EP4654884A1 - Procédé de caractérisation lésionnelle du coeur et système associé - Google Patents

Procédé de caractérisation lésionnelle du coeur et système associé

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EP4654884A1
EP4654884A1 EP24702501.8A EP24702501A EP4654884A1 EP 4654884 A1 EP4654884 A1 EP 4654884A1 EP 24702501 A EP24702501 A EP 24702501A EP 4654884 A1 EP4654884 A1 EP 4654884A1
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blood
image
acquisition
images
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Aurélien BUSTIN
Hubert COCHET
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Universite de Bordeaux
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Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
Universite de Bordeaux
Fondation Bordeaux Universite
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Definitions

  • the invention relates to the field of cardiac magnetic resonance imaging (MRI) by late gadolinium enhancement or LGE, with reference to the Anglo-Saxon expression “Late Gadolinium Enhancement”.
  • the field of application of the invention relates more particularly to methods and systems for characterizing lesions of the heart. This characterization makes it possible, in particular, to guide ablations.
  • the reference technique for the characterization of regional lesions including myocardial fibrosis is imaging by late gadolinium enhancement in white blood or BR-LGE (for the Anglo-Saxon expression “bright-blood LGE”) by inversion recovery such as the PSIR sequence (from the Anglo-Saxon expression “phase-sensitive inversion-recovery”).
  • inversion recovery such as the PSIR sequence (from the Anglo-Saxon expression “phase-sensitive inversion-recovery”).
  • the cancellation of the viable myocardial signal is caused using inversion-recovery pulses, which allows lesions to be visualized with high contrast between healthy myocardial tissue and the lesions.
  • black blood LGE (BL-LGE) imaging techniques have been proposed. They make it possible to simultaneously cancel the signals from the healthy myocardium and the blood, thus providing high contrast both between the lesions and between the blood and between the lesions and the healthy myocardium.
  • black blood imaging techniques do not make it possible to correctly characterize the lesions, in particular to locate them precisely in relation to the myocardium, as the contrast between the blood and the healthy myocardium is not sufficiently high.
  • the characterization of scars is currently carried out by radiologists by manually segmenting the scars. lesions from images from PSIR sequences, which then makes it possible to calculate their transmurality and their size.
  • this process is time-consuming since 25 to 30 minutes are necessary for the radiologist to carry out such segmentation.
  • segmentation is imprecise and not reproducible. Indeed, the low contrast between the lesion and the blood often leads the radiologist to imagine the subendocardial wall, which leads to an overestimation or underestimation of the characteristics of the scar.
  • An aim of the invention is to limit at least one of the aforementioned drawbacks.
  • the subject of the invention is a method for characterizing lesions of the heart using images of an area to be imaged comprising the heart of a patient, the heart comprising a myocardium delimiting a cavity of the heart, the images comprising:
  • the segmentation uses a learning function to segment the white blood image so as to obtain the positioning data.
  • the learning function is a convolutional neural network.
  • the learning function is trained from a set of training images of the area to be imaged generated from signals acquired during respective acquisition steps by magnetic resonance in white blood by late enhancement of the distinct gadolinium inversion sequences recovery.
  • the assembly of at least one wall comprises a first wall delimiting and surrounding the myocardium.
  • the characterization includes lesion segmentation to locate a myocardial lesion on the black blood image using data from positioning data of the first wall.
  • the lesion segmentation comprises the selection of pixels of the black blood image having an intensity greater than a predetermined threshold, the pixels being taken only from the pixels of the black blood image surrounded by the first wall.
  • the assembly of at least one wall comprises a second wall delimiting the myocardium and surrounded by the first wall.
  • the characterization comprises the calculation of data representative of a lesion size from data resulting from the positioning data of the first wall and possibly a second wall surrounded by the first wall.
  • the characterization comprises the calculation of data representative of a percentage of transmurality of the lesion from data resulting from the positioning data of the first wall and the second wall.
  • the method comprises the display, on a screen, of a representation of data calculated during the characterization step.
  • the process comprises:
  • black blood acquisition - generation of the image in white blood from the signals acquired during the magnetic resonance acquisition in black blood by late gadolinium enhancement, called black blood acquisition.
  • the black blood acquisition and the white blood acquisition belong to an acquisition sequence comprising an elementary acquisition sequence each comprising a white blood acquisition and a black blood acquisition.
  • the black blood acquisition and the white blood acquisition are implemented during a pair of interbeats consisting of two consecutive interbeats.
  • the elementary acquisition sequences are implemented during pairs of consecutive respective interbeats.
  • the method comprises lesion segmentation and characterization from black blood and white blood images generated from white blood images and black blood images generated from signals acquired during elementary sequences of the sequence of acquisition.
  • the method includes the acquisition sequence.
  • the method comprises the generation of the black blood image and the white blood image.
  • the black blood image and the white blood image are two-dimensional.
  • the invention also relates to a system comprising the hardware and software elements for implementing the method according to the invention.
  • the system advantageously comprises a processing unit configured to implement the segmentation step and the lesion characterization step.
  • the processing unit is a processing unit.
  • the system comprises a set of measuring equipment comprising a magnetic resonance imaging device capable of implementing acquisition by magnetic resonance in black blood and acquisition by magnetic resonance in white blood.
  • the processing unit is configured to generate commands intended for the MRI device so that it implements acquisition by magnetic resonance in black blood and acquisition by magnetic resonance in white blood.
  • the processing unit is configured to generate white blood and black blood images from the signals acquired during the respective acquisitions.
  • the system comprises an electrocardiograph configured to acquire an electrocardiogram of the patient during the respective acquisitions.
  • the invention also relates to a computer program product comprising instructions which cause the system according to the invention to execute the steps of the method according to the invention.
  • the invention also relates to a computer-readable medium, on which the computer program according to the invention is recorded.
  • FIG. 1 an example of producing a system according to the invention
  • FIG. 2 a schematic representation of an elementary signal acquisition sequence for generating black blood images and white blood images used in the method according to the invention
  • FIG. 3 a schematic representation of an MRI acquisition phase in black blood and white blood carried out on a plurality of heart beats
  • FIG. 4 a schematic representation of a heart in three dimensions (3D) illustrating different section planes distributed along the long axis of the heart and images generated from signals acquired in one of the section planes
  • FIG. 5 a flowchart of an example of a process according to the invention
  • FIG. 6 a schematic representation of four images comprising at the top left a white blood image and at the top right a white blood image on which the walls detected during the step of segmentation, and at the bottom left an image in black blood and the representation of the walls transferred to the image in black blood,
  • FIG. 7 at the top, the bottom left image of Figure 6 on which sectors have been represented, at the bottom left a bull's eye type representation of the lesion size and at the bottom right an eye type representation of beef with a lesional percentage of transmurality.
  • the invention relates to the field of cardiac imaging by magnetic resonance or MRI, late enhancement of gadolinium in black blood and white blood.
  • the invention relates to a method for characterizing cardiac lesions, and more precisely of at least one cardiac muscle, for example the myocardium.
  • Cardiac injury means injury to a muscle of the myocardium.
  • Cardiac lesions can be divided into acute lesions following acute myocardial damage, such as acute myocardial infarction, and chronic lesions characteristic of chronic cardiac pathologies. These lesions are cardiac lesions, for example of the myocardium or papillary muscles. These lesions include myocardial fibrosis which frequently develops in the context of hypertrophic or dilated cardiomyopathy, but which also represents a frequent sequela of inflammatory heart disease or myocardial infarction.
  • the lesions also include myocardial necrosis, that is to say the volumes of myocytes whose cell membrane has been destroyed and the volumes of extracellular matrices and collagen constituting the fibrous scars, in the chronic phase of the infarction.
  • FIG. 1 schematically represents an exemplary embodiment of a system S according to the invention.
  • the system comprises the hardware and software means for implementing the method according to the invention.
  • this system S comprises a set of measuring equipment A comprising a magnetic resonance imaging (MRI) device B as well as an electrocardiograph referenced ECR in FIG. 1.
  • MRI magnetic resonance imaging
  • ECR electrocardiograph referenced
  • the system S also includes a processing device C comprising a processing unit TC and a man-machine interface INT.
  • This processing device can be part of the imaging device B or be external to this device, the system is then a device. Alternatively, the system has a distributed architecture.
  • the MRI imaging device B comprises a static magnetic field generator GEN_B, a gradient generator GEN_GRAD and a radio frequency (RF) device D_RF.
  • GEN_B static magnetic field generator
  • GEN_GRAD gradient generator
  • RF radio frequency
  • the static magnetic field generator GEN_B comprises a main polarization magnet intended to generate, along a longitudinal axis z, a static magnetic field of substantially uniform polarization in a polarization zone (generally a tunnel) intended to include the area of the patient to be imaged , this area to be imaged including the heart.
  • a polarization zone generally a tunnel
  • the patient is a mammal.
  • the mammal is a man.
  • the GEN_GRAD gradient generator comprises three gradient coils (or solenoids) arranged and configured to vary the intensity of the magnetic field in the polarization zone according to the respective orthogonal x, y and z axes fixed with respect to the polarization zone.
  • the choice of intensities circulating in these coils makes it possible to select, among several possibilities, a section, presenting a given thickness and a section plane on which the section is centered, in which the magnetization of the patient's area to be imaged will be measured. received in the polarization zone.
  • the D_RF radiofrequency device comprises coils or solenoids and is capable of generating MRI acquisition sequences including preparatory sequences for the magnetization of the area to be imaged and reading sequences of RF signals from the area to be imaged.
  • Each of the preparatory and reading sequences comprises at least one radio frequency pulse of predetermined and adjustable frequency, shape, duration, phase, and amplitude.
  • the preparatory sequence is configured to excite, that is to say modify the direction of the magnetization of the tissues in the area to be imaged.
  • the reading sequence is configured to measure the magnetization of the area to be imaged resulting from the preparatory module.
  • the ECR electrocardiograph is intended to acquire an electrocardiogram of the patient
  • the processing unit TC is configured to generate commands intended for the IRM device B, in particular intended for the RF device D_RF and the gradient generator GEN_GRAD, so that the IRM device generates the predefined acquisition sequences of signals from predefined volumes or sections of the area to be imaged.
  • the TC processing unit is also configured to generate images of the area to be imaged from the measured signals, using reconstruction techniques known to those skilled in the art, and to process these images as we will see in more detail. in the remainder of the description.
  • Figure 2 represents an example of an elementary acquisition sequence SE1 of an MRI acquisition sequence of RF signals making it possible to generate images of the heart as well as an electrocardiogram (ECG) E measured by the electrocardiograph ECR during the sequence elementary SE1.
  • ECG electrocardiogram
  • the acquisition sequence comprises a series of elementary acquisition sequences SE1 such as that represented in Figure 2.
  • the lower part of Figure 2 represents the variation of the longitudinal magnetization Mz of the tissues of the area to be imaged as a function of time t during this elementary sequence SE1.
  • the elementary acquisition sequence SE1 includes an acquisition called black blood ACQ1 followed by an acquisition called white blood ACQ2 which will be described later.
  • Acquisition in black blood ACQ1 makes it possible to acquire the signals of the area to be imaged making it possible to generate an elementary image in black blood IM1 of the area to be imaged.
  • Acquisition in white blood ACQ2 makes it possible to acquire the signals of the area to be imaged, making it possible to generate an elementary image in white blood IM2 of the area to be imaged.
  • These Acquisition stages ACQ1, ACQ2 each include a preparatory module PREP1, PREP2 and a reading module LE1, LE2.
  • module means a step comprising a radio frequency pulse or a series of radio frequency pulses.
  • the static magnetic field generator GEN_B is controlled by the processing unit TC so that 'it generates a fixed static magnetic field along the z axis.
  • the gradient generator GEN_GRAD is for its part controlled for the processing unit TC so that the radio frequency device D_RF acquires signals coming from a predefined section having a predefined thickness during the elementary acquisition sequence SE1.
  • the acquisition sequence is an acquisition sequence by late gadolinium enhancement implemented following the injection of a Gadolinium-based contrast product intravenously into the patient, 10 to 15 minutes before the start-up. implements acquisition sequences so as to obtain images with maximum contrast between lesions and healthy tissues and blood.
  • a Gadolinium-based contrast product intravenously into the patient, 10 to 15 minutes before the start-up.
  • contrast is rapidly eliminated from healthy myocardium, poor in interstitial tissue, but accumulates over a prolonged period in myocardial lesions.
  • Gadolinium has an extracellular distribution, that is to say it does not cross the membranes of cardiomyocytes.
  • Gadolinium has the effect of shortening the T1 relaxation time of the tissues where it accumulates.
  • the relaxation of the magnetization of lesions following a magnetization reversal pulse is thus faster than that of blood and healthy myocardium.
  • the RF device D_RF implements an acquisition step in black blood ACQ1 in inversion-recovery.
  • This ACQ1 black blood acquisition step includes a longitudinal inversion pulse denoted 180° in Figure 2, which tilts the longitudinal magnetization of the tissues of the imaged area in the opposite direction, that is to say which inverts the longitudinal magnetization of these tissues.
  • the magnetization of the area to be imaged goes from Mz to -Mz under the effect of the inversion pulse. Due to longitudinal relaxation, the longitudinal magnetization of the different tissues present in the area to be imaged increases to return to its initial value, passing through the zero value. Naturally, the relaxation kinetics of different tissues are different.
  • the black blood acquisition ACQ1 also comprises a preparatory module PREP1 implemented after the 180° longitudinal inversion pulse, for example, an adiabatic module in T1 -rho (Tip) of duration denoted TSL (acronym of the Anglo-Saxon expression “Time of Spin Lock”) or a T2-weighted module, or MTC type (acronym of the Anglo-Saxon expression “Magnetization Transfer Contrast”) or a combination of two of these modules or these three modules.
  • a preparatory module PREP1 implemented after the 180° longitudinal inversion pulse, for example, an adiabatic module in T1 -rho (Tip) of duration denoted TSL (acronym of the Anglo-Saxon expression “Time of Spin Lock”) or a T2-weighted module, or MTC type (acronym of the Anglo-Saxon expression “Magnetization Transfer Contrast”) or a combination of two of these modules or these three modules.
  • the PREP1 preparatory module is configured so that the longitudinal magnetization of the blood A(Blood) and that of the healthy myocardium A(Musk) cancel each other out at the same instant t.
  • the longitudinal magnetization of the A(Cica) lesions is significantly greater than zero.
  • the first acquisition step ACQ1 in inversion-recovery then comprises a reading sequence LE1 comprising a 90° pulse applied at time te and a reading gradient to read the transverse magnetization of the area to be imaged.
  • the inversion time Tl is the duration separating the 180° pulse of the reading sequence LE1 from the elementary sequence ACQ1.
  • the reading module LE1 of the black blood acquisition is spaced temporally from the preparatory module PREP1 of the black blood acquisition.
  • the LE1 reading module begins as soon as the PREP1 preparatory module ends. The same applies to the relative temporal positioning between the PREP2 preparatory module of the white blood acquisition and the LE2 reading module of the white blood acquisition.
  • the inversion pulse IMP1 is generated before the preparatory module PREP1.
  • the preparatory module PREP1 is generated before the inversion pulse IMP1.
  • the elementary white blood image IM2 of the area to be imaged is generated from signals acquired by implementing the white blood acquisition step ACQ2 comprising a preparatory module PREP2 followed by a reading module LE2.
  • the preparatory module PREP2 is identical to the preparatory module PREP1 of the black blood acquisition step ACQ1, but the invention also applies when these modules are distinct.
  • the PREP2 preparatory module is, for example, an adiabatic T1 rho sequence.
  • the PREP2 module comprises at least one preparatory sequence taken from a T2-weighted module and an MTC type preparatory module (acronym for the Anglo-Saxon expression “Magnetization Transfer Contrast”) or a combination of two of these modules or of these three modules.
  • the white blood acquisition step ACQ2 then comprises a reading module LE2 comprising a reading gradient to read the transverse magnetization of the area to be imaged.
  • This reading module LE2 can be produced in gradient echo or spin echo, just like the reading module LE1 of the black blood acquisition step LE1.
  • the LE1 and LE2 reading modules can be the same or different.
  • the duration D2 separating the reading module LE2 is defined so that the longitudinal magnetization of the blood A(Blood) is greater than that of the Myocardium A(MUSC) which leads to generating an image in which the pixels or voxels of the blood are white, that is to say with a high luminance, and in which the pixels of the myocardial tissues are a little less luminous than those of the blood as can be deduced from the curves shown in Figure 2.
  • the processing unit TC is configured to synchronize the acquisition sequence SE with the electrocardiogram E.
  • the TC processing unit uses the electrocardiogram E to generate commands for triggering the acquisition sequences intended for the RF device, the gradient generator and possibly the generator of the main magnetic field.
