ES2274588T3 - Composiciones de los canales de calcio a baja tension y procedimientos correspondientes. - Google Patents

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Abstract

Un fragmento de ácido nucleico aislado que codifica una subunidad a1H de baja tensión de un canal de calcio animal, en el que la secuencia de nucleótidos comprende la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID números 12 - 16.

Description

Composiciones de los canales de calcio activas a baja tensión y procedimientos correspondientes.
Campo técnico
La presente invención se refiere a biología molecular y farmacobiología. Más particularmente, la invención se refiere a las composiciones de los canales de calcio y procedimientos de preparación y uso de los mismos.
Antecedentes de la invención
Los canales de calcio son proteínas de multisubunidades, que se extienden sobre las membranas que permiten controlar la entrada de iones Ca^{2+} en las células a partir del fluido extracelular. Las células del reino animal, y al menos algunas células bacterianas, fúngicas y vegetales, poseen uno o más tipos del canal de calcio. El tipo más común de los canales de calcio es dependiente de la tensión. Todas las células "excitables" en animales, tales como neuronas del sistema nervioso central (SNC), células nerviosas periféricas y células musculares, incluyendo aquellas de los músculos esqueléticos, músculos cardíacos, y músculos lisos arteriales, que tienen canales de calcio dependientes de la tensión (VGCCs). La "apertura" de un canal dependiente de voltaje que permite un influjo de los iones de Ca^{2+} en las células requiere una despolarización hasta un cierto nivel de la diferencia de potencial entre el interior de la célula que lleva la célula. La velocidad de influjo de Ca^{2+} en la célula depende de su diferencia de potencial.
Los canales de calcio son proteínas de multisubunidades que contienen dos grandes subunidades, denominadas \alpha_{1} y \alpha_{2}, que tienen pesos moleculares entre aproximadamente 130 y aproximadamente 200 kilodaltons ("kD"), y uno a tres subunidades más pequeñas diferentes de menos de aproximadamente 60 kD de peso molecular. Al menos una de las subunidades mayores y posiblemente alguna de las subunidades más pequeñas están glicosiladas. Algunas de las subunidades son capaces de estar fosforiladas. La subunidad \alpha_{1} tiene un peso molecular de aproximadamente 150 a aproximadamente 170 kD cuando se analiza mediante electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE) de dodecilsulfato de sodio (SDS) después del aislamiento a partir de tejido muscular de mamíferos y tiene sitios de unión específicos para diversos 1,4-dihidropiridinas (DHPs) y fenilalquilaminas. En condiciones no reductoras (en presencia de N-etilmaleimida), la subunidad \alpha_{2} migra en SDS - PAGE como una banda correspondiente a un peso molecular de aproximadamente 160-190 kD. Tras la reducción, y fragmento grande y fragmentos más pequeños se liberan. La subunidad \beta del canal de calcio de músculo esquelético de conejo es una proteína fosforilada que tiene un peso molecular de 52-65 kD como se determina mediante análisis de SDS - PAGE. Esta subunidad es insensible a las condiciones reductoras. La subunidad \gamma del canal de calcio parece ser una glicoproteína con un peso molecular aparente de 30-33 kD, como se determina mediante análisis de SDS - PAGE.
Con el fin de estudiar la estructura de los canales de calcio, se necesitan grandes cantidades de proteína de los canales puros. Debido a la naturaleza compleja de estas proteínas de multisubunidades, las concentraciones variables de los canales de calcio en las fuentes de tejido de la proteína, la presencia de poblaciones mixtas de los canales de calcio en los tejidos, las dificultades en la obtención de tejidos de interés, y las modificaciones de la proteína nativa que se puede producir durante el procedimiento de aislamiento, es extremadamente difícil de obtener grandes cantidades de proteína de los canales de calcio altamente purificada, completamente intacta.
Debido a que los canales de calcio están presentes en diversos tejidos y tienen un papel central en la regulación de las concentraciones de ion de calcio intracelular, están implicados en un número de los procesos vitales en animales, incluyendo liberación del neurotransmisor, contracción intramuscular, actividad del marcapasos, y secreción de hormonas y otras sustancias. Estos procedimientos parecen estar implicados en numerosos trastornos humanos, tales como trastornos del sistema nervioso central y enfermedades cardiovasculares. Los canales de calcio, de este modo, también están implicados en numerosos trastornos. Un número de compuestos útiles para tratar diversas enfermedades cardiovasculares, incluyendo seres humanos, se cree que ejercen sus efectos beneficiosos mediante la modulación de funciones de los canales de calcio dependientes de la tensión presentes en el músculo liso cardíaco y/o vascular. Muchos de estos compuestos se unen a los canales de calcio y bloquean, o reducen la velocidad de, influjo de Ca^{2+} en las células en respuesta a la despolarización de la membrana celular.
Los resultados de los estudios de expresión recombinante de los clones de ADNc que codifican la subunidad \alpha_{1} de los canales de calcio de conejo y transcripciones de los clones de ADNc indican que las formas de la subunidad \alpha_{1} de del poro a través de las el calcio entra en las células. La relevancia de las corrientes de bario generadas en estas células recombinantes a la corriente real generada por los canales de calcio que contienen como un componente las subunidades \alpha_{1} in vivo no está claro. Con el fin de caracterizar completamente y precisamente y evaluar los tipos de canales de calcio diferentes, sin embargo, es esencial examinar las propiedades funcionales de los canales de calcio recombinantes que contienen todas las subunidades como se encuentran in vivo.
Con el fin de llevar a cabo este examen y entender completamente la estructura y función de los canales de calcio, es crítico identificar y caracterizar como muchas subunidades de los canales de calcio. También con el fin de preparar células recombinantes para uso en la identificación de los compuestos que interactúan con canales de calcio, es necesario ser capaz de producir células que expresan poblaciones uniformes de canales de calcio que contienen las subunidades definidas.
Un entendimiento de la farmacología de los compuestos que interactúan con los canales de calcio en otros sistemas de órganos, tales como el SNC, puede ayudar en el diseño racional de los compuestos que actúan específicamente con los subtipos de canales de calcio humanos que tienen los efectos terapéuticos deseados, tales como en el tratamiento de trastornos neurodegenerativos y cardiovasculares. Sin embargo, tal entendimiento y la capacidad de diseñar racionalmente los compuestos eficaces se han complicado por una incapacidad de determinar independientemente los tipos de los canales de calcio humanos y la naturaleza molecular de los subtipos individuales, particularmente en el SNC, y mediante la incapacidad de las preparaciones puras de subtipos de los canales específicos para uso para evaluación de la especificidad de los compuestos que efectúan los canales de calcio y el uso de tal ADN para expresión de las subunidades de los canales de calcio y canales de calcio funcionales ayudarían en la selección y diseño de compuestos terapéuticamente eficaces.
Se han identificado múltiples tipos de canales de calcio en células de mamíferos a partir de diversos tejidos, incluyendo músculo esquelético, músculo cardíaco, pulmón, músculo liso y cerebro, (véase, por ejemplo, Bean, B. P. (1989) Ann. Rev. Physiol. 51: 367-384\alpha y Hess, P. (1990) Ann. Rev. Neurosci. 56: 337). Los tipos diferentes de los canales de calcio se han categorizado ampliamente en cuatro clases, tipo L-, T-, P-, Q y R, distinguidos por cinética de corriente, manteniendo la sensibilidad potencial y sensibilidad a los agonistas y antagonistas de los canales de calcio. La determinación primaria de la diversidad entre los canales de calcio es la naturaleza de la subunidad \alpha_{1} que forma el poro. El ácido nucleico que codifica las numerosas subunidades \alpha_{1} se han clonado y se han expresado las subunidades expresadas. Se han establecido las correlaciones entre las subunidades \alpha_{1} y las corrientes de Ca^{2+} definidas operacionalmente. Seis producto génicos \alpha_{1A}-\alpha_{1-E} y \alpha_{1S} participan en la formación de canales activados por alta tensión, que incluyen los canales de tipo L, N, P, Q y R.
Se han descrito las subunidades \alpha_{1} humanas que codifican ADN, que incluyen las subunidades \alpha_{1A}-, \alpha_{1B}-, \alpha_{1C}-, \alpha_{1D}- y \alpha_{1E}- y variantes de ayuste de los mismos (véase, por ejemplo, la patente de Estados Unidos Nº 5.429.921, patente de Estados Unidos Nº 5.846.756, patente de Estados Unidos Nº 5.851.824, solicitud PCT internacional publicada Nº PCT/US92/06903, y la solicitud PCT internacional publicada Nº PCT/US94/09230). Estas subunidades parecen participar en la formación de los canales de calcio de alta tensión (HVA), que además de estas subunidades \alpha_{1}, incluye una subunidad \beta y una subunidad \alpha_{2}, incluyendo \delta, que se une a \alpha_{2} mediante un puente disulfuro y proviene del mismo precursor. Las propiedades biofísicas y farmacológicas de cada canal derivan principalmente de la subunidad \alpha_{1}, pero están modulados por subunidades auxiliares, principalmente las subunidades \betaasociadas al canal. Las subunidades \beta se ha mostrado que incrementan la amplitud de la corriente máxima, para desplazar las curvas de activación/inactivación hacia potenciales más hiperpolarizados y alterar la cinética de activación e inactivación (véase, por ejemplo, Lambert y col., (1997) J. Neurosci. 17: 6621-6625). La subunidad \alpha_{2}\delta, que es específica de tejido, incrementa la corriente generada por cualquier subunidad \alpha_{1} y potencia la respuesta estimuladora de las subunidades \beta.
Canales de tipo T o LVA
Se conoce poco sobre los canales que se han denominado canales T o canales LVA (activado por baja tensión). Los canales de calcio, activados por baja tensión (LVA), es decir de tipo T se encuentran de manera reseñada en una diversidad de tipos de células. Los canales activados por baja tensión (LVA) o de tipo T se distribuyen también de manera amplia en el sistema nervioso central y periférico y aparentemente implicados en una estructura extensa de procesos neuronales diferentes.
En general se cree que las corrientes de tipo T no se diferencial fundamentalmente de otras corrientes de Ca^{2+}. Del mismo modo que los canales de HVA, los canales de tipo T son selectivamente permeables a cationes divalentes, mientras que una mínima concentración de cationes divalentes esté presente en el medio externo. Para las corrientes LVA (o tipo T), esta concentración mínima de Ca^{2+} es aproximadamente 25 \mum, y para las corrientes de HVA es aproximadamente 1 \muM. La corriente de tipo T se indica que se satura con una k_{d} de aproximadamente 10 mM de Ca^{2+}, que es similar a la reseñada para corrientes de HVA. Sin embargo, los canales parece que muestran ciertas diferencias. Se diferencian en su permeabilidad relativa a los cationes divalentes. En general, los canales de HVA no son más permeables a Ba^{2+} que a Ca^{2+}; el tipo T es igual o ligeramente menos permeable a Ba^{2+} que a Ca^{2+}. Los canales de tipo T se cree que también muestran activación/inactivación más lenta y cinética de desactivación y se ha reseñado que muestran sensibilidad relativamente más alto a Ni^{2+}. este tipo de canal se activa cerca del potencial restante de la membrana, y se cree que es responsable de la generación de actividad de descarga repetitiva u oscilaciones neuronales intrínsecas y para la entrada de Ca^{2+} que acompaña a la actividad de adición (véase, por ejemplo, Huguenard (1996) Annual Rev. Physiol. 58: 329-348). Los datos recientes sugieren que al subunidades \beta identificadas hasta la fecha no pueden ser una subunidad de canal de tipo T constitutiva (véase, Lambert y col., (1997) J. Neurosci. 17: 6621-6625). La estructura de los canales de calcio que generan las diversas corrientes de LVA. Ninguna de las subunidades \alpha_{1} clonadas previamente parecen tener todas las propiedades que se han atribuido a los canales de tipo T (o LVA) activados por baja tensión.
Cribbs LL (1998) Circ Res, 83 (1): 103-109 describe la clonación y caracterización de la subunidad alfa 1H de la familia de genes de los canales de Ca^{2+} de tipo T de corazón humano (documento publicado en julio de 1998).
En esta memoria descriptiva es un objeto proporcionar ácido nucleico que codifica las subunidades de los canales de calcio específicos que tienen propiedades estructurales y funcionales que difieren de los canales de tipo HVA. También es un objeto de la presente memoria descriptiva proporcionar ácido nucleico que codifica canales que tienen actividades que se han atribuido a los canales de tipo T y proporcionar células eucarióticas que llevan canales de calcio específicos de tejido o específicos de subtipo. También es un objeto proporcionar ensayos para la identificación de compuestos potencialmente terapéuticos que actúan como moduladores de la actividad de los canales de calcio, particularmente los específicos para canales que muestran propiedades de los canales de tipo T y otros tipos de canales.
Sumario de la invención
Se proporcionan los fragmentos de ácidos nucleicos aislados y purificados que codifican las subunidades de los canales de calcio. Las subunidades forman canales activados por baja tensión (LVA), particularmente los canales que tienen propiedades asociadas a los canales de tipo T. Las subunidades y resultados proporcionados en esta memoria descriptiva, proporcionan una familia de subunidades \alpha_{1H} que corresponden a canales LVA, o de tipo. Los canales que contienen estas subunidades tienen la capacidad de abrirse a baja diferencia de potencial, pero permanecen abiertos durante períodos de tiempo moderados. Estos canales se localizan en lugares fisiológicos críticos, incluyendo neuronas en el tálamo, hipotálamo, y tronco cerebral, y por consiguiente pueden estar implicados en las funciones nerviosas autonómicas, quizás implicadas en la regulación de actividades cardiovasculares tales como insuficiencia cardíaca, inervación y tono del músculo liso arterial y venoso, ritmo pulmonar y otras actividades fisiológicas críticas.
Se proporciona el ADN que codifica estas subunidades \alpha_{1H} de un canal de calcio animal, y ARN que codifica tales subunidades, hechas de transcripciones de tal ADN. En particular, se proporciona el ácido nucleico que codifica los canales de calcio de tipo T, denominadas subunidades \alpha_{1H}(denominadas \alpha_{1F} en el documento de prioridad solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/984.709) de un canal de calcio, particularmente un canal de calcio animal y más particularmente un canal de calcio de mamíferos.
De particular interés en esta memoria descriptiva es el ácido nucleico que codifica las subunidades \alpha_{1H} de los canales de calcio, particularmente canales de calcio de mamíferos. Se proporciona ácido nucleico que codifica subunidades \alpha_{1H} ejemplares. Se proporciona el ácido nucleico que codifica dos variantes de ayuste, denominadas \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2}, a partir de los canales de calcio humanos. Las secuencias de ácido nucleico y aminoácidos codificados de las subunidades ejemplificadas se muestran en las SEQ ID números 12 (\alpha_{1H-1}), 15 (\alpha_{1H-1}) y 16 (\alpha_{1H-2}). Las SEQ ID números 12 y 15 difieren solamente en que el aminoácido 2230 (bases 6983-6985) es Asp (GAC) en la SEQ ID Nº 15 y Glu (GAA) en la SEQ ID Nº 12.
Este ácido nucleico se puede usar para aislar variantes, incluyendo variantes de ayuste adicionales del ácido nucleico que codifica las subunidades \alpha_{1H}, las variantes alélicas y las subunidades \alpha_{1H} de otros animales, particularmente mamíferos. Tal ácido nucleico incluye el ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H-1} que tiene sustancialmente la misma secuencia de aminoácidos codificada por el ADN expuesto en las SEQ ID Números 12 y 15. Este ácido nucleico también se puede usar para aislar el ADN que codifica las subunidades \alpha_{1H} de otras especies, particularmente otros mamíferos.
También se proporciona ácido nucleico que codifica una segunda variante de ayuste, denominada \alpha_{1H-2}. la secuencia de ácido nucleico de esta variante, difiere de \alpha_{1H-1} en que tiene una supresión de 957 nucleótidos, que dan como resultado la pérdida de 319 aminoácidos (que corresponden a los aminoácidos 470-788 de \alpha_{1H-1}).
También se incluyen cualesquiera subunidades que están codificadas por ácido nucleico que contienen los nucleótidos nt 1506 a nt 2627 de la SEQ ID Nº 12 ó 15 o las subunidades que están codificadas por ácido nucleico que se hibrida, preferiblemente en condiciones de alta rigurosidad, a una sonda derivada de esta región que codifica un canal T, que se puede identificar usando los procedimientos en esta memoria descriptiva.
La subunidad \alpha_{1H} difiere de las subunidades de los canales de calcio \alpha_{1A}-\alpha_{1E} en un número de aspectos. Primero, el bucle intracelular posicionado entre los dominios transmembrana I y II considerablemente más largo que los canales de calcio de HVA. Por ejemplo, como se ejemplifica en las SEQ ID números 12 y 15 y descritos más adelante, el bucle intracelular entre los dominios I y II es mayor que 1, 100 nt (1122 nt), mientras que la región correspondiente en los canales de calcio de HVA varía entre 351 y 381 nt de longitud. De este modo, el bucle intracelular de \alpha_{1H} contiene aproximadamente 370 restos de aminoácidos adicionales (aa 420 a aa 794 de la SEQ ID Nº 12) no encontrados en las subunidades \alpha_{1} de los canales de calcio de HVA. Además, la secuencia de aminoácidos codificada de esta región de bucle es altamente rica en prolina y contiene una región de poli-HIS de 9 residuos de histidina consecutivos.
Otras características diferenciadoras de la subunidad \alpha_{1H}, incluyen la ausencia de residuos de aminoácidos en el bucle intracelular entre los dominios transmembrana I y II que se sabe que son críticos (por ejemplo, véase De Waard y col., (1996) FEBS Letters 380: 272-276; Pragnell y col., (1994) Nature 368: 67-70) para la interacción entre una subunidad \alpha_{1} y una subunidad \beta. La subunidad \alpha_{1H} también contiene un bucle extracelular notablemente grande en el dominio I entre IS5 e IS6. Las subunidades de los canales de calcio \alpha_{1H} de HVA proporcionadas en esta memoria descriptiva contienen 249-270 residuos de nucleótidos en este bucle. Por el contrario, la subunidad \alpha_{1H} humana contienen 426 restos de nucleótidos en este bucle. El bucle intracelular entre los dominios III y IV transmembrana también es ligeramente mayor que las subuniaddes \alpha_{1} de HVA (186 nt comparado con 159-162 nt).
Se describen las sondas de ácido nucleico, que se pueden marcar para detección, que contienen al menos 16, o, si desea, 20 ó 30 o más, nucleótidos contiguos de ácido nucleico que codifican \alpha_{1H}. También se describen los procedimientos que usan las sondas para el aislamiento y clonación del ADN que codifica la subunidad de los canales de calcio, que incluyen variantes de ayuste dentro de tejidos y sus variantes entre tejidos. Las regiones particularmente preferidas a partir de las que se construyen las sondas para el aislamiento de ADN que codifica una subunidad \alpha_{1H} humana incluyen la secuencia de ácido nucleico que codifica el bucle intracelular notablemente largo entre los dominios I y II transmembrana (por ejemplo, nt 1506 a nt 2627 de las SEQ ID números 12 y 15). Las sondas para aislar el ADN que codifica un una subunidad \alpha_{1H} humana tienen preferiblemente 16 nucleótidos contiguos de longitud. En algunos casos, se usan sondas de 30 ó 50 nucleótidos y en otros casos se usan sondas entre 50 y 100 nucleótidos.
Se proporcionan células eucarióticas que contienen ADN heterólogo que codifica una o más de las subunidades de los canales de calcio, particularmente las subunidades de los canales de calcio humanos, o que contienen transcripciones de ARN de clones de ADN que codifican una o más subunidades. Una sola subunidad \alpha_{1H} puede formar un canal. Sin embargo, la combinación requerida de las subunidades para la formación de canales activos en células seleccionadas, se puede determinar empíricamente usando los procedimientos en esta memoria descriptiva. Por ejemplo, si un subtipo de \alpha_{1} seleccionado o variante no forma un canal activo en una línea celular seleccionada, una subunidad o subuniaddes adicionales se pueden añadir hasta que se forma un canal activo. Otras subunidades se pueden añadir para determinar los efectos de tal adición.
En realizaciones preferidas, las células contienen ADN o ARN que codifican una subunidad \alpha_{1H} de un animal, preferiblemente, de un canal de calcio de mamífero. Las realizaciones en las que las células contienen ácido nucleico que codifica una \alpha_{1H} son de particular interés en esta memoria descriptiva. En otra realización, las células contienen ADN o ARN que codifican subunidades heterólogas adicionales, incluyendo una \alpha_{2}\delta. Las células también pueden incluir ácido nucleico que codifican una subunidad \beta y/o una subunidad \gamma. En tales realizaciones, se proporcionan células eucarióticas transfectadas estable o transitoriamente con cualquier combinación de uno, dos, tres o cuatro de los clones de ADN que codifican subunidades, tal como ADN que codifica cualquiera de \alpha_{1}, \alpha_{1} + \beta, \alpha_{1} + \beta + \alpha_{2}. Las células eucarióticas proporcionadas en esta memoria descriptiva contienen ácido nucleico heterólogo que codifica una subunidad \alpha_{1H} y opcionalmente una subunidad \alpha_{2} y/o una subunidad \beta y/o una subunidad \gamma.
En realizaciones preferidas, las células eucarióticas expresan canales de calcio funcionales, heterólogos que son capaces de controlar el paso de iones selectivos de los canales de calcio y/o compuestos de unión que, a concentraciones fisiológicas, modulan la actividad del canal de calcio heterólogo. En ciertas realizaciones, los canales de calcio heterólogos incluyen al menos una subunidad de los canales de calcio heterólogos. En las realizaciones más preferidas, los canales de calcio que se expresan sobre la superficie de las células eucarióticas están compuestas sustancialmente o completamente de subunidades codificadas por el ADN o ARN heterólogo. En realizaciones preferidas, los canales de calcio heterólogos de tales células se pueden distinguir de cualquiera de los canales de calcio endógenos de la célula huésped. Tales células proporcionan un medio de obtener poblaciones homogéneas de canales de calcio. Típicamente, las células contienen el canal de calcio seleccionado como el único canal de ion heterólogo expresado por la célula.
En ciertas realizaciones las células eucarióticas recombinantes que contienen el ADN heterólogo que codifica las subuniaddes de los canales de calcio se producen mediante la transfección con ADN que codifica una o más de las subunidades o se inyectan con transcripciones de ARN de ADN que codifica una o más de las subunidades de los canales de calcio. El ADN se puede introducir como un fragmento de ADN lineal o se puede incluir en un vector de expresión para la expresión estable o transitoria del ADN que codifica la subunidad. También se proporcionan los vectores que contienen ADN que codifican subunidades de los canales de calcio humanos.
Las células eucarióticas que expresan los canales de calcio heterólogos se pueden usar en ensayos para la función de los canales de calcio o, en el caso de las células transformadas con menos ácido nucleicos codificadores de las subunidades que los necesarios para constituir un canal de calcio de tipo humano recombinante y funcional, dichas células se pueden usar para valorar los efectos de las subunidades adicionales en la actividad de los canales de calcio. Las subunidades adicionales se pueden proporcionar mediante la transfección posterior de dicha célula con uno o más clones de ADN o transcripciones de ARN que codifican las subunidades de los canales de calcio de tipo humano.
Las células eucarióticas recombinantes que expresan los canales de calcio heterólogos pertenecientes a la membrana se pueden usar en los procedimientos para identificar compuestos que modulan la actividad de los canales de calcio. En particular, las células se usan en ensayos que identifican los agonistas y antagonistas de la actividad de los canales de calcio en seres humanos y/o la valoración de la contribución de las diversas subunidades de los canales de calcio para el transporte y regulación del transporte de los iones de calcio. Debido a que las células constituyen poblaciones homogéneas de de los canales de calcio, proporcionan un medio de identificar los agonistas y antagonistas de la actividad de los canales de calcio que son específicos para cada una de dichas poblaciones.
Las células proporcionadas en esta memoria descriptiva se pueden usar para determinar la función de los canales de tipo T y distribución de tejidos y para identificar los compuestos que modulan la actividad de los canales de tipo T. Debido a que los canales de tipo T son operativos en las neuronas en el tálamo, hipotálamo, y tronco cerebral, y pueden estar implicadas en las funciones nerviosas autonómicas, en la regulación de actividades cardiovasculares tales como ritmo cardíaco, inervación y tono del músculo liso arterial y venosa, ritmo pulmonar y otros procesos fundamentales, ensayos diseñados para valorar tales actividades y ensayos los moduladores de identidad de estas actividades proporcionan un medio de entender los procesos fundamentales y también un medio de identificar nuevos candidatos de fármacos para una serie de trastornos.
También se proporcionan los ensayos que usan las células eucarióticas para identificar compuestos que modulan la actividad de los canales de calcio. En la práctica de estos ensayos la célula eucariótica que expresa un canal de calcio heterólogo, que contiene al menos una subunidad codificada por el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva, está en una solución que contiene un compuesto de ensayo y un ión selectivo de los canales de calcio, la membrana celular se desmoraliza y se detecta la intensidad de corriente en la célula. Si el compuesto de ensayo es uno que modula la actividad de los canales de calcio, la corriente que se detecta es diferente de la producida mediante la despolarización de la misma célula o sustancialmente idéntica en presencia del mismo ión selectivo de los canales de calcio pero en ausencia del compuesto. En las realizaciones preferidas, antes de la etapa de despolarización, la célula se mantiene a un potencial de mantenimiento que inactiva sustancialmente los canales de calcio que son endógenos a la célula. También en realizaciones preferidas, las células son células de mamíferos, más preferiblemente células HEK u ovocitos de anfibios.
Las células que expresan los canales T o canales LVA se pueden usar en ensayos que seleccionan compuestos que tienen actividad como moduladores, particularmente antagonistas, de la actividad de estos canales.
Se proporciona los ensayos basados en transcripción para identificar compuestos que modulan la actividad de los canales de calcio (véanse, las patentes de Estados Unidos números 5.436.128 y 5.401.6291, particularmente canales de calcio que contienen una subunidad \alpha_{1H}. Estos ensayos usan células que expresan los canales de calcio, particularmente los canales de calcio que contienen una subunidad \alpha_{1H}, y más preferiblemente una subunidad \alpha_{1H} codificada por ADN heterólogo, y también contienen ácido nucleico que codifica una construcción de gen indicador que contiene un gen indicador en enlace operativo con uno o más elementos de control de transcripción que está regulado por un canal de calcio. Los ensayos se efectúan comparando la diferencia en la cantidad de transcripción de un gen indicador en las células proporcionadas en presencia del compuesto con la cantidad de transcripción en ausencia del compuesto, o con la cantidad de transcripción en ausencia del canal de calcio heterólogo, por lo cual los compuestos que modulan la actividad del canal de calcio heterólogo en la célula se identifican. El gen indicador es cualquier gen conocido por los expertos en la técnica, que incluyen, pero no se limita a al gen que codifica la cloranfenicol acetiltransferasa, el gen que codifica la luciferasa de luciérnaga, el gen que codifica la luciferasa bacteriana, el gen que codifica la \beta-galactosidasa o el gen que codifica la fosfatasa alcalina, y el elemento de control transcripcional es cualquier elemento conocido por los expertos en la técnica, que incluye, pero no se limita a elementos sensibles de suero, elementos sensibles a monofosfato de adenosina cíclica, el promotor del gen c-fos, el promotor del gen de péptido intestinal vasoactivo, el promotor del gen de somatostatina, el promotor de proencefalina, el promotor del gen de la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa o el promotor del gen del factor 1 A de crecimiento nervioso y los elementos sensibles a los niveles de iones de calcio intracelular.
Otros ensayos en los que la actividad receptora en respuesta a los compuestos de ensayo se mide también se puede practicar con las células proporcionadas en esta memoria descriptiva (véase, por ejemplo, la patente de Estados Unidos nº 5.670.113).
Debido a que los canales de tipo T parece que están asociados con una diversidad de funciones clave, las células que expresan los canales de T y ensayos que usan tales células serán útiles para la identificación de compuestos para el tratamiento de de una diversidad de trastornos, enfermedades y afecciones. Los compuestos identificados pueden ser candidatos para uso en el tratamiento de trastornos y afecciones asociadas a la actividad de los canales T. Tales actividades incluyen, pero no se limitan a, las que están implicadas en la excitabilidad del músculo, secreción y actividad del marcapasos, ondas completas dependientes de Ca^{2+}, oscilaciones neuronales, y potenciación de señales sinápticas, para la mejora de la conformidad en hipertensión sistólica, o mejora del tono vascular, tal como la disminución del fluido vascular, y otros. Otros trastornos incluyen, pero no se limitan a hipertensión, trastornos cardiovasculares, incluyendo pero sin limitación a: infarto de miocardio, arritmia cardíaca, insuficiencia cardíaca angina de pecho, trastornos neurológicos, tales como esquizofrenia, epilepsia y depresión, trastornos de los músculos periféricos, trastornos respiratorios y trastornos endocrinos.
En particular, las células que expresan canales de LVA, tales como las subunidades \alpha_{1H}, son útiles para identificar compuestos que son candidatos para el tratamiento de trastornos asociados a tejidos de conducción, tales como células con función del marcapasos arteriales, fibras de Purkinje, y también músculos lisos coronarios. Tales trastornos incluyen, pero no se limitan a, compuestos útiles para el tratamiento de cardiovascular, tal como angina, vascular, tal como hipertensión, y terapias urológicas, hepática, reproductora, complementarias para el reestablecimiento del ritmo cardíaco normal y rendimiento cardíaco que después de lesión traumática, ataque al corazón y otras lesiones cardíacas; tratamientos de infarto de miocardio (MI), post - MI y en un ajuste agudo. Otros compuestos que interaccionan con LVA, particularmente los canales de calcio de tipo T, pueden ser eficaces para aumentar la fuerza contráctil cardíaca, tal como la medida por la presión ventricular izquierda y diastólica, y sin cambiar la presión sanguínea o ritmo cardíaco. En un agudo pueden ser eficaces otros compuestos para disminuir la formación de tejido cicatrizado, tal como el medido por la deposición de colágeno o espesor del septo, y sin efectos cardiovasculares. Los ensayos pueden identificar compuestos útiles en la regulación del tono muscular liso vascular, o bien mediante vasodilatación o vasoconstricción en: (a) tratamientos para reestablecimiento del control de la presión sanguínea, por ejemplo, después de lesión traumática, cirugía o desviación cardiovascular, y en tratamientos profilácticos diseñados para minimizar los efectos cardiovasculares de fármacos anestésicos; (b) tratamientos para mejorar los reflejos vasculares y control de presión sanguínea mediante el sistema nervioso autónomo; para identificar los compuestos útiles en el tratamiento de enfermedades urológicas: (a) tratamiento y restauración de la función renal después de cirugía, lesión traumática, uremia y reacciones adversas de fármacos; (b) tratamiento de disfunciones de vejiga; y (c) toxicidad neuronal urémica e hipotensión en pacientes en hemodiálisis; trastornos reproductores, para la identificación de compuestos útiles en el tratamiento de: (a) trastornos de la función sexual que incluyen impotencia; (b) impotencia alcohólica (en control autónomo que puede estar sometido a controles de los canales de calcio); trastornos hepáticos para identificar compuestos útiles en el tratamiento y reducción de la toxicidad neuronal y daño en el sistema nervioso autónomo que produce por el exceso agudo de consumo de alcohol; trastornos neurológicos para la identificación de compuestos útiles en el tratamiento de: (a) epilepsia y epilepsia diencefálica; (b) enfermedad de Parkinson; (c) control de temperatura aberrante, tales como, anormalidades de temblores y secreción de la glándulas sudoríparas y suministro de la sangre vascular periférica; (d) funciones aberrantes de la pituitaria e hipotálamo que incluye secreción anormal de noradrenalina, dopamina y otras hormonas; para sistema respiratorio tal como en el tratamiento de la respiración anormal, por ejemplo, complicaciones postquirúrgicas y anestésicas; y trastornos endocrinos, para identificar compuestos útiles en el tratamiento de la secreción aberrante de hormonas incluyendo por ejemplo, tratamientos posibles de la sobreproducción de insulina, tiroxina, adrenalina, y otros desequilibrios hormonales.
