DE102008014059A1 - Method for creating a fat-reduced spatially resolved magnetic resonance spectrum - Google Patents
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Abstract
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Erstellung eines fettreduzierten ortsaufgelösten Magnetresonanzspektrums eines Untersuchungsobjekts, mit den folgenden Schritten: - Aufnehmen von ersten Messdaten zur Erzeugung einer ortsaufgelösten Spektroskopiemessung, - Erzeugen von zweiten ortsaufgelösten Messdaten, die im Wesentlichen nur Fettsignalanteile aufweisen, und - Subtrahieren der zweiten Messdaten von den ersten Messdaten zur Erstellung des fettreduzierten ortsaufgelösten Magnetresonanzspektrums.The invention relates to a method for producing a fat-reduced spatially resolved magnetic resonance spectrum of an examination subject, comprising the following steps: recording first measured data to produce a spatially resolved spectroscopy measurement, generating second spatially resolved measurement data essentially having only fat signal portions, and subtracting the second measured data from the first measurement data for the production of the fat-reduced spatially resolved magnetic resonance spectrum.
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Erstellung eines fettreduzierten ortsaufgelösten Magnetresonanzspektrums eines Untersuchungsobjekts und eine Magnetresonanzanlage hierfür.The The present invention relates to a method for producing a fat-reduced spatially resolved Magnetic resonance spectrum of an examination subject and a magnetic resonance system therefor.
Die Verfahren der ortsaufgelösten MR-Spektroskopie unterscheiden sich von den Verfahren der MR-Bildgebung dadurch, dass zusätzlich zur Ortsauflösung der MR-Signale bei der Spektroskopie auch die chemische Verschiebung aufgelöst werden soll. Im Allgemeinen müssen spektroskopische MR-Verfahren insbesondere den Umständen Rechnung tragen, dass die interessierenden Stoffwechselprodukte eine um etwa vier Größenordnungen geringere Konzentration als die in der MR-Bildgebung dargestellten Wasser- und Fettmoleküle aufweisen. Die wesentliche Information der ortsaufgelösten MR-Spektroskopie liegt im spektralen Bereich zwischen der Linie des freien Wassers bei 0 ppm und den Linien der Fettprotonen bei ungefähr 3 ppm. Diese Lipidsignale erscheinen beispielsweise im Hirnspektrum vom Bereich außerhalb des untersuchten Bereichs oder VOI (voxel of interest) und erschweren die Interpretation und Quantifizierung der Linien von Metaboliten wie NAA, Cholin, Gaba und Inositol. In der spektroskopischen Bildgebung ist ein Verfahren unter der Kennung CSI-Verfahren (Chemical Shift Imaging) bekannt. Bei CSI-Mammospektroskopien oder auch bei Prostataspektroskopien kann die Bestimmung des Citrat/Cholin/Kreatin-Verhältnisses durch die Kontamination des dominierenden Fettspektrums sehr stark gestört, wenn nicht gar unmöglich gemacht werden.The Method of spatially resolved MR spectroscopy differs from the methods of MR imaging in addition to that to the spatial resolution the MR signals in the spectroscopy and the chemical shift disbanded shall be. In general, need spectroscopic MR method in particular the circumstances account carry that the metabolic products of interest by about four orders of magnitude lower concentration than that shown in MR imaging Water and fat molecules exhibit. The essential information of spatially resolved MR spectroscopy lies in the spectral range between the line of free water at 0 ppm and the lines of fat protons at about 3 ppm. These lipid signals appear, for example, in the brain spectrum of Area outside of the examined area or VOI (voxel of interest) and complicate the Interpretation and quantification of the lines of metabolites such as NAA, choline, gaba and inositol. In spectroscopic imaging is a method under the identifier CSI method (Chemical Shift Imaging) known. In CSI mammographic spectroscopy or in prostate spectroscopy can determine the citrate / choline / creatine ratio by the contamination of the dominant fat spectrum very much disturbed, though not impossible be made.