  • Each elementary acquisition sequence SEi is advantageously implemented during two consecutive cardiac cycles, preferably during two consecutive interbeats C1, C2 referenced in Figure 2 constituting a pair of interbeats CBi referenced in Figure 1.
  • An interest is to minimize the acquisition time and therefore to minimize the movements of the heart between the different acquisitions and the spatial shifts between the images IM1 and IM2.
  • a beat, a QRS complex, and an interbeat a phase of a cardiac cycle located between two consecutive beats.
  • the consecutive elementary acquisition sequences SEi are implemented during pairs of consecutive interbeats CBi.
  • Each SEi elementary acquisition sequence includes:
  • An advantage is to minimize the acquisition time and therefore to minimize the movements of the heart between the different acquisitions and the spatial shifts between the images IM 1 and IM2 acquired during the different elementary sequences SEi.
  • the acquisition sequence SE and the electrocardiogram E are synchronized so that the reading modules LE1, LE2, are implemented during the same phase of respective cardiac cycles C1, C2 .
  • this phase is an interbeat.
  • this phase is diastole.
  • the acquisition sequence SE and the electrocardiogram E are synchronized so that the reading modules LE1, LE2 of the black blood and white blood acquisition steps ACQ1, ACQ2 are implemented at the same instants of these cardiac cycles respective C1, C2.
  • the temporal reference is, for example; the maximum of the QRS complex.
  • the synchronization of the reading modules LE1, LE2 of the black blood and white blood acquisition sequences ACQ1, ACQ2 and, as we will see later, of different step reading modules acquisition in white blood on the one hand and the different modules for reading acquisition stages in black blood on the other hand, makes it possible to generate images of the heart at times when the heart occupies the same position in a reference frame fixed relative to the main magnet which allows the images obtained to be superimposed without any registration being necessary or by carrying out a simple registration.
  • the invention also applies when the order of the acquisition steps is different. For example, we can implement several ACQ1 black blood acquisition steps during consecutive interbeats then several ACQ2 white blood acquisition steps during consecutive interbeats and vice versa.
  • At least one ACQ2 white blood acquisition step is spaced from a temporally closest black blood ACQ1 acquisition step.
  • the TC control processing unit is configured so as to generate commands intended for the MRI device to acquire respective cut signals distributed along a predefined axis of the heart.
  • the axis is advantageously the long axis of the heart.
  • the cuts obtained are then so-called short axis cuts.
  • An advantage is that it allows excellent visualization of both ventricles.
  • the invention also applies to the case where the sections are distributed along another axis of the heart, for example an axis in 2 cavities (long vertical axis) or 4 cavities (long horizontal axis) of the heart.
  • Each section has a thickness defined along the axis and is centered on a predefined cutting plane perpendicular to the axis.
  • cut we mean in the present application, a slice or layer perpendicular to the axis g and having a predefined thickness along the axis.
  • the cuts are contiguous along the axis.
  • the signals are acquired according to adjacent or partially overlapping sections. This allows the heart to be completely imaged.
  • the gradient generator GEN_GRAD is controlled so that several two-dimensional images of each section can be generated, from the signals acquired during the acquisition sequence SE.
  • the cutting planes are distributed from the AP apex to the BA base of the CO heart. Consequently, the cuts are called “short axis cuts”.
  • the system is configured to acquire signals from a volume, for example from the entire heart so as to enable the generation of three-dimensional images.
  • the SE acquisition sequence is implemented while the patient is in apnea.
  • the SE acquisition sequence is implemented in free breathing.
  • Free-breathing acquisition has temporal advantages. Indeed, free-diving acquisition must be rapid, which requires reducing the acquisition time from a few seconds to a few minutes and often involves having to reduce the area to be imaged, for example by limiting it to a 3D portion.
  • the acquisition sequence SE being synchronized with the ECG so that the reading sequences are put implemented at the same time marker of different cardiac cycles, breath-hold acquisition leads to generating a limited number of images.
  • the TC processing unit is configured to generate GEN, by reconstruction techniques known to those skilled in the art, images of the area to be imaged.
  • the generation step includes a step of generating elementary two-dimensional (2D) or three-dimensional (3D) images of the area to be imaged from the signals acquired during the acquisition sequence SE.
  • the elementary images IM1, IM2 are advantageously generated in gray level.
  • Each image comprises a set of unit elements of pixel or voxel type, each characterized by an intensity I capable of taking a set of N values (N being a finite integer greater than 1) corresponding to N gray levels ranging from 0 and N-1.
  • N being a finite integer greater than 1
  • this value can take 256 values between 0 and 255, but N is not limited to 256.
  • This value can advantageously take 4096 values between 0 and 4095.
  • the TC processing unit is also configured to use the elementary images obtained to characterize lesions of the heart, for example of the myocardium as we will see in more detail later in the text.
  • the elementary images generated by the processing unit TC can be intended to be displayed on a screen of the man-machine interface INT.
  • the method does not have an image registration step.
  • the step of generating GEN images comprises the registration of elementary images in black blood with each other and/or the registration of elementary images in white blood with each other and/or the registration of elementary images in black blood and in white blood between them.
  • the method comprises the registration of elementary images in black blood of the same section.
  • the registration is carried out using a non-rigid image registration algorithm.
  • the method comprises the registration of elementary white blood images of the same section.
  • the registration is carried out using a non-rigid image registration algorithm.
  • the method comprises the registration of elementary images in black blood IM1 and in white blood IM2 with each other.
  • the method comprises the registration of elementary images in white blood and elementary images in black blood of the same section.
  • this registration is carried out using a non-rigid image registration algorithm.
  • these algorithms are identical. It is possible to choose a different algorithm for processing elementary images in black blood and white blood, but it is preferable to choose the same algorithm for ease of implementation. Registration significantly improves the quality, in particular the contrast, of an image resulting from a plurality of images elementary from the same cup. Furthermore, it helps reduce artifacts related to breathing.
  • At least one of the non-rigid algorithms is an algorithm based on the method of mutual information between images based on statistical relationships.
  • the function to be optimized can be implemented by a statistical similarity criterion.
  • At least one of the non-rigid algorithms is based on a transformation model is implemented.
  • the transformation model makes it possible to determine functions to minimize the difference between two images.
  • the deviation can be translated by a geometric error to be minimized.
  • Different approaches can be used, such as those based on the extraction from each of the images of geometric primitives or shape descriptors such as salient points, singularities of shapes or contours.
  • a parametric or non-parametric approach can be used.
  • the least squares method can be used.
  • the registration can be carried out by choosing a reference image and determining a transformation function of the other images of the same section with respect to this image. Each image is then registered by optimizing a transformation to obtain the reference image according to a geometric criterion from the image considered.
  • acquiring three-dimensional images it is possible to acquire several three-dimensional images of the heart, which can possibly be registered.
  • the combination of images can be carried out before, during or after the GEN generation of the images.
  • the combination is an averaging.
  • Averaging is, for example, carried out in image space or in Fourier space (i.e., the frequency domain, before reconstruction of the images). These solutions are computationally inexpensive and fast.
  • Averaging has the advantage of preserving image detail, since it increases the signal-to-noise ratio (SNR). This technique smoothes noise to reduce residual image artifacts. Additionally, averaging helps improve the bit depth of the digital image beyond what is possible with a single image.
  • SNR signal-to-noise ratio
  • An advantage of the step of averaging the images produced from the same section is to reduce the maximum deviation.
  • the amplitude of the noise decreases as the square root of the number of images used, i.e. with only 4 images we can reduce the amplitude of the noise by a factor two. According to an example of a free breathing acquisition lasting 2 minutes, it is possible to collect 4 to 5 images per cutting plane, which makes it possible to obtain good noise reduction performance.
  • the combination of images can alternatively be implemented by motion-compensated iterative reconstruction.
  • this type of combination is implemented during image reconstruction.
  • Compensated MRI reconstruction techniques are described in particular in the following articles: Odille F, et al., “Generalized reconstruction by inversion of coupled systems (GRICS) applied to free-breathing MRI” Magnetic Resonance in Medicine, 2008; and “3D whole-heart isotropic sub-millimeter resolution coronary magnetic resonance angiography with non-rigid motion-compensated PROST”, Bustin A, et al, Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 2020.
  • GRICS inversion of coupled systems
  • the elementary images on the one hand in black blood and on the other hand in white blood are respectively combined so as to produce a combined black blood image ISNk and a combined white blood image ISBk by section.
  • these elementary images IM1, IM2 are generated from signals acquired by implementing an acquisition sequence.
  • This acquisition sequence includes ACQ2 white blood acquisition steps.
  • Each ACQ2 white-blood acquisition step is distinct from a reversal-recovery sequence.
  • this sequence is devoid of a pulse for reversing the longitudinal magnetization of the area to be imaged. Consequently, unlike PSIR imaging during white blood acquisition, the longitudinal magnetization of the myocardium is not canceled which makes it possible to obtain images presenting a stronger contrast between the lesions and the blood and therefore promote diagnosis and image processing.
  • the white blood acquisition is configured so that when the LE2 reading module is implemented, the respective longitudinal magnetizations of the healthy myocardium, the blood and the lesions are positive and the longitudinal magnetization of the lesions is between the magnetization of healthy myocardium and that of blood. This is obtained by the configuration of the preparatory module PREP2 and that of the reading module LE2 and by the relative temporal positioning between these two modules.
  • the lesion characterization process includes the following steps:
  • Each white blood ISB, respectively black blood ISN image is an elementary image IM1 k(j), IM2kO) or a combined image in white blood ISBk, respectively in black blood ISNk.
  • each image in white blood ISB is a combined image in white blood ISBk and that each image in black blood ISN is a combined image in black blood ISNk .
  • the invention makes it possible to characterize, in an automatic, reproducible, reliable and precise manner, a cardiac lesion, and more precisely cardiac muscles, in particular lesions of the myocardium.
  • segmentation of ISBk white blood images generated from signals measured during the ACQ2 white blood acquisition steps distinct from inversion-recovery sequences makes it possible to position the walls in an automatic, robust, reliable and precise manner. delineating the myocardium, as these images show significant contrast between the myocardium and blood. ISNk black blood images do not provide as good results due to the lack of contrast between the healthy myocardium and the blood.
  • the lesion characterization which uses, in addition to the positioning data resulting from the segmentation, an ISNk black-blood image, makes it possible to obtain good results that would not make it possible to obtain on its own the ISBk white-blood image containing little or no no information on cardiac damage.
  • the SEG segmentation is implemented using at least one white blood image ISBk so as to generate positioning data of a first wall L1 and a second wall L2 delimiting the myocardium M and surrounding and delimiting a cavity of the heart, the first wall L1 surrounding the second wall L2.
  • the positioning data relating to a wall corresponds, for example, to the identification of the pixels constituting the wall.
  • the generated images are, for example, in gray levels.
  • the white areas in Figure 6 represent areas lighter than the dotted areas represent areas lighter than the gridded areas which represent areas lighter than the bricks.
  • the cavity of the heart is the left ventricle and the SEG segmentation is implemented so as to delimit the walls L1, L2 of the part of the myocardium surrounding and delimiting the left ventricle.
  • the invention is described in the case where the cavity of the heart is the left ventricle, but the invention is applicable to any chamber of the heart, such as the right ventricle and atria which are also surrounded and bounded by the myocardium and subject to cardiac damage.
  • the second L2 wall is the wall delimiting the myocardium and the LV left ventricle.
  • the first L1 wall surrounding the second L2 wall is the external wall, that is to say facing outwards, of the LV left ventricle, of the part of the myocardium surrounding the LV left ventricle. This is the epicardium.
  • the second L2 wall is the wall of the myocardium delimiting the left ventricle. This is the endocardium.
  • SEG segmentation is implemented so as to generate positioning data for only one of these two walls, for example the external wall of the myocardium.
  • the segmentation is carried out by implementing a learning function or algorithm, for example an artificial neural network, to segment a white blood image so as to delimit at least one wall of the myocardium surrounding and delimiting a cavity of the heart.
  • a learning function or algorithm for example an artificial neural network
  • the learning function is a neural network.
  • the artificial neural network used for segmentation is advantageously a convolutional neural network.
  • the convolutional neural network is, for example, of the U-Net type or of the transformer type also called self-attentive model, for example, of the type commonly called swin transformer.
  • the neural network or more generally the learning function, is implemented on two-dimensional (2D) images and/or on three-dimensional (3D) images. In other words, it is trained to carry out the desired segmentation by receiving 2D and/or 3D images as input.
  • the learning function is trained, prior to implementing the method according to the invention, from white blood images of the heart, generated from signals acquired during respective white blood acquisition stages distinct from recovery inversion sequences, and labeled by specialists, that is to say segmented by specialists, so that the trained learning function receiving input data comprising a white blood image of the heart, is able to segment so as to delimit at least one wall of the myocardium surrounding and delimiting a cavity of the heart.
  • the learning function is, for example, configured to deliver, from a white blood input image generated from signals acquired during a white blood acquisition step distinct from a sequence of inversion recovery, an output image in which the pixels or voxels corresponding to the walls or contours L1 and L2 are colorized in a predetermined intensity or color or in respective predetermined colors.
  • the method may include a step of propagation of the walls detected during the SEG segmentation step, on at least one dark blood image.
  • the method can include a REP transfer step, that is to say the propagation, comprising the identification, on a black blood image ISNk, of the pixels or voxels corresponding to the walls L1 and L2 identified during SEG segmentation.
  • FIG 6 there is shown schematically at the bottom left a black blood image ISNk of the section of the heart and at the bottom right the black blood image on which the walls L1 and L2 detected are represented in thick black lines during the SEG segmentation step.
  • the identification, on the black blood image ISNk, of the pixels or voxels corresponding to the first wall L1 and respectively to the second wall L2 is determined from the positions of the pixels or voxels corresponding to these walls on the blood image white ISBk.
  • pixels or voxels can have the same respective positions on the white blood image and on the black blood image when we consider that these images are spatially aligned and because these images have the same size and the same resolution.
  • a predetermined or calculated spatial offset may alternatively be applied to these pixels or voxels when it is estimated that a spatial offset exists between these images.
  • the report may include the annotation or coloring of pixels or voxels corresponding to walls L1 and L2.
  • the characterization includes segmentation for each ISBk white blood image so as to generate respective positioning data obtained from the respective ISBk white blood images.
  • the characterization includes the transfer to each black blood image ISNk, of the pixels or voxels corresponding to the L1 and L2 walls identified during the SEG segmentation, from one of the white blood images ISBk.
  • the pixels or voxels reported on the different black blood images or combined black blood images are advantageously identified from respective white blood images.
  • the positioning data used for transfer to a black blood image ISNk are generated from a white blood image ISBk generated from signals measured during the same elementary acquisition sequence.
  • the positioning data generated from a combined white blood image ISBk of order k is advantageously transferred to a combined black blood image ISNk of order k.
  • the CAR lesion characterization step consists of characterizing the heart from the point of view of the lesions using one or more black-blood image(s) ISNk and positioning data of at least one wall, for example of the second wall L2 , obtained from one or more ISBk white blood images.
  • This step advantageously makes it possible to generate data characterizing the heart from the point of view of lesions.
  • This step is implemented by the CT processing unit.
  • the CAR characterization step may include a DE lesion detection step and/or a CAE lesion characterization step.
  • the CAE lesion characterization step is implemented.
  • the CAE lesion characterization step can be implemented only on the condition that a lesion is detected during the DE detection step.
  • the DE detection step is implemented after the CAE lesion characterization step or after one of the steps of this CAE effective lesion characterization step.
  • the CAE lesion characterization step does not have a DE detection step.
  • the detection step will be described later.
  • the lesion characterization step CAE advantageously comprises a lesion segmentation step SC of at least one black blood image ISNk so as to generate positioning data of at least one cardiac lesion possibly present in the figure, the lesion segmentation SC using positioning data from the first wall L1 and possibly those from the second wall L2, generated during the SEG segmentation step.
  • size of a lesion we mean data representative of the dimensions of the lesion, such as a volume or a surface, for example or a number of pixels or voxels.
  • SC lesion segmentation uses one or more ISNk black blood image(s) and positioning data from the first wall L1 and possibly those of the second L2 wall resulting from SEG segmentation.
  • This positioning data can be positioning data generated during the SEG segmentation step or positioning data from the REP report step.
  • the SG lesion segmentation step includes the report step.
  • This step makes it possible to locate cardiac lesions, that is to say, to generate data on the location of cardiac lesions.
  • This lesion location data includes, for example, the identification or positions of pixels or voxels corresponding to lesions.
  • the SC lesion segmentation step is advantageously implemented by thresholding.
  • This zone is determined from the positioning data of the first wall L1 and possibly those of the second wall L2 resulting from the SEG segmentation.
  • the area of the black blood image is the area surrounded and delimited by the first wall L1.