Se proporcionan las subunidades de los canales de calcio \alpha_{1H} y canales de calcio humanos purificados que contienen tales subunidades. Las subunidades y canales se pueden aislar a partir de una célula eucariótica transfectada con ácido nucleico que codifica la subunidad.
Se describen inmunoglobulinas o anticuerpos obtenidos a partir del suero de de un animal inmunizado con una preparación sustancialmente pura de un canal de calcio humano, subunidad de canal de calcio o fragmento que contiene epítope de una subunidad de canal de calcio. También se describen los anticuerpos monoclonales producidos usando un canal de calcio, subunidad de canal de calcio o fragmento que contiene epítopes de los mismos como un inmunógeno. También se pueden usar como inmunógenos proteínas de fusión de E. coli que incluyen una subunidad de los canales de calcio humanos. Tales proteínas de fusión pueden contener una proteína bacteriana o porción de las mismas, tales como la proteína TrpE de E. coli, condensada a un péptido de subunidades de los canales de calcio. Las inmunoglobulinas que se producen usando las subunidades de los canales de calcio o canales de calcio purificados como inmunógenos tienen, entre otras propiedades, la capacidad de unirse específicamente y preferentemente y/o producir la inmunoprecipitación de un canal de calcio humano o una subunidad del mismo que puede estar presente en una muestra biológica o una solución derivada de tal muestra biológica. Tales anticuerpos también se pueden usar para aislar selectivamente células que expresan canales de calcio que contienen la subunidad para las que son específicos los anticuerpos.
También se proporcionan los procedimientos para modular la actividad de los canales iónicos mediante la puesta en contacto de los canales de calcio con una cantidad eficaz de los anticuerpos descritos anteriormente.
De este modo, se proporcionan los ensayos para identificar los compuestos que modulan la actividad de los canales de calcio LVA, particularmente los canales de tipo T así como los compuestos identificados mediante los procedimientos.
También se proporcionan procedimientos para la diagnosis de los trastornos, mediados pos los canales de calcio LVA, particularmente mediados por los canales de calcio de tipo T. Los procedimientos de diagnosis implicarán la detección de expresión o función aberrante de los canales, tales como secuencias de aminoácidos alteradas y perfiles farmacológicos y perfiles electrofisiológicos alterados comparados con los canales de tipo salvaje. Tales procedimientos típicamente pueden emplear anticuerpos específicos para el canal alterado o sondas de ácido nucleico para detectar genes o transcripciones alterados.
Descripción de las figuras
La Figura 1 muestra la dependencia de la tensión de activación (moo) e inactivación de estado constante (h) de canales de calcio \alpha_{1H} expresados transitoriamente en células HEK. La dependencia de la tensión de la activación (moo) se determinó a partir del análisis de la corriente de cola. Las corrientes de cola se normalizaron con respecto a la corriente de cola de pico máximo obtenida a + 60 mV y se representaron gráficamente (símbolos en círculos en blanco, media \pm error típico de la media; n = 11) contra el potencial de ensayo. Los datos se ajustaron mediante la suma de dos funciones Boltzman
m \infty = FA * [1 + exp (-(V_{ensayo} - V1/2, A)/KA)]1 + F_{B} *[1 + exp (-(V_{ensayo} - V_{1/2. B})/K_{B})]^{-1}, F_{A} = 0,67, V_{1/2} = -21,5 mV, k_{A} = 7,5, F_{B} = 0,33, V_{1/2}._{B} = 25,5 mV, k_{B} = 14,7. La inactivación en estado constante (h \infty) se determinó a partir de un potencial de mantenimiento de - 100 mV mediante un pulso de ensayo a -20 mV (p1), seguido de un prepulso de 20 segundos desde - 100 mV a - 10 mV en decrementos (p H antiguo) precedido de un segundo pulso de ensayo a - 20 mM (p2). Las amplitudes de corrientes normalizadas se representaron gráficamente (símbolos de círculo en negro, media \pm error típico de la media; n = 9) contra el potencial de mantenimiento. Los datos se ajustaron mediante una función de Boltzman
h \infty = [1 + exp ((V_{mantenida} - V1/2, A)/k)]^{-1}, V_{1/2} = 63,9 mV, k = 3,9 mV.
La Figura 2 muestra la cinética de activación (Figura 2A) e inactivación (Figura 2B) de los canales de calcio \alpha_{1H} (\alpha_{1H -1}); la cinética de activación e inactivación se determinaron a partir de los indicios de corriente mediante ajuste de una función exponencial a la fase creciente (Fig. 2A) o menguante (Fig. 2B) de la corriente (a la dependencia de la tensión para la activación e inactivación sigue aproximadamente una función exponencial).
La Figura 3 muestra esquemáticamente las características de la subunidad \alpha_{1H -1} y muestra el alineamiento de la secuencia de aminoácidos de \alpha_{1H} con \alpha_{1D} y \alpha_{1E} en cada una de las cuatro regiones de poros; * indica los residuos implicados en la selectividad de iones en cada una de las cuatro regiones de poros; el bucle grande inusualmente en las subunidades \alpha_{1H} entre dominios transmembrana I y II.
La Figura 4A muestra las corrientes de cola inducidas por la repolarización a - 90 mV después de una etapa de 10 ms de despolarización entre - 80 y - 10 mV, para las mediciones de las corrientes de cola las tasas de digitalización/filtro eran 50/16 kHz. La mengua de la corriente de cola se ajustó a una función bi-exponencial de la forma I = A_{0} + A_{1} exp (-t/\tau_{1}) + A_{2} exp (-t/\tau_{2}). El perfil de mengua biexponencial de la corriente de cola se observó en cada célula examinada (n = 12). Las Figuras 4B y 4C muestran la dependencia de la tensión sw las constantes de tiempo \tau_{1} y \tau_{2} para la desactivación de la corriente (Figura 4B) y las fracciones de corriente A_{1} y A_{2} (Figura 4C).
Descripción detallada de la invención Definiciones
Salvo que se defina otra cosa, todos los términos técnicos y científicos usados en esta memoria descriptiva tienen el mismo significado como entienden comúnmente los expertos en la técnica a la que esta invención pertenece.
La referencia a cada una de las subunidades de los canales de calcio incluye las subunidades que se describen específicamente en esta memoria descriptiva y las subunidades de los canales de calcio codificadas por ácido nucleico que se puede aislar usando el ácido nucleico descrito como sondas y seleccionando un ADNc humano apropiado o genoteca genómica en al menos baja rigurosidad, preferiblemente alta rigurosidad. Tal ADN incluye ADN que codifica proteínas que tienen aproximadamente 40% de homología, típicamente al menos aproximadamente 90% de identidad de secuencia teniendo en cuenta huecos) con cualquiera de las proteínas de subunidades descritas en esta memoria descriptiva o ADN o ARN que se híbrida en condiciones de al menos baja rigurosidad al ADN proporcionado en esta memoria descriptiva y la proteína codificada por tal ADN muestra características identificativas adicionales, tales como función o peso molecular. En particular, la referencia a una subunidad \alpha_{1H} se refiere a subunidades que se pueden aislar a partir de genotecas de ácido nucleico a partir de cualquier fuente deseada usando el ácido nucleico descrito en esta memoria descriptiva como una sonda. La subunidad codificada caracterizada por la presencia del bucle intracelular notablemente largo entre los dominios transmembrana I y II, y/o proteínas atribuidas a los canales de tipo T o tipo LVA.
Se entiende que las subunidades que están codificadas por las transcripciones que representan variantes de ayuste de las subunidades descritas u otras tales subunidades pueden mostrar menos de 40% de homología global con cualquier subunidad individual, pero incluirán regiones de tal homología con una o más de tales subunidades. También se entiende que 40% de homología se refiere a proteínas que comparten aproximadamente 40% de sus aminoácidos en común o que comparten algo menos, pero incluyen sustituciones conservadoras de aminoácidos, en las que la actividad de la proteína no se altera sustancialmente.
Las subunidades y fragmentos de ADN que codifican tales subunidades se proporcionan en esta memoria descriptiva o son conocidas por los expertos en la técnica (véase, las aplicaciones PCT internacionales publicadas números WO 89/09834, WO 93/04083, WO 95/04822, patentes de Estados Unidos Números 5.792.846, 5.726.035, 5.407.820, 5.686.241, 5.618.720, 5.710.250, 5.429.921, 5.429.921 y 5.386.025) incluyen cualesquiera subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2}, \beta o \gamma de un canal de calcio humano.
Se proporcionan en esta memoria descriptiva el ácido nucleico que codifica las subunidades LVA, particularmente las subunidades \alpha_{1H} de canales de calcio humanos o de otros animales. En particular, tales fragmentos de ADN incluyen un fragmento de ácido nucleico aislado que codifica una subunidad \alpha_{1H} activada por baja tensión de un canal de calcio animal en el que la secuencia de nucleótidos comprende la parte codificadora de la secuencia de nucleótidos establecida en cualquiera de las SEQ ID números 12-16.
En una realización es ácido nucleico que codifica una subunidad \alpha_{1H-1} o \alpha_{1H-2} que comprende la parte codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las secuencias números 12, 15 ó 16.
Como se usa en esta memoria descriptiva, los tipos de subunidades \alpha_{1}, codificadas por genes diferentes, se designan como tipo \alpha_{1A}, \alpha_{1B}, \alpha_{1C}, \alpha_{1D}, \alpha_{1E} y \alpha_{1H}. Estos tipos también se han denominado VDCC IV para \alpha_{1B}, VDCC II para \alpha_{1C} y VDCC III para \alpha_{1D}. Los subtipos de subunidades que son variantes de ayuste, se denominan, por ejemplo, \alpha_{1H - 1}, \alpha_{1H - 2}, \alpha_{1B - 1}, \alpha_{1B - 2}, \alpha_{1C - 1}, etc.
Así pues, como se usa en esta memoria descriptiva, el ácido nucleico (ADN o ARN) que codifica la subunidad \alpha_{1} se refiere al ácido nucleico que se hibrida al ADN proporcionado en esta memoria descriptiva en condiciones de al menos baja rigurosidad, típicamente alta rigurosidad, o codifica una subunidad que tiene más o menos aproximadamente 40% de homología con la proteína codificada por el ADN descrito en esta memoria descriptiva que codifica una subunidad \alpha_{1} de un canal de calcio humano. En el caso de los canales de LVA, el ácido nucleico que codifica una subunidad que se hibrida en al menos baja rigurosidad, preferiblemente alta rigurosidad, al ácido nucleico que codifica una subunidad \alpha_{1}, y que codifica una subunidad que tiene las propiedades de LVA requeridas en ensayos para tal actividad, como las descritas en esta memoria descriptiva. Las variantes de ayuste tendrán porcentajes variables de homología (o identidad) global, pero se derivará del mismo gen e incluirá regiones de 100% de identidad.
En particular, una variante de ayuste de cualquiera de las subunidades \alpha_{1} (o cualquiera de las subunidades particularmente descritas en esta memoria descriptiva) contendrán regiones (al menos un exón) de divergencia y una o más regiones (al menos un exón, típicamente más que aproximadamente 16 nucleótidos, y generalmente sustancialmente más) que tienen 100% de homología con uno o más de los subtipos de las subunidades \alpha_{1} proporcionadas en esta memoria descriptiva, y también contendrán una región que tiene sustancialmente menos homología, ya que se deriva de de un exón diferente. Está bien dentro de los expertos en la técnica identificar exones y variantes de ayuste. Así, por ejemplo, una subunidad \alpha_{1H} será fácilmente identificable, debido a que comparte aproximadamente 40% de homología de proteína con una de las subunidades \alpha_{1H} descritas en esta memoria descriptiva, e incluirá al menos una región (un exón) que es 100% homóloga. También tendrá actividad, como se describe más adelante, que indica que es una subunidad \alpha_{1} de LVA.
En esta memoria descriptiva se indica, que identidad y homología se refieren al porcentaje de aminoácidos cuando se comparan proteínas o nucleótidos cuando se comparan ácidos nucleicos que están compartidos. Están disponibles numerosos programas de ordenador para la determinación de la identidad. En todos los casos, las penalizaciones de huecos pretendidos y otros parámetros son los defectos establecidos por el fabricante. Aunque no se necesitan realmente cuando existe un alto grado (90% o más) de identidad entre las secuencias de tales programas incluyen, pero no se limitan a programas de alineación de secuencias disponibles, tales como el programa Enastar "MegAlign" (Madison, WI) y el programa "Gap" del Grupo de Ordenadores de Genética de la Universidad de Wisconsin (UWG) (Madison, WI), para determinar un porcentaje de identidad de secuencia (véase, también, von Heijne, titulado "Sequence Análisis in Molecular Biology: Treasure Trove of Trivial Pursuit" Academis Press (1987) Apéndice 2 (que citan a UWG y Dnastar entre siete programas de software disponibles comercialmente)).
Una subunidad \alpha_{1} se puede identificar por su capacidad de formar un canal de calcio. Típicamente, las subunidades \alpha_{1} tienen masas moleculares mayores que al menos aproximadamente 120 kD. También los estudios hidropáticos de las secuencia de los aminoácidos de la subunidad \alpha_{1} deducida indican que las subunidades \alpha_{1} contienen cuatro repeticiones internas, conteniendo cada una seis dominios transmembrana. Una subunidad \alpha_{1H} se identifica por su capacidad de formar poros y también la activación por baja tensión del canal resultante.
La actividad de un canal de calcio se puede valorar in vitro mediante los procedimientos conocidos por los expertos en la técnica, que incluyen los procedimientos electrofisiológicos y otros descritos en esta memoria descriptiva. Típicamente, las subunidades \alpha_{1} incluyen regiones con las que interactúan directa o indirectamente uno o más moduladores de la actividad de los canales de calcio tal como un 1,4-DHP o \omega-CgTx.G Los tipos de las subunidades \alpha_{1} se pueden distinguir mediante cualquier procedimiento conocido por los expertos en la técnica, que se incluyen en función de su especificad de unión. Por ejemplo, se ha encontrado en esta memoria descriptiva que las subunidades \alpha_{1B} participan en la formación de canales que se han mencionado anteriormente como los canales de tipo N, las subunidades \alpha_{1D} participan en la formación de canales que se habían mencionado anteriormente como canales de tipo L y las subunidades \alpha_{1A} parece que participan en la formación de canales que exhiben características típicas de canales que se habían previamente denominado tipo P, y las subunidades \alpha_{1H} parece que participan en los canales que muestran actividades asociadas a los canales de tipo T. De este modo, por ejemplo, la actividad de los canales que contienen la subunidad \alpha_{1B} es insensible a los 1,4-DHP; mientras que la actividad de los canales que contienen la subunidad \alpha_{1D} se modula o se alteran mediante 1,4-DHP. Actualmente se prefiere aludir a los canales de calcio en función de las características farmacológicas y cinética de corriente y evitar designaciones históricas. Los tipos y subtipos de las subunidades \alpha_{1} se pueden caracterizar en función de los efectos de dichos moduladores en la subunidad o un canal que contiene la subunidad así como diferencias en corrientes y cinética de la corriente producida por los canales de calcio que contienen la subunidad. Las subunidades \alpha_{1h} se pueden además identificar mediante la presencia de regiones de bucle intracelular notablemente largas, tales como entre los dominios transmembrana I y II (por ejemplo, nt 1506 a nt 2627 de la SEQ ID Nº 12), y también el bucle en el dominio I.
En particular el ácido nucleico que codifica la subunidad \alpha_{1H} como se usa en esta memoria descriptiva, se hidridará en condiciones de alta rigurosidad al ácido nucleico descrito en esta memoria descriptiva como las SEQ ID números 12, 15 y 16, y formarán un canal en una célula de mamífero, tal como una célula HEK, que muestra propiedades electrofisiológicas y/o farmacológicas de un canal LVA o T. Las propiedades electrofisiológicas incluyen uno o más de las siguientes propiedades electrofisiológicas una conductancia relativa de Ba^{2+} de aproximadamente 5 pS (picosegundos) a aproximadamente 9 pS, un tiempo de activación de 2 a aproximadamente 8 milisegundos, un valor V_{1/2} de cinética de activación de aproximadamente - 60 milivoltios a aproximadamente 26 milivoltios, un tiempo de activación de aproximadamente 10 a aproximadamente 30 milisegundos, un valor V_{1/2} de cinética de activación de aproximadamente -100 milivoltios a aproximadamente - 500 milivoltios, y un tiempo de desactivación de cola de aproximadamente 2 a aproximadamente 12 milisegundos.
Además, el canal resultante puede tenor propiedades farmacológicas, tal como un grado relativamente alto de sensibilidad a mibefradil, metoxiacetato de (1S, 2S)-2-[2-[[3-(1H-bencimidazol-2-il)propil]metil-amino]etil]-6-fluoro-1-isopropil-1,2,3,4-tetrahidronaftalen-2-ilo (hoffman-LaRoche, Inc) y/o un grado relativamente alto de resistencia a las toxinas del caracol Conus GVIA y MVIIC así como las toxinas de arácnidos AgaIIIA y AgaIVA comparado con los canales de calcio HVA.
Como se utiliza en esta memoria descriptiva, una subunidad \alpha_{2} se codifica mediante un ácido nucleico (ADN o ARN) descrito por ejemplo, en la patente de Estados Unidos Nº 5.407.820, patente de Estados Unidos Nº 5.792.846, y la solicitud PCT internacional Nº WO 95/04822 que codifica una subunidad \alpha_{2} de un canal de calcio de mamíferos o que se hibrida a ADN en condiciones de baja rigurosidad, preferiblemente alta rigurosidad, o codifica una proteína que tiene al menos aproximadamente 40% de homología, típicamente al menos aproximadamente 90% de identidad, teniendo en cuenta los huecos, con la que se describe en esta memoria descriptiva. Tal ADN codifica una proteína que típicamente tiene una masa molecular mayor que aproximadamente 120 kD, pero no forma un canal de calcio en la ausencia de una subunidad \alpha_{1}, y puede alterar la actividad de un canal de calcio que contiene una subunidad \alpha_{1}. Los subtipos de la subunidad \alpha_{2} que surgen como variantes de ayuste se designan mediante una letra minúscula, tal como \alpha_{2a}, ... \alpha_{2e}. Además, la subunidad \alpha_{2} y el fragmento grande producido cuando la proteína se somete a condiciones reductoras parece que está glicosilado con al menos azúcares unidos a N y no se unen específicamente a los 1,4-DHP y fenilalquilaminas que se unen específicamente a la subunidad \alpha_{1}. El fragmento más pequeño, el fragmento C-terminal se denomina la subunidad \delta e incluye los aminoácidos de aproximadamente 946 (numerado según la solicitud PCT internacional Nº WO 95/04822, por ejemplo, SEQ ID Nº 11 en ese documento) a aproximadamente el extremo C. Este fragmento se puede disociar de la parte restante de \alpha_{2} cuando al subunidad \alpha_{2} se expone a condiciones reductoras. Para los propósitos en esta memoria descriptiva \alpha_{2} también se denomina \alpha_{2}\delta. De este modo la referencia a \alpha_{2}\delta significa la subunidad \alpha_{2}, incluyendo la parte \delta C-terminal.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una subunidad \beta está codificada por el ADN descrito, por ejemplo, en la patente de Estados Unidos Nº 5.407.820, patente de Estados Unidos Nº 5.792.846, y la solicitud PCT internacional Nº WO 95/04822 o que se hibrida al ADN proporcionado en esta memoria descriptiva en condiciones de baja rigurosidad, preferiblemente alta rigurosidad, o codifica una proteína que tiene al menos aproximadamente 40% de homología, típicamente aproximadamente al menos 90% de homología) con la descrita en esta memoria descriptiva y es una proteína que típicamente tiene un peso molecular menor que las subunidades \alpha y del orden de aproximadamente 50-80 kD, no forma un canal de calcio detectable en ausencia de una subunidad \alpha_{1}, pero puede alterar la actividad de un canal de calcio que contiene una subunidad \alpha_{1} o que contiene una subunidad \alpha_{1} y \alpha_{2}.
Los tipos de la subunidad \beta que están codificados por genes diferentes se designan con subíndices tales como \beta_{1}, \beta_{2}, \beta_{3} y \beta_{4}. Los subtipos de las unidades \beta que surgen como variantes de ayuste de un tipo particular se designan con un subíndice numérico referente al subtipo y a la variante. Tales subtipos incluyen, pero sin limitación las variantes de ayuste de \beta_{1}, incluyendo \beta_{1 - 1}-\beta_{1 - 5} y variantes \beta_{2}, incluyendo y \beta_{2C}-\beta_{2E}.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una subunidad \gamma es una subunidad de canal de calcio codificada por el ADN descrito por ejemplo, en la patente de Estados Unidos Nº 5.726.035 y 5.386.025; véase también Jay y col. (1990) Science 248: 490-492 y Lett y col., (* 1998) Nature Genetics 19: 340-347) y se puede aislar e identificar usando el ácido nucleico descrito en ese documento como una sonda mediante la hibridación u otro procedimiento tal conocido por los expertos en la técnica, en el que los clones de longitud completa que codifican una subunidad \gamma se puede aislar o construir. Una subunidad \gamma estará codificada por ADN que se hibrida al ADN proporcionado en ese documento en condiciones de baja rigurosidad, preferiblemente alta rigurosidad, muestra homología de secuencia suficiente para codificar una proteína que tiene aproximadamente 40% de homología con la subunidad \gamma descrita en esta memoria descriptiva.
De este modo, los expertos en la técnica, a la luz de la descripción en esta memoria descriptiva, pueden identificar el ADN que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2}, \beta, \delta y \gamma de las subunidades de los canales de calcio, que incluyen los tipos codificados por genes diferentes y subtipos que representan variantes de ayuste. Por ejemplo, las sondas de ADN o ARN basadas en el ADN descrito ene esta memoria descriptiva se pueden usar para seleccionar una genoteca apropiada, incluyendo una genoteca genómica o de ADNc, para hibridación a la sonda y obtienen ADN en uno o más clones que incluye un fragmento abierto de lectura que codifica una proteína entera. Posteriormente a la selección de una genoteca apropiada con el ADN descrito en esta memoria descriptiva, el ADN aislado se puede examinar para la presencia de una fase abierta de lectura a partir de la cual se puede deducir la secuencia de la proteína codificada. La determinación del peso molecular y comparación con las secuencias en esta memoria descriptiva deben revelar la identidad de la subunidad como una subunidad \alpha_{1}, \alpha_{2} etc. Los ensayos funcionales, pueden si es necesario, usarse para determinar si la subunidad es una subunidad \alpha_{1}, \alpha_{2} o \beta.
Por ejemplo, el ADN que codifica \alpha_{1A} se puede aislar seleccionando una genoteca apropiada con ADN, que codifica toda o una parte de la subunidad \alpha_{1A} humana. Tal ADN incluye el ADN en el fago depositado en el número de acceso 75293 de la ATCC que codifica una parte de una subunidad \alpha_{1}. El ADN que codifica una subunidad \alpha_{1A} se puede obtener a partir de una genoteca apropiada mediante selección con un oligonucleótido que tiene toda o una parte de la secuencia de una subunidad \alpha_{1A} (véase, por ejemplo la solicitud PCT internacional publicada Nº WO 95/04822, particularmente las SEQ ID números 21, 22 y/o 23 o con el ADN en el fago depositado en ese documento). Como alternativa, tal ADN puede tener la secuencia codificadora que codifica una subunidad \alpha_{1A}. Se puede usar cualquier procedimiento conocido por los expertos en la técnica para el aislamiento e identificación de ADN y preparación de clones genómicos o de ADNc de longitud completa, que incluyen los procedimientos ejemplificados en esta memoria descriptiva.
El ADN que codifica \alpha_{1H} se puede aislar mediante la selección de de una línea celular de carcinoma de tiroides medular humana (células TT) u otra genoteca de ADNc humana adecuada con sondas de ADN preparadas a partir de ácido nucleico proporcionadas en esta memoria descriptiva. Los clones de longitud completa se construyen y expresan como se describe y ejemplifica en esta memoria descriptiva y los canales resultantes ensayados para verificar que el ácido nucleico codificador codifica un canal LVA.
La subunidad codificada mediante el ADN aislado se puede identificar por comparación con el ADN y las secuencias de aminoácidos de las subunidades proporcionadas en esta memoria descriptiva. Las variantes de ayuste comparten amplias regiones de homología, pero incluyen regiones no homólogas, subunidades codificadas por genes diferentes comparten una distribución uniforme de secuencias no homólogas.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una variante de ayuste se refiere a una variante producida mediante procesamiento diferencial de una transcripción primaria de ADN genómico que da como resultado más de un tipo de ARNm. Las variantes de ayuste se pueden producir dentro de un único tipo de tejido o entre tejidos (variantes específicas de tejido). Así pues, los clones de ADNc que codifican subtipos de subunidades de calcio que tienen regiones de aminoácidos y regiones idénticas de diferentes secuencias de aminoácidos se denominan en esta memoria descriptiva "variantes de ayuste".
Como se usa en esta memoria descriptiva, un "ion selectivo de los canales de calcio" es un ion que es capaz de fluir a través, o que está bloqueado para fluir a través de, un canal de calcio que atraviesa una membrana celular en condiciones que sustancialmente de manera similar permitirían o bloquearían el flujo de Ca^{2+}. Ba^{2+} es un ejemplo de un ion que es un ion selectivo de los canales de calcio.
Como se usa en esta memoria descriptiva, un compuesto que modula la actividad de los canales de calcio es uno que afecta a la capacidad del canal de calcio para pasar iones selectivos de canales de calcio o afecta a otras características de los canales de calcio detectables, tal como la cinética de corriente. Tales compuestos incluyen antagonistas y agonistas de canales de calcio y compuestos que ejercen su efecto sobre la actividad del canal de calcio directa o indirectamente.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una subunidad o proteína "sustancialmente pura" es una subunidad o proteína que está sustancialmente libre de otros contaminantes polipeptídicos que parecen homogéneos mediante SDS - PAGE o se secuencia no ambiguamente.
Como se usa en esta memoria descriptiva, se hibrida selectivamente significa que un fragmento de ADN se hibrida a un segundo fragmento con especificidad suficiente para permitir que el segundo fragmento se identifique o aísle de entre una pluralidad de fragmentos. En general, la hibridación selectiva se produce en condiciones de alta rigurosidad.
Como se usa en esta memoria descriptiva, ADN y ARN heterólogo o foráneo se usan indistintamente y se refiere a ADN o ARN que no son de origen natural como parte del genoma en el que está presente o que se encuentra en un lugar o lugares en el genoma que difieren de aquel porque se produce en la naturaleza. Es ADN o ARN que no es endógeno para la célula y se ha introducido artificialmente en la célula. Los ejemplos de ADN heterólogo incluyen, pero sin limitación, ADN que codifica una subunidad de los canales de calcio y ADN que codifica ARN o proteínas que median o alteran la expresión de ADN endógeno afectando la transfección, traducción, u otros procesos biológicos regulables. La célula que expresa el ADN heterólogo, tal como ADN que codifica la subunidad de los canales de calcio, puede contener ADN que codifica la misma o diferentes subunidades de los canales de calcio. El ADN heterólogo no necesita expresarse y se puede introducir de una manera tal que se integra en el genoma de la células hospedadora o se mantiene episomalmente.
Como se usa en esta memoria descriptiva, enlace operativo de ADN heterólogo a secuencias reguladoras y efectoras de nucleótidos, tales como promotores, potenciadores, sitios de detención transcripcional y traduccional, y otras secuencias señal, se refiere a la relación funcional entre tal ADN y tales secuencias de nucleótidos. Por ejemplo, enlace operativo de ADN heterólogo a un promotor se refiere a la relación física y funcional entre el ADN y el promotor de manera que la transcripción de tal ADN se inicia a partir del promotor mediante una ARN polimerasa que específicamente reconoce, se une a y transcribe el ADN en la fase de lectura.
Como se usa en esta memoria descriptiva, ADN aislado, sustancialmente puro se refiere a fragmentos de ADN purificados de acuerdo a las técnica habituales empleadas por los expertos en la técnica [véase, por ejemplo, Maniatis y col., (1982) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY].
Como se usa en esta memoria descriptiva, la expresión se refiere al proceso mediante el que el ácido nucleico se transcribe en ARNm y se traduce en péptidos, polipéptidos, o proteínas. Si el ácido nucleico se deriva de ADN genómico, la expresión puede, si se selecciona una célula u organismo hospedador eucariótico apropiada, incluir ayuste del ARNm.
Como se usa en esta memoria descriptiva, vector o plásmido se refiere a elementos discretos que se usan para introducir ADN heterólogo en células para bien la expresión del ADN heterólogo o para replicación del ADN heterólogo clonado. La selección y uso de tales vectores y plásmidos están dentro del nivel de experiencia en la técnica.
Como se usa en esta memoria descriptiva, el vector de expresión incluye vectores capaces de expresar fragmentos de ADN que están en unión operativa con secuencias reguladoras, tal como regiones promotoras, que son capaces de efectuar la expresión de tales fragmentos de ADN. De este modo, un vector de expresión se refiere a una construcción de ADN o ARN recombinante, tal como un plásmido, un fago, virus recombinante u otro vector que, tras la introducción en una célula hospedadora apropiada, da como resultado la expresión del ADN clonado. Los vectores de expresión apropiados los conocen bien los expertos en la técnica e incluyen los que son replicables en células eucarióticas y/o células procarióticas y las que permanecen episomales o se pueden integrar en el genoma de la célula hospedadora.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una región promotora se refiere a la porción de ADN de un gen que controla la transcripción de ADN al que se une operativamente. La región promotora incluye secuencias específicas de ADN que son suficientes para el reconocimiento de ARN polimerasa, unión e inicio de transcripción. Esta porción de la región promotora se denomina promotor. Además, la región promotora incluye secuencias que modulan este reconocimiento, unión y actividad de inicio de transcripción de la ARN polimerasa. Estas secuencias pueden actuar en cis o puede ser responsable de los factores actuando en trans. Los promotores, que dependen de la naturaleza de la regulación pueden ser constitutivos o regulados.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una célula eucariótica recombinante es una célula eucariótica que contiene ADN o ARN heterólogo.
Como se usa en esta memoria descriptiva, un canal de calcio recombinante o heterólogo se refiere a un canal de calcio que contiene una o más subunidades que se codifican por ADN heterólogo que se ha introducido y expresado en una célula eucariótica que expresa el canal de calcio recombinante. Un canal de calcio recombinante también puede incluir las subunidades que se producen por ADN endógeno a la célula. En ciertas realizaciones, el canal de calcio recombinante o heterólogo pueden contener solamente unidades que están codificadas por el ADN heterólogo.
Como se usa en esta memoria descriptiva, "funcional" con respecto a un canal de calcio recombinante o heterólogo significa que el canal es capaz de proporcionar y regular la entrada de los iones selectivos de los canales de calcio, incluyendo, pero sin limitación, Ca^{2+} o Ba^{2+}, en respuesta a un estímulo y/o ligandos de unión con afinidad para el canal. Preferiblemente tal actividad de los canales de calcio es distinguible, tal como electrofisiológico, farmacológico y otros medios conocidos por los expertos en la técnica, de cualquier actividad de los canales de calcio endógenos en la célula hospedadora.
Como se usa en esta memoria descriptiva, un canal de tipo T o canal de tipo LVA típicamente se refiere a un canal de calcio que muestra una corriente de calcio de bajo umbral que se activa e inactiva a tensiones bajas comparado con los canales de calcio (tales como los que incluyen una subunidad \alpha_{1D}) denominados canales activados por alta tensión (HVA). Además o como alternativa, un canal de tipo T se puede caracterizar mediante características biofísicas distintas, tales como velocidades de desactivación lentas, conductancias muy bajas (5-9 pS) e inactivación dependiente de la tensión. Los canales T pueden mostrar un grado relativamente alto de sensibilidad a mibefradil (Hoffman - LaRoche, Inc) y/o un alto relativamente alto de resistencia a resistencia a las toxinas del caracol Conus GVIA y MVIIC así como las toxinas de arácnidos AgaIIIA y AgaIVA comparado con los canales de calcio HVA. Estos canales también típicamente muestran afinidad reducida para calcio. Los canales de tipo T o canales de tipo LVA también pueden estar caracterizados al nivel de ácido nucleico mediante la presencia de uno o más bucles intracelulares extendidos (véase, pro ejemplo, SEQ ID Nº 12, 15 y 16) entre dominios transmembrana, tales como entre dominios transmembrana I y II.
Como se usa en esta memoria descriptiva, un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos sustancialmente como se expone en una SEC ID Nº particular incluye proteína que tiene la misma función pero pueden incluir variaciones menores en secuencia, tal como cambios conservadores de aminoácidos o supresiones o inserciones menores que no alteran la actividad del péptido. La actividad de una proteína de la subunidad receptora de los canales de calcio, particularmente un canal de tipo LVA o T, se refiere a su capacidad para formar canales de calcio funcionales con otras de tales subunidades. Un canal de tipo T tendrá las propiedades discernidoras definidas en esta memoria descriptiva.
Como se usa en esta memoria descriptiva, una concentración fisiológica de un compuesto es la que es necesaria y suficiente para que un proceso biológico se produzca. Por ejemplo, una concentración fisiológica de un ion selectivo de los canales de calcio es una concentración del ion selectivo de los canales de calcio necesaria y suficiente para proporcionar una corriente interior cuando los canales se abren.
Como se usa en esta memoria descriptiva, actividad de un canal de calcio se refiere al movimiento de un ion selectivo de los canales de calcio a través de un canal de calcio. Tal actividad se puede medir mediante cualquier proceso conocido por los expertos en la técnica, incluyendo, pero sin limitación, la medición de la cantidad de corriente que fluye a través del canal recombinante en respuesta a un estímulo.
Como se usa en esta memoria descriptiva, un "ensayo funcional" se refiere a un ensayo que identifica canales de calcio funcionales. Así pues, un ensayo funcional, es un ensayo que evalúa la función.
Como entienden los expertos en la técnica, los procedimientos de ensayo para identificar los compuestos, tales como antagonistas y agonistas, que modulan la actividad de los canales de calcio, generalmente requieren comparación con un control. Un tipo de una célula "control" o cultivo "control" es una célula o cultivo que se trata sustancialmente la misma como la célula o cultivo expuesto al compuesto de ensayo excepto que el cultivo control no está expuesto al compuesto de ensayo. Otro tipo de célula "control" o cultivo "control" puede ser una célula o un cultivo de células que son idénticas a las células transfectadas excepto que las células empleadas para el cultivo control no expresan los canales de calcio funcionales. En esta situación, la respuesta de la célula de ensayo al compuesto de ensayo comparada con la respuesta (o carencia de respuesta) de la célula negativa al compuesto de ensayo, cuando las células o cultivos de cada tipo se exponen a sustancialmente las mismas condiciones de reacción en presencia del compuesto que se está ensayando. Por ejemplo, en los procedimientos que usan procedimientos electrofisiológicos de patch clamp, la misma célula se puede ensayar en presencia y ausencia del compuesto de ensayo, cambiando la solución externa que baña la célula como se conoce en la técnica.
También se entiende que cada una de las subunidades descritas en esta memoria descriptiva se pueden modificar realizando sustituciones conservadoras de aminoácidos y las sustituciones modificadas resultantes se contemplan en esta memoria descriptiva. Las sustituciones conservadoras adecuadas de los aminoácidos las conocen los expertos en esta técnica y se pueden realizar generalmente sin alterar la actividad biológica de la molécula resultante. Los expertos en esta técnica reconocen que, en general, las sustituciones únicas de aminoácidos en las regiones no esenciales de un polipéptido no alteran sustancialmente la actividad biológica (véase, por ejemplo, Watson y col., Molecular Biology of the Gene, edición 4ª, 1987, The Bejamin/Cummings Pub. Co., p. 224). Dichas sustituciones se realizan preferiblemente, aunque no exclusivamente, de acuerdo con las expuestas en la tabla 1 como sigue:
TABLA 1
Residuo original Sustitución conservadora
Ala (A) Gly; Ser
Arg (R) Lys
Asn (N) Gln; His
Cys (C) Ser
Gln (Q) Asn
Glu (E) Asp
Gly (G) Ala; Pro
His (H) Asn; Gln
Ile (I) Leu; Val
Leu (L) Ile; Val
Lys (K) Arg; Gln; Glu
Met (M) Leu; Tyr; Ile
Phe (F) Met; Leu; Tyr
Ser (S) Thr
Thr (T) Ser
Trp (W) Tyr
Tyr (Y) Trp; Phe
Val (V) Ile; Leu
Se pueden permitir también otras sustituciones y se pueden determinar empíricamente o de acuerdo con sustituciones conservadoras. Cualquiera de dichas modificaciones del polipéptido se puede efectuar mediante cualquiera de los procedimientos conocidos por los expertos en esta técnica., que incluyen la mutagénesis de sitio específico o de sitio dirigido de ADN que codifica la proteína y el uso de procedimientos de ampliación de ADN que usan cebadores para introducir y ampliar las alteraciones en el molde de ADN.
Como se usa en esta memoria descriptiva, tratamiento significa cualquier manera en la que los síntomas de una afección,, trastorno o enfermedad se mejoran o de otra manera se alteran de manera beneficiosa. tratamiento también abarca cualquier uso farmacéutico de las composiciones en esta memoria descriptiva, tal como el uso como agentes anticonceptivos.
Como se usa en esta memoria descriptiva, un trastorno mediado por los canales de calcio activados por LVA se refiere a trastornos que están asociados a las actividades de los canales de LVA. Los trastornos mediados por los canales de calcio de tipo T trastornos mediados por los canales de calcio activados por LVA que están asociados con los canales de tipo T. Tales trastornos incluyen, pero no se limitan a: trastornos cardiovasculares, hepáticos, endocrinos, urológicos, reproductores, musculares, neurológicos y otros trastornos en los que los canales de LVA, particularmente los canales de tipo T, juegan un papel o bien en la mediación del trastorno que de alguna manera contribuye a ello.
Como se usa en esta memoria descriptiva, la mejora de los síntomas de un trastorno particular mediante la administración de una composición farmacéuticamente particular se refiere a cualquier disminución, o bien permanente o temporal, duradera o transitoria se puede atribuir a o asociada a la administración de la composición.
Como se usa en esta memoria descriptiva, sustancialmente puro significa suficientemente homogéneo para aparecer impurezas libres o fácilmente detectables como se determina mediante procedimientos convencionales de análisis, tal como cromatografía en capa fina (TLC), electroforesis en gel y cromatografía líquida de alta resolución (HPLC), usados por los expertos en la técnica para determinar tal pureza, o suficientemente pura de manera que la purificación adicional no alteraría de manera detectable las propiedades físicas y químicas, tal como actividades enzimáticas y biológicas, de la sustancia. Los procedimientos para la purificación de los compuestos para producir compuestos sustancialmente químicamente puros son conocidos por los expertos en la técnica. Sin embargo, un compuesto sustancialmente puro puede ser una mezcla de estereoisómeros. En tales casos, la purificación adicional puede incrementar la actividad específica del compuesto.
Como se usa en esta memoria descriptiva, la actividad biológica se refiere a las actividades in vivo de un compuesto o respuestas fisiológicas que se producen tras la administración in vivo de un compuesto, composición u otra mezcla. De esta menara la actividad biológica abarca los efectos terapéuticos y actividad farmacéutica de tales compuestos, composiciones y mezclas.
Identificación y aislamiento de ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio de tipo humano
Se proporcionan los procedimientos para identificar y aislar ácido nucleico (ADN y ARN) que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2}, \beta y \gamma, particularmente las subunidades \alpha_{1H} LVA de los canales de calcio de tipo humano.
La identificación y aislamiento de tal ácido nucleico se puede llevar a cabo mediante hibridación, en condiciones apropiadas, al menos rigurosidad, preferiblemente alta rigurosidad, a ADN humano digerido con enzimas de restricción con una sonda marcada que tiene al menos 16 o más nucleótidos (25, 30 o más largos) y derivados de cualquier porción contigua de ADN que tiene una secuencia de nucleótidos expuestos en esta memoria descriptiva mediante el número de identificación de la secuencia. Una vez que el fragmento de hibridación se identifica en la reacción de hibridación, se puede clonar empleando técnicas de clonación estándar conocidas por los expertos en la técnica. Los clones de longitud completa se pueden identificar mediante la presencia de una fase de lectura abierta completa y la identidad de la proteína codificada verificada mediante comparación de secuencias con las subunidades proporcionadas en esta memoria descriptiva y mediante ensayos funcionales para valorar la capacidad de formación de los canales de calcio u otra función. Este procedimiento se puede utilizar para identificar el ADN genómico que codifica la subunidad o ADNc que codifica las variantes de ayuste de las subunidades de los canales de calcio de tipo humano generadas por ayuste alternativo de la transcripción primaria del ADN de la subunidad genómica. Por ejemplo, ADN, ADNc o ADN genómico que codifica una subunidad de los canales de calcio se puede identificar mediante hibridación a una sonda de ADN y caracterizarse mediante los procedimientos conocidos por los expertos en la técnica, tales como los de mapeo de restricción y secuenciación de ADN y compararse con el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva con el fin de identificar la heterogeneidad o divergencia en las secuencia de ADN. Tales diferencias de secuencias pueden indicar que las transcripciones a partir de los cuales se produjo ADNc se originan de un ayuste alternativo de un transcripción primaria, si las regiones no homólogas y homólogas se agrupan., o de un gen diferente si las regiones no homólogas se distribuyen por todo el ADN clonado. Las variantes de ayuste comparten regiones de 100% de homología. Como se ha indicado en esta memoria descriptiva, el ácido nucleico resultante se puede expresar en células y las células resultantes ensayarse para verificar o averiguar que los canales de calcio expresados muestran propiedades farmacológicas y/o electrofisiológicas de los canales LVA o T.
Se puede usar cualquier procedimiento adecuado para aislar los genes que utilizan el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva. Por ejemplo, los oligonucleótidos correspondientes a las regiones de las diferencias de secuencias se han usado para aislar, mediante hibridación, ADN que codifica la variante de ayuste de longitud completa y se pueden usar para aislar clones genómicos. Una sonda, a base de una secuencia de nucleótidos descrita en esta memoria descriptiva que codifica al menos una porción de una subunidad de un canal de calcio de tipo humano, tal como un exón de tejido específico, se puede usar como sonda para clonar el ADN relativo, para clonar un clon de ADNc o clon genómico que codifica la subunidad de los canales de calcio de tipo humano.
Se describen el marcado, incluyendo, pero no limitado a, radiactivamente o enzimáticamente marcado, ARN o ADN de hebra sencilla de al menos 16 bases contiguas, generalmente al menos 30 bases contiguas de un ácido nucleico que codifica al menos una porción de una subunidad de los canales de calcio de tipo humano, la secuencia de cuyo ácido nucleico corresponde a un segmento de una secuencia de ácido nucleico descrito en esta memoria descriptiva mediante la referencia a una SEC ID Nº. Tales segmentos de ácido nucleico se pueden usar como sondas en los procedimientos proporcionados en esta memoria descriptiva para clonar ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio. Véase, en general, Sambrook y col., (1989) Molecular cloning: A Laboratory Manual, edición 2ª, Cold Spring Harbor Laboratory Press.
Además, las técnicas de amplificación de ácidos nucleicos, que se conocen bien en la técnica, se pueden usar para localizar las variantes de ayuste de las subunidades de los canales de calcio mediante el empleo de los oligonucleótidos a base de secuencias de ADN circundantes de los cebadores de las secuencias divergentes para ampliar ARN humano o ADN genómico. Las determinaciones del tamaño y secuencia de los productos de ampliación pueden revelar las variantes de ayuste. Además, el aislamiento de las secuencias de ADN genómicos de tipo humano mediante hibridación puede producir ADN que contiene múltiples exones, separados por intrones, que corresponden a diferentes variantes de ayuste de transcripciones que codifican las subunidades de los canales de calcio de tipo humano.
El ADN que codifica tipos y subtipos de cada una de las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2}, \beta y \gamma de los canales de calcio de tipo humano dependiente de voltaje se ha clonado en esta memoria descriptiva mediante la ampliación de ácido nucleico de ADNc de tejidos seleccionados o mediante la selección de genotecas de ADNc de tipo humano preparadas a partir de poli A+ ARNm aislado de líneas celulares o tejido de origen humano tal como los canales de calcio. Entre las fuentes de dichas células o tejido para obtener ARNm están el tejido de cerebro humano o una línea celular humana de origen neural, tal como una línea celular de neuroblastoma, músculo esquelético humano o células de músculo liso y similares. Los procedimientos para preparar bibliotecas de ADNc se conocen bien en la técnica (véase en general Ausubel y col. (1987) Current Protocols in Molecular Biology, Wiley - Interscience, Nueva York; y Davis y col., (1986) Basic Methods in Molecular Biology, Elsevier Science Publishing Co., Nueva York).
Las regiones preferidas a partir de las cuales se construyen sondas incluyen las secuencias codificadoras de 5' y/o 3', las secuencias pronosticadas para codificar dominios transmembrana, secuencias pronosticadas para codificar bucles citoplásmicos, secuencias señal, sitios de unión a ligandos y otras secuencias funcionalmente significativas (véase la tabla más adelante). Tanto el ADN que codifica la subunidad de longitud completa como los fragmentos del mismo se pueden usar como sondas, preferiblemente marcado por medios de marcaje adecuados para la pronta detección. Cuando los fragmentos se usan como sondas, preferiblemente las secuencias de ADN serán típicamente de la porción que codifica el extremo carboxi del ADN y más preferiblemente incluirá porciones que codifican los dominios transmembrana pronosticados a base de análisis hidropáticos de la secuencia de aminoácidos deducida [véase, por ejemplo, Kyte y Doolittle (1982) J. Mol. Biol. 167: 105].
Se han preparado las ribosondas que son específicas para los tipos o subtipos de las subunidades de los canales de calcio de tipo humano. Estas sondas son útiles para identificar la expresión de las subunidades particulares en tejidos y células seleccionadas. Las regiones a partir de las cuales se preparan las sondas se identificaron comparando el ADN y las secuencias de aminoácidos de todos los subtipos de las subunidades \alpha o \beta conocidas. Se seleccionaron las regiones de menor homología, preferiblemente las secuencias derivadas de tipo humano y generalmente aproximadamente 250 a aproximadamente 600 nucleótidos. Se han preparado numerosas ribosondas para las subunidades \alpha o \beta; algunas de éstas se enumeran en la siguiente tabla.
TABLA 2
1
Para las sondas específicas de \alpha_{1H} (y también anticuerpos), se pueden usar las regiones únicas a las subunidades \alpha_{1H}, tales como los bucles intracelulares extendidos presentes en estos canales. Para los anticuerpos específicos de \alpha_{1H-1} la región presente en \alpha_{1H-1} y ausente de \alpha_{1H-2} puede ser útil para el propósito de la preparación de las sondas específicas de la subunidad.
De este modo los clones de ADN y fragmentos de los mismos proporcionados en esta memoria descriptiva se pueden usar para aislar clones genómicos que codifican cada subunidad y aislar cualquier variante de ayuste mediante la selección de hibridación de genotecas preparadas a partir de diferentes tejidos humanos. Las técnicas de amplificación de los ácidos nucleicos, que se conocen bien en la técnica, también se pueden usar para localizar el ADN que codifica las variantes de ayuste de las subunidades de los canales de calcio de tipo humano. Esto se lleva acabo mediante el empleo de oligonucleótidos a base de secuencias de ADN que rodean la(s) secuencia(s) divergente(s) como cebadores para amplificar ARN humano o ADN genómico. Las determinaciones del tamaño y secuencia de los productos de amplificación pueden revelar la existencia de variantes de ayuste. Además, el aislamiento de secuencias de ADN genómico humano mediante hibridación puede producir ADN que contiene múltiples exones, separados por intrones, que corresponden a diferentes variantes de ayuste de transcripciones que codifican las subunidades de los canales de calcio de tipo humano.
Una vez que se aísla el ADN que codifica una subunidad de los canales de calcio se pueden emplear los ensayos de protección de ribonucleasa (ARNasa) para determinar qué tejidos expresan el ARNm que codifica una subunidad o una variante de los canales de calcio particular. Estos ensayos proporcionan un medio sensible para detectar y cuantificar una especie de ARN en una mezcla de complejos del ARN total celular. El ADN de la subunidad se marca y se hibridiza con ARN celular. Si está presente ARNm complementario en el ARN celular, se produce un híbrido ADN - ARN. Después la muestra de ARN se trata con ARNasa, que se degrada a ARN de hebra sencilla. Cualesquiera de los híbridos ARN - ADN se protege de la degradación con ARNasa y se puede visualizar mediante electroforesis en gel y autorradiografía. Las técnicas de hibridación in situ se pueden también usar para determinar qué tejidos expresan ARNm que codifica una subunidad de los canales de calcio particular. Los clones de ADN que codifican las subunidades marcadas se hibridan con diferentes ayustes de tejidos diferentes para visualizar la expresión de ARNm de las subunidades.
Con respecto a cada una de las subunidades (\alpha_{1}, \alpha_{2}, \beta o \gamma) de los canales de calcio de tipo humano, una vez que se ha identificado el ADN que codifica la subunidad de los canales mediante un procedimiento de selección de ácidos nucleicos, se usó el clon aislado para selección adicional con el fin de identificar los clones de superposición. Algunos de los fragmentos de ADN clonados pueden y se han clonado en un vector apropiado tal como pIBI24/25 (IBI, New Haven, CT), M13mp18/19, pGEM4, pGEM3, pGEM 7Z, pSP72 y otro de tales vectores conocidos por los expertos en esta técnica y caracterizados por secuenciación de ADN y mapeo con enzimas de restricción. De este modo una serie secuencial de clones superpuestos se pueden generar para cada una de las subunidades hasta que se pueda preparar un clon de longitud completa mediante procedimientos conocidos por los expertos en la técnica, que incluye la identificación de los codones de iniciación de la traducción (comienzo) y terminación de la traducción (parada). Para la expresión del ADN clonado, la región no codificadora en 5' y otras regiones de control de transcripción y traducción de dicho clon se pueden reemplazar con un sitio de unión al ribosoma eficaz y otras regiones reguladoras como se conoce en la técnica. Si se considera necesario se pueden efectuar otras modificaciones del extremo 5', conocidas por los expertos en la técnica, que también se pueden requerir para optimizar la eficacia de la traducción y la transcripción.
Los ejemplos 1-3 más adelante, describen en detalle la clonación de ADN que codifica las variantes de ayuste \alpha_{1H} y propiedades electrofisiológicas y farmacológicas de las mismas. Excepto cuando se indique, los procedimientos de expresión y otros datos se describen con referencia al ácido nucleico que codifica \alpha_{1H-1}. Se entiende que los procedimientos ejemplificados se pueden usar para aislar variantes de ayuste adicionales y subunidades relacionadas de seres humanos y otros mamíferos y animales y también se pueden usar para expresar tal ácido nucleico para producir células para uso en la selección de ensayos para identificar compuestos que modulan la actividad de los canales activados de LVA, particularmente los canales de tipo T. El ácido nucleico también se puede usar en ensayos de diagnóstico para identificar mutaciones y para producir proteínas y después anticuerpos para uso como reactivos en ensayos de diagnóstico para trastornos asociados a las actividades de los canales de calcio de tipo T.
Subunidades \alpha_{1} de los canales LVA
Se proporcionan en esta memoria descriptiva el ácido nucleico que codifica las subunidades \alpha_{1} que forman los canales LVA. El ácido nucleico proporcionado en esta memoria descriptiva también se puede usar para aislar canales relacionados a partir de otros tejidos, y otros mamíferos y animales.
Identificación y aislamiento de ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio de tipo humano
Los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} deben mostrar propiedades que difieren de los canales HVA conocidos, formados a partir de las subunidades de los canales de calcio \alpha_{1A}-\alpha_{1E}. Tales diferencias pueden incluir activación por baja tensión, inactivación dependiente de la tensión, sensibilidad relativamente alta a mibefradil y resistencia relativamente alta a las toxinas de caracol y arácnidos que muestran la mayoría de los canales HVA (por ejemplo toxinas del veneno de arañas \omega-AgaIIIA y \omega-AgaIVA y la toxina del caracol Conos GVIA. Además las subunidades \alpha_{1H} se pueden identificar mediante homología con otras subunidades \alpha_{1} y adicionalmente mediante la presencia de un bucle intracelular extendido en la subunidad codificada (véase, por ejemplo, SEQ ID Nº 12, nucleótidos 1506-2627) localizada entre los dominios trnasmembrana I y II. esta región en \alpha_{1H} se extiende comparada con otras subunidades \alpha_{1} de los canales de calcio, tales como \alpha_{1A}-\alpha_{1E}.
El ADN que codifica una subunidad \alpha_{1H} se puede aislar usando el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva. En particular, las sondas de al menos aproximadamente 16 nucleótidos o 30 nucleótidos u otra longitud adecuada, tal como 30, 100 etc. bases, se pueden usar para seleccionar genotecas seleccionadas, incluyendo genotecas de ADN de mamífero. Las genotecas seleccionadas se preparan preferiblemente a partir de tejido de mamífero o fuentes celulares conocidas por expresar los canales de tipo T. La secuencia de la sonda se basa preferiblemente en la secuencia del bucle intracelular localizado entre los dominios transmembrana I y II (véase, por ejemplo, las SEQ ID Números 12 y 15).
El ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H} se aisló mediante la amplificación de una región de genes que codifican una subunidad \alpha_{1} expresada en una línea celular de carcinoma de tiroides humano (células TT) usando cebadores de oligonucleótidos degenerados.
La línea celular TT se deriva de un carcinoma de tiroides medular humano y se ha usado para estudiar la secreción de calcitonina y expresión de genes (deBustros y col., (1986) J. Biol. Chem. 261: 8036-8041; deBustros y col 1990 Mol. Cell. Biol. 10: 1773-1778). Los registros de células enteras de estas células revelan que solamente los canales de calcio controlados por tensión expresados mediante estas células están activados por bajo voltaje, inactivando rápidamente y desactivando lentamente, que son propiedades biofísicas consistentes con un canal de tipo T.
Una parte de uno de los clones positivos se usó para seleccionar además una genoteca de ADNc de carcinoma de tiroides para identificar clones de superposición que se extienden sobre la longitud entera de la secuencia de nucleótidos que codifican la subunidad \alpha_{1H} humana. Un clon de ADN de \alpha_{1H} de longitud completa se puede construir mediante partes de ligación de los clones de ADNc parcial como se describe en el ejemplo 1. La SEQ ID Nº 15 establece la secuencia de nucleótidos de un clon que codifica una subunidad \alpha_{1H-1} así como la secuencia de aminoácidos deducida.
Se detectaron dos variantes de ayuste \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2}, mediante RT - PCR (ampliación de transcriptasa inversa) usando ARN de tejidos múltiples. La isoforma \alpha_{1H-2} (SEQ ID Nº 16) contiene una supresión de 957 nucleótidos, con relación a \alpha_{1H-1} (SEQ ID números 12 y 15) en el bucle intracelular, es decir nt 1506 a nt 2627 de la SEQ ID nº 12).
La subunidad \alpha_{1H-1} muestra notables diferencias de secuencia, así como ciertas similitudes estructurales a las subunidades \alpha_{1} previamente clonadas. Notablemente, la secuencia de aminoácidos deducida de \alpha_{1H-1} comparte menos de un 30% de identidad de secuencia global con los ácidos nucleicos que codifican \alpha_{1A}-\alpha_{1E} humanas, que codifican los canales de calcio activados por alta tensión. El análisis de transferencia Northern indica que las transcripciones del ARNm para \alpha_{1H} se expresan en el cerebro, principalmente en la amígdala, núcleo caudal y putamen, principalmente en el hígado, riñón y corazón.
Específicamente, una comparación del asido nucleico y secuencias de aminoácidos deducidos de esta subunidad de los canales de calcio \alpha_{1H} con otras subunidades \alpha_{1} humanas revela varias características distintas. Existen notables diferencias entre las secuencias de \alpha_{1H} y \alpha_{1} HVA. Primero, el bucle intracelular entre los dominios I y II transmembrana es notablemente más largo. Como se ejemplifica en la SEQ ID Nº 12, el bucle intracelular de la subunidad \alpha_{1H} humana es 1.122 nt de longitud mientras que los bucles intracelulares correspondientes en las otras subunidades \alpha_{1H} humanas descritas en esta memoria descriptiva varían entre 351 y 381 nt de longitud. De este modo, el bucle intracelular de \alpha_{1H} humana es aproximadamente 250 aminoácidos más largo que las subunidades \alpha_{1H} humanas encontradas en los canales de calcio HVA. La secuencia de aminoácidos deducida de esta región (aa 420 a aa 794 de la SEQ ID Nº 12) contiene un número mayor de resto de prolina e incluye una región poli - HIS de 9 restos histidina contiguos (aa 52 a aa 528 de la SEQ ID Nº 12) y una región donde 8 de 10 restos son alanina. El bucle intracelular grande localizado entre los dominios transmembrana I y II parece los bucles intracelulares grandes encontrados en una localización correspondiente en las subunidades \alpha de los canales de sodio alguna de las cuales pueden funcionar como hormonas. Se ha propuesto que los canales de tipo T tienen una actividad que es un híbrido entre los canales de calcio HVA y canales de sodio. Las subunidades \alpha_{1H} proporcionadas en esta memoria descriptiva también pueden funcionar como canales de sodio.
Segundo, la subunidad \alpha_{1H} humana aislada carece de restos de aminoácidos que se sabe generalmente que son críticos (por ejemplo, véase De Warrd y col., (1996) FEBS Letters 380: 272-276; Pragnell y col., (1994) Nature 368: 67-70) para la interacción entre las subunidades \alpha_{1} y las subunidades \beta. Existen al menos trece restos localizados en este bucle intracelular entre los dominios transmembrana I y II que forman un motivo que está altamente conservado entre las subunidades \alpha_{1}, tales como \alpha_{1A}-\alpha_{1E} descritas en esta memoria descriptiva (véase también Pragnell y col., (1994) Nature 368: 67-70). En particular, este bucle carece del dominio de interacción \alpha_{1} (AID) implicado en al unión de la subunidad \beta. También ausente de esta región es el motivo de unión G\beta\gamma, GlnXXGluArg, originalmente identificado en la adenilil ciclasa 2 y encontrado en las subunidades de tipo no L, HVA \alpha_{1}. Sin embargo se produce una secuencia idéntica dentro del bucle intracelular II-III de la secuencia \alpha_{1H}, que sugiere una posible interacción de G\beta\gamma en esta región. La subunidad \alpha_{1H} también contiene diferencias en los determinantes de selectividad de ion encontrada en los engarces S5-S6 de los canales HVA. En los bucles de poros S5-S6 del dominio III y IV, los restos glutamato que juegan un papel crítico en la selectividad de Ca^{2+} y permeación de iones se reemplazan por restos aspartato.
Tercero, la subunidad \alpha_{1H} humana tiene otro bucle extracelular notablemente largo en el dominio I localizado entre IS5 e IS6. Este bucle extracelular varía entre 249 a 270 restos de nucleótidos en otras subunidades \alpha_{1} humanas mientras que la subunidad \alpha_{1H} humana tiene 426 restos de nucleótidos. Otras características discernidoras se pueden averiguar y de ha averiguado que mediante la expresión de la subunidad en las células como se ha descrito en esta memoria descriptiva.
El ácido nucleico que codifica la subunidad \alpha_{1H} se puede usar para seleccionar genotecas apropiadas, particularmente genotecas de mamíferos, y mas particularmente genotecas de mamíferos de tejidos o células que muestran la actividad de los canales de tipo T. La subunidad codificada se puede identificar por las propiedades discernidoras indicadas anteriormente. Las sondas de ácido nucleico del clon que codifica \alpha_{1H-1} se usó para identificar y aislar clones que
codifican una segunda variante, denominada \alpha_{1H-2}, que tiene una supresión de 957 pares de bases con relación a \alpha_{1H-1}.
La subunidad \alpha_{1H} forma un canal funcional en dos sistemas de expresión diferentes sin la adición de las subunidades \alpha_{2}\delta y \beta. La ausencia de un sitio de interacción de la subunidad \beta dentro del bucle I-II de la secuencia de \alpha_{1H} es consistente con la reseña de que la supresión de la subunidad \beta con oligonucleótidos de sentido contrario en los ganglios nudosos no tiene efecto sobre las corrientes de tipo T en esa región. Además, ninguna de las subunidades \beta conocidas en las células HEK293 se detectó mediante análisis de Western usando antisueros específicos de la subunidad \beta, indicando que las subunidades \beta clonadas anteriormente pueden no jugar un papel en la formación de canales de Ca^{2+} LVA que contienen \alpha_{1H}. Los ovocitos y células HEK293 expresan una subunidad \alpha_{2}\delta y que las células TT, la fuente de las subunidades \alpha_{1H} descritas en este documento, expresan cantidades relativamente altas de la proteína \alpha_{2}\delta. Por consiguiente, es posible que los canales que contienen \alpha_{1H} expresados, contengan la subunidad \alpha_{2}\delta, y que la subunidad \alpha_{2}\delta es un componente de los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} nativa.
