienta, o los valores de las variables deben procesarse de manera diferente basado en información de selección.
Aunque se han descrito en detalle partes específicas de la presente divulgación, es evidente para los expertos en la técnica que las descripciones detalladas son simplemente realizaciones preferibles y no limitan el alcance de la presente divulgación. Por lo tanto, debe entenderse que el alcance real de la presente divulgación está definido por las reivindicaciones adjuntas al presente documento y sus equivalentes.

Claims (16)

REIVINDICACIONES
1. Un método para controlar un instrumento (100) de preparación que prepara una
composición de detección utilizada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra, comprendiendo el método:
visualizar una pluralidad de campos (S210) de opción que comprenden un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana que se desea detectar en una pantalla para determinar una composición de detección deseada, en el que la composición de detección incluye un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción para amplificación del ácido nucleico;
recibir información de selección de usuario de cada uno de la pluralidad de campos (S220) de opción;
determinar un archivo (S230) de datos de trabajo en base a la información de selección, en el que el archivo (510, 520, 530) de datos de trabajo comprende una lista de trabajo que comprende acciones de trabajo de series temporales requeridas para preparar el extracto de ácido nucleico y/o una lista de trabajo que comprende acciones de trabajo de series temporales requeridas para preparar la solución de reacción para la amplificación de ácido nucleico, y comprende información del nombre de la instrucción e información de procesamiento de instrucciones utilizadas para implementar las acciones de trabajo en el instrumento de preparación;
buscar una instrucción (S240) que coincida con la información de nombre de instrucción asignada a una acción de trabajo de un archivo (540) de instrucciones integrado, de acuerdo con el orden de las acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo determinado, en el que el archivo de instrucciones integrado comprende todas las instrucciones utilizadas para implementar todas las acciones de trabajo que se desea operar en el instrumento de preparación, y las instrucciones comprenden instrucciones para mover una pipeta, que realiza el pipeteo en el instrumento de preparación, hacia arriba y hacia abajo, hacia la izquierda y hacia la derecha, y hacia adelante y hacia atrás, y para dispensar, aspirar o transferir un líquido; y
realizar el control de manera que las instrucciones recuperadas se procesen de acuerdo con la información (S250) de procesamiento de instrucciones y las acciones de trabajo se implementen en el instrumento (S260) de preparación.
2. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, en el que la etapa de determinar el archivo de datos de trabajo comprende:
generar el archivo de datos de trabajo al utilizar la información de selección y uno o más archivos de datos de gestión seleccionados basándose en la información de selección, en el que los archivos de datos de gestión se clasifican y almacenan de acuerdo con un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana, y comprende acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo requerido de acuerdo con la información de selección, e información de nombre de instrucción e información de procesamiento de instrucción asociada con cada acción de trabajo; en el que preferiblemente la etapa de generar el archivo de datos de trabajo comprende:
generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en un único archivo de datos de gestión, o generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en cada uno de los dos o más archivos de datos de gestión y combinar las acciones de trabajo extraídas.
3. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, en el que la información de procesamiento de instrucciones comprende:
variables de acción unitaria que indican acciones unitarias de acciones de trabajo implementadas por las instrucciones recuperadas y valores de variables asignados a las variables de acción unitaria.
4. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, en el que cada instrucción en el archivo de instrucciones integrado comprende variables de acción unitaria definidas para una instrucción correspondiente, las variables de acción unitaria indican acciones unitarias de una acción de trabajo implementada por una instrucción, y cada instrucción se procesa al utilizar variables de acción unitaria de las cuales se proporcionan valores variables de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones entre las variables de acción unitaria definidas para cada instrucción.
5. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, en el que al menos una instrucción en el archivo de instrucciones integrado implementa dos o más acciones de trabajo;
en el que preferiblemente las variables de acción unitaria que se usarán entre las variables de acción unitaria definidas para al menos una instrucción se configuran para que sean diferentes, de modo que se implementen dos o más acciones de trabajo.
6. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, que comprende además:
visualizar, en la pantalla, una ventana de trabajo para visualizar o editar acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo antes de controlar el instrumento de preparación.
7. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, en el que, cuando se suspende el trabajo mientras funciona el instrumento de preparación, el método comprende además visualizar, en la pantalla, una ventana de trabajo para visualizar información de estado de la acción de trabajo suspendida o editar una acción de trabajo posterior.
8. El método como se reivindicó en la reivindicación 1, que comprende además: generar un archivo de datos de configuración en el que se registra la información de selección, en el que la información de selección registrada en el archivo de datos de configuración se procesa mediante interoperación con el archivo de instrucciones integrado.
9. Un dispositivo (300) para controlar un instrumento (100) de preparación que prepara una composición de detección utilizada para detectar una molécula de ácido nucleico diana en una muestra, el dispositivo (300) comprende: una pantalla (310), uno o más procesadores (320) y una memoria (330), en el que el procesador está configurado para realizar:
visualización de una pluralidad de campos (S210) de opción que comprenden un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana que se desea detectar en la pantalla para determinar una composición de detección deseada, en el que la composición de detección comprende un extracto de ácido nucleico y una solución de reacción para amplificación del ácido nucleico;
recibir información de selección de usuario de cada uno de la pluralidad de campos (S220) de opción para determinar (S230) un archivo (510, 520, 530) de datos de trabajo basándose en la información de selección, en el que el archivo de datos de trabajo comprende una lista de trabajo que comprende acciones de trabajo de series de tiempo requeridas para preparar el extracto de ácido nucleico y/o una lista de trabajo que comprende acciones de trabajo en series de tiempo requeridas para preparar la solución de reacción para la amplificación de ácido nucleico, y comprende información del nombre de la instrucción e información de procesamiento de instrucciones utilizada para implementar las acciones de trabajo en el instrumento de preparación;
buscar una instrucción (S240) que coincida con la información del nombre de instrucción asignada a una acción de trabajo de un archivo (540) de instrucciones integrado, de acuerdo con el orden de acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo determinado, en el que el archivo de instrucciones integrado comprende todas las instrucciones utilizadas para implementar todas las acciones de trabajo que se desea operar en el instrumento de preparación, y las instrucciones comprenden instrucciones para mover una pipeta, que realiza el pipeteo en el instrumento de preparación, hacia arriba y hacia abajo, hacia la izquierda y hacia la derecha, y hacia adelante y hacia atrás y para dispensar, aspirar o transferir un líquido; y
realizar el control (S250) de manera que las instrucciones recuperadas se procesen de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones y las acciones de trabajo se implementen en el instrumento (S260) de preparación.
10. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que la memoria está configurada para almacenar un archivo de datos de gestión que comprende acciones de trabajo incluidas en un archivo de datos de trabajo requerido de acuerdo con la información de selección, e información de nombre de instrucción e información de procesamiento de instrucciones asociada con cada acción de trabajo, en el que el archivo de datos de gestión se clasifica y almacena de acuerdo con un tipo de composición de detección y un tipo de molécula de ácido nucleico diana; y
el procesador está configurado para generar el archivo de datos de trabajo al utilizar la información de selección y uno o más archivos de datos de gestión seleccionados en base a la información de selección, e implementa la determinación del archivo de datos de trabajo; en el que preferiblemente el procesador está configurado para generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en un único archivo de datos de gestión, o para generar el archivo de datos de trabajo al extraer algunas o todas las acciones de trabajo incluidas en cada una de los dos o más archivos de datos de gestión y combinar las acciones de trabajo extraídas.
11. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que la información de procesamiento de instrucciones comprende:
variables de acción unitaria que indican acciones unitarias de acciones de trabajo implementadas por las instrucciones recuperadas y valores de variables asignados a las variables de acción unitaria.
12. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que cada instrucción en el archivo de instrucciones integrado comprende variables de acción unitaria definidas para una instrucción correspondiente, y las variables de acción unitaria indican acciones unitarias de una acción de trabajo implementada por una instrucción; y
el procesador está configurado para procesar cada instrucción al utilizar variables de acción unitaria cuyos valores variables se proporcionan de acuerdo con la información de procesamiento de instrucciones entre las variables de acción unitaria definidas para cada instrucción.
13. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que el procesador está configurado para permitir que al menos una instrucción en el archivo de instrucciones integrado implemente dos o más acciones de trabajo; en el que preferiblemente el procesador está configurado para establecer variables de acción unitaria, que se van a usar entre variables de acción unitaria definidas para al menos una instrucción, para que sean diferentes, de modo que se implementen dos o más acciones de trabajo.
14. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que el procesador está configurado para visualizar, en la pantalla, una ventana de trabajo para visualizar o editar las acciones de trabajo incluidas en el archivo de datos de trabajo antes de controlar el instrumento de preparación.
15. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que, cuando el trabajo se suspende mientras el instrumento de preparación está en funcionamiento, el procesador se configura para visualizar, en la pantalla, una ventana de trabajo para visualizar información del estado de la acción de trabajo suspendida o para editar una acción de trabajo posterior.
16. El dispositivo como se reivindicó en la reivindicación 9, en el que el procesador está configurado para generar un archivo de datos de configuración en el que se registra la información de selección, y para procesar la información de selección registrada en el archivo de datos de configuración mediante la interoperación con el archivo de instrucciones integrado.
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