CN114736963A - 一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合、试剂盒及应用 - Google Patents

一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合、试剂盒及应用 Download PDF

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Abstract

本发明涉及一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合,其包括用于检测选自多个位点中的一个或多个SNP位点的物质。以及包括该物质组合的试剂盒,及该物质的组合在制备预测阿尔茨海默病发病风险的试剂盒中的应用。本申请提供的物质和试剂盒能够预测正常中老年人或无症状期的AD发生AD的风险,预测准确度达到80%以上。并且,本申请的方法仅取静脉血即可完成检测,且具有以下有益技术效果:(1)具有几乎无创伤,低风险等优势;(2)具有成本低的优势,无需在医院或专业医疗机构完成,受检测人员无需住院;(3)具备良好的灵敏性和特异性。

Description

一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合、试剂盒 及应用
技术领域
本发明涉及基因检测领域,特别涉及一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合、试剂盒及应用。
背景技术:
根据2019年全球疾病负担研究(GBD 2019)估计,当前全世界约有5700万痴呆患者。在中国,这一数字为1500万,其中有65%是阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)。在所有AD患者中,晚发性AD(late onset Alzheimer’s disease,LOAD)占90-95%,其遗传特征复杂,遗传度为56-79%,有研究表明这是由许多低外显率的遗传基因变异所导致。鉴于遗传因素对LOAD发病起着重要作用,其可以被用于用其来指导LOAD的筛查、治疗,以及生活方式干预。虽然目前没有治愈阿尔茨海默病的药物和手段,许多证据表明,基于生活方式的干预可以降低高危人群发生认知障碍的风险。随着干预和预防策略的实施,AD的患病率及其造成的经济负担都有望降低。
多基因风险评分(polygenic risk scores,PRS)能反映个体对特定疾病的遗传易感性,是实现上述目标的重要工具之一。PRS基于全基因组关联研究(genome-wideassociation studies,GWAS)所得数据,将各风险关联位点进行权重,量化多个基因或位点的累积效应,将基因组变异信息浓缩成衡量个体疾病易感性的分值。目前PRS已被用于AD、乳腺癌、精神疾病和其他许多疾病的基础和临床研究。基于LOAD的遗传特点,PRS十分适用于其研究。
迄今为止,GWAS已经确定了50个以上与AD相关的基因关联位点,随着更多的基因研究正在进行,这一数字仍在上升,并将提高PRS应用于AD临床应用的能力。然而,这些GWAS研究中的大多数是在欧洲人群中进行的,基于这些人群来源的GWAS数据计算得出的PRS应用于中国人群时其效能可能较低。这是由于不同人种间的遗传异质性,如不同的等位基因频率、不同的连锁不平衡模式、基因的不同效应及效应大小的差异。
对于AD,已有许多研究揭示了中国人群和其他人群之间的遗传异质性:如TOMM4、TREM2、PSENs/APP等基因的不同多态性,以及其他中国人特有的罕见基因突变。最明确的LOAD风险基因APOE4,在中国人群的等位基因频率也比白种人更低。
因鉴于此,特提出此发明。
发明内容
本发明的目的旨在提供一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合,其包括用于检测选自以下的一个或多个SNP位点的物质:
rs429358、rs7412、rs13114510、rs6456964、rs1801133、rs453755、rs11117959、rs7494172、rs3130593、rs4646211、rs9557106、rs1588346、rs12578418、rs17822931、rs4578651、rs6933672、rs8040604、rs7219、rs909079、rs2718786、rs9555767、rs1861229、rs941852、rs3864294、rs11017226、rs117435254、rs11656626、rs79443662、rs6657849、rs2095629、rs17026871、rs7738638、rs6414375、rs174550、rs13181561、rs4859242、rs7734266、rs3130786、rs6675339、rs11039260、rs58015131、rs911186、rs2276875、rs10514308、rs117344883、rs13208315、rs1506436、rs1003902、rs57747793、rs7950019、rs116907231、rs10030915、rs12578006、rs2688443、rs9929106、rs1076714、rs5743562、rs3138105、rs11607554、rs1790244、rs1646235、rs58531877、rs79067922、rs12470292、rs1276584、rs12322708、rs1332952、rs1020426、rs9475975、rs13226348、rs2071809、rs1912163、rs556569、rs117356781、rs75931448、rs3802215、rs699459、rs200085363、rs1786681、rs61442297、rs73655160、rs1814139、rs9372400、rs2365681、rs78299931。
优选或可选的,其还包括用于检测选自以下一个或多个SNP位点的物质:
rs117357864、rs3811454、rs891764、rs10211548、rs3786238、rs10958017、rs74817407、rs1483701、rs9553426、rs4689212、rs12356074、rs7147317、rs1914654、rs11654954、rs12126682、rs1865958、rs7617314、rs117629150、rs17024993、rs7246006、rs4378065、rs4757292、rs11926063、rs6117562、rs77994613、rs57893710、rs729005、rs10461685、rs7947746、rs4784652、rs6731238、rs10480321、rs4788074、rs11917602、rs17243191、rs73210935、rs1856150、rs1027695、rs9296691、rs1998953、rs989682、rs7745964、rs79030707、rs10249498、rs17052409、rs17139596、rs4238565、rs2851912。
优选或可选的,所述物质的组合包括用于检测全部所述SNP位点的物质。
优选或可选的,所述物质的组合包括成套的单链DNA,所述成套单链DNA由引物对1-85组成;
所述引物对1用于测定rs429358位点,由SEQ No.1和SEQ No.2所示的单链DNA组成;
所述引物对2用于测定rs7412位点,由SEQ No3和SEQ No.4所示的单链DNA组成;
所述引物对3用于测定rs13114510位点,由SEQ No.5和SEQ No.6所示的单链DNA组成;
所述引物对4用于测定rs6456964位点,由SEQ No.7和SEQ No.8所示的单链DNA组成;
所述引物对5用于测定rs1801133位点,由SEQ No9和SEQ No.10所示的单链DNA组成;
所述引物对6用于测定rs453755位点,由SEQ No.11和SEQ No.12所示的单链DNA组成;
所述引物对7用于测定rs11117959位点,由SEQ No.13和SEQ No.14所示的单链DNA组成;
所述引物对8用于测定rs7494172位点,由SEQ No.15和SEQ No.16所示的单链DNA组成;
所述引物对9用于测定rs3130593位点,由SEQ No.17和SEQ No.18所示的单链DNA组成;
所述引物对10用于测定rs4646211位点,由SEQ No.19和SEQ No.20所示的单链DNA组成;
所述引物对11用于测定rs9557106位点,由SEQ No.21和SEQ No.22所示的单链DNA组成;
所述引物对12用于测定rs1588346位点,由SEQ No.23和SEQ No.24所示的单链DNA组成;
所述引物对13用于测定rs12578418位点,由SEQ No.25和SEQ No.26所示的单链DNA组成;
所述引物对14用于测定rs17822931位点,由SEQ No.27和SEQ No.28所示的单链DNA组成;
所述引物对15用于测定rs4578651位点,由SEQ No.29和SEQ No.30所示的单链DNA组成;
所述引物对16用于测定rs6933672位点,由SEQ No.31和SEQ No.32所示的单链DNA组成;
所述引物对17用于测定rs8040604位点,由SEQ No.33和SEQ No.34所示的单链DNA组成;
所述引物对18用于测定rs7219位点,由SEQ No.35和SEQ No.36所示的单链DNA组成;
所述引物对19用于测定rs909079位点,由SEQ No.37和SEQ No.38所示的单链DNA组成;
所述引物对20用于测定rs2718786位点,由SEQ No.39和SEQ No.40所示的单链DNA组成;
所述引物对21用于测定rs9555767位点,由SEQ No.41和SEQ No.42所示的单链DNA组成;
所述引物对22用于测定rs1861229位点,由SEQ No.43和SEQ No.44所示的单链DNA组成;
所述引物对23用于测定rs941852位点,由SEQ No.45和SEQ No.46所示的单链DNA组成;
所述引物对24用于测定rs3864294位点,由SEQ No.47和SEQ No.48所示的单链DNA组成;
所述引物对25用于测定rs11017226位点,由SEQ No.49和SEQ No.50所示的单链DNA组成;
所述引物对26用于测定rs117435254位点,由SEQ No.51和SEQ No.52所示的单链DNA组成;
所述引物对27用于测定rs11656626位点,由SEQ No.53和SEQ No.54所示的单链DNA组成;
所述引物对28用于测定rs79443662位点,由SEQ No.55和SEQ No.56所示的单链DNA组成;
所述引物对29用于测定rs6657849位点,由SEQ No.57和SEQ No.58所示的单链DNA组成;
所述引物对30用于测定rs2095629位点,由SEQ No.59和SEQ No.60所示的单链DNA组成;
所述引物对31用于测定rs17026871位点,由SEQ No.61和SEQ No.62所示的单链DNA组成;
所述引物对32用于测定rs7738638位点,由SEQ No.63和SEQ No.64所示的单链DNA组成;
所述引物对33用于测定rs6414375位点,由SEQ No.65和SEQ No.66所示的单链DNA组成;
所述引物对34用于测定rs174550位点,由SEQ No.67和SEQ No.68所示的单链DNA组成;
所述引物对35用于测定rs13181561位点,由SEQ No.69和SEQ No.70所示的单链DNA组成;
所述引物对36用于测定rs4859242位点,由SEQ No.71和SEQ No.72所示的单链DNA组成;
所述引物对37用于测定rs7734266位点,由SEQ No.73和SEQ No.74所示的单链DNA组成;
所述引物对38用于测定rs3130786位点,由SEQ No.75和SEQ No.76所示的单链DNA组成;
所述引物对39用于测定rs6675339位点,由SEQ No.77和SEQ No.78所示的单链DNA组成;
所述引物对40用于测定rs11039260位点,由SEQ No.79和SEQ No.80所示的单链DNA组成;
所述引物对41用于测定rs58015131位点,由SEQ No.81和SEQ No.82所示的单链DNA组成;
所述引物对42用于测定rs911186位点,由SEQ No.83和SEQ No.84所示的单链DNA组成;
所述引物对43用于测定rs2276875位点,由SEQ No.85和SEQ No.86所示的单链DNA组成;
所述引物对44用于测定rs10514308位点,由SEQ No.87和SEQ No.88所示的单链DNA组成;
所述引物对45用于测定rs117344883位点,由SEQ No.89和SEQ No.90所示的单链DNA组成;
所述引物对46用于测定rs13208315位点,由SEQ No.91和SEQ No.92所示的单链DNA组成;
所述引物对47用于测定rs1506436位点,由SEQ No.93和SEQ No.94所示的单链DNA组成;
所述引物对48用于测定rs1003902位点,由SEQ No.95和SEQ No.96所示的单链DNA组成;
所述引物对49用于测定rs57747793位点,由SEQ No.97和SEQ No.98所示的单链DNA组成;
所述引物对50用于测定rs7950019位点,由SEQ No.99和SEQ No.100所示的单链DNA组成;
所述引物对51用于测定rs116907231位点,由SEQ No.101和SEQ No.102所示的单链DNA组成;
所述引物对52用于测定rs10030915位点,由SEQ No.103和SEQ No.104所示的单链DNA组成;
所述引物对53用于测定rs12578006位点,由SEQ No.105和SEQ No.106所示的单链DNA组成;
所述引物对54用于测定rs2688443位点,由SEQ No.107和SEQ No.108所示的单链DNA组成;
所述引物对55用于测定rs9929106位点,由SEQ No.109和SEQ No.110所示的单链DNA组成;
所述引物对56用于测定rs1076714位点,由SEQ No.111和SEQ No.112所示的单链DNA组成;
所述引物对57用于测定rs5743562位点,由SEQ No.113和SEQ No.114所示的单链DNA组成;
所述引物对58用于测定rs3138105位点,由SEQ No.115和SEQ No.116所示的单链DNA组成;
所述引物对59用于测定rs11607554位点,由SEQ No.117和SEQ No.118所示的单链DNA组成;
所述引物对60用于测定rs1790244位点,由SEQ No.119和SEQ No.120所示的单链DNA组成;
所述引物对61用于测定rs1646235位点,由SEQ No.121和SEQ No.122所示的单链DNA组成;
所述引物对62用于测定rs58531877位点,由SEQ No.123和SEQ No.124所示的单链DNA组成;
所述引物对63用于测定rs79067922位点,由SEQ No.125和SEQ No.126所示的单链DNA组成;
所述引物对64用于测定rs12470292位点,由SEQ No.127和SEQ No.128所示的单链DNA组成;
所述引物对65用于测定rs1276584位点,由SEQ No.129和SEQ No.130所示的单链DNA组成;
所述引物对66用于测定rs12322708位点,由SEQ No.131和SEQ No.132所示的单链DNA组成;
所述引物对67用于测定rs1332952位点,由SEQ No.133和SEQ No.134所示的单链DNA组成;
所述引物对68用于测定rs1020426位点,由SEQ No.135和SEQ No.136所示的单链DNA组成;
所述引物对69用于测定rs9475975位点,由SEQ No.137和SEQ No.138所示的单链DNA组成;
所述引物对70用于测定rs13226348位点,由SEQ No.139和SEQ No.140所示的单链DNA组成;
所述引物对71用于测定rs2071809位点,由SEQ No.141和SEQ No.142所示的单链DNA组成;
所述引物对72用于测定rs1912163位点,由SEQ No.143和SEQ No.144所示的单链DNA组成;
所述引物对73用于测定rs556569位点,由SEQ No.145和SEQ No.146所示的单链DNA组成;
所述引物对74用于测定rs117356781位点,由SEQ No.147和SEQ No.148所示的单链DNA组成;
所述引物对75用于测定rs75931448位点,由SEQ No.149和SEQ No.150所示的单链DNA组成;
所述引物对76用于测定rs3802215位点,由SEQ No.151和SEQ No.152所示的单链DNA组成;
所述引物对77用于测定rs699459位点,由SEQ No.153和SEQ No.154所示的单链DNA组成;
所述引物对78用于测定rs200085363位点,由SEQ No.155和SEQ No.156所示的单链DNA组成;
所述引物对79用于测定rs1786681位点,由SEQ No.157和SEQ No.158所示的单链DNA组成;
所述引物对80用于测定rs61442297位点,由SEQ No.159和SEQ No.160所示的单链DNA组成;
所述引物对81用于测定rs73655160位点,由SEQ No.161和SEQ No.162所示的单链DNA组成;
所述引物对82用于测定rs1814139位点,由SEQ No.163和SEQ No.164所示的单链DNA组成;
所述引物对83用于测定rs9372400位点,由SEQ No.165和SEQ No.166所示的单链DNA组成;
所述引物对84用于测定rs2365681位点,由SEQ No.167和SEQ No.168所示的单链DNA组成;
所述引物对85用于测定rs78299931位点,由SEQ No.169和SEQ No.170所示的单链DNA组成。
优选或可选的,所述物质的组合还包括引物对86-133;其中,
所述引物对86用于测定rs117357864位点,由SEQ No.171和SEQ No.172所示的单链DNA组成;
所述引物对87用于测定rs3811454位点,由SEQ No.173和SEQ No.174所示的单链DNA组成;
所述引物对88用于测定rs891764位点,由SEQ No.175和SEQ No.176所示的单链DNA组成;
所述引物对89用于测定rs10211548位点,由SEQ No.177和SEQ No.178所示的单链DNA组成;
所述引物对90用于测定rs3786238位点,由SEQ No.179和SEQ No.180所示的单链DNA组成;
所述引物对91用于测定rs10958017位点,由SEQ No.181和SEQ No.182所示的单链DNA组成;
所述引物对92用于测定rs74817407位点,由SEQ No.183和SEQ No.184所示的单链DNA组成;
所述引物对93用于测定rs1483701位点,由SEQ No.185和SEQ No.186所示的单链DNA组成;
所述引物对94用于测定rs9553426位点,由SEQ No.187和SEQ No.188所示的单链DNA组成;
所述引物对95用于测定rs4689212位点,由SEQ No.189和SEQ No.190所示的单链DNA组成;
所述引物对96用于测定rs12356074位点,由SEQ No.191和SEQ No.192所示的单链DNA组成;
所述引物对97用于测定rs7147317位点,由SEQ No.193和SEQ No.194所示的单链DNA组成;
所述引物对98用于测定rs1914654位点,由SEQ No.195和SEQ No.196所示的单链DNA组成;
所述引物对99用于测定rs11654954位点,由SEQ No.197和SEQ No.198所示的单链DNA组成;
所述引物对100用于测定rs12126682位点,由SEQ No.199和SEQ No.200所示的单链DNA组成;
所述引物对101用于测定rs1865958位点,由SEQ No.201和SEQ No.202所示的单链DNA组成;
所述引物对102用于测定rs7617314位点,由SEQ No.203和SEQ No.204所示的单链DNA组成;
所述引物对103用于测定rs117629150位点,由SEQ No.205和SEQ No.206所示的单链DNA组成;
所述引物对104用于测定rs17024993位点,由SEQ No.207和SEQ No.208所示的单链DNA组成;
所述引物对105用于测定rs7246006位点,由SEQ No.209和SEQ No.210所示的单链DNA组成;
所述引物对106用于测定rs4378065位点,由SEQ No.211和SEQ No.212所示的单链DNA组成;
所述引物对107用于测定rs4757292位点,由SEQ No.213和SEQ No.214所示的单链DNA组成;
所述引物对108用于测定rs11926063位点,由SEQ No.215和SEQ No.216所示的单链DNA组成;
所述引物对109用于测定rs6117562位点,由SEQ No.217和SEQ No.218所示的单链DNA组成;
所述引物对110用于测定rs77994613位点,由SEQ No.219和SEQ No.220所示的单链DNA组成;
所述引物对111用于测定rs57893710位点,由SEQ No.221和SEQ No.222所示的单链DNA组成;
所述引物对112用于测定rs729005位点,由SEQ No.223和SEQ No.224所示的单链DNA组成;
所述引物对113用于测定rs10461685位点,由SEQ No.225和SEQ No.226所示的单链DNA组成;
所述引物对114用于测定rs7947746位点,由SEQ No.227和SEQ No.228所示的单链DNA组成;
所述引物对115用于测定rs4784652位点,由SEQ No.229和SEQ No.230所示的单链DNA组成;
所述引物对116用于测定rs6731238位点,由SEQ No.231和SEQ No.232所示的单链DNA组成;
所述引物对117用于测定rs10480321位点,由SEQ No.233和SEQ No.234所示的单链DNA组成;
所述引物对118用于测定rs4788074位点,由SEQ No.235和SEQ No.236所示的单链DNA组成;
所述引物对119用于测定rs11917602位点,由SEQ No.237和SEQ No.238所示的单链DNA组成;
所述引物对120用于测定rs17243191位点,由SEQ No.239和SEQ No.240所示的单链DNA组成;
所述引物对121用于测定rs73210935位点,由SEQ No.241和SEQ No.242所示的单链DNA组成;
所述引物对122用于测定rs1856150位点,由SEQ No.243和SEQ No.244所示的单链DNA组成;
所述引物对123用于测定rs1027695位点,由SEQ No.245和SEQ No.246所示的单链DNA组成;
所述引物对124用于测定rs9296691位点,由SEQ No.247和SEQ No.248所示的单链DNA组成;
所述引物对125用于测定rs1998953位点,由SEQ No.249和SEQ No.250所示的单链DNA组成;
所述引物对126用于测定rs989682位点,由SEQ No.251和SEQ No.252所示的单链DNA组成;
所述引物对127用于测定rs7745964位点,由SEQ No.253和SEQ No.254所示的单链DNA组成;
所述引物对128用于测定rs79030707位点,由SEQ No.255和SEQ No.256所示的单链DNA组成;
所述引物对129用于测定rs10249498位点,由SEQ No.257和SEQ No.258所示的单链DNA组成;
所述引物对130用于测定rs17052409位点,由SEQ No.259和SEQ No.260所示的单链DNA组成;
所述引物对131用于测定rs17139596位点,由SEQ No.261和SEQ No.262所示的单链DNA组成;
所述引物对132用于测定rs4238565位点,由SEQ No.263和SEQ No.264所示的单链DNA组成;
所述引物对133用于测定rs2851912位点,由SEQ No.265和SEQ No.266所示的单链DNA组成。
另一方面,本发明提供了一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的试剂盒,包括上述的物质的组合。
优选或可选的,所述试剂盒还包括用于PCR扩增的试剂和/或用于构建多重PCR文库的试剂。
优选或可选的,所述试剂盒还包括预测阿尔茨海默病发病风险的评判标准。
第三方面,本发明还提供了上述的物质的组合在制备用于预测阿尔茨海默病发病风险的试剂盒中的应用。
本申请提供的物质的组合和试剂盒能够预测正常中老年人或无症状期的AD发生AD的风险,预测准确度达到80%以上。并且,本申请的方法仅取静脉血即可完成检测,且具有以下有益技术效果:(1)具有几乎无创伤,低风险等优势;(2)具有成本低的优势,无需在医院或专业医疗机构完成,受检测人员无需住院;(3)具备良好的灵敏性和特异性。
附图说明
图1为本发明实施例3中多重PCR反应流程图;
图2为本发明实施例3中对80例验证样本测定的结果图。
具体实施方式
以下对本发明的具体实施方式进行详细说明。应当理解的是,此处所描述的具体实施方式仅用于说明和解释本发明,并不用于限制本发明。
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1
本发明实施例提供了一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的引物池,所述引物池用于多重PCR反应以检测以下133个SNP位点:
rs429358、rs7412、rs13114510、rs6456964、rs1801133、rs453755、rs11117959、rs7494172、rs3130593、rs4646211、rs9557106、rs1588346、rs12578418、rs17822931、rs4578651、rs6933672、rs8040604、rs7219、rs909079、rs2718786、rs9555767、rs1861229、rs941852、rs3864294、rs11017226、rs117435254、rs11656626、rs79443662、rs6657849、rs2095629、rs17026871、rs7738638、rs6414375、rs174550、rs13181561、rs4859242、rs7734266、rs3130786、rs6675339、rs11039260、rs58015131、rs911186、rs2276875、rs10514308、rs117344883、rs13208315、rs1506436、rs1003902、rs57747793、rs7950019、rs116907231、rs10030915、rs12578006、rs2688443、rs9929106、rs1076714、rs5743562、rs3138105、rs11607554、rs1790244、rs1646235、rs58531877、rs79067922、rs12470292、rs1276584、rs12322708、rs1332952、rs1020426、rs9475975、rs13226348、rs2071809、rs1912163、rs556569、rs117356781、rs75931448、rs3802215、rs699459、rs200085363、rs1786681、rs61442297、rs73655160、rs1814139、rs9372400、rs2365681、rs78299931,及rs117357864、rs3811454、rs891764、rs10211548、rs3786238、rs10958017、rs74817407、rs1483701、rs9553426、rs4689212、rs12356074、rs7147317、rs1914654、rs11654954、rs12126682、rs1865958、rs7617314、rs117629150、rs17024993、rs7246006、rs4378065、rs4757292、rs11926063、rs6117562、rs77994613、rs57893710、rs729005、rs10461685、rs7947746、rs4784652、rs6731238、rs10480321、rs4788074、rs11917602、rs17243191、rs73210935、rs1856150、rs1027695、rs9296691、rs1998953、rs989682、rs7745964、rs79030707、rs10249498、rs17052409、rs17139596、rs4238565、rs2851912。
其中,所述的133各位点中,前85个为主要位点,后48个为次要位点。
其中各个SNP位点均对应一个引物对,每个引物对均包括两条单链DNA引物:
所述引物对1用于测定rs429358位点,由SEQ No.1和SEQ No.2所示的单链DNA组成;
所述引物对2用于测定rs7412位点,由SEQ No3和SEQ No.4所示的单链DNA组成;
所述引物对3用于测定rs13114510位点,由SEQ No.5和SEQ No.6所示的单链DNA组成;
所述引物对4用于测定rs6456964位点,由SEQ No.7和SEQ No.8所示的单链DNA组成;
所述引物对5用于测定rs1801133位点,由SEQ No9和SEQ No.10所示的单链DNA组成;
所述引物对6用于测定rs453755位点,由SEQ No.11和SEQ No.12所示的单链DNA组成;
所述引物对7用于测定rs11117959位点,由SEQ No.13和SEQ No.14所示的单链DNA组成;
所述引物对8用于测定rs7494172位点,由SEQ No.15和SEQ No.16所示的单链DNA组成;
所述引物对9用于测定rs3130593位点,由SEQ No.17和SEQ No.18所示的单链DNA组成;
所述引物对10用于测定rs4646211位点,由SEQ No.19和SEQ No.20所示的单链DNA组成;
所述引物对11用于测定rs9557106位点,由SEQ No.21和SEQ No.22所示的单链DNA组成;
所述引物对12用于测定rs1588346位点,由SEQ No.23和SEQ No.24所示的单链DNA组成;
所述引物对13用于测定rs12578418位点,由SEQ No.25和SEQ No.26所示的单链DNA组成;
所述引物对14用于测定rs17822931位点,由SEQ No.27和SEQ No.28所示的单链DNA组成;
所述引物对15用于测定rs4578651位点,由SEQ No.29和SEQ No.30所示的单链DNA组成;
所述引物对16用于测定rs6933672位点,由SEQ No.31和SEQ No.32所示的单链DNA组成;
所述引物对17用于测定rs8040604位点,由SEQ No.33和SEQ No.34所示的单链DNA组成;
所述引物对18用于测定rs7219位点,由SEQ No.35和SEQ No.36所示的单链DNA组成;
所述引物对19用于测定rs909079位点,由SEQ No.37和SEQ No.38所示的单链DNA组成;
所述引物对20用于测定rs2718786位点,由SEQ No.39和SEQ No.40所示的单链DNA组成;
所述引物对21用于测定rs9555767位点,由SEQ No.41和SEQ No.42所示的单链DNA组成;
所述引物对22用于测定rs1861229位点,由SEQ No.43和SEQ No.44所示的单链DNA组成;
所述引物对23用于测定rs941852位点,由SEQ No.45和SEQ No.46所示的单链DNA组成;
所述引物对24用于测定rs3864294位点,由SEQ No.47和SEQ No.48所示的单链DNA组成;
所述引物对25用于测定rs11017226位点,由SEQ No.49和SEQ No.50所示的单链DNA组成;
所述引物对26用于测定rs117435254位点,由SEQ No.51和SEQ No.52所示的单链DNA组成;
所述引物对27用于测定rs11656626位点,由SEQ No.53和SEQ No.54所示的单链DNA组成;
所述引物对28用于测定rs79443662位点,由SEQ No.55和SEQ No.56所示的单链DNA组成;
所述引物对29用于测定rs6657849位点,由SEQ No.57和SEQ No.58所示的单链DNA组成;
所述引物对30用于测定rs2095629位点,由SEQ No.59和SEQ No.60所示的单链DNA组成;
所述引物对31用于测定rs17026871位点,由SEQ No.61和SEQ No.62所示的单链DNA组成;
所述引物对32用于测定rs7738638位点,由SEQ No.63和SEQ No.64所示的单链DNA组成;
所述引物对33用于测定rs6414375位点,由SEQ No.65和SEQ No.66所示的单链DNA组成;
所述引物对34用于测定rs174550位点,由SEQ No.67和SEQ No.68所示的单链DNA组成;
所述引物对35用于测定rs13181561位点,由SEQ No.69和SEQ No.70所示的单链DNA组成;
所述引物对36用于测定rs4859242位点,由SEQ No.71和SEQ No.72所示的单链DNA组成;
所述引物对37用于测定rs7734266位点,由SEQ No.73和SEQ No.74所示的单链DNA组成;
所述引物对38用于测定rs3130786位点,由SEQ No.75和SEQ No.76所示的单链DNA组成;
所述引物对39用于测定rs6675339位点,由SEQ No.77和SEQ No.78所示的单链DNA组成;
所述引物对40用于测定rs11039260位点,由SEQ No.79和SEQ No.80所示的单链DNA组成;
所述引物对41用于测定rs58015131位点,由SEQ No.81和SEQ No.82所示的单链DNA组成;
所述引物对42用于测定rs911186位点,由SEQ No.83和SEQ No.84所示的单链DNA组成;
所述引物对43用于测定rs2276875位点,由SEQ No.85和SEQ No.86所示的单链DNA组成;
所述引物对44用于测定rs10514308位点,由SEQ No.87和SEQ No.88所示的单链DNA组成;
所述引物对45用于测定rs117344883位点,由SEQ No.89和SEQ No.90所示的单链DNA组成;
所述引物对46用于测定rs13208315位点,由SEQ No.91和SEQ No.92所示的单链DNA组成;
所述引物对47用于测定rs1506436位点,由SEQ No.93和SEQ No.94所示的单链DNA组成;
所述引物对48用于测定rs1003902位点,由SEQ No.95和SEQ No.96所示的单链DNA组成;
所述引物对49用于测定rs57747793位点,由SEQ No.97和SEQ No.98所示的单链DNA组成;
所述引物对50用于测定rs7950019位点,由SEQ No.99和SEQ No.100所示的单链DNA组成;
所述引物对51用于测定rs116907231位点,由SEQ No.101和SEQ No.102所示的单链DNA组成;
所述引物对52用于测定rs10030915位点,由SEQ No.103和SEQ No.104所示的单链DNA组成;
所述引物对53用于测定rs12578006位点,由SEQ No.105和SEQ No.106所示的单链DNA组成;
所述引物对54用于测定rs2688443位点,由SEQ No.107和SEQ No.108所示的单链DNA组成;
所述引物对55用于测定rs9929106位点,由SEQ No.109和SEQ No.110所示的单链DNA组成;
所述引物对56用于测定rs1076714位点,由SEQ No.111和SEQ No.112所示的单链DNA组成;
所述引物对57用于测定rs5743562位点,由SEQ No.113和SEQ No.114所示的单链DNA组成;
所述引物对58用于测定rs3138105位点,由SEQ No.115和SEQ No.116所示的单链DNA组成;
所述引物对59用于测定rs11607554位点,由SEQ No.117和SEQ No.118所示的单链DNA组成;
所述引物对60用于测定rs1790244位点,由SEQ No.119和SEQ No.120所示的单链DNA组成;
所述引物对61用于测定rs1646235位点,由SEQ No.121和SEQ No.122所示的单链DNA组成;
所述引物对62用于测定rs58531877位点,由SEQ No.123和SEQ No.124所示的单链DNA组成;
所述引物对63用于测定rs79067922位点,由SEQ No.125和SEQ No.126所示的单链DNA组成;
所述引物对64用于测定rs12470292位点,由SEQ No.127和SEQ No.128所示的单链DNA组成;
所述引物对65用于测定rs1276584位点,由SEQ No.129和SEQ No.130所示的单链DNA组成;
所述引物对66用于测定rs12322708位点,由SEQ No.131和SEQ No.132所示的单链DNA组成;
所述引物对67用于测定rs1332952位点,由SEQ No.133和SEQ No.134所示的单链DNA组成;
所述引物对68用于测定rs1020426位点,由SEQ No.135和SEQ No.136所示的单链DNA组成;
所述引物对69用于测定rs9475975位点,由SEQ No.137和SEQ No.138所示的单链DNA组成;
所述引物对70用于测定rs13226348位点,由SEQ No.139和SEQ No.140所示的单链DNA组成;
所述引物对71用于测定rs2071809位点,由SEQ No.141和SEQ No.142所示的单链DNA组成;
所述引物对72用于测定rs1912163位点,由SEQ No.143和SEQ No.144所示的单链DNA组成;
所述引物对73用于测定rs556569位点,由SEQ No.145和SEQ No.146所示的单链DNA组成;
所述引物对74用于测定rs117356781位点,由SEQ No.147和SEQ No.148所示的单链DNA组成;
所述引物对75用于测定rs75931448位点,由SEQ No.149和SEQ No.150所示的单链DNA组成;
所述引物对76用于测定rs3802215位点,由SEQ No.151和SEQ No.152所示的单链DNA组成;
所述引物对77用于测定rs699459位点,由SEQ No.153和SEQ No.154所示的单链DNA组成;
所述引物对78用于测定rs200085363位点,由SEQ No.155和SEQ No.156所示的单链DNA组成;
所述引物对79用于测定rs1786681位点,由SEQ No.157和SEQ No.158所示的单链DNA组成;
所述引物对80用于测定rs61442297位点,由SEQ No.159和SEQ No.160所示的单链DNA组成;
所述引物对81用于测定rs73655160位点,由SEQ No.161和SEQ No.162所示的单链DNA组成;
所述引物对82用于测定rs1814139位点,由SEQ No.163和SEQ No.164所示的单链DNA组成;
所述引物对83用于测定rs9372400位点,由SEQ No.165和SEQ No.166所示的单链DNA组成;
所述引物对84用于测定rs2365681位点,由SEQ No.167和SEQ No.168所示的单链DNA组成;
所述引物对85用于测定rs78299931位点,由SEQ No.169和SEQ No.170所示的单链DNA组成;
所述引物对86用于测定rs117357864位点,由SEQ No.171和SEQ No.172所示的单链DNA组成;
所述引物对87用于测定rs3811454位点,由SEQ No.173和SEQ No.174所示的单链DNA组成;
所述引物对88用于测定rs891764位点,由SEQ No.175和SEQ No.176所示的单链DNA组成;
所述引物对89用于测定rs10211548位点,由SEQ No.177和SEQ No.178所示的单链DNA组成;
所述引物对90用于测定rs3786238位点,由SEQ No.179和SEQ No.180所示的单链DNA组成;
所述引物对91用于测定rs10958017位点,由SEQ No.181和SEQ No.182所示的单链DNA组成;
所述引物对92用于测定rs74817407位点,由SEQ No.183和SEQ No.184所示的单链DNA组成;
所述引物对93用于测定rs1483701位点,由SEQ No.185和SEQ No.186所示的单链DNA组成;
所述引物对94用于测定rs9553426位点,由SEQ No.187和SEQ No.188所示的单链DNA组成;
所述引物对95用于测定rs4689212位点,由SEQ No.189和SEQ No.190所示的单链DNA组成;
所述引物对96用于测定rs12356074位点,由SEQ No.191和SEQ No.192所示的单链DNA组成;
所述引物对97用于测定rs7147317位点,由SEQ No.193和SEQ No.194所示的单链DNA组成;
所述引物对98用于测定rs1914654位点,由SEQ No.195和SEQ No.196所示的单链DNA组成;
所述引物对99用于测定rs11654954位点,由SEQ No.197和SEQ No.198所示的单链DNA组成;
所述引物对100用于测定rs12126682位点,由SEQ No.199和SEQ No.200所示的单链DNA组成;
所述引物对101用于测定rs1865958位点,由SEQ No.201和SEQ No.202所示的单链DNA组成;
所述引物对102用于测定rs7617314位点,由SEQ No.203和SEQ No.204所示的单链DNA组成;
所述引物对103用于测定rs117629150位点,由SEQ No.205和SEQ No.206所示的单链DNA组成;
所述引物对104用于测定rs17024993位点,由SEQ No.207和SEQ No.208所示的单链DNA组成;
所述引物对105用于测定rs7246006位点,由SEQ No.209和SEQ No.210所示的单链DNA组成;
所述引物对106用于测定rs4378065位点,由SEQ No.211和SEQ No.212所示的单链DNA组成;
所述引物对107用于测定rs4757292位点,由SEQ No.213和SEQ No.214所示的单链DNA组成;
所述引物对108用于测定rs11926063位点,由SEQ No.215和SEQ No.216所示的单链DNA组成;
所述引物对109用于测定rs6117562位点,由SEQ No.217和SEQ No.218所示的单链DNA组成;
所述引物对110用于测定rs77994613位点,由SEQ No.219和SEQ No.220所示的单链DNA组成;
所述引物对111用于测定rs57893710位点,由SEQ No.221和SEQ No.222所示的单链DNA组成;
所述引物对112用于测定rs729005位点,由SEQ No.223和SEQ No.224所示的单链DNA组成;
所述引物对113用于测定rs10461685位点,由SEQ No.225和SEQ No.226所示的单链DNA组成;
所述引物对114用于测定rs7947746位点,由SEQ No.227和SEQ No.228所示的单链DNA组成;
所述引物对115用于测定rs4784652位点,由SEQ No.229和SEQ No.230所示的单链DNA组成;
所述引物对116用于测定rs6731238位点,由SEQ No.231和SEQ No.232所示的单链DNA组成;
所述引物对117用于测定rs10480321位点,由SEQ No.233和SEQ No.234所示的单链DNA组成;
所述引物对118用于测定rs4788074位点,由SEQ No.235和SEQ No.236所示的单链DNA组成;
所述引物对119用于测定rs11917602位点,由SEQ No.237和SEQ No.238所示的单链DNA组成;
所述引物对120用于测定rs17243191位点,由SEQ No.239和SEQ No.240所示的单链DNA组成;
所述引物对121用于测定rs73210935位点,由SEQ No.241和SEQ No.242所示的单链DNA组成;
所述引物对122用于测定rs1856150位点,由SEQ No.243和SEQ No.244所示的单链DNA组成;
所述引物对123用于测定rs1027695位点,由SEQ No.245和SEQ No.246所示的单链DNA组成;
所述引物对124用于测定rs9296691位点,由SEQ No.247和SEQ No.248所示的单链DNA组成;
所述引物对125用于测定rs1998953位点,由SEQ No.249和SEQ No.250所示的单链DNA组成;
所述引物对126用于测定rs989682位点,由SEQ No.251和SEQ No.252所示的单链DNA组成;
所述引物对127用于测定rs7745964位点,由SEQ No.253和SEQ No.254所示的单链DNA组成;
所述引物对128用于测定rs79030707位点,由SEQ No.255和SEQ No.256所示的单链DNA组成;
所述引物对129用于测定rs10249498位点,由SEQ No.257和SEQ No.258所示的单链DNA组成;
所述引物对130用于测定rs17052409位点,由SEQ No.259和SEQ No.260所示的单链DNA组成;
所述引物对131用于测定rs17139596位点,由SEQ No.261和SEQ No.262所示的单链DNA组成;
所述引物对132用于测定rs4238565位点,由SEQ No.263和SEQ No.264所示的单链DNA组成。
所述引物对133用于测定rs2851912位点,由SEQ No.265和SEQ No.266所示的单链DNA组成。
即本实施例提供的引物池中包括上述全部的133各引物对共266条单链DNA引物。
实施例2
本发明实施例提供了一种预测用于预测阿尔茨海默病发病风险的试剂盒,所述试剂盒包括以下内容物:
实施例1中提供的引物池,该引物池中各引物的浓度均为100μM,采用1x浓度的缓冲液进行稀释;
polymerase mixture;
Enhancer buffer NB(1N);
Enhancer buffer M;
YF buffer B;
I5 Index(10μM)和I7 Index(10μM)。
其中,polymerase mixture、Enhancer buffer NB(1N)、Enhancer buffer M、以及YF buffer B均来自森广生物的SMU371V1 Library Preparation Kit-Box。
其中I5 Index和I7 Index用于区分标记各样品,使标记后的各样品可以在混合测序后进行区分。
表1和表2为两组可行的I5 Index和I7 Index,但是应该注意的是,本发明对I5Index各序列和I7 Index各序列不做具体限定,本领域技术人员可根据实际需要进行调整。
表1 96孔板中I5Index各孔位对应序列
Figure BDA0003661707500000211
Figure BDA0003661707500000221
本表中,Index分样序列了Inprimer分样序列分别对应不同的测序平台,本领域技术人员可根据实际情况和需求进行选择。
表2 96孔板中I7Index各孔位对应序列
Figure BDA0003661707500000222
Figure BDA0003661707500000231
实施例3
本实施例提供了使用实施例2中提供的试剂盒的一个具体测试实例。
其中,受试者选择80名具有脑脊液检测结果的受试者,其中AD患者40例,平均年龄为70.35±7.30,女性29例,占72.5%;健康对照40例,平均年龄为71.63±7.17,女性28例,占70.0%。取各受试者的静脉血,并提取gDNA用于后续的检测。
gDNA在使用前先用Qubit进行定量测试以测定样品的浓度,以便在每个反应管中定量添加40ng的gDNA。
在每个反应管中添加下述物质:
gDNA与双蒸水共9μL,Enhancer buffer NB(1N)3.5μL,Enhancer buffer M 2.5μL,实施例1中的引物池5μL,DNA聚合酶10μL。
将反应管震荡摇匀后置入PCR仪(北京东胜创新生物科技有限公司)中进行多重PCR反应,多重PCR的流程如图1所示。
第一轮多重PCR反应的流程条件为:
Figure BDA0003661707500000241
第一轮PCR反应完成后,进行第一轮磁珠纯化,具体步骤为:
向30μL第一轮PCR产物中加入27μL室温平衡后的AMPure XP磁珠,用移液器轻缓吸打混匀20次;
室温下孵育5min,将反应管置于磁力架(DynaMag-96Side)上静置3min;
移除上清,从磁力架取下反应管,向管内加入50μL YF buffer B,用移液器轻缓吸打混匀20次;
室温下孵育5min,将反应管置于磁力架上静置3min;
移去上清,将反应管1放置在磁力架上,向管内加入180μL80%乙醇溶液,静置30s,并重复一次;
移去上清,室温下静置至乙醇挥发完全;
将反应管取下,加入24μL无核酸酶水,用移液器轻缓吸打使磁珠重悬,室温下静置2min;
置于磁力架上,静置3min;
吸取13.5μl上清液至新的反应管内,用于后续的检测步骤。
在装有第一轮磁珠纯化后产物的反应管内继续添加Enhancer buffer M 2.5μL,双蒸水2μL,I5 Index(10μM)1μL,I7 Index(10μM)1μL,DNA聚合酶10μL。
将反应管震荡摇匀后置入PCR仪(北京东胜创新生物科技有限公司)中进行第二轮接头PCR反应。
第二轮接头PCR反应的流程条件为:
Figure BDA0003661707500000251
第二轮PCR反应完成后,进行第二轮磁珠纯化,具体步骤为:
向30μL第一轮PCR产物中加入27μL室温平衡后的AMPure XP磁珠,用移液器轻缓吸打混匀20次;
室温下孵育5min,将反应管置于磁力架(DynaMag-96Side)上静置3min;
移除上清,从磁力架取下反应管,向管内加入50μL YF buffer B,用移液器轻缓吸打混匀20次;
室温下孵育5min,将反应管置于磁力架上静置3min;
移去上清,将反应管1放置在磁力架上,向管内加入180μL80%乙醇溶液,静置30s,并重复一次;
移去上清,室温下静置至乙醇挥发完全;
将反应管取下,加入24μL无核酸酶水或1×TE buffer(pH 8.0),用移液器轻缓吸打使磁珠重悬,室温下静置2min;
置于磁力架上,静置3min;
吸取20μL上清液至新的反应管内,即为制备好的多重PCR文库。
将制备好的多重PCR文库进行质检:
取2μL制备出的多重PCR文库,采用Qubit 3.0Fluorometer(Qubit dsDNA HSAssay Kit)测定文库的浓度,正常样品的浓度范围应在5-70ng/μL的区间范围之内。
取1μL制备出的多重PCR文库,采用Qsep400全自动核酸蛋白分析系统进行文库片段长度和纯度测量,正常样品的应在380bp附近存在较高的峰。
将通过质检的多重PCR文库进行测序:
本实施例中,测序平台为illumina公司的Nova 6000。
将测序结果中各位点与表3进行比对,并根据该表3中各位点的权重,采用加性模型计算每个测试标本的PRS得分,其中,测序结果与表3对应位点相同的记为1基础分,不同的记为0基础分,将同一样本的各位点的基础分与对于权重相乘后乘积之和即为该样品的最终得分。
表3各位点对应结果及权重表
Figure BDA0003661707500000261
Figure BDA0003661707500000271
Figure BDA0003661707500000281
Figure BDA0003661707500000291
将获得的某一样品的PRS得分通过下述公式计算并预测其患AD的概率P(AD):
Figure BDA0003661707500000292
其中,P(AD)在60%以下则表示该样品来源的AD发病风险为低风险、60~80%中风险,>80%高风险。
本实施例测定的80例验证样本中,结果如图2所示。
由图2可以看出,其AUC曲线下面积达到了80.3%(95%CI:71.0-89.6),当界定值定为-0.008时,灵敏度为70.0%,特异度为72.5%。可见,本实施例提供的试剂盒产品对AD具备良好的检测灵敏度和特异性。
以上详细描述了本发明的优选实施方式,但是,本发明并不限于上述实施方式中的具体细节,在本发明的技术构思范围内,可以对本发明的技术方案进行多种简单变型,这些简单变型均属于本发明的保护范围。
此外,本发明的各种不同的实施方式之间也可以进行任意组合,只要其不违背本发明的思想,其同样应当视为本发明所公开的内容。
SEQUENCE LISTING
<110> 首都医科大学宣武医院
<120> 一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合、试剂盒及应用
<130> 1
<160> 266
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 1
gctgggcgcg gacatg 16
<210> 2
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 2
tccaccaggg gcccca 16
<210> 3
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 3
gctgggcgcg gacatg 16
<210> 4
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 4
tccaccaggg gcccca 16
<210> 5
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 5
ccaaagccct tactttgcac tg 22
<210> 6
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 6
cacttcatcc ccactggaaa gt 22
<210> 7
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 7
gccttgtgga atcagagtgg at 22
<210> 8
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 8
ccatgcttga tttcagcaga cg 22
<210> 9
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 9
atctgggaag aactcagcga ac 22
<210> 10
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 10
agcacttgaa ggagaaggtg tc 22
<210> 11
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 11
atcctgaccc ctgagatttc ct 22
<210> 12
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 12
tcctggacac catggtttca tc 22
<210> 13
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 13
tcctgagctc aagcaatcct ct 22
<210> 14
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 14
gagtgcaggg aagctgtcat atat 24
<210> 15
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 15
gtctgatccc agcaacatgg tt 22
<210> 16
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 16
accaaaatcc tctctagggg ca 22
<210> 17
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 17
gtgttgctgc acacatctgt ac 22
<210> 18
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 18
actctctgag gagcacttct ga 22
<210> 19
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 19
ggctttgggc ttcaacatat gc 22
<210> 20
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 20
accacgagag gttggtcatt tc 22
<210> 21
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 21
aatagagcct gcctcctaga gt 22
<210> 22
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 22
ctcatgatct gccatcagca tg 22
<210> 23
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 23
gccttcacag tattgaagag agtga 25
<210> 24
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 24
ctgaaaggct tcttgtgtca aagag 25
<210> 25
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 25
cactcacaat acttctgccc agt 23
<210> 26
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 26
gaaccaatgc tttccttcaa ccc 23
<210> 27
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 27
tccatcgcta aacctctgaa gc 22
<210> 28
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 28
gtctcaaggc gagggattga aa 22
<210> 29
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 29
gccatcagct atagctgagc aa 22
<210> 30
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 30
ctcaaaatac tacgggcagc ca 22
<210> 31
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 31
ctgagagcta agagtcctgg aga 23
<210> 32
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 32
aacccaggaa gcagagacaa c 21
<210> 33
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 33
ctaaagaact gcctgaatta ctgcaa 26
<210> 34
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 34
aacccattct cactcaacca gaatta 26
<210> 35
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 35
ctcctgcttt gtctcctttg ct 22
<210> 36
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 36
tctctttcca ctttgttggc cc 22
<210> 37
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 37
caagtcggca ggttgtttta gc 22
<210> 38
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 38
tcacattgga ctaaggagcc ca 22
<210> 39
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 39
tccattggag accaaaggaa tcag 24
<210> 40
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 40
cagagtctga tccccaaagg aaaa 24
<210> 41
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 41
aggggaaatg gaaaccctga ac 22
<210> 42
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 42
caaggcgagt tttagagcag ga 22
<210> 43
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 43
cagctgaaga catgctagag ca 22
<210> 44
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 44
catcattgca actacctgca gc 22
<210> 45
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 45
cccaaatcca gatgtggaag ct 22
<210> 46
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 46
actcacgaac tcactctgca tg 22
<210> 47
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 47
tcccaggcgg aaagaattaa gg 22
<210> 48
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 48
ttggacagtt ccttcttcga gc 22
<210> 49
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 49
aaatgaagca gccgagccat 20
<210> 50
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 50
actccctccc tttgacaaca ct 22
<210> 51
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 51
catgattctg actcaaccca gct 23
<210> 52
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 52
gagttaaagc aggcatgcag aac 23
<210> 53
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 53
ggtgggtggt ctaagagtaa tcac 24
<210> 54
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 54
gtcttcttat aacctggtcc ccac 24
<210> 55
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 55
cctcccaaaa ggagttgttc ct 22
<210> 56
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 56
ccaaacctgt cctctctgtc aa 22
<210> 57
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 57
aggagcagaa cagtttcaaa gga 23
<210> 58
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 58
tgctgtggtt cagtaatgct ga 22
<210> 59
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 59
catccttgtc ttgttcccaa tccta 25
<210> 60
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 60
ctcaatggat gcagaaaagg cattta 26
<210> 61
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 61
tcagaccaca tcttcaaaaa tctcct 26
<210> 62
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 62
ggaaatcttg ccccataccc tt 22
<210> 63
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 63
tccatgttgt ctactcccca gt 22
<210> 64
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 64
accacatatg tctggtgctg tc 22
<210> 65
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 65
cagtgccttt gattgcctta gac 23
<210> 66
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 66
catggcaatt ctggggtcct at 22
<210> 67
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 67
tcctgcagta tctagtgcca ct 22
<210> 68
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 68
ccatggtcct ggcagattca tt 22
<210> 69
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 69
acaatgcacc aggtagactc tg 22
<210> 70
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 70
tcagtcccct tgtccacact at 22
<210> 71
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 71
accacaatca tcactggctc ag 22
<210> 72
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 72
aggaacacaa ctgaagctgg ag 22
<210> 73
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 73
ccatgcctac atttgcatga acc 23
<210> 74
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 74
cctacaccac ttgcccatta gt 22
<210> 75
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 75
tgaggtgaag gagcacaaag tc 22
<210> 76
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 76
actcttaccc tcaagcagtc ct 22
<210> 77
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 77
tttctgtttg catacattgc aggtt 25
<210> 78
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 78
ggaacacact catcatcttg ctttt 25
<210> 79
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 79
cctctgcttc tagatcctct gcta 24
<210> 80
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 80
ctgttgccac aaagtgaaca gg 22
<210> 81
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 81
ggccagcagt gtttgttaac tc 22
<210> 82
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 82
tccttgagtc gcttttcagc tc 22
<210> 83
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 83
caaaccagga ggaatgtgag ca 22
<210> 84
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 84
accactgtga gggtttccct at 22
<210> 85
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 85
gtttgtccac ccatccatcc at 22
<210> 86
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 86
cttcagggcg aatgctgtga ta 22
<210> 87
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 87
gtgctgctat gatgccatca ag 22
<210> 88
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 88
agtctccaca gacttacagg ga 22
<210> 89
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 89
agaggacacc tctgatacag ct 22
<210> 90
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 90
aggagttgat aaggtggttg gc 22
<210> 91
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 91
tgccttctta ctctgctctc ca 22
<210> 92
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 92
ctgtttgtgc aggctgtttt cc 22
<210> 93
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 93
tctgcagctc ctcagatagg tt 22
<210> 94
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 94
atggggaagt gagtttccac tg 22
<210> 95
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 95
agggctggta ccttggtagt ag 22
<210> 96
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 96
cagagggaga gagaagggag aa 22
<210> 97
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 97
agatgaacag ccagaagctg ag 22
<210> 98
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 98
catgcagcct ccataagaac ct 22
<210> 99
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 99
gagacaggct ctctggtaaa tctac 25
<210> 100
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 100
ccttctgtac cagttaggct attca 25
<210> 101
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 101
caacaacggg acaactgaca tc 22
<210> 102
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 102
tcctcccttc tccttttcac ct 22
<210> 103
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 103
cttacaacca catggcctct ga 22
<210> 104
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 104
agagagggtc ttggtgacag aa 22
<210> 105
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 105
gggtgcttcg gttcttatct ca 22
<210> 106
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 106
gcatggctgt ccctggatat aa 22
<210> 107
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 107
tggtttccct agtgccaaga ac 22
<210> 108
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 108
cacatagctc agtctctctt ctgc 24
<210> 109
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 109
gaggtggtaa tttgtgggtg ct 22
<210> 110
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 110
tggagttaca ccggatcact ga 22
<210> 111
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 111
accatgagga tgccgtaaag ac 22
<210> 112
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 112
ttccggaaaa ggaagaggga ga 22
<210> 113
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 113
cagaagagct gaacagcagc at 22
<210> 114
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 114
tcctctggga ataacacctc gt 22
<210> 115
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 115
ggggaaatga ggaatccttc ct 22
<210> 116
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 116
ccaagggcac tatcactacc aa 22
<210> 117
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 117
cactaactgc ttacgagcac ca 22
<210> 118
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 118
tagctgcttt gaccgacaca tg 22
<210> 119
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 119
tcaagtgaga agggctctcc ta 22
<210> 120
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 120
cttgctggcg tttcttactc ag 22
<210> 121
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 121
tctgcttgtc cctctggtca 20
<210> 122
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 122
tccacaaatg ataagtgccc cg 22
<210> 123
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 123
aggtccttga tgagaaggtg gt 22
<210> 124
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 124
cttcgagcgc attctcttac ct 22
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<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 125
tgatggaagg agctagcaaa gc 22
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<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 126
tgcatgggtg tttcgtaaag gt 22
<210> 127
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 127
atgaagggct tccaagtgat gg 22
<210> 128
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 128
tgacaggaag agaagggaca ca 22
<210> 129
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 129
ggtggctgaa aaggaagaga ca 22
<210> 130
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 130
tgagccctga gcatgtacaa tg 22
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<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 131
cgctacagca agttttcaat ctgt 24
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<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 132
cgaatgtttt gtttcctcct gca 23
<210> 133
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 133
agtttccaca cctggacaca ag 22
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<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 134
tccacaagga cagacatgca ag 22
<210> 135
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 135
gatgccctct gcttcaattc ca 22
<210> 136
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 136
acctggggga catctttctt ct 22
<210> 137
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 137
cggtcaacat cccatagtgt ca 22
<210> 138
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 138
ctgtgatgag ccatgaaggg at 22
<210> 139
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 139
agagaagcag ggagagatga ga 22
<210> 140
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 140
gacatctgtg tggatttgcc ag 22
<210> 141
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 141
cataggattc cgtggcaaga gt 22
<210> 142
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 142
ttcccagtgg ccacaagtaa tc 22
<210> 143
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 143
gggtcctttg tactcttggc tt 22
<210> 144
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 144
gttgtaggct ctgtggacac aa 22
<210> 145
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 145
ctggcgatgg gttttacaca ga 22
<210> 146
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 146
acaggaggtg ctcaatacat gc 22
<210> 147
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 147
gtcttgcatt gggcattcca tc 22
<210> 148
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 148
gagtatggca gttgctccct tt 22
<210> 149
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 149
tggaggatgt caacatccca ct 22
<210> 150
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 150
ttggctgagc atttggtcca tc 22
<210> 151
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 151
cactaccctc aggtcacaga ga 22
<210> 152
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 152
cttccacgct gagaacagca 20
<210> 153
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 153
tcaggattta aatccacccc cttc 24
<210> 154
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 154
gactctgtcc tggtatcctt ttcc 24
<210> 155
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 155
accaacaagg tggaagtcca tc 22
<210> 156
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 156
agcaacaaag gtggataggg ac 22
<210> 157
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 157
gaccacatag agtaccaaag tgct 24
<210> 158
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 158
cactgaggta ttcttcagca gtga 24
<210> 159
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 159
atagaaaggc tccctgcttt gg 22
<210> 160
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 160
ccttgcccac actatggaat ga 22
<210> 161
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 161
tctaggtcac ccacaaagtc ct 22
<210> 162
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 162
tggtcctggg tgaacttaga gt 22
<210> 163
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 163
cagctcataa aggcagtgtg ga 22
<210> 164
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 164
cgtttgatga tacccacacc ca 22
<210> 165
<211> 28
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 165
ctatgagctg accttgattg atatctct 28
<210> 166
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 166
aggagatgtc attcaggttg agatatc 27
<210> 167
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 167
gaaagtgtgg aagtggacaa cg 22
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<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 168
tgctctgtag gggatggtga ta 22
<210> 169
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 169
ctcctgttgt tgcatgtagc aa 22
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<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 170
cctaggcgac aagagaaaaa ctc 23
<210> 171
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 171
tcatgctgtg cctcaacttc tag 23
<210> 172
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 172
cgtttgagtc cctattactg tctcc 25
<210> 173
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 173
aagccatcct gggttttcat cc 22
<210> 174
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 174
ctcagactgc ctttgtgacc tt 22
<210> 175
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 175
gacatggtgg gcactattga ct 22
<210> 176
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 176
ggaaatcatc cactggaccc aa 22
<210> 177
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 177
caccacattt gtccactcat tcttc 25
<210> 178
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 178
gatctggtaa gagctggaga ttcag 25
<210> 179
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 179
ctggtaaaca gcactgtgag ga 22
<210> 180
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 180
acagccattt acatggggtc tc 22
<210> 181
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 181
tcctctccaa cactggttac tga 23
<210> 182
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 182
gaagatggcc cttctgcatt ga 22
<210> 183
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 183
aggttggaat aggtaaggag acca 24
<210> 184
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 184
acagtagtag actggataca cccc 24
<210> 185
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 185
actctgtcta ctgcaggagg tt 22
<210> 186
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 186
cctagtctct caagtaccaa accc 24
<210> 187
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 187
caaacactcc agcttcctga ga 22
<210> 188
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 188
ggaagtggac acttccacgt at 22
<210> 189
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 189
ggaaatgcca ctgtcagtcc aa 22
<210> 190
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 190
tgctgtgtag tgctctgtca tg 22
<210> 191
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 191
gcatggagct gtcaagggaa 20
<210> 192
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 192
tctgaggagt cagagaacag ca 22
<210> 193
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 193
ttcaaggaca cacagctgct ac 22
<210> 194
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 194
cacaaggggg ctctttctca aa 22
<210> 195
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 195
ctgtgtgtca tacaacattg agacaag 27
<210> 196
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 196
tcacaatcat ttctgtcctg aggg 24
<210> 197
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 197
actcagggaa gaggtgatgt ga 22
<210> 198
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 198
gacagaaacc cgagtcacct tt 22
<210> 199
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 199
agagagaaaa ggggaagggg aa 22
<210> 200
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 200
ccttcctgag cctcagtttc tt 22
<210> 201
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 201
cggaacttcc acttatggct ct 22
<210> 202
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 202
gcatggatat cttggtggag gt 22
<210> 203
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 203
gccggacatt gtgagttttt cc 22
<210> 204
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 204
tcaggaaggt cttgcctcag ta 22
<210> 205
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 205
gacctactaa tgcgttgcaa cc 22
<210> 206
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 206
gcaagaagcc tatgaagagg ga 22
<210> 207
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 207
ggcacgcaat accacttaaa gtag 24
<210> 208
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 208
gaactgcagg ggattttatc ttgg 24
<210> 209
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 209
gaaaacggga caagtggaac ac 22
<210> 210
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 210
taccaatcac cacccaactt cc 22
<210> 211
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 211
tgccctcatc acagaaactg ag 22
<210> 212
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 212
agaggggtgt ttgagctcaa tc 22
<210> 213
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 213
cgctcttcct tttagcctcc tt 22
<210> 214
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 214
gcaatgacag gtaaccaagg ga 22
<210> 215
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 215
ctctctagga caataaggcg tgac 24
<210> 216
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 216
cttgcccagt ctagctagaa gttc 24
<210> 217
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 217
caaaaaggcc ccagagaaaa gg 22
<210> 218
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 218
caacttcctg agagcaggga tt 22
<210> 219
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 219
ttgagctgag tccccttagg aa 22
<210> 220
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 220
aagcaggttg gaattctgag gg 22
<210> 221
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 221
tgaactcggc aatagggttc ag 22
<210> 222
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 222
gtgatcgtga gcagttctca gt 22
<210> 223
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 223
gtcccaaggc aatttccagt tc 22
<210> 224
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 224
tgctcacccc ttcttctttc ac 22
<210> 225
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 225
tcctggggtc aatctaaggg tt 22
<210> 226
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 226
tgcaggcttc agccttgaat 20
<210> 227
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 227
gtgagaacac agtggtcatt gc 22
<210> 228
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 228
ctctttccaa ctgacctctg ct 22
<210> 229
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 229
caaactgaca agagctggag ga 22
<210> 230
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 230
atggtacagc tggtgctgta tg 22
<210> 231
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 231
ggcaacgtga agtgaatgat cac 23
<210> 232
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 232
caagcgatgc agaccttgtt atg 23
<210> 233
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 233
attagagcca taccggtgac ct 22
<210> 234
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 234
tcctttgcca tccctggact at 22
<210> 235
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 235
ccagtctgaa aggttacgtg ct 22
<210> 236
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 236
ctctgtgtgt tctgccgttc ta 22
<210> 237
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 237
cacctagttg aaaagcccat tgc 23
<210> 238
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 238
cctttacatt ccctgagtgt accc 24
<210> 239
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 239
agcctttggt tcatgtatac ctga 24
<210> 240
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 240
atcccaggaa tgaaggacca tatg 24
<210> 241
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 241
tgtactgcct gcagaatcat gag 23
<210> 242
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 242
aagccaaatg tcagccctat acc 23
<210> 243
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 243
ctaagaccta gccttcgaga gaga 24
<210> 244
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 244
gaacacaagc ccattaaagg cc 22
<210> 245
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 245
tcttaggaat gaagtggcag caa 23
<210> 246
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 246
gactagggaa tattttaaat gccccag 27
<210> 247
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 247
ctgctacctc gtgctttaat gc 22
<210> 248
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 248
cttgagattt gcaggcaaga cg 22
<210> 249
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 249
gtaagttgag ggacatgcag gaa 23
<210> 250
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 250
agagacagcc ataactttgg gc 22
<210> 251
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 251
tggggatgaa tcctacacgg at 22
<210> 252
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 252
cacagtgtcc ctttagccac at 22
<210> 253
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 253
tcatcaccca aaacagaatg tcct 24
<210> 254
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 254
tgacagggca aaactctgtc ttaa 24
<210> 255
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 255
tgaggttagg tggagtgacc aa 22
<210> 256
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 256
tcctttggtg tagtgtggga gt 22
<210> 257
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 257
gcagccagaa tggactaagg ta 22
<210> 258
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 258
gtgtcacaaa catcaccaga gc 22
<210> 259
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 259
ggtcacatgg caaacaagtg tg 22
<210> 260
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 260
ctctcaacat ttccccaacc ca 22
<210> 261
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 261
ggttatgaag cccctttctc ca 22
<210> 262
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 262
gtgagcaatt ccctttcttc cag 23
<210> 263
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 263
tggaatggcc tttccaagct t 21
<210> 264
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 264
agagcagcct caagtgcttt t 21
<210> 265
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 265
ccctcgttgc cttattgacc aa 22
<210> 266
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 266
agctgcagct tccttaatcc ag 22

Claims (9)

1.一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的物质的组合,其包括用于检测选自以下的一个或多个SNP位点的物质:
rs429358、rs7412、rs13114510、rs6456964、rs1801133、rs453755、rs11117959、rs7494172、rs3130593、rs4646211、rs9557106、rs1588346、rs12578418、rs17822931、rs4578651、rs6933672、rs8040604、rs7219、rs909079、rs2718786、rs9555767、rs1861229、rs941852、rs3864294、rs11017226、rs117435254、rs11656626、rs79443662、rs6657849、rs2095629、rs17026871、rs7738638、rs6414375、rs174550、rs13181561、rs4859242、rs7734266、rs3130786、rs6675339、rs11039260、rs58015131、rs911186、rs2276875、rs10514308、rs117344883、rs13208315、rs1506436、rs1003902、rs57747793、rs7950019、rs116907231、rs10030915、rs12578006、rs2688443、rs9929106、rs1076714、rs5743562、rs3138105、rs11607554、rs1790244、rs1646235、rs58531877、rs79067922、rs12470292、rs1276584、rs12322708、rs1332952、rs1020426、rs9475975、rs13226348、rs2071809、rs1912163、rs556569、rs117356781、rs75931448、rs3802215、rs699459、rs200085363、rs1786681、rs61442297、rs73655160、rs1814139、rs9372400、rs2365681、rs78299931。
2.根据权利要求1所述的物质的组合,其特征在于,其还包括用于检测选自以下一个或多个SNP位点的物质:
rs117357864、rs3811454、rs891764、rs10211548、rs3786238、rs10958017、rs74817407、rs1483701、rs9553426、rs4689212、rs12356074、rs7147317、rs1914654、rs11654954、rs12126682、rs1865958、rs7617314、rs117629150、rs17024993、rs7246006、rs4378065、rs4757292、rs11926063、rs6117562、rs77994613、rs57893710、rs729005、rs10461685、rs7947746、rs4784652、rs6731238、rs10480321、rs4788074、rs11917602、rs17243191、rs73210935、rs1856150、rs1027695、rs9296691、rs1998953、rs989682、rs7745964、rs79030707、rs10249498、rs17052409、rs17139596、rs4238565、rs2851912。
3.根据权利要求1或2所述的物质的组合,其特征在于,所述物质的组合包括用于检测全部所述SNP位点的物质。
4.根据权利要求3所述的物质的组合,其特征在于,所述物质的组合包括成套的单链DNA,所述成套单链DNA包括引物对1-85;
所述引物对1用于测定rs429358位点,由SEQ No.1和SEQ No.2所示的单链DNA组成;
所述引物对2用于测定rs7412位点,由SEQ No3和SEQ No.4所示的单链DNA组成;
所述引物对3用于测定rs13114510位点,由SEQ No.5和SEQ No.6所示的单链DNA组成;
所述引物对4用于测定rs6456964位点,由SEQ No.7和SEQ No.8所示的单链DNA组成;
所述引物对5用于测定rs1801133位点,由SEQ No9和SEQ No.10所示的单链DNA组成;
所述引物对6用于测定rs453755位点,由SEQ No.11和SEQ No.12所示的单链DNA组成;
所述引物对7用于测定rs11117959位点,由SEQ No.13和SEQ No.14所示的单链DNA组成;
所述引物对8用于测定rs7494172位点,由SEQ No.15和SEQ No.16所示的单链DNA组成;
所述引物对9用于测定rs3130593位点,由SEQ No.17和SEQ No.18所示的单链DNA组成;
所述引物对10用于测定rs4646211位点,由SEQ No.19和SEQ No.20所示的单链DNA组成;
所述引物对11用于测定rs9557106位点,由SEQ No.21和SEQ No.22所示的单链DNA组成;
所述引物对12用于测定rs1588346位点,由SEQ No.23和SEQ No.24所示的单链DNA组成;
所述引物对13用于测定rs12578418位点,由SEQ No.25和SEQ No.26所示的单链DNA组成;
所述引物对14用于测定rs17822931位点,由SEQ No.27和SEQ No.28所示的单链DNA组成;
所述引物对15用于测定rs4578651位点,由SEQ No.29和SEQ No.30所示的单链DNA组成;
所述引物对16用于测定rs6933672位点,由SEQ No.31和SEQ No.32所示的单链DNA组成;
所述引物对17用于测定rs8040604位点,由SEQ No.33和SEQ No.34所示的单链DNA组成;
所述引物对18用于测定rs7219位点,由SEQ No.35和SEQ No.36所示的单链DNA组成;
所述引物对19用于测定rs909079位点,由SEQ No.37和SEQ No.38所示的单链DNA组成;
所述引物对20用于测定rs2718786位点,由SEQ No.39和SEQ No.40所示的单链DNA组成;
所述引物对21用于测定rs9555767位点,由SEQ No.41和SEQ No.42所示的单链DNA组成;
所述引物对22用于测定rs1861229位点,由SEQ No.43和SEQ No.44所示的单链DNA组成;
所述引物对23用于测定rs941852位点,由SEQ No.45和SEQ No.46所示的单链DNA组成;
所述引物对24用于测定rs3864294位点,由SEQ No.47和SEQ No.48所示的单链DNA组成;
所述引物对25用于测定rs11017226位点,由SEQ No.49和SEQ No.50所示的单链DNA组成;
所述引物对26用于测定rs117435254位点,由SEQ No.51和SEQ No.52所示的单链DNA组成;
所述引物对27用于测定rs11656626位点,由SEQ No.53和SEQ No.54所示的单链DNA组成;
所述引物对28用于测定rs79443662位点,由SEQ No.55和SEQ No.56所示的单链DNA组成;
所述引物对29用于测定rs6657849位点,由SEQ No.57和SEQ No.58所示的单链DNA组成;
所述引物对30用于测定rs2095629位点,由SEQ No.59和SEQ No.60所示的单链DNA组成;
所述引物对31用于测定rs17026871位点,由SEQ No.61和SEQ No.62所示的单链DNA组成;
所述引物对32用于测定rs7738638位点,由SEQ No.63和SEQ No.64所示的单链DNA组成;
所述引物对33用于测定rs6414375位点,由SEQ No.65和SEQ No.66所示的单链DNA组成;
所述引物对34用于测定rs174550位点,由SEQ No.67和SEQ No.68所示的单链DNA组成;
所述引物对35用于测定rs13181561位点,由SEQ No.69和SEQ No.70所示的单链DNA组成;
所述引物对36用于测定rs4859242位点,由SEQ No.71和SEQ No.72所示的单链DNA组成;
所述引物对37用于测定rs7734266位点,由SEQ No.73和SEQ No.74所示的单链DNA组成;
所述引物对38用于测定rs3130786位点,由SEQ No.75和SEQ No.76所示的单链DNA组成;
所述引物对39用于测定rs6675339位点,由SEQ No.77和SEQ No.78所示的单链DNA组成;
所述引物对40用于测定rs11039260位点,由SEQ No.79和SEQ No.80所示的单链DNA组成;
所述引物对41用于测定rs58015131位点,由SEQ No.81和SEQ No.82所示的单链DNA组成;
所述引物对42用于测定rs911186位点,由SEQ No.83和SEQ No.84所示的单链DNA组成;
所述引物对43用于测定rs2276875位点,由SEQ No.85和SEQ No.86所示的单链DNA组成;
所述引物对44用于测定rs10514308位点,由SEQ No.87和SEQ No.88所示的单链DNA组成;
所述引物对45用于测定rs117344883位点,由SEQ No.89和SEQ No.90所示的单链DNA组成;
所述引物对46用于测定rs13208315位点,由SEQ No.91和SEQ No.92所示的单链DNA组成;
所述引物对47用于测定rs1506436位点,由SEQ No.93和SEQ No.94所示的单链DNA组成;
所述引物对48用于测定rs1003902位点,由SEQ No.95和SEQ No.96所示的单链DNA组成;
所述引物对49用于测定rs57747793位点,由SEQ No.97和SEQ No.98所示的单链DNA组成;
所述引物对50用于测定rs7950019位点,由SEQ No.99和SEQ No.100所示的单链DNA组成;
所述引物对51用于测定rs116907231位点,由SEQ No.101和SEQ No.102所示的单链DNA组成;
所述引物对52用于测定rs10030915位点,由SEQ No.103和SEQ No.104所示的单链DNA组成;
所述引物对53用于测定rs12578006位点,由SEQ No.105和SEQ No.106所示的单链DNA组成;
所述引物对54用于测定rs2688443位点,由SEQ No.107和SEQ No.108所示的单链DNA组成;
所述引物对55用于测定rs9929106位点,由SEQ No.109和SEQ No.110所示的单链DNA组成;
所述引物对56用于测定rs1076714位点,由SEQ No.111和SEQ No.112所示的单链DNA组成;
所述引物对57用于测定rs5743562位点,由SEQ No.113和SEQ No.114所示的单链DNA组成;
所述引物对58用于测定rs3138105位点,由SEQ No.115和SEQ No.116所示的单链DNA组成;
所述引物对59用于测定rs11607554位点,由SEQ No.117和SEQ No.118所示的单链DNA组成;
所述引物对60用于测定rs1790244位点,由SEQ No.119和SEQ No.120所示的单链DNA组成;
所述引物对61用于测定rs1646235位点,由SEQ No.121和SEQ No.122所示的单链DNA组成;
所述引物对62用于测定rs58531877位点,由SEQ No.123和SEQ No.124所示的单链DNA组成;
所述引物对63用于测定rs79067922位点,由SEQ No.125和SEQ No.126所示的单链DNA组成;
所述引物对64用于测定rs12470292位点,由SEQ No.127和SEQ No.128所示的单链DNA组成;
所述引物对65用于测定rs1276584位点,由SEQ No.129和SEQ No.130所示的单链DNA组成;
所述引物对66用于测定rs12322708位点,由SEQ No.131和SEQ No.132所示的单链DNA组成;
所述引物对67用于测定rs1332952位点,由SEQ No.133和SEQ No.134所示的单链DNA组成;
所述引物对68用于测定rs1020426位点,由SEQ No.135和SEQ No.136所示的单链DNA组成;
所述引物对69用于测定rs9475975位点,由SEQ No.137和SEQ No.138所示的单链DNA组成;
所述引物对70用于测定rs13226348位点,由SEQ No.139和SEQ No.140所示的单链DNA组成;
所述引物对71用于测定rs2071809位点,由SEQ No.141和SEQ No.142所示的单链DNA组成;
所述引物对72用于测定rs1912163位点,由SEQ No.143和SEQ No.144所示的单链DNA组成;
所述引物对73用于测定rs556569位点,由SEQ No.145和SEQ No.146所示的单链DNA组成;
所述引物对74用于测定rs117356781位点,由SEQ No.147和SEQ No.148所示的单链DNA组成;
所述引物对75用于测定rs75931448位点,由SEQ No.149和SEQ No.150所示的单链DNA组成;
所述引物对76用于测定rs3802215位点,由SEQ No.151和SEQ No.152所示的单链DNA组成;
所述引物对77用于测定rs699459位点,由SEQ No.153和SEQ No.154所示的单链DNA组成;
所述引物对78用于测定rs200085363位点,由SEQ No.155和SEQ No.156所示的单链DNA组成;
所述引物对79用于测定rs1786681位点,由SEQ No.157和SEQ No.158所示的单链DNA组成;
所述引物对80用于测定rs61442297位点,由SEQ No.159和SEQ No.160所示的单链DNA组成;
所述引物对81用于测定rs73655160位点,由SEQ No.161和SEQ No.162所示的单链DNA组成;
所述引物对82用于测定rs1814139位点,由SEQ No.163和SEQ No.164所示的单链DNA组成;
所述引物对83用于测定rs9372400位点,由SEQ No.165和SEQ No.166所示的单链DNA组成;
所述引物对84用于测定rs2365681位点,由SEQ No.167和SEQ No.168所示的单链DNA组成;
所述引物对85用于测定rs78299931位点,由SEQ No.169和SEQ No.170所示的单链DNA组成。
5.根据权利要求4所述的物质的组合,其特征在于,所述成套单链DNA还包括引物对86-133;其中,
所述引物对86用于测定rs117357864位点,由SEQ No.171和SEQ No.172所示的单链DNA组成;
所述引物对87用于测定rs3811454位点,由SEQ No.173和SEQ No.174所示的单链DNA组成;
所述引物对88用于测定rs891764位点,由SEQ No.175和SEQ No.176所示的单链DNA组成;
所述引物对89用于测定rs10211548位点,由SEQ No.177和SEQ No.178所示的单链DNA组成;
所述引物对90用于测定rs3786238位点,由SEQ No.179和SEQ No.180所示的单链DNA组成;
所述引物对91用于测定rs10958017位点,由SEQ No.181和SEQ No.182所示的单链DNA组成;
所述引物对92用于测定rs74817407位点,由SEQ No.183和SEQ No.184所示的单链DNA组成;
所述引物对93用于测定rs1483701位点,由SEQ No.185和SEQ No.186所示的单链DNA组成;
所述引物对94用于测定rs9553426位点,由SEQ No.187和SEQ No.188所示的单链DNA组成;
所述引物对95用于测定rs4689212位点,由SEQ No.189和SEQ No.190所示的单链DNA组成;
所述引物对96用于测定rs12356074位点,由SEQ No.191和SEQ No.192所示的单链DNA组成;
所述引物对97用于测定rs7147317位点,由SEQ No.193和SEQ No.194所示的单链DNA组成;
所述引物对98用于测定rs1914654位点,由SEQ No.195和SEQ No.196所示的单链DNA组成;
所述引物对99用于测定rs11654954位点,由SEQ No.197和SEQ No.198所示的单链DNA组成;
所述引物对100用于测定rs12126682位点,由SEQ No.199和SEQ No.200所示的单链DNA组成;
所述引物对101用于测定rs1865958位点,由SEQ No.201和SEQ No.202所示的单链DNA组成;
所述引物对102用于测定rs7617314位点,由SEQ No.203和SEQ No.204所示的单链DNA组成;
所述引物对103用于测定rs117629150位点,由SEQ No.205和SEQ No.206所示的单链DNA组成;
所述引物对104用于测定rs17024993位点,由SEQ No.207和SEQ No.208所示的单链DNA组成;
所述引物对105用于测定rs7246006位点,由SEQ No.209和SEQ No.210所示的单链DNA组成;
所述引物对106用于测定rs4378065位点,由SEQ No.211和SEQ No.212所示的单链DNA组成;
所述引物对107用于测定rs4757292位点,由SEQ No.213和SEQ No.214所示的单链DNA组成;
所述引物对108用于测定rs11926063位点,由SEQ No.215和SEQ No.216所示的单链DNA组成;
所述引物对109用于测定rs6117562位点,由SEQ No.217和SEQ No.218所示的单链DNA组成;
所述引物对110用于测定rs77994613位点,由SEQ No.219和SEQ No.220所示的单链DNA组成;
所述引物对111用于测定rs57893710位点,由SEQ No.221和SEQ No.222所示的单链DNA组成;
所述引物对112用于测定rs729005位点,由SEQ No.223和SEQ No.224所示的单链DNA组成;
所述引物对113用于测定rs10461685位点,由SEQ No.225和SEQ No.226所示的单链DNA组成;
所述引物对114用于测定rs7947746位点,由SEQ No.227和SEQ No.228所示的单链DNA组成;
所述引物对115用于测定rs4784652位点,由SEQ No.229和SEQ No.230所示的单链DNA组成;
所述引物对116用于测定rs6731238位点,由SEQ No.231和SEQ No.232所示的单链DNA组成;
所述引物对117用于测定rs10480321位点,由SEQ No.233和SEQ No.234所示的单链DNA组成;
所述引物对118用于测定rs4788074位点,由SEQ No.235和SEQ No.236所示的单链DNA组成;
所述引物对119用于测定rs11917602位点,由SEQ No.237和SEQ No.238所示的单链DNA组成;
所述引物对120用于测定rs17243191位点,由SEQ No.239和SEQ No.240所示的单链DNA组成;
所述引物对121用于测定rs73210935位点,由SEQ No.241和SEQ No.242所示的单链DNA组成;
所述引物对122用于测定rs1856150位点,由SEQ No.243和SEQ No.244所示的单链DNA组成;
所述引物对123用于测定rs1027695位点,由SEQ No.245和SEQ No.246所示的单链DNA组成;
所述引物对124用于测定rs9296691位点,由SEQ No.247和SEQ No.248所示的单链DNA组成;
所述引物对125用于测定rs1998953位点,由SEQ No.249和SEQ No.250所示的单链DNA组成;
所述引物对126用于测定rs989682位点,由SEQ No.251和SEQ No.252所示的单链DNA组成;
所述引物对127用于测定rs7745964位点,由SEQ No.253和SEQ No.254所示的单链DNA组成;
所述引物对128用于测定rs79030707位点,由SEQ No.255和SEQ No.256所示的单链DNA组成;
所述引物对129用于测定rs10249498位点,由SEQ No.257和SEQ No.258所示的单链DNA组成;
所述引物对130用于测定rs17052409位点,由SEQ No.259和SEQ No.260所示的单链DNA组成;
所述引物对131用于测定rs17139596位点,由SEQ No.261和SEQ No.262所示的单链DNA组成;
所述引物对132用于测定rs4238565位点,由SEQ No.263和SEQ No.264所示的单链DNA组成;
所述引物对133用于测定rs2851912位点,由SEQ No.265和SEQ No.266所示的单链DNA组成。
6.一种用于预测阿尔茨海默病发病风险的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1-5任一所述的物质的组合。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于PCR扩增的试剂和/或用于构建多重PCR文库的试剂。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括预测阿尔茨海默病发病风险的评判标准。
9.权利要求1-5任一所述的物质的组合在制备用于预测阿尔茨海默病发病风险的试剂盒中的应用。
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