  • the lesion segmentation step SC comprises the search for pixels or voxels of intensity greater than or equal to a predetermined intensity threshold only in the area delimited and surrounded by the first wall L1 on one or more image(s). in black blood ISNk.
  • these pixels or voxels are taken only from the pixels or voxels of an area of the image or images in black blood surrounded and delimited by the first wall L1. This helps prevent erroneous detection of lesions by beyond the epicardium, avoiding confusion between lesions and fat surrounding the epicardium and represented, on black blood images, by high intensity pixels.
  • the zone Z is the zone of the black blood image(s) ISNk delimited by the first wall L1 and by the second wall L2.
  • SC lesion segmentation includes the search for pixels of intensity greater than or equal to a predetermined intensity threshold only in the area delimited by the two walls L1 and L2 of one or more black blood images ISNk.
  • This variant has the advantage of identifying pixels or voxels of myocardial lesions only. Indeed, it happens that patients have necrosis of the papillary muscles (located in the area delimited by the L2 wall). In these patients the muscles are white on the black blood image which can lead to errors in lesion characterization when segmenting the lesions in the entire area delimited by L1.
  • the SC lesion segmentation includes the search for pixels of intensity greater than or equal to a predetermined intensity threshold only in the area surrounded by the L2 wall. This step makes it possible to identify the pixels or voxels of the papillary muscles only.
  • the segmentation is implemented using a neural network, for example, a convolutional neural network trained to segment cardiac lesions in an area delimited by the L1 and/or L2 walls when it receives data as input.
  • a neural network for example, a convolutional neural network trained to segment cardiac lesions in an area delimited by the L1 and/or L2 walls when it receives data as input.
  • the DE detection step comprises detecting the absence or presence of lesions using a black-blood image ISNk and positioning data of at least one wall, for example, of the second wall L2. It generates an output indication of the presence or absence of cardiac lesions.
  • the DE detection step can be carried out by thresholding or by using a neural network like the segmentation step.
  • This step may consist of determining whether a number of contiguous pixels or voxels greater than a predetermined threshold has an intensity greater than a predetermined threshold in the area delimited by the wall L1 and/or the wall L2 whose positioning is defined during the SEG segmentation step of the myocardium. The presence of cardiac lesions is detected if this condition is verified and the absence of cardiac lesions is detected if this condition is not verified.
  • the neural network is, for example, a convolutional neural network.
  • the neural network is, for example, trained to detect the presence or absence of cardiac lesions in an area delimited by the walls L1 and/or L2 when it receives as input the positioning data of the corresponding wall(s) and the image in black blood.
  • the next step is advantageously the GENR generation step.
  • the black blood image ISNk is shown, on which the limits L1 and L2 identified during the segmentation and transferred, that is to say propagated, on the image are represented in thick lines. in black blood ISNk as well as the pixels identified as being pixels of the lesion.
  • the CAR characterization advantageously includes a CTA calculation step of lesion size.
  • This CTA calculation step comprises the determination of at least one elementary data representative of the size of at least one cardiac lesion, for example of the myocardium, using location data of the location data of the first and/or second walls L1 , L2 which are for example directly the positioning data resulting from the SEG segmentation of the myocardium or data resulting from these data, for example, data resulting from the transfer step or positioning data of the lesion obtained during the SC lesion segmentation step.
  • An elementary data representative of a lesion size can be a percentage of a surface of the myocardium occupied by a lesion on a SEC sector of a black blood image ISNk or a volume or a mass of the lesion in this SEC sector starting from axis I parallel to axis p and passing substantially through the center of the cardiac cavity on the black blood image ISNk and delimited by two rays R starting from axis I as visible on the black blood image ISNk.
  • the percentage of the surface of the myocardium occupied by the lesion in the SEC sector can be calculated from the ratio between the number of pixels corresponding to the lesion in this SEC sector and the number of pixels corresponding to the myocardium in this SEC sector.
  • the number of pixels corresponding to the lesion in this SEC sector can be calculated from the location data obtained during the lesion segmentation step or directly be calculated during the CTA calculation step, for example by selecting, by thresholding, the number of pixels having an intensity greater than a predetermined threshold in the portion of the SEC sector delimited by the walls L1 and L2 or by the wall L1.
  • the CTA step may include the calculation of data representative of the lesion size in a SEC sector from several elementary data representative of the lesion size calculated, in this SEC sector, for several black blood images ISNk distributed along the p axis.
  • a combination or an average of elementary data is calculated.
  • the volume of lesion on a SEC sector can be calculated from the ratio between the number of pixels corresponding to the lesion on this sector and the number of pixels corresponding to the myocardium on this sector, from the thickness of the section corresponding to a black blood image ISNk, when the image is two-dimensional.
  • the size and/or volume are advantageously also calculated from the predetermined resolution of the images.
  • the density of the myocardium is 1.06 g/ml. We therefore consider that the mass of a lesion is approximately equal to the volume of the latter, which makes it possible to evaluate the mass of the lesion.
  • the CTA calculation step can, for example, include the division of the black blood image ISNk into a first predefined number, equal to 12 in the non-limiting example of Figure 1, predefined SEC sectors of the same angle crl opening fc pointing towards axis I and the calculation of the percentage of myocardial surfaces occupied by the lesion on the different SEC sectors.
  • the first number of sectors and the opening angle al k can vary depending on the cutting plane PCk. For example, the closer the cutting plane PCk gets to the apex along the major axis, the more the number of sectors decreases and the opening angle al k increases.
  • the method advantageously comprises a GENR generation step, by computer, for example by processing unit, a set of at least representation of lesion characterization data and an AFFD display step of at least one representation of the set of at least one representation on a screen of the human interface - machine.
  • the generation step comprises for example the generation of data representative of the result of the detection step DE, that is to say the absence or presence of lesion and the display step comprises displaying this data.
  • the set of at least one representation advantageously comprises a first REPT representation of the data representative of the lesion size calculated during the CTA calculation step.
  • the Bull's eye representation is defined by the American Heart Association AHA with reference to the Anglo-Saxon expression "American Heart Association” and described in the following article: "Standardized Myocardial Segmentation and Nomenclature for Tomography Imaging of the Heart: A Statement for Healthcare Professionals From the Cardiac Imaging Committee of the Council on Clinical Cardiology of the American Heart Association. » Manuel D. Cerqueira et Al, Circulation, 2002; 105:539-42.
  • the bull's eye type representation includes a plurality of concentric circles CE separated in pairs by crowns CO.
  • Each CO crown is assigned to a cut or set of cuts contiguous knowing that the more the crown CO corresponds to a cut or a set of cuts close to the apex, the closer it is to the center of the circles.
  • Each crown CO is divided into portions of sectors PSE in which are displayed, as in the example of Figure 7, the percentages of the surface of the myocardium occupied by a lesion and calculated for the respective sectors of the black blood image ISNk of the corresponding section or combinations, for example averages, percentages calculated from the percentages of the surface of the myocardium occupied by a lesion calculated for the sectors of the black blood images of the set of corresponding sections.
  • the intensity of the pixels of the different portions of crowns depends on the calculated percentage. The lower this percentage, the higher the intensity of the corresponding corona.
  • the display is shown in the form of a known bull's eye type representation of the respective averages of the percentages of the size of the lesion calculated in the respective sectors defined on three sets of images in contiguous black blood distributed along the p axis associated with the three respective crowns corresponding respectively to a section of the apex (inner crown), to the mid-ventricle (middle crown) and to the basal zone (outer crowns).
  • the CAR characterization step advantageously includes a step of calculating data representative of a percentage of transmurality of a lesion.
  • percentage of transmurality we mean the percentage of a thickness of the myocardium occupied by a lesion.
  • This CTT calculation step comprises the determination of at least one data representative of the percentage of transmurality of at least one myocardial lesion using lesion location data and location data of the first and/or second walls L1, L2 from the segmentation step.
  • This data can be a percentage of the thickness of the myocardium occupied by a lesion on a sector of the black blood image ISNk starting from axis I
  • the percentage of the thickness of the myocardium occupied by the lesion on the sector can be calculated from the ratio between a number of pixels corresponding to the thickness of the lesion on this sector and the number of pixels corresponding to the thickness of the myocardium in this sector.
  • the number of pixels corresponding to the thickness of the lesion can be a number obtained from the results of the SC lesion segmentation step or be calculated, for example by thresholding, during the CTT calculation step from the data. positioning of L1 and possibly L2 from the SEG segmentation step.
  • the number of pixels corresponding to the thickness of the lesion on a sector can be an average or a maximum of numbers of pixels, corresponding to the thickness of the lesion, calculated according to different radii of the sector.
  • the number of pixels corresponding to the thickness of the myocardium on a sector can be an average or a maximum of numbers of pixels, corresponding to the thickness of the myocardium, calculated according to different radii of the sector. These numbers are calculated from positioning data of walls L1 and L2.
  • the CTT calculation step can, for example, include the division of the black blood image ISNk into a second predefined number of sectors with the same opening angle a2 k pointing towards the center of the cardiac cavity and the calculation of the percentage of surfaces of the myocardium occupied by the lesion on the different sectors.
  • the second number of sectors and therefore the opening angle a2 k can vary depending on the cutting plane PCk. For example, the closer the cutting plane PCk gets to the apex, the more the number of sectors decreases and the opening angle a2 k increases.
  • the CTT step may include the calculation of data representative of the transmurality in a sector from several elementary data representative of the transmurality calculated in this sector for several black blood images ISNk distributed along the p axis.
  • a combination or an average of elementary data is calculated.
  • This step can be implemented for different black blood images ISNk of different sections centered on respective PCk section planes.
  • the GENR step advantageously comprises the generation of a REPTR representation of data representative of a percentage of transmurality.
  • the AFFD display step advantageously includes the display of this representation.
  • the intensity of the pixels in this image advantageously, but not necessarily, represents the percentage of transmurality.
  • the display is shown in the form of a bull's eye type REPTR representation of the averages of percentages of transmurality of the lesion calculated in the sectors defined on several sets of black blood images. contiguous taken according to respective cutting planes distributed along the axis p.
  • the bull's eye type representation includes a plurality of portions of sectors whose intensity corresponds to the combination of the percentage of transmurality calculated for this portion of sector.
  • the percentages are displayed in the sector portions.
  • the acquisition sequence in black blood and white blood of the method according to the invention requires a relatively short acquisition time, in particular when signals are acquired to generate 2D images which involve little calculation.
  • This advantageously makes it possible to implement the acquisition sequence during apnea breathing and to limit the movements of the heart between the images and therefore the corrections to be made, which makes it possible to limit the calculation resources and the implementation of the method in time. real.
  • long MRI acquisitions are uncomfortable for the patient. A duration of 10 to 20 min is considered a very long duration and it is difficult for the patient to remain within the MRI without making any movement.
  • artifacts of an image extracted from a cutting plane of the 3D image likely to result in cases in which it is impossible to discriminate the presence of a potential lesion from the presence of blood located near the muscle.
  • the lesion is so close to the blood, we call it subendocardial, that it is difficult to know, on images presenting artifacts, if it is a lesion, blood or an artifact of the image.
  • the method according to the invention makes it possible to base a clinical decision with little risk of diagnostic error on the presence of a lesion or not.
  • the TC processing unit can be seen as a calculator interacting with computer programs.
  • the TC processing unit comprises at least one computer, for example, a microcomputer, a computer network, an electronic component, a tablet, a Smartphone or a personal digital assistant (PDA).
  • a microcomputer for example, a microcomputer, a computer network, an electronic component, a tablet, a Smartphone or a personal digital assistant (PDA).
  • PDA personal digital assistant
  • the TC processing and control unit comprises, for example, a calculator, comprising a set of at least one processor, and possibly a memory operationally coupled to the calculator.
  • the memory includes, for example, a computer-readable medium.
  • the computer-readable medium is a tangible device readable by a reader of the processing unit, capable of memorizing electronic instructions and of being coupled to the communication system or communication unit.
  • computer-readable media is tangible media. That is, it is not a transient signal per se, such as radio waves or other freely propagating electromagnetic waves, such as light pulses or electronic signals.
  • a computer-readable storage medium is, for example, an electronic storage device, a magnetic storage device, an optical storage device, an electromagnetic storage device, a semiconductor storage device or any combination thereof. -this.
  • the readable medium is an optical disk, a magneto-optical disk, a read-only memory (ROM, from English Read-Only Memory), an erasable and programmable read-only memory (EPROM, from English Erasable Programmable Read-Only Memory), a programmable and electrically erasable read-only memory (ÉEPROM, from English Electrically Erasable Programmable Read-Only Memory), a random access memory (RAM, from English Random Access Memory), a magnetic card or a optical card.
  • ROM read-only memory
  • EPROM erasable and programmable read-only memory
  • EUEPROM programmable and electrically erasable read-only memory
  • RAM random access memory
  • magnetic card or a optical card.
  • the readable medium may include an operating system and load the programs according to the invention. It includes registers adapted to record parameter variables created and modified during the execution of the aforementioned programs.
  • a computer program comprising software instructions is then stored on the readable medium.
  • program instructions are taken from an external source and downloaded over a network. This is particularly the case for applications.
  • the processing and control unit comprises a calculator, that is to say at least one electronic data processing circuit designed to manipulate and/or transform data represented by electronic or physical quantities in registers of the system evaluation and/or memories into other similar data corresponding to physical data in the memories of registers or other types of display devices, transmission devices or storage devices.
  • the CT processing unit comprises, for example, memories, for storing data, for example black blood and white blood images, operationally coupled to the data processing circuit and a reader adapted to read a computer readable medium.
  • the steps of the method according to the invention are, for example, executed by causing the processing circuits of the CT processing unit to read predetermined programs recorded on hardware such as memories such that their data processing circuits perform calculations, control communications and read and/or write data to memories.
  • the characterization is, for example, carried out on a processing device, for example a single computer, or on a system distributed between several computers (in particular via the use of cloud computing).
  • the CT processing unit comprises at least one calculator comprising at least elements listed below: a set of one or more processors (for example at least one central processing unit (CPU) and/or at least one processing unit graphics processing (GPU) and/or a microcontroller and/or a digital signal processor (DSP)) ASIC capable of interpreting instructions in the form of a computer program and/or a hardware assembly such as an integrated circuit specific to an application ( ASIC), an in situ programmable gate array (FPGA), a programmable logic device (PLD), programmable logic arrays (PLA), a system on chip (SOC), and/or an electronic card in which steps of the method according to the invention are implemented in hardware elements.
  • the invention relates to a computer program product comprising the computer readable medium containing instructions which, when executed by the processing circuit, cause the system S to implement the steps of the method according to the invention .
  • the program product may include the computer-readable recording medium.
  • the invention also relates to a computer-readable medium on which the computer program is recorded.
  • program instructions are taken from an external source and downloaded over a network.
  • the computer program product comprises a computer-readable data carrier on which the program instructions are stored or a data carrier signal on which the program instructions are encoded.
  • the form of the program instructions is, for example, a source code form, a computer executable form or any intermediate form between a source code and a computer executable form, such as the form resulting from the conversion of the source code via a interpreter, assembler, compiler, linker or locator.
  • the program instructions are microcode, firmware instructions, state definition data, integrated circuit configuration data (e.g. VHDL), or object code.
  • Program instructions are written in any combination of one or more programming languages, for example, object-oriented programming language (C++, JAVA, Python), procedural programming language (C language for example).
  • the communication unit comprises at least one communication device allowing communication between the elements of the system and possibly between at least one element of the system and a device external to the system.
  • Communication systems can establish a physical link between elements of the system and/or between an element of the system and a device external to the system and/or a remote (wireless) communication link between elements of the system and/or between an element of the system and a device external to the system.
  • the communications device may include any hardware, firmware and/or software suitable for communicating information between elements of the device to which the communications device belongs, for example via a data bus, or to an element external to the device.
  • these devices include firmware and/or software hardware making it possible to establish, between them, a wired or wireless communication link. , for example Wi-Fi, Bluetooth, cellular or Ethernet.
  • the INT user interface allows a user to enter data or commands so as to be able to interact with the programs according to the invention.
  • the INT user interface includes, for example, an INTS interface and output and an INTE input interface.
  • the input interface includes, for example, a keyboard or a pointing interface, such as a mouse, an optical pen, a touchpad, a remote control, a voice recognition device, a haptic device.
  • a keyboard or a pointing interface such as a mouse, an optical pen, a touchpad, a remote control, a voice recognition device, a haptic device.
  • the INTS output interface is designed to return information to a user, sensorially or electrically, for example visually or audibly.
  • the output interface includes, for example, a display.
  • the AFFD display step can be a step of restoring information by means other than a display.
  • the INTS output interface can be the INTE input device, for example, in the case of a touchscreen tablet.