Distribución de las transcripciones \alpha_{1H}
Transferencias de Northern que contienen ARNm humano de varios tejidos neuronales y no neuronales se sondaron con fragmentos marcados generados a partir del ADNc de \alpha_{1H} de longitud completa. Una única transcripción de \sim8,5 kb está presente en todos los tejidos examinados, que incluyen corazón, cerebro, placenta, pulmón, músculo esquelético, riñón, páncreas. Los tejidos neuronales incluían cerebelo, córtex cerebral, médula, médula espinal, lóbulo occipital, lóbulo frontal, lóbulo temporal, putamen, amígdala, núcleo caudal, cuerpo calloso, hipocampo, sustancia nigra, núcleo subtalámico y tálamo. En los tejidos no neuronales, los niveles de expresión más altos se encuentran en el riñón,
hígado, y corazón. En el cerebro, la transcripción de \alpha_{1H} es la más abundante en la amígdala, núcleo caudal, y putamen.
Identificación y aislamiento de ADN que codifica los tipos y subtipos de las subunidades \alpha_{1} de los canales de calcio de tipo humano
El ADN que codifica las subunidades \alpha_{1} adicionales se pueden aislar e identificar usando el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva como se describe para las subunidades \alpha_{1A}, \alpha_{1B}, \alpha_{1C}, \alpha_{1D}, \alpha_{1E} y \alpha_{1H} o usando otros procedimientos conocidos por los expertos en la técnica. En particular, el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva se puede usar para seleccionar genotecas adecuadas para aislar el ADN relacionado. Los clones de longitud completa se pueden construir usando procedimientos, tales como los descritos en esta memoria descriptiva y las subunidades resultantes caracterizadas por comparación de sus secuencias y las propiedades electrofisiológicas y farmacológicas con las subunidades ejemplificadas en esta memoria descriptiva.
Un número de genes de la subunidad \alpha_{1} de los canales de calcio dependiente de la tensión, que se expresan en el SNC y otros tejidos, se han identificado y se han denominado \alpha_{1A}, \alpha_{1B} (o VDCC IV), \alpha_{1C} (o VDCC II), \alpha_{1D} (o VDCC III), \alpha_{1E} y \alpha_{1H}. Se ha aislado el ADN, aislado de genotecas de ADN que codifica cada una de los tipos de las subunidades. También se proporciona el ADN que codifica cada uno de los tipos que aparecen como variantes de ayuste. Los subtipos se designan en esta memoria descriptiva, por ejemplo, como \alpha_{1B-1}, \alpha_{1B-2}. La subunidad \alpha_{1H} es de particular interés en esta memoria descriptiva.
Los tipos de la subunidad \alpha_{1} A, B, C, D, E y F de los canales de calcio dependientes de la tensión, y subtipos de los mismos, se diferencian con respecto a la sensibilidad a las clases conocidas de los agonistas y antagonistas de los canales de calcio, tales como los DHP, las fenilalquilaminas, la conotoxina omega (\omega-CgTx), la \omega-agatoxina IV de la araña de tela en embudo y las pirazonoilguanidinas y o en otras propiedades físicas y estructurales. Estos tipos de subunidad también parece que difieren en el potencial de mantenimiento y en la cinética de corrientes producidas tras la despolarización de las membranas celulares que contienen canales de calcio que incluyen tipos diferentes de las subunidades \alpha_{1}.
Se proporciona el ADN que codifica una subunidad \alpha_{1} que se une a al menos un compuesto seleccionado de entre dihidropiridinas, fenilalquilaminas, \omega-CgTx, componentes de la toxina de la araña de tela en embudo y pirazonoilguanidinas. Por ejemplo, la subunidad \alpha_{1B} proporcionada en esta memoria descriptiva parece interactuar específicamente con \omega-CgTx en los canales de tipo N y la subunidad \alpha_{1D} proporcionada en esta memoria descriptiva interactúa específicamente con los DHP en los canales de tipo L.
Anticuerpos
Los anticuerpos, monoclonales o policlonales, específicos de los subtipos de las subunidades de de los canales de calcio o para los tipos de los canales de calcio se pueden preparar empleando técnicas estándar, conocidas por los expertos en la técnica, que usan las proteínas de las subunidades o porciones de las mismas como antígenos. Se pueden usar los anticuerpos de la las proteínas antipéptido y antifusión (véase, por ejemplo, Bahouth y col., (1991) Trends Pharmacol. Sci. 12: 338-343; Current Protocols in Molecular Bilogy (Ausubel y col., eds.) John Wiley y Sons, Nueva York (1984)). Los factores a considerar en la selección de las porciones de las subunidades de los canales de calcio para uso como inmunógenos (o bien en forma de un péptido sintético o en forma de una proteína de fusión bacteriana producida por recombinación) incluyen la accesibilidad antigénica (es decir, dominios extracelulares y citoplásmicos), singularidad a la subunidad particular y otros factores conocidos por los expertos en esta técnica. Los anticuerpos tienen usos terapéuticos y también uso en ensayos de diagnóstico.
La disponibilidad de los anticuerpos específicos de las subunidades hace posible la aplicación de la técnica de inmunohistoquímica para controlar la distribución y la densidad de la expresión de diversas subunidades (por ejemplo, en tejido de cerebro normal frente a enfermo). Dichos anticuerpos se podrían también emplear en diagnostico, tales como la diagnosis LES y aplicaciones terapéuticas, tales como usando los anticuerpos que modulan las actividades de los canales de calcio.
Los anticuerpos se pueden administrar a un sujeto empleando procedimientos convencionales, tales como por ejemplo, mediante inyección intraperitoneal, intramuscular, intravenosa o subcutánea, implante o formas transdérmicas de administración y los similares. Un experto en la técnica puede determinar empíricamente las formas de dosis, regímenes de tratamiento, etc., dependiendo de la forma de administración empleada.
Se han preparado los anticuerpos monoclonales específicos de subunidades y antisueros policlonales. Las regiones de las que los antígenos venían se identificaron comparando las secuencias del ADN y de aminoácidos de todos los subtipos de las subunidades \alpha o \beta conocidas. Se seleccionaron las regiones de menos homología, preferiblemente las secuencias derivadas de seres humanos. Las regiones o proteínas de fusión seleccionadas que contenían las regiones seleccionadas se utilizaron como inmunógenos. También se realizaron los análisis de hidrofobicidad de los residuos en las regiones proteicas seleccionadas y proteínas de fusión; se evitan las regiones de alta hidrofobicidad. También, y más importante, cuando se preparan las proteínas de fusión en hospedadores bacterianos, se evitan los codones raros. En particular, se evita la inclusión de 3 o más codones raros sucesivos en un hospedador seleccionado. Se han preparado numerosos anticuerpos, policlonales y monoclonales, específicos para los tipos o subtipos de las subunidades \alpha o \beta; algunos de éstos se enumeran en la tabla siguiente. Los ejemplos de anticuerpos ejemplares y antígenos de péptidos usados para preparar los anticuerpos se exponen en la siguiente tabla:
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TABLA 3
3
Las proteínas de fusión de GST son cada una específica para la región de bucle citoplásmica IIS6-IIS1, que es una región de homología de subtipos baja para todos los subtipos, incluyendo \alpha_{1C} y \alpha_{1D}, para las que se preparan fusiones similares y antisueros.
Usando procedimientos similares, se pueden preparar los anticuerpos específicos para las subunidades de LVA, particularmente las subunidades \alpha_{1H} proporcionadas en esta memoria descriptiva, usando, por ejemplo, bucles intracelulares extendidos. Tales anticuerpos tendrán uso en ensayos de diagnóstico para trastornos en los que están implicados canales de calcio LVA.
Preparación de células eucarióticas recombinantes que contienen el ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio heterólogos
El ADN que codifica una o más de las subunidades de los canales de calcio o una porción de una subunidad de los canales de calcio se puede introducir en una célula hospedadora para la expresión o replicación del ADN. Dicho ADN se puede introducir usando los procedimientos descritos en los siguientes ejemplos o usando los procedimientos bien conocidos por los expertos en la técnica. Se conoce bien en la técnica la incorporación de ADN clonado en un vector de expresión adecuado, la transfección de células eucarióticas con un vector de plásmidos o una combinación de vectores de plásmidos, que codifican cada uno de ellos uno o más genes distintos o con ADN lineal, y la selección de células transfectadas [véase por ejemplo, Sambrook y col., (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, segunda edición, Cold Spring Harbor Laboratiry Press).
El ácido nucleico clonado de longitud completa que codifica cualquiera de las subunidades de un canal de calcio de tipo humano se puede introducir en un vector plásmido para la expresión en una célula eucariótica. Dicho ADN puede ser ADN o ADNc o ARN genómico. Actualmente las células preferidas son aquellas que contienen ADN heterólogo que codifica la subunidad \alpha_{1H}. Las células huéspedes se pueden transfectar con uno o una combinación de los plásmidos, cada uno de los cuales codifica al menos una subunidad de los canales de calcio. Como alternativa, las células hospedadoras se pueden transfectar con ADN lineal utilizando procedimientos bien conocidos por los expertos en la técnica.
Mientras que el ADN proporcionado en esta memoria descriptiva se puede expresar en cualquier célula eucariótica, incluyendo las células de levaduras tales como P. pastoris [véase, por ejemplo, Cregg y col., (1987) Bio/Technology 5: 479], se prefieren los sistemas de expresión de mamíferos para la expresión del ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio de tipo humano proporcionado en esta memoria descriptiva.
El ADN heterólogo se puede introducir mediante cualquier procedimiento conocido por los expertos en la técnica, tal como transfección con un vector que codifica el ADN heterólogo. Los vectores particularmente preferidos para la transfección de células de mamíferos son los vectores de expresión pSV2dhfr, que contienen el promotor temprano SV40, gen dhfr de ratón, sitios de poliadenilación y ayuste y las secuencias necesarias para mantener el vector en las bacterias, vectores a base de promotores de citomegalovirus (abreviadamente CNV) tales como pCDNA1, o pcDNA-amp y vectores a base de promotores de MMTV. El vector ocDNA1 es un vector de expresión eucariótico que contiene un promotor de citomegalovirus (CMV) que es un promotor constitutivo reconocido por la ARN polimerasa II de células huéspedes de mamífero. El ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio de tipo humano se han insertado en el vector pCDNA 1 en una porción inmediatamente siguiente al promotor de CMV. Actualmente se prefiere el vector pCDNA1 y se ha usado para expresar las subunidades \alpha_{1H} en células de mamífero.
Las células de mamíferos transfectadas temporal o establemente se pueden preparar mediante procedimientos conocidos en la técnica transfectando las células con un vector de expresión que tiene un gen marcador seleccionable tal como el gen para timidinaquinasa, dihidrofolatorreductasa, resistencia a la neomicina o los similares y, para transfección temporal, desarrollando las células transfectadas en condiciones selectivas para las células que expresan el gen marcador. Los canales de calcio funcionales dependientes de la tensión se han producido en las células HEK 293 transfectadas con un derivado del vector pCDNA1 que contiene el ADN que codifica una subunidad de los canales de calcio de tipo humano.
El ADN heterólogo se puede mantener en las células como un elemento episomal o se pueden integrar en ADN cromosómico de la célula. Después las células recombinantes resultantes se pueden cultivar o subcultivar (o multiplicadas por cultivo, en el caso de células de mamíferos) a partir de dicho cultivo o un subcultivo del mismo. Los procedimientos para la transfección, inyección y cultivo de células recombinantes los conocen bien los expertos en la técnica. Las células eucarióticas en las que se puede introducir ADN o ARN incluyen todas las células que se pueden transfectar mediante dichos ADN o ARNo en las que dicho ADN se puede inyectar. Virtualmente cualquier célula eucariótica puede servir como vehículo para el ADN heterólogo. Las células preferidas son las que también pueden expresar en ADN y ARN y las células más preferidas son las que pueden formar canales de calcio recombinantes o heterólogos que incluyen una o más subunidades codificadas por el ADN heterólogo. Dichas células se pueden identificar empíricamente o seleccionarse de entre las conocidas que son fácilmente transfectadas o inyectadas. Las células preferidas para introducir ADN incluyen las que se pueden transfectar temporal o establemente e incluyen, pero no se limitan a, las células de origen mamífero, tales como las células COS, células L de ratón, células CHO, células de riñón embrionario de tipo humano, células de mono verde africano y otras de dichas células conocidas por los expertos en la técnica, células de anfibios, tales como ovocitos de Xenopus lavéis o las de levaduras tales como Saccharomyces cerevisiae o Pichia pastoris. Las células preferidas para expresar transcripciones de ARN inyectado o cDNA incluyen ovocitos de Xenopus lavéis. Las células que se prefieren para la trasnfección de ADN son las que se pueden transfectar fácil y eficazmente. Dichas células las conocen los expertos en la técnica o se pueden identificar empíricamente. Las células preferidas incluyen células DG44 y células HEK 293, particularmente las células HEK 293 que se pueden congelar en nitrógeno líquido y después descongelarse y volverse a desarrollar. Dichas células HEK 293 se describen, por ejemplo en la patente de Estados Unidos Nº 5.024.939 de Gorman [véase también Stillman y col. (1985) Mol. Cell. Biol. 5: 2051-2060].
Las células se pueden usar como vehículos para replicar ADN heterólogo introducido en ellas o para expresar o para expresar el ADN introducido en ellas. En ciertas realizaciones, las células se usan como vehículos para expresar el ADN heterólogo como medio para producir sustancialmente subunidades de los canales de calcio de tipo humano o los canales de calcio heterólogos. Las células hospedadoras que contienen el ADN heterólogo se pueden cultivar en condiciones en las que se expresan los canales de calcio. Las subunidades de los canales de calcio se pueden purificar usando los procedimientos de de purificación de proteínas conocidos por los expertos en la técnica. Por ejemplo se pueden usar, los anticuerpos, tales como los proporcionados en esta memoria descriptiva, que se unen específicamente a uno o más de las subunidades para purificación de afinidad de la subunidad o los canales de calcio que contienen las subunidades.
Sustancialmente se proporcionan las subunidades puras de las subunidades \alpha_{1} de los canales de calcio de un canal de calcio de tipo humano, las subunidades \alpha_{2} de los canales de calcio de un canal de calcio de tipo humano y las subunidades \beta de los canales de calcio de un canal de calcio de tipo humano y subunidades \gamma de un canal de calcio de tipo humano. Sustancialmente también se proporcionan los canales de calcio puros aislados que contienen al menos una de las subunidades de los canales de calcio de tipo humano. Sustancialmente también se proporcionan los canales de calcio puros que contienen una mezcla de una o más subunidades codificadas por la células hospedadora y una o más subunidades codificadas por ADN o ARN heterólogos que se han introducido en la célula. Sustancialmente también se proporcionan los canales de calcio de un tipo específico de tejido.
En una realización, se proporcionan las células eucarióticas que contienen ADN heterólogo que codifica al menos una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio que expresa la subunidad \alpha_{1H} y forman canales de calcio que contienen \alpha_{1H} de tipo humano homomérica funcional. Estas células se pueden usar para seleccionar los compuestos que modulan la actividad de los canales de tipo T y canales de calcio de tipo LVA.
En otra realización, se proporcionan las células eucarióticas que contienen ADN heterólogo que codifica al menos una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio de tipo humano, una subunidad \alpha_{2} de un canal de calcio de tipo humano, una subunidad \beta de un canal de calcio de tipo humano y una subunidad \gamma de un canal de calcio de tipo humano. De acuerdo con una realización preferida, el ADN heterólogo se expresa en la célula eucariótica y codifica preferentemente una subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano.
Expresión de los canales de calcio heterólogos: electrofisiología y farmacología
El ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H-1} se expresó de manera transitoria en células HEK203 y se asoció con la expresión de una proteína \alpha_{1H-1} de aproximadamente 260 kDa \alpha_{1H-1}, como se identifica por análisis SDS - PAGE/transferencia de Western.
Las corrientes de Ba^{2+} o Ca^{2+} registradas de las células HEK293 que expresan transitoriamente los canales \alpha_{1H-1}, y se encontró que mostraban propiedades biofísicas y farmacológicas características de corrientes de canales de calcio activadas por baja tensión, es decir, de tipo T. Se obtuvieron resultados similares en ovocitos de Xenopus que expresan \alpha_{1H-1}.
Los expertos en la técnica conocen los procedimientos electrofisiológicos para medir la actividad de los canales de calcio y se ejemplifican en esta memoria descriptiva. Cualquiera de dichos procedimientos se puede usar con el fin de detectar la formación de canales de calcio funcionales y caracterizar la cinética y otras características de las corrientes resultantes. Los estudios farmacológicos se pueden combinar con las mediciones electrofisiológicas con el fin de caracterizar posteriormente los canales de calcio.
Con respecto a las mediciones de la actividad de los canales de calcio heterólogos funcionales, preferiblemente, la actividad de los canales iónicos endógenos y, si se desea, la actividad de los canales heterólogos de los canales que no contienen las subunidades deseadas de una célula hospedadora se pueden inhibir en un grado significativo mediante medios químicos, farmacológicos y electrofisiológicos, que incluyen el uso del potencial de mantenimiento diferencial para incrementar la relación S/R (señal/ruido) de la actividad medida de los canales de calcio heterólogos.
De este modo, las diversas combinaciones de las subunidades codificadas por el ARN proporcionado en esta memoria descriptiva se introducen en las células eucarióticas. Las células resultantes se pueden examinar para averiguar si los canales funcionales se expresan y para determinar las propiedades de los canales. En los aspectos particularmente preferidos, la célula eucariótica que contiene el ARN heterólogo los expresa y forma una actividad de los canales de calcio funcionales recombinantes. En los aspectos más preferidos, la actividad de los canales de calcio recombinantes se detecta fácilmente debido a que es un tipo que no está en la célula hospedadora no transfectada o es de una magnitud y/o propiedades farmacológicas o exhibe propiedades biofísicas no mostradas en la célula no transfectada.
Las células eucarióticas se pueden transfectar con diversas combinaciones de los subtipos de subunidades proporcionadas en esta memoria descriptiva. Las células resultantes proporcionaran una población uniforme de los canales de calcio para estudio de la actividad de los canales de calcio y para uso en los ensayos de análisis de fármacos proporcionados en esta memoria descriptiva. Los experimentos que se han realizado han demostrado la inadecuación de los esquemas de clasificación anteriores.
Entre las células transfectadas preferidas está una célula eucariótica recombinante con un canal de calcio heterólogo funcional. La célula recombinante se puede producir mediante la introducción expresión de transcripciones de ARN o ARN heterólogos que codifican una subunidad \alpha_{1} de de un canal de calcio de tipo humano, más preferiblemente expresando también un ARN heterólogo que codifica una subunidad \beta de un canal de calcio de tipo humano y/o ARN heterólogo que codifica una subunidad \alpha_{2} de un canal de calcio de tipo humano. Se prefiere especialmente la expresión en dicha célula recombinante de cada una de las subunidades \alpha_{1H}, \beta y \alpha_{2} codificadas por dichas transcripciones de ARN o ARN heterólogos, y opcionalmente la expresión de la transcripción de ADN o ARN heterólogos que codifican una subunidad \gamma de un canal de calcio de tipo humano. Los canales de calcio funcionales preferiblemente pueden incluir al menos una subunidad \alpha_{1H} y una subunidad \beta de un canal de calcio de tipo humano. Las células eucarióticas que expresan estas dos subunidades y también las células que expresan subunidades adicionales se han preparado mediante transfección de ADN y mediante inyección de transcripciones de ARN. Dichas células han exhibido la actividad de los canales de calcio dependientes de tensión atribuibles a los canales de calcio que contienen una o más de las subunidades de los canales de calcio heterólogos de tipo humano. Por ejemplo, las células eucarióticas que expresan los canales de calcio heterólogos conteniendo una subunidad \alpha_{2} además de la subunidad \alpha_{1} y una subunidad \beta han mostrado que exhiben un flujo aumentado de iones selectivos de calcio a través de la membrana celular en respuesta a la despolarización, que indica que la subunidad \alpha_{2} puede potenciar la función de los canales de calcio. Las células que se han cotransfectado con relaciones crecientes de \alpha_{2} a \alpha_{1} y se ha medido la actividad de los canales de calcio resultantes. Los resultados indican que el incremento de la cantidad de ARN que codifica \alpha_{2} relativo a las otras subunidades transfectadas incrementa la actividad de los canales de calcio.
Se prefieren las células eucarióticas que expresan los canales de calcio heterólogos que contienen una subunidad \alpha_{1H} como un homómero y al menos una subunidad \alpha_{1H} de tipo humano y opcionalmente una subunidad \alpha_{2}\delta y/o una subunidad \beta de tipo humano. Las células eucarióticas trasformadas con una composición que contiene ADN o una transcripción de ARN que codifica una subunidad \alpha_{1H} sola o en combinación con una subunidad \beta y/o \alpha_{2} se pueden producir para producir las células que expresan los canales de calcio funcionales. Ya que las células recombinantes que expresan los canales de calcio de tipo humano que contienen todas las subunidades humanas codificadas por los ADN o ARN heterólogos son las que se prefieren especialmente, es deseable inyectar o transferir dichas células hospedadoras con una concentración suficiente de los ácidos nucleicos que codifican las subunidades para formar los canales de calcio que contienen las subunidades de tipo humano codificadas por ADN o ARN heterólogos. Las cantidades y relaciones precisas de ADN y ARN que codifican las subunidades se pueden determinar empíricamente y optimizarse para una combinación particular de subunidades, células y condiciones de ensayo.
En particular, las células de mamíferos se han transfectado temporal y establemente con ARN que codifica una o más subunidades de los canales de calcio de tipo humano. Dichas células expresan los canales de calcio heterólogos que exhiben propiedades farmacológicas y electrofisiológicas que se pueden atribuir a los canales de calcio de tipo humano. Sin embargo, dichas células representan poblaciones homogéneas y los datos farmacológicos y electrofisiológicos proporcionan la adquisición de una nueva percepción de la actividad de los canales de calcio de tipo humano hasta ahora irrealizable. Por ejemplo, las células HEK que se han transfectado temporalmente con ADN que codifica las subunidades \alpha_{1E-1}, \alpha_{2b} y \beta_{1-3}. Las células resultantes expresan temporalmente estas subunidades, que forman canales de calcio que tienen propiedades que parecen ser una clase farmacológicamente distinta de los canales de calcio activados con voltaje distintas de las de los acanales de tipo L-, N- T- y P-. Las corrientes de \alpha_{1E} observadas eran insensibles a los fármacos y toxinas previamente usadas para definir otras clases de canales de calcio activados con tensión.
Las células HEK que se han transfectado de manera transitoria con ADN que codifica \alpha_{1E-1}, \alpha_{2b} y \beta_{1-2} expresan canales de calcio heterólogos que muestran sensibilidad a la conotoxina w y corrientes típicas de los canales de calcio de tipo N. Se ha encontrado que la alteración de las relaciones molares de \alpha_{1E-1}, \alpha_{2b} y \beta_{1-2} introducidas en las células para lograr niveles equivalentes de ARNm incrementaron significativamente el número de receptores por célula, la densidad de células, y afectaban a la K_{d} de la conotoxina \omega.
Las propiedades electrofisiológicas de estos canales producidas a partir de \alpha_{1E-1}, \alpha_{2b} y \beta_{1-2} se compararon con las de los canales producidas mediante la transfección transitoria de células HEK con ADN que codifica \alpha_{1E-1}, \alpha_{2b} y \beta_{1-3}. Los canales muestran una dependencia de tensión similar de activación, sustancialmente dependencia de tensión idéntica, cinética similar de activación y corrientes de cola que se podrían ajustar mediante una única exponencial. La dependencia de tensión de la cinética de inactivación era significativamente diferente en todas las tensiones examinadas.
En ciertas realizaciones, la célula eucariótica con un canal de calcio heterólogo se produce mediante la introducción de una primera composición en la célula que contiene al menos una transcripción de ARN que se traduce en la célula en una subunidad de un canal de calcio de tipo humano. En realizaciones preferidas, las subunidades que se traducen incluyen una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio de tipo humano. Más preferiblemente, la composición que se introduce contiene una transcripción de ARN que codifica una subunidad de \alpha_{1H} de un canal de calcio de tipo human y también contiene (1) una transcripción de ARN que codifica una subunidad \beta de un canal de calcio humano y/o (2) una transcripción de ARN que codifica una subunidad de \alpha_{2} de un canal de calcio de tipo humano. Se prefiere especialmente la introducción de un ARN que codifica una subunidad de \alpha_{1H}, una de \beta y una de \alpha_{2} de canales de calcio de tipo humano, y opcionalmente una subunidad \gamma de un canal de calcio de tipo humano. Los procedimientos para la transcripción in vitro de un ADN clonado y la inyección del ARN resultante en células eucarióticas se conocen bien en la técnica. Las transcripciones de cualquier ADN de longitud completa que codifica cualquiera de las subunidades de un canal de calcio de tipo humano se puede inyectar solo o en combinación con otras transcripciones en células eucarióticas para la expresión en las células. Se prefieren particularmente lo ovocitos de anfibios para la expresión de las transcripciones in vivo de los clones de ADNc de las subunidades de los canales de calcio de tipo humano proporcionados en esta memoria descriptiva. Los ovocitos de anfibios que expresan los canales de calcio heterólogos funcionales se han producido mediante este procedimiento.
Propiedades farmacológicas y electrofisiológicas
Como se describe en los ejemplos, el ácido nucleico que codifica \alpha_{1H-1} y el ácido nucleico que codifica \alpha_{1H-2} se ha expresado en células de mamífero y en ovocitos de anfibio. Se han estudiado las propiedades electrofisiológicas y farmacológicas.
Las propiedades biofísicas de los canales \alpha_{1H}^{2+} humanos recombinantes expresados en las células HEK293 y ovocitos de Xenopuus están de acuerdo, indicando que las propiedades biofísicas de los canales \alpha_{1H} de tipo humano recombinantes son independientes del sistema de expresión. Varias características biofísicas apoyan la conclusión de que la subunidad \alpha_{1H} de tipo humano es la formación de poros de un canal de tipo T. Las velocidades de activación, inactivación, y desactivación y la conductancia de los canales individuales de los canales que contienen \alpha_{1H} están dentro de los intervalos descritos para los canales de tipo T. El valor de conductancia de 9 pS medido en este estudio está cerca del valor determinado para los canales que contienen \alpha_{1G} de rata y es significativamente menor que los determinados para los canales HVA recombinantes. Además, los canales que contienen \alpha_{1H} conducen Ba^{2+} y Ca^{2+} igualmente bien, consistente con el hallazgo de que la conductancia de los canales de tipo T para Ba^{2+} y Ca^{2+} es casi equivalente en la mayoría de los tipos de células.
Los canales de Ca^{2+} que contienen \alpha_{1H} muestran un perfil farmacológico que difiere de los canales de HVA. Las corrientes mediadas por \alpha_{1H} están inhibidas por Ni^{2+}, amiloride, y mibefradil (Ro 40-5967), agentes mostrados que reducen las corrientes de LVA en numerosos tipos de células. Por el contrario, etosuximida, un agente antiepiléptico que inhibe las corrientes de LVA en algunos tipos de células, no tenían ningún efecto sobre las corrientes mediadas por \alpha_{1H}. Aunque los moduladores de los canales de Ca^{2+} de tipo T nimodipina y (-)-Bay K 8644 tienen poco efecto a una concentración de 1 \muM sobre los canales que contienen \alpha_{1H}, ambos compuestos producían una inhibición notable a una concentración de 10 \muM, consistente con sus efectos sobre los canales de tipo T en neuronas del hipotálamo de ratas (Alkaike y col., 1989). En resumen, las propiedades farmacológicas de los canales que contienen \alpha_{1H} descritas en esta memoria descriptiva tienen muchas similitudes con los canales de tipo T nativos estudiados en una diversidad de tipos de células. Los perfiles farmacológicos de Leo canales de tipo T varían considerablemente entre los tipos de células, y no se ha identificado ninguna característica farmacológica de sello de los canales de tipo T. estos resultados son consistentes con el hallazgo en esta memoria descriptiva de que múltiples subunidades \alpha_{1} son responsables de los perfiles farmacológicos de una familia de los canales de tipo LVA, o T.
Ensayos y usos clínicos de las células y canales de calcio Ensayos Ensayos para identificar compuestos que modulan la actividad de los canales de calcio
Entre los usos para las células eucarióticas que expresan de una forma recombinante una o más de las subunidades son ensayos para determinar si un compuesto de ensayo tiene actividad agonista o antagonista de los canales de calcio. Estas células eucarióticas también se pueden usar para seleccionar a partir de agonistas y antagonistas de los canales de calcio conocidos los que exhiben una especificidad de los subtipos de los canales de calcio particulares y por lo tanto seleccionar los compuestos que tienen potencial como agentes terapéuticos de enfermedad o tejido específico.
Se proporcionan los procedimientos in vitro para identificar compuestos, tales como agonista y antagonistas de los canales de calcio, que modulan la actividad de los canales de calcio que usan células eucarióticas que expresan los canales de calcio heterólogos de tipo humano.
En particular, los ensayos usan células eucarióticas que expresan subunidades de canales de calcio heterólogos de calcio humano codificados por ADN heterólogo proporcionado en esta memoria descriptiva, para seleccionar los agonistas y los antagonistas potenciales de los canales de calcio que son específicos para los canales de calcio de tipo humano y particularmente para seleccionar los compuestos que son específicos para los subtipos de los canales de calcio de tipo humano particulares. Dichos ensayos se pueden usar junto con los procedimientos de diseño de fármaco racional para seleccionar entre agonistas y antagonistas que se diferencian ligeramente en estructura, los que son particularmente útiles para modular la actividad de los canales de calcio de tipo humano y diseñar o seleccionar los compuestos que muestran actividades de agonistas y antagonistas de los canales de calcio de subtipos o tejidos específicos. Estos ensayos deben predecir exactamente la eficacia terapéutica relativa de un compuesto para el tratamiento de ciertos trastornos en seres humanos. Además, ya que se proporcionan las subunidades de los canales de calcio específicas de subtipos y tejidos, las células con canales de calcio recombinantes específicos de subtipos y tejidos se pueden preparar y utilizar en ensayos para la identificación de fármacos de subtipos y tejidos específicos de los canales de calcio de tipo humano.
Deseablemente, la célula hospedadora para la expresión de las subunidades de los canales de calcio endógenas del tipo o en una cantidad que sustancialmente interfiere con la detección de las subunidades de los canales de calcio heterólogos en ensayos de unión de ligandos o detección de la función de de los canales de calcio heterólogos tal como la generación de la corriente de calcinen ensayos funcionales. También, las células hospedadoras preferiblemente no deben producir canales de calcio endógenos que interactúan de maneta detectable con los compuestos que tienen, a concentraciones fisiológicas (generalmente nanomolares o picomolares) afinidad por los canales de calcio que contienen una o todas las subunidades de los canales de calcio de tipo humano proporcionados en esta memoria descriptiva.
Con respecto a los ensayos de ligandos para identificar un compuesto que tiene una afinidad para los canales de calcio, se emplean las células que expresan, preferiblemente, al menos una subunidad de \alpha_{1H} heteróloga. Las células eucarióticas transfectadas que expresan al menos una subunidad de \alpha_{1} se pueden usar para determinar la capacidad de un compuesto de ensayo para unirse específicamente a los canales de calcio heterólogos mediante, por ejemplo, la evaluación de la capacidad del compuesto de ensayo para inhibir la interacción de un compuesto marcado conocido para interactuar específicamente con los canales de calcio. Dichos ensayos de unión de ligandos se pueden realizar sobre células transfectadas o membranas preparadas de las mismas.
La capacidad de un compuesto de para unirse o de otra manera interactuar con las membranas que contienen los canales de calcio heterólogos que contienen la subunidad \alpha_{1H} se pueden determinar usando cualquier procedimiento adecuado, tal como los análisis de unión competitiva, tales como los estudios de Scatchard, en los que la capacidad de unión de tales membranas se determina en presencia y ausencia de una o más concentraciones de un compuesto que tiene afinidad conocida para el canal de calcio. Cuando es necesario, los resultados, se pueden comparar a un experimento de control diseñado de acuerdo a los procedimientos estándar conocidos por los expertos en la técnica. Por ejemplo, como control negativo, los resultados se pueden comparar a los de los ensayos de una preparación de membranas tratada idénticamente a partir de células hospedadoras que no se han transfectado con uno o más ácidos nucleicos que codifican las subunidades.
Los ensayos implican poner en contacto la membrana celular de una célula eucariótica recombinante que expresa al menos una subunidad de un canal de calcio de tipo humano con un compuesto de ensayo y midiendo la capacidad del compuesto de ensayo de unirse específicamente a la membrana o alterar o modular la actividad de un canal de calcio heterólogo en la membrana.
En las realizaciones preferidas, el ensayo utiliza una célula recombinante que tiene un canal de calcio que contiene una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio de tipo humano. En otras realizaciones preferidas, el ensayo usa una célula recombinante que tiene un canal de calcio que contiene una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio de tipo humano en combinación con una subunidad \beta de un canal de calcio humano y/o una subunidad \alpha_{2} de un canal de calcio de tipo humano. Las células recombinantes que expresan los canales de calcio heterólogos que contienen cada una de las subunidades de tipo humano \alpha_{1H} y opcionalmente una \beta y/o \alpha_{2}, y, opcionalmente, una subunidad \gamma de un canal de calcio de tipo humano se prefieren especialmente para uso en tales ensayos.
En ciertas realizaciones, los ensayos para identificar los compuestos que modulan la actividad de los canales de calcio se ejercen mediante la medición de la actividad de los canales de calcio de una célula eucariótica que tiene un canal de calcio heterólogo funcional cuando dichas célula se expone a una solución que contiene el compuesto de ensayo y un ión selectivo del canal de calcio y comparando la actividad medida de los canales de calcio con la actividad de los canales de calcio de la misma célula o una célula de control idéntica sustancialmente en una solución que no contiene el compuesto de ensayo. La célula se mantiene en una solución que contiene una concentración de iones de de los canales de calcio selectivos suficiente para proporcionar una corriente interna cuando se abre el canal. Las células recombinantes que expresan los canales de calcio que incluyen cada una de las subunidades de tipo humano \alpha_{1H}, \beta y \alpha_{2}, y, opcionalmente, una subunidad \gamma de una canal de calcio de tipo humano, se prefieren especialmente para uso en dichos ensayos. Los expertos en la técnica conocen los procedimientos para ejercer dichos ensayos. Por ejemplo, para procedimientos similares aplicados con ovocitos de Xenopus laevis y receptores de acetilcolina, véase Mishina y col., [(1985) Nature] 313: 364 y con dichos ovocitos y canales de calcio [véase, Noda y col (1986) Nature 322: 826: 828]. Para estudios similares que se han llevado a cabo con el receptor de acetilcolina véase, por ejemplo, Claudio y col., [(1987) Science 238: 1688-1694]. Los ensayos basados en transcripciones también se contemplan en esta memoria descriptiva.
Los canales de calcio recombinantes o heterólogos funcionales se pueden identificar mediante cualquier procedimiento conocido por los expertos en la técnica. Por ejemplo, se pueden usar los procedimientos electrofisiológicos para medir la corriente a través de una membrana selectiva de iones de una célula que se conocen bien. La cantidad y duración del flujo de iones de calcio selectivos mediante los canales de calcio heterólogos de una célula recombinante que contiene ADN que codifica una o más de las subunidades proporcionadas en esta memoria descriptiva se han medido usando un electrodo doble y las técnicas de pinzamiento zonal de las célula completa. Con el fin de mejorar la sensibilidad de los ensayos, se pueden utilizar los procedimientos conocidos para eliminar o reducir las corrientes no de calcio y las corrientes de calcio que se producen a partir de los canales de calcio endógenos, cuando se miden las corrientes de calcio a través los canales recombinantes. Por ejemplo, el DHP Bay K 8644 potencia específicamente la función de los canales de calcio de tipo L mediante el incremento de la duración del estado abierto de los canales [véase, por ejemplo, Hess, J. B. y col., (1984) Nature 311: 538-534]. La apertura prolongada de los canales da como resultado corrientes de calcio de magnitud y duración aumentada. Las corrientes de cola se pueden observar tras la repolarización de la membrana celular después de la activación de los canales iónicos mediante un comando de voltaje de despolarización. Los canales abiertos requieren un tiempo finito para cerrarse o "desactivarse" después de la depolarización y la corriente que fluye a través de durante este período se denomina corriente de cola. Debido a que el Bay K 8644 prolonga los acontecimientos de apertura en los canales de calcio, esto tiendo a prolongar estas corrientes de cola y hacerlas más pronunciadas.
En la práctica de estos ensayos, las células transfectadas estable o temporalmente o células inyectadas que expresan los canales de calcio de tipo humano dependiente de voltaje que contienen una o más de las subunidaes de un canal de calcio de tipo humano su puede usar deseablemente en ensayos para identificar agentes, tales como los agonistas y antagonistas de los canales de calcio, que modulan la actividad de los canales de calcio. El ensayo funcional de la actividad de los compuestos de ensayo, que incluyen los compuestos que tienen una actividad desconocida, de la actividad del agonista o antagonista para determinar si el compuesto de ensayo potencia, inhibe o de otra manera altera el flujo de los iones de calcio u otros iones a través de un canal de calcio se pueden llevar a cabo mediante (a) mantener una célula eucariótica que se transfecta o se inyecta para expresar un canal de calcio heterólogo funcional capaz de regular el flujo de los iones selectivos de los canales de calcio en la célula en un medio que contiene iones selectivos de los canales de calcio (i) en presencia de y (ii) en ausencia de un compuesto de ensayo; (b) mantener la célula en condiciones tales que los canales de calcio heterólogos están cerrados sustancialmente y los canales de calcio endógenos de la célula están sustancialmente inhibidos (c) despolarizar la membrana de la célula mantenida en la etapa (b) a un grado y durante una duración de tiempo suficiente para ocasionar (preferiblemente, solamente sustancialmente) los canales de calcio heterólogos para hacerse permeables a los iones selectivos de los canales de calcio; y (d) comparar la cantidad y duración del flujo de corriente en la célula en presencia del compuesto de ensayo al del flujo de corriente en la célula, o una célula sustancialmente similar en ausencia del compuesto de ensayo.
Los ensayos que de esta manera usan células, proporcionados en esta memoria descriptiva, que expresan los canales de calcio heterólogos funcionales y miden funcionalmente, tal como electrofisiológicamente, la capacidad de un compuesto de ensayo para potenciar, antagonizar o de otra manera modular la magnitud y duración del flujo de los iones selectivos de los canales de calcio, tales como Ca^{++} o Ba^{++}, a través del canal heterólogo funcional. La cantidad de corriente que fluye a través de los canales de calcio recombinantes de una célula se puede determinar directamente, tal como electrofisiológicamente, o mediante el control de una reacción independiente que se produce intracelularmente y que está directamente influenciada de una manera dependiente del ión calcio (u otro). Se puede utilizar cualquier procedimiento para valorar la actividad de un canal de calcio junto con las células y ensayos proporcionados en esta memoria descriptiva. Por ejemplo, en una realización del procedimiento para ensayar un compuesto para su capacidad de modular la actividad de los canales de calcio, la cantidad de corriente se mide por su modulación de una reacción que es sensible a los iones de los iones selectivos de los canales de calcio y utiliza una célula eucariótica que expresa un canal de calcio heterólogo y también contiene un elemento de control transcripcional unido operativamente para la expresión a un gen estructural que codifica una proteína indicadora. El elemento de control transcripcional usado para la transcripción del gen indicador es sensible en la célula a un ión selectivo de los canales de calcio, tales como Ca^{2+} y Ba^{2+}. Los detalles de dichos ensayos fundamentados transcripcionales se describen en la solicitud de patente internacional PCT Nº PCT/US91/5625, presentada el 7 de agosto de 1991, de propiedad común con la presente, que reivindica prioridad a la solicitud de Estados Unidos de propiedad y cesión común en tramitación con la presente nº de serie 07/563.751, presentada el 7 de agosto de 1990; véase también, la solicitud de patente internacional PCT publicada PCT US92/11090, de propiedad común con la presente, que corresponde con las solicitudes de Estados Unidos en tramitación con la presente números de serie 08/229.150 y 08/244.985. El contenido de estas solicitudes se incorpora en estas memorias descriptivas por referencia a ellas.
Propiedades biofísicas y farmacológicas de las subunidades \alpha_{1H}
Se transfectaron células HEK con ADN y se inyectaron ovocitos con ácido nucleico proporcionado en esta memoria descriptiva. La célula expresaba canales de calcio, que después se caracterizaban electrofisiológicamente y farmacológicamente. Estso resultados se describen en los ejemplos. Ambas variantes de ayuste formaban canales de calcio que mostraban propiedades asociadas a los canales de tipo T. Se observaron propiedades específicas de variantes.
Estas diferencias observadas en las secuencias de aminoácidos de \alpha_{1H- 1}, \alpha_{1H-2} dará como resultados notables diferencias en la susceptibilidad de estos receptores para la regulación celular, particularmente ya que la región observada de la divergencia de secuencias reside en la región de engarce citosólica entre los dominios I y II y la región de secuencia análoga en los canales de calcio activados por alta tensión se han implicado en la unión de proteínas reguladoras citosólicas. Las diferencias observadas en las propiedades biofísicas de \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2} son también probablemente indicadoras de las diferencias en al sensibilidad de estas dos subunidades de canales diferentes a los compuestos farmacéuticos. De este modo, parece probable que los canales de calcio activados por baja tensión que contienen o bien la subunidad \alpha_{1H-1} o \alpha_{1H-2} se someterá a diferentes controles reguladores, y diferentes perfiles de susceptibilidad a los compuestos farmacéuticos. Por ejemplo, la amiloride bloquea la corriente de tipo T en células de neuroblastoma con una CI_{50} de \sim50 \muM, mientras que en las neuronas del hipocampo la amiloride 300 \alpha_{1H- 1}, \alpha_{1H-2} dará reduce la corriente de tipo T en solamente 40%.
A este respecto, cada canal de \alpha_{1H} diferente es una diana de selección separada para el desarrollo de compuestos fármacos farmacéuticos. Los efectos diferenciales de fármacos sobre diferentes células neurales y en diferentes tejidos neurales se pueden entender basándose en diferentes patrones de expresión de \alpha_{1H-1} y/o \alpha_{1H-2} in vivo y proporcionará un medio de identificar fármacos específicos de cada subtipo y trastornos o afecciones asociados. La variación de secuencia observada en las subunidades \alpha_{1H} explica la variabilidad farmacológica observada de los canales de calcio de tipo T en diferentes tejidos nativos, proporcionando una herramienta útil para identificar candidatos fármacos terapéuticos.
Las diferencias en la funcionalidad de \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2} y la expresión en diferentes tejidos proporciona la base para usar células recombinantes que expresan canales de calcio que tienen o bien la subunidad \alpha_{1H-1} o \alpha_{1H-2}. Los agonistas y antagonistas capaces de afectar de manera diferencial los canales de calcio que contienen estas dos subunidades diferentes deben ser útiles para dirigir la intervención terapéutica en localizaciones neurales seleccionadas, por ejemplo, para neuronas cardiovasculares neuronas de tipo marcapasos cardiaco que expresan \alpha_{1H-2}.Los canales de calcio formados a partir de subunidades \alpha_{1H} se abren a pequeños cambios en el potencial de membrana, pero solamente permiten un influjo de Ca ^{2+} moderado antes de cerrarse. Permitiendo un influjo moderado de de iones divalentes los canales que contienen \alpha_{1H} canales es probable que:
(i)
participen en rutas que desencadenan cambios en la expresión de genes en respuesta a un cambio sutil en la diferencia de potencial de membrana, es decir, en tipos de células neuronales y no neuronales (por ejemplo, en la activación de células inmunes tales como células T, en activación de células de riñón e hígado en respuesta a cambios metabólicos;
(ii)
ejercen controles sutiles sobre la excitabilidad o accesibilidad global de neuronas para la transmisión sináptica, tal como en la determinación de qué neuronas responderán a los estímulos, y en qué grado, tal como en neuronas y ganglios periféricos;
(iii)
determinan el grado de respuestas neurales a los estímulos tales como dolor crónico;
(iv)
regulan la sensibilidad de las neuronas en centros neurales críticos de manera que las células neurales en estos centros están protegidas de los efectos adversos asociados a ondas completas excesivas (por ejemplo, en el marcapasos cardiaco);
(v)
actúan para establecer el patrón de estado constante de inactivación de neuronas en regiones diferentes del cerebro, (por ejemplo, en respuesta al sueño, sexo, emoción, depresión, fatiga y los otros estímulos o condiciones).
Electrofisiología de células que expresan los canales que contienen la subunidad \alpha_{1H-1} Expresión de los canales de \alpha_{1H-1} recombinantes
Después de la transfección transitoria de células HEK 293 con un ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H}, se observaron corrientes de Ba ^{2+} que se activaban e inactivaban rápidamente. Se midieron las corrientes de Ba ^{2+} (15 mM) inducidas mediante despolarizaciones de etapa a diversos potenciales de ensayo a partir de un potencial de mantenimiento de - 90 mV. Las corrientes se activaron a un potencial de ensayo de - 50 mV, con máximos entre - 20 y - 10 mV, y se invertían a un potencial de membrana más positivo que + 60 mV. Se obtuvieron resultados similares con
Ca ^{2+} (15 mV) como el vehículo de carga.
Un sello de los canales de LVA es su velocidad lenta de desactivación, que se refleja en una disminución de la función de de las corrientes de cola. La constante de tiempo de esta disminución es \sim10 veces más lenta para los canales de LVA (2-12 ms) que para los canales de HVA < 300 \mus. Se observó una lenta disminución de las corrientes de cola mediadas por \alpha_{1H-1} durante un período de \sim15 ms. Por el contrario que la disminución monoexponencial de las corrientes de cola para muchos canales de Ca ^{2+} de tipo T nativos, las corrientes de cola de los canales de \alpha_{1H-1} mostraban una disminución biexponencial. A un potencial de ensayo de - 20 mV, la velocidad de disminución del componente lento, que comprende 88,1 \pm 33,8% de la corriente total, era 2,1 \pm 1,06 ms (n = 6), que es similar a las observadas en
los canales de Ca ^{2+} de tipo T nativos. La velocidad de disminución del último componente era 0,64 \pm 0,21 ms (n = 6).
Los registros de match clamp de células enteras se realizaron en células HEK 293 que expresan transitoriamente la subunidad \alpha_{1H-1} humana. Las despolarizaciones por etapas inducían corrientes internas de Ba ^{2+} que se activan lentamente y se inactivan rápidamente (2,8 \pm 0,6 y 16,9 \pm 5,3 ms a - 20 mV). La curva de activación de \alpha_{1H-1} se desplaza a la izquierda (V1/2: - 29,5 mV) comparada con los canales de Ca ^{2+} de HVA. Las corrientes de cola de los canales que contienen \alpha_{1H-1} disminuyen rápidamente (\tau1, \tau2, \pm 1,0, 0,6, \pm 0,2 ms). La permeabilidad para Ba ^{2+} y Ca ^{2+} era prácticamente idéntica. La conductancia de los canales individuales, determinada con 110 mM Ba como vehículo de carga, es 9 ps.
La dependencia de la tensión de la activación de los canales de Ca ^{2+} que contienen \alpha_{1H-1} se determinó a partir del análisis de las corrientes de cola. Las amplitudes de las corrientes de cola normalizadas se representaron gráficamente como una función del potencial de ensayo y reveló una curva de activación bifásica que se ajustó mediante la suma de dos funciones de Boltzmann (Figura 1). Los potenciales para la activación semimáxima de los términos de Boltzmann individuales eran como sigue: V_{^{1}/_{2} \ A}: - 25,1 \pm 3 3,0 mV; y V _{^{1}/_{2} \ B}: + 25,5 \pm 3 9,9 mV (n = 11). Se ha reseñado previamente un valor similar a V 1/2 A para la dependencia de tensión de la activación de los canales de Ca ^{2+} de tipo T en la línea celular TT humana (-27 mV). El valor del segundo término de Boltzmann V _{^{1}/_{2} \ B} es algo similar al reseñado para los canales de Ca ^{2+} HVA. Usando un protocolo similar, las corrientes de cola de los canales de Ca ^{2+} HVA disminuyen con las constantes de tiempo de < 300 \mus, mientras que con \alpha_{1H} los más prominentes a los potenciales de ensayo cierran a V _{^{1}/_{2} \ B}. La disponibilidad de los canales de Ca ^{2+} que contienen \alpha_{1H} para la apertura dependía de la membrana para el potencial como se muestra en la Fig. 1. El potencial para la inactivación en estado constante semimáxima (V _{^{1}/_{2}}) era - 63,2 \pm 2,0 mV (n = 9).
La inactivación rápida de los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H} era altamente dependiente de la tensión. la disminución de corriente se describía mejor con una función exponencial variando las constantes de tiempo entre 42,2 \pm 7,8 y 8,8 \pm 3,8 ms a potenciales de membrana entre - 50 y + 30 mV (n = 6; datos no mostrados). La cinética de activación de los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H} eran también dependientes de la tensión con constantes de tiempo variando entre 9,9 \pm 4,7 y 0,9 \pm 0,3 ms para potenciales de membrana entre -50 y +30 mV (n = 8; datos no mostrados). Los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H} se inactivaban completamente durante la despolarización de 150 ms. La recuperación de la inactivación se produjo en un período de \sim3 s con un componente rápido (\tau = 37 \pm 9 ms; 16,5 \pm 4,6% de todos los canales) y un componente lento (\tau = 37 \pm 61 ms; 78 \pm 8,5% de todos los canales; n = 3; datos no mostrados). Para confirmar las propiedades biofísicas de los canales \alpha_{1H} recombinantes observados en los registros de células completas a partir de las células HEK 293, se ensayó la expresión funcional de \alpha_{1H} en ovocitos de Xenopus. Se observaron las corrientes sustanciales (< 1 \muA) después de la inyección de transcripciones \alpha_{1H \ solas}. La cinética de activación e inactivación, así como las propiedades de inactivación de estado constante, eran similares a las obtenidas en las células HEK 293 (véanse los ejemplos).
Las propiedades de los canales individuales de los canales de Ca ^{2+} \alpha_{1H} en las células HEK 293 se determinaron en los registros unidos a células con 110 mM de Ba ^{2+} como el vehículo de carga. Los registros de los canales individuales a un potencial de ensayo de - 30 mV a partir de un parche que contiene al menos tres \alpha_{1H} mostraban que las aperturas de los canales de producían en ráfagas y se agrupaban principalmente en el primer tercio del pulso despolarizante de 10 ms, especialmente con despolarizaciones más fuertes. Ocasionalmente, la actividad de los canales se ampliaba a lo largo del recorrido completo. El transcurso del tiempo de la corriente promediada conjunta registrada a - 30 mV en 110 mM de Ba ^{2+} era similar a la corriente de Ba ^{2+} de células enteras de \alpha_{1H} registrada a - 40 mV en 15 mM
Ba ^{2+}. Las corrientes se compararon a diferentes potenciales para compensar el desplazamiento en la curva de activación con potenciales más positivos debido al incremento en la concentración divalente. La relación de corriente - tensión unitaria produjo una conductancia de pendiente unitaria de 9,06 \pm 0,22 ps (N = 4).
Sumario de características electrofisiológicas
Se evaluaron las propiedades biofísicas de los canales de calcio que contenían la subunidad \alpha_{1H} humana. Los registros de células enteras de células HEK 293 transfectadas transitoriamente indican que al relación corriente - tensión, permeabilidad a Ca ^{2+} y Ba ^{2+}, cinética de activación, y conductancia de los canales individuales de los canales de calcio que contenían subunidades \alpha_{1H} eran similares a los de los canales de calcio de tipo T nativos en los tejidos. Las corrientes de cola de los canales \alpha_{1H} mostraron una disminución biexponencial, que muestra un componente más rápido y más lento. A potenciales de membrana muy negativos (- 150 a - 100 mV) el componente rápido (R: 200-450 \mus) dominaba el proceso de inactivación, mientras que a potenciales despolarizantes > - 50 mV dominaba el componente más lento (2-3 ms). En el potencial de membrana restante, es decir, \leq - 80 mV, ambos componentes contribuían de manera igual.
Propiedades farmacológicas
Las propiedades farmacológicas de los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} también eran consistentes con las observadas para los canales de calcio de tipo T nativos. De manera interesante, la sensibilidad de los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} a Cd ^{2+} o Amiloride era aproximadamente 10 veces menor cuando se expresaban en células HEK 293 que cuando se expresan en ovocitos de Xenopus.
Los datos indican que las subunidades de los canales de calcio de \alpha_{1H} humana tienen propiedades consistentes con los canales de calcio de tipo T nativos y, como tal, \alpha_{1H} representa un miembro en la familia de rápido crecimiento de los canales de calcio activados por baja tensión.
Ensayos para la diagnosis de los trastornos mediados por los canales de calcio de LVA y aplicaciones clínicas Aplicaciones clínicas
En relación con el tratamiento terapéutico de diversos estados patológicos, la disponibilidad del ADN que codifica las subunidades de de los canales de calcio de tipo humano permite la identificación de cualesquiera alteraciones en tales genes (por ejemplo, mutaciones) que pueden correlacionarse con la existencia de ciertos estados patológicos. Además, se hace posible la creación de modelos animales de dichos estados patológicos mediante la introducción específica de dichas mutaciones en los fragmentos de ADN sintéticos que después se pueden introducir en animales de laboratorio o en sistemas de ensayo in vitro para determinar los efectos de los mismos.
También, la selección genética se puede llevar a cabo utilizando las secuencias de nucleótidos como sondas. De este modo las muestras de ácidos nucleicos a partir de sujetos que tienen estados patológicos sospechosos de implicar alteración/modificación de una cualquiera o más de las subunidades de los canales de calcio se puede seleccionar con sondas apropiadas para determinar si existe cualquier anormalidad con respecto a cualquiera de los canales de calcio endógenos. De manera similar los sujetos que tienen una historia familiar de estados patológicos relativos a la disfunción de los canales de calcio se puede seleccionar para determinar si también ellos están predispuestos a dichos estados patológicos.
Los trastornos y para los que los ensayos de selección se pueden desarrollar y también para los que los compuestos candidatos para el tratamiento de los trastornos incluyen, pero no se limitan a: tratamientos cardíacos, tales como infarto de miocardio, arritmia cardíaca, insuficiencia cardíaca, y angina de pecho. Los compuestos identificados serán útiles en: (a) terapias complementarias para reestablecer el ritmo cardíaco normal y el rendimiento cardíaco después de lesión traumática, ataque cardíaco y otras lesiones cardíacas; (b) tratamientos de infarto de miocardio (MI), escenario después de infarto de miocardio y agudo. Los compuestos pueden ser eficaces para incrementar la fuerza contráctil cardíaca, tal como la medida por la presión diastólica final ventricular, y sin cambiar la presión sanguínea del ritmo cardíaco. En un escenario agudo los compuestos pueden ser eficaces para disminuir la formación de tejido cicatrizado, tal como la medida por deposición de colágeno o espesor de septos, y sin efectos cardiodepresores. Los compuestos identificados serán útiles para ensayos y para diagnosis y selección de compuestos serán útiles en relación con tratamientos vasculares e hipertensión, para identificar compuestos útiles en la regulación del tono muscular liso vascular, incluyendo vasodilatación y vasoconstricción. Tales compuestos se pueden usar en (a) tratamiento para reestablecer el control de presión sanguínea, por ejemplo, después de lesión traumática, cirugía y derivación cardiopulmonar, y tratamientos profilácticos diseñados para minimizar los efectos cardiovasculares de fármacos anestésicos; (b) tratamientos para mejorar los reflejos vasculares y control de presión sanguínea mediante el sistema nervioso autónomo. Otras afecciones incluyen, urológicas, para identificar los compuestos útiles en: (a) tratar y reestablecer la función renal después de cirugía, lesión traumática y reacciones de fármacos adversas; (b) tratar disfunciones de vejiga; y (c) toxicidad neuronal urémica e hipotensión en pacientes con hemodiálisis; afecciones reproductoras, para identificar los compuestos útiles en el tratamiento de: (a) trastornos de función sexual que incluyen impotencia; y (b) impotencia alcohólica (en control autónomo que puede estar sometido a controles de los canales T); hepática, para identificar los compuestos útiles en el tratamiento y reducción de la toxicidad neuronal y daño del sistema nervioso autónomo que se produce por el consumo excesivo agudo de alcohol; afecciones neurológicas para identificar compuestos útiles en el tratamiento de: (a) epilepsia y epilepsia diencefálica;
(b) enfermedad de parkinson; (c) control de temperatura aberrante, tal como anormalidades de temblor y secreción de las glándulas sudoríparas y suministro de sangre vascular periférica;
(d) funciones de la pituitaria e hipotalámicas aberrantes que incluyen la secreción anormal de noradrenalina, dopamina y otras hormonas; afecciones respiratorias, para identificar compuestos útiles en el tratamiento de respiración anormal, tal como, complicaciones después de cirugía de anestésicos; trastornos endocrinos para identificar compuestos útiles en el tratamiento de secreción aberrante de hormonas tales como tratamientos para la sobreproducción de hormonas que incluyen insulina, tiroxina, y adrenalina.
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Ejemplos
Los siguientes ejemplos se incluyen solamente con propósitos ilustrativos y no pretenden limitar el alcance de la invención.
Ejemplo 1 Aislamiento de ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H-1} de los canales de calcio de tipo humano
Usando ARNm y células TT, se usó un planteamiento de PCR degenerado para aislar ácido nucleico que codifica uña subunidad \alpha_{1H-1}. Se aisló el ácido nucleico que codifica una subunidad \alpha_{1H-1} y ácido nucleico que codifica una subunidad denominada \alpha_{1H-2}. Se expresaron el ácido nucleico se introdujo en células HEK 293 y ovocitos de Xenopus y canales de calcio activados por tensión. Estos canales muestran propiedades farmacológicas y electrofisiológicas consistentes con canales LVA, de tipo T nativos.
A. Materiales y procedimientos Amplificación de ácido nucleico
Se sintetizaron el siguiente cebador de PCR de 20 mer de hebra de polaridad positiva, que corresponde a los nucleótidos 1945-1964 de ADN que codifica una subunidad \alpha_{1E} humana:
AC(A/C/G/T)GTGTT(C/T)CAGATCCTGAC (cebador 1) SEQ ID Nº 4
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También se sintetizó un cebador de PCR de 22 nucleótidos de polaridad negativa, correspondiente a los nucleótidos 3919 a 3940 de \alpha_{1E} humana:
T(C/T)CCCTTGAAGAGCTG(A/C/G/T)ACCCC (Cebador 2) SEQ ID Nº 1
Los cebadores de polaridad positiva y polaridad negativa se usaron en las reacciones de amplificación con ADNc preparados a partir de células TT y Pfu ADN polimerasa (Stratagene Inc., San Diego, CA).
Condiciones de reacción: 95ºC durante 5 minutos seguido de 20 segundos de cada uno a 95ºC; después de 20 segundos a 42ºC; 2,5 minutos a 72ºC; y, 30 ciclos de 20 segundos cada uno a 95ºC seguido de 20 segundos a 50ºC y finalmente 2,5 minutos a 72ºC. El producto de reacción se denomina en esta memoria descriptiva (más adelante) "los productos de PCR originales".
Se diseñó un segundo cebador de oligonucleótido degenerado 5' correspondiente a una porción de la secuencia reseñada para C. elegans, cósmico C54D2 (Nº de acceso del Genebank U37548), como una porción de la secuencia de hebra de polaridad positiva que se alinea con una porción de la secuencia de ADn de la subunidad \alpha_{1E} humana entre el nucleótido 3598 y 3614. Este cebador tenía la siguiente secuencia:
GA(A/G)ATGATGATGAA(A/G)GT (cebador 3) SEQ ID Nº 10
El cebador 3 se usó en una reacción de amplificación jerarquizada con los productos de PCR originales y el cebador 2.
Aislamiento y caracterización de los clones: Se construyó una genoteca de ADNc recombinante en un vector fago \lambdagt10 usando ARN seleccionado de poli (A)^{+} a partir de la línea celular TT. Aproximadamente 1,5 x 10^{6} se seleccionaron con el fragmento PCR en alta rigurosidad (hibridación: formamida al 50%, 5X SSPE, 5X Denhardt's, SDS al 0,2%, 200 \mug/ml de ADN de esperma de arenque durante 16-18 horas a 42ºC; lavado: 6 lavados de 30 minutos cada uno en 0,1 X SSPE, SDS al 0,1% a 65ºC).
Análisis de transferencia Northern: Se seleccionaron tejidos múltiples en transferencias Northern usando 2 \mug de Poli (A) ^{+} ARN por banda (Clontech, palo Alto, CA). Las transferencias se sondaron a alta rigurosidad, como se ha descrito anteriormente, con fragmentos marcados generados a partir del ADNc de \alpha_{1H} de longitud completa, es decir, nucleótido - 6 a 7390.
Análisis de transferencia Western: Se aislaron membranas celulares (total) a partir de células HEK 293 que expresan diferentes subunidades \alpha_{1H}; se separaron las proteínas de membrana mediante SDS - PAGE; se transfirieron a nitrocelulosa; y, se transfirieron usando un antisuero anti \alpha_{1H} policlonal y tampón TBS - T. Las proteínas transferidas se visualizaron usando el kit de reactivo Lumiglo (KPL, Gaithersburg, MD) de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
B. Aislamiento de ARN
Células de carcinoma de tiroides medular humano (células TT; Nº de acceso CRL 1803 de ATCC) se hicieron crecer en medio DMEM suplementado con suero de ternera fetal al 10% a 37ºC en atmósfera de CO_{2} al 5% y ARN citoplásmico total se aisló a partir de cuarenta placas de 10 cm usando un kit de aislamiento de ARN "midi-prep" (Qiagen) según las instrucciones del fabricante. El protocolo supone el uso del detergente NP40 que lisa la membrana celular en condiciones suaves de manera que la membrana nuclear permanece intacta por lo tanto eliminando de manera incompleta las transcripciones de ARN ayustadas de la preparación.
Se aisló PoliA + ARN a partir de ARN citoplásmico total usando dos pases en una columna de oligo(dT)-celulosa. En resumen, 2-3 mg de ARN citoplásmico total se volvió a suspender en tampón NETS (NaCl 500 mM, EDTA 10 mM, Tris 10 mM, pH 7,4, SDS al 0,2%) y se pasó lentamente en una columna que contenía 0,5 g de oligo(dT)-celulosa (Collaborative Research) equilibrado en tampón NETS. La columna se lavó con 30 ml de tampón NETS y poliA + ARN se eluyó usando aproximadamente 3 ml de tampón ETS (EDTA 10 mM, Tris 10 mM, pH 7,4, SDS al 0,2%). La resistencia iónico del tampón que contiene poli A + ARN se ajustó hasta NaCl 500 mM y se pasó durante una segunda columna de oligo (dT) - celulosa esencialmente como se ha descrito anteriormente. Después de la elución de la segunda columna, el poliA + ARN se precipitó dos veces en etanol y se volvió a suspender en H_{2}O.
