CN107298701B - 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用 - Google Patents

玉米转录因子ZmbZIP22及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN107298701B
CN107298701B CN201710251008.9A CN201710251008A CN107298701B CN 107298701 B CN107298701 B CN 107298701B CN 201710251008 A CN201710251008 A CN 201710251008A CN 107298701 B CN107298701 B CN 107298701B
Authority
CN
China
Prior art keywords
zmbzip22
corn
prolamin
transcription factor
protein
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201710251008.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN107298701A (zh
Inventor
宋任涛
李朝斌
祁巍巍
朱晨光
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
University of Shanghai for Science and Technology
Original Assignee
University of Shanghai for Science and Technology
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by University of Shanghai for Science and Technology filed Critical University of Shanghai for Science and Technology
Priority to CN201710251008.9A priority Critical patent/CN107298701B/zh
Publication of CN107298701A publication Critical patent/CN107298701A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN107298701B publication Critical patent/CN107298701B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8251Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8251Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
    • C12N15/8253Methionine or cysteine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8251Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
    • C12N15/8254Tryptophan or lysine

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

本发明涉及一个玉米籽粒转录因子在调控醇溶蛋白方面的应用。该基因为SEQ ID NO:1所示的碱基序列。该序列编码的蛋白ZmbZIP22可直接结合并激活27kDa γ‑醇溶蛋白启动子。利用CRISPR‑Cas9技术将ZmbZIP22的基因片段SEQ ID NO:2作为guide RNA进行转化玉米幼胚,并获得基因缺失突变体的植株。相对野生型籽粒而言,转基因突变体玉米籽粒出现不规则且较薄的蛋白体外壳,成熟籽粒的醇溶蛋白含量显著下降,常规玉米缺乏的赖氨酸等必需氨基酸含量显著上升,从而提高了玉米的营养品质。

Description

玉米转录因子ZmbZIP22及其应用
技术领域
本发明涉及一种玉米转录因子ZmbZIP22及其应用。
技术背景
玉米(Zea mays)是世界上产量最高的禾本科作物之一。除了作为粮食外,玉米还是禽畜重要的饲料来源,也是重要的工业原料。因此玉米对于社会的进步起到了重要的作用。随着人们生活水平的不断提高,对于所摄取食物的品质也提出了更高的要求。因此玉米品质的提升成为一个重要的研究课题。玉米籽粒的主要成分包括淀粉、蛋白质和油脂,其中蛋白质决定了玉米籽粒的营养价值,因而玉米的蛋白质品质是一个重要的研究性状。
醇溶蛋白是玉米籽粒中的主要储藏蛋白,占总蛋白的60%以上,然而其赖氨酸、色氨酸和甲硫氨酸等必需氨基酸含量极低,导致传统的玉米籽粒中氨基酸组成不均衡。其中赖氨酸的欠缺尤为严重,玉米在作为禽畜饲料时仍需添加人工合成的赖氨酸或其他富含赖氨酸的蛋白质。在籽粒主要农艺性状不改变的条件下,降低籽粒中醇溶蛋白的比例能够显著地提高籽粒赖氨酸的相对含量,从而提高籽粒的蛋白质品质。
玉米籽粒中醇溶蛋白由4个基因家族编码,分为α-zein(Mr 19kDa、22kDa),β-zein(Mr 14kDa), γ-zein(Mr 16kDa、27kDa),δ-zein(Mr 10kDa、15kDa)。醇溶蛋白通过形成蛋白体来在玉米籽粒胚乳中储藏。在各类醇溶蛋白中27kDa γ-醇溶蛋白的表达在籽粒发育过程中最早出现,这主要是由于27kDa γ-醇溶蛋白分布在蛋白体的外壳区域,其主要功能是促使蛋白体的初始形成。已有的DNase I footprint研究表明,在27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子上,仍有未知的转录因子参与其表达调控。
鉴于27kDa γ-醇溶蛋白在胚乳中表达量极高,对于蛋白体形成,乃至储藏蛋白累积过程的重要作用,寻找其他参与27kDa γ-醇溶蛋白转录调控的转录因子将有利于降低醇溶蛋白的累积,提高非醇溶蛋白的比例,从而提高玉米的营养品质。
酵母单杂交技术(Y1H)是采用已知启动子筛选其相互作用的蛋白的经典技术。利用该技术可以实现对目标启动子互作蛋白的大规模筛选。但是其弊端是背景较高。
染色质免疫共沉淀实验(ChIP)是一种验证启动子与蛋白相互作用的技术。利用这项技术,可以对酵母单杂交方法筛选到的蛋白进行验证。
双荧光转录激活检测系统是一种验证转录因子与启动子是否结合并激活下游基因表达的技术,该技术可以验证酵母单杂交技术得到的目标蛋白是否能够直接调控该启动子所驱动的基因。
发明内容
本发明的目的之一在于提供一种转录因子ZmbZIP22。
本发明的目的之二在于提供该转录因子ZmbZIP22的应用。
为达到上述目的,本发明采用如下技术方案:
一种玉米转录因子ZmbZIP22,其特征在于该转录因子具有SEQ ID NO:1所示的碱基序列。
一种载体,其特征在于该载体含有根据权利要求1所述的转录因子ZmbZIP22。
上述载体是ZmbZIP22的CRISPR-Cas9转基因载体。
一种上述的转录因子ZmbZIP22在调控玉米籽粒储藏蛋白27kDa γ-醇溶蛋白中的应用。
一种上述的转录因子ZmbZIP22在结合并转录激活27kDa γ-醇溶蛋白的启动子中的应用。
一种转录因子ZmbZIP22转基因CRISPR-Cas9表达载体的构建方法,其特征在于采用pCAMBIA3301 为转基因载体,将SEQ ID NO:2所示序列作为gRNA spacer和scaffold连入pCAMBIA3301转基因载体中获得,其中pCAMBIA3301 载体经过改造,以玉米U6启动子和终止子表达gRNA,同时以玉米泛素启动子和NOS终止子表达玉米密码子优化的Cas9蛋白。
一种玉米转录因子ZmbZIP22基因突变后在农业高品质玉米育种方面的应用,其特征在于籽粒赖氨酸和甲硫氨酸含量的上升、醇溶蛋白含量的下降导致蛋白质品质的提升。
本发明通过ChIP-qPCR和双荧光转录激活实验明确了ZmbZIP22在体内能直接结合并激活27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子。
通过对醇溶蛋白基因的定量PCR实验证明了该基因在转基因缺失突变后会导致27kDa醇溶蛋白的表达下降。
通过醇溶蛋白抽提实验以及蛋白定量证明了醇溶蛋白的累积在ZmbZIP22突变体中下降。
通过透射电镜观察证明了该基因在转基因突变后会导致细胞内蛋白体外壳变薄且不规则。
通说总氨基酸定量明确了该基因在转基因突变后赖氨酸和甲硫氨酸等必需氨基酸含量显著提高。
本发明通过酵母单杂交技术找到了27kDa γ-醇溶蛋白基因的转录因子ZmbZIP22,并通过ChIP-qPCR和转录激活测试进行了验证。CRISPR-Cas9基因编辑的方法获得了该转录因子的突变体转基因玉米,通过醇溶蛋白抽提,透射电镜观察等对转基因材料进行了表型分析,发现醇溶蛋白在突变体中显著下降,籽粒的蛋白质品质得到了提升。
本发明发现了一个新的27kDa γ-醇溶蛋白基因的转录调控因子,能够直接影响醇溶蛋白表达,在细胞学上对蛋白体的结构和形状产生影响。通过CRISPR-Cas9基因突变创造的ZmbZIP22突变体玉米在醇溶蛋白累积中有明显下降,赖氨酸和甲硫氨酸含量显著提升,从而使籽粒的营养品质显著提升。
附图说明
图1是酵母单杂筛库获得的阳性克隆滴板验证结果图。实验采用27kDa γ-醇溶蛋白启动子序列为饵,筛选了玉米籽粒发育各时期的cDNA文库。
图2是通过ChIP-qPCR实验验证ZmbZIP22在体内与27kDaγ-醇溶蛋白启动子的直接结合。
图3是双荧光转录激活系统载体的构建示意图。
图4是通过双荧光转录激活系统验证ZmbZIP22对27kDaγ-醇溶蛋白启动子的转录激活。
图5是ZmbZIP22转基因CRISPR-Cas9载体构建示意图。
图6是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9基因编辑两个阳性事件籽粒中ZmbZIP22在基因组水平的编辑情况。
图7是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9 9号事件未成熟籽粒中ZmbZIP22在蛋白水平的表达量检测。
图8是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9 9号与10号事件中27kDaγ-醇溶蛋白转录水平的表达量检测。
图9是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9 9号与10号事件中总蛋白、醇溶蛋白和非醇溶蛋白的定量分析。
图10是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9 9号与10号事件中醇溶蛋白的SDS-PAGE检测。
图11是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9 9号事件未成熟种子的透射电镜观察。
图12是ZmbZIP22 CRISPR-Cas9 9号事件成熟籽粒的总赖氨酸和甲硫氨酸定量。
具体实施方式
下面结合具体实施事例,进一步阐述本发明。应理解,这些实例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体实验条件的实验方法,通常按照常规条件,如分子克隆(Molecular Cloning: A Laboratory Manual,3rd ed.)或植物分子生物学-实验手册(Plant Molecular Biology-A Laboratory Manual, Melody S. Clark编, Springer-verlag Berlin Heidelberg, 1997)中所述条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例一:利用酵母单杂实验筛选27kDa γ-醇溶蛋白的潜在转录因子
首先采取了SMART方法,获得了均一化的玉米籽粒cDNA片段。将该cDNA片段与单杂载体pGADT7-Rec2连接转化,获得了约1.0×106个克隆。在饵质粒的构建中,采用27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子为饵。
结果:通过PEG/LiAc法将构建的库质粒以及饵质粒转入酵母Y187中,得到106个酵母转化子。通过DDO与TDO的筛选,共获得了27个疑似阳性克隆。对这些克隆质粒抽提、测序分析以及回转酵母,筛选出一个bZIP类型的转录因子基因ZmbZIP22,参见图1。
实施例二:ZmbZIP22与27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子体内结合的验证
1.取授粉后15天的野生型未成熟玉米籽粒,采用1%的甲醛进行真空交联。
2.对交联过的籽粒进行细胞核抽提,并超声将染色质打断为300bp左右的片段。
3.加入兔免疫前血清,4℃孵育1h,对染色质进行预纯化。
4.加入40μl GE Protein A agarose beads,4℃孵育1h。
5.将孵育后液体800g离心2min,将上清分成两等分,分别加入自制的ZmbZIP22抗体和等量的IgG,4℃孵育过夜。
6.加入20μl GE Protein A agarose beads,4℃孵育90min。
7.离心,用IP buffer洗柱子,共5遍。
8.用洗脱缓冲液进行洗脱。加入Proteinase K对免疫沉淀到的染色质蛋白进行消化,55℃去交联6h。
用乙醇沉淀染色质DNA,酚氯仿纯化后用于Real-time定量PCR检测。
结果:用27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子的引物和泛素启动子的引物分别进行定量PCR检测,结果显示27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子在ZmbZIP22抗体免疫沉淀的材料中比在IgG免疫沉淀的材料中有明显的富集,而泛素启动子在上述材料中均无富集。说明ZmbZIP22能够在体内结合27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子(图2)。
实施例三:ZmbZIP22对27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子的转录激活
采用双荧光转录激活系统检测ZmbZIP22对27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子的转录激活,策略示意图如图3。
1.通过Hind IIIBamH I酶点将靶标基因启动子连入融合荧光素酶基因的报告载体pGreen-0800中,将转录因子ZmbZIP22开放阅读框连入35S启动子驱动的效应载体中。
2.将载体通过热激法转入农杆菌菌株GV3101中。
3.通过农杆菌侵染烟草叶片细胞瞬时表达报告载体和效应载体所携带的蛋白。
4.48h后抽提侵染后的叶片蛋白。
5.采用全波长荧光检测仪(TECAN)检测萤火虫荧光素酶酶活。
6.将萤火虫荧光素酶反应终止,检测海肾荧光素酶酶活。
7.计算两次酶活的比值,获得转录激活数据。
结果:经过计算ZmbZIP22组相比负对照组,荧光素酶酶活比值显著较高(图4)。说明ZmbZIP22能够显著地激活27kDa γ-醇溶蛋白基因启动子。
实施例四:构建ZmbZIP22的CRISPR-Cas9转基因载体,并用于转基因转化。
选取本实验室之前已经构建完毕的适用于玉米的CRISPR-Cas9载体作为农杆菌转化玉米幼胚的载体。用Pst I酶切载体,分别将合成的ZmbZIP22用于转基因的guide RNA序列连同玉米U6启动子和终止子插入到载体中(图5)。并且电击转化EHA105菌株。选取PBPA玉米品系授粉8-12天的幼胚,大小约1.5mm左右作为受体材料,进行幼胚转化,具体流程:
1.农杆菌侵染10min-共培养20℃ 3天。
2.恢复培养28℃ 7天-筛选培养(双丙氨磷 1.5mg/l)28℃ 14天。
3.筛选培养(双丙氨磷 3mg/l)28℃ 14天 3-5轮。
4.获得抗性愈伤组织-暗再生培养28℃ 14-21天。
5.光再生培养28℃ 14-21天-获得阳性苗。
6.移入盆中,授粉并获得后代。
结果:选取1000个幼胚作为受体材料,经过转化筛选后获得10个转基因阳性事件。获得后对各个事件进行鉴定,通过TPS法抽提各事件植株的基因组,并针对guide RNA序列所在基因组的位置,设计跨越guide RNA序列PCR引物,扩增得到目的片段后进行TA克隆,挑选阳性克隆进行测序,获得了具有移码突变形式的9号和10号事件(图6)。扩繁保种,用于获得纯合突变体并进行下游分析。证明转基因突变体材料成功获得。
实施例五:ZmbZIP22的转基因移码突变材料中ZmbZIP22表达情况的检测
1.取未成熟籽粒8-10颗。
2.去种皮和胚后鉴定TPS法鉴定基因型。
3.分别抽提移码突变的ZmbZIP突变体材料和野生型材料总蛋白。使用液氮研磨胚乳达到粉末级,取研磨后的籽粒胚乳粉末装入EP管中,加入IP裂解液,冰上裂解20min。
4.离心,取上清。两个样品各取4μl的蛋白,加入1μl混有1M DTT的5× SDS 蛋白上样缓冲液,99℃变性10分钟后,立即将蛋白样品插在冰上。
5.SDS-PAGE电泳,堆积胶为5%,80V电泳半小时后,分离胶为12.5%,电泳时间约为2小时。
6.200mA转膜1h。用TBST配置5%牛奶室温封闭1h。
7.用ZmbZIP22抗体和Tubulin抗体(Sigma)以1/1000比例稀释在5%牛奶中。室温杂交1h。
8.TBST洗膜6次,每次5min。
9.用相应二抗室温杂交1h。
10. TBST洗膜6次,每次5min。
11. 加入显色底物,用TANON化学发光成像仪现象。
结果显示内参Tubulin在两种材料中都存在,而ZmbZIP22仅存在于野生型基因型的材料中(图7),说明Cas9转基因移码突变体是ZmbZIP22缺失突变体。
实施例六:ZmbZIP22的Cas9缺失突变体中27kDa γ-醇溶蛋白转录情况检测
1.取未成熟籽粒8-10颗。
2.去种皮和胚后鉴定TPS法鉴定基因型。
3.分别用TIANGEN植物多糖多酚总RNA抽提试剂盒抽提移码突变的ZmbZIP突变体材料和野生型材料总RNA。
4.用TOYOBO反转录试剂盒进行RNA的反转录。
5.以泛素基因为内参,SYBR Green探针相对定量法检测27kDa γ-醇溶蛋白基因的转录情况。
结果显示,相对与野生型,27kDa γ-醇溶蛋白基因在ZmbZIP22突变体中的转录下降了超过25%(图8)。
实施例七: ZmbZIP22基因编辑缺失突变体籽粒中醇溶蛋白的SDS-PAGE检测
1.将籽粒去皮去胚,剩下胚乳待用。
2.使用液氮研磨胚乳达到粉末级。
3.取研磨后的籽粒胚乳粉末装入EP管中,放入冷冻干燥机中,冷冻抽干。
4.取50mg冷冻抽干的籽粒胚乳粉末装入EP管中,加入1ml石油醚,涡旋混匀后,摇床室温孵育1小时。
5.12,000rpm,离心15分钟,弃上清。
6.再加入1ml石油醚,斡旋混匀后,12,000rpm,离心15分钟,弃上清。
7.得到的沉淀放入冷冻干燥机中,冷冻抽干。
8.加入1ml硼酸钠缓冲液,20μl巯基乙醇。斡旋混匀后,置于37度恒温摇床中,孵育过夜(12小时)。
9.12,000rpm,离心15分钟,移取上清大约900μl至新管中,上清液则为总蛋白。
10.取300μl总蛋白溶液,加入700μl无水乙醇,斡旋混匀,摇床室温孵育2小时。
11.12,000rpm,离心15分钟,吸取全部上清至新管中,上清液则为醇溶蛋白,沉淀为非醇溶蛋白。
12.用70%的乙醇洗沉淀两次,12,000rpm,离心5分钟。风干至边缘透明且管中没有乙醇味后,加入200μl IPG溶液后,弹匀溶解。
13.上清液放入冷冻干燥机中,冷冻抽干,加入200μl IPG溶液后,弹匀溶解。
14.取300μl总蛋白溶液,放入冷冻干燥机中,冷冻抽干,加入200μl IPG溶液后,弹匀溶解。
15.各取4μl的溶解的总蛋白、醇溶蛋白和非醇溶蛋白,加入1μl混有1M DTT的5×SDS 蛋白上样缓冲液,99℃变性10分钟后,立即将蛋白样品插在冰上。
16.SDS-PAGE电泳验证,堆积胶为5%,80V电泳半小时后,分离胶为12.5%,电泳时间约为2小时。
17.取下蛋白胶,放入考马斯亮蓝中摇床室温染色4小时,使用脱色液脱色,至背景透明,使用Bio-Rad电泳成像仪拍胶。
18.完全溶解蛋白标准品,取10μl稀释至100μl,使终浓度为0.5mg/ml。蛋白样品在什么溶液中,标准品也宜用什么溶液稀释。但是为了简便起见,也可以用0.9%NaCl或PBS稀释标准品。
19.将标准品按0, 1, 2, 4, 8, 12, 16, 20μl加到96孔板的标准品孔中,加标准品稀释液补足到20μl。
20.加适当体积样品到96孔板的样品孔中,加标准品稀释液到20μl。
21.各孔加入200μl G250染色液,室温放置3-5分钟。
22.用酶标仪测定A595,或560-610nm之间的其它波长的吸光度。
23.根据标准曲线计算出样品中的蛋白浓度。
结果:醇溶蛋白在基因编辑突变体籽粒中出现显著的下降,非醇溶蛋白略有上升(图9)。27kDa γ-醇溶蛋白的含量在基因编辑突变体籽粒中出现显著的下降(图10)。
实施例八:透射电镜观察籽粒细胞形态
1.取材和固定:一般样品块的大小约为1立方毫米,取材完成后立即放入2.5%戊二醛的固定液中,真空泵抽气两到三次,每次2min(不要让固定液溅出)。然后用PBS缓冲液清洗3次,每次20分钟,换蒸馏水洗三次,每次30分钟;用1%锇酸(用蒸馏水配制)在室温下固定1.5小时,用蒸水清洗三次,每次30分钟。
2.脱水:用50%、60%、70%、85%、95%、100%的乙醇分别浸渍固定的材料,每种浓度处理10~15min。
3.置换树脂:
①在管瓶中加入2ml无水乙醇和1ml丙酮,处理材料10min。
②向管瓶中追加1ml丙酮,处理材料10min。
③向管瓶中再追加2ml丙酮,处理材料10min。
④倾倒出管瓶中的无水乙醇和丙酮混合液,加入纯丙酮3次,每次10min。
4.浸透:用丙酮:epon812树脂以2:1,1:1和1:2进行渗透,每次4小时,再用纯包埋剂epon812树脂渗透三次,第一次过夜,后两次每次6小时。
5.包埋与聚合:在包埋模的两端放上已浸透的材料(用牙签将样品挑出管瓶),用滴管吸取新配制的树脂,并注满每个穴孔,用牙签拨样品,使样品按一定方位(有利修块、切片和观察)排列,做好记载,在40℃,50℃和60℃各聚合12h。
6.包埋块经过修块后,在Leica超薄切片机上切取超薄切片,切片厚度为60-80nm;将超薄切片捞在覆有Forwever膜的铜网上。
7.捞在铜网上的超薄切片直接用于染色。先用醋酸双氧铀染色20分钟,用蒸馏水漂洗五次,每次10分钟。再用柠檬酸铅染色20-30分钟,用蒸馏水漂洗五次,每次10分钟。用滤纸吸干铜网上的水分,放入铜网盒中干燥保存。
8.Hitachi-7650(Japan)透射电子显微镜观察,并拍照保存。
结果:从图11的透射电镜结果中可以看到,部蛋白体在ZmbZIP22突变体籽粒中出现外壳变薄并且不规则的现象。
实施例九:酸水解法测总氨基酸
1.精确称取适量试样(如30.00mg),放入水解管/瓶中。
2.加入5mL 6mol/L优级纯盐酸和0.02 mL重蒸苯酚,充高纯氮气5分钟,封口,将水解管/瓶置110℃恒温干燥箱中水解22小时。
3.水解结束后冷却至室温,将水解液过滤并定容,混匀,取适量滤液于55℃氮气吹干或减压干燥。
4.用适量0.02 mol/L优级纯盐酸充分溶解混匀,0.45μm滤膜过滤收集续滤液。
5.用L-8900全自动氨基酸分析仪进行测定。
结果:经测定,常规玉米欠缺的赖氨酸和甲硫氨酸在基因编辑的突变体中均有显著上升(图12)。说明突变体的蛋白质品质确实得到了提升。
<110> 上海大学
<120> 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用
<160> 2
<210> 1
<211> 1437
<212> DNA
<213> 基因序列
<400> 1
Atgga cgagg accgg agcgc cgatc ccgct cgcag cggcc gcctc ctctc gccga cgagc 60
ggtca gcccc aaacc cagac acagt cacag ccccc gctcc ccatg gacct cgcct cccag 120
tacca acgcc tcttt gcacc gtcgg tgttc ctccc accga tggcg ccccc gccgc cccgc 180
ctggc gtcca gctcc tgctt ctcgg ccttc agcaa ctatc agagc ctacc gacgc tcgcg 240
cccgc ggtgg gcgcc ggatc gcatc tcgct cgctc ggtac ctaag ccgcc gctct tctca 300
gtgga ctctc tagct ccgct tccgt actcc accgg tccag cggcg agggc agcgg caggg 360
gcggc ggtcc cgcgt tcccc gccgt cccca ggcag ctccg agctg caagg cccgt ccgcg 420
tccgg cctgc cgccg cgtgg ggcgg ggcac cggag gtccc gtagc gattt cctcg tcggg 480
ttctc ggggg cgaac cagct gcccc tgccg atgac tcctg cggct ggggc gtaca ggccg 540
aggga cgcct ccgca ctgga ggagc tattc cgctc ataca gggat ccgaa tctcg gctcc 600
cccgg ggata acaat aatga aagga acgat cactt aagta gacaa ctgac cggcc aacgc 660
gcttg gagcc ccggt gatag cagcg acaac gaggc tgaga gctgg gcggt cagtg gcagc 720
gcaga cacca gcgct agcca tcctc gccat tgccg cagcc tgtcg gtgga cagca tcatg 780
gccaa tctca acttt ggagg cctgg accag gtttc tctga gagtg ccacc tctgt ctcca 840
gtggc aggcg ccagt gccag cctct cgcgc actgg aaccg gagca tcggg cggtg cggtt 900
gcggc tgctt cttct gaact tacca acgga gagtt cagcg aggct gagat gaaga agatc 960
atggc caatg atcgc ctcgc tgaga tcgct ctttc tgatc ctaag agggt caaga ggatt 1020
ctagc taatc ggatc tcggc agcaa agtct aagga gcgca aggtg aagta catgg gtgag 1080
cttga gcgta aagtt cgtgt gctgc agacg gaaac taata catta tcttc gaaag cagca 1140
ttgtc gcaga gggaa tgcga ggcac ttcga actct gaaca atgag atgaa gatca ggctg 1200
caagc aatgg agcag caagc acagc tgaaa gatgc tctga atgaa gcact gacag ctgaa 1260
gtgca gcgcc tgaaa caaat ggctg gcgag gccag tgatc ttcat gtgcc gaacg gttcg 1320
catca tcata tgaac cgcca gattc tcgaa cagct gcagc aggta cagaa gcggc catca 1380
gaggc ccagc aggct cagca gcagc cacag gaacc agagc agttc aaagc tcagt aa 1440
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 基因序列
<400> 1
Gtcac agccc ccgct cccca 20

Claims (5)

1.一种玉米转录因子ZmbZIP22,其特征在于,该转录因子能够利用酵母单杂实验筛选玉米籽粒储藏蛋白27kDa γ-醇溶蛋白,其基因序列为SEQ ID NO:1所示的碱基序列。
2.一种根据权利要求1所述玉米转录因子ZmbZIP22在调控玉米籽粒储藏蛋白27kDaγ-醇溶蛋白中的应用。
3.一种根据权利要求1所述玉米转录因子ZmbZIP22在结合并转录激活玉米籽粒储藏蛋白27kDa γ-醇溶蛋白的启动子中的应用。
4.一种靶向权利要求1所述玉米转录因子ZmbZIP22的转基因CRISPR-Cas9表达载体的构建方法,其特征在于采用pCAMBIA3301 为转基因载体,将SEQ ID NO:2所示序列作为gRNAspacer和scaffold连入pCAMBIA3301转基因载体中获得,其中pCAMBIA3301 载体经过改造,以玉米U6启动子和终止子表达gRNA,同时以玉米泛素启动子和NOS终止子表达玉米密码子优化的Cas9蛋白。
5.一种权利要求1所述玉米转录因子ZmbZIP22的基因突变后在农业高品质玉米育种方面的应用,其特征在于,高品质玉米表现为:醇溶蛋白含量的下降、赖氨酸和甲硫氨酸含量的上升而导致的籽粒蛋白质品质的提升。
CN201710251008.9A 2017-04-18 2017-04-18 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用 Active CN107298701B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710251008.9A CN107298701B (zh) 2017-04-18 2017-04-18 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201710251008.9A CN107298701B (zh) 2017-04-18 2017-04-18 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN107298701A CN107298701A (zh) 2017-10-27
CN107298701B true CN107298701B (zh) 2020-10-30

Family

ID=60137502

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201710251008.9A Active CN107298701B (zh) 2017-04-18 2017-04-18 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN107298701B (zh)

Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2734621B1 (en) 2011-07-22 2019-09-04 President and Fellows of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
US9163284B2 (en) 2013-08-09 2015-10-20 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease
US9359599B2 (en) 2013-08-22 2016-06-07 President And Fellows Of Harvard College Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof
US9322037B2 (en) 2013-09-06 2016-04-26 President And Fellows Of Harvard College Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof
US9340799B2 (en) 2013-09-06 2016-05-17 President And Fellows Of Harvard College MRNA-sensing switchable gRNAs
US9526784B2 (en) 2013-09-06 2016-12-27 President And Fellows Of Harvard College Delivery system for functional nucleases
US9840699B2 (en) 2013-12-12 2017-12-12 President And Fellows Of Harvard College Methods for nucleic acid editing
AU2015298571B2 (en) 2014-07-30 2020-09-03 President And Fellows Of Harvard College Cas9 proteins including ligand-dependent inteins
IL310721A (en) 2015-10-23 2024-04-01 Harvard College Nucleobase editors and their uses
EP3494215A1 (en) 2016-08-03 2019-06-12 President and Fellows of Harvard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
EP3497214B1 (en) 2016-08-09 2023-06-28 President and Fellows of Harvard College Programmable cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
WO2018039438A1 (en) 2016-08-24 2018-03-01 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
JP2019530464A (ja) 2016-10-14 2019-10-24 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ 核酸塩基エディターのaav送達
US10745677B2 (en) 2016-12-23 2020-08-18 President And Fellows Of Harvard College Editing of CCR5 receptor gene to protect against HIV infection
WO2018165504A1 (en) 2017-03-09 2018-09-13 President And Fellows Of Harvard College Suppression of pain by gene editing
CN110914310A (zh) 2017-03-10 2020-03-24 哈佛大学的校长及成员们 胞嘧啶至鸟嘌呤碱基编辑器
IL306092A (en) 2017-03-23 2023-11-01 Harvard College Nucleic base editors that include nucleic acid programmable DNA binding proteins
WO2018209320A1 (en) 2017-05-12 2018-11-15 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation
EP3658573A1 (en) 2017-07-28 2020-06-03 President and Fellows of Harvard College Methods and compositions for evolving base editors using phage-assisted continuous evolution (pace)
WO2019139645A2 (en) 2017-08-30 2019-07-18 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising gam
CN111757937A (zh) 2017-10-16 2020-10-09 布罗德研究所股份有限公司 腺苷碱基编辑器的用途
CN107904245B (zh) * 2017-12-01 2019-09-24 四川省农业科学院生物技术核技术研究所 玉米转录因子ZmNF-YB2在改良水稻中的应用及其方法
DE112020001306T5 (de) 2019-03-19 2022-01-27 Massachusetts Institute Of Technology Verfahren und zusammensetzungen zur editierung von nukleotidsequenzen
CN110759980B (zh) * 2019-09-04 2021-07-27 中国科学院遗传与发育生物学研究所 一种降低小麦籽粒储藏蛋白含量的转录因子nac2及其应用
CN110759981B (zh) * 2019-09-04 2021-07-27 中国科学院遗传与发育生物学研究所 一种抑制小麦籽粒储藏蛋白合成的转录因子odorant1及其应用
JP2023525304A (ja) 2020-05-08 2023-06-15 ザ ブロード インスティテュート,インコーポレーテッド 標的二本鎖ヌクレオチド配列の両鎖同時編集のための方法および組成物
CN113637677A (zh) * 2020-12-02 2021-11-12 上海大学 能降低玉米中α醇溶蛋白的靶点基因及其应用

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003014349A1 (en) * 2001-08-06 2003-02-20 Meristem Therapeutics Sa Bifactorial endosperm box, trans-activating factor that binds thereto, and method of regulation of promoter activity
CN1472223A (zh) * 2002-07-30 2004-02-04 中国农业科学院生物技术研究所 一个玉米bZIP类转录因子及其编码基因与应用
WO2009123946A1 (en) * 2008-03-31 2009-10-08 Monsanto Technology Llc Novel opaque modifiers in corn and related methods
US8030546B2 (en) * 1998-09-22 2011-10-04 Mendel Biotechnology, Inc. Biotic and abiotic stress tolerance in plants
CN105441459A (zh) * 2015-12-29 2016-03-30 上海大学 玉米转录因子ZmMADS47基因及其应用

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8030546B2 (en) * 1998-09-22 2011-10-04 Mendel Biotechnology, Inc. Biotic and abiotic stress tolerance in plants
WO2003014349A1 (en) * 2001-08-06 2003-02-20 Meristem Therapeutics Sa Bifactorial endosperm box, trans-activating factor that binds thereto, and method of regulation of promoter activity
CN1472223A (zh) * 2002-07-30 2004-02-04 中国农业科学院生物技术研究所 一个玉米bZIP类转录因子及其编码基因与应用
WO2009123946A1 (en) * 2008-03-31 2009-10-08 Monsanto Technology Llc Novel opaque modifiers in corn and related methods
CN105441459A (zh) * 2015-12-29 2016-03-30 上海大学 玉米转录因子ZmMADS47基因及其应用

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Genome-wide analysis of bZIP-encoding genes in maize;Wei K等;《DNA RESEARCH》;20121026;第19卷(第6期);第463-476页 *
Recurrent Selection for Transgene Activity Levels in Maize Results in Proxy Selection for a Native Gene with the Same Promoter;Bodnar, AL等;《PLOS ONE》;20160219;第11卷(第2期);第1-13页 *
植物bZIP转录因子的生物学功能;张计育等;《西北植物学报》;20110515;第31卷(第5期);第1066-1075页 *
玉米A 亚族bZIP 转录因子基因ZmbZIP81的克隆、表达与功能分析;王策等;《作物学报》;20140627;第40卷(第9期);第1549-1556页 *
玉米转录因子ZmMADS47与Opaque2互作调控醇溶蛋白的研究;乔祯逸;《基础科学辑》;20170215(第2期);A006-44 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN107298701A (zh) 2017-10-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107298701B (zh) 玉米转录因子ZmbZIP22及其应用
CN107266541B (zh) 玉米转录因子ZmbHLH167及其应用
JP5655947B2 (ja) 成葉特異的プロモーター
DK2728004T3 (en) Bacterial toxin vaccine
CN1176661A (zh) 低温诱导性启动子序列
CN105316344B (zh) 植物花粉发育调控基因Ms1及其编码蛋白
CN109022454A (zh) 一种棉花长纤维高表达基因GhLFHE2及其编码的蛋白质和应用
CN103451228A (zh) 一种调控水稻籽粒大小和粒重的方法
CN103045604B (zh) 缢蛏抗菌肽基因的pcr重组制备抗菌肽的方法与用途
CN107177600B (zh) 水稻雄性不育基因OsFIGNL1及其应用
CN103667339A (zh) 来源于水稻的蛋白质OsMKK4及其相关生物材料在调控植物穂型中的应用
CN103074348A (zh) 重组鲤鱼Nrf2基因、蛋白及其制备与检测方法和应用
CN109355290A (zh) 一种植物环状rna表达框架及其应用
CN114514321A (zh) 调节植物中的糖和氨基酸含量(sultr3)
CN114829587A (zh) 调节植物中的还原糖含量(inv)
CN109797158A (zh) 基因OsNTL3在改良水稻高温抗性方面的应用及获得的水稻高温抗性基因
CN109295071A (zh) 一种水稻花器官发育调控基因peh1及其编码的蛋白质和应用
CN1379783A (zh) 通过功能性地抑制植物细胞周期蛋白抑制剂基因增加植物细胞增殖的方法
CN113061602A (zh) 一种高通量启动子变异创制方法
DK2397554T3 (en) Inhibition of flowering
US20220033835A1 (en) Rice plant material resistant against biotic stress
CN115247184A (zh) 一种籽粒粒型及产量控制基因及其应用
CN107619436B (zh) 一种抗逆蛋白及其编码基因
CN105695576A (zh) 一种山核桃Aux/IAA基因克隆的分析方法
CN111138520A (zh) 小麦磷脂酰肌醇转运蛋白TaSec14基因及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant