CN116121290A - CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺发育中的应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺发育中的应用,涉及农业生物技术领域。本发明通过筛选发现了黄瓜CsSS1基因与黄瓜果刺大小及形态相关,黄瓜突变体果实果刺大小较野生型‘649’显著减小,并且出现一种类似于黄瓜果刺的毛状体(Type‑II Like)。该基因能够应用于筛选小果刺黄瓜果实,改良黄瓜果实商品质量性状。

Description

CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺发育中的应用
技术领域
本发明涉及农业生物技术领域,特别是涉及CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺发育中的应用。
背景技术
黄瓜(cucumis sativus L.)是葫芦科(Cucurbitaceae)黄瓜属(cucumis)一年蔓生的草本植物。黄瓜具有产量高、效益好等特点,是世界十大重要的蔬菜作物之一,也是我国主栽蔬菜作物之一,占全国蔬菜面积的10%左右。品质育种在黄瓜育种工作中具有非常重要的地位,其中黄瓜刺瘤是影响其外观商品品质的重要指标之一。我国的华北类型黄瓜果实上的果瘤和果刺大且数目多,华南类型黄瓜果瘤和果刺大数目较少,欧洲温室类型黄瓜无果瘤,且果刺小而且少,被称为“水果”黄瓜,其市场价格为普通黄瓜的2-3倍。外观光滑的黄瓜污染少,清洗方便,食用卫生,是无公害蔬菜的理想品种。
黄瓜表皮毛是高度特化的结构,起源于表皮细胞,形态多样,毛状体可分为八种形态不同的类型(I-VIII)。黄瓜果刺是黄瓜表皮的一种多细胞非腺体毛,属于II型毛状体,由半圆形多细胞基部和生长在其上面的茎毛组成,在保护黄瓜果实免受高温、低温和蚜虫等食草昆虫胁迫方面发挥着重要作用。果刺是商品质量性状,对黄瓜的商业价值很重要。例如,中国种植的大多数新鲜市场黄瓜的果实都有浓密、大而白色的刺,深受消费者的喜爱。北美加工黄瓜(泡菜)通常在每种果实上都有一些大刺,而欧洲温室型或水果黄瓜果实表面果刺很少或没有可见的果刺,很容易清洗、包装并且农药残留量相对较少。因此,了解黄瓜果刺的器官发生、发育和遗传学具有重要的理论和应用价值。
模式植物拟南芥中的毛状体是单细胞、分枝和非腺体的,覆盖叶片等大多数器官中。在拟南芥中,由bHLH转录因子GL3/EGL3以及R2R3MYB转录因子GL1和WD重复转录因子TTG1组成的三聚体复合物,可以通过促进HD-ZIP IV蛋白GL2和EGL2的表达来激活表皮毛起始,在黄瓜中与拟南芥同源基因GL3和GL1对黄瓜果刺形成至关重要。在黄瓜中,已经报道的无毛突变体csgl3、完全无毛突变体tril和少刺突变体fs1是等位基因,由同一基因Csa6M514870的突变引起。无毛突变体csgl1、小果刺突变体tbh和微毛突变体mict也是等位基因,由基因Csa3G748220不同位置突变引起的。
目前报道的调控黄瓜果刺大小的相关基因较少,仅有基因CsSBS1、CsMYB6等,比如公开号为CN106609267A的专利申请公开了黄瓜CsTTG1基因在调控植物表皮毛、果刺及刺瘤发育中的应用。其通过构建黄瓜CsTTG1基因的过表达载体和干扰载体,并将其转入黄瓜中,证明CsTTG1基因的过量表达可引起黄瓜果实上果刺的大量增加,果刺细胞数目的变化,单个果刺的性状也会发生变化,且可使黄瓜中果瘤相关基因CsTu的表达量显著提高。而干扰CsTTG1基因的表达可引起黄瓜果实上果刺数目的减少。基因CsSS1在黄瓜果刺性状中的作用,暂时未见报道。
发明内容
本发明针对现有技术中存在的上述不足,提供了CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺大小及形态中的应用,改善黄瓜果实商品质量性状。
本发明的技术方案如下:
本发明提供了CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺发育中的应用。
所述调控黄瓜果刺发育体现在减小果刺基座体积。
所述CsSS1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,CsSS1基因编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
本发明还提供了一种培育转基因黄瓜的方法,将黄瓜中CsSS1基因沉默或敲除。
所述CsSS1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
本发明提供的方法,具体包括以下步骤:
(1)构建基因沉默或敲除载体,所述基因沉默或敲除载体为带有用于对碱基序列如SEQ ID NO.1所示的CsSS1基因进行沉默或敲除的序列的植物表达载体;
(2)将步骤(1)基因沉默或敲除载体导入黄瓜的细胞中将碱基序列如SEQ ID NO.1所示的CsSS1基因沉默或敲除,培养后转基因黄瓜植株。
上述方法中,所述植物表达载体为PU6gRNACas9。
上述方法中,基因敲除针对的靶点为双靶点,序列为:
(1)CCAATGTTAAGAAAGGGCCATGG;
(2)TGTAGTCTCTATGTTAGTATTGG。
本发明通过筛选发现了黄瓜CsSS1基因与黄瓜果刺大小及形态相关,黄瓜突变体果实果刺大小较野生型‘649’显著减小,并且出现一种类似于黄瓜果刺的毛状体(Type-IILike)。该基因能够应用于筛选小果刺黄瓜果实,改良黄瓜果实商品质量性状。
附图说明
图1为黄瓜野生型植株‘649’和突变体‘Csss1’黄瓜果刺状况图;其中a,b为黄瓜高代自交系植株‘649’(WT)开花0d果刺(Type-II)形态图,c为WT果刺形态放大图,d为WT果刺扫描电镜图。
图2为黄瓜野生型植株‘649’和突变体‘Csssl’黄瓜果刺状况图;其中a,b为Csss1果刺形态图,c为Csss1果刺形态放大图,d为Csss1果刺扫描电镜图,e为Csss1 Type-IILike形态图。
图3为黄瓜野生型植株‘649’和突变体‘Csssl’黄瓜果刺大小统计图,WT和突变体‘Csss1’的果刺(Type-II)基座高度和果刺茎长无差异,但果刺(Type-II)基座宽度差异显著,Csss1 Type-II Like基座高度和宽度显著小于WT和突变体‘Csss1’,并且无果刺茎长;a、b、c表示显著性分析。
图4为WT与Csss1突变体石蜡切片图。
图5为基因敲除CsSS1基因靶点的示意图和CsSS1基因中的Target 1和Target 2测序检测示意图。
图6为黄瓜‘凯特’以及敲除基因CsSS1不同靶点的黄瓜CsSS1#1的果刺对比图;其中,a,b为黄瓜‘凯特’(KT)开花0d果刺(Type-II)形态图,c为KT果刺形态放大图,d为KT果刺扫描电镜图。
图7为黄瓜‘凯特’以及敲除基因CsSS1不同靶点的黄瓜KT-CR-CsSS1-#1的果刺对比图;其中,a,b为KT-CR-CsSS1-#1果刺形态图,c为KT-CR-CsSS1-#1果刺形态放大图,d为KT-CR-CsSS1-#1果刺扫描电镜图,e为KT-CR-CsSS1-#1Type-II Like形态图。
图8为黄瓜‘凯特’(KT)和敲除基因CsSS1不同靶点的黄瓜KT-CR-CsSS1-#1的果刺大小统计图,黄瓜‘凯特’(KT)和敲除株系KT-CR-CsSS1-#1果刺茎长无差异,但敲除株系KT-CR-CsSS1-#1的果刺(Type-II)基座高度和宽度显著减小,并且敲除株系KT-CR-CsSS1-#1Type-II Like基座高度和宽度显著小于黄瓜‘凯特’(KT)和敲除株系KT-CR-CsSS1-#1,并且无果刺茎长;a、b、c表示显著性分析。
图9为载体PU6gRNACas9的图谱。
具体实施方式
实施例1:控制黄瓜果刺大小及形态性状相关的SNP位点的发现
利用2%的EMS诱变剂(v/v,甲基磺酸乙酯)对黄瓜高代自交系植株‘649’进行诱变,并从诱变体库中筛选获得一株稳定遗传的黄瓜小果刺突变体‘Csss1’,通过mutmap和KASP基因分型等方法定位于2号染色体的CsSS1基因,通过表型观察及遗传分析发现突变体‘ss1’与野生型‘649’果皮颜色与果刺性状共分离(表1)。将稳定遗传的黄瓜黄绿皮突变体‘ss1’与高代自交系野生型‘649’杂交,获得F1,F1代黄瓜单株自交留种,获得F2。正反交F1代10株,F2代分离群体85株。F1单株表型均为野生型表型,F2分离群体中小果刺表型20株,WT果刺表型植株65株。经卡方检验,黄瓜正常果刺与小果刺表型的分离比例符合3∶1(χ2=0.107,P>0.05),表明黄瓜小果刺性状是单基因隐性遗传。突变体‘Csssl’黄瓜果刺显著小于野生型,除果刺(Type-II)外,还发现突变体表面有类似于果刺并且无果刺茎长(stalk)的果刺(Type-II Like),如图1-3所示。
表1
Figure BDA0003838323870000041
Figure BDA0003838323870000051
实施例2:Csss1突变体和野生型WT果刺细胞学观察
取野生型WT和突变体Csss1开花0d果实为材料,用自来水冲洗干净,用薄刀片切成约0.5-1cm长的小块。将上述材料分别置于FAA固定液固定12h,之后将材料取出,经过组织脱水固定、包埋、切片、甲苯胺蓝染色、白光扫描观察果实刺基大小及果刺形态。WT果实中只有正常形态果刺(图4),果刺基座(base)体积大于突变体;Csss1中果刺基座(base)宽度变小,细胞数目变少,Type-II Like果刺数量增加,但是其果刺茎长(stalk)没有形成。
实施例3:CsSS1基因CRISPR载体转化黄瓜
委托未米生物科技(江苏)有限公司设计CsSS1基因敲除双靶点,序列如下:
其一:CCAATGTTAAGAAAGGGCCATGG;
其二:TGTAGTCTCTATGTTAGTATTGG。
并转入载体PU6gRNACas9中(图谱见图9),以构建CsSS1-CRISPR载体。选择构建成功的载体,并对黄瓜‘凯特’(KT)品种(寿光市凯特种业有限公司)进行遗传转化,转化成功的植株在CsSS1基因靶点发生突变(图5)。待上述基因编辑黄瓜植株定植10d,观察编辑植株与对照植株果实果刺表型,并以基因编辑植株与对照植株为材料,利用Photoshop软件进行果刺大小测量,利用日立TM3030扫描电镜对果实表面拍照。结果CsSS1基因敲除后的黄瓜(KT-CR-CsSS1-#1)果实果刺基座(base)高度和宽度显著小于对照(KT),并且出现类似于果刺的毛状体(图6-8)。

Claims (8)

1.CsSS1基因或其编码的蛋白在调控黄瓜果刺发育中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述调控黄瓜果刺发育体现在减小果刺基座体积。
3.如权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述CsSS1基因的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示,CsSS1基因编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
4.一种培育转基因黄瓜的方法,其特征在于,将黄瓜中CsSS1基因沉默或敲除。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述CsSS1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)构建基因沉默或敲除载体,所述基因沉默或敲除载体为带有用于对碱基序列如SEQID NO.1所示的CsSS1基因进行沉默或敲除的序列的植物表达载体;
(2)将步骤(1)基因沉默或敲除载体导入黄瓜的细胞中将碱基序列如SEQ ID NO.1所示的CsSS1基因沉默或敲除,培养后转基因黄瓜植株。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述植物表达载体为PU6gRNACas9。
8.如权利要求6所述的方法,其特征在于,基因敲除针对的靶点为双靶点,序列为:
(1)CCAATGTTAAGAAAGGGCCATGG;
(2)TGTAGTCTCTATGTTAGTATTGG。
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