CN1753997A - 葡萄糖脱氢酶的制造方法 - Google Patents

葡萄糖脱氢酶的制造方法 Download PDF

Info

Publication number
CN1753997A
CN1753997A CN03824735.6A CN03824735A CN1753997A CN 1753997 A CN1753997 A CN 1753997A CN 03824735 A CN03824735 A CN 03824735A CN 1753997 A CN1753997 A CN 1753997A
Authority
CN
China
Prior art keywords
ala
subunit
gly
leu
pro
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN03824735.6A
Other languages
English (en)
Other versions
CN100540669C (zh
Inventor
早出广司
山冈秀亮
星岛光博
黑坂啓介
川瀬至道
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Arkray Inc
Original Assignee
Arkray Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Arkray Inc filed Critical Arkray Inc
Publication of CN1753997A publication Critical patent/CN1753997A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN100540669C publication Critical patent/CN100540669C/zh
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Lifetime legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明涉及葡萄糖脱氢酶的制造方法。该制造方法是,将含有编码在序列号1记载的具有葡萄糖脱氢活性的α亚单位及作为电子传递蛋白质的β亚单位的序列的DNA导入属于假单胞菌属的微生物中,形成转化体,培养该转化体,产生含有上述β亚单位的第1葡萄糖脱氢酶和不含上述β亚单位的第2葡萄糖脱氢酶。所述α亚单位在例如还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量约为60kDa,所述β亚单位在例如还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量约为43kDa。