C. Construcción de genotecas
Se sintetizó ADNc de doble hebra (ADNdsc) según los procedimientos habituales [véase, por ejemplo, Gubler y col., (1985) Gene 25: 263-269; Lapeyre y col., (1985 37: 215-220). En resumen, la síntesis de la primera hebra de ADNc se inició usando poliA + ARN de células TT como molde y usando cebadores al azar y transcriptasa inversa de Virus de leucemia murina de Molones (MMLV - RT). La segunda hebra se sintetizó usando una combinación de la ADN polimeradsa de E. coli, ADN ligasa de E. coli y ARNasa H.
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Las regiones de ADN de hebra sencilla se convirtieron en ADN de doble hebra usando la ADN polimerasa de T4 que genera fragmentos de doble hebra de extremo romo. Adaptadores de sitio de endonucleasa de restricción
EcoRI:
5' CGTGCACGTCACGCTAG 3' (SEQ ID NO. 2)
3' GCACGTGCAGTGCGATCTTAA 5' (SEQ ID NO. 3)
se ligaron al ADNc de doble hebra usando un protocolo habitual (véase, por ejemplo, Sambrook y col., (1989) en: Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Capítulo 8). El ADN de doble hebra con los adaptadores EcoRI ligados se purificaron a partir de los adaptadores libres o no ligados mediante cromatografía en columna usando resina Sepharose CL-4B seguido de la selección por tamaño del ADNc en un gel de azarosa al 1,2%. Después de visualizar el ADN resuelto usando bromuro de etidio, se aislaron dos fracciones de ADNc, > 3,5 kb y 1,0-3,5 kb a partir del gel y se insertaron en el vector \lambdagt10.
El \lambdagt10 ligado que contenía la inserción de ADNc se empaquetó en los virones del fago \lambda in vitro usando el kit de empaquetamiento Gigapack III Gold (Stratagene, La Jolla, CA). Usando este procedimiento, se obtuvieron genotecas de fago de \sim ^{1,5 \ x \ 106} recombinantes para la fracción de ADNc > 3,5 kb y \sim 10 x 10^{6} recombinantes para la fracción de ADN entre 1,0 y 3,5 kb.
D. Aislamiento de ADN que codifica una porción de las subunidades \alpha_{1} de los canales de calcio de tipo humano
Se aisló el ADN que codifica una pequeña región de las subunidades \alpha_{1} de tipo humano codificado en las células TT usando amplificación degenerada a base de PCR (por ejemplo, véase Williams y col., J. Biol. Chem. 269: 22347-22357). Estos fragmentos amplificados se usaron para generar sondas de ADN para el aislamiento de ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano de longitud completa.
Como se ha indicado anteriormente, se sintetizaron dos conjuntos de nucleótidos degenerados basándose en las regiones flanqueantes del bucle II-III que se sabe que comparten un alto grado de identidad de secuencia contra las subunidades \alpha_{1} de los canales de calcio tipo humano conocidas: 1) dos oligonucleótidos degenerados complementarios a las regiones del bucle IIS5-IIS6 se sintetizaron como cebadores cadena arriba de 5' (SEQ ID números 4 y 5); y 2) dos oligonucleótidos degenerados complementarios a una porción del segmento transmembrana IIIS5 se sintetizaron como cebadores cadena debajo de 3' (SEQ ID números 6 y 7).
Estos fragmentos de oligonucleótidos degenerados se usaron como pares de cebadores en reacciones de amplificación de PCR jerarquizadas usando la ADN polimerasa de Pfu (Stratagene, La Jolla, CA) y las reacciones se realizaron de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Se colocaron las muestras en un termociclador disponible comercialmente (Perkin - Elmer) y las reacciones de amplificación se establecieron como sigue: 1 ciclo, 5 min a 95ºC; 5 ciclos, 20 segundos a 95ºC/20 segundos a 42ºC/2,5 min a 72ºC; 30 ciclos, 20 segundos a 95ºC/20 segundos a 50ºC/2,5 min a 72ºC; y 1 ciclo , 7 min a 72ºC. Los productos de ADN amplificados se sometieron a electroforesis sobre un gel de azarosa usando procedimientos convencionales.
E. Amplificación de ADN que codifica una porción de una subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano
Para amplificar el ADN que codifica una porción de una subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano, se sintetizaron tres oligonucleótidos degenerados (SEQ ID números 8-10) que comparten complementariedad parcial con una región del dominio III como cebadores en 5'. La región está abarcada dentro de todos los fragmentos que codifican \alpha_{1} amplificados de la sección C anterior. Se usaron dos oligonucleótidos basados en las secuencias en IIIS2 (SEQ ID números 8 y 10) como cebadores en 5' junto con los cebadores transmembrana 3'IIIS5 usados en las reacciones de PCR iniciales (SEQ ID Números 6 y 7 para amplificar el ADN que codifica una porción de la subunidad \alpha_{1H} de tipo humano usando los productos amplificados como moldes.
Los productos amplificados de ADN se subclonaron en el vector romo de PCR (Invitrogen), ADN plásmido se purificó a partir de transformantes aislados y se determinó la secuencia de ADN de cada inserción. Se identificó un fragmento de 340 pares de bases (SEQ ID Nº 11; nt 4271 a 4610 de la SEQ ID Nº 12) que comparte aproximadamente 55-60% de identidad de secuencia con las subunidades \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano conocidas. Este fragmento de ADN llamado PCR1, se usó como una sonda de ADN para aislar ADN que codifica una subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano.
F. Aislamiento y caracterización de hibridación de clones individuales y condiciones de lavado
La hibridación de ácidos nucleicos radiomarcados con ADN inmovilizado para el propósito de selección de genotecas de ADNc, transferencias de Southern de ADN, o transferencias Northern se realizaron de manera rutinaria en condiciones de hibridación convencionales (hibridación: formamida desionizada al 50%, 200 \mug/ml de ADN de esperma de arenque sonicado (nº de catálogo, Boehringer Mannheim Biochemicals, Indianápolis, IN) 5 x SSPE, 5 x Denhardt's, 42ºC; lavado: 0,2 x SSPE, SDS al 0,1%, 65ºC). Los receptores de SSPE y Denhardt's y la preparación de formamida desionizada se describen, por ejemplo, en Sambrook y col., (1989) Molecular cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, capítulo 8). En algunas hibridaciones, se usaron condiciones de menor rigurosidad ya que la formamida desionizada al 10% reemplazaba la formamida desionizada al 50% descrita para las condiciones de hibridación habituales.
Las condiciones de lavado para retirar la sonda no específica de los filtros era rigurosidad o bien alta, media, o baja como se describe más adelante:
1) alta rigurosidad: 0,1 x SSPE, SDS al 0,1%, 65ºC
2) media rigurosidad: 0,2 x SSPE, SDS al 0,1%, 50ºC
3) baja rigurosidad: 1,0 x SSPE, SDS al 0,1%, 50ºC
Se entiende que se pueden lograr rigurosidades equivalentes usando tampones, sales y temperaturas alternativos.
Aproximadamente se sembraron 1,5 x 10^{5} recombinantes de las inserciones que contienen genotecas de fago de células TT > 3,5 kb y se prepararon toma de muestras por duplicado a partir de cada placa. Las réplicas se sondaron con PCR1 radiomarcado usando condiciones de hibridación convencionales, se lavaron los filtros y se identificaron aproximadamente 100 placas positivas. Inicialmente, 5 positivas, \lambda1.201-\lambda1.205, se seleccionaron para la purificación y caracterización de placas.
La digestión con endonucleasa de restricción de ADN purificado aislado a partir de \lambda1.201-\lambda1.205 con EcoRI indicaba que el clon 1.201 contiene la inserción original de \sim350 pares de bases del fragmento PCR1, mientras que los clones 1.202, 1.203, 1.204 y 1.205 contienen inserciones de \sim1100, \sim4000, \sim2600 y \sim2200 nt, respectivamente.
F. Aislamiento de ADN que codifica una subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano y construcción de ADN que codifica una subunidad \alpha_{1H} de los canales de longitud completa 1. Lista de referencia de clones de \alpha_{1H} de tipo humano parciales
Las secuencias de ADNc de \alpha_{1H} de longitud completa se expone en la SEQ ID Nº 12. Una lista de clones de ADN parciales usados para caracterizar la secuencia de \alpha_{1H} y la posición de nucleótido de cada clon con relación a la secuencia de ADNc de \alpha_{1H} de longitud completa se muestra más adelante. El aislamiento y caracterización de estos clones se describen más adelante.
1.305 nt 1 a 3530 de la SEQ ID Nº 12
1.205 nt 2432 a 4658 de la SEQ ID Nº 12
1.204 nt 3154 a 5699 de la SEQ ID Nº 12
PCR1 nt 4271 a 4610 de la SEQ ID Nº 12
1.202 nt 4372 a 5476 de la SEQ ID Nº 12
1.203 nt 3891 a 7898 de la SEQ ID Nº 12
2. Caracterización de los clones
La secuenciación de ADN de cada inserción reveló que el clon 1.202 contiene la inserción de 1105 pares de bases correspondiente al nt 4372 a 5476 de la SEQ ID Nº 12; el clon 1.203 contiene la inserción de 4008 pares de bases correspondiente a nt 3891 a 7898 de la SEQ ID Nº 12; el clon 1.204 contiene la inserción de 2546 pares de bases correspondiente a nt 3154 a 5699 de la SEQ ID Nº 12; y el clon 1.205 contiene la inserción de 2227 pares de bases correspondiente a nt 2432 a 4658 de la SEQ ID Nº 12. Estos cuatro clones de ADN contienen secuencias de superposición que codifican un marco abierto de lectura de aproximadamente 6,6 kb que codifica una mayoría de la subunidad \alpha_{1H} de, incluyendo el extremo carboxi entero y el codón de parada traduccional en la fase.
El ADN que codifica el extremo 5' de la subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio de tipo humano se aisló usando un fragmento de endonucleasa de restricción EcoRI-NcoI de 548 pares de bases del extremo 5' del clon 1.205 (nt 2432 a nt 2979 SEQ ID Nº 12) para volver a seleccionar la genoteca de ADNc de células TT en condiciones de alta rigurosidad.
En resumen, el ADN que codifica el extremo amino del calcio \alpha_{1H} que contiene inserciones de > 3,5 kb se incubó con el fragmento de restricción purificado y se hibridó a 42ºC y se lavó en condiciones de alta rigurosidad como se ha descrito anteriormente.
Un clon recombinante 1.305, se identificó que contiene una inserción de 3.530 nucleótidos que comparte en su extremo 3' aproximadamente 1,1 kb de identidad de secuencia con el extremo 5' del clon 1.205 (\sim nt 2432 a nt 3530 SEQ ID Nº 12) y también contiene 2,4 kb de secuencia cadena arriba del sitio EcoRI localizado en el extremo 5' del clon 1.205 (nt 2433 a nt 2438 SEQ ID Nº 12). Esta secuencia codifica el codón de inicio ATG (nt 249 a nt 251 SEQ ID Nº 12) y 1049 aminoácidos del extremo amino de la subunidad \alpha_{1H} así como 248 pares de bases de la secuencia no traducida en 5', incluyendo un sitio de unión de ribosoma de consenso (nt 244 a nt 248 de la SEQ ID Nº 12.)
También se identificaron otros dos recombinantes (SEQ ID números 13 y 14) que comparten aproximadamente 1,1 kb de identidad de secuencia con el extremo 3' del clon 1.305 pero difiere en la longitud de la secuencia de ADN que corresponde al bucle intracelular extendido localizado entre los dominios I y II transmembrana.
3. Construcción de un clon de ADN que codifica \alpha_{1H} de longitud completa
Se pueden ligar porciones de estos clones de ADNc parciales para generar un ADNc de \alpha_{1H} de longitud completa que usa sitios de endonucleasa de restricción común compartidos entre los fragmentos que codifican \alpha_{1H}. Un clon que codifica \alpha_{1H} de longitud completa se construyó mediante 1) combinación del ADN que codifica el extremo 5' de \alpha_{1H} presente en el clon 1.305 con el clon 1.205 usando un sitio EcoRI común (nt 2433 a 2438 SEQ ID Nº 12); y 2) el clon resultante, que codifica el extremo amino de \alpha_{1H} se combinó con las secuencias terminales carboxi de \alpha_{1H} codificadas en el clon 1.203 que usa el sitio de endonucleasa de restricción EcoRV compartido entre el clon 1.205 y 1.203 (nt 4517-4522 de la SEQ ID Nº 12). La subunidad \alpha_{1H} de de los canales de calcio de tipo humano de longitud completa tiene 2353 restos de aminoácidos de longitud (SEQ ID Nº 12). La construcción de expresión se ensambló en pCDNA1 (Invitrogen, San Diego, CA) e incluía un sitio de unión de ribosoma de consenso (RBS) seguido de la secuencia que codifica \alpha_{1H} de longitud completa (véase, para una descripción de vectores basados en pcDNA 1 que contienen el RBS, véase, por ejemplo, en la solicitud PCT internacional, Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos nº de serie 08/149.097, la patente de Estados Unidos Nº 5.851.824, y la patente de Estados Unidos Nº 5.846.756). La construcción resultante se denominó pcDNA 1\alpha_{1H}RBS.
Ejemplo 2 Clonación de la subunidad \alpha_{1H-2} de Leo canales de calcio de tipo humano
Las corrientes de los canales de tipo T son heterogéneas entre los diferentes tipos de células, con perfiles variable de biofísicas y farmacológicas, y como se muestra en este y los siguientes ejemplos se pueden producir por la expresión de subtipos de la subunidad \alpha_{1} diferentes en células diferentes.
A. Clonación de \alpha_{1H-2}
Como se ha descrito anteriormente, los cebadores 1 y 2 de PCR, elegidos basándose en un alineamiento de las secuencias \alpha_{1A}-\alpha_{1E} en la región del bucle II/III citoplásmica central y el cebador 3 (GA(A/G)ATGATGATGAA(A/G)GT SEQ ID Nº 10) se eligió después de considerar las secuencias de C. elegans relacionadas con \alpha_{1} en el cósmico C54D2 con las secuencias de ácido nucleico que codifican \alpha_{1} de tipo humano.
Los ácidos nucleicos codificadores relacionados con \alpha_{1} se amplificaron en dos etapas a partir de poli(A) + ARN celular de TT, usando los cebadores 1 y 2 primero en una reacción de amplificación degenerada seguido del cebador 3 y cebador 2 en una amplificación de PCR jerarquizada. Esto da como resultado la amplificación de un fragmento de 340 nucleótidos que codifica una porción de la subunidad \alpha_{1H}. Este producto de amplificación se usó como una sonda para seleccionar la genoteca para aislar clones de ácido nucleico que codifican una subunidad \alpha_{1H} de longitud completa.
Usando una base de cebador sobre al secuencia de \alpha_{1H-1} y RT - PCR en diversos tejidos, las transcripciones con una supresión en fase con relación a \alpha_{1H-1} se identificaron y se aislaron a partir de la genoteca de células TT. Los fragmentos que extienden esta supresión se aislaron y, cuando se alinearon se emparejaron con la secuencia de \alpha_{1H-1} excepto para una supresión de 957 pares de bases. un clon de longitud completa, denominado \alpha_{1H-2} (véase la SEQ ID Nº 16), se construyó a partir de estos fragmentos, y se insertó en el pcADN1 con el RBS como para \alpha_{1H-1}. Las transcripciones de \alpha_{1H-2} se identificaron en todos los tejidos examinados.
El ácido nucleico que codifica \alpha_{1H-2} se produce por un ARN ayustado alternativamente y tiene 957 nucleótidos en supresión de fase con relación a \alpha_{1H-1}, como se detecta en los productos PCR de numerosos tejidos y células, incluyendo ADNc celular TT, ADNc de amígdala, ADNc de núcleo caudal, ADNc de putamen, ADNc de corazón, ADNc de riñón y ADNc de hígado. Los cebadores de PCR eran: (i) cebador de 5' correspondiente a la hebra de polaridad positiva de \alpha_{1H-1} en el nucleótido 1373 a 1393; (ii) cebador de 3' correspondiente a la hebra de polaridad negativa de \alpha_{1H-1} en el nucleótido 2657 a 2680.
Las SEQ ID números 12 y 15 muestran la secuencia de nucleótidos de \alpha_{1H-1}. La secuencia que codifica \alpha_{1H-1} comienza en el nucleótido 249 y termina en 7310. (SEQ ID números 12 y 15 difieren en consideraciones menores, por ejemplo, aminoácido 2230 (bases 6983-6985) es Asp (GAC) en al SEQ ID Nº 15 y Glu (GAA) en la SEQ ID Nº 12).
La SEQ ID Nº 16 muestra la secuencia de nucleótidos de la variante de ayuste \alpha_{1H-2}. La secuencia codificadora para \alpha_{1H-2} comienza en 249 y termina en 6353.
B. Sumario
Los clones de ácido nucleico que codifican el subtipo de los canales de calcio de tipo T \alpha_{1H} se aislaron a partir de células TT. Aunque similar en la topografía de la secuencia de nucleótidos global a otras subunidades de \alpha_{1} HVA previamente clonadas, la subunidad \alpha_{1H} contenía varias características inusuales, incluyendo un gran bucle de dominio I-II, ausencia del dominio de interacción de \alpha_{1} común, y propiedades de selectividad de iones alterados. Se identificaron dos isoformas de \alpha_{1H} denominadas \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2}. La primera \alpha_{1H-1} es la mayor de las dos, y la segunda \alpha_{1H-2} es la más pequeña de las dos que contienen una supresión de 957 nucleótidos en el bucle I-II con relación a \alpha_{1H-1}. La secuencia de nucleótidos de \alpha_{1H-1} se establece en la SEQ ID Nº 12 y Nº 15 y la de \alpha_{1H-2} se establece en la SEQ ID Nº 16. \alpha_{1H-2} contiene una supresión de 957 nucleótidos con relación a \alpha_{1H-1} que da como resultado una pérdida de 319 aminoácidos (aminoácidos 470-788 de \alpha1H-1) desde dentro del bucle intracelular entre los dominios I y II. La supresión de la variante de ayuste se identificó mediante PCR en todas las células y tejidos examinados. Éstos incluyen células TT, amígdala, núcleo caudal, putamen, corazón, riñón y células del hígado. En la expresión del cerebro es principalmente en la amígdala, núcleo caudal y putamen. Hígado, riñón y corazón tienen altos niveles. La secuencia codificadora para \alpha_{1H-1} comienza en el nucleótido 249 y termina en el nucleótido 7310 mientras que la secuencia codificadora para \alpha_{1H-2} comienza en el nucleótido 249 y termina en el nucleótido 6353.
Antisuero policlonal se construyó para el dominio de bucle intracelular II-III supuesto de la subunidad \alpha_{1H}. Seguido de la expresión transitoria en células HEK 293 se detectó una proteína del tamaño apropiado mediante SDS - PAGE y transferencia de Western. La caracterización funcional de los canales \alpha_{1H} de tipo humano se proporciona en el Ejemplo 3.
Ejemplo 3 Propiedades biofísicas y farmacológicas de los canales que contienen las subunidades \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2} A. Materiales y procedimientos
Los materiales y procedimientos para el estudio biofísico y farmacología de las subunidades de los canales de calcio se describen en este Ejemplo y el Ejemplo 4 más adelante con referencia a las subunidades previamente clonadas. Tales procedimientos u otros procedimientos similares conocidos por los expertos en la técnica se han usado para estudiar estas propiedades de las subunidades \alpha_{1H-1} como se describen en este Ejemplo.
Electrofisiología: Se transfectaron transitoriamente células HEK 293 con 6 \mug de pcDNA1 \alpha_{1H}RBS usando un procedimiento de fosfato de Ca ^{2+} convencional (véase, por ejemplo, el Ejemplo más adelante, también Williams y col (1992) Neuron, 8: 71-84, para procedimiento de transfección). pCMVCD4, un plásmido de expresión de CD humano, se incluyó en las transfecciones como un marcador que permite la identificación de células transfectadas. Antes de registrar, las células se lavaron con solución de Ringer de mamíferos, se incubaron durante aproximadamente 10 minutos en una solución que contiene una dilución 1/1000 de perlas Dyna M-450 CD4 (Dyna Inc., Lake Success, NY) y se volvieron a lavar con solución de Ringer de mamíferos para retirar el exceso de perlas. La expresión funcional de los canales de \alpha_{1H} en células transfectadas se evaluó 24-48 horas después de la transfección usando la técnica de match clamp de células enteras. Todos los registros se realizaron en células individuales a temperatura ambiente (19-24ºC). Las corrientes de células enteras se registraron usando un Axopatch - 200A (Axon Instruments, Foster City, CA) o un amplificador de patch clamp EPC-9 (HEKA elektronic, Lambretcht, Alemania), filtrado de paso bajo a 1 kHz (-3 dB, filtro Bessel de poste 8) y se digitalizó a una velocidad de 10 kHz, salvo que se establezca otra cosa. Las pipetas se fabricaron de vidrio de borosilicato (TW150, WPI, Sarasota, FI)), revestidas con Sylgard (Dow Corning Midland, MI), y tenía una resistencia de 1,1-2,0 M\Omega cuando se llena con solución interna. La resistencia en serie era 2-5 M\Omega y se usó generalmente compensación de resistencia en serie de 70-90%. La solución de pipeta contenía (en mM): 135 CsCl, 10 EGTA, 1 MfCl_{2}, 10 HEPES (pH 7,3, ajustado con Cs - OH). La solución externa contenía (en mM): 15 BaCl_{2} o CaCl_{2}, 150 Colina C1, 1 MgCl_{2}, 5 TEA-OH y 10 HEPES (pH 7,3, ajustado con HCl). Los registros de los canales individuales contenían (en mM): 110 BaCl_{2}, 10 HEPES (pH 7,3, ajustado con TEA-OH). El potencial de membrana de las células individuales HEK 293 se estableció a cero con una solución que contenía (en mM): 140 aspartato de K, 5 EGTA, y 10 HEPES (pH 7,3). Los potenciales de membrana en los registros de los canales individuales no estaban corregidos para la compensación del potencial de unión de líquido (+ 12 mV). Las corrientes de pérdida lineal y capacitivas residuales se restaron en línea usando un protocolo P/4 (registro de células enteras) o se escalaron rastreos de canales individuales sin actividad (registros de los canales individuales).
Fármacos: Mibefradil (Ro 40-5967) fue un regalo de F. Hoffman - LaROche. Nimodiina y (-)Bay-8644 se obtuvieron de Research Biochemiclas (Natick, MA). Las toxinas de péptidos w-CgTx GVIA (conotoxina) y \omega-CmTx MVIIC (conotoxina) se obtuvieron de Bachem (Torrance, A). Todos los compuestos restantes se obtuvieron de Sigma. Las soluciones madre se prepararon en dimetil sulfóxido (amiloride, nimodipina), etanol ((-) BayK-8644) o agua (verapamil, mibefradil, etosuximida, \omega-CmT x GVIA y \omega-CmTx MVIIC) y se almacenó a 4ºC. Los fármacos se prepararon recientes cada día experimental a partir de soluciones madre y se aplicaron mediante una bomba peristáltica a un caudal de < 0,5 ml/min. La concentración de disolvente máxima en al solución de ensayo final era < 0,1%. A estas concentraciones estos disolventes no tienen efecto sobre las corrientes mediadas por \alpha_{1H}.
Estudios de ovocitos de Xenopus: Ranas Xenopus laevis se compraron en Nasco (Fort Atkinson, Wisconsin). Los ovocitos se incubaron en solución libre de Ca ^{2+} que contenía NaCl 88 mM, MgSO_{4} 0,82 mM, NaHCO_{3} 2,4 mM, HEPES 10 mM y 1,5 mg/ml de colagenasa A (Worthington, Freehold NJ; Tipo 4, 1,5 horas y posteriormente Sigma, St. Louis, MO, Eipo 1A, 0,5 horas). Después del tratamiento de colagenasa, los ovocitos se transfirieron a solución de Ringer de rana que contenía NaCl 88 mM, KCl 1 mM, CaCl_{2} 0,91 mM, MgSO_{4} 0,82 mM, Ca(NO_{3})_{2} 0,33 mM, NaHCO_{3} 2,4 mM y HEPES 10 mM. En estas condiciones, no se requería la retirada manual de la capa de células de folículo. Los ovocitos se inyectaron con 50 ng (1 \mug/ml) de transcripciones in vitro que codifican la subunidad \alpha_{1H} y se incubaron durante 3-5 días a 19ºC antes de registrar. El medio de incubación era solución de Ringer de rana que contenía penicilina/estreptomicina (Sigma; 10 ml/l), gentamicina (Sigma; 1 ml/l y suero de caballo inactivado por calo al 5% (Gibco, Gaithersburg, MD). Se deslizaron los electrodos en un deslizador horizontal (Modelo P80, Sutter Instruments, Novato, CA); se llenaron con KCl 3 M; y se seleccionaron para resistencias en el intervalo entre 0,5-2,0 M\Omega. Los datos se registraron usando un GeneClamp 500; se digitalizaron a 1-5 kHz; y se almacenaron en discos magnéticos para análisis fuera de línea usando software pClamp o Axograph (Axon Instruments). Las corrientes de
Ba ^{2+} o Ca ^{2+} se registraron en una solución que contenía TEA-OH 36 mM, KOH 2,5 mM, manitol 75 mM, HEPES 10 mM y Ba(OH)_{2} o Ca(OH)_{2} 15 mM respectivamente a pH 7,3. Las corrientes se restaron las pérdidas de corriente usando el protocolo P/6. Para bloquear las corrientes de cloruro activadas por Ca ^{2+}, se incluyó ácido niflúmico (300 \muM) en los experimentos en los que se midió la permeabilidad relativa de los canales de \alpha_{1H} a Ba ^{2+} o Ca ^{2+}. Todos los valores se indican como media \pm D. E. salvo que se establezca otra cosa. Los fármacos (anteriores) se aplicaron mediante un sistema de infiltración de alimentación por gravedad. A las concentraciones usadas en esta memoria descriptiva, los disolventes no tenían efecto sobre las corrientes mediadas por \alpha_{1H}.
B. Electrofisiología 1. Propiedades corriente - tensión
La rápida inactivación de los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H-1} eran altamente dependientes de la tensión. La disminución de corriente se describió mejor con una función exponencial variando las constantes de tiempo entre 42,2 \pm 7,8 y 8,8 \pm 3,8 ms a potenciales de membrana entre - 50 y + 30 mV (N = 6; datos no mostrados). La cinética de activación de los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H-1} era también dependiente de la tensión variando las constantes de tiempo entre 9,9 \pm 4,7 y 0,9 \pm 0,3 ms para potenciales de membrana entre - 50 y + 30 mV (n = 8; datos no mostrados). Los canales de
Ca ^{2+} de \alpha_{1H-1} se inactivaron completamente durante la despolarización de 150 ms. La recuperación de la inactivación se produjo en un período de \sim3 s con un componente rápido (\tau = 37 \pm 9 ms; 16,5 \pm 4,6% de todos los canales) y un componente lento (\tau = 37 \pm 61 ms; 78 \pm 8,5% de todos los canales; n = 3; datos no mostrados). Para confirmar las propiedades biofísicas de los canales \alpha_{1H} recombinantes observados en los registros de células completas a partir de las células HEK 293, se ensayó la expresión funcional de \alpha_{1H} en ovocitos de Xenopus. Se observaron solas las corrientes sustanciales (< 1 \muA) después de la inyección de transcripciones \alpha_{1H}.
Se determinó la relación corriente - tensión para Ba ^{2+} o Ca ^{2+} a partir de pequeñas cantidades. Después de la transfección transitoria de las células HEK 293 con un ADN que codifica la subunidad \alpha_{1H-1}, se observaron las corrientes de Ba ^{2+} que se inactivaban e inactivaban rápidamente. Se midieron las corrientes de Ba ^{2+} (15 mM) inducidas mediante las despolarizaciones por etapas para diversos potenciales de ensayo a partir de un potencial de mantenimiento de - 90 mV. Las corrientes se activaron a un potencial de ensayo de - 50 mV, con máximos entre - 20 y - 10 mV, y se invirtieron a un potencial de membrana más positivo que + 60 mV. Se obtuvieron resultados similares con Ca ^{2+} (15 mM) como el vehículo de carga.
2. Dependencia de la tensión de la activación e inactivación
La Figura 1 muestra la dependencia de la tensión de la activación (moo) e inactivación en estado constante (h) de los canales de calcio de \alpha_{1H} de tipo humano expresados transitoriamente en células HEK. La dependencia de tensión de la activación (moo) se determinó a partir del análisis de las corrientes de cola. Las corrientes de cola se normalizaron con respecto a la corriente de cola de pico máximo obtenida a +60 mV y se representaron gráficamente (símbolos en círculos en blanco, media \pm error típico de la media; n = 11) contra el potencial de ensayo. Los datos se ajustaron mediante la suma de dos funciones Boltzman
m \infty = FA * [1 + exp (-(V_{ensayo} - V1/2, A)/KA)]1 + F_{B} *[1 + exp (-(V_{ensayo} - V_{^{1}/_{2}. \ B})/K_{B})]^{-1}, F_{A} = 0,67, V_{^{1}/_{2}} = -21,5 mV, k_{A} = 7,5, F_{B} = 0,33, V_{^{1}/_{2}}\cdot_{B} = 25,5 mV, k_{B} = 14,7. La inactivación en estado constante (h \infty) se determinó a partir de un potencial de mantenimiento de - 100 mV mediante un pulso de ensayo a - 20 mV (p1), seguido de un prepulso de 20 segundos desde - 100 mV a - 10 mV en decrementos (p H antiguo) precedido de un segundo pulso de ensayo a - 20 mM (p2). Las amplitudes de corrientes normalizadas se representaron gráficamente (símbolos de círculo en negro, media \pm error típico de la media; n = 9) contra el potencial de mantenimiento. Los datos se ajustaron mediante una función de Boltzmann h \infty = [1 + exp ((V_{mantenida} - V1/2, A)/k)]^{-1}, V_{^{1}/_{2}} = 63,9 mV, k = 3,9 mV.
3. Desactivación de las corrientes de cola
Se estudiaron los perfiles de desactivación de las corrientes de cola para los canales de calcio de \alpha_{1H} en células HEK transfectadas de manera transitoria. Un sello de los canales de LVA es su velocidad lenta de desactivación, que se refleja en un disminución de actuación de las corrientes de cola. La constante de tiempo de esta disminución es \sim10 veces más lenta para los canales de LVA (2-12 ms) que para los canales de HVA < 300 \mus. Se observó una lenta disminución de las corrientes de cola mediadas por \alpha_{1H} durante un período de \sim15 ms. Al contrario que la disminución monoexponencial de las corrientes de cola reseñadas para muchos canales de Ca ^{2+} nativos, las corrientes de cola de los canales de \alpha_{1H-1} mostraron una disminución biexponencial. A un potencial de ensayo de - 20 mV, la velocidad de disminución del componente lento, que comprende 88,1 \pm 33,8% de la corriente total, era 2,1 \pm 1,06 ms (n = 6), que es similar a las observadas en los canales de Ca ^{2+} de tipo T nativos. La velocidad de disminución del componente más rápido era 0,64 \pm 0,21 ms (n = 6). La lenta disminución de las corrientes de cola mediadas por \alpha_{1H} se observaron durante un período de 15 ms.
La dependencia de tensión de la activación de \alpha_{1H} que contiene los canales de Ca ^{2+} se determinó a partir del análisis de las corrientes de cola. Las amplitudes de las corrientes de cola normalizadas se representaron gráficamente como una función de potencial de ensayo y reveló una curva de activación bifásica que se ajustó mediante la suma de dos funciones Boltzmann (Figura 1). Los potenciales para la activación semimáxima de los términos de Boltzmann individuales eran como sigue: V _{^{1}/_{2} \ A}: - 25,1 \pm 3 3,0 mV; y V _{^{1}/_{2} \ B}: + 25,5 \pm 3 9,9 mV (n = 11). Se ha reseñado previamente un valor similar a V _{1/2 A} para la dependencia de tensión de la activación de los canales de Ca ^{2+} de tipo T en la línea celular TT humana (-27 mV). El valor del segundo término de Boltzmann V _{^{1}/_{2} \ B} es algo similar al reseñado para los canales de Ca ^{2+} HVA. Usando un protocolo similar, las corrientes de cola de los canales de Ca ^{2+} HVA disminuyen con las constantes de tiempo de < 300 \mus, mientras que con \alpha_{1H} los más prominentes a los potenciales de ensayo cierran a V _{^{1}/_{2} \ B}. La disponibilidad de los canales de Ca ^{2+} que contienen \alpha_{1H} para la apertura dependía de la membrana para el potencial como se muestra en la Figura 1. El potencial para la inactivación en estado constante semimáxima (V _{^{1}/_{2}}) era - 63,2 \pm 2,0 mV (n = 9).
4. Cinética de la activación e inactivación de los canales de \alpha_{1H}
La Figura 2 muestra la cinética de activación de (Figura 2A) e inactivación (Figura 2B) de los canales de calcio de \alpha_{1H}. La cinética de activación e inactivación se determinaron a partir de pequeñas cantidades de corrientes mediante ajuste de una función exponencial para aumentar (Figura 2A) o disminuir (Figura 2B) la fase de la corriente. la dependencia de la tensión para la activación e inactivación sigue aproximadamente una función exponencial.
5. Recuperación de la inactivación
Se evaluó la recuperación de los canales de \alpha_{1H} expresados de manera transitoria en células HEK 293 a partir de la inactivación inducida usando un protocolo de doble pulso usando la despolarización de pulsos hasta - 20 mV. La fracción de los canales recuperados se representó gráficamente contra los intervalos entre pulsos y los puntos de datos se ajustaron mediante una función biexponencial en la forma 1 = Ao + A1 exp (-t/\tau1) + A2 exp (-t/\tau2). \tau1:35 ms, A1: 0,165, \tau2:337 ms, A2: 0,788.
6. Registro de los canales de calcio a partir de los canales de calcio \alpha_{1H} de tipo humano
Se determinaron las propiedades de los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H} en células HEK 293 en los registros unidos a células con Ba ^{2+} 110 mM como el vehículo de carga. Los registros de los canales individuales a un potencial de ensayo de - 30 mV a partir de un parche a que contiene al menos tres \alpha_{1H} mostraban que las aperturas de los canales de producían en ráfagas y se agrupaban principalmente en el primer tercio del pulso despolarizante de 10 ms, especialmente con despolarizaciones más fuertes. Ocasionalmente, la actividad de los canales se ampliaba a lo largo del recorrido completo. El transcurso del tiempo de la corriente promediada conjunta registrada a - 30 mV en 110 mM de Ba ^{2+} era similar a la corriente de Ba ^{2+} de células enteras de \alpha_{1H} registrada a - 40 mV en 15 mM
Ba ^{2+}. Las corrientes se compararon a diferentes potenciales para compensar el desplazamiento en la curva de activación con potenciales más positivos debido al incremento en la concentración divalente. La relación de corriente - tensión unitaria produjo una conductancia de pendiente unitaria de 9,06 \pm 0,22 ps (n = 4).
C. Caracterización biofísica de los canales de calcio de \alpha_{1H} de tipo humano en ovocitos de Xenopus 1. Visión general
Los canales de calcio de \alpha_{1H} de tipo humano se caracterizaron además mediante la expresión transitoria de ARNm de \alpha_{1H} en ovocitos de Xenopus. La inyección de ARNm de \alpha_{1H-1} solo dio como resultado la expresión de grandes corrientes, es decir, típicamente > 1 \muA cuando se registra en Ba ^{2+} 15 mM. Los canales de \alpha_{1H} se activaron a aproximadamente - 50 mV con respuestas máximas entre - 30 mV y - 40 mV, que es consistente con los canales activados por baja tensión. La permeabilidad de los canales de \alpha_{1H} a Ca ^{2+} era ligeramente mayor que a Ba ^{2+}. Al contrario que con el canal de alta tensión, los canales de \alpha_{1H} se activaban lentamente (\tau = 13,4 \pm 1,9 ms en el máximo de la curva I-V, 12,2 \pm 1,5 ms a - 20 mV). Los canales de \alpha_{1H} expresados en ovocitos eran sensibles a la inactivación de estado constante a potenciales de membrana relativamente negativos (V1/2 = 64,5 \pm 1,0 mV) y se recuperaron rápidamente de la inactivación (\tau de recuperación = 330 ms). Estos valores eran muy similares a los obtenidos a partir de los canales de \alpha_{1H} expresados en las células HEK 293. Las corrientes de Ba ^{2+} a lo largo de los canales de \alpha_{1H} en ovocitos eran sensibles al bloqueo mediante Ni ^{2+} y Cd con valores de CI_{50} de 6,3 \muM y 8,3 \muM, respectivamente. De los antagonistas ensayados, solamente amiloride (CI_{50} = 2 \muM) inhibían de manera notable las corrientes de ba ^{2+} mediadas por \alpha_{1H} a través de los canales de \alpha_{1H} expresados en ovocitos. Tomados juntos los resultados indican que \alpha_{1H} representa una subunidad de los canales de calcio activados por baja tensión.
2. Propiedades de activación e inactivación de las corrientes de Ba ^{2+} de los canales de \alpha_{1H}
Las relaciones corriente - tensión para las corrientes Ba ^{2+} (15 mM) se registraron a partir de ovocitos individuales inyectados con ARNm que codifica la subunidad \alpha_{1H} de tipo humano. Las corrientes de Ba ^{2+} se activaron a un potencial de membrana de aproximadamente - 50 mV y máximos a - 30 mV. Las velocidades de inactivación relativas de los canales de \alpha_{1H} de tipo humano se investigaron en diferentes preparaciones de ovocitos y se compararon con las velocidades de inactivación de los canales de \alpha1A-2\alpha2b\delta\beta4a; canales \alpha1B-1\alpha2b\delta\beta3a; y canales \alpha1E-3\alpha2b\delta\beta1b. Las corrientes de Ba ^{2+} se indujeron usando un comando de tensión en el intervalo de - 120 mV a - 30 mV para los canales de \alpha_{1H}, o - 90 mV a 0 mV o + 10 mV para los otros canales que contienen \alpha_{1A}, \alpha_{1B} y \alpha_{1E} respectivas. Los resultados presentados muestran el intervalo de activación relativamente electro negativo de los canales de \alpha_{1H} en comparación con los canales de calcio \alpha1A-2\alpha2b\delta\beta4a, \alpha1B-1\alpha2b\delta\beta3a y \alpha1E- 3\alpha2b\delta\beta1b.
3. Propiedades de permeabilidad, inactivación y biofísicas de \alpha_{1H} expresada en ovocitos de Xenopus
Las propiedades de permeabilidad e inactivación de los canales de \alpha_{1H} se investigaron en ovocitos mediante el estudio de las corrientes de Ba ^{2+} y Ca ^{2+}. Los resultados muestran que las corrientes de Ba^{2+} no eran significativamente mayores que las corrientes de Ca ^{2+} en ovocitos que expresan la subunidad \alpha_{1H}. Los resultados presentados en las curvas de inactivación de estado constante normalizadas para las corrientes de Ba ^{2+} mediadas por \alpha_{1H}, donde V1/2 se calculó para que fueran iguales a un valor de - 64,5 \pm 1,0 mV. Se usó un protocolo de doble pulso, es decir, con incremento de intervalos de tiempo entre pulsos para examinar la recuperación de los canales de \alpha_{1H} de la inactivación. Los resultados de la recuperación relativa de los canales representados gráficamente contra el intervalo entre pulsos (ms) y demostraron que las corrientes de los canales de \alpha_{1H} se recuperaron rápidamente de la inactivación, con una constante de tiempo media de 330 ms (n = 5).
a. Cadmio, níquel, amiloride y mibefradil antagonizan las corrientes de Ba ^{2+} de los canales de \alpha_{1H} de tipo humano
Cd ^{2+} se encontró que antagoniza las corrientes de \alpha_{1H} de tipo humano de bajo umbral en ovocitos en una concentración diferente de Cd ^{2+}, una CI_{50} de 10,3 \muM como se calculó. Ni ^{2+} también se encontró que antagoniza los canales de \alpha_{1H} de tipo humano de bajo umbral en ovocitos, y también de una manera dependiente de la concentración. Se ensayó la inhibición de las corrientes de Ba ^{2+} producidas mediante concentraciones diferentes de Ni ^{2+} (n = 4 experimentos; n_{H} = 0,84). La CI_{50} calculada para Ni ^{2+} era 6,3 \muM. El antagonismo por Ni ^{2+} y Ba ^{2+} era ampliamente reversible.
Además, cada uno de Amiloride y Midefrabil bloqueaban las corrientes de Ba ^{2+} de bajo umbral de una manera dependiente de la concentración que proporcionaba una CI_{50} calculada de 1,6 \muM para Amiloride; media de 7 experimentos, n_{H} = 0,62) y media de 2,1 \muM para Midefradil; media de 4 experimentos, n_{H} = 0,71).
Estos resultados demuestran que la incorporación de de una subunidad \alpha_{1H} en los canales de calcio funcionales en las membranas de células, transmite las propiedades electrofisiológicas y biofísicas de los canales de calcio, particularmente de tipo T, activados por baja tensión sobre aquellos canales. Los canales que contienen \alpha_{1H} se activaron rápidamente a potenciales de membrana relativamente negativos (es decir, V _{1/2} = 64,5 mV), y también se activaron rápidamente (es decir, \tau = 12,2 ms a - 20 mV). Se observó la actividad de apertura de los canales máxima a un potencial de membrana de - 30 mV. estos canales también mostraron aproximadamente una permeabilidad igual para Ca ^{2+} y Ba ^{2+}.
Las propiedades farmacológicas de los canales que contienen \alpha_{1H} también eran consistentes con aquellas de los canales de calcio de bajo umbral. Están bloqueados por Ni ^{2+} (CI_{50} = 6,3 \muM), Cd ^{2+} (CI_{50} = 10,3 \muM), Amiloride (CI_{50} = 16,1 \muM) y Mibefradil (CI_{50} = 2,1 \muM).
D. Comparación de los canales de calcio que contienen las subunidades de \alpha_{1H} de tipo humano expresadas en células HEK 293 con las expresadas en ovocitos de Xenopus
La Tabla 4 resume las propiedades biofísicas de: (i) canales de calcio que contienen \alpha_{1H-1} de tipo humano expresados en células HEK 293, (ii) canales que contienen \alpha_{1H-1} de tipo humano expresados en ovocitos de Xenopus, y (iv) canales de calcio de tipo T humanos expresados en diversos tejidos.
TABLA 4
4
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E. Propiedades de canales de calcio que contienen subunidades \alpha_{1H-2} Discusión del sumario
Las propiedades biofísicas de \alpha_{1H-2}, reveló un desplazamiento en el V _{^{1}/_{2}} de la inactivación isocrónica (20 segundos) a - 73 mV comparado con un V _{^{1}/_{2}} de - 62,5 mV para \alpha_{1H-1}. La V _{^{1}/_{2}} de \alpha_{1H-2}, de este modo muestra un intervalo más cercano a los valores de V _{^{1}/_{2}} reseñados para ciertos canales de calcio de tipo T (Huguenard (1996) Annual Rev. Physiol. 58: 329-348). Por ejemplo, en condiciones de registro similares la V_{^{1}/_{2}} de inactivación isocrónica para los canales T en las neuronas del asta dorsal (DHN) del movimiento se reseña que es - 82 mV, mientras que la V _{^{1}/_{2}} registrado en las neuronas geniculadas laterales (LGN) dorsales del movimiento es - 64 mV. Además, la V _{^{1}/_{2}} de \alpha_{1H-2} más estrechamente aproxima la V _{^{1}/_{2}} en DHN de ratas nativas al valor para \alpha_{1H-1}, que, en su lugar, se hace más cercano al valor registrado para los canales de calcio de tipo T en LGN. De este modo, las diferencias observadas de la secuencia de aminoácidos de las subunidades \alpha_{1H-1} y \alpha_{1H-2} parece que está ligado a las diferencias en al distribución de tejidos de estas dos formas diferentes del canal de \alpha_{1H-1}. Estos resultados también proporcionan la base para entender los amplios intervalos diferentes observados de valores que se han reseñado para la inactivación de V _{^{1}/_{2}} de los canales de calcio de tipo T (- 100 a - 50 mV) en tejidos diferentes (véase, por ejemplo, Huguenard (1996) Annual Rev. Physiol. 58: 329-348).
F. Sumario de las propiedades biofísicas de los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} de tipo humano
La Tabla 5 resume las propiedades biofísicas de los canales de calcio que contienen las subunidades \alpha_{1H} de tipo humano.
TABLA 5
6
G. Perfil farmacológico de los canales de calcio de \alpha_{1H}
Se ensayo la sensibilidad de los canales de Ca ^{2+} de \alpha_{1H} expresados en células HEK 293 a varios agentes conocidos que se sabe que actúan en VGCCs (tabla más adelante). Las corrientes mediadas por \alpha_{1H} eran 10 veces más sensibles a Ni ^{2+} (CI_{50} = 6,6 \muM) que a Cd ^{2+} (CI_{50} = 104 \muM). Las corrientes también se inhibían por los antagonistas de los canales de tipo T amiloride (CI_{50} = 167 \muM) y mibefradil (51,0 \pm 10,0% a 1 \muM; n = 5). Por el contrario, el antagonista de los canales de tipo T eoxsuximide producía poca inhibición de las corrientes mediadas por \alpha_{1H} (7,2 \pm 1,8% de inhibición a 300 \muM; n = 5). El inhibidor de los canales de calcio verapamil, el antagonista de tipo L nimopidine, y el agonista de tipo L (-)Bay K 8644 tenía poco efecto sobre los canales de \alpha_{1H} a una concentración de 1 \muM. Una concentración más alta (10 \muM) de nimodipina o (-)Bay K 8644 producía una notable inhibición (43,7 \pm 4,1%, n = 4, y 18,1 \pm 9,1%, n = 5, respectivamente). Las toxinas de péptido \omega- CgTx GVIA y \omega-CmTx MVIIC a una concentración de 1 \muM proporcionó poca o ninguna inhibición de las corrientes mediadas por \alpha_{1H}.
Los estudios farmacéuticos revelan que el siguiente orden de graduación de potencia para la inhibición que contienen \alpha_{1H-1}: Ni ^{2+} (CI_{50} = 6,6 \muM) \approx mibefradil (51% a 1 \muM) > Cd ^{2+} (CI_{50} = 167 \muM) >> Etosuximide (7% a 300 \muM). Nimodipine, Verapamil, \omega-CgTx GVIA y \omega-CmTx MVIIC tiene poco efecto (0-17%) a una concentración de 1 \muM. Estos hallazgos demuestran que los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} tienen propiedades correspondientes a canales de calcio de LVA, o de tipo T nativos.
La tabla 6 resume el perfil farmacológico de los canales de calcio que contienen \alpha_{1H} expresados en células HEK 293. Con la excepción de \omega-CmTx MVIIC, en todos los casos el vehículo de carga era Ba ^{2+} 15 mM. En el caso de \omega-CmTx MVIIC el vehículo de carga era Ba ^{2+} 2 mM debido a que \omega-CmTx MVIIC era un inhibidor más eficaz a concentraciones divalentes menores Los valores para el % de bloqueo son media \pm D E (n). Los valores de CI_{50} se calcularon a partir de los datos de ajuste de curva sigmoidea (Prism, Graphpad, Inc.) para los puntos de datos de 3 a 6 determinaciones.
TABLA 6
7
Ejemplo 4 Expresión recombinante de las transcripciones de ADNc y ARN que codifican las subunidades de los canales de calcio neurales de tipo humano en células de mamífero
Los procedimientos y ensayos descritos en este ejemplo, se pueden emplear usando el ácido nucleico que codifica una subunidad \alpha_{1H} en lugar de las subunidades \alpha_{1} ejemplificadas más adelante. De particular interés son las células que expresan la subunidad \alpha_{1H} sola, como hormonas, monómeros o multímeros, o en combinación con las subunidades \alpha_{2} seleccionadas.
A. Expresión recombinante de ADNc de la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales tipo humano en células DG44 1. Transfección estable de células DG44
Las células DG44 [células de ovario de hámster chino dhfr; véase, por ejemplo, Urlaub, G. y col., (1986) Som. Cell Molec. Genet. 12: 555-566] obtenidas de Lawrence Chasin en la Universidad de Columbia se transfectaron establemente mediante los procedimientos de precipitación con CaPO_{4} [Wigler y col., (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 76: 1373-1376] con el vector pSV2dhfr que contenía el ADNc de la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales de tipo humano para la expresión/selección policistrónica en células transfectadas. Se desarrollaron los transfectantes en medio DMEM al 10% sin hipoxantina o timidita con el fin de seleccionar las células que habían incorporado el vector de expresión. Se establecieron doce líneas celulares transfectantes según indicaba su capacidad para sobrevivir en este medio.
2. Análisis de la expresión de ADNc de la subunidad \alpha_{2} en las células DG44 transfectadas
Se extrajo el ARN total según el procedimiento de Birnboim [(1988) Nuc. Acids Res. 16: 1487-1497] a partir de cuatro líneas celulares de DG44 que se habían transfectado establemente con pSV2dhfr que contenía el ADNc de la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales de tipo humano. Se separó el ARN (\sim15 \mug por banda) en un gel de azarosa al 1% formaldehído, se transfirió a nitrocelulosa y se hibridó al ADNc de \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales de tipo humano cebado aleatoriamente (hibridación: formamida al 50%, SSOE 5 x, solución de Denhardt 5 x, 42ºC; lavado: SSPE 0,2 x, SDS al 0,1%, 65ºC.) El análisis de transferencia de Northern del ARN total de cuatro de las líneas celulares de DG44 que se habían transfectado establemente con pSV2dhfr que contenía el ADNc de la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales de tipo humano reveló que una de las cuatro líneas celulares contenía el tamaño de ARNm de hibridación esperado para la transcripción del ADNc de la subunidad \alpha_{2}. (500 nt en función del tamaño del ADNc) cuando se desarrolla en presencia de butirato de sodio 10 mM durante dos días. El butirato induce no específicamente la transcripción y a menudo se usa para inducir el promotor temprano de SV40 [Gorman, C. y Howard, B. (1983) Nucleic Acids Res. 11: 1631]. Esta línea celular, 44\alpha_{2}-9, también producía espacies de ARNm más pequeñas (varias especies) y mayores (6800 nt) que el tamaño esperado para la transcripción del ADN de \alpha_{2} de (5000 nt) que se hibridó a la sonda a base de ADNc de \alpha_{2}. Las transcripciones de 5000 y 6800 nt producidos mediante este transfectante debe contener la subunidad \alpha_{2} entera que codifica la secuencia y por lo tanto debe producir una proteína de la subunidad \alpha_{2} de longitud completa. Una transcripción de 8000 nucleótidos que se hibrida débilmente estaba presente en las células de DG44 no transfectadas y transfectadas. Aparentemente, las células DG44 transcriben un gen de la subunidad de \alpha_{2} de los canales de calcio o similar a niveles bajos. El nivel de expresión de esta transcripción de la subunidad \alpha_{2} endógena no parecía estar afectada mediante la exposición de las células al butirato antes del aislamiento de ARN para análisis de northern.
Se extrajo la proteína total de tres de las líneas celulares de DG44 que se habían transfectado establemente con pSV2dhfrque contenía el ADNc de la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales de tipo humano. Aproximadamente se sonicaron 10^{7} células en 300 \mul de una solución que contenía HEPES 50 mM, EDTA 1 mM, PMSF 1 mM. Un volumen igual de tinte de carga 2 x [Laemmli, Reino Unido, (1970). Nature 227: 680] se añadió a las muestras y se sometió la proteína a electroforesis en un gel de poliacrilamida al 8% y después se electrotransfirió a nitrocelulosa. La nitrocelulosa se incubó con antisueros de cobayas policlonales (dilución 1:200) dirigido contra la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio de los músculos esqueléticos de conejo (obtenidos de K. Campbell, Universidad de Iowa) seguido de la incubación con proteína A-[^{125}I]. La transferencia se expuso a una película de Rayos X a -70ºC. Las muestras reducidas de la proteína de las células transfectadas así como de las células no transfectadas contenían proteína inmunorreactiva del tamaño esperado para la subunidad \alpha_{2} del canal de calcio neuronal de tipo humano (130-150 kDa). El nivel de esta proteína inmunorreactiva era más alto en las células 44\alpha_{2}-9 que se habían desarrollado en presencia de butirato de sodio 10 mM que en las células 44\alpha_{2}-9 que se desarrollaron en ausencia de butirato de sodio. Estos datos se correlacionan bien con los obtenidos en los análisis de northern del ARN total de las células 44\alpha_{2}-9 y DG44 transfectadas. La línea celular 44\alpha_{2}-9 también producía una proteína inmunorreactiva de 110 kd que bien puede ser un producto de degradación proteolítica de la subunidad \alpha_{2} de longitud completa o un producto de traducción de uno de los ARNm más cortos (< 5000 nt) producido en esta línea celular que se hibridaza a la sonda de ADNc de la subunidad \alpha_{2}.
B. Expresión de ADN de que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} de los canales de calcio neuronales tipo humano en células HEK
Las células de riñón embrionarias de tipo humano (células HEK 293) se transfectaron transitoria y establemente con el ADN neuronal humano que codifica las subunidadaes de los canales de calcio. Los transfectantes individuales se analizaron electrofisiológicamente para la presencia de corrientes de bario activadas por la tensión y los canales de calcio dependientes de la tensión.
1. Transfección de células HEK 293
Los vectores de expresión separados que contienen ADN que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano, plásmidos pVDCCIII (A), pHBCaCH\alpha_{2}A y pHBCaCH\beta_{1a}RBS (A), respectivamente se construyeron como se describe en la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097. Estos tres vectores se utilizaron para cotransfectar transitoriamente las células HEK 293. Para la transfección estable de las células HEK 293 se utilizó el vector pHBCaCH\beta_{1b}RBS (A) en lugar de pHBCaCH\beta_{1a}RBS (A) para introducir el ADN que codifica la subunidad \beta_{1} en las células junto con pVDCCIII (A) y pHBCaCH\alpha_{2}A.
a. Transfección transitoria
Los vectores de expresión pVDCCIII (A), pHBCaCH\alpha_{2}A y pHBCaCH\beta_{1a}RBS (A) se utilizaron en dos conjuntos de transfecciones transitoriaes de células HK 293 (Nº de acceso de la ATCC CRL1573). En un procedimiento de transfección, las células HEK 293 se cotransfectaron transitoriamente con el plásmido de expresión de ADNc de la subunidad \alpha_{1}, el plásmido de expresión de ADNc de la subunidad \alpha_{2}, el plásmido de expresión de ADNc de la subunidad \beta_{2} y el plásmido pCMV\betagal (Clontech Laboratorios, Palo Alto, CA). El plásmido pCMV\betagal contiene el gen lacZ (que codifica la \beta-galactosidasa de E. coli) fusionada al promotor de citomegalovirus (CMV) y se incluyó en esta transfección como gen marcador para controlar la eficacia de la transfección. En el otro procedimiento de transfección, las células HEK 293 se cotransfectaron transitoriamente con en plásmido pVDCCIII de expresión de ADNc de la subunidad \alpha_{1} y pCMV\betagal. En ambas transfecciones, 2-4 x 10^{6} células HEK 293 en placas de cultivo de tejidos de 10 cm se cotransfectaron transitoriamente con 5 \mug de cada uno de los plásmidos incluidos en los experimentos según los procedimientos de transfección de precipitación con CaPO_{4} (Wigler y col., (1979) Proc. Natl. Acad. Sci Estados Unidos 76: 1373-1376). Se analizaron los transfectantes para la expresión de \beta-galactosidasa mediante la tinción directa del producto de una reacción que implica \beta-galactosidasa y el sustrato de X-gal [Jones, J. R. (1986) EMBO 5: 3133-3142] y mediante la medición de la actividad de la \beta-galactosidasa [Miller, J. H. (1972) Experiments in Molecular Genetics, pp. 352-355, Cold Spring Harbor Press]. Para evaluar la expresión del ADNc de las subunidades en estos transfectantes, se analizaron las células para la producción de las transcripciones de las subunidades (análisis de northern), producción de las proteínas de inducción (análisis de inmunotransferencia de lisados celulares) y expresión de los canales de calcio funcionales (análisis electrofisiológico).
b. Transfección estable
Se transfectaron células HEK 293 usando el procedimiento de transfección de fosfato de calcio [Current Protocols in Molecular Biology, Vol. 1, Wiley Inter - Science, Supplement 14, Unit 9.1.1-9.1.9 (1990)]. Placas de diez cm que contenía cada una entre uno y dos millones de células HEK 293 se transfectaron con 1 ml de precipitado de ADN/fosfato de calcio que contenía 5 \mug de pVDCCIII (A), 5 \mug de pVDCCIII (A), 5 \mug de pHBCaCH\alpha_{2}A, 5 \mug de pHBCaCH\beta_{1b}RBS (A), 5 \mug de pCMVBgal y 1 \mug de pSV2neo (como marcador seleccionable). Después de 10-20 días se desarrollo en medio que contenía 500 \mug de G418, se habían formado las colonias y se aislaron usando cilindros de clonación.
2. Análisis de células HEK 293 transfectadas transitoriamente con ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio neuronales de tipo humano a. Análisis de expresión de la \beta-galactosidasa
Se ensayaron los transfectantes transitorios para la expresión de la \beta-galactosidasa mediante ensayos de actividad de \beta-galactosidasa (Miller, J. H., (1972) Experiments in Molecular Genetics, p. 352-355, Cold Spring Harbor Press) de lisados de células (preparados como se describe en la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097) y la tinción de las células fijadas (Jones, J. R. (1986) EMBO 5: 3133-3142). Los resultados de estos ensayos indican que aproximadamente el 30% de las células HEK 293 se habían transfectado.
b. Análisis de Northern
Se aisló Poli A+ ARN usando el kit de Invitrogen Fast Trak (Invitrogen, San Diego, CA) de células HEK 293 transfectadas transitoriamente con ADN que codifica cada una de las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ o la subunidad \alpha_{1} y el gen lacZ. Se sometió el ARN a electroforesis en un gel de agarosa y se transfirió a nitrocelulosa. Después la nitrocelulosa se hibridó con una o más de las siguientes sondas marcadas radiactivamente: el gen lacZ, el ADNc que codifica la subunidad \alpha_{1D} de los canales de calcio neuronales de tipo humano, el ADNc que codifica la subunidad \alpha_{2} de los canales de calcio neuronales de tipo humano o el ADNc que codifica la subunidad \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano. Dos transcripciones que se hibridaron con el ADNc que codifica la subunidad \alpha_{1} se detectaron en las células HEK 293 transfectadas con el ADN que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ así como en las células HEK 293 transfectadas con el ADNc de la subunidad \alpha_{1} y el gen lacZ. Una especie de ARNm tenía el tamaño esperado para la transcripción del ADNc de la subunidad \alpha_{1} (8000 nucleótidos). La segunda especie de ARN era más pequeña (4000 nucleótidos) que el tamaño esperado para esta transcripción. El ARN del tamaño esperado para la transcripción del gen lacZ se detectó en las células transfectadas con el ADNc que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ y en las células transfectadas con el ADNc de la subunidad \alpha_{1} y el gen lacZ mediante hibridación a la secuencia del gen lacZ.
El ARN de las células transfectadas con el ADNc que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ también se hibridaron con las sondas del ADNc de las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1}. Se hibridaron dos especies de ARNm a la sonda de ADNc de la subunidad \alpha_{2}. Una especie era del tamaño esperado para la transcripción del ADNc de la subunidad \alpha_{2} (4000 nucleótidos). Las otras especies eran mayores (6000 nucleótidos) que el tamaño esperado de esta transcripción. Múltiples especies de ARN en las células cotransfectadas con el ADNc que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ se hibridaron a la sonda de ADNc de la subunidad \beta_{1}. Se produjeron múltiples transcripciones de la subunidad \beta de tamaños variables ya que el vector de expresión del ADNc de la subunidad \beta contiene dos sitios de adición de poli A^{+} potenciales.
c. Análisis electrofisiológicos
Las células HEK 293 individuales transfectadas transitoriamente se ensayaron para la presencia de corrientes de bario dependientes de tensión usando la variante de célula entera de la técnica de pinzamiento zonal [Hamill y col., (1981). Pflugers Arch. 391: 85-100]. Las células HEK 293 transfectadas transitoriamente con pCMV\betagal se ensayaron solamente para corrientes de bario como un control negativo en estos experimentos. Se situaron las células en una solución de baño que contenía iones de bario para servir como portador de corriente. Se utilizó cloruro de colina en lugar de NaCl o KCl como el componente principal de la sal de la solución del baño para eliminar las corrientes a través de los canales de sodio y potasio. La solución del baño contenía MgCl_{2} 1 mM y se tamponó a pH 7,3 con HEPES 10 mM (pH ajustado con hidróxido de sodio o de tetraetilamonio). Las pipetas zonales se llenaron con una solución que contenía CsCl 135 mM, MgCl_{2} 1 mM, glucosa 10 mM, EGTA 10 mM, ATP 4 mM y HEPES 10 mM (pH ajustado hasta 7,3 con hidróxido de tetraetilamonio). Los iones de cesio y tetraetilamonio bloquean la mayoría de los tipos de los canales de potasio. Las pipetas se recubrieron con Sylgard (Dow - Corning, Midland, MI) y tenían resistencias entre 1 y 4 megohm. Las corrientes se midieron mediante un resistor de headstage de 500 megohm con el amplificador Axopatch IC (Axon Instruments, Foster City, CA), interconectada con un tablero de adquisición de datos Labmaster (Scientific Solutions, Solon, OH) en un PC compatible IBM. Se utilizó PClamp (Axon instruments) para generar los comandos de tensión y adquirir datos. Se analizaron los datos con los programas pClamp o Quattro Professional (Borland Internacional, Scotts Valley, CA).