Im Stand der Technik ist es bekannt, den Beitrag des Fettspektrums zu unterdrücken durch die Anwendung von Pulsen, die die Fettsignale außerhalb des untersuchten Bereichs anregen und deren Magnetisierung zerstören, damit diese Fettsignale bei der nachfolgenden bildgebenden Spektroskopie keine oder geringe Signalanteile haben. In vielen Anwendungen können jedoch diese räumlich zu platzierenden Sättigungsstreifen nur unzureichend der Anatomie angepasst werden. Zudem wird im Überlappungsbereich der Sättigungspulse durch die Refokussierungswirkung der vielen Pulse auf die Magnetisierung das Signal zum Teil wieder restauriert, wodurch Artefakte entstehen können. Weiterhin ist das Platzieren der vielen unterschiedlichen Sättigungsstreifen zur Bestimmung der gesättigten Bereiche zeitaufwändig.in the State of the art it is known the contribution of the fat spectrum to suppress through the application of pulses that take the fat signals outside stimulate the area under investigation and destroy its magnetization, so these fat signals in the subsequent imaging spectroscopy none or have low signal components. In many applications, however, can these spatially to be placed saturation stripes insufficiently adapted to the anatomy. In addition, in the overlap area the saturation pulses by the refocusing effect of the many pulses on the magnetization the signal partially restored, creating artifacts can. Furthermore, placing the many different saturation stripes for the determination of the saturated Areas of time consuming.
Es ist daher eine Aufgabe der vorliebenden Erfindung bei einer spektroskopischen Bildgebung auf einfache Weise die Fettsignalanteile im Spektroskopiesignal zu unterdrücken.It is therefore an object of the present invention in a spectroscopic Imaging in a simple way the fat signal components in the spectroscopy signal to suppress.
Diese Aufgabe wird durch die Merkmale der unabhängigen Ansprüche gelöst. In den abhängigen Ansprüchen sind bevorzugte Ausführungsformen der Erfindung beschrieben.These The object is solved by the features of the independent claims. In the dependent claims preferred embodiments of the invention.
Gemäß einem ersten Aspekt der Erfindung wird ein Verfahren zur Erstellung des fettreduzierten ortsaufgelösten Magnetresonanzspektrums bereitgestellt, bei dem erste Messdaten zur Erzeugung einer ortsaufgelösten Spektroskopiemessung aufgenommen werden. In einem weiteren Schritt werden zweite ortsaufgelöste Messdaten erzeugt, die im Wesentlichen nur Fettsignalanteile aufweisen. Schließlich werden die zweiten Messdaten von den ersten Messdaten abgezogen, um das fettreduzierte ortsaufgelöste Magnetresonanzspektrum zu erzeugen. Vorzugsweise ist die Ortsauflösung der ersten Messdaten im Wesentlichen gleich der Ortsauflösung der zweiten Messdaten. Üblicherweise werden Fettsignale durch die andere Resonanzfrequenz im Bild räumlich versetzt dargestellt. Da jedoch der Versatz der Fettsignale in der ortsaufgelösten Spektroskopiemessung gleich dem Versatz der Fettsignale bei den zweiten ortsaufgelösten Messdaten ist, kann durch Subtraktion der zweiten ortsaufgelösten Messdaten, dem so genannten Lipidbild eine fettreduzierte Spektroskopiemessung erreicht werden.According to one The first aspect of the invention is a method of creating the fat-reduced spatially resolved Magnetic resonance spectrum provided in the first measurement data for generating a spatially resolved Spectroscopy measurement are recorded. In a further step become second spatially resolved Generates measurement data which essentially only have fat signal components. After all the second measurement data are subtracted from the first measurement data, to the fat-reduced spatially resolved To produce magnetic resonance spectrum. Preferably, the spatial resolution of first measurement data substantially equal to the spatial resolution of the second Measurement data. Usually Grease signals are spatially offset by the other resonance frequency in the image shown. However, since the offset of the fat signals in the spatially resolved spectroscopy measurement equal to the offset of the fat signals in the second spatially resolved measurement data is, by subtracting the second spatially resolved measurement data, the so-called Lipidbild a fat-reduced spectroscopy measurement be achieved.
In einer Ausführungsform der Erfindung werden die ersten Messdaten gemäß dem CSI-Verfahren aufgenommen. Bei dem CSI-Verfahren werden simultan die Aufzeichnungen von Spektren vieler räumlicher Zielvolumina ermöglicht, wobei bei dem CSI-Verfahren das Volumen nach der Messung frei wählbar ist. Eine Möglichkeit zur Erzeugung der zweiten ortsaufgelösten Messdaten besteht darin, diese Messdaten ebenso mit dem CSI-Verfahren aufzunehmen. Während bei der Erzeugung der ersten Messdaten gemäß dem CSI-Verfahren die Repetitionszeit TR möglichst lang ist, ist diese bei der Erzeugung der zweiten ortsaufgelösten Messdaten möglichst kurz, um eine Fettgewichtung der erzeugten Messdaten zu erreichen.In an embodiment According to the invention, the first measurement data are recorded according to the CSI method. In the CSI process become simultaneously the records of spectrums of many spatial Target volumes, being in the CSI process the volume is freely selectable after the measurement. A possibility for generating the second spatially resolved measurement data is to also record these measurement data using the CSI method. While at generating the first measurement data according to the CSI method, the repetition time TR possible is long, this is in the generation of the second spatially resolved measurement data preferably short, in order to achieve a grease weighting of the generated measurement data.
Neben der Möglichkeit, die zweiten ortsaufgelösten Messdaten ebenfalls mit einer Spektroskopiemessung aufzunehmen, besteht auch die Möglichkeit die zweiten Messdaten durch Aufnahme von normalen, d. h. nicht spektroskopischen, Fett gewichteten Bildgebungssequenzen zu erzeugen. Um eine Subtraktion zu vereinfachen, sollte jedoch die Ortsauflösung der zweiten Messdaten immer gleich der Ortsauflösung der ersten Messdaten sein.Next The possibility, the second spatially resolved Also to record measured data with a spectroscopic measurement, there is also the possibility the second measurement data by recording normal, d. H. not spectroscopic, To generate fat-weighted imaging sequences. To a subtraction However, the spatial resolution of the second measurement data should be simplified always equal to the spatial resolution be the first measurement data.
Die Fettwichtung der Bildgebungssequenz kann entweder durch geeignete Wahl der Bildparameter erreicht werden, oder es ist möglich, die zweiten Messdaten derart aufzunehmen, dass zweite Messsignale aufgenommen werden und in MR-Datensätze umgewandelt werden wobei die Nichtfettsignalanteile in den MR-Bilddaten unterdrückt werden, beispielsweise durch Segmentieren der MR-Bilddaten zur Erkennung der im Bild meist hellen Fettsignale und durch Unterdrücken der Nichtfettsignale im Bild. Selbstverständlich können auch beide Möglichkeiten kombiniert werden.The fat-weighting of the imaging sequence can be achieved either by suitable choice of the image parameters, or it is possible to record the second measurement data in such a way that second measurement signals are recorded and converted into MR data sets gnalanteile be suppressed in the MR image data, for example, by segmenting the MR image data to detect the mostly bright in the image fat signals and by suppressing the non-fat signals in the image. Of course, both options can be combined.
Werden die zweiten Messdaten mit Hilfe einer spektroskopischen Bildgebungssequenz erzeugt kann beispielsweise eine stark T1-gewichtete CSI-Messsequenz verwendet werden. Da die Repetitionszeit möglichst kurz gehalten wird werden pro Phasenkodierschritt nur sehr wenige Messpunkte aufgenommen. Im Prinzip reicht ein Messpunkt pro Phasenkodierschritt, es können jedoch auch mehrere Messpunkte wie bis zu 5 oder 10 Messpunkte pro Phasenkodierschritt aufgenommen werden.If the second measurement data are generated with the aid of a spectroscopic imaging sequence, for example, a strongly T 1 -weighted CSI measurement sequence can be used. Since the repetition time is kept as short as possible, only very few measurement points are recorded per phase encoding step. In principle, one measuring point per phase coding step is sufficient, but it is also possible to record several measuring points, such as up to 5 or 10 measuring points per phase coding step.
Falls die zweiten Messdaten durch eine nichtspektroskopische herkömmliche Bildgebungssequenz erzeugt werden ist beispielsweise die Wahl einer stark T1-gewichteten Bildgebungssequenz möglich von der die Messsignale einer STIR (Short Tau Inversion Recovery) Bildgebungssequenz abgezogen werden. Hierdurch erhält man ein reines Fettbild. Eine weitere Möglichkeit besteht in der Aufnahme einer stark T1-gewichteten Spinechosequenz mit kurzer Repetitionszeit und einem Flipwinkel α < 90°.For example, if the second measurement data is generated by a non-spectroscopic conventional imaging sequence, it is possible to choose a highly T 1 -weighted imaging sequence from which to subtract the measurement signals of an STIR (Short Tau Inversion Recovery) imaging sequence. This gives a pure fat image. Another possibility is to record a strongly T 1 -weighted spin echo sequence with a short repetition time and a flip angle α <90 °.