Description

葡萄糖脱氢酶的制造方法
技术领域
本发明涉及葡萄糖脱氢酶的制造方法。由该方法得到的葡萄糖脱氢酶,可以用于葡萄糖传感器中。
背景技术
使用对于特定底物有特异反应的酶的生物传感器的开发,不分产业领域地正在盛行起来。作为生物传感器的代表,可以举出主要在医疗领域使用的葡萄糖传感器。
葡萄糖传感器是用于构筑含有酶和电子传递物质的反应体系的器件,在利用该葡萄糖传感器的情况下,例如采用电流分析的方法对葡萄糖进行定量测定。作为酶来说,使用葡萄糖氧化酶(GOD)和葡萄糖脱氢酶(GDH)(日本国特开2002-65778号公报)。
GOD,因为针对葡萄糖的底物特异性高、热稳定性优异、能够实现酶的批量化生产,所以,与其它酶相比,有生产成本低的优点。其反面,使用GOD的体系,因为容易受到测定样品中的溶解氧的影响,所以有溶解氧对测定结果产生影响的问题。
另一方面,使用GDH的体系不易受到测定样品中的溶解氧的影响。因此,使用GDH的体系,即使在氧分压低的环境下进行测定、对要求氧量多的高浓度样品进行测定时,也可以精度高地测定葡萄糖浓度。其反面是GDH有热稳定性差、底物特异性比GOD差的问题。
从这样的情况出发,摸索着弥补GOD和GDH双方的缺点。如国际公开WO02/36779号公报所公开的那样,作为本发明人之一的早出从温泉附近的土壤中分离出新型菌株(Burkhorderia cepacia KS1株),由该菌株取得了新的GDH。该GDH是由α、β、γ亚单位构成的(以下称“CyGDH”),与电子传递物质的反应速度高,在耐热性方面也没有问题,作为葡萄糖传感器用的酶是合适的。
但是,在KS1菌株中,因为CyGDH的生产性差,所以在考虑到工业化应用时,由KS1菌株批量化生产CyGDH是困难的。因此,本发明人等人,将编码α、β、γ亚单位的DNA导入大肠菌中进行表达,高效率地产生GDH。但是,该GDH是由α、γ亚单位构成的,欠缺β亚单位(以下称“αGDH”)。这样,在转化大肠菌的方法中,不能使α、β、γ亚单位全部表达。
本发明人等人,再对αGDH的特性进行了调查,结果是,虽然与CyGDH相比,αGDH与电子传递物质的反应速度小,但是比CyGDH耐热性高,相对于葡萄糖的Km小。即,与CyGDH同样,αGDH是作为葡萄糖传感器用的酶是有用的,这已确认。
目前,在制造这样有用的2种酶时,需要分别进行表达菌株的取得、培养及精制,在制造成本、效率方面是不利的。
发明内容
本发明的目的在于高效率地制造例如在葡萄糖传感器等中能够应用的2种GDH。
本发明的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于,将含有编码在序列号1记载的具有葡萄糖脱氢活性的α亚单位和作为电子传递蛋白质的β亚单位的序列的DNA导入属于假单胞菌属的微生物中,形成转化体,培养该转化体,产生含有上述β亚单位的第1葡萄糖脱氢酶和不含上述β亚单位的第2葡萄糖脱氢酶。
上述α亚单位在例如还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量是约60kDa。另一方面,上述β亚单位,在例如还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量是约43kDa。
上述DNA也可以含有将在还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量是约14kDa的γ亚单位编码的碱基序列。此时,产生上述第1及第2葡萄糖脱氢酶作为含有上述γ亚单位的产物。
作为属于上述假单胞菌属的微生物来说,可以列举恶臭假单胞菌、萤光假单胞菌、铜绿假单胞菌等,但从重组体的安全性方面考虑,优选使用恶臭假单胞菌。
上述DNA例如是属于Burkhorderia属的微生物,可以从具有产生带有葡萄糖脱氢活性的酶的能力的微生物取得。在本发明中采用的属于Burkhorderia属的微生物,如果是属于具有产生该酶能力的Burkhorderia属的微生物,就没有特别的限制,但优选Burkhorderiacepacia,特别优选Burkhorderia cepacia KS1株(以下简称为“KS1株”)。
该KS1株是早出等人从温泉附近的土壤中分离的新型菌株,从其菌学性质鉴定为Burkhorderia cepacia,被命名为KS1株。该KS1株在平成12年9月25日(2000年9月25日)在独立行政法人产业技术综合研究所专利生物保藏中心(
Figure A0382473500071
305-8566日本国茨城县つくば市东1丁目1番地1中央第6)以微生物保藏号第FERM BP-7306号保藏。
另外,对于KS1株以外的株,本发明人等人索取了寄存在财团法人发酵研究所(Institute for Fermentation Osaka,IFO)或理化学研究所微生物系统保存设施(Japan Collection of Microorganisms,JCM)的该Burkhorderia cepacia的几个菌株,测定了葡萄糖脱氢活性,结果确认所有的菌株都有活性。因此,作为用于取得本发明中所使用的DNA的微生物来说,可以采用KS1株以外的Burkhorderia cepacia、例如JCM5506、JCM5507、JCM2800、JCM2801、IFO15124、IFO14595。
上述DNA从Burkhorderia cepacia染色体的DNA分离,但其碱基序列及由该碱基序列编码的氨基酸序列很清楚,所以,基于这些序列,也可以通过化学合成取得。
作为上述α亚单位来说,例如可以采用具有序列号3的氨基酸序列、或在序列号3的氨基酸序列中取代、空缺、插入或加成了一个或多个的氨基酸残基的氨基酸序列的α亚单位。该α亚单位由例如序列号1的碱基序列之中由碱基序号764~2380组成的碱基序列来编码。因此,作为本发明中所使用的DNA来说,优选使用具有上述碱基序列的DNA。
作为上述β亚单位来说,例如可以采用具有序列号5的氨基酸序列、或在序列号5的氨基酸序列中取代、空缺、插入或加成了一个或多个的氨基酸残基的氨基酸序列的β亚单位。该β亚单位由例如序列号1的碱基序列之中由碱性序号2386~3660组成的碱基序列来编码。因此,作为本发明中所使用的DNA来说,优选使用具有上述碱基序列的DNA。
早出等人确认,与只表达α亚单位的情况相比,若使上述γ亚单位与α亚单位一起表达,则可以得到高的酶活性。因此,从酶活性的观点出发,优选表达γ亚单位,在上述DNA中,编码γ亚单位的碱基序列,优选在编码α亚单位的碱基序列的上游区域含有。如果那样,可以认为,在产生α亚单位时,首先表达γ亚单位,作为蛋白质而存在,由此可以在微生物体内高效率地产生α亚单位。
作为上述γ亚单位来说,例如可以采用具有序列号2的氨基酸序列、或在序列号2的氨基酸序列中取代、空缺、插入或加成了一个或多个的氨基酸残基的氨基酸序列的γ亚单位。该γ亚单位由例如序列号1的碱序列之中由碱基序号258~761组成的碱基序列来编码。因此,作为本发明中所使用的DNA来说,优选使用具有上述碱基序列的DNA。
序列号1的碱基序列之中,碱基序号2386以后的碱基序列,推定为编码β亚单位,但碱基序号2386~2451的碱基序列,推定为编码β亚单位的信号肽。推定该信号肽的氨基酸序列是序列号4的氨基酸序号1~22的氨基酸序列。
由于信号肽是用核糖体合成的蛋白质通过内膜而在胞质空间分泌时是必要的肽,所以,如果信号肽存在,则在菌体胞质或培养上清液中含有的蛋白质量就增加。因此,作为上述DNA来说,优选使用含有编码上述β亚单位的信号肽的表达的碱基序列的DNA。
附图说明
图1表示从转化体取得的可溶化部分的Q-Sepharose FF层析法的结果。
图2表示SDS-PAGE的结果。
具体实施方式
以下,具体地说明本发明的葡萄糖脱氢酶的制造方法。
在本制造方法中,包括:取得编码例如α亚单位及β亚单位的表达的DNA的第1工序;将含有该DNA的重组媒介物导入属于假单胞菌属的微生物中形成转化体的第2工序;在培养基上培养该转化体、产生含有β亚单位的葡萄糖脱氢酶(例如CyGDH)和不含β亚单位的葡萄糖脱氢酶(例如αGDH)的第3工序;和,从培养基或微生物中采取葡萄糖脱氢酶的第4工序。
<第1工序(DNA的取得)>
在取得DNA时,首先构筑重组媒介物。重组媒介物通过如下这样来构筑,即,从属于Burkhorderia属的微生物(例如Burkhorderia cepaciaKS1株)分离并精制染色体DNA后、切断该染色体DNA的染色体DNA断片或由PCR等放大的DNA断片与直链的表达媒介物进行结合闭链。
染色体DNA的分离和精制,基于将微生物溶菌而得到的溶菌物来进行。作为溶菌的方法来说,可以列举由例如溶菌酶(lysozyme)等溶菌酶来处理,除了该处理之外,还可以根据需要现时使用蛋白水解酶、其它的酶和十二烷基硫酸钠(SDS)等表面活性剂。而且,还可以组合冻结熔解或法式细胞破碎仪(French press)处理等的物理破碎方法。另一方面,DNA从溶菌物中的分离和精制,可以通过适当组合例如苯酚处理或蛋白水解酶处理的除蛋白处理、核糖核酸酶处理、醇沉淀处理等的方法来进行。
染色体DNA的切断,按照通常方法、例如可以使用超声波处理或限制酶处理来进行。作为限制酶来说,可以使用例如在特定核苷酸序列作用的II型限制酶。
染色体DNA断片和表达媒介物的结合,使用例如DNA连接酶来进行。
作为表达媒介物来说,适合在宿主微生物内从能自律地增殖的噬菌体或质粒作为基因重组用而被构筑。作为噬菌体来说,例如在将后述的大肠杆菌作为宿主微生物时,例示Lambda gt10、Lambda gt11等。另一方面,作为质粒来说,例如在将大肠杆菌作为宿主微生物时,例不pBR322、pUC18、pUC118、pUC19、pUC119、pTrc99A、pBluescript或作为粘粒的SuperCosI等。另外,使用假单胞菌时,例示革兰氏阴性菌用广宿主域媒介物的RSF1010、pBBR122、pCN51等。
接着,在重组媒介物上实施标记,将该重组媒介物移入宿主微生物中,形成转化体。从该转化体,以媒介物的标记和酶活性的表达为指标进行筛选,得到保持含有将GDH编码的基因的重组媒介物的基因给予微生物。
作为宿主微生物来说,只要重组媒介物是稳定的、且能自律地增殖、可以表达外来性基因,就没有特别的限制。一般地,可以使用大肠杆菌DH5α、XL-1Blue MR等。作为在宿主微生物中移入重组媒介物的方法,例如在宿主微生物是大肠杆菌时,可以使用由钙处理的感受态细胞法和电蚀孔法等。
培养基因给予微生物,再从该微生物分离和精制重组媒介物后,从重组媒介物中采集将GDH编码的基因(克隆化断片)。该克隆化断片的采集可以用与采集染色体DNA同样的方法进行。
该克隆化断片,具有编码含葡萄糖脱氢活性的α亚单位和作为电子传递蛋白质的β亚单位的碱基序列。在从Burkhorderia cepacia KS1株得到目标DNA时,克隆化断片,除了编码α亚单位和β亚单位(包括β亚单位的信号肽)的碱基序列以外,还得到作为含有编码γ亚单位的碱基序列的克隆化断片。另外,可以通过如下这样确认,克隆化断片编码α亚单位和β亚单位或者编码γ亚单位,可以用通常的方法解读该克隆化断片的碱基序列。
<第2工序(转化体的形成)>
含有作为目标的DNA的转化体,将在第1工序得到的克隆化断片组入媒介物中后,通过导入属于假单胞菌属的微生物就可以形成。作为属于假单胞菌属的微生物来说,优选使用例如恶臭假单胞菌。向宿主微生物中导入重组媒介物的导入方法,可以用与第1工序中筛选时形成转化体同样的方法进行。
<第3工序(转化体的培养和GDH的产生)>
在第2工序中得到的转化体,为了产生GDH而进行培养。从该转化体同时产生含有β亚单位的GDH和不含β亚单位的GDH。例如,从Burkhorderia cepacia KS1株得到作为目标的DNA时,同时产生具有α、β、γ亚单位的CyGDH和具有α、γ亚单位的αGDH。
转化体的培养形态,考虑宿主的营养生理性质、选择培养条件就可以,多数情况下进行液体培养。工业上进行通气搅拌培养是有利的。
作为培养基的营养源来说,在微生物培养中通常所使用的就可以广泛使用。作为碳源来说,如果是可供应的碳化合物就可以,例如使用葡萄糖、蔗糖、乳糖、麦芽糖、糖蜜、丙酮酸等。作为氮源来说,可供应的氮化合物就可以,例如使用胨、肉提取物、酵母提取物、酪蛋白水解物、豆粕提取物等。其它,根据需要可使用磷酸盐、碳酸盐、硫酸盐、镁、钙、钾、铁、锰、锌等的盐类、特定的氨基酸、特定的维生素等。
培养温度,可以在转化体生长发育、转化体产生GDH的范围内适当变化,但优选是20~42℃左右。预计GDH达到最高产量时、在适当时间结束培养就可以,通常培养时间设为12~72小时。培养基的pH,可以在转化体生长发育、转化体产生GDH的范围内适当变化,但优选是pH为5.0~9.0左右的范围。
<第4工序(GDH的采集)>
GDH的采集,一般按照通常方法,从培养液或转化体中分离含有GDH的溶液后,精制该含有GDH的溶液。
含有GDH的溶液,在GDH存在于菌体内时,通过过滤或离心分离等手段从培养液中采集菌体之后,以机械方法或溶菌酶等酶方法破坏该菌体,根据需要添加EDTA等螯合剂和表面活性剂,使GDH成为可溶化,从而可以得到。另一方面,GDH存在于菌体外(培养液中)时,可以由过滤或离心分离等手段分离培养液和菌体而得到。
含有GDH的溶液的精制,可以从该溶液直接进行,但也可以浓缩该溶液中的GDH之后进行。就浓缩来说,可以由例如减压浓缩、膜浓缩、盐析处理或由亲水性有机溶剂(例如甲醇、乙醇、丙酮)进行分别沉淀来进行。在GDH的浓缩中,加热处理或等电点处理也是有效的精制手段。浓缩液的精制,可以通过适当组合例如过滤、吸附层析法、离子交换层析法、亲和层析法来进行。由此,可以分别地得到含有β亚单位的GDH和不含β亚单位的GDH。
这样得到的精制酶,可以由例如冷冻干燥、真空干燥、喷雾干燥而粉末化,在市场上流通。
实施例
以下,对上述制造方法的具体例子进行说明,同时,由该例实际证明可以得到2种GDH。
<源自Burkhorderia cepacia KS1株的染色体DNA的调制>
源自Burkhorderia cepacia KS1株的染色体DNA,根据通常的方法来调制。即,首先,使用TL液体培养液(聚蛋白胨=10g、酵母提取液=1g、NaCl=5g、KH2PO4=2g、葡萄糖=5g、总量为1L、pH7.2),在34℃温度下,振荡KS1株一个晚上。用离心分离机回收增殖的菌体。在含有10mM NaCl、20mM Tris-HCl(pH8.0)、1mM EDTA、0.5%SDS、100μg/mL的蛋白酶K的溶液中悬浊该菌体,在50℃处理6小时。在该悬浊液中加入等量的苯酚-氯仿,在室温下搅拌10分钟后,用离心分离机回收上清液。在其中加入醋酸钠,使最终浓度为0.3M,将2倍量的乙醇成为双层,使染色体DNA在中间层析出。用玻璃棒捞出析出物,用70%乙醇洗净后,使之溶解在适当量的TE缓冲液中,成为染色体DNA溶液。
<转化体的形成>