Para aplicar los fármacos, se usaron pipetas de "golpe de pistón" posicionadas dentro de varios micrómetros de la célula en estudio para aplicar las soluciones mediante aplicación a presión. El fármaco utilizado para la caracterización farmacológica se disolvió en una solución idéntica a la solución del baño. Las muestras de una solución madre 10 mM de Bay K 8644 (RBI, Natick, MA) que se había preparado en DMSO, se diluyeron hasta una concentración final de 1 \muM en una solución del baño que contenía Ba^{2+} 15 mM antes de que se aplicaran.
Se analizaron veintiún controles negativos de células HEK 293 (transfectadas transitoriamente con el vector de expresión pCMV\betagal del gen lacZ solamente mediante la variante de la célula completa del procedimiento del match clamp para registrar las corrientes. Solamente una célula mostró una corriente interna de bario discernible; esta corriente no se afectó por la presencia de Bay K 8644 1 \muM. Además, la aplicación de Bay K 8644 a cuatro células que no mostraron corrientes de Ba^{2+} no producían la aparición de ninguna corriente.
Dos días después de la transfección transitoria de las células HEK 293 con el ADNc que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ, se ensayaron los transfectantes individuales para las corrientes de bario dependientes de la tensión. Las corrientes. Se registraron las corrientes en nueve transfectantes. Debido a que la eficacia de la transfección de una célula puede variar de la eficacia de transfección de otra célula, el grado de expresión de las proteínas heterólogas en los transfectantes individuales varía y algunas células no incorporan o expresan el ADN extraño. Las corrientes de bario internas se detectaron en dos de estos nueve transfectantes. En estos ensayos el potencial de mantenimiento era de -90 mV. Se despolarizó la membrana en una serie de etapas de tensión a diferentes potenciales de ensayo y se registró la corriente en presencia y ausencia Bay K 8644 1 \muM. La corriente de bario interna se potenció significativamente en magnitud mediante la adición de Bay K 8644. La mayor corriente de bario interna (\sim160 pA) se registró cuando la membrana se despolarizó hasta 0 mV en presencia de Bay K 8644 1 \muM. Una comparación de las curvas I-V, generadas mediante el trazado de de la curva mayor registrada después de cada despolarización frete a la tensión de despolarización, correspondiente a los registros llevados a cabo en ausencia y presencia de Bay K 8644 ilustraron el aumento de de la corriente activada por tensión en presencia de Bay K 8644.
Las corrientes de cola pronunciadas se detectaron en los trazados de las corrientes generadas en presencia de Bay K 8644 en las células HEK 293 transfectadas con el ADNc que codifica las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} y el gen lacZ, indicando que los canales de calcio recombinantes responsables de las corrientes de bario activadas por tensión registradas en esta transfectada parecía ser sensible a DHP.
La segunda de las dos células transfectadas que mostraba corrientes de bario internas expresaba una corriente de \sim50 pA cuando se despolarizaba la membrana desde - 90 mV. Esta corriente se bloqueaba casi completamente con cadmio 200 \muM, un bloqueante de los canales de calcio establecido.
Diez células que se transfectaron transitoriamente con el ADN que codifica la subunidad \alpha_{1} y el gen lacZ se analizaron mediante los procedimientos de pinzamiento zonal de células enteras dios días después de la transfección. Una de estas células mostró una corriente de bario interna de 30 pA. Esta corriente amplificada dos veces en presencia de Bay K 8644 1 \muM. además, se detectaron pequeñas corrientes de cola en presencia de Bay K 8644. Estos datos indican que la expresión del el ADNc que codifica las subunidades \alpha_{1D} de los acanales de calcio neuronales de tipo humano en las células HEK 293 produce un canal de calcio funcional sensible a DHP.
3. Análisis de células HEK 293 transfectada establemente con ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio neuronales de tipo humano
Las células HEK 293 individuales transfectadas establemente se ensayaron electrofisiológicamente para la presencia de corrientes de bario dependientes de la tensión como se describe para el análisis de electrofisiológicamente de células HEK 293 transfectadas transitoriamente (véase el ejemplo VII. B. 2c.). En un esfuerzo para maximizar la actividad de de los canales de calcio mediante la fosforilación mediada por quinasas dependiente de AMP cíclico [Pelzer y col., (1990) Rev. Physiol. Biochem. Pharmacol 114: 107-207], se añadió cAMP (sal sódica 250 \muM) a la solución de la pipeta y se añadió forskolin (10 \muM) a la solución del baño en alguno de los registros. Se obtuvieron resultados cualitativamente similares si estos compuestos estaban presentes o no.
Se registraron corrientes de bario de las células transfectadas establemente en ausencia y presencia de Bay K 8644 (1 \muM). Cuando se despolarizó la célula hasta - 10 mV desde un potencial de mantenimiento de - 90 mV en ausencia de Bay K 8644, se registró una corriente de aproximadamente 35 pA con una corriente de cola que se desactivaba rápidamente. Durante la aplicación de Bay K 8644, un protocolo despolarizante idéntico producía como respuesta una corriente de aproximadamente 75 pA, acompañada de una corriente de cola aumentada y prolongada. Se valoró la magnitud máxima de las corrientes registradas desde este mismo canal como función de una serie de tensiones despolarizantes. Las respuestas en presencia de Bay K 8644 no solamente aumentaban, sino que la relación de la tensión de la corriente entera se desplazaba aproximadamente - 10 mV. Así que, se observaron tres típicos contrastes de acción de Bay K 8644, a saber magnitud de aumento de corriente, corrientes de cola prolongadas y tensión de activación desplazada negativamente, que indicaban claramente la expresión de un canal de calcio sensible a DHP en estas células transfectadas establemente.. No se observaron ninguno de dichos efectos en las células HEK 293 no transfectadas, bien con o sin cAMP o forskolin.
C. Uso de vectores a base de pCMV y vectores a base de pcDNA1 para la expresión de ADN que codifica las subunidades de los canales de calcio neuronales de tipo humano 1. Preparación de las construcciones
Se construyeron vectores de expresión adicionales usando pCMV. El ADNc de \alpha_{1D} de longitud completa de pVDCCIII (A) (véase la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097), el ADNc de \alpha_{2} de longitud completa contenido en un fragmento EcoRI de 3600 kp de HBCaCH \alpha_{2} (véase la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097) y un ADNc de la subunidad \beta_{1} de longitud completa de pHBCaCH\beta_{1b}RBS (A) (véase la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097) se subclonaron separadamente en el plásmido pCMV\betagal. El plásmido pCMV\betagal se digirió con NotI para retirar el gen lacZ. La porción del vector restante del plásmido, denominada pCMV, se despuntó en los sitios NotI. El ADN que codifica \alpha_{2} de longitud completa y el ADN que codifica \beta_{1}, contenidos los fragmentos EcoRI separados se aislaron, se despuntaron y se ligaron separadamente al fragmento del vector despuntado de pCMV que localizan el ADN entre el promotor de CMV y los sitios de poliadenilación de SV40 en pCMV. Para ligar el ADNc que codifica \alpha_{1D} con pCMV, los sitios de restricción en los poliengarces inmediatamente 5' del promotor de CMV e inmediatamente 3' del sitio de poliadenilación SV40 se retiraron de pCMV. Se añadió un poliengarce en el sitio NotI. El polienengarce tenía la siguiente secuencia de los sitios de reconocimiento de enzimas de restricción:
9
Después el ADN que codifica \alpha_{1D} aislado como un fragmento BamHI/XhoI de pVDCCIII (A) se ligó a pCMV digerido con XbaII/SalI para situarlo entre el promotor de CMV y el sitio de poliadenilación de SV40.
El plásmido pCMV contiene el promotor CMV lo mismo que pADNc1, pero difiere de pADNc en la localización de los sitios de donante de ayuste/aceptor de ayuste relativos al ADN que codifica la subunidad insertada. Después de la inserción el ADN que codifica la subunidad en pCMV los sitios de donante de ayuste/aceptor de ayuste se localizan en 3' del promotor de CMV y 5' del codón de partida de ADN que codifica la subunidad. Después de la inserción del ADN que codifica la subunidad en pADNc1, los sitios de donante de ayuste/aceptor de ayuste se localizan en 3' del codón de parada del ADNc de la subunidad.
2. Transfección células HEK 293
Las células HEK 293 se cotransfectaron con el ADN que codifica las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} en pCMV o con el ADN que codifica las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta en pADNc1 (vectores pVDCCIII (A), pHBCaCH\alpha_{2}A y
pHBCaCH\beta_{1b}RBS (A), respectivamente, como se describe en el ejemplo VII. B. 1. a. El plásmido pCMV\betagal se incluyó en cada transfección como una medida de la eficacia de transfección. Los resultados de los ensayos de \beta-galactosidasa de los transfectantes (véase la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097), indicaron que las células HEK 293 se transfectaron de manera igual eficazmente con plásmidos a base de pCMV- y pADNc1. Sin embargo, los plásmidos, a base de pADNc1 se prefieren actualmente para la expresión de los receptores de los canales de calcio.
D. Expresión en ovocitos de Xenopus laevis de ARN que codifica las subunidades de los canales de calcio neuronales de tipo humano
Se inyectaron diversas combinaciones de las transcripciones de ADN que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} preparados in vitro en ovocitos de Xenopus laevis. Los inyectados con combinaciones que incluyen \alpha_{1D} exhibían corrientes de bario activadas por tensión.
1. Preparación de transcripciones
Las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano se sintetizaron según las instrucciones del kit CAPPING de ARNm de mCAP (Stratagene La Jolla, CA, número de catálogo 200350). Como se describe en la solicitud PCT internacional Nº PCT/US94/09230, véase, también la solicitud de Estados Unidos Nº de serie 08/149.097 los plásmidos pVDCC III. RBS (A), que contenían pADNc1 y el ADNc de \alpha_{1D} que comienza con un sitio de unión a ribosomas y el codón octavo ATG de la secuencia codificadora, el plásmido pHBCaCH\alpha_{1}A que contiene pADNc1 y un ADNc de la subunidad \alpha_{2}, y el plásmido pHBCaCH\beta_{1b}RSB (A) que contiene pADNc1 y el ADN de \beta_{1} carente de la secuencia de intrones y que contiene un sitio de unión a ribosomas se linealizaron mediante digestión de restricción. Los plásmidos que codifican la subunidad \alpha_{2} y el ADNc de \alpha_{1D} se digirieron con XhoI y el plásmido que codifica la subunidad \beta_{1} se digirió con EcoRV. La inserción de ADN se transcribió con RNApolimerasa de T7.
2. Inyección de ovocitos
Los ovocitos de Xenopus laevis se aislaron y se desfolicularon mediante tratamiento con colagenasa y se mantuvieron en NaCl 100 mM, KCl 2 mM, CaCl_{2} 1,8 mM, HEPES 5 mM, pH7,6, 20 \mug/ml de estreptomicina a 19-25ºC durante 2 a 5 días después de la inyección y antes de realizar los registros. Para cada transcripción que se inyectó en el ovocito, se inyectaron 6 ng del ARNm específico por célula en un volumen total de 50 nl.
3. Registros de la tensión intracelular
Se examinaron los ovocitos inyectados para las corrientes de bario dependientes de la tensión usando los procedimientos de pinzamiento de tensión de dos electrodos [Dascal, N. (1987) CRC Crit. Rev. Biochem. 22: 317]. Se utilizó el paquete de software pClamp (Axon Instruments) junto con una interconexión de adquisición de datos Labmaster de 125 kHz para generar los comandos de tensión y adquirir y analizar los datos. También se utilizó Quattro Professional en este análisis. Se digitalizaron las señales de las corrientes a 1 - 5 kHz y se filtraron apropiadamente. La solución del baño contenía lo siguiente: BaCl_{2} 40 mM, cloruro de tetraetilamonio 36 mM (abreviadamente TEA-Cl), ClK 2 mM, 4-aminopiridina 5 mM, ácido niflúmico 0,15 mM, HEPES 5 mM, pH 7,6.
a. Análisis electrofisiológico de ovocitos inyectados con transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1}, \alpha_{2} y \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano
Se examinaron los ovocitos no inyectados mediante los procedimientos de pinzamiento de tensión de dos electrodos y se detectó una corriente interna de Ba^{2+} muy pequeña solamente en una de las siete células analizadas.
Los ovocitos coinyectados con las transcripciones de las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} expresaban corrientes de bario interna mantenidas tras la despolarización de la membrana de un potencial de mantenimiento de - 90 mV o - 50 mV (154 \pm 129 nA, n = 21). Estas corrientes mostraban típicamente una inactivación pequeña cuando se administraron los pulsos de prueba variando entre 140 y 700 mseg. La despolarización a una serie de tensiones reveló corrientes que primero aparecían a aproximadamente - 30 mV con máximo a aproximadamente 0 mV.
\newpage
La aplicación de la DHP Bay K 8644 incrementaba la magnitud de las corrientes, prolongaba las corrientes de cola presentes tras la repolarización de la célula e inducía un desplazamiento hiperpolarizante en la activación de la corriente. El Bay K 8644 se preparó reciente a partir de una solución madre en DMSO y se introdujo en forma de un concentrado 10 x directamente en el baño de 60 \mul mientras la bomba de perfusión se desconectaba. La concentración de DMSO de las soluciones de los fármacos diluidos en contacto con la célula nunca excedía de 0,1%. Los experimentos de control mostraron que 0,1% de DMSO no tenían ningún efecto sobre las corrientes de las membranas.
La aplicación del antagonista de DHP nifedipina (solución madre preparada en DMSO y aplicada a la célula como se ha descrito para la aplicación de Bay K 8644) bloqueaba una fracción sustancial (91 \pm 6%, n = 7) de la corriente interna de bario en ovocitos coinyectados con transcripciones de las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1}. Un componente inactivador residual de la corriente interna de bario permanecía típicamente después de la aplicación de la nifedipina. La corriente interna de bario se bloqueó completamente mediante Cd^{2+} 50 \muM pero solamente aproximadamente un 15% mediante Ni^{2+} 100 \muM.
Se investigó el efecto de \omegaCgTX en las corrientes de bario internas en los ovocitos coinyectados con las transcripciones de las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1}. El \omegaCgTX (Bachem, Inc, Torrance CA) se preparó en la solución de baño de BaCl_{2} 15 mM más 0,1% de citocromo C (Sigma) para servir como proteína portadora. Los experimentos de control mostraron que el citocromo C no tenía ningún efecto sobre las corrientes. Una serie de pulsos de tensión entre un potencial de mantenimiento de - 90 mV a 0 mV se registró a intervalos de 20 mseg. Para reducir la inhibición de unión a \omegaCgTX por cationes divalentes, los registros se hicieron en BaCl_{2} 15 mM, cloruro de tetraetilamonio 73,5 mM y el resto de los ingredientes idénticos a la solución registradora de Ba^{2+} 40 mM. El Bay K 8644 se aplicó a la célula antes de la adición a \omegaCgTXcon el fin de determinar el efecto de \omegaCgTX en el componente de las corrientes sensibles a DHP que se distinguían por las corrientes de cola prolongadas. La corriente de bario interna se bloqueó débilmente (54 \pm 29%, n = 7) y reversiblemente mediante concentraciones relativamente altas (10-15 \muM) de \omegaCgTX. Las corrientes de prueba y las corrientes de cola acompañantes se bloquearon progresivamente en dos a tres minutos después de la aplicación de \omegaCgTX pero ambas se recuperaban parcialmente a medida que el \omegaCgTX fluía del baño.
b. Análisis de ovocitos inyectados solamente una transcripción que codifica la \alpha_{1D} de los canales de calcio neuronales de tipo humano o las transcripciones que codifican una \alpha_{1D} y otras subunidades
La contribución de las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} a la corriente de bario interna en ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} se valoraron mediante la expresión de la subunidad \alpha_{1D} sola o en combinación bien con la subunidad \beta_{1} o la subunidad \alpha_{2}. En los ovocitos inyectados solamente con la transcripción de un ADNc de \alpha_{1D}, no se detectaron corrientes de Ba^{2+} (n = 3). En los ovocitos inyectados con las transcripciones de los ADNc de \alpha_{1D} y \beta_{1}, se detectaron pequeñas corrientes de Ba^{2+} (108 \pm 39 nA) tras la despolarización de la membrana de un potencial de mantenimiento de - 90 mV que se parece a las corrientes observadas en las células inyectadas con las transcripciones de los ADNc de \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} aunque la magnitud de la corriente era menor. En dos de los cuatro ovocitos inyectados con transcripciones del ADN que codifica \alpha_{1D} y que codifica \beta_{1}, las corrientes de Ba^{2+} exhibían una sensibilidad a Bay K 8644 que era similar a la sensibilidad de Bay K 8644 de las corrientes Ba^{2+} expresadas en los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{1-},\alpha_{2-} y \beta_{1}.
Tres de los cinco ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D} y \alpha_{2} exhibían corrientes muy pequeñas de Ba^{2+} (15-30 nA) tras la despolarización de la membrana de un potencial de mantenimiento de - 90 mV. Estas corrientes de bario mostraron poca o ninguna respuesta a Bay K 8644.
c. Análisis de ovocitos inyectados con transcripciones que codifican la subunidad \alpha_{2} y/o \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano
Para evaluar la contribución de la subunidad de \alpha_{1} \alpha_{1D} a las corrientes de bario internas detectadas en los ovocitos coinyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} de, los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y/o \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano se ensayaron para las corrientes de bario. Los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican la subunidad \alpha_{2} no mostraba ninguna corriente de bario interna detectable (n = 5). Los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican una subunidad \beta_{1} mostraban corrientes de bario internan mensurables (54 \pm 23 nA, n = 5) tras la despolarización y ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} mostraron corrientes internas de bario que eran aproximadamente 50% mayores (80 \pm 61 nA, n = 18) que las detectadas en ovocitos inyectados con transcripciones del ADN que codifica \beta_{1} solamente.
Las corrientes de bario internas en ovocitos inyectados con transcripciones que codifican la subunidad \beta_{1} o las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} se observaron primero cuando la membrana estaba despolarizada hasta - 30 mM de un potencial de mantenimiento de - 90 mV y maximizada cuando se despolarizaba la membrana hasta 10 a 20 mV. Microscópicamente, las corrientes en los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} o con transcripciones que codifican la subunidad \beta_{1} eran indistinguibles. En contraste a las corrientes en ovocitos coinyectados las transcripciones de los ADNc de las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1}, estas corrientes mostraban una inactivación significativa durante el pulso de prueba y una fuerte sensibilidad para el potencial de mantenimiento. Las corrientes de bario internas en ovocitos coinyectados con transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} usualmente inactivados hasta 10-60% de la magnitud máxima durante un pulso de 140 mseg. y eran significativamente más sensibles al potencial de mantenimiento que las de en ovocitos coinyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1}. cambiando el potencial de mantenimiento de las membranas de ovocitos coinyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} entre - 90 y - 50 mV daba como resultado aproximadamente 81% (n = 11) de reducción en la magnitud de la corriente de bario interna de estas células. En contraste, la corriente de bario interna medida en ovocitos coinyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1} se redujeron aproximadamente 24% (n = 11) cuando el potencial de mantenimiento se cambió de - 90 a - 50 mV.
Las corrientes de bario internas detectadas en ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} se distinguen farmacológicamente de las observadas en ovocitos coinyectados con transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1}. Los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} mostraban corrientes de bario internas que eran insensibles a Bay K 8644 (n = 11). La sensibilidad a nifedipina era difícil de medir debido a la sensibilidad al potencial de mantenimiento de la nifedipina y la corriente observada en los ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1}. En cualquier caso, dos ovocitos que se coinyectaron con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} mostraban corrientes de bario internas (25 a 45 nA) medibles que eran insensibles a la nifedipina (5 a 10 \muM), cuando se desporalizaban de un potencial de mantenimiento de - 50 mV. Las corrientes de bario internas en ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} mostraban la misma sensibilidad a los metales pesados que las corrientes detectadas en ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{1D}, \alpha_{2} y \beta_{1}.
La corriente de bario interna detectada en ovocitos inyectados con las transcripciones que codifican las subunidades \alpha_{2} y \beta_{1} tenían propiedades farmacológicas y biofísicas que se parecen a las corrientes de calcio en ovocitos de Xenopus no inyectados. Debido a que los aminoácidos de esta subunidad \beta_{1} de los canales de calcio neuronales de tipo humano carecen de segmentos hidrófobos capaces de formar dominios transmembrana, es improbable que las subunidades recombinantes \beta_{1} solo puedan formar un canal iónico. Es más probable que una subunidad \alpha_{1} endógena homóloga existe en ovocitos y que la actividad mediada por tal subunidad \alpha_{1} se potencia mediante la expresión de una subunidad \beta_{1} neuronal de de tipo humano.
Aunque la materia sujeto de la invención se ha descrito con alguna especificidad, se pueden realizar modificaciones evidentes para los expertos en la técnica sin salirse del alcance de la invención. Ya que tales modificaciones serán evidentes para los expertos en la técnica, se pretende que esta invención esté limitada solamente por el alcance de las reivindicaciones anexas.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: SIBIS Neurosciences, Inc.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 505 COAST BLVD SOUTH, SUITE 300
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: La Jolla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 92037 - 4641
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Mark E, Williams
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 946 Jasmine Court
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Carlsbad
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 92009
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Kenneth A, Stauderman
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 3615 Lotus Dr.
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: San Diego
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 92106
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Michael M, Harpold
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 1462 Encina Road
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Santa Fe
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: Nuevo México
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 87505-4726
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Michael Hans
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 2635 Clemente Terrace
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: San Diego
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 92122
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Arturo Urrutia
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 778 Beech Avenue
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Uchla Vista
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 91910
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Mark S. Washburn
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 1535 Kings Cross Drive
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Cardiff
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): 92007
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: COMPOSICIONES Y PROCEDIMIENTOS DE LOS CANALES DE CALCIO.
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 16
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN POSTAL
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DIRECCIÓN: Heller Ehrman White y McAuliffe
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 4250 Executive Square, 7º Piso
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: La Jolla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 92307
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE DE ORDENADOR
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(SOFTWARE): FastSEQ Version 1.5 y PatentIn 2.0
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE SOLICITUD ACTUAL
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 3 de diciembre de 1998
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD PREVIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: 09/188.932
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 10 de noviembre de 1998
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD PREVIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: 08/984.709
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 3 de diciembre de 1997
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
ABOGADO/INFORMACIÓN DEL AGENTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Seidman, Stephanie L.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 33.779
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
REFERENCIA/NÚMERO DE EXPEDIENTE: 24735-9815PC
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (619) 450-8400
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FAX: (619) 450-8499
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(I)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR/SOLICITANTE
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TYCCCTTGAA GAGCTGNACC CC
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(I)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGTGCACGTC ACGCTAG
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AATTCTAGCG TGACGTGCAC G
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACNGTGTTYC AGATCCTGAC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATCCTGACNG GNGARGACTG GAA
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TYCCCTTGAA GAGCTGNACN GC
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TYCCCTTGA AGAGCTGNAC CCC
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AACTGYATYA CCCTGGC
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATYACCCTGG CNATGGAGCG
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GARATGATGA TGAARGT
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 342 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: desconocida
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 7898 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: Secuencia codificadora
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 249 ... 7307
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
OTRA INFORMACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1669 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 13:
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1413 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 14:
24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 7898 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: Secuencia codificadora
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 249 ... 7307
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
OTRA INFORMACIÓN: \alpha_{1H-1}
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 15:
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
LONGITUD: 6941 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DE POLARIDAD NEGATIVA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO:
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: Secuencia codificadora
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 249 … 6353
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
OTRA INFORMACIÓN: \alpha_{1H-2}
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45

Claims (28)

1. Un fragmento de ácido nucleico aislado que codifica una subunidad \alpha_{1H} de baja tensión de un canal de calcio animal, en el que la secuencia de nucleótidos comprende la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID números 12-16.
2. El ácido nucleico de la reivindicación 1 que codifica una subunidad \alpha_{1H-1} o \alpha_{1H-2} que comprende la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID números 12, 15 ó 16.
3. Una célula eucariótica, que comprende ácido nucleico heterólogo que codifica una subunidad \alpha_{1H}, en la que la subunidad \alpha_{1H} está codificada por el ácido nucleico de la reivindicación 1 ó 2.
4. La célula de la reivindicación 3, que comprende además ácido nucleico que codifica una subunidad \alpha_{2}\delta de un canal de calcio.
5. La célula eucariótica de la reivindicación 3 o reivindicación 4 que tiene un canal de calcio heterólogo que contiene al menos una subunidad codificada por el ácido nucleico de la reivindicación 1 ó 2.
6. La célula eucariótica de cualquiera de las reivindicaciones 3-5 seleccionada entre el grupo constituido por células HEK 293, células de ovario de hámster chino, células de mono verde africano, y células L de ratón.
7. La célula eucariótica de cualquiera de las reivindicaciones 3-5 que es un ovocito de anfibio.
8. La célula eucariótica de la reivindicación 5, en la que el canal de calcio heterólogo comprende una pluralidad de subunidades \alpha_{1H} codificados por la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuestos en cualquiera de las SEQ ID Números 12-16.
9. La célula eucariótica de la reivindicación 8, en la que las subunidades \alpha_{1H} comprenden un homómero.
10. La célula eucariótica de cualquiera de las reivindicaciones 3-9, en la que el ácido nucleico heterólogo codifica un canal de calcio de tipo T.
11. Un procedimiento de identificación de un compuesto que modula la actividad de un canal de calcio que contiene una subunidad \alpha_{1H}, que comprende:
suspender una célula eucariótica de cualquiera de las reivindicaciones 3-10 que contiene un canal de calcio funcional que contiene una subunidad \alpha_{1H} en una solución que contiene el compuesto y un ion selectivo de los canales de calcio:
despolarizar la membrana celular de la célula; y
detectar la corriente o iones que fluyen en la célula,
en la que:
la corriente que se detecta es diferente de la producida mediante despolarización de la misma célula antes de la adición del compuesto o una preparación de célula de ensayo idéntica desarrollado en paralelo a la cual el compuesto no se añade más tarde, en presencia del mismo ion selectivo de los canales de calcio, si es necesario, con un control.
12. El procedimiento de la reivindicación 11, en el que antes de la etapa de despolarización la célula se mantiene a un potencial de mantenimiento que sustancialmente inactiva los canales de calcio que son endógenos a la célula.
13. El procedimiento de la reivindicación 12, en el que:
la célula es un ovocito de anfibio;
las subunidades heterólogas están codificadas por el ácido nucleico inyectado en el ovocito; y
las subunidades heterólogas incluyen una subunidad \alpha_{1H} codificada por el ácido nucleico de la reivindicación 1 ó 2.
14. El procedimiento de las reivindicaciones 11 ó 12, en el que la célula es una célula HEK y al subunidad heteróloga está codificada por el ácido nucleico heterólogo de la reivindicación 1 ó 2.
15. Una subunidad \alpha_{1H} sustancialmente pura codificada por la molécula de ácido nucleico de la reivindicación 1 ó 2.
16. Un procedimiento para identificar ácidos nucleicos que codifican una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio que está codificada por la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID números 12-16, que comprende hibridar en condiciones de al menos baja estringencia (1,0 x SSPE, SDS al 0,1%, 50ºC) una sonda de ARN o ADN de al menos 16 bases de longitud, que comprenden al menos 16 bases de ácidos nucleicos contiguos de una secuencia de nucleótidos que codifica una subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio que está codificada por la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID números 12-16.
17. El procedimiento de la reivindicación 16 en el que la sonda contiene al menos 30 bases de ácido nucleico contiguas que codifican la subunidad \alpha_{1H} de un canal de calcio que está codificada por el ácido nucleico de la reivindicación 1 ó 2.
18. El procedimiento de la reivindicación 16 ó 17, en el que la hibridación se efectúa en condiciones de alta rigurosidad (0,1 SSPE, SDS al 0,1%, 65ºC).
19. Un procedimiento para identificar células o tejidos que expresan un ácido nucleicos que codifica una subunidad \alpha_{1H} de los canales de calcio dicha subunidad \alpha_{1H} está codificada por la porción codificadora de la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID números 12-16, que comprende hibridar en condiciones de al menos baja estringencia (1,0 x SSPE, SDS al 0,1%, 50ºC) una sonda como se ha definido en la reivindicación 16 ó 17 con ARNm expresado en las células o tejidos o ADNc producida a partir del ARNm, y por lo tanto identificar las células o tejido que expresan ARNm que codifica la subunidad.
20. El procedimiento de la reivindicación 19, en el que la hibridación se efectúa en condiciones de alta estringencia (0,1 SSPE, SDS al 0,1%, 65ºC).
21. Una molécula de proteína aislada, que comprende la secuencia de aminoácidos codificada por los nucleótidos 1506 a 2627 de la SEQ ID nº 12.
22. La molécula de ácido nucleico aislada que comprende la secuencia de nucleótidos expuesta en los nucleótidos 1506 a 2627 de la SEQ ID nº 12.
23. El ácido nucleico de la reivindicación 1, 2 ó 22 que es ARN.
24. El ácido nucleico de 1, 2 ó 22 que es ADN.
25. La célula de una cualquiera de las reivindicaciones 3-10 que comprende además ácido nucleico que codifica una construcción de gen indicador que confíen un gen indicador en enlace operativo con uno o más elementos de control transcripcional que se regula mediante un canal de calcio.
26. Un procedimiento de identificación de los compuestos que modulan la actividad de un canal de calcio activado por baja tensión, comprendiendo el procedimiento:
comparar la diferencia en la cantidad de transcripción del gen indicador en al célula de la reivindicación 25 en la presencia del compuesto con la cantidad de transcripción en la ausencia del compuesto, o con la cantidad de transcripción en la ausencia del canal de calcio heterólogo, por lo cual se identifican los compuestos que modulan la actividad del canal de calcio heterólogo en la célula.
27. Un ensayo de selección para identificar un compuesto que modula la actividad de un canal de calcio activado por baja tensión (LVA) que comprende las etapas de:
poner en contacto el compuesto de ensayo con una célula funcional de una cualquiera de las reivindicaciones 3 a 10; y
medir la actividad del canal de calcio de LVA en la célula antes y después de la adición del compuesto de ensayo en una célula comparable que no expresa el canal de calcio LVA; y
determinar que el compuesto de ensayo modula la actividad del canal de calcio LVA si al medición después de la adición del compuesto es diferente de la medición antes de la adición del compuesto o si la medición en presencia del canal de calcio LVA es diferente de la medición en ausencia del canal de calcio LVA.
28. El procedimiento de la reivindicación 27, en el que la célula expresa un canal de calcio de baja tensión que tiene una conductancia relativa de Ba ^{2+} de aproximadamente 5 pS a aproximadamente 9 ps, un tiempo de activación de aproximadamente 2 a aproximadamente 8 milisegundos, una cinética de valor V _{1/2} de activación de aproximadamente - 60 milivoltios a aproximadamente 26 milivoltios, un tiempo de inactivación de aproximadamente 10 a aproximadamente 30 milisegundos, una cinética de valor V _{1/2} de inactivación de aproximadamente - 100 milivoltios a aproximadamente - 500 milivoltios, y un tiempo de desactivación de cola de aproximadamente 2 a aproximadamente 12 milisegundos.
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