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Abstract

Procédé de caractérisation lésionnelle du cœur utilisant des images comprenant : - une image en sang noir générée à partir de signaux acquis lors d'une acquisition par résonnance magnétique en sang noir (ACQ1) par rehaussement tardif du gadolinium, - une image en sang blanc générée à partir de signaux acquis lors d'une acquisition par résonnance magnétique en sang blanc par rehaussement tardif du gadolinium, l'étape d'acquisition en sang blanc (ACQ2) étant distincte d'une séquence d'inversion récupération, le procédé comprenant : - segmentation, par ordinateur, de l'image en sang blanc de sorte à générer des données de positionnement d'un ensemble d'au moins une paroi délimitant le myocarde, - caractérisation lésionnelle du cœur, par ordinateur, à partir de l'image en sang noir et de données de positionnement, d'au moins une paroi de l'ensemble d'au moins une paroi, prises parmi les données de positionnement d'un ensemble d'au moins une paroi délimitant le myocarde.

Description

Description
Titre : PROCÉDÉ DE CARACTÉRISATION LÉSIONNELLE DU CŒUR ET SYSTÈME ASSOCIÉ
Domaine de l’invention
L’invention concerne le domaine de l’imagerie par résonance magnétique (IRM) cardiaque par rehaussement tardif du gadolinium ou LGE, en référence à l’expression anglo-saxonne « Late Gadolinium Enhancement ».
Le domaine d’application de l’invention se rapporte plus particulièrement aux procédés et systèmes de caractérisation lésionnelle du cœur. Cette caractérisation permet, notamment, de guider les ablations.
La technique de référence pour la caractérisation de lésions régionales dont la fibrose myocardique est l’imagerie par rehaussement tardif du gadolinium en sang blanc ou BR-LGE (pour l’expression anglo-saxonne « bright-blood LGE ») par inversion récupération telle que la séquence PSIR (de l’expression anglo-saxonne « phase-sensitive inversion-recovery »). Dans ce type d’imagerie, on provoque l'annulation du signal myocardique viable à l'aide d'impulsions d’inversion-récupération ce qui permet de visualiser des lésions avec un contraste élevé entre le tissu myocardique sain et les lésions. Cependant, pour les lésions myocardiques adjacentes aux cavités sanguines du cœur (ventricules droit et gauche), l’intensité élevée du signal issu du sang et donc le faible contraste entre les lésions et le sang empêche la caractérisation automatique, précise, fiable et robuste des cicatrices, en particulier des cicatrices sous-endocardiques.
Afin de contourner ce problème, des techniques d'imagerie LGE en sang noir (BL-LGE) ont été proposées. Elles permettent d’annuler simultanément les signaux du myocarde sain et du sang fournissant ainsi un contraste élevé à la fois entre les lésions et entre le sang et entre les lésions et le myocarde sain.
Toutefois, les techniques d’imagerie en sang noir ne permettent pas de caractériser correctement les lésions, notamment les localiser précisément par rapport au myocarde, le contraste entre le sang et le myocarde sain n’étant pas suffisamment élevé.
Au vu des inconvénients précités, la caractérisation des cicatrices est actuellement réalisée par les radiologues en segmentant manuellement les lésions à partir des images issues des séquences PSIR, ce qui permet ensuite de calculer leur transmuralité et leur taille. Toutefois, ce procédé est chronophage puisque 25 à 30 minutes sont nécessaires au radiologue pour réaliser une telle segmentation. Par ailleurs, une telle segmentation est imprécise et non reproductible. En effet, le faible contraste entre la lésion et le sang, conduisant souvent le radiologue à imaginer la paroi sous-endocardique ce qui entraîne une surestimation ou une sous-estimation des caractéristiques de la cicatrice.
Un but de l’invention est de limiter au moins un des inconvénients précités.
A cet effet, l’invention a pour objet un procédé de caractérisation lésionnelle du cœur utilisant des images d’une zone à imager comprenant le cœur d’un patient, le cœur comprenant un myocarde délimitant une cavité du cœur, les images comprenant :
- une image en sang noir générée à partir de signaux acquis lors d’une acquisition par résonnance magnétique en sang noir par rehaussement tardif du gadolinium,
- une image en sang blanc générée à partir de signaux acquis lors d’une acquisition par résonnance magnétique en sang blanc par rehaussement tardif du gadolinium, l’acquisition par résonnance magnétique en sang blanc étant distincte d’une séquence d’inversion récupération, le procédé comprenant :
- segmentation, par ordinateur, de l’image en sang blanc de sorte à générer des données de positionnement d’un ensemble d’au moins une paroi délimitant le myocarde,
- caractérisation lésionnelle du cœur, par ordinateur, à partir de l’image en sang noir et de données de positionnement, d’au moins une paroi de l’ensemble d’au moins une paroi, prises parmi les données de positionnement d’un ensemble d’au moins une paroi délimitant le myocarde.
Avantageusement, la segmentation utilise une fonction d’apprentissage pour segmenter l’image en sang blanc de sorte à obtenir les données de positionnement. Avantageusement, la fonction d’apprentissage est un réseau de neurones convolutifs.
Avantageusement, la fonction d’apprentissage est entraînée à partir d’un ensemble d’images d’entraînement de la zone à imager générées à partir de signaux acquis lors d’étapes d’acquisitions respectives par résonnance magnétique en sang blanc par rehaussement tardif du gadolinium distinctes de séquences d’inversion récupération.
Avantageusement, l’ensemble d’au moins une paroi comprend une première paroi délimitant et entourant le myocarde.
Avantageusement, la caractérisation comprend une segmentation lésionnelle pour localiser une lésion du myocarde sur l’image en sang noir en utilisant des données issues de données de positionnement de la première paroi.
Avantageusement, la segmentation lésionnelle comprend la sélection des pixels de l’image en sang noir présentant une intensité supérieure à un seuil prédéterminé, les pixels étant pris uniquement parmi les pixels de l’image en sang noir entourés de la première paroi.
Avantageusement, l’ensemble d’au moins une paroi comprend une deuxième paroi délimitant le myocarde et entourée par la première paroi.
Avantageusement, la caractérisation comprend le calcul d’une donnée représentative d’une taille de lésion à partir de données issues des données de positionnement de la première paroi et éventuellement d’une deuxième paroi entourée par la première paroi.
Avantageusement, la caractérisation comprend le calcul de données représentatives d’un pourcentage de transmuralité de la lésion à partir de données issues des données de positionnement de la première paroi et de la deuxième paroi.
Avantageusement, le procédé comprend l’affichage, sur un écran, d’une représentation de données calculées lors de l’étape de caractérisation.
Avantageusement, le procédé comprend :
- l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir par rehaussement tardif du gadolinium,
- génération de l’image en sang noir à partir des signaux acquis lors l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir par rehaussement tardif du gadolinium, dite acquisition sang blanc. - acquisition par résonnance magnétique en sang blanc par rehaussement tardif du gadolinium,
- génération de l’image en sang blanc à partir des signaux acquis lors de l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir par rehaussement tardif du gadolinium, dite acquisition sang noir.
Avantageusement, l’acquisition sang noir et l’acquisition sang blanc appartiennent à une séquence d’acquisition comprenant une séquence d’acquisition élémentaires comprenant chacune une acquisition sang blanc et une acquisition sang noir.
Avantageusement, dans chaque séquence d’acquisition élémentaire, l’acquisition sang noir et l’acquisition sang blanc sont mises en œuvre lors d’un couple d’interbattements constitué de deux interbattements consécutifs.
Avantageusement, les séquences d’acquisition élémentaires sont mises en œuvre lors de couples d’interbattements respectifs consécutifs.
Avantageusement, le procédé comprend la segmentation et la caractérisation lésionnelles à partir d’images sang noir et sang blanc générées à partir d’images sang blanc et d’images sang noir générées à partir de signaux acquis lors de séquences élémentaires de la séquence d’acquisition.
Avantageusement, le procédé comprend la séquence d’acquisition.
Avantageusement, le procédé comprend la génération de l’image en sang noir et de l’image en sang blanc.
Avantageusement, l’image en sang noir et l’image en sang blanc sont bidimensionnelles.
L’invention a également pour objet un système comprenant les éléments matériels et logiciels pour mettre en œuvre le procédé selon l’invention.
Le système comprend avantageusement une unité de traitement configuré pour mettre en œuvre l’étape de segmentation et l’étape de caractérisation lésionnelle.
Avantageusement, l’unité de traitement est une unité de traitement.
Avantageusement, le système comprend un ensemble d’équipements de mesure comprenant un dispositif d’imagerie par résonance magnétique apte à mettre en œuvre l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir et l’acquisition par résonnance magnétique en sang blanc. Avantageusement, l’unité de traitement est configurée pour générer les commandes à destination du dispositif IRM afin qu’il mette en œuvre l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir et l’acquisition par résonnance magnétique sang blanc.
En variante et/ou en sus l’unité de traitement est configurée pour générer les images en sang blanc et en sang noir à partir des signaux acquis lors des acquisitions respectives.
Avantageusement, le système comprend un électrocardiographe configuré pour acquérir un électrocardiogramme du patient lors des acquisitions respectives.
L’invention se rapporte également à un produit-programme d'ordinateur comprenant des instructions qui conduisent le système selon l’invention à exécuter les étapes du procédé selon l’invention.
L’invention se rapporte également à un support lisible par ordinateur, sur lequel est enregistré le programme d'ordinateur selon l’invention.
Brève description des figures
D’autres caractéristiques et avantages de l’invention ressortiront à la lecture de la description détaillée qui suit, en référence aux figures annexées, qui illustrent :
[Fig. 1 ] : un exemple de réalisation d’un système selon l’invention,
[Fig. 2] : une représentation schématique d’une séquence élémentaire d’acquisition de signaux pour générer des images en sang noir et des images en sang blanc utilisées dans le procédé selon l’invention,
[Fig. 3] : une représentation schématique d’une phase d’acquisition IRM en sang noir et sang blanc réalisée sur une pluralité de battements cardiaques, [Fig. 4] : une représentation schématique d’un cœur en trois dimensions (3D) illustrant différents plans de coupes répartis selon le grand axe du coeur et des images générées à partir de signaux acquis dans un des plans de coupe, [Fig. 5] : un ordinogramme d’un exemple de procédé selon l’invention,
[Fig. 6] : une représentation schématique de quatre images comprenant en haut à gauche une image en sang blanc et en haut à droite une image à sang blanc sur laquelle sont représentées les parois détectées lors de l’étape de segmentation, et en bas à gauche une image en sang noir et la représentation des parois reportées sur l’image en sang noir,
[Fig. 7] : en haut, l’image du bas à gauche de la figure 6 sur laquelle on a représenté des secteurs, en bas à gauche une représentation de type œil de bœuf de la taille lésionnelle et en bas à droite une représentation de type œil de bœuf d’un pourcentage lésionnel de transmuralité.
Description invention
L’invention se rapporte au domaine de l’imagerie cardiaque par résonance magnétique ou IRM, rehaussement tardif du gadolinium en sang noir et sang blanc.
L’invention concerne un procédé de caractérisation lésionnelle cardiaque, et plus précisément d’au moins un muscle cardiaque, par exemple du myocarde.
Par lésion cardiaque, on entend une lésion d’un muscle du myocarde.
Les lésions cardiaques peuvent être divisées en lésions aiguës consécutives à une atteinte myocardique aiguë, telle que l’infarctus du myocarde en phase aiguë, et les lésions chroniques caractéristiques de pathologies cardiaques chroniques. Ces lésions sont des lésions cardiaques, par exemple du myocarde ou d’muscles papillaires. Ces lésions comprennent les fibroses myocardiques se développant fréquemment dans le contexte des cardiomyopathies hypertrophiques ou dilatées, mais qui représentent également une séquelle fréquente des cardiopathies inflammatoires ou de l’infarctus myocardique.
Les lésions comprennent également les nécroses myocardiques, c’est-à-dire les volumes des myocytes dont la membrane cellulaire a été détruite et les volumes des matrices extracellulaires et de collagène constituant les cicatrices fibreuses, dans la phase chronique de l’infarctus.
Système d’imagerie
La figure 1 représente schématiquement un exemple de réalisation d’un système S selon l’invention. Le système comprend les moyens matériels et logiciels pour mettre en œuvre le procédé selon l’invention. Avantageusement, ce système S comporte un ensemble d’équipements de mesure A comprenant un dispositif d’imagerie par résonance magnétique (IRM) B ainsi qu’un électrocardiographe référencé ECR sur la figure 1 .
Le système S comprend également un dispositif de traitement C comprenant une unité de traitement TC et une interface homme-machine INT. Ce dispositif de traitement peut faire partie du dispositif d’imagerie B ou être externe à ce dispositif, le système est alors un dispositif. En variante, le système présente une architecture répartie.
De façon connue en soit, le dispositif d’imagerie IRM B comprend un générateur de champ magnétique statique GEN_B, un générateur de gradient GEN_GRAD et un dispositif radiofréquence (RF) D_RF.
Le générateur de champ magnétique statique GEN_B comprend un aimant principal de polarisation destiné à générer, selon un axe longitudinal z, un champ magnétique statique de polarisation sensiblement uniforme dans une zone de polarisation (généralement un tunnel) destinée à comprendre la zone du patient à imager, cette zone à imager comprenant le cœur.
Le patient est un mammifère. De façon non limitative, le mammifère est un homme.
Le générateur de gradient GEN_GRAD comprend trois bobines (ou solénoïdes) de gradient disposées et configurées pour faire varier l’intensité du champ magnétique dans la zone de polarisation selon les axes respectifs orthogonaux x, y et z fixes par rapport à la zone de polarisation. Le choix des intensités circulant dans ces bobines permet de sélectionner, parmi plusieurs possibles, une coupe, présentant une épaisseur donnée et un plan de coupe sur lequel est centrée la coupe, dans laquelle va être mesurée l’aimantation de la zone à imager du patient reçu dans la zone de polarisation.
Le dispositif radiofréquence D_RF comprend des bobines ou solénoïdes et est apte à générer des séquences d’acquisition IRM comprenant, des séquences préparatoires de l’aimantation de la zone à imager et des séquences de lecture de signaux RF issus de la zone à imager.
Chacune des séquences préparatoires et de lecture comprend au moins un puise radiofréquence de fréquence, de forme, durée, phase, amplitude prédéterminée et réglable. La séquence préparatoire est configurée pour exciter, c’est-à-dire modifier la direction de l’aimantation des tissus de zone à imager.
La séquence de lecture est configurée pour mesurer l’aimantation de la zone à imager résultant du module préparatoire.
L’électrocardiographe ECR est destiné à acquérir un électrocardiogramme du patient
L’unité de traitement TC est configurée pour générer des commandes à destination du dispositif IRM B, notamment à destination du dispositif RF D_RF et du générateur de gradient GEN_GRAD, de sorte que le dispositif IRM génère les séquences d’acquisition prédéfinies de signaux issus de volumes ou coupes prédéfinies de la zone à imager.
L’unité de traitement TC est également configurée pour générer des images de la zone à imager à partir des signaux mesurés, à partir de techniques de reconstruction connues de l’homme du métier, et pour traiter ces images comme nous le verrons plus en détail dans la suite de la description.
Séquence d’acquisition
La figure 2 représente un exemple de séquence d’acquisition élémentaire SE1 d’une séquence d’acquisition IRM de signaux RF permettant de générer des images du cœur ainsi qu’un électrocardiogramme (ECG) E mesuré par l’électrocardiographe ECR lors de la séquence élémentaire SE1 .
La séquence d’acquisition comprend une suite de séquences d’acquisitions élémentaires SE1 telle que celle représentée en figure 2.
La partie basse de la figure 2 représente la variation de l’aimantation longitudinale Mz des tissus de la zone à imager en fonction du temps t pendant cette séquence élémentaire SE1 .
La séquence d’acquisition élémentaire SE1 comprend une acquisition dite en sang noir ACQ1 suivi d’une acquisition dite en sang blanc ACQ2 qui seront décrites ultérieurement. L’acquisition en sang noir ACQ1 permet d’acquérir les signaux de la zone à imager permettant de générer une image élémentaire en sang noir IM1 de la zone à imager. L’acquisition en sang blanc ACQ2 permet d’acquérir les signaux de la zone à imager permettant de générer une image élémentaire en sang blanc IM2 de la zone à imager. Ces étapes d’acquisition ACQ1 , ACQ2 comprennent chacune un module préparatoire PREP1 , PREP2 et un module de lecture LE1 , LE2.
Dans la présente demande de brevet, par module, on entend une étape comprenant une impulsion radiofréquence ou une suite d’impulsions radiofréquence.
Il est à noter que pendant toute la durée de la séquence d’acquisition élémentaire SE1 et de préférence pendant toute la durée de la séquence d’acquisition IRM, le générateur de champ magnétique statique GEN_B est commandé par l’unité de traitement TC pour qu’il génère un champ magnétique statique fixe selon l’axe z.
