CZ365098A3 - Isolated and recombinant nucleic acid, bas-1 protein or peptide thereof and preparation, antibody, expression vector, host cell as well as processes of their use - Google Patents
Isolated and recombinant nucleic acid, bas-1 protein or peptide thereof and preparation, antibody, expression vector, host cell as well as processes of their use Download PDFInfo
- Publication number
- CZ365098A3 CZ365098A3 CZ983650A CZ365098A CZ365098A3 CZ 365098 A3 CZ365098 A3 CZ 365098A3 CZ 983650 A CZ983650 A CZ 983650A CZ 365098 A CZ365098 A CZ 365098A CZ 365098 A3 CZ365098 A3 CZ 365098A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- bas
- protein
- antibody
- cells
- leo
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 159
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 140
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 107
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 40
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 36
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 36
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims description 80
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 title claims description 17
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title description 7
- 230000008569 process Effects 0.000 title description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 123
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims abstract description 91
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims abstract description 42
- 238000011161 development Methods 0.000 claims abstract description 8
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 78
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 71
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 51
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 47
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 38
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 26
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 21
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 claims description 15
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 12
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 claims description 11
- 239000000556 agonist Substances 0.000 claims description 9
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 8
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 claims description 8
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 claims description 8
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 claims description 8
- 230000037361 pathway Effects 0.000 claims description 8
- 241001529936 Murinae Species 0.000 claims description 7
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 claims description 7
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 claims description 7
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 claims description 6
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 claims description 6
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 claims description 6
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 claims description 5
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 claims description 5
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 4
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 4
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 4
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 4
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 claims description 4
- 210000000285 follicular dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000009396 radiation induced apoptosis Effects 0.000 claims description 3
- 102000006306 Antigen Receptors Human genes 0.000 claims description 2
- 108010083359 Antigen Receptors Proteins 0.000 claims description 2
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims description 2
- 210000002536 stromal cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 claims 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 claims 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 abstract description 84
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 abstract description 84
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 abstract description 83
- 238000000746 purification Methods 0.000 abstract description 13
- 238000002955 isolation Methods 0.000 abstract description 9
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 abstract description 8
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 120
- 241000282322 Panthera Species 0.000 description 65
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 65
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 45
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 44
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 44
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 37
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 34
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 33
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 29
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 26
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 26
- 241000894007 species Species 0.000 description 25
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 20
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 19
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 19
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 18
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 18
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 14
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 14
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 14
- 239000000047 product Substances 0.000 description 14
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 14
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 14
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 13
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 13
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 12
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 12
- 230000006870 function Effects 0.000 description 12
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 12
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 11
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 11
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 11
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 11
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 11
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 11
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 11
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 10
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 10
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 10
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 10
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 10
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 10
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 10
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 10
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 9
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 9
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 9
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 9
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 9
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 8
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 8
- YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N Ser-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 8
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 8
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 8
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 8
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 8
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- -1 (IL1) Proteins 0.000 description 7
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 7
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 7
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 7
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 7
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 7
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 7
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 7
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 6
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 6
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 6
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 6
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 6
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 6
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 6
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 6
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 6
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 6
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 6
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 6
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 6
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 6
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 6
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 6
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 6
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 6
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 6
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 5
- 101000946850 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD86 Proteins 0.000 description 5
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 5
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 5
- 206010062016 Immunosuppression Diseases 0.000 description 5
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 5
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 5
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 description 5
- 102100034924 T-lymphocyte activation antigen CD86 Human genes 0.000 description 5
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 5
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 5
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 5
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 238000007877 drug screening Methods 0.000 description 5
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 5
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 5
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 5
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 5
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 5
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 5
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 5
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 5
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 5
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 5
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- 102100031585 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Human genes 0.000 description 4
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 4
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 4
- 102000008203 CTLA-4 Antigen Human genes 0.000 description 4
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 4
- 101000777636 Homo sapiens ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Proteins 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 4
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 4
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N Thr-His Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 4
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 4
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 4
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- 230000031864 metaphase Effects 0.000 description 4
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 4
- 238000004091 panning Methods 0.000 description 4
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 4
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 4
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 4
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 4
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 4
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 4
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 4
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 4
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 3
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 3
- 230000003844 B-cell-activation Effects 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 3
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 3
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 description 3
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 3
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 3
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Chemical compound CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 3
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 3
- 230000003302 anti-idiotype Effects 0.000 description 3
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 3
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 3
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 3
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 3
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 3
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 3
- 238000002050 diffraction method Methods 0.000 description 3
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 3
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 3
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 3
- 238000001400 expression cloning Methods 0.000 description 3
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 3
- BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N geneticin Chemical compound O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C(C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N 0.000 description 3
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 3
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 3
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 3
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 3
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 3
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 3
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 3
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 3
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 3
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 3
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 238000004062 sedimentation Methods 0.000 description 3
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 3
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 3
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 3
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 3
- 238000010396 two-hybrid screening Methods 0.000 description 3
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VUDQSRFCCHQIIU-UHFFFAOYSA-N 1-(3,5-dichloro-2,6-dihydroxy-4-methoxyphenyl)hexan-1-one Chemical compound CCCCCC(=O)C1=C(O)C(Cl)=C(OC)C(Cl)=C1O VUDQSRFCCHQIIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]propane-1-sulfonate Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCC[N+](C)(C)CCCS([O-])(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 UMCMPZBLKLEWAF-BCTGSCMUSA-N 0.000 description 2
- 101100111953 Arabidopsis thaliana CYP734A1 gene Proteins 0.000 description 2
- XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N Arg-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O XNSKSTRGQIPTSE-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 2
- OMSMPWHEGLNQOD-UWVGGRQHSA-N Asn-Phe Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMSMPWHEGLNQOD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- VCJCPARXDBEGNE-GUBZILKMSA-N Asn-Pro-Pro Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 VCJCPARXDBEGNE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- DZQKLNLLWFQONU-LKXGYXEUSA-N Asp-Cys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DZQKLNLLWFQONU-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- YTXCCDCOHIYQFC-GUBZILKMSA-N Asp-Met-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O YTXCCDCOHIYQFC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 2
- GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N Asp-Thr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O GCACQYDBDHRVGE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- 208000003950 B-cell lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 101150100308 BAS1 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100165166 Barbarea vulgaris LUP5 gene Proteins 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 241000224495 Dictyostelium Species 0.000 description 2
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 2
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 2
- XMAUFHMAAVTODF-STQMWFEESA-N His-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 XMAUFHMAAVTODF-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101100099884 Homo sapiens CD40 gene Proteins 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 2
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- FJUKMPUELVROGK-IHRRRGAJSA-N Leu-Arg-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N FJUKMPUELVROGK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- JKGHDYGZRDWHGA-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JKGHDYGZRDWHGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IZPVWNSAVUQBGP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N Leu-Ser-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BRTVHXHCUSXYRI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 2
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 2
- KZRQONDKKJCAOL-DKIMLUQUSA-N Phe-Leu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O KZRQONDKKJCAOL-DKIMLUQUSA-N 0.000 description 2
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 2
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 2
- UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N Ser-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UOLGINIHBRIECN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- QYSFWUIXDFJUDW-DCAQKATOSA-N Ser-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QYSFWUIXDFJUDW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N Thr-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)CCCN=C(N)N JNQZPAWOPBZGIX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 2
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 2
- 206010052779 Transplant rejections Diseases 0.000 description 2
- ZRSZTKTVPNSUNA-IHRRRGAJSA-N Val-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O ZRSZTKTVPNSUNA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- HJSLDXZAZGFPDK-ULQDDVLXSA-N Val-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](C(C)C)N HJSLDXZAZGFPDK-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000001270 agonistic effect Effects 0.000 description 2
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 2
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 2
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 2
- 238000007413 biotinylation Methods 0.000 description 2
- 230000006287 biotinylation Effects 0.000 description 2
- 230000008614 cellular interaction Effects 0.000 description 2
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- WLNARFZDISHUGS-MIXBDBMTSA-N cholesteryl hemisuccinate Chemical compound C1C=C2C[C@@H](OC(=O)CCC(O)=O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 WLNARFZDISHUGS-MIXBDBMTSA-N 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 2
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 2
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 2
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 2
- 230000000139 costimulatory effect Effects 0.000 description 2
- 125000000151 cysteine group Chemical class N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 2
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 2
- 239000003792 electrolyte Substances 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 208000037828 epithelial carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 2
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 210000001102 germinal center b cell Anatomy 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 description 2
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 2
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 2
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 2
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 2
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 2
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 2
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 2
- 210000004901 leucine-rich repeat Anatomy 0.000 description 2
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 238000000670 ligand binding assay Methods 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 2
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 2
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 2
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 2
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 2
- DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N phosphotyrosine Chemical compound OC(=O)C(N)CC1=CC=C(OP(O)(O)=O)C=C1 DCWXELXMIBXGTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 2
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 2
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 2
- 230000012743 protein tagging Effects 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 2
- 238000011896 sensitive detection Methods 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 2
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 2
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 2
- DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N (2R)-6-amino-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R,3S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[2-[[2-[[2-[(2-amino-1-hydroxyethylidene)amino]-3-carboxy-1-hydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxypropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1,5-dihydroxy-5-iminopentylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxybutylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1,3-dihydroxypropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]-1-hydroxy-3-sulfanylpropylidene]amino]-1-hydroxyethylidene]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=N[C@@H](CS)C(=N[C@@H](C)C(=N[C@@H](CO)C(=NCC(=N[C@@H](CCC(=N)O)C(=NC(CS)C(=N[C@H]([C@H](C)O)C(=N[C@H](CS)C(=N[C@H](CO)C(=NCC(=N[C@H](CS)C(=NCC(=N[C@H](CCCCN)C(=O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)N=C([C@H](CS)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](CO)N=C([C@H](C)N=C(CN=C([C@H](CO)N=C([C@H](CS)N=C(CN=C(C(CS)N=C(C(CC(=O)O)N=C(CN)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O)O DIGQNXIGRZPYDK-WKSCXVIASA-N 0.000 description 1
- XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N (2s)-1-[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- BHKKSKOHRFHHIN-MRVPVSSYSA-N 1-[[2-[(1R)-1-aminoethyl]-4-chlorophenyl]methyl]-2-sulfanylidene-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one Chemical compound N[C@H](C)C1=C(CN2C(NC(C3=C2C=CN3)=O)=S)C=CC(=C1)Cl BHKKSKOHRFHHIN-MRVPVSSYSA-N 0.000 description 1
- KYWMCFOWDYFYLV-UHFFFAOYSA-N 1h-imidazole-2-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)C1=NC=CN1 KYWMCFOWDYFYLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005084 2D-nuclear magnetic resonance Methods 0.000 description 1
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 5-bromodeoxyuridine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- AAQGRPOPTAUUBM-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AAQGRPOPTAUUBM-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N Ala-Phe-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 1
- 102000007698 Alcohol dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108010021809 Alcohol dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 101710187573 Alcohol dehydrogenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710133776 Alcohol dehydrogenase class-3 Proteins 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 101710145634 Antigen 1 Proteins 0.000 description 1
- OSASDIVHOSJVII-WDSKDSINSA-N Arg-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N OSASDIVHOSJVII-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- BKDDABUWNKGZCK-XHNCKOQMSA-N Asn-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O BKDDABUWNKGZCK-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- MYCSPQIARXTUTP-SRVKXCTJSA-N Asn-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N MYCSPQIARXTUTP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- DJIMLSXHXKWADV-CIUDSAMLSA-N Asn-Leu-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DJIMLSXHXKWADV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- BYLSYQASFJJBCL-DCAQKATOSA-N Asn-Pro-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BYLSYQASFJJBCL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AAIUGNSRQDGCDC-ZLUOBGJFSA-N Asp-Cys-Cys Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)C(=O)O AAIUGNSRQDGCDC-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N Asp-Gly-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SVABRQFIHCSNCI-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- DRCOAZZDQRCGGP-GHCJXIJMSA-N Asp-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O DRCOAZZDQRCGGP-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- QSFHZPQUAAQHAQ-CIUDSAMLSA-N Asp-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QSFHZPQUAAQHAQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N Asp-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N Asp-Val-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- 206010003694 Atrophy Diseases 0.000 description 1
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-UHFFFAOYSA-N BROMODEOXYURIDINE Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- 208000011691 Burkitt lymphomas Diseases 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000557626 Corvus corax Species 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- CMSMOCZEIVJLDB-UHFFFAOYSA-N Cyclophosphamide Chemical compound ClCCN(CCCl)P1(=O)NCCCO1 CMSMOCZEIVJLDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N Cyclosporin A Chemical compound CC[C@@H]1NC(=O)[C@H]([C@H](O)[C@H](C)C\C=C\C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C1=O PMATZTZNYRCHOR-CGLBZJNRSA-N 0.000 description 1
- 108010036949 Cyclosporine Proteins 0.000 description 1
- UPURLDIGQGTUPJ-ZKWXMUAHSA-N Cys-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CS)N UPURLDIGQGTUPJ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- LBOLGUYQEPZSKM-YUMQZZPRSA-N Cys-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CS)N LBOLGUYQEPZSKM-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XZFYRXDAULDNFX-UWVGGRQHSA-N Cys-Phe Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- RESAHOSBQHMOKH-KKUMJFAQSA-N Cys-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](CS)N RESAHOSBQHMOKH-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NMWZMKLDGZXRKP-BZSNNMDCSA-N Cys-Phe-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NMWZMKLDGZXRKP-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N Cys-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YXQDRIRSAHTJKM-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- KVCJEMHFLGVINV-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Asn Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O KVCJEMHFLGVINV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 108010020195 FLAG peptide Proteins 0.000 description 1
- XZWYTXMRWQJBGX-VXBMVYAYSA-N FLAG peptide Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XZWYTXMRWQJBGX-VXBMVYAYSA-N 0.000 description 1
- 102000008175 FSH Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010060374 FSH Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100037362 Fibronectin Human genes 0.000 description 1
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LGQZOQRDEUIZJY-YUMQZZPRSA-N Gly-Cys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)CN)C(O)=O LGQZOQRDEUIZJY-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- FCKPEGOCSVZPNC-WHOFXGATSA-N Gly-Ile-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 FCKPEGOCSVZPNC-WHOFXGATSA-N 0.000 description 1
- XVYKMNXXJXQKME-XEGUGMAKSA-N Gly-Ile-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XVYKMNXXJXQKME-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- FNXSYBOHALPRHV-ONGXEEELSA-N Gly-Val-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN FNXSYBOHALPRHV-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 description 1
- NIKBMHGRNAPJFW-IUCAKERBSA-N His-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 NIKBMHGRNAPJFW-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- CJGDTAHEMXLRMB-ULQDDVLXSA-N His-Arg-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O CJGDTAHEMXLRMB-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- HRGGKHFHRSFSDE-CIUDSAMLSA-N His-Asn-Ser Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N HRGGKHFHRSFSDE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VJJSDSNFXCWCEJ-DJFWLOJKSA-N His-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O VJJSDSNFXCWCEJ-DJFWLOJKSA-N 0.000 description 1
- MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N His-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KDDKJKKQODQQBR-NHCYSSNCSA-N His-Val-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N KDDKJKKQODQQBR-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 description 1
- 101001027128 Homo sapiens Fibronectin Proteins 0.000 description 1
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 description 1
- 101000917826 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Proteins 0.000 description 1
- 101000917824 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Proteins 0.000 description 1
- 101000946889 Homo sapiens Monocyte differentiation antigen CD14 Proteins 0.000 description 1
- 101000914484 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 208000003352 Hyper-IgM Immunodeficiency Syndrome Diseases 0.000 description 1
- CCYGNFBYUNHFSC-MGHWNKPDSA-N Ile-His-Phe Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O CCYGNFBYUNHFSC-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 1
- PFPUFNLHBXKPHY-HTFCKZLJSA-N Ile-Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N PFPUFNLHBXKPHY-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 1
- GVKKVHNRTUFCCE-BJDJZHNGSA-N Ile-Leu-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N GVKKVHNRTUFCCE-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- CNMOKANDJMLAIF-CIQUZCHMSA-N Ile-Thr-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CNMOKANDJMLAIF-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- QGXQHJQPAPMACW-PPCPHDFISA-N Ile-Thr-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N QGXQHJQPAPMACW-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N L-tryptophan-L-tyrosine Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 102000023108 LH Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010011942 LH Receptors Proteins 0.000 description 1
- WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N Leu-Ala-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QPRQGENIBFLVEB-BJDJZHNGSA-N Leu-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O QPRQGENIBFLVEB-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N Leu-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KVOFSTUWVSQMDK-KKUMJFAQSA-N Leu-His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CN=CN1 KVOFSTUWVSQMDK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N Leu-Leu-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- JDBQSGMJBMPNFT-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O JDBQSGMJBMPNFT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ADJWHHZETYAAAX-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N ADJWHHZETYAAAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- MVHXGBZUJLWZOH-BJDJZHNGSA-N Leu-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MVHXGBZUJLWZOH-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- RNYLNYTYMXACRI-VFAJRCTISA-N Leu-Thr-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O RNYLNYTYMXACRI-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- HGLKOTPFWOMPOB-MEYUZBJRSA-N Leu-Thr-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HGLKOTPFWOMPOB-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- 108010006444 Leucine-Rich Repeat Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100029204 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Human genes 0.000 description 1
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 1
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 241001124569 Lycaenidae Species 0.000 description 1
- ZXEUFAVXODIPHC-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ZXEUFAVXODIPHC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QZONCCHVHCOBSK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- JYVCOTWSRGFABJ-DCAQKATOSA-N Lys-Met-Ser Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N JYVCOTWSRGFABJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N Lys-Tyr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 1
- PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N Maleimide Chemical compound O=C1NC(=O)C=C1 PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 108010038049 Mating Factor Proteins 0.000 description 1
- 108010090054 Membrane Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000012750 Membrane Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- WYEXWKAWMNJKPN-UBHSHLNASA-N Met-Ala-Phe Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N WYEXWKAWMNJKPN-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- NDYNTQWSJLPEMK-WDSKDSINSA-N Met-Cys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O NDYNTQWSJLPEMK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- GTRWUQSSISWRTL-NAKRPEOUSA-N Met-Cys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCSC)N GTRWUQSSISWRTL-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- LHXFNWBNRBWMNV-DCAQKATOSA-N Met-Ser-His Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N LHXFNWBNRBWMNV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 108090000157 Metallothionein Proteins 0.000 description 1
- 102000003792 Metallothionein Human genes 0.000 description 1
- 102100035877 Monocyte differentiation antigen CD14 Human genes 0.000 description 1
- 101100241859 Mus musculus Oacyl gene Proteins 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N N-L-cysteinyl-L-phenylalanine Natural products SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N N-L-tyrosyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 1
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 description 1
- BZQFBWGGLXLEPQ-UHFFFAOYSA-N O-phosphoryl-L-serine Natural products OC(=O)C(N)COP(O)(O)=O BZQFBWGGLXLEPQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000425347 Phyla <beetle> Species 0.000 description 1
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 241000125945 Protoparvovirus Species 0.000 description 1
- 101100408135 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) phnA gene Proteins 0.000 description 1
- 108020005067 RNA Splice Sites Proteins 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- RNFKSBPHLTZHLU-WHFBIAKZSA-N Ser-Cys-Gly Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)O)N)O RNFKSBPHLTZHLU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- CICQXRWZNVXFCU-SRVKXCTJSA-N Ser-His-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CICQXRWZNVXFCU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LQESNKGTTNHZPZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O LQESNKGTTNHZPZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N Ser-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N Ser-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QUGRFWPMPVIAPW-IHRRRGAJSA-N Ser-Pro-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QUGRFWPMPVIAPW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- FLMYSKVSDVHLEW-SVSWQMSJSA-N Ser-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O FLMYSKVSDVHLEW-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N Ser-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- UQGAAZXSCGWMFU-UBHSHLNASA-N Ser-Trp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N UQGAAZXSCGWMFU-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- MFQMZDPAZRZAPV-NAKRPEOUSA-N Ser-Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CO)N MFQMZDPAZRZAPV-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 1
- 206010042971 T-cell lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 102100027222 T-lymphocyte activation antigen CD80 Human genes 0.000 description 1
- PXQUBKWZENPDGE-CIQUZCHMSA-N Thr-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N PXQUBKWZENPDGE-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- SKHPKKYKDYULDH-HJGDQZAQSA-N Thr-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SKHPKKYKDYULDH-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N Thr-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JWQNAFHCXKVZKZ-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 1
- AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N Thr-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 102000003911 Thyrotropin Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000253 Thyrotropin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 1
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 1
- KWTRGSQOQHZKIA-PMVMPFDFSA-N Trp-Lys-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)CCCCN)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 KWTRGSQOQHZKIA-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- MXKUGFHWYYKVDV-SZMVWBNQSA-N Trp-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1c[nH]c2ccccc12)C(C)C)C(O)=O MXKUGFHWYYKVDV-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 1
- 102000014384 Type C Phospholipases Human genes 0.000 description 1
- 108010079194 Type C Phospholipases Proteins 0.000 description 1
- 241000700618 Vaccinia virus Species 0.000 description 1
- APQIVBCUIUDSMB-OSUNSFLBSA-N Val-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N APQIVBCUIUDSMB-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- FEXILLGKGGTLRI-NHCYSSNCSA-N Val-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N FEXILLGKGGTLRI-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- DAVNYIUELQBTAP-XUXIUFHCSA-N Val-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N DAVNYIUELQBTAP-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- UOUIMEGEPSBZIV-ULQDDVLXSA-N Val-Lys-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 UOUIMEGEPSBZIV-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- INAPMGSXUVUWAF-GCVPSNMTSA-N [(2r,3s,5r,6r)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl] dihydrogen phosphate Chemical compound OC1[C@H](O)[C@@H](O)C(OP(O)(O)=O)[C@H](O)[C@@H]1O INAPMGSXUVUWAF-GCVPSNMTSA-N 0.000 description 1
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 description 1
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 1
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 description 1
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 1
- 229940024171 alpha-amylase Drugs 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical group 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000008485 antagonism Effects 0.000 description 1
- 230000001028 anti-proliverative effect Effects 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000037444 atrophy Effects 0.000 description 1
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- 239000012148 binding buffer Substances 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000002306 biochemical method Methods 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 230000009141 biological interaction Effects 0.000 description 1
- 230000008512 biological response Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 230000036760 body temperature Effects 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 125000005997 bromomethyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229950004398 broxuridine Drugs 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 1
- 230000011712 cell development Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 210000003588 centroblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000013522 chelant Substances 0.000 description 1
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 1
- 239000012627 chemopreventive agent Substances 0.000 description 1
- 229940124443 chemopreventive agent Drugs 0.000 description 1
- 230000000973 chemotherapeutic effect Effects 0.000 description 1
- VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N chloramine T Chemical class [Na+].CC1=CC=C(S(=O)(=O)[N-]Cl)C=C1 VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004218 chloromethyl group Chemical group [H]C([H])(Cl)* 0.000 description 1
- 229960001265 ciclosporin Drugs 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000006957 competitive inhibition Effects 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical compound BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004397 cyclophosphamide Drugs 0.000 description 1
- 229930182912 cyclosporin Natural products 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 210000000172 cytosol Anatomy 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000003412 degenerative effect Effects 0.000 description 1
- 230000022811 deglycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 230000009025 developmental regulation Effects 0.000 description 1
- UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N dexamethasone Chemical compound C1CC2=CC(=O)C=C[C@]2(C)[C@]2(F)[C@@H]1[C@@H]1C[C@@H](C)[C@@](C(=O)CO)(O)[C@@]1(C)C[C@@H]2O UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N 0.000 description 1
- 229960003957 dexamethasone Drugs 0.000 description 1
- 229950006137 dexfosfoserine Drugs 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 150000004985 diamines Chemical class 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L disodium;(2',7'-dibromo-3',6'-dioxido-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-4'-yl)mercury;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Na+].O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(Br)=C([O-])C([Hg])=C1OC1=C2C=C(Br)C([O-])=C1 BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 238000009510 drug design Methods 0.000 description 1
- 238000007876 drug discovery Methods 0.000 description 1
- 238000003255 drug test Methods 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 210000004700 fetal blood Anatomy 0.000 description 1
- 238000002875 fluorescence polarization Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 238000002825 functional assay Methods 0.000 description 1
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 1
- 108010074605 gamma-Globulins Proteins 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 210000001280 germinal center Anatomy 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 1
- 125000004970 halomethyl group Chemical group 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108060003552 hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004754 hybrid cell Anatomy 0.000 description 1
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 125000004029 hydroxymethyl group Chemical group [H]OC([H])([H])* 0.000 description 1
- 206010066130 hyper-IgM syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 210000002570 interstitial cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000031146 intracellular signal transduction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000011031 large-scale manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 108010077158 leucinyl-arginyl-tryptophan Proteins 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 210000003563 lymphoid tissue Anatomy 0.000 description 1
- 239000008176 lyophilized powder Substances 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- SKEFKEOTNIPLCQ-LWIQTABASA-N mating hormone Chemical compound C([C@@H](C(=O)NC(CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCS(C)=O)C(=O)NC(CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CN=CN1 SKEFKEOTNIPLCQ-LWIQTABASA-N 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 210000001806 memory b lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000001466 metabolic labeling Methods 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 210000003887 myelocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002276 neurotropic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000001216 nucleic acid method Methods 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 239000003883 ointment base Substances 0.000 description 1
- JRZJOMJEPLMPRA-UHFFFAOYSA-N olefin Natural products CCCCCCCC=C JRZJOMJEPLMPRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 1
- 238000012261 overproduction Methods 0.000 description 1
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 239000005011 phenolic resin Substances 0.000 description 1
- 229920001568 phenolic resin Polymers 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 1
- NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N phloretic acid Chemical compound OC(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 NMHMNPHRMNGLLB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- BZQFBWGGLXLEPQ-REOHCLBHSA-N phosphoserine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)COP(O)(O)=O BZQFBWGGLXLEPQ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- USRGIUJOYOXOQJ-GBXIJSLDSA-N phosphothreonine Chemical compound OP(=O)(O)O[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O USRGIUJOYOXOQJ-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 238000000053 physical method Methods 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000006461 physiological response Effects 0.000 description 1
- 210000004180 plasmocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000098 polyolefin Polymers 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 108700042769 prolyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 239000000700 radioactive tracer Substances 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000001525 receptor binding assay Methods 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 230000000284 resting effect Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 230000011218 segmentation Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 1
- BHZOKUMUHVTPBX-UHFFFAOYSA-M sodium acetic acid acetate Chemical compound [Na+].CC(O)=O.CC([O-])=O BHZOKUMUHVTPBX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000006104 solid solution Substances 0.000 description 1
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004989 spleen cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004988 splenocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 description 1
- 239000003270 steroid hormone Substances 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000006277 sulfonation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000011269 tar Substances 0.000 description 1
- 208000001608 teratocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 229960000814 tetanus toxoid Drugs 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 150000003568 thioethers Chemical class 0.000 description 1
- 230000002992 thymic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000024664 tolerance induction Effects 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- JREYOWJEWZVAOR-UHFFFAOYSA-N triazanium;[3-methylbut-3-enoxy(oxido)phosphoryl] phosphate Chemical compound [NH4+].[NH4+].[NH4+].CC(=C)CCOP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O JREYOWJEWZVAOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150044170 trpE gene Proteins 0.000 description 1
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/10—Cells modified by introduction of foreign genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/02—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
Description
BUŇKA A ZPŮSOBY JEJICH POUŽITÍ :.1 CELL AND METHODS OF USING THEM : . 1
OBLAST TECHNIKY • · • · · • · ·AREA OF TECHNOLOGY • · • · · • · ·
Předkládaný vynález se týká řady biologických látek, které se používají k modulování lidské*.··.The present invention relates to a number of biological agents that are used to modulate human*.··.
• · · imunitní odpovědi. Zejména je zaměřený na použité látky a metody, např. při interakci B a T*’ buněk.• · · immune responses. In particular, it is focused on the substances and methods used, e.g. in the interaction of B and T*' cells.
DOSAVADNÍ STAV TECHNIKYSTATE OF THE ART
Leukémie, lymfomy, karcinomy a jiná zhoubná bujení jsou popsány např. v Wilson et al. (eds.) Harrisonů Principles of Internal medicine, McGraw-Hill, New York, pp. 1599 - 1612. Jeden z příkladů takových nemocí, maligní lymfomy jsou neoplastické transformované buňky, které se převážně vyskytují v lymfoidních tkáních (např. Nadler L. M. v Harrisnovi). 90 % lymfomů nepatřící mezi Hodgkinsnovy, z nichž se ve Spojených státech vyskytuje přibližně 30 000 nových případů ročně, jsou B buněčné lymfomy. Méně než 25 % těchto případů je léčeno. Jiným příkladem je leukémie, z nichž se ve Spojených státech vyskytuje ročně přibližně 30 000 nových případů. Proto je potřeba, aby se B a T buněčné lymfomy, leukémie, karcinomy a jiná zhoubná bujení léčily efektivněji.Leukemias, lymphomas, carcinomas and other malignancies are described, for example, in Wilson et al. (eds.) Harrison's Principles of Internal medicine, McGraw-Hill, New York, pp. 1599 - 1612. One example of such diseases, malignant lymphomas are neoplastic transformed cells that predominantly occur in lymphoid tissues (eg Nadler L.M. in Harrisn). 90% of non-Hodgkins lymphomas, of which approximately 30,000 new cases occur in the United States each year, are B cell lymphomas. Less than 25% of these cases are treated. Another example is leukemia, of which approximately 30,000 new cases occur annually in the United States. Therefore, there is a need to treat B and T cell lymphomas, leukemias, cancers and other malignancies more effectively.
Růst normálních klidových B buněk (také označovaných jako „B lymfocyty“) zahrnuje dva rozdílné způsoby. Prvním klidové buňky aktivují přechod z Gofáze do Gi fáze buněčného cyklu. Viz např. Alberts et al. (eds. 1989) Molecular Biology of the Cell, Garland Publ., NY a Darnell et al. (1990) Molecular Cell Biology, Freeman, NY. Dále aktivované buňky indukují proliferaci. Viz např. Paul, ed. (1989) Fundamental Immunology, 2nd ed., Raven Press, NY a třetí edice. Bylo identifikováno několik faktorů, které indukují růst B buněk obsahujících interleukin-1, (IL1), IL-2, IL-4, IL-10 a IL 13. Kromě toho bylo zjištěno, že protilátky proti určitým B buněčným povrchovým molekulám podporují B buněčnou proliferaci. U T buněk (také označovány jako „T lymfocyty“) rovněž indukují proliferaci některé faktory, které obsahují fytohemaglutinin, anti-T buněčné receptorové monoklonální protilátky, anti-CD3 monoklonální protilátky a jiné látky. Řada studií zahrnuje molekulu CD40 jako růstový faktorový receptor a důležitý regulátor lidské B buněčné proliferace a vývoje. B lymfocyty jsou aktivovány tak, že dojde k interakci molekuly CD40 na povrchu B lymfocytů s ligandem, čímž se přechodně exprimuje v aktivovaném helperu T buněk.The growth of normal resting B cells (also referred to as "B lymphocytes") involves two distinct pathways. First, quiescent cells activate the transition from the Go phase to the Gi phase of the cell cycle. See, for example, Alberts et al. (eds. 1989) Molecular Biology of the Cell, Garland Publ., NY and Darnell et al. (1990) Molecular Cell Biology, Freeman, NY. Furthermore, activated cells induce proliferation. See, for example, Paul, ed. (1989) Fundamental Immunology, 2nd ed., Raven Press, NY and third edition. Several factors have been identified that induce B cell growth, including interleukin-1, (IL1), IL-2, IL-4, IL-10, and IL 13. In addition, antibodies against certain B cell surface molecules have been found to promote B cell proliferation. UT cells (also referred to as "T lymphocytes") are also induced to proliferate by certain factors that include phytohemagglutinin, anti-T cell receptor monoclonal antibodies, anti-CD3 monoclonal antibodies, and others. A number of studies implicate the CD40 molecule as a growth factor receptor and an important regulator of human B cell proliferation and development. B lymphocytes are activated by the interaction of the CD40 molecule on the surface of B lymphocytes with a ligand, thereby transiently expressing it in activated helper T cells.
·· · • * · · · ··· · • * · · · ·
CD40 je membránový glykoprotein exprimovaný v normálních B lymfocytech a B buňkácK ϊ’ζ • · · zhoubných nádorů, vmezeřených buňkách, folikulárních dendritických buňkách, tymických · • · · · epiteliálních buňkách a jiných karcinomech. Lidský CD40 byl poprvé identifikován v roce 198^<>ee· • · jako epitop monoklonální protilátky, který je téměř výhradně exprimován vB lymfocytech á ...í proto je používán jako znak pro B buňky. Lidský CD40 antigen je 45 až 50 kD glykoprotein.CD40 is a membrane glycoprotein expressed in normal B lymphocytes and B cellsK ϊ'ζ • · · malignant tumors, interstitial cells, follicular dendritic cells, thymic · • · · · epithelial cells and other cancers. Human CD40 was first identified in 198^ <>ee · • · as a monoclonal antibody epitope that is almost exclusively expressed in B lymphocytes and is therefore used as a marker for B cells. The human CD40 antigen is a 45 to 50 kD glycoprotein.
• · ·• · ·
Anti-CD40 protilátky způsobují silný kostimulační signál pro B buněčnou proliferaci ····* • · · indukovanou acetátem kyseliny forbolmyristové (PMA), anti-CD20 protilátkami nebo anti-.í..’ imunoglobulinovými protilátkami. Kromě toho anti-lidské CD40 protilátky s IL-40 na aktivovaných B buňkách rovněž způsobuje řadu vlivů, včetně krátkodobé replikace, indukce syntézy IgE a dlouhodobé proliferace, když jsou kultury dále doplňovány CD32 transfektovánými L buňkami.Anti-CD40 antibodies cause a strong costimulatory signal for B cell proliferation ····* • · · induced by phorbolmyristic acid acetate (PMA), anti-CD20 antibodies or anti-.í..' immunoglobulin antibodies. In addition, anti-human CD40 antibodies with IL-40 on activated B cells also cause a variety of effects, including short-term replication, induction of IgE synthesis, and long-term proliferation when cultures are further supplemented with CD32-transfected L cells.
B7 (CD80) a B70 (CD86) jsou druhou „skupinou“ molekul, jenž zprostředkují pevnou B a T buněčnou interakci. Tyto molekuly interagují s ligandy CD28 na B buňkách a CTLA-4 na T buňkách. Tyto interakce jsou hlavními kostimulačními signály aktivace B i T buněk.B7 (CD80) and B70 (CD86) are a second “group” of molecules that mediate tight B and T cell interaction. These molecules interact with the ligands CD28 on B cells and CTLA-4 on T cells. These interactions are the main costimulatory signals of both B and T cell activation.
