EP2859479A1 - Procede de determination de volumes fonctionnels pour la determination de biocinetiques - Google Patents

Procede de determination de volumes fonctionnels pour la determination de biocinetiques

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Publication number
EP2859479A1
EP2859479A1 EP13728700.9A EP13728700A EP2859479A1 EP 2859479 A1 EP2859479 A1 EP 2859479A1 EP 13728700 A EP13728700 A EP 13728700A EP 2859479 A1 EP2859479 A1 EP 2859479A1
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
kinetics
denotes
spatial
dirichlet
concentration
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP13728700.9A
Other languages
German (de)
English (en)
Inventor
Eric Barat
Claude COMTAT
Thomas Dautremer
Thierry Montagu
Régine TREBOSSEN
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Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
Original Assignee
Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
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Filing date
Publication date
Application filed by Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA filed Critical Commissariat a lEnergie Atomique et aux Energies Alternatives CEA
Publication of EP2859479A1 publication Critical patent/EP2859479A1/fr
Withdrawn legal-status Critical Current

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    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01TMEASUREMENT OF NUCLEAR OR X-RADIATION
    • G01T1/00Measuring X-radiation, gamma radiation, corpuscular radiation, or cosmic radiation
    • G01T1/29Measurement performed on radiation beams, e.g. position or section of the beam; Measurement of spatial distribution of radiation
    • G01T1/2914Measurement of spatial distribution of radiation
    • G01T1/2985In depth localisation, e.g. using positron emitters; Tomographic imaging (longitudinal and transverse section imaging; apparatus for radiation diagnosis sequentially in different planes, steroscopic radiation diagnosis)
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16HHEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
    • G16H50/00ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
    • G16H50/50ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for simulation or modelling of medical disorders
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01TMEASUREMENT OF NUCLEAR OR X-RADIATION
    • G01T1/00Measuring X-radiation, gamma radiation, corpuscular radiation, or cosmic radiation
    • G01T1/16Measuring radiation intensity
    • G01T1/167Measuring radioactive content of objects, e.g. contamination

Definitions

  • the invention relates to a method for determining functional volumes for positron emission tomography and is particularly applicable to the fields of position emission tomography and pharmacokinetics.
  • Positron emission tomography is a nuclear medicine imaging technology that uses molecules labeled with a positron emitting radionuclide to image in vivo the molecular interactions of biological processes with minimal disruption.
  • PET is the reference modality for molecular imaging because of its molecular sensitivity of the order of femto-mole and the quantitative nature of the measurements it allows.
  • PET imaging is used in particular to determine the functional volumes designated in the following description by the acronym VF.
  • a functional volume VF corresponds to an area consisting of tissues with identical metabolic properties.
  • the state of the art in functional volume estimation proceeds indirectly by reconstructing in a first step a time series of discretized images and then estimating the functional volumes from this series of images.
  • radio-tracer also called radio-pharmaceutical
  • PET molecular imaging is inherently dynamic insofar as the distribution of the radio-tracer injected into the body evolves over time depending on the molecular interactions between the tracer and the tissues.
  • the objective of the interpretation of the examination can then be summarized as a quantitative and objective characterization of spatial extensions with similar temporal pharmacokinetic behaviors, hence the concept of functional volumes. It is quantitative in that it must decide on the uncertainty associated with the molecular concentration contained in each functional volume in terms of the amount of radio-tracer. It is objective insofar as the number, the positioning and the extension of the functional volumes do not rest on the supervision of an expert having defined beforehand one or more regions of interest.
  • the determination of the spatial extension of the functional volume is defined a priori, from the anatomical imagery. Then, from the time series of images, the average activity concentration within the functional volume, which corresponds to an anatomical volume, is measured for each time slot.
  • Existing methods can determine the extension of the functional volume directly from the dynamic images. Source separation techniques are also used to determine distinct molecular processes from reconstructed images. However, the number of kinetics is fixed in these approaches. A. Reader et al. Repeat this principle in their article entitled Joint estimation of dynamic PET images and temporal basis functions fully 4D ML-EM, Physics in Medicine and Biology, 51 (21): 5455-5474, 2006, using a dictionary of temporal functions and seek decomposition in a functional base that best fits the dataset.
  • This modeling although it allows the automatic detection of any number of kinetics, is not optimal in the sense that the kinetic discrimination uses only their forms and does not take into account the notion of concentration. ie the amplitude of the TACs expressed in terms of Becquerel per second, this unit being denoted by Bq.s "1.
  • the limit of this modeling comes from the model adopted for the clustering of the spatial components with a particular kinetics. Indeed, it implements a hierarchical model where the random distribution of kinetics, represented by / c 0 , is itself distributed according to a Dirichlet process of Pôlya trees, then the distribution of spatio-temporal components noted. H is chosen as a Dirichlet process whose central measurement involves K, Q. No information on the concentration is present in this stochastic model.
  • An object of the invention is in particular to overcome the aforementioned drawbacks.
  • the subject of the invention is a method for determining functional volumes for kinetic research, representing the evolution of the concentration of a radio-tracer in a zone of biological tissue.
  • the method is applied to spatial components and comprises the following steps iteratively applied according to a Markov chain Monte Carlo scheme:
  • each spatial component of the index k of kinetic selection probabilities of all ⁇ 3 ⁇ 4 are weighted by introducing a function ⁇ k representative of the concentration of radio tracer in this component so as to obtain a set of indicator values, an indicator value D k designating the kinetics with which the spatial component k is associated;
  • a step of constructing functional volumes a functional volume VF j consisting of all the spatial components that share the same indicator value
  • a step calculates averages of the functional volumes VFj obtained during the iterative process.
  • a step determines statistical estimators of the VFj functional volumes obtained during the iterative process to quantify the estimation uncertainty.
  • the variance of the functional volumes VFj obtained during the iterative process can then be determined.
  • a credible interval can also be determined.
  • the set ⁇ 3 ⁇ 4 is obtained by the determination of two sets of scalar variables Vj and ⁇ , ⁇ , these variables relating to kinetic components of index j, where Vj represents a fixed weighting coefficient independent of the concentration A and v ⁇ represents a reference concentration value associated with the kinetics of index j.
  • V i is determined using the expression:
  • m. j denotes the number of components of the distribution M allocated to the component j omc of H being a random measure distributed according to a partially dependent Dinchlet process, being an uncountable collection of random probability measures that admit as a distribution a local Dirichlet process;
  • - Kn denotes the largest index of the components of tc ⁇ having at least one component of H allocated
  • Beta (,) represents the law of probability beta.
  • r, - is determined using the expression:
  • V j denotes the characteristic parameter of the concentration associated with the kinetics j
  • D denotes the set of variables D k which indicate to which kinetics of the spatial component k is associated;
  • Vj ⁇ k ⁇ ": D k > j ⁇ represents the set of indices k of spatial components associated with a kinetics of index greater than j;
  • w denotes the set of weights w k of the spatial components k in the Dirichlet mixture H ;
  • Z denotes the set of parameters, average and covariance matrix, z k associated with the spatial component k of the Dirichlet M mixture;
  • V denotes a coefficient associated with each kinetics involved in the weighting of said kinetics in
  • 3 ⁇ 4 ' ⁇ is a threshold chosen a priori which makes it possible to parameterize A3 ⁇ 4.
  • the labeling step is performed:
  • ⁇ ⁇ denotes the number of spatial components to which at least one coincidence event is associated
  • K * denotes the total number of spatial components of the Dirichlet mixture H for a given iteration
  • v denotes the set of coefficients V) involved in the weightings of the kinetic mixture A3 ⁇ 4;
  • v represents the set of auxiliary variables Vk used in the representation of the kinetic Dirichlet process
  • Q * denotes the set of Polya Q * trees characterizing the kinetics
  • denotes the set of parameters i j characteristic of the concentration associated with the kinetics j;
  • C denotes the set of classification variables c t that associate each coincidence event i with a spatial component of the Dirichlet mixture
  • T represents the set of occurrence times r, coincidence events
  • p jk denotes the probability of associating the component k of the Dirichlet mixture H with the kinetics j;
  • P j (X) represents the weight function taken in ⁇ associated with the probability of the kinetics j of J 3 ⁇ 4;
  • indicates here an independent random generation for each classification variable D k ;
  • max ⁇ represents the function "maximum of"
  • ⁇ designate is an arbitrarily chosen threshold parameter involved in the implementation of the slice sampiing algorithm of the local Dirichlet kinetics process
  • / Q. represents the kinetics of the density of the Po! yaj tree of the local Dirichlet kinetic mixture
  • J * denotes the total number of components of the local Dirichlet kinetics mixture for a given iteration.
  • the concentration ⁇ k is obtained by
  • E 13 ⁇ 4 designates the expectation with respect to the Gaussian probability law of x k , ⁇ '( ⁇ ;
  • N () represents the Gaussian probability law.
  • the invention also relates to a positron emission tomography device implementing the method described above.
  • the method according to the invention has the decisive advantage of increasing the distances between functional volumes and thereby increasing the quality of separation.
  • the method according to the invention resides on a new approach making it possible judiciously to establish the posterior distribution of the concentration of each kinetics, thus conferring on the process the possibility of providing an estimation of the uncertainty on the asymptotic parameters. metabolism of a tissue.
  • the method according to the invention makes it possible to substantially reduce the dose injected to the patient during a four-dimensional PET imaging while providing functional information at the molecular level.
  • a decrease in the dose of injected radio-tracer automatically induces a decrease in the exposure to ionizing radiation of the medical personnel involved in the preparation and execution of the examination as well as the patient's environment.
  • FIG. 1 schematically illustrates the various steps of the method of determining the functional volumes
  • FIG. 2 illustrates the manner in which the weights and auxiliary variables of the distribution H of the spatiotemporal components are generated
  • Figure 3 schematically illustrates how the spatial parameters used by the method are generated
  • FIG. 4 schematically illustrates a way of determining the local and auxiliary variables of the set
  • Figure 5 illustrates how the kinetics are allocated to the components of the set A3 ⁇ 4;
  • Figure 6 shows how the places of emission are determined and how the components of H are determined
  • Figure 1 schematically illustrates the different steps of the method of determining functional volumes.
  • the objective of the method is to determine functional volumes for kinetic research. It is applied to measurements presented as coincidence events 106 and includes a series of iteratively applied steps 111 according to a Markov chain Monte Carlo scheme.
  • a first step 108 is generated a set t composed of a set of candidate kinetics associated with probability values of appearance of these kinetics, these values depending on the ⁇ concentration of radio-tracer.
  • a second labeling step 109 for each spatial component of index k 106, the selection probabilities of the kinetics of the set ⁇ 3 ⁇ 4 are weighted 102 by introducing a function ⁇ k .
  • This function is representative of the radiotracer concentration of this component so as to obtain a set of indicator values 103.
  • An indicator value u k denoting the kinetics with which the spatial component k is associated is determined.
  • the functional volumes are constructed, a functional volume VFj being composed of the set of spatial components that share the same indicator value z3 ⁇ 4. The method of determining functional volumes described below makes it possible to overcome the independence of the model used by Fall, Barat et al. vis-à-vis the concentration information.
  • the concentration of the radio-tracer is estimated at all points in the space by marginalization, that is to say by integration over time of the spatio-temporal activity distribution. This estimated concentration is then considered as an endogenous random co-variable of the problem.
  • a local IDP Dirichlet process of Polya trees is selected.
  • the distribution H of spatio-temporal components is no longer generated according to a Dirichlet process but according to a distribution called in the following description Dirichlet process partially dependent and designated by the acronym pdDP from the expression Anglo-Saxon "partially depend Dirichlet Process".
  • the construction of the pdDP is parameterized by a function ⁇ ⁇ which makes it possible to link the concentration co-variable A to the parameters of the spatial marginal distribution obtained by integration over time of the spatio-temporal distribution.
  • the general problem of reconstruction of a probability distribution G (-) of which only samples of a projection of this one denoted F (-) are observable is formulated in the nonparametric Bayesian framework for the inverse problems by using the expressions following:
  • (.) G is a random probability distribution distributed following ç, defined by (X X T. ⁇ ⁇ .) ® ⁇ ⁇ ));
  • x) is the so-called known probability distribution, called projector, indexed by and defined on (y, a (y) ⁇ ;
  • each event in coincidence is assigned to a virtual line LOR, acronym from the Anglo-Saxon "line-of-response", joining the centers of the two detectors.
  • An LOR response line of index l is characterized by the parameters defining its position in the space of the detectors.
  • a correspondence is hereinafter constructed between the parameters of the LOR and the index t such that the variable y, corresponds to the index of the LOR having recorded the observed coincidence mc . More precisely, the observation y t denotes the coordinates of the LOR which joins the two detectors having recorded the coincident photons resulting from the positron annihilation which occurred in Xi .
  • equation (1) corresponds to the following interpretation:
  • X c R 3 corresponds to the region of the reconstruction space
  • T c . f + corresponds to the acquisition time range
  • Ti corresponds to the time of occurrence of the observed event mc ;
  • Cl is the spatio-temporal distribution of the emissions corresponding to the recorded events.
  • the set of observations is truncated because of the limited axial field of the imager.
  • the spatio-temporal density of emission sites can then be written: expression in which j y v * (dyjx) denotes the probability of recording a localized x-ray emission taking into account the geometry of the system and the physical properties of the detection system.
  • Expression (2) formally defines the proposed model that takes into account spatial concentration as an endogenous co-variable of the reconstruction problem:
  • H is a random measure distributed according to a partially dependent Dirichlet process pdDP defined as
  • V (m, ⁇ ) denotes the multi-variate Gaussian normal law in p-3 dimension parameterized by its mean m and its covariance matrix ⁇ , density:
  • the generative model defined in expression (2) and the notion of pdDP of expression (3) are explained below.
  • M in (3) is a statistical mixture where w k corresponds to the weight of the component kk , z k to the spatial parameters and Q k to the kinetics, that is to say the temporal probability distribution, of the fc eMe spatio-temporal component of the mixture.
  • the distributions for the 3 ⁇ 4 and Z k are identical to those of a Dirichlet process.
  • G 0 which can be for example chosen as a Normal-Wishart inverse model ⁇ NIW ⁇ . ⁇ ( , ⁇ 11 ) such that z k - (m A , ⁇ A ) with:
  • W denotes the Wishart distribution whose density is expressed using the expression (4) wherein n u is the degree of freedom of the law Wishart et ⁇ 0 the associated scale matrix.
  • M (T) represents the set of measurements on T.
  • ⁇ ( ⁇ ) takes its values in A c R .
  • the function ⁇ ⁇ can be chosen as the value of the expectation of the spatial density taken on the component k:
  • 3 ⁇ 4 (A) V3 ⁇ 4ll (d (A, r i ) ⁇ ) and d ( ⁇ , ⁇ ') represents the Euclidean distance between A and A'.
  • the W collection consists of mutually independent random variables
  • Vt GB ( f Q (t) 2 T 'f Qc (t) ⁇ Q (3 ⁇ 4, ... £ ,)
  • the justification for a partial specification of the Pôlya tree can be supported by the fact that for Continuous distributions, the parameters increase rapidly according to the levels of the tree. The updating of the law from the data then little influence the law a priori because the number of observations in the high levels becomes low vis-à- screw of the parameter a priori.
  • the method according to the invention can be provided with auxiliary variables that will make effective the iterative procedure of reconstruction and the implementation of a method of the MCMC type, acronym from the Anglo-Saxon "Markov Chain Monte Carlo".
  • slice sampling Auxiliary variables for slice sampling, usually referred to as slice sampling, are described below.
  • slice sampling a technique called slice sampling as described in the article by M. Kalii, JE Griffin and SG Walker entitled Slice sampling mixture models, Statistics and Computing, 21 (1): 93 -105, 2011.
  • This approach requires the introduction of additional variables.
  • Let u ⁇ ui, u-2, u n be uniform random variables.
  • ⁇ ⁇ . a dependent slice variable
  • the MCMC sampler successively generates samples from the following conditional distributions: Places of emission / allocation to the components of H ( ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ )
  • Figure 2 illustrates how the weights and auxiliary variables of the H distribution of spatio-temporal components are generated, that is, how conditional distribution samples (.ujC) are generated.
  • the w k are generated for t. ⁇ ⁇ . (w 1 , w 2 , ..., w Kn , r Kn ⁇ C) ⁇ Dirichlet (m, n 2 n Kn1 ⁇ )
  • UI samples , W 2 , ... c are generated. ⁇
  • a third step 202 the samples "3 ⁇ 4. are generated for k>"". As long as rfc _ J >"*,
  • Figure 3 schematically illustrates how the spatial parameters are generated, i.e. how conditional distribution samples z C ; X) are generated.
  • Figure 4 schematically illustrates one way of determining the local and auxiliary variables of the set A3 ⁇ 4. For this, (V, ⁇ , v
  • V ⁇ (k ⁇ ⁇ : D k > ./ ⁇
  • m j as the number of components of M allocated to the f mc component of f $.
  • min ( pj , i, ..., ⁇ .K .,).
  • Figure 5 illustrates how kinetics are allocated to x réellees components, ie how is generated.
  • At first 500 is generated independently for all k ⁇ ⁇ :
  • Polya trees must then be generated from the generated kinetics.
  • Figure 6 shows how the places of emission are determined and how the components of H are determined. This is done by generating (C. Xjw, u, Z, Q * , D, Y, T).
  • conditional law has a form that does not allow a direct generation. Indeed, it uses the projector v ⁇ Y l ⁇ X l ) which integrates geometric and physical characteristics of the detection device, which excludes in practice to find an analytical expression for the distribution offering a hope of simple generation. So we use a Metropolis-Hastings stage. We begin by expressing the conditional distribution using the Bayes rule. , Xi lYi, T uw, Z, Q *, DV x (3 ⁇ 4 (Q, 3 ⁇ 4) with fc.
  • C * is generated independently 601 such that:
  • x * is generated 802 indefinitely such that: X * ' ⁇ A r (X * 1 rnr, y,, ⁇ (?, F )
  • This expression can be evaluated by a sampling technique of importance. For that, for a given number of particles ⁇ ⁇ and for all k, one independently generates 700 for all ⁇ ⁇ ⁇ : Then we calculate 701 for all ⁇ ⁇ :
  • the spatio-temporal density corresponding to all the events, which are not necessarily observable, is obtained by normalization.
  • any other functional of the posterior distributions can be calculated, such as a conditional variance or a credibility interval.

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Abstract

L'invention a pour objet un procédé de détermination de volumes fonctionnels pour la recherche de cinétiques représentant l'évolution de la concentration d'un radio-traceur dans une zone de tissu biologique, le procédé étant appliqué à des composantes spatiales (106) et comprend les étapes suivantes appliquées de manière itérative (111) selon un schéma de Monte-Carlo par chaîne de Markov : une étape de génération (108) d'un ensemble (formule A)composé d'un ensemble de cinétiques candidates associées à des valeurs de probabilité d'apparition de ces cinétiques, ces valeurs dépendant de la concentration lambda de radio-traceur; une étape d'étiquetage (109) durant laquelle pour chaque composante spatiale d'indice k (106) les probabilités de sélection des cinétiques de l'ensemble(formule B)sont pondérées (102) en y introduisant une fonction lambda kappa représentative de la concentration de radio-traceur dans cette composante de manière à obtenir un ensemble de valeurs indicatrices (103), une valeur indicatrice D k désignant la cinétique à laquelle est associée la composante spatiale k; une étape de construction de volumes fonctionnels (110), un volume fonctionnel VF j , étant composé de l'ensemble des composantes spatiales qui partagent la même valeur indicatrice D k .

Description

PROCEDE DE DETERMINATION DE VOLUMES FONCTIONNELS POUR LA DETERMINATION DE BIOCINETIQUES
L'invention concerne un procédé de détermination de volumes fonctionnels pour la tomographie par émission de positons et s'applique notamment aux domaines de le tomographie par émission de positions et de la pharmacocinétique.
La tomographie par émission de positons, habituellement désignée par l'acronyme TEP, est une technologie d'imagerie de médecine nucléaire qui utilise des molécules marquées avec un radionucléide émetteur de positons pour imager in vivo les interactions moléculaires de processus biologiques avec un minimum de perturbations. La TEP est la modalité de référence pour l'imagerie moléculaire en raison de sa sensibilité moléculaire de l'ordre de la femto-mole et du caractère quantitatif des mesures qu'elle permet. L'imagerie TEP est utilisée en particulier pour déterminer les volumes fonctionnels désignés dans la suite de la description par l'acronyme VF. Un volume fonctionnel VF correspond à une zone constituée de tissus présentant des propriétés métaboliques identiques.
L'état de la technique en matière d'estimation de volumes fonctionnels procède indirectement en reconstruisant dans une première étape une série temporelle d'images discrétisées puis en estimant les volumes fonctionnels à partir de cette série d'images. Or la diminution de la dose de radio-traceur, appelé aussi radio-pharmaceutique, contribue à dégrader le rapport signal sur bruit de chacune des images ce qui nuit, dans cette approche indirecte, à la détermination des volumes fonctionnels.
L'utilisation en routine clinique de la TEP se fait encore souvent dans un cadre statique, spatial 2D ou 3D, où la variable temps est ignorée, par manque d'outils permettant une analyse des données dynamiques robuste, automatique et validée. Cette utilisation est significativement sous- optimale. En effet, l'imagerie moléculaire TEP est par essence dynamique dans la mesure où la distribution du radio-traceur injecté dans l'organisme évolue dans le temps en fonction des interactions moléculaires entre le traceur et les tissus. L'objectif de l'interprétation de l'examen peut alors se résumer à une caractérisation quantitative et objective des extensions spatiales présentant des comportements pharmacocinétiques temporels similaires, d'où la notion de volumes fonctionnels. Elle est quantitative dans la mesure où elle doit se prononcer sur l'incertitude associée à la concentration moléculaire contenue dans chaque volume fonctionnel en termes de quantité de radio-traceur. Elle est objective dans la mesure où le nombre, le positionnement et l'extension des volumes fonctionnels ne reposent pas sur la supervision d'un expert ayant défini au préalable une ou plusieurs régions d'intérêt.
L'état de la technique dans l'étude dynamique des biocinétiques par imagerie TEP s'appuie sur une segmentation temporelle de l'information afin d'obtenir une série 3D. Cela signifie que l'acquisition est subdivisée en tranches temporelles reconstruites indépendamment les unes des autres. Bien que permettant un suivi dynamique de la distribution du radio-traceur à partir de la série d'images reconstruites, cette approche présente l'inconvénient que seule une partie des observations est utilisée pour reconstruire une image. Cette perte statistique induit fatalement une détérioration de la qualité de la reconstruction d'autant plus que la tranche temporelle est courte.
La plupart du temps, la détermination de l'extension spatiale du volume fonctionnel est définie a priori, à partir de l'imagerie anatomique. Ensuite, on mesure à partir de la série temporelle d'images la concentration d'activité moyenne à l'intérieur du volume fonctionnel, qui correspond en réalité à un volume anatomique, et ce pour chaque tranche temporelle. Des méthodes existantes permettent de déterminer l'extension du volume fonctionnel directement à partir des images dynamiques. Des techniques de séparations de sources sont également utilisées pour déterminer les processus moléculaires distincts à partir des images reconstruites. Cependant, le nombre de cinétiques est fixé dans ces approches. A. Reader et al reprennent ce principe dans leur article intitulé Joint estimation of dynamic PET images and temporal basis functions using fully 4D ML-EM, Physics in Medicine and Biology, 51 (21 ) :5455-5474, 2006, en utilisant un dictionnaire de fonctions temporelles et cherchent la décomposition dans une base fonctionnelle qui ajuste au mieux le jeu de données. À partir d'un nombre limité de fonctions de base temporelles, typiquement une petite dizaine, on peut a priori décrire par leur combinaison un nombre infini de courbes d'activité temporelle, désignées habituellement par l'acronyme TAC venant de l'expression anglo-saxonne « Time Activity Curve ». Ces méthodes de reconstruction 4D permettent d'améliorer le rapport signal sur bruit des images reconstruites. Toutes ces techniques cherchent à procéder à une classification, désignée aussi en utilisant le mot anglais « clustering », de données spatio-temporel des désintégrations, mais procèdent indirectement pour y parvenir puisqu'une étape de reconstructions d'images voxélisées sur tout l'espace est nécessaire. En effet, ces techniques requièrent la discrétisation de toutes les dimensions spatiales et temporelle, entraînant la manipulation et le stockage de gros volumes de données ainsi que des temps de calcul considérables. D'autre part, cette dernière approche ne permet pas de quantifier sans approximation l'erreur d'estimation.
Des travaux sur la reconstruction en tomographie d'émission sans recourir à la discrétisation de l'espace ont été menés dans un cadre bayésien non paramétrique. Cette approche a été étendue à la reconstruction spatiotemporelle comme présenté dans l'article de D. Fall, E. Barat, C. Comtat, T. Dautremer, T. Montagu, et S. Stute intitulé Continuous space-time reconstruction in 4D PET, IEEE Médical Imaging Conférence, 2011 . Cet article est appelé Fall, Barat et al . dans la suite de la description. Cette méthode adresse le problème de la détermination quantitative de l'erreur de reconstruction des volumes fonctionnels et l'objectif de diminution de la dose injectée au patient. Elle propose en outre un « clustering » spatio-temporel dans un espace continu directement à partir des observations. Cependant, dans cette approche, les TAC sont toutes considérées comme des cinétiques normalisées. Cette modélisation, bien qu'elle autorise la détection automatique d'un nombre quelconque de cinétiques, n'est pas optimale dans le sens où la discrimination entre cinétiques n'utilise que leurs formes et ne prend pas en compte la notion de concentration, c'est-à-dire l'amplitude des TAC exprimée en termes de Becquerel par seconde, cette unité étant notée Bq.s"1. La limite de cette modélisation vient du modèle retenu pour le clustering des composantes spatiales à une cinétique particulière. En effet, celui-ci met en œuvre un modèle hiérarchique où la distribution aléatoire des cinétiques, représentée par /c0, est elle-même distribuée suivant un processus de Dirichlet d'arbres de Pôlya. Puis, la distribution des composantes spatio-temporelles notée H est choisie comme un processus de Dirichlet dont la mesure centrale fait intervenir K,Q. Aucune information relative à la concentration n'est présente dans ce modèle stochastique.
Un but de l'invention est notamment de pallier les inconvénients précités.
A cet effet l'invention a pour objets un procédé de détermination de volumes fonctionnels pour la recherche de cinétiques représentant l'évolution de la concentration d'un radio-traceur dans une zone de tissu biologique. Le procédé est appliqué à des composantes spatiales et comprend les étapes suivantes appliquées de manière itérative selon un schéma de Monte-Carlo par chaîne de Markov :
- une étape de génération d'un ensemble A¾ composé d'un ensemble de cinétiques candidates associées à des valeurs de probabilité d'apparition de ces cinétiques, ces valeurs dépendant de la concentration λ de radio-traceur ;
- une étape d'étiquetage durant laquelle pour chaque composante spatiale d'indice k les probabilités de sélection des cinétiques de l'ensemble Λ¾ sont pondérées en y introduisant une fonction \k représentative de la concentration de radio- traceur dans cette composante de manière à obtenir un ensemble de valeurs indicatrices, une valeur indicatrice Dk désignant la cinétique à laquelle est associée la composante spatiale k ;
- une étape de construction de volumes fonctionnels, un volume fonctionnel VFj étant composé de l'ensemble des composantes spatiales qui partagent la même valeur indicatrice
Selon un aspect de l'invention, une étape calcule des moyennes des volumes fonctionnels VFj obtenus au cours du processus itératif.
Dans un mode de réalisation, une étape détermine des estimateurs statistiques sur les volumes fonctionnels VFj obtenus au cours du processus itératif de manière à quantifier l'incertitude d'estimation. La variance des volumes fonctionnels VFj obtenus au cours du processus itératif peut alors être déterminée. Un intervalle crédible peut aussi être déterminé.
A titre d'exemple, l'ensemble λ¾ est obtenu par la détermination de deux ensembles de variables scalaires Vj et Ι ,·, ces variables se rapportant à des composantes cinétiques d'indice j, où Vj représente un coefficient de pondération fixe indépendant de la concentration A et v} représente une valeur de concentration de référence associée à la cinétique d'indice j.
Selon un aspect de l'invention, Vj est déterminé en utilisant l'expression :
Vj
expression dans laquelle :
- pour tout j, m.j désigne le nombre de composantes de la distribution M allouées à la jômc composante de H étant une mesure aléatoire distribuée selon un processus de Dinchlet partiellement dépendent, étant une collection indénombrable de mesures de probabilité aléatoires qui admet comme distribution un processus de Dirichlet local ;
- jKn désigne le plus grand indice des composantes de tc^ possédant au moins une composante de H allouée ;
- Beta(, ) représente représente la loi de probabilité bêta.
Dans un mode de réalisation, r,- est déterminé en utilisant l'expression :
Γ,Ι^, ϋ, ,, Ζ ^ ^ ιΤ,) avec
U] (Γ/) ex 1 ( ,r < Tj < bj' ) x Π (1 - ^ 1 (d (Afe) Tj) < )} expressions dans lesquelles :
Vj désigne le paramètre caractéristique de la concentration associée à la cinétique j ;
D désigne l'ensemble des variables Dk qui indiquent à quelle cinétique de la composante spatiale k est associée ;
T) j = {k < η : Dk = j\ représente l'ensemble des indices k des composantes spatiales associées à la cinétique j ;
Vj = \ k < „ : Dk > j } représente l'ensemble des indices k des composantes spatiales associées à une cinétique d'indice supérieur à j ;
w désigne l'ensemble des pondérations wk des composantes spatiales k dans le mélange Dirichlet H ; Z désigne l'ensemble des paramètres, moyenne et matrice de covariance, zk associés à la composante spatiale k du mélange Dirichlet M ;
l~ indique ici une génération aléatoire indépendante pour chaque paramètre 1 ;
ex signifie ici «proportionnel à» ;
!() représente la fonction «porte» telle que t(œndition) = i si condition est vraie, et 0 sinon ;
V] désigne un coefficient associé à chaque cinétique intervenant dans la pondération de ladite cinétique dans ;
d{) représente la distance euclidienne dans R : d(xi , x2) = χι -r2 | où
X\ , X'2€ R ;
¾'· est un seuil choisi a priori qui permet de paramétrer A¾ .
Selon un aspect de l'invention, l'étape d'étiquetage est réalisée :
- en générant indépendamment pour tout fc < «n :
j*
(D*|V, v, Q*, r, w. Z, C, T) ∑Pj,k ôj {-) avec
p ex 1 (pj (Xk ) > vk ) max (pj (XK ) , ς ) J"Q* (T, )
{i ; C,=k}
et générant indépendamment pour tout k, tel que
j'
avec
Pj,k oc 1 {p3 (Xk) > !¾) l'iHX (¾· . ς) dans ces expressions,
κη désigne le nombre de composantes spatiales auxquelles au moins un événement de coïncidence est associé ;
K* désigne le nombre total de composantes spatiales du mélange Dirichlet H pour une itération donnée ;
v désigne l'ensemble des coefficients V) intervenant dans les pondérations du mélange de cinétiques A¾ ;
v représente l'ensemble des variables auxiliaires Vk utilisées dans la représentation du processus de Dirichlet de cinétiques ;
Q* désigne l'ensemble des arbres de Polya Q* caractérisant les cinétiques ;
Γ désigne l'ensemble des paramètres i j caractéristiques de la concentration associée à la cinétique j ;
C désigne l'ensemble des variables de classification ct qui associent chaque événement de coïncidence i à une composante spatiale du mélange Dirichlet ;
T représente l'ensemble des temps d'occurrences r, des événements de coïncidence ;
pj k désigne la probabilité d'associer la composante k du mélange Dirichlet H à la cinétique j ;
Pj(X) représente la fonction de poids prise en λ associée à la probabilité de la cinétique j de J ¾ ;
6j () représente la fonction mesure de Dirac telle que d, (f) - 1 si j = f et vaut 0 sinon ;
~' indique ici une génération aléatoire indépendante pour chaque variable de classification Dk ;
max{) représente la fonction «maximum de» ; ζ désigne est un paramètre de seuil choisi de façon arbitraire intervenant dans l'implémentation de l'algorithme de « slice sampiing » du processus de Dirichlet local de cinétiques ;
{i : Q - k} désigne l'ensemble des événements de coïncidences i qui sont associés à la composante spatiale fc ;
/Q. représente la cinétique j i.e. la densité de l'arbre de Po!ya j du mélange Dirichlet local de cinétiques ;
J* désigne le nombre total de composantes du mélange Dirichlet local de cinétiques pour une itération donnée.
Selon un autre aspect de l'invention, la concentration Âk est obtenue par app
avec :
dans laquelle :
E désigne l'espérance mathématique par rapport à la loi de probabilité gaussienne de xk, Λ'(ί ;
N() représente la loi de probabilité gaussienne.
L'invention a aussi pour objet un dispositif de tomographie par émission de positons mettant en œuvre le procédé décrit précédemment.
Le procédé selon l'invention présente l'avantage déterminant d'accroître les distances entre volumes fonctionnels et de ce fait d'augmenter la qualité de séparation.
D'autre part, le procédé selon l'invention réside sur une approche nouvelle permettant d'établir judicieusement la loi a posteriori de la concentration de chaque cinétique, conférant ainsi au procédé la possibilité de fournir une estimation de l'incertitude sur les paramètres asymptotiques de métabolisation d'un tissu. Avantageusement, le procédé selon l'invention permet de diminuer substantiellement fa dose injectée au patient lors d'une imagerie TEP à quatre dimensions tout en fournissant des informations fonctionnelles à l'échelle moléculaire.
Une utilisation répétée de l'imagerie TEP lors de suivi thérapeutique peut alors être envisagée sans préjudice dosimétrique pour le patient. Une utilisation plus développée en pédiatrie et dans la recherche translationnelle peut être également considérée.
En outre, une diminution de la dose de radio-traceur injectée induit automatiquement une diminution de l'exposition aux rayonnements ionisants du personnel médical participant à la préparation et la réalisation de l'examen ainsi que de l'entourage du patient.
D'autres caractéristiques et avantages de l'invention apparaîtront à l'aide de la description qui suit donnée à titre illustratif et non limitatif, faite en regard des dessins annexés parmi lesquels : la figure 1 illustre schématiquement les différentes étapes du procédé de détermination de volumes fonctionnels ;
- la figure 2 illustre la manière dont les poids et variables auxiliaires de la distribution H des composantes spatiotemporelles sont générés ;
la figure 3 illustre schématiquement la manière dont les paramètres spatiaux utilisés par le procédé sont générés ;
la figure 4 illustre schématiquement une manière de déterminer les variables locales et auxiliaires de l'ensemble
la figure 5 illustre la manière dont les cinétiques sont allouées aux composantes de l'ensemble A¾ ;
la figure 6 montre comment les lieux d'émission sont déterminés et comment les composantes de H sont déterminées ;
la figure 7 présente une manière de calculer la concentration \k de radio-traceur ;
La figure 1 illustre schématiquement les différentes étapes du procédé de détermination de volumes fonctionnels.
Le procédé a pour objectif la détermination de volumes fonctionnels pour la recherche de cinétiques. Il est appliqué à des mesures présentées sous forme d'événements en coïncidence 106 et comprend une série d'étapes appliquées de manière itérative 111 selon un schéma de Monte-Carlo par chaîne de Markov.
Dans une première étape 108 est généré un ensemble t composé d'un ensemble de cinétiques candidates associé à des valeurs de probabilité d'apparition de ces cinétiques, ces valeurs dépendant de la concentration λ de radio-traceur.
Dans une seconde étape dite d'étiquetage 109, pour chaque composante spatiale d'indice k 106 les probabilités de sélection des cinétiques de l'ensemble Λ¾ sont pondérées 102 en y introduisant une fonction Àk. Cette fonction est représentative de la concentration de radio- traceur de cette composante de manière à obtenir un ensemble de valeurs indicatrices 103. Une valeur indicatrice uk désignant la cinétique à laquelle est associée la composante spatiale k est déterminée. Dans une troisième étape 1 10, les volumes fonctionnels sont construits, un volume fonctionnel VFj étant composé de l'ensemble des composantes spatiales qui partagent la même valeur indicatrice z¾. La méthode de détermination de volumes fonctionnels décrite ci- après permet de pallier l'indépendance du modèle utilisé par Fall, Barat et ai. vis-à-vis de l'information de concentration. Pour ce faire, la concentration de radio-traceur est estimée en tout point de l'espace par marginalisation, c'est- à-dire par intégration sur le temps de la distribution d'activité spatio- temporelle. Cette concentration estimée est alors considérée comme une co- variable aléatoire endogène du problème. Par le terme endogène, il est souligné que cette co-variable n'est pas extérieure car celle-ci est déterminée en commençant la reconstruction. Muni de cette co-variable notée A, la méthode proposée met en œuvre une modélisation dans la distribution des cinétiques dépendante de la concentration de radio-traceur. Ceci revient à substituer à la distribution A;0 une collection de distributions f .$ =- { h'£ : A ( A }. Cette collection de distributions admet alors comme distribution un processus de Dirichlet dépendant.
Dans un mode de réalisation, un processus de Dirichlet local IDP d'arbres de Polya est choisi. Une conséquence est que la distribution H des composantes spatio-temporelles n'est plus générée suivant un processus de Dirichlet mais suivant une distribution appelée dans la suite de la description processus de Dirichlet partiellement dépendant et désigné par l'acronyme pdDP venant de l'expression anglo-saxonne « partially dépendent Dirichlet Process ».
Selon un aspect de l'invention, la construction du pdDP est paramétrée par une fonction ψχ qui permet de relier la co-variable de concentration A aux paramètres de la distribution marginale spatiale obtenue par intégration sur le temps de la distribution spatio-temporelle. Le problème général de reconstruction d'une distribution de probabilité G( -) dont uniquement des échantillons d'une projection de celle-ci notée F(-) sont observables se formule dans le cadre bayésien non paramétrique pour les problèmes inverses en utilisant les expressions suivantes :
G ~ G
J? (., t) = 7> (.|x) G (dx, t)
KJ. H IF -' F. for i = (1 ) dans lesquelles :
- n est le nombre d'échantillons observés ;
G(.) est une distribution de probabilité aléatoire distribuée suivant ç, définie sur (X X T.. σ{Χ) ® σ{Τ)) ;
la distribution G{ ) est estimée à partir des observations distribuées selon F( ) : (Υ, τ)' = {(ΥΙ , ΤΊ), . . . . (Υ„, τη)} ;
- (-|x) est la distribution de probabilité supposée connue, appelée projecteur, indicée par et définie sur (y, a(y)} ;
la notation σ(£) correspond à la sigma-algèbre sur i.
L'objet que l'on cherche à reconstruire est la distribution spatiale d'activité dans le champ de vue du tomographe. En TEP, chaque événement en coïncidence est affecté à une ligne virtuelle LOR, acronyme venant de l'expression anglo-saxonne « Line-Of-Response », joignant les centres des deux détecteurs. Une ligne de réponse LOR d'indice l est caractérisée par les paramètres définissant sa position dans l'espace des détecteurs. Une correspondance est ci-après construite entre les paramètres des LOR et l'indice t de telle sorte que la variable y, corresponde à l'indice de la LOR ayant enregistré la mc coïncidence observée. Plus précisément, l'observation yt désigne les coordonnées de la LOR qui joint les deux détecteurs ayant enregistré les photons en coïncidence issus de l'annihilation des positons ayant eu lieu en Xi.
Dans ce contexte, les termes de l'équation (1 ) correspondent à l'interprétation suivante :
X c R3 correspond à la région de l'espace de reconstruction ;
T c. f + correspond à la plage temporelle d'acquisition ;
Yi correspond à l'indice de la LOR observée ;
Ti correspond au temps d'occurrence du mc événement observé ;
V ( = m x) pour m = 1, . . . , M est la distribution correspondant au projecteur c'est-à-dire à la probabilité d'enregistrer un événement sur la même LOR de détection pour une émission localisée en x, c'est-à-dire le lieu d'annihilation, pour tout x e X,
Cl ) est la distribution spatio-temporelle des émissions correspondant aux événements enregistrés. L'ensemble des observations est tronqué du fait du champ axial limité de l'imageur.
Afin de prendre en compte ces troncatures dans la reconstruction, une LOR d'indice nul est définie, celle-ci correspondant aux émissions non observables de telle sorte que >" = >» u {<)}. Il est alors possible de définir la probabilité de projection p* (y - m\x) sur ( *. a(y)) et
(yjx) _ PA (yix)
P (y|x) =
Jy P* (riylx) T^= l V* (j
La densité spatio-temporelle des lieux d'émissions peut alors s'écrire : expression dans laquelle jy v* (dyjx) désigne la probabilité d'enregistrer une émission localisée en x en tenant compte de la géométrie du système et des propriétés physiques du système de détection.
L'expression (2) définit formellement le modèle proposé qui permet de prendre en compte la concentration spatiale comme co-variable endogène du problème de reconstruction :
= { 1 : λ€ A} ~ ÎDP {y, ¥TL (A <¾)■ T0. Φ) (2)
Dans cette expression,
H est une mesure aléatoire distribuée selon un processus de Dirichlet partiellement dépendant pdDP défini comme
ou
H () =∑ ¾ ,¾. ()
k=i (3) δξ {·) la mesure de Dirac en ξ.
,V (m,∑) désigne la loi normale gaussienne multi-variée en dimension p ~ 3 paramétrée par sa moyenne m et sa matrice de covariance ∑, de densité : Le modèle génératif défini dans l'expression (2) et la notion de pdDP de l'expression (3) sont explicités ci-après.
L'expression de M dans (3) est un mélange statistique où wk correspond au poids de la kémc composante, zk aux paramètres spatiaux et Qk à la cinétique, c'est-à-dire la distribution probabilité temporelle, de la fcêMe composante spatio-temporelle du mélange. Les distributions pour les «¾ et Zk sont identiques à celles d'un processus de Dirichlet.
On a w = w'i, ~ GE (0) comme indiqué dans l'article de J, Pitman intitulé Some developments of the Blackwell-MacQueen urn scheme, T. F, et al. editor, Statistics Probability and Game Theory, Papers in honor of David Blackwell, volume 30 of Lecture Notes-Monograph Séries, pages 245-267, Institute of Mathematical Statistics, 1996, tel que :
i«i .= î-i ;
pour tout k > 2, u:k = ¾■ f!*^1 (i ) où vL , v2. . . . sont identiquement distribués suivant une loi Ueta ( l, û), dont la peut être obtenue en utilisant l'expression suivante :
Γ (fi + b)
fl ^ υ)
Γ (α) Γ («} dans laquelle le symbole r représente la fonction gamma.
Z - Zi , Z2 , . . . sont identiquement distribuées suivant la loi a priori G0 qui peut être par exemple choisie comme un modèle Normal-Wishart Inverse {NIW^ .μ( ,∑11) tel que zk - (mA.,∑A) avec :
Hk 1 L~ " W(∑k 1 «o . («ti ¾) X).
Où W désigne la distribution de Wishart dont la densité s'exprime en utilisant l'expression (4) dans laquelle nu est le degré de liberté de la loi Wishart et∑0 la matrice d'échelle associée.
C'est ici qu'intervient la concentration spatiale comme co-variable endogène pour la distribution des paramètres cinétiques Qk, Tout d'abord la distribution spatiale s(-) est introduite comme loi marginale de la distribution spatio-temporelle H. L'expression de S( -) est donnée par :
S (.) = / H (; dQ) =
>M(T) k l
dans laquelle M (T) représente l'ensemble des mesures sur T.
On peut remarquer que, par les définitions de mk et zk, s(-) est distribué suivant un processus de Dirichlet de paramètre de concentration 0 et de mesure de base a0 :
S ~ DP (Θ. G0 )
Q - Q\ . Q>, . . . sont alors indépendamment distribuées selon :
avec xk = ψλ ^ k, s) où φχ (■) prend ses valeurs dans A c R.. Par exemple, la fonction ψχ peut être choisie comme étant la valeur de l'espérance de la densité spatiale prise sur la composante k :
On peut remarquer que dans le cas où Qk est indépendant de la marginale S tel que xk = nous obtenons :
Qk\Zk ~ A0
expressions dans lesquelles F0 zk, Qk ) - GQ zk) K°1 ^ Qk Cela implique que H ~ DP (Θ, F0). La distribution de M est un processus de Dirichlet. Dans cette situation la concentration n'intervient pas en tant que covariable endogène. Cependant le modèle couvre alors la possibilité d'avoir recours à une covariable exogène provenant d'une information de type anatomique par exemple.
Il reste à établir la distribution des A'A. On définit j j = {K : λ G Λ} une collection indénombrable de mesures de probabilités aléatoires qui admet comme distribution un processus de Dirichlet local noté IDF, défini comme suit Soient : v= Vi, v2, ... sont identiquement distribués tel que Vj ~ lieta(i,;/),
iid
Q* _ Q\.Q?,, , , . sont identiquement distribués tel que Q) ~ WL (A Q0) est un arbre de Pôlya à L-niveaux, de paramètres A et de distribution de base Q0, r— i"2, ... sont identiquement distribués tel que Γ,· ~ T0,
Alors,
Ko ( =∑Pi (A) ½;{·)
i=i
avec p (À) = pi (X),p2 (A) , ... défini par l'expression dans laquelle :
¾(λ) = ¾(λ)Π(ι- Ηλ))
Kj
¾(A)= V¾ll(d(A,ri}< ) et d (λ, λ') représente la distance euclidienne entre A et A'.
On notera que si AC - {KQ : A - A} ~ 1DP ( , PT (A, <¾) · T0. ), alors pour tout λ e Λ, κ$\\ ~ DP (//. PT (A, (¾))■ La loi conditionnelle de K sachant A est un processus de Dirichlet d'arbres de Pôlya.
On notera que dans le cas limite où ψ→∞, on a pour tout A e Λ, κ§ = Ko avec 0 ~ DP (i, PT (A. Q0)), par conséquent H ~ DP (0. Go x /¾)
II reste à rappeler la définition d'un arbre de Polya pour compléter le modèle. Nous adoptons le formalisme de Lavine présenté dans son article intitulé Some aspects of Polya tree distributions for statistical modelling, Ann. Statist, 20 :1222-1235, 1992, pour la définition de l'arbre de Polya dyadique. Soit E - {(), l } et E! le /-produit cartésien E χ ■ ■ ■ χ E avec E° _ ø. Soit E* = uf 0EL. Soit B9 = {T} et soit n = {B0, B BM, B0i , . . .} and arbre binaire séparable de partitions de tel que les ensembles H,( /+, sont obtenus par découpe binaire des ensembles B£1.,.d et j¾ iit;...ti+i définit les ensembles mesurables. L'indice 00 (respectivement 01) est interprété comme 0 (respectivement 1).
On dit que la mesure aléatoire q sur T admet comme distribution un arbre de Polya de paramètres (A, ¾) que l'on notera Q ~ PT (A ¾), s'il existe des réels positifs A - { ,: : c c E*} et des variables aléatoires yy = {w ·. c c E" } tel que :
la collection W consiste en des variables aléatoires mutuellement indépendantes,
Vt G E*. Wc ~ Bet.a (ac0. ttci).
V I - 1, 2, . . . et Ve f E!,
avec des facteurs égaux à w où i - if Α· - i.
Considérons la mesure de probabilité g0. L'arbre de Polya peut être centré autour de Q„ en prenant :
et e0 = «ei, Ve G E* Dans ce cas, nous notons ( = a; pour ι = 1.2, . . .. et e e El. Ce schéma de construction définit l'arbre de Pôlya canonique. Dans ce contexte, si Q ~ PT (A. Qo), alors E [Q) = Q0.
La construction de la partition peut être poursuivie à l'infini mais comme il n'est pas envisageable de calculer un arbre infini en pratique, les arbres de Pôlya sont souvent simplifiés en spécifiant les paramètres et en construisant la partition jusqu'à un niveau borné L. Si nous notons fQ (·) la densité de probabilité de Q ~ ΡΤχ (A Qo) alors :
Vt G B( fQ (t) = 2T'fQc (t) · Q (¾, ...£, ) La justification d'un spécification partielle de l'arbre de Pôlya peut être étayée par le fait que pour les distributions continues, les paramètres augmentent rapidement en fonction des niveaux de l'arbre. La mise à jour de la loi à partir des données influence alors peu la loi a priori car le nombre d'observations dans les niveaux élevés devient faible vis-à-vis du paramètre a priori.
L'objectif étant d'aboutir à un algorithme de reconstruction de volumes fonctionnels, le procédé selon l'invention peut être muni de variables auxiliaires qui vont rendre efficace la procédure itérative de reconstruction et la mise en œuvre d'une méthode de type MCMC, acronyme venant de l'expression anglo-saxonne « Markov Chain Monte-Carlo ».
Nous introduisons c = c{, c¾ cm les variables de classification des données aux composantes de H tel que [Zi . Q,) = (Zc, , Q t) pour tout 1 < n.
De la même manière, soit D = D D2, . . . tel que Qk = Q-Dk pour tout k.
Les variables auxiliaires pour l'échantillonnage par tranches, désigné habituellement par l'expression slice sampling sont décrit ci-après. Afin d'implémenter un échantillonneur de Gibbs efficace, nous suivons une technique dite de slice sampling comme décrite dans l'article de M. Kalii, J. E. Griffin et S. G. Walker intitulé Slice sampling mixture models, Statistics and Computing, 21 (1 ) :93-105, 2011. Cette approche requiert l'introduction de variables supplémentaires. Soit u ~ ui , u-2 , un des variables aléatoires uniformes. La densité jointe de (.¾, ¾,«,;), pour une séquence quelconque (¾.) positive peut être déterminée en utilisant l'expression : dans laquelle est fa distribution uniforme sur ]a, 61 Nous vérifions aisément que par marginalisation sur «, de la formule précédente, nous obtenons la distribution de ^γ, , T, jw. Z, Q). Nous proposons d'adopter une variable de slice (ξΑ.) dépendante , c'est-à-dire que pour tout k,
dans laquelle c ]o. i] et est indépendant de «¾. En pratique, des valeurs de correspondant à l'espérance du poids de la première composante ne possédant pas de donnée allouée offrent des propriétés de mélange satisfaisantes (ç % {n+g^l+0 - Muni de ce choix de l'expression suivante est obtenue :
( Ti! ¾ Z, Q) - C1
dans laquelle les deux sommes sont finies en vertu de #{j : w} > ε} < oo pour tout > 0.
De façon analogue, soit v = n. ¾ ... des variables auxiliaires uniformes et ς e ](}, i|. Alors, pour tout k, on a :
(Qk,
expression dans laquelle \k = ψχ (zk, s) et ¾ ( k) sont définis supra. Le modèle (2) est ensuite réécrit en lui adjoignant les variables cachées et auxiliaires :
¾ (C,-)
D,, vk\V, Γ, w, Z ¾' (t;fc|0, min (ç, ¾ (À,))) Pjλ) ¾ (¾)
j=i
w ~ GEM (0) Vj ¾ Beta (l, i )
Q; ¾ PT,, (A Qo) (5) avec
Pj (½) = ¾ (Àfc) Π,^ (l - Vl ( )} Vj (Afc) _ V3 1 (rf (Afc ; ï3) < φ) et
À partir de ce modèle génératif, il est possible d'exprimer les différentes lois conditionnelles a posteriori qui vont intervenir dans l'échantillonneur de Gibbs.
L'échantillonnage des lois conditionnelles a posteriori par algorithme de Monte-Carlo par chaînes de Markov CMC est décrit ci-après avec l'appui des figures 2 à 7.
À partir de l'expression (5), l'échantillonneur MCMC génère successivement des échantillons provenant des distributions conditionnelles suivantes : Lieux d'émission / allocation aux composantes de H (χ,θΝν,υ,ζ,ςτ,ο,γ,τ)
Paramètres spatiaux : (Z|C, X)
Poids et variables auxiliaires de H : (w,u|C)
Allocation des cinétiques aux composantes de JCQ : (D|V,v,Q*,I\w,Z,C,T)
Arbres de Pôlya des cinétiques : (Q*|D,C,T)
Pondérations, variables locales et auxiliaires de JCQ : (V,r,V|D,w,Z,T)
La figure 2 illustre la manière dont les poids et variables auxiliaires de la distribution H des composantes spatio-temporelles sont générés, c'est- à-dire la manière dont des échantillons de distribution conditionnelle ( .ujC) sont générés.
Nous notons le nombre latent de composantes du mélange spatio-temporel pour n observations et nÀ. = #{i : < = k} pour k < κη. Nous adoptons l'approche présenté dans l'article de Kalli et al. Précédemment cité et procédons à la génération conjointe de (w.u|C) en échantillonnant tout d'abord w w2... ,wK C, puis «(ωχ, «/Kr_,c, et finalement wKn+2, , .. Wi, w2, ... , wKn,C
Dans ce cadre, en suivant la définition neuf et le corollaire vingt de l'article de J. Pitman intitulé Some developments ofthe Blackwell-MacQueen urn scheme dans T. F. et al., editor, Statistics, Probability and Game Theory ; Papers in honor of David Blackwell, volume 30 of Lecture Notes-Monograph Séries, pages 245-267, Institute of Mathematical Statistics, 1996, nous sommes en mesure d'exprimer la loi a posteriori du processus de Dirichlet comme la somme d'une somme finie de composantes dont les poids sont distribués par une distribution de Dirichlet distribution et d'un processus de Dirichlet indépendant des données. La présence de la variable auxiliaire u permet de ne générer qu'un nombre fini κ* de poids et de lieux d'émission lors de la génération du processus de Dirichlet indépendant.
Dans un premier temps 200, les wk sont générés pour t. < κη. (w1,w2,...,wKn,rKn\C) ~ Dirichlet (m, n2 nKn1 Θ) Dans un second temps 201 , les échantillons UÎ , W2, ... c sont générés. ΐΗ |C '~ ' U {lit |0, min (wr, , ζ))
XL* = iiiin(u)
Dans un troisième temps 202, les échantillons «¾. sont générés pour k > «„. Tant que rfc_J > «*,
Uk ~ Beta ('! , Θ) 7¾ = rfc i ( i - ¾)
Dans un quatrième temps 203, il est posé K" = mm {{k ·. rk < u*} ).
Clairement, M¾ < u * pour tout k > κ\ Pour cette raison, un jeu fini de «¾ est suffisant pour l'allocation des données aux composantes. Ajoutons que nous abandonnons dans les calculs également tous les wk tel que wk < υ'- pour k < κΗ.
La figure 3 illustre schématiquement la manière dont les paramètres spatiaux sont générés, c'est-à-dire la manière dont des échantillons de distribution conditionnelle z C; X) sont générés.
Dans un premier temps 300 sont générés (Z C. X) pour tout k < nn, à partir d'une loi Normale-Wishart Inverse dont les paramètres sont mis-à-jour à partir des observations de par la propriété de conjugaison :
avec
Qk = Q + ""k
ρ μυ + nk fîk
ΰ + nk
1lk ∑ ¾
{i:C',=Jt}
et avec
=
Dans un deuxième temps 301, les échantillons Zfesont générés :
La figure 4 illustre schématiquement une manière de déterminer les variables locales et auxiliaires de l'ensemble A¾. Pour cela, (V, Γ, v|D. w, z , T) doivent être générés.
Nous considérons comme loi a priori rf, (.) Pour tout j, nous définissons
Vj = {k< κη : Dk = j}
V† = (k < κη : Dk > ./}
Et désignons pour tout j, mj = comme le nombre de composantes de M allouées à la fmc composante de f $.
Nous définissons également le plus grand indice des composantes de tc possédant au moins une composante de H allouée :
max({j : rn, > U})
Nous adoptons le même schéma de génération que pour l'échantillonnage de (w.u'C), c'est-à-dire que nous générons en premier lieu ( ,r,-|D, ,z,T) pour j<jKn 400, puis (v\O,v ... , VJriH,Ti, , . * ,TJKU. ,Z) 401 et, finalement, Vj et Vj pour j > jKn 402.
Pour tout j < jKn, sont générés indépendamment : Pour tout j < JKII, nous posons aj p -* inax ( max ( , - Ψ) t «r
puis générons :
OU
U (Γ, ) « 1 ( ,Γ < Γ, < ¾· Γ) Χ Π (1 - ¾ 1 (d (Xk, Tj) < T»))
L'échantillonnage de ¾J requiert une étape Metropolis-Hastings (MH). Nous proposons un échantillonneur MH indépendant avec comme distribution candidate :
Ainsi, à l'itération t ι l, pour tout j < j^,
- Générer r* ~ u (r ';-,r, ¾.r)
- Calculer le ratio d'accep
où est la valeur de la chaîne de Markov à l'itération t.
- Tester l'acceptation de la proposition 1"'* i.e. affecter r†H) = Γ* avec une probabilité
sinon affecter rf+l ) = r . - Pour tout k < Kilt poser Pi%k = _ . (1 - Vj i [d (Xk, Γ,·) < f>)) et
| = ιηΐιι(¾,ι,...,^·,Κι1).
- Pour tout k < «„, générer indépendamment
¾|D, ½,..., jKn , Γΐ5... , TjKn , w, Z ¾> W (¾[0, min (p¾ (Xk) , ç)) et poser
u* = initi(v)
- Générer v3- et ij pour j > jKn. Tant que p*_, > ¾,»*,
¾· ~ Beta
- Pour tout k < K,,, poser Pjsk = Pj_l>k (l - V31 (ά{Χ^Γ3) < V)J et
} = min(pj,i,...,^.K.,).
- Poser J* - min ({j : p* <
La figure 5 illustre la manière dont les cinétiques sont allouées aux composantes de x¾, c'est-à-dire comment est généré.
Dans un premier temps 500 est généré indépendamment pour tout k < κη :
r
(Dk\ V, v, QM\ w. Z,C.T) ¾?∑ p k Sj (·) avec
pjjt oc 1 (pj (Xk) > 1·/·) ma (¾ (Xk) . ç) JJ /g; (7*)
{t:C,-ft}
Dans un deuxième temps 501 est généré indépendamment pour tout k, te! que Hn < k < K* : avec
Pj,k « 1 ÎPj ί½) > ¾) max (pj (Afc) , ς)
11 faut ensuite générer les arbres de Polya des cinétiques générés.
D'après la propriété de conjugaison de l'arbre de Polya, pour tout j < jH n , on génère indépendamment (Q* D. C, T) suivant une distribution d'arbre de Polya avec des paramètres mis-à-jour Aj' - {<yJ' t ■ ? e tel que
avec
et
n = # {i€\ l n} : (Dr, = i) A (ï| e fit)|
Puis, pour tout j n < j < j*. générer indépendamment ^ ρ, Ο, Τ ^ Ρΐ (Â. Qo)
La figure 6 montre comment les lieux d'émission sont déterminés et comment les composantes de H sont déterminées. Cela se fait en générant (C. Xjw, u. Z, Q*. D, Y, T).
La loi conditionnelle présente une forme qui ne permet pas une génération directe. En effet, elle fait appel au projecteur v {Yl\Xl) qui intègre des caractéristiques géométriques et physiques du dispositif de détection, ce qui exclut en pratique de trouver une expression analytique pour la distribution offrant un espoir de génération simple. Nous avons donc recours à une étape de Metropolis-Hastings. Nous commençons par exprimer la distribution conditionnelle en utilisant la règle de Bayes. , Xi lYi, T u w, Z, Q*, D V x (¾ (Q, ¾) avec fc. (Ci-, Xi) oc m) mox (wk, Q fAr (¾[¾) (T.) ¾ (£¾) et ^(y'iiA'i) correspond à la vraisemblance du projecteur pour le jeux d'événements observées (tronqué). Comme cette vraisemblance n'admet pas de forme standard permettant l'échantillonnage direct, nous utilisons un algorithme de Metropolis-Hastings indépendant et devons définir une loi candidate que nous notons G* pour / = i, .. , , n. À chaque itération t + i nous devons générer (C*.X-) ~ G; et calculer le ratio d'acceptation. Cette étape est la plus coûteuse en termes de calculs.
Nous proposons ainsi une loi candidate de la forme :
fct (Ct,XÏ) * f (λΪ ,,,ΣΪ-) x fôi iC X )
Nous remplaçons le projecteur ρ(ΐίΐλ',) par M dans la loi conditionnelle pour construire la distribution candidate 600, où m'y et ∑ sont choisis de façon à approximer convenablement τ(γ^χ{). Nous pouvons alors exprimer /£(·) en utilisant l'expression :
«*
Je; (C*, Xt) oc∑l(«¾ > Ui) max (wk, Q r xJ (Xt] k.Y: , i) (C?)
k=l k
avec pour tout k < K* et m < Λί ,
= ((∑, )-' +Σ 1)"1
Il est alors possible de procéder à l'échantillonnage de (C,,¾), pour tout i < n à l'itération t + i.
C* est généré indépendamment 601 tel que :
K*
Ci ~∑*'*.t<M-)
fc=l avec
wk,i oc 1 (wk > ιι,.) max(¾., )¾F, Q.¾ (Γ,) et E^!^-L
Ensuite x* est généré indédendemment 802 tel que : X* '~ Ar (X* 1 rnr , y, ,∑(? , f )
Les ratios d'acceptation > uite calculés 603 : u (< ,*?), <cf> x«>) = , ω (xt,x )
On pourra remarquer que <¾(¾,„¥,) et c disparaissent du ratio d'acceptation.
11 reste alors à tester 604 l'acceptation de (C*, A',*), c'est-à-dire d'affecter (c+1).Af+i)) = (C7*, *) avec la probabilité
sinon affecter (c|'+,),Af+ 5) = (c .A\(iî}) La figure 7 présente une manière de calculer la concentration \k.
L'évaluation de xk est nécessaire pour la génération de ;v.r.v|D.w, Z,T) et de (Ό|ν,ν,<¾',Γ,ν,ζ,ο,τ>
L'expression de \k, pour le choix particulier de é\(Zk.S) donné précédemment, peut être déterminé d'après l'équation (5) en utilisant l'expression :
Cette expression peut être évaluée par une technique d'échantillonnage d'importance. Pour cela, pour un nombre de particules donné τλ et pour tout k, on génère indépendamment 700 pour tout ι < Ί\ : Ensuite, on calcule 701 pour tout ι < Ί :
Dans un troisième temps 702, est évalué :
Reste ensuite à déterminer les volumes fonctionnels VF 105,
fois que l'algorithme MCMC a atteint l'équilibre, l'échantillonneur fournit des tirages de la loi jointe a posteriori de (X, C. D, w, u. z, Q* Y. T). Pour chaque tirage de paramètres retenu, il est possible de construire un échantillon de la distribution d'activité spatiotemporelle des événements enregistrés à l'itération {t) : f f (x. <) = -v (χΙ¾) ÎQk (t)
(6)
La densité spatio-temporelle correspondant à tous les événements, qui ne sont pas nécessairement observables, est obtenue par normalisation.
De la même façon, l'entière distribution des volumes fonctionnels est accessible. Nous marginalisons sur le temps et définissons la distribution spatiale d'un volume fonctionnel j associé à la cinétique Q* à l'itération (t) en utilisant l'expression :
(7) Tous les éléments sont alors disponibles pour déterminer les estimateurs de distribution d'activité spatio-temporelles et des volumes fonctionnels VF pour T itérations de l'algorithme retenues. Les expressions suivantes peuvent alors être utilisées pour cela : (8) et
*=ι ' (9)
De la même façon, toute autre fonctionnelle des distributions a posteriori peuvent être calculées, comme une variance conditionnelle ou un intervalle de crédibilité.

Claims

REVENDICATIONS
Procédé de détermination de volumes fonctionnels pour la recherche de cinétiques représentant l'évolution de la concentration d'un radio- traceur dans une zone de tissu biologique, le procédé étant appliqué à des composantes spatiales (106) et comprend les étapes suivantes appliquées de manière itérative (111 ) selon un schéma de Monte- Carlo par chaîne de Markov :
- une étape de génération (108) d'un ensemble λ¾ composé d'un ensemble de cinétiques candidates associées à des valeurs de probabilité d'apparition de ces cinétiques, ces valeurs dépendant de la concentration A de radio-traceur ;
- une étape d'étiquetage (109) durant laquelle pour chaque composante spatiale d'indice k (106) les probabilités de sélection des cinétiques de l'ensemble A¾ sont pondérées (102) en y introduisant une fonction xk représentative de la concentration de radio-traceur dans cette composante de manière à obtenir un ensemble de valeurs indicatrices (103), une valeur indicatrice Dk désignant la cinétique à laquelle est associée la composante spatiale k ;
- une étape de construction de volumes fonctionnels (110), un volume fonctionnel V F} étant composé de l'ensemble des composantes spatiales qui partagent la même valeur indicatrice Dk.
Procédé selon la revendication 1 comprenant une étape de calcul des moyennes des volumes fonctionnels VFj obtenus au cours du processus itératif. 3- Procédé selon l'une des revendications précédentes comprenant une étape de détermination d'estimateurs statistiques sur les volumes fonctionnels V ) obtenus au cours du processus itératif de manière à quantifier l'incertitude d'estimation.
4- Procédé selon la revendication 3 dans lequel est déterminé fa variance des volumes fonctionnels v t) obtenus au cours du processus itératif.
5- Procédé selon l'une des revendications 3 ou 4 dans lequel est déterminé un intervalle crédible.
6- Procédé selon l'une des revendications précédentes dans lequel l'ensemble x¾ est obtenu par la détermination (100) de deux ensembles de variables scalaires v} et Γ,, ces variables se rapportant à des composantes cinétiques d'indice j, où Vj représente un coefficient de pondération fixe indépendant de la concentration λ et v} représente une valeur de concentration de référence associée à la cinétique d'indice j.
7- Procédé selon la revendication 6 dans lequel Vj est déterminé en utilisant l'expression :
expression dans laquelle :
- pour tout j, nij désigne le nombre de composantes de la distribution H allouées à la fmc composante de /¾\ H étant une mesure aléatoire distribuée selon un processus de Dirichlet partiellement dépendent, |j étant une collection indénombrable de mesures de probabilité aléatoires qui admet comme distribution un processus de Dirichlet focal ;
- jlin désigne le plus grand indice des composantes de /c possédant au moins une composante de M allouée ;
- Beta(, ) représente représente la loi de probabilité bêta.
- Procédé selon l'une des revendications 6 ou 7 dans lequel i , est déterminé en utilisant l'expression :
avec
u* (Γ,) « i ( Γ < Yj < ¾.r) x H (1 - vd i (d (Xk, Tj) < φ)) expressions dans lesquelles :
Tj désigne le paramètre caractéristique de la concentration associée à la cinétique j ;
D désigne l'ensemble des variables uk qui indiquent à quelle cinétique de ¾ la composante spatiale k est associée ;
Vj - {A- < Kn■ Dk - j} représente l'ensemble des indices k des composantes spatiales associées à la cinétique j ;
V = {k < κ„ ; l' > j} représente l'ensemble des indices k des composantes spatiales associées à une cinétique dindice supérieur à j ;
w désigne l'ensemble des pondérations wk des composantes spatiales k dans le mélange Dirichlet H ; z désigne l'ensemble des paramètres, moyenne et matrice de covariance, zk associés à la composante spatiale k du mélange Dirichlet H ; indique ici une génération aléatoire indépendante pour chaque paramètre Γ, ;
ex signifie ici «proportionnel à» ;
l() représente la fonction «porte» telle que i(eonditt<m ) - 1 si condition est vraie, et 0 sinon ;
Vj désigne un coefficient associé à chaque cinétique intervenant dans la pondération de ladite cinétique dans Λ¾ ;
d{ ) représente la distance euclidienne dans R : d(x1 , x2) = ι - x2 | où x\ . x- € R !
est un seuil choisi a priori qui permet de paramétrer .
Procédé selon l'une des revendications précédentes dans lequel l'étape d'étiquetage (109) est réalisée : en générant (500) indépendamment pour tout k < nn : avec
V3.K oc 1 (pj (A*) > i k ) max ( j (Xk ) . ç) JJ /Q* (T. ) et
en générant (501 ) indépendamment pour tout k, tel que „ < k < * : avec
Pj,k oc t Û¾ (Afc) > ·¾) max (j¾ (AFC) , c) et ∑ :: ¾fc = i- dans ces expressions,
κη désigne le nombre de composantes spatiales auxquelles au moins un événement de coïncidence est associé ;
K* désigne le nombre total de composantes spatiales du mélange Dirichlet H pour une itération donnée ;
V désigne l'ensemble des coefficients Yj intervenant dans les pondérations du mélange de cinétiques A¾ ;
v représente l'ensemble des variables auxiliaires Vk utilisées dans la représentation du processus de Dirichlet de cinétiques ;
q* désigne l'ensemble des arbres de Polya Q* caractérisant les cinétiques ;
Γ désigne l'ensemble des paramètres ij caractéristiques de la concentration associée à la cinétique j ;
c désigne l'ensemble des variables de classification ct qui associent chaque événement de coïncidence ί à une composante spatiale du mélange Dirichlet H ;
T représente l'ensemble des temps d'occurrences rt des événements de coïncidence ;
pj k désigne la probabilité d'associer la composante k du mélange Dirichlet H à fa cinétique j ;
Pj iX) représente la fonction de poids prise en λ associée à la probabilité de la cinétique j de j¾ ;
6j() représente la fonction mesure de Dirac telle que <¾{/) - 1 si j = f et vaut 0 sinon ;
'~ indique ici une génération aléatoire indépendante pour chaque variable de classification nk ;
ma.\() représente la fonction «maximum de» ; ( désigne est un paramètre de seuil choisi de façon arbitraire intervenant dans l'implémentation de l'algorithme de sliœ sampling du processus de Dirichlet local de cinétiques ;
{i : C: = k} désigne l'ensemble des événements de coïncidences i qui sont associés à la composante spatiale k ;
fQ- représente la cinétique j Le. la densité de l'arbre de Po!ya j du mélange Dirichlet local de cinétiques ;
J* désigne le nombre total de composantes du mélange Dirichlet local de cinétiques pour une itération donnée.
10- Procédé selon l'une des revendication précédentes dans laquelle la concentration Àk est obtenue ar a lication d'une fonction φλ définie telle que = Φχ
dans laquelle :
Eîk désigne l'espérance mathématique par rapport à la loi de probabilité gaussienne de xk, Ai(.rk \zk) ;
N() représente la loi de probabilité gaussienne.
1 1 - Dispositif de tomographie par émission de positons mettant en œuvre le procédé selon l'une des revendications 1 à 10.
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