Le générateur de gradients GEN_GRAD est quant à lui commandé pour l’unité de traitement TC pour que le dispositif radiofréquence D_RF acquiert des signaux provenant d’une coupe prédéfinie présentant une épaisseur prédéfinie lors de la séquence d’acquisition élémentaire SE1.
La séquence d’acquisition est une séquence d’acquisition par rehaussement tardif au gadolinium mise en œuvre suite à l’injection d’un produit de contraste à base de Gadolinium par voie intraveineuse chez le patient, de 10 à 15 minutes avant la mise en œuvre des séquences d’acquisition de façon à obtenir des images présentant un contraste maximal entre les lésions et les tissus sains et le sang. Au niveau du cœur, le contraste est rapidement éliminé du myocarde sain, pauvre en tissu interstitiel, mais s’accumule de façon prolongée dans les lésions myocardiques. Le gadolinium une distribution extracellulaire, c’est-à-dire qu’il ne traverse pas les membranes des cardiomyocytes.
Le gadolinium a pour effet de raccourcir le temps de relaxation T1 des tissus où il s’accumule. La relaxation de l’aimantation des lésions suite à une impulsion d’inversion de l’aimantation est ainsi plus rapide que celle du sang et du myocarde sain.
Acquisition en sang noir
Dans un premier temps, on cherche à générer des images élémentaires en sang noir IM1. Dans une image de ce type, l’intensité des pixels correspondant au sang et au muscle sain est nulle (pixels noirs) ou sensiblement nulle. Afin de générer une telle image élémentaire en sang noir IM1 , le dispositif RF D_RF met en oeuvre une étape d’acquisition en sang noir ACQ1 en inversion-récupération. Cette étape d’acquisition sang noir ACQ1 comprend une impulsion d’inversion longitudinale notée 180° sur la figure 2, qui fait basculer l’aimantation longitudinale des tissus de la zone imager dans la direction opposée, c’est-à-dire qui inverse l’aimantation longitudinale de ces tissus. Sur la figure 2, on constate que l’aimantation de la zone à imager passe de Mz à -Mz sous l’effet de l’impulsion d’inversion. Du fait de la relaxation longitudinale, l’aimantation longitudinale des différents tissus présents dans la zone à imager croît pour revenir à sa valeur initiale, en passant par la valeur nulle. Naturellement, la cinétique de relaxation des différents tissus est différente.
De façon connue en soi, l’acquisition sang noir ACQ1 comprend également un module préparatoire PREP1 mis oeuvre après l’impulsion d’inversion longitudinale 180°, par exemple, un module adiabatique en T1 -rho (Tip) de durée notée TSL (acronyme de l’expression anglo-saxonne « Time of Spin Lock ») ou un module pondéré en T2, ou de type MTC (acronyme de l’expression anglo-saxonne « Magnétisation Transfert Contrast ») ou une combinaison de deux de ces modules ou de ces trois modules.
Le module préparatoire PREP1 est configuré de sorte que l’aimantation longitudinale du sang A(Blood) et celle du myocarde sain A(Musc) s’annulent au même instant te.
À ce même instant te, l’aimantation longitudinale des lésions A(Cica) est nettement supérieure à zéro. En faisant l’acquisition des signaux issus de la zone à imager à cet instant te, on obtient une image présentant un contraste très élevé entre les pixels ou voxels correspondant au sang et au myocarde sain qui sont noirs et les pixels ou voxels correspondant aux lésions, globalement blancs.
La première étape d’acquisition ACQ1 en inversion-récupération comprend ensuite une séquence de lecture LE1 comprenant une impulsion de 90° appliquée à l’instant te et un gradient de lecture pour lire l’aimantation transversale de la zone à imager. Le temps d’inversion Tl est la durée séparant l’impulsion de 180° de la séquence de lecture LE1 de la séquence élémentaire ACQ1 . Afin d’obtenir le meilleur contraste entre les lésions myocardiques et le sang ainsi qu’entre les lésions myocardiques et le myocarde sain, on fait avantageusement débuter la séquence de lecture LE1 à l’instant te où les aimantations longitudinales du sang et du myocarde s’annulent afin de générer l’image présentant le meilleur contraste.
Dans l’exemple de la figure 2, le module de lecture LE1 de l’acquisition sang noir est espacé temporellement du module préparatoire PREP1 de l’acquisition sang noir. En variante, le module de lecture LE1 débute dès que le module préparatoire PREP1 se termine. Il en est de même pour le positionnement temporel relatif entre le module préparatoire PREP2 de l’acquisition sang blanc et le module de lecture LE2 de l’acquisition sang blanc.
Dans l’exemple de la figure 2, l’impulsion d’inversion IMP1 est générée avant le module préparatoire PREP1. En variante, le module préparatoire PREP1 est généré avant l’impulsion d’inversion IMP1.
Acquisition en sang blanc
L’image élémentaire en sang blanc IM2 de la zone à imager est générée à partir de signaux acquis en mettant en œuvre l’étape d’acquisition en sang blanc ACQ2 comprenant un module préparatoire PREP2 suivie d’un module de lecture LE2.
Avantageusement, le module préparatoire PREP2 est identique au module préparatoire PREP1 de l’étape d’acquisition en sang noir ACQ1 , mais l’invention s’applique aussi lorsque ces modules sont distincts.
Le module préparatoire PREP2 est, par exemple, une séquence adiabatique en T1 rho.
En variante, le module PREP2 comprend au moins une séquence préparatoire prise parmi un module pondéré en T2 et un module préparatoire de type MTC (acronyme de l’expression anglo-saxonne « Magnetisation Transfert Contrast ») ou une combinaison de deux de ces modules ou de ces trois modules.
L’étape d’acquisition en sang blanc ACQ2 comprend ensuite un module de lecture LE2 comprenant un gradient de lecture pour lire l’aimantation transversale de la zone à imager. Ce module de lecture LE2 peut être réalisé en écho de gradient ou en écho de spin, tout comme le module de lecture LE1 de l’étape d’acquisition en sang noir LE1 . Les modules de lecture LE1 et LE2 peuvent être identiques ou différents. La durée D2 séparant le module de lecture LE2 est définie de sorte que l’aimantation longitudinale du sang A(Blood) est supérieure à celle du Myocarde A(MUSC) ce qui conduit à générer une image dans laquelle les pixels ou voxels du sang sont blancs, c’est-à-dire avec une forte luminance, et dans laquelle les pixels des tissus du myocarde sont un peu moins lumineux que ceux du sang comme on peut le déduire des courbes représentées en figure 2. Ces images permettent de visualiser parfaitement l’anatomie cardiaque permettant de délimiter le myocarde sur cette image, ce qui n’est pas possible sur une image en sang noir.
On comprend qu’en utilisant les deux images IM1 et IM2 il est possible de détecter cette lésion et aussi de la caractériser, par exemple de la localiser précisément par rapport au myocarde et de la dimensionner par rapport au myocarde.
Synchronisation des étapes d’acquisition avec les cycles cardiaques
Préférentiellement, l’unité de traitement TC est configurée pour synchroniser la séquence d’acquisition SE avec l’électrocardiogramme E.
A cet effet, l’unité de traitement TC utilise l’électrocardiogramme E pour générer des commandes de déclenchement des séquences d’acquisition à destination du dispositif RF, du générateur de gradient et éventuellement du générateur du champ magnétique principal.
Avantageusement, la séquence d’acquisition SE comprend, comme visible en figure 3, une pluralité de séquences d’acquisition élémentaires SEi, avec i = 1 à N, où N est supérieur à 1 où i est l’indice de la séquence élémentaire, dont les étapes d’acquisition ACQ1 , ACQ2 sont identiques. i= 1 sur la figure 2.
Chaque séquence d’acquisition élémentaire SEi est, avantageusement mise en œuvre lors de deux cycles cardiaques consécutifs, de préférence lors de deux interbattements consécutifs C1 , C2 référencés sur la figure 2 constituant un couple d’interbattements CBi référencé sur la figure 1. Un intérêt est de minimiser le temps d’acquisition et donc de minimiser les mouvements du cœur entre les différentes acquisitions et les décalages spatiaux entre les images IM1 et IM2. Dans la suite du texte, on nomme battement, un complexe QRS, et un interbattement, une phase d’un cycle cardiaque située entre deux battements consécutifs.
Avantageusement, les séquences d’acquisition élémentaires consécutives SEi sont mises en œuvre lors de couples d’interbattements CBi consécutifs.
Chaque séquence d’acquisition élémentaire SEi comprend :
- Lors du premier interbattement C1 du couple d’interbattements CBi, l’étape d’acquisition sang noir ACQ1 ;
- Lors du deuxième interbattement C2 du couple d’interbattements CBi, l’étape d’acquisition en sang blanc ACQ2.
Un intérêt est de minimiser le temps d’acquisition et donc de minimiser les mouvements du cœur entre les différentes acquisitions et les décalages spatiaux entre les images IM 1 et IM2 acquises lors des différentes séquences élémentaires SEi.
Avantageusement, comme représenté sur la figure 2, la séquence d’acquisition SE et l’électrocardiogramme E sont synchronisés de sorte que les modules de lecture LE1 , LE2, soient mis en œuvre lors d’une même phase de cycles cardiaques respectifs C1 , C2.
Avantageusement, cette phase est un interbattement.
Avantageusement, cette phase est la diastole.
Avantageusement, la séquence d’acquisition SE et l’électrocardiogramme E sont synchronisés de sorte que les modules de lecture LE1 , LE2 des étapes d’acquisition sang noir et sang blanc ACQ1 , ACQ2 soient mises en œuvre à des mêmes instants de ces cycles cardiaques respectifs C1 , C2.
Ces instants sont définis par rapport à une même référence temporelle des cycles cardiaques C1 , C2. La référence temporelle est, par exemple ; le maximum du complexe QRS.
Ces instants sont séparés d’une même durée D2’ du maximum de l’onde R dans l’exemple de la figure 2.
La synchronisation des modules de lecture LE1 , LE2 des séquences d’acquisition en sang noir et en sang blanc ACQ1 , ACQ2 et, comme nous le verrons par la suite, de différents modules de lecture d’étapes d’acquisition en sang blanc d’une part et des différents modules de lecture d’étapes d’acquisition en sang noir d’autre part, permet de générer des images du cœur à des instants où le cœur occupe la même position dans un référentiel fixe par rapport à l’aimant principal ce qui permet de superposer les images obtenues sans qu’un recalage soit nécessaire ou en effectuant un recalage simple.
L’invention s’applique également lorsque l’ordre des étapes d’acquisition est différent. On peut par exemple mettre en œuvre plusieurs étapes d’acquisition sang noir ACQ1 lors d’interbattements consécutifs puis plusieurs étapes d’acquisition sang blanc ACQ2 lors d’interbattements consécutifs et inversement.
On peut également mettre en œuvre au moins une étape d’acquisition sang noir ACQ1 et au moins une étape d’acquisition sang-blanc ACQ2 lors d’un même interbattement.
En variante, au moins une étape d’acquisition sang blanc ACQ2 est espacée d’une étape d’acquisition sang noir ACQ1 la plus proche temporellement.
Acquisition de coupes
Avantageusement, l’unité de traitement est commande TC est configurée de sorte à générer de commandes à destination du dispositif IRM pour acquérir des signaux de coupes respectives réparties selon un axe prédéfini du cœur.
L’axe est avantageusement le grand axe du cœur. Les coupes obtenues sont alors des coupes dites petit axe. Un avantage est de permettre une excellente visualisation des deux ventricules. Toutefois, l’invention s’applique aussi au cas où les coupes sont réparties le long d’un autre axe du cœur, par exemple un axe en 2 cavités (axe long vertical) ou 4 cavités (axe long horizontal) du cœur. Chaque coupe présente une épaisseur définie selon l’axe et est centrée sur un plan de coupe prédéfini perpendiculaire à l’axe. Par coupe, on entend dans la présente demande, une tranche ou couche perpendiculaire à l’axe g et présentant une épaisseur prédéfinie selon l’axe.
Avantageusement, les coupes sont contiguës selon l’axe.
Cela est réalisé par les commandes générées par le choix des commandes générées à destination du générateur de gradient GEN_GRAD en synchronisant les commandes à destination du générateur de gradient GEN_GRAD et à destination du dispositif RF D_RF.
Avantageusement, on acquiert les signaux selon des coupes accolées ou se recouvrant partiellement. Cela permet d’imager complètement le cœur.
Avantageusement, le générateur de gradient GEN_GRAD est commandé de sorte que l’on puisse générer plusieurs images bidimensionnelles de chaque coupe, à partir des signaux acquis lors de la séquence d’acquisition SE.
La figure 4 représente une vue tridimensionnelle (3D) d’un cœur comportant une pluralité de plans de coupe notés PCk répartis le long le grand axe g, avec k= 1 à K, K étant un entier supérieur à 1 . Les plans de coupe sont répartis depuis l’apex AP jusqu’à la base BA du cœur CO. Par conséquent, les coupes sont des coupes dites « coupes petit axe ».
Seules les images issues de la coupe centrée sur le plan de coupe PCk sont représentées sur la figure 4.
De préférence, on génère plusieurs images élémentaires en sang noir IM1 k(j) et/ou plusieurs images élémentaires en sang blanc IM2k(j) avecj= 1 à J, J étant un entier supérieur ou égal à 2 pour au moins un plan de coupe PCk, par exemple pour chaque plan de coupe PCk. Cela permet de rendre plus robuste l’analyse des images obtenues.
En variante, le système est configuré pour acquérir des signaux provenant d’un volume, par exemple de la totalité du cœur de sorte à permettre la génération d’images tridimensionnelles.
Avantageusement, la séquence d’acquisition SE est mise en œuvre alors que le patient est en apnée. Un avantage est d’obtenir des images parfaitement recalées qui permettent de limiter, simplifier ou de se passer d’un recalage d’images.
En variante, la séquence d’acquisition SE est mise en œuvre en respiration libre. L’acquisition en respiration libre présente des avantages temporels. En effet, l’acquisition en apnée doit être rapide ce qui entraîne la nécessité de réduire le temps d’acquisition de quelques secondes à quelques minutes et implique souvent de devoir réduire la zone à imager par exemple en se limitant à une portion 3D. Or, la séquence d’acquisition SE étant synchronisée avec l’ECG de sorte que les séquences de lecture soient mises en œuvre à un même marqueur temporel de différents cycles cardiaques, l’acquisition en apnée conduit à générer un nombre d’images limité.
Génération des images
L’unité de traitement TC est configurée pour générer GEN, par des techniques de reconstruction connues de l’homme du métier, des images de la zone à imager.
On peut, par exemple utiliser l’algorithme GRAPPA ou l’algorithme SENSE (et sa version itérative).
L’étape de génération comprend une étape de génération des images élémentaires bidimensionnelles (2D) ou tridimensionnelles (3D) de la zone à imager à partir des signaux acquis lors de la séquence d’acquisition SE.
Dans le cas 2D, on génère avantageusement, pour chaque étape d’acquisition en sang noir ACQ1 , une image en sang noir IM1 à partir des signaux acquis lors de l’étape d’acquisition en sang noir ACQ1 et, pour chaque étape d’acquisition en sang blanc ACQ2, une image en sang blanc IM2 à partir des signaux acquis lors de l’étape d’acquisition en sang blanc ACQ2.
Les images élémentaires IM1 , IM2 sont avantageusement générées en niveau de gris. Chaque image comprend un ensemble d’éléments unitaires de type pixels ou voxels caractérisé, chacun, par une intensité I susceptible de prendre un ensemble de N valeurs (N étant un nombre entier fini supérieur à 1 ) correspondant à N niveaux de gris allant de 0 et N-1 . Par exemple, cette valeur peut prendre 256 valeurs comprises entre 0 et 255, mais N n’est pas limité à 256. Cette valeur peut avantageusement prendre 4096 valeurs entre 0 et 4095.
L’unité de traitement TC est également configurée pour utiliser les images élémentaires obtenues pour caractériser les lésions du cœur, par exemple dumyocarde comme nous le verrons plus en détail dans la suite du texte.
Les images élémentaires générées par l’unité de traitement TC peuvent être destinées à être affichées sur un écran de l’interface homme- machine INT.
Recalage Avantageusement, le procédé est dépourvu d’étape de recalage d’images.
En variante, l’étape de génération d’images GEN comprend le recalage d’images élémentaires en sang noir entre elles et/ou le recalage d’images élémentaires en sang blanc entre elles et/ou le recalage d’images élémentaires en sang noir et en sang blanc entre elles. Cela permet, notamment lorsque le patient est en respiration libre pendant la séquence d’acquisition SE de limiter les effets de la respiration sur la position du cœur et donc d’éviter les décalages spatiaux induits par la respiration sur les images et susceptibles d’affecter la précision et la fiabilité des analyses de ces images ou de combinaison de ces images. En effet, le rythme de la respiration est a priori différent du rythme cardiaque, mais même si des corrélations existent entre ces deux rythmes, il est possible que la respiration s’accélère alors que le battement cardiaque reste stable ou inversement.
Avantageusement, le procédé comprend le recalage d’images élémentaires en sang noir d’une même coupe.
Avantageusement, le recalage est réalisé en utilisant mettant en œuvre un algorithme de recalage d’images non rigide.
Avantageusement, le procédé comprend le recalage d’images élémentaires en sang blanc d’une même coupe.
Avantageusement, le recalage est réalisé en utilisant mettant en œuvre un algorithme de recalage d’images non rigide.
Avantageusement, le procédé comprend le recalage d’images élémentaires en sang noir IM1 et en sang blanc IM2 entre elles.
Avantageusement, le procédé comprend le recalage d’images élémentaires en sang blanc et d’images élémentaires en sang noir d’une même coupe.
Avantageusement, ce recalage est réalisé en utilisant mettant en œuvre un algorithme de recalage d’images non rigide.
Avantageusement ces algorithmes sont identiques. Il est possible de choisir un algorithme différent pour le traitement des images élémentaires en sang noir et en sang blanc, mais il est préférable de choisir le même algorithme par facilité d’implémentation. Le recalage améliore sensiblement la qualité, notamment le contraste, d’une image issue d’une pluralité d’images élémentaires d’une même coupe. Par ailleurs, il permet de réduire les artefacts liés à la respiration.
Selon un premier exemple, au moins un des algorithmes non rigides est un algorithme basé sur la méthode de l'information mutuelle entre images fondée sur des relations statistiques. La fonction à optimiser peut-être mise en œuvre par un critère de similarité statistique. Un intérêt de cette méthode est que l'appariement entre attributs homologues d’images d’une même coupe est indépendant de leur position géométrique. Par ailleurs, cette méthode est particulièrement performante pour recaler des images élémentaires présentant des contrastes différents, telles que les images en sang noir et en sang blanc.
Selon un deuxième exemple compatible avec le premier exemple, au moins un des algorithmes non rigides est basé sur un modèle de transformation est mis en œuvre. Le modèle de transformation permet de déterminer des fonctions permettant de minimiser l’écart entre deux images. L’écart peut être traduit par une erreur géométrique à minimiser. Différentes approches peuvent être utilisées telles que celles se basant sur l'extraction à partir de chacune des images de primitives géométriques ou de descripteurs de formes tels que des points saillants, des singularités de formes ou de contours. Une approche paramétrique ou non paramétrique peut être utilisée.
Selon un exemple d’optimisation d’un modèle de transformation ou d’un critère de similarité, la méthode des moindres carrés peut être utilisée.
D’autres méthodes d’optimisation peuvent être mises en œuvre telles que la descente de gradients. Toutefois, cette dernière méthode s’applique plus particulièrement sur les intensités d’images et n’est pas optimale dans le cadre de l’invention puisqu’on cherche à optimiser la netteté et le contraste de l’image fusionnée. Néanmoins, l’invention inclut ce mode de réalisation.
Le recalage peut être réalisé en choisissant une image de référence et en déterminant une fonction de transformation des autres images de la même coupe vis-à-vis de cette image. Chaque image est alors recalée en optimisant une transformation pour obtenir l’image de référence selon un critère géométrique à partir de l’image considérée. Lors de l’acquisition d’images tridimensionnelles, il est possible d’acquérir plusieurs images tridimensionnelles du cœur, que l’on éventuellement recaler.
Combinaison d’images
Lorsqu’une pluralité d’images élémentaires d’une même coupe est générée, il est possible de réaliser des opérations visant à combiner, c’est-à- dire fusionner ces images afin de produire une unique image combinée par coupe.
Avantageusement, l’étape de génération des images GEN comprend, pour au moins une coupe d’indice k, par exemple pour chaque coupe, la combinaison d’images en sang blanc de la coupe IM2k(j), par exemple pour j = 1 à J de sorte à obtenir une image combinée ISBk en sang blanc de la coupe.
Avantageusement, le procédé comprend, pour au moins une coupe, par exemple pour chaque coupe, la combinaison d’images en sang noir IM1k(j), par exemple pour j = 1 à J de la coupe d’indice k de sorte à obtenir une image combinée en sang noir ISNkde la coupe.
Cela permet de réduire le bruit et augmenter le rapport signal sur bruit.
La combinaison des images peut être réalisée avant, pendant ou après la génération GEN des images.
Selon un exemple, la combinaison est un moyennage. Le moyennage est, par exemple, effectué dans l’espace image ou dans l’espace de Fourier (i.e. , le domaine des fréquences, avant reconstruction des images). Ces solutions sont peu coûteuses en calculs et rapides.
Le moyennage présente l'avantage de conserver le détail de l’image, puisqu'il accroît le rapport signal sur bruit (SNR). Cette technique permet de lisser le bruit pour réduire les artefacts résiduels de l’image. En outre, le moyennage permet d’améliorer la profondeur de bit de l’image numérique au-delà de ce qui est possible avec une image unique.
Un intérêt de l’étape de moyennage des images réalisées d’une même coupe est de réduire la déviation maximum. L'amplitude du bruit diminue comme la racine carrée du nombre d'images utilisées, c'est-à-dire qu'avec seulement 4 images, on peut réduire l'amplitude du bruit par un facteur deux. Selon un exemple d’une acquisition en respiration libre d’une durée de 2min, il est possible de recueillir 4 à 5 images par plan de coupe, ce qui permet d’obtenir de bonnes performances de réduction de bruit.
Dans un exemple de réalisation, la combinaison des images peut en variante être mise en œuvre par reconstruction itérative compensée en mouvement. Autrement dit, ce type de combinaison est mis en œuvre pendant la reconstruction des images. Des techniques de reconstruction IRM compensées sont notamment décrites dans les articles suivants: Odille F, et al., « Generalized reconstruction by inversion of coupled systems (GRICS) applied to free-breathing MRI » Magnetic Resonance in Medicine, 2008 ; et “3D whole-heart isotropic sub-millimeter resolution coronary magnetic resonance angiography with non-rigid motion-compensated PROST”, Bustin A, et al, Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 2020.
Avantageusement, les images élémentaires d’une part en sang noir et d’autre part en sang blanc sont respectivement combinées de manière à produire une image sang noir combinée ISNk et une image sang blanc combinée ISBk par coupe.
Lors de l’acquisition d’images tridimensionnelles, il est possible d’acquérir plusieurs images tridimensionnelles du cœur, que l’on peut combiner, par exemple moyenner pour obtenir une unique image tridimensionnelle du cœur.
Caractérisation des lésions
Comme vu précédemment, lors de la séquence d’acquisition SE, on acquiert des signaux pour la génération d’images élémentaires en sang noir IM1 et d’images élémentaires en sang blanc IM2 et on génère ces images élémentaires IM1 , IM2 à partir des signaux acquis.
Selon l’invention, ces images élémentaires IM1 , IM2 sont générées à partir de signaux acquis en mettant en œuvre une séquence d’acquisition. Cette séquence d’acquisition comprend des étapes d’acquisition sang-blanc ACQ2. Chaque étape d’acquisition sang-blanc ACQ2 est distincte d’une séquence d’inversion-récupération.
En d’autres termes, cette séquence est dépourvue d’une impulsion d’inversion de l’aimantation longitudinale de la zone à imager. Par conséquent, contrairement à l’imagerie PSIR lors de l’acquisition sang blanc, l’aimantation longitudinale du myocarde n’est pas annulée ce qui permet d’obtenir des images présentant un plus fort contraste entre les lésions et le sang et donc de favoriser le diagnostic et le traitement d’images.
Avantageusement, l’acquisition sang blanc est configurée de sorte que lors de la mise en œuvre du module de lecture LE2, les aimantations longitudinales respectives du myocarde sain, du sang et des lésions soient positives et que l’aimantation longitudinale des lésions soit comprise entre l’aimantation du myocarde sain et celle du sang. Cela est obtenu par la configuration du module préparatoire PREP2 et celle du module de lecture LE2 et par le positionnement temporel relatif entre ces deux modules.
Comme visible sur la figure 5, le procédé de caractérisation lésionnelle comprend les étapes suivantes :
- la segmentation SEG, par ordinateur, d’au moins une image sang-blanc ISB de sorte à générer des données de positionnement d’une première paroi L1 délimitant le myocarde,
- la caractérisation lésionnelle CAR, par ordinateur, d’une lésion cardiaque en utilisant au moins une image sang noir ISN et des données de positionnement de la première paroi L1 prises parmi les données calculées lors de l’étape de segmentation SEG.
Ces étapes sont mises en œuvre par l’unité de traitement TC qui utilise à cet effet des images sang blanc ISBk et sang noir ISNk générées par le procédé précédemment décrit.
Chaque image sang blanc ISB, respectivement sang noir ISN est une image élémentaire IM1 k(j), IM2kO)ou une image combinée en sang blanc ISBk, respectivement en sang noir ISNk.
Dans la suite du texte, on considère, comme dans l’exemple de la figure 5, que chaque image en sang blanc ISB est une image combinée en sang blanc ISBk et que chaque image en sang noir ISN est une image combinée en sang noir ISNk.
L’invention permet de caractériser, de façon automatique, reproductible, fiable et précise une lésion cardiaque, et plus précisément des muscles cardiaques, notamment les lésions du myocarde. En effet, la segmentation d’images en sang blanc ISBk générées à partir de signaux mesurés lors des étapes d’acquisition en sang blanc ACQ2 distinctes de séquences d’inversion-récupération permet de positionner de façon automatique, robuste, fiable et précise les parois délimitant le myocarde, car ces images présentent un contraste significatif entre le myocarde et le sang. Les images en sang noir ISNk ne permettent pas d’obtenir d’aussi bons résultats du fait de l’absence de contraste entre le myocarde sain et le sang. La caractérisation lésionnelle qui utilise outre les données de positionnement issues de la segmentation, une image sang-noir ISNk, permet d’obtenir de bons résultats que ne permettrait pas d’obtenir à elle seule l’image en sang- blanc ISBk contenant peu ou pas d’information sur les lésions cardiaques.
Segmentation
Selon un exemple, la segmentation SEG est mise en œuvre en utilisant au moins une image en sang blanc ISBk de sorte à générer des données de positionnement d’une première paroi L1 et d’une deuxième paroi L2 délimitant le myocarde M et entourant et délimitant une cavité du cœur, la première paroi L1 entourant la deuxième paroi L2.
Les données de positionnement relatives à une paroi correspondent, par exemple, à l’identification des pixels constituant la paroi.
Le résultat de cette segmentation est visible en figure 6 représentant schématiquement en haut à gauche une image en sang blanc d’une coupe du cœur ISBk et en haut à droite l’image en sang blanc de la coupe sur laquelle la première paroi L1 et la deuxième paroi L2 obtenues lors de l’étape de segmentation sont représentés en traits noirs épais.
Les images générées sont, par exemple en niveaux de gris. Les zones blanches de la figure 6 représentent des zones plus claires que les zones pointillées représentent des zones plus claires que les zones quadrillées qui représentent des zones plus claires que les briques.
Dans l’exemple de la figure 6, la cavité du cœur est le ventricule gauche et la segmentation SEG est mise en œuvre de sorte à délimiter les parois L1 , L2 de la partie du myocarde entourant et délimitant le ventricule gauche.
Il est à noter que dans la présente description l’invention est décrite dans le cas où la cavité du cœur est le ventricule gauche, mais l’invention est applicable à toute cavité du cœur, telle que le ventricule droit et les oreillettes qui sont également entourées et délimitées par le myocarde et sujette à des lésions cardiaques.
La deuxième paroi L2 est la paroi délimitant le myocarde et le ventricule gauche VG. La première paroi L1 entourant la deuxième paroi L2 est la paroi externe, c’est-à-dire tournée vers l’extérieur du ventricule gauche VG, de la partie du myocarde entourant le ventricule gauche VG. Il s’agit de l’épicarde.
La deuxième paroi L2 est la paroi du myocarde délimitant le ventricule gauche. Il s’agit d’endocarde.
Sur les images de la figure 6 qui sont des coupes du cœur ces parois L1 , L2 forment des courbes fermées en ce qu’elles entourent complètement le ventricule gauche VG dans des coupes en petit axe.
On comprend aisément qu’en 3D ces parois forment des surfaces.
En variante, la segmentation SEG est mise en œuvre de sorte à générer des données de positionnement d’une seule de ces deux parois, par exemple de la paroi externe du myocarde.
La segmentation est réalisée en mettant en œuvre une fonction ou algorithme d’apprentissage, par exemple un réseau de neurones artificiels, pour segmenter une image en sang blanc de sorte à délimiter au moins une paroi du myocarde entourant et délimitant une cavité du cœur.
Dans un exemple non limitatif, la fonction d’apprentissage est un réseau de neurones.
Le réseau de neurones artificiels utilisé pour la segmentation est avantageusement un réseau neuronal convolutif.
Le réseau de neurones convolutif est, par exemple, de type U-Net ou de type transformeur aussi appelé modèle auto-attentif, par exemple, de type communément appelé swin transformer.
Le réseau de neurones, ou plus généralement la fonction d’apprentissage, est mis en œuvre sur des images bidimensionnelles (2D) et/ou sur des images tridimensionnelles (3D). Autrement dit, il est entraîné pour réaliser la segmentation souhaitée en recevant en entrée des images 2D et/ou 3D.
Avantageusement, la fonction d’apprentissage est entraînée, préalablement à la mise en œuvre du procédé selon l’invention, à partir d’images en sang blanc du cœur, générées à partir de signaux acquis lors d’étapes respectives d’acquisition en sang blanc distinctes de séquences d’inversion récupération, et labellisées par des spécialistes, c’est-à-dire segmentées par des spécialistes, de sorte que la fonction d’apprentissage entraînée recevant des données d’entrée comprenant une image en sang blanc du cœur, soit apte à segmenter de façon à délimiter au moins une paroi du myocarde entourant et délimitant une cavité du cœur.
La fonction d’apprentissage est, par exemple, configurée pour délivrer, à partir d’une image d’entrée en sang blanc générée à partir de signaux acquis lors d’une étape d’acquisition en sang blanc distincte d’une séquence d’inversion récupération, une image de sortie dans laquelle les pixels ou voxels correspondant aux parois ou contours L1 et L2 sont colorisés dans une intensité ou couleur prédéterminée ou dans des couleurs respectives prédéterminées.
Propagation
Le procédé peut comprendre une étape de propagation des parois détectées lors de l’étape de segmentation SEG, sur au moins une image en sang noir. Autrement dit, le procédé peut comprendre une étape de report REP, c’est-à-dire la propagation, comprenant, l’identification, sur une image en sang noir ISNk, des pixels ou voxels correspondant aux parois L1 et L2 identifiées lors de la segmentation SEG.
Sur la figure 6, on a représenté schématiquement en bas à gauche une image en sang noir ISNk de la coupe du cœur et en bas à droite l’image en sang noir sur laquelle on a représenté en traits noirs épais les parois L1 et L2 détectées lors de l’étape de segmentation SEG.
L’identification, sur l’image en sang noir ISNk, des pixels ou voxels correspondant à la première paroi L1 et respectivement à la deuxième paroi L2 est déterminée à partir des positions des pixels ou voxels correspondant à ces parois sur l’image en sang blanc ISBk.
Ces pixels ou voxels peuvent présenter les mêmes positions respectives sur l’image en sang blanc et sur l’image en sang noir lorsque l’on considère que ces images sont recalées spatialement et car ces images présentent la même taille et la même résolution. Un décalage spatial prédéterminé ou calculé peut en variante être appliqué à ces pixels ou voxels lorsqu'on estime qu’un décalage spatial existe entre ces images.
Le report peut comprendre l’annotation ou la colorisation des pixels ou voxels correspondant aux parois L1 et L2. Avantageusement, la caractérisation comprend la segmentation pour chaque image en sang blanc ISBk de sorte à générer des données de positionnement respectives obtenues à partir des images en sang blanc ISBk respectives.
Avantageusement, la caractérisation comprend le report sur chaque image en sang noir ISNk, des pixels ou voxels correspondant aux parois L1 et L2 identifiées lors de la segmentation SEG, à partir d’une des images en sang blanc ISBk. Les pixels ou voxels reportés sur les différentes images en sang noir ou images combinées en sang noir sont avantageusement identifiés à partir d’images en sang blanc respectives.
Avantageusement, les données de positionnement utilisées pour le report sur une image en sang noir ISNk sont générées à partir d’une image en sang blanc ISBk générée à partir de signaux mesurés lors d’une même séquence d’acquisition élémentaire.
Ainsi, on reporte avantageusement les données de positionnement générées à partir d’une image combinée en sang blanc ISBk d’ordre k sur une image combinée en sang noir ISNk d’ordre k.
Étape de caractérisation lésionnelle
L’étape de caractérisation lésionnelle CAR consiste à caractériser le cœur du point de vue des lésions en utilisant une ou plusieurs image(s) sang-noir ISNk et des données de positionnement d’au moins une paroi, par exemple de la deuxième paroi L2, obtenues à partir d’une ou plusieurs images en sang blanc ISBk.
Cette étape permet avantageusement de générer des données caractérisant le cœur du point de vue des lésions.
Cette étape est mise en œuvre par l’unité de traitement CT.
L’étape de caractérisation CAR peut comprendre une étape de détection DE de lésion et/ou une étape de caractérisation de lésion CAE. Avantageusement, lorsqu’une lésion est détectée, l’étape de caractérisation de lésion CAE est mise en œuvre. Autrement dit, l’étape de caractérisation de lésion CAE peut être mise en œuvre uniquement à condition qu’une lésion soit détectée lors de l’étape de détection DE.
En variante, l’étape de détection DE est mise en œuvre après l’étape de caractérisation de lésion CAE ou après une des étapes de cette étape de caractérisation de lésion effective CAE.
En variante, l’étape caractérisation de lésion CAE est dépourvue d’étape de détection DE.
L’étape de détection sera décrite ultérieurement.
L’étape de caractérisation de lésion CAE comprend avantageusement une étape de segmentation lésionnelle SC d’au moins une image en sang noir ISNk de sorte à générer des données de positionnement d’ au moins une lésion cardiaque éventuellement présente sur la figure, la segmentation lésionnelle SC utilisant des données de positionnement de la première paroi L1 et éventuellement celles de la deuxième paroi L2, générées lors de l’étape de segmentation SEG.
L’étape de caractérisation de lésion CAE comprend éventuellement les étapes suivantes :
- calcul CTA de taille de lésion CIC à partir des données de positionnement de la première paroi L1 et éventuellement de la deuxième paroi L2 issues de l’étape de segmentation SEG, et/ou
- calcul CTT d’au moins un degré de transmuralité TR de la lésion CIC à partir de première paroi L1 et de la deuxième paroi L2 issues de l’étape de segmentation SEG.
Ces calculs sont effectués en utilisant un ensemble d’au moins une image en sang noir.
Par taille d’une lésion, on entend une donnée représentative de dimensions de la lésion, telle qu’un volume ou une surface, par exemple ou un nombre de pixels ou de voxels.
Segmentation lésionnelle
La segmentation lésionnelle SC utilise une ou plusieurs image(s) sang noir ISNk et des données de positionnement de la première paroi L1 et éventuellement celles de la deuxième paroi L2 issues de la segmentation SEG.
Ces données de positionnement peuvent être des données de positionnement générées lors l’étape de segmentation SEG ou des données de positionnement issues de l’étape de report REP. En variante l’étape de segmentation lésionnelle SG comprend l’étape de report.
Cette étape permet de localiser les lésions cardiaques, c’est-à-dire de générer des données de localisation des lésions cardiaques.
Ces données de localisation des lésions comprennent par exemple l’identification ou les positions des pixels ou voxels correspondant à des lésions.
L’étape de segmentation lésionnelle SC est avantageusement mise en œuvre par seuillage.
Elle comprend avantageusement l’identification des pixels ou voxels présentant une intensité supérieure ou égale à un seuil d’intensité prédéterminé uniquement dans une zone prédéterminée d’au moins une image en sang noir ISNk délimitée par la première panroi L1 et/ou la deuxième paroi L2. En effet, comme on peut le déduire de la figure 2, les lésions présentent, sur les images en sang noir, une intensité élevée comparée au myocarde sain et au sang.
Cette zone est déterminée à partir des données de positionnement de la première paroi L1 et éventuellement celles de la deuxième paroi L2 issues de la segmentation SEG.
Il s’agit par exemple de la zone d’une image sang noir ISNk délimitée par les pixels ou voxels de la première paroi L1 et/ou les pixels ou voxels de la deuxième paroi L2 reportés sur l’image sang noir ISNk.
Avantageusement, la zone de l’image en sang noir est la zone entourée et délimitée par la première paroi L1 .
Autrement dit, l’étape de segmentation lésionnelle SC comprend la recherche des pixels ou voxels d’intensité supérieure ou égale à un seuil d’intensité prédéterminé uniquement dans la zone délimitée et entourée par la première paroi L1 sur une ou plusieurs image(s) en sang noir ISNk. Autrement dit, ces pixels ou voxels sont pris uniquement parmi les pixels ou voxels d’une zone de l’image ou des images en sang noir entourée et délimitée par la première paroi L1 . Cela permet d’éviter la détection erronée de lésions en au- delà de répicarde, en évitant confusion entre des lésions et de la graisse entourant l’épicarde et représentée, sur les images en sang noir, par des pixels d’intensité élevée.
En variante, la zone Z est la zone de la ou des images en sang noir ISNk délimitée par la première paroi L1 et par la deuxième paroi L2.
Autrement dit, à la segmentation lésionnelle SC comprend la recherche les pixels d’intensité supérieure ou égale à un seuil d’intensité prédéterminé uniquement dans la zone délimitée par les deux parois L1 et L2 d’une ou plusieurs images en sang noir ISNk. Cette variante présente l’avantage d’identifier les pixels ou voxels des lésions du myocarde uniquement. En effet, il arrive que des patients aient des nécroses des muscle papillaires (se trouvant dans la zone délimitée par la paroi L2). Chez ces patients les muscles sont blancs sur l’image en sang noir ce qui peut entraîner des erreurs de caractérisation lésionnelle lorsque l’on segmente les lésions dans toute la zone délimitée par L1 .
En variante et/ou en sus, la segmentation lésionnelle SC comprend la recherche des pixels d’intensité supérieure ou égale à un seuil d’intensité prédéterminé uniquement dans la zone entourée par la paroi L2. Cette étape permet d’identifier les pixels ou voxels des muscles papillaires uniquement.
En variante, la segmentation est mise en œuvre en utilisant un réseau de neurones, par exemple, un réseau de neurones convolutif entraîné pour segmenter les lésions cardiaques dans une zone délimitée par les parois L1 et/ou L2 lorsqu’il reçoit en entrée les données de positionnement de la ou des parois correspondantes et l’image en sang noir, ou en utilisant au moins un algorithme de segmentation par contour actif, c’est-à-dire un algorithme de segmentation utilisant un modèle de contour actif.
L’étape de détection DE comprend la détection de l’absence ou de la présence de lésions en utilisant une image sang-noir ISNk et des données de positionnement d’au moins une paroi, par exemple, de la deuxième paroi L2. Elle génère en sortie une indication de la présence ou de l’absence de lésions cardiaques.
L’étape de détection DE peut être réalisée par seuillage ou en utilisant un réseau de neurones comme l’étape de segmentation. Cette étape peut consister à déterminer si un nombre de pixels ou voxels contigus supérieur à un seuil prédéterminé présente une intensité supérieure à un seuil prédéterminé dans la zone délimitée par la paroi L1 et/ou la paroi L2 dont le positionnement est défini lors de l’étape de segmentation SEG du myocarde. La présence de lésions cardiaques est détectée si cette condition est vérifiée et l’absence de lésions cardiaques est détectée si cette condition n’est pas vérifiée.
Le réseau de neurones est, par exemple, un réseau de neurones convolutif. Le réseau de neurones est, par exemple, entraîné pour détecter la présence ou l’absence de lésions cardiaques dans une zone délimitée par les parois L1 et/ou L2 lorsqu’il reçoit en entrée les données de positionnement de la ou des parois correspondantes et l’image en sang noir.
Avantageusement, lorsqu’aucune lésion n’est détectée, c’est-à-dire lorsque l’absence de lésion est détectée lors de l’étape DE.
Si aucune lésion n’est détectée, l’étape suivante est avantageusement l’étape de génération GENR.
Sur la figure 7, on a représenté l’image en sang noir ISNk, sur laquelle on a représenté en trais épais les limites L1 et L2 identifiées lors de la segmentation et reportées, c’est-à-dire propagées, sur l’image en sang noir ISNk ainsi que les pixels identifiés comme étant des pixels de la lésion.
Calcul de taille lésionnelle
La caractérisation CAR comprend avantageusement une étape de calcul CTA de taille lésionnelle.
Cette étape de calcul CTA comprend la détermination d’au moins une donnée élémentaire représentative de la taille d’au moins une lésion cardiaque, par exemple du myocarde, en utilisant des données de localisation des données de localisation des première et/ou deuxième parois L1 , L2 qui sont par exemple directement les données de positionnement issues de la segmentation SEG du myocarde ou bien des données issues de ces données, par exemple, des données issues de l’étape de report ou des données de positionnement de la lésion obtenues lors de l’étape de segmentation lésionnelle SC.
Une donnée élémentaire représentative d’une taille lésionnelle peut être un pourcentage d’une surface du myocarde occupé par une lésion sur un secteur SEC d’une image en sang noir ISNk ou un volume ou une masse de la lésion dans ce secteur SEC partant de l’axe I parallèle à l’axe p et passant sensiblement par le centre de la cavité cardiaque sur l’image en sang noir ISNk et délimité par deux rayons R partant de l’axe I comme visible sur l’image en sang noir ISNk..
Le pourcentage de la surface du myocarde occupé par la lésion sur le secteur SEC peut être calculé à partir du rapport entre le nombre des pixels correspondant à la lésion dans ce secteur SEC et le nombre de pixels correspondant au myocarde dans ce secteur SEC.
Le nombre de pixels correspondant à la lésion dans ce secteur SEC peut être calculé à partir des données de localisation obtenues lors de l’étape de segmentation lésionnelle ou bien directement être calculé, lors de l’étape de calcul CTA, par exemple en sélectionnant, par seuillage, le nombre de pixels présentant une intensité supérieure à un seuil prédéterminé dans la portion du secteur SEC délimité par les parois L1 et L2 ou par la paroi L1. L’étape CTA peut comprendre le calcul d’une donnée représentative de la taille lésionnelle dans un secteur SEC à partir de plusieurs données élémentaires représentatives de la taille lésionnelle calculée, dans ce secteur SEC, pour plusieurs images en sang noir ISNk réparties le long de l’axe p.
On calcule par exemple une combinaison ou une moyenne des données élémentaires.
Le volume de lésion sur un secteur SEC peut être calculée à partir du rapport entre le nombre des pixels correspondant à la lésion sur ce secteur et le nombre de pixels correspondant au myocarde sur ce secteur, à partir de l’épaisseur la coupe correspondant à une image en sang noir ISNk, lorsque l’image est bidimensionnelle.
La taille et/ou le volume sont avantageusement également calculés à partir de la résolution prédéterminée des images.
Il est à noter que la masse volumique du myocarde est de 1 ,06 g/ml. On considère donc que la masse d’une lésion est sensiblement égale au volume de cette dernière ce qui permet d’évaluer la masse de la lésion.
L’étape de calcul CTA peut, par exemple, comprendre la division de l’image en sang noir ISNk en un premier nombre prédéfini, égal à 12 dans l’exemple non limitatif de la figure 1 , prédéfini de secteurs SEC de même angle crlfc d’ouverture pointant vers l’axe I et le calcul du pourcentage des surfaces du myocarde occupé par la lésion sur les différents secteurs SEC. Le premier nombre de secteurs et l’angle d’ouverture alk peuvent varier en fonction du plan de coupe PCk. Par exemple, plus le plan de coupe PCk se rapproche de l’apex selon le grand axe, plus le nombre de secteurs diminue et l’angle d’ouverture alk augmente.
Cette étape peut être mise en œuvre pour différentes images en sang noir ISNk de différentes coupes centrées sur des plans de coupe PCk respectifs avec k = 1 à K. Le procédé comprend avantageusement, une étape de génération GENR, par ordinateur, par exemple par l’unité de traitement, d’un ensemble d’au moins représentation de données de caractérisation lésionnelle et une étape d’affichage AFFD d’au moins une représentation de l’ensemble d’au moins une représentation sur un écran de l’interface homme- machine.
L’étape de génération comprend par exemple la génération d’une donnée représentative du résultat de l’étape de détection DE, c’est-à-dire de l’absence ou de la présence de lésion et l’étape d’affichage comprend l’affichage de cette donnée.
L’ensemble d’au moins une représentation comprend avantageusement une première représentation REPT de la ou des données représentatives de la taille lésionnelle calculées lors de l’étape de calcul CTA.
On peut par exemple, générer, comme visible sur la figure 7, une représentation de type œil de bœuf (aussi appelée « Bull’s eye » en terminologie anglo-saxonne) des pourcentages ou de données représentatives des pourcentages des surfaces du myocarde occupé par la lésion dans différents secteurs d’images en sang noir ISNk prises selon les plans de coupe respectifs PCk.
La représentation Bull’s eye est définie par l’association américaine du cœur AHA en référence à l’expression anglo-saxonne « American Heart Association » et décrite dans l’article suivant : « Standardized Myocardial Segmentation and Nomenclature for Tomographie Imaging of the Heart: A Statement for Healthcare Professionals From the Cardiac Imaging Committee of the Council on Clinical Cardiology of the American Heart Association. », Manuel D. Cerqueira et Al, Circulation, 2002; 105:539-42.
La représentation de type œil de bœuf comprend une pluralité de cercles concentriques CE séparés deux à deux par des couronnes CO. Chaque couronne CO est attribuée à une coupe ou un ensemble de coupes contiguës sachant que plus la couronne CO correspond à une coupe ou un ensemble de coupes proche de l’apex, plus elle est proche du centre des cercles. Chaque couronne CO est divisée en portions de secteurs PSE dans lesquels sont affichés, comme dans l’exemple de la figure 7, les pourcentages de la surface du myocarde occupés par une lésion et calculés pour les secteurs respectifs de l’image en sang noir ISNk de la coupe correspondante ou des combinaisons, par exemple des moyennes, des pourcentages calculés à partir des pourcentages de la surface du myocarde occupée par une lésion calculés pour les secteurs des images en sang noir de l’ensemble de coupes correspondantes.
En variante et/ou en sus, l’intensité des pixels des différentes portions de couronnes dépend du pourcentage calculé. Plus ce pourcentage est faible et plus l’intensité de la couronne correspondante est élevée.
Par exemple, sur la figure 7, on a représenté l’affichage sous la forme d’une représentation connue de type œil de bœuf les moyennes respectives des pourcentages de la taille de la lésion calculés dans les secteurs respectifs définis sur trois ensembles d’images en sang noir contigus répartis le long de l’axe p associés aux trois couronnes respectives correspondant respectivement à une coupe de l’apex (couronne intérieure), au mi-ventricule (couronne du milieu) et à la zone basale (couronne extérieures).
Les portions de secteurs associés à un pourcentage supérieur à 80% sont représentées en pointillées et celles associées à un pourcentage est inférieur ou égal à 80% sont représentées en blanc.
Lorsqu’on génère une image 3D du cœur, on divise avantageusement l’image en plusieurs couches selon l’axe p et on calcule les mêmes données qu’à partir d’images 2D à partir de ces différentes couches.
Transmu ralité
L’étape de caractérisation CAR comprend avantageusement une étape de calcul d’une donnée représentative d’un pourcentage de transmuralité d’une lésion. Par pourcentage de transmuralité, on entend le pourcentage d’une épaisseur du myocarde occupé par une lésion.
Cette étape de calcul CTT comprend la détermination d’au moins une donnée représentative du pourcentage de transmuralité d’au moins une lésion du myocarde en utilisant des données de localisation d’une lésion et des données de localisation des première et/ou deuxième parois L1 , L2 issues de l’étape de segmentation.
Cette donnée peut être un pourcentage de l’épaisseur du myocarde occupé par une lésion sur un secteur de l’image en sang noir ISNk partant de l’axe I
Le pourcentage de l’épaisseur du myocarde occupé par la lésion sur le secteur peut être calculé à partir du rapport entre un nombre de pixels correspondant à l’épaisseur de la lésion sur ce secteur et le nombre de pixels correspondant à l’épaisseur du myocarde sur ce secteur. Le nombre de pixels correspondant à l’épaisseur de la lésion peut être un nombre obtenu à partir des résultats de l’étape de segmentation lésionnelle SC ou être calculé, par exemple par seuillage, lors de l’étape de calcul CTT à partir des données de positionnement de L1 et éventuellement de L2 issues de l’étape de segmentation SEG.
Le nombre de pixels correspondant à l’épaisseur de la lésion sur un secteur peut être une moyenne ou un maximum de nombres de pixels, correspondant à l’épaisseur de la lésion, calculés selon différents rayons du secteur.
Le nombre de pixels correspondant à l’épaisseur du myocarde sur un secteur peut être une moyenne ou un maximum de nombres de pixels, correspondant à l’épaisseur du myocarde, calculés selon différents rayons du secteur. Ces nombres sont calculés à partir de données de positionnement des parois L1 et L2.
L’étape de calcul CTT peut, par exemple comprendre la division de l’image en sang noir ISNk en un deuxième nombre prédéfini de secteurs de même angle a2k d’ouverture pointant vers le centre de la cavité cardiaque et le calcul du pourcentage des surfaces du myocarde occupé par la lésion sur les différents secteurs.
Le deuxième nombre de secteurs et donc l’angle d’ouverture a2k peuvent varier en fonction du plan de coupe PCk. Par exemple, plus le plan de coupe PCk se rapproche de l’apex, plus le nombre de secteurs diminue et l’angle d’ouverture a2k augmente.
Avantageusement le deuxième nombre est supérieur au premier nombre. L’étape CTT peut comprendre le calcul d’une donnée représentative de la transmuralité dans un secteur à partir de plusieurs données élémentaires représentatives de la transmuralité calculées dans ce secteur pour plusieurs images en sang noir ISNk réparties le long de l’axe p.
On calcule par exemple une combinaison ou une moyenne des données élémentaires.
Cette étape peut être mise en œuvre pour différentes images en sang noir ISNk de différentes coupes centrées sur des plans de coupe PCk respectifs.
L’étape GENR comprend avantageusement la génération d’une représentation REPTR de données représentatives d’un pourcentage de transmuralité. L’étape d’affichage AFFD comprend avantageusement l’affichage de cette représentation.
On peut par exemple, générer une représentation de type œil de bœuf des combinaisons, par exemple des moyennes, de pourcentages de la transmuralité de la lésion dans des secteurs d’ensembles d’images en sang noir ISNk contiguës prises selon les plans de coupe respectifs PCk.
L’intensité des pixels de cette image représente avantageusement, mais non nécessairement, le pourcentage de transmuralité.
Par exemple, sur la figure 7, on a représenté l’affichage sous la forme d’une représentation REPTR de type œil de bœuf des moyennes de pourcentages de transmuralité de la lésion calculées dans les secteurs définis sur plusieurs ensembles d’images en sang noir contiguës prises selon des plans de coupe respectifs répartis le long de l’axe p.
Tout comme précédemment, la représentation de type œil de bœuf comprend une pluralité de portions de secteurs dont l’intensité correspond à la combinaison du pourcentage de transmuralité calculée pour cette portion de secteur.
Plus ce pourcentage est faible et plus l’intensité de la couronne correspondante est élevée. En variante et/ou en sus les pourcentages sont affichés dans les portions de secteurs.
Avantages La solution proposée permet d’obtenir des images présentant une résolution et un contraste suffisant pour détecter et caractériser précisément les lésions et de façon fiable et reproductible.
Par ailleurs, elle permet, en séparant deux informations importantes, à savoir l’anatomie du cœur et les lésions, sur deux images distinctes, à savoir respectivement les images en sang blanc et les images en sang noir, de mettre en œuvre un procédé automatique de caractérisation des lésions. Cette automatisation permet un gain significatif de temps et de reproductibilité par rapport aux solutions de l’art antérieur.
La séquence d’acquisition en sang noir et sang blanc du procédé selon l’invention nécessite un temps d’acquisition relativement réduit, en particulier lorsque l’on acquiert des signaux pour générer des images 2D qui impliquent peu de calcul. Cela permet avantageusement de mettre en œuvre la séquence d’acquisition en respiration en apnée et de limiter les déplacements du cœur entre les images et donc les corrections à réaliser ce qui permet de limiter les ressources de calcul et la mise en œuvre du procédé en temps réel. Cela permet également de limiter les artefacts altérant la lisibilité des images. Ces artefacts accentuent la difficulté de reconstruire des images nettes et précises afin de localiser et détecter la lésion. Par ailleurs, les longues acquisitions en IRM sont inconfortables pour le patient. Une durée de 10 à 20 min est considérée comme une durée très longue et il est difficile pour le patient de se maintenir au sein de l’ IRM sans effectuer de mouvement.
En outre, dans le cas de la génération d’images 2D par le procédé selon l’invention, on évite les artefacts d’une image extraite d’un plan de coupe de l’image 3D susceptibles d’aboutir à des cas dans lesquels il est impossible de discriminer la présence d’une lésion potentielle de présence du sang située à proximité du muscle. En effet, dans certains cas, la lésion est tellement proche du sang, on la nomme sous endocardique, qu’il est difficile de savoir, en sur des images présentant des artefacts, si c’est une lésion, du sang ou un artefact de l’image.
Le procédé selon l’invention permet de fonder une décision clinique avec peu de risque d’erreur de diagnostic sur la présence d’une lésion ou non.
Matériel D’un point de vue matériel, l’unité de traitement TC peut être vue comme un calculateur interagissant avec des programmes d’ordinateur.
L’unité de traitement TC comprend au moins un ordinateur, par exemple, un micro-ordinateur, un réseau d’ordinateurs, un composant électronique, une tablette, un Smartphone ou un assistant numérique personnel (PDA).
L’unité de traitement et commande TC comprend par exemple, un calculateur, comprenant un ensemble d’au moins un processeur, et éventuellement une mémoire couplée opérationnellement au calculateur.
La mémoire comprend par exemple un support lisible par ordinateur. Le support lisible par ordinateur est un dispositif tangible lisible par un lecteur de l’unité de traitement, apte à mémoriser des instructions électroniques et à être couplé au système de communication ou unité de communication.
Autrement dit, le support lisible par ordinateur est un support tangible. Autrement dit, ce n'est pas un signal transitoire en soi, tels que des ondes radio ou d'autres ondes électromagnétiques à propagation libre, telles que des impulsions lumineuses ou des signaux électroniques. Un tel support de stockage lisible par ordinateur est, par exemple, un dispositif de stockage électronique, un dispositif de stockage magnétique, un dispositif de stockage optique, un dispositif de stockage électromagnétique, un dispositif de stockage à semi- conducteur ou toute combinaison de ceux-ci.
A titre d'exemple, le support lisible est un disque optique, un disque magnéto-optique, une mémoire morte (ROM, de l'anglais Read-Only Memory), une mémoire morte effaçable et programmable (EPROM, de l'anglais Erasable Programmable Read-Only Memory), une mémoire morte programmable et effaçable électriquement (ÉEPROM, de l'anglais Electrically Erasable Programmable Read-Only Memory), une mémoire vive (RAM, de l'anglais Random Access Memory), une carte magnétique ou une carte optique.
Le support lisible peut comporter un système d’exploitation et charger les programmes selon l’invention. Il comporte des registres adaptés à enregistrer des variables de paramètres créés et modifiés eu cours de l’exécution des programmes précités. Sur le support lisible est alors mémorisé un programme d'ordinateur comportant des instructions logicielles. En variante, les instructions des programmes sont issues d’une source externe et téléchargées via un réseau. C’est notamment le cas pour les applications.
L’unité de de traitement et de commande comprend un calculateur, c’est-à-dire au moins circuit électronique de traitement de données conçu pour manipuler et/ou pour transformer des données représentées par des quantités électroniques ou physiques dans des registres du système d'évaluation et/ou des mémoires en d'autres données similaires correspondant à des données physiques dans les mémoires de registres ou d'autres types de dispositifs d'affichage, de dispositifs de transmission ou de dispositifs de mémorisation.
L’unité de traitement CT comprend, par exemple, des mémoires, pour stocker des données, par exemple les images sang-noir et sang blanc, couplées opérationnellement au circuit traitement de données et un lecteur adapté à lire un support lisible par ordinateur.
Les étapes du procédé selon l’invention sont, par exemple, exécutées en amenant les circuits de traitement de l’unité de traitement CT à lire des programmes prédéterminés enregistrés sur des matériels tels que des mémoires de telle sorte que leurs circuits de traitement de données exécutent des calculs, commandent des communications et à lisent et/ou écrivent des données dans des mémoires.
La caractérisation est, par exemple, exécutée sur un dispositif de traitement, par exemple ordinateur unique, ou sur un système distribué entre plusieurs ordinateurs (notamment via l’utilisation de l’informatique en nuage).
L’unité de traitement CT comprend au moins un calculateur comprenant au moins des éléments listés ci-après : un ensemble d’un ou plusieurs processeurs (par exemple au moins une unité de traitement centrale (CPU) et/ou au moins une unité de traitement graphique (GPU) et/ou au un microcontrôleur et/ou au un processeur de signal numérique (DSP)) ASIC aptes à interpréter des instructions sous forme de programme informatique et/ou un ensemble matériel comme un circuit intégré spécifique à une application (ASIC), un réseau de portes programmables in situ (FPGA), un dispositif logique programmable (PLD) des réseaux logiques programmables (PLA), un système sur puce (SOC), et/ou une carte électronique dans laquelle des étapes du procédé selon l’invention sont implémentées dans des éléments matériels. L’invention se rapporte à un produit programme d’ordinateur comprenant le support lisible par ordinateur contenant des instructions qui, lorsqu'elles sont exécutées par le circuit de traitement, amènent le système S à mettre en œuvre les étapes du procédé selon l’invention.
Le produit-programme peut comprendre le support d’enregistrement lisible par ordinateur.
L’invention se rapporte également à un support lisible par ordinateur, sur lequel est enregistré le programme d’ordinateur.
En variante, les instructions du programme sont issues d’une source externe et téléchargées via un réseau. C’est notamment le cas pour les applications. Dans ce cas, le produit programme d'ordinateur comprend un support de données lisible par ordinateur sur lequel sont stockées les instructions de programme ou un signal de support de données sur lequel sont codées les instructions de programme.
La forme des instructions de programme est, par exemple, une forme de code source, une forme exécutable par ordinateur ou toute forme intermédiaire entre un code source et une forme exécutable par ordinateur, telle que la forme résultant de la conversion du code source via un interpréteur, un assembleur, un compilateur, un éditeur de liens ou un localisateur. En variante, les instructions de programme sont un microcode, des instructions firmware, des données de définition d’état, des données de configuration pour circuit intégré (par exemple du VHDL) ou un code objet. Les instructions de programme sont écrites dans n’importe quelle combinaison d’un ou de plusieurs langages de programmation, par exemple un langage de programmation orienté objet (C++, JAVA, Python), un langage de programmation procédural (langage C par exemple).
L’unité de communication comprend au moins un dispositif de communication permettant une communication entre les éléments du système et éventuellement entre au moins un élément du système et un dispositif extérieur au système. Les systèmes de communication peuvent établir un lien physique entre des éléments du système et/ou entre un élément du système et un dispositif extérieur au système et/ou un lien en communication à distance (sans fil) entre des éléments du système et/ou entre un élément du système et un dispositif extérieur au système. Le dispositif de communication peut comprendre n'importe quel matériel, microprogramme et/ou logiciel approprié pour communiquer des informations entre des éléments du dispositif auquel appartient le dispositif de communication, par exemple via un bus de données, ou à un élément extérieur au dispositif. Afin de permettre la communication de données entre différents dispositifs auxquels appartiennent, le cas échéant, des dispositifs de communication, ces dispositifs comprennent du matériel micrologiciel et/ou logiciel permettant d’établir, entre eux, une liaison de communication câblée, ou sans-fil, par exemple Wi-Fi, Bluetooth, cellulaire ou Ethernet.
L'interface utilisateur INT permet à un utilisateur de saisir des données ou des commandes de façon à pouvoir interagir avec les programmes selon l’invention.
L’interface utilisateur INT comprend, par exemple, une interface et sortie INTS et une interface d’entrée INTE.
L’interface d’entrée comprend, par exemple, un clavier ou un une interface de pointage, tel qu’une souris, un crayon optique, un pavé tactile, une télécommande, un dispositif de reconnaissance vocale, un dispositif haptique.
L’interface de sortie INTS est conçue pour restituer des informations à un utilisateur, de façon sensorielle ou électrique, comme, par exemple de façon visuelle ou sonore. L’interface de sortie comprend, par exemple, un afficheur. L’étape d’affichage AFFD peut être une étape de restitution d’informations par un autre moyen qu’un afficheur.
L’interface de sortie INTS peut être le dispositif d’entrée INTE, par exemple, dans le cas d’une tablette tactile.

Claims

REVENDICATIONS
1. Procédé de caractérisation lésionnelle du cœur utilisant des images d’une zone à imager comprenant le cœur (CO) d’un patient, le cœur comprenant un myocarde délimitant une cavité du cœur, les images comprenant :
- une image en sang noir (ISN) générée à partir de signaux acquis lors d’une acquisition par résonnance magnétique en sang noir (ACQ1 ) par rehaussement tardif du gadolinium,
- une image en sang blanc (ISB) générée à partir de signaux acquis lors d’une acquisition par résonnance magnétique en sang blanc par rehaussement tardif du gadolinium, l’acquisition en sang blanc (ACQ2) étant distincte d’une séquence d’inversion récupération, le procédé comprenant :
- segmentation (SEG), par ordinateur, de l’image en sang blanc (ISB) de sorte à générer des données de positionnement d’un ensemble d’au moins une paroi délimitant le myocarde,
- caractérisation lésionnelle (CAR) du cœur, par ordinateur, à partir de l’image en sang noir (ISN) et de données de positionnement, d'au moins une paroi (L1 , L2) de l’ensemble d’au moins une paroi délimitant le myocarde, prises parmi les données de positionnement de l’ensemble d’au moins une paroi délimitant le myocarde.
2. Procédé selon la revendication précédente, dans lequel la segmentation (SEG) utilise une fonction d’apprentissage pour segmenter l’image en sang blanc (ISB) de sorte à obtenir les données de positionnement.
3. Procédé selon la revendication précédente, dans lequel la fonction d’apprentissage est un réseau de neurones convolutifs.
4. Procédé selon l’une quelconque des revendications 2 à 3, dans lequel la fonction d’apprentissage est entraînée à partir d’un ensemble d’images d’entraînement de la zone à imager générées à partir de signaux acquis lors d’étapes d’acquisitions respectives par résonnance magnétique en sang blanc par rehaussement tardif du gadolinium distinctes de séquences d’inversion récupération.
5. Procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l’ensemble d’au moins une paroi comprend une première paroi (L1) délimitant et entourant le myocarde.
6. Procédé selon la revendication 5, dans lequel la caractérisation (CAR) comprend une segmentation lésionnelle (SC) pour localiser une lésion du myocarde sur l’image en sang noir (ISN) en utilisant des données issues de données de positionnement de la première paroi (L1).
7. Procédé selon la revendication 6, dans lequel la segmentation lésionnelle (SC) comprend la sélection des pixels de l’image en sang noir (ISN) présentant une intensité supérieure à un seuil prédéterminé, les pixels étant pris uniquement parmi les pixels de l’image en sang noir (ISN) entourés de la première paroi (L1 ).
8. Procédé selon l’une quelconque des revendications 5 à 7, dans lequel l’ensemble d’au moins une paroi comprend une deuxième paroi (L2) délimitant le myocarde et entourée par la première paroi (L1 ).
9. Procédé selon la revendication 8, dans lequel la caractérisation (CAR) comprend un calcul (CTT) de données représentatives d’un pourcentage de transmuralité de la lésion (CIC) à partir de données issues des données de positionnement de la première paroi (L1 ) et de la deuxième paroi (L2).
10. Procédé selon l'une quelconque des revendications 8 à 9, dans lequel la caractérisation comprend un calcul (CTA) d’une donnée représentative d’une taille de lésion (CIC) à partir de données issues des données de positionnement de la première paroi (L1 ) et de la deuxième paroi (L2).
11. Procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes, comprenant l’affichage, sur un écran, d’une représentation de données calculées lors de l’étape de caractérisation (CAR).
12. Procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes, comprenant les étapes suivantes : o l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir (ACQ1 ) par rehaussement tardif du gadolinium, o génération de l’image en sang noir (ISN) à partir des signaux acquis lors l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir (ACQ1 ) par rehaussement tardif du gadolinium, o acquisition par résonnance magnétique en sang blanc (ACQ2) par rehaussement tardif du gadolinium, o génération de l’image en sang blanc (ISB) à partir des signaux acquis lors de l’acquisition par résonnance magnétique en sang noir (ACQ2) par rehaussement tardif du gadolinium.
13. Procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l’image en sang noir et l’image en sang blanc sont bidimensionnelles.
14. Système comprenant les éléments matériels et logiciels pour mettre en œuvre le procédé selon l’une quelconque des revendications précédentes, le système comprenant une unité de traitement configurée pour mettre en œuvre l’étape de segmentation et l’étape de caractérisation lésionnelle.
15. Produit-programme d'ordinateur comprenant des instructions qui conduisent le système selon la revendication 14 à exécuter les étapes du procédé selon l’une quelconque des revendications 1 à 13.
16. Support lisible par ordinateur, sur lequel est enregistré le programme d'ordinateur selon la revendication 15.
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