Během posledních 15 let se objasnilo, že tyto dvě dvojice povrchových molekul mají základní funkci v aktivaci T a B buněk. Byla prokázána řada in vitro a in vivo pokusů, kde tyto dvě dvojice molekul představují v imunosupresi důležitou úlohu. Viz například Banchereau et cil. (1994) Ann. Rev. Immunol. 12: 881 - 922, van Kooten et al. (1996) Adv. Immunol. 61: 1 - 77, Linsley and Ledbetter (1993) Ann. Rev. Immunol. 11: 191 - 212.Over the past 15 years, it has become clear that these two pairs of surface molecules have a fundamental function in the activation of T and B cells. A number of in vitro and in vivo experiments have been demonstrated where these two pairs of molecules play an important role in immunosuppression. See, for example, Banchereau et cil. (1994) Ann. Roar. Immunol. 12: 881-922, van Kooten et al. (1996) Adv. Immunol. 61:1-77, Linsley and Ledbetter (1993) Ann. Roar. Immunol. 11: 191–212.
Imunosuprese představuje velice důležitý imunologický zákrok k ochraně a léčení autoimunních nemocí a odmítnutí štěpu během transplantace. Imunosuprese může být dosaženo a) antiproliferačními léky (cyklofosfamidem, 15-deoxystergualinem atd.), b) glukokortikosteroidy, c) inhibitory intracelulárních signalizačních drah (např. cyklosporinem), d) imunosupresivními cytokiny (např. TGF-β, IL-10), e) specifickou toleranční indukcí antigeny a f) inhibici buněčných povrchových molekul zahrnutých v aktivaci T a B lymfocytů, jako jsou CD40/CD40 ligand a B7/B70 s CD28/CTLA-4.Immunosuppression is a very important immunological intervention to protect and treat autoimmune diseases and graft rejection during transplantation. Immunosuppression can be achieved by a) antiproliferative drugs (cyclophosphamide, 15-deoxystergualine, etc.), b) glucocorticosteroids, c) inhibitors of intracellular signaling pathways (e.g. cyclosporine), d) immunosuppressive cytokines (e.g. TGF-β, IL-10), e) specific tolerance induction by antigens and f) inhibition of cell surface molecules involved in the activation of T and B lymphocytes, such as CD40/CD40 ligand and B7/B70 with CD28/CTLA-4.
V roce 1995 byla jiná molekula, nazvaná jako RP105, klonována ze slezinných buněk myší.In 1995, another molecule, called RP105, was cloned from mouse spleen cells.
Např. Miyake et al. (1995) „RP105, a novel B cell surface molecule implicated in B cell activation, is a number of the leucine-rich repeat protein family“ J. Immunol. 154: 3333 - 3340. Monoklonální protilátka proti RP105 indukuje silnou proliferaci myších B buněk a chrání myší B buňky proti apoptóze indukované ozářením podobným způsobem jako anti-CD40 protilátka nebo CD40-ligand. Viz Miyake et al. (1994) „Murine B cell proliferation and protection from apoptosis with an antibody againts a 105 kDa molecule: Unresponsiveness of X-linked immunodeficient B cells“ J. Exp. Med. 180: 1217 - 1224.E.g. Miyake et al. (1995) "RP105, a novel B cell surface molecule implicated in B cell activation, is a member of the leucine-rich repeat protein family" J. Immunol. 154: 3333-3340. Monoclonal antibody against RP105 induces robust proliferation of murine B cells and protects murine B cells against radiation-induced apoptosis in a manner similar to anti-CD40 antibody or CD40-ligand. See Miyake et al. (1994) "Murine B cell proliferation and protection from apoptosis with an antibody against a 105 kDa molecule: Unresponsiveness of X-linked immunodeficient B cells" J. Exp. Copper. 180: 1217–1224.
I • · · · <I • · · · <
► « · · 4 • » ··· · · <► « · · 4 • » ··· · · <
RP105 a jeho údajný ligand mohou být třetí dvojicí molekul, jenž hrají důležitou roli v aktivaci ;*· • · · a B buněk. Avšak až dosud nebyla lidská sekvence dostupná a ani jeho struktura a aktivity · J ···· nebyly stanoveny. Předkládaný vynález poskytuje tento a mnoho jiných používaných postupů. ·....* • · · • · · ·RP105 and its putative ligand may be a third pair of molecules that play an important role in the activation of ;*· • · · and B cells. However, until now, the human sequence was not available, nor were its structure and activities · J ···· determined. The present invention provides this and many other practices in use. ·....* • · · • · · ·
PODSTATA VYNÁLEZU • · · • · · • · ·· • · • · ·SUMMARY OF THE INVENTION • · · • · · • · ·· • · • · ·
Předkládaný vynález se zabývá složkami vybranými ze skupiny, která se skládá: z izolované····* nebo rekombinantní nukleové kyseliny kódujících lidský BAS-1 protein nebo jeho fragment, ze značně čistého BAS-1 proteinu nebo jeho peptidu, zfúzního proteinu obsahujícího proteinové sekvence BAS-1, a z protilátky vyvolané proti rekombinantnímu nebo purifikovanému opičímu BAS-1 proteinu.The present invention deals with components selected from the group consisting of: isolated ····* or recombinant nucleic acid encoding human BAS-1 protein or a fragment thereof, highly purified BAS-1 protein or its peptide, a fusion protein containing protein sequences BAS-1, and from an antibody raised against recombinant or purified monkey BAS-1 protein.
V případech izolované nebo rekombinantní nukleové kyseliny, může tato kyselina obsahovat sekvenci, jenž je definovaná v SEQ ID NO: 1.In the case of an isolated or recombinant nucleic acid, the acid may comprise the sequence defined in SEQ ID NO: 1.
V případech proteinů, může být proteinem značně čistý BAS-1 protein nebo jeho peptid, může být vybrán ze skupiny skládající se z: proteinu nebo peptidu z primátů, obsahující lidský protein, proteinu nebo peptidu obsahující alespoň jeden polypeptidový segment definovaný v SEQ ID NO: 2, proteinu nebo peptidu, jenž vykazuje posttranslační modifikovaný vzor odlišný od přírodního BAS-1 proteinu a protein postrádající intracelulární doménu BAS-1 a může to být látka obsahující protein a farmaceuticky přijatelný nosič.In the case of proteins, the protein may be highly purified BAS-1 protein or a peptide thereof, may be selected from the group consisting of: a primate protein or peptide comprising a human protein, a protein or peptide comprising at least one polypeptide segment defined in SEQ ID NO: 2, a protein or peptide that exhibits a post-translationally modified pattern different from the native BAS-1 protein and a protein lacking the intracellular domain of BAS-1, and may be a substance containing the protein and a pharmaceutically acceptable carrier.
V případech protilátky jsou zahrnuty ty, kde BAS-1 protein je opičí protein, obsahující jeden z lidských proteinů, protilátka je vyvolaná proti peptidu o sekvenci definované v SEQ ID NO: 2, protilátka vykazuje Kd alespoň kolem 10 μΜ, protilátkou je monoklonální protilátka nebo je protilátka značená. Další případy zahrnují ty, kde protilátka indukuje silnou proliferaci B buněk a nebo chrání B buňky proti apoptóze vyvolané ozáření nebo steroidním hormonem.Examples of an antibody include those wherein the BAS-1 protein is a monkey protein comprising one of the human proteins, the antibody is raised against a peptide of the sequence defined in SEQ ID NO: 2, the antibody exhibits a Kd of at least about 10 μΜ, the antibody is a monoclonal antibody, or the antibody is labeled. Other cases include those where the antibody induces robust B cell proliferation and or protects B cells against radiation- or steroid hormone-induced apoptosis.
Předkládaný vynález rovněž zahrnuje soupravu, která obsahuje, např. nukleovou kyselinu kódující BAS-1 protein nebo peptid, značně čistý BAS-1 protein nebo fragment nebo protilátku nebo receptor, který specificky váže BAS-1 protein. Souprava, která obsahuje nukleovou kyselinu zahrnuje kódující sekvenci definovanou v SEQ ID NO: 1. Pro soupravu, která obsahuje protein nebo peptid, je polypeptid často vybrán ze skupiny skládající se: z proteinu nebo peptidu z primátu obsahující lidský protein, proteinu nebo peptidu obsahující alespoň jeden polypeptidový segment definovaný v SEQ ID NO: 2 a proteinu nebo peptidu, který vykazuje posttranslační modifikovaný vzor odlišný od přírodního BAS-1 proteinu.The present invention also includes a kit that contains, e.g., a nucleic acid encoding a BAS-1 protein or peptide, a highly purified BAS-1 protein or fragment, or an antibody or receptor that specifically binds the BAS-1 protein. A kit that comprises a nucleic acid comprises the coding sequence defined in SEQ ID NO: 1. For a kit that comprises a protein or peptide, the polypeptide is often selected from the group consisting of: a protein or peptide from a primate comprising a human protein, a protein or peptide comprising at least one polypeptide segment defined in SEQ ID NO: 2 and a protein or peptide that exhibits a post-translationally modified pattern different from the native BAS-1 protein.
Jiná souprava může zahrnovat protilátku nebo receptor, kde BAS-1 protein je opičí protein obsahující jeden z lidských proteinů. Tvorba protilátky je vyvolána proti peptidové sekvenciAnother kit may include an antibody or receptor where the BAS-1 protein is a monkey protein containing one of the human proteins. Antibody formation is induced against the peptide sequence
·· · definované vSEQ NO; 2, protilátka vykazuje Kd alespoň okolo 10 μΜ a je monoklonálnj ·’· • · · protilátkou nebo je značená. · • · · ··· · defined in SEQ NO; 2, the antibody exhibits a Kd of at least about 10 μΜ and is a monoclonal ·'· • · · antibody or is labeled. · • · · ·
Vynález rovněž poskytuje metodu prozkoumání vzorku vazebného partnera pro BAS-1 proteitl....’ • · zahrnující postup tvorby purifikovaného nebo rekombinantního BAS-1 proteinu a prozkoumán?..·.· vzorku pro specifickou vazbu vazebného partnera na BAS-1 protein. V některých případech • · · vzorek obsahuje proteiny z T buňky, dentritické buňky zahrnující folikulární dentritickou buňku*··· • · · nebo obsahuje stromatickou buňku zahrnující vazivovou buňku, endotelovou buňku a epitelovoú····’ buňku. V jiných případech je vazebným partnerem protilátka a vzorek je hybridomový supernantant.The invention also provides a method of screening a sample of a binding partner for BAS-1 protein....' • · comprising the process of producing purified or recombinant BAS-1 protein and screening?..·.· sample for specific binding of a binding partner to BAS-1 protein. In some cases • · · the sample contains proteins from a T cell, a dendritic cell including a follicular dendritic cell*··· • · · or contains a stromal cell including a fibrous cell, an endothelial cell, and an epithelial····' cell. In other cases, the binding partner is an antibody and the sample is a hybridoma supernatant.
Z jiného pohledu předkládaný vynález zahrnuje metodu modulace fyziologie nebo vývoje buňky obsahující spojení buňky s agonistem nebo antagonistem BAS-1 proteinu. Fyziologie je vybrána z: imunosuprese, aktivace cytotoxické smrti, modulace tvorby cytokinu nebo růst lymfomu. Antagonistem je často protilátka proti opičímu BAS-1 proteinu. A metoda může zahrnovat právě v kombinaci s mediátorem signálu přes antigenový receptor, dráhu ligandu CD40:CD40 nebo dráhu CD28/CTLA-4:B7/B70, např. anti-CD3, anti-CD40, ligand anti-CD40, anti-CD28, antiCTLA-4, anti B7, anti B70 nebo rozpustnou část vhodně povrchově značené molekuly.In another aspect, the present invention includes a method of modulating the physiology or development of a cell comprising contacting the cell with an agonist or antagonist of a BAS-1 protein. The physiology is selected from: immunosuppression, activation of cytotoxic death, modulation of cytokine production, or lymphoma growth. The antagonist is often an antibody against the monkey BAS-1 protein. And the method may include precisely in combination with a signal mediator through the antigen receptor, the CD40:CD40 ligand pathway or the CD28/CTLA-4:B7/B70 pathway, e.g. anti-CD3, anti-CD40, anti-CD40 ligand, anti-CD28, antiCTLA-4, anti B7, anti B70 or a soluble part of a suitably surface labeled molecule.
I. ObecněI. In general
Předkládaný vynález poskytuje aminokyselinovou sekvenci a sekvenci DNA lidského proteinu, který vykazuje vlastnosti aktivovaného antigenu. Tento protein je označen jako BAS-1 (B cell Activation and Survival antigen-1). Zde popsaná sekvence primáta byla nalezena až poté, co byl popsán myší gen. Viz Miyake et al. (1995) J. Immunol. 154: 3333 - 3340. Podobné proteinové sekvence v jiných druzích primátů by mohly být rovněž použitelné. Níže uvedené příklady jsou, ve vzorových případech, zaměřeny na popsanou lidskou BAS-1 přírodní alelu, ale jsou stejně tak aplikovatelné do alelických a nebo polymorfních variant, např. z jiných jedinců, tak jako z variant upravených sestřihem, např. přírodní druhů.The present invention provides the amino acid sequence and DNA sequence of a human protein that exhibits the properties of an activated antigen. This protein is designated BAS-1 (B cell Activation and Survival antigen-1). The primate sequence described here was not found until after the mouse gene was described. See Miyake et al. (1995) J. Immunol. 154: 3333-3340. Similar protein sequences in other primate species could also be applicable. The examples below are, in exemplary cases, focused on the described human BAS-1 wild-type allele, but are equally applicable to allelic and or polymorphic variants, e.g. from other individuals, as well as spliced variants, e.g. wild species.
Tyto geny umožňují izolaci jiných opičích genů kódujících proteiny podobné tomuto, dále rozšiřují skupinu mimo popsané specifické případy. Způsob je podrobně popsán níže.These genes allow the isolation of other monkey genes encoding proteins similar to this one, further expanding the group beyond the specific cases described. The method is described in detail below.
Lidský BAS-1 je takto nazván podle jeho biologické aktivity. Monoklonální protilátka proti myšímu homologu RP105 indukuje silnou proliferaci myších B buněk a chrání myší B buňky proti apoptóze indukované ozářením podobným způsobem jako anti-CD40 protilátka nebo CD40-ligand.Human BAS-1 is so named for its biological activity. A monoclonal antibody against the murine homolog of RP105 induces robust proliferation of murine B cells and protects murine B cells against radiation-induced apoptosis in a manner similar to anti-CD40 antibody or CD40-ligand.
• 000• 000
000 ·0 0 0000 0000 00 0 0000 0 0000000 0 0 « 000 000 000 0000 0 ·000 ·0 0 0000 0000 00 0 0000 0 0000000 0 0 « 000 000 000 0000 0 ·
0 0 00 0 0
Lidská BAS-1 cDNA byla vyizolovaná použitím sekvence nukleové kyseliny, založené na; ;·;Human BAS-1 cDNA was isolated using a nucleic acid sequence based on; ;·;
0 0 sekvenci myšího RP105. Analýza příslušného kódovaného proteinu naznačuje, že lidský BAS-10 0 sequence of mouse RP105. Analysis of the respective encoded protein suggests that human BAS-1
0 0 0 patří do skupiny proteinů obsahující úsek bohatý na leucin. Jiní zástupci této skupiny zahrnuj5 Ϊ0 0 0 belongs to a group of proteins containing a leucine-rich stretch. Other representatives of this group include 5 Ϊ
CD14-LPS receptor, FSH/LH/TSH receptory a neurotropní receptory. Předpokládá se, že jsOu;* . ;CD14-LPS receptor, FSH/LH/TSH receptors and neurotropic receptors. They are assumed to be;* . ;
0 0 0 tyto receptory zahrnuty v signální transdukci.0 0 0 these receptors involved in signal transduction.
0 00 0
Lidská BAS-1 cDNA byla odvozena s použitím sekvencí řady oblastí myšího RP105. Porovnání*.!..’Human BAS-1 cDNA was derived using the sequences of several regions of mouse RP105. Comparison*.!..'
0 homologie otevřených čtecích rámců mezi myším a lidským BAS-1 ukazuje přibližně 67%·.;..’ homologii DNA sekvence a přibližně 73% shodnost aminokyselinové sekvence s myším RP105.0 open reading frame homology between mouse and human BAS-1 shows approximately 67% ·.;..' DNA sequence homology and approximately 73% amino acid sequence identity to mouse RP105.
Lidský BAS-1 může mít značnou roli ve vnějším imunitním systému, např. ve vývojové regulac v jiných buňkách. Viz např. Gilbert (1991) Developmental Biology (3rd ed.), Sinauer Associates, Sunderland, MA, Browder et al. (1991) Developmental Biology (3rd ed.), Saunders, Philadelphia, PA., Russo et al. (1992) Development: The Molecular Genetic Approach, Springer-Verlag, New York, N.Y. a Wilkins (1993) Genetic Analysis of Animal Development (2nd ed.) Wiley-Liss, New York, N.Y. Identifikace ligandu pro lidský BAS-1 může zodpovědět některé otázky, které se naskytly tímto pozorováním.Human BAS-1 may have a significant role in the external immune system, eg in developmental regulation in other cells. See, eg, Gilbert (1991) Developmental Biology ( 3rd ed.), Sinauer Associates, Sunderland, MA, Browder et al. (1991) Developmental Biology ( 3rd ed.), Saunders, Philadelphia, PA., Russo et al. (1992) Development: The Molecular Genetic Approach, Springer-Verlag, New York, NY and Wilkins (1993) Genetic Analysis of Animal Development (2 nd ed.) Wiley-Liss, New York, NY Identification of a ligand for human BAS-1 may answer some of the questions raised by this observation.
II. Purifikovaný lidský BAS-1 proteinII. Purified human BAS-1 protein
SEQ ID NO: 1 popisuje nukleotidovou sekvenci cDNA a odpovídající aminokyselinovou sekvenci. Aminokyselinovou sekvenci rovněž vyjadřuje SEQ ID NO: 2. Domníváme se, že signální sekvence jde od Met (1) po Val (20), N-konec, který obsahuje na asparaginu (zbytek 34, 53) dvě potenciálně N-vazebná glykosylovaná místa, jde od Cys (28) po Leu (58), tandemové repetice oblasti bohaté na leucin, která obsahuje 9 potenciálních míst pro N-vazebnou glykosylaci na asparaginu (zbytky 70, 78, 201, 234, 244, 394, 402, 451 a 573), jde od Thr (55) po Tyr (592). C-lemovací oblast jde od Leu (574) po Cys (625), transmembránová oblast je od Ala (629) po Val (650), intracelulární oblast, jenž obsahuje dvě potenciálně fosforylovaná místa na tyrosinu (652 a 658), jde od Lys (651) po Phe (661).SEQ ID NO: 1 describes the nucleotide sequence of the cDNA and the corresponding amino acid sequence. The amino acid sequence is also given by SEQ ID NO: 2. We believe that the signal sequence runs from Met (1) to Val (20), the N-terminus, which contains two potential N-linked glycosylated sites on the asparagine (residues 34, 53), runs from Cys (28) to Leu (58), a tandem repeat of a leucine-rich region that contains 9 potential sites for N-linked glycosylation on asparagine (residues 70, 78, 201, 234, 244, 394, 402, 451, and 573 ), goes from Thr (55) to Tyr (592). The C-flanking region runs from Leu (574) to Cys (625), the transmembrane region runs from Ala (629) to Val (650), the intracellular region, which contains two potentially phosphorylated tyrosine sites (652 and 658), runs from Lys (651) to Phe (661).
Následující tabulka zobrazuje seřazení repeticí bohatých na leucin lidského BAS-1 proteinu popsaného v SEQ ID NO: 2.The following table shows the alignment of the leucine-rich repeats of the human BAS-1 protein described in SEQ ID NO: 2.
Tabulka 1Table 1
C I I konsenzus: lúQíIZXLXXNXIŮCXLX^C I I consensus: lúQíIZXLXXNXIŮCXLX^
1: 55-78 TEFLEFSFNFLPTIHNRTFSRIiMN » · φ · » φ φ φ φ«1: 55-78 TEFLEFSFNFLPTIHNRTFSRIiMN » · φ · » φ φ φ φ«
I Φ Φ φ · φI Φ Φ φ · φ
ΦΦΦΦ φφφ • ·ΦΦΦΦ φφφ • ·
V souvislosti s proteinem se, zde používaný termín „lidský BAS-l“, odkazuje na protein o aminokyselinové sekvenci popsané v SEQ ID NO: 2. Předkládaný vynález také zahrnuje proteiny obsahující jeho velký fragment, např. mutanty a polymorfní varianty, společně se získaným lidským polypeptidem, který vykazuje shodné biologické funkce nebo interakce s vazebnými složkami specifickými k lidskému BAS-l. Tyto vazebné složky se typicky váží na lidský BAS-l s vysokou afinitou, např. alespoň 100 nM, obvykle lépe než 30 nM, častěji lépe než 10 nM a nejčastěji lépe než 3 nM. Homologní proteiny se nacházejí v jiných druzích než lidských, např. primátů.In the context of a protein, the term "human BAS-1" as used herein refers to a protein having the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2. The present invention also includes proteins comprising a large fragment thereof, e.g., mutants and polymorphic variants, together with the obtained a human polypeptide that exhibits identical biological functions or interactions with binding components specific to human BAS-1. These binding moieties typically bind to human BAS-1 with high affinity, eg, at least 100 nM, usually better than 30 nM, more often better than 10 nM, and most often better than 3 nM. Homologous proteins are found in non-human species such as primates.
Zde používaný termín „polypeptid“ vyjadřuje fragment nebo segment a zahrnuje úsek aminokyselinových zbytků alespoň 8 aminokyselin, obecně alespoň 10 aminokyselin, nejobecněji alespoň 12 aminokyselin, často alespoň 14 aminokyselin, častěji alespoň 16 aminokyselin, typicky alespoň 20 aminokyselin, obvykle alespoň 22 aminokyselin, častěji alespoň 24 aminokyselin, lépe alespoň 26 aminokyselin, častěji alespoň 28 aminokyselin, a částečně upřednostňované alespoň 30 nebo více aminokyselin, např. 33, 37, 41, 45, 49, 53, 57 atd.As used herein, the term "polypeptide" refers to a fragment or segment and includes a stretch of amino acid residues of at least 8 amino acids, generally at least 10 amino acids, most generally at least 12 amino acids, often at least 14 amino acids, more often at least 16 amino acids, typically at least 20 amino acids, usually at least 22 amino acids, more often at least 24 amino acids, preferably at least 26 amino acids, more often at least 28 amino acids, and partially preferred at least 30 or more amino acids, e.g. 33, 37, 41, 45, 49, 53, 57, etc.
Termín „ligand“ nebo „vazebná složka“ se odkazuje na molekuly, které se specificky váží na BAS-l, např. protilátka-antigen. Jiné interakce zahrnují např. typ ligand-receptor, nebo s látkami, které se spojují s BAS-l, např. v interakci protein-protein, buď kovalentní nebo nekovalentni • ·The term "ligand" or "binding component" refers to molecules that specifically bind to BAS-1, eg, an antibody-antigen. Other interactions include e.g. the ligand-receptor type, or with substances that bind to BAS-1, e.g. in a protein-protein interaction, either covalently or non-covalently • ·
9 9 • · · · · 99 9 • · · · · 9
99 9 999 • 9 vazbou. Molekula může být polymer nebo chemické činidlo. Žádný jiný náznak pokud jde o tcj99 9999 • 9 binding. A molecule can be a polymer or a chemical agent. No other indication as to tcj
9 9 zdaje BAS-1 v interakci ligand-receptor buď ligand nebo receptor, není uveden, než že interakce *9 9 appears BAS-1 in ligand-receptor interaction either ligand or receptor, not shown, except that the interaction *
9 vykazuje specifickou afinitu. Funkčním analogem může být ligand se strukturními modifikacerrí....’9 shows specific affinity. A functional analogue can be a ligand with structural modifications...'
9 nebo úplně jiná molekula v takovém molekulovém tvaru, jenž interaguje s vhodným ligandovýn?..·,: vazebným determinantem. Ligandy mohou sloužit jako agonisti nebo antagonisti, viz např. .♦9 or a completely different molecule in such a molecular form that interacts with a suitable ligand binding determinant. Ligands can serve as agonists or antagonists, see e.g. .♦
9 99 9
Goodman et al. (eds.) (1990) Goodman and Gilmarís: The Pharmacological Bases of**Goodman et al. (eds.) (1990) Goodman and Gilmarís: The Pharmacological Bases of**
9 99 9
Therapeutics (8th ed.), Pergamon Press. *.í·.*Therapeutics (8 th ed.), Pergamon Press. *.and·.*
Rozpustnost polypeptidu nebo fragmentu záleží na prostředí a polypeptidu. Rozpustnost je ovlivněna mnoha faktory, např. teplotou, prostředím elektrolytu, velikostí a molekulární vlastností polypetidu a původem rozpouštědla. Běžně je teplota, při které je polypeptid používán v rozmezí od 4 °C do 65 °C. Obvykle je používaná teplota vyšší než 18 °C a častější je, když je vyšší než 22 °C. Pro diagnostické účely se obvykle používá pokojová teplota nebo teplejší, ale při stanovení se používá teplota nižší než je denaturační teplota složek. Pro terapeutické účely se obvykle používá tělesná teplota, typická pro lidi je 37 °C, ačkoli za určitých situací může být vyšší nebo nižší in šitu nebo in vitro.The solubility of the polypeptide or fragment depends on the environment and the polypeptide. Solubility is influenced by many factors, such as temperature, electrolyte environment, size and molecular properties of the polypeptide, and solvent origin. Typically, the temperature at which the polypeptide is used is between 4°C and 65°C. Usually, the temperature used is higher than 18 °C, and it is more common when it is higher than 22 °C. Room temperature or warmer is usually used for diagnostic purposes, but a temperature lower than the denaturation temperature of the components is used in the determination. Body temperature is usually used for therapeutic purposes, typically 37°C in humans, although in certain situations it may be higher or lower in situ or in vitro.
Elektrolyty se obvykle blíží in šitu k fyziologickým podmínkám, ale mohou být modifikovány na vyšší nebo nižší iontovou sílu, která je výhodná. Konkrétní ionty mohou být modifikovány, aby se upravily na standardní pufry používané ve fyziologických nebo analytických podmínkách. Velikost a struktura polypeptidu by měla být obvykle v dosti stabilním stavu, nikoliv v denaturované formě. Polypeptid může být spojen s jinými polypeptidy za vzniku kvarterní struktury, např. umožnit rozpustnost, nebo spojen s lipidy nebo detergenty způsobem, který je podobný přírodní lipidové dvojvrstvě. Zejména se zdá, že přírodní protein je často spojen k lipidu PI vazbou.Electrolytes usually closely approximate physiological conditions, but may be modified to a higher or lower ionic strength that is preferred. Specific ions can be modified to adapt to standard buffers used in physiological or analytical conditions. The size and structure of the polypeptide should usually be in a fairly stable state, not in a denatured form. A polypeptide may be linked to other polypeptides to form a quaternary structure, eg to allow solubility, or linked to lipids or detergents in a manner that is similar to a natural lipid bilayer. In particular, it appears that the natural protein is often linked to the lipid by a PI bond.
Rozpouštědlo je obvykle biologicky kompatibilní pufr používaný pro zachování biologických aktivit a je obvykle upraven fyziologickým rozpouštědlem. Rozpouštědlo má běžně neutrální pH mezi 5 a 10, ale lépe kolem 7,5. V některých případech je přidáván mírný nedenaturovaný detergent, např. CHS (cholesteryl hemisukcinát) nebo CHAPS (3-([3-cholamidopropyl] dimethylamonio)-l-propansulfonát) nebo je přidán v dostatečně nízké koncentraci, aby nenarušil terciární strukturu proteinu.The solvent is usually a biologically compatible buffer used to preserve biological activities and is usually conditioned with a physiological solvent. The solvent normally has a neutral pH between 5 and 10, but preferably around 7.5. In some cases, a mild non-denaturing detergent, e.g. CHS (cholesteryl hemisuccinate) or CHAPS (3-([3-cholamidopropyl] dimethylammonio)-1-propanesulfonate) is added or is added at a sufficiently low concentration not to disturb the tertiary structure of the protein.
Rozpustnost je vyjádřena sedimentací měřenou v Sedbergových jednotkách, které jsou za konkrétních podmínek mírou sedimentační rychlosti molekuly. Stanovení sedimentační rychlosti bylo klasicky provedeno v analytické ultracentrifuze, ale nyní se běžně provádí ve standarní ultracentrifuze. Viz Freifelder (1982) Physical Biochemistry (2nd ed.), W. H. Freeman a Cantor and Schimel (1980) Biophysical Chemistry, část 1 až 3, W. H. Freeman & Co., San Francisco.Solubility is expressed by sedimentation measured in Sedberg units, which are a measure of the sedimentation rate of a molecule under specific conditions. Sedimentation velocity determination was classically performed in an analytical ultracentrifuge, but is now commonly performed in a standard ultracentrifuge. See Freifelder (1982) Physical Biochemistry ( 2nd ed.), WH Freeman and Cantor and Schimel (1980) Biophysical Chemistry, Parts 1 to 3, WH Freeman & Co., San Francisco.
0000 «« 0 0 000000 «« 0 0 00
Při přibližném stanovení je vzorek, obsahující údajně rozpustný polypeptid, stočen ve standardní ;*íIn an approximate determination, a sample containing a supposedly soluble polypeptide is curled in a standard ;*í
0 0 ultracentrifuze pri 50K rpm 10 minut a rozpustné molekuly zůstanou v supernatantu. Rozpustné *0 0 ultracentrifuge at 50K rpm for 10 minutes and soluble molecules remain in the supernatant. Soluble *
0 částice nebo polypeptid budou méně než 30S, běžně méně než 15S, obvykle méně než 10S, čast<5.·..*0 particle or polypeptide will be less than 30S, usually less than 15S, usually less than 10S, part<5.·..*
0 méně než 6S, zejména častěji méně než 4S a nejčastěji méně než 3S.0 less than 6S, especially more often less than 4S and most often less than 3S.
III. Fyzikální varianty ··”III. Physical variants ··”
0 0 0 0 0 00000 0 0 0 0 0000
Tento vynález rovněž zahrnuje proteiny nebo peptidy o značně shodné aminokyselinové sekvenci, jako je aminokyselinová sekvence lidského BAS-1. Obsahuje například jedno-, dvoua třívlásenkové konzervativní substituce. Vhodněji bývá substituce mimo konzervativní cysteiny a občas bývá mimo oblast helikální strukturní domény. Takové varianty mohou být používány k tvorbě specifických protilátek a často spolu sdílí mnoho nebo všechny biologické vlastnosti.The present invention also includes proteins or peptides having a substantially identical amino acid sequence, such as the amino acid sequence of human BAS-1. It contains, for example, one-, two- and three-hairpin conservative substitutions. More preferably, the substitution is outside the conservative cysteines and occasionally outside the region of the helical structural domain. Such variants can be used to generate specific antibodies and often share many or all biological properties.
Shodnost aminokyselinové sekvence je stanovena optimalizováním zbytkových odpovídajících částí. Ty se změní kdykoliv vzhledem ke konzervativním substitucím. Konzervativní substituce běžně zahrnují substituce v následujících skupinách: glycin, alanin; valin, izoleucin, leucin; aspartamová kyselina, glutamová kyselina; asparagin, glutamin; serin, threonin; lysin, arginin a fenylalanin, tyrosin. Předpokládá se, že podobné aminokyselinové sekvence zahrnují v jednotlivých proteinových sekvencích přírodní alelické varianty. Běžné homologní proteiny nebo peptidy mohou mít s aminokyselinovou sekvencí lidského BAS-1 85 až 100% shodnost (pokud jsou uvedeny mezery) a do 90 až 100 % (jestliže je zahrnuta konzervativní substituce). Stupeň shodnosti je alespoň kolem 85 %, obecně kolem 87 %, často alespoň kolem 89 %, běžně alespoň 91 %, obvykle alespoň kolem 93 %, častěji alespoň kolem 95 %, lépe alespoň kolem 97 % a nejčastěji alespoň kolem 98 % a zejména nejlépe alespoň kolem 99 % nebo více. Viz také Needleham et al. (1970) 48: 443 - 453, Sankoff et al. (1983) kapitola první v Time Warps,Amino acid sequence identity is determined by optimizing residual matching portions. These will change at any time due to conservative substitutions. Conservative substitutions commonly include substitutions in the following groups: glycine, alanine; valine, isoleucine, leucine; aspartic acid, glutamic acid; asparagine, glutamine; serine, threonine; lysine, arginine and phenylalanine, tyrosine. Similar amino acid sequences are believed to include natural allelic variants in individual protein sequences. Common homologous proteins or peptides may have 85 to 100% identity (if gaps are provided) and up to 90 to 100% (if conservative substitutions are included) to the amino acid sequence of human BAS-1. The degree of agreement is at least about 85%, generally about 87%, often at least about 89%, commonly at least about 91%, usually at least about 93%, more often at least about 95%, preferably at least about 97% and most often at least about 98% and especially best at least around 99% or more. See also Needleham et al. (1970) 48: 443-453, Sankoff et al. (1983) chapter one in Time Warps,
String Edits, and Macromolecules: The Theory and Practice of Sequence Comparison Addison Wesley, Reading, MA a software od IntelliGenetics, Mountain View, CA a University of Wisconsin Genetics Computer Group, Madison, WI.String Edits, and Macromolecules: The Theory and Practice of Sequence Comparison Addison Wesley, Reading, MA and software by IntelliGenetics, Mountain View, CA and University of Wisconsin Genetics Computer Group, Madison, WI.
Vyizolovaná lidská BAS-1 DNA může být snadno modifikována substitucí nukleotidů, nukleotidovou delecí, inzercí a inverzí nukleotidového úseku. Výsledkem těchto modifikací budou nové DNA sekvence, které kódují užitečné antigeny, jejich deriváty nebo proteiny s podobnou nebo opačnou aktivitou. Tyto modifikované sekvence mohou být použity k tvorbě mutantních antigenů nebo zesilovat expresi. Zesílení exprese může zahrnovat genovou amplifikaci, zvýšenou transkripci, translaci a další mechanismy. Mutantní BAS-1 deriváty obsahují predeterminované nebo místně specifické mutace příslušného proteinu nebo jeho ·· · ··· · · · · · ♦ · • · · · φ » · · · · · • * ···· · · · · · ··· ··· ···· ······· · · · · ·· · · · · · · · «9 · * ···· fragmentů. „Mutant BAS-1“ obsahuje polypeptid, jenž jinak sdílí důležitý rys lidského BAS-1; ;*· ·· · jak je uvedeno výše, ale má aminokyselinovou sekvenci rozdílnou od původního BAS-1, což je · ···· způsobeno delecí, substitucí nebo inzercí. Zejména „místně specifický mutant BAS-1“ jé....’ • · definován tak, že je homologní s antigenem popsaným v SEQ ID NO: 2 a tak sdílí s tímto..·,; antigenem řadu biologických aktivit. Podobná pojetí se vztahují na různé BAS-1 proteiny, J 9 9 · , . Q r · · 9 9 9 zejména ty, jenž jsou nalezeny v různých jiných primátech. Jak bylo dříve uvedeno a**·· • · · zdůrazněno, příklady obecně uvádějí další BAS-1 proteiny, které se výhradně neomezují ná····’ konkrétně diskutované lidské případy.Isolated human BAS-1 DNA can be easily modified by nucleotide substitution, nucleotide deletion, insertion and inversion of the nucleotide stretch. These modifications will result in new DNA sequences that encode useful antigens, their derivatives, or proteins with similar or opposite activity. These modified sequences can be used to generate mutant antigens or enhance expression. Enhancement of expression may involve gene amplification, increased transcription, translation, and other mechanisms. Mutant BAS-1 derivatives contain predetermined or site-specific mutations of the respective protein or its ·· · ··· · · · · ♦ · • · · · φ » · · · · · • * ···· · · · · ··· ··· ···· ······· · · · · ·· · · · · · · · «9 · * ···· fragments. "Mutant BAS-1" comprises a polypeptide that otherwise shares an important feature of human BAS-1; ;*· ·· · as above but has an amino acid sequence different from native BAS-1, which is · ···· caused by deletion, substitution or insertion. In particular, a "site-specific BAS-1 mutant"is....' • · defined as being homologous to the antigen described in SEQ ID NO: 2 and thus sharing with this..·,; antigen a number of biological activities. Similar concepts apply to various BAS-1 proteins, J 9 9 · , . Q r · · 9 9 9 especially those found in various other primates. As previously noted and emphasized, the examples generally list other BAS-1 proteins, which are not strictly limited to the particular human cases discussed.
Ačkoli jsou místa místně specifické mutace predeterminované, mutanty nemusí být místně specifické. Mutageneze lidského BAS-1 může být způsobena inzercí nebo delecí aminokyseliny. Substituce, delece, inzerce nebo jiné kombinace mohou být generovány, aby byla dosažena konečné podoby. Inzerce zahrnuje spojení N- a C-konce. Náhodná mutageneze může vést k cílovému kodonu a poté může být u exprimovaných mutantů zkoumána požadovaná aktivita. Metody substituovaných mutací na předem určených místech DNA o známé sekvenci jsou v oboru dobře známé, např. mutageneze Ml3 primeru. Viz také Sambrook et al. (1989) a Ausubel etal. (1987 a doplněk).Although the sites of site-specific mutations are predetermined, mutants need not be site-specific. Mutagenesis of human BAS-1 can be caused by amino acid insertion or deletion. Substitutions, deletions, insertions, or other combinations may be generated to achieve the final form. The insertion involves joining the N- and C-termini. Random mutagenesis can lead to a target codon and then the expressed mutants can be examined for the desired activity. Methods of substitution mutations at predetermined sites of DNA of known sequence are well known in the art, e.g. M13 primer mutagenesis. See also Sambrook et al. (1989) and Ausubel et al. (1987 and supplement).
Mutací DNA by se běžně nepřemístila kódující sekvence mimo čtecí rámce a lépe se nevytvoří komplementární oblast, která by mohla hybridizovat za vzniku sekundární mRNA struktury, jako jsou smyčky nebo vlásenky.Mutation of DNA would not normally move the coding sequence out of reading frames and better not create a complementary region that could hybridize to form a secondary mRNA structure such as loops or hairpins.
Předkládaný vynález rovněž zahrnuje rekombinantní proteiny, např. heterologní fúzi proteiny využívající segmenty z těchto proteinů. Heterologní fúze proteinů je taková fuze proteinů nebo segmentů, které obvykle nefózují stejným způsobem. A tak je produktem fuze imunoglogulinu s BAS-1 polypeptidem spojená molekula proteinu o sekvenci, která vznikne charakteristickou peptidovou vazbou. Molekula je typicky vytvořena jako jednoduchý translační produkt a vykazuje vlastnosti pocházející zobou peptidových zdrojů. Podobné pojetí se aplikuje i na heterologní sekvence kyseliny nukleové.The present invention also includes recombinant proteins, eg, heterologous fusion proteins using segments from these proteins. Heterologous protein fusion is the fusion of proteins or segments that do not normally fuse in the same way. Thus, the fusion product of immunoglobulin with BAS-1 polypeptide is a protein molecule with a sequence that is formed by a characteristic peptide bond. The molecule is typically formed as a simple translation product and exhibits properties derived from both peptide sources. A similar concept is also applied to heterologous nucleic acid sequences.
Kromě toho může nový konstrukt vzniknout kombinací podobných funkčních domén z jiných proteinů. Například segmenty vázající ligand nebo jiné segmenty mohou být „vyměněny“ s různými novými fúzními polypeptidy nebo fragmenty. Viz např. Cunningham et al. (1989) Science 243: 1330 - 1336 a O'Dowd et al. (1988) J. Biol. Chem. 263: 15985 - 15992. Nové chimérické polypeptidy vykazují nové kombinace specifit, které jsou výsledkem funkční vazby specifit vázajících ligand a jiných funkčních domén.In addition, a new construct can be created by combining similar functional domains from other proteins. For example, ligand binding segments or other segments can be "swapped" with different new fusion polypeptides or fragments. See, for example, Cunningham et al. (1989) Science 243: 1330-1336 and O'Dowd et al. (1988) J. Biol. Chem. 263: 15985-15992. Novel chimeric polypeptides exhibit novel combinations of specificities resulting from the functional linkage of ligand-binding specificities and other functional domains.
Fosforamiditovou metodou popsanou Breaucage and Carruthers (1981) Tetra. Letts. 22: 1859 1862, vznikají vhodné syntetické DNA fragmenty. Dvojřetězcový fragment se často získává buďBy the phosphoramidite method described by Breaucage and Carruthers (1981) Tetra. Lets. 22: 1859 1862, suitable synthetic DNA fragments are produced. A double-stranded fragment is often obtained either
44444444
44 • · · 44 4 444444 • · · 44 4 4444
4444 44 4 44444444 44 4 4444
4 4444 4 4 4 · · 444 4444 4444 4 4 4 · · 444 444
444 4444 4 4 ?444 4444 4 4 ?
4 44 44 44 44 * syntézou komplementárního řetězce a současně za vhodných podmínek teplotní hybridi žací řetězce nebo přidáním komplementárního řetězce k vhodnému primeru s použitím DNA polymerázy. · ····4 44 44 44 44 * by synthesis of the complementary strand and at the same time under appropriate conditions temperature hybridization of the strand or by adding the complementary strand to a suitable primer using DNA polymerase. · ····
4444 444 • · 4 44444 444 • · 4 4
4 • 444 •4 • 444 •
4 4 4 • 44 4 4 • 4
S 4 4 4 4With 4 4 4 4
IV. Funkční varianty ..IV. Functional variants ..
4 «4 «
4 44 4
4 4 4 444 4 4 44
4 44 4
Blokace fyziologické odpovědi na BAS-1 antigeny může vyplývat z inhibice vazby ligandu ná····’ BAS-1, pravděpodobně kompetitivní inhibice. Tudíž při stanovení in vitro předkládaného vynálezu bude často používán izolovaný protein, membrány z buněk exprimující rekombinantní BAS-1, rozpustné fragmenty obsahující segmenty vázající ligand těchto antigenů nebo fragmenty upevněné na pevné fáze substrátů. Tato stanovení budou rovněž připouštět při diagnostickém stanovení vlivy buď mutací a modifikací vazebného segmentu nebo mutací a modifikací ligandu, např. analogy ligandu.Blockade of the physiological response to BAS-1 antigens may result from inhibition of ligand binding to BAS-1, probably competitive inhibition. Thus, isolated protein, membranes from cells expressing recombinant BAS-1, soluble fragments containing the ligand-binding segments of these antigens, or fragments fixed to solid phase substrates will often be used in the in vitro assay of the present invention. These assays will also allow for diagnostic assays to be influenced by either mutations and modifications of the binding segment or mutations and modifications of the ligand, e.g. ligand analogs.
Vynález rovněž pozoruje použití prozkoumávání kompetitivního léčiva, kde např. neutralizující protilátky proti antigenů nebo antigenovým fragmentům soutěží s testovanou látkou o vazbu na protein. Takto mohou být použity protilátky k detekci přítomnosti některých polypeptidů, které sdílejí jedno nebo více vazebných míst antigenů a rovněž mohou být použity k obsazení vazebných míst na proteinu, které mohou být jinak obsazeny ligandem.The invention also contemplates the use of competitive drug screening where, for example, neutralizing antibodies against antigens or antigenic fragments compete with the test substance for protein binding. Thus, antibodies can be used to detect the presence of certain polypeptides that share one or more antigen binding sites and can also be used to occupy binding sites on a protein that may otherwise be occupied by a ligand.
Navíc, neutralizační protilátky proti BAS-1 a jeho rozpustnému fragmentu, který obsahuje vysoce afinitní vazebné místo ligandu, mohou být použity k inhibici funkce ligandu v tkáních, např. tkáních podstupujících abnormální fyziologii.In addition, neutralizing antibodies against BAS-1 and a soluble fragment thereof that contains a high-affinity ligand binding site can be used to inhibit ligand function in tissues, e.g., tissues undergoing abnormal physiology.
„Deriváty“ BAS-1 antigenů obsahují aminokyselinové mutanty, glykosylované varianty a kovalentní konjugáty nebo konjugáty spojené s jinými chemickými složkami. Kovalentní deriváty mohou být připraveny vazbou funkčních skupin, které se nacházejí na aminokyselinovém místě řetězců BAS-1 antigenů nebo na N- nebo C-konci polypeptidů způsobem, který jev oboru dobře známý. Tyto deriváty mohou zahrnovat bez omezení alifatické estery nebo amidy na C-konci polypeptidů nebo zbytky obsahující karhoxylové místo řetězců, Oacylové deriváty hydroxylových skupin obsahujících zbytky a N-acylové deriváty N-konce aminokyselin nebo aminoskupina obsahující zbytky, např. lysin nebo arginin. Acylové skupiny pocházejí z alkylových skupin obsahující C3 až Cis alkyl, čímž se tvoří alkanoylaroylové druhy. Zejména jsou zde zahrnuty glykosylové úpravy, např. modifikace glykosylového vzoru polypeptidů během jeho syntézy a postupu nebo jiné způsoby. Obzvlášť vhodným způsobem pro toto provedení je působení glykosylačních enzymů získaných z buněk, které obvykle zajišťují tento proces, např. lidské glykosylační enzymy. Rovněž jsou studovány deglykosylační enzymy."Derivatives" of BAS-1 antigens include amino acid mutants, glycosylated variants, and covalent conjugates or conjugates linked to other chemical components. Covalent derivatives can be prepared by linking functional groups located at the amino acid site of the BAS-1 antigen chains or at the N- or C-terminus of the polypeptides in a manner well known in the art. These derivatives may include, without limitation, aliphatic esters or amides at the C-terminus of polypeptides or residues containing a carboxyl site of the chains, Oacyl derivatives of hydroxyl group containing residues, and N-acyl derivatives of the N-terminus of amino acids or amino group containing residues, e.g., lysine or arginine. Acyl groups are derived from alkyl groups containing C 3 to C 18 alkyl, forming alkanoylaroyl species. In particular, glycosyl modifications are included, eg, modification of the glycosyl pattern of polypeptides during its synthesis and processing or other methods. A particularly suitable method for this embodiment is the action of glycosylation enzymes obtained from cells that usually ensure this process, e.g. human glycosylation enzymes. Deglycosylation enzymes are also being studied.
4444 ·· « • 4 4 • 4 4 · • · 4 9 ·· · 4 ·· 44444 ·· « • 4 4 • 4 4 · • · 4 9 ·· · 4 ·· 4
4« k·*·4« k·*·
4 « • 4 44 «4 444 « • 4 44 «4 44
4 4 4 • 4 4 44 4 4 • 4 4 4
444 444444 444
44
4444
4444 444 • · 4 44444 444 • · 4 4
44
Vynález také zahrnuje variantu stejné primární aminokyselinové sekvence, která je troch® modifikovaná a obsahuje fosforylované aminokyselinové zbytky, např. fosfotyrosin, fosfoserin nebo fosfothreonin. ·The invention also includes a variant of the same primary amino acid sequence that is slightly modified and contains phosphorylated amino acid residues, eg phosphotyrosine, phosphoserine or phosphothreonine. ·
Hlavní skupinou derivátů jsou kovalentní konjugáty BAS-1 antigenů nebo jeho fragmente s jinými polypeptidovými proteiny. Tyto deriváty mohou být syntetizovány v rekombinovanéThe main group of derivatives are covalent conjugates of BAS-1 antigens or its fragments with other polypeptide proteins. These derivatives can be synthesized in recombined
4444 •4444 •
4444 4 »4444 4 »
44
4444
44
44
4444 kultuře, jako jsou N- a C-koncová fuze nebo použitím činidel známých v oboru pro jejich prospěšnost v zesíťovaných proteinech na reaktivních místech skupin. Vhodnější místa pro derivatizaci ligandů se zesíťujícími činidly jsou na volných aminoskupinách, uhlovodíkových částech a cysteinových zbytcích.4444 culture, such as N- and C-terminal fusion or by using reagents known in the art for their utility in cross-linking proteins at reactive site groups. More suitable sites for derivatization of ligands with cross-linking agents are on free amino groups, hydrocarbon moieties and cysteine residues.
Byla rovněž provedena fuze polypeptidů mezi BAS-1 antigeny a jinými homologními a heterologními proteiny. Homologní proteiny mohou být spojeny s různými povrchovými vzory, například hybridní protein vykazuje ligandovou specifitu jednoho nebo více vzorových proteinů. Podobně může být vytvořena heterologní fúze, jenž by vykazovala kombinaci vlastností a aktivit odvozených proteinů. Typickým příkladem je luze reportérového polypeptidu, např. luciferázy se segmentem nebo doménou antigenů, např. segment vázající ligand, takže může být snadněji určena přítomnost nebo umístění požadované ligandu. Viz např. Duli et al., U.S. Patent No. 4,859,609, který je zde citován. Jiné genové fuzní partnery zahrnují bakteriální B-galaktosidáza, trpE, protein A, β-laktamáza, α-amyláza, alkoholdehydrogenáza a kvasničný a mating faktor. Viz např. Godowski etal. (1988) Science 241: 812-816.Fusion polypeptides between BAS-1 antigens and other homologous and heterologous proteins have also been performed. Homologous proteins can be associated with different surface patterns, for example a hybrid protein exhibits the ligand specificity of one or more pattern proteins. Similarly, a heterologous fusion can be created that exhibits a combination of the properties and activities of the derived proteins. A typical example is the fusion of a reporter polypeptide, eg, luciferase, with a segment or domain of antigens, eg, a ligand-binding segment, so that the presence or location of the desired ligand can be more easily determined. See, e.g., Duli et al., U.S. Patent No. 4,859,609, which is cited herein. Other gene fusion partners include bacterial B-galactosidase, trpE, protein A, β-lactamase, α-amylase, alcohol dehydrogenase, and yeast and mating factor. See, for example, Godowski et al. (1988) Science 241: 812-816.
Fosforamiditovou metodou popsanou Beaucage and Carruthers (1981) Tetra. Letts. 22: 1859 1862 vznikají vhodné syntetické DNA fragmenty. Dvojřetězcový fragment se často získává buď syntézou komplementárního řetězce a současně za vhodných podmínek teplotní hybridizací řetězce nebo přidáním komplementárního řetězce k vhodnému primeru s použitím DNA polymerázy.By the phosphoramidite method described by Beaucage and Carruthers (1981) Tetra. Lets. 22: 1859 1862 suitable synthetic DNA fragments are produced. A double-stranded fragment is often obtained either by synthesis of the complementary strand and simultaneously, under appropriate conditions, thermal hybridization of the strand or by adding the complementary strand to a suitable primer using DNA polymerase.
Takové polypeptidy mohou mít zbytky aminokyselin, které jsou chemicky modifikovány fosforylací, sulfonací, biotinylací nebo přidáním nebo odstraněním jiných částí, zejména těch jejichž tvar molekuly je podobný fosfátové skupině. V některých případech budou modifikacemi vhodné značené látky nebo poslouží jako purifíkační cíle, např. ligandová afinita.Such polypeptides may have amino acid residues that are chemically modified by phosphorylation, sulfonation, biotinylation, or the addition or removal of other moieties, especially those whose molecular shape is similar to a phosphate group. In some cases, the modifications will be suitable labeled substances or will serve as purification targets, eg ligand affinity.
Fúze proteinů může obecně nastat buď metodami rekombinovaných nukleových kyselin nebo syntézou polypeptidů. Způsoby manipulací s nukleovou kyselinou a metody exprese jsou obecně popsány např. v Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd ed), Vols. 1 - 3, Cold Spring Harbor Laboratory. Metody syntetizování polypeptidů jsou popsány např. vMerrifield (1963) J. Amer. Chem. Soc. 85: 2149 - 2156, Merrifield (1986) Science 232:Fusion of proteins can generally occur either by recombinant nucleic acid methods or by polypeptide synthesis. Nucleic acid manipulation methods and expression methods are generally described in, e.g., Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual ( 2nd ed), Vols. 1 - 3, Cold Spring Harbor Laboratory. Methods of synthesizing polypeptides are described, for example, in Merrifield (1963) J. Amer. Chem. Soc. 85: 2149-2156, Merrifield (1986) Science 232:
44
4444 ♦ » ···♦ ···· » · « ··«« * ····· · * · . * ·.· ··· • · · · · · . · * ·· « ·· ·· ·· ·· **·.4444 ♦ » ···♦ ···· » · « ··«« * ····· · * · . * ·.· ··· • · · · · · . · * ·· « ·· ·· ·· ·· **·.
341 - 347 a Atherton et al. (1989) Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, IRE....* Press, Oxford. ·. J ·341-347 and Atherton et al. (1989) Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, IRE...* Press, Oxford. ·. J ·
Tento vynález rovněž popisuje použití derivátů BAS-1 antigenů jiných, než jsou varianty v.λ.This invention also describes the use of derivatives of BAS-1 antigens other than the v.λ variants.
• · aminokyselinové sekvenci nebo glykosylace. Takové deriváty mohou být s chemickými částmi””.• · amino acid sequence or glycosylation. Such derivatives may be with chemical moieties.
• · spojeny kovalentně nebo nahromaděny do shluků. Tyto deriváty obecně patří do tří tříd: (1) soli’··’·· (2) řetězcové místo a koncové části kovalentních modifikací a (3) adsorpční komplexy, např» ·**· • · · · s buněčnými membránami. Takové kovalentní a nahromaděné deriváty jsou používány jakc; ,··, • · · imunogeny, látky při imunologických stanoveních nebo purifíkačních metodách, jako je afinitní ”” purifikace ligandů nebo vazebných ligandů. Například BAS-1 antigen může být, v oboru dobře známými metodami, imobilizován kovalentní vazbou na pevný povrch, jako je Sepharoza aktivovaná kyanogenbromidem nebo adsorpcí na polyolefinové povrchy se zesítěním glutaraldehydem nebo bez něj, pro stanovení nebo k purifikaci anti-BAS-1 protilátek nebo jeho ligandů. Pro diagnostická stanovení mohou být BAS-1 antigeny také značeny detekovatelnou skupinou, např. radiojódovaným chloraminem T, kovalentně vázanou na výjimečné půdní cheláty nebo mohou být konjugovaný na jiné fluoreskující části.• · covalently linked or assembled into clusters. These derivatives generally belong to three classes: (1) salts'··'·· (2) chain site and terminal parts of covalent modifications and (3) adsorption complexes, eg» ·**· • · · · with cell membranes. Such covalent and stacked derivatives are used as; ,··, • · · immunogens, substances in immunological assays or purification methods, such as affinity "" purification of ligands or binding ligands. For example, BAS-1 antigen can be, by methods well known in the art, immobilized by covalent binding to a solid surface such as cyanogen bromide-activated Sepharose or by adsorption to polyolefin surfaces with or without glutaraldehyde cross-linking, for the determination or purification of anti-BAS-1 antibodies or of its ligands. For diagnostic assays, BAS-1 antigens can also be labeled with a detectable group, eg, radioiodinated chloramine T, covalently bound to exceptional soil chelates or conjugated to other fluorescent moieties.
Rozpustný BAS-1 antigen, v tomto vynálezu, může být používán jako imunogen k tvorbě antiséra nebo protilátky specifické proti antigenů nebo některé jeho části. Purifikované antigeny mohou být použity ke zkoumání monoklonálních protilátek nebo fragmentů vázajících antigen, které byly připraveny imunizací různých druhů znečištěných preparátů obsahujících proteiny. Termín „protilátky“ zahrnuje zejména fragmenty přírodních protilátek vázající antigen. Purifikovaný BAS-1 antigen se může rovněž používat jako látka k detekci protilátek vzniklých jako odpověď na přítomnost zvýšené hladiny BAS-1 nebo buněčných částí obsahujících antigen za podmínek abnormálně diagnostických nebo specificky fyziologických či při nemoci. Navíc v předkládaném vynálezu mohou BAS-1 fragmenty sloužit jako imunogeny k tvorbě protilátek, jak je popsáno níže. Například předkládaný vynález zkoumá protilátky získané proti aminokyselinovým sekvencím nebo kódované nukleotidovou sekvencí popsané v SEQ ID NO: 1 nebo jejich fragmenty. Tento vynález pozoruje protilátky, které mají vazebnou afinitou k specifickým fragmentům nebo jsou získány proti specifickým fragmentům, jenž podle předpokladů leží mimo oblast lipidové dvojvrstvy. Navíc může řada konstruktů vzniknout fůzí membránově nahromaděných segmentů s jinak extracelulárně volnými částmi molekul.The soluble BAS-1 antigen, in the present invention, can be used as an immunogen to generate an antiserum or antibody specific to the antigens or some part thereof. Purified antigens can be used to examine monoclonal antibodies or antigen-binding fragments that have been prepared by immunization of various types of contaminated preparations containing proteins. The term "antibodies" includes in particular antigen-binding fragments of natural antibodies. Purified BAS-1 antigen can also be used as an agent to detect antibodies raised in response to the presence of elevated levels of BAS-1 or antigen-containing cellular components under abnormally diagnostic or specifically physiological or disease conditions. Additionally, in the present invention, BAS-1 fragments can serve as immunogens to generate antibodies, as described below. For example, the present invention examines antibodies raised against the amino acid sequences or encoded by the nucleotide sequence described in SEQ ID NO: 1 or fragments thereof. The present invention contemplates antibodies that have binding affinity to or are raised against specific fragments predicted to lie outside the region of the lipid bilayer. In addition, a number of constructs can arise from the fusion of membrane-accumulated segments with otherwise extracellular free parts of molecules.
Předkládaný vynález prozkoumává izolaci dalších podobných druhů. Je vysoce pravděpodobné, že alelické druhy existují v různých jedincích, např. je zde popsaná více než 90 až 97% shodnost k případu popsaném dříve.The present invention explores the isolation of other similar species. It is highly likely that allelic species exist in different individuals, eg, greater than 90 to 97% similarity to the case previously described is described here.
4 4 4 »» 4··* • 4 4 • · 4 4 ·4 4 4 »» 4··* • 4 4 • · 4 4 ·
4« 444« 44
Vynález rovněž předkládá způsoby izolace skupin příbuzných antigenů s rozdílnou i podobnoú....* · 4 · strukturou, expresí a funkcí. Vysvětlení mnoha fyziologických vlivů antigenů bude velm?..· · urychleno izolací a charakterizací odlišných druhů protějších částí antigenů. Předkládaný.^..The invention also provides methods for isolating groups of related antigens with different and similar...* · 4 · structure, expression and function. The elucidation of the many physiological effects of antigens will be greatly accelerated by the isolation and characterization of distinct species of the opposite parts of antigens. Submitted.^..
• · vynález předkládá zejména použití nukleotidových sond k identifikaci dalších homologní ch****.• · the invention presents in particular the use of nucleotide probes to identify other homologous ch****.
4 genetických entit v různých druzích.4 genetic entities in different species.
Vyizolované geny umožňují transformaci buněk postrádajících expresi BAS-1, např. jiná .**.The isolated genes allow the transformation of cells lacking BAS-1 expression, eg other .**.
4 4 4 druhové typy nebo buňky, které postrádají odpovídající antigeny a vykazují negativní aktivitu. .··.4 4 4 species types or cells that lack the corresponding antigens and show negative activity. .··.
· ·· ·
Exprese transformovaných genů umožňuje izolaci antigenně čistých buněčných linií, s’*” definovanými nebo jednodruhovými variantami. Tento přístup umožňuje mnohem citlivější detekci a rozlišení fyziologických vlivů jakýchkoli ligandů. Subcelulární fragmenty, např. cytoplasty nebo membránové fragmenty mohou být izolovány a používány.Expression of the transformed genes allows the isolation of antigenically pure cell lines, with '*' defined or single-species variants. This approach allows for much more sensitive detection and discrimination of the physiological effects of any ligands. Subcellular fragments, eg cytoplasts or membrane fragments, can be isolated and used.
Rozbor kritických strukturálních částí, které ovlivňují řadu různých funkcí zajišťovaných ligandy, umožňuje používání standardních metod moderní molekulární biologie, zvláště v porovnání členů podobných tříd. Viz např. metoda mutageneze snímající homolog popsaná Cunningham et al. (1989) Science 243: 1339 - 1336 a postupy používané v 0'Dowd et al. (1988)Dissecting the critical structural parts that influence the many different functions provided by the ligands allows the use of standard methods of modern molecular biology, especially in the comparison of members of similar classes. See, e.g., the method of homolog sensing mutagenesis described by Cunningham et al. (1989) Science 243: 1339-1336 and the procedures used in O'Dowd et al. (1988)
J. Biol. Chem. 263: 15985 - 15992 a Lechleiter etal. (1990) EMBO J. 9: 4381 - 4390.J. Biol. Chem. 263: 15985-15992 and Lechleiter et al. (1990) EMBO J. 9: 4381-4390.
Segmenty vázající ligandy mohou být substituovány druhovými variantami, aby se určilo, jaké strukturní rysy jsou důležité v obou ligandových vazebných afinitách a specificitách. Řada různých BAS-1 variant bude použita pro sledování ligandů vykazujících kombinované interakční vlastnosti s jinými druhovými variantami.Ligand binding segments can be substituted with species variants to determine what structural features are important in both ligand binding affinities and specificities. A number of different BAS-1 variants will be used to screen for ligands exhibiting combined interaction properties with other species variants.
Intracelulární funkce by se patrně týkala antigenových segmentů, které jsou běžně dostupné v cytosolu. Avšak antigenová internalizace může nastat za jistých okolností a může dojít k interakci mezi intracelulárními složkami a určenými „extracelulárními“ segmenty. Specifické vazebné segmenty BAS-1 antigenů s jinými intracelulárními složkami mou být identifikovány mutagenezí nebo přímo biochemicky, např. zesítění nebo afinitní metody. Rovněž se bude aplikovat strukturní analýza krystalografií nebo jinými fyzikálními metodami. Další výzkum mechanismu signální transdukce může zahrnovat studium nahromaděných složek, které mohou být izolovány afinitními metodami.Intracellular function would likely involve antigenic segments that are normally available in the cytosol. However, antigen internalization can occur under certain circumstances and interactions between intracellular components and designated "extracellular" segments can occur. Specific binding segments of BAS-1 antigens to other intracellular components may be identified by mutagenesis or directly biochemically, eg, cross-linking or affinity methods. Structural analysis by crystallography or other physical methods will also be applied. Further investigation of the mechanism of signal transduction may involve the study of accumulated components that can be isolated by affinity methods.
Dále se bude studovat exprese a kontrola BAS-1 antigenů. Kontrolované složky spojené s antigeny vykazují různé vývojové, tkáňově specifické nebo jiné expresní vzory. Předmětem zájmu jsou horní a dolní genetické oblasti, např. kontrola složek.Furthermore, the expression and control of BAS-1 antigens will be studied. Controlled antigen-associated components show different developmental, tissue-specific, or other expression patterns. Upstream and downstream genetic regions are of interest, eg component control.
Studium struktury BAS-1 antigenů vede k sestrojení nových ligandů, zvláště analogů vykazujících agonistické a antagonistické vlastnosti. Toto může být kombinováno s dříve popsanými a sledovanými metodami na izolaci ligandů s požadovaným spektrem aktivit.The study of the structure of BAS-1 antigens leads to the construction of new ligands, especially analogs showing agonistic and antagonistic properties. This can be combined with previously described and monitored methods to isolate ligands with the desired spectrum of activities.
• · · 0 ·· ···· ·· · • · «· ·* • · · · · · · • · · 0 · * « 0*00 • ······· · 0 0 0 * 0> · 0 * • · · 0 · 0 0 0 0 ·· * ·· ·· ·· ♦· ···· • · ·• · · 0 ·· ···· ·· · • · «· ·* • · · · · · · • · · 0 · * « 0*00 • ······· · 0 0 0 * 0 > · 0 * • · · 0 · 0 0 0 0 ·· * ·· ·· ·· ♦· ···· • · ·
Exprese v jiných buněčných druzích bude často v konkrétních antigenech způsobovat rozdílnou •Expression in other cell types will often cause different •
glykosylaci. Rada druhů může mít rozdílné funkce založené na různé struktuře oprotí aminokyseliné sekvenci. Rozdílná modifikace může být zodpovědná za rozdílné funkce a nyní je možné tyto vlivy objasnit.glycosylation. A number of species may have different functions based on different structure versus amino acid sequence. Different modification may be responsible for different functions and it is now possible to elucidate these effects.
V předkládaném vynálezu jsou zdůrazněny důležité vývojové antigeny a látky na nich závislé. Ačkoliv se uvedené příklady zaměřují především na lidský BAS-1, znalci v oboru ihned poznají· že vynález obsahuje další BAS-1 antigeny, např. primátů a jiných savců. .Important developmental antigens and substances dependent on them are highlighted in the present invention. Although the above examples focus primarily on human BAS-1, those skilled in the art will immediately recognize that the invention includes other BAS-1 antigens, e.g. primates and other mammals. .
V. ProtilátkyV. Antibodies
Protilátky mohou být vytvořeny proti řadě alelických variant BAS-1 antigenů a jejich fragmentů, jak v původně vyskytujícím se tvaru, tak v jejich rekombinované podobě. Navíc mohou protilátky vzniknout proti BAS-1 buď ve své aktivní nebo vinaktivní formě. Často jsou pozorovány protilátky antiidiotypové.Antibodies can be raised against a number of allelic variants of BAS-1 antigens and their fragments, both in the originally occurring form and in their recombined form. Additionally, antibodies can be raised against BAS-1 in either its active or inactive form. Anti-idiotype antibodies are often observed.
Protilátky, které obsahují vazebné fragmenty a jednořetězcové formy, proti předem definovaným fragmentům BAS-1 vznikají imunizací zvířat konjugáty fragmentů s imunogennímí proteiny. Monoklonální protilátky jsou připravovány z buněk vylučujících požadované protilátky. U těchto protilátek může být sledována vazba na normální a chybný BAS-1 nebo aktivita ligandu agonistů nebo antagonistů. Tyto monoklonální protilátky jsou obvykle vázány sKd alespoň více než 1 mM, běžněji alespoň více než 300 μΜ, typicky více než 30 μΜ, vhodněji více než 10 μΜ a nejlépe více než 3 μΜ, např. 1 μΜ, 300 nM, 100 nM, 30 nM, 10 nM, 3 nM, 1 nM, 300 pM, 100 pM, 30 pM atd.Antibodies that contain binding fragments and single-chain forms against predefined fragments of BAS-1 are created by immunization of animals by conjugates of fragments with immunogenic proteins. Monoclonal antibodies are prepared from cells secreting the desired antibodies. These antibodies can be monitored for binding to normal and defective BAS-1 or ligand activity of agonists or antagonists. These monoclonal antibodies are usually bound with an sKd of at least more than 1 mM, more commonly at least more than 300 μΜ, typically more than 30 μΜ, more preferably more than 10 μΜ and most preferably more than 3 μΜ, e.g. 1 μΜ, 300 nM, 100 nM, 30 nM, 10 nM, 3 nM, 1 nM, 300 pM, 100 pM, 30 pM, etc.
Tyto protilátky obsahující fragmenty vázající antigen mohou mít v diagnostice a terapeutice podstatný význam. Mohou být silnými antagonisty, jenž váží BAS-1 a inhibují vazbu ligandu nebo schopnost ligandu vyvolat biologickou odpověď. Také mohou být používány jako protilátky bez neutralizujících účinků a připojeny na toxiny nebo radionuklidy tak, že se protilátka naváže na antigen a samotná buňka je zničena. Dále mohou být tyto protilátky konjugovány s léky nebo jinými terapeutickými činidly a to buď přímo nebo nepřímo přes spojovník.These antibodies containing antigen-binding fragments can be of significant importance in diagnostics and therapy. They may be potent antagonists that bind to BAS-1 and inhibit ligand binding or the ability of the ligand to elicit a biological response. They can also be used as antibodies without neutralizing effects and attached to toxins or radionuclides so that the antibody binds to the antigen and the cell itself is destroyed. Furthermore, these antibodies can be conjugated with drugs or other therapeutic agents, either directly or indirectly through the linker.
Protilátky v tomto vynálezu mohou být použity v diagnostice. Jako zachycené nebo protilátky bez neutralizačních účinků se mohou vázat na BAS-1 bez inhibiční ligandové vazby. Jako neutralizační protilátky mohou být použity při kompetitivních vazebných stanoveních. Rovněž mohou být využity k detekci nebo kvantifikaci BAS-1 nebo jeho ligandů.The antibodies of the present invention can be used in diagnostics. As captured or non-neutralizing antibodies, they can bind to BAS-1 without inhibitory ligand binding. As neutralizing antibodies they can be used in competitive binding assays. They can also be used to detect or quantify BAS-1 or its ligands.
ΦΦ 4 » 4 • · · · • Φ φ φ · ΦΦΦ 4 » 4 • · · · • Φ φ φ · Φ
ΦΦΦ • 4 4ΦΦΦ • 4 4
ΦΦ
ΦΦ
ΦΦ
4» ·«/*·4» ·«/*·
Φ»Φ»
Φ · Φ ΦΦ · Φ Φ
Φ Φ Φ ·Φ Φ Φ ·
Φ φ* Φ φφφΦ φ* Φ φφφ
Φ Φ *»· ·· • ΦΦΦΦ Φ *»· ·· • ΦΦΦ
BAS-1 fragmenty mohou být vázány na jiné materiály, zejména polypeptidy, tak být fúzovány····*BAS-1 fragments can be bound to other materials, especially polypeptides, thus being fused*
Φ Φ Φ 4 nebo kovalentně spojeny polypeptidy a použity jako imunogeny. BAS-1 a jeho fragmenty mohofl..* ;Φ Φ Φ 4 or covalently linked polypeptides and used as immunogens. BAS-1 and its fragments mohofl..* ;
Φ být fúzovány nebo kovalentně spojeny na řadu imunogenů, jako jsou hemocyanin kužalnatky^····.Φ be fused or covalently linked to a number of immunogens, such as the hemocyanin of the cogs^····.
• · hovězí sérový albumin, tetanus toxoid atd. Viz Microbiology, Hoeber Medical Division, Harper*’”.• · bovine serum albumin, tetanus toxoid, etc. See Microbiology, Hoeber Medical Division, Harper*'”.
Φ Φ and Row, 1969, Landsteiner (1962) Specificity of Serological Reactions, Dover Publications,·· ” New York, a Williams et al. (1967) Methods in Immunology and Immunochemistry Vol. 1. ·”.Φ Φ and Row, 1969, Landsteiner (1962) Specificity of Serological Reactions, Dover Publications,·· ” New York, and Williams et al. (1967) Methods in Immunology and Immunochemistry Vol. 1. ·”.
• φ Φ Φ• φ Φ Φ
Academie Press, New York, pro popis metod přípravy polyklonálního antiséra. Typická metoda .**.Academie Press, New York, for a description of methods for preparing polyclonal antisera. Typical method .**.
Φ φ Φ se týká hyperimunizace zvířat antigeny. Krev zvířete je poté odebrána krátce potom, co je zopakována imunizace a gama-globulin vyizolován. Nebo mohou být k tvorbě hybridomů odebrány buňky.Φ φ Φ refers to hyperimmunization of animals with antigens. The animal's blood is then collected shortly after the immunization is repeated and the gamma-globulin is isolated. Or cells can be harvested to form hybridomas.
V některých příkladech se požaduje příprava monoklonálních protilátek z jiných savčích hostitelů, jako jsou myši, krysy, opice, lidé atd. Popis metod přípravy monoklonálních protilátek byl nalezen např. v Stites et al. (eds.) Basic and Clinical Immunology (4th ed.), Lange Medical Publications, Los Altos, CA a citace zde uvedené, Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press, Goding (1986) Monoclonal Antibodies: Principles and Practise (2nd ed.) Academie Press, New York, a částečně v Kohler and Milstein (1975) v Nátuře 256: 495 - 497, kde se diskutuje jedna metoda generování monoklonálních protilátek. Krátce shrnuto, tyto metody se týkají injektování zvířat imunogenem. Zvíře je potom obětováno a buňky ze sleziny jsou odebrány a spojeny s myelocyty. Výsledkem je hybridní buňka nebo „hybridom“ schopný reprodukce in vitro. Populace hybridomů je poté sledována izolací jednotlivých klonů, z nichž každý vylučuje k imunogenu jeden druh protilátky. Tímto způsobem získané jednotlivé druhy protilátek jsou produkty stále živých a klonovaných jednotlivých B buněk z imunních zvířat, které vznikly jako odpověď na specifické místo rozpoznané imunogenní látkou.In some examples, it is desired to prepare monoclonal antibodies from other mammalian hosts, such as mice, rats, monkeys, humans, etc. A description of methods for preparing monoclonal antibodies is found, e.g., in Stites et al. (eds.) Basic and Clinical Immunology (4 th ed.), Lange Medical Publications, Los Altos, CA and cited herein, Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press, Goding (1986) Monoclonal Antibodies: Principles and Practice ( 2nd ed.) Academie Press, New York, and in part in Kohler and Milstein (1975) in Nature 256: 495-497, where one method of generating monoclonal antibodies is discussed. Briefly summarized, these methods relate to injecting animals with an immunogen. The animal is then sacrificed and cells from the spleen are collected and combined with myelocytes. The result is a hybrid cell or "hybridoma" capable of in vitro reproduction. The hybridoma population is then monitored by isolating individual clones, each of which secretes one type of antibody to the immunogen. The individual types of antibodies obtained in this way are products of still living and cloned individual B cells from immune animals, which arose in response to a specific site recognized by an immunogenic substance.
Jiné vhodné techniky se týkají in vitro projevu lymfocytů na antigenní polypeptidy nebo na selekci protilátkové knihovny ve fágu nebo podobných vektorech. Viz Huse et al. (1989) „Generation of Large Combinatorial Library of the Immunoglobulin Repertoire in Phage Lambda“, Science 246: 1275 - 1281 a Ward et al. (1989) Nátuře 341: 544 - 546. Polypeptidy a protilátky v předkládaném vynálezu mohou být použity jako modifikované nebo nemodifikované, včetně chimérických nebo humanizovaných protilátek. Polypeptidy a protilátky jsou častěji značeny látkou, buď kovalentně nebo nekovalentně vázanou, která vykazuje detekovatelný signál. Je známé široké spektrum značených látek a konjugačních technik a jsou uvedeny četně ve vědecké i patentové literatuře. Mezi vhodné značené látky patří radionuklidy, enzymy, substráty, kofaktory, inhibitory, fluorescenční skupiny, chemiluminiscenční skupiny, magnetické částice atd. Použití těchto značených látek obsahují tyto U.S. Patenty č. 3,817,837;Other suitable techniques involve the in vitro display of lymphocytes for antigenic polypeptides or the selection of an antibody library in phage or similar vectors. See Huse et al. (1989) "Generation of Large Combinatorial Library of the Immunoglobulin Repertoire in Phage Lambda", Science 246: 1275-1281 and Ward et al. (1989) Nature 341:544-546. The polypeptides and antibodies of the present invention may be used as modified or unmodified, including chimeric or humanized antibodies. Polypeptides and antibodies are more often labeled with a substance, either covalently or non-covalently bound, that exhibits a detectable signal. A wide spectrum of labeled substances and conjugation techniques are known and are mentioned numerously in the scientific and patent literature. Suitable labeled agents include radionuclides, enzymes, substrates, cofactors, inhibitors, fluorescent moieties, chemiluminescent moieties, magnetic particles, etc. Uses of these labeled agents include these U.S. Pat. Patent No. 3,817,837;
«· ·♦ ♦· ··*· ·· ·· • · · · · φ < · * · • · » · · · · · · · · • · ···· · · · · · «·» ··· • · · ···· · · ♦ · ♦ ·♦ ·· ·· ····«· ·♦ ♦· ··*· ·· ·· • · · · · φ < · * · • · » · · · · · · · · • · ···· · · · · · «·» · ·· • · · ···· · · ♦ · ♦ ·♦ ·· ·· ····
3,850,752; 3,939,350; 3,996,345; 4,277,437; 4,275,145 a 4,366,241. Také mohou být····1 • · · produkovány rekombinantní imunoglobuliny, viz Cabilly U.S. Patent č. 4,816,567. *..* I3,850,752; 3,939,350; 3,996,345; 4,277,437; 4,275,145 and 4,366,241. Recombinant immunoglobulins can also be···· 1 • · · produced, see Cabilly US Patent No. 4,816,567. *..* I
Protilátky tohoto vynálezu mohou být rovněž použity k izolaci proteinů afinitní chromatografií.····, • ·The antibodies of this invention can also be used to isolate proteins by affinity chromatography.····, • ·
Kolony mohou být připraveny tehdy, když jsou protilátky navázány na pevný povrch, např. naZ’**.Columns can be prepared when the antibodies are bound to a solid surface, e.g. to Z'**.
• · · částice, jako je agaróza, SEPHADEX apod. Potom co buněčný lyzát projde kolonou, kolona se’* ’* promyje, následuje zvýšení koncentrací mírného denaturujícího činidla, čímž se uvolrjí ·**· • ··· purifikovaný BAS-1 protein. Protilátky také mohou být použity ke sledování exprese knihoven • · · · pro konkrétní expresní produkty. Obvykle jsou protilátky použity v takových případech, kde jsou značeny skupinami, které vazbou na protilátku snadno detekují přítomnost antigenu.• · · particles such as agarose, SEPHADEX, etc. After the cell lysate passes through the column, the column is'* '* washed, followed by increasing concentrations of a mild denaturing agent, releasing the ·**· • ··· purified BAS-1 protein . Antibodies can also be used to monitor the expression of libraries • · · · for specific expression products. Typically, antibodies are used in such cases where they are labeled with groups that easily detect the presence of an antigen by binding to the antibody.
Protilátky získané proti BAS-1 antigenu budou rovněž použity k získání antiidiotypových protilátek. Toto bude prospěšné k detekování nebo stanovení různých imunologických podmínek souvisejících s expresí příslušných antigenů.Antibodies obtained against the BAS-1 antigen will also be used to obtain anti-idiotype antibodies. This will be beneficial to detect or determine various immunological conditions related to the expression of relevant antigens.
VI. Nukleové kyselinyVI. Nucleic acids
Sonda lidského BAS-1 nebo jeho fragmenty budou identifikovány nebo budou izolovány nukleové kyseliny kódující homologní proteiny z jiných druhů nebo jiné podobné proteiny ze stejných nebo jiných druhů.The human BAS-1 probe or fragments thereof will be identified or nucleic acids encoding homologous proteins from other species or other similar proteins from the same or other species will be isolated.
Tento vynález sleduje použití izolované DNA nebo fragmentů kódujících biologicky aktivní příslušný BAS-1 polypeptid. Kromě toho se vynález zabývá izolovanou nebo rekombinovanou DNA, která kóduje biologicky aktivní protein nebo polypeptid, jenž je schopný za vhodných podmínek hybridizovat s DNA sekvencí zde popsanou. Zmíněný biologicky aktivní protein nebo polypeptid může být celý BAS-1 nebo fragment a má aminokyselinovou sekvenci kódovanou nukleovou kyselinou uvedenou v SEQ ID NO: 1. Dále se v tomto vynálezu uvádí použití izolované nebo rekombinované DNA nebo fragmentů, které kódují protein, jenž je homologní k BAS-1 nebo které byly vyizolovány s použitím cDNA kódující lidský BAS-1 jako sondy. Izolovaná DNA může mít vlastní regulátorovou sekvenci na 5' a 3' koncích, např. promotory, zesilovače, polyadenylační signály a další.The present invention contemplates the use of isolated DNA or fragments encoding the biologically active respective BAS-1 polypeptide. In addition, the invention relates to isolated or recombinant DNA that encodes a biologically active protein or polypeptide that is capable of hybridizing under appropriate conditions with the DNA sequence described herein. Said biologically active protein or polypeptide may be the entire BAS-1 or a fragment and has the amino acid sequence encoded by the nucleic acid shown in SEQ ID NO: 1. The present invention further provides the use of isolated or recombinant DNA or fragments that encode a protein that is homologous to to BAS-1 or that were isolated using cDNA encoding human BAS-1 as a probe. Isolated DNA can have its own regulatory sequence at the 5' and 3' ends, eg promoters, enhancers, polyadenylation signals and others.
„Izolovaná“ nukleová kyselina je nukleová kyseliny, např. RNA, DNA nebo smíšený polymer, jenž je zcela oddělen od jiných složek, které se bezprostředně nacházejí v původní sekvenci, např. ribozómy, polymerázy a lemovací genomové sekvence z původních druhů. Vynález zahrnuje nukleovou kyselinu, která je odebrána z prostředí, kde se původně vyskytovala a obsahuje rekombinantní nebo klonované DNA izoláty a chemicky syntetizované analogy nebo ···· ·· ·· • · · · « • · · · «An "isolated" nucleic acid is a nucleic acid, e.g., RNA, DNA, or mixed polymer, that is completely separated from other components immediately adjacent to the original sequence, e.g., ribosomes, polymerases, and flanking genomic sequences from the original species. The invention includes nucleic acid that is taken from the environment where it originally occurred and contains recombinant or cloned DNA isolates and chemically synthesized analogs or ···· ·· ·· • · · · « • · · · «
analogy biologicky syntetizované heterologními systémy. Značně čistá molekula obsahuje····’ J · · · · • 9 · izolované formy molekuly. ·..· íanalogues biologically synthesized by heterologous systems. A substantially pure molecule contains····' J · · · · • 9 · isolated forms of the molecule. ·..· i
Izolovaná nukleová kyseliny bude obecně homogenní molekula, ale v některých případech bude····.An isolated nucleic acid will generally be a homogeneous molecule, but in some cases it will be····.
• · mít menší různorodost. Heterogenita se obvykle nachází na polymerních koncích nebo částech,!*”.• · have less diversity. Heterogeneity is usually found at the polymer ends or parts,!*”.
• · • 9 9 jenž nejsou náročné na požadovanou biologickou funkci nebo aktivitu. ·· „Rekombinantní“ nukleová kyselina je definovaná buď metodou její produkce nebo jejj • · · · strukturou. V citaci pro metodu produkce, např. produkt byl získán způsobem, způsob js .”.• · • 9 9 which are not demanding on the required biological function or activity. ·· A "recombinant" nucleic acid is defined either by the method of its production or by its • · · · structure. In the citation for the method of production, e.g. the product was obtained by the method, the method is .”.
• · · · použitím technik rekombinantní nukleové kyseliny, např. zahrnuje lidský zásah do nukleotidové sekvence. Nebo může být nukleová kyselina vytvořena generováním sekvence obsahující dva spojené fragmenty, které si původně nejsou navzájem blízké, aleje zaznamenáno, že nepřipouští přírodní produkty, např. přírodně se vyskytující mutanty. Tedy, např. produkty vzniklé transformací buněk sjakýmkoli nepřírodně se vyskytujícím vektorem, jako jsou nukleové kyseliny obsahující sekvenci, jenž vznikla s použitím některých syntetických oligonukleotidových metod. To je často provedeno, aby se přemístil kodon s redundantním kodonem kódujícím stejnou nebo konzervativní aminokyselinu, zatímco charakteristicky zavedení nebo přemístění, např. restrikce nebo sekvence rozpoznávacího místa. Je tedy provedeno spojení segmentů nukleové kyseliny požadovaných funkcí, aby byly vytvořeny jednoduché genetické entity obsahující požadovanou kombinaci funkcí, které nebyly v obecně dostupných přírodních formách nalezeny. Restrikční enzymy rozpoznávacích míst jsou často cílem takových umělých manipulací, s výjimkou jiných míst specifických cílů, např. promotory,• · · · using recombinant nucleic acid techniques, eg involving human intervention in the nucleotide sequence. Alternatively, a nucleic acid can be made by generating a sequence containing two linked fragments that are not initially close to each other, but have been noted not to admit natural products, eg, naturally occurring mutants. Thus, eg, products produced by transformation of cells with any non-naturally occurring vector, such as nucleic acids containing a sequence produced using some synthetic oligonucleotide methods. This is often done to relocate a codon with a redundant codon encoding the same or conservative amino acid, while typically introducing or relocating, eg, a restriction or recognition site sequence. Thus, the joining of nucleic acid segments of desired functions is performed to create simple genetic entities containing the desired combination of functions not found in generally available natural forms. Restriction enzymes of recognition sites are often the target of such manipulations, to the exclusion of other sites of specific targets, e.g. promoters,
DNA replikační místa, regulační sekvence, kontrolní sekvence nebo jiné použité znaky mohou být zahrnuty v plánu.DNA replication sites, regulatory sequences, control sequences, or other characters used may be included in the plan.
Podobné pojetí je určeno pro rekombinanty, např. fuze, polypeptid. Konkrétně jsou zahrnuty syntetické nukleové kyseliny, které přebytečným genetickou vybavením kódují podobné polypeptidy na fragmenty těchto antigenů a fuze sekvencí řady různých druhů.A similar concept is intended for recombinants, e.g. fusion, polypeptide. In particular, synthetic nucleic acids that encode similar polypeptides to fragments of these antigens and sequence fusions of a number of different species by redundant genetic engineering are included.
„Fragment“ v souvislosti s nukleovou kyselinou je příbuzný segment o velikosti alespoň 17 nukleotidů, obvykle alespoň 20 nukleotidů, častěji alespoň okolo 23 nukleotidů, běžně alespoň 26 nukleotidů, běžněji alespoň 29 nukleotidů, často alespoň 32 nukleotidů, častěji alespoň okolo 35 nukleotidů, příznačně alespoň 38 nukleotidů, příznačněji alespoň okolo 41 nukleotidů, obvykle alespoň 44 nukleotidů, obvykleji alespoň 47 nukleotidů, lépe alespoň 50 nukleotidů, výhodněji alespoň 53 nukleotidů a zejména vhodné je alespoň 56 a více nukleotidů, např. 60, 75,A "fragment" in the context of a nucleic acid is a cognate segment of at least 17 nucleotides, typically at least 20 nucleotides, more commonly at least about 23 nucleotides, commonly at least 26 nucleotides, more commonly at least 29 nucleotides, often at least 32 nucleotides, more commonly at least about 35 nucleotides, typically at least 38 nucleotides, more typically at least around 41 nucleotides, usually at least 44 nucleotides, more usually at least 47 nucleotides, better at least 50 nucleotides, more preferably at least 53 nucleotides and especially suitable is at least 56 or more nucleotides, e.g. 60, 75,
100, 150, 200, 250, 300 atd.100, 150, 200, 250, 300 etc.
DNA, která kóduje BAS-1 protein bude zejména používaná k identifikaci genů, mRNA a cDNA, které kódují podobné nebo homologní antigeny, stejně jako DNA která kóduje homologní ·· · ·· ···· ·· · ·· ·· ·· ” ··*« • 9 proteiny z různých druhů. Různé BAS-1 proteiny by měly mít podobné sekvence a jsou zde····* • ♦ · popsány. Avšak shodné proteiny, které mají evolučně rozdílný vztah k BAS-1, mohou být..· í *In particular, the DNA that encodes the BAS-1 protein will be used to identify genes, mRNAs and cDNAs that encode similar or homologous antigens, as well as DNA that encodes homologous ·· · ·· ···· ·· · ·· ·· ·· ” ··*« • 9 proteins from different species. The various BAS-1 proteins should have similar sequences and are described here····* • ♦ ·. However, identical proteins that have an evolutionarily different relationship to BAS-1 may be..· í *
snadno izolovány použitím těchto sekvencí, pokud vykazují dostatečnou podobnost. Opičí BAS;····easily isolated using these sequences if they show sufficient similarity. Monkey BAS;····
9 proteiny mají konkrétní význam. Z * ’ ’, • 99 proteins have a specific meaning. From * ’ ’, • 9
9 99 9
Tento vynalez dále popisuje rekombinantní DNA molekuly a fragmenty o DNA sekvenci shodné*’ ** nebo vysoce homologní k izolovaným DNA, jenž jsou zde uvedeny. Zejména sekvence budoij ·”·This invention further describes recombinant DNA molecules and fragments with a DNA sequence identical to or highly homologous to the isolated DNAs disclosed herein. Especially the budoij sequence ·”·
9 99 často použitelně spojené kDNA segmentům, které jsou zodpovědné za kontrolu transkripcej • · · · translace a DNA replikace. Nebo rekombinantní klony získané z genomových sekvencí, tj. obsahující introny, budou používány k transgenním studiím, zahrnující např. transgenní buňky a organismy a ke genovou terapii. Viz např. Goodnow (1992) „Transgenic Animals“ vRoitt (ed.) Encyclopedia of Immunology Academie Press, San Diego, 1502 - 1504, Travis (1992) Science 256: 1392 - 1394, Kuhn et al. (1991) Science 254: 707 - 710, Capecchi (1989) Science 244:9 99 often functionally linked to DNA segments that are responsible for controlling transcription • · · · translation and DNA replication. Or recombinant clones obtained from genomic sequences, i.e. containing introns, will be used for transgenic studies, including, for example, transgenic cells and organisms and for gene therapy. See, e.g., Goodnow (1992) "Transgenic Animals" in Roitt (ed.) Encyclopedia of Immunology Academie Press, San Diego, 1502-1504, Travis (1992) Science 256: 1392-1394, Kuhn et al. (1991) Science 254: 707-710, Capecchi (1989) Science 244:
1288, Robertson (1987) (ed.) Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach IRL Press, Oxford, a Rosenberg (1992) J. Clinical Oncology 10: 180 - 199.1288, Robertson (1987) (ed.) Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach IRL Press, Oxford, and Rosenberg (1992) J. Clinical Oncology 10: 180-199.
Homologní sekvence nukleové kyseliny, které jsou porovnávány, vykazují významnou sekvenční podobnost. Standardy pro homologii v nukleových kyselinách jsou měřeny buď pro homologii všeobecně používanou v oboru porovnáním sekvence nebo jsou založeny na hybridizačních podmínkách. Hybridizační podmínky jsou detailně popsány níže.Homologous nucleic acid sequences that are compared show significant sequence similarity. Standards for homology in nucleic acids are either measured for homology commonly used in the art by sequence comparison or are based on hybridization conditions. Hybridization conditions are detailed below.
Porovnáním sekvence nukleové kyseliny byla zjištěna značná shodnost, což znamená, že porovnávané segmenty nebo jejich komplementární řetězce jsou identické tehdy, když jsou optimálně zarovnány vhodnými inzercemi nebo delecemi nukleotidů, v alespoň 50 % nukleotidů, obecně alespoň 56 %, obyčejně alespoň 62 %, obyčejněji alespoň 65 %, často alespoň 68 %, častěji alespoň 71 %, typicky alespoň 74 %, mnohem typicky alespoň 77 %, obvykle alespoň 80 %, více obvykle alespoň 85 %, lépe alespoň 90 %, výhodněji alespoň 95 až 98 % nebo více a v některých případech víc než 99 % nebo více nukleotidů. Nebo značná shodnost se vyskytuje, pokud segmenty budou za selektivních hybridizačních podmínek hybridizovat s řetězcem nebo jeho komplementárním úsekem, typicky používaná sekvence je vybraná z SEQ ID NO: 1. Typicky může selektivní hybridizace nastat, když je alespoň 55% homologie oblastí alespoň 14 nukleotidů, lépe když je homologie alespoň okolo 65 %, výhodněji alespoň okolo 75 % a nejvýhodněji alespoň okolo 90 %. Viz Kanehisa (1984) Nuc. Acids Res. 12: 203 - 213. Délka porovnávané homologie, jak je popsána, může být delší oblast a v některých případě bude oblast alespoň 17 nukleotidů, obvykle alespoň 20 nukleotidů, více obvykle alespoň 24 nukleotidů, typicky alespoň 28 nukleotidů, mnohem typicky alespoň 40 nukleotidů, výhodně alespoň okolo • · · · · • · · ·· · ·· • · · nukleotidů a mnohem výhodněji alespoň 75 až 100 nebo více nukleotidů, např. 125, 150, 200*····* 250, 300 atd. ‘.JíNucleic acid sequence comparison shows substantial identity, meaning that the compared segments or their complementary strands are identical when optimally aligned by appropriate nucleotide insertions or deletions, in at least 50% of the nucleotides, generally at least 56%, typically at least 62%, more typically at least 65%, often at least 68%, more often at least 71%, typically at least 74%, more typically at least 77%, typically at least 80%, more typically at least 85%, better at least 90%, more preferably at least 95 to 98% or more, and in some cases more than 99% or more nucleotides. Or substantial identity occurs if the segments will hybridize under selective hybridization conditions to the strand or a complementary stretch thereof, typically the sequence used is selected from SEQ ID NO: 1. Typically, selective hybridization can occur when at least 55% homology is to a region of at least 14 nucleotides, better when the homology is at least about 65%, more preferably at least about 75% and most preferably at least about 90%. See Kanehisa (1984) Nuc. Acid Res. 12: 203-213. The length of homology compared as described can be a longer region and in some cases the region will be at least 17 nucleotides, typically at least 20 nucleotides, more typically at least 24 nucleotides, typically at least 28 nucleotides, more typically at least 40 nucleotides, preferably at least about • · · · · • · · ·· · ·· • · · nucleotides and much more preferably at least 75 to 100 or more nucleotides, e.g. 125, 150, 200*····* 250, 300 etc.' .Her
Přísné podmínky, v odkazu na identitu v souvislosti s hybridizací, budou přísné kombinovaný····.Strict conditions, in reference to identity in connection with hybridization, will be strict combined····.
• · podmínky solí, teploty, organických rozpouštědel a jiných parametrů typicky kontrolovaných^’”.• · conditions of salts, temperature, organic solvents and other parameters typically controlled^'”.
• · · při hybridizačních reakcích. Striktní teplotní podmínky budou obvykle zahrnovat teploty přes** ’* °C, obvykle přes 37 °C, typicky přes 45 °C, mnohem typicky přes 55 °C,výhodně přes 65 °(· ·”· ···· a mnohem výhodněji přes 70 °C. Striktní obsah solí bude obyčejně nižší než 500 mM, obvykle .*’.• · · in hybridization reactions. Strict temperature conditions will typically include temperatures above** '*°C, typically above 37°C, typically above 45°C, more typically above 55°C, preferably above 65°(· ·”· ···· and more preferably above 70° C. The strict salt content will usually be less than 500 mM, usually .*'.
• · Φ » nižší než 350 mM, mnohem obvykleji nižší než 200 mM, typicky nižší než 150 mM, vhodněji nižší než 100 mM a mnohem vhodněji nižší než 50 mM. Avšak kombinace parametrů je mnohem důležitější než měření jednotlivých parametrů. Viz např. Wetmur and Davidson (1968)• · Φ » less than 350 mM, more usually less than 200 mM, typically less than 150 mM, more preferably less than 100 mM and more preferably less than 50 mM. However, the combination of parameters is much more important than the measurement of individual parameters. See, e.g., Wetmur and Davidson (1968)
J. Mol.Biol. 31:349 -370.J. Mol. Biol. 31:349 -370.
BAS-1 protein z jiných lidských subjektů může být nakloňován a izolován hybridizací nebo PCR. Alternativní příprava protilátkového přípravku, který vykazuje nižší alelickou specificitu může být použit při klonování exprese. Alelické varianty mohou být charakterizovány použitím např. kombinace redundantní PCR a sekvenační analýzy, např. použitím definovaných primerů tak, že poskytují informace o alelických obměnách v lidské populaci.BAS-1 protein from other human subjects can be cloned and isolated by hybridization or PCR. An alternative preparation of an antibody preparation that exhibits lower allelic specificity can be used in expression cloning. Allelic variants can be characterized using, e.g., a combination of redundant PCR and sequencing analysis, e.g., using defined primers to provide information on allelic variation in the human population.
VII. Příprava BAS-1, mimetikyVII. Preparation of BAS-1, mimetics
DNA, která kóduje BAS-1 antigen nebo jeho fragmenty, se může získat chemickou syntézou, prozkoumáním knihoven cDNA nebo prozkoumáním genových knihoven připravených z širokého výběru buněčných linií nebo vzorků tkání.DNA that encodes the BAS-1 antigen or fragments thereof can be obtained by chemical synthesis, screening of cDNA libraries, or screening of gene libraries prepared from a wide variety of cell lines or tissue samples.
Tato DNA může být exprimována v širokém výběru hostitelských buněk pro syntézu celého antigenu nebo jeho fragmentů, které mohou být dále, např. použity pro generování polyklonálních nebo monoklonálních protilátek, pro vazebné studie, pro konstrukci a expresi modifikovaných molekul, a pro studie zabývající se strukturou a funkcí. Každý antigen nebo jeho fragment může být exprimován v hostitelských buňkách, které jsou transformovány nebo transfektovány s vhodnými expresními vektory. Tyto molekuly mohou být zcela purifikovány, aby neobsahovaly žádné bílkoviny nebo celulární kontaminanty, např. kontaminanty od rekombinantního hostitele, a tak jsou po sloučení s farmaceuticky přijatelnými nosiči a nebo rozpouštědly využity zejména ve farmaceutických prostředcích. Antigen nebo jeho části mohou být exprimovány při fúzích s jinými proteiny.This DNA can be expressed in a wide variety of host cells to synthesize the entire antigen or its fragments, which can be further used, e.g., for the generation of polyclonal or monoclonal antibodies, for binding studies, for the construction and expression of modified molecules, and for structural studies and functions. Each antigen or fragment thereof can be expressed in host cells that are transformed or transfected with appropriate expression vectors. These molecules can be completely purified so that they do not contain any proteins or cellular contaminants, e.g. contaminants from the recombinant host, and thus, after combining with pharmaceutically acceptable carriers and or solvents, they are used especially in pharmaceutical preparations. The antigen or parts thereof can be expressed in fusions with other proteins.
Expresní vektory jsou typicky samoreplikační DNA nebo RNA konstrukty, které obsahují požadovaný antigenový gen nebo jeho fragmenty, obvykle použitelně spojené k vhodným ··· · · · · · · · ···· · · · ···· • · ···· · · · · · ··· ···Expression vectors are typically self-replicating DNA or RNA constructs that contain the desired antigenic gene or fragments thereof, usually operably linked to appropriate ··· · · · · · · ···· · · · ···· • · ··· · · · · · · ··· ···
0 0 ···· · · ·· 0 ·· ·· ·· ·*·♦·· • · geneticky kontrolovaným prvkům, které lze ve vhodné hostitelské buňce poznat. Tyto kontrolní···»* J · 0 · 0 0 0 0 prvky jsou ve vhodném hostiteli schopné účinné exprese. Specifické typy kontrolních prvků..· !0 0 ···· · · ·· 0 ·· ·· ·· ·*·♦·· • · genetically controlled elements that can be recognized in a suitable host cell. These control···»* J · 0 · 0 0 0 0 elements are capable of efficient expression in a suitable host. Specific types of control elements..· !
nutných pro účinnou expresi závisí na typu použité hostitelské buňky. Obyčejně mohou····required for efficient expression depends on the type of host cell used. They can usually
0 geneticky kontrolované prvky obsahovat prokaryotický promotorový systém nebo eukaryotickýZ”*.0 genetically controlled elements contain a prokaryotic promoter system or eukaryoticZ”*.
0 0 promotorový expresní kontrolní systém a typicky zahrnují transkripční promotor, volitelný·* ** operátor pro kontrolu počátku transkripce, transkripční zesilovače pro zvýšení hladiny expresy ·’’· 0000 mRNA, sekvence kódující vhodné vazebné místo ribozomu a sekvence zakončující transkripci a .·*♦ 0000 translaci. Expresní vektory také obvykle obsahují počátek replikace, což umožňuje, aby se vektor replikoval nezávisle na hostitelské buňce.0 0 promoter expression control system and typically include a transcriptional promoter, an optional·* ** operator to control transcription initiation, transcriptional enhancers to increase the expression level of ·''· 0000 mRNA, a sequence encoding an appropriate ribosome binding site, and a transcription termination sequence and .·* ♦ 0000 translation. Expression vectors also usually contain an origin of replication, which allows the vector to replicate independently of the host cell.
Vektory v tomto vynálezu obsahují DNA, která kóduje lidský BAS-1 antigen nebo jeho fragment kódující biologicky aktivní polypeptid. DNA může být pod kontrolou virového promotoru a může kódovat selekční vzor. Tento vynález dále obsahuje použití takových expresních vektorů, které jsou schopné exprese eukaryotické cDNA kódující lidský BAS-1 antigen v prokaryotickém nebo eukaryotickém hostiteli, kde je vektor kompatibilní s hostitelem a kde je eukaryotická cDNA kódující antigen vložena do vektoru tak, že růst hostitele obsahující vektor exprimuje příslušnou cDNA. Obvykle jsou expresní vektory navrženy pro stabilní replikaci ve svých hostitelských buňkách nebo pro amplifikaci, aby došlo ke zvýšení celkového počtu kopií požadovaného genu na buňku. Není vždy nutné požadovat, aby se expresní vektor replikoval v hostitelské buňce, např. je možné provést přechodnou expresi antigenů nebo jeho fragmentů v různých hostitelích pomocí vektorů, které neobsahují počátek replikace, který hostitelská buňka rozpozná. Je také možné použít vektory, které způsobují integraci lidského BAS-1 genu nebo jeho fragmentů do hostitelské DNA pomocí rekombinace.The vectors of the present invention contain DNA that encodes a human BAS-1 antigen or a fragment thereof encoding a biologically active polypeptide. The DNA may be under the control of a viral promoter and may encode a selection pattern. The present invention further includes the use of such expression vectors that are capable of expressing a eukaryotic cDNA encoding a human BAS-1 antigen in a prokaryotic or eukaryotic host, wherein the vector is compatible with the host and wherein the eukaryotic cDNA encoding the antigen is inserted into the vector such that the growth of the host containing the vector expresses the respective cDNA. Typically, expression vectors are designed for stable replication in their host cells or for amplification to increase the total number of copies of the desired gene per cell. It is not always necessary to require the expression vector to replicate in the host cell, eg it is possible to transiently express antigens or fragments thereof in different hosts using vectors that do not contain an origin of replication recognized by the host cell. It is also possible to use vectors that cause integration of the human BAS-1 gene or fragments thereof into host DNA by recombination.
Vektory, jenž jsou zde používány, zahrnují plazmidy, viry, bakteriofágy, integrovatelné DNA fragmenty a jiné, které umožňují integraci DNA fragmentů do genomu hostitele. Expresní vektory jsou specializované vektory, které obsahují prvky genetické kontroly, které způsobí expresi použitelně spojených genů. Plazmidy jsou nejvíce používanou formou vektorů, ale všechny jiné formy vektorů, které poskytují ekvivalentní funkce a které jsou nebo se stávají v oboru známé, jsou vhodné proto, aby se zde použily. Viz např. Powels et al. (1985 and Supplements) Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, N.Y. a Rodriquez et al. (1988) (eds.) Vectors: A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses, Buttersworth, Boston,Vectors used herein include plasmids, viruses, bacteriophages, integrable DNA fragments, and others that allow the DNA fragments to be integrated into the host genome. Expression vectors are specialized vectors that contain genetic control elements that cause the expression of usefully linked genes. Plasmids are the most commonly used form of vectors, but all other forms of vectors that provide equivalent functionality and that are or become known in the art are suitable for use herein. See, for example, Powels et al. (1985 and Supplements) Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, N.Y. and Rodriquez et al. (1988) (eds.) Vectors: A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses, Buttersworth, Boston,
MA.MA.
Transformované buňky jsou buňky, lépe savčí, které byly transformovány nebo transfektovány s lidskými BAS-1 vektory vytvořenými pomocí technik rekombinace DNA. Transformované hostitelské buňky obvykle exprimují antigen nebo jeho fragmenty, ale za účelem klonování,Transformed cells are cells, preferably mammalian, that have been transformed or transfected with human BAS-1 vectors created using recombinant DNA techniques. Transformed host cells usually express the antigen or its fragments, but for the purpose of cloning,
4 4 4 ·· 4 4 • · 4 4 4 4 * · 4 4 4 44 4 4 ·· 4 4 • · 4 4 4 4 * · 4 4 4 4
44 444 44444,444,444
4 4 4 4 ·♦ ·· ·· 44»· amplifikace a manipulace DNA nemusí exprimovat protein. Tento vynález dále obsahuje····’4 4 4 4 ·♦ ·· ·· 44»· DNA amplification and manipulation may not express protein. This invention further includes
4 4 kultivaci transformovaných buněk v živném médiu, tak umožňují akumulaci proteinu v kultuře*.·* í4 4 cultivation of transformed cells in a nutrient medium, thus enabling the accumulation of protein in the culture*.·* í
Protein může být získán buď z kultury nebo z kultivačního média. .··*’.The protein can be obtained either from the culture or from the culture medium. .··*'.
44
Za účelem tohoto vynálezu jsou DNA sekvence použitelně spojeny, pokud jsou funkčně””.For the purpose of this invention, DNA sequences are operably linked if they are "operably".
4 4 navzájem podobné. Například DNA je pro presekvenci nebo sekrekční váčky použitelně spojena** ** k polypeptidů, jestliže je exprimován jako preprotein nebo se podílí na zapojení polypeptidů n$ ·”;4 4 similar to each other. For example, DNA is usefully linked** ** to polypeptides for presequencing or secretion vesicles if it is expressed as a preprotein or participates in the assembly of polypeptides n$ ·”;
4444 buněčnou membránu nebo v sekreci polypeptidů. Promotor je použitelně připojen ke kódující ·**.4444 cell membrane or in the secretion of polypeptides. The promoter is operably linked to the coding ·**.
44 4 sekvenci, jestliže kontroluje transkripci polypeptidů. Vazebné místo ribozomu je použitelně připojeno ke kódující sekvenci, jestliže je umístěn tak, aby mohla proběhnout translace. Obvykle použitelně připojen znamená sousedící, avšak ve čtecím rámci nejsou určité genetické prvky, jako jsou represorové geny, přilehle spojené ale stále vázány k operátorovým sekvencím, které zapínají kontrolovanou expresi.44 4 sequence if it controls the transcription of polypeptides. A ribosome binding site is operably linked to a coding sequence if it is positioned so that translation can occur. Usually, as used, contiguous means contiguous, but in the reading frame certain genetic elements, such as repressor genes, are not contiguous but still bound to operator sequences that turn on controlled expression.
Vhodnými hostitelskými buňkami jsou prokaryota, nižší a vyšší eukaryota. Mezi prokaryota jsou zahrnuty oboje grampozitivní i gramnegativní organismy, např. E. coli a B. subtilis. Nižší eukaryota jsou kvasinky, např. S. cerevisiae a Pichia a druhy rodu Dictyostelium. Vyšší eukaryota zahrnují jmenované tkáňové buněčné kultury z živočišných buněk, jak původu nesavěího, např. buňky hmyzu, ptáků, tak savčí, např. lidské, opičí a krys.Suitable host cells are prokaryotes, lower and higher eukaryotes. Prokaryotes include both gram-positive and gram-negative organisms, such as E. coli and B. subtilis. Lower eukaryotes are yeasts, such as S. cerevisiae and Pichia and species of the genus Dictyostelium. Higher eukaryotes include named tissue cell cultures from animal cells, both of non-mammalian origin, e.g., insect, bird, and mammalian, e.g., human, monkey, and rat origin.
Prokaryotické systémy hostitelských vektorů obsahují široké spektrum vektorů mnoha různých druhů. Jak je zde použito, E. coli a její vektory budou obecně použity, aby obsahovaly ekvivalentní vektory používané v jiných prokaryotách. Reprezentativním vektorem pro amplifikaci DNA je pBR322 nebo mnoho jeho derivátů. Vektory, které mohou být použité k expresi lidských BAS-1 antigenů nebo jejich fragmentů, zahrnují, ale nejsou například omezené na vektory, jenž obsahují lac promotor (pUC druhy), trp promotor (pBR322-trp), Ipp promotor (pIN druhy), λ-ρΡ nebo pR promotory (pOTS) nebo hybridní promotory, jako je ptač (pDR540).Prokaryotic host vector systems contain a wide spectrum of vectors of many different species. As used herein, E. coli and its vectors will generally be used to include equivalent vectors used in other prokaryotes. A representative vector for DNA amplification is pBR322 or many of its derivatives. Vectors that can be used to express human BAS-1 antigens or fragments thereof include, but are not limited to, for example, vectors that contain the lac promoter (pUC species), the trp promoter (pBR322-trp), the Ipp promoter (pIN species), λ-ρΡ or pR promoters (pOTS) or hybrid promoters such as bird (pDR540).
Viz Brosius et al. (1988) „Expression Vectors Employing Lambda-, trp-, lac-, and IPP-derived Promoters“ v Rodriguez and Denhardt (eds.) Vectors: A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses, Buttersworth, Boston, kapitola 10, str. 205 až 236.See Brosius et al. (1988) "Expression Vectors Employing Lambda-, trp-, lac-, and IPP-derived Promoters" in Rodriguez and Denhardt (eds.) Vectors: A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses, Buttersworth, Boston, Chapter 10, p .205 to 236.
Nižší eukaryota, např. kvasinky a Dictyostelium, mohou být transformovány s lidským BAS-1 antigenem obsahujícím vektory. Cílem tohoto vynálezu je, aby nejběžnějším hostitelem nižších eukaryot byla kvasinka Saccharomyces cerevisae. Ta bude použita obecně představovat nižší eukaryota, ačkoli je rovněž k dispozici řada jiných kmenů a druhů. Kvasničné vektory se převážně skládají z replikačního počátku (pokud možno integrativního typu), selekčního genu, promotoru, DNA kódující požadovaný protein nebo jeho fragment a sekvence pro terminaci translace, polyadenylaci a terminaci transkripce. Vhodnými expresními vektory kvasinek jsouLower eukaryotes such as yeast and Dictyostelium can be transformed with human BAS-1 antigen containing vectors. The aim of this invention is that the most common host of lower eukaryotes is the yeast Saccharomyces cerevisae. This will be used generally to represent the lower eukaryotes, although a number of other phyla and species are also available. Yeast vectors mainly consist of an origin of replication (preferably integrative type), a selection gene, a promoter, DNA encoding the desired protein or its fragment, and sequences for translation termination, polyadenylation and transcription termination. Suitable yeast expression vectors are
9191
9 9 • 9 99 9 • 9 9
9 9 9 49 9 9 4
99999999
9999 9 9 9 9 99999 9 9 9 9 9
99
99
99999999
9999 9 99999 9 9
99
99 jak konstitutivní promotory, tak 3-fosfoglycerátkinasa a řada jiných promotorů glykolytickýcfí enzymů nebo jak inducibilní promotory, tak promotor alkoholdehydrogenasy 2 nebó metalothioninový promotor. Vhodné promotory obsahují deriváty následujících typů, samoreplikační nízkokopiový (jako jsou druhy YRp), samoreplikační vysokokopiový (jako jsou99 both constitutive promoters and 3-phosphoglycerate kinase and a number of other glycolytic enzyme promoters or both inducible promoters and the alcohol dehydrogenase 2 promoter or the metallothionein promoter. Suitable promoters include derivatives of the following types, self-replicating low-copy (such as YRp species), self-replicating high-copy (such as
YEp), integrativní typy (jako jsou Yip druhy) nebo minichromozomy (jako jsou YCp druhy). Vhodnými hostitelskými buňkami k expresi funkčně aktivního lidského BAS-1 antigenovéhcj proteinu jsou tkáňové buněčné kultury vyšších eukaryot. V podstatě funguje mnoho tkáňových buněčných kultur vyšších eukaryot, např. expresní systémy hmyzího baculoviru, ať jsou z obratlovců nebo bezobratlých. Avšak v kotranslačních i posttranslačních postupech se dává přednost savčím buňkám.YEp), integrative types (such as Yip species) or minichromosomes (such as YCp species). Suitable host cells for the expression of functionally active human BAS-1 antigen hcj protein are tissue cell cultures of higher eukaryotes. In essence, many tissue cell cultures of higher eukaryotes, e.g., insect baculovirus expression systems, whether from vertebrates or invertebrates, work. However, in both co-translational and post-translational procedures, mammalian cells are preferred.
Tranformace nebo tranfekce a propagace takových buněk se stala rutinní metodou. Příkladem používaných buněčných linií jsou HeLa buňky, Chinese harmster ovary (CHO) buněčná linie, baby rat kidney (BRK) buněčná linie, hmyzí buněčná linie, ptačí buněčná linie a myší buněčná linie (COS). Expresní vektory pro takové buněčné linie obvykle obsahují počátek replikace, promotor, iniciační místo translace, místo sestřihu RNA (pokud se používá genomová DNA), polyadenylační místo a terminační místo trankripce. Tyto vektory rovněž obvykle obsahují selekční nebo amplifikační gen. Vhodnými expresními vektory mohou být plasmidy, viry nebo retro viry nesoucí promotory získané, např. z takových zdrojů, jako jsou adenoviry, SV40, parvoviry, virus vakcíny nebo cytomegalovirus. Reprezentativním příkladem vhodných expresních vektorů jsou pCDNAl, pCD viz Okayama et al. (1985) Mol. Cell Biol. 5: 1136 1142, pMClneo Poly-A viz Thomas et al. (1987) Cell 51: 503 - 512 a vektor baculoviru, jako je pAC 373 nebo pAC 610.Transformation or transfection and propagation of such cells has become a routine method. Examples of cell lines used are HeLa cells, Chinese hamster ovary (CHO) cell line, baby rat kidney (BRK) cell line, insect cell line, bird cell line and mouse cell line (COS). Expression vectors for such cell lines typically contain an origin of replication, a promoter, a translation initiation site, an RNA splice site (if genomic DNA is used), a polyadenylation site, and a transcription termination site. These vectors also usually contain a selection or amplification gene. Suitable expression vectors may be plasmids, viruses or retroviruses carrying promoters obtained, for example, from such sources as adenoviruses, SV40, parvoviruses, vaccinia virus or cytomegalovirus. A representative example of suitable expression vectors are pCDNAl, pCD see Okayama et al. (1985) Mol. Cell Biol. 5: 1136 1142, pMClneo Poly-A see Thomas et al. (1987) Cell 51: 503-512 and a baculovirus vector such as pAC 373 or pAC 610.
Často se požaduje, aby se polypeptid lidského BAS-1 antigenu exprimoval v systému, který dává specifický nebo definovaný glykosylační vzor. V takovém případě bude obvyklý vzor přirozeně opatřen expresním systémem. Avšak vzor bude modifikovatelný tak, že na polypeptid, např. neglykosylovanou formu, působí vhodné glykosylační proteiny uvedené v heterologním expresním systému. Například geny antigenu BAS-1 mohou být kotransformovány jedním nebo více geny kódujícími savčí nebo jiné glykosylační enzymy. Použitím tohoto přístupu budou určité savčí glykosylační vzory dosažitelné nebo přiblíženy v prokaryotických nebo jiných buňkách.It is often desired that the human BAS-1 antigen polypeptide be expressed in a system that gives a specific or defined glycosylation pattern. In such a case, the usual pattern will naturally be equipped with an express system. However, the pattern will be modifiable so that the polypeptide, e.g. non-glycosylated form, is acted upon by suitable glycosylation proteins indicated in the heterologous expression system. For example, BAS-1 antigen genes can be cotransformed with one or more genes encoding mammalian or other glycosylation enzymes. Using this approach, certain mammalian glycosylation patterns will be achievable or approximated in prokaryotic or other cells.
BAS-1 antigen by mohl být rovněž produkován ve formě, kterou je vázaný fosfatidylinositol (PI), ale může být odstraněn z membrán použitím enzymu štěpícího fosfatidylinositol, např. fosfatidylinositol fosfolipasa-C. Tak se uvoní antigen v biologicky aktivní formě a umožní purifikaci standarními biochemickými metodami. Viz např. Low (1989) Biochim. Biophys. ActaBAS-1 antigen could also be produced in a phosphatidylinositol (PI)-bound form, but can be removed from membranes using a phosphatidylinositol-cleaving enzyme, eg, phosphatidylinositol phospholipase-C. Thus, the antigen is released in a biologically active form and enables purification by standard biochemical methods. See, e.g., Low (1989) Biochim. Biophys. Acta
99
99
9999 999999 99
99
99
9 9 9 • •9 99 99*9 99 449 9 9 • •9 99 99*9 99 44
9Q 999 99999999Q 999 9999999
9 9 9 99 9 99999 9 9 99 9 9999
9 9999 999 99 999 9999 9999 999 99 999 999
999 9999 9 9999 9999 9 9
9 99 99 99 999 99 99 99 99
988: 427 - 454, Tse et al. (1985) Science 230: 1003 - 1008 a Brunner et al. (1991) J. Cell Bioí··;;’ • 9 4988: 427-454, Tse et al. (1985) Science 230: 1003-1008 and Brunner et al. (1991) J. Cell Bioí··;;' • 9 4
114: 1275 - 1283. Nebo mohou být sestrojeny purifikované segmenty v sekvenci, např. na N^··* · konci nebo C-konci, aby pomáhaly při purifikaci nebo detekci proteinového produktu. Τρ····.114: 1275 - 1283. Alternatively, purified segments can be constructed in the sequence, eg, at the N^ ··* · terminus or C-terminus to aid in the purification or detection of the protein product. Тр····.
• 9 znamená, že odstranění takových segmentů může být rovněž sestrojeno, např. proteázou štěpíc.!**’*, místa. *..*4• 9 means that removal of such segments can also be engineered, e.g., by protease cleaves.!**'*, sites. *..*4
Nyní je známa tato celá sekvence, a tak lidské BAS-1 antigeny, fragmenty nebo jejich derivátjThis entire sequence is now known, and thus human BAS-1 antigens, fragments or their derivativesj
9444 mohou být připraveny konvenčními postupy pro syntézu peptidů. Zahrnují rovněž postupy, jak9444 can be prepared by conventional procedures for peptide synthesis. They also include how to
94 9 jsou popsány v Stewart and Young (1984) Solid Phase peptide Synthesis, Pierce Chemical Co., Rockford, IL, Bodanszky and Bodanszky (1984) The Practice of Peptide Synthesis, SpringerVerlag, New York a Bodanszky (1984) The Principles of peptide Synthesis, Springer-Verlag,94 9 are described in Stewart and Young (1984) Solid Phase peptide Synthesis, Pierce Chemical Co., Rockford, IL, Bodanszky and Bodanszky (1984) The Practice of Peptide Synthesis, SpringerVerlag, New York and Bodanszky (1984) The Principles of peptide Synthesis, Springer-Verlag,
New York. Například mohou být použity azidový způsob, chlorovodíkový způsob, způsob kyseliny anhydridové, míchaný anhydridový způsob, způsob aktivního esteru (např. pnitrofenylester, N-hydroxysukcinimidester nebo kyanomethylester), karboxyimidazolový způsob, oxidačně-redukční způsob nebo způsob dicyklohexylkarbodiimid (DCCD)/aditivní. Pevná fáze a roztok syntéz jsou pro dříve zmíněné způsoby aplikovatelné.New York. For example, the azide method, the hydrochloric acid method, the anhydride method, the mixed anhydride method, the active ester method (eg, pnitrophenyl ester, N-hydroxysuccinimide ester, or cyanomethyl ester), the carboxyimidazole method, the redox method, or the dicyclohexylcarbodiimide (DCCD)/additive method may be used. Solid phase and solution syntheses are applicable for the previously mentioned methods.
Lidské BAS-1 antigeny, fragmenty nebo deriváty jsou vhodně připravené v souladu svýše uvedenými způsoby, které jsou typicky používané v syntéze peptidů, obecně kterýmkoli tzv. postupným způsobem, který zahrnuje kondenzaci aminokyselin na koncové aminokyselině v sekvenci nebo párováním peptidových fragmentů na koncové aminokyselině. Aminoskupiny, které nejsou používány k párování, musí být chráněny, aby nedošlo k párování v nesprávné oblasti.Human BAS-1 antigens, fragments or derivatives are conveniently prepared in accordance with the above-mentioned methods that are typically used in peptide synthesis, generally by any so-called stepwise method that involves the condensation of amino acids at the terminal amino acid in a sequence or by the pairing of peptide fragments at the terminal amino acid. Amino groups not used for pairing must be protected to avoid pairing in the wrong region.
Jestliže je zvolena syntéza v pevné fázi, C-konec aminokyseliny je navázán na nerozpustný nosič nebo podklad svou karboxylovou skupinou. Nerozpustný nosič není zvláště limitován pokud má vazebnou kapacitu k reaktivní karboxylové skupině. Příkladem takových nerozpustných nosičů jsou halo methylové pryskyřice, jako je chlormethylová pryskyřice nebo brommethylová pryskyřice, hydroxymethylové pryskyřice, fenolové pryskyřice, terč. alkyloxykarbonylhydrazidované pryskyřice apod.If solid-phase synthesis is chosen, the C-terminus of the amino acid is bound to an insoluble carrier or support by its carboxyl group. The insoluble carrier is not particularly limited as long as it has a binding capacity to a reactive carboxyl group. Examples of such insoluble carriers are halo methyl resins such as chloromethyl resin or bromomethyl resin, hydroxymethyl resins, phenolic resins, tar. alkyloxycarbonylhydrazide resins, etc.
Chráněná aminoskupina aminokyseliny je vázána v sekvenci kondenzací své aktivované karboxylové skupiny a reaktivní aminoskupiny dříve vzniklého peptidu nebo řetězce, aby se postupně syntetizoval peptid. Po syntéze kompletní sekvence se peptid odtrhne od nerozpustného nosiče a vznikne samotný peptid. Získání pevné fáze obecně popisuje Merrifield et al. (1963) v J. Am. Chem. Soc. 85: 2149 - 2156.The protected amino group of an amino acid is bound in sequence by condensing its activated carboxyl group and the reactive amino group of a previously formed peptide or chain to sequentially synthesize the peptide. After the synthesis of the complete sequence, the peptide is detached from the insoluble carrier and the peptide itself is formed. Solid phase recovery is generally described by Merrifield et al. (1963) in J. Am. Chem. Soc. 85: 2149–2156.
Připravovaný antigen a jeho fragmenty mohou být izolovány a purifikovány z reakční směsi separací peptidů, např. extrakcí, precipitací, elektroforézou a řadou různých chromatografií apod.The prepared antigen and its fragments can be isolated and purified from the reaction mixture by separation of peptides, e.g. extraction, precipitation, electrophoresis and a number of different chromatographies, etc.
0000
0 0 ·0 0 ·
0 0 00 0 0
000 000000,000
0 ·· ·· 0··0 ·· 00 ·· ·· 0··0 ·· 0
0 00 0
0 0 00 0 0
000000000000
0 0 ·0 0 ·
l* 0090l* 0090
0 00 0
Lidské BAS-1 antigeny v tomto vynálezu mohou být získány v různých stupních čistoty····* • · * v závislosti na požadovaném použití. Purifikace může být dosaženo zde objevenými technikami..* í proteinové purifikace nebo použitím zde popsaných protilátek v aminoabsorpční afinitnj····,The human BAS-1 antigens of the present invention can be obtained in various degrees of purity ····* • · * depending on the desired use. Purification can be achieved by the techniques disclosed herein..* í protein purification or by using the antibodies described herein in aminoabsorption affinity····,
0 chromatografii. Tato aminoabsorpční afinitní chromatografie je provedena zaprvé vazbou!***.0 chromatography. This aminoabsorption affinity chromatography is performed first by binding!***.
0 9 protilátky na pevný podklad a poté spojením navázané protilátky s rozpustnými lyzáty malé’* ” buňky plícních rakovinných buněk, lyzáty jiných buněk exprimující BAS-1 antigeny nebo lyzáty0 9 antibodies to a solid support and then combining the bound antibodies with soluble lysates of small'* ” lung cancer cells, lysates of other cells expressing BAS-1 antigens or lysates
0000 nebo supernatanty buněk produkujících BAS-1 antigeny jako výsledek DNA technik, viz níže. ·0000 or supernatants of cells producing BAS-1 antigens as a result of DNA techniques, see below. ·
VIII. PoužitíVIII. Use
Předkládaný vynález poskytuje látky, které najdou použití v diagnostice, jak je zde někde popsáno, např. obecný popis vývojových a fyziologických abnormalit nebo v níže uvedeném popisu souprav pro diagnostiku.The present invention provides agents that find use in diagnostics as described elsewhere herein, eg, the general description of developmental and physiological abnormalities or in the description of diagnostic kits below.
Tento vynález rovněž poskytuje látky s důležitým terapeutickým významem. Lidský BAS-1 (přírodně se vyskytující nebo rekombinant), jeho fragmenty a protilátky spolu s identifikovanými látkami, které mají vazebnou aktivitu k lidskému BAS-1, by mohly být použity k léčení stavu spojeného s abnormální B buněčnou odpovědí, zahrnující abnormální proliferaci, např. rakovinné stavy nebo degenerativní stavy. Abnormální proliferace, regenerace, degenerace a atrofie mohou být modulovány vhodnou terapeutickou léčbou používající složky, jenž jsou zde poskytnuty. Například nemoc nebo potíže spojené s abnormální expresí nebo abnormálním působením BAS-1 by mohly být pravděpodobně cílem agonistů nebo antagonistů antigenu. BAS-1 pravděpodobně hraje roli v aktivaci nebo regulaci B buněk, které ovlivňují imunologické odpovědi, např. autoimunní potíže nebo alergické odpovědi.This invention also provides substances of important therapeutic value. Human BAS-1 (naturally occurring or recombinant), fragments and antibodies thereof, together with identified agents having binding activity to human BAS-1, could be used to treat a condition associated with an abnormal B cell response, including abnormal proliferation, e.g. .cancer conditions or degenerative conditions. Abnormal proliferation, regeneration, degeneration and atrophy can be modulated by appropriate therapeutic treatment using the components provided herein. For example, a disease or disorder associated with abnormal expression or abnormal action of BAS-1 could potentially be targeted by agonists or antagonists of the antigen. BAS-1 likely plays a role in the activation or regulation of B cells that influence immunological responses, eg, autoimmune disorders or allergic responses.
Mimo jiné, interakce BAS-1:BAS-1 vazebný partner může být zahrnována v T:B buněčné interakci, která připouští aktivaci, proliferaci a nebo diferenciaci prostých B buněk, jak bylo pozorováno v hyper-IgM syndromu. Tudíž léčení může způsobovat druh interference s BAS1:BAS-1 vazebným partnerem signální trandukci. Blokace signálu může být způsobena, např. rozpustným BAS-1 nebo protilátkou k BAS-1.Among other things, the BAS-1:BAS-1 binding partner interaction may be involved in the T:B cell interaction that allows activation, proliferation and/or differentiation of naïve B cells, as observed in the hyper-IgM syndrome. Thus, the treatment may cause some kind of interference with the BAS1:BAS-1 binding partner of signal transduction. Blockage of the signal can be caused by, for example, soluble BAS-1 or an antibody to BAS-1.
Interakce BAS-1:BAS-1 vazebného partneru může být rovněž vyžadována v iniciaci a nebo regulaci silné proliferace B buněčných blastů a centroblastů v tmavé oblasti zárodečných center. Viz např. Banchereau and Rosset (1992) Adv. Immunol. 125: 868 - 877. Interakce buněčného povrchu zahrnuté v signálu, aby iniciovali a nebo regulovali somatický mutační proces Ig, mohou rovněž vyžadovat BAS-1 a mohou být regulovány agonistickými nebo antagonistickými zákroky.The BAS-1:BAS-1 binding partner interaction may also be required in the initiation and/or regulation of robust proliferation of B cell blasts and centroblasts in the dark region of the germinal centers. See, e.g., Banchereau and Rosset (1992) Adv. Immunol. 125: 868-877. Cell surface interactions involved in signaling to initiate and/or regulate the somatic Ig mutational process may also require BAS-1 and may be regulated by agonistic or antagonistic interventions.
φφ φφφφφφ φφφφ
ΦΦ φ φφ φφ φ φ φ φ φ φ φ φφφφ φφ « Φφφφ φ φ φφφφ φφφ φ · ··· φφφ φφφ φφφφ · · φφ φ φ* ·· ·· ·· φφφφ • φΦΦ φ φφ φφ φ φ φ φ φ φ φφφφ φφ « Φφφφφ φ φ φφφφ φφφ φ · ··· φφφ φφφ φφφφ · · φφ φ φ* ·· ·· ·· φφφφ • φ
Jiné abnormální vývojové stavy jsou známy v každém buněčné typu, analýzou Nothernova··”’Other abnormal developmental states are known in each cell type, by analysis of Nothernov··”'
Φ · fr přenosu dokazují, že mají BAS-1 mRNA. Viz Berkow (ed.) The Merck Manual Diagnosis an3··* íΦ · fr transfer prove that they have BAS-1 mRNA. See Berkow (ed.) The Merck Manual Diagnosis an3··* í
ΦΦ
Therapy, Merck & Co., Rahway N.J. a Thorn et al. Harrison's Principles of Internal Medicín^····.Therapy, Merck & Co., Rahway N.J. and Thorne et al. Harrison's Principles of Internal Medicine^····.
Φ ·Φ
McGraw-Hill, N.Y. Například terapeutické imunosuprese může být dosaženo blokací T·***·McGraw-Hill, N.Y. For example, therapeutic immunosuppression can be achieved by blocking T·***·
Φ Φ « lymfocytu a interakcí B lymfocytu touto molekulou. Představuje důležitou terapii pro kontrolu*’ ” autoimunních nemocí a odmítnutí štěpu během transplantace. Nebo anti-B buněčné tumoroví φφφφ terapie může být dosaženo blokací růstu a pozůstávajících vlivů BAS-1 na B buňky. Blokacf ·”;Φ Φ « of the lymphocyte and the interaction of the B lymphocyte with this molecule. It represents an important therapy for the control*' ” of autoimmune diseases and graft rejection during transplantation. Alternatively, anti-B cell tumor φφφφ therapy may be achieved by blocking the growth and residual effects of BAS-1 on B cells. Blokacf ·”;
ΦΦΦΦ může být ovlivněna složením blokujících vazeb, např. neutralizačními protilátkami nebo molekulami, které interferují s interakcí BAS-1 s protireceptorem. Rozpustný BAS-1 může blokovat protireceptorovou vazbu.ΦΦΦΦ can be affected by the composition of blocking bonds, eg, neutralizing antibodies or molecules that interfere with the interaction of BAS-1 with the counterreceptor. Soluble BAS-1 can block anti-receptor binding.
Rekombinantní BAS-1 nebo BAS-1 protilátky mohou být purifikovány a poté zavedeny do pacienta. Tyto látky mohou být pro terapeutické účely kombinovány s dalšími aktivními složkami, např. konvenčními farmaceuticky přijatelnými nosiči nebo rozpouštědly, např. imunogenní adjuvans spolu s fyziologicky neškodnými stabilizátory a masťovými základy. Tyto kombinace mohou být sterilizovány filtrací a nadávkovány do dávkovačích lahviček lyofdizací nebo uskladněny ve formě stabilizovaného vodného roztoku. Tento vynález rovněž popisuje použití protilátek nebo jejich vazebných fragmentů, které nejsou doplněny vazbou.Recombinant BAS-1 or BAS-1 antibodies can be purified and then introduced into the patient. These substances can be combined for therapeutic purposes with other active ingredients, e.g., conventional pharmaceutically acceptable carriers or solvents, e.g., an immunogenic adjuvant together with physiologically harmless stabilizers and ointment bases. These combinations can be sterilized by filtration and dispensed into dosing vials by lyophilization or stored in the form of a stabilized aqueous solution. This invention also describes the use of antibodies or binding fragments thereof that are not supplemented with binding.
Prozkoumání léku používající BAS-1 nebo jeho fragmenty může být provedeno tak, aby se identifikovaly sloučeniny s vazebnou afinitou k BAS-1 včetně izolace spojených složek. Poté mohou být využity další biologické stanovení k určení, zda má látka skutečnou stimulační aktivitu a tudíž způsobuje blokaci a neboje antagonista, tedy blokuje aktivitu ligandu. Stejně tak může látka s vlastní stimulační aktivitou aktivovat antigen a je tedy agonista tím, že simuluje aktivitu BAS-1. Tento vynález dále popisuje terapeutické využití protilátek proti BAS-1 jako antagonistům. Toto zjištění by mohlo být zejména.použito s dalšími druhy BAS-1.Drug screening using BAS-1 or fragments thereof can be performed to identify compounds with binding affinity for BAS-1 including isolation of associated components. Further biological assays can then be used to determine whether the substance has true stimulatory activity and thus causes blockade and is not antagonistic, thus blocking the activity of the ligand. Likewise, a substance with intrinsic stimulatory activity can activate an antigen and is therefore an agonist by simulating BAS-1 activity. This invention further describes the therapeutic use of BAS-1 antibodies as antagonists. In particular, this finding could be used with other BAS-1 species.
Množství látek nezbytných k účinné terapii bude záviset na mnoha různých faktorech, jako jsou řízení, cílové místo, fyziologický stav pacienta a další podávané léky. Tudíž by měly být lečebné dávky titrovány na optimální bezpečnost a efektivnost. Typické dávky použité in vitro mohou poskytovat užitečnou radu o množství použitém pro in šitu podání těchto látek. Testování efektivní dávky u zvířat při léčení konkrétních potíží poskytuje další předběžné indikace lidské dávky. Řadu případů popisují např. Gilman eí al. (eds.) (1990) Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8th Ed., Pergamon Press a Remingtonů Pharmaceutical Sciences, 17* ed. (1990), Mack Publishing Co., Easton, Penn. Metody podávání jsou zde i níže diskutovány, např. pro orální, intravenózní, intraperitoneálni nebo nitrosvalové, transdermální difúze a další. Farmaceuticky vhodnými nosiči jsou voda, solné roztoky, pufry a další, jenž uvádíThe amount of agent necessary for effective therapy will depend on many different factors, such as administration, target site, physiological state of the patient, and other drugs being administered. Thus, treatment doses should be titrated for optimal safety and efficacy. Typical doses used in vitro can provide useful guidance on the amount used for in vitro administration of these agents. Testing the effective dose in animals to treat specific conditions provides further preliminary indications of the human dose. A number of cases are described, for example, by Gilman et al. (eds.) (1990) Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8 th Ed., Pergamon Press and Remington's Pharmaceutical Sciences, 17* ed. (1990), Mack Publishing Co., Easton, Penn. Methods of administration are discussed herein and below, e.g., for oral, intravenous, intraperitoneal or intramuscular, transdermal diffusion, and others. Pharmaceutically suitable carriers are water, saline solutions, buffers and others, which he mentions
9 »99 99 »99 9
9 9 9 9 » · 9999 9 « »99 99 9 9 9 » · 9999 9 « »99 9
9 «9 «
9 9 9 99 9 9 9
999 999999,999
99
99 Ι·*| např. Merck Index, Merck & Co., Rahway, New Jersey. Rozmezí dávek se běžně předpokládá*·»* · 9 že je v množství koncentrace menší než 1 mM, typicky menší než 10 μΜ, obvykle je menší než·** Σ 100 nM, lépe nižší než ΙΟρΜ (pikomolární) a nejlépe menší než lfM (femtomolární) vg«···.99 Ι·*| e.g., Merck Index, Merck & Co., Rahway, New Jersey. The dose range is commonly assumed*·»* · 9 to be in an amount of concentration less than 1 mM, typically less than 10 μΜ, typically less than·** Σ 100 nM, preferably less than ΙΟρΜ (picomolar) and preferably less than lfM (femtomolar) vg«···.
• 9 vhodném nosiči. Pomalu se uvolňují látky nebo zařízení pro pomalé uvolňování látek bývá často·”*.• 9 to a suitable carrier. Slow-release substances or devices for slow-release substances are often·”*.
9 9 využíváno k nepřetržitému podávání. ” **9 9 used for continuous administration. **
Lidský BAS-1, jeho fragmenty a protilátky proti němu nebo jeho fragmentům, antagonisti 5 ;’*· • 999 agonisti mohou být zavedeny přímo do hostitele, aby ho léčili nebo v závislosti na velikosti ·”· • 99 9 sloučenin se požaduje, aby konjugovali na nosičových proteinech, jako jsou ovalbumin, sérový albumin, ještě před jejich podáním. Terapeutické látky mohou být podávány v mnoha konvenčních dávkách. Zatímco je možno zavádět aktivní složku samotnou, je vhodnější podávat ji jako farmaceutickou látku. Látky spíše obsahují alespoň jednu aktivní složku, jak je definováno výše, spolu s jedním nebo více přijatelnými nosiči. Každý nosič by měl být jak farmaceuticky, tak fyziologicky přijatelný z hlediska kompatibility s jinými složkami a neměl by být pro pacienta škodlivý. Látky jsou podávány místně, orálně, rektálně, nasálně nebo parenterálně (zahrnující subkutánně, nitrosvalově, intravenózně a intradermálně). Látky mohou být vhodně podávány v jednotkové dávkové formě a mohou být připraveny metodami v oboru farmacie dobře známými. Viz např. Gilman et al. (eds.) (1990) Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8th Ed., Pergamon Press a Remingtonů Pharmaceutical Sciences, 17th ed. (1990), Mack Publishing Co., Easton, Penn. Terapie v tomto vynálezu může být kombinována nebo používána ve spojení s jinými chemoterapeutickými nebo chemopreventivními činidly.Human BAS-1, its fragments and antibodies against it or its fragments, antagonists 5 ;'*· • 999 agonists can be introduced directly into the host to treat it or depending on the size ·”· • 99 9 compounds are required to conjugated to carrier proteins such as ovalbumin, serum albumin, before their administration. Therapeutic agents may be administered in a number of conventional doses. While it is possible to introduce the active ingredient alone, it is preferable to administer it as a pharmaceutical substance. Rather, the compositions contain at least one active ingredient as defined above together with one or more acceptable carriers. Each carrier should be both pharmaceutically and physiologically acceptable in terms of compatibility with other ingredients and should not be harmful to the patient. The agents are administered topically, orally, rectally, nasally, or parenterally (including subcutaneously, intramuscularly, intravenously, and intradermally). The agents may conveniently be administered in unit dosage form and may be prepared by methods well known in the art of pharmacy. See, for example, Gilman et al. (eds.) (1990) Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, 8 th Ed., Pergamon Press and Remington's Pharmaceutical Sciences, 17 th ed. (1990), Mack Publishing Co., Easton, Penn. The therapy of this invention may be combined or used in conjunction with other chemotherapeutic or chemopreventive agents.
Obě formy BAS-1 antigenů, původně se vyskytující a rekombinantní tvar, jsou v tomto vynálezu používány zejména v soupravách a při metodách stanovení, které jsou schopné prozkoumávat vazebnou aktivitu sloučenin na proteiny. V posledních letech byly vyvinuty některé metody automatických stanovení, které umožňují během krátké doby prozkoumávat desítky tisíc látek.Both forms of BAS-1 antigens, native and recombinant form, are used in the present invention particularly in kits and assay methods capable of examining the protein binding activity of the compounds. In recent years, some methods of automatic determinations have been developed, which make it possible to examine tens of thousands of substances in a short time.
Viz např. Fodor et al. (1991) Science 251: 767 - 773, kde je popsáno testování vazebné afinity množstvím definovaných polymerů syntetizovaných na pevném substrátu. Vývoj vhodných stanovení může být značně usnadněn dostupností velkého množství purifikovaného, rozpustného BAS-1, jak poskytuje tento vynálezu.See, for example, Fodor et al. (1991) Science 251: 767-773, where binding affinity testing of a number of defined polymers synthesized on a solid substrate is described. The development of suitable assays can be greatly facilitated by the availability of large quantities of purified, soluble BAS-1 as provided by the present invention.
Například, antagonisté mohou být obvykle zjištěny, jakmile je BAS-1 strukturně definovaný. Testovat potenciálně ligandové antagonisty je nyní možné díky rozvoje vysoce automatizovaných metod stanovení používající purifikovaný BAS-1. Použitím zde dostupných technik prozkoumávání je zejména možné objevit nové agonisty a antagonisty. Zvlášť důležité • fc «fcfc* ♦ fc fc fcfcfc fcfc · fcfcfcfc • fcfcfc fcfc · fcfcfcfc • fc fcfcfcfc fcfcfc fcfc fcfcfc fcfcfc • fcfc fcfcfcfc · · fcfc · fcfc fcfc ·· fcfc fcfcfcfc • · jsou ty zjištěné látky, které mají kombinovanou vazebnou aktivitu k četným BAS-1 proteinům’·*·»· 9 99 např. sloučeniny, které mohou sloužit jako antagonisti pro alelické varianty BAS-1. *··* ίFor example, antagonists can usually be discovered once BAS-1 is structurally defined. Testing potential ligand antagonists is now possible thanks to the development of highly automated assay methods using purified BAS-1. In particular, novel agonists and antagonists may be discovered using the screening techniques available herein. Especially important • fc «fcfc* ♦ fc fc fcfcfc fcfc · fcfcfcfc • fcfcfc fcfc · fcfcfcfc • fc fcfcfcfc fcfcfc fcfc fcfcfc fcfcfc • fcfc fcfcfcfc · · fcfc · fcfc fcfc ·· fcfc fcfcfcfc • · are those detected substances that have a combined binding activity to numerous BAS-1 proteins'·*·»· 9 99 eg compounds that can serve as antagonists for BAS-1 allelic variants. *··* ί
Kromě toho jelikož signalizování BAS-l.BAS-l vazebný partner může fungovat v kombinaci §····.In addition, since signaling BAS-l.BAS-l binding partner can work in combination §····.
• · jinými signály, např. CD28/CTLA-4:B7/B70 a nebo dráhou CD40:CD40 ligand, kombinace^’**.• · other signals, e.g. CD28/CTLA-4:B7/B70 and or CD40:CD40 ligand pathway, combination^'**.
• · · složek nebo kombinace terapie s takovými dráhami může být rovněž brána v úvahu. Tudíž může** ** být použit antagonismus četných signálových drah nebo stimulace s mnoha dráhami. ; ·**· fcfcfcfc• · · components or combination therapy with such pathways may also be considered. Thus, antagonism of multiple signaling pathways or stimulation with multiple pathways may be used. ; ·**· fcfcfcfc
Tento vynález je obzvlášť zaměřen na prozkoumávání sloučenin za pomocí rekombinantních ·**· fcfcfcfc antigenů jakýmkoli druhem techniky prozkoumání léků. Výhody používání rekombinantních proteinů v prozkoumávání specifických ligandů jsou: a) zlepšení obnovitelného zdroje BAS-1 ze specifického zdroje, b) teoreticky větší počet molekul antigenů na buňku s lepším poměrem signálu k šumu ve stanovení a c) druh variantové specificky (teoreticky s větší biologickou specifickou a specifickou nemoci).The present invention is particularly directed to the screening of compounds using recombinant ·**· fcfcfcfc antigens by any type of drug screening technique. The advantages of using recombinant proteins in the investigation of specific ligands are: a) an improvement in the renewable source of BAS-1 from a specific source, b) theoretically a larger number of antigen molecules per cell with a better signal-to-noise ratio in the assay, and c) a type of variant specificity (theoretically with greater biological specificity and specific disease).
Jedna z metod prozkoumávám léků využívá eukaryotické a prokaryotické buňky hostitele, které jsou stabilně transformovány rekombinantními molekulami DNA exprimujícími BAS-1. Buňky mohou být izolovány, přičemž se během izolace z jiných exprimuje BAS-1. Takové buňky mohou být, buď živé nebo ve fixované formě, použity pro standardní antigen/ligand vazebné stanovení. Viz také Parce et al. (1989) Science 246: 243 - 247 a Owicki et al. (1990) Proč. Naťl Acad. Sci. USA 87: 4007 - 4011, kde se popisují citlivé metody detekce buněčných odpovědí. Kompetitivní stanovení jsou používána zejména, když jsou buňky (zdroj BAS-1) navázány a inkubovány se značeným ligandem o známé vazebné afinitě k antigenů, jako je ligand 125I a testovaná sloučenina, jejíž vazebná afinita k BAS-1 je změřena. Navázaný a volný ligand jsou potom odděleny, aby se určil stupeň vazby ligandů. Množství vázané testované sloučeniny je nepřímo úměrné množství měřené značené ligandové vazby. Jakákoliv z mnoha technik může být použita k oddělení vazby z volného ligandů, aby se určil stupeň ligandové vazby. Tento separační krok by mohl vyžadovat postup, jako je adheze na filtry, následné promytí, adheze na plast, následné promytí nebo centrifugace buněčných membrán. Živé buňky by mohly být rovněž použity ke zkoumání vlivů léků na funkce BAS-1, např. druhá mediátorová hladina, tj. Ca2+, buněčná proliferace, změny inositolfosfátových zásob a další. Některé metody detekce umožňují eliminaci separačního kroku, např. blízkost sensitivního detekčního systému. Barvivo citlivé na vápník může být použito k detekci hladiny Ca2+ s využitím fluorimetru nebo přístrojem rozdělující buňky podle fluorescence.One method of drug discovery uses eukaryotic and prokaryotic host cells that are stably transformed with recombinant DNA molecules expressing BAS-1. Cells can be isolated, expressing BAS-1 during isolation from others. Such cells can be used, either live or in fixed form, for standard antigen/ligand binding assays. See also Parce et al. (1989) Science 246: 243-247 and Owicki et al. (1990) Why. Naľl Acad. Sci. USA 87: 4007-4011, where sensitive methods for detecting cellular responses are described. In particular, competitive assays are used when cells (the source of BAS-1) are bound and incubated with a labeled ligand of known antigen binding affinity, such as 125 I ligand, and a test compound whose binding affinity to BAS-1 is measured. Bound and free ligand are then separated to determine the degree of ligand binding. The amount of test compound bound is inversely proportional to the amount of labeled ligand binding measured. Any of a number of techniques can be used to separate the bound from the free ligand to determine the degree of ligand binding. This separation step could require a procedure such as adhesion to filters, subsequent washing, adhesion to plastic, subsequent washing, or centrifugation of cell membranes. Live cells could also be used to investigate the effects of drugs on BAS-1 functions, eg the second mediator level, i.e. Ca 2+ , cell proliferation, changes in inositol phosphate stores and others. Some detection methods allow the elimination of the separation step, e.g. the proximity of a sensitive detection system. A calcium-sensitive dye can be used to detect Ca 2+ levels using a fluorimeter or a fluorescence cell-splitter.
Jiné metody využívají membrány transformovaných eukaryotických nebo prokaryotických buněk hostitele jako zdroje lidského BAS-1. Tyto buňky jsou stabilně transformovány s DNA vektory, které řídí expresi lidského BAS-1 antigenů. V podstatě by byly membrány připraveny z ·* ··<·· ··· · · · * ·· · • · · · ·· ♦ · · · · • ···»· · · · · · ··· ··· • · » · · · · · tOther methods use the membranes of transformed eukaryotic or prokaryotic host cells as a source of human BAS-1. These cells are stably transformed with DNA vectors that direct the expression of human BAS-1 antigens. Essentially, the membranes would be prepared from ·* ··<·· ··· · · · * ·· · • · · · ·· ♦ · · · · • ···»· · · · · · ··· · ·· • · » · · · · · t
0· · ·· ·· ·· ♦· jiných buněk a použity v jakýchkoliv receptor/ligand vazebných stanovení, jako je kompetitivní stanovení uvedené výše. j * * * * j • · · ·0· · ·· ·· ·· ♦· other cells and used in any receptor/ligand binding assays such as the competition assay described above. j * * * * j • · · ·
Ještě dalším přístupem je použití rozpustného, nepurifikovaného nebo rozpustného, · ·*!Still another approach is to use a soluble, unpurified or soluble, · ·*!
• · · puntíkovaného BAS-1 z transformovaných eukaryotických a prokaryotických buněk hostitele. · • ·• · · punctate BAS-1 from transformed eukaryotic and prokaryotic host cells. · • ·
Toto umožňuje stanovení „molekulární“ vazby s výhodami zvýšení specificky, schopnosti automatizovat a vysokého výkonu testovaného léku. ·..·.:This enables the determination of "molecular" binding with the advantages of increased specificity, the ability to automate and the high throughput of the drug being tested. ·..·.:
Jiná technika zkoumání léku zahrnuje přístup, který zajišťuje vysoký výkon prozkoumávání • · · sloučenin s vhodnou vazebnou afinitou k BAS-1 a podrobněji popisuje Geysen, European Patent·····* • · ·Another drug screening technique involves an approach that provides high throughput screening • · · for compounds with suitable binding affinity to BAS-1 and is described in more detail by Geysen, European Patent·····* • · ·
Application 84/03564, publikovaná 13. září 1984. Zaprvé je na pevném substrátu, např. *·!··* umělohmotné špendlíky nebo některé jiné vhodné povrchy, viz Fodor et al. (1991), syntetizováno velké množství různých malých peptidových testovaných sloučenin. Poté všechny špendlíky reagují s rozpustným, nepurifikovaným nebo rozpustným, purifikovaným BAS-1 a jsou promyty. Dalším krokem je detekce vázaného BAS-1.Application 84/03564, published September 13, 1984. First, it is on a solid substrate, eg *·!··* plastic pins or some other suitable surface, see Fodor et al. (1991), synthesized a large number of different small peptide test compounds. All pins are then reacted with soluble, unpurified or soluble, purified BAS-1 and washed. The next step is to detect bound BAS-1.
Racionální forma léku může být také založena na strukturálních studiích molekulárního tvaru BAS-1 a jiných efektorů nebo ligandů. Efektory mohou být jiné proteiny, které zprostředkují jiné funkce v odpovědi na ligandovou vazbu nebo jiné proteiny, které obvykle interagují s antigenem.A rational drug design can also be based on structural studies of the molecular shape of BAS-1 and other effectors or ligands. Effectors may be other proteins that mediate other functions in response to ligand binding or other proteins that normally interact with the antigen.
Jedním ze způsobů, jak určit místo interakce se specifickými dalšími proteiny, je určení fyzikální struktury, např. strukturní krystalografie nebo technika dvourozměrné NMR. Tyto poskytnou informace o tom, na kterých aminokyselinových zbytcích se tvoří molekulární spojení. Pro podrobnější popis určení struktury proteinu je, viz např. Blundell and Johnson (1976) Protein Crystallography, Academie Press, NewYork.One way to determine the site of interaction with specific other proteins is to determine the physical structure, eg structural crystallography or two-dimensional NMR techniques. These will provide information on which amino acid residues form the molecular bond. For a more detailed description of protein structure determination, see, for example, Blundell and Johnson (1976) Protein Crystallography, Academie Press, New York.
Puntíkovaný BAS-1 může být pro použití ve výše uvedené technice zkoumání léčiv nalit přímo na misky. Avšak protilátky, které nejsou neutralizační proti těmto antigenům, mohou být použity jako nosiče protilátek při imobilizaci příslušného BAS-1 na pevnou fázi.Spotted BAS-1 can be poured directly onto dishes for use in the above drug screening technique. However, antibodies that are not neutralizing against these antigens can be used as antibody carriers when immobilizing the respective BAS-1 on a solid phase.
IX. SoupravyIX Kits
Tento vynález rovněž zahrnuje použití BAS-1 proteinů, jeho fragmentů a jejich fuzních produktů v řadě diagnostických souprav a metody pro detekci přítomnosti BAS-1 nebo ligandu. Běžně má souprava část obsahující buď definovaný BAS-1 peptid nebo genový segment nebo látku, která rozpozná jeden nebo druhý.The present invention also includes the use of BAS-1 proteins, fragments thereof and fusion products thereof in a variety of diagnostic kits and methods for detecting the presence of BAS-1 or ligand. Typically, the kit has a portion containing either a defined BAS-1 peptide or a gene segment, or an agent that recognizes one or the other.
Souprava pro detekci vazebné afinity testované sloučeniny k BAS-1 běžně obsahuje testovanou látku, značenou látku, např. ligand nebo protilátku se známou vazebnou afinitou k BAS-1, zdroj BAS-1 (přírodně se vyskytující nebo rekombinantní) a prostředek pro oddělení vazby z volněA kit for detecting the binding affinity of a test compound to BAS-1 typically includes a test substance, a labeled substance, e.g., a ligand or antibody with known binding affinity to BAS-1, a source of BAS-1 (naturally occurring or recombinant), and a means for cleaving the binding from loosely
4444
4 4 4 44 4 4 4
4 4 44 4 4
4 »44 4444 »44,444
4 44 4
44 • 4- 444444 • 4- 4444
4« 44« 4
4 4 4 44 4 4 4
4 4 4 4 4 >444444 44 4 4 4 4 >444444 4
4 4 4 4 4 · 44 značené látky, jako je pevná fáze pro imobilizovaný BAS-1. Jakmile jsou sloučeniny prozkoumány, tak ty látky, které mají vhodnou vazebnou afinitu k BAS-1 mohou být;”**;4 4 4 4 4 · 44 labeled substances such as the solid phase for immobilized BAS-1. Once the compounds are screened, those with suitable binding affinity to BAS-1 can be;”**;
4 4 4 vyhodnoceny vhodnými v oboru dobře známými biologickými rozbory, aby se určilo, zda seí í*í4 4 4 evaluated by appropriate biological assays well known in the art to determine whether
4 4 jedná o agonisty nebo antagonisty. Použitelnost rekombinantních BAS-1 polypeptidů rovněž ·4 4 are agonists or antagonists. The applicability of recombinant BAS-1 polypeptides also
44 4 zajišťuje dobře definované standardy pro kalibraci takových stanovení. *....* ·44 4 provides well-defined standards for the calibration of such determinations. *....* ·
Vhodnější souprava k určení koncentrace, například BAS-1 ve vzorku, by měla běžně obsahovat ί . í J 4 4 4 4 značenou látku, např. ligand nebo protilátku, s dobře známou vazebnou afinitou k BAS-1, zdrojA more suitable kit to determine the concentration of, for example, BAS-1 in a sample should normally contain ί . í J 4 4 4 4 labeled substance, e.g., ligand or antibody, with well-known binding affinity to BAS-1, source
4 44 4
BAS-1 (přírodně se vyskytující nebo rekombinantní) a prostředek pro oddělení vazby z volně*·!··*BAS-1 (naturally occurring or recombinant) and an agent for unbinding from free*·!··*
V 4 4 4 značené látky, např. pevná fáze pro imobilizovaný BAS-1. Část obsahující činidla a instrukce*.:..* bude obvykle poskytnuta.V 4 4 4 labeled substances, e.g. solid phase for immobilized BAS-1. A section containing reagents and instructions*.:..* will usually be provided.
Metoda k určení koncentrace BAS-1 ve vzorku by měla typicky zahrnovat tyto kroky: 1) přípravu membrán ze vzorku obsahujícího zdroj BAS-1, 2) promytí membrány a suspendování v pufru, 3) rozpuštění BAS-1 inkubací membrány v kultivačním médiu, do kterého je přidán vhodný detergent, 4) upravení koncentrace detergentu rozpuštěného BAS-1, 5) spojení a inkubace zmíněného roztoku s radioznačeným ligandem v komplexy, 6) znovuzískání komplexů filtrací přes polyethyleniminem upravený filtr a 7) měření radioaktivity znovuzískaných komplexů.A method to determine the concentration of BAS-1 in a sample should typically include the following steps: 1) preparing membranes from a sample containing a source of BAS-1, 2) washing the membrane and suspending it in buffer, 3) dissolving BAS-1 by incubating the membrane in culture medium, to to which a suitable detergent is added, 4) adjusting the concentration of the detergent dissolved in BAS-1, 5) connecting and incubating the aforementioned solution with the radiolabeled ligand in complexes, 6) recovering the complexes by filtering through a polyethylenimine-treated filter and 7) measuring the radioactivity of the recovered complexes.
Protilátky včetně fragmentů vázajících antigen, specifické pro lidský BAS-1 nebo BAS-1 fragmenty jsou v diagnostice používány, např. pro detekci přítomnosti zvýšené hladiny BAS-1 a nebo jeho fragmentů. V takových diagnostických stanoveních se mohou používat lyzáty, živé buňky, fixované buňky, imunofluorescence, buněčné kultury, tělní tekutiny a další, které mohou detekovat antigeny příbuzné k BAS-1 v seru nebo podobně. Diagnostické rozbory mohou být homogenní (bez separačního kroku mezi volnou látkou a komplexem antigen-ligand) nebo heterogenní (včetně separačního kroku). Existuje mnoho komerčních stanovení, jako jsou radioimunoanalýza (RIA), enzymově spřažené imunochemické stanovení (ELISA), enzymová imunoanalýza (EIA), mnohonásobně enzymová imunoanalyzační technika (EMIT), substrátově značená fluorescenční imunoanalýza (SLFIA) a podobně. Například neznačené protilátky mohou být použity s druhou protilátkou, která je značená a která rozpozná protilátku proti BAS-1 nebo proti jeho konkrétnímu fragmentu. Tato stanovení byla v literatuře značně diskutována. Viz např. Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH.Antibodies, including antigen-binding fragments, specific for human BAS-1 or BAS-1 fragments are used in diagnostics, e.g. to detect the presence of elevated levels of BAS-1 and/or its fragments. Lysates, live cells, fixed cells, immunofluorescence, cell cultures, body fluids, and others that can detect BAS-1-related antigens in serum or the like can be used in such diagnostic assays. Diagnostic assays can be homogeneous (without a separation step between the free substance and the antigen-ligand complex) or heterogeneous (including a separation step). There are many commercial assays such as radioimmunoassay (RIA), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), enzyme-linked immunosorbent assay (EIA), enzyme-linked immunosorbent assay (EMIT), substrate-labeled fluorescence immunoassay (SLFIA), and the like. For example, unlabeled antibodies can be used with a second antibody that is labeled and that recognizes an antibody against BAS-1 or a particular fragment thereof. These determinations have been widely debated in the literature. See, for example, Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH.
Antiidiotypové protilátky mohou být podobně používány pro stanovení přítomnosti protilátek proti lidskému BAS-1, jako takové mohou být diagnostické pro různé abnormální stavy. Například nadprodukce BAS-1 může být výsledkem produkce různých imunologických reakcí, • · · · • · · · »«» ··» • · ·· ·· *· r»»t «« « s * ♦ · · · « · · · · · * • 9999999 · ·Anti-idiotype antibodies can similarly be used to determine the presence of antibodies against human BAS-1, as such they can be diagnostic for various abnormal conditions. For example, overproduction of BAS-1 can result from the production of various immunological reactions, • · · · • · · · »«» ··» • · ·· ·· *· r»»t «« « s * ♦ · · · « · · · · · * • 9999999 · ·
9 9 9 9 9 99 9 9 9 9 9
9 9· 99 které mohou být diagnostické pro abnormální fyziologické stavy, zejména v rozrůstání buněčných forem jako je rakovina nebo abnormální diferenciace. j9 9· 99 which may be diagnostic of abnormal physiological conditions, particularly in the proliferation of cellular forms such as cancer or abnormal differentiation. j
Často jsou činidla pro diagnostická stanovení dodávána v soupravách tak, aby optimalizovalaΪ citlivost stanovení. Předmět vynálezu závisející na podstatě rozboru, protokolu a značené látce, buď značené nebo neznačené protilátky nebo značeného BAS-1 je zajištěn. Obvykle je ve· spojení s dalšími přísadami, jako jsou pufry, stabilizátory, materiály nezbytné pro signální i produkci, jako jsou enzymové substráty apod. Je vhodné, když souprava bude obsahovat •Often reagents for diagnostic assays are supplied in kits to optimize assay sensitivity. Subject matter of the invention depending on the nature of the assay, the protocol and the labeled substance, either labeled or unlabeled antibody or labeled BAS-1 is provided. It is usually combined with other ingredients, such as buffers, stabilizers, materials necessary for signaling and production, such as enzyme substrates, etc. It is convenient if the kit contains •
instrukce pro správné použití a odstraňování obsahu po použití. Souprava má běžně části pro’ v · každé použité činidlo. Činidla jsou vhodně dodávána ve formě suchého lyofilizovaného prášku,* čímž mohou být rozpuštěna ve vodném médiu zajišťující vhodné koncentrace činidel pro funkční stanovení.instructions for proper use and disposal of content after use. The kit normally has parts for each reagent used. Reagents are conveniently supplied in the form of a dry lyophilized powder,* whereby they can be dissolved in an aqueous medium providing suitable reagent concentrations for functional assays.
Některé ze shora zmíněných základních složek zkoumání léků a diagnostických rozborů mohou být použity bez modifikací nebo mohou být různými způsoby modifikovány. Například značení může být dosaženo vazbou kovalentní nebo nekovalentní skupiny, která poskytuje přímo nebo nepřímo detekovatelný signál. V některých těchto stanoveních mohou být ligand, testovaná látka, BAS-1 nebo protilátky značeny buď přímo nebo nepřímo. Možnosti přímého značení zahrnují značené skupiny: látka značená radioaktivně, jako je 125I, enzymy (U.S. Pat. č. 3,645,090), jako jsou peroxidáza a alkalická fosfatáza a látky značené fluorescenčně (U.S. Pat. č. 3,940,475) schopné zaznamenávat změnu ve fluorescenční intenzitě, posun vlnové délky nebo fluorescenční polarizace. Oba patenty jsou zde uvedeny v citacích. Možnosti nepřímého značení zahrnují biotinylaci jedné složky, následnou vazbu na avidinový pár na jednu ze značených skupin.Some of the basic components of drug testing and diagnostic assays mentioned above may be used without modification or may be modified in various ways. For example, labeling can be achieved by the attachment of a covalent or non-covalent group that provides a directly or indirectly detectable signal. In some of these assays, the ligand, test substance, BAS-1, or antibodies may be labeled either directly or indirectly. Direct labeling options include labeled groups: a radiolabeled substance such as 125 I, enzymes (US Pat. No. 3,645,090) such as peroxidase and alkaline phosphatase, and fluorescently labeled substances (US Pat. No. 3,940,475) capable of recording a change in fluorescence intensity , wavelength shift or fluorescence polarization. Both patents are cited here. Options for indirect labeling include biotinylation of one component, followed by binding to an avidin pair on one of the labeled groups.
Je rovněž řada metod oddělující vazbu z volného ligandů nebo jinak vazbu z volně testované látky. BAS-1 může být imobilizován na různé matrice a následně promyt. Vhodnými matricemi může být plast, jako je ELISA destička, filtry nebo kuličky. Metoda imobilizace BAS-1 na matrici bez omezení zahrnuje přímou adhezi na plast, použití zachycené protilátky, chemické spřažení a biotin-avidin. Poslední krok v posledním případě vyžaduje precipitaci antigenligandového komplexu kteroukoliv metodou včetně tohoto využití, např. organické rozpouštědlo, jako je polyethylenglykol nebo sůl, jako je síran amonný. Jiná vhodná separační technika bez omezení zahrnuje metodu fluorescenční protilátky přitahující částice je popsána v Rattle et al. (1984) Cli. Chem. 30: 1457 - 1461 a dvojnásobná separace protilátky magnetickou částicí, jak je popsáno v U.S. Pat. č. 4,659,678.There are also a number of methods for separating binding from free ligands or otherwise binding from a free tested substance. BAS-1 can be immobilized on different matrices and subsequently washed. Suitable matrices can be plastic, such as an ELISA plate, filters or beads. Methods for immobilizing BAS-1 on a matrix include, without limitation, direct adhesion to plastic, use of captured antibody, chemical conjugation, and biotin-avidin. The final step in the latter case requires precipitation of the antigen-ligand complex by any method including this use, eg an organic solvent such as polyethylene glycol or a salt such as ammonium sulfate. Other suitable separation techniques include, but are not limited to, the particle-attracting fluorescent antibody method described in Rattle et al. (1984) Cl. Chem. 30: 1457-1461 and dual magnetic particle antibody separation as described in U.S. Pat. Pat. No. 4,659,678.
Metoda vazby proteinů nebo jejich fragmentů na různé značené látky byla v literatuře značně popsána. Mnoho technik se týká použití aktivovaných karboxylových skupin buď použitím ·· · ·The method of binding proteins or their fragments to various labeled substances has been extensively described in the literature. Many techniques involve the use of activated carboxyl groups either by using ·· · ·
99 9 ♦ · ♦· • · * · • · · · ··· ··· • « ·· *· ·· «99 9 ♦ · ♦· • · * · • · · · ··· ··· • « ·· *· ·· «
• ♦ • · · • ···· • · • · · · · • · * · · • · · · ·· ·· karbodiimidu nebo aktivního esteru za vzniku peptidových vazeb, tvorby thioetherů reakcí merkaptové skupiny s aktivovaným halogenem, jako je chloracetyl nebo s aktivovaným;”**;• ♦ • · · • ···· • · • · · · · • · * · · • · · · ·· ·· carbodiimide or active ester to form peptide bonds, formation of thioethers by reaction of mercapte group with activated halogen, such as chloracetyl or with activated;”**;
• ·· · olefinem, jako je maleimid chemickou vazbou nebo podobně. Fúze proteinů rovněž v tétoí ΙΊ ·· · žádosti nachází uplatnění. · • 0· ·• ·· · an olefin such as maleimide by chemical bonding or the like. Protein fusion also finds application in this ΙΊ ·· · application. · • 0· ·
Jiný diagnostický aspekt tohoto vynálezu zahrnuje použití polynukleotidových nebo·.,..· • 0 oligonukleotidových sekvencí z BAS-1 sekvence. Tyto sekvence mohou být použity jako sondyΪ · í pro detekční hladiny antigenů ve vzorcích pacientů, u kterých je podezření na abnormální stav, ’..Another diagnostic aspect of the present invention involves the use of polynucleotide or·.,.·• 0 oligonucleotide sequences from the BAS-1 sequence. These sequences can be used as probes for the detection of antigen levels in samples from patients suspected of having an abnormal condition.
* · · např. rakovina nebo vývojový problém. Příprava obou RNA a DNA nukleotidových sekvencí,*····* • 0 · značení sekvencí a preferovaná velikost sekvencí je bohatě obsažena v popisu a diskutovány v‘.í..’ literatuře. Obvykle by měla mít oligonukletidová sonda alespoň 14 nukleotidů, běžně alespoň 18 nukleotidů a polynukleotidové sondy mohou být nanejvýš několik kilobází. Může být použita řada značených látek, nejběžněji to jsou radionukleotidy zejména 32P. Jiné techniky však mohou být rovněž použity, jako jsou biotinem modifikované nukleotidy pro zavedení do polynukleotidu.* · · eg cancer or developmental problem. The preparation of both RNA and DNA nucleotide sequences, sequence labeling, and preferred sequence sizes are abundantly described and discussed in the literature. Typically, an oligonucleotide probe should be at least 14 nucleotides, commonly at least 18 nucleotides, and polynucleotide probes can be at most a few kilobases. A number of labeled substances can be used, the most common being radionucleotides, particularly 32 P. However, other techniques can also be used, such as biotin-modified nucleotides for incorporation into the polynucleotide.
Biotin se poté podává jako místo pro vazbu avidinu nebo protilátek, které mohou být značeny různými druhy značených látek, jako jsou radionukleotidy, fluorescenčně značené látky, enzymy a podobně. Nebo mohou být použity protilátky, které rozeznávají specifické dvoušroubovice včetně DNA dvoušroubovice, RNA dvoušroubovice, hybridní DNA-RNA dvoušroubovice nebo DNA-proteinové dvoušroubovice. Protilátky mohou být značeny za sebou a stanovení provedeno tehdy, když je dvoušroubovice navázána na povrch tak, že po vytvoření dvoušroubovice na povrchu a může být detekována přítomnost protilátky navázané na dvoušroubovici. Použití sondy k nové antimediátorové RNA může být provedeno jakoukoliv konvenční technikou, jako je hybridizace nukleových kyselin, s a bez prozkoumávání, rekombinace, translace uvolňující hybrid (HRT) a translace zadržující hybrid (HART). Také mohou být zahrnuty techniky amplifikace, jako je polymerázová řetězová reakce (PCR).Biotin is then administered as a binding site for avidin or antibodies, which can be labeled with various types of labels such as radionucleotides, fluorescent labels, enzymes, and the like. Alternatively, antibodies that recognize specific double helixes including DNA double helix, RNA double helix, hybrid DNA-RNA double helix, or DNA-protein double helix can be used. The antibodies can be labeled sequentially and the assay performed while the double helix is bound to the surface such that after the double helix is formed on the surface and the presence of the antibody bound to the double helix can be detected. Application of the probe to the novel anti-mediator RNA can be performed by any conventional technique, such as nucleic acid hybridization, with and without probing, recombination, hybrid release translation (HRT), and hybrid retention translation (HART). Amplification techniques such as polymerase chain reaction (PCR) may also be included.
Jsou také popsány diagnostické soupravy, které rovněž testují kvantitu a kvalitu dalších vzorů. Diagnóza nebo prognóza jsou závislé na kombinaci několikanásobných indikací používaných jako vzory. Tudíž soupravy mohou testovat kombinace vzorů. Viz např. Viallet et al. (1989) Progress in Growth Factor Res. 1: 89 - 97.Also described are diagnostic kits that also test the quantity and quality of other patterns. Diagnosis or prognosis is dependent on a combination of multiple indications used as patterns. Thus, kits can test combinations of patterns. See, for example, Viallet et al. (1989) Progress in Growth Factor Res. 1: 89-97.
X. Ligand nebo protireceptor.X. Ligand or counterreceptor.
Popis BAS-1 proteinu zde poskytuje prostředky k identifikaci protireceptoru nebo ligandu. Takový ligand nebo protireceptor by se specificky vázal na BAS-1 s dostatečně vysokou afinitou. Řada konstruktů, které poskytují další značení BAS-1, aby se detekoval jeho partner, je připravena tak, aby byly dostupné. Například přímé značení BAS-1, fuze na znaky pro sekundární značení, např. FLAG nebo jiné epitopové nádory, fuze Ig domény atd., poskytují • ·· · detekci vazebných partnerů. Může se jednat o hystologické, jak afinitní metoda biochemické· ·’!The description of the BAS-1 protein herein provides the means to identify a counterreceptor or ligand. Such a ligand or counterreceptor would specifically bind to BAS-1 with sufficiently high affinity. A number of constructs that provide additional labeling of BAS-1 to detect its partner are being made available. For example, direct labeling of BAS-1, fusions to markers for secondary labeling, eg FLAG or other tumor epitopes, Ig domain fusions, etc., provide • ·· · detection of binding partners. It can be a histological or an affinity method biochemical· ·'!
• · · purifikace, tak značení nebo selekce v expresním klonování. Dvouhybridní selekční systém · vytvářející vhodné konstrukty s dostupnými BAS-1 sekvencemi, může být rovněž aplikován. Viz ·....· Fields and Song (1989) Nátuře 340: 245 - 246.• · · purification, labeling or selection in expression cloning. A two-hybrid selection system · generating suitable constructs with available BAS-1 sequences can also be applied. See ·....· Fields and Song (1989) Nature 340: 245 - 246.
Široké pojetí tohoto vynálezu se nejlépe pochopí, pokud jde o následující příklady, které nejsou myšleny tak, aby limitovaly vynález na specifické případy.The broad concept of this invention is best understood by reference to the following examples, which are not intended to limit the invention to specific instances.
PŘÍKLADY PROVEDENI VYNALEZUEXAMPLES OF IMPLEMENTATION OF THE INVENTION
Příklad 1: Obecné metody.Example 1: General methods.
Některé standardní metody jsou popsány nebo uvedeny např. v Maniatis et al. (1982) Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Press, Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning, A Laboratory Manual, (2nd ed.) vols. 1-3, CSH Press, NY, Ausubel et al., Biology, Greene Publishing Associates, Brooklyn, NY nebo Ausubel et al. (1987 and Supplements) Current Protocols in Molecular Biology, Greene/Wiley, New York. Metody proteinové purifikace zahrnují takové metody, jako je srážení síran amonným, kolonová chromatografie, elektroforézy, centrifugace, krystalizace a další. Viz např. Ausubel et al. (1987 and periodic Supplements), Deutscher (1990) Guide to Protein Purification v Methods in Enzymology, vol. 182 a další svazky v této sérii a literatura na použití proteinových purifikovaných produktů, např. Pharmacia, Piscataway N. J. nebo Bio-Rad, Richmond, CA. Kombinace s jinými rekombinantními technikami umožňuje fúzi s vhodnými segmenty, např. sFLAG sekvencí nebo ekvivalentem, který může být fúzován přes proteázou-odstranitelnou sekvenci. Víz např. Hochuli (1989) Chemische Industrie 12: 69 - 70, Hochuli (1990) „Purification of Recombinant Proteins with Metal Chelate Absorbent“ v Setlow (ed.) Genetic Engineering, Principle and Methods 12: 87 - 98, Plenům Press, N.Y. a Crowe et al. (1992) QIAexpress: The High Level Expression & Protein Purification System QUIAGEN, lne., Chatsworth, CA.Some standard methods are described or presented, for example, in Maniatis et al. (1982) Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Press, Sambrook et al. (1989) Molecular Cloning, A Laboratory Manual, ( 2nd ed.) vols. 1-3, CSH Press, NY, Ausubel et al., Biology, Greene Publishing Associates, Brooklyn, NY or Ausubel et al. (1987 and Supplements) Current Protocols in Molecular Biology, Greene/Wiley, New York. Protein purification methods include such methods as ammonium sulfate precipitation, column chromatography, electrophoresis, centrifugation, crystallization, and others. See, for example, Ausubel et al. (1987 and periodic Supplements), Deutscher (1990) Guide to Protein Purification in Methods in Enzymology, vol. 182 and other volumes in this series and literature on the use of protein purified products, e.g., Pharmacia, Piscataway NJ or Bio-Rad, Richmond, ca. Combination with other recombinant techniques allows fusion with suitable segments, eg the sFLAG sequence or equivalent, which can be fused through a protease-cleavable sequence. See e.g. Hochuli (1989) Chemische Industrie 12: 69 - 70, Hochuli (1990) "Purification of Recombinant Proteins with Metal Chelate Absorbent" in Setlow (ed.) Genetic Engineering, Principle and Methods 12: 87 - 98, Plenům Press, NY and Crowe et al. (1992) QIAexpress: The High Level Expression & Protein Purification System QIAGEN, lne., Chatsworth, CA.
Byla provedena počítačová sekvenční analýza, např. použití dostupných softwarových programů, obsažených ve zdrojích GCG (U. Wisconsin) a GenBank. Rovněž byla použita veřejná sekvenční databáze, např. GenBank a další.Computerized sequence analysis was performed, eg, using available software programs contained in the GCG (U. Wisconsin) and GenBank resources. Public sequence databases such as GenBank and others were also used.
·· 44 • · · · ···· · · · 4 · · · • · · · 4 4 · 4 · · · 4 ·4 · · ··· 44 • · · · ···· · · · 4 · · · • · · · 4 4 · 4 · · · 4 ·4 · · ·
4 4 4 4·· · · ·· · · · · · ·· ··4 4 4 4·· · · ·· · · · · · ·· ··
Příklad 2: Amplifikace fragmentu lidského BAS-1 metodou PCR.Example 2: Amplification of human BAS-1 fragment by PCR method.
9· » · • · • · • · · ·9 · » · • · • · • · · ·
Podle myších sekvencí RP105 byly navrženy dva primery. Viz Miyake et al. (1995) J. Immunol. í i*:Two primers were designed according to mouse RP105 sequences. See Miyake et al. (1995) J. Immunol. í i*:
154: 3333 - 3340. Pořadí nukleotidů bylo vypočítáno z CTT sekvence. 5'-primer A (TTG...) se · • ··· shoduje s 24 nukleotidy od 162 po 185 a 3'-primer F (...TTC) odpovídá 24 nukleotidům od 1462 ·,...· ·154: 3333-3340. The nucleotide sequence was calculated from the CTT sequence. 5'-primer A (TTG...) matches · • ··· 24 nucleotides from 162 to 185 and 3'-primer F (...TTC) matches 24 nucleotides from 1462 ·,...· ·
po 1485. Z lidských tonzilárních B buněk nebyly zjištěny žádné produkty PCR.after 1485. No PCR products were detected from human tonsillar B cells.
Byly vytvořeny tři 5'-primery: primer B (ACA...) zahrnuje nukleotidy v poloze 321 až 344, • · 4 primer C (AAG...) obsahuje nukleotidy v polohách 568 až 591 a primer D (TCT...) zahrnuje’····* • 4 · nukletidy v poloze 859 až 882. Rovněž byly vytvořeny další tři 3'-primery: primer G (,..ΤΤΑ)’·ϊ··* obsahující nukleotidy 1765 až 1788, primer H (...GAA) obsahující nukleotidy v poloze 2024 až 2047 a primer E (.. .TGG) obsahující nukleotidy 1164 až 1187.Three 5'-primers were created: primer B (ACA...) includes nucleotides in position 321 to 344, • · 4 primer C (AAG...) contains nucleotides in positions 568 to 591 and primer D (TCT... ) includes'····* • 4 · nucleotides at position 859 to 882. Three other 3'-primers were also created: primer G (,..ΤΤΑ)'·ϊ··* containing nucleotides 1765 to 1788, primer H (...GAA) containing nucleotides at position 2024 to 2047 and primer E (.. .TGG) containing nucleotides 1164 to 1187.
Ke zvýšení pravděpodobností pro získání PCR produktů z lidských tonzilárních B buněk byly použity PCR reakce jednoho 5'-primeru v kombinaci se čtyřmi 3'-primery. Ze čtyř skupin PCR reakcí byl získán pouze jeden čistý 300 bp produkt, jenž spojil úsek od 5'-primeru D k 3'primeru E. Tento produkt byl purifikován, suklonován do pCR™ vektoru (Invitrogen, San Diego CA) a poté sekvenován. Viz SEQ ID NO: 1.PCR reactions of one 5'-primer in combination with four 3'-primers were used to increase the probability of obtaining PCR products from human tonsillar B cells. From the four groups of PCR reactions, only one pure 300 bp product was obtained that joined the stretch from 5'-primer D to 3'-primer E. This product was purified, subcloned into the pCR™ vector (Invitrogen, San Diego CA) and then sequenced. See SEQ ID NO: 1.
Podle 300 bp lidské sekvence byly navrženy 3 primery: 5'-primer K, 3'-primery I a L. Použitím obdobné PCR metody byly kombinací primerů C a I (viz SEQ ID NO: 1) získány další 300 bp lidské fragmenty.According to the 300 bp human sequence, 3 primers were designed: 5'-primer K, 3'-primers I and L. Using a similar PCR method, additional 300 bp human fragments were obtained by combining primers C and I (see SEQ ID NO: 1).
Příklad 3: Tkáňové rozšíření lidského BAS-1.Example 3: Tissue expansion of human BAS-1.
Jako sonda (sonda D-E) ke studiu tkáňového rozšíření BAS-1 v lidských tkáních byl použit PCR produkt amplifikovaný dvojicí primerů D-E (viz SEQ ID NO: 1). V lidské slezině a ve vyšší hladině v lidském srdci byla metodou Nothernova přenosu detekována 2,6 kb mRNA. Což nebylo tak lehce detekováno v lidském mozku, brzlíku, plících, játrech, kosterním svalu, ledvinách, prostatě, varlatech, vaječníku, tenkém (smáli) střevu, tlustém střevu a periferních krevních leukocytech. Kromě toho byla metodou Nothernova přenosu v sIgD+ lymfomové buněčné linie B104 a ve vyšší hladině v Burkitově lymfomové buněčné linie BL2, detekována 2,6 kb mRNA. Avšak nebyla detekována v ledvinové epiteliální karcinomové buněčné linie CHA, plicní epiteliální karcinomové buněčné linii MRC-5, EBV buněčné linii JY nebo monocytní buněčné linii U937.A PCR product amplified by a pair of DE primers (see SEQ ID NO: 1) was used as a probe (DE probe) to study the tissue distribution of BAS-1 in human tissues. A 2.6 kb mRNA was detected in the human spleen and at a higher level in the human heart by the Nothern transfer method. Which was not so readily detected in human brain, thymus, lung, liver, skeletal muscle, kidney, prostate, testis, ovary, small (small) intestine, large intestine and peripheral blood leukocytes. In addition, a 2.6 kb mRNA was detected by the Nothern transfer method in the sIgD + lymphoma cell line B104 and at a higher level in the Burkitt lymphoma cell line BL2. However, it was not detected in the renal epithelial carcinoma cell line CHA, the lung epithelial carcinoma cell line MRC-5, the EBV cell line JY, or the monocyte cell line U937.
Metodou PCR byla lidská BAS-1 mRNA nalezena vsIgD+CD38' jednoduchých B buňkách, s!gD+CD38+ zárodečném centru B buněk, s!gD'CD38+ zárodečném centru B buněk, v slgD' • · · · · · • · • · • · · · ·By PCR, human BAS-1 mRNA was found in vsIgD + CD38' simple B cells, s!gD + CD38 + germinal center B cells, s!gD'CD38 + germinal center B cells, in slgD' • · · · · · • · • · • · · · ·
CD38' paměťových B buňkách, v sCD38++CD20mzke plazmatických buňkách, dendritických buňkách generovaných od CD14+ monocytů kultivovaných s GM-CSF a IL-4 a dendritických; buňkách generovaných od CD34+ strunových krevních buněk kultivovaných s GM-CSF a TNFa. Toto nebylo v lidské T buněčné linii MT9 metodou PCR detekovatelné.CD38' memory B cells, in sCD38 ++ CD20 marrow plasma cells, dendritic cells generated from CD14 + monocytes cultured with GM-CSF and IL-4, and dendritic cells; cells generated from CD34+ cord blood cells cultured with GM-CSF and TNFα. This was not detectable in the human T cell line MT9 by PCR.
• ·· · ··· • ·• ·· · ··· • ·
Příklad 4: Prozkoumávání plazmidové knihovny cDNA odvozené z lidské sIgD+ lymfomové^.·.· buněčné linii B104.Example 4: Screening of a cDNA plasmid library derived from the human sIgD+ lymphoma cell line B104.
• · • · * ···· • ·• · • · * ···· • ·
9 99 9
99
Z výsledků analýzy Nothernova přenosu byla v 6 pg poly-A mRNA buněčné linie B104* detekována exprese BAS-1. Podle toho byla vplazmidu pSPORTl (Gibco Life Technologies, Cergy Pontoise, Francie) zkonstruována B104 knihovna cDNA. Po dokončení sledování 150 000 bakteriálních kolonií nebyly s použitím sondy D-E nalezeny žádné pozitivní klony. Což nasvědčuje tomu, že exprese BAS-1 v lidských buňkách může být velmi nízká.From the results of the Nothern transfer analysis, BAS-1 expression was detected in 6 pg poly-A mRNA of B104* cell line. Accordingly, a B104 cDNA library was constructed in plasmid pSPORT1 (Gibco Life Technologies, Cergy Pontoise, France). After completion of screening of 150,000 bacterial colonies, no positive clones were found using the D-E probe. This suggests that the expression of BAS-1 in human cells may be very low.
Příklad 5: Prozkoumávání knihovny XgtlO bakteriofága lidské sleziny.Example 5: Human Spleen Bacteriophage XgtlO Library Screening.
Pro zkoumání většího množství klonů byla použita knihovna XgtlO bakteriofága lidské sleziny (Clontech). Po prozkoumání 2,4 x 106 klonů bylo identifikováno 8 pozitivních klonů. Ty byly izolovány, přečištěny a subklonovány do plazmidu pME18S (DNAX, Palo Alto, CA). Po sekvenování byly nalezeny dva klony S2 a LI, které označují celou délku lidského BAS-1 (viz SEQ ID NO: 1). Celá délka izolované lidské BAS-1 cDNA je asi 2635 bp a kóduje protein o velikosti asi 661 aminokyselin. Tento proteinový produkt obsahuje kolem 11 potenciálních glykosylačních míst a kolem 22 repetic bohatých na leucin. Kódovaná oblast této lidské BAS-1 cDNA sdílí kolem 72 % homologií s kódovanou oblastí myší RP105 sekvence a tato úplná BAS1 cDNA má 67% homologií s úplnou myší cDNA sekvencí. Aminokyselinová homologie mezi lidskou BAS-1 a myší RP105 je asi 73,5 %.A human spleen bacteriophage XgtlO library (Clontech) was used to screen a larger number of clones. After screening 2.4 x 10 6 clones, 8 positive clones were identified. These were isolated, purified, and subcloned into plasmid pME18S (DNAX, Palo Alto, CA). After sequencing, two clones, S2 and LI, were found to represent the full length of human BAS-1 (see SEQ ID NO: 1). The full length of the isolated human BAS-1 cDNA is about 2635 bp and encodes a protein of about 661 amino acids. This protein product contains about 11 potential glycosylation sites and about 22 leucine-rich repeats. The coding region of this human BAS-1 cDNA shares about 72% homology with the coding region of the mouse RP105 sequence, and this complete BAS1 cDNA has 67% homology with the complete mouse cDNA sequence. The amino acid homology between human BAS-1 and mouse RP105 is about 73.5%.
Příklad 6: Exprese lidského BAS-1 proteinu.Example 6: Expression of human BAS-1 protein.
Všechny konstrukty byly vytvořeny odstraněním 5' a 3' nekódujících oblastí a přidáním Marylin Kozák (Ref: J. Biol. Chem. 266: 19867, 1991) konsenzusové sekvence (ACCATGG, SEQ ID NO: 3), aby se zvýšila translační hladina.All constructs were made by removing the 5' and 3' non-coding regions and adding the Marylin Kozák (Ref: J. Biol. Chem. 266: 19867, 1991) consensus sequence (ACCATGG, SEQ ID NO: 3) to increase the level of translation.
Rozpustný BAS-1-FLAG protein byl dočasně exprimován do Cos 7 buněk. Rekombinantní forma BAS-1 s FLAG peptidem na karboxylovém konci (Hoppe et al. (1988) Biotechnology 6:Soluble BAS-1-FLAG protein was transiently expressed in Cos 7 cells. A recombinant form of BAS-1 with a FLAG peptide at the carboxyl terminus (Hoppe et al. (1988) Biotechnology 6:
• ♦ 9 • · ···· · · · 9 9 999 999• ♦ 9 • · ···· · · · 9 9 999 999
9 9 9 9 9 9 9 9 ·· · ·· ·· ·· ··9 9 9 9 9 9 9 9 ·· · ·· ·· ·· ··
1205 - 1210) byla vložena do expresního vektoru pME18S a následně elektroporací transfektována do Cos-7 buněk. Elektroporované buňky rostly vDMEM médiu doplněném buď:**”:1205 - 1210) was inserted into the expression vector pME18S and subsequently transfected into Cos-7 cells by electroporation. Electroporated cells were grown in DMEM medium supplemented with either:**”:
« · · ·«
1% Nutridoma HU (Boehringer Mannheim, Mannheim, Germany) nebo v samotném DMEM; ·’· • ♦ · médiu po dobu 5 dnů. · ··♦» • · • 9 999 91% Nutridoma HU (Boehringer Mannheim, Mannheim, Germany) or in DMEM alone; ·'· • ♦ · medium for 5 days. · ··♦» • · • 9,999 9
99
Příklad 7: Purifikace rozpustného BAS-1 Flag proteinu.Example 7: Purification of soluble BAS-1 Flag protein.
• · • · ·• · • · ·
Běžně bylo 280 ml supernatantu obsahující rozpustný BAS-1 FLAG dán na 20 ml kolonu s Cu2+*····* · 9 ionty připojenými na Chelating Sepharose Fast Flow matrici (Pharmacia, Upsalla, Sweden). Ρο*·ϊ··’ promytí 16 objemy vazebného pufru (His-Bind Buffer Kit, Novagen, Madison, WI), byly proteiny zachycené na kovové ionty eluovány gradientem 20 až 100 mM imidazolu. Obsah lidského BAS-1 FLAG veluátové frakci byl stanoven metodou tečkového přenos s použitím anti-FLAG monoklonální protilátky M2 (Eastman Kodak, New Haven, CT) a Coomassie blue a stříbrem obarvenou SDS-PAGE. Frakce BAS-1 FLAG proteinu byly poté spojeny dohromady a dialyzovány proti PBS. Jak bylo předem odhadnuto z aminokyselinových sekvencí metodou Westernová přenosu, obohacený lidský BAS-1 odpovídá proteinům o velikosti kolem 95 a 97 kD.Typically, 280 ml of supernatant containing soluble BAS-1 FLAG was applied to a 20 ml column with Cu 2+ *····* · 9 ions attached to a Chelating Sepharose Fast Flow matrix (Pharmacia, Upsalla, Sweden). After washing with 16 volumes of binding buffer (His-Bind Buffer Kit, Novagen, Madison, WI), proteins captured on metal ions were eluted with a gradient of 20 to 100 mM imidazole. The human BAS-1 FLAG content of the veluate fraction was determined by dot blotting using anti-FLAG monoclonal antibody M2 (Eastman Kodak, New Haven, CT) and Coomassie blue and silver-stained SDS-PAGE. Fractions of BAS-1 FLAG protein were then pooled together and dialyzed against PBS. As previously estimated from amino acid sequences by Western blotting, the enriched human BAS-1 corresponds to proteins of around 95 and 97 kD.
Příklad 8: Stabilní exprese membránového BAS-1 v NIH-3T3 buňkách.Example 8: Stable expression of membrane BAS-1 in NIH-3T3 cells.
Přírodní membránová forma byla subklonována do expresního vektoru pMAMneo (Clontech,The native membrane form was subcloned into the expression vector pMAMneo (Clontech,
Palo Alto, California), který obsahuje RSV-LTR zesilovač připojený na dexamethason induktivní MMTV-LTR promotor. Tento konstrukt byl poté elektroporací transfektován do NIH3T3 buněk. Transfektované NIH-3T3 buňky byly přeočkovány na selektivní 0,5 mg/mi Geneticin (G418) (Boehringer-Mannheim, Mannheim, Germany) DMEM médium doplněné 10% Fetal Calf sérem.Palo Alto, California), which contains the RSV-LTR enhancer linked to the dexamethasone-inducible MMTV-LTR promoter. This construct was then transfected into NIH3T3 cells by electroporation. Transfected NIH-3T3 cells were plated on selective 0.5 mg/ml Geneticin (G418) (Boehringer-Mannheim, Mannheim, Germany) DMEM medium supplemented with 10% Fetal Calf serum.
Biochemická charakterizace membránového BAS-1 proteinu v těchto stabilních transfektovaných NIH-3T3 buňkách je provedena metabolickým značením. Buňky byly poté kultivovány 24 hodin v DMEM médiu doplněném 10% Fetal Calf sérem a ΙμΜ dexamethasonem (Sigma, Saint Quentin Fallavier, Francie). Pro značení celulárních proteinů byly poté buňky inkubovány s 35S-Met a 35S-Cys během posledních 12 hodin. Analýzy proteinů za redukčních podmínek na SDS-PAGE dokázaly přítomnost předpokládanho 110 kD proteinu vlyzátu transfektovaných NIH-3T3 buněk, ale nikoliv vlyzátu netransfektovaných NIH-3T3 buněk.Biochemical characterization of the membrane BAS-1 protein in these stably transfected NIH-3T3 cells is performed by metabolic labeling. Cells were then cultured for 24 h in DMEM medium supplemented with 10% Fetal Calf serum and ΙμΜ dexamethasone (Sigma, Saint Quentin Fallavier, France). To label cellular proteins, cells were then incubated with 35 S-Met and 35 S-Cys for the last 12 hours. Protein analyzes under reducing conditions on SDS-PAGE demonstrated the presence of the predicted 110 kD protein in the lysate of transfected NIH-3T3 cells, but not in the lysate of non-transfected NIH-3T3 cells.
·· · • · · · · · ···· • · · · ·· · · · « · • ····· · · · · · ··· ··· • · · ···· · · ·· · ·· · · ♦· · ··· · • · · · · · ···· • · · · ·· · · · « · • ····· · · · · · ··· ··· • · · ···· · · ·· · ·· · · ♦· · ·
Příklad 9: Příprava protilátek specifických proti BAS-1. .*·*’.Example 9: Preparation of Antibodies Specific to BAS-1. .*·*'.
• ·· · • ··· • · · • · ·• ·· · • ··· • · · • · ·
Inbrední Balb/c myši byly intraperitoneálně imunizovány rekombinantními formami lidského .Inbred Balb/c mice were immunized intraperitoneally with recombinant forms of human .
··♦· proteinu. Nejdřív byl získán purifikovaný rozpustný BAS-1 FLAG a dále byly stabilní 5 · transfektované NIH-3T3 buňky. Zvířata byla povzbuzena ve vhodnou dobu proteinem s nebo bez; . ;··♦· protein. First, purified soluble BAS-1 FLAG was obtained and then stable 5· transfected NIH-3T3 cells. Animals were stimulated at appropriate times with or without protein; . ;
·· ·· dalších pomocných látek pro další stimulaci tvorby protilátky. Sérum je získáno nebo hybridomy · • · · jsou produkovány získanými slezinami. *. í.. ’ • *·· ·· other auxiliary substances for further stimulation of antibody formation. Serum is obtained or hybridomas · • · · are produced by obtained spleens. *. í.. ’ • *
Jinak jsou Balb/c myši imunizovány buňkami transformovanými geny nebo fragmenty, buď*.i..· endogenních nebo exogenních buněk, nebo jsou imunizovány vyizolovanými membránami obohacenými o expresi antigenu. Sérum je vhodně získáno běžně po řadě dalších aplikací. Pro vyvolání imunitní odpovědi mohou být použity různé genové terapeutické techniky, např. v produkování proteinu in šitu.Alternatively, Balb/c mice are immunized with gene-transformed cells or fragments of either endogenous or exogenous cells, or are immunized with isolated membranes enriched for antigen expression. The serum is conveniently obtained normally after a series of further applications. Various gene therapy techniques can be used to induce an immune response, eg in the production of a protein in situ.
Mohou být vytvořeny monoklonální protilátky. Například splenocyty jsou spojeny s vhodným fúzním partnerem a hybridomy jsou selektovány v růstovém médiu standardními metodami. Supernatanty hybridomu jsou zkoumány pro zjištění přítomnosti protilátek, které se váží na lidský BAS-1, např. metodou ELIS A nebo dalšími stanoveními. Protilátky, které specificky rozpoznají lidský BAS-1, nikoliv druhové varianty, mohou být rovněž selektovány nebo připraveny.Monoclonal antibodies can be produced. For example, splenocytes are fused to an appropriate fusion partner and hybridomas are selected in growth medium by standard methods. Hybridoma supernatants are examined for the presence of antibodies that bind to human BAS-1, eg, by ELIS A or other assays. Antibodies that specifically recognize human BAS-1, rather than species variants, can also be selected or prepared.
Jinou metodu představují syntetizované peptidy nebo purifikovaný protein imunitního systému, vyvolávající monoklonální nebo polyklonální protilátky. Viz např. Coligan (1991) Current Protcols in Immunology Wiley/Greene a Harlow and Lané (1989) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press. Za vhodných okolností je vazebné činidlo bud’ značeno, jak je uvedeno výše, např. fluorescenčně nebo jinak, nebo je imobilizováno na substrát při panning metodě. Nukleové kyseliny mohou být zavedeny do buněk zvířat, aby docházelo k produkci antigenu, který slouží k vyvolání imunitní odpovědi. Viz např. Wang et al. (1993) Proč. Naťl.Another method is represented by synthesized peptides or purified protein of the immune system, inducing monoclonal or polyclonal antibodies. See, e.g., Coligan (1991) Current Protocols in Immunology Wiley/Greene and Harlow and Lané (1989) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press. In appropriate circumstances, the binding agent is either labeled as above, eg fluorescently or otherwise, or is immobilized on the substrate by a panning method. Nucleic acids can be introduced into animal cells to produce an antigen that serves to elicit an immune response. See, for example, Wang et al. (1993) Why. Nachl.
Acad. Sci. 90: 4156 - 4160, Barry et al. (1994) BioTechniques 16: 616 - 619 a Xiang et al.Acad. Sci. 90: 4156-4160, Barry et al. (1994) BioTechniques 16: 616-619 and Xiang et al.
(1995) Immunity 2: 129 - 135.(1995) Immunity 2: 129–135.
Příklad 10: Velkoobjemová produkce BAS-1 v NSO buňkách.Example 10: Large-scale production of BAS-1 in NSO cells.
Velké množství rozpustného BAS-1 a rozpustného BAS-1 FLAG může být produkováno ze stabilních transformantů NSO buněk připravených např. podle metodologie rozpracované v Celltech (Slough, Berkshire, UK, International Patent Applications WQ86/05807, WO87/04462, • · · · · · φφφ · · · · · · · φφφφ ·· · · φ φ · • · ···· · · · · · ··· φφφ φφφ · · · · · · ·· · · · « φ φφ φφLarge amounts of soluble BAS-1 and soluble BAS-1 FLAG can be produced from stable transformants of NSO cells prepared, for example, according to the methodology developed by Celltech (Slough, Berkshire, UK, International Patent Applications WQ86/05807, WO87/04462, • · · · · · φφφ · · · · · · · φφφφ ·· · · φ φ · • · ···· · · · · · ··· φφφ φφφ · · · · · · ·· · · · « φ φφ φφ
W089/01036 a W089/10404). Oba BAS-1 a BAS-1 FLAG byly subklonovány do pEE12 a následně transfektovány elektroporaci do NSO buněk. Transfektované NSO buňky bylyj*”*·WO89/01036 and WO89/10404). Both BAS-1 and BAS-1 FLAG were subcloned into pEE12 and subsequently transfected by electroporation into NSO cells. Transfected NSO cells werej*”*·
ΦΦΦ · naočkovány do selektivního DMEM bez glutaminu doplněného 10% Fetal Calf sérem, jak jeí popsána v Celltechově protokolu. Supernatanty z nejlépe produkující linie byly použity *.ΦΦΦ · inoculated into selective DMEM without glutamine supplemented with 10% Fetal Calf serum, as described in the Celltech protocol. Supernatants from the best producing line were used *.
ΦΦΦΦ v biologických analýzách a purifikaci rozpustného BAS-1 a rozpustného BAS-1 -FLAG.ΦΦΦΦ in biological assays and purification of soluble BAS-1 and soluble BAS-1 -FLAG.
Pro větší produkci rekombinantních proteinů mohou být použity i další expresní systémy. J . ίOther expression systems can also be used for greater production of recombinant proteins. J. ί
Příklad 11: Produkce fuze proteinů s BAS-1.Example 11: Production of fusion proteins with BAS-1.
<<
Byla vytvořena řada fuzních konstruktů s BAS-1 extracelulární doménou. Tato část genu je připojena na jiný protein, např. FLAG epitopový nádor, Ig doménu nebo na dvouhybridní systémový konstrukt. Viz např. Fields and Song (1989) Nátuře 340: 245 - 246.A number of fusion constructs with the BAS-1 extracellular domain have been generated. This part of the gene is attached to another protein, eg FLAG tumor epitope, Ig domain or to a two-hybrid system construct. See, for example, Fields and Song (1989) Nature 340: 245-246.
Epitopový nádor může být použit v expresním klonování s detekcí vazebného partnera antiFLAG protilátkou, např. ligand pro BAS-1. Jinak Ig domény mohou být použity pro purifikaci použitím látky podobné antigenu s afinitou k ligandu. Dva hybridní systémy mohou být rovněž použity k izolaci proteinů, které se specificky váží na BAS-1.The tumor epitope can be used in expression cloning with detection of a binding partner with an antiFLAG antibody, eg a ligand for BAS-1. Alternatively, the Ig domains can be used for purification using an antigen-like substance with ligand affinity. Two hybrid systems can also be used to isolate proteins that specifically bind to BAS-1.
Příklad 12: Mapování lidského BAS-1 metodou hybridizace in šitu.Example 12: Mapping of human BAS-1 by in situ hybridization.
Byl připraven chromozom. Hybridizace in šitu byla provedena na chromozómovém preparátu získaném z lidských lymfocytů stimulovaných fytohemaglutininem kultivovaných 72 hodin. Pro zaručení dobré kvality posthybridizačních pásů chromozomů byl na posledních 7 hodin kultivace přidán 5-bromdeoxyuridin (60 gg/ml média).A chromosome was prepared. In situ hybridization was performed on a chromosome preparation obtained from phytohemagglutinin-stimulated human lymphocytes cultured for 72 hours. To guarantee good quality of the post-hybridization chromosome bands, 5-bromodeoxyuridine (60 ug/ml medium) was added for the last 7 hours of culture.
655 bp PCR fragment amplifikovaný pomocí primerů, např. odpovídající nukleotidům 395 až 411 a 1027 až 1050, na celkovém B buněčném cDNA templátu, byl klonován do vhodného vektoru. Vektor byl značen 3H posunem jednořetězcového zlomu. Radioaktivně značená sonda hybridizovala do metafáze v konečné koncentraci 200 ng/ml hybridizačního roztoku, jak je popsáno v Mattei et al. (1985) Hum. Genet. 69: 327 - 331.A 655 bp PCR fragment amplified with primers eg corresponding to nucleotides 395 to 411 and 1027 to 1050 of the total B cell cDNA template was cloned into the appropriate vector. The vector was labeled with a 3 H shift of the single-stranded break. The radiolabeled probe hybridized to metaphase in a final concentration of 200 ng/ml hybridization solution as described by Mattei et al. (1985) Hum. Genet. 69: 327–331.
Po polití nukleární stopovou emulzí (KODAK NTB2) byly diapozitivy exponovány 18 dní při 4 °C. Abychom se vyhnuly jakýmkoliv proužkům stříbrných zrnek během vazebné procedury, byl chromozom polit pufrovaným roztokem Giemsa a metafáze vyfotografována. R-pásy byly poté ukázány metodou fluorochromfotolýzy-Giemsa (FPG) a metafáze znova vyfotografovaná před analýzou.After coating with nuclear tracer emulsion (KODAK NTB 2 ), the slides were exposed for 18 days at 4 °C. To avoid any streaks of silver beads during the binding procedure, the chromosome was washed with buffered Giemsa solution and the metaphase was photographed. R-bands were then visualized by fluorochrome photolysis-Giemsa (FPG) and metaphase rephotographed before analysis.
0··· • 00 · · · 00000··· • 00 · · · 0000
0000 00 0 00000000 00 0 0000
0 0000 0 0 0 0 0 000 0000 0000 0 0 0 0 0 000 000
000 0000 0 ·000 0000 0 ·
0 00 00 00 0·0 00 00 00 0·
Ve 100 metafázových buňkách testovaných po hybridizaci in šitu bylo 20 % stříbrných zrn umístěno na chromozomu 5. Rozšíření zrn nebylo náhodné, 67 % žních mapovalo v oblasti;****;In 100 metaphase cells tested after in situ hybridization, 20% of the silver grains were located on chromosome 5. Grain expansion was not random, 67% of the harvesters mapped in the region;****;
0000 ql 1.2-ql3.1 chromozomu 5 dlouhé rameno. Toto mapuje lidský BAS-1 v oblasti 5q 11.2-q 13.15 ΓΪ Π 0 0 0 lidského genomu. .0000 ql 1.2-ql3.1 of chromosome 5 long arm. This maps to human BAS-1 in the 5q 11.2-q 13.15 ΓΪ Π 0 0 0 region of the human genome. .
0000 0 0 • 00000 0 0 • 0
00000000
Příklad 13: Izolace receptorů pro lidský BAS-1. ;* , JExample 13: Isolation of receptors for human BAS-1. ;* , J
0 0 00 0 0
0« • 0 00« • 0 0
Lidský BAS-1 může být použit jako specifické vazebné činidlo pro identifikaci svého vazebného*····’Human BAS-1 can be used as a specific binding agent to identify its binding*····’
00
0 0 partnera, pro jeho výhodnou vazebnou specificitu by měly být použity raději protilátky. Vazebné*,;..* činidlo je buď značeno, jak je popsáno výše, např. fluorescenčně nebo jinak nebo imobilizováno na substrát pro panning metody.0 0 partner, for its advantageous binding specificity, antibodies should be used instead. The binding agent*,;..* is either labeled as described above, eg fluorescently or otherwise, or immobilized on a substrate for panning methods.
Vazebná směs je používána ke sledování expresní knihovny, která byla vytvořena z buněčné linie exprimující vazebného partnera, např. receptor. Standardní barvící techniky jsou použity k detekci nebo zařazení intracelularního nebo exprimováného povrchového receptoru nebo jsou povrchově exprimující transformované buňky sledovány metodou panning. Sledování intracelulární exprese je provedeno řadou barvících nebo imunofluorescenčních postupů. Viz také McMahan et al. (1991) EMBO J. 10: 2821 - 2832.The binding mixture is used to screen an expression library that has been generated from a cell line expressing a binding partner, eg a receptor. Standard staining techniques are used to detect or include an intracellular or surface-expressed receptor, or surface-expressing transformed cells are monitored by panning. Intracellular expression monitoring is performed by a variety of staining or immunofluorescence procedures. See also McMahan et al. (1991) EMBO J. 10: 2821-2832.
Například 0. den předem potáhnout dvoukomorové permanoxové podložní sklíčko fibronektinem 1 ml na komoru, 10 ng/ml vPBS 30 minut při pokojové teplotě. Jednou opláchnout PBS. Poté zaočkovat COS buňkami na 2 - 3 x 105 buněk na komoru v 1,5 ml růstového média. Inkubovat přes noc při 37 °C.For example, on day 0, pre-coat a two-chamber permanox slide with fibronectin 1 ml per chamber, 10 ng/ml in PBS for 30 min at room temperature. Rinse once with PBS. Then inoculate with COS cells at 2 - 3 x 10 5 cells per chamber in 1.5 ml of growth medium. Incubate overnight at 37 °C.
1. den pro každý vzorek připravit 1,5 ml roztoku 66 pg/ml DEAE-dextranu, 66 μΜ chlorquin a 44 pg DNA v séru bez DME. Pro každou sadu byla připravena pozitivní kontrola, např. lidská BAS-1-FLAG cDNA v ředění 1 a 1/200 a negativní kontrola. Buňky opláchnout sérem bez DME. Přidat roztok DNA a inkubovat 5 hodin při 37 °C. Odstranit médium a přidat 0,5 ml 10% DMSO v DME 2,5 minuty. Odstranit a promýt jednou v DME. Přidat 1,5 ml růstového média a inkubovat přes noc.On day 1, for each sample, prepare 1.5 ml of a solution of 66 pg/ml DEAE-dextran, 66 μΜ chlorquine and 44 pg DNA in serum without DME. A positive control, e.g., human BAS-1-FLAG cDNA at 1 and 1/200 dilution and a negative control, were prepared for each set. Rinse cells with DME-free serum. Add the DNA solution and incubate for 5 hours at 37 °C. Remove the medium and add 0.5 ml of 10% DMSO in DME for 2.5 min. Remove and wash once in DME. Add 1.5 ml growth medium and incubate overnight.
2. den vyměnit médium. 3. den nebo 4. den jsou buňky fixovány a obarveny. Buňky opláchnout dvakrát roztokem HBSS (Hank's Buffered Salině Solution) a fixovat 5 minut ve 4% roztoku paraformaldehyd (PFA)/glukóza. Omýt třikrát roztokem HBSS. Po odstranění veškeré kapaliny byla podložní sklíčka uchována pri teplotě -80 °C. V každé komoře bylo provedeno 0,5 ml inkubací následujícím způsobem. Přidat na 20 minut roztok HBSS/saponin (0,1%) s 32 μΐ/ml 1M NaN3 Buňky byly poté jedenkrát promyty roztokem HBSS/saponin. K buňkám přidat lidský BAS-1 nebo komplex BAS-1/protilátka a inkubovat 30 minut. Buňky promýt dvakrát roztokem ··· · ·· · • · · · · · 99·· ···· ·· · · · · · « · ···· · · · · · ··· ··« · · · · 9 · · • 9 · ·· ·· ·· ··On day 2, replace the medium. On day 3 or day 4, cells are fixed and stained. Rinse cells twice with HBSS (Hank's Buffered Saline Solution) and fix for 5 minutes in 4% paraformaldehyde (PFA)/glucose solution. Wash three times with HBSS solution. After all liquid was removed, the slides were stored at -80°C. In each chamber, 0.5 ml was incubated as follows. Add HBSS/saponin solution (0.1%) with 32 μΐ/ml 1M NaN 3 for 20 minutes. Cells were then washed once with HBSS/saponin solution. Add human BAS-1 or BAS-1/antibody complex to the cells and incubate for 30 min. Wash cells twice with solution ··· · ·· · • · · · · · 99·· ···· ·· · · · · · « · ···· · · · · · ··· ··« · · · · 9 · · • 9 · ·· ·· ·· ··
HBSS/saponin. Je-li vhodné, přidat na 30 minut první protilátku. Přidat druhou protilátku, např.HBSS/saponin. If appropriate, add the first antibody for 30 minutes. Add a second antibody, e.g.
vektor protilátky proti myším v ředění 1/200 a inkubovat 30 minut. Připravit ELISA roztok,;****;anti-mouse antibody vector at a dilution of 1/200 and incubate for 30 minutes. Prepare ELISA solution,;****;
···· např. vektor elitní ABC křenový peroxidázový roztok a předem inkubovat 30 minut. Použít; !*!···· e.g. vector elite ABC horseradish peroxidase solution and pre-incubate for 30 minutes. Use; !*!
• · · například 1 kapku roztoku A (avidin) a 1 kapku roztoku B (biotin) na 2,5 ml HBSS/saponin. · ····• · · for example, 1 drop of solution A (avidin) and 1 drop of solution B (biotin) per 2.5 ml of HBSS/saponin. · ····
Buňky promýt dvakrát roztokem HBSS/saponin. Přidat ABC HRP roztok a inkubovat 30 minut *....* • ·Wash cells twice with HBSS/saponin solution. Add ABC HRP solution and incubate for 30 minutes *....* • ·
Buňky promýt dvakrát roztokem HBSS, podruhé promývat po dobu 2 minut, čímž se buňky!...J uzavřou. Poté přidat na 5 až 10 minut vektor diaminbenzoové kyseliny (DAB). Použít 2 kapky *., pufru s 4 kapkami DAB a 2 kapkami H2O2 na 5 ml destilované vody. Opatrně odstranit komoru a ····* omýt sklíčko vodou. Na vzduchu osušit na několik minut, poté přidat 1 kapku Crystal Mount a*··* přikrýt krycím sklíčkem. Sušit 5 minut při 85 až 90 °C.Wash the cells twice with HBSS solution, wash the second time for 2 min to seal the cells!...J. Then add diamine benzoic acid (DAB) vector for 5 to 10 minutes. Use 2 drops of *., buffer with 4 drops of DAB and 2 drops of H 2 O 2 per 5 ml of distilled water. Carefully remove the chamber and ····* wash the slide with water. Air dry for a few minutes, then add 1 drop of Crystal Mount and*··* cover with a coverslip. Dry for 5 minutes at 85 to 90 °C.
Vyhodnotit pozitivní barvení a postupně subklon pro izolaci jednotlivých genů odpovědných za vazbu.Evaluate positive staining and gradually subclone to isolate individual genes responsible for binding.
Nebo jsou BAS-1 činidla používána k afinitní purifikaci nebo výběru buněk exprimujících receptor. Viz např. Sambrook et al. nebo Ausubel et al.Alternatively, BAS-1 reagents are used to affinity purify or select cells expressing the receptor. See, for example, Sambrook et al. or Ausubel et al.
Dalším způsobem je sledování membránově vázaného receptoru metodou panning. Receptor cDNA je zkonstruován, jak je popsáno výše. Ligand může být imobilizován a použit k imobilizaci exprimujících buněk. Imobilizace může být dosaženo použitím vhodných protilátek, které rozeznají např. FLAG sekvenci BAS-1 fuzního konstruktu nebo použitím protilátek vybraných proti prvním protilátkám. Znovu použitelné cykly selekce a amplifikace vedou k obohacení vhodných klonů a konečné izolaci receptorů exprimujících klony.Another method is tracking the membrane-bound receptor by the panning method. The receptor cDNA is constructed as described above. The ligand can be immobilized and used to immobilize expressing cells. Immobilization can be achieved by using suitable antibodies that recognize e.g. the FLAG sequence of the BAS-1 fusion construct or by using antibodies selected against the first antibodies. Reusable cycles of selection and amplification lead to enrichment of suitable clones and ultimate isolation of receptor expressing clones.
Fágové expresní knihovny mohou být zkoumány lidským BAS-1. Vhodné techniky značení např. anti-FLAG protilátky, umožňují specifické značení vhodných klonů.Phage expression libraries can be screened by human BAS-1. Suitable labeling techniques, e.g. anti-FLAG antibodies, allow specific labeling of suitable clones.
Všechny uvedené citace jsou zahrnuty v referencích ve stejném rozsahu, jako by jednotlivé publikace nebo patentové přihlášky byly konkrétně a jednotlivě uvedeny, aby byly zahrnuty v referencích.All cited citations are incorporated by reference to the same extent as if the individual publications or patent applications were specifically and individually indicated to be incorporated by reference.
Může být vypracováno mnoho modifikací a variací tohoto vynálezu bez odchýlení se od jeho podstaty a sféry působnosti, jak bude zřejmé odborníkům v oboru. Specifické příklady zde popsané jsou předloženy pouze ve formě příkladů a vynález může být limitován termíny doplněnými nároky spolu s celou řadou ekvivalentů, na které tyto nároky poukazují.Many modifications and variations of this invention may be made without departing from its spirit and scope, as will be apparent to those skilled in the art. The specific examples described herein are presented by way of example only, and the invention may be limited by the terms appended to the claims along with the full range of equivalents to which those claims point.
9999 • 9 · · · · · 49999 • 9 · · · · · 4
999 999999,999
SEZNAM SEKVENCI (1) OBECNE INFORMACE:LIST OF SEQUENCES (1) GENERAL INFORMATION:
(i) PŘIHLAŠOVATEL: Schering Corporation (ii) NÁZEV VYNÁLEZU: Izolovaná a rekombinantní nukleová kyselina, BAS-1 protein nebo peptid a prostředek, protilátka, expresní vektor, hostitelská buňka a způsoby jejich použití (iii) POČET SEKVENCÍ: 3 (iv) KONTAKTNÍ ADRESA:(i) APPLICANT: Schering Corporation (ii) TITLE OF THE INVENTION: Isolated and Recombinant Nucleic Acid, BAS-1 Protein or Peptide and Agent, Antibody, Expression Vector, Host Cell and Methods of Use Thereof (iii) NUMBER OF SEQUENCES: 3 (iv) CONTACT ADDRESS:
(A) ADRESA: Schering-Plough Corporation (B) ULICE: 2000 Galloping Hill Road (C) MĚSTO: Kenilworth (D) STÁT: New Jersey (E) ZEMĚ: USA (F) PSČ: 07033 (v) DRUH POČÍTAČOVÉHO ZPRACOVÁNÍ:(A) ADDRESS: Schering-Plough Corporation (B) STREET: 2000 Galloping Hill Road (C) CITY: Kenilworth (D) STATE: New Jersey (E) COUNTRY: USA (F) ZIP CODE: 07033 (v) TYPE OF COMPUTER PROCESSING:
(A) TYP MÉDIA: Floppy disk (B) POČÍTAČ: Macintosh (C) OPERAČNÍ SYSTÉM: 7.5.3 (vi) SOUČASNÉ DATUM PŘIHLÁŠKY:(A) MEDIA TYPE: Floppy disk (B) COMPUTER: Macintosh (C) OPERATING SYSTEM: 7.5.3 (vi) CURRENT APPLICATION DATE:
(A) ČÍSLO PŘIHLÁŠKY:(A) APPLICATION NUMBER:
(B) DATUM PODÁNÍ:(B) FILING DATE:
(vii) PŘEDCHOZÍ DATUM PŘIHLÁŠKY:(vii) PREVIOUS APPLICATION DATE:
(A) ČÍSLO PŘIHLÁŠKY (B) DATUM PODÁNÍ: 17.5. 1996 (viii) INFORMACE O PRÁVNÍM ZÁSTUPCI A AGENTOVI:(A) APPLICATION NUMBER (B) SUBMISSION DATE: 17.5. 1996 (viii) LEGAL REPRESENTATIVE AND AGENT INFORMATION:
9999 • 9«·9999 • 9«·
9 9 • 9 ·9 9 • 9 ·
9 jeho *9 his *
9999 9 99999 9 9
99
99999999
99
99
9 99 9
99 • 9 «99 • 9 «
99999999
99
9 99 9
9« «9« «
9 9 9 (A) JMÉNO: Cynthia L. Foulke, Esq.9 9 9 (A) NAME: Cynthia L. Foulke, Esq.
(B) REGISTRAČNÍ ČÍSLO: 32,364 (C) ČÍSLO POSUDKU: DX0580PCT (ix) TELEKOMUNIKAČNÍ INFORMACE:(B) REGISTRATION NUMBER: 32,364 (C) CERTIFICATE NUMBER: DX0580PCT (ix) TELECOMMUNICATION INFORMATION:
(A) TELEFON: 908-298-2987 (B) FAX: 908-298-5388 (2) INFORMACE PRO SEQ ID NO: 1 (i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCE:(A) TELEPHONE: 908-298-2987 (B) FAX: 908-298-5388 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1 (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 2635 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) ŘETĚZEC: jednoduchý (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (ix) ZNAK:(A) LENGTH: 2635 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) CHAIN: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA (ix) CHARACTER:
(A) NÁZEV/KLÍČ: CDS (B) POLOHA: 97..2082 (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 1:(A) NAME/KEY: CDS (B) POSITION: 97..2082 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 1:
ATTCCGGCGG CTGCCAAATT GCCAGGGCCT TCACAGTTTG ATTCCATTTC TCAGCTCCAA • 4ATTCCGGCGG CTGCCAAATT GCCAGGGCCT TCACAGTTTG ATTCCATTTC TCAGCTCCAA • 4
44444444
4444
4 4 4 4 4 44 4 4 4 4 4
4 4 4 4 4 4 « · 4 4 444 4444 4 4 4 4 4 « · 4 4 444 444
4 4 4 · ·4 4 4
44 44 4444 44 44
44444444
GCATTAGGTA AACCCACCAA GCAATCCTAG CCTGTG ATG GCG TTT GAC GTC AGC 114GCATTAGGTA AACCCACCAA GCAATCCTAG CCTGTG ATG GCG TTT GAC GTC AGC 114
44 444 4
4 4 44 4 4
4 44 4
4 44 4
44
44444444
4 44 4
4 44 4
44444444
44
4 ·4·
44944494
4444 * 9 44444 * 9 4
4 4 44 4 4
4444444444
4 44 4
4 ·♦ • 4 9·· • 4 4 44 ·♦ • 4 9·· • 4 4 4
4 444 4444,444,444
4 44 4
9999
10261026
11701170
»» ··»»»» ··»»
18421842
CTTGAA GGC TCG GAG GAG ACA CGT GTG CAA AAC CCG CCA TCT CTA AGG 1938 ·· · ·· ···· •···» * • · · · ··· ··· • «· · · · ·· ·· »♦ ♦·CTTGAA GGC TCG GAG GAG ACA CGT GTG CAA AAC CCG CCA TCT CTA AGG 1938 ·· · ·· ···· •···» * • · · · ··· ··· • «· · · · ·· · · »♦ ♦·
26222622
GAAAAGCATA ΑΤΑ 2635 (2) INFORMACE PRO SEQ ID NO: 2 (i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCE:GAAAAGCATA ΑΤΑ 2635 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2 (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DÉLKA: 661 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO.2.(A) LENGTH: 661 amino acids (B) TYPE: amino acid (D) TOPOLOGY: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: protein (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO.2.
Met Ala Phe Asp Val Ser Cys Phe Phe Trp Val Val Leu Phe Ser Ala 1.5 10 15Met Ala Phe Asp Val Ser Cys Phe Phe Trp Val Val Leu Phe Ser Ala 1.5 10 15
Gly Cys Lys Val Ile Thr Ser Trp Asp Gin Met Cys Ile Glu Lvs »4· 4 4 ·Gly Cys Lys Val Ile Thr Ser Trp Asp Gin Met Cys Ile Glu Lvs »4· 4 4 ·
········
4 »4 » 4* a » 4 4 a4 »4 » 4* a » 4 4 a
444 44a a444 44a a
4444
370370
385385
390390
395395
400 • ·· · • · ···« • » • ·400 • ·· · • · ···« • » • ·
Leu Asn. Leu Ser His Asn Glu Pro Leu Gly Leu Gin Ser Gin Ala Phe 405 410 415Leu Asn. Leu Ser His Asn Glu Pro Leu Gly Leu Gin Ser Gin Ala Phe 405,410,415
Lys Glu Cys Pro Gin Leu Glu Leu Leu Ašp Leu Ala Phe Thr Arg Leu 420 425 430Lys Glu Cys Pro Gin Leu Glu Leu Leu Asp Leu Ala Phe Thr Arg Leu 420 425 430
His Ile Asn Ala Pro Gin Ser Pro Phe Gin Asn Leu His Phe Leu Gin 435 440 445 • 4 • · · • · * ···♦ • « • * · • ·· ·His Ile Asn Ala Pro Gin Ser Pro Phe Gin Asn Leu His Phe Leu Gin 435 440 445 • 4 • · · • · * ···♦ • « • * · • ·· ·
Val Leu Asn Leu Thr Tyr Cys Phe Leu Asp Thr Ser Asn Gin His Leu 450 455 460Val Leu Asn Leu Thr Tyr Cys Phe Leu Asp Thr Ser Asn Gin His Leu 450 455 460
Leu Ala Gly Leu Pro Val Leu Arg His Leu Asn Leu Lys Gly Asn His 465 470 475 480Leu Ala Gly Leu Pro Val Leu Arg His Leu Asn Leu Lys Gly Asn His 465 470 475 480
Phe Gin Asp Gly Thr Ile Thr Lys Thr Asn Leu Leu Gin Thr Val Gly 485 490 495Phe Gin Asp Gly Thr Ile Thr Lys Thr Asn Leu Leu Gin Thr Val Gly 485 490 495
Ser Leu Glu Val Leu Ile Leu Ser Ser Cys Gly Leu Leu Ser Ile Asp 500 505 510Ser Leu Glu Val Leu Ile Leu Ser Ser Cys Gly Leu Leu Ser Ile Asp 500 505 510
Gin Gin Ala Phe His Ser Leu Gly Lys Met Ser His Val Asp Leu SerGin Gin Ala Phe His Ser Leu Gly Lys Met Ser His Val Asp Leu Ser
515 ,, 520 525515 ,, 520 525
His Asn Ser Leu Thr Cys Asp Ser Ile Asp Ser Leu Ser His Leu LysHis Asn Ser Leu Thr Cys Asp Ser Ile Asp Ser Leu Ser His Leu Lys
530 535 540530 535 540
Gly Ile Tyr Leu Asn Leu Ala Ala Asn Ser Ile Asn Ile Ile Ser Pro 545 550 555 560Gly Ile Tyr Leu Asn Leu Ala Ala Asn Ser Ile Asn Ile Ile Ser Pro 545 550 555 560
Arg Leu Leu Pro Ile Leu Ser Gin Gin Ser Thr Ile Asn Leu Ser His 565 570 575Arg Leu Leu Pro Ile Leu Ser Gin Gin Ser Thr Ile Asn Leu Ser His 565 570 575
Asn Pro Leu Asp Cys Thr Cys Ser Asn Ile His Phe Leu Thr Trp Tyr 580 585 590Asn Pro Leu Asp Cys Thr Cys Ser Asn Ile His Phe Leu Thr Trp Tyr 580 585 590
Lys Glu Asn Leu His Lys Leu Glu Gly Ser Glu Glu Thr Arg Val Gin 595 600 605Lys Glu Asn Leu His Lys Leu Glu Gly Ser Glu Glu Thr Arg Val Gin 595 600 605
Asn Pro Pro Ser Leu Arg Gly Val Lys Leu Ser Asp Val Lys Leu Ser 610 615 620Asn Pro Pro Ser Leu Arg Gly Val Lys Leu Ser Asp Val Lys Leu Ser 610 615 620
Cys Gly Ile Thr Ala Ile Gly Ile Phe Phe Leu Ile Val Phe Leu Leu 625 630 635 640Cys Gly Ile Thr Ala Ile Gly Ile Phe Phe Leu Ile Val Phe Leu Leu 625 630 635 640
Leu Leu Ala Ile Leu Leu Phe Phe Ala Val Lys Tyr Leu Leu Arg Trp 645 650 655Leu Leu Ala Ile Leu Leu Phe Phe Ala Val Lys Tyr Leu Leu Arg Trp 645 650 655
Lys Tyr Gin His PheLys Tyr Gin His Phe
660 (2) INFORMACE PRO SEQ ID NO: 3:660 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCE· (A) DÉLKA: 7 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) ŘETĚZEC: jednoduchý • 9 9 ♦ * · • · · · • · · · · · • · · ·(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS· (A) LENGTH: 7 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) STRAND: single • 9 9 ♦ * · • · · · • · · · · · • · · ·
•9 «949 • · 9 · ·•9 «949 • · 9 · ·
9 * 9 99 * 9 9
9 9 9 «99 9 9 «9
99 « 9 9 9 » 9 9 999 « 9 9 9 » 9 9 9
999 999999,999
99
99 (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 399 (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: cDNA (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 3
ACCATGG 7ACCATGG 7
9999 • · • 99999 • · • 9
99999999
999999
9 9 • 9 99 9 • 9 9
9 •9 •
9999 9 99999 9 9
99
99999999
99
99
9 ·9 ·
9999
9 99 9
9 99 9
99999999
99
9 99 9
9 99 9
99999999
Ρΐ/ΜΓ»- Ή • · · · « fc fcfc • · · · « • fc fcfc » fcfc I » ·· a ··· ·· a • a ·· ·· »· · ·· «fcfcfc • fcfc · · · • · · · · · « • · ···· fc · · · · fc · · ···· • fc · fcfc ·· • fc fcfc ύ t · · fc · · · •fcfc ··· « · ·« ·· /fcgrs-Ρΐ/ΜΓ»- Ή • · · · « fc fcfc • · · · « • fc fcfc » fcfc I » ·· a ··· ·· a • a ·· ·· »· · ·· «fcfcfc • fcfc · · · • · · · · · « • · ···· fc · · · · fc · · ···· • fc · fcfc ·· • fc fcfc ύ t · · fc · · · •fcfc ··· « · ·« ·· /fcgrs-
Claims (26)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US64955396A | 1996-05-17 | 1996-05-17 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ365098A3 true CZ365098A3 (en) | 1999-06-16 |
Family
ID=24605301
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ983650A CZ365098A3 (en) | 1996-05-17 | 1997-05-15 | Isolated and recombinant nucleic acid, bas-1 protein or peptide thereof and preparation, antibody, expression vector, host cell as well as processes of their use |
Country Status (13)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0910636A1 (en) |
JP (1) | JP2000514281A (en) |
KR (1) | KR20000011101A (en) |
AU (1) | AU722499B2 (en) |
BR (1) | BR9710968A (en) |
CA (1) | CA2254843A1 (en) |
CZ (1) | CZ365098A3 (en) |
IL (1) | IL126811A0 (en) |
NO (1) | NO985339L (en) |
NZ (1) | NZ332598A (en) |
PL (1) | PL329930A1 (en) |
SK (1) | SK157498A3 (en) |
WO (1) | WO1997044452A1 (en) |
Families Citing this family (70)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5780609A (en) * | 1995-10-19 | 1998-07-14 | Smithkline Beecham Corporation | DNA sequence of human RP-105 |
SI2489364T1 (en) | 2003-11-06 | 2015-04-30 | Seattle Genetics, Inc. | Monomethylvaline compounds conjugated to antibodies |
CA2567520A1 (en) | 2004-06-01 | 2005-12-15 | Genentech, Inc. | Maytansinoid-antibody conjugates |
US20100111856A1 (en) | 2004-09-23 | 2010-05-06 | Herman Gill | Zirconium-radiolabeled, cysteine engineered antibody conjugates |
EP3088004B1 (en) | 2004-09-23 | 2018-03-28 | Genentech, Inc. | Cysteine engineered antibodies and conjugates |
US8470980B2 (en) | 2009-09-09 | 2013-06-25 | Centrose, Llc | Extracellular targeted drug conjugates |
SI2528625T1 (en) | 2010-04-15 | 2013-11-29 | Spirogen Sarl | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
WO2011156328A1 (en) | 2010-06-08 | 2011-12-15 | Genentech, Inc. | Cysteine engineered antibodies and conjugates |
CN103313990B (en) | 2010-11-17 | 2016-07-20 | 基因泰克公司 | Alanyl maytansinol antibody coupling matter |
RU2638806C2 (en) | 2011-05-12 | 2017-12-15 | Дженентек, Инк. | Lc-ms/ms method for multiple reactions monitoring to identify therapeutic antibodies in animal species using framework signature peptides |
PL2750713T3 (en) | 2011-10-14 | 2016-03-31 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
WO2013130093A1 (en) | 2012-03-02 | 2013-09-06 | Genentech, Inc. | Biomarkers for treatment with anti-tubulin chemotherapeutic compounds |
PL2906298T3 (en) | 2012-10-12 | 2019-04-30 | Adc Therapeutics Sa | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
ES2680153T3 (en) | 2012-10-12 | 2018-09-04 | Adc Therapeutics Sa | Anti-PSMA-pyrrolobenzodiazepine antibody conjugates |
DK2906253T3 (en) | 2012-10-12 | 2018-10-22 | Adc Therapeutics Sa | Pyrrolobenzodiazepine anti-PSMA antibody conjugates |
EP2906296B1 (en) | 2012-10-12 | 2018-03-21 | ADC Therapeutics SA | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
ES2660029T3 (en) | 2012-10-12 | 2018-03-20 | Medimmune Limited | Antibody-pyrrolobenzodiazepine conjugates |
PL2766048T3 (en) | 2012-10-12 | 2015-05-29 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
MX364327B (en) | 2012-10-12 | 2019-04-23 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepine-anti-cd22 antibody conjugates. |
EA032986B1 (en) | 2012-12-21 | 2019-08-30 | Медимьюн Лимитед | Pyrrolobenzodiazepines |
US9562049B2 (en) | 2012-12-21 | 2017-02-07 | Medimmune Limited | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
US9821074B2 (en) | 2013-03-13 | 2017-11-21 | Genentech, Inc. | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
KR102066318B1 (en) | 2013-03-13 | 2020-01-14 | 메디뮨 리미티드 | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
BR112015023333A8 (en) | 2013-03-13 | 2018-04-17 | Medimmune Ltd | pyrrolbenzodiazepines and conjugates thereof |
JP6993084B2 (en) | 2013-08-12 | 2022-02-03 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | 1- (Chloromethyl) -2,3-dihydro-1H-benzo [E] indole dimer antibody-drug conjugate compound, and method of use and treatment |
GB201317982D0 (en) | 2013-10-11 | 2013-11-27 | Spirogen Sarl | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
WO2015052535A1 (en) | 2013-10-11 | 2015-04-16 | Spirogen Sàrl | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
WO2015052534A1 (en) | 2013-10-11 | 2015-04-16 | Spirogen Sàrl | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
EP3054983B1 (en) | 2013-10-11 | 2019-03-20 | Medimmune Limited | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
MX371092B (en) | 2013-12-16 | 2020-01-16 | Genentech Inc | Peptidomimetic compounds and antibody-drug conjugates thereof. |
SG11201604905WA (en) | 2013-12-16 | 2016-07-28 | Genentech Inc | Peptidomimetic compounds and antibody-drug conjugates thereof |
CA2929565A1 (en) | 2013-12-16 | 2015-06-25 | Genentech, Inc. | 1-(chloromethyl)-2,3-dihydro-1h-benzo[e]indole dimer antibody-drug conjugate compounds, and methods of use and treatment |
WO2016037644A1 (en) | 2014-09-10 | 2016-03-17 | Medimmune Limited | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
GB201416112D0 (en) | 2014-09-12 | 2014-10-29 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
CN106714844B (en) | 2014-09-12 | 2022-08-05 | 基因泰克公司 | Anthracycline disulfide intermediates, antibody-drug conjugates and methods |
US10077318B2 (en) | 2014-09-12 | 2018-09-18 | Genentech, Inc. | Cysteine engineered antibodies and conjugates |
MA40575A (en) | 2014-09-17 | 2016-03-24 | Genentech Inc | Pyrrolobenzodiazepines and antibody disulfide conjugates thereof |
CA2968447A1 (en) | 2014-11-25 | 2016-06-02 | Adc Therapeutics Sa | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates and their use to treat neoplasms |
JP6752204B2 (en) | 2014-12-03 | 2020-09-09 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | Quadruple amine compounds and their antibodies-drug conjugates |
GB201506411D0 (en) | 2015-04-15 | 2015-05-27 | Bergenbio As | Humanized anti-axl antibodies |
GB201506402D0 (en) | 2015-04-15 | 2015-05-27 | Berkel Patricius H C Van And Howard Philip W | Site-specific antibody-drug conjugates |
MA43345A (en) | 2015-10-02 | 2018-08-08 | Hoffmann La Roche | PYRROLOBENZODIAZEPINE ANTIBODY-DRUG CONJUGATES AND METHODS OF USE |
MA43354A (en) | 2015-10-16 | 2018-08-22 | Genentech Inc | CONJUGATE DRUG CONJUGATES WITH CLOUDY DISULPHIDE |
MA45326A (en) | 2015-10-20 | 2018-08-29 | Genentech Inc | CALICHEAMICIN-ANTIBODY-DRUG CONJUGATES AND METHODS OF USE |
GB201601431D0 (en) | 2016-01-26 | 2016-03-09 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepines |
GB201602356D0 (en) | 2016-02-10 | 2016-03-23 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepine Conjugates |
GB201602359D0 (en) | 2016-02-10 | 2016-03-23 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepine Conjugates |
WO2017165734A1 (en) | 2016-03-25 | 2017-09-28 | Genentech, Inc. | Multiplexed total antibody and antibody-conjugated drug quantification assay |
GB201607478D0 (en) | 2016-04-29 | 2016-06-15 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepine Conjugates |
PL3458101T3 (en) | 2016-05-20 | 2021-05-31 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Protac antibody conjugates and methods of use |
CN109313200B (en) | 2016-05-27 | 2022-10-04 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | Bioanalytical methods for characterizing site-specific antibody-drug conjugates |
EP3464280B1 (en) | 2016-06-06 | 2021-10-06 | F. Hoffmann-La Roche AG | Silvestrol antibody-drug conjugates and methods of use |
JP7093767B2 (en) | 2016-08-11 | 2022-06-30 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | Pyrrolobenzodiazepine prodrug and its antibody conjugate |
EP3522933B1 (en) | 2016-10-05 | 2021-12-15 | F. Hoffmann-La Roche AG | Methods for preparing antibody drug conjugates |
GB201617466D0 (en) | 2016-10-14 | 2016-11-30 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepine conjugates |
GB201702031D0 (en) | 2017-02-08 | 2017-03-22 | Medlmmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
SI3544636T1 (en) | 2017-02-08 | 2021-08-31 | Adc Therapeutics Sa | Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates |
DK3612537T3 (en) | 2017-04-18 | 2022-08-08 | Medimmune Ltd | PYRROLOBENZODIAZEPIN CONJUGATES |
CN110536703B (en) | 2017-04-20 | 2024-07-12 | Adc治疗有限公司 | Combination therapy using anti-AXL antibody-drug conjugates |
CA3064804A1 (en) | 2017-06-14 | 2018-12-20 | Adc Therapeutics Sa | Dosage regimes for the administration of an anti-cd19 adc |
SI3668874T1 (en) | 2017-08-18 | 2022-04-29 | Medimmune Limited | Pyrrolobenzodiazepine conjugates |
US20200216463A1 (en) | 2017-09-20 | 2020-07-09 | Ph Pharma Co., Ltd. | Thailanstatin analogs |
GB201803342D0 (en) | 2018-03-01 | 2018-04-18 | Medimmune Ltd | Methods |
GB201806022D0 (en) | 2018-04-12 | 2018-05-30 | Medimmune Ltd | Pyrrolobenzodiazepines and conjugates thereof |
GB201814281D0 (en) | 2018-09-03 | 2018-10-17 | Femtogenix Ltd | Cytotoxic agents |
WO2020086858A1 (en) | 2018-10-24 | 2020-04-30 | Genentech, Inc. | Conjugated chemical inducers of degradation and methods of use |
JP2022513198A (en) | 2018-12-10 | 2022-02-07 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | Photocrosslinkable peptide for site-specific conjugation to Fc-containing proteins |
GB201901197D0 (en) | 2019-01-29 | 2019-03-20 | Femtogenix Ltd | G-A Crosslinking cytotoxic agents |
GB2597532A (en) | 2020-07-28 | 2022-02-02 | Femtogenix Ltd | Cytotoxic compounds |
WO2024138128A2 (en) | 2022-12-23 | 2024-06-27 | Genentech, Inc. | Cereblon degrader conjugates, and uses thereof |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5707829A (en) * | 1995-08-11 | 1998-01-13 | Genetics Institute, Inc. | DNA sequences and secreted proteins encoded thereby |
-
1997
- 1997-05-15 IL IL12681197A patent/IL126811A0/en unknown
- 1997-05-15 AU AU30599/97A patent/AU722499B2/en not_active Ceased
- 1997-05-15 WO PCT/US1997/007648 patent/WO1997044452A1/en not_active Application Discontinuation
- 1997-05-15 KR KR1019980709260A patent/KR20000011101A/en not_active Application Discontinuation
- 1997-05-15 EP EP97925468A patent/EP0910636A1/en not_active Withdrawn
- 1997-05-15 PL PL97329930A patent/PL329930A1/en unknown
- 1997-05-15 CA CA002254843A patent/CA2254843A1/en not_active Abandoned
- 1997-05-15 NZ NZ332598A patent/NZ332598A/en unknown
- 1997-05-15 SK SK1574-98A patent/SK157498A3/en unknown
- 1997-05-15 JP JP09542423A patent/JP2000514281A/en active Pending
- 1997-05-15 CZ CZ983650A patent/CZ365098A3/en unknown
- 1997-05-15 BR BR9710968-1A patent/BR9710968A/en unknown
-
1998
- 1998-11-16 NO NO985339A patent/NO985339L/en not_active Application Discontinuation
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU3059997A (en) | 1997-12-09 |
CA2254843A1 (en) | 1997-11-27 |
NO985339L (en) | 1999-01-15 |
PL329930A1 (en) | 1999-04-26 |
KR20000011101A (en) | 2000-02-25 |
SK157498A3 (en) | 1999-10-08 |
WO1997044452A1 (en) | 1997-11-27 |
AU722499B2 (en) | 2000-08-03 |
IL126811A0 (en) | 1999-08-17 |
JP2000514281A (en) | 2000-10-31 |
BR9710968A (en) | 2001-09-04 |
EP0910636A1 (en) | 1999-04-28 |
NZ332598A (en) | 2000-04-28 |
NO985339D0 (en) | 1998-11-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ365098A3 (en) | Isolated and recombinant nucleic acid, bas-1 protein or peptide thereof and preparation, antibody, expression vector, host cell as well as processes of their use | |
US7025962B1 (en) | Mammalian cell surface antigens; related reagents | |
JP4440344B2 (en) | Mammalian cell surface antigens; related reagents | |
US6562333B1 (en) | Purified mammalian CTLA-8 antigens and related reagents | |
JP2001157593A (en) | Mammal chemokine ccf18 and receptor cckr3 | |
US7063841B2 (en) | Mammalian cell surface antigens; related reagents | |
JP2003534013A (en) | Mammalian receptor proteins; related reagents and methods | |
JP2001512017A (en) | Mammalian cell membrane proteins; related reagents | |
JP2002509438A (en) | Isolated dendritic cell membrane protein gene | |
JP2003523179A (en) | Mammalian receptor proteins; related reagents and methods | |
JP2001507219A (en) | Isolated mammalian monocyte cell gene; related reagents | |
JPH09501822A (en) | Purified mammalian FLT3 ligand and agonists and antagonists thereof | |
JP2003501030A (en) | Mammalian receptor proteins; related reagents and methods | |
WO1995006738A1 (en) | B70(b7-2):ctla-4 bonding protein | |
US5811284A (en) | Nucleic acids encoding kp43 protein and antigenic fragments thereof | |
US5965401A (en) | Purified mammalian NK antigens and related reagents | |
ES2301164T3 (en) | SLAM, ANTIGEN COESTIMULATOR OF THE SURFACE OF CELLS T. | |
WO1995002053A1 (en) | Purified components of mammalian transcription regulation complexes, and analogs | |
US6124436A (en) | Purified mammalian monocyte antigens and related reagents | |
WO1997020046A1 (en) | Dnam, an nk antigen and adhesion molecule of the immunoglobulin superfamily | |
CA2163105A1 (en) | Purified mammalian flt3 ligands and agonists and antagonists thereof | |
JP2001511345A (en) | Secreted protein encoded by human chromosome 13 | |
MXPA97003956A (en) | Purified genes that codify antigens of surface of mammali cells, proteins and antibody | |
JP2003500054A (en) | Secreted alpha helix protein-32 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |