CN106834341B - 一种基因定点突变载体及其构建方法和应用 - Google Patents

Abstract

本发明属于生物工程技术领域，具体涉及一种基因定点突变载体及其构建方法和应用。本发明通过大量的优化，提供一种基因定点突变载体，通过CRISPR系统将胞嘧啶脱氨酶引导至胞嘧啶附近，将胞嘧啶变成尿嘧啶，随后植物细胞内的自发修复最终将尿嘧啶变成了胸腺嘧啶，最终在植物中实现C到T的定点突变，产生抗除草剂抗性。另外还可在非sgRNA靶点区域产生点突变，带来新的抗除草剂的重大农艺性状。

Description

一种基因定点突变载体及其构建方法和应用

技术领域

本发明属于生物工程技术领域，具体涉及一种基因定点突变载体及其构建方法和应用。

背景技术

通过CRISPR-Cas9技术在生物体内进行基因编辑是生命科学领域内的重大突破。在引导RNA(gRNA)的引导下，gRNA-Cas9复合物专一结合与gRNA互补的DNA区域，并切断DNA双链，细胞随即展开修复。如果修复过程中没有可供修复的DNA模板，修复的过程会引入大量的随机突变；如果提供修复模板，就有可能将修复模板整合在DNA中，从而引入设计的突变类型。但是这两种基因编辑方式，都需要将DNA双链切开，且通过修复模板DNA引入，设计突变技术难度很大。

发明内容

本发明的目的是提出一种基因定点突变载体及其构建方法和应用，具体技术方案如下：

一种基因定点突变载体，在基础载体的基础上构建，5’到3’包括启动子、sgRNA、胞嘧啶脱氨酶基因、Cas9基因、尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因和终止子；

所述sgRNA表达区含有植物除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列；

用XTEN将胞嘧啶脱氨酶基因连接在Cas9基因的5’端，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因连接在Cas9基因的3’端，核定位信号序列连接在尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因的3’端，进行植物偏好密码子的优化，得到优化的融合基因CT3，序列如SEQ ID No.1所示。

所述基础载体为PHEE401E，序列如SEQ ID No.2所示；

所述Cas9基因为D10A。

所述载体为双元载体。

所述启动子是植物内的组成型启动子、组织特异性启动子或诱导型启动子。

所述胞嘧啶脱氨酶基因来自人类基因组，Cas9基因来自嗜热链球菌，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因来自噬菌体。

所述除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列的胞嘧啶3`端方向23个碱基内具有PAM序列NGG。

所述植物为粮食和油料作物，包括水稻、棉花、玉米、小麦、大豆、油菜、向日葵；蔬菜作物，包括白菜、甘蓝、黄瓜、番茄；水果作物，包括西瓜、甜瓜、草莓，蓝莓，葡萄；中草药，包括板蓝根、甘草、人参、防风；以及拟南芥；

所述植物除草剂所抑制的酶的相关基因包括ALS、EPSPS、PPO、HPPD、PDS、ACCASE、GS、DOXPS、PsbA。

一种基因定点突变载体的构建方法，包括如下步骤：

1)用XTEN将胞嘧啶脱氨酶基因连接在Cas9基因的5’端，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因连接在Cas9基因的3’端，核定位信号序列连接在尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因的3’端，进行植物偏好密码子的优化，得到优化的融合基因CT3，序列如SEQ ID No.1所示；

2)用步骤1)中CT3替换载体PHEE401E上的Cas9基因，所得载体命名为PHEE401CT；PHEE401E的序列如SEQ ID No.2所示；

3)将除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列克隆到PHEE401CT中的sgRNA表达区，至此PHEE401CT载体构建完成。

步骤3)中除草剂所抑制的酶的相关基因为拟南芥ALS基因，序列如SEQ ID No.3所示。

所述除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列如SEQ ID No.4所示。

一种抗除草剂植物的制备，包括如下步骤：将构建的PHEE401CT载体转到农杆菌中，通过蘸花法转化植株，通过喷施除草剂获得具有除草剂抗性的植株。

一种基因定点突变载体在植物靶点序列产生C-T的突变。

一种基因定点突变载体还在PAM序列NGG处产生点突变，形成NGA，实现重大农艺性状。

一种基因定点突变载体在PAM序列TGG产生点突变，变成TGA。

本发明的有益效果为：本发明通过大量的优化，提供一种基因定点突变载体，通过CRISPR系统将胞嘧啶脱氨酶引导至胞嘧啶附近，将胞嘧啶变成尿嘧啶，随后植物细胞内的自发修复最终将尿嘧啶变成了胸腺嘧啶，最终在植物中实现C到T的定点突变，产生抗除草剂抗性。另外还可在非sgRNA靶点区域产生点突变，带来新的抗除草剂的重大农艺性状。

附图说明

图1为引入靶点序列的方法。

图2为苯磺隆(tribenuron)处理下，T2植株的抗性表现。

图3为G202D导致除草剂抗性。

具体实施方式

本发明提出了一种基因定点突变载体及其构建方法和应用，下面结合实施例对本发明做进一步介绍。

一、材料与试剂

大肠杆菌杆菌感受态菌株EPI300，生态型拟南芥植株Arabidopsis thanlianaColumbia，农杆菌感受态菌株GV3101。

DNA凝胶回收试剂盒，小提质粒试剂盒，购自Axygen生物技术公司。

限制性内切酶：XbaI、SacI和BsaI。均购自NEB生物技术公司。

T4连接酶购自TaKaRa生物技术公司，2xTaq MaterMix购自康为世纪生物技术公司。

引物由天一辉远生物技术公司合成。

抗生素：氨苄青霉素(Amp)储液100mg/ml、卡那霉素(Kan)储液100mg/ml、硫酸庆大霉素储液(Gen)100mg/ml、激霉素(Spe)150mg/ml、利福平(Rif)50mg/L、潮霉素B(购自Roche公司)。

拟南芥转化辅助试剂Silwet L-77，购自中科瑞泰生物技术公司。其余化学试剂均购自sigma公司或国药集团化学试剂公司。

二、溶液和培养基配方

LB(1L)：10g Tryptone，5g Yeast extract，10g NaCl，调节pH值至7.0；固体含1.5％琼脂。

MS培养基(1L)：4.4g MS盐，30g蔗糖，调PH至5.8-6.0；加植物凝胶7.5g。

YEB(1L)：5g Beef extract，1g Yeast extract，5gTryptone，5g蔗糖，0.5gMgSO4.7H2O，调节pH值至7.0；固体含1.5％琼脂。

实施例1：拟南芥基因ALS定点突变的方法

(1)用XTEN将胞嘧啶脱氨酶基因(rAPOBEC1)连接在Cas9基因(D10A)的5’端，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因(UGI)连接在Cas9基因(D10A)的3’端，核定位信号序列(NLS)连接在UGI的3’端，进行植物偏好密码子的优化，得到优化的融合基因CT3，序列如SEQ IDNo.1所示。

(2)用步骤(1)中优化的融合基因CT3替换载体PHEE401E上的Cas9基因，命名为PHEE401CT，载体PHEE401E序列如SEQ ID No.2所示。

具体包括步骤如下：

1)分别用XbaI、SacI双酶切PHEE401E质粒和优化的融合基因CT3，反应体系(40μL)如下：

2)回收纯化酶切产物，将纯化回收后的两种DNA片段进行连接，

连接体系(10μL)如下：

用移液器轻轻吹打混合均匀，室温离心数秒，于20-25℃孵育连接1-2h，或16℃孵育连接过夜。

3)从-70℃超低温冰柜中取出一管(100μL)感受态菌，立即用手指加温融化后插入冰上，冰浴10min，加入10μL连接产物，轻轻震荡后放置冰上20min，轻轻摇匀后插入42℃水浴中90秒进行热休克，然后迅速放回冰中，静置3min，在超净工作台中向上述各管中分别加入900μL LB培养基轻轻混匀，然后固定到摇床的弹簧架上37℃震荡复苏50min。

4)复苏结束后于5000r/min室温离心1min，吸去800μL上清，然后重悬菌体，将菌体涂布于含有Amp和Kan的LB固体平板上，37℃倒置培养过夜。

5)用无菌牙签挑取白色单菌落用CT3-IDF和CT3-IDR引物进行菌落PCR鉴定，选出能扩增出目的片段的菌株接种于5ml的已加入Amp和Kan的液体LB培养基中，37℃下250rpm振荡培养12-16h，小提质粒后用XbaI、SacI进一步进行酶切检验和测序验证，保存质粒构建正确的菌株。

引物：

CT3-IDF 5’-CATACCTCCCAGAACACAAATAAGC-3’

CT3-IDR 5’-ACTGAAGGGCAATAGTGAAGAATGT-3’

(3)将拟南芥基因ALS的靶点序列克隆到PHEE401CT中的sgRNA表达区，如图1，至此PHEE401CT载体构建完成；其中ALS基因序列如SEQ ID No.3所示，ALS基因的靶点序列如SEQID No.4所示。其他除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列的可以按照本方法克隆到sgRNA表达区。

具体包括如下步骤：

1)用BsaI酶切步骤(2)中PHEE401CT质粒，反应体系(40μL)如下：

酶切反应结束后，将酶切产物在65℃失活；

2)将靶点序列引物oJ-T1F和oJ-T1R在95℃变性后退火，露出粘性末端，冷却至常温；

oJ-T1F：5’-ATTGAAGTCCCTCGTCGTATGAT-3’

oJ-T1R：5’-AAACATCATACGACGAGGGACTT-3’

3)将步骤1)和步骤2)中两种DNA片段进行连接，连接体系为10μL：

用移液器轻轻吹打混合均匀，室温离心数秒，于20-25℃孵育连接1-2h，或16℃孵育连接过夜。

4)从-70℃超低温冰柜中取出一管(100μL)感受态菌EPI300，立即用手指加温融化后插入冰上，冰浴10min，加入10μL连接产物，轻轻震荡后放置冰上20min，轻轻摇匀后插入42℃水浴中90秒进行热休克，然后迅速放回冰中，静置3min，在超净工作台中向上述各管中分别加入900μL LB培养基轻轻混匀，然后固定到摇床的弹簧架上37℃震荡复苏50min。

5)复苏结束后于5000r/min室温离心1min；吸去800μL上清，然后重悬菌体，将菌体涂布于含有Kan的LB固体平板上，37℃倒置培养过夜。

6)用无菌牙签挑取白色单菌落，用U626-IDF和U629-IDR引物进行菌落PCR鉴定，选出能扩增出目的片段的菌株接种于5ml的已加入Kan的液体LB培养基中，37℃下250rpm振荡培养12-16h，小提质粒后用测序验证，保存质粒构建正确的菌株。

U626-IDF：5’-TGTCCCAGGATTAGAATGATTAGGC-3’

U629-IDR：5’-AGCCCTCTTCTTTCGATCCATCAAC-3’

(4)将构建的PHEE401CT载体转到农杆菌(GV3101)中，通过蘸花法转化拟南芥，在潮霉素(25mg/L)的MS培养基上对收获的种子筛选转基因植株，通过对T2代拟南芥喷施除草剂获得具有除草剂抗性的植株。

构建的PHEE401CT载体转入根癌农杆菌(GV3101)步骤包括：从-80℃冰箱中取出GV3101感受态细胞(100μL)，置于冰上解冻；加入5μL含目的基因的质粒，轻轻混匀，冰水浴5min；液氮冷冻2min；37℃水浴热激5min；加入900μL LB液体培养基后于28℃，160r/min振荡培养4h复苏；复苏结束后于5000r/min室温离心1min；吸去800μL上清，然后重悬菌体，将菌体涂布于含有Gen、Kan和Rif的YEB固体平板上；28℃倒置培养直至长出阳性菌落；挑取单克隆菌落并通过菌落PCR验证，转化成功的农杆菌经即可用于后期拟南芥转化用。

拟南芥转化的步骤包括：将带有表达载体的农杆菌菌株，在对应抗性平板上划线，挑取单菌落接种于5ml的已加入Gen、Kan和Rif的液体YEB培养基中，28℃下250rpm振荡培养18-24h；相同条件下按照1:100接种扩大培养，总菌液体积为200ml，直到OD600值在0.8-1.0范围内；离心沉淀并去上清液，用等体积的5％的蔗糖溶液重悬菌体，在菌液中加入0.02％-0.04％的SilwetL-77混匀内；将拟南芥的花序在菌液中蘸取0.5-1min即可；将拟南芥苗放置于黑暗条件下培养24h，转入温室光照培养；收取植株种子，干燥后，将种子用10％次氯酸钠溶液消毒30min，在用无菌水冲洗次；将种子播种于含潮霉素的MS平板上生长，黑暗环境下4℃春化2d，再移入22℃光照培养箱培养5～7d；筛选出下胚轴较长的健壮阳性苗。

实施例2：拟南芥抗除草剂的基因定点突变检测

实施例1中转基因拟南芥植株移栽到基质中，3周后提取拟南芥DNA，在打靶位点上下游设计引物，并利用提取的DNA作为模板进行PCR扩增，PCR产物纯化后测序。

所用引物序列：

ALS-1F：5'-CCTTAACCCGCTCTTCCTCA-3'

ALS-1R：5'-CCCCGTAAGCTCAACAAACC-3'

结果表明检测的240株拟南芥中，有4株的靶点区域中C突变成T，其中有1株产生了同义突变，其他3株突变后靶点序列如SEQ ID No.5，SEQ ID No.6，SEQ ID No.7所示。

实施例3：编辑形成的抗除草剂的定点突变能够稳定遗传

对在4个成功编辑的T1代种子抗除草剂T2植株表型鉴定：将4个系的T2代种子铺到含有苯磺隆(tribenuron)的MS培养基上，并设对照。结果表明，含有抗性突变的T1代产生了大量抗除草剂后代(图2)，表明T1代产生的抗除草剂性状能够稳定遗传。

对在4个成功编辑的T1代种子抗除草剂T2植株基因型鉴定(表1)，利用如下引物进行PCR反应并测序，结果表明T2抗除草剂后代含有T1代的抗性突变；

ALS-1F：5'-CCTTAACCCGCTCTTCCTCA-3'

ALS-1R：5'-CCCCGTAAGCTCAACAAACC-3'

同时利用如下引物检测，发现了6株非转基因的抗除草剂植株，说明其抗除草剂性状不是基因再次编辑的结果，而是因为T1代抗除草剂抗性的遗传。

CT3-IDF：5’-CATACCTCCCAGAACACAAATAAGC-3’

CT3-IDR：5’-ACTGAAGGGCAATAGTGAAGAATGT-3’

综上表明T1代产生的抗除草剂性状能够稳定遗传。

表1抗性的T2植株含有T1的突变基因

实施例4：在新的区域产生抗性突变类型

实施例1中构建的载体(C-T编辑系统)能够在一个全新的区域产生定点突变，即PAM序列“NGG”突变成了“NGA”，导致了G202D突变，在ALS202位置的突变产生抗性是为本专利的发现，突变后靶点区域及PAM序列如SEQ ID No.8所示。纯合的抗性植株苯磺隆(5mg/L)MS培养基上的抗性表现，如图3所示。

SEQUENCE LISTING

<110> 中国农业大学

<120> 一种基因定点突变载体及其构建方法和应用

<130> 2016

<160> 8

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 5145

<212> DNA

<213> 融合基因

<400> 1

tctagaagat gtcttccgag acaggaccgg ttgccgtcga ccctactctt agaaggcgca 60

ttgagccaca cgagttcgag gtgttcttcg atccgagaga gctgaggaag gagacttgcc 120

tcctttacga gatcaattgg ggcggaaggc actctatttg gcgccatacc tcccagaaca 180

caaataagca tgtggaggtt aatttcatcg agaagttcac taccgagagg tacttctgcc 240

caaacacacg ctgcagcatc acttggttcc ttagctggtc accgtgcgga gagtgctctc 300

gcgccattac agagttcctg tccagatacc cgcacgttac tcttttcatc tacattgcca 360

gactgtacca ccatgcggat cctcgcaaca gacagggtct tagggacctg atcagctcag 420

gcgtcaccat ccagattatg acagagcagg agtctggata ctgctggcgc aacttcgtga 480

attactctcc ttccaatgag gctcactggc caagataccc gcatctgtgg gtcaggctct 540

acgtgctcga gctttactgc atcattcttg gtctgcctcc atgcctcaac atccttagaa 600

ggaagcagcc acagctcaca ttcttcacta ttgcccttca gtcttgccac taccagaggc 660

ttccgcctca tattctgtgg gcgactggcc tcaagagcgg ctcagagact ccgggaacat 720

ctgagtccgc tactcctgag tctgacaaga agtactccat cggactcgcc attggtacta 780

actccgttgg atgggcggtc atcaccgatg agtacaaggt gcctagcaag aagttcaagg 840

ttcttggtaa cacagacaga cactcaatca agaagaatct gattggtgct ctgctcttcg 900

attctggaga gactgccgag gctaccaggc tcaagagaac cgcccgcaga aggtacacac 960

gcagaaagaa taggatctgc taccttcagg agattttctc taacgagatg gctaaggttg 1020

atgacagctt cttccatcgc cttgaggagt cattcctggt cgaggaggac aagaagcacg 1080

agagacatcc tatcttcggt aacattgtcg atgaggtggc ctaccacgag aagtacccaa 1140

ctatctacca tcttaggaag aagctggtgg atagcaccga caaggcggat ctccgcctta 1200

tctacctggc tctcgcccac atgattaagt tcagaggcca tttcctcatc gagggcgatc 1260

tcaacccaga taattcagac gtcgataagc tcttcatcca gcttgtgcag acatacaatc 1320

agcttttcga ggagaacccg attaatgcga gcggtgttga tgcgaaggct atcctgtcag 1380

ctagactcag caagtcaagg cgcctggaga acctcatcgc ccagctgcca ggcgagaaga 1440

agaacggtct tttcggcaat ctgattgcgc tttctctggg actcaccccg aacttcaagt 1500

ccaatttcga cctggctgag gatgccaagc tccagctgtc taaggataca tacgatgacg 1560

atctcgacaa ccttctggct cagatcggcg accagtacgc cgatctcttc cttgctgcca 1620

agaatcttag cgatgccatc ctcctttcag acattctgag agttaacact gagattacca 1680

aggctccgct gtctgcctcc atgatcaaga gatacgatga gcaccatcag gacctcactc 1740

tgctcaaggc gctggtccgc cagcagctcc ctgagaagta caaggagatc ttcttcgacc 1800

agtctaagaa cggctacgcg ggttacattg atggtggcgc tagccaggag gagttctaca 1860

agttcatcaa gccaattctg gagaagatgg atggcactga ggagcttctg gtcaagctca 1920

atagggagga tctccttagg aagcagcgca ccttcgacaa cggatctatc cctcaccaga 1980

ttcatcttgg agagctgcac gccatcctca gaaggcagga ggatttctac ccattcctta 2040

aggacaaccg cgagaagatc gagaagattc tgactttcag aatcccttac tacgttggcc 2100

cgctcgctag aggcaactct aggttcgcgt ggatgaccag gaagtcagag gagactatca 2160

ccccttggaa cttcgaggag gtggttgaca agggagccag cgcgcagtca ttcattgagc 2220

gcatgactaa tttcgataag aacctgccta atgagaaggt cctcccaaag catagcctgc 2280

tctacgagta cttcactgtg tacaacgagc ttaccaaggt gaagtatgtg acagagggca 2340

tgcgcaagcc ggctttcctt tcaggagagc agaagaaggc catcgtggat cttctgttca 2400

agactaatag aaaggtcacc gtgaagcagc tgaaggagga ttacttcaag aagattgagt 2460

gcttcgactc tgttgagatc tccggtgtcg aggataggtt caacgcttcc ctcggcacct 2520

accacgacct ccttaagatc attaaggaca aggatttcct ggataacgag gagaatgagg 2580

acatcctcga ggatattgtg ctgacactca ctcttttcga ggacagggag atgatcgagg 2640

agcgccttaa gacatacgcg catctgttcg acgataaggt tatgaagcag ctcaagcgca 2700

gaaggtacac tggatggggt agactctcta ggaagctcat caacggcatc agagataagc 2760

agtctggcaa gactattctc gatttcctta agtccgacgg cttcgctaac aggaatttca 2820

tgcagctcat tcacgacgat tctcttactt tcaaggagga catccagaag gcgcaggtta 2880

gcggccaggg agattcactg cacgagcata tcgcgaacct cgctggctcc cctgctatca 2940

agaagggcat cctccagacc gttaaggtcg tggatgagct ggttaaggtc atgggcagac 3000

ataagccaga gaacatcgtc attgagatgg ccagggagaa tcagacaact cagaagggac 3060

agaagaactc tagggagcgc atgaagagaa tcgaggaggg tattaaggag cttggctccc 3120

agatcctgaa ggagcacccg gtggagaaca cacagctgca gaatgagaag ctgtacctct 3180

actacctcca gaatggccgc gacatgtatg tggatcagga gcttgacatt aacagacttt 3240

ctgactacga tgtggaccat atcgttccac agtctttcct taaggacgat tccattgata 3300

ataaggtgct gactagatcc gataagaaca ggggaaagtc tgacaatgtt ccgtccgagg 3360

aggttgtcaa gaagatgaag aactactgga ggcagctgct caatgctaag ctcatcaccc 3420

agaggaagtt cgacaacctt acaaaggccg agcgcggagg tctgagcgag cttgataagg 3480

cgggtttcat taagagacag ctcgttgaga caaggcagat cactaagcac gtcgcccaga 3540

ttcttgactc aaggatgaac accaagtacg acgagaatga taagctgatc cgcgaggtga 3600

aggttattac actgaagagc aagctcgttt cagatttcag aaaggacttc cagttctaca 3660

aggtcaggga gatcaacaat taccaccatg cccatgatgc gtacctcaac gcggtggttg 3720

gtactgctct tattaagaag tacccgaagc tggagtctga gttcgtgtac ggcgattaca 3780

aggtgtacga cgttagaaag atgatcgcta agagcgagca ggagattggc aaggctaccg 3840

ccaagtactt cttctactca aacattatga atttcttcaa gacagagatc actctcgcga 3900

acggcgagat cagaaagagg ccacttattg agactaacgg cgagacagga gagatcgtct 3960

gggataaggg tcgcgacttc gctactgtca gaaaggtgct ctctatgccg caggttaata 4020

ttgtcaagaa gactgaggtg cagaccggcg gattctctaa ggagtccatt ctccctaaga 4080

ggaactccga caagctcatc gcccgcaaga aggattggga ccctaagaag tacggtggct 4140

tcgatagccc aaccgtcgct tactcagtgc ttgtcgtggc caaggtcgag aagggaaaga 4200

gcaagaagct gaagtcagtg aaggagcttc tgggtatcac aattatggag aggtcttcct 4260

tcgagaagaa tcctatcgac ttcctcgagg cgaagggcta caaggaggtt aagaaggatc 4320

ttatcattaa gctgccaaag tactcacttt tcgagctgga gaacggacgc aagagaatgc 4380

tggcgtctgc tggagagctt cagaagggta atgagcttgc tctgccgtct aagtatgtga 4440

acttcctcta ccttgcctct cattacgaga agctcaaggg ctcccctgag gacaacgagc 4500

agaagcagct gttcgtcgag cagcacaagc attacctcga tgagatcatt gagcagatta 4560

gcgagttctc aaagagagtg atcctcgccg atgcgaatct cgacaaggtt cttagcgcgt 4620

acaacaagca ccgcgataag ccaatcagag agcaggctga gaatatcatt catctcttca 4680

cccttacaaa cctgggtgct ccggcggctt tcaagtactt cgataccaca attgacagga 4740

agcgctacac ttcaaccaag gaggtgctgg acgccaccct catccaccag tctattactg 4800

gcctctacga gactaggatc gatctctccc agcttggtgg tgactctggc ggatccacca 4860

acctcagcga tatcattgag aaggagacag gcaagcagct tgttatccag gagtcaattc 4920

tgatgctccc ggaggaggtg gaggaggtta ttggcaataa gcctgagtct gatatcctcg 4980

tgcatactgc ctacgatgag agcaccgacg agaacgttat gctccttaca tcagacgcgc 5040

ctgagtacaa gccttgggct ctcgtcattc aggattccaa cggagagaat aagatcaaga 5100

tgcttagcgg tggctctcct aagaagaaga gaaaggtgtg agctc 5145

<210> 2

<211> 17112

<212> DNA

<213> 质粒

<400> 2

gtttacccgc caatatatcc tgtcaaacac tgatagttta aactgaaggc gggaaacgac 60

aatctgatcc aagctcaagc tgctctagca ttcgccattc aggctgcgca actgttggga 120

agggcgatcg gtgcgggcct cttcgctatt acgccagctg gcgaaagggg gatgtgctgc 180

aaggcgatta agttgggtaa cgccagggtt ttcccagtca cgacgttgta aaacgacggc 240

cagtgccaag cttcgacttg ccttccgcac aatacatcat ttcttcttag ctttttttct 300

tcttcttcgt tcatacagtt tttttttgtt tatcagctta cattttcttg aaccgtagct 360

ttcgttttct tctttttaac tttccattcg gagtttttgt atcttgtttc atagtttgtc 420

ccaggattag aatgattagg catcgaacct tcaagaattt gattgaataa aacatcttca 480

ttcttaagat atgaagataa tcttcaaaag gcccctggga atctgaaaga agagaagcag 540

gcccatttat atgggaaaga acaatagtat ttcttatata ggcccattta agttgaaaac 600

aatcttcaaa agtcccacat cgcttagata agaaaacgaa gctgagttta tatacagcta 660

gagtcgaagt agtgattggg agaccaaccc agtggacata agcctgttcg gttcgtaagc 720

tgtaatgcaa gtagcgtatg cgctcacgca actggtccag aaccttgacc gaacgcagcg 780

gtggtaacgg cgcagtggcg gttttcatgg cttgttatga ctgttttttt ggggtacagt 840

ctatgcctcg ggcatccaag cagcaagcgc gttacgccgt gggtcgatgt ttgatgttat 900

ggagcagcaa cgatgttacg cagcagggca gtcgccctaa aacaaagtta aacatcatgg 960

gggaagcggt gatcgccgaa gtatcgactc aactatcaga ggtagttggc gtcatcgagc 1020

gccatctcga accgacgttg ctggccgtac atttgtacgg ctccgcagtg gatggcggcc 1080

tgaagccaca cagtgatatt gatttgctgg ttacggtgac cgtaaggctt gatgaaacaa 1140

cgcggcgagc tttgatcaac gaccttttgg aaacttcggc ttcccctgga gagagcgaga 1200

ttctccgcgc tgtagaagtc accattgttg tgcacgacga catcattccg tggcgttatc 1260

cagctaagcg cgaactgcaa tttggagaat ggcagcgcaa tgacattctt gcaggtatct 1320

tcgagccagc cacgatcgac attgatctgg ctatcttgct gacaaaagca agagaacata 1380

gcgttgcctt ggtaggtcca gcggcggagg aactctttga tccggttcct gaacaggatc 1440

tatttgaggc gctaaatgaa accttaacgc tatggaactc gccgcccgac tgggctggcg 1500

atgagcgaaa tgtagtgctt acgttgtccc gcatttggta cagcgcagta accggcaaaa 1560

tcgcgccgaa ggatgtcgct gccgactggg caatggagcg cctgccggcc cagtatcagc 1620

ccgtcatact tgaagctaga caggcttatc ttggacaaga agaagatcgc ttggcctcgc 1680

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gcaaataatg tctagctaga aattcgttca agccgacgcc gcttcgcggc gcggcttaac 1800

tcaagcgtta gatgcactaa gcacataatt gctcacagcc aaactatcag gtcaagtctg 1860

cttttattat ttttaagcgt gcataataag ccggtctcgg ttttagagct agaaatagca 1920

agttaaaata aggctagtcc gttatcaact tgaaaaagtg gcaccgagtc ggtgcttttt 1980

tttgcaaaat tttccagatc gatttcttct tcctctgttc ttcggcgttc aatttctggg 2040

gttttctctt cgttttctgt aactgaaacc taaaatttga cctaaaaaaa atctcaaata 2100

atatgattca gtggttttgt acttttcagt tagttgagtt ttgcagttcc gatgagataa 2160

accaatacca tggttatact agtgaataaa agcatttgcg tttggtttat cattgcgttt 2220

atacaaggac agagatccac tgagctggaa tagcttaaaa ccattatcag aacaaaataa 2280

accatttttt gttaagaatc agagcatagt aaacaacaga aacaacctaa gagaggtaac 2340

ttgtccaaga agatagctaa ttatatctat tttataaaag ttatcatagt ttgtaagtca 2400

caaaagatgc aaataacaga gaaactagga gacttgagaa tatacattct tgtatatttg 2460

tattcgagat tgtgaaaatt tgaccataag tttaaattct taaaaagata tatctgatct 2520

aggtgatggt tatagactgt aattttacca catgtttaat gatggatagt gacacacatg 2580

acacatcgac aacactatag catcttattt agattacaac atgaaatttt tctgtaatac 2640

atgtctttgt acataattta aaagtaattc ctaagaaata tatttataca aggagtttaa 2700

agaaaacata gcataaagtt caatgagtag taaaaaccat atacagtata tagcataaag 2760

ttcaatgagt ttattacaaa agcattggtt cactttctgt aacacgacgt taaaccttcg 2820

tctccaatag gagcgctact gattcaacat gccaatatat actaaatacg tttctacagt 2880

caaatgcttt aacgtttcat gattaagtga ctatttaccg tcaatccttt cccattcctc 2940

ccactaatcc aactttttaa ttactcttaa atcaccacta agctagtaac gcctatcatg 3000

aattagctct actaaatcta gcaacctttc aaatttgcag tattgcaggt gtctctgtgt 3060

ctttaaaata gttgccttat gatttcttcg gtttcaagat gatcaaatag ttatagattt 3120

catgctcaca catgctcatt agatgtgtac atactttact tacccaaatc tattttctcg 3180

caaagatttt gatggtaaag ctgatttggt tctattgaac taaatcaaac gagtttcaga 3240

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aatagagtaa ttacacctag tttacccact aaaccactaa gcactaatta tctcacaatc 3360

taatgagctt ccctcgtaat tacttgggct ttcactctac catttatttg taacagtcaa 3420

gtctctactg tctctatata aactctctaa agttaacaca caattctcat cacaaacaaa 3480

tcaaccaaag caacttctac tctttcttct ttcgacctta tcaatctgtt gagaaatcta 3540

gatggattac aaggaccacg acggggatta caaggaccac gacattgatt acaaggatga 3600

tgatgacaag atggctccga agaagaagag gaaggttggc atccacgggg tgccagctgc 3660

tgacaagaag tactcgatcg gcctcgatat tgggactaac tctgttggct gggccgtgat 3720

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ttccatcaag aagaatctca ttggcgctct cctgttcgac agcggcgaga cggctgaggc 3840

tacgcggctc aagcgcaccg cccgcaggcg gtacacgcgc aggaagaatc gcatctgcta 3900

cctgcaggag attttctcca acgagatggc gaaggttgac gattctttct tccacaggct 3960

ggaggagtca ttcctcgtgg aggaggataa gaagcacgag cggcatccaa tcttcggcaa 4020

cattgtcgac gaggttgcct accacgagaa gtaccctacg atctaccatc tgcggaagaa 4080

gctcgtggac tccacagata aggcggacct ccgcctgatc tacctcgctc tggcccacat 4140

gattaagttc aggggccatt tcctgatcga gggggatctc aacccggaca atagcgatgt 4200

tgacaagctg ttcatccagc tcgtgcagac gtacaaccag ctcttcgagg agaaccccat 4260

taatgcgtca ggcgtcgacg cgaaggctat cctgtccgct aggctctcga agtctcggcg 4320

cctcgagaac ctgatcgccc agctgccggg cgagaagaag aacggcctgt tcgggaatct 4380

cattgcgctc agcctggggc tcacgcccaa cttcaagtcg aatttcgatc tcgctgagga 4440

cgccaagctg cagctctcca aggacacata cgacgatgac ctggataacc tcctggccca 4500

gatcggcgat cagtacgcgg acctgttcct cgctgccaag aatctgtcgg acgccatcct 4560

cctgtctgat attctcaggg tgaacaccga gattacgaag gctccgctct cagcctccat 4620

gatcaagcgc tacgacgagc accatcagga tctgaccctc ctgaaggcgc tggtcaggca 4680

gcagctcccc gagaagtaca aggagatctt cttcgatcag tcgaagaacg gctacgctgg 4740

gtacattgac ggcggggcct ctcaggagga gttctacaag ttcatcaagc cgattctgga 4800

gaagatggac ggcacggagg agctgctggt gaagctcaat cgcgaggacc tcctgaggaa 4860

gcagcggaca ttcgataacg gcagcatccc acaccagatt catctcgggg agctgcacgc 4920

tatcctgagg aggcaggagg acttctaccc tttcctcaag gataaccgcg agaagatcga 4980

gaagattctg actttcagga tcccgtacta cgtcggccca ctcgctaggg gcaactcccg 5040

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ggtcgacaag ggcgctagcg ctcagtcgtt catcgagagg atgacgaatt tcgacaagaa 5160

cctgccaaat gagaaggtgc tccctaagca ctcgctcctg tacgagtact tcacagtcta 5220

caacgagctg actaaggtga agtatgtgac cgagggcatg aggaagccgg ctttcctgtc 5280

tggggagcag aagaaggcca tcgtggacct cctgttcaag accaaccgga aggtcacggt 5340

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taaggataag gacttcctgg acaacgagga gaatgaggat atcctcgagg acattgtgct 5520

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gaaggttgtg gacgagctgg tgaaggtcat gggcaggcac aagcctgaga acatcgtcat 5940

tgagatggcc cgggagaatc agaccacgca gaagggccag aagaactcac gcgagaggat 6000

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ggagaacacg cagctgcaga atgagaagct ctacctgtac tacctccaga atggccgcga 6120

tatgtatgtg gaccaggagc tggatattaa caggctcagc gattacgacg tcgatcatat 6180

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caagaaccgg ggcaagtctg ataatgttcc ttcagaggag gtcgttaaga agatgaagaa 6300

ctactggcgc cagctcctga atgccaagct gatcacgcag cggaagttcg ataacctcac 6360

aaaggctgag aggggcgggc tctctgagct ggacaaggcg ggcttcatca agaggcagct 6420

ggtcgagaca cggcagatca ctaagcacgt tgcgcagatt ctcgactcac ggatgaacac 6480

taagtacgat gagaatgaca agctgatccg cgaggtgaag gtcatcaccc tgaagtcaaa 6540

gctcgtctcc gacttcagga aggatttcca gttctacaag gttcgggaga tcaacaatta 6600

ccaccatgcc catgacgcgt acctgaacgc ggtggtcggc acagctctga tcaagaagta 6660

cccaaagctc gagagcgagt tcgtgtacgg ggactacaag gtttacgatg tgaggaagat 6720

gatcgccaag tcggagcagg agattggcaa ggctaccgcc aagtacttct tctactctaa 6780

cattatgaat ttcttcaaga cagagatcac tctggccaat ggcgagatcc ggaagcgccc 6840

cctcatcgag acgaacggcg agacggggga gatcgtgtgg gacaagggca gggatttcgc 6900

gaccgtcagg aaggttctct ccatgccaca agtgaatatc gtcaagaaga cagaggtcca 6960

gactggcggg ttctctaagg agtcaattct gcctaagcgg aacagcgaca agctcatcgc 7020

ccgcaagaag gactgggatc cgaagaagta cggcgggttc gacagcccca ctgtggccta 7080

ctcggtcctg gttgtggcga aggttgagaa gggcaagtcc aagaagctca agagcgtgaa 7140

ggagctgctg gggatcacga ttatggagcg ctccagcttc gagaagaacc cgatcgattt 7200

cctggaggcg aagggctaca aggaggtgaa gaaggacctg atcattaagc tccccaagta 7260

ctcactcttc gagctggaga acggcaggaa gcggatgctg gcttccgctg gcgagctgca 7320

gaaggggaac gagctggctc tgccgtccaa gtatgtgaac ttcctctacc tggcctccca 7380

ctacgagaag ctcaagggca gccccgagga caacgagcag aagcagctgt tcgtcgagca 7440

gcacaagcat tacctcgacg agatcattga gcagatttcc gagttctcca agcgcgtgat 7500

cctggccgac gcgaatctgg ataaggtcct ctccgcgtac aacaagcacc gcgacaagcc 7560

aatcagggag caggctgaga atatcattca tctcttcacc ctgacgaacc tcggcgcccc 7620

tgctgctttc aagtacttcg acacaactat cgatcgcaag aggtacacaa gcactaagga 7680

ggtcctggac gcgaccctca tccaccagtc gattaccggc ctctacgaga cgcgcatcga 7740

cctgtctcag ctcgggggcg acaagcggcc agcggcgacg aagaaggcgg ggcaggcgaa 7800

gaagaagaag tgagctcaga gctttcgttc gtatcatcgg tttcgacaac gttcgtcaag 7860

ttcaatgcat cagtttcatt gcgcacacac cagaatccta ctgagtttga gtattatggc 7920

attgggaaaa ctgtttttct tgtaccattt gttgtgcttg taatttactg tgttttttat 7980

tcggttttcg ctatcgaact gtgaaatgga aatggatgga gaagagttaa tgaatgatat 8040

ggtccttttg ttcattctca aattaatatt atttgttttt tctcttattt gttgtgtgtt 8100

gaatttgaaa ttataagaga tatgcaaaca ttttgttttg agtaaaaatg tgtcaaatcg 8160

tggcctctaa tgaccgaagt taatatgagg agtaaaacac ttgtagttgt accattatgc 8220

ttattcacta ggcaacaaat atattttcag acctagaaaa gctgcaaatg ttactgaata 8280

caagtatgtc ctcttgtgtt ttagacattt atgaactttc ctttatgtaa ttttccagaa 8340

tccttgtcag attctaatca ttgctttata attatagtta tactcatgga tttgtagttg 8400

agtatgaaaa tattttttaa tgcattttat gacttgccaa ttgattgaca acgaattcgt 8460

aatcatgtca tagctgtttc ctgtgtgaaa ttgttatccg ctcacaattc cacacaacat 8520

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aattgcgttg cgctcactgc ccgctttcca gtcgggaaac ctgtcgtgcc agctgcatta 8640

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caaagggcta ttgagacttt tcaacaaagg gtaatatcgg gaaacctcct cggattccat 8820

tgcccagcta tctgtcactt catcaaaagg acagtagaaa aggaaggtgg cacctacaaa 8880

tgccatcatt gcgataaagg aaaggctatc gttcaagatg cctctgccga cagtggtccc 8940

aaagatggac ccccacccac gaggagcatc gtggaaaaag aagacgttcc aaccacgtct 9000

tcaaagcaag tggattgatg tgataacatg gtggagcacg acactctcgt ctactccaag 9060

aatatcaaag atacagtctc agaagaccaa agggctattg agacttttca acaaagggta 9120

atatcgggaa acctcctcgg attccattgc ccagctatct gtcacttcat caaaaggaca 9180

gtagaaaagg aaggtggcac ctacaaatgc catcattgcg ataaaggaaa ggctatcgtt 9240

caagatgcct ctgccgacag tggtcccaaa gatggacccc cacccacgag gagcatcgtg 9300

gaaaaagaag acgttccaac cacgtcttca aagcaagtgg attgatgtga tatctccact 9360

gacgtaaggg atgacgcaca atcccactat ccttcgcaag accttcctct atataaggaa 9420

gttcatttca tttggagagg acacgctgaa atcaccagtc tctctctaca aatctatctc 9480

tctcgagctt tcgcagatcc cggggggcaa tgagatatga aaaagcctga actcaccgcg 9540

acgtctgtcg agaagtttct gatcgaaaag ttcgacagcg tctccgacct gatgcagctc 9600

tcggagggcg aagaatctcg tgctttcagc ttcgatgtag gagggcgtgg atatgtcctg 9660

cgggtaaata gctgcgccga tggtttctac aaagatcgtt atgtttatcg gcactttgca 9720

tcggccgcgc tcccgattcc ggaagtgctt gacattgggg agtttagcga gagcctgacc 9780

tattgcatct cccgccgtgc acagggtgtc acgttgcaag acctgcctga aaccgaactg 9840

cccgctgttc tacaaccggt cgcggaggct atggatgcga tcgctgcggc cgatcttagc 9900

cagacgagcg ggttcggccc attcggaccg caaggaatcg gtcaatacac tacatggcgt 9960

gatttcatat gcgcgattgc tgatccccat gtgtatcact ggcaaactgt gatggacgac 10020

accgtcagtg cgtccgtcgc gcaggctctc gatgagctga tgctttgggc cgaggactgc 10080

cccgaagtcc ggcacctcgt gcacgcggat ttcggctcca acaatgtcct gacggacaat 10140

ggccgcataa cagcggtcat tgactggagc gaggcgatgt tcggggattc ccaatacgag 10200

gtcgccaaca tcttcttctg gaggccgtgg ttggcttgta tggagcagca gacgcgctac 10260

ttcgagcgga ggcatccgga gcttgcagga tcgccacgac tccgggcgta tatgctccgc 10320

attggtcttg accaactcta tcagagcttg gttgacggca atttcgatga tgcagcttgg 10380

gcgcagggtc gatgcgacgc aatcgtccga tccggagccg ggactgtcgg gcgtacacaa 10440

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ggaaaccgac gccccagcac tcgtccgagg gcaaagaaat agagtagatg ccgaccggat 10560

ctgtcgatcg acaagctcga gtttctccat aataatgtgt gagtagttcc cagataaggg 10620

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atttgtattt gtaaaatact tctatcaata aaatttctaa ttcctaaaac caaaatccag 10740

tactaaaatc cagatccccc gaattaattc ggcgttaatt cagtacatta aaaacgtccg 10800

caatgtgtta ttaagttgtc taagcgtcaa tttgtttaca ccacaatata tcctgccacc 10860

agccagccaa cagctccccg accggcagct cggcacaaaa tcaccactcg atacaggcag 10920

cccatcagtc cgggacggcg tcagcgggag agccgttgta aggcggcaga ctttgctcat 10980

gttaccgatg ctattcggaa gaacggcaac taagctgccg ggtttgaaac acggatgatc 11040

tcgcggaggg tagcatgttg attgtaacga tgacagagcg ttgctgcctg tgatcaccgc 11100

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ttgttataat tagcttcttg gggtatcttt aaatactgta gaaaagagga aggaaataat 11280

aaatggctaa aatgagaata tcaccggaat tgaaaaaact gatcgaaaaa taccgctgcg 11340

taaaagatac ggaaggaatg tctcctgcta aggtatataa gctggtggga gaaaatgaaa 11400

acctatattt aaaaatgacg gacagccggt ataaagggac cacctatgat gtggaacggg 11460

aaaaggacat gatgctatgg ctggaaggaa agctgcctgt tccaaaggtc ctgcactttg 11520

aacggcatga tggctggagc aatctgctca tgagtgaggc cgatggcgtc ctttgctcgg 11580

aagagtatga agatgaacaa agccctgaaa agattatcga gctgtatgcg gagtgcatca 11640

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tagccgaatt ggattactta ctgaataacg atctggccga tgtggattgc gaaaactggg 11760

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ccgaagagga acttgtcttt tcccacggcg acctgggaga cagcaacatc tttgtgaaag 11880

atggcaaagt aagtggcttt attgatcttg ggagaagcgg cagggcggac aagtggtatg 11940

acattgcctt ctgcgtccgg tcgatcaggg aggatatcgg ggaagaacag tatgtcgagc 12000

tattttttga cttactgggg atcaagcctg attgggagaa aataaaatat tatattttac 12060

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tgcgcgtaat ctgctgcttg caaacaaaaa aaccaccgct accagcggtg gtttgtttgc 12240

cggatcaaga gctaccaact ctttttccga aggtaactgg cttcagcaga gcgcagatac 12300

caaatactgt ccttctagtg tagccgtagt taggccacca cttcaagaac tctgtagcac 12360

cgcctacata cctcgctctg ctaatcctgt taccagtggc tgctgccagt ggcgataagt 12420

cgtgtcttac cgggttggac tcaagacgat agttaccgga taaggcgcag cggtcgggct 12480

gaacgggggg ttcgtgcaca cagcccagct tggagcgaac gacctacacc gaactgagat 12540

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cctggtatct ttatagtcct gtcgggtttc gccacctctg acttgagcgt cgatttttgt 12720

gatgctcgtc aggggggcgg agcctatgga aaaacgccag caacgcggcc tttttacggt 12780

tcctggcctt ttgctggcct tttgctcaca tgttctttcc tgcgttatcc cctgattctg 12840

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ccgcatagtt aagccagtat acactccgct atcgctacgt gactgggtca tggctgcgcc 13080

ccgacacccg ccaacacccg ctgacgcgcc ctgacgggct tgtctgctcc cggcatccgc 13140

ttacagacaa gctgtgaccg tctccgggag ctgcatgtgt cagaggtttt caccgtcatc 13200

accgaaacgc gcgaggcagg gtgccttgat gtgggcgccg gcggtcgagt ggcgacggcg 13260

cggcttgtcc gcgccctggt agattgcctg gccgtaggcc agccattttt gagcggccag 13320

cggccgcgat aggccgacgc gaagcggcgg ggcgtaggga gcgcagcgac cgaagggtag 13380

gcgctttttg cagctcttcg gctgtgcgct ggccagacag ttatgcacag gccaggcggg 13440

ttttaagagt tttaataagt tttaaagagt tttaggcgga aaaatcgcct tttttctctt 13500

ttatatcagt cacttacatg tgtgaccggt tcccaatgta cggctttggg ttcccaatgt 13560

acgggttccg gttcccaatg tacggctttg ggttcccaat gtacgtgcta tccacaggaa 13620

acagaccttt tcgacctttt tcccctgcta gggcaatttg ccctagcatc tgctccgtac 13680

attaggaacc ggcggatgct tcgccctcga tcaggttgcg gtagcgcatg actaggatcg 13740

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gcttgcgcac ggtgaaacag aacttcttga actctccggc gctgccactg cgttcgtaga 13860

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tgtttaaccg aatgcaggtt tctaccaggt cgtctttctg ctttccgcca tcggctcgcc 14220

ggcagaactt gagtacgtcc gcaacgtgtg gacggaacac gcggccgggc ttgtctccct 14280

tcccttcccg gtatcggttc atggattcgg ttagatggga aaccgccatc agtaccaggt 14340

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gaagctcgta gcggatcacc tcgccagctc gtcggtcacg cttcgacaga cggaaaacgg 14460

ccacgtccat gatgctgcga ctatcgcggg tgcccacgtc atagagcatc ggaacgaaaa 14520

aatctggttg ctcgtcgccc ttgggcggct tcctaatcga cggcgcaccg gctgccggcg 14580

gttgccggga ttctttgcgg attcgatcag cggccgcttg ccacgattca ccggggcgtg 14640

cttctgcctc gatgcgttgc cgctgggcgg cctgcgcggc cttcaacttc tccaccaggt 14700

catcacccag cgccgcgccg atttgtaccg ggccggatgg tttgcgaccg ctcacgccga 14760

ttcctcgggc ttgggggttc cagtgccatt gcagggccgg cagacaaccc agccgcttac 14820

gcctggccaa ccgcccgttc ctccacacat ggggcattcc acggcgtcgg tgcctggttg 14880

ttcttgattt tccatgccgc ctcctttagc cgctaaaatt catctactca tttattcatt 14940

tgctcattta ctctggtagc tgcgcgatgt attcagatag cagctcggta atggtcttgc 15000

cttggcgtac cgcgtacatc ttcagcttgg tgtgatcctc cgccggcaac tgaaagttga 15060

cccgcttcat ggctggcgtg tctgccaggc tggccaacgt tgcagccttg ctgctgcgtg 15120

cgctcggacg gccggcactt agcgtgtttg tgcttttgct cattttctct ttacctcatt 15180

aactcaaatg agttttgatt taatttcagc ggccagcgcc tggacctcgc gggcagcgtc 15240

gccctcgggt tctgattcaa gaacggttgt gccggcggcg gcagtgcctg ggtagctcac 15300

gcgctgcgtg atacgggact caagaatggg cagctcgtac ccggccagcg cctcggcaac 15360

ctcaccgccg atgcgcgtgc ctttgatcgc ccgcgacacg acaaaggccg cttgtagcct 15420

tccatccgtg acctcaatgc gctgcttaac cagctccacc aggtcggcgg tggcccatat 15480

gtcgtaaggg cttggctgca ccggaatcag cacgaagtcg gctgccttga tcgcggacac 15540

agccaagtcc gccgcctggg gcgctccgtc gatcactacg aagtcgcgcc ggccgatggc 15600

cttcacgtcg cggtcaatcg tcgggcggtc gatgccgaca acggttagcg gttgatcttc 15660

ccgcacggcc gcccaatcgc gggcactgcc ctggggatcg gaatcgacta acagaacatc 15720

ggccccggcg agttgcaggg cgcgggctag atgggttgcg atggtcgtct tgcctgaccc 15780

gcctttctgg ttaagtacag cgataacctt catgcgttcc ccttgcgtat ttgtttattt 15840

actcatcgca tcatatacgc agcgaccgca tgacgcaagc tgttttactc aaatacacat 15900

caccttttta gacggcggcg ctcggtttct tcagcggcca agctggccgg ccaggccgcc 15960

agcttggcat cagacaaacc ggccaggatt tcatgcagcc gcacggttga gacgtgcgcg 16020

ggcggctcga acacgtaccc ggccgcgatc atctccgcct cgatctcttc ggtaatgaaa 16080

aacggttcgt cctggccgtc ctggtgcggt ttcatgcttg ttcctcttgg cgttcattct 16140

cggcggccgc cagggcgtcg gcctcggtca atgcgtcctc acggaaggca ccgcgccgcc 16200

tggcctcggt gggcgtcact tcctcgctgc gctcaagtgc gcggtacagg gtcgagcgat 16260

gcacgccaag cagtgcagcc gcctctttca cggtgcggcc ttcctggtcg atcagctcgc 16320

gggcgtgcgc gatctgtgcc ggggtgaggg tagggcgggg gccaaacttc acgcctcggg 16380

ccttggcggc ctcgcgcccg ctccgggtgc ggtcgatgat tagggaacgc tcgaactcgg 16440

caatgccggc gaacacggtc aacaccatgc ggccggccgg cgtggtggtg tcggcccacg 16500

gctctgccag gctacgcagg cccgcgccgg cctcctggat gcgctcggca atgtccagta 16560

ggtcgcgggt gctgcgggcc aggcggtcta gcctggtcac tgtcacaacg tcgccagggc 16620

gtaggtggtc aagcatcctg gccagctccg ggcggtcgcg cctggtgccg gtgatcttct 16680

cggaaaacag cttggtgcag ccggccgcgt gcagttcggc ccgttggttg gtcaagtcct 16740

ggtcgtcggt gctgacgcgg gcatagccca gcaggccagc ggcggcgctc ttgttcatgg 16800

cgtaatgtct ccggttctag tcgcaagtat tctactttat gcgactaaaa cacgcgacaa 16860

gaaaacgcca ggaaaagggc agggcggcag cctgtcgcgt aacttaggac ttgtgcgaca 16920

tgtcgttttc agaagacggc tgcactgaac gtcagaagcc gactgcacta tagcagcgga 16980

ggggttggat caaagtactt tgatcccgag gggaaccctg tggttggcat gcacatacaa 17040

atggacgaac ggataaacct tttcacgccc ttttaaatat ccgttattct aataaacgct 17100

cttttctctt ag 17112

<210> 3

<211> 2013

<212> DNA

<213> Arabidopsis thaliana

<400> 3

atggcggcgg caacaacaac aacaacaaca tcttcttcga tctccttctc caccaaacca 60

tctccttcct cctccaaatc accattacca atctccagat tctccctccc attctcccta 120

aaccccaaca aatcatcctc ctcctcccgc cgccgcggta tcaaatccag ctctccctcc 180

tccatctccg ccgtgctcaa cacaaccacc aatgtcacaa ccactccctc tccaaccaaa 240

cctaccaaac ccgaaacatt catctcccga ttcgctccag atcaaccccg caaaggcgct 300

gatatcctcg tcgaagcttt agaacgtcaa ggcgtagaaa ccgtattcgc ttaccctgga 360

ggtgcatcaa tggagattca ccaagcctta acccgctctt cctcaatccg taacgtcctt 420

cctcgtcacg aacaaggagg tgtattcgca gcagaaggat acgctcgatc ctcaggtaaa 480

ccaggtatct gtatagccac ttcaggtccc ggagctacaa atctcgttag cggattagcc 540

gatgcgttgt tagatagtgt tcctcttgta gcaatcacag gacaagtccc tcgtcgtatg 600

attggtacag atgcgtttca agagactccg attgttgagg taacgcgttc gattacgaag 660

cataactatc ttgtgatgga tgttgaagat atccctagga ttattgagga agctttcttt 720

ttagctactt ctggtagacc tggacctgtt ttggttgatg ttcctaaaga tattcaacaa 780

cagcttgcga ttcctaattg ggaacaggct atgagattac ctggttatat gtctaggatg 840

cctaaacctc cggaagattc tcatttggag cagattgtta ggttgatttc tgagtctaag 900

aagcctgtgt tgtatgttgg tggtggttgt ttgaattcta gcgatgaatt gggtaggttt 960

gttgagctta cggggatccc tgttgcgagt acgttgatgg ggctgggatc ttatccttgt 1020

gatgatgagt tgtcgttaca tatgcttgga atgcatggga ctgtgtatgc aaattacgct 1080

gtggagcata gtgatttgtt gttggcgttt ggggtaaggt ttgatgatcg tgtcacgggt 1140

aagcttgagg cttttgctag tagggctaag attgttcata ttgatattga ctcggctgag 1200

attgggaaga ataagactcc tcatgtgtct gtgtgtggtg atgttaagct ggctttgcaa 1260

gggatgaata aggttcttga gaaccgagcg gaggagctta agcttgattt tggagtttgg 1320

aggaatgagt tgaacgtaca gaaacagaag tttccgttga gctttaagac gtttggggaa 1380

gctattcctc cacagtatgc gattaaggtc cttgatgagt tgactgatgg aaaagccata 1440

ataagtactg gtgtcgggca acatcaaatg tgggcggcgc agttctacaa ttacaagaaa 1500

ccaaggcagt ggctatcatc aggaggcctt ggagctatgg gatttggact tcctgctgcg 1560

attggagcgt ctgttgctaa ccctgatgcg atagttgtgg atattgacgg agatggaagc 1620

tttataatga atgtgcaaga gctagccact attcgtgtag agaatcttcc agtgaaggta 1680

cttttattaa acaaccagca tcttggcatg gttatgcaat gggaagatcg gttctacaaa 1740

gctaaccgag ctcacacatt tctcggggat ccggctcagg aggacgagat attcccgaac 1800

atgttgctgt ttgcagcagc ttgcgggatt ccagcggcga gggtgacaaa gaaagcagat 1860

ctccgagaag ctattcagac aatgctggat acaccaggac cttacctgtt ggatgtgatt 1920

tgtccgcacc aagaacatgt gttgccgatg atcccgagtg gtggcacttt caacgatgtc 1980

ataacggaag gagatggccg gattaaatac tga 2013

<210> 4

<211> 19

<212> DNA

<213> 拟南芥（Arabidopsis thaliana）

<400> 4

aagtccctcg tcgtatgat 19

<210> 5

<211> 19

<212> DNA

<213> 拟南芥（Arabidopsis thaliana）

<400> 5

aagttcttcg tcgtatgat 19

<210> 6

<211> 19

<212> DNA

<213> 拟南芥（Arabidopsis thaliana）

<400> 6

aagtttttcg tcgtatgat 19

<210> 7

<211> 19

<212> DNA

<213> 拟南芥（Arabidopsis thaliana）

<400> 7

aagtttctcg tcgtatgat 19

<210> 8

<211> 19

<212> DNA

<213> 拟南芥（Arabidopsis thaliana）

<400> 8

aagttcctcg tcgtatgatt ga 22

Claims (14)

1.一种基因定点突变载体，其特征在于，所述载体在基础载体的基础上构建，5’到3’包括启动子、sgRNA、胞嘧啶脱氨酶基因、Cas9基因、尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因和终止子；

所述sgRNA表达区含有植物除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列；

用XTEN将胞嘧啶脱氨酶基因连接在Cas9基因的5’端，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因连接在Cas9基因的3’端，核定位信号序列连接在尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因的3’端，进行植物偏好密码子的优化，得到优化的融合基因CT3，序列如SEQ ID No.1所示。

2.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述基础载体为PHEE401E，序列如SEQ IDNo.2所示。

3.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述Cas9基因为D10A。

4.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述载体为双元载体。

5.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述启动子是植物内的组成型启动子、组织特异性启动子或诱导型启动子。

6.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述胞嘧啶脱氨酶基因来自人类基因组，Cas9基因来自嗜热链球菌，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因来自噬菌体。

7.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列的胞嘧啶3`端方向23个碱基内具有PAM序列NGG。

8.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述植物为粮食和油料作物，包括水稻、棉花、玉米、小麦、大豆、油菜、向日葵；蔬菜作物，包括白菜、甘蓝、黄瓜、番茄；水果作物，包括西瓜、甜瓜、草莓，蓝莓，葡萄；中草药，包括板蓝根、甘草、人参、防风；以及拟南芥；

所述植物除草剂所抑制的酶的相关基因为ALS。

9.一种基因定点突变载体的构建方法，其特征在于，包括如下步骤：

1)用XTEN将胞嘧啶脱氨酶基因连接在Cas9基因的5’端，尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因连接在Cas9基因的3’端，核定位信号序列连接在尿嘧啶DNA糖基化酶抑制剂基因的3’端，进行植物偏好密码子的优化，得到优化的融合基因CT3，序列如SEQ ID No.1所示；

2)用步骤1)中CT3替换载体PHEE401E上的Cas9基因，所得载体命名为PHEE401CT；PHEE401E的序列如SEQ ID No.2所示；

3)将除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列克隆到PHEE401CT中的sgRNA表达区，至此PHEE401CT载体构建完成。

10.根据权利要求9所述的构建方法，其特征在于，步骤3)中除草剂所抑制的酶的相关基因为拟南芥ALS基因，序列如SEQ ID No.3所示。

11.根据权利要求9或10所述的构建方法，其特征在于，所述除草剂所抑制的酶的相关基因的靶点序列如SEQ ID No.4所示。

12.一种抗除草剂植物的制备，其特征在于，包括如下步骤：

将权利要求9所述的PHEE401CT载体转到农杆菌中，通过蘸花法转化植株，通过喷施除草剂获得具有除草剂抗性的植株。

13.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述载体在植物靶点序列产生C-T的突变。

14.根据权利要求1所述的载体，其特征在于，所述载体还在PAM序列NGG处产生点突变，形成NGA，实现重大农艺性状。

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