Die Fettsignalanteile bei den zweiten ortsaufgelösten Messdaten können auch verstärkt werden, indem beispielsweise bei der Umwandlung der Signalanteile in Grauwerte die Fettanteile mit einem hohen Signal stärker verstärkt werden als die übrigen Signalanteile mit einem niedrigeren Signal. Dies bedeutet, dass die Umwandlung der mit Hilfe einer Fett gewichteten Bildgebungssequenz erzeugten Messdaten nichtlinear in Grauwerte umgewandelt werden, um die Fettsignalanteile noch stärker hervorzuheben. Nach einer derartigen nichtlinearen Korrektur kann das fettverstärkte Bild wieder Fouriertransformiert werden, wobei diese komplexen Rohdaten die zweiten Messdaten darstellen, die dann von den ersten Messdaten abgezogen werden können.The Fat signal components in the second spatially resolved measurement data can also reinforced For example, when converting the signal components in gray values, the fat components are intensified more strongly with a high signal than the remaining signal components with a lower signal. This means that the conversion generated using a fat-weighted imaging sequence Measurement data are converted nonlinearly into gray values to the fat signal components even stronger emphasized. After such a nonlinear correction, the fat increased Image again be Fourier transformed, using this complex raw data represent the second measurement data, then from the first measurement data can be deducted.
Allgemein ist das Subtrahieren der zweiten Messdaten von den ersten Messdaten im Bildraum oder im Rohdaten- oder Fourier-Raum möglich.Generally is the subtraction of the second measurement data from the first measurement data in the image space or in the raw data or Fourier space possible.
Zur Erzeugung einer Fettgewichtung der zweiten ortsaufgelösten Messdaten ist beispielsweise eine Repetitionszeit zwischen 60 und 200 ms, vorzugsweise zwischen 80 und 120 ms, und weiter vorzugsweise von 100 ms denkbar.to Generating a weighting of the second spatially resolved measurement data is, for example, a repetition time between 60 and 200 ms, preferably between 80 and 120 ms, and more preferably from 100 ms conceivable.
Die Erfindung betrifft weiterhin eine Magnetresonanzanlage zur Erststellung des fettreduzierten ortsaufgelösten Magnetresonanzspektrums, ein Computerprogrammprodukt mit einem Computerprogramm zur Ausführung des oben genannten Verfahrens und einen elektronisch lesbaren Datenträger.The The invention further relates to a magnetic resonance system for initial production the fat-reduced spatially resolved Magnetic resonance spectrum, a computer program product with a computer program for execution the above method and an electronically readable medium.
Die Erfindung wird nachfolgend unter Bezugnahme auf die beiliegenden Zeichnungen näher erläutert. Hierbei zeigen:The Invention will be described below with reference to the accompanying Drawings closer explained. Hereby show:
In
Die
Art und Weise wie in einer MR-Anlage durch Einstrahlen einer Abfolge
von HF-Pulsen und Gradienten ein spektroskopisches MR-Bild erzeugt wird,
ist dem Fachmann im Allgemeinen bekannt, so dass aus Übersichtlichkeitsgründen auf
eine genaue Erläuterung
hiervon verzichtet wird. Die MR-Anlage
Wie
die fettreduzierten ortsaufgelösten Spektroskopiedaten
erhalten werden, wird in Zusammenhang mit den
Wie
nun in
Anstelle
der in
Die bei der Erzeugung des Lipidbildes detektierten Messsignale können noch durch weitere Schritte nachverarbeitet werden, um den Fettsignalanteil im Bild noch zu verstärken. Da die Fettsignalanteile im Bild üblicherweise eine größere Signalintensität haben als die übrigen Signalanteile, ist es möglich durch Segmentieralgorithmen die Lipidsignale zu isolieren und die anderen Signalanteile im Bild zu unterdrücken. Ein derart segmentiertes Lipidbild kann anschließend wieder in den Rohdatenraum rücktransformiert werden, wodurch die zweiten Messdaten erzeugt werden, die von den ersten Messdaten abgezogen werden.The Measurement signals detected during the generation of the lipid image can still be detected be reprocessed by further steps to the fat signal component in the picture yet to reinforce. Since the fat signal components in the image usually have a greater signal intensity than the rest Signal components, it is possible by segmentation algorithms to isolate the lipid signals and the suppress other signal components in the image. Such a segmented Lipid picture can subsequently transformed back into the raw data space which generates the second measurement data, which is generated by the first measured data are deducted.
Eine weitere Möglichkeit zur Stärkung des Fettsignals ist die Verwendung einer nichtlinearen Kennlinie bei der Umwandlung von zweiten ortsaufgelösten Messdaten (für das Lipidbild) in Grauwerte. Durch eine nichtlineare beispielsweise quadratische Kennlinie können die Fettsignalanteile gegenüber den anderen Signalanteilen noch weiter verstärkt werden.A another possibility to strengthen of the fat signal is the use of a non-linear characteristic in the conversion of second spatially resolved measurement data (for the lipid image) in gray values. By a non-linear, for example, quadratic characteristic can the fat signal components compared to the other signal components are further enhanced.
In
Durch das oben beschriebene Verfahren ist es erfindungsgemäß möglich, den Fettsignalanteil bei der Spektroskopiebildgebung zu verringern. Die notwendigen und beschriebenen Verarbeitungsschritte lassen sich automatisieren, wodurch automatisch fettreduzierte Spektren erzeugt werden können. Das erfindungsgemäße Verfahren hat weiterhin den Vorteil, dass keine Sättigungsstreifen verwendet werden müssen, so dass durch Sättigungsstreifen induzierte Magnetisierungen nicht auftreten können, wodurch Artefakte verhindert werden können. Das anatomische Bildfeld, in dem Spektren dargestellt werden können, ist nicht eingeschränkt. Besonders vorteilhaft ist die vorgeschlagene Fettsättigungsmethode bei der Untersuchung von Bereichen bei denen Fett in enger räumlicher Nachbarschaft zum Wassergewebe liegt, wie beispielsweise bei der Prostata- oder Mammospektroskopie.By The method described above, it is possible according to the invention, the Reduce fat signal fraction in spectroscopic imaging. The necessary and described processing steps can be automate, which automatically generates fat-reduced spectra can be. The inventive method has the further advantage that no saturation stripes are used Need to become, so by saturation stripes induced magnetizations can not occur, thereby preventing artifacts can be. The anatomical image field in which spectra can be represented is not limited. Particularly advantageous is the proposed fat saturation method in the study of areas where fat in close spatial Neighborhood to the water tissue, such as in the Prostate or mammary spectroscopy.
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Haupt, C.J.(et al.): Removal of Lipid Artifacts in 1H Spectroscopic Imaging by Data Extrapolation. In: Magn. Reson. Med., Vol. 35, 1996, S. 678-687 * |
Haupt, C.J.(et al.): Removal of Lipid Artifacts in 1H Spectroscopic Imaging by Data Extrapolation. In: Magn. Reson. Med., Vol. 35, 1996, S. 678-687 Ebel, A.(et al.): comparison of Methods for Reduction of Lipid Contamination for In Vivo Proton MR Spectroscopic Imaging of the Brain. In: Magn. reson. Med., Vol. 46, 2001, S. 706-712 Maudsley, A.A.(et al.): Comprehensive processing, display and analysis for in vivo MR spectroscopic imaging. In: NMR Biomed., Vol. 19, 2006, S. 492-503 In't Zandt, H.J.A.(et al.): Common processing of in vivo MR spectra. In: NMR Biomed., Vol. 14, 2001, S. 224-232 Mierisova, S.(et al.): MR spectroscopy quantitation: A review of frequency domain methods. In: NMR Biomed., Vol. 14, 2001, S. 247-259 Vanhamme, L.(et al.): MR spectroscopy quantitation: a review of time-domain methods. In: NMR Biomed., Vol. 14, 2001, S. 233-246 |
In't Zandt, H.J.A.(et al.): Common processing of in vivo MR spectra. In: NMR Biomed., Vol. 14, 2001, S. 224-232 * |
Maudsley, A.A.(et al.): Comprehensive processing, display and analysis for in vivo MR spectroscopic imaging. In: NMR Biomed., Vol. 19, 2006, S. 492-503 * |
Mierisova, S.(et al.): MR spectroscopy quantitation: A review of frequency domain methods. In: NMR Biomed., Vol. 14, 2001, S. 247-259 * |
Vanhamme, L.(et al.): MR spectroscopy quantitation: a review of time-domain methods. In: NMR Biomed., Vol. 14, 2001, S. 233-246 * |
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