以先前得到的染色体DNA为模型,用PCR法放大编码GDH的基因全长。就引物来说,使用了GDH的γ亚单位的N末端部分的序列和GDH的β亚单位的C末端部分的序列。调整在位于各引物的端部的限制酶识别部位切断该DNA断片而得到的断片以及含有trc启动子的DNA断片,与广宿主域媒介物RSF1010结合后,导入大肠杆菌JM109中,用含有50μg/ml链霉素的LB琼脂培养基形成菌落。由所产生的菌落调整质粒,以此为模型,通过使用上述PCR引物的PCR,选择约3.4kb的断片被放大的克隆,通过将其导入恶臭假单胞菌ATCC47054株中,得到作为目标的转化体(GDH表达菌株)。
<转化体的培养和GDH的产生>
转化体的培养,在有氧的培养条件下进行。更具体地说,转化体的培养,使用每1升培养液的组成如表1所示那样调整的7L培养基、在34℃下进行8小时。以9000×g(4℃、10分钟)离心分离该培养液7L而得到了菌体。
表1:培养基组成
  聚蛋白胨   10g
  酵母提取液   1g
  NaCl   5g
  KH2PO4   2g
  葡萄糖   5g
  Einol(ABLE Co.,东京 日本)   0.14g
  Total、蒸馏水   1L
  pH调制   7.2
<GDH的精制>
在10mM的磷酸钾缓冲液(pH6.0)使所得到的菌体分散的状态下,用法式细胞破碎仪(大竹制作所 东京 日本)施加1,500Kg/cm2的压力差进行破坏。以8000×g、10分钟离心分离此时所得到的细胞提取液,除去细胞固形物,得到了粗酶溶液。
粗酶溶液,添加Triton-X100,使最终浓度成为1%。然后,在4℃下缓慢搅拌一个晚上。接着,在超离心(4℃、69800×g、90分钟)后,再离心(4℃、15000×g、15分钟),作为上清液,得到了可溶化部分。
用含有0.2%Triton-X100的10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0)透析该可溶化部分后,将此溶液供给至用含有0.2%Triton-X100的10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0)等量化过的Q-Sepharose FF柱(22mmID×20cmAmershambiosciences)。使蛋白质以直线性梯度来洗脱,使得10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0)中的NaCl的浓度成为0~500mM。其流速为5mL/min。
对于洗脱液,测定每部分GDH活性。图1示意性地表示了该结果。如图1所示的那样,在梯度范围内确认了2个大峰。
GDH的活性测定,基于葡萄糖的脱氢化,通过追踪电子接收体的还原反应来进行。作为电子接收体,使用了2,6-二氯靛酚(DCIP)和菲双甲氧硫酸盐(PMS)。反应在聚乙烯管内以规定的温度来实施。
首先,在20μL的含有0.75mM PMS和0.75mM DCIP的25mM三羟甲基氨基甲烷盐酸缓冲液(pH8.0)中添加5μL酶溶液,准备混合液。该混合液在事前定温放置1分钟。在混合液中加入1μL的2M葡萄糖(最终浓度:77mM),使反应开始,定温放置2分钟。接着,加入100μL的冰冷蒸馏水或120μL的7.5M尿素,将试样冷却。对于该试样,使用超微量测量用比色皿(100μL)和可以用其测量的分光光度计(UV160岛津制作所 京都 日本),随着时间推移地测量基于DCIP还原的退色。测定波长设定为DCIP吸收波长600nm。DCIP的摩尔吸收系数为22.23mM×cm-1。1单位酶(U)定义为,在标准检测条件下,每1分钟氧化1μM葡萄糖的量。蛋白浓度以半限注法测定。
其次,对于2个GDH活性的峰,分别收集部分(fraction),用含有0.2%Triton-X100的10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0、4℃)透析一夜,调整了2种GDH溶液。
对于各自的GDH调整溶液,使用DEAE-5PW柱(8.0mmID×7.5cm东ソ一、东京),进行个别的精制。柱预先用含有0.2%Triton-X100的10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0)平衡化。蛋白质用直线性梯度、流速为1mL/min来洗脱,使得10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0)中的NaCl浓度为0-400mM。收集各个层析法中的GDH活性最高的部分,用含有0.2%Triton-X100的10mM磷酸钾缓冲液(pH8.0)脱盐一夜,得到了2种精制酶(以下,为了方便,称为“第1精制酶”和“第2精制酶”)。
<精制酶的亚单位的特定>
用SDS-PAGE对各精制酶液进行电泳,特定亚单位的分子量。就SDS-PAGE来说,使用Tris-Tricline缓冲液,在8~25%聚丙烯酰胺的梯度凝胶中实施。该凝胶的蛋白质进行科麦西染料染色。通过PhastSystem(Pharmacia),自动地进行分离和展开。由标准蛋白的相对移动度测定了分子质量。
图2表示SDS-PAGE电泳的结果。在图2中,路线1表示分子量标准标记蛋白质的科麦西染料染色,路线2表示第1精制酶的科麦西染料染色,路线3表示第2精制酶的科麦西染料染色。由该图中可以看出,第1精制酶分离为分子量约60kDa、约43kDa和约14kDa的蛋白质。因此,显示出第1精制酶是分子量约60kDa的α亚单位、分子量约43kDa的β亚单位和分子量约14kDa的γ亚单位结合在一起。第2精制酶分离为分子量约60kDa和约14kDa的蛋白质。因此,显示出第2精制酶是分子量约60kDa的α亚单位和分子量约14kDa的γ亚单位结合在一起。SDS-PAGE电泳的结果显示出,第1精制酶和第2精制酶是不同的GDH,同时生成2种GDH。
分别切取由电泳得到的含有α亚单位、β亚单位的带,复制到聚偏氟乙烯膜之后,由氨基酸定序器(岛津制作所、PPSQ-10)解读氨基酸序列。
对于α亚单位来说,确认了在序列号3的氨基酸序列中含有由氨基酸序号2~12组成的11残基构成的肽序列。另一方面,对于β亚单位来说,可以确认序列号5所示的N末端的16残基的氨基酸序列。
<重组媒介物的分析>
从具有GDH活性的恶臭假单胞菌的转化体中提取目标重组媒介物。对于该重组媒介物的插入DNA断片,由通常方法决定碱基序列。其结果是,含有序列号258~3660的碱基序列。
如国际公开WO02/36779号公报等公开的那样,编码α亚单位的碱基序列是序列号1的碱基序列中的碱基序号764~2380的碱基序列,编码β亚单位的碱基序列是序列号1的碱基序列中的碱基序号2386~3660的碱基序列,编码γ亚单位的碱基序列是序列号1的碱基序列中的碱基序号258~761的碱基序列,编码β亚单位的信号肽的碱基序列是序列号1的碱基序列中的碱基序号2386~2451的碱基序列。
因此,确认了目标重组媒介物含有编码α亚单位、β亚单位(包含β亚单位的信号肽)、γ亚单位的碱基序列。另外,对应于各碱基序列的氨基酸序列,对于α亚单位来说,示于序列号3,对于β亚单位来说,示于序列号5,对于γ亚单位来说,示于序列号2,对于β亚单位的信号肽来说,示于序列号4的氨基酸序列中的氨基酸序号1~22。
由以上可以清楚,在本发明中,例如αGDH和CyGDH那样,可以同时而且高效率地制造2种GDH。
                      序列表
<110>早出广司;爱科来株式会社
<120>葡萄糖脱氢酶的制造方法
<130>WO-AR2003-7
<150>JP 2002/253752
<151>2002-8-30
<160>5
<210>1
<211>3706
<212>DNA
<213>Burkhorderia cepacia
<220>
<221>CDS
<222>(258)..(761)
<220>
<221>CDS
<222>(764)..(2380)
<220>
<221>CDS
<222>(2386)..(3660)
<400>1
aagctttctg tttgattgca cgcgattcta accgagcgtc tgtgaggcgg aacgcgacat 60
gcttcgtgtc gcacacgtgt cgcgccgacg acacaaaaat gcagcgaaat ggctgatcgt 120
tacgaatggc tgacacattg aatggactat aaaaccattg tccgttccgg aatgtgcgcg 180
tacatttcag gtccgcgccg atttttgaga aatatcaagc gtggttttcc cgaatccggt 240
gttcgagaga aggaaac atg cac aac gac aac act ccc cac tcg cgt cgc    290
                  Met His Asn Asp Asn Thr Pro His Ser Arg Arg
                    1              5                  10
cac ggc gac gca gcc gca tca ggc atc acg cgg cgt caa tgg ttg caa   338
His Gly Asp Ala Ala Ala Ser Gly Ile Thr Arg Arg Gln Trp Leu Gln
            15                  20                  25
ggc gcg ctg gcg ctg acc gca gcg ggc ctc acg ggt tcg ctg aca ttg   386
Gly Ala Leu Ala Leu Thr Ala Ala Gly Leu Thr Gly Ser Leu Thr Leu
         30                 35                  40
cgg gcg ctt gca gac aac ccc ggc act gcg ccg ctc gat acg ttc atg   434
Arg Ala Leu Ala Asp Asn Pro Gly Thr Ala Pro Leu Asp Thr Phe Met
     45                  50                  55
acg ctt tcc gaa tcg ctg acc ggc aag aaa ggg ctc agc cgc gtg atc   482
Thr Leu Ser Glu Ser Leu Thr Gly Lys Lys Gly Leu Ser Arg Val Ile
 60                 65                  70                  75
ggc gag cgc ctg ctg cag gcg ctg cag aag ggc tcg ttc aag acg gcc   530
Gly Glu Arg Leu Leu Gln Ala Leu Gln Lys Gly Ser Phe Lys Thr Ala
                80                   85                  90
gac agc ctg ccg cag ctc gcc ggc gcg ctc gcg tcc ggt tcg ctg acg   578
Asp Ser Leu Pro Gln Leu Ala Gly Ala Leu Ala Ser Gly Ser Leu Thr
            95                  100                 105
cct gaa cag gaa tcg ctc gca ctg acg atc ctc gag gcc tgg tat ctc   626
Pro Glu Gln Glu Ser Leu Ala Leu Thr Ile Leu Glu Ala Trp Tyr Leu
        110                 115                 120
ggc atc gtc gac aac gtc gtg att acg tac gag gaa gca tta atg ttc  674
Gly Ile Val Asp Asn Val Val Ile Thr Tyr Glu Glu Ala Leu Met Phe
    125                 130                 135
ggc gtc gtg tcc gat acg ctc gtg atc cgt tcg tat tgc ccc aac aaa  722
Gly Val Val Ser Asp Thr Leu Val Ile Arg Ser Tyr Cys Pro Asn Lys
140                 145                 150                 155
ccc ggc ttc tgg gcc gac aaa ccg atc gag agg caa gcc tg atg gcc   769
Pro Gly Phe Trp Ala Asp Lys Pro Ile Glu Arg Gln Ala    Met Ala
                160                 165                    170
gat acc gat acg caa aag gcc gac gtc gtc gtc gtt gga tcg ggt gtc  817
Asp Thr Asp Thr Gln Lys Ala Asp Val Val Val Val Gly Ser Gly Val
                175                 180                 185
gcg ggc gcg atc gtc gcg cat cag ctc gcg atg gcg ggc aag gcg gtg  865
Ala Gly Ala Ile Val Ala His Gln Leu Ala Met Ala Gly Lys Ala Val
            190                 195                 200
atc ctg ctc gaa gcg ggc ccg cgc atg ccg cgc tgg gaa atc gtc gag  913
Ile Leu Leu Glu Ala Gly Pro Arg Met Pro Arg Trp Glu Ile Val Glu
        205                 210                 215
cgc ttc cgc aat cag ccc gac aag atg gac ttc atg gcg ccg tac ccg  96l
Arg Phe Arg Asn Gln Pro Asp Lys Met Asp Phe Met Ala Pro Tyr Pro
    220                 225                 230
tcg agc ccc tgg gcg ccg cat ccc gag tac ggc ccg ccg aac gac tac  1009
Ser Ser Pro Trp Ala Pro His Pro Glu Tyr Gly Pro Pro Asn Asp Tyr
235                 240                 245                 250
ctg atc ctg aag ggc gag cac aag ttc aac tcg cag tac atc cgc gcg  1057
Leu Ile Leu Lys Gly Glu His Lys Phe Asn Ser Gln Tyr Ile Arg Ala
                255                 260                 265
gtg ggc ggc acg acg tgg cac tgg gcc gcg tcg gcg tgg cgc ttc att   1105
Val Gly Gly Thr Thr Trp His Trp Ala Ala Ser Ala Trp Arg Phe Ile
            270                 275                 280
ccg aac gac ttc aag atg aag agc gtg tac ggc gtc ggc cgc gac tgg   1153
Pro Asn Asp Phe Lys Met Lys Ser Val Tyr Gly Val Gly Arg Asp Trp
        285                 290                 295
ccg atc cag tac gac gat ctc gag ccg tac tat cag cgc gcg gag gaa   1201
Pro Ile Gln Tyr Asp Asp Leu Glu Pro Tyr Tyr Gln Arg Ala Glu Glu
    300                 305                 310
gag ctc ggc gtg tgg ggc ccg ggc ccc gag gaa gat ctg tac tcg ccg   1249
Glu Leu Gly Val Trp Gly Pro Gly Pro Glu Glu Asp Leu Tyr Ser Pro
315                 320                 325                 330
cgc aag cag ccg tat ccg atg ccg ccg ctg ccg ttg tcg ttc aac gag   1297
Arg Lys Gln Pro Tyr Pro Met Pro Pro Leu Pro Leu Ser Phe Asn Glu
                335                 340                 345
cag ace atc aag acg gcg ctg aac aac tac gat ccg aag ttc cat gtc   1345
Gln Thr Ile Lys Thr Ala Leu Asn Asn Tyr Asp Pro Lys Phe His Val
            350                 355                 360
gtg acc gag ccg gtc gcg cgc aac agc cgc ccg tac gac ggc cgc ccg   1393
Val Thr Glu Pro Val Ala Arg Asn Ser Arg Pro Tyr Asp Gly Arg Pro
        365                 370                 375
act tgt tgc ggc aac aac aac tgc atg ccg atc tgc ccg atc ggc gcg   1441
Thr Cys Cys Gly Asn Asn Asn Cys Met Pro Ile Cys Pro Ile Gly Ala
    380                 385                 390
atg tac aac ggc atc gtg cac gtc gag aag gcc gaa cgc gcc ggc gcg   1489
Met Tyr Asn Gly Ile Val His Val Glu Lys Ala Glu Arg Ala Gly Ala
395                 400                 405                 410
aag ctg atc gag aac gcg gtc gtc tac aag ctc gag acg ggc ccg gac   1537
Lys Leu Ile Glu Asn Ala Val Val Tyr Lys Leu Glu Thr Gly Pro Asp
                415                 420                 425
aag cgc atc gtc gcg gcg ctc tac aag gac aag acg ggc gcc gag cat   1585
Lys Arg Ile Val Ala Ala Leu Tyr Lys Asp Lys Thr Gly Ala Glu His
            430                 435                 440
cgc gtc gaa ggc aag tat ttc gtg ctc gcc gcg aac ggc atc gag acg   1633
Arg Val Glu Gly Lys Tyr Phe Val Leu Ala Ala Asn Gly Ile Glu Thr
        445                 450                 455
ccg aag atc ctg ctg atg tcc gcg aac cgc gat ttc ccg aac ggt gtc   1681
Pro Lys Ile Leu Leu Met Ser Ala Asn Arg Asp Phe Pro Asn Gly Val
    460                 465                 470
gcg aac agc tcg gac atg gtc ggc cgc aac ctg atg gac cat ccg ggc   1729
Ala Asn Ser Ser Asp Met Val Gly Arg Asn Leu Met Asp His Pro Gly
475                 480                 485                 490
acc ggc gtg tcg ttc tat gcg agc gag aag ctg tgg ccg ggc cgc ggc   1777
Thr Gly Val Ser Phe Tyr Ala Ser Glu Lys Leu Trp Pro Gly Arg Gly
                495                 500                 505
ccg cag gag atg acg tcg ctg atc ggt ttc cgc gac ggt ccg ttc cgc   1825
Pro Gln Glu Met Thr Ser Leu Ile Gly Phe Arg Asp Gly Pro Phe Arg
            510                 515                 520
gcg acc gaa gcg gcg aag aag atc cac ctg tcg aac ctg tcg cgc atc   1873
Ala Thr Glu Ala Ala Lys Lys Ile His Leu Ser Asn Leu Ser Arg Ile
        525                 530                 535
gac cag gag acg cag aag atc ttc aag gcc ggc aag ctg atg aag ccc   1921
Asp Gln Glu Thr Gln Lys Ile Phe Lys Ala Gly Lys Leu Met Lys Pro
    540                 545                 550
gac gag ctc gac gcg cag atc cgc gac cgt tcc gca cgc tac gtg cag   1969
Asp Glu Leu Asp Ala Gln Ile Arg Asp Arg Ser Ala Arg Tyr Val Gln
555                 560                 565                 570
ttc gac tgc ttc cac gaa atc ctg ccg caa ccc gag aac cgc atc gtg   2017
Phe Asp Cys Phe His Glu Ile Leu Pro Gln Pro Glu Asn Arg Ile Val
                575                 580                 585
ccg agc aag acg gcg acc gat gcg atc ggc att ccg cgc ccc gag atc   2065
Pro Ser Lys Thr Ala Thr Asp Ala Ile Gly Ile Pro Arg Pro Glu Ile
            590                 595                 600
acg tat gcg atc gac gac tac gtg aag cgc ggc gcc gcg cat acg cgc   2113
Thr Tyr Ala Ile Asp Asp Tyr Val Lys Arg Gly Ala Ala His Thr Arg
        605                 610                 615
gag gtc tac gcg acc gcc gcg aag gtg ctc ggc ggc acg gac gtc gtg   2161
Glu Val Tyr Ala Thr Ala Ala Lys Val Leu Gly Gly Thr Asp Val Val
    620                 625                 630
ttc aac gac gaa ttc gcg ccg aac aat cac atc acg ggc tcg acg atc   2209
Phe Asn Asp Glu Phe Ala Pro Asn Asn His Ile Thr Gly Ser Thr Ile
635                 640                 645                 650
atg ggc gcc gat gcg cgc gac tcc gtc gtc gac aag gac tgc cgc acg   2257
Met Gly Ala Asp Ala Arg Asp Ser Val Val Asp Lys Asp Cys Arg Thr
                655                 660                 665
ttc gac cat ccg aac ctg ttc att tcg agc agc gcg acg atg ccg acc   2305
Phe Asp His Pro Asn Leu Phe Ile Ser Ser Ser Ala Thr Met Pro Thr
            670                 675                 680
gtc ggt acc gta aac gtg acg ctg acg atc gcc gcg ctc gcg ctg cgg   2353
Val Gly Thr Val Asn Val Thr Leu Thr Ile Ala Ala Leu Ala Leu Arg
        685                 690                 695
atg tcg gac acg ctg aag aag gaa gtc tgacc gtg cgg aaa tct act ctc 2403
Met Ser Asp Thr Leu Lys Lys Glu Val       Val Arg Lys Ser Thr Leu
    700                 705                       710
act ttc ctc atc gcc ggc tgc ctc gcg ttg ccg ggc ttc gcg cgc gcg   2451
Thr Phe Leu Ile Ala Gly Cys Leu Ala Leu Pro Gly Phe Ala Arg Ala
    715                 720                 725
gcc gat gcg gcc gat ccg gcg ctg gtc aag cgc ggc gaa tac ctc gcg   2499
Ala Asp Ala Ala Asp Pro Ala Leu Val Lys Arg Gly Glu Tyr Leu Ala
730                 735                 740                 745
acc gcc atg ccg gta ccg atg ctc ggc aag atc tac acg agc aac atc   2547
Thr Ala Met Pro Val Pro Met Leu Gly Lys Ile Tyr Thr Ser Asn Ile
                750                 755                 760
acg ccc gat ccc gat acg ggc gac tgc atg gcc tgc cac acc gtg aag   2595
Thr Pro Asp Pro Asp Thr Gly Asp Cys Met Ala Cys His Thr Val Lys
            765                 770                 775
ggc ggc aag ccg tac gcg ggc ggc ctt ggc ggc atc ggc aaa tgg acg   2643
Gly Gly Lys Pro Tyr Ala Gly Gly Leu Gly Gly Ile Gly Lys Trp Thr
        780                 785                 790
ttc gag gac ttc gag cgc gcg gtg cgg cac ggc gtg tcg aag aac ggc   2691
Phe Glu Asp Phe Glu Arg Ala Val Arg His Gly Val Ser Lys Asn Gly
    795                 800                 805
gac aac ctg tat ccg gcg atg ccg tac gtg tcg tac gcg aag atc aag   2739
Asp Asn Leu Tyr Pro Ala Met Pro Tyr Val Ser Tyr Ala Lys Ile Lys
810                 815                 820                 825
gac gac gac gta cgc gcg ctg tac gcc tac ttc atg cac ggc gtc gag   2787
Asp Asp Asp Val Arg Ala Leu Tyr Ala Tyr Phe Met His Gly Val Glu
                830                 835                 840
ccg gtc aag cag gcg ccg ccg aag aac gag atc cca gcg ctg cta agc   2835
Pro Val Lys Gln Ala Pro Pro Lys Asn Glu Ile Pro Ala Leu Leu Ser
            845                 850                 855
atg cgc tgg ccg ctg aag atc tgg aac tgg ctg ttc ctg aag gac ggc   2883
Met Arg Trp Pro Leu Lys Ile Trp Asn Trp Leu Phe Leu Lys Asp Gly
        860                 865                 870
ccg tac cag ccg aag ccg tcg cag agc gcc gaa tgg aat cgc ggc gcg   2931
Pro Tyr Gln Pro Lys Pro Ser Gln Ser Ala Glu Trp Asn Arg Gly Ala
    875                 880                 885
tat ctg gtg cag ggt ctc gcg cac tgc agc acg tgc cac acg ccg cgc   2979
Tyr Leu Val Gln Gly Leu Ala His Cys Ser Thr Cys His Thr Pro Arg
890                 895                 900                 905
ggc atc gcg atg cag gag aag tcg ctc gac gaa acc ggc ggc agc ttc   3027
Gly Ile Ala Met Gln Glu Lys Ser Leu Asp Glu Thr Gly Gly Ser Phe
                910                 915                 920
ctc gcg ggg tcg gtg ctc gcc ggc tgg gac ggc tac aac atc acg tcg   3075
Leu Ala Gly Ser Val Leu Ala Gly Trp Asp Gly Tyr Asn Ile Thr Ser
            925                 930                 935
gac ccg aat gcg ggg atc ggc agc tgg acg cag cag cag ctc gtg cag   3123
Asp Pro Asn Ala Gly Ile Gly Ser Trp Thr Gln Gln Gln Leu Val Gln
        940                 945                 950
tat ttg cgc acc ggc agc gtg ccg ggc gtc gcg cag gcg gcc ggg ccg   3171
Tyr Leu Arg Thr Gly Ser Val Pro Gly Val Ala Gln Ala Ala Gly Pro
    955                 960                 965
atg gcc gag gcg gtc gag cac agc ttc tcg aag atg acc gaa gcg gac   3219
Met Ala Glu Ala Val Glu His Ser Phe Ser Lys Met Thr Glu Ala Asp
970                 975                 980                 985
atc ggt gcg atc gcc acg tac gtc cgc acg gtg ccg gcc gtt gcc gac   3267
Ile Gly Ala Ile Ala Thr Tyr Val Arg Thr Val Pro Ala yal Ala Asp
                990                 995                 1000
agc aac gcg aag cag ccg cgg tcg tcg tgg ggc aag ccg gcc gag gac   3315
Ser Asn Ala Lys Gln Pro Arg Ser Ser Trp Gly Lys Pro Ala Glu Asp
            1005                1010                1015
ggg ctg aag ctg cgc ggt gtc gcg ctc gcg tcg tcg ggc atc gat ccg   3363
Gly Leu Lys Leu Arg Gly Val Ala Leu Ala Ser Ser Gly Ile Asp Pro
        1020                1025                1030
gcg cgg ctg tat ctc ggc aac tgc gcg acg tgc cac cag atg cag ggc   3411
Ala Arg Leu Tyr Leu Gly Asn Cys Ala Thr Cys His Gln Met Gln Gly
   1035                1040                 1045
aag ggc acg ccg gac ggc tat tac ccg tcg ctg ttc cac aac tcc acc    3459
Lys Gly Thr Pro Asp Gly Tyr Tyr Pro Ser Leu Phe His Asn Ser Thr
1050                1055                1060                1065
gtc ggc gcg tcg aat ccg tcg aac crc gtg cag gtg arc ctg aac ggc    3507
Val Gly Ala Ser Asn Pro Ser Asn Leu Val Gin Val Ile Leu Asn Gly
                1070                1075                1080
gtg cag cgc aag arc ggc agc gag gat atc ggg atg ccc gct ttc cgc    3555
Val Gln Arg Lys Ile Gly Set Glu Asp Ile Gly Met Pro Ala Phe Arg
            1085                1090                1095
tac gat ctg aac gac gcg cag atc gcc gcg ctg acg aac tac gtg acc    3603
Tyr Asp Leu Asn Asp Ala Gln lle Ala Ala Leu Thr Asn Tyr Val Thr
        1100                1105                1110
gcg cag ttc ggc aat ccg gcg gcg aag gtg acg gag cag gac gtc gcg    3651
Ala Gln Phe Gly Asn Pro Ala Ala Lys Val Thr Glu Gln Asp Val Ala
    1115                1120                1125
aag ctg cgc tga catagtcggg cgcgccgaca cggcgcaacc gataggacag gag    3706
Lys Leu Arg
1130
<210>2
<211>168
<212>PRT
<213>恶臭假单胞菌
<400>2
Met His Asn Asp Asn Thr Pro His Ser Arg Arg His Gly Asp Ala Ala
  1              5                   10                  15
Ala Ser Gly Ile Thr Arg Arg Gln Trp Leu Gln Gly Ala Leu Ala Leu
            20                  25                  30
Thr Ala Ala Gly Leu Thr Gly Ser Leu Thr Leu Arg Ala Leu Ala Asp
         35                  40                  45
Asn Pro Gly Thr Ala Pro Leu Asp Thr Phe Met Thr Leu Ser Glu Ser
     50                  55                  60
Leu Thr Gly Lys Lys Gly Leu Ser Arg Val Ile Gly Glu Arg Leu Leu
 65                 70                   75                 80
Gln Ala Leu Gln Lys Gly Ser Phe Lys Thr Ala Asp Ser Leu Pro Gln
                85                   90                  95
Leu Ala Gly Ala Leu Ala Ser Gly Ser Leu Thr Pro Glu Gln Glu Ser
            100                 105                 110
Leu Ala Leu Thr Ile Leu Glu Ala Trp Tyr Leu Gly Ile Val Asp Asn
        115                 120                 125
Val Val lle Thr Tyr Glu Glu Ala Leu Met Phe Gly Val Val Ser Asp
    130                 135                 140
Thr Leu Val Ile Arg Ser Tyr Cys Pro Asn Lys Pro Gly Phe Trp Ala
145                 150                 155                 160
Asp Lys Pro Ile Glu Arg Gln Ala
                165
<210>3
<211>539
<212>PRT
<213>恶臭假单胞菌
<400>3
Met Ala Asp Thr Asp Thr Gln Lys Ala Asp Val Val Val Val Gly Ser
 1               5                  10                   15
Gly Val Ala Gly Ala Ile Val Ala His Gln Leu Ala Met Ala Gly Lys
            20                  25                  30
Ala Val Ile Leu Leu Glu Ala Gly Pro Arg Met Pro Arg Trp Glu Ile
         35                  40                  45
Val Glu Arg Phe Arg Asn Gln Pro Asp Lys Met Asp Phe Met Ala Pro
     50                  55                  60
Tyr Pro Ser Ser Pro Trp Ala Pro His Pro Glu Tyr Gly Pro Pro Asn
 65                  70                  75                  80
Asp Tyr Leu Ile Leu Lys Gly Glu His Lys Phe Asn Ser Gln Tyr Ile
                 85                  90                  95
Arg Ala Val Gly Gly Thr Thr Trp His Trp Ala Ala Ser Ala Trp Arg
            100                 105                 110
Phe Ile Pro Asn Asp Phe Lys Met Lys Ser Val Tyr Gly Val Gly Arg
        115                 120                 125
Asp Trp Pro Ile Gln Tyr Asp Asp Leu Glu Pro Tyr Tyr Gln Arg Ala
    130                 135                 140
Glu Glu Glu Leu Gly Val Trp Gly Pro Gly Pro Glu Glu Asp Leu Tyr
145                 150                 155                 160
Ser Pro Arg Lys Gln Pro Tyr Pro Met Pro Pro Leu Pro Leu Ser Phe
                165                 170                 175
Asn Glu Gln Thr Ile Lys Thr Ala Leu Asn Asn Tyr Asp Pro Lys Phe
            180                 185                 190
His Val Val Thr Glu Pro Val Ala Arg Asn Ser Arg Pro Tyr Asp Gly
        195                 200                 205
Arg Pro Thr Cys Cys Gly Asn Asn Asn Cys Met Pro Ile Cys Pro Ile
    210                 215                 220
Gly Ala Met Tyr Asn Gly Ile Val His Val Glu Lys Ala Glu Arg Ala
225                 230                 235                 240
Gly Ala Lys Leu Ile Glu Asn Ala Val Val Tyr Lys Leu Glu Thr Gly
                245                 250                 255
Pro Asp Lys Arg Ile Val Ala Ala Leu Tyr Lys Asp Lys Thr Gly Ala
            260                 265                 270
Glu His Arg Val Glu Gly Lys Tyr Phe Val Leu Ala Ala Asn Gly Ile
        275                 280                 285
Glu Thr Pro Lys Ile Leu Leu Met Ser Ala Asn Arg Asp Phe Pro Asn
    290                 295                 300
Gly Val Ala Asn Ser Ser Asp Met Val Gly Arg Asn Leu Met Asp His
305                 310                 315                 320
Pro Gly Thr Gly Val Ser Phe Tyr Ala Ser Glu Lys Leu Trp Pro Gly
                325                 330                 335
Arg Gly Pro Gln Glu Met Thr Ser Leu Ile Gly Phe Arg Asp Gly Pro
            340                 345                 350
Phe Arg Ala Thr Glu Ala Ala Lys Lys Ile His Leu Ser Asn Leu Ser
        355                 360                 365
Arg Ile Asp Gln Glu Thr Gln Lys Ile Phe Lys Ala Gly Lys Leu Met
    370                 375                 380
Lys Pro Asp Glu Leu Asp Ala Gln Ile Arg Asp Arg Ser Ala Arg Tyr
385                 390                 395                 400
Val Gln Phe Asp Cys Phe His Glu Ile Leu Pro Gln Pro Glu Asn Arg
                405                 410                 415
Ile Val Pro Ser Lys Thr Ala Thr Asp Ala Ile Gly Ile Pro Arg Pro
            420                 425                 430
Glu Ile Thr Tyr Ala Ile Asp Asp Tyr Val Lys Arg Gly Ala Ala His
        435                 440                 445
Thr Arg Glu Val Tyr Ala Thr Ala Ala Lys Val Leu Gly Gly Thr Asp
    450                 455                 460
Val Val Phe Asn Asp Glu Phe Ala Pro Asn Asn His Ile Thr Gly Ser
465                 470                 475                 480
Thr Ile Met Gly Ala Asp Ala Arg Asp Ser Val Val Asp Lys Asp Cys
                485                 490                 495
Arg Thr Phe Asp His Pro Asn Leu Phe Ile Ser Ser Ser Ala Thr Met
            500                 505                 510
Pro Thr Val Gly Thr Val Asn Val Thr Leu Thr Ile Ala Ala Leu Ala
        515                 520                 525
Leu Arg Met Ser Asp Thr Leu Lys Lys Glu Val
    530                 535
<210>4
<211>27
<212>PRT
<213>恶臭假单胞菌
<400>4
Val Arg Lys Ser Thr Leu Thr Phe Leu Ile Ala Gly Cys Leu Ala Leu
  1              5                  10                  15
Pro Gly Phe Ala Arg Ala Ala Asp Ala Ala Asp
            20                  25
<210>5
<211>425
<212>PRT
<213>恶臭假单胞菌
<400>5
Val Arg Lys Ser Thr Leu Thr Phe Leu Ile Ala Gly Cys Leu Ala Leu Pro Gly Phe
 1               5                  10                  15
Ala Arg Ala Ala Asp Ala Ala Asp Pro Ala Leu Val Lys Arg Gly Glu Tyr Leu Ala
20                  25                  30                  35
Thr A1a Met Pro Val Pro Met Leu Gly Lys 11e Tyr Thr Ser Asn Ile Thr Pro Asp
    40                  45                  50                  55
Pro Asp Thr Gly Asp Cys Met Ala Cys His Thr Val Lys G1y Gly Lys Pro Tyr Ala
        60                  65                  70                  75Gly
G1y Leu Gly Gly Ile Gly Lys Trp Thr Phe Glu Asp Phe Glu Arg A1a Val Arg
           80                  85                 90
 95
His Gly Val Ser Lys Asn Gly Asp Asn Leu Tyr Pro A1a Met Pro Tyr Val Ser Tyr
                100                 105                 110
A1a Lys Ile Lys Asp Asp Asp Val Arg Ala Leu Tyr Ala Tyr Phe Met His Gly Val
115                 120                 125                 130
Glu Pro Val Lys Gln Ala Pro Pro Lys Asn Glu Ile Pro Ala Leu Leu Ser Met Arg
    135                 140                 145                  150
Trp Pro Leu Lys Ile Trp Asn Trp Leu Phe Leu Lys Asp Gly Pro Tyr Gln Pro Lys
        155                 160                 165                 170Pro
Ser Gln Ser Ala Glu Trp Asn Arg Gly Ala Tyr Leu Val Gln Gly Leu Ala His
           175                180                 185               190
Cys Ser Thr Cys His Thr Pro Arg Gly Ile Ala Met Gln Glu Lys Ser Leu Asp Glu
                195                 200                 205
Thr Gly Gly Ser Phe Leu Ala Gly Ser Val Leu Ala Gly Trp Asp Gly Tyr Asn Ile
210                 215                 220                 225
Thr Ser Asp Pro Asn Ala Gly Ile Gly Ser Trp Thr Gln Gln Gln Leu Val Gln
    230                 235                 240                 245
Tyr Leu Arg Thr Gly Ser Val Pro Gly Val Ala Gln Ala Ala Gly Pro Met Ala Glu
            250                 255                 260                 265
Ala Val Glu His Ser Phe Ser Lys Met Thr Glu Ala Asp Ile Gly Ala Ile Ala Thr
                270                 275                 280
Tyr Val Arg Thr Val Pro Ala Val Ala Asp Ser Asn Ala Lys Gln Pro Arg Ser Ser
285                 290                 295                 300
Trp Gly Lys Pro Ala Glu Asp Gly Leu Lys Leu Arg Gly Val Ala Leu Ala Ser Ser
    305                 310                 315                 320
Gly Ile Asp Pro Ala Arg Leu Tyr Leu Gly Asn Cys Ala Thr Cys His Gln Met Gln
        325                 330                 335                 340Gly
Lys Gly Thr Pro Asp Gly Tyr Tyr Pro Ser Leu Phe His Asn Ser Thr Val Gly
            345                350                355               360
Ala Ser Asn Pro Ser Asn Leu Val Gln Val Ile Leu Asn Gly Val Gln Arg Lys Ile
                365                 370                 375
Gly Ser Glu Asp Ile Gly Met Pro Ala Phe Arg Tyr Asp Leu Asn Asp Ala Gln Ile
380                 385                 390                 395
Ala Ala Leu Thr Asn Tyr Val Thr Ala Gln Phe Gly Asn Pro Ala Ala Lys Val Thr
    400                 405                 410                 415
Glu Gln Asp Val Ala Lys Leu Arg
        420                 425

Claims (16)

1.一种葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
将含有编码在序列号1记载的具有葡萄糖脱氢活性的α亚单位及作为电子传递蛋白质的β亚单位的序列的DNA导入属于假单胞菌属的微生物中,形成转化体,培养该转化体,产生含有所述β亚单位的第1葡萄糖脱氢酶和不含所述β亚单位的第2葡萄糖脱氢酶。
2.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述α亚单位在还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量约为60kDa,
所述β亚单位在还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量约为43kDa。
3.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述DNA含有编码在还原条件下的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳中测定的分子量约为14kDa的γ亚单位的碱基序列,
所述第1及第2葡萄糖脱氢酶,作为含有所述γ亚单位的酶来产生。
4.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:所述属于假单胞菌属的微生物是恶臭假单胞菌。
5.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述DNA是属于Burkhorderia属的微生物,从具有产生葡萄糖脱氢酶能力的微生物取得。
6.如权利要求5所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:属于所述Burkhorderia属的微生物是Burkhorderia cepacia KS1株(FERMBP-7306)。
7.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述α亚单位具有序列号3的氨基酸序列或在序列号3的氨基酸序列中取代、空缺、插入或加成一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
8.如权利要求7所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述DNA含有在序列号1的碱基序列之中、编码由碱基序号764~2380组成的α亚单位的碱基序列。
9.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述β亚单位具有序列号5的氨基酸序列或在序列号5的氨基酸序列之中取代、空缺、插入或加成一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
10.如权利要求9所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述DNA含有在序列号1的碱基序列之中、编码由碱基序号2386~3660组成的β亚单位的碱基序列。
11.如权利要求3所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述γ亚单位具有序列号2的氨基酸序列或在序列号2的氨基酸序列之中取代、空缺、插入或加成一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
12.如权利要求11所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述DNA含有在序列号1的碱基序列之中、编码由碱基序号258~761组成的γ亚单位的碱基序列。
13.如权利要求12所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述DNA,在编码α亚单位的碱基序列的上游区域含有编码γ亚单位的碱基序列。
14.如权利要求1所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:所述DNA含有编码所述β亚单位的信号肽的碱基序列。
15.如权利要求15所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述信号肽具有序列号4的氨基酸序列之中的氨基酸序号1~22的氨基酸序列。
16.如权利要求15所述的葡萄糖脱氢酶的制造方法,其特征在于:
所述信号肽由序列号1的碱基序列之中的碱基序号2386~2451的碱基序列来编码。
CNB038247356A 2002-08-30 2003-08-20 葡萄糖脱氢酶的制造方法 Expired - Lifetime CN100540669C (zh)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP253752/2002 2002-08-30
JP2002253752A JP4102138B2 (ja) 2002-08-30 2002-08-30 グルコース脱水素酵素の製造方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN1753997A true CN1753997A (zh) 2006-03-29
CN100540669C CN100540669C (zh) 2009-09-16

Family

ID=31972810

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CNB038247356A Expired - Lifetime CN100540669C (zh) 2002-08-30 2003-08-20 葡萄糖脱氢酶的制造方法

Country Status (8)

Country Link
US (1) US7713718B1 (zh)
EP (1) EP1536014B1 (zh)
JP (1) JP4102138B2 (zh)
CN (1) CN100540669C (zh)
AT (1) ATE469965T1 (zh)
AU (1) AU2003262259A1 (zh)
DE (1) DE60332845D1 (zh)
WO (1) WO2004020638A1 (zh)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE602005025104D1 (de) 2004-04-23 2011-01-13 Arkray Inc Mutierte glucosedehydrogenase
KR101399727B1 (ko) * 2005-06-20 2014-05-29 아크레이 가부시키가이샤 변이 글루코오스 탈수소효소
JP7339723B2 (ja) * 2017-07-04 2023-09-06 アークレイ株式会社 変異型シトクロムタンパク質およびその利用

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002065778A (ja) 2000-08-31 2002-03-05 Toshiba Tec Corp マット式エアーマッサージ機
DK1331272T3 (da) * 2000-10-31 2007-10-08 Koji Sode Ny glucosedehydrogenase og fremgangsmåde til at producere dehydrogenasen
JP4036667B2 (ja) * 2002-03-25 2008-01-23 広司 早出 新規グルコース脱水素酵素及びそれをコードする遺伝子
WO2003091430A1 (en) * 2002-04-26 2003-11-06 Koji Sode GLUCOSE DEHYDROGENASE β-SUBUNIT AND DNA ENCODING THE SAME

Also Published As

Publication number Publication date
JP2004089052A (ja) 2004-03-25
CN100540669C (zh) 2009-09-16
EP1536014B1 (en) 2010-06-02
WO2004020638A1 (ja) 2004-03-11
AU2003262259A8 (en) 2004-03-19
EP1536014A4 (en) 2006-08-23
EP1536014A1 (en) 2005-06-01
US7713718B1 (en) 2010-05-11
DE60332845D1 (de) 2010-07-15
ATE469965T1 (de) 2010-06-15
JP4102138B2 (ja) 2008-06-18
AU2003262259A1 (en) 2004-03-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN100347291C (zh) 用于发酵制备l-半胱氨酸、l-胱氨酸、n-乙酰丝氨酸或四氢噻唑衍生物的微生物和方法
CN1260363C (zh) 由腈化合物生产酰胺的方法
CN1366550A (zh) (r)-2-辛醇脱氢酶,产生此酶的方法,编码此酶的dna,以及使用此酶生产醇类的方法
CN1688689A (zh) 醛脱氢酶基因
CN101061222A (zh) 编码甲基化儿茶素生物合成酶的基因
CN1795270A (zh) 编码具有d-乳酸脱氢酶活性蛋白质的dna及其用途
CN1224697C (zh) 氨基醇及其衍生物的制备方法
CN1262644C (zh) 一种腈水合酶及其编码基因与应用
CN1650006A (zh) 葡萄糖脱氢酶β亚基及其编码DNA
CN1036405A (zh) 酸性脲酶及其生产
CN1160459C (zh) 乳发酵短杆菌细胞色素bd型醌醇氧化酶基因
CN1639328A (zh) 新型脱氢酶和编码该脱氢酶的基因
CN1894404A (zh) 有机酸存在下的启动子及其用途
CN1517436A (zh) 氧化还原酶
CN1753997A (zh) 葡萄糖脱氢酶的制造方法
CN1230544C (zh) 磷酸己酮糖异构酶和编码该酶的基因
CN1108372C (zh) 酰胺的制备工艺
CN1639340A (zh) 控制乙醇产生的方法
CN1229497C (zh) 与高谷氨酸生产相关的基因及其应用
CN1671839A (zh) 葡萄糖脱氢酶
CN1816623A (zh) 新型微生物、麦芽糖磷酸化酶和海藻糖磷酸化酶及其制造方法
CN1070686A (zh) 制备酰胺的方法
CN1643151A (zh) 醋酸耐性相关基因、利用该基因育种的醋酸菌、以及利用该醋酸菌的食醋的制造方法
CN1302117C (zh) 生产l-抗坏血酸的方法
CN1636066A (zh) 制备维生素b12的方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CX01 Expiry of patent term

Granted publication date: 20090916

CX01 Expiry of patent term